PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC9776316 | XRCC4 knockdown was found to strongly aggravate the DNA damage caused by cisplatin treatment. | [
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"cisplatin",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC11265931 | To exemplify, current methods such as radiotherapy and chemotherapy could have side effects such as damaging healthy cells as well as cancer cells. | [
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
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"exemplify",
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"current",
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"such",
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"and",
"chemotherapy",
"could",
"have",
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"effects",
"such",
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"damaging",
"healthy",
"cells",
"as",
"well",
"as",
"cancer",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC10587429 | Antibodies for flow cytometry and immunofluorescent analyses (see Table 1 ). - | [
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"O",
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"O",
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],
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"cytometry",
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"immunofluorescent",
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"Table",
"1",
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".",
"-"
]
}
] |
PMC11391695 | Following that, protein samples were extracted utilizing a 10% PAGE gel rapid preparation kit (EpiZyme, China) and subsequently transferred onto a PVDF membrane (Milipore, Germany) with a pore size of 0.45 µm. | [
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"%",
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"rapid",
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"kit",
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",",
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")",
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"transferred",
"onto",
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"PVDF",
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"(",
"Milipore",
",",
"Germany",
")",
"with",
"a",
"pore",
"size",
"of",
"0.45",
"µm",
"."
]
}
] |
PMC10729469 | D. Time course of TCRAβ expression on engineered TCRAβ-Tregs post electroporation with TCRAβ plasmid. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O"
],
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"D.",
"Time",
"course",
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"expression",
"on",
"engineered",
"TCRAβ-Tregs",
"post",
"electroporation",
"with",
"TCRAβ",
"plasmid",
"."
]
}
] |
PMC11795610 | All data are expressed as mean ± SD (n = 5). ** | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"are",
"expressed",
"as",
"mean",
"±",
"SD",
"(",
"n",
"=",
"5",
")",
".",
"*",
"*"
]
}
] |
PMC10197932 | Figure 9A shows the ROS levels in healthy lymphocytes after 30 min and 24 hours post 2T US-treatment. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"9A",
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"the",
"ROS",
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"lymphocytes",
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"30",
"min",
"and",
"24",
"hours",
"post",
"2",
"T",
"US-treatment",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Eligible patients received intravitreal MTX injection and the ZR regimen for 6 cycles as induction therapy, followed by zanubrutinib monotherapy for maintenance for 2 years, or until disease progression, intolerable toxicity, or death. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O"
],
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"Eligible",
"patients",
"received",
"intravitreal",
"MTX",
"injection",
"and",
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"regimen",
"for",
"6",
"cycles",
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"induction",
"therapy",
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",",
"or",
"until",
"disease",
"progression",
",",
"intolerable",
"toxicity",
",",
"or",
"death",
"."
]
}
] |
PMC11472639 | Unlike CLL, the bulk of clonal cells in myeloma reside in the bone marrow (Kyle et al., 2003), with only a small frequency of plasma cells circulating in blood (Sanoja-Flores et al., 2018; Termini et al., 2022). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"Unlike",
"CLL",
",",
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"of",
"clonal",
"cells",
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"myeloma",
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"the",
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"et",
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",",
"2003",
")",
",",
"with",
"only",
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"of",
"plasma",
"cells",
"circulating",
"in",
"blood",
"(",
"Sanoja-Flores",
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",",
"2018",
";",
"Termini",
"et",
"al.",
",",
"2022",
")",
"."
]
}
] |
PMC11653168 | However, total STAT3 levels remained stable across all time points, suggesting that Stattic may specifically inhibit STAT3 activation without affecting its overall expression (Fig. 2A). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"tokens": [
"However",
",",
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"time",
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",",
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"specifically",
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"STAT3",
"activation",
"without",
"affecting",
"its",
"overall",
"expression",
"(",
"Fig.",
"2A",
")",
"."
]
}
] |
PMC11777207 | Since the blockade of PD-L1 through the 10F.9G2 clone results in loss of CD80 interactions, and potentially the physical removal of CD80 from the surface of migratory DCs, including cDC1s and cDC2 (fig. S2, C to H) (9, 43), we next evaluated whether CD80 itself was important for dermal DC migration. | [
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"O",
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"O",
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"O",
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",",
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"."
]
}
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PMC3734024 | B lymphocytes are best known as the mediators of humoral immunity, and in this capacity are crucial for host defense and maintaining homeostasis with commensal microbes. | [
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"O",
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"are",
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"homeostasis",
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"commensal",
"microbes",
"."
]
}
] |
PMC9621239 | Levels of DNA replication were examined using 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) incorporation assays in Huh 7 cells. | [
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"Huh",
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"cells",
"."
]
}
] |
PMC11634794 | In high-grade gliomas (HGG), the cytoplasm and blood vessels of glioblastoma exhibit notable expression of the LAMP1 gene, with significantly higher transcriptional activity compared to normal brain tissue. | [
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"tissue",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Risk factors for SPM in lymphoma patients were older age (HR 1.06 [1.04;1.08] per year) and COPD (HR 3.15 [1.16;8.57]). | [
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"and",
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"(",
"HR",
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"[",
"1.16;8.57",
"]",
")",
"."
]
}
] |
PMC4112127 | Epigenetic suppression of tumor suppressor gene expression by gene methylation is a well-known mechanism of early carcinogenesis, tumor promotion, and metastasis which has been exploited as a biomarker of malignant transformation. | [
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"tumor",
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"transformation",
"."
]
}
] |
PMC11566417 | We performed mass spectrometry on the CM from primary and immortalized MDECs at both p10 and p20 to look for changes in protein composition that might correlate with the differences in secretome activity observed between the cell lines at different passages. | [
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"the",
"cell",
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"at",
"different",
"passages",
"."
]
}
] |
PMC8750422 | Lung adenocarcinoma is one of the leading causes of cancer-related deaths. | [
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"O",
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"is",
"one",
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"the",
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"causes",
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"cancer-related",
"deaths",
"."
]
}
] |
PMC9895440 | We then sequenced the gRNAs of each sample (n = 5 biological donor replicates) and used the PinAPL-py platform for gRNA mapping and counting. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O"
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"tokens": [
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | X. Li, J. Liu, B. Huang, J. Gu, J. Li The first affiliated hospital of sun yat-sen university, Guangzhou, China Background: Multiple myeloma(MM)is a common hematological cancer. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"X.",
"Li",
",",
"J.",
"Liu",
",",
"B.",
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":",
"Multiple",
"myeloma(MM)is",
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"cancer",
"."
]
}
] |
PMC11291697 | A Levels of glycine and IL-10 evaluated by ELISA in the proband’s lymphoblastoid cell line (LCL) and cell culture supernatant. | [
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"O",
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"O",
"O",
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],
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"LCL",
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"."
]
}
] |
PMC11402217 | To encapsulate, these results support XD23’s potential as a therapeutic agent in alleviating OS-induced skeletal deterioration. | [
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"O",
"O",
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"OS-induced",
"skeletal",
"deterioration",
"."
]
}
] |
PMC11476106 | Once the monolayer culture of each line reached cell confluence, a 250 μL aliquot containing approximately 100,000 cells was taken to perform the cytospin procedure. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Once",
"the",
"monolayer",
"culture",
"of",
"each",
"line",
"reached",
"cell",
"confluence",
",",
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"250",
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"aliquot",
"containing",
"approximately",
"100,000",
"cells",
"was",
"taken",
"to",
"perform",
"the",
"cytospin",
"procedure",
"."
]
}
] |
PMC10823017 | The bar diagram reflects the mean fluorescence intensity of the cells calculated by Image J software. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"bar",
"diagram",
"reflects",
"the",
"mean",
"fluorescence",
"intensity",
"of",
"the",
"cells",
"calculated",
"by",
"Image",
"J",
"software",
".",
"("
]
}
] |
PMC10578720 | Representative shear-wave elastography images of mice are presented; the right bottom corner shows the corresponding statistical result for liver stiffness values obtained from shear-wave elastography. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Representative",
"shear-wave",
"elastography",
"images",
"of",
"mice",
"are",
"presented",
";",
"the",
"right",
"bottom",
"corner",
"shows",
"the",
"corresponding",
"statistical",
"result",
"for",
"liver",
"stiffness",
"values",
"obtained",
"from",
"shear-wave",
"elastography",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Further validations and investigation of the molecular mechanisms are planned for the top-performing drugs to strengthen the translational potential for AML therapy. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Further",
"validations",
"and",
"investigation",
"of",
"the",
"molecular",
"mechanisms",
"are",
"planned",
"for",
"the",
"top-performing",
"drugs",
"to",
"strengthen",
"the",
"translational",
"potential",
"for",
"AML",
"therapy",
"."
]
}
] |
PMC10048572 | The next task was to investigate the relationship between the accumulation of mutations in cells and the growth rate of clones. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"next",
"task",
"was",
"to",
"investigate",
"the",
"relationship",
"between",
"the",
"accumulation",
"of",
"mutations",
"in",
"cells",
"and",
"the",
"growth",
"rate",
"of",
"clones",
"."
]
}
] |
PMC11718274 | The fluorescence emitted by Rhodamine-123 was visualized and captured with an epi-fluorescence microscope at 200x magnification thus any changes in integrity of mitochondrial membrane potential upon exposure to Y2O3NPs could be assessed. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"fluorescence",
"emitted",
"by",
"Rhodamine-123",
"was",
"visualized",
"and",
"captured",
"with",
"an",
"epi-fluorescence",
"microscope",
"at",
"200x",
"magnification",
"thus",
"any",
"changes",
"in",
"integrity",
"of",
"mitochondrial",
"membrane",
"potential",
"upon",
"exposure",
"to",
"Y2O3NPs",
"could",
"be",
"assessed",
"."
]
}
] |
PMC9545714 | The lipids of the stratum corneum consist mainly of ceramides, cholesterol, and fatty acids. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"lipids",
"of",
"the",
"stratum",
"corneum",
"consist",
"mainly",
"of",
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",",
"cholesterol",
",",
"and",
"fatty",
"acids",
"."
]
}
] |
PMC10810426 | Images were scored for spot localization in the nucleus (pink spots in the nucleus), nuclear membrane (red spots at the nuclear edge), and cytoplasm. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
],
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"were",
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"for",
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"nucleus",
")",
",",
"nuclear",
"membrane",
"(",
"red",
"spots",
"at",
"the",
"nuclear",
"edge",
")",
",",
"and",
"cytoplasm",
"."
]
}
] |
PMC11746942 | The purified DNA from the input and immunoprecipitated samples was then subjected to PCR with S1PR3 promoter-specific primers. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"purified",
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"to",
"PCR",
"with",
"S1PR3",
"promoter-specific",
"primers",
"."
]
}
] |
PMC3931643 | Proteins from the cap bound fraction were detected by western blotting along with the total cellular proteins. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"detected",
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"along",
"with",
"the",
"total",
"cellular",
"proteins",
"."
]
}
] |
PMC11711871 | This is likely due to the large variability within one group and the limited number of experimental animals. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"is",
"likely",
"due",
"to",
"the",
"large",
"variability",
"within",
"one",
"group",
"and",
"the",
"limited",
"number",
"of",
"experimental",
"animals",
"."
]
}
] |
PMC11768281 | The involvement of NKT cells in this process is further supported by studies showing that their activation can enhance CD8+ T-cell responses and overall anti-malaria immunity when combined with suboptimal doses of irradiated sporozoites or malaria antigen-expressing viruses . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"involvement",
"of",
"NKT",
"cells",
"in",
"this",
"process",
"is",
"further",
"supported",
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"studies",
"showing",
"that",
"their",
"activation",
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"CD8",
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"and",
"overall",
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"immunity",
"when",
"combined",
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"suboptimal",
"doses",
"of",
"irradiated",
"sporozoites",
"or",
"malaria",
"antigen-expressing",
"viruses",
"."
]
}
] |
PMC11478724 | After 24 h, caspase 3 and 7 activity was 3.284 times higher (P < 0.0001), and after 48 h, it increased 6.927-fold (P < 0.0001) compared to the control group. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"24",
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",",
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")",
",",
"and",
"after",
"48",
"h",
",",
"it",
"increased",
"6.927-fold",
"(",
"P",
"<",
"0.0001",
")",
"compared",
"to",
"the",
"control",
"group",
"."
]
}
] |
PMC11706776 | Of note, decreased EWS::FLI1 protein level is observed as early as 8 h after treatment of the cells with doxycycline (Supplementary Fig. 2C). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Of",
"note",
",",
"decreased",
"EWS::FLI1",
"protein",
"level",
"is",
"observed",
"as",
"early",
"as",
"8",
"h",
"after",
"treatment",
"of",
"the",
"cells",
"with",
"doxycycline",
"(",
"Supplementary",
"Fig.",
"2C",
")",
"."
]
}
] |
PMC11224020 | The following primers were used: Mm99999130_s1 for Ccr7, Mm01284324_m1 for Pla2g4a and Mm99999915 for Gapdh (endogenous control). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"following",
"primers",
"were",
"used",
":",
"Mm99999130_s1",
"for",
"Ccr7",
",",
"Mm01284324_m1",
"for",
"Pla2g4a",
"and",
"Mm99999915",
"for",
"Gapdh",
"(",
"endogenous",
"control",
")",
"."
]
}
] |
PMC9509578 | The merits of nanosystems need to be further explored to effectively combat drug-resistant cancer. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"merits",
"of",
"nanosystems",
"need",
"to",
"be",
"further",
"explored",
"to",
"effectively",
"combat",
"drug-resistant",
"cancer",
"."
]
}
] |
PMC11640115 | In this study, although the lymphocyte count alone was able to predict prognosis, no significant differences were found in the NLR, which included the lymphocyte count. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"study",
",",
"although",
"the",
"lymphocyte",
"count",
"alone",
"was",
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"to",
"predict",
"prognosis",
",",
"no",
"significant",
"differences",
"were",
"found",
"in",
"the",
"NLR",
",",
"which",
"included",
"the",
"lymphocyte",
"count",
"."
]
}
] |
PMC10222971 | viability = (Total number of viable cells/Total number of viable and non-viable cells) × 100 Detection of apoptosis was performed using the kit Annexin V FITC assay, which contains Annexin V-FITC, propidium iodide staining solution, and Annexin V binding buffer. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"viability",
"=",
"(",
"Total",
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"of",
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"cells/Total",
"number",
"of",
"viable",
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")",
"×",
"100",
"Detection",
"of",
"apoptosis",
"was",
"performed",
"using",
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"kit",
"Annexin",
"V",
"FITC",
"assay",
",",
"which",
"contains",
"Annexin",
"V-FITC",
",",
"propidium",
"iodide",
"staining",
"solution",
",",
"and",
"Annexin",
"V",
"binding",
"buffer",
"."
]
}
] |
PMC11021472 | This indicated that the miR-150 binding site region is dispensable for the growth promoting role of circZDHHC11. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"indicated",
"that",
"the",
"miR-150",
"binding",
"site",
"region",
"is",
"dispensable",
"for",
"the",
"growth",
"promoting",
"role",
"of",
"circZDHHC11",
"."
]
}
] |
PMC11748335 | The stacked bar charts show the proportions of common PMDs, common HMDs, and non-common PMD/HMD regions covered by these three groups of LOCKs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"stacked",
"bar",
"charts",
"show",
"the",
"proportions",
"of",
"common",
"PMDs",
",",
"common",
"HMDs",
",",
"and",
"non-common",
"PMD/HMD",
"regions",
"covered",
"by",
"these",
"three",
"groups",
"of",
"LOCKs",
"."
]
}
] |
PMC11413393 | Taken together, these data indicate that PRMT1 is a targetable therapeutic vulnerability in ccRCC. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Taken",
"together",
",",
"these",
"data",
"indicate",
"that",
"PRMT1",
"is",
"a",
"targetable",
"therapeutic",
"vulnerability",
"in",
"ccRCC",
"."
]
}
] |
PMC10197932 | In particular, the interest for the adoption of low-intensity treatment is related to its potentiality of selectivity connected with different resonance frequencies of the healthy and malignant cells. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"particular",
",",
"the",
"interest",
"for",
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"adoption",
"of",
"low-intensity",
"treatment",
"is",
"related",
"to",
"its",
"potentiality",
"of",
"selectivity",
"connected",
"with",
"different",
"resonance",
"frequencies",
"of",
"the",
"healthy",
"and",
"malignant",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC10606998 | The Spread-Out Bragg Peak (SOBP) range was 25 mm in water, and the cells were positioned in the water equivalent to the middle of the SOBP. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"Spread-Out",
"Bragg",
"Peak",
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")",
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"water",
",",
"and",
"the",
"cells",
"were",
"positioned",
"in",
"the",
"water",
"equivalent",
"to",
"the",
"middle",
"of",
"the",
"SOBP",
"."
]
}
] |
PMC10818573 | First, the reaction temperature was set to 25° C, 35 °C, or 45 °C, and the reaction time was set to 20 min. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"First",
",",
"the",
"reaction",
"temperature",
"was",
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"to",
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"°",
"C",
",",
"35",
"°",
"C",
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"or",
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"°",
"C",
",",
"and",
"the",
"reaction",
"time",
"was",
"set",
"to",
"20",
"min",
"."
]
}
] |
PMC11682525 | The observed findings could also be ascribed to an elevated translation rate. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"observed",
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"could",
"also",
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"an",
"elevated",
"translation",
"rate",
"."
]
}
] |
PMC11201245 | Despite different types of OC, the CGH results of these three authors largely correspond to our data, although we deliberately included all OC types in our study. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"OC",
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"our",
"study",
"."
]
}
] |
PMC10530622 | Moreover, the bacterial profile of urine samples has more similarities with stone bacterial profiles than with stool microbiota , suggesting a putative role of the urinary microbiota in stone formation. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"."
]
}
] |
PMC11803149 | Female mice were used in all experiments. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | A. Dinmohamed, C. Maas, O. Visser, J. Doorduijn, R. Mous, R. Raymakers, A. Kater, W. Posthuma Research and Development, Netherlands Comprehensive Cancer Organisation (IKNL), Utrecht; Public Health, Erasmus MC, Rotterdam; Hematology, Amsterdam UMC, Amsterdam; Registration, Netherlands Comprehensive Cancer Organisation (IKNL), Utrecht; Hematology, Erasmus MC Cancer Institute, Rotterdam; Hematology, UMC Utrecht, Utrecht; Internal Medicine, Reinier de Graaf Gasthuis, Delft; Hematology, Leiden University Medical Center, Leiden, Netherlands Background: At present, no other therapeutic strategy has substantially outperformed purine nucleoside analogues (PNAs)—introduced around the late 1980s and early 1990s—to manage hairy cell leukemia (HCL). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"Dinmohamed",
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",",
"Netherlands",
"Comprehensive",
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"Organisation",
"(",
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")",
",",
"Utrecht",
";",
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",",
"Erasmus",
"MC",
"Cancer",
"Institute",
",",
"Rotterdam",
";",
"Hematology",
",",
"UMC",
"Utrecht",
",",
"Utrecht",
";",
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"Medicine",
",",
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"de",
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"Gasthuis",
",",
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";",
"Hematology",
",",
"Leiden",
"University",
"Medical",
"Center",
",",
"Leiden",
",",
"Netherlands",
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":",
"At",
"present",
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"no",
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"strategy",
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"substantially",
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"nucleoside",
"analogues",
"(PNAs)—introduced",
"around",
"the",
"late",
"1980s",
"and",
"early",
"1990s",
"—",
"to",
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"cell",
"leukemia",
"(",
"HCL",
")",
"."
]
}
] |
PMC11470999 | The knockdown efficiency of CIP2A by shRNA in B16 and A375 cells was detected by immunoblot assays. ( | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"B-CellLine",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"by",
"immunoblot",
"assays",
".",
"("
]
}
] |
PMC9268620 | In Malaysia, a total of 48,639 new cases and 29,530 cancer deaths occurred in 2020 . | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"Malaysia",
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"48,639",
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"cancer",
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"occurred",
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"2020",
"."
]
}
] |
PMC8164677 | Moreover, 2D images of the most probable interaction of wedelolactone and reference drugs with selected targets are represented in Figure 7 to 10. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moreover",
",",
"2D",
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"10",
"."
]
}
] |
PMC6267596 | Cells are lysed with RIPA buffer (CST# 9806) in presence of Protease/Phosphatase Inhibitor Cocktail (CST# 5872) followed by acetone precipitation of proteins and handed over to core facility for LC-MS/MS. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"core",
"facility",
"for",
"LC-MS/MS",
"."
]
}
] |
PMC11243198 | Further, docking with transcription factors such as GLI1 can be challenging due to their flexibility, the absence of well-defined binding pockets, and their generally flat surfaces . | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"."
]
}
] |
PMC10831439 | The results are expressed as mean fluorescence intensity (MFI). | [
{
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"O",
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"MFI",
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"."
]
}
] |
PMC8913139 | However, the role of miR-448 in GBM remains largely unknown. | [
{
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"."
]
}
] |
PMC10969097 | In the in vitro tests, a substance called Ganoderic Acid D (GAD), which is the main component of SBSGL, was evaluated alone and was shown to decrease the survival of ovarian tumour cells. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O"
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"."
]
}
] |
PMC7039683 | . | [
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"O"
],
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"."
]
}
] |
PMC7812570 | To measure the inhibitory activity of GPI-m36.4 or GPI-FluIgG03, 293FT cells stably expressing CCR5/CXCR4/DSP8–11 (referred to as 293FTTarget cells) were first transduced with a lentiviral vector encoding GPI-m36.4 or GPI-FluIgG03. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"B-CellLine",
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | The risk of progression or death after 2L treatment was 2.44 higher in pts with low LN TL % (CI 95%: 1.07-5.57, p: 0.03). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
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"%",
":",
"1.07",
"-",
"5.57",
",",
"p",
":",
"0.03",
")",
"."
]
}
] |
PMC11591030 | This supports the hypothesis that NF-κB p65 may be located upstream of Nrf2/Keap1 and negatively regulate Nrf2 expression through feedback mechanisms. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"supports",
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"hypothesis",
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"NF-κB",
"p65",
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"and",
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"regulate",
"Nrf2",
"expression",
"through",
"feedback",
"mechanisms",
"."
]
}
] |
PMC10706275 | Zhao M et al. (2018) employed a similar site-specific integration approach, exploring three sites C12orf35, HPRT, and GRIK1 with potential high transcriptional activities in CHO cells. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
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"tokens": [
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"(",
"2018",
")",
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"site-specific",
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"exploring",
"three",
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"transcriptional",
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"in",
"CHO",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11477621 | Compound 20 promoted apoptosis in RPMI-8226 cells in a dose-dependent manner, exhibiting a superior inhibitory effect compared to the identical concentration of chidamide. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Compound",
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"cells",
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"identical",
"concentration",
"of",
"chidamide",
"."
]
}
] |
PMC11279598 | Pinocembrin, a flavonoid that is rich in MH, inhibited BC cell proliferation and metastasis also through inhibition of the PI3K/AKT pathway . | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Pinocembrin",
",",
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"in",
"MH",
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"inhibited",
"BC",
"cell",
"proliferation",
"and",
"metastasis",
"also",
"through",
"inhibition",
"of",
"the",
"PI3K/AKT",
"pathway",
"."
]
}
] |
PMC10158546 | ReN PRNP cells (ReN KO) were transduced with lentivirus by diluting the concentrated lentiviral preparation 1:600 in 15 mL complete growth medium that was added to the ReN cells at~30%-50% confluence in T75 flasks. | [
{
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"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ReN",
"PRNP",
"cells",
"(",
"ReN",
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")",
"were",
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"lentivirus",
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"the",
"concentrated",
"lentiviral",
"preparation",
"1:600",
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"15",
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"complete",
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"that",
"was",
"added",
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"ReN",
"cells",
"at~30%-50",
"%",
"confluence",
"in",
"T75",
"flasks",
"."
]
}
] |
PMC10545062 | There was no difference in creatinine or lactate during the injury phase (T0-T75) or during the CCP (T75-T330). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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PMC11634027 | DNA was labeled with Hoechst 33342 (Life Technologies). | [
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PMC7887261 | freq.%) carriersMeta-analysis(ClinVar)TRICL: 1045 LC, 885 ControlGELCC: 380 LC, COPDGene: 318 ControlTCGA: 1015 LC, GnomAD: 134,187 ControlGWAS studies @ OncoArray/AffymetrixTotal freq.% carrier LC/ControlOR (95% CI)P-valueATM missense SNV p.V2716A, rs587782652 (Pathogenic)2 (0.19%) / 00 / 02 (0.20%)/ 5 (0.004%)5 (0.03%) / 0 @ OncoArray0.05% / 0.003%19.55 (5.04–75.6)1.7e-05POMC 3′ UTR deletion c.*28delT, rs756770132 (VUS)6 (0.57%) / 04 (1.05%) / 06 (0.59%) / 207 (0.17%)-0.66% / 0.15%4.33 (2.03–9.24)0.00015STAU2 LoF deletion p.N364M fs*67, rs74650129821 (2.01%) / 4 (0.45%)4 (1.05%) / 00 / 25 (0.02%)-1.02% / 0.02%4.48 (1.73–11.55)0.0019MPZL2 LoF deletion p.I24M fs*22, rs752672077 (Pathogenic)3 (0.29%) / 04 (1.05%) / 05 (0.49%) / 189 (0.15%)-0.49% / 0.14%3.88 (1.71–8.8)0.0012MLNR LoF deletion, p.Q334V fs*3, rs5639476999 (0.86%) / 06 (1.58%) / 07 (0.69%) / 431 (0.35%)29 (0.54%) / 49 (0.86%) @ Affymetrix0.65% / 0.34%2.69 (1.33–5.43)0.0060TRICL Transdisciplinary Research in Cancer of the Lung, SNV single nucleotide variants, Indels insertion (ins)/deletion (del), LoF loss of function, fs frameshift, VUS variant of uncertain significance from ClinVar, NA not available, LC lung cancer, AD adenocarcinoma, FLC familiar lung cancer, OR odds ratio, CI confidence interval.#The validation sets include 26,803 LCs and 555,107 controls: 1) Genetic Epidemiology of LC (GELCC) WES data for 380 LCs (122 FLC and 258 sporadic); 2) COPDGene WES data for 318 controls; 3) TCGA (The Cancer Genome Atlas) WES data for 1015 LCs; 4) GnomAD (genome aggregation database) WES and WGS data for 134,187 non-cancer controls; 5) OncoArray genotyping data for 17,878 LCs vs. 13,425 controls; 6) Affymetrix exome array data for 5364 LCs vs. 5724 controls; 7) UK Biobank (UKB) genotyping data for 2166 LCs vs. 401,453 controls. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O"
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]
}
] |
PMC11144200 | To investigate the production for cytokines within effector T cells in order to verify their cytotoxicity mechanism, we conducted ELISA to evaluate the supernatant for these T cells after exposure to tumor antigen. | [
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]
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] |
PMC9429973 | Comparing survival between HGBCL and PMBCL, the latter had significantly better PFS and OS. | [
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]
}
] |
PMC11391695 | Following a gentle wiping of the upper chambers with a cotton swab, the quantity of invading cells in the lower chambers was determined using a microscope. | [
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"."
]
}
] |
PMC11319300 | The MYEOV-3′-putative enhancer shows activity across a broad spectrum of human tissues, as indicated by the presence of H3K27ac. | [
{
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}
] |
PMC9684669 | Drug-category-response scores are based on IC50 (μM). ( | [
{
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".",
"("
]
}
] |
PMC11757230 | While it has been reported that human MSCs promote breast cancer cell metastasis by secreting chemokine ligand type 5 , they have also been shown to inhibit breast cancer cell growth and metastasis by blocking the phosphoinositide 3-kinase/protein kinase B signaling pathway . | [
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"3-kinase/protein",
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"."
]
}
] |
PMC9386809 | After the completion of the reaction, the reaction mixture was removed from heating, and 2 mL of EtOH was added. | [
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"O",
"O",
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]
}
] |
PMC10040136 | The results showed that the proportion of MSC was significantly increased in samples from the drug-resistant group compared to the drug-sensitive group (Fig. 2E). | [
{
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"."
]
}
] |
PMC9031474 | Bis-acetals 57a, b, 62a, b, 63a, b and 58 showed comparable or even enhanced antiproliferative effects compared to polygodial (2). | [
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"."
]
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] |
PMC11224020 | Bottom, representative example of the data obtained in cPLA2 inguinal lymph nodes. | [
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"."
]
}
] |
PMC10988555 | Using the optimized geometry, TD-DFT calculations were performed, typically requesting the lowest allowed 20 excitations. | [
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]
}
] |
PMC11473843 | The human NSCLC cell lines A549, A427 and H460 were cultured in RPMI-1640 (Gibco) supplied with 10% FBS (Thermo Fisher), 100 I.U./mL penicillin and 100 μg/mL streptomycin (Gibco). | [
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"."
]
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] |
PMC11686380 | Transfection experiments using COS7 cells were conducted with polyethyleneimine “MAX” reagent (Polysciences Inc., Warrington, PA). | [
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | DEK-NUP214 is the sole cytogenetic abnormality in the majority of these patients at the time of diagnosis, suggesting its central role in disease development. | [
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"."
]
}
] |
PMC10932641 | Compared with that of blank control group, the tumor volume and weight of nude mice in the negative control group were not significantly different (P>0.05). | [
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"."
]
}
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PMC11371747 | In three other colon cancer cell lines, PCFT expression was lower than in CaCo2 and WiDr cells. | [
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]
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] |
PMC9429973 | Aims: Our goal was to study the risk of NRM and the impact on overall survival (OS) by EASIX and HCT-CI scores in patients with CMML undergoing alloSCT. | [
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]
}
] |
PMC9429973 | Stable disease occurred in 30 % and progressive disease in 7.5%. | [
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]
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] |
PMC11464609 | Precise detection of the causative pathogen is crucial for definite diagnosis, prognosis and related therapy decisions. | [
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"."
]
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] |
PMC10571053 | FIN56 appeared to be a weak P-gp substrate, as A673 B1 cells were about 6-fold resistant [Table 1]. | [
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]
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] |
PMC11261875 | Based on these data, imatinib was considered to interact with glycolysis and GLUT-4 expression. | [
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]
}
] |
PMC9119314 | To this was added 100 μL of SYBR green solution [SYBR Green I (Thermo Fisher Scientific, S7563), diluted 1:5000 in a lysis buffer made of 20 mM Tris, 5 mM EDTA, 0.008% (w/v) saponin, 0.08% (v/v) Triton X-100, pH 7.5]. | [
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"]",
"."
]
}
] |
PMC11700523 | The content of this article was previously presented as a meeting poster at the annual meeting of the Japanese Society of Nephrology on August 19, 2020. | [
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]
}
] |
PMC11360263 | This association has prompted researchers to explore the intricate molecular mechanisms underlying HCMV-induced oncogenesis. | [
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"."
]
}
] |
PMC11656657 | Our bioinformatic analysis, conducted using the Xena Genome Browser and multiple public databases, including the TCGA and GTEX datasets, revealed that B4GALNT1 is overexpressed in various solid tumors compared to healthy tissues. | [
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PMC10898159 | KIT expression and its downstream activation pathway regulation mechanism needs to be taken seriously as its mechanism is not fully explained. | [
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]
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] |
PMC10094712 | This may indicate the activation of the IRE1α signaling pathway UPR. | [
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PMC11680391 | Therefore, we need to consider plausible explanations to interpret the findings of increased cooperation and high BTSCC, such as (1) a recent acute clinical mastitis problem encouraged the farmers to seek advice from the herd veterinarian, (2) the dairy farmers are in the process of improving the BTSCC and therefore feel confident and recognize the value created by the herd veterinarian, or (3) the dairy farmer or the herd veterinarian over- or underestimate the advice. | [
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"."
]
}
] |
PMC11674146 | D, E) Validation on the knockdown efficiency of CLP36-specific siRNAs (si-CLP36#1 and si-CLP36#2) on lymphoma cells BJAB (D) and RA 1 (E), as calculated by qPCR. ( | [
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".",
"("
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.