Datasets:
OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
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PMC9841531
Strikingly, none of the indole derivatives had a considerable impact on the cell viability of NIH/3T3 cells up to a concentration of 50 μM (Figure 5).
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PMC9780037
Cyt c proteolysis by trypsin restores the quantum dot fluorescence decreased upon cyt c binding .
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PMC11740907
Similar to the POM-PKB complex, in the EGFR-inhibitor complex, POM remains near the solvent-exposed region and does not exploit hinge residues.
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PMC10812665
For instance, Rot (mito-toxicant) and Col (microtubule disruptor) were included for their well-known toxicities.
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PMC9429973
Among patients with thalassemia diseases, high fever or systemic reactogenicity after vaccination may trigger hemolysis, resulting in a sudden decrease in hemoglobin levels.
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PMC10587429
Validate tumor infiltration of human and mouse immune cells by immunofluorescent staining of freshly isolated tumor tissues.
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PMC11470381
dist1 corresponds to the back half and dist2 corresponds to the front half of the bisected ROI. (
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PMC11285179
CHIP-qPCR was performed to investigate the binding of transcription factor RXRα to the promoter region of the target gene ANGPT1.
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PMC11772449
After exposure to PFD, the proliferation, differentiation and migration of non-small cell lung cancer (NSCLC) cells, mesothelioma and pancreatic cancer cells (Kozono et al., 2013; Li et al., 2018; Fujiwara et al., 2017) decreased.
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PMC11727000
The cells were then pulsed with biotin for 16 h to induce biotinylation of proteins in the proximity of the expressed bait (Figure 1B).
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PMC9848491
GSEA indicated that the pathways were mainly enriched for cancer, immunity and reproduction related pathways.
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PMC11656657
High GD2-expressing cell lines, such as MG-63, 143B, and U-2OS (OS), were significantly controlled by CAR.GD2 T-cells.
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PMC11726183
The compound 23 had less negative value (−2.671) when compared indicating its low skin permeability.
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PMC9429973
Methods: We conducted a single-center retrospective study.
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PMC11790599
RT-PCR, western blot, lentiviral-mediated gene overexpression, and pharmacological inhibitor assays were comprehensively designed to regulate the identified signaling pathways and confirm the mechanism of tanshinlactone.
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PMC11519077
Additionally, it was shown that IL-12 gene expression was significantly higher in the BM-MSC (20.85 ± 2.756; p < 0.001) and BM-CM (21.36 ± 2.695; p < 0.001) groups than in the control group.
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PMC11629461
Blue LED light (450 nm, 85 mW/cm, 1.5 min) (i.e., 7.65 J/cm) irradiation had no effect on NOX5‐CHO‐K1 cells (Figure 4C).
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PMC9429973
The PML-RARA transcript was positive in 100% of cases.
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PMC11802929
Sorted cells were immediately pelleted, resuspended, and loaded into a 10X Chromium reaction for single-cell RNA sequencing (scRNA-seq).
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PMC11021472
In ST486, the decrease in the percentage of GFP cells was 55% for sh1 and 90% for sh2 at day 22.
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PMC11228511
The gaps in the abnormal regions of the progerin meshwork ranged in size from 0.01 to 1.4 µm (vs. 0.01 to 0.27 µm in the lamin A meshwork) and on average were larger (0.25 vs. 0.085 µm in prelamin A–expressing SMCs) (Fig. 1 E and F).
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No CARD11 variants have ever been described to be associated with MF.
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PMC11594074
It is evident that 48 h after treatment, two doses of compound 4 treatment led to a significant decrease (p < 0.003) in the cell migration of breast cancer cells, and colon cancer cells.
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PMC11549612
Notably, BOLA1, BOLA2, and BOLA3 genes exhibit connections with pivotal cellular complexes such as the Fe-S cluster assembly complex, implicating their involvement in essential processes like iron metabolism and redox regulation.
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PMC11201989
In immune synapse assembly, the BBSome complex protein BBS1 controls T cell polarity by allowing for centrosome polarization towards the immune synapse and clearance of centrosomal F-actin .
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PMC3681794
In the presence of oxygen the alpha subunits are hydroxylated by oxygen-dependant prolyl hydroxylases allowing binding to the Von Hippel Lindau (VHL) protein and targeting for ubiquitination and degradation.
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PMC11467800
Cells were then harvested by centrifugation and injected into the yolk sac of 2 dpf larvae.
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Cells were washed twice with MACS Buffer and sorted (5x10 cells) for ACKR3 positivity or negativity in 500 µL of RNA-later (Sigma-Aldrich).
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EWS::FLI1, like EWS::ERG, promotes KCNN1 and SK1 expression, binding to GGAA microsatellites near the promoter of KCNN1 isoforms.
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Matrigel-based spheroids were derived from PancOVA H2B Cerulean cells, SIINFEKL-reactive OT-I CD8 CTLs, and CD206 macrophages.
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Translational research showed activation of CD8+T cells and B/Plasma cells in response to treatment, indicating that BEM elicits activation of two major adaptive immune cell populations responsible for anti-AML immune responses.
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From the SAR study, each of the double bond at C-11 and 2,3 and 14-acetoxyl groups in compound 74 were found to be essential to the MDR reversing activity (Aoki et al., 2001).
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Approximately 48 fractions of 200 μL were collected and assayed for AChE, β-galactosidase, and alkaline phosphatase activities.
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This figure was created with BioRender.com released under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 International License.
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PMC9429973
Aims: To evaluate the frequency of IE caused by pathogens other than viridans streptococci in neutropenic patients and characterize the clinical presentation of IE in such patients.
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PMC11806818
Based on the types of reactions they catalyze, nanozymes can be classified as oxidase (OXD) mimics, peroxidase (POD) mimics, catalase (CAT) mimics, superoxide dismutase (SOD) mimics, and hydrolase mimics.
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PMC11635519
To assess the potency of GLP-1 and the discovered peptides, we used the HTRF cAMP assay.
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PMC10873328
The protein expression level of TGFBI after time gradient of cisplatin in A2780 (IC50 as 119.2 μM). (
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PMC10142392
In this case, multi-block PEG/PCL copolymers with 3, 4, and 8 arms were synthesized using this method.
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PMC11543885
Import to STRING Database: Import the filtered data into the STRING database search portal.c.
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PMC11129910
Although we have used a small group of patients for the study, we obtained a highly significant result for RAB25 loss in spindle cell carcinoma cases.
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PMC11541409
Chan, A., et al., Final Efficacy Results of Neratinib in HER2-positive Hormone Receptor-positive Early-stage Breast Cancer From the Phase III ExteNET Trial.
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PMC11461833
STXBP5 and STXBP6 are marked with arrows.
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PMC10734950
The adherent cell lines, A373, PANC-1, MDA-MB-231, and Hs-27, were initially left to incubate overnight to allow their attachment to the bottom of the plate in media.
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PMC11730311
Arteries that exhibited a 2 mN increase in force were selected for the experiments.
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PMC11790971
A stability threshold of 30% serves as an indication of the cell line’s ability to maintain consistent productivity over an extended period.
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PMC11628309
Tricyclic and tetracyclic antidepressants, such as amitriptyline, desipramine, imipramine, protriptyline among others, have shown significant upregulation of VMAT2 activity.
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PMC11543935
Histological sectioning was done 48 h after ablation (see section “Analyses”).
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PMC10788478
LGR6 mRNA expression in 23 SCLC and 40 NSCLC cell lines, including the CTNNB1‐mutated cell lines HCC15 (red dot) and A427 (orange dot), and the APC‐mutated cell line HCC2935 (green dot).
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PMC3915447
Thus, it may be possible that a combination of SPIO and FA is sufficient and less toxic method in blood cancer therapy.
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PMC7215722
These effects were not due to DSS cytotoxicity as demonstrated above (Figure 1A).
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PMC11706491
These studies also benefited from temperature-sensitive mutants, which allowed synchronization of cells at specific cell cycle phases, enabling synchronous release into subsequent cell cycle stages.
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PMC11705862
Statistical tests applied in each experiment are indicated in the figure legends.
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PMC11470381
These signals efficiently navigate the cells toward inflamed tissues and secondary lymphoid organs, where they mount the onset of the vital adaptive immune response.
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PMC11237030
48-well plates and slides were imaged using an inverted fluorescence microscope Leica DMi8 or Nikon spinning disk confocal microscope for better visualization of the membranes or the Olympus BX60 microscope.
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PMC9164404
Taking A2780 cell (human ovarian cancer cell) as an example, the IC50 of Abplatin, CisPt(IV), and cisplatin were 1.35 µM, 1.60 µM and 25.10 µM, respectively.
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PMC10291556
As shown in Tables 1 and 2, the SIs determined for Pt(IV) complexes 2–4 were noticeably higher than those obtained for Pt(II) complex 1 in all cancer cell lines except HCT-116 and, importantly, than SIs determined for clinically used cisplatin in all investigated cancer cell lines.
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PMC11190062
Most patients treated with PIs develop resistance.
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PMC11367146
The signalling receptor activity, molecular transducer activity, transition metal ion binding, signalling receptor binding, etc.
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PMC9429973
Results: In the intent-to-treat population (N = 559) (data cut-off Oct 26, 2017), 93/281 (33.1%) pts who received PVd and 93/278 (33.5%) who received Vd were frail.
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PMC11745823
The control groups are crucial for assessing the specificity and efficiency of gene knockdown by facilitating comparisons with cells infected with RIT1 and c‐Myc‐targeting shRNAs.
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PMC10734950
The total apoptotic cell populations were determined by combining both the early and late stages of apoptosis .
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PMC10079526
Small molecule ML792 and its analogue TAK981 specifically block the SUMO activating enzyme (SAE), consequently impairing the SUMOylation cascade thereby blocking target SUMOylation .
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PMC10033453
Cells were washed with PBS, blocked with mouse CD16/32 Fc block (BioLegend), and then stained with Zombie UV dye (BioLegend) and surface antibody cocktail, then permeabilized with eBioScience FoxP3 Fixation/Permeabilization kit (eBioscience, Waltham, MA, USA) according to manufacturer’s protocol.
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PMC6948907
P < 0.001, n = 3 The Apoptosis-Inducing Effect of VPA (5μM) was Investigated by Flow Cytometric Analysis of HepG2 Cells after Treatment Times (24 and 48 h) Stained with Annexin V and Propidium Iodide, the Control Groups Received DMSO Only.
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PMC8481254
These results suggested that the proliferation ability of liver cancer cells was enhanced in response to HG culture, but CA could inhibit this enhanced viability.
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PMC11604768
A list of promoter (row) labels can be found in Supplementary Data 6.
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PMC9786247
When testing shop and farm retail dairy products from Latvia, 26.67% of unpasteurized Latvian cow milk samples were PCR-positive, whereas 76.47% of pasteurized equivalents and 63.13% of fermented milk products were PCR-positive .
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PMC11337594
Cells were treated with different doses (0, 1.0, 2.0 and 3.0 µg/ml) of TER, and the expression of apoptosis-related proteins (FAS and BAX) was detected via SDS‒PAGE and protein blotting (n = 3). (
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PMC5173112
Similarly, our data displayed a prominently decrease in CSCs population in USP21 knockdown cells (Figure 3G and 3H).
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PMC11467800
The adaptive transcriptional landscape facilitates the development of resistance through the rewiring of signalling pathways.
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PMC10551595
However, based on the dosage and duration of administration, GCCs may generate complications including severe bacterial and fungal infection, osteonecrosis, bone fracture, and mood disorders.
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PMC11787381
Next, capillaries were incubated 2 h with primary antibody, at room temperature: anti-PSD95 (postsynaptic density protein 95; Cell signaling, 2507S) and anti-synaptophysin (Cell signaling, 5461).
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PMC8469018
30 μL of obtained cells in suspension was loaded into the NC-slide and analyzed in NucleoCounter NC-3000.
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PMC11286266
The table lists the top 10 genes positively selected in the ATF6α repressor screen, with calreticulin (CRT) highlighted as the hit for further focussed analysis. (
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PMC11025866
Statistical analysis included the Wald statistic test, p-value, and adjusted p-value adjusted according to the False Discovery Rate adjustment based on the overall number of genes tested in that set.
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PMC11592837
After final washing with PBS, cells were analyzed on a BD FACSCelesta™ (BD Biosciences, San Jose, CA, USA).
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PMC11496728
The secondary antibody was incubated for 1.5 h at room temperature (1:20000, Proteintech, Wuhan, China).
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PMC11684297
MTT assay was used for the evaluation of in vitro biocompatibility using normal fibroblast cells (V79 cells) and undifferentiated rat phaeochromocytoma cells (PC12 cells).
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In addition, the 160 μM group exhibited the highest apoptotic rate, whereas the 10 μM group presented the lowest apoptotic rate, showing a concentration-dependent relationship (Table 1).
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PMC11628904
This finding demonstrates that progressive spreading of epithelial damage, a component of burn wound conversion, is a feature of the epithelial response to burn injury in larval zebrafish.
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PMC11792090
To further assess the safety of SAP UCAR-T cells in vivo, up to 6×10 cells were injected into 786-0 tumor-bearing mice.
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PMC9105697
Among these were ACOT11, MRPS16, P2RX7, KIAA1328 and STAP-2.
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Although FSL-1-HMC-1 CM was associated with enhanced HaCaT cell migration, its cytokine and growth factor levels did not differ significantly from those of HMC-1 CM.
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PMC11478724
Hsa-MiR-320a is known to play a crucial role in the lung cancer.
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PMC11322866
RPMI-8226 and OCI-MY5 cells were pre-treated with GSK126 (1.5 μM) for 2 h and then cocultured with AG126 (30 μM) for 22 h. SA-β-gal activity was measured.
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PMC11180402
Relative miRNA levels in 5637 cells treated with 20 μM ISO at indicated times by RT-qPCR. (
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PMC10571053
ABCG2 overexpression did not confer appreciable resistance to any of the FINs examined.
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Moreover, ETV1 directly binds to the enhancer and promoter regions of KIT gene and thus forming a positive feedback regulation that advances their expression .
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PMC10671321
Therefore, the mutated protein does not seem to accumulate in specific organelles.
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PMC9429973
After 5 years, the TTT-free survival was 42% (95%CI: 33-55%) for the total cohort.
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PMC9429973
The HCRU analysis on the 2011-2018 period included patient data from 7 countries (Greece, France, the Netherlands, Portugal, the Czech Republic, Austria, and Spain [only dialysis information available]).
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PMC11055323
SS, SS18-SSX1.
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PMC11637276
For 384-well plates, cells were extracted twice for 2 min.
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PMC10936243
Performing multiple roles results in an increased workload and insufficient time for other commitments, especially those pertaining to patients, as reported here. “
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PMC11082662
Cell scratch assay measuring the migration of HEY ovarian cancer cells after ACER2 knockdown (200 µm); n=3.
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PMC10545062
While our definition of fluid responsiveness was created a priori, it is not consistent with the conventional definition of a greater than 15% increase in CO in response to a fluid bolus.
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PMC11155445
The proton conductivity of prepared MOF was temperature and humidity-dependent.
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Activity (IC50 in μM)Positive control (kojic acid, IC50 in μM)Mulberrofuran J (1)191.28 ; 4.54 46.95; 19.60Mongolicin F (2)3.20 19.60Chalcomoracin (5)2.59 ; 2.27 ; 5.61 32.62; 19.60; 14.18 (Arbutin)Mulberrofuran O (13)1.83 19.60Mulberrofuran G (31)6.35 ; 17.53 ; 14.65 36.0; 46.95; 50.43Albanol B (46) > 350 36.0Guangsangon J (51)0.67 19.60Guangsangon E (56)0.57 19.60Macrourin F (59)0.50 19.60Macrourin E (60)0.39 19.60Kuwanol E (62)0.54 19.60Sorocein A (68)0.67 19.60Kuwanon J (81)0.17 32.62Kuwanon G (92)67.6 ; > 200 ; > 200 36.0; 46.95; 50.43Kuwanon H (93)10.34 46.95Moracenin D (95)4.61 50.43Kuwanon N (110)78.95 50.43Kuwanon L (118)58.82 50.43Kuwanon O (119)1.81 50.43Sanggenon T (124)1.20 50.43Sanggenon D (128)7.3 24.8Sanggenon C (130)1.17 32.62Sanggenon O (131)1.15 32.62Sorocein H (132)6.49 32.62 Inhibitory activities of MDAAs against tyrosinase According to the anti-HBV assay on the HepG 2.2.15 cell line in vitro, mulberrofuran G (31) exhibited moderate inhibitory activity against hepatitis B virus (HBV) DNA replication (IC50 = 3.99 μM) .
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PMC11453018
However, the initial decrease in BCL-2 expression in senescent cells might suggest a reduced target scope for BCL-2-targeting senolytics like Fisetin, Navitoclax, and Quercetin .
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