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BioData-CellLine_annotated

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PMC11320834
Fig. 3Dose–response matrixes of proliferation inhibition after 72 h single or combination treatment with TLLs and OLLs.
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PMC9429973
Methods: Adult pts (≥18 years) with R/R MCL underwent leukapheresis and conditioning chemotherapy followed by a single infusion of KTE-X19.
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PMC9031474
It is overexpressed in different cancer cell lines and attracts increasing attention in cancer-related processes .
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PMC11127909
Fluorescence (505/535 nm) was recorded by a VarioskanLUX instrument (Thermo Scientific, USA).
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PMC11128598
Due to the inhibition of DSB repair, NHEJ inhibitors (NHEJi) have been shown to increase the cytotoxicity of several genotoxic drugs or radiotherapy in different cancer types (36–41).
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PMC11411131
Under Chx treatment, MeHg did not affect the full-length form of TrxR1 (Fig. 1D).
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PMC9739791
Thus, water was proposed as the reducing agent of the Pt(IV) complex 13, which was then proved by detecting OO oxygen above the solution of the complex in water enriched with H2O (Figure 10).
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PMC11695623
DCUN1D5-related genes are involved in 366 biological processes (GO-BP), 102 cellular components (GO-CC), 63 molecular functions (GO-MF) and 11 KEGG.
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PMC11291490
Statistical significance was assessed using an unpaired Student’s t-test.
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PMC10142392
Under inverse conditions, vesicles are formed.
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PMC11568601
The cells that did not receive TGT treatment were set as the control group.
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PMC11697703
I, J, M, and N) ANOVA-Tukey, p values are presented as follows; ∗p < 0.05, ∗∗p < 0.01.
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PMC9429973
CNS-IPI score was high in 12/18 (67%) of pts without CNS-prophylaxis, in 31/51 of pts (61%) with HD-MTX-containing prophylaxis, in 16/22 of pts (72%) with ETI (p>0,05).
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PMC11531744
qRT-PCR analysis for viral transcripts showed GBP1P1 was significantly reduced in sh-GBP1P1 W038 cells compared with sh-CTRL W038 cells (Fig. 8D).
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PMC10114490
Strategies based on the use of PSC-derived HLC are technically demanding and use expensive growth factors .
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PMC10887351
It should be underlined that the immune system modulation through the β-AR signaling supported the normal immune response in physiologic conditions; instead, in altered processes, the prolonged stimulation of SNS/CA/β-ARs may have damaging consequences where the constant stimulation of the adrenergic signaling could promote pathological processes, including cancer progression .
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PMC11745355
Agents selected based on DELFIA and ΔTm values were tested for Pin1 degradation in the pancreatic cancer cell line BxPC3.
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PMC11726848
The mechanism of cell death was studied by staining cells with AnnexinV-FITC (AnxV-FITC) and the nuclear dye propidium iodide (PI) using flow cytometry.
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PMC10587429
With careful design and optimization, our approach can be generalized to other human bone cancers. -
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PMC11785489
For each of the four T cell states of interest, we trained a convolutional neural network (CNN) to detect possibly nonlinear associations between TCR amino acid motifs and T cell fate (STAR Methods).
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PMC11638288
b NKp46 unknown ligands expressed by Fusobacterium nucleatum, microorganisms-infected cells, pancreatic beta cells, immature myeloid dendritic cell, and fibroblast-like synoviocytes.
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PMC11514418
The percentages of CD8+ T cells and serum INF-γ levels showed no statistically significant differences (P > 0.05), as shown in Table 3.
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PMC9964635
Figure 9 demonstrates 2D and 3D diagrams displaying the most suitable binding interactions between 7f and the active pocket of the kinase B protein.
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PMC8524093
It was believed that the presence of a packaging signal (PS) composed by structural RNA elements located in the nsP2 gene was the key element responsible for it (Kim et al., 2011).
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PMC10033453
In vitro, human sarcoma cell lines did not produce appreciable levels of IFNβ in response to viral infection.
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PMC11001582
It is also interesting that only polyGR but not polyPR mice showed this phenotype.
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PMC11489175
Peculiar of this family is the loop structure hiding the entrance of the active site that selects the substrates according to the size 20, 33.
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PMC6461034
Phosphopeptide data: Identified and quantified peptides are extracted from modificationSpecificPeptides table.
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PMC11699465
For this purpose, we performed a Cut&Tag assay and global sequencing to disclose its gene binding profile.
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PMC10988555
The SDS-PAGE was loaded with 20 ug of protein on 10% polyacrylamide gel and transferred to a 45 μm PVDF membrane (GE Healthcare).
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PMC11001582
Current in vivo and in vitro studies have identified common downstream molecular pathways that are dysregulated in C9ALS/FTD, including autophagy, nucleocytoplasmic transport, pre-messenger RNA splicing, stress granule dynamics, DNA damage repair, mitochondrial dysfunction, nuclear pore alterations and synaptic dysfunction.
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PMC11775197
Furthermore, the potential impact of combining PPAR modulators in patients with CRC merits investigation.
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PMC11279598
Oral gavage (0.1 mL volume) with 50% (w/v) Manuka honey or dextrose control was performed twice daily from days 1 to 28 and then once daily thereafter to day 42.
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PMC11711127
In 2019, Galazka et al. (169), studied the role of gene related to anergy in lymphocytes (GRAIL) induction in maintenance of T cell anergy.
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PMC11638288
Additionally, NKp46 expression can accelerate the progression of autoimmune diseases such as type 1 diabetes , systemic lupus erythematosus , rheumatoid arthritis , and colitis induced by congenital immune hyperactivation .
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PMC11742231
In this particular section, our initial focus will be on presenting an outline of the framework in its entirety, and this will be followed by a detailed description of each individual module included in it.
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PMC11766309
The results of GSEA-Reactome analysis of CESCs revealed that YKT6 functions in the endoplasmic reticulum–Golgi transport step and vesicular transport.
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PMC7452526
The formazan crystals formed by mitochondrial reduction of MTT were solubilized in 150 μL of DMSO (dimethyl sulphoxide) which was added to each well and mixed, then the absorbance at 540 nm was measured using the microplate reader (biotek-epoch).
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PMC11507371
Unless indicated otherwise, cells and media were directly treated with plasma for 30, 60, 90, 120, 150, or 180 s, respectively.
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PMC11092382
has been scientifically proven to possess potent antiarrhythmic effects (Hu et al., 2023) and to act as a natural KCNQ5 agonist (Manville et al., 2019).
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PMC7504302
Gene expression analysis of FGFRi-sensitive and FGFRi-resistant MPM cell lines revealed a remarkable correlation between elevated FGF9 mRNA expression and treatment response to PD-173074 and AZD4547.
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PMC9848491
For prognosis prediction in UCEC patients, the AUC of the risk score was 0.788, which was superior to age and grade ( Figure 3E ).
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One of the pivotal advantages of TIL therapy is that it offers a terminal treatment corroborated to be more potent in anti-tumor toxicity than those derived from peripheral blood lymphocytes .
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The procedure has been described previously (Kuramoto et al., 2022b).
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It was observed that the expression level of p‐ERK protein was upregulated by TMZ at higher concentrations.
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PMC11082662
SMPDL3B indirectly alters the homeostasis of the tumor microenvironment by influencing the biological behavior of tumor cells.
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These findings suggested the role of FAK/Src in coordinating Rac1, contributed to keratinocyte migration during wound-healing processes.
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PMC8662250
In parallel with this, cannabidiol also induced a significant reduction of condensed nuclei (−20%, −36%, −68% vs. SP 10 ng/ml group) (Figure 1b,c).
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PMC11394227
Two GSH molecules are dehydrogenated by sulfhydryl groups to form an oxidized glutathione (GSSG) molecule, thereby maintaining the intracellular redox balance through reversible redox reactions between GSH and GSSG.
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Edge weights are proportional to the interaction weight, and thicker edge line indicates a stronger signal. (
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A value of P < 0.05 was taken to indicate statistical significance.
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In recent years, researchers have made progress in CRC through continuous research.
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The impact of C-PC addition on the size and polydispersity of nanophytosomes using three different ratios from C-PC: lecithin (1:1, 1:2, and 1:3), respectively, was investigated.
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To gain molecular-level insights into native BSA-GAG interactions, we conducted computer simulations with model systems.
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b CCL2 expression in GIST882 cells stably expressing shcon or shp65 was analyzed by Western blotting.
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Two independent pathologists diagnosed HCC based on the World Health Organization criteria.
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Analysing the prognostic value of quantitative SUVmax, patients with SUVmax< 3,8 (28/58; 48%) presented better outcomes, with larger PFS (p < 0.001) and less HT (p= 0.004).
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This complexity arises because multiple non-canonical pathways can be activated by a ligand or receptor, with either inhibitory or stimulatory effects.
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Despite being highly resistant to conventional therapies, CML cells are sensitive to blocking the survival signal provided by BCR/Abl.
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The pathway analysis has also demonstrated lower arginine biosynthesis in Molt-4 in comparison to the other cell lines.
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Interestingly, ER stress in A-172 cells with SELENOT-KD altered ATF-4 and ATF-6 expression, and SeNP altered XBP1s expression (Figure 11b), which may be related to different signaling pathways activated by ER stress inducers.
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This study showed that different sarcoma histological subtypes are characterised by distinct proteomic profiles .
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Claudio D. Stern and Jane Dodd) for 5 hr.
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Patient-derived mouse xenograft (PDX) model.
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Moreover, fluorescence analysis of unloaded NPs (Figure 3C) confirmed that there were no interferences in the emission spectrum, as no fluorescence was found in the 800–850 nm emission wavelength range.
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Following the described chemical synthesis method, six hybrids of ≥95% purity were obtained with high yields (≥70%) based on the spectroscopic analysis.
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Amongst these, five genes had acquired high impact SNVs (PPP2R4, C9orf43, CTB-47B11.3, CYFIP2 and SGCD) in all progeny cell lines compared to the parental strain.
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100 µl of the chromogen TMB substrate solution was added to each well of samples and incubated for 15 min at R.T., away from the light.
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Cutting-edge therapies are focused on the reversion of exhausted state through immune checkpoint inhibition to recover the immune response against the tumor.
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The presence of neovascular capillary networks supplying tumors induces sluggish blood flow, resulting in transient hypoxia.
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We monitored median relative apoptosis (cPARP/GAPDH immunoblotting) levels in the presence and absence of JAK inhibitors (ruxolitinib or tofacitinib) and dasatinib.
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HLA-B* 3501 was likely an important risk factor for postmenopausal osteoporosis in a Chinese Han population .
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Short interfering RNAs (siRNAs) for STAT2 and IRF9 came from Bioneer, Republic of Korea.
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P < 0.05, **P < 0.01, ***P < 0.001, ****P < 0.0001.
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The cDNA was prepared by reverse transcription using the RevertAid First Strand cDNA synthesis kit (Thermo Scientific) and used as a template for RT-PCR (GoTaq qPCR Promega kit).
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PMC10297204
The invasion assay was conducted using a 24-well BD BioCoat invasion chamber (8-um pore size, 6.4 mm diameter).
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PMC10237474
Additionally, the batch-to-batch variation in expression level makes titers and yields unpredictable during large-scale production, particularly for low-expressing proteins.
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PMC8382973
In brief, the 2P23 gel was stored at 4°C, 25°C, 40°C, and 60°C for 1 to 24 weeks at 75% relative humidity (RH).
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PMC9780037
Its stability under high temperature, high pH, oxidative stress, and denaturants was also enhanced .
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Scale bar = 5 μm. *
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PMC9429973
Indeed, FTO deactivation was proved to render resistant leukemia cells sensitive to targeted agents, which suggests a potential combination therapy strategy of FB23-2.
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PMC7185206
Box plots and statistical data including p value versus control, mean, and 95% confidence intervals by unpaired Student’s t-test are shown. ***
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PMC5311252
Our data demonstrate that miRNAs with an AAGUGC motif in their seed sequence increase both cancer cell proliferation and sensitivity to EGFR inhibitors.
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PMC11742047
As shown in Fig. 3A,B, CBD was unable to increase caspase 3/7 activity in both cell lines tested.
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PMC11737091
Using the TCGA cohort and two datasets from GEO, we compared DBF4 expression levels between cancer and normal samples.
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PMC9786247
Different from NMI, strain Cb30/14, which was found to significantly up-regulate expression of IL-1β and TNF-α at 7 d p.i. (
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PMC5833712
Due to the ERβ-mediated loss of the ERα protein, presented data strongly support our notion that the growth inhibition by E2, in the presence of both ER subtypes, is mediated by ERβ.
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PMC10849234
Also, while a majority of the NLCs derived from both cell lines did show substantially increased surface localization of CD63 upon stimulation (Fig 1C and 1D), the percentage of cells with surface-expressed CD63 did not reach 100% (Fig 1F), suggesting heterogeneity for degranulation capabilities within the cell lines.
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PMC10047551
Notably, PD-L1 is also regulated on the post-transcriptional and post-translational levels, as exemplified by miRNAs regulating PD-L1 mRNA stability; chemokine-like-factor (CKLF)-like MARVEL transmembrane domain-containing proteins 4 and 6 (CMTM4 and CMTM6), regulating PD-L1 protein translocation at the cancer cell membrane; and various modifications regulating PD-L1 localization and stability .
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Fifty micrograms of protein was used in SDS-PAGE electrophoresis.
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PMC7081114
Univariate and multivariate analyses revealed KIF21B as an independent risk factor for overall survival and disease-free survival in patients with HCC after hepatectomy.
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PMC11637276
Future studies will focus on the mechanism regulating the trafficking of ECM to the lysosomes.
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PMC11628309
In this cell line, there are two converging cellular populations: one neuroblast-like cells adherent and a low proportion of epithelial-like cells (Lopez-Suarez et al., 2022).
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PMC9398137
Following antibodies were used: MCL1 (S-19, Santa Cruz Biotechnology, sc-819), BCL2 (C21, Santa Cruz Biotechnology, sc-783), isotype control immunoglobulin (rabbit polyclonal IgG, Calbiochem or Santa Cruz Biotechnology).
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PMC8164677
Total intracellular platinum contents were determined by graphite furnace AAS using a Varian SpectrAA-240 plus with GTA 120 atomic absorption spectrophotometer.
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Scale bar: 5 μm.
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PMC11607321
A total of 1523 cancer cell lines were profiled with each cell line having at least two of these datasets.
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PMC11354225
However, when red light is applied, ROS levels increase significantly in A-431 cells treated with MAL-PDT + EGCG (Figure 6C and Figure 7B,C).
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PMC9429973
Results: Between April 18, 2019, and June 24, 2021, 120 patients with BM EC <0.1% were randomly assigned for NAC (Group A, N=80) or nonprophylaxis (Group B, N=40), and 105 patients with EC≥0.1% (Group C) were also analyzed.
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PMC10522430
Cell apoptosis was determined using the Annexin V-PI biomarker and analyzed through flow cytometry.
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