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Endocardite orale da streptococco, abitudini di igiene orale e procedure odontoiatriche recenti: uno studio caso-controllo.Il nostro obiettivo era confrontare le abitudini di igiene orale, lo stato orodentale , e procedure odontoiatriche in pazienti con endocardite infettiva (IE) a seconda che il microrganismo che causa l'IE abbia avuto origine nella cavità orale. Abbiamo condotto uno studio caso-controllo in cieco per valutatore in 6 ospedali terziari francesi. Le abitudini di igiene orale sono state registrate utilizzando un questionario auto-somministrato. Lo stato orodentale è stato analizzato da dentisti addestrati in cieco al microrganismo, utilizzando un esame clinico standardizzato e tomografia panoramica dentale. L'anamnesi delle procedure odontoiatriche è stata ottenuta attraverso interviste con pazienti e dentisti. I microrganismi sono stati classificati come streptococchi orali o agenti patogeni non orali utilizzando un elenco convalidato da esperti mantenuto riservato durante il corso dello studio Casi e controlli avevano una EI definita causata da streptococchi orali o non orali patogeni, rispettivamente. I partecipanti sono stati arruolati tra maggio 2008 e gennaio 2013. I casi (n = 73) avevano maggiori probabilità rispetto ai controlli (n = 192) di essere di età <65 anni (odds ratio [OR], 2,85; 95% CI, 1,41-5,76 ), essere di sesso femminile (OR, 2,62; IC 95%, 1,20-5,74), avere una malattia valvolare nativa (OR, 2,44; IC 95%, 1,16-5,13), utilizzare stuzzicadenti, getto d'acqua dentale, spazzolino interdentale e /o filo interdentale (OR, 3,48; 95% CI, 1,30-9,32), e di aver subito procedure odontoiatriche durante i 3 mesi precedenti (OR, 3,31; 95% CI, 1,18-9,29), mentre avevano meno probabilità di spazzolare denti dopo i pasti. La presenza di infiammazione gengivale, tartaro e malattie dentali infettive non differiva significativamente tra i gruppi. I pazienti con EI causata da streptococchi orali differiscono dai pazienti con EI causata da agenti patogeni non orali per quanto riguarda le caratteristiche di base, le abitudini di igiene orale e le recenti procedure dentistiche, ma non l'attuale stato orodentale.
Ipertensione arteriosa polmonare nelle cardiopatie congenite: opportunità traslazionali per studiare la reversibilità della malattia vascolare polmonare.L'ipertensione arteriosa polmonare (PAH) è una malattia progressiva e malattia vascolare polmonare letale (PVD). Sebbene negli ultimi anni l'esito sia migliorato grazie a nuovi trattamenti che ritardano la progressione della malattia, una cura non è stata ancora raggiunta. Nella PAH associata a cardiopatia congenita (CHD), il rimodellamento del sistema vascolare polmonare raggiunge un'irreversibile fenotipo simile a tutte le forme di PAH allo stadio terminale. Nella PAH-CHD si riconosce però anche uno stadio precoce, che può essere completamente reversibile. Questa fase reversibile non è mai stata riconosciuta in altre forme di PAH, molto probabilmente perché questi pazienti sono diagnosticata solo una volta che la malattia avanzata si è sviluppata Proponiamo che il modello clinico di PAH-CHD, con uno stadio reversibile precoce e irreversibile avanzato, offra opportunità uniche per studiare fisiopatologia e meccanismi molecolari che orchestrano la transizione dall'ipertrofia mediale reversibile alle lesioni plessiformi irreversibili. La comprensione di questi meccanismi non è solo fondamentale nella valutazione clinica della progressione della malattia e dell'operabilità dei pazienti con PAH-CHD; il targeting specifico di questi meccanismi può anche portare a interventi farmacologici che trasformano le lesioni plessiformi \'irreversibili\' in un PVD reversibile: uno che è suscettibile di cura. Negli ultimi anni, sono stati compiuti passi significativi nello sforzo di \'invertire l'irreversibile\'. Questa recensione fornisce una panoramica delle attuali conoscenze cliniche e sperimentali sulla reversibilità della PAH, concentrandosi sui meccanismi associati al flusso e sul potenziale nel prossimo futuro per far avanzare questo campo.
Rafforzare la governance del sistema di salute mentale in sei paesi a basso e medio reddito in Africa e Asia meridionale: sfide, bisogni e potenziali strategie.Cattiva governance è stata identificata come una barriera all'efficace integrazione dell'assistenza sanitaria mentale nei paesi a basso e medio reddito. La governance include la fornitura della politica e del quadro legislativo necessari per promuovere e proteggere la salute mentale di una popolazione, nonché la progettazione e la qualità del sistema sanitario garanzia per garantire un'attuazione ottimale delle politiche. Lo scopo di questo studio era identificare le principali sfide di governance, i bisogni e le potenziali strategie che potrebbero facilitare un'adeguata integrazione della salute mentale nelle strutture di assistenza sanitaria di base nei paesi a basso e medio reddito. Le interviste qualitative agli informatori chiave sono state tenuto con 141 partecipanti in sei paesi che partecipano al programma di ricerca sui sistemi di salute mentale emergenti nei paesi a basso e medio reddito (Emerald): Etiopia a, India, Nepal, Nigeria, Sudafrica e Uganda. I dati sono stati trascritti (e, ove necessario, tradotti in inglese) e analizzati tematicamente utilizzando l'analisi quadro, prima a livello nazionale, poi sintetizzati a livello transnazionale. Mentre tutti i paesi hanno ottenuto buoni risultati rispetto alla visione strategica sotto forma di sviluppo di politiche nazionali per la salute mentale, le strategie chiave di governance identificate per affrontare le sfide includevano: rafforzare la capacità dei manager a livello subnazionale di sviluppare e attuare piani integrati; rafforzare gli aspetti chiave degli elementi costitutivi essenziali del sistema sanitario per promuovere la reattività, l'efficienza e l'efficacia; sviluppare meccanismi attuabili per la collaborazione intersettoriale, nonché il coinvolgimento della comunità e degli utenti dei servizi; e lo sviluppo di approcci innovativi per migliorare l'alfabetizzazione sulla salute mentale e la riduzione dello stigma. Un finanziamento inadeguato è emerso come la più grande sfida per il buon governo. Oltre alla necessità di una buona governance complessiva di un sistema sanitario, questo studio identifica una serie di strategie specifiche per migliorare la governance dell'assistenza sanitaria mentale integrata nei paesi a basso e medio reddito.
Vantaggio significativo di sopravvivenza dell'indice venoso polmonare elevato e della presenza di arteria polmonare nativa nell'atresia polmonare con difetto del setto ventricolare e importanti arterie collaterali aortopolmonari: risultati dell'angiografia preoperatoria con tomografia computerizzata." La prognosi dell'atresia polmonare con difetto del setto ventricolare e delle maggiori arterie collaterali aortopolmonari (PA-VSD-MAPCAs) dopo l'intervento chirurgico mostra una sostanziale eterogeneità clinica e mancano predittori per gli esiti. Questo studio mirava a valutare il valore predittivo del preoperatorio angiografia con tomografia computerizzata cardiaca (CTA) per la sopravvivenza in pazienti con PA-VSD-MAPCA Abbiamo analizzato retrospettivamente pazienti PA-VSD-MAPCA con CTA preoperatoria che sono stati sottoposti sia alla ricostruzione del tratto di efflusso ventricolare destro che all'unifocalizzazione MAPCA ( n = 24) o dell'arteria polmonare riabilitazione ( n = 28). L'end-point era la sopravvivenza globale. I valori prognostici di CTA sono stati valutati utilizzando Cox uni analisi variabili e multivariate. La soglia significativa dei parametri indipendenti è stata calcolata utilizzando le curve della caratteristica operativa del ricevitore (ROC). Durante un follow-up mediano di 1145 giorni, sono stati osservati un totale di 13 decessi. L'analisi multivariata ha identificato un indice venoso polmonare elevato (PVI) [rapporto di rischio (HR) = 0,03; intervallo di confidenza al 95% (CI): 0,03, 0,28; P < 0,01] e la presenza di arteria polmonare nativa (HR = 0,06; 95% CI: 0,10, 0,35; P < 0,01) come predittori positivi indipendenti di una migliore sopravvivenza. L'area sotto la curva ROC per PVI era 0,79 ( P < 0,01) e un punto di cut-off di 438 mm 2 /m 2 è stato ritenuto la soglia significativa per la sopravvivenza (sensibilità 92%, specificità 72%). L'alto PVI preoperatorio e la presenza di arteria polmonare nativa erano predittori morfologici significativi di un vantaggio di sopravvivenza positivo nei pazienti PA-VSD-MAPCA. Un PVI ≥438 mm 2 /m 2 può essere un prognostico positivo affidabile che potrebbe migliorare la strategia decisionale per i pazienti PA-VSD-MAPCA.
Un semplice punteggio preoperatorio che include l'esperienza del chirurgo per prevedere la probabilità di una riparazione della valvola mitrale di successo.Secondo le recenti linee guida, la valvola mitrale ( La riparazione VM) è preferibile alla sostituzione. Tuttavia, la sostituzione è talvolta inevitabile. Gli obiettivi dello studio erano identificare le variabili che predissero il rischio di una riparazione VM non riuscita e valutare un punteggio che potesse aiutare nella pianificazione delle procedure chirurgiche VM. Dati clinici di tutti Dal nostro registro clinico sono state estratte le procedure chirurgiche consecutive della valvola mitrale nell'adulto, eseguite nell'arco di 50 mesi, e combinate con le variabili ecocardiografiche. Le variabili identificate da un'analisi univariata, insieme a fattori noti in letteratura come indicativi di un possibile rischio di un riparazione VM non riuscita, sono stati compilati in un'analisi di regressione logistica multivariabile. È stata anche presa in considerazione l'esperienza del chirurgo. Di 545 procedure VM, 162 (29,7%) erano VM sostituzioni. Sette variabili sono state identificate come predittori indipendenti di sostituzione VM (rapporto dispari; 95% CI): endocardite (7,8; 3,7-16,5), assenza di dilatazione anulare (3,6; 2,2-5,9), calcificazione dei lembi (6,1; 3,0-12,7), calcificazione anulare (3,7; 1,9-7,3), stenosi mitralica (29,6; 9,3-93,8), sclerosi mitralica (3,0; 1,7-5,3), esperienza limitata del chirurgo (3,9; 1,4-11,0). È stata calcolata la capacità di questo modello di discriminare tra riparazione e sostituzione ed è stata mostrata un'area sotto la curva ROC di 0,87. È stato calcolato un punteggio per ciascun paziente e distribuito in quattro categorie di rischio: rischio basso (0-6), rischio moderato (7-10), rischio alto (11-16) e rischio molto alto (>16) di sostituzione VM con, rispettivamente, 10,2 vs 10,0%, 40,5% vs 38,9%, 66,7 vs 70,4% e 93,2 vs 93,2% osservata vs probabilità prevista di sostituzione VM. La valutazione preoperatoria di sette variabili può prevedere con precisione il rischio di una riparazione VM non riuscita.
Salvataggio selettivo dell'ansia aumentata ma non dell'atassia dell'andatura in un modello murino 90CGG con premutazione della sindrome da tremore/atassia associata all'X Fragile.Una ripetizione CGG l'espansione nell'intervallo di premutazione nel gene del ritardo mentale 1 dell'X fragile (FMR1) è stata identificata come la causa genetica della sindrome da tremore/atassia associata all'X fragile (FXTAS), una malattia neurodegenerativa a esordio tardivo che si manifesta con tremore da azione, atassia dell'andatura e disturbi cognitivi. In questo studio, abbiamo utilizzato un modello murino bigenico, in cui l'espressione di un tratto di premutazione 90CGG viene attivata nelle cellule neurali dopo la somministrazione di doxiciclina-P90CGG modello murino. Noi, qui, dimostriamo la manifestazione comportamentale di caratteristiche clinicamente rilevanti di FXTAS pazienti e individui portatori di premutazione in questo modello di topo inducibile. I topi P90CGG mostrano ansia aumentata, deficit nella coordinazione motoria e andatura alterata e rappresentano il primo modello FXTAS che mostra un fenotipo di atassia come o servato nei pazienti. Il fenotipo comportamentale è accompagnato dalla formazione di inclusioni intranucleari positive all'ubiquitina/FMRpoliglicina, come un altro segno distintivo di FXTAS, nel cervelletto, nell'ippocampo e nell'amigdala. Sorprendentemente, alla cessazione dell'induzione del transgene il fenotipo dell'ansia dei topi si riprende insieme a una riduzione delle inclusioni intranucleari nel giro dentato e nell'amigdala. Al contrario, la funzione motoria si deteriora ulteriormente e nel cervelletto non si osserva alcuna riduzione delle inclusioni intranucleari. I nostri dati dimostrano quindi che l'espressione di un'espansione della premutazione 90CGG al di fuori del contesto FMR1 è sufficiente per evocare un fenotipo comportamentale simile a FXTAS. La neuropatologia specifica della regione del cervello e la reversibilità comportamentale (parziale) rendono l'inducibile P90CGG un prezioso modello murino per testare meccanismi patogeni e metodi di intervento terapeutico.
Gli sviluppi nella fecondazione in vitro giustificano l'adozione di nuovi indicatori di performance per le cliniche ART, ma non giustificano l'abbandono delle misure centrate sul paziente.Recenti progressi nella La tecnologia di congelamento degli embrioni, insieme alle crescenti preoccupazioni per le nascite multiple, ha spostato il paradigma di una fecondazione in vitro appropriata, portando all'adozione di nuovi indicatori di prestazione per le cliniche ART da parte degli schemi di segnalazione nazionali, come quelli curati dalla Society for Assisted Reproductive Technology (SART) e l'Autorità per la fecondazione umana e l'embriologia (HFEA). Utilizzando queste organizzazioni come casi di studio, esaminiamo diverse misure di esito da una prospettiva statistica. Descriviamo diversi denominatori utilizzati per calcolare i tassi di natalità vivi. Questi includono i tassi di natalità cumulativi calcolati da tutti i nuovi e procedure di trasferimento congelato derivanti da una particolare raccolta di ovuli o dall'inizio di un ciclo e tassi di natalità vivi calcolati per embrione trasferito entrambi gli schemi, sosteniamo che tutti i cicli dovrebbero essere inclusi nel denominatore, indipendentemente dal fatto che la raccolta e la fecondazione degli ovuli abbiano avuto successo o meno. L'esclusione dei cicli annullati riduce l'impatto della confusione dovuta alle caratteristiche del paziente, ma rimuove anche le differenze di policy e prestazioni che riteniamo rappresentino importanti fonti di variazione. Può essere fuorviante presentare alle potenziali pazienti misure essenzialmente ipotetiche delle prestazioni basate sulla parità di stimolazione ovarica e politiche di trasferimento. Sebbene il parto vivo per embrione abbia il vantaggio di incoraggiare il trasferimento di un singolo embrione, sosteniamo che sia soggetto a interpretazioni errate. Questo perché la probabilità di un parto vivo non è proporzionale al numero di embrioni trasferiti. Concludiamo che non è possibile presentare una singola misura che comprenda sia l'efficacia che la sicurezza. Invece, proponiamo che sia necessaria una serie di indicatori di esito chiari e pertinenti per consentire ai pazienti subfertili di fare scelte informate su se e dove essere trattati.
Unità singole nella corteccia parietale posteriore codificano modelli di coordinazione bimanuale.La coordinazione bimanuale è fondamentale per un'ampia gamma di comportamenti. I batteristi, ad esempio, devono coordinare attentamente i movimenti delle loro 2 braccia, a volte battendo sullo stesso tamburo e a volte su altri diversi. Mentre il comportamento coordinato è ben studiato, le prime fasi della pianificazione non sono ben comprese. Nella regione parietale della portata (PRR) del posteriore corteccia parietale (PPC), la presenza di neuroni che modulano quando un braccio si muove da solo è stata presa come prova di un ruolo nella coordinazione bimanuale. Per testare questa nozione, abbiamo registrato i neuroni durante i movimenti sia unilaterali che bimanuali. Troviamo che l'attività che precede un movimento del braccio omolaterale è principalmente una risposta sensoriale a un bersaglio nel campo recettivo visivo del neurone e non un piano per muovere il braccio omolaterale. Al contrario, l'attività che precede un movimento del braccio controlaterale nt è la somma di un piano di movimento più una risposta sensoriale. Nonostante non codificano i movimenti del braccio omolaterali, circa la metà dei neuroni discrimina tra diversi modelli di movimenti bimanuali. Questi risultati forniscono una prova diretta che i neuroni PRR rappresentano piani di portata bimanuale e suggeriscono che la coordinazione bimanuale ha origine nel flusso di elaborazione sensoriale-motorio prima della corteccia motoria, all'interno del PPC.
Canalizzazione ambientale della durata della vita e dell'espressione genica in Caenorhabditis elegans.Gli animali, in particolare le poichiloterme, mostrano fisiologie distinte a diverse temperature ambientali. Qui, abbiamo ipotizzato che le differenze di temperatura nella fisiologia potrebbero influenzare la quantità di variazione in tratti quantitativi complessi. In particolare, abbiamo esaminato, in Caenorhabditis elegans, come diverse temperature (15°C, 20°C e 25°C) influenzano la quantità di variazione interindividuale nella durata della vita e anche espressione di tre geni reporter-reporter trascrizionali per vit-2, gpd-2 e hsp-16.2 (un biomarcatore della durata della vita). Abbiamo trovato la relazione inversa prevista tra temperatura e durata media della vita. Sorprendentemente, abbiamo trovato che alla temperatura più alta, c'erano meno differenze tra gli individui nella durata della vita e meno variazione interindividuale nell'espressione di tutti e tre i reporter. Suggeriamo che la crescita a 25°C potrebbe canalizzare (ridurre i differenze interindividuali nella durata della vita e nell'espressione di alcuni geni provocando una piccola risposta costitutiva allo shock termico. La crescita a 25°C richiede hsf-1 wild-type, che codifica per il principale attivatore trascrizionale della risposta allo shock termico. Ipotizziamo che l'aumento dell'attività di chaperone a 25 ° C possa ridurre la variazione interindividuale nell'espressione genica aumentando l'efficienza del ripiegamento delle proteine. Ipotizziamo che una variazione ridotta nell'espressione genica possa in definitiva causare una variazione ridotta nella durata della vita.
Volontariato e rischio di mortalità: un progetto quasi sperimentale controllato dal partner.Il consenso sul fatto che il volontariato sia associato a un rischio di mortalità inferiore deriva da un corpo di studi osservazionali e quindi vulnerabile a confusione incontrollata o residua. Questa potenziale limitazione è probabilmente particolarmente problematica per i volontari che, per definizione, sono auto-selezionati e noti per essere significativamente diversi dai non volontari per una serie di fattori associati migliore sopravvivenza. Questo è uno studio di record linkage basato su censimento di 308 733 coppie sposate di età pari o superiore a 25 anni, inclusi 100 571 volontari, con follow-up della mortalità per 33 mesi. Abbiamo utilizzato un modello standard di Cox per esaminare se il rischio di mortalità nella partner dei volontari è stato influenzato dallo stato di volontariato del partner, qualcosa che ci si aspettava se gli effetti del volontariato sul rischio di mortalità fossero dovuti a caratteristiche familiari o comportamentali condivise. più benestanti, più istruiti e più religiosi dei loro coetanei non volontari; avevano anche un rischio di mortalità inferiore [rapporto di rischio (HR)adj = 0,78: intervallo di confidenza al 95% (CI) = 0,71, 0,85 per i maschi e HRadj = 0,77: IC al 95% = 0,68, 0,88 per le femmine]. Tuttavia, tra i membri della coorte che non erano volontari, avere un partner che era un volontario non era associato a un vantaggio sulla mortalità (HRadj = 1.01: 95% CI = 0.92, 1.11 per gli uomini e HRadj = 1.00: 95% CI \ = 0.88, 1.13 donne). Questo studio fornisce ulteriori prove del fatto che è improbabile che la mortalità più bassa associata al volontariato sia dovuta alla selezione sanitaria oa confusione residua derivante da effetti di selezione non misurati all'interno delle famiglie. Aumenta quindi la plausibilità di un effetto causale diretto.
Rinascita della malaria a seguito dell'interruzione dell'irrorazione residua di insetticidi in un'area dell'Uganda con un'intensità di trasmissione precedentemente elevata.Spruzzatura residua in interni (IRS) e reti insetticide a lunga durata (LLIN) sono gli strumenti principali per la prevenzione della malaria in Africa. Non è noto se le riduzioni della malaria possano essere sostenute dopo la sospensione dell'IRS. Il nostro scopo in questo studio era di valutare i cambiamenti nella morbilità della malaria in un'area dell'Uganda con trasmissione storicamente elevata in cui l'IRS è stato interrotto dopo un periodo di 4 anni seguito dalla distribuzione universale di LLIN. I dati di sorveglianza della malaria a livello individuale sono stati raccolti da 1 reparto ambulatoriale e 1 struttura ospedaliera nel distretto di Apac, Uganda, da luglio 2009 a novembre 2015 I cicli di IRS sono stati consegnati approssimativamente ogni 6 mesi da febbraio 2010 a maggio 2014 seguiti dalla distribuzione universale di LLIN nel giugno 2014. Cambiamenti temporali nella positività al test della malaria tasso (TPR) sono stati stimati durante e dopo l'IRS utilizzando analisi di serie temporali interrotte, controllando l'età, le precipitazioni e l'autocorrelazione. I dati includono 65 421 visite ambulatoriali e 13 955 ricoveri ospedalieri pediatrici per i quali è stato eseguito un test diagnostico per la malaria. Nei pazienti ambulatoriali di età <5 anni, il TPR al basale era del 60%-80% seguito da una diminuzione rapida e poi sostenuta al 15%-30%. Durante i 4-18 mesi successivi all'interruzione dell'IRS, i valori TPR assoluti sono aumentati in media del 3,29% al mese (intervallo di confidenza 95%, 2,01%-4,57%), tornando ai livelli di base. Tendenze simili sono state osservate nei pazienti ambulatoriali di età ≥5 anni e nei ricoveri pediatrici. L'interruzione dell'IRS in un'area con intensità di trasmissione storicamente elevata è stata associata a un rapido aumento della morbilità della malaria ai livelli pre-IRS.
Riparazione robotica della valvola mitrale: un'esperienza europea a singolo centro.Riportiamo i risultati della riparazione robotica della valvola per il rigurgito mitralico degenerativo (MR) nel nostro Tra febbraio 2012 e luglio 2016, 134 pazienti sono stati sottoposti a riparazione robotica della valvola mitrale (MV) con il sistema da Vinci Si. Tutti gli interventi sono stati eseguiti tramite mini-toracotomia nel quarto spazio intercostale destro, bypass cardiopolmonare e lieve ipotermia. il follow-up clinico ed ecocardiografico è stato completo al 100%. Non ci sono stati decessi ospedalieri. Il tempo medio di cross-clamp e di bypass cardiopolmonare era rispettivamente di 112±23 e 159±33 min. Gli ecocardiogrammi pre-dimissione hanno mostrato MR residuo da nullo a lieve in tutti i pazienti. Il follow-up mediano è stato di 24,1 mesi. Abbiamo osservato 1 reintervento precoce e 4 tardivo sulla VM per una libertà complessiva da reintervento del 98,2% e del 94,1% rispettivamente a 12 e 36 mesi. Inoltre, il follow-up ecocardiografico ha rivelato libertà dal recupero rrenenza di MR maggiore del Grado 1+ del 92,5% e dell'80,7% rispettivamente a 12 e 36 mesi. Tuttavia, l'assenza di recidive di MR superiore al Grado 2+ è stata del 97,2% a 12 e 36 mesi. La riparazione robotica della VM è un'opzione fattibile e sicura per il trattamento della RM degenerativa in pazienti selezionati con eccellenti risultati perioperatori. I risultati precoci e a medio termine sono notevoli e sono associati a un basso rischio di recidiva tardiva di risonanza magnetica e reintervento. È necessario un follow-up a lungo termine per confermare la durata della riparazione della valvola.
Il ruolo del sesso e dello stato di accoppiamento nel processo di espansione di Arhopalus rusticus (Coleoptera: Cerambycidae)-un Cerambycid esotico in Argentina.Nella provincia di Córdoba , nell'Argentina centrale, vi è un'area di pini introdotti, in cui un invasore Cerambycid, Arhopalus rusticus (L. ), è stato individuato in questa regione per la prima volta nel 2006. Da allora la specie ha ampliato il suo areale fino a occupare la intera area. Arhopalus rusticus è una specie comune nelle foreste di pini dell'emisfero settentrionale. In questo articolo, analizziamo come il sesso e lo stato di accoppiamento influenzano le prestazioni di volo e la potenziale distribuzione di questa specie. Lo studio è stato condotto con individui raccolti da foreste di pini introdotte nel centro-ovest della provincia di Córdoba (Argentina). La capacità di dispersione di A. rusticus è stata determinata misurando la velocità di volo e la distanza percorsa da A. rusticus recentemente emersi, accoppiati e non accoppiati, nei mulini di volo. Dati del peso corporeo prevolo t, peso corporeo dopo il volo, lunghezza del corpo e dimensione delle elitre sono stati ottenuti dagli individui che sono stati pilotati nel mulino di volo. Abbiamo scoperto che le femmine avevano una lunghezza del corpo maggiore, pesavano di più, avevano elitre più lunghe ed erano volatrici più forti dei maschi. Abbiamo anche scoperto che gli individui accoppiati volavano per distanze più veloci e più lunghe rispetto agli individui non accoppiati e consumavano una frazione più piccola del loro peso corporeo. È stato osservato un rapporto positivo tra la dimensione delle elitre e la velocità di volo. È stata prodotta una mappa delle distanze di dispersione di maschi\' e femmine\' per la regione di studio, utilizzando la distribuzione corretta della distanza di dispersione di maschi e femmine. Le prestazioni di volo hanno mostrato che, quando le femmine si disperdono dopo l'accoppiamento, aumentano le possibilità di stabilire la specie in aree non occupate.
Nessun ruolo per il peso corporeo del paziente nella valutazione della funzione renale per il dosaggio dei farmaci.Valutare la capacità di valutazione della funzione renale in base al peso corporeo (RFA ) formule per prevedere gli intervalli di velocità di eliminazione target per la gentamicina in pazienti con vari gradi di funzionalità renale. È stato condotto uno studio di farmacocinetica retrospettiva di 6 anni in un ospedale universitario. Un totale di 85 pazienti ha soddisfatto i criteri di inclusione e sono stati analizzati 127 file di farmacocinetica da pazienti ricoverati in reparti medico-chirurgici (53%) e in terapia intensiva medico-chirurgica (13%) che ricevevano gentamicina per via endovenosa per il trattamento, nonché da pazienti che la ricevevano per profilassi chirurgica (34%). tabelle per la gentamicina. Una tabella dei tassi di eliminazione accettabili è stata generata utilizzando un picco tradizionale di 8 μmg/L e un minimo tra 0,5 e 2 μmg/L associato a ciascuna delle estensioni dell'intervallo di dosaggio. La capacità di ciascuna formula RFA di se sono stati valutati i tassi di eliminazione mirati. La formula RFA assumendo un peso corporeo normalizzato di 72 kg e un fattore di aggiustamento del reagente di creatinina modificato del 90% ha fornito la selezione più accurata della velocità di eliminazione sul target. Questo metodo era superiore alla selezione dell'intervallo di dosaggio basata sulla formula Modification in Diet Renal Disease (MDRD), il metodo guida di Sanford e le formule di Cockcroft-Gault che utilizzano il peso corporeo totale, il peso corporeo ideale o il peso corporeo magro ( P < 0,0001). Basati sull'uso della gentamicina come guida surrogata per i farmaci aggiustati per il rene, questi risultati supportano la selezione dell'intervallo di dosaggio basata su un metodo del peso corporeo normalizzato e un fattore di aggiustamento del reagente della formula del 90% all'interno della formula di Cockcroft-Gault.
Sperimentazione randomizzata e controllata sulla tollerabilità e il completamento di maraviroc rispetto a Kaletra® in combinazione con Truvada® per la profilassi post-esposizione dell'HIV (studio MiPEP).La profilassi post-esposizione (PEP) per l'HIV è spesso mal tollerata e non completata. I regimi PEP alternativi possono migliorare l'aderenza e il completamento, aiutando la prevenzione dell'HIV. Abbiamo condotto uno studio randomizzato controllato di un regime PEP a base di maraviroc rispetto a uno standard di -regime di cura utilizzando lopinavir potenziato con ritonavir. I pazienti che soddisfano i criteri per la PEP sono stati randomizzati a tenofovir disoproxil/emtricitabina (200/245 mg) una volta al giorno più lopinavir potenziato con ritonavir (Kaletra® 400/100 mg) o maraviroc 300 mg due volte al giorno. l'endpoint primario composito era il completamento di 28 giorni del regime PEP assegnato senza eventi avversi (AE) clinici o di laboratorio di grado 3 o 4. Duecentotredici individui sono stati randomizzati (107 a maraviroc; 106 al braccio Kaletra ®). I tassi di follow-up erano alti in entrambi i gruppi. Non c'era alcuna differenza nell'endpoint primario; 70 (71%) nel maraviroc e 64 (65%) nel braccio Kaletra ® ( P = 0,36) hanno completato la PEP senza AE di grado 3 o 4. L'interruzione della PEP è stata la stessa (18%) in entrambi i gruppi. Non ci sono stati eventi avversi clinici di grado 3 o 4 in nessuno dei due bracci, ma più eventi avversi clinici di grado 1 o 2 nel braccio Kaletra ® (91% contro 70%; P < 0,001). L'uso di farmaci antidiarroici è stato maggiore nel braccio Kaletra ® (67% contro 25%; P < 0,001). Non ci sono state sieroconversioni HIV nel periodo di studio. Il tasso di completamento in assenza di eventi avversi di grado 3 o 4 era simile con entrambi i regimi. La PEP a base di Maraviroc è stata meglio tollerata, supportandone l'uso come opzione per la PEP non professionale.
Le sostituzioni localizzate dei domini di base TWIST1 e TWIST2 causano quattro malattie umane distinte che possono essere modellate in Caenorhabditis elegans.Fattori di trascrizione twist, membri dell'elica di base -loop-helix family, gioca un ruolo cruciale nello sviluppo del mesoderma in tutti gli animali. Gli esseri umani hanno due geni paraloghi, TWIST1 e TWIST2 e mutazioni in ciascun gene sono state identificate in specifici disturbi craniofacciali. Qui descriviamo una nuova entità clinica, Sweeney- Sindrome di Cox, associata a distinte sostituzioni aminoacidiche de novo (p. Glu117Val e p. Glu117Gly) ad un residuo di acido glutammico altamente conservato situato nel dominio basico di legame del DNA di TWIST1, in due soggetti con displasia frontonasale e ulteriori malformazioni. Anche se circa uno centinaia di diverse mutazioni TWIST1 sono state riportate in pazienti con la sindrome da aploinsufficienza dominante Saethre-Chotzen (tipicamente associata a craniosinostosi), sostituzioni che interessano unicamente il Gl Il codone u117 non è stato osservato in precedenza. Recentemente, è stato scoperto che soggetti con sindromi di Barber-Say e Ablepharon-Macrostomia ospitano sostituzioni missenso eterozigoti nel residuo di acido glutammico paralogo in TWIST2 (p. Glu75Ala, p. Glu75Gln e p. Glu75Lys). Per studiare sistematicamente gli effetti di queste sostituzioni nelle singole cellule del mesoderma in via di sviluppo, abbiamo ingegnerizzato tutti e cinque gli alleli associati alla malattia nell'equivalente residuo Glu29 codificato da hlh-8, il singolo omologo Twist presente in Caenorhabditis elegans. Questa serie allelica ha rivelato che diverse sostituzioni mostrano una gravità graduale, in termini sia di espressione genica che di fenotipo cellulare, che incorporiamo in un modello che spiega i vari fenotipi della malattia umana. L'analisi genetica favorisce un meccanismo prevalentemente dominante-negativo per l'azione delle sostituzioni di aminoacidi su questo residuo di acido glutammico altamente conservato e illustra il valore della mutagenesi sistematica di C. elegans per lo studio mirato dei processi patologici umani.
Depressione in tarda età e associazione con multimorbilità e polifarmacia: uno studio trasversale.La depressione in tarda età spesso coincide con malattie somatiche croniche e , di conseguenza, con la polifarmacia, che può complicare il trattamento medico. Per determinare le associazioni tra i pazienti con diagnosi di depressione in età avanzata nelle cure primarie e multimorbilità e polifarmacia. Questo studio osservazionale trasversale è stato condotto utilizzando i dati delle cure primarie del 2012. Pazienti depressi di età ≥ 60 anni sono stati confrontati con pazienti abbinati per età e sesso con diagnosi di altre diagnosi psicologiche e controlli mentalmente sani. Sono stati combinati dati di morbilità e prescrizione e sono state eseguite analisi di regressione per le associazioni tra depressione e malattia cronica e uso cronico di droghe. Abbiamo incluso 4477 pazienti; 1512 avevano un record di depressione, 1457 di altre malattie mentali o diagnosi psicologiche e 1508 erano controlli. I pazienti depressi avevano un 16% [Rapporto di prevalenza (PR) 1,16; Intervallo di confidenza al 95% (95% CI) 10%-24%] tasso più elevato di malattia somatica cronica e probabilità più elevate di multimorbilità (OR 1,55; 95% CI 1,33-1,81) rispetto ai controlli. Non esistevano differenze tra pazienti depressi e pazienti con altre diagnosi psicologiche. Rispetto ai controlli, i pazienti depressi avevano un tasso più alto del 46% (95% CI 39-53%) di uso cronico di droghe e maggiori probabilità di politerapia (OR 2,89; 95% CI 2,41-3,47). I pazienti depressi avevano anche tassi più elevati di consumo cronico di droghe e probabilità più elevate di politerapia rispetto ai pazienti con altre diagnosi psicologiche (PR 1,26; OR 1,75; entrambi P < 0,001). La depressione in età avanzata nei pazienti delle cure primarie è associata a un uso più cronico di droghe, anche al di là dell'aumento dei tassi di malattie somatiche in comorbidità. I medici di base dovrebbero prendere in considerazione le revisioni dei farmaci per prevenire problemi correlati ai farmaci non necessari in questi pazienti.
La riduzione dell'MBNL1 citoplasmatico è un evento precoce in un modello murino specifico del cervello di distrofia miotonica.La distrofia miotonica di tipo 1 (DM1) è causata da un espansione delle ripetizioni CTG nella regione non tradotta 3\' (UTR) del gene della distrofia miotonia protein chinasi (DMPK). Il danno cognitivo associato al cambiamento strutturale nel cervello è prevalente nel DM1 Il modo in cui questa anomalia istopatologica si sviluppa durante la progressione della malattia rimane elusivo. L'accumulo nucleare di mRNA DMPK mutante contenente RNA CUG espanso che interrompe le attività citoplasmatiche e nucleari della proteina muscleblind-like (MBNL) è stato implicato nella patogenesi neurale di DM1. L'associazione tra disfunzione MBNL e cambiamenti morfologici non è stata studiata. Abbiamo generato un modello murino per l'espressione postnatale dell'RNA CUG espanso nel cervello che ricapitola le caratteristiche del cervello DM1, inclusa la formazione di RNA nucleare e focolai MBNL, difficoltà di apprendimento, brai n atrofia e splicing alternativo non regolato. La caratterizzazione delle anomalie patologiche da parte di uno studio nel corso del tempo ha rivelato che l'apprendimento correlato all'ippocampo e il potenziamento sinaptico erano compromessi prima dei cambiamenti strutturali nel cervello, seguiti dall'atrofia cerebrale associata alla progressiva riduzione dell'integrità degli assoni e dei dendriti. Inoltre, la distribuzione citoplasmatica di MBNL1 sui dendriti è diminuita prima della degenerazione dei dendriti, mentre la ridotta espressione di MBNL2 e lo splicing alternativo regolato da MBNL alterato erano evidenti dopo la degenerazione. Questi risultati suggeriscono che l'espressione dell'RNA CUG espanso nel cervello DM1 determina processi neurodegenerativi, con MBNL1 citoplasmatico ridotto come risposta precoce all'RNA CUG espanso.
La salute degli uomini in spazi alternativi: esplorare i capannoni degli uomini in Irlanda.Gli uomini spesso faticano a trovare o ad accedere a servizi sanitari significativi. Nonostante o a causa di questa tendenza, gli uomini sono sempre più alla ricerca di fonti alternative di sostegno per il loro benessere. Le conversazioni e le politiche sulla salute globale richiedono una maggiore consapevolezza dei problemi di salute degli uomini, l'adozione di strategie sensibili al genere e l'integrazione della comunità e settori del volontariato. Men\'s Sheds, che sono spazi comunitari e gestiti da volontari per uomini, stanno aumentando di popolarità per gli uomini in tutta l'Irlanda. Questo studio mirava a indagare le esperienze degli uomini come membri di Men\'s Sheds e il rapporto tra il loro coinvolgimento nel capannone e il loro benessere. Metodi qualitativi tra cui: interviste semi-strutturate, focus group e osservazioni sono stati utilizzati con uomini (n = 27) provenienti da cinque diversi capannoni in tutta l'Irlanda. I risultati suggeriscono che le caratteristiche chiave o f Partecipazione capannone (es. l'utilizzo e lo sviluppo di nuove competenze, il senso di appartenenza, il sostegno e l'essere supportati dai coetanei e il contributo alla comunità) contribuiscono al benessere generale degli uomini, nonché al consenso o al supporto degli uomini per i capannoni degli uomini. Nonostante il sostegno per Men\'s Sheds, la negoziazione dell'adesione, il finanziamento e i limiti del supporto tra pari rimangono sfide persistenti che minacciano la sostenibilità dello spazio e dell'appartenenza a Shed. Il lavoro futuro che esamini le opportunità di collaborazione significativa tra gli Sheds e i servizi comunitari circostanti potrebbe aiutare a fornire più percorsi per gli uomini per accedere al supporto senza compromettere l'integrità e l'intenzionalità degli Sheds come spazi gestiti da pari.
Associazione di cellule tumorali circolanti con recidiva precoce e captazione con tomografia a emissione di positroni 18F-fluorodesossiglucosio in tumori polmonari non a piccole cellule resecati.Più di 20 % di pazienti affetti da cancro del polmone sviluppa una recidiva, anche dopo resezione curativa. Abbiamo ipotizzato che la recidiva possa derivare dalla disseminazione di cellule tumorali circolanti (CTC). Questo studio valuta l'importanza della rilevazione di CTC per quanto riguarda la recidiva del polmone non a piccole cellule cancro (NSCLC) in pazienti resecati chirurgicamente. In secondo luogo, abbiamo studiato l'associazione tra CTC e l'assorbimento di 18 F-fluorodeossiglucosio (FDG) da parte del tumore primario su una scansione tomografica a emissione di positroni (PET). In questo studio prospettico a centro singolo, campioni di sangue per l'analisi delle CTC sono stati ottenuti da 102 pazienti con NSCLC in stadio I-IIIA sia prima (CTC1) che 1 mese dopo (CTC2) resezione radicale. Le CTC sono state isolate utilizzando tecniche immunomagnetiche. La presenza di CTC è stata correlata con il valore massimo di assorbimento standardizzato (SUVmax) misurato su scansioni preoperatorie FDG PET/tomografia computerizzata. È stata eseguita l'analisi della sopravvivenza libera da recidiva (RFS). Le CTC sono state rilevate nel 39,2% dei pazienti prima e nel 27,5% 1 mese dopo l'operazione. La presenza di CTC dopo l'operazione era significativamente correlata con SUVmax su scansioni PET, stadio patologico e approccio chirurgico. Solo SUVmax era un predittore indipendente per la presenza di CTC2 all'analisi multivariata. Le CTC postoperatorie erano significativamente correlate con un RFS più breve ( P = 0.005). Nell'analisi multivariata, la presenza di CTC2 era associata a RFS, indipendentemente dallo stadio della malattia. Il rilevamento di CTC 1 mese dopo la resezione radicale potrebbe essere un utile marker per prevedere la recidiva precoce nel NSCLC in stadio I-III. Il valore SUVmax del tumore primario sulle scansioni PET preoperatorie è stato associato alla presenza di CTC 1 mese dopo l'operazione.
Uno studio qualitativo sui determinanti dell'attuazione delle linee guida sull'HIV in due distretti sudorientali della Tanzania.Le attuali politiche sull'HIV in Tanzania hanno adottato le tre lunghe - risultati di impatto a termine di zero nuove infezioni, zero decessi per HIV e zero stigma e discriminazione. Le strategie per raggiungere questi risultati includono l'aumento dei test e la consulenza sull'HIV (HTC), la prevenzione della trasmissione da madre a figlio (PMTCT) e il rafforzamento dell'assistenza e Servizi della clinica di trattamento (CTC). Precedenti studi hanno dimostrato che la politica sull'HIV e le raccomandazioni delle linee guida non sono state sempre attuate nelle zone rurali della Tanzania meridionale. Questo studio mira a identificare i determinanti dell'attuazione delle linee guida sull'HIV. Uno studio qualitativo di 23 interviste semi-strutturate con la struttura in- spese sanitarie, operatori sanitari, coordinatori HIV distrettuali, regionali e nazionali. Cinque strutture sanitarie sono state appositamente selezionate per livello, proprietà e vicinanza alla sede distrettuale. Le interviste sono state analizzato secondo Fleuren\'s cinque determinanti dell'assorbimento dell'innovazione relative a: strategie utilizzate nello sviluppo e nella diffusione delle linee guida; caratteristiche delle linee guida; l'organizzazione di attuazione delle linee guida; utenti delle linee guida; e il contesto socio-culturale e normativo. Nessuna delle strutture disponeva del documento delle linee guida nazionali HTC. Il mancato coinvolgimento dei fornitori nelle revisioni e la scarsa pianificazione per la diffusione delle linee guida hanno impedito la loro attuazione. Le linee guida lunghe e quelle scritte in inglese sono state sottoutilizzate e le attività percepite come complicate, come la messa in scena dell'OMS, sono state evitate. La disponibilità di personale e la mancanza di forniture come kit di test e farmaci hanno impedito l'implementazione. La collaborazione tra le strutture ha migliorato l'implementazione, così come il supporto tra pari tra i fornitori. Le caratteristiche del fornitore, tra cui il livello di istruzione, la conoscenza e l'impegno nei confronti della linea guida hanno influenzato l'attuazione. Secondo i fornitori, le determinanti dell'uso del servizio da parte dei clienti includevano norme di genere, stigma, fiducia e benefici percepiti. Il contesto normativo vietava agli ospedali privati di acquistare forniture per l'HIV. Essendo strumenti per mettere in pratica le politiche, le linee guida nazionali sono cruciali negli sforzi verso i tre zeri. Le strategie per migliorare l'aderenza dei fornitori\' alle linee guida dovrebbero includere lo sviluppo di piani di diffusione delle linee guida più chiari, il rafforzamento del sistema sanitario e possibilmente affrontare le barriere a livello di paziente percepite dai fornitori all'utilizzo dei servizi per l'HIV.
Le mutazioni germinali TP53 determinano un difetto costitutivo del legame al DNA di p53 e della risposta trascrizionale al danno del DNA.La sindrome di Li-Fraumeni (LFS) deriva da eterozigoti mutazioni germinali di TP53, che codifica per un fattore trascrizionale chiave attivato in risposta al danno al DNA Abbiamo recentemente dimostrato, da un'ampia serie di LFS, che le mutazioni missenso dominanti-negative sono le più gravi clinicamente e, grazie a un nuovo test funzionale p53 nei linfociti , che alterano la risposta trascrizionale di p53 al danno al DNA in modo più drastico rispetto alle mutazioni nulle. In questo studio, abbiamo prima confermato questa osservazione eseguendo il test funzionale di p53 nei linfociti di 56 portatori di mutazioni TP53 che ospitano 35 alterazioni distinte. Quindi, per confrontare l'impatto dei diversi tipi di mutazioni germinali di TP53 sul legame al DNA, abbiamo eseguito il sequenziamento dell'immunoprecipitazione della cromatina (ChIP-Seq) in linfociti esposti a doxorubicina. I linfociti di controllo TP53 hanno mappato accuratamente 1287 siti di legame p53. Nuovi siti di legame p53 sono stati convalidati utilizzando un test funzionale nel lievito. L'analisi ChIP-Seq dei linfociti LFS portatori di mutazioni nulle di TP53 (p. P152Rfs*18 o delezione completa) o della mutazione a basso penetrante \'brasiliano\' p. R337H ha rivelato una moderata diminuzione dei siti di legame di p53 (949, 580 e 620, rispettivamente ) e delle profondità di picco di ChIP-Seq. Al contrario, l'analisi dei linfociti LFS con mutazioni missenso dominanti negative di TP53 p. R273H o p. R248W ha rivelato rispettivamente solo 310 e 143 siti di legame p53 e le profondità dei picchi corrispondenti sono state drasticamente ridotte. Complessivamente, i nostri risultati mostrano che i portatori della mutazione TP53 mostrano un difetto costitutivo della risposta trascrizionale al danno del DNA e che la gravità clinica delle mutazioni missenso dominanti-negative di TP53 è spiegata da un'alterazione massiccia e globale del legame al DNA di p53.
Rilevamento di cimici dei letti (Hemiptera: Cimicidae) in appartamenti a basso reddito e a molti piani utilizzando quattro o meno monitor passivi.Cimice dei letti, Cimex lectularius L. , la gestione negli alloggi a basso reddito e nei grattacieli per anziani e disabili può essere difficile. La diagnosi precoce è la chiave per rallentarne la diffusione e ridurre i costi di gestione e il tempo necessario per il controllo. Determinare il numero minimo di monitor passivi necessari per rilevare le infestazioni di cimici dei letti di basso livello in questo ambiente, abbiamo valutato tre monitor posizionati uno, due o quattro per appartamento in un progetto sperimentale 3 per 3. Un monitor appiccicoso, The Bedbug Detection System, e i due monitor di trappole, ClimbUp Insect Sono stati valutati Interceptors BG e BlackOut BedBug Detector. Le cimici dei letti sono state intrappolate dagli Interceptor ClimbUp Insect BG e dal BlackOut BedBug Detector rispettivamente nell'88% e nel 79% degli appartamenti, ma solo nel 39% degli appartamenti monitorati con The Bedbug Detection System Il sistema di rilevamento delle cimici dei letti lo stelo ha richiesto un tempo significativamente più lungo per rilevare le cimici dei letti rispetto al ClimbUp Insect Interceptor BG o al BlackOut BedBug Detector. Con i dati del sistema di rilevamento delle cimici meno efficaci rimossi dalle analisi, i tassi di rilevamento variavano dall'80 al 90%, senza differenze significative tra uno, due o quattro monitor per appartamento. I risultati indicano che è particolarmente importante includere un posizionamento a letto quando si posizionano solo pochi monitor. Il lavoro futuro dovrebbe confrontare la combinazione di rapide ispezioni visive con vari numeri di monitor e posizionamenti per appartamento per determinare il sistema più efficiente ed economico che sarà accettato e implementato negli alloggi a basso reddito.
EUPAN consente studi pan-genomici di un gran numero di genomi eucariotici.Le analisi pan-genomiche vengono eseguite di routine per i batteri per interpretare l'interno- specie geni presenza/assenza variazioni (PAV). Tuttavia, le analisi pan-genoma sono rare per gli eucarioti a causa delle grandi dimensioni e della maggiore complessità dei loro genomi. Qui abbiamo proposto EUPAN, un kit di strumenti per l'analisi pan-genomica eucariotica, che consente l'analisi automatica su larga scala analisi del pangenoma eucariotico e rilevamento di PAV genici a una profondità di sequenziamento relativamente bassa. Negli studi precedenti, abbiamo dimostrato l'efficacia e l'elevata accuratezza di EUPAN nell'analisi del pangenoma di 453 genomi di riso, in cui abbiamo anche rivelato PAV genetici diffusi tra i singoli genomi di riso. Inoltre, EUPAN può essere applicato direttamente agli attuali progetti di ri-sequenziamento incentrati principalmente sui polimorfismi a singolo nucleotide. EUPAN è implementato in Perl, R e C ++. È supportato sotto Linux e preferito per un calcolo r cluster con sistema di pianificazione del lavoro LSF e SLURM. EUPAN insieme alla sua procedura operativa standard (SOP) è disponibile gratuitamente per uso non commerciale (CC BY-NC 4.0) all'indirizzo http://cgm. sjtu. edu. cn/eupan/index. html. ccwei@sjtu. edu. cn o jianxin. shi@sjtu. edu. cn. I dati supplementari sono disponibili su Bioinformatica online.
Prestazioni diagnostiche e fattibilità clinica di un test point-of-care per le infezioni virali respiratorie nell'assistenza sanitaria di base.Sono ancora livelli inappropriatamente elevati di antibiotici prescritto nell'assistenza sanitaria di base per le infezioni del tratto respiratorio (RTI). L'accesso ai test diagnostici point-of-care (POCT) per le RTI potrebbe ridurre questa sovra-prescrizione. Lo scopo del nostro studio era determinare le prestazioni diagnostiche e la fattibilità clinica di un POCT diagnostico recentemente sviluppato per virus respiratori, il mariPOC®, in un ambiente sanitario primario olandese. Nei pazienti con sintomi di RTI che si presentavano in uno studio di famiglia durante la stagione invernale 2015-2016, abbiamo determinato la sensibilità e la specificità del test rispetto alla catena della polimerasi test di reazione (PCR) eseguiti in laboratorio. La fattibilità clinica del POCT è stata valutata intervistando i medici di base. Uno o più virus respiratori sono stati rilevati nel 54,9% dei pa tienti (n = 204). Per il virus dell'influenza A (n = 24), la sensibilità del POCT era del 54,2% e la specificità era del 98,9%; per il virus dell'influenza B (n = 18), la sensibilità era del 72,2% e la specificità del 99,5%; e per il virus respiratorio sinciziale (RSV) (n = 12), la sensibilità era del 50,0% e la specificità del 100%. Nei campioni con una maggiore carica virale, la sensibilità era dell'85,7% per l'influenza A, del 78,6% per l'influenza B e dell'85,7% per l'RSV. La disponibilità di un test diagnostico per i virus respiratori è stata apprezzata sia dai pazienti che dai medici di base. Il nostro studio mostra che i POCT diagnostici per i virus respiratori potrebbero contribuire a una diagnosi precisa e basata sull'evidenza delle RTI e potrebbero influenzare positivamente la prescrizione di antibiotici da parte dei medici di base. Tuttavia, prima dell'implementazione nell'assistenza sanitaria primaria, l'accuratezza diagnostica del POCT deve essere migliorata e il suo impatto sul processo decisionale clinico dovrebbe essere ulteriormente valutato.
Diversità e distribuzione spazio-temporale delle comunità di macrofauna del suolo lungo l'elevazione del monte Changbai, Cina.La comprensione dei modelli di variazione verticale e della diversità di La flora e la fauna lungo il cambiamento di elevazione sono state ben stabilite nel secolo scorso. Tuttavia, non è chiaro se vi sia un modello di distribuzione altimetrica per la fauna del suolo. Questo studio ha rivelato la diversità e la distribuzione spazio-temporale delle comunità di macrofauna del suolo in diverse zone di vegetazione da foresta alla tundra alpina lungo l'elevazione del monte Changbai, Cina. L'abbondanza, la ricchezza e l'indice di diversità Shannon-Wiener delle comunità di macrofauna del suolo sono stati confrontati in quattro distinte zone di vegetazione tra cui la zona di foresta mista di conifere e latifoglie, la zona di foresta di conifere, la la zona forestale della betulla nana subalpina (Betula ermanii) e la zona della tundra alpina La macrofauna del suolo è stata estratta nei mesi di maggio, luglio e settembre di 2009. In ogni stagione, l'abbondanza e la ricchezza della macrofauna del suolo diminuiscono con l'aumentare dell'elevazione. Gli indici di diversità di Shannon-Wiener della macrofauna del suolo erano più alti nelle zone di vegetazione di elevazione inferiore rispetto a quelle di elevazione maggiore. Sono state osservate differenze significative nell'abbondanza, nella ricchezza e nell'indice di diversità Shannon-Wiener per le zone di vegetazione studiate. La macrofauna del suolo si è aggregata principalmente allo strato di lettiera nelle aree a bassa quota e nello strato di suolo di 0-5 cm delle aree a quota più elevata. I risultati hanno evidenziato che la diversità delle comunità di macrofauna del suolo diminuiva all'aumentare dell'elevazione e possedeva le caratteristiche distinte di zonazione nell'ecosistema montano. La diversità e la distribuzione delle comunità di macrofauna del suolo sono state influenzate dalle precipitazioni medie annuali, dall'altitudine, dalla quantità di radiazioni annuali e dalla temperatura media annuale.
Il collagene XIII assicura l'integrità pre- e postsinaptica della sinapsi neuromuscolare.Sia i segnali transmembrana che quelli extracellulari, uno dei quali è il collagene XIII, regolano la formazione e la funzione della sinapsi neuromuscolare, e la loro assenza provoca miastenia Mostriamo che i cambiamenti fenotipici nei topi knock-out del collagene XIII sono più lievi dei sintomi nei pazienti umani, ma i topi Col13a1-/- ricapitolano i principali risultati muscolari della sindrome miastenica congenita tipo 19 e fungono da modello di malattia. In mancanza di collagene XIII le sinapsi neuromuscolari non raggiungono la dimensione completa, l'allineamento, la complessità e la funzione con conseguente riduzione della forza muscolare. Il collagene XIII è particolarmente importante per l'integrità preterminale e, quando assente, la destabilizzazione del i nervi motori provocano la rigenerazione muscolare e l'atrofia soprattutto nel caso di fibre muscolari lente. È stato scoperto che il collagene XIII influisce sull'integrità sinaptica attraverso il legame della coda del ColQ o f acetilcolina esterasi. Sebbene il collagene XIII sia una molecola transmembrana legata ai muscoli, subisce anche la perdita di ectodominio per diventare un componente della lamina basale sinaptica. Abbiamo studiato i ruoli delle due forme\' di nuovi topi Col13a1tm/tm in cui la diffusione dell'ectodominio è compromessa. Mentre la maturazione postsinaptica, la ramificazione terminale e la neurotrasmissione erano esagerate nei topi Col13a1tm/tm, la presenza della forma transmembrana era sufficiente per prevenire i difetti nell'adesione transsinaptica, l'invaginazione/retrazione delle cellule di Schwann, l'accumulo di vescicole e il clustering del recettore dell'acetilcolina e la dispersione dell'acetilcolinesterasi osservati nella Col13a1 -/- topi, indicando la forma transmembrana come il principale conduttore degli effetti del collagene XIII. Complessivamente, il collagene XIII assicura l'integrità postsinaptica, sinaptica e presinaptica ed è necessario per ottenere e mantenere dimensioni, complessità e capacità funzionali normali della sinapsi neuromuscolare.
Vietare il fumo di narghilè nei luoghi pubblici in Iran: una prospettiva quadro della coalizione di advocacy sul processo politico e sul cambiamento.Il fumo di narghilè è un'usanza diffusa in Iran con una prevalenza in rapida crescita soprattutto tra i giovani. In questo articolo, analizziamo il processo politico di applicazione di un divieto federale/statale sul fumo di narghilè in tutti i luoghi pubblici nella provincia di Kerman, in Iran. Guidati dall'Advocacy Coalition Framework (ACF), indaghiamo come un divieto di fumare narghilè ha raggiunto l'agenda politica nel 2011, come è stato definito da diversi attori politici e perché non ha avuto luogo alcun progresso significativo nonostante la sua inclusione nell'agenda. Abbiamo condotto uno studio qualitativo utilizzando un approccio di caso di studio. Due fonti principali di dati sono stati impiegati: interviste approfondite faccia a faccia e analisi documentale di testi politici chiave. Abbiamo intervistato 24 attori politici di diversi settori. Un quadro tematico qualitativo, che incorpora analisi sia induttive che deduttive, è stato em utilizzato per analizzare i nostri dati. Abbiamo scoperto che il settore sanitario è stato l'attore principale che ha spinto la questione del fumo di narghilè nell'agenda politica inquadrandolo come un rischio per la salute pubblica. Il settore sanitario e i suoi alleati hanno sostenuto l'applicazione di una legge federale per vietare il fumo di narghilè in tutti i luoghi pubblici, comprese le sale da tè e i ristoranti tradizionali, mentre un altro gruppo di attori si è opposto al divieto. Il gruppo pro-ban non è stato in grado di neutralizzare le strategie del gruppo anti-ban e di orientare il dibattito verso i danni alla salute del fumo di narghilè. La nostra analisi scopre tre ragioni principali alla base della stasi politica: mancanza di apprendimento delle politiche a causa della mancanza di accordo sulle prove e relativi conflitti analitici tra i due gruppi legati alle differenze nelle convinzioni fondamentali e politiche; l'incapacità del gruppo pro-divieto di sfruttare le opportunità nel sottosistema di politica esterna generando un sostegno pubblico più forte per l'applicazione del divieto di fumo di narghilè; e la natura del contesto istituzionale, in particolare la governance autocratica di CHFS che ha contribuito alla mancanza di apprendimento delle politiche all'interno del sottosistema politico. La nostra ricerca ha dimostrato l'utilità dell'ACF come quadro teorico per analizzare il processo politico e il cambiamento politico per promuovere il controllo del tabacco. Mostra l'importanza di tenere conto dei sistemi di credenze degli attori politici e dell'inquadramento dei problemi per comprendere come alcune questioni ottengano maggiore importanza nel processo di definizione delle politiche rispetto ad altre. I nostri risultati indicano inoltre la necessità di risorse significative impiegate dallo stato attraverso campagne di sensibilizzazione pubblica per cambiare la percezione pubblica del fumo di narghilè in Iran, che è una pratica culturale profondamente ancorata.
Distanza dal centro cardiaco invasivo, esecuzione di angiografia coronarica acuta e angioplastica ed esiti associati nell'arresto cardiaco extraospedaliero: uno studio nazionale.Valutare se la distanza dal sito dell'evento a un centro cardiaco invasivo, angiografia coronarica acuta (CAG)/intervento coronarico percutaneo (PCI) e livello di assistenza ospedaliera (centro cardiaco invasivo vs ospedale locale) è associata alla sopravvivenza in pazienti con arresto cardiaco extraospedaliero (OHCA). Studio storico nazionale di follow-up su 41 186 pazienti con OHCA non selezionati, in cui è stata tentata la rianimazione tra il 2001 e il 2013, identificati attraverso il registro danese degli arresti cardiaci. Abbiamo osservato un aumento della percentuale di pazienti sottoposti a RCP da parte di astanti (18% nel 2001, 60% nel 2013, P < 0,001), ottenendo il ritorno della circolazione spontanea (ROSC) (10% nel 2001, 29% nel 2013, P < 0,001) e ricoverati direttamente a un centro invasivo (26% nel 2001, 45% nel 2013 , P < 0,001). Contemporaneamente, la sopravvivenza a 30 giorni è passata dal 5% nel 2001 al 12% nel 2013, P < 0,001. Tra i pazienti che hanno raggiunto il ROSC, una percentuale maggiore è stata sottoposta a CAG/PCI acuta (5% nel 2001, 27% nel 2013, P < 0,001). La proporzione di pazienti sottoposti annualmente a CAG/PCI acuti in ciascuna regione è stata definita come indice CAG/PCI. Le seguenti variabili sono state associate a una mortalità più bassa nelle analisi multivariabili: ammissione diretta al centro cardiaco invasivo (HR 0,91, 95% CI: 0,89-0,93), indice CAG/PCI (HR 0,33, 95% CI: 0,25-0,45), densità di popolazione superiore a 2000 per chilometro quadrato (HR 0,94, IC 95%: 0,89-0,98), RCP da parte di astanti (HR 0,97, IC 95%: 0,95-0,99) e OHCA assistito (HR 0,87, IC 95%: 0,85-0,89), mentre la distanza al centro invasivo più vicino non è stato associato alla sopravvivenza. L'ammissione a un centro cardiaco invasivo e le prestazioni regionali di CAG/PCI acute erano associate a una migliore sopravvivenza nei pazienti con OHCA, mentre la distanza dal centro invasivo non lo era. Questi risultati supportano una strategia centralizzata per l'assistenza post-rianimazione immediata nei pazienti affetti da OHCA.
La stimolazione non invasiva della corteccia prefrontale ventromediale migliora l'elaborazione piacevole della scena.I pazienti depressi mostrano tipicamente un'attenzione parziale verso materiale emotivo spiacevole e lontano da materiale emotivo piacevole. Studi di imaging suggeriscono che le disfunzioni in una rete neurale distribuita, inclusa la corteccia prefrontale ventromediale (vmPFC), sono associate a questo bias di elaborazione. Di conseguenza, i cambiamenti nell'attivazione di vmPFC dovrebbero mediare i cambiamenti nell'elaborazione degli stimoli emotivi. Qui, abbiamo studiato l'effetto di inibitori ed eccitatori stimolazione transcranica a corrente continua (tDCS) del vmPFC sull'elaborazione della scena emotiva in due esperimenti all'interno del soggetto utilizzando la risonanza magnetica funzionale (fMRI) e la magnetoencefalografia (MEG). Entrambi gli studi hanno dimostrato che l'eccitatorio rispetto al tDCS inibitorio amplifica l'elaborazione del piacevole rispetto allo spiacevole scene in partecipanti sani Questo effetto modulatorio si è verificato in una rete distribuita ork comprese le regioni della corteccia sensoriale e prefrontale ed era visibile durante le fasi di elaborazione molto precoci e tardive. Vengono discussi i risultati relativi ai modelli neurofisiologici dell'elaborazione emotiva. La convergenza degli effetti di stimolazione tra gruppi indipendenti di partecipanti sani e metodi complementari di neuroimaging (fMRI, MEG) fornisce una base per ulteriori indagini su un uso potenzialmente terapeutico di questo nuovo approccio di stimolazione in pazienti con depressione o altri disturbi affettivi.
Risultato a lungo termine della resezione polmonare per la malattia polmonare da micobatteri non tubercolari.La resezione polmonare insieme alla terapia antimicrobica multipla ha prodotto esiti favorevoli in alcuni centri. Tuttavia, poco si sa per quanto riguarda i fattori di rischio per la sopravvivenza a lungo termine e la recidiva microbiologica dopo resezione polmonare per malattia polmonare da micobatteri non tubercolari (NTMPD). Abbiamo valutato gli esiti a lungo termine della resezione polmonare, inclusa la recidiva microbiologica e la sopravvivenza. Questo studio di coorte retrospettivo inclusi 125 pazienti (età media, 60 anni) con NTMPD trattati con resezione polmonare presso due centri di riferimento tra gennaio 1994 e agosto 2015. Complicazioni postoperatorie si sono verificate in 27 pazienti (22%). tipi di resezione polmonare (odds ratio, 4,1; intervallo di confidenza al 95% [CI], 1,6-10,3; P = .005). periodo di crescita è stato di 7,1 anni. Mentre 19 pazienti hanno manifestato recidiva microbiologica, 26 sono morti. L'analisi multivariata ha rivelato pneumonectomia (rapporto di rischio aggiustato [aHR], 0,12; 95% CI, .007-.66; P = .0098) e lesioni cavitarie dopo l'intervento chirurgico (aHR, 6,73; 95% CI, 1,68-22,7; P \ = .0095) per essere predittori di recidiva microbiologica e vecchiaia (aHR, 1,06; 95% CI, 1,01-1,13; P = .016), basso indice di massa corporea (BMI; aHR per ogni aumento di 1 kg/m2, 0,72; IC 95%, .60-.85; P < .0001), pneumonectomia (aHR, 4,38; IC 95%, 1,78-11,3; P = .014) e lesioni cavitarie residue (aHR, 3,53; 95 % CI, 1,35-9,57; P = .011) per essere predittori di prognosi infausta. I pazienti che potrebbero trarre beneficio dalla resezione polmonare dovrebbero essere accuratamente selezionati considerando l'età, l'IMC, le lesioni residue dopo l'intervento chirurgico e il tipo di resezione polmonare.
Consenso sui dati contestuali del campione di piante.Il gruppo di lavoro sulla conformità e l'interoperabilità del Consorzio per gli standard genomici facilita la creazione di una comunità di esperti e lo sviluppo di raccomandazioni per descrivere i dati genomici e le informazioni associate. Qui presentiamo la nostra strategia in corso per armonizzare la segnalazione dei dati contestuali dei campioni di piante associati alla genomica e alla genomica funzionale. Questo commento riassume lo stato attuale dei nostri sforzi di armonizzazione dei dati contestuali dei campioni di piante per coinvolgere un ampio impianto comunità scientifica.
Analisi ottica comparativa del genoma di due specie di pangolino: Manis pentadactyla e Manis javanica.Il pangolino è un mammifero Pholidota con grandi scaglie di cheratina che ne proteggono la pelle. Due specie di pangolino ( Manis pentadactyla e Manis javanica ) sono state registrate come in pericolo di estinzione nella Lista rossa delle specie minacciate dell'Unione internazionale per la conservazione della natura. La mappatura ottica costruisce mappe di restrizione ad alta risoluzione da singole molecole di DNA per l'analisi del genoma su scala megabase e per assistere l'assemblaggio del genoma. Qui, abbiamo costruito mappe di restrizione di M. pentadactyla e M. javanica utilizzando la mappatura ottica per assistere con l'assemblaggio del genoma e l'analisi di queste specie. Il DNA genomico è stato intaccato con Nt. BspQI e quindi etichettato utilizzando basi marcate in modo fluorescente che erano rilevate dal sistema di mappatura ottica Irys In totale, 3.313.734 molecole di DNA (517.847 Gb) per M. pentadactyla e 3.439.885 molecole di DNA (504.743 Gb) per M. javanica w ottenuto, che corrispondeva a una copertura del genoma di circa 178X e 177X, rispettivamente. Le molecole qualificate (≥150 kb con una densità di etichetta di >6 siti per 100 kb) sono state analizzate utilizzando il programma di assemblaggio de novo incorporato nella pipeline IrysView. Abbiamo ottenuto due mappe di dimensioni 2,91 Gb e 2,85 Gb con N50 rispettivamente di 1,88 Mb e 1,97 Mb. La mappatura ottica rivela informazioni strutturali su larga scala che sono particolarmente importanti per i genomi non modello che mancano di un buon riferimento. L'approccio ha il potenziale per guidare l'assemblaggio de novo dei genomi sequenziati utilizzando il sequenziamento di nuova generazione. I nostri dati forniscono una risorsa per l'analisi del genoma di Manidae e riferimenti per l'assemblaggio de novo. Questa nota fornisce anche nuove informazioni sull'analisi evolutiva dei Manidae a livello della struttura del genoma.
Adesione dei medici generici\' alle raccomandazioni di work-up e di riferimento nell'assistenza alla fertilità.Qual è l'attuale aderenza alle linee guida da parte dei medici generici (GP) per work-up e successivo rinvio dall'assistenza primaria a quella secondaria per i pazienti affetti da infertilità. L'aderenza alle linee guida da parte dei medici di base sull'infertilità è stata del 9,2% nelle coppie segnalate. L'adesione alle raccomandazioni può ridurre il rinvio, la diagnostica e i trattamenti non necessari e, di conseguenza, comportare minori spese. Inoltre , i pazienti possono essere salvati da visite ospedaliere non necessarie, oneri emotivi e costi vivi. Uno studio di coorte retrospettivo su 306 pazienti indirizzati per un work-up di fertilità di base tra gennaio 2011 e giugno 2013 dall'assistenza primaria a un ospedale universitario di assistenza secondaria o terziario ospedale con strutture per la fecondazione in vitro. Le coppie potevano partecipare quando non c'era un precedente rinvio per problemi di fertilità e la durata del desiderio del bambino era <2 anni. I dati per valutare l'aderenza alle linee guida sono stati raccolti dalla lettera di riferimento e dalle cartelle cliniche. È stato utilizzato un questionario per i pazienti per determinare le caratteristiche generali e relative alla fertilità dei pazienti. Il medico di famiglia ha eseguito un test del titolo anticorpale della Chlamydia (CAT) e un'analisi del liquido seminale come raccomandato rispettivamente nel 15,9% e nel 42,2% dei pazienti segnalati. Secondo la linea guida, il 39% delle coppie è stato sottoposto a un rinvio (cioè non immediatamente segnalato come raccomandato), l'8,8% è stato inviato inutilmente e l'analisi CAT e dello sperma è stata ripetuta inutilmente nell'assistenza secondaria nell'80,0% e nel 57,1% dei casi, rispettivamente. Non abbiamo potuto includere pazienti non referenziati con gestione in attesa nelle cure primarie, un numero imprecisato delle quali è rimasta incinta in questo periodo. Ciò potrebbe aver portato a una sottovalutazione delle prestazioni delle cure primarie. I nostri risultati mostrano che l'aderenza alle linee guida relative al work-up e al successivo rinvio per problemi di fertilità è bassa. L'influenza delle richieste di rinvio da parte dei pazienti rimane in gran parte sconosciuta. Dovrebbero essere determinati ostacoli e facilitatori per l'aderenza alle linee guida per sviluppare interventi per migliorare l'aderenza alle linee guida nelle aree di lavoro e riferimento per l'assistenza alla fertilità e per ridurre i test duplicati nelle cure secondarie. Finanziato da CZ, un assicuratore sanitario olandese (numero di concessione AFVV 11-232). CZ non ha avuto alcun ruolo nella progettazione dello studio, nella raccolta dei dati, nell'analisi e nell'interpretazione dei dati o nella stesura del rapporto. Interessi concorrenti: nessuno. Non applicabile.
Recente miglioramento della prognosi di sopravvivenza dopo metastasectomia polmonare e chemioterapia avanzata per pazienti con cancro del colon-retto.Nuovi regimi chemioterapici (cioè FOLFOX o FOLFIRI con farmaci a bersaglio molecolare ) hanno migliorato la prognosi dei pazienti con cancro del colon-retto non operabile o ricorrente. Per stimare l'impatto prognostico di queste chemioterapie, abbiamo esaminato il cambiamento cronologico nei tassi di sopravvivenza dei pazienti sottoposti a metastasectomia polmonare per metastasi del cancro del colon-retto. Utilizzando un ampio database, abbiamo condotto un studio retrospettivo, multi-istituzionale per raccogliere i dati di 1223 pazienti eleggibili provenienti da 26 istituzioni che erano stati sottoposti a metastasectomia polmonare con intento curativo. Abbiamo suddiviso i pazienti sottoposti a metastasectomia in diversi periodi di tempo in base alla tendenza principale dei regimi chemioterapici per il cancro del colon-retto ricorrente: quelli che ha subito metastasectomia tra il 1990 e il 1999 ( N = 451, Gruppo A), tra il 2000 e il 2004 ( N = 433, Gruppo B) o tra il 2005 e il 2007 ( N = 339, Gruppo C). I tassi di sopravvivenza globale a cinque anni dopo metastasectomia erano del 45% nel Gruppo A, del 56% nel Gruppo B e del 66% nel Gruppo C ( P < 0.0001) mentre i tassi dopo metastasectomia più chemioterapia erano del 32% nel Gruppo A, 47% nel Gruppo B e 70% nel Gruppo C ( P = 0,0059). La prognosi dei pazienti sottoposti sia a metastasectomia che a chemioterapia nel gruppo C era significativamente migliore di quella degli altri due gruppi. La sopravvivenza globale dei pazienti che non hanno ricevuto la chemioterapia non era significativamente diversa tra i gruppi. I tassi di sopravvivenza dei pazienti dopo metastasectomia polmonare per metastasi del cancro del colon-retto sottoposti a chemioterapia sono aumentati nel corso degli anni. Ciò implica che i nuovi regimi chemioterapici potrebbero aver avuto un impatto positivo su questi pazienti.
Modifiche genetiche di Mecr rivelano un ruolo della 2-enoil-CoA/ACP reduttasi mitocondriale nello sviluppo placentare nei topi.Sintesi mitocondriale di acidi grassi (mtFAS) ) è un processo metabolico sottovalutato ma altamente conservato, indispensabile per la respirazione mitocondriale. È stato recentemente riportato che la disfunzione del mtFAS causa l'insorgenza nell'infanzia di distonia e atrofia ottica nell'uomo (MEPAN). Per studiare il ruolo del mtFAS nei mammiferi, abbiamo generato tre diversi linee murine con modificazioni del gene Mecr, che codifica per l'enoil-CoA/ACP reduttasi mitocondriale (Mecr). Una mutazione di primo tipo knock-out, basata sull'inserimento di un forte terminatore trascrizionale tra i primi due esoni di Mecr, ha mostrato letalità embrionale su un'ampia finestra di tempo e a causa di una varietà di cause. La completa rimozione dell'esone 2 o la sostituzione di Mecr endogeno con il suo analogo procariotico funzionale fabI (Mecrtm(fabI)) ha portato a fenotipi di letalità più coerenti e ha rivelato una placenta ipoplasica. Le analisi di diversi parametri mitocondriali indicano che la capacità mitocondriale per il metabolismo aerobico è ridotta in caso di interruzione della funzione mtFAS. Un'ulteriore analisi dei modelli sintetici Mecrtm(fabI) ha rivelato difetti nello sviluppo di trofoblasti placentari coerenti con la segnalazione disturbata del recettore attivato dal proliferatore del perossisoma. Concludiamo che il mtFAS interrotto porta a una carenza nella respirazione mitocondriale, che sta alla radice degli effetti pantropici osservati sullo sviluppo embrionale e placentare in questi modelli murini.
Un assemblaggio migliorato del megagenoma del pino loblolly utilizzando il sequenziamento a singola molecola a lettura lunga.Il genoma da 22 gigabase del pino loblolly (Pinus taeda) è uno dei più grandi mai sequenziati. Il progetto di assieme pubblicato nel 2014 è stato costruito interamente da brevi letture Illumina, con lunghezze che vanno da 100 a 250 coppie di basi (bp). L'assieme era piuttosto frammentato, contenendo oltre 11 milioni di contig il cui peso la dimensione media (N50) era di 8206 bp. Per migliorare questo risultato, abbiamo generato una copertura di circa 12 volte nelle letture lunghe utilizzando la tecnologia di sequenziamento in tempo reale della singola molecola sviluppata presso Pacific Biosciences. Abbiamo assemblato le letture lunghe e brevi utilizzando il mega-maSuRCA legge l'algoritmo di assemblaggio, che ha prodotto un assemblaggio sostanzialmente migliore, P. taeda versione 2.0. Il nuovo assemblaggio ha una dimensione contig N50 di 25 361, più di tre volte più grande di quella ottenuta nell'assemblaggio originale e una dimensione dell'impalcatura N50 di 107 821 , 61% più grande di th e precedente assemblea.
Il genoma del copepode endemico antartico, Tigriopus kingsejongensis.La zona intertidale antartica è continuamente soggetta a fattori di stress biotici e abiotici estremamente variabili. La Penisola Antartica è la regione che si riscalda più rapidamente sulla Terra. Gli organismi che vivono nelle pozze intertidali antartiche sono quindi interessanti per la ricerca sull'adattamento evolutivo ad ambienti estremi e gli effetti del cambiamento climatico. Riportiamo l'intera sequenza del genoma del copepode arpacticoide antartico-endemico Tigriopus kingsejongensi. La sequenza di DNA grezzo da 37 Gb è stata generata utilizzando la piattaforma Illumina Miseq. Le librerie sono state preparate con una copertura di 65 volte e una lunghezza totale di 295 Mb. L'assemblaggio finale consiste di 48 368 contig con una lunghezza contig N50 di 17,5 kb e 27 823 scaffold con una lunghezza contig N50 di 159,2 kb. Un totale di 12 772 geni codificanti sono stati dedotti utilizzando la pipeline di annotazione MAKER. L'analisi comparativa del genoma ha rivelato che I geni specifici di T. kingsejongensis sono arricchiti nei processi di trasporto e metabolismo. Inoltre, i geni in rapida evoluzione correlati al metabolismo energetico hanno mostrato firme di selezione positive. Il genoma di T. kingsejongensis fornisce un esempio interessante di una strategia evolutiva per l'adattamento al freddo antartico e offre nuove informazioni genetiche sul biota intertidale antartico.
Analisi morfometrica delle foglie di Passiflora: la relazione tra punti di riferimento del sistema vascolare e descrittori di Fourier ellittici della lama.La forma delle foglie tra le specie di Passiflora è spettacolarmente diversa Alla base di questa diversità nella forma delle foglie ci sono profondi cambiamenti nel modello della vascolarizzazione primaria e nella crescita laminare. Ciascuno di questi aspetti della morfologia delle foglie - vascolarizzazione e lama - fornisce diverse intuizioni sul modello delle foglie. Qui, analizziamo morfometricamente >3300 foglie da 40 diverse specie di Passiflora raccolte in sequenza attraverso la vite Ogni foglia viene misurata in due modi diversi: utilizzando 1) 15 punti di repere omologhi del sistema vascolare, dei seni e dei lobi regolati da Procuste e 2) Descrittori di Fourier ellittici (EFD), che quantificano il contorno della foglia. La capacità dei punti di riferimento, degli EFD e di entrambi i set di dati vengono confrontati insieme per determinare la loro capacità relativa di prevedere le specie e la posizione dei nodi all'interno del vite. La correlazione a coppie delle coordinate del punto di riferimento x e y e dei coefficienti armonici EFD rivela strette associazioni tra tratti e approfondimenti sulla relazione tra vascolarizzazione e configurazione della lama. I punti di riferimento, più riflettenti del sistema vascolare, e gli EFD, più riflettenti del contorno della lama, descrivono caratteristiche sia simili che distinte della morfologia fogliare. I punti di riferimento e gli EFD variano nella capacità di prevedere l'identità delle specie e la posizione dei nodi nella vite e mostrano una struttura correlazionale (sia all'interno dei tratti di riferimento o EFD che tra i due tipi di dati) rivelando i vincoli tra il patterning vascolare e della lama sottostante la variazione naturale nella morfologia fogliare tra Passiflora specie.
Bozza del genoma del cetriolo di mare Apostichopus japonicus e polimorfismo genetico tra le varianti di colore.Il cetriolo di mare giapponese (Apostichopus japonicus Selenka 1867) è un importante specie come fonte di frutti di mare e ingrediente nella medicina tradizionale. Si trova principalmente al largo delle coste del nord-est asiatico. Recentemente, lo sfruttamento sostanziale e le diffuse malattie biotiche in A. japonicus hanno generato una crescente preoccupazione per la conservazione. Tuttavia, la base di conoscenza genomica e le risorse disponibili per i ricercatori da utilizzare nella gestione di questa risorsa naturale e per stabilire sistemi di allevamento su base genetica per l'acquacoltura di cetrioli di mare sono ancora in una fase nascente. Un totale di 312 Gb di sequenze grezze sono state generate utilizzando la piattaforma Illumina HiSeq 2000 e assemblate a una dimensione finale di 0,66 Gb, che è circa l'80,5% della dimensione stimata del genoma (0,82 Gb). Abbiamo osservato che l'eterozigosi a livello di nucleotide all'interno del genoma assemblato è dello 0,986%. risultante bozza di assemblaggio del genoma comprendente 132 607 scaffold con un valore N50 di 10,5 kb contiene un totale di 21 771 predetti geni codificanti proteine. Abbiamo identificato 6,6-14,5 milioni di polimorfismi a singolo nucleotide eterozigoti nel genoma assemblato delle tre varianti di colore naturali (verde, rosso e nero), risultando in una diversità nucleotidica stimata di 0,00146. Riportiamo la prima bozza del genoma di A. japonicus e forniamo una panoramica generale della variazione genetica nelle tre principali varianti di colore di A. japonicus. Questi dati aiuteranno a fornire una visione completa delle relazioni genetiche, fisiologiche ed evolutive tra le varianti di colore in A. japonicus e saranno risorse inestimabili per la ricerca genomica dei cetrioli di mare.
Sequenza del genoma di un parassita del riso, la cavalletta dal dorso bianco (Sogatella furcifera).La Sogatella furcifera è un importante virus che succhia la linfa del floema e delle piante -insetto migratore trasmittente del riso. A causa del suo alto potenziale riproduttivo, capacità di dispersione e trasmissione di malattie virali delle piante, S. furcifera provoca notevoli danni alla produzione di chicchi di riso e ha grandi impatti economici e agricoli. Studi approfonditi sugli aspetti ecologici e virus-ospite interazioni di S. furcifera sono state limitate a causa della mancanza di una sequenza genomica ben assemblata Un totale di 241,3 Gb di letture grezze dall'intero genoma di S. furcifera sono stati generati dal sequenziamento Illumina utilizzando diverse combinazioni di accoppiamenti e accoppiamenti -end librerie da 17 librerie di inserti comprese tra 180 bp e 40 kbp. L'assemblaggio finale del genoma (0,72 Gb), con dimensione media del contig N50 di 70,7 kb e scaffold N50 di 1,18 Mb, copre il 98,6% del geno stimato me taglia di S. furcifera. L'annotazione del genoma, assistita da otto diversi stadi di sviluppo (embrioni, ninfe di 1°-5° stadio, adulti di 5 giorni e adulti di 10 giorni), ha generato 21 254 geni codificanti proteine, che hanno catturato il 99,59 % (247/ 248) dei geni CEGMA core e il 91,7% (2453/2675) dei geni BUSCO. Riportiamo la prima sequenza e trascrittoma dell'intero genoma assemblato e annotato di S. furcifera. La bozza del genoma assemblato di S. furcifera sarà una risorsa preziosa per gli studi di interazione ecologica e virus-ospite di questo parassita.
Educazione sanitaria nella vecchiaia: risultati di uno studio trasversale tedesco.L'alfabetizzazione sanitaria è particolarmente importante per le persone anziane per mantenere o migliorare la salute residua risorse e capacità di autogestione. Lo scopo dello studio era determinare il livello di alfabetizzazione sanitaria e l'associazione tra alfabetizzazione sanitaria, fattori demografici e socioeconomici negli anziani tedeschi di età pari o superiore a 65 anni, stratificati per fascia di età. valutati tramite interviste personali assistite da computer utilizzando HLS-EU-Q47 su un campione rappresentativo della popolazione di lingua tedesca. Statistiche descrittive, analisi bivariate e modelli di regressione logistica stratificati per fascia di età sono state condotte per valutare l'alfabetizzazione sanitaria di 475 intervistati di età compresa tra 65 anni e sopra. Nel complesso, il 66,3% di tutti gli intervistati di età pari o superiore a 65 anni aveva un'alfabetizzazione sanitaria limitata. L'alfabetizzazione sanitaria limitata era particolarmente diffusa tra gli intervistati di età superiore a 76 anni (80,6%). l'alfabetizzazione sanitaria era associata alla deprivazione finanziaria (OR: 3,05; 95% CI: 1,99-4,67) e alfabetizzazione sanitaria funzionale limitata (OR: 2,16; 95% CI: 1,29-3,61). La deprivazione finanziaria era il predittore più forte di alfabetizzazione sanitaria limitata nel campione totale e stratificato per fascia di età. L'alfabetizzazione sanitaria limitata è un fenomeno frequente negli adulti tedeschi di età pari o superiore a 65 anni. La ricerca sull'alfabetizzazione sanitaria in età avanzata e sul ruolo nelle disparità di salute è urgentemente necessaria.
Ipoadiponectinemia indotta dall'obesità: le influenze opposte dei compartimenti adiposo centrale e periferico.La sostanziale riduzione della concentrazione di adiponectina tra gli individui obesi sembra dipendere dal grasso distribuzione ed è un marker di disfunzione metabolica e del tessuto adiposo Abbiamo mirato a: (i) valutare se il grasso addominale proveniente da diversi compartimenti (viscerale, addominale sottocutaneo profondo e addominale sottocutaneo superficiale) e il grasso gluteofemorale sono indipendentemente associati alla concentrazione di adiponectina nel sangue; e ( ii) indagare se l'accumulo di grasso addominale (in prossimità della circonferenza della vita) e gluteofemorale (in prossimità della circonferenza dell'anca) determina causalmente la concentrazione di adiponectina nel sangue. adulti di un anno della coorte di nascita Pelotas 1982 (n = 2.743). Per valutare la c ruolo ausale dell'accumulo di grasso addominale e gluteofemorale sulla concentrazione di adiponectina, abbiamo utilizzato la randomizzazione mendeliana e i dati di due consorzi di studi di associazione sull'intero genoma: i consorzi GIANT (n > 210 000) e ADIPOGen (n = 29 347). Nell'analisi di regressione multivariabile, tutti i depositi di grasso addominale erano associati negativamente alla concentrazione di adiponectina, specialmente grasso addominale viscerale [uomini: β = -0,24 unità standard di log adiponectina per unità standard aumento del grasso addominale; intervallo di confidenza al 95% (CI) = -0,31, -0,18; P = 8*10-13; donne: β = -0,31; 95% CI = -0,36, -0,25; P = 7*10-27), mentre il grasso gluteofemorale era associato positivamente alla concentrazione di adiponectina (uomini: β = 0,13 unità standard di log adiponectina per unità standard di aumento del grasso gluteofemorale; 95% CI = 0,03, 0,22; P \ = 0,008; donne: β = 0,24; 95% CI = 0,17, 0,31; P = 7*10-11). Nell'analisi della randomizzazione mendeliana, la circonferenza della vita geneticamente prevista era inversamente correlata alla concentrazione di adiponectina nel sangue (β = -0,27 unità standard di log adiponectina per unità standard di aumento della circonferenza della vita; 95% CI = -0,36, -0,19; P \ = 2*10-11), mentre la circonferenza dell'anca geneticamente prevista era positivamente associata alla concentrazione di adiponectina nel sangue (β = 0,17 unità standard di log adiponectina per unità standard di aumento della circonferenza dell'anca; 95% CI = 0,11, 0,24; P \ = 1*10-7). Questi risultati supportano l'ipotesi che vi sia una complessa interazione tra la distribuzione del grasso corporeo e la concentrazione di adiponectina circolante e che mentre l'ipoadiponectinemia indotta dall'obesità sembra essere principalmente attribuita all'accumulo di grasso addominale, è probabile che l'accumulo di grasso gluteofemorale eserciti un effetto protettivo.
Epidemiologia dell'infezione da tubercolosi latente tra i pazienti con e senza diabete mellito.Gli individui con diabete mellito di tipo 2 (DM) sono a maggior rischio di tubercolosi (TB) riattivazione. Vi è una scarsità di informazioni sui fattori di rischio associati all'infezione da tubercolosi latente (LTBI) nei pazienti con diabete. Abbiamo condotto uno studio osservazionale per confrontare la prevalenza e i fattori di rischio associati ai fattori LTBI negli adulti malesi con e senza DM. Quattrocentoquattro pazienti con DM e 359 pazienti con non DM presso una clinica regionale di cure primarie sono stati reclutati come partecipanti a questo studio caso-controllo. È stato eseguito il test di sensibilità alla tubercolina (TST). La presenza di LTBI è stata definita da un valore TST di 10 mm nei pazienti DM e 10 mm nel gruppo non DM. È stato utilizzato un modello di regressione logistica per identificare le variabili associate a LTBI. Non c'era alcuna differenza statisticamente significativa nei tassi di prevalenza se it tra il gruppo DM e non DM dello studio. La prevalenza di LTBI tra i pazienti con DM era del 28,5%. La percentuale di pazienti nel gruppo non DM con LTBI è stata del 29,2%. Quando è stato utilizzato un cut-off critico di 8 mm, l'odds ratio aggiustato di LTBI nei pazienti con DM era 1,88 (intervallo di confidenza 95%: 1,22-2,82). Il fumo era un fattore di rischio indipendente per LTBI indipendentemente dallo stato di DM. I livelli di HbA1c o le misurazioni antropometriche non erano associati a LTBI nei pazienti diabetici. Non vi è alcun rischio significativo di contrarre LTBI nei pazienti con DM utilizzando il cut-off TST standard di 10 mm. Tuttavia, l'utilizzo di cut-off inferiori in una popolazione DM sembra valido. Il fumo è un importante predittore di LTBI.
Banding dell'arteria polmonare assorbibile: una strategia per ridurre i reinterventi.Il bendaggio dell'arteria polmonare (PAB) rimane nell'armamentario delle tecniche per diverse anomalie cardiache congenite, ma richiede un reintervento per l'eventuale rimozione. Abbiamo cercato di valutare l'efficacia di un PAB assorbibile nell'evitare la necessità di reintervento. Dal 2003 al 2015, 45 pazienti consecutivi con un'età media di 1,6 mesi (2 giorni-11 mesi) sono stati sottoposti a posizionamento di un PAB riassorbibile con polidiossanone. In 28 pazienti (62%), la banda è stata posizionata in concomitanza alla chiusura di un difetto del setto ventricolare (VSD) e in 17 (38%), la banda era l'unica procedura per i VSD. Quattordici pazienti avevano cardiopatie aggiuntive anomalie e 9 pazienti presentavano anomalie dell'arco aortico, che sono state riparate al momento del posizionamento del PAB assorbibile. C'è stata 1 morte in ospedale. La banda è stata rimossa precocemente in 3 pazienti. Il tempo medio per il follow-up è stato di 5,2 ± ± 3,5 anni. Complessivamente, 32 dei 41 pazienti dis caricati dall'ospedale con PAB riassorbibili non hanno richiesto il reintervento sui VSD o sulla banda, con conseguente riparazione definitiva in un'unica fase del 78%. Il tempo mediano al riassorbimento della PAB assorbibile è stato di 7,2 mesi (intervallo interquartile, 5,0-10,4). La libertà dal reintervento correlato a DIV residui o ostruzione PAB è stata del 78% (95% CI: 61-87%) a 10 anni. L'uso di polidiossanone PAB assorbibili è un metodo efficace per ridurre i reinterventi per più VSD. Il loro uso dovrebbe essere incorporato nella strategia chirurgica per la riparazione dei DIV muscolari e residui.
La maggiore magnitudo dell'onda riflessa aortica spiega l'impatto del genere femminile sull'aumento della pressione aortica in un gruppo di antenati africani.Grandezza dell'onda riflessa aortica (RM) ) potrebbe non spiegare le differenze sesso-specifiche nell'aumento della pressione aortica nei caucasici. Tuttavia, le onde riflesse aortiche sono maggiori nei gruppi di discendenza africana rispetto ad altri gruppi etnici. Abbiamo determinato se RM o fattori alternativi spiegano l'impatto del sesso sull'aumento della pressione aortica ( Pa) in partecipanti di origine africana. Abbiamo valutato la funzione aortica (tonometria ad applanazione radiale, SphygmoCor) in 1.197 partecipanti alla comunità di origine africana (età ≥ 16 anni) reclutati casualmente. La separazione delle onde aortiche in avanti (Pf) e indietro (Pb) è stata eseguita assumendo un'onda di flusso triangolare aortica convalidata rispetto alle misurazioni della velocità aortica. Nel corso della vita adulta, le donne avevano un indice di aumento multivariato aggiustato (AIx) e Pa. Questo era associato a aumenti multivariati, aggiustati per età, di Pb, RM (Pb/Pf) e tempo al picco di Pf e diminuzioni del tempo del piede d'onda all'indietro; ma non aumenta in Pf. Con i regolatori, Pa era associato al genere femminile (coefficiente β = 3,81 ± 0,34), una relazione che è stata notevolmente attenuata dagli aggiustamenti per RM (coefficiente β = 1,78 ± 0,31, P < 0,0001 vs. senza aggiustamenti per RM ) e Pb (coefficiente β = 2,05 ± 0,19, P < 0,0001 rispetto a senza regolazioni per Pb), ma non mediante regolazioni per Pf, tempo al picco di Pf o tempo del piede d'onda all'indietro. Allo stesso modo, AIx è stato associato al genere femminile, una relazione che è stata notevolmente attenuata dagli aggiustamenti per RM, Pb e tempo del piede d'onda all'indietro, ma non da fattori alternativi. Contrariamente a quanto riportato in popolazioni alternative, la relazione tra aumento della pressione aortica e genere femminile nei partecipanti di origine africana è dovuta principalmente all'aumento della RM.
Origine ed evoluzione della pandemia del cancro del kiwi.Epidemie ricorrenti di cancro emorragico del kiwi (Actinidia spp. ) sono causate da Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa). Al fine di rafforzare la comprensione della struttura della popolazione, della filogeografia e delle dinamiche evolutive, abbiamo isolato Pseudomonas da kiwi coltivati e selvatici in sei province della Cina. Sulla base dell'analisi di 80 genomi di Psa sequenziati, dimostriamo che la Cina è l'origine del lignaggio pandemico, ma la diversità del ceppo in Cina è confinata a un solo clade. Al contrario, Corea e Giappone ospitano ceppi da più cladi. Eventi distinti di trasmissione indipendenti hanno segnato l'introduzione del lignaggio pandemico in Nuova Zelanda, Cile, Europa, Corea, e Giappone. Nonostante l'elevata somiglianza all'interno del genoma centrale e l'impatto minimo della ricombinazione all'interno del clade, abbiamo osservato ampie variazioni anche all'interno del singolo clade da cui è sorta la pandemia globale.
HiC-spector: una libreria di matrici per l'analisi spettrale e di riproducibilità delle mappe di contatto Hi-C.Saggi basati sulla legatura di prossimità dell'intero genoma come Hi- C hanno aperto una finestra sull'organizzazione 3D del genoma, presentando strutture di dati diverse dalle tradizionali tracce di segnale 1D. Per sfruttare la natura 2D delle mappe di contatto Hi-C, sono particolarmente utili tecniche a matrice come l'analisi spettrale Qui presentiamo HiC-spector, una raccolta di funzioni relative alla matrice per l'analisi delle mappe di contatto Hi-C. In particolare, introduciamo una nuova metrica di riproducibilità per quantificare la somiglianza tra le mappe di contatto basate sulla decomposizione spettrale. La metrica separa con successo il contatto mappe mappate da dati Hi-C provenienti da replicati biologici, pseudo-replicati e diversi tipi di cellule. Il codice sorgente in Julia e Python e la documentazione dettagliata sono disponibili su https://github. com/gersteinlab/HiC-spector. koonkiu. yan @gmail. com o mark@gersteinlab. org. I dati supplementari sono disponibili su Bioinformatica online.
Determinazione di bortezomib nei campioni API mediante HPLC: valutazione delle impurezze enantiomeriche e diastereomeriche.Una nuova cromatografia liquida ad alte prestazioni in fase normale (NP-HPLC ) è stato sviluppato per la separazione degli enantiomeri di Bortezomib (BZB) e la determinazione quantitativa dell'enantiomero (1S,2R) di BZB in campioni di ingredienti farmaceutici attivi (API). Il metodo sviluppato è stato convalidato sulla base delle linee guida della Conferenza internazionale sull'armonizzazione (ICH) e si è dimostrato accurato, preciso e robusto. La risoluzione ottenuta (RS) tra gli enantiomeri è stata superiore a 2. La curva di calibrazione per (1S,2R)-enantiomero è risultata lineare nell'intervallo di concentrazione di 0,24-5,36 mg /L con coefficiente di regressione (R2) di 0,9998. Inoltre, il limite di rilevamento (LOD) e il limite di quantificazione (LOQ) erano rispettivamente 0,052 e 0,16 mg/L. Inoltre, in questo studio, un gradiente preciso, sensibile e robusto metodo HPLC in fase inversa (RP-HPLC) d è stato sviluppato e convalidato per la determinazione di BZB nei campioni API. La risposta del rivelatore è stata lineare nell'intervallo di concentrazione di 0,26-1110,5 mg/L. I valori di R2, LOD e LOQ erano rispettivamente di 0,9999, 0,084 e 0,25 mg/L. Per entrambi i metodi NP-HPLC e RP-HPLC, tutti i valori RSD (%) ottenuti nello studio di precisione erano <1.0%. I parametri di idoneità del sistema in termini di fattore di scodamento (TF), numero di piastre teoriche (N) e RS erano TF < 2.0, N > 2.000 e RS > 2.0. Sono state studiate le prestazioni di due metodi di integrazione comuni di valle a valle e goccia perpendicolare per tracciare la linea di base tra due picchi adiacenti per la determinazione dell'impurità diastereomerica (Imp-D) nei campioni BZB-API. I risultati hanno mostrato che il metodo da valle a valle supera il metodo perpendicolare a goccia per il calcolo delle aree dei picchi Imp-D. Pertanto, per l'integrazione dei picchi è stato scelto il metodo da valle a valle.
Trasformazione genetica rapida ed efficiente del lievito oleaginoso Rhodosporidium toruloides mediante elettroporazione.L'ingegneria metabolica di Rhodosporidium toruloides, un robusto produttore di lipidi e carotenoidi, è di grande importanza per la produzione di oleochimici e carotenoidi. Tuttavia, la trasformazione genica mediata da Agrobacterium è noiosa e richiede tempo. Qui, abbiamo descritto una trasformazione genetica rapida ed efficiente di R. toruloides utilizzando l'elettroporazione con frammenti di DNA lineare e il processo è stato ottimizzato. i risultati hanno mostrato che è possibile ottenere 2 × 103 trasformanti a 0,7 kV/μg di DNA lineare utilizzando igromicina e bleomicina come marcatori di selezione dopo che le cellule competenti sono state pretrattate con 25 mM DTT e 100 mM LiAc. I nostri risultati faciliterebbero la costruzione di librerie mutanti e l'ingegneria metabolica di R. toruloides per la produzione di oleochimici e carotenoidi Abbiamo inoltre dimostrato che tutti i trasformanti sono sorti a causa di inte illegittime grazione di trasformare frammenti di DNA mediante colony PCR.
Dinamica tempo-spaziale del curculio adulto di prugne (Coleoptera: Curculionidae) basata sulla cattura di trappole con esca semiochimica nei mirtilli.Plum curculio, Conotrachelus nenuphar ( Herbst), è diventato un importante parassita dei mirtilli ad alto fusto negli Stati Uniti nordorientali. Qui, abbiamo condotto esperimenti nel 2010-2013 per confrontare l'efficacia delle trappole con esche semiochimiche per C. nenuphar rispetto ai metodi di campionamento convenzionali (con un panno) nei mirtilli, e per comprendere l'abbondanza stagionale e la distribuzione degli adulti di C. nenuphar all'interno e tra i campi di mirtilli usando queste trappole. Le trappole a piramide nera innescate con l'acido grandisoico di feromone di aggregazione di C. nenuphar e la benzaldeide volatile del frutto catturavano da tre a quattro volte più adulti delle trappole senza esca senza causare un aumento del danno alle bacche nei cespugli vicini. Il numero di tonchi adulti catturati nelle trappole è correlato a quelli sui cespugli (battendo campioni di tessuto), indicando che la trappola c onti possono prevedere l'abbondanza di C. nenuphar nel campo. All'inizio della stagione, le trappole poste a 20 m dai bordi dei campi vicino a una foresta catturavano un numero maggiore di C. nenuphar rispetto alle trappole poste a distanze maggiori, suggerendo il movimento di punteruoli svernati dai campi esterni. Utilizzando una rete di cattura su più campi in un'azienda agricola biologica, abbiamo trovato prove dell'aggregazione di C. nenuphar in "punti caldi"; all'inizio della stagione, i numeri di C. nenuphar nelle trappole erano più alti in mezzo ai campi e c'era una correlazione tra questi numeri e la distanza dalla foresta nel 2013, ma non nel 2012. Questi risultati mostrano che le trappole con esca semiochimica sono efficaci in catturare gli adulti di C. nenuphar nei mirtilli e che queste trappole dovrebbero essere posizionate all'interno dei campi preferibilmente, ma non esclusivamente, vicino ad habitat boschivi per massimizzare la loro efficacia.
NeBcon: previsione della mappa di contatto delle proteine utilizzando l'addestramento della rete neurale abbinato a classificatori Bayes ingenui.Recenti esperimenti CASP hanno assistito a progressi entusiasmanti sulla piegatura di grandi dimensioni non -proteine humungous con l'assistenza di predizioni di contatto basate sulla coevoluzione. Il successo è tuttavia aneddotico dovuto alla necessità di metodi di previsione di contatto per l'alto volume di omologhi di sequenza che non sono disponibili per la maggior parte dei target proteici non humungous. di metodi efficienti in grado di generare mappe di contatto bilanciate e affidabili per diversi tipi di target proteici è essenziale per aumentare il tasso di successo della previsione ab initio della struttura proteica Abbiamo sviluppato una nuova pipeline, NeBcon, che utilizza il teorema del classificatore naïve Bayes (NBC) per combinare otto metodi di contatto all'avanguardia che sono costruiti da co-evoluzione e approcci di apprendimento automatico. Le probabilità a posteriori del modello NBC vengono quindi addestrate con int caratteristiche strutturali rinsic attraverso l'apprendimento della rete neurale per la previsione della mappa di contatto finale. NeBcon è stato testato su 98 proteine non ridondanti, il che migliora del 22% l'accuratezza del miglior predittore meta-server basato sulla coevoluzione; l'entità del miglioramento aumenta al 45% per gli obiettivi hard che mancano di sequenza e omologhi strutturali nei database. L'analisi dettagliata dei dati ha mostrato che il principale contributo al miglioramento è dovuto alla combinazione NBC ottimizzata delle informazioni complementari provenienti sia dalla coevoluzione che dalle previsioni di apprendimento automatico. L'addestramento della rete neurale aiuta anche a migliorare l'accoppiamento della probabilità a posteriori del NBC e le caratteristiche strutturali intrinseche, che sono risultate particolarmente importanti per le proteine che non hanno un numero sufficiente di sequenze omologhe per derivare profili di coevoluzione affidabili. Il server in linea e il pacchetto autonomo del programma sono disponibili all'indirizzo http://zhanglab. ccmb. med. umich. edu/NeBcon/. zhng@umich. edu. I dati supplementari sono disponibili su Bioinformatica online.
Sirt3 protegge i neuroni dopaminergici dallo stress ossidativo mitocondriale.L'aumento dipendente dall'età dello stress ossidativo mitocondriale è ampiamente ipotizzato come uno dei principali fattori alla base della perdita di substantia nigra pars compacta (SNc) neuroni dopaminergici nella malattia di Parkinson (PD). Tuttavia, i collegamenti meccanicistici tra invecchiamento e stress ossidativo non sono ben compresi. Sirtuin-3 (Sirt3) è una deacetilasi mitocondriale che potrebbe mediare questa connessione. Infatti, la delezione genetica di Sirt3 aumenta lo stress ossidativo e diminuisce il potenziale di membrana dei mitocondri nei neuroni dopaminergici SNc. Questo cambiamento è attribuibile all'aumento dell'acetilazione e alla diminuzione dell'attività della superossido dismutasi di manganese (MnSOD). Mutagenesi sito diretta della lisina 68 in glutammina (K68Q), mimando acetilazione, diminuzione dell'attività MnSOD nei neuroni dopaminergici SNc, mentre la mutagenesi della lisina 68 in arginina (K68R), mimando la deacetilazione, aumento dell'attività. L'oduzione di K68R MnSOD ha salvato lo stato redox mitocondriale e il potenziale di membrana dei neuroni dopaminergici SNc da knockout Sirt3. Inoltre, la delezione di DJ-1, che aiuta a orchestrare le difese ossidanti nucleari e Sirt3 nei topi, ha portato a una chiara perdita legata all'età dei neuroni dopaminergici SNc. Infine, l'acetilazione K68 di MnSOD era significativamente aumentata nel SNc dei pazienti con PD. Nel loro insieme, i nostri studi suggeriscono che un declino legato all'età nella funzione protettiva di Sirt3 è un fattore importante alla base dell'aumento dello stress ossidativo mitocondriale e della perdita di neuroni dopaminergici SNc nel PD.
Confronto randomizzato di stent polimerici bioriassorbibili a eluizione di sirolimus e biolimus: studio di tomografia a coerenza ottica SORT-OUT VII.Per mostrare la non inferiorità di dallo stent a eluizione di farmaco Orsiro (DES) con uno spessore di 67 o 87 µm e a rilascio di sirolimus allo stent Nobori a rilascio di biolimus dello spessore di 122 µm per quanto riguarda le dimensioni del lume del vaso al di fuori dello stent al follow-up di 13 mesi. allo studio SORT-OUT VII, un confronto prospettico, randomizzato 1:1, dei due stent in pazienti con malattia coronarica stabile o sindrome coronarica acuta. La tomografia a coerenza ottica è stata acquisita dopo intervento coronarico percutaneo e dopo 13 mesi di follow-up. Il sottostudio è stato potenziato per accedere alla non inferiorità (Δ = 0,60 mm2) del DES Orsiro rispetto al DES Nobori per l'endpoint primario del lume extra dello stent medio (ESL), cioè il lume del vaso al di fuori dello stent a 13 mesi di follow- Abbiamo randomizzato 124 pazienti a Orsiro (n = 60) o Nobori (n =64). A causa di una differenza nell'intervallo di confidenza unilaterale al 95% di 0,26 mm2, ma aumentato a 0,82 mm2 dopo un'appropriata trasformazione logaritmica, non si poteva rifiutare che Orsiro avesse superato il limite di non inferiorità. Testando la superiorità, Orsiro ha avuto un ESL medio significativamente maggiore al follow-up (Orsiro: 0,11 mm2 [0,02;0,30] mm2, Nobori: 0,03 mm2 [0,00;0,17] mm2, P = 0,04). La copertura del puntone dello stent era, Orsiro: 97,6% [93,8;99,4]% e Nobori: 96,3% [90,5;98,6]% (P = 0,13). Orsiro DES aveva un ESL medio significativamente maggiore al follow-up e non si poteva escludere che Orsiro avesse superato il limite di non inferiorità. Nobori DES aveva una distribuzione più eterogenea della neointima ma la copertura del puntone dello stent non differiva significativamente tra i due stent.
Chiarimento del potenziale metanogeno delle comunità microbiche del giacimento di carbone modificato con acidi grassi volatili.Il potenziale per la moderna metanogenesi dei bacini carboniferi è stato valutato utilizzando l'acqua di formazione dell'Illinois Bacino, bacino del fiume Powder e giacimento di gas di Cook Inlet come inoculi per incubazioni complete di nutrienti modificati con acidi grassi C1-C5 come presunti intermedi formati durante la biodegradazione anaerobica del carbone Invece della prevista rapida mineralizzazione di questi substrati, la metanogenesi è stata eccessivamente lenta (∼1 μmol giorno-1), dopo lunghi periodi di ritardo (>100 giorni) e le rese di metano in genere non hanno raggiunto i livelli stechiometricamente previsti. Tuttavia, un microarray genico ha confermato il potenziale per un'ampia varietà di funzioni microbiologiche, inclusa la metanogenesi, in tutti i siti. Le incubazioni di Cook Inlet producevano metano a una velocità relativamente rapida quando modificate con butirrato (r = 0,98; p = 0,001) o valerato (r = 0,84; p = 0.04), un risultato che era significativamente correlato con il numero di sonde di sequenza genica mcr positive dal microarray genico funzionale ed era coerente con il rilevamento in situ di acidi alcanoici C4-C5. Questa scoperta ha evidenziato il ruolo della sintrofia per la biodegradazione della lignite più morbida e del carbone subbituminoso in questa formazione, ma la metanogenesi dai carboni subbituminosi e bituminosi più duri negli altri campi era meno evidente. Concludiamo che la metanogenesi del carbone probabilmente non è limitata dall'intrinseca mancanza di potenziale metabolico, dalla presenza di accettori di elettroni alternativi o dalla mancanza di nutrienti disponibili, ma più probabilmente è limitata dall'intrinseca recalcitranza del carbone stesso.
La genomica comparativa di Rhodococcus equi I plasmidi di virulenza indicano l'evoluzione guidata dall'ospite dell'isola di patogenicità vap.Il plasmide di virulenza coniugativa è un componente chiave del Rhodococcus equi accessorio essenziale per la patogenesi. Sono stati identificati tre tipi di plasmidi di virulenza associati all'ospite: le varianti circolari pVAPA equina e pVAPB suino, e la pVAPN lineare trovata negli isolati bovini (ruminanti). Recentemente abbiamo caratterizzato il pangenoma di R. equi (Anastasi E, et al. 2016. Pangenoma e analisi filogenomica dell'actinobacterium patogeno Rhodococcus equi. Genome Biol Evol. 8:3140-3148. ) e riportiamo qui l'analisi comparativa dei genomi del plasmide di virulenza. I plasmidi all'interno di ciascun tipo associato all'ospite erano molto simili nonostante le loro origini diverse. La variazione è stata spiegata da polimorfismi a singolo nucleotide sparsi e indel a nucleotide corto, mentre indel più grandi, principalmente nella regione di plasticità vicino al vap p sottotipi genomici di plasmidi definiti dall'isola di athogencity (PAI). Solo uno dei plasmidi analizzati, di tipo pVAPN, era eccezionalmente divergente a causa dell'accumulo di indel nella struttura portante della casa. Ogni tipo di plasmide associato all'ospite portava un PAI unico che differiva nel complemento del gene vap, suggerendo un'evoluzione animale specifica dell'ospite della famiglia multigene vap. All'interno di ciascun tipo di plasmide associato all'ospite è stata osservata la completa conservazione del PAI vap. Sia la diversità dei tipi di plasmide associati all'ospite che la clonalità di specifiche combinazioni di tipo genomico cromosomico-plasmide sono state osservate all'interno dello stesso sottoclade filogenomico di R. equi. I nostri dati indicano che la forte conservazione complessiva dei plasmidi di virulenza associati all'ospite R. equi è il risultato combinato della selezione guidata dall'ospite, del trasferimento laterale tra i ceppi e della diffusione geografica dovuta agli scambi internazionali di bestiame.
Vedolizumab induce la guarigione della mucosa a lungo termine in pazienti con malattia di Crohn e colite ulcerosa.Vedolizumab ha dimostrato efficacia nella malattia infiammatoria intestinale [IBD] , ma la guarigione della mucosa a lungo termine nella malattia di Crohn [CD], così come l'incidenza di neoplasie del colon-retto in IBD, tra i pazienti trattati con vedolizumab non sono state studiate. Abbiamo mirato a documentare la guarigione della mucosa ed esplorare il rischio di malattia del colon-retto neoplasia con terapia di mantenimento con vedolizumab. La colonscopia di sorveglianza è stata programmata prospetticamente per i pazienti con colite ulcerosa [CU] o MC di lunga data presso un centro di riferimento terziario, nella fase di estensione in aperto (vedolizumab 300 mg per via endovenosa [IV] ogni 4 settimane) dei Gemelli studi [GEMINI LTS, numero di studio NCT00790933]. Mayo score ≤ 1 o scomparsa dell'ulcera [in CD] è stata definita come guarigione della mucosa. Le biopsie mirate sono state classificate per infiammazione e displasia. Di 68 pazienti [29 CD/39 UC] trattati per ≥ 1anno [mediana 3,2 anni, range 1,1-6,1], 58 [24 CD/34 UC] sono stati monitorati endoscopicamente. La guarigione endoscopica durevole corretta dall'imputazione dei non responder è stata trovata in 7/24, 29% [CD] e 17/34, 50% [UC]. La guarigione istologica e della mucosa combinata è stata osservata in 5/24 [CD] e 11/34 [UC] di quelli con guarigione endoscopica. La displasia di basso grado è stata rilevata nel 10% dei pazienti e la displasia di alto grado nel campione di resezione di un paziente con displasia di basso grado dimostrata dalla biopsia. La guarigione endoscopica e istologica a lungo termine è stata osservata in una percentuale di pazienti trattati con vedolizumab a lungo termine. Il rischio di displasia con vedolizumab merita ulteriori studi.
L'asse STAT3/Twist bloccato da 8-Bromo-7-metossicrisina inibisce la staminalità delle cellule simili alle cellule staminali del cancro originate da cellule SMMC-7721.Il trasduttore di segnale e attivatore della trascrizione 3 (STAT3) è un membro della famiglia dei fattori trascrizionali citoplasmatici latenti che potrebbero regolare la proliferazione, la sopravvivenza e lo sviluppo cellulare. È stato riportato che Twist è un gene bersaglio di STAT3 e STAT3/Twist segnalazione svolge un ruolo importante nella regolazione del progresso del cancro. Qui, per esplorare se l'8-bromo-7-metossicrisina (BrMC) inibisce le proprietà delle cellule staminali del cancro al fegato (LCSLC) tramite l'interruzione della segnalazione STAT3/Twist, abbiamo coltivato cellule SMMC-7721 in vitro e ha valutato gli effetti di BrMC sulla staminalità degli sferoidi determinando la capacità e la migrazione di formazione di sfere. I risultati del test di formazione di sfere hanno mostrato una diminuzione dipendente dalla concentrazione della capacità di formazione di sfere in LCSLC (P < 0,05) trattati con diversi concentrazioni di BrM C. I risultati dei saggi di guarigione delle ferite hanno dimostrato un declino dipendente dalla concentrazione nella migrazione cellulare di LCSLC trattati con diverse concentrazioni di BrMC. Inoltre, i livelli di CD133, CD44 e ALDH1 erano diminuiti nelle LCSLC trattate con BrMC. Il trattamento con diverse concentrazioni di BrMC ha anche ridotto le espressioni delle proteine p-STAT3 e Twist1. L'effetto di BrMC è stato sostanzialmente potenziato dal co-trattamento con JSI-124, un inibitore specifico di STAT3. L'espressione ectopica di Twist1 ha attenuato gli effetti inibitori di BrMC sulla formazione delle sfere, sulla migrazione e sull'espressione dei marcatori nelle LCSLC. Tuttavia, non ha avuto alcun effetto sull'espressione di p-STAT3 nelle LCSLC. Questi risultati hanno dimostrato che BrMC inibisce la staminalità delle LCSLC originate dalla linea cellulare SMMC-7721 inibendo l'asse del segnale STAT3/Twist.
GfsA è una β1,5-galattofuranosiltransferasi coinvolta nella biosintesi della catena laterale del galattofurano del galattomannano di tipo fungino in Aspergillus fumigatus.In precedenza, abbiamo ha riferito che GfsA è una nuova galattofuranosiltransferasi coinvolta nella biosintesi dell'O-glicano, nel corretto mantenimento della morfologia fungina, nella formazione di conidi e nella resistenza antifungina in Aspergillus nidulans e A. fumigatus (Komachi Y et al. , 2013. GfsA codifica una nuova galattofuranosiltransferasi coinvolta nella biosintesi dell'antigene galattofuranosio dell'O-glicano in Aspergillus nidulans e Aspergillus fumigatus. Mol. Microbiol. 90:1054-1073). Nel presente articolo, per ottenere una comprensione approfondita delle funzioni enzimatiche di GfsA in A. fumigatus (AfGfsA), abbiamo stabilito un test in vitro per misurare l'attività della galattofuranosiltransferasi utilizzando AfGfsA purificato, UDP-α-d-galattofuranosio come donatore di zucchero e p-nitrofenil-β-d-galattofuranoside come substrato accettore. Le analisi LC/MS, 1H-NMR e di metilazione dei prodotti enzimatici di AfGfsA hanno rivelato che questa proteina ha la capacità di trasferire il galattofuranosio alla posizione C-5 del residuo -galattofuranosio tramite un legame. AfGfsA richiede un catione bivalente di manganese per la massima attività e consuma UDP-α-d-galattofuranosio come donatore di zucchero. Il suo intervallo di pH ottimale è 6,5-7,5 e il suo intervallo di temperatura ottimale è 20-30°C. Le analisi 1H-NMR, 13C-NMR e di metilazione del galattomannano di tipo fungino estratto dal ceppo ∆AfgfsA hanno rivelato che AfGfsA è responsabile della biosintesi del β1,5-galattofuranosio nella catena laterale del galattofurano del galattomannano di tipo fungino. Sulla base di questi risultati, concludiamo che AfGfsA agisce come un UDP-α-d-galattofuranosio: β-d-galattofuranoside β1,5-galattofuranosiltransferasi nella via biosintetica dei galattomannani.
Misurare il successo nella formazione sanitaria globale: dati da 14 anni di una borsa di studio post-dottorato in malattie infettive e medicina tropicale.Nella medicina accademica moderna, in particolare in Nei campi delle malattie infettive e della salute globale, gli aspiranti medici-scienziati spesso aspettano anni prima di raggiungere l'indipendenza come ricercatori di base, traslazionali e clinici. Questo studio ha impiegato metodi misti per valutare il successo del Burroughs Wellcome Fund/American Society for Tropical Medicine and Hygiene (BWF/ASTMH) borsa di studio post-dottorato sulla salute globale nella promozione dell'indipendenza scientifica Abbiamo esaminato i dati quantitativi ottenuti dal National Institutes of Health (NIH) e i dati qualitativi forniti dall'ASTMH e dai partecipanti al programma per valutare il successo dei tirocinanti BWF/ASTMH nel guadagnare NIH borse di studio, pubblicazione di manoscritti e acquisizione di posizioni di facoltà. Abbiamo anche calcolato il ritorno sull'investimento (ROI) associato al programma di formazione per div. iding costi diretti delle borse di ricerca NIH assegnate ai tirocinanti dai costi diretti investiti dalla borsa di studio BWF/ASTMH. Quarantuno tirocinanti hanno ricevuto borse di studio tra il 2001 e il 2015. Entro 3 anni dal completamento delle borse, 21 su 35 (60%) hanno ricevuto premi per lo sviluppo della carriera e, entro 5 anni, 12 su 26 (46%) hanno ricevuto premi per la ricerca indipendente. Complessivamente, 22 su 35 (63%) hanno ricevuto 1 o più premi di ricerca. I destinatari BWF/ASTMH con almeno 3 anni di dati di follow-up erano coautori di una media di 36 pubblicazioni (range, 2-151) e 29 su 35 (82%) hanno ricoperto posizioni accademiche. Il ritorno sull'investimento è stato complessivo di 11,9 e 31,8 per le borse di studio assegnate tra il 2001 e il 2004. Tra il 2001 e il 2015, il programma di formazione post-dottorato BWF/ASTMH ha facilitato con successo il progresso verso l'indipendenza scientifica. Questo modello di programma sottolinea l'importanza di una formazione post-dottorato personalizzata come ponte verso i premi NIH e l'autonomia professionale.
Insufficienza valvolare atrioventricolare comune durante palliazione del ventricolo singolo†.Per determinare il rischio di insufficienza valvolare atrioventricolare (intervento valvolare o rigurgito moderato o maggiore) durante il vita dei pazienti con fisiologia del singolo ventricolo e valvola atrioventricolare comune. I dati dei pazienti sono stati estratti da un registro binazionale esistente basato sulla popolazione. È stata intrapresa una revisione retrospettiva delle loro cartelle cliniche per determinare l'incidenza di riparazione/sostituzione della valvola atrioventricolare o moderata o maggiore rigurgito. Da un registro di 1468 sopravvissuti a Fontan, sono stati identificati 136 pazienti con valvola atrioventricolare comune. Il follow-up ecocardiografico completo era disponibile per 114 pazienti. La durata mediana del follow-up era di 10,2 anni (intervallo interquartile 5-15 anni). La sopravvivenza a venticinque anni e la libertà dall'insufficienza di Fontan sono state rispettivamente del 94% [intervallo di confidenza (CI) al 95%, 88-100%] e del 74% (IC al 95%, 64-87%). -otto pazienti sono stati sottoposti a 24 riparazioni iniziali e 4 sostituzioni. I 24 pazienti sottoposti a riparazione successivamente hanno avuto bisogno di 6 riparazioni, 2 sostituzioni e 8 hanno avuto un rigurgito moderato o maggiore all'ultimo follow-up. La libertà a quattro anni dal fallimento della riparazione della valvola atrioventricolare è stata del 50% (95% CI, 34-75%). Altri 30 pazienti hanno sviluppato un rigurgito della valvola atrioventricolare moderato o maggiore (6 New York Heart Association ≥3, 10 fallimenti di Fontan, 0 decessi). L'incidenza cumulativa dell'endpoint composito di insufficienza valvolare atrioventricolare a 28 anni è stata del 62% (95% CI, 49-74%). I pazienti con fisiologia del ventricolo singolo e valvola atrioventricolare comune sperimentano un continuo declino della funzione valvolare. La maggior parte dei pazienti manifesta insufficienza valvolare nei primi 30 anni di vita.
Il butirrato di sodio salva le cellule dopaminergiche dalla deregolazione trascrizionale indotta dall'alfa-sinucleina e dai danni al DNA.L'alfa-sinucleina (aSyn) è considerata una delle principali colpevoli in Fisiopatologia della malattia di Parkinson (PD). Tuttavia, la precisa funzione molecolare della proteina rimane sfuggente. Prove recenti suggeriscono che aSyn può svolgere un ruolo nella regolazione della trascrizione, probabilmente modulando lo stato di acetilazione degli istoni. Il nostro studio mirava a valutare l'impatto di wild-type (WT) e mutante A30P aSyn sull'espressione genica, in un modello di cellula neuronale dopaminergica, e decifrare i potenziali meccanismi alla base della deregolazione trascrizionale mediata da aSyn Abbiamo eseguito analisi dell'espressione genica utilizzando il sequenziamento dell'RNA in cellule mesencefaliche umane di Lund (LUHMES) che esprimono livelli endogeni (di controllo) o aumentati di WT o A30P aSyn. Rispetto alle cellule di controllo, le cellule che esprimono entrambe le varianti di aSyn hanno mostrato forti cambiamenti nell'espressione di diversi geni, in includendo la downregulation dei principali geni coinvolti nella riparazione del DNA. WT aSyn, a differenza di A30P aSyn, ha promosso il danno al DNA e aumentato i livelli di p53 fosforilata. Nelle cellule neuronali dopaminergiche, l'aumento dell'espressione di aSyn ha portato a livelli ridotti di istone 3 acetilato. È importante sottolineare che il trattamento con butirrato di sodio, un inibitore dell'istone deacetilasi (HDACi), ha salvato il danno al DNA indotto da WT aSyn, probabilmente tramite sovraregolazione dei geni coinvolti nella riparazione del DNA. Nel complesso, i nostri risultati forniscono informazioni nuove e avvincenti sui meccanismi associati alla neurotossicità di aSyn nelle cellule dopaminergiche, che potrebbero essere migliorate con un HDACi. Gli studi futuri saranno cruciali per convalidare ulteriormente questi risultati e definire nuovi possibili bersagli per l'intervento nel PD.
Impatto dell'assenza prolungata di basse temperature sui modelli di eclosione degli adulti del moscerino della frutta del ciliegio occidentale (Diptera: Tephritidae).Moscerino della frutta del ciliegio occidentale, Rhagoletis indifferens (Curran) (Diptera: Tephritidae), è un grave parassita delle ciliegie (Prunus spp. ) nel Pacifico nord-occidentale degli Stati Uniti. Ricerche precedenti suggeriscono che è improbabile che R. indifferens si stabilisca nelle aree commerciali di produzione di ciliegie in California e nelle zone tropicali mercati di esportazione perché le temperature fredde, inferiori a 5 ° C, in quelle regioni sembrano insufficienti per completare la diapausa. Tuttavia, non è chiaro come l'assenza prolungata di esposizione al freddo influenzi la cessazione della diapausa in R. indifferens. Qui, abbiamo esaminato questa domanda esponendo R. indifferens pupe per 40 settimane a condizioni temperate e tropicali simulate di 23 o 26°C, 40 o 80% UR e un fotoperiodo di 16:8 o 12:12 (L:D) h. Schemi di eclosione tra gruppi di mosche nelle quattro condizioni non differiva Per tutti i gruppi, volare eclosio n da pupe non esposte al freddo hanno mostrato una distribuzione bimodale. Il primo picco maggiore, che comprendeva il 3,2% dell'emergenza totale della mosca, si è verificato a 1-10 settimane. Il secondo picco maggiore, che comprende il restante 96,8%, si è verificato con una modalità di 30 settimane. Sulla base delle risposte a nessuna esposizione a freddo e freddo (3 ± 1.5 °C), c'erano tre distinti gruppi di diapausa pupale: il primo gruppo di eclosione era probabilmente pupe non in diapausa; il secondo gruppo di eclosione era probabilmente in diapausa delle pupe; un terzo gruppo che è rimasto vitale ma non ha prodotto adulti dopo 40 settimane può rappresentare pupe a dormienza prolungata. Suggeriamo che l'eclosione degli adulti dopo una prolungata assenza di esposizione al freddo debba essere incorporata in modelli per il potenziale insediamento di mosche in climi caldi.
Le alte velocità del vento impediscono la formazione di una distinta comunità di batterioneuston nel microstrato della superficie del mare.Il microstrato della superficie del mare (SML) al confine tra l'atmosfera e l'idrosfera rappresentano un habitat impegnativo per i batteri. La velocità del vento è un fattore cruciale ma poco studiato per la sua integrità fisica. L'aumento del carico atmosferico di CO2, come suggerito per scenari climatici futuri, potrebbe agire in particolare su questo habitat all'interfaccia aria-mare. Abbiamo studiato l'effetto dell'aumento della velocità del vento e dei diversi livelli di pCO2 sulle comunità microbiche SML in un tunnel delle onde del vento, che offriva il vantaggio di una bassa variabilità spaziale e temporale. Abbiamo scoperto che l'arricchimento di batteri nel SML si è verificato esclusivamente a una velocità del vento U10 di ≤5,6 m s-1 nel tunnel e ≤4,1 m s-1 nel Mar Baltico. Livelli elevati di pCO2 hanno ulteriormente intensificato l'arricchimento batterico nell'SML durante la bassa velocità del vento. Inoltre, la bassa velocità del vento e la pCO2 hanno indotto la formazione di o f una comunità batterica distintiva come rivelata dalle impronte digitali del gene 16S rRNA e ha influenzato la presenza o l'assenza di singole unità tassonomiche all'interno del LMS. Concludiamo che la stabilità fisica dell'SML al di sotto di una soglia di velocità del vento specifica del sistema induce comunità batteriche specifiche nell'SML che comportano forti implicazioni per il funzionamento dell'ecosistema a causa di impatti provocati dal vento sulle proprietà dell'habitat, sullo scambio di gas e sui processi di ciclo della materia.
Tossicità del Thiamethoxam ed effetti sul comportamento di consumo in Orius insidiosus (Hemiptera: Anthocoridae) su Soy.Residui di neonicotinoidi possono essere presenti nel tessuto vegetativo della soia, preda insetti e tessuti dei fiori, rendendoli potenzialmente tossici per gli impollinatori e i nemici naturali. Le informazioni di base sulla tossicità dei neonicotinoidi per gli insetti utili diversi dagli impollinatori attraverso molteplici vie di esposizione agli insetticidi sono limitate. Gli obiettivi di questo studio erano 1) valutare la tossicità di thiamethoxam al predatore hemipteran, Orius insidiosus Say, esposto a residui attraverso il tessuto vegetativo trattato e prede di insetti, e 2) per valutare l'effetto del thiamethoxam sull'abbondanza di questa specie predatore nei campi di soia. I predatori sono stati esposti al thiamethoxam nelle foglie di soia e Aphis glycines Matsumura utilizzando un saggio biologico sistemico. L'abbondanza del predatore è stata valutata in campi trattati con semi di thiamethoxam durante due diversi così ybean stagioni. I nostri risultati indicano che le concentrazioni richieste per uccidere >50% degli insetti valutati erano superiori alle concentrazioni che è probabile che gli insetti incontrino sul campo. Il consumo di A. glycines da parte di O. insidiosus è stato influenzato a 10 ng/ml e 5 ng/ml di thiamethoxam a 24 h di valutazione. Si è verificata una mortalità significativa per O. insidiosus a 24 ore dopo l'esposizione ad afidi trattati con thiamethoxam a queste concentrazioni. Nei campi di soia non sono state riscontrate differenze significative nel numero di O. insidiosus tra gli appezzamenti trattati con thiamethoxam e il controllo. Il thiamethoxam può avere effetti significativi sui predatori se O. insidiosus si nutre di tessuto vegetativo precoce di soia o di prede contaminate. Questi risultati suggeriscono che la compatibilità del thiamethoxam con i programmi IPM per A. glycines necessita di un'ulteriore valutazione.
Marker sierici candidati nella malattia di Crohn precoce: predittori del decorso della malattia.Più della metà dei pazienti con malattia di Crohn [MC] si sviluppa complicanze della malattia che richiedono una terapia medica aggressiva o un intervento chirurgico nel tempo. Tuttavia, la previsione del decorso della malattia e della risposta al trattamento rimane difficile. Abbiamo quindi identificato analiti sierici distintivi associati all'attività e al decorso della malattia in pazienti non trattati di nuova diagnosi al momento della presentazione e durante il loro follow-up. uno studio pilota, un'analisi immunologica multipla su 36 marcatori è stata eseguita sul siero di 20 pazienti affetti da CD al momento della diagnosi primaria dopo valutazione endoscopica. I 12 marcatori più potenti associati all'attività della malattia, al fenotipo e al decorso sono stati analizzati in una coorte consecutiva di 66 Pazienti con CD alla diagnosi e al follow-up [n = 39]. Un gruppo di controllo sano [n = 20] è stato incluso come riferimento. I pazienti con CD avevano livelli basali più elevati di sTNF-R2 [ p = 0.001], sIL-2R [p = 0.0001] e MMP-1 [p = 0.001] rispetto ai controlli sani. Le misurazioni seriali hanno rivelato che questi tre analiti sono diminuiti in modo statisticamente significativo dal livello di base durante la remissione ed erano alti durante l'esacerbazione. Durante la remissione è stato riscontrato un notevole calo dei livelli di sTNF-R1, con livelli inferiori di 6,7 volte rispetto ai controlli sani [p = 0,015]. I pazienti che non hanno risposto al trattamento iniziale con prednisone avevano livelli basali più elevati di sTNF-R2 [p = 0,001]. I pazienti che hanno manifestato recidive durante il follow-up avevano livelli basali di sTNF-R2 e VCAM inferiori rispetto ai pazienti con remissione di lunga durata. In un'ampia coorte di pazienti con CD non trattati di nuova diagnosi, abbiamo identificato marcatori sierici candidati [sTNF-R1, sTNF-R2, sIL-2R e MMP-1] associati all'attività della malattia. Inoltre, sTNF-R2 è stato associato alla risposta al prednisone e, insieme al VCAM, alla remissione di lunga durata.
annotatr: genomic region in context.L'analisi dei dati di sequenziamento di nuova generazione spesso si traduce in un elenco di regioni genomiche. Queste possono includere CpG differenzialmente metilati /regioni, siti di legame del fattore di trascrizione, regioni interagenti della cromatina o SNP associati a GWAS, tra gli altri. Un passaggio comune dell'analisi consiste nell'annotare tali regioni genomiche in annotazioni genomiche (promotori, esoni, potenziatori, ecc. ). Gli strumenti esistenti sono limitati da una mancanza di fonti di annotazione e opzioni flessibili, il tempo necessario per annotare le regioni, una mappatura uno a uno artificiale regione-annotazione, una mancanza di opzioni di visualizzazione per riassumere facilmente i dati o una loro combinazione. Pacchetto bioconduttore per riassumere e tracciare in modo flessibile e rapido annotazioni di regioni genomiche. Il pacchetto annotatr riporta tutte le intersezioni di regioni e annotazioni, fornendo una migliore comprensione del contesto genomico delle regioni. Una varietà di grafici le funzioni sono implementate per tracciare facilmente i dati numerici o categoriali associati alle regioni attraverso le annotazioni e attraverso le intersezioni di annotazioni, fornendo informazioni su come le caratteristiche delle regioni differiscono tra le annotazioni. Dimostriamo che annotatr è fino a 27 volte più veloce dei pacchetti R comparabili. Nel complesso, annotatr consente un'interpretazione biologica più ricca degli esperimenti. http://bioconductor. org/packages/annotatr/ e https://github. com/rcavalcante/annotatr. rcavalca@umich. edu. I dati supplementari sono disponibili su Bioinformatica online.
Sottotipi di disturbo depressivo come predittori di obesità negli adulti statunitensi: moderazione per razza/etnia.Abbiamo confrontato l'importanza relativa del disturbo depressivo maggiore atipico ( Abbiamo esaminato i dati di 17.787 adulti inizialmente non obesi nel National Epidemiological Survey on Alcohol and Related Conditions onde 1 (2001-2002) e 2 (2004-2005) che erano rappresentative della popolazione degli Stati Uniti. I sottotipi di disturbi depressivi nel corso della vita sono stati determinati utilizzando un'intervista strutturata e gli esiti dell'obesità sono stati calcolati dall'altezza e dal peso auto-riferiti. MDD atipico ( odds ratio (OR) = 1,68, intervallo di confidenza (CI): 1,43, 1,97; P < 0,001) e disturbo distimico (OR = 1,66, IC 95%: 1,29, 2,12; P < 0,001) erano più forti predittori di obesità incidente rispetto a MDD non atipici (OR = 1.11, IC 95%: 1,01, 1,22; P = 0.027) e nessuna storia di disturbo depressivo. MDD atipico (B = 0,41 (errore standard, 0,15); P = 0,007) era un predittore più forte di aumenti dell'indice di massa corporea rispetto al disturbo distimico (B = -0,31 (errore standard, 0,21); P = 0,142 ), MDD non atipico (B = 0,007 (errore standard, 0,06); P = 0,911) e nessuna storia di disturbo depressivo. La razza/etnia era un moderatore; MDD atipico era un predittore più forte di obesità incidente negli ispanici/latinos (OR = 1,97, IC 95%: 1,73, 2,24; P < 0,001) rispetto ai bianchi non ispanici (OR = 1,54, IC 95%: 1,25, 1.91; P < 0.001) e neri (OR = 1.72, IC 95%: 1.31, 2.26; P < 0.001). Gli adulti statunitensi con MDD atipico sono particolarmente a rischio di aumento di peso e obesità, e gli ispanici/latini possono essere particolarmente vulnerabili alle conseguenze obesogeniche delle depressioni.
Controllo del trasporto del glutammato da parte del potassio extracellulare: basi per un feedback negativo sulla trasmissione sinaptica.Il glutammato e il K+, entrambi rilasciati durante l'attivazione neuronale, devono essere strettamente regolato per garantire un'accurata trasmissione sinaptica. Il glutammato extracellulare e il K+ ([K+]o) vengono rapidamente assorbiti dai trasportatori del glutammato e dai trasportatori o dai canali del K+, rispettivamente. Il trasporto del glutammato include lo scambio di un glutammato, 3 Na+ e un protone , in cambio di un K +. Questo efflusso di K + consente al sito di legame del glutammato di riorientarsi nella posizione rivolta verso l'esterno e avviare un nuovo ciclo di trasporto. Qui, dimostriamo la sensibilità del processo di trasporto ai cambiamenti di [K +] o. Aumentando [K +] o nel range fisiologico ha avuto un'azione inibitoria immediata e reversibile sui trasportatori del glutammato. Questa inibizione del trasportatore K+-dipendente è stata rivelata mediante microspettrofluorimetria negli astrociti primari e patch-clamp a cellule intere nel brai acuto n fette e cellule HEK293 che esprimono trasportatori di glutammato. Precedenti studi hanno dimostrato che l'inibizione farmacologica dei trasportatori del glutammato riduce la trasmissione neuronale tramite lo spillover extrasinaptico del glutammato e la successiva attivazione dei recettori metabotropici del glutammato (mGluRs). Qui, dimostriamo che l'aumento di [K+]o provoca anche una diminuzione della frequenza neuronale mEPSC, che è prevenuta dall'inibizione del gruppo II mGluR. Questi risultati evidenziano un nuovo meccanismo di feedback negativo fisiologico precedentemente non segnalato in cui gli aumenti di [K+]o inibiscono i trasportatori del glutammato, svelando un nuovo meccanismo per la modulazione dell'attività sinaptica dipendente dall'attività.
Analisi dei test rapidi del virus dell'immunodeficienza umana falsi negativi eseguiti sul fluido orale in 3 studi di ricerca clinica internazionale.The OraQuick Advance Rapid HIV-1/ 2 Test è un test point-of-care in grado di rilevare gli anticorpi specifici del virus dell'immunodeficienza umana (HIV) nel sangue e nel fluido orale. Per comprendere le prestazioni del test e i fattori che contribuiscono a risultati falsi negativi negli studi longitudinali, abbiamo esaminato i risultati dei partecipanti arruolati nel Botswana TDF/FTC Oral HIV Prophylaxis Trial, nel Bangkok Tenofovir Study e nel Bangkok MSM Cohort Study, 3 studi clinici separati su persone HIV-negative ad alto rischio condotti in Botswana e Thailandia. In un'analisi osservazionale retrospettiva, abbiamo confrontato fluido orale OraQuick (OFOQ) tra i partecipanti che hanno contratto l'infezione da HIV ai risultati ottenuti in modo retrospettivo utilizzando test immunoenzimatici e test di amplificazione dell'acido nucleico su campioni conservati. Abbiamo classificato i risultati OFOQ negativi come vero-negativo o falso negativo rispetto al test di amplificazione dell'acido nucleico e/o al dosaggio immunoenzimatico e ha determinato il ritardo nella conversione dell'OFOQ rispetto al tempo stimato di infezione. Abbiamo utilizzato la regressione log-binomia e le equazioni di stima generalizzate per esaminare l'associazione tra risultati falsi negativi e fattori partecipanti, clinici e del sito di test. Duecentotrentatre risultati OFOQ falsi negativi si sono verificati in 80 su 287 individui sieroconvertenti. Il ritardo di conversione OFOQ stimato variava da 14,5 a 547,5 (mediana, 98,5) giorni. La conversione ritardata OFOQ è stata associata al sito clinico e all'operatore del test (P < .05), profilassi pre-esposizione (P = .01), bassa carica virale plasmatica (P < .02) e tempo di scadenza del kit (P < .01). L'età, il sesso e il sottotipo di HIV dei partecipanti non sono stati associati a risultati falsi negativi. Il lungo tempo di ritardo nella conversione dell'OFOQ è stato associato all'esposizione agli antiretrovirali e alla bassa carica virale plasmatica. L'incapacità dell'OFOQ di rilevare l'infezione da HIV-1 era frequente e di origine multifattoriale. Negli studi longitudinali, i risultati negativi del fluido orale devono essere confermati tramite l'analisi di campioni di sangue.
Resistenza antimicrobica nel Mycobacterium tuberculosis: prospettive meccanicistiche ed evolutive.I ceppi di Mycobacterium tuberculosis resistenti agli antibiotici stanno minacciando progressi nel contenimento dell'epidemia globale di tubercolosi. Mycobacterium tuberculosis è intrinsecamente resistente a molti antibiotici, limitando il numero di composti disponibili per il trattamento. Questa resistenza intrinseca è dovuta a una serie di meccanismi tra cui un involucro cellulare spesso, ceroso, idrofobo e la presenza di enzimi che degradano e modificano i farmaci. sono attivi contro M. tuberculosis è, in assenza di determinanti di resistenza trasferiti orizzontalmente, conferito da mutazioni cromosomiche. Queste mutazioni cromosomiche possono conferire resistenza ai farmaci attraverso la modifica o la sovraespressione del bersaglio del farmaco, nonché mediante la prevenzione dell'attivazione del profarmaco. può avere effetti pleiotropici che portano a una riduzione del batterio\u002 Fitness 7s, quantificabile ad es. da una riduzione del tasso di crescita in vitro. Le cosiddette mutazioni compensatorie secondarie, non coinvolte nel conferire resistenza, possono migliorare il costo di fitness interagendo epistaticamente con la mutazione di resistenza. Sebbene la diversità genetica di M. tuberculosis sia bassa rispetto ad altri batteri patogeni, è stato dimostrato che il background genetico del ceppo influenza molteplici aspetti nell'evoluzione della resistenza ai farmaci. Il tasso di evoluzione della resistenza e i costi di fitness delle mutazioni della resistenza ai farmaci possono variare in funzione del background genetico.
Confronto tra Child-Pugh, MELD e FIB-4 per prevedere gli esiti clinici nelle persone infettate dal virus dell'epatite C: risultati di ERCHIVES.Identificazione dell'epatite Le persone positive al virus C (HCV) ad alto rischio di complicanze precoci possono aiutare a dare priorità alle decisioni terapeutiche Abbiamo condotto questo studio per confrontare i punteggi Child-Turcotte-Pugh (CP), MELD e FIB-4 per prevedere gli esiti clinici e per identificare quelli a basso rischio di complicanze All'interno della coorte recuperata elettronicamente di veterani infetti da HCV, abbiamo identificato le persone HCV-positive ed escluso quelle con virus dell'immunodeficienza umana (HIV), antigene di superficie dell'epatite B (HBsAg), scompenso epatico prevalente (HD), carcinoma epatocellulare (HCC) e quelli trattati per HCV. Abbiamo calcolato i tassi di incidenza per HD, HCC e mortalità per tutte le cause a 1, 3 e 5 anni dopo la diagnosi di HCV. Utilizzando le curve delle caratteristiche operative del ricevitore (ROC), abbiamo determinato il taglio ottimale -valori off per ogni punteggio per questi risultati S. Tra le 21.116 persone valutate, l'89,7% era CP Classe-A, il 79,9% aveva MELD<9 e il 43,4% aveva FIB-4<1.45. AUROC per HD a 1, 3 e 5 anni era più alto per FIB-4 (0,84-0,86) rispetto a MELD (0,70-0,76) (P < .001). AUROC per HCC a 1, 3 e 5 anni era 0,81-0,82 per FIB-4 ma 0,61-0,68 per punteggi CP e MELD. (P < .001) AUROC per la mortalità per tutte le cause a 3 e 5 anni era 0,65-0,68. I punteggi di cut-off ottimali per identificare le persone a basso rischio di complicanze erano i seguenti: CP <5; MESCOLARE <8; FIB-4 <3 per HD e HCC e <2 per mortalità per tutte le cause, al di sotto del quale <1,5% ha sviluppato HD e HCC e ≤2,5% è morto a 3 anni. Il punteggio FIB-4 è un migliore predittore di HD e HCC nelle persone HCV-positive. Un punteggio di <3 è associato a un basso rischio di HD e HCC 1 e 3 anni dopo la diagnosi di HCV.
Gestione chirurgica delle lesioni toraciche penetranti durante gli attacchi di Parigi del 13 novembre 2015.Gli attacchi terroristici di Parigi del 13 novembre 2015 hanno causato 482 vittime, di cui 130 morti e 352 feriti. Di fronte a questi attacchi terroristici multisito, gli ospedali pubblici e militari parigini hanno gestito contemporaneamente numerosi pazienti con lesioni toraciche penetranti. Lo scopo di questo studio era analizzare questa coorte, i modelli di lesioni e valutare i risultati di questa mobilitazione. sono stati esaminati i record di tutti i pazienti ricoverati negli ospedali pubblici e militari parigini con una lesione toracica penetrante correlata agli attacchi terroristici di Parigi del 13 novembre Il gruppo di studio comprendeva 25 pazienti (7% delle vittime) con un'età media di 34 ± 8 anni e la maggior parte delle ferite da arma da fuoco ( n = 20, 80%). La maggior parte dei pazienti presentava gravi lesioni toraciche (punteggio abbreviato di lesione toracica 3,3 ± 1,2) e anche lesioni non toraciche associate a 21 casi (84%). Il punteggio medio di gravità delle lesioni era 26,8 ± 9,4. Otto pazienti (32%) sono stati gestiti con l'inserimento del tubo toracico e 17 (68%) hanno richiesto un intervento chirurgico toracico. La resezione polmonare, la riparazione diaframmatica e la sutura polmonare sono state eseguite rispettivamente in 6 (36%), 6 (35%) e 5 casi (29%). In 16 pazienti sono state eseguite procedure chirurgiche extratoraciche, principalmente per lesioni alle estremità. La mortalità postoperatoria era del 12% ( n = 3) e la morbilità postoperatoria era del 60% ( n = 15). Il coordinamento degli ospedali militari e civili parigini ha consentito la gestione chirurgica di 25 pazienti. La mortalità è elevata ma coerente con quanto riportato nelle serie precedenti. I tempi attuali ci espongono alla minaccia di nuovi attacchi terroristici e richiedono che la comunità medica sia preparata.
Impatto delle visite di follow-up cliniche sul controllo del peso corporeo nelle persone con prediabete o diabete mellito: studio di coorte giapponese non anziana.Il controllo del peso corporeo è considerato essenziale per la gestione del diabete mellito. I medici hanno un ruolo importante nell'educare e guidare i pazienti con diabete a controllare il loro peso corporeo. Lo scopo del presente studio era di chiarire se le visite cliniche influenzassero il controllo del peso corporeo delle persone con prediabete o diabete mellito. Per esaminare se gli individui con diabete mellito che visitano le cliniche mostrano un migliore controllo del peso, abbiamo utilizzato un ampio database giapponese (Japan Medical Data Center, Tokyo, Giappone) di screening per le malattie legate allo stile di vita collegato a dati di reclamo amministrativo per identificare retrospettivamente le persone con prediabete o diabete mellito sulla base della loro concentrazione di glucosio plasmatico a digiuno e di emoglobina glicata (HbA1c) Abbiamo raccolto dati sulle loro caratteristiche di base (tra cui età, sesso, indice di massa corporea e storia della malattia) e i loro stili di vita. Abbiamo usato la probabilità inversa del punteggio di propensione delle equazioni di stima generalizzate ponderate per il trattamento per esaminare l'associazione tra le visite cliniche e il cambiamento nell'indice di massa corporea. Tra il 2013 e il 2014, abbiamo identificato 11004 individui con prediabete o diabete. La percentuale di visite alle cliniche dopo la prima diagnosi effettuata allo screening è stata del 27,8%. La visita clinica era significativamente associata a un indice di massa corporea inferiore dopo aggiustamento per le caratteristiche del paziente al basale un anno dopo il primo screening (-0,17 kg/m2; intervallo di confidenza al 95%, da -0,22 a -0,12). Nei giapponesi che hanno scoperto di avere il prediabete o il diabete durante uno screening sanitario annuale, coloro che hanno visitato le cliniche dopo la loro prima diagnosi avevano probabilmente un migliore controllo del peso corporeo.
Impianto di valvola aortica transaortica transcatetere come scelta di prima linea o come ultima risorsa? Un'analisi basata sul registro ROUTE.Valvola aortica transaortica transcatetere l'impianto (TAo-TAVI) è un'alternativa recentemente sviluppata alla TAVI transapicale (TA) o transfemorale (TF) Abbiamo mirato ad analizzare l'efficacia e la sicurezza di TAo-TAVI come approccio di prima linea e confrontarlo con i pazienti che ricevono TAo-TAVI come ultima risorsa, che è la pratica corrente. ROUTE è un registro prospettico multicentrico per valutare gli esiti clinici della TAo-TAVI. I pazienti senza controindicazioni per TA- e TF-TAVI (TAo-first) sono stati confrontati con pazienti con controindicazioni per entrambi di queste vie di accesso (TAo-last). L'analisi dei risultati si è basata sugli end-point clinici definiti dal VARC II. Sono stati inclusi trecentouno pazienti, di cui 224 pazienti che soddisfacevano i criteri TAo-first e 77 TAo-last. La valvola è stata consegnata e catetere recuperato con successo in tutti i pazienti ent. Nel gruppo TAo-first, i tassi di conversione alla chirurgia aperta e la richiesta di una seconda valvola erano bassi e non diversi rispetto ai pazienti TAo-last (1% contro 3%, P = 0.46 e 1% contro 3%, P = 0.46, rispettivamente). Questo era vero anche per il tasso di rigurgito paravalvolare (≥ moderato: 4% vs. 3%). La mortalità per tutte le cause a 30 giorni è stata del 6% vs. 5% ( P = 0.76), tassi di ictus 2% vs. 0% ( P = 0.24), impianto di pacemaker (11% vs. 4%, P \ = 0.093) e sanguinamento potenzialmente letale 4% vs. 3% ( P = 0.70). La sicurezza della valvola (entrambi 85%, P = 0.98) e l'efficacia clinica (80% vs. 82%; P = 0.73) non differivano tra i gruppi. Sebbene nella presente analisi non fossero disponibili dati comparativi per le procedure di TA e TF, i risultati suggeriscono che la TAo può essere considerata non solo come una strategia di ultima istanza quando le vie di accesso classiche sono ritenute irrealizzabili, ma anche come una potenziale opzione di prima linea, con solo bassi tassi di rigurgito paravalvolare e impianto di pacemaker permanente. NCT01991431.
Trattamento ibrido di uno pseudoaneurisma aortico complesso di grandi dimensioni conseguente a coartazione.Trattamento endovascolare di pseudoaneurisma successivo a preesistente coartazione aortica sta diventando una soluzione tecnica ben accettata soprattutto nei pazienti che presentano problematiche anatomiche che coinvolgono l'arco aortico. Segnaliamo il caso di una donna di 65 anni con un enorme pseudoaneurisma dell'aorta toracica discendente. La valutazione per immagini diagnostiche ha documentato anche la presenza di un'arteria succlavia destra aneurismatica aberrante. A causa delle condizioni anatomiche dell'arteria del paziente, abbiamo deciso di trattare l'aneurisma applicando un approccio ibrido.
Clisteri di mesalamina per l'induzione della remissione nella colite ulcerosa pediatrica refrattaria alla mesalamina orale: uno studio prospettico di coorte.La colite ulcerosa pediatrica [UC] è più estesa rispetto alla malattia degli adulti e più spesso refrattario alla mesalamina. Tuttavia, nessuno studio prospettico ha valutato i clisteri di mesalamina per indurre la remissione nei bambini. Il nostro obiettivo era valutare la capacità dei clisteri di mesalamina di indurre la remissione nella CU pediatrica da lieve a moderata refrattaria alla mesalamina orale. Questo era un braccio in aperto di uno studio randomizzato controllato precedentemente riportato di mesalamina una volta al giorno nella CU pediatrica attiva [studio MUPPIT]. Bambini di età compresa tra 4-18 anni, con un punteggio dell'indice di attività della colite ulcerosa pediatrica [PUCAI] di 10-55 , sono stati arruolati dopo aver fallito almeno 3 settimane di mesalamina orale a dose piena. Sono stati esclusi i pazienti trattati con steroidi o clisteri nel mese precedente e quelli con proctite isolata. I bambini hanno ricevuto clisteri Pentasa® 2 5 mg/kg [fino a 1 g] al giorno per 3 settimane con la precedente dose orale. L'endpoint primario era la remissione clinica entro la settimana 3. È stato arruolato un totale di 38 bambini (età media 14,6 ± 2,3 anni; 17/38 [45%] con colite estesa). La remissione clinica è stata ottenuta in 16 [42%] e la risposta è stata ottenuta in 27 [71%] alla settimana 3. Otto bambini si sono deteriorati e hanno richiesto steroidi. Non ci sono state differenze nei parametri di base tra coloro che sono entrati o non sono entrati in remissione, inclusa l'estensione della malattia [43% nella colite sinistra e 41% nella colite estesa] e l'attività della malattia [44% nell'attività lieve e 41% nell'attività moderata]. La remissione clinica può essere notevolmente aumentata nei bambini refrattari alla mesalamaina orale aggiungendo clisteri di mesalamina per 3 settimane, prima di iniziare gli steroidi.
La prognosi non così buona dell'infezione articolare periprotesica streptococcica gestita dalla ritenzione dell'impianto: i risultati di un ampio studio multicentrico.Gli streptococchi non sono un causa rara di infezione articolare periprotesica (PJI). Si ritiene che la gestione mediante debridement, antibiotici e ritenzione dell'impianto (DAIR) produca una buona prognosi, ma si sa poco sulla reale probabilità di successo. Uno studio internazionale retrospettivo, osservazionale, multicentrico è stata eseguita nel periodo 2003-2012. I pazienti idonei avevano una PJI streptococcica che è stata gestita con DAIR. L'endpoint primario era il fallimento, definito come morte correlata all'infezione, recidiva/persistenza dell'infezione o necessità di terapia di salvataggio. Complessivamente, 462 casi sono stati inclusi (età media 72 anni, 50% uomini). La specie più frequente era Streptococcus agalactiae (34%) e il 52% di tutti i casi era ematogeno. Il trattamento antibiotico utilizzava principalmente -lattamici e il 37% dei pazienti riceveva rifampicina. Gli esiti erano valutabili in 444 pazienti: il fallimento si è verificato in 187 (42,1%; intervallo di confidenza 95%, 37,5%-46,7%) dopo una mediana di 62 giorni dal debridement; i pazienti senza fallimento sono stati seguiti per una mediana di 802 giorni. I predittori indipendenti (hazard ratio) di fallimento erano l'artrite reumatoide (2,36), l'infezione tardiva post-chirurgica (2,20) e la batteriemia (1,69). Predittori indipendenti di successo erano lo scambio di componenti rimovibili (0,60), l'uso precoce di rifampicina (0,98 al giorno di trattamento entro i primi 30 giorni) e trattamenti lunghi (≥21 giorni) con -lattamici, sia come monoterapia (0,48) o in combinazione con rifampicina (0,34). Questa è la serie più ampia a nostra conoscenza di PJI streptococcica gestita da DAIR, che mostra una prognosi peggiore rispetto a quanto riportato in precedenza. Gli effetti benefici dello scambio dei componenti rimovibili e dei -lattamici sono confermati e forse anche un potenziale beneficio dall'aggiunta di rifampicina.
Equilibrio dell'espressione genomica in un vertebrato triibrido triploide.La poliploidia è sempre più riconosciuta come un fattore trainante della diversità biologica. Come e perché la poliploidizzazione influisce sull'espressione genica è fondamentale per comprendere il legame tra elevazione della ploidia e diversificazione. Nelle piante poliploidi numerosi studi hanno dimostrato che l'elevazione della ploidia può conferire conseguenze importanti ma variabili per l'espressione genica, che vanno da alterazioni gene per gene a genomi completamente silenziati. Al contrario, i poliploidi animali rimangono in gran parte non caratterizzato. Di conseguenza, il modo in cui gli animali rispondono e gestiscono gli eventi di poliploidia non è compreso. Qui, affrontiamo questa importante lacuna di conoscenza analizzando i trascrittomi di un animale ibrido triploide, una salamandra unisessuale di Ambystoma e tre specie di Ambystoma sessuali che rappresentano tutti e tre i genomi parentali in l'unisessuale. Abbiamo utilizzato una nuova pipeline bioinformatica che include la mappatura competitiva di sequenze triploidi ad un set di riferimento di geni ortologhi nella specie sessuale per valutare l'espressione del sottogenoma. I nostri confronti dei livelli di espressione genica tra i tre genomi parentali hanno rivelato che il triploide unisessuale mostra un modello di equilibrio genomico, in cui il 72% dei geni analizzati è stato espresso equamente tra i sottogenomi. Questo risultato è sorprendentemente diverso dallo squilibrio del genoma tipicamente osservato nelle piante poliploidi ibride. Le nostre analisi rappresentano le prime ad affrontare l'espressione genica in un animale ibrido triploide e ad introdurre una nuova struttura bioinformatica per l'analisi dei dati trascrittomici.
Imaging cranico prima della puntura lombare in adulti con meningite acquisita in comunità: utilità clinica e aderenza alle linee guida della Società per le malattie infettive.Le malattie infettive Le linee guida della Society of America (IDSA) delineano i criteri per l'uso della tomografia computerizzata (TC) della testa prima della puntura lombare (LP) negli adulti con meningite acquisita in comunità (CAM). Ci sono dati limitati per documentare l'aderenza a queste linee guida e valutare l'utilità clinica dell'imaging cerebrale Questa è stata un'analisi retrospettiva da gennaio 2005 a gennaio 2010 a Houston, in Texas. Tra 614 adulti con CAM, 407 pazienti (66,3%) non avevano un'indicazione per una TAC della testa e 207 (33,7 %) lo ha fatto. I pazienti con un'indicazione di scansione TC erano più anziani, avevano più comorbidità, erano più malati e avevano eziologie trattabili più urgenti ed esiti clinici avversi (P < .001). Una scansione TC è stata ordinata prima del LP in 549 pazienti ( 89%). Nel complesso, i medici non ha aderito alle linee guida cliniche in 368 su 614 (60%) soggetti. Una TC della testa è stata ordinata quando non indicata in 355 su 549 pazienti (64%) e non eseguita quando indicata in 13 su 207 pazienti (0,6%). La TC della testa ha rivelato anomalie intracraniche in 35 su 193 pazienti (18,1%) con un'indicazione per l'imaging cerebrale, rispetto a solo 2 su 356 (0,05%) senza indicazione (P < .05). I principali reperti intracranici sono stati osservati solo in 15 pazienti su 549 (2,7%), tutti con un'indicazione per l'imaging cerebrale. Inoltre, solo 8 pazienti presentavano anomalie che influivano sulla gestione clinica. La maggior parte dei medici non aderisce alle linee guida IDSA, ritardando la diagnosi di LP e aumentando i costi. L'utilità della TC della testa in pazienti con CAM senza indicazione per l'imaging è limitata e non ha alcun impatto sulla gestione clinica.
Predittori preoperatori di conversione in chirurgia toracoscopica per empiema pleurico.La toracoscopia è un metodo di trattamento efficace per l'empiema pleurico; tuttavia, non è ancora ben definito su quali sottogruppi di pazienti potrebbero trarne il massimo beneficio. Lo scopo dello studio era identificare i fattori preoperatori che potrebbero facilitare la selezione dell'intervento chirurgico appropriato e valutare il periodo postoperatorio precoce. Settantuno pazienti sono stati inclusi prospetticamente nello studio, che è stato condotto da gennaio 2011 a giugno 2014. La chirurgia toracoscopica per empiema pleurico in stadio II/III è stata eseguita in tutti i pazienti. La toracoscopia non è riuscita in 18 (25,4%) pazienti, richiedendo la conversione alla toracotomia. Sono stati analizzati i fattori preoperatori che potrebbero predire la conversione. Pleurico obliterato lo spazio (12 pazienti) e il mancato raggiungimento della riespansione polmonare (6 pazienti) sono state le ragioni principali della conversione Demo dell'analisi della regressione logistica multivariata Abbiamo rilevato che ogni giorno di malattia [odds ratio 1,1 (intervallo di confidenza 95% 1,0-1,2], P = 0,004] e pus franco [odds ratio 4,4 (intervallo di confidenza 95% 1,2-15,3), P = 0,021] erano predittori indipendenti di conversione. Utilizzando l'analisi delle caratteristiche operative del ricevitore, è stato determinato che la durata della malattia aveva un alto valore predittivo per la conversione [area sotto la curva 0,8 (intervallo di confidenza 95% 0,7-0,9), P < 0,001]. Il valore di cut-off per la durata della malattia era di 16 giorni (sensibilità 94,4%, specificità 54,7%). Il gruppo di conversione aveva un bisogno significativamente maggiore di permanenza in unità di terapia intensiva postoperatoria ( P = 0.022) ma un tasso inferiore di reinterventi ( P = 0.105). La durata della malattia e il pus franco scoperto durante la toracentesi possono aiutare nella selezione del paziente per un intervento appropriato. Un intervento chirurgico precedente per l'empiema pleurico può ridurre il tasso di conversione e reintervento.
Rapporto sulla mortalità da innesto di grasso gluteo: raccomandazioni della task force ASERF.L'innesto di grasso gluteo è tra le procedure estetiche in più rapida crescita negli Stati Uniti e in tutto il mondo. Dati i numerosi rapporti aneddotici e pubblicati sull'embolia grassa polmonare fatale e non fatale risultante da questa procedura, l'Aesthetic Surgery Education and Research Foundation (ASERF) ha formato una Task Force per studiare questa complicanza. Per determinare l'incidenza di fatali e non fatali embolia di grasso polmonare associata all'innesto di grasso gluteo e fornire raccomandazioni per ridurre i rischi della procedura. Un sondaggio anonimo basato sul Web è stato inviato a 4843 chirurghi plastici in tutto il mondo. Ulteriori dati su morbilità e mortalità sono stati raccolti attraverso interviste riservate con chirurghi plastici e medici legali , le richieste di documenti pubblici per i rapporti autoptici negli Stati Uniti e attraverso l'American Association for the Accreditation of Ambula tori chirurgici (AAAASF). Seicentonovantadue (692) chirurghi che hanno risposto al sondaggio hanno riportato 198.857 casi di innesto di grasso gluteo. Nel corso della loro carriera, i chirurghi hanno riportato 32 decessi per emboli di grasso polmonare e 103 emboli di grasso polmonare non fatali. Il 3% (3%) degli intervistati ha avuto la morte di un paziente e il 7% degli intervistati ha riportato almeno un'embolia di grasso polmonare in un paziente nel corso della propria carriera. I chirurghi che hanno segnalato la pratica dell'iniezione nel muscolo profondo hanno riscontrato un aumento significativo del tasso di incidenza di emboli grassi polmonari fatali e non fatali. Venticinque decessi sono stati confermati negli Stati Uniti negli ultimi 5 anni attraverso referti autoptici e interviste con chirurghi e medici legali. Quattro decessi sono stati segnalati dal 2014 al 2015 per emboli di grasso polmonare nelle strutture AAAASF. Nonostante la crescente popolarità dell'innesto di grasso gluteo, tassi di mortalità significativamente più elevati sembrano essere associati all'innesto di grasso gluteo rispetto a qualsiasi altra procedura chirurgica estetica. Sulla base di questo sondaggio, dovrebbero essere evitate le iniezioni di grasso nel muscolo profondo, utilizzando cannule inferiori a 4 mm e puntando la cannula di iniezione verso il basso. Sono necessarie ulteriori ricerche per aumentare la sicurezza di questa procedura.
Tratti occipitali di sostanza bianca nell'uomo e nel macaco.Confrontiamo diversi tratti principali di sostanza bianca nel lobo occipitale umano e macaco utilizzando la risonanza magnetica per diffusione. Il confronto suggerisce somiglianze ma anche differenze significative nei tratti. Ci sono diversi tratti apparentemente omologhi nelle 2 specie, tra cui il fascicolo occipitale verticale (VOF), la radiazione ottica, il forcipe maggiore e il fascicolo longitudinale inferiore (ILF). C'è un grande tratto umano, il fascicolo fronto-occipitale inferiore, senza fascicolo corrispondente nel macaco. Potremmo identificare il macaco VOF (mVOF), che è stato poco studiato. La sua posizione è coerente con i classici studi anatomici invasivi di Wernicke. L'omologia VOF è supportata da somiglianza degli endpoint in V3A e V4 ventrale tra le specie. Le fibre mVOF si intrecciano con il segmento dorsale dell'ILF, ma il VOF umano sembra essere laterale all'ILF. Queste somiglianze a Le differenze tra i tratti del lobo occipitale saranno utili per stabilire quale circuito nel macaco può servire da modello accurato per la corteccia visiva umana.
Parasitoid Diaeretiella rapae (Hymenoptera: Braconidae) regola la strategia riproduttiva quando si compete per gli ospiti.L'idoneità del parassitoide dipende dalla sua capacità di manipolare le strategie riproduttive quando è in competizione Questo studio ha studiato il parassitismo e le strategie di allocazione del sesso della vespa parassita Diaeretiella rapae McIntosh a una gamma di host (Brevicoryne brassicae L. ) e densità conspecifiche. I risultati suggeriscono che le femmine di D. rapae aggiustano la loro produzione di progenie e il rapporto tra i sessi della progenie con il cambiamento competizione. Quando si foraggiano da sole, le femmine di D. rapae parassitano un numero maggiore di ninfe di B. brassicae quando il numero di ospiti disponibili aumenta, ma la proporzione complessiva di ospiti parassitizzati diminuisce con l'aumento della densità dell'ospite. Anche la proporzione di figli femminili diminuisce con l'aumento densità dell'ospite L'aumento del numero di femmine di D. rapae che foraggiano insieme ha aumentato il parassitismo totale, ma ha ridotto il contributo relativo di ciascuna singola femmina. Il numero di discendenti femminili è diminuito quando più femmine hanno gareggiato per lo stesso ospite. Tuttavia, l'esperienza di foraggiamento in presenza di uno o più conspecifici ha aumentato il tasso di parassitismo e la proporzione della progenie femminile. Le femmine in competizione erano più attive durante l'ovideposizione e avevano una vita più breve. Lo studio suggerisce che le densità sia dell'ospite che della fondatrice (parassitoide femminile) hanno un effetto significativo sulla produzione di progenie, sull'allocazione del sesso e sulla longevità delle femmine in cerca di cibo.
Verso il miglioramento della diagnosi precoce della malattia di Chagas congenita in un ambiente endemico.Si stima che la trasmissione congenita del Trypanosoma cruzi rappresenti il 22% delle nuove infezioni, rappresenta un significativo problema di salute pubblica in tutta l'America Latina e a livello internazionale. Il trattamento durante l'infanzia è altamente efficace e ben tollerato, ma i test attuali per la diagnosi precoce non riescono a rilevare >50% dei neonati infetti e il follow-up a 9 mesi è basso. Donne che presentati per la consegna in 2 ospedali urbani nel dipartimento di Santa Cruz, Bolivia, sono stati sottoposti a screening mediante test rapido. I campioni di neonati di donne infette sono stati testati mediante microscopia (micrometodo), PCR quantitativa (qPCR) e immunoglobuline (Ig)M tripomastigote escreto-secreto antigene (TESA) alla nascita e 1 mese e mediante sierologia IgG a 6 e 9 mesi Tra 487 neonati di 476 donne sieropositive, l'infezione congenita da T. cruzi è stata rilevata in 38 neonati di 35 madri (7,8%). , Le sensibilità/specificità di qPCR, TESA-blot e micrometodo erano 68,6%/99,1%, 58,3%/99,1% e 16,7%/100%, rispettivamente. Quando sono stati combinati i risultati di nascita e 1 mese, le sensibilità cumulative hanno raggiunto rispettivamente l'84,2%, il 73,7% e il 34,2%. Basso peso alla nascita e/o difficoltà respiratoria sono stati riportati in 11 (29%) neonati infetti. I neonati con segni clinici avevano carichi di parassiti più elevati ed avevano una probabilità significativamente maggiore di essere rilevati dal micrometodo. La proporzione di neonati infetti da T. cruzi con segni clinici è diminuita dagli anni '90, ma la malattia di Chagas congenita sintomatica rappresenta ancora un problema di salute pubblica significativo, sebbene difficile da rilevare. I metodi molecolari potrebbero facilitare la diagnosi precoce e aggirare la perdita al follow-up, ma rimangono logisticamente ed economicamente proibitivi per lo screening di routine in contesti con risorse limitate.
Sostituzione rapida della valvola aortica per stenosi aortica grave: risultati a 1 anno in 150 pazienti.Questo studio mirava a valutare la sicurezza e l'efficacia di Sostituzione rapida della valvola aortica (RDAVR) per stenosi aortica grave (SA) Tutti i pazienti consecutivi con SA grave sottoposti a RDAVR con la bioprotesi EDWARDS INTUITY sono stati inclusi in modo prospettico in uno studio di coorte a centro singolo tra luglio 2012 e aprile 2015. Clinico l'esame e l'ecocardiografia transtoracica sono stati eseguiti prima dell'intervento e al follow-up di 1 mese e 1 anno. Abbiamo incluso 150 pazienti: età media 76,8 α 6,2 anni, 68,7% maschi e media EuroSCORE II 3,4 α 3,7%. L'impianto ha avuto successo in tutti: 103 (68,7%) hanno avuto una sostituzione della valvola aortica isolata (AVR) e 47 (31,3%) hanno avuto procedure concomitanti. Per l'AVR isolato, i tempi medi di cross-clamp e di bypass cardiopolmonare erano rispettivamente 37,6α 13,3 e 59,9α 20,4 min. Sopravvivenza Kaplan-Meier a 1 anno il tasso era del 97,1% (intervallo di confidenza 95% 92,4-98,9%). A 1 anno, ictus si è verificato in 5 pazienti (3,34%), infarto miocardico in 1 (0,69%), endocardite in 1 (0,69%), espianto precoce in 1 (0,67%), impianto di pacemaker in 8 (5,6%) e grado 2 rigurgito periprotesico su 4 (3,2%; nessun grado 3 su 4). Ci sono state diminuzioni significative rispetto al basale ( P < 0.001) nella proporzione alla New York Heart Association Class III/V (35,3-4,1%), gradiente medio (54,9 ± 17,3 mmHg a 11,3 ± 4,8 mmHg) e indice di massa ventricolare sinistro medio (da 160,3 ± 44,8 g/m2 a 118,5 ± 39,4 g/m2). L'area dell'orifizio effettiva indicizzata media a 1 anno era 1,02 ± 0,37 cm 2 /m 2. Dieci pazienti (6,6%) presentavano una grave discrepanza paziente-protesi. RDAVR per AS grave ha fornito esiti favorevoli in 1 anno.
Un follow-up di 2 anni dopo un RCT di 2 anni con vitamina D ed esercizio fisico: effetti su cadute, cadute dannose e funzionamento fisico tra le donne anziane.Sia l'esercizio fisico che la vitamina D sono mezzi raccomandati per prevenire le cadute tra gli anziani, ma i loro effetti combinati sulle lesioni indotte dalla caduta sono scarsamente studiati. Follow-up di 2 anni di un precedente studio randomizzato controllato di 2 anni con vitamina D ed esercizio (Ex) di 409 donne anziane residenti in casa utilizzando un disegno fattoriale 2 × 2 (D-Ex-, D+Ex-, D-Ex+, D+Ex+). Oltre ai diari mensili autunnali, la densità minerale ossea del collo femorale ( fn-BMD) e il funzionamento fisico sono stati valutati a 1 e 2 anni dopo l'intervento. Dopo l'intervento, le concentrazioni di S-25OHD sono scese ai livelli basali in entrambi i gruppi di integratori. I gruppi non differivano per il cambiamento di fn-BMD o funzionamento fisico , ad eccezione della forza dei muscoli estensori delle gambe, che è rimasta circa il 10% maggiore nei gruppi di esercizi rispetto al gruppo di riferimento (D-Ex-). Non ci sono state differenze tra i gruppi nel tasso di tutte le cadute, ma le cadute dannose assistite da un medico si sono ridotte nei gruppi D+Ex- e D-Ex+ rispetto a D-Ex-. Tuttavia, tutti i precedenti gruppi di trattamento avevano meno feriti che cadevano assistiti da un medico, con FC (95% CI) di 0,62 (0,39-1,00) per D+Ex-, 0,46 (0,28-0,76) per D-Ex+ e 0,55 (0,34-0,88) per D+Ex+, rispetto a D-Ex-. I benefici indotti dall'esercizio nel funzionamento fisico sono rimasti in parte 2 anni dopo la cessazione dell'allenamento supervisionato. Sebbene non vi fosse alcuna differenza nel tasso di tutte le cadute, gli ex gruppi di esercizi hanno continuato ad avere un tasso inferiore di cadute ferite assistite da cure mediche rispetto ai referenti anche 2 anni dopo l'intervento. La vitamina D senza esercizio era associata a cadute meno dannose senza alcuna differenza nel funzionamento fisico.
Asportazione di cisti epicardica originata dal ventricolo sinistro mediante chirurgia toracoscopica video-assistita senza bypass cardiopolmonare.Le cisti pericardiche vengono occasionalmente riscontrate ed escisse con successo utilizzando video chirurgia toracoscopica assistita (VATS). Tuttavia, le cisti cardiache originate dall'epicardio sono estremamente rare. Qui riportiamo una cisti epicardica che è stata completamente asportata mediante VATS. La cisti epicardica aveva un vaso di alimentazione dal ventricolo sinistro ed era considerata originata dal ventricolo sinistro. Per quanto a nostra conoscenza, questo caso è il primo a segnalare l'escissione di una cisti epicardica mediante VATS.
Il continuum assistenziale del virus dell'immunodeficienza umana nei paesi dell'Unione europea nel 2013: dati e sfide.Il programma congiunto delle Nazioni Unite sull'HIV/AIDS (UNAIDS ) ha fissato un obiettivo "90-90-90" per frenare l'epidemia di virus dell'immunodeficienza umana (HIV) entro il 2020, ma i metodi utilizzati per valutare se i paesi hanno raggiunto questo obiettivo non sono standardizzati, ostacolando i confronti. Attraverso una collaborazione formata da il Centro europeo per la prevenzione e il controllo delle malattie (ECDC) con le coorti europee per l'HIV e le agenzie di sorveglianza, abbiamo costruito un continuum standardizzato in 4 fasi della cura dell'HIV per 11 paesi dell'Unione europea per il 2013. Le fasi sono state definite come (1) il numero di persone che vivono con HIV nel paese entro la fine del 2013; (2) proporzione dello stadio 1 mai diagnosticata; (3) proporzione dello stadio 2 che ha mai avviato l'ART; e (4) proporzione dello stadio 3 che è diventato viralmente soppresso (≤200 copie/mL I dati di sorveglianza del caso sono stati utilizzati principalmente per derivare gli stadi 1 (utilizzando b modelli di calcolo ack) e 2, e dati di coorte per gli stadi 3 e 4. Nel 2013, si stima che 674500 persone negli 11 paesi convivono con l'HIV, che vanno da 5500 a 153400 in ciascun paese. La prevalenza complessiva dell'HIV è stata dello 0,22% (intervallo, 0,09%-0,36%). Le proporzioni complessive di ciascuna fase precedente sono state diagnosticate per l'84%, per l'84% con ART e per l'85% con soppressione virale (60% delle persone che vivono con l'HIV). Due paesi hanno raggiunto ≥90% per tutte le fasi e più della metà ha raggiunto ≥90% per almeno 1 fase. I paesi dell'Unione Europea si stanno avvicinando all'obiettivo 90-90-90. La riduzione della percentuale non diagnosticata rimane la più grande barriera al raggiungimento di questo obiettivo, suggerendo che sono necessari ulteriori sforzi per migliorare i tassi di test dell'HIV. La standardizzazione dei metodi per derivare continuum di cura comparabili rimane una sfida.
Spresso: un metodo di pre-screening dei composti ultraveloce basato sulla decomposizione dei composti.Recentemente, il numero di strutture e composti terziari proteici disponibili è aumentato. Tuttavia , lo screening virtuale basato sulla struttura è computazionalmente costoso a causa delle simulazioni di attracco. Pertanto, sono stati proposti metodi che filtrano i composti ovviamente non necessari prima di simulazioni di attracco computazionalmente costose. Tuttavia, la velocità di calcolo di questi metodi non è abbastanza veloce da valutare ≥ 10 milioni composti. In questo articolo, proponiamo un nuovo protocollo di pre-screening basato su docking denominato Spresso (Metodo Speedy PRE-Screening con composti segmentati). Le strutture parziali (frammenti) sono comuni tra molti composti; pertanto, il numero di variazioni dei frammenti necessarie per la valutazione è più piccolo di quello dei composti. Il nostro metodo aumenta la velocità di calcolo di ∼200 volte rispetto ai metodi convenzionali. Spresso è scritto in C ++ e Python, e io è disponibile come codice open source (http://www. bi. cs. titech. ac. jp/spresso/) sotto licenza GPLv3. akiyama@c. titech. ac. jp. I dati supplementari sono disponibili su Bioinformatica online.
L'epidermolisi bollosa distrofica recessiva provoca una neuropatia dolorosa delle piccole fibre.Le piccole fibre della pelle sono vulnerabili ai danni in condizioni metaboliche o tossiche come il diabete mellito o chemioterapia con conseguente neuropatia delle piccole fibre e dolore neuropatico associato. Non è ancora chiaro se la lesione alla porzione più distale delle piccole fibre sensoriali dovuta a un disturbo dermatologico primario possa causare dolore neuropatico. L'epidermolisi bollosa distrofica recessiva (RDEB) è una condizione rara in cui mutazioni delle proteine della giunzione dermo-epidermica portano a cicli di formazione di vesciche seguiti da rigenerazione della pelle. Il danno è esclusivo della pelle e delle mucose, senza compromissione diretta nota del sistema nervoso. È sempre più riconosciuto che la maggior parte dei pazienti con RDEB sperimentano dolore quotidiano, la cui eziologia non è chiara ma può includere infiammazione (nelle ferite), muscoloscheletrico (dovuto ad atrofia e cicatrici da retrazione che limitano movimento) o dolore neuropatico. In questo studio abbiamo studiato l'incidenza del dolore neuropatico ed esaminato la presenza di disfunzioni nervose nei pazienti con RDEB. Circa tre quarti dei pazienti presentavano dolore con caratteristiche neuropatiche, che avevano una distribuzione dipendente dalla lunghezza. I test sensoriali quantitativi del piede hanno rivelato notevoli menomazioni nelle soglie di rilevamento termico combinate con un aumento della sensibilità al dolore meccanico e del rapporto di avvolgimento (somma temporale degli stimoli meccanici nocivi). Gli studi sulla conduzione nervosa hanno mostrato una normale conduzione nervosa sensoriale e motoria delle grandi fibre; tuttavia, la biopsia cutanea ha mostrato una significativa diminuzione della densità delle fibre nervose intraepidermiche. I test del sistema nervoso autonomo non hanno rivelato anomalie nella frequenza cardiaca e nella variabilità della pressione sanguigna, tuttavia la risposta simpatica della pelle del piede è stata compromessa e l'innervazione delle ghiandole sudoripare è stata ridotta. Concludiamo che la lesione cutanea cronica può portare a lesioni e disfunzioni della parte più distale delle piccole fibre sensoriali in una distribuzione dipendente dalla lunghezza con conseguente dolore neuropatico invalidante. Questi risultati supportano anche l'uso di strumenti di screening del dolore neuropatico in questi pazienti e algoritmi di trattamento progettati per colpire il dolore neuropatico.
Relazione tra carico di calcio, eccentricità del telaio dello stent ecocardiografico e perdita paravalvolare dopo impianto di valvola aortica transcatetere corevalvolare.Perdita aortica paravalvolare (PVL) dopo valvola aortica transcatetere impianto (TAVI) è una complicanza con conseguenze potenzialmente gravi. La relazione tra carico di calcio della radice aortica nativa, eccentricità del telaio dello stent e PVL non è stata studiata prima. L'eccentricità del telaio di afflusso dello stent ecocardiografico è stata definita come diametro maggiore-minore in una vista dell'asse corto >2 mm. PVL è stato valutato secondo il Valve Academic Research Consortium aggiornato (VARC-2) In un sottogruppo di 162 (73%) pazienti, era disponibile il punteggio Agatston del calcio È stata osservata un'eccentricità del telaio dello stent in 77 (35%) dei pazienti. La correlazione tra il punteggio Agatston e l'eccentricità del telaio dello stent era significativa (ρ = 0.241, P = 0.003). La perdita paravalvolare era assente in 91 casi (41%), lieve in 67 (30%), moderata in 51 (23%) e grave in 14 (6%). La correlazione tra l'eccentricità del telaio dello stent e la gravità del PVL era significativa (ρ = 0,525, P < 0,0001). C'era una relazione tra particolari forme eccentriche del telaio dello stent e il sito di PVL. La calcificazione dell'anello aortico è associata a una successiva forma eccentrica della protesi CoreValve. Questa forma eccentrica si traduce in più PVL, con la localizzazione di PVL correlata alla forma dell'eccentricità del telaio dello stent.
Mortalità delle uova e delle larve appena schiuse di Lobesia botrana (Lepidoptera: Tortricidae) esposte ad alte temperature in laboratorio.L'ipotesi che la zona grappolo la defogliazione riduce le infestazioni della falena europea della vite, Lobesia botrana (Denis \& Schiffermüller) (Lepidoptera: Tortricidae), aumentando la mortalità delle uova e delle larve a causa dell'esposizione alla luce solare è stata valutata in laboratorio sottoponendo diverse fasi dell'uovo (bianco, occhi rossi , e testa nera) e larve appena schiuse ad alte temperature Sulla base delle temperature registrate in un vigneto del nord Italia su acini esposti al sole appartenenti a grappoli esposti a sud-ovest, le uova sono state sottoposte a temperature costanti di 40 °C e 37 °C per uno o due periodi di 3 o 6 h e a cicli di temperatura di 24 h con picco di 40 ° C. Le larve sono state esposte a cicli di alta temperatura di 24 h con picchi di 35, 37 e 40 C. I risultati ha mostrato mortalità parziale delle uova a 40 °C, aumentando con l'esposizione h nostro e periodi, e come uova maturate. La mortalità delle uova non è stata influenzata dall'esposizione a 37°C. La sopravvivenza larvale è già diminuita significativamente a 37°C ed era ancora più bassa a 40°C. Questi dati di laboratorio sono in accordo con l'ipotesi che le temperature raggiunte dalle bacche esposte alla luce solare causino mortalità delle uova e delle larve. I dati sulla suscettibilità delle uova e delle larve alle alte temperature hanno anche implicazioni per la distribuzione delle specie e gli effetti dei cambiamenti climatici.
Spargimento urinario da citomegalovirus in donne in gravidanza affette da HIV e infezione congenita da citomegalovirus.Spargimento urinario da citomegalovirus (CMV) in donne in gravidanza infette da virus dell'immunodeficienza umana ( HIV) è stato valutato per determinare se rappresenta un aumento del rischio di infezione congenita da CMV (cCMV). È stato valutato un sottogruppo di coppie madre-bambino arruolate nello studio perinatale NICHD HPTN 040 (distinto dall'assenza di uso di antiretrovirali prima del travaglio). le urine sono state testate mediante reazione a catena della polimerasi in tempo reale qualitativa (RT-PCR) per il DNA di CMV con RT-PCR quantitativa eseguita su campioni positivi. I campioni di urina erano disponibili per 260 donne con l'85,4% dalle Americhe e il 14,6% dal Sud Africa. -quattro donne (9,2%) presentavano una viruria da CMV rilevabile mediante PCR qualitativa. La viruria da CMV materna non era associata alla conta media delle cellule CD4 o alla carica virale dell'HIV, ma era associata all'età materna più giovane (P = .02). di 260 neonati (3,8%) aveva cCMV. Le donne con viruria rilevabile peripartum CMV avevano maggiori probabilità di avere bambini con cCMV rispetto a quelle senza: 20,8% (5/24) contro 2,1% (5/236), (P = .0001). Le donne con viruria da CMV avevano tassi significativamente più alti di trasmissione perinatale dell'HIV (29,2% contro 8,1%, P = .002). Avevano 5 volte (odds ratio aggiustato [aOR] = 5,6, intervallo di confidenza 95% [CI] 1,9-16,8) e quasi 30 volte (aOR, 29,7; 95% CI, 5,4-164,2) più probabilità di trasmettere HIV e CMV rispettivamente ai loro bambini. Anche la gonorrea materna (aOR, 19,5; 95% CI, 2,5-151,3) e una maggiore carica virale materna dell'HIV log10 (OR, 2,8; 95% CI, 1,3-6,3) erano fattori di rischio significativi per cCMV. In questa coorte di donne incinte infette da HIV che non assumevano antiretrovirali, la diffusione urinaria di CMV era un fattore di rischio significativo per la trasmissione di CMV e HIV ai neonati. NCT00099359.
Autoschema come non bevitore: una risorsa protettiva contro il bere pesante nelle studentesse messicano-americane.L'uso di alcol è considerato meno accettabile per donne rispetto agli uomini nella cultura messicana. Tuttavia, recenti studi sulle donne messicano-americane (MA) mostrano che la prevalenza e i tassi di consumo di alcol stanno aumentando, in particolare in quelli con un'elevata acculturazione agli standard occidentali. Basandosi su studi recenti che hanno dimostrato che bere- identità correlate (schemi di sé) sono importanti predittori del consumo di alcol nelle popolazioni universitarie, questa analisi dei dati secondari ha studiato l'associazione tra acculturazione, valori culturali MA e stress acculturativo, schemi di sé correlati al bere e consumo eccessivo di alcol nel tempo negli iscritti al college Donne MA I dati sono stati tratti da uno studio longitudinale di 12 mesi sugli schemi personali e sui comportamenti a rischio per la salute in 477 donne MA iscritte al college. 5 stress sono stati misurati al basale e il consumo eccessivo di alcol è stato misurato al basale, 3, 6, 9 e 12 mesi. Il 36% delle donne aveva un auto-schema da non bevitore, ma solo il 3% aveva un auto-schema da bevitore. La spiritualità superiore era protettiva contro il bere pesante, e questo effetto può essere parzialmente spiegato dalla presenza di un auto-schema non bevitore. Gli interventi che enfatizzano l'importanza personale dell'essere un non bevitore e supportano l'importanza della spiritualità possono aiutare a prevenire il consumo eccessivo di alcol nelle donne del college MA.
GenoGAM: modelli additivi generalizzati a livello di genoma per l'analisi ChIP-Seq.L'immunoprecipitazione della cromatina seguita dal sequenziamento profondo (ChIP-Seq) è un metodo ampiamente utilizzato approccio allo studio delle interazioni proteina-DNA. Spesso, le quantità di interesse sono le occupazioni differenziali relative ai controlli, tra background genetici, trattamenti o loro combinazioni. Gli attuali metodi per l'occupazione differenziale dei dati ChIP-Seq si basano tuttavia su tecniche di binning o finestre scorrevoli , per i quali la scelta delle dimensioni della finestra e del bin è soggettiva. Qui presentiamo GenoGAM (Genome-wide Generalized Additive Model), che porta il framework di modelli additivi generalizzati ben consolidato e flessibile alle applicazioni genomiche utilizzando una strategia di parallelismo dei dati. modello ChIP-Seq legge le frequenze di conteggio come prodotti di funzioni regolari lungo i cromosomi I parametri di lisciatura sono stimati oggettivamente dai dati mediante convalida incrociata, eliminando binning e windowi ad hoc ng necessari per gli approcci attuali. GenoGAM fornisce test di significatività a livello base e regionale per progetti fattoriali completi. L'applicazione a un set di dati ChIP-Seq nel lievito ha mostrato una maggiore sensibilità rispetto ai metodi di occupazione differenziale esistenti durante il controllo del tasso di errore di tipo I. Analizzando una serie di dati sulla metilazione del DNA e illustrando un'estensione a un chiamante di picco, dimostriamo ulteriormente il potenziale di GenoGAM come strumento di modellazione statistica generica per analisi dell'intero genoma. Il software è disponibile da Bioconductor: https://www. bioconductor. org/packages/release/bioc/html/GenoGAM. html. gagneur@in. tum. de. Ulteriori informazioni sono disponibili su Bioinformatica online.
Chlamydia trachomatis ChxR è un regolatore trascrizionale dei fattori di virulenza che funzionano nelle interazioni in vivo ospite-patogeno.Chlamydia trachomatis è un patogeno intracellulare obbligato caratterizzato da un ciclo di sviluppo bifasico unico che si alterna tra organismi infettivi e non infettivi. Chlamydial ChxR è un attivatore trascrizionale che è stato implicato nella regolazione del ciclo di sviluppo. Abbiamo utilizzato un approccio di genetica inversa per generare tre mutanti nulli chxR. Tutti e tre i mutanti sono cresciuti normalmente in cellule di mammifero in coltura. Il sequenziamento dell'intero genoma ha identificato SNP in altri geni; tuttavia, nessuno dei geni mutati era comune a tutti e tre i mutanti null di ChxR, argomentando contro un meccanismo di compensazione genetica che spiegherebbe il fenotipo di crescita in vitro non essenziale. identificato cinque proteine, CT005, CT214, CT565, CT694 e CT695, che erano significativamente sottoregolate in tutti i mutanti null di ChxR. Questo gruppo include membrane di inclusione stabilite e proteine secrete di tipo III. La regolazione trascrizionale di ChxR di questi geni è stata confermata da qRT-PCR. È importante sottolineare che, mentre i mutanti null di ChxR non hanno mostrato carenze di crescita in vitro, hanno mostrato differenze significative nella crescita in vivo utilizzando un modello di tratto genitale di topo. Nel complesso, i nostri risultati hanno dimostrato che ChxR è un attivatore trascrizionale che regola l'espressione dei geni di virulenza le cui funzioni sono limitate all'infezione in vivo.
Determinazione simultanea e farmacocinetica comparativa degli alcaloidi solubili in acqua Fuzi tra ratti con insufficienza cardiaca normale e acuta mediante il metodo di cromatografia liquida Ultra Performance.Per confrontare la farmacocinetica degli alcaloidi idrosolubili Fuzi tra ratti con insufficienza cardiaca normale e acuta, è stato sviluppato un metodo di cromatografia liquida ultra performante (UPLC) per la determinazione simultanea di esso nel plasma di ratto. I campioni di plasma sono stati trattati con il metodo della precipitazione delle proteine. Sette alcaloidi idrosolubili sono stati separati su una colonna CAPCELL e rilevati in condizioni cromatografiche ottimizzate. Le curve di calibrazione di sette componenti mirati hanno mostrato una buona linearità con r2 > 0,9990 con recuperi medi dall'82,72 al 103,33% e l'effetto matrice variava dal 90,02 al 104,03%. e le deviazioni standard relative inter-batch erano <10,72% e l'errore relativo di precisione era compreso nell'intervallo -12,79-4,44%, rispetto molto. Dopo somministrazione orale, ne sono state studiate le caratteristiche farmacocinetiche. Rispetto al gruppo normale, la Cmax e l'AUClast (area sotto la curva concentrazione plasmatica-tempo dal momento della somministrazione al momento dell'ultima concentrazione quantificabile) di sette componenti eccetto 3-metossi-p-tiramina cloridrato sono risultate ovviamente aumentate con notevole prolungamento t1/2 nel gruppo con insufficienza cardiaca acuta. In conclusione, è stato sviluppato e convalidato per la prima volta un metodo UPLC rapido, semplice e sensibile per la quantificazione simultanea di sette alcaloidi idrosolubili nel plasma di ratto. E lo studio ha dimostrato che la condizione della malattia ha avuto un impatto sulla farmacocinetica degli alcaloidi idrosolubili Fuzi nei ratti in vivo.
Economia sanitaria computazionale per l'identificazione di iscritti all'assistenza sanitaria non redditizi.Gli assicuratori sanitari possono tentare di progettare i loro piani sanitari per attirare iscritti redditizi e scoraggiare quelli non redditizi. Tali assicuratori non fornirebbero livelli di assistenza socialmente efficienti fornendo piani sanitari che massimizzano i benefici per la società, ma piuttosto distorcendo intenzionalmente i benefici del piano per evitare iscritti ad alto costo, potenzialmente a scapito della salute e dell'efficienza. componente specifico della progettazione del piano sanitario a rischio di distorsione dell'assicurazione sanitaria nei mercati dell'assicurazione sanitaria: il formulario dei farmaci da prescrizione Introduciamo una funzione di apprendimento automatico insieme per determinare se le variabili di utilizzo del farmaco sono predittive di una nuova misura della non redditività degli iscritti che deriviamo, e quindi vulnerabili alle distorsioni da parte degli assicuratori. La nostra implementazione contiene anche un'esclusiva selezione di variabili specifiche per l'applicazione per ol. Questo studio dimostra che il super apprendimento è efficace nell'estrarre il segnale rilevante per questo problema di previsione e che un piccolo numero di variabili farmacologiche può essere utilizzato per identificare gli iscritti non redditizi. I risultati sono incoraggianti e preoccupanti. Mentre l'aggiustamento del rischio sembra essere stato ragionevolmente efficace nell'indebolire la relazione tra l'utilizzo di farmaci specifici per classe terapeutica e la non redditività, alcune classi rimangono predittive delle perdite degli assicuratori. Gli iscritti vulnerabili i cui regimi di farmaci soggetti a prescrizione includono farmaci in queste classi potrebbero aver bisogno di una protezione speciale da parte delle autorità di regolamentazione nella progettazione del mercato dell'assicurazione sanitaria.
DLTree: ricostruzione della filogenesi efficiente e accurata utilizzando il metodo del linguaggio dinamico.Nel passato sono stati proposti numerosi metodi senza allineamento per la ricostruzione della filogenesi due decenni. Ma ci sono alcune sfide di vecchia data in questi metodi, tra cui la necessità di un'enorme memoria del computer e del tempo della CPU e l'esistenza di calcoli duplicati. In questo articolo, affrontiamo queste sfide con l'idea di vettore compresso, impronta digitale e memoria scalabile Con queste idee abbiamo sviluppato l'algoritmo DLTree per l'implementazione efficiente del modello linguistico dinamico e l'analisi filogenetica basata sull'intero genoma. L'algoritmo DLTree è stato confrontato con altri strumenti privi di allineamento, dimostrando che è più efficiente e preciso per la ricostruzione della filogenesi. L'algoritmo DLTree è disponibile gratuitamente su http://dltree. xtu. edu. cn. yuzuguo@aliyun. com o yangjy@nankai. edu. cn. Dati supplementari sono disponibili su Bioinforma tic online.