PMCID
string | Sentences
string | ner
list |
|---|---|---|
PMC9429973
|
By Day 100 post-HCT, the KM–estimated survival rate was 73% (95% CI: 49%, 87%).
|
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"100",
"post-HCT",
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"%",
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"95",
"%",
"CI",
":",
"49",
"%",
",",
"87",
"%",
")",
"."
]
}
] |
PMC7642379
|
Moreover, a significant loss of the ADAM3A pseudogene (< -1 log2-fold change), which has previously been associated with different cancers, was observed in all progeny cell lines except 293-H compared to HEK293 (Supplementary Fig. S4).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"significant",
"loss",
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"ADAM3A",
"pseudogene",
"(",
"<",
"-1",
"log2-fold",
"change",
")",
",",
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"different",
"cancers",
",",
"was",
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"in",
"all",
"progeny",
"cell",
"lines",
"except",
"293-H",
"compared",
"to",
"HEK293",
"(",
"Supplementary",
"Fig.",
"S4",
")",
"."
]
}
] |
PMC11047729
|
The expression of c-Myc was measured after 18 and 32 h; however, 32 h of incubation proved to be more efficient .
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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],
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"and",
"32",
"h",
";",
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",",
"32",
"h",
"of",
"incubation",
"proved",
"to",
"be",
"more",
"efficient",
"."
]
}
] |
PMC11021472
|
Vectors were all purchased from System Biosciences (Palo Alto, CA, USA).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Vectors",
"were",
"all",
"purchased",
"from",
"System",
"Biosciences",
"(",
"Palo",
"Alto",
",",
"CA",
",",
"USA",
")",
"."
]
}
] |
PMC11696576
|
An example showing the gating strategy used to assess ROS-Red staining is found in Fig. S9d.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"An",
"example",
"showing",
"the",
"gating",
"strategy",
"used",
"to",
"assess",
"ROS-Red",
"staining",
"is",
"found",
"in",
"Fig.",
"S9d",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
T cells were analyzed by flow cytometry, confocal microscopy or extracellular flux analysis (Seahorse), either directly after thawing or after a 2 day culture with or without αCD3/αCD28 antibodies.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O"
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"tokens": [
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"cells",
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"analyzed",
"by",
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",",
"confocal",
"microscopy",
"or",
"extracellular",
"flux",
"analysis",
"(",
"Seahorse",
")",
",",
"either",
"directly",
"after",
"thawing",
"or",
"after",
"a",
"2",
"day",
"culture",
"with",
"or",
"without",
"αCD3/αCD28",
"antibodies",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
In our country generic imatinib(Imatib) is the cost-effective initial treatment in CML-CP.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"our",
"country",
"generic",
"imatinib(Imatib",
")",
"is",
"the",
"cost-effective",
"initial",
"treatment",
"in",
"CML-CP",
"."
]
}
] |
PMC10523483
|
A scheme of construction and tumor induction of K (Kras;H1c) and KH (Kras;H1c) mice.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"scheme",
"of",
"construction",
"and",
"tumor",
"induction",
"of",
"K",
"(",
"Kras;H1c",
")",
"and",
"KH",
"(",
"Kras;H1c",
")",
"mice",
"."
]
}
] |
PMC7185206
|
While correlative in nature and encompassing whole tumor beds including stromal cells, these results suggested a possible role for ADAM10 and/or ADAM17 in PD-L1 removal from the tumor cell surface.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"While",
"correlative",
"in",
"nature",
"and",
"encompassing",
"whole",
"tumor",
"beds",
"including",
"stromal",
"cells",
",",
"these",
"results",
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"role",
"for",
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"and/or",
"ADAM17",
"in",
"PD-L1",
"removal",
"from",
"the",
"tumor",
"cell",
"surface",
"."
]
}
] |
PMC10667689
|
We observed the significant upregulation of ACC-1 as a result of increased TIM-3 and in the presence of its ligand, Gal-9.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"observed",
"the",
"significant",
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"of",
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"of",
"increased",
"TIM-3",
"and",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"its",
"ligand",
",",
"Gal-9",
"."
]
}
] |
PMC11394227
|
These anti-apoptotic cell engineering strategies help combat the apoptosis caused by ER stress, maintain cell homeostasis, and positively affect the productivity of recombinant products.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"anti-apoptotic",
"cell",
"engineering",
"strategies",
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"cell",
"homeostasis",
",",
"and",
"positively",
"affect",
"the",
"productivity",
"of",
"recombinant",
"products",
"."
]
}
] |
PMC9777812
|
Further, the expression levels of cell-cycle-related genes such as CDK4, Cyclin E, and CDK2 were observed to be up-regulated when bta-miR-106b was over-expressed (Figure 4C; p < 0.05); on the contrary, bta-miR-106b inhibitors decreased the expression of Cyclin D and CDK2 genes (Figure 4D; p < 0.05, p < 0.01).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Further",
",",
"the",
"expression",
"levels",
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"cell-cycle-related",
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",",
"and",
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"over-expressed",
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";",
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")",
";",
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"contrary",
",",
"bta-miR-106b",
"inhibitors",
"decreased",
"the",
"expression",
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"Cyclin",
"D",
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"(",
"Figure",
"4D",
";",
"p",
"<",
"0.05",
",",
"p",
"<",
"0.01",
")",
"."
]
}
] |
PMC11789597
|
CAV1 knockdown significantly increased the mRNA and protein levels of SLC1A5 (ASCT2) and SLC7A5 (LAT1) but did not affect the overall level of SLC3A2 (Figure 6H–J; Figure S8D, Supporting Information).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
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"level",
"of",
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"6H",
"–",
"J",
";",
"Figure",
"S8D",
",",
"Supporting",
"Information",
")",
"."
]
}
] |
PMC11721587
|
However, in cells expressing either Fu or Fu, Hh could still induce phosphorylation of Fu and Sufu but failed to induce Ci phosphorylation or ptc expression (Fig. 1K).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"in",
"cells",
"expressing",
"either",
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"or",
"Fu",
",",
"Hh",
"could",
"still",
"induce",
"phosphorylation",
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"Sufu",
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"induce",
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"phosphorylation",
"or",
"ptc",
"expression",
"(",
"Fig.",
"1",
"K",
")",
"."
]
}
] |
PMC11496491
|
Meanwhile, the fluorescence signal intensity of the probe under study can also be quantitatively reflected and processed with specific values (Fig. 1B).Fig.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Meanwhile",
",",
"the",
"fluorescence",
"signal",
"intensity",
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"the",
"probe",
"under",
"study",
"can",
"also",
"be",
"quantitatively",
"reflected",
"and",
"processed",
"with",
"specific",
"values",
"(",
"Fig.",
"1B).Fig",
"."
]
}
] |
PMC9250505
|
In vitro experimental evidence indicates that PARP-inhibitor-induced activation of the RAS/MEK/ERK and PI3K/AKT/mTOR pathway limit the efficacy of PARPis resulting in the development of PARPi resistance in EOC.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"vitro",
"experimental",
"evidence",
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"that",
"PARP-inhibitor-induced",
"activation",
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"the",
"RAS/MEK/ERK",
"and",
"PI3K/AKT/mTOR",
"pathway",
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"the",
"efficacy",
"of",
"PARPis",
"resulting",
"in",
"the",
"development",
"of",
"PARPi",
"resistance",
"in",
"EOC",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Methods: We pre-clinically investigate CD20-TCB efficacy in CLL utilizing immune and TME model assays that include in vitro functional T cell assays, patient-derived xenografts and lymph node organotypic models.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Methods",
":",
"We",
"pre-clinically",
"investigate",
"CD20-TCB",
"efficacy",
"in",
"CLL",
"utilizing",
"immune",
"and",
"TME",
"model",
"assays",
"that",
"include",
"in",
"vitro",
"functional",
"T",
"cell",
"assays",
",",
"patient-derived",
"xenografts",
"and",
"lymph",
"node",
"organotypic",
"models",
"."
]
}
] |
PMC10919056
|
Primary antibodies against GJA5 (1:1,000; ABclonal, Wuhan, China), GJB1 (1:1000; ABclonal, Wuhan, China), GADPH (1:10,000; Proteintech, Wuhan, China), E-cad (1:1000; ABclonal, Wuhan, China), N-cad (1:1000; ABclonal, Wuhan, China), VIM (1:1000; ABclonal, Wuhan, China), Bax (1:1000; ABclonal, Wuhan, China), and Bcl-2 (1:1000; ABclonal, Wuhan, China) were incubated with the membrane overnight at 4°C.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Primary",
"antibodies",
"against",
"GJA5",
"(",
"1:1,000",
";",
"ABclonal",
",",
"Wuhan",
",",
"China",
")",
",",
"GJB1",
"(",
"1:1000",
";",
"ABclonal",
",",
"Wuhan",
",",
"China",
")",
",",
"GADPH",
"(",
"1:10,000",
";",
"Proteintech",
",",
"Wuhan",
",",
"China",
")",
",",
"E-cad",
"(",
"1:1000",
";",
"ABclonal",
",",
"Wuhan",
",",
"China",
")",
",",
"N-cad",
"(",
"1:1000",
";",
"ABclonal",
",",
"Wuhan",
",",
"China",
")",
",",
"VIM",
"(",
"1:1000",
";",
"ABclonal",
",",
"Wuhan",
",",
"China",
")",
",",
"Bax",
"(",
"1:1000",
";",
"ABclonal",
",",
"Wuhan",
",",
"China",
")",
",",
"and",
"Bcl-2",
"(",
"1:1000",
";",
"ABclonal",
",",
"Wuhan",
",",
"China",
")",
"were",
"incubated",
"with",
"the",
"membrane",
"overnight",
"at",
"4",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC11723947
|
Unexpectedly, Treg protected better from allograft rejection mediated by HP1γ-deficient than by wild-type Tconv.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Unexpectedly",
",",
"Treg",
"protected",
"better",
"from",
"allograft",
"rejection",
"mediated",
"by",
"HP1γ-deficient",
"than",
"by",
"wild-type",
"Tconv",
"."
]
}
] |
PMC11707577
|
These results closely resemble the in vitro experiments showed in the 2.2 section.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"results",
"closely",
"resemble",
"the",
"in",
"vitro",
"experiments",
"showed",
"in",
"the",
"2.2",
"section",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Fifty-five patients were phi negative ALL treated with GRAALL protocol, and 15 were ph+ ALL and treated with GRAAPH protocol.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Fifty-five",
"patients",
"were",
"phi",
"negative",
"ALL",
"treated",
"with",
"GRAALL",
"protocol",
",",
"and",
"15",
"were",
"ph+",
"ALL",
"and",
"treated",
"with",
"GRAAPH",
"protocol",
"."
]
}
] |
PMC9105697
|
Five-year overall survival for tumors without metastases reaches approximately 90% in the pediatric population, whereas it is only 13% for those with metastases .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Five-year",
"overall",
"survival",
"for",
"tumors",
"without",
"metastases",
"reaches",
"approximately",
"90",
"%",
"in",
"the",
"pediatric",
"population",
",",
"whereas",
"it",
"is",
"only",
"13",
"%",
"for",
"those",
"with",
"metastases",
"."
]
}
] |
PMC10761571
|
Asterisks (*) show a significant difference with control group (*** = P < 0.001, ** = P < 0.01, * = P < 0.05).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Asterisks",
"(",
"*",
")",
"show",
"a",
"significant",
"difference",
"with",
"control",
"group",
"(",
"*",
"*",
"*",
"=",
"P",
"<",
"0.001",
",",
"*",
"*",
"=",
"P",
"<",
"0.01",
",",
"*",
"=",
"P",
"<",
"0.05",
")",
"."
]
}
] |
PMC11543853
|
The differences may be caused by (i) the viruses utilizing distinct receptors for cell entry, which may affect the speed of endocytosis and conditions in endosomes, (ii) different particle stability, which affects the timing of the initiation of genome release, and (iii) differences in the stability of empty particles of the enteroviruses, which may fall apart and thus would not be included in our statistics.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"differences",
"may",
"be",
"caused",
"by",
"(",
"i",
")",
"the",
"viruses",
"utilizing",
"distinct",
"receptors",
"for",
"cell",
"entry",
",",
"which",
"may",
"affect",
"the",
"speed",
"of",
"endocytosis",
"and",
"conditions",
"in",
"endosomes",
",",
"(",
"ii",
")",
"different",
"particle",
"stability",
",",
"which",
"affects",
"the",
"timing",
"of",
"the",
"initiation",
"of",
"genome",
"release",
",",
"and",
"(",
"iii",
")",
"differences",
"in",
"the",
"stability",
"of",
"empty",
"particles",
"of",
"the",
"enteroviruses",
",",
"which",
"may",
"fall",
"apart",
"and",
"thus",
"would",
"not",
"be",
"included",
"in",
"our",
"statistics",
"."
]
}
] |
PMC11590870
|
MO leaf flour protein was extracted in 0.05 M Tris-HCl buffer pH 8.0 containing 2% (w/v) PVPP, 0.15 M NaCl, 0.01 M EDTA, and 0.001 M PMSF, 1:5 (w/v).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MO",
"leaf",
"flour",
"protein",
"was",
"extracted",
"in",
"0.05",
"M",
"Tris-HCl",
"buffer",
"pH",
"8.0",
"containing",
"2",
"%",
"(",
"w/v",
")",
"PVPP",
",",
"0.15",
"M",
"NaCl",
",",
"0.01",
"M",
"EDTA",
",",
"and",
"0.001",
"M",
"PMSF",
",",
"1:5",
"(",
"w/v",
")",
"."
]
}
] |
PMC11064533
|
The primers used are all listed in Table S4.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"primers",
"used",
"are",
"all",
"listed",
"in",
"Table",
"S4",
"."
]
}
] |
PMC11643491
|
Analyses were performed using the FlowJo V10 software.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Analyses",
"were",
"performed",
"using",
"the",
"FlowJo",
"V10",
"software",
"."
]
}
] |
PMC11098378
|
While genome-wide CRISPR-Cas9 and RNA interference (RNAi) screening platforms have been used to identify host immunity factors affecting arbovirus replication [6–8], these assays can be difficult, time-consuming, and cost prohibitive to set up, and are not easily applicable to non-model host systems.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"While",
"genome-wide",
"CRISPR-Cas9",
"and",
"RNA",
"interference",
"(",
"RNAi",
")",
"screening",
"platforms",
"have",
"been",
"used",
"to",
"identify",
"host",
"immunity",
"factors",
"affecting",
"arbovirus",
"replication",
"[",
"6–8",
"]",
",",
"these",
"assays",
"can",
"be",
"difficult",
",",
"time-consuming",
",",
"and",
"cost",
"prohibitive",
"to",
"set",
"up",
",",
"and",
"are",
"not",
"easily",
"applicable",
"to",
"non-model",
"host",
"systems",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Results: The results indicated that As2O3 could significantly inhibit human MM cell proliferation and cell death in a time- and dose-dependent manner in vitro.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
":",
"The",
"results",
"indicated",
"that",
"As2O3",
"could",
"significantly",
"inhibit",
"human",
"MM",
"cell",
"proliferation",
"and",
"cell",
"death",
"in",
"a",
"time-",
"and",
"dose-dependent",
"manner",
"in",
"vitro",
"."
]
}
] |
PMC8922418
|
We first used CRISPR/SaCas9 combined with multiple gRNAs in an all-in-one lentiviral vector to efficiently target latent HIV-1 provirus in Jurkat C11 and TZM-bl cells (Wang et al., 2018).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"first",
"used",
"CRISPR/SaCas9",
"combined",
"with",
"multiple",
"gRNAs",
"in",
"an",
"all-in-one",
"lentiviral",
"vector",
"to",
"efficiently",
"target",
"latent",
"HIV-1",
"provirus",
"in",
"Jurkat",
"C11",
"and",
"TZM-bl",
"cells",
"(",
"Wang",
"et",
"al.",
",",
"2018",
")",
"."
]
}
] |
PMC11012012
|
Lower levels were detected in Jurkat T cells, while SLAMF6/CD352 was not detected in myeloid-derived cells (THP-1, U939, and K562).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Lower",
"levels",
"were",
"detected",
"in",
"Jurkat",
"T",
"cells",
",",
"while",
"SLAMF6/CD352",
"was",
"not",
"detected",
"in",
"myeloid-derived",
"cells",
"(",
"THP-1",
",",
"U939",
",",
"and",
"K562",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
scRNA-seq confirmed expansion of LT-HSC in Sucnr1-KO versus WT mice.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"scRNA-seq",
"confirmed",
"expansion",
"of",
"LT-HSC",
"in",
"Sucnr1-KO",
"versus",
"WT",
"mice",
"."
]
}
] |
PMC11281366
|
Gene ontology analyses (using g:Profiler, https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost (accessed on 26 January 2024)) of the most differentially expressed genes (both upregulated and downregulated) revealed a predominance of genes involved in signal transduction, immune system processes, immune and defense response, inflammatory response, programmed cell death and responses to stress and virus (Figure 1B).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Gene",
"ontology",
"analyses",
"(",
"using",
"g",
":",
"Profiler",
",",
"https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost",
"(",
"accessed",
"on",
"26",
"January",
"2024",
")",
")",
"of",
"the",
"most",
"differentially",
"expressed",
"genes",
"(",
"both",
"upregulated",
"and",
"downregulated",
")",
"revealed",
"a",
"predominance",
"of",
"genes",
"involved",
"in",
"signal",
"transduction",
",",
"immune",
"system",
"processes",
",",
"immune",
"and",
"defense",
"response",
",",
"inflammatory",
"response",
",",
"programmed",
"cell",
"death",
"and",
"responses",
"to",
"stress",
"and",
"virus",
"(",
"Figure",
"1B",
")",
"."
]
}
] |
PMC4485648
|
Ovarian cancer has the highest mortality among the gynecologic cancers.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Ovarian",
"cancer",
"has",
"the",
"highest",
"mortality",
"among",
"the",
"gynecologic",
"cancers",
"."
]
}
] |
PMC6948907
|
HepG2 cells were treated with GE (25 μM/L), VPA (5 μM/L) and GE/VPA (25/5 μM) for 24 and 48h, the control groups received DMSO only.
|
[
{
"tags": [
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"HepG2",
"cells",
"were",
"treated",
"with",
"GE",
"(",
"25",
"μM/L",
")",
",",
"VPA",
"(",
"5",
"μM/L",
")",
"and",
"GE/VPA",
"(",
"25/5",
"μM",
")",
"for",
"24",
"and",
"48h",
",",
"the",
"control",
"groups",
"received",
"DMSO",
"only",
"."
]
}
] |
PMC8609870
|
Furthermore, miRNAs have also been found to be indispensable for the pathogenesis of RSA .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"miRNAs",
"have",
"also",
"been",
"found",
"to",
"be",
"indispensable",
"for",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"RSA",
"."
]
}
] |
PMC11775197
|
However, this view has changed.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"this",
"view",
"has",
"changed",
"."
]
}
] |
PMC11684269
|
Therefore, KN93 alleviates renal injury by inhibiting CaMK4, reducing downstream glycolysis, and enhancing OXPHOS.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"KN93",
"alleviates",
"renal",
"injury",
"by",
"inhibiting",
"CaMK4",
",",
"reducing",
"downstream",
"glycolysis",
",",
"and",
"enhancing",
"OXPHOS",
"."
]
}
] |
PMC11640247
|
Brain tissues were collected postnatally at designated time points, fixed, sectioned, and prepared for further analysis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Brain",
"tissues",
"were",
"collected",
"postnatally",
"at",
"designated",
"time",
"points",
",",
"fixed",
",",
"sectioned",
",",
"and",
"prepared",
"for",
"further",
"analysis",
"."
]
}
] |
PMC11476106
|
Similar VN release was found at 2 and 3 weeks without added VN in both cell lines (Figure S4).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Similar",
"VN",
"release",
"was",
"found",
"at",
"2",
"and",
"3",
"weeks",
"without",
"added",
"VN",
"in",
"both",
"cell",
"lines",
"(",
"Figure",
"S4",
")",
"."
]
}
] |
PMC11397654
|
The calixarenes 33a and 33b were tested for their activity using a DLD-1 colorectal adenocarcinoma cell line and healthy colon epithelial cells (CCD-18Co).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"calixarenes",
"33a",
"and",
"33b",
"were",
"tested",
"for",
"their",
"activity",
"using",
"a",
"DLD-1",
"colorectal",
"adenocarcinoma",
"cell",
"line",
"and",
"healthy",
"colon",
"epithelial",
"cells",
"(",
"CCD-18Co",
")",
"."
]
}
] |
PMC9927933
|
We first confirmed a direct binding between CDH1 and DEPTOR by reciprocal immunoprecipitation (IP) assays (Supplemental Figure 5A).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"first",
"confirmed",
"a",
"direct",
"binding",
"between",
"CDH1",
"and",
"DEPTOR",
"by",
"reciprocal",
"immunoprecipitation",
"(",
"IP",
")",
"assays",
"(",
"Supplemental",
"Figure",
"5A",
")",
"."
]
}
] |
PMC11768281
|
Stimulatory receptors such as ICOS and OX40 amplify immune responses, while inhibitory receptors, including PD-1, CTLA-4, TIM-3, LAG-3, and TIGIT, suppress T-cell function to regulate immune activation and prevent overreaction .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Stimulatory",
"receptors",
"such",
"as",
"ICOS",
"and",
"OX40",
"amplify",
"immune",
"responses",
",",
"while",
"inhibitory",
"receptors",
",",
"including",
"PD-1",
",",
"CTLA-4",
",",
"TIM-3",
",",
"LAG-3",
",",
"and",
"TIGIT",
",",
"suppress",
"T-cell",
"function",
"to",
"regulate",
"immune",
"activation",
"and",
"prevent",
"overreaction",
"."
]
}
] |
PMC6803987
|
The 80 mg/kg esculetin treatment group inhibited the secretion of HBeAg and HBsAg more strongly than the 3TC group.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"80",
"mg/kg",
"esculetin",
"treatment",
"group",
"inhibited",
"the",
"secretion",
"of",
"HBeAg",
"and",
"HBsAg",
"more",
"strongly",
"than",
"the",
"3TC",
"group",
"."
]
}
] |
PMC11487720
|
E COS7 cells were treated with UV (480 mJ/cm) and then cultured at 4 or 37℃ for 90 min, or 4 °C for 90 min without UV exposure.
|
[
{
"tags": [
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"E",
"COS7",
"cells",
"were",
"treated",
"with",
"UV",
"(",
"480",
"mJ/cm",
")",
"and",
"then",
"cultured",
"at",
"4",
"or",
"37",
"℃",
"for",
"90",
"min",
",",
"or",
"4",
"°",
"C",
"for",
"90",
"min",
"without",
"UV",
"exposure",
"."
]
}
] |
PMC11726848
|
GraphPad Prism version 9.0 (GraphPad Software, La Jolla, CA, USA) was used for the statistical analysis of the data.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"GraphPad",
"Prism",
"version",
"9.0",
"(",
"GraphPad",
"Software",
",",
"La",
"Jolla",
",",
"CA",
",",
"USA",
")",
"was",
"used",
"for",
"the",
"statistical",
"analysis",
"of",
"the",
"data",
"."
]
}
] |
PMC9964635
|
On each side of triazole and acetamide, we developed a molecular framework with hydrophobic aryl rings.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"On",
"each",
"side",
"of",
"triazole",
"and",
"acetamide",
",",
"we",
"developed",
"a",
"molecular",
"framework",
"with",
"hydrophobic",
"aryl",
"rings",
"."
]
}
] |
PMC11291490
|
The freshly isolated duPBMCs and chPBMCs were adjusted to a concentration of 5 × 10 cells/mL and were then seeded into 96-well plates at a volume of 100 μL per well, respectively.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"freshly",
"isolated",
"duPBMCs",
"and",
"chPBMCs",
"were",
"adjusted",
"to",
"a",
"concentration",
"of",
"5",
"×",
"10",
"cells/mL",
"and",
"were",
"then",
"seeded",
"into",
"96-well",
"plates",
"at",
"a",
"volume",
"of",
"100",
"μL",
"per",
"well",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC9412887
|
Taken together, these results confirmed that ACF could combat cisplatin-acquired resistance by inhibiting HIF-1 function.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Taken",
"together",
",",
"these",
"results",
"confirmed",
"that",
"ACF",
"could",
"combat",
"cisplatin-acquired",
"resistance",
"by",
"inhibiting",
"HIF-1",
"function",
"."
]
}
] |
PMC10582049
|
Cryopreserved single-cell suspensions prepared from isolated LUAD tissues were used for scRNAseq.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cryopreserved",
"single-cell",
"suspensions",
"prepared",
"from",
"isolated",
"LUAD",
"tissues",
"were",
"used",
"for",
"scRNAseq",
"."
]
}
] |
PMC10900886
|
The underlying mechanism for these differences among donors and possibly among different virus subclades, as well as their association with the risk of the development of extra-respiratory diseases, are still unclear.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"underlying",
"mechanism",
"for",
"these",
"differences",
"among",
"donors",
"and",
"possibly",
"among",
"different",
"virus",
"subclades",
",",
"as",
"well",
"as",
"their",
"association",
"with",
"the",
"risk",
"of",
"the",
"development",
"of",
"extra-respiratory",
"diseases",
",",
"are",
"still",
"unclear",
"."
]
}
] |
PMC11367146
|
The CC terms involved intrinsic components of the plasma membrane, integral components of the plasma membrane, plasma membrane region, synapses, mitochondria, etc.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"CC",
"terms",
"involved",
"intrinsic",
"components",
"of",
"the",
"plasma",
"membrane",
",",
"integral",
"components",
"of",
"the",
"plasma",
"membrane",
",",
"plasma",
"membrane",
"region",
",",
"synapses",
",",
"mitochondria",
",",
"etc",
"."
]
}
] |
PMC11544122
|
Aliquots of each reaction were transferred to a 96-well plate, and the absorbance at 405 nm was measured in a microplate reader.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aliquots",
"of",
"each",
"reaction",
"were",
"transferred",
"to",
"a",
"96-well",
"plate",
",",
"and",
"the",
"absorbance",
"at",
"405",
"nm",
"was",
"measured",
"in",
"a",
"microplate",
"reader",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Aims: Here we report the preliminary efficacy and safety analysis for the Phase 2 PTCL and CTCL cohorts.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aims",
":",
"Here",
"we",
"report",
"the",
"preliminary",
"efficacy",
"and",
"safety",
"analysis",
"for",
"the",
"Phase",
"2",
"PTCL",
"and",
"CTCL",
"cohorts",
"."
]
}
] |
PMC11634027
|
Here, we use a structure-function approach to investigate potential signal transduction downstream of Ds.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Here",
",",
"we",
"use",
"a",
"structure-function",
"approach",
"to",
"investigate",
"potential",
"signal",
"transduction",
"downstream",
"of",
"Ds",
"."
]
}
] |
PMC6379402
|
We collected three human molecular interaction data-sets: PPIs from IID database v.2016-03, COEXs from COXPRESdb v.6.0 and GIs from BioGRID v.3.4.137 and from SynLethDB.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"collected",
"three",
"human",
"molecular",
"interaction",
"data-sets",
":",
"PPIs",
"from",
"IID",
"database",
"v.2016",
"-",
"03",
",",
"COEXs",
"from",
"COXPRESdb",
"v.6.0",
"and",
"GIs",
"from",
"BioGRID",
"v.3.4.137",
"and",
"from",
"SynLethDB",
"."
]
}
] |
PMC11295144
|
Fluorescent imaging was done using Zeiss 700 confocal microscope at 63 × magnification with image size 1,024 × 1,024.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Fluorescent",
"imaging",
"was",
"done",
"using",
"Zeiss",
"700",
"confocal",
"microscope",
"at",
"63",
"×",
"magnification",
"with",
"image",
"size",
"1,024",
"×",
"1,024",
"."
]
}
] |
PMC11290772
|
Furthermore, the absence of CD3 expression in conjunction with the positive expression of CD56 substantiated the high purity of the isolated primary NK cells.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"the",
"absence",
"of",
"CD3",
"expression",
"in",
"conjunction",
"with",
"the",
"positive",
"expression",
"of",
"CD56",
"substantiated",
"the",
"high",
"purity",
"of",
"the",
"isolated",
"primary",
"NK",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11359735
|
Shown in the upper panels is total fluorescence intensity from 25 images per well quantified using Image J. Data were pooled from 3 (P. berghei) or 2 (P. falciparum) independent experiments and normalized to percent motility by dividing each sample’s fluorescence value by the mean of the untreated control’s fluorescence value.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Shown",
"in",
"the",
"upper",
"panels",
"is",
"total",
"fluorescence",
"intensity",
"from",
"25",
"images",
"per",
"well",
"quantified",
"using",
"Image",
"J.",
"Data",
"were",
"pooled",
"from",
"3",
"(",
"P.",
"berghei",
")",
"or",
"2",
"(",
"P.",
"falciparum",
")",
"independent",
"experiments",
"and",
"normalized",
"to",
"percent",
"motility",
"by",
"dividing",
"each",
"sample",
"’s",
"fluorescence",
"value",
"by",
"the",
"mean",
"of",
"the",
"untreated",
"control",
"’s",
"fluorescence",
"value",
"."
]
}
] |
PMC11438317
|
F Graph representing the mean data obtained by densitometry in three experiments like the one shown in (E).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"F",
"Graph",
"representing",
"the",
"mean",
"data",
"obtained",
"by",
"densitometry",
"in",
"three",
"experiments",
"like",
"the",
"one",
"shown",
"in",
"(",
"E",
")",
"."
]
}
] |
PMC11438317
|
In this study, we identify in T lymphocytes several adaptor proteins as potential substrates targeted by LYP, including FYB, SLP-76, HS-1, Vav, SKAP1 and SKAP2.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"identify",
"in",
"T",
"lymphocytes",
"several",
"adaptor",
"proteins",
"as",
"potential",
"substrates",
"targeted",
"by",
"LYP",
",",
"including",
"FYB",
",",
"SLP-76",
",",
"HS-1",
",",
"Vav",
",",
"SKAP1",
"and",
"SKAP2",
"."
]
}
] |
PMC11345828
|
Several new compounds have recently entered clinical trials; however, to date there is no approved therapy for Mcl-1 inhibition.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Several",
"new",
"compounds",
"have",
"recently",
"entered",
"clinical",
"trials",
";",
"however",
",",
"to",
"date",
"there",
"is",
"no",
"approved",
"therapy",
"for",
"Mcl-1",
"inhibition",
"."
]
}
] |
PMC11653168
|
In CCRF-CEM cells, Stattic reduced p-STAT3 levels in a dose-dependent manner.
|
[
{
"tags": [
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"CCRF-CEM",
"cells",
",",
"Stattic",
"reduced",
"p-STAT3",
"levels",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"."
]
}
] |
PMC9895440
|
However, due to low T cell infiltration in the tumor, in vivo screens often suffer from guide underrepresentation limiting the discovery of new targets.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"due",
"to",
"low",
"T",
"cell",
"infiltration",
"in",
"the",
"tumor",
",",
"in",
"vivo",
"screens",
"often",
"suffer",
"from",
"guide",
"underrepresentation",
"limiting",
"the",
"discovery",
"of",
"new",
"targets",
"."
]
}
] |
PMC10197932
|
Flow cytometry data were obtained using Invitrogen Attune NxT 488 blue laser and BD FACS Melody cell sorter flow cytometers.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Flow",
"cytometry",
"data",
"were",
"obtained",
"using",
"Invitrogen",
"Attune",
"NxT",
"488",
"blue",
"laser",
"and",
"BD",
"FACS",
"Melody",
"cell",
"sorter",
"flow",
"cytometers",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
We used Kaplan Meier curves and multivariable Cox regression analysis was used to evaluate outcomes.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"used",
"Kaplan",
"Meier",
"curves",
"and",
"multivariable",
"Cox",
"regression",
"analysis",
"was",
"used",
"to",
"evaluate",
"outcomes",
"."
]
}
] |
PMC11367146
|
The complementary DNA (cDNA) was carried out using an IScript cDNA synthesis kit (Bio-Rad, CA).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"complementary",
"DNA",
"(",
"cDNA",
")",
"was",
"carried",
"out",
"using",
"an",
"IScript",
"cDNA",
"synthesis",
"kit",
"(",
"Bio-Rad",
",",
"CA",
")",
"."
]
}
] |
PMC11790599
|
This was replicated using another fluorescent dye, lucifer yellow (Supplementary Figures S6A–D).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"was",
"replicated",
"using",
"another",
"fluorescent",
"dye",
",",
"lucifer",
"yellow",
"(",
"Supplementary",
"Figures",
"S6A",
"–",
"D",
")",
"."
]
}
] |
PMC11792888
|
Venom was obtained from LifEscozul company.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Venom",
"was",
"obtained",
"from",
"LifEscozul",
"company",
"."
]
}
] |
PMC11457557
|
Moreover, it summarizes data from prior genetic research methodologies on susceptibility genetic variants and epigenetic modifications that influence dorsal vagal complex (DVC).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moreover",
",",
"it",
"summarizes",
"data",
"from",
"prior",
"genetic",
"research",
"methodologies",
"on",
"susceptibility",
"genetic",
"variants",
"and",
"epigenetic",
"modifications",
"that",
"influence",
"dorsal",
"vagal",
"complex",
"(",
"DVC",
")",
"."
]
}
] |
PMC11724582
|
This study demonstrated that H1975 cells stimulated by almonertinib promoted the accumulation of CAFs in NSCLC cells, likely through increased secretion of TGF-β1.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"study",
"demonstrated",
"that",
"H1975",
"cells",
"stimulated",
"by",
"almonertinib",
"promoted",
"the",
"accumulation",
"of",
"CAFs",
"in",
"NSCLC",
"cells",
",",
"likely",
"through",
"increased",
"secretion",
"of",
"TGF-β1",
"."
]
}
] |
PMC11281366
|
Interestingly, HIV-1 has been shown to incorporate CD59 and other complement-regulatory proteins, such as CD55, into its viral envelope during the budding process, a condition that confers protection against complement-mediated lysis (CML) .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Interestingly",
",",
"HIV-1",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"incorporate",
"CD59",
"and",
"other",
"complement-regulatory",
"proteins",
",",
"such",
"as",
"CD55",
",",
"into",
"its",
"viral",
"envelope",
"during",
"the",
"budding",
"process",
",",
"a",
"condition",
"that",
"confers",
"protection",
"against",
"complement-mediated",
"lysis",
"(",
"CML",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
However, liquid biopsy monitoring is limited by signal dilution, as an approximately 1-log reduction in cfDNA was observed compared to PPCs, which should be considered in bioinformatic analyses.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"liquid",
"biopsy",
"monitoring",
"is",
"limited",
"by",
"signal",
"dilution",
",",
"as",
"an",
"approximately",
"1-log",
"reduction",
"in",
"cfDNA",
"was",
"observed",
"compared",
"to",
"PPCs",
",",
"which",
"should",
"be",
"considered",
"in",
"bioinformatic",
"analyses",
"."
]
}
] |
PMC11529598
|
But whether it can regulate glioblastoma phenotype has not yet been reported.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"But",
"whether",
"it",
"can",
"regulate",
"glioblastoma",
"phenotype",
"has",
"not",
"yet",
"been",
"reported",
"."
]
}
] |
PMC11271800
|
In GIST, PD-1 is expressed at low levels on T cells, whereas PD-L1 is predominantly found in GIST cells.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"GIST",
",",
"PD-1",
"is",
"expressed",
"at",
"low",
"levels",
"on",
"T",
"cells",
",",
"whereas",
"PD-L1",
"is",
"predominantly",
"found",
"in",
"GIST",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11476666
|
After 24 h of treatment with stilbenes, the cells were washed twice with PBS and 5 mL of fresh medium was added.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"24",
"h",
"of",
"treatment",
"with",
"stilbenes",
",",
"the",
"cells",
"were",
"washed",
"twice",
"with",
"PBS",
"and",
"5",
"mL",
"of",
"fresh",
"medium",
"was",
"added",
"."
]
}
] |
PMC8956657
|
Proteins were stained using Coomassie blue stain (top panel; red), and the overlay is represented in the bottom panel, where the complex produces a yellow color.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Proteins",
"were",
"stained",
"using",
"Coomassie",
"blue",
"stain",
"(",
"top",
"panel",
";",
"red",
")",
",",
"and",
"the",
"overlay",
"is",
"represented",
"in",
"the",
"bottom",
"panel",
",",
"where",
"the",
"complex",
"produces",
"a",
"yellow",
"color",
"."
]
}
] |
PMC11637276
|
For PPP2R1A knockdown, cells were seeded on a glass bottom dish and knockdown efficiency was analysed in ImageJ. Alternatively, for ITGA2 knockdown migration and invasion assays in MDA-MB-231 cells, cells were seeded in 6-well plates.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"PPP2R1A",
"knockdown",
",",
"cells",
"were",
"seeded",
"on",
"a",
"glass",
"bottom",
"dish",
"and",
"knockdown",
"efficiency",
"was",
"analysed",
"in",
"ImageJ.",
"Alternatively",
",",
"for",
"ITGA2",
"knockdown",
"migration",
"and",
"invasion",
"assays",
"in",
"MDA-MB-231",
"cells",
",",
"cells",
"were",
"seeded",
"in",
"6-well",
"plates",
"."
]
}
] |
PMC11803918
|
The tumor volume growth curve of individual mice in four groups (n = 6 for each group). (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"tumor",
"volume",
"growth",
"curve",
"of",
"individual",
"mice",
"in",
"four",
"groups",
"(",
"n",
"=",
"6",
"for",
"each",
"group",
")",
".",
"("
]
}
] |
PMC9429973
|
Elthrombopag dose was 150 mg daily in patients who were 12 years of age or older, at a dose of 75 mg daily in patients who were 6 to 11 years of age, and at a dose of 2.5 mg per kilogram of body weight per day in patients who were 2 to 5 years of age.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Elthrombopag",
"dose",
"was",
"150",
"mg",
"daily",
"in",
"patients",
"who",
"were",
"12",
"years",
"of",
"age",
"or",
"older",
",",
"at",
"a",
"dose",
"of",
"75",
"mg",
"daily",
"in",
"patients",
"who",
"were",
"6",
"to",
"11",
"years",
"of",
"age",
",",
"and",
"at",
"a",
"dose",
"of",
"2.5",
"mg",
"per",
"kilogram",
"of",
"body",
"weight",
"per",
"day",
"in",
"patients",
"who",
"were",
"2",
"to",
"5",
"years",
"of",
"age",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
There were no significant differences in both groups in the need for more information in the following areas: psychological support, support for their families, side effects of treatment, diagnosis and what it means, and fertility (Table 1).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"There",
"were",
"no",
"significant",
"differences",
"in",
"both",
"groups",
"in",
"the",
"need",
"for",
"more",
"information",
"in",
"the",
"following",
"areas",
":",
"psychological",
"support",
",",
"support",
"for",
"their",
"families",
",",
"side",
"effects",
"of",
"treatment",
",",
"diagnosis",
"and",
"what",
"it",
"means",
",",
"and",
"fertility",
"(",
"Table",
"1",
")",
"."
]
}
] |
PMC11144382
|
The role of NFIX in MSS is currently poorly understood.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"role",
"of",
"NFIX",
"in",
"MSS",
"is",
"currently",
"poorly",
"understood",
"."
]
}
] |
PMC11180402
|
Furthermore, the primers used for the miR-129 MSP are detailed in Supplementary Materials.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"the",
"primers",
"used",
"for",
"the",
"miR-129",
"MSP",
"are",
"detailed",
"in",
"Supplementary",
"Materials",
"."
]
}
] |
PMC11473750
|
We also found a clinical association between RNF121 amplification with esophageal cancer and HNSCC, both known to be driven by MYC.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"also",
"found",
"a",
"clinical",
"association",
"between",
"RNF121",
"amplification",
"with",
"esophageal",
"cancer",
"and",
"HNSCC",
",",
"both",
"known",
"to",
"be",
"driven",
"by",
"MYC",
"."
]
}
] |
PMC10748106
|
The regions with more electron density in Geniposide are located mainly at the oxygen of the carbonyl at C11, the oxygen of the hydroxyl at C10, and the 3′, 4′, and 6′ hydroxyls of the sugar.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"regions",
"with",
"more",
"electron",
"density",
"in",
"Geniposide",
"are",
"located",
"mainly",
"at",
"the",
"oxygen",
"of",
"the",
"carbonyl",
"at",
"C11",
",",
"the",
"oxygen",
"of",
"the",
"hydroxyl",
"at",
"C10",
",",
"and",
"the",
"3′",
",",
"4′",
",",
"and",
"6′",
"hydroxyls",
"of",
"the",
"sugar",
"."
]
}
] |
PMC11767725
|
Metabolic disorders worsen this dysbiosis by altering sebaceous lipid composition and increasing follicular pH, favoring the dominance of pathogenic C. acnes strains.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Metabolic",
"disorders",
"worsen",
"this",
"dysbiosis",
"by",
"altering",
"sebaceous",
"lipid",
"composition",
"and",
"increasing",
"follicular",
"pH",
",",
"favoring",
"the",
"dominance",
"of",
"pathogenic",
"C.",
"acnes",
"strains",
"."
]
}
] |
PMC11013014
|
It can be observed that EA is less stable in the caspase-3 pocket compared to the synthesised compounds 2 and 3.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"can",
"be",
"observed",
"that",
"EA",
"is",
"less",
"stable",
"in",
"the",
"caspase-3",
"pocket",
"compared",
"to",
"the",
"synthesised",
"compounds",
"2",
"and",
"3",
"."
]
}
] |
PMC11774747
|
The development of CAR-VST presents a promising alternative to conventional allogeneic CAR-T cell therapy, offering a versatile and potentially more accessible therapeutic option.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"development",
"of",
"CAR-VST",
"presents",
"a",
"promising",
"alternative",
"to",
"conventional",
"allogeneic",
"CAR-T",
"cell",
"therapy",
",",
"offering",
"a",
"versatile",
"and",
"potentially",
"more",
"accessible",
"therapeutic",
"option",
"."
]
}
] |
PMC6600592
|
ESIMS: m/z 396.2179 [M + H], 418.1994 [M +Na], calculated for C24H29NO4 (395.50).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ESIMS",
":",
"m/z",
"396.2179",
"[",
"M",
"+",
"H",
"]",
",",
"418.1994",
"[",
"M",
"+",
"Na",
"]",
",",
"calculated",
"for",
"C24H29NO4",
"(",
"395.50",
")",
"."
]
}
] |
PMC5415764
|
The molecular mechanism of PTX resistance in ovarian cancer cells is related to the overexpression of P-glycoprotein (P-gp), an ATP-binding cassette transporter, which results in PTX cellular efflux2.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"The",
"molecular",
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"cancer",
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"the",
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"which",
"results",
"in",
"PTX",
"cellular",
"efflux2",
"."
]
}
] |
PMC11787381
|
One-way ANOVA followed by Fisher’s LSD test. *
|
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"One-way",
"ANOVA",
"followed",
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"’s",
"LSD",
"test",
".",
"*"
]
}
] |
PMC9100622
|
SKNMC, TC71, MHHES1, EW1, and POE cells and the POE shEGR2_4#22 clone were cultured in RPMI (SH30027.01; GE Healthcare), 10% FBS, 1% Penicillin/Streptomycin, and 5% CO2, and on collagen from bovine skin (C4243; Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA) for SKNMC, TC71 and EW1.
|
[
{
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"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O"
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"cultured",
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"C4243",
";",
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"St.",
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")",
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"SKNMC",
",",
"TC71",
"and",
"EW1",
"."
]
}
] |
PMC11637276
|
Indeed, MAPK11 promotes metastatic dissemination to the bone, where it promotes osteolytic bone destruction .
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"bone",
"destruction",
"."
]
}
] |
PMC10988555
|
These results indicate that the tested complexes, especially complexes 2 and 4, have antimetastatic properties, which might be considered a good indicator for a potential therapeutic agent avoiding the spread of the tumor.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"the",
"spread",
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"the",
"tumor",
"."
]
}
] |
PMC7090062
|
Although newly acquired mutations in KIT or PDGFRA that interfere with the IM-binding sites account for 70% to 80% of all cases of secondary resistance, alternative pathways were activated in more than 10% of patients.
|
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"%",
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"of",
"secondary",
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"alternative",
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"in",
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"."
]
}
] |
PMC2193049
|
All peptides were purchased from Bachem.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"from",
"Bachem",
"."
]
}
] |
PMC10706275
|
SSI of the target gene was identified using 5′ and 3′ junction PCR.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"."
]
}
] |
PMC11634027
|
Deletion of the entire ICD resulted in a 71% reduction in cross-vein distance compared to controls, and cross-vein distance was reduced by 85% in ds (Fig. 1L,N,Q).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"the",
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"in",
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",",
"and",
"cross-vein",
"distance",
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"%",
"in",
"ds",
"(",
"Fig.",
"1L",
",",
"N",
",",
"Q",
")",
"."
]
}
] |
PMC11650848
|
The FASSTT Offspring Trial showed that continued FA supplementation in the second and third trimesters of pregnancy prevented the reduction of serum folate often seen in pregnancy while increasing maternal and cord blood RBC folate concentrations .
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"FASSTT",
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"third",
"trimesters",
"of",
"pregnancy",
"prevented",
"the",
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"folate",
"often",
"seen",
"in",
"pregnancy",
"while",
"increasing",
"maternal",
"and",
"cord",
"blood",
"RBC",
"folate",
"concentrations",
"."
]
}
] |
PMC11730320
|
Genetic aberrations in key molecules involved in pathways of T cell development lead to profound immunodeficiencies such as severe combined immunodeficiency (SCID), rendering infants susceptible to bacterial, viral, and fungal invasive infections.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Genetic",
"aberrations",
"in",
"key",
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"involved",
"in",
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"T",
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"combined",
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"SCID",
")",
",",
"rendering",
"infants",
"susceptible",
"to",
"bacterial",
",",
"viral",
",",
"and",
"fungal",
"invasive",
"infections",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
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