Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11441402
The automated cell imaging system is similar to this new method, utilizing fluorescence imaging for analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "automated", "cell", "imaging", "system", "is", "similar", "to", "this", "new", "method", ",", "utilizing", "fluorescence", "imaging", "for", "analysis", "." ] } ]
PMC11529598
In addition, the invasion ability was also enhanced in TP53INP1 knockdown glioblastoma cells, and interference of TP53INP1 eliminated the difference between miR-3154 sponge cells and control cells (Fig. 5H&I, supplementary Fig. 4B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "the", "invasion", "ability", "was", "also", "enhanced", "in", "TP53INP1", "knockdown", "glioblastoma", "cells", ",", "and", "interference", "of", "TP53INP1", "eliminated", "the", "difference", "between", "miR-3154", "sponge", "cells", "and", "control", "cells", "(", "Fig.", "5H&I", ",", "supplementary", "Fig.", "4B", ")", "." ] } ]
PMC11798926
IFITM3 is trafficked transiently to the plasma membrane but rapidly endocytosed and transported to the endolysosomal network, where it acts to restrict viral entry, perhaps by inhibiting the formation of a fusion pore (Spence et al., 2019; Desai et al., 2014).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IFITM3", "is", "trafficked", "transiently", "to", "the", "plasma", "membrane", "but", "rapidly", "endocytosed", "and", "transported", "to", "the", "endolysosomal", "network", ",", "where", "it", "acts", "to", "restrict", "viral", "entry", ",", "perhaps", "by", "inhibiting", "the", "formation", "of", "a", "fusion", "pore", "(", "Spence", "et", "al.", ",", "2019", ";", "Desai", "et", "al.", ",", "2014", ")", "." ] } ]
PMC9503541
The bioactivity of the fractions was also consistent with the results of the scratch/wound healing assay.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "bioactivity", "of", "the", "fractions", "was", "also", "consistent", "with", "the", "results", "of", "the", "scratch/wound", "healing", "assay", "." ] } ]
PMC9429973
A. M. Zeidan, E. S. Mearns, C. Ng, A. Shah, N. Lamarre, A. Yellow-Duke, N. Alrawashdh, B. Yang, W. Cheng, C. N. Bui, A. Svensson Yale Cancer Center, Yale University School of Medicine, New Haven; Genentech, Inc., South San Francisco; Real World Data Analytics, Genesis Research, Hoboken; Roche Diagnostics, Santa Clara; AbbVie, North Chicago, United States of America Background: Myelodysplastic syndromes (MDS) are a spectrum of hematopoietic neoplasms characterized by variable degrees of cytopenias and risk of progression to acute myeloid leukemia (AML).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "M.", "Zeidan", ",", "E.", "S.", "Mearns", ",", "C.", "Ng", ",", "A.", "Shah", ",", "N.", "Lamarre", ",", "A.", "Yellow-Duke", ",", "N.", "Alrawashdh", ",", "B.", "Yang", ",", "W.", "Cheng", ",", "C.", "N.", "Bui", ",", "A.", "Svensson", "Yale", "Cancer", "Center", ",", "Yale", "University", "School", "of", "Medicine", ",", "New", "Haven", ";", "Genentech", ",", "Inc.", ",", "South", "San", "Francisco", ";", "Real", "World", "Data", "Analytics", ",", "Genesis", "Research", ",", "Hoboken", ";", "Roche", "Diagnostics", ",", "Santa", "Clara", ";", "AbbVie", ",", "North", "Chicago", ",", "United", "States", "of", "America", "Background", ":", "Myelodysplastic", "syndromes", "(", "MDS", ")", "are", "a", "spectrum", "of", "hematopoietic", "neoplasms", "characterized", "by", "variable", "degrees", "of", "cytopenias", "and", "risk", "of", "progression", "to", "acute", "myeloid", "leukemia", "(", "AML", ")", "." ] } ]
PMC9503685
In addition, in parallel with the previously obtained data, ceragenins have been shown to have bactericidal activity .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "in", "parallel", "with", "the", "previously", "obtained", "data", ",", "ceragenins", "have", "been", "shown", "to", "have", "bactericidal", "activity", "." ] } ]
PMC11777207
Error bars indicate SEM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Error", "bars", "indicate", "SEM", "." ] } ]
PMC11794588
Previous studies on the chemical composition of various Cestrum species, such as parquine, carboxyparquine, and steroids, were conducted.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Previous", "studies", "on", "the", "chemical", "composition", "of", "various", "Cestrum", "species", ",", "such", "as", "parquine", ",", "carboxyparquine", ",", "and", "steroids", ",", "were", "conducted", "." ] } ]
PMC11045125
The following antibodies were used for immunoblot analyses in this study: anti-R rabbit polyclonal antibody directed against the R peptide (peptide sequence EDPDEETSSQAVKALREMAD, anti-BACH2 (Cell Signaling #80775), anti-BCL6 (Cell Signaling #14895), anti-BHRF1 (Millipore #MAB8188), anti-BIM (Cell Signaling #2933), anti-BLIMP1 (Cell Signaling #9115), anti-BMRF1 (Millipore #MAB8186), anti-BZLF1 (Santa Cruz #sc-53904), anti-CD10 (Abcam #ab227659), anti-CD19 (Abcam #ab134114), anti-CD30 (Invitrogen #MA536219), anti-CD179b (Invitrogen #702901), anti-Cyclin D2 (Cell Signaling #3741), anti-Cyclin D3 (Cell Signaling #2936), anti-DNMT1 (Abcam #ab188453), anti-DNMT3B (Santa Cruz #sc-376043), anti-EBNA1 (Santa Cruz #sc-81581), anti-EBNA2 (Abcam #ab90543), anti-EBNA3A (Exalpha #F115P), anti-GCSAM (Cell Signaling #20289), anti-GFP (Santa Cruz #sc-9996), anti-IL7R (Santa Cruz #sc-514445), anti-IL10Rα (R&D #MAB2742), anti-IL21R (R&D #MAB991), anti-IRF4 (Santa Cruz #sc-56713), anti-JAK1 (Cell Signaling #3332), anti-JAK2 (Cell Signaling #3230), anti-LMP1 (Abcam #ab78113), anti-c-Myb (Cell Signaling #12319), anti-c-Myc (Abcam #ab32072), anti-p100/52 (Cell Signaling #3017), anti-RAG1 (Cell Signaling #3968), anti-SOCS1 (Cell Signaling #55313), anti-SRC (Cell Signaling #2109), anti-phospho-SRC (Tyr416) (Cell Signaling #2101), anti-STAT3 (Cell Signaling #4904), anti-phospho-STAT3 (Y705) (Cell Signaling #9145), anti-phospho-STAT5 (Y694) (Cell Signaling #9359), anti-TCF3 (E2A) (Cell Signaling #4865), anti-TCL1 (Cell Signaling #4042), anti-TDT (Invitrogen #14-9739-82), anti-UHRF1 (Cell Signaling #12387), anti-Tubulin (Sigma #T5168), and anti-Actin (Sigma #A5441).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "following", "antibodies", "were", "used", "for", "immunoblot", "analyses", "in", "this", "study", ":", "anti-R", "rabbit", "polyclonal", "antibody", "directed", "against", "the", "R", "peptide", "(", "peptide", "sequence", "EDPDEETSSQAVKALREMAD", ",", "anti-BACH2", "(", "Cell", "Signaling", "#", "80775", ")", ",", "anti-BCL6", "(", "Cell", "Signaling", "#", "14895", ")", ",", "anti-BHRF1", "(", "Millipore", "#", "MAB8188", ")", ",", "anti-BIM", "(", "Cell", "Signaling", "#", "2933", ")", ",", "anti-BLIMP1", "(", "Cell", "Signaling", "#", "9115", ")", ",", "anti-BMRF1", "(", "Millipore", "#", "MAB8186", ")", ",", "anti-BZLF1", "(", "Santa", "Cruz", "#", "sc-53904", ")", ",", "anti-CD10", "(", "Abcam", "#", "ab227659", ")", ",", "anti-CD19", "(", "Abcam", "#", "ab134114", ")", ",", "anti-CD30", "(", "Invitrogen", "#", "MA536219", ")", ",", "anti-CD179b", "(", "Invitrogen", "#", "702901", ")", ",", "anti-Cyclin", "D2", "(", "Cell", "Signaling", "#", "3741", ")", ",", "anti-Cyclin", "D3", "(", "Cell", "Signaling", "#", "2936", ")", ",", "anti-DNMT1", "(", "Abcam", "#", "ab188453", ")", ",", "anti-DNMT3B", "(", "Santa", "Cruz", "#", "sc-376043", ")", ",", "anti-EBNA1", "(", "Santa", "Cruz", "#", "sc-81581", ")", ",", "anti-EBNA2", "(", "Abcam", "#", "ab90543", ")", ",", "anti-EBNA3A", "(", "Exalpha", "#", "F115P", ")", ",", "anti-GCSAM", "(", "Cell", "Signaling", "#", "20289", ")", ",", "anti-GFP", "(", "Santa", "Cruz", "#", "sc-9996", ")", ",", "anti-IL7R", "(", "Santa", "Cruz", "#", "sc-514445", ")", ",", "anti-IL10Rα", "(", "R&D", "#", "MAB2742", ")", ",", "anti-IL21R", "(", "R&D", "#", "MAB991", ")", ",", "anti-IRF4", "(", "Santa", "Cruz", "#", "sc-56713", ")", ",", "anti-JAK1", "(", "Cell", "Signaling", "#", "3332", ")", ",", "anti-JAK2", "(", "Cell", "Signaling", "#", "3230", ")", ",", "anti-LMP1", "(", "Abcam", "#", "ab78113", ")", ",", "anti-c-Myb", "(", "Cell", "Signaling", "#", "12319", ")", ",", "anti-c-Myc", "(", "Abcam", "#", "ab32072", ")", ",", "anti-p100/52", "(", "Cell", "Signaling", "#", "3017", ")", ",", "anti-RAG1", "(", "Cell", "Signaling", "#", "3968", ")", ",", "anti-SOCS1", "(", "Cell", "Signaling", "#", "55313", ")", ",", "anti-SRC", "(", "Cell", "Signaling", "#", "2109", ")", ",", "anti-phospho-SRC", "(", "Tyr416", ")", "(", "Cell", "Signaling", "#", "2101", ")", ",", "anti-STAT3", "(", "Cell", "Signaling", "#", "4904", ")", ",", "anti-phospho-STAT3", "(", "Y705", ")", "(", "Cell", "Signaling", "#", "9145", ")", ",", "anti-phospho-STAT5", "(", "Y694", ")", "(", "Cell", "Signaling", "#", "9359", ")", ",", "anti-TCF3", "(", "E2A", ")", "(", "Cell", "Signaling", "#", "4865", ")", ",", "anti-TCL1", "(", "Cell", "Signaling", "#", "4042", ")", ",", "anti-TDT", "(", "Invitrogen", "#", "14", "-", "9739", "-", "82", ")", ",", "anti-UHRF1", "(", "Cell", "Signaling", "#", "12387", ")", ",", "anti-Tubulin", "(", "Sigma", "#", "T5168", ")", ",", "and", "anti-Actin", "(", "Sigma", "#", "A5441", ")", "." ] } ]
PMC9429973
In survey 1, the questions with the lowest number of correct answers were Q3 (7%), about cefepime dose and Q1 (9%) which asked about the epidemiologic link between the use of high-dose cytarabine and viridans streptococcal bacteremia.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "survey", "1", ",", "the", "questions", "with", "the", "lowest", "number", "of", "correct", "answers", "were", "Q3", "(", "7", "%", ")", ",", "about", "cefepime", "dose", "and", "Q1", "(", "9", "%", ")", "which", "asked", "about", "the", "epidemiologic", "link", "between", "the", "use", "of", "high-dose", "cytarabine", "and", "viridans", "streptococcal", "bacteremia", "." ] } ]
PMC11679033
The widespread occurrence of moulds has recently drawn researchers’ attention to study their presence in new plants used in food and medicine, including medical cannabis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "widespread", "occurrence", "of", "moulds", "has", "recently", "drawn", "researchers", "’", "attention", "to", "study", "their", "presence", "in", "new", "plants", "used", "in", "food", "and", "medicine", ",", "including", "medical", "cannabis", "." ] } ]
PMC7433824
The common proteins in P4‐treated A172 cells were alpha‐enolase, protein disulfide‐isomerase A6, heat shock 71 kDa cognate protein, mitochondrial ATP synthase subunit beta, glyceraldehyde‐3‐phosphate dehydrogenase, and mitochondrial ornithine aminotransferase.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "common", "proteins", "in", "P4‐treated", "A172", "cells", "were", "alpha‐enolase", ",", "protein", "disulfide‐isomerase", "A6", ",", "heat", "shock", "71", "kDa", "cognate", "protein", ",", "mitochondrial", "ATP", "synthase", "subunit", "beta", ",", "glyceraldehyde‐3‐phosphate", "dehydrogenase", ",", "and", "mitochondrial", "ornithine", "aminotransferase", "." ] } ]
PMC11759543
Doxorubicin, an anthracycline antibiotic, is a potent anti-cancer drug used to treat a wide variety of cancers.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Doxorubicin", ",", "an", "anthracycline", "antibiotic", ",", "is", "a", "potent", "anti-cancer", "drug", "used", "to", "treat", "a", "wide", "variety", "of", "cancers", "." ] } ]
PMC11755467
RNA from cell lysates used for Enoxacin HIV-1 ELISA assays was extracted with Trizol ™ (ThermoFisher, Waltham, MA, USA), quantified with Nanodrop (ThermoFisher, Waltham, MA, USA) and Taq-Man miRNA qRT-PCR performed according to the producer’s protocol on a Roche LightCycler 480 device and analyzed by ΔΔCt-method relative to control probe pool (U18 and Z30 small RNA) and DMSO only treated cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RNA", "from", "cell", "lysates", "used", "for", "Enoxacin", "HIV-1", "ELISA", "assays", "was", "extracted", "with", "Trizol", "™", "(", "ThermoFisher", ",", "Waltham", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "quantified", "with", "Nanodrop", "(", "ThermoFisher", ",", "Waltham", ",", "MA", ",", "USA", ")", "and", "Taq-Man", "miRNA", "qRT-PCR", "performed", "according", "to", "the", "producer", "’s", "protocol", "on", "a", "Roche", "LightCycler", "480", "device", "and", "analyzed", "by", "ΔΔCt-method", "relative", "to", "control", "probe", "pool", "(", "U18", "and", "Z30", "small", "RNA", ")", "and", "DMSO", "only", "treated", "cells", "." ] } ]
PMC10936243
The study aimed to understand the specific barriers experienced by Malaysian small animal veterinarians in seeking to provide good clinical care for post-operative cats.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "study", "aimed", "to", "understand", "the", "specific", "barriers", "experienced", "by", "Malaysian", "small", "animal", "veterinarians", "in", "seeking", "to", "provide", "good", "clinical", "care", "for", "post-operative", "cats", "." ] } ]
PMC10055960
In every well, a 10µL compound was pipetted and the plates were incubated for 24 h, in triplicate.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "every", "well", ",", "a", "10µL", "compound", "was", "pipetted", "and", "the", "plates", "were", "incubated", "for", "24", "h", ",", "in", "triplicate", "." ] } ]
PMC11700247
Please see the supplemental Methods for additional methods, including mice strains, cell lines, tumor challenge, irradiation, lymphodepleting chemotherapy, CART-19 cell manufacturing, adoptive T-cell transfer, cell isolation, flow cytometry, immunoblotting, and enzyme-linked immunospot.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Please", "see", "the", "supplemental", "Methods", "for", "additional", "methods", ",", "including", "mice", "strains", ",", "cell", "lines", ",", "tumor", "challenge", ",", "irradiation", ",", "lymphodepleting", "chemotherapy", ",", "CART-19", "cell", "manufacturing", ",", "adoptive", "T-cell", "transfer", ",", "cell", "isolation", ",", "flow", "cytometry", ",", "immunoblotting", ",", "and", "enzyme-linked", "immunospot", "." ] } ]
PMC10530622
Moreover, AhR activation suppressed IRF1 and HIF-1α levels and decreased M1 macrophage polarization in vitro.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "AhR", "activation", "suppressed", "IRF1", "and", "HIF-1α", "levels", "and", "decreased", "M1", "macrophage", "polarization", "in", "vitro", "." ] } ]
PMC11794568
The supernatant was collected and photochemically reacted with the ATP working solution.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "supernatant", "was", "collected", "and", "photochemically", "reacted", "with", "the", "ATP", "working", "solution", "." ] } ]
PMC9739791
Due to the extraordinary redox properties of riboflavin, it is widely used as a photocatalyst in the synthesis of different organic compounds, including thiobenzanilides, coumarins, and nitriles .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Due", "to", "the", "extraordinary", "redox", "properties", "of", "riboflavin", ",", "it", "is", "widely", "used", "as", "a", "photocatalyst", "in", "the", "synthesis", "of", "different", "organic", "compounds", ",", "including", "thiobenzanilides", ",", "coumarins", ",", "and", "nitriles", "." ] } ]
PMC11591038
We have shown previously that EPO may exert neuroprotective effects against metabolic insults induced by mitochondrial inhibitor 3-nitropropionic acid (3-NP) in primary cortical neurons .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "have", "shown", "previously", "that", "EPO", "may", "exert", "neuroprotective", "effects", "against", "metabolic", "insults", "induced", "by", "mitochondrial", "inhibitor", "3-nitropropionic", "acid", "(", "3-NP", ")", "in", "primary", "cortical", "neurons", "." ] } ]
PMC8494202
To further study the relationship between CKAP2L expression and prognosis of glioma, we analyzed three transcriptome datasets: CGGA microarray, CGGA RNA-seq, and TCGA RNA-seq.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "study", "the", "relationship", "between", "CKAP2L", "expression", "and", "prognosis", "of", "glioma", ",", "we", "analyzed", "three", "transcriptome", "datasets", ":", "CGGA", "microarray", ",", "CGGA", "RNA-seq", ",", "and", "TCGA", "RNA-seq", "." ] } ]
PMC4695073
Briefly, tissues were fixed with formalin and embedded with paraffin then sectioned to a thickness of 4 μm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "tissues", "were", "fixed", "with", "formalin", "and", "embedded", "with", "paraffin", "then", "sectioned", "to", "a", "thickness", "of", "4", "μm", "." ] } ]
PMC7987994
We observed the same effect of FBS in the case of extracts of Zn_SPS (Fig. 3).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "observed", "the", "same", "effect", "of", "FBS", "in", "the", "case", "of", "extracts", "of", "Zn_SPS", "(", "Fig.", "3", ")", "." ] } ]
PMC11718274
The Sulforhodamine B (SRB) assay for cell viability evaluation, while, apoptosis induction was detected using chromatin diffusion assay.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Sulforhodamine", "B", "(", "SRB", ")", "assay", "for", "cell", "viability", "evaluation", ",", "while", ",", "apoptosis", "induction", "was", "detected", "using", "chromatin", "diffusion", "assay", "." ] } ]
PMC7642379
Moreover, the 293T and 293-H cell lines have a gain of the genomic loci surrounding the FH gene, while maintaining the copy number of the FH gene compared to HEK293.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "the", "293", "T", "and", "293-H", "cell", "lines", "have", "a", "gain", "of", "the", "genomic", "loci", "surrounding", "the", "FH", "gene", ",", "while", "maintaining", "the", "copy", "number", "of", "the", "FH", "gene", "compared", "to", "HEK293", "." ] } ]
PMC9429973
4 pts discontinued treatment due to an AE, 2 of which were treatment related (n=1 each of Grade 2 fatigue; Grade 3 anemia).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "4", "pts", "discontinued", "treatment", "due", "to", "an", "AE", ",", "2", "of", "which", "were", "treatment", "related", "(", "n=1", "each", "of", "Grade", "2", "fatigue", ";", "Grade", "3", "anemia", ")", "." ] } ]
PMC11474209
Research supports the idea that an imbalance of mitochondrial-nuclear crosstalk plays a crucial part in the genesis, advancement, and pathogenesis of several MC-LR-mediated human illnesses.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Research", "supports", "the", "idea", "that", "an", "imbalance", "of", "mitochondrial-nuclear", "crosstalk", "plays", "a", "crucial", "part", "in", "the", "genesis", ",", "advancement", ",", "and", "pathogenesis", "of", "several", "MC-LR-mediated", "human", "illnesses", "." ] } ]
PMC11409031
8PFN1 is upregulated in human OV cell line HEY. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "8PFN1", "is", "upregulated", "in", "human", "OV", "cell", "line", "HEY", ".", "(" ] } ]
PMC9325715
Previously, the server was successfully used for the prediction of different metal ions binding to proteins, among others Fe to desulfoferrodoxin from Desulfovibriodesulfuricans (1DFX).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Previously", ",", "the", "server", "was", "successfully", "used", "for", "the", "prediction", "of", "different", "metal", "ions", "binding", "to", "proteins", ",", "among", "others", "Fe", "to", "desulfoferrodoxin", "from", "Desulfovibriodesulfuricans", "(", "1DFX", ")", "." ] } ]
PMC11536589
7 Hub genes identified by protein-protein interaction network analysis in Cluster 5. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "7", "Hub", "genes", "identified", "by", "protein-protein", "interaction", "network", "analysis", "in", "Cluster", "5", ".", "(" ] } ]
PMC11806106
Given the high functionality observed with both the rat MOR FRET- and BRET-based receptor conformation sensors across different approaches, we applied our strategy on the remaining family members of the opioid receptors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Given", "the", "high", "functionality", "observed", "with", "both", "the", "rat", "MOR", "FRET-", "and", "BRET-based", "receptor", "conformation", "sensors", "across", "different", "approaches", ",", "we", "applied", "our", "strategy", "on", "the", "remaining", "family", "members", "of", "the", "opioid", "receptors", "." ] } ]
PMC11075223
At present, there are nearly 80 kinds of traditional Chinese patent medicines available in the market containing Cimicifugae Rhizoma.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "present", ",", "there", "are", "nearly", "80", "kinds", "of", "traditional", "Chinese", "patent", "medicines", "available", "in", "the", "market", "containing", "Cimicifugae", "Rhizoma", "." ] } ]
PMC11394112
Here, we sought to develop an easily accessible new xenograft mouse model that better recapitulates the human disease for preclinical studies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "we", "sought", "to", "develop", "an", "easily", "accessible", "new", "xenograft", "mouse", "model", "that", "better", "recapitulates", "the", "human", "disease", "for", "preclinical", "studies", "." ] } ]
PMC11659921
TNFSF11 and OV immune microenvironment and chemotherapy sensitivity analysis. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TNFSF11", "and", "OV", "immune", "microenvironment", "and", "chemotherapy", "sensitivity", "analysis", ".", "(" ] } ]
PMC8735881
To testify the anti-HIV breadth and potency of GPI-scFvs in TZM-bl cells, a “global panel” of HIV-1 pseudoviruses, which included 12 divergent subtypes of viral Envs representing the world-wide AIDS epidemic, was further used .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "testify", "the", "anti-HIV", "breadth", "and", "potency", "of", "GPI-scFvs", "in", "TZM-bl", "cells", ",", "a", "“", "global", "panel", "”", "of", "HIV-1", "pseudoviruses", ",", "which", "included", "12", "divergent", "subtypes", "of", "viral", "Envs", "representing", "the", "world-wide", "AIDS", "epidemic", ",", "was", "further", "used", "." ] } ]
PMC11805741
PY medium (10 g L peptone, 5 g L yeast extract, 5 g L NaCl), pH 7.0, was used in isolation step.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PY", "medium", "(", "10", "g", "L", "peptone", ",", "5", "g", "L", "yeast", "extract", ",", "5", "g", "L", "NaCl", ")", ",", "pH", "7.0", ",", "was", "used", "in", "isolation", "step", "." ] } ]
PMC11730311
For Schild analysis, log [DR-1] was plotted against log [Antagonist (M)] and analysed with linear regression analysis in GraphPad Prism 9.4.1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "Schild", "analysis", ",", "log", "[", "DR-1", "]", "was", "plotted", "against", "log", "[", "Antagonist", "(", "M", ")", "]", "and", "analysed", "with", "linear", "regression", "analysis", "in", "GraphPad", "Prism", "9.4.1", "." ] } ]
PMC11696576
Cells were treated with indicated concentrations of AVX420 (µM), 1 mM H2O2, 1 µM RSL-3, or 1 µM doxorubicin (dox) for 4 h. Data are the mean ± stdev of 3 biological replicates.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "treated", "with", "indicated", "concentrations", "of", "AVX420", "(", "µM", ")", ",", "1", "mM", "H2O2", ",", "1", "µM", "RSL-3", ",", "or", "1", "µM", "doxorubicin", "(", "dox", ")", "for", "4", "h.", "Data", "are", "the", "mean", "±", "stdev", "of", "3", "biological", "replicates", "." ] } ]
PMC11694066
Therefore, targeting downstream consequences of EWS–WT1 presence, such as transcription factor–induced oncogenic programs or replication stress, is an attractive strategy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "targeting", "downstream", "consequences", "of", "EWS", "–", "WT1", "presence", ",", "such", "as", "transcription", "factor", "–", "induced", "oncogenic", "programs", "or", "replication", "stress", ",", "is", "an", "attractive", "strategy", "." ] } ]
PMC11224020
To make the polydimethylsiloxane (PDMS; RTV615) pillars at a certain height, 12-mm glass coverslips were sonicated in methanol, washed in ethanol, plasma treated and placed on the top of a PDMS mixture on top of wafer molds that contained the pillars at the desired height.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "make", "the", "polydimethylsiloxane", "(", "PDMS", ";", "RTV615", ")", "pillars", "at", "a", "certain", "height", ",", "12-mm", "glass", "coverslips", "were", "sonicated", "in", "methanol", ",", "washed", "in", "ethanol", ",", "plasma", "treated", "and", "placed", "on", "the", "top", "of", "a", "PDMS", "mixture", "on", "top", "of", "wafer", "molds", "that", "contained", "the", "pillars", "at", "the", "desired", "height", "." ] } ]
PMC10958426
Bar plot of patient count representing whether the patient's DEGreg is enriched in the GO term. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bar", "plot", "of", "patient", "count", "representing", "whether", "the", "patient", "'s", "DEGreg", "is", "enriched", "in", "the", "GO", "term", ".", "(" ] } ]
PMC8998437
The BL cell lines were obtained from the collection at the Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology of the Karolinska Institute (Stockholm, Sweden) and included four EBV-negative and nine EBV-carrying BL cell lines: three type I, four type II, and two type III lines (Figure 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "BL", "cell", "lines", "were", "obtained", "from", "the", "collection", "at", "the", "Department", "of", "Microbiology", ",", "Tumor", "and", "Cell", "Biology", "of", "the", "Karolinska", "Institute", "(", "Stockholm", ",", "Sweden", ")", "and", "included", "four", "EBV-negative", "and", "nine", "EBV-carrying", "BL", "cell", "lines", ":", "three", "type", "I", ",", "four", "type", "II", ",", "and", "two", "type", "III", "lines", "(", "Figure", "1", ")", "." ] } ]
PMC10965680
In summary, our research contributes valuable insights into the genomic characteristics of the Xiangdong black goat, underscoring its importance and utility in future breeding programs and conservation initiatives within the field of animal breeding and genetics.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "summary", ",", "our", "research", "contributes", "valuable", "insights", "into", "the", "genomic", "characteristics", "of", "the", "Xiangdong", "black", "goat", ",", "underscoring", "its", "importance", "and", "utility", "in", "future", "breeding", "programs", "and", "conservation", "initiatives", "within", "the", "field", "of", "animal", "breeding", "and", "genetics", "." ] } ]
PMC10218459
The latter are held responsible for the important biomedical effects of CPP .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "latter", "are", "held", "responsible", "for", "the", "important", "biomedical", "effects", "of", "CPP", "." ] } ]
PMC11422150
P values are based on the Wilcoxon test. *
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P", "values", "are", "based", "on", "the", "Wilcoxon", "test", ".", "*" ] } ]
PMC11721096
The pcDNA3.1 (+) plasmid was synthesized by GenScript Corporation (GenScript, Nanjing, China).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "pcDNA3.1", "(", "+", ")", "plasmid", "was", "synthesized", "by", "GenScript", "Corporation", "(", "GenScript", ",", "Nanjing", ",", "China", ")", "." ] } ]
PMC11799978
4T1 cells were cocultured with CAFs in a Transwell system for 48 h with or without the addition of NaHCO3 (0, 40, 80, 160, and 320 μg/mL) in the upper chamber for the last 24 h. The number of 4T1 cells was measured after 48 h of coculture using the trypan blue assay. (
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "4T1", "cells", "were", "cocultured", "with", "CAFs", "in", "a", "Transwell", "system", "for", "48", "h", "with", "or", "without", "the", "addition", "of", "NaHCO3", "(", "0", ",", "40", ",", "80", ",", "160", ",", "and", "320", "μg/mL", ")", "in", "the", "upper", "chamber", "for", "the", "last", "24", "h.", "The", "number", "of", "4T1", "cells", "was", "measured", "after", "48", "h", "of", "coculture", "using", "the", "trypan", "blue", "assay", ".", "(" ] } ]
PMC2118063
In addition, IRF8 cells were almost all positive for Ki-67, a marker for the highly proliferative population of centroblasts (not depicted).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "IRF8", "cells", "were", "almost", "all", "positive", "for", "Ki-67", ",", "a", "marker", "for", "the", "highly", "proliferative", "population", "of", "centroblasts", "(", "not", "depicted", ")", "." ] } ]
PMC11806182
All three of these subtypes were up-regulated in miR-330 high samples.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "three", "of", "these", "subtypes", "were", "up-regulated", "in", "miR-330", "high", "samples", "." ] } ]
PMC11122631
Furthermore, the COSY correlations of H2-2 (δH 2.38 and 1.29)/H2-3 (δH 2.05 and 1.95)/H-4 /H-5/H-6/H-7 and the HMBC correlations form the methoxy/H-2 to C-1, H-4/H3-2′ to C-1′, and from H-6 to C-8, indicated the α-side chain was located at C-8 with an acetoxy group attaching at C-4.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "the", "COSY", "correlations", "of", "H2", "-", "2", "(", "δH", "2.38", "and", "1.29)/H2", "-", "3", "(", "δH", "2.05", "and", "1.95)/H-4", "/H-5/H-6/H-7", "and", "the", "HMBC", "correlations", "form", "the", "methoxy/H-2", "to", "C-1", ",", "H-4/H3", "-", "2′", "to", "C-1′", ",", "and", "from", "H-6", "to", "C-8", ",", "indicated", "the", "α-side", "chain", "was", "located", "at", "C-8", "with", "an", "acetoxy", "group", "attaching", "at", "C-4", "." ] } ]
PMC11576293
Pharmacokinetics and drug-likeness prediction for all the newly synthesized compounds was performed using the online tool SwissADME predictor software (http://www.swissadme.ch/) made by the Swiss Institute of Bioinformatics.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pharmacokinetics", "and", "drug-likeness", "prediction", "for", "all", "the", "newly", "synthesized", "compounds", "was", "performed", "using", "the", "online", "tool", "SwissADME", "predictor", "software", "(", "http://www.swissadme.ch/", ")", "made", "by", "the", "Swiss", "Institute", "of", "Bioinformatics", "." ] } ]
PMC9429973
The target dose of venetoclax was 400mg once a day.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "target", "dose", "of", "venetoclax", "was", "400", "mg", "once", "a", "day", "." ] } ]
PMC11789597
Moreover, using random forest analysis, the top ten metabolites that are mostly related to CAV1 inhibition in the positive (POS) or negative (NEG) ion model were identified (Figure 5H).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "using", "random", "forest", "analysis", ",", "the", "top", "ten", "metabolites", "that", "are", "mostly", "related", "to", "CAV1", "inhibition", "in", "the", "positive", "(", "POS", ")", "or", "negative", "(", "NEG", ")", "ion", "model", "were", "identified", "(", "Figure", "5H", ")", "." ] } ]
PMC11695623
T test for paired or unpaired samples were used for data that met normality and Chi-square for both groups, and Wilcoxon rank sum test were used for information that did not meet normal distribution.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "T", "test", "for", "paired", "or", "unpaired", "samples", "were", "used", "for", "data", "that", "met", "normality", "and", "Chi-square", "for", "both", "groups", ",", "and", "Wilcoxon", "rank", "sum", "test", "were", "used", "for", "information", "that", "did", "not", "meet", "normal", "distribution", "." ] } ]
PMC10734950
Intracellular esterase’s cleave this nonfluorescent carboxy-H2DCFDA leading to oxidation and forming a green fluorescent product 2′,7′-dichlorofluorescein (DCF) .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Intracellular", "esterase", "’s", "cleave", "this", "nonfluorescent", "carboxy-H2DCFDA", "leading", "to", "oxidation", "and", "forming", "a", "green", "fluorescent", "product", "2′,7′-dichlorofluorescein", "(", "DCF", ")", "." ] } ]
PMC11345828
The crude residue was purified by flash column chromatography eluting with 0 to 40% EtOAc in hexanes to afford the title compound (8.08 g, 63% yield).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "crude", "residue", "was", "purified", "by", "flash", "column", "chromatography", "eluting", "with", "0", "to", "40", "%", "EtOAc", "in", "hexanes", "to", "afford", "the", "title", "compound", "(", "8.08", "g", ",", "63", "%", "yield", ")", "." ] } ]
PMC11755467
There are a few reported examples of host miRNAs that enhance replication of HIV-1; for instance, on the one hand hsa-miR-132-3p was found to reactivate the latent pro-virus and, on the other hand to enhance HIV-1 replication in activated CD4+ T-cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "are", "a", "few", "reported", "examples", "of", "host", "miRNAs", "that", "enhance", "replication", "of", "HIV-1", ";", "for", "instance", ",", "on", "the", "one", "hand", "hsa-miR-132", "-", "3p", "was", "found", "to", "reactivate", "the", "latent", "pro-virus", "and", ",", "on", "the", "other", "hand", "to", "enhance", "HIV-1", "replication", "in", "activated", "CD4", "+", "T-cells", "." ] } ]
PMC11474209
Neelam Sahu: Investigation, Formal analysis, Data curation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Neelam", "Sahu", ":", "Investigation", ",", "Formal", "analysis", ",", "Data", "curation", "." ] } ]
PMC11637276
TrypLE Express Enzyme was neutralised with 80 μl 10% FBS DMEM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TrypLE", "Express", "Enzyme", "was", "neutralised", "with", "80", "μl", "10", "%", "FBS", "DMEM", "." ] } ]
PMC11206502
The differences were significant for all HB treatments except for 0.4 mg/mL (p = 0.12).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "differences", "were", "significant", "for", "all", "HB", "treatments", "except", "for", "0.4", "mg/mL", "(", "p", "=", "0.12", ")", "." ] } ]
PMC7709199
Here, it is shown that the GlycoDelete HEK293 cell line engineered to produce glycan stumps produces homogeneous glycoproteins that are ideal for crystallogenesis and other structural studies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "it", "is", "shown", "that", "the", "GlycoDelete", "HEK293", "cell", "line", "engineered", "to", "produce", "glycan", "stumps", "produces", "homogeneous", "glycoproteins", "that", "are", "ideal", "for", "crystallogenesis", "and", "other", "structural", "studies", "." ] } ]
PMC11449273
SKOV-3 cells were grown on glass coverslip to confluency and processed for immunofluorescence staining using anti-plakoglobin antibody (green).
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SKOV-3", "cells", "were", "grown", "on", "glass", "coverslip", "to", "confluency", "and", "processed", "for", "immunofluorescence", "staining", "using", "anti-plakoglobin", "antibody", "(", "green", ")", "." ] } ]
PMC8526701
Therefore, in this study, we focused on the role of BRD9 in GISTs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "in", "this", "study", ",", "we", "focused", "on", "the", "role", "of", "BRD9", "in", "GISTs", "." ] } ]
PMC11682172
Notoriously, the expression of the cell motility-related protein coronin-1A rose from virtually zero to high levels upon co-culturing with activated T lymphocytes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Notoriously", ",", "the", "expression", "of", "the", "cell", "motility-related", "protein", "coronin-1A", "rose", "from", "virtually", "zero", "to", "high", "levels", "upon", "co-culturing", "with", "activated", "T", "lymphocytes", "." ] } ]
PMC11592008
In contrast to NLRP1, IL1B had more heterogeneous mRNA expression profiles among the cell lines analyzed (Figure 1B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "contrast", "to", "NLRP1", ",", "IL1B", "had", "more", "heterogeneous", "mRNA", "expression", "profiles", "among", "the", "cell", "lines", "analyzed", "(", "Figure", "1B", ")", "." ] } ]
PMC11269792
p < 0.05.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.05", "." ] } ]
PMC11721587
Cl8 cells were cultured in Shields and Sang M3 medium (MilliporeSigma) with 2.5% of FBS, 2.5% fly extract, and insulin (0.5 mg/ml) (MilliporeSigma).
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cl8", "cells", "were", "cultured", "in", "Shields", "and", "Sang", "M3", "medium", "(", "MilliporeSigma", ")", "with", "2.5", "%", "of", "FBS", ",", "2.5", "%", "fly", "extract", ",", "and", "insulin", "(", "0.5", "mg/ml", ")", "(", "MilliporeSigma", ")", "." ] } ]
PMC11674146
In the beginning, with the purpose of exploring the specific effects of CLP36 in lymphoma, we searched and downloaded the data of CLP36 expression pattern in lymphoma from The Cancer Genome Atlas program.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "beginning", ",", "with", "the", "purpose", "of", "exploring", "the", "specific", "effects", "of", "CLP36", "in", "lymphoma", ",", "we", "searched", "and", "downloaded", "the", "data", "of", "CLP36", "expression", "pattern", "in", "lymphoma", "from", "The", "Cancer", "Genome", "Atlas", "program", "." ] } ]
PMC11766332
The assessment of study miRNAs in terms of their interaction with glycosylation pathways associated is reported in Table 1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "assessment", "of", "study", "miRNAs", "in", "terms", "of", "their", "interaction", "with", "glycosylation", "pathways", "associated", "is", "reported", "in", "Table", "1", "." ] } ]
PMC11786600
Effect of different dressings on viable/dead staining of NIH/3T3 cells. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Effect", "of", "different", "dressings", "on", "viable/dead", "staining", "of", "NIH/3T3", "cells", ".", "(" ] } ]
PMC5535901
At present, I3C and DIM supplements are widely touted as an adjunct for prevention of various types of cancer, backed by many reported health effects that may be irrelevant to what can be physiologically achievable in vivo.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "present", ",", "I3C", "and", "DIM", "supplements", "are", "widely", "touted", "as", "an", "adjunct", "for", "prevention", "of", "various", "types", "of", "cancer", ",", "backed", "by", "many", "reported", "health", "effects", "that", "may", "be", "irrelevant", "to", "what", "can", "be", "physiologically", "achievable", "in", "vivo", "." ] } ]
PMC11721587
A and B) Representative images of immunostaining (top) and quantification (bottom; n = 15 cells) of ciliary-localized Ulk3-HA and Flag-Gli2 (A) or Sufu (B) in NIH3T3 cells expressing endogenously tagged Ulk3 and Gli2 and treated with Shh for the indicated time.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "and", "B", ")", "Representative", "images", "of", "immunostaining", "(", "top", ")", "and", "quantification", "(", "bottom", ";", "n", "=", "15", "cells", ")", "of", "ciliary-localized", "Ulk3-HA", "and", "Flag-Gli2", "(", "A", ")", "or", "Sufu", "(", "B", ")", "in", "NIH3T3", "cells", "expressing", "endogenously", "tagged", "Ulk3", "and", "Gli2", "and", "treated", "with", "Shh", "for", "the", "indicated", "time", "." ] } ]
PMC9424261
P < 0.05; **P < 0.01; ***P < 0.001 indicates statistical significance.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P", "<", "0.05", ";", "*", "*", "P", "<", "0.01", ";", "*", "*", "*", "P", "<", "0.001", "indicates", "statistical", "significance", "." ] } ]
PMC9436459
Sanggenon B (165) was also isolated from M. alba, which can be regarded as derived from 164 by hydrolyzing its 2,4-dihydroxybenzoyl group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Sanggenon", "B", "(", "165", ")", "was", "also", "isolated", "from", "M.", "alba", ",", "which", "can", "be", "regarded", "as", "derived", "from", "164", "by", "hydrolyzing", "its", "2,4-dihydroxybenzoyl", "group", "." ] } ]
PMC11185260
The cells were also subjected to Western blot analysis using antibodies against CDKN2A (#80772, 1:1000 dilution, Cell Signaling Technology) and CDKN1A (#2947, 1:1000 dilution, Cell Signaling Technology).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cells", "were", "also", "subjected", "to", "Western", "blot", "analysis", "using", "antibodies", "against", "CDKN2A", "(", "#", "80772", ",", "1:1000", "dilution", ",", "Cell", "Signaling", "Technology", ")", "and", "CDKN1A", "(", "#", "2947", ",", "1:1000", "dilution", ",", "Cell", "Signaling", "Technology", ")", "." ] } ]
PMC11548041
Given their ease of modification, aptamers that target EpCAM can be conjugated with various moieties to generate EpCAM-directed diagnostics or therapeutics.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Given", "their", "ease", "of", "modification", ",", "aptamers", "that", "target", "EpCAM", "can", "be", "conjugated", "with", "various", "moieties", "to", "generate", "EpCAM-directed", "diagnostics", "or", "therapeutics", "." ] } ]
PMC6160470
Therefore, we sought to elucidate mechanisms of action of 16 structurally related adamantyl-substituted monoaza- (MAC) and diaza- (DAC) crown compounds (Fig. 1), with the focus on their effect towards P-gp mediated MDR phenotype.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "we", "sought", "to", "elucidate", "mechanisms", "of", "action", "of", "16", "structurally", "related", "adamantyl-substituted", "monoaza-", "(", "MAC", ")", "and", "diaza-", "(", "DAC", ")", "crown", "compounds", "(", "Fig.", "1", ")", ",", "with", "the", "focus", "on", "their", "effect", "towards", "P-gp", "mediated", "MDR", "phenotype", "." ] } ]
PMC11659921
G, H) Transcript levels of TNFSF11 in SK‐OV‐3 and CoC1 cell lines compared to IOSE80 cell line. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "G", ",", "H", ")", "Transcript", "levels", "of", "TNFSF11", "in", "SK‐OV‐3", "and", "CoC1", "cell", "lines", "compared", "to", "IOSE80", "cell", "line", ".", "(" ] } ]
PMC11055443
However, there are some problems for optimal rehydration of patients with severe cholera at a critical time, especially in epidemics that indicate the necessity of adjunctive therapy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "there", "are", "some", "problems", "for", "optimal", "rehydration", "of", "patients", "with", "severe", "cholera", "at", "a", "critical", "time", ",", "especially", "in", "epidemics", "that", "indicate", "the", "necessity", "of", "adjunctive", "therapy", "." ] } ]
PMC9429973
In addition to surveying patients and caregivers, viewpoints from healthcare professionals (HCPs) should also be considered, as the perspectives of HCPs may impact or reflect patient QOL.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "surveying", "patients", "and", "caregivers", ",", "viewpoints", "from", "healthcare", "professionals", "(", "HCPs", ")", "should", "also", "be", "considered", ",", "as", "the", "perspectives", "of", "HCPs", "may", "impact", "or", "reflect", "patient", "QOL", "." ] } ]
PMC11377827
Transcript quantification was performed with Salmon against the Gencode Homo sapiens reference transcriptome/genome (build 44) using a decoy-aware transcriptome index for accurate mapping.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transcript", "quantification", "was", "performed", "with", "Salmon", "against", "the", "Gencode", "Homo", "sapiens", "reference", "transcriptome/genome", "(", "build", "44", ")", "using", "a", "decoy-aware", "transcriptome", "index", "for", "accurate", "mapping", "." ] } ]
PMC9014716
A–D) The screening procedure of miRNAs potentially targeting ABCB1 gene. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "–", "D", ")", "The", "screening", "procedure", "of", "miRNAs", "potentially", "targeting", "ABCB1", "gene", ".", "(" ] } ]
PMC11596967
These observations suggest that Ddes-P3 effectively mitigates radiation-induced mitochondrial dysfunction and cellular damage by preserving mitochondrial membrane potential, highlighting its potential as a radioprotective agent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "observations", "suggest", "that", "Ddes-P3", "effectively", "mitigates", "radiation-induced", "mitochondrial", "dysfunction", "and", "cellular", "damage", "by", "preserving", "mitochondrial", "membrane", "potential", ",", "highlighting", "its", "potential", "as", "a", "radioprotective", "agent", "." ] } ]
PMC11612626
In addition, autosomal recessive homozygous or compound heterozygous loss-of-function mutations in PSMB8 cause a syndrome that has historically been referred to as joint contractures, muscle atrophy, microcytic anemia, and panniculitis-induced childhood-onset lipodystrophy syndrome, Nakajo–Nishimura syndrome, or chronic atypical neutrophilic dermatosis and constitute a spectrum of proteasome-associated autoinflammatory syndromes (ref.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "autosomal", "recessive", "homozygous", "or", "compound", "heterozygous", "loss-of-function", "mutations", "in", "PSMB8", "cause", "a", "syndrome", "that", "has", "historically", "been", "referred", "to", "as", "joint", "contractures", ",", "muscle", "atrophy", ",", "microcytic", "anemia", ",", "and", "panniculitis-induced", "childhood-onset", "lipodystrophy", "syndrome", ",", "Nakajo", "–", "Nishimura", "syndrome", ",", "or", "chronic", "atypical", "neutrophilic", "dermatosis", "and", "constitute", "a", "spectrum", "of", "proteasome-associated", "autoinflammatory", "syndromes", "(", "ref", "." ] } ]
PMC11748335
Besides, we observed that in S-PMDs, a larger proportion of oncogenes was located within long LOCKs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Besides", ",", "we", "observed", "that", "in", "S-PMDs", ",", "a", "larger", "proportion", "of", "oncogenes", "was", "located", "within", "long", "LOCKs", "." ] } ]
PMC7090062
Autophagosomes were identified in confocal images by merging the red and green fluorescent regions merge.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Autophagosomes", "were", "identified", "in", "confocal", "images", "by", "merging", "the", "red", "and", "green", "fluorescent", "regions", "merge", "." ] } ]
PMC11738017
MESF, molecules of equivalent soluble fluorochrome.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MESF", ",", "molecules", "of", "equivalent", "soluble", "fluorochrome", "." ] } ]
PMC8345486
A similar B accumulation pattern was found for compounds in both cell lines A2780 and A2780cis (R = 0.961; p < 0.00001, Figure 4A left); however, it was 30% lower in cisplatin-resistant cells than in the sensitive cells (Figure 4A right and Figure 4B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "similar", "B", "accumulation", "pattern", "was", "found", "for", "compounds", "in", "both", "cell", "lines", "A2780", "and", "A2780cis", "(", "R", "=", "0.961", ";", "p", "<", "0.00001", ",", "Figure", "4A", "left", ")", ";", "however", ",", "it", "was", "30", "%", "lower", "in", "cisplatin-resistant", "cells", "than", "in", "the", "sensitive", "cells", "(", "Figure", "4A", "right", "and", "Figure", "4B", ")", "." ] } ]
PMC10812665
Val increased the basal respiration by 30% at a concentration of ~3 nM (Figure 4C,D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Val", "increased", "the", "basal", "respiration", "by", "30", "%", "at", "a", "concentration", "of", "~3", "nM", "(", "Figure", "4C", ",", "D", ")", "." ] } ]
PMC9429973
The nuclear volume and area were significantly higher in SRSF2 Mut compared with WT MOLM14 cells regardless of ROCKi.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "nuclear", "volume", "and", "area", "were", "significantly", "higher", "in", "SRSF2", "Mut", "compared", "with", "WT", "MOLM14", "cells", "regardless", "of", "ROCKi", "." ] } ]
PMC9429973
They can be substitutions or deletions, in these cases, the loss ranges from a single nucleotide to 44 nucleotides, so we wonder if the phenotype is due to the size of the deletion or the location of the mutation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "can", "be", "substitutions", "or", "deletions", ",", "in", "these", "cases", ",", "the", "loss", "ranges", "from", "a", "single", "nucleotide", "to", "44", "nucleotides", ",", "so", "we", "wonder", "if", "the", "phenotype", "is", "due", "to", "the", "size", "of", "the", "deletion", "or", "the", "location", "of", "the", "mutation", "." ] } ]
PMC11683130
Liu Y, et al. (38) identified four novel mutations in SerpinA3 in seventy children with GPP and demonstrated that three of these mutations lead to loss of function of ACT (the protein encoded by SerpinA3), thereby reduce the inhibition of ACT on Cathepsin G. Cathepsin G (a protease produced by infiltrating neutrophils in the epidermis) can activate IL-36γ in the epidermis of patients with GPP, and activated IL-36γ induces an increased ability of keratinocytes to produce chemokines (CXCL1, CXCL2 and CXCL8) and enhance recruitment of neutrophils, thereby exacerbating skin inflammation (30, 39).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Liu", "Y", ",", "et", "al.", "(", "38", ")", "identified", "four", "novel", "mutations", "in", "SerpinA3", "in", "seventy", "children", "with", "GPP", "and", "demonstrated", "that", "three", "of", "these", "mutations", "lead", "to", "loss", "of", "function", "of", "ACT", "(", "the", "protein", "encoded", "by", "SerpinA3", ")", ",", "thereby", "reduce", "the", "inhibition", "of", "ACT", "on", "Cathepsin", "G.", "Cathepsin", "G", "(", "a", "protease", "produced", "by", "infiltrating", "neutrophils", "in", "the", "epidermis", ")", "can", "activate", "IL-36γ", "in", "the", "epidermis", "of", "patients", "with", "GPP", ",", "and", "activated", "IL-36γ", "induces", "an", "increased", "ability", "of", "keratinocytes", "to", "produce", "chemokines", "(", "CXCL1", ",", "CXCL2", "and", "CXCL8", ")", "and", "enhance", "recruitment", "of", "neutrophils", ",", "thereby", "exacerbating", "skin", "inflammation", "(", "30", ",", "39", ")", "." ] } ]
PMC9429973
One of those has been historical: the decrease for the first time in 30 years in the whole transplant activity (Passweg J. BMT 2022) Aims: To analyse the impact of the pandemic on HCT activity in 2020 compared to pre-pandemic 2019 Methods: In April 2021, a survey was sent to all EBMT centres to collect the HCT activity, reporting the number of transplant patients by month for 2020 and 2019 Results: A total of 168 centres participated: 136 adult and 75 paediatric centres (43 did both) 1.- HCT activity in adults 1.1 Global (allo & auto): a marked decrease in activity from March-May, with the biggest drop in April 2020 (-40.6%) (Fig 1) 1.2 Allogeneic: a marked decrease in activity from March-May 2020, the biggest drop in April (-39%), and a moderate total decrease (-6.1%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One", "of", "those", "has", "been", "historical", ":", "the", "decrease", "for", "the", "first", "time", "in", "30", "years", "in", "the", "whole", "transplant", "activity", "(", "Passweg", "J.", "BMT", "2022", ")", "Aims", ":", "To", "analyse", "the", "impact", "of", "the", "pandemic", "on", "HCT", "activity", "in", "2020", "compared", "to", "pre-pandemic", "2019", "Methods", ":", "In", "April", "2021", ",", "a", "survey", "was", "sent", "to", "all", "EBMT", "centres", "to", "collect", "the", "HCT", "activity", ",", "reporting", "the", "number", "of", "transplant", "patients", "by", "month", "for", "2020", "and", "2019", "Results", ":", "A", "total", "of", "168", "centres", "participated", ":", "136", "adult", "and", "75", "paediatric", "centres", "(", "43", "did", "both", ")", "1.-", "HCT", "activity", "in", "adults", "1.1", "Global", "(", "allo", "&", "auto", "):", "a", "marked", "decrease", "in", "activity", "from", "March-May", ",", "with", "the", "biggest", "drop", "in", "April", "2020", "(", "-40.6", "%", ")", "(", "Fig", "1", ")", "1.2", "Allogeneic", ":", "a", "marked", "decrease", "in", "activity", "from", "March-May", "2020", ",", "the", "biggest", "drop", "in", "April", "(", "-39", "%", ")", ",", "and", "a", "moderate", "total", "decrease", "(", "-6.1", "%", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Western blot detected the expression of proliferation, apoptosis and cell cycle related proteins, and the results were consistent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Western", "blot", "detected", "the", "expression", "of", "proliferation", ",", "apoptosis", "and", "cell", "cycle", "related", "proteins", ",", "and", "the", "results", "were", "consistent", "." ] } ]
PMC11424574
Our result revealed that MTA2 inhibited osteosarcoma metastasis via activation of ERK1/2-inhibited uPA signaling.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "result", "revealed", "that", "MTA2", "inhibited", "osteosarcoma", "metastasis", "via", "activation", "of", "ERK1/2-inhibited", "uPA", "signaling", "." ] } ]
PMC11721295
Controls also included single- or triple-transgenic mice given ad-Cre.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Controls", "also", "included", "single-", "or", "triple-transgenic", "mice", "given", "ad-Cre", "." ] } ]
PMC7841189
p < 0.05 versus control.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.05", "versus", "control", "." ] } ]
PMC11518702
Urticaria is diagnosed by a well-defined set of clinical markers (69).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Urticaria", "is", "diagnosed", "by", "a", "well-defined", "set", "of", "clinical", "markers", "(", "69", ")", "." ] } ]
PMC11585254
It is emerging that receptor-specific determinants specify these divergent functions at GPCRs, yet this remains poorly understood.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "emerging", "that", "receptor-specific", "determinants", "specify", "these", "divergent", "functions", "at", "GPCRs", ",", "yet", "this", "remains", "poorly", "understood", "." ] } ]