id
int64 0
4.72k
| body
stringlengths 12
227
| answer
stringlengths 2
3.35k
| relevant_passages
listlengths 1
83
| approx_word_count_original
int64 10
3.79k
| approx_word_count_translated
int64 8
2.21k
|
|---|---|---|---|---|---|
100
|
Wat is de functie van het AIRE-gen in het embryonale stadium?
|
Aire reguleert de expressie van differentiatie-geassocieerde genen en de zelfvernieuwing van embryonale stamcellen. Aire en Deaf1 helpen bij het reguleren van de ectopische expressie van diverse weefsel-specifieke antigenen om zelf-immuun tolerantie te vestigen. Knockdown van Aire in muis ESC's resulteerde in een significant verminderde klonenvormende efficiëntie evenals een verzwakte celcyclus, wat suggereert dat Aire een rol speelt in de zelfvernieuwing van ESC's. Aire bevordert de expressie van de pluripotente factor Lin28 en de zelfvernieuwing van ES-cellen.
|
[
"Auto-immuun regulator (Aire) is een van de best gekarakteriseerde moleculen in auto-immuniteit, maar de functie ervan buiten het immuunsysteem is grotendeels onbekend. De recente ontdekking van Aire-expressie in stamcellen en vroege embryonale cellen en de functie ervan in de zelfvernieuwing van embryonale stamcellen (ES-cellen) benadrukt het belang van Aire in deze cellen.",
"We presenteren bewijs dat Aire de expressie van de pluripotente factor Lin28 en de zelfvernieuwing van ES-cellen bevordert.",
"In plaats daarvan verminderde Aire de mitochondriale reductase van T-cellen door negatief een pro-inflammatoire cytokine, vroege T-cel activatiefactor (Eta)-1, te reguleren.",
"Aire reguleert de expressie van differentiatie-geassocieerde genen en de zelfvernieuwing van embryonale stamcellen.",
"Aire en Deaf1 helpen bij het reguleren van de ectopische expressie van diverse weefsel-specifieke antigenen om zelf-immuun tolerantie te vestigen.",
"Mutaties in het auto-immuun regulator (AIRE) eiwit veroorzaken een ineenstorting van de centrale tolerantie die geassocieerd is met verminderde expressie van zelf-antigenen in de thymus.",
"Aire reguleert de expressie van differentiatie-geassocieerde genen en de zelfvernieuwing van embryonale stamcellen.",
"De recente ontdekking van Aire-expressie in stamcellen en vroege embryonale cellen en de functie ervan in de zelfvernieuwing van embryonale stamcellen (ES-cellen) benadrukt het belang van Aire in deze cellen.",
"Aire bevordert de zelfvernieuwing van embryonale stamcellen via Lin28.",
"Samenvatting Auto-immuun regulator (Aire) is een van de best gekarakteriseerde moleculen in auto-immuniteit, maar de functie ervan buiten het immuunsysteem is grotendeels onbekend. De recente ontdekking van Aire-expressie in stamcellen en vroege embryonale cellen en de functie ervan in de zelfvernieuwing van embryonale stamcellen (ES-cellen) benadrukt het belang van Aire in deze cellen.",
"De recente ontdekking van Aire-expressie in stamcellen en vroege embryonale cellen en de functie ervan in de zelfvernieuwing van embryonale stamcellen (ES-cellen) benadrukt het belang van Aire in deze cellen. In deze studie presenteren we bewijs dat Aire de expressie van de pluripotente factor Lin28 en de zelfvernieuwing van ES-cellen bevordert.",
"Samenvatting Auto-immuun regulator (Aire) is een van de best gekarakteriseerde moleculen in auto-immuniteit, maar de functie ervan buiten het immuunsysteem is grotendeels onbekend. De recente ontdekking van Aire-expressie in stamcellen en vroege embryonale cellen en de functie ervan in de zelfvernieuwing van embryonale stamcellen (ES-cellen) benadrukt het belang van Aire in deze cellen."
] | 439
| 432
|
101
|
Wat is het principe van de PAR-CLIP-methodologie?
|
In het bijzonder maakt PAR-CLIP gebruik van een fotoactiveerbare nucleoside voor efficiëntere crosslinking. Een recente methode, PAR-CLIP, gebruikt photoreactieve nucleosiden om RBPs te crosslinken aan doel-RNA's in cellen voorafgaand aan immunoprecipitatie. Een kenmerkend aspect van cDNA-bibliotheken die door PAR-CLIP zijn voorbereid, is dat de precieze positie van crosslinking kan worden geïdentificeerd door mutaties die aanwezig zijn in het gesequencede cDNA.
|
[
"We ontwikkelden een celgebaseerde crosslinking-benadering om op hoge resolutie en transcriptome-breed de bindingsplaatsen van cellulaire RBPs en miRNPs te bepalen.",
"Om inzicht te krijgen in de complexiteit van snoRNA-verwerking en de functionele relevantie van snoRNA-afgeleide kleine RNA's, sequencen we lange en korte RNA's, kleine RNA's die co-precipiteren met het Argonaute 2-eiwit en RNA-fragmenten verkregen via photoreactieve nucleotide-versterkte crosslinking en immunoprecipitatie (PAR-CLIP) van kern-snoRNA-geassocieerde eiwitten.",
"Een groot aantal miRNA-doelinteracties (MTI's) is geïdentificeerd door crosslinking en immunoprecipitatie (CLIP) en photoactivatable-ribonucleoside-enhanced CLIP (PAR-CLIP) samen met next-generation sequencing (NGS).",
"PAR-CLIP toont een hoge efficiëntie van RNA co-immunoprecipitatie, maar leidt ook tot T naar C conversie in miRNA-RNA-eiwit crosslinking regio's.",
"Een recente methode, PAR-CLIP, gebruikt photoreactieve nucleosiden om RBPs te crosslinken aan doel-RNA's in cellen voorafgaand aan immunoprecipitatie.",
"In dit artikel bespreken we crosslinking en immunoprecipitatie (CLIP) methoden die zijn aangepast voor grootschalige identificatie van doel-RNA-bindingsplaatsen en de respectieve RNA-herkenningselementen.",
"CLIP-methoden hebben het potentieel om honderdduizenden bindingsplaatsen in enkele experimenten te detecteren, hoewel het scheiden van signaal van ruis uitdagend kan zijn.",
"We richten ons op photoactivatable ribonucleoside-enhanced CLIP, dat berust op de intracellulaire incorporatie van photoactivatable ribonucleoside-analogen in nieuw gevormde transcripties, en karakteristieke sequentieveranderingen oplevert bij crosslinking die het scheiden van signaal van ruis vergemakkelijken.",
"De Photo-Activatable Ribonucleoside-enhanced CrossLinking and ImmunoPrecipitation (PAR-CLIP) methode is recent ontwikkeld voor globale identificatie van RNA's die interageren met eiwitten.",
"De kracht van deze veelzijdige methode komt voort uit de inductie van specifieke T naar C overgangen op interactieplaatsen.",
"PAR-CLIP onthult een verzameling RNA's die aan een eiwit gebonden zijn, terwijl SILAC-gebaseerde RNA pull-downs een groep eiwitten identificeren die aan een RNA gebonden zijn.",
"Hier presenteren we een stapsgewijs protocol en richtlijnen voor de computationele analyse voor de grootschalige identificatie van miRNA-doelplaatsen in gekweekte cellen door photoactivatable ribonucleoside enhanced crosslinking en immunoprecipitatie (PAR-CLIP) van AGO-eiwitten.",
"In het bijzonder maakt PAR-CLIP gebruik van een fotoactiveerbare nucleoside voor efficiëntere crosslinking.",
"Crosslinking en immunoprecipitatie (CLIP) protocollen hebben het mogelijk gemaakt transcriptome-breed RNA-eiwit interactieplaatsen te identificeren.",
"In dit nummer van Molecular Cell identificeren Mukherjee et al. (2011) en Lebedeva et al. (2011) transcriptome-brede HuR-RNA interacties met behulp van PAR-CLIP, waarmee de nucleaire rol van HuR in pre-mRNA verwerking wordt onthuld.",
"Cross-linking en immunoprecipitatie (CLIP) wordt steeds vaker gebruikt om transcriptome-brede bindingsplaatsen van RNA-bindende eiwitten in kaart te brengen.",
"We ontwikkelden een methode voor CLIP data-analyse en pasten deze toe om CLIP te vergelijken met photoactivatable ribonucleoside-enhanced CLIP (PAR-CLIP) en om te achterhalen hoe verschillen in crosslinking en ribonuclease digestie de geïdentificeerde plaatsen beïnvloeden.",
"Om de specificiteit en positionele resolutie te verhogen, werd een strategie geïntroduceerd die bekend staat als CLIP (UV cross-linking en immunoprecipitatie).",
"Recentelijk werd PAR-CLIP geïntroduceerd, dat photoreactieve ribonucleoside-analogen gebruikt voor cross-linking.",
"PAR-CLIP--een methode om transcriptome-breed de bindingsplaatsen van RNA-bindende eiwitten te identificeren.",
"We ontwikkelden een krachtige celgebaseerde crosslinking-benadering om op hoge resolutie en transcriptome-breed de bindingsplaatsen van cellulaire RBPs en miRNPs te bepalen, die we PAR-CLIP noemen (Photoactivatable-Ribonucleoside-Enhanced Crosslinking and Immunoprecipitation).",
"De methode berust op de incorporatie van photoreactieve ribonucleoside-analogen, zoals 4-thiouridine (4-SU) en 6-thioguanosine (6-SG), in nieuw gevormde RNA-transcripten door levende cellen.",
"Een kenmerkend aspect van cDNA-bibliotheken die door PAR-CLIP zijn voorbereid, is dat de precieze positie van crosslinking kan worden geïdentificeerd door mutaties die aanwezig zijn in het gesequencede cDNA."
] | 584
| 575
|
102
|
Welke geneesmiddelen worden gebruikt voor de behandeling van amiodaron-geïnduceerde thyreotoxicose?
|
De behandeling van amiodaron-geïnduceerde thyreotoxicose omvat antithyroïdmedicatie en corticosteroïdtherapie. Radioactief jodiumtherapie (RIT) kan een veilige en nuttige methode zijn voor de behandeling van AIT bij patiënten met een lage RAIU, bij wie andere behandelingsmethoden gecontra-indiceerd zijn. Lithium is een nuttig en veilig medicijn voor de behandeling van jodium-geïnduceerde thyreotoxicose veroorzaakt door amiodaron. Thyreoïdectomie kan noodzakelijk zijn bij afwezigheid van respons op standaard medische behandelingen.
|
[
"goede respons op antithyroïdmedicatie en corticosteroïdtherapie",
"Het ziekteverloop van amiodaron-geïnduceerde thyreotoxicose is meestal goedaardig en remt met tijdige toediening van antithyroïdmedicatie, met of zonder corticosteroïden.",
"RIT kan een veilige en nuttige methode zijn voor de behandeling van AIT bij patiënten met een lage RAIU, bij wie andere behandelingsmethoden gecontra-indiceerd zijn.",
"De behandeling bestaat uit het gebruik van een hoge dosis antithyroïdmedicatie en corticosteroïden, afzonderlijk of in combinatie.",
"De toevoeging van lithiumcarbonaat aan de twee andere geneesmiddelen resulteerde in een succesvolle en veilige therapie voor het beheersen van amiodaron-geïnduceerde thyreotoxicose.",
"Lithium is een nuttig en veilig medicijn voor de behandeling van jodium-geïnduceerde thyreotoxicose veroorzaakt door amiodaron.",
"Twee patiënten met amiodaron-geïnduceerde thyreotoxicose werden succesvol behandeld met kaliumperchloraat en carbimazol terwijl de behandeling met amiodaron werd voortgezet.",
"Amiodaron-geïnduceerde thyreotoxicose lijkt een voorbijgaande aandoening te zijn die succesvol kan worden behandeld met een korte kuur antithyroïdmedicatie zonder de amiodaronbehandeling te stoppen.",
"Beide patiënten werden succesvol behandeld met propylthiouracil (PTU) en dexamethason (DXT)."
] | 220
| 222
|
103
|
Hoe wordt spastische diplegie gediagnosticeerd?
|
De diagnose van spastische diplegie wordt voornamelijk gesteld door middel van klinische loopanalyse (CGA), met variaties zoals de 1-minuut looptest, LSU en 10-meter looptest, of de Gross Motor Function Measure-88 (GMFM-88). Andere methoden die worden gebruikt voor de evaluatie van patiënten zijn hersenmagnetische resonantiebeeldvorming (MRI) en motorische functie, aanwezigheid van epileptische episodes en IQ of ontwikkelingsquotiënt.
|
[
"Spastische diplegie is de meest voorkomende vorm van cerebrale parese wereldwijd.",
"Patiënten met erfelijke spastische paraparese (HSP) en spastische diplegie (SD) vertonen een sterke klinische gelijkenis. Daarom worden HSP-patiënten vaak verkeerd gediagnosticeerd als een milde vorm van SD. Klinische loopanalyse (CGA) is naar voren gebracht als een mogelijk hulpmiddel om de differentiële diagnose van HSP en SD te ondersteunen.",
"Het overheersende klinische kenmerk van patiënten met erfelijke spastische paraparesis (HSP) is loopstoornis door spasticiteit en zwakte van de onderste ledematen; de spasticiteit bij vroeg begin van de ziekte (baby- of kinderleeftijd) kan vaak niet worden onderscheiden van een milde vorm van spastische diplegie (SD).",
"Het doel van deze studie was om de loopstrategie te kwantificeren bij kinderen met HSP en SD, met focus op de verschillen tussen groepen wat betreft functionele beperkingen tijdens het lopen. 9 HSP- en 16 SD-kinderen werden geëvalueerd met behulp van loopanalyse; kinematische en kinetische parameters en EMG-patronen tijdens het lopen werden geïdentificeerd en berekend om de twee loopstrategieën te vergelijken.",
"In tegenstelling tot andere ureumcyclusstoornissen wordt hyperammonemische encefalopathie zelden waargenomen bij patiënten met argininemie. De meeste vertonen eerder een sluipend begin en progressie van neurologische manifestaties, waaronder spastische diplegie.",
"Wij concluderen dat argininemie vaker in de differentiële diagnose moet worden overwogen bij een patiënt met langzaam progressieve neurologische manifestaties, vooral progressieve spastische diplegie, zelfs in een populatie waar argininemie voorheen onbekend was.",
"Om de betrouwbaarheid en validiteit te beoordelen van een nieuw beschreven classificatie van sagittale vlak uitlijning bij spastische diplegische gang.",
"Het doel van deze prospectieve studie was de toepassing van protonmagnetische resonantiespectroscopie bij kinderen met spastische diplegie (SD) om het metabolietprofiel van SD-kinderen in de linker basale ganglia te bepalen en de relatie van dit profiel met motorische en mentale ontwikkeling te beoordelen.",
"Het doel van deze studie was om de betrouwbaarheid en validiteit vast te stellen van visuele loopevaluatie bij kinderen met spastische diplegie, die zich in de gemeenschap of thuis konden voortbewegen, met behulp van een aangepaste versie van de Physicians Rating Scale, bekend als de Observational Gait Scale (OGS).",
"Het doel van deze studie was om de gang van HSP- en SD-patiënten kwantitatief te analyseren om het looppatroon bij HSP te definiëren en de verschillen tussen de twee aandoeningen.",
"Deze studie toont aan dat GA traditionele klinische evaluaties aanvult, waardoor het mogelijk is duidelijk onderscheid te maken tussen motorische vaardigheden bij HSP- en SD-patiënten; de duur van de knie-hyperextensie tijdens de midstance bleek onderscheidend te zijn tussen de twee looppatronen.",
"Constructvaliditeit van de In-Hand Manipulation Test (IMT) door het vermogen van de test te beoordelen om te onderscheiden tussen kinderen met en zonder bekende fijne motorische problemen. METHODE: De IMT werd afgenomen bij 55 kinderen zonder bekende fijne motorische problemen en 24 kinderen met spastische diplegie die milde tot matige fijne motorische problemen hadden.",
"Een discriminantanalyse gaf aan dat de totale IMT-score 83,33% van de deelnemers correct classificeerde als wel of geen fijne motorische problemen hebbend.",
"Calcaneale gang of deformiteit kan een significante complicatie zijn na het verlengen van de hielpees. Na verlenging van de hielpees werden 20 kinderen met spastische diplegie geëvalueerd door loopanalyse om calcaneale gang objectief te definiëren en de bijbehorende morbiditeit te beschrijven.",
"Significante verschillen werden gevonden in geboortegewicht, hoofdomtrek bij geboorte en de Apgar-score na één minuut.",
"Intracraniële bloedingen en neonatale aanvallen kwamen significant vaker voor bij zuigelingen met SD.",
"Bij de Movement Assessment of Infants op 4 maanden leeftijd vertoonden kinderen met hemiplegie en quadriplegie significant hogere risicoscores dan de niet-gehandicapte groep.",
"Op 1-jarige leeftijd was de Bayley Motor Scale echter uiterst gevoelig in het opsporen van motorische tekorten bij kinderen met alle drie typen cerebrale parese.",
"Heupflexie gecombineerd met knie-extensie (beenheffing) en geïsoleerde kniebewegingen werden niet gezien bij diplegische zuigelingen, maar wel bij alle controle vroeggeboren zuigelingen met een goede prognose, respectievelijk na vijf en zes maanden gecorrigeerde leeftijd. Het ontbreken van deze bewegingen is een nuttig diagnostisch item voor spastische diplegie.",
"Volledige lichaam loopanalyse kan de diagnostische differentiatie tussen erfelijke spastische paraparese en spastische diplegie verbeteren.",
"Klinische loopanalyse (CGA) is naar voren gebracht als een mogelijk hulpmiddel om de differentiële diagnose van HSP en SD te ondersteunen. Eerdere analyses richtten zich op het onderlichaam, maar niet op het bovenlichaam, waar talrijke compensaties tijdens het lopen plaatsvinden. Het doel van deze studie was om de volledige lichaamsbewegingen van HSP- en SD-groepen te vergelijken, en in het bijzonder de beweging van de bovenste ledematen.",
"De studiepersonen waren acht patiënten met spastische diplegie en acht normale kinderen. Drie-dimensionale loopanalyse werd gebruikt voor het onderzoek. De gemeten loopvariabelen waren de gewrichten van de onderste extremiteit in het sagittale vlak, frontale vlak en transversale vlakken en de maximale en minimale hoeken van hun standfase en zwaaifasen.",
"Relaties tussen spasticiteit, kracht, gang en de GMFM-66 bij personen met spastische diplegie cerebrale parese.",
"[Doel] Deze studie had tot doel de effecten van Vojta-therapie op spatiotemporele loopparameters te onderzoeken bij kinderen met spastische diplegie. [Methoden] De studiepopulatie bestond uit 3 kinderen gediagnosticeerd met spastische diplegie.",
"Het doel van deze studie was om de fysieke status en looppatronen te onderzoeken van kinderen met spastische diplegie secundair aan human immunodeficiency virus encefalopathie (HIVE). Een dwarsdoorsnede studie werd uitgevoerd bij kinderen gediagnosticeerd met HIVE en spastische diplegie.",
"De resultaten toonden aan dat HSP-patiënten meer wervelbewegingen gebruikten om te compenseren voor veranderingen in de beweging van de onderste ledematen, terwijl SD-patiënten hun armen gebruikten voor compensatie.",
"Om de associatie te onderzoeken tussen magnetische resonantiebeeldvorming (MRI)-patronen en motorische functie, epileptische episodes en IQ of ontwikkelingsquotiënt bij patiënten die voldragen zijn geboren met spastische diplegie.",
"Om de validiteit en klinische bruikbaarheid te onderzoeken van functionele beoordelingen (1-minuut looptest, 10-meter looptest, Timed Up&Go [TUG]-test, Timed Up and Down Stairs [TUDS]-test, zit-naar-sta [STS]-test en laterale step-up [LSU]-test).",
"Deze functionele beoordelingen (1-minuut loop, LSU en 10-meter looptests) zijn eenvoudig toe te passen, snel, goedkoop en gebruiksvriendelijk. Hoewel deze beoordelingen geen vervanging zijn voor de criteriumstandaard (GMFM-88), kunnen ze worden gebruikt voor een snelle beoordeling bij adolescenten met cerebrale parese (niveaus I-III), zowel op school als tijdens revalidatie, vooral wanneer de tijd beperkt is.",
"Het doel van deze studie was om het effect van dynamische bilaterale houdingsstabiliteit op balanscontrole en loopparameters te evalueren bij kinderen met cerebrale parese. ONTWERP: Dertig kinderen met spastische diplegie (8-10 jaar) werden in deze studie opgenomen."
] | 1,074
| 1,071
|
104
|
Wat is het genetische defect dat Neurofibromatose type 1 veroorzaakt?
|
Neurofibromatose type 1 (NF1) wordt veroorzaakt door alle soorten mutaties in het neurofibromine (NF1) gen.
|
[
"Neurofibromatose type 1 en het Noonan-syndroom zijn beide veelvoorkomende genetische aandoeningen met autosomaal dominante overerving.",
"Moleculaire analyse toonde een missense-mutatie aan in exon 25 van het NF1-gen (4288A>G, p.N1430D)",
"Identificatie van vijfenveertig nieuwe en drieëntwintig bekende NF1-mutaties bij Chinese patiënten met neurofibromatose type 1",
"Neurofibromatose type 1 (NF1), gekenmerkt door huidneurofibromen en een overmaat aan café-au-lait vlekken, wordt veroorzaakt door mutaties in het neurofibromine (NF1) gen. Het identificeren van het genetische defect bij individuen met de ziekte vormt een aanzienlijke uitdaging omdat het gen extreem groot is met een hoge incidentie van sporadische mutaties verspreid over het gehele gen, variërend van enkelvoudige nucleotidevervangingen tot grote deleties.",
"Achtenvijftig werden aanvankelijk geïdentificeerd met behulp van heteroduplex-analytische technieken en bevestigd door sequentieanalyse. Vijf extra werden alleen door directe sequentieanalyse geïdentificeerd. De overige bleken grote deleties in het NF1-gen te dragen door het aantonen van verlies van heterozygotie, wat werd bevestigd door gen-dosismetingen met behulp van kwantitatieve PCR-technieken. Missense-, nonsense-, frameshift- of splice-site mutaties werden geïdentificeerd over het gehele gen, waarvan de meerderheid (45/68) nieuw van aard was.",
"Neurofibromatose type 1 (NF1) is een veelvoorkomend tumorpredispositie syndroom dat ongeveer 1 op de 4.000 personen treft. Het is een autosomaal-dominante aandoening waarbij de helft van de gevallen het gevolg is van spontane mutaties.",
"Karakterisering van het somatische mutatiespectrum van het neurofibromatose type 1 (NF1) gen bij neurofibromatosepatiënten met goedaardige en kwaadaardige tumoren",
"Eenennegentig tumoren van 31 NF1-patiënten werden gescreend op grote veranderingen in het NF1-gen met behulp van microsatelliet/restrictiefragmentlengtepolymorfisme (RFLP) markers; verlies van heterozygotie (LOH) werd gevonden in 17 van de 91 (19%) tumoren (inclusief twee van de zeven MPNST's). Denaturerende high performance vloeistofchromatografie (DHPLC) werd vervolgens gebruikt om 43 LOH-negatieve en 10 LOH-positieve tumoren te screenen op NF1-microletsels op zowel RNA- als DNA-niveau. Dertien germinale en twaalf somatische mutaties werden geïdentificeerd, waarvan drie germinale (IVS7-2A>G, 3731delT, 6117delG) en acht somatische (1888delG, 4374-4375delCC, R2129S, 2088delG, 2341del18, IVS27b-5C>T, 4083insT, Q519P) nieuw waren. Een mozaïekmutatie (R2429X) werd ook geïdentificeerd in een neurofibroom door DHPLC-analyse en klonering/sequencing.",
"Het DNA-gebied gelegen tussen twee translocatie-breukpunten is gekloond en een DNA-sequentie die een 11-13 kb mRNA codeert, is geïdentificeerd. Het feit dat deze sequentie deleties en puntmutaties vertoont bij NF1-aangedane individuen en niet bij normale controles, levert sterk bewijs dat dit inderdaad het NF1-gen is."
] | 403
| 389
|
105
|
Wat is het menselijke selenoproteïne dat meerdere Se-Cys-residuen bevat?
|
Selenoproteïne P, dat 10 selenocysteïnes bevat.
|
[
"selenoproteïne P en verschillende andere selenoproteïnen staan bekend om het bevatten van meerdere selenocysteïnes",
"Sepp1) is een uitgescheiden eiwit dat bestaat uit 2 domeinen. Het grotere N-terminale domein bevat 1 selenocysteïne-residu in een redoxmotief en het kleinere C-terminale domein bevat de andere 9 selenocysteïnes",
"selenoproteïne P-genen coderen voor meerdere UGA's en twee SECIS-elementen",
"Menselijk selenoproteïne P (HSelP) is een uniek eiwit dat 10 selenocysteïnes bevat, gecodeerd door 10 in-frame UGA's",
"SeP) is een extracellulair glycoproteïne met 8-10 selenocysteïnes per molecuul",
"menselijke, rund- en knaagdier selenoproteïne P-genen coderen voor eiwitten die 10-12 selenocysteïnes bevatten",
"Selenoproteïne P is uniek doordat zijn mRNA 10-12 selenocysteïne-residuen codeert",
"De afgeleide polypeptide-sequentie bestaat uit 380 residuen inclusief tien selenocysteïnes",
"selenoproteïne-P",
"selenoproteïne P-achtig eiwit dat 12 selenocysteïnes bevat",
"rat- en menselijk selenoproteïne P cDNA, maar bevatte 12 in plaats van 10 TGA's"
] | 142
| 138
|
106
|
Welk pakket is beschikbaar voor het analyseren van genomische interacties in R/Bioconductor?
|
r3Cseq is een R/Bioconductor-pakket dat is ontworpen om 3C-seq data-analyse uit te voeren in verschillende experimentele ontwerpen. Het pakket leest een veelgebruikt formaat van uitgelijnde reads, biedt datanormalisatie, maakt visualisatie van kandidaat-interactiegebieden mogelijk en detecteert statistisch significante chromatine-interacties, waardoor hypothesevorming en interpretatie van experimentele resultaten sterk worden vergemakkelijkt.
|
[
"r3Cseq: een R/Bioconductor-pakket voor de ontdekking van langafstand genomische interacties uit chromosoomconformatie-capturing en next-generation sequencing data.",
"We presenteren r3Cseq, een R/Bioconductor-pakket dat is ontworpen om 3C-seq data-analyse uit te voeren in verschillende experimentele ontwerpen. Het pakket leest een veelgebruikt formaat van uitgelijnde reads, biedt datanormalisatie, maakt visualisatie van kandidaat-interactiegebieden mogelijk en detecteert statistisch significante chromatine-interacties, waardoor hypothesevorming en interpretatie van experimentele resultaten sterk worden vergemakkelijkt. We tonen verder het gebruik aan in een reeks toepassingen uit de praktijk",
"r3Cseq: een R/Bioconductor-pakket voor de ontdekking van langafstand genomische interacties uit chromosoomconformatie-capturing en next-generation sequencing data"
] | 164
| 150
|
107
|
Hoeveel klinische onderzoeken naar off-label geneesmiddelen bij pasgeborenen worden in de literatuur genoemd.
|
Er zijn geen rapporten over klinische onderzoeken met off-label geneesmiddelen bij pasgeborenen. Een analyse van Pediatric Investigation Plans die tussen 2007 en 2010 zijn ingediend, toont aan dat pasgeborenen werden opgenomen in het onderzoek van 4 producten, maar het is onbekend of de onderzochte geneesmiddelen off-label zijn en of de onderzoeken überhaupt worden uitgevoerd.
|
[
"Van de 17 ingediende Pediatric Investigation Plans hebben 14 geleid tot een EMA-beslissing, 3 werden door de aanvragers ingetrokken, 8 kregen een volledige vrijstelling van ontwikkeling en 1 resulteerde in een negatief advies. De genomen beslissingen omvatten 15 klinische onderzoeken, waarbij ten minste 1.282 kinderen zullen worden gerekruteerd voor studies met vijf verschillende producten. Pasgeborenen waren opgenomen in vier van de producten. CONCLUSIES: Het geringe aantal indieningen wijst op een gebrek aan nieuwe geneesmiddelen die worden ontwikkeld voor pijnbestrijding. Ethische bezwaren dat te veel kwetsbare kinderen worden gerekruteerd voor klinische onderzoeken moeten worden afgewogen tegen het beperken van het aantal off-label voorschriften en het verkrijgen van leeftijdsadequate informatie over pediatrisch gebruik.",
"Pediatric Investigation Plans (PIPs) die met een beslissing (uitkomst) werden afgesloten tussen september 2007 en maart 2010, werden opgenomen in de analyse."
] | 198
| 197
|
108
|
Zijn stressgranules betrokken bij de pathogenese van Amyotrofische Laterale Sclerose?
|
Stressgranules zijn cytoplasmatische insluitsels die de translatie van een subset van RNA's onderdrukken tijdens cellulaire stress, en verschillende eiwitten die betrokken zijn bij neurodegeneratie (zoals Ataxine-2 en SMN) interageren met stressgranules. Mutante FUS-eiwitten die amyotrofische laterale sclerose veroorzaken, worden opgenomen in stressgranules. ALS-gerelateerde mutaties in profiline 1 veranderen de dynamiek van stressgranules, wat verder bewijs levert voor de mogelijke rol van stressgranules in de pathogenese van ALS. ALS-mutaties in FUS NLS kunnen de nucleaire lokalisatie van FUS verstoren, cytoplasmatische insluitsels en stressgranules induceren, en mogelijk het RNA-metabolisme verstoren.
|
[
"SG's zijn in verband gebracht met verschillende pathologieën, waaronder inflammatoire ziekten, kanker, virale infecties en neurodegeneratieve ziekten zoals amyotrofische laterale sclerose (ALS) en frontotemporale dementie (FTD).",
"Net als verschillende andere met ALS geassocieerde eiwitten wordt CREST gerekruteerd naar geïnduceerde stressgranules.",
"Onze gegevens geven aan dat CREST en bepaalde andere ALS-gerelateerde eiwitten verschillende kenmerken delen die betrokken zijn bij de pathogenese van ALS, namelijk het vermogen om te aggregeren, gerekruteerd te worden naar stressgranules en de integriteit van paraspeckles te veranderen.",
"Een verenigend kenmerk van veel eiwitten die geassocieerd zijn met ALS, waaronder TDP-43 en ataxine-2, is dat ze zich lokaliseren in stressgranules.",
"Twee RNA-bindende eiwitten, TDP-43 en FUS, aggregeren in de degenererende motorneuronen van ALS-patiënten, en mutaties in de genen die deze eiwitten coderen veroorzaken sommige vormen van ALS.",
"Recent werk dat TDP-43 en FUS verbindt met stressgranules heeft gesuggereerd hoe deze cellulaire route, die eiwitaggregatie als onderdeel van zijn normale functie omvat, mogelijk wordt gekaapt tijdens de ziektepathogenese.",
"Amyotrofische laterale sclerose (ALS)-gerelateerde fused in sarcoma/translocated in liposarcoma (FUS/TLS of FUS) concentreert zich binnen cytoplasmatische stressgranules onder omstandigheden van geïnduceerde stress. Aangezien alleen de mutanten, maar niet de endogene wild-type FUS, geassocieerd zijn met stressgranules onder de meeste tot nu toe gerapporteerde stresscondities, vertegenwoordigt de relatie tussen FUS en stressgranules een mutanten-specifiek fenotype en kan dus van belang zijn bij mutanten-geïnduceerde pathogenese.",
"Fused in sarcoma (FUS) behoort tot de groep RNA-bindende eiwitten die worden beschouwd als onderliggende factoren bij amyotrofische laterale sclerose (ALS) en bepaalde andere neurodegeneratieve ziekten. Meerdere FUS-genmutaties zijn gekoppeld aan erfelijke vormen, en aggregatie van FUS-eiwit wordt verondersteld een belangrijke rol te spelen in de pathogenese van deze ziekten. In gekweekte cellen kunnen FUS-varianten met ziekte-geassocieerde aminozuursubstituties of korte deleties die het nucleaire lokalisatiesignaal (NLS) beïnvloeden en cytoplasmatische mislokalisatie veroorzaken, worden gevangen in stressgranules (SG's).",
"Profiline 1 associeert met stressgranules en ALS-gerelateerde mutaties veranderen de dynamiek van stressgranules.",
"Hier rapporteren we dat profiline 1 en het gerelateerde eiwit profiline 2 nieuwe stressgranule-geassocieerde eiwitten zijn in muis primaire corticale neuronen en in menselijke cellijnen, en dat ALS-gerelateerde mutaties in profiline 1 de dynamiek van stressgranules veranderen, wat verder bewijs levert voor de mogelijke rol van stressgranules in de pathogenese van ALS.",
"Bovendien assembleerden onder oxidatieve stress of hitte-shock condities in culturen en in vivo de ALS-gerelateerde FUS-mutanten, maar niet wild-type FUS, in perinucleaire stressgranules in verhouding tot hun cytoplasmatische expressieniveaus.",
"Mutante FUS-eiwitten die amyotrofische laterale sclerose veroorzaken, worden opgenomen in stressgranules.",
"Onze resultaten suggereren dat de ALS-mutaties in FUS NLS de nucleaire lokalisatie van FUS kunnen verstoren, cytoplasmatische insluitsels en stressgranules kunnen induceren, en mogelijk het RNA-metabolisme kunnen verstoren.",
"De RNA-bindende capaciteit van FUS reguleert neurodegeneratie, cytoplasmatische mislokalisatie en opname in stressgranules geassocieerd met FUS met ALS-gerelateerde mutaties.",
"TDP-43 is een RNA-bindend eiwit dat gekoppeld is aan amyotrofische laterale sclerose (ALS) en waarvan bekend is dat het de splicing, het transport en de opslag van specifieke mRNA's in stressgranules reguleert.",
"Bij amyotrofische laterale sclerose (ALS) en frontotemporale lobaire degeneratie hoopt TAR DNA-bindend eiwit 43 (TDP-43) zich op in het cytoplasma van aangetaste neuronen en gliacellen, waar het geassocieerd is met stressgranules (SG's) en grote insluitsels vormt.",
"Amyotrofische laterale sclerose (ALS)-gerelateerde fused in sarcoma/translocated in liposarcoma (FUS/TLS of FUS) concentreert zich binnen cytoplasmatische stressgranules onder omstandigheden van geïnduceerde stress.",
"Mutante FUS-eiwitten die amyotrofische laterale sclerose veroorzaken, worden opgenomen in stressgranules.",
"Mutaties in Fus veroorzaken amyotrofische laterale sclerose (ALS) en het mutante eiwit vormt insluitsels die lijken overeen te komen met stressgranules.",
"Recent werk suggereert ook dat TDP-43 geassocieerd is met cytoplasmatische stressgranules, die tijdelijke structuren zijn die zich vormen als reactie op stress.",
"We vonden dat TDP-43 als reactie op oxidatieve stress en verschillende soorten omgevingsschade in staat is om te assembleren in stressgranules (SG's), ribonucleoproteïnecomplexen waar de eiwitsynthese tijdelijk wordt stilgelegd.",
"Bovendien co-deponeren eiwitten die bekend staan als stressgranule-markers met insluitsels in fALS- en FTLD-FUS-patiënten, wat wijst op een rol van stressgranulevorming in de pathogenese van deze ziekten. We stellen voor dat twee pathologische factoren, namelijk defecten in nucleaire import en cellulaire stress, betrokken zijn bij de pathogenese van FUS-pathieën.",
"Amyotrofische laterale sclerose (ALS)-gerelateerde fused in sarcoma/translocated in liposarcoma (FUS/TLS of FUS) concentreert zich binnen cytoplasmatische stressgranules onder omstandigheden van geïnduceerde stress.",
"Amyotrofische laterale sclerose-gerelateerde FUS/TLS verandert de assemblage en dynamiek van stressgranules.",
"Bovendien co-deponeren eiwitten die bekend staan als stressgranule-markers met insluitsels in fALS- en FTLD-FUS-patiënten, wat wijst op een rol van stressgranulevorming in de pathogenese van deze ziekten. We stellen voor dat twee pathologische factoren, namelijk defecten in nucleaire import en cellulaire stress, betrokken zijn bij de pathogenese van FUS-pathieën.",
"Autofagie reguleert amyotrofische laterale sclerose-gerelateerde fused in sarcoma-positieve stressgranules in neuronen.",
"De rol van autofagie in de regulatie van FUS-positieve stressgranules (SG's) en aggregaten blijft echter onduidelijk.",
"Hoewel FUS/TLS en PRMT1 onder normale omstandigheden voornamelijk in de kern gelokaliseerd zijn, werden ze gedeeltelijk gerekruteerd naar cytoplasmatische granules onder oxidatieve stress, die samenvielen met stressgranule (SG) markers in SH-SY5Y cellen.",
"Het effect van PRMT1-gemedieerde argininemethylering op de subcellulaire lokalisatie, stressgranules en detergent-onoplosbare aggregaten van FUS/TLS.",
"Stressgranules zijn cytoplasmatische insluitsels die de translatie van een subset van RNA's onderdrukken tijdens cellulaire stress, en verschillende eiwitten die betrokken zijn bij neurodegeneratie (zoals Ataxine-2 en SMN) interageren met stressgranules.",
"Deze bevindingen ondersteunen een tweehitshypothese, waarbij cytoplasmatische mislokalisatie van FUS-eiwit, gevolgd door cellulaire stress, bijdraagt aan de vorming van cytoplasmatische aggregaten die FUS kunnen sequestreren, RNA-verwerking kunnen verstoren en motorneuronaal degeneratie kunnen initiëren.",
"Hier maakten we gebruik van een Drosophila-model van ALS en neuronale cellijnen om de rol van de RNA-bindende capaciteit van FUS te verduidelijken bij het reguleren van FUS-gemedieerde toxiciteit, cytoplasmatische mislokalisatie en opname in stressgranules (SG's).",
"Stressgranules als smeltkroezen van ALS-pathogenese."
] | 1,004
| 997
|
109
|
Speelt TGF-beta een rol bij cardiale regeneratie na myocardinfarct?
|
TGFβ-signaaltransductie orkestreert de gunstige wisselwerking tussen litteken-gebaseerd herstel en cardiomyocyt-gebaseerde regeneratie om volledige hartregeneratie te bereiken.
|
[
"Vervolgens voerden we een chemische screening uit en identificeerden verschillende kleine moleculen die de proliferatie van cardiomyocyten tijdens de hartontwikkeling verhogen of verminderen. Deze verbindingen werken via Hedgehog-, Insuline-achtige groeifactor- of Transforming growth factor β-signaleringsroutes.",
"Hier rapporteren we dat het evenwicht tussen de reparatieve en regeneratieve processen wordt bereikt via Smad3-afhankelijke TGFβ-signaaltransductie.",
"Dus orkestreert TGFβ-signaaltransductie de gunstige wisselwerking tussen litteken-gebaseerd herstel en cardiomyocyt-gebaseerde regeneratie om volledige hartregeneratie te bereiken.",
"Zoals verwacht was transforming growth factor (TGF)-beta, een profibrotische cytokine, dramatisch verhoogd in MI-harten, maar zijn gefosforyleerde comediator (pSmad) was significant verlaagd in de kernen van Cx43-deficiënte harten na MI, wat suggereert dat de downstream signalering van TGF-beta substantieel verminderd is in Cx43-deficiënte harten. Deze vermindering in profibrotische TGF-beta signalering resulteerde in de afzwakking van nadelige structurele remodeling zoals beoordeeld door echocardiografie.",
"Potentieel gunstige veranderingen omvatten toename van de HSMP secretorische-leukocyten-protease-remmer (SLPI) en cytokine transforming growth factor (TGF)-beta(1). Het richten op deze eiwitten kan de versterkte LV-remodeling en disfunctie bij veroudering verminderen.",
"Na letsel leidde de aanwezigheid van macrofagen, die hoge niveaus van transforming growth factor-beta en vasculaire endotheliale groeifactor-A afscheidden, tot snelle verwijdering van celresten en vervanging door granulatieweefsel met inflammatoire cellen en bloedvaten, gevolgd door myofibroblastinfiltratie en collageenafzetting.",
"De secretie van transforming growth factor-beta en vasculaire endotheliale groeifactor-A evenals neovascularisatie, myofibroblastinfiltratie en collageenafzetting namen af.",
"De repressie van pro-inflammatoire cytokine- en chemokinesynthese, mede gemedieerd door Transforming Growth Factor (TGF)-beta en Interleukine (IL)-10, is cruciaal voor de resolutie van de inflammatoire infiltratie en de overgang naar fibrotische weefselafzetting.",
"TGF-beta leidde de myogene differentiatie van CD117+ stamcellen door de expressie van GATA-4 en NKx-2.5 op te voeren. Daarom ondersteunde de intramyocardiale implantatie van TGF-beta-voorgeprogrammeerde CD117+ cellen effectief de myocardiale regeneratie en induceerde therapeutische angiogenese, wat bijdroeg aan functionele cardiale regeneratie.",
"Deze resultaten geven aan dat TGF-beta/Smad-signaaltransductie mogelijk betrokken is bij de remodeling van het infarctlitteken na de voltooiing van de wondgenezing zelf, via voortdurende stimulatie van matrixafzetting."
] | 342
| 330
|
110
|
Is er een genetische component voor geluk?
|
Resultaten van studies over genetische factoren gaven een gemiddelde effectiviteit van genetica van ongeveer 35-50 procent op geluk. Het MAOA-gen voorspelt geluk bij vrouwen. De erfelijkheid van geluk werd geschat op 22% voor mannen en 41% voor vrouwen.
|
[
"Ten slotte werd een systematische review uitgevoerd op basis van bestaande informatie. Resultaten van studies over genetische factoren gaven een gemiddelde effectiviteit van genetica van ongeveer 35-50 procent op geluk.",
"Het MAOA-gen voorspelt geluk bij vrouwen.",
"Hoewel tweelingstudies schatten dat genetische factoren verantwoordelijk zijn voor 35-50% van de variantie in menselijk geluk, is de kennis over specifieke genen beperkt.",
"Dit onderzoek onderzoekt de associatie tussen geluk en het monoamine-oxidase A (MAOA) genotype.",
"Degenen met het syndroom hebben een aanleg voor schijnbaar geluk en aanvallen van lachen, en deze bevinding helpt het Angelman-syndroom te onderscheiden van andere syndromen die gepaard gaan met ernstige ontwikkelingsachterstand.",
"De erfelijkheid van geluk werd geschat op 22% voor mannen en 41% voor vrouwen.",
"Biometrische studies hebben aangetoond dat geluk sterk wordt beïnvloed door genen.",
"De clustering van de vier verschillende metingen (algemene kwaliteit van leven, tevredenheid met het leven, kwaliteit van leven op dit moment en subjectief geluk) werd verklaard door een onderliggende additieve genetische factor en een onderliggende niet-additieve genetische factor.",
"Geluk en de omgeving worden beïnvloed door genetische factoren en de opvoeding binnen het gezin.",
"De resultaten suggereren dat veel vermeende indicatoren van de omgeving sterk erfelijk zijn en dat dezelfde genen die de omgeving beïnvloeden ook het geluk kunnen beïnvloeden."
] | 239
| 241
|
111
|
Welk enzym wordt geremd door Opicapone?
|
Opicapone is een nieuwe catechol-O-methyltransferase (COMT) remmer die gebruikt wordt als aanvullende therapie bij met levodopa behandelde patiënten met de ziekte van Parkinson.
|
[
"DOEL: Opicapone (OPC) is een nieuwe catechol-O-methyltransferase (COMT) remmer die gebruikt wordt als aanvullende therapie bij met levodopa behandelde patiënten met de ziekte van Parkinson.",
"Hersen- en perifere farmacokinetiek van levodopa bij de cynomolgus-aap na toediening van opicapone, een COMT-remmer van de derde generatie nitrocatechol.",
"DOELSTELLING: De huidige studie had tot doel het effect van opicapone, een COMT-remmer van de derde generatie nitrocatechol, te evalueren op de systemische en centrale biologische beschikbaarheid van 3,4-dihydroxy-l-fenylalanine (levodopa) en gerelateerde metabolieten bij de cynomolgus-aap.",
"CONCLUSIES: Opicapone gedroeg zich als een langwerkende COMT-remmer die de systemische en centrale biologische beschikbaarheid van levodopa aanzienlijk verhoogde.",
"ACHTERGROND EN DOELSTELLINGEN: Opicapone is een nieuwe COMT-remmer van de derde generatie. Het doel van deze studie was het vergelijken van het farmacokinetische profiel van levodopa gedurende een dag, gestuurd door COMT-remming, hetzij na herhaalde doses opicapone, hetzij gelijktijdige toediening met entacapone.",
"CONCLUSIE: Opicapone, een nieuwe COMT-remmer van de derde generatie, biedt in vergelijking met entacapone een superieure respons op de biologische beschikbaarheid van levodopa, geassocieerd met een meer uitgesproken, langdurige en aanhoudende COMT-remming.",
"Farmacokinetiek, farmacodynamiek en verdraagbaarheid van opicapone, een nieuwe catechol-O-methyltransferase remmer, bij gezonde proefpersonen: voorspelling van langzame dissociatie van het enzym-remmercomplex van een kortlevende en zeer langwerkende remmer.",
"Opicapone is een nieuwe catechol-O-methyltransferase (COMT) remmer.",
"Opicapone is een nieuwe COMT-remmer van de derde generatie.",
"Het doel van deze studie was het evalueren van de verdraagbaarheid, farmacokinetiek (inclusief het effect van voedsel) en farmacodynamiek (effect op COMT-activiteit) na enkele orale doses opicapone bij jonge gezonde mannelijke vrijwilligers.",
"DOEL: Het doel van deze studie was het beoordelen van de verdraagbaarheid, farmacokinetiek en het remmende effect op de activiteit van oplosbare catechol-O-methyltransferase (S-COMT) in erytrocyten na herhaalde doses opicapone.",
"CONCLUSIE: Ondanks de korte eliminatiehalfwaardetijd remde opicapone de S-COMT-activiteit in erytrocyten aanzienlijk en duurzaam, waardoor het geschikt is voor een eenmaal daagse dosering.",
"Opicapone toonde een duidelijke en aanhoudende remming van de oplosbare COMT-activiteit in erytrocyten.",
"De lange duur van COMT-remming door opicapone leek echter onafhankelijk van de ingenomen dosis te zijn."
] | 329
| 345
|
112
|
Welk type affiniteitspurificatie zou u gebruiken om oplosbare lysosomale eiwitten te isoleren?
|
De reden voor de zuivering van de oplosbare lysosomale eiwitten ligt in hun karakteristieke suiker, mannose-6-fosfaat (M6P), die een gemakkelijke zuivering mogelijk maakt door affiniteitchromatografie op geïmmobiliseerde M6P-receptoren.
|
[
"De meeste luminale lysosomale eiwitten worden gesynthetiseerd als voorlopers die mannose 6-fosfaat (Man6-P) bevatten en een aantal recente studies hebben affiniteitspurificatie van Man6-P-bevattende eiwitten uitgevoerd als een stap richting het definiëren van de samenstelling van het lysosoom.",
"Dit hoofdstuk beschrijft het proces van productie, zuivering, scheiding en massaspectrometrische identificatie van oplosbare lysosomale eiwitten. De reden voor de zuivering van deze eiwitten ligt in hun karakteristieke suiker, mannose-6-fosfaat (M6P), die een gemakkelijke zuivering mogelijk maakt door affiniteitchromatografie op geïmmobiliseerde M6P-receptor (MPR",
"secreties van deze cellen werden affiniteit-gezuiverd met behulp van een affiniteitmatrix gederivatiseerd met MPR46 en MPR300. In de eiwitfractie die aan de affiniteitmatrix gebonden was en werd eluëerd met mannose 6-fosfaat,",
"Eiwitten die mannose 6-fosfaat (Man6-P) bevatten, een koolhydraatmodificatie die wordt gebruikt voor het richten van residentiële oplosbare lysosomale eiwitten naar het lysosoom, werden affiniteit-gezuiverd met behulp van geïmmobiliseerde Man6-P receptor.",
". We hebben mannose 6-gefosforyleerde eiwitten gezuiverd door affiniteitchromatografie",
"Aangezien oplosbare lysosomale eiwitten worden gekenmerkt door de aanwezigheid van mannose-6-fosfaat, werden ze gezuiverd op een affiniteitsondersteuning met mannose-6-fosfaat receptor",
"De meest overvloedige lysosomale substraten van Acp2 en Acp5 werden geïdentificeerd door Man6P affiniteitchromatografie en massaspectrometrie.",
"urine-eiwitten werden affiniteit-gezuiverd op geïmmobiliseerde Man-6-P receptoren,",
"Een aantal proteomische studies hebben zich gericht op lysosomale eiwitten, gebruikmakend van het feit dat Man-6-P-bevattende vormen kunnen worden gezuiverd door affiniteitchromatografie op geïmmobiliseerde MPRs.",
"In deze studie hebben we de Man-6-P glycoformen van eiwitten uit menselijk plasma gezuiverd door affiniteitchromatografie op geïmmobiliseerde MPRs."
] | 271
| 266
|
113
|
Welke genen worden verondersteld gereguleerd te worden door EWS/FLI?
|
Het EWS/FLI translocatieproduct is het veroorzakende oncogen bij Ewing-sarcoom en fungeert als een abnormale transcriptiefactor. EWS/FLI verstoort de genexpressie tijdens tumorvorming door genen abnormaal te activeren of te onderdrukken. De expressieniveaus van een aanzienlijk aantal genen worden beïnvloed bij Ewing-sarcoom, waarvan sommige bekend zijn dat ze direct of indirect door EWS/FLI worden gereguleerd. Dergelijke genen zijn BCL11B, NR0B1, GSTM4, NKX2.2 en p53.
|
[
"BCL11B wordt omhoog gereguleerd door EWS/FLI en draagt bij aan het getransformeerde fenotype bij Ewing-sarcoom",
"EWS/FLI verstoort de genexpressie tijdens tumorvorming door genen abnormaal te activeren of te onderdrukken. De expressieniveaus van duizenden genen worden beïnvloed bij Ewing-sarcoom, maar het is onbekend welke van deze genen bijdragen aan het getransformeerde fenotype. Hier karakteriseren we BCL11B als een omhoog gereguleerd EWS/FLI-doelwit dat noodzakelijk is voor het behoud van transformatie in patiëntafgeleide Ewing-sarcoom cellijnen",
"BCL11B, een zinkvinger transcriptiefactor, fungeert als transcriptierepressor in Ewing-sarcoom en draagt bij aan het door EWS/FLI onderdrukte genensignatuur",
"EWS/FLI functioneert als een abnormale transcriptiefactor om genen te reguleren die het oncogene fenotype van Ewing-sarcoom mediëren. Een van deze gereguleerde genen, NR0B1, codeert voor een corepressor-eiwit en speelt waarschijnlijk een transcriptierol in tumorvorming",
"GSTM4 is een microsatelliet-bevattend EWS/FLI-doelwit betrokken bij de oncogenese en therapeutische resistentie van Ewing-sarcoom",
"We toonden recent aan dat EWS/FLI een van zijn sleuteldoelwitten, NR0B1, reguleert via een GGAA-microsatelliet in de promotor",
"We vonden dat EWS/FLI direct bindt aan de GSTM4-promotor en reguleert de expressie van GSTM4 via een GGAA-microsatelliet in de promotor",
"Het gen dat het meest reproduceerbaar omhoog werd gereguleerd door EWS/FLI was NR0B1",
"We valideerden NR0B1 als een door EWS/FLI verstoord gen en bevestigden de expressie ervan in primaire humane tumormonsters",
"Expressieprofilering van EWS/FLI identificeert NKX2.2 als een cruciaal doelgen in Ewing-sarcoom",
"Functionele analyse toonde aan dat NKX2.2 een door EWS/FLI gereguleerd gen is dat noodzakelijk is voor oncogene transformatie in deze tumor",
"Neuroblastoom-Ews/Fli-1 geïnfecteerde cellijnen vertoonden duidelijke verhogingen in p53-eiwitexpressie zonder transcriptie-upregulatie",
"We testten vervolgens het p53-respons pad en observeerden dat de oudercellen van neuroblastoom reageerden op genotoxische stress, terwijl de neuroblastoom-Ews/Fli-1 geïnfecteerden dat niet deden. Deze resultaten suggereren dat Ews/Fli-1 het p53-pad direct kan onderdrukken om tumorvorming te bevorderen",
"We toonden recent aan dat EWS/FLI interacteert met GGAA-microsatellieten om enkele van zijn doelgenen te reguleren, waaronder NR0B1, een door EWS/FLI gereguleerd gen dat vereist is voor het oncogene fenotype van Ewing-sarcoom.",
"BCL11B wordt omhoog gereguleerd door EWS/FLI en draagt bij aan het getransformeerde fenotype bij Ewing-sarcoom.",
"Het gen dat het meest reproduceerbaar omhoog werd gereguleerd door EWS/FLI was NR0B1.",
"Hier karakteriseren we BCL11B als een omhoog gereguleerd EWS/FLI-doelwit dat noodzakelijk is voor het behoud van transformatie in patiëntafgeleide Ewing-sarcoom cellijnen."
] | 432
| 422
|
114
|
Bevatten archaeale genomen één of meerdere replicatieoorsprongen?
|
Sommige archaea repliceren vanaf enkele oorsprongen, maar de meeste archaea en alle eukaryoten repliceren met meerdere oorsprongen.
|
[
"Daarom suggereren deze bewijslijnen sterk dat de geïdentificeerde regio een replicatieoorsprong is, die wordt aangeduid als oriC1. De analyse van de y-component van de Z-curve, d.w.z. de MK-dispariteitscurve, suggereert de aanwezigheid van een andere replicatieoorsprong die overeenkomt met een van de pieken in de MK-dispariteitscurve rond 1.388 kb van het genoom",
"Onze resultaten suggereren sterk dat de enkele replicatieoorsprong van M. mazei zich bevindt in de intergene regio",
"Bacteriën en sommige archaea repliceren vanaf enkele oorsprongen, terwijl de meeste archaea en alle eukaryoten repliceren met meerdere oorsprongen.",
"Meerdere DNA-replicatieoorsprongen zijn een kenmerk van eukaryoten en sommige archaea",
"Meerdere orc/cdc6-geassocieerde replicatieoorsprongen werden voorspeld in alle geanalyseerde haloarchaeale genomen",
"Verschillende replicatieoorsprongen in sommige archaeale genomen laten behoorlijk verschillende patronen van strengasymmetrie zien",
"Het enkele chromosoom van Pyrobaculum calidifontis bevat vier replicatieoorsprongen",
"Zes archaeale genomen van het geslacht Sulfolobus met drie replicatieoorsprongen werden geselecteerd",
"De sterke replicatie-biased structuur van het Sulfolobus-chromosoom impliceert dat de meerdere replicatieoorsprongen andere doelen dienen dan alleen het verkorten van de benodigde tijd voor replicatie",
"De 3 DNA-replicatieoorsprongen van Sulfolobus acidocaldarius",
"We hebben een combinatie van genetische, biochemische en bio-informatica benaderingen gebruikt om DNA-replicatieoorsprongen in H. volcanii in kaart te brengen. Vijf autonoom replicerende sequenties werden gevonden naast cdc6/orc1-genen",
"Het paradigma van meerdere replicatieoorsprongen is ook aangetoond binnen het archaeale domein van het leven",
"Meerdere chromosoom-replicatieoorsprongen in Sulfolobus-soorten hebben nog een eukaryotische eigenschap toegevoegd aan de archaea",
"We hebben Z-curve-analyse toegepast om één replicatieoorsprong in het Methanocaldococcus jannaschii-genoom te identificeren, twee replicatieoorsprongen in het Halobacterium species NRC-1-genoom en één replicatieoorsprong in het Methanosarcina mazei-genoom.",
"Archaea lijken te repliceren met een enkele oorsprong (net als eubacteriën), hoewel archaeale replicatiefactoren meer lijken op die van eukaryoten",
"Op basis van bovenstaande analyse is een model van replicatie van Halobacterium NRC-1 met twee replicatieoorsprongen en twee termina voorgesteld.",
"Bovendien worden de potentiële meerdere replicatieoorsprongen van de archaeon Sulfolobus solfataricus gesuggereerd door de analyse gebaseerd op de Z-curve-methode",
"Hoewel meerdere replicatieoorsprongen zijn waargenomen in archaea, is er aanzienlijk minder bekend over hun evolutionaire processen.",
"Meerdere orc/cdc6-geassocieerde replicatieoorsprongen in haloarchaeale genomen"
] | 380
| 340
|
115
|
Welke pathologische aandoeningen worden veroorzaakt door mutaties in het CYLD-gen?
|
Aangezien verlies van CYLD-expressie kan worden waargenomen bij verschillende typen menselijke kanker, is het nu goed vastgesteld dat CYLD fungeert als een tumorsuppressorgen. Pathogene mutaties in CYLD kunnen worden geïdentificeerd bij patiënten met het Brooke-Spiegler-syndroom, (familiaire) cylindromatose of multiple familiale trichoepitheliomen. CYLD-expressie is ook gerapporteerd als sterk gereduceerd in basaalcelcarcinoom (BCC), de meest voorkomende kanker bij mensen.
|
[
"We detecteerden een frameshift-mutatie in het CYLD-gen, aangeduid als 2253delG, die ten grondslag ligt aan de aandoening en konden aantonen dat een enkele mutatie kan resulteren in verschillende klinische en histologische uitingen bij familiale cylindromatose.",
"Eerder was een kandidaat MTF-locus in kaart gebracht op 9p21, terwijl het ziektegen voor familiale cylindromatose, het CYLD-gen gelegen op 16q21-13, was geïdentificeerd.",
"Hier tonen we aan dat mutaties in het CYLD-gen ook de genetische basis vormen voor drie verschillende Chinese families met MFT.",
"Familiale trichoepithelioma (MFT) en familiale cylindromatose zijn twee klinisch verschillende kankersyndromen. MFT-patiënten ontwikkelen voornamelijk trichoepitheliomen in het gezicht, terwijl cylindromatose-patiënten cylindromen ontwikkelen, voornamelijk (ongeveer 90%) op hoofd en nek.",
"Fenotype van familiale cylindromatose geassocieerd met een R758X nonsense-mutatie in het CYLD tumorsuppressorgen.",
"We beschrijven een familie met cylindromatose, waarin getroffen individuen een geërfde R758X nonsense-mutatie van CYLD hebben.",
"CYLD-mutaties liggen ten grondslag aan Brooke-Spiegler, familiale cylindromatose en multiple familiale trichoepithelioma-syndromen.",
"We beschrijven een enkele familie met getroffen leden die ofwel het FC- of het MFT-fenotype vertonen, geassocieerd met een mutatie in het CYLD-gen.",
"Individuen met germinale mutaties in het tumorsuppressorgen CYLD lopen een hoog risico op het ontwikkelen van ontsierende cutane aanhangseltumoren, waarbij de kenmerkende tumor de sterk georganiseerde cylindroom is.",
"CYLD is een tumorsuppressorgen dat gemuteerd is in huidaanhangseltumoren zoals cylindromen, trichoepitheliomen en spiradenomen.",
"Daarnaast hebben we Maspin-downregulatie gekarakteriseerd in cylindromen, trichoepitheliomen en spiradenomen die functionele inactiverende mutaties van CYLD dragen, wat ook bewijs levert voor de correlatie tussen verminderde CYLD-functie en afgenomen Maspin-expressie in vivo in menselijke tumoren.",
"Germinale mutatie in cylindromatose (CYLD), een tumorsuppressorgen, veroorzaakt familiale cylindromatose en het Brooke-Spiegler-syndroom.",
"Patiënten met heterozygote germinale truncerende mutaties in het CYLD-gen ontwikkelen meerdere primaire tumoren gerelateerd aan haarfollikels. Zowel een sterk gepatterneerde tumor, genaamd cylindroom, als een sterk gedesorganiseerde tumor, genaamd spiradenoom, kunnen zich bij dezelfde patiënt ontwikkelen.",
"Multiple trichoepitheliomen geassocieerd met een nieuwe heterozygote mutatie in het CYLD-gen als aanvulling op de histopathologische diagnose.",
"Multiple trichoepitheliomen (TE's), vooral in familiale context, zijn geassocieerd met germinale heterozygote mutaties in het CYLD-gen.",
"We beschrijven een 35-jarige vrouw met meerdere gezichts-TE's, bij wie de moleculair-genetische analyse een nieuwe heterozygote c.1843delT-mutatie in het CYLD-gen aan het licht bracht.",
"Deze frameshift-mutatie was ook aanwezig in heterozygote toestand in de TE-tumorcellen. De aantoning van een nieuwe CYLD-mutatie werd gebruikt als aanvulling op de histopathologische diagnose in dit geval.",
"Nieuwe germinale mutatie in het CYLD-gen bij een Slowaakse patiënt met het Brooke-Spiegler-syndroom.",
"Deze nieuwe germinale mutatie in het CYLD-gen van een Slowaakse patiënt met het Brooke-Spiegler-syndroom breidt de catalogus van bekende CYLD-germinale mutaties bij deze aandoening uit.",
"Moleculair biologisch onderzoek van het CYLD-gen uitgevoerd op perifere bloedmonsters identificeerde een nieuwe splice-site c.2041+1 G>T-mutatie.",
"Patiënten met het Brooke-Spiegler-syndroom hebben verschillende mutaties in het CYLD-gen, een tumorsuppressorgen gelegen op chromosoom 16q.",
"Mutatie en verlies van heterozygotie van het CYLD-gen veroorzaken de ontwikkeling van cylindromatose, een goedaardige tumor die afkomstig is van de huid.",
"Onze studie toont aan dat CYLD-expressie sterk gereduceerd is in basaalcelcarcinoom (BCC), de meest voorkomende kanker bij mensen.",
"Hoewel sommige vroege studies een rol suggereerden voor het PTCH-gen op chromosoom 9q22.3 in de etiopathogenese van MFT, identificeerden recente studies bij incidentele patiënten met het MFT-klinische fenotype mutaties in het CYLD-gen op chromosoom 16q12-q13, een gen verantwoordelijk voor BSS.",
"Aangezien verlies van CYLD-expressie kan worden waargenomen bij verschillende typen menselijke kanker, is het nu goed vastgesteld dat CYLD fungeert als een tumorsuppressorgen.",
"Mutaties in CYLD kunnen worden geïdentificeerd bij patiënten met het Brooke-Spiegler-syndroom, (familiaire) cylindromatose of multiple familiale trichoepithelioma.",
"We tonen aan dat expressie in tumorige epidermale cellen van een catalytisch inactieve vorm van CYLD (CYLD(C/S)), die de geïdentificeerde mutaties van CYLD in menselijke tumoren nabootst en concurreert met het endogene CYLD, leidt tot verhoogde celproliferatie en remming van apoptose.",
"In tegenstelling tot eerdere studies die de ontwikkeling van goedaardige tumoren door mutaties in het CYLD-gen toonden, leveren wij hier bewijs dat het optreden van mutaties in het CYLD-gen in tumorige epidermale cellen (met eerdere mutaties) de agressiviteit van carcinomen verhoogt, voornamelijk door versterking van de expressie van angiogene factoren, en daarmee een sleutelrol speelt in de maligniteit van epidermale kanker.",
"Door interphase cytogenetica werd een (sub)clonale biallelic CYLD-deletie waargenomen in 1 van 29 primaire cHL, terwijl signaalpatronen die verminderde CYLD-kopieaantallen aangeven werden waargenomen in totaal 10 van 29 primaire gevallen.",
"Mutatie in het CYLD-gen binnen een familie met het Brooke-Spiegler-syndroom.",
"Het Brooke-Spiegler-syndroom is een zeldzame autosomaal dominante ziekte gekenmerkt door meerdere huidaanhangseltumoren veroorzaakt door diverse mutaties in het CYLD-gen op chromosoom 16q12-q13.",
"Auteurs rapporteren een geval van het Brooke-Spiegler-syndroom (BSS) met een nieuwe germinale CYLD-mutatie en diverse somatische mutaties geïdentificeerd in de laesies.",
"Het beschikbare histopathologische materiaal omvatte 24 trichoepitheliomen, 2 grote nodulaire basaalcelcarcinomen (BCC's), 2 spiradenomen, 1 spiradenocylindroom en 1 trichoblastoom bestaande uit grote en kleine noduli met prominente clear cell-differentiatie.",
"Om de omvang en ernst van klinische kenmerken bij getroffen individuen uit 2 grote families met bewezen heterozygote mutaties in het CYLD-locus volledig vast te stellen en deze bevindingen te correleren met de 3 aanhangseltumor predispositie syndromen (familiale cylindromatose, Brooke-Spiegler-syndroom en multiple familiale trichoepitheliomen) die bekend zijn geassocieerd met dergelijke germinale mutaties.",
"In dit rapport identificeerden we een nieuwe mutatie van het CYLD-gen in een Chinese familie met MFT.",
"Geval van het Brooke-Spiegler-syndroom met een nieuwe germinale diepe intronmutatie in het CYLD-gen leidend tot intronale exonisatie, diverse somatische mutaties en ongebruikelijke histologie.",
"We presenteren een geval van het Brooke-Spiegler-syndroom met een germinale diepe intronmutatie in het CYLD-gen leidend tot intronale exonisatie.",
"Een diepe intronmutatie die exonisatie veroorzaakt en een somatische sequentiemutatie die exon skipping veroorzaakt, zijn tot nu toe niet gerapporteerde genetische mechanismen die het CYLD-gen betreffen bij patiënten met het Brooke-Spiegler-syndroom.",
"Nieuwe splice-mutatie van het CYLD-gen in een Taiwanese familie met multiple familiale trichoepitheliomen.",
"Mutaties in het CYLD-gen, dat ook het gen is dat verantwoordelijk is voor familiale cylindromatose, zijn recentelijk gerapporteerd.",
"We rapporteren een nieuwe splice-mutatie (IVS12 + 1 G-->A) in het CYLD-gen in een Taiwanese stamboom met MFT, en bespreken nieuwe ontwikkelingen in behandelingsopties.",
"Nieuwe CYLD-mutaties in huidaanhangseltumoren en bewijs dat asparaginezuur 681 in CYLD essentieel is voor de deubiquitinase-activiteit.",
"Het Brooke-Spiegler-syndroom, familiale cylindromatose en familiale trichoepithelioma zijn autosomaal-dominante genetische predisposities voor goedaardige tumoren van huidaanhangsels veroorzaakt door mutaties in het CYLD-gen gelokaliseerd op chromosoom 16q12-q13.",
"Het ziektegen werd in kaart gebracht op 16q12-13, en mutaties in het CYLD-gen werden geïdentificeerd in families met BSS.",
"Door sequentieanalyse identificeerden we een terugkerende mutatie 2272C>T (R758X) van het CYLD-gen bij de getroffen individuen van deze familie, die eerder was geïdentificeerd in andere etnische families met familiale cylindromatose.|"
] | 1,185
| 1,096
|
116
|
Wat is de genetische basis van Spinale Musculaire Atrofie (SMA)?
|
De moleculair genetische basis van spinale musculaire atrofie (SMA), een autosomaal recessieve neuromusculaire aandoening, is het verlies van functie van het survival motor neuron-gen (SMN1). Mutaties in het SMN1-gen zijn verantwoordelijk voor SMA. Een enkele nucleotide in het SMN-gen reguleert splicing en is verantwoordelijk voor spinale musculaire atrofie. Een cruciale vraag is waarom alleen het homozygote verlies van SMN1, en niet SMN2, resulteert in spinale musculaire atrofie (SMA). H4F5 is ook sterk gedeleteerd in type I SMA-chromosomen en is daarmee een kandidaat fenotypische modulator voor SMA.
De moleculair genetische basis van spinale musculaire atrofie (SMA), een autosomaal recessieve neuromusculaire aandoening, is het verlies van functie van het survival motor neuron-gen (SMN1).
|
[
"Mutaties in TRPV4, dat codeert voor een kationkanaal, zijn recentelijk geïdentificeerd in één grote dominante congenitale spinale musculaire atrofie-familie, maar de genetische basis van dominante congenitale spinale musculaire atrofie in veel families blijft onbekend.",
"Wij rapporteren klinische, elektrofysiologische, spier-MRI en histopathologische bevindingen in een familie over vier generaties met typische kenmerken van dominante congenitale spinale musculaire atrofie, zonder mutaties in TRPV4, en waarbij koppeling aan andere bekende dominante neuropathie- en spinale musculaire atrofie-genen is uitgesloten. De autopsiebevindingen bij de proband, die op 14 maanden overleed aan een niet-gerelateerde ziekte, boden een zeldzame gelegenheid om de neuropathologische basis van dominante congenitale spinale musculaire atrofie te bestuderen. Er was een reductie",
"Recentelijk zijn de veelvoorkomende vormen van spinale musculaire atrofie (SMA) geassocieerd met mutaties in de SMN- en NAIP-genen op chromosoom 5, in het gebied q11.2-13.3.",
"Er is enige correlatie vastgesteld tussen SMN-eiwitniveaus en ziekteverloop; desalniettemin blijft de genetische basis voor fenotypische variabiliteit van SMA onduidelijk, en er is verondersteld dat het verlies van een extra modifierende factor bijdraagt aan de ernst van type I SMA",
"Met behulp van vergelijkende genomica om naar zo'n factor te zoeken tussen evolutionair geconserveerde sequenties tussen muis en mens, hebben we een nieuw transcript geïdentificeerd, H4F5, dat dichter bij SMN1 ligt dan enig eerder geïdentificeerd gen in het gebied.",
"Een multi-copy microsatellietmarker die in meer dan 90% van de type I SMA-chromosomen is gedeleteerd, is ingebed in een intron van dit gen, wat aangeeft dat H4F5 ook sterk gedeleteerd is in type I SMA-chromosomen en daarmee een kandidaat fenotypische modulator voor SMA is.",
"Een enkele nucleotide in het SMN-gen reguleert splicing en is verantwoordelijk voor spinale musculaire atrofie",
"Een cruciale vraag is waarom alleen het homozygote verlies van SMN1, en niet SMN2, resulteert in spinale musculaire atrofie (SMA).",
"Dus het falen van SMN2 om SMN1 volledig te compenseren en te beschermen tegen SMA is te wijten aan een nucleotide-uitwisseling (C/T) die de activiteit van een exonic enhancer vermindert.",
"Autosomaal recessieve proximale SMA bij kinderen is de meest voorkomende vorm en wordt veroorzaakt door mutaties in een gen dat codeert voor een nieuw eiwit, SMN, dat een cruciale rol lijkt te spelen in RNA-metabolisme maar ook is aangetoond te interageren met actine-bindende eiwitten en mediatoren van geprogrammeerde celdood.",
"Mutaties in het SMN1-gen zijn verantwoordelijk voor SMA.",
"Alle patiënten bleken homozygoot te zijn voor het verlies van ofwel exon 7 of exonen 7 en 8 van het SMN1-gen",
"Zes extra patiënten hadden een ziekte van de voorhoorncellen maar waren negatief voor de SMN1-gen deletie. Alle zes hadden uitsluitingskenmerken vermeld in de internationale richtlijnen.",
"De moleculair genetische basis van spinale musculaire atrofie (SMA), een autosomaal recessieve neuromusculaire aandoening, is het verlies van functie van het survival motor neuron-gen (SMN1)",
"De structuren van het SMN1-gen en het SMN2-pseudogen, mutaties die de SMN1-functie verstoren, de structuur en functies van het Smn-neurotrofische eiwit, de rol ervan in de biogenese van kleine nucleaire ribonucleoproteïnen (snRNP's), en de principes en problemen van moleculaire diagnostiek bij SMA worden beschreven.",
"SMA wordt veroorzaakt door mutaties in het survival of motor neuron-gen (SMN1) die leiden tot een vermindering van de hoeveelheid SMN-eiwit.",
"Vanuit een beter begrip van de genetische basis van SMA en de defecten die voortkomen uit mutaties in SMN1 in cellulaire of diermodellen, zijn verschillende therapeutische strategieën geselecteerd die gericht zijn op SMN2, een gedeeltelijk functionele kopie van het SMN1-gen die bij patiënten aanwezig blijft, of om neuronen te beschermen tegen celdood.",
"We gebruikten een homozygootmapping- en positionele kloningsbenadering in een consanguine familie van Asjkenazische Joodse afkomst en identificeerden een nonsense-mutatie in het vaccinia-gerelateerde kinase 1-gen (VRK1) als oorzaak van SMA-PCH",
"SMN1- en SMN2-quantificatie werd uitgevoerd om de genotype-fenotype relatie te onderzoeken. RESULTATEN: Twee nieuwe puntmutaties werden geïdentificeerd in exon 3 van SMN1 (p.Tyr130Cys en p.Tyr130His) in het sterk geconserveerde Tudor-domein van het Smn-eiwit. CONCLUSIES: De genetische basis van SMA in de zeldzame gevallen van compound heterozygote dragers van SMN1-deleties is complex."
] | 775
| 747
|
117
|
Wat zijn de veelvoorkomende symptomen van het syndroom van Cushing?
|
Het syndroom van Cushing is het geheel van tekenen en symptomen veroorzaakt door langdurige blootstelling aan glucocorticoïden. Veelvoorkomende verschijnselen zijn gewichtstoename, groeiachterstand, hirsutisme, obesitas, striae, acne en hypertensie.
|
[
"Het syndroom van Cushing is het geheel van tekenen en symptomen veroorzaakt door langdurige blootstelling aan glucocorticoïden. De meest voorkomende oorzaak van het syndroom van Cushing bij kinderen en adolescenten is de exogene toediening van glucocorticoïden. Veelvoorkomende verschijnselen zijn gewichtstoename, groeiachterstand, hirsutisme, obesitas, striae, acne en hypertensie.",
"Dit is een zeldzaam syndroom en de belangrijkste endocriene manifestatie, primair gepigmenteerde nodulaire bijnieraandoening (PPNAD), is een ongewone oorzaak van adrenocorticotroop hormoon-onafhankelijk syndroom van Cushing. We rapporteren de casus van een 20-jarige patiënt met een voorgeschiedenis van gewichtstoename, hirsutisme, acne, secundaire amenorroe en gezichtslentiginose."
] | 124
| 126
|
118
|
Wat is de derde subeenheid van het TSC1-TSC2-complex stroomopwaarts van mTORC1?
|
TBC1D7 werd geïdentificeerd als een stabiel geassocieerde en alomtegenwoordige derde kernsubeenheid van het TSC1-TSC2-complex. Er werd aangetoond dat TSC1-TSC2-TBC1D7 (TSC-TBC) het functionele complex is dat specifieke cellulaire groeicondities detecteert en Rheb-GAP-activiteit bezit om de mTORC1-activiteit negatief te reguleren. In overeenstemming hiermee bleek uit knockdown van TBC1D7 dat dit leidt tot verhoogde mTORC1-signalisatie, vertraagde inductie van autofagie en versterkte celgroei onder slechte groeicondities.
|
[
"Het tubere sclerose complex (TSC) tumorrepressoren vormen het TSC1-TSC2-complex, dat de celgroei beperkt als reactie op slechte groeicondities. Via zijn GTPase-activerende eiwit (GAP)-activiteit richting Rheb remt dit complex het mechanistische doelwit van rapamycine (mTOR) complex 1 (mTORC1), een belangrijke bevorderaar van celgroei.",
"Hier identificeren en biochemisch karakteriseren we TBC1D7 als een stabiel geassocieerde en alomtegenwoordige derde kernsubeenheid van het TSC1-TSC2-complex. We tonen aan dat het TSC1-TSC2-TBC1D7 (TSC-TBC) complex het functionele complex is dat specifieke cellulaire groeicondities detecteert en Rheb-GAP-activiteit bezit.",
"Knockdown van TBC1D7 vermindert de associatie van TSC1 en TSC2, wat leidt tot verminderde Rheb-GAP-activiteit, zonder effect op de lokalisatie van TSC2 naar het lysosoom.",
"Net als de andere TSC-TBC-componenten leidt knockdown van TBC1D7 tot verhoogde mTORC1-signalisatie, vertraagde inductie van autofagie en versterkte celgroei onder slechte groeicondities."
] | 210
| 195
|
119
|
Welke kinase wordt geremd door het kleine molecuul KN-93?
|
De calcium/calmoduline-afhankelijke proteïnekinase-II (CaMK-II) wordt geremd door het kleine molecuul KN-93. KN-93 is een membraan-permeabel calcium/calmoduline-afhankelijk kinase II (CaMK-II)-selectief remmer
|
[
"KN-93, een membraan-permeabele calcium/calmoduline-afhankelijke kinase-selectieve remmer, induceert apoptose in sommige lijnen van menselijke tumorcellen.",
"Knockdown van βCaMKII door lentivirale gemedieerde expressie van shRNA voorkwam de synaptische inactiviteit-geïnduceerde toename in GluA1, net als behandeling met de CaM kinase remmer KN-93, maar niet met de inactieve analoog KN-92.",
"Om de effecten van KN-93, een CaMKII-selectieve remmer, op celproliferatie en de expressie van p53 of p21-eiwit in menselijke hepatische stercellen te onderzoeken.",
"Injectie van de CaM kinase remmer KN-93 in poppen resulteerde in een verminderd aantal antennale lob gliale cellen die in het neuropil migreerden om grenzen rond glomeruli te vormen.",
"Daarentegen blokkeerde toevoeging van de intracellulaire Ca2+ chelator BAPTA-AM of de Ca2+/calmoduline-afhankelijke (CaM) kinase remmer KN-93 de activatie van het reporter-gen als reactie op IH.",
"Deze toename in CPEB-fosforylering werd verminderd door een specifieke peptide-remmer van CaMKII en door de algemene CaM-kinase remmer KN-93.",
"Alternatief remde behandeling met KN-93, een selectieve remmer van CaMKII-activatie, of adenovirale overexpressie van kinase-negatieve CaMKII-delta(2), ATP-afhankelijke activatie van ERK1/2, maar had geen effect op PDBu- of PDGF-gestimuleerde ERK1/2.",
"Ca(2+)/CaM-afhankelijke proteïnekinase remmer KN-93 blokkeerde ook de verlenging van de zygote, terwijl de ineffectieve analoog KN-92 dit effect niet had.",
"CaM kinase remmer KN-93 vertoont op zichzelf weinig toxiciteit tot 10 mM, gemeten door de afgifte van lactaatdehydrogenase (LDH) in het kweekmedium.",
"Om het mechanisme van calcium-geïnduceerde ERK-activatie verder te verduidelijken, gebruikten we de CaM-kinase remmer KN-93 en een inactieve analoog van KN-93 (KN-92).",
"Harten werden voorbehandeld met de CaM kinase remmer KN-93 of de inactieve analoog KN-92 (0,5 microM) gedurende 10 minuten vóór blootstelling aan clofilium.",
"De calmoduline-afhankelijke proteïnekinase-II (CaMK-II) remmer KN-93 is aangetoond dat het muis- en menselijke cellen reversibel arresteert in de G1-fase van de celcyclus.",
"NE-geïnduceerde MAP kinase en cPLA2 activatie werden ook geremd in cellen behandeld met een CaM kinase II remmer, KN-93, of met CaM kinase II antisense oligonucleotide.",
"Een nieuwe Ca2+/calmoduline-afhankelijke proteïnekinase II (CaM Kinase II) remmer, KN-93, remt krachtig de maagzuursecretie van pariëtale cellen.",
"CaM kinase II activatie werd geremd door KN-93 voorbehandeling (IC(50) ongeveer 1 microM).",
"In vitro remde KN-93 krachtig de CaM kinase activiteit van konijn myocardium (berekende Ki",
"KN-93 remde ook de autophosphorylering van zowel de alfa- als beta-subunits van CaMKII.",
"CaM kinase II activatie werd geremd door KN-93 voorbehandeling (IC(50) ongeveer 1 microM)",
"In vitro remde KN-93 krachtig de CaM kinase activiteit van konijn myocardium (berekende Ki ≤ 2,58 microM), maar de inactieve analoog KN-92 niet (Ki > 100 microM)."
] | 426
| 412
|
120
|
Wat is het effect van Chk2 splice-varianten op de kinase-activiteit van wild-type Chk2?
|
Er is aangetoond dat Chk2 splice-varianten een dominant-negatief effect uitoefenen op de kinase-activiteit van wild-type Chk2.
|
[
"Chk2 splice-varianten vertonen een dominant-negatief effect op de kinase-activiteit van wild-type Chk2.",
"Hier hebben we de functie geëvalueerd van vier Chk2 splice-eiwitten waarvoor mRNA splice-varianten zijn geïdentificeerd in menselijke borstkankers. Deze splice-varianten werden stabiel tot expressie gebracht als nucleaire eiwitten. Twee splice-vormen (Chk2Delta4 en Chk2del(2-3)) vertoonden kinase-activiteit, terwijl de varianten Chk2Delta11 en Chk2isoI in wezen kinase-inactief waren. Onafhankelijk van intrinsieke kinase-activiteit belemmerde elke splice-variant de wild-type Chk2-activiteit via heterodimerisatie.",
"Wij suggereren alternatieve splicing als een mogelijk nieuw mechanisme voor repressie van de wild-type functie van Chk2.",
"Chk2 splice-varianten vertonen een dominant-negatief effect op de kinase-activiteit van wild-type Chk2.",
"Onafhankelijk van intrinsieke kinase-activiteit belemmerde elke splice-variant de wild-type Chk2-activiteit via heterodimerisatie.",
"Onafhankelijk van intrinsieke kinase-activiteit belemmerde elke splice-variant de wild-type Chk2-activiteit via heterodimerisatie."
] | 154
| 144
|
121
|
Noem genen die gemuteerd zijn gevonden bij CMT1A (Charcot-Marie-Tooth ziekte type 1 A).
|
PMP22 is het meest voorkomende gen dat gemuteerd is door een duplicatie bij CMT1A. Andere genen zijn MPZ en SH3TC2
|
[
"De meeste gevallen van CMT worden veroorzaakt door mutaties in PMP22,",
" structureel myeline-eiwit PMP22",
"Duplicatie van het gen dat het perifere myeline-eiwit van 22 kDa (PMP22) codeert, ligt ten grondslag aan de meest voorkomende erfelijke neuropathie, Charcot-Marie-Tooth 1A (CMT1A), een ziekte zonder bekende genezing.",
"Twee patiënten vertoonden herschikkingen in het PMP22-gen, dat vaak geassocieerd wordt met CMT1",
"Veel PMP22-mutanten hopen zich in overmaat op in het endoplasmatisch reticulum (ER) en leiden tot de erfelijke neuropathieën van Charcot-Marie-Tooth (CMT) ziekte.",
"De T118M-mutatie in het PMP22-gen wordt geassocieerd met Charcot-Marie-Tooth, type 1A (CMT1A).",
"Bij CMT1 was duplicatie van PMP22 de meest voorkomende mutatie, terwijl het tweede gen in frequentie MPZ was bij familiale gevallen en SH3TC2 bij geïsoleerde gevallen.",
"CMT1A/PMP22 duplicatie",
"De meest voorkomende subtype is type 1A (CMT1A) veroorzaakt door duplicatie in chromosoom 17p12 die PMP22 omvat."
] | 162
| 160
|
122
|
Welke virussen zijn het best bekend om myocarditis te veroorzaken?
|
De meest voorkomende virussen die myocarditis veroorzaken zijn Enterovirus, Adenovirus en Coxsackie B-virussen.
|
[
"Enterovirussen (EV) zijn een belangrijke oorzaak van neonatale ziekten, waaronder hepatitis, meningo-encefalitis en myocarditis die kunnen leiden tot overlijden of ernstige langdurige gevolgen.",
"Enterovirussen worden beschouwd als de meest voorkomende oorzaak van acute myocarditis en een mogelijke oorzaak van gedilateerde cardiomyopathie.",
"In onze studie werd het adenovirusgenoom het meest frequent aangetroffen in geëxplanteerde hartweefsels.",
"Coxsackie B-virussen (typen 1 tot 5) zijn de meest gerapporteerde oorzaak van acute virale myocarditis."
] | 94
| 87
|
123
|
Welke genen zijn geassocieerd met Cerebrale Cavernieuze Malformatie?
|
Verlies-van-functie mutaties in genen die CCM1 (ook bekend als KRIT1), CCM2 (ook bekend als OSM en malcavernin) of CCM3 (ook bekend als PDCD10) coderen veroorzaken cerebrale cavernieuze malformaties (CCM's).
|
[
"Cerebrale cavernieuze malformaties geassocieerd met meningeoom: Hoge penetrantie in een nieuwe familie met een mutatie in het PDCD10-gen",
"We schetsen een consistente associatie tussen PDCD10-mutaties en een syndroom van CCM's met meerdere meningeomen",
"Cerebrale cavernieuze malformatie (CCM) is een ziekte van vasculaire malformaties die wordt veroorzaakt door mutaties in een van drie genen: CCM1, CCM2 of CCM3",
"Om de moleculair genetische en klinische kenmerken van cerebrale cavernieuze malformaties (CCM) te bestuderen in een cohort van Spaanse patiënten. METHODEN: We analyseerden de CCM1-, CCM2- en CCM3-genen",
"Verlies-van-functie mutaties in genen die KRIT1 (ook bekend als CCM1), CCM2 (ook bekend als OSM en malcavernin) of PDCD10 (ook bekend als CCM3) coderen veroorzaken cerebrale cavernieuze malformaties (CCM's)",
"Onderzoek naar genetische varianten en moleculaire fylogenie van het gen voor cerebrale cavernieuze malformatie, CCM3/PDCD10",
"De drie genen voor cerebrale cavernieuze malformaties (CCM's), namelijk CCM1/KRIT1, CCM2/MGC4607 en CCM3/PDCD10, zijn geïdentificeerd waarbij mutaties cerebrale cavernieuze malformaties veroorzaken",
"Minstens 45% van de families die getroffen zijn door cerebrale cavernieuze malformaties draagt een mutatie in het Krev interaction trapped-1 (Krit1) gen (cerebrale cavernieuze malformatie gen-1, CCM1).",
"Mutaties in het Krev1 interaction trapped gen 1 (KRIT1) veroorzaken cerebrale cavernieuze malformatie, een autosomaal dominante ziekte gekenmerkt door malformatie van cerebrale capillairen die leidt tot cerebrale bloedingen, beroertes en epileptische aanvallen.",
"KRIT1, een gen gemuteerd bij cerebrale cavernieuze malformatie, codeert voor een microtubule-geassocieerd eiwit.",
"Germinale mutaties in het CCM1-gen, dat Krit1 codeert, veroorzaken cerebrale cavernieuze malformaties.",
"Mutaties in het programmed cell death 10-gen veroorzaken cerebrale cavernieuze malformaties.",
"Neuronale expressie van het Ccm2-gen in een nieuw muismodel van cerebrale cavernieuze malformaties.",
"Deze bevindingen documenteren een de novo germinale mutatie in het Krit1-gen die cerebrale cavernieuze malformaties veroorzaakt.",
"Cerebrale cavernieuze malformatie is een veelvoorkomende menselijke vasculaire ziekte die ontstaat door verlies-van-functie mutaties in genen die drie intracellulaire adaptor-eiwitten coderen, namelijk cerebrale cavernieuze malformaties 1-eiwit (CCM1), CCM2 en CCM3.",
"Cerebrale cavernieuze malformatie is een veelvoorkomende menselijke vasculaire ziekte die ontstaat door verlies-van-functie mutaties in genen die drie intracellulaire adaptor-eiwitten coderen, namelijk cerebrale cavernieuze malformaties 1-eiwit (CCM1), CCM2 en CCM3",
"Mutatie- en expressieanalyse van het KRIT1-gen geassocieerd met cerebrale cavernieuze malformaties (CCM1).",
"Variabele expressie van cerebrale cavernieuze malformaties bij dragers van een premature stopcodon in exon 17 van het Krit1-gen.",
"Verlies-van-functie mutaties in CCM1/KRIT1, CCM2/MGC4607 en CCM3/PDCD10 genen worden geïdentificeerd in de overgrote meerderheid van familiale gevallen met meerdere cerebrale cavernieuze malformaties (CCM's).",
"Mutaties in drie genen worden geassocieerd met CCM. Deze genen coderen voor de eiwitten KRIT1/CCM1 (krev interaction trapped 1/cerebrale cavernieuze malformaties 1), cerebrale cavernieuze malformaties 2, osmosensing scaffold voor MEKK3 (CCM2/malcavernin/OSM), en cerebrale cavernieuze malformaties 3/programmed cell death 10 (CCM3/PDCD10).",
"Minstens 45% van de families die getroffen zijn door cerebrale cavernieuze malformaties draagt een mutatie in het Krev interaction trapped-1 (Krit1) gen (cerebrale cavernieuze malformatie gen-1,",
"Uitzonderlijke agressiviteit van cerebrale cavernieuze malformatie ziekte geassocieerd met PDCD10-mutaties.",
"Een nieuwe CCM1-mutatie geassocieerd met meerdere cerebrale en wervel-cavernieuze malformaties.",
"Deze genen coderen voor de eiwitten KRIT1/CCM1 (krev interaction trapped 1/cerebrale cavernieuze malformaties 1), cerebrale cavernieuze malformaties 2, osmosensing scaffold voor MEKK3 (CCM2/malcavernin/OSM), en cerebrale cavernieuze malformaties 3/programmed cell death 10 (CCM3/PDCD10).",
"CCM1 wordt veroorzaakt door een mutatie in het KRIT1-gen en CCM2 wordt veroorzaakt door een mutatie in het MGC4607-gen, terwijl het gen voor CCM3 nog niet is geïdentificeerd.",
"Mutatie- en expressieanalyse van het KRIT1-gen geassocieerd met cerebrale cavernieuze malformaties (CCM1).",
"Minstens 45% van de families die getroffen zijn door cerebrale cavernieuze malformaties draagt een mutatie in het Krev interaction trapped-1 (Krit1) gen (cerebrale cavernieuze malformatie gen-1, CCM1).",
"KRIT1, een gen gemuteerd bij cerebrale cavernieuze malformatie, codeert voor een microtubule-geassocieerd eiwit."
] | 591
| 593
|
124
|
Is DITPA een schildklierhormoonanaloog dat wordt gebruikt in experimentele en klinische studies
|
Er is een zeer grote hoeveelheid bewijs dat DITPA een echt schildklierhormoonanaloog is, dat grotendeels wordt gebruikt in experimentele en klinische studies.
|
[
"DITPA normaliseerde het verhoogde serum T(3) en TSH wanneer de dosis 1 mg/kg · d bereikte en T(4) en rT(3) stegen naar het lagere normale bereik.",
"De identificatie van 3,5-diiodothyropropionzuur (DITPA) dat bindt aan zowel α- als β-type TR's met relatief lage affiniteit was uniek omdat deze analoog de linker ventrikel functie verbetert bij hartfalen en tevens het cholesterol verlaagt.",
"Behandeling met DITPA vermindert de acute ontstekingsreactie en verkleint de omvang van het myocardinfarct.",
"Dus DITPA-toediening schaadt de basale hartparameters bij muizen en kan fataal zijn tijdens in vivo acute myocardiale I/R.",
"DITPA verbeterde enkele hemodynamische en metabole parameters, maar er was geen bewijs voor symptomatisch voordeel bij congestief hartfalen",
"De resultaten suggereerden dat DITPA een gezonde vasculatuur kan bevorderen onafhankelijk van zijn schildkliergerelateerde metabole effecten.",
"Bovendien waren DITPA en T(4) effectief in het voorkomen van de effecten van hypothyreoïdie op de hartfunctie en BVD",
"Zowel T4 als DITPA hadden gunstige effecten op kamerremodellering, wat waarschijnlijk te wijten was aan gunstige veranderingen in celvorm en verbeterde vasculaire aanvoer.",
"De schildklieranaloog DITPA versterkt de endotheliale stikstofmonoxide- en bèta-adrenerge gemedieerde vasorelaxatie door het verhogen van stikstofmonoxide in de vasculatuur."
] | 214
| 211
|
125
|
Wat is een Tarlov-cyste?
|
Tarlov- of perineurale cysten zijn zenuwwortelcysten die het meest voorkomen op het niveau van de sacrale wervelkolom, ontstaan tussen de bedekkende lagen van het perineurium en het endoneurium nabij het dorsale wortelganglion en zijn meestal asymptomatisch.
|
[
"Zij onderging echografie, CT en uiteindelijk MRI-onderzoeken die leidden tot de diagnose van een gigantische (6,7 × 6,4 × 6,6 cm) Tarlov-cyste die afkomstig was van de rechter S-2 zenuwwortelmouw/sacraal foramen met intrapelvinale uitbreiding.",
"Hier rapporteren wij een geval van multiloculaire gedissemineerde perineurale of Tarlov-cysten (TC's).",
"TC's zijn typisch goedaardige, asymptomatische laesies die eenvoudig kunnen worden gecontroleerd.",
"Tarlov-cystesyndroom is een zeldzame, vaak asymptomatische aandoening, gekenmerkt door geïsoleerde of meerdere zenuwwortelcysten, meestal voorkomend in de sacrale wervelkolom, nabij het dorsale wortelganglion, tussen het perineurium en endoneurium.",
"Perineurale (Tarlov) cysten worden het vaakst gevonden in het sacrale gebied en zijn zeldzaam in de cervicale wervelkolom.",
"Een geval van symptomatische cervicale perineurale (Tarlov) cyste: klinische manifestatie en behandeling.",
"Tarlov-cysten of spinale perineurale cysten zijn zeldzame laesies.",
"Tarlov-cystesyndroom is een zeldzame, vaak asymptomatische aandoening, gekenmerkt door geïsoleerde of meerdere zenuwwortelcysten, meestal voorkomend in de sacrale wervelkolom, nabij het dorsale wortelganglion, tussen het perineurium en endoneurium.",
"Symptomatische sacrale perineurale (Tarlov) cysten.",
"Vervolg MRI en CT-myelografie toonden aan dat het fotopenische gebied het gevolg was van wervelerosie door een sacrale perineurale cyste (Tarlov-cyste).",
"Tarlov-cysten zijn sacrale perineurale cysten. Dit casusrapport beschrijft het klinische verloop na biopsie van een zeer grote Tarlov-cyste via laparoscopie, die preoperatief werd beschouwd als een adnexale massa.",
"Vervolg MRI en CT-myelografie toonden aan dat het fotopenische gebied het gevolg was van wervelerosie door een sacrale perineurale cyste (Tarlov-cyste).",
"Er werd vervolgens een spinale MRI-scan gemaakt die een sacrale fractuur toonde die uitmondde in een onbekende perineurale cyste (Tarlov-cyste).",
"Tarlov- of perineurale cysten zijn laesies van de zenuwwortel die het vaakst in het sacrale gebied worden gevonden. Hoewel men het erover eens is dat asymptomatische Tarlov-cysten gevolgd moeten worden, is het nog steeds onderwerp van discussie of patiënten met symptomatische Tarlov-cysten chirurgisch behandeld moeten worden.",
"Tarlov-cysten (sacrale perineurale cysten) zijn zenuwwortelcysten die het meest voorkomen in de sacrale wortels,",
"Tarlov-cysten of spinale perineurale cysten zijn zeldzame laesies.",
"Sacrale perineurale (Tarlov) cysten zijn zeldzame laesies."
] | 365
| 343
|
126
|
Wat zijn 'vildagliptine', 'sitagliptine', 'saxagliptine', 'alogliptine', 'linagliptine' en 'dutogliptine'?
|
"Sitagliptine," "vildagliptine," "saxagliptine," "alogliptine," "linagliptine," en "dutogliptine" zijn dipeptidylpeptidase-4 (DPP-4) remmers.
|
[
"De huidige meta-analyse is ontworpen om het effect van DPP-4 remmers op bloedlipiden te beoordelen, waarbij mogelijke verschillen tussen verbindingen van deze klasse worden geverifieerd. METHODEN: Een uitgebreide zoekactie in Medline en de Cochrane Library (tot en met 31 december 2010, beperkt tot gerandomiseerde klinische onderzoeken, gepubliceerd in het Engels) werd uitgevoerd voor alle onderzoeken waarin in elk veld de woorden \"sitagliptine,\" \"vildagliptine,\" \"saxagliptine,\" \"alogliptine,\" \"linagliptine,\" en/of \"dutogliptine\" voorkwamen.",
"Sitagliptine (MK-0431), Saxagliptine, Melogliptine, Linagliptine (BI-1356), Dutogliptine, Carmegliptine, Alogliptine en Vildagliptine (LAF237).",
"Bovendien bevinden linagliptine, vildagliptine en alogliptine zich momenteel in fase III ontwikkeling in de Verenigde Staten, terwijl studies met een andere DPP IV remmer, dutogliptine, zijn stopgezet (2).",
"Het testen van de therapeutische gelijkwaardigheid van alogliptine, linagliptine, saxagliptine, sitagliptine of vildagliptine als monotherapie of in combinatie met metformine bij patiënten met type 2 diabetes.",
"Het doel van deze review is om de klinische farmacokinetiek van beschikbare DPP-4 remmers (alogliptine, linagliptine, saxagliptine, sitagliptine en vildagliptine) te vergelijken met het oog op het identificeren van potentiële voorkeuren voor selectie op basis van individuele patiëntvariabelen en comorbiditeiten.",
"De lezer zal gedetailleerde farmacologische en klinische informatie verkrijgen over alogliptine, dutogliptine en linagliptine en zal leren hoe deze DPP IV remmers de gehele geneesmiddelklasse kunnen verbreden.",
"In totaal beschouwd suggereren de in dit rapport beoordeelde gegevens dat de beste algehele balans tussen potentie en de klinische farmacokinetische kenmerken van distributie, metabolisme en eliminatie mogelijk wordt waargenomen bij linagliptine, gevolgd door vildagliptine, saxagliptine, sitagliptine en alogliptine.",
"Momenteel zijn er vier DPP IV remmers beschikbaar in verschillende landen - alogliptine, sitagliptine, vildagliptine en saxagliptine (1).",
"De verschillende op de markt gebrachte of in ontwikkeling zijnde potentiële gliptines zijn gekozen om een farmacoforenmodel te bouwen, bijvoorbeeld Sitagliptine (MK-0431), Saxagliptine, Melogliptine, Linagliptine (BI-1356), Dutogliptine, Carmegliptine, Alogliptine en Vildagliptine (LAF237).",
"Momenteel zijn er vier DPP IV remmers beschikbaar in verschillende landen - alogliptine, sitagliptine, vildagliptine en saxagliptine (1).",
"Bovendien bevinden linagliptine, vildagliptine en alogliptine zich momenteel in fase III ontwikkeling in de Verenigde Staten, terwijl studies met een andere DPP IV remmer, dutogliptine, zijn stopgezet (2).",
"Onlangs rapporteerde de SAVOR TIMI-53 (Saxagliptin Assessment of Vascular Outcomes Recorded in patients with diabetes mellitus--Thrombolysis in Myocardial Infarction-53) een significante toename van het risico op ziekenhuisopnames voor hartfalen bij patiënten die met saxagliptine werden behandeld in vergelijking met placebo.",
"Van deze zijn er twee goedgekeurd voor klinisch gebruik in de Verenigde Staten: sitagliptine en saxagliptine.",
"Langdurige veiligheid en werkzaamheid van empagliflozine, sitagliptine en metformine: een actief-gecontroleerde, parallelle groep, gerandomiseerde, 78 weken durende open-label verlengingsstudie bij patiënten met type 2 diabetes.",
"Het onderzoeken van de langdurige veiligheid en werkzaamheid van empagliflozine, een natrium-glucose cotransporter 2 remmer; sitagliptine; en metformine bij patiënten met type 2 diabetes.",
"METHODEN: DATA BRONNEN: een uitgebreide zoekactie in Medline, Embase en de Cochrane Database naar 'vildagliptine', 'sitagliptine', 'saxagliptine', 'alogliptine', 'linagliptine' en 'dutogliptine' werd uitgevoerd tot 1 maart 2013.",
"ONDERZOEKSONTWERP EN METHODEN: Een uitgebreide zoekactie in Medline en Embase naar 'vildagliptine', 'sitagliptine', 'saxagliptine', 'alogliptine', 'linagliptine' en 'dutogliptine' werd uitgevoerd, waarbij alle gerandomiseerde klinische onderzoeken bij mensen tot 1 maart 2011 werden verzameld.",
"METHODEN: We voerden een zoekactie uit in MEDLINE, Embase en de Cochrane Collaborative database naar gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken (RCT's) van DPP-4 remmers en metformine als initiële combinatietherapie of als monotherapie bij patiënten met T2DM tot eind december 2012, met gebruik van de trefwoorden 'alogliptine', 'dutogliptine', 'linagliptine', 'saxagliptine', 'sitagliptine', 'vildagliptine' en 'metformine'.",
"Sitagliptine (MK-0431), Saxagliptine, Melogliptine, Linagliptine (BI-1356), Dutogliptine, Carmegliptine, Alogliptine en Vildagliptine (LAF237).",
"Het doel van de huidige meta-analyse is de systematische verzameling en synthese van informatie over behandelingsgerelateerde gevallen van acuut hartfalen beschreven in gerandomiseerde klinische onderzoeken met DPP4. DATA BRONNEN: Een uitgebreide zoekactie in Medline, Embase en de Cochrane Database naar \"vildagliptine\", \"sitagliptine\", \"saxagliptine\", \"alogliptine\", \"linagliptine\" en \"dutogliptine\" werd uitgevoerd, waarbij alle gerandomiseerde klinische onderzoeken bij mensen tot 1 oktober 2013 werden verzameld.",
"Kwantiatief model van de relatie tussen dipeptidylpeptidase-4 (DPP-4) remming en respons: meta-analyse van de werkzaamheidsresultaten van alogliptine, saxagliptine, sitagliptine en vildagliptine.",
"De dipeptidylpeptidase-4 (DPP-4) remmers linagliptine, sitagliptine, saxagliptine, vildagliptine en alogliptine worden ontwikkeld en zijn goedgekeurd voor de behandeling van type 2 diabetes.",
"Het doel van deze modelgebaseerde meta-analyse was het beschrijven van het tijdsverloop van HbA1c-respons na dosering met alogliptine (ALOG), saxagliptine (SAXA), sitagliptine (SITA) of vildagliptine (VILD).",
"Ontdekking van zeer krachtige DPP-4 remmers door hybride verbinding ontwerp gebaseerd op linagliptine en alogliptine.",
"De dipeptidylpeptidase-IV remmers sitagliptine, vildagliptine en saxagliptine belemmeren de aangeboren en adaptieve immuunresponsen niet.",
"Concluderend remde BI 1356 DPP-4 effectiever dan vildagliptine, sitagliptine, saxagliptine en alogliptine en heeft het potentieel om de eerste echt eenmaal daagse DPP-4 remmer te worden voor de behandeling van type 2 diabetes.",
"Zeer krachtige DPP-4 remmers zijn geïdentificeerd door hybride verbinding ontwerp gebaseerd op linagliptine en alogliptine.",
"DOEL: We beoordeelden de werkzaamheid van dipeptidylpeptidase-4 (DPP-4) remmers vildagliptine, sitagliptine, saxagliptine en alogliptine om het hemoglobine HbA1c-doel van <7% te bereiken bij mensen met type 2 diabetes.",
"Of de DPP-IV remmers sitagliptine, vildagliptine of saxagliptine immuunresponsen belemmeren is echter momenteel onbekend.",
"DOEL: De werkzaamheid en veiligheid van DPP-4 remmers, inclusief sitagliptine, saxagliptine, vildagliptine en linagliptine, bij type 2 diabetes beoordelen.",
"Als monotherapie toegediend voldeden linagliptine, sitagliptine en vildagliptine (maar niet saxagliptine) aan het gelijkwaardigheidscriterium wanneer ze met elkaar werden vergeleken.",
"In combinatie met metformine toegediend, toonden linagliptine, saxagliptine, sitagliptine en vildagliptine een gelijkwaardig effect, terwijl alogliptine niet aan het gelijkwaardigheidscriterium voldeed.",
"Een uitgebreide zoekactie in Medline, Embase en de Cochrane Database naar 'vildagliptine', 'sitagliptine', 'saxagliptine', 'alogliptine', 'linagliptine' en 'dutogliptine' werd uitgevoerd tot 1 maart 2013.",
"Een uitgebreide zoekactie in Medline en Embase naar 'vildagliptine', 'sitagliptine', 'saxagliptine', 'alogliptine', 'linagliptine' en 'dutogliptine' werd uitgevoerd, waarbij alle gerandomiseerde klinische onderzoeken bij mensen tot 1 maart 2011 werden verzameld.",
"Een uitgebreide zoekactie in Medline, Embase en de Cochrane Database naar \"vildagliptine\", \"sitagliptine\", \"saxagliptine\", \"alogliptine\", \"linagliptine\" en \"dutogliptine\" werd uitgevoerd, waarbij alle gerandomiseerde klinische onderzoeken bij mensen tot 1 oktober 2013 werden verzameld.",
"Saxagliptine.",
"Vildagliptine.",
"Een uitgebreide zoekactie in Medline, Embase en de Cochrane Database naar 'vildagliptine', 'sitagliptine', 'saxagliptine', 'alogliptine', 'linagliptine' en 'dutogliptine' werd uitgevoerd tot 1 maart 2013.",
"Een uitgebreide zoekactie in Medline en Embase naar 'vildagliptine', 'sitagliptine', 'saxagliptine', 'alogliptine', 'linagliptine' en 'dutogliptine' werd uitgevoerd, waarbij alle gerandomiseerde klinische onderzoeken bij mensen tot 1 maart 2011 werden verzameld.",
"Een uitgebreide zoekactie in Medline, Embase en de Cochrane Database naar \"vildagliptine\", \"sitagliptine\", \"saxagliptine\", \"alogliptine\", \"linagliptine\" en \"dutogliptine\" werd uitgevoerd, waarbij alle gerandomiseerde klinische onderzoeken bij mensen tot 1 oktober 2013 werden verzameld.",
"de woorden \"sitagliptine,\" \"vildagliptine,\" \"saxagliptine,\" \"alogliptine,\" \"linagliptine,\" en/of \"dutogliptine.\" Voltooide maar niet gepubliceerde onderzoeken werden geïdentificeerd via een zoekopdracht op de website ClinicalTrials.gov,",
"Sitagliptine (MK-0431), Saxagliptine, Melogliptine, Linagliptine (BI-1356), Dutogliptine, Carmegliptine, Alogliptine en Vildagliptine (LAF237).",
"Van deze zijn er twee goedgekeurd voor klinisch gebruik in de Verenigde Staten: sitagliptine en saxagliptine. Bovendien bevinden linagliptine, vildagliptine en alogliptine zich momenteel in fase III ontwikkeling in de Verenigde Staten, terwijl studies met een andere DPP IV remmer, dutogliptine, zijn stopgezet (2).",
"We voerden een zoekactie uit in MEDLINE, Embase en de Cochrane Collaborative database naar gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken (RCT's) van DPP-4 remmers en metformine als initiële combinatietherapie of als monotherapie bij patiënten met T2DM tot eind december 2012, met gebruik van de trefwoorden 'alogliptine', 'dutogliptine', 'linagliptine', 'saxagliptine', 'sitagliptine', 'vildagliptine' en 'metformine'.",
"Als monotherapie toegediend voldeden linagliptine, sitagliptine en vildagliptine (maar niet saxagliptine) aan het gelijkwaardigheidscriterium wanneer ze met elkaar werden vergeleken. In combinatie met metformine toegediend, toonden linagliptine, saxagliptine, sitagliptine en vildagliptine een gelijkwaardig effect, terwijl alogliptine niet aan het gelijkwaardigheidscriterium voldeed.",
"Bovendien bevinden linagliptine, vildagliptine en alogliptine zich momenteel in fase III ontwikkeling in de Verenigde Staten, terwijl studies met een andere DPP IV remmer, dutogliptine, zijn stopgezet (2). Alogliptine werd in april 2010 goedgekeurd voor gebruik in Japan onder de handelsnaam Nesina® (3).",
"Elke DPP-4 remmer (vildagliptine, sitagliptine, saxagliptine, linagliptine of alogliptine).",
"Een uitgebreide zoekactie in Medline en de Cochrane Library (tot en met 31 december 2010, beperkt tot gerandomiseerde klinische onderzoeken, gepubliceerd in het Engels) werd uitgevoerd voor alle onderzoeken waarin in elk veld de woorden \"sitagliptine,\" \"vildagliptine,\" \"saxagliptine,\" \"alogliptine,\" \"linagliptine,\" en/of \"dutogliptine\" voorkwamen. Voltooide maar niet gepubliceerde onderzoeken werden geïdentificeerd via een zoekopdracht op de website ClinicalTrials.gov, met gebruik van dezelfde trefwoorden als hierboven.",
"Een systematische review en meta-analyse van gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken (RCT's) van DPP-4 remmers (vildagliptine, sitagliptine, saxagliptine, linagliptine en alogliptine) op HbA1c werden uitgevoerd.",
"Verschillende klinische onderzoeken hebben de toevoeging van GLP-1 receptoragonisten [exenatide BID (tweemaal daags), lixisenatide, albiglutide] of DPP-4 remmers (vildagliptine, sitagliptine, saxagliptine, alogliptine, linagliptine) aan lopende insulinetherapie bestudeerd of het toevoegen van insuline aan lopende therapie met een GLP-1 receptoragonist (liraglutide).",
"Het testen van de therapeutische gelijkwaardigheid van alogliptine, linagliptine, saxagliptine, sitagliptine of vildagliptine als monotherapie of in combinatie met metformine bij patiënten met type 2 diabetes.",
"Bovendien bevinden linagliptine, vildagliptine en alogliptine zich momenteel in fase III ontwikkeling in de Verenigde Staten, terwijl studies met een andere DPP IV remmer, dutogliptine, zijn stopgezet (2).",
"Deze review vat de beschikbare gegevens samen over geneesmiddelinteracties die in de literatuur zijn gerapporteerd voor deze vijf DPP-4 remmers: sitagliptine, vildagliptine, saxagliptine, alogliptine en linagliptine."
] | 1,426
| 1,446
|
127
|
Wat is de belangrijkste prognostische sub-classificatie bij Chronische Lymfatische Leukemie?
|
De mutatiestatus van de immunoglobuline zware variabele (IGHV) genen definieert twee subsets: gemuteerde en ongemuteerde CLL. Patiënten met ongemuteerde CLL tonen een kortere progressievrije en totale overleving dan patiënten met gemuteerde CLL.
|
[
"Een van de meest betrouwbare prognostische markers bij chronische lymfatische leukemie (CLL) is de mutatiestatus van immunoglobuline zware variabele (IGHV) genen, die 2 subsets definieert, gemuteerde CLL (M-CLL) en ongemuteerde CLL (U-CLL), met verschillende klinische verloop.",
"De mutatiestatus van de immunoglobuline zware keten variabele regio's (IGHV's) van CLL-cellen biedt nuttige prognostische informatie voor hoogrisicopatiënten",
"maar tijd en economische kosten voorkwamen aanvankelijk dat het routinematig in een klinische setting werd gebruikt. In plaats daarvan worden vaak alternatieve markers van IGHV-status gebruikt, zoals zeta-geassocieerd eiwit (ZAP70) of messenger RNA-niveaus",
"Patiënten met ongemuteerde IgV(H)-genen tonen een kortere progressievrije en totale overleving dan patiënten met gemuteerde immunoglobuline zware keten variabele regio's (IgV(H))-genen"
] | 151
| 145
|
128
|
Is MammaPrint goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration?
|
Ja. MammaPrint is goedgekeurd door de FDA voor het terugkeren van borstkanker.
|
[
"Real-time RT-PCR bevestigde het 5-gen prognostische signatuur dat verschilde van een door de FDA goedgekeurd 70-gen signatuur van het MammaPrint-paneel en van het Oncotype DX terugkeerscore-assaypaneel."
] | 48
| 47
|
129
|
Is amantadine effectief voor de behandeling van bewustzijnsstoornissen?
|
Amantadine, een dopaminerge stof, is aangetoond effectief te zijn voor het induceren van herstel van bewustzijnsstoornissen. Amantadine is een veel voorgeschreven medicijn voor patiënten met langdurige bewustzijnsstoornissen na traumatisch hersenletsel. Amantadine versnelt het tempo van functioneel herstel tijdens actieve behandeling bij patiënten met posttraumatische bewustzijnsstoornissen. Hogere doseringen van amantadine kunnen worden overwogen bij hersenletsel.
|
[
"Hier bieden wij een systematisch overzicht van de therapeutische effecten van amantadine, apomorfine en zolpidem bij patiënten die herstellen van coma. Bewijs uit klinische onderzoeken met deze veel voorgeschreven farmacologische middelen suggereert positieve veranderingen in de neurologische status van patiënten, wat soms leidt tot dramatische verbeteringen.",
"Geneesmiddelen die inwerken op de zuurstofgebaseerde aminozuursystemen van de hersenen omvatten de GABAerge medicaties zolpidem en baclofen, terwijl die inwerken op de monoamine-assen de dopaminerge medicaties L-Dopa, amantadine, bromocriptine, apomorfine en methylfenidaat omvatten, en de noradrenerge en serotonerge medicaties desipramine, amitriptyline, protriptyline en fluoxetine.",
"Sporadische gevallen van herstel van een bewustzijnsstoornis (DOC) zijn gerapporteerd na toediening van verschillende farmacologische middelen (baclofen, zolpidem, amantadine, enz.).",
"Amantadine hydrochloride is een van de meest voorgeschreven medicijnen voor patiënten met langdurige bewustzijnsstoornissen na traumatisch hersenletsel. Voorlopige studies suggereren dat amantadine functioneel herstel kan bevorderen.",
"Tijdens de 4-weekse behandelperiode was het herstel significant sneller in de amantadinegroep dan in de placebogroep, gemeten met de DRS-score (verschil in helling, 0,24 punten per week; P=0,007), wat wijst op een voordeel met betrekking tot de primaire uitkomstmaat.",
"Amantadine versnelde het tempo van functioneel herstel tijdens actieve behandeling bij patiënten met posttraumatische bewustzijnsstoornissen.",
"Sporadische gevallen van dramatisch herstel van DOC na toediening van verschillende farmacologische middelen, zoals baclofen, zolpidem en amantadine, worden recent ondersteund door intrigerende wetenschappelijke observaties.",
"Volgens de 16 in aanmerking komende studies hebben medische behandelingen met dopaminerge middelen (levodopa, amantadine), zolpidem en medianuszenuwstimulatie, of chirurgische behandelingen zoals diepe hersenstimulatie, extradurale corticale stimulatie, ruggenmergstimulatie en intrathecale baclofen aangetoond het bewustzijnsniveau in bepaalde gevallen te verbeteren.",
"Hogere blootstelling aan amantadine (gemiddelde concentratie van amantadine bij 6 mg/kg/dag > 1,5 mg/L) kan geassocieerd zijn met beter herstel van het bewustzijn.",
"Op basis van de voorlopige gegevens kan hogere dosering worden overwogen bij hersenletsel.",
"Patiënten behandeld met PK-Merz vertoonden een significantere herstel van het bewustzijn en betere dynamiek (regressie) van het neurologisch tekort met het meest intensieve herstel van het neurologisch tekort op de eerste dag, wat het gebruik van amantadine sulfaat in de eerste uren van ischemische beroerte en ter preventie van reperfusieschade bij recanalisatietherapie van ischemische beroerte aanbeveelt.",
"Er was geen significant verschil in de hellingen van herstel tijdens beide behandelarmen voor de Coma/Near-Coma Scale (P = 0,24) of de Coma Recovery Scale-Revised (P = 0,28), hoewel verbeteringen in bewustzijn werden opgemerkt door de arts tijdens de weken waarin amantadine werd gegeven (P = 0,02).",
"Deze studie suggereert dat amantadine het herstel van bewustzijn bij pediatrisch verworven hersenletsel bevordert en belangrijke informatie levert die nodig is voor het ontwerpen van toekomstige meer definitieve studies.",
"De studie heeft een positief effect van dit medicijn bij het ontwaken uit coma aangetoond, wat zich uitte in klinische verbetering en een betere uitkomst van de ziekte.",
"Dit artikel zal het bewijs bespreken voor het gebruik van psychostimulantia (methylfenidaat), antidepressiva (amitriptyline, selectieve serotonineheropnameremmers en bupropion), Parkinsonmedicatie (amantadine, bromocriptine, carbidopa/levodopa), anticonvulsiva (valproïnezuur), modafinil (Provigil), lactaat, hyperbare zuurstofkamer, elektroconvulsietherapie en transmagnetische stimulatie bij patiënten na een hoofdletsel.",
"Van de psychoactieve medicaties werd amantadine hydrochloride geassocieerd met groter herstel en dantroleensodium met minder herstel, gemeten aan de hand van de DRS-score na 16 weken, maar niet met de tijd totdat opdrachten werden opgevolgd."
] | 616
| 568
|
130
|
Wat is er nodig voor MMP-eiwitten om functioneel te zijn?
|
Extracellulaire matrix metalloproteïnasen (MMP's) zijn een familie van zinkafhankelijke neutrale endopeptidasen.
|
[
"matrix metalloproteïnase (MMP)-9",
"matrix metalloproteïnase-3 (MMP-3) gen",
"matrix metalloproteïnasen (MMP's)",
"Matrix metalloproteïnase-9 (MMP-9) is een uitgescheiden glycoproteïne met een belangrijke rol in het vormen van de extracellulaire matrix en een gedetailleerd begrip van het secretie mechanisme kan helpen methoden te identificeren om ziekten te corrigeren die voortkomen uit dysregulatie van secretie.",
"Gelatinase B/matrix metalloproteïnase-9 (MMP-9) (EC 3.4.24.35) knipt vele substraten en wordt door de meeste celtypen geproduceerd als een zymogeen",
"Extracellulaire matrix metalloproteïnasen (MMP's) zijn een familie van zinkafhankelijke neutrale endopeptidasen die betrokken zijn bij fysiologische en pathologische processen, door het knippen van de extracellulaire matrix.",
"Extracellulaire matrix metalloproteïnasen (MMP's) zijn een familie van endopeptidasen die een zinkion nodig hebben op hun actieve plaats voor proteolytische activiteit."
] | 121
| 130
|
131
|
Wat is hyperosmie
|
Hyperosmie is een verhoogde reukacuïteit
|
[
"Hyperosmie wordt vermoed tijdens de zwangerschap; echter, geen enkele empirische studie met gevalideerde meetmethoden van de reukfunctie heeft de anekdotische meldingen van dit fenomeen duidelijk bevestigd.",
"Subjectieve hyperosmie wordt voornamelijk geassocieerd met negatieve geurgerelateerde ervaringen.",
"Hyperosmie is een verhoogde reukacuïteit"
] | 44
| 44
|
132
|
Wat is het aantal lange niet-coderende RNA's in het menselijk genoom
|
Verschillende schattingen plaatsen momenteel het aantal menselijke lange niet-coderende RNA's tussen 10.000 en 20.000
|
[
"De recente ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements) studie rapporteerde 9.640 lncRNA loci in het menselijk genoom, wat overeenkomt met ongeveer de helft van het aantal eiwit-coderende genen.",
"Meer dan 18.000 transcripties zijn momenteel geannoteerd als lncRNA, en omvatten eerder geannoteerde klassen van niet-coderende transcripties, waaronder grote intergene niet-coderende RNA's, antisense RNA en verwerkte pseudogenen",
"ACHTERGROND: Meer dan 10.000 lange intergene niet-coderende RNA's (lincRNA's) zijn geïdentificeerd in het menselijk genoom."
] | 93
| 90
|
133
|
Wat is de meest bekende bacterie die verantwoordelijk is voor botulisme (worstvergiftiging)?
|
Botulisme is een ernstige neuroparalytische ziekte veroorzaakt door botulinum neurotoxine (BoNT), en treft mensen, alle warmbloedige dieren, vogels en sommige vissen. Botulinumtoxine wordt onder anaerobe omstandigheden geproduceerd door de bacterie Clostridium botulinum, die het meest bekende etiologische agens van de ziekte is, en enkele andere clostridia, en is een van de gevaarlijkste toxines ter wereld.
|
[
"Botulisme is een ernstige voedselgerelateerde neuroparalytische ziekte, veroorzaakt door botulinum neurotoxine (BoNT), geproduceerd door de anaerobe bacterie Clostridium botulinum.",
"Rundveebotulisme is een fatale intoxicatie veroorzaakt door botulinum neurotoxines (BoNTs) geproduceerd door Clostridium botulinum serotypen C en D",
"Botulisme bij paarden in de VS wordt toegeschreven aan Clostridium botulinum types A, B of C.",
"Clostridium botulinum is het etiologische agens van botulisme. Vanwege voedselvergiftiging en het potentiële gebruik van het extreem toxische botulinum neurotoxine (BoNT) van C. botulinum",
"Botulisme is een ernstige neuroparalytische ziekte veroorzaakt door toxines van Clostridium botulinum. Botulinumtoxine wordt onder anaerobe omstandigheden geproduceerd en is een van de gevaarlijkste toxines ter wereld.",
"Botulisme is een neuroparalytische ziekte die kan voorkomen bij alle warmbloedige dieren, vogels en vissen. De ziekte bij dieren wordt voornamelijk veroorzaakt door toxines geproduceerd door Clostridium botulinum stammen behorend tot groep III, hoewel uitbraken door toxines geproduceerd door organismen uit groep I en II zijn erkend.",
"Botulisme is een ernstige neuroparalytische ziekte die mensen, alle warmbloedige dieren en sommige vissen treft. De ziekte wordt veroorzaakt door blootstelling aan toxines geproduceerd door Clostridium botulinum en andere botulinum toxine-producerende clostridia.",
"De botulinum neurotoxines (BoNTs) geproduceerd door verschillende stammen van de bacterie Clostridium botulinum zijn verantwoordelijk voor de ziekte botulisme en omvatten een groep immunologisch verschillende serotypen (A, B, E en F) die worden beschouwd als de meest dodelijke natuurlijke eiwitten die bekend zijn voor mensen.",
"Botulinumtoxine (BTX) is een neurotoxine geproduceerd door Clostridium botulinum onder anaerobe omstandigheden en is verantwoordelijk voor botulisme, een meldingsplichtige bacteriële vorm van voedselvergiftiging.",
"Botulisme is een ziekte die wordt gekenmerkt door neuromusculaire verlamming en wordt veroorzaakt door botulinum neurotoxines (BoNTs) die voorkomen in de Gram-positieve bacterie Clostridium botulinum.",
"Een epidemiologisch onderzoek en laboratoriumdetectiestudies toonden aan dat worst besmet met type A Clostridium botulinum deze uitbraak van voedselvergiftiging veroorzaakte.",
"Botulisme wordt veroorzaakt door botulinum neurotoxine geproduceerd door de bacterie Clostridium botulinum.",
"Botulinumtoxine (BTX) is een neurotoxine geproduceerd door Clostridium botulinum onder anaerobe omstandigheden en is verantwoordelijk voor botulisme, een meldingsplichtige bacteriële vorm van voedselvergiftiging."
] | 394
| 384
|
134
|
Wat is de associatie van spermidine met α-synucleïne neurotoxiciteit?
|
Spermidine beschermt tegen α-synucleïne neurotoxiciteit. Bij de fruitvlieg remde eenvoudige voeding met spermidine het verlies van klimactiviteit en vroegtijdige organismale dood bij heterologe expressie van menselijke α-synucleïne, waarvan wordt gedacht dat het de belangrijkste toxische trigger is van de ziekte van Parkinson (ZP). In deze lijn herstelde toediening van spermidine het door α-synucleïne geïnduceerde verlies van dopaminerge neuronen, een kenmerk van ZP, bij nematoden. Verlichting van ZP-gerelateerde neurodegeneratie door spermidine ging gepaard met inductie van autofagie, wat suggereert dat dit cytoprotectieve proces verantwoordelijk kan zijn voor de gunstige effecten van spermidine-toediening.
|
[
"Spermidine beschermt tegen α-synucleïne neurotoxiciteit.",
"Hier tonen we aan dat toediening van de van nature voorkomende polyamine spermidine, die continu afneemt tijdens het verouderingsproces bij verschillende soorten, een reeks ZP-gerelateerde degeneratieve processen verlicht in de fruitvlieg Drosophila melanogaster en de nematode Caenorhabditis elegans, twee gevestigde modelsystemen voor ZP-pathologie. Bij de fruitvlieg remde eenvoudige voeding met spermidine het verlies van klimactiviteit en vroegtijdige organismale dood bij heterologe expressie van menselijke α-synucleïne, waarvan wordt gedacht dat het de belangrijkste toxische trigger is van ZP. In deze lijn herstelde toediening van spermidine het door α-synucleïne geïnduceerde verlies van dopaminerge neuronen, een kenmerk van ZP, bij nematoden. Verlichting van ZP-gerelateerde neurodegeneratie door spermidine ging gepaard met inductie van autofagie, wat suggereert dat dit cytoprotectieve proces verantwoordelijk kan zijn voor de gunstige effecten van spermidine-toediening.",
"Spermidine beschermt tegen α-synucleïne neurotoxiciteit",
"Bij de fruitvlieg remde eenvoudige voeding met spermidine het verlies van klimactiviteit en vroegtijdige organismale dood bij heterologe expressie van menselijke α-synucleïne, waarvan wordt gedacht dat het de belangrijkste toxische trigger is van ZP. In deze lijn herstelde toediening van spermidine het door α-synucleïne geïnduceerde verlies van dopaminerge neuronen, een kenmerk van ZP, bij nematoden",
"Samen met het feit dat spermidine de late stadia van α-Syn aggregatie faciliteert, tonen onze gegevens aan dat spermidine de zeer vroege stadia van eiwitaggregatie bevordert, inclusief α-Syn misvouwing en dimerisatie. Deze bevinding suggereert dat verhoogde niveaus van spermidine en mogelijk andere polyaminen het ziektegerelateerde proces van α-Syn kunnen initiëren."
] | 323
| 334
|
135
|
Lijst van symptomen van 4H leukodystrofie.
|
Hypomyelinisatie, hypodontie en hypogonadotroop hypogonadisme zijn de belangrijkste symptomen van 4H leukodystrofie.
|
[
"MRI toonde diffuse cerebrale hypomyelinisatie, cerebellaire atrofie en een dun corpus callosum; röntgenfoto toonde blijvende melktanden en hypoplastische kronen en wortels (figuur), indicatief voor het 4H-syndroom (hypomyelinisatie, hypodontie, hypogonadotroop hypogonadisme).",
"4H-syndroom is een zeldzame en onderscheidende leukodystrofie gekenmerkt door hypomyelinisatie, hypogonadotroop hypogonadisme en hypodontie.",
"Het 4H-syndroom (hypomyelinisatie, hypodontie, hypogonadotroop hypogonadisme) is een recent erkende leukodystrofie.",
"De vijf overlappende klinische fenotypes (voorheen als afzonderlijke entiteiten beschreven voordat hun moleculaire basis bekend was) omvatten: Hypomyelinisatie, hypodontie, hypogonadotroop hypogonadisme (4H-syndroom); Ataxie, vertraagde dentitie en hypomyelinisatie (ADDH); Tremor-ataxie met centrale hypomyelinisatie (TACH); Leukodystrofie met oligodontie (LO); en Hypomyelinisatie met cerebellaire atrofie en hypoplasie van het corpus callosum (HCAHC).",
"DOEL: Het rapporteren van een nieuwe klinische en genetische presentatie van een patiënt met 4H-syndroom, een recent beschreven leukodystrofiesyndroom gekenmerkt door ataxie, hypomyelinisatie, hypodontie en hypogonadotroop hypogonadisme.",
"Omdat deze families werden gelokaliseerd op hetzelfde locus als leukodystrofie met oligodontie (LO) en klinische en radiologische overlap vertoonden met personen met hypomyelinisatie, hypodontie en hypogonadotroop hypogonadisme (4H) syndroom, hebben we dit gen gesequenced bij negen personen met 4H en acht met LO.",
"DOEL: Het rapporteren van een patiënt met langzaam progressieve encefalopathie, ataxie, centrale hypomyelinisatie, hypodontie en hypogonadotroop hypogonadisme, het 4H-syndroom.",
"4H-syndroom is een zeldzame en onderscheidende leukodystrofie gekenmerkt door hypomyelinisatie, hypogonadotroop hypogonadisme en hypodontie.",
"Omdat deze families werden gelokaliseerd op hetzelfde locus als leukodystrofie met oligodontie (LO) en klinische en radiologische overlap vertoonden met personen met hypomyelinisatie, hypodontie en hypogonadotroop hypogonadisme (4H) syndroom, hebben we dit gen gesequenced bij negen personen met 4H en acht met LO.",
"MRI toonde diffuse cerebrale hypomyelinisatie, cerebellaire atrofie en een dun corpus callosum; röntgenfoto toonde blijvende melktanden en hypoplastische kronen en wortels (figuur), indicatief voor het 4H-syndroom (hypomyelinisatie, hypodontie, hypogonadotroop hypogonadisme).",
"Omdat deze families werden gelokaliseerd op hetzelfde locus als leukodystrofie met oligodontie (LO) en klinische en radiologische overlap vertoonden met personen met hypomyelinisatie, hypodontie en hypogonadotroop hypogonadisme (4H) syndroom, hebben we dit gen gesequenced bij negen personen met 4H en acht met LO.",
"Het 4H-syndroom (hypomyelinisatie, hypodontie, hypogonadotroop hypogonadisme) is een recent erkende leukodystrofie.",
"4H-syndroom is een zeldzame en onderscheidende leukodystrofie gekenmerkt door hypomyelinisatie, hypogonadotroop hypogonadisme en hypodontie."
] | 360
| 352
|
136
|
Wat is de extracellulaire kern "matrisoom"?
|
Het "matrisoom" wordt gedefinieerd als het geheel van extracellulaire matrixeiwitten (ECM) en bijbehorende factoren. Het kernmatrisoom is bij zoogdieren gedefinieerd door de analyse van volledige genomen en bestaat uit ongeveer 300 eiwitten.
|
[
"Meer dan 300 ECM-moleculen zijn gedefinieerd als behorend tot het \"kernmatrisoom\" bij zoogdieren door de analyse van volledige genomen.",
"De voltooiing van genoomsequenties voor veel organismen maakt een redelijk volledige definitie mogelijk van het complement van extracellulaire matrix (ECM) eiwitten. Bij zoogdieren omvat dit \"kernmatrisoom\" ongeveer 300 eiwitten.",
"We hebben een bio-informatica benadering ontwikkeld om het in silico \"matrisoom\" te voorspellen, gedefinieerd als het geheel van ECM-eiwitten en bijbehorende factoren."
] | 113
| 104
|
137
|
Is GAGA geassocieerd met nucleosoomvrije gebieden (NFR)?
|
De GAGA-factor is een eiwit dat bekend staat om betrokken te zijn bij de vorming en/of het onderhoud van nucleosoomvrije gebieden van chromatine. De interacties van de GAGA-factor en de heat shock-factor met hun bindingsplaatsen in chromatine vonden op twee manieren plaats. Hun interactie met bindingsplaatsen in de nucleosoomvrije gebieden vereiste geen ATP. In aanwezigheid van ATP interageerden beide factoren ook met nucleosomale bindingsplaatsen, wat leidde tot herschikkingen van nucleosomen en een verfijning van nucleosoomposities. Hoewel chromatine-remodellering bij interactie met transcriptiefactoren eerder werd geïnterpreteerd als nucleosoomverstoring, suggereren de gegevens energie-afhankelijke nucleosoomverschuiving als het hoofdprincipe van chromatineherorganisatie.
|
[
"Een van de drie nuclease-hypersensitieve sites in de Fab-7 grens, HS1, bevat meerdere consensus-bindingssequenties voor de GAGA-factor, een eiwit dat bekend staat om betrokken te zijn bij de vorming en/of het onderhoud van nucleosoomvrije gebieden van chromatine.",
"De HS3-sequentie bevat consensus-bindingsplaatsen voor de GAGA-factor, een eiwit dat betrokken is bij de vorming van nucleosoomvrije gebieden van chromatine, en Pleiohomeotic (Pho), een Polycomb-groepeiwit dat verwant is aan de mammaire transcriptiefactor YY1.",
"De interacties van de GAGA-factor en heat shock-factor met hun bindingsplaatsen in chromatine vonden op twee manieren plaats. Hun interactie met bindingsplaatsen in de nucleosoomvrije gebieden vereiste geen ATP. In aanwezigheid van ATP interageerden beide factoren ook met nucleosomale bindingsplaatsen, wat leidde tot herschikkingen van nucleosomen en een verfijning van nucleosoomposities",
"Hoewel chromatine-remodellering bij interactie met transcriptiefactoren eerder werd geïnterpreteerd als nucleosoomverstoring, suggereren de gegevens energie-afhankelijke nucleosoomverschuiving als het hoofdprincipe van chromatineherorganisatie.",
"Deze (CT)n herhalingen zijn in vivo geassocieerd met een niet-histon-eiwit(en) en worden in vitro gebonden door een gezuiverd Drosophila-eiwit, de GAGA-factor.",
"Dit (CT)n element lijkt bij te dragen aan de vorming van de wild-type chromatinestructuur van hsp26, een georganiseerde nucleosoomreeks die de HSE's in nucleosoomvrije, DNase I-hypersensitieve (DH) site laat.",
"De HS3-sequentie bevat consensus-bindingsplaatsen voor de GAGA-factor, een eiwit dat betrokken is bij de vorming van nucleosoomvrije gebieden van chromatine, en Pleiohomeotic (Pho), een Polycomb-groepeiwit dat verwant is aan de mammaire transcriptiefactor YY1.",
"Een van de drie nuclease-hypersensitieve sites in de Fab-7 grens, HS1, bevat meerdere consensus-bindingssequenties voor de GAGA-factor, een eiwit dat bekend staat om betrokken te zijn bij de vorming en/of het onderhoud van nucleosoomvrije gebieden van chromatine.",
"Het iab-7 polycomb-respons-element bevindt zich in een nucleosoomvrij gebied van chromatine en vereist zowel GAGA als pleiohomeotic voor silenceringactiviteit.",
"De HS3-sequentie bevat consensus-bindingsplaatsen voor de GAGA-factor, een eiwit dat betrokken is bij de vorming van nucleosoomvrije gebieden van chromatine, en Pleiohomeotic (Pho), een Polycomb-groepeiwit dat verwant is aan de mammaire transcriptiefactor YY1."
] | 440
| 406
|
138
|
Welke zijn de plant DNA (cytosine-5) methyltransferase families?
|
De plant DNA (cytosine-5) methyltransferases worden ingedeeld in de families: MET, CMT en de de novo DRM.
|
[
"De topologieën van de bomen waren over het algemeen congruent: vier monofyletische groepen die overeenkomen met de vier plant C5-MTase families werden duidelijk onderscheiden. Daarnaast werden sequentieanalyses uitgevoerd van de plant C5-MTase target herkenningsdomein sequenties en werden fylogenetische bomen gereconstrueerd die aantoonden dat er een goede conservatie is tussen, maar niet binnen de plant C5-MTase families.",
"Om de overerving van DNA methyltransferase genen en hun expressiepatronen te bepalen, onderzochten we drie belangrijke DNA methyltransferase families (MET1, CMT3 en DRM) van tabak en de voorouderlijke soorten.",
"Het vergelijkend onderzoek van transcriptieniveaus van verschillende genen van de cytosine DNA methyltransferase familie MET (MET1, MET2a, MET2b, MET3) en hun methylatiepatronen toont aan dat er mogelijk mechanismen bestaan die het meest actief getranscribeerde gen MET1 van deze familie beschermen tegen methylatie-gemedieerde silencering. In tegenstelling tot het DRM2 gen konden we geen adenine-gemethyleerde GATC sites vinden in het MET1 gen.",
"Met behulp van het 1kb 3' terminale DNA-fragment van de muis methyltransferase cDNA als probe en lage stringente hybridisatiecondities, werd een nieuwe potentiële methyltransferase (MTase) genfamilie geïsoleerd uit een Arabidopsis thaliana genomische DNA-bibliotheek.",
"De Dnmt3 familie van de novo DNA methyltransferases is recentelijk gekarakteriseerd in dieren. Hier beschrijven we DNA methyltransferase genen van zowel Arabidopsis als maïs die een hoog niveau van sequentiegelijkheid vertonen met Dnmt3, wat suggereert dat ze plant de novo methyltransferases coderen. Ten opzichte van alle bekende eukaryote methyltransferases bevatten deze planteneiwitten een nieuwe rangschikking van de motieven die nodig zijn voor de katalytische activiteit van DNA methyltransferase.",
"Deze resultaten leveren de eerste directe demonstratie dat DNA-METases van een hogere eukaryoot gecodeerd worden door een genfamilie.",
"Hier tonen we aan dat Arabidopsis DNA methyltransferase2 (AtDNMT2) gelokaliseerd is in de kern en geassocieerd is met histon deacetylatie.",
"Om mogelijke relaties tussen DNA methylatieniveau en accumulatie van DNA-(cytosine-5) methyltransferase (DNMT) transcripties te onderzoeken, zijn de volledige coderende sequenties die overeenkomen met drie verschillende DNMT families in oliepalm, namelijk de MET, CMT en DRM klassen, geïsoleerd en gekarakteriseerd.",
"In Arabidopsis zijn een SWI2/SNF2 chromatin remodeling factor-gerelateerd eiwit DDM1 en een cytosine methyltransferase MET1 vereist voor het behoud van genomische cytosine methylatie.",
"Ten opzichte van alle bekende eukaryote methyltransferases bevatten deze planteneiwitten een nieuwe rangschikking van de motieven die nodig zijn voor de katalytische activiteit van DNA methyltransferase.",
"In de huidige studie worden de isolatie en karakterisering van twee verschillende cDNAs die coderen voor wortel DNA (cytosine-5)-methyltransferase (DNA-METase) gerapporteerd.",
"De Arabidopsis methylase heeft acht van de tien geconserveerde sequentiemotieven die gevonden worden in prokaryote cytosine-5 methyltransferases en vertoont 50% homologe aan het muizen enzym in het methyltransferase domein.",
"Zoals afgeleid uit de DNA-sequentie bevat dit eiwit alle geconserveerde sequentiemotieven specifiek voor de 5m cytosine MTases."
] | 444
| 450
|
139
|
Waar is het histonvariant CENPA bij voorkeur gelokaliseerd?
|
Centromeer-eiwit A (Cenpa voor muizen, CENP-A voor andere soorten) is een essentieel histon H3-achtig eiwit dat zich lokaliseert in het centromeergebied van eukaryote chromosomen, waar het het conventionele histon H3 vervangt en samen met centromeerspecifieke DNA-bindende factoren de assemblage van actieve kinetochoren aanstuurt.
|
[
"centromeer-eiwit A (CENPA),",
"De centromeeractiviteit van de alphoid YAC werd onderdrukt op ectopische locaties op het gastheerschromosoom, zoals blijkt uit de afwezige of verminderde assemblage van CENP-A en -C.",
"Heterozygote en homozygote Cenpa-GFP fusie-eiwit muismutanten, gegenereerd door gerichte insertie van het gen voor groene fluorescerende eiwit (GFP) in het muis Cenpa-genlocus, vertonen specifieke gelokaliseerde fluorescentie op alle centromeren.",
"Co-immunoprecipitatie-assay toont interactie aan tussen PARP-2 en zijn functionele homoloog PARP-1, constitutieve centromeereiwitten Cenpa en Cenpb, en het spoelfoutcontrole-eiwit Bub3, maar niet met een derde constitutief centromeereiwit Cenpc.",
"Hier onderzochten we de interactie van dit eiwit met, en poly(ADP-ribosyl)atie van, drie constitutieve centromeereiwitten, Cenpa, Cenpb en Cenpc, en een spoelfoutcontrole-eiwit, Bub3",
"Het bewijs is consistent met het voorstel van een cruciale epigenetische functie voor CENP-A bij het markeren van een chromosomale regio voor centromeervorming",
"CENPA is een lid van de histon H3-achtige eiwitten en wordt verondersteld histon H3 te vervangen in centromeer-nucleosomen. CENPC is een DNA-bindend eiwit dat zich bevindt op de binnenste kinetochorplaat van actieve zoogdiercentromeren.",
"ENPA/Cse4 assembleert centromeerchromatine op diverse DNA",
"constitutieve kinetochore-eiwitten zoals CENPA",
"Een specifiek histon H3-variant, CENPA, vervangt conventioneel histon H3 en stuurt samen met centromeerspecifieke DNA-bindende factoren de assemblage van actieve kinetochoren aan"
] | 251
| 237
|
140
|
In welke eiwitten is het chromodomein aanwezig?
|
Het chromodomein (chromatine-organizer modifier domein) is een sterk geconserveerd motief van 40-50 aminozuren lang, aanwezig in een breed scala aan dierlijke en plantaardige eiwitten die betrokken zijn bij chromatineorganisatie. Eiwitten die chromodomeinen bevatten kunnen worden ingedeeld in bredere families, met name op basis van de aanwezigheid van andere typen domeinen. Chromodomein is aanwezig in: de heterochromatine-eiwitten HP1 alfa en HP1 bèta, chromointegrases (bijv. Tf1 integrase), de chromodomein helicase DNA-bindende eiwitten (CHD) en CHD1-achtige (CHD1L), CReMM (chromatine-gerelateerde mesenchymale modulator), DNA-methyltransferase 3 (cmt3), de chromointegrase van LTR-retrotransposons, de Polycomb-groep (PcG) eiwitten, de muis Polycomb-homologen (Cbx2, Cbx4, Cbx6, Cbx7, Cbx8), de chromodomein Y-chromosoom (CDY) familie van eiwitten en het CDY-achtige eiwit (CDYL), de histon-acetyltransferases TgMYST-A en –B, MRG-1 en -15 (MORF4-gerelateerd gen op chromosoom 15), ADP/ATP-translocase 1, MPP8, MSL3, NlMof, Chp1, Chriz, dMi-2, Corto, cpSRP43, KISMET, PICKLE (PKL), ScoHET1 en ScoHET2.
|
[
"Chromodomein helicase DNA-bindend eiwit 2 beïnvloedt de reparatie van door röntgen- en UV-straling geïnduceerde DNA-schade.",
"Chromodomein helicase DNA-bindende eiwitten (CHD) behoren tot een groep sterk geconserveerde chromatine-remodellerende eiwitten die betrokken zijn bij de regulatie van transcriptie. Om de fysiologische rol van een van de CHD-leden in een zoogdiermodel te begrijpen, ontwikkelden we een mutante muismodel voor het Chd2-gen.",
"Kristalstructuur van het DNA-bindende domein van chromodomein helicase DNA-bindend eiwit 1 (Chd1) in complex met DNA.",
"Omdat DNA-methylatie in planten kan dienen als signaal voor H3-lysine9-dimethylatie (H3K9me2) en vervolgens voor DNA-methylatie buiten de CG-context, werden mutaties in SET-domein histonmethyltransferase en chromodomein DNA-methyltransferase 3 (cmt3) geïntrogreerd. In suvh4 suvh5 suvh6 en cmt3 mutanten is H3K9me2 geassocieerd met lacO herhalingen verminderd, maar homologe paring blijft bestaan.",
"Mutaties in CHD7, het gen dat codeert voor chromodomein helicase DNA-bindend eiwit 7, zijn aanwezig bij 60-80% van de individuen met het CHARGE-syndroom.",
"Chromodomein is aanwezig in de integrasestructuren van blastopia en 412 subgroep LTR-retrotransposons en kan het proces van niet-specifieke integratie vergemakkelijken.",
"Het CHARGE-syndroom is een meervoudig aangeboren malformatiesyndroom dat meestal het gevolg is van deletie of heterozygote verlies-van-functie mutaties in het chromodomein helicase DNA-bindend eiwit 7 (CHD7) gen op 8q12.1.",
"Een causale mutatie binnen het chromodomein helicase DNA-bindend eiwit-7 gen, dat een belangrijke rol speelt in de embryonale ontwikkeling, is aanwezig bij 2/3 van de getroffen patiënten.",
"CHD1 is een subfamilielid van de CHD-familie, die een chromodomein, een helicase-domein en een DNA-bindend domein bezit.",
"Het chromatine-organizer modifier domein (chromodomein) is aanwezig in eiwitten die bijdragen aan chromatineorganisatie en hun binding aan gemethyleerd histon H3 mediëren.",
"Massaspectrometrische analyse toonde serine-42, een geconserveerd aminozuur in het chromodomein, aan als een fosforyleringsplaats van Cbx2. Fosforylering van het chromodomein van Cbx2 op dit residu in vitro resulteerde in een verminderde binding aan een H3-peptide met getrimethyleerde lysine-9 en een toename van de binding aan een H3-peptide met getrimethyleerde lysine-27, wat suggereert dat dergelijke fosforylering de bindingsspecificiteit van Cbx2 voor gemodificeerd histon H3 verandert. Fosforylering van het chromodomein van Cbx2 kan daarom dienen als een moleculaire schakel die de interpretatie van de histonmodificatiecode beïnvloedt en daarmee de epigenetische cellulaire geheugenregeling.",
"Hier identificeren we de ATP-afhankelijke chromatine-remodellerende factor chromodomein helicase DNA-bindend eiwit 8 (CHD8) als een nieuwe coregulator van androgeen-responsieve transcriptie.",
"Mutaties in CHD7, een chromodomein-gen, zijn aanwezig bij de meerderheid van de individuen met het CHARGE-syndroom, een meervoudige anomalie aandoening gekenmerkt door oculaire coloboma, hartafwijkingen, atresie van de choanae, vertraagde groei en ontwikkeling, genitale hypoplasie en oorafwijkingen.",
"Twee nieuwe chromodomein-bevattende eiwitten die associëren met heterochromatine in Sciara coprophila chromosomen.",
"Beide eiwitten, ScoHET1 van 37 kDa en ScoHET2 van 44 kDa, vertonen twee chromodomeinmotieven die de geconserveerde residuen bevatten die essentieel zijn voor de herkenning van gemethyleerd histon H3 op lysine 9.",
"In deze studie presenteren we een gedetailleerde histomorfologische karakterisering van muizen met een mutatie in het chromodomein helicase DNA-bindend eiwit 2 (Chd2).",
"Specificiteit van de chromodomein Y-chromosoom familie van chromodomeinen voor lysine-gemethyleerde ARK(S/T) motieven.",
"Eerdere studies hebben aangetoond dat twee homologue chromodomeinmodules in de HP1 en Polycomb-eiwitten onderscheidende binding vertonen aan verwante methyllysine-residuen (ingebed in ARKS-motieven) van de histon H3-staart.",
"Bij gewervelden zijn HP1-achtige chromodomeinen ook aanwezig in de chromodomein Y-chromosoom (CDY) familie van eiwitten naast een vermoedelijk katalytisch motief. Het menselijk genoom codeert voor drie CDY-familie-eiwitten, CDY, CDYL en CDYL2.",
"Het CDY chromodomein vertoont onderscheidende binding aan lysine-gemethyleerde ARK(S/T) motieven, terwijl het CDYL2 chromodomein met vergelijkbare sterkte bindt aan meerdere ARK(S/T) motieven. Interessant genoeg verhinderen subtiele aminozuurveranderingen in het CDYL chromodomein dergelijke bindingsinteracties in vitro en in vivo.",
"We bepaalden de mRNA-transcriptenhoeveelheid van zeven genen die coderen voor eiwitten met gevestigde rollen in epigenetisch-gemedieerde genstillegging [transcriptie co-repressor SIN3A, DNA (cytosine-5-) methyltransferase 1, methyl CpG-bindend eiwit 2, chromodomein helicase DNA-bindend eiwit 4, histon-bindend eiwit rbbp4, histon deacetylase 1 en nucleair receptor co-repressor 2] met behulp van qRT-PCR.",
"CHD7 is een lid van de chromodomein helicase DNA-bindend domein (CHD) familie van ATP-afhankelijke chromatine-remodellerende enzymen.",
"De cysteïnerijke CXXC-domeinen van MBD1 binden aan Ring1b en het chromodomein van hPc2.",
"Methylatie van lysine 9 binnen histon H3 en de daaropvolgende binding van het chromodomeineiwit heterochromatine-eiwit 1 (HP1) worden verondersteld heterochromatinevorming in vivo te initiëren en een heterochromatische toestand te propaganderen die meerdere celdelingen duurt.",
"Hier tonen we aan dat het SNF2-achtige chromodomein helicase-eiwit CHD8 interacteert met het insulator-bindende eiwit CTCF.",
"Het chromodomein (CD) van het Drosophila Polycomb-eiwit vertoont een voorkeur voor binding aan histon H3 wanneer deze getrimethyleerd is op lysine 27.",
"Ondanks een hoge mate van conservatie vertonen de Cbx chromodomeinen significante verschillen in bindingsvoorkeuren.",
"Driedimensionale oplossingsstructuren van de chromodomeinen van cpSRP43.",
"Recentelijk zijn drie functioneel verschillende chromodomeinen (CD's) geïdentificeerd in cpSRP43.",
"Het C-terminale helicale segment dat typisch wordt gevonden in de nucleaire chromodomeinen ontbreekt in CD1.",
"Kritische vergelijking van de structuren van de chromodomeinen van cpSRP43 met die in nucleaire chromodomeineiwitten onthulde dat de diverse eiwit-eiwitinteracties die door de CD's worden gemedieerd voort lijken te komen uit verschillen in de oppervlakte-ladingspotentiaal van elk CD.",
"Karakterisering en functionele analyse van CReMM, een nieuw chromodomein helicase DNA-bindend eiwit.",
"De huidige studie beschrijft een nieuw geïdentificeerd eiwit genaamd CReMM (chromatine-gerelateerde mesenchymale modulator). Het eiwit werd bestudeerd met bio-informatica en geclassificeerd als lid van de derde subfamilie van chromodomein helicase DNA-bindende eiwitten (CHD). In silico vertaling definieerde CReMM als een meervoudig domeineiwit inclusief twee chromodomeinen, SNF2/ATPase, helicase C-domein en een A/T-DNA-bindend domein (DBD).",
"Identificatie en analyse van chromodomein-bevattende eiwitten gecodeerd in het muizentranscriptoom.",
"Het chromodomein is 40-50 aminozuren lang en geconserveerd in een breed scala aan chromatische en regulerende eiwitten die betrokken zijn bij chromatine-remodellering. Eiwitten met chromodomeinen kunnen worden ingedeeld in families op basis van hun bredere kenmerken, met name de aanwezigheid van andere typen domeinen, die correleren met verschillende subklassen van de chromodomeinen zelf.",
"Hier tonen we aan dat het chromodomein van CMT3 direct kan interageren met de N-terminale staart van histon H3, maar alleen wanneer deze gelijktijdig gemethyleerd is op zowel de H3K9- als H3K27-posities.",
"Naast het canonieke MYST HAT katalytische domein bezitten zowel TgMYST-A als -B een atypische C2HC-zinkvinger en een chromodomein.",
"Clr7 en Clr8 zijn vereist voor de lokalisatie van het Swi6 chromodomeineiwit en voor histon H3 lysine 9 methylatie, waarmee niet alleen de wisseling van het paringstype wordt beïnvloed, maar ook transcriptiestillegging in alle eerder gekarakteriseerde heterochromatische regio's, chromosoomsegregatie en meiotische recombinatie in het paringstypegebied.",
"MRG15, een nieuw chromodomeineiwit, is aanwezig in twee verschillende multiproteïnecomplexen die betrokken zijn bij transcriptieactivatie.",
"MRG15 is een nieuw chromodomeineiwit dat lid is van een familie genen gerelateerd aan MORF4. MORF4 (mortality factor op chromosoom 4) induceert senescentie in een subset van menselijke tumorcelijnen.",
"Analyse van deletiemutanten van MRG15 toonde aan dat de leucine-rits aan het C-terminale uiteinde van MRG15 belangrijk was voor de eiwitassociaties in MAF1 en dat het N-terminale chromodomein vereist was voor de assemblage van het MAF2-eiwitcomplex. Consistent met deze gegevens was het feit dat een histon-acetyltransferase-activiteit geassocieerd met MRG15 verloren ging wanneer het chromodomein werd verwijderd en dat beide mutante MRG15-eiwitten er niet in slaagden de B-myb-promotor te activeren. De verschillende mechanismen waarmee MRG15 genexpressie kan activeren worden besproken.",
"Het chromodomein (CD) is een sterk geconserveerd motief aanwezig in diverse dierlijke en plantaardige eiwitten, en de waarschijnlijke rol is het assembleren van diverse macromoleculaire complexen in chromatine.",
"Structuur van HP1 chromodomein gebonden aan een lysine 9-gemethyleerde histon H3-staart.",
"Het chromodomein van de HP1-familie eiwitten herkent histonstaarten met specifiek gemethyleerde lysines. Hier presenteren we structurele, energetische en mutatieanalyses van het complex tussen het Drosophila HP1 chromodomein en de histon H3-staart met een methyllysine op residu 9, een modificatie geassocieerd met epigenetische stillegging. De histonstaart schuift in als een beta-streng, waarmee de beta-sandwich architectuur van het chromodomein wordt voltooid. De methylammoniumgroep wordt omsloten door drie aromatische zijketens, terwijl aangrenzende residuen onderscheidende contacten vormen met één zijde van het chromodomein.",
"Het MORF4-gerelateerde gen op chromosoom 15 (MRG15) is lid van een nieuwe genfamilie die oorspronkelijk werd geïdentificeerd in studies naar factoren die cel-senescentie induceren. MRG15 bevat verschillende voorspelde eiwitmotieven, waaronder een nucleair lokalisatiesignaal, een helix-loop-helix regio, een leucine-rits en een chromodomein.",
"Vier allelen van dMi-2 mutanten werden verder gekarakteriseerd in moleculaire aard; dMi-2(BL1) bleek een mutatie te hebben in het ATP-bindingsmotief van het ATPase-domein, dMi-2(BL7) in het kernhistidine van de eerste plant homeodomein zinkvinger en dMi-2(BL12) in een geconserveerde serine in het chromodomein.",
"Deze analyses suggereren ook dat de msl-3/MRG15 duplicatie plaatsvond na de splitsing tussen schimmel en dier, terwijl een onafhankelijke duplicatie plaatsvond in planten. De door deze genen gecodeerde eiwitten hebben vergelijkbare structuren, inclusief een vermoedelijk chromodomein dicht bij hun N-terminale uiteinde en een vermoedelijke leucine-rits aan hun C-terminus.",
"CHD1 interageert met SSRP1 en is afhankelijk van zowel zijn chromodomein als zijn ATPase/helicase-achtig domein voor juiste associatie met chromatine.",
"Interactie tussen een integraal eiwit van het binnenmembraan van de nucleaire envelop en menselijke chromodomeineiwitten homolog aan Drosophila HP1.",
"Een zoogdier DNA-bindend eiwit dat een chromodomein en een SNF2/SWI2-achtig helicase-domein bevat.",
"Een Southern blot-analyse toonde aan dat dit eiwit, dat we CHD-1 hebben genoemd, aanwezig is in de meeste, zo niet alle, zoogdiersoorten.",
"Hier tonen we aan dat chromodomein helicase DNA-bindend eiwit 4 (Chd4) een complex vormt met Gata3 in Th2-cellen dat zowel de transcriptie van Th2-cytokinen activeert als het Th1-cytokine IFN-γ onderdrukt.",
"Chromodomein helicase DNA-bindend eiwit 4 (CHD4), het bepalende subunit van het nucleosoom-remodellerende en deacetylase (NuRD) complex, is een nucleosoom-remodellerend eiwit van de SNF2/ISWI2 familie, waarvan de leden twee chromodomeinen en een ATP-afhankelijk helicase-module bevatten.",
"Onder die eiwitten met >40% regulatie waren Macrophage Capping protein (CAPG) en Chromodomein Helicase DNA-bindend eiwit 4 (CHD4) die significant werden opgereguleerd door overexpressie van pp32r1 en pp32r1Y140H.",
"Dit heterochromatine coördineert expressieniveaus door associatie met een chromodomeineiwit Chp1 en een antisilencing factor Epe1.",
"Binnen NCC's werkt Brg1 samen met chromatine-remodeller Chromodomein-helicase-DNA-bindend eiwit 7 (Chd7) op de PlexinA2-promotor om PlexinA2 te activeren, dat een receptor codeert voor semaforine om NCC's naar"
] | 3,423
| 1,702
|
141
|
Wat is Genomicus?
|
Genomicus is ontwikkeld als een database en een browser om gen-syntenie te bestuderen in moderne en voorouderlijke genomen. Het maakt eenvoudige vergelijkende genomische visualisatie mogelijk in meer dan 150 eukaryote genomen en in vier verschillende fyla (Gewervelden, Schimmels, Metazoa en Planten). Het biedt een manier om ruimtelijke informatie te verkennen met betrekking tot genorganisatie binnen en tussen genomen en temporele relaties gerelateerd aan gen- en genoom-evolutie. Voor het specifieke gewervelde fyla biedt het ook toegang tot reconstructies van voorouderlijke genvolgordes en informatie over geconserveerde niet-coderende elementen. De grafische modules van Genomicus tonen hoe het in staat is om differentiële genverlies en -winst, segmentale of genoomduplicaties te onthullen en het bestuderen van de evolutie van een locus via homologierelaties te vergemakkelijken. De Genomicus-server biedt toegang tot voorouderlijke genvolgordes, evenals computationeel voorspelde regulatoire interacties, dankzij de representatie van geconserveerde niet-coderende elementen met hun veronderstelde gentargets.
|
[
"Genomicus: een database en een browser om gen-syntenie te bestuderen in moderne en voorouderlijke genomen.",
"Hier presenteren we Genomicus, een nieuwe synteniebrowser die een onbeperkt aantal genomen kan weergeven en vergelijken in een brede fylogenetische context. Bovendien bevat Genomicus gereconstrueerde voorouderlijke genorganisatie, wat de interpretatie van de gegevens aanzienlijk vergemakkelijkt. BESCHIKBAARHEID: Genomicus is vrij beschikbaar voor online gebruik op http://www.dyogen.ens.fr/genomicus terwijl gegevens kunnen worden gedownload via ftp://ftp.biologie.ens.fr/pub/dyogen/genomicus.",
"Genomicus (http://www.dyogen.ens.fr/genomicus/) is een database en een online tool die eenvoudige vergelijkende genomische visualisatie mogelijk maakt in meer dan 150 eukaryote genomen. Het biedt een manier om ruimtelijke informatie te verkennen met betrekking tot genorganisatie binnen en tussen genomen en temporele relaties gerelateerd aan gen- en genoom-evolutie. Voor het specifieke gewervelde fyla biedt het ook toegang tot reconstructies van voorouderlijke genvolgordes en informatie over geconserveerde niet-coderende elementen. We hebben de Genomicus-database, oorspronkelijk gewijd aan gewervelden, uitgebreid naar vier nieuwe clades, waaronder planten, niet-gewervelde metazoa, protisten en schimmels. Deze visualisatietool maakt evolutionaire fylogenomische analyse en verkenning mogelijk. Hier beschrijven we de grafische modules van Genomicus en tonen we hoe het in staat is differentieel genverlies en -winst, segmentale of genoomduplicaties te onthullen en de evolutie van een locus via homologierelaties te bestuderen.",
"Genomicus update 2015: KaryoView en MatrixView bieden een genoom-brede perspectief op multispecies vergelijkende genomica.",
"De Genomicus-webserver (http://www.genomicus.biologie.ens.fr/genomicus) is een visualisatietool die vergelijkende genomica mogelijk maakt in vier verschillende fyla (Gewervelden, Schimmels, Metazoa en Planten). Het biedt toegang tot genomische informatie van bestaande soorten, evenals voorouderlijke geninhoud en genvolgorde voor gewervelden en bloemplanten. Hier presenteren we de nieuwe functies beschikbaar voor het gewervelde genoom met een focus op nieuwe grafische tools. De interface om de database te betreden is verbeterd, twee pairwise genoomvergelijkingstools zijn nu beschikbaar (KaryoView en MatrixView) en de tools voor meervoudige genoomvergelijking (PhyloView en AlignView) bieden drie nieuwe soorten representatie en een intuïtiever menu. Deze nieuwe ontwikkelingen zijn geïmplementeerd voor het Genomicus-portaal dat gewervelden bedient. Dit maakt de analyse mogelijk van 68 bestaande dierlijke genomen, evenals 58 gereconstrueerde voorouderlijke genomen. De Genomicus-server biedt ook toegang tot voorouderlijke genvolgordes, om evolutionaire en vergelijkende genomica-studies te vergemakkelijken, evenals computationeel voorspelde regulatoire interacties, dankzij de representatie van geconserveerde niet-coderende elementen met hun veronderstelde gentargets.",
"Genomicus: vijf genoombrowsers voor vergelijkende genomica in eukaryoten.",
"Genomicus (http://www.dyogen.ens.fr/genomicus/) is een database en een online tool die eenvoudige vergelijkende genomische visualisatie mogelijk maakt in meer dan 150 eukaryote genomen.",
"De Genomicus-webserver (http://www.genomicus.biologie.ens.fr/genomicus) is een visualisatietool die vergelijkende genomica mogelijk maakt in vier verschillende fyla (Gewervelden, Schimmels, Metazoa en Planten).",
"De Genomicus-webserver (http://www.genomicus.biologie.ens.fr/genomicus) is een visualisatietool die vergelijkende genomica mogelijk maakt in vier verschillende fyla (Gewervelden, Schimmels, Metazoa en Planten).",
"De Genomicus-webserver (http://www.genomicus.biologie.ens.fr/genomicus) is een visualisatietool die vergelijkende genomica mogelijk maakt in vier verschillende fyla (Gewervelden,",
"Genomicus (http://www.dyogen.ens.fr/genomicus/) is een database en een online tool die eenvoudige vergelijkende genomische visualisatie mogelijk maakt in >150 eukaryote genomen.",
"De Genomicus-webserver (http://www.genomicus.biologie.ens.fr/genomicus) is een visualisatietool die vergelijkende genomica mogelijk maakt in vier verschillende fyla (Gewervelden, Schimmels, Metazoa en Planten)."
] | 639
| 620
|
142
|
Is amiodaron een klasse I anti-aritmicum?
|
Hoewel het wordt beschouwd als een klasse III anti-aritmicum, heeft amiodaron ook klasse I, II en IV effecten, wat het een uniek farmacologisch en anti-aritmisch profiel geeft
|
[
"Veelvoorkomende klasse I middelen worden uitgesloten vanwege de inherente abnormale hartstructuur en functie bij cardiogene shock. Klasse III medicatie-opties omvatten dofetilide en amiodaron.",
"Amiodaron wordt sinds de jaren 70 gebruikt als anti-aritmicum en heeft een gevestigde rol in de behandeling van ventriculaire tachyaritmieën. Hoewel het wordt beschouwd als een klasse III anti-aritmicum, heeft amiodaron ook klasse I, II en IV effecten, wat het een uniek farmacologisch en anti-aritmisch profiel geeft.",
"Amiodaron, een gejodeerd benzofuraanderivaat, geïntroduceerd in de jaren 60 als een anti-angineus middel, ontwikkelde zich in de jaren 70 tot een krachtig anti-aritmicum en is momenteel een van de meest voorgeschreven geneesmiddelen in de VS voor ventriculaire en atriale aritmieën. Hoewel amiodaron wordt beschouwd als een klasse III anti-aritmicum, heeft het ook klasse I, II en IV effecten, waardoor het een uniek en effectief anti-aritmicum is.",
"Amiodaron, een representatief klasse III middel, oefent negatieve dromotropie uit door het onderdrukken van de snelle natriumstroom die verantwoordelijk is voor geleiding bij acute toediening (klasse I effecten). Chronisch gebruik van amiodaron veroorzaakt verlenging van de ERP (klasse III effecten), wat soms geassocieerd is met negatieve dromotropie gebaseerd op de verandering van passieve of actieve membraaneigenschappen.",
"Amiodaron, een gejodeerd benzofuraanderivaat met voornamelijk klasse III anti-aritmische effecten, wordt gebruikt voor de behandeling van supraventriculaire en ventriculaire aritmieën.",
"Hoewel amiodaron wordt beschouwd als een klasse III anti-aritmicum, heeft het ook klasse I, II en IV effecten, waardoor het een uniek en effectief anti-aritmicum is",
"Amiodaron, een klasse III anti-aritmisch geneesmiddel, is een van de meest effectieve geneesmiddelen die worden gebruikt bij de behandeling van ventriculaire en paroxysmale supraventriculaire tachyaritmieën",
"Hoewel amiodaron wordt beschouwd als een klasse III anti-aritmicum, heeft het ook klasse I, II en IV effecten, waardoor het een uniek en effectief anti-aritmicum is",
"Hoewel het wordt beschouwd als een klasse III anti-aritmicum, heeft amiodaron ook klasse I, II en IV effecten, wat het een uniek farmacologisch en anti-aritmisch profiel geeft",
"Amiodaron is een krachtig klasse III anti-aritmisch geneesmiddel dat ook bètablokkerende eigenschappen bezit"
] | 343
| 351
|
143
|
Wat is de prognostische betekenis van vertraagde versterking gedocumenteerd bij patiënten met hypertrofische cardiomyopathie?
|
Vertraagde versterking door CMR heeft prognostische waarde bij het voorspellen van nadelige cardiovasculaire gebeurtenissen bij HCM-patiënten, en wordt geassocieerd met cardiovasculaire mortaliteit, overlijden door hartfalen en sterfte door alle oorzaken bij HCM.
|
[
"Het is mogelijk te concluderen dat er een hoge prevalentie is van myocardiale fibrose bij patiënten met hypertrofische cardiomyopathie met een hoog risico of die hersteld zijn van plotselinge hartdood, zoals degenen met een klinische indicatie voor een implanteerbare cardioverter-defibrillator.",
"Atriumfibrilleren (AF) bij HCM is gerelateerd aan myocardiale fibrose gedetecteerd door DE-CMR en dilatatie van het linker atrium (LA).",
"Tijdens de follow-up periode was het jaarlijkse percentage nadelige cardiovasculaire gebeurtenissen bij patiënten met DE hoger dan bij patiënten zonder DE, maar bereikte dit geen statistische significantie (5,5% versus 3,3%; P=0,5).",
"Late gadoliniumversterking door CMR heeft prognostische waarde bij het voorspellen van nadelige cardiovasculaire gebeurtenissen bij HCM-patiënten. Er zijn significante verbanden tussen LGE en cardiovasculaire mortaliteit, overlijden door hartfalen en sterfte door alle oorzaken bij HCM. Daarnaast vertoonden LGE en SCD/afgebroken SCD een trend richting significantie.",
"Het hyperversterkte apicale myocard had een lager percentage systolische myocardverdikking en werd geassocieerd met ernstige symptomen (bijv. syncope) en ventriculaire aritmieën.",
"Een semi-kwantitatieve index van DCE is een significante multivariabele voorspeller van zowel klinische VT/VF als van het risico op SCD en kan bijdragen aan risicobeoordeling in grensgevallen of controversiële gevallen.",
"Myocardiale littekens afgebeeld door CE-CMR komen vaak voor bij patiënten met HCM en voorspellen VT."
] | 234
| 239
|
144
|
Wat is de COUGER-tool?
|
COUGER neemt als invoer twee sets genomische regio's die gebonden zijn door paraloge transcriptiefactoren (TF's), en het identificeert een kleine set van vermoedelijke co-factoren die de twee sets sequenties het beste onderscheiden.
|
[
"COUGER--co-factoren geassocieerd met uniek gebonden genomische regio's.",
"Hier presenteren we een interactieve webimplementatie van COUGER, een classificatie-gebaseerd raamwerk voor het identificeren van proteïne co-factoren die mogelijk specificiteit bieden aan paraloge TF's. COUGER neemt als invoer twee sets genomische regio's die gebonden zijn door paraloge TF's, en het identificeert een kleine set van vermoedelijke co-factoren die de twee sets sequenties het beste onderscheiden. Om deze taak te bereiken, gebruikt COUGER een classificatiebenadering, met kenmerken die de DNA-bindingsspecificiteiten van de vermoedelijke co-factoren weerspiegelen. De geïdentificeerde co-factoren worden gepresenteerd op een gebruiksvriendelijke outputpagina, samen met informatie die de gebruiker in staat stelt de bijdragen van individuele co-factor kenmerken te begrijpen en te verkennen. COUGER kan worden uitgevoerd als een zelfstandige tool of via een webinterface: http://couger.oit.duke.edu.",
"Hier presenteren we een interactieve webimplementatie van COUGER, een classificatie-gebaseerd raamwerk voor het identificeren van proteïne co-factoren die mogelijk specificiteit bieden aan paraloge TF's.",
"COUGER neemt als invoer twee sets genomische regio's die gebonden zijn door paraloge TF's, en het identificeert een kleine set van vermoedelijke co-factoren die de twee sets sequenties het beste onderscheiden.",
"COUGER neemt als invoer twee sets genomische regio's die gebonden zijn door paraloge TF's, en het identificeert een kleine set van vermoedelijke co-factoren die de twee sets sequenties het beste onderscheiden",
"Hier presenteren we een interactieve webimplementatie van COUGER, een classificatie-gebaseerd raamwerk voor het identificeren van proteïne co-factoren die mogelijk specificiteit bieden aan paraloge TF's. COUGER neemt als invoer twee sets genomische regio's die gebonden zijn door paraloge TF's, en het identificeert een kleine set van vermoedelijke co-factoren die de twee sets sequenties het beste onderscheiden.",
"COUGER neemt als invoer twee sets genomische regio's die gebonden zijn door paraloge TF's, en het identificeert een kleine set van vermoedelijke co-factoren die de twee sets sequenties het beste onderscheiden. Om deze taak te bereiken, gebruikt COUGER een classificatiebenadering, met kenmerken die de DNA-bindingsspecificiteiten van de vermoedelijke co-factoren weerspiegelen.",
"Hier presenteren we een interactieve webimplementatie van COUGER, een classificatie-gebaseerd raamwerk voor het identificeren van proteïne co-factoren die mogelijk specificiteit bieden aan paraloge TF's. COUGER neemt als invoer twee sets genomische regio's die gebonden zijn door paraloge TF's, en het identificeert een kleine set van vermoedelijke co-factoren die de twee sets sequenties het beste onderscheiden."
] | 388
| 396
|
145
|
Zijn er medicijnen voor door teken overgedragen encefalitis?
|
Er is momenteel geen medicamenteuze behandeling beschikbaar
|
[
"Door teken overgedragen encefalitis (TBE) is vastgesteld in Bulgarije. Gezien de opmerkelijke toename van TBE-ziektegevallen in Europa in de afgelopen twee decennia, hebben we een onderzoek uitgevoerd naar TBE bij patiënten met acute virale meningitis die tussen 2009 en 2012 in Bulgarije waren opgenomen.",
"Virussen die behoren tot de familie Flaviviridae verspreiden zich voornamelijk via geleedpotige vectoren en zijn de belangrijkste oorzaken van ziekte en sterfte wereldwijd. De familie Flaviviridae bestaat uit 3 geslachten, waaronder het geslacht Flavivirus (typesoort: gele koortsvirus) als het grootste geslacht, het Hepacivirus (typesoort: hepatitis C-virus) en het Pestivirus (typesoort: runderdiareevirus). De flavivirussen (geslacht Flavivirus) zijn kleine RNA-virussen die worden overgedragen door muggen en teken en die de gastheercelmachinerie overnemen om zich te vermenigvuldigen. Hepacivirussen en pestivirussen worden echter niet overgedragen door geleedpotigen. Ondanks uitgebreid onderzoek en bezorgdheid op het gebied van volksgezondheid met betrekking tot flavivirusziekten, is er tot op heden geen specifieke behandeling beschikbaar voor flavivirusinfecties, hoewel commercieel verkrijgbare vaccins bestaan voor gele koorts, Japanse encefalitis en door teken overgedragen encefalitis."
] | 179
| 179
|
146
|
Wordt SLC22A3 tot expressie gebracht in de hersenen?
|
Ja, SLC22A3 (organische kationentransporter (OCT3)) wordt wijdverspreid tot expressie gebracht in verschillende organen bij mensen en is betrokken bij de verwerking van vele exogene en endogene verbindingen. Verschillende bewijslijnen suggereren dat OCT3, dat in de hersenen tot expressie wordt gebracht, een belangrijke rol speelt bij de regulatie van neurotransmissie.
|
[
"De organische kationentransporter (OCT) 3 wordt wijdverspreid tot expressie gebracht in verschillende organen bij mensen en is betrokken bij de verwerking van vele exogene en endogene verbindingen. Verschillende bewijslijnen suggereren dat OCT3, dat in de hersenen tot expressie wordt gebracht, een belangrijke rol speelt bij de regulatie van neurotransmissie.",
"De organische kationentransporter 3 (OCT3; synoniem: extraneuronale monoaminetransporter, EMT, Slc22a3) codeert voor een isoform van de organische kationentransporters en wordt wijdverspreid tot expressie gebracht in de gehele hersenen.",
"In overeenstemming met deze distributie tonen OCT3/Slc22a3-deficiënte muizen aanwijzingen van veranderde monoamine neurotransmissie in de hersenen, met een verlaagd intracellulair gehalte en een verhoogde turnover van aminergische neurotransmitters.",
"CRT, taurine-transporter (TauT/SLC6A6) en organische kationentransporter (OCT3/SLC22A3) die tot expressie worden gebracht aan de BCSFB zijn betrokken bij het effluxtransport van guanidinoazijnzuur of creatinine uit het CSF.",
"De organische kationentransporter 3 (OCT3; synoniem: extraneuronale monoaminetransporter, EMT, Slc22a3) codeert voor een isoform van de organische kationentransporters en wordt wijdverspreid tot expressie gebracht in de gehele hersenen.",
"De organische kationentransporter 3 (OCT3; synoniem: extraneuronale monoaminetransporter, EMT, Slc22a3) codeert voor een isoform van de organische kationentransporters en wordt wijdverspreid tot expressie gebracht in de gehele hersenen.",
"CRT kan een sleutelfactor zijn die het bloed-naar-hersenen transport van guanidinoazijnzuur faciliteert bij patiënten die deficient zijn in S-adenosylmethionine:guanidinoazijnzuur N-methyltransferase, het creatinesynthetiserende enzym, wat resulteert in cerebrale accumulatie van guanidinoazijnzuur. CRT, taurine-transporter (TauT/SLC6A6) en organische kationentransporter (OCT3/SLC22A3) die tot expressie worden gebracht aan de BCSFB zijn betrokken bij het effluxtransport van guanidinoazijnzuur of creatinine uit het CSF.",
"Slc22a3) codeert voor een isoform van de organische kationentransporters en wordt wijdverspreid tot expressie gebracht in de gehele hersenen.",
"CRT, taurine-transporter (TauT/SLC6A6) en organische kationentransporter (OCT3/SLC22A3) die tot expressie worden gebracht aan de BCSFB zijn betrokken bij het effluxtransport van guanidinoazijnzuur of creatinine uit het CSF. Interessant is dat het BBB-effluxtransport van GC's, inclusief guanidinoazijnzuur en creatinine, verwaarloosbaar is, hoewel de BBB verschillende effluxtransportsystemen heeft voor synthetische voorlopers van GC's, zoals aminozuren en neurotransmitters.",
"De organische kationentransporter (OCT) 3 wordt wijdverspreid tot expressie gebracht in verschillende organen bij mensen en is betrokken bij de verwerking van vele exogene en endogene verbindingen. Verschillende bewijslijnen suggereren dat OCT3, dat in de hersenen tot expressie wordt gebracht, een belangrijke rol speelt bij de regulatie van neurotransmissie.",
"CRT, taurine-transporter (TauT/SLC6A6) en organische kationentransporter (OCT3/SLC22A3) die tot expressie worden gebracht aan de BCSFB zijn betrokken bij het effluxtransport van guanidinoazijnzuur of creatinine uit het CSF.",
"Verschillende bewijslijnen suggereren dat OCT3, dat in de hersenen tot expressie wordt gebracht, een belangrijke rol speelt bij de regulatie van neurotransmissie.",
"De organische kationentransporter 3 (OCT3; synoniem: extraneuronale monoaminetransporter, EMT, Slc22a3) codeert voor een isoform van de organische kationentransporters en wordt wijdverspreid tot expressie gebracht in de gehele hersenen.",
"OCT2-OCT-3 vertonen een differentiële weefselverdeling: OCT1 wordt voornamelijk gevonden in de lever van mensen, en in lever en nier bij knaagdieren; OCT2 wordt het sterkst tot expressie gebracht in zowel menselijke als knaagdierlijke nieren, terwijl OCT3 voornamelijk in de placenta tot expressie wordt gebracht, maar ook breder wordt gedetecteerd in verschillende weefsels, waaronder hersenen en longen."
] | 512
| 543
|
147
|
Is het eiwit TIEG1 in verband gebracht met apoptose?
|
Ja, TIEG1 (ook bekend als KLF10) lijkt een rol te spelen bij het reguleren van apoptose.
|
[
"TGF-beta) induceerbaar vroeg gen 1 (TIEG1) staat bekend om het induceren van apoptose in TGF-beta gevoelige pancreaskankercellen, maar het effect op TGF-beta resistente kankercellen blijft onduidelijk",
"overexpressie van TIEG1 beschermde ALL-cellen tegen chemotherapie-geïnduceerde celdood",
"TIEG1 zou betrokken kunnen zijn bij het bemiddelen van dit effect van de micro-omgeving op de leukemiecellen",
"We tonen ook aan dat ectopische expressie van TIEG-1 in CGNP's celcyclusarrest induceert dat kan leiden tot apoptose, maar niet tot differentiatie",
"TIEG1 fungeert als een inducerende of onderdrukkende factor van genexpressie om het TGFbeta/Smad-pad, evenals andere signaalroutes, te versterken en zo celproliferatie, differentiatie en apoptose te reguleren.",
"TGFbeta induceerbaar vroeg gen (TIEG1) bootst de werking van TGFbeta na en induceert apoptose",
"het transformeerend groeifactor-beta- (TGF-beta-) induceerbare vroegresponsgen 1 (TIEG1), dat een cruciale rol speelt in TGF-beta-gereguleerde celgroeiregulatie en apoptose",
"Inductie van mRNA voor Smad4 en de door TGF-beta1 gereguleerde apoptose-inducerende transcriptiefactor TGF-beta1-induceerbaar vroeg gen (TIEG1) werd binnen de eerste 6 uur na doxazosinbehandeling gedetecteerd",
"TIEG1 (TGF-beta induceerbaar vroeg gen) is een recent gekarakteriseerde transcriptiefactor gereguleerd door TGF-beta die apoptose induceert wanneer overexpressie optreedt in pancreatische adenocarcinoomcelijnen",
"Invloed van TIEG1 op apoptose",
"de invloed van TIEG1 op apoptose van HL-60 cellen en de expressie van Bcl-2/Bax",
"De expressie van genen betrokken bij insulineresistentie (PDK4, AHSG) is verhoogd, samen met de expressie van TIEG1, een transcriptiefactor die apoptose via de mitochondriale route kan induceren",
"de overexpressie van TIEG1 veroorzaakte groeiremming en apoptose in TGF-β1-resistente HCC-celijnen,",
"Aan de andere kant vertoonden KLF10-deficiënte keratinocyten verhoogde proliferatie en apoptose",
"LF10, transformeerend groeifactor-β-induceerbaar vroeg gen 1",
"IEG1 kan apoptose van kankercellen induceren",
"TGF-β induceerbaar vroeg gen 1 speelt een belangrijke rol bij het reguleren van celproliferatie en apoptose",
"TIEG1 is een Krüppel-achtig transcriptiefactor (KLF10) die oorspronkelijk werd gekloond uit menselijke osteoblasten als een vroegresponsgen op TGF-β-behandeling",
"Adenovirale toediening van TIEG1 (AdTIEG1) aan TIEG1(-/-) cellen herstelde het RANKL-geïnduceerde NFATc1-signaleringsdefect in TIEG1(-/-) voorlopercellen en elimineerde de differentiatie- en apoptosedefecten",
"(TGF)-β induceerbaar vroeg gen (TIEG)-1 is betrokken bij de controle van celproliferatie, differentiatie en apoptose in sommige celtypen",
"TIEG1 is aangetoond dat het de effecten van TGF-beta in verschillende carcinoomcellen nabootst en speelt een cruciale rol in de apoptotische cascade",
"(TIEG) is een familie van primaire responsgenen geïnduceerd door TGF-beta, die bekend staan om hun regulatie van cellulaire proliferatie en apoptose",
"In menselijke en muizenweefsels is aangetoond dat TIEG1 en TIEG2 apoptose induceren en celgroei remmen",
"overexpressie van TIEG1 in OLI-neu cellen induceerde apoptose",
"(TGF-beta(1))-induceerbare transcriptiefactoren hebben recent belangstelling gewekt vanwege hun cruciale rol in de regulatie van celproliferatie, differentiatie en apoptose",
"ectopische overexpressie van TIEG is voldoende om het apoptotische celprogramma in deze cellen te activeren"
] | 457
| 428
|
148
|
Wat is de cellulaire lokalisatie van het eiwit Opa1?
|
Het Opa1-eiwit lokaliseert zich in de mitochondriën.
|
[
"De subcellulaire distributie van overexpressed mOPA1 in COS-7 cellen overlapt grotendeels die van endogeen cytochroom c, een bekende mitochondriale marker,",
"vrijgave van hoge MW Opa-1 isoformen van de mitochondriën naar het cytosol",
"mitochondriale fusie (opa-1)",
"mitochondriale fusiegenen Mfn1 (mitofusine 1), Mfn2 (mitofusine 2), Opa1 (optische atrofie 1)",
"Biochemische onderzoeken tonen aan dat beide OPA1-isoformen aanwezig zijn in de intermembranaire ruimte. Submitochondriale fractionering door sucrose dichtheidsgraadcentrifugatie toont aan dat het 88-kDa eiwit voornamelijk geassocieerd is met het mitochondriale buitenmembraan, terwijl het 93-kDa eiwit geassocieerd is met het binnenmembraan.",
"Hier beschrijven we een nucleair gen, OPA1, dat binnen het kandidaatgebied ligt en codeert voor een dynamine-achtig eiwit dat gelokaliseerd is in mitochondriën.",
"Het dynamine-achtige eiwit Opa1 is gelokaliseerd in de mitochondriale intermembranaire ruimte, waar het fusie tussen mitochondriën faciliteert.",
"Regulatie van het mitochondriale dynamine-achtige eiwit Opa1 door proteolytische splitsing.",
"Differentiele sublokalisatie van de dynamine-achtige eiwit OPA1 isoformen in mitochondriën.",
"Het menselijke dynamine-achtige eiwit OPA1 is verankerd aan het mitochondriale binnenmembraan gericht naar de intermembranaire ruimte.",
"Naast het vermogen van deze eiwitten om fusie te bevorderen, reguleren mitofusine 2 of OPA1 het mitochondriale metabolisme en verlies van functie vermindert zuurstofverbruik en het vermogen om substraten te oxideren.",
"Hier identificeerden we twee isoformen van OPA1-eiwitten in HeLa-cellen en onderzochten hun submitochondriale lokalisatie en complexvorming.",
"Onze experimenten beperken de functie van prohibitines tot mitochondriën en identificeren de verwerking van de dynamine-achtige GTPase OPA1, een essentieel onderdeel van het mitochondriale fusieapparaat, als het centrale cellulaire proces dat door prohibitines wordt gecontroleerd.",
"LRRK2 colokaliseert gedeeltelijk met endosomale dynamine-1 of met mitofusines en OPA1 aan mitochondriale membranen.",
"Hoewel initiële fusie van mitochondriën door 15d-PGJ2 de aanwezigheid vereiste van zowel buitenste (Mfn1 en Mfn2) als binnenste (OPA1) mitochondriale membraanfusie-eiwitten, omvatten latere mitochondriale veranderingen verhoogde afbraak van het fusie-eiwit OPA1 en ubiquitinering van nieuw gesynthetiseerde OPA1 samen met verminderde expressie van Mfn1 en Mfn2, wat waarschijnlijk bijdroeg aan het verlies van buisvormige stijfheid, desorganisatie van cristae en vorming van grote gezwollen gedegradeerde disfunctionele mitochondriën.",
"Test en eigenschappen van het mitochondriale dynamine-achtige eiwit Opa1.",
"Mitochondriale herstructurering na remming van splitsing door 15d-PGJ2 omvat moleculaire veranderingen in het mitochondriale fusie-eiwit OPA1.",
"We hebben eerder beschreven dat het stilleggen van het mitochondriale eiwit OPA1 de mitochondriale Ca(2+)-signalisatie en aldosteronproductie in H295R bijniercorticale cellen versterkt.",
"Onze resultaten definiëren voor het eerst een functie van het middelste domein van het Opa1-eiwit en tonen aan dat mitochondriale retentie van Opa1 essentieel is voor normale embryogenese.",
"Hier identificeerden we twee isoformen van OPA1-eiwitten in HeLa-cellen en onderzochten hun submitochondriale lokalisatie en complexvorming",
"Differentiele sublokalisatie van de dynamine-achtige eiwit OPA1 isoformen in mitochondriën",
"Het dynamine-achtige eiwit Opa1 is gelokaliseerd in de mitochondriale intermembranaire ruimte, waar het fusie tussen mitochondriën faciliteert.",
"Mitochondriale splitsing en fusie-mediatoren, hFis1 en OPA1, moduleren cellulaire veroudering.",
"Het dynamine-achtige GTPase-eiwit OPA1, gelokaliseerd in de intermembranaire ruimte en verankerd aan het binnenmembraan van mitochondriën, neemt deel aan de fusie van deze organellen.",
"Het ontbreken van mitochondriale retentie van Opa1 is voldoende om het cellulaire Opa1 verlies-van-functie fenotype te veroorzaken aangezien de mitochondriën gefragmenteerd zijn, wat wijst op een onvermogen tot fusie.",
"Opa1, ook bekend als Mgm1 in gist, is een mitochondriaal lid van de dynaminefamilie.",
"In tegenstelling tot andere leden van de dynaminefamilie heeft Opa1 een N-terminale mitochondriale doelwitsequentie, wat suggereert dat dit eiwit in mitochondriën wordt geïmporteerd.",
"Hier beschrijven we biochemische technieken, zoals mitochondriale isolatie, digitonine-extractie, een proteasebeschermingstest en carbonatextractie, die werden gebruikt om aan te tonen dat het zoogdier-Opa1 zich bevindt in de intermembranaire ruimte waar het stevig gebonden is aan het binnenmembraan.",
"Het dynamine-achtige eiwit Opa1 is gelokaliseerd in de mitochondriale intermembranaire ruimte,",
"Het dynamine-achtige GTPase-eiwit OPA1, gelokaliseerd in de intermembranaire ruimte en verankerd aan het binnenmembraan van mitochondriën, neemt deel aan de fusie van deze organellen.",
"we identificeerden twee isoformen van OPA1-eiwitten in HeLa-cellen en onderzochten hun submitochondriale lokalisatie en complexvorming.",
"PKA fosforyleert perilipine, een eiwit gelokaliseerd aan het oppervlak van lipidedruppels dat fungeert als poortwachter om de toegang van lipasen te reguleren die opgeslagen triglyceriden omzetten in vrije vetzuren en glycerol op een fosforylatie-afhankelijke manier. Hier rapporteren we een nieuwe functie voor optic atrophy 1 (OPA1), een eiwit dat bekend staat om de regulatie van mitochondriale dynamiek, als een dual-specificiteit A-kinase verankeringsproteïne geassocieerd met lipidedruppels.",
"We vinden dat Mgm1/OPA1 gelokaliseerd is in de mitochondriale intermembranaire ruimte,"
] | 708
| 687
|
149
|
Welke geneesmiddelen worden gebruikt voor het brandende mondsyndroom?
|
Dopaminerge geneesmiddelen moeten worden gegeven aan patiënten met BMS.
Catuama vermindert de symptomen van BMS en kan een nieuwe therapeutische strategie zijn voor de behandeling van deze ziekte.
Capsaïcine, alfa-liponzuur (ALA) en clonazepam waren degenen die de meeste vermindering van de symptomen van BMS lieten zien.
Behandeling met placebo's produceerde een respons die 72% zo groot was als de respons op actieve geneesmiddelen.
|
[
"Gemiddeld produceerde behandeling met placebo's een respons die 72% zo groot was als de respons op actieve geneesmiddelen.",
"De gelijktijdige voorschrijving van tongbeschermer en AV is effectief voor de behandeling van patiënten met BMS.",
"Wij suggereren dat een subset van patiënten met BMS een fenotypische variant van RLS kan zijn en dat een proef met dopaminerge geneesmiddelen moet worden gegeven aan patiënten met BMS die een voorgeschiedenis hebben die wijst op RLS of aan een patiënt die niet reageert op de gebruikelijke therapieën voor BMS.",
"De systemische toediening van Catuama vermindert de symptomen van BMS en kan een nieuwe therapeutische strategie zijn voor de behandeling van deze ziekte.",
"Therapieën die capsaïcine, alfa-liponzuur (ALA) en clonazepam gebruikten, waren degenen die de meeste vermindering van de symptomen van BMS lieten zien.",
"Topisch clonazepam, waarvan eerdere analyses van klinisch bewijs hebben aangetoond dat het het geneesmiddel van keuze is voor BMS, bleek ook het meest kosteneffectief te zijn van de geneesmiddelen die voor deze aandoening werden geanalyseerd."
] | 221
| 226
|
150
|
Is PTEN betrokken bij folliculair schildkliercarcinoom?
|
De frequentie van PTEN-mutaties bij niet-geselecteerde gevallen van folliculair schildkliercarcinoom was 4,8%.
|
[
"Twee van de 259 patiënten (0,8%), met zowel folliculair schildkliercarcinoom als macrocefalie, bleken een germinale mutatie in het PTEN-gen te dragen. De frequentie van PTEN-mutaties bij niet-geselecteerde gevallen van folliculair schildkliercarcinoom was 4,8%.",
"De frequentie van germinale pathogene PTEN-mutaties in een niet-geselecteerde serie patiënten met DTC is relatief laag, maar wordt verhoogd door rekening te houden met folliculaire histologie en macrocefalie.",
"Evenzo is er toenemend bewijs dat mutaties die leiden tot activatie van de fosfatidylinositol 3-kinase (PI3K)/AKT-effectoren - PTEN en PI3KCa - essentieel zijn voor de pathogenese van folliculair schildkliercarcinoom (FTC).",
"Een enkele man met folliculair schildkliercarcinoom uit een van deze 64 (2%) CS-achtige families droeg een germinale puntmutatie, c.209T-->C.",
"Evenzo is er toenemend bewijs dat mutaties die leiden tot activatie van de fosfatidylinositol 3-kinase (PI3K)/AKT-effectoren - PTEN en PI3KCa - essentieel zijn voor de pathogenese van folliculair schildkliercarcinoom (FTC).",
"De transcriptionele stillegging van PTEN was significant geassocieerd met het anaplastische subtype, wat suggereert dat PTEN betrokken is bij de carcinogenese van hoogmaligne of laatstadium schildklierkankers, terwijl dit specifieke mechanisme van minder belang lijkt te zijn bij gedifferentieerde folliculaire schildkliertumoren.",
"Deze resultaten tonen een hoge frequentie van hypermethylatie van de PTEN-promotor, vooral in folliculaire tumoren, wat wijst op een mogelijke rol in de tumorvorming van de schildklier.",
"Onze bevindingen suggereren dat het PTEN-tumorsuppressorgen af en toe geïnactiveerd is in sporadische folliculaire schildkliertumoren.",
"Germinale mutaties in het tumorsuppressorgen PTEN, dat codeert voor een dual-specificiteit fosfatase, zijn gevonden bij tot 80% van de patiënten met het Cowden-syndroom, wat wijst op een rol van PTEN in de pathogenese van folliculaire schildkliertumoren.",
"De meest voorkomende neoplasmata bij patiënten met de ziekte van Cowden ontstaan in de borst, huid en schildklier (folliculair subtype).",
"De transcriptionele stillegging van PTEN was significant geassocieerd met het anaplastische subtype, wat suggereert dat PTEN betrokken is bij de carcinogenese van hoogmaligne of laatstadium schildklierkankers, terwijl dit specifieke mechanisme van minder belang lijkt te zijn bij gedifferentieerde folliculaire schildkliertumoren."
] | 332
| 324
|
151
|
Welke genoombrowserdatabase voor DNA-vormannotaties is beschikbaar?
|
De Genome Browser voor DNA-vormannotaties (GBshape; gratis beschikbaar op http://rohslab.cmb.usc.edu/GBshape/) biedt voorspellingen van de breedte van de minor groove, propeller twist, roll, helix twist en hydroxylradicaal-splijting voor de volledige genomen van 94 organismen. Extra genomen kunnen eenvoudig worden toegevoegd met behulp van het GBshape-framework. GBshape kan worden gebruikt om DNA-vormannotaties kwalitatief te visualiseren in een genoombrowser-trackformaat, en om kwantitatieve waarden van DNA-vormkenmerken te downloaden als functie van de genomische positie op nucleotide-resolutie.
|
[
"GBshape: een genoombrowserdatabase voor DNA-vormannotaties.",
"Onze Genome Browser voor DNA-vormannotaties (GBshape; gratis beschikbaar op http://rohslab.cmb.usc.edu/GBshape/) biedt voorspellingen van de breedte van de minor groove, propeller twist, roll, helix twist en hydroxylradicaal-splijting voor de volledige genomen van 94 organismen. Extra genomen kunnen eenvoudig worden toegevoegd met behulp van het GBshape-framework. GBshape kan worden gebruikt om DNA-vormannotaties kwalitatief te visualiseren in een genoombrowser-trackformaat, en om kwantitatieve waarden van DNA-vormkenmerken te downloaden als functie van de genomische positie op nucleotide-resolutie. Als biologische toepassingen illustreren we de periodiciteit van DNA-vormkenmerken die aanwezig zijn in nucleosoom-bezette sequenties van mens, vlieg en worm, en we tonen structurele overeenkomsten aan tussen transcriptiestartplaatsen in de genomen van vier Drosophila-soorten.",
"GBshape kan worden gebruikt om DNA-vormannotaties kwalitatief te visualiseren in een genoombrowser-trackformaat, en om kwantitatieve waarden van DNA-vormkenmerken te downloaden als functie van de genomische positie op nucleotide-resolutie.",
"Onze Genome Browser voor DNA-vormannotaties (GBshape; gratis beschikbaar op http://rohslab.cmb.usc.edu/GBshape/) biedt voorspellingen van de breedte van de minor groove, propeller twist, roll, helix twist en hydroxylradicaal-splijting voor de volledige genomen van 94 organismen.",
"GBshape kan worden gebruikt om DNA-vormannotaties kwalitatief te visualiseren in een genoombrowser-trackformaat, en om kwantitatieve waarden van DNA-vormkenmerken te downloaden als functie van de genomische positie op nucleotide-resolutie.",
"GBshape kan worden gebruikt om DNA-vormannotaties kwalitatief te visualiseren in een genoombrowser-trackformaat, en om kwantitatieve waarden van DNA-vormkenmerken te downloaden als functie van de genomische positie op nucleotide-resolutie. Als biologische toepassingen illustreren we de periodiciteit van DNA-vormkenmerken die aanwezig zijn in nucleosoom-bezette sequenties van mens, vlieg en worm, en we tonen structurele overeenkomsten aan tussen transcriptiestartplaatsen in de genomen van vier Drosophila-soorten.",
"Hoewel hogere-orde effecten, zoals chromatintoegankelijkheid, cooperativiteit en cofactoren, zijn beschreven, kreeg DNA-vorm recentelijk aandacht als een andere eigenschap die de DNA-bindingsspecificiteiten van sommige transcriptiefactorfamilies fijn afstemt. Onze Genome Browser voor DNA-vormannotaties (GBshape; gratis beschikbaar op http://rohslab.cmb.usc.edu/GBshape/) biedt voorspellingen van de breedte van de minor groove, propeller twist, roll, helix twist en hydroxylradicaal-splijting voor de volledige genomen van 94 organismen.",
"Extra genomen kunnen eenvoudig worden toegevoegd met behulp van het GBshape-framework. GBshape kan worden gebruikt om DNA-vormannotaties kwalitatief te visualiseren in een genoombrowser-trackformaat, en om kwantitatieve waarden van DNA-vormkenmerken te downloaden als functie van de genomische positie op nucleotide-resolutie.",
"Onze Genome Browser voor DNA-vormannotaties (GBshape; gratis beschikbaar op http://rohslab.cmb.usc.edu/GBshape/) biedt voorspellingen van de breedte van de minor groove, propeller twist, roll, helix twist en hydroxylradicaal-splijting voor de volledige genomen van 94 organismen. Extra genomen kunnen eenvoudig worden toegevoegd met behulp van het GBshape-framework.",
"GBshape kan worden gebruikt om DNA-vormannotaties kwalitatief te visualiseren in een genoombrowser-trackformaat, en om kwantitatieve waarden van DNA-vormkenmerken te downloaden als functie van de genomische positie op nucleotide-resolutie.",
"Onze Genome Browser voor DNA-vormannotaties (GBshape; gratis beschikbaar op http://rohslab.cmb.usc.edu/GBshape/) biedt voorspellingen van de breedte van de minor groove, propeller twist, roll, helix twist en hydroxylradicaal-splijting voor de volledige genomen van 94 organismen."
] | 592
| 531
|
152
|
Wat is bekend over de klinische werkzaamheid van ceftriaxon voor de behandeling van amyotrofische laterale sclerose?
|
Er zijn enkele casusrapporten die suggereren dat ceftriaxon effectief kan zijn voor de behandeling van amyotrofische laterale sclerose. Echter, andere casusrapporten meldden geen klinisch voordeel van ceftriaxontherapie voor ALS. Er is gerapporteerd dat ceftriaxon neuronale schade bij amyotrofische laterale sclerose vermindert door verhoogde expressie en activiteit van de glutamaattransporter, GLT1. Klinische onderzoeken naar mogelijke klinische voordelen van ceftriaxon bij ALS zijn gaande.
|
[
"Belangrijk is dat ceftriaxon momenteel in klinische onderzoeken is voor de behandeling van amyotrofische laterale sclerose.",
"Ceftriaxon vertraagt het verlies van neuronen in genetische diermodellen van amyotrofische laterale sclerose door opregulatie van de expressie van astrocytaire glutamaattransporters (GLT-1).",
"DOELSTELLINGEN: Ceftriaxon verhoogt de expressie van de astrocytaire glutamaattransporter, EAAT2, wat mogelijk beschermt tegen glutamaat-gemedieerde excitotoxiciteit.",
"Vierendertig verbindingen (inclusief riluzol, ceftriaxon, minocycline, PBA, lithium, acetylcysteïne) in humane en muizen ALS-onderzoeken en een extra set van 1040 door de FDA goedgekeurde verbindingen toonden ook geen effect op de SOD1-promotoractiviteit.",
"Twee van deze patiënten kregen ceftriaxon gedurende 1 maand zonder klinische verbetering.",
"Bij amyotrofische laterale sclerose wordt verondersteld dat de downregulatie van de astrocyt-specifieke glutamaat excitatoire aminozuurtransporter 2 leidt tot een toename van extracellulair glutamaat, wat resulteert in excitotoxische motoneuronaire dood. Het antibioticum ceftriaxon werd recentelijk gerapporteerd als inductie van excitatoire aminozuurtransporter 2 en verlenging van de overleving van mutante superoxide dismutase 1 transgene muizen.",
"DOEL: Er is gerapporteerd dat ceftriaxon neuronale schade vermindert bij amyotrofische laterale sclerose en in een in-vitro model van neuronale ischemie door verhoogde expressie en activiteit van de glutamaattransporter, GLT1.",
"Dysfunctie van EAAT2 wordt geassocieerd met acute en chronische neurologische aandoeningen, waaronder beroerte/ischemie, temporale lob epilepsie, amyotrofische laterale sclerose, de ziekte van Alzheimer, door HIV-1 geassocieerde dementie en groei van maligne gliomen. Ceftriaxon, een van de bèta-lactam antibiotica, stimuleert de expressie van EAAT2 met neuroprotectieve effecten in zowel in vitro als in vivo modellen, deels gebaseerd op het vermogen om neuronale celdood door glutamaat excitotoxiciteit te remmen.",
"Herstel van motorneuronziekte geassocieerd met IV ceftriaxon en anti-Babesia therapie.",
"Dit rapport vat samen wat wij beschouwen als het eerste verifieerbare geval van een significante en progressieve motorneuronziekte (MND) consistent met amyotrofische laterale sclerose die oploste tijdens behandeling met i.v. ceftriaxon plus orale atovaquon en mefloquine.",
"Andere middelen (ceftriaxon, minocycline, ONO-2506 en IGF-1 polypeptide) zijn al in fase III onderzoeken met grote aantallen ALS-patiënten.",
"Lopende onderzoeken verkennen de waarde van antiglutamaterge middelen, waaronder het cefalosporine antibioticum ceftriaxon, evenals antioxidanten, mitochondriale versterkers en anti-apoptotische geneesmiddelen.",
"Recentelijk rapporteerden Rothstein et al. dat bèta-lactam antibiotica, waaronder penicilline en ceftriaxon, potentiële therapeutische middelen zijn voor de behandeling van sommige neurologische aandoeningen, bijvoorbeeld amyotrofische laterale sclerose (ALS), door modulatie van de expressie van glutamaattransporter GLT1 via genactivatie.",
"Ceftriaxon was neuroprotectief in vitro bij modellen van ischemisch letsel en motorneuron degeneratie, beide deels gebaseerd op glutamaat toxiciteit. In een diermodel van de fatale ziekte ALS vertraagde het middel het verlies van neuronen en spierkracht en verhoogde het de overleving van muizen.",
"We beschrijven twee patiënten met laterale amyotrofische sclerose die, na geïnformeerde toestemming, empirisch werden behandeld met intraveneus ceftriaxon in een dosis van 2 g/24 uur gedurende drie weken, zonder positieve resultaten.",
"Ondanks veelbelovende fase 2 gegevens toonde fase 3 van dit onderzoek met ceftriaxon bij amyotrofische laterale sclerose geen klinische werkzaamheid.",
"Belangrijk is dat ceftriaxon momenteel in klinische onderzoeken is voor de behandeling van amyotrofische laterale sclerose.",
"Het cefalosporine antibioticum ceftriaxon werd geëvalueerd als een potentieel therapeutisch middel voor de behandeling van amyotrofische laterale sclerose (ALS)."
] | 581
| 558
|
153
|
Wat is de relatie tussen TailorX en Oncotype?
|
De TAILORx-studie gebruikt de Oncotype DX recidiefscore om oestrogeenreceptor-positieve (ER+), knoop-negatieve patiënten toe te wijzen aan chemotherapie plus hormoontherapie versus alleen hormoontherapie.
|
[
"De TAILORx-studie gebruikt de Oncotype DX recidiefscore om oestrogeenreceptor-positieve (ER+), knoop-negatieve patiënten toe te wijzen aan chemotherapie plus hormoontherapie versus alleen hormoontherapie.",
"Er werd een cohortstudie uitgevoerd, inclusief opeenvolgende patiënten met vroeg stadium knoop-negatieve, ER-positieve borstkanker gediagnosticeerd tussen 2006 en mei 2013, inclusief een periode van prospectieve klinische studie (Trial Assigning Individualised Options for Treatment (TAILORx)) werving.",
"Gegevens werden verzameld over patiëntendemografie, klinisch-pathologische kenmerken van de tumor, gebruik van Oncotype DX en recidiefscore en gebruik van chemotherapie.",
"Oncotype DX-testen begonnen op proefbasis in 2007 en tot oktober 2011 maakten alleen patiënten die deelnamen aan TAILORx gebruik van genomische profilering.",
"479 opeenvolgende patiënten werden in de studie opgenomen, waarvan 241 (50%) een Oncotype DX-test ondergingen, 97 als onderdeel van de TAILORx klinische studie.",
"Om het vermogen te evalueren om behandelbeslissingen te sturen in de groep met een recidiefscore in het middenbereik, ontwikkelden de Noord-Amerikaanse samenwerkingsgroepen de Trial Assessing Individualized Options for Treatment for breast cancer, een gerandomiseerde studie van chemotherapie gevolgd door hormoontherapie versus alleen hormoontherapie op invasieve ziektevrije overleving-ductaal carcinoom in situ (IDFS-DCIS) overleving bij vrouwen met knoop-negatieve, oestrogeenreceptor-positieve borstkanker met een recidiefscore van 11-25.",
"Een van deze tests, Oncotype DX™, is een diagnostische test bestaande uit een 21-genen assay toegepast op paraffine-ingebedde borstkankertumorweefsels, waarmee artsen subgroepen van hormoonreceptor-positieve, knoop-negatieve patiënten kunnen voorspellen die mogelijk baat hebben bij alleen hormoontherapie of adjuvante chemotherapie nodig hebben om de beste overlevingsuitkomst te bereiken.",
"We testten of Oncotype DX en TAILORx risicocategorieën konden worden voorspeld door standaard pathologische kenmerken en eiwitmarkers die overeenkomen met 10 genen in de assay (ER, PR, Ki67, HER2, BCL2, CD68, Aurora A kinase, survivin, cycline B1 en BAG1) bij 52 patiënten die deelnamen aan TAILORx.",
"De TAILORx-studie gebruikt de Oncotype DX recidiefscore om oestrogeenreceptor-positieve (ER+), knoop-negatieve patiënten toe te wijzen aan chemotherapie plus hormoontherapie versus alleen hormoontherapie.",
"Voorspelling van Oncotype DX en TAILORx risicocategorieën met behulp van histopathologische en immunohistochemische markers door classificatie- en regressiebomen (CART) analyse.",
"Elke patiënt wordt ingedeeld in een risicocategorie op basis van een recidiefscore (RS) en de TAILORx-studie bepaalt het voordeel van chemotherapie voor patiënten met recidiefscores in het middenbereik. We testten of Oncotype DX en TAILORx risicocategorieën konden worden voorspeld door standaard pathologische kenmerken en eiwitmarkers die overeenkomen met 10 genen in de assay (ER, PR, Ki67, HER2, BCL2, CD68, Aurora A kinase, survivin, cycline B1 en BAG1) bij 52 patiënten die deelnamen aan TAILORx.",
"479 opeenvolgende patiënten werden in de studie opgenomen, waarvan 241 (50%) een Oncotype DX-test ondergingen, 97 als onderdeel van de TAILORx klinische studie. Oncotype DX-testen begonnen op proefbasis in 2007 en tot oktober 2011 maakten alleen patiënten die deelnamen aan TAILORx gebruik van genomische profilering.",
"De TAILORx-studie gebruikt de Oncotype DX recidiefscore om oestrogeenreceptor-positieve (ER+),"
] | 491
| 464
|
154
|
Heeft intensieve lichamelijke activiteit invloed op het schildklierhormoonmetabolisme?
|
JA
|
[
"De resultaten van de huidige studie in een uniek experimenteel menselijk model van maximale blootstelling aan hoogte en lichamelijke inspanning tonen aan dat extreme hoogte en intensieve lichamelijke inspanning gepaard gaan met specifieke endocriene aanpassingen. Deze omvatten een verhoogde activiteit van de GH/IGF-I-as en een laag T(3)-syndroom",
"3,5,3'-trijoodthyronine (T3) en T4-niveaus stijgen tijdens intensieve inspanning, en aan het einde van de inspanningsperiode wordt een daling van T3- en T4-niveaus gezien, met een toename van TSH gedurende de volgende 4-5 dagen.",
"De verkregen resultaten geven aan dat bij intense inspanning, die leidt tot snelle vermoeidheid, snelle stijgingen in serumspiegels van hormonen van de hypofyse-bijnier, hypofyse-gonadale en hypofyse-schildklier systemen optreden.",
"Gemiddelde niveaus van nuchtere plasma-estradiol, luteïniserend hormoon, follikelstimulerend hormoon, vrij thyroxine en trijoodthyronine waren significant lager in AR vergeleken met ER en SE.",
"Verminderingen in plasma T4, T3 en de T3/T4-ratio zijn waarschijnlijk te wijten aan remming van T4-secretie en 5'-monodejodering met mogelijke omzetting van T4 naar reverse T3 (rT3). Deze processen kunnen een mechanisme vertegenwoordigen voor de regulatie van het schildklierhormoonmetabolisme tijdens intensieve en langdurige vlucht.",
"Intensieve duursporttraining lijkt slechts geringe veranderingen te veroorzaken in de functie van de schildklier. Verlaagde T4-niveaus bij hardlopers kunnen eerder te wijten zijn aan verlaagde TBG-niveaus dan aan een direct effect van training.",
"Korte intensieve zwem- of matige fietsbeweging had weinig of geen effect op de concentraties schildklierhormonen wanneer rekening werd gehouden met de bijbehorende hemoconcentratie.",
"Thyroxine werd bepaald bij 26 mannen die deelnamen aan een 90 km langlaufwedstrijd, voor, direct na en in de daaropvolgende dagen",
"Totale thyroxine en vrije thyroxine in serum waren significant verhoogd aan het einde van de race, maar waren tijdens de rest van de observatieperiode teruggekeerd naar de niveaus van voor de race.",
"Er zijn controversiële resultaten met betrekking tot het schildklierhormoonmetabolisme tijdens intensieve inspanning bij volwassen atleten en slechts beperkte gegevens over de impact van intensieve inspanning op het schildklierhormoonmetabolisme bij kinderen en adolescenten."
] | 320
| 314
|
155
|
Wat is de belangrijkste functie van "RNA sponzen"?
|
Natuurlijke RNA-cirkels functioneren als efficiënte microRNA-sponzen. Onlangs is aangetoond dat de activiteit van miRNA wordt beïnvloed door de aanwezigheid van miRNA-spons-transcripten, de zogenaamde concurrerende endogene RNA in mensen en doelmimicry in planten.
|
[
"Pseudogen OCT4-pg4 functioneert als een natuurlijke microRNA-spons om de expressie van OCT4 te reguleren door te concurreren om miR-145 in hepatocellulair carcinoom.",
"Mechanistische analyse toonde aan dat OCT4-pg4 functioneert als een natuurlijke microRNA-spons om het OCT4-transcript te beschermen tegen remming door miR-145.",
"Natuurlijke RNA-cirkels functioneren als efficiënte microRNA-sponzen.",
"Onlangs is aangetoond dat de activiteit van miRNA wordt beïnvloed door de aanwezigheid van miRNA-spons-transcripten, de zogenaamde concurrerende endogene RNA in mensen en doelmimicry in planten.",
"Hier tonen we aan dat dit circRNA fungeert als een miR-7 spons; we noemen dit circulaire transcript ciRS-7 (circulaire RNA-spons voor miR-7).",
"We tonen verder aan dat het testis-specifieke circRNA, het geslachtsbepalende gebied Y (Sry), fungeert als een miR-138 spons, wat suggereert dat miRNA-spons effecten bereikt door circRNA-vorming een algemeen fenomeen zijn.",
"Natuurlijke RNA-sponzen die cellulaire niet-coderende RNA-moleculen afvangen, zijn gevonden in diverse organismen.",
"In dit nummer rapporteren Lalaouna et al. (2015) een ander type RNA-spons, waarbij wordt aangetoond dat stabiele tussenproducten van bacteriële tRNA-verwerking endogene kleine RNA's reguleren.",
"Circulaire RNA's kunnen functioneren als sjablonen voor viroid- en virale replicatie, als tussenproducten in RNA-verwerkingsreacties, als regulatoren van transcriptie in cis, als snoRNA's en als miRNA-sponzen.",
"Recente onderzoeken hebben aangetoond dat circRNA's kunnen functioneren als microRNA (miRNA) sponzen, regulatoren van splicing en transcriptie, en als modificatoren van de expressie van ouderlijke genen.",
"Dit kan RNA-sponzen omvatten die regulerende RNA's van mRNA's in hetzelfde regulon afvangen, maar het onderliggende moleculaire mechanisme van dergelijke mRNA-interactie blijft weinig begrepen. Hier rapporteren we spons-gemedieerde mRNA-interactie in het posttranscriptionele netwerk van GcvB, een geconserveerd Hfq-afhankelijk klein RNA met een van de grootste bekende regulons in bacteriën. We tonen aan dat mRNA-afbraak van het gltIJKL-locus, dat een aminozuur ABC-transporter codeert, een stabiel fragment (SroC) genereert dat base-pairing aangaat met GcvB.",
"De geslachtsbepalende regio Y (Sry) en het cerebellaire degeneratie-gerelateerde eiwit 1 (CDR1as) RNA-transcripten zijn beschreven als een nieuwe klasse van posttranscriptionele regulerende RNA's die zich gedragen als circulaire endogene RNA-sponzen voor de microRNA's (miRNA's) miR-138 en miR-7."
] | 377
| 351
|
156
|
Wordt het gen MAOA epigenetisch gewijzigd door methylatie?
|
In de afgelopen jaren is de rol van epigenetische fenomenen, zoals methylatie, bij het beïnvloeden van kwetsbaarheid voor gedragsziekten steeds meer erkend. Een prominente locus waar epigenetische fenomenen vermoedelijk een rol spelen, is de monoamine-oxidase A (MAOA) locus. We concluderen dat methylatie van MAOA een significante rol kan spelen bij veelvoorkomende psychiatrische aandoeningen en dat verdere studie van epigenetische processen op deze locus gewenst is.
|
[
"Bewijs dat de methylatiestatus van het monoamine-oxidase A (MAOA) gen de hersenactiviteit van het MAO A-enzym voorspelt bij gezonde mannen.",
"We vonden significante interindividuele verschillen in methylatiestatus en methylatiepatronen van de kernpromotor van MAOA.",
"In de huidige studie werden DNA-methylatiepatronen in de MAOA-regulerende regio en exon 1/intron 1 onderzocht op associatie met paniekstoornis, met bijzondere aandacht voor mogelijke effecten van geslacht en omgevingsfactoren.",
"De huidige pilotgegevens suggereren een potentiële rol van MAOA-gen hypomethylatie in de pathogenese van paniekstoornis, met name bij vrouwelijke patiënten, mogelijk bemiddelend een nadelige invloed van negatieve levensgebeurtenissen.",
"De MAOA-promotor was hypergemethyleerd direct stroomopwaarts van het startcodon in cholangiocarcinoommonsters en cellijnen, maar niet in niet-maligne tegenhangers.",
"MAOA-promotormethylatie en vatbaarheid voor carotisatherosclerose: rol van familiale factoren in een monozygote tweelingsteekproef.",
"Omdat tweelingen die samen zijn opgevoed vroege levenservaringen delen, die een langdurige epigenetische markering kunnen achterlaten, kan abnormale MAOA-methylatie een vroege biomarker zijn voor een ongezonde familiale omgeving.",
"Effecten van MAOA-promotormethylatie op vatbaarheid voor paranoïde schizofrenie.",
"Concluderend kunnen afwijkingen in DNA-methylatie bij de MAOA-promotor geassocieerd zijn met schizofrenie bij mannen.",
"In onze studie analyseerden we DNA-methylatiepatronen van 14 neuropsychiatrische genen (COMT, DAT1, GABRA1, GNB3, GRIN2B, HTR1B, HTR2A, 5-HTT, MAOA, MAOB, NOS1, NR3C1, TPH1 en TH). D",
"Onze gegevens suggereren dat afwijkende epigenetische regulatie van neuropsychiatrische genen kan bijdragen aan de pathogenese van BPD.",
"We concluderen dat roken betrouwbaar de MAOA-methylatie verlaagt, maar de exacte karakterisering van effecten op het methylatieniveau hangt af van genotype, rookgeschiedenis, huidige rookstatus, geslacht en het onderzochte gebied van het promotor-geassocieerde CpG-eiland.",
"Aangezien DNA-methylatie gekoppeld is aan de regulatie van genexpressie, stelden we de hypothese dat epigenetische mechanismen een rol spelen in de expressie van MAOA.",
"De uitgebreide MAOA-regulerende regio bevat twee CpG-eilanden (CGI's), waarvan er één overlapt met de canonieke MAOA-promotor en de andere verder stroomopwaarts ligt; beide CGI's vertonen gevoeligheid voor differentiële methylatie.",
"Identificatie en karakterisering van vermeende methylatiedoelen in de MAOA-locus met behulp van bio-informatica.",
"DNA-methylatie is een belangrijk epigenetisch mechanisme betrokken bij de ontwikkelingsregulatie van genexpressie.",
"MAOA-methylatie wordt geassocieerd met nicotine- en alcoholafhankelijkheid bij vrouwen.",
"In de afgelopen jaren is de rol van epigenetische fenomenen, zoals methylatie, bij het beïnvloeden van kwetsbaarheid voor gedragsziekten steeds meer erkend. Een prominente locus waar epigenetische fenomenen vermoedelijk een rol spelen, is de monoamine-oxidase A (MAOA) locus.",
"We concluderen dat methylatie van MAOA een significante rol kan spelen bij veelvoorkomende psychiatrische aandoeningen en dat verdere studie van epigenetische processen op deze locus gewenst is.",
"Analyse van CpG-methylatie in het MAOA-promotorgebied toonde aanzienlijke methylatie aan bij vrouwen, maar niet bij mannen.",
"Daarom wordt allelische mRNA-expressie beïnvloed door genetische en epigenetische gebeurtenissen, die beide het potentieel hebben om de biogene aminetoon in het centraal zenuwstelsel te moduleren."
] | 542
| 492
|
157
|
Welke mutaties van fosfolamban zijn gevonden bij patiënten met cardiomyopathie?
|
PLN-mutatie R14del [of c.40_42delAGA(p.Arg14del)] werd geïdentificeerd bij 12 (12%) ARVC-patiënten en bij 39 (15%) DCM-patiënten. Een andere PLN-mutatie is een T116G puntmutatie, waarbij een stopcodon wordt vervangen door Leu-39 (L39stop), en deze werd gevonden in twee families met erfelijke hartfalen. Erfelijke mutanten van fosfolamban, zoals Arg(9) naar Cys, Arg(9) naar Leu, Arg(9) naar His, veroorzaken dodelijke, erfelijke gedilateerde cardiomyopathie. Specifiek presenteerden twee patiënten een G-T missense mutatie op het G26 nucleotide, wat een Arg-Leu substitutie op codon 9 (R9L) codeert. Eén patiënt had een G-A missense mutatie op hetzelfde nucleotide, wat een Arg-His substitutie op codon 9 (R9H) codeert. Een missense mutatie in het cytoplasmatische domein van PLN (R9C) veroorzaakt gedilateerde cardiomyopathie bij mensen, leidend tot voortijdige dood.
|
[
"Bij 19 van de 142 patiënten (13%) werd de PLN-founder mutatie c.40_42delAGA (p.Arg14del) geïdentificeerd. Dragers van de PLN-mutatie hadden vaker laag-voltage elektrocardiogrammen (p = 0,004), omgekeerde T-golven in leads V4 tot V6 (p <0,001), en aanvullende structurele (p = 0,007) of functionele (p = 0,017) linker ventrikelstoornissen, terwijl dragers van desmosomale mutaties vaker solitaire rechter ventrikelafwijkingen hadden.",
"Recent toonden we aan dat de c.40_42delAGA (p.Arg14del) mutatie in het fosfolamban (PLN) gen kan worden geïdentificeerd bij 10-15% van de Nederlandse patiënten met gedilateerde cardiomyopathie of aritmogene cardiomyopathie.",
"PLN-mutatie R14del werd geïdentificeerd bij 12 (12%) ARVC-patiënten en bij 39 (15%) DCM-patiënten.",
"De PLN R14del founder mutatie is aanwezig bij een aanzienlijk aantal patiënten die klinisch zijn gediagnosticeerd met DCM of ARVC. R14del+ patiënten gediagnosticeerd met DCM vertoonden een aritmogeen fenotype, en plotselinge hartdood op jonge leeftijd kan het eerste symptoom zijn. Deze bevindingen ondersteunen het concept van 'aritmogene cardiomyopathie'.",
"Hier onthullen we mechanistische inzichten in hoe vier erfelijke mutanten van fosfolamban, Arg(9) naar Cys, Arg(9) naar Leu, Arg(9) naar His, en Arg(14) deletie, de regulatie van SERCA veranderen. Deletie van Arg(14) verstoort het herkenningsmotief van proteïnekinase A, wat fosfolamban fosforylering uitschakelt en resulteert in constitutieve SERCA-remming. Mutatie van Arg(9) veroorzaakt complexere functionele veranderingen, waarbij hydrofobe substituties zoals cysteïne en leucine zowel SERCA-remming als fosfolamban fosforylering elimineren, terwijl een aromatische substitutie zoals histidine selectief de fosforylering verstoort. We tonen aan dat de rol van Arg(9) in fosfolambanfunctie veelzijdig is: het is belangrijk voor remming van SERCA, verhoogt de efficiëntie van fosforylering, en is cruciaal voor proteïnekinase A herkenning in de context van het fosfolamban pentameer. Gezien de synergetische gevolgen voor contractiliteit is het niet verrassend dat de mutanten dodelijke, erfelijke gedilateerde cardiomyopathie veroorzaken.",
"Fosfolamban (PLN) is een belangrijke regulator van het SR en de hartfunctie, en PLN-mutaties bij mensen zijn geassocieerd met gedilateerde cardiomyopathie (DCM). We rapporteerden eerder de deletie van het sterk geconserveerde aminozuur arginine 14 (nucleotiden 39, 40 en 41) bij DCM-patiënten.",
"Om de functie van deze mutant PLN te beoordelen, introduceerden we de PLN-R14Del in hartspiercellen van de PLN-null muis.",
"Dus, menselijke PLN-R14Del wordt verkeerd gerouteerd naar het sarcolemma, in afwezigheid van endogene PLN, en verandert de NKA-activiteit, wat leidt tot hartremodellering.",
"Mutaties in het gen dat PLN codeert zijn geassocieerd met idiopathische gedilateerde cardiomyopathie; echter is er geen systematisch onderzoek naar PLN-mutaties bij hartfalen uitgevoerd.",
"Twee patiënten presenteerden een G-T missense mutatie op het G26 nucleotide, wat een Arg-Leu substitutie op codon 9 (R9L) codeert.",
"Eén patiënt presenteerde een G-A missense mutatie op hetzelfde nucleotide, wat een Arg-His substitutie op codon 9 (R9H) codeert. De vierde aangedane patiënt had een T-G nonsense mutatie op nucleotide 116, waarbij een stopcodon wordt vervangen voor Leu-39 (L39stop).",
"De genetische analyse richtte zich op de R9C-mutatie met het vermogen om PLN-fosforylering te blokkeren, wat leidt tot chronische remming van SERCA2a-activiteit. Een andere geanalyseerde mutatie die het PLN-niveau in cellen veranderde, hield verband met de substitutie van een leucine-residu op positie 39 door een voortijdig stopcodon (L39X).",
"Een missense mutatie in het cytoplasmatische domein van PLN (R9C) veroorzaakt gedilateerde cardiomyopathie bij mensen, leidend tot voortijdige dood.",
"Deze effecten worden versterkt onder oxiderende omstandigheden, wat suggereert dat oxidatieve stress de cardiotoxische effecten van de PLN(R9C) mutant kan verergeren.",
"We identificeerden 1 familie met een deletie van arginine 14 in PLN. Interessant is dat, in tegenstelling tot andere individuen met dezelfde PLN-mutatie, deze personen pas in hun zevende decennium werden gediagnosticeerd met gedilateerde cardiomyopathie, toen ze slechts mild symptomatisch waren met congestief hartfalen.",
"Fosfolamban R14 deletie resulteert in laat optredende, milde, erfelijke gedilateerde cardiomyopathie.",
"Door genetische screening van patiënten met gedilateerde cardiomyopathie identificeerden we een eerder niet-gekarakteriseerde deletie van arginine 14 (PLN-R14Del) in het coderende gebied van het fosfolamban (PLN) gen in een grote familie met erfelijk hartfalen. Er werden geen homozygote individuen gevonden. Rond de middelbare leeftijd ontwikkelden heterozygote individuen linker ventrikel dilatatie, contractiestoornissen en episodische ventrikelaritmieën, met in sommige gevallen duidelijk hartfalen.",
"Transgene muizen die de mutant PLN-R14Del overexpressen, vertoonden een vergelijkbare cardiomyopathie als bij mensen, met vergelijkbare histopathologische afwijkingen en voortijdige dood.",
"Een mutatie in het menselijke fosfolamban-gen, waarbij arginine 14 wordt verwijderd, resulteert in dodelijke, erfelijke cardiomyopathie.",
"Hier werd een T116G puntmutatie geïdentificeerd, waarbij een stopcodon wordt vervangen door Leu-39 (L39stop), in twee families met erfelijk hartfalen. De heterozygote individuen vertoonden hypertrofie zonder verminderde contractiele prestaties. Opmerkelijk ontwikkelden beide homozygote individuen voor L39stop gedilateerde cardiomyopathie en hartfalen, wat leidde tot harttransplantatie op 16 en 27-jarige leeftijd.",
"Hier rapporteren we dat een erfelijke menselijke gedilateerde cardiomyopathie met refractair congestief hartfalen wordt veroorzaakt door een dominante Arg --> Cys missense mutatie op residu 9 (R9C) in fosfolamban (PLN), een transmembraan fosfoproteïne dat de cardiale sarcoplasmatische reticulum Ca2+-adenosinetrifosfatase (SERCA2a) pomp remt. Transgene PLN(R9C) muizen vertoonden menselijke hartfalen met voortijdige dood. Cellulaire en biochemische studies toonden aan dat, in tegenstelling tot wildtype PLN, PLN(R9C) SERCA2a niet direct remde. In plaats daarvan ving PLN(R9C) proteïnekinase A (PKA), wat PKA-gemedieerde fosforylering van wildtype PLN blokkeerde en daardoor de afname van calciumtransiënten in myocyten vertraagde.",
"Fosfolamban R14del mutatie bij patiënten gediagnosticeerd met gedilateerde cardiomyopathie of aritmogene rechter ventrikel cardiomyopathie: bewijs ter ondersteuning van het concept van aritmogene cardiomyopathie.",
"De PLN -42 C>G mutatie werd gevonden bij één patiënt met laat optredende familiale apicale hypertrofische cardiomyopathie."
] | 996
| 970
|
158
|
Wat zijn de aanvullende antioxidanten bij atleten?
|
Er zijn verschillende antioxidant supplementen die tot verschillende families behoren, zoals vitamines, polyfenolen, alfa-liponzuur, ubiquinonen, n-3 meervoudig onverzadigde vetzuren (PUFA's), mineralen en anderen. Ondanks het wijdverbreide gebruik van deze supplementen, wordt hun werkelijke nut nog steeds betwist en wordt het gebruik ervan bij atleten niet unaniem aanbevolen.
|
[
"Hoewel deze supplementen steeds vaker worden gebruikt door masteratleten, zijn er zeer weinig gegevens beschikbaar over hun effecten op oxidatieve stress, spierherstel en fysieke prestaties. De potentiële voordelen van supplementgebruik bij atleten zijn dus twijfelachtig. Sommige studies geven geen voordelen aan, terwijl andere mogelijke negatieve bijwerkingen van vitamine-suppletie benadrukken.",
"Deze gegevens geven aan dat RQ de door inspanning geïnduceerde lipidenperoxidatie significant vermindert zonder geassocieerde veranderingen in ontsteking of plasma-antioxidantstatus.",
"Cr-suppletie remde de toename van ontstekingsmarkers TNF-α en CRP, maar niet van oxidatieve stressmarkers, veroorzaakt door acute inspanning.",
"Quercetine- en vitamine C-suppletie kunnen mogelijk niet gunstig zijn voor verbetering van het lipidenprofiel, hoewel het spierbeschadiging en het lichaamsvetpercentage kan verminderen.",
"Vitamines C en E-suppletie hadden geen significant effect op een van de bestudeerde parameters.",
"De effecten van de twee behandelingen ten opzichte van placebo op de gemiddelde prestatie in de incrementele test en tijdrit waren onduidelijk, maar lopers die sneller waren met 1 SD van de pieksnelheid toonden een mogelijke verbetering van de pieksnelheid met BC-sap (1,9%; ±2,5%).",
"Trainingsstatus correleert sterker met antioxidantstatus dan dieet.",
"Daarom kunnen we concluderen dat Biostimine-suppletie het postinspanningniveau van TBARS verlaagt door de antioxidantactiviteit van plasma te verhogen, maar geen effect heeft op ontstekingsmarkers.",
"Suppletie met Asx zou de door inspanning geïnduceerde productie van vrije radicalen en uitputting van niet-enzymatische antioxidantverdediging bij jonge voetballers kunnen voorkomen.",
"Samenvattend geven deze resultaten aan dat behandeling met melatonine bij acute sportinspanning oxidatieve stress omkeert, de verdediging en het lipidenmetabolisme verbetert, wat zou resulteren in een verbetering van de fitheid.",
"CoQ(10)-suppletie vóór zware inspanning vermindert de oxidatieve stress en moduleert de ontstekingssignalisatie, waardoor de daaropvolgende spierschade wordt verminderd.",
"Tot nu toe zijn de positieve therapeutische voordelen van Cr bij verschillende oxidatieve stress-gerelateerde ziekten in de literatuur gerapporteerd en recentelijk is ook aangetoond dat Cr directe antioxidante effecten uitoefent.",
"Deze resultaten geven aan dat Cr-suppletie oxidatieve DNA-schade en lipidenperoxidatie, veroorzaakt door een enkele sessie weerstandstraining, verminderde.",
"Niettemin wordt, op basis van het groeiende bewijs dat veel atletische populaties een vitamine D-tekort of -insufficiëntie hebben, aanbevolen dat atleten hun serum vitamine D-concentratie monitoren en overleggen met hun zorgverlener en/of voedingsdeskundige om te bepalen of zij gezondheidsvoordelen zouden hebben bij vitamine D-suppletie.",
"Deze studie onderzocht de effecten van 1.000 mg quercetine + 1.000 mg vitamine C (QC); 1.000 mg quercetine, 1.000 mg vitamine C, 400 mg isoquercetine, 30 mg epigallocatechinegallaat en 400 mg n-3 vetzuren (QFO).",
"De twee stammen, L. rhamnosus IMC 501(®) en L. paracasei IMC 502(®), oefenen sterke antioxidantactiviteit uit. Atleten en iedereen die wordt blootgesteld aan oxidatieve stress kunnen profiteren van het vermogen van deze probiotica om antioxidantniveaus te verhogen en de effecten van reactieve zuurstofsoorten te neutraliseren.",
"Deze resultaten geven aan dat suppletie met n-3 LCPUFA's de oxidatieve stress in rust en na een judo-trainingssessie significant verhoogde.",
"Rhodiola Rosea is een adaptogene plant waarvan is gerapporteerd dat het het gebruik van vetzuren bevordert, de antioxidantfunctie verbetert en de lichaamsweerstand tegen fysieke inspanningen verhoogt.",
"Suppletie met antioxidant vitamine E bij atleten van 267 mg (400 IUs) of meer is gerapporteerd om de niveaus van lipidenperoxidatie geassocieerd met inspanning te verminderen.",
"De aan het einde van de studie verkregen resultaten geven aan dat zinksuppletie de productie van vrije radicalen voorkomt door het activeren van het antioxidantsysteem.",
"De significante toename van de onverzadigde index (UI) van erytrocytenmembranen duidt op potentieel schadelijke effecten, omdat een hoge inname van PUFA de vatbaarheid voor lipidenperoxidatie kan verhogen die niet wordt gecompenseerd door een hogere toename van de totale antioxidantactiviteit (TAA). Het naleven van het mediterrane dieet lijkt de betere keuze.",
"Een aantal klinische onderzoeken zijn met succes uitgevoerd met wei- en/of soja-eiwitten bij de behandeling van veel ziekten. Beide hebben antioxidante eigenschappen, wat ook een factor lijkt te zijn bij aerobe fysieke prestaties.",
"Het antioxidante effect van de twee eiwitten is gebaseerd op verschillende werkingsmechanismen."
] | 676
| 660
|
159
|
Is het glycyl-tRNA synthetase-gen betrokken bij de ontwikkeling van de ziekte van Charcot-Marie-Tooth?
|
Dominante mutaties in GARS, dat het essentiële enzym glycyl-tRNA synthetase (GlyRS) codeert, leiden tot een vorm van de ziekte van Charcot-Marie-Tooth, type 2D (CMT2D), die voornamelijk wordt gekenmerkt door degeneratie van de lagere motorische zenuwen.
|
[
"De ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D (CMT2D) is een autosomaal-dominante axonale perifere neuropathie die wordt gekenmerkt door een verminderde motorische en sensorische functie in de distale extremiteiten. Mutaties in het glycyl-tRNA synthetase (GARS) gen veroorzaken CMT2D.",
"Dominante mutaties in GARS veroorzaken zeldzame vormen van de ziekte van Charcot-Marie-Tooth en distale spinale musculaire atrofie.",
"Met behulp van exoomsequencing werd vastgesteld dat zij samengestelde heterozygote mutaties in het glycyl-tRNA synthetase (GARS) gen draagt.",
"Mutaties in het menselijke GlyRS (hGlyRS) werden ook in verband gebracht met de ziekte van Charcot-Marie-Tooth.",
"Dominante mutaties in GARS, dat het essentiële enzym glycyl-tRNA synthetase (GlyRS) codeert, leiden tot een vorm van de ziekte van Charcot-Marie-Tooth, type 2D (CMT2D), die voornamelijk wordt gekenmerkt door degeneratie van de lagere motorische zenuwen.",
"Een nieuwe mutatie in glycyl-tRNA synthetase veroorzaakte de ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D met betrokkenheid van de gezichtsspieren en ademhalingsspieren.",
"Hier beschrijven we een 45-jarige vrouw met een langdurige motorisch-dominante neuropathie. Distale zwakte verscheen in de kindertijd en verergerde met de leeftijd. Na de diagnose CMT type 2 namen de symptomen toe, en in haar vierde decennium trad zwakte van de gezichtsspieren en ademhalingsspieren op, wat uiteindelijk niet-invasieve mechanische ventilatie noodzakelijk maakte. Er was geen familiegeschiedenis van CMT. Uitgebreide analyse van bekende CMT-gerelateerde genen toonde een nieuwe heterozygote c.815T>A, p.L218Q mutatie in glycyl-tRNA synthetase (GARS), een oorzakelijk gen voor zowel CMT type 2D (CMT2D) als distale spinale musculaire atrofie type V (dSMA-V).",
"De ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D (CMT2D) is een dominant overervende perifere neuropathie veroorzaakt door missense mutaties in het glycyl-tRNA synthetase-gen (GARS).",
"Langafstand structurele effecten van een ziekte van Charcot-Marie-Tooth veroorzakende mutatie in menselijk glycyl-tRNA synthetase.",
"Mutaties in glycyl tRNA synthetase bij ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D en distale spinale musculaire atrofie type V.",
"[Een nieuwe mutatie in glycyl-tRNA synthetase veroorzaakte ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D met betrokkenheid van gezichtsspieren en ademhalingsspieren].",
"Glycyl-tRNA synthetase (GARS), dat het enzym codeert dat verantwoordelijk is voor het beladen van tRNA(Gly) met glycine in zowel het cytoplasma als de mitochondriën, wordt in verband gebracht met ziekte van Charcot-Marie-Tooth 2D (CMT2D) en distale erfelijke motorische neuropathie type V (dHMN-V).",
"Deze aanvullende functies kunnen verklaren waarom dominante mutaties in glycyl-tRNA synthetase (GlyRS) en tyrosyl-tRNA synthetase de ziekte van Charcot-Marie-Tooth (CMT) veroorzaken, de meest voorkomende erfelijke ziekte van het perifere zenuwstelsel.",
"Hier rapporteren we de identificatie van vier ziekte-geassocieerde missense mutaties in het glycyl tRNA synthetase-gen in families met CMT2D en dSMA-V.",
"Mutaties in het glycyl-tRNA synthetase (GARS) gen veroorzaken CMT2D.",
"Van de vele erfelijke perifere neuropathieën van Charcot-Marie-Tooth wordt type 2D (CMT2D) veroorzaakt door dominante puntmutaties in het GARS-gen, dat glycyl tRNA synthetase (GlyRS) codeert.",
"De ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D (CMT2D) is een dominant overervende perifere neuropathie veroorzaakt door missense mutaties in het glycyl-tRNA synthetase-gen (GARS).",
"De ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D is een erfelijke axonale neuropathie geassocieerd met glycyl-tRNA synthetase (GARS) die wordt veroorzaakt door een mutatie in GARS.",
"Langafstand structurele effecten van een ziekte van Charcot-Marie-Tooth veroorzakende mutatie in menselijk glycyl-tRNA synthetase.",
"Deze aanvullende functies kunnen verklaren waarom dominante mutaties in glycyl-tRNA synthetase (GlyRS) en tyrosyl-tRNA synthetase de ziekte van Charcot-Marie-Tooth (CMT) veroorzaken, de meest voorkomende erfelijke ziekte van het perifere zenuwstelsel.",
"Een nieuwe mutatie in glycyl-tRNA synthetase veroorzaakte de ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D met betrokkenheid van gezichtsspieren en ademhalingsspieren.",
"De ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D (CMT2D) is een dominant overervende perifere neuropathie veroorzaakt door missense mutaties in het glycyl-tRNA synthetase-gen (GARS).",
"Mutaties in het glycyl-tRNA synthetase (GARS) gen veroorzaken CMT2D.",
"Een ENU-geïnduceerde mutatie in muis glycyl-tRNA synthetase (GARS) veroorzaakt perifere sensorische en motorische fenotypen en creëert een model van Charcot-Marie-Tooth type 2D perifere neuropathie.",
"We hebben eerder mutaties in het gen dat glycyl-tRNA synthetase (GARS) codeert geïmpliceerd als oorzaak van CMT2D en dSMA-V.",
"Een actieve dominante mutatie van glycyl-tRNA synthetase veroorzaakt neuropathie in een muismodel van Charcot-Marie-Tooth 2D.",
"De ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D is een erfelijke axonale neuropathie geassocieerd met glycyl-tRNA synthetase (GARS) die wordt veroorzaakt door een mutatie in GARS.",
"Dominante mutaties in GARS, dat het essentiële enzym glycyl-tRNA synthetase (GlyRS) codeert, leiden tot een vorm van de ziekte van Charcot-Marie-Tooth, type 2D (CMT2D), die voornamelijk wordt gekenmerkt door degeneratie van de lagere motorische zenuwen.",
"De ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D (CMT2D) is een dominant overervende perifere neuropathie veroorzaakt door missense mutaties in het glycyl-tRNA synthetase-gen (GARS). Naast GARS veroorzaken mutaties in drie andere tRNA synthetase-genen vergelijkbare neuropathieën, hoewel de onderliggende mechanismen niet volledig worden begrepen.",
"Deze aanvullende functies kunnen verklaren waarom dominante mutaties in glycyl-tRNA synthetase (GlyRS) en tyrosyl-tRNA synthetase de ziekte van Charcot-Marie-Tooth (CMT) veroorzaken.",
"De ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D (CMT2D) is een autosomaal-dominante axonale perifere neuropathie die wordt gekenmerkt door een verminderde motorische en sensorische functie in de distale extremiteiten. Mutaties in het glycyl-tRNA synthetase (GARS) gen veroorzaken CMT2D.",
"Van de vele erfelijke perifere neuropathieën van Charcot-Marie-Tooth wordt type 2D (CMT2D) veroorzaakt door dominante puntmutaties in het GARS-gen, dat glycyl tRNA synthetase (GlyRS) codeert.",
"De ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D (CMT2D) is een dominant overervende perifere neuropathie veroorzaakt door missense mutaties in het glycyl-tRNA synthetase-gen (GARS).",
"Langafstand structurele effecten van een ziekte van Charcot-Marie-Tooth veroorzakende mutatie in menselijk glycyl-tRNA synthetase.",
"Mutaties in glycyl tRNA synthetase bij ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D en distale spinale musculaire atrofie type V.",
"Deze aanvullende functies kunnen verklaren waarom dominante mutaties in glycyl-tRNA synthetase (GlyRS) en tyrosyl-tRNA synthetase de ziekte van Charcot-Marie-Tooth (CMT) veroorzaken, de meest voorkomende erfelijke ziekte van het perifere zenuwstelsel.",
"Een nieuwe mutatie in glycyl-tRNA synthetase veroorzaakte de ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2D met betrokkenheid van gezichtsspieren en ademhalingsspieren.",
"Een actieve dominante mutatie van glycyl-tRNA synthetase veroorzaakt neuropathie in een muismodel van Charcot-Marie-Tooth 2D.",
"Glycyl-tRNA synthetase (GARS), dat het enzym codeert dat verantwoordelijk is voor het beladen van tRNA(Gly) met glycine in zowel het cytoplasma als de mitochondriën, wordt in verband gebracht met ziekte van Charcot-Marie-Tooth 2D (CMT2D) en distale erfelijke motorische neuropathie type V (dHMN-V)."
] | 900
| 981
|
160
|
Is er software voor geautomatiseerde analyse van FISH-beelden?
|
FISH is een populaire moleculaire cytogenetische methode. Het resultaat van een enkele FISH-analyse is een set van enkele tientallen tot honderden microscopische beelden — een enkele geëvalueerde monster heeft een diameter van ongeveer 20 mm. Het doel van een geautomatiseerde evaluatie is om de subjectieve beoordeling van beelden door de laboratoriumtechnicus te vervangen om een hogere uniformiteit van de resultaten te bereiken. Na een uitleg van het principe van de methode en de typische inhoud van beelden, wordt de verwerkingsstroom van beeldsegmentatie geschetst en worden de resultaten gepresenteerd aan de hand van verschillende voorbeeldbeelden. Op basis van de resultaten is er software voor geautomatiseerde analyse van FISH-beelden.
|
[
"De studie toonde de haalbaarheid aan van geautomatiseerde FISH-signaalanalyse door een CAD-schema toe te passen op de automatisch gegenereerde 2D-projectiebeelden.",
"Een kleurbeeldtechniek, multiplex fluorescent in situ hybridisatie (M-FISH), is ontwikkeld om de analyse van het proces te vergemakkelijken. Met behulp van een M-FISH-techniek wordt elke chromosoomklasse (1,2, …,22,X,Y) gekleurd met een unieke kleur. Er worden echter aanzienlijke variaties tussen beelden waargenomen als gevolg van verschillende factoren zoals ongelijke hybridisatie en spectrale overlap tussen kanalen. Deze soorten variaties beïnvloeden de pixelclassificatie-nauwkeurigheid van beeldclassificatiemethoden die begeleid zijn en een set geannoteerde beelden voor training vereisen. In dit artikel presenteren we een volledig onbewaakte M-FISH chromosoombeeldclassificatiemethodologie. Onze belangrijkste bijdragen zijn 1) de aanname dat de intensiteit van een chromosoompixel wordt bemonsterd uit meerdere Gaussiaanse componenten [Gaussiaans mengmodel (GMM)] zodat elke component overeenkomt met één chromosoomklasse, en 2) de initialisatie van het GMM-model met behulp van de emissie-informatie van elke chromosoomklasse. Dit is haalbaar omdat we vóór het verkrijgen van het M-FISH-beeld al weten welke chromosoomklasse uitzendt naar elk van de vijf M-FISH-beeldkanalen. De methode is getest op een groot aantal M-FISH-beelden en een totale nauwkeurigheid van 89,85% wordt gerapporteerd. Onze methode is onbewaakt en toont een hogere classificatienauwkeurigheid, zelfs vergeleken met gangbare begeleide methoden.",
"Hybridisatietests (FISH) bieden veelbelovende moleculaire beeldvormingsbiomarkers om kankers en genetische aandoeningen nauwkeuriger en betrouwbaarder te detecteren en diagnosticeren. Aangezien de huidige handmatige FISH-signaalanalyse inefficiënt en inconsistent is, wat de klinische bruikbaarheid beperkt, trekt de ontwikkeling van geautomatiseerde FISH-beeldscansystemen en computerondersteunde detectieschema's (CAD) onderzoeksinteresse aan. Om hoge-resolutie FISH-beelden te verkrijgen in een multispectrale scanmodus, wordt een enorme hoeveelheid beeldgegevens gegenereerd met een stapel van meerdere driedimensionale (3D) beeldslices van een enkel monster. Het automatisch voorbewerken van deze gescande beelden om niet-nuttige en redundante gegevens te elimineren is belangrijk om geautomatiseerde FISH-tests acceptabel te maken in klinische toepassingen. In deze studie werd een dual-detector fluorescentiebeeldscansysteem toegepast om vier monsterslides met FISH-gelabelde chromosoom X te scannen. Een CAD-schema werd ontwikkeld om analyseerbare interfasecellen te detecteren en de meerdere beeldslices met geregistreerde FISH-gelabelde signalen om te zetten in 2D-projectiebeelden. Het CAD-schema werd vervolgens toegepast op elk projectiebeeld om analyseerbare interfasecellen te detecteren met een adaptief meervoudig-drempelalgoritme, FISH-gelabelde signalen te identificeren met een top-hat-transformatie, en de verhoudingen tussen normale en abnormale cellen te berekenen. Om de CAD-prestaties te beoordelen, werden de FISH-gelabelde signalen ook onafhankelijk visueel gedetecteerd door een waarnemer. De Kappa-coëfficiënten voor overeenstemming tussen CAD en waarnemer varieerden van 0,69 tot 1,0 bij het detecteren/tellen van FISH-signaalpunten in vier testmonsters.",
"In dit artikel ontwikkelden we een classificatie-algoritme op basis van spaarzame representatie (SRC) gebaseerd op L1-norm minimalisatie voor het classificeren van chromosomen uit multikleur fluorescent in situ hybridisatie (M-FISH) beelden. Het algoritme is getest op een uitgebreide M-FISH-database die we hebben opgezet, wat verbeterde prestaties in classificatie aantoont. Vergeleken met andere pixelgewijze M-FISH-beeldclassificatoren zoals fuzzy c-means (FCM) clusteringalgoritmen en adaptieve fuzzy c-means (AFCM) clusteringalgoritmen die we eerder voorstelden, gaf de huidige methode de laagste classificatiefout. Om de prestaties van verschillende SRC-methoden voor M-FISH beeldanalyse te evalueren, werden drie verschillende spaarzame representatiemethoden getest en vergeleken, namelijk de Homotopy-methode, Orthogonal Matching Pursuit (OMP) en Least Angle Regression (LARS). Resultaten van onze statistische analyse toonden aan dat de op Homotopy gebaseerde methode significant beter is dan de andere twee methoden.",
"Fluorescent in situ hybridisatie (FISH) wordt gebruikt om de organisatie en positionering van specifieke DNA-sequenties binnen de celkern te bestuderen. Het analyseren van gegevens uit FISH-beelden is een tijdrovend proces dat een element van subjectiviteit met zich meebrengt. Geautomatiseerde FISH-beeldanalyse bespaart tijd en biedt het voordeel van objectieve data-analyse. Hoewel verschillende FISH-beeldanalysetools zijn ontwikkeld, gebruiken ze vaak een drempelgebaseerd segmentatiealgoritme voor kernsegmentatie. Aangezien fluorescerende signaalintensiteiten aanzienlijk kunnen variëren van experiment tot experiment, van cel tot cel en binnen een cel, is drempelgebaseerde segmentatie inflexibel en vaak onvoldoende voor automatische beeldanalyse, wat leidt tot extra handmatige segmentatie en mogelijke subjectieve bias. Om deze problemen te overwinnen, ontwikkelden we een grafische softwaretool genaamd FISH Finder om FISH-beelden die aanzienlijk variëren automatisch te analyseren. Door kernsegmentatie als een classificatieprobleem te formuleren, wordt een samengestelde Bayesiaanse classifier gebruikt zodat contextuele informatie wordt benut, wat resulteert in betrouwbare classificatie en grensextractie. Dit maakt het mogelijk om FISH-beelden efficiënt en objectief te analyseren zonder aanpassing van invoerparameters. Bovendien is FISH Finder ontworpen om de afstanden tussen verschillend gekleurde FISH-probes te analyseren.",
"De gelijktijdige detectie van eiwitexpressie en veranderingen in genkopieaantal in patiëntmonsters, zoals paraffine-ingebedde weefselsecties, is uitdagend omdat de procedures van immunohistochemie (IHC) en fluorescent in situ hybridisatie (FISH) elkaar negatief beïnvloeden, wat vaak resulteert in suboptimale kleuring. Daarom ontwikkelden we een nieuw geautomatiseerd algoritme gebaseerd op relocatie dat de daaropvolgende detectie van eiwitinhoud en veranderingen in genkopieaantal binnen dezelfde cel mogelijk maakt. METHODEN: Paraffine-ingebedde weefselsecties van colorectale kankers werden gekleurd voor CD133-expressie. IHC-beelden werden verkregen en beeldcoördinaten geregistreerd. Slides werden vervolgens gehybridiseerd met fluorescent gelabelde DNA-probes. FISH-beelden werden genomen op de eerder geregistreerde posities, wat directe vergelijking van eiwitexpressie en genkopieaantal signalen binnen dezelfde cellen/weefselgebieden mogelijk maakt. Relocatie, acquisitie van de IHC- en FISH-beelden, en telling van FISH-signalen in de immunofenotypeerde tumorgebieden werden geautomatiseerd uitgevoerd. RESULTATEN: Geautomatiseerde FISH-analyse werd uitgevoerd op 13 verschillende colonkankermonsters die voor CD133 waren gekleurd; elk monster werd gescoord voor MYC, ZNF217 en Chromosoom 6 in CD133-positieve en negatieve klieren. Van de 13 gevallen toonden vier (31%) amplificatie van het MYC-oncogen en zeven van de 13 (54%) gevallen waren versterkt voor ZNF217.",
"De gelijktijdige detectie van eiwitexpressie en veranderingen in genkopieaantal in patiëntmonsters, zoals paraffine-ingebedde weefselsecties, is uitdagend omdat de procedures van immunohistochemie (IHC) en fluorescent in situ hybridisatie (FISH) elkaar negatief beïnvloeden, wat vaak resulteert in suboptimale kleuring. Daarom ontwikkelden we een nieuw geautomatiseerd algoritme gebaseerd op relocatie dat de daaropvolgende detectie van eiwitinhoud en veranderingen in genkopieaantal binnen dezelfde cel mogelijk maakt. METHODEN: Paraffine-ingebedde weefselsecties van colorectale kankers werden gekleurd voor CD133-expressie. IHC-beelden werden verkregen en beeldcoördinaten geregistreerd. Slides werden vervolgens gehybridiseerd met fluorescent gelabelde DNA-probes. FISH-beelden werden genomen op de eerder geregistreerde posities, wat directe vergelijking van eiwitexpressie en genkopieaantal signalen binnen dezelfde cellen/weefselgebieden mogelijk maakt. Relocatie, acquisitie van de IHC- en FISH-beelden, en telling van FISH-signalen in de immunofenotypeerde tumorgebieden werden geautomatiseerd uitgevoerd. RESULTATEN: Geautomatiseerde FISH-analyse werd uitgevoerd op 13 verschillende colonkankermonsters die voor CD133 waren gekleurd; elk monster werd gescoord voor MYC, ZNF217 en Chromosoom 6 in CD133-positieve en negatieve klieren. Van de 13 gevallen toonden vier (31%) amplificatie van het MYC-oncogen en zeven van de 13 (54%) gevallen waren versterkt voor ZNF217. Er was geen significant verschil tussen CD133-positieve tumor- en CD133-negatieve tumorcellen.",
"De gelijktijdige detectie van eiwitexpressie en veranderingen in genkopieaantal in patiëntmonsters, zoals paraffine-ingebedde weefselsecties, is uitdagend omdat de procedures van immunohistochemie (IHC) en fluorescent in situ hybridisatie (FISH) elkaar negatief beïnvloeden, wat vaak resulteert in suboptimale kleuring. Daarom ontwikkelden we een nieuw geautomatiseerd algoritme gebaseerd op relocatie dat de daaropvolgende detectie van eiwitinhoud en veranderingen in genkopieaantal binnen dezelfde cel mogelijk maakt. Methoden: Paraffine-ingebedde weefselsecties van colorectale kankers werden gekleurd voor CD133-expressie. IHC-beelden werden verkregen en beeldcoördinaten geregistreerd. Slides werden vervolgens gehybridiseerd met fluorescent gelabelde DNA-probes. FISH-beelden werden genomen op de eerder geregistreerde posities, wat directe vergelijking van eiwitexpressie en genkopieaantal signalen binnen dezelfde cellen/weefselgebieden mogelijk maakt. Relocatie, acquisitie van de IHC- en FISH-beelden, en telling van FISH-signalen in de immunofenotypeerde tumorgebieden werden geautomatiseerd uitgevoerd. Resultaten: Geautomatiseerde FISH-analyse werd uitgevoerd op 13 verschillende colonkankermonsters die voor CD133 waren gekleurd; elk monster werd gescoord voor MYC, ZNF217 en Chromosoom 6 in CD133-positieve en negatieve klieren. Van de 13 gevallen toonden vier (31%) amplificatie van het MYC-oncogen en zeven van de 13 (54%) gevallen waren versterkt voor ZNF217. Er was geen significant verschil tussen CD133-positieve tumor- en CD133-negatieve tumorcellen."
] | 1,518
| 1,365
|
161
|
Hoe veroorzaken histonmethyltransferases histonmodificatie?
|
Histonmethyltransferases (HMT's) zijn verantwoordelijk voor de plaats-specifieke toevoeging van covalente modificaties op de histonstaarten, die dienen als markers voor de rekrutering van chromatine-organisatiecomplexen. Er zijn twee hoofdtypen HMT's: histon-lysine N-methyltransferases en histon-arginine N-methyltransferases. De eerste methyleren specifieke lysine (K) residuen zoals 4, 9, 27, 36 en 79 op histon H3 en residu 20 op histon H4. De laatste methyleren arginine (R) residuen zoals 2, 8, 17 en 26 op histon H3 en residu 3 op histon H4. Afhankelijk van welk residu wordt gemodificeerd en de mate van methylatie (mono-, di- en tri-methylatie), wordt lysinemethylatie van histonen gekoppeld aan ofwel transcriptioneel actief of stil chromatine.
|
[
"Lysinemethylatie van histonen wordt geassocieerd met zowel transcriptioneel actief chromatine als met stil chromatine, afhankelijk van welk residu wordt gemodificeerd. Histonmethyltransferases en demethylases zorgen ervoor dat histonmethylaties dynamisch zijn en kunnen variëren afhankelijk van de celcyclus- of ontwikkelingsfase.",
"Deze benadering identificeerde Txr1p als een histonmethyltransferase in Tetrahymena thermophila en karakteriseerde de relaties van de Txr1p en Ezl2p methyltransferases met histon H3 modificatie.",
"Histonmethyltransferases katalyseren plaats-specifieke afzetting van methylgroepen, waardoor de rekrutering van transcriptieregulatoren mogelijk wordt. Bij zoogdieren wordt trimethylatie van lysine 4 in histon H3, een modificatie gelokaliseerd bij de transcriptiestartplaatsen van actieve genen, gekatalyseerd door zes enzymen (SET1a en SET1b, MLL1-MLL4) waarvan de specifieke functies grotendeels onbekend zijn.",
"Epigenetische regulatie van genexpressie door covalente modificatie van histonen is belangrijk voor de ontwikkeling van kiemlijncellen. Bij zoogdieren spelen histon H3 lysine 9 (H3K9)-specifieke histonmethyltransferases (HMTases), zoals G9a, SETDB1 en SUV39H, een cruciale rol, maar de bijdrage van H3K9-specifieke HMTases in Drosophila moet nog worden opgehelderd, vooral in mannelijk sperma.",
"Door de distributie van histonmodificaties in kernen te analyseren met behulp van kwantitatieve fluorescentiemicroscopie, vonden we dat H4K16 acetylatie (H4K16ac) ondervertegenwoordigd is en H4K20 monomethylatie (H4K20me1) verrijkt is op hermafrodiete X-chromosomen op een DCC-afhankelijke wijze.",
"Hier vonden we de epigenetische modificatie van de BZLF1-promoter in latente Raji-cellen door histon H3 lysine 27 trimethylatie (H3K27me3), H3K9me2/me3 en H4K20me3.",
"Hoewel is aangetoond dat DNA-methyltransferases interageren met histonmethyltransferases zoals EZH2 (die histon H3 op lysine 27 methyleert) en G9a (die histon H3 op lysine 9 methyleert), is de relatie tussen DNA-methylatie en repressieve histonmerken nog niet volledig bestudeerd.",
"Methylatie van histon H4 lysine 20 (H4K20me) speelt een cruciale rol in diverse cellulaire processen zoals genexpressie, celcyclusprogressie en DNA-schadeherstel, waarbij elk van de drie methylatiestadia (mono-, di- en tri-methylatie) een unieke bijdrage levert.",
"Histon H3-lysine (K) 4, H3-K9 en H3-K27 modificaties in al deze vier genen werden onderzocht met chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay in HCC cellijnen.",
"De N-terminale staart van histon H4 wordt al lange tijd beschouwd als een belangrijke regulator in chromatinestructuur en functie.",
"Gentranscriptie wordt kritisch beïnvloed door chromatinestructuur en de modificatiestatus van histonstaarten. Methylatie van lysineresiduen in histonstaarten wordt dynamisch gereguleerd door de tegengestelde activiteiten van histonmethyltransferases en histondemethylases.",
"Het SAS3-afhankelijke NuA3 histonacetyltransferasecomplex werd oorspronkelijk geïdentificeerd op basis van zijn vermogen om histon H3 in vitro te acetylateren.",
"SU(VAR)3-9-achtige histonmethyltransferases controleren heterochromatische domeinen in eukaryoten.",
"Methylatie van positie-specifieke lysineresiduen in histon N-terminale uiteinden is een centrale modificatie voor het reguleren van epigenetische overgangen in chromatine. Elk methylabel lysineresidu kan bestaan in een mono-, di- of trimethyleringstoestand, waardoor het indexeringspotentieel van deze specifieke modificatie wordt uitgebreid.",
"Een van deze modificaties, histon lysinemethylatie, is aangetoond zeer stabiel te zijn en een epigenetische verandering te vertegenwoordigen.",
"Voornamelijk door de recente ontdekking van de SET domein-afhankelijke H3-specifieke histonmethyltransferases SUV39H1 en Suv39h1, die selectief lysine 9 van de H3 N-terminale methyleren, heeft deze post-translationele modificatie weer wetenschappelijke interesse gekregen.",
"Set9, een nieuw histon H3 methyltransferase dat transcriptie faciliteert door histonstaartmodificaties die nodig zijn voor heterochromatinevorming te verhinderen.",
"Onze resultaten suggereren dat de methylatie van histonstaarten verschillende effecten op transcriptie kan hebben, afhankelijk van de chromosomale locatie, de combinatie van post-translationele modificaties en het enzym (of eiwitcomplex) dat betrokken is bij de specifieke modificatie.",
"Onder de verschillende groepen enzymen die bekend staan om covalente modificaties te katalyseren, zijn de meest recente toevoegingen de histonmethyltransferases (HMTases), waarvan de functies nu worden gekarakteriseerd."
] | 700
| 641
|
162
|
Is er een verhoogd risico op kanker bij Dyskeratose Congenita?
|
Mensen met DC hebben een verhoogd risico op progressief beenmergfalen (BMF), myelodysplastisch syndroom (MDS) of acute myeloïde leukemie (AML), solide tumoren (meestal plaveiselcelcarcinoom van het hoofd/halsgebied of anogenitale kanker), en pulmonale fibrose
|
[
"Mensen met DC hebben een verhoogd risico op progressief beenmergfalen (BMF), myelodysplastisch syndroom (MDS) of acute myeloïde leukemie (AML), solide tumoren (meestal plaveiselcelcarcinoom van het hoofd/halsgebied of anogenitale kanker), en pulmonale fibrose",
"De klinische progressie van de ziekte kan leiden tot aplastische anemie (86% van alle patiënten) en tot pulmonale of levercomplicaties. Deze patiënten hebben ook een verhoogd risico op kanker.",
"Fanconi-anemie (FA), dyskeratose congenita (DC), Diamond-Blackfan-anemie (DBA) en Shwachman-Diamond-syndroom (SDS) vormen belangrijke erfelijke beenmergfalen-syndromen (IBMFS). Bijwerkingen omvatten ernstig beenmergfalen (BMF), myelodysplastisch syndroom (MDS), acute myeloïde leukemie (AML) en solide tumoren (ST)",
"Patiënten met FA hadden een eerdere aanvang van kanker, behoefte aan stamceltransplantatie en overlijden; gevolgd door DC; DBA en SDS waren het mildst. Terwijl FA- en DC-patiënten duidelijk verhoogde risico's op kanker, AML en MDS hadden, waren er geen gevallen van leukemie bij DBA- of SDS-patiënten",
"De bevindingen tonen aan dat zowel FA als DC belangrijke kankergevoeligheidssyndromen zijn",
"Mensen met DC hebben een verhoogd risico op progressief beenmergfalen (BMF), myelodysplastisch syndroom (MDS) of acute myeloïde leukemie (AML), solide tumoren (meestal plaveiselcelcarcinoom van het hoofd/halsgebied of anogenitale kanker), en pulmonale fibrose",
"Patiënten met dyskeratose congenita (DC) hebben een verhoogd risico op kanker, maar vertonen ook een verhoogde stralingsgevoeligheid.",
"Dyskeratose congenita (DC) wordt gekenmerkt door de klinische triade van reticulaire huidpigmentatie, orale leukoplakie en nageldystrofie, geassocieerd met beenmergfalen (BMF) en een hoog risico op het ontwikkelen van kanker en pulmonale complicaties.",
"CONCLUSIE: Dyskeratose congenita is een zeldzame aandoening; het is echter van vitaal belang om het verhoogde risico op kankers van het bovenste aerodigestieve tractus bij deze patiënten te herkennen.",
"Puntmutaties in het DKC1-gen dat dyskerine codeert veroorzaken het zeldzame erfelijke syndroom genaamd X-gebonden dyskeratose congenita, gekenmerkt door falen van prolifererende weefsels en verhoogde vatbaarheid voor kanker.",
"Dyskeratose Congenita (DC), ook bekend als Zinsser-Engman-Cole syndroom, is een zeldzaam multisysteem-beenmergfalen-syndroom gekenmerkt door mucocutane afwijkingen en een verhoogde aanleg voor kanker.",
"Dyskeratose congenita is een erfelijk syndroom gekenmerkt door mucocutane kenmerken, beenmergfalen, een verhoogd risico op maligniteiten en andere somatische afwijkingen.",
"Dyskeratose congenita is een zeldzame aandoening; het is echter van vitaal belang om het verhoogde risico op kankers van het bovenste aerodigestieve tractus bij deze patiënten te herkennen.",
"Epidermale atrofie, haar groeistoornissen, beenmergfalen en verhoogd risico op kanker komen ook vaak voor bij DC-patiënten.",
"Telomeerdisfunctie en tumoronderdrukkingsreacties bij dyskeratose congenita: het balanceren van kanker en weefselvernieuwingsstoornissen.",
"Patiënten met dyskeratose congenita (DC) hebben een verhoogd risico op kanker, maar vertonen ook een verhoogde stralingsgevoeligheid",
"Dyskeratose congenita is een zeldzame aandoening; het is echter van vitaal belang om het verhoogde risico op kankers van het bovenste aerodigestieve tractus bij deze patiënten te herkennen",
"Dyskeratose congenita is een erfelijk syndroom gekenmerkt door mucocutane kenmerken, beenmergfalen, een verhoogd risico op maligniteiten en andere somatische afwijkingen",
"Terwijl FA- en DC-patiënten duidelijk verhoogde risico's op kanker, AML en MDS hadden, waren er geen gevallen van leukemie bij DBA- of SDS-patiënten",
"Net als bij Fanconi-anemie en dyskeratose congenita is DBA zowel een erfelijk beenmergfalen-syndroom als een kankervoorspellend syndroom; de kankerrisico's lijken lager te zijn bij DBA dan bij Fanconi-anemie of dyskeratose congenita",
"Ernstige pancytopenie veroorzaakt vaak vroegtijdige sterfte bij DC-patiënten, die een verhoogd risico hebben op het ontwikkelen van orofaryngeaal plaveiselcelcarcinoom",
"Hier worden verschillende aspecten van telomeerbiologie, met betrekking tot volwassen stamcelveroudering, tumoronderdrukking en kanker, beschouwd in de context van DC, resulterend in twee translationele modellen: late aanvang van DC-symptomen bij dragers van telomeergerelateerde mutaties is een potentiële indicator van verhoogd kankerrisico en verschillen in tumoronderdrukkingscapaciteiten tussen de genetische subgroepen zijn (althans gedeeltelijke) oorzaken van verschillende klinische manifestaties van de ziekte",
"Puntmutaties in het DKC1-gen dat dyskerine codeert veroorzaken het zeldzame erfelijke syndroom genaamd X-gebonden dyskeratose congenita, gekenmerkt door falen van prolifererende weefsels en verhoogde vatbaarheid voor kanker",
"Dyskeratose congenita is een kankergevoelig beenmergfalen-syndroom veroorzaakt door afwijkingen in telomeerbiologie."
] | 687
| 638
|
163
|
Draagt MicroRNA-21 (miR-21) bij aan hart- en vaatziekten?
|
MicroRNA-21 (miR-21) is een sterk tot expressie komende microRNA (miRNA) in het cardiovasculaire systeem. Recente studies hebben aangetoond dat de expressie ervan ontregeld is in het hart en de bloedvaten onder aandoeningen van hart- en vaatziekten zoals proliferatieve vaatziekte, cardiale hypertrofie en hartfalen, en ischemische hartziekte. miR-21 blijkt een belangrijke rol te spelen bij de proliferatie en apoptose van vasculaire gladde spiercellen, de groei en het afsterven van hartcellen, en de functies van cardiale fibroblasten. Dienovereenkomstig is bewezen dat miR-21 betrokken is bij de pathogenese van de bovengenoemde hart- en vaatziekten, zoals aangetoond door zowel verlies-als winst-functie benaderingen.
|
[
"Het synergetische effect van miR-21 en miR-1 werd functioneel gevalideerd voor hun significante invloed op myocardiale apoptose, cardiale hypertrofie en fibrose.",
"Samenvattend vonden we een nieuwe wederzijdse lus tussen miR-21 en TGFβRIII in cardiale fibrose veroorzaakt door myocardinfarct bij muizen, en het richten op deze route zou een nieuwe strategie kunnen zijn voor de preventie en behandeling van myocardiale remodeling.",
"Het is nog controversieel of microRNA-21 (miR-21) deelneemt aan het proces van cardiale fibrose.",
"Bij muizen is overexpressie van myocardiaal miR-21 gerelateerd aan cardiale fibrose veroorzaakt door drukbelasting.",
"De myocardiale en plasmatische niveaus van miR-21 waren significant hoger bij AS-patiënten vergeleken met controles en correleerden direct met de echocardiografische gemiddelde transvalvulaire gradiënten.",
"Onze resultaten ondersteunen de rol van miR-21 als regulator van het fibrotische proces dat optreedt als reactie op drukbelasting bij AS-patiënten en benadrukken de waarde van circulerend miR-21 als biomarker voor myocardiale fibrose.",
"Ad-miR-21 verbetert LV-remodeling en vermindert de apoptose van myocardiale cellen, wat wijst op het mogelijke mechanisme waarmee Ad-miR-21 functioneert ter bescherming tegen I/R-schade.",
"In de Ad-miR-21 groep namen LV-afmetingen, myocardiale infarctgrootte, LV/BW, collageen type Ⅰ, type Ⅲ en PCNA-positieve cellen allemaal significant af vergeleken met de Ad-GFP groep.",
"Terwijl miR-21, -133, -150, -195 en -214 cardiomyocytenhypertrofie reguleren, zijn miR-1/-133 en miR-208 geïdentificeerd als beïnvloeders van myocardiale contractiele functie. Daarnaast lijken miR-21, -24, -133, -210, -494 en -499 myocyten te beschermen tegen I/R-geïnduceerde apoptose, terwijl miR-1, -29, -199a en -320 apoptose bevorderen. Myocardiale fibrose kan worden gereguleerd door de miR-29 familie en miR-21.",
"De kleine regulerende RNA microRNA-21 (miR-21) speelt een cruciale rol in tal van biologische functies en ziekten, waaronder ontwikkeling, kanker, hart- en vaatziekten en ontsteking.",
"In de afgelopen jaren zijn aanvullende rollen van miR-21 beschreven in cardiovasculaire en pulmonale ziekten, waaronder cardiale en pulmonale fibrose evenals myocardinfarct.",
"Aan de andere kant zijn miR-21, miR-199a, miR-210 en miR-494 bewezen cruciaal voor de aanpassing en overleving van myocyten tijdens hypoxie/ischemie.",
"Studies hebben aangetoond dat verschillende miRs, waaronder miR-1, miR-133, miR-21, miR-126, miR-320, miR-92a en miR-199a, gereguleerd worden na preconditioning en een actieve rol spelen in de bescherming van het hart tegen ischemie/reperfusie schade.",
"Studies met diverse in vivo, ex vivo en in vitro modellen suggereren de mogelijke betrokkenheid van miR-1, miR-21, miR-29, miR-92a, miR-133, miR-199a en miR-320 bij ischemie-reperfusie schade en/of remodeling na myocardinfarct.",
"MicroRNA-21 (miR-21) is een sterk tot expressie komende microRNA (miRNA) in het cardiovasculaire systeem. Recente studies hebben aangetoond dat de expressie ervan ontregeld is in het hart en de bloedvaten onder aandoeningen van hart- en vaatziekten zoals proliferatieve vaatziekte, cardiale hypertrofie en hartfalen, en ischemische hartziekte. miR-21 blijkt een belangrijke rol te spelen bij de proliferatie en apoptose van vasculaire gladde spiercellen, de groei en het afsterven van hartcellen, en de functies van cardiale fibroblasten. Dienovereenkomstig is bewezen dat miR-21 betrokken is bij de pathogenese van de bovengenoemde hart- en vaatziekten, zoals aangetoond door zowel verlies-als winst-functie benaderingen.",
"miR-21 zou een nieuw therapeutisch doelwit kunnen zijn bij hart- en vaatziekten.",
"Dit overzichtsartikel vat de onderzoeksvoortgang samen met betrekking tot de rollen van miR-21 bij hart- en vaatziekten.",
"Opmerkelijk was dat miR-21 een van de meest opgereguleerde miRNA's was in harten na IP. In vivo werd de door IP gemedieerde cardiale bescherming tegen ischemie/reperfusie schade geremd door knockdown van cardiale miR-21. In gekweekte cardiale myocyten identificeerden we dat miR-21 ook een beschermend effect had op hypoxie/reoxygenatie-geïnduceerde celdood, wat geassocieerd was met het doelwitgen geprogrammeerde celdood 4. Het beschermende effect van miR-21 op cardiale celapoptose werd verder bevestigd in rattenharten na ischemie/reperfusie schade in vivo.",
"Recentelijk onthulden enkele belangrijke artikelen dat de veranderde expressie van miRNA's zoals miR-1, miR-133, miR-21, miR-208 enzovoort in harten ook bijdroeg aan hart- en vaatziekten, zoals hartischemie, cardiale hypertrofie en hartritmestoornissen.",
"Opmerkelijk was dat de expressie van miR-21 significant was afgenomen in geïnfarceerde gebieden, maar was opgereguleerd in grensgebieden. De afname van miR-21 in de geïnfarceerde gebieden werd geremd door ischemische preconditioning, een bekende cardiale beschermingsmethode. Overexpressie van miR-21 via adenovirus dat miR-21 tot expressie brengt (Ad-miR-21) verminderde de myocardiale infarctgrootte met 29% na 24 uur en verminderde de afmetingen van de linker ventrikels na 2 weken na AMI. Met behulp van zowel winst- als verlies-functie benaderingen in gekweekte cardiale myocyten identificeerden we dat miR-21 een beschermend effect had op ischemie-geïnduceerde celdood, wat geassocieerd was met het doelwitgen geprogrammeerde celdood 4 en de activator protein 1 route. Het beschermende effect van miR-21 tegen ischemie-geïnduceerde schade aan cardiale myocyten werd verder bevestigd in vivo door verminderde celdood in de grens- en geïnfarceerde gebieden van geïnfarceerde rattenharten na behandeling met Ad-miR-21. De resultaten suggereren dat miRNA's zoals miR-21 een cruciale rol kunnen spelen in de vroege fase van AMI.",
"De resultaten suggereren dat miR-21 gevoelig is voor H(2)O(2)-stimulatie. miR-21 neemt deel aan H(2)O(2)-gemedieerde genregulatie en functionele modulatie in cardiale myocyten. miR-21 zou een essentiële rol kunnen spelen bij hartaandoeningen gerelateerd aan ROS zoals cardiale hypertrofie, hartfalen, myocardinfarct en myocardiale ischemie/reperfusie schade.",
"MicroRNA-21 draagt bij aan myocardiale ziekte door stimulatie van MAP kinase signalering in fibroblasten.",
"Myocardiale en circulerende niveaus van microRNA-21 weerspiegelen linker ventrikel fibrose bij patiënten met aortaklepstenose.",
"MicroRNA 21 remt linker ventrikel remodeling in de vroege fase van een ratmodel met ischemie-reperfusie schade door het onderdrukken van celdood.",
"MicroRNA-21 beschermt tegen H(2)O(2)-geïnduceerde schade aan cardiale myocyten via zijn doelwitgen PDCD4.",
"MicroRNA-21 (miR-21) is een sterk tot expressie komende microRNA (miRNA) in het cardiovasculaire systeem.",
"MicroRNA-21 draagt bij aan myocardiale ziekte door stimulatie van MAP kinase signalering in fibroblasten.",
"MicroRNA-21 (miR-21) is een sterk tot expressie komende microRNA (miRNA) in het cardiovasculaire systeem.",
"miR-21 zou een nieuw therapeutisch doelwit kunnen zijn bij hart- en vaatziekten.",
"MicroRNA-21 als therapeutisch doelwit bij kanker en hart- en vaatziekten.",
"Deze bevindingen tonen aan dat microRNA's kunnen bijdragen aan myocardiale ziekte door een effect in cardiale fibroblasten.",
"Onze resultaten bevestigen miR-21 als een ziekte-doelwit bij hartfalen en stellen de therapeutische effectiviteit van microRNA therapeutische interventie vast in een setting van hart- en vaatziekten."
] | 1,032
| 1,052
|
164
|
Wat is de enzymatische activiteit van het borstkanker geassocieerde gen BRCA1?
|
E3-ubiquitine ligase activiteit is de enige bekende enzymatische activiteit van BRCA1, die wordt gemedieerd door het N-terminale RING-vingerdomein. Het nucleaire transport van BRCA1 en de enzymatische activiteit van ubiquitine E3 ligase worden nauwkeurig gereguleerd door de dimerische bindingspartner BARD1 van BRCA1 en verder gemoduleerd door kankermutaties en diverse signaalroutes.
|
[
"E3-ubiquitine ligase activiteit is de enige bekende enzymatische activiteit van BRCA1, die wordt gemedieerd door het N-terminale RING-vingerdomein.",
"Het nucleaire transport van BRCA1 en de enzymatische activiteit van ubiquitine E3 ligase worden nauwkeurig gereguleerd door de dimerische bindingspartner BARD1 van BRCA1 en verder gemoduleerd door kankermutaties en diverse signaalroutes.",
"De E3 ligase activiteit van BRCA1 is niet essentieel voor de levensvatbaarheid van zoogdiercellen of voor homologie-gedreven reparatie van dubbelstrengs DNA-breuken.",
"Het door BRCA1 gecodeerde eiwit interageert in vivo met het gerelateerde BARD1-eiwit om een heterodimerisch complex te vormen dat fungeert als een ubiquitine E3 ligase. Omdat de enzymatische activiteit van het BRCA1/BARD1 heterodimeer over een breed fylogenetisch spectrum geconserveerd is, wordt aangenomen dat het cruciaal is voor de centrale functies van BRCA1.",
"Een mechanisme voor transcriptierepressie afhankelijk van de BRCA1 E3 ubiquitine ligase.",
"In deze studie identificeerden we een ubiquitine-afhankelijk mechanisme waarmee BRCA1 transcriptie remt. BRCA1 ubiquitineert het transcriptie preinitiatiefcomplex, waardoor de stabiele associatie van TFIIE en TFIIH wordt voorkomen, en zo de initiatie van mRNA-synthese wordt geblokkeerd.",
"In de structuur is de rangschikking van de Ring-domeinen vergelijkbaar met een andere H2A E3 ligase, het BRCA1/BARD1 complex, maar de complexvorming is afhankelijk van een N-terminale arm van Ring1b die het Bmi1 Ring-domein omarmt.",
"Het ontdekken van de precieze functie van de borstkanker- en ovarium-specifieke tumorsuppressor BRCA1 is behoorlijk ingewikkeld gebleken. Er is vastgesteld dat BRCA1, samen met BARD1, een E3 ubiquitine ligase vormt. Nu bekend is dat BRCA1 een enzym is, is de uitdaging voor BRCA1-onderzoek om te leren hoe deze enzymatische activiteit functioneert in normale borst- en ovariumcellen om kankerverandering te onderdrukken.",
"Het BRCA1 tumorsuppressorgen wordt tot expressie gebracht in alle zoogdiercellen. Binnen deze cellen interageert het BRCA1-eiwitproduct met verschillende schijnbaar verschillende nucleaire complexen. Eiwitten binnen deze complexen zijn potentiële doelwitten voor de E3-ubiquitine ligase activiteit geassocieerd met BRCA1:BARD1 complexen.",
"Tijdens zowel DNA-replicatie als DNA-reparatie lijkt BRCA1 zowel adaptor- als enzymfuncties te vervullen. Rollen omvatten de tijdelijke fysieke rekrutering van NBS1, gammaH2AX, FANCD2 en andere eiwitten in specifieke reparatie-geassocieerde complexen, en enzymatische activiteit als een E3-ubiquitine ligase tegen een subset van deze eiwitten.",
"Het BRCA1-eiwit vertoont E3 ubiquitine ligase activiteit, en deze enzymatische functie wordt verondersteld vereist te zijn voor tumorsuppressie."
] | 425
| 410
|
165
|
Lijst van markers voor autofagie.
|
Expressie van LC3-II en BECN1 evenals SQSTM1 worden gebruikt als markers voor autofagie-activiteit.
|
[
"Lichtketen 3/Atg8 als een marker voor autofagie",
"toegenomen omzetting van microtubule-geassocieerd eiwit, 1A/1B-lichtketen 3, van zijn cytosolische vorm (LC3B-I) naar zijn gelipideerde vorm (LC3B-II), verhoogde Beclin-1 niveaus, en toegenomen acridine oranje kleuring zoals bepaald door flowcytometrie-analyse, wat verder bewijs levert van γ-tocotrieenol-geïnduceerde autofagie in deze mammacarcinoom cellijnen",
"Western blotting werd gebruikt om de expressie van het hepatische microtubule-geassocieerde eiwit 1 lichtketen 3 (LC3)-II als marker voor autofagie te detecteren",
"autofagie marker LC3-II",
"autofagie marker LC3B",
"de autofagie marker LC3",
"autofagie markermoleculen, p62 en LC3-II",
"LC3-I naar LC3-II en is bevestigd in meerdere zoogdiercelijnen met meerdere autofagie markers",
"lichtketen 3 (LC3), wat een autofagie marker is.",
"LC3 (tfLC3) autofagie marker",
"de autofagie marker LC3,",
"autofagie marker beclin 1 en microtubule-geassocieerd eiwit lichtketen 3 (LC3) werden geanalyseerd in controle,",
"LC3-II niveaus (een autofagie marker);",
"autofagie marker, microtubule-geassocieerd eiwit lichtketen 3 (LC3)",
"de autofagie marker LC3B-II",
"autofagie marker eiwit microtubule-geassocieerd eiwit 1 lichtketen 3 (LC3)",
"autofagie marker LC3",
"We gebruikten de expressie van LC3-II en BECN1 evenals SQSTM1 als markers voor autofagie-activiteit.",
"autofagie marker LC3"
] | 195
| 170
|
166
|
Zijn er statistische methoden voor het normaliseren en identificeren van differentiële regio's in histonmodificatie ChIP-seq data?
|
Ja. ChIPnorm is een tweefasige statistische methode om ChIP-seq data te normaliseren en om differentiële regio's in het genoom te vinden, gegeven twee bibliotheken van histonmodificaties van verschillende celtypen.
|
[
"ChIPnorm: een statistische methode voor het normaliseren en identificeren van differentiële regio's in histonmodificatie ChIP-seq bibliotheken.",
"In dit artikel stellen we een tweefasige statistische methode voor, genaamd ChIPnorm, om ChIP-seq data te normaliseren en om differentiële regio's in het genoom te vinden, gegeven twee bibliotheken van histonmodificaties van verschillende celtypen. We tonen aan dat de ChIPnorm-methode het grootste deel van de ruis en bias in de data verwijdert en beter presteert dan andere normalisatiemethoden. We correleren de histonmerken met genexpressiegegevens en bevestigen dat histonmodificaties H3K27me3 en H3K4me3 respectievelijk fungeren als een repressor en een activator van genen. Vergeleken met wat eerder in de literatuur werd gerapporteerd, vinden we dat een aanzienlijk groter deel van de bivalente merken in ES-cellen voor H3K27me3 en H3K4me3 overgaat in een K27-only toestand. We vinden dat de meeste promotorregio's in eiwit-coderende genen differentiële histonmodificatieplaatsen bevatten.",
"In dit artikel stellen we een tweefasige statistische methode voor, genaamd ChIPnorm, om ChIP-seq data te normaliseren en om differentiële regio's in het genoom te vinden, gegeven twee bibliotheken van histonmodificaties van verschillende celtypen.",
"In dit artikel stellen we een tweefasige statistische methode voor, genaamd ChIPnorm, om ChIP-seq data te normaliseren en om differentiële regio's in het genoom te vinden, gegeven twee bibliotheken van histonmodificaties van verschillende celtypen.",
"In dit artikel stellen we een tweefasige statistische methode voor, genaamd ChIPnorm, om ChIP-seq data te normaliseren en om differentiële regio's in het genoom te vinden, gegeven twee bibliotheken van histonmodificaties van verschillende celtypen. We tonen aan dat de ChIPnorm-methode het grootste deel van de ruis en bias in de data verwijdert en beter presteert dan andere normalisatiemethoden.",
"In dit artikel stellen we een tweefasige statistische methode voor, genaamd ChIPnorm, om ChIP-seq data te normaliseren en om differentiële regio's in het genoom te vinden, gegeven twee bibliotheken van histonmodificaties van verschillende celtypen.",
"In dit artikel stellen we een tweefasige statistische methode voor, genaamd ChIPnorm, om ChIP-seq data te normaliseren en om differentiële regio's in het genoom te vinden, gegeven twee bibliotheken van histonmodificaties van verschillende celtypen. We tonen aan dat de ChIPnorm-methode het grootste deel van de ruis en bias in de data verwijdert en beter presteert dan andere normalisatiemethoden.",
"Dit probleem blijkt verrassend moeilijk te zijn, zelfs bij eenvoudige paargewijze vergelijkingen, vanwege het significante niveau van ruis in ChIP-seq data. In dit artikel stellen we een tweefasige statistische methode voor, genaamd ChIPnorm, om ChIP-seq data te normaliseren en om differentiële regio's in het genoom te vinden, gegeven twee bibliotheken van histonmodificaties van verschillende celtypen.",
"In dit artikel stellen we een tweefasige statistische methode voor, genaamd ChIPnorm, om ChIP-seq data te normaliseren en om differentiële regio's in het genoom te vinden, gegeven twee bibliotheken van histonmodificaties van verschillende celtypen."
] | 475
| 482
|
167
|
Is CD84 genetisch geassocieerd met artritis?
|
Drie leden van deze genfamilie, Ly108, Ly9 en CD84, vertonen polymorfismen die de vatbaarheid voor systemische auto-immuniteit sterk beïnvloeden, met name bij muizen, maar ook in sommige menselijke populaties. Onze studie toont aan dat een allel dat geassocieerd is met de respons op etanercepttherapie ook geassocieerd is met de expressie van het CD84-gen, en verder dat de expressie van CD84 correleert met de ziekteactiviteit van reumatoïde artritis.
|
[
"De SNP wordt voorspeld de bindingsplaatsmotieven van transcriptiefactoren in het 3' UTR van een immuungerelateerd gen, CD84, te verstoren, en het allel dat geassocieerd is met een betere respons op etanercept werd geassocieerd met een hogere expressie van het CD84-gen in perifere bloedmononucleaire cellen (P = 1 × 10(-11) in 228 niet-RA-patiënten en P = 0,004 in 132 RA-patiënten)",
"Onze studie toont aan dat een allel dat geassocieerd is met de respons op etanercepttherapie ook geassocieerd is met de expressie van het CD84-gen, en verder dat de expressie van CD84 correleert met de ziekteactiviteit",
"Drie leden van deze genfamilie, Ly108, Ly9 en CD84, vertonen polymorfismen die de vatbaarheid voor systemische auto-immuniteit sterk beïnvloeden, met name bij muizen, maar ook in sommige menselijke populaties"
] | 175
| 192
|
168
|
Wat is de functie van Neu5Gc (N-Glycolylneuraminezuur)?
|
N-glycolylneuraminezuur (Neu5Gc) is een immunogeen suiker van voedingsafkomst die metabolisch wordt ingebouwd in diverse inheemse glycoconjugaten bij mensen. Mensen missen een functioneel cytidine-monofosfaat-N-acetylneuraminezuur hydroxylase (CMAH) eiwit en kunnen de suiker Neu5Gc, een aangeboren zoogdierlijk signaal van eigenheid, niet synthetiseren. N-Glycolylneuraminezuur (Neu5Gc) kan worden ingebouwd in menselijke cellen en kan een immuunrespons veroorzaken, een respons die divers en polyclonaal is. Omdat voedings-Neu5Gc voornamelijk voorkomt in rood vlees en melkproducten, wordt gesuggereerd dat deze voortdurende antigeen-antilichaamreactie chronische ontsteking kan veroorzaken, wat mogelijk bijdraagt aan de hoge frequentie van dieetgerelateerde carcinomen en andere ziekten bij mensen.
|
[
"Mensen missen een functioneel cytidine-monofosfaat-N-acetylneuraminezuur hydroxylase (CMAH) eiwit en kunnen de suiker Neu5Gc, een aangeboren zoogdierlijk signaal van eigenheid, niet synthetiseren.",
"N-glycolylneuraminezuur (Neu5Gc) is een immunogeen suiker van voedingsafkomst die metabolisch wordt ingebouwd in diverse inheemse glycoconjugaten bij mensen.",
"N-Glycolylneuraminezuur (Neu5Gc) is een siaalzuur dat door dieren wordt gesynthetiseerd, maar niet door mensen of vogels. Het kan echter worden ingebouwd in menselijke cellen en kan een immuunrespons veroorzaken.",
"Menselijke heterofiele antilichamen die dierlijke erytrocyten agglutineren, zijn bekend om het niet-menselijke siaalzuur N-glycolylneuraminezuur (Neu5Gc) te detecteren.",
"De menselijke anti-Neu5Gc antilichaamrespons is divers en polyclonaal.",
"Omdat voedings-Neu5Gc voornamelijk voorkomt in rood vlees en melkproducten, suggereren wij dat deze voortdurende antigeen-antilichaamreactie chronische ontsteking kan veroorzaken, wat mogelijk bijdraagt aan de hoge frequentie van dieetgerelateerde carcinomen en andere ziekten bij mensen.",
"Deze gegevens suggereren dat anti-Neu5Gc antilichamen een barrière vormen voor de lange termijn acceptatie van varkens-xenotransplantaten. Omdat anti-Neu5Gc antilichamen chronische ontsteking kunnen bevorderen, verdient de lange termijn veiligheid van levende en acellulaire varkensweefselimplantaten bij ontvangers nadere evaluatie."
] | 275
| 256
|
169
|
Zijn er specifieke tegengiffen voor rivaroxaban?
|
Momenteel is er geen specifiek tegengif voor rivaroxaban
|
[
"Nieuwe orale anticoagulantia (NOAC's) – apixaban, dabigatran en rivaroxaban – hebben een aanzienlijk kleiner risico op intracerebrale bloeding (ICH). Echter, twee feiten maken deze situatie gecompliceerd: Ten eerste is het risico op hematoma-uitbreiding onbekend voor NOAC's. Ten tweede is er geen specifiek tegengif voor geen van de NOAC's.",
"De nieuwe orale anticoagulantia dabigatran etexilaat (Pradaxa), rivaroxaban (Xarelto) en apixaban (Eliquis) hebben voorspelbare farmacokinetische en farmacodynamische profielen en zijn alternatieven voor warfarine. Veel artsen zijn echter terughoudend met deze geneesmiddelen, omdat er beperkte bewijs is over hoe bloeding bij patiënten die ze gebruiken te behandelen, en omdat er geen specifiek tegengif bekend is om hun anticoagulerende effect te keren.",
"Gezien het ontbreken van een specifiek tegengif, moet de te nemen actie in deze situaties worden vastgesteld.",
"Het feit dat er geen specifiek tegengif is om de anticoagulerende werking van de nieuwe anticoagulantia te keren, kan de behandeling van hemorragische complicaties bemoeilijken;",
"Zoals bij elke nieuwe therapie moeten de potentiële voordelen worden afgewogen tegen de mogelijke uitdagingen, en een van de meest zorgwekkende aspecten van de nieuwe doelgerichte orale anticoagulantia is het ontbreken van een bewezen methode om hun effect te keren. In tegenstelling tot de vitamine K-antagonist, namelijk warfarine, is er geen specifiek tegengif voor deze medicijnen.",
"Twee grote nadelen zijn enerzijds het risico van geneesmiddelaccumulatie bij nier- en/of leverziekte en anderzijds het ontbreken van specifieke tegengiffen.",
"NOA hebben ook andere onopgeloste problemen: geneesmiddelinteracties zijn nog steeds mogelijk, specifieke stollingstests om deze te beoordelen moeten worden ontwikkeld, en er is momenteel geen specifiek tegengif beschikbaar in geval van hemorragische complicaties.",
"Maar ze hebben ook nadelen, ze zijn afhankelijk van renale klaring, kunnen interageren met andere medicatie en missen een specifiek tegengif.",
"Hoewel deze trialgegevens zeer bemoedigend zijn, moeten verschillende praktische kwesties (bijv. gebrek aan specifiek tegengif, veiligheid van langdurige behandeling of kosteneffectiviteit in de \"real-life\" klinische praktijk) nog worden opgehelderd.",
"In geval van massale bloeding is het beheer onduidelijk en geen van deze nieuwere middelen heeft een specifiek tegengif dat het anticoagulerende effect volledig terugdraait.",
"De korte halfwaardetijd van deze nieuwe middelen compenseert in veel gevallen het ontbreken van een specifiek tegengif.",
"Momenteel heeft geen van deze nieuwe middelen een specifiek tegengif, en kan er weinig advies worden gegeven over hoe een ernstige bloeding te behandelen.",
"Rivaroxaban, dat geactiveerde factor X (Xa) remt, is momenteel in klinische onderzoeken en is de meest vergevorderde factor Xa-remmer. Het medicijn wordt eenmaal daags oraal toegediend, zonder noodzaak voor injecties, dosistitratie of frequente bloedtesten om de internationale genormaliseerde ratio te monitoren. Het heeft een snelle aanvang van werking en hoewel er geen specifiek tegengif is, heeft het een korte plasmaverdelingstijd (ongeveer 5-9 uur).",
"Het gebruik van dabigatran, rivaroxaban en apixaban als orale anticoagulantia voor de behandeling van atriumfibrilleren en acute diepe veneuze trombose is toegenomen ondanks het ontbreken van bekende tegengiffen voor deze medicijnen.",
"Er is geen tegengif voor reversie en geen betrouwbare laboratoriummonitoring van het anticoagulerende effect voor noodsituaties.",
"Verdere zorgen over het gebruik van NOAC bij ouderen zijn de hoge prevalentie van nierinsufficiëntie bij AF-patiënten ouder dan 75 jaar, het grotendeels onbekende risico van geneesmiddel-geneesmiddel- en geneesmiddel-voedselinteracties, het ontbreken van gemakkelijk beschikbare laboratoriumtesten voor anticoagulerende activiteit en het ontbreken van een tegengif.",
"Specifieke tegengiffen voor het terugdraaien van het anticoagulerende effect van deze geneesmiddelen, zoals monoklonale antilichamen tegen de directe trombine-remmer dabigatran of recombinant Xa-analogen in het geval van factor Xa-remmers, worden nog onderzocht in vroege klinische onderzoeken.",
"Begin 2013 is er geen tegengif voor dabigatran, rivaroxaban of apixaban, noch enige specifieke behandeling met bewezen effectiviteit voor ernstige bloedingen gerelateerd aan deze geneesmiddelen."
] | 610
| 585
|
170
|
Welke metaboliet activeert AtxA?
|
Bij infectie van een zoogdiergastheer reageert Bacillus anthracis op gastheersignalen, en met name op verhoogde temperatuur (37°C) en bicarbonaat/CO2-concentraties, met een verhoogde expressie van virulentiefactoren waaronder de miltvuurtoxines en de extracellulaire kapsellaag. Culturen gekweekt met verhoogde CO2/bicarbonaat vertoonden verhoogde AtxA dimer/monomeer verhoudingen en verhoogde AtxA-activiteit, vergeleken met culturen gekweekt zonder toegevoegde CO2/bicarbonaat, wat suggereert dat dit gastheersignaal de AtxA-functie versterkt door het dimer/monomeer evenwicht te verschuiven naar de dimerische toestand. CO2-verhoogde transcriptie van toxinegenen wordt niet waargenomen in atx4-null mutanten. De gegevens geven een duidelijke associatie aan van atxA met CO2-verhoogde genexpressie in B. anthracis en leveren bewijs dat atxA genen reguleert anders dan de structurele genen voor de miltvuurtoxineiwitten.
|
[
"Hier rapporteren we dat bioinformatica-analyses de aanwezigheid in AtxA suggereerden van twee PTS (fosfoenolpyruvaat : suiker fosfotransfersysteem) regulatiedomeinen (PRD) die doorgaans gereguleerd worden door fosforylering/defosforylering op geconserveerde histidine-residuen.",
"Onze resultaten koppelen de productie van virulentiefactoren in B. anthracis aan koolhydraatmetabolisme en bieden voor het eerst een mechanistische verklaring voor de transcriptie-activiteit van AtxA.",
"Bij infectie van een zoogdiergastheer reageert Bacillus anthracis op gastheersignalen, en met name op verhoogde temperatuur (37°C) en bicarbonaat/CO2-concentraties, met een verhoogde expressie van virulentiefactoren waaronder de miltvuurtoxines en de extracellulaire kapsellaag.",
"De 475 aminozuursequentie van AtxA onthult DNA-bindingsmotieven en regio’s die lijken op eiwitten geassocieerd met het fosfoenolpyruvaat: koolhydraat fosfotransfersysteem (PTS).",
"Culturen gekweekt met verhoogde CO2/bicarbonaat vertoonden verhoogde AtxA dimer/monomeer verhoudingen en verhoogde AtxA-activiteit, vergeleken met culturen gekweekt zonder toegevoegde CO2/bicarbonaat, wat suggereert dat dit gastheersignaal de AtxA-functie versterkt door het dimer/monomeer evenwicht te verschuiven naar de dimerische toestand.",
"Transcriptie van de belangrijkste virulentiegenen van Bacillus anthracis wordt geactiveerd door CO2, een signaal dat de gastheeromgeving nabootst.",
"Bovendien maakt AtxA in vitro in aanwezigheid van CO2 en in vivo deel uit van het sap- en eag-regulatienetwerk.",
"Regulatie van de expressie van het miltvuurtoxine-activatorgen (atxA) in Bacillus anthracis: temperatuur, niet CO2/bicarbonaat, beïnvloedt AtxA-synthese.",
"In atxA+ stammen wordt de expressie van de toxinegenen (pag, lef en cya) versterkt door twee fysiologisch significante signalen: verhoogde CO2/bicarbonaat en temperatuur.",
"Onze gegevens geven aan dat de expressie van atxA niet wordt beïnvloed door CO2/bicarbonaat niveaus. Echter, het steady-state niveau van atxA mRNA in cellen gekweekt in verhoogde CO2/bicarbonaat bij 37 graden C is vijf- tot zesmaal hoger dan dat waargenomen in cellen gekweekt onder dezelfde condities bij 28 graden C.",
"De miltvuurtoxinegenen van Bacillus anthracis, cya, lef en pag, kunnen worden gezien als een regulon, waarbij transcriptie van alle drie de genen in trans wordt geactiveerd door hetzelfde regulerende gen, atxA, als reactie op hetzelfde signaal, CO2.",
"CO2-verhoogde transcriptie van toxinegenen wordt niet waargenomen in atx4-null mutanten.",
"Vergelijking van de resulterende eiwitpatronen gaf aan dat de synthese van niet-toxineiwitten wordt beïnvloed door groei in verhoogde CO2 en de toxinegen-regulator, atxA.",
"Transposon-insertiebibliotheken werden gescreend op mutanten die CO2-verhoogde atxA-afhankelijke beta-galactosidase-activiteit vertoonden. DNA-sequentieanalyse van transposon-insertieplaatsen in 17 mutanten met CO2- en atxA-gereguleerde fusies onthulde 10 mutanten met onafhankelijke inserties op het 185-kb toxineplasmide pXO1 die niet mapten op de toxinegenen.",
"De gegevens geven een duidelijke associatie aan van atxA met CO2-verhoogde genexpressie in B. anthracis en leveren bewijs dat atxA genen reguleert anders dan de structurele genen voor de miltvuurtoxineiwitten.",
"Transcriptie geïnitieerd vanaf P1 en P2 werd geactiveerd door zowel atxA als acpA, en activatie leek gestimuleerd te worden door bicarbonaat.",
"Het miltvuurtoxine-activatorgen atxA is geassocieerd met CO2-verhoogde niet-toxine genexpressie in Bacillus anthracis.",
"Transcriptome-analyse identificeert Bacillus anthracis-genen die reageren op CO2 via een AtxA-afhankelijk mechanisme.",
"Transcriptie geïnitieerd vanaf P1 en P2 werd geactiveerd door zowel atxA als acpA, en activatie leek gestimuleerd te worden door bicarbonaat.",
"Transcriptome-analyse identificeert Bacillus anthracis-genen die reageren op CO2 via een AtxA-afhankelijk mechanisme.",
"Expressie van de toxinegenen door B. anthracis wordt versterkt tijdens groei onder verhoogde CO2-niveaus.",
"Dit CO2-effect wordt alleen waargenomen in aanwezigheid van een ander pXO1-gen, atxA, dat codeert voor een transactivator van miltvuurtoxinesynthese.",
"Hier tonen we aan dat transcriptie van atxA niet lijkt te verschillen in cellen gekweekt in 5% CO2 vergeleken met cellen gekweekt in lucht.",
"Transcriptie geïnitieerd vanaf P1 en P2 werd geactiveerd door zowel atxA als acpA, en activatie leek gestimuleerd te worden door bicarbonaat. Deletie-analyse van de upstream regio van de cap-promotor toonde aan dat activatie door zowel atxA als acpA een DNA-segment van 70 bp vereist dat zich uitstrekt stroomopwaarts van de P1-locatie.",
"We identificeerden twee belangrijke schijnbare transcriptiestartplaatsen, aangeduid als P1 en P2, gelegen op respectievelijk 731 bp en 625 bp stroomopwaarts van het translatie-initiatiesignaal van capB. Transcriptie geïnitieerd vanaf P1 en P2 werd geactiveerd door zowel atxA als acpA, en activatie leek gestimuleerd te worden door bicarbonaat.",
"Transcriptie geïnitieerd vanaf P1 en P2 werd geactiveerd door zowel atxA als acpA, en activatie leek gestimuleerd te worden door bicarbonaat.",
"Regulatie van de expressie van het miltvuurtoxine-activatorgen (atxA) in Bacillus anthracis: temperatuur, niet CO2/bicarbonaat, beïnvloedt AtxA-synthese.",
"Het miltvuurtoxine-activatorgen atxA is geassocieerd met CO2-verhoogde niet-toxine genexpressie in Bacillus anthracis."
] | 838
| 773
|
171
|
Wat is de functie van 6SRNA in bacteriën?
|
6S RNA, voor het eerst beschreven als een ncRNA in E. coli, bootst een open promotorstructuur na, die een grote uitstulping heeft met twee haarspeld-/steelstructuren die de transcriptie reguleren via interacties met RNA-polymerase. Escherichia coli 6S RNA vertegenwoordigt een niet-coderend RNA (ncRNA), waarvan op basis van de geconserveerde secundaire structuur en eerdere functionele studies werd gesuggereerd dat het interfereert met transcriptie. De carboxy-terminus die de Arg-Gly-Gly (RGG) herhalingsdomeinen in deze eiwitten bevat, is noodzakelijk voor cis-repressie van transcriptieactivatie en HAT-activiteit door het N-terminaal glutamine-rijke domein.
|
[
"Qbeta-replicase zonder subeenheid alfa (R-alfa) is in staat om sjablonen te repliceren anders dan de (+) streng, zoals (--), \"6S\" RNA, poly(C) enz., in afwezigheid van de gastheerfactor.",
"Het Escherichia coli 6S RNA-gen maakt deel uit van een transcriptie-eenheid met dubbele functie.",
"De DNA-sequentieresultaten bevestigen de nauwkeurigheid van de eerder vastgestelde RNA-sequentie en, samen met genomische hybridisatiedata, tonen aan dat er slechts één kopie van het 6S DNA in het chromosoom aanwezig is. In overeenstemming met de ontspannen expressiewijze werd vastgesteld dat het promotorgebied van het 6S RNA-gen het hypothetische GC-rijke discriminator-domein mist dat gebruikelijk is bij andere stabiele RNA-genen onder strikte controle. De sequentieresultaten onthulden ook het voorkomen van een open leesraam van 540 basenparen direct stroomafwaarts van het coderingsgebied van 6S RNA.",
"De functie van 6S RNA bevordert de langetermijnoverleving van cellen.",
"6S RNA-deficiënte cellen hebben een nadeel voor overleving in de stationaire fase, een periode waarin 6S RNA transcriptie reguleert.",
"De remming van sigma(70)-afhankelijke transcriptie door 6S RNA was niet alomtegenwoordig, ondanks het feit dat het merendeel van sigma(70)-RNA-polymerase tijdens de stationaire fase door 6S RNA wordt gebonden.",
"De door 6S RNA geremde sigma(70)-afhankelijke promotoren bevatten een uitgebreid -10 promotorelement, wat suggereert dat deze eigenschap een klasse van door 6S RNA gereguleerde genen kan definiëren.",
"Een secundair effect van 6S RNA is de activatie van sigma(S)-afhankelijke transcriptie bij verschillende promotoren.",
"De regulatie van zowel sigma(70)- als sigma(S)-activiteiten door 6S RNA draagt bij aan een verhoogde persistentie van cellen tijdens voedingsstoffentekort.",
"Escherichia coli 6S RNA vertegenwoordigt een niet-coderend RNA (ncRNA), waarvan op basis van de geconserveerde secundaire structuur en eerdere functionele studies werd gesuggereerd dat het interfereert met transcriptie.",
"De voorkeurbinding van 6S RNA aan Esigma(70) werd bevestigd, maar zwakkere binding aan Esigma(38) werd ook waargenomen.",
"Bovendien tonen we voor het eerst aan dat 6S RNA fungeert als sjabloon voor de transcriptie van gedefinieerde RNA-moleculen in afwezigheid van DNA. Concluderend onthult deze studie nieuwe aspecten van de functie van 6S RNA.",
"6S RNA, voor het eerst beschreven als een ncRNA in E. coli, bootst een open promotorstructuur na, die een grote uitstulping heeft met twee haarspeld-/steelstructuren die de transcriptie reguleren via interacties met RNA-polymerase.",
"De vrijgave-reactie is afhankelijk van een kenmerkende eigenschap van 6S RNA's, namelijk het fungeren als sjabloon voor de de novo synthese van kleine RNA's, aangeduid als pRNA's. Hier gebruikten we beperkte hydrolyse met structuur-specifieke RNases en in-line probing van geïsoleerd 6S RNA en 6S RNA ∼ pRNA-complexen om de moleculaire details die leiden tot de vrijgave-reactie te onderzoeken.",
"De vrijgave-reactie is afhankelijk van een kenmerkende eigenschap van 6S RNA's, namelijk het fungeren als sjabloon voor de de novo synthese van kleine RNA's, aangeduid als pRNA's. Hier gebruikten we beperkte hydrolyse met structuur-specifieke RNases en in-line probing van geïsoleerd 6S RNA en 6S RNA ∼ pRNA-complexen om de moleculaire details die leiden tot de vrijgave-reactie te onderzoeken.",
"De vrijgave-reactie is afhankelijk van een kenmerkende eigenschap van 6S RNA's, namelijk het fungeren als sjabloon voor de de novo synthese van kleine RNA's, aangeduid als pRNA's. Hier gebruikten we beperkte hydrolyse met structuur-specifieke RNases en in-line probing van geïsoleerd 6S RNA en 6S RNA ∼ pRNA-complexen om de moleculaire details die leiden tot de vrijgave-reactie te onderzoeken."
] | 597
| 606
|
172
|
Is cytisine superieur aan nicotinevervangende therapie voor stoppen met roken?
|
Ja, een klinische studie die direct de stoppercentages vergeleek tussen cytisine en nicotinevervangende therapie rapporteerde dat cytisine superieur was aan nicotinevervangende therapie bij het helpen van rokers om te stoppen met roken, maar het was geassocieerd met een hogere frequentie van zelfgerapporteerde bijwerkingen.
|
[
"De effectiviteit van cytisine voor continue onthouding was superieur aan die van nicotinevervangende therapie na 1 week, 2 maanden en 6 maanden. In een vooraf gespecificeerde subgroepanalyse van de primaire uitkomst was cytisine superieur aan nicotinevervangende therapie bij vrouwen en niet-inferieur bij mannen.",
"CONCLUSIES: In combinatie met korte gedragsmatige ondersteuning bleek cytisine superieur te zijn aan nicotinevervangende therapie bij het helpen van rokers om te stoppen met roken, maar het was geassocieerd met een hogere frequentie van zelfgerapporteerde bijwerkingen."
] | 125
| 129
|
173
|
Welk aminozuurresidu lijkt in de meeste gerapporteerde gevallen met CADASIL-syndroom gemuteerd te zijn?
|
CADASIL wordt meestal veroorzaakt door missense-mutaties in het NOTCH3-gen, die onvermijdelijk een cysteïneresidu betreffen.
|
[
"Missense-mutaties en kleine deleties in het NOTCH3-gen, die geen cysteïneresiduen betreffen, zijn beschreven bij patiënten die als getroffen door paucisymptomatische CADASIL worden beschouwd. De betekenis van dergelijke moleculaire varianten is echter nog onduidelijk.",
"CADASIL wordt meestal veroorzaakt door missense-mutaties in het NOTCH3-gen, die onvermijdelijk een cysteïneresidu betreffen.",
"Cerebrale autosomaal dominante arteriopathie met subcorticale infarcten en leuko-encefalopathie (CADASIL) is een erfelijke cerebrovasculaire aandoening door mutaties die verlies of winst van een cysteïneresidu in het NOTCH3-gen veroorzaken. Oorspronkelijk werd een cluster van mutaties rond exon 3 en 4 gerapporteerd.",
"De auteurs rapporteren een familie met CADASIL die een deletie in het Notch3-gen draagt die geen cysteïneresidu betrof."
] | 141
| 127
|
174
|
Welke syndromen worden geassocieerd met mutaties in het EZH2-gen?
|
EZH2-mutaties die het Weaver-syndroom veroorzaken, zijn voornamelijk missense-varianten en de zeldzame truncerende mutaties die tot nu toe zijn gerapporteerd bevinden zich in het laatste exon, wat suggereert dat eenvoudige haplo-insufficiëntie waarschijnlijk niet verantwoordelijk is voor het overgroeifenotype, hoewel het exacte mechanisme nog niet is vastgesteld. Recente studies hebben aangetoond dat EZH2-mutaties vaak geassocieerd zijn met RUNX1-mutaties bij MDS-patiënten, hoewel de pathologische functie hiervan nog moet worden onderzocht. Deze gegevens tonen aan dat mutaties in EZH2 het Weaver-syndroom veroorzaken. Het EZH2-gen is een homoloog van het Drosophila Polycomb-groep (PcG) gen enhancer of zest, een cruciale regulator van homeotische genexpressie.
|
[
"Verlies-van-functie mutaties van EZH2, een katalytisch onderdeel van het polycomb repressor complex 2 (PRC2), worden waargenomen bij ongeveer 10% van de patiënten met myelodysplastisch syndroom (MDS), maar zijn zeldzaam bij acute myeloïde leukemie (AML).",
"We beschrijven het gebruik van een oligo-SNP-array voor genomische profilering van aCNA en cnLOH, samen met sequentieanalyse van herhaaldelijk gemuteerde genen, bij een patiënt met myelodysplastisch syndroom (MDS) die een normaal karyotype en FISH-resultaat vertoonde.",
"Voorwaardelijk verwijderen van Ezh2 in rijpe T-cellen verminderde dramatisch de productie van BM-destructieve Th1-cellen in vivo, verminderde BM-infiltrerende Th1-cellen en redde muizen van BM-falen.",
"Verworven aplastische anemie (AA) is een potentieel fatale beenmerg (BM) faal syndroom.",
"Constitutionele NSD1- en EZH2-mutaties veroorzaken respectievelijk Sotos- en Weaver-syndromen, overgroeisyndromen met aanzienlijke fenotypische overlap.",
"EZH2-mutaties die het Weaver-syndroom veroorzaken, zijn voornamelijk missense-varianten en de zeldzame truncerende mutaties die tot nu toe zijn gerapporteerd bevinden zich in het laatste exon, wat suggereert dat eenvoudige haplo-insufficiëntie waarschijnlijk niet verantwoordelijk is voor het overgroeifenotype, hoewel het exacte mechanisme nog niet is vastgesteld.",
"Weaver-syndroom en EZH2-mutaties.",
"In 2011 werd aangetoond dat mutaties in de histonmethyltransferase EZH2 het Weaver-syndroom veroorzaken.",
"De identificatie van een EZH2-mutatie kan daarom een objectief middel bieden om een subtiele presentatie van het Weaver-syndroom te bevestigen en/of het Weaver- en Sotos-syndroom van elkaar te onderscheiden.",
"Mutaties in EZH2 veroorzaken het Weaver-syndroom.",
"Deze gegevens tonen aan dat mutaties in EZH2 het Weaver-syndroom veroorzaken.",
"Het mutatiespectrum van EZH2 in het Weaver-syndroom vertoont aanzienlijke overlap met de inactiverende somatische EZH2-mutaties die recentelijk zijn gerapporteerd bij myeloïde maligniteiten.",
"EZH2-mutaties als oorzaak van het Weaver-syndroom en bieden verdere verbanden tussen histonmodificaties en de regulatie van menselijke groei.",
"Mutaties op tyrosine 641 (Y641F, Y641N, Y641S en Y641H) in het SET-domein van EZH2 zijn geïdentificeerd bij patiënten met bepaalde subtypes van non-Hodgkin-lymfoom (NHL).",
"Het EZH2-gen werd eerder gerapporteerd op chromosoom 21q22 en werd voorgesteld als een kandidaatgen voor sommige kenmerken van het Down-syndroom fenotype.",
"Recente uitgebreide mutatieanalyses van myeloïde maligniteiten hebben aangetoond dat inactiverende somatische mutaties in PcG-genen zoals EZH2 en ASXL1 vaak voorkomen bij patiënten met myelodysplastische aandoeningen, waaronder myelodysplastische syndromen (MDS) en MDS/myeloproliferatieve neoplasma (MPN) overlapstoornissen (MDS/MPN).",
"EZH2 wordt vaak overgeëxprimeerd en beschouwd als een oncogen in kankers; desalniettemin wordt EZH2 beschouwd als een kandidaat tumor suppressorgen bij MDS vanwege EZH2-mutaties die geassocieerd zijn met een slechte overleving.",
"In 2011 werd aangetoond dat mutaties in de histonmethyltransferase EZH2 het Weaver-syndroom veroorzaken.",
"Onder hen zijn Sotos- en Weaver-syndromen klinisch goed gedefinieerd en worden veroorzaakt door heterozygote mutaties in respectievelijk NSD1 en EZH2.",
"Weaver-syndroom en EZH2-mutaties: het klinische fenotype verduidelijken.",
"Constitutionele NSD1- en EZH2-mutaties veroorzaken respectievelijk Sotos- en Weaver-syndromen, overgroeisyndromen met aanzienlijke fenotypische overlap.",
"De identificatie van een EZH2-mutatie kan daarom een objectief middel bieden om een subtiele presentatie van het Weaver-syndroom te bevestigen en/of het Weaver- en Sotos-syndroom van elkaar te onderscheiden.",
"We stelden de hypothese op dat mutaties in schrijvers van deze twee chromatinemarkeringen overgroeistoestanden kunnen veroorzaken, die lijken op Sotos- of Weaver-syndromen, bij patiënten zonder NSD1- of EZH2-afwijkingen.",
"Recente uitgebreide mutatieanalyses van myeloïde maligniteiten hebben aangetoond dat inactiverende somatische mutaties in PcG-genen zoals EZH2 en ASXL1 vaak voorkomen bij patiënten met myelodysplastische aandoeningen, waaronder myelodysplastische syndromen (MDS) en MDS/myeloproliferatieve neoplasma (MPN) overlapstoornissen (MDS/MPN).",
"Somatische mutaties van epigenetische genregulatoren zijn gebruikelijk bij patiënten met myelodysplastische syndromen (MDS) en correleren met enkele klinische en laboratoriumkenmerken.",
"Recentelijk heeft de opkomst van next generation sequencing (NGS)-technieken geholpen bij het identificeren van somatische genmutaties in 75-80% van MDS, die voornamelijk clusteren in vier functionele groepen, namelijk cytokinesignalering (RAS-genen), DNA-methylering (TET2, IDH1/2, DNMT3a-genen), histonmodificaties (ASXL1 en EZH2-genen) en spliceosoom (SF3B1 en SRSF2-genen) samen met mutaties van RUNX1- en TP53-genen.",
"Constitutionele NSD1- en EZH2-mutaties veroorzaken respectievelijk Sotos- en Weaver-syndromen, overgroeisyndromen met aanzienlijke fenotypische overlap. NSD1-mutaties die Sotos-syndroom veroorzaken zijn verlies-van-functie, voornamelijk truncerende mutaties of missense-mutaties op sleutelresiduen in functionele domeinen.",
"EZH2 wordt beschouwd als een kandidaat tumor suppressorgen bij MDS vanwege EZH2-mutaties die geassocieerd zijn met een slechte overleving.",
"Er is ook aanzienlijke fenotypische overlap tussen Sotos- en Weaver-syndromen. De identificatie van een EZH2-mutatie kan daarom een objectief middel bieden om een subtiele presentatie van het Weaver-syndroom te bevestigen en/of het Weaver- en Sotos-syndroom van elkaar te onderscheiden.",
"EZH2 wordt vaak overgeëxprimeerd en beschouwd als een oncogen in kankers; desalniettemin wordt EZH2 beschouwd als een kandidaat tumor suppressorgen bij MDS vanwege EZH2-mutaties die geassocieerd zijn met een slechte overleving.",
"Constitutionele NSD1- en EZH2-mutaties veroorzaken respectievelijk Sotos- en Weaver-syndromen, overgroeisyndromen met aanzienlijke fenotypische overlap.",
"De deletie betrof meerdere genen, waaronder twee kandidaat tumor suppressorgen (CTNNA1 en HSPA9) die geassocieerd zijn met MDS/AML.",
"Somatische mutaties van epigenetische genregulatoren zijn gebruikelijk bij patiënten met myelodysplastische syndromen (MDS) en correleren met enkele klinische en laboratoriumkenmerken."
] | 895
| 837
|
175
|
Welke databases bestaan er voor experimenteel bepaalde topologieën van α-helicale transmembraaneiwitten?
|
ExTopoDB en TMPDB.
|
[
" ExTopoDB: een database van experimenteel afgeleide topologische modellen van transmembraaneiwitten ",
" ExTopoDB is een openbaar toegankelijke database van experimenteel afgeleide topologische modellen van transmembraaneiwitten. Het bevat informatie verzameld uit studies in de literatuur die het gebruik van biochemische methoden rapporteren voor de bepaling van de topologie van α-helicale transmembraaneiwitten. De topologie van transmembraaneiwitten is zeer belangrijk om hun functie te begrijpen en ExTopoDB biedt een actuele, volledige en uitgebreide dataset van experimenteel bepaalde topologieën van α-helicale transmembraaneiwitten. Topologische informatie wordt gecombineerd met voorspellingen van transmembraantopologie, wat resulteert in betrouwbaardere topologische modellen. BESCHIKBAARHEID: http://bioinformatics.biol.uoa.gr/ExTopoDB ",
" TMPDB: een database van experimenteel gekarakteriseerde transmembraantopologieën ",
" TMPDB is een database van experimenteel gekarakteriseerde transmembraan (TM) topologieën. TMPDB release 6.2 bevat in totaal 302 TM-eiwitsequenties, waarvan 276 alfa-helicale sequenties, 17 beta-strengvormige en 9 alfa-helicale sequenties met korte porievormende helices ingebed in het membraan. De TM-topologieën in TMPDB werden experimenteel bepaald door middel van röntgendiffractie, NMR, genfusietechniek, methode van vervangen cysteïne toegankelijkheid, N-gebonden glycosyleringsexperiment en andere biochemische methoden. TMPDB is nuttig als test- en/of trainingsdataset voor het verbeteren van voorgestelde TM-topologievoorspellingsmethoden of voor het ontwikkelen van nieuwe methoden met hogere prestaties, en als gids voor zowel bioinformatici als biologen om TM-eiwitten beter te begrijpen. TMPDB en zijn subsets zijn vrij beschikbaar op de volgende website: http://bioinfo.si.hirosaki-u.ac.jp/~TMPDB/ ",
" De topologie van transmembraaneiwitten is zeer belangrijk om hun functie te begrijpen en ExTopoDB biedt een actuele, volledige en uitgebreide dataset van experimenteel bepaalde topologieën van α-helicale transmembraaneiwitten. ",
" TMPDB: een database van experimenteel gekarakteriseerde transmembraantopologieën. ",
" TMPDB is een database van experimenteel gekarakteriseerde transmembraan (TM) topologieën. ",
" De TM-topologieën in TMPDB werden experimenteel bepaald door middel van röntgendiffractie, NMR, genfusietechniek, methode van vervangen cysteïne toegankelijkheid, N-gebonden glycosyleringsexperiment en andere biochemische methoden. ",
" De topologie van transmembraaneiwitten is zeer belangrijk om hun functie te begrijpen en ExTopoDB biedt een actuele, volledige en uitgebreide dataset van experimenteel bepaalde topologieën van α-helicale transmembraaneiwitten. ",
" De topologie van transmembraaneiwitten is zeer belangrijk om hun functie te begrijpen en ExTopoDB biedt een actuele, volledige en uitgebreide dataset van experimenteel bepaalde topologieën van α-helicale transmembraaneiwitten. ",
" ONGETAGD: ExTopoDB is een openbaar toegankelijke database van experimenteel afgeleide topologische modellen van transmembraaneiwitten. ",
" De TM-topologieën in TMPDB werden experimenteel bepaald door middel van röntgendiffractie, NMR, genfusietechniek, methode van vervangen cysteïne toegankelijkheid, N-gebonden glycosyleringsexperiment en andere biochemische methoden. ",
" De topologie van transmembraaneiwitten is zeer belangrijk om hun functie te begrijpen en ExTopoDB biedt een actuele, volledige en uitgebreide dataset van experimenteel bepaalde topologieën van α-helicale transmembraaneiwitten ",
" De TM-topologieën in TMPDB werden experimenteel bepaald door middel van röntgendiffractie, NMR, genfusietechniek, methode van vervangen cysteïne toegankelijkheid, N-gebonden glycosyleringsexperiment en andere biochemische methoden ",
" TMPDB is een database van experimenteel gekarakteriseerde transmembraan (TM) topologieën ",
" ExTopoDB: een database van experimenteel afgeleide topologische modellen van transmembraaneiwitten. ",
" ExTopoDB is een openbaar toegankelijke database van experimenteel afgeleide topologische modellen van transmembraaneiwitten"
] | 496
| 487
|
176
|
Welke ziekte wordt gekenmerkt door congenitale afwezigheid van intrinsieke ganglioncellen van het maagdarmkanaal?
|
Hirschsprung-ziekte (HSCR, aganglionaire megacolon) is een veelvoorkomende congenitale afwijking die leidt tot darmobstructie, met een incidentie van 1/5.000 levendgeborenen. Het wordt gekenmerkt door de afwezigheid van intrinsieke ganglioncellen in de myenterische en submucosale plexussen langs variabele lengtes van het maagdarmkanaal.
|
[
"Hirschsprung-ziekte (HSCR), ook bekend als aganglionaire megacolon, is het gevolg van een congenitale afwijking van het enterische zenuwstelsel (ENS).",
"Deze ernstige congenitale aandoening wordt veroorzaakt door de afwezigheid van neurale ganglia in de dikke darm en dus het ontbreken van intrinsieke innervatie van de dikke darm, als gevolg van een onjuiste kolonisatie van de zich ontwikkelende darmen door ENS-voorlopercellen.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in de zenuwplexussen van de onderste dikke darm.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR, aganglionaire megacolon) is een veelvoorkomende congenitale afwijking die leidt tot darmobstructie, met een incidentie van 1/5.000 levendgeborenen. Het wordt gekenmerkt door de afwezigheid van intrinsieke ganglioncellen in de myenterische en submucosale plexussen langs variabele lengtes van het maagdarmkanaal.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die geassocieerd wordt met de afwezigheid van intrinsieke ganglioncellen in het distale maagdarmkanaal.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in de zenuwplexussen van de onderste dikke darm.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in de zenuwplexussen van de onderste dikke darm.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in de zenuwen die het plexus van de onderste darm vormen.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een erfelijke aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in het distale maagdarmkanaal.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een veelvoorkomende congenitale aandoening (1 op 5.000 pasgeborenen) van onbekende oorsprong, gekenmerkt door het ontbreken van parasympathische intrinsieke ganglioncellen van het achterste deel van de darm.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een neurocristopathie die wordt gekenmerkt door het ontbreken van parasympathische intrinsieke ganglioncellen in de submucosale en myenterische plexussen langs een variabel deel van het darmkanaal.",
"ACHTERGROND: Hirschsprung-ziekte (HD) is een ontwikkelingsstoornis van het enterische zenuwstelsel, gekenmerkt door het ontbreken van ganglioncellen in de submucosale (Meissner) en myenterische (Auerbach) plexussen van het distale deel van de darm.",
"Hirschsprung-ziekte is een erfelijke aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van ganglioncellen in het distale deel van de darm.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale ziekte die wordt gekenmerkt door het ontbreken van ganglioncellen in verschillende lengtes van het distale spijsverteringskanaal.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die geassocieerd wordt met het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in het distale maagdarmkanaal.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale darmaandoening, gekenmerkt door het ontbreken van ganglioncellen in het distale deel van het darmkanaal.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intramurale ganglioncellen langs variabele lengtes van het maagdarmkanaal.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in de zenuwplexussen van de onderste dikke darm.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in de zenuwplexussen van de onderste dikke darm.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in de zenuwen die het plexus van de onderste darm vormen.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een veelvoorkomende congenitale aandoening (1 op 5.000 pasgeborenen) van onbekende oorsprong, gekenmerkt door het ontbreken van parasympathische intrinsieke ganglioncellen van het achterste deel van de darm.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een neurocristopathie die wordt gekenmerkt door het ontbreken van parasympathische intrinsieke ganglioncellen in de submucosale en myenterische plexussen langs een variabel deel van het darmkanaal.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een erfelijke aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van intrinsieke ganglioncellen in het distale maagdarmkanaal.",
"Hirschsprung-ziekte (HSCR) is een congenitale aandoening die wordt gekenmerkt door het ontbreken van ganglioncellen in de zenuwplexussen van het onderste spijsverteringskanaal."
] | 626
| 617
|
177
|
Wat is de ziekte waarbij patiënten gevoelig zijn voor DNA-kruislinkerende middelen, gepresenteerd met een hoge frequentie van chromosomale aberraties?
|
Fanconi-anemie (FA) is een autosomale aandoening die genomische instabiliteit veroorzaakt en zich manifesteert door defecten in DNA-herstel, overgevoeligheid voor DNA-kruislinkerende middelen en een hoge mate van chromosomale aberraties.
|
[
"Fanconi-anemie (FA) is een autosomale aandoening die genomische instabiliteit veroorzaakt. FA-patiënten hebben ontwikkelingsafwijkingen, vroegtijdige beenmergfalen en een aanleg voor kanker. De ziekte manifesteert zich door defecten in DNA-herstel, overgevoeligheid voor DNA-kruislinkerende middelen en een hoge mate van chromosomale aberraties.",
"Fanconi-anemie (FA) wordt op cellulair niveau gekenmerkt door een hoge frequentie van spontane chromosomale aberraties; kruislinkerende middelen veroorzaken een abnormale toename van de frequentie van chromosomale schade, en semiconservatieve DNA-synthese wordt ernstig geremd.",
"Kenmerken van chromosomale aberraties, overgevoeligheid voor DNA-kruislinkerende middelen en aanleg voor maligniteit suggereren een fundamentele afwijking in DNA-herstel bij Fanconi-anemie.",
"Cellen van patiënten met Fanconi-anemie zijn ongewoon gevoelig voor middelen die in staat zijn DNA te kruislinken.",
"Een verhoogde frequentie van chromosoomaberraties, die verder wordt versterkt door blootstelling van cellen aan DNA-kruislinkerende middelen, is een algemeen kenmerk van Fanconi-anemie.",
"FA-patiënten vertonen spontane chromosoombreuken en FA-cellen zijn gevoelig voor DNA-interstrand kruislinkmiddelen en vertonen een hoge frequentie van chromosoombreuken.",
"Fanconi-anemie (FA) wordt op cellulair niveau gekenmerkt door een hoge frequentie van spontane chromosomale aberraties; kruislinkerende middelen veroorzaken een abnormale toename van de frequentie van chromosomale schade, en semiconservatieve DNA-synthese wordt ernstig geremd.",
"Cellen van patiënten met Fanconi-anemie zijn ongewoon gevoelig voor middelen die in staat zijn DNA te kruislinken.",
"Op cellulair niveau wordt FA gekenmerkt door overgevoeligheid voor DNA-kruislinkerende middelen en door hoge frequenties van geïnduceerde chromosomale aberraties, een eigenschap die wordt gebruikt voor diagnose.",
"Een verhoogde frequentie van chromosoomaberraties, die verder wordt versterkt door blootstelling van cellen aan DNA-kruislinkerende middelen, is een algemeen kenmerk van Fanconi-anemie.",
"Evenzo zijn Fanconi-anemie cellen, die chromosomaal gevoelig zijn voor kruislinkerende middelen en defect lijken te zijn in het \"ontkoppelen\" van gekoppelde polynucleotideketens [15, 16, 49, 51], gerapporteerd als chromosomaal gevoelig voor ethylmethaan sulfonaat [29], en gevoelig voor ioniserende straling [7, 19, 20], wat opnieuw wijst op overlappende reparatiesystemen."
] | 368
| 330
|
178
|
Hoe wordt oprozomib toegediend?
|
Oprozomib wordt oraal toegediend.
|
[
"Verder wordt de nieuwe oraal toegediende tweede-generatie PI oprozomib onderzocht.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare structurele analoog oprozomib zijn tweede-generatie, hoogselectieve proteasoomremmers.",
"Deze review geeft een overzicht van de rol van orale proteasoomremmers, waaronder Marizomib, Oprozomib, Delanzomib, chemische proteasoomremmers en cinnabaramiden, in de therapie van MM, met focus op ontwikkelingen in de afgelopen vijf jaar.",
"Daarnaast hebben nieuwe medicijnklassen veelbelovende activiteit getoond bij RR MM, waaronder de oraal toegediende proteasoomremmers ixazomib en oprozomib; monoklonale antilichamen zoals het anti-CS1 monoklonale antilichaam elotuzumab en het anti-CD38 monoklonale antilichaam daratumumab; en histon deacetylase remmers zoals panobinostat en rocilinostat.",
"Verder wordt de nieuwe oraal toegediende tweede-generatie PI oprozomib onderzocht.",
"Daarnaast hebben nieuwe medicijnklassen veelbelovende activiteit getoond bij RR MM, waaronder de oraal toegediende proteasoomremmers ixazomib en oprozomib; monoklonale antilichamen zoals het anti-CS1 monoklonale antilichaam elotuzumab en het anti-CD38 monoklonale antilichaam daratumumab; en histon deacetylase remmers zoals panobinostat en rocilinostat.",
"We concludeerden dat oprozomib, op basis van zijn activiteit en orale biologische beschikbaarheid, verdere studie verdient in een dierlijk GvHD preventiemodel.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare analoog oprozomib verminderden effectief de levensvatbaarheid van MM-cellen na continue of tijdelijke behandeling die de in vivo farmacokinetiek nabootst.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare structurele analoog oprozomib zijn tweede-generatie, hoogselectieve proteasoomremmers.",
"Verder wordt de nieuwe oraal toegediende tweede-generatie PI oprozomib onderzocht.",
"Daarnaast hebben nieuwe medicijnklassen veelbelovende activiteit getoond bij RR MM, waaronder de oraal toegediende proteasoomremmers ixazomib en oprozomib; monoklonale antilichamen zoals het anti-CS1 monoklonale antilichaam elotuzumab en het anti-CD38 monoklonale antilichaam daratumumab; en histon deacetylase remmers zoals panobinostat en rocilinostat.",
"De epoxyketon-gebaseerde proteasoomremmers carfilzomib en oraal bio-beschikbare oprozomib hebben naast anti-myelomale effecten ook anti-resorptieve en bot-anabole activiteit.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare structurele analoog oprozomib zijn tweede-generatie, hoogselectieve proteasoomremmers. Echter, de mechanismen van verworven resistentie tegen carfilzomib en oprozomib zijn nog niet volledig begrepen, en effectieve strategieën om deze resistentie te overwinnen zijn nodig.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare analoog oprozomib verminderden effectief de levensvatbaarheid van MM-cellen na continue of tijdelijke behandeling die de in vivo farmacokinetiek nabootst.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare structurele analoog oprozomib zijn tweede-generatie, hoogselectieve proteasoomremmers.",
"Nieuwe oraal toegediende tweede-generatie PI oprozomib wordt onderzocht.",
"Inclusief de oraal toegediende proteasoomremmers ixazomib en oprozomib; monoklonale antilichamen zoals het anti-CS1 monoklonale antilichaam elotuzumab en het anti-CD38 monoklonale antilichaam daratumumab; en histon deacetylase remmers zoals panobinostat en rocilinostat.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare structurele analoog oprozomib zijn tweede-generatie, hoogselectieve proteasoomremmers. Echter, de mechanismen van verworven resistentie tegen carfilzomib en oprozomib zijn nog niet volledig begrepen, en effectieve strategieën om deze resistentie te overwinnen zijn nodig.",
"Tot slot vonden we dat incubatie van DC met het(e) medicijn(en) de expressie van IκB verhoogde en dat oprozomib de expressie van NF-κB remde. We concludeerden dat oprozomib, op basis van zijn activiteit en orale biologische beschikbaarheid, verdere studie verdient in een dierlijk GvHD preventiemodel."
] | 454
| 450
|
179
|
Wat is een Caveolae?
|
Caveolae, invaginaties van het plasmamembraan met een diameter van 60-80 nm, zijn een subset van lipidenvlootjes die verrijkt zijn met cholesterol en sfingolipiden.
|
[
"Caveolae zijn flesvormige invaginaties van het plasmamembraan die gevormd worden door constitutieve caveolineiwitten en regulerende cavineiwitten.",
"Caveolae zijn membraansubdomeinen die functioneren als signaalplatforms, endocytotische dragers, sensoren van membraanspanning en mechanische stress, evenals in lipidehomeostase.",
"Caveolae zijn cholesterolrijke microdomeinen die mechanisch vervormbare invaginaties van het sarcolemma vormen.",
"Caveolae zijn gespecialiseerde membraanlipidenvlootjes bedekt met caveolineiwit-skeletproteïnen.",
"Caveolae zijn membraanmicrodomeinen waar belangrijke signaalroutes worden samengesteld en moleculaire effecten worden doorgegeven.",
"Caveolae, invaginaties van het plasmamembraan met een diameter van 60-80 nm, zijn een subset van lipidenvlootjes die verrijkt zijn met cholesterol en sfingolipiden.",
"De efficiëntie van jeugd is gebaseerd op cellulaire signaalskeletstructuren die strakke en gecoördineerde signalering bieden. Lipidenvlootjes zijn zo'n skeletstructuur waarvan caveolae een subset vormen.",
"Caveolae zijn submicroscopische putjes in het plasmamembraan die overvloedig aanwezig zijn in veel zoogdierceltypen.",
"Caveolae zijn niet-clathrine invaginaties van het plasmamembraan in de meeste celtypen.",
"Caveolae zijn cholesterol- en sfingolipidenrijke subcellulaire domeinen op het plasmamembraan.",
"Caveolae zijn een overvloedig kenmerk van het plasmamembraan van veel zoogdierceltypen.",
""
] | 188
| 174
|
180
|
Wat zijn de rollen van chromatinecompartimenten in de eukaryote celkern?
|
De complexiteit in samenstelling en functie van de eukaryote celkern wordt bereikt door de organisatie ervan in gespecialiseerde nucleaire compartimenten. Benaderingen met chromosoomconformatie-captatie hebben aangetoond dat interfasechromatine is verdeeld in ruimtelijk gescheiden compartimenten van Mb-grootte en topologische domeinen van sub-Mb-grootte. Men denkt dat deze compartimentalisatie het afstemmen van genen en regulatorische elementen vergemakkelijkt. Cohesine-gebaseerde chromatine-interacties maken gereguleerde genexpressie binnen vooraf bestaande architecturale compartimenten mogelijk. Daarom is het concentreren van eiwitten die nodig zijn voor verschillende stappen van RNA-synthese binnen gespecialiseerde nucleaire compartimenten belangrijk bij het coördineren van gebeurtenissen die nodig zijn voor efficiënte genexpressie.
|
[
"Het concentreren van eiwitten die nodig zijn voor verschillende stappen van RNA-synthese binnen gespecialiseerde nucleaire compartimenten zal belangrijk zijn bij het coördineren van gebeurtenissen die nodig zijn voor efficiënte genexpressie.",
"Chromatine-domeinen en nucleaire compartimenten: het vaststellen van locaties van genexpressie in eukaryote kernen.",
"Met de volwassen runderlens als modelsysteem worden nucleaire veranderingen die gepaard gaan met denucleatie beschreven, met bijzondere nadruk op de lamina, nucleolaire en coiled body compartimenten in lenskernen.",
"Veranderingen in de nucleolaire en coiled body compartimenten gaan vooraf aan lamina- en chromatineherschikking tijdens denucleatie van vezelcellen in de runderlens.",
"Voorafgaand aan chromatinecondensatie werd coiline herverdeeld naar het nucleolaire compartiment en was afwezig in kernen waar chromatine begon te condenseren.",
"Deze beperkingen weerspiegelen de fysieke hechting van chromatine aan nucleaire compartimenten of sterische belemmering veroorzaakt door lokale ultrastructuur.",
"Een aantal van deze eiwitten hoopt zich op in virale replicatiecompartimenten in de geïnfecteerde celkern, wat aangeeft dat deze eiwitten mogelijk een rol spelen bij virale replicatie.",
"Nucleaire marginalisatie van gastheercelchromatine geassocieerd met uitbreiding van twee discrete virus-geïnduceerde subnucleaire compartimenten tijdens baculovirusinfectie.",
"In het late stadium van infectie werd echter ook het peristromale gebied (PR), een ander virus-geïnduceerd subnucleair compartiment, uitgesloten van het gebied waar chromatine zich bevindt.",
"Deze correlatie tussen compartimentalisatie en chromatine-exclusie suggereert de mogelijkheid dat een chromatine-exclusieve eigenschap van virale moleculen, althans gedeeltelijk, de nucleaire compartimentalisatie van virus-geïnfecteerde cellen ondersteunt.",
"Chromatine-modificaties in hematopoëtische multipotente en gecommitteerde voorlopercellen zijn onafhankelijk van de subnucleaire positionering van genen ten opzichte van repressieve compartimenten.",
"Om de bijdrage van nucleaire architectuur aan de regulatie van genexpressiepatronen tijdens differentiatie van menselijke multipotente cellen verder te verduidelijken, analyseerden we de expressiestatus, histonmodificaties en subnucleaire positionering ten opzichte van repressieve compartimenten van hematopoëtische loci in multipotente en lijn-gecommitteerde primaire menselijke hematopoëtische voorlopercellen.",
"We rapporteren hier dat de positionering van lijn-geaffilieerde loci ten opzichte van pericentromerisch heterochromatine compartimenten (PCH) identiek is in multipotente cellen van verschillende oorsprong en onveranderd blijft tussen multipotente en lijn-gecommitteerde hematopoëtische voorlopercellen.",
"De complexiteit in samenstelling en functie van de eukaryote celkern wordt bereikt door de organisatie ervan in gespecialiseerde nucleaire compartimenten.",
"Cohesine-gebaseerde chromatine-interacties maken gereguleerde genexpressie binnen vooraf bestaande architecturale compartimenten mogelijk.",
"Benaderingen met chromosoomconformatie-captatie hebben aangetoond dat interfasechromatine is verdeeld in ruimtelijk gescheiden compartimenten van Mb-grootte en topologische domeinen van sub-Mb-grootte. Men denkt dat deze compartimentalisatie het afstemmen van genen en regulatorische elementen vergemakkelijkt,",
"we vinden dat architecturale compartimenten behouden blijven in niet-cyclische muis-thymocyten na genetische uitputting van cohesine in vivo",
"Onze bevindingen geven aan dat cohesine-gemedieerde langafstandinteracties discrete genexpressiestaten binnen vooraf bestaande chromosomale compartimenten faciliteren.",
"Histon post-translationele modificaties bemiddelen de totstandbrenging van structureel en functioneel verschillende chromatinecompartimenten van eukaryote kernen.",
"Recente studies met chromatin conformatie capture-technieken tonen aan dat Hox-clusters een opmerkelijke ruimtelijke configuratie aannemen, waarbij actieve en inactieve genen zijn gescheiden in twee verschillende chromatinecompartimenten.",
"Recente Hi-C mapping heeft substructuur binnen chromatinecompartimenten onthuld, topologisch associërende domeinen (TADs) genoemd, die grotendeels geconserveerd zijn in hun posities tussen celtypen en vergelijkbaar zijn in grootte met replicatiedomeinen.",
"Interacties van SP100 met HP1-eiwitten: een link tussen de promyelocytaire leukemie-geassocieerde nucleaire lichamen en het chromatinecompartiment.",
"We stellen voor dat er in principe drie nucleaire compartimenten bestaan: een \"open\" hoger-orde chromatinecompartiment met chromatinedomeinen die actieve genen bevatten, een \"gesloten\" chromatinecompartiment bestaande uit inactieve genen, en een interchromatine domein (ICD) compartiment (Cremer et al., 1993; Zirbel et al., 1993) dat macromoleculaire complexen bevat voor transcriptie, splicing, DNA-replicatie en reparatie. Genen in \"open\", maar niet in \"gesloten\" hoger-orde chromatinecompartimenten hebben toegang tot transcriptie- en splicingcomplexen die zich in het ICD-compartiment bevinden.",
"Genen in \"open\", maar niet in \"gesloten\" hoger-orde chromatinecompartimenten hebben toegang tot transcriptie- en splicingcomplexen die zich in het ICD-compartiment bevinden. Chromatinedomeinen die het \"open\" chromatinecompartiment vormen, zijn zo georganiseerd dat ze direct contact van genen en nieuw gevormd RNA met transcriptie- en splicingcomplexen in het ICD-compartiment mogelijk maken.",
"We stellen voor dat er in principe drie nucleaire compartimenten bestaan: een \"open\" hoger-orde chromatinecompartiment met chromatinedomeinen die actieve genen bevatten, een \"gesloten\" chromatinecompartiment bestaande uit inactieve genen, en een interchromatine domein (ICD) compartiment (Cremer et al.'"
] | 744
| 739
|
181
|
Wordt de abnormale dosering van ultrabewaardeerde elementen ongunstig bevonden in kankercellen?
|
Nee. Abnormale dosering van ultrabewaardeerde elementen wordt sterk ongunstig bevonden in gezonde cellen, maar niet in kankercellen.
|
[
"Abnormale dosering van ultrabewaardeerde elementen wordt sterk ongunstig bevonden in gezonde cellen, maar niet in kankercellen.",
"We beginnen met aan te tonen dat uitputting van UCE's kenmerkend is voor de meest recente grootschalige menselijke CNV-datasets en vinden vervolgens dat zelfs nieuw gevormde de novo CNV's, die hooguit één keer door meiose zijn gegaan, significant uitgeput zijn voor UCE's. In opvallend contrast zijn CNV's die specifiek in kankercellen ontstaan, doorgaans niet uitgeput voor UCE's en kunnen zelfs significant verrijkt zijn. Deze observatie roept de mogelijkheid op dat CNV's die somatisch ontstaan en relatief nieuw gevormd zijn, minder waarschijnlijk een CNV-profiel hebben ontwikkeld dat uitgeput is voor UCE's. Alternatief kan het ontbreken van uitputting voor UCE's in kanker-CNV's de zieke toestand weerspiegelen. Ter ondersteuning van deze laatste verklaring zijn somatische CNV's die niet geassocieerd zijn met ziekte, wel uitgeput voor UCE's. Ten slotte tonen we aan dat het mogelijk is om te observeren dat de CNV's van geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPS) in de loop van de tijd uitgeput raken voor UCE's, wat suggereert dat uitputting kan worden vastgesteld door selectie tegen UCE-verstorende CNV's zonder de noodzaak van meiotische delingen.",
"Alternatief kan het ontbreken van uitputting voor UCE's in kanker-CNV's de zieke toestand weerspiegelen."
] | 215
| 225
|
182
|
Reguleert schildklierhormoon de calciumtransiënt in het myocard?
|
JA
|
[
"3-jodothyronamine (T(1)AM) is een nieuw endogeen verwant van schildklierhormoon, dat in staat is te interageren met trace amine-geassocieerde receptoren, een klasse van plasmamembraan G-eiwit-gekoppelde receptoren, en een negatief inotroop en chronotroop effect te produceren",
"Bij volwassen rat cardiomyocyten verminderde acute blootstelling aan 20 microM T(1)AM de amplitude en duur van de calciumtransiënt.",
"In normaal varkensmyocard had T3 geen effect op de mate van isometrische krachtontwikkeling, maar versnelde het het tijdsverloop van krachtontwikkeling (p < 0,05) en verhoogde de calciumtransiënt (p < 0,001). Na inductie van myocarddepressie door blootstelling aan epinefrine versnelde T3 de intracellulaire calciumtransiënten en verminderde het diastolisch calcium",
"De experimentele gegevens die verhoogde krachtamplitudes tonen bij onveranderde amplitudes van de intracellulaire calciumtransiënt en een zelfs verminderde calcium tijdintegraal leveren sterk bewijs voor een sensibilisatie van het contractiele apparaat voor calcium door triiodothyronine",
"Deze resultaten geven aan dat de schildklierstatus het tijdsverloop van de calciumtransiënt beïnvloedt en zijn consistent met de verkorting in de duur van de contractie die wordt waargenomen in de hyperthyroïde toestand."
] | 178
| 169
|
183
|
Wat zijn de voorgestelde biologische rollen voor eiwitten die het SPRY-domein bevatten?
|
verdediging tegen retrovirale infectie
aangeboren en adaptieve immuniteit
vesiculair transport
neurale differentiatie
embryonale ontwikkeling
|
[
"het SPRY-domein van de TRIM5α van apen herkent meerdere epitopen die zich uitstrekken over verschillende capsidemonomeren aan het oppervlak van de volwassen virale kern van HIV-1",
"Deze eigenschappen, die de weerstand van TRIM5α tegen capsidemutaties kunnen versterken, resulteren in een relatief lage affiniteit van de individuele SPRY-domeinen voor de capsid",
"RIM5α is een retrovirale restrictiefactor, waarbij de B30.2 (SPRY) en coiled-coil domeinen samenwerken om de specificiteit van TRIM5α-gemedieerde vangst van retrovirale capsiden te bepalen",
"functie van de SPRY/B30.2 domeineiwitten betrokken bij de aangeboren immuniteit",
"Het SPRY-domein is een eiwitinteractiemodule die voorkomt in 77 muizeiwitten en ongeveer 100 humane eiwitten, en wordt betrokken bij belangrijke biologische routes, waaronder die welke de aangeboren en adaptieve immuniteit reguleren",
"TRIM5α is een krachtig antiviraal eiwit dat infectie door HIV-1 en andere retrovirussen beperkt",
"TRIM5α herkent het rooster van de retrovirale capsid via zijn B30.2 (PRY/SPRY) domein op een soortspecifieke wijze",
"binding van het PRY-SPRY domein uit het C-terminale gebied van TRIM50 aan fosfatidylinositolsoorten, wat suggereert dat TRIM50 betrokken is bij vesiculaire dynamiek door het waarnemen van de gefosforyleerde staat van fosfoinositollipiden",
"TRIM50 lijkt een essentiële rol te spelen in tubulovesiculaire dynamiek",
"TRIM67 reguleert Ras-signaaltransductie via afbraak van 80K-H, wat leidt tot neurale differentiatie inclusief neuritogenese",
"TRIM67, dat een TRIM-motief, een FN3-domein en een SPRY-domein heeft, wordt sterk tot expressie gebracht in het cerebellum",
"De coderende regio van Vasa is voldoende voor zijn selectieve verrijking en we vinden dat gustavus, het B30.2/SPRY en SOCS-box domeineiwitgen",
"Wij stellen voor dat Gustavus een geconserveerde, positieve regulatorische rol heeft in de accumulatie van Vasa-eiwit tijdens de embryonale ontwikkeling",
"twee zebravisgenen, SSB-1 en SSB-4 (SPRY-domein SOCS-box eiwitten)",
"Wij veronderstellen dat SSB-4 een rol speelt in de vroege ontwikkeling van kiemcellen",
"Het SPRY-domein van Pyrin, gemuteerd bij patiënten met familiaire mediterrane koorts, interageert met inflammasoomcomponenten en remt de verwerking van proIL-1beta",
"TRIM-eiwitten kunnen bevorderlijk zijn voor de convergente evolutie van virusbeperkende factoren.",
"SPRY- en B30.2-eiwitdomeinen. Evolutie van een component van immuunverdediging",
"De combinatie van SPRY en PRY om B30.2-domeinen te produceren kan zijn geselecteerd en behouden als een component van immuunverdediging",
"evolutie van primaten TRIM5alpha, een gen dat HIV-1-infectie beperkt",
"Het SPRY-domein van TRIM5alpha, dat mogelijk verantwoordelijk is voor de herkenning van binnenkomende virale capsiden, vertoonde hogere verhoudingen van niet-synonieme/synonieme substituties dan het niet-SPRY-domein, wat aangeeft dat de adaptieve evolutie van TRIM5alpha bij primaten een aangeboren strategie kan zijn die is ontwikkeld ter verdediging tegen retrovirale infectie tijdens de evolutie van primaten",
"De resultaten zijn consistent met een rol voor TRIM5alpha in de aangeboren immuniteit tegen retrovirussen",
"B30.2(SPRY) domein van de retrovirale restrictiefactor TRIM5alpha",
"primate TRIM5alpha identificeert een kritisch soortspecifiek retroviraal restrictiedomein",
"Door functionele studies van chimere TRIM5alpha-genen te gebruiken, tonen we aan dat deze patch over het algemeen essentieel is voor retrovirale restrictie en verantwoordelijk is voor het grootste deel van de soortspecifieke antiretrovirale restrictieactiviteit",
"SPRY-eiwitdomein",
"Heterozygoten voor gus of een deletie inclusief gus produceren embryo's met minder poolcellen en defecten in de posterieure patroonvorming",
"SPRY-domein en SOCS-box bevattend eiwit, GUSTAVUS."
] | 478
| 485
|
184
|
Hoe kunnen we functionele associaties afleiden uit genfusie-evenementen?
|
De detectie van genfusie-evenementen over genomen heen kan worden gebruikt voor de voorspelling van functionele associaties van eiwitten, gebaseerd op de observatie dat gerelateerde eiwitten in één organisme (inclusief fysiek interacterende eiwitten/leden van complexen, eiwitten betrokken bij dezelfde route) in andere soorten vaak worden gevonden als een gefuseerd samengesteld gen dat codeert voor een enkel multifunctioneel eiwit. Voor dit doel kunnen genfusie-evenementen worden gebruikt als het enige bewijs of als onafhankelijke informatie gecombineerd met andere 'genoom-bewuste' of op gelijkenis gebaseerde methoden, en functionele associaties kunnen op verschillende niveaus worden voorspeld. Een voordeel van deze benadering is dat het niet nodig is om de functie van het samengestelde/de componenten te kennen om associatie af te leiden.
|
[
"Genfusie is een belangrijk evolutionair proces. Het kan waardevolle informatie opleveren om de interacties en functies van eiwitten af te leiden.",
"We hebben een Bayesiaans kader ontwikkeld om fosforyleringsnetwerken af te leiden uit tijdreeksmetingen van fosfositesconcentraties na ligandstimulatie. Om de voorspellingsnauwkeurigheid te verhogen, hebben we verschillende soorten data geïntegreerd, bijvoorbeeld aminozuursequentiegegevens, genomische contextgegevens (genfusie, genbuurt en fylogenetische profielen)",
"Er wordt aangenomen dat twee eiwitten, die in één (of meerdere) genomen worden getranscribeerd door één transcript, waarschijnlijk functioneel gekoppeld zijn, bijvoorbeeld door te functioneren in dezelfde metabole route of door het vormen van een multiproteïnecomplex. Deze methode is bijzonder interessant voor het bestuderen van genen die geen of slechts verre homologen vertonen met reeds goed gekarakteriseerde eiwitten.",
"PLEX-zoekresultaten worden vergezeld van kwantitatieve schattingen van de betrouwbaarheid van koppeling, waardoor gebruikers kunnen profiteren van co-erfelijkheid, operon- en genfusie-gebaseerde methoden voor het afleiden van genfunctie en het reconstrueren van cellulaire systemen en routes.",
"Hoewel fylogenomische profielen de centrale focus van Phydbac2 blijven, integreert het nu ook chromosomale nabijheid en genfusie-analyses als twee aanvullende niet-gelijkheidsgebaseerde indicatoren voor het afleiden van functionele relaties tussen genparen.",
"Detectie van genfusie-evenementen kan bijdragen aan het verklaren van functionele associaties van eiwitten binnen volledige genomen",
"Afleiding van genfunctie op basis van genfusie-evenementen: de rosetta-stone methode.",
"Eiwitdomeinfusies in menselijke eiwitinteractienetwerken voorspelling",
"Sommige eiwitten, betrokken bij een gemeenschappelijk biologisch proces en gecodeerd door afzonderlijke genen in één organisme, kunnen in andere organismen gefuseerd worden gevonden binnen een enkele eiwitketen. Door deze triplets te detecteren, kan een functionele relatie worden vastgesteld tussen de niet-gefuseerde eiwitten.",
"Deze resultaten suggereren dat domeinfusie een geschikte methode is voor het voorspellen van eiwitcomplexen.",
"De detectie van genfusie-evenementen over genomen heen kan worden gebruikt voor de voorspelling van functionele associaties van eiwitten, inclusief fysieke interacties of complexvorming.",
"Deze genomische beperkingen vormen de basis voor diverse technieken die systematische genoomvergelijkingen gebruiken om functionele associaties tussen genen te voorspellen. De krachtigste technieken tot nu toe zijn gebaseerd op geconserveerde genbuurt, genfusie-evenementen en gemeenschappelijke fylogenetische distributies van genfamilies",
"Functionele verbanden tussen eiwitten kunnen vaak worden afgeleid uit genomische associaties tussen de genen die ze coderen: groepen genen die nodig zijn voor dezelfde functie vertonen vaak een vergelijkbare soortendekking, bevinden zich vaak dicht bij elkaar op het genoom (bij prokaryoten) en zijn vaak betrokken bij genfusie-evenementen.",
"Genen die door fusie-evenementen zijn gekoppeld, behoren over het algemeen tot dezelfde functionele categorie",
"Een functionele associatie tussen twee genen kan worden afgeleid uit het bestaan van een fusie van beide als één continue sequentie in een ander genoom",
"Eiwitinteractiekaarten voor volledige genomen gebaseerd op genfusie-evenementen",
"Omdat er selectiedruk moet zijn geweest om bepaalde genen in de loop van de evolutie te fuseren, kunnen we functionele associaties van eiwitten voorspellen.",
"We observeerden dat genfusie-evenementen meer gerelateerd zijn aan fysieke interactie tussen eiwitten dan aan andere zwakkere functionele relaties zoals deelname aan een gemeenschappelijke biologische route.",
"FusionDB biedt een karakterisering van een groot aantal genfusie-evenementen aan de hand van meervoudige sequentie-uitlijningen.",
"Domeinfusie-analyse is recentelijk voorgesteld om de functionele associatie van de component-eiwitten af te leiden.",
"Hier presenteren we een methode die genfusie-evenementen in volledige genomen identificeert, uitsluitend gebaseerd op sequentievergelijking."
] | 659
| 615
|
185
|
Het eiwit NONO vormt heterodimeren. Met welke eiwitten?
|
Het eiwit NONO vormt heterodimeren met PSPC1, SFPQ.
|
[
"De paraspeckle component 1 (PSPC1) en non-POU-domein-bevattend octameer-bindend eiwit (NONO) heterodimeer is een essentieel structureel onderdeel van paraspeckles,",
"PSPC1-NONO heterodimeer.",
"Kristallisatie van een paraspeckle-eiwit PSPC1-NONO heterodimeer",
"moeilijk heterodimeer complex van twee menselijke eiwitten, paraspeckle component 1 (PSPC1) en non-POU domein-bevattend octameer-bindend eiwit (NONO), die betrokken zijn bij genregulatie en de structurele integriteit van nucleaire lichamen genaamd paraspeckles wordt beschreven.",
"SFPQ (PSF) en NONO (p54) zijn nucleaire eiwitten die met elkaar interageren en diverse rollen hebben in het metabolisme van nucleïnezuren. Het SFPQ/NONO heterodimeer bleek eerder DNA-strengbreukherstel in vitro te bevorderen.",
"We identificeerden een heterodimeer, p54nrb en PSF,",
"P54nrb vormt een heterodimeer met PSP1 dat zich op RNA-afhankelijke wijze lokaliseert naar paraspeckles.",
"We toonden aan dat de PSF heterodimeerpartner, p54nrb (non-POU-domein-bevattend, octameer-bindend eiwit), ook kan functioneren als transcriptiecorepressor, onafhankelijk van PSF.",
"Het PSPC1/NONO heterodimeer heeft een rechtsdraaiende antiparallelle coiled-coil",
"Structuur van het heterodimeer van menselijk NONO en paraspeckle-eiwitcomponent 1"
] | 164
| 153
|
186
|
Welk syndroom wordt geassocieerd met mutant DVL1?
|
Mutaties in DVL1 veroorzaken een osteosclerotische vorm van het Robinow-syndroom.
|
[
"Mutaties in DVL1 veroorzaken een osteosclerotische vorm van het Robinow-syndroom.",
"Hier identificeerden we de novo frameshift-mutaties in DVL1, een mediator van zowel de canonieke als niet-canonieke Wnt-signaleringsroutes, als de oorzaak van RS-OS, een subtype van RS dat osteosclerose omvat, bij drie niet-verwante individuen.",
"Frameshift-mutaties in DVL1 die clusteren in het voorlaatste exon veroorzaken autosomaal-dominant Robinow-syndroom.",
"Gerichte Sanger-sequencing bij aanvullende personen met DRS onthulde mutaties in exon 14 van DVL1 bij vijf individuen, waaronder een paar eeneiige tweelingen."
] | 88
| 89
|
187
|
Zijn proteasoomremmers goede kandidaten voor de behandeling van leukemie en solide tumoren?
|
Ja, verschillende verbindingen die verschillende leden van het proteasoompad remmen (bijvoorbeeld Bortezomib) worden getest voor de behandeling van leukemie en solide tumoren. Het lijkt erop dat een combinatie met andere geneesmiddelen een nuttige therapie kan zijn voor solide tumoren.
|
[
"We tonen aan dat behandeling met b-AP15 de tumorprogressie remde in vier verschillende in vivo modellen van solide tumoren en orgaaninfiltratie remde in een model van acute myeloïde leukemie. Onze resultaten tonen aan dat de deubiquitinerende activiteit van het 19S regelgevende deeltje een nieuw antikankermiddeldoelwit is.",
"We vonden verder dat ATO AME target via zowel myelodysplastisch syndroom 1 (MDS1) als EVI1 componenten en EVI1 afbreekt via het ubiquitine-proteasoompad en MDS1 op een proteasoomonafhankelijke wijze. Onze resultaten suggereren dat ATO gebruikt kan worden als onderdeel van gerichte therapie voor AME-, AML1/MDS1-, MDS1/EVI1- en EVI1-positieve menselijke kankers.",
"Eerder hadden we het synergetische effect van bortezomib en thiostrepton aangetoond in borstkankercellen in vitro, waarbij sub-apoptotische concentraties van beide proteasoomremmers resulteerden in een synergetische toename van celdood wanneer gecombineerd als behandeling. Hier gaven we zo'n combinatie aan MDA-MB-231 xenograft tumoren in vivo, en vonden dat het effect van complementaire proteasoomremmers de tumorgroeisnelheden efficiënter verminderde dan wanneer ze afzonderlijk werden toegediend.",
"Toevoeging van een proteasoomremmer aan anti-hormonale therapie resulteerde in een klinisch batenpercentage van 22% bij een beperkt aantal patiënten met endocriene resistente en progressieve metastatische borstkanker.",
"Samengevat ondersteunen deze gegevens de klinische ontwikkeling van MLN9708 voor zowel hematologische als solide tumor indicaties.",
"Bortezomib heeft minimale activiteit als monotherapie bij de behandeling van recidiverende platinum-gevoelige EOC/PPC.",
"Onze studie wijst op een moleculair mechanisme waarmee de gevoeligheid van schildklierkankercellen wordt gereguleerd door het niveau van GRP78 evenals de voorkeur voor inductie van GRP78 of CHOP bij behandeling met proteasoomremmers. Onze experimenten suggereren daarom een nieuwe benadering voor het sensibiliseren van schildklierkankercellen voor proteasoomremmers.",
"Bortezomib (PS-341) is een nieuw antineoplastisch middel dat goed wordt verdragen bij doses die 3,0 mg (equivalent aan 1,75 mg/m2) niet overschrijden, herhaald op dag 1 en dag 4 om de andere week. Deze dosis correleert met 70% remming van 20S proteasoomactiviteit.",
"De maximaal verdragen dosis en aanbevolen fase II dosis van bortezomib in dit schema is 1,6 mg/m(2). Biologische activiteit (remming van nucleaire factor-kappa B-gerelateerde markers) en antitumorale activiteit worden gezien bij AIPCa bij verdragen doses van bortezomib.",
"Gezien de resultaten van deze studie is het veilig en redelijk om behandeling met PS341 aan te bevelen volgens het schema gebruikt in deze studie bij 1,56 mg/m2/dosis in fase II studies. Bijzondere zorg moet worden besteed aan patiënten met bestaande neuropathie.",
"De successen van proteasoomremmers bij MM worden nu vertaald naar andere hematologische maligniteiten, waaronder acute leukemie.",
"Dergelijke inspanningen hebben geleid tot bortezomib, de eerste door de FDA goedgekeurde proteasoomremmer die nu wordt gebruikt als eerstelijnsbehandeling voor nieuw gediagnosticeerde multipel myeloom (MM), teruggekeerd/refractair MM en mantelcellymfoom.",
"We rapporteerden recent de impact en mechanismen van carfilzomib en oprozomib, proteasoomremmers van de tweede generatie met hogere specificiteit en verminderde toxiciteiten, tegen plaveiselcelcarcinoom van hoofd en hals (HNSCC). Carfilzomib en oprozomib remmen krachtig de overleving van HNSCC-cellen en de groei van HNSCC-tumoren."
] | 520
| 503
|
188
|
Is er een verband tussen CTF4 en CTF18 tijdens de cohesie van zusterchromatiden?
|
Ja. CTF4 en CTF18 zijn nodig voor een nauwkeurige chromosoomsegregatie. Beide vertonen genetische en fysieke verbindingen met componenten van de replicatievork. Afwezigheid van CTF4 of CTF18 veroorzaakt falen van zusterchromatidecohesie en leidt tot een preanafase-accumulatie van cellen die afhankelijk is van de spoelfiguurassemblagecontrole. De fysieke en genetische interacties tussen CTF4, CTF18 en kerncomponenten van replicatievorkcomplexen suggereren dat beide genproducten samenwerken met de replicatievork om zusterchromatidecohesie te faciliteren.
|
[
"Onze resultaten suggereren dat Elg1, Ctf4 en Ctf18 mogelijk de relatieve beweging van de replicatievork coördineren ten opzichte van de cohesinering",
"Deze gegevens definiëren twee cohesie-paden, één met CSM3, TOF1, CTF4 en CHL1, en het tweede met MRC1, CTF18, CTF8 en DCC1",
"Hier tonen we aan dat drie eiwitten die nodig zijn voor zusterchromatidecohesie, Eco1, Ctf4 en Ctf18, aanwezig zijn bij, en dat Ctf4 langs chromosomen reist met, replicatievorken. Het ringvormige cohesincomplex wordt vóór de S-fase op chromosomen geladen in een ATP-hydrolyse-afhankelijke reactie. Cohesie-establishing tijdens DNA-replicatie volgt zonder verdere cohesinrekrutering en zonder dat cohesin opnieuw een ATP-hydrolysemotief hoeft te activeren dat cruciaal is voor de initiële DNA-binding. Dit levert bewijs voor cohesie-establishing in de context van replicatievorken en legt beperkingen op aan het betrokken mechanisme.",
"Zusterchromatidecohesie, gemedieerd door het alternatieve RF-C Ctf18/Dcc1/Ctf8, de helicase Chl1 en het polymerase-alfa-geassocieerde eiwit Ctf4, is essentieel voor chromatide-scheiding tijdens meiose II.",
"In gist (budding yeast) zijn een gespecialiseerd replicatiefactor C genaamd RF-C(Ctf18/Dcc1/Ctf8) en het DNA-polymerase-alfa-geassocieerde eiwit Ctf4 nodig om zusterchromatidecohesie te behouden in cellen die langdurig in mitose zijn opgehouden.",
"We tonen ook aan dat, in tegenstelling tot mitose, RF-C(Ctf18/Dcc1/Ctf8), Ctf4 en Chl1 essentieel zijn voor chromosoomsegregatie tijdens meiose en voor de levensvatbaarheid van meiotische producten.",
"Ctf8p is een component van Ctf18-RFC, een alternatief replicatiefactor C-achtig complex dat nodig is voor efficiënte zusterchromatidecohesie in Saccharomyces cerevisiae. We voerden een synthetische genetische array (SGA) analyse uit met een ctf8 deletiestrain als primaire screening om andere niet-essentiële genen te identificeren die nodig zijn voor efficiënte zusterchromatidecohesie. Vervolgens beoordeelden we de cohesie op drie chromosomale loci in stammen met deleties van de genen geïdentificeerd in de ctf8 SGA-screening. Deletie van zeven genen (CHL1, CSM3, BIM1, KAR3, TOF1, CTF4 en VIK1) resulteerde in defecte zusterchromatidecohesie.",
"Saccharomyces cerevisiae CTF18 en CTF4 zijn nodig voor zusterchromatidecohesie.",
"CTF4 en CTF18 zijn nodig voor een nauwkeurige chromosoomsegregatie. Beide vertonen genetische en fysieke verbindingen met componenten van de replicatievork. We vinden dat afwezigheid van CTF4 of CTF18 leidt tot falen van zusterchromatidecohesie en tot een preanafase-accumulatie van cellen die afhankelijk is van de spoelfiguurassemblagecontrole. De fysieke en genetische interacties tussen CTF4, CTF18 en kerncomponenten van replicatievorkcomplexen die in deze studie en andere zijn waargenomen, suggereren dat beide genproducten samenwerken met de replicatievork om zusterchromatidecohesie te faciliteren.",
"De noodzaak van CTF4 en CTF18 voor robuuste cohesie identificeert nieuwe rollen voor replicatie-accessoire-eiwitten in dit proces.",
"Hier tonen we aan dat drie eiwitten die nodig zijn voor zusterchromatidecohesie, Eco1, Ctf4 en Ctf18, aanwezig zijn bij, en dat Ctf4 langs chromosomen reist met, replicatievorken.",
"Saccharomyces cerevisiae CTF18 en CTF4 zijn nodig voor zusterchromatidecohesie.",
"We vinden dat afwezigheid van CTF4 of CTF18 leidt tot falen van zusterchromatidecohesie en tot een preanafase-accumulatie van cellen die afhankelijk is van de spoelfiguurassemblagecontrole.",
"In gist (budding yeast) zijn een gespecialiseerd replicatiefactor C genaamd RF-C(Ctf18/Dcc1/Ctf8) en het DNA-polymerase-alfa-geassocieerde eiwit Ctf4 nodig om zusterchromatidecohesie te behouden in cellen die langdurig in mitose zijn opgehouden.",
"De fysieke en genetische interacties tussen CTF4, CTF18 en kerncomponenten van replicatievorkcomplexen die in deze studie en andere zijn waargenomen, suggereren dat beide genproducten samenwerken met de replicatievork om zusterchromatidecohesie te faciliteren.",
"Zusterchromatidecohesie, gemedieerd door het alternatieve RF-C Ctf18/Dcc1/Ctf8, de helicase Chl1 en het polymerase-alfa-geassocieerde eiwit Ctf4, is essentieel voor chromatide-scheiding tijdens meiose II.",
"Genetische analyses toonden aan dat Rmi1 zusterchromatidecohesie bevorderde in een proces dat verschilde van zowel het cohesie-establishing pad met Ctf4, Csm3 en Chl1 als het pad met acetylatie van Smc3.",
"De fysieke en genetische interacties tussen CTF4, CTF18 en kerncomponenten van replicatievorkcomplexen die in deze studie en andere zijn waargenomen, suggereren dat beide genproducten samenwerken met de replicatievork om zusterchromatidecohesie te faciliteren.",
"Hier tonen we aan dat drie eiwitten die nodig zijn voor zusterchromatidecohesie, Eco1, Ctf4 en Ctf18, aanwezig zijn bij, en dat Ctf4 langs chromosomen reist met, replicatievorken.",
"We vinden dat afwezigheid van CTF4 of CTF18 leidt tot falen van zusterchromatidecohesie en tot een preanafase-accumulatie van cellen die afhankelijk is van de spoelfiguurassemblagecontrole.",
"In gist (budding yeast) zijn een gespecialiseerd replicatiefactor C genaamd RF-C(Ctf18/Dcc1/Ctf8) en het DNA-polymerase-alfa-geassocieerde eiwit Ctf4 nodig om zusterchromatidecohesie te behouden in cellen die langdurig in mitose zijn opgehouden.",
"Hier tonen we aan dat drie eiwitten die nodig zijn voor zusterchromatidecohesie, Eco1, Ctf4 en Ctf18, aanwezig zijn bij, en dat Ctf4 langs chromosomen reist met, replicatievorken.",
"De fysieke en genetische interacties tussen CTF4, CTF18 en kerncomponenten van replicatievorkcomplexen die in deze studie en andere zijn waargenomen, suggereren dat beide genproducten samenwerken met de replicatievork om zusterchromatidecohesie te faciliteren.",
"We vinden dat afwezigheid van CTF4 of CTF18 leidt tot falen van zusterchromatidecohesie en tot een preanafase-accumulatie van cellen die afhankelijk is van de spoelfiguurassemblagecontrole.",
"Naast Eco1 dragen verschillende andere factoren bij aan cohesie-establishing, waaronder Ctf4, Ctf18, Tof1, Csm3, Chl1 en Mrc1, maar er is weinig bekend over hun rollen."
] | 913
| 840
|
189
|
Wat is de Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool (GREAT)?
|
Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool (GREAT) is een hulpmiddel om de functionele betekenis te analyseren van cis-regulerende regio's die zijn geïdentificeerd door gelokaliseerde metingen van DNA-bindingsgebeurtenissen over een heel genoom. Waar eerdere methoden alleen rekening hielden met bindingen dicht bij genen, kan GREAT ook distale bindingsplaatsen correct verwerken en vals-positieven controleren met behulp van een binomiale test over de ingevoerde genomische regio's. GREAT bevat annotaties uit 20 ontologieën en is beschikbaar als een webapplicatie. Door GREAT toe te passen op datasets van chromatin immunoprecipitatie gekoppeld aan massaal parallelle sequencing (ChIP-seq) van meerdere transcriptie-geassocieerde factoren, waaronder SRF, NRSF, GABP, Stat3 en p300 in verschillende ontwikkelingscontexten, worden veel functies van deze factoren teruggevonden die door bestaande gen-gebaseerde hulpmiddelen worden gemist, en worden toetsbare hypothesen gegenereerd. De bruikbaarheid van GREAT is niet beperkt tot ChIP-seq, aangezien het ook kan worden toegepast op open chromatine, gelokaliseerde epigenomische markers en vergelijkbare functionele datasets, evenals vergelijkende genomica sets.
|
[
"We hebben de Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool (GREAT) ontwikkeld om de functionele betekenis te analyseren van cis-regulerende regio's die zijn geïdentificeerd door gelokaliseerde metingen van DNA-bindingsgebeurtenissen over een heel genoom. Waar eerdere methoden alleen rekening hielden met bindingen dicht bij genen, kan GREAT ook distale bindingsplaatsen correct verwerken en vals-positieven controleren met behulp van een binomiale test over de ingevoerde genomische regio's.",
"GREAT bevat annotaties uit 20 ontologieën en is beschikbaar als een webapplicatie. Door GREAT toe te passen op datasets van chromatin immunoprecipitatie gekoppeld aan massaal parallelle sequencing (ChIP-seq) van meerdere transcriptie-geassocieerde factoren, waaronder SRF, NRSF, GABP, Stat3 en p300 in verschillende ontwikkelingscontexten, vinden we veel functies van deze factoren terug die door bestaande gen-gebaseerde hulpmiddelen worden gemist, en genereren we toetsbare hypothesen. De bruikbaarheid van GREAT is niet beperkt tot ChIP-seq, aangezien het ook kan worden toegepast op open chromatine, gelokaliseerde epigenomische markers en vergelijkbare functionele datasets, evenals vergelijkende genomica sets.",
"We hebben de Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool (GREAT) ontwikkeld om de functionele betekenis te analyseren van cis-regulerende regio's die zijn geïdentificeerd door gelokaliseerde metingen van DNA-bindingsgebeurtenissen over een heel genoom.",
"We hebben de Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool (GREAT) ontwikkeld om de functionele betekenis te analyseren van cis-regulerende regio's die zijn geïdentificeerd door gelokaliseerde metingen van DNA-bindingsgebeurtenissen over een heel genoom.",
"We hebben de Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool (GREAT) ontwikkeld om de functionele betekenis te analyseren van cis-regulerende regio's die zijn geïdentificeerd door gelokaliseerde metingen van DNA-bindingsgebeurtenissen over een heel genoom.",
"We hebben de Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool (GREAT) ontwikkeld om de functionele betekenis te analyseren van cis-regulerende regio's die zijn geïdentificeerd door gelokaliseerde metingen van DNA-bindingsgebeurtenissen over een heel genoom. Waar eerdere methoden alleen rekening hielden met bindingen dicht bij genen, kan GREAT ook distale bindingsplaatsen correct verwerken en vals-positieven controleren met behulp van een binomiale test over de ingevoerde genomische regio's.",
"We hebben de Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool (GREAT) ontwikkeld om de functionele betekenis te analyseren van cis-regulerende regio's die zijn geïdentificeerd door gelokaliseerde metingen van DNA-bindingsgebeurtenissen over een heel genoom. Waar eerdere methoden alleen rekening hielden met bindingen dicht bij genen, kan GREAT ook distale bindingsplaatsen correct verwerken en vals-positieven controleren met behulp van een binomiale test over de ingevoerde genomische regio's."
] | 537
| 534
|
190
|
Wat is het doelwit van het medicijn Olaparib?
|
Het medicijn Olaparib richt zich op het eiwit poly(ADP-ribose) polymerase.
|
[
"We tonen aan dat het richten op PARP met de kleine molecuulremmers, Olaparib ",
"Na behandeling met de PARP1-remmer olaparib, ",
"de PARP-remmer olaparib",
"Olaparib (AZD-2281, Ku-0059436) is een oraal bioavailable en goed verdragen poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) remmer die momenteel wordt onderzocht bij patiënten met solide tumoren.",
"De poly(ADP-ribose) polymerase remmer olaparib",
"olaparib (poly(ADP ribose)polymerase remmer)",
" olaparib, een PARP-remmer, ",
"Olaparib is een orale poly (ADP-ribose) polymerase remmer",
"olaparib, een kleine molecuulremmer van de reparatie-enzymen PARP1/2. ",
"de poly (ADP-ribose) polymerase remmer olaparib ",
" PARP-remmer, Olaparib",
"Olaparib is een poly(ADP-ribose) polymerase remmer",
"olaparib, een specifieke PARP1-remmer.",
"PARP-remmer olaparib ",
"We gebruikten twee PARP-remmers in klinische ontwikkeling, olaparib en rucaparib",
" de PARPi, olaparib,"
] | 119
| 116
|
191
|
Zijn mutaties in de schildklierhormoonreceptor alfa1 betrokken bij het schildklierhormoonresistentiesyndroom?
|
Het ontbreken van TR alfa1 verergert de manifestatie van RTH bij TR betaPV-muizen. Daarom zou TR alfa1 een compenserende rol kunnen spelen bij het mediëren van de functies van T3 bij heterozygote patiënten met RTH
|
[
"Deze studie rapporteert de gevolgen van LT4-behandeling over een langere periode bij 2 van de eerste patiënten met een heterozygote mutatie in TRα1.",
"Hier tonen we aan dat de dysregulatie van de hypofyse-schildklieras werd verergerd door het ontbreken van TR alfa1 bij TR betaPV-muizen, en dat er een ernstige belemmering van de postnatale groei werd waargenomen bij TR betaPV-muizen die deficient zijn in TR alfa1.",
"Heterozygote 2- tot 3 weken oude muizen vertonen een ernstige vertraging van de postnatale ontwikkeling en groei, maar slechts een geringe verlaging van de serumthyroxinespiegels.",
"De gegevens tonen een nieuw scala aan effecten gemedieerd door een dominant negatief TRalpha1, en kunnen belangrijke aanwijzingen bieden voor de identificatie van een mogelijk onherkend menselijke aandoening en de behandeling ervan.",
"Er werden geen mutaties gevonden in de DNA- en hormoonbindingsdomeinen van de TRbeta1- en TRalpha1-genen bij de proband, wat suggereert dat het defect mogelijk te wijten is aan een onbekende mutatie in het TR-gen of een postreceptorafwijking.",
"Deze resultaten tonen aan dat het ontbreken van TR alfa1 de manifestatie van RTH bij TR betaPV-muizen verergert. Daarom zou TR alfa1 een compenserende rol kunnen spelen bij het mediëren van de functies van T3 bij heterozygote patiënten met RTH."
] | 231
| 237
|
192
|
Wat is de rol van RhoA bij blaaskanker?
|
Bij blaaskanker werd RhoA vaker geactiveerd gevonden in de latere stadia van de ziekte. Deze activatie werd geassocieerd met slechte tumordifferentiatie, spierinvasie, lymfekliermetastasen en verkorte ziektevrije en algehele overleving.
|
[
"Veranderingen in de expressie van RhoA, RhoB, RhoC, Rac1 en Cdc42 spelen een belangrijke rol bij het ontstaan en de progressie van urotheelcelcarcinoom (UCC) van de urineblaas.",
"Gepubliceerde rapporten suggereren dat verhoogde RhoA/Rho-kinase signalering een rol speelt bij de ontwikkeling van goedaardige prostaathyperplasie, erectiestoornissen, nierfalen, ejaculatiestoornissen, het ontstaan van prostaat- en blaaskanker en uiteindelijk metastasering.",
"Het onderdrukkende effect van de Rho-kinase remmer Y-27632 op oncogene Ras/RhoA geïnduceerde invasie/migratie van menselijke blaaskankercellen TSGH.",
"Onze resultaten leveren bewijs dat Ras-geïnduceerde activatie van RhoA en NF-kappaB betrokken was bij de invasie/migratie van blaaskanker.",
"Verhoogde RHOA-expressie kwam vaker voor in graad 3 dan in graad 2 tumoren (P = 0,016).",
"RhoA, RhoC en ROCK waren overvloediger aanwezig in tumoren en metastatische lymfeklieren dan in niet-tumorale blaas en niet-betrokken lymfeklieren (P < 0,0001).",
"Hoge expressie van RhoA, RhoC en ROCK werd geassocieerd met slechte tumordifferentiatie (P < 0,05, P < 0,01 en P < 0,01, respectievelijk), spierinvasie (P < 0,001) en lymfekliermetastasen (P < 0,05).",
"Kaplan-Meier-curves koppelden hoge eiwitexpressie van RhoA, RhoC en ROCK aan verkorte ziektevrije en algehele overleving (P < 0,0001).",
"Bij univariate analyse voorspelde hoge eiwitexpressie van RhoA, RhoC en ROCK een verkorte ziektevrije en algehele overleving (P < 0,0001).",
"De algehele overleving bij tumoren die de spier infiltreren (T2 tot T4; 44 patiënten) werd significant beïnvloed door RhoA, RhoC en ROCK in een Kaplan-Meier-analyse (P < 0,0001, P < 0,0001 en P < 0,01, respectievelijk)."
] | 276
| 260
|
193
|
Noem menselijke eiwitten die onderhevig zijn aan een dimer-naar-tetramer overgang.
|
GAC
SHMT2
AMPAR
Orai1
Orai3
|
[
" het vermogen van GAC om de dimer-naar-tetramer overgang te ondergaan die nodig is voor enzymactivatie.",
"terwijl SHMT2 een dimer-naar-tetramer overgang ondergaat bij PLP-binding.",
"AMPARs die vereist is voor de kritieke dimer-naar-tetramer overgang.",
"We concluderen dat de menselijke Orai1- en Orai3-kanalen een dimer-naar-tetramer overgang ondergaan om een Ca(2+)-selectieve porie te vormen tijdens store-geactiveerde activatie en dat Orai3 een dimerische niet-selectieve kationporie vormt bij activatie door 2-APB.",
"de conformationele vereiste voor de dimer-naar-tetramer overgang tijdens de rijping van AMPA-Rs."
] | 84
| 83
|
194
|
Remming van welke transporter is het werkingsmechanisme van het geneesmiddel Canagliflozine?
|
Remming van natrium-glucose co-transporter 2 (SGLT2) is het belangrijkste werkingsmechanisme van canagliflozine. Canagliflozine is de eerste SGLT2-remmer die in de VS is goedgekeurd voor de behandeling van type 2 diabetes en is in de EU onder regelgevende beoordeling. Andere SGLT2-remmers zijn onder andere dapagliflozine en empagliflozine.
|
[
"In het afgelopen jaar zijn twee SGLT2-remmers, canagliflozine en dapagliflozine, goedgekeurd voor de behandeling van type 2 diabetes.",
"Momenteel is dapagliflozine, een van de drie meest geavanceerde SGLT2-remmers in ontwikkeling (samen met canagliflozine en empagliflozine), al op de markt in enkele Europese landen en is canagliflozine goedgekeurd door de Food and Drug Administration (FDA) in de VS.",
"Remming van natrium-glucose co-transporter 2 (SGLT2) met canagliflozine bij type 2 diabetes mellitus.",
"Dit rapport bespreekt de mogelijk gunstige effecten van SGLT2-remmers bij type 2 diabetes mellitus, met specifieke focus op canagliflozine, de enige SGLT2-remmer die is goedgekeurd voor gebruik in de Verenigde Staten.",
"De natrium-glucose co-transporter 2-remmer canagliflozine verlaagde de bloedglucose, bloeddruk en het lichaamsgewicht, met een verhoogd risico op urogenitale infecties in fase 2-studies.",
"Canagliflozine (Invokana™), een orale selectieve natrium-glucose co-transporter 2 (SGLT2) remmer, wordt wereldwijd ontwikkeld door Mitsubishi Tanabe Pharma en Janssen Pharmaceuticals, een dochteronderneming van Johnson and Johnson, voor de behandeling van type 2 diabetes mellitus.",
"Canagliflozine is de eerste SGLT2-remmer die in de VS is goedgekeurd en is in de EU onder regelgevende beoordeling.",
"Canagliflozine, een remmer van natrium-glucose cotransporter 2, voor de behandeling van type 2 diabetes mellitus.",
"Canagliflozine is een oraal toegediende natrium-glucose cotransporter 2-remmer die wordt voorgesteld voor de behandeling van type 2 diabetes.",
"In deze review vatten we recente dier- en humane studies samen over ipragliflozine en andere SGLT2-remmers, waaronder dapagliflozine, canagliflozine, empagliflozine, tofogliflozine en luseogliflozine.",
"Canagliflozine, een natrium-glucose cotransporter (SGLT) 2-remmer, is ook een remmer met lage potentie van SGLT1.",
"Canagliflozine verlaagt de postprandiale plasmaglucose en insuline door het verhogen van de urineglucose-excretie (via renale SGLT2-remming) en het vertragen van de RaO, waarschijnlijk door intestinale SGLT1-remming."
] | 329
| 317
|
195
|
Wat is de prognostische rol van schildklierhormoon bij patiënten met hartfalen?
|
Veranderde schildklierprofielen, met name het zieke euthyroïde syndroom, zijn een onafhankelijke voorspeller van mortaliteit bij patiënten met chronisch hartfalen en voegen prognostische informatie toe aan conventionele klinische en functionele cardiale parameters.
|
[
"De cumulatieve overleving was significant lager bij patiënten met vrije triiodothyronine < 2,12 pg/mL en bij patiënten met brain natriuretisch peptide > 686 pg/mL. In multivariate analyse waren de significante onafhankelijke voorspellers van grote cardiale gebeurtenissen leeftijd, vrije triiodothyronine en brain natriuretisch peptide.",
"De T3 was betekenisvoller dan de BNP in de prognose van CHF. De combinatie van BNP en T3 detectie was waardevoller bij het bepalen van de ernst van CHF en de prognose.",
"fT3 en BNP hebben een onafhankelijke en additieve prognostische waarde bij HF.",
"Univariate regressieanalyse toonde aan dat TSH (p<0,0001), fT3 (p<0,0001), fT4 (p=0,016) en fT3/fT4 (p<0,0001) geassocieerd waren met progressie van hartfalen, maar multivariate analyse toonde aan dat alleen TSH, beschouwd als een continue variabele (p = 0,001), evenals subklinische hypothyreoïdie (TSH > 5,5 mUI/l; p=0,014), significant geassocieerd bleven met de gebeurtenissen.",
"Lage T(3)-waarden zijn een onafhankelijke voorspeller van mortaliteit bij patiënten met chronisch hartfalen en voegen prognostische informatie toe aan conventionele klinische en functionele cardiale parameters.",
"Zestien patiënten (14%) overleden tijdens de follow-up periode; hun fT3/fT4-ratio was significant lager dan die van de overlevende patiënten (1,31+/-0,37 versus 2,01+/-0,72, p<0,001).",
"De auteurs concluderen dat bij oudere patiënten met hartfalen lagere triiodothyronineconcentraties vaker voorkomen en geassocieerd zijn met een slechtere prognose.",
"Een lage vrije T3-index/omgekeerde T3-ratio is geassocieerd met een slechte ventriculaire functie en voedingsstatus en is de sterkste voorspeller tot nu toe geïdentificeerd voor de korte termijn uitkomst bij patiënten met gevorderd hartfalen."
] | 272
| 271
|
196
|
Welke mutaties van het fosfolamban-gen zijn gevonden die hypertrofische cardiomyopathie veroorzaken?
|
De volgende mutaties van het fosfolamban-gen zijn geassocieerd met hypertrofische cardiomyopathie: PLN L39X nonsense mutatie; PLN Leu39Ter; PLN -42 C>G en PLN -77A-->G
|
[
"Een L39X nonsense mutatie werd geïdentificeerd in 1 van de 1.064 HCM-probanden met een familiegeschiedenis van HCM, die eerder negatief waren bevonden voor het huidige HCM-genetische testpanel. Deze mutatie segregereerde mee met het voorkomen van HCM in een multigenerationele familie.",
"De PLN -42 C>G mutatie werd gevonden bij een patiënt met late onset familiaire apicale hypertrofische cardiomyopathie.",
"De PLN -42 C>G mutatie wordt geassocieerd met een goedaardige vorm van apicale hypertrofische cardiomyopathie in deze familie, hoewel de aanwezigheid van een gezonde volwassen drager suggereert dat andere genetische en omgevingsfactoren betrokken kunnen zijn.",
"We vonden een heterozygote enkelvoudige nucleotide transitie van A naar G op -77 bp stroomopwaarts van de transcriptiestartplaats in de promotorregio van fosfolamban bij een patiënt met familiaire hypertrofische cardiomyopathie.",
"Met behulp van neonatale rat cardiomyocyten verhoogde de mutatie, -77A-->G, de promotoractiviteit van fosfolamban. Er werd geen nucleotideverandering in het coderende gebied van fosfolamban gevonden bij 99 patiënten met cardiomyopathie. We vermoeden dat de mutatie een belangrijke rol speelt in de ontwikkeling van hypertrofische cardiomyopathie.",
"Twee nieuwe mutaties in het CALR3-gen werden geïdentificeerd (Lys82Arg, Arg73Gln) en één truncatie mutatie in het PLN-gen (Leu39Ter)."
] | 225
| 212
|
197
|
Welke genstreng wordt door transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) gericht?
|
Nucleotide Excisie Reparatie (NER) verwijdert verschillende helix-vervormende beschadigingen uit DNA. Het heeft twee subroutes, de globale genoom (gg) NER en de transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR). TCR wordt geactiveerd wanneer een RNA-polymerase, dat langs de getranscribeerde streng beweegt, wordt geblokkeerd bij een beschadiging of ongebruikelijke structuur in het DNA. TCR is specifiek gericht op het herstellen van de getranscribeerde streng van een actief gen.
|
[
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) is de belangrijkste route die betrokken is bij het verwijderen van UV-geïnduceerde fotobeschadigingen van de getranscribeerde streng van actieve genen.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) zorgt voor snellere reparatie van de getranscribeerde streng van actieve genen.",
"Er zijn twee subroutes van nucleotide excisie reparatie (NER), de globale genoom (gg) NER en de transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR). TCR kan de omvangrijke DNA-beschadigingen die zich op de getranscribeerde streng van een transcriptioneel actief gen bevinden, sneller verwijderen dan die op de niet-getranscribeerde streng of het gehele genoom.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) richt zich op DNA-schade die zich bevindt op de getranscribeerde of coderende streng van DNA.",
"Nucleotide Excisie Reparatie (NER), die verschillende helix-vervormende beschadigingen uit DNA verwijdert, wordt geïnitieerd door twee verschillende DNA-schade-herkenningsmechanismen. Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) verwijdert schade van de actieve streng van getranscribeerde genen.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) is een subroute van nucleotide excisie reparatie die een verbeterde reparatie van de getranscribeerde streng van actieve genen mogelijk maakt.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) is een nucleotide excisie reparatie (NER) route die specifiek gericht is op reparatie in de getranscribeerde streng van een actief gen.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) is een route die zich toelegt op het verwijderen van schade van de templatestrengen van actief getranscribeerde genen.",
"Hoewel het gedetailleerde mechanisme van TCR nog niet volledig begrepen is, wordt aangenomen dat het wordt geactiveerd wanneer een translerend RNA-polymerase wordt geblokkeerd bij een beschadiging of ongebruikelijke structuur in het DNA.",
"Een van deze processen is transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR), die de verwijdering van DNA-beschadigingen van de getranscribeerde streng van tot expressie gebrachte genen katalyseert, wat vaak resulteert in een voorkeur voor het opruimen van schade van deze streng ten opzichte van de niet-getranscribeerde tegenhanger.",
"Deze resultaten suggereren dat UV-behandeling leidt tot geïnduceerde reparatie van UV-beschadigd DNA in de getranscribeerde streng van een actief gen in XP-C en normale cellen door een versterking van TCR of een mechanisme dat het TCR-pad omvat.",
"TCR kan de omvangrijke DNA-beschadigingen die zich op de getranscribeerde streng van een transcriptioneel actief gen bevinden, sneller verwijderen dan die op de niet-getranscribeerde streng of het gehele genoom.",
"De efficiënte reparatie van de niet-getranscribeerde streng kan niet worden verklaard door de toegewijde subroute van transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR), die gericht is op de getranscribeerde streng in tot expressie gebrachte genen.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) is een universele subroute van het nucleotide excisie reparatiesysteem (NER) die beperkt is tot de getranscribeerde streng van actieve structurele genen.",
"NER kan via twee subroutes werken: globale genoomreparatie (GGR) en een gespecialiseerde route gekoppeld aan actieve transcriptie (transcriptie-gekoppelde reparatie, TCR) die gericht is op DNA-beschadigingen in de getranscribeerde streng van actieve genen.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR), een speciale subroute van nucleotide excisie reparatie (NER), verwijdert snel transcriptie-blokkerende beschadigingen van de transcripterende streng van actieve genen.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) werkt uitsluitend op de getranscribeerde streng van tot expressie gebrachte genen, terwijl globale genoomreparatie (GGR) verantwoordelijk is voor de alomtegenwoordige reparatie van het genoom.",
"Naast de herkenning en excisie van DNA-schade door het hele genoom (GGR), bestaat er een mechanisme, transcriptie-gekoppelde nucleotide excisie reparatie (TCR), voor het herkennen van bepaalde typen DNA-schade in de getranscribeerde streng van genen in Escherichia coli, gist en zoogdiercellen.",
"De efficiënte reparatie van de niet-getranscribeerde streng kan niet worden verklaard door de toegewijde subroute van transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR), die gericht is op de getranscribeerde streng in tot expressie gebrachte genen.",
"TCR kan de omvangrijke DNA-beschadigingen die zich op de getranscribeerde streng van een transcriptioneel actief gen bevinden, sneller verwijderen dan die op de niet-getranscribeerde streng of het gehele genoom.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) is een subroute van nucleotide excisie reparatie (NER) die specifiek werkt op beschadigingen in de getranscribeerde streng van tot expressie gebrachte genen.",
"De blokkade van transcriptie-elongatie door RNA-polymerase II (pol II) op een DNA-beschadigingsplaats op de getranscribeerde streng activeert transcriptie-gekoppelde DNA-reparatie (TCR), die snel DNA-schade op de getranscribeerde streng van het tot expressie gebrachte gen verwijdert en de hervatting van transcriptie mogelijk maakt.",
"Eerder is aangetoond dat verstoring van RAD26 in giststam W303-1B resulteert in een stam die deficient is in transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR), de voorkeurreparatie van de getranscribeerde streng van een tot expressie gebracht gen boven de niet-getranscribeerde streng en de rest van het genoom.",
"De efficiënte reparatie van de niet-getranscribeerde streng kan niet worden verklaard door de toegewijde subroute van transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR), die gericht is op de getranscribeerde streng in tot expressie gebrachte genen.",
"Een toegewijde excisieroute, genoemd transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR), richt zich op het verwijderen van DNA-beschadigingen van getranscribeerde strengen van tot expressie gebrachte genen.",
"NER kan via twee subroutes werken: globale genoomreparatie (GGR) en een gespecialiseerde route gekoppeld aan actieve transcriptie (transcriptie-gekoppelde reparatie, TCR) die gericht is op DNA-beschadigingen in de getranscribeerde streng van actieve genen.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) is een nucleotide excisie reparatie (NER) route die specifiek gericht is op reparatie in de getranscribeerde streng van een actief gen.",
"Transcriptie-gekoppelde reparatie (TCR) wordt over het algemeen waargenomen als een snellere of efficiëntere verwijdering van bepaalde typen DNA-schade van de getranscribeerde strengen van tot expressie gebrachte genen vergeleken met de niet-getranscribeerde strengen.",
"Naast de herkenning en excisie van DNA-schade door het hele genoom (GGR), bestaat er een mechanisme, transcriptie-gekoppelde nucleotide excisie reparatie (TCR), voor het herkennen van bepaalde typen DNA-schade in de getranscribeerde streng van genen in Escherichia coli, gist en zoogdiercellen."
] | 916
| 907
|
198
|
Afwijkingen in welke chromosomen werden in verband gebracht met de Moyamoya-ziekte?
|
Chromosomen 3, 6, 8, 12, 15, 17, 21, X en Y werden geïmpliceerd bij de Moyamoya-ziekte.
|
[
"Complexe chromosoomherordening van 6p25.3->p23 en 12q24.32->qter bij een kind met moyamoya.",
"Routine karyotype toonde extra chromosomaal materiaal op 6p. Single nucleotide polymorphism microarray onthulde een eerder niet gerapporteerde complexe de novo genetische herordening die subtelomerische segmenten op chromosomen 6p en 12q betrof.",
"Wat betreft de genetica suggereert recente literatuur een lage penetrantie autosomaal dominante of polygenische overdrachtswijze waarbij chromosomen 3, 6, 8, 12 en 17 betrokken zijn bij familiaire MMD.",
"Bovendien heeft de huidige literatuur over familiaire MMD gewezen op een lage penetrantie autosomaal dominante of polygenische overdrachtswijze op loci op chromosomen 3, 6, 8, 12 en 17.",
"Hier rapporteren we over drie niet-verwante families die getroffen zijn door een X-gebonden moyamoya-syndroom gekenmerkt door de associatie van een moyamoya-angiopathie, korte gestalte en een gestandaardiseerde gezichtsdysporfie.",
"We tonen aan dat dit syndromische moyamoya wordt veroorzaakt door Xq28 deleties die MTCP1/MTCP1NB en BRCC3 verwijderen.",
"Een genoomwijde associatiestudie van 785.720 single-nucleotide polymorfismen (SNP's) werd uitgevoerd, waarbij 72 Japanse MMD-patiënten werden vergeleken met 45 Japanse controles, wat resulteerde in een sterke associatie van chromosoom 17q25-ter met MMD-risico. Dit resultaat werd verder bevestigd door een locus-specifieke associatiestudie met 335 SNP's in het 17q25-ter gebied.",
"Onderzoeken omvatten neuroimaging, cardiologische en oftalmologische evaluatie, hormonale testen, hemoglobine-elektroforese, chromosomaal karyotyperen, spierbiopsie voor morfologie, immunohistochemie en enzymassays, mtDNA-mutatiescreening en haplotype-analyse van 2 loci die eerder aan moyamoya werden gekoppeld, op chromosomen 10 (ACTA2) en 17.",
"Deze gegevens suggereren sterk dat deze familie getroffen is door een erfelijke moyamoya multisysteemstoornis met een X-gebonden recessief overervingspatroon.",
"Haar kenmerken waren consistent met TS en chromosoomanalyse onthulde mosaicisme waarbij 17% van de cellen een pseudoisodicentrisch Y-chromosoom toonde: 45,X (25)/46,X psu idic (Y)(11.2) (5).",
"Het kleine aantal gevallen staat geen gedetailleerde analyse toe anders dan het noteren van de leeftijd van de patiënt (twee ouder dan 40 jaar), karyotype (twee anderen geassocieerd met isochrome Xq) en geassocieerde cardiale risicofactoren (één met BAV).",
"Studies hebben een mogelijke genetische associatie van MMD gekoppeld aan chromosoom 17 aangetoond bij Japanse gevallen evenals bij gevallen in andere demografieën.",
"Het gen dat verantwoordelijk is voor NF1 bevindt zich op chromosoomregio 17q11.2 en voor familiaire moyamoya-ziekte op chromosoom 17q25.",
"Autosomaal dominante moyamoya-ziekte is gelokaliseerd op chromosoom 17q25.3.",
"Onder beide classificaties werd significante bewijs van koppeling alleen waargenomen op chromosoom 17q25.3, met maximale multipoint logarithme van odds (lod) scores van 6,57 (onder de nauwe classificatie) en 8,07 (onder de brede classificatie) bij D17S704. Haplotype-analyse onthulde segregatie van een ziektehaplotype in alle families behalve één, en informatieve crossovers maakten het mogelijk het MMD-locus te mappen naar een 3,5-Mb regio tussen D17S1806 en de telomeer van 17q, met inbegrip van 94 geannoteerde genen. CONCLUSIES: Onze gegevens suggereren dat er een belangrijk genlocus is voor autosomaal dominante moyamoya-ziekte op chromosoom 17q25.3.",
"Echter, het mitochondriale DNA en Y-chromosomaal genotype toonden aan dat getroffen leden dezelfde sequentie hadden van het mitochondriale 3 deel van de D-loop als Japanse patiënten.",
"Smith-Magenis syndroom en Moyamoya-ziekte bij een patiënt met del(17)(p11.2p13.1).",
"We hebben een combinatie van aCGH, FISH en MLPA gebruikt om een ongeveer 6,3 Mb deletie te karakteriseren die het chromosoomgebied 17p11.2-p13.1 bij deze patiënt beslaat, met het proximale breekpunt binnen het RAI1-gen.",
"Moyamoya-syndroom bij een kind met trisomie 12p-syndroom.",
"Dit rapport presenteert het eerste geval van moyamoya-syndroom met trisomie 12p met een familiaire pericentrische inversie van chromosoom 12.",
"Zij was prenataal gediagnosticeerd met trisomie 12p met een familiaire pericentrische inversie van chromosoom 12 afkomstig van haar moeder. Ze vertoonde ontwikkelingsachterstand en enkele dysmorfe kenmerken van het gezicht en de ledematen die compatibel zijn met de klinische kenmerken van trisomie 12p.",
"De genen die weefselremmer van metalloproteïnase (TIMP) 4 en TIMP2 coderen, beslaan respectievelijk chromosomen 3p24.2-p26 en 17q25, wat de locaties zijn van familiaire moyamoya-ziekte (FMMD) genen.",
"We veronderstellen dat een eiwit gecodeerd op chromosoom 21 gerelateerd kan zijn aan de pathogenese van het Down-syndroom met moyamoya-syndroom.",
"[Moleculaire screening voor moyamoya-ziekte met gebruik van expressed sequence tag op chromosoom 3p].",
"Om de expressed sequence tags (EST's) met monoallele expressies op chromosoom 3 te identificeren, gebruikten we muis A9 hybride cellen met menselijk chromosoom 3. Twee EST's toonden alleen maternale expressie in muis A9 hybride cellen, en vier toonden geen expressie in de lymfocyten afkomstig van moyamoya-patiënten.",
"Een nieuw susceptibiliteitslocus voor moyamoya-ziekte op chromosoom 8q23.",
"Eerdere koppelingstudies hebben aangegeven dat susceptibiliteitsloci voor de ziekte zich bevinden op chromosomen 3p, 6q en 17q. In de huidige studie zochten we naar loci gekoppeld aan de ziekte in 12 Japanse families met behulp van 428 microsatellietmarkers en vonden significant bewijs voor koppeling aan 8q23 [maximale LOD-score (MLS) van 3,6] en suggestief bewijs voor koppeling aan 12p12 (MLS=2,3).",
"Gezien de functie selecteerden we negen genen als kandidaten uit in totaal 65 genen geïdentificeerd in het 9-cM gebied van D17S785-D17S836 op chromosoom 17q25, en voerden sequentieanalyse uit op DNA-monsters verkregen van een stamboom van familiaire moyamoya-ziekte, die een volledige koppeling aan het gebied toonde door haplotype-analyse.",
"Koppeling van familiaire moyamoya-ziekte (spontane occlusie van de cirkel van Willis) aan chromosoom 17q25.",
"De karakteristieke laesies van moyamoya-ziekte worden soms gezien bij neurofibromatose type 1, waarvan het veroorzakende gen (NF1) is toegewezen aan chromosoom 17q11.2.",
"CONCLUSIES: Een gen voor familiaire moyamoya-ziekte bevindt zich op chromosoom 17q25.",
"Recente genetische studies suggereren enkele verantwoordelijke genetische loci op chromosomen 3, 6 en 17.",
"Om het genetische component van moyamoya-ziekte verder te specificeren, werd een koppelingstudie van moyamoya-ziekte uitgevoerd met markers op chromosoom 6, waar het HLA-gen is gelokaliseerd.",
"Mapping van een familiair moyamoya-ziektegen naar chromosoom 3p24.2-p26.",
"Er werd een koppeling gevonden tussen de ziekte en markers gelegen op 3p24.2-26.",
"We veronderstellen dat een eiwit gecodeerd op chromosoom 21 gerelateerd kan zijn aan de pathogenese van moyamoya-ziekte.",
"De diagnose van PWS werd genetisch bevestigd door de methode van fluorescentie in situ hybridisatie die de deletie van chromosoom 15 aantoonde."
] | 993
| 936
|
199
|
Wat is de consensussequentie van de branch site in U12-afhankelijke introns?
|
De consensussequentie van de branch site in U12-afhankelijke introns is UUCCUUAAC.
|
[
"Sterk geconserveerde sequenties bij de 5' splice site en de branch site van U12-afhankelijke introns zijn belangrijke bepalende factoren voor splicing door U12-afhankelijke spliceosomen. Deze studie onderzoekt de in vivo splicingfenotypen van mutaties in de consensussequentie van de branch site van het U12-afhankelijke intron F van een menselijke NOL1 (P120) minigen. Intron F bevat een volledig consensus branch site sequentie (UUCCUUAAC).",
"Intron F bevat een volledig consensus branch site sequentie (UUCCUUAAC).",
"Intron F bevat een volledig consensus branch site sequentie (UUCCUUAAC)."
] | 96
| 99
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.