PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC11075223 | The component analysis showed that triterpenoid saponins may be effective components against breast cancer, inducing cell apoptosis through the mitochondrial pathway . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"component",
"analysis",
"showed",
"that",
"triterpenoid",
"saponins",
"may",
"be",
"effective",
"components",
"against",
"breast",
"cancer",
",",
"inducing",
"cell",
"apoptosis",
"through",
"the",
"mitochondrial",
"pathway",
"."
]
}
] |
PMC11085211 | Interestingly, the analysis revealed the presence of pyrogallol-bearing compounds in all the active subfractions (Figure 10 and Supplementary Figure S6a). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Interestingly",
",",
"the",
"analysis",
"revealed",
"the",
"presence",
"of",
"pyrogallol-bearing",
"compounds",
"in",
"all",
"the",
"active",
"subfractions",
"(",
"Figure",
"10",
"and",
"Supplementary",
"Figure",
"S6a",
")",
"."
]
}
] |
PMC10607604 | These results were subsequently confirmed by another group . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"results",
"were",
"subsequently",
"confirmed",
"by",
"another",
"group",
"."
]
}
] |
PMC11721096 | Recently, we reported a new strategy for ligand fishing in which the target protein was displayed at the surface of E. coli by molecular engineering instead of being immobilized on solid materials via covalent binding, providing a “natural” conformation of the protein to ensure a more reliable screening . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Recently",
",",
"we",
"reported",
"a",
"new",
"strategy",
"for",
"ligand",
"fishing",
"in",
"which",
"the",
"target",
"protein",
"was",
"displayed",
"at",
"the",
"surface",
"of",
"E.",
"coli",
"by",
"molecular",
"engineering",
"instead",
"of",
"being",
"immobilized",
"on",
"solid",
"materials",
"via",
"covalent",
"binding",
",",
"providing",
"a",
"“",
"natural",
"”",
"conformation",
"of",
"the",
"protein",
"to",
"ensure",
"a",
"more",
"reliable",
"screening",
"."
]
}
] |
PMC11521786 | This cytotoxic effect likely occurs through the induction of apoptosis, as supported by our findings. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"cytotoxic",
"effect",
"likely",
"occurs",
"through",
"the",
"induction",
"of",
"apoptosis",
",",
"as",
"supported",
"by",
"our",
"findings",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | We aimed to estimate the prevalence of platelet dysfunction disorders in patients with IBD. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"aimed",
"to",
"estimate",
"the",
"prevalence",
"of",
"platelet",
"dysfunction",
"disorders",
"in",
"patients",
"with",
"IBD",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | This trial is registered at ClinicalTrials.gov (NCT04038411). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"trial",
"is",
"registered",
"at",
"ClinicalTrials.gov",
"(",
"NCT04038411",
")",
"."
]
}
] |
PMC11703992 | D Detection of IL-1β, IL-2, IL-6, IL-17 and TNF-α expression levels in different groups of Jurkat cells (n = 3). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"D",
"Detection",
"of",
"IL-1β",
",",
"IL-2",
",",
"IL-6",
",",
"IL-17",
"and",
"TNF-α",
"expression",
"levels",
"in",
"different",
"groups",
"of",
"Jurkat",
"cells",
"(",
"n",
"=",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC11345828 | The title compound (32 mg, 43% yield) was prepared following General Procedure F using compound 48 (70 mg, 0.089 mmol, 1.0 equiv) and (R)-(tetrahydrofuran-2-yl)methyl 4-methylbenzenesulfonate (75 mg, 0.29 mmol, 3.2 equiv) followed by saponification using General Procedure G. LCMS Method 2: RT = 1.376 min, MS (ESI): mass calcd for C45H47Cl2N5O7, 839.3, m/z found 839.8 (M + H). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"title",
"compound",
"(",
"32",
"mg",
",",
"43",
"%",
"yield",
")",
"was",
"prepared",
"following",
"General",
"Procedure",
"F",
"using",
"compound",
"48",
"(",
"70",
"mg",
",",
"0.089",
"mmol",
",",
"1.0",
"equiv",
")",
"and",
"(R)-(tetrahydrofuran-2-yl)methyl",
"4-methylbenzenesulfonate",
"(",
"75",
"mg",
",",
"0.29",
"mmol",
",",
"3.2",
"equiv",
")",
"followed",
"by",
"saponification",
"using",
"General",
"Procedure",
"G.",
"LCMS",
"Method",
"2",
":",
"RT",
"=",
"1.376",
"min",
",",
"MS",
"(",
"ESI",
"):",
"mass",
"calcd",
"for",
"C45H47Cl2N5O7",
",",
"839.3",
",",
"m/z",
"found",
"839.8",
"(",
"M",
"+",
"H",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Glofitamab is a new bispecific antibody, with a unique 2:1 molecular configuration resulting in superior potency compared with other CD20xCD3 bispecific antibodies with a 1:1 format. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Glofitamab",
"is",
"a",
"new",
"bispecific",
"antibody",
",",
"with",
"a",
"unique",
"2:1",
"molecular",
"configuration",
"resulting",
"in",
"superior",
"potency",
"compared",
"with",
"other",
"CD20xCD3",
"bispecific",
"antibodies",
"with",
"a",
"1:1",
"format",
"."
]
}
] |
PMC11266100 | Dot line indicates transfection efficacy using 1.2 kV/cm × 100 μs × 8 protocol. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Dot",
"line",
"indicates",
"transfection",
"efficacy",
"using",
"1.2",
"kV/cm",
"×",
"100",
"μs",
"×",
"8",
"protocol",
"."
]
}
] |
PMC11711127 | Legoux et al. (121) however only studied a pancreatic promotor exhibiting no overt thymic expression, and thus observed no deletion. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Legoux",
"et",
"al.",
"(",
"121",
")",
"however",
"only",
"studied",
"a",
"pancreatic",
"promotor",
"exhibiting",
"no",
"overt",
"thymic",
"expression",
",",
"and",
"thus",
"observed",
"no",
"deletion",
"."
]
}
] |
PMC11707577 | Development of phage‐derived 1‐D thiophene nanoparticles M13EGFR(TNP). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Development",
"of",
"phage‐derived",
"1‐D",
"thiophene",
"nanoparticles",
"M13EGFR(TNP",
")",
"."
]
}
] |
PMC11489175 | First generation inhibitors have been reported (e.g., P5091) capable of overcoming resistance to proteasome inhibitors targeting the 20S CP (i.e., bortezomib) 116. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"First",
"generation",
"inhibitors",
"have",
"been",
"reported",
"(",
"e.g.",
",",
"P5091",
")",
"capable",
"of",
"overcoming",
"resistance",
"to",
"proteasome",
"inhibitors",
"targeting",
"the",
"20S",
"CP",
"(",
"i.e.",
",",
"bortezomib",
")",
"116",
"."
]
}
] |
PMC9503669 | More recently, Liu et al. screened a library of FDA-approved drugs for inhibitors of Nef-mediated MHC-I downregulation by flow cytometry . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"More",
"recently",
",",
"Liu",
"et",
"al.",
"screened",
"a",
"library",
"of",
"FDA-approved",
"drugs",
"for",
"inhibitors",
"of",
"Nef-mediated",
"MHC-I",
"downregulation",
"by",
"flow",
"cytometry",
"."
]
}
] |
PMC11769516 | MON, due to its small molecular size, low mass and high polarity, is a compound difficult to analyze quantitatively, which is why there are few studies that could explain its mechanism of action and its neurotoxicity . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MON",
",",
"due",
"to",
"its",
"small",
"molecular",
"size",
",",
"low",
"mass",
"and",
"high",
"polarity",
",",
"is",
"a",
"compound",
"difficult",
"to",
"analyze",
"quantitatively",
",",
"which",
"is",
"why",
"there",
"are",
"few",
"studies",
"that",
"could",
"explain",
"its",
"mechanism",
"of",
"action",
"and",
"its",
"neurotoxicity",
"."
]
}
] |
PMC7185206 | In primary tumors, cell PD-L1 staining is often performed on tumor samples prior to treatment. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"primary",
"tumors",
",",
"cell",
"PD-L1",
"staining",
"is",
"often",
"performed",
"on",
"tumor",
"samples",
"prior",
"to",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC3813807 | The identification of miRNA target genes remains a great challenge. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"identification",
"of",
"miRNA",
"target",
"genes",
"remains",
"a",
"great",
"challenge",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | At the cytogenetic level, it usually arises from the balanced (9;22)(q34;q11) translocation. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"At",
"the",
"cytogenetic",
"level",
",",
"it",
"usually",
"arises",
"from",
"the",
"balanced",
"(9;22)(q34;q11",
")",
"translocation",
"."
]
}
] |
PMC11680982 | For HER2-low tumor volume on day 21: normal saline vs. medium-dose ET + CDK4/6i + Ner, P = 0.0001; normal saline vs. low-dose ET + CDK4/6i + Ner, P = 0.0017; normal saline vs. ET + CDK4/6i, P = 0.003; ET + CDK4/6i vs. medium-dose ET + CDK4/6i + Ner, P = 0.0021. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"HER2-low",
"tumor",
"volume",
"on",
"day",
"21",
":",
"normal",
"saline",
"vs.",
"medium-dose",
"ET",
"+",
"CDK4/6i",
"+",
"Ner",
",",
"P",
"=",
"0.0001",
";",
"normal",
"saline",
"vs.",
"low-dose",
"ET",
"+",
"CDK4/6i",
"+",
"Ner",
",",
"P",
"=",
"0.0017",
";",
"normal",
"saline",
"vs.",
"ET",
"+",
"CDK4/6i",
",",
"P",
"=",
"0.003",
";",
"ET",
"+",
"CDK4/6i",
"vs.",
"medium-dose",
"ET",
"+",
"CDK4/6i",
"+",
"Ner",
",",
"P",
"=",
"0.0021",
"."
]
}
] |
PMC11536589 | Each was stored at -20 °C, and thawed and diluted with complete medium before each experiment. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Each",
"was",
"stored",
"at",
"-20",
"°",
"C",
",",
"and",
"thawed",
"and",
"diluted",
"with",
"complete",
"medium",
"before",
"each",
"experiment",
"."
]
}
] |
PMC11694066 | Scatter plot shows the percentage of PD-L1–positive cells within the DAPI-negative population, normalized to the DMSO condition. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Scatter",
"plot",
"shows",
"the",
"percentage",
"of",
"PD-L1–positive",
"cells",
"within",
"the",
"DAPI-negative",
"population",
",",
"normalized",
"to",
"the",
"DMSO",
"condition",
"."
]
}
] |
PMC11703896 | The aqueous solution of rapamycin was concentrated using rotary evaporator and dried to powder form (Rani et al. 2013). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"aqueous",
"solution",
"of",
"rapamycin",
"was",
"concentrated",
"using",
"rotary",
"evaporator",
"and",
"dried",
"to",
"powder",
"form",
"(",
"Rani",
"et",
"al.",
"2013",
")",
"."
]
}
] |
PMC10158546 | Spheroid number, area, GFAP signal, PrP signal and TUBB3 signal were determined using imagej. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Spheroid",
"number",
",",
"area",
",",
"GFAP",
"signal",
",",
"PrP",
"signal",
"and",
"TUBB3",
"signal",
"were",
"determined",
"using",
"imagej",
"."
]
}
] |
PMC11683130 | The Serpin protein superfamily is divided into groups called clades based on their sequence similarity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"Serpin",
"protein",
"superfamily",
"is",
"divided",
"into",
"groups",
"called",
"clades",
"based",
"on",
"their",
"sequence",
"similarity",
"."
]
}
] |
PMC9509578 | PDT mainly eradicates cancer cells through the transfer of energy from light-activated photosensitizers to oxygen and generates intracellular oxidative stress via reactive oxygen species (ROS) . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"PDT",
"mainly",
"eradicates",
"cancer",
"cells",
"through",
"the",
"transfer",
"of",
"energy",
"from",
"light-activated",
"photosensitizers",
"to",
"oxygen",
"and",
"generates",
"intracellular",
"oxidative",
"stress",
"via",
"reactive",
"oxygen",
"species",
"(",
"ROS",
")",
"."
]
}
] |
PMC7612475 | Clearly, further investigation is needed to pinpoint the precise mechanism with which SF3B1 prevents uncontrolled nucleolytic degradation of damaged replication forks. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Clearly",
",",
"further",
"investigation",
"is",
"needed",
"to",
"pinpoint",
"the",
"precise",
"mechanism",
"with",
"which",
"SF3B1",
"prevents",
"uncontrolled",
"nucleolytic",
"degradation",
"of",
"damaged",
"replication",
"forks",
"."
]
}
] |
PMC11754436 | The differences in overall survival time between the two groups were compared using the stratified log-rank test. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"differences",
"in",
"overall",
"survival",
"time",
"between",
"the",
"two",
"groups",
"were",
"compared",
"using",
"the",
"stratified",
"log-rank",
"test",
"."
]
}
] |
PMC9812014 | MLV was inhibited by CAST-B with an IC50 of 0.05 µg/mL. CAST-B also showed strong inhibition of the glucosidase enzyme with an IC50 of 0.7 µg/mL. Viral replication of MLV was targeted by this alkaloid and a relationship between glucosidase-I inhibition and MOLV replication was observed in this experiment . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MLV",
"was",
"inhibited",
"by",
"CAST-B",
"with",
"an",
"IC50",
"of",
"0.05",
"µg/mL.",
"CAST-B",
"also",
"showed",
"strong",
"inhibition",
"of",
"the",
"glucosidase",
"enzyme",
"with",
"an",
"IC50",
"of",
"0.7",
"µg/mL.",
"Viral",
"replication",
"of",
"MLV",
"was",
"targeted",
"by",
"this",
"alkaloid",
"and",
"a",
"relationship",
"between",
"glucosidase-I",
"inhibition",
"and",
"MOLV",
"replication",
"was",
"observed",
"in",
"this",
"experiment",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Characteristics of the patients are described in Table 1. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Characteristics",
"of",
"the",
"patients",
"are",
"described",
"in",
"Table",
"1",
"."
]
}
] |
PMC11461025 | I and J) Lane 1: control cells (DMSO), Lane 2: 25 μM of isoginkgetin, Lane 3: 50 μM of isoginkgetin, Lane 4: 1 μM of staurosporine. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"I",
"and",
"J",
")",
"Lane",
"1",
":",
"control",
"cells",
"(",
"DMSO",
")",
",",
"Lane",
"2",
":",
"25",
"μM",
"of",
"isoginkgetin",
",",
"Lane",
"3",
":",
"50",
"μM",
"of",
"isoginkgetin",
",",
"Lane",
"4",
":",
"1",
"μM",
"of",
"staurosporine",
"."
]
}
] |
PMC10887351 | In addition, findings that hyperoxia downregulated retinal β3-ARs, in combination with HIF-1α and VEGF reduction, suggested the probable involvement of β3-ARs in response to high oxygen tension. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"findings",
"that",
"hyperoxia",
"downregulated",
"retinal",
"β3-ARs",
",",
"in",
"combination",
"with",
"HIF-1α",
"and",
"VEGF",
"reduction",
",",
"suggested",
"the",
"probable",
"involvement",
"of",
"β3-ARs",
"in",
"response",
"to",
"high",
"oxygen",
"tension",
"."
]
}
] |
PMC11674834 | Computational homology modeling based on the NAT1 crystal structure indicates that the side chain of R187 is partially exposed to the domain II beta-barrel, the protein surface, and the active site pocket . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Computational",
"homology",
"modeling",
"based",
"on",
"the",
"NAT1",
"crystal",
"structure",
"indicates",
"that",
"the",
"side",
"chain",
"of",
"R187",
"is",
"partially",
"exposed",
"to",
"the",
"domain",
"II",
"beta-barrel",
",",
"the",
"protein",
"surface",
",",
"and",
"the",
"active",
"site",
"pocket",
"."
]
}
] |
PMC10213179 | Lysate aliquots (≥40 μg) were resolved by 8%, 10%, 12%, or 15% SDS-PAGE (depending on protein molecular weight) and transferred to 0.2-μm pore nitrocellulose membranes (Bio-Rad). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Lysate",
"aliquots",
"(",
"≥40",
"μg",
")",
"were",
"resolved",
"by",
"8",
"%",
",",
"10",
"%",
",",
"12",
"%",
",",
"or",
"15",
"%",
"SDS-PAGE",
"(",
"depending",
"on",
"protein",
"molecular",
"weight",
")",
"and",
"transferred",
"to",
"0.2-μm",
"pore",
"nitrocellulose",
"membranes",
"(",
"Bio-Rad",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Only 50% of centers have the facilities to perform the preservation of gametes in their own institution. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Only",
"50",
"%",
"of",
"centers",
"have",
"the",
"facilities",
"to",
"perform",
"the",
"preservation",
"of",
"gametes",
"in",
"their",
"own",
"institution",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Patients with GVHD have a lower incidence of relapse, but at high grades a higher incidence of non-relapse mortality (NRM). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Patients",
"with",
"GVHD",
"have",
"a",
"lower",
"incidence",
"of",
"relapse",
",",
"but",
"at",
"high",
"grades",
"a",
"higher",
"incidence",
"of",
"non-relapse",
"mortality",
"(",
"NRM",
")",
"."
]
}
] |
PMC11564322 | EDPs have been shown to attract the human mononuclear phagocyte (U937) cell line by chemotactic activity through activation of EBP, which may explain the inflammatory response in tissues in which the level of EDPs increases . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"EDPs",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"attract",
"the",
"human",
"mononuclear",
"phagocyte",
"(",
"U937",
")",
"cell",
"line",
"by",
"chemotactic",
"activity",
"through",
"activation",
"of",
"EBP",
",",
"which",
"may",
"explain",
"the",
"inflammatory",
"response",
"in",
"tissues",
"in",
"which",
"the",
"level",
"of",
"EDPs",
"increases",
"."
]
}
] |
PMC11726848 | The count of living cells was calculated as the percentage of mean optical density in the wells with the irradiated cells to the mean optical density in the wells with the non-irradiated cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"count",
"of",
"living",
"cells",
"was",
"calculated",
"as",
"the",
"percentage",
"of",
"mean",
"optical",
"density",
"in",
"the",
"wells",
"with",
"the",
"irradiated",
"cells",
"to",
"the",
"mean",
"optical",
"density",
"in",
"the",
"wells",
"with",
"the",
"non-irradiated",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Overall Response Rate (ORR) (RECIST) was 78%, CR 41%; PR (Partial response) 37%; and PD 22%. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Overall",
"Response",
"Rate",
"(",
"ORR",
")",
"(",
"RECIST",
")",
"was",
"78",
"%",
",",
"CR",
"41",
"%",
";",
"PR",
"(",
"Partial",
"response",
")",
"37",
"%",
";",
"and",
"PD",
"22",
"%",
"."
]
}
] |
PMC11472569 | More than 50% of cancers exhibiting an MDR phenotype have been found to express these ABC transporters constitutively or inducibly, enabling them to expel chemotherapeutic drugs and reduce intracellular drug concentrations. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"More",
"than",
"50",
"%",
"of",
"cancers",
"exhibiting",
"an",
"MDR",
"phenotype",
"have",
"been",
"found",
"to",
"express",
"these",
"ABC",
"transporters",
"constitutively",
"or",
"inducibly",
",",
"enabling",
"them",
"to",
"expel",
"chemotherapeutic",
"drugs",
"and",
"reduce",
"intracellular",
"drug",
"concentrations",
"."
]
}
] |
PMC8759873 | Renal cell carcinoma that is abbreviated as RCC, referred to as kidney cancer, accounts for 2-3% of all adult malignant tumors. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Renal",
"cell",
"carcinoma",
"that",
"is",
"abbreviated",
"as",
"RCC",
",",
"referred",
"to",
"as",
"kidney",
"cancer",
",",
"accounts",
"for",
"2",
"-",
"3",
"%",
"of",
"all",
"adult",
"malignant",
"tumors",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Key secondary objectives include: assessment of objective response rate as determined by the investigator, duration of response (DOR) and minimal residual disease status; pharmacokinetic evaluation; and characterization of immunogenicity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Key",
"secondary",
"objectives",
"include",
":",
"assessment",
"of",
"objective",
"response",
"rate",
"as",
"determined",
"by",
"the",
"investigator",
",",
"duration",
"of",
"response",
"(",
"DOR",
")",
"and",
"minimal",
"residual",
"disease",
"status",
";",
"pharmacokinetic",
"evaluation",
";",
"and",
"characterization",
"of",
"immunogenicity",
"."
]
}
] |
PMC9964635 | It bonded with residues Leu183, val166, and Lys181 via hydrophobic alkyl interactions. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"bonded",
"with",
"residues",
"Leu183",
",",
"val166",
",",
"and",
"Lys181",
"via",
"hydrophobic",
"alkyl",
"interactions",
"."
]
}
] |
PMC11753435 | Thus, we chose that k would range between 5 and 22, sampling the full range of sequence transformations. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Thus",
",",
"we",
"chose",
"that",
"k",
"would",
"range",
"between",
"5",
"and",
"22",
",",
"sampling",
"the",
"full",
"range",
"of",
"sequence",
"transformations",
".",
"("
]
}
] |
PMC9429973 | Vamifeport significantly reduced plasma NTBI levels in transfused Hbb mice to the levels of non-transfused controls. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Vamifeport",
"significantly",
"reduced",
"plasma",
"NTBI",
"levels",
"in",
"transfused",
"Hbb",
"mice",
"to",
"the",
"levels",
"of",
"non-transfused",
"controls",
"."
]
}
] |
PMC11578343 | Each column corresponds to a single cell. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Each",
"column",
"corresponds",
"to",
"a",
"single",
"cell",
"."
]
}
] |
PMC5311252 | For this reason, we will refer to this core motif as the oncomotif and to the group of 28 miRNAs as oncomotif-miRNAs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"this",
"reason",
",",
"we",
"will",
"refer",
"to",
"this",
"core",
"motif",
"as",
"the",
"oncomotif",
"and",
"to",
"the",
"group",
"of",
"28",
"miRNAs",
"as",
"oncomotif-miRNAs",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The primary endpoint was event-free survival (EFS). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"primary",
"endpoint",
"was",
"event-free",
"survival",
"(",
"EFS",
")",
"."
]
}
] |
PMC9164404 | Therefore, in this paper, CisPt(IV) with two hydrophobic aliphatic chains in the axial position was chosen. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"in",
"this",
"paper",
",",
"CisPt(IV",
")",
"with",
"two",
"hydrophobic",
"aliphatic",
"chains",
"in",
"the",
"axial",
"position",
"was",
"chosen",
"."
]
}
] |
PMC10530622 | In their turn, urea-splitting organisms, particularly Proteus mirabilis, decompose urea in urine which generates products that alkalinize the urine and participate in the formation of infection stones . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"their",
"turn",
",",
"urea-splitting",
"organisms",
",",
"particularly",
"Proteus",
"mirabilis",
",",
"decompose",
"urea",
"in",
"urine",
"which",
"generates",
"products",
"that",
"alkalinize",
"the",
"urine",
"and",
"participate",
"in",
"the",
"formation",
"of",
"infection",
"stones",
"."
]
}
] |
PMC10212663 | Raw data of RNA‐sequencing data and relevant clinical information of pan‐cancer including LUAD were obtained from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database (https://portal.gdc.cancer.gov/) manually, which contained a total of 516 tumor samples and 59 normal samples for LUAD samples. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Raw",
"data",
"of",
"RNA‐sequencing",
"data",
"and",
"relevant",
"clinical",
"information",
"of",
"pan‐cancer",
"including",
"LUAD",
"were",
"obtained",
"from",
"The",
"Cancer",
"Genome",
"Atlas",
"(",
"TCGA",
")",
"database",
"(",
"https://portal.gdc.cancer.gov/",
")",
"manually",
",",
"which",
"contained",
"a",
"total",
"of",
"516",
"tumor",
"samples",
"and",
"59",
"normal",
"samples",
"for",
"LUAD",
"samples",
"."
]
}
] |
PMC6182045 | bNAbs were captured onto a CM5 sensor chip via a covalently immobilized anti-human FC antibody. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"bNAbs",
"were",
"captured",
"onto",
"a",
"CM5",
"sensor",
"chip",
"via",
"a",
"covalently",
"immobilized",
"anti-human",
"FC",
"antibody",
"."
]
}
] |
PMC11352746 | Since the application of these instruments is relatively new, we will highlight some of the technical specifications and summarize the trends in the experimental conditions from relevant publications, particularly those focusing on neurite kinetic assays. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Since",
"the",
"application",
"of",
"these",
"instruments",
"is",
"relatively",
"new",
",",
"we",
"will",
"highlight",
"some",
"of",
"the",
"technical",
"specifications",
"and",
"summarize",
"the",
"trends",
"in",
"the",
"experimental",
"conditions",
"from",
"relevant",
"publications",
",",
"particularly",
"those",
"focusing",
"on",
"neurite",
"kinetic",
"assays",
"."
]
}
] |
PMC11591030 | Studies indicate that polysaccharides may mitigate oxidative stress in animals by activating the Nrf2/Keap1 signaling pathway, which enhances the activity of antioxidant enzymes and scavenges excess free radicals . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Studies",
"indicate",
"that",
"polysaccharides",
"may",
"mitigate",
"oxidative",
"stress",
"in",
"animals",
"by",
"activating",
"the",
"Nrf2/Keap1",
"signaling",
"pathway",
",",
"which",
"enhances",
"the",
"activity",
"of",
"antioxidant",
"enzymes",
"and",
"scavenges",
"excess",
"free",
"radicals",
"."
]
}
] |
PMC11093197 | In addition, overexpressed H‐RAS recovered c‐Myc protein levels. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"overexpressed",
"H‐RAS",
"recovered",
"c‐Myc",
"protein",
"levels",
"."
]
}
] |
PMC10890055 | Figure 5 shows that the extracts were more toxic to the L929 cell line. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Figure",
"5",
"shows",
"that",
"the",
"extracts",
"were",
"more",
"toxic",
"to",
"the",
"L929",
"cell",
"line",
"."
]
}
] |
PMC11271278 | F The averaged virtual 4 C signal between the top 50 MYC-interacting regions from the MYC locus (ranked by their interactions with the MYC promoter) and the promoter of MYC (left) or ERBB2 (right). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"F",
"The",
"averaged",
"virtual",
"4",
"C",
"signal",
"between",
"the",
"top",
"50",
"MYC-interacting",
"regions",
"from",
"the",
"MYC",
"locus",
"(",
"ranked",
"by",
"their",
"interactions",
"with",
"the",
"MYC",
"promoter",
")",
"and",
"the",
"promoter",
"of",
"MYC",
"(",
"left",
")",
"or",
"ERBB2",
"(",
"right",
")",
"."
]
}
] |
PMC11525028 | The red dot represents ATF4. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"red",
"dot",
"represents",
"ATF4",
".",
"("
]
}
] |
PMC11021472 | ST486 cells transfected with the lentiviral vector for circZDHHC11 overexpression (triangles) or control vector (circles) (both with GFP reporter) were transfected with the lentiviral vector for miR-150 overexpression carrying a BFP reporter (dark and light blue) or control (black and grey). | [
{
"tags": [
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ST486",
"cells",
"transfected",
"with",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"for",
"circZDHHC11",
"overexpression",
"(",
"triangles",
")",
"or",
"control",
"vector",
"(",
"circles",
")",
"(",
"both",
"with",
"GFP",
"reporter",
")",
"were",
"transfected",
"with",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"for",
"miR-150",
"overexpression",
"carrying",
"a",
"BFP",
"reporter",
"(",
"dark",
"and",
"light",
"blue",
")",
"or",
"control",
"(",
"black",
"and",
"grey",
")",
"."
]
}
] |
PMC9784246 | Therefore, as a part of our continuous efforts to exploit local plants in the KSA to overcome lung cancer and CL, we phytochemically and pharmacologically investigated Carissa macrocarpa (Eckl.) | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"as",
"a",
"part",
"of",
"our",
"continuous",
"efforts",
"to",
"exploit",
"local",
"plants",
"in",
"the",
"KSA",
"to",
"overcome",
"lung",
"cancer",
"and",
"CL",
",",
"we",
"phytochemically",
"and",
"pharmacologically",
"investigated",
"Carissa",
"macrocarpa",
"(",
"Eckl",
".",
")"
]
}
] |
PMC11704834 | Gefitinib, a first-generation EGFR-TKI, shows effective antitumor activity in patients with EGFR-mutant LUAD as compared with chemotherapy. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Gefitinib",
",",
"a",
"first-generation",
"EGFR-TKI",
",",
"shows",
"effective",
"antitumor",
"activity",
"in",
"patients",
"with",
"EGFR-mutant",
"LUAD",
"as",
"compared",
"with",
"chemotherapy",
"."
]
}
] |
PMC11206502 | Additionally, addressing other tumor microenvironment components, such as immune cells and cancer-associated fibroblasts, is crucial. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Additionally",
",",
"addressing",
"other",
"tumor",
"microenvironment",
"components",
",",
"such",
"as",
"immune",
"cells",
"and",
"cancer-associated",
"fibroblasts",
",",
"is",
"crucial",
"."
]
}
] |
PMC10329074 | ns: no significance Univariate regression analysis and multivariate analysis of prognostic variables in ccRCC patients (Progressive disease); SD (stable disease); PR (partial response); CR (Compete response); G1 (Grade 1); G2 (Grade 2); G3 (Grade 3); G4 (Grade 4) Looking at the TNM stages, the results of subgroup survival analyses of the OS rates revealed that patients’ prognosis with high expression of YBX3 (“YBX3-high”) was poorer in the T2 (HR: 2.64; 95% CI: 1.05–6.63; P < 0.05), M0 (HR: 1.89; 95% CI: 1.28–2.80; P < 0.01) and N0 (HR: 2.01; 95% CI: 1.29–3.15; P < 0.001) subgroups (Fig. 4). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ns",
":",
"no",
"significance",
"Univariate",
"regression",
"analysis",
"and",
"multivariate",
"analysis",
"of",
"prognostic",
"variables",
"in",
"ccRCC",
"patients",
"(",
"Progressive",
"disease",
")",
";",
"SD",
"(",
"stable",
"disease",
")",
";",
"PR",
"(",
"partial",
"response",
")",
";",
"CR",
"(",
"Compete",
"response",
")",
";",
"G1",
"(",
"Grade",
"1",
")",
";",
"G2",
"(",
"Grade",
"2",
")",
";",
"G3",
"(",
"Grade",
"3",
")",
";",
"G4",
"(",
"Grade",
"4",
")",
"Looking",
"at",
"the",
"TNM",
"stages",
",",
"the",
"results",
"of",
"subgroup",
"survival",
"analyses",
"of",
"the",
"OS",
"rates",
"revealed",
"that",
"patients",
"’",
"prognosis",
"with",
"high",
"expression",
"of",
"YBX3",
"(",
"“",
"YBX3-high",
"”",
")",
"was",
"poorer",
"in",
"the",
"T2",
"(",
"HR",
":",
"2.64",
";",
"95",
"%",
"CI",
":",
"1.05–6.63",
";",
"P",
"<",
"0.05",
")",
",",
"M0",
"(",
"HR",
":",
"1.89",
";",
"95",
"%",
"CI",
":",
"1.28–2.80",
";",
"P",
"<",
"0.01",
")",
"and",
"N0",
"(",
"HR",
":",
"2.01",
";",
"95",
"%",
"CI",
":",
"1.29–3.15",
";",
"P",
"<",
"0.001",
")",
"subgroups",
"(",
"Fig.",
"4",
")",
"."
]
}
] |
PMC10362265 | Fig. 2 (a) Cα fluctuations calculated for the last 200 ns. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Fig.",
"2",
"(",
"a",
")",
"Cα",
"fluctuations",
"calculated",
"for",
"the",
"last",
"200",
"ns",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Linear mixed-effects models for repeated measures assessed the least squares (LS) mean change from baseline for visits with ≥ 10 patients. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Linear",
"mixed-effects",
"models",
"for",
"repeated",
"measures",
"assessed",
"the",
"least",
"squares",
"(",
"LS",
")",
"mean",
"change",
"from",
"baseline",
"for",
"visits",
"with",
"≥",
"10",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC11344246 | Key proteins identified by our network analysis ‘Betweenness’ is the betweenness centrality in the differential interaction network and drug score is derived via fPocket. ‘ | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Key",
"proteins",
"identified",
"by",
"our",
"network",
"analysis",
"‘",
"Betweenness",
"’",
"is",
"the",
"betweenness",
"centrality",
"in",
"the",
"differential",
"interaction",
"network",
"and",
"drug",
"score",
"is",
"derived",
"via",
"fPocket",
".",
"‘"
]
}
] |
PMC11578343 | The gold standard, atomic force microscopy (AFM), , can provide extensive information on the viscoelastic properties—the elastic modulus (G′) and viscous modulus (G″)—of a single cell at different frequencies; however, throughput is extraordinarily low at approximately ten cells per hour. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"gold",
"standard",
",",
"atomic",
"force",
"microscopy",
"(",
"AFM",
")",
",",
",",
"can",
"provide",
"extensive",
"information",
"on",
"the",
"viscoelastic",
"properties",
"—",
"the",
"elastic",
"modulus",
"(",
"G′",
")",
"and",
"viscous",
"modulus",
"(G″)—of",
"a",
"single",
"cell",
"at",
"different",
"frequencies",
";",
"however",
",",
"throughput",
"is",
"extraordinarily",
"low",
"at",
"approximately",
"ten",
"cells",
"per",
"hour",
"."
]
}
] |
PMC9220170 | It is possible that SELENOT directly or indirectly interacts with thiol groups and/or glycosylated regions of intracellular calcium channels and pumps and regulates their activity through a redox mechanism. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"is",
"possible",
"that",
"SELENOT",
"directly",
"or",
"indirectly",
"interacts",
"with",
"thiol",
"groups",
"and/or",
"glycosylated",
"regions",
"of",
"intracellular",
"calcium",
"channels",
"and",
"pumps",
"and",
"regulates",
"their",
"activity",
"through",
"a",
"redox",
"mechanism",
"."
]
}
] |
PMC8068766 | For this reason, the identification of novel biomarkers that play key roles on those compensatory pathways is very critical. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"this",
"reason",
",",
"the",
"identification",
"of",
"novel",
"biomarkers",
"that",
"play",
"key",
"roles",
"on",
"those",
"compensatory",
"pathways",
"is",
"very",
"critical",
"."
]
}
] |
PMC11352311 | The results indicated that the BPs of these intersected genes were primarily associated with processes such as negative regulation of the apoptotic process, the extrinsic apoptotic signaling pathway in the absence of ligands, and protein phosphorylation. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"results",
"indicated",
"that",
"the",
"BPs",
"of",
"these",
"intersected",
"genes",
"were",
"primarily",
"associated",
"with",
"processes",
"such",
"as",
"negative",
"regulation",
"of",
"the",
"apoptotic",
"process",
",",
"the",
"extrinsic",
"apoptotic",
"signaling",
"pathway",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"ligands",
",",
"and",
"protein",
"phosphorylation",
"."
]
}
] |
PMC10831439 | Cytotoxicity of CD19-CAR-iNKT cells against K562 wild-type (WT) cells was slightly enhanced in comparison to untransduced iNKT cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cytotoxicity",
"of",
"CD19-CAR-iNKT",
"cells",
"against",
"K562",
"wild-type",
"(",
"WT",
")",
"cells",
"was",
"slightly",
"enhanced",
"in",
"comparison",
"to",
"untransduced",
"iNKT",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11787355 | Created in BioRender. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Created",
"in",
"BioRender",
"."
]
}
] |
PMC11787355 | The expression levels were normalized to the parental line, and two qPCR targets were assessed for two different coding sequences (CDS) of PTPRZ1. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"expression",
"levels",
"were",
"normalized",
"to",
"the",
"parental",
"line",
",",
"and",
"two",
"qPCR",
"targets",
"were",
"assessed",
"for",
"two",
"different",
"coding",
"sequences",
"(",
"CDS",
")",
"of",
"PTPRZ1",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Divided by etiology, IO was more frequent with viral (62.5%) and metabolic (53.6%) etiologies, compared to autoimmune and other causes (p=0.012). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Divided",
"by",
"etiology",
",",
"IO",
"was",
"more",
"frequent",
"with",
"viral",
"(",
"62.5",
"%",
")",
"and",
"metabolic",
"(",
"53.6",
"%",
")",
"etiologies",
",",
"compared",
"to",
"autoimmune",
"and",
"other",
"causes",
"(",
"p=0.012",
")",
"."
]
}
] |
PMC9919300 | Inside the mitochondria, the β-oxidation uses four enzymes to convert acyl-CoA into acetyl CoA: acyl-CoA dehydrogenases, enoyl-CoA hydratase, L3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, and 3-ketoacyl-CoAthiolase. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Inside",
"the",
"mitochondria",
",",
"the",
"β-oxidation",
"uses",
"four",
"enzymes",
"to",
"convert",
"acyl-CoA",
"into",
"acetyl",
"CoA",
":",
"acyl-CoA",
"dehydrogenases",
",",
"enoyl-CoA",
"hydratase",
",",
"L3-hydroxyacyl-CoA",
"dehydrogenase",
",",
"and",
"3-ketoacyl-CoAthiolase",
"."
]
}
] |
PMC11696659 | The study of the telomeres from blood samples was carried out in the laboratories of Life Length SL (Madrid, Spain) within the scope of CLIA (99D2112462) and ISO 15189 quality standards. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"study",
"of",
"the",
"telomeres",
"from",
"blood",
"samples",
"was",
"carried",
"out",
"in",
"the",
"laboratories",
"of",
"Life",
"Length",
"SL",
"(",
"Madrid",
",",
"Spain",
")",
"within",
"the",
"scope",
"of",
"CLIA",
"(",
"99D2112462",
")",
"and",
"ISO",
"15189",
"quality",
"standards",
"."
]
}
] |
PMC11747467 | Immunostaining for ERBB2 was then performed on these 31 MIBC tissues. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Immunostaining",
"for",
"ERBB2",
"was",
"then",
"performed",
"on",
"these",
"31",
"MIBC",
"tissues",
"."
]
}
] |
PMC6627640 | RNA sequencing was performed by the Roy J. Carver Biotechnology Center (UIUC, Champaign, IL, USA). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"RNA",
"sequencing",
"was",
"performed",
"by",
"the",
"Roy",
"J.",
"Carver",
"Biotechnology",
"Center",
"(",
"UIUC",
",",
"Champaign",
",",
"IL",
",",
"USA",
")",
"."
]
}
] |
PMC9841531 | Imax = 93.3 ± 2.6%. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Imax",
"=",
"93.3",
"±",
"2.6",
"%",
"."
]
}
] |
PMC11634794 | Currently, there is a lack of comprehensive studies elucidating the precise mechanism underlying LAMP1’s involvement in tumorigenesis. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Currently",
",",
"there",
"is",
"a",
"lack",
"of",
"comprehensive",
"studies",
"elucidating",
"the",
"precise",
"mechanism",
"underlying",
"LAMP1",
"’s",
"involvement",
"in",
"tumorigenesis",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | C. Sauter, J. Simonet, C. Fournier, M. Mounier, M. Rebourgeon, L. Brignoli, A. Aznague, A. Largeot, Y. Hérault, G. Sauvageau, F. Guidez, M. Callanan, J.-N. Bastie, L. Delva, R. Aucagne UMR 1231 Inserm, Équipe Epi2THM, Équipe Labex LipSTIC, Université de Bourgogne Franche-Comté; Unité d’Innovation en Génétique et Épigénétique en Oncologie (IGEO), Plateforme CRISPR Genomics (CRIGEN), CHU François-Mitterrand; Registre des hémopathies malignes de Côte d’Or, Université de Bourgogne Franche-Comté, Dijon; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Département of de Génomique Fonctionnelle, UMR 7104 CNRS, UMR 964 Inserm, Université Louis Pasteur, Collège de France et Institut Clinique de la Souris (ICS), Illkirch, France; Laboratoire de Génétique Moléculaire des Cellules Souches, Institut de Recherche en Immunologie et Cancer, Université de Montréal, Montréal, Canada; Service d’Hématologie Clinique, CHU François-Mitterrand, Dijon, France Background: Protein Arginine Methyltransferases (PRMTs) are epigenetic factors involved in several cellular processes including regulation of gene expression through methylation of histone tails. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"C.",
"Sauter",
",",
"J.",
"Simonet",
",",
"C.",
"Fournier",
",",
"M.",
"Mounier",
",",
"M.",
"Rebourgeon",
",",
"L.",
"Brignoli",
",",
"A.",
"Aznague",
",",
"A.",
"Largeot",
",",
"Y.",
"Hérault",
",",
"G.",
"Sauvageau",
",",
"F.",
"Guidez",
",",
"M.",
"Callanan",
",",
"J.-N.",
"Bastie",
",",
"L.",
"Delva",
",",
"R.",
"Aucagne",
"UMR",
"1231",
"Inserm",
",",
"Équipe",
"Epi2THM",
",",
"Équipe",
"Labex",
"LipSTIC",
",",
"Université",
"de",
"Bourgogne",
"Franche-Comté",
";",
"Unité",
"d’Innovation",
"en",
"Génétique",
"et",
"Épigénétique",
"en",
"Oncologie",
"(",
"IGEO",
")",
",",
"Plateforme",
"CRISPR",
"Genomics",
"(",
"CRIGEN",
")",
",",
"CHU",
"François-Mitterrand",
";",
"Registre",
"des",
"hémopathies",
"malignes",
"de",
"Côte",
"d’Or",
",",
"Université",
"de",
"Bourgogne",
"Franche-Comté",
",",
"Dijon",
";",
"Institut",
"de",
"Génétique",
"et",
"de",
"Biologie",
"Moléculaire",
"et",
"Cellulaire",
"(",
"IGBMC",
")",
",",
"Département",
"of",
"de",
"Génomique",
"Fonctionnelle",
",",
"UMR",
"7104",
"CNRS",
",",
"UMR",
"964",
"Inserm",
",",
"Université",
"Louis",
"Pasteur",
",",
"Collège",
"de",
"France",
"et",
"Institut",
"Clinique",
"de",
"la",
"Souris",
"(",
"ICS",
")",
",",
"Illkirch",
",",
"France",
";",
"Laboratoire",
"de",
"Génétique",
"Moléculaire",
"des",
"Cellules",
"Souches",
",",
"Institut",
"de",
"Recherche",
"en",
"Immunologie",
"et",
"Cancer",
",",
"Université",
"de",
"Montréal",
",",
"Montréal",
",",
"Canada",
";",
"Service",
"d’Hématologie",
"Clinique",
",",
"CHU",
"François-Mitterrand",
",",
"Dijon",
",",
"France",
"Background",
":",
"Protein",
"Arginine",
"Methyltransferases",
"(",
"PRMTs",
")",
"are",
"epigenetic",
"factors",
"involved",
"in",
"several",
"cellular",
"processes",
"including",
"regulation",
"of",
"gene",
"expression",
"through",
"methylation",
"of",
"histone",
"tails",
"."
]
}
] |
PMC8382973 | TZM-bl indicator cells were obtained from Dr. John C. Kappes, Dr. Xiaoyun Wu, and Tranzyme Inc (24–29), which stably express large amounts of CD4 and CCR5 with endogenous expression of CXCR4 and were maintained in complete growth medium composed of DMEM (HyClone™, GE Healthcare, Utah, USA) supplemented with 10% heat-inactivated FBS (Gibco, Grand Island, NY, USA), 100 IU/ml penicillin, and 100 μg/ml streptomycin (HyClone). | [
{
"tags": [
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"TZM-bl",
"indicator",
"cells",
"were",
"obtained",
"from",
"Dr.",
"John",
"C.",
"Kappes",
",",
"Dr.",
"Xiaoyun",
"Wu",
",",
"and",
"Tranzyme",
"Inc",
"(",
"24–29",
")",
",",
"which",
"stably",
"express",
"large",
"amounts",
"of",
"CD4",
"and",
"CCR5",
"with",
"endogenous",
"expression",
"of",
"CXCR4",
"and",
"were",
"maintained",
"in",
"complete",
"growth",
"medium",
"composed",
"of",
"DMEM",
"(",
"HyClone",
"™",
",",
"GE",
"Healthcare",
",",
"Utah",
",",
"USA",
")",
"supplemented",
"with",
"10",
"%",
"heat-inactivated",
"FBS",
"(",
"Gibco",
",",
"Grand",
"Island",
",",
"NY",
",",
"USA",
")",
",",
"100",
"IU/ml",
"penicillin",
",",
"and",
"100",
"μg/ml",
"streptomycin",
"(",
"HyClone",
")",
"."
]
}
] |
PMC11770199 | In the melanoma model, the treatment was performed near the tumor injection position on day 3 after the tumor implantation. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"the",
"melanoma",
"model",
",",
"the",
"treatment",
"was",
"performed",
"near",
"the",
"tumor",
"injection",
"position",
"on",
"day",
"3",
"after",
"the",
"tumor",
"implantation",
"."
]
}
] |
PMC5963610 | Kaplan-Meier survival curves are showed (B, p<0.0004). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Kaplan-Meier",
"survival",
"curves",
"are",
"showed",
"(",
"B",
",",
"p<0.0004",
")",
"."
]
}
] |
PMC3931643 | Because TORC1 activity prevents 4EBPs from displacing eIF4G binding to eIF4E in the cap binding complex, we wanted to see if the absence of 4EBP1 in VAL cells maintained the active complex (also known as the eIF4F complex) upon MLN0128 treatment. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Because",
"TORC1",
"activity",
"prevents",
"4EBPs",
"from",
"displacing",
"eIF4",
"G",
"binding",
"to",
"eIF4E",
"in",
"the",
"cap",
"binding",
"complex",
",",
"we",
"wanted",
"to",
"see",
"if",
"the",
"absence",
"of",
"4EBP1",
"in",
"VAL",
"cells",
"maintained",
"the",
"active",
"complex",
"(",
"also",
"known",
"as",
"the",
"eIF4F",
"complex",
")",
"upon",
"MLN0128",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC9261184 | Engines exhibited higher methane slip rates at low loads, and optimized operation could reduce slip rates by half. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Engines",
"exhibited",
"higher",
"methane",
"slip",
"rates",
"at",
"low",
"loads",
",",
"and",
"optimized",
"operation",
"could",
"reduce",
"slip",
"rates",
"by",
"half",
"."
]
}
] |
PMC8164677 | indicates P <0.01 and # shows significant difference relative to the control through two-way ANOVA followed by post hoc Bonferroni multiple comparisons test. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"indicates",
"P",
"<",
"0.01",
"and",
"#",
"shows",
"significant",
"difference",
"relative",
"to",
"the",
"control",
"through",
"two-way",
"ANOVA",
"followed",
"by",
"post",
"hoc",
"Bonferroni",
"multiple",
"comparisons",
"test",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Eight patients (12%) developed myeloid transformation; in 6 of those a somatic molecular work-up was performed, and truncating mutations in the granulocyte-colony stimulating factor were detected in 4. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Eight",
"patients",
"(",
"12",
"%",
")",
"developed",
"myeloid",
"transformation",
";",
"in",
"6",
"of",
"those",
"a",
"somatic",
"molecular",
"work-up",
"was",
"performed",
",",
"and",
"truncating",
"mutations",
"in",
"the",
"granulocyte-colony",
"stimulating",
"factor",
"were",
"detected",
"in",
"4",
"."
]
}
] |
PMC11656657 | In this context, the inhibition of Enhancer of zeste homolog 2 (EZH2) with Tazemetostat has been demonstrated to restore the expression of sialyltransferase GD3 synthase (GD3S; ST8SIA1), thereby potentially re-establishing GD2 expression in several cancers, including EWS , SCLC and non-SCLC (NSCLC) , NBL and medulloblastoma . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"context",
",",
"the",
"inhibition",
"of",
"Enhancer",
"of",
"zeste",
"homolog",
"2",
"(",
"EZH2",
")",
"with",
"Tazemetostat",
"has",
"been",
"demonstrated",
"to",
"restore",
"the",
"expression",
"of",
"sialyltransferase",
"GD3",
"synthase",
"(",
"GD3S",
";",
"ST8SIA1",
")",
",",
"thereby",
"potentially",
"re-establishing",
"GD2",
"expression",
"in",
"several",
"cancers",
",",
"including",
"EWS",
",",
"SCLC",
"and",
"non-SCLC",
"(",
"NSCLC",
")",
",",
"NBL",
"and",
"medulloblastoma",
"."
]
}
] |
PMC11551844 | Combined JDH fractions, namely JDH (2–3), JDH (5–7), JDH (10–14), JDH (15–21), JDH (22–25) and JC-2, were evaluated on three cancer cell lines, namely, human brain cancer—glioblastoma (A172), human colorectal carcinoma (DLD1), human testicular embryonal carcinoma (TERA1) and one normal cell line namely human colon cells (CCD18Co). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Combined",
"JDH",
"fractions",
",",
"namely",
"JDH",
"(",
"2–3",
")",
",",
"JDH",
"(",
"5–7",
")",
",",
"JDH",
"(",
"10–14",
")",
",",
"JDH",
"(",
"15–21",
")",
",",
"JDH",
"(",
"22–25",
")",
"and",
"JC-2",
",",
"were",
"evaluated",
"on",
"three",
"cancer",
"cell",
"lines",
",",
"namely",
",",
"human",
"brain",
"cancer",
"—",
"glioblastoma",
"(",
"A172",
")",
",",
"human",
"colorectal",
"carcinoma",
"(",
"DLD1",
")",
",",
"human",
"testicular",
"embryonal",
"carcinoma",
"(",
"TERA1",
")",
"and",
"one",
"normal",
"cell",
"line",
"namely",
"human",
"colon",
"cells",
"(",
"CCD18Co",
")",
"."
]
}
] |
PMC10329074 | C and D) The cell cycle of ACHN was detected via flow cytometry. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"C",
"and",
"D",
")",
"The",
"cell",
"cycle",
"of",
"ACHN",
"was",
"detected",
"via",
"flow",
"cytometry",
".",
"("
]
}
] |
PMC11761919 | This material is pH sensitive and exhibits different solubility and swelling at different pH values. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"material",
"is",
"pH",
"sensitive",
"and",
"exhibits",
"different",
"solubility",
"and",
"swelling",
"at",
"different",
"pH",
"values",
"."
]
}
] |
PMC11271278 | Indeed, we found three additional cell lines NCIH2170, NCIH446, and MCF7 that have clusters of highly amplified HAPI genes hijacking enhancers from different chromosomes (Fig. 5A–C). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Indeed",
",",
"we",
"found",
"three",
"additional",
"cell",
"lines",
"NCIH2170",
",",
"NCIH446",
",",
"and",
"MCF7",
"that",
"have",
"clusters",
"of",
"highly",
"amplified",
"HAPI",
"genes",
"hijacking",
"enhancers",
"from",
"different",
"chromosomes",
"(",
"Fig.",
"5A",
"–",
"C",
")",
"."
]
}
] |
PMC4685411 | Hence,to increase the total cell number within a fed-batch the glutamine concentration and constant feed rate were optimized using multiple response surface designs with I optimality and 5 lack-of-fit and 5 replicate points(DesignExpert9).Each parameter combination of the experimental design was simulated(Matlab2014b),the maximal cell number(N)was calculated and exported to generate response surface plots(DesignExpert9).Optimization methods tend to high substrate concentrations, which can lead to increasing metabolite concentrations and to cell death. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Hence",
",",
"to",
"increase",
"the",
"total",
"cell",
"number",
"within",
"a",
"fed-batch",
"the",
"glutamine",
"concentration",
"and",
"constant",
"feed",
"rate",
"were",
"optimized",
"using",
"multiple",
"response",
"surface",
"designs",
"with",
"I",
"optimality",
"and",
"5",
"lack-of-fit",
"and",
"5",
"replicate",
"points(DesignExpert9).Each",
"parameter",
"combination",
"of",
"the",
"experimental",
"design",
"was",
"simulated(Matlab2014b),the",
"maximal",
"cell",
"number(N)was",
"calculated",
"and",
"exported",
"to",
"generate",
"response",
"surface",
"plots(DesignExpert9).Optimization",
"methods",
"tend",
"to",
"high",
"substrate",
"concentrations",
",",
"which",
"can",
"lead",
"to",
"increasing",
"metabolite",
"concentrations",
"and",
"to",
"cell",
"death",
"."
]
}
] |
PMC11683240 | Using this approach, α1AT was determined to directly interact with the PT holotoxin but not with the PTS1 enzyme subunit (Fig. 12A). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Using",
"this",
"approach",
",",
"α1AT",
"was",
"determined",
"to",
"directly",
"interact",
"with",
"the",
"PT",
"holotoxin",
"but",
"not",
"with",
"the",
"PTS1",
"enzyme",
"subunit",
"(",
"Fig.",
"12A",
")",
"."
]
}
] |
PMC11753435 | Immunoblot to probe endogenous SS18-SSX1 fusion in HS-SYII synovial sarcoma cells treated with SS-PpC_4 3 days after transient transfection. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Immunoblot",
"to",
"probe",
"endogenous",
"SS18-SSX1",
"fusion",
"in",
"HS-SYII",
"synovial",
"sarcoma",
"cells",
"treated",
"with",
"SS-PpC_4",
"3",
"days",
"after",
"transient",
"transfection",
"."
]
}
] |
PMC9895440 | a Schematic representation of the CAR T cell transfer experiments. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"a",
"Schematic",
"representation",
"of",
"the",
"CAR",
"T",
"cell",
"transfer",
"experiments",
"."
]
}
] |
PMC11697703 | Expression of miR-365 did not significantly change the overall MAPK8 signal in layer II-III (Figures S2F–S2H); however, at the cellular level, it reduced MAPK8 signal in the somata (Figure S2I). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Expression",
"of",
"miR-365",
"did",
"not",
"significantly",
"change",
"the",
"overall",
"MAPK8",
"signal",
"in",
"layer",
"II-III",
"(",
"Figures",
"S2F",
"–",
"S2H",
")",
";",
"however",
",",
"at",
"the",
"cellular",
"level",
",",
"it",
"reduced",
"MAPK8",
"signal",
"in",
"the",
"somata",
"(",
"Figure",
"S2I",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | However, the effect of WDR5 inhibitor and CX-4945 in T-ALL remains unknown. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"the",
"effect",
"of",
"WDR5",
"inhibitor",
"and",
"CX-4945",
"in",
"T-ALL",
"remains",
"unknown",
"."
]
}
] |
PMC11585565 | A normality test was conducted to determine the data distribution. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"normality",
"test",
"was",
"conducted",
"to",
"determine",
"the",
"data",
"distribution",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.