PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC11453018 | C Immunostaining shows a complete absence of LMNB1 (red) expression in iP300w-treated cells after 72 hours. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"C",
"Immunostaining",
"shows",
"a",
"complete",
"absence",
"of",
"LMNB1",
"(",
"red",
")",
"expression",
"in",
"iP300w-treated",
"cells",
"after",
"72",
"hours",
"."
]
}
] |
PMC10914904 | MAPK plays a crucial role in multiple facets of the immune response, including innate immune activation, immune cell proliferation, and the orchestrated regulation of cell death in response to the completion of immune functions . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MAPK",
"plays",
"a",
"crucial",
"role",
"in",
"multiple",
"facets",
"of",
"the",
"immune",
"response",
",",
"including",
"innate",
"immune",
"activation",
",",
"immune",
"cell",
"proliferation",
",",
"and",
"the",
"orchestrated",
"regulation",
"of",
"cell",
"death",
"in",
"response",
"to",
"the",
"completion",
"of",
"immune",
"functions",
"."
]
}
] |
PMC11683240 | A concentration-dependent inhibition was observed under most conditions. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"concentration-dependent",
"inhibition",
"was",
"observed",
"under",
"most",
"conditions",
"."
]
}
] |
PMC11787651 | The solution was then serially diluted with the culture medium to obtain the desired concentration. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"solution",
"was",
"then",
"serially",
"diluted",
"with",
"the",
"culture",
"medium",
"to",
"obtain",
"the",
"desired",
"concentration",
"."
]
}
] |
PMC11727306 | It is proposed that the observation of Ramnath et al., who showed that when abrin toxin was delivered to mice in sub-lethal doses it decreased solid tumor cell numbers in vivo and significantly increased mice survival time , which could be explained by abrin toxin amplification of activation of T-cells arriving at the tumor site. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"is",
"proposed",
"that",
"the",
"observation",
"of",
"Ramnath",
"et",
"al.",
",",
"who",
"showed",
"that",
"when",
"abrin",
"toxin",
"was",
"delivered",
"to",
"mice",
"in",
"sub-lethal",
"doses",
"it",
"decreased",
"solid",
"tumor",
"cell",
"numbers",
"in",
"vivo",
"and",
"significantly",
"increased",
"mice",
"survival",
"time",
",",
"which",
"could",
"be",
"explained",
"by",
"abrin",
"toxin",
"amplification",
"of",
"activation",
"of",
"T-cells",
"arriving",
"at",
"the",
"tumor",
"site",
"."
]
}
] |
PMC10565698 | For example, circ-100395, circ-0039459, and circ-CSPP1 are aberrantly expressed in LC and associated with cancer cell proliferation, apoptosis, migration, and invasion [, , ]. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"example",
",",
"circ-100395",
",",
"circ-0039459",
",",
"and",
"circ-CSPP1",
"are",
"aberrantly",
"expressed",
"in",
"LC",
"and",
"associated",
"with",
"cancer",
"cell",
"proliferation",
",",
"apoptosis",
",",
"migration",
",",
"and",
"invasion",
"[",
",",
",",
"]",
"."
]
}
] |
PMC10482220 | Importantly, we show that endogenous G3BP becomes partially dephosphorylated on Ser 149 localized in the acidic domain during the formation of SGs, consistent with the idea that this event could participate in the regulation of SG assembly in vivo. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Importantly",
",",
"we",
"show",
"that",
"endogenous",
"G3BP",
"becomes",
"partially",
"dephosphorylated",
"on",
"Ser",
"149",
"localized",
"in",
"the",
"acidic",
"domain",
"during",
"the",
"formation",
"of",
"SGs",
",",
"consistent",
"with",
"the",
"idea",
"that",
"this",
"event",
"could",
"participate",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"SG",
"assembly",
"in",
"vivo",
"."
]
}
] |
PMC8978939 | Lacking experimental structures of the two variants considered, in silico mutations were introduced by replacing the residue of interest at the native structure using the SWISS-PDB Viewer software (42). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Lacking",
"experimental",
"structures",
"of",
"the",
"two",
"variants",
"considered",
",",
"in",
"silico",
"mutations",
"were",
"introduced",
"by",
"replacing",
"the",
"residue",
"of",
"interest",
"at",
"the",
"native",
"structure",
"using",
"the",
"SWISS-PDB",
"Viewer",
"software",
"(",
"42",
")",
"."
]
}
] |
PMC11768927 | These cell lines were highly heterogeneous in the susceptibility to the virus. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"cell",
"lines",
"were",
"highly",
"heterogeneous",
"in",
"the",
"susceptibility",
"to",
"the",
"virus",
"."
]
}
] |
PMC11541241 | Moderate levels of reactive oxygen species (ROS) in pathogens are necessary for vegetative growth and pathogenicity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moderate",
"levels",
"of",
"reactive",
"oxygen",
"species",
"(",
"ROS",
")",
"in",
"pathogens",
"are",
"necessary",
"for",
"vegetative",
"growth",
"and",
"pathogenicity",
"."
]
}
] |
PMC8777939 | Beside, AGR2 is also found in plasma membrane, cytoplasm, and the extracellular environment . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Beside",
",",
"AGR2",
"is",
"also",
"found",
"in",
"plasma",
"membrane",
",",
"cytoplasm",
",",
"and",
"the",
"extracellular",
"environment",
"."
]
}
] |
PMC11696576 | Fig. S3). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Fig.",
"S3",
")",
"."
]
}
] |
PMC11607321 | For example, in generating drug response predictions, the MOSA model could disproportionately emphasize the input drug response data, neglecting the potential contributions from other omic layers, such as transcriptomic and proteomic data. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"example",
",",
"in",
"generating",
"drug",
"response",
"predictions",
",",
"the",
"MOSA",
"model",
"could",
"disproportionately",
"emphasize",
"the",
"input",
"drug",
"response",
"data",
",",
"neglecting",
"the",
"potential",
"contributions",
"from",
"other",
"omic",
"layers",
",",
"such",
"as",
"transcriptomic",
"and",
"proteomic",
"data",
"."
]
}
] |
PMC11766309 | P < 0.05, **P < 0.01, ***P < 0.001, ns—not statistically significant. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"P",
"<",
"0.05",
",",
"*",
"*",
"P",
"<",
"0.01",
",",
"*",
"*",
"*",
"P",
"<",
"0.001",
",",
"ns",
"—",
"not",
"statistically",
"significant",
"."
]
}
] |
PMC6803987 | In addition to being a Tujia medicine, the botanical drug is used to treat stomach cold pain, bronchial asthma, rheumatic pain, gonococcal disease and dysentery , and is also used by other ethnic minorities of Miao, Mulao and Lisu nationality. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
"to",
"being",
"a",
"Tujia",
"medicine",
",",
"the",
"botanical",
"drug",
"is",
"used",
"to",
"treat",
"stomach",
"cold",
"pain",
",",
"bronchial",
"asthma",
",",
"rheumatic",
"pain",
",",
"gonococcal",
"disease",
"and",
"dysentery",
",",
"and",
"is",
"also",
"used",
"by",
"other",
"ethnic",
"minorities",
"of",
"Miao",
",",
"Mulao",
"and",
"Lisu",
"nationality",
"."
]
}
] |
PMC11629461 | A–F) Fura‐2‐loaded CHO‐K1 (A), NOX5‐CHO‐K1 (B–F) cells were perifused, SALPC 2 μM (A, C, E, F), red light (LED 675 nm, 85 mW/cm, 1.5 min) (A, D, E, F) or DPI 30 μM (F) were applied as indicated by the horizontal bars. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"–",
"F",
")",
"Fura‐2‐loaded",
"CHO‐K1",
"(",
"A",
")",
",",
"NOX5‐CHO‐K1",
"(",
"B",
"–",
"F",
")",
"cells",
"were",
"perifused",
",",
"SALPC",
"2",
"μM",
"(",
"A",
",",
"C",
",",
"E",
",",
"F",
")",
",",
"red",
"light",
"(",
"LED",
"675",
"nm",
",",
"85",
"mW/cm",
",",
"1.5",
"min",
")",
"(",
"A",
",",
"D",
",",
"E",
",",
"F",
")",
"or",
"DPI",
"30",
"μM",
"(",
"F",
")",
"were",
"applied",
"as",
"indicated",
"by",
"the",
"horizontal",
"bars",
".",
"("
]
}
] |
PMC11791478 | The percentage of FXa generated in the presence of 25A3 relative to a nonantibody control was reported. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"percentage",
"of",
"FXa",
"generated",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"25A3",
"relative",
"to",
"a",
"nonantibody",
"control",
"was",
"reported",
"."
]
}
] |
PMC11530949 | The Ag-doped CuO NPs were seen to exhibit agglomerations because of their tiny size (~50 nm). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"Ag-doped",
"CuO",
"NPs",
"were",
"seen",
"to",
"exhibit",
"agglomerations",
"because",
"of",
"their",
"tiny",
"size",
"(",
"~50",
"nm",
")",
"."
]
}
] |
PMC10669128 | All these neoplasms are believed to derive from the transformation of a common multipotent cell of origin, which can differentiate into specific lineages . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"these",
"neoplasms",
"are",
"believed",
"to",
"derive",
"from",
"the",
"transformation",
"of",
"a",
"common",
"multipotent",
"cell",
"of",
"origin",
",",
"which",
"can",
"differentiate",
"into",
"specific",
"lineages",
"."
]
}
] |
PMC11402217 | Scale bars = 10 μM.(I) Western blotting of Calcinerin A and Calcinerin B protein expression after treated with XD23 for 24h or 48h.(J) Normalized protein expression analysis of (I). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Scale",
"bars",
"=",
"10",
"μM.(I",
")",
"Western",
"blotting",
"of",
"Calcinerin",
"A",
"and",
"Calcinerin",
"B",
"protein",
"expression",
"after",
"treated",
"with",
"XD23",
"for",
"24h",
"or",
"48h.(J",
")",
"Normalized",
"protein",
"expression",
"analysis",
"of",
"(",
"I",
")",
"."
]
}
] |
PMC11075223 | Cimicifugae Rhizoma belonging to the Ranunculaceae, is widely distributed in China, Korea Peninsula, Mongolia and Russia Far East . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cimicifugae",
"Rhizoma",
"belonging",
"to",
"the",
"Ranunculaceae",
",",
"is",
"widely",
"distributed",
"in",
"China",
",",
"Korea",
"Peninsula",
",",
"Mongolia",
"and",
"Russia",
"Far",
"East",
"."
]
}
] |
PMC9341513 | In particular, in both U266 and Z-138, an H3K4me3 broad domain containing several DHSs appears over CCND1. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"particular",
",",
"in",
"both",
"U266",
"and",
"Z-138",
",",
"an",
"H3K4me3",
"broad",
"domain",
"containing",
"several",
"DHSs",
"appears",
"over",
"CCND1",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | SPINK2 status also identified high risk patients of the IR cytogenetic subgroup. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"SPINK2",
"status",
"also",
"identified",
"high",
"risk",
"patients",
"of",
"the",
"IR",
"cytogenetic",
"subgroup",
"."
]
}
] |
PMC11532793 | If N(B − 1) is large, then the estimate of τt will be very precise. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"If",
"N(B",
"−",
"1",
")",
"is",
"large",
",",
"then",
"the",
"estimate",
"of",
"τt",
"will",
"be",
"very",
"precise",
"."
]
}
] |
PMC11126803 | E, invasion assays proved that high expression of LncRNA-SERB leads to increased cell invasion, and vice versa. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"E",
",",
"invasion",
"assays",
"proved",
"that",
"high",
"expression",
"of",
"LncRNA-SERB",
"leads",
"to",
"increased",
"cell",
"invasion",
",",
"and",
"vice",
"versa",
"."
]
}
] |
PMC11764090 | The ability of many plant species to express robust phenotypes depends on light and photosynthetic activity during cold growth. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"ability",
"of",
"many",
"plant",
"species",
"to",
"express",
"robust",
"phenotypes",
"depends",
"on",
"light",
"and",
"photosynthetic",
"activity",
"during",
"cold",
"growth",
"."
]
}
] |
PMC6835428 | In women under 40 years of age, OC is rare; however, the risk increases above age 40, peaking in the late 70s . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"women",
"under",
"40",
"years",
"of",
"age",
",",
"OC",
"is",
"rare",
";",
"however",
",",
"the",
"risk",
"increases",
"above",
"age",
"40",
",",
"peaking",
"in",
"the",
"late",
"70s",
"."
]
}
] |
PMC11730000 | Notably, the application of 100 µM EGCG resulted in an increase in ROS levels in CHO-K1 cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Notably",
",",
"the",
"application",
"of",
"100",
"µM",
"EGCG",
"resulted",
"in",
"an",
"increase",
"in",
"ROS",
"levels",
"in",
"CHO-K1",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11747949 | Changes in CAIX and HIF1A, as well as DLL1 and p53 upregulation are of particular interest. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Changes",
"in",
"CAIX",
"and",
"HIF1A",
",",
"as",
"well",
"as",
"DLL1",
"and",
"p53",
"upregulation",
"are",
"of",
"particular",
"interest",
"."
]
}
] |
PMC8711270 | While rAAVs are commonly produced in HEK293-based systems, baculovirus-based systems have been developed showing comparable rAAV titers. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"While",
"rAAVs",
"are",
"commonly",
"produced",
"in",
"HEK293-based",
"systems",
",",
"baculovirus-based",
"systems",
"have",
"been",
"developed",
"showing",
"comparable",
"rAAV",
"titers",
"."
]
}
] |
PMC11806182 | D Survival curve for samples stratified by the abundance of CD4.T.cells.1. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"D",
"Survival",
"curve",
"for",
"samples",
"stratified",
"by",
"the",
"abundance",
"of",
"CD4.T.cells.1",
"."
]
}
] |
PMC11489351 | The ratio of the protein of interest normalized to loading control was calculated from exported densitometry data. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"ratio",
"of",
"the",
"protein",
"of",
"interest",
"normalized",
"to",
"loading",
"control",
"was",
"calculated",
"from",
"exported",
"densitometry",
"data",
"."
]
}
] |
PMC10547921 | Besides, certain other characteristics of ADC payloads, such as cytotoxicity, immunogenicity, stability of storage during preparation and circulation, water solubility, and modifiability are also important. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Besides",
",",
"certain",
"other",
"characteristics",
"of",
"ADC",
"payloads",
",",
"such",
"as",
"cytotoxicity",
",",
"immunogenicity",
",",
"stability",
"of",
"storage",
"during",
"preparation",
"and",
"circulation",
",",
"water",
"solubility",
",",
"and",
"modifiability",
"are",
"also",
"important",
"."
]
}
] |
PMC10551595 | The anti‐cancer effect of GinA is confirmed in breast cancer cells by initiating ROS‐mediated oxidative stress. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"anti‐cancer",
"effect",
"of",
"GinA",
"is",
"confirmed",
"in",
"breast",
"cancer",
"cells",
"by",
"initiating",
"ROS‐mediated",
"oxidative",
"stress",
"."
]
}
] |
PMC11795610 | In the terminal differentiation, the KC lose their nuclei and become corneocytes, which form the bricks in the “bricks and mortar” model, lipids secreted by lamellar body act as mortar, and the tight junctions between KC serve as “steel rebar,” which together constitute the intact epidermal barrier. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"the",
"terminal",
"differentiation",
",",
"the",
"KC",
"lose",
"their",
"nuclei",
"and",
"become",
"corneocytes",
",",
"which",
"form",
"the",
"bricks",
"in",
"the",
"“",
"bricks",
"and",
"mortar",
"”",
"model",
",",
"lipids",
"secreted",
"by",
"lamellar",
"body",
"act",
"as",
"mortar",
",",
"and",
"the",
"tight",
"junctions",
"between",
"KC",
"serve",
"as",
"“",
"steel",
"rebar",
",",
"”",
"which",
"together",
"constitute",
"the",
"intact",
"epidermal",
"barrier",
"."
]
}
] |
PMC11751675 | The results indicated that artemisinin and its derivatives exhibited good oral absorption and a bioavailability score of 0.55. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"results",
"indicated",
"that",
"artemisinin",
"and",
"its",
"derivatives",
"exhibited",
"good",
"oral",
"absorption",
"and",
"a",
"bioavailability",
"score",
"of",
"0.55",
"."
]
}
] |
PMC11543853 | Enterovirus capsids are built from VP1, VP2, and VP3 subunits organized with pseudo-T = 3 icosahedral symmetry and minor capsid proteins VP4 symmetrically attached to the inner face of the capsid. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Enterovirus",
"capsids",
"are",
"built",
"from",
"VP1",
",",
"VP2",
",",
"and",
"VP3",
"subunits",
"organized",
"with",
"pseudo-T",
"=",
"3",
"icosahedral",
"symmetry",
"and",
"minor",
"capsid",
"proteins",
"VP4",
"symmetrically",
"attached",
"to",
"the",
"inner",
"face",
"of",
"the",
"capsid",
"."
]
}
] |
PMC11790599 | Activated Rac1 localizes to the plasma membrane, where it stimulates the reorganization of actin filaments and membrane ruffling (Hall, 1998; Stow et al., 2020). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Activated",
"Rac1",
"localizes",
"to",
"the",
"plasma",
"membrane",
",",
"where",
"it",
"stimulates",
"the",
"reorganization",
"of",
"actin",
"filaments",
"and",
"membrane",
"ruffling",
"(",
"Hall",
",",
"1998",
";",
"Stow",
"et",
"al.",
",",
"2020",
")",
"."
]
}
] |
PMC11748335 | Moreover, long LOCKs in S-PMDs were associated with lower expression levels of oncogenes compared to other genes. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moreover",
",",
"long",
"LOCKs",
"in",
"S-PMDs",
"were",
"associated",
"with",
"lower",
"expression",
"levels",
"of",
"oncogenes",
"compared",
"to",
"other",
"genes",
"."
]
}
] |
PMC11515150 | CD5 Raji cells were used as a negative control. | [
{
"tags": [
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CD5",
"Raji",
"cells",
"were",
"used",
"as",
"a",
"negative",
"control",
"."
]
}
] |
PMC9100622 | After 24 h, Atorvastatin (1 µM A673, 2.6 µM TC71, and 2.4 µM POE) was added to the culture medium in the absence or presence of 100 µM MEV, 10 µM Fpp, or GGpp for 72 h. The experiments with NAC, an inhibitor of intracellular ROS (NAC), were performed in flasks of 25 cm with 4.5 × 10 of A673 cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"24",
"h",
",",
"Atorvastatin",
"(",
"1",
"µM",
"A673",
",",
"2.6",
"µM",
"TC71",
",",
"and",
"2.4",
"µM",
"POE",
")",
"was",
"added",
"to",
"the",
"culture",
"medium",
"in",
"the",
"absence",
"or",
"presence",
"of",
"100",
"µM",
"MEV",
",",
"10",
"µM",
"Fpp",
",",
"or",
"GGpp",
"for",
"72",
"h.",
"The",
"experiments",
"with",
"NAC",
",",
"an",
"inhibitor",
"of",
"intracellular",
"ROS",
"(",
"NAC",
")",
",",
"were",
"performed",
"in",
"flasks",
"of",
"25",
"cm",
"with",
"4.5",
"×",
"10",
"of",
"A673",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11718109 | In some nerve terminals, tightly-packed SSVs with clear post-synaptic densities (PSDs) were observed (Fig. 8B), however, the presence of varicosities lacking clear PSDs (bouton-like) comprising of pleiomorphic vesicle pools were frequently observed (Fig. 8C). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"some",
"nerve",
"terminals",
",",
"tightly-packed",
"SSVs",
"with",
"clear",
"post-synaptic",
"densities",
"(",
"PSDs",
")",
"were",
"observed",
"(",
"Fig.",
"8B",
")",
",",
"however",
",",
"the",
"presence",
"of",
"varicosities",
"lacking",
"clear",
"PSDs",
"(",
"bouton-like",
")",
"comprising",
"of",
"pleiomorphic",
"vesicle",
"pools",
"were",
"frequently",
"observed",
"(",
"Fig.",
"8C",
")",
"."
]
}
] |
PMC10329074 | Logistic regression and multivariate Cox analyses were subsequently employed to scrutinize the association between YBX3 expression and the clinicopathological characteristics of patients. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Logistic",
"regression",
"and",
"multivariate",
"Cox",
"analyses",
"were",
"subsequently",
"employed",
"to",
"scrutinize",
"the",
"association",
"between",
"YBX3",
"expression",
"and",
"the",
"clinicopathological",
"characteristics",
"of",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC11615101 | The lysate was centrifuged (15,000 × g, 4°C, 30 min), and protein 40 microgram (µg) estimated by bicinchoninic acid assay (BCA) (G-biosciences, USA) was run on sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and transferred onto a nitrocellulose membrane (NC) (G-biosciences, USA) using a semi dry transfer unit (Bio-Rad, USA). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"lysate",
"was",
"centrifuged",
"(",
"15,000",
"×",
"g",
",",
"4",
"°",
"C",
",",
"30",
"min",
")",
",",
"and",
"protein",
"40",
"microgram",
"(",
"µg",
")",
"estimated",
"by",
"bicinchoninic",
"acid",
"assay",
"(",
"BCA",
")",
"(",
"G-biosciences",
",",
"USA",
")",
"was",
"run",
"on",
"sodium",
"dodecyl",
"sulfate-polyacrylamide",
"gel",
"electrophoresis",
"(",
"SDS-PAGE",
")",
"and",
"transferred",
"onto",
"a",
"nitrocellulose",
"membrane",
"(",
"NC",
")",
"(",
"G-biosciences",
",",
"USA",
")",
"using",
"a",
"semi",
"dry",
"transfer",
"unit",
"(",
"Bio-Rad",
",",
"USA",
")",
"."
]
}
] |
PMC11758416 | We describe steps for preparing L and T cells for the assay and incubation of target cells with effector cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"describe",
"steps",
"for",
"preparing",
"L",
"and",
"T",
"cells",
"for",
"the",
"assay",
"and",
"incubation",
"of",
"target",
"cells",
"with",
"effector",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The effect on patients with an early transfusion need warrants further studies. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"effect",
"on",
"patients",
"with",
"an",
"early",
"transfusion",
"need",
"warrants",
"further",
"studies",
"."
]
}
] |
PMC11360263 | Thus, mainly IE1-expressing cells displayed EMT and stemness properties compared to the uninfected cells in the culture. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Thus",
",",
"mainly",
"IE1-expressing",
"cells",
"displayed",
"EMT",
"and",
"stemness",
"properties",
"compared",
"to",
"the",
"uninfected",
"cells",
"in",
"the",
"culture",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | However, some real-life studies evaluating young population of MM patients has been conducted to identify patient and disease features may have impact on this group of patients. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"some",
"real-life",
"studies",
"evaluating",
"young",
"population",
"of",
"MM",
"patients",
"has",
"been",
"conducted",
"to",
"identify",
"patient",
"and",
"disease",
"features",
"may",
"have",
"impact",
"on",
"this",
"group",
"of",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC11551844 | The synthesis of conjugated AuNPs was successful only with contignasterol and ansellone A. AuNPs-contignasterol displayed less activity than contignasterol on the A172 cell line, and there was no significant difference in the activity of AuNPs-ansellone A and ansellone A on the A172 and HaCaT cell lines. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"synthesis",
"of",
"conjugated",
"AuNPs",
"was",
"successful",
"only",
"with",
"contignasterol",
"and",
"ansellone",
"A.",
"AuNPs-contignasterol",
"displayed",
"less",
"activity",
"than",
"contignasterol",
"on",
"the",
"A172",
"cell",
"line",
",",
"and",
"there",
"was",
"no",
"significant",
"difference",
"in",
"the",
"activity",
"of",
"AuNPs-ansellone",
"A",
"and",
"ansellone",
"A",
"on",
"the",
"A172",
"and",
"HaCaT",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC7987994 | Error bars stand for the standard error deviation of six measurements. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Error",
"bars",
"stand",
"for",
"the",
"standard",
"error",
"deviation",
"of",
"six",
"measurements",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Image: Summary/Conclusion: Within our cohort of patients with haematological cancer diagnosed with COVID19 infection, the role of immunisations and presence of the Omicron strain within the community has resulted in a mortality rate of 4% which is lower than the rates observed in previous studies. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Image",
":",
"Summary/Conclusion",
":",
"Within",
"our",
"cohort",
"of",
"patients",
"with",
"haematological",
"cancer",
"diagnosed",
"with",
"COVID19",
"infection",
",",
"the",
"role",
"of",
"immunisations",
"and",
"presence",
"of",
"the",
"Omicron",
"strain",
"within",
"the",
"community",
"has",
"resulted",
"in",
"a",
"mortality",
"rate",
"of",
"4",
"%",
"which",
"is",
"lower",
"than",
"the",
"rates",
"observed",
"in",
"previous",
"studies",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The TET2/SF3B1 group showed better mOS (HR 0.34, p=0.041) compared to the TP53/RAS group showing inferior mOS (HR 4.64, p<0.001) (shown in figure). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"TET2/SF3B1",
"group",
"showed",
"better",
"mOS",
"(",
"HR",
"0.34",
",",
"p=0.041",
")",
"compared",
"to",
"the",
"TP53/RAS",
"group",
"showing",
"inferior",
"mOS",
"(",
"HR",
"4.64",
",",
"p<0.001",
")",
"(",
"shown",
"in",
"figure",
")",
"."
]
}
] |
PMC11095939 | Further studies are needed to explore what domain(s) is (are) responsible for the interaction between Mecp2 and Nedd4, which corresponding ubiquitylation sites within Mecp2 are targeted by Nedd4, and whether ubiquitylation site mutations of Mecp2 can completely abolish cell cycle reentry. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Further",
"studies",
"are",
"needed",
"to",
"explore",
"what",
"domain(s",
")",
"is",
"(",
"are",
")",
"responsible",
"for",
"the",
"interaction",
"between",
"Mecp2",
"and",
"Nedd4",
",",
"which",
"corresponding",
"ubiquitylation",
"sites",
"within",
"Mecp2",
"are",
"targeted",
"by",
"Nedd4",
",",
"and",
"whether",
"ubiquitylation",
"site",
"mutations",
"of",
"Mecp2",
"can",
"completely",
"abolish",
"cell",
"cycle",
"reentry",
"."
]
}
] |
PMC9024365 | Quantification indicates a significant increase in the mean cluster size of GluA1 and GluA2 puncta when co-expressed with SD4 compared with receptor alone (Figure 1B). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Quantification",
"indicates",
"a",
"significant",
"increase",
"in",
"the",
"mean",
"cluster",
"size",
"of",
"GluA1",
"and",
"GluA2",
"puncta",
"when",
"co-expressed",
"with",
"SD4",
"compared",
"with",
"receptor",
"alone",
"(",
"Figure",
"1B",
")",
"."
]
}
] |
PMC10891340 | Our results revealed a significant up-regulation of the pro-apoptotic factors Bak and poly ADP-ribose polymerase (PARP) during DPV infection. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"results",
"revealed",
"a",
"significant",
"up-regulation",
"of",
"the",
"pro-apoptotic",
"factors",
"Bak",
"and",
"poly",
"ADP-ribose",
"polymerase",
"(",
"PARP",
")",
"during",
"DPV",
"infection",
"."
]
}
] |
PMC11653533 | However, aqueous, methanol, and chloroform extracts of F. religiosa have conveyed potential antibacterial activity against Enterotoxigenic E. coli, which were isolated from diarrheal patients with a zone of inhibition value equal to 10, 14, and 12 mm for 4 mg/ml aqueous, methanol and chloroform extracts, respectively (Uma et al., 2009). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"aqueous",
",",
"methanol",
",",
"and",
"chloroform",
"extracts",
"of",
"F.",
"religiosa",
"have",
"conveyed",
"potential",
"antibacterial",
"activity",
"against",
"Enterotoxigenic",
"E.",
"coli",
",",
"which",
"were",
"isolated",
"from",
"diarrheal",
"patients",
"with",
"a",
"zone",
"of",
"inhibition",
"value",
"equal",
"to",
"10",
",",
"14",
",",
"and",
"12",
"mm",
"for",
"4",
"mg/ml",
"aqueous",
",",
"methanol",
"and",
"chloroform",
"extracts",
",",
"respectively",
"(",
"Uma",
"et",
"al.",
",",
"2009",
")",
"."
]
}
] |
PMC11783017 | The results showed that at all tested hydrogel formulations, the viability of L929 cells exceeded 90 %, demonstrating the excellent biocompatibility of the hydrogels (Fig. S7). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"results",
"showed",
"that",
"at",
"all",
"tested",
"hydrogel",
"formulations",
",",
"the",
"viability",
"of",
"L929",
"cells",
"exceeded",
"90",
"%",
",",
"demonstrating",
"the",
"excellent",
"biocompatibility",
"of",
"the",
"hydrogels",
"(",
"Fig.",
"S7",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Methods: Patients were treated with 9 induction cycles (28 days) of ixazomib (4mg on day 1, 8 and 15), thalidomide (100mg on day 1-28) and dexamethasone (40mg on day 1, 8, 15 and 22), followed by maintenance with either ixazomib or placebo (4mg, both on day 1, 8 and 15, every 28 days). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Methods",
":",
"Patients",
"were",
"treated",
"with",
"9",
"induction",
"cycles",
"(",
"28",
"days",
")",
"of",
"ixazomib",
"(",
"4",
"mg",
"on",
"day",
"1",
",",
"8",
"and",
"15",
")",
",",
"thalidomide",
"(",
"100",
"mg",
"on",
"day",
"1",
"-",
"28",
")",
"and",
"dexamethasone",
"(",
"40",
"mg",
"on",
"day",
"1",
",",
"8",
",",
"15",
"and",
"22",
")",
",",
"followed",
"by",
"maintenance",
"with",
"either",
"ixazomib",
"or",
"placebo",
"(",
"4",
"mg",
",",
"both",
"on",
"day",
"1",
",",
"8",
"and",
"15",
",",
"every",
"28",
"days",
")",
"."
]
}
] |
PMC11740508 | This places the coordinated activity of PARP1, DNMT1, and their inhibitors at replication forks. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"places",
"the",
"coordinated",
"activity",
"of",
"PARP1",
",",
"DNMT1",
",",
"and",
"their",
"inhibitors",
"at",
"replication",
"forks",
"."
]
}
] |
PMC9966931 | Specifically, the compound 2-Isopropyl-5-methylphenyl benzoate (1) was most active as an antifungal compound and as a potential anticancer drug, and was also one of the most reliable hybrids obtained via chemical and enzymatic methods. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Specifically",
",",
"the",
"compound",
"2-Isopropyl-5-methylphenyl",
"benzoate",
"(",
"1",
")",
"was",
"most",
"active",
"as",
"an",
"antifungal",
"compound",
"and",
"as",
"a",
"potential",
"anticancer",
"drug",
",",
"and",
"was",
"also",
"one",
"of",
"the",
"most",
"reliable",
"hybrids",
"obtained",
"via",
"chemical",
"and",
"enzymatic",
"methods",
"."
]
}
] |
PMC9874064 | The results showed that the bioluminence intensity of the nude mice treated with NP-Pt-USP1i gradually decreased with days post injection, and the average bioluminence value after 15 days of treatment changed from the initial 9.72 × 10 p/s/cm/sr to 1.34 × 10 p/s/cm/sr, which was 1/50 of that of mice treated with PBS (5.74 × 10 p/s/cm/sr), and 1/20 of that of mice treated with NP-Pt (2.96 × 10 p/s/cm/sr) (Fig. 5C). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"results",
"showed",
"that",
"the",
"bioluminence",
"intensity",
"of",
"the",
"nude",
"mice",
"treated",
"with",
"NP-Pt-USP1i",
"gradually",
"decreased",
"with",
"days",
"post",
"injection",
",",
"and",
"the",
"average",
"bioluminence",
"value",
"after",
"15",
"days",
"of",
"treatment",
"changed",
"from",
"the",
"initial",
"9.72",
"",
"×",
"10",
"p/s/cm/sr",
"to",
"1.34",
"",
"×",
"10",
"p/s/cm/sr",
",",
"which",
"was",
"1/50",
"of",
"that",
"of",
"mice",
"treated",
"with",
"PBS",
"(",
"5.74",
"",
"×",
"10",
"p/s/cm/sr",
")",
",",
"and",
"1/20",
"of",
"that",
"of",
"mice",
"treated",
"with",
"NP-Pt",
"(",
"2.96",
"",
"×",
"10",
"p/s/cm/sr",
")",
"(",
"Fig.",
"5C",
")",
"."
]
}
] |
PMC11244823 | Sera reacting above the negative value in each of these comparisons, were considered “true positive”. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Sera",
"reacting",
"above",
"the",
"negative",
"value",
"in",
"each",
"of",
"these",
"comparisons",
",",
"were",
"considered",
"“",
"true",
"positive",
"”",
"."
]
}
] |
PMC11591038 | ROS and several signal transduction pathways, including IKK/NF-kB, PI3K/AKT/mTOR, and RAS/RAF/MEK/ERK, can induce HIF-1 expression . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ROS",
"and",
"several",
"signal",
"transduction",
"pathways",
",",
"including",
"IKK/NF-kB",
",",
"PI3K/AKT/mTOR",
",",
"and",
"RAS/RAF/MEK/ERK",
",",
"can",
"induce",
"HIF-1",
"expression",
"."
]
}
] |
PMC10213179 | Unless otherwise specified, cell culture reagents were purchased from Gibco (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Unless",
"otherwise",
"specified",
",",
"cell",
"culture",
"reagents",
"were",
"purchased",
"from",
"Gibco",
"(",
"Thermo",
"Fisher",
"Scientific",
",",
"Waltham",
",",
"MA",
")",
"."
]
}
] |
PMC11731161 | The data are expressed as mean ± SD. * | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"data",
"are",
"expressed",
"as",
"mean",
"±",
"SD",
".",
"*"
]
}
] |
PMC7351993 | The timing of the data acquisition is controlled by the distributed trigger signals from the TM node. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"timing",
"of",
"the",
"data",
"acquisition",
"is",
"controlled",
"by",
"the",
"distributed",
"trigger",
"signals",
"from",
"the",
"TM",
"node",
"."
]
}
] |
PMC11441402 | Net cell growth inhibition and cell death were determined using the following calculations: If Ti≥Tz:% growth inhibition=Ti−TzC−Tz×100 If Ti<Tz:% growth inhibtion=Ti−TzTz×100 Values greater than 100% indicate increased cell proliferation compared to the untreated control, values between 0% and 100% indicate inhibition of cell proliferation, and negative values indicate cell death. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Net",
"cell",
"growth",
"inhibition",
"and",
"cell",
"death",
"were",
"determined",
"using",
"the",
"following",
"calculations",
":",
"If",
"Ti≥Tz:%",
"growth",
"inhibition",
"=",
"Ti−TzC−Tz",
"×",
"100",
"If",
"Ti",
"<",
"Tz:%",
"growth",
"inhibtion",
"=",
"Ti−TzTz",
"×",
"100",
"Values",
"greater",
"than",
"100",
"%",
"indicate",
"increased",
"cell",
"proliferation",
"compared",
"to",
"the",
"untreated",
"control",
",",
"values",
"between",
"0",
"%",
"and",
"100",
"%",
"indicate",
"inhibition",
"of",
"cell",
"proliferation",
",",
"and",
"negative",
"values",
"indicate",
"cell",
"death",
"."
]
}
] |
PMC11483468 | Our further study revealed that the GST-TAT-LPTS39 protein could induce senescence of telomerase-positive cancer BEL-7404 and Hela cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"further",
"study",
"revealed",
"that",
"the",
"GST-TAT-LPTS39",
"protein",
"could",
"induce",
"senescence",
"of",
"telomerase-positive",
"cancer",
"BEL-7404",
"and",
"Hela",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC10887351 | In human atrial myocytes, β3-ARs stimulated an L-type calcium current that caused the calcium channels’ phosphorylation and ICa to increase . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"human",
"atrial",
"myocytes",
",",
"β3-ARs",
"stimulated",
"an",
"L-type",
"calcium",
"current",
"that",
"caused",
"the",
"calcium",
"channels",
"’",
"phosphorylation",
"and",
"ICa",
"to",
"increase",
"."
]
}
] |
PMC11721064 | Morphological observations revealed a significant decline in rounded epithelial cells and the emergence of predominantly fibroblast-like cell outgrowths by P3 (Fig. 2A). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Morphological",
"observations",
"revealed",
"a",
"significant",
"decline",
"in",
"rounded",
"epithelial",
"cells",
"and",
"the",
"emergence",
"of",
"predominantly",
"fibroblast-like",
"cell",
"outgrowths",
"by",
"P3",
"(",
"Fig.",
"2A",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | In our study, we found overall CNS relapse incidence 6.8% in DLBCL. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"our",
"study",
",",
"we",
"found",
"overall",
"CNS",
"relapse",
"incidence",
"6.8",
"%",
"in",
"DLBCL",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Methods: A multicenter cross-sectional study of 434 patients with hemoglobinopathies (303 β-thalassemia major, 118 β-thalassemia intermedia, and 13 sickle-thalassemia) were conducted from March to July 2021 in IRAN. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Methods",
":",
"A",
"multicenter",
"cross-sectional",
"study",
"of",
"434",
"patients",
"with",
"hemoglobinopathies",
"(",
"303",
"β-thalassemia",
"major",
",",
"118",
"β-thalassemia",
"intermedia",
",",
"and",
"13",
"sickle-thalassemia",
")",
"were",
"conducted",
"from",
"March",
"to",
"July",
"2021",
"in",
"IRAN",
"."
]
}
] |
PMC11792090 | The results demonstrated that the killing efficiency of all five constructed CAR-T cells were comparable to or even superior to that of P8F8 CAR-T cells ( Figure 1D ). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"results",
"demonstrated",
"that",
"the",
"killing",
"efficiency",
"of",
"all",
"five",
"constructed",
"CAR-T",
"cells",
"were",
"comparable",
"to",
"or",
"even",
"superior",
"to",
"that",
"of",
"P8F8",
"CAR-T",
"cells",
"(",
"Figure",
"1D",
")",
"."
]
}
] |
PMC11726183 | The cells were sowed in a 96-well plate at a 1.0 × 10 cells per well density and incubated for 24 h at 37 °C in 5% CO2. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cells",
"were",
"sowed",
"in",
"a",
"96-well",
"plate",
"at",
"a",
"1.0",
"×",
"10",
"cells",
"per",
"well",
"density",
"and",
"incubated",
"for",
"24",
"h",
"at",
"37",
"°",
"C",
"in",
"5",
"%",
"CO2",
"."
]
}
] |
PMC9250505 | The addition of 1 µM NPB produced a substantial decrease in PARPi IC50 in EOC cell lines. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"addition",
"of",
"1",
"µM",
"NPB",
"produced",
"a",
"substantial",
"decrease",
"in",
"PARPi",
"IC50",
"in",
"EOC",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | At diagnosis, median age was 63 years. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"At",
"diagnosis",
",",
"median",
"age",
"was",
"63",
"years",
"."
]
}
] |
PMC10674574 | short tandem repeats) . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"short",
"tandem",
"repeats",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | 26 pts initiated next line treatment in C3 after 1 year. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"26",
"pts",
"initiated",
"next",
"line",
"treatment",
"in",
"C3",
"after",
"1",
"year",
"."
]
}
] |
PMC9611901 | The extent of treatment-induced DNA damage was determined using the alkaline comet assay. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"extent",
"of",
"treatment-induced",
"DNA",
"damage",
"was",
"determined",
"using",
"the",
"alkaline",
"comet",
"assay",
"."
]
}
] |
PMC11661040 | GSK3 inhibitor: 5µM CHIR99021) (*P < 0.05, **P < 0.01, ***P < 0.001) CGREF1 modulates osteosarcoma cell proliferation via the GSK3/β-catenin signaling pathway, and activation of the Wnt signaling pathway can counteract the impact of CGREF1 knockdown on osteosarcoma cells. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"GSK3",
"inhibitor",
":",
"5µM",
"CHIR99021",
")",
"(",
"*",
"P",
"<",
"0.05",
",",
"*",
"*",
"P",
"<",
"0.01",
",",
"*",
"*",
"*",
"P",
"<",
"0.001",
")",
"CGREF1",
"modulates",
"osteosarcoma",
"cell",
"proliferation",
"via",
"the",
"GSK3/β-catenin",
"signaling",
"pathway",
",",
"and",
"activation",
"of",
"the",
"Wnt",
"signaling",
"pathway",
"can",
"counteract",
"the",
"impact",
"of",
"CGREF1",
"knockdown",
"on",
"osteosarcoma",
"cells",
".",
"("
]
}
] |
PMC11462673 | Almeida etal. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Almeida",
"etal",
"."
]
}
] |
PMC11538390 | c Chromatograms illustrating the three genotypes (TT, TG and GG) of rs570516915 in iPSCs generated by CRISPR-Cas9 mediated homology-directed repair. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"c",
"Chromatograms",
"illustrating",
"the",
"three",
"genotypes",
"(",
"TT",
",",
"TG",
"and",
"GG",
")",
"of",
"rs570516915",
"in",
"iPSCs",
"generated",
"by",
"CRISPR-Cas9",
"mediated",
"homology-directed",
"repair",
"."
]
}
] |
PMC11707832 | Furthermore, studies have implicated MAN2B1 in the immune response against viral infections. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"studies",
"have",
"implicated",
"MAN2B1",
"in",
"the",
"immune",
"response",
"against",
"viral",
"infections",
"."
]
}
] |
PMC11638255 | Spleens obtained from tumor-bearing Th-MYCN mice were used as a control for single antibody and OPAL multiplex optimization. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Spleens",
"obtained",
"from",
"tumor-bearing",
"Th-MYCN",
"mice",
"were",
"used",
"as",
"a",
"control",
"for",
"single",
"antibody",
"and",
"OPAL",
"multiplex",
"optimization",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Multivariable regression analyses were conducted to examine the association between AF and clinical outcomes. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Multivariable",
"regression",
"analyses",
"were",
"conducted",
"to",
"examine",
"the",
"association",
"between",
"AF",
"and",
"clinical",
"outcomes",
"."
]
}
] |
PMC9454852 | The endoplasmic reticulum (ER) plays a master role in many fundamental functions for cell survival, and several of these are tightly related with the ER Ca level. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"endoplasmic",
"reticulum",
"(",
"ER",
")",
"plays",
"a",
"master",
"role",
"in",
"many",
"fundamental",
"functions",
"for",
"cell",
"survival",
",",
"and",
"several",
"of",
"these",
"are",
"tightly",
"related",
"with",
"the",
"ER",
"Ca",
"level",
"."
]
}
] |
PMC10376064 | The final membrane preparation was suspended in a storage buffer and aliquoted before storage at −80 °C. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"final",
"membrane",
"preparation",
"was",
"suspended",
"in",
"a",
"storage",
"buffer",
"and",
"aliquoted",
"before",
"storage",
"at",
"−80",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC11087055 | Taken together, our data show that Vg1 is capable of inducing and reprogramming the large-scale cell flow during gastrulation even though the midline structure is diminished. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Taken",
"together",
",",
"our",
"data",
"show",
"that",
"Vg1",
"is",
"capable",
"of",
"inducing",
"and",
"reprogramming",
"the",
"large-scale",
"cell",
"flow",
"during",
"gastrulation",
"even",
"though",
"the",
"midline",
"structure",
"is",
"diminished",
".",
"("
]
}
] |
PMC9024365 | Cells were washed with PBS and fixed in 4% paraformaldehyde (PFA) for 10 min. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cells",
"were",
"washed",
"with",
"PBS",
"and",
"fixed",
"in",
"4",
"%",
"paraformaldehyde",
"(",
"PFA",
")",
"for",
"10",
"min",
"."
]
}
] |
PMC8540692 | Another frequent event in GBM cells is the epigenetic silencing of a master cell cycle regulator, RASSF1A . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Another",
"frequent",
"event",
"in",
"GBM",
"cells",
"is",
"the",
"epigenetic",
"silencing",
"of",
"a",
"master",
"cell",
"cycle",
"regulator",
",",
"RASSF1A",
"."
]
}
] |
PMC11657744 | Furthermore, analysis of PCNA-positive cells with cilia showed a substantial increase in Cep89 and Fbf1-deficient cells compared to controls at all time points up to 12 h post-serum addition. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"analysis",
"of",
"PCNA-positive",
"cells",
"with",
"cilia",
"showed",
"a",
"substantial",
"increase",
"in",
"Cep89",
"and",
"Fbf1-deficient",
"cells",
"compared",
"to",
"controls",
"at",
"all",
"time",
"points",
"up",
"to",
"12",
"h",
"post-serum",
"addition",
"."
]
}
] |
PMC11314247 | The cells were fixed by adding 700 μL of 90% ethanol drop by drop and with slight agitation (gentle vortex) at 20 °C. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cells",
"were",
"fixed",
"by",
"adding",
"700",
"μL",
"of",
"90",
"%",
"ethanol",
"drop",
"by",
"drop",
"and",
"with",
"slight",
"agitation",
"(",
"gentle",
"vortex",
")",
"at",
"20",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC11357960 | In order to accurately evaluate the relationship between the mRNA expression of SUMO machinery components and outcomes of anti-PD-1 immunotherapy, we used the formula [(express value-baseline value)/baseline value] ×100% to calculate the relative percentage change in SUMO machinery component mRNA levels after implementation of anti PD-1 immunotherapy. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"order",
"to",
"accurately",
"evaluate",
"the",
"relationship",
"between",
"the",
"mRNA",
"expression",
"of",
"SUMO",
"machinery",
"components",
"and",
"outcomes",
"of",
"anti-PD-1",
"immunotherapy",
",",
"we",
"used",
"the",
"formula",
"[",
"(",
"express",
"value-baseline",
"value)/baseline",
"value",
"]",
"×100",
"%",
"to",
"calculate",
"the",
"relative",
"percentage",
"change",
"in",
"SUMO",
"machinery",
"component",
"mRNA",
"levels",
"after",
"implementation",
"of",
"anti",
"PD-1",
"immunotherapy",
"."
]
}
] |
PMC11449273 | As such, its upregulated expression in response to p53-175 but not p53-273 in H1299 cells may be responsible for the increased migratory and invasive properties exhibited by the H1299-p53-175 relative to -273 in these cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"such",
",",
"its",
"upregulated",
"expression",
"in",
"response",
"to",
"p53",
"-",
"175",
"but",
"not",
"p53",
"-",
"273",
"in",
"H1299",
"cells",
"may",
"be",
"responsible",
"for",
"the",
"increased",
"migratory",
"and",
"invasive",
"properties",
"exhibited",
"by",
"the",
"H1299-p53",
"-",
"175",
"relative",
"to",
"-273",
"in",
"these",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The management of patients with limited stage disease BIA-ALCL is primarily surgical, but the optimal treatment of patients with advanced stage disease is largely unknown. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"management",
"of",
"patients",
"with",
"limited",
"stage",
"disease",
"BIA-ALCL",
"is",
"primarily",
"surgical",
",",
"but",
"the",
"optimal",
"treatment",
"of",
"patients",
"with",
"advanced",
"stage",
"disease",
"is",
"largely",
"unknown",
"."
]
}
] |
PMC9621239 | The plasmid pMYC-pro was co-transfected with pcHBx-WT, pcHBx-SM, pcHBx-DM or pcHBxTM into 293 T cells using Fugen HD (E2311, Promega, USA) according to the manufacturer's protocol. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"plasmid",
"pMYC-pro",
"was",
"co-transfected",
"with",
"pcHBx-WT",
",",
"pcHBx-SM",
",",
"pcHBx-DM",
"or",
"pcHBxTM",
"into",
"293",
"T",
"cells",
"using",
"Fugen",
"HD",
"(",
"E2311",
",",
"Promega",
",",
"USA",
")",
"according",
"to",
"the",
"manufacturer",
"'s",
"protocol",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Aims: Here, we report early results from 14 treatment-naïve patients with CLL who enrolled in this ongoing phase 2 trial (NCT04505254) since September, 2020 at MD Anderson Cancer Center. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aims",
":",
"Here",
",",
"we",
"report",
"early",
"results",
"from",
"14",
"treatment-naïve",
"patients",
"with",
"CLL",
"who",
"enrolled",
"in",
"this",
"ongoing",
"phase",
"2",
"trial",
"(",
"NCT04505254",
")",
"since",
"September",
",",
"2020",
"at",
"MD",
"Anderson",
"Cancer",
"Center",
"."
]
}
] |
PMC8427838 | The result showed that loss of moesin inhibited TMIGD-1 mediated F-actin orientation (Fig. 6C). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"result",
"showed",
"that",
"loss",
"of",
"moesin",
"inhibited",
"TMIGD-1",
"mediated",
"F-actin",
"orientation",
"(",
"Fig.",
"6C",
")",
"."
]
}
] |
PMC11424574 | To determine the effect of MTA2 on the progression of metastasis in osteosarcoma in vivo, we introduced MTA2-depleted 143B cells with lentiviral infection into mice. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"determine",
"the",
"effect",
"of",
"MTA2",
"on",
"the",
"progression",
"of",
"metastasis",
"in",
"osteosarcoma",
"in",
"vivo",
",",
"we",
"introduced",
"MTA2-depleted",
"143B",
"cells",
"with",
"lentiviral",
"infection",
"into",
"mice",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Median RFS was numerically shorter for VEN-AZA than for IC (9.5 vs 11.0 mo; P=0.689); when including censoring for SCT, RFS was longer for VEN-AZA (7.5 vs 5.7 mo; P=0.027). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Median",
"RFS",
"was",
"numerically",
"shorter",
"for",
"VEN-AZA",
"than",
"for",
"IC",
"(",
"9.5",
"vs",
"11.0",
"mo",
";",
"P=0.689",
")",
";",
"when",
"including",
"censoring",
"for",
"SCT",
",",
"RFS",
"was",
"longer",
"for",
"VEN-AZA",
"(",
"7.5",
"vs",
"5.7",
"mo",
";",
"P=0.027",
")",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.