extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "The", "set", "of", "genes", "identified", "that", "show", "regulatory", "modulation", "at", "different", "Cr", "doses", "provide", "specific", "candidates", "for", "further", "studies", "aimed", "at", "determination", "of", "how", "whales", "exhibit", "resistance", "to", "Cr", "toxicity", "and", "what", "role", "(", "s", ")", "reactive", "oxygen", "species", "(", "ROS", ")", "may", "play", "in", "this", "process", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "miR", "-", "194", "suppresses", "metastasis", "of", "non", "-", "small", "cell", "lung", "cancer", "through", "regulating", "expression", "of", "BMP1", "and", "p27", "(", "kip1", ".", ")" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MicroRNAs", "(", "miRNAs", ")", "are", "increasingly", "implicated", "in", "regulating", "tumor", "malignance", "through", "their", "capacity", "to", "coordinately", "repress", "expression", "of", "tumor", "-", "related", "genes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "show", "that", "overexpression", "of", "miR", "-", "194", "in", "lung", "cancer", "cell", "lines", ",", "results", "in", "suppressing", "metastasis", "of", "lung", "cancer", "cells", ",", "while", "inhibiting", "its", "expression", "through", "'", "miRNA", "sponge", "'", "promotes", "the", "cancer", "cells", "to", "metastasize", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "miR", "-", "194", "expression", "is", "also", "found", "to", "be", "in", "strongly", "negative", "association", "with", "metastasis", "in", "clinical", "specimens", "of", "non", "-", "small", "cell", "lung", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "demonstrate", "that", "miR", "-", "194", "directly", "targets", "both", "BMP1", "and", "p27", "(", "kip1", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "resulting", "downregulation", "of", "BMP1", "leads", "to", "suppression", "of", "TGF", "beta", "activity", "and", ",", "thus", ",", "to", "downregulation", "of", "the", "expression", "of", "key", "oncogenic", "genes", "(", "matrix", "metalloproteinases", "MMP2", "and", "MMP9", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "leads", ",", "in", "turn", ",", "to", "decreased", "tumor", "invasion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "the", "miRNA", "-", "194", "-", "induced", "suppression", "of", "p27", "(", "kip1", ")", "activates", "the", "RhoA", "pathway", ",", "producing", "enhanced", "development", "of", "actin", "stress", "fibers", "and", "impaired", "migration", "of", "cancer", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "reveal", "two", "structurally", "independent", "but", "functionally", "linked", "branches", "of", "the", "regulatory", "and", "signaling", "pathway", "that", "together", "provide", "a", "bridge", "between", "the", "metastasis", "-", "depressing", "miRNA", "and", "the", "key", "genes", "that", "govern", "the", "malignancy", "of", "lung", "cancers", ".", "Oncogene", "advance", "online", "publication", ",", "15", "April", "2013", ";", "doi", ":", "10", ".", "1038", "/", "onc", ".", "2013", ".", "108", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "histone", "demethylase", "Jmjd3", "sequentially", "associates", "with", "the", "transcription", "factors", "Tbx3", "and", "Eomes", "to", "drive", "endoderm", "differentiation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Stem", "cell", "differentiation", "depends", "on", "transcriptional", "activation", "driven", "by", "lineage", "-", "specific", "regulators", "as", "well", "as", "changes", "in", "chromatin", "organization", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "coordination", "of", "these", "events", "is", "poorly", "understood", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "show", "that", "T", "-", "box", "proteins", "team", "up", "with", "chromatin", "modifying", "enzymes", "to", "drive", "the", "expression", "of", "the", "key", "lineage", "regulator", ",", "Eomes", "during", "endodermal", "differentiation", "of", "embryonic", "stem", "(", "ES", ")", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Eomes", "locus", "is", "maintained", "in", "a", "transcriptionally", "poised", "configuration", "in", "ES", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "During", "early", "differentiation", "steps", ",", "the", "ES", "cell", "factor", "Tbx3", "associates", "with", "the", "histone", "demethylase", "Jmjd3", "at", "the", "enhancer", "element", "of", "the", "Eomes", "locus", "to", "allow", "enhancer", "-", "promoter", "interactions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "spatial", "reorganization", "of", "the", "chromatin", "primes", "the", "cells", "to", "respond", "to", "Activin", "signalling", ",", "which", "promotes", "the", "binding", "of", "Jmjd3", "and", "Eomes", "to", "its", "own", "bivalent", "promoter", "region", "to", "further", "stimulate", "Eomes", "expression", "in", "a", "positive", "feedback", "loop", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "Eomes", "activates", "a", "transcriptional", "network", "of", "core", "regulators", "of", "endodermal", "differentiation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "demonstrate", "that", "Jmjd3", "sequentially", "associates", "with", "two", "T", "-", "box", "factors", ",", "Tbx3", "and", "Eomes", "to", "drive", "stem", "cell", "differentiation", "towards", "the", "definitive", "endoderm", "lineage", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Synthesis", "of", "3", "-", "O", "-", "propargylated", "betulinic", "acid", "and", "its", "1", ",", "2", ",", "3", "-", "triazoles", "as", "potential", "apoptotic", "agents", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cytotoxic", "agents", "from", "nature", "are", "presently", "the", "mainstay", "of", "anticancer", "chemotherapy", ",", "and", "the", "need", "to", "reinforce", "the", "arsenal", "of", "anticancer", "agents", "is", "highly", "desired", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chemical", "transformation", "studies", "carried", "out", "on", "betulinic", "acid", ",", "through", "concise", "1", ",", "2", ",", "3", "-", "triazole", "synthesis", "via", "click", "chemistry", "approach", "at", "C", "-", "3position", "in", "ring", "A", "have", "been", "evaluated", "for", "their", "cytotoxic", "potentiation", "against", "nine", "human", "cancer", "cell", "lines", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Most", "of", "the", "derivatives", "have", "shown", "higher", "cytotoxic", "profiles", "than", "the", "parent", "molecule", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Two", "compounds", "i", ".", "e", ".", "3", "{", "1N", "(", "2", "-", "cyanophenyl", ")", "-", "1H", "-", "1", ",", "2", ",", "3", "-", "triazol", "-", "4yl", "}", "methyloxy", "betulinic", "acid", "(", "7", ")", "and", "3", "{", "1N", "(", "5", "-", "hydroxy", "-", "naphth", "-", "1yl", ")", "-", "1H", "-", "1", ",", "2", ",", "3", "-", "triazol", "-", "4yl", "}", "methyloxy", "betulinic", "acid", "(", "13", ")", "displayed", "impressive", "IC50", "values", "(", "2", ".", "5", "and", "3", ".", "5", "mu", "M", "respectively", ")", "against", "leukemia", "cell", "line", "HL", "-", "60", "(", "5", "-", "7", "-", "fold", "higher", "potency", "than", "betulinic", "acid", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "evident", "from", "various", "biological", "end", "points", ",", "inhibition", "of", "cell", "migration", "and", "colony", "formation", ",", "mitochondrial", "membrane", "disruption", "followed", "by", "DNA", "fragmentation", "and", "apoptosis", ",", "is", "demonstrated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Synthesis", "and", "in", "vitro", "antiproliferative", "effect", "of", "novel", "quinoline", "-", "based", "potential", "anticancer", "agents", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Several", "derivatives", "with", "a", "quinoline", "scaffold", "and", "a", "flexible", ",", "semi", "-", "flexible", "or", "rigid", "side", "chains", "at", "position", "8", "of", "the", "quinoline", "ring", "were", "synthesized", "and", "assessed", "for", "their", "in", "vitro", "activity", "versus", "the", "human", "colon", "cancer", "cell", "line", "HT29", "and", "the", "human", "breast", "cancer", "cell", "line", "MDA", "-", "MB231", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "HT29", "cell", "line", "was", "more", "refractory", "to", "the", "cytotoxic", "activity", "of", "some", "compounds", ",", "meanwhile", "all", "the", "quinoline", "derivatives", "except", "one", "displayed", "high", "to", "moderate", "activity", "against", "MDA", "-", "MB231", "with", "IC50", "values", "ranging", "between", "4", ".", "6", "and", "48", ".", "2", "mu", "M", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "most", "active", "derivative", "in", "this", "study", "against", "both", "tested", "cell", "lines", "was", "the", "Schiff", "'", "s", "base", "4e", "with", "IC50", "of", "4", ".", "7", "and", "4", ".", "6", "mu", "M", "against", "HT29", "and", "MDA", "-", "MB231", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Gene", "identification", "and", "comparative", "molecular", "modeling", "of", "a", "Trypanosoma", "rangeli", "major", "surface", "protease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Trypanosoma", "rangeli", "is", "a", "hemoflagellate", "parasite", "which", "is", "able", "to", "infect", "humans", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Distinct", "from", "Trypanosoma", "cruzi", ",", "the", "causative", "agent", "of", "Chagas", "disease", ",", "T", ".", "rangeli", "is", "non", "-", "pathogenic", "to", "the", "vertebrate", "host", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "manner", "by", "which", "the", "T", ".", "rangeli", "interacts", "with", "the", "host", "is", "still", "unknown", ",", "but", "it", "certainly", "depends", "on", "the", "surface", "molecules", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Major", "surface", "proteins", "(", "MSP", ")", "are", "GPI", "-", "anchored", ",", "zinc", "-", "dependent", "metalloproteases", "present", "in", "the", "surface", "of", "all", "trypanosomatids", "studied", "so", "far", ",", "which", "are", "implicated", "as", "virulence", "factors", "in", "pathogenic", "trypanosomatids", ",", "such", "as", "Leishmania", "spp", "and", "T", ".", "cruzi", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "aims", "of", "this", "work", "were", "to", "generate", "the", "complete", "sequence", "of", "a", "T", ".", "rangeli", "MSP", "(", "TrMSP", ")", "gene", "and", "to", "determine", "the", "3D", "-", "structure", "of", "the", "predicted", "protein", "by", "homology", "modeling", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "plasmid", "bearing", "a", "complete", "copy", "of", "a", "TrMSP", "gene", "was", "completely", "sequenced", "and", "the", "predicted", "protein", "was", "modeled", "using", "Modeller", "software", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Results", "indicate", "that", "TrMSP", "open", "reading", "frame", "(", "ORF", ")", "codes", "for", "a", "predicted", "588", "amino", "acid", "protein", "and", "shows", "all", "elements", "required", "for", "its", "posttranslational", "processing", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Multiple", "sequence", "alignment", "of", "TrMSP", "with", "other", "trypanosomatids", "'", "MSPs", "showed", "an", "extensive", "conservation", "of", "the", "N", "-", "terminal", "and", "central", "regions", "and", "a", "more", "divergent", "C", "-", "terminal", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Leishmania", "major", "MSP", "(", "LmMSP", ")", ",", "which", "had", "its", "crystal", "structure", "previously", "determined", ",", "has", "an", "overall", "35", "%", "identity", "with", "TrMSP", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "identity", "allowed", "the", "comparative", "molecular", "modeling", "of", "TrMSP", ",", "which", "demonstrated", "a", "high", "degree", "of", "structural", "conservation", "between", "MSPs", "from", "other", "trypanosomatids", "(", "TrypMSPs", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "modeled", "MSPs", "have", "a", "conserved", "folding", "pattern", ",", "apart", "from", "structural", "divergences", "in", "the", "C", "-", "domain", "and", "discrete", "differences", "of", "charge", "and", "topology", "in", "the", "catalytic", "cleft", ",", "and", "present", "the", "same", "geometry", "of", "the", "canonical", "HEXXH", "zinc", "-", "binding", "motif", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "determination", "of", "surface", "charges", "of", "the", "molecules", "revealed", "that", "TrMSP", "is", "a", "predominantly", "positive", "protein", ",", "whereas", "LmMSP", "and", "Trypanosoma", "cruzi", "MSP", "(", "TcMSP", ")", "are", "negative", "proteins", ",", "suggesting", "that", "substrates", "recognized", "by", "TcMSP", "and", "LmMSP", "could", "not", "interact", "with", "TrMSP", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "the", "comparison", "between", "TrMSP", "and", "TcMSP", "protein", "sequences", "has", "revealed", "45", "non", "-", "neutral", "amino", "acid", "substitutions", ",", "which", "can", "be", "further", "assessed", "through", "protein", "engineering", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "characteristics", "of", "TrMSP", "could", "explain", ",", "at", "least", "in", "part", ",", "the", "lack", "of", "pathogenicity", "of", "T", ".", "rangeli", "to", "humans", "and", "point", "to", "the", "necessity", "of", "identifying", "the", "biological", "targets", "of", "this", "enzyme", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Long", "single", "ZnO", "nanowire", "for", "logic", "and", "memory", "circuits", ":", "NOT", ",", "NAND", ",", "NOR", "gate", ",", "and", "SRAM", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "demonstrate", "logic", "and", "static", "random", "access", "memory", "(", "SRAM", ")", "circuits", "using", "a", "100", "mu", "m", "long", "and", "100", "nm", "thin", "single", "ZnO", "nanowire", "(", "NW", ")", ",", "which", "acts", "as", "a", "channel", "of", "field", "-", "effect", "transistors", "(", "FETs", ")", "with", "Al2O3", "dielectrics", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "NW", "FETs", "are", "thus", "arrayed", "in", "one", "dimension", "to", "consist", "of", "NOT", ",", "NAND", ",", "and", "NOR", "gate", "logic", ",", "and", "SRAM", "circuits", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Two", "respective", "top", "-", "gate", "NW", "FETs", "with", "Au", "and", "indium", "-", "tin", "-", "oxide", "(", "ITO", ")", "were", "connected", "to", "form", "an", "inverter", ",", "the", "basic", "NOT", "gate", "component", ",", "since", "the", "former", "gate", "leads", "to", "an", "enhanced", "mode", "FET", "while", "the", "latter", "to", "depletion", "mode", "due", "to", "their", "work", "function", "difference", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "inverters", "showed", "a", "high", "voltage", "gain", "of", "22", "under", "a", "5", "V", "operational", "voltage", ",", "resulting", "in", "successful", "operation", "of", "all", "other", "devices", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "thus", "conclude", "that", "our", "long", "single", "NW", "approach", "is", "quite", "promising", "to", "extend", "the", "field", "of", "nano", "-", "electronics", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Induction", "of", "the", "metabolic", "regulator", "Txnip", "in", "fasting", "-", "induced", "and", "natural", "torpor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Torpor", "is", "a", "physiological", "state", "characterised", "by", "controlled", "lowering", "of", "metabolic", "rate", "and", "core", "body", "temperature", ",", "allowing", "substantial", "energy", "savings", "during", "periods", "of", "reduced", "food", "availability", "or", "harsh", "environmental", "conditions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "hypothalamus", "coordinates", "energy", "homeostasis", "and", "thermoregulation", ",", "and", "plays", "a", "key", "role", "in", "directing", "torpor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "recently", "showed", "that", "mice", "lacking", "the", "orphan", "G", "protein", "coupled", "receptor", "Gpr50", "readily", "enter", "torpor", "in", "response", "to", "fasting", ",", "and", "have", "now", "used", "these", "mice", "to", "conduct", "a", "microarray", "analysis", "of", "hypothalamic", "gene", "expression", "changes", "related", "to", "the", "torpor", "state", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "revealed", "a", "strong", "induction", "of", "thioredoxin", "interacting", "protein", "(", "Txnip", ")", "in", "the", "hypothalamus", "of", "torpid", "mice", ",", "which", "was", "confirmed", "by", "quantitative", "RT", "-", "PCR", "and", "Western", "blot", "analyses", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "situ", "hybridisation", "identified", "the", "ependyma", "lining", "the", "third", "ventricle", "as", "the", "principal", "site", "of", "torpor", "-", "related", "expression", "of", "Txnip", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "characterise", "further", "the", "relationship", "between", "Txnip", "and", "torpor", ",", "we", "profiled", "Txnip", "expression", "in", "mice", "during", "prolonged", "fasting", ",", "cold", "exposure", ",", "and", "2", "-", "deoxyglucose", "-", "induced", "hypometabolism", ",", "as", "well", "as", "in", "naturally", "occurring", "torpor", "bouts", "in", "the", "Siberian", "hamster", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Strikingly", ",", "pronounced", "upregulation", "of", "Txnip", "expression", "was", "only", "observed", "in", "WT", "mice", "when", "driven", "into", "torpor", ",", "and", "during", "torpor", "in", "the", "Siberian", "hamster", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Increase", "of", "Txnip", "was", "not", "limited", "to", "the", "hypothalamus", ",", "with", "exaggerated", "expression", "in", "white", "adipose", "tissue", ",", "brown", "adipose", "tissue", ",", "and", "liver", "also", "demonstrated", "in", "torpid", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Given", "the", "recent", "identification", "of", "Txnip", "as", "a", "molecular", "nutrient", "sensor", "important", "in", "the", "regulation", "of", "energy", "metabolism", ",", "our", "data", "suggest", "that", "elevated", "Txnip", "expression", "is", "critical", "to", "regulating", "energy", "expenditure", "and", "fuel", "utilisation", "during", "the", "extreme", "hypometabolic", "state", "of", "torpor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Optimization", "of", "DDI", "Study", "Design", ":", "Comparison", "of", "Minimal", "PBPK", "Models", "on", "Prediction", "of", "CYP3A", "Inhibition", "by", "Ketoconazole", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ketoconazole", "is", "a", "potent", "CYP3A", "inhibitor", "used", "to", "assess", "the", "contribution", "of", "CYP3A", "to", "drug", "clearance", "and", "quantify", "the", "increase", "in", "drug", "exposure", "due", "to", "a", "strong", "inhibitor", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Physiologically", "based", "pharmacokinetic", "(", "PBPK", ")", "models", "have", "been", "employed", "to", "evaluate", "dosing", "regimens", "resulting", "in", "maximal", "CYP3A", "inhibition", "by", "ketoconazole", "but", "have", "reached", "different", "conclusions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "compare", "two", "PBPK", "models", "of", "the", "ketoconazole", "-", "midazolam", "interaction", ",", "Model", "1", "(", "Chien", "et", "al", ".", ",", "2006", ")", "and", "Model", "2", "implemented", "in", "Simcyp", "(", "version", "11", ")", "to", "predict", "16", "published", "dosing", "regimens", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "Model", "2", ",", "41", "%", "of", "the", "study", "point", "estimates", "of", "AUC", "ratio", "and", "71", "%", "of", "the", "90", "%", "confidence", "intervals", "were", "predicted", "within", "1", ".", "5", "-", "fold", "of", "the", "observed", "but", "these", "increased", "to", "82", "%", "and", "100", "%", "respectively", "with", "Model", "1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "midazolam", ",", "Model", "2", "predicted", "a", "maximal", "midazolam", "AUC", "ratio", "of", "8", "and", "a", "hepatic", "fraction", "metabolized", "by", "CYP3A", "of", "0", ".", "97", "whereas", "Model", "1", "predicted", "17", "and", "0", ".", "90", "respectively", ",", "which", "are", "more", "consistent", "with", "observed", "data", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Based", "on", "Model", "1", ",", "ketoconazole", "400mg", "QD", "for", "at", "least", "3", "days", "and", "substrate", "administration", "within", "2", "hours", "is", "required", "for", "maximal", "CYP3A", "inhibition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ketoconazole", "dosing", "regimens", "that", "employ", "200", "mg", "BID", "underestimate", "the", "systemic", "fraction", "metabolized", "by", "CYP3A", "(", "0", ".", "86", "vs", ".", "0", ".", "90", ")", "for", "midazolam", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "The", "systematic", "underprediction", "also", "applies", "to", "CYP3A", "substrates", "with", "high", "bioavailability", "and", "long", "half", "-", "lives", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "superior", "predictive", "performance", "of", "Model", "1", "reflects", "the", "need", "for", "accumulation", "of", "ketoconazole", "at", "enzyme", "site", "and", "protracted", "inhibition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Model", "2", "is", "not", "recommended", "for", "inferring", "optimal", "study", "design", "and", "estimation", "of", "fraction", "metabolized", "by", "CYP3A", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Vandetanib", ":", "opening", "a", "new", "treatment", "practice", "in", "advanced", "medullary", "thyroid", "carcinoma", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Medullary", "thyroid", "cancer", "(", "MTC", ")", "is", "frequently", "diagnosed", "in", "a", "locally", "advanced", "or", "metastatic", "stage", ",", "and", "10", "-", "year", "survival", "rates", "in", "these", "cases", "are", "below", "20", "%", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cytotoxic", "chemotherapy", "has", "no", "significant", "impact", "on", "overall", "or", "progression", "-", "free", "survival", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Vandetanib", "(", "Caprelsa", "(", "(R)", ")", ",", "AstraZeneca", ")", "is", "a", "once", "-", "daily", "oral", "tyrosine", "kinase", "inhibitor", "that", "selectively", "inhibits", "signalling", "mediated", "by", "growth", "-", "factor", "receptor", "tyrosine", "kinase", "RET", "(", "constitutively", "activated", "in", "roughly", "60", "%", "of", "all", "MTCs", ")", ",", "vascular", "endothelial", "growth", "-", "factor", "receptors", "2", "and", "3", ",", "and", "epidermal", "growth", "-", "factor", "receptors", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "the", "first", "systemic", "drug", "with", "demonstrated", "anti", "-", "tumor", "benefits", "in", "advanced", "MTC", ",", "and", "it", "has", "recently", "been", "approved", "for", "locally", "advanced", "or", "metastatic", "MTC", "by", "the", "United", "States", "Food", "and", "Drug", "Administration", "(", "April", "2011", ")", "and", "the", "European", "Medicines", "Agency", "(", "February", "2012", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "review", ",", "starting", "from", "the", "phases", "II", "and", "III", "efficacy", "and", "safety", "data", "that", "led", "to", "these", "approvals", ",", "explores", "important", "issues", "related", "to", "dosing", ",", "patient", "selection", ",", "and", "strategies", "for", "managing", "the", "substantial", "risk", "of", "toxicity", "associated", "with", "the", "drug", "(", "including", "life", "-", "threatening", "cardiac", "events", "that", "are", "the", "subject", "of", "a", "black", "-", "box", "warning", "in", "the", "United", "States", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "these", "issues", "still", "remain", "to", "be", "defined", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Vandetanib", "is", "becoming", "a", "standard", "of", "care", "for", "symptomatic", ",", "progressive", ",", "metastatic", "MTCs", ",", "to", "be", "used", "selectively", "in", "those", "patients", "who", "are", "likely", "to", "benefit", "from", "it", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Structural", "Transformation", "between", "Supramolecular", "Nanofibers", "with", "Drastic", "Change", "of", "Conductivity", "by", "Heat", "and", "Ultrasound", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Transformation", "with", "every", "fiber", "of", "its", "being", ":", "Dehydrobenzoannulene", "derivatives", "with", "a", "boomerang", "shape", ",", "dipole", "moment", ",", "and", "substituents", "that", "make", "diverse", "interactions", "enable", "the", "contruction", "of", "stimuli", "-", "responsive", "nanofibers", "despite", "the", "lack", "of", "stimuli", "-", "responsive", "groups", "in", "these", "compounds", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interestingly", ",", "the", "supramolecular", "nanofibers", "obtained", "after", "ultrasonic", "treatment", "displayed", "an", "80", "%", "decrease", "in", "conductivity", "as", "compared", "to", "untreated", "nanofibers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "is", "the", "first", "example", "of", "an", "electronic", "wire", "for", "which", "the", "conductivity", "can", "be", "controlled", "by", "ultrasound", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "NMDA", "Receptor", "Activation", "Down", "-", "Regulates", "Expression", "of", "delta", "Subunit", "-", "Containing", "GABA", "-", "A", "Receptors", "in", "Cultured", "Hippocampal", "Neurons", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Neurosteroids", "are", "endogenous", "allosteric", "modulators", "of", "gamma", "amino", "-", "butyric", "acid", "type", "A", "receptors", "(", "GABARs", ")", ",", "and", "enhance", "GABAR", "-", "mediated", "inhibition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "GABARs", "expressed", "on", "hippocampal", "dentate", "granule", "neurons", "of", "epileptic", "animals", "are", "modified", "such", "that", "their", "neurosteroid", "sensitivity", "is", "reduced", "and", "delta", "subunit", "expression", "is", "diminished", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "molecular", "mechanisms", "triggering", "this", "GABAR", "plasticity", "were", "explored", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "cultured", "hippocampal", "neurons", "treatment", "with", "NMDA", "(", "10", "mu", "M", ")", "for", "48", "hrs", "reduced", "surface", "expression", "of", "delta", "and", "alpha", "4", "subunits", ",", "but", "did", "not", "increase", "expression", "of", "gamma", "2", "subunits", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "tonic", "current", "recorded", "from", "neurons", "in", "NMDA", "-", "treated", "cultures", "was", "reduced", ",", "and", "its", "neurosteroid", "modulation", "was", "also", "diminished", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "synaptic", "inhibition", "and", "its", "modulation", "by", "neurosteroids", "were", "preserved", "in", "these", "neurons", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "time", "course", "of", "NMDA", "effects", "on", "surface", "and", "total", "delta", "subunit", "expression", "were", "distinct", ";", "shorter", "(", "6", "hrs", ")", "treatment", "decreased", "surface", "expression", ",", "whereas", "longer", "treatment", "reduced", "both", "surface", "and", "total", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "APV", "blocked", "NMDA", "effects", "on", "delta", "subunit", "expression", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chelation", "of", "calcium", "ions", "by", "BAPTA", "-", "AM", "or", "blockade", "of", "ERK1", "/", "2", "activation", "by", "UO126", "also", "prevented", "the", "NMDA", "effects", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Thus", "prolonged", "activation", "of", "NMDA", "receptors", "in", "hippocampal", "neurons", "reduced", "GABAR", "delta", "subunit", "expression", "through", "Ca2", "+", "entry", "and", "at", "least", "in", "part", "by", "ERK1", "/", "2", "activation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Kinetic", "Evidence", "for", "a", "Non", "-", "Langmuir", "-", "Hinshelwood", "Surface", "Reaction", ":", "H", "/", "D", "Exchange", "over", "Pd", "Nanoparticles", "and", "Pd", "(", "111", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "The", "mechanism", "of", "hydrogen", "recombination", "on", "a", "Pd", "(", "111", ")", "single", "crystal", "and", "well", "-", "defined", "Pd", "nanoparticles", "is", "studied", "using", "pulsed", "multi", "-", "molecular", "beam", "techniques", "and", "the", "H2", "/", "D2", "isotope", "exchange", "reaction", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "focus", "of", "this", "study", "is", "to", "obtain", "a", "microscopic", "understanding", "of", "the", "role", "of", "subsurface", "hydrogen", "in", "enhancing", "the", "associative", "desorption", "of", "molecular", "hydrogen", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "HD", "production", "from", "H2", "and", "D2", "over", "Pd", "is", "investigated", "using", "pulsed", "molecular", "beams", ",", "and", "the", "temperature", "dependence", "and", "reaction", "orders", "are", "obtained", "for", "the", "rate", "of", "HD", "production", "under", "various", "reaction", "conditions", "designed", "to", "modulate", "the", "amount", "of", "subsurface", "hydrogen", "present", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "The", "experimental", "data", "are", "compared", "to", "the", "results", "of", "kinetic", "modeling", "based", "on", "different", "mechanisms", "for", "hydrogen", "recombination", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "We", "found", "that", "under", "conditions", "where", "virtually", "no", "subsurface", "hydrogen", "species", "are", "present", ",", "the", "HD", "formation", "rate", "can", "be", "described", "exceptionally", "well", "by", "a", "classic", "Langmuir", "-", "Hinshelwood", "model", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "set", "of", "genes", "identified", "that", "show", "regulatory", "modulation", "at", "different", "Cr", "doses", "provide", "specific", "candidates", "for", "further", "studies", "aimed", "at", "determination", "of", "how", "whales", "exhibit", "resistance", "to", "Cr", "toxicity", "and", "what", "role", "(", "s", ")", "reactive", "oxygen", "species", "(", "ROS", ")", "may", "play", "in", "this", "process", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "miR", "-", "194", "suppresses", "metastasis", "of", "non", "-", "small", "cell", "lung", "cancer", "through", "regulating", "expression", "of", "BMP1", "and", "p27", "(", "kip1", ".", ")" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "MicroRNAs", "(", "miRNAs", ")", "are", "increasingly", "implicated", "in", "regulating", "tumor", "malignance", "through", "their", "capacity", "to", "coordinately", "repress", "expression", "of", "tumor", "-", "related", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "show", "that", "overexpression", "of", "miR", "-", "194", "in", "lung", "cancer", "cell", "lines", ",", "results", "in", "suppressing", "metastasis", "of", "lung", "cancer", "cells", ",", "while", "inhibiting", "its", "expression", "through", "'", "miRNA", "sponge", "'", "promotes", "the", "cancer", "cells", "to", "metastasize", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "miR", "-", "194", "expression", "is", "also", "found", "to", "be", "in", "strongly", "negative", "association", "with", "metastasis", "in", "clinical", "specimens", "of", "non", "-", "small", "cell", "lung", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "demonstrate", "that", "miR", "-", "194", "directly", "targets", "both", "BMP1", "and", "p27", "(", "kip1", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "resulting", "downregulation", "of", "BMP1", "leads", "to", "suppression", "of", "TGF", "beta", "activity", "and", ",", "thus", ",", "to", "downregulation", "of", "the", "expression", "of", "key", "oncogenic", "genes", "(", "matrix", "metalloproteinases", "MMP2", "and", "MMP9", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "leads", ",", "in", "turn", ",", "to", "decreased", "tumor", "invasion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "the", "miRNA", "-", "194", "-", "induced", "suppression", "of", "p27", "(", "kip1", ")", "activates", "the", "RhoA", "pathway", ",", "producing", "enhanced", "development", "of", "actin", "stress", "fibers", "and", "impaired", "migration", "of", "cancer", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "reveal", "two", "structurally", "independent", "but", "functionally", "linked", "branches", "of", "the", "regulatory", "and", "signaling", "pathway", "that", "together", "provide", "a", "bridge", "between", "the", "metastasis", "-", "depressing", "miRNA", "and", "the", "key", "genes", "that", "govern", "the", "malignancy", "of", "lung", "cancers", ".", "Oncogene", "advance", "online", "publication", ",", "15", "April", "2013", ";", "doi", ":", "10", ".", "1038", "/", "onc", ".", "2013", ".", "108", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "histone", "demethylase", "Jmjd3", "sequentially", "associates", "with", "the", "transcription", "factors", "Tbx3", "and", "Eomes", "to", "drive", "endoderm", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Stem", "cell", "differentiation", "depends", "on", "transcriptional", "activation", "driven", "by", "lineage", "-", "specific", "regulators", "as", "well", "as", "changes", "in", "chromatin", "organization", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "coordination", "of", "these", "events", "is", "poorly", "understood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "show", "that", "T", "-", "box", "proteins", "team", "up", "with", "chromatin", "modifying", "enzymes", "to", "drive", "the", "expression", "of", "the", "key", "lineage", "regulator", ",", "Eomes", "during", "endodermal", "differentiation", "of", "embryonic", "stem", "(", "ES", ")", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "Eomes", "locus", "is", "maintained", "in", "a", "transcriptionally", "poised", "configuration", "in", "ES", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "During", "early", "differentiation", "steps", ",", "the", "ES", "cell", "factor", "Tbx3", "associates", "with", "the", "histone", "demethylase", "Jmjd3", "at", "the", "enhancer", "element", "of", "the", "Eomes", "locus", "to", "allow", "enhancer", "-", "promoter", "interactions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "spatial", "reorganization", "of", "the", "chromatin", "primes", "the", "cells", "to", "respond", "to", "Activin", "signalling", ",", "which", "promotes", "the", "binding", "of", "Jmjd3", "and", "Eomes", "to", "its", "own", "bivalent", "promoter", "region", "to", "further", "stimulate", "Eomes", "expression", "in", "a", "positive", "feedback", "loop", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "Eomes", "activates", "a", "transcriptional", "network", "of", "core", "regulators", "of", "endodermal", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "demonstrate", "that", "Jmjd3", "sequentially", "associates", "with", "two", "T", "-", "box", "factors", ",", "Tbx3", "and", "Eomes", "to", "drive", "stem", "cell", "differentiation", "towards", "the", "definitive", "endoderm", "lineage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Synthesis", "of", "3", "-", "O", "-", "propargylated", "betulinic", "acid", "and", "its", "1", ",", "2", ",", "3", "-", "triazoles", "as", "potential", "apoptotic", "agents", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cytotoxic", "agents", "from", "nature", "are", "presently", "the", "mainstay", "of", "anticancer", "chemotherapy", ",", "and", "the", "need", "to", "reinforce", "the", "arsenal", "of", "anticancer", "agents", "is", "highly", "desired", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Chemical", "transformation", "studies", "carried", "out", "on", "betulinic", "acid", ",", "through", "concise", "1", ",", "2", ",", "3", "-", "triazole", "synthesis", "via", "click", "chemistry", "approach", "at", "C", "-", "3position", "in", "ring", "A", "have", "been", "evaluated", "for", "their", "cytotoxic", "potentiation", "against", "nine", "human", "cancer", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Most", "of", "the", "derivatives", "have", "shown", "higher", "cytotoxic", "profiles", "than", "the", "parent", "molecule", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "compounds", "i", ".", "e", ".", "3", "{", "1N", "(", "2", "-", "cyanophenyl", ")", "-", "1H", "-", "1", ",", "2", ",", "3", "-", "triazol", "-", "4yl", "}", "methyloxy", "betulinic", "acid", "(", "7", ")", "and", "3", "{", "1N", "(", "5", "-", "hydroxy", "-", "naphth", "-", "1yl", ")", "-", "1H", "-", "1", ",", "2", ",", "3", "-", "triazol", "-", "4yl", "}", "methyloxy", "betulinic", "acid", "(", "13", ")", "displayed", "impressive", "IC50", "values", "(", "2", ".", "5", "and", "3", ".", "5", "mu", "M", "respectively", ")", "against", "leukemia", "cell", "line", "HL", "-", "60", "(", "5", "-", "7", "-", "fold", "higher", "potency", "than", "betulinic", "acid", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "evident", "from", "various", "biological", "end", "points", ",", "inhibition", "of", "cell", "migration", "and", "colony", "formation", ",", "mitochondrial", "membrane", "disruption", "followed", "by", "DNA", "fragmentation", "and", "apoptosis", ",", "is", "demonstrated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Synthesis", "and", "in", "vitro", "antiproliferative", "effect", "of", "novel", "quinoline", "-", "based", "potential", "anticancer", "agents", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Several", "derivatives", "with", "a", "quinoline", "scaffold", "and", "a", "flexible", ",", "semi", "-", "flexible", "or", "rigid", "side", "chains", "at", "position", "8", "of", "the", "quinoline", "ring", "were", "synthesized", "and", "assessed", "for", "their", "in", "vitro", "activity", "versus", "the", "human", "colon", "cancer", "cell", "line", "HT29", "and", "the", "human", "breast", "cancer", "cell", "line", "MDA", "-", "MB231", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "HT29", "cell", "line", "was", "more", "refractory", "to", "the", "cytotoxic", "activity", "of", "some", "compounds", ",", "meanwhile", "all", "the", "quinoline", "derivatives", "except", "one", "displayed", "high", "to", "moderate", "activity", "against", "MDA", "-", "MB231", "with", "IC50", "values", "ranging", "between", "4", ".", "6", "and", "48", ".", "2", "mu", "M", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "most", "active", "derivative", "in", "this", "study", "against", "both", "tested", "cell", "lines", "was", "the", "Schiff", "'", "s", "base", "4e", "with", "IC50", "of", "4", ".", "7", "and", "4", ".", "6", "mu", "M", "against", "HT29", "and", "MDA", "-", "MB231", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Gene", "identification", "and", "comparative", "molecular", "modeling", "of", "a", "Trypanosoma", "rangeli", "major", "surface", "protease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Trypanosoma", "rangeli", "is", "a", "hemoflagellate", "parasite", "which", "is", "able", "to", "infect", "humans", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Distinct", "from", "Trypanosoma", "cruzi", ",", "the", "causative", "agent", "of", "Chagas", "disease", ",", "T", ".", "rangeli", "is", "non", "-", "pathogenic", "to", "the", "vertebrate", "host", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "manner", "by", "which", "the", "T", ".", "rangeli", "interacts", "with", "the", "host", "is", "still", "unknown", ",", "but", "it", "certainly", "depends", "on", "the", "surface", "molecules", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Major", "surface", "proteins", "(", "MSP", ")", "are", "GPI", "-", "anchored", ",", "zinc", "-", "dependent", "metalloproteases", "present", "in", "the", "surface", "of", "all", "trypanosomatids", "studied", "so", "far", ",", "which", "are", "implicated", "as", "virulence", "factors", "in", "pathogenic", "trypanosomatids", ",", "such", "as", "Leishmania", "spp", "and", "T", ".", "cruzi", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "aims", "of", "this", "work", "were", "to", "generate", "the", "complete", "sequence", "of", "a", "T", ".", "rangeli", "MSP", "(", "TrMSP", ")", "gene", "and", "to", "determine", "the", "3D", "-", "structure", "of", "the", "predicted", "protein", "by", "homology", "modeling", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "plasmid", "bearing", "a", "complete", "copy", "of", "a", "TrMSP", "gene", "was", "completely", "sequenced", "and", "the", "predicted", "protein", "was", "modeled", "using", "Modeller", "software", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Results", "indicate", "that", "TrMSP", "open", "reading", "frame", "(", "ORF", ")", "codes", "for", "a", "predicted", "588", "amino", "acid", "protein", "and", "shows", "all", "elements", "required", "for", "its", "posttranslational", "processing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Multiple", "sequence", "alignment", "of", "TrMSP", "with", "other", "trypanosomatids", "'", "MSPs", "showed", "an", "extensive", "conservation", "of", "the", "N", "-", "terminal", "and", "central", "regions", "and", "a", "more", "divergent", "C", "-", "terminal", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Leishmania", "major", "MSP", "(", "LmMSP", ")", ",", "which", "had", "its", "crystal", "structure", "previously", "determined", ",", "has", "an", "overall", "35", "%", "identity", "with", "TrMSP", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "identity", "allowed", "the", "comparative", "molecular", "modeling", "of", "TrMSP", ",", "which", "demonstrated", "a", "high", "degree", "of", "structural", "conservation", "between", "MSPs", "from", "other", "trypanosomatids", "(", "TrypMSPs", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "modeled", "MSPs", "have", "a", "conserved", "folding", "pattern", ",", "apart", "from", "structural", "divergences", "in", "the", "C", "-", "domain", "and", "discrete", "differences", "of", "charge", "and", "topology", "in", "the", "catalytic", "cleft", ",", "and", "present", "the", "same", "geometry", "of", "the", "canonical", "HEXXH", "zinc", "-", "binding", "motif", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "determination", "of", "surface", "charges", "of", "the", "molecules", "revealed", "that", "TrMSP", "is", "a", "predominantly", "positive", "protein", ",", "whereas", "LmMSP", "and", "Trypanosoma", "cruzi", "MSP", "(", "TcMSP", ")", "are", "negative", "proteins", ",", "suggesting", "that", "substrates", "recognized", "by", "TcMSP", "and", "LmMSP", "could", "not", "interact", "with", "TrMSP", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "the", "comparison", "between", "TrMSP", "and", "TcMSP", "protein", "sequences", "has", "revealed", "45", "non", "-", "neutral", "amino", "acid", "substitutions", ",", "which", "can", "be", "further", "assessed", "through", "protein", "engineering", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "characteristics", "of", "TrMSP", "could", "explain", ",", "at", "least", "in", "part", ",", "the", "lack", "of", "pathogenicity", "of", "T", ".", "rangeli", "to", "humans", "and", "point", "to", "the", "necessity", "of", "identifying", "the", "biological", "targets", "of", "this", "enzyme", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Long", "single", "ZnO", "nanowire", "for", "logic", "and", "memory", "circuits", ":", "NOT", ",", "NAND", ",", "NOR", "gate", ",", "and", "SRAM", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "demonstrate", "logic", "and", "static", "random", "access", "memory", "(", "SRAM", ")", "circuits", "using", "a", "100", "mu", "m", "long", "and", "100", "nm", "thin", "single", "ZnO", "nanowire", "(", "NW", ")", ",", "which", "acts", "as", "a", "channel", "of", "field", "-", "effect", "transistors", "(", "FETs", ")", "with", "Al2O3", "dielectrics", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "NW", "FETs", "are", "thus", "arrayed", "in", "one", "dimension", "to", "consist", "of", "NOT", ",", "NAND", ",", "and", "NOR", "gate", "logic", ",", "and", "SRAM", "circuits", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "respective", "top", "-", "gate", "NW", "FETs", "with", "Au", "and", "indium", "-", "tin", "-", "oxide", "(", "ITO", ")", "were", "connected", "to", "form", "an", "inverter", ",", "the", "basic", "NOT", "gate", "component", ",", "since", "the", "former", "gate", "leads", "to", "an", "enhanced", "mode", "FET", "while", "the", "latter", "to", "depletion", "mode", "due", "to", "their", "work", "function", "difference", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "inverters", "showed", "a", "high", "voltage", "gain", "of", "22", "under", "a", "5", "V", "operational", "voltage", ",", "resulting", "in", "successful", "operation", "of", "all", "other", "devices", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "thus", "conclude", "that", "our", "long", "single", "NW", "approach", "is", "quite", "promising", "to", "extend", "the", "field", "of", "nano", "-", "electronics", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Induction", "of", "the", "metabolic", "regulator", "Txnip", "in", "fasting", "-", "induced", "and", "natural", "torpor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Torpor", "is", "a", "physiological", "state", "characterised", "by", "controlled", "lowering", "of", "metabolic", "rate", "and", "core", "body", "temperature", ",", "allowing", "substantial", "energy", "savings", "during", "periods", "of", "reduced", "food", "availability", "or", "harsh", "environmental", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "hypothalamus", "coordinates", "energy", "homeostasis", "and", "thermoregulation", ",", "and", "plays", "a", "key", "role", "in", "directing", "torpor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "recently", "showed", "that", "mice", "lacking", "the", "orphan", "G", "protein", "coupled", "receptor", "Gpr50", "readily", "enter", "torpor", "in", "response", "to", "fasting", ",", "and", "have", "now", "used", "these", "mice", "to", "conduct", "a", "microarray", "analysis", "of", "hypothalamic", "gene", "expression", "changes", "related", "to", "the", "torpor", "state", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "revealed", "a", "strong", "induction", "of", "thioredoxin", "interacting", "protein", "(", "Txnip", ")", "in", "the", "hypothalamus", "of", "torpid", "mice", ",", "which", "was", "confirmed", "by", "quantitative", "RT", "-", "PCR", "and", "Western", "blot", "analyses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "situ", "hybridisation", "identified", "the", "ependyma", "lining", "the", "third", "ventricle", "as", "the", "principal", "site", "of", "torpor", "-", "related", "expression", "of", "Txnip", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "characterise", "further", "the", "relationship", "between", "Txnip", "and", "torpor", ",", "we", "profiled", "Txnip", "expression", "in", "mice", "during", "prolonged", "fasting", ",", "cold", "exposure", ",", "and", "2", "-", "deoxyglucose", "-", "induced", "hypometabolism", ",", "as", "well", "as", "in", "naturally", "occurring", "torpor", "bouts", "in", "the", "Siberian", "hamster", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Strikingly", ",", "pronounced", "upregulation", "of", "Txnip", "expression", "was", "only", "observed", "in", "WT", "mice", "when", "driven", "into", "torpor", ",", "and", "during", "torpor", "in", "the", "Siberian", "hamster", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Increase", "of", "Txnip", "was", "not", "limited", "to", "the", "hypothalamus", ",", "with", "exaggerated", "expression", "in", "white", "adipose", "tissue", ",", "brown", "adipose", "tissue", ",", "and", "liver", "also", "demonstrated", "in", "torpid", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Given", "the", "recent", "identification", "of", "Txnip", "as", "a", "molecular", "nutrient", "sensor", "important", "in", "the", "regulation", "of", "energy", "metabolism", ",", "our", "data", "suggest", "that", "elevated", "Txnip", "expression", "is", "critical", "to", "regulating", "energy", "expenditure", "and", "fuel", "utilisation", "during", "the", "extreme", "hypometabolic", "state", "of", "torpor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Optimization", "of", "DDI", "Study", "Design", ":", "Comparison", "of", "Minimal", "PBPK", "Models", "on", "Prediction", "of", "CYP3A", "Inhibition", "by", "Ketoconazole", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ketoconazole", "is", "a", "potent", "CYP3A", "inhibitor", "used", "to", "assess", "the", "contribution", "of", "CYP3A", "to", "drug", "clearance", "and", "quantify", "the", "increase", "in", "drug", "exposure", "due", "to", "a", "strong", "inhibitor", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Physiologically", "based", "pharmacokinetic", "(", "PBPK", ")", "models", "have", "been", "employed", "to", "evaluate", "dosing", "regimens", "resulting", "in", "maximal", "CYP3A", "inhibition", "by", "ketoconazole", "but", "have", "reached", "different", "conclusions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "compare", "two", "PBPK", "models", "of", "the", "ketoconazole", "-", "midazolam", "interaction", ",", "Model", "1", "(", "Chien", "et", "al", ".", ",", "2006", ")", "and", "Model", "2", "implemented", "in", "Simcyp", "(", "version", "11", ")", "to", "predict", "16", "published", "dosing", "regimens", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "Model", "2", ",", "41", "%", "of", "the", "study", "point", "estimates", "of", "AUC", "ratio", "and", "71", "%", "of", "the", "90", "%", "confidence", "intervals", "were", "predicted", "within", "1", ".", "5", "-", "fold", "of", "the", "observed", "but", "these", "increased", "to", "82", "%", "and", "100", "%", "respectively", "with", "Model", "1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "midazolam", ",", "Model", "2", "predicted", "a", "maximal", "midazolam", "AUC", "ratio", "of", "8", "and", "a", "hepatic", "fraction", "metabolized", "by", "CYP3A", "of", "0", ".", "97", "whereas", "Model", "1", "predicted", "17", "and", "0", ".", "90", "respectively", ",", "which", "are", "more", "consistent", "with", "observed", "data", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Based", "on", "Model", "1", ",", "ketoconazole", "400mg", "QD", "for", "at", "least", "3", "days", "and", "substrate", "administration", "within", "2", "hours", "is", "required", "for", "maximal", "CYP3A", "inhibition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ketoconazole", "dosing", "regimens", "that", "employ", "200", "mg", "BID", "underestimate", "the", "systemic", "fraction", "metabolized", "by", "CYP3A", "(", "0", ".", "86", "vs", ".", "0", ".", "90", ")", "for", "midazolam", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "The", "systematic", "underprediction", "also", "applies", "to", "CYP3A", "substrates", "with", "high", "bioavailability", "and", "long", "half", "-", "lives", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "superior", "predictive", "performance", "of", "Model", "1", "reflects", "the", "need", "for", "accumulation", "of", "ketoconazole", "at", "enzyme", "site", "and", "protracted", "inhibition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Model", "2", "is", "not", "recommended", "for", "inferring", "optimal", "study", "design", "and", "estimation", "of", "fraction", "metabolized", "by", "CYP3A", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Vandetanib", ":", "opening", "a", "new", "treatment", "practice", "in", "advanced", "medullary", "thyroid", "carcinoma", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Medullary", "thyroid", "cancer", "(", "MTC", ")", "is", "frequently", "diagnosed", "in", "a", "locally", "advanced", "or", "metastatic", "stage", ",", "and", "10", "-", "year", "survival", "rates", "in", "these", "cases", "are", "below", "20", "%", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cytotoxic", "chemotherapy", "has", "no", "significant", "impact", "on", "overall", "or", "progression", "-", "free", "survival", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Vandetanib", "(", "Caprelsa", "(", "(R)", ")", ",", "AstraZeneca", ")", "is", "a", "once", "-", "daily", "oral", "tyrosine", "kinase", "inhibitor", "that", "selectively", "inhibits", "signalling", "mediated", "by", "growth", "-", "factor", "receptor", "tyrosine", "kinase", "RET", "(", "constitutively", "activated", "in", "roughly", "60", "%", "of", "all", "MTCs", ")", ",", "vascular", "endothelial", "growth", "-", "factor", "receptors", "2", "and", "3", ",", "and", "epidermal", "growth", "-", "factor", "receptors", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "the", "first", "systemic", "drug", "with", "demonstrated", "anti", "-", "tumor", "benefits", "in", "advanced", "MTC", ",", "and", "it", "has", "recently", "been", "approved", "for", "locally", "advanced", "or", "metastatic", "MTC", "by", "the", "United", "States", "Food", "and", "Drug", "Administration", "(", "April", "2011", ")", "and", "the", "European", "Medicines", "Agency", "(", "February", "2012", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "review", ",", "starting", "from", "the", "phases", "II", "and", "III", "efficacy", "and", "safety", "data", "that", "led", "to", "these", "approvals", ",", "explores", "important", "issues", "related", "to", "dosing", ",", "patient", "selection", ",", "and", "strategies", "for", "managing", "the", "substantial", "risk", "of", "toxicity", "associated", "with", "the", "drug", "(", "including", "life", "-", "threatening", "cardiac", "events", "that", "are", "the", "subject", "of", "a", "black", "-", "box", "warning", "in", "the", "United", "States", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "these", "issues", "still", "remain", "to", "be", "defined", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Vandetanib", "is", "becoming", "a", "standard", "of", "care", "for", "symptomatic", ",", "progressive", ",", "metastatic", "MTCs", ",", "to", "be", "used", "selectively", "in", "those", "patients", "who", "are", "likely", "to", "benefit", "from", "it", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Structural", "Transformation", "between", "Supramolecular", "Nanofibers", "with", "Drastic", "Change", "of", "Conductivity", "by", "Heat", "and", "Ultrasound", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transformation", "with", "every", "fiber", "of", "its", "being", ":", "Dehydrobenzoannulene", "derivatives", "with", "a", "boomerang", "shape", ",", "dipole", "moment", ",", "and", "substituents", "that", "make", "diverse", "interactions", "enable", "the", "contruction", "of", "stimuli", "-", "responsive", "nanofibers", "despite", "the", "lack", "of", "stimuli", "-", "responsive", "groups", "in", "these", "compounds", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Interestingly", ",", "the", "supramolecular", "nanofibers", "obtained", "after", "ultrasonic", "treatment", "displayed", "an", "80", "%", "decrease", "in", "conductivity", "as", "compared", "to", "untreated", "nanofibers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "is", "the", "first", "example", "of", "an", "electronic", "wire", "for", "which", "the", "conductivity", "can", "be", "controlled", "by", "ultrasound", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "NMDA", "Receptor", "Activation", "Down", "-", "Regulates", "Expression", "of", "delta", "Subunit", "-", "Containing", "GABA", "-", "A", "Receptors", "in", "Cultured", "Hippocampal", "Neurons", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Neurosteroids", "are", "endogenous", "allosteric", "modulators", "of", "gamma", "amino", "-", "butyric", "acid", "type", "A", "receptors", "(", "GABARs", ")", ",", "and", "enhance", "GABAR", "-", "mediated", "inhibition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "GABARs", "expressed", "on", "hippocampal", "dentate", "granule", "neurons", "of", "epileptic", "animals", "are", "modified", "such", "that", "their", "neurosteroid", "sensitivity", "is", "reduced", "and", "delta", "subunit", "expression", "is", "diminished", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "molecular", "mechanisms", "triggering", "this", "GABAR", "plasticity", "were", "explored", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "cultured", "hippocampal", "neurons", "treatment", "with", "NMDA", "(", "10", "mu", "M", ")", "for", "48", "hrs", "reduced", "surface", "expression", "of", "delta", "and", "alpha", "4", "subunits", ",", "but", "did", "not", "increase", "expression", "of", "gamma", "2", "subunits", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "tonic", "current", "recorded", "from", "neurons", "in", "NMDA", "-", "treated", "cultures", "was", "reduced", ",", "and", "its", "neurosteroid", "modulation", "was", "also", "diminished", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "synaptic", "inhibition", "and", "its", "modulation", "by", "neurosteroids", "were", "preserved", "in", "these", "neurons", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "time", "course", "of", "NMDA", "effects", "on", "surface", "and", "total", "delta", "subunit", "expression", "were", "distinct", ";", "shorter", "(", "6", "hrs", ")", "treatment", "decreased", "surface", "expression", ",", "whereas", "longer", "treatment", "reduced", "both", "surface", "and", "total", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "APV", "blocked", "NMDA", "effects", "on", "delta", "subunit", "expression", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Chelation", "of", "calcium", "ions", "by", "BAPTA", "-", "AM", "or", "blockade", "of", "ERK1", "/", "2", "activation", "by", "UO126", "also", "prevented", "the", "NMDA", "effects", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Thus", "prolonged", "activation", "of", "NMDA", "receptors", "in", "hippocampal", "neurons", "reduced", "GABAR", "delta", "subunit", "expression", "through", "Ca2", "+", "entry", "and", "at", "least", "in", "part", "by", "ERK1", "/", "2", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Kinetic", "Evidence", "for", "a", "Non", "-", "Langmuir", "-", "Hinshelwood", "Surface", "Reaction", ":", "H", "/", "D", "Exchange", "over", "Pd", "Nanoparticles", "and", "Pd", "(", "111", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "The", "mechanism", "of", "hydrogen", "recombination", "on", "a", "Pd", "(", "111", ")", "single", "crystal", "and", "well", "-", "defined", "Pd", "nanoparticles", "is", "studied", "using", "pulsed", "multi", "-", "molecular", "beam", "techniques", "and", "the", "H2", "/", "D2", "isotope", "exchange", "reaction", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "focus", "of", "this", "study", "is", "to", "obtain", "a", "microscopic", "understanding", "of", "the", "role", "of", "subsurface", "hydrogen", "in", "enhancing", "the", "associative", "desorption", "of", "molecular", "hydrogen", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "HD", "production", "from", "H2", "and", "D2", "over", "Pd", "is", "investigated", "using", "pulsed", "molecular", "beams", ",", "and", "the", "temperature", "dependence", "and", "reaction", "orders", "are", "obtained", "for", "the", "rate", "of", "HD", "production", "under", "various", "reaction", "conditions", "designed", "to", "modulate", "the", "amount", "of", "subsurface", "hydrogen", "present", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "The", "experimental", "data", "are", "compared", "to", "the", "results", "of", "kinetic", "modeling", "based", "on", "different", "mechanisms", "for", "hydrogen", "recombination", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "We", "found", "that", "under", "conditions", "where", "virtually", "no", "subsurface", "hydrogen", "species", "are", "present", ",", "the", "HD", "formation", "rate", "can", "be", "described", "exceptionally", "well", "by", "a", "classic", "Langmuir", "-", "Hinshelwood", "model", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]