Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11696576
The metabolic stability of the compounds was determined through in vitro stability assays in human plasma.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "metabolic", "stability", "of", "the", "compounds", "was", "determined", "through", "in", "vitro", "stability", "assays", "in", "human", "plasma", "." ] } ]
PMC11429241
The sophisticated architecture plays a key role in enhancing the area for cell support.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "sophisticated", "architecture", "plays", "a", "key", "role", "in", "enhancing", "the", "area", "for", "cell", "support", "." ] } ]
PMC11001582
Following a small incision, the skin overlying the skull was retracted and connective tissue over the skull cleared.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Following", "a", "small", "incision", ",", "the", "skin", "overlying", "the", "skull", "was", "retracted", "and", "connective", "tissue", "over", "the", "skull", "cleared", "." ] } ]
PMC9429973
First VC (VC1) had 86 pts, and median age was 44 years.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "First", "VC", "(", "VC1", ")", "had", "86", "pts", ",", "and", "median", "age", "was", "44", "years", "." ] } ]
PMC7504302
Although not translated into proteins, ncRNAs have been shown to play multidimensional roles in a wide range of biological processes such as activation or repression of transcription, regulation of mRNA translation, post-translational modifications, and chromatin remodeling .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "not", "translated", "into", "proteins", ",", "ncRNAs", "have", "been", "shown", "to", "play", "multidimensional", "roles", "in", "a", "wide", "range", "of", "biological", "processes", "such", "as", "activation", "or", "repression", "of", "transcription", ",", "regulation", "of", "mRNA", "translation", ",", "post-translational", "modifications", ",", "and", "chromatin", "remodeling", "." ] } ]
PMC11656657
Notably, CAR.GD2 T-cells demonstrated a significant and highly effective lysis of tumor cells even at a very low E:T ratio of 1:32 (p = 0.0044 for 143B and p = 0.0130 for RD cell line, respectively) in 2D models (Supplemental Fig. 6A-B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Notably", ",", "CAR.GD2", "T-cells", "demonstrated", "a", "significant", "and", "highly", "effective", "lysis", "of", "tumor", "cells", "even", "at", "a", "very", "low", "E", ":", "T", "ratio", "of", "1:32", "(", "p", "=", "0.0044", "for", "143B", "and", "p", "=", "0.0130", "for", "RD", "cell", "line", ",", "respectively", ")", "in", "2D", "models", "(", "Supplemental", "Fig.", "6A-B", ")", "." ] } ]
PMC11499955
The mean number of TMPP linked to the antibodies, TAR for Tag-Antibody-Ratio, was determined (TAR from 2 to 4, Fig. 3 and Table S1†).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "mean", "number", "of", "TMPP", "linked", "to", "the", "antibodies", ",", "TAR", "for", "Tag-Antibody-Ratio", ",", "was", "determined", "(", "TAR", "from", "2", "to", "4", ",", "Fig.", "3", "and", "Table", "S1†", ")", "." ] } ]
PMC11322866
Western blots showing p21 levels in RPMI-8226 and OCI-MY5 cells after GSK126 treatment. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Western", "blots", "showing", "p21", "levels", "in", "RPMI-8226", "and", "OCI-MY5", "cells", "after", "GSK126", "treatment", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
E. Heyes, A. S. Wilhelmson, A. Wenzel, M. B. Schuster, M. Ali, T. D’Altri, T. Eder, G. Manhart, E. Rzepa, L. Schmidt, M. Meggendorfer, T. Haferlach, G. Volpe, C. Nerlov, J. Frampton, K. Jae Won, F. Grebien, B. Porse Institute of Medical Biochemistry, University of Veterinary Medicine Vienna, Vienna, Austria; The Finsen Laboratory, Rigshospitalet, Faculty of Health Sciences; Biotech Research and Innovation Center (BRIC); Novo Nordisk Foundation Center for Stem Cell Biology, DanStem, Faculty of Health Sciences, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark; MLL Munich Leukemia Laboratory, München, Germany; Institute of Cancer and Genomic Sciences, College of Medical and Dental Sciences, University of Birmingham, Birmingham; MRC Molecular Haematology Unit, Weatherall Institute of Molecular Medicine, University of Oxford, Oxford, United Kingdom Background: The transcription factor CCAAT-enhancer-binding protein alpha (C/EBPα) is a master regulator of granulopoiesis and is mutated in 10-15 % of Acute Myeloid Leukemia (AML) patients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "E.", "Heyes", ",", "A.", "S.", "Wilhelmson", ",", "A.", "Wenzel", ",", "M.", "B.", "Schuster", ",", "M.", "Ali", ",", "T.", "D’Altri", ",", "T.", "Eder", ",", "G.", "Manhart", ",", "E.", "Rzepa", ",", "L.", "Schmidt", ",", "M.", "Meggendorfer", ",", "T.", "Haferlach", ",", "G.", "Volpe", ",", "C.", "Nerlov", ",", "J.", "Frampton", ",", "K.", "Jae", "Won", ",", "F.", "Grebien", ",", "B.", "Porse", "Institute", "of", "Medical", "Biochemistry", ",", "University", "of", "Veterinary", "Medicine", "Vienna", ",", "Vienna", ",", "Austria", ";", "The", "Finsen", "Laboratory", ",", "Rigshospitalet", ",", "Faculty", "of", "Health", "Sciences", ";", "Biotech", "Research", "and", "Innovation", "Center", "(", "BRIC", ")", ";", "Novo", "Nordisk", "Foundation", "Center", "for", "Stem", "Cell", "Biology", ",", "DanStem", ",", "Faculty", "of", "Health", "Sciences", ",", "University", "of", "Copenhagen", ",", "Copenhagen", ",", "Denmark", ";", "MLL", "Munich", "Leukemia", "Laboratory", ",", "München", ",", "Germany", ";", "Institute", "of", "Cancer", "and", "Genomic", "Sciences", ",", "College", "of", "Medical", "and", "Dental", "Sciences", ",", "University", "of", "Birmingham", ",", "Birmingham", ";", "MRC", "Molecular", "Haematology", "Unit", ",", "Weatherall", "Institute", "of", "Molecular", "Medicine", ",", "University", "of", "Oxford", ",", "Oxford", ",", "United", "Kingdom", "Background", ":", "The", "transcription", "factor", "CCAAT-enhancer-binding", "protein", "alpha", "(", "C/EBPα", ")", "is", "a", "master", "regulator", "of", "granulopoiesis", "and", "is", "mutated", "in", "10", "-", "15", "%", "of", "Acute", "Myeloid", "Leukemia", "(", "AML", ")", "patients", "." ] } ]
PMC9429973
Patients were aged >18 years with untreated DLBCL and impaired cardiac function with a left ventricular ejection fraction (LVEF) >40% and ≤ 50%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patients", "were", "aged", ">", "18", "years", "with", "untreated", "DLBCL", "and", "impaired", "cardiac", "function", "with", "a", "left", "ventricular", "ejection", "fraction", "(", "LVEF", ")", ">", "40", "%", "and", "≤", "50", "%", "." ] } ]
PMC8584319
In addition, the combined treatment with AZD8055 and refametinib or SB203580 did not affect the phosphorylation pattern of 4E-BP1 (Figure 3c,d).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "the", "combined", "treatment", "with", "AZD8055", "and", "refametinib", "or", "SB203580", "did", "not", "affect", "the", "phosphorylation", "pattern", "of", "4E-BP1", "(", "Figure", "3c", ",", "d", ")", "." ] } ]
PMC7987994
Extracts were either added to a sub-confluent cell monolayer 24 h post-seeding (1st mode) or were added to freshly suspended cells (2nd mode).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Extracts", "were", "either", "added", "to", "a", "sub-confluent", "cell", "monolayer", "24", "h", "post-seeding", "(", "1st", "mode", ")", "or", "were", "added", "to", "freshly", "suspended", "cells", "(", "2nd", "mode", ")", "." ] } ]
PMC10938377
Cisplatin and RAPTA-C were tested as positive (0–100 μM) and negative (>200 μM) controls, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cisplatin", "and", "RAPTA-C", "were", "tested", "as", "positive", "(", "0–100", "μM", ")", "and", "negative", "(", ">", "200", "μM", ")", "controls", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11765879
Generally, quercetin exerted a more potent influence than rutin in both cell lines, as the resulting IC50 values were around 90 and 50 µM for rutin and quercetin, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Generally", ",", "quercetin", "exerted", "a", "more", "potent", "influence", "than", "rutin", "in", "both", "cell", "lines", ",", "as", "the", "resulting", "IC50", "values", "were", "around", "90", "and", "50", "µM", "for", "rutin", "and", "quercetin", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11740907
The first need is that particles must have a size large enough to hinder their excretion via the kidneys.55 The second condition is that the particles have a small size to avoid being engulfed by phagocytosis and then eliminated by the system of reticuloendothelial cells (RES).56 Current research suggests that biomolecules weighing more than 40 kDa, together with nanostructures varying in dimension from 10 to 500 nm, may pass through the network of capillaries and concentrate in the interstitial region of tumors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "first", "need", "is", "that", "particles", "must", "have", "a", "size", "large", "enough", "to", "hinder", "their", "excretion", "via", "the", "kidneys.55", "The", "second", "condition", "is", "that", "the", "particles", "have", "a", "small", "size", "to", "avoid", "being", "engulfed", "by", "phagocytosis", "and", "then", "eliminated", "by", "the", "system", "of", "reticuloendothelial", "cells", "(RES).56", "Current", "research", "suggests", "that", "biomolecules", "weighing", "more", "than", "40", "kDa", ",", "together", "with", "nanostructures", "varying", "in", "dimension", "from", "10", "to", "500", "nm", ",", "may", "pass", "through", "the", "network", "of", "capillaries", "and", "concentrate", "in", "the", "interstitial", "region", "of", "tumors", "." ] } ]
PMC11087766
The Upper panel shows a cell with a single nucleus, while the Lower panel depicts a cell with multiple phage nuclei and a single PicA punctum on each nucleus. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Upper", "panel", "shows", "a", "cell", "with", "a", "single", "nucleus", ",", "while", "the", "Lower", "panel", "depicts", "a", "cell", "with", "multiple", "phage", "nuclei", "and", "a", "single", "PicA", "punctum", "on", "each", "nucleus", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
Methods: STIMULUS-MDS1 (NCT03946670) is an international, randomized, double-blind, placebo-controlled, ph II trial evaluating sabatolimab + HMA in pts with very-high, high-, or intermediate-risk (vH/H/IR)-MDS who have completed enrollment (N=127).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "STIMULUS-MDS1", "(", "NCT03946670", ")", "is", "an", "international", ",", "randomized", ",", "double-blind", ",", "placebo-controlled", ",", "ph", "II", "trial", "evaluating", "sabatolimab", "+", "HMA", "in", "pts", "with", "very-high", ",", "high-", ",", "or", "intermediate-risk", "(vH/H/IR)-MDS", "who", "have", "completed", "enrollment", "(", "N=127", ")", "." ] } ]
PMC9429973
LNPs were characterized by dynamic light scattering (DLS) and cryo electron microscopy (EM).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "LNPs", "were", "characterized", "by", "dynamic", "light", "scattering", "(", "DLS", ")", "and", "cryo", "electron", "microscopy", "(", "EM", ")", "." ] } ]
PMC9429973
L. Van Der Straten, C. C. Maas, M.-D. Levin, O. Visser, E. F. Posthuma, J. K. Doorduin, A. W. Langerak, A. P. Kater, A. G. Dinmohamed Research and Development, Netherlands Comprehensive Cancer Organisation (IKNL), Utrecht; Internal Medicine, Albert Schweitzer hospital, Dordrecht; Immunology, Laboratory Medical Immunology, Erasmus MC; Public Health, Erasmus MC, University Medical Center Rotterdam, Rotterdam; Registration, Netherlands Comprehensive Cancer Organisation (IKNL), Utrecht; Internal Medicine, Reinier The Graaf Hospital, Delft; Hematology, Leiden University Medical Center, Leiden; Hematology, Erasmus MC Cancer Institute, University Medical Center Rotterdam, Rotterdam; Hematology, Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Cancer Center Amsterdam, Lymphoma and Myeloma Center Amsterdam; Hematology, Amsterdam UMC, Vrije Universiteit Amsterdam, Cancer Center Amsterdam, Amsterdam, Netherlands Background: The introduction of chemoimmunotherapy heralded a new era for chronic lymphocytic leukemia (CLL) management.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "L.", "Van", "Der", "Straten", ",", "C.", "C.", "Maas", ",", "M.-D.", "Levin", ",", "O.", "Visser", ",", "E.", "F.", "Posthuma", ",", "J.", "K.", "Doorduin", ",", "A.", "W.", "Langerak", ",", "A.", "P.", "Kater", ",", "A.", "G.", "Dinmohamed", "Research", "and", "Development", ",", "Netherlands", "Comprehensive", "Cancer", "Organisation", "(", "IKNL", ")", ",", "Utrecht", ";", "Internal", "Medicine", ",", "Albert", "Schweitzer", "hospital", ",", "Dordrecht", ";", "Immunology", ",", "Laboratory", "Medical", "Immunology", ",", "Erasmus", "MC", ";", "Public", "Health", ",", "Erasmus", "MC", ",", "University", "Medical", "Center", "Rotterdam", ",", "Rotterdam", ";", "Registration", ",", "Netherlands", "Comprehensive", "Cancer", "Organisation", "(", "IKNL", ")", ",", "Utrecht", ";", "Internal", "Medicine", ",", "Reinier", "The", "Graaf", "Hospital", ",", "Delft", ";", "Hematology", ",", "Leiden", "University", "Medical", "Center", ",", "Leiden", ";", "Hematology", ",", "Erasmus", "MC", "Cancer", "Institute", ",", "University", "Medical", "Center", "Rotterdam", ",", "Rotterdam", ";", "Hematology", ",", "Amsterdam", "UMC", ",", "University", "of", "Amsterdam", ",", "Cancer", "Center", "Amsterdam", ",", "Lymphoma", "and", "Myeloma", "Center", "Amsterdam", ";", "Hematology", ",", "Amsterdam", "UMC", ",", "Vrije", "Universiteit", "Amsterdam", ",", "Cancer", "Center", "Amsterdam", ",", "Amsterdam", ",", "Netherlands", "Background", ":", "The", "introduction", "of", "chemoimmunotherapy", "heralded", "a", "new", "era", "for", "chronic", "lymphocytic", "leukemia", "(", "CLL", ")", "management", "." ] } ]
PMC11754432
However, SREBP2 protein localisation was not altered in keratinocytes upon ALOX15B silencing.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "SREBP2", "protein", "localisation", "was", "not", "altered", "in", "keratinocytes", "upon", "ALOX15B", "silencing", "." ] } ]
PMC11478724
Then 150µl of the solution was centrifuged at 400g for 5 min and 50 µl of the supernatant to was an equal proportion of buffer and substrate solution.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Then", "150µl", "of", "the", "solution", "was", "centrifuged", "at", "400", "g", "for", "5", "min", "and", "50", "µl", "of", "the", "supernatant", "to", "was", "an", "equal", "proportion", "of", "buffer", "and", "substrate", "solution", "." ] } ]
PMC6600253
The ectopic subunit of the telomerase complex is able to maintain the telomere length and immortalize normal cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "ectopic", "subunit", "of", "the", "telomerase", "complex", "is", "able", "to", "maintain", "the", "telomere", "length", "and", "immortalize", "normal", "cells", "." ] } ]
PMC11799620
Also, Future research is needed to carry out further biochemical investigations to isolate and clarify the mechanism behind the activity of this extract.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Also", ",", "Future", "research", "is", "needed", "to", "carry", "out", "further", "biochemical", "investigations", "to", "isolate", "and", "clarify", "the", "mechanism", "behind", "the", "activity", "of", "this", "extract", "." ] } ]
PMC11770746
Progress of reactions was monitored by analytical HPLC system (Thermo Scientific UltiMate 3000) with a reversed-phase C18 column Phenomenex Kinetex, length 100 mm, internal dia 4.60 mm, particle size 2.6 μm, pore size 100 Å. The purity and retention time (RT) of the synthesized compound reported here were measured with the same analytical HPLC system water/acetonitrile gradient at the flow rate of 1 mL/min.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Progress", "of", "reactions", "was", "monitored", "by", "analytical", "HPLC", "system", "(", "Thermo", "Scientific", "UltiMate", "3000", ")", "with", "a", "reversed-phase", "C18", "column", "Phenomenex", "Kinetex", ",", "length", "100", "mm", ",", "internal", "dia", "4.60", "mm", ",", "particle", "size", "2.6", "μm", ",", "pore", "size", "100", "Å.", "The", "purity", "and", "retention", "time", "(", "RT", ")", "of", "the", "synthesized", "compound", "reported", "here", "were", "measured", "with", "the", "same", "analytical", "HPLC", "system", "water/acetonitrile", "gradient", "at", "the", "flow", "rate", "of", "1", "mL/min", "." ] } ]
PMC11597291
Next, the samples were centrifuged at 1000× g for 5 min.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Next", ",", "the", "samples", "were", "centrifuged", "at", "1000", "×", "g", "for", "5", "min", "." ] } ]
PMC11474209
Abbreviations: Bcl-2: B-cell leukemia/lymphoma 2 protein; cdc2: Cell division control 2; cdc25C: Cell division cycle 25; cGAS: Cyclic GMP-AMP synthase; cGAS-STING signaling pathway: Cyclic GMP–AMP synthase-stimulator of interferon gene signaling pathway; c-Myc: Cellular Myc; COX2: Cyclooxygenase enzyme; CTNNB1: Ctenin Beta 1; ERα: Estrogen receptors alpha; FAK: Focal adhesion kinase; FOXM1: Forkhead box M1; GS: Glycogen synthase; GSK-3: Glycogen synthase kinase 3; GSK3β: Glycogen synthase kinase 3 β; GSK3β: Glycogen synthase kinase 3 β; HAVSMCs: Human aortic vascular smooth muscle cells; HCC: Hepatocellular carcinoma; HIF-1α: Hypoxia-inducible factor 1-alpha; HL7702 cell: Human normal liver cells; HSP27: Heat shock protein 27; Hsp90: Heat shock protein 90; HUC-1 cells: Human uroepithelial cells-1 cells; HUVECs: Human umbilical vein endothelial cells; INS: Insulin; IRS1: Insulin receptor substrate 1; JAK2: Janus kinase 2; Krt16: Keratin 16; MAPK: Mitogen-activated protein kinases; MLC: Myosin light chain; MMP: Mitochondrial membrane potential; MMP7: Matrix metalloproteinase-7; mTOR: Mammalian target of rapamycin; P53: Tumor protein 53; PI3K: Phosphatidylinositol-3 kinase; PI3K: phosphoinositide 3-kinase; ROCK: Rho-associated protein kinase; ROS: Reactive oxygen species; S6K1: Ribosomal protein S6 kinase beta-1; SGC-7901 cells: Human gastric cancer cell line; STAT3: signal transducer and activator of transcription 3; VASP: vasodilator-stimulated phosphoprotein; VEGFCyclin D1: Vascular endothelial growth factor Cyclin D1; PPI3/AKT: phpsphoinositide 3-kinase/protein kinaseB; HL7702: Human normal liver cell line; OATP1B1: Organic anion transporting polypeptide 1B1; OATP1B3: Organic anion transporting polypeptide 1B3; L02: Human normal liver cell line; HepG2: Human hepatoma cell line; RWPE-1: Epithelial cell derived cell line; LX-2: Human hepatic stellate cell line; NCM460: Human normal intestinal epithelium cell line; HepG2: Human hepatoma cell line; L02: Human normal liver cell line: CaCo2: Cancer coli-2 cell line.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Abbreviations", ":", "Bcl-2", ":", "B-cell", "leukemia/lymphoma", "2", "protein", ";", "cdc2", ":", "Cell", "division", "control", "2", ";", "cdc25C", ":", "Cell", "division", "cycle", "25", ";", "cGAS", ":", "Cyclic", "GMP-AMP", "synthase", ";", "cGAS-STING", "signaling", "pathway", ":", "Cyclic", "GMP", "–", "AMP", "synthase-stimulator", "of", "interferon", "gene", "signaling", "pathway", ";", "c-Myc", ":", "Cellular", "Myc", ";", "COX2", ":", "Cyclooxygenase", "enzyme", ";", "CTNNB1", ":", "Ctenin", "Beta", "1", ";", "ERα", ":", "Estrogen", "receptors", "alpha", ";", "FAK", ":", "Focal", "adhesion", "kinase", ";", "FOXM1", ":", "Forkhead", "box", "M1", ";", "GS", ":", "Glycogen", "synthase", ";", "GSK-3", ":", "Glycogen", "synthase", "kinase", "3", ";", "GSK3β", ":", "Glycogen", "synthase", "kinase", "3", "β", ";", "GSK3β", ":", "Glycogen", "synthase", "kinase", "3", "β", ";", "HAVSMCs", ":", "Human", "aortic", "vascular", "smooth", "muscle", "cells", ";", "HCC", ":", "Hepatocellular", "carcinoma", ";", "HIF-1α", ":", "Hypoxia-inducible", "factor", "1-alpha", ";", "HL7702", "cell", ":", "Human", "normal", "liver", "cells", ";", "HSP27", ":", "Heat", "shock", "protein", "27", ";", "Hsp90", ":", "Heat", "shock", "protein", "90", ";", "HUC-1", "cells", ":", "Human", "uroepithelial", "cells-1", "cells", ";", "HUVECs", ":", "Human", "umbilical", "vein", "endothelial", "cells", ";", "INS", ":", "Insulin", ";", "IRS1", ":", "Insulin", "receptor", "substrate", "1", ";", "JAK2", ":", "Janus", "kinase", "2", ";", "Krt16", ":", "Keratin", "16", ";", "MAPK", ":", "Mitogen-activated", "protein", "kinases", ";", "MLC", ":", "Myosin", "light", "chain", ";", "MMP", ":", "Mitochondrial", "membrane", "potential", ";", "MMP7", ":", "Matrix", "metalloproteinase-7", ";", "mTOR", ":", "Mammalian", "target", "of", "rapamycin", ";", "P53", ":", "Tumor", "protein", "53", ";", "PI3", "K", ":", "Phosphatidylinositol-3", "kinase", ";", "PI3", "K", ":", "phosphoinositide", "3-kinase", ";", "ROCK", ":", "Rho-associated", "protein", "kinase", ";", "ROS", ":", "Reactive", "oxygen", "species", ";", "S6K1", ":", "Ribosomal", "protein", "S6", "kinase", "beta-1", ";", "SGC-7901", "cells", ":", "Human", "gastric", "cancer", "cell", "line", ";", "STAT3", ":", "signal", "transducer", "and", "activator", "of", "transcription", "3", ";", "VASP", ":", "vasodilator-stimulated", "phosphoprotein", ";", "VEGFCyclin", "D1", ":", "Vascular", "endothelial", "growth", "factor", "Cyclin", "D1", ";", "PPI3/AKT", ":", "phpsphoinositide", "3-kinase/protein", "kinaseB", ";", "HL7702", ":", "Human", "normal", "liver", "cell", "line", ";", "OATP1B1", ":", "Organic", "anion", "transporting", "polypeptide", "1B1", ";", "OATP1B3", ":", "Organic", "anion", "transporting", "polypeptide", "1B3", ";", "L02", ":", "Human", "normal", "liver", "cell", "line", ";", "HepG2", ":", "Human", "hepatoma", "cell", "line", ";", "RWPE-1", ":", "Epithelial", "cell", "derived", "cell", "line", ";", "LX-2", ":", "Human", "hepatic", "stellate", "cell", "line", ";", "NCM460", ":", "Human", "normal", "intestinal", "epithelium", "cell", "line", ";", "HepG2", ":", "Human", "hepatoma", "cell", "line", ";", "L02", ":", "Human", "normal", "liver", "cell", "line", ":", "CaCo2", ":", "Cancer", "coli-2", "cell", "line", "." ] } ]
PMC3730428
Surprisingly, all MPM cell lines assessed were highly resistant to SMCs either alone or when incubated in the presence of clinically relevant levels of TNFα.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Surprisingly", ",", "all", "MPM", "cell", "lines", "assessed", "were", "highly", "resistant", "to", "SMCs", "either", "alone", "or", "when", "incubated", "in", "the", "presence", "of", "clinically", "relevant", "levels", "of", "TNFα", "." ] } ]
PMC11665555
Master regulator analysis of the RNA-Seq results helped us identify TFs orchestrating differentially expressed target genes (41, 42).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Master", "regulator", "analysis", "of", "the", "RNA-Seq", "results", "helped", "us", "identify", "TFs", "orchestrating", "differentially", "expressed", "target", "genes", "(", "41", ",", "42", ")", "." ] } ]
PMC6442998
Cells were washed with 0.01M PBS pH 7.4 and fixed for 30 min in fresh 4% paraformaldehyde, pH 7.4 then washed two times with 0.01M TBS, pH7.4 and stored in 0.01M TBS/Sodium azide 0.1% solution until use.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "washed", "with", "0.01", "M", "PBS", "pH", "7.4", "and", "fixed", "for", "30", "min", "in", "fresh", "4", "%", "paraformaldehyde", ",", "pH", "7.4", "then", "washed", "two", "times", "with", "0.01", "M", "TBS", ",", "pH7.4", "and", "stored", "in", "0.01", "M", "TBS/Sodium", "azide", "0.1", "%", "solution", "until", "use", "." ] } ]
PMC11757230
The normality of the data was tested using the Shapiro–Wilks normality test.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "normality", "of", "the", "data", "was", "tested", "using", "the", "Shapiro", "–", "Wilks", "normality", "test", "." ] } ]
PMC11471176
Note: Red color (circles) is for the Vero Cell line, Green (squares) for the luminal or hormonal breast cancer cell line (MCF-7), Blue (diamond) for human triple negative breast cancer cell line (MDA-MB-231), Grey (triangle) for the murine cell line (EMT-6).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Note", ":", "Red", "color", "(", "circles", ")", "is", "for", "the", "Vero", "Cell", "line", ",", "Green", "(", "squares", ")", "for", "the", "luminal", "or", "hormonal", "breast", "cancer", "cell", "line", "(", "MCF-7", ")", ",", "Blue", "(", "diamond", ")", "for", "human", "triple", "negative", "breast", "cancer", "cell", "line", "(", "MDA-MB-231", ")", ",", "Grey", "(", "triangle", ")", "for", "the", "murine", "cell", "line", "(", "EMT-6", ")", "." ] } ]
PMC11678368
In the IR spectra of these complexes, a band observed in the 3319–3219 cm range is attributed to the antisymmetric stretching vibration, νas(N1H), of the pyrrole ring.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "IR", "spectra", "of", "these", "complexes", ",", "a", "band", "observed", "in", "the", "3319–3219", "cm", "range", "is", "attributed", "to", "the", "antisymmetric", "stretching", "vibration", ",", "νas(N1H", ")", ",", "of", "the", "pyrrole", "ring", "." ] } ]
PMC9429973
Furthermore, a limiting dilution was introduced to determine the lowest cell concentration required for invasion.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "a", "limiting", "dilution", "was", "introduced", "to", "determine", "the", "lowest", "cell", "concentration", "required", "for", "invasion", "." ] } ]
PMC11412752
The wild-type (WT) HepG2 cell line was kindly provided by Professor Qiaoming Long (Medical College of Soochow University, Suzhou, China) .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "wild-type", "(", "WT", ")", "HepG2", "cell", "line", "was", "kindly", "provided", "by", "Professor", "Qiaoming", "Long", "(", "Medical", "College", "of", "Soochow", "University", ",", "Suzhou", ",", "China", ")", "." ] } ]
PMC11470999
Thus, combining PF with existing standard treatments might produce synergistic effects in treating melanoma and its metastases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "combining", "PF", "with", "existing", "standard", "treatments", "might", "produce", "synergistic", "effects", "in", "treating", "melanoma", "and", "its", "metastases", "." ] } ]
PMC11696576
Inducing ROS-dependent cell death has become a key approach in cancer biology.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Inducing", "ROS-dependent", "cell", "death", "has", "become", "a", "key", "approach", "in", "cancer", "biology", "." ] } ]
PMC10772747
In other words, EBE compounds have the potential to inhibit the activity of CDK 4/6, maintain Rb in an unphosphorylated state, and prevent the release of E2F.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "other", "words", ",", "EBE", "compounds", "have", "the", "potential", "to", "inhibit", "the", "activity", "of", "CDK", "4/6", ",", "maintain", "Rb", "in", "an", "unphosphorylated", "state", ",", "and", "prevent", "the", "release", "of", "E2F", "." ] } ]
PMC9918897
In the development of a XN-based functional health product, preliminary in vivo experimental experience is essential to unravel the factors that may result in the maximum health benefit of the product.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "development", "of", "a", "XN-based", "functional", "health", "product", ",", "preliminary", "in", "vivo", "experimental", "experience", "is", "essential", "to", "unravel", "the", "factors", "that", "may", "result", "in", "the", "maximum", "health", "benefit", "of", "the", "product", "." ] } ]
PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: •Our study generates data that contribute to future research on physicians exposed to prolonged uncertainties in clinical and laboratory practice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "•Our", "study", "generates", "data", "that", "contribute", "to", "future", "research", "on", "physicians", "exposed", "to", "prolonged", "uncertainties", "in", "clinical", "and", "laboratory", "practice", "." ] } ]
PMC11049294
Graphpad Prism 9.0 (Graphad, San Diego, CA, USA) was used for statistical analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Graphpad", "Prism", "9.0", "(", "Graphad", ",", "San", "Diego", ",", "CA", ",", "USA", ")", "was", "used", "for", "statistical", "analysis", "." ] } ]
PMC11699042
Interestingly, Ben-David et al. reanalyzed the genomic data (whole exome sequencing) of 106 cancer cell lines provided by the Broad and the Sanger Institutes and showed a significant diversity in allelic fraction for somatic variants in this panel of cell lines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "Ben-David", "et", "al.", "reanalyzed", "the", "genomic", "data", "(", "whole", "exome", "sequencing", ")", "of", "106", "cancer", "cell", "lines", "provided", "by", "the", "Broad", "and", "the", "Sanger", "Institutes", "and", "showed", "a", "significant", "diversity", "in", "allelic", "fraction", "for", "somatic", "variants", "in", "this", "panel", "of", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC11721587
Gli1: TATGGGGTTGGGAGAGTTTG(F); AAAGAGACCTGG-GACAGACAC(R).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Gli1", ":", "TATGGGGTTGGGAGAGTTTG(F", ")", ";", "AAAGAGACCTGG-GACAGACAC(R", ")", "." ] } ]
PMC3681794
indicates p<0.05 as determined by the 2-tailed student t-test.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "indicates", "p<0.05", "as", "determined", "by", "the", "2-tailed", "student", "t-test", "." ] } ]
PMC11295144
Representative examples of voltage-clamp recordings of IPSCs in HEK cells expressing (A) α2β3γ2-GABAARs without NL2, (B) α2β3γ2 with NL2, (C) α4β3γ2 with NL2, (D) α4β3δ without NL2, (E) α4β3δ with NL2, and (F) α2β3δ with NL2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Representative", "examples", "of", "voltage-clamp", "recordings", "of", "IPSCs", "in", "HEK", "cells", "expressing", "(", "A", ")", "α2β3γ2-GABAARs", "without", "NL2", ",", "(", "B", ")", "α2β3γ2", "with", "NL2", ",", "(", "C", ")", "α4β3γ2", "with", "NL2", ",", "(", "D", ")", "α4β3δ", "without", "NL2", ",", "(", "E", ")", "α4β3δ", "with", "NL2", ",", "and", "(", "F", ")", "α2β3δ", "with", "NL2", "." ] } ]
PMC5963610
However, NGcGM3/VSSP vaccine surprisingly reduces the phosphorylation of EGFR (Figure 2B) and Stat3 (Figure 2C) as compared with 7A7 mAb and the control (PBS).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "NGcGM3/VSSP", "vaccine", "surprisingly", "reduces", "the", "phosphorylation", "of", "EGFR", "(", "Figure", "2B", ")", "and", "Stat3", "(", "Figure", "2C", ")", "as", "compared", "with", "7A7", "mAb", "and", "the", "control", "(", "PBS", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: We studied factors that affected early and late optimal PCR responses (OPR) and survival in patients (pts) of CBF AML who were treated with fludarabine based regiemns (fludarabine, cytarabine and GCSF) with idarubicin (FLAG-IDA) or gemtuzumab (FLAG-GO).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "We", "studied", "factors", "that", "affected", "early", "and", "late", "optimal", "PCR", "responses", "(", "OPR", ")", "and", "survival", "in", "patients", "(", "pts", ")", "of", "CBF", "AML", "who", "were", "treated", "with", "fludarabine", "based", "regiemns", "(", "fludarabine", ",", "cytarabine", "and", "GCSF", ")", "with", "idarubicin", "(", "FLAG-IDA", ")", "or", "gemtuzumab", "(", "FLAG-GO", ")", "." ] } ]
PMC10605143
In the case of MCF12A cells with reduced HSF1 expression, they began to form clusters in subconfluent 2D culture, which was not observed in cells with normal HSF1 levels (Figure 2g, upper panel).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "case", "of", "MCF12A", "cells", "with", "reduced", "HSF1", "expression", ",", "they", "began", "to", "form", "clusters", "in", "subconfluent", "2D", "culture", ",", "which", "was", "not", "observed", "in", "cells", "with", "normal", "HSF1", "levels", "(", "Figure", "2", "g", ",", "upper", "panel", ")", "." ] } ]
PMC7917457
All naive mice presented uncontrollable tumor growth and were sacrificed at day 29 post-tumor implantation, whereas none of the complete responders from any group showed signs of tumor growth at this time point, indicating an effective systemic immunity against the injected tumor.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "naive", "mice", "presented", "uncontrollable", "tumor", "growth", "and", "were", "sacrificed", "at", "day", "29", "post-tumor", "implantation", ",", "whereas", "none", "of", "the", "complete", "responders", "from", "any", "group", "showed", "signs", "of", "tumor", "growth", "at", "this", "time", "point", ",", "indicating", "an", "effective", "systemic", "immunity", "against", "the", "injected", "tumor", "." ] } ]
PMC11615101
Figure 7Alpha-Taxilin ameliorates RA-like symptom in CIA rats. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "7Alpha-Taxilin", "ameliorates", "RA-like", "symptom", "in", "CIA", "rats", ".", "(" ] } ]
PMC9325715
The results may indicate, that the first adsorption layer was fully filled with iron in the obtained complex.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "may", "indicate", ",", "that", "the", "first", "adsorption", "layer", "was", "fully", "filled", "with", "iron", "in", "the", "obtained", "complex", "." ] } ]
PMC4685407
We were able to efficiently insert exogenous genes into a specific genomic region using the simple CRISPR-Cas9 vector system; additionally, Dnmt3a knock-out CHO cell lines were successfully constructed using this method.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "were", "able", "to", "efficiently", "insert", "exogenous", "genes", "into", "a", "specific", "genomic", "region", "using", "the", "simple", "CRISPR-Cas9", "vector", "system", ";", "additionally", ",", "Dnmt3a", "knock-out", "CHO", "cell", "lines", "were", "successfully", "constructed", "using", "this", "method", "." ] } ]
PMC11628904
Following burn injury, larvae were returned to 28.5°C until imaging.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Following", "burn", "injury", ",", "larvae", "were", "returned", "to", "28.5", "°", "C", "until", "imaging", "." ] } ]
PMC11594806
Extracellular ADO can function as both an immune stimulator and suppressor, depending on the context and the signaling pathways involved .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Extracellular", "ADO", "can", "function", "as", "both", "an", "immune", "stimulator", "and", "suppressor", ",", "depending", "on", "the", "context", "and", "the", "signaling", "pathways", "involved", "." ] } ]
PMC11320834
BRCA1 and BRCA2 regulate cellular processes, e.g., transcription, the cell cycle, and the DNA damage response (DDR), with a particularly significant role in the mechanism of DNA double-strand break repair and homologous recombination .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "BRCA1", "and", "BRCA2", "regulate", "cellular", "processes", ",", "e.g.", ",", "transcription", ",", "the", "cell", "cycle", ",", "and", "the", "DNA", "damage", "response", "(", "DDR", ")", ",", "with", "a", "particularly", "significant", "role", "in", "the", "mechanism", "of", "DNA", "double-strand", "break", "repair", "and", "homologous", "recombination", "." ] } ]
PMC11224020
Data were analyzed by ordinary one-way ANOVA; ****P < 0.0001; *P = 0.0134.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "were", "analyzed", "by", "ordinary", "one-way", "ANOVA", ";", "*", "*", "*", "*", "P", "<", "0.0001", ";", "*", "P", "=", "0.0134", "." ] } ]
PMC11513011
The DIB group had significantly suppressed cell proliferation at each concentration in all kind of bladder cancer cells tested.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "DIB", "group", "had", "significantly", "suppressed", "cell", "proliferation", "at", "each", "concentration", "in", "all", "kind", "of", "bladder", "cancer", "cells", "tested", "." ] } ]
PMC11300639
CDK4/6 inhibitors have been approved for the clinical treatment of breast cancer, and it has been found that they have synergistic effects with estrogen antagonists in breast cancer cell lines [8–10].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CDK4/6", "inhibitors", "have", "been", "approved", "for", "the", "clinical", "treatment", "of", "breast", "cancer", ",", "and", "it", "has", "been", "found", "that", "they", "have", "synergistic", "effects", "with", "estrogen", "antagonists", "in", "breast", "cancer", "cell", "lines", "[", "8–10", "]", "." ] } ]
PMC11599565
Both SKOV3 and SKOV3 cells were exposed to single drugs or to the combinations of the MAP4K4 inhibitor (MAP4K4i) with each one of the Notch pathway inhibitors for 24h.
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Both", "SKOV3", "and", "SKOV3", "cells", "were", "exposed", "to", "single", "drugs", "or", "to", "the", "combinations", "of", "the", "MAP4K4", "inhibitor", "(", "MAP4K4i", ")", "with", "each", "one", "of", "the", "Notch", "pathway", "inhibitors", "for", "24h", "." ] } ]
PMC11733919
The dissolved iron ions were retained around the NP core as a ring, most probably forming coordination complexes with the carboxylic groups of the polymer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "dissolved", "iron", "ions", "were", "retained", "around", "the", "NP", "core", "as", "a", "ring", ",", "most", "probably", "forming", "coordination", "complexes", "with", "the", "carboxylic", "groups", "of", "the", "polymer", "." ] } ]
PMC10870498
KIF23, kinesin family member 23; ATC, anaplastic thyroid cancer; RT-qPCR, reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction; THCA, thyroid carcinoma KIF23 was highly expressed in ATC cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "KIF23", ",", "kinesin", "family", "member", "23", ";", "ATC", ",", "anaplastic", "thyroid", "cancer", ";", "RT-qPCR", ",", "reverse", "transcription-quantitative", "polymerase", "chain", "reaction", ";", "THCA", ",", "thyroid", "carcinoma", "KIF23", "was", "highly", "expressed", "in", "ATC", "cells", "." ] } ]
PMC11774747
GD2.ζ and GD2.41BBζ VSTs exhibited also higher frequencies of apoptotic cells and increased Fas expression compared to NT controls and GD2.CD28ζ-transduced VST.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GD2.ζ", "and", "GD2.41BBζ", "VSTs", "exhibited", "also", "higher", "frequencies", "of", "apoptotic", "cells", "and", "increased", "Fas", "expression", "compared", "to", "NT", "controls", "and", "GD2.CD28ζ-transduced", "VST", "." ] } ]
PMC9429973
During the follow-up, 5 vaccinated pts were diagnosed with COVID-19 when the Delta variant was prevalent and 9 - during the Omicron wave.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "During", "the", "follow-up", ",", "5", "vaccinated", "pts", "were", "diagnosed", "with", "COVID-19", "when", "the", "Delta", "variant", "was", "prevalent", "and", "9", "-", "during", "the", "Omicron", "wave", "." ] } ]
PMC9429973
These inhibitors also exhibit cytotoxic effect on activated Treg cells ex vivo, reinforcing its therapeutic potential for CLL treatment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "inhibitors", "also", "exhibit", "cytotoxic", "effect", "on", "activated", "Treg", "cells", "ex", "vivo", ",", "reinforcing", "its", "therapeutic", "potential", "for", "CLL", "treatment", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: We report updated efficacy and safety results from MajesTEC-1 in patients treated at the RP2D, including additional patients and longer follow-up.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "We", "report", "updated", "efficacy", "and", "safety", "results", "from", "MajesTEC-1", "in", "patients", "treated", "at", "the", "RP2D", ",", "including", "additional", "patients", "and", "longer", "follow-up", "." ] } ]
PMC11360263
Due to their tumor-promoting functions, PGCCs are considered potential markers for predicting treatment response and patient outcomes in cancer and detecting their presence in biological fluids has become a new paradigm in cancer progression .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Due", "to", "their", "tumor-promoting", "functions", ",", "PGCCs", "are", "considered", "potential", "markers", "for", "predicting", "treatment", "response", "and", "patient", "outcomes", "in", "cancer", "and", "detecting", "their", "presence", "in", "biological", "fluids", "has", "become", "a", "new", "paradigm", "in", "cancer", "progression", "." ] } ]
PMC11551844
Growth and stabilization resulted in AuNP formation, which is indicated by a color change of the solution.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Growth", "and", "stabilization", "resulted", "in", "AuNP", "formation", ",", "which", "is", "indicated", "by", "a", "color", "change", "of", "the", "solution", "." ] } ]
PMC8567602
Approximately half of GBAF remains bound to insoluble chromatin following nuclear extraction from synovial sarcoma cells without fusion depletion (Fig. 7F).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Approximately", "half", "of", "GBAF", "remains", "bound", "to", "insoluble", "chromatin", "following", "nuclear", "extraction", "from", "synovial", "sarcoma", "cells", "without", "fusion", "depletion", "(", "Fig.", "7F", ")", "." ] } ]
PMC9429973
I. Dogliotti, M. Clerico, F. Vassallo, S. Ragaini, V. Peri, B. Botto, C. Consoli, L. Orsucci, R. Freilone, S. Ferrero, A. Lonardo, G. De Luca, D. Ferrero, F. Cavallo Division of Hematology 1U, Department of Biotechnology and Health Sciences, University of Torino; Division of Hematology 2, University Hospital AOU Città della Salute e della Scienza, Torino, Italy Background: Nearly 40% diffuse large B cell lymphoma (DLBCL) patients relapse after first line treatment (Crump, Blood 2017) and around 15% are chemorefractory (Feugier, JCO 2005).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "I.", "Dogliotti", ",", "M.", "Clerico", ",", "F.", "Vassallo", ",", "S.", "Ragaini", ",", "V.", "Peri", ",", "B.", "Botto", ",", "C.", "Consoli", ",", "L.", "Orsucci", ",", "R.", "Freilone", ",", "S.", "Ferrero", ",", "A.", "Lonardo", ",", "G.", "De", "Luca", ",", "D.", "Ferrero", ",", "F.", "Cavallo", "Division", "of", "Hematology", "1U", ",", "Department", "of", "Biotechnology", "and", "Health", "Sciences", ",", "University", "of", "Torino", ";", "Division", "of", "Hematology", "2", ",", "University", "Hospital", "AOU", "Città", "della", "Salute", "e", "della", "Scienza", ",", "Torino", ",", "Italy", "Background", ":", "Nearly", "40", "%", "diffuse", "large", "B", "cell", "lymphoma", "(", "DLBCL", ")", "patients", "relapse", "after", "first", "line", "treatment", "(", "Crump", ",", "Blood", "2017", ")", "and", "around", "15", "%", "are", "chemorefractory", "(", "Feugier", ",", "JCO", "2005", ")", "." ] } ]
PMC11528603
Interestingly, the HL60 cell-growth inhibition acknowledged in our study is also in line with the same reported effects of S. affinis derived extract and compound on HeLa cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "the", "HL60", "cell-growth", "inhibition", "acknowledged", "in", "our", "study", "is", "also", "in", "line", "with", "the", "same", "reported", "effects", "of", "S.", "affinis", "derived", "extract", "and", "compound", "on", "HeLa", "cells", "." ] } ]
PMC10850553
Figure 4The co-expression of C5AR1 and its ligand C5a in intracranial aneurysm lesions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "4The", "co-expression", "of", "C5AR1", "and", "its", "ligand", "C5a", "in", "intracranial", "aneurysm", "lesions", "." ] } ]
PMC11788920
DNA construct indicating the relative positions of the RNAP promoter, the PQS, and one of the dCas9 target sites. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DNA", "construct", "indicating", "the", "relative", "positions", "of", "the", "RNAP", "promoter", ",", "the", "PQS", ",", "and", "one", "of", "the", "dCas9", "target", "sites", ".", "(" ] } ]
PMC11754784
All fluorescence spectra were measured using a FS5 Spectrofluorometer fluorescence spectrophotometer (Edinburgh Instruments, UK).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "fluorescence", "spectra", "were", "measured", "using", "a", "FS5", "Spectrofluorometer", "fluorescence", "spectrophotometer", "(", "Edinburgh", "Instruments", ",", "UK", ")", "." ] } ]
PMC9429973
S. De Coninck, P. Van Vlierberghe, S. Goossens, R. De Smedt, B. Lintermans Biomolecular Medicine; Cancer Research Institute Ghent (CRIG); Center for Medical Genetics; Diagnostic Sciences, Ghent University, Ghent, Belgium Background: T cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is an aggressive hematologic malignancy that accounts for 10-15% of pediatric and 25% of adult ALL cases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "S.", "De", "Coninck", ",", "P.", "Van", "Vlierberghe", ",", "S.", "Goossens", ",", "R.", "De", "Smedt", ",", "B.", "Lintermans", "Biomolecular", "Medicine", ";", "Cancer", "Research", "Institute", "Ghent", "(", "CRIG", ")", ";", "Center", "for", "Medical", "Genetics", ";", "Diagnostic", "Sciences", ",", "Ghent", "University", ",", "Ghent", ",", "Belgium", "Background", ":", "T", "cell", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "(", "T-ALL", ")", "is", "an", "aggressive", "hematologic", "malignancy", "that", "accounts", "for", "10", "-", "15", "%", "of", "pediatric", "and", "25", "%", "of", "adult", "ALL", "cases", "." ] } ]
PMC10507284
KM, Kaplan–Meier; OS, overall survival; PFI, progression‐free interval; DSS, disease‐specific survival; DL, dedifferentiated liposarcoma; LMS, leiomyosarcomas; UPS, undifferentiated pleomorphic sarcoma. *
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "KM", ",", "Kaplan", "–", "Meier", ";", "OS", ",", "overall", "survival", ";", "PFI", ",", "progression‐free", "interval", ";", "DSS", ",", "disease‐specific", "survival", ";", "DL", ",", "dedifferentiated", "liposarcoma", ";", "LMS", ",", "leiomyosarcomas", ";", "UPS", ",", "undifferentiated", "pleomorphic", "sarcoma", ".", "*" ] } ]
PMC9429973
The Hans algorithm based on immunohistochemistry (IHC) analysis helps classifying DLBCL into GCB and non-GCB subtypes in clinical practice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Hans", "algorithm", "based", "on", "immunohistochemistry", "(", "IHC", ")", "analysis", "helps", "classifying", "DLBCL", "into", "GCB", "and", "non-GCB", "subtypes", "in", "clinical", "practice", "." ] } ]
PMC11180402
A Methylation status of the miR-129 promoter in 5637 cells treated with ISO at indicated concentrations was determined by MS-PCR.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "Methylation", "status", "of", "the", "miR-129", "promoter", "in", "5637", "cells", "treated", "with", "ISO", "at", "indicated", "concentrations", "was", "determined", "by", "MS-PCR", "." ] } ]
PMC10968586
Hematological malignancies arise from the loss of hematopoietic homeostasis, and may be configured as a large category including both myeloid and lymphatic neoplasms (leukemia, lymphoma, and multiple myeloma) whose incidence is pretty variable at the regional level .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hematological", "malignancies", "arise", "from", "the", "loss", "of", "hematopoietic", "homeostasis", ",", "and", "may", "be", "configured", "as", "a", "large", "category", "including", "both", "myeloid", "and", "lymphatic", "neoplasms", "(", "leukemia", ",", "lymphoma", ",", "and", "multiple", "myeloma", ")", "whose", "incidence", "is", "pretty", "variable", "at", "the", "regional", "level", "." ] } ]
PMC11300639
Data are presented as the mean ± SEM of three replicates for in vitro assay and six replicates for in vivo assay.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "presented", "as", "the", "mean", "±", "SEM", "of", "three", "replicates", "for", "in", "vitro", "assay", "and", "six", "replicates", "for", "in", "vivo", "assay", "." ] } ]
PMC11541241
TOR inhibition through inhibitor treatments, RNAi, or VIGS technologies primes immunity and pathogen resistance in plants.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TOR", "inhibition", "through", "inhibitor", "treatments", ",", "RNAi", ",", "or", "VIGS", "technologies", "primes", "immunity", "and", "pathogen", "resistance", "in", "plants", "." ] } ]
PMC11143482
To recap, in this study, NSG mice were randomly divided into three groups.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "recap", ",", "in", "this", "study", ",", "NSG", "mice", "were", "randomly", "divided", "into", "three", "groups", "." ] } ]
PMC7369657
The tumor volume in the CQD-treated group was smaller than that in the control group, and the tumor volume inhibition rate was 38.9%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "tumor", "volume", "in", "the", "CQD-treated", "group", "was", "smaller", "than", "that", "in", "the", "control", "group", ",", "and", "the", "tumor", "volume", "inhibition", "rate", "was", "38.9", "%", "." ] } ]
PMC11352666
To further evaluate the therapeutic potential of MERTK inhibition in EWS, we tested the activity of MRX-2843 against EWS cell lines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "evaluate", "the", "therapeutic", "potential", "of", "MERTK", "inhibition", "in", "EWS", ",", "we", "tested", "the", "activity", "of", "MRX-2843", "against", "EWS", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC11448304
d Immunoprecipitation of EGFR and pan anti-hydroxyisobutyryllysine antibody was used for immunoblotting Combined analysis of transcriptome, proteome, and 2-hydroxyisobutyrylome.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "d", "Immunoprecipitation", "of", "EGFR", "and", "pan", "anti-hydroxyisobutyryllysine", "antibody", "was", "used", "for", "immunoblotting", "Combined", "analysis", "of", "transcriptome", ",", "proteome", ",", "and", "2-hydroxyisobutyrylome", "." ] } ]
PMC11640419
Afterwards, 70 μL of streptavidin-phycoerythrin (streptavidin-PE) (Luminex, USA) was added to each well and incubated for 30 min at room temperature on a shaker at 600 rpm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Afterwards", ",", "70", "μL", "of", "streptavidin-phycoerythrin", "(", "streptavidin-PE", ")", "(", "Luminex", ",", "USA", ")", "was", "added", "to", "each", "well", "and", "incubated", "for", "30", "min", "at", "room", "temperature", "on", "a", "shaker", "at", "600", "rpm", "." ] } ]
PMC11247842
The Radial plot shows a the enrichment (OR) in meta-analysis of clinical mastitis; b OR in meta-analysis of somatic cell score, c OR in multi-trait analysis of clinical mastitis, d OR in multi-trait analysis of somatic cell score.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Radial", "plot", "shows", "a", "the", "enrichment", "(", "OR", ")", "in", "meta-analysis", "of", "clinical", "mastitis", ";", "b", "OR", "in", "meta-analysis", "of", "somatic", "cell", "score", ",", "c", "OR", "in", "multi-trait", "analysis", "of", "clinical", "mastitis", ",", "d", "OR", "in", "multi-trait", "analysis", "of", "somatic", "cell", "score", "." ] } ]
PMC11555465
The present study evaluated the effect of T. gondii tachyzoite culture supernatant on the induction of apoptosis in bladder cancer 5637 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "present", "study", "evaluated", "the", "effect", "of", "T.", "gondii", "tachyzoite", "culture", "supernatant", "on", "the", "induction", "of", "apoptosis", "in", "bladder", "cancer", "5637", "cells", "." ] } ]
PMC11718817
However, two different conditions were investigated with T cells from two fully separated mouse lines, WT and Il18r OT-I mice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "two", "different", "conditions", "were", "investigated", "with", "T", "cells", "from", "two", "fully", "separated", "mouse", "lines", ",", "WT", "and", "Il18r", "OT-I", "mice", "." ] } ]
PMC11543853
The resulting maps were used as initial models for subsequent 3D refinements.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "resulting", "maps", "were", "used", "as", "initial", "models", "for", "subsequent", "3D", "refinements", "." ] } ]
PMC11064533
In this study, ΔyggT in the gentamicin-stressed adhesion assay as well as the gentamicin MIC assay exhibited the highest sensitivity compared to the wild type and other mutants.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "study", ",", "ΔyggT", "in", "the", "gentamicin-stressed", "adhesion", "assay", "as", "well", "as", "the", "gentamicin", "MIC", "assay", "exhibited", "the", "highest", "sensitivity", "compared", "to", "the", "wild", "type", "and", "other", "mutants", "." ] } ]
PMC4485786
After incubation for another 4 d (ZCRH and SRH) or 10 d (CCA) living cells were counted.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "incubation", "for", "another", "4", "d", "(", "ZCRH", "and", "SRH", ")", "or", "10", "d", "(", "CCA", ")", "living", "cells", "were", "counted", "." ] } ]
PMC11279397
From the TCMSP database, we retrieved the monomeric constituents of Perilla frutescens, ranked their OB, and selected the top 20% with higher OB (%) values for the literature review using the PubMed database.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "From", "the", "TCMSP", "database", ",", "we", "retrieved", "the", "monomeric", "constituents", "of", "Perilla", "frutescens", ",", "ranked", "their", "OB", ",", "and", "selected", "the", "top", "20", "%", "with", "higher", "OB", "(", "%", ")", "values", "for", "the", "literature", "review", "using", "the", "PubMed", "database", "." ] } ]
PMC9429973
In the TCL1-driven CLL mouse model, administration of the DUSP1/6 inhibitor is effective in lowering CLL cell progression (>50% reduction of total CLL cell count in the spleen; n=5; p=0.0029).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "TCL1-driven", "CLL", "mouse", "model", ",", "administration", "of", "the", "DUSP1/6", "inhibitor", "is", "effective", "in", "lowering", "CLL", "cell", "progression", "(", ">", "50", "%", "reduction", "of", "total", "CLL", "cell", "count", "in", "the", "spleen", ";", "n=5", ";", "p=0.0029", ")", "." ] } ]
PMC11769522
The culture media was incubated at 37 °C in a cell incubator with 5% CO2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "culture", "media", "was", "incubated", "at", "37", "°", "C", "in", "a", "cell", "incubator", "with", "5", "%", "CO2", "." ] } ]
PMC11397654
The newly obtained macrocycles could be promising theranostic compounds allowing the antiangiogenic treatment and monitoring the delivery using the fluorescent fragment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "newly", "obtained", "macrocycles", "could", "be", "promising", "theranostic", "compounds", "allowing", "the", "antiangiogenic", "treatment", "and", "monitoring", "the", "delivery", "using", "the", "fluorescent", "fragment", "." ] } ]
PMC9429973
Studies were reviewed against predefined eligibility criteria by two independent reviewers.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Studies", "were", "reviewed", "against", "predefined", "eligibility", "criteria", "by", "two", "independent", "reviewers", "." ] } ]
PMC11216402
Also, following the method of Ghandi et al. (2016) for feature interpretation but not for quantitative assessment, we use the gapped k-mer weight vector when training on all the data to reduce variability in the inferred features.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Also", ",", "following", "the", "method", "of", "Ghandi", "et", "al.", "(", "2016", ")", "for", "feature", "interpretation", "but", "not", "for", "quantitative", "assessment", ",", "we", "use", "the", "gapped", "k-mer", "weight", "vector", "when", "training", "on", "all", "the", "data", "to", "reduce", "variability", "in", "the", "inferred", "features", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: To evaluate the Q30 Kit to detect rearrangements on bone marrow and peripheral blood specimens from newly diagnosed AML patients; and compare concordance of Q30 and FISH in identifying leukaemia fusion genes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "To", "evaluate", "the", "Q30", "Kit", "to", "detect", "rearrangements", "on", "bone", "marrow", "and", "peripheral", "blood", "specimens", "from", "newly", "diagnosed", "AML", "patients", ";", "and", "compare", "concordance", "of", "Q30", "and", "FISH", "in", "identifying", "leukaemia", "fusion", "genes", "." ] } ]
PMC11790971
Cell lines C and D had similar Peak Titre and Peak Viable Cell Concentration (VCC) values, but they had different stability profiles (i.e., cell line C was unstable, while cell line D was stable).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "lines", "C", "and", "D", "had", "similar", "Peak", "Titre", "and", "Peak", "Viable", "Cell", "Concentration", "(", "VCC", ")", "values", ",", "but", "they", "had", "different", "stability", "profiles", "(", "i.e.", ",", "cell", "line", "C", "was", "unstable", ",", "while", "cell", "line", "D", "was", "stable", ")", "." ] } ]
PMC9577200
Furthermore, for BC and PAO1, different mixture ratios of GO to CS (2:1, 1:1, and 1:2) were prepared using GO (700 μg ml) and CS (0.6 and 0.8%), respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "for", "BC", "and", "PAO1", ",", "different", "mixture", "ratios", "of", "GO", "to", "CS", "(", "2:1", ",", "1:1", ",", "and", "1:2", ")", "were", "prepared", "using", "GO", "(", "700", "μg", "ml", ")", "and", "CS", "(", "0.6", "and", "0.8", "%", ")", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11128598
We previously reported that CQ/LBH-induced lethality in ovarian cancer cell lines largely depended on DSBs caused by ROS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "previously", "reported", "that", "CQ/LBH-induced", "lethality", "in", "ovarian", "cancer", "cell", "lines", "largely", "depended", "on", "DSBs", "caused", "by", "ROS", "." ] } ]