Ribozyme
stringlengths 2
37
| Organism
stringclasses 56
values | Variable_reactant
stringlengths 2
100
⌀ | Kobs
stringlengths 1
19
⌀ | Unit_Kobs
stringclasses 11
values | km
stringclasses 287
values | Unit_Km
stringclasses 11
values | kcat
stringclasses 262
values | Unit_Kcat
stringclasses 9
values | km_kcat
stringlengths 1
16
⌀ | Unit_Kcat/Km
stringclasses 30
values | Kcleav
stringclasses 52
values | Unit_Kcleav
stringclasses 3
values | Commentary[Temp]
stringclasses 29
values | Commentary[pH]
stringclasses 34
values | Commentary[Mutant]
stringlengths 2
89
⌀ | Commentary[Others]
stringlengths 3
94
⌀ | pubmed_id
stringclasses 164
values | Source
stringclasses 4
values |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
VS
|
Neurospora
|
A621 R_P
|
0.0023
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
G638I
|
10 mM MgCl2, 20 µM Cd2+ , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
oxo
|
0.0336
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
A756(3cP)
|
10 mM MgCl2 , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
A621 S_P
|
<0.0001
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
A756(3cP)
|
10 mM MgCl2 , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
A621 R_P
|
0.0041
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
A756(3cP)
|
10 mM MgCl2 , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
oxo
|
0.035
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
A756(3cP)
|
10 mM MgCl2, 20 µM Cd2+ , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
A621 S_P
|
0.0016
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
A756(3cP)
|
10 mM MgCl2, 20 µM Cd2+ , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
A621 R_P
|
0.0033
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
A756(3cP)
|
10 mM MgCl2, 20 µM Cd2+ , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
oxo
|
0.0023
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
G638I and A756(3cP)
|
10 mM MgCl2 , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
A621 S_P
|
<0.0001
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
G638I and A756(3cP)
|
10 mM MgCl2 , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
A621 R_P
|
0.014
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
G638I and A756(3cP)
|
10 mM MgCl2 , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
oxo
|
0.0018
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
G638I and A756(3cP)
|
10 mM MgCl2, 20 µM Cd2+ , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
A621 S_P
|
0.0009
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
G638I and A756(3cP)
|
10 mM MgCl2, 20 µM Cd2+ , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
VS
|
Neurospora
|
A621 R_P
|
0.011
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8
|
G638I and A756(3cP)
|
10 mM MgCl2, 20 µM Cd2+ , 25mM KCl, 2mM spermidine
|
31959957
|
Table
|
glmS
|
NA
|
GlcN6P
|
6.4 × 10^-2
|
s^-1
|
2
|
mM
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.8
|
WT
|
10 mM GlcN6P
|
32245964
|
Text
|
glmS
|
NA
|
GlcN6P
|
1.5 × 10^-1
|
s^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.8
|
NA
|
NA
|
32245964
|
Text
|
Hatchet
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
4
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
7.5
|
WT
|
NA
|
32944725
|
Text
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
Chimeric substrate
|
0.043
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
WT
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
RNA substrate
|
0.022
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
WT
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
Chimeric substrate
|
0.0054
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(S)8
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
Chimeric substrate
|
0.0117
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(R)8
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
Chimeric substrate
|
0.0044
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(S)11
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
Chimeric substrate
|
0.0011
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(R)11
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
Chimeric substrate
|
0.0065
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(S)8-C(S)11
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
RNA substrate
|
0.022
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(R)8
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
RNA substrate
|
0.0158
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(S)8-C(S)11
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
Chimeric substrate
|
0.014
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
EB
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
RNA substrate
|
0.0131
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
EB
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
Chimeric substrate
|
0.023
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(R)8 EB
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
RNA substrate
|
0.017
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(R)8 EB
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
Chimeric substrate
|
0.002
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(S)8-C(S)11 EB
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
8-17 DNAzyme
|
NA
|
RNA substrate
|
0.0008
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7
|
C(S)8-C(S)11 EB
|
50 mM MgCl2
|
33142406
|
Table
|
Pistol
|
Paenibacillus polymyxa
|
Mg^2+
|
0.3
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
7.5
|
WT
|
1 mM MgCl2
|
33622172
|
Text
|
Pistol
|
Paenibacillus polymyxa
|
Mg^2+
|
>6
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
7.5-9.0
|
WT
|
>50 mM MgCl2
|
33622172
|
Text
|
Pistol
|
Paenibacillus polymyxa
|
Mg^2+
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
1.35
|
min^-1
|
NA
|
7.5
|
WT
|
5 mM MgCl2
|
33622172
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Mg2+
|
0.0219
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
8
|
WT
|
6 mM Mg2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Mg2+
|
0.0092
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
6 mM Mg2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Mg2+
|
0.0047
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
8
|
WT
|
2 mM Mg2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Mn2+
|
0.0415
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
8
|
WT
|
6 mM Mn2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Ca2+
|
0.0133
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
8
|
WT
|
6 mM Ca2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Li+
|
0.0046
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
9
|
WT
|
4 M LiCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Mg2+
|
0.1791
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
9
|
WT
|
6 mM Mg2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Chimpanzee homologs
|
Mg2+
|
0.012
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
8
|
WT
|
6 mM Mg2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Bonobo homologs
|
Mg2+
|
0.0127
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
8
|
WT
|
6 mM Mg2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Mg2+
|
0.0169
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
8
|
rs72720496
|
6 mM Mg2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Mg2+
|
0.0025
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
8
|
83-nt minimal
|
6 mM Mg2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
hovlinc
|
Homo sapiens
|
Mg2+
|
0.0171
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
9
|
83-nt minimal
|
6 mM Mg2+, 150 mM KCl
|
33753927
|
Text
|
TNA enzyme T8-6
|
NA
|
2′,3′-diol and a 5′-triphosphate group
|
1.1 × 10^-2
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
9
|
NA
|
40 mM Mg^2+
|
34028252
|
Text
|
TNA enzyme T8-7
|
NA
|
2′,3′-diol and a 5′-triphosphate group
|
2.1 × 10^-3
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
NA
|
40 mM Mg^2+
|
34028252
|
Text
|
TNA enzyme T8-8
|
NA
|
2′,3′-diol and a 5′-triphosphate group
|
0.087
|
h^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
NA
|
5 mM Mn^2+
|
34028252
|
Text
|
TNA enzyme T8-9
|
NA
|
2′,3′-diol and a 5′-triphosphate group
|
0.014
|
h^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
NA
|
1.25 mM Zn^2+
|
34028252
|
Text
|
Class II RNA ligase ribozyme a4-10t
|
NA
|
NA
|
1.1 × 10^-2
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
7.4
|
NA
|
60 mM Mg^2+
|
34028252
|
Text
|
10-18
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
1.5-5.2× 10^-2
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
8.5
|
NA
|
25 mM Mg^2+
|
34028252
|
Text
|
E100 RNA ligase ribozyme
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
> 20
|
min^-1
|
1 × 10^8
|
M−1·min−1
|
NA
|
NA
|
NA
|
8.5
|
NA
|
15 mM Mg^2+
|
34028252
|
Text
|
9DB1
|
NA
|
NA
|
4 × 10^-2
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
9
|
NA
|
40 mM Mg^2+
|
34028252
|
Text
|
9DB2
|
NA
|
NA
|
3 × 10^-3
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
7.5
|
NA
|
40 mM Mg^2+
|
34028252
|
Text
|
F2R17_1
|
NA
|
NA
|
2 × 10^-4
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
50 mM Mg^2+ 1mM Zn^2+
|
34028252
|
Text
|
H.c.LSU group II intron
|
Histoplasma capsulatum
|
NA
|
0.023
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
10 mM MgCl2, 150 mM NH4Cl, from the beacon assay
|
35438748
|
Text
|
H.c.LSU group II intron
|
Histoplasma capsulatum
|
NA
|
0.036
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
10 mM MgCl2, 150 mM NH4Cl, from the radioanalytical assay
|
35438748
|
Text
|
H.c.LSU group II intron
|
Histoplasma capsulatum
|
NA
|
0.043
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
10 mM MgCl2, 150 mM NH4Cl, 5% DMSO
|
35438748
|
Text
|
H.c.LSU group II intron
|
Histoplasma capsulatum
|
NA
|
0.048
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
10 mM MgCl2, 150 mM NH4Cl
|
35438748
|
Text
|
glmS ribozyme
|
Clostridium difficile
|
glmS mRNA
|
1.206
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
200 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Clostridium difficile
|
glmS mRNA
|
0.786
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
20 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Clostridium difficile
|
glmS mRNA
|
0.147
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
2 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Clostridium difficile
|
glmS mRNA
|
0.198
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
0.2 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Clostridium difficile
|
glmS mRNA
|
0.03
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
200 µM GlcN, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Listeria monocytogenes
|
glmS mRNA
|
0.548
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
40 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Listeria monocytogenes
|
glmS mRNA
|
0.259
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
4 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Listeria monocytogenes
|
glmS mRNA
|
0.039
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
0.4 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Listeria monocytogenes
|
glmS mRNA
|
0.048
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.5
|
WT
|
1500 µM GlcN, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Listeria monocytogenes
|
glmS mRNA
|
1.868
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
6°C
|
7.5
|
WT
|
40 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Listeria monocytogenes
|
glmS mRNA
|
0.295
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
6°C
|
7.5
|
WT
|
4 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
glmS ribozyme
|
Listeria monocytogenes
|
glmS mRNA
|
0.057
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
6°C
|
7.5
|
WT
|
0.4 µM GlcN6P, 10 mM MgCl2
|
36194523
|
Table
|
M1-S-A
|
NA
|
HBV substrate s37
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
0.35± 0.09
|
µM^-1·min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
7.5
|
NA
|
50 mM Tris, 100 mM NH4Cl, 100 mM MgCl2
|
36985227
|
Table
|
M1-S-I
|
NA
|
HBV substrate s37
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
<5 × 10^-5
|
µM^-1·min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
7.5
|
NA
|
50 mM Tris, 100 mM NH4Cl, 100 mM MgCl2
|
36985227
|
Table
|
M1-P
|
NA
|
HBV substrate s37
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
<5 × 10^-5
|
µM^-1·min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
7.5
|
NA
|
50 mM Tris, 100 mM NH4Cl, 100 mM MgCl2
|
36985227
|
Table
|
F-RTA
|
Escherichia coli
|
rta-39
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
0.27
|
µM^-1·min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
WT
|
100 mM MgCl2, 100 mM NH4Cl
|
37110852
|
Table
|
C-RTA
|
Escherichia coli
|
rta-39
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
<5 × 10^-6
|
µM^-1·min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
A347C348→C347U348, C353C354C355G356→G353G354A355U356
|
100 mM MgCl2, 100 mM NH4Cl
|
37110852
|
Table
|
M1 RNA
|
Escherichia coli
|
rta-39
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
<5 × 10^-6
|
µM^-1·min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
M1-TK
|
100 mM MgCl2, 100 mM NH4Cl
|
37110852
|
Table
|
II-R1-3
|
NA
|
L-phenylalanine
|
5.6 × 10^-2
|
min^-1
|
4.8
|
µM
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.05
|
NA
|
0.05 M HEPES, 0.1 M NaCl, 0.04 M MgCl2, 1 mM ZnCl2
|
37207331
|
Text
|
II-R1-3
|
NA
|
NA
|
1.1 × 10^-2
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.05
|
NA
|
No ligand, 0.05 M HEPES, 0.1 M NaCl, 0.04 M MgCl2, 1 mM ZnCl2
|
37207331
|
Text
|
II-R1-7
|
NA
|
L-phenylalanine
|
3.4 × 10^-2
|
min^-1
|
19.3
|
µM
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.05
|
NA
|
0.05 M HEPES, 0.1 M NaCl, 0.04 M MgCl2, 1 mM ZnCl2
|
37207331
|
Text
|
II-R1-7
|
NA
|
NA
|
2.0 × 10^-3
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.05
|
NA
|
No ligand, 0.05 M HEPES, 0.1 M NaCl, 0.04 M MgCl2, 1 mM ZnCl2
|
37207331
|
Text
|
II-R1-1
|
NA
|
L-phenylalanine
|
3.6 × 10^-2
|
min^-1
|
20.3
|
µM
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.05
|
NA
|
0.05 M HEPES, 0.1 M NaCl, 0.04 M MgCl2, 1 mM ZnCl2
|
37207331
|
Text
|
II-R1-1
|
NA
|
NA
|
1.6 × 10^-6
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
37°C
|
7.05
|
NA
|
No ligand, 0.05 M HEPES, 0.1 M NaCl, 0.04 M MgCl2, 1 mM ZnCl2
|
37207331
|
Text
|
Ribozyme 51
|
NA
|
Yb^3+ fast
|
1.1
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
22°C
|
6.8
|
WT
|
500 mM KCl, 5 mM MgCl2, 3.3 mM cTmp
|
37326001
|
Text
|
Ribozyme 51
|
NA
|
Yb^3+ slow
|
0.1
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
22°C
|
6.8
|
WT
|
500 mM KCl, 5 mM MgCl2, 3.3 mM cTmp
|
37326001
|
Text
|
Ribozyme 51
|
NA
|
Yb^3+
|
0.65
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
22°C
|
7.3
|
WT
|
150 mM NaCl, 10 mM cTmp,1mM Yb3+
|
37326001
|
Text
|
11-5 DNAzyme
|
NA
|
5'-TTCTAGTTGrAGAGAGTCACGGTCACG-3'
|
0.086
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
Room temperature
|
6.8
|
WT
|
500 µM Mn^2+, 50 mM Bis-Tris, 300 mM NaCl
|
37388692
|
Text
|
11-5 DNAzyme
|
NA
|
5'-TTCTAGTTGrAGAGAGTCACGGTCACG-3'
|
0.058
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
Room temperature
|
6.8
|
WT
|
400 µM Mn^2+, 50 mM Bis-Tris, 300 mM NaCl
|
37388692
|
Figure
|
11-5 DNAzyme
|
NA
|
5'-TTCTAGTTGrAGAGAGTCACGGTCACG-3'
|
0.038
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
Room temperature
|
6.8
|
WT
|
300 µM Mn^2+, 50 mM Bis-Tris, 300 mM NaCl
|
37388692
|
Figure
|
11-5 DNAzyme
|
NA
|
5'-TTCTAGTTGrAGAGAGTCACGGTCACG-3'
|
0.016
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
Room temperature
|
6.8
|
WT
|
200 µM Mn^2+, 50 mM Bis-Tris, 300 mM NaCl
|
37388692
|
Figure
|
11-5 DNAzyme
|
NA
|
5'-TTCTAGTTGrAGAGAGTCACGGTCACG-3'
|
0.009
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
Room temperature
|
6.8
|
WT
|
100 µM Mn^2+, 50 mM Bis-Tris, 300 mM NaCl
|
37388692
|
Figure
|
11-5 DNAzyme
|
NA
|
5'-TTCTAGTTGrAGAGAGTCACGGTCACG-3'
|
0.007
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
Room temperature
|
6.8
|
WT
|
50 µM Mn^2+, 50 mM Bis-Tris, 300 mM NaCl
|
37388692
|
Figure
|
11-5 DNAzyme
|
NA
|
5'-TTCTAGTTGrAGAGAGTCACGGTCACG-3'
|
0.005
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
Room temperature
|
6.8
|
WT
|
10 µM Mn^2+, 50 mM Bis-Tris, 300 mM NaCl
|
37388692
|
Figure
|
DR11-4T12
|
NA
|
DMSO
|
2.5 × 10^-2
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
23°C
|
7.5
|
NA
|
35% DMSO, 300 mM NH4+, 30 mM Mg2+
|
37648674
|
Text
|
DR11-4T12
|
NA
|
DMSO
|
1.2 × 10^-5
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
23°C
|
7.5
|
NA
|
0% DMSO, 300 mM NH4+, 30 mM Mg2+
|
37648674
|
Text
|
DR11-4
|
NA
|
DMSO
|
3.8 × 10^-4
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
23°C
|
7.5
|
NA
|
35% DMSO, 300 mM NH4+, 30 mM Mg2+
|
37648674
|
Text
|
DR11-4
|
NA
|
DMSO
|
1.7 × 10^-6
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
23°C
|
7.5
|
NA
|
0% DMSO, 300 mM NH4+, 30 mM Mg2+
|
37648674
|
Text
|
DR11-4T12
|
NA
|
NH4+
|
2.9 × 10^-2
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
23°C
|
7.5
|
NA
|
35% DMSO, 300 mM NH4+, 30 mM Mg2+
|
37648674
|
Text
|
DR11-4T12
|
NA
|
NH4+
|
9.3 × 10^-3
|
min^-1
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
NA
|
23°C
|
7.5
|
NA
|
35% DMSO, 0 mM NH4+, 30 mM Mg2+
|
37648674
|
Text
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.