extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "However", ",", "this", "model", "completely", "fails", "to", "reproduce", "the", "experimentally", "observed", "high", "HD", "formation", "rates", "and", "the", "reaction", "orders", "under", "reaction", "conditions", "where", "subsurface", "hydrogen", "is", "present", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "To", "analyze", "this", "phenomenon", ",", "we", "develop", "two", "kinetic", "models", "that", "account", "for", "the", "role", "of", "subsurface", "hydrogen", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "First", ",", "we", "investigate", "the", "possibility", "of", "a", "change", "in", "the", "reaction", "mechanism", ",", "where", "recombination", "of", "one", "subsurface", "and", "one", "surface", "hydrogen", "species", "(", "known", "as", "a", "breakthrough", "mechanism", ")", "becomes", "dominant", "when", "subsurface", "hydrogen", "is", "present", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "Second", ",", "we", "investigate", "the", "possibility", "of", "the", "modified", "Langmuir", "-", "Hinshelwood", "mechanism", "with", "subsurface", "hydrogen", "lowering", "the", "activation", "energy", "for", "recombination", "of", "two", "hydrogen", "species", "adsorbed", "on", "the", "surface", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "the", "experimental", "reaction", "kinetics", "can", "be", "well", "described", "by", "both", "kinetic", "models", "based", "on", "non", "-", "Langmuir", "-", "Hinshelwood", "-", "type", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Accurate", "detection", "of", "differential", "RNA", "processing", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Deep", "transcriptome", "sequencing", "(", "RNA", "-", "Seq", ")", "has", "become", "a", "vital", "tool", "for", "studying", "the", "state", "of", "cells", "in", "the", "context", "of", "varying", "environments", ",", "genotypes", "and", "other", "factors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RNA", "-", "Seq", "profiling", "data", "enable", "identification", "of", "novel", "isoforms", ",", "quantification", "of", "known", "isoforms", "and", "detection", "of", "changes", "in", "transcriptional", "or", "RNA", "-", "processing", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Existing", "approaches", "to", "detect", "differential", "isoform", "abundance", "between", "samples", "either", "require", "a", "complete", "isoform", "annotation", "or", "fall", "short", "in", "providing", "statistically", "robust", "and", "calibrated", "significance", "estimates", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "propose", "a", "suite", "of", "statistical", "tests", "to", "address", "these", "open", "needs", ":", "a", "parametric", "test", "that", "uses", "known", "isoform", "annotations", "to", "detect", "changes", "in", "relative", "isoform", "abundance", "and", "a", "non", "-", "parametric", "test", "that", "detects", "differential", "read", "coverages", "and", "can", "be", "applied", "when", "isoform", "annotations", "are", "not", "available", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "methods", "account", "for", "the", "discrete", "nature", "of", "read", "counts", "and", "the", "inherent", "biological", "variability", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "demonstrate", "that", "these", "tests", "compare", "favorably", "to", "previous", "methods", ",", "both", "in", "terms", "of", "accuracy", "and", "statistical", "calibrations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "use", "these", "techniques", "to", "analyze", "RNA", "-", "Seq", "libraries", "from", "Arabidopsis", "thaliana", "and", "Drosophila", "melanogaster", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "identified", "differential", "RNA", "processing", "events", "were", "consistent", "with", "RT", "-", "qPCR", "measurements", "and", "previous", "studies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "proposed", "toolkit", "is", "available", "from", "http", ":", "/", "/", "bioweb", ".", "me", "/", "rdiff", "and", "enables", "in", "-", "depth", "analyses", "of", "transcriptomes", ",", "with", "or", "without", "available", "isoform", "annotation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "effect", "of", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "on", "fracture", "healing", "during", "different", "loading", "conditions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Parathyroid", "hormone", "(", "PTH", ")", "and", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "have", "been", "shown", "to", "promote", "bone", "healing", "in", "several", "animal", "studies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "known", "that", "the", "mechanical", "environment", "is", "important", "in", "fracture", "healing", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "PTH", "and", "mechanical", "loading", "has", "been", "suggested", "to", "have", "synergistic", "effects", "on", "intact", "bone", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "aim", "of", "the", "present", "study", "was", "to", "investigate", "whether", "the", "effect", "of", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "on", "fracture", "healing", "in", "rats", "was", "influenced", "by", "reduced", "mechanical", "loading", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "this", "purpose", "we", "used", "female", ",", "25", "-", "week", "-", "old", "ovariectomized", "rats", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Animals", "were", "subjected", "to", "closed", "midshaft", "fracture", "of", "the", "right", "tibia", "ten", "weeks", "after", "ovariectomy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Five", "days", "before", "fracture", ",", "half", "of", "the", "animals", "received", "Botulinum", "Toxin", "A", "-", "injections", "in", "the", "muscles", "of", "the", "fractured", "leg", "to", "induce", "muscle", "paralysis", "(", "unloaded", "group", ")", ",", "while", "the", "other", "half", "received", "saline", "injections", "(", "control", "group", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "the", "following", "eight", "weeks", ",", "half", "of", "the", "animals", "in", "each", "group", "received", "injections", "of", "hPTH", "(", "1", "-", "34", ")", "(", "20", "micro", "g", "/", "kg", "/", "day", ")", "and", "the", "other", "half", "received", "vehicle", "treatment", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fracture", "healing", "was", "assessed", "by", "radiology", ",", "DXA", ",", "histology", "and", "bone", "strength", "analysis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "that", "unloading", "reduced", "callus", "area", "significantly", ",", "while", "no", "effects", "of", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "on", "callus", "area", "were", "seen", "in", "neither", "normally", "nor", "unloaded", "animals", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "increased", "callus", "bone", "mineral", "density", "(", "BMD", ")", "and", "bone", "mineral", "content", "(", "BMC", ")", "significantly", ",", "while", "unloading", "decreased", "callus", "BMD", "and", "BMC", "significantly", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "-", "treatment", "increased", "bone", "volume", "of", "the", "callus", "in", "both", "unloaded", "and", "control", "animals", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "-", "treatment", "increased", "ultimate", "force", "of", "the", "fracture", "by", "63", "%", "in", "both", "control", "and", "unloaded", "animals", "and", "no", "interaction", "of", "the", "two", "interventions", "could", "be", "detected", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "was", "able", "to", "stimulate", "bone", "formation", "in", "normally", "loaded", "as", "well", "as", "unloaded", "intact", "bone", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "the", "study", "confirms", "the", "stimulatory", "effect", "of", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "on", "fracture", "healing", "and", "our", "data", "suggest", "that", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "is", "able", "to", "promote", "fracture", "healing", ",", "as", "well", "as", "intact", "bone", "formation", "during", "conditions", "of", "reduced", "mechanical", "loading", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Bottom", "-", "up", "Synthesis", "of", "Nanoscale", "Conjugation", "-", "Interrupted", "Frameworks", "and", "Their", "Electrical", "Properties", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Soluble", "covalent", "organic", "nanoframeworks", "up", "to", "generation", "2", ".", "5", "(", "G2", ".", "5", ")", "are", "synthesized", "with", "self", "-", "similar", "H", "-", "shaped", "conformations", "by", "using", "a", "bottom", "-", "up", "approach", "including", "iterative", "C", "-", "H", "bond", "functionalization", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "The", "electrical", "characteristics", "of", "nanoscale", "thin", "-", "film", "semiconductors", "of", "the", "conjugation", "-", "interrupted", "frameworks", "can", "be", "tuned", "by", "post", "-", "modification", "with", "diazonium", "salt", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Dual", "Growth", "Factor", "Delivery", "Using", "Biocompatible", "Core", "-", "Shell", "Microcapsules", "for", "Angiogenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "optimized", "electrodropping", "system", "produces", "homogeneous", "core", "-", "shell", "microcapsules", "(", "C", "-", "S", "MCs", ")", "by", "using", "poly", "(", "L", "-", "lactic", "-", "co", "-", "glycolic", "acid", ")", "(", "PLGA", ")", "and", "alginate", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fluorescence", "imaging", "clearly", "shows", "the", "C", "-", "S", "domain", "in", "the", "MC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "release", "control", ",", "the", "use", "of", "high", "-", "molecular", "-", "weight", "PLGA", "(", "HMW", "270", "000", ")", "restrains", "the", "initial", "burst", "release", "of", "protein", "compared", "to", "that", "of", "low", "-", "MW", "PLGA", "(", "LMW", "40", "000", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Layer", "-", "by", "-", "layer", "(", "LBL", ")", "assembly", "of", "chitosan", "and", "alginate", "on", "MCs", "is", "also", "useful", "in", "controlling", "the", "release", "profile", "of", "biomolecules", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "LBL", "(", "7", "-", "layer", ")", "treatment", "is", "effective", "in", "suppressing", "the", "initial", "burst", "release", "of", "protein", "compared", "to", "no", "LBL", "(", "0", "-", "layer", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "difference", "of", "cumulative", "albumin", "release", "between", "HMW", "(", "7", "-", "layer", "LBL", ")", "and", "LMW", "(", "0", "-", "layer", "LBL", ")", "PLGA", "is", "determined", "to", "be", "more", "than", "40", "%", "on", "day", "5", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "dual", "angiogenic", "growth", "factors", "(", "GFs", ")", ",", "such", "as", "platelet", "-", "derived", "GF", "(", "PDGF", ")", "and", "vascular", "endothelial", "GF", "(", "VEGF", ")", ",", "are", "encapsulated", "separately", "in", "the", "core", "and", "shell", "domains", ",", "respectively", ",", "the", "VEGF", "release", "rate", "is", "much", "greater", "than", "that", "of", "PDGF", ",", "and", "the", "difference", "of", "the", "cumulative", "release", "percentage", "between", "the", "two", "GFs", "is", "about", "30", "%", "on", "day", "7", "with", "LMW", "core", "PLGA", "and", "more", "than", "45", "%", "with", "HMW", "core", "PLGA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "As", "for", "the", "angiogenic", "potential", "of", "MC", "GFs", "with", "human", "umbilical", "vein", "endothelial", "cells", "(", "HUVECs", ")", ",", "the", "fluorescence", "signal", "of", "CD31", "+", "suggests", "that", "the", "angiogenic", "sprout", "of", "ECs", "is", "more", "active", "in", "MC", "-", "mediated", "GF", "delivery", "than", "conventional", "GF", "delivery", ",", "and", "this", "difference", "is", "significant", ",", "based", "on", "the", "number", "of", "capillary", "branches", "in", "the", "unit", "area", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "demonstrates", "that", "the", "fabrication", "of", "biocompatible", "C", "-", "S", "MCs", "is", "possible", ",", "and", "that", "the", "release", "control", "of", "biomolecules", "is", "adjustable", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "MC", "-", "mediated", "GFs", "remain", "in", "an", "active", "form", "and", "can", "upregulate", "the", "angiogenic", "activity", "of", "ECs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Surface", "Matters", ":", "Enhanced", "Bactericidal", "Property", "of", "Core", "-", "Shell", "Ag", "-", "Fe2", "O3", "Nanostructures", "to", "Their", "Heteromer", "Counterparts", "from", "One", "-", "Pot", "Synthesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "facile", "one", "-", "pot", "synthesis", "of", "Ag", "@", "Fe2", "O3", "core", "-", "shell", "and", "Ag", "-", "Fe2", "O3", "heteromer", "nanoparticles", "is", "developed", ",", "and", "the", "core", "-", "shell", "nanoparticles", "have", "shown", "superior", "antibacterial", "properties", "compared", "to", "their", "heteromer", "counterparts", "and", "plain", "Ag", "nanoparticles", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "The", "mechanism", "for", "the", "increased", "efficiency", "is", "proposed", "to", "be", "due", "to", "the", "enhanced", "Ag", "ion", "release", "from", "the", "iron", "oxide", "shell", "-", "protected", "pristine", "Ag", "surface", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Glassy", "Interfacial", "Dynamics", "of", "Ni", "Nanoparticles", ":", "Part", "II", "Discrete", "Breathers", "as", "an", "Explanation", "of", "Two", "-", "Level", "Energy", "Fluctuations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recent", "studies", "of", "the", "dynamics", "of", "diverse", "condensed", "amorphous", "materials", "have", "indicated", "significant", "heterogeneity", "in", "the", "local", "mobility", "and", "a", "progressive", "increase", "in", "collective", "particle", "motion", "upon", "cooling", "that", "takes", "the", "form", "of", "string", "-", "like", "particle", "rearrangements", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "a", "previous", "paper", "(", "Part", "I", ")", ",", "we", "examined", "the", "possibility", "that", "fluctuations", "in", "potential", "energy", "E", "and", "particle", "mobility", "mu", "associated", "with", "this", "'", "dynamic", "heterogeneity", "'", "might", "offer", "information", "about", "the", "scale", "of", "collective", "motion", "in", "glassy", "materials", "based", "on", "molecular", "dynamics", "simulations", "of", "the", "glassy", "interfacial", "region", "of", "Ni", "nanoparticles", "(", "NPs", ")", "at", "elevated", "temperatures", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "that", "the", "noise", "exponent", "associated", "with", "fluctuations", "in", "the", "Debye", "-", "Waller", "factor", ",", "a", "mobility", "related", "quantity", ",", "was", "directly", "proportional", "to", "the", "scale", "of", "collective", "motion", "L", "under", "a", "broad", "range", "of", "conditions", ",", "but", "the", "noise", "exponent", "associated", "with", "E", "(", "t", ")", "fluctuations", "was", "seemingly", "unrelated", "to", "L", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "work", ",", "we", "focus", "on", "this", "unanticipated", "difference", "between", "potential", "energy", "and", "mobility", "fluctuations", "by", "examining", "these", "quantities", "at", "an", "atomic", "scale", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "find", "that", "the", "string", "atoms", "exhibit", "a", "jump", "-", "like", "motion", "between", "two", "well", "-", "separated", "bands", "of", "energy", "states", "and", "the", "rate", "at", "which", "these", "jumps", "occur", "seems", "to", "be", "consistent", "with", "the", "phenomenology", "of", "the", "'", "slow", "-", "beta", "'", "relaxation", "process", "of", "glass", "-", "forming", "liquids", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Concurrently", "with", "these", "local", "E", "(", "t", ")", "jumps", ",", "we", "also", "find", "'", "quake", "-", "like", "'", "particle", "displacements", "having", "a", "power", "-", "law", "distribution", "in", "magnitude", "so", "that", "particle", "displacement", "fluctuations", "within", "the", "strings", "are", "strikingly", "different", "from", "local", "E", "(", "t", ")", "fluctuations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "analysis", "of", "these", "E", "(", "t", ")", "fluctuations", "suggests", "that", "we", "are", "dealing", "with", "'", "discrete", "breather", "'", "excitations", "in", "which", "large", "energy", "fluctuations", "develop", "in", "arrays", "of", "non", "-", "linear", "oscillators", "by", "virtue", "of", "large", "anharmonicity", "in", "the", "interparticle", "interactions", "and", "discreteness", "effects", "associated", "with", "particle", "packing", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "quantify", "string", "collective", "motions", "on", "a", "fast", "caging", "times", "scale", "(", "picoseconds", ")", "and", "explore", "the", "significance", "of", "these", "collective", "motions", "for", "understanding", "the", "Boson", "peak", "of", "glass", "-", "forming", "materials", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Tuning", "the", "Emission", "Properties", "of", "Fluorescent", "Ligands", "by", "Changing", "pH", ":", "The", "Unusual", "Case", "of", "an", "Acridine", "-", "Containing", "Polyamine", "Macrocycle", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Synthesis", "and", "characterization", "of", "a", "new", "macrocyclic", "compound", ",", "composed", "by", "a", "triethylentetraamine", "chain", "linking", "the", "4", "and", "5", "positions", "of", "an", "acridine", "moiety", ",", "are", "reported", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "molecule", ",", "devised", "as", "a", "fluorescent", "chemosensor", "for", "anions", ",", "has", "revealed", "an", "intriguing", "pH", "-", "dependent", "spectroscopic", "behavior", ",", "whose", "features", "are", "the", "specific", "object", "of", "this", "article", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ligand", "protonation", "in", "aqueous", "solution", "has", "been", "analyzed", "by", "means", "of", "potentiometric", ",", "(", "1", ")", "H", "NMR", ",", "UV", "-", "vis", ",", "and", "fluorescence", "emission", "measurements", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "molecule", "binds", "up", "to", "four", "protons", "in", "the", "pH", "range", "2", "-", "11", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Protonation", "takes", "place", "on", "the", "aliphatic", "tetraamine", "chain", ",", "while", "the", "acridine", "nitrogen", "does", "not", "participate", "to", "proton", "binding", "even", "at", "very", "low", "pH", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Differently", "from", "acridine", ",", "the", "UV", "-", "vis", "spectra", "are", "almost", "unaffected", "by", "the", "pH", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "On", "the", "opposite", ",", "the", "emission", "spectra", "are", "strongly", "pH", "-", "dependent", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "fact", ",", "at", "low", "pH", "values", ",", "the", "spectra", "show", "a", "blue", "-", "shifted", "emission", ",", "resembling", "that", "of", "unprotonated", "acridine", ",", "while", "at", "slightly", "acidic", "and", "alkaline", "pH", "the", "fluorescence", "features", "a", "red", "-", "shifted", "band", "similar", "to", "that", "of", "acridinium", "cation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "This", "unusual", "behavior", "occurs", "in", "the", "mono", "-", ",", "bi", "-", ",", "and", "triprotonated", "forms", "of", "the", "compound", "and", "is", "interpreted", "as", "due", "to", "an", "excited", "state", "proton", "transfer", "from", "an", "aliphatic", "ammonium", "group", "adjacent", "to", "the", "acridine", "moiety", "to", "the", "acridine", "nitrogen", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "In", "the", "fully", "protonated", "state", ",", "this", "process", "is", "prevented", "owing", "to", "unfavorable", "molecular", "arrangements", "mainly", "determined", "by", "electrostatic", "repulsions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "interpretation", "is", "supported", "by", "quantum", "mechanical", "calculations", "as", "well", "as", "molecular", "dynamics", "simulations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Self", "-", "Seeding", "in", "One", "Dimension", ":", "A", "Route", "to", "Uniform", "Fiber", "-", "like", "Nanostructures", "from", "Block", "Copolymers", "with", "a", "Crystallizable", "Core", "-", "Forming", "Block", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One", "-", "dimensional", "micelles", "formed", "by", "the", "self", "-", "assembly", "of", "crystalline", "-", "coil", "poly", "(", "ferrocenyldimethylsilane", ")", "(", "PFS", ")", "block", "copolymers", "exhibit", "self", "-", "seeding", "behavior", "when", "solutions", "of", "short", "micelle", "fragments", "are", "heated", "above", "a", "certain", "temperature", "and", "then", "cooled", "back", "to", "room", "temperature", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "process", ",", "a", "fraction", "of", "the", "fragments", "(", "the", "least", "crystalline", "fragments", ")", "dissolves", "at", "elevated", "temperature", ",", "but", "the", "dissolved", "polymer", "crystallizes", "onto", "the", "ends", "of", "the", "remaining", "seed", "fragments", "upon", "cooling", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "process", "yields", "longer", "nanostructures", "(", "up", "to", "1", "mu", "m", ")", "with", "uniform", "width", "(", "ca", ".", "15", "nm", ")", "and", "a", "narrow", "length", "distribution", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "paper", ",", "we", "describe", "a", "systematic", "investigation", "of", "factors", "that", "affect", "the", "self", "-", "seeding", "behavior", "of", "PFS", "block", "copolymer", "micelle", "fragments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "PI1000", "-", "PFS50", "(", "the", "subscripts", "refer", "to", "the", "number", "average", "degree", "of", "polymerization", ")", "in", "decane", ",", "these", "factors", "include", "the", "presence", "of", "a", "good", "solvent", "(", "THF", ")", "for", "PFS", "and", "the", "effect", "of", "annealing", "the", "fragments", "prior", "to", "the", "self", "-", "seeding", "experiments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "THF", "promoted", "the", "dissolution", "of", "the", "micelle", "fragments", ",", "while", "preannealing", "improved", "their", "stability", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "also", "extended", "our", "experiments", "to", "other", "PFS", "block", "copolymers", "with", "different", "corona", "-", "forming", "blocks", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "included", "PI637", "-", "PFS53", "in", "decane", ",", "PFS60", "-", "PDMS660", "in", "decane", "(", "PDMS", "=", "polydimethylsiloxane", ")", ",", "and", "PFS30", "-", "P2VP300", "in", "2", "-", "propanol", "(", "P2VP", "=", "poly", "(", "2", "-", "vinylpyridine", ")", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "The", "most", "remarkable", "result", "of", "these", "experiments", "is", "our", "finding", "that", "the", "corona", "-", "forming", "chain", "plays", "an", "important", "role", "in", "affecting", "how", "the", "PFS", "chains", "crystallize", "in", "the", "core", "of", "the", "micelles", "and", ",", "subsequently", ",", "the", "range", "of", "temperatures", "over", "which", "the", "micelle", "fragments", "dissolve", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "also", "show", "that", "self", "-", "seeding", "is", "a", "versatile", "approach", "to", "generate", "uniform", "PFS", "fiber", "-", "like", "nanostructures", ",", "and", "in", "principle", ",", "the", "method", "should", "be", "extendable", "to", "a", "wide", "variety", "of", "crystalline", "-", "coil", "block", "copolymers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Kinetics", "and", "Mechanism", "of", "the", "Tropospheric", "Oxidation", "of", "Vinyl", "Acetate", "Initiated", "by", "OH", "Radical", ":", "A", "Theoretical", "Study", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Vinyl", "acetate", "[", "VA", "(", "CH3COOC2H3", ")", "]", "is", "an", "important", "unsaturated", "and", "oxygenated", "volatile", "organic", "compound", "responsible", "for", "atmospheric", "pollution", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "work", ",", "possible", "reaction", "mechanisms", "for", "the", "degradation", "of", "OH", "-", "initiated", "atmospheric", "oxidation", "of", "VA", "are", "investigated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "potential", "energy", "surfaces", "(", "PESs", ")", "for", "the", "reaction", "of", "OH", "radical", "with", "VA", "in", "the", "presence", "of", "O2", "and", "NO", "have", "been", "studied", "using", "the", "M06", "-", "2X", "/", "6", "-", "311", "+", "+", "G", "(", "d", ",", "p", ")", "method", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "initial", "addition", "reactions", "of", "more", "and", "less", "substituted", "ethylenic", "C", "-", "atoms", "of", "VA", "are", "treated", "separately", ",", "followed", "by", "a", "conventional", "transition", "state", "theory", "(", "TST", ")", "calculation", "for", "reaction", "rates", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "direct", "H", "-", "abstraction", "mechanism", "and", "kinetics", "have", "also", "been", "studied", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "initial", "OH", "addition", "occurs", "through", "a", "prereactive", "complex", ",", "and", "the", "calculated", "rate", "constants", "in", "the", "temperature", "range", "250", "-", "350", "K", "for", "both", "the", "addition", "reactions", "are", "found", "to", "have", "negative", "temperature", "dependence", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "calculation", "indicates", "that", "the", "reaction", "proceeds", "predominantly", "via", "the", "addition", "of", "OH", "radical", "to", "the", "double", "bond", "rather", "than", "the", "direct", "abstraction", "of", "H", "-", "atoms", "in", "VA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IM1", "[", "CH3C", "(", "O", ")", "O", "(", "", ")", "CHCH2OH", "]", "and", "IM2", "[", "CH3C", "(", "O", ")", "OCH", "(", "OH", ")", "(", "", ")", "CH2", "]", ",", "the", "OH", "adduct", "complexes", "formed", "initially", ",", "react", "with", "ubiquitous", "O2", "followed", "by", "NO", "before", "their", "rearrangement", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "formation", "of", "the", "prereactive", "complex", "plays", "an", "important", "role", "in", "reaction", "mechanism", "and", "kinetics", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "calculated", "rate", "constant", ",", "k298K", "=", "1", ".", "61", "x", "10", "(", "-", "11", ")", "cm", "(", "3", ")", "molecule", "(", "-", "1", ")", "s", "(", "-", "1", ")", ",", "is", "well", "harmonized", "with", "the", "previous", "experimental", "data", ",", "k298K", "=", "(", "2", ".", "48", "+/-", "0", ".", "61", ")", "x", "10", "(", "-", "11", ")", "cm", "(", "3", ")", "molecule", "(", "-", "1", ")", "s", "(", "-", "1", ")", "(", "Blanco", "et", "al", ".", ")", "and", "k298K", "=", "(", "2", ".", "3", "+/-", "0", ".", "3", ")", "x", "10", "(", "-", "11", ")", "cm", "(", "3", ")", "molecule", "(", "-", "1", ")", "s", "(", "-", "1", ")", "(", "Picquet", "-", "Varrult", "et", "al", ".", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Additionally", ",", "consistent", "and", "reliable", "enthalpies", "of", "formation", "at", "298", ".", "15", "K", "(", "Delta", "fH", "degrees", "298", ".", "15", ")", "have", "been", "computed", "for", "all", "the", "species", "involved", "in", "the", "title", "reaction", "using", "the", "composite", "CBS", "-", "QB3", "method", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "theoretical", "results", "confirm", "that", "the", "major", "products", "are", "formic", "acetic", "anhydride", ",", "acetic", "acid", ",", "and", "formaldehyde", "in", "the", "OH", "-", "initiated", "oxidation", "of", "VA", "in", "the", "presence", "of", "O2", "and", "NO", ",", "which", "are", "in", "excellent", "agreement", "with", "the", "experimental", "findings", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Development", "of", "a", "Selective", "Peptide", "Macrocycle", "Inhibitor", "of", "Coagulation", "Factor", "XII", "toward", "the", "Generation", "of", "a", "Safe", "Antithrombotic", "Therapy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Inhibition", "of", "coagulation", "factor", "XII", "(", "FXII", ")", "activity", "represents", "an", "attractive", "approach", "for", "the", "treatment", "and", "prevention", "of", "thrombotic", "diseases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "few", "existing", "FXII", "inhibitors", "suffer", "from", "low", "selectivity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "phage", "display", "combined", "to", "rational", "design", ",", "we", "developed", "a", "potent", "inhibitor", "of", "FXII", "with", "more", "than", "100", "-", "fold", "selectivity", "over", "related", "proteases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "highly", "selective", "peptide", "macrocycle", "is", "a", "promising", "candidate", "for", "the", "control", "of", "FXII", "activity", "in", "antithrombotic", "therapy", "and", "a", "valuable", "tool", "in", "hematology", "research", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Structures", "of", "the", "Dehydrogenation", "Products", "of", "Methane", "Activation", "by", "5d", "Transition", "Metal", "Cations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "The", "activation", "of", "methane", "by", "gas", "-", "phase", "transition", "metal", "cations", "(", "M", "+", ")", "has", "been", "studied", "extensively", ",", "both", "experimentally", "and", "using", "density", "functional", "theory", "(", "DFT", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "this", "model", "completely", "fails", "to", "reproduce", "the", "experimentally", "observed", "high", "HD", "formation", "rates", "and", "the", "reaction", "orders", "under", "reaction", "conditions", "where", "subsurface", "hydrogen", "is", "present", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "To", "analyze", "this", "phenomenon", ",", "we", "develop", "two", "kinetic", "models", "that", "account", "for", "the", "role", "of", "subsurface", "hydrogen", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "First", ",", "we", "investigate", "the", "possibility", "of", "a", "change", "in", "the", "reaction", "mechanism", ",", "where", "recombination", "of", "one", "subsurface", "and", "one", "surface", "hydrogen", "species", "(", "known", "as", "a", "breakthrough", "mechanism", ")", "becomes", "dominant", "when", "subsurface", "hydrogen", "is", "present", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "Second", ",", "we", "investigate", "the", "possibility", "of", "the", "modified", "Langmuir", "-", "Hinshelwood", "mechanism", "with", "subsurface", "hydrogen", "lowering", "the", "activation", "energy", "for", "recombination", "of", "two", "hydrogen", "species", "adsorbed", "on", "the", "surface", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "show", "that", "the", "experimental", "reaction", "kinetics", "can", "be", "well", "described", "by", "both", "kinetic", "models", "based", "on", "non", "-", "Langmuir", "-", "Hinshelwood", "-", "type", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Accurate", "detection", "of", "differential", "RNA", "processing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Deep", "transcriptome", "sequencing", "(", "RNA", "-", "Seq", ")", "has", "become", "a", "vital", "tool", "for", "studying", "the", "state", "of", "cells", "in", "the", "context", "of", "varying", "environments", ",", "genotypes", "and", "other", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RNA", "-", "Seq", "profiling", "data", "enable", "identification", "of", "novel", "isoforms", ",", "quantification", "of", "known", "isoforms", "and", "detection", "of", "changes", "in", "transcriptional", "or", "RNA", "-", "processing", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Existing", "approaches", "to", "detect", "differential", "isoform", "abundance", "between", "samples", "either", "require", "a", "complete", "isoform", "annotation", "or", "fall", "short", "in", "providing", "statistically", "robust", "and", "calibrated", "significance", "estimates", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "propose", "a", "suite", "of", "statistical", "tests", "to", "address", "these", "open", "needs", ":", "a", "parametric", "test", "that", "uses", "known", "isoform", "annotations", "to", "detect", "changes", "in", "relative", "isoform", "abundance", "and", "a", "non", "-", "parametric", "test", "that", "detects", "differential", "read", "coverages", "and", "can", "be", "applied", "when", "isoform", "annotations", "are", "not", "available", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "methods", "account", "for", "the", "discrete", "nature", "of", "read", "counts", "and", "the", "inherent", "biological", "variability", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "demonstrate", "that", "these", "tests", "compare", "favorably", "to", "previous", "methods", ",", "both", "in", "terms", "of", "accuracy", "and", "statistical", "calibrations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "use", "these", "techniques", "to", "analyze", "RNA", "-", "Seq", "libraries", "from", "Arabidopsis", "thaliana", "and", "Drosophila", "melanogaster", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "identified", "differential", "RNA", "processing", "events", "were", "consistent", "with", "RT", "-", "qPCR", "measurements", "and", "previous", "studies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "proposed", "toolkit", "is", "available", "from", "http", ":", "/", "/", "bioweb", ".", "me", "/", "rdiff", "and", "enables", "in", "-", "depth", "analyses", "of", "transcriptomes", ",", "with", "or", "without", "available", "isoform", "annotation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "effect", "of", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "on", "fracture", "healing", "during", "different", "loading", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Parathyroid", "hormone", "(", "PTH", ")", "and", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "have", "been", "shown", "to", "promote", "bone", "healing", "in", "several", "animal", "studies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "known", "that", "the", "mechanical", "environment", "is", "important", "in", "fracture", "healing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "PTH", "and", "mechanical", "loading", "has", "been", "suggested", "to", "have", "synergistic", "effects", "on", "intact", "bone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "aim", "of", "the", "present", "study", "was", "to", "investigate", "whether", "the", "effect", "of", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "on", "fracture", "healing", "in", "rats", "was", "influenced", "by", "reduced", "mechanical", "loading", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "this", "purpose", "we", "used", "female", ",", "25", "-", "week", "-", "old", "ovariectomized", "rats", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Animals", "were", "subjected", "to", "closed", "midshaft", "fracture", "of", "the", "right", "tibia", "ten", "weeks", "after", "ovariectomy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Five", "days", "before", "fracture", ",", "half", "of", "the", "animals", "received", "Botulinum", "Toxin", "A", "-", "injections", "in", "the", "muscles", "of", "the", "fractured", "leg", "to", "induce", "muscle", "paralysis", "(", "unloaded", "group", ")", ",", "while", "the", "other", "half", "received", "saline", "injections", "(", "control", "group", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "the", "following", "eight", "weeks", ",", "half", "of", "the", "animals", "in", "each", "group", "received", "injections", "of", "hPTH", "(", "1", "-", "34", ")", "(", "20", "micro", "g", "/", "kg", "/", "day", ")", "and", "the", "other", "half", "received", "vehicle", "treatment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fracture", "healing", "was", "assessed", "by", "radiology", ",", "DXA", ",", "histology", "and", "bone", "strength", "analysis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "that", "unloading", "reduced", "callus", "area", "significantly", ",", "while", "no", "effects", "of", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "on", "callus", "area", "were", "seen", "in", "neither", "normally", "nor", "unloaded", "animals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "increased", "callus", "bone", "mineral", "density", "(", "BMD", ")", "and", "bone", "mineral", "content", "(", "BMC", ")", "significantly", ",", "while", "unloading", "decreased", "callus", "BMD", "and", "BMC", "significantly", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "-", "treatment", "increased", "bone", "volume", "of", "the", "callus", "in", "both", "unloaded", "and", "control", "animals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "-", "treatment", "increased", "ultimate", "force", "of", "the", "fracture", "by", "63", "%", "in", "both", "control", "and", "unloaded", "animals", "and", "no", "interaction", "of", "the", "two", "interventions", "could", "be", "detected", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "was", "able", "to", "stimulate", "bone", "formation", "in", "normally", "loaded", "as", "well", "as", "unloaded", "intact", "bone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "the", "study", "confirms", "the", "stimulatory", "effect", "of", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "on", "fracture", "healing", "and", "our", "data", "suggest", "that", "PTH", "(", "1", "-", "34", ")", "is", "able", "to", "promote", "fracture", "healing", ",", "as", "well", "as", "intact", "bone", "formation", "during", "conditions", "of", "reduced", "mechanical", "loading", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Bottom", "-", "up", "Synthesis", "of", "Nanoscale", "Conjugation", "-", "Interrupted", "Frameworks", "and", "Their", "Electrical", "Properties", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Soluble", "covalent", "organic", "nanoframeworks", "up", "to", "generation", "2", ".", "5", "(", "G2", ".", "5", ")", "are", "synthesized", "with", "self", "-", "similar", "H", "-", "shaped", "conformations", "by", "using", "a", "bottom", "-", "up", "approach", "including", "iterative", "C", "-", "H", "bond", "functionalization", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "The", "electrical", "characteristics", "of", "nanoscale", "thin", "-", "film", "semiconductors", "of", "the", "conjugation", "-", "interrupted", "frameworks", "can", "be", "tuned", "by", "post", "-", "modification", "with", "diazonium", "salt", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Dual", "Growth", "Factor", "Delivery", "Using", "Biocompatible", "Core", "-", "Shell", "Microcapsules", "for", "Angiogenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "optimized", "electrodropping", "system", "produces", "homogeneous", "core", "-", "shell", "microcapsules", "(", "C", "-", "S", "MCs", ")", "by", "using", "poly", "(", "L", "-", "lactic", "-", "co", "-", "glycolic", "acid", ")", "(", "PLGA", ")", "and", "alginate", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fluorescence", "imaging", "clearly", "shows", "the", "C", "-", "S", "domain", "in", "the", "MC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "release", "control", ",", "the", "use", "of", "high", "-", "molecular", "-", "weight", "PLGA", "(", "HMW", "270", "000", ")", "restrains", "the", "initial", "burst", "release", "of", "protein", "compared", "to", "that", "of", "low", "-", "MW", "PLGA", "(", "LMW", "40", "000", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Layer", "-", "by", "-", "layer", "(", "LBL", ")", "assembly", "of", "chitosan", "and", "alginate", "on", "MCs", "is", "also", "useful", "in", "controlling", "the", "release", "profile", "of", "biomolecules", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "LBL", "(", "7", "-", "layer", ")", "treatment", "is", "effective", "in", "suppressing", "the", "initial", "burst", "release", "of", "protein", "compared", "to", "no", "LBL", "(", "0", "-", "layer", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "difference", "of", "cumulative", "albumin", "release", "between", "HMW", "(", "7", "-", "layer", "LBL", ")", "and", "LMW", "(", "0", "-", "layer", "LBL", ")", "PLGA", "is", "determined", "to", "be", "more", "than", "40", "%", "on", "day", "5", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "dual", "angiogenic", "growth", "factors", "(", "GFs", ")", ",", "such", "as", "platelet", "-", "derived", "GF", "(", "PDGF", ")", "and", "vascular", "endothelial", "GF", "(", "VEGF", ")", ",", "are", "encapsulated", "separately", "in", "the", "core", "and", "shell", "domains", ",", "respectively", ",", "the", "VEGF", "release", "rate", "is", "much", "greater", "than", "that", "of", "PDGF", ",", "and", "the", "difference", "of", "the", "cumulative", "release", "percentage", "between", "the", "two", "GFs", "is", "about", "30", "%", "on", "day", "7", "with", "LMW", "core", "PLGA", "and", "more", "than", "45", "%", "with", "HMW", "core", "PLGA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "As", "for", "the", "angiogenic", "potential", "of", "MC", "GFs", "with", "human", "umbilical", "vein", "endothelial", "cells", "(", "HUVECs", ")", ",", "the", "fluorescence", "signal", "of", "CD31", "+", "suggests", "that", "the", "angiogenic", "sprout", "of", "ECs", "is", "more", "active", "in", "MC", "-", "mediated", "GF", "delivery", "than", "conventional", "GF", "delivery", ",", "and", "this", "difference", "is", "significant", ",", "based", "on", "the", "number", "of", "capillary", "branches", "in", "the", "unit", "area", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "demonstrates", "that", "the", "fabrication", "of", "biocompatible", "C", "-", "S", "MCs", "is", "possible", ",", "and", "that", "the", "release", "control", "of", "biomolecules", "is", "adjustable", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "MC", "-", "mediated", "GFs", "remain", "in", "an", "active", "form", "and", "can", "upregulate", "the", "angiogenic", "activity", "of", "ECs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Surface", "Matters", ":", "Enhanced", "Bactericidal", "Property", "of", "Core", "-", "Shell", "Ag", "-", "Fe2", "O3", "Nanostructures", "to", "Their", "Heteromer", "Counterparts", "from", "One", "-", "Pot", "Synthesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "facile", "one", "-", "pot", "synthesis", "of", "Ag", "@", "Fe2", "O3", "core", "-", "shell", "and", "Ag", "-", "Fe2", "O3", "heteromer", "nanoparticles", "is", "developed", ",", "and", "the", "core", "-", "shell", "nanoparticles", "have", "shown", "superior", "antibacterial", "properties", "compared", "to", "their", "heteromer", "counterparts", "and", "plain", "Ag", "nanoparticles", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "The", "mechanism", "for", "the", "increased", "efficiency", "is", "proposed", "to", "be", "due", "to", "the", "enhanced", "Ag", "ion", "release", "from", "the", "iron", "oxide", "shell", "-", "protected", "pristine", "Ag", "surface", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Glassy", "Interfacial", "Dynamics", "of", "Ni", "Nanoparticles", ":", "Part", "II", "Discrete", "Breathers", "as", "an", "Explanation", "of", "Two", "-", "Level", "Energy", "Fluctuations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recent", "studies", "of", "the", "dynamics", "of", "diverse", "condensed", "amorphous", "materials", "have", "indicated", "significant", "heterogeneity", "in", "the", "local", "mobility", "and", "a", "progressive", "increase", "in", "collective", "particle", "motion", "upon", "cooling", "that", "takes", "the", "form", "of", "string", "-", "like", "particle", "rearrangements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "a", "previous", "paper", "(", "Part", "I", ")", ",", "we", "examined", "the", "possibility", "that", "fluctuations", "in", "potential", "energy", "E", "and", "particle", "mobility", "mu", "associated", "with", "this", "'", "dynamic", "heterogeneity", "'", "might", "offer", "information", "about", "the", "scale", "of", "collective", "motion", "in", "glassy", "materials", "based", "on", "molecular", "dynamics", "simulations", "of", "the", "glassy", "interfacial", "region", "of", "Ni", "nanoparticles", "(", "NPs", ")", "at", "elevated", "temperatures", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "that", "the", "noise", "exponent", "associated", "with", "fluctuations", "in", "the", "Debye", "-", "Waller", "factor", ",", "a", "mobility", "related", "quantity", ",", "was", "directly", "proportional", "to", "the", "scale", "of", "collective", "motion", "L", "under", "a", "broad", "range", "of", "conditions", ",", "but", "the", "noise", "exponent", "associated", "with", "E", "(", "t", ")", "fluctuations", "was", "seemingly", "unrelated", "to", "L", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "work", ",", "we", "focus", "on", "this", "unanticipated", "difference", "between", "potential", "energy", "and", "mobility", "fluctuations", "by", "examining", "these", "quantities", "at", "an", "atomic", "scale", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "find", "that", "the", "string", "atoms", "exhibit", "a", "jump", "-", "like", "motion", "between", "two", "well", "-", "separated", "bands", "of", "energy", "states", "and", "the", "rate", "at", "which", "these", "jumps", "occur", "seems", "to", "be", "consistent", "with", "the", "phenomenology", "of", "the", "'", "slow", "-", "beta", "'", "relaxation", "process", "of", "glass", "-", "forming", "liquids", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Concurrently", "with", "these", "local", "E", "(", "t", ")", "jumps", ",", "we", "also", "find", "'", "quake", "-", "like", "'", "particle", "displacements", "having", "a", "power", "-", "law", "distribution", "in", "magnitude", "so", "that", "particle", "displacement", "fluctuations", "within", "the", "strings", "are", "strikingly", "different", "from", "local", "E", "(", "t", ")", "fluctuations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "analysis", "of", "these", "E", "(", "t", ")", "fluctuations", "suggests", "that", "we", "are", "dealing", "with", "'", "discrete", "breather", "'", "excitations", "in", "which", "large", "energy", "fluctuations", "develop", "in", "arrays", "of", "non", "-", "linear", "oscillators", "by", "virtue", "of", "large", "anharmonicity", "in", "the", "interparticle", "interactions", "and", "discreteness", "effects", "associated", "with", "particle", "packing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "quantify", "string", "collective", "motions", "on", "a", "fast", "caging", "times", "scale", "(", "picoseconds", ")", "and", "explore", "the", "significance", "of", "these", "collective", "motions", "for", "understanding", "the", "Boson", "peak", "of", "glass", "-", "forming", "materials", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Tuning", "the", "Emission", "Properties", "of", "Fluorescent", "Ligands", "by", "Changing", "pH", ":", "The", "Unusual", "Case", "of", "an", "Acridine", "-", "Containing", "Polyamine", "Macrocycle", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Synthesis", "and", "characterization", "of", "a", "new", "macrocyclic", "compound", ",", "composed", "by", "a", "triethylentetraamine", "chain", "linking", "the", "4", "and", "5", "positions", "of", "an", "acridine", "moiety", ",", "are", "reported", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "molecule", ",", "devised", "as", "a", "fluorescent", "chemosensor", "for", "anions", ",", "has", "revealed", "an", "intriguing", "pH", "-", "dependent", "spectroscopic", "behavior", ",", "whose", "features", "are", "the", "specific", "object", "of", "this", "article", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ligand", "protonation", "in", "aqueous", "solution", "has", "been", "analyzed", "by", "means", "of", "potentiometric", ",", "(", "1", ")", "H", "NMR", ",", "UV", "-", "vis", ",", "and", "fluorescence", "emission", "measurements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "molecule", "binds", "up", "to", "four", "protons", "in", "the", "pH", "range", "2", "-", "11", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Protonation", "takes", "place", "on", "the", "aliphatic", "tetraamine", "chain", ",", "while", "the", "acridine", "nitrogen", "does", "not", "participate", "to", "proton", "binding", "even", "at", "very", "low", "pH", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Differently", "from", "acridine", ",", "the", "UV", "-", "vis", "spectra", "are", "almost", "unaffected", "by", "the", "pH", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "On", "the", "opposite", ",", "the", "emission", "spectra", "are", "strongly", "pH", "-", "dependent", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "fact", ",", "at", "low", "pH", "values", ",", "the", "spectra", "show", "a", "blue", "-", "shifted", "emission", ",", "resembling", "that", "of", "unprotonated", "acridine", ",", "while", "at", "slightly", "acidic", "and", "alkaline", "pH", "the", "fluorescence", "features", "a", "red", "-", "shifted", "band", "similar", "to", "that", "of", "acridinium", "cation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "This", "unusual", "behavior", "occurs", "in", "the", "mono", "-", ",", "bi", "-", ",", "and", "triprotonated", "forms", "of", "the", "compound", "and", "is", "interpreted", "as", "due", "to", "an", "excited", "state", "proton", "transfer", "from", "an", "aliphatic", "ammonium", "group", "adjacent", "to", "the", "acridine", "moiety", "to", "the", "acridine", "nitrogen", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "In", "the", "fully", "protonated", "state", ",", "this", "process", "is", "prevented", "owing", "to", "unfavorable", "molecular", "arrangements", "mainly", "determined", "by", "electrostatic", "repulsions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "interpretation", "is", "supported", "by", "quantum", "mechanical", "calculations", "as", "well", "as", "molecular", "dynamics", "simulations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Self", "-", "Seeding", "in", "One", "Dimension", ":", "A", "Route", "to", "Uniform", "Fiber", "-", "like", "Nanostructures", "from", "Block", "Copolymers", "with", "a", "Crystallizable", "Core", "-", "Forming", "Block", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "-", "dimensional", "micelles", "formed", "by", "the", "self", "-", "assembly", "of", "crystalline", "-", "coil", "poly", "(", "ferrocenyldimethylsilane", ")", "(", "PFS", ")", "block", "copolymers", "exhibit", "self", "-", "seeding", "behavior", "when", "solutions", "of", "short", "micelle", "fragments", "are", "heated", "above", "a", "certain", "temperature", "and", "then", "cooled", "back", "to", "room", "temperature", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "process", ",", "a", "fraction", "of", "the", "fragments", "(", "the", "least", "crystalline", "fragments", ")", "dissolves", "at", "elevated", "temperature", ",", "but", "the", "dissolved", "polymer", "crystallizes", "onto", "the", "ends", "of", "the", "remaining", "seed", "fragments", "upon", "cooling", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "process", "yields", "longer", "nanostructures", "(", "up", "to", "1", "mu", "m", ")", "with", "uniform", "width", "(", "ca", ".", "15", "nm", ")", "and", "a", "narrow", "length", "distribution", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "paper", ",", "we", "describe", "a", "systematic", "investigation", "of", "factors", "that", "affect", "the", "self", "-", "seeding", "behavior", "of", "PFS", "block", "copolymer", "micelle", "fragments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "PI1000", "-", "PFS50", "(", "the", "subscripts", "refer", "to", "the", "number", "average", "degree", "of", "polymerization", ")", "in", "decane", ",", "these", "factors", "include", "the", "presence", "of", "a", "good", "solvent", "(", "THF", ")", "for", "PFS", "and", "the", "effect", "of", "annealing", "the", "fragments", "prior", "to", "the", "self", "-", "seeding", "experiments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "THF", "promoted", "the", "dissolution", "of", "the", "micelle", "fragments", ",", "while", "preannealing", "improved", "their", "stability", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "extended", "our", "experiments", "to", "other", "PFS", "block", "copolymers", "with", "different", "corona", "-", "forming", "blocks", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "included", "PI637", "-", "PFS53", "in", "decane", ",", "PFS60", "-", "PDMS660", "in", "decane", "(", "PDMS", "=", "polydimethylsiloxane", ")", ",", "and", "PFS30", "-", "P2VP300", "in", "2", "-", "propanol", "(", "P2VP", "=", "poly", "(", "2", "-", "vinylpyridine", ")", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "The", "most", "remarkable", "result", "of", "these", "experiments", "is", "our", "finding", "that", "the", "corona", "-", "forming", "chain", "plays", "an", "important", "role", "in", "affecting", "how", "the", "PFS", "chains", "crystallize", "in", "the", "core", "of", "the", "micelles", "and", ",", "subsequently", ",", "the", "range", "of", "temperatures", "over", "which", "the", "micelle", "fragments", "dissolve", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "also", "show", "that", "self", "-", "seeding", "is", "a", "versatile", "approach", "to", "generate", "uniform", "PFS", "fiber", "-", "like", "nanostructures", ",", "and", "in", "principle", ",", "the", "method", "should", "be", "extendable", "to", "a", "wide", "variety", "of", "crystalline", "-", "coil", "block", "copolymers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Kinetics", "and", "Mechanism", "of", "the", "Tropospheric", "Oxidation", "of", "Vinyl", "Acetate", "Initiated", "by", "OH", "Radical", ":", "A", "Theoretical", "Study", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Vinyl", "acetate", "[", "VA", "(", "CH3COOC2H3", ")", "]", "is", "an", "important", "unsaturated", "and", "oxygenated", "volatile", "organic", "compound", "responsible", "for", "atmospheric", "pollution", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "work", ",", "possible", "reaction", "mechanisms", "for", "the", "degradation", "of", "OH", "-", "initiated", "atmospheric", "oxidation", "of", "VA", "are", "investigated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "potential", "energy", "surfaces", "(", "PESs", ")", "for", "the", "reaction", "of", "OH", "radical", "with", "VA", "in", "the", "presence", "of", "O2", "and", "NO", "have", "been", "studied", "using", "the", "M06", "-", "2X", "/", "6", "-", "311", "+", "+", "G", "(", "d", ",", "p", ")", "method", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "initial", "addition", "reactions", "of", "more", "and", "less", "substituted", "ethylenic", "C", "-", "atoms", "of", "VA", "are", "treated", "separately", ",", "followed", "by", "a", "conventional", "transition", "state", "theory", "(", "TST", ")", "calculation", "for", "reaction", "rates", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "direct", "H", "-", "abstraction", "mechanism", "and", "kinetics", "have", "also", "been", "studied", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "initial", "OH", "addition", "occurs", "through", "a", "prereactive", "complex", ",", "and", "the", "calculated", "rate", "constants", "in", "the", "temperature", "range", "250", "-", "350", "K", "for", "both", "the", "addition", "reactions", "are", "found", "to", "have", "negative", "temperature", "dependence", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "calculation", "indicates", "that", "the", "reaction", "proceeds", "predominantly", "via", "the", "addition", "of", "OH", "radical", "to", "the", "double", "bond", "rather", "than", "the", "direct", "abstraction", "of", "H", "-", "atoms", "in", "VA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IM1", "[", "CH3C", "(", "O", ")", "O", "(", "*", ")", "CHCH2OH", "]", "and", "IM2", "[", "CH3C", "(", "O", ")", "OCH", "(", "OH", ")", "(", "*", ")", "CH2", "]", ",", "the", "OH", "adduct", "complexes", "formed", "initially", ",", "react", "with", "ubiquitous", "O2", "followed", "by", "NO", "before", "their", "rearrangement", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "formation", "of", "the", "prereactive", "complex", "plays", "an", "important", "role", "in", "reaction", "mechanism", "and", "kinetics", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "calculated", "rate", "constant", ",", "k298K", "=", "1", ".", "61", "x", "10", "(", "-", "11", ")", "cm", "(", "3", ")", "molecule", "(", "-", "1", ")", "s", "(", "-", "1", ")", ",", "is", "well", "harmonized", "with", "the", "previous", "experimental", "data", ",", "k298K", "=", "(", "2", ".", "48", "+/-", "0", ".", "61", ")", "x", "10", "(", "-", "11", ")", "cm", "(", "3", ")", "molecule", "(", "-", "1", ")", "s", "(", "-", "1", ")", "(", "Blanco", "et", "al", ".", ")", "and", "k298K", "=", "(", "2", ".", "3", "+/-", "0", ".", "3", ")", "x", "10", "(", "-", "11", ")", "cm", "(", "3", ")", "molecule", "(", "-", "1", ")", "s", "(", "-", "1", ")", "(", "Picquet", "-", "Varrult", "et", "al", ".", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Additionally", ",", "consistent", "and", "reliable", "enthalpies", "of", "formation", "at", "298", ".", "15", "K", "(", "Delta", "fH", "degrees", "298", ".", "15", ")", "have", "been", "computed", "for", "all", "the", "species", "involved", "in", "the", "title", "reaction", "using", "the", "composite", "CBS", "-", "QB3", "method", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "theoretical", "results", "confirm", "that", "the", "major", "products", "are", "formic", "acetic", "anhydride", ",", "acetic", "acid", ",", "and", "formaldehyde", "in", "the", "OH", "-", "initiated", "oxidation", "of", "VA", "in", "the", "presence", "of", "O2", "and", "NO", ",", "which", "are", "in", "excellent", "agreement", "with", "the", "experimental", "findings", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Development", "of", "a", "Selective", "Peptide", "Macrocycle", "Inhibitor", "of", "Coagulation", "Factor", "XII", "toward", "the", "Generation", "of", "a", "Safe", "Antithrombotic", "Therapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Inhibition", "of", "coagulation", "factor", "XII", "(", "FXII", ")", "activity", "represents", "an", "attractive", "approach", "for", "the", "treatment", "and", "prevention", "of", "thrombotic", "diseases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "few", "existing", "FXII", "inhibitors", "suffer", "from", "low", "selectivity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "phage", "display", "combined", "to", "rational", "design", ",", "we", "developed", "a", "potent", "inhibitor", "of", "FXII", "with", "more", "than", "100", "-", "fold", "selectivity", "over", "related", "proteases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "highly", "selective", "peptide", "macrocycle", "is", "a", "promising", "candidate", "for", "the", "control", "of", "FXII", "activity", "in", "antithrombotic", "therapy", "and", "a", "valuable", "tool", "in", "hematology", "research", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Structures", "of", "the", "Dehydrogenation", "Products", "of", "Methane", "Activation", "by", "5d", "Transition", "Metal", "Cations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "The", "activation", "of", "methane", "by", "gas", "-", "phase", "transition", "metal", "cations", "(", "M", "+", ")", "has", "been", "studied", "extensively", ",", "both", "experimentally", "and", "using", "density", "functional", "theory", "(", "DFT", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]