Subset (3)

corpus · 171k rows

Split (1)

test · 171k rows

_id stringlengths 8 8	text stringlengths 0 5.05k	title stringlengths 0 900
dbikkq0u	عفونت های مزمن نشان دهنده نبرد مداوم بین سیستم ایمنی میزبان و تکثیر پاتوژن است. بسیاری از انگل های تک یاخته ای مرحله چرخه حیات کیست را ایجاد کرده اند که محافظت بیشتری از تخریب محیطی و همچنین مکانیسم های میزبان درون زا برای حمله فراهم می کند. در مورد توکسوپلاسما گوندی، این کیست ها عمدتاً در مغز محافظت شده از سیستم ایمنی یافت می شوند که پاکسازی انگل را دشوارتر کرده و منجر به عفونت مادام العمر می شود. در حال حاضر، اطلاعات کمی در مورد ماهیت پاسخ ایمنی تحریک شده توسط حضور این کیست ها یا نحوه انتشار آنها وجود دارد. در اینجا ما یک مکانیسم جدید وابسته به کیتیناز برای کنترل کیست در مغز آلوده ایجاد می کنیم. با وجود پاسخ ایمنی غالب Th1 در طول عفونت توکسوپلاسما، جمعیتی از ماکروفاژهای فعال جایگزین (AAMØ) در CNS آلوده وجود دارد. این سلول ها قادر به لیز کیست از طریق تولید AMCase هستند که توسط تصویربرداری زنده آشکار می شود و این کیتیناز برای ایمنی محافظتی در CNS ضروری است. این داده‌ها فعالیت کیتیناز در مغز را در پاسخ به یک پاتوژن تک یاخته نشان می‌دهند و مکانیسم جدیدی را برای تسهیل پاکسازی کیست در طول عفونت‌های مزمن ارائه می‌دهند.	کنترل وابسته به کیتیناز بار کیست تک یاخته ای در مغز
pci4rhkn	این مطالعه یک سیستم جدید تشخیص به کمک کامپیوتر (CAD) را برای تشخیص خودکار و کمی کردن دقیق کدورت‌های انشعاب ندولری غیرطبیعی در توموگرافی کامپیوتری قفسه سینه (CT) ارائه می‌کند که توسط ادبیات رادیولوژی کدورت درخت در جوانه (TIB) نامیده می‌شود. سیستم CAD توسعه‌یافته در این مطالعه مبتنی بر 1) محلی‌سازی سریع الگوهای تصویربرداری نامزد با استفاده از اطلاعات مقیاس محلی تصاویر، و 2) روش استخراج ویژگی ثابت موبیوس بر اساس شکل محلی و ویژگی‌های بافت الگوهای TIB است. برای محلی‌سازی سریع الگوهای تصویربرداری کاندید، از فیلتر در مقیاس توپ استفاده می‌کنیم و بر اساس مشاهده الگوی مورد نظر، از انتخاب مقیاس مناسب برای حفظ الگوهای اندازه کوچک استفاده می‌شود. هنگامی که الگوهای ناهنجاری نامزد شناسایی شدند، ویژگی های شکل پیشنهادی را از مناطقی که حداقل یک الگوی نامزد اشغال می کند استخراج می کنیم. ارزیابی مقایسه ای روش پیشنهادی با روش های رایج CAD با مجموعه داده ای از 60 CT قفسه سینه ارائه شده است (39 CT برونشیولیت ویروسی پاراآنفلوانزای انسانی و 21 CT قفسه سینه طبیعی تایید شده است). نتایج کمی به‌عنوان سطح زیر منحنی‌های ویژگی‌های اپراتور گیرنده و امتیاز رایانه (حجم تحت‌تاثیر TIB) به عنوان خروجی سیستم CAD ارائه می‌شوند. علاوه بر این، یک طرح درجه بندی بصری به داده های بیمار توسط سه رادیولوژیست به خوبی آموزش دیده اعمال می شود. توافقات بین ناظر و ناظر-رایانه با روش های آماری مربوطه در مناطق مختلف ریه به دست می آید. نتایج تجربی نشان می‌دهد که سیستم CAD پیشنهادی می‌تواند به نرخ‌های تشخیص بالا با دقت کلی 90.96 درصد دست یابد. علاوه بر این، همبستگی‌های مشاهده‌گر-مشاهده [فرمول: متن را ببینید]، [فرمول: متن را ببینید] و توافق‌های ناظر-CAD [فرمول: متن را ببینید]، [فرمول: متن را ببینید] امکان‌سنجی استفاده از سیستم CAD پیشنهادی را تأیید می‌کند. تشخیص و کمی سازی الگوهای TIB	تشخیص خودکار و تعیین کمیت تیرگی درخت در جوانه (TIB) از سی تی اسکن
880nqc0f	سابقه و هدف: لکتین متصل به مانوز یک کلتین است که در دفاع میزبان در برابر عفونت نقش دارد. اینکه آیا کمبود لکتین متصل به مانوز با تشدید حاد بیماری مزمن انسدادی ریه مرتبط است یا خیر مورد بحث است. روش‌ها: شرکت‌کنندگان در یک مطالعه طراحی شده برای تعیین اینکه آیا آزیترومایسین مصرف شده روزانه به مدت یک سال باعث کاهش تشدید حاد می‌شود، غلظت لکتین اتصال‌دهنده به مانوز سرم در زمان ثبت‌نام اندازه‌گیری شده است یا خیر. نتایج: از 1037 نفر (91%) نمونه در کارآزمایی به دست آمد. شیوع کمبود لکتین اتصال مانوز از 0.5٪ تا 52.2٪ بسته به اینکه چگونه کمبود تعریف شد، متغیر بود. هیچ تفاوتی در شیوع کمبود با توجه به هیچ یک از متغیرهای جمعیت شناختی ارزیابی شده مشاهده نشد، و هیچ تفاوتی در زمان تا اولین تشدید، میزان تشدید، یا درصد افراد نیازمند بستری شدن برای تشدید در بیماران مبتلا به کمبود در مقایسه با افراد بدون، بدون توجه به چگونه کمبود تعریف شد نتیجه‌گیری: در نمونه بزرگی از افراد مبتلا به بیماری مزمن انسدادی ریه که به دلیل افزایش خطر ابتلا به تشدید حاد بیماری مزمن انسدادی ریه انتخاب شدند، تنها 1.9 درصد غلظت لکتین اتصال‌دهنده به مانوز کمتر از محدوده طبیعی داشتند و ما هیچ ارتباطی بین مانوز پیدا نکردیم. - اتصال غلظت لکتین و زمان به اولین تشدید حاد یا تکرار تشدید حاد در طول یک سال پیگیری آینده نگر.	کمبود لکتین متصل به مانوز و تشدید حاد بیماری انسدادی مزمن ریه
01b0vnnm	نزدیک به یک قرن از توصیف اولیه میکروگلیا توسط Rio-Hortega می گذرد. از آن زمان بسیاری از ویژگی های بیولوژیکی و پاتولوژیک میکروگلیا شناخته شده است. امروزه میکروگلیاها عموماً به دلیل توانایی آنها در بررسی محیط و بقایای فاگوسیتوز برای هموستاز در حالت استراحت مفید هستند. با این حال، زمانی که میکروگلیاهای فعال فنوتیپ‌های متنوعی از ملتهب کامل، که شامل آزادسازی بسیاری از سیتوکین‌های پیش‌التهابی است، تا سیتوکین‌های ضد التهابی یا نوروتروفین‌های فعال شده، را در نظر بگیرند، پیامدهای آن برای نورون‌ها می‌تواند از مضر تا حمایتی متغیر باشد. با توجه به مجموعه‌ها و شرایط تجربی مختلف، نتایج متناقضی در رابطه با این سوال بحث‌برانگیز به دست آمده است که آیا میکروگلیا خوب یا بد است. در حالی که به خوبی درک شده است که نقش دوگانه میکروگلیای فعال به موقعیت‌های خاص بستگی دارد، مکانیسم‌های اساسی تا حد زیادی نامشخص باقی مانده‌اند و تفسیر یافته‌های خاص مربوط به فنوتیپ‌های میکروگلیال متنوع همچنان مشکل‌ساز است. در این بررسی، عملکرد میکروگلیا در بقای عصبی و نوروژنز، تداخل بین میکروگلیا و سلول‌های اطراف، و عوامل بالقوه‌ای که می‌توانند بر تظاهرات نهایی میکروگلیا تأثیر بگذارند، مورد بحث قرار می‌دهیم.	تغییر فنوتیپ میکروگلیا از هموستاز به بیماری
5b29wtim	سابقه و هدف: سالمونلوز در گوساله‌های گاومیش آبی (Bubalus bubalis) یک بیماری شایع است که با ضایعات شدید گوارشی، اسهال شدید و کم‌آبی شدید مشخص می‌شود که گاهی اوقات یک دوره سیستمیک را نشان می‌دهد. به نظر می رسد که چندین سرووار سالمونلا می توانند گاومیش های آبی را آلوده کنند، اما جدایه های سالمونلا جمع آوری شده از این گونه جانوری به خوبی مشخص نشده اند. در مطالعه حاضر، شیوع گونه های سالمونلا. در گوساله های گاومیش آبی مبتلا به گاستروانتریت کشنده مورد بررسی قرار گرفت و یک خصوصیات پلی فازی سویه های جدا شده از S. Typhimurium انجام شد. ResultsThe تجزیه و تحلیل میکروبیولوژیکی از محتویات روده به دست آمده از 248 گوساله گاومیش آبی مبتلا به گاستروانتریت کشنده به نمایش گذاشته شیوع قابل توجهی از گونه های سالمونلا. (25%) که با سرووارهای مختلف مشخص می شود، اغلب تیفی موریوم (21%)، Muenster (11%) و Give (11%). 13 ایزوله S. Typhimurium همگی با انتروکولیت همراه بودند که با آسیب شدید روده مشخص می شد و تنها به صورت پراکنده با یک عامل ایجاد کننده احتمالی دیگر مسئول گاستروانتریت، مانند Cryptosporidium spp.، Rotavirus یا Clostridium perfringens جدا شدند. سایر ایزوله‌های سالمونلا عمدتاً از ضایعات روده‌ای جزئی و اغلب (78 درصد موارد) با سایر میکروارگانیسم‌ها، عمدتاً اشریشیاکلی سم‌زا (35%)، Cryptosporidium spp جدا شده‌اند. (20%) و روتا ویروس (10%). سویه های S. Typhimurium با تایپ فاژ مشخص شدند و بیشتر با شناسایی 24 ژن حدت با واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) ژنوتیپ شدند. جدایه ها 9 نوع فاژ مختلف و 10 پروفایل ژنتیکی مختلف را نشان دادند. سه جدایه S. Typhimurium تک فازی (B: 4،12: i:-) نیز یافت و مشخص شد که سه نوع فاژ مختلف و سه نوع مختلف ویروس را نشان می دهد. خصوصیات مولکولی به جدایه های 7 S. Muenster و 7 S. Give که جمع آوری شده بودند، گسترش یافت که نشان دهنده وجود ویروس های مختلف نیز در این سرووارها است. سه سویه نماینده S. Typhimurium در داخل بدن در یک مدل موش از عفونت مخلوط مورد آزمایش قرار گرفتند. بیماریزاترین سویه با تعداد بالایی از فاکتورهای حدت و حضور لوکوس agfA مشخص شد که برای یک فیمبریای نازک تجمعی کد می‌کند. نتیجه گیری: این نتایج شواهدی را ارائه می دهد که سالمونلا اغلب با گاستروانتریت در گوساله های گاومیش آبی، به ویژه S. Typhimurium همراه است. علاوه بر این، تنوع در تعداد و توزیع نشانگرهای حدت مختلف در میان سویه‌های جمع‌آوری‌شده S. Typhimurium نشان می‌دهد که در این سرووار پاتوتیپ‌های مختلفی وجود دارد که به طور بالقوه مسئول سندرم‌های بالینی مختلف هستند.	تنوع گونه های سالمونلا سرووارهای جدا شده از روده گوساله های گاومیش آبی مبتلا به گاستروانتریت
z65xxk1f	سابقه و هدف: مالاریا مغزی (CM) و کم خونی مالاریا شدید (SMA) جدی ترین سندرم های بالینی تهدید کننده زندگی عفونت پلاسمودیوم فالسیپاروم در دوران کودکی هستند. بنابراین، درک آسیب شناسی زمینه ساز ایجاد CM و SMA، در مقابل مالاریا بدون عارضه (UM) مهم است. پاسخ‌های میزبان مختلف به عفونت احتمالاً در الگوهای پروتئوم پلاسما که با وضعیت بالینی مرتبط است منعکس می‌شوند و بنابراین شاخص‌هایی از پاتوژنز این سندرم‌ها را ارائه می‌دهند. روش‌ها و یافته‌ها: پلاسما و داده‌های بالینی جامع برای گروه‌های کشف و اعتبارسنجی به عنوان بخشی از یک مطالعه مورد-شاهدی آینده‌نگر مالاریا شدید دوران کودکی در بیمارستان عالی اصلی شهر عبادان، یک منطقه مالاریا هولوآندمیک شهری و پرجمعیت در نیجریه به‌دست آمد. . در مجموع 946 کودک در این مطالعه شرکت کردند. پلاسما در معرض پروفایل پروتئومی با کارایی بالا قرار گرفت. روش‌های آماری تشخیص الگو برای یافتن الگوهای پروتئوم که گروه‌های بیماری را تعریف می‌کنند، استفاده شد. الگوهای پروتئوم پلاسما به طور دقیق کودکان مبتلا به CM و SMA را از کودکان مبتلا به UM، و از کودکان سالم یا به شدت بیمار مبتلا به مالاریا منفی متمایز کرد. نتیجه‌گیری: ما گزارش می‌کنیم که با استفاده از الگوهای پروتئوم پلاسما می‌توان به تعریف دقیق سندرم‌های مالاریا در دوران کودکی دست یافت. از داده‌های پروتئومی ما می‌توان برای درک پاتوژنز سندرم‌های مالاریا شدید دوران کودکی استفاده کرد.	سندرم های مالاریا شدید دوران کودکی که توسط پروفایل های پروتئوم پلاسما تعریف شده اند
iuglkdcp	انگیزه: تعیین ساختار RNA آزمایشگاهی سخت و پرهزینه است و بنابراین، پیش‌بینی ساختار محاسباتی یک کار مهم است. روش‌های تک دنباله‌ای برای پیش‌بینی ساختار ثانویه RNA با دقت مدل تاشوی زیربنایی محدود می‌شوند، اگر ساختاری توسط خانواده‌ای از توالی‌های مرتبط تکاملی پشتیبانی شود، می‌توان مطمئن‌تر بود که پیش‌بینی دقیق است. شبه گره های RNA عناصر عملکردی هستند که ساختارهای بسیار حفاظت شده دارند. با این حال، تعداد کمی از روش‌های پیش‌بینی ساختار مقایسه‌ای می‌توانند گره‌های کاذب را به دلیل پیچیدگی محاسباتی مدیریت کنند. یافته ها: یک روش مقایسه ای پیش بینی گره کاذب به نام DotKnot-PW بر اساس مقایسه ساختاری عناصر ساختار ثانویه و کاندیدای گره کاذب نوع H معرفی شده است. DotKnot-PW از سایر روش‌های موجود در ادبیات مجموعه آزمایشی دستی از ساختارهای RNA با پشتیبانی تجربی بهتر عمل می‌کند. در دسترس بودن: DotKnot-PW و مجموعه تست ساختار RNA در وب سایت http://dotknot.csse.uwa.edu.au/pw موجود است. تماس: janaspe@csse.uwa.edu.au اطلاعات تکمیلی: اطلاعات تکمیلی در Bioinformatics به صورت آنلاین موجود است.	پیش بینی ساختارهای شبه گره در دو توالی RNA
jo883b0y	شباهت ژنتیکی مشاهده شده در بین گونه ها معمولاً به وجود یک نیای مشترک نسبت داده می شود. با این حال، تعداد فزاینده ای از شواهد نشان می دهد که تبادل مواد ژنتیکی به انتقال از والدین به فرزندان محدود نمی شود، بلکه می تواند از طریق انتقال افقی (HT) نیز رخ دهد. عناصر قابل انتقال (TEs) قطعات DNA با تمایل ذاتی برای HT هستند. آنها متحرک هستند و دارای ویژگی های انگلی هستند که به آنها امکان وجود و تکثیر در ژنوم میزبان را می دهد. با این حال، انتقال افقی ترانسپوزون (HTT) به راحتی قابل تشخیص نیست، در درجه اول به این دلیل که چرخه زندگی پیچیده TE می تواند الگوهای فیلوژنتیکی مشابه آنچه برای رویدادهای HTT انتظار می رود ایجاد کند. تعداد فزاینده‌ای از پروژه‌های جدید ژنوم، در همه شاخه‌های زندگی، فرصت بی‌سابقه‌ای برای ارزیابی محتوای TE و رویدادهای HTT در این گونه‌ها فراهم کرده است، اگرچه قبل از ارزیابی روند نرخ‌های HTT، یک روش استاندارد تشخیص HTT مورد نیاز است. در طیف گسترده ای از گونه های یوکاریوتی و پیش بینی هایی در مورد این رویدادها می توان انجام داد. بنابراین، ما یک آزمون فرضیه ساده را پیشنهاد می کنیم که می تواند توسط متخصصان TE و غیرمتخصصان به طور یکسان برای تمایز بین رویدادهای HTT و الگوهای چرخه زندگی TE طبیعی استفاده شود. ما همچنین چندین توضیح و پیش‌بینی قابل قبول برای توزیع و فرکانس HTT و سوگیری‌های ذاتی تشخیص HTT را مورد بحث قرار می‌دهیم. در نهایت، ما برخی از نگرانی‌های روش‌شناختی برای تشخیص HTT را مورد بحث قرار می‌دهیم که ممکن است منجر به دست کم‌گرفتن و برآورد بیش از حد نرخ HTT در طول تکامل ژنوم یوکاریوتی شود.	انتقال ترانسپوزون افقی در یوکاریا: تشخیص، تعصب و چشم اندازها
ertnvzwk	این مطالعه به منظور تهیه یک فرمول نانو امولسیون لیپیدی لیکورین مانوسیله (M-LYC-OA-LNEs) با هدف دستیابی به تحویل لیکورین (LYC) با هدف تومور انجام شد. چربی دوستی کم LYC پراکندگی آن را در نانو امولسیون های لیپیدی (LNEs) سخت کرده است. به منظور افزایش چربی دوستی، کمپلکس یونی لیکورین-اولئیک اسید (LYC-OA) ساخته شد. M-LYC-OA-LNEs و نانو امولسیون های لیپیدی بدون پوشش اسید لیکورین اولئیک (LYC-OA-LNEs) با روش تزریق حلال تهیه و با میکروسکوپ الکترونی عبوری (TEM)، اندازه ذرات، شاخص پراکندگی، پتانسیل زتا مشخص شدند. و تجزیه و تحلیل کارایی به دام افتادن مطالعات جذب سلولی در شرایط آزمایشگاهی و فعالیت مهار رشد بر روی رده های سلولی A549 انجام شد. راندمان به دام افتادن M-LYC-OA-LNEs 1.6 ± 82.7 درصد بود. مطالعه جذب سلولی نشان داد که LNE های پوشش داده شده ترجیحاً توسط سلول های A549 گرفته می شوند تا LNE های بدون پوشش. آزمایش موثر با روش MTT فعالیت بازدارندگی رشد بهتر M-LYC-OA-LNEs را در رده های سلولی A549 در مقایسه با LYC-OA-LNEs و LNEs خالی نشان داد. این نتایج نشان داد که M-LYC-OA-LNEs می‌تواند یک فرمول امیدوارکننده برای هدف قرار دادن تومور LYC با پتانسیل استفاده در تشخیص و درمان سرطان باشد.	نانو امولسیون های لیپیدی مانوسیله بارگیری شده با کمپلکس یونی لیکورین-اولئیک اسید برای تحویل اختصاصی سلول های توموری
bu43gmpc	پس زمینه: نقش عوامل جمعیت شناختی، شرایط آب و هوایی، چرخه های مدرسه، و الگوهای اتصال در شکل دادن به پویایی مکانی-زمانی آنفلوانزای همه گیر به وضوح درک نشده است. در اینجا ما تکامل مکانی، سنی و زمانی همه‌گیری آنفولانزای A/H1N1 در سال 2009 را در شیلی، کشوری در نیمکره جنوبی که نوار بلند و باریکی شامل عرض‌های جغرافیایی 17 تا 56 درجه جنوبی را پوشش می‌دهد، تحلیل کردیم. روش‌ها: ما الگوهای انتشار بیماری همه‌گیر A/H1N1 2009 را در 15 منطقه شیلی بر اساس بستری شدن روزانه به دلیل بیماری حاد تنفسی شدید و عفونت آنفلوانزای A/H1N1 تایید شده آزمایشگاهی از 01-مه تا 31-دسامبر 2009 تجزیه و تحلیل کردیم. ارتباط بین زمان شروع همه گیری و اوج فعالیت همه گیری و چندین شاخص جغرافیایی و جمعیتی، تعطیلات مدارس، عوامل آب و هوایی و مسافران بین المللی. ما همچنین تعداد تولید مثل (R) را بر اساس نرخ رشد فاز همه‌گیری نمایی بر اساس تاریخ شروع علائم، تخمین زده‌شده با استفاده از روش‌های حداکثر احتمال، تخمین زدیم. نتایج: در حالی که شروع بیماری همه گیر قبلی با جمعیت بزرگتر همراه بود، هیچ ارتباطی با عوامل ارتباطی، جمعیتی، مدرسه یا آب و هوا وجود نداشت. در مقابل، یک گرادیان عرضی در زمان اوج بیماری همه گیر وجود داشت که نشان دهنده یک تاخیر 16-39 روزه در فعالیت بیماری از مناطق جنوبی نسبت به شمالی ترین منطقه بود (001/0 > P). تفاوت های جغرافیایی در عرض جغرافیایی مناطق شیلی، حداکثر دما و رطوبت ویژه 68.5٪ از تغییرات در زمان اوج را توضیح داد (0.01 = P). علاوه بر این، یک شیب کاهشی در تعداد تولید مثل از جنوب به شمال شیلی وجود داشت (0001/0 > P). برآورد میانگین منطقه ای R به ترتیب 1.6-2.0، 1.3-1.5 و 1.2-1.3 برای مناطق جنوبی، مرکزی و شمالی بود که تحت تأثیر دوره تعطیلات زمستانی قرار نگرفتند. نتیجه‌گیری: در دوره شدیدترین فعالیت آنفلوانزای همه‌گیر سال 2009 به دنبال الگوی سفر از جنوب به شمال در سراسر مناطق شیلی تاخیر وجود داشت که به طور قابل‌توجهی با تفاوت‌های جغرافیایی در حداقل دما و رطوبت خاص مرتبط بود. شیب عرضی در زمان‌بندی فعالیت همه‌گیر با یک گرادیان در تعداد تولید مثل همراه بود (0001/0 > P). استراتژی‌های نظارتی تشدید شده در مناطق سردتر و خشک‌تر جنوبی می‌تواند منجر به تشخیص زودهنگام ویروس‌های آنفلوانزای همه‌گیر و بهبود نتایج کنترل شود.	تاثیر شرایط آب و هوایی بر پویایی انتقال بیماری همه گیر آنفولانزای A/H1N1 2009 در شیلی
nuwvge0t	پس‌زمینه: شبیه‌سازی نوترکیبی با استفاده از فناوری Gateway (TM) روش انتخابی برای پروژه‌های omics با کارایی بالا بوده است که منجر به در دسترس بودن کل ORFeomes در بردارهای سازگار با Gateway (TM) شده است. سیستم MultiSite Gateway (TM) امکان ترکیب چند قطعه ژنتیکی مانند پروموتر، ORF و برچسب اپی توپ را در یک واکنش واحد فراهم می کند. تا به امروز، این فناوری در مخمر ساکارومایسس سرویزیه، یکی از پرکاربردترین سیستم های آزمایشی در زیست شناسی مولکولی، به دلیل عدم وجود بردارهای مقصد مناسب، قابل دسترسی نبوده است. نتایج: در اینجا، مجموعه‌ای از وکتورهای مقصد سه‌بخشی MultiSite Gateway (TM) را ارائه می‌کنیم که برای بیان ژن در S. cerevisiae ایجاد شده‌اند و امکان مونتاژ هر پروموتر، چارچوب خواندن باز، ترتیب تگ اپی توپ را در ترکیب با هر از چهار نشانگر اکسوتروفیک و سه مکانیسم تکرار متمایز. به عنوان نمونه ای از کاربرد آن، ما از مخمر سه هیبریدی برای ارائه شواهدی برای مونتاژ یک مجموعه سه تایی از پروتئین های گیاهی درگیر در سیگنال دهی جاسمونات و متشکل از پروتئین های JAZ، NINJA و TOPLESS استفاده کردیم. نتیجه‌گیری: بردارهای ما شبیه‌سازی MultiSite Gateway (TM) را در S. cerevisiae قابل دسترسی می‌سازند و یک روش شبیه‌سازی سریع و همه‌کاره را برای آنالیز عملکردی پرتوان پروتئین‌های (هترولوگ) در یکی از پرکاربردترین موجودات مدل برای تحقیقات زیست‌شناسی مولکولی پیاده‌سازی می‌کنند.	مجموعه وکتور MultiSite Gateway (TM) برای تجزیه و تحلیل عملکردی ژن ها در مدل ساکارومایسس سرویزیه
z6ufx206	از لحاظ نظری، محیط‌های همگن به نفع تکامل متخصصان هستند در حالی که محیط‌های ناهمگن به نفع عمومی‌ها هستند. دیستمپر سگ یک بیماری گوشتخوار چند میزبان است که توسط ویروس دیستمپر سگ (CDV) ایجاد می شود. گیرنده سلولی توصیف شده CDV SLAM (CD150) است. اتصال پروتئین هماگلوتینین CDV (CDV-H) به این گیرنده، همجوشی و ورود ویروس را در همکاری با پروتئین فیوژن (CDV-F) تسهیل می کند. ما بررسی کردیم که آیا سویه‌های CDV در جمعیت سگ‌های خانگی بزرگ و همگن، ویژگی‌های تخصصی را نشان می‌دهند یا خیر، و سویه‌های سازگار با محیط ناهمگن جمعیت‌های کوچک‌تر از گوشتخواران مختلف، ویژگی‌های عمومی را نشان می‌دهند. مقایسه توالی‌های اسید آمینه ناحیه اتصال SLAM شباهت بیشتری را بین توالی‌های گونه‌های Canidae نسبت به توالی‌هایی از سایر خانواده‌های گوشتخوار نشان داد. با استفاده از یک روش آزمایشگاهی، ما تشکیل سینسیشیا را با واسطه پروتئین‌های CDV-H از سویه‌های CDV سگ و غیر سگ در سلول‌هایی که SLAM سگ، شیر یا گربه را بیان می‌کنند، اندازه‌گیری کردیم. پروتئین‌های CDV-H از سویه‌های سگ مقادیر قابل‌توجهی بالاتری را با سلول‌هایی که SLAM سگ را بیان می‌کنند نسبت به سلول‌هایی که SLAM شیر یا گربه را بیان می‌کنند، تولید می‌کنند. پروتئین‌های CDV-H از سویه‌های گونه‌های غیرسگی مقادیر مشابهی را در هر سه نوع سلول تولید کردند، اما مقادیر کمتری در سلول‌های بیان‌کننده SLAM سگ نسبت به مقادیر به‌دست‌آمده برای پروتئین‌های CDV-H از سویه‌های سگ تولید کردند. با تغییر تجربی یک اسید آمینه (Y549H) در پروتئین CDV-H یک سویه سگ، بیان صفات تخصصی را کاهش دادیم و بیان صفات عمومی را افزایش دادیم، در نتیجه اهمیت عملکردی آن را تأیید کردیم. یک سنجش تیتر ویروس نشان داد که سویه‌های سگ در سلول‌هایی که SLAM سگ را بیان می‌کنند، تیترهای بالاتری نسبت به سلول‌هایی که SLAM میزبان‌های غیرسگ را بیان می‌کنند، تولید می‌کنند، که مزایای تناسب اندام احتمالی ورود پس از سلول تخصصی را پیشنهاد می‌کند. ما شواهدی را در شرایط آزمایشگاهی برای بیان صفات تخصصی و عمومی توسط سویه‌های CDV، و تناسب اندام در محیط‌های میزبان گوشتخوار ناشی از پلیوتروپی متضاد ارائه می‌کنیم. این یافته ها دانش را در مورد اپیدمیولوژی مولکولی CDV که ارتباط خاصی با گوشتخواران وحشی دارد گسترش می دهد.	تناسب اندام و پلیوتروپی متضاد، ویژگی های تخصصی و عمومی را در سویه های ویروس دیستمپر سگ نشان می دهد.
qg1b5p1j	پنتراکسین 3 (PTX3) یک گیرنده تشخیص الگوی محلول است که به عنوان یک پنتراکسین طولانی در خانواده پنتراکسین طبقه بندی می شود. شناخته شده است که نقش مهمی در ایمنی ذاتی، تنظیم التهابی و باروری زنان دارد. PTX3 توسط سلول های خاص، در درجه اول در پاسخ به سیگنال های التهابی سنتز می شود. در میان این سلول های مختلف، نوتروفیل ها دارای یک سیستم تولید PTX3 منحصر به فرد هستند. نوتروفیل ها PTX3 را در گرانول های مخصوص نوتروفیل ذخیره می کنند و سپس PTX3 ذخیره شده آزاد می شود و در تله های خارج سلولی نوتروفیل (NETs) محلی می شود. اگرچه اجزای خاص NET مانند هیستون ها و پروتئین های ضد میکروبی شناسایی شده اند، مکانیسم های دقیقی که NET ها بوسیله آن ها بومی سازی می شوند و همچنین میکروب ها را می گیرند و می کشند، به طور کامل مشخص نشده است. PTX3 یک نشانگر کاندید تشخیصی عفونت و آسیب عروقی است. در بیماری های عفونی شدید مانند سپسیس، غلظت PTX3 در گردش به شدت افزایش می یابد (تا 100 نانوگرم در میلی لیتر، یعنی تا 100 برابر سطح طبیعی). حتی اگر به وضوح اشاره شود که PTX3 نقش محافظتی در سپسیس و برخی اختلالات دیگر ایفا می کند، مکانیسم های دقیقی که توسط آن انجام می دهد نامشخص است. یک مطالعه پروتئومی لیگاندهای PTX3 در بیماران سپتیک نشان داد که PTX3 یک کمپلکس با پروتئین‌های جزء NET خاص تشکیل می‌دهد. این نشان‌دهنده نقشی برای PTX3 است که در آن کارایی پاکسازی پاتوژن پروتئین ضد میکروبی را با تعامل با هر دو عامل بیماری‌زا و پروتئین‌های ضد میکروبی تسهیل می‌کند. ما در مورد روابط احتمالی بین پروتئین‌های جزء PTX3 و NET در حفاظت میزبان که توسط پاسخ ایمنی ذاتی ایجاد می‌شود، بحث می‌کنیم. کمپلکس PTX3 این پتانسیل را دارد که یک نشانگر تشخیصی بسیار مفید برای سپسیس و سایر بیماری های التهابی باشد.	اثر محافظتی میزبان پنتراکسین 3 در گردش (PTX3) و تشکیل کمپلکس با تله های خارج سلولی نوتروفیل
v22k72tw	ویروس ابولا (EBOV) علاوه بر گلیکوپروتئین سطحی خود (GP(1,2))، تولید مقادیر زیادی از یک ایزوفرم گلیکوپروتئین کوتاه (sGP) را که به فضای خارج سلولی ترشح می‌شود، هدایت می‌کند. تولید آنتی ژن های ترشح شده در چندین ویروس مورد مطالعه قرار گرفته و به عنوان مکانیزم فرار ایمنی میزبان از طریق جذب آنتی بادی ها و تداخل با کلیرانس به واسطه آنتی بادی پیشنهاد شده است. با این حال چنین نقشی به طور قطعی برای ویروس ابولا sGP تعیین نشده است. در این مطالعه، ما موش‌ها را با ساختارهای DNA که GP(1،2) و/یا sGP را بیان می‌کنند واکسینه کردیم و نشان دادیم که sGP می‌تواند به طور موثر برای آنتی‌بادی‌های ضد GP(12) رقابت کند، اما فقط از موش‌هایی که توسط sGP ایمن‌سازی شده‌اند. ما این پدیده را براندازی آنتی ژنی می نامیم و مدلی را پیشنهاد می کنیم که به موجب آن sGP پاسخ آنتی بادی میزبان را برای تمرکز بر روی اپی توپ هایی که با GP (1،2) متصل به غشاء مشترک است، هدایت می کند، در نتیجه به آن اجازه می دهد تا آنتی GP (1،2) را جذب کند. ) آنتی بادی ها به طور غیرمنتظره، ما دریافتیم که sGP همچنین می‌تواند پاسخ ضد GP(1،2) میزبانی که قبلاً ایمن شده است را واژگون کند که منجر به واکنش متقابل قوی با sGP می‌شود. این یافته به ویژه با واکسن شناسی EBOV مرتبط است زیرا بر اهمیت ایجاد ایمنی قوی که برای پاکسازی سریع عفونت قبل از وقوع براندازی آنتی ژنی کافی است، تأکید می کند. براندازی آنتی ژنیک نشان دهنده یک استراتژی جدید فرار ویروس است که احتمالاً به EBOV کمک می کند تا از ایمنی میزبان فرار کند و ممکن است مانع مهمی برای طراحی واکسن EBOV باشد.	براندازی آنتی ژنی: مکانیزم جدید فرار ایمنی میزبان توسط ویروس ابولا
jiy4cp4n	تکنیک های تقویت اسید نوکلئیک در حال حاضر معمولا برای تشخیص بیماری های ویروسی و مدیریت بیماران مبتلا به این نوع بیماری ها استفاده می شود. این تکنیک ها طی 30 سال گذشته با کشف و معرفی چندین روش در تشخیص بالینی، مسیر توسعه سریع اما غیر متعارفی داشته اند. افزایش تعداد روش های تجاری موجود، استفاده از این فناوری را در اکثر آزمایشگاه های جهان تسهیل کرده است. این فناوری استفاده از برخی تکنیک‌های دیگر مانند روش‌های مبتنی بر کشت ویروسی و سنجش‌های سرولوژیکی را در آزمایشگاه ویروس‌شناسی بالینی کاهش داده است. علاوه بر این، تکنیک های تقویت اسید نوکلئیک در حال حاضر روش های مرجع و همچنین مفیدترین سنجش برای تشخیص در بسیاری از بیماری ها هستند. معرفی این تکنیک ها و اتوماسیون آنها فرصت های جدیدی را برای آزمایشگاه بالینی فراهم می کند تا بر مراقبت از بیمار تأثیر بگذارد. اهداف اصلی در انجام آزمایشات اسید نوکلئیک در این زمینه، ارائه نتایج به موقع و مفید برای مراقبت از بیمار با کیفیت بالا با هزینه مناسب است، زیرا نتایج سریع با بهبود در مراقبت از بیمار همراه است. استفاده از تکنیک‌های تقویت مانند واکنش زنجیره‌ای پلیمراز، واکنش زنجیره‌ای پلیمراز بلادرنگ یا تقویت مبتنی بر توالی اسید نوکلئیک برای تشخیص ویروس، ژنوتیپ‌سازی و کمی‌سازی دارای مزایایی مانند حساسیت بالا و تکرارپذیری و همچنین دامنه دینامیکی گسترده است. این مرور یک به روز از تکنیک های اصلی اسید نوکلئیک و کاربردهای بالینی آنها و چالش ها و فرصت های ویژه ای است که این تکنیک ها در حال حاضر برای آزمایشگاه ویروس شناسی بالینی فراهم می کنند.	کاربرد تکنیک های تشخیص مولکولی برای آزمایش ویروسی
zwfxnd7r	سابقه و هدف: آنفلوانزای خوکی (H1N1) یک عفونت تنفسی بسیار مسری است و سازمان بهداشت جهانی (WHO) سطح هشدار را به فاز 6 (همه‌گیری) افزایش داده است. مطالعه تظاهرات بالینی و آزمایشگاهی و همچنین یافته های تصویربرداری رادیولوژیک به تشخیص زودهنگام آن کمک می کند. هدف: هدف از این مطالعه بررسی یافته های تصویربرداری بیماران مبتلا به عفونت H1N1 ثبت شده مراجعه کننده به مرکز ما بود. بیماران و روش ها: سی و یک بیمار (16 مرد) با عفونت H1N1 ثبت شده در مطالعه ما وارد شدند. رادیوگرافی اولیه به دست آمده از بیماران با توجه به الگوی (تثبیت، شیشه زمین، گره ها و شبکه)، توزیع (کانونی، چند کانونی، و انتشار) و نواحی ریوی درگیر مورد بررسی قرار گرفت. اسکن توموگرافی کامپیوتری (CT) نیز برای همین ناهنجاری ها مورد بررسی قرار گرفت. پرونده بیماران برای بیماری های زمینه ای احتمالی آنها مورد مطالعه قرار گرفت. یافته ها: میانگین سنی 97/37 ± 9/13 سال بود. هفده بیمار (54.8%) دارای شرایط هم‌زمان (هشت تنفسی، پنج بیماری قلبی عروقی، دو مورد نقص ایمنی، دو مورد سرطان، چهار نفر دیگر) بودند. 12 نفر (7/38%) نیاز به بستری در بخش مراقبت های ویژه (ICU) داشتند. پنج نفر (16.1%) فوت کردند. (25.8%) رادیوگرافی اولیه طبیعی داشتند. شایع ترین ناهنجاری تثبیت (31/12؛ 7/38 درصد) در ناحیه محیطی (31/11؛ 5/35 درصد) و به دنبال آن نواحی اطراف برونکوواسکولار (31/10؛ 3/32 درصد) بود که بیشتر در ناحیه تحتانی مشاهده شد. بیماران بستری شده در ICU بیشتر احتمال داشت که دو یا چند ناحیه ریه درگیر شوند (005/0 = P). نتیجه گیری: در بیماران مبتلا به عفونت جدید آنفولانزای خوکی، شایع ترین ناهنجاری رادیوگرافی مشاهده شده تثبیت در نواحی تحتانی ریه بود. بیماران بستری شده در ICU بیشتر احتمال داشت که دو یا چند ناحیه ریه درگیر شوند.	یافته های تصویربرداری در بیماران مبتلا به آنفولانزای H1N1 A
e2p2e8rl	رتروویروس ها شامل عوامل عفونی هستند که باعث ایجاد بیماری های شدید در انسان و حیوانات می شوند. علاوه بر این، رتروویروس ها به طور گسترده ای به عنوان ابزاری برای انتقال ژن های مورد نظر به سلول های هدف استفاده می شوند. درک مکانیسم ورود رتروویروس‌ها به توسعه رویکردهای درمانی جدید در برابر بیماری‌های ناشی از رتروویروس و بهره‌برداری کارآمد از ناقل‌های رتروویروسی کمک می‌کند. ورود ویروس‌های پوشش‌دار به سیتوپلاسم سلول میزبان با ادغام بین پوشش ویروسی و غشای سلول میزبان در سطح سلول یا وزیکول‌های درون سلولی حاصل می‌شود. بسیاری از رتروویروس های حیوانی از طریق اندوزوم ها وارد سلول های میزبان می شوند و نیاز به اسیدی شدن آندوزوم دارند. ورود ویروس لوسمی موش اکوتروپیک نیازمند پروتئازهای کاتپسین است که توسط اسیدی شدن آندوزوم فعال می شود. تصور می شود عفونت ویروس نقص ایمنی انسانی وابسته به CD4 (HIV) از طریق آندوزوم ها رخ می دهد، اما اسیدی شدن آندوزوم برای ورود ضروری نیست در حالی که ورود HIV های مستقل از CD4، که تصور می شود نمونه های اولیه ویروس های وابسته به CD4 هستند، وابسته به pH پایین است. . چندین نتیجه بحث برانگیز در مورد مسیرهای ورود رتروویروسی وجود دارد. از آنجا که اندوسیتوز و اسیدی شدن آندوزوم به طور پیچیده توسط مکانیسم های سلولی کنترل می شوند، مسیرهای ورود رتروویروس ممکن است در رده های سلولی مختلف متفاوت باشد.	ورود رتروویروس توسط اندوسیتوز و پروتئازهای کاتپسین
m6abyuvx	هپاتیت C مزمن که در اثر عفونت با ویروس هپاتیت C (HCV) ایجاد می شود، یک مشکل بهداشت جهانی است. با استفاده از یک مدل موشی هپاتیت C، ما اثرات درمانی یک ویروس واکسینیا نوترکیب (rVV) که پروتئین HCV را کد می‌کند، بررسی کردیم. ما موش‌های دارای قابلیت ایمنی تولید کردیم که هر کدام چندین پروتئین HCV را از طریق یک سیستم سوئیچینگ Cre/loxP بیان کردند و چندین سویه rVV ضعیف‌شده مجزا ایجاد کردند. پروتئین هسته HCV به طور مداوم پس از تزریق پلی‌اینوزینیک اسید-پلی سیتیدیلیک اسید در کبد بیان شد و این موش‌ها یافته‌های پاتولوژیک مزمن مرتبط با هپاتیت C (ناهنجاری‌های هپاتوسیت، تجمع گلیکوژن، استئاتوز)، فیبروز کبدی و کارسینوم سلول‌های کبدی را نشان دادند. ایمن سازی با یک سویه rVV (rVV-N25)، که پروتئین های غیرساختاری HCV را کد می کرد، سطح سیتوکین های التهابی سرم را سرکوب کرد و علائم هپاتیت مزمن C پاتولوژیک را طی 7 روز پس از تزریق کاهش داد. علاوه بر این، سطح پروتئین HCV در بافت کبد نیز به روشی وابسته به سلول T CD4 و CD8 کاهش یافت. مطابق با این نتایج، ما نشان دادیم که ایمن سازی rVV-N25 باعث ایجاد یک پاسخ ایمنی قوی سلول T CD8 می شود که مخصوص پروتئین غیرساختاری HCV 2 بود. ما همچنین نشان دادیم که شروع هپاتیت مزمن در CN2-29 ((+/-) )/MxCre((+/-)) موش عمدتاً به سیتوکین های التهابی، (فاکتور نکروز تومور) TNF-α و (اینترلوکین) IL-6 نسبت داده شد. بنابراین، مدل موش‌های تولید شده ما باید برای بررسی بیشتر فرآیندهای ایمنی مرتبط با بیان مداوم پروتئین‌های HCV مفید باشد زیرا این موش‌ها تحمل ایمنی نسبت به آنتی‌ژن HCV ایجاد نکرده بودند. علاوه بر این، ما پیشنهاد می کنیم که rVV-N25 می تواند به عنوان یک واکسن درمانی موثر توسعه یابد.	ایمن سازی با ویروس واکسینیا نوترکیب که پروتئین های غیرساختاری ویروس هپاتیت C را کد می کند، سطح پروتئین ویروسی را در کبد موش سرکوب می کند.
35kfabe1	پروتئین HIV-1 Nef اساساً با انواع برهمکنش های پروتئین-پروتئین در سلول میزبان به آسیب شناسی ایدز کمک می کند. عملکرد همه کاره Nef تا حدی به حالت‌های ساختاری مختلف و تغییرات پس از ترجمه، مانند myristoylation نسبت داده می‌شود. تاکنون، بسیاری از شرکای تعامل Nef با استفاده از صفحه نمایش دو هیبریدی مخمر کلاسیک شناسایی شده اند. چنین صفحه‌هایی به فعال‌سازی رونویسی ژن‌های گزارشگر در هسته برای تشخیص فعل و انفعالات متکی هستند. بنابراین، شناسایی شرکای تعامل Nef که پروتئین‌های غشایی یکپارچه، پروتئین‌های مرتبط با غشاء یا سایر پروتئین‌هایی هستند که به هسته منتقل نمی‌شوند، با مشکل مواجه می‌شود. در مطالعه حاضر، یک صفحه نمایش دو هیبریدی مخمر مبتنی بر اسپلیت یوبیکوئیتین برای شناسایی شرکای جدید تعامل موضعی غشایی Nef استفاده شد. بیش از 80 درصد از شرکای برهمکنش شناسایی شده Nef پروتئین های گذرنده هستند. بازدیدهای شناسایی شده عبارتند از: GPM6B، GPM6A، BAP31، TSPAN7، CYB5B، CD320/TCblR، VSIG4، PMEPA1، OCIAD1، ITGB1، CHN1، PH4، CLDN10، HSPA9، APR-3، PEBP1 و B3GNT فرآیندهای متنوعی مانند، سیگنالینگ، آپوپتوز، نوروژنز، چسبندگی سلولی و قاچاق پروتئین یا کنترل کیفیت. برای بخش فرعی از پروتئین‌های شناسایی‌شده، داده‌هایی را ارائه می‌کنیم که از تعامل مستقیم آنها با HIV-1 Nef پشتیبانی می‌کند. ما نتایج را با توجه به بسیاری از فنوتیپ های مشاهده شده در سلول ها و بیماران آلوده به HIV مورد بحث قرار می دهیم. شرکای تعامل Nef شناسایی شده ممکن است به روشن شدن بیشتر اساس مولکولی بیماری های مرتبط با HIV کمک کنند.	غربالگری گسترده ترانسکریپتوم مغز برای شرکای تعامل با پروتئین HIV-1 نف، پروتئین های مرتبط با غشای مختلف را نشان می دهد
zz1zarbk	ظهور مجدد سیاه سرفه نگرانی های بهداشت عمومی را حتی در کشورهای توسعه یافته با پوشش واکسیناسیون بالا افزایش داده است. هدف از این مطالعه توصیف ویژگی‌های بالینی سیاه سرفه نوزاد، و تعیین اهمیت نسبی انتقال خانگی در کره بود. مطالعه چند مرکزی به صورت آینده‌نگر از ژانویه 2009 تا سپتامبر 2011 انجام شد. ما اطلاعات دموگرافیک و بالینی این بیماران را شناسایی کردیم و آزمایش‌های تشخیصی سیاه سرفه را در تماس‌های خانگی آنها انجام دادیم. بیست و یک بیمار مبتلا به سیاه سرفه تایید شده در تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. تمام عفونت ها در نوزادان کمتر از 6 ماه (میانگین سنی 2.5 ماه) که واکسیناسیون اولیه DTaP را به جز یک بیمار کامل نکرده بودند، رخ داد. نوزادانی که سابقه واکسیناسیون نداشتند لنفوسیتوز بیشتر و طول مدت بستری طولانی تری در مقایسه با آنهایی که واکسینه شده بودند داشتند. همه با PCR (100٪) تشخیص داده شدند، با این حال، تست های کشت کمترین حساسیت را نشان دادند (42.9٪). منبع احتمالی عفونت در تماس های خانگی در 85.7٪، عمدتا والدین (52.6٪) ثبت شده است. سیاه سرفه در نوزادان جوانی که به طور کامل واکسینه نشده بودند، یک عوارض عمده داشت. اعضای خانواده مسئول انتقال سیاه سرفه در نوزادانی بودند که منبعی در آنها قابل شناسایی بود. کنترل سیاه سرفه از طریق واکسیناسیون تقویتی با Tdap در خانواده هایی که از نوزادان خردسال مراقبت می کنند در کره ضروری است.	سیاه سرفه نوزاد و انتقال خانگی در کره
bmcku2yb	مطالعه ناهمگونی جمعیت سلولی در طیف وسیعی از سیستم‌های بیولوژیکی، از ویروس‌ها گرفته تا جدایه‌های باکتریایی و نمونه‌های تومور، با پیشرفت‌های اخیر در توالی‌یابی تغییر یافته است. در حالی که پوشش بالا ارائه شده می تواند، در اصل، برای شناسایی انواع بسیار نادر در یک جمعیت مورد استفاده قرار گیرد، رویکردهای موردی موجود اغلب در تشخیص انواع واقعی از خطاهای توالی ناموفق هستند. ما روشی (LoFreq) را گزارش می‌کنیم که توالی‌بندی نرخ‌های خطای خاص اجرا را برای فراخوانی دقیق انواعی که در <0.05٪ از جمعیت رخ می‌دهند، مدل می‌کند. با استفاده از مجموعه داده‌های شبیه‌سازی‌شده و واقعی (ویروسی، باکتریایی و انسانی)، نشان می‌دهیم که LoFreq دارای ویژگی تقریباً کامل است، با حساسیت بهبود یافته قابل‌توجهی در مقایسه با روش‌های موجود و می‌تواند به طور موثر مجموعه داده‌های توالی Illumina عمیق را بدون توسل به تقریب یا اکتشافی تجزیه و تحلیل کند. ما همچنین اعتبار تجربی LoFreq را بر روی دو پلتفرم مختلف (Fluidigm و Sequenom) و کاربرد آن برای فراخوانی انواع جسمانی نادر از مجموعه داده‌های توالی اگزوم برای سرطان معده ارائه می‌کنیم. کد منبع و فایل های اجرایی LoFreq به صورت رایگان در http://sourceforge.net/projects/lofreq/ در دسترس هستند.	LoFreq: یک فراخوان دهنده متغیر بسیار حساس و آگاه با کیفیت توالی برای کشف ناهمگونی جمعیت سلولی از مجموعه داده های توالی یابی با توان عملیاتی بالا
rdpsxb4n	تشکیل خودبه‌خود و برگشت‌پذیر کانون‌ها و رشته‌هایی که حاوی پروتئین‌های درگیر در فرآیندهای متابولیکی مختلف هستند، هم در هسته و هم در سیتوپلاسم رایج است. گرانول های استرس (SGs) و اجسام پردازش (PBs) متعلق به خانواده جدیدی از ساختارهای سلولی هستند که مجموعاً به عنوان کانون های خاموش کننده mRNA شناخته می شوند که mRNA های سرکوب شده و پروتئین های مرتبط با آنها را در خود جای داده اند. SGs و PBs بسیار پویا هستند و بر اثر استرس تشکیل می‌شوند و حل می‌شوند، بنابراین mRNA‌های سرکوب‌شده را با توجه به تغییرات فیزیولوژی سلولی آزاد می‌کنند. علاوه بر این، سنگدانه های حاوی پروتئین های غیر طبیعی در اختلالات نورودژنراتیو مکرر هستند. علیرغم ارتباط فزاینده این توده های فوق مولکولی با عملکردهای سلولی متنوع، یک ابزار خودکار قابل اعتماد برای تجزیه و تحلیل سیستماتیک آنها وجود ندارد. در اینجا ما یک اسکریپت MATLAB به نام BUHO را برای تجزیه و تحلیل تصویر با توان بالا از کانون های سلولی گزارش می کنیم. ما از BUHO برای ارزیابی تعداد، اندازه و توزیع اشیاء متمایز با حداقل انحراف از پارامترهای دستی استفاده کردیم. BUHO با موفقیت به القای SGs و PBs در سلول‌های پستانداران و حشرات در معرض محرک‌های مختلف استرس پرداخت. ما همچنین از BUHO برای ارزیابی پویایی کانون‌های خاموش کننده mRNA خاص به نام کانون Smaug 1 (S-foci) در نورون‌های اولیه بر اثر تحریک سیناپسی استفاده کردیم. در نهایت، ما از BUHO برای تجزیه و تحلیل نقش ژن‌های کاندید در تشکیل SG در یک آزمایش مبتنی بر RNAi استفاده کردیم. ما دریافتیم که FAK56D، GCN2 و PP1 بر تشکیل SG حکومت می کنند. نقش PP1 در سلول‌های پستانداران حفظ می‌شود، همانطور که توسط اثر بازدارنده PP1 salubrinal قضاوت می‌شود و شامل دفسفوریلاسیون فاکتور ترجمه eIF2α است. همه این آزمایش‌ها به صورت دستی و توسط BUHO تجزیه و تحلیل شدند و نتایج در کمتر از 5 درصد از مقدار میانگین متفاوت بود. تجزیه و تحلیل خودکار با استفاده از این روش کاربرپسند، با ارائه جایگزینی قوی، انعطاف‌پذیر و قابل اعتماد برای بررسی دقیق بصری پر زحمت و گاهی غیرقابل اجرا، امکان پردازش تصویر با توان بالا را در زمان‌های کوتاه فراهم می‌کند.	BUHO: یک اسکریپت MATLAB برای مطالعه گرانول های استرس و اجسام پردازشی توسط تجزیه و تحلیل تصویر با توان بالا
4mhh29l0	این مطالعه به ارزیابی اثرات پلی ساکاریدهای پالیدوم سارگاسوم (SPP) بر پاسخ های ایمنی در مدل مرغ می پردازد. کمکی پلی ساکاریدهای Sargassum pallidum در بیماری نیوکاسل (ND)، برونشیت عفونی (IB) و آنفولانزای پرندگان (AI) با بررسی تیتر آنتی بادی و تکثیر لنفوسیت پس از ایمن سازی در جوجه ها مورد بررسی قرار گرفت. به جوجه ها واکسن های ترکیبی غیرفعال ND، IB و AI حاوی SPP در غلظت های 10، 30 و 50 میلی گرم در میلی لیتر، با استفاده از واکسن کمکی روغن به عنوان شاهد، تزریق شدند. تیتر آنتی بادی ND، IB و AI و تکثیر لنفوسیت در 30 میلی گرم در میلی لیتر SPP افزایش یافت. در نتیجه، یک دوز مناسب از SPP ممکن است کاندیدای محرک ایمنی ایمن و کارآمدی باشد که برای واکسن‌ها برای ایجاد پروفیلاکسی اولیه و پایدار مناسب است.	فعالیت کمکی پلی ساکاریدهای Sargassum pallidum در برابر بیماری های ترکیبی نیوکاسل، برونشیت عفونی و واکسن های غیرفعال آنفلوانزای پرندگان
56sag9d0	در 11 ژوئن 2009، سازمان بهداشت جهانی (WHO) اعلام کرد که جهان در مرحله 6 همه گیری آنفلوانزا قرار دارد. در هند، اولین مورد آنفلوانزای H1N1 در سال 2009 در 16 مه 2009 گزارش شد و تا اوت 2010 (زمانی که همه‌گیری اعلام شد)، 38730 مورد H1N1 در سال 2009 تایید شده بود که از این میان 2024 مورد مرگ و میر وجود داشت. در اینجا، ما یک مدل مفهومی از منابع نابرابری سلامت در یک بیماری همه‌گیر آنفولانزا در هند پیشنهاد می‌کنیم. با هدایت یک مدل منتشر شده از منابع محتمل چنین نابرابری‌ها در ایالات متحده، ما ادبیات را برای عوامل تعیین‌کننده منابع محتمل نابرابری‌های بهداشتی در طول یک بیماری همه‌گیر در هند بررسی کردیم. ما دریافتیم که عواملی در سطوح مختلف اجتماعی می‌توانند نابرابری‌ها را در خطر مواجهه و حساسیت به آنفلوآنزا و همچنین دسترسی به درمان پس از ابتلا تعیین کنند: (1) مذهب، کاست و هویت بومی، و همچنین تحصیلات و جنسیت در سطح فردی. ; (2) ثروت در سطح خانوار؛ و (3) نوع مکان، نسبت پزشکان مراقبت های بهداشتی به جمعیت خدمت شده، دسترسی به حمل و نقل و هزینه های عمومی برای مراقبت های بهداشتی در منطقه جغرافیایی محل سکونت. چنین نابرابری هایی می تواند منجر به سطوح نابرابر بیماری و مرگ شود. در حالی که زمانی که داده‌های بروز و مرگ و میر جمع‌آوری‌شده در ارتباط با عوامل اجتماعی-اقتصادی و جغرافیایی در دسترس قرار می‌گیرند، تنها با آزمایش مدل می‌توان عوامل علّی را تعیین کرد، ما توصیه‌هایی را ارائه می‌کنیم که سیاست‌گذاران می‌توانند انجام دهند تا اطمینان حاصل شود که برنامه آمادگی همه‌گیری شامل تمرکز است. در مورد نابرابری های اجتماعی در هند به منظور جلوگیری از تشدید آنها در یک بیماری همه گیر.	نابرابری های بهداشتی موجود در هند: اطلاع رسانی برنامه ریزی آمادگی برای همه گیری آنفولانزا
wubaahn2	یک اولویت کلیدی در تحقیقات بیماری‌های عفونی، درک محرک‌های اکولوژیکی و تکاملی بیماری‌های ویروسی از داده‌های مربوط به بروز بیماری و همچنین تنوع ژنتیکی و آنتی ژنی ویروسی است. ما استفاده از یک روش بیزی مبتنی بر شبیه‌سازی به نام محاسبات تقریبی بیزی (ABC) را برای برازش و ارزیابی مدل‌های فیلودینامیکی که تکامل پاتوژن و بوم‌شناسی را در برابر خلاصه‌ای از این داده‌ها شبیه‌سازی می‌کنند، پیشنهاد می‌کنیم. ما تطبیق پذیری روش را با تجزیه و تحلیل دو مدل فضایی که فیلودینامیک زیرگروه ویروس آنفولانزای انسانی بین همه‌گیر A (H3N2) را توصیف می‌کنند، نشان می‌دهیم. مدل اول رانش آنتی ژنی را به صورت پدیدار شناختی با ایمنی به طور مداوم کاهش می دهد، و مدل دوم تکامل دوره ای جایگزینی خوشه های آنتی ژنی نسبتاً طولانی مدت را توصیف می کند. با ترکیب ویژگی‌های داده‌های نظارت بلندمدت از هلند با ویژگی‌های توالی‌های ژن هماگلوتینین آنفولانزای A (H3N2) نمونه‌برداری شده در شمال اروپا، پارامترهای فیلودینامیک کلیدی را می‌توان با ABC تخمین زد. تجزیه و تحلیل های تناسب نشان می دهد که بی نظمی در بروز بین سالانه و فیلوژنی هماگلوتینین نردبان مانند H3N2 از نظر کمی فقط تحت مدل تکامل دوره ای در یک زمینه فضایی تکثیر می شود. با این حال، پویایی بروز همزمان منجر به تعداد تولید مثل بسیار زیادی می شود و با برآوردهای تجربی میزان حمله در سطح جمعیت H3N2 سازگار نیست. این نتایج نشان می‌دهد که تعاملات بین فرآیندهای تکاملی و زیست‌محیطی، محدودیت‌های کمی متعددی را بر مسیرهای فیلودینامیکی آنفولانزای A(H3N2) تحمیل می‌کند، به طوری که داده‌های توالی و نظارت را می‌توان به صورت هم افزایی مورد استفاده قرار داد. ABC، یکی از چندین رویکرد سنتز داده‌ها، می‌تواند به راحتی کلاس وسیعی از مدل‌های فیلودینامیکی را با انواع مختلفی از داده‌ها ارتباط دهد، اما نیاز به کالیبراسیون دقیق خلاصه‌ها و پارامترهای تحمل دارد.	استنتاج فیلودینامیک و ارزیابی مدل با محاسبه تقریبی بیزی: آنفولانزا به عنوان یک مطالعه موردی
5is9kc52	یک سری از آلکالوئیدهای فنانتروکینولیزیدین 1-24 تهیه شد و ابتدا برای فعالیت ضد ویروسی آنها در برابر ویروس موزاییک تنباکو (TMV) مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج سنجش زیستی نشان داد که اکثر این ترکیبات فعالیت ضد TMV in vivo خوب تا عالی از خود نشان دادند، که ترکیبات 1، 2، 15 و 16 فعالیت قابل توجهی بالاتری نسبت به (R) -antofine و Ningnanmycin تجاری در همان شرایط آزمایش نشان دادند. جانشین های موجود در قسمت فنانترن نقش مهمی در حفظ فعالیت ضد ویروسی بالا در داخل بدن ایفا می کنند. معرفی 6-هیدروکسیل، که برای تعامل با TMV RNA پیشنهاد شده است، فعالیت ضد TMV را افزایش داد. پیکربندی 14aR به عنوان پیکربندی ضد ویروسی ترجیحی برای آلکالوئیدهای فنانتروکینولیزیدین تأیید شد. معرفی گروه هیدروکسی در موقعیت 15 آلکالوئیدهای فنانتروکینولیزیدین باعث افزایش فعالیت برای پیکربندی S شد اما فعالیت را برای پیکربندی R کاهش داد. مطالعه حاضر پشتیبانی اساسی برای توسعه و بهینه سازی آلکالوئیدهای فنانتروکینولیزیدین به عنوان مهار کننده های بالقوه ویروس گیاهی ارائه می دهد.	اولین کشف و مطالعه رابطه ساختار-فعالیت فنانتروکینولیزیدین ها به عنوان عوامل ضد ویروسی جدید علیه ویروس موزائیک تنباکو (TMV)
kff3gig0	پس زمینه. توانایی واکسن‌های آنفولانزا برای استخراج سلول‌های CD4 (+) T و رابطه بین القای سلول‌های T CD4 (+) و پاسخ‌های آنتی‌بادی خنثی‌کننده ناشی از واکسن بحث‌برانگیز بوده است. ظهور ویروس آنفولانزای A با منشاء 2009، زیرگروه H1N1 (A[H1N1]pdm09) فرصتی منحصر به فرد برای بررسی پاسخ به واکسن آنفولانزا متشکل از هر دو آنتی ژن جدید و قبلی و بررسی رابطه بین B-cell و T فراهم کرد. -پاسخ سلولی به واکسیناسیون روش ها ما پاسخ‌های سلول T و آنتی‌بادی CD4(+) را در افراد انسانی واکسینه شده با واکسن A(H1N1)pdm09 زیر واحد تک ظرفیتی دنبال کردیم. ویژگی و بزرگی پاسخ سلول T CD4 (+) با استفاده از سنجش‌های نقطه‌ای ایمونوسوربنت متصل به آنزیم سیتوکین در ترکیب با استخرهای پپتیدی که پروتئین‌های ویروس آنفولانزای مجزا را نشان می‌دهند، ارزیابی شد. نتایج مطالعات ما نشان داد که واکسیناسیون سلول‌های T CD4(+) را به‌راحتی قابل تشخیص برای بخش‌های حفاظت‌شده هماگلوتینین (HA) و پروتئین‌های ویروسی داخلی القا می‌کند. جالب توجه است، گسترش سلول‌های T CD4 (+) اختصاصی HA با پاسخ آنتی‌بادی ارتباط تنگاتنگی داشت. نتیجه گیری این نتایج نشان می‌دهد که گسترش سلول‌های T CD4 (+) ممکن است یک عامل محدودکننده در توسعه پاسخ‌های آنتی‌بادی خنثی‌کننده به واکسن‌های آنفولانزای همه‌گیر باشد و نشان می‌دهد که رویکردهایی برای تسهیل جذب سلول‌های T CD4 (+) ممکن است آنتی‌بادی خنثی‌کننده تولید شده در پاسخ به واکسن های ضد سویه های جدید آنفلوانزا	گسترش سلول‌های T CD4(+) پاسخ‌های آنتی‌بادی خنثی‌کننده را به واکسن زیرگروه H1N1 ویروس آنفلوانزای همه‌گیر 2009 غیرفعال و تک ظرفیتی پیش‌بینی می‌کند.
e1bn79ui		ECR 2011 Book of Abstracts - A - برنامه آموزشی تحصیلات تکمیلی
w7uhqsio		ECR 2011 Book of Abstracts - B - Scientific Sesions
qfl3i7c6	پس زمینه: ایالت ویکتوریا استرالیا، با 5.2 میلیون ساکن، قرنطینه خانگی را در طول همه گیری H1N1 در سال 2009 اعمال کرد. این استراتژی کودکان مدرسه ای را هدف قرار داده بود. هدف از این مطالعه بررسی میزان ارتباط دسترسی والدین به مرخصی استعلاجی با حقوق یا مرخصی استعلاجی با حقوق با (الف) زمان مرخصی از کار برای مراقبت از کودکان قرنطینه شده، (ب) امور مالی خانوار، و (ج) تبعیت از آنها بود. با توصیه های قرنطینه روش‌ها: ما یک نظرسنجی آنلاین و تلفنی از خانواده‌هایی که از طریق 33 مدرسه (85٪ مدارس واجد شرایط) استخدام شده بودند، انجام دادیم، 314 پاسخ (27٪) دریافت کردیم، و نمونه فرعی 133 خانوار را که در آن همه والدین ساکن شاغل بودند، تجزیه و تحلیل کردیم. نتایج: در 52 درصد از خانواده ها، والدین برای مراقبت از کودکان قرنطینه شده از کار مرخصی گرفتند. به نظر می رسد خانوارهایی که در آنها هیچ والدین مقیمی به مرخصی دسترسی نداشته اند، کمتر احتمال دارد که از کار مرخصی بگیرند (42٪ در مقابل 58٪، p=0.08) اگرچه این تفاوت فقط اهمیت مرزی دارد. در میان والدینی که مرخصی داشتند، آنهایی که در خانواده‌های بدون دسترسی به مرخصی بودند، بیشتر احتمال داشت حقوق خود را از دست بدهند (73٪ در مقابل 21٪، P<0.001). از 26 خانواری که یکی از والدین آنها به دلیل مرخصی گرفتن از کار حقوق خود را از دست داده است، 42 درصد با عواقب مالی بیشتری مانند ناتوانی در پرداخت صورتحساب مواجه شده اند. دسترسی به مرخصی انطباق با توصیه های قرنطینه را پیش بینی نمی کرد. نتیجه‌گیری: برنامه‌های همه‌گیری آتی باید هزینه‌های اقتصادی متحمل شده توسط خانوارها و گزینه‌های جبران خسارت خانواده‌های قرنطینه شده را در نظر بگیرند.	حقوق مرخصی، مرخصی از کار و تأثیرات مالی خانواده ناشی از رعایت قرنطینه در طول شیوع H1N1
5qa2z9jj	برای بررسی تأثیرات یک برنامه بهداشت عمومی پیشگیری از HIV در چند شهر (پروژه دور پنجم صندوق جهانی چین) بر استفاده از کاندوم و عفونت HIV، ما چهار نظرسنجی سالانه مقطعی را از سال 2006 تا 2009 در میان 20843 مردی که با مردان رابطه جنسی دارند، تجزیه و تحلیل کردیم. MSM) در 16 شهر چین. استفاده از کاندوم خود گزارش شده در آخرین رابطه جنسی با شریک مرد از 58 درصد در سال 2006 به 81 درصد در سال 2009 افزایش یافته است (آزمون روند، 001/0 P<). شیوع HIV از 2.3 درصد در سال 2006 به 5.3 درصد در سال 2009 افزایش یافته است (P<0.001). تجزیه و تحلیل رگرسیون لجستیک چند متغیره نشان داد که دریافت مداخلات گزارش‌شده توسط خود یک پیش‌بینی‌کننده مستقل افزایش استفاده از کاندوم در آخرین رابطه جنسی با شریک مرد در طول زمان بود (نسبت شانس تعدیل‌شده [aOR]، 1.63 در سال 2006 تا 2.33 در سال 2009؛ P<0.001). و شیوع HIV کمتر (aOR، 1.08 در سال 2006 تا 0.45 در سال 2009؛ P<0.001). شیوع HIV از سال 2006 تا 2009 برای شرکت‌کنندگانی که هیچ مداخله‌ای گزارش نشده بودند (2.1 درصد در سال 2006 به 10.3 درصد در سال 2009) و کمتر برای کسانی که مداخلات داشتند (2.4 درصد تا 4.7 درصد) افزایش یافت. این برنامه بهداشت عمومی چین تأثیرات مثبتی بر رفتارها و میزان بیماری در بین جمعیت MSM داشت. تشدید پوشش و شدت مداخلات موثر برای افزایش بیشتر استفاده از کاندوم و برای معکوس کردن روند رو به افزایش اپیدمی HIV مورد نیاز است.	اثربخشی مداخلات یکپارچه پیشگیری از HIV در میان مردان چینی که با مردان رابطه جنسی دارند: ارزیابی برنامه بهداشت عمومی 16 شهر
y0zjkmoe	سابقه و هدف: برخی از بیماران نسبت به سایرین که سطح مشابهی از تکثیر ویروسی دارند، پاسخ بیشتری به عفونت ویروسی دارند. هیپرسیتوکینمی مکانیسم آسیب شناسی ایمنی اصلی است که به یک دوره بالینی شدیدتر در موارد آنفولانزای A/H1N1 کمک می کند. مزیت تولید یا آسیب ناشی از این سیتوکین ها در بیماری شدید مشخص نیست. ژن‌هایی که این مولکول‌ها را کد می‌کنند چندشکلی هستند و آلل‌های خاصی با استعداد ابتلا به بیماری‌های مختلف مرتبط هستند. هدف از مطالعه حاضر تعیین ارتباط بین پلی مورفیسم های TNF، LTA، IL1B، IL6، IL8، و CCL1 و عفونت و شدت بیماری ناشی از همه گیری A/H1N1 در مکزیک در سال 2009 بود. : مطالعه موردی- شاهدی. بیماران مبتلا به عفونت با ویروس همه گیر A/H1N1 با Real Time PCR تایید شدند. گروه شاهد، بیماران مبتلا به عفونتی شبیه به آنفولانزا و افراد سالم غیر خانوادگی بیماران مبتلا به آنفولانزا بودند. سابقه پزشکی و نتیجه بیماری ثبت شد. نمونه های DNA برای پلی مورفیسم های TNF rs361525، rs1800629 و rs1800750 ژنوتیپ شدند. LTA rs909253; IL1B rs16944; IL6 rs1818879; IL8 rs4073; و CCL1 rs2282691. نسبت شانس (OR) و فاصله اطمینان 95٪ (95٪ CI) محاسبه شد. مدل رگرسیون لجستیک بر اساس سن و شدت بیماری در موارد تنظیم شد. ResultsInfection با ویروس همه گیر A/H1N1 با ژنوتیپ های زیر همراه بود: TNF rs361525 AA، OR = 27.00. 95% CI = 3.07-1248.77)؛ LTA rs909253 AG (OR = 4.33، 95% CI = 1.82-10.32)؛ TNF rs1800750 AA (OR = 4.33، 95% فاصله اطمینان (CI = 1.48-12.64)؛ علاوه بر این، LTA rs909253 AG یک ارتباط آماری معنادار محدود با مرگ و میر را نشان داد (0.06 = P، OR = 3.13). حاملان ژنوتیپ TNF rs1800629 GA با سطوح بالای نیتروژن اوره خون (0.05 = P) همراه بود. آنهایی که از ژنوتیپ TNF rs1800750 AA، با سطوح بالای کراتین فسفوکیناز (P=0.05). ژنوتیپ IL1B rs16944 AA با افزایش تعداد لکوسیت ها (P<0.001) و ژنوتیپ IL8 rs4073 AA، با مقدار بالاتر برای P(a)O(2) میلی متر جیوه همراه بود. نتیجه‌گیری: پلی‌مورفیسم‌های ژن‌های درگیر در فرآیند التهابی به شدت رفتار بالینی عفونت توسط ویروس آنفلوانزای همه‌گیر A/H1N1 کمک می‌کنند.	عفونت ویروسی آنفلوانزای همه‌گیر A/H1N1 و پلی‌مورفیسم‌های TNF، LTA، IL1B، IL6، IL8، و CCL در جمعیت مکزیک: مطالعه مورد-شاهدی
1bsoc3rq	مکمل یک بخش اساسی از پاسخ ایمنی ذاتی است. با مسیرهای درون زا متنوع تعامل دارد و به حفظ هموستاز، تعدیل پاسخ های ایمنی تطبیقی و ایجاد آسیب شناسی های مختلف کمک می کند. سودمندی بالقوه، هم در محیط های تحقیقاتی و هم بالینی، ترکیباتی که فعالیت مکمل را شناسایی یا تعدیل می کنند، منجر به هزاران نشریه در مورد نوآوری های مرتبط با مکمل در زمینه هایی مانند کشف دارو، تشخیص و درمان بیماری، و سنجش ایمنی، و غیره شده است. این مطالعه روند توزیع و انتشار پتنت های مربوط به سیستم مکمل را که توسط اداره ثبت اختراع و علائم تجاری ایالات متحده از سال 1976 تا به امروز اعطا شده است، برجسته می کند. مقایسه ای با اسناد مرتبط با مکمل منتشر شده توسط سازمان جهانی مالکیت فکری نیز گنجانده شده است. تجزیه و تحلیل های آماری افزایش تنوع در علایق تحقیقاتی مرتبط با مکمل را در طول زمان نشان داد. بیش از نیمی از پتنت‌ها بر روی کشف بازدارنده‌ها تمرکز داشتند. علاقه به کلاس‌های بازدارنده‌های مختلف، در سال‌های اخیر تبدیل قابل‌توجهی را از ترکیبات شیمیایی به پروتئین‌ها و آنتی‌بادی‌ها نشان داد. در میان کاربردهای بالینی، پروتئین های مکمل و تعدیل کننده های آن به طور گسترده برای تشخیص و درمان بیماری های چشم (به ویژه دژنراسیون ماکولا مرتبط با سن)، رد پیوند، سرطان، سپسیس و انواع دیگر بیماری های التهابی و ایمنی به ثبت رسیده اند. تمام پتنت‌های مورد بحث در این فصل، و همچنین مواردی که از پایگاه‌های اطلاعاتی دیگر ارائه می‌شوند، از پایگاه داده پتنت جدید ساخته شده ما در دسترس هستند: www.innateimmunity.us/patent.	مکمل در عمل: تجزیه و تحلیل روند ثبت اختراع از سال 1976 تا 2011
rrezynbs	سابقه و هدف: تولید آنتی بادی های مونوکلونال انسانی که فعالیت خنثی کننده گسترده ای از خود نشان می دهند برای جلوگیری از عفونت HIV-1 مورد نیاز است، با این حال تنها تعداد کمی از این آنتی بادی ها تا به امروز تولید شده اند. جداسازی آنتی‌بادی‌ها توسط فناوری هیبریدوما، فرآیندی دشوار و با بازده کمتر است. علاوه بر این، از دست دادن کلون های ناپایدار یا آهسته در حال رشد که ممکن است ویژگی های اتصال منحصر به فرد داشته باشند، اغلب در طول شبیه سازی و تکثیر رخ می دهد و کلون های به شدت مثبت اغلب از بین می روند. با فرآیندی که در این مقاله توضیح داده شد، از این امر اجتناب شد، که در آن، با ترکیب استراتژی تبدیل EBV و فناوری DNA نوترکیب، ما قطعات متغیر تک زنجیره انسانی (scFvs) را در برابر سومین ناحیه متغیر (V3) از کلاد C HIV- ساختیم. 1 پاکت. ResultsAn یک کتابخانه فاژ خاص آنتی ژن از 7000 کلون از آنتی بادی غنی شده V3- مثبت ترشح شده EBV سلول های تبدیل شده ساخته شد. با بستن DNA scFv هضم شده به وکتور فاژمید و بررسی زیستی در برابر پپتیدهای اجماع HIV-1 C و B V3 به دنبال انتخاب تصادفی 40 کلون، ما 15 کلون را شناسایی کردیم که واکنش V3 را در ELISA فاژ نشان دادند. تجزیه و تحلیل اثر انگشت DNA و توالی یابی نشان داد که 13 کلون از 15 کلون متمایز بودند. بیان کلون های مثبت توسط SDS-PAGE و وسترن بلات آزمایش شد. همه 13 scFvs ضد V3 واکنش متقابل را در برابر هر دو پپتید C و B V3 نشان دادند و هیچ واکنشی در برابر سایر پپتیدهای نامرتبط در ELISA نشان ندادند. سنجش های اولیه خنثی سازی درجات مختلفی از خنثی سازی ویروس های کلاد C و B را نشان داد. تبدیل EBV، به دنبال انتخاب آنتی ژن خطوط برای شناسایی بایندرهای خاص، انتخاب فاژ را از خطوط کلون نشده برای تولید scFv فعال کرد، بنابراین از مشکلات فناوری هیبریدوما جلوگیری کرد. علاوه بر این، همانطور که کلون ها برای اتصال آنتی ژن از قبل آزمایش شدند، یک کتابخانه نسبتا کوچک برای انتخاب تعداد قابل توجهی از فاژهای اتصال آنتی ژن منحصر به فرد کافی بود. پس از انتخاب، کلون های فاژ به روش کلونال تکثیر شدند. نتیجه گیری: این استراتژی می تواند به طور موثر مورد استفاده قرار گیرد و برای تولید آنتی بادی های نوترکیب متنوع مقرون به صرفه است. این اولین مطالعه برای تولید scFvs ضد V3 علیه HIV-1 Clade C است.	یک استراتژی جدید برای تولید کارآمد scFvs ضد V3 انسانی در برابر HIV-1 clade C
baxxcyji	سابقه و هدف: اگرچه استفاده از ماسک در اماکن عمومی برای پیشگیری از آنفولانزا توصیه نشده است، این دستگاه ها اغلب در بسیاری از کشورهای آسیایی در طول فصل آنفولانزا استفاده می شوند. در ژاپن، تصور می‌شود که چنین رفتاری می‌تواند نشانه‌ای از سایر اقدامات بهداشتی مثبت باشد. بنابراین، هدف این مطالعه تعیین این بود که آیا پوشیدن ماسک صورت در اماکن عمومی با سایر اقدامات بهداشتی و رفتارهای بهداشتی مثبت در میان بزرگسالان ژاپنی مرتبط است یا خیر. روش‌ها: ما در ابتدا حدود 3000 فرد ژاپنی 20 تا 69 ساله را که در یک شرکت نظرسنجی وب ثبت‌نام شده بودند، استخدام کردیم. از شرکت کنندگان خواسته شد تا اقدامات بهداشت شخصی خود را در طول فصل آنفولانزا در سال گذشته به یاد بیاورند. سپس از تحلیل رگرسیون لجستیک برای بررسی ارتباط بین پوشیدن ماسک صورت در اقدامات بهداشت عمومی و شخصی و رفتارهای بهداشتی استفاده شد. نتایج: در مجموع 3129 نفر به این نظرسنجی پاسخ دادند که در میان آنها 38 درصد گزارش کردند که در فصل قبلی آنفولانزا از ماسک صورت در مکان های عمومی استفاده کرده اند. استفاده از ماسک صورت در ملاء عام با روش‌های بهداشتی گزارش‌شده مختلفی از جمله: شستن مکرر دست‌ها (نسبت شانس تعدیل‌شده [OR]: 1.67؛ 95% فاصله اطمینان [95% CI]: 1.34-1.96)، شستن گاه به گاه دست‌ها (OR) همراه بود. : 1.43؛ 95% CI: 1.10-1.75)، پرهیز مکرر از شلوغی (OR: 1.85؛ 95% CI: 1.70-1.98)، گاهی اوقات اجتناب از شلوغی (OR: 1.65؛ 95% CI: 1.53-1.76)، غرغره کردن مکرر : 1.68؛ 95% CI: 1.51-1.84)، غرغره کردن گاه به گاه (OR: 1.46؛ 95% CI: 1.29-1.62)، اجتناب از تماس نزدیک با فرد آلوده (OR: 1.50؛ 95% CI: 1.33-1.67)، اجتناب از تماس نزدیک با فرد مبتلا (OR: 1.31؛ 95% CI: 1.16-1.46) و واکسینه شدن آنفولانزا در فصل گذشته (OR: 1.31؛ 95% CI: 1.17-1.45). نتیجه‌گیری: به طور کلی، این مطالعه نشان می‌دهد که پوشیدن ماسک صورت در اماکن عمومی ممکن است با سایر شیوه‌های بهداشت شخصی و رفتارهای بهداشتی در میان بزرگسالان ژاپنی مرتبط باشد. به جای جلوگیری از آنفولانزا، استفاده از ماسک صورت ممکن است نشانگر اقدامات بهداشتی اضافی و مثبت و سایر رفتارهای بهداشتی مطلوب در همان افراد باشد.	پوشیدن ماسک صورت در اماکن عمومی در طول فصل آنفولانزا ممکن است منعکس کننده سایر اقدامات بهداشتی مثبت در ژاپن باشد
uylgyhs8	کنترل بیماری های عفونی مانند ویروس آنفولانزای خوکی (SwIV) نقش مهمی در تولید غذا هم از نظر سلامت حیوانات و هم از نظر بهداشت عمومی ایفا می کند. میکروارگانیسم‌های پروبیوتیک و سایر مکمل‌های غذایی بهبود دهنده سلامت در سال‌های اخیر مورد توجه فزاینده‌ای قرار گرفته‌اند، اما هیچ اطلاعاتی در مورد اثرات پروبیوتیک‌ها بر ویروس آنفولانزای خوکی در دسترس نیست. در اینجا ما با ارزیابی پتانسیل مهاری پروبیوتیک Enterococcus faecium NCIMB 10415 (E.faecium) بر روی تکثیر دو سویه خوک ویروس آنفولانزا (سویه H1N1 و H3N2) در رده سلولی ماکروفاژ خوک پیوسته (3D4/21) به این سوال می پردازیم. و در سلول های MDBK. کشت سلولی با E.faecium در غلظت غیر سمی 1×10(6) CFU/ml در محیط رشد به مدت 60 تا 90 دقیقه قبل، در طول و بعد از عفونت SwIV تحت درمان قرار گرفتند. پس از انکوباسیون بیشتر کشت ها در محیط رشد عاری از پروبیوتیک، زنده ماندن سلولی و انتشار ویروس در 48 ساعت یا 96 ساعت پس از عفونت تعیین شد. نتایج به‌دست‌آمده بهبود تقریباً کامل زنده‌مانی سلول‌های آلوده به SwIV و مهار تکثیر ویروس را تا چهار واحد ورود به سیستم در سلول‌های تیمار شده با E. faecium نشان می‌دهد. در هر دو سلول 3D4/21- و MDBK، یک درمان 60 دقیقه ای با E. faecium باعث انتشار اکسید نیتریک (NO) شد که مطابق با شواهد منتشر شده برای عملکرد ضد ویروسی NO است. علاوه بر این، E. faecium باعث بیان سلولی اصلاح شده واسطه‌های دفاعی منتخب در سلول‌های 3D4 شد: در حالی که بیان TNF-α، TLR-3 و IL-6 در سلول‌های آلوده به SwIV و تحت درمان با پروبیوتیک کاهش یافت، IL-10. افزایش یافت. از آنجایی که ما شواهد تجربی برای به دام انداختن جذب مستقیم SwIV از طریق E.faecium به دست آوردیم، این میکروارگانیسم پروبیوتیک ویروس های آنفولانزا را حداقل با دو مکانیسم، تعامل فیزیکی مستقیم و تقویت دفاع ذاتی در سطح سلولی مهار می کند.	تاثیر مهاری انتروکوکوس فاسیوم بر انتشار ویروس آنفلوانزای A در محیط آزمایشگاهی
m9q4av7g	تصور می‌شود که سلول‌های T ضد ویروسی تنظیم می‌کنند که آیا ویروس هپاتیت C (HCV) و عفونت‌های HIV منجر به کنترل ویروسی، تداوم بدون علامت یا بیماری شدید می‌شود، اگرچه دلایل این پیامدهای متفاوت نامشخص است. با این حال، شواهد ژنتیکی اخیر، همبستگی بین گیرنده‌های سلولی کشنده طبیعی (NK) و پیشرفت عفونت HIV و HCV (1-3) را نشان داده است، که نشان می‌دهد سلول‌های NK در این بیماری‌های مرتبط با سلول T نقش دارند. در حالی که لیز مستقیم سلول های آلوده به ویروس با واسطه سلول های NK ممکن است به دفاع ضد ویروسی در طول برخی عفونت های ویروسی، به ویژه عفونت های سیتومگالوویروس موشی (MCMV) در موش و شاید HIV در انسان (4-5) کمک کند، سلول های NK نیز مشکوک شده اند. به عنوان داشتن عملکردهای تنظیم کننده ایمنی. به عنوان مثال، سلول های NK ممکن است به طور غیرمستقیم پاسخ های سلول های T را با لیز کردن سلول های ارائه دهنده آنتی ژن آلوده به MCMV تنظیم کنند (6-7). برخلاف MCMV، عفونت ویروس کورمننژیت لنفوسیتی (LCMV) در موش به هر گونه اثرات ضد ویروسی مستقیم سلول های NK مقاوم به نظر می رسد (5،8). در اینجا نقش سلول‌های NK در تنظیم پایداری ویروسی وابسته به سلول T و آسیب‌شناسی ایمنی در موش‌های آلوده به LCMV، یک مدل تثبیت‌شده برای عفونت‌های HIV و HCV در انسان، مورد بررسی قرار گرفت. ما یک تعامل سه‌طرفه را توصیف می‌کنیم، که به موجب آن سلول‌های NK فعال شده، سلول‌های CD4 T فعال‌شده‌ای را که بر عملکرد و فرسودگی سلول‌های CD8 تأثیر می‌گذارند، از بین می‌برند. در دوز بالای ویروس، سلول‌های NK از آسیب‌شناسی کشنده جلوگیری کردند و در عین حال خستگی سلول‌های T و ماندگاری ویروسی را ممکن ساختند، اما در دوز متوسط سلول‌های NK به‌طور متناقضی آسیب‌شناسی با واسطه سلول‌های T کشنده را تسهیل کردند. بنابراین، سلول‌های NK می‌توانند به‌عنوان رئوستات عمل کنند و پشتیبانی با واسطه سلول‌های CD4 T را برای سلول‌های CD8 T ضد ویروسی که پاتوژنز و تداوم ویروس را کنترل می‌کنند، تنظیم کنند.	سلول های کشنده طبیعی به عنوان رئوستات عمل می کنند که سلول های T ضد ویروسی را تعدیل می کنند
qic51knn	پس زمینه: در استرالیا، اپیدمی آنفولانزای A(H1N1)pdm09 در سال 2009 منجر به افزایش پذیرش در مراقبت های ویژه شد. تخمین سهم سالانه آنفولانزا در استفاده از مراقبت‌های ویژه دشوار است، زیرا بسیاری از افراد مبتلا به آنفولانزا بدون سندرم آنفلوانزای کلاسیک و آزمایش‌های آزمایشگاهی ممکن است انجام نشوند. ما از یک رویکرد مبتنی بر جمعیت برای برآورد و مقایسه تأثیر اپیدمی‌های اخیر آنفولانزای فصلی و همه‌گیر استفاده کردیم. روش‌ها: برای سال‌های 2007 تا 2010، سری‌های زمانی توصیف‌کننده پیامدهای سلامت در گروه‌های جمعیتی مختلف از پایگاه داده‌ای از تمام پذیرش‌های بخش مراقبت‌های ویژه (ICU) در ایالت نیو ساوت ولز، استرالیا تهیه شد. رویکرد Serfling، یک روش سری زمانی، برای تخمین الگوهای فصلی در پیامدهای سلامت در غیاب اپیدمی‌های آنفلوانزا مورد استفاده قرار گرفت. سهم آنفلوانزا با کم کردن استفاده فصلی مورد انتظار از استفاده مشاهده شده در طول هر دوره همه‌گیری برآورد شد. نتایج: میزان بیش از حد تخمینی بستری‌های ICU تنفسی مرتبط با آنفولانزا به ازای هر 100000 نفر در سال 2007 بیش از سه برابر بیشتر از سال 2007/100/100000 (2.6/100000، 95% فاصله اطمینان (CI 2.0 تا 3.1)) نسبت به سال همه‌گیری، 2009/2009/576% CI بود (0.0.0). 0.04 تا 1.48). در سال 2009، بالاترین میزان پذیرش بیش از حد تنفسی در ICU در افراد 17 تا 64 سال (2.9/100000، 95% فاصله اطمینان (CI): 2.2 تا 3.6) بود، در حالی که در سال 2007، بالاترین میزان مازاد در بیماران 65 ساله یا بالاتر (9.5/100،00) بود. ، 95% فاصله اطمینان (CI): 6.2 تا 12.8). در سال 2009، میزان مازاد 17/100000 (95% فاصله اطمینان (CI 14 تا 20) در افراد بومی و 14/100000 (95% فاصله اطمینان (CI 13 تا 16) در زنان باردار بود. نتیجه‌گیری: در حالی که آنفولانزا به طور مکرر تشخیص داده شد و اوج استفاده از مراقبت‌های ویژه در طول همه‌گیری آنفولانزای همه‌گیر در سال 2009 بیشتر بود، پذیرش کلی بیش از حد در مراقبت‌های ویژه برای بیماری‌های تنفسی در طول فصل آنفولانزا در سال 2007 بسیار بیشتر بود. بنابراین، تأثیر فصلی آنفولانزا در مراقبت های ویژه ممکن است قبلاً کمتر شناخته شده باشد. در سال 2009، استفاده زیاد از ICU در میان بزرگسالان جوان تا میانسال با استفاده نسبتاً کم در میان افراد مسن جبران شد و افراد بومی و زنان باردار به طور قابل ملاحظه ای بیش از حد در ICU حضور داشتند. تاکید بیشتر بر پیشگیری از بیماری های جدی در افراد بومی و زنان باردار باید در اولویت برنامه ریزی همه گیری باشد.	تاثیر آنفولانزای A(H1N1)pdm09 در مقایسه با آنفولانزای فصلی بر پذیرش مراقبت‌های ویژه در نیو ساوت ولز، استرالیا، 2007 تا 2010: تجزیه و تحلیل سری زمانی
s7h6884o	پاسخ پروتئین بازشده (UPR) یک مکانیسم محافظ سلولی ناشی از استرس است که به سمت هجوم مقدار زیادی پروتئین در شبکه آندوپلاسمی (ER) ایجاد می‌شود. در مطالعه حاضر، ارزیابی کردیم که آیا AAV مسیرهای UPR را در طول عفونت دستکاری می کند یا خیر. ما ابتدا نقش سه محور اصلی UPR، یعنی آنزیم 1 نیازمند اینوزیتول اندوریبونوکلئاز (IRE1α)، فعال کننده فاکتور رونویسی 6 (ATF6) و ER کیناز شبه PKR (PERK) را در سلول های آلوده به AAV بررسی کردیم. RNA کل از سلول‌های HeLa آلوده به ساختگی یا AAV برای تعیین سطوح 8 رونوشت مختلف پاسخگو به استرس ER از این مسیرها استفاده شد. ما افزایش قابل توجهی از ژن‌های IRE1α (تا 11 برابر) و PERK (تا 8 برابر) را 12 تا 48 ساعت پس از عفونت با وکتورهای AAV2 خود تکمیلی (sc) مشاهده کردیم، اما با وکتورهای AAV2 تک رشته‌ای (ss) کمتر برجسته بود. . مطالعات بیشتر نشان داد که scAAV1 و scAAV6 همچنین UPR سلولی را در شرایط آزمایشگاهی القا می کنند، با وکتورهای AAV1 مسیر PERK را فعال می کنند (3 برابر) در حالی که وکتورهای AAV6 افزایش قابل توجهی را در هر سه مسیر اصلی UPR ایجاد می کنند [6-16 برابر]. این داده ها نشان می دهد که نوع و قدرت فعال سازی UPR به کپسید ویروسی بستگی دارد. سپس بررسی کردیم که آیا مهار گذرا مسیرهای UPR توسط تداخل RNA تأثیری بر انتقال AAV دارد یا خیر. خاموش کردن PERK و IRE1α با واسطه siRNA تأثیر متوسطی بر بیان ژن با واسطه AAV2 و AAV6 (~1.5-2 برابر) در شرایط آزمایشگاهی داشت. علاوه بر این، انتقال ژن کبدی وکتورهای scAAV2 در داخل بدن، مسیرهای IRE1α و PERK را به شدت افزایش داد (به ترتیب 2 و 3.5 برابر). با این حال، هنگامی که حیوانات در طول انتقال ژن scAAV2 با یک مهارکننده UPR دارویی (متفورمین) از قبل تحت درمان قرار گرفتند، سیگنال دهی UPR و پاسخ التهابی بعدی آن همزمان با افزایش متوسط 2.8 برابری در بیان ژن کاهش یافت. در مجموع، این داده ها نشان می دهد که وکتورهای AAV مسیرهای UPR سلولی را فعال می کنند و مهار انتخابی آنها ممکن است در طول انتقال ژن با واسطه AAV مفید باشد.	فعال‌سازی پاسخ پروتئین بازشده سلولی توسط ناقل‌های ویروس مرتبط با آدنو نوترکیب
8g9jd240	هیپوکسی یک عامل ریزمحیطی مهم است که باعث متاستاز سرطان می شود. هیپوکسی/فاکتور القایی هیپوکسی-1α (HIF-1α) بسیاری از مراحل مهم فرآیندهای متاستاتیک را تنظیم می‌کند، به‌ویژه انتقال اپیتلیال- مزانشیمی (EMT) که یکی از مکانیسم‌های حیاتی برای ایجاد مراحل اولیه متاستاز تومور است. برای درک بهتر مکانیسم متاستاز تنظیم‌شده با هیپوکسی، ژن‌های هدف تنظیم‌شده با هیپوکسی/HIF-1α به کلاس‌های مختلفی از جمله فاکتورهای رونویسی، اصلاح‌کننده‌های هیستون، آنزیم‌ها، گیرنده‌ها، کینازها، GTPase‌های کوچک، ناقل‌ها، مولکول‌های چسبندگی دسته‌بندی می‌شوند. مولکول های سطحی، پروتئین های غشایی و میکرو RNA ها. نقش های مختلف این ژن های هدف با توجه به ارتباط آنها با متاستاز ناشی از هیپوکسی شرح داده شده است. ما امیدواریم که این بررسی چارچوبی برای کاوش بیشتر ژن‌های هدف تنظیم‌شده با هیپوکسی/HIF-1α و نمای جامعی از تصویر متاستاتیک ناشی از هیپوکسی فراهم کند.	ژن های هدف تنظیم شده با هیپوکسی که در متاستاز تومور نقش دارند
nj1ub77s	ژن درمانی چشمی به سرعت در حال تبدیل شدن به واقعیت است. تا نوامبر 2012، تقریباً 28 کارآزمایی بالینی برای ارزیابی عوامل ژن درمانی جدید تأیید شد. عفونت های ویروسی مانند کراتیت تبخال ناشی از ویروس هرپس سیمپلکس 1 (HSV-1) می تواند عوارض جدی ایجاد کند که ممکن است منجر به کوری شود. عود بیماری محتمل است و بنابراین پیوند قرنیه ممکن است راه حل درمانی ایده آلی نباشد. این مقاله بر روی وضعیت فعلی تحقیقات ژن درمانی چشمی علیه کراتیت هرپس، از جمله استفاده از ناقل‌های ویروسی و غیر ویروسی، مسیرهای تحویل ژن‌های درمانی، تکنیک‌های جدید و استراتژی‌های تحقیقاتی کلیدی تمرکز خواهد کرد. در حالی که اصلاح بیماری های ارثی هدف اولیه زمینه ژن درمانی بود، در اینجا به بیان تراریخته، جایگزینی ژن، خاموش کردن یا بریدن می پردازیم. ژن درمانی کراتیت هرپسی که قبلاً در ادبیات گزارش شده بود با تأکید بر اهداف ژن درمانی کاندید غربالگری می شود. استراتژی‌های متداول اتخاذ شده برای ارزیابی مزایای نسبی درمان محافظتی با استفاده از داروهای ضد ویروسی و ژن درمانی رایج در برابر علائم طولانی‌مدت عفونت چشمی HSV-1، التهاب و نئوواسکولاریزاسیون مورد بحث قرار می‌گیرند. ژن درمانی موفق می تواند راه حل های فیزیولوژیکی و دارویی نوآورانه ای را در برابر کراتیت هرپسی ارائه دهد.	هدف قرار دادن کراتیت هرپتیک توسط ژن درمانی
2qds187e	اثرات نامتناسب اپیدمی H1N1 در سال 2009 بر بسیاری از جوامع بومی کانادا، توجه را به آسیب پذیری این جوامع از نظر پیامدهای بهداشتی در مواجهه با بیماری های عفونی در حال ظهور و ظهور مجدد جلب کرده است. بررسی چالش های خاص پیش روی این جوامع برای بهبود برنامه ریزی بهداشت عمومی ضروری است. در راستای اهداف تیم مدل‌سازی تحقیقات شیوع آنفلوآنزای همه‌گیر (Pan-InfORM)، کارگاه بهداشت عمومی کانادا در مرکز مدل‌سازی بیماری (CDM) برگزار شد تا: (i) ارزیابی یافته‌های تحقیقات پس از همه‌گیری. (2) شناسایی شکاف های موجود در دانش که هنوز از طریق تحقیقات جاری و فعالیت های مشترک برطرف نشده است. و (iii) بر اساس مشارکت های موجود در جامعه تحقیقاتی برای ایجاد پیوندهای مشترک جدید با سازمان های بهداشتی بومیان. این کارگاه به اهداف خود در شناسایی یافته‌های تحقیقاتی اصلی و اطلاعات در حال ظهور پس از همه‌گیری، و برجسته کردن چالش‌های کلیدی که موانع قابل‌توجهی برای حفاظت از سلامت و ارتقای جمعیت بومیان کانادا ایجاد می‌کند، دست یافت. چالش‌های بهداشتی که جمعیت‌های بومی کانادا با آن مواجه هستند منحصربه‌فرد و پیچیده هستند و تنها از طریق تعامل فعال با جوامع آسیب‌دیده قابل حل هستند. جامعه پژوهشی دانشگاهی باید یک چارچوب میان رشته ای جدید ایجاد کند، که بر اساس مفاهیم «جوامع عمل» است، تا اطمینان حاصل شود که اولویت های پژوهشی شناسایی و هدفمند هستند، و نتایج در زمینه سلامت جامعه برای بهبود سیاست و عملکرد ترجمه می شود. .	حفاظت از سلامت جمعیت بومی: دیدگاه کانادایی
7cgqxt2m	ویروس اشمالنبرگ (SBV) یک ارتوبونیاویروس نوظهور نشخوارکنندگان است که با شیوع ناهنجاری‌های مادرزادی در حیوانات سقط‌شده و مرده‌زایی همراه است. از زمان کشف آن در نوامبر 2011، SBV به سرعت در بسیاری از کشورهای اروپایی گسترش یافته است. در اینجا، ما ابزارهای مولکولی و سرولوژیکی و یک مدل تجربی in vivo را به عنوان بستری برای مطالعه پاتوژنز SBV، تروپیسم و برهمکنش‌های ویروس-سلول میزبان توسعه دادیم. با استفاده از یک رویکرد زیست شناسی مصنوعی، ما یک سیستم ژنتیک معکوس برای نجات سریع و دستکاری ژنتیکی SBV ایجاد کردیم. ما نشان دادیم که SBV دارای یک تروپیسم گسترده در کشت سلولی است و SBV مصنوعی در شرایط آزمایشگاهی به همان اندازه ویروس نوع وحشی کارآمد تکرار می شود. ما یک مدل آزمایشی موش را برای مطالعه عفونت SBV توسعه دادیم و نشان دادیم که این ویروس به وفور در نورون‌ها تکثیر می‌شود، جایی که باعث ماسکی مغزی و واکوئل شدن قشر مغز می‌شود. این ضایعات حاد ناشی از ویروس برای درک پیشرفت از واکوئلاسیون به پورانسفالی و تخریب بافت گسترده، که اغلب در بره ها و گوساله های سقط شده در موارد طبیعی اشمالنبرگ مشاهده می شود، مفید هستند. در واقع، ما سطوح بالایی از آنتی‌ژن‌های SBV را در نورون‌های ماده خاکستری مغز و نخاع بره‌ها و گوساله‌هایی که به طور طبیعی مبتلا شده‌اند شناسایی کردیم، که نشان می‌دهد هیپوپلازی عضلانی مشاهده‌شده در بره‌های آلوده به SBV عمدتاً ثانویه به آسیب سیستم عصبی مرکزی است. در نهایت، ما عوامل مولکولی حدت SBV را بررسی کردیم. جالب توجه است، ما یک کلون بیولوژیکی SBV را پیدا کردیم که پس از عبور در کشت سلولی، میزان حدت را در موش ها افزایش می دهد. ما همچنین دریافتیم که یک جهش حذف SBV از پروتئین غیر ساختاری NSs (SBVΔNSs) در موش ها نسبت به نوع وحشی SBV بدخیم تر است. کاهش حدت SBV به ناتوانی SBVΔNSs در مسدود کردن سنتز IFN در سلول های آلوده به ویروس بستگی دارد. در نتیجه، این کار یک چارچوب تجربی مفید برای مطالعه زیست‌شناسی و پاتوژنز SBV فراهم می‌کند.	پاتوژنز ویروس اشمالنبرگ، تروپیسم و تعامل با سیستم ایمنی ذاتی میزبان
21hg9t8h	مقدمه: همانژیوم حفره ای رحم ضایعات خوش خیم عروقی نادری هستند. 9 مورد همانژیوم حفره ای منتشر رحم حاملگی گزارش شده است که اکثر آنها به صورت انتشاری میومتر را درگیر می کنند. این ناهنجاری های عروقی از نظر بالینی قابل توجه هستند و ممکن است باعث خونریزی شدید و در نتیجه مرگ مادر یا جنین شوند. ترومبوز همانژیوم غاری رحم قبلا گزارش شده است. ما در اینجا اولین موردی را گزارش می کنیم که در آن همانژیوم غاری ترومبوز شده میومتر منجر به آمبولی ریه کشنده در یک زن پس از زایمان شد. ارائه مورد: یک زن 25 ساله آفریقایی-آمریکایی چاق که یک بار بارداری داشت و با سزارین دوقلو به دنیا آمد، 1 هفته پس از زایمان موفقیت آمیز بستری شد. دوره بالینی 12 روزه شامل نارسایی تنفسی وابسته به ونتیلاتور، فشار خون سیستمیک، استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین در خلط، لکوسیتوز و آسیستول بود. معاینه اولتراسوند از طریق شکم، محصولات ضخیم و نامنظم ناهمگن را در کانال آندومتر نشان داد. مقادیر آزمایشگاهی برای افزایش زمان پروترومبین، زمان ترومبوپلاستین جزئی فعال، فریتین و کاهش هموگلوبین مرتبط بود. علت بالینی مرگ سندرم دیسترس تنفسی حاد ذکر شد. در کالبد شکافی، یک رحم اسفنجی و خونریزی دهنده 400 گرمی با فضاهای کیستیک متعدد به ابعاد تقریباً 0.5 × 0.4 سانتی متر پر از ترومبوس در داخل میومتر شناسایی شد. بررسی ایمونوهیستولوژیک با رنگ CD31 برای آنتی ژن مرتبط با اندوتلیوم عروقی، چندین رگ پوشیده از اندوتلیوم را تایید کرد که برخی از آنها حاوی ترومبوز بودند. این ویژگی های بافت شناسی با همانژیوم غاری میومتر مطابقت داشت. بررسی بافت‌شناسی ریه‌ها، ترومبوآمبولی‌های تازه متعدد را در شریان‌های ریوی کوچک و متوسط در لوب‌های فوقانی و تحتانی راست بدون سازمان، اما با نواحی مجاور انفارکتوس هموراژیک تازه نشان داد. نتیجه گیری: این مورد بر اهمیت شاخص بالای سوء ظن در یک زن باردار یا پس از زایمان که با علائم تنفسی مراجعه می کند، تأکید می کند. ترومبوز همانژیوم غاردار رحم حاملگی یا پس از زایمان یک موجود نادر است. این مورد مورد توجه است زیرا نشان می دهد که این وضعیت می تواند به طور کشنده با آمبولیزاسیون ترومب در همانژیوم میومتر کاورنو پیچیده شود. اگرچه زایمان با روش های محافظه کارانه و همچنین سزارین بدون توسل به هیسترکتومی امکان پذیر است، اما گاهی اوقات، عواقب آن مانند این مورد می تواند کشنده باشد.	همانژیوم حفره ای میومتر با ترومبوآمبولی ریوی در یک زن پس از زایمان: گزارش مورد و بررسی ادبیات
imjiwslh	پس زمینه: ویروس آنفلوانزا A (IAV) عضوی از خانواده Orthomyxoviridae است و شامل هشت بخش از ژنوم RNA تک رشته ای با قطبیت منفی است. اولین پاندمی آنفلوانزا در این قرن در آوریل 2009 با ظهور یک سویه جدید H1N1 IAV (H1N1pdm) در مکزیک و ایالات متحده اعلام شد. درک میزان و علل سوگیری در استفاده از کدون برای درک تکامل ویروسی ضروری است. یک مطالعه جامع برای بررسی تأثیر فشار انتخابی اعمال شده توسط میزبان انسانی بر استفاده از کدون یک سویه IAV در حال ظهور و همه‌گیر و روند استفاده از کدون ویروسی در طول دوره زمانی همه‌گیری بسیار مورد نیاز است. ResultsWe یک تجزیه و تحلیل جامع استفاده از کدون از 310 سویه IAV از همه گیری سال 2009 انجام دادیم. استفاده از کدون بسیار مغرضانه برای Ala، Arg، Pro، Thr و Ser پیدا شد. استفاده از کدون به شدت تحت تأثیر سوگیری های اساسی در ترکیب پایه است. هنگامی که تجزیه و تحلیل متناظر (COA) در استفاده از کدون مترادف نسبی (RSCU) اعمال می شود، توزیع ORF های IAV در صفحه تعریف شده توسط دو عامل بعدی اصلی نشان داد که سویه های مختلف در مکان های مختلف قرار دارند، که نشان می دهد استفاده از کدون IAV نیز منعکس کننده است. یک فرآیند تکاملی نتیجه‌گیری: یک ارتباط کلی بین سوگیری استفاده از کدون، ترکیب پایه و سازگاری ضعیف ویروس با مخزن tRNA میزبان مربوطه، نشان می‌دهد که فشار جهش نیروی اصلی شکل‌دهنده استفاده از کدون IAV pdm H1N1 است. یک فرآیند پویا در تنوع استفاده از کدون سویه‌های ثبت‌شده در این مطالعات مشاهده می‌شود. این نتایج نشان‌دهنده تعادلی از تعصب جهشی و انتخاب طبیعی است که به ویروس اجازه می‌دهد تا استفاده از کدون خود را با محیط‌های مختلف کاوش و دوباره تطبیق دهد. رمزگذاری مجدد IAV با در نظر گرفتن سوگیری کدون، ترکیب پایه و سازگاری با tRNA میزبان ممکن است سرنخ های مهمی را برای ایجاد واکسن های جدید و مناسب ارائه دهد.	استفاده مجدد از کدون ویروس آنفولانزای A همه‌گیر: تعصبات، سازگاری و پیامدهای توسعه سویه واکسن
jb8228vn	سابقه و هدف: بستری شدن در بیمارستان LRTI کودکان بار قابل توجهی بر بیماران، خانواده ها و سیستم های مراقبت های بهداشتی است. این مطالعه بار LRTI های کودکان را بر روی تنظیمات بیمارستانی در بریتیش کلمبیا و مزایای استراتژی های پیشگیری از آنجایی که با تقاضای منابع مراقبت های بهداشتی مرتبط است، تعیین کرد. روش‌ها: قسمت‌های بستری LRTI برای بیماران کمتر از 19 سال در طول سال‌های 2008-2010 از پایگاه داده چکیده BC تخلیه استخراج شد. تعداد سالانه تخت‌های مراقبت‌های حاد مورد نیاز برای درمان LRTI‌های کودکان برآورد شد. تجزیه و تحلیل های فرعی بار ناشی از نوزادان کمتر از 1 سال و نوزادان پرخطر را تعیین کرد. پیش‌بینی‌های جمعیتی برای پیش‌بینی بستری‌های LRTI و اثربخشی طرح‌های بهداشت عمومی برای کاهش بروز LRTIs تا سال‌های 2020 و 2030 مورد استفاده قرار گرفت. این سیستم به ترتیب در کودکان کمتر از 19 سال و نوزادان کمتر از 1 سال است. نوزادان کمتر از 1 سال به ترتیب 47 و 77 درصد بستری شدن در بیمارستان به دلیل LRTI های کودکان و بستری LRTI کودکان به طور خاص به دلیل ویروس سنسیشیال تنفسی (RSV) بودند. میانگین مدت اقامت برای نوزادان سالم کمتر از 1 سال 3.1 روز و برای نوزادان پرخطر 9.1 روز بود (P <0.0001). 73.1% بستری LRTI کودکان بین نوامبر و آوریل رخ داده است. در طول بازه زمانی مطالعه، 19.6 تخت مراقبت حاد به طور متوسط برای مراقبت از LRTI های کودکان مورد نیاز بود که در اوج بستری LRTI به 64.0 تخت افزایش یافت. افزایش در روزهای تخت خواب LRTI به ترتیب 5.5 و 16.2 درصد در بین افراد کمتر از 19 سال تا سال 2020 و 2030 پیش بینی شده بود. اجرای راهبردهای پیشگیری مناسب می‌تواند باعث 307 و 338 بستری کمتر از LRTI در افراد زیر 19 سال در سال‌های 2020 و 2030 شود. ConclusionPediatric بستری LRTI نیاز به استفاده قابل توجهی از زیرساخت مراقبت حاد به ویژه بین نوامبر و آوریل. پیش‌بینی‌های جمعیتی نشان می‌دهد که بار ممکن است در 20 سال آینده افزایش یابد، اما اجرای استراتژی‌های پیشگیری از سلامت عمومی موثر ممکن است به کاهش تقاضای مراقبت‌های حاد و حمایت از تلاش‌ها برای پایداری کلی مراقبت‌های بهداشتی کودکان کمک کند.	استفاده از مراقبت های شدید به دلیل بستری شدن در بیمارستان برای عفونت های دستگاه تنفسی تحتانی کودکان در بریتیش کلمبیا، کانادا
y24kbzy1	برای ارزیابی نقش محل برش پروتئین F در تکثیر و بیماری زایی پارامیکسوویروس های پرندگان (APMVs)، ما یک سیستم ژنتیک معکوس برای بازیابی APMV-4 نوترکیب عفونی از cDNA شبیه سازی شده ساختیم. APMV-4 نوترکیب بازیافت شده از نظر خصوصیات رشد در شرایط آزمایشگاهی و بیماریزایی در داخل بدن شبیه ویروس بیولوژیکی بود. توالی محل برش F APMV-4 (DIQPR↓F) حاوی یک اسید آمینه پایه منفرد، در موقعیت -1 است. شش ویروس جهش یافته APMV-4 بازیابی شد که در آن ها محل برش پروتئین F برای حاوی تعداد بیشتری از اسیدهای آمینه اساسی یا تقلید از محل های برش طبیعی چندین پارامیکسو ویروس، از جمله سویه های عصبی و غیر ویروسی NDV، جهش یافته بود. وجود یک باقیمانده گلوتامین در موقعیت -3 برای بازیابی ویروس جهش یافته مهم است. علاوه بر این، سایت‌های برش حاوی موتیف پروتئاز فورین باعث افزایش تکثیر و تشکیل سینسیتیوم در شرایط آزمایشگاهی شدند. با این حال، تجزیه و تحلیل بیماری‌زایی ویروسی در تخم مرغ‌های 9 روزه، جوجه‌های 1 روزه و 2 هفته‌ای و اردک‌های 3 هفته‌ای نشان داد که هیچ‌یک از جهش‌های محل برش پروتئین F باعث تغییر تکثیر، تروپیسم نشدند. و بیماریزایی APMV-4، و هیچ تفاوت معنی داری بین ویروس های والدین و جهش یافته APMV-4 در داخل بدن مشاهده نشد. اگرچه ویروس‌های والدین و جهش‌یافته در اردک‌ها تا حدودی بهتر از جوجه‌ها تکثیر می‌شوند، اما همه آنها در هر دو گونه بسیار محدود و غیرقابل‌خطر بودند. این نتایج نشان داد که توالی محل برش پروتئین F یک عامل محدود کننده بیماری زایی APMV-4 در جوجه ها و اردک ها نیست.	جهش در محل برش پروتئین فیوژن سروتیپ 4 پارامیکسوویروس پرندگان باعث افزایش تکثیر و تشکیل سینسیتیوم در شرایط آزمایشگاهی می شود اما تکثیر و بیماری زایی را در جوجه ها و اردک ها افزایش نمی دهد.
bz4rr6bh	سابقه و هدف: از نظر تاریخی، کشورهای جزیره ای اقیانوس آرام و سرزمین ها (PICTs) شدیدتر از هر بخش دیگری از جهان تحت تأثیر همه گیری آنفولانزا قرار گرفته اند. ما در اینجا ظهور و ویژگی‌های اپیدمیولوژیک آنفولانزای همه‌گیر H1N1 را در PICT‌ها از سال 2009 تا 2010 توصیف می‌کنیم. روش‌ها: سازمان بهداشت جهانی گزارش‌هایی از بیماری‌های مشابه آنفولانزا و موارد همه‌گیری H1N1 تایید شده توسط آزمایشگاه از تمام 23 کشور و منطقه جزیره‌ای اقیانوس آرام جمع‌آوری کرد. آوریل 2009 تا آگوست 2010. داده ها از طریق گزارش های ایمیل هفتگی از کشورهای جزیره ای اقیانوس آرام و مناطق و از طریق ایمیل یا پیگیری تلفنی جمع آوری شد. نتایج: کشورهای جزیره‌ای اقیانوس آرام و سرزمین‌های اقیانوس آرام شناسایی موارد همه‌گیر H1N1 را در ژوئن 2009، ابتدا در پلی‌نزی فرانسه، با آخرین تشخیص جدید در اوت 2009 در تووالو آغاز کردند. 19 کشور و منطقه جزیره‌ای اقیانوس آرام 1972 مورد تایید شده را گزارش کردند که در اوت 2009 به اوج خود رسید. دومی قرنطینه شدید دریایی را ایجاد کرد. نظارت بر بیماری شبه آنفولانزا روندی مشابه نظارت بر موارد تایید شده را نشان داد. هفت کشور و منطقه جزیره‌ای اقیانوس آرام 21 مورد مرگ ناشی از همه‌گیری H1N1 را گزارش کردند. بیماران موردی به دلیل سندرم دیسترس تنفسی حاد یا نارسایی چند عضوی یا هر دو فوت کردند. بیشترین موارد گزارش شده مربوط به چاقی، بیماری ریوی، بیماری قلبی و بارداری بود. کشورهای جزیره ای اقیانوس آرام و مناطق مختلف اقدامات کاهشی از جمله غربالگری سلامت ورود را انجام دادند. شرکای متعدد برنامه ریزی آمادگی آنفلوانزا و واکنش به شیوع را تسهیل کردند. نتیجه‌گیری: آنفولانزای همه‌گیر به‌سرعت در سراسر اقیانوس آرام با وجود فواصل بسیار زیاد و انزوای نسبی گسترش یافت. توکلائو و پیتکرن ممکن است تنها حوزه های قضایی باشند که عاری از همه گیری باقی مانده اند. کشورهای جزیره و مناطق اقیانوس آرام علیرغم اینکه به خوبی آماده شده بودند، مطابق با سایر تنظیمات بومی و کم منابع، عوارض و مرگ و میر قابل توجهی را تجربه کردند. برای اولین بار، نظارت منطقه ای بیماری شبه آنفلوانزا در اقیانوس آرام انجام شد و به مقامات بهداشتی اجازه داد تا گسترش و شدت همه گیری را در زمان واقعی نظارت کنند. واکنش‌های منطقه‌ای آینده احتمالاً از درس‌های آموخته شده در طول این شیوع سود خواهد برد.	نظارت بر آنفولانزا در کشورها و سرزمین‌های جزیره اقیانوس آرام در طول همه‌گیری 2009: یک مطالعه مشاهده‌ای
06e9lkwl	مقدمه: حتی در اقتصادهای توسعه‌یافته، بیماری‌های عفونی شایع‌ترین علت بیماری در دوران کودکی هستند. درک فعلی ما از اپیدمیولوژی این عفونت‌ها با تکیه بر داده‌های چند دهه پیش که با استفاده از روش‌های آزمایشگاهی با حساسیت کم انجام شده‌اند، و مطالعات اخیر که بیماری‌های شدید و تحت مدیریت بیمارستان را گزارش می‌کنند، محدود شده است. روش‌ها و تجزیه و تحلیل: مطالعه مشاهده‌ای در مورد بیماری‌های عفونی دوران کودکی (ORChID) یک مطالعه در حال انجام است که یک گروه تولد پویا را برای مستند کردن اپیدمیولوژی مبتنی بر جامعه عفونت‌های تنفسی و گوارشی ویروسی در اوایل کودکی ثبت می‌کند. زنان به صورت دوران بارداری انتخاب می شوند و نوزاد سالم آنها در 2 سال اول زندگی تحت نظر قرار می گیرد. والدین یک دفترچه روزانه علائم برای کودک مورد مطالعه نگه می دارند، یک سواب هفتگی قدامی بینی و سواب پوشک کثیف جمع آوری می کنند و زمانی که کودک معیارهای بیماری از پیش تعریف شده را برآورده می کند، یک دفترچه خاطرات بار را تکمیل می کنند. نمونه‌ها برای طیف وسیعی از ویروس‌ها با سنجش زمان واقعی PCR آزمایش خواهند شد. تجزیه و تحلیل اولیه شامل محاسبه میزان بروز بیماری حاد تنفسی (ARI) و گاستروانتریت حاد (AGE) برای گروه بر اساس سن و فصلی است. مواد کنترلی از کودکان در زمانی که بدون علائم هستند به ما امکان می دهد تا تعیین کنیم چه نسبتی از ARIs و AGE را می توان به پاتوژن های خاص نسبت داد. آنالیزهای ثانویه میزان بروز و مدت ریزش پاتوژن های خاص تنفسی و گوارشی را ارزیابی خواهند کرد. اخلاق و انتشار: این مطالعه توسط کمیته‌های اخلاقی پژوهش انسانی بیمارستان و خدمات بهداشتی درمانی کوئینزلند، بیمارستان رویال بریزبن و زنان و دانشگاه کوئینزلند تأیید شده است. ثبت کارآزمایی:clinicaltrials.gov NCT01304914.	تحقیقات مشاهده ای در بیماری های عفونی دوران کودکی (ORChID): یک مطالعه کوهورت تولد پویا
rrscfo33	سابقه و هدف: شناسایی سویه‌های ویروس جدید برای مطالعه بیماری‌های عفونی مهم است، اما روش‌های زیست‌شناسی مولکولی فعلی (یا موجود) محدود هستند زیرا توالی هدف باید برای طراحی پرایمرهای PCR خاص ژنوم شناخته شود. بنابراین، ما یک روش جدید برای کشف ویروس‌های ناشناخته بر اساس تکنیک cDNA - تکثیر تصادفی DNA چند شکلی (cDNA-RAPD) ایجاد کردیم. ویروس گتا، متعلق به خانواده Togaviridae در جنس آلفا ویروس، یک ویروس RNA پوشیده شده توسط پشه است که با استفاده از روش Virus-Discovery-cDNA RAPD (VIDISCR) شناسایی شد. نتایج: یک ویروس جدید گتا توسط VIDISCR از موش های شیرده در معرض پشه (Aedes albopictus) جمع آوری شده در استان یوننان، چین شناسایی شد. ژن پروتئین غیر ساختاری، nsP3، ژن پروتئین ساختاری، ژن پروتئین کپسید، و ناحیه ترجمه نشده 3' (UTR) جدایه جدید ویروس گتا شبیه‌سازی و توالی‌یابی شدند. هویت توالی نوکلئوتیدی هر ژن به ترتیب 97.1-99.3٪، 94.9-99.4٪ و 93.6-99.9٪ در مقایسه با ژنوم 10 سویه دیگر ویروس گتا تعیین شد. نتیجه‌گیری: روش VIDISCR قادر به شناسایی ایزوله‌های ویروس شناخته شده و ایزوله جدید ویروس گتا از موش‌های آلوده بود. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک نشان داد که ایزوله YN08 بیشتر از سویه YN0540 به سویه هبی HB0234 مرتبط بود و از نظر ژنتیکی از سویه اولیه MM2021 مالزی متمایزتر بود.	شناسایی یک ویروس جدید گتا توسط Virus-Discovery-cDNA DNA polymorphic تکثیر شده تصادفی (RAPD)
dr2uow4m	میزوریبین مونوفسفات (MZP) یک مهارکننده خاص اینوزین-5'-مونوفسفات دهیدروژناز سلولی (IMPDH) است، آنزیمی که مرحله محدودکننده سرعت بیوسنتز نوکلئوتید گوانین را کاتالیز می‌کند. MZP یک مهارکننده آنتاگونیستی بسیار قوی IMPDH است که تکثیر لنفوسیت های T و B را که تقریباً منحصراً از مسیر de novo سنتز نوکلئوتید گوانین استفاده می کنند، مسدود می کند. در مطالعه حاضر، ما توانایی MZP را برای مهار مستقیم آنزیم پوشاننده RNA انسانی (HCE)، پروتئینی که دارای هر دو فعالیت RNA 5'-تری فسفاتاز و RNA گوانیلیل ترانسفراز است، بررسی کردیم. HCE در سنتز ساختار کلاهک موجود در انتهای 5' mRNA های یوکاریوتی نقش دارد که برای اتصال اینترون کلاهک پروگزیمال، انتقال mRNA ها از هسته به سیتوپلاسم و برای پایداری و پایداری بسیار مهم است. ترجمه mRNA ها مطالعات بیوشیمیایی ما اولین بینش را ارائه می دهد که MZP می تواند از تشکیل ساختار کلاهک RNA کاتالیز شده توسط HCE جلوگیری کند. در حضور MZP، فعالیت RNA 5'-تری فسفاتاز نسبتاً بی‌تأثیر به نظر می‌رسد در حالی که فعالیت RNA guanylyltransferase مهار می‌شود، که نشان می‌دهد فعالیت RNA guanylyltransferase هدف اصلی مهار MZP است. مطالعات جنبشی نشان می‌دهد که MZP یک مهارکننده غیررقابتی است که احتمالاً یک مکان آلوستریک در HCE را هدف قرار می‌دهد. میزوریبین همچنین درپوش mRNA در سلول های زنده را مختل می کند که می تواند مکانیسم جهانی عمل این عامل درمانی را توضیح دهد. با هم، مطالعه ما به وضوح نشان می دهد که میزوریبین مونوفسفات، RNA گوانیلیل ترانسفراز انسانی را در شرایط آزمایشگاهی مهار می کند و پوشش mRNA را در سلول را مختل می کند.	عامل سرکوب کننده سیستم ایمنی Mizoribine Monophosphate یک مهار کننده آنزیم پوشاننده RNA انسانی است.
ckkcpt1b	علاقه فزاینده ای به پتانسیل نشانگرهای زیستی بازدمی، مانند ترکیبات آلی فرار (VOCs)، برای بهبود تشخیص های دقیق و تصمیم گیری های مدیریتی در بیماری های ریوی وجود دارد. هدف این مقاله مرور سیستماتیک دانش فعلی در مورد VOCهای بازدمی با توجه به کاربرد بالینی بالقوه آنها در آسم، سرطان ریه، بیماری انسدادی مزمن ریه (COPD)، فیبروز کیستیک (CF) و عفونت‌های دستگاه تنفسی است. یک جستجوی متون سیستماتیک در PubMed، EMBASE، پایگاه داده Cochrane و فهرست های مرجع مطالعات بازیابی شده انجام شد. مطالعات کنترل شده، بالینی به زبان انگلیسی که ارزش تشخیصی و نظارتی VOCs در آسم، COPD، CF، سرطان ریه و عفونت‌های دستگاه تنفسی را بررسی می‌کنند، وارد شدند. داده‌های مربوط به طراحی مطالعه، تنظیم، ویژگی‌های شرکت‌کننده، تکنیک‌های VOCs و معیارهای نتیجه استخراج شد. هفتاد و سه مطالعه شامل 3952 بیمار و 2973 فرد سالم بود. جمع‌آوری و تجزیه و تحلیل VOCهای بازدمی غیرتهاجمی است و می‌تواند به راحتی در طیف وسیعی از بیماران، از جمله افراد مبتلا به بیماری شدید و کودکان استفاده شود. گروه‌های تحقیقاتی مختلف نشان دادند که پروفایل‌های VOCs می‌توانند به دقت بیماران مبتلا به بیماری ریوی را از افراد سالم متمایز کنند. به نظر می‌رسد که بیماری‌های ریوی با اثر تنفسی خاص بیماری مشخص می‌شوند، زیرا پروفایل‌های متمایز در بیماران مبتلا به بیماری‌های متفاوت یافت شد. ناهمگونی مطالعات، مقایسه بین آزمایشگاهی را به چالش کشید. در نتیجه، پروفایل های VOCs به طور بالقوه قادر به تشخیص دقیق بیماری های مختلف ریوی هستند. علی‌رغم این یافته‌های امیدوارکننده، چالش‌های متعددی مانند استانداردسازی بیشتر و اعتبارسنجی تکنیک‌های متنوع باید قبل از استفاده از VOCs در عمل بالینی تسلط پیدا کنند.	استفاده بالینی از ترکیبات آلی فرار بازدمی در بیماری های ریوی: یک بررسی سیستماتیک
vnwpzsu8	یک استراتژی برای کشف داروی ضد ویروسی، توضیح و تقلید مکانیسم‌های تداخل ویروسی است. بیماران HIV-1 از یک عفونت همزمان با GB Virus C (GBV-C) سود می برند، زیرا افراد HIV مثبت با ویرمی طولانی مدت GBV-C نرخ بقای بهتری نسبت به بیماران HIV-1 بدون ادامه GBV-C نشان می دهند. تأثیر مستقیم GBV-C بر تکثیر HIV-1 در آزمایشات عفونی همزمان نشان داده شده است. GBV-C یک عضو غیر بیماریزای انسانی از خانواده flaviviridae است که می تواند در سلول های T و B تکثیر شود. بنابراین، GBV-C تا حدودی جایگاه اکولوژیکی مشابهی با HIV-1 دارد. در کار قبلی ما نشان داده‌ایم که گلیکوپروتئین نوترکیب E2 از GBV-C و پپتیدهای مشتق شده از انتهای N E2 با ورود HIV تداخل می‌کنند. در این مطالعه ما مکانیسم اساسی را بررسی کردیم. با انجام یک سنجش همجوشی ویروس-سلول و سینتیک عفونت HIV-دستگیر در دما، شواهدی ارائه می‌کنیم که پپتیدهای E2 مهارکننده HIV با مراحل ورود اواخر HIV-1 پس از درگیری gp120 با گیرنده CD4 و گیرنده مرکزی تداخل دارند. آزمایش‌های اتصال و رقابت نشان داد که پپتیدهای N ترمینال E2 به ناحیه حلقه دی سولفیدی پروتئین گذرنده HIV-1 gp41 متصل می‌شوند. در ارتباط با تحلیل‌های محاسباتی، ما شباهت‌های دنباله‌ای را بین انتهای N GBV-C E2 و گلیکوپروتئین HIV-1 gp120 شناسایی کردیم. به نظر می رسد این شباهت پایانه N GBV-C E2 را قادر می سازد با حلقه دی سولفید gp41 HIV-1، یک حوزه حیاتی درگیر در رابط gp120-gp41، تعامل داشته باشد. علاوه بر این، نتایج مطالعه حاضر اثبات اولیه این مفهوم را ارائه می‌کند که پپتیدهای هدف‌گیری شده برای حلقه دی سولفید gp41 قادر به مهار همجوشی HIV هستند و باید الهام بخش توسعه این کلاس جدید از مهارکننده‌های ورود HIV-1 باشند.	فیوژن HIV-1 از طریق اتصال پپتیدهای GB ویروس C E2D به حلقه دی سولفید gp41 HIV-1 مسدود شده است.
250sdmq6	فرض بر این است که در غیاب بیماری، مغز یک اندام استریل است، اگرچه تأثیر اختلالات ایمنی از نظر تنوع یا کمیت میکروبی مغز نامشخص است. برای بررسی تنوع و کمیت میکروبی در مغز، مشخصات عوامل عفونی در مغزهای سالم و غیرطبیعی پاتولوژیک افراد مبتلا به HIV/AIDS [HIV] (12=n)، سایر گروه‌های کنترل بیماری [ODC] (14=n) و در برداشتن جراحی مغز برای صرع [SURG] (n = 6). توالی یابی عمیق RNA مشتق از ماده سفید مغزی از بیماران HIV (4 نفر) و ODC (4 نفر) و SURG (n = 2) توالی های RNA 16 s با کدگذاری باکتریایی را در تمام نمونه های مغزی با α-پروتئوباکتری نشان داد. بیش از 70 درصد از توالی های باکتریایی در حالی که 30 درصد دیگر از کلاس های باکتریایی به طور گسترده ای متفاوت بودند. rRNA باکتری در سلول‌های گلیال ماده سفید با هیبریداسیون درجا شناسایی شد و رنگ‌پذیری پپتیدوگلیکان نیز عمدتاً در گلیا در مغز انسان مشخص شد. تجزیه و تحلیل توالی‌های rRNA 16 s باکتری تقویت‌شده نشان داد که پروتئوباکتری‌ها شاخه باکتریایی اصلی در تمام نمونه‌های مغز انسان با مقادیر مشابه rRNA باکتریایی در گروه‌های HIV و ODC با وجود افزایش پاسخ‌های عصبی عصبی میزبان در گروه HIV بود. ویروس‌های اگزوژن شامل باکتریوفاژ و ویروس‌های هرپس انسانی-4، -5 و -6 به طور متغیر در مغزهای کالبدشکافی شده از هر دو گروه بالینی شناسایی شدند. مغزهای ماکاک‌های آلوده به SIV و SHIV نمایه‌ای از فیلاهای باکتریایی را نشان دادند که تحت سلطه پروتئوباکتری‌ها نیز بودند، اما توالی‌های باکتریایی در مغز گربه‌ها یا موش RAG1 (-/-) آلوده به FIV تشخیص داده نشد. کاشت داخل مغزی هموژنه‌های مغز انسان در موش‌های RAG1(-/-) غلبه توالی‌های RNA α-پروتئوباکتری 16 s را در مغز موش‌های دریافت‌کننده در 7 هفته پس از کاشت نشان داد، که با عملیات حرارتی قبلی همگن مغز لغو شد. . بنابراین، آلفا پروتئوباکتری ها بدون توجه به وضعیت ایمنی زیربنایی، جزء باکتریایی اصلی میکروبیوم مغز پستانداران را نشان می دهند، که می تواند به میزبان های ساده منتقل شود و منجر به تداوم میکروبی در مغز شود.	جمعیت های میکروبی مغز در HIV/AIDS: آلفا-پروتئوباکتری ها مستقل از وضعیت ایمنی میزبان غالب هستند
qdfrjvu1	سابقه و هدف: آنفلوانزای خوکی (SI) یک بیماری حاد تنفسی است که توسط ویروس آنفلوانزای خوکی (SIV) ایجاد می شود. آنفلوانزای خوکی معمولاً با شروع حاد تب و علائم تنفسی مشخص می شود. شایع ترین عوارض آنفولانزا، پنومونی باکتریایی ثانویه است. هدف از این کار، بررسی پاسخ‌های پروتئین‌های فاز حاد (APP) پس از عفونت همزمان خوک‌ها با ویروس آنفلوانزای خوکی H1N1 (SwH1N1) و پاستورلا مولتوسیدا (PM) به منظور شناسایی اینکه آیا پاسخ APP فردی با شدت بیماری مرتبط است یا خیر بود. می تواند به عنوان نشانگر وضعیت سلامت خوک های آلوده استفاده شود. نتایج: در همه خوک‌های آلوده به هم‌زمان علائم بالینی، از جمله تب، سرفه و تنگی نفس مشاهده شد. ریزش ویروس از 2 تا 7 نقطه در اینچ مشاهده شد. میانگین سطح آنتی بادی های ضد درمونکروتوکسین Pm در خوکچه های آلوده به طور قابل توجهی از 7 dpi افزایش می یابد. آنتی بادی ضد SwH1N1 در سرم از 7 dpi شناسایی شد. غلظت پروتئین واکنشی C (CRP) به طور قابل توجهی در dpi 1 نسبت به خوک های کنترل افزایش یافته است، و به طور قابل توجهی بالاتر به 3 dpi باقی مانده است. سطح آمیلوئید A (SAA) سرم به طور قابل توجهی از 2 تا 3 نقطه در اینچ بالاتر بود. هاپتوگلوبین (HP) به طور قابل توجهی از 3 dpi تا پایان مطالعه بالا بود، در حالی که خوک پروتئین فاز حاد اصلی (Pig-MAP) از 3 تا 7 dpi. غلظت CRP، Hp و SAA قبل از شناسایی آنتی بادی های اختصاصی به طور قابل توجهی افزایش یافت. همبستگی مثبت بین غلظت سرمی Hp و SAA و نمرات ریه، و بین نمره بالینی و غلظت Pig-MAP و SAA پیدا شد. نتیجه‌گیری: نتایج مطالعه حاضر تأیید کرد که نظارت بر APP ممکن است عفونت مداوم را نشان دهد و از این طریق می‌تواند در انتخاب خوک‌های سالم بالینی (یعنی قبل از ادغام در یک گله غیر آلوده) مفید باشد. نتایج حاضر یافته‌های قبلی ما را تأیید می‌کند که SAA می‌تواند یک شاخص بالقوه مفید در مطالعات عفونت تجربی (مانند بررسی‌های کارآیی واکسن) یا به‌عنوان نشانگری برای شدت بیماری باشد، زیرا همبستگی مشاهده شده بین غلظت آن در سرم و شدت بیماری (نمرات ریه، نمرات بالینی) ).	پروتئین واکنشی C، هاپتوگلوبین، آمیلوئید A سرم و پاسخ پروتئین فاز حاد اصلی خوک در خوک هایی که به طور همزمان با ویروس آنفلوانزای خوکی H1N1 و پاستورلا مولتوسیدا آلوده شده اند.
ej0e1c4d	سیستم ایمنی به سرعت به عفونت‌های داخل سلولی با شناسایی اپی توپ‌های سلول T محدود شده کلاس I که بر روی سلول‌های آلوده ارائه می‌شوند، پاسخ می‌دهد. در ابتدا تصور می‌شد که پپتیدهای ویروسی در طول گردش پروتئین سازنده آزاد می‌شوند، اما این با این مشاهدات که اپی توپ‌های ویروسی در عرض چند دقیقه پس از سنتزشان شناسایی می‌شوند، حتی زمانی که پروتئین‌های منبع آن‌ها نیمه‌عمر چند روزه را نشان می‌دهند، در تعارض است. فرضیه DRiPs پیشنهاد می‌کند که اپی توپ‌ها از محصولات ریبوزومی معیوب (DRiPs) به‌جای تخریب محصولات پروتئینی بالغ مشتق می‌شوند. یکی از منابع بالقوه DRiP ها، پایان زودرس ترجمه است. اگر این منبع اصلی DRiPs است، این باید در سوگیری موقعیتی نسبت به انتهای N منعکس شود. در مقابل، اگر شروع پایین دست منبع اصلی DRiP ها باشد، باید سوگیری موقعیتی نسبت به C-پایانه وجود داشته باشد. در اینجا، ما به طور سیستماتیک سوگیری موقعیتی اپی توپ‌ها را در آنتی‌ژن‌های ویروسی ارزیابی کردیم و از مجموعه بزرگی از داده‌های موجود در پایگاه داده و منبع تحلیل اپی توپ ایمنی استفاده کردیم. ما یک درجه از نظر آماری معنی‌دار از انحراف موقعیتی در میان اپی توپ‌ها را نشان می‌دهیم. اپی توپ از هر دو انتهای آنتی ژن تمایل به کمتر نشان داده شده است. انحراف مرکزی با تعصب نسبت به پپتیدهای اتصال دهنده کلاس I که به موازات درجه بالاتر حفاظت تکاملی بیش از حد در وسط نشان داده می شوند، ارتباط دارد.	سوگیری موضعی اپی توپ های محدود سلول T کلاس I MHC در آنتی ژن های ویروسی به احتمال زیاد به دلیل سوگیری در حفاظت است.
x8sw5wdp	سابقه و هدف: این مطالعه با هدف ایجاد یک سیستم آزمایشگاهی مناسب برای بررسی اثرات پاتوژن ها و سموم تنفسی بر بیوانرژتیک بافت ریه (تنفس سلولی و محتوای ATP) و فعالیت کاسپاز انجام شد. موش‌های صحرایی ویستار و موش‌های C57Bl/6 با استنشاق سووفلوران بیهوش شدند. سپس قطعات ریه جمع‌آوری و در دمای 37 درجه سانتی‌گراد در یک محیط گازی (با 95% O2): 5% CO2) حداقل محیط ضروری (MEM) یا بافر Krebs-Henseleit انکوبه شدند. تحلیلگر فسفرسانس O2 که غلظت O2 محلول را به عنوان تابعی از زمان اندازه گیری می کرد برای نظارت بر میزان مصرف O2 میتوکندری سلولی استفاده شد. محتوای ATP سلولی با استفاده از سیستم لوسیفرین/لوسیفراز اندازه گیری شد. سوبسترای کاسپاز-3 N-acetyl-asp-glu-val-asp-7-amino-4-methylcoumarin (Ac-DEVD-AMC) برای نظارت بر فعالیت کاسپاز درون سلولی استفاده شد. قطعات AMC بریده شده (بازتاب دهنده فعالیت کاسپاز) در HPLC از هم جدا شدند و با فلورسانس شناسایی شدند. بافت شناسی ریه و رنگ آمیزی ایمنی با آنتی بادی کاسپاز 3 ضد شکاف نیز انجام شد. نتایج: برای موش‌های صحرایی ویستار، مقادیر k (c) و ATP برای 0 < t ≤ 7 ساعت (میانگین ± SD) 0.15 ± 0.02 میکرومولار O2 در دقیقه (-1) میلی‌گرم (-1) (n = 18) بود. ضریب تغییرات، Cv = 13٪ و 131 ± 69 pmol mg (-1) (n = 16، Cv = 53٪)، به ترتیب. مناطق اوج AMC با وجود افزایش 5 برابری در طی 6 ساعت نسبتاً کوچک باقی ماندند. حفظ بافت خوب با وجود افزایش وابسته به زمان در سلول های آپوپتوز مشهود بود. بیوانرژیک بافت ریه، فعالیت کاسپاز و ساختار در محلول های بدون اکسیژن یا به طور متناوب اکسیژن مضر بودند. جوجه کشی بافت ریه در O(2) MEM تخلیه شده به مدت 30 دقیقه یا بیهوشی با یورتان هیچ تاثیری بر بیوانرژتیک ریه نداشت، اما فعالیت کاسپاز بالاتری تولید کرد. نتیجه‌گیری: بیوانرژتیک‌ها و ساختار بافت ریه را می‌توان در شرایط آزمایشگاهی در بافر اکسیژن‌دار برای چند ساعت حفظ کرد و بنابراین به‌عنوان نشانگرهای زیستی برای بررسی پاتوژن‌ها یا سموم تنفسی استفاده کرد.	بیوانرژیک بافت ریه و فعالیت کاسپاز در جوندگان
yujp9zpx	یک ویروس بدخیم برونشیت عفونی پرندگان (IBV) از جوجه های گوشتی 30 روزه جدا شد که علائم تنفسی، ضایعات نفروپاتولوژیک و نسبت بالایی از مرگ و میر را در جمهوری خلق چین در سال 2005 نشان دادند. این سویه که YN نامگذاری شد، ژنتیکی بود. و از نظر پاتولوژیک مشخص می شود. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک نشان داد که YN و بسیاری از جدایه های IBV که قبلاً مشخص شده بودند در چین یافت شده بودند، از نظر فیلوژنتیکی در 2 خوشه ژنتیکی اصلی طبقه بندی شدند. ایزوله YN باعث ضایعات شدید شد و منجر به مرگ 65٪ در عفونت های تجربی جوجه های 30 روزه بدون پاتوژن خاص شد. ضایعات نای و کلیوی شدید در همه پرندگان آلوده ایجاد شده است که توانایی سویه YN را در القای بیماری های تنفسی و کلیوی تایید می کند. آنتی ژن های IBV با تجزیه و تحلیل ایمونوهیستوشیمی در نای، ریه، کلیه، و بورس، مطابق با مشاهدات هیستوپاتولوژیک، جداسازی ویروس و تشخیص PCR رونویسی معکوس شناسایی شدند. ما نشان دادیم که YN IBV بیماری‌زایی شدیدی در جوجه‌ها نشان می‌دهد، و ویروس‌های مشابه در چین شایع هستند.	ویروس برونشیت عفونی پرندگان ویروسی، جمهوری خلق چین
zspl6qv8	شبکه نظارت بر بیماری حوضه مکونگ (MBDS) به طور رسمی در سال 2001 از طریق یادداشت تفاهم امضا شده توسط شش وزیر بهداشت کشورهای زیر منطقه مکونگ بزرگ تأسیس شد: کامبوج، چین (یوننان و گوانگشی)، PDR لائوس، میانمار، تایلند و ویتنام حوزه‌های اصلی تمرکز شبکه عبارتند از: 1) بهبود بررسی شیوع بیماری‌های عفونی فرامرزی و واکنش با به اشتراک گذاشتن داده‌های نظارتی و بهترین شیوه‌ها در شناسایی و گزارش بیماری، و از طریق واکنش مشترک به شیوع. ii) توسعه تخصص در نظارت اپیدمیولوژیک در سراسر کشورها. و 3) افزایش ارتباطات بین کشورها. MBDS متشکل از مقامات ارشد بهداشتی، اپیدمیولوژیست ها، پزشکان بهداشت و سایر متخصصان، در طول سال ها رشد کرده و به نهادی مبتنی بر اعتماد متقابل تبدیل شده است که می تواند در آینده پایدار بماند. مناطق دیگر تقلید از کارهای پیشگامانه شبکه را آغاز کرده اند. در این مقاله، توسعه MBDS، روشی که امروزه در آن عمل می کند و برخی از دستاوردهای آن را شرح می دهیم. ما چالش‌های کلیدی را ارائه می‌دهیم که اعضای آن با آن مواجه شده‌اند و درس‌هایی را در مورد چگونگی ایجاد اعتماد کافی برای سلامت و سایر متخصصان برای هشدار دادن به یکدیگر در مورد تهدیدات بیماری در سراسر مرزهای ملی و در نتیجه مبارزه مؤثرتر با این تهدیدات، ارائه می‌کنیم.	نظارت بر بیماری حوضه مکونگ (MBDS): یک شبکه مبتنی بر اعتماد
zxe95qy9	در هزاره جدید، استراتژی قرنطینه قرنطینه در حال تبدیل شدن به یک مؤلفه قدرتمند از پاسخ بهداشت عمومی به بیماری های عفونی در حال ظهور و ظهور مجدد است. در طول همه‌گیری سندرم حاد تنفسی در سال 2003، استفاده از قرنطینه، کنترل‌های مرزی، ردیابی تماس و نظارت در مهار تهدید جهانی در کمتر از 3 ماه مؤثر بود. برای قرن ها، این شیوه ها سنگ بنای پاسخ های سازمان یافته به شیوع بیماری های عفونی بوده اند. با این حال، استفاده از قرنطینه و سایر اقدامات برای کنترل بیماری‌های همه‌گیر همیشه بحث‌برانگیز بوده است، زیرا چنین استراتژی‌هایی مسائل سیاسی، اخلاقی و اجتماعی-اقتصادی را مطرح می‌کنند و نیازمند تعادل دقیق بین منافع عمومی و حقوق فردی هستند. در دنیای جهانی شده که روز به روز در برابر بیماری های واگیر آسیب پذیرتر می شود، یک دیدگاه تاریخی می تواند به روشن شدن کاربرد و پیامدهای یک استراتژی بهداشت عمومی هنوز معتبر کمک کند.	درس هایی از تاریخچه قرنطینه، از طاعون تا آنفولانزای A
hcbvfpg0	پیشرفت سریع فناوری های ژنومی نویدبخش بهبود کیفیت و سرعت تحقیقات آزمایشگاهی بالینی و بهداشت عمومی و کاهش هزینه آنها است. آخرین نسل از توالی یابی DNA ژنوم می تواند اطلاعات بسیار دقیق و قوی در مورد میکروب های بیماری زا ارائه دهد و در آینده نزدیک این فناوری ها برای استفاده معمول در آزمایشگاه های بهداشت عمومی ملی، منطقه ای و جهانی مناسب خواهند بود. با پیشرفت‌های بیشتر در ابزار دقیق، این توالی‌سنج‌های نسل بعدی یا سوم احتمالاً جایگزین روش‌های معمولی مبتنی بر کشت و تایپ مولکولی می‌شوند تا تشخیص بالینی نقطه‌ای مراقبت و سایر اطلاعات ضروری برای درمان سریع‌تر و بهتر بیماران را ارائه دهند. به شرط اشتراک گذاری رایگان اطلاعات توسط همه آزمایشگاه های بالینی و بهداشت عمومی، این ابزارهای ژنومی می توانند یک سیستم جهانی از پایگاه های داده مرتبط ژنوم های پاتوژن ایجاد کنند که تشخیص، پیشگیری و کنترل موثرتر بیماری های بومی، نوظهور و سایر بیماری های عفونی را تضمین می کند. شیوع در سراسر جهان	ادغام انفورماتیک مبتنی بر ژنوم برای نوسازی نظارت بر بیماری های جهانی، اشتراک گذاری اطلاعات و پاسخگویی
usz7pnvu	بوکاویروس انسانی (HBoV) اخیراً در کودکان مبتلا به دیسترس تنفسی و/یا اسهال کشف شده است. طبق اطلاعات ما، هیچ مطالعه قبلی وجود بوکاویروس را در عربستان سعودی گزارش نکرده است. نمونه‌های سواب از 80 کودک مبتلا به عفونت‌های دستگاه تنفسی برای وجود HBoV مورد بررسی قرار گرفت. واکنش زنجیره ای پلیمراز بلادرنگ به عنوان یک روش حساس برای تشخیص HBoV استفاده شد. برای تعیین ژنوتیپ جدایه های ویروس شناسایی شده از توالی یابی مستقیم ژن استفاده شد. HBoV در 22.5 درصد از بیماران مورد بررسی قرار گرفت. توالی ژن جزئی NP1 از همه بیماران نشان داد که سویه های در گردش با ژنوتیپ HBoV-1 مرتبط هستند. اکثر بیماران آلوده به HBoV شواهدی از عفونت همزمان مخلوط با سایر پاتوژن های ویروسی را نشان دادند. مطالعه حاضر به وضوح نشان داد که HBoV1 ژنتیکی حفظ شده در عربستان سعودی در گردش است. جالب توجه است که بیشتر موارد آلوده به HBoV1 با نرخ بالای عفونت همزمان با سایر ویروس ها همراه بود.	تشخیص بوکاویروس در کودکان مبتلا به عفونت های حاد دستگاه تنفسی در عربستان سعودی
pccw41s5	اسید گلیسیریزیک از دیرباز در طب سنتی هند مورد استفاده قرار می گرفته است. از عصاره ریشه گلیسیریزاگلابرا به دست می آید. تنوع فصلی محتوای اسید گلیسیریزیک در ریشه گیاه وجود دارد. بنابراین یک روش مناسب برای کمی سازی آن از فرآورده های گیاهی موجود در بازار ضروری است. یک روش کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا فاز معکوس ساده، سریع، حساس و خاص برای تخمین کمی اسید گلیسیریزیک از آماده‌سازی چند گیاهی حاوی عصاره آبی ریشه گلیسیرریزاگلابرا با استفاده از آشکارساز آرایه دیود فوتودی توسعه داده شده است. تایید هویت با استفاده از طیف سنجی جرمی انجام شد. وضوح پایه پیک اسید گلیسیریزیک در یک ستون C18 فاز معکوس (125 میلی متر × 4.0 میلی متر، 5 μ) با استفاده از یک فاز متحرک ایزوکراتیک متشکل از 5.3 میلی مولار بافر فسفات و استونیتریل در نسبت 65:35 v/v به دست آمد. کروماتوگرام ها در 252 نانومتر بررسی شدند. زمانی که از آشکارساز MS استفاده شد، بافر فسفات 5.3 میلی مولار با بافر استات آمونیوم 0.5 میلی مولار در فاز متحرک جایگزین شد. روش خطی در محدوده غلظت 12.4 تا 124 میکروگرم در میلی لیتر با ضریب همبستگی 0.999 یافت شد. حد تشخیص و حد کمیت به ترتیب 3.08 میکروگرم بر میلی لیتر و 10.27 میکروگرم بر میلی لیتر بود. میانگین بهبودی از سه سطح سنبله 0.26 ± 99.93٪ بود. تایید هویت پیک کروماتوگرافی توسط طیف سنجی جرمی یونیزاسیون الکترواسپری و پیک یون مولکولی مشابه برای نمونه و استاندارد به دست آمد. روش توسعه‌یافته برای آنالیز معمول، تست پایداری و سنجش اسید گلیسیریزیک از فرآورده‌های چند گیاهی حاوی عصاره‌های آبی گلیسیریزاگلابرا مناسب است.	تجزیه و تحلیل کمی اسید گلیسیریزیک از یک فرآورده گیاهی با استفاده از تکنیک کروماتوگرافی مایع
v2vw3an1	در طول پیشرفت بیماری به ایدز، افراد آلوده به HIV-1 به طور فزاینده ای سرکوب شده و مستعد ابتلا به عفونت های فرصت طلب می شوند. همچنین نشان داده شده است که زیرمجموعه‌های متعدد سلول‌های دندریتیک (DC)، از جمله سلول‌های DC-SIGN(+)، به طور قابل‌توجهی در خون و بافت‌های لنفاوی بیماران مبتلا به ایدز کاهش می‌یابند، که ممکن است به شکست در شروع پاسخ‌های ایمنی میزبان موثر کمک کند. مکانیسم تخلیه DC، با این حال، نامشخص است. همچنین مشخص شده است که مقادیر زیادی از پروتئین پوششی ویروسی gp120 از ویریون های HIV-1 بالغ می ریزد و کمپلکس های ایمنی در حال گردش را در سرم افراد آلوده به HIV-1 تشکیل می دهد، اما نقش پاتولوژیک gp120 در پاتوژنز HIV-1 مبهم باقی مانده است. در اینجا ما یک مکانیسم ناشناخته از مرگ DC را در عفونت مزمن HIV-1 توصیف می‌کنیم، که در آن بستن DC-SIGN توسط gp120، DC را حساس می‌کند تا در پاسخ به انواع محرک‌های فعال‌سازی دچار آپوپتوز تسریع شود. DC مشتق از مونوسیت کشت شده و همچنین DC-SIGN(+) خون تازه ایزوله شده که در معرض gp120 نوترکیب متقاطع یا gp120 کمپلکس ایمنی در سرم HIV(+) قرار گرفتند، پس از بستن CD40 یا قرار گرفتن در معرض باکتری، تحت آپوپتوز قابل توجهی قرار گرفتند. لیپوپلی ساکارید (LPS) یا سیتوکین های پیش التهابی مانند TNFα و IL-1β. علاوه بر این، DC-SIGN(+) DC در گردش که مستقیماً از افراد HIV-1(+) جدا شده بودند، در واقع توسط سرم gp120 برای آپوپتوز گزاف ناشی از فعال سازی از قبل حساس شده بودند. در تمام موارد آپوپتوز DC بطور قابل ملاحظه ای توسط محاصره DC-SIGN مهار شد. در نهایت، ما نشان دادیم که آپوپتوز DC تسریع شده نتیجه مستقیم فعال شدن بیش از حد مولکول پرو آپوپتوز ASK-1 بود و انتقال siRNA در برابر ASK-1 به طور قابل توجهی از مرگ بیش از حد DC ناشی از فعال سازی جلوگیری کرد. مطالعه ما مکانیسمی را که قبلاً ناشناخته از تعدیل ایمنی توسط پروتئین پوششی gp120 بود، فاش می‌کند، بینش‌های جدیدی در مورد ایمونوپاتوژنز HIV ارائه می‌کند، و رویکردهای درمانی بالقوه را برای جلوگیری از کاهش DC در عفونت مزمن HIV پیشنهاد می‌کند.	اتصال HIV-1 gp120 به DC-SIGN آپوپتوز ناشی از فعال سازی وابسته به ASK-1 سلول های دندریتیک انسانی را ارتقا می دهد.
cnxgsmvk	اپیتلیوم آلوئولی به عنوان یک مانع بین ارگانیسم و محیط عمل می کند و به عنوان اولین خط محافظت در برابر پاتوژن های تنفسی بالقوه عمل می کند. سلول های آلوئولی نوع II (TII) به طور سنتی سلول های ایمنی اپیتلیوم آلوئولی در نظر گرفته می شوند، زیرا دارای عملکردهای تعدیل کننده ایمنی هستند. با این حال، نقش دقیق سلول‌های آلوئولی نوع I (TI) که حدود 95 درصد از سطح اپیتلیال آلوئولی را تشکیل می‌دهند، در ایمنی ریه مشخص نیست. ما به دنبال این بودیم که مشخص کنیم آیا تفاوتی در پاسخ سلول‌های TI و TII به آسیب ریه وجود دارد و آیا سلول‌های TI می‌توانند به طور فعال در پاسخ ایمنی آلوئولی شرکت کنند. سلول‌های TI جدا شده از طریق مرتب‌سازی سلول‌های فعال شده با فلورسانس (FACS) از موش‌های آسیب‌دیده با LPS، القای تاشو بیشتر واسطه‌های التهابی را نسبت به سلول‌های TII جدا شده به روشی مشابه از همان حیوانات نشان دادند. سطوح سیتوکین‌های TNF-α، IL-6 و IL-1β از سلول‌های TI موش اولیه کشت‌شده پس از تحریک LPS به طور قابل‌توجهی در مقایسه با سلول‌های TII اولیه موش‌های صحرایی مورد مطالعه مشابه افزایش یافت. ما دریافتیم که برخلاف گزارش‌های منتشر شده، سلول‌های TII کشت‌شده مقادیر نسبتاً کمی TNF-α، IL-6 و IL-1β را پس از درمان LPS تولید می‌کنند. سطوح بالاتر بیان سیتوکین از سلول های TII کشت شده گزارش شده در مقالات احتمالاً از آلودگی ماکروفاژها به دلیل روش های سنتی جداسازی سلول های غیر FACS TII بود. کشت همزمان سلول‌های TII با ماکروفاژها قبل از تحریک LPS، تولید TNF-α و IL-6 را به سطوح گزارش‌شده توسط سایر محققان برای سلول‌های TII افزایش داد، با این حال، کشت همزمان سلول‌های TI و ماکروفاژها قبل از درمان LPS منجر به افزایش قابل توجهی در تولید TNF-α و IL-6. در نهایت، سورفکتانت اگزوژن پاسخ IL-6 به LPS را در سلول‌های TI کشت‌شده کاهش داد. روی هم رفته، این یافته‌ها از نقش سلول‌های TI در پاسخ ایمنی ذاتی حمایت می‌کنند و نشان می‌دهند که سلول‌های TI و TII بازیکنان فعالی در مکانیسم‌های دفاعی میزبان در ریه هستند.	پاسخ افتراقی سلول های آلوئولی نوع اول و نوع دوم به تحریک LPS
s90geszi	RNA پلیمراز وابسته به RNA (RdRp) برای تکثیر ویروس ضروری است و بنابراین یکی از اهداف اولیه اقدامات متقابل علیه این عوامل عفونی خطرناک است. توسعه درمان های طیف وسیعی که پلیمرازها را هدف قرار می دهند به دلیل تنوع توالی شدید این توالی ها با مشکل مواجه شده است. طول RdRps از 400 تا 800 باقیمانده متغیر است، اما تنها حاوی 20 باقیمانده است که در اکثر گونه‌ها حفظ شده‌اند. در این مطالعه، ما مقایسه‌های مبتنی بر ساختار را انجام دادیم که مستقل از ترکیب توالی با استفاده از یک الگوریتم اخیرا توسعه‌یافته است. ما تطابق باقیمانده به باقیمانده ساختارهای پروتئینی متعدد را شناسایی کردیم و نقشه‌های هم ترازی مبتنی بر ساختار (دو بعدی) از 37 ساختار پلیمراز را ایجاد کردیم که هم توالی و هم جزئیات ساختار را ارائه می‌دهند. با استفاده از این نقشه‌ها، ما تعیین کردیم که حدود 75٪ از هر گونه پلیمراز از هفت بخش پروتئینی تشکیل شده است که هر یک از آنها شباهت ساختاری بالایی با بخش‌های موجود در گونه‌های دیگر دارند، اگرچه آنها به طور گسترده در ترکیب و ترتیب توالی متفاوت هستند. ما هر یک از این بخش‌ها را به‌عنوان یک «همومورف» تعریف می‌کنیم، و هر کدام شامل (اگرچه بیشتر آنها بسیار بزرگ‌تر از) هستند، موتیف‌های شناخته‌شده پلیمراز حفاظت‌شده را شامل می‌شوند. همه همومورف ها با تونل الگو یا تونل ورودی نوکلئوزید تری فسفات (NTP) و قسمت بیرونی پروتئین تماس می گیرند، که نشان می دهد آنها یک اسکلت ساختاری و عملکردی مشترک در بین پلیمرازها را تشکیل می دهند.	قاب های ساختاری بسیار مشابه، تونل الگو و تونل ورودی NTP را به سطح بیرونی در RNA پلیمرازهای وابسته به RNA متصل می کند.
majlef5h	پس زمینه: دیسکینزی مژگانی اولیه (PCD) یک اختلال تنفسی مادرزادی نادر است که با حرکت غیرطبیعی مژگان که منجر به عفونت مزمن راه هوایی می شود مشخص می شود. ارزیابی کیفی الگوی ضربان مژگانی بر اساس آنالیز میکروسکوپی دیجیتالی با سرعت بالا در فرآیند تشخیص PCD پیشنهاد شده است. اگرچه این ارزیابی در موارد معمولی آسان است، اما زمانی که ضربان مژگانی تا حدی حفظ شود دشوار می شود. ما فرض کردیم که تجزیه و تحلیل کمی الگوی ضربان تشخیص PCD را بهبود می بخشد. ما پارامترهای کمی را با ارزیابی کیفی الگوی ضربان مژگانی در بیمارانی که تشخیص PCD در آنها تایید یا حذف شد، مقایسه کردیم. MethodsNasal اندازه گیری اکسید نیتریک بینی، مسواک زدن بینی و بیوپسی به صورت آینده نگر در 34 بیمار مشکوک به PCD انجام شد. در ترکیب با تجزیه و تحلیل کیفی، 12 پارامتر کمی الگوی ضربان مژگانی بر روی ضبط‌های میکروسکوپی ویدئویی با سرعت بالای ضربان لبه‌های مژکدار تعیین شد. ترکیبی از ناهنجاری های فراساختاری مژگانی در تجزیه و تحلیل میکروسکوپ الکترونی عبوری با سطوح پایین اکسید نیتریک بینی استاندارد طلایی مورد استفاده برای ایجاد تشخیص PCD بود. نتایج: این «استاندارد طلایی» PCD را در 15 بیمار (بیماران غیر PCD) حذف کرد، در 10 بیمار (بیماران PCD) PCD را تأیید کرد و در 9 بیمار بی‌نتیجه بود. در بین 12 پارامتر، مسافت طی شده توسط نوک مژگان وزن شده با درصد ضربان لبه های مژک دار، حساسیت 96 درصد و ویژگی 95 درصد را نشان می دهد. ارزیابی کیفی و تجزیه و تحلیل کمی در بیماران غیر PCD همخوان بود. در 9/10 بیمار PCD، تجزیه و تحلیل کمی با استاندارد طلا مطابقت داشت، در حالی که ارزیابی کیفی با استاندارد طلایی در 3/10 مورد ناسازگار بود. در میان بیمارانی که دارای «استاندارد طلایی» غیرقطعی بودند، استفاده از پارامترهای کمی از تشخیص PCD در 9/4 بیمار (تأیید شده با شناسایی جهش‌های ایجادکننده بیماری در یک بیمار) و خروج PCD در 9/2 بیمار پشتیبانی کرد. نتیجه‌گیری: وقتی الگوی ضربان طبیعی یا تقریباً بی‌تحرک است، ارزیابی کیفی برای مطالعه ضربان مژگانی در بیماران مشکوک به PCD کافی است. با این حال، هنگامی که مژک ها هنوز در حال ضربان هستند اما با تغییرات متوسط (بیش از 40٪ از بیماران مشکوک به PCD)، تجزیه و تحلیل کمی برای تشخیص دقیق مورد نیاز است و می توان برای انتخاب بیماران واجد شرایط برای TEM پیشنهاد داد.	تجزیه و تحلیل کمی ضربان مژگانی در دیسکینزی مژگانی اولیه: یک مطالعه آزمایشی
cq27eq5h	پس زمینه. دلایل الگوهای غیرمعمول مرگ و میر خاص سنی در همه گیری آنفولانزای 1918-1919 ناشناخته باقی مانده است. در اینجا ما مرگ و میر مربوط به بیماری همه گیر را تا سن یک سالگی در یک مجموعه داده منحصر به فرد کنتاکی در سراسر ایالت مشخص می کنیم و نقاط شکست در منحنی های سن را بررسی می کنیم. روش ها گواهی‌های فوت فردی از کنتاکی طی سال‌های 1911-1919 توسط پرسنل آموزش‌دیده پزشکی انتزاع شد. میزان مرگ و میر اضافی مرتبط با بیماری همه گیر با کم کردن نرخ های مشاهده شده در طول ماه های همه گیر از نرخ های سال های گذشته، به طور جداگانه برای هر سال سن و بر اساس جنسیت محاسبه شد. نتایج مشخصات سنی خطر مرگ و میر بیش از حد در پاییز 1918 با حداکثر در بین نوزادان، حداقل در سنین 9-10 سال، حداکثر در سنین 24-26 سال و حداقل دوم در سنین 56-59 سال مشخص شد. خطر مرگ و میر بیش از حد در بزرگسالان جوان تا زمستان 1919 بسیار کاهش یافته بود. نقاط شکست سنی خطر مرگ و میر بین مردان و زنان تفاوتی نداشت. نتیجه گیری نقاط شکست مرگ و میر مشاهده شده در گروه‌های مرد و زن متولد شده در سال‌های 1859-1862، 1892-1894، و 1908-1909 با تاریخ‌های شناخته شده همه‌گیری‌های تاریخی منطبق نبود. الگوهای مرگ و میر غیر معمول سنی در همه گیری 1918-1919 را نمی توان تنها با ازدحام نظامی، عوامل مرتبط با جنگ، یا مصونیت قبلی توضیح داد و احتمالاً ناشی از ترکیبی از عوامل ناشناخته است.	مرگ و میر خاص سن و جنس مرتبط با همه گیر آنفولانزای 1918-1919 در کنتاکی
zq8kqf6h	عملکرد هر غشای بیولوژیکی معین تا حد زیادی توسط مجموعه خاصی از پروتئین های غشایی انتگرال تعبیه شده در آن، و پروتئین های غشای محیطی متصل به سطح غشاء تعیین می شود. فعالیت این پروتئین ها به نوبه خود می تواند توسط ترکیب فسفولیپیدی غشاء تعدیل شود. بازسازی پروتئین های غشایی در یک غشای مدل امکان بررسی ویژگی ها و فعالیت های فردی یک جزء غشای سلولی را فراهم می کند. با این حال، حفظ فعالیت پروتئین های غشایی اغلب پس از بازسازی دشوار است، زیرا ترکیب دولایه فسفولیپید مدل با غشای سلولی بومی متفاوت است. این بررسی در مورد بازسازی فعالیت‌های پروتئین غشایی در چهار نوع مختلف غشای مدل - تک لایه‌ها، دولایه‌های لیپیدی پشتیبانی‌شده، لیپوزوم‌ها و نانودیسک‌ها، و مقایسه مزایای آنها در بازسازی پروتئین غشایی بحث می‌کند. تنوع در محیط های مدل اطراف برای این چهار نوع مختلف لایه غشایی می تواند بر ساختار سه بعدی پروتئین های بازسازی شده تأثیر بگذارد و احتمالاً منجر به از دست دادن فعالیت پروتئین ها شود. ما همچنین نمونه هایی را مورد بحث قرار می دهیم که در آن پروتئین های غشایی یکسان با موفقیت به دو یا چند سیستم غشایی مدل با مقایسه فعالیت مشاهده شده در هر سیستم بازسازی شده اند. درک تغییرات رفتاری برای پروتئین‌ها در سیستم‌های غشایی مدل پس از بازسازی غشا اغلب پیش‌نیاز تحقیقات پروتئین است. یافتن راه‌حل‌های بهتر برای حفظ فعالیت‌های پروتئین غشایی برای اندازه‌گیری و شناسایی در شرایط آزمایشگاهی ضروری است.	بازسازی پروتئین های غشایی به غشاهای مدل: جستجوی راه های بهتر برای حفظ فعالیت های پروتئین
uj5gcvmd	تعریف ارتباطات بین نورون ها برای درک ما از ساختار و عملکرد سیستم عصبی بسیار مهم است. ویروس های نوترکیب مهندسی شده برای انتقال از طریق سیناپس ها، یک رویکرد قدرتمند برای تشریح مدارهای عصبی در داخل بدن ارائه می کنند. ما اخیراً نشان داده‌ایم که ویروس استوماتیت تاولی نوترکیب (VSV) می‌تواند با ارائه گلیکوپروتئین‌های مختلف به ویروس، دارای توانایی ردیابی ترانس سیناپسی انتروگراد یا رتروگراد باشد. در اینجا ما خصوصیات انتقال و بیان ژن VSV نوترکیب (rVSV) را با گلیکوپروتئین ویروس هاری (RABV-G) گسترش می‌دهیم، و نمونه‌هایی از فعالیت آن را نسبت به شکل ردیاب ترانس‌سیناپسی انتروگراد rVSV ارائه می‌کنیم. مشخص شد rVSV با RABV-G بیان قوی تراریخته‌ها را هدایت می‌کند و به سرعت از یک نورون به نورون دیگر تنها به صورت رتروگراد پخش می‌شود. بسته به نحوه تحویل RABV-G، VSV به عنوان یک ردیاب پلی سیناپسی یا تک سیناپسی عمل می کرد، یا می توانست از طریق جذب آکسونی و انتقال رتروگراد، پیش بینی ها را تعریف کند. در حیواناتی که همزمان با rVSV در شکل انتروگراد آن آلوده شده‌اند، rVSV با RABV-G می‌تواند برای توصیف شباهت‌ها و تفاوت‌ها در اتصالات به مناطق مختلف استفاده شود. rVSV با RABV-G یک ابزار ردیابی منعطف، سریع و همه کاره را فراهم می کند که مکمل ردیاب ترانس سیناپسی انتروگراد مبتنی بر VSV است که قبلا توضیح داده شد.	ویروس استوماتیت وزیکولار با گلیکوپروتئین ویروس هاری، انتقال ترانس سیناپسی رتروگراد را در بین نورون ها در داخل بدن هدایت می کند.
kkh4gvp0		داروی ضد مالاریا کلروکین در درمان عفونت ویروس آنفولانزای پرندگان A H5N1 در مدل حیوانی بسیار موثر است.
ku2dsy4f	مقدمه: اگرچه ذات الریه به عنوان تنها شایع ترین عامل خطر برای آسیب حاد ریه (ALI) شناخته شده است، ما دانش محدودی در مورد اینکه چرا ALI در برخی از بیماران مبتلا به پنومونی ایجاد می شود و در برخی دیگر نه، داریم. هدف از این مطالعه تعیین فراوانی، عوامل خطر و پیامد ALI در بیماران مبتلا به پنومونی عفونی بود. MethodsA یک مطالعه کوهورت گذشته نگر از بیماران بزرگسال مبتلا به پنومونی مثبت میکروبیولوژیکی، بستری در دو بیمارستان مایو کلینیک روچستر بین 1 ژانویه 2005 و 31 دسامبر 2007. در تجزیه و تحلیل مورد شاهدی تودرتوی بعدی، ما تفاوت ها را در بیمارستان های پیش بیمارستانی و داخل بیمارستانی ارزیابی کردیم. قرار گرفتن در معرض بین بیماران با و بدون ALI / سندرم زجر تنفسی حاد (ARDS) مطابق با پاتوژن خاص، محل جداسازی، جنسیت و نزدیکترین سن به روش 1:1. ResultsThe مطالعه شامل 596 بیمار. 365 نفر (61.2%) مرد بودند. میانگین سنی 65 (IQR، 53 تا 75) سال بود. در مجموع، 171 بیمار (28.7%) با ALI تشخیص داده شدند. بروز ALI در پنومونی های باکتریایی (n = 99 از 412، 24%) در مقایسه با پنومونی های ویروسی (n = 19 از 55، 35%)، قارچی (n = 39 از 95، 41%) کمتر بود. n = 14 از 34، 41% P = 0.002). پس از تنظیم شدت پایه بیماری و بیماری‌های همراه، بیمارانی که در آنها ALI ایجاد شد، خطر مرگ در بیمارستان به طور قابل توجهی افزایش یافت (OR(adj)9.7؛ 95% فاصله اطمینان (CI)، 6.0 تا 15.9). در یک مطالعه مورد-شاهدی تودرتو، وجود شوک (OR، 8.9؛ 95% فاصله اطمینان (CI)، 2.8 تا 45.9)، درمان ضد میکروبی اولیه نامناسب (OR، 3.2؛ 95% CI، 1.3 تا 8.5)، و تزریق خون (OR، 4.8; 95٪ CI، 1.5 تا 19.6) به طور مستقل توسعه ALI را پیش بینی کردند. نتیجه‌گیری: توسعه ALI در میان بیماران بستری شده با پنومونی عفونی در بین پاتوژن‌های ریوی متفاوت بود و با افزایش مرگ‌ومیر همراه بود. درمان ضد میکروبی اولیه و انتقال خون نامناسب، توسعه ALI را مستقل از پاتوژن پیش بینی می کند.	عوامل خطر برای ایجاد آسیب حاد ریه در بیماران مبتلا به پنومونی عفونی
2586thss	هدف از این مطالعه غربالگری آنتی‌ژن‌های ویروس هپاتیت C (HCV) برای ایجاد روش ایمونواسی جریان ساندویچ جانبی آنتی‌بادی دوگانه (DAS-LFIA) برای آزمایش وجود آنتی‌بادی‌های ضد HCV در سرم یا پلاسمای انسانی بود. مجموعه‌ای از پروتئین‌های نوترکیب مختلف HCV در سلول‌های اشریشیا کلی ساخته، بیان، خالص‌سازی شد و نوار جدید DAS-LFIA توسعه یافت. حساسیت و ویژگی نوار DAS-LFIA جدید با شناسایی 23 سرم HCV مثبت، مجموعه ای از مراجع کنترل کیفیت برای تشخیص ضد HCV که حاوی مقادیر شناخته شده آنتی بادی های ضد HCV و 8 سرم HCV منفی است، ارزیابی شد. در مجموع 300 نمونه سرم بالینی با هر دو نوار DAS-LFIA جدید و سنجش ایمونوسوربنت متصل به آنزیم (ELISA) مورد بررسی قرار گرفت. داده ها با استفاده از نرم افزار SPSS 11.5 تجزیه و تحلیل شد. حساسیت و ویژگی نوار جدید DAS-LFIA 100٪ بود. پایین ترین خط تست نوارهای HCV DAS-LFIA 2 NCU/ml بود. علاوه بر این، تطابق بین نوار جدید DAS-LFIA و روش های ELISA 94.33٪ بود. در نتیجه، روش آزمایش جدید ما سریع، ساده، حساس است و به طور خاص وجود آنتی بادی های ضد HCV را در سرم یا پلاسمای انسانی تشخیص می دهد. بنابراین، ممکن است برای نظارت بر HCV استفاده شود.	یک روش ایمونواسی جریان جانبی دوگانه آنتی بادی جدید برای تشخیص سریع و ساده ویروس هپاتیت C
wt2gctys	اگرچه ویروس هپاتیت C (HCV) تقریباً 130 تا 170 میلیون نفر را در سراسر جهان تحت تأثیر قرار می دهد، هیچ واکسنی در دسترس نیست. HCV یکی از علل مهم هپاتیت مزمن، سیروز و کارسینوم سلول های کبدی است که منجر به نیاز به پیوند کبد می شود. در این مطالعه، کورکومین، ماده‌ای که در طب سنتی چینی استفاده می‌شود، از نظر فعالیت و مکانیسم ضد HCV، با استفاده از یک رده سلولی کبدی انسانی حاوی مشابه ژنوتیپ HCV 1b مورد ارزیابی قرار گرفت. زیر غلظت 20 درصد سمیت سلولی، کورکومین وابسته به دوز تکثیر HCV را با سنجش ژن گزارشگر لوسیفراز، تشخیص HCV RNA و آنالیز پروتئین HCV مهار کرد. تحت شرایط یکسان، کورکومین همچنین وابسته به دوز هم اکسیژناز-1 را با بالاترین القاء در 24 ساعت القا کرد. همین، یک القاکننده هم اکسیژناز-1، همچنین بیان پروتئین HCV را به صورت وابسته به دوز مهار کرد. نابودی هم اکسیژناز-1 تا حدی بیان پروتئین HCV مهار شده با کورکومین را معکوس کرد. علاوه بر القای هم اکسیژناز-1، فعالیت‌های مولکول سیگنال‌دهنده AKT، کینازهای تنظیم‌شده با سیگنال خارج سلولی (ERK) و فاکتور هسته‌ای-κB (NF-κB) توسط کورکومین مهار شدند. با استفاده از مهارکننده‌های خاص PI3K-AKT، MEK-ERK و NF-kB، نتایج نشان داد که تنها مهار PI3K-AKT به طور مثبت در تکثیر HCV مهار شده با کورکومین نقش دارد. مهار ERK و NF-kB به احتمال زیاد بیان پروتئین HCV را ترویج می‌کند. به طور خلاصه، کورکومین با القای هم اکسیژناز-1 و مهار مسیر AKT، تکثیر HCV را مهار کرد. اگرچه کورکومین همچنین فعالیت های ERK و NF-kB را مهار می کند، بیان پروتئین HCV را اندکی افزایش می دهد. این نتیجه ممکن است اطلاعاتی را در مورد استفاده از کورکومین به عنوان یک کمکی در درمان ضد HCV ارائه دهد.	کورکومین با القای هم اکسیژناز-1 و سرکوب AKT، تکثیر HCV را مهار می کند.
uvs3waq5	پس زمینه: در مراحل اولیه یک بیماری همه گیر آنفولانزای جدید، محدودیت سفر یک وسیله فوری و غیردارویی برای به تاخیر انداختن رشد بروز است. این چارچوب زمانی کاهش موثر را افزایش می دهد، به ویژه زمانی که ویژگی های ویروس در حال ظهور ناشناخته باشد. در مطالعه حاضر، ما از همه‌گیری آنفلوانزای A در سال 2009 به عنوان مطالعه موردی برای ارزیابی تأثیر تنظیم حمل‌ونقل هوایی، دریایی و زمینی استفاده کردیم. سایر استراتژی های دولت، یعنی داروهای ضد ویروسی و بستری شدن در بیمارستان نیز مورد ارزیابی قرار گرفت. روش‌ها: ورودی‌های هنگ‌کنگ از 44 کشور از طریق حمل‌ونقل هوایی، دریایی و زمینی به یک مدل جریان میزبان تصادفی حساس، در معرض، عفونی و بازیابی شده (SEIR) وارد شدند. این مدل به تعدادی از موارد نهفته و عفونی اجازه عبور از مرز را داد که منبع انتقال بیماری محلی است. ما همچنین استراتژی‌های ضد ویروسی و پیشگیری از بستری را برای مقایسه اثربخشی این اقدامات کنترلی مدل‌سازی کردیم. نرخ بازتولید پایه از داده های نظارت معمول برآورد شد. نتایج: با توجه به سفر هوایی، مسیر اصلی متصل به منطقه منبع آنفلوانزا باید برای محدودیت‌های سفر هدف‌گذاری شود. اعمال محدودیت 99 درصدی سفر هوایی، اوج اپیدمی را تا دو هفته به تاخیر انداخت. هنگامی که همه گیری در چین ایجاد شد، ارتباط زمینی قوی بین هنگ کنگ و چین هنگ کنگ را آسیب پذیر کرد. مشخص شد که داروهای ضد ویروسی و بستری شدن در بیمارستان در کاهش نرخ حمله موثرتر از محدودیت های سفر هستند. استراتژی های ترکیبی (با محدودیت 99 درصدی در همه حالت های حمل و نقل) اوج را برای مدت طولانی به تعویق انداخت تا یک برنامه واکسیناسیون ایجاد شود. نتیجه‌گیری: یافته‌ها به سیاست‌گذاران در تصمیم‌گیری در مورد مدیریت همه‌گیری‌های مشابه آینده کمک می‌کند. ما همچنین پیشنهاد می‌کنیم زمانی که محدودیت برای کنترل همه‌گیری ضروری تشخیص داده شد، میزان محدودیت و نحوه حمل و نقل را تنظیم کنید. اگرچه محدودیت‌های سفر هنوز مورد پذیرش اجتماعی قرار نگرفته است، اما زمانی که یک ویروس جدید و بسیار مزاحم ظاهر می‌شود، زمان لازم را برای واکنش‌های کاهش‌دهنده فراهم می‌کند.	مدل‌سازی تأثیر محدودیت‌های سفر هوایی، دریایی و زمینی که با سایر مداخلات تکمیل شده بر ظهور یک ویروس همه‌گیر آنفلوانزای جدید
5r2in1gw	مقدمه: آنفولانزا در بخش‌های مراقبت‌های ویژه (ICU) به‌راحتی نادیده گرفته می‌شود، به‌ویژه در بیمارانی که علل جایگزین نارسایی تنفسی دارند یا در افرادی که در طول اقامت در ICU به آنفولانزا مبتلا می‌شوند. MethodsWe یک مطالعه آینده نگر از بیماران بستری در سه ICU بزرگسالان بیمارستان ما از دسامبر 2010 تا فوریه 2011 انجام دادیم. تمام نمونه های آسپیراسیون نای (TA) ارسال شده به بخش میکروبیولوژی به طور سیستماتیک برای آنفولانزا غربالگری شدند. اگر آزمایش درخواست نشود و بیمار پس از جمع‌آوری نمونه، درمان تجربی ضد ویروسی دریافت نکرده باشد، آنفولانزا را به‌عنوان نامشخص تعریف کردیم. ResultsWe نمونه TA از 105 بیمار دریافت کرد. آنفلوانزا در 31 بیمار تشخیص داده شد و در 15 بیمار (48.4%) به عنوان غیر مشکوک و در 13 بیمار (42%) به عنوان اکتسابی بیمارستان طبقه بندی شد. موارد مشکوک و غیر مشکوک با هم مقایسه شدند و تفاوت معنی داری از نظر سن (53 در مقابل 69 سال متوسط)، نارسایی شدید تنفسی (68.8٪ در مقابل 20٪)، جراحی (6.3٪ در مقابل 60٪)، میانگین روزهای اقامت در ICU قبل از تشخیص مشاهده شد. 1 در مقابل 4)، عفونت بیمارستانی (18.8٪ در مقابل 66.7٪)، سرفه (93.8٪ در مقابل 53.3٪)، ارتشاح موضعی در رادیوگرافی قفسه سینه (6.3٪ در مقابل 40٪)، روزهای متوسط تا درمان ضد ویروسی (2 در مقابل 9)، ذات الریه ( 93.8٪ در مقابل 53.3٪، و سندرم دیسترس تنفسی حاد (75٪ در مقابل 26.7٪). تجزیه و تحلیل چند متغیره پذیرش در ICU جراحی را نشان داد (نسبت شانس (OR)، 37.1؛ فاصله اطمینان 95٪ (CI)، 2.1 تا 666.6؛ 0.01 = P) و ارتشاح موضعی در رادیوگرافی قفسه سینه (OR، 27.8؛ 95٪ فاصله اطمینان (CI)، 1.3 به 584.1؛ P = 0.03) به عنوان عوامل خطر مستقل برای آنفولانزای مشکوک. مرگ و میر کلی در 30 روز 29٪ بود. بستری شدن در ICU برای نارسایی شدید تنفسی یک عامل خطر مستقل برای نتیجه ضعیف بود. نتیجه‌گیری: در طول فصل آنفولانزا، تقریباً یک سوم بیماران بحرانی مشکوک به عفونت دستگاه تنفسی تحتانی، آنفولانزا داشتند و در 48.4 درصد، آنفولانزا مشکوک نبود. نمونه های تنفسی تحتانی از ICU بزرگسالان باید به طور سیستماتیک برای آنفولانزا در طول اپیدمی های فصلی غربالگری شوند.	آیا ترشحات دستگاه تنفسی تحتانی بیماران مراقبت های ویژه باید به طور سیستماتیک برای ویروس آنفولانزا در طول فصل آنفولانزا غربالگری شوند؟
l9862er0	مقدمه: بار خاص تحمیل شده بر واحدهای مراقبت ویژه (ICU) در طول همه گیری آنفولانزای A/H1N1 در سال 2009 به خوبی مورد بررسی قرار نگرفته است. یک رجیستری غربالگری آنلاین امکان گزارش روزانه میزان اشغال تخت های ICU توسط بیماران مبتلا به آنفولانزا (Flu-OR) بستری در ICU فرانسه را فراهم می کند. روش‌ها: ما یک مطالعه کوهورت اولیه آینده‌نگر را با نتایج یک رجیستری غربالگری آنلاین طراحی‌شده برای ارزیابی روزانه بار ICU انجام دادیم. نتایج: از میان 108 مرکز شرکت‌کننده در شبکه تحقیقاتی H1N1 فرانسه در مورد تهویه مکانیکی (REVA) - ثبت انجمن مراقبت‌های ویژه فرانسه (SRLF)، 69 ICU متعلق به هفت منطقه جغرافیایی بزرگ به‌طور داوطلبانه در یک فهرست غربالگری وب‌سایت شرکت کردند. هدف ارزیابی روزانه میزان اشغال تخت های ICU توسط بیماران مبتلا به آنفولانزا و غیر آلوده به مدت حداقل سه هفته بود. سیصد و نود و یک بیمار مبتلا به بیماری بدخیم در گروه ثبت نام شدند که نشان دهنده زیرمجموعه ای از 35٪ از کل گروه همه گیر فرانسه در سال 2009 است. 73٪ تهویه مکانیکی، 13٪ نیاز به اکسیژن رسانی اضافی غشای بدن (ECMO) و 22٪ فوت کردند. آنفولانزای جهانی در این ICU تنها 7.6٪ بود، اما از آستانه بحرانی از پیش تعریف شده 15٪ در 32 ICU برای مجموع 103 هفته فراتر رفت. آنفولانزای OR در دانشگاه به طور قابل توجهی بالاتر از بیمارستان های غیر دانشگاهی بود. اوج بار ICU با مشاهدات به دست آمده در سطح مناطق جغرافیایی بزرگ به خوبی پیش بینی نشده بود. نتیجه‌گیری: پیک Flu-OR در طول همه‌گیری به طور قابل‌توجهی از آستانه بحرانی 15 درصد در تقریباً نیمی از ICU فراتر رفت، با توزیع نابرابر با زمان، مناطق جغرافیایی و بین بیمارستان‌های دانشگاهی و غیر دانشگاهی. ارزیابی آنلاین Flu-OR از طریق یک رجیستری اختصاصی ساده ممکن است به تطبیق بهتر منابع و نیازها کمک کند.	علاقه مندی به یک رجیستری ساده غربالگری آنلاین برای اندازه گیری بار ICU مربوط به یک بیماری همه گیر آنفولانزا
t81g3oyq	مقدمه: پنومونی اکتسابی از جامعه (CAP) سهم بالایی از بستری شدن در بخش مراقبت های ویژه را به خود اختصاص می دهد و استرپتوکوک پنومونیه عامل اصلی این عفونت ها است. با این حال، اطلاعات کمی در مورد ویژگی های بالینی و نتایج بیماران ICU مبتلا به پنومونی پنوموکوکی وجود دارد. هدف از این مطالعه ارائه داده های اپیدمیولوژیک و تعیین عوامل خطر مرگ و میر در بیماران بستری در بخش مراقبت های ویژه به دلیل S.pneumoniae CAP شدید بود. MethodsWe یک بررسی گذشته‌نگر از دو پایگاه داده ICU چند مرکزی (2001-2008) انجام دادیم. بیمارانی که برای مدیریت CAP شدید پنوموکوکی بستری شده بودند، در صورتی که معیارهای انجمن قفسه سینه آمریکا در سال 2001 را برای ذات الریه شدید برآورده می کردند، نارسایی اندام تهدید کننده حیات داشتند و نمونه میکروبیولوژیکی مثبت برای S. pneumoniae داشتند، ثبت نام می شدند. بیماران مبتلا به برونشیت، پنومونی آسپیراسیون یا با عفونت های پنوموکوکی غیر ریوی از مطالعه خارج شدند. نتایج: دویست و بیست و دو بیمار با میانگین نمره SAPS II به 47 رسید [36-64]. نارسایی حاد تنفسی (154=n) و شوک سپتیک (54=n) شایع ترین علل بستری در ICU بودند. شوک سپتیک در 170 بیمار (77%) رخ داد و تهویه مکانیکی در 186 بیمار (84%) مورد نیاز بود. درمان جایگزینی کلیه در 70 بیمار (32 درصد) آغاز شد. باکتریمی در 101 بیمار تشخیص داده شد. شیوع سویه های استافیلوکوکوس پنومونیه با کاهش حساسیت به پنی سیلین 7/39 درصد بود. اگرچه آنتی بیوتراپی در 92.3 درصد موارد کافی بود، مرگ و میر بیمارستانی به 28.8 درصد رسید. در تجزیه و تحلیل چند متغیره، عوامل خطر مستقل برای مرگ و میر عبارت بودند از سن (OR 1.05 (95% فاصله اطمینان: 1.02-1.08))، جنس مرد (OR 2.83 (95% فاصله اطمینان (CI: 1.16-6.91)) و درمان جایگزینی کلیه (OR 3.78 (95٪) CI: 1.71-8.36)). عوارض جانبی، تجویز ماکرولید، باکتریمی همزمان یا حساسیت به پنی سیلین بر نتیجه تأثیری نداشت. نتیجه‌گیری: در بخش مراقبت‌های ویژه، مرگ و میر CAP پنوموکوکی علیرغم درمان کافی ضد میکروبی همچنان بالاست. داده های اولیه جمعیت شناختی و درمان جایگزینی کلیه تأثیر عمده ای بر پیامد نامطلوب دارند.	اپیدمیولوژی و پیامد پنومونی شدید پنوموکوکی بستری در بخش مراقبت های ویژه: یک مطالعه چند مرکزی
uj4ymadl	ارگانیسم‌های جدید و سیستم‌های بیولوژیکی که برای برآوردن نیازهای انسان طراحی شده‌اند، از جمله اهداف ژنومیک مصنوعی و زیست‌شناسی مصنوعی هستند. زیست شناسی مصنوعی به دنبال مدل سازی و ساخت اجزای بیولوژیکی، عملکردها و موجوداتی است که در طبیعت وجود ندارند یا سیستم های بیولوژیکی موجود را برای انجام عملکردهای جدید طراحی مجدد می کند. از سوی دیگر، ژنومیکس مصنوعی، فناوری‌هایی را برای تولید ژنوم‌های کامل سنتز شده شیمیایی یا بخش‌های بزرگ‌تری از ژنوم‌ها در بر می‌گیرد که امکان مهندسی همزمان تغییرات بی‌شماری را در ماده ژنتیکی موجودات فراهم می‌کند. بنابراین، توابع پیچیده مهندسی یا موجودات جدید در زیست شناسی مصنوعی به تدریج به ژنومیکس مصنوعی وابسته می شوند و با آن همگرا می شوند. در حالی که پیش‌بینی می‌شود که کاربردهای هر دو حوزه با ساخت داروهای جدید، مواد شیمیایی تجدیدپذیر یا انرژی پاک، مزایای بزرگی را ارائه می‌دهند، اما نگرانی‌هایی در مورد خطرات ایمنی، زیست‌محیطی و اجتماعی-اقتصادی جدید ایجاد کرده‌اند - که بحث‌های قطبی فزاینده‌ای را برانگیخته است. در اینجا ما قصد داریم تا مروری بر پیشرفت‌های اخیر در کاربردهای زیست‌پزشکی و بیوتکنولوژیک ژنومیکس مصنوعی و زیست‌شناسی مصنوعی و همچنین استدلال‌ها و شواهد مربوط به مزایای احتمالی، خطرات و پیامدهای حاکمیتی آنها ارائه دهیم.	کاربردهای ژنومیکس مصنوعی و زیست شناسی مصنوعی بین امیدها و نگرانی ها
z5rdf0mi	انتخاب کدون های مترادف به ترکیب نوکلئوتیدی/دی نوکلئوتیدی ژنوم (که فشار جهش نامیده می شود) و فراوانی نسبی tRNA ها در یک سلول (فشار ترجمه) بستگی دارد. فشار جهش معمولاً به محتوای GC ژنومی ساده می شود. با این حال، فرکانس های مونوکلئوتیدی و دی نوکلئوتیدی در ژنوم ها یا mRNA های مختلف ممکن است به طور قابل توجهی متفاوت باشد، به ویژه در ویروس های RNA. مجموعه‌ای از الگوریتم‌های درهم‌آمیزی سیلیکو برای توضیح این ویژگی‌ها و تجزیه و تحلیل تأثیر نسبی مولفه‌های فشار جهش بر بایاس استفاده از کدون در ویروس‌های RNA توسعه داده شد. محتوای کل GC یک توصیف ضعیف از ترکیب ژنوم ویروسی و علل سوگیری استفاده از کدون بود. محتوای نوکلئوتید ژنومی تنها عامل مهم استفاده از کدون مترادف بود. علاوه بر این، انتخاب بین اسیدهای آمینه سازگار (به عنوان مثال، لوسین و ایزولوسین) به شدت تحت تأثیر ترکیب نوکلئوتید ژنومی قرار گرفت. ترکیب دی نوکلئوتیدی در موقعیت های کدون 2-3 تأثیر بیشتری بر استفاده از کدون داشت. همراه با سوگیری ترکیب مونونوکلئوتیدی، می‌تواند تقریباً کل سوگیری استفاده از کدون را در ویروس‌های RNA توضیح دهد. از سوی دیگر، بایاس قوی محتوای دی نوکلئوتید در موقعیت کدون 3-1 که در برخی از ویروس ها یافت می شود تأثیر بسیار کمی بر استفاده از کدون داشت. یک حسگر ایمنی ذاتی فرضی برای CpG در RNA می‌تواند تا حدی سوگیری استفاده از کدون را توضیح دهد، اما به دلیل وابستگی ترجمه ویروس به ماشین‌های ترجمه میزبان بایاس، مطالعات تجربی برای کشف بیشتر منبع سوگیری دی نوکلئوتیدی در ویروس‌های RNA مورد نیاز است.	علل و پیامدهای سوگیری استفاده از کدون در ویروس های RNA
0mncitnr	سابقه و هدف: نارسایی کلیوی با دنبال کردن درمان جایگزینی مستمر کلیه، یک مشکل بالینی عمده در گیرندگان پیوند کبد است که میزان بروز آن بین 3 تا 20 درصد گزارش شده است. اطلاعات کمی در مورد اهمیت نارسایی حاد کلیه پس از عمل یا نارسایی حاد بر مزمن کلیه بر نتیجه بعد از عمل در گیرندگان پیوند کبد وجود دارد. MethodsIn این تجزیه و تحلیل post hoc، میزان مرگ و میر 135 گیرنده پیوند کبد را طی 6 سال در مرکز ما با توجه به شرایط پایه کلیوی و RRT پس از عمل مقایسه کردیم. ما بیماران را با توجه به فرمول Cockcroft محاسبه شده قبل از عمل و بروز درمان جایگزینی کلیه پس از عمل به 4 گروه طبقه بندی کردیم. سپس داده ها با توجه به میزان مرگ و میر و علاوه بر عوامل خطر قبل و قبل از پیوند مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. ResultsThere تفاوت معنی داری در مرگ و میر ICU (0.008=p)، مرگ و میر بیمارستانی (0.002=p) و بقای تجمعی (P<0.0001) بین گروه ها وجود داشت. بیشترین میزان مرگ و میر در گروه با RRT و عملکرد کلیه نرمال پایه (به ترتیب 20% مرگ و میر ICU، 26.6% مرگ و میر بیمارستانی و 50% مرگ و میر تجمعی 1 ساله) رخ داد. نسبت خطر در این گروه 9.6 بود (CI 3.2-28.6، p=.0001). نتیجه‌گیری: این مطالعه نشان می‌دهد که در نارسایی حاد کلیه گیرندگان پیوند کبد با RRT بعد از عمل با مرگ و میر همراه است و میزان مرگ و میر بیشتر از بیماران مبتلا به نارسایی حاد بر مزمن کلیه و درمان جایگزینی کلیه پس از عمل است.	رابطه بین کلیرانس کراتینین قبل از عمل و نتایج برای بیماران تحت پیوند کبد: یک مطالعه مشاهده ای گذشته نگر
upy19l3s	به عنوان یک استاندارد نمونه‌برداری بیوآئروسل، ضربه‌گیر نوع Andersen از زمان اختراع خود در دهه 1950، از جمله بررسی حملات سیاه زخم در ایالات متحده در سال 2001، به طور گسترده مورد استفاده قرار می‌گیرد. با این حال، مشکلات مرتبط با آن مانند فشار نهفته و خشک شدن و همچنین جهش ذرات مورد استفاده قرار نگرفته است. حل شده است. در اینجا، ما کارایی جمع آوری بیولوژیکی آن را با آبکاری یک لایه روغن معدنی (100 میکرولیتر) روی صفحه آگار بهبود دادیم. یک نمونه‌بر شش مرحله‌ای Andersen و یک ضربه‌گیر BioStage با صفحات آگار پخش‌شده با روغن معدنی در جمع‌آوری آئروسل‌های باکتریایی و قارچی داخلی و خارجی مورد آزمایش قرار گرفتند. اثرات زمان‌های نمونه‌برداری (5، 10 و 20 دقیقه) نیز با استفاده از ضربه‌گیر BioStage هنگام نمونه‌برداری از آئروسل‌های زیست محیطی و همچنین باسیلوس سوبتیلیس (G+) و اشریشیا کلی (G-) مورد مطالعه قرار گرفت. علاوه بر این، کاهش جهش ذرات توسط صفحه روغن معدنی نیز با استفاده از شمارنده ذرات نوری (OPC) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج تجربی نشان داد که استفاده از پلیت آگار پخش‌شده با روغن معدنی می‌تواند به طور قابل‌توجهی بازیابی آئروسل زیستی قابل کشت توسط ضربه‌گیرهای نوع آندرسن را افزایش دهد (p-value<0.05). افزایش بازیابی به اندازه بیوآئروسل، نوع، زمان نمونه برداری و محیط بستگی دارد. به طور کلی، پیشرفت‌های بیشتری (20 درصد اضافی) برای آخرین مرحله نمونه‌بردارهای شش مرحله‌ای اندرسن در مقایسه با ضربه‌گیر BioStage برای نمونه‌برداری 10 دقیقه‌ای مشاهده شد. هنگام نمونه‌برداری از آئروسل‌های B. subtilis، E. coli و آئروسل‌های محیطی، افزایش با افزایش زمان نمونه‌برداری افزایش می‌یابد که از 50 درصد افزایش در 5 دقیقه تا 100 درصد در 20 دقیقه متغیر است. نتایج OPC نشان داد که استفاده از روغن معدنی می‌تواند به طور موثر جهش ذرات را با میانگین 66 درصد برای نمونه‌برداری 10 دقیقه کاهش دهد. کار ما نشان می‌دهد که بهبود آئروسل‌های قارچی در درجه اول به کاهش استرس نهفتگی نسبت داده می‌شود، در حالی که برای آئروسل‌های باکتریایی کاهش نهفتگی، خشک شدن و جهش ذرات نقش اصلی را ایفا می‌کنند. فناوری توسعه‌یافته می‌تواند به آسانی تکنیک‌های مبتنی بر آگار از جمله نمونه‌برهای قابل حمل با حجم بالا برای نظارت بر بیوآئروسل را بهبود بخشد.	افزایش نمونه برداری بیوآئروسل توسط ایمپکتورهای اندرسن با استفاده از پلیت آگار روغن معدنی
vlns6j0j	پس زمینه: دانستن بار بیماری ملی آنفولانزای شدید در کشورهای کم درآمد می تواند تصمیمات سیاستی در مورد درمان و پیشگیری از آنفولانزا را تعیین کند. ما یک روش جدید را با استفاده از داده های محلی تولید شده برای تخمین این بار ارائه می کنیم. روش‌ها و یافته‌ها: این روش با محاسبه بروز بیماری حاد تنفسی حاد بستری در بیمارستان برای کودکان کمتر از 5 سال و افراد بالای 5 سال از پایش مبتنی بر جمعیت در یک استان آغاز می‌شود. سپس این نرخ پایه SARI برای هر استان بر اساس شیوع عوامل خطر و رفتار جستجوی مراقبت‌های بهداشتی تنظیم می‌شود. درصد SARI با ویروس آنفولانزا شناسایی شده از پایش نگهبان در سطح استان تعیین می‌شود و بر نرخ‌های استانی تعدیل‌شده ساری بستری در بیمارستان اعمال می‌شود. داده‌های جستجوی مراقبت‌های بهداشتی از نظرسنجی‌های استفاده از مراقبت‌های بهداشتی برای تخمین SARI مرتبط با آنفولانزای غیر بیمارستانی استفاده می‌شود. نرخ SARI مرتبط با آنفولانزای بستری و غیر بستری در بیمارستان به داده‌های سرشماری برای محاسبه تعداد ملی موارد اعمال می‌شود. این روش به صورت میدانی در کنیا آزمایش شد و در گواتمالا با استفاده از داده‌های آگوست 2009 تا ژوئیه 2011 تأیید شد. کمتر از 5 سال (2.9-4.7 در هر 1000 نفر) و 6882-7836 برای افراد ≥5 سال (0.21-0.24 در هر 1000 نفر)، بسته به سال و نرخ پایه استفاده شده. در گواتمالا (جمعیت 2011 14.7 میلیون نفر)، تعداد سالانه موارد بستری در بیمارستان پنومونی مرتبط با آنفلوانزا بین 1065-2259 (0.5-1.0 در هر 1000 نفر) در بین کودکان کمتر از 5 سال و 779-2.252 مورد در هر 1.1 بود. 1000 نفر) برای افراد بالای 5 سال، بسته به سال و نرخ پایه استفاده شده. در هر دو کشور، تعداد موارد غیر بستری مرتبط با آنفلوانزا چندین برابر بیشتر از موارد بستری در بیمارستان بود. نتیجه گیری: ویروس آنفلوانزا با مقدار قابل توجهی از بیماری شدید در کنیا و گواتمالا همراه بود. این روش را می توان در اکثر کشورهای با درآمد کم و متوسط پایین انجام داد.	برآورد بار بیماری ملی بیماری حاد تنفسی شدید مرتبط با آنفولانزا در کنیا و گواتمالا: یک روش جدید
5hx84kki	سابقه و هدف: عفونت ویروس لنفوتروپیک سلول T انسانی نوع 1 (HTLV-1) می تواند منجر به ایجاد لوسمی/لنفوم سلول T بزرگسالان (ATL) یا میلوپاتی مرتبط با HTLV-1/پاراپازیس اسپاستیک استوایی (HAM/TSP) در زیر مجموعه ای از افراد آلوده شود. موضوعات ژن فاکتور زیپ لوسین پایه HTLV-1 (HBZ) نقش مهمی در عفونت HTLV-1 و ایجاد ATL و HAM/TSP دارد. با این حال، اطلاعات کمی در مورد پاسخ ایمنی در برابر HBZ در افراد آلوده به HTLV-1 وجود دارد. در این مطالعه، ما پاسخ‌های آنتی‌بادی علیه HBZ را در نمونه‌های سرم/پلاسما از 436 نفر از جمله اهداکنندگان سرم منفی HTLV-1، حاملان بدون علامت (AC)، ATL، و بیماران HAM/TSP با استفاده از سیستم ایمنی لوسیفراز بررسی کردیم. ResultsImmunoreactivity در برابر HBZ در زیر مجموعه های همه افراد آلوده به HTLV-1 تشخیص داده شد، اما این آزمون بین AC، ATL و HAM/TSP تمایز قائل نشد. با این حال، فراوانی تشخیص آنتی بادی های اختصاصی HBZ در سرم بیماران ATL با زیرگروه مزمن بیشتر از بیماران ATL با زیرگروه لنفوماتوز بود. پاسخ آنتی بادی علیه HBZ نیز در مایع مغزی نخاعی بیماران HAM/TSP با آنتی HBZ در سرم شناسایی شد. پاسخ آنتی بادی علیه HBZ با بار پروویروسی و بیان mRNA HBZ در بیماران HAM/TSP ارتباط نداشت، اما حضور پاسخ اختصاصی HBZ با کاهش فعال‌سازی سلول‌های T CD4(+) در بیماران HAM/TSP همراه بود. علاوه بر این، آنتی بادی اختصاصی HBZ از تکثیر لنفاوی در PBMC بیماران HAM/TSP جلوگیری کرد. نتیجه‌گیری: این اولین گزارشی است که پاسخ ایمنی هومورال را در برابر HBZ مرتبط با عفونت HTLV-I نشان می‌دهد. بنابراین، یک پاسخ ایمنی هومورال در برابر HBZ ممکن است در عفونت HTLV-1 نقش داشته باشد.	پاسخ ایمنی هومورال به فاکتور زیپ لوسین پایه HTLV-1 (HBZ) در افراد آلوده به HTLV-1
sc854ug9	تنوع ژنتیکی به پاسخ ها و پیامدهای میزبان پس از عفونت توسط ویروس آنفولانزای A یا سایر عفونت های ویروسی کمک می کند. با این حال، پنجره‌های باریک علائم بیماری و عوامل محیطی مخدوش‌کننده، شناسایی ژن‌های چند شکلی را که به نتایج متفاوت بیماری در جمعیت‌های انسانی کمک می‌کنند، دشوار کرده است. بنابراین، برای کنترل این متغیرهای محیطی مخدوش کننده در سیستمی که سطوح تنوع ژنتیکی موجود در جمعیت های هم نژاد مانند انسان ها را مدل می کند، از خطوط اولیه پانل همخون (RI) نوترکیب صلیب مشارکتی (CC) بسیار متنوع ژنتیکی (قبلی) استفاده کردیم. جمعیت CC) برای مطالعه چگونگی تأثیر تنوع ژنتیکی بر بیماری مرتبط با آنفولانزا در یک جمعیت دارای تنوع ژنتیکی. طیف گسترده ای از تنوع در فنوتیپ های مرتبط با بیماری آنفولانزا از جمله تکثیر ویروس، التهاب ناشی از ویروس و کاهش وزن مشاهده شد. بسیاری از فنوتیپ های مرتبط با بیماری با تکثیر ویروسی و التهاب ناشی از ویروس پیش بینی کننده کاهش وزن ناشی از ویروس هستند. با وجود این همبستگی‌ها، موش‌های Pre-CC با ترکیبات فنوتیپ بیماری منحصر به فرد و جدید مشاهده شدند. ما همچنین مجموعه‌ای از رونوشت‌ها (ماژول‌ها) را شناسایی کردیم که با جنبه‌های بیماری مرتبط بودند. به منظور شناسایی اینکه چگونه پلی‌مورفیسم‌های ژنتیکی میزبان به تنوع مشاهده‌شده در بیماری کمک می‌کنند، ما نقشه‌برداری مکان‌های صفت کمی (QTL) را انجام دادیم. ما چندین QTL را شناسایی کردیم که به جنبه‌های خاص پاسخ میزبان از جمله کاهش وزن ناشی از ویروس، تیتر، ادم ریوی، جذب نوتروفیل در راه‌های هوایی و بیان رونویسی کمک می‌کنند. داده‌های توالی کل ژنوم موجود برای شناسایی ژن‌های کاندید با اولویت بالا در مناطق QTL استفاده شد. پاسخ میزبان کلیدی QTL در محل ژن Mx1 ضد آنفلوانزای شناخته شده قرار داشت. ما نواحی کدکننده Mx1 را در هشت سویه پایه‌گذار CC توالی‌بندی کردیم و یک آلل جدید Mx1 را شناسایی کردیم که توانایی کاهش یافته در مهار تکثیر ویروسی را نشان داد، در حالی که محافظت در برابر کاهش وزن را حفظ کرد.	مدل سازی تنظیم ژنتیکی میزبان پاتوژنز آنفولانزا در صلیب مشترک
0hghpwyr	سابقه و هدف: آسم شایع ترین بیماری همراه در میان بیماران بستری شده با عفونت آنفولانزای همه گیر A(H1N1)pdm09 [pH1N1] بود. هدف مقایسه ویژگی های بیماران بستری با pH1N1 با و بدون آسم و ارزیابی عوامل مرتبط با شدت در بین بیماران آسم بود. روش‌ها: داده‌های بیمار از دو سری موارد همه‌گیر در سال 2009 از بستری شدن در بیمارستان با pH1N1 ایالات متحده استخراج شد. یک مورد به عنوان یک فرد ≥ 2 ساله بستری در بیمارستان با pH1N1 تایید شده توسط آزمایشگاه تعریف شد. وضعیت آسم از طریق بررسی نمودار تعیین شد. یافته‌ها: از میان 473 مورد، 29 درصد مبتلا به آسم بودند. افراد مبتلا به آسم بیشتر احتمال دارد 2 تا 17 سال سن داشته باشند (39٪ در مقابل 30٪، 0.04 = p) و سیاه پوست (29٪ در مقابل 18٪، P <0.01) و بیماری انسداد مزمن ریه (13٪ در مقابل) 9٪، p = 0.04) اما احتمال کمتری برای ابتلا به ذات الریه (37٪ در مقابل 47٪)، p = 0.05)، نیاز به تهویه مکانیکی (13٪ در مقابل 23٪، p = 0.02) و مرگ (4٪ در مقابل). 10٪، p = 0.04) نسبت به افراد بدون آسم. در میان بیماران مبتلا به آسم، افرادی که در بخش مراقبت‌های ویژه (ICU) بستری شده‌اند یا فوت کرده‌اند (n = 38) در مقایسه با بازماندگانی که در ICU بستری نشده‌اند (n = 99) احتمال بیشتری برای ابتلا به ذات‌الریه در هنگام پذیرش داشتند (60٪ در مقابل 27). ٪، p <0.01) یا سندرم زجر تنفسی حاد (24٪ در مقابل 0٪، p <0.01) و احتمال کمتری برای دریافت داروهای ضد ویروسی آنفولانزا ≤ 2 روز از پذیرش (73٪ در مقابل 92٪، p = 0.02). نتیجه گیری: اکثر افراد مبتلا به آسم یک دوره بدون عارضه داشتند. با این حال، بیماری شدید، از جمله بستری در ICU و مرگ، در بیماران آسمی که با ذات الریه مراجعه کردند، رخ داد. داروهای ضد ویروسی آنفولانزا باید در بیماران بستری مشکوک به آنفولانزا، از جمله مبتلایان به آسم، زودتر شروع شود.	آسم در بیماران بستری با آنفولانزای همه گیر A(H1N1)pdm09 ویروس عفونت – ایالات متحده، 2009
ew8orn0z	سابقه و هدف: ارتباط بین سطح تکرار در توالی ژنومی و اندازه ژنوم با استفاده از ژنوم‌های کامل پروکاریوتی و یوکاریوتی بررسی شده است، اما مطالعات مرتبط به ندرت در ژنوم‌های ویروس انجام شده است. یافته‌ها: در این مطالعه، در مجموع 257 ویروس مورد بررسی قرار گرفت که 90 درصد جنس‌ها را پوشش می‌دهند. نتایج نشان داد که تکرارهای توالی ساده (SSRs) با اندازه ژنوم همبستگی قوی، مثبت و معناداری دارد. کلاس تکرار معینی در محدوده مشخصی از طول توالی ژنوم توزیع می شود. تکرارهای تک، دو و سه به طور گسترده در همه ژنوم های ویروس توزیع شده است، تترا SSR ها به عنوان یک جزء مشترک در ژنوم هایی با اندازه بیش از 100 کیلوبایت تشکیل شده اند. در محدوده ژنوم کمتر از 100 کیلوبایت، ژنوم‌های حاوی SSR‌های پنتا و هگزا بیش از 50 درصد نیستند. تجزیه و تحلیل اجزای اصلی (PCA) نشان داد که تکرار دی نوکلئوتید بر تفاوت‌های SSRها به شدت در بین ژنوم‌های ویروس تأثیر می‌گذارد. نتایج نشان داد که SSR ها تمایل به تجمع در ژنوم های ویروسی بزرگتر دارند. و هر چه توالی ژنوم طولانی تر باشد، واحدهای تکرار طولانی تر. نتیجه گیری: ما این تحقیق را بر روی ارتفاع کل ویروس انجام دادیم. ما به این نتیجه رسیدیم که اندازه ژنوم یک عامل مهم در تأثیرگذاری بر وقوع SSR است. میزبان ها همچنین مسئول واریانس های محتوای SSR تا حدی هستند.	تکامل همزمان بین تکرارهای توالی ساده (SSRs) و اندازه ژنوم ویروس
d0a8oib4	پروتئین کیناز القایی با اینترفرون PKR جزء ضروری ایمنی ذاتی است. این توسط کشش های طولانی dsRNA فعال می شود و با مهار شروع ترجمه در سلول آلوده، اولین خط دفاع میزبان در برابر پاتوژن ها را فراهم می کند. بسیاری از رونوشت‌های سلولی و ویروسی حاوی تغییرات نوکلئوزیدی و/یا ساختار سوم هستند که می‌توانند بر فعال‌سازی PKR تأثیر بگذارند. ما قبلاً نشان داده‌ایم که یک تری فسفات انتهایی 5 - امضای رونوشت‌های ویروسی و باکتریایی خاص - توانایی رونوشت‌های مدل RNA نسبتاً بدون ساختار را برای فعال کردن PKR برای مهار ترجمه به ارمغان می‌آورد و این فعال‌سازی با تغییرات خاصی که در RNA‌های سلولی وجود دارد لغو می‌شود. . به منظور درک مفاهیم بیولوژیکی ساختار سوم RNA بومی و تغییرات نوکلئوزیدی بر روی فعال‌سازی PKR، ما در اینجا tRNA‌های سلولی به شدت اصلاح‌شده و tRNA‌های میتوکندری اصلاح‌نشده یا کمی اصلاح‌شده (mt-tRNA) را مطالعه می‌کنیم. ما متوجه شدیم که هر دو رونوشت T7 از tRNA مخمر (Phe) و mt-tRNA کل کبد گاو استخراج شده بومی، PKR را در شرایط آزمایشگاهی فعال می‌کنند، در حالی که E. coli بومی، کبد گاو، مخمر و tRNA گندم (Phe) این کار را نمی‌کنند، و نه انواع رونوشت های T7 اصلاح شده با پایه یا شکر. این نتایج بیشتر با فعال‌سازی PKR توسط رونوشت T7 تا شده بومی از tRNA (Phe) در داخل بدن پشتیبانی می‌شوند که از اهمیت اصلاح tRNA در سرکوب فعال‌سازی PKR در سلول‌ها حمایت می‌کند. ما همچنین فعال‌سازی PKR را توسط رونوشت T7 از جهش‌زای بیماری‌زا A14G mt-tRNA (Leu) که به دیمر شدن معروف است، بررسی می‌کنیم و متوجه می‌شویم که شکل دایمری اشتباه تا شده PKR را در شرایط آزمایشگاهی فعال می‌کند در حالی که شکل مونومر اینطور نیست. به طور کلی، یافته‌های in vitro و in vivo در اینجا نشان می‌دهد که tRNA‌ها توانایی ذاتی برای فعال کردن PKR دارند و تغییرات نوکلئوزیدی و چین‌خوردگی سوم RNA بومی ممکن است، حداقل تا حدی، برای سرکوب چنین فعال‌سازی عمل کنند، بنابراین برای تشخیص خود و غیر فعال‌سازی عمل می‌کنند. خود tRNA در ایمنی ذاتی	ساختار سوم بومی و تغییرات نوکلئوزیدی توانایی ذاتی tRNA را برای فعال کردن سنسور ایمنی ذاتی PKR سرکوب می‌کند.
g6ffaer1	هدف: ارزیابی اثربخشی و تحمل سورافنیب همراه با کرایوآبلیشن در درمان کارسینوم کبدی غیرقابل برداشت (HCC). MethodsPatients با HCC پیشرفته غیرقابل برداشت، کریوابلیشن و سورافنیب را با دوز 400 میلی گرم دو بار در روز در سیکل های 4 هفته ای در همان روز کرایوابلاسیون دریافت کردند. پاسخ تومور، میانگین بقای کلی و زمان متوسط تا پیشرفت رادیولوژیک محاسبه شد و سمیت ارزیابی شد. نتایج: هفتاد و هشت بیمار مبتلا به HCC غیرقابل برداشت در این مطالعه شرکت کردند. میانگین سنی 52 سال (محدوده 22-81 سال) بود. نمرات وضعیت عملکرد گروه انکولوژی تعاونی شرقی (ECOG) 0 (39.7%)، 1 (55.1%) و 2 (5.1%) بود. نه نفر (11.5%) در مرحله A سرطان کبد (BCLC) کلینیک بارسلونا، بیست و چهار بیمار (30.8%) در مرحله B و 45 نفر (57.7%) در مرحله C بودند. پنج (6.4%) به پاسخ نسبی دست یافتند. و 34 نفر (6/43%) به بیماری پایدار دست یافتند. میانگین زمان پیشرفت (TTP) برای همه بیماران ثبت نام شده 6.6 ماه و میانگین بقای کلی (OS) 12.2 ماه بود. ConclusionCryoablation همراه با سورافنیب نشان دهنده اثربخشی خوب و تحمل پذیری در درمان بیماران HCC پیشرفته غیرقابل برداشت است.	سورافنیب همراه با کرایوآبلیشن برای درمان کارسینوم کبدی غیرقابل برداشت
1rhlu59c	نقش دقیق سلول های T CD8(+) در طول عفونت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس (Mtb) به شدت مورد بحث قرار گرفته است، با این حال به طور کلی پذیرفته شده است که سلول های CD8(+) T در محافظت در برابر Mtb نقش دارند. با این حال، در این مطالعه، ما نشان می‌دهیم که سویه موش CBA/J حساس به Mtb، تعداد زیادی از سلول‌های T CD8(+) را با پیشرفت عفونت در ریه انباشته می‌کند، و این سلول‌ها یک فنوتیپ ناکارآمد و سرکوبگر ایمنی را نشان می‌دهند (PD-1( +)، Tim-3 (+)، CD122 (+)). گسترش سلول‌های T CD8(+) از ریه‌های موش CBA/J آلوده به Mtb نیز قادر به ترشح سیتوکین اینترلوکین-10 (IL-10) سرکوبگر سیستم ایمنی بود، اگرچه کاهش سلول‌های T CD8(+) در داخل بدن به طور قابل‌توجهی Mtb را تغییر نداد. بار تجزیه و تحلیل بیشتر نشان داد که سلول‌های CD8(+) T ریوی موش‌های CBA/J آلوده به Mtb به صورت کلونی گسترش یافته و ترجیحاً گیرنده سلول T (TcR) زنجیره Vβ 8 (8.2، 8.3) یا Vβ 14 را بیان می‌کنند. اگرچه Vβ8(+) CD8( +) سلول های T مسئول اکثر تولید IL-10 بودند، کاهش in vivo Vβ8 (+) به طور قابل توجهی نتیجه عفونت Mtb را تغییر نداد، که ما فرض می کنیم نتیجه ترشح دوگانه IL-10/IFN-γ آنها بود. پروفایل ها داده های ما نشان می دهد که سلول های T CD8(+) ترشح کننده IL-10 می توانند در طول عفونت مزمن Mtb ایجاد شوند، اگرچه اهمیت این جمعیت سلول T در پاتوژنز سل نامشخص است.	گسترش کلونال سلول های CD8(+) T با ظرفیت ترشح IL-10 در طول عفونت مزمن مایکوباکتریوم توبرکلوزیس رخ می دهد.
6fp8nly0	در حال حاضر تعدادی از عوامل برای محافظت در برابر تشعشعات یونیزان در دسترس هستند. با این حال، این عوامل محافظ در برابر تشعشع، اثرات نامطلوب زیادی دارند. تلاش هایی برای توسعه عوامل جدید محافظ در برابر تشعشع برای کاربردهای پزشکی انجام شده است. در اینجا، ما بررسی کردیم که آیا یک ترکیب، پلی اتیلنیمین (PEI)، که مسیرهای سیگنالینگ NF-kB با واسطه گیرنده Toll مانند 5 (TLR5) را فعال می‌کند، می‌تواند اثر ضد تشعشعی بر روی مدل موش داشته باشد. ابتدا، یک مدل غربالگری مبتنی بر سلول برای آگونیست مسیر NF-kB با واسطه TLR5 ایجاد شد و سپس با فعال سازی فعالیت گزارشگر NF-kB لوسیفراز با واسطه TLR5 با آگونیست TLR5 شناخته شده، فلاژلین، اعتبارسنجی شد. ما دریافتیم که PEI باعث فعال‌سازی وابسته به دوز مسیر NF-kB با واسطه TLR5 می‌شود، که نشان می‌دهد PEI در واقع آگونیست TLR5 است. علاوه بر این، اثر ضد تشعشع پلی اتیلنیمین با استفاده از مدل موش تابش کل بدن اشعه γ (TBI) ارزیابی شد. در مقایسه با کنترل پرتودهی، هم زمان بقا و هم میزان بقا در موش هایی که دوز پایین پلی اتیلنیمین (019/0=P) یا دوز بالای پلی اتیلنیمین (001/0 P<) دریافت کردند، به طور قابل توجهی بهبود یافت. ما همچنین یک همبستگی مثبت بین وزن بدن حیوان و زمان بقا در موش هایی مشاهده کردیم که دوز پایین پلی اتیلنمین، دوز بالایی از پلی اتیلنیمین و آمیفوستین را در طی یک دوره 30 روزه دریافت کردند، r=0.42 (P<0.02)، 0.72 (P <0.0001) و 0.95 (P<0.0001)، در حالی که یک همبستگی منفی بین وزن بدن حیوان و زمان بقا در کنترل تابش مشاهده شد (r = -0.89؛ P <0.0001). این نتایج نشان می دهد که پلی اتیلنیمین آگونیست جدید TLR5 با کاربرد بالقوه در ارائه محافظت برای بیمارانی که رادیوتراپی دریافت می کنند یا در حوادث مربوط به پرتو درمانی است.	اثر آسیب ضد تشعشع پلی اتیلنمین به عنوان یک آگونیست هدفمند گیرنده 5 شبه تلفات
j3w0f8oq	مالاریا یک بیماری نوظهور در کشورهایی است که قبلا ریشه کن شده بود، در حالی که در بسیاری از کشورها از جمله کشورهای گرمسیری بومی است. در هند، عفونت مالاریا به دلیل شهرنشینی سریع و ازدحام بیش از حد در تمام شهرهای بزرگ در حال افزایش است. بروز موربیدیتی و مرگ و میر ناشی از عفونت مالاریا در حال افزایش است و می توان آن را به مقاومت دارویی در سویه های انگل مالاریا نسبت داد. ترکیب استراتژی های تعدیل ایمنی با داروهای ضد مالاریا در تلاش برای بهبود درمان مالاریا اثر مفیدی دارد. همراه با تظاهرات بالینی و پیامد این عفونت انگلی، درک اختلالات ایمنی مرتبط با مکانیسم‌های بیولوژیکی زیربنای این اقدامات برای درک بهتر پاتوژنز عفونت مالاریا مهم است. پاسخ های ایمنی و التهابی در عفونت مالاریا توسط سیتوکین ها و کموکاین های مختلف کنترل و هماهنگ می شوند. این بررسی بر روی اختلالات ایمونولوژیک رایج مرتبط با عفونت مالاریا تمرکز دارد که منجر به عملکردهای ایمنی هومورال و سلولی مرتبط با ایمنی تطبیقی ذاتی تا بعدی در مقابله با این عفونت انگلی می شود.	اختلالات ایمنی مرتبط با عفونت مالاریا
e278thvo	عوامل تعیین کننده اپیدمیولوژیک توسعه موفقیت آمیز واکسن با استفاده از متغیرهای بیولوژیکی قابل اندازه گیری از جمله پایداری آنتی ژنی و نیاز به ایمنی سلول T مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از یک مدل رگرسیون لجستیک، ما نشان می‌دهیم که میل ترکیبی بالا با خون و سلول‌های ایمنی و فعل و انفعالات پاتوژن (به عنوان مثال تداخل) عوامل خطر شکست در توسعه واکسن خواهد بود.	عوامل اپیدمیولوژیک تعیین کننده توسعه موفقیت آمیز واکسن
yts4xppb	سابقه و هدف: تمرکز اخیر بر روی تشخیص زودهنگام معرفی پاتوژن در جمعیت های انسانی و حیوانی منجر به توسعه سیستم های نظارتی مبتنی بر نظارت خودکار داده های بهداشتی شده است. نظارت واقعی یا تقریباً هم‌زمان داده‌های پیش‌تشخیصی مستلزم طبقه‌بندی خودکار سوابق به سندرم‌ها - نظارت سندرمی - با استفاده از الگوریتم‌هایی است که دانش پزشکی را به روشی قابل اعتماد و کارآمد ترکیب می‌کند، در حالی که برای کاربران نهایی قابل درک است. روش‌ها: این مقاله کاربرد دو روش یادگیری ماشینی (Naive Bayes و Decision Trees) و روش‌های مبتنی بر قانون را برای استخراج اطلاعات سندرمی از درخواست‌های تست آزمایشگاهی ارائه شده به یک آزمایشگاه تشخیصی دامپزشکی توصیف می‌کند. نتایج: عملکرد بالا (F(1)-macro = 0.9995) از طریق استفاده از یک طبقه‌بندی سندرم مبتنی بر قانون، بر اساس القای قانون و به دنبال آن اصلاح دستی در طول فاز ساخت‌وساز به دست آمد، که همچنین منجر به تفسیر واضح طبقه‌بندی حاصل شد. فرآیند یک الگوریتم القای قانون اصلاح نشده به امتیاز F(1-میکرو) 0.979 دست یافت، اما این به 0.677 کاهش یافت که عملکرد برای کلاس های فردی به صورت غیر وزنی (F(1-ماکرو)) به طور میانگین انجام شد، به دلیل این واقعیت که الگوریتم موفق به انجام آن نشد. 3 کلاس از 16 کلاس را از مجموعه آموزشی یاد بگیرید. درختان تصمیم تفسیرپذیری یکسانی را با رویکردهای مبتنی بر قاعده نشان دادند، اما امتیاز F (1 میکرو) 0.923 را به دست آوردند (در صورتی که به کلاس ها وزن برابر داده شود به 0.311 کاهش می یابد). یک طبقه‌بندی‌کننده ساده بیز همه کلاس‌ها را آموخت و به عملکرد بالایی دست یافت (F(1-micro) = 0.994 و F(1-macro) = 0.955)، اما فرآیند طبقه‌بندی برای متخصصان دامنه شفاف نیست. نتیجه‌گیری: استفاده از یک مجموعه قوانین سفارشی دستی امکان توسعه سیستمی برای طبقه‌بندی تست‌های آزمایشگاهی به گروه‌های سندرمی با عملکرد بسیار بالا و قابلیت تفسیر بالا توسط متخصصان حوزه را فراهم کرد. تحقیقات بیشتر برای توسعه قوانین اعتبارسنجی داخلی به منظور ایجاد روش های خودکار برای به روز رسانی قوانین مدل بدون ورودی کاربر مورد نیاز است.	تحلیل اکتشافی روش‌های طبقه‌بندی خودکار دستورات آزمایش آزمایشگاهی به گروه‌های سندرمی در دامپزشکی
s76c5ebd	ویروس های RNA عوامل ایجاد کننده ایدز، آنفولانزا، سارس و سایر تهدیدات جدی سلامتی هستند. توسعه روش‌های سریع و گسترده برای توالی‌یابی کامل ژنوم ویروسی برای درک کامل همه جنبه‌های این عوامل عفونی و همچنین برای نظارت بر تهدیدات همه‌گیر ویروسی و پاتوژن‌های در حال ظهور بسیار مطلوب است. با این حال، روش‌های سنتی تشخیص ویروسی به دانش قبلی یا آنتی ژن متکی هستند. در این مطالعه، ما تقویت مستقل از توالی را برای نمونه‌های حاوی مقادیر بسیار کم RNA ویروسی همراه با توالی‌یابی Illumina و مونتاژ de novo بهینه‌سازی شده برای ژنوم‌های ویروسی توصیف می‌کنیم. با 5 میلیون مطالعه، 96 تا 100 درصد از ناحیه کدکننده پروتئین ویروسی نمونه‌های ویروسی HIV، سنسیشیال تنفسی و نمونه‌های ویروسی نیل غربی را از 100 کپی از RNA ویروسی می‌گیریم. روش‌های ارائه‌شده در اینجا برای تعداد زیادی نمونه مقیاس‌پذیر هستند و می‌توانند ژنوم‌های کامل یا نزدیک به طول کامل ویروسی را از نمونه‌های کلون و بالینی با مقادیر کم RNA ویروسی، بدون اطلاعات توالی قبلی و در حضور آلودگی قابل توجه میزبان تولید کنند.	توالی یابی کامل ژنوم RNA ویروسی نمونه های بسیار کم کپی با تقویت مستقل از توالی
njlqgih3	این بررسی اهمیت رو به رشد تقلیدهای اپی توپ پروتئین را در کشف مولکول های فعال بیولوژیکی جدید و کاربردهای بالقوه آنها در تحقیقات دارویی و واکسن برجسته می کند. تمرکز روی تقلیدهای بتا-پینه موی تا شده است، که برای تقلید موتیف های بتا-پینه مو در پپتیدها و پروتئین های مهم بیولوژیکی طراحی شده اند. تعداد فزاینده‌ای از ساختارهای کریستالی پروتئین نشان می‌دهد که چگونه نقوش بتا-پینه مو اغلب نقش‌های کلیدی را در تعاملات پروتئین-پروتئین و پروتئین-اسید نوکلئیک بازی می‌کنند. این بررسی نشان می‌دهد که چگونه استفاده از ساختارهای پروتئینی به‌عنوان نقطه شروع برای طراحی تقلیدی مولکول‌های کوچک می‌تواند لیگاندهای جدیدی را به‌عنوان مهارکننده‌های برهمکنش پروتئین-پروتئین، به‌عنوان مهارکننده‌های پروتئاز، و به‌عنوان لیگاند برای گیرنده‌های کموکاین و اهداف RNA تاخورده، و همچنین آنتی‌بیوتیک‌های جدید برای مبارزه فراهم کند. تهدید رو به رشد سلامت ناشی از ظهور باکتری های مقاوم به آنتی بیوتیک. نشان داده شده است که آنتی‌بیوتیک‌های β-پینه مو، پروتئین غشای بیرونی بشکه بتا (LptD) را در سودوموناس sp.، که برای بیوژنز غشای سلول خارجی ضروری است، هدف قرار می‌دهند. چشم‌انداز هیجان‌انگیز دیگر این است که تقلیدهای اپی توپ پروتئین در طراحی واکسن مصنوعی، در زمینه نوظهور واکسن‌شناسی ساختاری از اهمیت فزاینده‌ای برخوردار خواهند بود. ساختارهای کریستالی آنتی بادی های محافظ متصل به اپی توپ های مشتق شده از پاتوژن آنها نقطه شروع ایده آلی برای طراحی تقلیدهای اپی توپ مصنوعی فراهم می کند. مقلدها را می توان در قالب بسیار ایمنی زا بر روی سطح ذرات مصنوعی ویروس مانند به سیستم ایمنی تحویل داد. چالش های علمی در طراحی مولکولی همچنان بزرگ است، اما اهمیت بالقوه موفقیت در این زمینه حتی بیشتر است. حق چاپ © 2013 انجمن پپتید اروپا و جان وایلی و پسران، با مسئولیت محدود.	سخنرانی ماکس برگمان تقلیدهای اپی توپ پروتئین در عصر واکسن شناسی ساختاری ‡
6l6c7jpq	در میان تقریباً 1000 آدنوویروس از شامپانزه‌ها و بونوبوها که اخیراً مورد مطالعه قرار گرفته‌اند، پان آدنوویروس نوع 3 (PanAd3، جدا شده از بونوبو، Pan paniscus) یکی از بهترین پروفایل‌ها برای یک ناقل واکسن را دارد که ترکیبی از ایمنی‌زایی ترانس ژنی قوی با حداقل ایمنی از قبل موجود است. جمعیت انسانی در این مطالعه، ما در یک PanAd3 معیوب همانندسازی، یک ترانس ژن بیان‌کننده یک پروتئین ترکیبی از آنتی‌ژن‌های آنفولانزای حفاظت‌شده نوکلئوپروتئین (NP) و ماتریس 1 (M1) قرار دادیم. سپس آنتی‌بادی و پاسخ‌های سلول T و همچنین محافظت در برابر عفونت چالش را در مدل موش مورد مطالعه قرار دادیم. یک تزریق داخل بینی منفرد واکسن PanAd3-NPM1 پاسخ آنتی بادی قوی و سلول های T را القا کرد و در برابر چالش ویروس کشنده آنفولانزا با دوز بالا محافظت کرد. بنابراین PanAd3 یک ناقل نامزد امیدوارکننده برای واکسن‌ها، از جمله واکسن‌های جهانی آنفلوانزا است.	واکسیناسیون آنتی ژن های آنفولانزای حفاظت شده در موش با استفاده از وکتور آدنوویروس سیمیان جدید، PanAd3، مشتق شده از پانیسکوس بونوبو
exqza1kg	انتظار می رود تغییرات آب و هوایی جهانی بر فراوانی، شدت و طول مدت رویدادهای آب و هوایی شدید مرتبط با آب مانند بارش بیش از حد، سیل و خشکسالی تأثیر بگذارد. ما یک بررسی سیستماتیک برای بررسی شیوع‌های ناشی از آب به دنبال چنین رویدادهایی انجام دادیم و توزیع آنها را بین انواع مختلف رویدادهای آب و هوایی شدید مرتبط با آب بررسی کردیم. چهار پایگاه داده پزشکی و هواشناسی (Medline، Embase، GeoRef، PubMed) و یک سیستم گزارش الکترونیکی جهانی (ProMED) از سال 1910 تا 2010 مورد جستجو قرار گرفتند. هشتاد و هفت طغیان آب که شامل رویدادهای آب و هوایی شدید مرتبط با آب بود، شناسایی و شامل 235 مورد شد. ProMED گزارش می دهد. بارندگی شدید و سیل شایع‌ترین رویدادهای قبل از شیوع مرتبط با آب و هوای شدید بودند و به ترتیب در 2/55 و 9/52 درصد گزارش‌ها گزارش شدند. شایع ترین پاتوژن های گزارش شده در این همه گیری ها Vibrio spp بودند. (21.6٪) و گونه های لپتوسپیرا. (12.7٪). شیوع به دنبال رویدادهای شدید آب و هوایی مرتبط با آب اغلب در نتیجه آلودگی منابع آب آشامیدنی (53.7٪) بود. تفاوت‌هایی در گزارش شیوع بیماری‌ها بین ادبیات علمی و ProMED مشاهده شد. رویدادهای آب و هوایی شدید مرتبط با آب، خطری برای سلامت عمومی در کشورهای توسعه یافته و در حال توسعه است، اما تأثیر آن نامتناسب خواهد بود و احتمالاً نابرابری های موجود در سلامت را تشدید می کند.	حوادث آب و هوایی شدید مرتبط با آب و بیماری های ناشی از آب
d0bk9gu5	شدیدترین تظاهرات مالاریا (ناشی از پلاسمودیوم فالسیپاروم) به‌عنوان نتیجه مستقیم پارازیتمی به دنبال تهاجم مروزوئیت‌های پس از مرحله خونی به گلبول‌های قرمز، و در طی سیتو چسبیدن گلبول‌های قرمز آلوده به اندوتلیوم عروقی رخ می‌دهد. با این حال، خوشه‌بندی نامتناسب اپیدمیولوژیک مالاریا شدید با اشکال تهاجمی بیماری‌های بومی مانند سارکوم کاپوزی (KS)، نئوپلاسمی که از نظر علت‌شناسی با عفونت با ویروس هرپس مرتبط با KS (KSHV) مرتبط است، بر اهمیت بیماری‌زای مشترکی که قبلاً کشف نشده بود، تأکید می‌کند. که پتانسیل تغییر بار کلی بیماری را در افراد مبتلا به همزمان دارند. بر اساس مطالعات اخیر در مورد مکانیسم‌هایی که P. falciparum و KSHV برای تعامل با میزبان انسانی متقابل خود تکامل یافته‌اند، چندین دیدگاه جدید در حال ظهور است که همگرایی شگفت‌انگیزی از موضوعات بیولوژیکی را برجسته می‌کند که به طور بالقوه زمینه‌ساز بیماری‌های همراه مرتبط با آنها است. در برابر این پس‌زمینه، مطالعات در حال انجام به سرعت در حال ساختن یک الگوی جدید جذاب هستند که در آن گیرنده‌های میزبان اصلی که تهاجم انگل (Basigin/CD147) و cyto-aderence (CD36) را کنترل می‌کنند، به طور شگفت‌آوری، نیز اهداف مهمی برای بهره‌برداری توسط KSHV هستند. در این مقاله، ما پیامدهای پاتوبیولوژیکی اصلی انتخاب مسیرهای سیگنالینگ Basigin/CD147 و CD36 توسط P. falciparum و KSHV را نه تنها به عنوان عوامل میزبان ضروری برای تداوم انگل، بلکه به عنوان واسطه‌های مهم پیش‌رگ‌زایی در نظر می‌گیریم. فنوتیپ در ریزمحیط اندوتلیال آلوده به ویروس در نتیجه، مثلث بندی تعاملات بین P. falciparum، KSHV، و میزبان انسانی متقابل آنها، یک رابطه سندیمی را بیان می کند که به یک چارچوب مفهومی برای شیوع اشکال تهاجمی KS در مناطق آندمیک مالاریا، با پیامدهایی برای امکان استفاده دوگانه اشاره می کند. درمان‌هایی علیه این عفونت‌های ناتوان‌کننده در بخش‌های با منابع محدود جهان.	پیوندهای خطرناک: مبنای مولکولی برای یک رابطه سندرمی بین سارکوم کاپوزی و مالاریا P. falciparum
0jx6mwiw	NOA36/ZNF330 یک پروتئین تکاملی است که در هسته و میتوکندری سلول‌های پستانداران به خوبی حفظ شده است. ما قبلا گزارش کرده‌ایم که فعالیت پرو آپوپتوزی این پروتئین توسط یک دامنه مشخصه غنی از سیستئین واسطه می‌شود. ما اکنون نشان می‌دهیم که محلی‌سازی هسته‌ای NOA36 به دلیل یک سیگنال محلی‌سازی هسته‌ای بسیار حفاظت‌شده (NoLS) موجود در باقیمانده‌های 1-33 است. این NoLS یک توالی شامل سه خوشه از دو یا سه اسید آمینه اساسی است. ما ترمینال آمینه NOA36 را به eGFP ادغام کردیم تا این NoLS فرضی را مشخص کنیم. ما نشان می دهیم که یک خوشه از سه باقی مانده لیزین در موقعیت های 3 تا 5 در این دنباله برای محلی سازی هسته ای حیاتی است. ما همچنین نشان می‌دهیم که توالی موجود در انسان می‌تواند eGFP را به هسته در چندین سلول پستانداران، ماهی و حشرات هدایت کند. علاوه بر این، این NoLS قادر است به طور خاص آنزیم مخمر سیتوزولی پلی فسفاتاز را به سمت هدف هسته سلول های HeLa هدایت کند، جایی که فعالیت آنزیمی آن شناسایی شد. بنابراین این NoLS می تواند به عنوان یک ابزار بسیار مفید به عنوان یک نشانگر هسته ای و برای هدایت پروتئین های خاص به هسته در گونه های حیوانی دور عمل کند.	پروتئین NOA36 حاوی یک سیگنال محلی سازی هسته ای بسیار حفاظت شده است که قادر به هدایت پروتئین های عملکردی به هسته سلول های پستانداران است.

Subsets and Splits

No community queries yet

The top public SQL queries from the community will appear here once available.