OTAR3088/BioData-CellLine_annotated · Datasets at Hugging Face

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PMC11389534	Additionally, in pancreatic cancer, UFMylation of ribosomal protein RPL10 has been found to significantly facilitate the proliferation and stemness of tumour cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "in", "pancreatic", "cancer", ",", "UFMylation", "of", "ribosomal", "protein", "RPL10", "has", "been", "found", "to", "significantly", "facilitate", "the", "proliferation", "and", "stemness", "of", "tumour", "cells", "." ] } ]
PMC11699465	We propose that the immune environment in vivo context mediates this tumor reduction in TMEM199-depleted xenografts, whereas this effect cannot be reflected in the tumor cell-only environment in vitro.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "propose", "that", "the", "immune", "environment", "in", "vivo", "context", "mediates", "this", "tumor", "reduction", "in", "TMEM199-depleted", "xenografts", ",", "whereas", "this", "effect", "can", "not", "be", "reflected", "in", "the", "tumor", "cell-only", "environment", "in", "vitro", "." ] } ]
PMC11252033	Evaluation of Bcl-2 and Bcl-xl mRNA expression in A2780S and A2780R cells following ASA treatment (ranging from 0,2 to 2 mM) for 72 h beta-2 microglobulin has been used as housekeeping gene.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Evaluation", "of", "Bcl-2", "and", "Bcl-xl", "mRNA", "expression", "in", "A2780S", "and", "A2780R", "cells", "following", "ASA", "treatment", "(", "ranging", "from", "0,2", "to", "2", "mM", ")", "for", "72", "h", "beta-2", "microglobulin", "has", "been", "used", "as", "housekeeping", "gene", "." ] } ]
PMC11759543	In our in vivo study, the combination of vorinostat and doxorubicin demonstrates a strong anti-tumor effect in mice.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "our", "in", "vivo", "study", ",", "the", "combination", "of", "vorinostat", "and", "doxorubicin", "demonstrates", "a", "strong", "anti-tumor", "effect", "in", "mice", "." ] } ]
PMC11666785	A Images at varying correlation values, χ = 0.7, 0.8, 0.9.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "Images", "at", "varying", "correlation", "values", ",", "χ", "=", "0.7", ",", "0.8", ",", "0.9", "." ] } ]
PMC11271278	In ZR751 cells, WGS-identified breakpoints support translocations underlying the enhancer-hijacking events.	[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "ZR751", "cells", ",", "WGS-identified", "breakpoints", "support", "translocations", "underlying", "the", "enhancer-hijacking", "events", "." ] } ]
PMC11684269	In addition to the effect on CD8 T cells, LCFAs are capable of enhancing differentiation and proliferation of Th1 and Th17 cells (57).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "the", "effect", "on", "CD8", "T", "cells", ",", "LCFAs", "are", "capable", "of", "enhancing", "differentiation", "and", "proliferation", "of", "Th1", "and", "Th17", "cells", "(", "57", ")", "." ] } ]
PMC3931643	Knocking down eIF4E did not affect basal survival or proliferation of VAL cells but increased sensitivity to cell death following MLN0128 treatment ( Fig. 6 ).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Knocking", "down", "eIF4E", "did", "not", "affect", "basal", "survival", "or", "proliferation", "of", "VAL", "cells", "but", "increased", "sensitivity", "to", "cell", "death", "following", "MLN0128", "treatment", "(", "Fig.", "6", ")", "." ] } ]
PMC11116779	PS-NPs also penetrated the cytoplasm of A549 cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "PS-NPs", "also", "penetrated", "the", "cytoplasm", "of", "A549", "cells", "." ] } ]
PMC9429973	RR Mechatronics).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RR", "Mechatronics", ")", "." ] } ]
PMC11711871	Each dose‒response curve was followed by a washing and equilibration step.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Each", "dose‒response", "curve", "was", "followed", "by", "a", "washing", "and", "equilibration", "step", "." ] } ]
PMC2193049	The samples were subjected to SDS–12% PAGE followed by autoradiography.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "samples", "were", "subjected", "to", "SDS–12", "%", "PAGE", "followed", "by", "autoradiography", "." ] } ]
PMC6182045	The TV1 gp120 expressed in 293 HEK cells was obtained from Immune Tech Corporation (New York, NY).	[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "B-CellLine", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "TV1", "gp120", "expressed", "in", "293", "HEK", "cells", "was", "obtained", "from", "Immune", "Tech", "Corporation", "(", "New", "York", ",", "NY", ")", "." ] } ]
PMC11791478	Results are summarized as mean with 95% confidence interval (CI), SD, or SEM, as indicated.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", "are", "summarized", "as", "mean", "with", "95", "%", "confidence", "interval", "(", "CI", ")", ",", "SD", ",", "or", "SEM", ",", "as", "indicated", "." ] } ]
PMC11470999	Subsequently, 20 µM MG132 was added for an additional 6 h. Immunoprecipitation was performed using an anti‐Flag antibody, followed by analysis of CIP2A ubiquitination using an anti‐HA antibody.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Subsequently", ",", "20", "µM", "MG132", "was", "added", "for", "an", "additional", "6", "h.", "Immunoprecipitation", "was", "performed", "using", "an", "anti‐Flag", "antibody", ",", "followed", "by", "analysis", "of", "CIP2A", "ubiquitination", "using", "an", "anti‐HA", "antibody", "." ] } ]
PMC11621565	Rotenone 0.3 µM was used as a positive control for α-synuclein overexpression.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Rotenone", "0.3", "µM", "was", "used", "as", "a", "positive", "control", "for", "α-synuclein", "overexpression", "." ] } ]
PMC11098378	Samples were then boiled for 10 min at 95°C, subjected to SDS-PAGE, and immunoblotted with anti-GST, anti-Ubiquitin, anti-His or anti-Flag antibodies.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Samples", "were", "then", "boiled", "for", "10", "min", "at", "95", "°", "C", ",", "subjected", "to", "SDS-PAGE", ",", "and", "immunoblotted", "with", "anti-GST", ",", "anti-Ubiquitin", ",", "anti-His", "or", "anti-Flag", "antibodies", "." ] } ]
PMC11301242	Red dots indicate genes located on ecDNA. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Red", "dots", "indicate", "genes", "located", "on", "ecDNA", ".", "(" ] } ]
PMC8540611	In addition, mutation could reduce the efficacy of cancer therapy .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "mutation", "could", "reduce", "the", "efficacy", "of", "cancer", "therapy", "." ] } ]
PMC9429973	Only 4 (8%) of 51 patients were CEBPA mutated.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Only", "4", "(", "8", "%", ")", "of", "51", "patients", "were", "CEBPA", "mutated", "." ] } ]
PMC11317131	Donor plasmids contain an att site and cargo DNA for genomic insertion.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Donor", "plasmids", "contain", "an", "att", "site", "and", "cargo", "DNA", "for", "genomic", "insertion", "." ] } ]
PMC9429973	These results support a synergistic effect when compared to CR rates of 20% and 0% with EPOCH-R and ven monotherapy, respectively.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "support", "a", "synergistic", "effect", "when", "compared", "to", "CR", "rates", "of", "20", "%", "and", "0", "%", "with", "EPOCH-R", "and", "ven", "monotherapy", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC9479186	The original contributions presented in the study are included in the article/ Supplementary Material .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "original", "contributions", "presented", "in", "the", "study", "are", "included", "in", "the", "article/", "Supplementary", "Material", "." ] } ]
PMC11348300	In recent years positron emission tomography (PET) tracers such as FMIZO and FAZA have been used to image hypoxia, and they indicate high contrast albeit with modest spatial resolution (27–29).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "recent", "years", "positron", "emission", "tomography", "(", "PET", ")", "tracers", "such", "as", "FMIZO", "and", "FAZA", "have", "been", "used", "to", "image", "hypoxia", ",", "and", "they", "indicate", "high", "contrast", "albeit", "with", "modest", "spatial", "resolution", "(", "27–29", ")", "." ] } ]
PMC8389560	These results require additional confirmation for their correct interpretation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "require", "additional", "confirmation", "for", "their", "correct", "interpretation", "." ] } ]
PMC11001582	WT (n = 4 mice), (GR)400 (n = 5 mice), (PR)400 (n = 6 mice); two-sided Welch’s t-test with 5% FDR multiple-correction.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "WT", "(", "n", "=", "4", "mice", ")", ",", "(GR)400", "(", "n", "=", "5", "mice", ")", ",", "(PR)400", "(", "n", "=", "6", "mice", ")", ";", "two-sided", "Welch", "’s", "t-test", "with", "5", "%", "FDR", "multiple-correction", "." ] } ]
PMC11787355	D170_44 cells were then transduced in the presence of 8 µg/ml Polybrene (#TR-1003-G, Sigma-Aldrich), and cells were selected and maintained with 1 µg/ml Blasticidin (#A1113903, Gibco).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D170_44", "cells", "were", "then", "transduced", "in", "the", "presence", "of", "8", "µg/ml", "Polybrene", "(", "#", "TR-1003-G", ",", "Sigma-Aldrich", ")", ",", "and", "cells", "were", "selected", "and", "maintained", "with", "1", "µg/ml", "Blasticidin", "(", "#", "A1113903", ",", "Gibco", ")", "." ] } ]
PMC11351758	Treating the cells with Ca induced significant membrane potential depolarization and ROS levels in NARP cybrids compared with Ca-free treatments, which did not exhibit statistically significant differences (Figure 2).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Treating", "the", "cells", "with", "Ca", "induced", "significant", "membrane", "potential", "depolarization", "and", "ROS", "levels", "in", "NARP", "cybrids", "compared", "with", "Ca-free", "treatments", ",", "which", "did", "not", "exhibit", "statistically", "significant", "differences", "(", "Figure", "2", ")", "." ] } ]
PMC10547921	Moana Tercel used a Pd-catalyzed amination method to convert seco-CBI (seco-1,2,9,9a-tetrahydrocyclopropa[c]benz[e]indol-4-one), a synthetic analog of the alkylating subunit of the duocarmycin natural products, from the phenol to amino form.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moana", "Tercel", "used", "a", "Pd-catalyzed", "amination", "method", "to", "convert", "seco-CBI", "(", "seco-1,2,9,9a-tetrahydrocyclopropa[c]benz[e]indol-4-one", ")", ",", "a", "synthetic", "analog", "of", "the", "alkylating", "subunit", "of", "the", "duocarmycin", "natural", "products", ",", "from", "the", "phenol", "to", "amino", "form", "." ] } ]
PMC10705095	p < 0.05, p < 0.01, and * p < 0.001 were considered statistically significant.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.05", ",", "", "", "p", "<", "0.01", ",", "and", "", "", "*", "p", "<", "0.001", "were", "considered", "statistically", "significant", "." ] } ]
PMC9429973	Results: We investigated a patient with early-onset HLH who fulfilled all diagnostic criteria who was wildtype for mutations in any of the known HLH genes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "We", "investigated", "a", "patient", "with", "early-onset", "HLH", "who", "fulfilled", "all", "diagnostic", "criteria", "who", "was", "wildtype", "for", "mutations", "in", "any", "of", "the", "known", "HLH", "genes", "." ] } ]
PMC9429973	At diagnosis, 14 patients had bone lesions and 4 had extramedullary plasmacytoma.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "diagnosis", ",", "14", "patients", "had", "bone", "lesions", "and", "4", "had", "extramedullary", "plasmacytoma", "." ] } ]
PMC11694066	P < 0.05; , P < 0.01; , P < 0.001; ***, P < 0.0001; ns, not significant.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P", "<", "0.05", ";", "", "", ",", "P", "<", "0.01", ";", "", "", "", ",", "P", "<", "0.001", ";", "", "", "", "*", ",", "P", "<", "0.0001", ";", "ns", ",", "not", "significant", "." ] } ]
PMC11782780	ECAR experiments and analysis of glycolysis metabolite production were performed to evaluate cellular glycolysis capacity.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ECAR", "experiments", "and", "analysis", "of", "glycolysis", "metabolite", "production", "were", "performed", "to", "evaluate", "cellular", "glycolysis", "capacity", "." ] } ]
PMC9429973	The overall response (CR+CRh+CRi+MLFS) was 54%.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "overall", "response", "(", "CR+CRh+CRi+MLFS", ")", "was", "54", "%", "." ] } ]
PMC11531735	Our study assessed the prophylactic potential of the orally administered inhibitor ER121 in preventing the formation of MMTV-erbB2-driven tumors in a transgenic mouse model.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "study", "assessed", "the", "prophylactic", "potential", "of", "the", "orally", "administered", "inhibitor", "ER121", "in", "preventing", "the", "formation", "of", "MMTV-erbB2-driven", "tumors", "in", "a", "transgenic", "mouse", "model", "." ] } ]
PMC6892818	b HRPT cells (seeded at 8000 cells/well) were either treated with 10 µg/ml cross-linked agonistic anti-CD40 mAb (G28-5) or mCD40L (by co-culture as above) for 24, 48 and 72 h alongside appropriate negative controls (and positive control, staurosporine-treated cells) and DNA fragmentation was assessed (see Methods).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "b", "HRPT", "cells", "(", "seeded", "at", "8000", "cells/well", ")", "were", "either", "treated", "with", "10", "µg/ml", "cross-linked", "agonistic", "anti-CD40", "mAb", "(", "G28", "-", "5", ")", "or", "mCD40L", "(", "by", "co-culture", "as", "above", ")", "for", "24", ",", "48", "and", "72", "h", "alongside", "appropriate", "negative", "controls", "(", "and", "positive", "control", ",", "staurosporine-treated", "cells", ")", "and", "DNA", "fragmentation", "was", "assessed", "(", "see", "Methods", ")", "." ] } ]
PMC11742670	It helps to analyse the model’s accuracy and promotes transparency.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "helps", "to", "analyse", "the", "model", "’s", "accuracy", "and", "promotes", "transparency", "." ] } ]
PMC10568263	According to literature reports, the (002) and (004) diffraction planes are observed due to the intercalation of ammonium ions increasing the interlayer spacing of MoS2.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "According", "to", "literature", "reports", ",", "the", "(", "002", ")", "and", "(", "004", ")", "diffraction", "planes", "are", "observed", "due", "to", "the", "intercalation", "of", "ammonium", "ions", "increasing", "the", "interlayer", "spacing", "of", "MoS2", "." ] } ]
PMC11703896	Hence, to uncover the exact potential of rapamycin in cancer therapy, a series of cell culture and in silico studies were conducted to identify other receptors capable of binding to rapamycin.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hence", ",", "to", "uncover", "the", "exact", "potential", "of", "rapamycin", "in", "cancer", "therapy", ",", "a", "series", "of", "cell", "culture", "and", "in", "silico", "studies", "were", "conducted", "to", "identify", "other", "receptors", "capable", "of", "binding", "to", "rapamycin", "." ] } ]
PMC11087055	Length of PS at HH3 for different concentrations of aphidicolin treatment (control 1.3±0.2 mm vs 0.1 μM aphidicolin 1.3±0.3 mm vs 1 μM aphidicolin 0.8±0.4 mm vs 10 μM aphidicolin 0.3±0.1 mm vs 100 μM aphidicolin 0.1±0.1 mm; n=6 for each, p=6.2e in one way ANOVA).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Length", "of", "PS", "at", "HH3", "for", "different", "concentrations", "of", "aphidicolin", "treatment", "(", "control", "1.3±0.2", "mm", "vs", "0.1", "μM", "aphidicolin", "1.3±0.3", "mm", "vs", "1", "μM", "aphidicolin", "0.8±0.4", "mm", "vs", "10", "μM", "aphidicolin", "0.3±0.1", "mm", "vs", "100", "μM", "aphidicolin", "0.1±0.1", "mm", ";", "n=6", "for", "each", ",", "p=6.2e", "in", "one", "way", "ANOVA", ")", "." ] } ]
PMC10810426	Since blocking NIH3T3 cell division greatly decreased the appearance of RTCs in the nucleus, nuclear reverse transcription likely occurs when the RTC ends up in the nucleus post-cell division.	[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Since", "blocking", "NIH3T3", "cell", "division", "greatly", "decreased", "the", "appearance", "of", "RTCs", "in", "the", "nucleus", ",", "nuclear", "reverse", "transcription", "likely", "occurs", "when", "the", "RTC", "ends", "up", "in", "the", "nucleus", "post-cell", "division", "." ] } ]
PMC11413393	Deamidation (NQ), oxidation (M), acetylation (protein N-term) were set as variable modifications.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Deamidation", "(", "NQ", ")", ",", "oxidation", "(", "M", ")", ",", "acetylation", "(", "protein", "N-term", ")", "were", "set", "as", "variable", "modifications", "." ] } ]
PMC11629192	Ofatumumab (OFA) is a fully human IgG1 monoclonal antibody targeting CD20, and it has been employed in the treatment of relapsing multiple sclerosis (MS) in adults .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ofatumumab", "(", "OFA", ")", "is", "a", "fully", "human", "IgG1", "monoclonal", "antibody", "targeting", "CD20", ",", "and", "it", "has", "been", "employed", "in", "the", "treatment", "of", "relapsing", "multiple", "sclerosis", "(", "MS", ")", "in", "adults", "." ] } ]
PMC7602170	Constitutive autophosphorylation of RTKs has an impact on the activation of the PI3K/AKT/mTOR pathway.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Constitutive", "autophosphorylation", "of", "RTKs", "has", "an", "impact", "on", "the", "activation", "of", "the", "PI3K/AKT/mTOR", "pathway", "." ] } ]
PMC10975211	Buforin IIb exhibited efficacy against breast cancer cells MX-1, MCF-7, and T47-D with little or no effects on normal cells , where it hinders tumor growth in a mouse xenograft model by two mechanisms (anti-vasculogenic and anti-angiogenic).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Buforin", "IIb", "exhibited", "efficacy", "against", "breast", "cancer", "cells", "MX-1", ",", "MCF-7", ",", "and", "T47-D", "with", "little", "or", "no", "effects", "on", "normal", "cells", ",", "where", "it", "hinders", "tumor", "growth", "in", "a", "mouse", "xenograft", "model", "by", "two", "mechanisms", "(", "anti-vasculogenic", "and", "anti-angiogenic", ")", "." ] } ]
PMC11765879	They belong to the flavonoid group, a class of polyphenols that are highly abundant in medicinal plants and well known to possess prominent cytotoxic activities .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "belong", "to", "the", "flavonoid", "group", ",", "a", "class", "of", "polyphenols", "that", "are", "highly", "abundant", "in", "medicinal", "plants", "and", "well", "known", "to", "possess", "prominent", "cytotoxic", "activities", "." ] } ]
PMC10882807	Cell cycle was detected by flow cytometry (Bio-Rad, USA).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "cycle", "was", "detected", "by", "flow", "cytometry", "(", "Bio-Rad", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11218145	As reported in Fig. 4, 24 h of TB treatment increased the mitochondrial respiration and ATP production, while prolonged exposure to TB provoked a progressive reduction (48 h) and loss (72 h) of these mitochondrial parameters.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "reported", "in", "Fig.", "4", ",", "24", "h", "of", "TB", "treatment", "increased", "the", "mitochondrial", "respiration", "and", "ATP", "production", ",", "while", "prolonged", "exposure", "to", "TB", "provoked", "a", "progressive", "reduction", "(", "48", "h", ")", "and", "loss", "(", "72", "h", ")", "of", "these", "mitochondrial", "parameters", "." ] } ]
PMC11224020	These results prompted us to investigate whether cPLA2 and IKKβ–NF-κB were part of the same signaling route.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "prompted", "us", "to", "investigate", "whether", "cPLA2", "and", "IKKβ", "–", "NF-κB", "were", "part", "of", "the", "same", "signaling", "route", "." ] } ]
PMC11678368	Additionally, the platinum complex was found to be approximately eight times less toxic than cisplatin against normal fibroblast cells (BALB/3T3), suggesting a potential advantage in anticancer treatment in terms of reduced side effects .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "the", "platinum", "complex", "was", "found", "to", "be", "approximately", "eight", "times", "less", "toxic", "than", "cisplatin", "against", "normal", "fibroblast", "cells", "(", "BALB/3T3", ")", ",", "suggesting", "a", "potential", "advantage", "in", "anticancer", "treatment", "in", "terms", "of", "reduced", "side", "effects", "." ] } ]
PMC7369657	The apoptosome initiates procaspase-9, an initiator caspase that is splitted into caspase-9.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "apoptosome", "initiates", "procaspase-9", ",", "an", "initiator", "caspase", "that", "is", "splitted", "into", "caspase-9", "." ] } ]
PMC9429973	Median duration of response was not estimable [NE] (range, 8.3 mo-NE).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Median", "duration", "of", "response", "was", "not", "estimable", "[", "NE", "]", "(", "range", ",", "8.3", "mo-NE", ")", "." ] } ]
PMC11544122	No detectable BRET response was measured in cells transfected with Rluc8-SNX9 or SNX9-RlucII alone.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No", "detectable", "BRET", "response", "was", "measured", "in", "cells", "transfected", "with", "Rluc8-SNX9", "or", "SNX9-RlucII", "alone", "." ] } ]
PMC11335267	G and H) Body weight and daily food intake (four days).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "G", "and", "H", ")", "Body", "weight", "and", "daily", "food", "intake", "(", "four", "days", ")", "." ] } ]
PMC10362265	Particle-mesh Ewald summation method was used to compute the long-range electrostatic interactions with a grid spacing of 1.2 Å and a cut-off of 12 Å for short-range interactions .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Particle-mesh", "Ewald", "summation", "method", "was", "used", "to", "compute", "the", "long-range", "electrostatic", "interactions", "with", "a", "grid", "spacing", "of", "1.2", "Å", "and", "a", "cut-off", "of", "12", "Å", "for", "short-range", "interactions", "." ] } ]
PMC9503669	While these in vitro studies support repurposing of lovastatin for Nef inhibitor development, a previous clinical trial showed that lovastatin treatment had no effect on HIV-1 plasma viral loads or circulating CD4 T cell counts in cART-naïve HIV-infected individuals .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "these", "in", "vitro", "studies", "support", "repurposing", "of", "lovastatin", "for", "Nef", "inhibitor", "development", ",", "a", "previous", "clinical", "trial", "showed", "that", "lovastatin", "treatment", "had", "no", "effect", "on", "HIV-1", "plasma", "viral", "loads", "or", "circulating", "CD4", "T", "cell", "counts", "in", "cART-naïve", "HIV-infected", "individuals", "." ] } ]
PMC9429973	A neurologic event (NE) occurred in 27%; 15% had a gr ≥3 NE, and none had gr 5 NE.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "neurologic", "event", "(", "NE", ")", "occurred", "in", "27", "%", ";", "15", "%", "had", "a", "gr", "≥3", "NE", ",", "and", "none", "had", "gr", "5", "NE", "." ] } ]
PMC8973085	Technical triplicates and three biological duplicates were used in all studies.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Technical", "triplicates", "and", "three", "biological", "duplicates", "were", "used", "in", "all", "studies", "." ] } ]
PMC11796104	CircRNA_0048211 negatively targets miRNA-93-5p to up-regulate BMP2, thus promotes osteoblast differentiation, indicating important role of miRNA-93-5p in osteoporosis .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CircRNA_0048211", "negatively", "targets", "miRNA-93", "-", "5p", "to", "up-regulate", "BMP2", ",", "thus", "promotes", "osteoblast", "differentiation", ",", "indicating", "important", "role", "of", "miRNA-93", "-", "5p", "in", "osteoporosis", "." ] } ]
PMC8913139	Recently, downregulation of miR-448 expression has been observed to be reduced in osteosarcoma and breast cancer , which is consistent with our results.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Recently", ",", "downregulation", "of", "miR-448", "expression", "has", "been", "observed", "to", "be", "reduced", "in", "osteosarcoma", "and", "breast", "cancer", ",", "which", "is", "consistent", "with", "our", "results", "." ] } ]
PMC10547921	Importantly, this conjugate has lower toxic side effects.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Importantly", ",", "this", "conjugate", "has", "lower", "toxic", "side", "effects", "." ] } ]
PMC11545737	Moreover, exposure to commensals or pathogens belonging to the same family determines important differences in the activation and outcomes of pyroptosis pathways.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "exposure", "to", "commensals", "or", "pathogens", "belonging", "to", "the", "same", "family", "determines", "important", "differences", "in", "the", "activation", "and", "outcomes", "of", "pyroptosis", "pathways", "." ] } ]
PMC11682525	Within the realm of cell therapy, a wide array of treatments exists, ranging from those involving stem cells to non-stem cell-based interventions, and encompassing single or multiple cell types.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Within", "the", "realm", "of", "cell", "therapy", ",", "a", "wide", "array", "of", "treatments", "exists", ",", "ranging", "from", "those", "involving", "stem", "cells", "to", "non-stem", "cell-based", "interventions", ",", "and", "encompassing", "single", "or", "multiple", "cell", "types", "." ] } ]
PMC11731161	After IP-MS detection and subsequent analysis, a total of 313 interacting proteins were identified in the control group, and 462 interacting proteins were identified in the SEL-treated group (Fig. 3D).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "IP-MS", "detection", "and", "subsequent", "analysis", ",", "a", "total", "of", "313", "interacting", "proteins", "were", "identified", "in", "the", "control", "group", ",", "and", "462", "interacting", "proteins", "were", "identified", "in", "the", "SEL-treated", "group", "(", "Fig.", "3D", ")", "." ] } ]
PMC5417661	Especially, at the 48 h time point the frequency of cell death was massive; the HCT116 cells were the most sensitive and exhibited an average CDI between 57% and 72% pending on the treatment while the MCF10A cells were the least sensitive of the three cell lines showing an average CDI between 40% and 49% pending on the compound (Figure 1D).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Especially", ",", "at", "the", "48", "h", "time", "point", "the", "frequency", "of", "cell", "death", "was", "massive", ";", "the", "HCT116", "cells", "were", "the", "most", "sensitive", "and", "exhibited", "an", "average", "CDI", "between", "57", "%", "and", "72", "%", "pending", "on", "the", "treatment", "while", "the", "MCF10A", "cells", "were", "the", "least", "sensitive", "of", "the", "three", "cell", "lines", "showing", "an", "average", "CDI", "between", "40", "%", "and", "49", "%", "pending", "on", "the", "compound", "(", "Figure", "1D", ")", "." ] } ]
PMC9509578	Table 2 provides a comprehensive list of various liposomal and solid lipid nanoformulations used for the reversal of MDR.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Table", "2", "provides", "a", "comprehensive", "list", "of", "various", "liposomal", "and", "solid", "lipid", "nanoformulations", "used", "for", "the", "reversal", "of", "MDR", "." ] } ]
PMC9429973	And more importantly, to assess the efficacy and tolerability of lenalidomide as maintenance therapy after BR.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "And", "more", "importantly", ",", "to", "assess", "the", "efficacy", "and", "tolerability", "of", "lenalidomide", "as", "maintenance", "therapy", "after", "BR", "." ] } ]
PMC9429973	Strikingly, two TCRs recognized hematopoietic progenitor cells expanded from CD34-enriched autologous bone marrow.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Strikingly", ",", "two", "TCRs", "recognized", "hematopoietic", "progenitor", "cells", "expanded", "from", "CD34-enriched", "autologous", "bone", "marrow", "." ] } ]
PMC10957991	This was evident by the lack of several markers for mature myoepithelial and luminal epithelial cells in TRPV4-depleted cell lines.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "was", "evident", "by", "the", "lack", "of", "several", "markers", "for", "mature", "myoepithelial", "and", "luminal", "epithelial", "cells", "in", "TRPV4-depleted", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC11367939	E COS7 cells were triple transfected with mRFP-Rab5 Q79L, ATG9A-EGFP, and synaptophysin-HA.	[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "E", "COS7", "cells", "were", "triple", "transfected", "with", "mRFP-Rab5", "Q79L", ",", "ATG9A-EGFP", ",", "and", "synaptophysin-HA", "." ] } ]
PMC11560255	Consistently, Shi et al. (2019) documented that proanthocyanidin from grape seeds could trigger apoptosis of human colon cancer SW480 and SW620 cells by facilitating the expression of the pro-apoptotic proteins Bax and Bax, suppressing the expression of the anti-apoptotic protein Bcl-2, and activating caspase-9 and caspase-3.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consistently", ",", "Shi", "et", "al.", "(", "2019", ")", "documented", "that", "proanthocyanidin", "from", "grape", "seeds", "could", "trigger", "apoptosis", "of", "human", "colon", "cancer", "SW480", "and", "SW620", "cells", "by", "facilitating", "the", "expression", "of", "the", "pro-apoptotic", "proteins", "Bax", "and", "Bax", ",", "suppressing", "the", "expression", "of", "the", "anti-apoptotic", "protein", "Bcl-2", ",", "and", "activating", "caspase-9", "and", "caspase-3", "." ] } ]
PMC11772449	It is worth noting that according to our findings, with the prolongation of administration time, the body weight of mice will be reduced to varying degrees, suggesting that the combination has certain toxic and side effects, and more research is needed before clinical application to determine the strategy (especially dose) and safety of the combination.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "worth", "noting", "that", "according", "to", "our", "findings", ",", "with", "the", "prolongation", "of", "administration", "time", ",", "the", "body", "weight", "of", "mice", "will", "be", "reduced", "to", "varying", "degrees", ",", "suggesting", "that", "the", "combination", "has", "certain", "toxic", "and", "side", "effects", ",", "and", "more", "research", "is", "needed", "before", "clinical", "application", "to", "determine", "the", "strategy", "(", "especially", "dose", ")", "and", "safety", "of", "the", "combination", "." ] } ]
PMC9429973	The possible coexistence of mixed infection (resistant/susceptible Aspergillus) was a concerned to 100% of experts.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "possible", "coexistence", "of", "mixed", "infection", "(", "resistant/susceptible", "Aspergillus", ")", "was", "a", "concerned", "to", "100", "%", "of", "experts", "." ] } ]
PMC8193046	Shown is mean ± SEM of at least three independent experiments.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Shown", "is", "mean", "±", "SEM", "of", "at", "least", "three", "independent", "experiments", "." ] } ]
PMC6461034	Kinase activity can be discerned from global protein phosphorylation profiles obtained with mass spectrometry‐based phosphoproteomics.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Kinase", "activity", "can", "be", "discerned", "from", "global", "protein", "phosphorylation", "profiles", "obtained", "with", "mass", "spectrometry‐based", "phosphoproteomics", "." ] } ]
PMC5925824	The therapeutic potential of LY3300054 to modulate T cell-mediated anti-tumor activity in an established tumor setting was evaluated using the HCC827 xenograft mouse tumor model, and animals reconstituted with ex-vivo expanded CD3+ T cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "therapeutic", "potential", "of", "LY3300054", "to", "modulate", "T", "cell-mediated", "anti-tumor", "activity", "in", "an", "established", "tumor", "setting", "was", "evaluated", "using", "the", "HCC827", "xenograft", "mouse", "tumor", "model", ",", "and", "animals", "reconstituted", "with", "ex-vivo", "expanded", "CD3", "+", "T", "cells", "." ] } ]
PMC11519567	D The upper row shows representative images of immunofluorescence of the endogenous SS18-SSX1 protein in the HS-SY-II cell line, and the bottom row shows representative images of immunofluorescence of the endogenous SS18 protein after SS18-SSX1 protein knockout in HS-SY-II.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O" ], "tokens": [ "D", "The", "upper", "row", "shows", "representative", "images", "of", "immunofluorescence", "of", "the", "endogenous", "SS18-SSX1", "protein", "in", "the", "HS-SY-II", "cell", "line", ",", "and", "the", "bottom", "row", "shows", "representative", "images", "of", "immunofluorescence", "of", "the", "endogenous", "SS18", "protein", "after", "SS18-SSX1", "protein", "knockout", "in", "HS-SY-II", "." ] } ]
PMC2614416	Each shotgun experiment consists of a 12-cycle MudPIT run in which a 60-minute nano-LC gradient is run for each of: 1D, 2D, 2D (0 mM NH4COO), 2D (25 mM NH4COO), 2D (50 mM NH4COO), 2D (75 mM NH4COO), 2D (100 mM NH4COO), 2D (150 mM NH4COO), 2D (200 mM NH4COO), 2D (250 mM NH4COO), 2D (300 mM NH4COO) and 2D (500 mM NH4COO).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Each", "shotgun", "experiment", "consists", "of", "a", "12-cycle", "MudPIT", "run", "in", "which", "a", "60-minute", "nano-LC", "gradient", "is", "run", "for", "each", "of", ":", "1D", ",", "2D", ",", "2D", "(", "0", "mM", "NH4COO", ")", ",", "2D", "(", "25", "mM", "NH4COO", ")", ",", "2D", "(", "50", "mM", "NH4COO", ")", ",", "2D", "(", "75", "mM", "NH4COO", ")", ",", "2D", "(", "100", "mM", "NH4COO", ")", ",", "2D", "(", "150", "mM", "NH4COO", ")", ",", "2D", "(", "200", "mM", "NH4COO", ")", ",", "2D", "(", "250", "mM", "NH4COO", ")", ",", "2D", "(", "300", "mM", "NH4COO", ")", "and", "2D", "(", "500", "mM", "NH4COO", ")", "." ] } ]
PMC11435360	H2S has also been shown to activate PARP-1, an ADP-ribosylating enzyme and a component of the earliest response to DNA damage, suggesting that H2S may promote DNA repair [Zhao 2014].	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "H2S", "has", "also", "been", "shown", "to", "activate", "PARP-1", ",", "an", "ADP-ribosylating", "enzyme", "and", "a", "component", "of", "the", "earliest", "response", "to", "DNA", "damage", ",", "suggesting", "that", "H2S", "may", "promote", "DNA", "repair", "[", "Zhao", "2014", "]", "." ] } ]
PMC9429973	Regarding safety, all trials reported grade 3 or 4 adverse events (N=739).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Regarding", "safety", ",", "all", "trials", "reported", "grade", "3", "or", "4", "adverse", "events", "(", "N=739", ")", "." ] } ]
PMC11751675	Viruses are the most widespread living organisms on Earth, existing alongside bacteria, plants, and other animals, including humans.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Viruses", "are", "the", "most", "widespread", "living", "organisms", "on", "Earth", ",", "existing", "alongside", "bacteria", ",", "plants", ",", "and", "other", "animals", ",", "including", "humans", "." ] } ]
PMC11321678	Our data suggest an important role of NTRs in determining the cell origin and tumor growth in MBs.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "data", "suggest", "an", "important", "role", "of", "NTRs", "in", "determining", "the", "cell", "origin", "and", "tumor", "growth", "in", "MBs", "." ] } ]
PMC11589157	Nomascus leucogenys is a critically endangered species of small apes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nomascus", "leucogenys", "is", "a", "critically", "endangered", "species", "of", "small", "apes", "." ] } ]
PMC9727330	According to the manufacturing procedures, 100µl of lysed cells was incubated with 100 µl LDH reaction mix for 30 min at room temperature.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "According", "to", "the", "manufacturing", "procedures", ",", "100µl", "of", "lysed", "cells", "was", "incubated", "with", "100", "µl", "LDH", "reaction", "mix", "for", "30", "min", "at", "room", "temperature", "." ] } ]
PMC10606998	Breaks can occur from the direct action of electrons or due to the action of free radicals formed in cells during irradiation .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Breaks", "can", "occur", "from", "the", "direct", "action", "of", "electrons", "or", "due", "to", "the", "action", "of", "free", "radicals", "formed", "in", "cells", "during", "irradiation", "." ] } ]
PMC9429973	RIC following the FLAMSA chemotherapy was 4Gy TBI and cyclophosphamide (73%), busulfan and cyclophosphamide (11%), melphalan (13%) or 2Gy TBI only (2%).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RIC", "following", "the", "FLAMSA", "chemotherapy", "was", "4Gy", "TBI", "and", "cyclophosphamide", "(", "73", "%", ")", ",", "busulfan", "and", "cyclophosphamide", "(", "11", "%", ")", ",", "melphalan", "(", "13", "%", ")", "or", "2Gy", "TBI", "only", "(", "2", "%", ")", "." ] } ]
PMC11564322	The cell co-treatment with the c-SRC inhibitor I and the VGVAPG peptide increased the PPARγ protein expression by 45.83%, compared to the control (Fig. 7E).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cell", "co-treatment", "with", "the", "c-SRC", "inhibitor", "I", "and", "the", "VGVAPG", "peptide", "increased", "the", "PPARγ", "protein", "expression", "by", "45.83", "%", ",", "compared", "to", "the", "control", "(", "Fig.", "7E", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Any patients with missing data at Week 26 were evaluated using the most recent value within the 6 weeks prior.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Any", "patients", "with", "missing", "data", "at", "Week", "26", "were", "evaluated", "using", "the", "most", "recent", "value", "within", "the", "6", "weeks", "prior", "." ] } ]
PMC10589262	All specimens were obtained via surgical resection, and some of the clinicopathological findings of the 42 GIST samples have been previously reported .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "specimens", "were", "obtained", "via", "surgical", "resection", ",", "and", "some", "of", "the", "clinicopathological", "findings", "of", "the", "42", "GIST", "samples", "have", "been", "previously", "reported", "." ] } ]
PMC11095939	Surprisingly, Mecp2, a well-known essential regulator of brain development, emerged as a dramatically repressed protein at the priming/initiation stage of PHx-induced liver regeneration.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Surprisingly", ",", "Mecp2", ",", "a", "well-known", "essential", "regulator", "of", "brain", "development", ",", "emerged", "as", "a", "dramatically", "repressed", "protein", "at", "the", "priming/initiation", "stage", "of", "PHx-induced", "liver", "regeneration", "." ] } ]
PMC11695623	The results showed that DCUN1D5 had a strong positive correlation with NDC1, DEPDC1 and CENPA (correlation coefficient R > 0.5).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "showed", "that", "DCUN1D5", "had", "a", "strong", "positive", "correlation", "with", "NDC1", ",", "DEPDC1", "and", "CENPA", "(", "correlation", "coefficient", "R", ">", "0.5", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Methods: Eligible pts ≥18 years with FL Grade I-IIIA, ECOG performance status 0-1, progressive disease after ≥2 prior therapies including an anti-CD20 antibody and chemotherapy, and no prior PI3Kδ inhibitor, provided consent and then received zandelisib 60 mg daily for two 28-day cycles then on ID.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "Eligible", "pts", "≥18", "years", "with", "FL", "Grade", "I-IIIA", ",", "ECOG", "performance", "status", "0", "-", "1", ",", "progressive", "disease", "after", "≥2", "prior", "therapies", "including", "an", "anti-CD20", "antibody", "and", "chemotherapy", ",", "and", "no", "prior", "PI3Kδ", "inhibitor", ",", "provided", "consent", "and", "then", "received", "zandelisib", "60", "mg", "daily", "for", "two", "28-day", "cycles", "then", "on", "ID", "." ] } ]
PMC9429973	Cytokine releasing syndrome (CRS) occurred in 15(58%) patients; most of them occurred in the initial two cycles and were mostly of grade 1/2 severity except two cases (8%) with grade 3 CRS, both resulted from transaminitis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cytokine", "releasing", "syndrome", "(", "CRS", ")", "occurred", "in", "15(58", "%", ")", "patients", ";", "most", "of", "them", "occurred", "in", "the", "initial", "two", "cycles", "and", "were", "mostly", "of", "grade", "1/2", "severity", "except", "two", "cases", "(", "8", "%", ")", "with", "grade", "3", "CRS", ",", "both", "resulted", "from", "transaminitis", "." ] } ]
PMC4839679	In addition we identified many genes involved in cell adhesion that are uniquely regulated by PBRM1, and could be used to specifically characterize and treat PBRM1-mutated ccRCC tumors.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "we", "identified", "many", "genes", "involved", "in", "cell", "adhesion", "that", "are", "uniquely", "regulated", "by", "PBRM1", ",", "and", "could", "be", "used", "to", "specifically", "characterize", "and", "treat", "PBRM1-mutated", "ccRCC", "tumors", "." ] } ]
PMC9027909	In addition, Blastocystis sp., can downregulates claudin-7, which is known as sealing factor.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "Blastocystis", "sp.", ",", "can", "downregulates", "claudin-7", ",", "which", "is", "known", "as", "sealing", "factor", "." ] } ]
PMC11344246	Furthermore, our siRNA knockdown effect on cell growth was generally mirrored by the effect of small molecule inhibition on cell growth.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "our", "siRNA", "knockdown", "effect", "on", "cell", "growth", "was", "generally", "mirrored", "by", "the", "effect", "of", "small", "molecule", "inhibition", "on", "cell", "growth", "." ] } ]
PMC11521786	Polyclonal antibody response of Mv-HER3. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Polyclonal", "antibody", "response", "of", "Mv-HER3", ".", "(" ] } ]
PMC8759873	We use kidney cancer cell lines as an in vitro research object and apply ultrasound microbubble gene transfection technology to transfect the VHL gene into kidney cancer cell line (786-0).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "use", "kidney", "cancer", "cell", "lines", "as", "an", "in", "vitro", "research", "object", "and", "apply", "ultrasound", "microbubble", "gene", "transfection", "technology", "to", "transfect", "the", "VHL", "gene", "into", "kidney", "cancer", "cell", "line", "(", "786", "-", "0", ")", "." ] } ]
PMC9429973	After stimulation with DCleu, antileukemic (T)cells are activated.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "stimulation", "with", "DCleu", ",", "antileukemic", "(T)cells", "are", "activated", "." ] } ]

PMC11389534

Additionally, in pancreatic cancer, UFMylation of ribosomal protein RPL10 has been found to significantly facilitate the proliferation and stemness of tumour cells.

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PMC11699465

We propose that the immune environment in vivo context mediates this tumor reduction in TMEM199-depleted xenografts, whereas this effect cannot be reflected in the tumor cell-only environment in vitro.

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PMC11252033

Evaluation of Bcl-2 and Bcl-xl mRNA expression in A2780S and A2780R cells following ASA treatment (ranging from 0,2 to 2 mM) for 72 h beta-2 microglobulin has been used as housekeeping gene.

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PMC11759543

In our in vivo study, the combination of vorinostat and doxorubicin demonstrates a strong anti-tumor effect in mice.

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PMC11666785

A Images at varying correlation values, χ = 0.7, 0.8, 0.9.

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In ZR751 cells, WGS-identified breakpoints support translocations underlying the enhancer-hijacking events.

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PMC11684269

In addition to the effect on CD8 T cells, LCFAs are capable of enhancing differentiation and proliferation of Th1 and Th17 cells (57).

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PMC3931643

Knocking down eIF4E did not affect basal survival or proliferation of VAL cells but increased sensitivity to cell death following MLN0128 treatment ( Fig. 6 ).

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PMC11116779

PS-NPs also penetrated the cytoplasm of A549 cells.

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PMC9429973

RR Mechatronics).

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PMC11711871

Each dose‒response curve was followed by a washing and equilibration step.

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PMC2193049

The samples were subjected to SDS–12% PAGE followed by autoradiography.

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PMC6182045

The TV1 gp120 expressed in 293 HEK cells was obtained from Immune Tech Corporation (New York, NY).

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PMC11791478

Results are summarized as mean with 95% confidence interval (CI), SD, or SEM, as indicated.

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PMC11470999

Subsequently, 20 µM MG132 was added for an additional 6 h. Immunoprecipitation was performed using an anti‐Flag antibody, followed by analysis of CIP2A ubiquitination using an anti‐HA antibody.

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PMC11621565

Rotenone 0.3 µM was used as a positive control for α-synuclein overexpression.

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PMC11098378

Samples were then boiled for 10 min at 95°C, subjected to SDS-PAGE, and immunoblotted with anti-GST, anti-Ubiquitin, anti-His or anti-Flag antibodies.

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PMC11301242

Red dots indicate genes located on ecDNA. (

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PMC8540611

In addition, mutation could reduce the efficacy of cancer therapy .

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PMC9429973

Only 4 (8%) of 51 patients were CEBPA mutated.

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PMC11317131

Donor plasmids contain an att site and cargo DNA for genomic insertion.

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PMC9429973

These results support a synergistic effect when compared to CR rates of 20% and 0% with EPOCH-R and ven monotherapy, respectively.

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PMC9479186

The original contributions presented in the study are included in the article/ Supplementary Material .

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PMC11348300

In recent years positron emission tomography (PET) tracers such as FMIZO and FAZA have been used to image hypoxia, and they indicate high contrast albeit with modest spatial resolution (27–29).

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PMC8389560

These results require additional confirmation for their correct interpretation.

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PMC11001582

WT (n = 4 mice), (GR)400 (n = 5 mice), (PR)400 (n = 6 mice); two-sided Welch’s t-test with 5% FDR multiple-correction.

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PMC11787355

D170_44 cells were then transduced in the presence of 8 µg/ml Polybrene (#TR-1003-G, Sigma-Aldrich), and cells were selected and maintained with 1 µg/ml Blasticidin (#A1113903, Gibco).

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PMC11351758

Treating the cells with Ca induced significant membrane potential depolarization and ROS levels in NARP cybrids compared with Ca-free treatments, which did not exhibit statistically significant differences (Figure 2).

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PMC10547921

Moana Tercel used a Pd-catalyzed amination method to convert seco-CBI (seco-1,2,9,9a-tetrahydrocyclopropa[c]benz[e]indol-4-one), a synthetic analog of the alkylating subunit of the duocarmycin natural products, from the phenol to amino form.

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PMC10705095

p < 0.05, ** p < 0.01, and *** p < 0.001 were considered statistically significant.

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PMC9429973

Results: We investigated a patient with early-onset HLH who fulfilled all diagnostic criteria who was wildtype for mutations in any of the known HLH genes.

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PMC9429973

At diagnosis, 14 patients had bone lesions and 4 had extramedullary plasmacytoma.

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PMC11694066

P < 0.05; **, P < 0.01; ***, P < 0.001; ****, P < 0.0001; ns, not significant.

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PMC11782780

ECAR experiments and analysis of glycolysis metabolite production were performed to evaluate cellular glycolysis capacity.

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PMC9429973

The overall response (CR+CRh+CRi+MLFS) was 54%.

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PMC11531735

Our study assessed the prophylactic potential of the orally administered inhibitor ER121 in preventing the formation of MMTV-erbB2-driven tumors in a transgenic mouse model.

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PMC6892818

b HRPT cells (seeded at 8000 cells/well) were either treated with 10 µg/ml cross-linked agonistic anti-CD40 mAb (G28-5) or mCD40L (by co-culture as above) for 24, 48 and 72 h alongside appropriate negative controls (and positive control, staurosporine-treated cells) and DNA fragmentation was assessed (see Methods).

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PMC11742670

It helps to analyse the model’s accuracy and promotes transparency.

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PMC10568263

According to literature reports, the (002) and (004) diffraction planes are observed due to the intercalation of ammonium ions increasing the interlayer spacing of MoS2.

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PMC11703896

Hence, to uncover the exact potential of rapamycin in cancer therapy, a series of cell culture and in silico studies were conducted to identify other receptors capable of binding to rapamycin.

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PMC11087055

Length of PS at HH3 for different concentrations of aphidicolin treatment (control 1.3±0.2 mm vs 0.1 μM aphidicolin 1.3±0.3 mm vs 1 μM aphidicolin 0.8±0.4 mm vs 10 μM aphidicolin 0.3±0.1 mm vs 100 μM aphidicolin 0.1±0.1 mm; n=6 for each, p=6.2e in one way ANOVA).

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PMC10810426

Since blocking NIH3T3 cell division greatly decreased the appearance of RTCs in the nucleus, nuclear reverse transcription likely occurs when the RTC ends up in the nucleus post-cell division.

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PMC11413393

Deamidation (NQ), oxidation (M), acetylation (protein N-term) were set as variable modifications.

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PMC11629192

Ofatumumab (OFA) is a fully human IgG1 monoclonal antibody targeting CD20, and it has been employed in the treatment of relapsing multiple sclerosis (MS) in adults .

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PMC7602170

Constitutive autophosphorylation of RTKs has an impact on the activation of the PI3K/AKT/mTOR pathway.

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PMC10975211

Buforin IIb exhibited efficacy against breast cancer cells MX-1, MCF-7, and T47-D with little or no effects on normal cells , where it hinders tumor growth in a mouse xenograft model by two mechanisms (anti-vasculogenic and anti-angiogenic).

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PMC11765879

They belong to the flavonoid group, a class of polyphenols that are highly abundant in medicinal plants and well known to possess prominent cytotoxic activities .

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PMC10882807

Cell cycle was detected by flow cytometry (Bio-Rad, USA).

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PMC11218145

As reported in Fig. 4, 24 h of TB treatment increased the mitochondrial respiration and ATP production, while prolonged exposure to TB provoked a progressive reduction (48 h) and loss (72 h) of these mitochondrial parameters.

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PMC11224020

These results prompted us to investigate whether cPLA2 and IKKβ–NF-κB were part of the same signaling route.

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PMC11678368

Additionally, the platinum complex was found to be approximately eight times less toxic than cisplatin against normal fibroblast cells (BALB/3T3), suggesting a potential advantage in anticancer treatment in terms of reduced side effects .

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PMC7369657

The apoptosome initiates procaspase-9, an initiator caspase that is splitted into caspase-9.

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PMC9429973

Median duration of response was not estimable [NE] (range, 8.3 mo-NE).

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PMC11544122

No detectable BRET response was measured in cells transfected with Rluc8-SNX9 or SNX9-RlucII alone.

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PMC11335267

G and H) Body weight and daily food intake (four days).

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PMC10362265

Particle-mesh Ewald summation method was used to compute the long-range electrostatic interactions with a grid spacing of 1.2 Å and a cut-off of 12 Å for short-range interactions .

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PMC9503669

While these in vitro studies support repurposing of lovastatin for Nef inhibitor development, a previous clinical trial showed that lovastatin treatment had no effect on HIV-1 plasma viral loads or circulating CD4 T cell counts in cART-naïve HIV-infected individuals .

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PMC9429973

A neurologic event (NE) occurred in 27%; 15% had a gr ≥3 NE, and none had gr 5 NE.

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PMC8973085

Technical triplicates and three biological duplicates were used in all studies.

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PMC11796104

CircRNA_0048211 negatively targets miRNA-93-5p to up-regulate BMP2, thus promotes osteoblast differentiation, indicating important role of miRNA-93-5p in osteoporosis .

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Recently, downregulation of miR-448 expression has been observed to be reduced in osteosarcoma and breast cancer , which is consistent with our results.

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Importantly, this conjugate has lower toxic side effects.

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Moreover, exposure to commensals or pathogens belonging to the same family determines important differences in the activation and outcomes of pyroptosis pathways.

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Within the realm of cell therapy, a wide array of treatments exists, ranging from those involving stem cells to non-stem cell-based interventions, and encompassing single or multiple cell types.

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PMC11731161

After IP-MS detection and subsequent analysis, a total of 313 interacting proteins were identified in the control group, and 462 interacting proteins were identified in the SEL-treated group (Fig. 3D).

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PMC5417661

Especially, at the 48 h time point the frequency of cell death was massive; the HCT116 cells were the most sensitive and exhibited an average CDI between 57% and 72% pending on the treatment while the MCF10A cells were the least sensitive of the three cell lines showing an average CDI between 40% and 49% pending on the compound (Figure 1D).

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PMC9509578

Table 2 provides a comprehensive list of various liposomal and solid lipid nanoformulations used for the reversal of MDR.

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PMC9429973

And more importantly, to assess the efficacy and tolerability of lenalidomide as maintenance therapy after BR.

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Strikingly, two TCRs recognized hematopoietic progenitor cells expanded from CD34-enriched autologous bone marrow.

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PMC10957991

This was evident by the lack of several markers for mature myoepithelial and luminal epithelial cells in TRPV4-depleted cell lines.

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PMC11367939

E COS7 cells were triple transfected with mRFP-Rab5 Q79L, ATG9A-EGFP, and synaptophysin-HA.

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PMC11560255

Consistently, Shi et al. (2019) documented that proanthocyanidin from grape seeds could trigger apoptosis of human colon cancer SW480 and SW620 cells by facilitating the expression of the pro-apoptotic proteins Bax and Bax, suppressing the expression of the anti-apoptotic protein Bcl-2, and activating caspase-9 and caspase-3.

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PMC11772449

It is worth noting that according to our findings, with the prolongation of administration time, the body weight of mice will be reduced to varying degrees, suggesting that the combination has certain toxic and side effects, and more research is needed before clinical application to determine the strategy (especially dose) and safety of the combination.

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PMC9429973

The possible coexistence of mixed infection (resistant/susceptible Aspergillus) was a concerned to 100% of experts.

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Shown is mean ± SEM of at least three independent experiments.

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PMC6461034

Kinase activity can be discerned from global protein phosphorylation profiles obtained with mass spectrometry‐based phosphoproteomics.

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PMC5925824

The therapeutic potential of LY3300054 to modulate T cell-mediated anti-tumor activity in an established tumor setting was evaluated using the HCC827 xenograft mouse tumor model, and animals reconstituted with ex-vivo expanded CD3+ T cells.

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PMC11519567

D The upper row shows representative images of immunofluorescence of the endogenous SS18-SSX1 protein in the HS-SY-II cell line, and the bottom row shows representative images of immunofluorescence of the endogenous SS18 protein after SS18-SSX1 protein knockout in HS-SY-II.

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PMC2614416

Each shotgun experiment consists of a 12-cycle MudPIT run in which a 60-minute nano-LC gradient is run for each of: 1D, 2D, 2D (0 mM NH4COO), 2D (25 mM NH4COO), 2D (50 mM NH4COO), 2D (75 mM NH4COO), 2D (100 mM NH4COO), 2D (150 mM NH4COO), 2D (200 mM NH4COO), 2D (250 mM NH4COO), 2D (300 mM NH4COO) and 2D (500 mM NH4COO).

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PMC11435360

H2S has also been shown to activate PARP-1, an ADP-ribosylating enzyme and a component of the earliest response to DNA damage, suggesting that H2S may promote DNA repair [Zhao 2014].

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PMC9429973

Regarding safety, all trials reported grade 3 or 4 adverse events (N=739).

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PMC11751675

Viruses are the most widespread living organisms on Earth, existing alongside bacteria, plants, and other animals, including humans.

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PMC11321678

Our data suggest an important role of NTRs in determining the cell origin and tumor growth in MBs.

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PMC11589157

Nomascus leucogenys is a critically endangered species of small apes.

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PMC9727330

According to the manufacturing procedures, 100µl of lysed cells was incubated with 100 µl LDH reaction mix for 30 min at room temperature.

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PMC10606998

Breaks can occur from the direct action of electrons or due to the action of free radicals formed in cells during irradiation .

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PMC9429973

RIC following the FLAMSA chemotherapy was 4Gy TBI and cyclophosphamide (73%), busulfan and cyclophosphamide (11%), melphalan (13%) or 2Gy TBI only (2%).

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PMC11564322

The cell co-treatment with the c-SRC inhibitor I and the VGVAPG peptide increased the PPARγ protein expression by 45.83%, compared to the control (Fig. 7E).

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PMC9429973

Any patients with missing data at Week 26 were evaluated using the most recent value within the 6 weeks prior.

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PMC10589262

All specimens were obtained via surgical resection, and some of the clinicopathological findings of the 42 GIST samples have been previously reported .

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PMC11095939

Surprisingly, Mecp2, a well-known essential regulator of brain development, emerged as a dramatically repressed protein at the priming/initiation stage of PHx-induced liver regeneration.

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PMC11695623

The results showed that DCUN1D5 had a strong positive correlation with NDC1, DEPDC1 and CENPA (correlation coefficient R > 0.5).

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PMC9429973

Methods: Eligible pts ≥18 years with FL Grade I-IIIA, ECOG performance status 0-1, progressive disease after ≥2 prior therapies including an anti-CD20 antibody and chemotherapy, and no prior PI3Kδ inhibitor, provided consent and then received zandelisib 60 mg daily for two 28-day cycles then on ID.

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PMC9429973

Cytokine releasing syndrome (CRS) occurred in 15(58%) patients; most of them occurred in the initial two cycles and were mostly of grade 1/2 severity except two cases (8%) with grade 3 CRS, both resulted from transaminitis.

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PMC4839679

In addition we identified many genes involved in cell adhesion that are uniquely regulated by PBRM1, and could be used to specifically characterize and treat PBRM1-mutated ccRCC tumors.

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PMC9027909

In addition, Blastocystis sp., can downregulates claudin-7, which is known as sealing factor.

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PMC11344246

Furthermore, our siRNA knockdown effect on cell growth was generally mirrored by the effect of small molecule inhibition on cell growth.

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PMC11521786

Polyclonal antibody response of Mv-HER3. (

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PMC8759873

We use kidney cancer cell lines as an in vitro research object and apply ultrasound microbubble gene transfection technology to transfect the VHL gene into kidney cancer cell line (786-0).

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PMC9429973

After stimulation with DCleu, antileukemic (T)cells are activated.

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