PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC8143558 | In one study, Callistemon viminalis (Sol. | [
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"."
]
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PMC11711347 | Notably, complex compounds containing Ni(II) metals have demonstrated significant antimicrobial properties . | [
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"properties",
"."
]
}
] |
PMC10213179 | injection of fluorescent-labeled aptamers with cyanine 7 (Cy7): Cy7-ATOP or Cy7-SCR at a concentration of 1.6 mg/kg. | [
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"of",
"1.6",
"mg/kg",
"."
]
}
] |
PMC9712534 | The t1/2 of fluorescence recovery was calculated to be 5.36 ± 0.98 s (DMSO) and 5.66 ± 1.01 s (ICRF). ( | [
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],
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"t1/2",
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"and",
"5.66",
"±",
"1.01",
"s",
"(",
"ICRF",
")",
".",
"("
]
}
] |
PMC9429973 | Rescue therapy with high dose cytarabine was promptly started. | [
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"promptly",
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"."
]
}
] |
PMC2118063 | We selected two independent clones, one expressing siRNA #2 and one expressing siRNA #5, in which Irf8 transcripts were reduced to levels 10% or less of those expressed by control cells when normalized to levels of β-actin or Gapdh (unpublished data). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"selected",
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"#",
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"Irf8",
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"expressed",
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"β-actin",
"or",
"Gapdh",
"(",
"unpublished",
"data",
")",
"."
]
}
] |
PMC11745823 | Subsequently, the culture media was discarded, and the cells were treated with cell counting kit‐8 (CCK‐8) (10 μL) as per the manufacturer's guidelines. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"(",
"10",
"μL",
")",
"as",
"per",
"the",
"manufacturer",
"'s",
"guidelines",
"."
]
}
] |
PMC11407042 | Refer to problem 3 and problem 4 for the solution of abnormal absorbance. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
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"abnormal",
"absorbance",
"."
]
}
] |
PMC11320834 | The signal was detected at 380 and 230 nm for topotecan and olaparib, respectively. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"and",
"olaparib",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Palpable spleen size was similar between patients with PMF and SMF (median 3 vs 4 cm, P=0.325). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"spleen",
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"was",
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"(",
"median",
"3",
"vs",
"4",
"cm",
",",
"P=0.325",
")",
"."
]
}
] |
PMC11676670 | The cell lines were regularly tested for mycoplasma contamination. | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"tested",
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"mycoplasma",
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"."
]
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] |
PMC11545868 | These signals lead to the activation of pro-apoptotic proteins such as Bax and Bak, which promote mitochondrial outer membrane permeabilization (MOMP). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"mitochondrial",
"outer",
"membrane",
"permeabilization",
"(",
"MOMP",
")",
"."
]
}
] |
PMC11529598 | p < 0.05. | [
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"O",
"O",
"O"
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"<",
"0.05",
"."
]
}
] |
PMC10079526 | NamalwaBurkitt Lymphoma (EBV)+-MutantRAMOSBurkitt Lymphoma+-MutantCA46Burkitt Lymphoma+-MutantDG75Burkitt Lymphoma+-MutantST486Burkitt Lymphoma (EBV)+-MutantOCI-Ly3Diffuse Large B-cell Lymphoma (ABC)-BCL2 (CNG)WTU2932Diffuse Large B-cell Lymphoma (ABC)-BCL2, BCL6MutantSC-1Diffuse Large B-cell Lymphoma (GCB)+BCL2MutantSUDHL4Diffuse Large B-cell Lymphoma (GCB)+BCL2, BCL6MutantSUDHL5Diffuse Large B-cell Lymphoma (GCB)+BCL2WT B cell lymphoma cell panel cell lines, specifics and mutational information. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
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"NamalwaBurkitt",
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"Lymphoma+-MutantST486Burkitt",
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"Large",
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"Lymphoma",
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"Large",
"B-cell",
"Lymphoma",
"(ABC)-BCL2",
",",
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"Large",
"B-cell",
"Lymphoma",
"(GCB)+BCL2MutantSUDHL4Diffuse",
"Large",
"B-cell",
"Lymphoma",
"(GCB)+BCL2",
",",
"BCL6MutantSUDHL5Diffuse",
"Large",
"B-cell",
"Lymphoma",
"(GCB)+BCL2WT",
"B",
"cell",
"lymphoma",
"cell",
"panel",
"cell",
"lines",
",",
"specifics",
"and",
"mutational",
"information",
"."
]
}
] |
PMC11365427 | Our findings indicated that protein expression levels were altered after the uptake of phenylalanine, leading to a significant enrichment of these proteins within the endoplasmic reticulum (ER) membrane structures. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"reticulum",
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")",
"membrane",
"structures",
"."
]
}
] |
PMC11486946 | Besides EGFR, various types of receptors on the plasma membrane have been reported to change their mobility according to their activation and the cluster formation to propagate downstream signaling, suggesting that single-molecule tracking-based drug screening is applicable to a wide variety of membrane receptors. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"."
]
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] |
PMC11803918 | Fluorescence spectra of Rhodamine B and Ce6 (excitation at 540 nm, emission at 550–700 nm). ( | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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",",
"emission",
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"550–700",
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")",
".",
"("
]
}
] |
PMC10006224 | Current models propose that cohesin is loaded at sites bound by NIPBL, often TSS or active enhancers, and then moves away extruding DNA until stopped and stabilized at CTCF sites. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"and",
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"CTCF",
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"."
]
}
] |
PMC11730311 | Nine metabolites were identified for hαCGRP8-37S19K-C20DA-γGlu. ( | [
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"-",
"37S19K-C20DA-γGlu",
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"("
]
}
] |
PMC11489351 | Finally, this work identifies pH-dependent pathways that may be dysregulated in diseases associated with altered pHi dynamics, such as cancer (increased pHi) (22) and neurodegeneration (lowered pHi) (23). | [
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"Finally",
",",
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"work",
"identifies",
"pH-dependent",
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"in",
"diseases",
"associated",
"with",
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"dynamics",
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"such",
"as",
"cancer",
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")",
"(",
"22",
")",
"and",
"neurodegeneration",
"(",
"lowered",
"pHi",
")",
"(",
"23",
")",
"."
]
}
] |
PMC9599726 | Cells were treated with either 50 µM of CumOOH for 45 min (GIST882 cells) or 100 µM for 30 min (GIST48) (Figures S1 and S2). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"B-CellLine",
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"O",
"B-CellLine",
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"O"
],
"tokens": [
"Cells",
"were",
"treated",
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"(",
"GIST48",
")",
"(",
"Figures",
"S1",
"and",
"S2",
")",
"."
]
}
] |
PMC8956657 | Whole cell lysates (4% of sample) and co-precipitation samples (25% of sample) were analyzed by western blot. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
],
"tokens": [
"Whole",
"cell",
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"%",
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")",
"and",
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"samples",
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"25",
"%",
"of",
"sample",
")",
"were",
"analyzed",
"by",
"western",
"blot",
"."
]
}
] |
PMC11317131 | This strategy allowed for the insertion of an att site using PE followed by the insertion of the donor plasmid by PhiC31 integrase at the target sequence (Figure 1A). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"strategy",
"allowed",
"for",
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"insertion",
"of",
"an",
"att",
"site",
"using",
"PE",
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"by",
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"insertion",
"of",
"the",
"donor",
"plasmid",
"by",
"PhiC31",
"integrase",
"at",
"the",
"target",
"sequence",
"(",
"Figure",
"1A",
")",
"."
]
}
] |
PMC11759543 | Vorinostat, an HDAC inhibitor used in anti-cancer treatment, has a different mechanism of action compared to doxorubicin. | [
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
],
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",",
"an",
"HDAC",
"inhibitor",
"used",
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"anti-cancer",
"treatment",
",",
"has",
"a",
"different",
"mechanism",
"of",
"action",
"compared",
"to",
"doxorubicin",
"."
]
}
] |
PMC11790971 | Five ML models were utilized and compared for the single cell classification, including the k-nearest neighbors (kNN), random forest (RF), gradient boosting classifier (GBC), support vector machine (SVM), and multi-layer perceptron (MLP). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Five",
"ML",
"models",
"were",
"utilized",
"and",
"compared",
"for",
"the",
"single",
"cell",
"classification",
",",
"including",
"the",
"k-nearest",
"neighbors",
"(",
"kNN",
")",
",",
"random",
"forest",
"(",
"RF",
")",
",",
"gradient",
"boosting",
"classifier",
"(",
"GBC",
")",
",",
"support",
"vector",
"machine",
"(",
"SVM",
")",
",",
"and",
"multi-layer",
"perceptron",
"(",
"MLP",
")",
"."
]
}
] |
PMC10957991 | TFM was done with silicone-based Nusil 96 well plates with embedded microspheres. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"TFM",
"was",
"done",
"with",
"silicone-based",
"Nusil",
"96",
"well",
"plates",
"with",
"embedded",
"microspheres",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Safety will be assessed by the incidence and severity of adverse events. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
],
"tokens": [
"Safety",
"will",
"be",
"assessed",
"by",
"the",
"incidence",
"and",
"severity",
"of",
"adverse",
"events",
"."
]
}
] |
PMC9874064 | Since there are disulfide bonds in the polymer backbone of PHHM, it can be possibly activated by GSH overexpressed in cancer cells, resulting in polymer carrier degradation, nanoparticle dissociation, and drug release. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Since",
"there",
"are",
"disulfide",
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"polymer",
"backbone",
"of",
"PHHM",
",",
"it",
"can",
"be",
"possibly",
"activated",
"by",
"GSH",
"overexpressed",
"in",
"cancer",
"cells",
",",
"resulting",
"in",
"polymer",
"carrier",
"degradation",
",",
"nanoparticle",
"dissociation",
",",
"and",
"drug",
"release",
"."
]
}
] |
PMC11743316 | The mitochondria constitute the “energy center” of the cell, producing over 90 % ATP. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"mitochondria",
"constitute",
"the",
"“",
"energy",
"center",
"”",
"of",
"the",
"cell",
",",
"producing",
"over",
"90",
"%",
"ATP",
"."
]
}
] |
PMC11190238 | Given the transitional and continuous nature of the EMT Spectrum, it is crucial to delineate the regulatory landscape of subpopulations of different EMT states under different context. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Given",
"the",
"transitional",
"and",
"continuous",
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"EMT",
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"crucial",
"to",
"delineate",
"the",
"regulatory",
"landscape",
"of",
"subpopulations",
"of",
"different",
"EMT",
"states",
"under",
"different",
"context",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | A majority of the variants were located in the runt homology domain (RHD). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"majority",
"of",
"the",
"variants",
"were",
"located",
"in",
"the",
"runt",
"homology",
"domain",
"(",
"RHD",
")",
"."
]
}
] |
PMC11711127 | Anti-neoplastic drugs are designed to kill (cancer cells), and therefore their main side-effect is the unwanted collateral death of other healthy cells, and T cells are no exception. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Anti-neoplastic",
"drugs",
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"cancer",
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")",
",",
"and",
"therefore",
"their",
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"side-effect",
"is",
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"unwanted",
"collateral",
"death",
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"other",
"healthy",
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",",
"and",
"T",
"cells",
"are",
"no",
"exception",
"."
]
}
] |
PMC11347429 | Analysis of the genotype date after quality control revealed that the percent of missing SNPs per sample ranged from 2% to 6% (mean, 4%) with results differing somewhat between batches (means: SIG_geno_0718: mean = 2%; SIG_geno_0419: mean = 4%; SIG_geno_2020: mean = 5%; SIG_geno_2022: mean = 5%) ( Supplementary Figure S2A ). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Analysis",
"of",
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"date",
"after",
"quality",
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")",
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":",
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":",
"mean",
"=",
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";",
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":",
"mean",
"=",
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"%",
";",
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":",
"mean",
"=",
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"%",
";",
"SIG_geno_2022",
":",
"mean",
"=",
"5",
"%",
")",
"(",
"Supplementary",
"Figure",
"S2A",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | We were able to confirm the following independent negative predictive parameters on survival in AML patients: increasing age ≥ 65 years, high-risk genetic aberrations, comorbidities (lung, heart) and higher ECOG-status. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"were",
"able",
"to",
"confirm",
"the",
"following",
"independent",
"negative",
"predictive",
"parameters",
"on",
"survival",
"in",
"AML",
"patients",
":",
"increasing",
"age",
"≥",
"65",
"years",
",",
"high-risk",
"genetic",
"aberrations",
",",
"comorbidities",
"(",
"lung",
",",
"heart",
")",
"and",
"higher",
"ECOG-status",
"."
]
}
] |
PMC10506676 | About 15-20% of all cancer cases are related to viruses, including Epstein-Barr virus (EBV), Hepatitis B virus (HBV), Hepatitis C virus (HCV), Human Herpes virus type 8 (HHV8), Human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1), Human Papillomavirus (HPV), and Merkel cell polyomavirus (MCPyV) (1). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"About",
"15",
"-",
"20",
"%",
"of",
"all",
"cancer",
"cases",
"are",
"related",
"to",
"viruses",
",",
"including",
"Epstein-Barr",
"virus",
"(",
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")",
",",
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"B",
"virus",
"(",
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")",
",",
"Hepatitis",
"C",
"virus",
"(",
"HCV",
")",
",",
"Human",
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"type",
"8",
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")",
",",
"Human",
"T-cell",
"lymphotropic",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"HTLV-1",
")",
",",
"Human",
"Papillomavirus",
"(",
"HPV",
")",
",",
"and",
"Merkel",
"cell",
"polyomavirus",
"(",
"MCPyV",
")",
"(",
"1",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Primary efficacy endpoint was investigator-assessed overall response rate (ORR, ≥partial response [PR] per IMWG criteria by investigator). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Primary",
"efficacy",
"endpoint",
"was",
"investigator-assessed",
"overall",
"response",
"rate",
"(",
"ORR",
",",
"≥partial",
"response",
"[",
"PR",
"]",
"per",
"IMWG",
"criteria",
"by",
"investigator",
")",
"."
]
}
] |
PMC11742290 | To date, only two studies investigated the role of LGR5 in ovarian cancer migration or invasion. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"date",
",",
"only",
"two",
"studies",
"investigated",
"the",
"role",
"of",
"LGR5",
"in",
"ovarian",
"cancer",
"migration",
"or",
"invasion",
"."
]
}
] |
PMC10197932 | We extended our analysis to the lymphoblastic Jurkat cells (Acute lymphoblastic leukemic T-cells) which are less susceptible to necrosis but show a G0/G1 arrest following US treatment. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"extended",
"our",
"analysis",
"to",
"the",
"lymphoblastic",
"Jurkat",
"cells",
"(",
"Acute",
"lymphoblastic",
"leukemic",
"T-cells",
")",
"which",
"are",
"less",
"susceptible",
"to",
"necrosis",
"but",
"show",
"a",
"G0/G1",
"arrest",
"following",
"US",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC11727062 | Furthermore, APS can also act as a local mucosal adjuvant to inhibit melanoma metastasis. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"APS",
"can",
"also",
"act",
"as",
"a",
"local",
"mucosal",
"adjuvant",
"to",
"inhibit",
"melanoma",
"metastasis",
"."
]
}
] |
PMC11531744 | Their consensus values were calculated after repeating for the number specified by the user, and cluster stability was evaluated by using several clustering runs of algorithm. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Their",
"consensus",
"values",
"were",
"calculated",
"after",
"repeating",
"for",
"the",
"number",
"specified",
"by",
"the",
"user",
",",
"and",
"cluster",
"stability",
"was",
"evaluated",
"by",
"using",
"several",
"clustering",
"runs",
"of",
"algorithm",
"."
]
}
] |
PMC11583010 | The average DAR of ETx-22 in monkey plasma samples was determined in high-dose recovery animals (Supplementary Table S5). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"average",
"DAR",
"of",
"ETx-22",
"in",
"monkey",
"plasma",
"samples",
"was",
"determined",
"in",
"high-dose",
"recovery",
"animals",
"(",
"Supplementary",
"Table",
"S5",
")",
"."
]
}
] |
PMC10899471 | Total RNA of HT-1080 cells and tumor tissues was extracted by using an RNA Purified Total RNA Extraction Kit (Beyotime), and then reversely transcribed into cDNA with RT Master Mix (MedChemExpress, Monmouth Junction, NJ, USA), as we previously described (24). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Total",
"RNA",
"of",
"HT-1080",
"cells",
"and",
"tumor",
"tissues",
"was",
"extracted",
"by",
"using",
"an",
"RNA",
"Purified",
"Total",
"RNA",
"Extraction",
"Kit",
"(",
"Beyotime",
")",
",",
"and",
"then",
"reversely",
"transcribed",
"into",
"cDNA",
"with",
"RT",
"Master",
"Mix",
"(",
"MedChemExpress",
",",
"Monmouth",
"Junction",
",",
"NJ",
",",
"USA",
")",
",",
"as",
"we",
"previously",
"described",
"(",
"24",
")",
"."
]
}
] |
PMC11098378 | Overall, Ceg10 is composed of 8 α-helices surrounding 7 β-sheets in a conformation resembling a cysteine proteinase with a putative catalytic triad consisting of Cys-159, His-196, and Asp-204 (Fig 4A and 4B). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Overall",
",",
"Ceg10",
"is",
"composed",
"of",
"8",
"α-helices",
"surrounding",
"7",
"β-sheets",
"in",
"a",
"conformation",
"resembling",
"a",
"cysteine",
"proteinase",
"with",
"a",
"putative",
"catalytic",
"triad",
"consisting",
"of",
"Cys-159",
",",
"His-196",
",",
"and",
"Asp-204",
"(",
"Fig",
"4A",
"and",
"4B",
")",
"."
]
}
] |
PMC11718109 | Scale bar, 10 μm. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Scale",
"bar",
",",
"10",
"μm",
"."
]
}
] |
PMC11745600 | The C96Y mutation causes impaired insulin synthesis and secretion, resulting in mild hyperglycemia, with blood glucose levels of approximately 200 mg/dL in male Ins1 NOG mice. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"C96Y",
"mutation",
"causes",
"impaired",
"insulin",
"synthesis",
"and",
"secretion",
",",
"resulting",
"in",
"mild",
"hyperglycemia",
",",
"with",
"blood",
"glucose",
"levels",
"of",
"approximately",
"200",
"mg/dL",
"in",
"male",
"Ins1",
"NOG",
"mice",
"."
]
}
] |
PMC11622247 | It should be noted that the fold changes of mean fluorescence intensity induced by the probes were relatively small, probably due to the mild microporation protocol. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"should",
"be",
"noted",
"that",
"the",
"fold",
"changes",
"of",
"mean",
"fluorescence",
"intensity",
"induced",
"by",
"the",
"probes",
"were",
"relatively",
"small",
",",
"probably",
"due",
"to",
"the",
"mild",
"microporation",
"protocol",
"."
]
}
] |
PMC8414691 | After SRCAP RNAi knockdown the antibody staining of nuclei, spindles and midbodies strongly decreased, as well as the amount of SRCAP protein present in the cells (Additional file 2: Fig. S1). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"SRCAP",
"RNAi",
"knockdown",
"the",
"antibody",
"staining",
"of",
"nuclei",
",",
"spindles",
"and",
"midbodies",
"strongly",
"decreased",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"amount",
"of",
"SRCAP",
"protein",
"present",
"in",
"the",
"cells",
"(",
"Additional",
"file",
"2",
":",
"Fig.",
"S1",
")",
"."
]
}
] |
PMC11711345 | However, only the activity of cuminaldehyde has been well investigated previously, and appropriate statistical tests were applied to determine the significance of the differences between experimental groups via ANOVA followed by a post-hoc test [5-7, 28]. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"only",
"the",
"activity",
"of",
"cuminaldehyde",
"has",
"been",
"well",
"investigated",
"previously",
",",
"and",
"appropriate",
"statistical",
"tests",
"were",
"applied",
"to",
"determine",
"the",
"significance",
"of",
"the",
"differences",
"between",
"experimental",
"groups",
"via",
"ANOVA",
"followed",
"by",
"a",
"post-hoc",
"test",
"[",
"5",
"-",
"7",
",",
"28",
"]",
"."
]
}
] |
PMC11342785 | Inspection of TPPP’s amino acid sequence and AlphaFold structure prediction revealed a folded ''CORE'' domain flanked by unstructured N- and C-terminal regions (IDRs) (Fig. 1B). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Inspection",
"of",
"TPPP",
"’s",
"amino",
"acid",
"sequence",
"and",
"AlphaFold",
"structure",
"prediction",
"revealed",
"a",
"folded",
"''",
"CORE",
"''",
"domain",
"flanked",
"by",
"unstructured",
"N-",
"and",
"C-terminal",
"regions",
"(",
"IDRs",
")",
"(",
"Fig.",
"1B",
")",
"."
]
}
] |
PMC11506827 | Each experiment was performed at least three times independently, and the results are presented as the mean ± SD. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Each",
"experiment",
"was",
"performed",
"at",
"least",
"three",
"times",
"independently",
",",
"and",
"the",
"results",
"are",
"presented",
"as",
"the",
"mean",
"±",
"SD",
"."
]
}
] |
PMC10669966 | A total of 190 patients with primary tumor samples were identified for the retrospective study series. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"total",
"of",
"190",
"patients",
"with",
"primary",
"tumor",
"samples",
"were",
"identified",
"for",
"the",
"retrospective",
"study",
"series",
"."
]
}
] |
PMC11412752 | PCR reaction was performed according to the protocol of 2 × Phanta Max Master Mix (P515; Vazyme) with the primers in Table 3. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"PCR",
"reaction",
"was",
"performed",
"according",
"to",
"the",
"protocol",
"of",
"2",
"×",
"Phanta",
"Max",
"Master",
"Mix",
"(",
"P515",
";",
"Vazyme",
")",
"with",
"the",
"primers",
"in",
"Table",
"3",
"."
]
}
] |
PMC10988555 | Each membrane was incubated for 2 h under constant agitation with 5% (w/v) nonfat milk in TBST 1× buffer (50 mM Tris–HCl at pH 7.5, 150 mM NaCl and 0.1% (w/v) Tween 20) and later incubated for 1 h, at RT under constant agitation, with the primary antibodies diluted in 5% nonfat milk in TBST 1×, anti-BAX (1:5000, reference 32503, Abcam) and anti-BCL-2 (1:100; reference B3170, Sigma). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Each",
"membrane",
"was",
"incubated",
"for",
"2",
"h",
"under",
"constant",
"agitation",
"with",
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"(",
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")",
"nonfat",
"milk",
"in",
"TBST",
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"×",
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"(",
"50",
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"Tris",
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"HCl",
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"pH",
"7.5",
",",
"150",
"mM",
"NaCl",
"and",
"0.1",
"%",
"(",
"w/v",
")",
"Tween",
"20",
")",
"and",
"later",
"incubated",
"for",
"1",
"h",
",",
"at",
"RT",
"under",
"constant",
"agitation",
",",
"with",
"the",
"primary",
"antibodies",
"diluted",
"in",
"5",
"%",
"nonfat",
"milk",
"in",
"TBST",
"1",
"×",
",",
"anti-BAX",
"(",
"1:5000",
",",
"reference",
"32503",
",",
"Abcam",
")",
"and",
"anti-BCL-2",
"(",
"1:100",
";",
"reference",
"B3170",
",",
"Sigma",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Nevertheless, this long term follow up demonstrated that there is still a room for improvement trying to identify PET3 negative pts that will relapse and escalating treatment in PET3 positive pts to improve outcome. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Nevertheless",
",",
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"term",
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"improvement",
"trying",
"to",
"identify",
"PET3",
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"that",
"will",
"relapse",
"and",
"escalating",
"treatment",
"in",
"PET3",
"positive",
"pts",
"to",
"improve",
"outcome",
"."
]
}
] |
PMC11711127 | Expression of E3 ubiquitin ligases such as c-Cbl and Cbl-b have also been observed at the c-SMAC of some anergic cells and thus may also maintain their hyporesponsive state (55). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Expression",
"of",
"E3",
"ubiquitin",
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"and",
"Cbl-b",
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"also",
"been",
"observed",
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"the",
"c-SMAC",
"of",
"some",
"anergic",
"cells",
"and",
"thus",
"may",
"also",
"maintain",
"their",
"hyporesponsive",
"state",
"(",
"55",
")",
"."
]
}
] |
PMC11389534 | B cells are essential to the immune system, fulfilling vital roles within the adaptive immune response. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"B",
"cells",
"are",
"essential",
"to",
"the",
"immune",
"system",
",",
"fulfilling",
"vital",
"roles",
"within",
"the",
"adaptive",
"immune",
"response",
"."
]
}
] |
PMC11306019 | Based on our findings, individuals undergoing treatment with boronic acid-based proteasome inhibitors should avoid consuming GA and flavonoids, particularly EGCG and EGC. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Based",
"on",
"our",
"findings",
",",
"individuals",
"undergoing",
"treatment",
"with",
"boronic",
"acid-based",
"proteasome",
"inhibitors",
"should",
"avoid",
"consuming",
"GA",
"and",
"flavonoids",
",",
"particularly",
"EGCG",
"and",
"EGC",
"."
]
}
] |
PMC11266100 | Subsequently, the plasmid was subjected to a wash with 70% ethanol and centrifuged once more. | [
{
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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",",
"the",
"plasmid",
"was",
"subjected",
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"wash",
"with",
"70",
"%",
"ethanol",
"and",
"centrifuged",
"once",
"more",
"."
]
}
] |
PMC11792766 | No. P9625), and nicotinamide adenine dinucleotide (Sigma Aldrich, Cat. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O"
],
"tokens": [
"No.",
"P9625",
")",
",",
"and",
"nicotinamide",
"adenine",
"dinucleotide",
"(",
"Sigma",
"Aldrich",
",",
"Cat",
"."
]
}
] |
PMC9046263 | Our qPCR experiments based on the primers for the ERVK3-1 locus in the A172 adherent line and GBM neurosphere lines (GBM28 and GBM43) confirmed robust expression of the HML-6 locus (A172 > GBM43 > GBM28) and support our bioinformatics findings (Fig. 3). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"qPCR",
"experiments",
"based",
"on",
"the",
"primers",
"for",
"the",
"ERVK3",
"-",
"1",
"locus",
"in",
"the",
"A172",
"adherent",
"line",
"and",
"GBM",
"neurosphere",
"lines",
"(",
"GBM28",
"and",
"GBM43",
")",
"confirmed",
"robust",
"expression",
"of",
"the",
"HML-6",
"locus",
"(",
"A172",
">",
"GBM43",
">",
"GBM28",
")",
"and",
"support",
"our",
"bioinformatics",
"findings",
"(",
"Fig.",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Two patients (9.1%) with grade I-II aGVHD were found in the CAR-T group. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Two",
"patients",
"(",
"9.1",
"%",
")",
"with",
"grade",
"I-II",
"aGVHD",
"were",
"found",
"in",
"the",
"CAR-T",
"group",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Additionally, ≈50% of patients (pts) become CS refractory/dependent (SR/D), requiring second-line treatment. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Additionally",
",",
"≈50",
"%",
"of",
"patients",
"(",
"pts",
")",
"become",
"CS",
"refractory/dependent",
"(",
"SR/D",
")",
",",
"requiring",
"second-line",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC4485786 | Final staining was performed with a Permanent AP Red Kit (Zytomed Systems). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Final",
"staining",
"was",
"performed",
"with",
"a",
"Permanent",
"AP",
"Red",
"Kit",
"(",
"Zytomed",
"Systems",
")",
"."
]
}
] |
PMC11283030 | a. The effects of ACLY silencing on the migration ability (wound healing). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"a.",
"The",
"effects",
"of",
"ACLY",
"silencing",
"on",
"the",
"migration",
"ability",
"(",
"wound",
"healing",
")",
"."
]
}
] |
PMC11767582 | On the one hand, 3,4,5-trimethoxyaryl azide 1 was prepared, in a quantitative yield, from the corresponding aniline by a two-step one-pot procedure, consisting of a standard diazotization followed by the displacement of the resulting diazo group with sodium azide (Scheme 3) . | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"On",
"the",
"one",
"hand",
",",
"3,4,5-trimethoxyaryl",
"azide",
"1",
"was",
"prepared",
",",
"in",
"a",
"quantitative",
"yield",
",",
"from",
"the",
"corresponding",
"aniline",
"by",
"a",
"two-step",
"one-pot",
"procedure",
",",
"consisting",
"of",
"a",
"standard",
"diazotization",
"followed",
"by",
"the",
"displacement",
"of",
"the",
"resulting",
"diazo",
"group",
"with",
"sodium",
"azide",
"(",
"Scheme",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC10213199 | In recent years, with the development of high-throughput technologies and innovative computational methods in drug discovery, the desire to elucidate the molecular mechanisms of TCM have been reinvigorated. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"recent",
"years",
",",
"with",
"the",
"development",
"of",
"high-throughput",
"technologies",
"and",
"innovative",
"computational",
"methods",
"in",
"drug",
"discovery",
",",
"the",
"desire",
"to",
"elucidate",
"the",
"molecular",
"mechanisms",
"of",
"TCM",
"have",
"been",
"reinvigorated",
"."
]
}
] |
PMC11700247 | These outcomes were driven by the activation of the stimulator of interferon genes (STING) pathway, which subsequently triggered crosspresentation and initiated a systemic effector T-cell response. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"tokens": [
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"."
]
}
] |
PMC8633974 | Cells were incubated overnight at 4C in a rocker. | [
{
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
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]
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] |
PMC10196713 | RNA isolation and RT-qPCR were conducted as previously described (28). | [
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"O",
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"."
]
}
] |
PMC11291490 | The receptor-binding domain (RBD) of the SARS-CoV-2 spike protein fused with msCD40L could enhance the humoral immunogenicity of RBD. | [
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"O",
"O",
"O",
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"RBD",
"."
]
}
] |
PMC11593713 | In the case of those patients, the differences in TAC levels were attributed to high ROS production, an acute inflammatory condition, the infiltration of inflammatory cells into the different organs, multiorgan involvement, and declined oxygen saturation . | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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",",
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",",
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"."
]
}
] |
PMC6034753 | Confocal photomicrographs are representative of three independent experiments on CEF, DF-1 and MSB-1 cells. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"B-CellLine",
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"B-CellLine",
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"cells",
"."
]
}
] |
PMC5916734 | Panel B – RT-PCR products for total mRNA with primers towards the 5’- and 3’- ends of the FIX ORF; the amplification product of expected size is shown with a red arrow. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"arrow",
"."
]
}
] |
PMC9688728 | We have also observed significant enrichment in several pathways associated with the metabolism and biosynthesis of various amino acids, e.g., alanine; aspartate and glutamate metabolism (map00250, p-value = 3.62 × 10). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"."
]
}
] |
PMC10809689 | a.) Displays changes in glutamate concentration (µmol/L) in control, PMA, and PG72 groups in the HL-60 cell line. ( | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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".",
"("
]
}
] |
PMC10551595 | The mechanism through which GinA may exert its cytotoxic effects on T‐ALL was further explored. | [
{
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],
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"."
]
}
] |
PMC8973725 | This is the first report to evaluate the influence of ZNF677 on ccRCC cells malignant biological behavior. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | At the time of relapse, 3/20 type 2 patients exhibited a hypermutator phenotype, probably caused by gains of mutations in TP53, BLM and BUB1B combined with PMS2. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
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"the",
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"."
]
}
] |
PMC8777939 | Statistical analysis was conducted by two-tailed unpaired Student’s t-test and one-way analysis of variance (ANOVA) using GraphPad Prism software version 7 (GraphPad, Inc., La Jolla, CA, USA). | [
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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")",
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"GraphPad",
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"Inc.",
",",
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"Jolla",
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"."
]
}
] |
PMC11467964 | Two cell lines (SW982 and SYO‐1) are distributed on six well plates. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"B-CellLine",
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"O",
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"O",
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | Using the same panel analysis, U2AF1 gene mutation was more frequently in the MDS-MF compared with those patients without MF (P=0.027). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O"
],
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"without",
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"P=0.027",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The morphology of the iPSCs line (primed cells) displayed a typical ESC-like colony appearance comprised of tightly packed cells. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"morphology",
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"the",
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"typical",
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"tightly",
"packed",
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"."
]
}
] |
PMC9080589 | After 24 h, the migrated cells on the lower surface of the filter were fixed, stained and counted under a light microscope (Olympus Corp., Tokyo, Japan). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"."
]
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] |
PMC10452486 | Indeed, the molecular mass (45 kDa) of the antigen reacting to mAb LA45 paralleled with the expression of Face-2. | [
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"O",
"O",
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"O",
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"Face-2",
"."
]
}
] |
PMC11367146 | Cells treated with IL-1β (10 ng/ml) for 2 h followed by different doses (50 and 100 μg/ml) of VTE and incubated for 24 h. The graph is plotted by integrating mean ± SD (n = 3). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"graph",
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"n",
"=",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC5916734 | Specific real-time PCR primers Table 2 lists the primers used to assess the copy number of the expression cassette integrated into the genome and the mRNA level. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"PCR",
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"copy",
"number",
"of",
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"expression",
"cassette",
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"genome",
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"the",
"mRNA",
"level",
"."
]
}
] |
PMC11012012 | The expression of SLAMF3/CD229 was particularly strong in lymphomas of marginal zone origin . | [
{
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"of",
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"zone",
"origin",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Methods: We reported the outcomes of a HLA-10/10 matched unrelated donor (MUD) allo-HSCT cohort, treated with PT-Cy (n=30) between April 2020 and July 2021, and performed a retrospective comparison with an historical control group treated with ATG (n=64). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"Methods",
":",
"We",
"reported",
"the",
"outcomes",
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"n=64",
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"."
]
}
] |
PMC10878518 | Oncolytic virotherapy became a novel antitumor therapy for inducing tumor-specific cell lysis. | [
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] |
PMC9429973 | For intolerant patients who received infratherapeutic doses, adverse events were resolved and quality of life improved. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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]
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] |
PMC11731614 | Glabrous paw skin is dissected from the mouse and incubated in dispase (2.3 mg/ml) overnight. | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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PMC11725127 | CETSA was performed on MM.1S cells as described in materials and methods. | [
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PMC11621493 | The “gene ratio” (x-axis) represents the ratio of core enriched genes (genes before or after the point at which the running enrichment score reaches its maximum or minimum; see B–D and H–J) to the total number of genes in the gene set. | [
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PMC10048572 | However, the wider the range of mutations, the more likely it is that the key ones determining the aggressive nature of the tumor will appear. | [
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PMC10582049 | Interestingly, high expression of DCN, LAMA2, and ELN in lung cancer is associated with better survival. | [
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PMC6133382 | Briefly, purified proteins were captured onto wells of black 96-well microtiter plates coated with a mouse monoclonal antibody against the N-terminal gD tag present in all 3 proteins. | [
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PMC7757104 | A recent study has also reported that interleukins produced by the tumor microenvironment promote the EMT through altered expression of several inducers of this process, including Snail and STAT transcription factors (5). | [
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PMC10955424 | Although tofacitinib was not studied in ovarian cancer, its interaction with PI3K may account for its superior effectiveness over roxolitinib in re-sensitizing OC cells . | [
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PMC10197932 | Monobromobimane cod. | [
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PMC11297139 | 3Loss of ARID1A LLPS significantly reduces proliferative and invasive property of Ewing’s sarcoma.a Expression levels of ARID1A protein in different types of cancer obtained from the cancer cell line encyclopedia. | [
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