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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC9105697
Each mutation allowed individual tracking of tumor dynamics in this patient (Figure 4B).
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PMC11543885
Import to STRING Database: Import the filtered data into the STRING database search portal.
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PMC11143482
A humanised mouse model is a laboratory mouse that has been genetically modified to contain specific human genes, cells, or tissues.
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PMC10877303
Shamima Afrose: Writing – original draft, Methodology, Investigation, Formal analysis, Data curation.
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PMC9429973
Flow cytometry analysis for Hematopoietic progenitors (defined by CD34, CD38, CD123, and CD45RA gated inside the CD45 cells) and mitochondrial markers (Mitotracker Green/DeepRed for mitochondrial mass/potential, respectively) in a set of primary AML samples (n=32), showed an enhanced proportion of L-GMP cells and a positive correlation with the mitochondrial potential (r=0.51) in AMLs with high mtDNAc.
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PMC8143558
This shows that the saponin content of one plant part cannot be regarded as the value for all the parts of the same plant.
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PMC11474209
The relatively low probability of adverse health effects is 20,000 cyanobacterial cells/mL, and a moderate probability of adverse health effects is 100,000 cyanobacterial cells/mL .
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PMC11763533
At 45 °C this displacement increased to 48 and 60 nm, respectively.
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PMC6889484
Supernatants were harvested every 2 to 3 days for 42 days and monitored by ELISA for p24 CA expression.
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PMC11310713
In pharmaceutical HRT, regardless of the delivery of P4, the serum E2 levels significantly increased in low-dose E2 groups compared to OVX at the 2 weeks after hormone delivery, but these levels tended to remain lower than those observed in ovary-intact rats over the 12 weeks (Fig. 4E and Fig. S1A).
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PMC11629143
p300 increases expression by promoting the active form of RNA polymerase II. (
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PMC11359735
The gel was fixed for 90 min in 25% methanol/12% acetic acid, washed 3 times with deionized H2O to remove the acetic acid, and cut in half, with each containing half of the immunoprecipitated, eluted CSP.
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PMC11286266
The bars and error bars represent the mean ± standard error of the mean (SEM) of data obtained from more than three independent experiments.
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PMC11641630
Gel zymograms were photographed using Chemidox XRS+ system (BioRad), and the intensity of the bands was then analyzed by plotting a curve and calculating the area under curve through ImageJ ver.2.0.0 software .
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PMC11015054
Finally, flow cytometry detection of cell apoptosis in SMMC‐7721 and HepG2 cells transfected with METTL5‐sh showed increased apoptosis after METTL5 downregulation (Figure 4C,D).
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PMC11155445
All compounds (95a–g) exhibited antioxidant activity, TAC for compounds 95f (∼25%) and 95d (∼43%) was highest while all remaining compounds showed total antioxidant activity between 10 and 15% (Fig. 33).
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PMC11621565
Hence, to unravel the precise role of the microbes in the initiation of PD, it is crucial to actively search for molecules produced by microbiota that can induce the overexpression or aggregation of α-synuclein.
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PMC9429973
The primary outcome was overall survival (OS), which was analyzed using the Kaplan-Meier method.
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PMC3164356
Abbreviations are defined in Supplementary Table 18. (
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PMC8540692
CCM and Aza were dissolved with DMSO to make 10 mM stock solutions, aliquoted and frozen at −20 °C, and −80 °C, respectively.
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PMC11591038
A previous study showed the critical role of the mTOR/HIF-1α pathway for NET formation in neutrophils in response to LPS stimulation .
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PMC11650848
This SNP has been previously associated with TNDM, severe COVID-19 and systemic lupus erythematosus .
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PMC9429973
Overall response rate was obtained in 86% (12) of patients treated with Pt - 5 with complete remission, 7 with partial remission and 2 with no response.
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PMC11323699
As depicted in Fig. 2a and b, the initial expression of CD47 was high (median value of 202), with no cases being completely negative for CD47 expression.
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PMC11473750
Gene gain was defined as an average gene copy number >2.40 or a gene/chromosome ratio between 1.30 and 1.99.
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PMC9080589
Another study showed that PCDH8 is frequently silenced by aberrant promoter methylation in clear cell renal cell carcinoma.
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PMC11676169
The overall numbers of γH2AX foci were increased at most early time points and reached a maximum at the latest time point (24 h) in BCAT1-depleted cells (Figure 4D).
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PMC11794847
This intricate molecular interplay warrants further exploration, especially in the context of therapeutic applications targeting the HVEM-GPT2 axis in immune-related conditions and cancers.
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PMC10092581
In contrast, the Au(I) complexes showed a completely different behavior; except for [AuCl], all gold complexes showed immediate signs of water coordination upon analysis right after dissolution (See Supporting Information).
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PMC9429973
The updated multivariate analyses showed a significant reduction of PFS and OS benefit magnitude only in cases with ISS stage III.
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PMC9429973
Within the cohort, 50.5% had a >PT ratio, 11.3% a >aPTT ratio and in 9.7% both were increased; 9.5% of pts had normal Fib and DD, 76.8% had HiDD with normal Fib, and 13.7% had both LowFib and HiDD.
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PMC11583010
Of note, the amount of unconjugated mAb at day 15 was estimated to be at most 12.5% of total ETx-22.
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PMC11437637
Add the appropriate antibodies (CD4-FITC, CD127-PE, CD183-APC, CD3-ECD, CD25-PC7, CD196-BV421) into the numbered tube in turn.
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PMC10957991
2D cultures were also grown on laminin coated micropattern (#10-020-00-18, Arena A, Cytoo) with different sized disc patterns.
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PMC9429973
Patients with complete remission (CR, ie, M1 BM) after treatment could undergo allogeneic hematopoietic stem cell transplant (alloHSCT).
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PMC9429973
Two patients (in the adult group) each reported 1 adverse drug reaction (ADR; infusion site inflammation and headache) at the inclusion visit, with no ADRs reported at any of the follow-up visits.
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PMC11626627
Protein expression of TWIST1 was detected using Western blotting in 786-O cells transfected with miR-204–3p inhibitor compared to NC and miR-204–3p mimic compared to NC.
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PMC11462929
Detailed information can be found in Data S1.
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PMC11155445
Acyl thiourea containing methoxy group at para position on benzene ring was 10.97 times more potent inhibitor than acyl thiourea having methyl group present at para position on the benzene ring.
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PMC9429973
Our study provided evidence that del(17q) identified a major leukemogenic mechanism, through the cooperation of: 17q genes loss of function, JAK/STAT constitutive activation, and altered cell cycle.
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PMC9428827
Furthermore, mutein can change the in vivo balance between Tregs and T CD8 memory/activated cells toward immune activation, in both healthy and tumor-bearing mice.
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PMC11535726
This is the first time Kirschsteiniotheliaatra has been reported from Edgeworthiachrysantha.
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PMC11468365
For the metric, MultiComb outperforms 0.95, so the consistency of MultiComb is high.
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The data represent n = 5 independent biological experiments.
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Dimethyl sulfoxide (DMSO) was purchased from Sigma (USA).
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Aims: To describe the rate of VOCs and use of opioids for VOC-related pain relief 12 months before crizanlizumab initiation and after ≥12 months of crizanlizumab treatment in SCD pts participating in the MAP, in countries where publication of these data is allowed.
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The cells were homogenized with a glass homogenizer (30 times) and then centrifuged at 600 × g for 10 min at 4 °C.
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OsGH3-2 regulates the homeostasis of endogenous free IAA and ABA and has different effects on drought and cold tolerance of Oryza sativa subsp.
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Right: quantification of the wound healing assay.
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Correlation between CD99 and cell state markers.
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D Western blot analysis of YTHDF2 levels after manipulating TRPM3 expression.
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Elevated ECM density and alignment are associated with increased ECM stiffness and tumor progression. ,
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PTS1 and α1AT were either directly added to CHO-K1 cell lysate with biotin-NAD and incubated for 40 min or preincubated for 15 min before addition to cell lysate and biotin-NAD.
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After three days, cells were lysed as described above.
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In mice, immune checkpoint receptors have been critically involved in both acquisition and maintenance of immunological self-tolerance, and immune checkpoints defects lead to severe immune dysfunction.
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If resistance of Aspergillus to azoles is suspected, switching to another broad-spectrum antifungal family would be the best option.
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To calculate the 50% cytotoxic concentration (CC50), we utilized linear interpolation as previously described.
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We found that CD45CD326 hematopoietic cells had lower TGF-βR3 expression than CD45CD326 stromal cells and CD45CD326 epithelial cells (Figure 4C).
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PMC11266100
CHO-K1 cells viability dependence on EP buffers composition (No. 1, 2, 5, and 7) and applied protocols with pEGFP-N1 plasmid encoding green fluorescent protein (GFP).
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More recently, we have reported the full genomic sequence of L. dispar and the LD652 cell transcriptome , making virus-LD652 cell systems more amenable to uncovering pathogen-host interactions at the molecular level.
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Initially isolated from the roots of Saussurea lappa Clarke, costunolide has emerged as a promising therapeutic candidate for the development of anti-HBV drugs.
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PMC7189327
Afterward, the functional enrichment analysis and protein-protein interaction (PPI) network analysis of these screened DEGs were performed.
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PMC11334037
After IGF2 knockdown or overexpression by transfection, the phenotypes (proliferation, migration, invasion, apoptosis) of GIST cells were characterized by cell counting kit 8, Transwell, and flow cytometry assays.
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We report our findings of the incidences of thromboembolism.
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PMC11564322
The RNA quality and quantity were determined spectrophotometrically at 260 nm and 280 nm (ND/1000 UV/Vis; Thermo Fisher NanoDrop, USA).
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The median IHC scores of SPOP, CD68 and CD206 were selected as a threshold for defining high and low expression, while the upper quartile for IHC scores of VEZF1 were regarded as high expression.
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Metastatic cancer cells are frequently deficient in WWOX protein or express dysfunctional WWOX (designated WWOXd) .
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The scorpion venom showed no effect on p-P38 MAPK or p-ERK expression (Figures 6 A and 6B).
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Platelet count increased from 69 × 10 /L on D28 to 451 × 10 /L on D38, 10 days after surgery.
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Our own work has demonstrated that T cellular IL-18 receptor (IL-18R) signaling influences intratumoral migration patterns of CTLs .
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DNA was sonicated for 30 s and four pulses.
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Based on our earlier report (Boddu et.
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RIP-qPCR analysis of ATF4 mRNA using ac4C antibody in WT and ac4C-MUT group (n = 3). (
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PMC11082662
In addition, SMPDL3B also participates in autophagy in the cell cycle, suggesting that high expression of SMPDL3B in ovarian cancer may help cancer cells escape protein hydrolysis and autophagy pathways, thereby causing ovarian cancer cell proliferation.
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PMC9786247
Relative gene expression levels of different host-specific cytokines in comparison to GAPDH as a housekeeping gene were determined by quantitative real-time SYBR Green-based (Applied Biosystem, Waltham, MA, USA) PCR, using ABI Prism7500 (Applied Biosystem).
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PMC11727907
It is well known that dimeric PKM2 can translocate to the nucleus and act as a transcriptional factor, promoting the expression of genes involved in glycolysis and proliferation .
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PMC9429973
SPINK2 expression was assessed by 3 hematopathologists in a double-blinded manner and quantified by a composite score (range: 0-16).
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PMC11317131
Additionally, the CMV promoter (which drives our integrase expression plasmid) has shown to be less effective in HeLa cells relative to HEK293 cells in which we did our optimizations (66).
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PMC11740207
CD133 PSCs express markers characteristic of various PSC types, such as those of endothelial, hematopoietic, and neurogenic origins.
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PMC5311252
Our next objective was to investigate the molecular consequences of AAGUGC-miRNA expression in relation to the detected phenotype.
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PMC9429973
In our hospital, this included relocating the entire Hematology Department to a remote location, reduction of hospital beds in the Hematology Inpatient Unit by approximately 60%, Day Clinic operating at a reduced capacity, and a complete suspension of Hematology Polyclinic during first lockdown.
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PMC11463018
To a solution of 2-amino-6-bromopyridine (11) (2.5 g, 14.7 mmol) in dichloromethane (100 ml) cooled to 5 °C was added ethoxycarbonyl isothiocyanate (1.73 ml, 14.7 mmol) dropwise over 15 min.
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PMC9429973
Contacts with the health care system are registered by the unique personal identification number, enabling linkage of data on person level across national registers.
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PMC7338939
Our data supported that the long-term and not short-term inhibition of Notch by DAPT may enhance tumor growth and motility through up-regulation of AXIN1, CSNK2A3, and CEBPA2 genes in B-raf mutated A375 cells.
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PMC11640555
Different cell lines were used in this study: normal human astrocyte cell lines (Homo sapiens astrocytes NHA-Astrocytes AGM LONZA CC-2565™) were used as normal counterparts and cultured with astrocyte culture medium and maintained in the incubator at 37 °C with 5% CO2.
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PMC11674441
After completing six vaccinations, peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were isolated to evaluate immune responses to each neoantigen peptide using interferon-γ (IFN-γ)-based enzyme-linked immunospot (ELISpot) assays.
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PMC10560648
Thereafter, the cells have been washed by Phosphate buffered saline (PBS), and finally, Annexin-V-(FITC) and 7-Amino-Actinomycin-D (7AAD) (Biolegend, USA) were used to determine the apoptotic cells by FACSCalibur flow cytometry (Becton Dickinson, Heidelberg, Germany).
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PMC9119314
The optical densities were read at 550 nM using an Azure 96-well microplate reader (Azure Biosystems Inc.), and % inhibition of growth was calculated by comparison with the control values.
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PMC11352311
Peng et al. predicted that MYC, MAPK8, and CXCL8 might be the targets of Astragali Radix in acetaminophen (APAP)-induced liver injury (ALI) by using network pharmacology.
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PMC10899471
Besides, BATF2 mRNA and protein expression was also downregulated in human fibrosarcoma cells (HT-1080) and synovial sarcoma cells (SW-982), compared with that in human skin fibroblast cells (HSF) ( Figures 1C, D ).
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PMC11247842
Among the genes prioritized based on biological support, some genes are annotated with GO terms “T cell differentiation” (SOX14, BCL11B), “somatic hypermutation of immunoglobulin genes” (MCM3AP), “response to steroid hormone (PAQR7)”, “negative regulation of respiratory burst involved in inflammatory response”, “positive regulation of regulatory T cell differentiation”, and “regulation of adaptive immune response” (DUSP10), “Immune response” and “inflammatory response” (CCRL2), “negative regulation of macrophage cytokine production” (TGFB3), “wound healing” (PLEC).
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PMC9429973
Other analyses include a subgroup analysis of patients with/without HSCT and an exploratory analysis by mutation status.
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PMC9817179
Although PFA fixation has been used to faithfully preserve live-cell conditions in many scenarios, a number of studies have uncovered situations in which fixation fails to cross-link DNA–protein interactions formed in living cells.
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PMC11478724
Pemetrexed (PMX) has been shown to be effective as a second-line treatment for advanced patients.
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PMC6182045
Although some TZ97008-rgp120 bound to the QFF anion exchange column (Figure 5B, lane 10), the majority of the rgp120 could be found in the flow through (Figure 5B, lane 11).
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PMC11127909
We obtained OS cell lines 143B, U2OS, MG63, Saos-2, and HEK293T embryonic kidney cell lines from the American Type Culture Collection (ATCC) and cultured them according to the protocol from ATCC.
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PMC9841531
Furthermore, the identified interactions of compounds 7, 8, 24, and 30 resembled in the same binding pocket embedded by not only Lys38 and Arg313 (shared amongst all four compounds) but also Pro37, Leu66, and Pro406 (shared amongst compounds 7, 24, and 30) despite the structural variation between reference inhibitors and indole derivatives.
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PMC11634027
Bottom two panels show blots on proteins immunoprecipitated with anti-FLAG beads and detected with V5 or FLAG antibodies.
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PMC7723249
Twenty-four, 48 and 72 hpi, cell supernatants were collected, the cells were recovered, washed 3 times with PBS and then lysed using 300μl of Trizol per well.
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PMC9739791
Using dynamic light scattering, the change of diameter of the Pt(IV) prodrug 30 aggregates was assessed under blue-light irradiation.
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