OTAR3088/BioData-CellLine_annotated · Datasets at Hugging Face

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PMC11629143	Methylated DNA was isolated using Protein A magnetic beads coupled to MBD2‐Fc protein.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methylated", "DNA", "was", "isolated", "using", "Protein", "A", "magnetic", "beads", "coupled", "to", "MBD2‐Fc", "protein", "." ] } ]
PMC11787355	d i.c.	[ { "tags": [ "O", "O", "O" ], "tokens": [ "d", "i.c", "." ] } ]
PMC11787355	MS/MS spectra were acquired in data-independent mode using 44 previously determined dynamic mass windows optimized for HLA class I peptides with an overlap of 0.5 m/z.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MS/MS", "spectra", "were", "acquired", "in", "data-independent", "mode", "using", "44", "previously", "determined", "dynamic", "mass", "windows", "optimized", "for", "HLA", "class", "I", "peptides", "with", "an", "overlap", "of", "0.5", "m/z", "." ] } ]
PMC11269933	These findings highlight the presence of complex and unique phosphorylation-mediated signaling transduction mechanisms in marine organisms, and provide new insights into the evolution and function of the crosstalk between classical pathways.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "findings", "highlight", "the", "presence", "of", "complex", "and", "unique", "phosphorylation-mediated", "signaling", "transduction", "mechanisms", "in", "marine", "organisms", ",", "and", "provide", "new", "insights", "into", "the", "evolution", "and", "function", "of", "the", "crosstalk", "between", "classical", "pathways", "." ] } ]
PMC7294030	A549 cells were treated with aurisin A (0, 1, 2, 4, 8, 16, 32 µM) on 24, 48, and 72 h. Viability of cells was determined by SRB assay.	[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A549", "cells", "were", "treated", "with", "aurisin", "A", "(", "0", ",", "1", ",", "2", ",", "4", ",", "8", ",", "16", ",", "32", "µM", ")", "on", "24", ",", "48", ",", "and", "72", "h.", "Viability", "of", "cells", "was", "determined", "by", "SRB", "assay", "." ] } ]
PMC6133382	While in theory this cell line could be used to produce a glycan-optimized gp120 vaccine, in reality, this is not practical.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "in", "theory", "this", "cell", "line", "could", "be", "used", "to", "produce", "a", "glycan-optimized", "gp120", "vaccine", ",", "in", "reality", ",", "this", "is", "not", "practical", "." ] } ]
PMC5443223	Subsequently, cells were resuspended in 1X binding buffer (BD Biosciences, San Jose, CA, USA) at a concentration of 1×10 cells/ml and stained with PE Annexin V with 7-AAD (BD Biosciences) in the dark for 15 min at room temperature.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Subsequently", ",", "cells", "were", "resuspended", "in", "1X", "binding", "buffer", "(", "BD", "Biosciences", ",", "San", "Jose", ",", "CA", ",", "USA", ")", "at", "a", "concentration", "of", "1", "×", "10", "cells/ml", "and", "stained", "with", "PE", "Annexin", "V", "with", "7-AAD", "(", "BD", "Biosciences", ")", "in", "the", "dark", "for", "15", "min", "at", "room", "temperature", "." ] } ]
PMC9429973	The risk of developing Hodgkin lymphoma, thyroid, and kidney cancers was high in the first year of FL diagnosis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "risk", "of", "developing", "Hodgkin", "lymphoma", ",", "thyroid", ",", "and", "kidney", "cancers", "was", "high", "in", "the", "first", "year", "of", "FL", "diagnosis", "." ] } ]
PMC11787355	While its expression is very limited across adult tissues, it is essential for gliomagenesis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "its", "expression", "is", "very", "limited", "across", "adult", "tissues", ",", "it", "is", "essential", "for", "gliomagenesis", "." ] } ]
PMC11621493	Principal component analysis indicated the highest separation of cytokine-stimulated KO cells from other groups (Fig. 8A).Fig.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Principal", "component", "analysis", "indicated", "the", "highest", "separation", "of", "cytokine-stimulated", "KO", "cells", "from", "other", "groups", "(", "Fig.", "8A).Fig", "." ] } ]
PMC9429973	Heteroduplex analysis followed by electrophoresis in polyacrylamide gel was used to screen for mutations in exon 12 of the JAK2 gene and exon 9 of CALR gene.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Heteroduplex", "analysis", "followed", "by", "electrophoresis", "in", "polyacrylamide", "gel", "was", "used", "to", "screen", "for", "mutations", "in", "exon", "12", "of", "the", "JAK2", "gene", "and", "exon", "9", "of", "CALR", "gene", "." ] } ]
PMC11638255	In contrast to the Th-MYCN model (Fig. 1b,c), anti-GD2 therapy alone did not mediate a substantial anti-tumor effect though the addition of TETA produced a remarkable anti-tumor effect (median survival: 29 days vs. 19 days in Saline + anti-GD2, p = 0.0091) leading to durable eradication in ~40% of animals (Fig. 7f).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "contrast", "to", "the", "Th-MYCN", "model", "(", "Fig.", "1b", ",", "c", ")", ",", "anti-GD2", "therapy", "alone", "did", "not", "mediate", "a", "substantial", "anti-tumor", "effect", "though", "the", "addition", "of", "TETA", "produced", "a", "remarkable", "anti-tumor", "effect", "(", "median", "survival", ":", "29", "days", "vs.", "19", "days", "in", "Saline", "+", "anti-GD2", ",", "p", "=", "0.0091", ")", "leading", "to", "durable", "eradication", "in", "~40", "%", "of", "animals", "(", "Fig.", "7f", ")", "." ] } ]
PMC11705547	Cisplatin can induce apoptosis in cancer cells by disrupting the plasma membrane and activate the Fas death receptor pathway (Figure 1).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cisplatin", "can", "induce", "apoptosis", "in", "cancer", "cells", "by", "disrupting", "the", "plasma", "membrane", "and", "activate", "the", "Fas", "death", "receptor", "pathway", "(", "Figure", "1", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Cultures are incubated at 37°C in 5% CO2.The proliferative potential and differentiation ability of bone marrow cells was determined by counting the number of corresponding colonies in a 14-day culture.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cultures", "are", "incubated", "at", "37", "°", "C", "in", "5", "%", "CO2.The", "proliferative", "potential", "and", "differentiation", "ability", "of", "bone", "marrow", "cells", "was", "determined", "by", "counting", "the", "number", "of", "corresponding", "colonies", "in", "a", "14-day", "culture", "." ] } ]
PMC9429973	A positive result by BMB, a positive PET/CT and the combined “PET/CT or BMB positive” result, were significantly associated with a shorter OS in univariate regression.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "positive", "result", "by", "BMB", ",", "a", "positive", "PET/CT", "and", "the", "combined", "“", "PET/CT", "or", "BMB", "positive", "”", "result", ",", "were", "significantly", "associated", "with", "a", "shorter", "OS", "in", "univariate", "regression", "." ] } ]
PMC9429973	Aims: To assess and identify predictors of hospital mortality in hematological patients with grade 4 neutropenia and concomitant coronavirus infection.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "To", "assess", "and", "identify", "predictors", "of", "hospital", "mortality", "in", "hematological", "patients", "with", "grade", "4", "neutropenia", "and", "concomitant", "coronavirus", "infection", "." ] } ]
PMC11389534	UFSP2 is necessary for the removal of UFM1 from the UFMylated PD‐L1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "UFSP2", "is", "necessary", "for", "the", "removal", "of", "UFM1", "from", "the", "UFMylated", "PD‐L1", "." ] } ]
PMC10890055	Zn-1Mg and Zn-1Mg-1Ag (wt.%) were prepared by mechanical alloying using pure zinc powder (99.9%, particle size < 149 µm, Thermo Fisher Scientific), pure magnesium (99.8%, particle size < 44 µm, Alfa Aesar-Thermo Fisher Scientific), and pure Ag (99.5%, particle size < 44 µm, Safina a.s.,	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Zn-1Mg", "and", "Zn-1Mg-1Ag", "(", "wt.%", ")", "were", "prepared", "by", "mechanical", "alloying", "using", "pure", "zinc", "powder", "(", "99.9", "%", ",", "particle", "size", "<", "149", "µm", ",", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ")", ",", "pure", "magnesium", "(", "99.8", "%", ",", "particle", "size", "<", "44", "µm", ",", "Alfa", "Aesar-Thermo", "Fisher", "Scientific", ")", ",", "and", "pure", "Ag", "(", "99.5", "%", ",", "particle", "size", "<", "44", "µm", ",", "Safina", "a.s", ".", "," ] } ]
PMC9599726	Cancer cells appear to be more sensitive to ferroptosis than normal cells, due to their “addiction to iron” required for proliferation on the one hand and their dependency on antioxidant systems on the other .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cancer", "cells", "appear", "to", "be", "more", "sensitive", "to", "ferroptosis", "than", "normal", "cells", ",", "due", "to", "their", "“", "addiction", "to", "iron", "”", "required", "for", "proliferation", "on", "the", "one", "hand", "and", "their", "dependency", "on", "antioxidant", "systems", "on", "the", "other", "." ] } ]
PMC11726848	To assess viability in the case of radiation exposure, the MTT assay can give false results , and therefore, we conducted additional cell viability tests.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "assess", "viability", "in", "the", "case", "of", "radiation", "exposure", ",", "the", "MTT", "assay", "can", "give", "false", "results", ",", "and", "therefore", ",", "we", "conducted", "additional", "cell", "viability", "tests", "." ] } ]
PMC11317131	Examples of PE sequences as well as primers can be found in Supplementary Tables S5 and S6.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Examples", "of", "PE", "sequences", "as", "well", "as", "primers", "can", "be", "found", "in", "Supplementary", "Tables", "S5", "and", "S6", "." ] } ]
PMC11792090	In addition to IL-7, other cytokines also showed beneficial effects on CAR-T cells (62), thus a more suitable signaling requires to be investigated.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "IL-7", ",", "other", "cytokines", "also", "showed", "beneficial", "effects", "on", "CAR-T", "cells", "(", "62", ")", ",", "thus", "a", "more", "suitable", "signaling", "requires", "to", "be", "investigated", "." ] } ]
PMC11643491	Understanding these differences is particularly important because cellular mechanical properties, such as deformability, may significantly influence the internalization of particles with different shapes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Understanding", "these", "differences", "is", "particularly", "important", "because", "cellular", "mechanical", "properties", ",", "such", "as", "deformability", ",", "may", "significantly", "influence", "the", "internalization", "of", "particles", "with", "different", "shapes", "." ] } ]
PMC11637284	The TAC60 variant lacking the C-terminal 283 aa and carrying a C-terminal 3x myc-tag, termed TAC60ΔC283-myc, was used as a positive control in our assay.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "TAC60", "variant", "lacking", "the", "C-terminal", "283", "aa", "and", "carrying", "a", "C-terminal", "3x", "myc-tag", ",", "termed", "TAC60ΔC283-myc", ",", "was", "used", "as", "a", "positive", "control", "in", "our", "assay", "." ] } ]
PMC10850553	In conclusion, in the present study, we have examined potential factors mediating the infiltration of neutrophils into IA lesions based on the recent experimental findings demonstrating the crucial role of neutrophils in the rupture of IAs.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "conclusion", ",", "in", "the", "present", "study", ",", "we", "have", "examined", "potential", "factors", "mediating", "the", "infiltration", "of", "neutrophils", "into", "IA", "lesions", "based", "on", "the", "recent", "experimental", "findings", "demonstrating", "the", "crucial", "role", "of", "neutrophils", "in", "the", "rupture", "of", "IAs", "." ] } ]
PMC10551595	After 3 h of incubation at 37°C, the formazan crystals were solubilized by adding 100 μL DMSO.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "3", "h", "of", "incubation", "at", "37", "°", "C", ",", "the", "formazan", "crystals", "were", "solubilized", "by", "adding", "100", "μL", "DMSO", "." ] } ]
PMC11449273	A construct encoding pGEX-TEV-PG was kindly provided by Dr. William Weis .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "construct", "encoding", "pGEX-TEV-PG", "was", "kindly", "provided", "by", "Dr.", "William", "Weis", "." ] } ]
PMC10607604	High-Grade Serous Ovarian Carcinoma (HGSOC) accounts for 60–70% of EOC and is the most aggressive subtype.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "High-Grade", "Serous", "Ovarian", "Carcinoma", "(", "HGSOC", ")", "accounts", "for", "60–70", "%", "of", "EOC", "and", "is", "the", "most", "aggressive", "subtype", "." ] } ]
PMC11244823	LIPS assay of the gD1_fragments gD1_83, gD1_160, gD1_180 and gD1_402 against the monoclonal anti-V5 mAb.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "LIPS", "assay", "of", "the", "gD1_fragments", "gD1_83", ",", "gD1_160", ",", "gD1_180", "and", "gD1_402", "against", "the", "monoclonal", "anti-V5", "mAb", "." ] } ]
PMC11388384	It would be interesting to examine whether the catalytic activity of SCUBE is similar or different from the activity of other morphogen-interacting proteins.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "would", "be", "interesting", "to", "examine", "whether", "the", "catalytic", "activity", "of", "SCUBE", "is", "similar", "or", "different", "from", "the", "activity", "of", "other", "morphogen-interacting", "proteins", "." ] } ]
PMC9164404	Moreover, Abplatin exhibited excellent stability within 7 days with limited size variations (Fig. 1C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "Abplatin", "exhibited", "excellent", "stability", "within", "7", "days", "with", "limited", "size", "variations", "(", "Fig.", "1C", ")", "." ] } ]
PMC11448304	Yet, this study offers novel insights into the mechanisms of radioresistance and highlights potential biomarkers and therapeutic targets, such as Khib-modified EGFR, for improving radiation therapy in NSCLC.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Yet", ",", "this", "study", "offers", "novel", "insights", "into", "the", "mechanisms", "of", "radioresistance", "and", "highlights", "potential", "biomarkers", "and", "therapeutic", "targets", ",", "such", "as", "Khib-modified", "EGFR", ",", "for", "improving", "radiation", "therapy", "in", "NSCLC", "." ] } ]
PMC9429973	Recent clinical trials conducted in Philadelphia (Ph) chromosome-negative BCP-ALL patients with CD20 expression revealed that the outcome of young adults may be improved by a combination of chemotherapy with rituximab, the anti-CD20 mAb.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Recent", "clinical", "trials", "conducted", "in", "Philadelphia", "(", "Ph", ")", "chromosome-negative", "BCP-ALL", "patients", "with", "CD20", "expression", "revealed", "that", "the", "outcome", "of", "young", "adults", "may", "be", "improved", "by", "a", "combination", "of", "chemotherapy", "with", "rituximab", ",", "the", "anti-CD20", "mAb", "." ] } ]
PMC11718817	Using this spheroid model of pancreatic carcinoma, intratumoral motility of antigen-specific T cells was investigated.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Using", "this", "spheroid", "model", "of", "pancreatic", "carcinoma", ",", "intratumoral", "motility", "of", "antigen-specific", "T", "cells", "was", "investigated", "." ] } ]
PMC11095939	Similarly, we identified a total of 14,640 and 15,350 Mecp2-binding genes before and after PHx in the Mecp2 control liver, respectively (Figure 6—figure supplement 1A and B).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Similarly", ",", "we", "identified", "a", "total", "of", "14,640", "and", "15,350", "Mecp2-binding", "genes", "before", "and", "after", "PHx", "in", "the", "Mecp2", "control", "liver", ",", "respectively", "(", "Figure", "6—figure", "supplement", "1A", "and", "B", ")", "." ] } ]
PMC9917080	An increase in the time of incubation of glioblastoma cells with the studied agents led to an increase in the level of expression of ER-stress genes and a significant depletion of the ER Ca pool, which correlates with an increase in the expression of proapoptotic genes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "An", "increase", "in", "the", "time", "of", "incubation", "of", "glioblastoma", "cells", "with", "the", "studied", "agents", "led", "to", "an", "increase", "in", "the", "level", "of", "expression", "of", "ER-stress", "genes", "and", "a", "significant", "depletion", "of", "the", "ER", "Ca", "pool", ",", "which", "correlates", "with", "an", "increase", "in", "the", "expression", "of", "proapoptotic", "genes", "." ] } ]
PMC10335954	When TRIP13 was knocked down in GC cells, the JAK/STAT signaling cascade was activated to upregulate the expression of IL-6.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "TRIP13", "was", "knocked", "down", "in", "GC", "cells", ",", "the", "JAK/STAT", "signaling", "cascade", "was", "activated", "to", "upregulate", "the", "expression", "of", "IL-6", "." ] } ]
PMC10719213	Mutation rate is similar in patients with MS versus healthy controls. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mutation", "rate", "is", "similar", "in", "patients", "with", "MS", "versus", "healthy", "controls", ".", "(" ] } ]
PMC9429973	Eligible HCPs had qualified in their primary specialty by 2014 and were managing ≥10 SCD pts at the time of survey (≥5 pts per HCP in Canada; ≥2 pts per HCP in the Netherlands).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Eligible", "HCPs", "had", "qualified", "in", "their", "primary", "specialty", "by", "2014", "and", "were", "managing", "≥10", "SCD", "pts", "at", "the", "time", "of", "survey", "(", "≥5", "pts", "per", "HCP", "in", "Canada", ";", "≥2", "pts", "per", "HCP", "in", "the", "Netherlands", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Early diagnosis of AML and improve supportive care is essential to reduce the ED rate and improve overall survival by establishing early treatment N. Siala, L. Khelifa, I. Frikha, F. Kallel, H. Sennana, S. Menif, N. Ben abdeljalil, S. Laddeb, Y. Fakhfekh, I. Ben Amor, O. Kassar, S. Hadiji, M. Charfi, T. Ben othmen, M. Medhaffar, M. Elloumi Hematology, Hedi Chaker Hospital, Sfax; Cytogenetic laboratory, Sousse; Hematology laboratory -Pasteur Institut; National bonne marrow transplantation centre, Tunis, Tunisia Background: Acute myeloid leukemia with Philadelphia chromosome (AML Ph+) is recently been listed in the 2016 revised World Health Organization (WHO) classification of myeloid malignancies as a provisional entity.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Early", "diagnosis", "of", "AML", "and", "improve", "supportive", "care", "is", "essential", "to", "reduce", "the", "ED", "rate", "and", "improve", "overall", "survival", "by", "establishing", "early", "treatment", "N.", "Siala", ",", "L.", "Khelifa", ",", "I.", "Frikha", ",", "F.", "Kallel", ",", "H.", "Sennana", ",", "S.", "Menif", ",", "N.", "Ben", "abdeljalil", ",", "S.", "Laddeb", ",", "Y.", "Fakhfekh", ",", "I.", "Ben", "Amor", ",", "O.", "Kassar", ",", "S.", "Hadiji", ",", "M.", "Charfi", ",", "T.", "Ben", "othmen", ",", "M.", "Medhaffar", ",", "M.", "Elloumi", "Hematology", ",", "Hedi", "Chaker", "Hospital", ",", "Sfax", ";", "Cytogenetic", "laboratory", ",", "Sousse", ";", "Hematology", "laboratory", "-Pasteur", "Institut", ";", "National", "bonne", "marrow", "transplantation", "centre", ",", "Tunis", ",", "Tunisia", "Background", ":", "Acute", "myeloid", "leukemia", "with", "Philadelphia", "chromosome", "(", "AML", "Ph+", ")", "is", "recently", "been", "listed", "in", "the", "2016", "revised", "World", "Health", "Organization", "(", "WHO", ")", "classification", "of", "myeloid", "malignancies", "as", "a", "provisional", "entity", "." ] } ]
PMC8469018	Nevertheless, the recognition of the mechanism of its action independent of the synthesis of pyrimidines, which makes it an effective anti-myeloma drug, may allow for the development of new therapeutic strategies in the treatment of myeloma and other cancers.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nevertheless", ",", "the", "recognition", "of", "the", "mechanism", "of", "its", "action", "independent", "of", "the", "synthesis", "of", "pyrimidines", ",", "which", "makes", "it", "an", "effective", "anti-myeloma", "drug", ",", "may", "allow", "for", "the", "development", "of", "new", "therapeutic", "strategies", "in", "the", "treatment", "of", "myeloma", "and", "other", "cancers", "." ] } ]
PMC11291490	Duck embryo fibroblasts (DEFs) were cultured in a minimum essential medium (MEM, Gibco, USA) supplemented with 10% NBS (Gibco, USA).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Duck", "embryo", "fibroblasts", "(", "DEFs", ")", "were", "cultured", "in", "a", "minimum", "essential", "medium", "(", "MEM", ",", "Gibco", ",", "USA", ")", "supplemented", "with", "10", "%", "NBS", "(", "Gibco", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11300639	Data are presented as the mean ± SEM of three replicates.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "presented", "as", "the", "mean", "±", "SEM", "of", "three", "replicates", "." ] } ]
PMC2193049	In brief, CTLs were added at the appropriate effector-to-target cell ratio (E/T) in 100 μl of IMDM supplemented with 10% human serum and 20 U/ml human rIL-2 (Glaxo Wellcome) provided by Dr. M. Nabholz (Swiss Institute for Experimental Cancer Research, Epalinges, Switzerland).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "brief", ",", "CTLs", "were", "added", "at", "the", "appropriate", "effector-to-target", "cell", "ratio", "(", "E/T", ")", "in", "100", "μl", "of", "IMDM", "supplemented", "with", "10", "%", "human", "serum", "and", "20", "U/ml", "human", "rIL-2", "(", "Glaxo", "Wellcome", ")", "provided", "by", "Dr.", "M.", "Nabholz", "(", "Swiss", "Institute", "for", "Experimental", "Cancer", "Research", ",", "Epalinges", ",", "Switzerland", ")", "." ] } ]
PMC11394227	The cells were then dispersed with 1 mL of ER-Tracker Red or Golgi-Tracker Red (Beyotime) diluent and incubated for 30 min.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cells", "were", "then", "dispersed", "with", "1", "mL", "of", "ER-Tracker", "Red", "or", "Golgi-Tracker", "Red", "(", "Beyotime", ")", "diluent", "and", "incubated", "for", "30", "min", "." ] } ]
PMC11739504	Ciliopathy includes a wide range of diseases, such as polycystic kidney disease (PKD), nephronophthisis (NPHP), Bardet-Biedl syndrome (BBS), and Joubert syndrome.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ciliopathy", "includes", "a", "wide", "range", "of", "diseases", ",", "such", "as", "polycystic", "kidney", "disease", "(", "PKD", ")", ",", "nephronophthisis", "(", "NPHP", ")", ",", "Bardet-Biedl", "syndrome", "(", "BBS", ")", ",", "and", "Joubert", "syndrome", "." ] } ]
PMC11265931	Human hepatoma cell line Hep3B (ATCC HB-8064), human neuroblastoma cell line SH-SY5Y(ATCC CRL-226), human pancreatic adenocarcinoma cell line Panc-1 (ATCC CRL-1469), human umbilical vein endothelial cell line HUVEC (ATCC CRL-1730), human glioblastoma cell line U87 (ATCC HTB-14) and prostate cancer cell line PC-3 (ATCC CRL-1435) were obtained from the American Type Culture Collection.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Human", "hepatoma", "cell", "line", "Hep3B", "(", "ATCC", "HB-8064", ")", ",", "human", "neuroblastoma", "cell", "line", "SH-SY5Y(ATCC", "CRL-226", ")", ",", "human", "pancreatic", "adenocarcinoma", "cell", "line", "Panc-1", "(", "ATCC", "CRL-1469", ")", ",", "human", "umbilical", "vein", "endothelial", "cell", "line", "HUVEC", "(", "ATCC", "CRL-1730", ")", ",", "human", "glioblastoma", "cell", "line", "U87", "(", "ATCC", "HTB-14", ")", "and", "prostate", "cancer", "cell", "line", "PC-3", "(", "ATCC", "CRL-1435", ")", "were", "obtained", "from", "the", "American", "Type", "Culture", "Collection", "." ] } ]
PMC11594806	Endogenous ATP can be released in substantial amounts during necrosis, apoptosis, and cellular damage, as well as in response to non-injury-related stimuli, such as vesicle exocytosis or ion channel activation via nucleotide transporters and connexin/pannexin hemichannels .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Endogenous", "ATP", "can", "be", "released", "in", "substantial", "amounts", "during", "necrosis", ",", "apoptosis", ",", "and", "cellular", "damage", ",", "as", "well", "as", "in", "response", "to", "non-injury-related", "stimuli", ",", "such", "as", "vesicle", "exocytosis", "or", "ion", "channel", "activation", "via", "nucleotide", "transporters", "and", "connexin/pannexin", "hemichannels", "." ] } ]
PMC11597291	The GO surface was functionalized with hydroxycamptothecin (GO-HCPT), and hyperthermia was induced via the application of a rotating magnetic field (RMF).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "GO", "surface", "was", "functionalized", "with", "hydroxycamptothecin", "(", "GO-HCPT", ")", ",", "and", "hyperthermia", "was", "induced", "via", "the", "application", "of", "a", "rotating", "magnetic", "field", "(", "RMF", ")", "." ] } ]
PMC11750712	For females who are not postmenopausal (<24 months of amenorrhea) or who are not surgically sterile (absence of ovaries and/or uterus), a highly effective method of contraception together with a barrier method must be used from the start of the preconditioning stage and for at least 12 months after the last dose of AUTO4 (study treatment).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "females", "who", "are", "not", "postmenopausal", "(", "<", "24", "months", "of", "amenorrhea", ")", "or", "who", "are", "not", "surgically", "sterile", "(", "absence", "of", "ovaries", "and/or", "uterus", ")", ",", "a", "highly", "effective", "method", "of", "contraception", "together", "with", "a", "barrier", "method", "must", "be", "used", "from", "the", "start", "of", "the", "preconditioning", "stage", "and", "for", "at", "least", "12", "months", "after", "the", "last", "dose", "of", "AUTO4", "(", "study", "treatment", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Blood samples were taken before and after each TPE session (TPE1 pre, TPE1 after, TPE2 pre, TPE2 after).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Blood", "samples", "were", "taken", "before", "and", "after", "each", "TPE", "session", "(", "TPE1", "pre", ",", "TPE1", "after", ",", "TPE2", "pre", ",", "TPE2", "after", ")", "." ] } ]
PMC11224020	Cells were then left for 48 h, washed to remove the viral particles and incubated in new medium until day 10 of culture.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "then", "left", "for", "48", "h", ",", "washed", "to", "remove", "the", "viral", "particles", "and", "incubated", "in", "new", "medium", "until", "day", "10", "of", "culture", "." ] } ]
PMC11705862	The arrival of firing action potential leads to the depolarization of presynaptic terminals, causing transient voltage-gated Ca channel opening, leading to a rise of Ca influx into neurons, which binds to synaptotagmin (Syt), and induces the assembly of the SNARE complex, mediating the docking and priming of presynaptic vesicles .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "arrival", "of", "firing", "action", "potential", "leads", "to", "the", "depolarization", "of", "presynaptic", "terminals", ",", "causing", "transient", "voltage-gated", "Ca", "channel", "opening", ",", "leading", "to", "a", "rise", "of", "Ca", "influx", "into", "neurons", ",", "which", "binds", "to", "synaptotagmin", "(", "Syt", ")", ",", "and", "induces", "the", "assembly", "of", "the", "SNARE", "complex", ",", "mediating", "the", "docking", "and", "priming", "of", "presynaptic", "vesicles", "." ] } ]
PMC11411131	The SECIS was derived from SelN. SelN cDNAs displayed a single-band signal.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "SECIS", "was", "derived", "from", "SelN.", "SelN", "cDNAs", "displayed", "a", "single-band", "signal", "." ] } ]
PMC3019555	Next, we transfected cells with a HIF-1α 3′ UTR luciferase reporter and monitored TX’s effect on its activity.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Next", ",", "we", "transfected", "cells", "with", "a", "HIF-1α", "3′", "UTR", "luciferase", "reporter", "and", "monitored", "TX", "’s", "effect", "on", "its", "activity", "." ] } ]
PMC11705630	To prove and validate the effects of GLDC further, we xenografted GLDC knock-downed ACHN and GLDC overexpressed A498 cells subcutaneously into the flank of nude mice.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "prove", "and", "validate", "the", "effects", "of", "GLDC", "further", ",", "we", "xenografted", "GLDC", "knock-downed", "ACHN", "and", "GLDC", "overexpressed", "A498", "cells", "subcutaneously", "into", "the", "flank", "of", "nude", "mice", "." ] } ]
PMC11679033	This step was carried out as follows: aliquots of heparinized blood (V = 600 μL per culture) were pipetted into a growth medium RPMI-1640 (Gibco, Grand Island, NY, USA) supplemented with 10% fetal calf serum (Gibco, Grand Island, NY, USA) and antibiotics (penicillin and streptomycin; Sigma-Aldrich, Steinheim, Germany).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "step", "was", "carried", "out", "as", "follows", ":", "aliquots", "of", "heparinized", "blood", "(", "V", "=", "600", "μL", "per", "culture", ")", "were", "pipetted", "into", "a", "growth", "medium", "RPMI-1640", "(", "Gibco", ",", "Grand", "Island", ",", "NY", ",", "USA", ")", "supplemented", "with", "10", "%", "fetal", "calf", "serum", "(", "Gibco", ",", "Grand", "Island", ",", "NY", ",", "USA", ")", "and", "antibiotics", "(", "penicillin", "and", "streptomycin", ";", "Sigma-Aldrich", ",", "Steinheim", ",", "Germany", ")", "." ] } ]
PMC9429973	CLL treatment was not held or modified at the time of vaccination.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CLL", "treatment", "was", "not", "held", "or", "modified", "at", "the", "time", "of", "vaccination", "." ] } ]
PMC11794568	RT-qPCR (A) and WB (B) confirmed that CRIP1 was stably overexpressed in SK-MEL-2 and A375 cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "RT-qPCR", "(", "A", ")", "and", "WB", "(", "B", ")", "confirmed", "that", "CRIP1", "was", "stably", "overexpressed", "in", "SK-MEL-2", "and", "A375", "cells", "." ] } ]
PMC11655536	We further analyzed the expression of NHE1 in the TCGA database, and found that NHE1 expression increased along with the aggravation of MM stage (Fig. 1C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "further", "analyzed", "the", "expression", "of", "NHE1", "in", "the", "TCGA", "database", ",", "and", "found", "that", "NHE1", "expression", "increased", "along", "with", "the", "aggravation", "of", "MM", "stage", "(", "Fig.", "1C", ")", "." ] } ]
PMC11342785	TPPP is a small 24 kDa MAP found in oligodendrocytes that contains only a single folded “CORE” domain (27, 28) (Fig. 1B).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TPPP", "is", "a", "small", "24", "kDa", "MAP", "found", "in", "oligodendrocytes", "that", "contains", "only", "a", "single", "folded", "“", "CORE", "”", "domain", "(", "27", ",", "28", ")", "(", "Fig.", "1B", ")", "." ] } ]
PMC11706491	To elucidate the precise role of Sty1 in cell cycle regulation, extending beyond the established genetic interactions with the Cdc25 phosphatase coding gene (Fig 4A), we deleted sty1 in the FLCCR strain.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "elucidate", "the", "precise", "role", "of", "Sty1", "in", "cell", "cycle", "regulation", ",", "extending", "beyond", "the", "established", "genetic", "interactions", "with", "the", "Cdc25", "phosphatase", "coding", "gene", "(", "Fig", "4A", ")", ",", "we", "deleted", "sty1", "in", "the", "FLCCR", "strain", "." ] } ]
PMC9429973	There were 178 patients received L-ASNase between 2011 to 2019 and 71 patients received PEG-ASNase between 2018-2021.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "were", "178", "patients", "received", "L-ASNase", "between", "2011", "to", "2019", "and", "71", "patients", "received", "PEG-ASNase", "between", "2018", "-", "2021", "." ] } ]
PMC8632470	Nevertheless, in another study on cultured granulosa cells from chicken ovarian follicles, quercetin confirmed the potential in preventing cadmium-induced cytotoxicity.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nevertheless", ",", "in", "another", "study", "on", "cultured", "granulosa", "cells", "from", "chicken", "ovarian", "follicles", ",", "quercetin", "confirmed", "the", "potential", "in", "preventing", "cadmium-induced", "cytotoxicity", "." ] } ]
PMC11539788	We subsequently manipulated the ILK expression level in RNF19A-deficient or RNF19A-overexpressing 5637 and T24 cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "subsequently", "manipulated", "the", "ILK", "expression", "level", "in", "RNF19A-deficient", "or", "RNF19A-overexpressing", "5637", "and", "T24", "cells", "." ] } ]
PMC9985266	The mRNA and protein expression levels of COL I and COL III were significantly reduced in the IL-27 group, as shown by RT‒qPCR and Western blot assays (Additional file 1: Fig. S2C–E).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "mRNA", "and", "protein", "expression", "levels", "of", "COL", "I", "and", "COL", "III", "were", "significantly", "reduced", "in", "the", "IL-27", "group", ",", "as", "shown", "by", "RT‒qPCR", "and", "Western", "blot", "assays", "(", "Additional", "file", "1", ":", "Fig.", "S2C", "–", "E", ")", "." ] } ]
PMC9429973	For patients with amyloid cardiomyopathy (12 patients), 5 were progressing at the end of treatment despite the fact that 4 of them were in hematological CR, and 2 died from cardiac decompensation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "patients", "with", "amyloid", "cardiomyopathy", "(", "12", "patients", ")", ",", "5", "were", "progressing", "at", "the", "end", "of", "treatment", "despite", "the", "fact", "that", "4", "of", "them", "were", "in", "hematological", "CR", ",", "and", "2", "died", "from", "cardiac", "decompensation", "." ] } ]
PMC11194678	Scale bar: 10 μm. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bar", ":", "10", "μm", ".", "(" ] } ]
PMC10898159	FOXF1 functions as a pioneer factor that modulates the chromatin accessibility for ETS translocation variant 1 (ETV1), after which they accumulate in the enhancer domain of the mutant KIT gene, promoting KIT expression .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "FOXF1", "functions", "as", "a", "pioneer", "factor", "that", "modulates", "the", "chromatin", "accessibility", "for", "ETS", "translocation", "variant", "1", "(", "ETV1", ")", ",", "after", "which", "they", "accumulate", "in", "the", "enhancer", "domain", "of", "the", "mutant", "KIT", "gene", ",", "promoting", "KIT", "expression", "." ] } ]
PMC11060216	S100A6 is the first member proven to play a role in tumor proliferation, progression, and invasion in this family.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "S100A6", "is", "the", "first", "member", "proven", "to", "play", "a", "role", "in", "tumor", "proliferation", ",", "progression", ",", "and", "invasion", "in", "this", "family", "." ] } ]
PMC7090062	c, d The cell viability was assessed by the CCK-8 assay. *	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "c", ",", "d", "The", "cell", "viability", "was", "assessed", "by", "the", "CCK-8", "assay", ".", "*" ] } ]
PMC11724582	It was first sanctioned as second-line therapy for patients with NSCLC who had received prior treatment with EGFR-TKIs and whose condition worsened during or after treatment for EGFR T790M-positive mutations .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "was", "first", "sanctioned", "as", "second-line", "therapy", "for", "patients", "with", "NSCLC", "who", "had", "received", "prior", "treatment", "with", "EGFR-TKIs", "and", "whose", "condition", "worsened", "during", "or", "after", "treatment", "for", "EGFR", "T790M-positive", "mutations", "." ] } ]
PMC11261875	A summary of FDG PET/CT in GIST is shown in Table 2.Table 2Overview of F-Fluorodeoxyglucose positron emission tomography/computed.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "summary", "of", "FDG", "PET/CT", "in", "GIST", "is", "shown", "in", "Table", "2.Table", "2Overview", "of", "F-Fluorodeoxyglucose", "positron", "emission", "tomography/computed", "." ] } ]
PMC7351993	c SRS images of Euglena gracilis cells with C/C-isotope probing (n = 5679 and 2075, respectively).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "c", "SRS", "images", "of", "Euglena", "gracilis", "cells", "with", "C/C-isotope", "probing", "(", "n", "=", "5679", "and", "2075", ",", "respectively", ")", "." ] } ]
PMC11087766	denote highly similar and weakly similar amino acids, respectively.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "denote", "highly", "similar", "and", "weakly", "similar", "amino", "acids", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11486946	Figure 6c illustrates the case of glafenine and nilotinib.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "6c", "illustrates", "the", "case", "of", "glafenine", "and", "nilotinib", "." ] } ]
PMC10944868	These tools expedite the drug design process by analyzing extensive databases and predicting biological activity, paving the way for the efficient development of compounds with therapeutic potential. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "tools", "expedite", "the", "drug", "design", "process", "by", "analyzing", "extensive", "databases", "and", "predicting", "biological", "activity", ",", "paving", "the", "way", "for", "the", "efficient", "development", "of", "compounds", "with", "therapeutic", "potential", ".", "(" ] } ]
PMC9429973	Methods: We generated a new genetically modified KANK1 (Kank1) knockout mouse model and analysed the phenotypic and developmental changes in hematopoiesis in young and aged mice.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "We", "generated", "a", "new", "genetically", "modified", "KANK1", "(", "Kank1", ")", "knockout", "mouse", "model", "and", "analysed", "the", "phenotypic", "and", "developmental", "changes", "in", "hematopoiesis", "in", "young", "and", "aged", "mice", "." ] } ]
PMC11726848	At ≥D37, the number of cells in the culture was halved between 48h and 72 h after irradiation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "≥D37", ",", "the", "number", "of", "cells", "in", "the", "culture", "was", "halved", "between", "48h", "and", "72", "h", "after", "irradiation", "." ] } ]
PMC11792888	Cells were exposed to fetal bovine serum-free culture medium for 3 days.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "exposed", "to", "fetal", "bovine", "serum-free", "culture", "medium", "for", "3", "days", "." ] } ]
PMC10291556	Calreticulin exposure to the cell surface.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Calreticulin", "exposure", "to", "the", "cell", "surface", "." ] } ]
PMC8711270	Eukaryotic expression systems are used to produce complex recombinant protein with complex PTMs for proper protein function.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Eukaryotic", "expression", "systems", "are", "used", "to", "produce", "complex", "recombinant", "protein", "with", "complex", "PTMs", "for", "proper", "protein", "function", "." ] } ]
PMC8540611	Decrease in cell survival in comparison with the AuNP14-rndRNA complexes was 7.5%.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Decrease", "in", "cell", "survival", "in", "comparison", "with", "the", "AuNP14-rndRNA", "complexes", "was", "7.5", "%", "." ] } ]
PMC11078693	However, some additional cell fixation takes place during this step.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "some", "additional", "cell", "fixation", "takes", "place", "during", "this", "step", "." ] } ]
PMC6442998	Immunofluorescence.	[ { "tags": [ "O", "O" ], "tokens": [ "Immunofluorescence", "." ] } ]
PMC11407042	For agar plate, store at 4°C for up to 4 weeks.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "agar", "plate", ",", "store", "at", "4", "°", "C", "for", "up", "to", "4", "weeks", "." ] } ]
PMC11532793	sleuth (17) tests for DTE under a linear measurement error model that decomposes the total variance into a biological variance component and an inferential variance component resulting from RTA that is estimated from transcript replicate counts.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "sleuth", "(", "17", ")", "tests", "for", "DTE", "under", "a", "linear", "measurement", "error", "model", "that", "decomposes", "the", "total", "variance", "into", "a", "biological", "variance", "component", "and", "an", "inferential", "variance", "component", "resulting", "from", "RTA", "that", "is", "estimated", "from", "transcript", "replicate", "counts", "." ] } ]
PMC11013014	Based on the anti-proliferative activities and drug-likeness property results, molecular docking analysis was accomplished for three molecules against two human proteins, glutathione S-transferase P1-1 pocket and caspase-3, as target enzymes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Based", "on", "the", "anti-proliferative", "activities", "and", "drug-likeness", "property", "results", ",", "molecular", "docking", "analysis", "was", "accomplished", "for", "three", "molecules", "against", "two", "human", "proteins", ",", "glutathione", "S-transferase", "P1", "-", "1", "pocket", "and", "caspase-3", ",", "as", "target", "enzymes", "." ] } ]
PMC11697703	Expression of GFP was under direction of the CMV promoter.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Expression", "of", "GFP", "was", "under", "direction", "of", "the", "CMV", "promoter", "." ] } ]
PMC11476004	In the present study, the average frequency of SCEs in healthy dogs was 5.2.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "present", "study", ",", "the", "average", "frequency", "of", "SCEs", "in", "healthy", "dogs", "was", "5.2", "." ] } ]
PMC11139449	CHO cells were co-transfected with the PX459 and PX460-1 plasmids.	[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CHO", "cells", "were", "co-transfected", "with", "the", "PX459", "and", "PX460", "-", "1", "plasmids", "." ] } ]
PMC11594588	They form a specific creative and conductive stimulus system of the heart .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "form", "a", "specific", "creative", "and", "conductive", "stimulus", "system", "of", "the", "heart", "." ] } ]
PMC10898159	Their expressions vary in GIST tissue, where H19 is 25.8-fold while FENDRR is 4.7-fold, both were in comparison to normal adjacent tissues .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Their", "expressions", "vary", "in", "GIST", "tissue", ",", "where", "H19", "is", "25.8-fold", "while", "FENDRR", "is", "4.7-fold", ",", "both", "were", "in", "comparison", "to", "normal", "adjacent", "tissues", "." ] } ]
PMC10335954	D Kaplan–Meier analysis of progression-free survival data with the log-rank test P-values indicatedFig.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", "Kaplan", "–", "Meier", "analysis", "of", "progression-free", "survival", "data", "with", "the", "log-rank", "test", "P-values", "indicatedFig", "." ] } ]
PMC11754094	NS, not significant. *	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "NS", ",", "not", "significant", ".", "*" ] } ]
PMC9429973	In this work, we report the experience of the hematology department of Sfax in the management of patients followed for AL amyloidosis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "work", ",", "we", "report", "the", "experience", "of", "the", "hematology", "department", "of", "Sfax", "in", "the", "management", "of", "patients", "followed", "for", "AL", "amyloidosis", "." ] } ]
PMC11525028	For overexpression of ATF4 and ASNS, the wild-type coding sequence of ATF4 and ASNS were obtained from the NCBI and cloned into the pCDH-CMV-MCS-EF1 vector plasmids obtained from Sun Yat-sen University.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "overexpression", "of", "ATF4", "and", "ASNS", ",", "the", "wild-type", "coding", "sequence", "of", "ATF4", "and", "ASNS", "were", "obtained", "from", "the", "NCBI", "and", "cloned", "into", "the", "pCDH-CMV-MCS-EF1", "vector", "plasmids", "obtained", "from", "Sun", "Yat-sen", "University", "." ] } ]
PMC9268620	Briefly, cells with a density of 1 × 10 cells/mL were treated with 30, 10, 3, and 1 µg/mL of nordamnacanthal and damnacanthal and incubated for 24 h. Controls that contained only the cells were included for each sample.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "cells", "with", "a", "density", "of", "1", "×", "10", "cells/mL", "were", "treated", "with", "30", ",", "10", ",", "3", ",", "and", "1", "µg/mL", "of", "nordamnacanthal", "and", "damnacanthal", "and", "incubated", "for", "24", "h.", "Controls", "that", "contained", "only", "the", "cells", "were", "included", "for", "each", "sample", "." ] } ]
PMC10976516	Mortality was reduced when radiation was used with chemotherapy for both extensive-stage and limited-stage illnesses.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mortality", "was", "reduced", "when", "radiation", "was", "used", "with", "chemotherapy", "for", "both", "extensive-stage", "and", "limited-stage", "illnesses", "." ] } ]
PMC10969097	The extraction process was carried out using an ultrasonic homogeniser in solvents (ultrapure water, methanol and ethanol) after pulverisation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "extraction", "process", "was", "carried", "out", "using", "an", "ultrasonic", "homogeniser", "in", "solvents", "(", "ultrapure", "water", ",", "methanol", "and", "ethanol", ")", "after", "pulverisation", "." ] } ]

PMC11629143

Methylated DNA was isolated using Protein A magnetic beads coupled to MBD2‐Fc protein.

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PMC11787355

d i.c.

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PMC11787355

MS/MS spectra were acquired in data-independent mode using 44 previously determined dynamic mass windows optimized for HLA class I peptides with an overlap of 0.5 m/z.

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PMC11269933

These findings highlight the presence of complex and unique phosphorylation-mediated signaling transduction mechanisms in marine organisms, and provide new insights into the evolution and function of the crosstalk between classical pathways.

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PMC7294030

A549 cells were treated with aurisin A (0, 1, 2, 4, 8, 16, 32 µM) on 24, 48, and 72 h. Viability of cells was determined by SRB assay.

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PMC6133382

While in theory this cell line could be used to produce a glycan-optimized gp120 vaccine, in reality, this is not practical.

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PMC5443223

Subsequently, cells were resuspended in 1X binding buffer (BD Biosciences, San Jose, CA, USA) at a concentration of 1×10 cells/ml and stained with PE Annexin V with 7-AAD (BD Biosciences) in the dark for 15 min at room temperature.

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PMC9429973

The risk of developing Hodgkin lymphoma, thyroid, and kidney cancers was high in the first year of FL diagnosis.

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PMC11787355

While its expression is very limited across adult tissues, it is essential for gliomagenesis.

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PMC11621493

Principal component analysis indicated the highest separation of cytokine-stimulated KO cells from other groups (Fig. 8A).Fig.

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PMC9429973

Heteroduplex analysis followed by electrophoresis in polyacrylamide gel was used to screen for mutations in exon 12 of the JAK2 gene and exon 9 of CALR gene.

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PMC11638255

In contrast to the Th-MYCN model (Fig. 1b,c), anti-GD2 therapy alone did not mediate a substantial anti-tumor effect though the addition of TETA produced a remarkable anti-tumor effect (median survival: 29 days vs. 19 days in Saline + anti-GD2, p = 0.0091) leading to durable eradication in ~40% of animals (Fig. 7f).

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PMC11705547

Cisplatin can induce apoptosis in cancer cells by disrupting the plasma membrane and activate the Fas death receptor pathway (Figure 1).

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PMC9429973

Cultures are incubated at 37°C in 5% CO2.The proliferative potential and differentiation ability of bone marrow cells was determined by counting the number of corresponding colonies in a 14-day culture.

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PMC9429973

A positive result by BMB, a positive PET/CT and the combined “PET/CT or BMB positive” result, were significantly associated with a shorter OS in univariate regression.

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PMC9429973

Aims: To assess and identify predictors of hospital mortality in hematological patients with grade 4 neutropenia and concomitant coronavirus infection.

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PMC11389534

UFSP2 is necessary for the removal of UFM1 from the UFMylated PD‐L1.

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PMC10890055

Zn-1Mg and Zn-1Mg-1Ag (wt.%) were prepared by mechanical alloying using pure zinc powder (99.9%, particle size < 149 µm, Thermo Fisher Scientific), pure magnesium (99.8%, particle size < 44 µm, Alfa Aesar-Thermo Fisher Scientific), and pure Ag (99.5%, particle size < 44 µm, Safina a.s.,

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PMC9599726

Cancer cells appear to be more sensitive to ferroptosis than normal cells, due to their “addiction to iron” required for proliferation on the one hand and their dependency on antioxidant systems on the other .

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PMC11726848

To assess viability in the case of radiation exposure, the MTT assay can give false results , and therefore, we conducted additional cell viability tests.

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PMC11317131

Examples of PE sequences as well as primers can be found in Supplementary Tables S5 and S6.

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PMC11792090

In addition to IL-7, other cytokines also showed beneficial effects on CAR-T cells (62), thus a more suitable signaling requires to be investigated.

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PMC11643491

Understanding these differences is particularly important because cellular mechanical properties, such as deformability, may significantly influence the internalization of particles with different shapes.

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PMC11637284

The TAC60 variant lacking the C-terminal 283 aa and carrying a C-terminal 3x myc-tag, termed TAC60ΔC283-myc, was used as a positive control in our assay.

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PMC10850553

In conclusion, in the present study, we have examined potential factors mediating the infiltration of neutrophils into IA lesions based on the recent experimental findings demonstrating the crucial role of neutrophils in the rupture of IAs.

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PMC10551595

After 3 h of incubation at 37°C, the formazan crystals were solubilized by adding 100 μL DMSO.

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PMC11449273

A construct encoding pGEX-TEV-PG was kindly provided by Dr. William Weis .

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PMC10607604

High-Grade Serous Ovarian Carcinoma (HGSOC) accounts for 60–70% of EOC and is the most aggressive subtype.

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PMC11244823

LIPS assay of the gD1_fragments gD1_83, gD1_160, gD1_180 and gD1_402 against the monoclonal anti-V5 mAb.

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PMC11388384

It would be interesting to examine whether the catalytic activity of SCUBE is similar or different from the activity of other morphogen-interacting proteins.

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PMC9164404

Moreover, Abplatin exhibited excellent stability within 7 days with limited size variations (Fig. 1C).

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PMC11448304

Yet, this study offers novel insights into the mechanisms of radioresistance and highlights potential biomarkers and therapeutic targets, such as Khib-modified EGFR, for improving radiation therapy in NSCLC.

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PMC9429973

Recent clinical trials conducted in Philadelphia (Ph) chromosome-negative BCP-ALL patients with CD20 expression revealed that the outcome of young adults may be improved by a combination of chemotherapy with rituximab, the anti-CD20 mAb.

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PMC11718817

Using this spheroid model of pancreatic carcinoma, intratumoral motility of antigen-specific T cells was investigated.

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PMC11095939

Similarly, we identified a total of 14,640 and 15,350 Mecp2-binding genes before and after PHx in the Mecp2 control liver, respectively (Figure 6—figure supplement 1A and B).

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PMC9917080

An increase in the time of incubation of glioblastoma cells with the studied agents led to an increase in the level of expression of ER-stress genes and a significant depletion of the ER Ca pool, which correlates with an increase in the expression of proapoptotic genes.

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PMC10335954

When TRIP13 was knocked down in GC cells, the JAK/STAT signaling cascade was activated to upregulate the expression of IL-6.

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PMC10719213

Mutation rate is similar in patients with MS versus healthy controls. (

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PMC9429973

Eligible HCPs had qualified in their primary specialty by 2014 and were managing ≥10 SCD pts at the time of survey (≥5 pts per HCP in Canada; ≥2 pts per HCP in the Netherlands).

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PMC9429973

Early diagnosis of AML and improve supportive care is essential to reduce the ED rate and improve overall survival by establishing early treatment N. Siala, L. Khelifa, I. Frikha, F. Kallel, H. Sennana, S. Menif, N. Ben abdeljalil, S. Laddeb, Y. Fakhfekh, I. Ben Amor, O. Kassar, S. Hadiji, M. Charfi, T. Ben othmen, M. Medhaffar, M. Elloumi Hematology, Hedi Chaker Hospital, Sfax; Cytogenetic laboratory, Sousse; Hematology laboratory -Pasteur Institut; National bonne marrow transplantation centre, Tunis, Tunisia Background: Acute myeloid leukemia with Philadelphia chromosome (AML Ph+) is recently been listed in the 2016 revised World Health Organization (WHO) classification of myeloid malignancies as a provisional entity.

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PMC8469018

Nevertheless, the recognition of the mechanism of its action independent of the synthesis of pyrimidines, which makes it an effective anti-myeloma drug, may allow for the development of new therapeutic strategies in the treatment of myeloma and other cancers.

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PMC11291490

Duck embryo fibroblasts (DEFs) were cultured in a minimum essential medium (MEM, Gibco, USA) supplemented with 10% NBS (Gibco, USA).

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PMC11300639

Data are presented as the mean ± SEM of three replicates.

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PMC2193049

In brief, CTLs were added at the appropriate effector-to-target cell ratio (E/T) in 100 μl of IMDM supplemented with 10% human serum and 20 U/ml human rIL-2 (Glaxo Wellcome) provided by Dr. M. Nabholz (Swiss Institute for Experimental Cancer Research, Epalinges, Switzerland).

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PMC11394227

The cells were then dispersed with 1 mL of ER-Tracker Red or Golgi-Tracker Red (Beyotime) diluent and incubated for 30 min.

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PMC11739504

Ciliopathy includes a wide range of diseases, such as polycystic kidney disease (PKD), nephronophthisis (NPHP), Bardet-Biedl syndrome (BBS), and Joubert syndrome.

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PMC11265931

Human hepatoma cell line Hep3B (ATCC HB-8064), human neuroblastoma cell line SH-SY5Y(ATCC CRL-226), human pancreatic adenocarcinoma cell line Panc-1 (ATCC CRL-1469), human umbilical vein endothelial cell line HUVEC (ATCC CRL-1730), human glioblastoma cell line U87 (ATCC HTB-14) and prostate cancer cell line PC-3 (ATCC CRL-1435) were obtained from the American Type Culture Collection.

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PMC11594806

Endogenous ATP can be released in substantial amounts during necrosis, apoptosis, and cellular damage, as well as in response to non-injury-related stimuli, such as vesicle exocytosis or ion channel activation via nucleotide transporters and connexin/pannexin hemichannels .

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PMC11597291

The GO surface was functionalized with hydroxycamptothecin (GO-HCPT), and hyperthermia was induced via the application of a rotating magnetic field (RMF).

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PMC11750712

For females who are not postmenopausal (<24 months of amenorrhea) or who are not surgically sterile (absence of ovaries and/or uterus), a highly effective method of contraception together with a barrier method must be used from the start of the preconditioning stage and for at least 12 months after the last dose of AUTO4 (study treatment).

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PMC9429973

Blood samples were taken before and after each TPE session (TPE1 pre, TPE1 after, TPE2 pre, TPE2 after).

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PMC11224020

Cells were then left for 48 h, washed to remove the viral particles and incubated in new medium until day 10 of culture.

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PMC11705862

The arrival of firing action potential leads to the depolarization of presynaptic terminals, causing transient voltage-gated Ca channel opening, leading to a rise of Ca influx into neurons, which binds to synaptotagmin (Syt), and induces the assembly of the SNARE complex, mediating the docking and priming of presynaptic vesicles .

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PMC11411131

The SECIS was derived from SelN. SelN cDNAs displayed a single-band signal.

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PMC3019555

Next, we transfected cells with a HIF-1α 3′ UTR luciferase reporter and monitored TX’s effect on its activity.

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PMC11705630

To prove and validate the effects of GLDC further, we xenografted GLDC knock-downed ACHN and GLDC overexpressed A498 cells subcutaneously into the flank of nude mice.

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PMC11679033

This step was carried out as follows: aliquots of heparinized blood (V = 600 μL per culture) were pipetted into a growth medium RPMI-1640 (Gibco, Grand Island, NY, USA) supplemented with 10% fetal calf serum (Gibco, Grand Island, NY, USA) and antibiotics (penicillin and streptomycin; Sigma-Aldrich, Steinheim, Germany).

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PMC9429973

CLL treatment was not held or modified at the time of vaccination.

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PMC11794568

RT-qPCR (A) and WB (B) confirmed that CRIP1 was stably overexpressed in SK-MEL-2 and A375 cells.

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PMC11655536

We further analyzed the expression of NHE1 in the TCGA database, and found that NHE1 expression increased along with the aggravation of MM stage (Fig. 1C).

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PMC11342785

TPPP is a small 24 kDa MAP found in oligodendrocytes that contains only a single folded “CORE” domain (27, 28) (Fig. 1B).

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PMC11706491

To elucidate the precise role of Sty1 in cell cycle regulation, extending beyond the established genetic interactions with the Cdc25 phosphatase coding gene (Fig 4A), we deleted sty1 in the FLCCR strain.

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PMC9429973

There were 178 patients received L-ASNase between 2011 to 2019 and 71 patients received PEG-ASNase between 2018-2021.

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PMC8632470

Nevertheless, in another study on cultured granulosa cells from chicken ovarian follicles, quercetin confirmed the potential in preventing cadmium-induced cytotoxicity.

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PMC11539788

We subsequently manipulated the ILK expression level in RNF19A-deficient or RNF19A-overexpressing 5637 and T24 cells.

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PMC9985266

The mRNA and protein expression levels of COL I and COL III were significantly reduced in the IL-27 group, as shown by RT‒qPCR and Western blot assays (Additional file 1: Fig. S2C–E).

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PMC9429973

For patients with amyloid cardiomyopathy (12 patients), 5 were progressing at the end of treatment despite the fact that 4 of them were in hematological CR, and 2 died from cardiac decompensation.

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Scale bar: 10 μm. (

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FOXF1 functions as a pioneer factor that modulates the chromatin accessibility for ETS translocation variant 1 (ETV1), after which they accumulate in the enhancer domain of the mutant KIT gene, promoting KIT expression .

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PMC11060216

S100A6 is the first member proven to play a role in tumor proliferation, progression, and invasion in this family.

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PMC7090062

c, d The cell viability was assessed by the CCK-8 assay. *

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It was first sanctioned as second-line therapy for patients with NSCLC who had received prior treatment with EGFR-TKIs and whose condition worsened during or after treatment for EGFR T790M-positive mutations .

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PMC11261875

A summary of FDG PET/CT in GIST is shown in Table 2.Table 2Overview of F-Fluorodeoxyglucose positron emission tomography/computed.

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PMC7351993

c SRS images of Euglena gracilis cells with C/C-isotope probing (n = 5679 and 2075, respectively).

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denote highly similar and weakly similar amino acids, respectively.

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Figure 6c illustrates the case of glafenine and nilotinib.

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These tools expedite the drug design process by analyzing extensive databases and predicting biological activity, paving the way for the efficient development of compounds with therapeutic potential. (

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PMC9429973

Methods: We generated a new genetically modified KANK1 (Kank1) knockout mouse model and analysed the phenotypic and developmental changes in hematopoiesis in young and aged mice.

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At ≥D37, the number of cells in the culture was halved between 48h and 72 h after irradiation.

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Cells were exposed to fetal bovine serum-free culture medium for 3 days.

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Calreticulin exposure to the cell surface.

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Eukaryotic expression systems are used to produce complex recombinant protein with complex PTMs for proper protein function.

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PMC8540611

Decrease in cell survival in comparison with the AuNP14-rndRNA complexes was 7.5%.

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However, some additional cell fixation takes place during this step.

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PMC6442998

Immunofluorescence.

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PMC11407042

For agar plate, store at 4°C for up to 4 weeks.

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sleuth (17) tests for DTE under a linear measurement error model that decomposes the total variance into a biological variance component and an inferential variance component resulting from RTA that is estimated from transcript replicate counts.

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PMC11013014

Based on the anti-proliferative activities and drug-likeness property results, molecular docking analysis was accomplished for three molecules against two human proteins, glutathione S-transferase P1-1 pocket and caspase-3, as target enzymes.

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Expression of GFP was under direction of the CMV promoter.

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In the present study, the average frequency of SCEs in healthy dogs was 5.2.

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CHO cells were co-transfected with the PX459 and PX460-1 plasmids.

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They form a specific creative and conductive stimulus system of the heart .

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Their expressions vary in GIST tissue, where H19 is 25.8-fold while FENDRR is 4.7-fold, both were in comparison to normal adjacent tissues .

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D Kaplan–Meier analysis of progression-free survival data with the log-rank test P-values indicatedFig.

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NS, not significant. *

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In this work, we report the experience of the hematology department of Sfax in the management of patients followed for AL amyloidosis.

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PMC11525028

For overexpression of ATF4 and ASNS, the wild-type coding sequence of ATF4 and ASNS were obtained from the NCBI and cloned into the pCDH-CMV-MCS-EF1 vector plasmids obtained from Sun Yat-sen University.

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PMC9268620

Briefly, cells with a density of 1 × 10 cells/mL were treated with 30, 10, 3, and 1 µg/mL of nordamnacanthal and damnacanthal and incubated for 24 h. Controls that contained only the cells were included for each sample.

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PMC10976516

Mortality was reduced when radiation was used with chemotherapy for both extensive-stage and limited-stage illnesses.

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PMC10969097

The extraction process was carried out using an ultrasonic homogeniser in solvents (ultrapure water, methanol and ethanol) after pulverisation.

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