Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC9429973
E. Tissino, R. Bomben, P. C. Maity, F. Pozzo, G. Forestieri, A. Nicolò, A. Härzschel, T. Bittolo, F. M. Rossi, M. Datta, F. Zaja, G. Capasso, G. D’Arena, A. Chiarenza, F. Di Raimondo, H. Jumaa, D. Rossi, G. Del Poeta, T. N. Hartmann, A. Zucchetto, V. Gattei Clinical and Experimental Onco-Hematology, Centro di Riferimento Oncologico, Aviano, Italy; Institut für Immunologie, Universitätsklinikum Ulm, Ulm, Germany; Division of Hematology, Oncology Institute of Southern Switzerland, Bellinzona, Switzerland; Department of Internal Medicine, Faculty of Medicine, University Medical Center Freiburg, University of Freiburg, Freiburg, Germany; Dipartimento di Scienze Mediche e Chirurgiche e della Salute, University of Trieste, Trieste; IRCCS Centro Di Riferimento Oncologico Della Basilicata, IRCCS Centro Di Riferimento Oncologico Della Basilicata, Rionero In Vulture; Divisione di Ematologia, Ospedale Ferrarotto, A.O.U. Policlinico-OVE, Università di Catania, Catania; Division Hematology, S.Eugenio Hospital and University of Tor Vergata, Rome, Italy Background: In chronic lymphocytic leukemia (CLL), CD49d, the alpha chain of the heterodimer CD49d/CD29 (VLA-4), is a strong negative prognosticator and key player of CLL microenvironmental interactions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "E.", "Tissino", ",", "R.", "Bomben", ",", "P.", "C.", "Maity", ",", "F.", "Pozzo", ",", "G.", "Forestieri", ",", "A.", "Nicolò", ",", "A.", "Härzschel", ",", "T.", "Bittolo", ",", "F.", "M.", "Rossi", ",", "M.", "Datta", ",", "F.", "Zaja", ",", "G.", "Capasso", ",", "G.", "D’Arena", ",", "A.", "Chiarenza", ",", "F.", "Di", "Raimondo", ",", "H.", "Jumaa", ",", "D.", "Rossi", ",", "G.", "Del", "Poeta", ",", "T.", "N.", "Hartmann", ",", "A.", "Zucchetto", ",", "V.", "Gattei", "Clinical", "and", "Experimental", "Onco-Hematology", ",", "Centro", "di", "Riferimento", "Oncologico", ",", "Aviano", ",", "Italy", ";", "Institut", "für", "Immunologie", ",", "Universitätsklinikum", "Ulm", ",", "Ulm", ",", "Germany", ";", "Division", "of", "Hematology", ",", "Oncology", "Institute", "of", "Southern", "Switzerland", ",", "Bellinzona", ",", "Switzerland", ";", "Department", "of", "Internal", "Medicine", ",", "Faculty", "of", "Medicine", ",", "University", "Medical", "Center", "Freiburg", ",", "University", "of", "Freiburg", ",", "Freiburg", ",", "Germany", ";", "Dipartimento", "di", "Scienze", "Mediche", "e", "Chirurgiche", "e", "della", "Salute", ",", "University", "of", "Trieste", ",", "Trieste", ";", "IRCCS", "Centro", "Di", "Riferimento", "Oncologico", "Della", "Basilicata", ",", "IRCCS", "Centro", "Di", "Riferimento", "Oncologico", "Della", "Basilicata", ",", "Rionero", "In", "Vulture", ";", "Divisione", "di", "Ematologia", ",", "Ospedale", "Ferrarotto", ",", "A.O.U.", "Policlinico-OVE", ",", "Università", "di", "Catania", ",", "Catania", ";", "Division", "Hematology", ",", "S.Eugenio", "Hospital", "and", "University", "of", "Tor", "Vergata", ",", "Rome", ",", "Italy", "Background", ":", "In", "chronic", "lymphocytic", "leukemia", "(", "CLL", ")", ",", "CD49d", ",", "the", "alpha", "chain", "of", "the", "heterodimer", "CD49d/CD29", "(", "VLA-4", ")", ",", "is", "a", "strong", "negative", "prognosticator", "and", "key", "player", "of", "CLL", "microenvironmental", "interactions", "." ] } ]
PMC11754094
c, Summarized box plot comparing the large-deletion frequencies among the BEs targeting ABLIM3, FANCF, KLHL29 and BRD4.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "c", ",", "Summarized", "box", "plot", "comparing", "the", "large-deletion", "frequencies", "among", "the", "BEs", "targeting", "ABLIM3", ",", "FANCF", ",", "KLHL29", "and", "BRD4", "." ] } ]
PMC11703992
Fig. 4The eQTL MR analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "4The", "eQTL", "MR", "analysis", "." ] } ]
PMC8751435
To further explain this phenomenon, this interaction may be mediated by autophagy‐apoptosis homeostasis according to Li Xu's finding (Xu et al., 2016).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "explain", "this", "phenomenon", ",", "this", "interaction", "may", "be", "mediated", "by", "autophagy‐apoptosis", "homeostasis", "according", "to", "Li", "Xu", "'s", "finding", "(", "Xu", "et", "al.", ",", "2016", ")", "." ] } ]
PMC9429973
FB23-2 displayed potent synergistic activity with ibrutinib in promoting cytotoxicity in CLL cells (Figure 1A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "FB23", "-", "2", "displayed", "potent", "synergistic", "activity", "with", "ibrutinib", "in", "promoting", "cytotoxicity", "in", "CLL", "cells", "(", "Figure", "1A", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: In this study, 244 patients diagnosed with MM in hematology clinic between January 2010 and January 2021, and 179 healthy individuals were included.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "In", "this", "study", ",", "244", "patients", "diagnosed", "with", "MM", "in", "hematology", "clinic", "between", "January", "2010", "and", "January", "2021", ",", "and", "179", "healthy", "individuals", "were", "included", "." ] } ]
PMC6267596
DIAP cells are thought to be responsible for treatment resistance, as they are capable of re-entering the cell cycle during off-therapy periods.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DIAP", "cells", "are", "thought", "to", "be", "responsible", "for", "treatment", "resistance", ",", "as", "they", "are", "capable", "of", "re-entering", "the", "cell", "cycle", "during", "off-therapy", "periods", "." ] } ]
PMC11628904
This is in part due to long‐lasting epithelial barrier disruption and aberrant antimicrobial activity in burned tissue, which itself is a primary site of microbial colonisation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "is", "in", "part", "due", "to", "long‐lasting", "epithelial", "barrier", "disruption", "and", "aberrant", "antimicrobial", "activity", "in", "burned", "tissue", ",", "which", "itself", "is", "a", "primary", "site", "of", "microbial", "colonisation", "." ] } ]
PMC10329074
Kaplan–Meier curves for overall survival of T4 subgroups for TCGA-KIRC samples. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Kaplan", "–", "Meier", "curves", "for", "overall", "survival", "of", "T4", "subgroups", "for", "TCGA-KIRC", "samples", ".", "(" ] } ]
PMC11064533
ffp, an uncharacterized gene, is involved in motility and resistance to ampicillin in a clumpy state.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ffp", ",", "an", "uncharacterized", "gene", ",", "is", "involved", "in", "motility", "and", "resistance", "to", "ampicillin", "in", "a", "clumpy", "state", "." ] } ]
PMC8481254
Bel-7404 cells (5 × 10 cells) expressing green fluorescent protein (GFP) were injected into 8-week-old athymic nude mice with or without STZ treatment and then injected 24 days later with methanol or CA (10 mg/kg/day).
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bel-7404", "cells", "(", "5", "×", "10", "cells", ")", "expressing", "green", "fluorescent", "protein", "(", "GFP", ")", "were", "injected", "into", "8-week-old", "athymic", "nude", "mice", "with", "or", "without", "STZ", "treatment", "and", "then", "injected", "24", "days", "later", "with", "methanol", "or", "CA", "(", "10", "mg/kg/day", ")", "." ] } ]
PMC11534035
Our findings reinforce the notion that these two cellular elements affect one another (14).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "findings", "reinforce", "the", "notion", "that", "these", "two", "cellular", "elements", "affect", "one", "another", "(", "14", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Median time from diagnosis to HSCT was 5 months.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Median", "time", "from", "diagnosis", "to", "HSCT", "was", "5", "months", "." ] } ]
PMC10547921
The specificity for imidazole by the α-amanitin pocket is achieved primarily through the interaction of amide NH of Gly7 to Rpb1 His1085 N (D1) and the carbonyl of Asn1 to Rpb1 His1085 NH (E2).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "specificity", "for", "imidazole", "by", "the", "α-amanitin", "pocket", "is", "achieved", "primarily", "through", "the", "interaction", "of", "amide", "NH", "of", "Gly7", "to", "Rpb1", "His1085", "N", "(", "D1", ")", "and", "the", "carbonyl", "of", "Asn1", "to", "Rpb1", "His1085", "NH", "(", "E2", ")", "." ] } ]
PMC11653533
Again, the same study reported that aqueous extract of the stem bark of F. sycomorus conveyed anticonvulsive potency by decreasing pentylenetetrazole and strychnine-induced convulsions in rats, where, 600 mg/kg extract with pentylenetetrazole showed a mean number of convulsions/min equal to 49.0 ± 1.83, meantime, 600 mg/kg extract with strychnine showed 13.2 ± 0.96 convulsions/min (Sandabe et al., 2003).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Again", ",", "the", "same", "study", "reported", "that", "aqueous", "extract", "of", "the", "stem", "bark", "of", "F.", "sycomorus", "conveyed", "anticonvulsive", "potency", "by", "decreasing", "pentylenetetrazole", "and", "strychnine-induced", "convulsions", "in", "rats", ",", "where", ",", "600", "mg/kg", "extract", "with", "pentylenetetrazole", "showed", "a", "mean", "number", "of", "convulsions/min", "equal", "to", "49.0", "±", "1.83", ",", "meantime", ",", "600", "mg/kg", "extract", "with", "strychnine", "showed", "13.2", "±", "0.96", "convulsions/min", "(", "Sandabe", "et", "al.", ",", "2003", ")", "." ] } ]
PMC11240448
In summary, we showed that cSTAR can generate digital twins, i.e., actionable computer models of a human cell.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "summary", ",", "we", "showed", "that", "cSTAR", "can", "generate", "digital", "twins", ",", "i.e.", ",", "actionable", "computer", "models", "of", "a", "human", "cell", "." ] } ]
PMC11730311
3Overview of purified hαCGRP8-37 analogues with associated IC50 values.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "3Overview", "of", "purified", "hαCGRP8", "-", "37", "analogues", "with", "associated", "IC50", "values", "." ] } ]
PMC9429973
Clinical data, including patient characteristics on diagnosis, treatment regimen, response to treatment and follow-up were obtained from hospital records.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Clinical", "data", ",", "including", "patient", "characteristics", "on", "diagnosis", ",", "treatment", "regimen", ",", "response", "to", "treatment", "and", "follow-up", "were", "obtained", "from", "hospital", "records", "." ] } ]
PMC11759751
Effect of chidamide on CD19 expression on B-NHL cells (D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Effect", "of", "chidamide", "on", "CD19", "expression", "on", "B-NHL", "cells", "(", "D", ")", "." ] } ]
PMC11423992
Besides, the lower molecular weight can enhance tumor penetration.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Besides", ",", "the", "lower", "molecular", "weight", "can", "enhance", "tumor", "penetration", "." ] } ]
PMC11467800
Zebrafish are particularly useful for cancer research, as the xenotransplantation of human cancer cells into zebrafish allows for the in vivo evaluation of cancer progression and drug discovery at a single‐cell resolution in real‐time.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Zebrafish", "are", "particularly", "useful", "for", "cancer", "research", ",", "as", "the", "xenotransplantation", "of", "human", "cancer", "cells", "into", "zebrafish", "allows", "for", "the", "in", "vivo", "evaluation", "of", "cancer", "progression", "and", "drug", "discovery", "at", "a", "single‐cell", "resolution", "in", "real‐time", "." ] } ]
PMC11519077
Additionally, Caco-2 cells cultured in a medium supplemented with IL-1β at 10 ng/mL showed a lower proportion of cell harming after 48 h of growth than other concentrations (78.186.59; p < 0.01) (Figure 5(b)).
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "Caco-2", "cells", "cultured", "in", "a", "medium", "supplemented", "with", "IL-1β", "at", "10", "ng/mL", "showed", "a", "lower", "proportion", "of", "cell", "harming", "after", "48", "h", "of", "growth", "than", "other", "concentrations", "(", "78.186.59", ";", "p", "<", "0.01", ")", "(", "Figure", "5(b", ")", ")", "." ] } ]
PMC10705095
Moreover, hemoglobin is more efficient in removing H2O2 compared to the glutathione peroxidase and glutathione reductase system .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "hemoglobin", "is", "more", "efficient", "in", "removing", "H2O2", "compared", "to", "the", "glutathione", "peroxidase", "and", "glutathione", "reductase", "system", "." ] } ]
PMC11539788
D-E) western blot analysis of the levels of the RNF19A, ILK, and proteins involved in mTOR signalling in tumour samples from the LV-Control and LV-RNF19A groups. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D-E", ")", "western", "blot", "analysis", "of", "the", "levels", "of", "the", "RNF19A", ",", "ILK", ",", "and", "proteins", "involved", "in", "mTOR", "signalling", "in", "tumour", "samples", "from", "the", "LV-Control", "and", "LV-RNF19A", "groups", ".", "(" ] } ]
PMC11770746
We chose paclitaxel because the combination of paclitaxel with platinum drugs shows clinical benefits.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "chose", "paclitaxel", "because", "the", "combination", "of", "paclitaxel", "with", "platinum", "drugs", "shows", "clinical", "benefits", "." ] } ]
PMC9429973
Paired PB MS and BM NGS samples were available for 13 patients at early (post-cycle 4) and 18 patients at later (cycles 8-24) timepoints.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Paired", "PB", "MS", "and", "BM", "NGS", "samples", "were", "available", "for", "13", "patients", "at", "early", "(", "post-cycle", "4", ")", "and", "18", "patients", "at", "later", "(", "cycles", "8", "-", "24", ")", "timepoints", "." ] } ]
PMC11506827
no. sc-7480), Bcl-2 (cat.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "no.", "sc-7480", ")", ",", "Bcl-2", "(", "cat", "." ] } ]
PMC10969097
They influence cytokine production, stimulate cells, enhance antibody responses and regulate activity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "influence", "cytokine", "production", ",", "stimulate", "cells", ",", "enhance", "antibody", "responses", "and", "regulate", "activity", "." ] } ]
PMC9841531
The plates were incubated for 72 h at 37 °C and a 5% CO2-humidified atmosphere, before subsequent processing with the regular MTT assay as described above.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "plates", "were", "incubated", "for", "72", "h", "at", "37", "°", "C", "and", "a", "5", "%", "CO2-humidified", "atmosphere", ",", "before", "subsequent", "processing", "with", "the", "regular", "MTT", "assay", "as", "described", "above", "." ] } ]
PMC11216402
To understand the regulatory mechanism for the differential expression of COL1A1 and FGF5, we compared the chromatin accessibility of their flanking cis-regulatory regions (Fig. 6D,E).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "understand", "the", "regulatory", "mechanism", "for", "the", "differential", "expression", "of", "COL1A1", "and", "FGF5", ",", "we", "compared", "the", "chromatin", "accessibility", "of", "their", "flanking", "cis-regulatory", "regions", "(", "Fig.", "6D", ",", "E", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Summary/Conclusion: BGB-16673-101 is the first in-human study of the BTK degrader BGB-16673.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Summary/Conclusion", ":", "BGB-16673", "-", "101", "is", "the", "first", "in-human", "study", "of", "the", "BTK", "degrader", "BGB-16673", "." ] } ]
PMC8010066
Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus often lead to serious lung infections.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pseudomonas", "aeruginosa", "and", "Staphylococcus", "aureus", "often", "lead", "to", "serious", "lung", "infections", "." ] } ]
PMC10993311
There was an effect of time [F(2;146) = 210.53; p<0.001] on TG, with T3>T2>T1 (p<0.001), and an effect of time*group interaction [F(2;146) = 2.77; p=0.05], with T3>T2>T1 (p<0.001), in AGWG and EGWG.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "was", "an", "effect", "of", "time", "[", "F(2;146", ")", "=", "210.53", ";", "p<0.001", "]", "on", "TG", ",", "with", "T3>T2>T1", "(", "p<0.001", ")", ",", "and", "an", "effect", "of", "time*group", "interaction", "[", "F(2;146", ")", "=", "2.77", ";", "p=0.05", "]", ",", "with", "T3>T2>T1", "(", "p<0.001", ")", ",", "in", "AGWG", "and", "EGWG", "." ] } ]
PMC10654497
The association between the risk of these three genes and survival status was also investigated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "association", "between", "the", "risk", "of", "these", "three", "genes", "and", "survival", "status", "was", "also", "investigated", "." ] } ]
PMC11534377
By 48 hours, more cells have likely accumulated sufficient damage or have had enough time to undergo the biochemical changes leading to the observed phenotypes of cell death.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "48", "hours", ",", "more", "cells", "have", "likely", "accumulated", "sufficient", "damage", "or", "have", "had", "enough", "time", "to", "undergo", "the", "biochemical", "changes", "leading", "to", "the", "observed", "phenotypes", "of", "cell", "death", "." ] } ]
PMC6835428
Delivery systems larger than the diameter of the aperture of the lymphatic lacunae will persist longer in the peritoneal cavity; those inferior in size will be predominantly cleared via the lacunar route, while the very small ones (nm range) will be mostly drained by blood vessels.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Delivery", "systems", "larger", "than", "the", "diameter", "of", "the", "aperture", "of", "the", "lymphatic", "lacunae", "will", "persist", "longer", "in", "the", "peritoneal", "cavity", ";", "those", "inferior", "in", "size", "will", "be", "predominantly", "cleared", "via", "the", "lacunar", "route", ",", "while", "the", "very", "small", "ones", "(", "nm", "range", ")", "will", "be", "mostly", "drained", "by", "blood", "vessels", "." ] } ]
PMC11402217
Figure 6XD23’s role in WNT/β-Catenin activation in vivo(A) TUNEL staining of OS tissue slices from each mouse groups.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "6XD23", "’s", "role", "in", "WNT/β-Catenin", "activation", "in", "vivo(A", ")", "TUNEL", "staining", "of", "OS", "tissue", "slices", "from", "each", "mouse", "groups", "." ] } ]
PMC11713609
Representative phase-contrast SYTOX staining images after TBH treatment for 8 h. Scale bar, 100 µm. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Representative", "phase-contrast", "SYTOX", "staining", "images", "after", "TBH", "treatment", "for", "8", "h.", "Scale", "bar", ",", "100", "µm", ".", "(" ] } ]
PMC11718109
Fluorescent image is merged on TEM image (bottom left, right).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fluorescent", "image", "is", "merged", "on", "TEM", "image", "(", "bottom", "left", ",", "right", ")", "." ] } ]
PMC7917457
B16.F10.9/K1 melanoma is a derivative of a highly metastatic, low major histocompatibility complex (MHC) class I-expressing B16.F10.9 melanoma that was transfected with MHC class I H-2Kb genes to generate H-2Kb-expressing clone K1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B16.F10.9/K1", "melanoma", "is", "a", "derivative", "of", "a", "highly", "metastatic", ",", "low", "major", "histocompatibility", "complex", "(", "MHC", ")", "class", "I-expressing", "B16.F10.9", "melanoma", "that", "was", "transfected", "with", "MHC", "class", "I", "H-2Kb", "genes", "to", "generate", "H-2Kb-expressing", "clone", "K1", "." ] } ]
PMC9429973
The circulating M1 proinflammatory macrophages (iNOS high /CD163 low/CD14+) and M2 antiinflammatory (iNOSlow/CD163high /CD14-) were analyzed by cytofluorimetry.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "circulating", "M1", "proinflammatory", "macrophages", "(", "iNOS", "high", "/CD163", "low/CD14", "+", ")", "and", "M2", "antiinflammatory", "(", "iNOSlow/CD163high", "/CD14-", ")", "were", "analyzed", "by", "cytofluorimetry", "." ] } ]
PMC11575040
F, G Inhibition of colony formation ability in A2058 and A375 cells after LINC00094 knockdown.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "F", ",", "G", "Inhibition", "of", "colony", "formation", "ability", "in", "A2058", "and", "A375", "cells", "after", "LINC00094", "knockdown", "." ] } ]
PMC10976516
Macrophages in the liver and spleen eliminate OVs. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Macrophages", "in", "the", "liver", "and", "spleen", "eliminate", "OVs", ".", "(" ] } ]
PMC4839679
Polybromo-1 is the second most commonly mutated gene in ccRCC, with mutation rates at ~40% [5–9].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Polybromo-1", "is", "the", "second", "most", "commonly", "mutated", "gene", "in", "ccRCC", ",", "with", "mutation", "rates", "at", "~40", "%", "[", "5–9", "]", "." ] } ]
PMC11394112
However, it raises another question whether human IL6 alone is sufficient for the homing of human DLBCL cells in immune-deficient mice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "it", "raises", "another", "question", "whether", "human", "IL6", "alone", "is", "sufficient", "for", "the", "homing", "of", "human", "DLBCL", "cells", "in", "immune-deficient", "mice", "." ] } ]
PMC10823017
For two decades, various strategies have been devised to address the VHL insufficiency due to genetic mutation that results in constitutive stabilization of hypoxia-inducible factor (HIF)-1α and HIF-2α (3).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "two", "decades", ",", "various", "strategies", "have", "been", "devised", "to", "address", "the", "VHL", "insufficiency", "due", "to", "genetic", "mutation", "that", "results", "in", "constitutive", "stabilization", "of", "hypoxia-inducible", "factor", "(HIF)-1α", "and", "HIF-2α", "(", "3", ")", "." ] } ]
PMC11678841
In this context, GA deserves further investigation as a possible co-adjuvant of anti-fungal therapy to lessen C. albicans-induced pro-inflammatory activation and to help restore epithelial homeostasis after fungal infection.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "context", ",", "GA", "deserves", "further", "investigation", "as", "a", "possible", "co-adjuvant", "of", "anti-fungal", "therapy", "to", "lessen", "C.", "albicans-induced", "pro-inflammatory", "activation", "and", "to", "help", "restore", "epithelial", "homeostasis", "after", "fungal", "infection", "." ] } ]
PMC11477621
The crude product was purified by silica gel chromatography to give the colorless oil 4g (677 mg, 77%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "crude", "product", "was", "purified", "by", "silica", "gel", "chromatography", "to", "give", "the", "colorless", "oil", "4", "g", "(", "677", "mg", ",", "77", "%", ")", "." ] } ]
PMC11792740
This review provided an overview of the mechanisms underlying T-cell depletion in tumors and discussed recent advances in clinical research related to T-cell immunotherapy for tumors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "review", "provided", "an", "overview", "of", "the", "mechanisms", "underlying", "T-cell", "depletion", "in", "tumors", "and", "discussed", "recent", "advances", "in", "clinical", "research", "related", "to", "T-cell", "immunotherapy", "for", "tumors", "." ] } ]
PMC10969097
HepG2 cells were treated with doses of 0.20 mM Trametes robiniophila Murr polysaccharides, 5.04 μM oxaliplatin, or 2.0 mM Trametes robiniophila Murr polysaccharides and 5.04 μM oxaliplatin.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HepG2", "cells", "were", "treated", "with", "doses", "of", "0.20", "mM", "Trametes", "robiniophila", "Murr", "polysaccharides", ",", "5.04", "μM", "oxaliplatin", ",", "or", "2.0", "mM", "Trametes", "robiniophila", "Murr", "polysaccharides", "and", "5.04", "μM", "oxaliplatin", "." ] } ]
PMC10092581
Error bars indicate SD.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Error", "bars", "indicate", "SD", "." ] } ]
PMC11541409
Combining these inhibitors with approved TKIs provide a possible strategy to overcome the drug-resistance phenotype, as they further block the leaked and reactivated pro-survival signals from oncoproteins or RTKs under non-covalent TKI adjuvant therapy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Combining", "these", "inhibitors", "with", "approved", "TKIs", "provide", "a", "possible", "strategy", "to", "overcome", "the", "drug-resistance", "phenotype", ",", "as", "they", "further", "block", "the", "leaked", "and", "reactivated", "pro-survival", "signals", "from", "oncoproteins", "or", "RTKs", "under", "non-covalent", "TKI", "adjuvant", "therapy", "." ] } ]
PMC9429973
C4d showed a significant (p = .01) ability to distinguish samples with significant terminal complement activation, implying engagement of the classical complement pathway.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C4d", "showed", "a", "significant", "(", "p", "=", ".01", ")", "ability", "to", "distinguish", "samples", "with", "significant", "terminal", "complement", "activation", ",", "implying", "engagement", "of", "the", "classical", "complement", "pathway", "." ] } ]
PMC5941560
Transgenic expression of INPP5D and SYK constructs has already generated breakthroughs in our understanding of their biological activities .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transgenic", "expression", "of", "INPP5D", "and", "SYK", "constructs", "has", "already", "generated", "breakthroughs", "in", "our", "understanding", "of", "their", "biological", "activities", "." ] } ]
PMC11402217
Wound healing assay demonstrating the inhibitory effect of XD23 (0.5 μM) on 143B cell migration and (C and C) the normalized wounding areas.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Wound", "healing", "assay", "demonstrating", "the", "inhibitory", "effect", "of", "XD23", "(", "0.5", "μM", ")", "on", "143B", "cell", "migration", "and", "(", "C", "and", "C", ")", "the", "normalized", "wounding", "areas", "." ] } ]
PMC11155445
The amidic C–N bond length was shorter than the normal C–N single bond.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "amidic", "C", "–", "N", "bond", "length", "was", "shorter", "than", "the", "normal", "C", "–", "N", "single", "bond", "." ] } ]
PMC10850553
All of the following experiments using animals, including animal care and use, complied with the National Institute of Health’s Guide for the Care and Use of Laboratory Animals and also followed the ARRIVE guidelines (https://arriveguidelines.org)) and were approved by the Institutional Animal Care and Use Committee of National Cerebral and Cardiovascular Center (Approval Number #19036, #20003, #20004, #21004, #21015, #22012, #22041) and of The Jikei University School of Medicine (Approval Number #2023-004, #2023-009).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "of", "the", "following", "experiments", "using", "animals", ",", "including", "animal", "care", "and", "use", ",", "complied", "with", "the", "National", "Institute", "of", "Health", "’s", "Guide", "for", "the", "Care", "and", "Use", "of", "Laboratory", "Animals", "and", "also", "followed", "the", "ARRIVE", "guidelines", "(", "https://arriveguidelines.org", ")", ")", "and", "were", "approved", "by", "the", "Institutional", "Animal", "Care", "and", "Use", "Committee", "of", "National", "Cerebral", "and", "Cardiovascular", "Center", "(", "Approval", "Number", "#", "19036", ",", "#", "20003", ",", "#", "20004", ",", "#", "21004", ",", "#", "21015", ",", "#", "22012", ",", "#", "22041", ")", "and", "of", "The", "Jikei", "University", "School", "of", "Medicine", "(", "Approval", "Number", "#", "2023", "-", "004", ",", "#", "2023", "-", "009", ")", "." ] } ]
PMC11225860
U2932 cells were treated synchronized with a double thymidine block over a two-day period.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "U2932", "cells", "were", "treated", "synchronized", "with", "a", "double", "thymidine", "block", "over", "a", "two-day", "period", "." ] } ]
PMC11697703
We show that miR-193b∼365 regulates MAPK8 signal, and decreased MAPK8 alters spine development in layer II-III neurons.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "show", "that", "miR-193b∼365", "regulates", "MAPK8", "signal", ",", "and", "decreased", "MAPK8", "alters", "spine", "development", "in", "layer", "II-III", "neurons", "." ] } ]
PMC9509578
Liu et al. evaluated the role of nanomicelles decorated with siRNA specific to silence the HIF-1α gene (siHIF) and doxorubicin in prostate cancer PC3 cells and in a xenograft mice model.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Liu", "et", "al.", "evaluated", "the", "role", "of", "nanomicelles", "decorated", "with", "siRNA", "specific", "to", "silence", "the", "HIF-1α", "gene", "(", "siHIF", ")", "and", "doxorubicin", "in", "prostate", "cancer", "PC3", "cells", "and", "in", "a", "xenograft", "mice", "model", "." ] } ]
PMC11252553
At 48 hours post-irradiation, the percentages are reduced to 13.15%, 15.96%, and 18.76% for doses of 4, 8, and 12 Gy, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "48", "hours", "post-irradiation", ",", "the", "percentages", "are", "reduced", "to", "13.15", "%", ",", "15.96", "%", ",", "and", "18.76", "%", "for", "doses", "of", "4", ",", "8", ",", "and", "12", "Gy", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11592837
On the day of venipuncture, whole blood samples of a healthy donor were collected using CPT BD Vacutainer (Becton Dickinson, Franklin Lakes, NJ, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "the", "day", "of", "venipuncture", ",", "whole", "blood", "samples", "of", "a", "healthy", "donor", "were", "collected", "using", "CPT", "BD", "Vacutainer", "(", "Becton", "Dickinson", ",", "Franklin", "Lakes", ",", "NJ", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11720107
To date, it has been reported that in rats, after 2 weeks on a diet containing 2% garlic, a decrease in Cat mRNA and CAT protein expression was observed in the kidney and liver .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "date", ",", "it", "has", "been", "reported", "that", "in", "rats", ",", "after", "2", "weeks", "on", "a", "diet", "containing", "2", "%", "garlic", ",", "a", "decrease", "in", "Cat", "mRNA", "and", "CAT", "protein", "expression", "was", "observed", "in", "the", "kidney", "and", "liver", "." ] } ]
PMC11286266
Additionally, the introduction of the reporter systems did not affect basal BiP protein levels when compared with plain CHO-K1 cells (Figure 1—figure supplement 1C). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "the", "introduction", "of", "the", "reporter", "systems", "did", "not", "affect", "basal", "BiP", "protein", "levels", "when", "compared", "with", "plain", "CHO-K1", "cells", "(", "Figure", "1—figure", "supplement", "1C", ")", ".", "(" ] } ]
PMC11389534
However, the roles of many other unconventional UBLs in immune responses have yet to be fully elucidated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "roles", "of", "many", "other", "unconventional", "UBLs", "in", "immune", "responses", "have", "yet", "to", "be", "fully", "elucidated", "." ] } ]
PMC7553912
RTECs and renal fibroblasts were isolated from the kidney of C57BL/6 J mice on day 3.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RTECs", "and", "renal", "fibroblasts", "were", "isolated", "from", "the", "kidney", "of", "C57BL/6", "J", "mice", "on", "day", "3", "." ] } ]
PMC9250505
A HR reporter assay demonstrated that NPB treatment suppressed HR efficiency both in BRCA wild-type (CAOV2) and BRCA mutant (AFC) EOC cells (Supplementary Fig. 5G).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "HR", "reporter", "assay", "demonstrated", "that", "NPB", "treatment", "suppressed", "HR", "efficiency", "both", "in", "BRCA", "wild-type", "(", "CAOV2", ")", "and", "BRCA", "mutant", "(", "AFC", ")", "EOC", "cells", "(", "Supplementary", "Fig.", "5", "G", ")", "." ] } ]
PMC11531744
The cell types annotated by marker genes. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cell", "types", "annotated", "by", "marker", "genes", ".", "(" ] } ]
PMC11075223
Firstly, Cimicifuga species are rich in resources, but it also brings the phenomenon of mixed use and misuse among the same genus .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Firstly", ",", "Cimicifuga", "species", "are", "rich", "in", "resources", ",", "but", "it", "also", "brings", "the", "phenomenon", "of", "mixed", "use", "and", "misuse", "among", "the", "same", "genus", "." ] } ]
PMC11252553
Annexin V-FITC and PI (5 and 10 µL) were added to each cell suspension.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Annexin", "V-FITC", "and", "PI", "(", "5", "and", "10", "µL", ")", "were", "added", "to", "each", "cell", "suspension", "." ] } ]
PMC6034753
The pulldown assays were performed both ways. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "pulldown", "assays", "were", "performed", "both", "ways", ".", "(" ] } ]
PMC11473750
We have complied with all relevant ethical regulations for animal use.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "have", "complied", "with", "all", "relevant", "ethical", "regulations", "for", "animal", "use", "." ] } ]
PMC11679326
Notably, the carbohydrate epitope A2G2F plays an important role in the metastasis of B16 melanoma cancer cells and the formation of pulmonary metastatic nodules, suggesting that the expression of the A2G2F glycan by glioma cells may influence their metastatic potential .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Notably", ",", "the", "carbohydrate", "epitope", "A2G2F", "plays", "an", "important", "role", "in", "the", "metastasis", "of", "B16", "melanoma", "cancer", "cells", "and", "the", "formation", "of", "pulmonary", "metastatic", "nodules", ",", "suggesting", "that", "the", "expression", "of", "the", "A2G2F", "glycan", "by", "glioma", "cells", "may", "influence", "their", "metastatic", "potential", "." ] } ]
PMC7351993
Among the PDs in the array, 24 PDs in the middle are used to produce a series of one-dimensional (1D) SRS lines at a line rate of 48 kHz (21 µs line).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "the", "PDs", "in", "the", "array", ",", "24", "PDs", "in", "the", "middle", "are", "used", "to", "produce", "a", "series", "of", "one-dimensional", "(", "1D", ")", "SRS", "lines", "at", "a", "line", "rate", "of", "48", "kHz", "(", "21", "µs", "line", ")", "." ] } ]
PMC10900886
Production of progeny viruses (~2–3 logarithmic increase of TCID50/mL within 24 h) was detected after inoculation with all three viruses, in which EV-D68/B2 and EV-D68/A2 replicated faster than EV-D68/A, albeit without any statistical differences (Fig. 2B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Production", "of", "progeny", "viruses", "(", "~2–3", "logarithmic", "increase", "of", "TCID50/mL", "within", "24", "h", ")", "was", "detected", "after", "inoculation", "with", "all", "three", "viruses", ",", "in", "which", "EV-D68/B2", "and", "EV-D68/A2", "replicated", "faster", "than", "EV-D68/A", ",", "albeit", "without", "any", "statistical", "differences", "(", "Fig.", "2B", ")", "." ] } ]
PMC11802929
Created in BioRender.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Created", "in", "BioRender", "." ] } ]
PMC11599565
Some markers were not detected (red triangles): NeuroN, SOX2 in normal cells and CD24 and EpCAM in “twin” cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Some", "markers", "were", "not", "detected", "(", "red", "triangles", "):", "NeuroN", ",", "SOX2", "in", "normal", "cells", "and", "CD24", "and", "EpCAM", "in", "“", "twin", "”", "cells", "." ] } ]
PMC10988555
Figure S16 shows a representation of the DNA damage (“comets”) of A2780 cells in the presence of 0.1% DMSO, 0.05% H2O2 (positive control), and 10× IC50 concentrations of complexes 2–4.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "S16", "shows", "a", "representation", "of", "the", "DNA", "damage", "(", "“", "comets", "”", ")", "of", "A2780", "cells", "in", "the", "presence", "of", "0.1", "%", "DMSO", ",", "0.05", "%", "H2O2", "(", "positive", "control", ")", ",", "and", "10", "×", "IC50", "concentrations", "of", "complexes", "2–4", "." ] } ]
PMC7215722
The biosynthetic labeling shows that the conversion of DPPIV to a complex glycosylated mature form is altered by DSS treatment (Figure 4B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "biosynthetic", "labeling", "shows", "that", "the", "conversion", "of", "DPPIV", "to", "a", "complex", "glycosylated", "mature", "form", "is", "altered", "by", "DSS", "treatment", "(", "Figure", "4B", ")", "." ] } ]
PMC11351758
The NARP cells harbor 98% of mitochondrial DNA T8993G mutations, and 143B osteosarcoma cell lines were the parental normal cells used for comparison.
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "NARP", "cells", "harbor", "98", "%", "of", "mitochondrial", "DNA", "T8993", "G", "mutations", ",", "and", "143B", "osteosarcoma", "cell", "lines", "were", "the", "parental", "normal", "cells", "used", "for", "comparison", "." ] } ]
PMC9817179
For PFA fixation, because its rate is sensitively dependent on the amino acid sequence of POI, the structure of POI, and POI’s cross-linked partners (Hoffman et al., 2015; Kamps et al., 2019; Metz et al., 2006; Metz et al., 2004), POI in different states likely has different PFA fixation rates regardless of the type of interaction it undergoes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "PFA", "fixation", ",", "because", "its", "rate", "is", "sensitively", "dependent", "on", "the", "amino", "acid", "sequence", "of", "POI", ",", "the", "structure", "of", "POI", ",", "and", "POI", "’s", "cross-linked", "partners", "(", "Hoffman", "et", "al.", ",", "2015", ";", "Kamps", "et", "al.", ",", "2019", ";", "Metz", "et", "al.", ",", "2006", ";", "Metz", "et", "al.", ",", "2004", ")", ",", "POI", "in", "different", "states", "likely", "has", "different", "PFA", "fixation", "rates", "regardless", "of", "the", "type", "of", "interaction", "it", "undergoes", "." ] } ]
PMC8973725
Different expression of ZNF677 in ccRCC based on individual cancer stages. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Different", "expression", "of", "ZNF677", "in", "ccRCC", "based", "on", "individual", "cancer", "stages", ".", "(" ] } ]
PMC10772747
In the analysis of the PPI network, it was found that 23 compound target genes in EBE are involved in biological processes of breast cancer, including SIRT1, TP53, CASP3, BCL2, ESR1, VEGFA, BAX, NQO2, JUN, MMP9, BIRC5, CDKN1A, NOS2, MAPK1, BCL2L1, CASP9, STAT3, CCND1, PIK3CG, NOS3, TNFSF10, PTGS2, CYCS (Table 2).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "analysis", "of", "the", "PPI", "network", ",", "it", "was", "found", "that", "23", "compound", "target", "genes", "in", "EBE", "are", "involved", "in", "biological", "processes", "of", "breast", "cancer", ",", "including", "SIRT1", ",", "TP53", ",", "CASP3", ",", "BCL2", ",", "ESR1", ",", "VEGFA", ",", "BAX", ",", "NQO2", ",", "JUN", ",", "MMP9", ",", "BIRC5", ",", "CDKN1A", ",", "NOS2", ",", "MAPK1", ",", "BCL2L1", ",", "CASP9", ",", "STAT3", ",", "CCND1", ",", "PIK3CG", ",", "NOS3", ",", "TNFSF10", ",", "PTGS2", ",", "CYCS", "(", "Table", "2", ")", "." ] } ]
PMC10452486
The IFN-γ-treated cells were suspended in a medium containing S-methionine and immunoprecipitated with the above mAbs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "IFN-γ-treated", "cells", "were", "suspended", "in", "a", "medium", "containing", "S-methionine", "and", "immunoprecipitated", "with", "the", "above", "mAbs", "." ] } ]
PMC11653533
While water and ethanolic extracts of F. auriculata leaves obtained by ultrasound appeared to have awesome antioxidant action with IC50 esteem of 182.87 ± 2.32a (for young leaves extracts) and 153.77 ± 1.48a (for mature leaves extracts) by free radical 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) radical scavenging test using gallic acid.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "water", "and", "ethanolic", "extracts", "of", "F.", "auriculata", "leaves", "obtained", "by", "ultrasound", "appeared", "to", "have", "awesome", "antioxidant", "action", "with", "IC50", "esteem", "of", "182.87", "±", "2.32a", "(", "for", "young", "leaves", "extracts", ")", "and", "153.77", "±", "1.48a", "(", "for", "mature", "leaves", "extracts", ")", "by", "free", "radical", "2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl", "(", "DPPH", ")", "radical", "scavenging", "test", "using", "gallic", "acid", "." ] } ]
PMC11594588
Its production can be increased in response to the accumulation of free Cu and Fe ions in tissues (mainly in the liver), which is known to occur in some procancerogenic diseases, Wilson disease, and primary hemochromatosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Its", "production", "can", "be", "increased", "in", "response", "to", "the", "accumulation", "of", "free", "Cu", "and", "Fe", "ions", "in", "tissues", "(", "mainly", "in", "the", "liver", ")", ",", "which", "is", "known", "to", "occur", "in", "some", "procancerogenic", "diseases", ",", "Wilson", "disease", ",", "and", "primary", "hemochromatosis", "." ] } ]
PMC7759933
The expression of TOP2α is cell cycle-dependent and encodes DNA topoisomerase, which is an enzyme that controls and alters the topologic states of DNA during transcription .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "expression", "of", "TOP2α", "is", "cell", "cycle-dependent", "and", "encodes", "DNA", "topoisomerase", ",", "which", "is", "an", "enzyme", "that", "controls", "and", "alters", "the", "topologic", "states", "of", "DNA", "during", "transcription", "." ] } ]
PMC6642070
Effect of dichloroacetate (DCA, 10 mM) on fluvastatin-induced lactate production in muscle cells (n = 3). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Effect", "of", "dichloroacetate", "(", "DCA", ",", "10", "mM", ")", "on", "fluvastatin-induced", "lactate", "production", "in", "muscle", "cells", "(", "n", "=", "3", ")", ".", "(" ] } ]
PMC10588957
These findings support the notion that allicin may represent a potential therapeutic candidate for treating HCC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "findings", "support", "the", "notion", "that", "allicin", "may", "represent", "a", "potential", "therapeutic", "candidate", "for", "treating", "HCC", "." ] } ]
PMC11128598
However, the persistent challenges of treatment resistance and the limited therapeutic arsenal available for specific cancer types still make research in new therapeutic strategies an urgent need.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "persistent", "challenges", "of", "treatment", "resistance", "and", "the", "limited", "therapeutic", "arsenal", "available", "for", "specific", "cancer", "types", "still", "make", "research", "in", "new", "therapeutic", "strategies", "an", "urgent", "need", "." ] } ]
PMC11638255
Fig. 8a–c).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "8a", "–", "c", ")", "." ] } ]
PMC10114490
We measured by RT-qPCR the mRNA levels of selected hepatocyte gene markers comprising immature/embryonic (ALB, PYGL, GLUL, PHKA2, HGD, GLS2, TAT and SERPINA1) and mature/adult hepatocytes (HPD, CYP3A4, GYS2, CYP2B6 and CYP2E1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "measured", "by", "RT-qPCR", "the", "mRNA", "levels", "of", "selected", "hepatocyte", "gene", "markers", "comprising", "immature/embryonic", "(", "ALB", ",", "PYGL", ",", "GLUL", ",", "PHKA2", ",", "HGD", ",", "GLS2", ",", "TAT", "and", "SERPINA1", ")", "and", "mature/adult", "hepatocytes", "(", "HPD", ",", "CYP3A4", ",", "GYS2", ",", "CYP2B6", "and", "CYP2E1", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Results: For ABL1 mRNA amplification primers flanking 2 gene introns were designed (see Table 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "For", "ABL1", "mRNA", "amplification", "primers", "flanking", "2", "gene", "introns", "were", "designed", "(", "see", "Table", "1", ")", "." ] } ]
PMC11528603
Therefore, this finding indicated that SA-EA also restricted cell proliferation through lowering PCNA expression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "this", "finding", "indicated", "that", "SA-EA", "also", "restricted", "cell", "proliferation", "through", "lowering", "PCNA", "expression", "." ] } ]
PMC9545474
Cells were incubated for 24 h at 37 °C and a 5 % CO2 humidified atmosphere.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "incubated", "for", "24", "h", "at", "37", "°", "C", "and", "a", "5", "%", "CO2", "humidified", "atmosphere", "." ] } ]
PMC11742670
Cancer is one of the most serious healthcare crises affecting humanity, as well as one of the most difficult tasks for scientists working on novel treatments or developing old ones with fewer adverse effects.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cancer", "is", "one", "of", "the", "most", "serious", "healthcare", "crises", "affecting", "humanity", ",", "as", "well", "as", "one", "of", "the", "most", "difficult", "tasks", "for", "scientists", "working", "on", "novel", "treatments", "or", "developing", "old", "ones", "with", "fewer", "adverse", "effects", "." ] } ]
PMC11476222
Percent recovery and the number of identified sphingolipids were used to evaluate the analytical merits of these methods.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Percent", "recovery", "and", "the", "number", "of", "identified", "sphingolipids", "were", "used", "to", "evaluate", "the", "analytical", "merits", "of", "these", "methods", "." ] } ]
PMC6337547
Based on the biosynthesis pathway of phenolic acids, flavonoids are known to be produced through the phenylpropanoid pathway .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Based", "on", "the", "biosynthesis", "pathway", "of", "phenolic", "acids", ",", "flavonoids", "are", "known", "to", "be", "produced", "through", "the", "phenylpropanoid", "pathway", "." ] } ]
PMC9429973
All cases showed a proliferation rate above 80%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "cases", "showed", "a", "proliferation", "rate", "above", "80", "%", "." ] } ]
PMC9429973
Majority of patients (10/11) were heavily pretreated with an Eastern Cooperative Oncology Group score of 2-3, whereas no early mortality (death within 90 days of therapy initiation) was recorded and disease relapse was the only cause of death.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Majority", "of", "patients", "(", "10/11", ")", "were", "heavily", "pretreated", "with", "an", "Eastern", "Cooperative", "Oncology", "Group", "score", "of", "2", "-", "3", ",", "whereas", "no", "early", "mortality", "(", "death", "within", "90", "days", "of", "therapy", "initiation", ")", "was", "recorded", "and", "disease", "relapse", "was", "the", "only", "cause", "of", "death", "." ] } ]