PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11348300
Relation between absolute pO2 measurement as measured using PdG4 and tissue oxygenation as measured using PpIX fluorescence.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Relation", "between", "absolute", "pO2", "measurement", "as", "measured", "using", "PdG4", "and", "tissue", "oxygenation", "as", "measured", "using", "PpIX", "fluorescence", "." ] } ]
PMC10965315
Gene expression of p53 and Bax were upregulated in harmaline‐treated A2780 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Gene", "expression", "of", "p53", "and", "Bax", "were", "upregulated", "in", "harmaline‐treated", "A2780", "cells", "." ] } ]
PMC9927933
We searched the DEPTOR protein sequence and identified 3 evolutionarily conserved D-box motifs (designated as D1, D2, and D3) (Supplemental Figure 5F).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "searched", "the", "DEPTOR", "protein", "sequence", "and", "identified", "3", "evolutionarily", "conserved", "D-box", "motifs", "(", "designated", "as", "D1", ",", "D2", ",", "and", "D3", ")", "(", "Supplemental", "Figure", "5F", ")", "." ] } ]
PMC11532793
The edgeR divided-count analysis approach was shown to outperform previous differential transcript expression (DTE) pipelines in terms of statistical power, false discovery rate (FDR), speed and flexibility (13).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "edgeR", "divided-count", "analysis", "approach", "was", "shown", "to", "outperform", "previous", "differential", "transcript", "expression", "(", "DTE", ")", "pipelines", "in", "terms", "of", "statistical", "power", ",", "false", "discovery", "rate", "(", "FDR", ")", ",", "speed", "and", "flexibility", "(", "13", ")", "." ] } ]
PMC10957991
n(ctrl siRNA) = 21, n(TRPV4 siRNA) = 22; Mean (+ /− SEM) is shown. ***
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "n(ctrl", "siRNA", ")", "=", "21", ",", "n(TRPV4", "siRNA", ")", "=", "22", ";", "Mean", "(", "+", "/−", "SEM", ")", "is", "shown", ".", "*", "*", "*" ] } ]
PMC7802142
Scale bar, 30 μm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bar", ",", "30", "μm", "." ] } ]
PMC10747160
The 293 medium is Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) (ThermoFisher Catalog # 11965-092, Waltham, MA, USA) supplemented with 25 mM HEPES (ThermoFisher Catalog # 11344041, Waltham, MA, USA), 2 mM L-glutamine (R&D Systems Catalog # R90010, Minneapolis, MN, USA), 250 μg mL G418 Sulfate (Corning Life Sciences Catalog # 30-234-CI, Tewksbury, MA, USA), and 10% Fetal Bovine Serum (R&D Systems Catalog # S11150, Minneapolis, MN, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "293", "medium", "is", "Dulbecco", "’s", "Modified", "Eagle", "Medium", "(", "DMEM", ")", "(", "ThermoFisher", "Catalog", "#", "11965", "-", "092", ",", "Waltham", ",", "MA", ",", "USA", ")", "supplemented", "with", "25", "mM", "HEPES", "(", "ThermoFisher", "Catalog", "#", "11344041", ",", "Waltham", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "2", "mM", "L-glutamine", "(", "R&D", "Systems", "Catalog", "#", "R90010", ",", "Minneapolis", ",", "MN", ",", "USA", ")", ",", "250", "μg", "mL", "G418", "Sulfate", "(", "Corning", "Life", "Sciences", "Catalog", "#", "30", "-", "234-CI", ",", "Tewksbury", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "and", "10", "%", "Fetal", "Bovine", "Serum", "(", "R&D", "Systems", "Catalog", "#", "S11150", ",", "Minneapolis", ",", "MN", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11675244
The Notch specific ligand, Jagged1, was shown to downregulate Gli2, an Hh effector, and, thus, promotes apoptosis and increases sensibility to drugs, as observed in a study conducted on in vitro and in vivo ovarian cancer models .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Notch", "specific", "ligand", ",", "Jagged1", ",", "was", "shown", "to", "downregulate", "Gli2", ",", "an", "Hh", "effector", ",", "and", ",", "thus", ",", "promotes", "apoptosis", "and", "increases", "sensibility", "to", "drugs", ",", "as", "observed", "in", "a", "study", "conducted", "on", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "ovarian", "cancer", "models", "." ] } ]
PMC2614415
Aurora kinase inhibitors represent a promising alternative to taxane therapy, especially for patients who overexpress the mitotic kinase Aurora-A, or other family members, or whose disease continues to progress during taxane therapy .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aurora", "kinase", "inhibitors", "represent", "a", "promising", "alternative", "to", "taxane", "therapy", ",", "especially", "for", "patients", "who", "overexpress", "the", "mitotic", "kinase", "Aurora-A", ",", "or", "other", "family", "members", ",", "or", "whose", "disease", "continues", "to", "progress", "during", "taxane", "therapy", "." ] } ]
PMC9318744
Antivirals can target multiple steps in the SARS-CoV-2 entry process, including virus attachment to the cell surface, receptor engagement, protease processing, and membrane fusion .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Antivirals", "can", "target", "multiple", "steps", "in", "the", "SARS-CoV-2", "entry", "process", ",", "including", "virus", "attachment", "to", "the", "cell", "surface", ",", "receptor", "engagement", ",", "protease", "processing", ",", "and", "membrane", "fusion", "." ] } ]
PMC6190245
Dimethyl sulfoxide (DMSO) was purchased from Merck (Darmstadt, Germany).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Dimethyl", "sulfoxide", "(", "DMSO", ")", "was", "purchased", "from", "Merck", "(", "Darmstadt", ",", "Germany", ")", "." ] } ]
PMC11585587
The comparison between the experimental group and the no-treatment control, *P < 0.05 was statistically significant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "comparison", "between", "the", "experimental", "group", "and", "the", "no-treatment", "control", ",", "*", "P", "<", "0.05", "was", "statistically", "significant", "." ] } ]
PMC10380508
To investigate the potential effects of PAX gene expression on clinical features in RCC patients, we combined the TCGA data for the three RCC subtypes (KIRC, KIRP, and KICH) into one analysis cohort.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "investigate", "the", "potential", "effects", "of", "PAX", "gene", "expression", "on", "clinical", "features", "in", "RCC", "patients", ",", "we", "combined", "the", "TCGA", "data", "for", "the", "three", "RCC", "subtypes", "(", "KIRC", ",", "KIRP", ",", "and", "KICH", ")", "into", "one", "analysis", "cohort", "." ] } ]
PMC2193049
However, digestion of peptide MAGE-3256–279 in the presence of 50 μM lactacystin resulted in 100-fold–increased recognition (Fig. 6 D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "digestion", "of", "peptide", "MAGE-3256–279", "in", "the", "presence", "of", "50", "μM", "lactacystin", "resulted", "in", "100-fold", "–", "increased", "recognition", "(", "Fig.", "6", "D", ")", "." ] } ]
PMC9587866
It was observed that BZ impaired the tumor proliferation in A673 cells in a dose dependent manner and reduced the expression of EYA3, which in turn regulated the angiogenic and VEGF-A function.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "was", "observed", "that", "BZ", "impaired", "the", "tumor", "proliferation", "in", "A673", "cells", "in", "a", "dose", "dependent", "manner", "and", "reduced", "the", "expression", "of", "EYA3", ",", "which", "in", "turn", "regulated", "the", "angiogenic", "and", "VEGF-A", "function", "." ] } ]
PMC11640419
All of the above effects of the hybrid compound we prepared indicate its high anticancer potential, and it is very likely that this molecule will activate apoptosis in p53-deficient tumor tissues.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "of", "the", "above", "effects", "of", "the", "hybrid", "compound", "we", "prepared", "indicate", "its", "high", "anticancer", "potential", ",", "and", "it", "is", "very", "likely", "that", "this", "molecule", "will", "activate", "apoptosis", "in", "p53-deficient", "tumor", "tissues", "." ] } ]
PMC11665584
The present study generated an inducible transgenic mouse model ectopically expressing PITX1 in the epidermis to assess how the transcription factor affects keratinocyte identity and the process of wound healing.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "present", "study", "generated", "an", "inducible", "transgenic", "mouse", "model", "ectopically", "expressing", "PITX1", "in", "the", "epidermis", "to", "assess", "how", "the", "transcription", "factor", "affects", "keratinocyte", "identity", "and", "the", "process", "of", "wound", "healing", "." ] } ]
PMC11377827
Endogenous 14-3-3 proteins were immunoprecipitated and samples were immunoblotted for USP43 (B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Endogenous", "14", "-", "3", "-", "3", "proteins", "were", "immunoprecipitated", "and", "samples", "were", "immunoblotted", "for", "USP43", "(", "B", ")", "." ] } ]
PMC11718817
All this suggests immunosuppressive, protumorigenic effects of intratumoral NLRP3 activation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "this", "suggests", "immunosuppressive", ",", "protumorigenic", "effects", "of", "intratumoral", "NLRP3", "activation", "." ] } ]
PMC11792090
Strategies such as knocking out related genes, along with the use of lymphodepleting drugs, have been employed (11–14).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Strategies", "such", "as", "knocking", "out", "related", "genes", ",", "along", "with", "the", "use", "of", "lymphodepleting", "drugs", ",", "have", "been", "employed", "(", "11–14", ")", "." ] } ]
PMC10671321
To address this question, we quantified the enzymatic activity and the molecular forms in the medium of COS cells expressing AChE and ColQ (WT and mutated).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "address", "this", "question", ",", "we", "quantified", "the", "enzymatic", "activity", "and", "the", "molecular", "forms", "in", "the", "medium", "of", "COS", "cells", "expressing", "AChE", "and", "ColQ", "(", "WT", "and", "mutated", ")", "." ] } ]
PMC11727907
The protein concentration of each sample was determined using the BCA Protein Assay Kit.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "protein", "concentration", "of", "each", "sample", "was", "determined", "using", "the", "BCA", "Protein", "Assay", "Kit", "." ] } ]
PMC11342785
DIC (left) and green fluorescence (right) images of GFP-TPPP FL and GFP-TPPP-CORE, both at the concentration of 20 μM with 20 mM Hepes, 50 mM NaCl, 3 mM DTT, and 12% dextran.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DIC", "(", "left", ")", "and", "green", "fluorescence", "(", "right", ")", "images", "of", "GFP-TPPP", "FL", "and", "GFP-TPPP-CORE", ",", "both", "at", "the", "concentration", "of", "20", "μM", "with", "20", "mM", "Hepes", ",", "50", "mM", "NaCl", ",", "3", "mM", "DTT", ",", "and", "12", "%", "dextran", "." ] } ]
PMC10317042
C and D, SU-CCS1 and Hewga-CCS cells were engrafted in nude mice, which were treated with vehicle (controls), or 0.4 mg/kg mivebresib, or 20 mg/kg vorinostat, or both drugs in combination (4 mice/group).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "and", "D", ",", "SU-CCS1", "and", "Hewga-CCS", "cells", "were", "engrafted", "in", "nude", "mice", ",", "which", "were", "treated", "with", "vehicle", "(", "controls", ")", ",", "or", "0.4", "mg/kg", "mivebresib", ",", "or", "20", "mg/kg", "vorinostat", ",", "or", "both", "drugs", "in", "combination", "(", "4", "mice/group", ")", "." ] } ]
PMC7724160
5 mL of day 14 sample was also prepared for protein A purification and subsequent HPLC separation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "5", "mL", "of", "day", "14", "sample", "was", "also", "prepared", "for", "protein", "A", "purification", "and", "subsequent", "HPLC", "separation", "." ] } ]
PMC11267830
Moreover, accumulating evidence indicates that RBM39 primarily modulates the selective splicing of a diverse set of genes by facilitating exon inclusion and intron exclusion.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "accumulating", "evidence", "indicates", "that", "RBM39", "primarily", "modulates", "the", "selective", "splicing", "of", "a", "diverse", "set", "of", "genes", "by", "facilitating", "exon", "inclusion", "and", "intron", "exclusion", "." ] } ]
PMC11770199
For A375 cells, hMSCs-14 versus hMSCs-GFP at a ratio of 1:5, *P = 0.044; at ratio of 1:12.5, ***P < 0.001; at ratio of 1:25, *P = 0.040. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "A375", "cells", ",", "hMSCs-14", "versus", "hMSCs-GFP", "at", "a", "ratio", "of", "1:5", ",", "*", "P", "=", "0.044", ";", "at", "ratio", "of", "1:12.5", ",", "*", "*", "*", "P", "<", "0.001", ";", "at", "ratio", "of", "1:25", ",", "*", "P", "=", "0.040", ".", "(" ] } ]
PMC11661024
This research investigated the mechanisms related to the function of two potential postbiotic Lactobacillus isolates, Lactobacillus fermentum CH and L. fermentum KH, isolated from indigenous Iranian dairy products.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "research", "investigated", "the", "mechanisms", "related", "to", "the", "function", "of", "two", "potential", "postbiotic", "Lactobacillus", "isolates", ",", "Lactobacillus", "fermentum", "CH", "and", "L.", "fermentum", "KH", ",", "isolated", "from", "indigenous", "Iranian", "dairy", "products", "." ] } ]
PMC11218145
The addition of TB to this type of treatment could be warranted in specific patients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "addition", "of", "TB", "to", "this", "type", "of", "treatment", "could", "be", "warranted", "in", "specific", "patients", "." ] } ]
PMC11352746
We hope that future labs will report the entirety of their experimental procedures and standardize the reporting of this type of experiment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "hope", "that", "future", "labs", "will", "report", "the", "entirety", "of", "their", "experimental", "procedures", "and", "standardize", "the", "reporting", "of", "this", "type", "of", "experiment", "." ] } ]
PMC11706297
This compound displayed significant EGFR inhibitory activity and presented high affinity in the ATP binding site of the EGFR.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "compound", "displayed", "significant", "EGFR", "inhibitory", "activity", "and", "presented", "high", "affinity", "in", "the", "ATP", "binding", "site", "of", "the", "EGFR", "." ] } ]
PMC8469018
Treatment of MM is primarily based on reducing the population of clonal plasma cells, thus decreasing the symptoms of the disease.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Treatment", "of", "MM", "is", "primarily", "based", "on", "reducing", "the", "population", "of", "clonal", "plasma", "cells", ",", "thus", "decreasing", "the", "symptoms", "of", "the", "disease", "." ] } ]
PMC7823217
A scheme showing the multi-cartridge module based Integrated Tissue Organ Printer (ITOP) system consisting of stage/controller, dispensing module with pressure controller and a closed chamber. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "scheme", "showing", "the", "multi-cartridge", "module", "based", "Integrated", "Tissue", "Organ", "Printer", "(", "ITOP", ")", "system", "consisting", "of", "stage/controller", ",", "dispensing", "module", "with", "pressure", "controller", "and", "a", "closed", "chamber", ".", "(" ] } ]
PMC9635307
Unexpectedly, the A20/2L showed accelerated cell proliferation compared to that of A20/VA when cells were not treated with anti-Igκ.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Unexpectedly", ",", "the", "A20/2L", "showed", "accelerated", "cell", "proliferation", "compared", "to", "that", "of", "A20/VA", "when", "cells", "were", "not", "treated", "with", "anti-Igκ", "." ] } ]
PMC11658074
The details of isolation are described in the supplementary information.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "details", "of", "isolation", "are", "described", "in", "the", "supplementary", "information", "." ] } ]
PMC11727062
However, resistance, both innate and acquired, to chemotherapy is a primary cause of treatment failure.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "resistance", ",", "both", "innate", "and", "acquired", ",", "to", "chemotherapy", "is", "a", "primary", "cause", "of", "treatment", "failure", "." ] } ]
PMC11625890
She was a physicist and in the first class of NASA astronauts to include women, who had a passion for encouraging children, especially girls, into the world of science.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "She", "was", "a", "physicist", "and", "in", "the", "first", "class", "of", "NASA", "astronauts", "to", "include", "women", ",", "who", "had", "a", "passion", "for", "encouraging", "children", ",", "especially", "girls", ",", "into", "the", "world", "of", "science", "." ] } ]
PMC8526701
A previous study showed that the synovial sarcoma cell line SYO1 was sensitive to BRD9 inhibition .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "previous", "study", "showed", "that", "the", "synovial", "sarcoma", "cell", "line", "SYO1", "was", "sensitive", "to", "BRD9", "inhibition", "." ] } ]
PMC9822769
Being prodrugs, Pt(IV) complexes must be activated in vivo, their reduction potential can offer information on the feasibility of the reduction process, especially in the case of an outer-sphere mechanism .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Being", "prodrugs", ",", "Pt(IV", ")", "complexes", "must", "be", "activated", "in", "vivo", ",", "their", "reduction", "potential", "can", "offer", "information", "on", "the", "feasibility", "of", "the", "reduction", "process", ",", "especially", "in", "the", "case", "of", "an", "outer-sphere", "mechanism", "." ] } ]
PMC11706491
Here, we show that Sty1 has, in fact, a minimal impact on unaltered cell cycle progression and that its large cell size phenotype can be almost exclusively explained by their increased cell growth rate.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "we", "show", "that", "Sty1", "has", ",", "in", "fact", ",", "a", "minimal", "impact", "on", "unaltered", "cell", "cycle", "progression", "and", "that", "its", "large", "cell", "size", "phenotype", "can", "be", "almost", "exclusively", "explained", "by", "their", "increased", "cell", "growth", "rate", "." ] } ]
PMC11155445
The presence of chlorine groups at the 2 and 4 positions on the benzene ring instead of the naphthoyl group at position 2 increased inhibitory activity about 61.75 times against SDH enzyme.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "presence", "of", "chlorine", "groups", "at", "the", "2", "and", "4", "positions", "on", "the", "benzene", "ring", "instead", "of", "the", "naphthoyl", "group", "at", "position", "2", "increased", "inhibitory", "activity", "about", "61.75", "times", "against", "SDH", "enzyme", "." ] } ]
PMC9429973
Results: On assessment of baseline tumour burden, there was no correlation between single lesion DW-MRI ADC and serum paraprotein [p>0.05]; however, there was moderate positive correlation between serum DKK1 and serum paraprotein [r=0.39, p=0.04].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "On", "assessment", "of", "baseline", "tumour", "burden", ",", "there", "was", "no", "correlation", "between", "single", "lesion", "DW-MRI", "ADC", "and", "serum", "paraprotein", "[", "p>0.05", "]", ";", "however", ",", "there", "was", "moderate", "positive", "correlation", "between", "serum", "DKK1", "and", "serum", "paraprotein", "[", "r=0.39", ",", "p=0.04", "]", "." ] } ]
PMC11026382
Thus, for each DHFR point mutant we used Monte Carlo sampling to identify a space of kcat and Km values consistent with the three growth rate measurements (in the three TYMS backgrounds).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "for", "each", "DHFR", "point", "mutant", "we", "used", "Monte", "Carlo", "sampling", "to", "identify", "a", "space", "of", "kcat", "and", "Km", "values", "consistent", "with", "the", "three", "growth", "rate", "measurements", "(", "in", "the", "three", "TYMS", "backgrounds", ")", "." ] } ]
PMC11768281
Articles excluded from the review included commentaries, editorials, and review papers.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Articles", "excluded", "from", "the", "review", "included", "commentaries", ",", "editorials", ",", "and", "review", "papers", "." ] } ]
PMC11548041
However, there was minimal degradation of PLD01 or PLD02 observed during serum exposure at any time points evaluated (Figure 3E).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "there", "was", "minimal", "degradation", "of", "PLD01", "or", "PLD02", "observed", "during", "serum", "exposure", "at", "any", "time", "points", "evaluated", "(", "Figure", "3E", ")", "." ] } ]
PMC11085211
In conclusion, although bio-guided fractionation did not lead to the identification of a single compound active in GIST cellular models, it was confirmed as a feasible tool for circumscribing phytochemicals of interest.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "conclusion", ",", "although", "bio-guided", "fractionation", "did", "not", "lead", "to", "the", "identification", "of", "a", "single", "compound", "active", "in", "GIST", "cellular", "models", ",", "it", "was", "confirmed", "as", "a", "feasible", "tool", "for", "circumscribing", "phytochemicals", "of", "interest", "." ] } ]
PMC11740907
The presence of these charges promotes interactions with the surrounding media, resulting in the creation of a hydration layer around the SLNs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "presence", "of", "these", "charges", "promotes", "interactions", "with", "the", "surrounding", "media", ",", "resulting", "in", "the", "creation", "of", "a", "hydration", "layer", "around", "the", "SLNs", "." ] } ]
PMC11612626
Eluted peptides were concentrated and desalted using solid-phase extraction with a Waters HPLC C18 column.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Eluted", "peptides", "were", "concentrated", "and", "desalted", "using", "solid-phase", "extraction", "with", "a", "Waters", "HPLC", "C18", "column", "." ] } ]
PMC11806613
Primary HMEC (n = 4) and TNBC (n = 3) cells were treated with 1 µL/mL of ethanol control or OST-01 (1 µL of OST-01 extract contains 250 µg of dry plant extract) for 24 h. A Levels of cell proliferation (left) and apoptosis (right).
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Primary", "HMEC", "(", "n", "=", "4", ")", "and", "TNBC", "(", "n", "=", "3", ")", "cells", "were", "treated", "with", "1", "µL/mL", "of", "ethanol", "control", "or", "OST-01", "(", "1", "µL", "of", "OST-01", "extract", "contains", "250", "µg", "of", "dry", "plant", "extract", ")", "for", "24", "h.", "A", "Levels", "of", "cell", "proliferation", "(", "left", ")", "and", "apoptosis", "(", "right", ")", "." ] } ]
PMC11733919
Moreover, the C=O stretching vibration accounting for the amide I bond formed between the amino groups of STV with the free carboxyl moieties of the MNP@PMAO was observed (Figure 2c).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "the", "C", "=", "O", "stretching", "vibration", "accounting", "for", "the", "amide", "I", "bond", "formed", "between", "the", "amino", "groups", "of", "STV", "with", "the", "free", "carboxyl", "moieties", "of", "the", "MNP@PMAO", "was", "observed", "(", "Figure", "2c", ")", "." ] } ]
PMC11394730
Cancer patients are particularly interested in using it because of the substantial risks involved with traditional therapies like chemotherapy and surgery .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cancer", "patients", "are", "particularly", "interested", "in", "using", "it", "because", "of", "the", "substantial", "risks", "involved", "with", "traditional", "therapies", "like", "chemotherapy", "and", "surgery", "." ] } ]
PMC7887261
The TRICL and Genetic Epidemiology of LC Consortium (GELCC) cases were enriched for having FHLC.Table 1Basic characteristics of LC cases and controls in the discovery and validations sets.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "TRICL", "and", "Genetic", "Epidemiology", "of", "LC", "Consortium", "(", "GELCC", ")", "cases", "were", "enriched", "for", "having", "FHLC.Table", "1Basic", "characteristics", "of", "LC", "cases", "and", "controls", "in", "the", "discovery", "and", "validations", "sets", "." ] } ]
PMC11643361
While these compounds have already demonstrated a wide range of biological activities, their full potential in biomedical applications, especially cancer therapy, remains underexplored.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "these", "compounds", "have", "already", "demonstrated", "a", "wide", "range", "of", "biological", "activities", ",", "their", "full", "potential", "in", "biomedical", "applications", ",", "especially", "cancer", "therapy", ",", "remains", "underexplored", "." ] } ]
PMC11637276
Indeed, p38 was shown to directly interact and phosphorylate NHE1 on 1 threonine and 3 serine residues in the C-terminal .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Indeed", ",", "p38", "was", "shown", "to", "directly", "interact", "and", "phosphorylate", "NHE1", "on", "1", "threonine", "and", "3", "serine", "residues", "in", "the", "C-terminal", "." ] } ]
PMC11748618
Overlap of putative causal variants and their corresponding functional annotations from HaploRegv4.2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Overlap", "of", "putative", "causal", "variants", "and", "their", "corresponding", "functional", "annotations", "from", "HaploRegv4.2", "." ] } ]
PMC11790599
The scale bar is 10 μm. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "scale", "bar", "is", "10", "μm", ".", "(" ] } ]
PMC10854447
Compounds 7j, 7k, and 7l were evaluated for their apoptotic potential activity, where findings indicated that compounds 7j, 7k, and 7l promote apoptosis by activating caspase-3, 8, and Bax and down-regulating the anti-apoptotic Bcl-2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Compounds", "7j", ",", "7k", ",", "and", "7l", "were", "evaluated", "for", "their", "apoptotic", "potential", "activity", ",", "where", "findings", "indicated", "that", "compounds", "7j", ",", "7k", ",", "and", "7l", "promote", "apoptosis", "by", "activating", "caspase-3", ",", "8", ",", "and", "Bax", "and", "down-regulating", "the", "anti-apoptotic", "Bcl-2", "." ] } ]
PMC11705067
The findings showed that FDX1 expression was significantly related to neutrophils, mast cells, eosinophils, TReg, aDC and cytotoxic cells (Fig. 6A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "findings", "showed", "that", "FDX1", "expression", "was", "significantly", "related", "to", "neutrophils", ",", "mast", "cells", ",", "eosinophils", ",", "TReg", ",", "aDC", "and", "cytotoxic", "cells", "(", "Fig.", "6A", ")", "." ] } ]
PMC10587429
Take fluorescent images using the EVOS M5000 imaging system or any fluorescent microscope with a camera.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Take", "fluorescent", "images", "using", "the", "EVOS", "M5000", "imaging", "system", "or", "any", "fluorescent", "microscope", "with", "a", "camera", "." ] } ]
PMC9429973
They were started on interferon-Alfa-2a as one million unit weekly, with excellent response, no blood transfusion requirement since starting therapy, and iron chelation has been stopped.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "were", "started", "on", "interferon-Alfa-2a", "as", "one", "million", "unit", "weekly", ",", "with", "excellent", "response", ",", "no", "blood", "transfusion", "requirement", "since", "starting", "therapy", ",", "and", "iron", "chelation", "has", "been", "stopped", "." ] } ]
PMC11532793
This shows edgeR-v4 to have the lowest number of false discoveries at any chosen number, followed by edgeR-v3, sleuth-Wald, Sleuth-LRT and Swish.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "shows", "edgeR-v4", "to", "have", "the", "lowest", "number", "of", "false", "discoveries", "at", "any", "chosen", "number", ",", "followed", "by", "edgeR-v3", ",", "sleuth-Wald", ",", "Sleuth-LRT", "and", "Swish", "." ] } ]
PMC9429973
All patients received Allo-SCT along with the required follow up medical care at AUBMC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "patients", "received", "Allo-SCT", "along", "with", "the", "required", "follow", "up", "medical", "care", "at", "AUBMC", "." ] } ]
PMC11451940
m/z)): 498.25 m/z [Cu(Lap)(mphen)] (498.10).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "m/z", ")", "):", "498.25", "m/z", "[", "Cu(Lap)(mphen", ")", "]", "(", "498.10", ")", "." ] } ]
PMC10079526
One-way ANOVA was used, followed by Tukey’s multiple comparisons with Graphpad prism Version 9.3.1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One-way", "ANOVA", "was", "used", ",", "followed", "by", "Tukey", "’s", "multiple", "comparisons", "with", "Graphpad", "prism", "Version", "9.3.1", "." ] } ]
PMC11471157
In addition to Medaka, the utilization of fish powder derived from other small fish species, such as Zebrafish, also shows promise and warrants further investigation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "Medaka", ",", "the", "utilization", "of", "fish", "powder", "derived", "from", "other", "small", "fish", "species", ",", "such", "as", "Zebrafish", ",", "also", "shows", "promise", "and", "warrants", "further", "investigation", "." ] } ]
PMC9429973
CRP was in the range of 10 -200 mg/L in 72% of patients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CRP", "was", "in", "the", "range", "of", "10", "-200", "mg/L", "in", "72", "%", "of", "patients", "." ] } ]
PMC6160470
Cells were then incubated for 30 minutes with anti-P-gp primary antibody in blocking solution (1:250, clone 4E3, Biolegend).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "then", "incubated", "for", "30", "minutes", "with", "anti-P-gp", "primary", "antibody", "in", "blocking", "solution", "(", "1:250", ",", "clone", "4E3", ",", "Biolegend", ")", "." ] } ]
PMC11739484
The dysregulation of matrix metalloproteinases (MMPs) in skin cutaneous melanoma (SKCM) represents a critical aspect of tumorigenesis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "dysregulation", "of", "matrix", "metalloproteinases", "(", "MMPs", ")", "in", "skin", "cutaneous", "melanoma", "(", "SKCM", ")", "represents", "a", "critical", "aspect", "of", "tumorigenesis", "." ] } ]
PMC11467800
Given that K562 cells are derived from blood tissue components, we next aimed to investigate their potential for extravasation from the circulatory system.
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Given", "that", "K562", "cells", "are", "derived", "from", "blood", "tissue", "components", ",", "we", "next", "aimed", "to", "investigate", "their", "potential", "for", "extravasation", "from", "the", "circulatory", "system", "." ] } ]
PMC11656380
Second, we observed cell morphology by microscopy after treating CCRF-CEM cells with Tat-Ram13 for 24 h (Figure 5B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Second", ",", "we", "observed", "cell", "morphology", "by", "microscopy", "after", "treating", "CCRF-CEM", "cells", "with", "Tat-Ram13", "for", "24", "h", "(", "Figure", "5B", ")", "." ] } ]
PMC11745823
Currently, HIF‐1α is the most intensively studied and has the most prominent function .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Currently", ",", "HIF‐1α", "is", "the", "most", "intensively", "studied", "and", "has", "the", "most", "prominent", "function", "." ] } ]
PMC9429973
University of Murcia, Murcia; Clínica Universidad de Navarra, Centro de Investigacion Medica Aplicada (CIMA), IDISNA, CIBERONC Pamplona, Pamplona; Hospital Universitario Virgen del Rocío, Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBIS/CSIC/CIBERONC), University of Sevilla, Sevilla, Spain Background: ARI0002h is a lentiviral autologous CAR T-cell product with a 4-1BB co-stimulatory domain and a humanized single chain variable fragment targeting BCMA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "University", "of", "Murcia", ",", "Murcia", ";", "Clínica", "Universidad", "de", "Navarra", ",", "Centro", "de", "Investigacion", "Medica", "Aplicada", "(", "CIMA", ")", ",", "IDISNA", ",", "CIBERONC", "Pamplona", ",", "Pamplona", ";", "Hospital", "Universitario", "Virgen", "del", "Rocío", ",", "Instituto", "de", "Biomedicina", "de", "Sevilla", "(", "IBIS/CSIC/CIBERONC", ")", ",", "University", "of", "Sevilla", ",", "Sevilla", ",", "Spain", "Background", ":", "ARI0002h", "is", "a", "lentiviral", "autologous", "CAR", "T-cell", "product", "with", "a", "4", "-", "1BB", "co-stimulatory", "domain", "and", "a", "humanized", "single", "chain", "variable", "fragment", "targeting", "BCMA", "." ] } ]
PMC9429973
M. Yu, C. Li, J. Xu, M. Liu, X. Cui Shandong University of traditional Chinese Medicine; The Second Affiliated Hospital of Shandong University of traditional Chinese medicine; Affiliated Hospital of Shandong University of traditional Chinese medicine, Jinan, China Background: N7-methylguanosine (m7G) is a positively charged, essential modification at the 5’ cap of eukaryotic mRNA, impacting RNA processing and function, especially mRNA sublocation, translation, and splicing, which is crucial for the regulation of tumor progression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "M.", "Yu", ",", "C.", "Li", ",", "J.", "Xu", ",", "M.", "Liu", ",", "X.", "Cui", "Shandong", "University", "of", "traditional", "Chinese", "Medicine", ";", "The", "Second", "Affiliated", "Hospital", "of", "Shandong", "University", "of", "traditional", "Chinese", "medicine", ";", "Affiliated", "Hospital", "of", "Shandong", "University", "of", "traditional", "Chinese", "medicine", ",", "Jinan", ",", "China", "Background", ":", "N7-methylguanosine", "(", "m7", "G", ")", "is", "a", "positively", "charged", ",", "essential", "modification", "at", "the", "5", "’", "cap", "of", "eukaryotic", "mRNA", ",", "impacting", "RNA", "processing", "and", "function", ",", "especially", "mRNA", "sublocation", ",", "translation", ",", "and", "splicing", ",", "which", "is", "crucial", "for", "the", "regulation", "of", "tumor", "progression", "." ] } ]
PMC6468656
Among ccRCC cell lines in CCLE dataset, the analysis was performed using variant Aurora A probes, and a positive correlation with ρ = 0.715 and 0.784 was observed respectively by each Aurora A probe (Figure 3A,B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "ccRCC", "cell", "lines", "in", "CCLE", "dataset", ",", "the", "analysis", "was", "performed", "using", "variant", "Aurora", "A", "probes", ",", "and", "a", "positive", "correlation", "with", "ρ", "=", "0.715", "and", "0.784", "was", "observed", "respectively", "by", "each", "Aurora", "A", "probe", "(", "Figure", "3A", ",", "B", ")", "." ] } ]
PMC11394730
Studies discussed in this review provide a solid ground for researchers to consider natural products in cancer treatment alone and in combination with conventional anticancer therapies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Studies", "discussed", "in", "this", "review", "provide", "a", "solid", "ground", "for", "researchers", "to", "consider", "natural", "products", "in", "cancer", "treatment", "alone", "and", "in", "combination", "with", "conventional", "anticancer", "therapies", "." ] } ]
PMC11536589
Increased Wnt/β-catenin signaling pathway activity plays a crucial role in the development of chemoresistance (Huang et al. 2020).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Increased", "Wnt/β-catenin", "signaling", "pathway", "activity", "plays", "a", "crucial", "role", "in", "the", "development", "of", "chemoresistance", "(", "Huang", "et", "al.", "2020", ")", "." ] } ]
PMC10898159
In addition, the expression of other miRNAs, including miR-142-5p , miR-9, miR-370, miR-494, and miR-501 , was negatively associated with the expression of the KIT gene in GIST cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "the", "expression", "of", "other", "miRNAs", ",", "including", "miR-142", "-", "5p", ",", "miR-9", ",", "miR-370", ",", "miR-494", ",", "and", "miR-501", ",", "was", "negatively", "associated", "with", "the", "expression", "of", "the", "KIT", "gene", "in", "GIST", "cells", "." ] } ]
PMC11185260
p<0.01. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p<0.01", ".", "(" ] } ]
PMC11615743
The cell mixture was analyzed via flow cytometry.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cell", "mixture", "was", "analyzed", "via", "flow", "cytometry", "." ] } ]
PMC11295144
Images were acquired using ELYRA PS.1 SIM (Carl Zeiss) at 63x oil lens following chromatic shift correction by recording fluorescent beads.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Images", "were", "acquired", "using", "ELYRA", "PS.1", "SIM", "(", "Carl", "Zeiss", ")", "at", "63x", "oil", "lens", "following", "chromatic", "shift", "correction", "by", "recording", "fluorescent", "beads", "." ] } ]
PMC11406030
Thus, there is an unmet need to identify new targets to bring novel effective therapies to the clinic.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "there", "is", "an", "unmet", "need", "to", "identify", "new", "targets", "to", "bring", "novel", "effective", "therapies", "to", "the", "clinic", "." ] } ]
PMC11747949
Tissues were exposed to Dab chromogen 8 min and then counterstained with hematoxylin, dehydrated, and mounted.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Tissues", "were", "exposed", "to", "Dab", "chromogen", "8", "min", "and", "then", "counterstained", "with", "hematoxylin", ",", "dehydrated", ",", "and", "mounted", "." ] } ]
PMC11222184
1Debio0932 (A) and XL-888 (B) cytotoxicity and IC50 values in SH-SY5Y cells after 24 h and 48 h Debio0932 (A) and XL-888 (B) cytotoxicity and IC50 values in SH-SY5Y cells after 24 h and 48 h A cancer pathway finder PCR array was used to determine the expression levels of cancer-associated genes in neuroblastoma cells exposed to Hsp90 inhibitors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "1Debio0932", "(", "A", ")", "and", "XL-888", "(", "B", ")", "cytotoxicity", "and", "IC50", "values", "in", "SH-SY5Y", "cells", "after", "24", "h", "and", "48", "h", "Debio0932", "(", "A", ")", "and", "XL-888", "(", "B", ")", "cytotoxicity", "and", "IC50", "values", "in", "SH-SY5Y", "cells", "after", "24", "h", "and", "48", "h", "A", "cancer", "pathway", "finder", "PCR", "array", "was", "used", "to", "determine", "the", "expression", "levels", "of", "cancer-associated", "genes", "in", "neuroblastoma", "cells", "exposed", "to", "Hsp90", "inhibitors", "." ] } ]
PMC11764090
Exogenous SA enhances cold response gene expression, PSII, Fv/Fm, and Pn, and reduces MDA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Exogenous", "SA", "enhances", "cold", "response", "gene", "expression", ",", "PSII", ",", "Fv/Fm", ",", "and", "Pn", ",", "and", "reduces", "MDA", "." ] } ]
PMC6364197
no. A07745), CD3-ECD (cat.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "no.", "A07745", ")", ",", "CD3-ECD", "(", "cat", "." ] } ]
PMC11462673
Ailen S. Cervino etal.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ailen", "S.", "Cervino", "etal", "." ] } ]
PMC11525293
The observation that Thal does reduce pseudo-SARS-CoV-2 infectivity, while the sole ΔNp63α downregulation does not, suggests that Thal might regulate multiple factors, warranting further investigations.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "observation", "that", "Thal", "does", "reduce", "pseudo-SARS-CoV-2", "infectivity", ",", "while", "the", "sole", "ΔNp63α", "downregulation", "does", "not", ",", "suggests", "that", "Thal", "might", "regulate", "multiple", "factors", ",", "warranting", "further", "investigations", "." ] } ]
PMC10454535
We sought to identify a synergistic combination of BTZ with a RES derivative and analyze the effects on reducing viability and inducing apoptosis in human MM cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "sought", "to", "identify", "a", "synergistic", "combination", "of", "BTZ", "with", "a", "RES", "derivative", "and", "analyze", "the", "effects", "on", "reducing", "viability", "and", "inducing", "apoptosis", "in", "human", "MM", "cells", "." ] } ]
PMC11337594
Both static bright-field images and fluorescence images were captured using an Olympus microscope (OLYMPUS IX51, Tokyo, Japan).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Both", "static", "bright-field", "images", "and", "fluorescence", "images", "were", "captured", "using", "an", "Olympus", "microscope", "(", "OLYMPUS", "IX51", ",", "Tokyo", ",", "Japan", ")", "." ] } ]
PMC10024132
Kaplan-Meier survival curves.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Kaplan-Meier", "survival", "curves", "." ] } ]
PMC9429973
Evidence of PH was found in 32 patients (38%, [90% CI 29-47]) of whom 12 (14% [90% CI 9-22]) had moderate to severe PH.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Evidence", "of", "PH", "was", "found", "in", "32", "patients", "(", "38", "%", ",", "[", "90", "%", "CI", "29", "-", "47", "]", ")", "of", "whom", "12", "(", "14", "%", "[", "90", "%", "CI", "9", "-", "22", "]", ")", "had", "moderate", "to", "severe", "PH", "." ] } ]
PMC7136814
Drugs were diluted in full media and final DMSO concentration on cells never exceeded 0.01%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Drugs", "were", "diluted", "in", "full", "media", "and", "final", "DMSO", "concentration", "on", "cells", "never", "exceeded", "0.01", "%", "." ] } ]
PMC7612475
Therefore, we also investigated the impact of SF3B1 depletion on cellular survival following treatment with these agents.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "we", "also", "investigated", "the", "impact", "of", "SF3B1", "depletion", "on", "cellular", "survival", "following", "treatment", "with", "these", "agents", "." ] } ]
PMC9412887
The results indicated that DOX@pPGNCs achieved the strongest antitumor efficacy with a TIR of 97.3% (Figure 3f,g), indicating the highly effective synergistic thermo-chemotherapy in MCF-7/ADR cell-bearing mice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "indicated", "that", "DOX@pPGNCs", "achieved", "the", "strongest", "antitumor", "efficacy", "with", "a", "TIR", "of", "97.3", "%", "(", "Figure", "3f", ",", "g", ")", ",", "indicating", "the", "highly", "effective", "synergistic", "thermo-chemotherapy", "in", "MCF-7/ADR", "cell-bearing", "mice", "." ] } ]
PMC8864075
STRING network and Cytoscape 3.7.2 were used to construct the PPI network (Figure 2B); AKT1 was the central protein.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "STRING", "network", "and", "Cytoscape", "3.7.2", "were", "used", "to", "construct", "the", "PPI", "network", "(", "Figure", "2B", ")", ";", "AKT1", "was", "the", "central", "protein", "." ] } ]
PMC11206502
Adverse effects were not detected in a single-dose administration lower than 35 mg/kg or in repeated, nine-day dosages with 10 mg/kg/bw .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Adverse", "effects", "were", "not", "detected", "in", "a", "single-dose", "administration", "lower", "than", "35", "mg/kg", "or", "in", "repeated", ",", "nine-day", "dosages", "with", "10", "mg/kg/bw", "." ] } ]
PMC7840816
In addition, knockdown of SOX9 drastically inhibited TPC-1 cell invasion.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "knockdown", "of", "SOX9", "drastically", "inhibited", "TPC-1", "cell", "invasion", "." ] } ]
PMC11748618
Analysis of monocyte CHD1L eQTLs from the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis cohort.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Analysis", "of", "monocyte", "CHD1L", "eQTLs", "from", "the", "Multi-Ethnic", "Study", "of", "Atherosclerosis", "cohort", "." ] } ]
PMC10812665
Our data suggest that the increased glycolytic rate (observed in Figure 3A,B) successfully buffered ATP production, even at compound concentrations which completely abolished mitochondrial respiration.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "data", "suggest", "that", "the", "increased", "glycolytic", "rate", "(", "observed", "in", "Figure", "3A", ",", "B", ")", "successfully", "buffered", "ATP", "production", ",", "even", "at", "compound", "concentrations", "which", "completely", "abolished", "mitochondrial", "respiration", "." ] } ]
PMC11290772
The comparison results of the IHC staining between tumor tissues and the organoids were detected with CA125, HE4 and CEA (Supplementary Figure 4) as the biomarker of the ovarian cancer .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "comparison", "results", "of", "the", "IHC", "staining", "between", "tumor", "tissues", "and", "the", "organoids", "were", "detected", "with", "CA125", ",", "HE4", "and", "CEA", "(", "Supplementary", "Figure", "4", ")", "as", "the", "biomarker", "of", "the", "ovarian", "cancer", "." ] } ]