extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "Monitoring", "enzymatic", "activity", "in", "vivo", "of", "individual", "homologous", "enzymes", "such", "as", "the", "matrix", "metalloproteinases", "(", "MMPs", ")", "by", "antagonist", "molecules", "is", "highly", "desired", "for", "defining", "physiological", "and", "pathophysiological", "pathways", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "rational", "design", "of", "antagonists", "targeting", "enzyme", "catalytic", "moieties", "specific", "to", "one", "of", "the", "homologous", "enzymes", "often", "appears", "to", "be", "an", "extremely", "difficult", "task", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "is", "mainly", "due", "to", "the", "high", "structural", "homology", "at", "the", "enzyme", "active", "sites", "shared", "by", "members", "of", "the", "protein", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Accordingly", ",", "controlling", "enzymatic", "activity", "via", "alternative", "allosteric", "sites", "has", "become", "an", "attractive", "proposition", "for", "drug", "design", "targeting", "individual", "homologous", "enzymes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Yet", ",", "the", "challenge", "remains", "to", "identify", "such", "regulatory", "alternative", "sites", "that", "are", "often", "hidden", "and", "scattered", "over", "different", "locations", "on", "the", "protein", "'", "s", "surface", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "designed", "branched", "amphiphilic", "molecules", "exhibiting", "specific", "inhibitory", "activity", "towards", "individual", "members", "of", "the", "MMP", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "amphiphilic", "isomers", "share", "the", "same", "chemical", "nature", ",", "providing", "versatile", "nonspecific", "binding", "reactivity", "that", "allows", "to", "probe", "hidden", "regulatory", "residues", "on", "a", "given", "protein", "surface", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "the", "advantage", "provided", "by", "amphiphilic", "ligands", ",", "here", "we", "explore", "a", "new", "approach", "for", "determining", "hidden", "regulatory", "sites", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "approach", "includes", "diverse", "experimental", "analysis", ",", "such", "as", "structural", "spectroscopic", "analyses", ",", "NMR", ",", "and", "protein", "crystallography", "combined", "with", "computational", "prediction", "of", "effector", "binding", "sites", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "demonstrate", "how", "our", "approach", "works", "by", "analyzing", "members", "of", "the", "MMP", "family", "that", "possess", "a", "unique", "set", "of", "such", "sites", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "work", "provides", "a", "proof", "of", "principle", "for", "using", "ligand", "effectors", "to", "unravel", "hidden", "regulatory", "sites", "specific", "to", "members", "of", "the", "structurally", "homologous", "MMP", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "approach", "may", "be", "exploited", "for", "the", "design", "of", "novel", "molecular", "effectors", "and", "therapeutic", "agents", "affecting", "protein", "catalytic", "function", "via", "interactions", "with", "structure", "-", "specific", "regulatory", "sites", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Prior", "oral", "exposure", "to", "environmental", "immunosuppressive", "chemicals", "methoxychlor", ",", "parathion", ",", "or", "piperonyl", "butoxide", "aggravates", "allergic", "airway", "inflammation", "in", "NC", "/", "Nga", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "BACKGROUND", ":", "Immunosuppressive", "environmental", "chemicals", "may", "increase", "the", "potency", "of", "allergens", "and", "thereby", "play", "a", "role", "in", "the", "development", "of", "respiratory", "tract", "allergies", ",", "such", "as", "allergic", "rhinitis", "and", "asthma", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "OBJECTIVES", ":", "We", "investigated", "the", "association", "between", "environmental", "immunosuppressive", "chemicals", "and", "the", "allergic", "airway", "inflammation", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "METHODS", ":", "We", "used", "a", "mouse", "model", "of", "ovalbumin", "(", "OVA", ")", "-", "induced", "allergic", "airway", "inflammation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "NC", "/", "Nga", "mice", "were", "exposed", "orally", "to", "pesticides", "parathion", "(", "an", "organophosphate", "compound", ")", "or", "methoxychlor", "(", "an", "organochlorine", "compound", ")", ",", "or", "to", "an", "insecticide", "synergist", "piperonyl", "butoxide", ",", "prior", "to", "OVA", "intraperitoneal", "sensitization", "and", "inhalation", "challenge", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "assessed", "serum", "IgE", "levels", ",", "B", "-", "cell", "counts", ",", "cytokine", "production", ",", "IgE", "production", "in", "hilar", "lymph", "nodes", ",", "eosinophil", "counts", ",", "chemokine", "levels", "in", "bronchoalveolar", "lavage", "fluid", ",", "and", "cytokine", "gene", "expression", "in", "the", "lung", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RESULTS", ":", "Exposure", "to", "environmental", "immunosuppressive", "chemicals", "markedly", "increased", "serum", "IgE", "-", "IgE", "-", "positive", "B", "-", "cells", ",", "IgE", "and", "cytokines", "in", "lymph", "nodes", "-", "eosinophils", "and", "chemokines", "in", "BALF", "-", "IL", "-", "10a", "and", "IL", "-", "17", "in", "the", "lung", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CONCLUSIONS", ":", "Allergic", "airway", "inflammation", "can", "be", "aggravated", "by", "prior", "exposure", "to", "immunosuppressive", "environmental", "chemicals", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Aminopropylindenes", "derived", "from", "Grundmann", "'", "s", "ketone", "as", "a", "novel", "chemotype", "of", "oxidosqualene", "cyclase", "inhibitors", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "series", "of", "aminopropylindenes", ",", "designed", "as", "mimics", "of", "a", "cationic", "high", "energy", "intermediate", "in", "the", "oxidosqualene", "cyclase", "(", "1", ")", "(", "OSC", ")", "-", "mediated", "cyclization", "of", "2", ",", "3", "-", "oxidosqualen", "to", "lanosterol", "was", "prepared", "from", "Grundmann", "'", "s", "ketone", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Screening", "on", "OSCs", "from", "five", "different", "organisms", "revealed", "interesting", "activities", "and", "selectivities", "of", "some", "of", "the", "compounds", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "N", ",", "N", "-", "dimethylaminopropyl", "derivative", "showed", "promising", "inhibition", "of", "Trypanosoma", "cruzi", "OSC", "in", "combination", "with", "low", "cytotoxicity", ",", "and", "showed", "significant", "reduction", "of", "cholesterol", "biosynthesis", "in", "a", "human", "cell", "line", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pleiotropic", "effect", "of", "histamine", "H4", "receptor", "modulation", "in", "the", "central", "nervous", "system", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "histamine", "H4", "receptor", "(", "H4R", ")", "is", "expressed", "primarily", "on", "cells", "involved", "in", "inflammation", "and", "immune", "responses", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recently", ",", "it", "has", "been", "reported", "the", "functional", "expression", "of", "H4R", "within", "neurons", "of", "the", "central", "nervous", "system", ",", "but", "their", "role", "has", "been", "poorly", "understood", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "study", "aimed", "to", "elucidate", "the", "physiopathological", "role", "of", "cerebral", "H4R", "in", "animal", "models", "by", "the", "intracerebroventricular", "administration", "of", "the", "H4R", "agonist", "VUF", "8430", "(", "20", "-", "40", "mu", "g", "per", "mouse", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Selectivity", "of", "results", "was", "confirmed", "by", "the", "prevention", "of", "the", "effects", "produced", "by", "the", "H4R", "antagonist", "JNJ", "10191584", "(", "3", "-", "9", "mg", "/", "kg", "p", ".", "o", ".", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Neuronal", "H4R", "activation", "induced", "acute", "thermal", "antinociception", ",", "indicating", "that", "neuronal", "histamine", "H4R", "might", "be", "involved", "in", "the", "production", "of", "antinociception", "in", "the", "absence", "of", "an", "inflammatory", "process", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "anxiolytic", "-", "like", "effect", "of", "intensity", "comparable", "to", "that", "exerted", "by", "diazepam", ",", "used", "as", "reference", "drug", ",", "was", "produced", "in", "the", "light", "-", "dark", "box", "test", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "VUF", "8430", "reversed", "the", "scopolamine", "-", "induced", "amnesia", "in", "the", "passive", "avoidance", "test", "and", "showed", "anorexant", "activity", "in", "food", "deprived", "mice", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Conversely", ",", "the", "H4R", "activation", "did", "not", "modify", "the", "immobility", "time", "in", "the", "tail", "suspension", "test", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Rotarod", "performance", "test", "was", "employed", "to", "demonstrate", "that", "the", "effects", "observed", "following", "the", "administration", "of", "VUF", "8430", "and", "JNJ", "10191584", "were", "not", "due", "to", "impaired", "motor", "function", "of", "animals", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "both", "compounds", "did", "not", "alter", "spontaneous", "mobility", "and", "exploratory", "activity", "in", "the", "hole", "board", "test", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "show", "the", "antinociceptive", ",", "antiamnesic", ",", "anxiolytic", "and", "anorexant", "effects", "induced", "by", "neuronal", "H4R", "agonism", ",", "suggesting", "that", "H4", "modulators", "may", "have", "broader", "utility", "further", "the", "control", "of", "inflammatory", "and", "immune", "processes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Lesions", "of", "the", "dorsomedial", "striatum", "impair", "formation", "of", "attentional", "set", "in", "rats", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Behavioural", "flexibility", "refers", "to", "the", "ability", "to", "rapidly", "adapt", "to", "novel", "situations", "and", "it", "has", "been", "suggested", "that", "the", "frontal", "lobe", "and", "basal", "ganglia", "are", "implicated", "in", "various", "components", "of", "adjusting", "to", "changes", "in", "environmental", "contingencies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Behavioural", "flexibility", "can", "be", "assessed", "using", "attentional", "set", "-", "shifting", "tasks", ",", "in", "which", "performance", "is", "impaired", "after", "damage", "to", "the", "prefrontal", "cortex", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "study", "explores", "the", "downstream", "contribution", "of", "the", "prefrontal", "projection", "zone", "in", "the", "dorsomedial", "striatum", "(", "DMS", ")", "to", "attentional", "set", "shifting", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Rats", "were", "tested", "in", "two", "set", "-", "shifting", "tasks", "following", "quinolinic", "acid", "injections", "bilaterally", "into", "the", "DMS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "tested", "in", "a", "rodent", "version", "of", "the", "set", "-", "shifting", "task", ",", "rats", "with", "a", "DMS", "lesion", "displayed", "a", "greater", "number", "of", "errors", "during", "the", "reversal", "stages", "of", "the", "task", "than", "sham", "lesion", "controls", "but", "the", "nature", "of", "the", "errors", "did", "not", "differ", "between", "the", "two", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interestingly", ",", "when", "the", "rats", "were", "tested", "in", "a", "modified", "version", "of", "the", "set", "-", "shifting", "task", ",", "directly", "designed", "for", "measuring", "the", "formation", "of", "an", "attentional", "set", ",", "sham", "lesion", "controls", "displayed", "a", "pronounced", "shift", "-", "cost", ",", "evident", "of", "successful", "set", "-", "formation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "rats", "with", "DMS", "lesions", "failed", "to", "form", "an", "attentional", "set", ",", "showing", "no", "performance", "cost", "when", "a", "shift", "of", "attention", "was", "required", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "support", "previous", "reports", "of", "the", "importance", "of", "the", "DMS", "in", "behavioural", "flexibility", "but", "also", "suggest", "that", "this", "region", "is", "vital", "for", "the", "formation", "of", "set", ",", "possibly", "by", "extrapolating", "different", "perceptions", "into", "a", "unified", "representation", "of", "a", "dimension", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Poor", "-", "prognosis", "colon", "cancer", "is", "defined", "by", "a", "molecularly", "distinct", "subtype", "and", "develops", "from", "serrated", "precursor", "lesions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Colon", "cancer", "is", "a", "clinically", "diverse", "disease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "heterogeneity", "makes", "it", "difficult", "to", "determine", "which", "patients", "will", "benefit", "most", "from", "adjuvant", "therapy", "and", "impedes", "the", "development", "of", "new", "targeted", "agents", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "More", "insight", "into", "the", "biological", "diversity", "of", "colon", "cancers", ",", "especially", "in", "relation", "to", "clinical", "features", ",", "is", "therefore", "needed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "demonstrate", ",", "using", "an", "unsupervised", "classification", "strategy", "involving", "over", "1", ",", "100", "individuals", "with", "colon", "cancer", ",", "that", "three", "main", "molecularly", "distinct", "subtypes", "can", "be", "recognized", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Two", "subtypes", "have", "been", "previously", "identified", "and", "are", "well", "characterized", "(", "chromosomal", "-", "instable", "and", "microsatellite", "-", "instable", "cancers", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "third", "subtype", "is", "largely", "microsatellite", "stable", "and", "contains", "relatively", "more", "CpG", "island", "methylator", "phenotype", "-", "positive", "carcinomas", "but", "cannot", "be", "identified", "on", "the", "basis", "of", "characteristic", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "provide", "evidence", "that", "this", "subtype", "relates", "to", "sessile", "-", "serrated", "adenomas", ",", "which", "show", "highly", "similar", "gene", "expression", "profiles", ",", "including", "upregulation", "of", "genes", "involved", "in", "matrix", "remodeling", "and", "epithelial", "-", "mesenchymal", "transition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "identification", "of", "this", "subtype", "is", "crucial", ",", "as", "it", "has", "a", "very", "unfavorable", "prognosis", "and", ",", "moreover", ",", "is", "refractory", "to", "epidermal", "growth", "factor", "receptor", "-", "targeted", "therapy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Kinetics", "and", "mechanism", "of", "oxygen", "reduction", "in", "a", "protic", "ionic", "liquid", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "oxygen", "reduction", "reaction", "(", "ORR", ")", "has", "been", "studied", "at", "Pt", "surfaces", "in", "the", "protic", "ionic", "liquid", "diethylmethylammonium", "trifluoromethanesulfonate", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Water", "content", "measurements", "suggested", "that", "the", "ORR", "proceeded", "in", "the", "ionic", "liquid", "predominantly", "via", "a", "4", "-", "electron", "reduction", "to", "water", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "mechanistic", "analysis", "using", "rotating", "ring", "-", "disk", "electrode", "(", "RRDE", ")", "voltammetry", "confirmed", "that", "negligible", "amounts", "of", "hydrogen", "peroxide", "were", "formed", "during", "the", "ORR", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "kinetic", "analysis", "of", "the", "ORR", "was", "performed", "using", "rotating", "disk", "electrode", "(", "RDE", ")", "voltammetry", "and", "the", "importance", "of", "correcting", "for", "ohmic", "(", "iR", ")", "drop", "prior", "to", "performing", "kinetic", "measurements", "in", "the", "ionic", "liquid", "is", "demonstrated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "Tafel", "analysis", "of", "the", "RDE", "voltammetry", "data", "revealed", "a", "change", "in", "the", "ORR", "Tafel", "slope", "from", "70", "mV", "per", "decade", "at", "low", "ORR", "overpotentials", "to", "117", "mV", "per", "decade", "at", "high", "overpotentials", ",", "and", "the", "reason", "for", "this", "change", "is", "discussed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "change", "in", "the", "Tafel", "slope", "for", "the", "ORR", "with", "increasing", "overpotential", "meant", "that", "the", "exchange", "current", "density", "for", "the", "ORR", "varied", "from", "0", ".", "007", "nA", "cm", "(", "-", "2", ")", "to", "10", "nA", "cm", "(", "-", "2", ")", ",", "depending", "on", "the", "applied", "potential", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Finally", ",", "the", "implications", "of", "these", "results", "for", "the", "development", "of", "protic", "ionic", "liquid", "fuel", "cells", "are", "discussed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Agomelatine", ":", "An", "antidepressant", "with", "new", "potent", "hepatoprotective", "effects", "on", "paracetamol", "-", "induced", "liver", "damage", "in", "rats", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Paracetamol", "was", "shown", "to", "induce", "hepatotoxicity", "or", "more", "severe", "fatal", "acute", "hepatic", "damage", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Agomelatine", ",", "commonly", "known", "as", "melatonin", "receptor", "agonist", ",", "is", "a", "new", "antidepressant", ",", "which", "resynchronizes", "circadian", "rhythms", "with", "subjective", "and", "objective", "improvements", "in", "sleep", "quality", "and", "architecture", ",", "as", "melatonin", "does", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "study", ",", "it", "was", "aimed", "to", "evaluate", "the", "hepatoprotective", "activity", "of", "agomelatine", "on", "paracetamol", "-", "induced", "hepatotoxicity", "and", "to", "understand", "the", "relationship", "between", "the", "hepatoprotective", "mechanism", "of", "agomelatine", "and", "antioxidant", "system", "and", "proinflammatory", "cytokines", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "total", "of", "42", "rats", "were", "divided", "into", "7", "groups", "as", "each", "composed", "of", "6", "rats", ":", "(", "1", ")", "intact", ",", "(", "2", ")", "40", "mg", "/", "kg", "agomelatine", ",", "(", "3", ")", "140", "mg", "/", "kg", "N", "-", "acetylcysteine", "(", "NAC", ")", ",", "(", "4", ")", "2", "g", "/", "kg", "paracetamol", ",", "(", "5", ")", "2", "g", "/", "kg", "paracetamol", "+", "140", "mg", "/", "kg", "NAC", ",", "(", "6", ")", "2", "g", "/", "kg", "paracetamol", "+", "20", "mg", "/", "kg", "agomelatine", ",", "and", "(", "7", ")", "2", "g", "/", "kg", "paracetamol", "+", "40", "mg", "/", "kg", "agomelatine", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Paracetamol", "-", "induced", "hepatotoxicity", "was", "applied", "and", "liver", "and", "blood", "samples", "were", "analyzed", "histopathologically", "and", "biochemically", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "were", "statistically", "significant", "increases", "in", "the", "activities", "of", "aspartate", "aminotransferase", ",", "alanine", "aminotransferase", ",", "levels", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "and", "interleukin", "-", "6", "(", "IL", "-", "6", ")", "and", "8", "-", "iso", "-", "prostane", ",", "and", "decreases", "in", "the", "activity", "of", "superoxide", "dismutase", "and", "level", "of", "glutathione", "in", "the", "group", "treated", "with", "paracetamol", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Administration", "of", "agomelatine", "and", "NAC", "separately", "reversed", "these", "changes", "significantly", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "agomelatine", "administration", "protects", "liver", "cells", "from", "paracetamol", "-", "induced", "hepatotoxicity", "via", "antioxidant", "activity", "and", "reduced", "proinflammatory", "cytokines", ",", "such", "as", "TNF", "-", "alpha", "and", "IL", "-", "6", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "influence", "of", "thermal", "degradation", "on", "the", "electrodeposition", "of", "aluminium", "from", "an", "air", "-", "and", "water", "-", "stable", "ionic", "liquid", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Aluminium", "electrodeposition", "is", "demonstrated", "from", "a", "thermally", "degraded", "ionic", "liquid", "solution", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "NMR", "and", "voltammetric", "analyses", "established", "that", "Al", "(", "3", "+", ")", "reduction", "was", "remarkably", "similar", "to", "that", "in", "non", "-", "degraded", "IL", "solutions", "suggesting", "that", "the", "electroactive", "metal", "-", "containing", "species", "was", "unaffected", "by", "heat", "treatment", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Electron", "microscopy", "revealed", "a", "significant", "grain", "refinement", "of", "the", "deposited", "metal", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Combined", "toxicity", "of", "ferroferric", "oxide", "nanoparticles", "and", "arsenic", "to", "the", "ciliated", "protozoa", "Tetrahymena", "Pyriformis", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fe3O4", "nanoparticles", "(", "NPs", ")", "have", "a", "high", "affinity", "for", "arsenic", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "As", "a", "result", "of", "this", "association", ",", "Fe3O4", "NPs", "loaded", "with", "high", "concentration", "of", "arsenic", "can", "enter", "into", "organisms", "and", "produce", "locally", "high", "concentrations", "of", "arsenic", ",", "which", "may", "lead", "to", "some", "unexpected", "toxicity", "to", "aquatic", "organisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "objectives", "of", "this", "research", "were", "to", "investigate", "the", "toxic", "effect", "of", "Fe3O4", "NPs", "in", "combination", "with", "As", "(", "V", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Cultured", "Tetrahymena", "pyriformis", "was", "chosen", "as", "a", "research", "model", "organism", "to", "evaluate", "the", "toxic", "effects", "of", "the", "combined", "agents", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "showed", "that", "after", "24h", "of", "As", "(", "V", ")", "exposure", ",", "the", "median", "effective", "concentration", "of", "As", "(", "V", ")", "to", "T", ".", "pyriformis", "was", "1", ".", "29mg", "/", "L", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fe3O4", "NPs", "alone", "were", "not", "only", "non", "-", "toxic", ",", "but", "actually", "promoted", "the", "growth", "of", "T", ".", "pyriformis", "at", "the", "experimental", "doses", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "24h", "exposure", ",", "the", "cell", "number", "increased", "by", "32", ".", "2", "%", "at", "an", "exposure", "level", "of", "3mg", "/", "L", "Fe3O4", "NPs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "After", "24h", "exposure", "to", "1", ".", "0mg", "/", "L", "As", "(", "V", ")", ",", "the", "survival", "rate", "increased", "from", "60", ".", "5", "%", "in", "the", "absence", "of", "Fe3O4", "NPs", "to", "73", ".", "8", "%", "and", "83", ".", "8", "%", "in", "the", "presence", "of", "13mg", "/", "L", "and", "19mg", "/", "L", "Fe3O4", "NPs", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "after", "30h", ",", "the", "combined", "toxic", "effect", "of", "As", "(", "V", ")", "and", "Fe3O4", "NPs", "on", "T", ".", "pyriformis", "was", "significantly", "enhanced", "and", "the", "survival", "rates", "for", "co", "-", "exposure", "to", "1", ".", "5mg", "/", "L", "As", "(", "V", ")", "and", "13mg", "/", "L", "Fe3O4", "NPs", "decreased", "from", "92", ".", "3", "%", "after", "18h", "to", "45", ".", "3", "%", "after", "30h", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "18h", "of", "exposure", "to", "Fe3O4", "NPs", "alone", ",", "the", "intracellular", "ROS", "levels", "were", "markedly", "increased", "and", "achieved", "steady", "state", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Compared", "with", "the", "control", "group", ",", "the", "intracellular", "ROS", "levels", "were", "significantly", "increased", "(", "2", ".", "56", "-", "fold", ")", "by", "the", "combination", "of", "19mg", "/", "L", "Fe3O4", "NPs", "and", "1", ".", "0mg", "/", "L", "As", "(", "V", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Accumulation", "of", "As", "(", "V", ")", "in", "T", ".", "pyriformis", "led", "to", "an", "increase", "in", "trivalent", "arsenics", "as", "a", "result", "of", "the", "saturation", "of", "the", "cellular", "arsenic", "methylation", "capability", "or", "/", "and", "redox", "reactions", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "exposures", "also", "resulted", "in", "an", "imbalance", "between", "oxidants", "and", "antioxidants", ",", "resulting", "in", "oxidative", "damage", "and", "cell", "death", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Transcriptomic", "analysis", "of", "cultured", "whale", "skin", "cells", "exposed", "to", "hexavalent", "chromium", "[", "Cr", "(", "VI", ")", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Hexavalent", "chromium", "Cr", "(", "VI", ")", "is", "known", "to", "produce", "cytotoxic", "effects", "in", "humans", "and", "is", "a", "highly", "toxic", "environmental", "contaminant", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interestingly", ",", "it", "has", "been", "shown", "that", "free", "ranging", "sperm", "whales", "(", "Phyester", "macrocephalus", ")", "may", "have", "exceedingly", "high", "levels", "of", "Cr", "in", "their", "skin", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Also", ",", "it", "has", "been", "demonstrated", "that", "skin", "cells", "from", "whales", "appear", "more", "resistant", "to", "both", "cytotoxicity", "and", "clastogenicity", "upon", "Cr", "exposure", "compared", "to", "human", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "molecular", "genetic", "mechanisms", "employed", "in", "whale", "skin", "cells", "that", "might", "lead", "to", "Cr", "tolerance", "are", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "an", "effort", "to", "understand", "the", "underlying", "mechanisms", "of", "Cr", "(", "VI", ")", "tolerance", "and", "to", "illuminate", "global", "gene", "expression", "patterns", "modulated", "by", "Cr", ",", "we", "exposed", "whale", "skin", "cells", "in", "culture", "to", "varying", "levels", "of", "Cr", "(", "VI", ")", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "0", ".", "0", ",", "0", ".", "5", ",", "1", ".", "0", "and", "5", ".", "0", "mu", "g", "/", "cm", "(", "2", ")", ")", "followed", "by", "short", "read", "(", "100bp", ")", "next", "generation", "RNA", "sequencing", "(", "RNA", "-", "seq", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RNA", "-", "seq", "reads", "from", "all", "exposures", "(", "=~", "280", "million", "reads", ")", "were", "pooled", "to", "generate", "a", "de", "novo", "reference", "transcriptome", "assembly", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "resulting", "whale", "reference", "assembly", "had", "11K", "contigs", "and", "an", "N50", "of", "2954bp", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "the", "reads", "from", "each", "dose", "(", "0", ".", "0", ",", "0", ".", "5", ",", "1", ".", "0", "and", "5", ".", "0", "mu", "g", "/", "cm", "(", "2", ")", ")", "we", "performed", "RNA", "-", "seq", "based", "gene", "expression", "analysis", "that", "identified", "35", "up", "-", "regulated", "genes", "and", "19", "down", "-", "regulated", "genes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "experimental", "results", "suggest", "that", "low", "dose", "exposure", "to", "Cr", "(", "1", ".", "0", "mu", "g", "/", "cm", "(", "2", ")", ")", "serves", "to", "induce", "up", "-", "regulation", "of", "oxidative", "stress", "response", "genes", ",", "DNA", "repair", "genes", "and", "cell", "cycle", "regulator", "genes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "at", "higher", "doses", "(", "5", ".", "0", "mu", "g", "/", "cm", "(", "2", ")", ")", "the", "DNA", "repair", "genes", "appeared", "down", "-", "regulated", "while", "other", "genes", "that", "were", "induced", "suggest", "the", "initiation", "of", "cytotoxicity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Monitoring", "enzymatic", "activity", "in", "vivo", "of", "individual", "homologous", "enzymes", "such", "as", "the", "matrix", "metalloproteinases", "(", "MMPs", ")", "by", "antagonist", "molecules", "is", "highly", "desired", "for", "defining", "physiological", "and", "pathophysiological", "pathways", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "rational", "design", "of", "antagonists", "targeting", "enzyme", "catalytic", "moieties", "specific", "to", "one", "of", "the", "homologous", "enzymes", "often", "appears", "to", "be", "an", "extremely", "difficult", "task", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "is", "mainly", "due", "to", "the", "high", "structural", "homology", "at", "the", "enzyme", "active", "sites", "shared", "by", "members", "of", "the", "protein", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Accordingly", ",", "controlling", "enzymatic", "activity", "via", "alternative", "allosteric", "sites", "has", "become", "an", "attractive", "proposition", "for", "drug", "design", "targeting", "individual", "homologous", "enzymes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Yet", ",", "the", "challenge", "remains", "to", "identify", "such", "regulatory", "alternative", "sites", "that", "are", "often", "hidden", "and", "scattered", "over", "different", "locations", "on", "the", "protein", "'", "s", "surface", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "designed", "branched", "amphiphilic", "molecules", "exhibiting", "specific", "inhibitory", "activity", "towards", "individual", "members", "of", "the", "MMP", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "amphiphilic", "isomers", "share", "the", "same", "chemical", "nature", ",", "providing", "versatile", "nonspecific", "binding", "reactivity", "that", "allows", "to", "probe", "hidden", "regulatory", "residues", "on", "a", "given", "protein", "surface", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "the", "advantage", "provided", "by", "amphiphilic", "ligands", ",", "here", "we", "explore", "a", "new", "approach", "for", "determining", "hidden", "regulatory", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "approach", "includes", "diverse", "experimental", "analysis", ",", "such", "as", "structural", "spectroscopic", "analyses", ",", "NMR", ",", "and", "protein", "crystallography", "combined", "with", "computational", "prediction", "of", "effector", "binding", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "demonstrate", "how", "our", "approach", "works", "by", "analyzing", "members", "of", "the", "MMP", "family", "that", "possess", "a", "unique", "set", "of", "such", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "work", "provides", "a", "proof", "of", "principle", "for", "using", "ligand", "effectors", "to", "unravel", "hidden", "regulatory", "sites", "specific", "to", "members", "of", "the", "structurally", "homologous", "MMP", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "approach", "may", "be", "exploited", "for", "the", "design", "of", "novel", "molecular", "effectors", "and", "therapeutic", "agents", "affecting", "protein", "catalytic", "function", "via", "interactions", "with", "structure", "-", "specific", "regulatory", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Prior", "oral", "exposure", "to", "environmental", "immunosuppressive", "chemicals", "methoxychlor", ",", "parathion", ",", "or", "piperonyl", "butoxide", "aggravates", "allergic", "airway", "inflammation", "in", "NC", "/", "Nga", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "BACKGROUND", ":", "Immunosuppressive", "environmental", "chemicals", "may", "increase", "the", "potency", "of", "allergens", "and", "thereby", "play", "a", "role", "in", "the", "development", "of", "respiratory", "tract", "allergies", ",", "such", "as", "allergic", "rhinitis", "and", "asthma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "OBJECTIVES", ":", "We", "investigated", "the", "association", "between", "environmental", "immunosuppressive", "chemicals", "and", "the", "allergic", "airway", "inflammation", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "METHODS", ":", "We", "used", "a", "mouse", "model", "of", "ovalbumin", "(", "OVA", ")", "-", "induced", "allergic", "airway", "inflammation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "NC", "/", "Nga", "mice", "were", "exposed", "orally", "to", "pesticides", "parathion", "(", "an", "organophosphate", "compound", ")", "or", "methoxychlor", "(", "an", "organochlorine", "compound", ")", ",", "or", "to", "an", "insecticide", "synergist", "piperonyl", "butoxide", ",", "prior", "to", "OVA", "intraperitoneal", "sensitization", "and", "inhalation", "challenge", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "assessed", "serum", "IgE", "levels", ",", "B", "-", "cell", "counts", ",", "cytokine", "production", ",", "IgE", "production", "in", "hilar", "lymph", "nodes", ",", "eosinophil", "counts", ",", "chemokine", "levels", "in", "bronchoalveolar", "lavage", "fluid", ",", "and", "cytokine", "gene", "expression", "in", "the", "lung", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RESULTS", ":", "Exposure", "to", "environmental", "immunosuppressive", "chemicals", "markedly", "increased", "serum", "IgE", "-", "IgE", "-", "positive", "B", "-", "cells", ",", "IgE", "and", "cytokines", "in", "lymph", "nodes", "-", "eosinophils", "and", "chemokines", "in", "BALF", "-", "IL", "-", "10a", "and", "IL", "-", "17", "in", "the", "lung", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CONCLUSIONS", ":", "Allergic", "airway", "inflammation", "can", "be", "aggravated", "by", "prior", "exposure", "to", "immunosuppressive", "environmental", "chemicals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Aminopropylindenes", "derived", "from", "Grundmann", "'", "s", "ketone", "as", "a", "novel", "chemotype", "of", "oxidosqualene", "cyclase", "inhibitors", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "series", "of", "aminopropylindenes", ",", "designed", "as", "mimics", "of", "a", "cationic", "high", "energy", "intermediate", "in", "the", "oxidosqualene", "cyclase", "(", "1", ")", "(", "OSC", ")", "-", "mediated", "cyclization", "of", "2", ",", "3", "-", "oxidosqualen", "to", "lanosterol", "was", "prepared", "from", "Grundmann", "'", "s", "ketone", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Screening", "on", "OSCs", "from", "five", "different", "organisms", "revealed", "interesting", "activities", "and", "selectivities", "of", "some", "of", "the", "compounds", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "N", ",", "N", "-", "dimethylaminopropyl", "derivative", "showed", "promising", "inhibition", "of", "Trypanosoma", "cruzi", "OSC", "in", "combination", "with", "low", "cytotoxicity", ",", "and", "showed", "significant", "reduction", "of", "cholesterol", "biosynthesis", "in", "a", "human", "cell", "line", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pleiotropic", "effect", "of", "histamine", "H4", "receptor", "modulation", "in", "the", "central", "nervous", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "histamine", "H4", "receptor", "(", "H4R", ")", "is", "expressed", "primarily", "on", "cells", "involved", "in", "inflammation", "and", "immune", "responses", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recently", ",", "it", "has", "been", "reported", "the", "functional", "expression", "of", "H4R", "within", "neurons", "of", "the", "central", "nervous", "system", ",", "but", "their", "role", "has", "been", "poorly", "understood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "present", "study", "aimed", "to", "elucidate", "the", "physiopathological", "role", "of", "cerebral", "H4R", "in", "animal", "models", "by", "the", "intracerebroventricular", "administration", "of", "the", "H4R", "agonist", "VUF", "8430", "(", "20", "-", "40", "mu", "g", "per", "mouse", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Selectivity", "of", "results", "was", "confirmed", "by", "the", "prevention", "of", "the", "effects", "produced", "by", "the", "H4R", "antagonist", "JNJ", "10191584", "(", "3", "-", "9", "mg", "/", "kg", "p", ".", "o", ".", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Neuronal", "H4R", "activation", "induced", "acute", "thermal", "antinociception", ",", "indicating", "that", "neuronal", "histamine", "H4R", "might", "be", "involved", "in", "the", "production", "of", "antinociception", "in", "the", "absence", "of", "an", "inflammatory", "process", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "anxiolytic", "-", "like", "effect", "of", "intensity", "comparable", "to", "that", "exerted", "by", "diazepam", ",", "used", "as", "reference", "drug", ",", "was", "produced", "in", "the", "light", "-", "dark", "box", "test", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "VUF", "8430", "reversed", "the", "scopolamine", "-", "induced", "amnesia", "in", "the", "passive", "avoidance", "test", "and", "showed", "anorexant", "activity", "in", "food", "deprived", "mice", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Conversely", ",", "the", "H4R", "activation", "did", "not", "modify", "the", "immobility", "time", "in", "the", "tail", "suspension", "test", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Rotarod", "performance", "test", "was", "employed", "to", "demonstrate", "that", "the", "effects", "observed", "following", "the", "administration", "of", "VUF", "8430", "and", "JNJ", "10191584", "were", "not", "due", "to", "impaired", "motor", "function", "of", "animals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "both", "compounds", "did", "not", "alter", "spontaneous", "mobility", "and", "exploratory", "activity", "in", "the", "hole", "board", "test", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "show", "the", "antinociceptive", ",", "antiamnesic", ",", "anxiolytic", "and", "anorexant", "effects", "induced", "by", "neuronal", "H4R", "agonism", ",", "suggesting", "that", "H4", "modulators", "may", "have", "broader", "utility", "further", "the", "control", "of", "inflammatory", "and", "immune", "processes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Lesions", "of", "the", "dorsomedial", "striatum", "impair", "formation", "of", "attentional", "set", "in", "rats", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Behavioural", "flexibility", "refers", "to", "the", "ability", "to", "rapidly", "adapt", "to", "novel", "situations", "and", "it", "has", "been", "suggested", "that", "the", "frontal", "lobe", "and", "basal", "ganglia", "are", "implicated", "in", "various", "components", "of", "adjusting", "to", "changes", "in", "environmental", "contingencies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Behavioural", "flexibility", "can", "be", "assessed", "using", "attentional", "set", "-", "shifting", "tasks", ",", "in", "which", "performance", "is", "impaired", "after", "damage", "to", "the", "prefrontal", "cortex", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "present", "study", "explores", "the", "downstream", "contribution", "of", "the", "prefrontal", "projection", "zone", "in", "the", "dorsomedial", "striatum", "(", "DMS", ")", "to", "attentional", "set", "shifting", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Rats", "were", "tested", "in", "two", "set", "-", "shifting", "tasks", "following", "quinolinic", "acid", "injections", "bilaterally", "into", "the", "DMS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "tested", "in", "a", "rodent", "version", "of", "the", "set", "-", "shifting", "task", ",", "rats", "with", "a", "DMS", "lesion", "displayed", "a", "greater", "number", "of", "errors", "during", "the", "reversal", "stages", "of", "the", "task", "than", "sham", "lesion", "controls", "but", "the", "nature", "of", "the", "errors", "did", "not", "differ", "between", "the", "two", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Interestingly", ",", "when", "the", "rats", "were", "tested", "in", "a", "modified", "version", "of", "the", "set", "-", "shifting", "task", ",", "directly", "designed", "for", "measuring", "the", "formation", "of", "an", "attentional", "set", ",", "sham", "lesion", "controls", "displayed", "a", "pronounced", "shift", "-", "cost", ",", "evident", "of", "successful", "set", "-", "formation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "rats", "with", "DMS", "lesions", "failed", "to", "form", "an", "attentional", "set", ",", "showing", "no", "performance", "cost", "when", "a", "shift", "of", "attention", "was", "required", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "support", "previous", "reports", "of", "the", "importance", "of", "the", "DMS", "in", "behavioural", "flexibility", "but", "also", "suggest", "that", "this", "region", "is", "vital", "for", "the", "formation", "of", "set", ",", "possibly", "by", "extrapolating", "different", "perceptions", "into", "a", "unified", "representation", "of", "a", "dimension", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Poor", "-", "prognosis", "colon", "cancer", "is", "defined", "by", "a", "molecularly", "distinct", "subtype", "and", "develops", "from", "serrated", "precursor", "lesions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Colon", "cancer", "is", "a", "clinically", "diverse", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "heterogeneity", "makes", "it", "difficult", "to", "determine", "which", "patients", "will", "benefit", "most", "from", "adjuvant", "therapy", "and", "impedes", "the", "development", "of", "new", "targeted", "agents", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "More", "insight", "into", "the", "biological", "diversity", "of", "colon", "cancers", ",", "especially", "in", "relation", "to", "clinical", "features", ",", "is", "therefore", "needed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "demonstrate", ",", "using", "an", "unsupervised", "classification", "strategy", "involving", "over", "1", ",", "100", "individuals", "with", "colon", "cancer", ",", "that", "three", "main", "molecularly", "distinct", "subtypes", "can", "be", "recognized", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "subtypes", "have", "been", "previously", "identified", "and", "are", "well", "characterized", "(", "chromosomal", "-", "instable", "and", "microsatellite", "-", "instable", "cancers", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "third", "subtype", "is", "largely", "microsatellite", "stable", "and", "contains", "relatively", "more", "CpG", "island", "methylator", "phenotype", "-", "positive", "carcinomas", "but", "cannot", "be", "identified", "on", "the", "basis", "of", "characteristic", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "provide", "evidence", "that", "this", "subtype", "relates", "to", "sessile", "-", "serrated", "adenomas", ",", "which", "show", "highly", "similar", "gene", "expression", "profiles", ",", "including", "upregulation", "of", "genes", "involved", "in", "matrix", "remodeling", "and", "epithelial", "-", "mesenchymal", "transition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "identification", "of", "this", "subtype", "is", "crucial", ",", "as", "it", "has", "a", "very", "unfavorable", "prognosis", "and", ",", "moreover", ",", "is", "refractory", "to", "epidermal", "growth", "factor", "receptor", "-", "targeted", "therapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Kinetics", "and", "mechanism", "of", "oxygen", "reduction", "in", "a", "protic", "ionic", "liquid", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "oxygen", "reduction", "reaction", "(", "ORR", ")", "has", "been", "studied", "at", "Pt", "surfaces", "in", "the", "protic", "ionic", "liquid", "diethylmethylammonium", "trifluoromethanesulfonate", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Water", "content", "measurements", "suggested", "that", "the", "ORR", "proceeded", "in", "the", "ionic", "liquid", "predominantly", "via", "a", "4", "-", "electron", "reduction", "to", "water", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "mechanistic", "analysis", "using", "rotating", "ring", "-", "disk", "electrode", "(", "RRDE", ")", "voltammetry", "confirmed", "that", "negligible", "amounts", "of", "hydrogen", "peroxide", "were", "formed", "during", "the", "ORR", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "kinetic", "analysis", "of", "the", "ORR", "was", "performed", "using", "rotating", "disk", "electrode", "(", "RDE", ")", "voltammetry", "and", "the", "importance", "of", "correcting", "for", "ohmic", "(", "iR", ")", "drop", "prior", "to", "performing", "kinetic", "measurements", "in", "the", "ionic", "liquid", "is", "demonstrated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "Tafel", "analysis", "of", "the", "RDE", "voltammetry", "data", "revealed", "a", "change", "in", "the", "ORR", "Tafel", "slope", "from", "70", "mV", "per", "decade", "at", "low", "ORR", "overpotentials", "to", "117", "mV", "per", "decade", "at", "high", "overpotentials", ",", "and", "the", "reason", "for", "this", "change", "is", "discussed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "change", "in", "the", "Tafel", "slope", "for", "the", "ORR", "with", "increasing", "overpotential", "meant", "that", "the", "exchange", "current", "density", "for", "the", "ORR", "varied", "from", "0", ".", "007", "nA", "cm", "(", "-", "2", ")", "to", "10", "nA", "cm", "(", "-", "2", ")", ",", "depending", "on", "the", "applied", "potential", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "the", "implications", "of", "these", "results", "for", "the", "development", "of", "protic", "ionic", "liquid", "fuel", "cells", "are", "discussed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Agomelatine", ":", "An", "antidepressant", "with", "new", "potent", "hepatoprotective", "effects", "on", "paracetamol", "-", "induced", "liver", "damage", "in", "rats", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Paracetamol", "was", "shown", "to", "induce", "hepatotoxicity", "or", "more", "severe", "fatal", "acute", "hepatic", "damage", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Agomelatine", ",", "commonly", "known", "as", "melatonin", "receptor", "agonist", ",", "is", "a", "new", "antidepressant", ",", "which", "resynchronizes", "circadian", "rhythms", "with", "subjective", "and", "objective", "improvements", "in", "sleep", "quality", "and", "architecture", ",", "as", "melatonin", "does", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "study", ",", "it", "was", "aimed", "to", "evaluate", "the", "hepatoprotective", "activity", "of", "agomelatine", "on", "paracetamol", "-", "induced", "hepatotoxicity", "and", "to", "understand", "the", "relationship", "between", "the", "hepatoprotective", "mechanism", "of", "agomelatine", "and", "antioxidant", "system", "and", "proinflammatory", "cytokines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "total", "of", "42", "rats", "were", "divided", "into", "7", "groups", "as", "each", "composed", "of", "6", "rats", ":", "(", "1", ")", "intact", ",", "(", "2", ")", "40", "mg", "/", "kg", "agomelatine", ",", "(", "3", ")", "140", "mg", "/", "kg", "N", "-", "acetylcysteine", "(", "NAC", ")", ",", "(", "4", ")", "2", "g", "/", "kg", "paracetamol", ",", "(", "5", ")", "2", "g", "/", "kg", "paracetamol", "+", "140", "mg", "/", "kg", "NAC", ",", "(", "6", ")", "2", "g", "/", "kg", "paracetamol", "+", "20", "mg", "/", "kg", "agomelatine", ",", "and", "(", "7", ")", "2", "g", "/", "kg", "paracetamol", "+", "40", "mg", "/", "kg", "agomelatine", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Paracetamol", "-", "induced", "hepatotoxicity", "was", "applied", "and", "liver", "and", "blood", "samples", "were", "analyzed", "histopathologically", "and", "biochemically", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "were", "statistically", "significant", "increases", "in", "the", "activities", "of", "aspartate", "aminotransferase", ",", "alanine", "aminotransferase", ",", "levels", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "and", "interleukin", "-", "6", "(", "IL", "-", "6", ")", "and", "8", "-", "iso", "-", "prostane", ",", "and", "decreases", "in", "the", "activity", "of", "superoxide", "dismutase", "and", "level", "of", "glutathione", "in", "the", "group", "treated", "with", "paracetamol", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Administration", "of", "agomelatine", "and", "NAC", "separately", "reversed", "these", "changes", "significantly", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "agomelatine", "administration", "protects", "liver", "cells", "from", "paracetamol", "-", "induced", "hepatotoxicity", "via", "antioxidant", "activity", "and", "reduced", "proinflammatory", "cytokines", ",", "such", "as", "TNF", "-", "alpha", "and", "IL", "-", "6", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "influence", "of", "thermal", "degradation", "on", "the", "electrodeposition", "of", "aluminium", "from", "an", "air", "-", "and", "water", "-", "stable", "ionic", "liquid", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Aluminium", "electrodeposition", "is", "demonstrated", "from", "a", "thermally", "degraded", "ionic", "liquid", "solution", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "NMR", "and", "voltammetric", "analyses", "established", "that", "Al", "(", "3", "+", ")", "reduction", "was", "remarkably", "similar", "to", "that", "in", "non", "-", "degraded", "IL", "solutions", "suggesting", "that", "the", "electroactive", "metal", "-", "containing", "species", "was", "unaffected", "by", "heat", "treatment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Electron", "microscopy", "revealed", "a", "significant", "grain", "refinement", "of", "the", "deposited", "metal", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Combined", "toxicity", "of", "ferroferric", "oxide", "nanoparticles", "and", "arsenic", "to", "the", "ciliated", "protozoa", "Tetrahymena", "Pyriformis", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fe3O4", "nanoparticles", "(", "NPs", ")", "have", "a", "high", "affinity", "for", "arsenic", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "As", "a", "result", "of", "this", "association", ",", "Fe3O4", "NPs", "loaded", "with", "high", "concentration", "of", "arsenic", "can", "enter", "into", "organisms", "and", "produce", "locally", "high", "concentrations", "of", "arsenic", ",", "which", "may", "lead", "to", "some", "unexpected", "toxicity", "to", "aquatic", "organisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "objectives", "of", "this", "research", "were", "to", "investigate", "the", "toxic", "effect", "of", "Fe3O4", "NPs", "in", "combination", "with", "As", "(", "V", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Cultured", "Tetrahymena", "pyriformis", "was", "chosen", "as", "a", "research", "model", "organism", "to", "evaluate", "the", "toxic", "effects", "of", "the", "combined", "agents", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "showed", "that", "after", "24h", "of", "As", "(", "V", ")", "exposure", ",", "the", "median", "effective", "concentration", "of", "As", "(", "V", ")", "to", "T", ".", "pyriformis", "was", "1", ".", "29mg", "/", "L", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fe3O4", "NPs", "alone", "were", "not", "only", "non", "-", "toxic", ",", "but", "actually", "promoted", "the", "growth", "of", "T", ".", "pyriformis", "at", "the", "experimental", "doses", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "24h", "exposure", ",", "the", "cell", "number", "increased", "by", "32", ".", "2", "%", "at", "an", "exposure", "level", "of", "3mg", "/", "L", "Fe3O4", "NPs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "After", "24h", "exposure", "to", "1", ".", "0mg", "/", "L", "As", "(", "V", ")", ",", "the", "survival", "rate", "increased", "from", "60", ".", "5", "%", "in", "the", "absence", "of", "Fe3O4", "NPs", "to", "73", ".", "8", "%", "and", "83", ".", "8", "%", "in", "the", "presence", "of", "13mg", "/", "L", "and", "19mg", "/", "L", "Fe3O4", "NPs", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "after", "30h", ",", "the", "combined", "toxic", "effect", "of", "As", "(", "V", ")", "and", "Fe3O4", "NPs", "on", "T", ".", "pyriformis", "was", "significantly", "enhanced", "and", "the", "survival", "rates", "for", "co", "-", "exposure", "to", "1", ".", "5mg", "/", "L", "As", "(", "V", ")", "and", "13mg", "/", "L", "Fe3O4", "NPs", "decreased", "from", "92", ".", "3", "%", "after", "18h", "to", "45", ".", "3", "%", "after", "30h", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "18h", "of", "exposure", "to", "Fe3O4", "NPs", "alone", ",", "the", "intracellular", "ROS", "levels", "were", "markedly", "increased", "and", "achieved", "steady", "state", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Compared", "with", "the", "control", "group", ",", "the", "intracellular", "ROS", "levels", "were", "significantly", "increased", "(", "2", ".", "56", "-", "fold", ")", "by", "the", "combination", "of", "19mg", "/", "L", "Fe3O4", "NPs", "and", "1", ".", "0mg", "/", "L", "As", "(", "V", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Accumulation", "of", "As", "(", "V", ")", "in", "T", ".", "pyriformis", "led", "to", "an", "increase", "in", "trivalent", "arsenics", "as", "a", "result", "of", "the", "saturation", "of", "the", "cellular", "arsenic", "methylation", "capability", "or", "/", "and", "redox", "reactions", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "exposures", "also", "resulted", "in", "an", "imbalance", "between", "oxidants", "and", "antioxidants", ",", "resulting", "in", "oxidative", "damage", "and", "cell", "death", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transcriptomic", "analysis", "of", "cultured", "whale", "skin", "cells", "exposed", "to", "hexavalent", "chromium", "[", "Cr", "(", "VI", ")", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Hexavalent", "chromium", "Cr", "(", "VI", ")", "is", "known", "to", "produce", "cytotoxic", "effects", "in", "humans", "and", "is", "a", "highly", "toxic", "environmental", "contaminant", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Interestingly", ",", "it", "has", "been", "shown", "that", "free", "ranging", "sperm", "whales", "(", "Phyester", "macrocephalus", ")", "may", "have", "exceedingly", "high", "levels", "of", "Cr", "in", "their", "skin", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Also", ",", "it", "has", "been", "demonstrated", "that", "skin", "cells", "from", "whales", "appear", "more", "resistant", "to", "both", "cytotoxicity", "and", "clastogenicity", "upon", "Cr", "exposure", "compared", "to", "human", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "molecular", "genetic", "mechanisms", "employed", "in", "whale", "skin", "cells", "that", "might", "lead", "to", "Cr", "tolerance", "are", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "an", "effort", "to", "understand", "the", "underlying", "mechanisms", "of", "Cr", "(", "VI", ")", "tolerance", "and", "to", "illuminate", "global", "gene", "expression", "patterns", "modulated", "by", "Cr", ",", "we", "exposed", "whale", "skin", "cells", "in", "culture", "to", "varying", "levels", "of", "Cr", "(", "VI", ")", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "0", ".", "0", ",", "0", ".", "5", ",", "1", ".", "0", "and", "5", ".", "0", "mu", "g", "/", "cm", "(", "2", ")", ")", "followed", "by", "short", "read", "(", "100bp", ")", "next", "generation", "RNA", "sequencing", "(", "RNA", "-", "seq", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RNA", "-", "seq", "reads", "from", "all", "exposures", "(", "=~", "280", "million", "reads", ")", "were", "pooled", "to", "generate", "a", "de", "novo", "reference", "transcriptome", "assembly", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "resulting", "whale", "reference", "assembly", "had", "11K", "contigs", "and", "an", "N50", "of", "2954bp", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "the", "reads", "from", "each", "dose", "(", "0", ".", "0", ",", "0", ".", "5", ",", "1", ".", "0", "and", "5", ".", "0", "mu", "g", "/", "cm", "(", "2", ")", ")", "we", "performed", "RNA", "-", "seq", "based", "gene", "expression", "analysis", "that", "identified", "35", "up", "-", "regulated", "genes", "and", "19", "down", "-", "regulated", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "experimental", "results", "suggest", "that", "low", "dose", "exposure", "to", "Cr", "(", "1", ".", "0", "mu", "g", "/", "cm", "(", "2", ")", ")", "serves", "to", "induce", "up", "-", "regulation", "of", "oxidative", "stress", "response", "genes", ",", "DNA", "repair", "genes", "and", "cell", "cycle", "regulator", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "at", "higher", "doses", "(", "5", ".", "0", "mu", "g", "/", "cm", "(", "2", ")", ")", "the", "DNA", "repair", "genes", "appeared", "down", "-", "regulated", "while", "other", "genes", "that", "were", "induced", "suggest", "the", "initiation", "of", "cytotoxicity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]