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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC11271278
These include known oncogenes TBX2 and BRIP1 from chromosome 17, and ZNF217 from chromosome 20.
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PMC11765243
Since the data of p110αKD-T thymuses suggest an enhanced generation of DP cells as well as an altered positive selection of CD4 SP and thymus Treg differentiation, we analyzed TCR- and PI3K-dependent signals that might be responsible for these effects.
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PMC11763764
The SORL1 plasmid was provided by Dr. Stephen Strittmatter, Yale University School of Medicine .
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PMC9621239
Moreover, the mutation L123S located in the transactivation region was found to be significantly increased in tumour tissues, mainly existing in the genotype-C X gene clones.
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PMC11401358
Compared to unheated SF, the nanofibres in SF-95 °C were thinner, longer and denser (Fig. 6E, Fig. S20B and Fig. S21B).
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PMC8751435
To our knowledge, this study firstly reported pyroptosis‐causing effect of CME against A549 cell line in vitro along with regulation on caspase‐3‐dependent GSDME pathway (shown as Figure 8).
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PMC11013014
Products 16a and 16b displayed IC50 values of 2.37 μM and 0.86 μM, respectively, against HL60.
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PMC11534377
Future research should prioritize advanced preclinical and clinical trials to validate these in vitro and in vivo findings and optimize the dosage and treatment scheduling of 5-Aza to maximize therapeutic benefits while minimizing adverse effects.
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PMC9822769
Interestingly enough, this outstanding activity was related to efficient (but undefined) transport-mediated cellular uptake, as well as an “instant” reductive activation process.
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PMC5386478
The number of cells considered viable (unstained cells) was counted in a Bürker haemocytometer within 5 min after staining.
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PMC11513571
Moreover, rhTSLP alone maintained B cell survival but did not induce antibody production.
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PMC11301931
In vitro studies of two ChRCC cell lines, UOK276 and RCJ-T2, revealed that while siRNA-mediated inhibition of GPX4 or FSP1 individually did not induce substantial cell death, their combination was synergistic and resulted in almost complete cell death (UOK276 mean viability 8% of siCTRL, p<0.0001; RCJ-T2 mean viability 13% of siCTRL, p<0.0001).
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PMC11411004
One of the traditional ways of assessing HDAC activity is to analyze the acetylation status of histones H3 and H4, a method that effectively reflects the level of HDAC activity (Bjerling et al. 2002); specifically, LSD1 acts as a regulator of gene transcription through its ability to remove mono- and dimethylation marks at lysine 4 (H3K4) and lysine 9 (H3K9) on histone H3 (including activation or repression) (Fang et al. 2019).
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PMC11593084
These CasMabs have different binding affinities ranging from 10 M to 10 M. Recently, CAR’s affinity for the antigen determines CAR-T therapy’s efficacy and persistence.
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PMC11597167
Percentage inhibition and IC50 values of the BACE1 inhibitory effects of the tested phenolic compounds at 10 mM stock concentration are given in Table 1.
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PMC11082662
The resulting centrifuged ultrafiltration solution was combined with a 10–12 w/v% polyethylene glycol solution at a 1:1 ratio based on volume, thoroughly mixed, and subsequently subjected to centrifugation at 4 ℃.
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PMC11599565
130–061-101, Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, Germany).
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PMC8358176
Other bands with the frequency of about 1033 cm corresponded to the bending vibration (O–H) of the carboxyl groups.
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PMC11802929
d Summary: The association between distinct peptide-TCR properties and cell fates for antigen-specific CD8 T cells.
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PMC9429973
D. Busa, M. Culen, T. Loja, I. Jeziskova, A. Folta, J. Mayer Department of Internal Medicine - Hematology and Oncology, Masaryk University; Department of Internal Medicine - Hematology and Oncology, University Hospital Brno; Central European Institute of Technology, Brno, Czechia Background: Palbociclib, a CDK4/6 inhibitor approved for breast cancer treatment, and ponatinib, a BCR/ABL1 inhibitor with a multi-kinase activity approved for chronic myeloid and acute lymphoid leukemia, were previously shown to be effective in vitro against different cancer types including acute myeloid leukemia (AML).
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PMC8973725
The results showed that ectopic expression of ZNF677 remarkably decreased the number of invaded cells (Figure 5a).
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PMC11634794
Flag-tagged lentiviral vectors encoding human LAMP1 (LV5-human Lamp1 + 3XFlag) and empty vectors (LV5NC) were generated in T293 cells (GenePharma, Shanghai, China).
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PMC6617630
Surprisingly, WT-MYC and DHL cells did not express surface PD-L1 as compared to isotype control.
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PMC9429973
Overall, 37 genes knockouts were depleted in the control group of both cell lines without additional drug treatment, suggesting that the related genes are required for survival and/ or proliferation.
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PMC9429973
IMGN632 is a CD123-targeting antibody-drug conjugate (ADC) comprising a novel anti-CD123 antibody coupled, via a peptide linker, to a unique DNA-alkylating cytotoxic payload of the IGN (indolinobenzodiazepine pseudodimer) class.
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PMC11129910
We were interested in understanding if RAB25 loss is associated explicitly with H-RAS mutations or even other oncogenes commonly mutated in breast cancer.
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PMC11743414
According to the manufacturer’s instructions, siRNA was transfected with 50 nM (1 × 10 cells/mL).
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PMC8540611
Figures S1 and S2 show the dependence of cellular uptake by HeLa on concentration for AuNP13 and AuNP15 nanoparticles, respectively.
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PMC11676169
We identified 129 candidate interacting proteins (≥10 enrichment compared to control IP), of which n = 44 were undetectable in the control IP (Supplementary Table S3 and Figure 2B) and found the KU70 (XRCC6) and KU80 (XRCC5) proteins to be highly prevalent (Figure 2B).
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PMC11794588
Using an internal diameter of 0.18 mm and a thickness of 0.18 mm, a Restek RXi-5sil MS 20 m column was employed, and the NIST 14 MS library was utilized to search the spectrum.
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PMC9424261
Data were analyzed using FlowJo software.
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PMC9681981
In this study, a standard plot was depicted for each gene to investigate the efficiency and other characteristics of RT-qPCR reactions.
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PMC9429973
High GLS1 expression is associated with poor prognosis in AML patients.
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PMC10669128
However, recent advances in immunotherapy highlighted the importance of immune response in cancer progression and treatment, and thus the need to develop new PDX models to investigate human cancer and immune system interactions .
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PMC11323699
Consequently, both the CD4/ FOXP3 (p = 0.001) and CD8/FOXP3 (p = 0.0005) ratios exhibited a twofold increase post NACT, exclusively in OC patients displaying the highest CD47 expression (Suppl.
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PMC11342785
Related to (Fig. S9).
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PMC11348300
and i.p.
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PMC11806106
F, G Averaged BRET-based measurement (F) of HEK293T cells expressing MOR and Go-case BRET-sensor.
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PMC6182045
Purified protein samples were run on a Bis-Tris 4–12% gradient gel (Invitrogen, Carlsbad, CA) and stained with SimplyBlue SafeStain (Invitrogen, Carlsbad, CA).
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PMC6442998
Cilostazol potentiated the effect of imatinib on GIST48 cells viability reduction, as reflected by a particularly low IC50 of 0.18μM (Figure 1B).
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PMC11765879
In addition, many cells were floating in the media with a noticeable reduction in the number and contact among cells in both cell lines.
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PMC5035325
2.5 × 10) with 3LL or subcutaneously (1 × 10) with 4T1 cells.
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PMC11739484
This figure presents the expression profiling of MMP7, MMP11, and MMP14 genes using GEPIA2, Western blotting analysis, and HPA database.
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PMC11365427
The control group and the phenylalanine-deprivation group were intraperitoneally injected with saline and BTZ (0.5 mg/kg) twice a week.
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PMC11711347
Superimposed compound–protein complex. (
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PMC8632470
The chlorophyll-rich methanol extract of A. keiskei planted in Korea possesses a strong antioxidant activity .
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PMC10362265
On the other hand, the C74’s sidechain is highly exposed in the crystal complex (7al7) (rASA = 0.748).
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PMC11525028
We next generated NAT10-KO 143B and HOS cell lines by CRISPR-Cas9 using two single-guide RNA (sgRNA) targeting NAT10 and a nontargeted control sgRNA (Figure 2A).
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PMC11532793
More precisely, parametric bootstrapping is performed with a multinomial model for ECs with probabilities computed from observed EC counts, a process that is equivalent to but more efficient than an ordinary bootstrap applied to the original sequence reads.
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PMC11371627
CSF flow cytometry analysis, molecular genetic analysis and KEL gene expression analysis in our patient. (
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PMC11638255
Importantly, we repurpose the clinically approved copper chelating agent Cuprior as a non-toxic, efficacious immunomodulatory strategy.
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PMC8143558
Therefore, limited access to water and soap are regarded as major barriers to good hygiene, something which has now emerged to be a cornerstone to non-pharmaceutical interventions in combatting COVID-19 and future pandemics.
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PMC11420784
After PBS washing, bladder was cut open and incubated with 500 µL of Hanks’ balanced salt solution (HBSS) buffer at 37°C 5% CO2 for 6 hours.
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PMC11536589
ROS: Reactive oxygen species; MDA: malondialdehyde; GSH: Glutathione PKF-118-310 synergize MRTX1133 induced MRTX1133-resistant PDAC cells ferroptosis. (
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PMC11772449
Existing studies have shown that Sorafenib can affect cell proliferation and survival, angiogenesis and other processes in vivo, thereby inhibiting tumor cell proliferation and inducing tumor cell apoptosis. (
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PMC10329237
Treatment with LOS (0.2–0.5 mM) and PFD, either alone or with BLM increased CAT and SOD activity (Figure 3, B and C).
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PMC10329074
At least three individual experiments were performed in each treatment group. **
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PMC9429973
The median number of days from EOT to PET was 41.
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PMC11063646
Release kinetics of andrographolide from optimized nanoemulgel ANG 12.
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PMC8343815
As displayed in Figure-2, AuNRs had a more significant impact on the dose enhancement of HeLa cells in comparison with AuNPs when treated with 6-MV X-ray at a dose of 2Gy.
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PMC11513011
Another study has already shown that DIB has no overt toxicity and no administration-related weight loss or infection.
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PMC11463018
The pharmacophore of HDAC inhibitors (HDACis) have been well summarised: a capping motif occupying the outside of the protein’s active pocket, a zinc-binding group (ZBG) such as hydroxamic acid or ortho-aminoaniline chelating the catalytically active zinc ion, and a linker chain connecting the above two parts (Figure 1).
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Schematic side view of the steps toward droplet fusion: secondary droplets with a content of interest are trapped in secondary traps next to the primary trapped droplets, subsequently fusion on droplets is induced. (
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PMC7504302
Although the use of asbestos has been regulated and restricted in Western countries, the global incidence of MPM is expected to increase over the next few decades due to the long latency period of the disease, estimated to be nearly 40 years after fiber exposure.
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PMC4485786
Desmin is a reliable marker for rhabdomyoblastic differentiation that is absent in either undifferentiated or poorly differentiated RMS.
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PMC5925824
After 1-h incubation, Tetanus Toxoid (50uL; 0.8μg/ml) (TT; #191A LIST Biological Laboratories Inc.) was added to wells with LY3300054 or medium control.
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PMC11129910
The viral supernatant was harvested after 48 hours and used to infect the growing cultures of HMEC 5.6 RAB25- and HMEC 2.6 RAB25- cells by using a polybrene reagent (Millipore, MA, USA).
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PMC8567602
Advancing understanding of the BAF family of complexes related to synovial sarcoma, MRT, EpS, and other cancers has increasingly ascribed oncogenic and tumor-suppressive functions to particular components and BAF-family subtypes.
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PMC11754432
We recently showed in primary human macrophages that lipid peroxidation alters cholesterol homoeostasis through ERK and SREBP2 .
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PMC11680562
The concentration of xanthan gum significantly influences the density and strength of the gel network.
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Moreover, Wang and He reported that increased expression of CKAP2L in hepatocellular carcinoma (HCC) cells promoted their migration and invasion, which was associated with poor prognosis of HCC .
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PMC11224206
Overall, oxygen consumption by oocytes and all stages of development until the blastocyst are low and relatively constant , a pattern that appears broadly conserved across a variety of mammals .
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PMC9429973
Aims: Describe our experiencua of the use of convalescent plasma for the management of COVID-19 in patients who required hospitalization in Hospital Metropolitano in Quito-Ecuador.
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PMC9429973
There was no grade 4 CRS.
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PMC11748618
This is likely due to the differences in tissue types and/or samples sizes between the GTEx, MESA and AGFR data sets.
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PMC11301242
Left: co-amplification in chromosome 1 of THP-1 cells.
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PMC11711935
It inhibits the expression level of melanocyte‐specific markers including DCT, MART1, TYR, GP100/Pmel17, and MITF .
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PMC11787381
A total of 2 µL/side of Aβ1-42 preparation (100 µM, containing ~15 μmol/L of oligomers precisely measured by automatic WB), or vehicle, was bilaterally injected with a Hamilton syringe in the CA1 area of the hippocampus (0.2 µL/min with an Elite Nanomite syringe pump).
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PMC3203927
The raw intensity values from Affymetrix genechips are background corrected, log2 transformed and then quartile normalized before a linear model was fit to obtain an expression measure for each probe set.
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PMC10213199
groups, respectively with thorough stirring.
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A. S. Sperling, S. Nikiforow, B. Derman, O. Nadeem, C. Mo, J. Laubach, K. Anderson, A. Alonso, S.-Y. Im, S. Ikwgawa, R. Prabhala, D. Hernandez Rodriduez, H. Daley, K. L. Shaw, Y. Arihara, S. Ansari, D. S. Quinn, D. Pearson, A. Hack, L. Treanor, D. Bu, J. Mataraza, L. Rispoli, M. Credi, J. Ritz, A. Jakubowiak, S. De Vita, N. Munshi Dana-Farber Cancer Institute, Harvard University, Boston; Section of Hematology/ONcology, University of Chicago Medical Center, Chicago; Novartis Institutes for BioMedical Research, Cambridge, United States of America; Novartis Institutes for BioMedical Research, Basel, Switzerland; Novartis Pharmaceuticals Corporation, East Hanover; Harvard University, Boston, United States of America Background: Chimeric antigen receptor (CAR)-T cell therapy (tx) is approved for treatment of r/r MM.
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FISH detected colocalization of circMAN1A2 and miR-135a-3p in SKOV3 and A2780 cells. *
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We utilized a CRISPR/Cas9 nuclease vector containing an orange fluorescent protein (OFP) reporter gene (Materials and methods).
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Many natural products with antioxidant properties have been reported to have advantageous effects in the remedy of nephrotoxicity .
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ESAs were started at mean Hb concentration of 9.31 g/dl, mean serum EPO concentration: 51 mU/L, after a mean time from diagnosis of 6 months (r.1-118).
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PMC10975211
With their diverse defensive functions, plant-derived AMPs, such as thionins and defensins, offer a rich repertoire of antimicrobial properties.
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Seven cases underwent 1 step of dose increase, 14 patients 2 steps 13 patients 3 levels and 3 patients 4 levels.
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PMC11705630
In summary, these results indicate that GLDC regulates cellular proliferation and colony formation.
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PMC10582049
All other parameters such as sex, age, treatment, histological type, and recurrence, were not taken into account.
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PMC10936243
Slightly over ten percent (10.2%; n = 4) claimed that nothing was provided post-OVH.
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Similar OS among KRAS-mut and KRAS-wtArbour et al. 330 (advanced stage)KRAS 330NAPlatinum/pemetrexed + bevacizumabOS(month)17NAThere was a significantly shorter survival in patients with co-mutations in KEAP1/NFE2L2.
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The activation was specific as it was strongly reduced against CD19 knockout Nalm6 cells.
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PMC11750712
a, CONSORT diagram for AUTO4/LibraT1 study (NCT03590574).
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Patients were further classified into low-risk, intermediate-risk, and high-risk categories while considering the observed death distribution of the total cohort by tertiles of 2-year outcome probability according to the BRIDGE score.
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PMC11476666
Total RNA was extracted from cultured cells using TRIzol™ Reagent (Thermo Fisher Scientific) according to the manufacturer’s instructions.
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The HEC gel is a “universal” gel that has shown sufficient stability in gel formulation, as previously described (32–34), and is safe and sufficiently inactive to be used in clinical studies of experimental microbicides.
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PMC11799620
One important factor influencing the amount of phenolic compound was the liquid-solid ratio ( p < 0.0009) (Table 2).
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PMC11474209
These MC-LR-altered prostate epithelial cells showed elevated expression of cyclooxygenase-2 (COX-2) and forkhead box M1 (FOXM1).
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PMC10671321
Since AChRs containing γ subunits have a lower conductance, the existence of such AChRs would lower the robustness of neurotransmission .
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PMC9960565
TOF-MS (ESI+) m/z calc.
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