Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11767793
Before incubation with cells, the test substance working solutions were prepared in the cell-specific medium without FBS by vortexing and a brief bath sonication for better dispersion.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Before", "incubation", "with", "cells", ",", "the", "test", "substance", "working", "solutions", "were", "prepared", "in", "the", "cell-specific", "medium", "without", "FBS", "by", "vortexing", "and", "a", "brief", "bath", "sonication", "for", "better", "dispersion", "." ] } ]
PMC9577200
This study revealed that chitosan enhanced early and late apoptosis and dead cells with decreased viable cells compared with the control HeLa cell line, indicating that it significantly stimulates apoptosis in HeLa cells (Chang et al., 2021).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "study", "revealed", "that", "chitosan", "enhanced", "early", "and", "late", "apoptosis", "and", "dead", "cells", "with", "decreased", "viable", "cells", "compared", "with", "the", "control", "HeLa", "cell", "line", ",", "indicating", "that", "it", "significantly", "stimulates", "apoptosis", "in", "HeLa", "cells", "(", "Chang", "et", "al.", ",", "2021", ")", "." ] } ]
PMC10891340
Mitophagy removes damaged mitochondria, reduces ROS production, and promotes cells survival (Basit et al., 2017; Pickles et al., 2018; Tian et al., 2018).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mitophagy", "removes", "damaged", "mitochondria", ",", "reduces", "ROS", "production", ",", "and", "promotes", "cells", "survival", "(", "Basit", "et", "al.", ",", "2017", ";", "Pickles", "et", "al.", ",", "2018", ";", "Tian", "et", "al.", ",", "2018", ")", "." ] } ]
PMC11588085
We first established OVCAR3 and SKOV3 cell lines that stably express a dead Cas9-KRAB (dCas9-KRAB) fusion by lentiviral transduction followed by antibiotic selection; the cell lines are referred to as OVCAR3-KRAB and SKOV3-KRAB hereafter.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "first", "established", "OVCAR3", "and", "SKOV3", "cell", "lines", "that", "stably", "express", "a", "dead", "Cas9-KRAB", "(", "dCas9-KRAB", ")", "fusion", "by", "lentiviral", "transduction", "followed", "by", "antibiotic", "selection", ";", "the", "cell", "lines", "are", "referred", "to", "as", "OVCAR3-KRAB", "and", "SKOV3-KRAB", "hereafter", "." ] } ]
PMC9429973
R. Bassan, S. Chiaretti, I. Della Starza, O. Spinelli, A. Santoro, L. Elia, M. S. De Propris, A. M. Scattolin, F. Paoloni, M. Messina, E. Audisio, L. Marbello, E. Borlenghi, P. Zappasodi, C. Vetro, G. Martinelli, D. Mattei, N. Fracchiolla, M. Bocchia, P. De Fabritiis, M. Bonifacio, A. Candoni, V. Cassibba, P. Di Bartolomeo, G. Latte, S. Trappolini, A. Guarini, A. Vitale, P. Fazi, M. Vignetti, A. Rambaldi, R. Foà Hematology, Ospedale dell’Angelo, Venice; Translational and Precision Medicine, Sapienza Univesrity of Rome; Translational and Precision Medicine, Sapienza University of Rome, Rome; UOC Ematologia, ASST-Papa Giovanni XXIII, Bergamo; Divisione di Ematologia con UTMO, Ospedali Riuniti Villa Sofia-Cervello, Palermo; GIMEMA Data Center; GIIMEMA Data Center, Fondazione GIMEMA – Franco Mandelli Onlus, Rome; Ematologia, Città della Salute, Torino; Hematology, Niguarda Ca’ Granda Hospital, Milan; Hematology, Spedali Civili, Brescia, Italy, Spedali Civili, Brescia; Hematology, Foundation IRCCS Policlinico San Matteo, Pavia; General Surgery and Medical-Surgical Specialties, University of Catania, Catania; Institute of Hematology, L. and A. Seràgnoli, Bologna; Hematology, Ospedale S. Croce, Cuneo, Italy, Cuneo; UOC Oncoematologia, Fondazione IRCCS Ca’ Granda Ospedale Maggiore Policlinico di Milano, Milan; Hematology Unit, Azienda Ospedaliera Universitaria Senese, Siena; Hematology Division, S. Eugenio Hospital, Rome; Ospedale Policlinico “G.B. Rossi”, University of Verona, Verona; Clinica Ematologica, Azienda Sanitaria Universitaria Integrata di Udine, Udine; Divisione di Ematologia, Ospedale Civile, Bolzano; Oncology Hematology, Ospedale Civile, Pescara; Hematology, S. Franceso Hospital, Nuoro; Clinica di Ematologia, Azienda Ospedaliero - Universitaria Ospedali Riuniti Umberto I, Ancona; Molecular Medicine, Sapienza University of Rome, Rome, Italy Background: Pediatric-inspired chemotherapy is standard of care for younger adults with Ph− ALL/LL.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "R.", "Bassan", ",", "S.", "Chiaretti", ",", "I.", "Della", "Starza", ",", "O.", "Spinelli", ",", "A.", "Santoro", ",", "L.", "Elia", ",", "M.", "S.", "De", "Propris", ",", "A.", "M.", "Scattolin", ",", "F.", "Paoloni", ",", "M.", "Messina", ",", "E.", "Audisio", ",", "L.", "Marbello", ",", "E.", "Borlenghi", ",", "P.", "Zappasodi", ",", "C.", "Vetro", ",", "G.", "Martinelli", ",", "D.", "Mattei", ",", "N.", "Fracchiolla", ",", "M.", "Bocchia", ",", "P.", "De", "Fabritiis", ",", "M.", "Bonifacio", ",", "A.", "Candoni", ",", "V.", "Cassibba", ",", "P.", "Di", "Bartolomeo", ",", "G.", "Latte", ",", "S.", "Trappolini", ",", "A.", "Guarini", ",", "A.", "Vitale", ",", "P.", "Fazi", ",", "M.", "Vignetti", ",", "A.", "Rambaldi", ",", "R.", "Foà", "Hematology", ",", "Ospedale", "dell’Angelo", ",", "Venice", ";", "Translational", "and", "Precision", "Medicine", ",", "Sapienza", "Univesrity", "of", "Rome", ";", "Translational", "and", "Precision", "Medicine", ",", "Sapienza", "University", "of", "Rome", ",", "Rome", ";", "UOC", "Ematologia", ",", "ASST-Papa", "Giovanni", "XXIII", ",", "Bergamo", ";", "Divisione", "di", "Ematologia", "con", "UTMO", ",", "Ospedali", "Riuniti", "Villa", "Sofia-Cervello", ",", "Palermo", ";", "GIMEMA", "Data", "Center", ";", "GIIMEMA", "Data", "Center", ",", "Fondazione", "GIMEMA", "–", "Franco", "Mandelli", "Onlus", ",", "Rome", ";", "Ematologia", ",", "Città", "della", "Salute", ",", "Torino", ";", "Hematology", ",", "Niguarda", "Ca", "’", "Granda", "Hospital", ",", "Milan", ";", "Hematology", ",", "Spedali", "Civili", ",", "Brescia", ",", "Italy", ",", "Spedali", "Civili", ",", "Brescia", ";", "Hematology", ",", "Foundation", "IRCCS", "Policlinico", "San", "Matteo", ",", "Pavia", ";", "General", "Surgery", "and", "Medical-Surgical", "Specialties", ",", "University", "of", "Catania", ",", "Catania", ";", "Institute", "of", "Hematology", ",", "L.", "and", "A.", "Seràgnoli", ",", "Bologna", ";", "Hematology", ",", "Ospedale", "S.", "Croce", ",", "Cuneo", ",", "Italy", ",", "Cuneo", ";", "UOC", "Oncoematologia", ",", "Fondazione", "IRCCS", "Ca", "’", "Granda", "Ospedale", "Maggiore", "Policlinico", "di", "Milano", ",", "Milan", ";", "Hematology", "Unit", ",", "Azienda", "Ospedaliera", "Universitaria", "Senese", ",", "Siena", ";", "Hematology", "Division", ",", "S.", "Eugenio", "Hospital", ",", "Rome", ";", "Ospedale", "Policlinico", "“", "G.B.", "Rossi", "”", ",", "University", "of", "Verona", ",", "Verona", ";", "Clinica", "Ematologica", ",", "Azienda", "Sanitaria", "Universitaria", "Integrata", "di", "Udine", ",", "Udine", ";", "Divisione", "di", "Ematologia", ",", "Ospedale", "Civile", ",", "Bolzano", ";", "Oncology", "Hematology", ",", "Ospedale", "Civile", ",", "Pescara", ";", "Hematology", ",", "S.", "Franceso", "Hospital", ",", "Nuoro", ";", "Clinica", "di", "Ematologia", ",", "Azienda", "Ospedaliero", "-", "Universitaria", "Ospedali", "Riuniti", "Umberto", "I", ",", "Ancona", ";", "Molecular", "Medicine", ",", "Sapienza", "University", "of", "Rome", ",", "Rome", ",", "Italy", "Background", ":", "Pediatric-inspired", "chemotherapy", "is", "standard", "of", "care", "for", "younger", "adults", "with", "Ph−", "ALL/LL", "." ] } ]
PMC10291556
Therefore, the intracellular concentrations of platinum from the investigated Pt(II) and Pt(IV) complexes were determined after the cells were exposed to the complexes at various concentrations and incubation periods and compared to those found for Pt(II) precursor 1 and cisplatin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "the", "intracellular", "concentrations", "of", "platinum", "from", "the", "investigated", "Pt(II", ")", "and", "Pt(IV", ")", "complexes", "were", "determined", "after", "the", "cells", "were", "exposed", "to", "the", "complexes", "at", "various", "concentrations", "and", "incubation", "periods", "and", "compared", "to", "those", "found", "for", "Pt(II", ")", "precursor", "1", "and", "cisplatin", "." ] } ]
PMC9429973
MSI2 upregulation significantly associated with chemoresistance and poor overall survival, independently of common risk factors (SOX11 expression, high copy number alterations, 17p/TP53, 11q/ATM and 9p/CDKN2A alterations), in MCL patients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MSI2", "upregulation", "significantly", "associated", "with", "chemoresistance", "and", "poor", "overall", "survival", ",", "independently", "of", "common", "risk", "factors", "(", "SOX11", "expression", ",", "high", "copy", "number", "alterations", ",", "17p/TP53", ",", "11q/ATM", "and", "9p/CDKN2A", "alterations", ")", ",", "in", "MCL", "patients", "." ] } ]
PMC9429973
Combination therapies may improve outcomes, but none are proven superior, and toxicities may pose limits.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Combination", "therapies", "may", "improve", "outcomes", ",", "but", "none", "are", "proven", "superior", ",", "and", "toxicities", "may", "pose", "limits", "." ] } ]
PMC11607764
We performed a systematic analysis of PTBP1 expression across the Cancer Genome Atlas (TCGA) and Genotype-Tissue Expression (GTEx) dataset projects.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "performed", "a", "systematic", "analysis", "of", "PTBP1", "expression", "across", "the", "Cancer", "Genome", "Atlas", "(", "TCGA", ")", "and", "Genotype-Tissue", "Expression", "(", "GTEx", ")", "dataset", "projects", "." ] } ]
PMC5025404
SDS-PAGE electrophoresis under reducing conditions was performed according to the standard procedure in a 12 % Laemmli gel followed by staining with Coomassie-R250 to check the ratio of heavy and light chains in the supernatant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SDS-PAGE", "electrophoresis", "under", "reducing", "conditions", "was", "performed", "according", "to", "the", "standard", "procedure", "in", "a", "12", "%", "Laemmli", "gel", "followed", "by", "staining", "with", "Coomassie-R250", "to", "check", "the", "ratio", "of", "heavy", "and", "light", "chains", "in", "the", "supernatant", "." ] } ]
PMC11389534
BILF1 expression is adequate to trigger the dislocation of MAVS from mitochondrial via K461 UFMylation, leading to the encapsulation of MAVS into vesicles derived from mitochondria, and subsequent lysosomal pathway for protein degradation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "BILF1", "expression", "is", "adequate", "to", "trigger", "the", "dislocation", "of", "MAVS", "from", "mitochondrial", "via", "K461", "UFMylation", ",", "leading", "to", "the", "encapsulation", "of", "MAVS", "into", "vesicles", "derived", "from", "mitochondria", ",", "and", "subsequent", "lysosomal", "pathway", "for", "protein", "degradation", "." ] } ]
PMC8526701
Cleaved caspase 3-positive cells were counted and plotted.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cleaved", "caspase", "3-positive", "cells", "were", "counted", "and", "plotted", "." ] } ]
PMC10728535
Cumulatively, the results of this study were obtained via investigating high‐throughput studies using in silico tools to predict molecular mechanisms of cisplatin resistance, therefore, using the results, researchers can develop hypotheses for future experimental studies in the area of drug resistance and targeted therapy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cumulatively", ",", "the", "results", "of", "this", "study", "were", "obtained", "via", "investigating", "high‐throughput", "studies", "using", "in", "silico", "tools", "to", "predict", "molecular", "mechanisms", "of", "cisplatin", "resistance", ",", "therefore", ",", "using", "the", "results", ",", "researchers", "can", "develop", "hypotheses", "for", "future", "experimental", "studies", "in", "the", "area", "of", "drug", "resistance", "and", "targeted", "therapy", "." ] } ]
PMC11615101
The substrate was then added and incubated (15min at 37°C), the reaction was stopped with stop solution, and absorbance was measured at 462 nanometer (nm) using a Spectra Max plus 384 (Molecular devices, USA).26 The concentration of α-Taxilin was measured in RA, OA, HC, and SLE using the standard curve generated by pure α-Taxilin concentration with respect to optical density as per the protocol (Provided).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "substrate", "was", "then", "added", "and", "incubated", "(", "15min", "at", "37", "°", "C", ")", ",", "the", "reaction", "was", "stopped", "with", "stop", "solution", ",", "and", "absorbance", "was", "measured", "at", "462", "nanometer", "(", "nm", ")", "using", "a", "Spectra", "Max", "plus", "384", "(", "Molecular", "devices", ",", "USA).26", "The", "concentration", "of", "α-Taxilin", "was", "measured", "in", "RA", ",", "OA", ",", "HC", ",", "and", "SLE", "using", "the", "standard", "curve", "generated", "by", "pure", "α-Taxilin", "concentration", "with", "respect", "to", "optical", "density", "as", "per", "the", "protocol", "(", "Provided", ")", "." ] } ]
PMC8609870
In recent years, new risk factors have been gradually recognized, but the aetiology of many patients with RSA remains unknown.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "recent", "years", ",", "new", "risk", "factors", "have", "been", "gradually", "recognized", ",", "but", "the", "aetiology", "of", "many", "patients", "with", "RSA", "remains", "unknown", "." ] } ]
PMC9429973
al., 2019; Hinze et al., 2020).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "al.", ",", "2019", ";", "Hinze", "et", "al.", ",", "2020", ")", "." ] } ]
PMC8316344
Data were analyzed by one-way ANOVA and expressed as mean ± SD from three independent experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "were", "analyzed", "by", "one-way", "ANOVA", "and", "expressed", "as", "mean", "±", "SD", "from", "three", "independent", "experiments", "." ] } ]
PMC9000591
Other contributors, such as functional groups of individual compounds, might be also important.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Other", "contributors", ",", "such", "as", "functional", "groups", "of", "individual", "compounds", ",", "might", "be", "also", "important", "." ] } ]
PMC11228511
Scale bar, 5 µm.)
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bar", ",", "5", "µm", ".", ")" ] } ]
PMC11434983
The medium was refreshed after irradiation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "medium", "was", "refreshed", "after", "irradiation", "." ] } ]
PMC11658074
b Morphology of EVs shown by transmission electron microscopy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "b", "Morphology", "of", "EVs", "shown", "by", "transmission", "electron", "microscopy", "." ] } ]
PMC9429973
By the development of an in vitro model reproducing endothelial damages at the early phase of DHTR (Nguyen et al, ASH 2018), our previous study suggested that RBC membrane-derived particles released during the onset stage of DHTR could be also involved in DHTR physiopathology.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "the", "development", "of", "an", "in", "vitro", "model", "reproducing", "endothelial", "damages", "at", "the", "early", "phase", "of", "DHTR", "(", "Nguyen", "et", "al", ",", "ASH", "2018", ")", ",", "our", "previous", "study", "suggested", "that", "RBC", "membrane-derived", "particles", "released", "during", "the", "onset", "stage", "of", "DHTR", "could", "be", "also", "involved", "in", "DHTR", "physiopathology", "." ] } ]
PMC9429973
Normalization of sBCMA may be a predictor of response to therapy, which may be independent of treatment and target.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Normalization", "of", "sBCMA", "may", "be", "a", "predictor", "of", "response", "to", "therapy", ",", "which", "may", "be", "independent", "of", "treatment", "and", "target", "." ] } ]
PMC11659921
In our study, we initially analyzed the TCGA‐OV dataset and the GSE66957 dataset to identify angiogenesis‐ and stemness‐related genes with differential expression and prognostic significance.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "our", "study", ",", "we", "initially", "analyzed", "the", "TCGA‐OV", "dataset", "and", "the", "GSE66957", "dataset", "to", "identify", "angiogenesis‐", "and", "stemness‐related", "genes", "with", "differential", "expression", "and", "prognostic", "significance", "." ] } ]
PMC11519583
The fixed cells were rinsed with 60% (v/v) isopropanol and stained with Oil Red O (FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation) in 60% (v/v) isopropanol at 20–24 °C for 30 min.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "fixed", "cells", "were", "rinsed", "with", "60", "%", "(", "v/v", ")", "isopropanol", "and", "stained", "with", "Oil", "Red", "O", "(", "FUJIFILM", "Wako", "Pure", "Chemical", "Corporation", ")", "in", "60", "%", "(", "v/v", ")", "isopropanol", "at", "20–24", "°", "C", "for", "30", "min", "." ] } ]
PMC8270637
Since blockage of the TGF-βR or CaN/NFATc1 pathway decreased the expression of PD-1 and CTLA-4 enhanced by TGF-β1, we next investigated whether SB431542, a TGF-βR inhibitor, and CsA, a CaN inhibitor, can inhibit the apoptosis upregulated by TGF-β1 and restored T cell cytotoxicity weakened by TGF-β1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Since", "blockage", "of", "the", "TGF-βR", "or", "CaN/NFATc1", "pathway", "decreased", "the", "expression", "of", "PD-1", "and", "CTLA-4", "enhanced", "by", "TGF-β1", ",", "we", "next", "investigated", "whether", "SB431542", ",", "a", "TGF-βR", "inhibitor", ",", "and", "CsA", ",", "a", "CaN", "inhibitor", ",", "can", "inhibit", "the", "apoptosis", "upregulated", "by", "TGF-β1", "and", "restored", "T", "cell", "cytotoxicity", "weakened", "by", "TGF-β1", "." ] } ]
PMC11599565
Nevertheless, these findings suggest that the conversion of mesoderm-derived cell type like ovarian carcinoma cells into a neuronal type had occurred at the transcriptional level.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nevertheless", ",", "these", "findings", "suggest", "that", "the", "conversion", "of", "mesoderm-derived", "cell", "type", "like", "ovarian", "carcinoma", "cells", "into", "a", "neuronal", "type", "had", "occurred", "at", "the", "transcriptional", "level", "." ] } ]
PMC11021472
ST486 cells transfected with the lentiviral vector for circZDHHC11 overexpression (triangles) or control vector (circles) (both with GFP reporter) were transfected with the lentiviral vector for miR-150 overexpression carrying a BFP reporter (dark and light blue) or control (black and grey).
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ST486", "cells", "transfected", "with", "the", "lentiviral", "vector", "for", "circZDHHC11", "overexpression", "(", "triangles", ")", "or", "control", "vector", "(", "circles", ")", "(", "both", "with", "GFP", "reporter", ")", "were", "transfected", "with", "the", "lentiviral", "vector", "for", "miR-150", "overexpression", "carrying", "a", "BFP", "reporter", "(", "dark", "and", "light", "blue", ")", "or", "control", "(", "black", "and", "grey", ")", "." ] } ]
PMC11075223
The crude extracts and its constituents had various pharmacological properties such as anti-inflammatory, antitumor, antiviral, antioxidant, neuroprotective, anti-osteoporosis and relieving menopausal symptoms.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "crude", "extracts", "and", "its", "constituents", "had", "various", "pharmacological", "properties", "such", "as", "anti-inflammatory", ",", "antitumor", ",", "antiviral", ",", "antioxidant", ",", "neuroprotective", ",", "anti-osteoporosis", "and", "relieving", "menopausal", "symptoms", "." ] } ]
PMC11746942
C Western blot showing that Src inhibition by Tri (100 nM) blocked CYM-induced P-STAT3 activation at 24 h. D Schematic of S1PR3 coupled with Gα proteins and their respective inhibitors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "Western", "blot", "showing", "that", "Src", "inhibition", "by", "Tri", "(", "100", "nM", ")", "blocked", "CYM-induced", "P-STAT3", "activation", "at", "24", "h.", "D", "Schematic", "of", "S1PR3", "coupled", "with", "Gα", "proteins", "and", "their", "respective", "inhibitors", "." ] } ]
PMC11395280
Intact HBEC-5i monolayers were established, CCL19, CCL21, or media (control) was added to the lower wells at the optimal concentration for migration (See Figure 1), and cells were allowed to migrate over 16 h. CCRF-CEM cells were layered on the apical surface of the HBEC-5i monolayer.
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Intact", "HBEC-5i", "monolayers", "were", "established", ",", "CCL19", ",", "CCL21", ",", "or", "media", "(", "control", ")", "was", "added", "to", "the", "lower", "wells", "at", "the", "optimal", "concentration", "for", "migration", "(", "See", "Figure", "1", ")", ",", "and", "cells", "were", "allowed", "to", "migrate", "over", "16", "h.", "CCRF-CEM", "cells", "were", "layered", "on", "the", "apical", "surface", "of", "the", "HBEC-5i", "monolayer", "." ] } ]
PMC8193813
Concurrent emission measurements of pollutant mass and carbon mass (as CO2+CO) can be used to calculate total emissions of the pollutant from the fuel using its carbon concentration and fuel burn rate.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Concurrent", "emission", "measurements", "of", "pollutant", "mass", "and", "carbon", "mass", "(", "as", "CO2+CO", ")", "can", "be", "used", "to", "calculate", "total", "emissions", "of", "the", "pollutant", "from", "the", "fuel", "using", "its", "carbon", "concentration", "and", "fuel", "burn", "rate", "." ] } ]
PMC11792888
A comprehensive comparative proteomic analysis has previously shown that these cells express different membrane and non-membrane proteins, including some potassium channels .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "comprehensive", "comparative", "proteomic", "analysis", "has", "previously", "shown", "that", "these", "cells", "express", "different", "membrane", "and", "non-membrane", "proteins", ",", "including", "some", "potassium", "channels", "." ] } ]
PMC5311252
The plasmids were transformed into E.coli separately and plasmid DNA was extracted using GeneJET plasmid midiprep kit (Thermo Fisher Scientific, K0482) according to product protocol.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "plasmids", "were", "transformed", "into", "E.coli", "separately", "and", "plasmid", "DNA", "was", "extracted", "using", "GeneJET", "plasmid", "midiprep", "kit", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ",", "K0482", ")", "according", "to", "product", "protocol", "." ] } ]
PMC10831439
In addition, relapse is the most common cause of death after transplant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "relapse", "is", "the", "most", "common", "cause", "of", "death", "after", "transplant", "." ] } ]
PMC11795610
p-values < 0.05 were considered to denote statistically significant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p-values", "<", "0.05", "were", "considered", "to", "denote", "statistically", "significant", "." ] } ]
PMC11726848
Additionally, after HDR irradiation, the percentage of «PI+» cells increased more than the percentage of cells «PI-AnnV+» (Figure 5C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "after", "HDR", "irradiation", ",", "the", "percentage", "of", "«", "PI+", "»", "cells", "increased", "more", "than", "the", "percentage", "of", "cells", "«", "PI-AnnV+", "»", "(", "Figure", "5C", ")", "." ] } ]
PMC9412887
In addition, erlotinib-loaded nanomicelles could trigger more apoptotic cells than erlotinib.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "erlotinib-loaded", "nanomicelles", "could", "trigger", "more", "apoptotic", "cells", "than", "erlotinib", "." ] } ]
PMC11502327
Therefore, targeted delivery of therapeutic drugs to Mir-21-inhibited OC cells using nanomedicine delivery systems can improve the mortality of tumor cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "targeted", "delivery", "of", "therapeutic", "drugs", "to", "Mir-21-inhibited", "OC", "cells", "using", "nanomedicine", "delivery", "systems", "can", "improve", "the", "mortality", "of", "tumor", "cells", "." ] } ]
PMC11244823
Accordingly, we established four parallel LIPS assays, in each of which increasing sized fragments of gD1 were fused to a nano-Luciferase to be used as antigens for the detection of fragment specific antibodies in horses.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Accordingly", ",", "we", "established", "four", "parallel", "LIPS", "assays", ",", "in", "each", "of", "which", "increasing", "sized", "fragments", "of", "gD1", "were", "fused", "to", "a", "nano-Luciferase", "to", "be", "used", "as", "antigens", "for", "the", "detection", "of", "fragment", "specific", "antibodies", "in", "horses", "." ] } ]
PMC9429973
RT-PCR and NGS assessment were performed in 17 pts (47%), 15 CM and 2 ISM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RT-PCR", "and", "NGS", "assessment", "were", "performed", "in", "17", "pts", "(", "47", "%", ")", ",", "15", "CM", "and", "2", "ISM", "." ] } ]
PMC10093184
Hematoxylin and eosin staining of spheroid sections revealed a concentric organization comprised of two (all COS cells) or three (D-17) zones with different cell densities and organization (Figure 8).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hematoxylin", "and", "eosin", "staining", "of", "spheroid", "sections", "revealed", "a", "concentric", "organization", "comprised", "of", "two", "(", "all", "COS", "cells", ")", "or", "three", "(", "D-17", ")", "zones", "with", "different", "cell", "densities", "and", "organization", "(", "Figure", "8)", "." ] } ]
PMC10652261
IR νmax (cm): 3103.46, 2970.38, 2937.59, 2845.00, 2792.93, 2748.56, 1645.28, 1606.70, 1577.77, 1550.77, 1508.33, 1462.04, 1446.61, 1409.96, 1381.03, 1348.24, 1328.95, 1313.52, 1290.38, 1253.73, 1224.80, 1192.01, 1166.93, 1139.93, 1064.71,1026.13, 1001.06, 981.77, 948.98, 920.05, 885.33, 864.11, 858.32, 802.39, 763.81, 738.74, 684.73, 630.72, 613.36.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IR", "νmax", "(", "cm", "):", "3103.46", ",", "2970.38", ",", "2937.59", ",", "2845.00", ",", "2792.93", ",", "2748.56", ",", "1645.28", ",", "1606.70", ",", "1577.77", ",", "1550.77", ",", "1508.33", ",", "1462.04", ",", "1446.61", ",", "1409.96", ",", "1381.03", ",", "1348.24", ",", "1328.95", ",", "1313.52", ",", "1290.38", ",", "1253.73", ",", "1224.80", ",", "1192.01", ",", "1166.93", ",", "1139.93", ",", "1064.71,1026.13", ",", "1001.06", ",", "981.77", ",", "948.98", ",", "920.05", ",", "885.33", ",", "864.11", ",", "858.32", ",", "802.39", ",", "763.81", ",", "738.74", ",", "684.73", ",", "630.72", ",", "613.36", "." ] } ]
PMC11753949
As SALs are represented by ER sheets, we examined the contribution to their structure of ER-shaping proteins.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "SALs", "are", "represented", "by", "ER", "sheets", ",", "we", "examined", "the", "contribution", "to", "their", "structure", "of", "ER-shaping", "proteins", "." ] } ]
PMC11266100
They act as a bridge between negatively-charged DNA and the negatively-charged cell plasma membrane and thus improve DNA–membrane binding (Wong and Neumann, 1982; Haberl et al., 2013).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "act", "as", "a", "bridge", "between", "negatively-charged", "DNA", "and", "the", "negatively-charged", "cell", "plasma", "membrane", "and", "thus", "improve", "DNA", "–", "membrane", "binding", "(", "Wong", "and", "Neumann", ",", "1982", ";", "Haberl", "et", "al.", ",", "2013", ")", "." ] } ]
PMC8409415
These results suggested that NF‐κB‐p65 expression may play a role in inducing CD70.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "suggested", "that", "NF‐κB‐p65", "expression", "may", "play", "a", "role", "in", "inducing", "CD70", "." ] } ]
PMC11541241
The invasive growth in F. oxysporum is affected by environmental cues, for instance, pH and nutrient status (López‐Berges et al., 2010a).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "invasive", "growth", "in", "F.", "oxysporum", "is", "affected", "by", "environmental", "cues", ",", "for", "instance", ",", "pH", "and", "nutrient", "status", "(", "López‐Berges", "et", "al.", ",", "2010a", ")", "." ] } ]
PMC6114978
Alexa 568 conjugated secondary antibody (catalog# A11031 or A11036) was obtained from Invitrogen-Life Technologies (Grand Island, NY, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Alexa", "568", "conjugated", "secondary", "antibody", "(", "catalog", "#", "A11031", "or", "A11036", ")", "was", "obtained", "from", "Invitrogen-Life", "Technologies", "(", "Grand", "Island", ",", "NY", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11742670
The assays were conducted using SRB assay at 5 different concentrations 0.01, 0.1, 1, 10, and 100 µg/mL as the method described before.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "assays", "were", "conducted", "using", "SRB", "assay", "at", "5", "different", "concentrations", "0.01", ",", "0.1", ",", "1", ",", "10", ",", "and", "100", "µg/mL", "as", "the", "method", "described", "before", "." ] } ]
PMC6487404
At 30 min, the mean LDH activity detected in the incubation media was 150 U/L/cm and was similar to that detected at 60 and 90 min (p > 0.05), indicating the viability of the gut sacs during the experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "30", "min", ",", "the", "mean", "LDH", "activity", "detected", "in", "the", "incubation", "media", "was", "150", "U/L/cm", "and", "was", "similar", "to", "that", "detected", "at", "60", "and", "90", "min", "(", "p", ">", "0.05", ")", ",", "indicating", "the", "viability", "of", "the", "gut", "sacs", "during", "the", "experiments", "." ] } ]
PMC9429973
The CRc rates were 75% and 72% in pts who received prior gilteritinib and prior HMA+VEN, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "CRc", "rates", "were", "75", "%", "and", "72", "%", "in", "pts", "who", "received", "prior", "gilteritinib", "and", "prior", "HMA+VEN", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11486946
In the obtained images, the average brightness was measured for circled regions of interest (ROI) within a cell and outside the cell (background).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "obtained", "images", ",", "the", "average", "brightness", "was", "measured", "for", "circled", "regions", "of", "interest", "(", "ROI", ")", "within", "a", "cell", "and", "outside", "the", "cell", "(", "background", ")", "." ] } ]
PMC11754094
By comparing CRISPR-treated data with negative control in each gene, we identified top ten genes associated with increase or decrease in large-deletion frequencies (Extended Data Fig. 6).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "comparing", "CRISPR-treated", "data", "with", "negative", "control", "in", "each", "gene", ",", "we", "identified", "top", "ten", "genes", "associated", "with", "increase", "or", "decrease", "in", "large-deletion", "frequencies", "(", "Extended", "Data", "Fig.", "6", ")", "." ] } ]
PMC11591038
This study adds an additional mechanism for probiotics to reduce oxidative stress and inflammation in AD models through the regulation of HIF-1α expression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "study", "adds", "an", "additional", "mechanism", "for", "probiotics", "to", "reduce", "oxidative", "stress", "and", "inflammation", "in", "AD", "models", "through", "the", "regulation", "of", "HIF-1α", "expression", "." ] } ]
PMC11321678
However, such an analysis has not been reported in primary MBs, especially for long‐term frozen samples due to technical difficulties.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "such", "an", "analysis", "has", "not", "been", "reported", "in", "primary", "MBs", ",", "especially", "for", "long‐term", "frozen", "samples", "due", "to", "technical", "difficulties", "." ] } ]
PMC9429973
Therefore, daratumumab treatment was stopped and replaced by inotuzumab and subsequent SCT, which led to a molecular CR3.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "daratumumab", "treatment", "was", "stopped", "and", "replaced", "by", "inotuzumab", "and", "subsequent", "SCT", ",", "which", "led", "to", "a", "molecular", "CR3", "." ] } ]
PMC11365983
These data demonstrate that Foxc1 moderately affects protein levels of total PDGFRα while strongly impacting its ligand-dependent phosphorylation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "data", "demonstrate", "that", "Foxc1", "moderately", "affects", "protein", "levels", "of", "total", "PDGFRα", "while", "strongly", "impacting", "its", "ligand-dependent", "phosphorylation", "." ] } ]
PMC11650848
We examined possible links between cognitive improvements at 11 years and mQTL genotypes for ZFP57.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "examined", "possible", "links", "between", "cognitive", "improvements", "at", "11", "years", "and", "mQTL", "genotypes", "for", "ZFP57", "." ] } ]
PMC6190245
The resulting formazan was solubilized using DMSO (100 μl).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "resulting", "formazan", "was", "solubilized", "using", "DMSO", "(", "100", "μl", ")", "." ] } ]
PMC9429973
36% of the patients received three or more lines of therapy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "36", "%", "of", "the", "patients", "received", "three", "or", "more", "lines", "of", "therapy", "." ] } ]
PMC11344246
siPLK and siTOX are expected to kill cells and show strong cell cycle changes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "siPLK", "and", "siTOX", "are", "expected", "to", "kill", "cells", "and", "show", "strong", "cell", "cycle", "changes", "." ] } ]
PMC11209164
Further, the effects of TPF on oncolytic virus replication and spread, analogously to DMF, were restricted to tumor cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Further", ",", "the", "effects", "of", "TPF", "on", "oncolytic", "virus", "replication", "and", "spread", ",", "analogously", "to", "DMF", ",", "were", "restricted", "to", "tumor", "cells", "." ] } ]
PMC11731614
KDEVs from SEC Fr2/3 are functionally internalized by primary DRG neurons.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "KDEVs", "from", "SEC", "Fr2/3", "are", "functionally", "internalized", "by", "primary", "DRG", "neurons", "." ] } ]
PMC10291556
Moreover, log P values of Pt complexes were also determined to assess the possible correlation between the lipophilicity of the Pt complexes and their cellular uptake.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "log", "P", "values", "of", "Pt", "complexes", "were", "also", "determined", "to", "assess", "the", "possible", "correlation", "between", "the", "lipophilicity", "of", "the", "Pt", "complexes", "and", "their", "cellular", "uptake", "." ] } ]
PMC11762280
The scores of UVB damage were used to evaluate the level of UVB skin damage as previously described .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "scores", "of", "UVB", "damage", "were", "used", "to", "evaluate", "the", "level", "of", "UVB", "skin", "damage", "as", "previously", "described", "." ] } ]
PMC9985266
As the main epigenetic modification pathway in mammals, DNA methyltransferase 1 (DNMT1) is responsible for maintaining the methylation of related genes during DNA replication, thus affecting the expression of related genes .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "the", "main", "epigenetic", "modification", "pathway", "in", "mammals", ",", "DNA", "methyltransferase", "1", "(", "DNMT1", ")", "is", "responsible", "for", "maintaining", "the", "methylation", "of", "related", "genes", "during", "DNA", "replication", ",", "thus", "affecting", "the", "expression", "of", "related", "genes", "." ] } ]
PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: CRE-BSI was regarded as an independent predictor predisposing to high mortality in neutropenic children.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "CRE-BSI", "was", "regarded", "as", "an", "independent", "predictor", "predisposing", "to", "high", "mortality", "in", "neutropenic", "children", "." ] } ]
PMC8557138
These cells form tubular vessel-like structures mimicking vasculature, fulfilling the nutritional needs of the tumor.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "cells", "form", "tubular", "vessel-like", "structures", "mimicking", "vasculature", ",", "fulfilling", "the", "nutritional", "needs", "of", "the", "tumor", "." ] } ]
PMC9268183
In fact, Duke’s CRC Handbook of Medicinal Herbs was by far the most inclusive, systematic and detailed work analysed of any of the sources consulted (Table 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "fact", ",", "Duke", "’s", "CRC", "Handbook", "of", "Medicinal", "Herbs", "was", "by", "far", "the", "most", "inclusive", ",", "systematic", "and", "detailed", "work", "analysed", "of", "any", "of", "the", "sources", "consulted", "(", "Table", "1", ")", "." ] } ]
PMC11740399
P<0.05 To determine the effective anti-tumor dose of 3025@ML for in vitro studies, T24 and 5637 cells were treated with 0, 0.1, 1, 10, and 100 µM of 3025@ML for 48 h (Fig. 3A and B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P<0.05", "To", "determine", "the", "effective", "anti-tumor", "dose", "of", "3025@ML", "for", "in", "vitro", "studies", ",", "T24", "and", "5637", "cells", "were", "treated", "with", "0", ",", "0.1", ",", "1", ",", "10", ",", "and", "100", "µM", "of", "3025@ML", "for", "48", "h", "(", "Fig.", "3A", "and", "B", ")", "." ] } ]
PMC11707832
The complexity of lysosomal functions complicates the development of targeted therapies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "complexity", "of", "lysosomal", "functions", "complicates", "the", "development", "of", "targeted", "therapies", "." ] } ]
PMC9424261
Ferrous ions (Fe) can initiate liposome peroxidation through Fenton reaction to promote ferroptosis .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ferrous", "ions", "(", "Fe", ")", "can", "initiate", "liposome", "peroxidation", "through", "Fenton", "reaction", "to", "promote", "ferroptosis", "." ] } ]
PMC6901583
4BRD4 overexpression promotes GIST cell proliferation and angiogenesis in vivo.a GIST882 control vector cells or BRD4 cells were subcutaneously injected into Balb/c nude mice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "4BRD4", "overexpression", "promotes", "GIST", "cell", "proliferation", "and", "angiogenesis", "in", "vivo.a", "GIST882", "control", "vector", "cells", "or", "BRD4", "cells", "were", "subcutaneously", "injected", "into", "Balb/c", "nude", "mice", "." ] } ]
PMC10317042
In addition, the mRNA expression of SOX10 was suppressed by vorinostat treatment (Fig. 5B), and our scRNA-seq analysis results were consistent with this finding (Supplementary Fig. S4A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "the", "mRNA", "expression", "of", "SOX10", "was", "suppressed", "by", "vorinostat", "treatment", "(", "Fig.", "5B", ")", ",", "and", "our", "scRNA-seq", "analysis", "results", "were", "consistent", "with", "this", "finding", "(", "Supplementary", "Fig.", "S4A", ")", "." ] } ]
PMC11585254
Our study provides evidence that β-arrestins are recruited to CXCR5 and are required for desensitization but are dispensable for internalization or signaling, suggesting that discrete receptor determinants specify the divergent functions of β-arrestins.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "study", "provides", "evidence", "that", "β-arrestins", "are", "recruited", "to", "CXCR5", "and", "are", "required", "for", "desensitization", "but", "are", "dispensable", "for", "internalization", "or", "signaling", ",", "suggesting", "that", "discrete", "receptor", "determinants", "specify", "the", "divergent", "functions", "of", "β-arrestins", "." ] } ]
PMC7709199
However, the shift in molecular weight is minimal for IL-12B and DSCAM, whereas for CSF-1RD1–D3 it entails a very substantial reduction of more than 10 kDa.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "shift", "in", "molecular", "weight", "is", "minimal", "for", "IL-12B", "and", "DSCAM", ",", "whereas", "for", "CSF-1RD1–D3", "it", "entails", "a", "very", "substantial", "reduction", "of", "more", "than", "10", "kDa", "." ] } ]
PMC10253553
Conversely, both cell lines were equally sensitive to Torin 2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Conversely", ",", "both", "cell", "lines", "were", "equally", "sensitive", "to", "Torin", "2", "." ] } ]
PMC11568601
A Tumor morphology, body weight and tumor volume curve were displayed (mean ± SD, n = 8).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "Tumor", "morphology", ",", "body", "weight", "and", "tumor", "volume", "curve", "were", "displayed", "(", "mean", "±", "SD", ",", "n", "=", "8)", "." ] } ]
PMC11657695
The method used to define high or low expression of KCNA2 is performed using the Kaplan Scan where an optimum survival cut-off is established based on statistical testing (see R2: Genomics Analysis and Visualization Platform).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "method", "used", "to", "define", "high", "or", "low", "expression", "of", "KCNA2", "is", "performed", "using", "the", "Kaplan", "Scan", "where", "an", "optimum", "survival", "cut-off", "is", "established", "based", "on", "statistical", "testing", "(", "see", "R2", ":", "Genomics", "Analysis", "and", "Visualization", "Platform", ")", "." ] } ]
PMC11718109
Each construct was validated by DNA sequencing.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Each", "construct", "was", "validated", "by", "DNA", "sequencing", "." ] } ]
PMC6379402
When clusterings are identical, off-diagonal entries of are either 0 or 1 and both and equal 1 (provided that the k clusters have the same size and that n/k is integer).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "clusterings", "are", "identical", ",", "off-diagonal", "entries", "of", "are", "either", "0", "or", "1", "and", "both", "and", "equal", "1", "(", "provided", "that", "the", "k", "clusters", "have", "the", "same", "size", "and", "that", "n/k", "is", "integer", ")", "." ] } ]
PMC8409415
This ADC consists of a humanized anti‐folate receptor alpha mAb attached via a cleavable disulfide linker to the cytotoxic maytansinoid DM4, which inhibits tubulin polymerization.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "ADC", "consists", "of", "a", "humanized", "anti‐folate", "receptor", "alpha", "mAb", "attached", "via", "a", "cleavable", "disulfide", "linker", "to", "the", "cytotoxic", "maytansinoid", "DM4", ",", "which", "inhibits", "tubulin", "polymerization", "." ] } ]
PMC11468365
These drug and cell line features are then concatenated into a single feature vector and input into an attention model, to output two different optimized weighted feature vectors for predicting synergy and sensitivity scores.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "drug", "and", "cell", "line", "features", "are", "then", "concatenated", "into", "a", "single", "feature", "vector", "and", "input", "into", "an", "attention", "model", ",", "to", "output", "two", "different", "optimized", "weighted", "feature", "vectors", "for", "predicting", "synergy", "and", "sensitivity", "scores", "." ] } ]
PMC9429973
The study outcomes will be assessed based on subgroups.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "study", "outcomes", "will", "be", "assessed", "based", "on", "subgroups", "." ] } ]
PMC7823217
Recent studies demonstrated that bioprinting of the cells in a co-culture with adipocytes resulted in morphological changes and differences in cell localization within printed structures .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Recent", "studies", "demonstrated", "that", "bioprinting", "of", "the", "cells", "in", "a", "co-culture", "with", "adipocytes", "resulted", "in", "morphological", "changes", "and", "differences", "in", "cell", "localization", "within", "printed", "structures", "." ] } ]
PMC10698968
However, Goyer et al. found a strong positivity for tumour endothelial marker 1 (TEM1) that was not expressed in normal peri-tumoural tissues .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "Goyer", "et", "al.", "found", "a", "strong", "positivity", "for", "tumour", "endothelial", "marker", "1", "(", "TEM1", ")", "that", "was", "not", "expressed", "in", "normal", "peri-tumoural", "tissues", "." ] } ]
PMC11609529
To assess whether the endogenous YM fusion exhibits such nuclear dot localization, we utilized CRISPR-Cas9 gene editing to target exon 1 of MAML2, achieving selective knockout (KO) of MAML2 while preserving the expression of the YM fusion (Figure 2C, bottom).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "assess", "whether", "the", "endogenous", "YM", "fusion", "exhibits", "such", "nuclear", "dot", "localization", ",", "we", "utilized", "CRISPR-Cas9", "gene", "editing", "to", "target", "exon", "1", "of", "MAML2", ",", "achieving", "selective", "knockout", "(", "KO", ")", "of", "MAML2", "while", "preserving", "the", "expression", "of", "the", "YM", "fusion", "(", "Figure", "2C", ",", "bottom", ")", "." ] } ]
PMC11481779
In case of Akita, the initial region was 1Mbp, and in caase of Orca, it was up to 256Mbp, depending on the resolution we are interested in.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "case", "of", "Akita", ",", "the", "initial", "region", "was", "1Mbp", ",", "and", "in", "caase", "of", "Orca", ",", "it", "was", "up", "to", "256Mbp", ",", "depending", "on", "the", "resolution", "we", "are", "interested", "in", "." ] } ]
PMC10994876
They showed that PTEN, which acts as a negative regulator of mTOR, plays a vital role in mediating the regulation of mTOR by YAP (Xu et al. 2021).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "showed", "that", "PTEN", ",", "which", "acts", "as", "a", "negative", "regulator", "of", "mTOR", ",", "plays", "a", "vital", "role", "in", "mediating", "the", "regulation", "of", "mTOR", "by", "YAP", "(", "Xu", "et", "al.", "2021", ")", "." ] } ]
PMC10831439
For that, cells were centrifuged (5 min, RT, 450xg) and the supernatant was completely removed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "that", ",", "cells", "were", "centrifuged", "(", "5", "min", ",", "RT", ",", "450xg", ")", "and", "the", "supernatant", "was", "completely", "removed", "." ] } ]
PMC11740207
Both VSELSCs and MIAMICs resemble LT-HSCs in maintaining homeostasis and promoting cellular longevity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Both", "VSELSCs", "and", "MIAMICs", "resemble", "LT-HSCs", "in", "maintaining", "homeostasis", "and", "promoting", "cellular", "longevity", "." ] } ]
PMC11633763
CCK‐8 assays showing proliferation capacity of 143B cells stably transfected with shUSP22 in the presence or absence of p‐HK2. *
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CCK‐8", "assays", "showing", "proliferation", "capacity", "of", "143B", "cells", "stably", "transfected", "with", "shUSP22", "in", "the", "presence", "or", "absence", "of", "p‐HK2", ".", "*" ] } ]
PMC9429973
In total 35% (405/1165) of the patients with elevated Hb/HCT or Plt should be investigated further to rule out MPN according to current guidelines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "total", "35", "%", "(", "405/1165", ")", "of", "the", "patients", "with", "elevated", "Hb/HCT", "or", "Plt", "should", "be", "investigated", "further", "to", "rule", "out", "MPN", "according", "to", "current", "guidelines", "." ] } ]
PMC7802142
b Volcano plot shows the relation between the P-values and the fold changes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "b", "Volcano", "plot", "shows", "the", "relation", "between", "the", "P-values", "and", "the", "fold", "changes", "." ] } ]
PMC11754094
b, Editing outcomes of nCas9 (D10A) (nickase Cas9) and the indicated BEs targeting ABLIM3, FANCF, KLHL29 and BRD4 (n = 3, mean ± s.e.m.).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "b", ",", "Editing", "outcomes", "of", "nCas9", "(", "D10A", ")", "(", "nickase", "Cas9", ")", "and", "the", "indicated", "BEs", "targeting", "ABLIM3", ",", "FANCF", ",", "KLHL29", "and", "BRD4", "(", "n", "=", "3", ",", "mean", "±", "s.e.m", ".", ")", "." ] } ]
PMC11597167
Quercetin and EGCG have been studied for their effects on CD33 expression, implicated in microglial activation and neuroinflammation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Quercetin", "and", "EGCG", "have", "been", "studied", "for", "their", "effects", "on", "CD33", "expression", ",", "implicated", "in", "microglial", "activation", "and", "neuroinflammation", "." ] } ]
PMC3931643
VAL and OCI-LY7 cell lines expressing the tetracycline transactivator protein (rtTA) were infected with the lentivirus and selected in IMDM culture medium containing 8 µg/ml Blasticidin and 2.0 µg/ml Puromycin.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "VAL", "and", "OCI-LY7", "cell", "lines", "expressing", "the", "tetracycline", "transactivator", "protein", "(", "rtTA", ")", "were", "infected", "with", "the", "lentivirus", "and", "selected", "in", "IMDM", "culture", "medium", "containing", "8", "µg/ml", "Blasticidin", "and", "2.0", "µg/ml", "Puromycin", "." ] } ]
PMC8193046
In total, 281 were removed, resulting in 1,229 unique compounds.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "total", ",", "281", "were", "removed", ",", "resulting", "in", "1,229", "unique", "compounds", "." ] } ]
PMC11583010
ADC treatments were administered twice (black arrowheads).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ADC", "treatments", "were", "administered", "twice", "(", "black", "arrowheads", ")", "." ] } ]
PMC10788478
Cell growth was assessed using colony formation assay.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "growth", "was", "assessed", "using", "colony", "formation", "assay", "." ] } ]