OTAR3088/BioData-CellLine_annotated · Datasets at Hugging Face

PMCID string	Sentences string	ner list
PMC11568601	and 10% FBS (Thermo Fisher Scientific, USA) at 37 ℃ with 5% CO2.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "and", "10", "%", "FBS", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ",", "USA", ")", "at", "37", "℃", "with", "5", "%", "CO2", "." ] } ]
PMC3122064	Results of at least three experiments are expressed as mean±(standard deviation) S.D. Student's unpaired t-test was used to compare values of test and control samples.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", "of", "at", "least", "three", "experiments", "are", "expressed", "as", "mean±(standard", "deviation", ")", "S.D.", "Student", "'s", "unpaired", "t-test", "was", "used", "to", "compare", "values", "of", "test", "and", "control", "samples", "." ] } ]
PMC11544771	It has been shown that PRE treatment can result in DNA double strand breaks (DSB) and cell death in the cells of S-phase presumptively by causing replication catastrophe .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "has", "been", "shown", "that", "PRE", "treatment", "can", "result", "in", "DNA", "double", "strand", "breaks", "(", "DSB", ")", "and", "cell", "death", "in", "the", "cells", "of", "S-phase", "presumptively", "by", "causing", "replication", "catastrophe", "." ] } ]
PMC9812014	The best inhibitory activity against NDV in the in-ovo studies on chicken embryos was 0.2 mg/kg HHT.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "best", "inhibitory", "activity", "against", "NDV", "in", "the", "in-ovo", "studies", "on", "chicken", "embryos", "was", "0.2", "mg/kg", "HHT", "." ] } ]
PMC10847511	Recently, their clinical utility as biomarkers has been investigated in other cancer types.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Recently", ",", "their", "clinical", "utility", "as", "biomarkers", "has", "been", "investigated", "in", "other", "cancer", "types", "." ] } ]
PMC9429973	Subsequently, we found that high TAC plasma levels correlate with detrimental clinical features, such as high levels of lactate dehydrogenase (LDH) and circulating CD34+ cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Subsequently", ",", "we", "found", "that", "high", "TAC", "plasma", "levels", "correlate", "with", "detrimental", "clinical", "features", ",", "such", "as", "high", "levels", "of", "lactate", "dehydrogenase", "(", "LDH", ")", "and", "circulating", "CD34", "+", "cells", "." ] } ]
PMC11451940	This analysis was conducted using the CYTO-ID® Autophagy detection kit 2.0 (ENZO, USA) according to the manufacturer's protocol to assess the induction of autophagy by complexes 1, 5, and 7.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "analysis", "was", "conducted", "using", "the", "CYTO-ID", "®", "Autophagy", "detection", "kit", "2.0", "(", "ENZO", ",", "USA", ")", "according", "to", "the", "manufacturer", "'s", "protocol", "to", "assess", "the", "induction", "of", "autophagy", "by", "complexes", "1", ",", "5", ",", "and", "7", "." ] } ]
PMC11706776	Bars indicate mean ± SD of counted colonies or the clones surface area observed on the left panel relative to the untreated cells (N = 3).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bars", "indicate", "mean", "±", "SD", "of", "counted", "colonies", "or", "the", "clones", "surface", "area", "observed", "on", "the", "left", "panel", "relative", "to", "the", "untreated", "cells", "(", "N", "=", "3", ")", "." ] } ]
PMC7334607	Researchers have tried adding ifosfamide and etoposide to standard EWS chemotherapy, increasing the drug doses administered, and decreasing the interval between doses, all without meaningful improvement to metastatic disease outcomes (Grier et al., 2003; Huang and Lucas, 2010; Womer et al., 2012).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Researchers", "have", "tried", "adding", "ifosfamide", "and", "etoposide", "to", "standard", "EWS", "chemotherapy", ",", "increasing", "the", "drug", "doses", "administered", ",", "and", "decreasing", "the", "interval", "between", "doses", ",", "all", "without", "meaningful", "improvement", "to", "metastatic", "disease", "outcomes", "(", "Grier", "et", "al.", ",", "2003", ";", "Huang", "and", "Lucas", ",", "2010", ";", "Womer", "et", "al.", ",", "2012", ")", "." ] } ]
PMC11525028	Any additional information required to reanalyze the data reported in this work paper is available from the lead contact upon request.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Any", "additional", "information", "required", "to", "reanalyze", "the", "data", "reported", "in", "this", "work", "paper", "is", "available", "from", "the", "lead", "contact", "upon", "request", "." ] } ]
PMC11247842	Variants with effect size estimates larger than three times the genetic standard deviation were removed.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Variants", "with", "effect", "size", "estimates", "larger", "than", "three", "times", "the", "genetic", "standard", "deviation", "were", "removed", "." ] } ]
PMC11644761	The obtained DNA was quantified by NanoDrop ND-1000 .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "obtained", "DNA", "was", "quantified", "by", "NanoDrop", "ND-1000", "." ] } ]
PMC11513011	Cell growth inhibitory effect of DIB.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "growth", "inhibitory", "effect", "of", "DIB", "." ] } ]
PMC6461034	Transfer the supernatant from the previous spin (peptide solution) to an “IP” tube with 20 μl aliquoted antibody‐conjugated beads, pipetting directly on top of the beads (without touching).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transfer", "the", "supernatant", "from", "the", "previous", "spin", "(", "peptide", "solution", ")", "to", "an", "“", "IP", "”", "tube", "with", "20", "μl", "aliquoted", "antibody‐conjugated", "beads", ",", "pipetting", "directly", "on", "top", "of", "the", "beads", "(", "without", "touching", ")", "." ] } ]
PMC11023271	HaCaT and A431 cells treated with serum or 10 μM LPA expressed decreased RIPK4 protein levels compared to control (C).	[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HaCaT", "and", "A431", "cells", "treated", "with", "serum", "or", "10", "μM", "LPA", "expressed", "decreased", "RIPK4", "protein", "levels", "compared", "to", "control", "(", "C", ")", "." ] } ]
PMC11536589	The pseudo-time trajectories analysis of MGST1 expression in Cluster 2 and Cluster 5.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "pseudo-time", "trajectories", "analysis", "of", "MGST1", "expression", "in", "Cluster", "2", "and", "Cluster", "5", "." ] } ]
PMC11286266	The cell lines used in this study have tested negative for mycoplasma contamination using the MycoAlert Mycoplasma Detection Kit (Lonza).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cell", "lines", "used", "in", "this", "study", "have", "tested", "negative", "for", "mycoplasma", "contamination", "using", "the", "MycoAlert", "Mycoplasma", "Detection", "Kit", "(", "Lonza", ")", "." ] } ]
PMC10125312	Following the cytotoxicity evaluation of AuNR, we established >70% viability of cell lines as a criterion to determine if laser light conditions were toxic to cell lines.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Following", "the", "cytotoxicity", "evaluation", "of", "AuNR", ",", "we", "established", ">", "70", "%", "viability", "of", "cell", "lines", "as", "a", "criterion", "to", "determine", "if", "laser", "light", "conditions", "were", "toxic", "to", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC11515150	To further verify the cytotoxicity of CAR-NK cells, CCRF-CEM cells were selected as the positive target cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "verify", "the", "cytotoxicity", "of", "CAR-NK", "cells", ",", "CCRF-CEM", "cells", "were", "selected", "as", "the", "positive", "target", "cells", "." ] } ]
PMC11066331	The intensity of peak at m/z = 4939 Da was used for demonstration of non-centered data (C) and median-centered data (D).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "intensity", "of", "peak", "at", "m/z", "=", "4939", "Da", "was", "used", "for", "demonstration", "of", "non-centered", "data", "(", "C", ")", "and", "median-centered", "data", "(", "D", ")", "." ] } ]
PMC11621493	Data are presented as mean ± SD.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "presented", "as", "mean", "±", "SD", "." ] } ]
PMC9429973	Higher relapse was observed in related recipients transplant (47%; p-value 0.04) and in patients with high and very high risk in DRI-index (54.5 and 60% respectively; p-value 0.001).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Higher", "relapse", "was", "observed", "in", "related", "recipients", "transplant", "(", "47", "%", ";", "p-value", "0.04", ")", "and", "in", "patients", "with", "high", "and", "very", "high", "risk", "in", "DRI-index", "(", "54.5", "and", "60", "%", "respectively", ";", "p-value", "0.001", ")", "." ] } ]
PMC9429973	King Abdullah International Medical Research Center.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "King", "Abdullah", "International", "Medical", "Research", "Center", "." ] } ]
PMC11791432	Marker genes for each cluster were performed using the FindAllMarkers function with parameters set to LogFC = 0.3 and Minpct = 0.25.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Marker", "genes", "for", "each", "cluster", "were", "performed", "using", "the", "FindAllMarkers", "function", "with", "parameters", "set", "to", "LogFC", "=", "0.3", "and", "Minpct", "=", "0.25", "." ] } ]
PMC11767793	It derives from the development of in vitro and in silico substitutes to ensure the safe use of novel nanoproducts.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "derives", "from", "the", "development", "of", "in", "vitro", "and", "in", "silico", "substitutes", "to", "ensure", "the", "safe", "use", "of", "novel", "nanoproducts", "." ] } ]
PMC11655536	C The tumor volume curves of the HA treatment groups and the control group.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "The", "tumor", "volume", "curves", "of", "the", "HA", "treatment", "groups", "and", "the", "control", "group", "." ] } ]
PMC10114490	Values correspond to the average of 2 experiments with four replicates each. ***	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Values", "correspond", "to", "the", "average", "of", "2", "experiments", "with", "four", "replicates", "each", ".", "", "", "*" ] } ]
PMC10887351	In an in vitro model of BC, propranolol increased the anti-angiogenic and anti-tumor efficacy of chemotherapic agents .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "an", "in", "vitro", "model", "of", "BC", ",", "propranolol", "increased", "the", "anti-angiogenic", "and", "anti-tumor", "efficacy", "of", "chemotherapic", "agents", "." ] } ]
PMC5574817	Fig. 3 shows the sequence alignment and comparison between the sequences of the cDNA insert against the hERG sequence [NM 000238.3 homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 2 (KCNH2), transcript variant 1, mRNA].	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "3", "shows", "the", "sequence", "alignment", "and", "comparison", "between", "the", "sequences", "of", "the", "cDNA", "insert", "against", "the", "hERG", "sequence", "[", "NM", "000238.3", "homo", "sapiens", "potassium", "voltage-gated", "channel", ",", "subfamily", "H", "(", "eag-related", ")", ",", "member", "2", "(", "KCNH2", ")", ",", "transcript", "variant", "1", ",", "mRNA", "]", "." ] } ]
PMC10165258	A first image of the complete microfluidic chip was obtained immediately after the drug addition to read the barcode on each of the spheroids.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "first", "image", "of", "the", "complete", "microfluidic", "chip", "was", "obtained", "immediately", "after", "the", "drug", "addition", "to", "read", "the", "barcode", "on", "each", "of", "the", "spheroids", "." ] } ]
PMC10547921	At the same time as the efficacy of the agonists increases, the toxicity will also increase, which makes it difficult to ensure that the efficacy can be improved in a safe and reliable manner.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "the", "same", "time", "as", "the", "efficacy", "of", "the", "agonists", "increases", ",", "the", "toxicity", "will", "also", "increase", ",", "which", "makes", "it", "difficult", "to", "ensure", "that", "the", "efficacy", "can", "be", "improved", "in", "a", "safe", "and", "reliable", "manner", "." ] } ]
PMC11478724	Finally, the cytotoxicity percentage was calculated using the following equation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Finally", ",", "the", "cytotoxicity", "percentage", "was", "calculated", "using", "the", "following", "equation", "." ] } ]
PMC11687167	Another study indicated that a third pathway critical for PCSK9-induced LDLR degradation was mediated by an adenylate cyclase-associated protein 1 (CAP1)-dependent protein with a globular C-terminus structurally similar to the C-terminal CHRD of PCSK9.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Another", "study", "indicated", "that", "a", "third", "pathway", "critical", "for", "PCSK9-induced", "LDLR", "degradation", "was", "mediated", "by", "an", "adenylate", "cyclase-associated", "protein", "1", "(CAP1)-dependent", "protein", "with", "a", "globular", "C-terminus", "structurally", "similar", "to", "the", "C-terminal", "CHRD", "of", "PCSK9", "." ] } ]
PMC10047551	Thus, the external induction of PD-L1 expression in cancer cells, e.g., in the tumor microenvironment, may have the ability to bypass concordant changes in PD-L1 promoter methylation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "the", "external", "induction", "of", "PD-L1", "expression", "in", "cancer", "cells", ",", "e.g.", ",", "in", "the", "tumor", "microenvironment", ",", "may", "have", "the", "ability", "to", "bypass", "concordant", "changes", "in", "PD-L1", "promoter", "methylation", "." ] } ]
PMC11354225	When confluence was 80%, cells were exposed to different treatments: EGCG 10 µM and EGCG 40 µM and untreated control (medium) for 4 h at 37 °C in darkness.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "confluence", "was", "80", "%", ",", "cells", "were", "exposed", "to", "different", "treatments", ":", "EGCG", "10", "µM", "and", "EGCG", "40", "µM", "and", "untreated", "control", "(", "medium", ")", "for", "4", "h", "at", "37", "°", "C", "in", "darkness", "." ] } ]
PMC7185206	We hypothesized that ADAM10 and ADAM17-generated tumor-derived sPD-L1 may induce human CD8 + T cell death.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "hypothesized", "that", "ADAM10", "and", "ADAM17-generated", "tumor-derived", "sPD-L1", "may", "induce", "human", "CD8", "+", "T", "cell", "death", "." ] } ]
PMC9429973	Moreover, in 25% of centers the cryopreservation costs are not covered by the public health system.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "in", "25", "%", "of", "centers", "the", "cryopreservation", "costs", "are", "not", "covered", "by", "the", "public", "health", "system", "." ] } ]
PMC4485786	Interleukin 12 (IL-12), the major player in this network, can induce tumor regression and affects innate and adaptive immunity.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interleukin", "12", "(", "IL-12", ")", ",", "the", "major", "player", "in", "this", "network", ",", "can", "induce", "tumor", "regression", "and", "affects", "innate", "and", "adaptive", "immunity", "." ] } ]
PMC9429973	Methods: Patient was treated with ibuprofen at regular therapeutic doses (approximately 30 mg/kg/24 hours daily initially) and serial full blood counts were monitored.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "Patient", "was", "treated", "with", "ibuprofen", "at", "regular", "therapeutic", "doses", "(", "approximately", "30", "mg/kg/24", "hours", "daily", "initially", ")", "and", "serial", "full", "blood", "counts", "were", "monitored", "." ] } ]
PMC11371747	l-LV, l-leucovorin; FA, folic acid; FBS, fetal bovine serum; dFBS: dialyzed fetal bovine serum; MPM, malignant pleural mesothelioma; NSCLC, non-small cell lung cancer; ALL, acute lymphoblastic leukemia; CHO, Chinese hamster ovary; CHO/C5, AA8 cells in which the natural RFC has been knocked out (k.o.),	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "l-LV", ",", "l-leucovorin", ";", "FA", ",", "folic", "acid", ";", "FBS", ",", "fetal", "bovine", "serum", ";", "dFBS", ":", "dialyzed", "fetal", "bovine", "serum", ";", "MPM", ",", "malignant", "pleural", "mesothelioma", ";", "NSCLC", ",", "non-small", "cell", "lung", "cancer", ";", "ALL", ",", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", ";", "CHO", ",", "Chinese", "hamster", "ovary", ";", "CHO/C5", ",", "AA8", "cells", "in", "which", "the", "natural", "RFC", "has", "been", "knocked", "out", "(", "k.o", ".", ")", "," ] } ]
PMC8358006	Kaplan–Meier survival curves and log-rank tests were used to compare the survival distribution between the high-expression and low-expression groups through the platform DrBioRight.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Kaplan", "–", "Meier", "survival", "curves", "and", "log-rank", "tests", "were", "used", "to", "compare", "the", "survival", "distribution", "between", "the", "high-expression", "and", "low-expression", "groups", "through", "the", "platform", "DrBioRight", "." ] } ]
PMC11257203	The normal distribution of all data was assessed using the Shapiro-Wilk test.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "normal", "distribution", "of", "all", "data", "was", "assessed", "using", "the", "Shapiro-Wilk", "test", "." ] } ]
PMC11093197	c‐Myc overexpression plasmid was purchased from Addgene (#20723), and CS‐IV TRE‐RfA‐UbC‐Puro‐H‐RAS was a kind gift from Yoshikazu Johmura.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "c‐Myc", "overexpression", "plasmid", "was", "purchased", "from", "Addgene", "(", "#", "20723", ")", ",", "and", "CS‐IV", "TRE‐RfA‐UbC‐Puro‐H‐RAS", "was", "a", "kind", "gift", "from", "Yoshikazu", "Johmura", "." ] } ]
PMC11301242	Box plots indicate the gene expression levels in lymphoma samples without ecDNA amplification (n=6), with asterisks denoting outliers.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Box", "plots", "indicate", "the", "gene", "expression", "levels", "in", "lymphoma", "samples", "without", "ecDNA", "amplification", "(", "n=6", ")", ",", "with", "asterisks", "denoting", "outliers", "." ] } ]
PMC11755519	Such growth might be caused by genetic mutations in proto-oncogenes such as fibroblast growth factor receptor-3 (FGFR3) and the viral Harvey Rat sarcoma virus (HRAS).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Such", "growth", "might", "be", "caused", "by", "genetic", "mutations", "in", "proto-oncogenes", "such", "as", "fibroblast", "growth", "factor", "receptor-3", "(", "FGFR3", ")", "and", "the", "viral", "Harvey", "Rat", "sarcoma", "virus", "(", "HRAS", ")", "." ] } ]
PMC11413393	Efficiency of RNA fractionation in these experiments was confirmed by assaying levels of the nuclear RNA, MALAT1 (Supplementary Fig. 9c).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Efficiency", "of", "RNA", "fractionation", "in", "these", "experiments", "was", "confirmed", "by", "assaying", "levels", "of", "the", "nuclear", "RNA", ",", "MALAT1", "(", "Supplementary", "Fig.", "9c", ")", "." ] } ]
PMC10777969	FCP23 induces oxidative stress, while FCP26 does not.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "FCP23", "induces", "oxidative", "stress", ",", "while", "FCP26", "does", "not", "." ] } ]
PMC11687167	There are no drug-drug interactions between these two drugs because they do not interact with cytochrome P450 enzymes or transporter proteins [27–29].	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "are", "no", "drug-drug", "interactions", "between", "these", "two", "drugs", "because", "they", "do", "not", "interact", "with", "cytochrome", "P450", "enzymes", "or", "transporter", "proteins", "[", "27–29", "]", "." ] } ]
PMC11546117	Rodent in vitro models have been used to estimate drug transport across the mammary epithelium , but they are not representative of the human mammary epithelium due to species differences .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Rodent", "in", "vitro", "models", "have", "been", "used", "to", "estimate", "drug", "transport", "across", "the", "mammary", "epithelium", ",", "but", "they", "are", "not", "representative", "of", "the", "human", "mammary", "epithelium", "due", "to", "species", "differences", "." ] } ]
PMC11422497	Once cells reached confluence, perpendicular scratches were carefully made across the marked lines.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Once", "cells", "reached", "confluence", ",", "perpendicular", "scratches", "were", "carefully", "made", "across", "the", "marked", "lines", "." ] } ]
PMC9429973	Only the WHO 2016 proposal (CMML-0 61.6% vs 34.6%, CMML-1 21.9% vs 30.8%, CMML-2 16.4 vs 34.6%, p=0.046) and the absence of peripheral blasts (61.1% vs 36.0%, p=0.037) were associated with statistically different rates of response, with a tendency to treat later ≥6m (37.0% vs 15.4%, p=0.05).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Only", "the", "WHO", "2016", "proposal", "(", "CMML-0", "61.6", "%", "vs", "34.6", "%", ",", "CMML-1", "21.9", "%", "vs", "30.8", "%", ",", "CMML-2", "16.4", "vs", "34.6", "%", ",", "p=0.046", ")", "and", "the", "absence", "of", "peripheral", "blasts", "(", "61.1", "%", "vs", "36.0", "%", ",", "p=0.037", ")", "were", "associated", "with", "statistically", "different", "rates", "of", "response", ",", "with", "a", "tendency", "to", "treat", "later", "≥6", "m", "(", "37.0", "%", "vs", "15.4", "%", ",", "p=0.05", ")", "." ] } ]
PMC11703896	After 24 h of treatment, plates were examined using an inverted phase-contrast tissue culture microscope (Olympus CKX41 equipped with Optika Pro5 CCD camera).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "24", "h", "of", "treatment", ",", "plates", "were", "examined", "using", "an", "inverted", "phase-contrast", "tissue", "culture", "microscope", "(", "Olympus", "CKX41", "equipped", "with", "Optika", "Pro5", "CCD", "camera", ")", "." ] } ]
PMC11502066	Baicalein presents therefore a promising candidate for the treatment of GPR30-positive breast cancer metastasis (Table 1).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Baicalein", "presents", "therefore", "a", "promising", "candidate", "for", "the", "treatment", "of", "GPR30-positive", "breast", "cancer", "metastasis", "(", "Table", "1", ")", "." ] } ]
PMC11026382	New microfluidics-based approaches for high-throughput biochemistry could play a key role in refining and testing such methodology.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "New", "microfluidics-based", "approaches", "for", "high-throughput", "biochemistry", "could", "play", "a", "key", "role", "in", "refining", "and", "testing", "such", "methodology", "." ] } ]
PMC11650848	F Isoform detected in demethylated SH-SY5Y.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O" ], "tokens": [ "F", "Isoform", "detected", "in", "demethylated", "SH-SY5Y", "." ] } ]
PMC9352806	Quantification of fluorescence intensity was evaluated with the ImageJ (NIH) software to measure the percentage of GFP-positive nuclei in transgenic worms.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Quantification", "of", "fluorescence", "intensity", "was", "evaluated", "with", "the", "ImageJ", "(", "NIH", ")", "software", "to", "measure", "the", "percentage", "of", "GFP-positive", "nuclei", "in", "transgenic", "worms", "." ] } ]
PMC9388315	Unlike normal cells, the energy supply in cancer cells is mainly through the anaerobic pathway or glycolysis .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Unlike", "normal", "cells", ",", "the", "energy", "supply", "in", "cancer", "cells", "is", "mainly", "through", "the", "anaerobic", "pathway", "or", "glycolysis", "." ] } ]
PMC11713609	Representative immunochemistry images of 4-HNE staining.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Representative", "immunochemistry", "images", "of", "4-HNE", "staining", "." ] } ]
PMC11754784	Serum stability experiments (Supplementary Fig. 29) shows that the DNPs remain stable after 6 h incubation in culture medium with 10% FBS, which is consistent with the previous reports.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Serum", "stability", "experiments", "(", "Supplementary", "Fig.", "29", ")", "shows", "that", "the", "DNPs", "remain", "stable", "after", "6", "h", "incubation", "in", "culture", "medium", "with", "10", "%", "FBS", ",", "which", "is", "consistent", "with", "the", "previous", "reports", "." ] } ]
PMC11424574	We found that ERK1/2 depletion increased the expression of uPA, facilitating osteosarcoma cell migration and invasion.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "ERK1/2", "depletion", "increased", "the", "expression", "of", "uPA", ",", "facilitating", "osteosarcoma", "cell", "migration", "and", "invasion", "." ] } ]
PMC11695546	The absorbance was determined using a reader for microplates at 410 nm (Cai et al. 2019).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "absorbance", "was", "determined", "using", "a", "reader", "for", "microplates", "at", "410", "nm", "(", "Cai", "et", "al.", "2019", ")", "." ] } ]
PMC6600253	Senescent cells exhibit permanent growth arrest, the increased expression of cell cycle inhibitors, changes in cellular structures, and protein expression.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Senescent", "cells", "exhibit", "permanent", "growth", "arrest", ",", "the", "increased", "expression", "of", "cell", "cycle", "inhibitors", ",", "changes", "in", "cellular", "structures", ",", "and", "protein", "expression", "." ] } ]
PMC10344560	Our patient did not have common predisposition factors for fungal peritonitis in PD patients.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "patient", "did", "not", "have", "common", "predisposition", "factors", "for", "fungal", "peritonitis", "in", "PD", "patients", "." ] } ]
PMC9429973	Each analysis considered a low, medium, and high ABR patient population.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Each", "analysis", "considered", "a", "low", ",", "medium", ",", "and", "high", "ABR", "patient", "population", "." ] } ]
PMC11481779	We have then copied the sequence of 200kbp, precisely chr8:33 450 000–33 650 000, and inserted it instead of sequence present at chr8:32 750 000–32 950 000.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "have", "then", "copied", "the", "sequence", "of", "200kbp", ",", "precisely", "chr8:33", "450", "000–33", "650", "000", ",", "and", "inserted", "it", "instead", "of", "sequence", "present", "at", "chr8:32", "750", "000–32", "950", "000", "." ] } ]
PMC8973725	786–0 cells were transfected with empty pcDNA3.1 or pcDNA-ZNF677.	[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "786–0", "cells", "were", "transfected", "with", "empty", "pcDNA3.1", "or", "pcDNA-ZNF677", "." ] } ]
PMC10891340	These data suggested CCCP could inverse the level of ROS at the early and late stage of DPV infection.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "data", "suggested", "CCCP", "could", "inverse", "the", "level", "of", "ROS", "at", "the", "early", "and", "late", "stage", "of", "DPV", "infection", "." ] } ]
PMC8540611	After 2 days, uptake begins to decline, but AuNP15 complexes successfully accumulate in the cell after 3 h, and then the content of the complexes noticeably decreases.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "2", "days", ",", "uptake", "begins", "to", "decline", ",", "but", "AuNP15", "complexes", "successfully", "accumulate", "in", "the", "cell", "after", "3", "h", ",", "and", "then", "the", "content", "of", "the", "complexes", "noticeably", "decreases", "." ] } ]
PMC9672323	The graphs show the mean ± SD.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "graphs", "show", "the", "mean", "±", "SD", "." ] } ]
PMC8469018	After 24 h of cells incubation with teriflunomide or DMSO as vehicle in control cultures, cells were harvested by centrifugation at 400× g at room temperature for 5 min.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "24", "h", "of", "cells", "incubation", "with", "teriflunomide", "or", "DMSO", "as", "vehicle", "in", "control", "cultures", ",", "cells", "were", "harvested", "by", "centrifugation", "at", "400", "×", "g", "at", "room", "temperature", "for", "5", "min", "." ] } ]
PMC9096373	The research design and route are shown in Figure 1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "research", "design", "and", "route", "are", "shown", "in", "Figure", "1", "." ] } ]
PMC9429973	Results: Starting from as few as 50,000 cells using the CRISPR/Cas9 system we demonstrate dual epigenetic and genetic editing in the same CD34+ cell with DNA methylation targeted at p15 and p14 as well as mutating TET2.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "Starting", "from", "as", "few", "as", "50,000", "cells", "using", "the", "CRISPR/Cas9", "system", "we", "demonstrate", "dual", "epigenetic", "and", "genetic", "editing", "in", "the", "same", "CD34", "+", "cell", "with", "DNA", "methylation", "targeted", "at", "p15", "and", "p14", "as", "well", "as", "mutating", "TET2", "." ] } ]
PMC11528603	The statistical differences were analyzed by two-tailed Student’s t-tests (ns P > 0.05, P ≤ 0.05, P ≤ 0.01, **P ≤ 0.001).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "statistical", "differences", "were", "analyzed", "by", "two-tailed", "Student", "’s", "t-tests", "(", "ns", "P", ">", "0.05", ",", "", "P", "≤", "0.05", ",", "", "", "P", "≤", "0.01", ",", "", "", "", "P", "≤", "0.001", ")", "." ] } ]
PMC7229095	Also, the most recent report highly concerns the genetic diversity, and the spontaneous mutations in CHO cells can rapidly occur in a very short period (risk of diversity even in a cell division) (Wurm and Wurm 2017).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Also", ",", "the", "most", "recent", "report", "highly", "concerns", "the", "genetic", "diversity", ",", "and", "the", "spontaneous", "mutations", "in", "CHO", "cells", "can", "rapidly", "occur", "in", "a", "very", "short", "period", "(", "risk", "of", "diversity", "even", "in", "a", "cell", "division", ")", "(", "Wurm", "and", "Wurm", "2017", ")", "." ] } ]
PMC10656496	microRNA-Sequencing was performed using the Illumina TruSeq Small RNA Sample Preparation Kit, which enables the sequencing of small RNAs between 17 and 35 nucleotides.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "microRNA-Sequencing", "was", "performed", "using", "the", "Illumina", "TruSeq", "Small", "RNA", "Sample", "Preparation", "Kit", ",", "which", "enables", "the", "sequencing", "of", "small", "RNAs", "between", "17", "and", "35", "nucleotides", "." ] } ]
PMC11767582	HRMS (ESI/Q-TOF): m/z [M+H] calcd.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HRMS", "(", "ESI/Q-TOF", "):", "m/z", "[", "M+H", "]", "calcd", "." ] } ]
PMC11413393	MS023 is known to have specific activity against all type I PRMT enzymes including PRMT1, PRMT3, PRMT4 (CARM1), PRMT6 and PRMT8.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MS023", "is", "known", "to", "have", "specific", "activity", "against", "all", "type", "I", "PRMT", "enzymes", "including", "PRMT1", ",", "PRMT3", ",", "PRMT4", "(", "CARM1", ")", ",", "PRMT6", "and", "PRMT8", "." ] } ]
PMC11306019	Data: mean ± SD (n = 3). (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", ":", "mean", "±", "SD", "(", "n", "=", "3", ")", ".", "(" ] } ]
PMC11706776	Western-blots of SK1 and EWS::FLI1 (right panel) in A-673/TR/shEF cell line after doxycycline treatment (1 µg/mL) (N = 2).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Western-blots", "of", "SK1", "and", "EWS::FLI1", "(", "right", "panel", ")", "in", "A-673/TR/shEF", "cell", "line", "after", "doxycycline", "treatment", "(", "1", "µg/mL", ")", "(", "N", "=", "2", ")", "." ] } ]
PMC9429973	A. De La Fuente, M. Diaz Beya, P. Beneit, C. Botella, A. Fernandez Moreno, A. Sampol, M. Arnan Sangerman, A. Yeguas Bermejo, M. D. L. L. Amigo, J. Labrador, A. Garcia Guinon, A. Garrido, J. Serrano, S. Vives Polo, M. Garcia Fortes, M. J. Sayas, J. M. Bergua, M. T. Olave, F. Vall LLovera, J. Bargay, M. Pereiro Sanchez, R. Garcia Boyero, A. Diaz Lopez, M. Tormo Hematology, MD Anderson CC Madrid, Madrid; Hematology, H. U. Clinic IDIBAPS, Barcelona; Hematology, H. U. San Juan de Alicante; Hematology, H. General de Alicante, Alicante; Hematology, H. U. Central de Asturias, Oviedo; Hematology, H. U. Son Espases, Palma de Mallorca; Hematology, ICO Hospitalet, L’Hospitalet de Llobregat, Barcelona; Hematology, H. U. Salamanca, Salamanca; Hematology, H. U. Morales Meseguer, Murcia; Hematology, H. U. de Burgos, Burgos; Hematology, H. U. Arnau de Vilanova, Lleida, Lleida; Hematology, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "De", "La", "Fuente", ",", "M.", "Diaz", "Beya", ",", "P.", "Beneit", ",", "C.", "Botella", ",", "A.", "Fernandez", "Moreno", ",", "A.", "Sampol", ",", "M.", "Arnan", "Sangerman", ",", "A.", "Yeguas", "Bermejo", ",", "M.", "D.", "L.", "L.", "Amigo", ",", "J.", "Labrador", ",", "A.", "Garcia", "Guinon", ",", "A.", "Garrido", ",", "J.", "Serrano", ",", "S.", "Vives", "Polo", ",", "M.", "Garcia", "Fortes", ",", "M.", "J.", "Sayas", ",", "J.", "M.", "Bergua", ",", "M.", "T.", "Olave", ",", "F.", "Vall", "LLovera", ",", "J.", "Bargay", ",", "M.", "Pereiro", "Sanchez", ",", "R.", "Garcia", "Boyero", ",", "A.", "Diaz", "Lopez", ",", "M.", "Tormo", "Hematology", ",", "MD", "Anderson", "CC", "Madrid", ",", "Madrid", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Clinic", "IDIBAPS", ",", "Barcelona", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "San", "Juan", "de", "Alicante", ";", "Hematology", ",", "H.", "General", "de", "Alicante", ",", "Alicante", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Central", "de", "Asturias", ",", "Oviedo", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Son", "Espases", ",", "Palma", "de", "Mallorca", ";", "Hematology", ",", "ICO", "Hospitalet", ",", "L’Hospitalet", "de", "Llobregat", ",", "Barcelona", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Salamanca", ",", "Salamanca", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Morales", "Meseguer", ",", "Murcia", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "de", "Burgos", ",", "Burgos", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Arnau", "de", "Vilanova", ",", "Lleida", ",", "Lleida", ";", "Hematology", ",", "Hospital", "de", "la", "Santa", "Creu", "i", "Sant", "Pau", "." ] } ]
PMC11568601	H&E staining experiment displayed that the stained images of the heart, liver and lungs in the low, medium and high-dose treatment groups of TGT were not significantly different compared to the control group.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "H&E", "staining", "experiment", "displayed", "that", "the", "stained", "images", "of", "the", "heart", ",", "liver", "and", "lungs", "in", "the", "low", ",", "medium", "and", "high-dose", "treatment", "groups", "of", "TGT", "were", "not", "significantly", "different", "compared", "to", "the", "control", "group", "." ] } ]
PMC11001582	Two-way ANOVA with Tukey’s multiple comparison test was used to calculate statistical significance.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Two-way", "ANOVA", "with", "Tukey", "’s", "multiple", "comparison", "test", "was", "used", "to", "calculate", "statistical", "significance", "." ] } ]
PMC11806182	A volcano plot was generated to visualize significant miRNAs with adjusted P-values < 0.01 and log2 fold change > 1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "volcano", "plot", "was", "generated", "to", "visualize", "significant", "miRNAs", "with", "adjusted", "P-values", "<", "0.01", "and", "log2", "fold", "change", ">", "1", "." ] } ]
PMC4839679	For inducible vectors, doxycycline was added to the culture media at 2 μg/mL for at least 72 hours prior to experiments.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "inducible", "vectors", ",", "doxycycline", "was", "added", "to", "the", "culture", "media", "at", "2", "μg/mL", "for", "at", "least", "72", "hours", "prior", "to", "experiments", "." ] } ]
PMC8728081	High-Temperature XRD (HTXRD) was carried out for Kajjali to understand the crystallographic changes occurring in the Rasasindura preparation procedure.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "High-Temperature", "XRD", "(", "HTXRD", ")", "was", "carried", "out", "for", "Kajjali", "to", "understand", "the", "crystallographic", "changes", "occurring", "in", "the", "Rasasindura", "preparation", "procedure", "." ] } ]
PMC11791203	BCL-2 family proteins are attractive targets for anticancer drugs due to their multifaceted roles in cancer, particularly in protecting tumour cells from apoptosis under various endogenous and exogenous stresses.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "BCL-2", "family", "proteins", "are", "attractive", "targets", "for", "anticancer", "drugs", "due", "to", "their", "multifaceted", "roles", "in", "cancer", ",", "particularly", "in", "protecting", "tumour", "cells", "from", "apoptosis", "under", "various", "endogenous", "and", "exogenous", "stresses", "." ] } ]
PMC11612626	RPMI-8226 cells were treated with compound A (1 μmol/L, 48 hours), lysates generated, MHC-I complexes immunoprecipitated using a pan-MHC antibody, and antigenic peptides eluted.	[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RPMI-8226", "cells", "were", "treated", "with", "compound", "A", "(", "1", "μmol/L", ",", "48", "hours", ")", ",", "lysates", "generated", ",", "MHC-I", "complexes", "immunoprecipitated", "using", "a", "pan-MHC", "antibody", ",", "and", "antigenic", "peptides", "eluted", "." ] } ]
PMC8873393	Color key represents relative expression on a log 2 scale.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Color", "key", "represents", "relative", "expression", "on", "a", "log", "2", "scale", "." ] } ]
PMC9964635	The structures of triazole-coupled acetamide scaffolds were verified by physiochemical and spectroscopic (HRMS, FTIR, CNMR, and HNMR) methods.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "structures", "of", "triazole-coupled", "acetamide", "scaffolds", "were", "verified", "by", "physiochemical", "and", "spectroscopic", "(", "HRMS", ",", "FTIR", ",", "CNMR", ",", "and", "HNMR", ")", "methods", "." ] } ]
PMC9429973	Data was collected through medical records review.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "was", "collected", "through", "medical", "records", "review", "." ] } ]
PMC11755519	The first example of their impact is the autocrine model.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "first", "example", "of", "their", "impact", "is", "the", "autocrine", "model", "." ] } ]
PMC11409031	Transcription of A2780 and HEY differed from that of IOSE80.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transcription", "of", "A2780", "and", "HEY", "differed", "from", "that", "of", "IOSE80", "." ] } ]
PMC11734514	One-way ANOVA followed by Tukey’s post hoc test was performed. *	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One-way", "ANOVA", "followed", "by", "Tukey", "’s", "post", "hoc", "test", "was", "performed", ".", "*" ] } ]
PMC9844987	This disagreement indicates that decomposed promoters within the same promoter reflect core promoters that may either operate and be regulated independently of each other or differ in their ability to compete for the transcriptional machinery, both of which may contribute to the overall robustness or plasticity of the promoter and, in turn, the gene.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "disagreement", "indicates", "that", "decomposed", "promoters", "within", "the", "same", "promoter", "reflect", "core", "promoters", "that", "may", "either", "operate", "and", "be", "regulated", "independently", "of", "each", "other", "or", "differ", "in", "their", "ability", "to", "compete", "for", "the", "transcriptional", "machinery", ",", "both", "of", "which", "may", "contribute", "to", "the", "overall", "robustness", "or", "plasticity", "of", "the", "promoter", "and", ",", "in", "turn", ",", "the", "gene", "." ] } ]
PMC11461874	g The functional domains of full-length TRAF7 and the peptide which could be synthesized in TRAF7 KO cell are shown schematically.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "g", "The", "functional", "domains", "of", "full-length", "TRAF7", "and", "the", "peptide", "which", "could", "be", "synthesized", "in", "TRAF7", "KO", "cell", "are", "shown", "schematically", "." ] } ]
PMC11013014	2-(2,3-dichloro-4-(2-methylenebutanoyl)phenoxy)-N-(1-methyl-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)acetamide (3).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "2-(2,3-dichloro-4-(2-methylenebutanoyl)phenoxy)-N-(1-methyl-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)acetamide", "(", "3", ")", "." ] } ]
PMC11240052	SIRT1 is over-expressed in a majority of ovarian cancers (42, 43) implying the role of SIRTs in ovarian tumorigenesis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SIRT1", "is", "over-expressed", "in", "a", "majority", "of", "ovarian", "cancers", "(", "42", ",", "43", ")", "implying", "the", "role", "of", "SIRTs", "in", "ovarian", "tumorigenesis", "." ] } ]
PMC9429973	Patients who had received maintenance therapy after CAR-T therapy showed better OS (49 months vs 9 months, P<0.001) and DFS (49 months vs 6 months, P<0.001) compared to those who received no maintenance therapy.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patients", "who", "had", "received", "maintenance", "therapy", "after", "CAR-T", "therapy", "showed", "better", "OS", "(", "49", "months", "vs", "9", "months", ",", "P<0.001", ")", "and", "DFS", "(", "49", "months", "vs", "6", "months", ",", "P<0.001", ")", "compared", "to", "those", "who", "received", "no", "maintenance", "therapy", "." ] } ]
PMC6642070	The doses of statins in cell culture were consistent with previous studies in SAMS .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "doses", "of", "statins", "in", "cell", "culture", "were", "consistent", "with", "previous", "studies", "in", "SAMS", "." ] } ]
PMC10123657	The terms related to binding to actin, Ca, and phospholipids in Figure 3B, resulted from the identification of proteins associated to the S100 and annexins complexes, probably reflecting the transfer of vesicles .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "terms", "related", "to", "binding", "to", "actin", ",", "Ca", ",", "and", "phospholipids", "in", "Figure", "3B", ",", "resulted", "from", "the", "identification", "of", "proteins", "associated", "to", "the", "S100", "and", "annexins", "complexes", ",", "probably", "reflecting", "the", "transfer", "of", "vesicles", "." ] } ]

PMC11568601

and 10% FBS (Thermo Fisher Scientific, USA) at 37 ℃ with 5% CO2.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "and", "10", "%", "FBS", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ",", "USA", ")", "at", "37", "℃", "with", "5", "%", "CO2", "." ] } ]

PMC3122064

Results of at least three experiments are expressed as mean±(standard deviation) S.D. Student's unpaired t-test was used to compare values of test and control samples.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", "of", "at", "least", "three", "experiments", "are", "expressed", "as", "mean±(standard", "deviation", ")", "S.D.", "Student", "'s", "unpaired", "t-test", "was", "used", "to", "compare", "values", "of", "test", "and", "control", "samples", "." ] } ]

PMC11544771

It has been shown that PRE treatment can result in DNA double strand breaks (DSB) and cell death in the cells of S-phase presumptively by causing replication catastrophe .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "has", "been", "shown", "that", "PRE", "treatment", "can", "result", "in", "DNA", "double", "strand", "breaks", "(", "DSB", ")", "and", "cell", "death", "in", "the", "cells", "of", "S-phase", "presumptively", "by", "causing", "replication", "catastrophe", "." ] } ]

PMC9812014

The best inhibitory activity against NDV in the in-ovo studies on chicken embryos was 0.2 mg/kg HHT.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "best", "inhibitory", "activity", "against", "NDV", "in", "the", "in-ovo", "studies", "on", "chicken", "embryos", "was", "0.2", "mg/kg", "HHT", "." ] } ]

PMC10847511

Recently, their clinical utility as biomarkers has been investigated in other cancer types.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Recently", ",", "their", "clinical", "utility", "as", "biomarkers", "has", "been", "investigated", "in", "other", "cancer", "types", "." ] } ]

PMC9429973

Subsequently, we found that high TAC plasma levels correlate with detrimental clinical features, such as high levels of lactate dehydrogenase (LDH) and circulating CD34+ cells.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Subsequently", ",", "we", "found", "that", "high", "TAC", "plasma", "levels", "correlate", "with", "detrimental", "clinical", "features", ",", "such", "as", "high", "levels", "of", "lactate", "dehydrogenase", "(", "LDH", ")", "and", "circulating", "CD34", "+", "cells", "." ] } ]

PMC11451940

This analysis was conducted using the CYTO-ID® Autophagy detection kit 2.0 (ENZO, USA) according to the manufacturer's protocol to assess the induction of autophagy by complexes 1, 5, and 7.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "analysis", "was", "conducted", "using", "the", "CYTO-ID", "®", "Autophagy", "detection", "kit", "2.0", "(", "ENZO", ",", "USA", ")", "according", "to", "the", "manufacturer", "'s", "protocol", "to", "assess", "the", "induction", "of", "autophagy", "by", "complexes", "1", ",", "5", ",", "and", "7", "." ] } ]

PMC11706776

Bars indicate mean ± SD of counted colonies or the clones surface area observed on the left panel relative to the untreated cells (N = 3).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bars", "indicate", "mean", "±", "SD", "of", "counted", "colonies", "or", "the", "clones", "surface", "area", "observed", "on", "the", "left", "panel", "relative", "to", "the", "untreated", "cells", "(", "N", "=", "3", ")", "." ] } ]

PMC7334607

Researchers have tried adding ifosfamide and etoposide to standard EWS chemotherapy, increasing the drug doses administered, and decreasing the interval between doses, all without meaningful improvement to metastatic disease outcomes (Grier et al., 2003; Huang and Lucas, 2010; Womer et al., 2012).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Researchers", "have", "tried", "adding", "ifosfamide", "and", "etoposide", "to", "standard", "EWS", "chemotherapy", ",", "increasing", "the", "drug", "doses", "administered", ",", "and", "decreasing", "the", "interval", "between", "doses", ",", "all", "without", "meaningful", "improvement", "to", "metastatic", "disease", "outcomes", "(", "Grier", "et", "al.", ",", "2003", ";", "Huang", "and", "Lucas", ",", "2010", ";", "Womer", "et", "al.", ",", "2012", ")", "." ] } ]

PMC11525028

Any additional information required to reanalyze the data reported in this work paper is available from the lead contact upon request.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Any", "additional", "information", "required", "to", "reanalyze", "the", "data", "reported", "in", "this", "work", "paper", "is", "available", "from", "the", "lead", "contact", "upon", "request", "." ] } ]

PMC11247842

Variants with effect size estimates larger than three times the genetic standard deviation were removed.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Variants", "with", "effect", "size", "estimates", "larger", "than", "three", "times", "the", "genetic", "standard", "deviation", "were", "removed", "." ] } ]

PMC11644761

The obtained DNA was quantified by NanoDrop ND-1000 .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "obtained", "DNA", "was", "quantified", "by", "NanoDrop", "ND-1000", "." ] } ]

PMC11513011

Cell growth inhibitory effect of DIB.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "growth", "inhibitory", "effect", "of", "DIB", "." ] } ]

PMC6461034

Transfer the supernatant from the previous spin (peptide solution) to an “IP” tube with 20 μl aliquoted antibody‐conjugated beads, pipetting directly on top of the beads (without touching).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transfer", "the", "supernatant", "from", "the", "previous", "spin", "(", "peptide", "solution", ")", "to", "an", "“", "IP", "”", "tube", "with", "20", "μl", "aliquoted", "antibody‐conjugated", "beads", ",", "pipetting", "directly", "on", "top", "of", "the", "beads", "(", "without", "touching", ")", "." ] } ]

PMC11023271

HaCaT and A431 cells treated with serum or 10 μM LPA expressed decreased RIPK4 protein levels compared to control (C).

[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HaCaT", "and", "A431", "cells", "treated", "with", "serum", "or", "10", "μM", "LPA", "expressed", "decreased", "RIPK4", "protein", "levels", "compared", "to", "control", "(", "C", ")", "." ] } ]

PMC11536589

The pseudo-time trajectories analysis of MGST1 expression in Cluster 2 and Cluster 5.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "pseudo-time", "trajectories", "analysis", "of", "MGST1", "expression", "in", "Cluster", "2", "and", "Cluster", "5", "." ] } ]

PMC11286266

The cell lines used in this study have tested negative for mycoplasma contamination using the MycoAlert Mycoplasma Detection Kit (Lonza).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cell", "lines", "used", "in", "this", "study", "have", "tested", "negative", "for", "mycoplasma", "contamination", "using", "the", "MycoAlert", "Mycoplasma", "Detection", "Kit", "(", "Lonza", ")", "." ] } ]

PMC10125312

Following the cytotoxicity evaluation of AuNR, we established >70% viability of cell lines as a criterion to determine if laser light conditions were toxic to cell lines.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Following", "the", "cytotoxicity", "evaluation", "of", "AuNR", ",", "we", "established", ">", "70", "%", "viability", "of", "cell", "lines", "as", "a", "criterion", "to", "determine", "if", "laser", "light", "conditions", "were", "toxic", "to", "cell", "lines", "." ] } ]

PMC11515150

To further verify the cytotoxicity of CAR-NK cells, CCRF-CEM cells were selected as the positive target cells.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "verify", "the", "cytotoxicity", "of", "CAR-NK", "cells", ",", "CCRF-CEM", "cells", "were", "selected", "as", "the", "positive", "target", "cells", "." ] } ]

PMC11066331

The intensity of peak at m/z = 4939 Da was used for demonstration of non-centered data (C) and median-centered data (D).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "intensity", "of", "peak", "at", "m/z", "=", "4939", "Da", "was", "used", "for", "demonstration", "of", "non-centered", "data", "(", "C", ")", "and", "median-centered", "data", "(", "D", ")", "." ] } ]

PMC11621493

Data are presented as mean ± SD.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "presented", "as", "mean", "±", "SD", "." ] } ]

PMC9429973

Higher relapse was observed in related recipients transplant (47%; p-value 0.04) and in patients with high and very high risk in DRI-index (54.5 and 60% respectively; p-value 0.001).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Higher", "relapse", "was", "observed", "in", "related", "recipients", "transplant", "(", "47", "%", ";", "p-value", "0.04", ")", "and", "in", "patients", "with", "high", "and", "very", "high", "risk", "in", "DRI-index", "(", "54.5", "and", "60", "%", "respectively", ";", "p-value", "0.001", ")", "." ] } ]

PMC9429973

King Abdullah International Medical Research Center.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "King", "Abdullah", "International", "Medical", "Research", "Center", "." ] } ]

PMC11791432

Marker genes for each cluster were performed using the FindAllMarkers function with parameters set to LogFC = 0.3 and Minpct = 0.25.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Marker", "genes", "for", "each", "cluster", "were", "performed", "using", "the", "FindAllMarkers", "function", "with", "parameters", "set", "to", "LogFC", "=", "0.3", "and", "Minpct", "=", "0.25", "." ] } ]

PMC11767793

It derives from the development of in vitro and in silico substitutes to ensure the safe use of novel nanoproducts.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "derives", "from", "the", "development", "of", "in", "vitro", "and", "in", "silico", "substitutes", "to", "ensure", "the", "safe", "use", "of", "novel", "nanoproducts", "." ] } ]

PMC11655536

C The tumor volume curves of the HA treatment groups and the control group.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "The", "tumor", "volume", "curves", "of", "the", "HA", "treatment", "groups", "and", "the", "control", "group", "." ] } ]

PMC10114490

Values correspond to the average of 2 experiments with four replicates each. ***

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Values", "correspond", "to", "the", "average", "of", "2", "experiments", "with", "four", "replicates", "each", ".", "*", "*", "*" ] } ]

PMC10887351

In an in vitro model of BC, propranolol increased the anti-angiogenic and anti-tumor efficacy of chemotherapic agents .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "an", "in", "vitro", "model", "of", "BC", ",", "propranolol", "increased", "the", "anti-angiogenic", "and", "anti-tumor", "efficacy", "of", "chemotherapic", "agents", "." ] } ]

PMC5574817

Fig. 3 shows the sequence alignment and comparison between the sequences of the cDNA insert against the hERG sequence [NM 000238.3 homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 2 (KCNH2), transcript variant 1, mRNA].

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "3", "shows", "the", "sequence", "alignment", "and", "comparison", "between", "the", "sequences", "of", "the", "cDNA", "insert", "against", "the", "hERG", "sequence", "[", "NM", "000238.3", "homo", "sapiens", "potassium", "voltage-gated", "channel", ",", "subfamily", "H", "(", "eag-related", ")", ",", "member", "2", "(", "KCNH2", ")", ",", "transcript", "variant", "1", ",", "mRNA", "]", "." ] } ]

PMC10165258

A first image of the complete microfluidic chip was obtained immediately after the drug addition to read the barcode on each of the spheroids.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "first", "image", "of", "the", "complete", "microfluidic", "chip", "was", "obtained", "immediately", "after", "the", "drug", "addition", "to", "read", "the", "barcode", "on", "each", "of", "the", "spheroids", "." ] } ]

PMC10547921

At the same time as the efficacy of the agonists increases, the toxicity will also increase, which makes it difficult to ensure that the efficacy can be improved in a safe and reliable manner.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "the", "same", "time", "as", "the", "efficacy", "of", "the", "agonists", "increases", ",", "the", "toxicity", "will", "also", "increase", ",", "which", "makes", "it", "difficult", "to", "ensure", "that", "the", "efficacy", "can", "be", "improved", "in", "a", "safe", "and", "reliable", "manner", "." ] } ]

PMC11478724

Finally, the cytotoxicity percentage was calculated using the following equation.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Finally", ",", "the", "cytotoxicity", "percentage", "was", "calculated", "using", "the", "following", "equation", "." ] } ]

PMC11687167

Another study indicated that a third pathway critical for PCSK9-induced LDLR degradation was mediated by an adenylate cyclase-associated protein 1 (CAP1)-dependent protein with a globular C-terminus structurally similar to the C-terminal CHRD of PCSK9.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Another", "study", "indicated", "that", "a", "third", "pathway", "critical", "for", "PCSK9-induced", "LDLR", "degradation", "was", "mediated", "by", "an", "adenylate", "cyclase-associated", "protein", "1", "(CAP1)-dependent", "protein", "with", "a", "globular", "C-terminus", "structurally", "similar", "to", "the", "C-terminal", "CHRD", "of", "PCSK9", "." ] } ]

PMC10047551

Thus, the external induction of PD-L1 expression in cancer cells, e.g., in the tumor microenvironment, may have the ability to bypass concordant changes in PD-L1 promoter methylation.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "the", "external", "induction", "of", "PD-L1", "expression", "in", "cancer", "cells", ",", "e.g.", ",", "in", "the", "tumor", "microenvironment", ",", "may", "have", "the", "ability", "to", "bypass", "concordant", "changes", "in", "PD-L1", "promoter", "methylation", "." ] } ]

PMC11354225

When confluence was 80%, cells were exposed to different treatments: EGCG 10 µM and EGCG 40 µM and untreated control (medium) for 4 h at 37 °C in darkness.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "confluence", "was", "80", "%", ",", "cells", "were", "exposed", "to", "different", "treatments", ":", "EGCG", "10", "µM", "and", "EGCG", "40", "µM", "and", "untreated", "control", "(", "medium", ")", "for", "4", "h", "at", "37", "°", "C", "in", "darkness", "." ] } ]

PMC7185206

We hypothesized that ADAM10 and ADAM17-generated tumor-derived sPD-L1 may induce human CD8 + T cell death.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "hypothesized", "that", "ADAM10", "and", "ADAM17-generated", "tumor-derived", "sPD-L1", "may", "induce", "human", "CD8", "+", "T", "cell", "death", "." ] } ]

PMC9429973

Moreover, in 25% of centers the cryopreservation costs are not covered by the public health system.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "in", "25", "%", "of", "centers", "the", "cryopreservation", "costs", "are", "not", "covered", "by", "the", "public", "health", "system", "." ] } ]

PMC4485786

Interleukin 12 (IL-12), the major player in this network, can induce tumor regression and affects innate and adaptive immunity.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interleukin", "12", "(", "IL-12", ")", ",", "the", "major", "player", "in", "this", "network", ",", "can", "induce", "tumor", "regression", "and", "affects", "innate", "and", "adaptive", "immunity", "." ] } ]

PMC9429973

Methods: Patient was treated with ibuprofen at regular therapeutic doses (approximately 30 mg/kg/24 hours daily initially) and serial full blood counts were monitored.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "Patient", "was", "treated", "with", "ibuprofen", "at", "regular", "therapeutic", "doses", "(", "approximately", "30", "mg/kg/24", "hours", "daily", "initially", ")", "and", "serial", "full", "blood", "counts", "were", "monitored", "." ] } ]

PMC11371747

l-LV, l-leucovorin; FA, folic acid; FBS, fetal bovine serum; dFBS: dialyzed fetal bovine serum; MPM, malignant pleural mesothelioma; NSCLC, non-small cell lung cancer; ALL, acute lymphoblastic leukemia; CHO, Chinese hamster ovary; CHO/C5, AA8 cells in which the natural RFC has been knocked out (k.o.),

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "l-LV", ",", "l-leucovorin", ";", "FA", ",", "folic", "acid", ";", "FBS", ",", "fetal", "bovine", "serum", ";", "dFBS", ":", "dialyzed", "fetal", "bovine", "serum", ";", "MPM", ",", "malignant", "pleural", "mesothelioma", ";", "NSCLC", ",", "non-small", "cell", "lung", "cancer", ";", "ALL", ",", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", ";", "CHO", ",", "Chinese", "hamster", "ovary", ";", "CHO/C5", ",", "AA8", "cells", "in", "which", "the", "natural", "RFC", "has", "been", "knocked", "out", "(", "k.o", ".", ")", "," ] } ]

PMC8358006

Kaplan–Meier survival curves and log-rank tests were used to compare the survival distribution between the high-expression and low-expression groups through the platform DrBioRight.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Kaplan", "–", "Meier", "survival", "curves", "and", "log-rank", "tests", "were", "used", "to", "compare", "the", "survival", "distribution", "between", "the", "high-expression", "and", "low-expression", "groups", "through", "the", "platform", "DrBioRight", "." ] } ]

PMC11257203

The normal distribution of all data was assessed using the Shapiro-Wilk test.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "normal", "distribution", "of", "all", "data", "was", "assessed", "using", "the", "Shapiro-Wilk", "test", "." ] } ]

PMC11093197

c‐Myc overexpression plasmid was purchased from Addgene (#20723), and CS‐IV TRE‐RfA‐UbC‐Puro‐H‐RAS was a kind gift from Yoshikazu Johmura.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "c‐Myc", "overexpression", "plasmid", "was", "purchased", "from", "Addgene", "(", "#", "20723", ")", ",", "and", "CS‐IV", "TRE‐RfA‐UbC‐Puro‐H‐RAS", "was", "a", "kind", "gift", "from", "Yoshikazu", "Johmura", "." ] } ]

PMC11301242

Box plots indicate the gene expression levels in lymphoma samples without ecDNA amplification (n=6), with asterisks denoting outliers.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Box", "plots", "indicate", "the", "gene", "expression", "levels", "in", "lymphoma", "samples", "without", "ecDNA", "amplification", "(", "n=6", ")", ",", "with", "asterisks", "denoting", "outliers", "." ] } ]

PMC11755519

Such growth might be caused by genetic mutations in proto-oncogenes such as fibroblast growth factor receptor-3 (FGFR3) and the viral Harvey Rat sarcoma virus (HRAS).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Such", "growth", "might", "be", "caused", "by", "genetic", "mutations", "in", "proto-oncogenes", "such", "as", "fibroblast", "growth", "factor", "receptor-3", "(", "FGFR3", ")", "and", "the", "viral", "Harvey", "Rat", "sarcoma", "virus", "(", "HRAS", ")", "." ] } ]

PMC11413393

Efficiency of RNA fractionation in these experiments was confirmed by assaying levels of the nuclear RNA, MALAT1 (Supplementary Fig. 9c).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Efficiency", "of", "RNA", "fractionation", "in", "these", "experiments", "was", "confirmed", "by", "assaying", "levels", "of", "the", "nuclear", "RNA", ",", "MALAT1", "(", "Supplementary", "Fig.", "9c", ")", "." ] } ]

PMC10777969

FCP23 induces oxidative stress, while FCP26 does not.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "FCP23", "induces", "oxidative", "stress", ",", "while", "FCP26", "does", "not", "." ] } ]

PMC11687167

There are no drug-drug interactions between these two drugs because they do not interact with cytochrome P450 enzymes or transporter proteins [27–29].

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "are", "no", "drug-drug", "interactions", "between", "these", "two", "drugs", "because", "they", "do", "not", "interact", "with", "cytochrome", "P450", "enzymes", "or", "transporter", "proteins", "[", "27–29", "]", "." ] } ]

PMC11546117

Rodent in vitro models have been used to estimate drug transport across the mammary epithelium , but they are not representative of the human mammary epithelium due to species differences .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Rodent", "in", "vitro", "models", "have", "been", "used", "to", "estimate", "drug", "transport", "across", "the", "mammary", "epithelium", ",", "but", "they", "are", "not", "representative", "of", "the", "human", "mammary", "epithelium", "due", "to", "species", "differences", "." ] } ]

PMC11422497

Once cells reached confluence, perpendicular scratches were carefully made across the marked lines.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Once", "cells", "reached", "confluence", ",", "perpendicular", "scratches", "were", "carefully", "made", "across", "the", "marked", "lines", "." ] } ]

PMC9429973

Only the WHO 2016 proposal (CMML-0 61.6% vs 34.6%, CMML-1 21.9% vs 30.8%, CMML-2 16.4 vs 34.6%, p=0.046) and the absence of peripheral blasts (61.1% vs 36.0%, p=0.037) were associated with statistically different rates of response, with a tendency to treat later ≥6m (37.0% vs 15.4%, p=0.05).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Only", "the", "WHO", "2016", "proposal", "(", "CMML-0", "61.6", "%", "vs", "34.6", "%", ",", "CMML-1", "21.9", "%", "vs", "30.8", "%", ",", "CMML-2", "16.4", "vs", "34.6", "%", ",", "p=0.046", ")", "and", "the", "absence", "of", "peripheral", "blasts", "(", "61.1", "%", "vs", "36.0", "%", ",", "p=0.037", ")", "were", "associated", "with", "statistically", "different", "rates", "of", "response", ",", "with", "a", "tendency", "to", "treat", "later", "≥6", "m", "(", "37.0", "%", "vs", "15.4", "%", ",", "p=0.05", ")", "." ] } ]

PMC11703896

After 24 h of treatment, plates were examined using an inverted phase-contrast tissue culture microscope (Olympus CKX41 equipped with Optika Pro5 CCD camera).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "24", "h", "of", "treatment", ",", "plates", "were", "examined", "using", "an", "inverted", "phase-contrast", "tissue", "culture", "microscope", "(", "Olympus", "CKX41", "equipped", "with", "Optika", "Pro5", "CCD", "camera", ")", "." ] } ]

PMC11502066

Baicalein presents therefore a promising candidate for the treatment of GPR30-positive breast cancer metastasis (Table 1).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Baicalein", "presents", "therefore", "a", "promising", "candidate", "for", "the", "treatment", "of", "GPR30-positive", "breast", "cancer", "metastasis", "(", "Table", "1", ")", "." ] } ]

PMC11026382

New microfluidics-based approaches for high-throughput biochemistry could play a key role in refining and testing such methodology.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "New", "microfluidics-based", "approaches", "for", "high-throughput", "biochemistry", "could", "play", "a", "key", "role", "in", "refining", "and", "testing", "such", "methodology", "." ] } ]

PMC11650848

F Isoform detected in demethylated SH-SY5Y.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O" ], "tokens": [ "F", "Isoform", "detected", "in", "demethylated", "SH-SY5Y", "." ] } ]

PMC9352806

Quantification of fluorescence intensity was evaluated with the ImageJ (NIH) software to measure the percentage of GFP-positive nuclei in transgenic worms.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Quantification", "of", "fluorescence", "intensity", "was", "evaluated", "with", "the", "ImageJ", "(", "NIH", ")", "software", "to", "measure", "the", "percentage", "of", "GFP-positive", "nuclei", "in", "transgenic", "worms", "." ] } ]

PMC9388315

Unlike normal cells, the energy supply in cancer cells is mainly through the anaerobic pathway or glycolysis .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Unlike", "normal", "cells", ",", "the", "energy", "supply", "in", "cancer", "cells", "is", "mainly", "through", "the", "anaerobic", "pathway", "or", "glycolysis", "." ] } ]

PMC11713609

Representative immunochemistry images of 4-HNE staining.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Representative", "immunochemistry", "images", "of", "4-HNE", "staining", "." ] } ]

PMC11754784

Serum stability experiments (Supplementary Fig. 29) shows that the DNPs remain stable after 6 h incubation in culture medium with 10% FBS, which is consistent with the previous reports.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Serum", "stability", "experiments", "(", "Supplementary", "Fig.", "29", ")", "shows", "that", "the", "DNPs", "remain", "stable", "after", "6", "h", "incubation", "in", "culture", "medium", "with", "10", "%", "FBS", ",", "which", "is", "consistent", "with", "the", "previous", "reports", "." ] } ]

PMC11424574

We found that ERK1/2 depletion increased the expression of uPA, facilitating osteosarcoma cell migration and invasion.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "ERK1/2", "depletion", "increased", "the", "expression", "of", "uPA", ",", "facilitating", "osteosarcoma", "cell", "migration", "and", "invasion", "." ] } ]

PMC11695546

The absorbance was determined using a reader for microplates at 410 nm (Cai et al. 2019).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "absorbance", "was", "determined", "using", "a", "reader", "for", "microplates", "at", "410", "nm", "(", "Cai", "et", "al.", "2019", ")", "." ] } ]

PMC6600253

Senescent cells exhibit permanent growth arrest, the increased expression of cell cycle inhibitors, changes in cellular structures, and protein expression.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Senescent", "cells", "exhibit", "permanent", "growth", "arrest", ",", "the", "increased", "expression", "of", "cell", "cycle", "inhibitors", ",", "changes", "in", "cellular", "structures", ",", "and", "protein", "expression", "." ] } ]

PMC10344560

Our patient did not have common predisposition factors for fungal peritonitis in PD patients.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "patient", "did", "not", "have", "common", "predisposition", "factors", "for", "fungal", "peritonitis", "in", "PD", "patients", "." ] } ]

PMC9429973

Each analysis considered a low, medium, and high ABR patient population.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Each", "analysis", "considered", "a", "low", ",", "medium", ",", "and", "high", "ABR", "patient", "population", "." ] } ]

PMC11481779

We have then copied the sequence of 200kbp, precisely chr8:33 450 000–33 650 000, and inserted it instead of sequence present at chr8:32 750 000–32 950 000.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "have", "then", "copied", "the", "sequence", "of", "200kbp", ",", "precisely", "chr8:33", "450", "000–33", "650", "000", ",", "and", "inserted", "it", "instead", "of", "sequence", "present", "at", "chr8:32", "750", "000–32", "950", "000", "." ] } ]

PMC8973725

786–0 cells were transfected with empty pcDNA3.1 or pcDNA-ZNF677.

[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "786–0", "cells", "were", "transfected", "with", "empty", "pcDNA3.1", "or", "pcDNA-ZNF677", "." ] } ]

PMC10891340

These data suggested CCCP could inverse the level of ROS at the early and late stage of DPV infection.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "data", "suggested", "CCCP", "could", "inverse", "the", "level", "of", "ROS", "at", "the", "early", "and", "late", "stage", "of", "DPV", "infection", "." ] } ]

PMC8540611

After 2 days, uptake begins to decline, but AuNP15 complexes successfully accumulate in the cell after 3 h, and then the content of the complexes noticeably decreases.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "2", "days", ",", "uptake", "begins", "to", "decline", ",", "but", "AuNP15", "complexes", "successfully", "accumulate", "in", "the", "cell", "after", "3", "h", ",", "and", "then", "the", "content", "of", "the", "complexes", "noticeably", "decreases", "." ] } ]

PMC9672323

The graphs show the mean ± SD.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "graphs", "show", "the", "mean", "±", "SD", "." ] } ]

PMC8469018

After 24 h of cells incubation with teriflunomide or DMSO as vehicle in control cultures, cells were harvested by centrifugation at 400× g at room temperature for 5 min.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "24", "h", "of", "cells", "incubation", "with", "teriflunomide", "or", "DMSO", "as", "vehicle", "in", "control", "cultures", ",", "cells", "were", "harvested", "by", "centrifugation", "at", "400", "×", "g", "at", "room", "temperature", "for", "5", "min", "." ] } ]

PMC9096373

The research design and route are shown in Figure 1.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "research", "design", "and", "route", "are", "shown", "in", "Figure", "1", "." ] } ]

PMC9429973

Results: Starting from as few as 50,000 cells using the CRISPR/Cas9 system we demonstrate dual epigenetic and genetic editing in the same CD34+ cell with DNA methylation targeted at p15 and p14 as well as mutating TET2.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "Starting", "from", "as", "few", "as", "50,000", "cells", "using", "the", "CRISPR/Cas9", "system", "we", "demonstrate", "dual", "epigenetic", "and", "genetic", "editing", "in", "the", "same", "CD34", "+", "cell", "with", "DNA", "methylation", "targeted", "at", "p15", "and", "p14", "as", "well", "as", "mutating", "TET2", "." ] } ]

PMC11528603

The statistical differences were analyzed by two-tailed Student’s t-tests (ns P > 0.05, *P ≤ 0.05, **P ≤ 0.01, ***P ≤ 0.001).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "statistical", "differences", "were", "analyzed", "by", "two-tailed", "Student", "’s", "t-tests", "(", "ns", "P", ">", "0.05", ",", "*", "P", "≤", "0.05", ",", "*", "*", "P", "≤", "0.01", ",", "*", "*", "*", "P", "≤", "0.001", ")", "." ] } ]

PMC7229095

Also, the most recent report highly concerns the genetic diversity, and the spontaneous mutations in CHO cells can rapidly occur in a very short period (risk of diversity even in a cell division) (Wurm and Wurm 2017).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Also", ",", "the", "most", "recent", "report", "highly", "concerns", "the", "genetic", "diversity", ",", "and", "the", "spontaneous", "mutations", "in", "CHO", "cells", "can", "rapidly", "occur", "in", "a", "very", "short", "period", "(", "risk", "of", "diversity", "even", "in", "a", "cell", "division", ")", "(", "Wurm", "and", "Wurm", "2017", ")", "." ] } ]

PMC10656496

microRNA-Sequencing was performed using the Illumina TruSeq Small RNA Sample Preparation Kit, which enables the sequencing of small RNAs between 17 and 35 nucleotides.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "microRNA-Sequencing", "was", "performed", "using", "the", "Illumina", "TruSeq", "Small", "RNA", "Sample", "Preparation", "Kit", ",", "which", "enables", "the", "sequencing", "of", "small", "RNAs", "between", "17", "and", "35", "nucleotides", "." ] } ]

PMC11767582

HRMS (ESI/Q-TOF): m/z [M+H] calcd.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HRMS", "(", "ESI/Q-TOF", "):", "m/z", "[", "M+H", "]", "calcd", "." ] } ]

PMC11413393

MS023 is known to have specific activity against all type I PRMT enzymes including PRMT1, PRMT3, PRMT4 (CARM1), PRMT6 and PRMT8.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MS023", "is", "known", "to", "have", "specific", "activity", "against", "all", "type", "I", "PRMT", "enzymes", "including", "PRMT1", ",", "PRMT3", ",", "PRMT4", "(", "CARM1", ")", ",", "PRMT6", "and", "PRMT8", "." ] } ]

PMC11306019

Data: mean ± SD (n = 3). (

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", ":", "mean", "±", "SD", "(", "n", "=", "3", ")", ".", "(" ] } ]

PMC11706776

Western-blots of SK1 and EWS::FLI1 (right panel) in A-673/TR/shEF cell line after doxycycline treatment (1 µg/mL) (N = 2).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Western-blots", "of", "SK1", "and", "EWS::FLI1", "(", "right", "panel", ")", "in", "A-673/TR/shEF", "cell", "line", "after", "doxycycline", "treatment", "(", "1", "µg/mL", ")", "(", "N", "=", "2", ")", "." ] } ]

PMC9429973

A. De La Fuente, M. Diaz Beya, P. Beneit, C. Botella, A. Fernandez Moreno, A. Sampol, M. Arnan Sangerman, A. Yeguas Bermejo, M. D. L. L. Amigo, J. Labrador, A. Garcia Guinon, A. Garrido, J. Serrano, S. Vives Polo, M. Garcia Fortes, M. J. Sayas, J. M. Bergua, M. T. Olave, F. Vall LLovera, J. Bargay, M. Pereiro Sanchez, R. Garcia Boyero, A. Diaz Lopez, M. Tormo Hematology, MD Anderson CC Madrid, Madrid; Hematology, H. U. Clinic IDIBAPS, Barcelona; Hematology, H. U. San Juan de Alicante; Hematology, H. General de Alicante, Alicante; Hematology, H. U. Central de Asturias, Oviedo; Hematology, H. U. Son Espases, Palma de Mallorca; Hematology, ICO Hospitalet, L’Hospitalet de Llobregat, Barcelona; Hematology, H. U. Salamanca, Salamanca; Hematology, H. U. Morales Meseguer, Murcia; Hematology, H. U. de Burgos, Burgos; Hematology, H. U. Arnau de Vilanova, Lleida, Lleida; Hematology, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "De", "La", "Fuente", ",", "M.", "Diaz", "Beya", ",", "P.", "Beneit", ",", "C.", "Botella", ",", "A.", "Fernandez", "Moreno", ",", "A.", "Sampol", ",", "M.", "Arnan", "Sangerman", ",", "A.", "Yeguas", "Bermejo", ",", "M.", "D.", "L.", "L.", "Amigo", ",", "J.", "Labrador", ",", "A.", "Garcia", "Guinon", ",", "A.", "Garrido", ",", "J.", "Serrano", ",", "S.", "Vives", "Polo", ",", "M.", "Garcia", "Fortes", ",", "M.", "J.", "Sayas", ",", "J.", "M.", "Bergua", ",", "M.", "T.", "Olave", ",", "F.", "Vall", "LLovera", ",", "J.", "Bargay", ",", "M.", "Pereiro", "Sanchez", ",", "R.", "Garcia", "Boyero", ",", "A.", "Diaz", "Lopez", ",", "M.", "Tormo", "Hematology", ",", "MD", "Anderson", "CC", "Madrid", ",", "Madrid", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Clinic", "IDIBAPS", ",", "Barcelona", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "San", "Juan", "de", "Alicante", ";", "Hematology", ",", "H.", "General", "de", "Alicante", ",", "Alicante", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Central", "de", "Asturias", ",", "Oviedo", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Son", "Espases", ",", "Palma", "de", "Mallorca", ";", "Hematology", ",", "ICO", "Hospitalet", ",", "L’Hospitalet", "de", "Llobregat", ",", "Barcelona", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Salamanca", ",", "Salamanca", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Morales", "Meseguer", ",", "Murcia", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "de", "Burgos", ",", "Burgos", ";", "Hematology", ",", "H.", "U.", "Arnau", "de", "Vilanova", ",", "Lleida", ",", "Lleida", ";", "Hematology", ",", "Hospital", "de", "la", "Santa", "Creu", "i", "Sant", "Pau", "." ] } ]

PMC11568601

H&E staining experiment displayed that the stained images of the heart, liver and lungs in the low, medium and high-dose treatment groups of TGT were not significantly different compared to the control group.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "H&E", "staining", "experiment", "displayed", "that", "the", "stained", "images", "of", "the", "heart", ",", "liver", "and", "lungs", "in", "the", "low", ",", "medium", "and", "high-dose", "treatment", "groups", "of", "TGT", "were", "not", "significantly", "different", "compared", "to", "the", "control", "group", "." ] } ]

PMC11001582

Two-way ANOVA with Tukey’s multiple comparison test was used to calculate statistical significance.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Two-way", "ANOVA", "with", "Tukey", "’s", "multiple", "comparison", "test", "was", "used", "to", "calculate", "statistical", "significance", "." ] } ]

PMC11806182

A volcano plot was generated to visualize significant miRNAs with adjusted P-values < 0.01 and log2 fold change > 1.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "volcano", "plot", "was", "generated", "to", "visualize", "significant", "miRNAs", "with", "adjusted", "P-values", "<", "0.01", "and", "log2", "fold", "change", ">", "1", "." ] } ]

PMC4839679

For inducible vectors, doxycycline was added to the culture media at 2 μg/mL for at least 72 hours prior to experiments.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "inducible", "vectors", ",", "doxycycline", "was", "added", "to", "the", "culture", "media", "at", "2", "μg/mL", "for", "at", "least", "72", "hours", "prior", "to", "experiments", "." ] } ]

PMC8728081

High-Temperature XRD (HTXRD) was carried out for Kajjali to understand the crystallographic changes occurring in the Rasasindura preparation procedure.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "High-Temperature", "XRD", "(", "HTXRD", ")", "was", "carried", "out", "for", "Kajjali", "to", "understand", "the", "crystallographic", "changes", "occurring", "in", "the", "Rasasindura", "preparation", "procedure", "." ] } ]

PMC11791203

BCL-2 family proteins are attractive targets for anticancer drugs due to their multifaceted roles in cancer, particularly in protecting tumour cells from apoptosis under various endogenous and exogenous stresses.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "BCL-2", "family", "proteins", "are", "attractive", "targets", "for", "anticancer", "drugs", "due", "to", "their", "multifaceted", "roles", "in", "cancer", ",", "particularly", "in", "protecting", "tumour", "cells", "from", "apoptosis", "under", "various", "endogenous", "and", "exogenous", "stresses", "." ] } ]

PMC11612626

RPMI-8226 cells were treated with compound A (1 μmol/L, 48 hours), lysates generated, MHC-I complexes immunoprecipitated using a pan-MHC antibody, and antigenic peptides eluted.

[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RPMI-8226", "cells", "were", "treated", "with", "compound", "A", "(", "1", "μmol/L", ",", "48", "hours", ")", ",", "lysates", "generated", ",", "MHC-I", "complexes", "immunoprecipitated", "using", "a", "pan-MHC", "antibody", ",", "and", "antigenic", "peptides", "eluted", "." ] } ]

PMC8873393

Color key represents relative expression on a log 2 scale.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Color", "key", "represents", "relative", "expression", "on", "a", "log", "2", "scale", "." ] } ]

PMC9964635

The structures of triazole-coupled acetamide scaffolds were verified by physiochemical and spectroscopic (HRMS, FTIR, CNMR, and HNMR) methods.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "structures", "of", "triazole-coupled", "acetamide", "scaffolds", "were", "verified", "by", "physiochemical", "and", "spectroscopic", "(", "HRMS", ",", "FTIR", ",", "CNMR", ",", "and", "HNMR", ")", "methods", "." ] } ]

PMC9429973

Data was collected through medical records review.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "was", "collected", "through", "medical", "records", "review", "." ] } ]

PMC11755519

The first example of their impact is the autocrine model.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "first", "example", "of", "their", "impact", "is", "the", "autocrine", "model", "." ] } ]

PMC11409031

Transcription of A2780 and HEY differed from that of IOSE80.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transcription", "of", "A2780", "and", "HEY", "differed", "from", "that", "of", "IOSE80", "." ] } ]

PMC11734514

One-way ANOVA followed by Tukey’s post hoc test was performed. *

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One-way", "ANOVA", "followed", "by", "Tukey", "’s", "post", "hoc", "test", "was", "performed", ".", "*" ] } ]

PMC9844987

This disagreement indicates that decomposed promoters within the same promoter reflect core promoters that may either operate and be regulated independently of each other or differ in their ability to compete for the transcriptional machinery, both of which may contribute to the overall robustness or plasticity of the promoter and, in turn, the gene.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "disagreement", "indicates", "that", "decomposed", "promoters", "within", "the", "same", "promoter", "reflect", "core", "promoters", "that", "may", "either", "operate", "and", "be", "regulated", "independently", "of", "each", "other", "or", "differ", "in", "their", "ability", "to", "compete", "for", "the", "transcriptional", "machinery", ",", "both", "of", "which", "may", "contribute", "to", "the", "overall", "robustness", "or", "plasticity", "of", "the", "promoter", "and", ",", "in", "turn", ",", "the", "gene", "." ] } ]

PMC11461874

g The functional domains of full-length TRAF7 and the peptide which could be synthesized in TRAF7 KO cell are shown schematically.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "g", "The", "functional", "domains", "of", "full-length", "TRAF7", "and", "the", "peptide", "which", "could", "be", "synthesized", "in", "TRAF7", "KO", "cell", "are", "shown", "schematically", "." ] } ]

PMC11013014

2-(2,3-dichloro-4-(2-methylenebutanoyl)phenoxy)-N-(1-methyl-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)acetamide (3).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "2-(2,3-dichloro-4-(2-methylenebutanoyl)phenoxy)-N-(1-methyl-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)acetamide", "(", "3", ")", "." ] } ]

PMC11240052

SIRT1 is over-expressed in a majority of ovarian cancers (42, 43) implying the role of SIRTs in ovarian tumorigenesis.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SIRT1", "is", "over-expressed", "in", "a", "majority", "of", "ovarian", "cancers", "(", "42", ",", "43", ")", "implying", "the", "role", "of", "SIRTs", "in", "ovarian", "tumorigenesis", "." ] } ]

PMC9429973

Patients who had received maintenance therapy after CAR-T therapy showed better OS (49 months vs 9 months, P<0.001) and DFS (49 months vs 6 months, P<0.001) compared to those who received no maintenance therapy.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patients", "who", "had", "received", "maintenance", "therapy", "after", "CAR-T", "therapy", "showed", "better", "OS", "(", "49", "months", "vs", "9", "months", ",", "P<0.001", ")", "and", "DFS", "(", "49", "months", "vs", "6", "months", ",", "P<0.001", ")", "compared", "to", "those", "who", "received", "no", "maintenance", "therapy", "." ] } ]

PMC6642070

The doses of statins in cell culture were consistent with previous studies in SAMS .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "doses", "of", "statins", "in", "cell", "culture", "were", "consistent", "with", "previous", "studies", "in", "SAMS", "." ] } ]

PMC10123657

The terms related to binding to actin, Ca, and phospholipids in Figure 3B, resulted from the identification of proteins associated to the S100 and annexins complexes, probably reflecting the transfer of vesicles .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "terms", "related", "to", "binding", "to", "actin", ",", "Ca", ",", "and", "phospholipids", "in", "Figure", "3B", ",", "resulted", "from", "the", "identification", "of", "proteins", "associated", "to", "the", "S100", "and", "annexins", "complexes", ",", "probably", "reflecting", "the", "transfer", "of", "vesicles", "." ] } ]