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OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

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1
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ner
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PMC11394112
We observed DLBCL cell infiltration and growth as early as two weeks post-injection, significantly faster than the MISTRG6 model .
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PMC11697065
Any missing values remained at zero.
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PMC9429973
Of the 457 pts with response assessed, 343 pts (75.1%) achieved ORR in the line of therapy (LOT) with BTKi-based regimen.
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PMC9412887
However, active targeting nanomedicines can achieve this goal regardless of particle size.
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PMC8864075
Statistical differences were determined by a two-sided Student’s t-test; Compared with 0 μg/μl TFAE. ***
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PMC9429973
Plasma concentrations of Clifutinib increased with increasing dose, with tmax between 2 and 6 hours.
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PMC10955424
RJY13 induced resistance was determined using cPARP immunoblotting (A).
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PMC9429973
Despite this heterogeneity in response, 59 unique compounds were identified with broad anti-leukemic activity; that is, “hits” in 4/7 PDX samples.
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PMC9454852
To examine the effect of the BOLD-100 on mitochondrial membrane integrity loss, calcein-AM cobalt (CoCl2) assay was performed.
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PMC9428827
non significant.
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PMC9429973
Out of total, 15(83%) had no addiction and 12 (67%) were from lower socioeconomic status.
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PMC11727145
Indeed, this element provides insights into local tissue damage and wound depth through analysis of cellular components, which aid in wound diagnosis .
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PMC11724582
Finally, qPCR and Western blot analyses were used to explore the signaling pathways by which CAFs induce resistance to almonertinib in NSCLC cells.
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PMC11194678
Untransfected cells were treated with 100 nM rapamycin.
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PMC9429973
Adverse events (AEs) most frequently reported by physicians were hematological (76.1%), general (73.9%) and gastrointestinal symptoms (59.9%) and infections (43.7%).
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PMC9429973
Results: We found that during ATO-induced apoptosis, the mitochondrial abundance of surviving cells increased, the mitochondrial division gene Drp1 was up-regulated, and the expression of mitochondrial fusion genes Opa1, Mfn1, and Mfn2 was down-regulated.
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PMC8140214
Similarly, Cordero-Herrera et al. used different D-glucose concentrations ranging from 20-60 mM for 24 hr, to assess hyperglycemia effects in human HepG2 cells (Cordero-Herrera et al., 2014 ▶).
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PMC9919300
The accumulation of TAG in the hepatocytes alters the redox-dependent mechanisms which play part in the development of steatosis .
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PMC11723947
Cryovials containing 20 × 10 PBMC were transferred at -80 °C at a cooling rate kept at 0.2–1 °C/minute using a cryopreservation module (StrataCooler Cryo Preservation Module, Agilent Technologies) and, after 24 to 96 h, transferred to liquid nitrogen.
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PMC11513011
After 24 h under conditions of 37ºC, 5% CO2, 10 nM DIB and DMSO at the same concentration were added.
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PMC9429973
Results: We observed no difference in anti-S and anti-N antibody titers between convalescent healthy controls and HSCT recipients (Figure 1A).
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PMC9429973
of Emergency and Organ Transplantation, University of Bari, Bari, Italy; Division of Hematology, Stanford Cancer Institute, Stanford University School of Medicine, Stanford, California, United States of America; Hematology, ASST Grande Ospedale Metropolitano Niguarda, Milan; Hematology, San Bortolo Hospital, Vicenza, Italy; Haematology Directorate, SA Pathology, Royal Adelaide Hospital and Flinders Medical Centre, Adelaide, Australia; Laboratory of Cytogenetics and Molecular Biology, Ospedale di Circolo, ASST Sette Laghi, Varese, Italy Background: Polycythemia vera (PV) and essential thrombocythemia (ET) are myeloproliferative neoplasms evolving to post-PV (PPV-) and post-ET (PET-) myelofibrosis (MF), called secondary MF (SMF).
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PMC11459296
To prevent potential variabilities due to sex of the mice, a total of 39 mice were used, comprising 19 females and 20 males.
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PMC11489351
B, TF analysis was performed (see Methods) to identify TFs with pH-independent expression but whose downstream targets are pH-sensitive.
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PMC11661040
The expression level of CGREF1 in various cancers was analyzed using data from the TIMER database. (
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PMC11594074
The optimal binding pose of this compound formed hydrogen bonds with different residues than those found for the control ligand SAH, indicating less favorable binding interactions (Table 3).
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PMC11754291
Direct blue light irradiation on melanocytes also increased pigmentation without significant cellular damage.
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Data were reported as mean ± standard deviation of three independent experiments.
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PMC11653533
Nutraceuticals are foods artificially altered to improve their nutritional value or medicinal properties; herbal medicines, on the other hand, result from centuries of traditional medicine practiced by Indigenous peoples.
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PMC9429973
The GVL effect after T-cell depleted haplo-identical SCT is mostly related to natural killer cell alloreactivity in patients with acute myeloid leukemia but not in ALL.
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PMC11257203
Data represent the mean ± SD of three separate experiments. **
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PMC8097906
P values: *** P < 0.001; ** P < 0.01; * P < 0.05 were considered statistically as significant.
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PMC11618052
The enzyme test showed that the five hybrids tested strongly blocked BRAF, with IC50 values ranging from 47 to 69 nM, as shown in Table 2.
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PMC8658661
As noted above, one of the key features of HB due to the exon 3 mutation CTNNB1 gene is a violation of the Wnt/β-catenin signaling pathway .
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PMC4277423
Recently, Cho et al. showed high frequencies of indels within CCR5 of the K562 cell line co-transfected with DNA plasmids encoding Cas9 and 2 of 28 CCR5 sgRNAs, but no indels at any of potential off-target sites to these 2 CCR5 sgRNAs .
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PMC9429973
E. Mondesert, M. GIANSILY-BLAIZOT, J. DELAGE, F. DANTON, P. AGUILAR-MARTINEZ Biological Haematology Department, CHU de Montpellier; Service d’hématologie clinique, Clinique du Parc, Montpellier, France Background: Beta-thalassemias result from defects in the production of beta globin chains.
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PMC11640419
The MDM2 protein has been demonstrated to exert a negative regulatory effect on the p53 tumor suppressor protein.
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PMC11708541
When tested on intracellular amastigotes, the IC50 values were found to be 14.4 μM for compound 39a and 27.1 μM for complex 39b.
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Negative Control; 7.
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PMC11593031
The presence of repetitive (likely satellite) DNA in all sub-bands A1 of murine chromosomes is illustrated in Figure 5 and Figure S1.
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A 5-compound combination is then deconvoluted into 10 pairwise combinations and 10 triple combinations, to identify a more clinically feasible combination for each patient.
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PMC9429973
Next generation sequencing (NGS) is rapidly replacing conventional Sanger sequencing approaches in the molecular diagnosis of patients with DBA and other inherited bone marrow failure syndromes.
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PMC10125312
Employing the appropriate controls when studying nanoparticle toxicity is important for the compatibility and efficacy of the therapy.
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PMC10376064
In addition, we explored potential options for the (in)effectiveness of DMF, which are presented in the current work.
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PMC7369657
The expression of protein Bcl-2 was significantly lower, and Bax was significantly higher in 143B cell line treated with CQDs compared with the control group.
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PMC11657744
Immunofluorescence analysis of Aurora A localization into the basal body in Cep89 or Fbf1 depleted NIH3T3 cells.
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PMC11451940
for C40H34CuN2O6·(H2O) (Mr = 720.3): C 66.7, H 5.0, N 3.9.
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Lipoic acid supplementation reduces oxidative stress by preventing lipid peroxidation .
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Compartmentalization of the cytoplasm into organelles enclosed by a semipermeable barrier is a hallmark of eukaryotic life.
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PMC10587429
VECTASHIELD antifade mounting medium (H-1200-10, Vector laboratories, Costa Mesa, CA).
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PMC11705862
All experiments were performed in at least three independent repeats.
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One of the most studied MC activity mechanisms is the suppression of serine/threonine protein phosphatases (PP1/PP2A) by interacting via their catalytic components .
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PMC9784246
Under these circumstances, which are exacerbated by the absence of a prophylactic vaccine and/or safe, affordable treatment, an in vitro anti-L. major assay of leaf extracts of C. macrocarpa against promastigotes and axenic amastigotes was performed in this research.
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Renal cancer cells lacking the VHL gene can form normal-sized tumors in nude mice, and the tumors formed after the introduction of wild-type VHL genes become significantly smaller, and even do not form tumors.
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A freshly conducted stability test for this study is described in Figure S4.
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Due to its definite clinical efficacy, Cimicifugae Rhizoma has gained widespread attention in phytochemistry and pharmacology.
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Here, we summarize the relevance of DUBs in ovarian carcinoma and provide insights into future challenges for the treatment of this disease.
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Image: Summary/Conclusion: In the updated analysis of the D-ALBA trial and the ancillary GIMEMA LAL2217 study, with a median OS of 40 months, we confirm the reported very favorable outcome.
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PMC11628309
For instance, VMAT2 deficient animals experience dramatic dopamine depletion, progressive loss of dopamine neurons, and α-synuclein accumulation (Bridi and Hirth, 2018; Taylor et al., 2011).
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PMC6461034
Figure 2 displays, per cell line, a row of bar graphs with the top 20 kinases for each of the four basic analyses (kinome, activation loop, PhosphoSitePlus, and NetworKIN) as well as the combined score analysis (INKA).
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A direct comparison with the Trans-SILAC method will certainly shed some light on this issue.
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RNA samples were treated with TURBO DNase (Thermo Fisher Scientific), and converted to complementary DNA using oligod(T) primers and Superscript II reverse transcriptase (Invitrogen).
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The mRNA and protein expression level of TGFBI in cisplatin-sensitive ovarian cancer cell line-A2780 and cisplatin-resistant ovarian cancer cell line-A2780/CDDP. (
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PMC8540611
Complexes based on AuNP14 were significantly different between sequences only for CEM-SS (82.7 ± 3.2% for rndRNA and 75.2 ± 2.9% for siBCL-xL).
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PMC11469524
Next to the removal of three (HBL-1) and two (OCI-LY3) links, both models required only two additional coefficients for their final best fit, suggesting that many insights from α-IgM-stimulated BL cells can be transferred to DLBCLs.
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By pulse SILAC experiments, we determined the proteins that are subjected to increased translation upon TLR stimulation, and to decreased translation upon FL3 treatment.
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We conclude that heparin interacted favorably with the BSA and BSA+ coatings.
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Its expression could be consistently observed also in human IA walls (Fig. 2C, Supplementary Fig. S1), but in some lesions the expression in endothelial cells was reduced presumably due to damage and loss of endothelial cells (Fig. 2C, Supplementary Fig. S1).
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Total mRNA was isolated from one T25 plate in the case of 2D and from a pool of 25 spheroids per sample in the case of 3D, using the TRIzol reagent.
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H. Representative images of hematoxylin and eosin (H&E) and Ki67 stained tumor sections for each dosing cohort.
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This reduction was consistent with a decrease in the primary lung tumor burden (Figure 13).
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The presence of electron-withdrawing NO2 group at the para position increases the acidity of the enol group and thus pKa1 decreases while that of pKa2 and pKa3 values increases slightly (Fig. 93).
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PMC5673060
Nodes represent each term and the connecting line their association; line thickness is number of overlapping proteins.
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PMC10142392
Where (v) and (l) are the molecular volume and the length of the solvophobic parts, respectively, and (a) is the optimal surface per molecule occupied by the solvophilic chains in the final assembly.
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PMC5839394
Autophagy is emerging as an important mediator of pathological responses and engages in cross-talk with ROS.
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PMC8806312
Then, an immune-related prognostic index was constructed.
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Silence of TP53INP1 reversed the effect of miR-3154 knockdown on proliferation and metastasis of glioblastoma cells.
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Perform the calculation below for all the ROIs (no. of ROIs = j), corresponding to varying cell positions across different time frames.
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PMC11301095
c, d are brain MRI images from day 7 showing shallower cerebral sulci, increased T2 FLAIR signal, and the formation of cerebellar tonsillar herniation.
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PMC11361748
Quantification of mean intensity of desmoplakin and E-cadherin was performed using CellProfiler.
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PMC11740207
CD36, a scavenger receptor, promotes AB phagocytosis by recognizing phosphatidylserine on its surface (Greenberg et al., 2006).
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PMC11201989
Protein samples were subjected to standard SDS-PAGE gels, transferred to immuno-blot PVDF membranes (Millipore, Burlington, MA, USA), blocked with 10% nonfat dry milk, and then incubated overnight at 4 °C with primary antibodies.
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PMC11063646
Andrographolide emulgels were prepared by a two-step process (Varma et al., 2014).
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However, apoptosis of MCF-7 cells was not observed after treatment with either equivalent concentrations of a regional US Mesquite honey or dextrose, the sugar that constitutes about 31% of honey .
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PMC6442998
Treatment with cilostazol or imatinib + cilostazol reduced nuclear YAP-ir in both cell lines.
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PMC11604015
These donor-derived fratricide-resistant CD7 CAR-T cells showed efficient antitumor activity in patients with R/R T-ALL, and 90% (n = 18) of patients achieved CR in their phase I clinical trial (NCT04689659).
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PMC11629143
MAb light and heavy chain mRNAs were significantly (p < 0.01) elevated in cells expressing dCas9‐p300, by 12.5‐fold and 3.9‐fold respectively, compared to cells expressing dCas9 alone (Figure 2F).
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PMC10545062
Vasopressin (0.04 units/minute) was added as a NE adjunct to lessen the catecholamine-based vasopressor effects when NE doses exceeded 0.3 μg/kg/min and stopped when NE dose fell below 0.2 μg/kg/min.
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PMC8584319
Treatment of HepG2 cells with AZD8055 for 0.5–24 h led to a clear decrease in the phosphorylated form of 4E-BP1 at Ser65 (p-4E-BP1) at 2 h; phosphorylated 4E-BP1 almost disappeared thereafter (Figure 3b).
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PMC8753818
Cells were incubated for 24, 48, 72 and 96 h and after that doubling time of cells was identified by using cell counter.
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PMC11787381
Day 5: Test session: the platform was removed.
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PMC11301242
Detailed description and protocols for running AA were provided in the documentation.
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PMC11568601
Additionally, IRE1 can activate its downstream apoptotic-signaling kinase 1 (ASK1), which subsequently induces Jun-N-terminal kinase (JNK) and p38 mitogen-activated protein kinase (p38 MAPK), leading to the activation of CHOP .
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PMC11464982
Based on data provided on thermostability (see Section 3.3.1), it is expected that the food enzyme is inactivated during processing of yeast and yeast products.
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PMC8414691
In fixed HeLa cell preparations, we categorized and quantified six classes of cell division defects (Fig. 3A–G and Table 1): multipolar spindles (MS) at pro-metaphase and metaphase (Fig. 3B), chromosome misalignments (CM) and altered spindle morphology (ASM) at metaphase (Fig. 3C), chromatin bridges (CB) at anaphase and telophase (Fig. 3D), long thin intercellular bridges (LIB) at the last stage of telophase (Fig. 3E), and multinucleated cells (MC) (Fig. 3F).
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PMC11592008
Importantly, we detected cleaved caspase-3 in the lysates of all UVB-irradiated keratinocyte cell lines.
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PMC11723947
In contrast, when naive Tconv are co-injected with bone marrow, the semi-allogeneic cells are fully eliminated and the retained syngeneic bone marrow allows the survival of the host (Fig. 1b, c).
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PMC9429973
A total of 115patients (60 males), median aged 5.77 years, median follow-up time was 45 months, were enrolled in this study.
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PMC9429973
Summary/Conclusion: We found no difference in tumor size reduction between two groups.
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