PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC11697703 | Together with our previous experiments showing that miR-193b∼365 LoF resulted in increased Mapk8 mRNA and protein in deep-layer neurons (Figures 2E and 2F), our results indicate that high expression of the miR-193b∼365 downregulates MAPK8 signaling, which in deep-layer neurons promotes neurite branching. | [
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"O"
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"deep-layer",
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"promotes",
"neurite",
"branching",
"."
]
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PMC9429973 | Results: The median age at MM diagnosis was 57 years (range 34-71) and 79.2% patients had EMM at diagnosis. | [
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"O",
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"O",
"O"
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":",
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"at",
"MM",
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"-",
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")",
"and",
"79.2",
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"EMM",
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"diagnosis",
"."
]
}
] |
PMC11756937 | Therefore, all of our source material analyses consistently show that source material does not significantly influence reprogramming success outcomes. | [
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"O",
"O",
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"reprogramming",
"success",
"outcomes",
"."
]
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PMC11271278 | The calculated enhancer origins, both trans and cis, for all HAPI genes are listed in Supplementary Data 1. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"in",
"Supplementary",
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"1",
"."
]
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] |
PMC11487720 | The observations again suggest cold shock suppresses nuclear bubbling and BCD at 37 °C. | [
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
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],
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"37",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Image: Summary/Conclusion: In our series, Allo-HSCT in adverse-cytogenetic risk AML are associated with better OS when it is performed in first complete remission and its benefit is unclear performed in partial response or in a refractory disease, where other strategies should be considered. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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":",
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":",
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"should",
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"."
]
}
] |
PMC11515150 | 12 C CAR-NK cells and NT-NK cells were cocultured with auto normal T cells (top panel) and two donors’ normal T cells (T1, T2; bottom panels) overnight at the indicated E: T ratio (n = 3; two-way ANOVA; ***p < 0.001, ****p < 0.0001). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"*",
"*",
"*",
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",",
"*",
"*",
"*",
"*",
"p",
"<",
"0.0001",
")",
"."
]
}
] |
PMC11453018 | Recognizing patient survival is unlikely to be regulated by a single gene, we conducted a Lasso Cox analysis of these genes to construct a model correlating gene expression with overall survival (Supplementary Fig. 4). | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"Supplementary",
"Fig.",
"4",
")",
"."
]
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] |
PMC11472569 | For instance, exosomes released by CD4+ T cells can suppress the responses of CD8+ cytotoxic T lymphocytes and thereby inhibit antitumor immunity. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"+",
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"."
]
}
] |
PMC11224020 | The violin plot shows median values and quartiles (N = 2, n = 25 cells in si-Ctrl at 4 µm (80% of cells), n = 21 cells in si-cPLA2 at 4 µm (75% of cells), n = 16 cells in si-Ctrl at 3 µm (75% of cells), n = 16 cells in si-cPLA2 at 3 µm (76% of cells)). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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")",
",",
"n",
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"si-Ctrl",
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"75",
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")",
",",
"n",
"=",
"16",
"cells",
"in",
"si-cPLA2",
"at",
"3",
"µm",
"(",
"76",
"%",
"of",
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")",
"."
]
}
] |
PMC11474209 | Schematic representation of the molecular mechanisms driving the toxicity of microcystins (MC). | [
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")",
"."
]
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] |
PMC8073654 | Barker et al. discovered a phenylbutenoid, (E)-1-(3′,4′-dimethoxyphenyl)but-1,3-diene (1), in Z. cassumunar. | [
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"(E)-1-(3′,4′-dimethoxyphenyl)but-1,3-diene",
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"1",
")",
",",
"in",
"Z.",
"cassumunar",
"."
]
}
] |
PMC11763111 | In the 12-h cytotoxicity assay, 4KO CAR-T, 1KO CAR-T, and 4KO-LLT1 CAR-T cells showed potent cytotoxicity against the target cell lines (Fig. 3A). | [
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"Fig.",
"3A",
")",
"."
]
}
] |
PMC3122064 | Finally, we tested the cytotoxicity of cisplatin in combination with minimally toxic concentrations of Nutlin-3 in TC cells. | [
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",",
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"the",
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"with",
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | Each cycle will be 28 days (4 weeks). | [
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"Each",
"cycle",
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"."
]
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PMC11093197 | Immunoblotting of indicated protein in MCF10A cells after induction of gRNA for retinoblastoma 1 (RB1) and RBL2. ( | [
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"O",
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"B-CellLine",
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"1",
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"RB1",
")",
"and",
"RBL2",
".",
"("
]
}
] |
PMC11718031 | Hence, glutamine was excluded from the cell culture media to maintain this selection marker. | [
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],
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"Hence",
",",
"glutamine",
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"from",
"the",
"cell",
"culture",
"media",
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"maintain",
"this",
"selection",
"marker",
"."
]
}
] |
PMC11640419 | Caspase-3 plays a pivotal role in apoptosis , a process that is initiated by various activators and can be broadly classified into two major signaling pathways: the death receptor-mediated pathway, which involves caspase-8 and caspase-10, and the mitochondrial-mediated pathway, which involves caspase-9 . | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"a",
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"by",
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"activators",
"and",
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"broadly",
"classified",
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":",
"the",
"death",
"receptor-mediated",
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"which",
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"and",
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",",
"and",
"the",
"mitochondrial-mediated",
"pathway",
",",
"which",
"involves",
"caspase-9",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | PK and PD endpoints include assessment of serum concentrations of crovalimab, complement activity by liposome immunoassay (LIA), and free C5 over time. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"PK",
"and",
"PD",
"endpoints",
"include",
"assessment",
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"serum",
"concentrations",
"of",
"crovalimab",
",",
"complement",
"activity",
"by",
"liposome",
"immunoassay",
"(",
"LIA",
")",
",",
"and",
"free",
"C5",
"over",
"time",
"."
]
}
] |
PMC11657695 | Lower panel: κ-Cono-sensitive current obtained by subtracting current amplitude before after κ-Cono application. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
],
"tokens": [
"Lower",
"panel",
":",
"κ-Cono-sensitive",
"current",
"obtained",
"by",
"subtracting",
"current",
"amplitude",
"before",
"after",
"κ-Cono",
"application",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Through overexpressing lncRNA SNHG15 in MM PMI8226 ALKBH5 cells, we display that lncRNA SNHG15 rescued the inhibited cell proliferation, the suppressed cell migration, and the accelerated cell apoptosis caused by ALKBH5 knockdown. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"B-CellLine",
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"O",
"O"
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"overexpressing",
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"we",
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"lncRNA",
"SNHG15",
"rescued",
"the",
"inhibited",
"cell",
"proliferation",
",",
"the",
"suppressed",
"cell",
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",",
"and",
"the",
"accelerated",
"cell",
"apoptosis",
"caused",
"by",
"ALKBH5",
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"."
]
}
] |
PMC7081114 | P < 0.05 was considered significant, P < 0.01. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"P",
"<",
"0.05",
"was",
"considered",
"significant",
",",
"P",
"<",
"0.01",
"."
]
}
] |
PMC11407042 | Determine the cell number three times on the Count Star automated cell counter. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
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"tokens": [
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"cell",
"number",
"three",
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"on",
"the",
"Count",
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"automated",
"cell",
"counter",
"."
]
}
] |
PMC11678368 | Fourier transform mid-infrared (MIR) and far-infrared (FIR) spectra were recorded using a Bruker VERTEX 70 V spectrometer (Bruker Optics GmbH & Co. KG, Ettlingen, Germany) equipped with a diamond ATR accessory and an air-cooled DTGS detector. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O"
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"GmbH",
"&",
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"KG",
",",
"Ettlingen",
",",
"Germany",
")",
"equipped",
"with",
"a",
"diamond",
"ATR",
"accessory",
"and",
"an",
"air-cooled",
"DTGS",
"detector",
"."
]
}
] |
PMC11422497 | Currently, the repertoire of effective tumor biomarkers for GISTs diagnosis and prognostication remains limited. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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],
"tokens": [
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"GISTs",
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"limited",
"."
]
}
] |
PMC11792766 | After incubation, the seeding medium was removed from each well, and the cells were exposed for 24 h to diluted extracts in exposure medium (as specified in the materials section). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"medium",
"(",
"as",
"specified",
"in",
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"section",
")",
"."
]
}
] |
PMC6600592 | 67.5–68.7 °C. | [
{
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"67.5–68.7",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC7022782 | In addition, the fluorescence studies confirmed that the spectra and the intensity values of ICG-loaded NPs did not change during the time, confirming a clear improvement of the stabilization of ICG in the aqueous media when incorporated into NPs. | [
{
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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],
"tokens": [
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"aqueous",
"media",
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"incorporated",
"into",
"NPs",
"."
]
}
] |
PMC11381192 | Furthermore, in vitro experiments using cell lines and clinical samples verified the expression and function of key genes from CSI. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"Furthermore",
",",
"in",
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"cell",
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"verified",
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"expression",
"and",
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"of",
"key",
"genes",
"from",
"CSI",
"."
]
}
] |
PMC11786767 | By comparison, only 10% of the Ki-67 knockdown cells entered metaphase under the same treatment (Fig. 5E). | [
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"O",
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"O",
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"O",
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"O"
],
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"comparison",
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"the",
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"cells",
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"metaphase",
"under",
"the",
"same",
"treatment",
"(",
"Fig.",
"5E",
")",
"."
]
}
] |
PMC11726848 | In turn, the acquired knowledge will need to be taken into account when transferring technologies into clinical practice. | [
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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],
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"turn",
",",
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"acquired",
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"be",
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"account",
"when",
"transferring",
"technologies",
"into",
"clinical",
"practice",
"."
]
}
] |
PMC11139449 | One drawback of combining the CRISPR-Cas9 system with the HITI strategy is the potential for off-target effects, which are unintended genetic alterations in non-target regions. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O"
],
"tokens": [
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"which",
"are",
"unintended",
"genetic",
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"non-target",
"regions",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | After completion of three Lonca-R cycles, pts who achieve CR or partial response (PR) will continue to receive 1 or 3 additional cycles of Lonca-R, respectively. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"will",
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"receive",
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"or",
"3",
"additional",
"cycles",
"of",
"Lonca-R",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC11462673 | C Our center's sequencing data of T-ALL patients demonstrated a statistically higher expression of the LDB1 gene in patients with a high bone marrow tumor burden. | [
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
],
"tokens": [
"C",
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"gene",
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"patients",
"with",
"a",
"high",
"bone",
"marrow",
"tumor",
"burden",
"."
]
}
] |
PMC11562028 | The appearance of the new absorption peak suggests that besides retaining many active groups of the Re molecule, new hydrophilic functional groups appear during the formation of the Re-CDs. | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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],
"tokens": [
"The",
"appearance",
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"groups",
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"Re",
"molecule",
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"new",
"hydrophilic",
"functional",
"groups",
"appear",
"during",
"the",
"formation",
"of",
"the",
"Re-CDs",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Summary/Conclusion: The ALKBH5/lncRNA SNHG15 axis promotes myelomagenesis and cell migration through β-catenin/CDH4 signal pathway. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Summary/Conclusion",
":",
"The",
"ALKBH5/lncRNA",
"SNHG15",
"axis",
"promotes",
"myelomagenesis",
"and",
"cell",
"migration",
"through",
"β-catenin/CDH4",
"signal",
"pathway",
"."
]
}
] |
PMC10891340 | DEFs infected with DPV-GFP at a dose of 1 MOI, at 24 hpi, the DEFs were treated with CCCP and DMSO for 8 h, and the staining of the cell nuclei was observed under fluorescence microscope by Hoechst 33342 staining. | [
{
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"DMSO",
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"was",
"observed",
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"fluorescence",
"microscope",
"by",
"Hoechst",
"33342",
"staining",
"."
]
}
] |
PMC10820104 | In addition, the crystal structure of a known derivative, rubrumline I (2), is reported for the first time. | [
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"the",
"crystal",
"structure",
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"I",
"(",
"2",
")",
",",
"is",
"reported",
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"the",
"first",
"time",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | 4 patients (1 with AML high-risk monosomy 7, 1 with Hodgkin’s Lymphoma, 1 with ALL and 1 with T-Lymphoblastic Lymphoma) showed reduced in ejection fraction (<55%) and concomitant increase in troponin value (max 35.85 pg/ml). | [
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"O",
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"O",
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"O",
"O"
],
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",",
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"1",
"with",
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")",
"showed",
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"<",
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")",
"and",
"concomitant",
"increase",
"in",
"troponin",
"value",
"(",
"max",
"35.85",
"pg/ml",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Josip Bencevic, Slavonski Brod; Departmenf of Medicine, University Hospital Center Osijek and School of Medicine University of Osijek, Osijek; Departmenf of Medicine, University Hospital Center Rijeka and School of Medicine University of Rijeka, Rijeka; Departmenf of Medicine, University Hospital Center Sisters of Mercy, Zagreb, Croatia Background: Central nervous system (CNS) relapse in multiple myeloma (MM) is a rare complication with dismal prognosis. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Josip",
"Bencevic",
",",
"Slavonski",
"Brod",
";",
"Departmenf",
"of",
"Medicine",
",",
"University",
"Hospital",
"Center",
"Osijek",
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"School",
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"Medicine",
"University",
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"Osijek",
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"Osijek",
";",
"Departmenf",
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"University",
"Hospital",
"Center",
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"School",
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"Medicine",
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"Rijeka",
";",
"Departmenf",
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",",
"University",
"Hospital",
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"Sisters",
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",",
"Zagreb",
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"Croatia",
"Background",
":",
"Central",
"nervous",
"system",
"(",
"CNS",
")",
"relapse",
"in",
"multiple",
"myeloma",
"(",
"MM",
")",
"is",
"a",
"rare",
"complication",
"with",
"dismal",
"prognosis",
"."
]
}
] |
PMC11119602 | Subsequently, cells were exposed to 0–20 µM of cisplatin for 24 h or 48 h, before the drug sensitivity of HepG2/cr cells was compared with that of non-drug-resistant parental control cells. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
],
"tokens": [
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"drug",
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"HepG2/cr",
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"that",
"of",
"non-drug-resistant",
"parental",
"control",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11531744 | Representative images of the invasion assay. ( | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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],
"tokens": [
"Representative",
"images",
"of",
"the",
"invasion",
"assay",
".",
"("
]
}
] |
PMC11684297 | The same sample was diluted nearly 50X to measure the hydrodynamic diameter and zeta potential using Malvern zeta sizer. | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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],
"tokens": [
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"same",
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"nearly",
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"hydrodynamic",
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"potential",
"using",
"Malvern",
"zeta",
"sizer",
"."
]
}
] |
PMC10158546 | RT-QuIC lag-phase measurements did not cluster based on timepoint post-inoculation, suggesting that prion-seeding activity did not change over time in any of the conditions tested. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"tokens": [
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"time",
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"the",
"conditions",
"tested",
"."
]
}
] |
PMC10391797 | However, the 1.0 mM VPA treatment did not prolong the survival of mice. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
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"tokens": [
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"mM",
"VPA",
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"did",
"not",
"prolong",
"the",
"survival",
"of",
"mice",
"."
]
}
] |
PMC11711127 | This immune evasion strategy might be responsible for advanced cancer as the accumulation of senescent T cells possibly lowers the response rate to chemo(radio)therapy and immunotherapy (86). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O"
],
"tokens": [
"This",
"immune",
"evasion",
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"lowers",
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"chemo(radio)therapy",
"and",
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"(",
"86",
")",
"."
]
}
] |
PMC11377827 | Source data are available online for this figure. | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"online",
"for",
"this",
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"."
]
}
] |
PMC11472639 | indicates a significant difference from ‘warm-up’ at p < 0.01. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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],
"tokens": [
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"significant",
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"’",
"at",
"p",
"<",
"0.01",
"."
]
}
] |
PMC11802855 | Previous studies have demonstrated that CXCL7 exerts a role in promoting proliferation and invasion in malignant tumors such as breast cancer, lung cancer, and renal cancer, and is associated with an adverse prognosis [10–12]. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"studies",
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"in",
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"cancer",
",",
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"cancer",
",",
"and",
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"cancer",
",",
"and",
"is",
"associated",
"with",
"an",
"adverse",
"prognosis",
"[",
"10–12",
"]",
"."
]
}
] |
PMC11569208 | MX2 and IFITM1 mRNA transcripts were quantified by qPCR (n = 3, mean ± SD; *P < 0.05, ***P < 0.001 by two-way ANOVA). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"*",
"*",
"*",
"P",
"<",
"0.001",
"by",
"two-way",
"ANOVA",
")",
"."
]
}
] |
PMC11773391 | In addition, after treatment, the tumour length and width in nude mice were surveyed every 2 days, and the tumour volume was calculated. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O"
],
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"and",
"the",
"tumour",
"volume",
"was",
"calculated",
"."
]
}
] |
PMC11392912 | Representative hind paw image of the rats from each group, where edema and redness were seen reduced in the Clo-miR-14 and MTX (standard drug) treated group compared with the CIA and NC groups. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
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"tokens": [
"Representative",
"hind",
"paw",
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")",
"treated",
"group",
"compared",
"with",
"the",
"CIA",
"and",
"NC",
"groups",
"."
]
}
] |
PMC11343332 | The interference with VEGF/FGF signaling pathways provides mechanistic insights into the anti-migratory effects of pycnogenol, suggesting its potential as a promising agent for preventing or limiting the spread of breast cancer. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"interference",
"with",
"VEGF/FGF",
"signaling",
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"mechanistic",
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"or",
"limiting",
"the",
"spread",
"of",
"breast",
"cancer",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Daratumumab, pomalidomide, dexamethasone, carfilzomib, and bortezomib will be administered according to manufacturer’s prescribing information. | [
{
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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],
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"be",
"administered",
"according",
"to",
"manufacturer",
"’s",
"prescribing",
"information",
"."
]
}
] |
PMC7351993 | Before setting the prepared sample to the sample inlet, we flushed out all particles and cells in the inlet tubing, outlet tubing, and microchannels to avoid unwanted carryovers. | [
{
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"O",
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],
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"sample",
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"the",
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",",
"outlet",
"tubing",
",",
"and",
"microchannels",
"to",
"avoid",
"unwanted",
"carryovers",
"."
]
}
] |
PMC11055323 | b Left panels are representative immunofluorescent images of endogenous HDAC1 in the BJ cells with lentiviral expression of SS18-SSX, N12 fused SS18-SSX and N12 with R3A or K5A mutation fused SS18-SSX, respectively. | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O"
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"with",
"R3A",
"or",
"K5A",
"mutation",
"fused",
"SS18-SSX",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC9428827 | Mice were treated with 30,000 IU of wtIL-2 or 300 IU of mutein; these doses are equivalent in the ability to stimulate effector cells, both CD8 activated and NK cells expressing the dimeric IL-2 receptor (βγc). | [
{
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
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"IU",
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"both",
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"and",
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"dimeric",
"IL-2",
"receptor",
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"βγc",
")",
"."
]
}
] |
PMC11366496 | For detailed information on antibodies, please see the Data S1. | [
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"detailed",
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"antibodies",
",",
"please",
"see",
"the",
"Data",
"S1",
"."
]
}
] |
PMC10907726 | DATS significantly inhibited proliferation, migration and EMT in osteosarcoma cells. | [
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"O",
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"O",
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"significantly",
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"proliferation",
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"migration",
"and",
"EMT",
"in",
"osteosarcoma",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC10253973 | The investigation on human protein tyrosine phosphatase (PTP-1B) found that it was less inhibited by complex 32, possibly by forming a coordination bond with the sulfur atom at position 215 of cysteine. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"a",
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"with",
"the",
"sulfur",
"atom",
"at",
"position",
"215",
"of",
"cysteine",
"."
]
}
] |
PMC5261804 | It has recently been shown that inhibition of JAKs attenuates growth of small cell lung cancers in vitro and in vivo , and that activation of JAK signaling induces resistance to EGFR mutations in non-small cell lung cancers . | [
{
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"has",
"recently",
"been",
"shown",
"that",
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"attenuates",
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",",
"and",
"that",
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"of",
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"resistance",
"to",
"EGFR",
"mutations",
"in",
"non-small",
"cell",
"lung",
"cancers",
"."
]
}
] |
PMC10810426 | We first confirmed that >98% of DCs analyzed at 10–11 days of differentiation ex vivo were quiescent (Fig 3A). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"first",
"confirmed",
"that",
">",
"98",
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"of",
"DCs",
"analyzed",
"at",
"10–11",
"days",
"of",
"differentiation",
"ex",
"vivo",
"were",
"quiescent",
"(",
"Fig",
"3A",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Eight patients responded to CAR-T therapies and 100% (n=6) of patients achieved MRD-negative hematological remission. | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Eight",
"patients",
"responded",
"to",
"CAR-T",
"therapies",
"and",
"100",
"%",
"(",
"n=6",
")",
"of",
"patients",
"achieved",
"MRD-negative",
"hematological",
"remission",
"."
]
}
] |
PMC11549612 | After 14 days, colonies were stained with 0.1% crystal violet. | [
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"14",
"days",
",",
"colonies",
"were",
"stained",
"with",
"0.1",
"%",
"crystal",
"violet",
"."
]
}
] |
PMC11240448 | Although omics data acquisition advances at a formidable pace, our ability to mechanistically interpret omics datasets and elucidate how they dictate cellular phenotypes is still trailing behind. | [
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Although",
"omics",
"data",
"acquisition",
"advances",
"at",
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"formidable",
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"ability",
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"mechanistically",
"interpret",
"omics",
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"elucidate",
"how",
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"dictate",
"cellular",
"phenotypes",
"is",
"still",
"trailing",
"behind",
"."
]
}
] |
PMC6364197 | IC50 of 335 nM with DNR was chosen for further experiments. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"335",
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"DNR",
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"for",
"further",
"experiments",
"."
]
}
] |
PMC9621239 | To confirm the difference in the heterogeneity of HBV QS across the X gene between tumour and non-tumour tissues, the heterogeneity was quantified into two aspects: complexity and diversity. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"confirm",
"the",
"difference",
"in",
"the",
"heterogeneity",
"of",
"HBV",
"QS",
"across",
"the",
"X",
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"and",
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",",
"the",
"heterogeneity",
"was",
"quantified",
"into",
"two",
"aspects",
":",
"complexity",
"and",
"diversity",
"."
]
}
] |
PMC11726848 | The results of the two methods for assessing cell count together allowed us to evaluate both the general radiosensitivity of the cells in culture and the dynamics of culture growth after irradiation. | [
{
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"tokens": [
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"and",
"the",
"dynamics",
"of",
"culture",
"growth",
"after",
"irradiation",
"."
]
}
] |
PMC11406030 | We designed peptides that target LMTK3 specifically, which manifested high efficacy and safety against ovarian and recurrent ovarian cancer. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"ovarian",
"cancer",
"."
]
}
] |
PMC11761919 | To these flasks, 0.5 g (1%, w/v) and 0.25 g (0.5%, w/v) of PINs, and 0.5 g (1%, w/v) of inulin were added, respectively. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"%",
",",
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")",
"of",
"inulin",
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",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC11683130 | IFNγ, in turn, stimulates the activation of dendritic cells, which triggers a T cell immune response (13). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"tokens": [
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"cell",
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"13",
")",
"."
]
}
] |
PMC9910796 | Proteins were transferred to PVDF membranes (0.2 μm, Bio-Rad) and incubated overnight at 4°C with the primary antibodies and for 1 h at RT with anti-rabbit, anti-rat or anti-mouse secondary antibodies conjugated to horseradish peroxidase (GE Healthcare) or TidyBlot (Biorad). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"or",
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"Biorad",
")",
"."
]
}
] |
PMC3164356 | This resulted in a final gene set comprising 24,383 predicted genes and 29,291 transcripts. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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],
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"."
]
}
] |
PMC11301095 | However, it has also been detected in untreated swimming pools, fountains, untreated drinking water, and water parks . | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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],
"tokens": [
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",",
"it",
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"swimming",
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"untreated",
"drinking",
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"and",
"water",
"parks",
"."
]
}
] |
PMC11306019 | Despite the advancements in cancer therapies, drug resistance remains a significant challenge in the management of cancer, including MM (Ahmad et al., 2023; Kozalak et al., 2023). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"the",
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"in",
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"therapies",
",",
"drug",
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",",
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";",
"Kozalak",
"et",
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",",
"2023",
")",
"."
]
}
] |
PMC7334607 | Color represents the log2 fold change of EC50 to a drug (columns) for a replicate at a given evolutionary time point (rows) compared with the average EC50 of the three control evolutionary replicates at the corresponding time point. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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],
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"three",
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"evolutionary",
"replicates",
"at",
"the",
"corresponding",
"time",
"point",
"."
]
}
] |
PMC11588008 | In our study, we found after HUC-MSCs treatment, the ROS level in injured granulosa cells was decreased compared with the model group (P < 0.05), and the level of MDA tended to decrease. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O"
],
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"study",
",",
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")",
",",
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"the",
"level",
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"MDA",
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"decrease",
"."
]
}
] |
PMC11468365 | These models offer powerful tools for simulating complex biomedical processes, advancing our understanding, and identifying effective drug combinations more efficiently and comprehensively. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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],
"tokens": [
"These",
"models",
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"for",
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"efficiently",
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"comprehensively",
"."
]
}
] |
PMC9479186 | Notwithstanding, we still believe NDUFC1 could be a target for tumor progression by inhibiting senescence and affecting Complex I–induced mitochondrial metabolism in HCC. | [
{
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
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],
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"and",
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"mitochondrial",
"metabolism",
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"HCC",
"."
]
}
] |
PMC11758416 | Gently transfer the cell solution from the microcentrifuge tubes to a 15 mL conical tube.c. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O"
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"cell",
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"conical",
"tube.c",
"."
]
}
] |
PMC11766350 | As mentioned earlier, rather than using an artificial shRNA, Blahetek et al. added artificial miRNA binding sites to the 3′ UTR of the cytotoxic transgene, which only interacted with an endogenous miRNA that is only highly expressed in HEK293 cells but not in the patient target tissue . | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"B-CellLine",
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"an",
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"not",
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"tissue",
"."
]
}
] |
PMC11539788 | qRT‒PCR analysis of RNF19A mRNA expression in T24 and 5637 cells stably overexpressing RNF19A. ( | [
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"O",
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"RNF19A",
".",
"("
]
}
] |
PMC11787651 | Cells were harvested in PBS, and cell pellets were frozen at −80 °C until further processing. | [
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"O",
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"O",
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"until",
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"processing",
"."
]
}
] |
PMC11476264 | Loss of FBXO11 increases ZEB1 levels, enhancing the invasiveness of lung cancer cells, while its overexpression reduces ZEB1 and suppresses invasion. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
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"while",
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"overexpression",
"reduces",
"ZEB1",
"and",
"suppresses",
"invasion",
"."
]
}
] |
PMC11622247 | In this sequence context too, introduction of a QB base surrogate and two light harvesting AF568 dyes provided the desired features of high brightness in the target-bound state while fluorescing poorly in the absence of target (Fig. S2†). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
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"context",
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"surrogate",
"and",
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"fluorescing",
"poorly",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"target",
"(",
"Fig.",
"S2†",
")",
"."
]
}
] |
PMC9577200 | These findings are in agreement with No et al. (2002) and Jeon et al. (2001), who noticed that chitosan at a level of 0.1% (w/v) had more potent antimicrobial effects against G+ bacteria than G– bacteria. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"findings",
"are",
"in",
"agreement",
"with",
"No",
"et",
"al.",
"(",
"2002",
")",
"and",
"Jeon",
"et",
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"(",
"2001",
")",
",",
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"noticed",
"that",
"chitosan",
"at",
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")",
"had",
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"effects",
"against",
"G+",
"bacteria",
"than",
"G–",
"bacteria",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The total number of relapses were 11.The median time to relapse for low risk and high risk was 23months(18-32months) and 20months(range 5-39months) respectively. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"total",
"number",
"of",
"relapses",
"were",
"11.The",
"median",
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"high",
"risk",
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"23months(18",
"-",
"32months",
")",
"and",
"20months(range",
"5",
"-",
"39months",
")",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Aims: This study aims to analyze the clinical features, prognosis and characteristics of the gene mutations of the primary myelodysplastic syndrome with myelofibrosis (MDS-MF) patients, ultimately to improve the cognition of MDS-MF. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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],
"tokens": [
"Aims",
":",
"This",
"study",
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"prognosis",
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"myelofibrosis",
"(",
"MDS-MF",
")",
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",",
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"."
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PMC11766309 | Moreover, we found that YKT6 is involved in the TGFB1 and TGFBR1 signaling pathways in CESC patients and may mediate the fusion of autophagosomes and lysosomes, affecting the response of CESC patients to immunotherapy. | [
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PMC8010066 | A limitation of the current study is that many variables can affect the growth of the bacterium in the A549 cell line. | [
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PMC5673955 | Jurkat and CD4 T cells were incubated for 48 h with different concentrations of RrA or with 0.1 U/mL of RrA followed by detection of telomerase activity. ( | [
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"("
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PMC9646302 | The 786-0 and CAKI-1 cells transfected with supernatant and polybrene (10 μl/ml) were added. | [
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PMC11747885 | To identify the structural elements crucial for Rlig1 inhibition, truncated derivatives lacking the R or R groups were synthesized. | [
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PMC11394386 | ChIP assays utilized EZ-ChIP KIT (Millipore) with 1,000,000 cells per dish, crosslinking DNA and protein. | [
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"."
]
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PMC9429973 | S. Choquet, B. Uttenthal, S. Chaganti, P. Comoli, R. Trappe, A. Friedetzky, B. Xing, X. Li, T. Polak, L. Gamelin, J.-H. Terwey, D. Dierickx Hématologie clinique, Sorbonne Université, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Paris, France; Department of Haematology, Cambridge University Teaching Hospitals NHS Foundation Trust, Cambridge; Department of Haematology, Queen Elizabeth Hospital, Birmingham, United Kingdom; Cell Factory and Pediatric Hematology, Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo, Pavia, Italy; DIAKO Evangelisches Diakonie-Krankenhaus Bremen, Bremen, Germany; Atara Biotherapeutics, Zug, Switzerland; Atara Biotherapeutics, Thousand Oaks, United States of America; Biostatistics & Epidemiology, ErasmusMC, Rotterdam; Real-World Data, myTomorrows, Amsterdam, Netherlands; Department of Hematology, University Hospital Leuven, Leuven, Belgium Background: Patients undergoing allogeneic hematopoietic cell transplant (HCT) or solid organ transplant (SOT) are at risk of developing Epstein–Barr virus driven post-transplant lymphoproliferative disorder (EBV PTLD), a rare hematologic malignancy, which is often aggressive and life-threatening. | [
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PMC11045125 | In comparison to the P493-6 line, the tumor-derived lines express similar levels of EBNA1 and EBNA3A but express much less BHRF1 (S5 Fig). | [
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PMC11730320 | However, flow cytometry analysis revealed a marked loss of naïve cells from the CD4+ population indicating a consistent low thymic output. | [
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PMC11754436 | Three fields were randomly selected, and the average percentage of brown or dark yellow particles in the cytoplasm was determined. | [
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PMC11794588 | The medium was withdrawn, and cells were re-suspended in complete media (1.0 mL). | [
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PMC11317131 | Plasmids used for expressing the epegRNA include a spacer sequence that directs the SpCas9 nickase to the genomic target sequence (22,32). | [
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Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.