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BioData-CellLine_annotated

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PMC11640419
A synthetic triterpenoid, oleanolic acid, was identified as a potent inhibitor of inflammation.
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PMC8540611
The pattern of cellular uptake varies greatly, both with the cell lines used and for the generation of surface dendrons.
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PMC7504302
High-throughput NGS technologies have revolutionized genomics studies and enabled the extensive characterization of cancer-specific somatic mutations at unprecedented resolution.
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PMC9429973
In combination with dexamethasone, a further decrease of viability was observed.
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PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: This research shows how most patients with PHD2 mutated erythrocytosis needed a treatment regardless of the mutation.
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PMC7812570
To determine the effects of the GPI-anchored antibodies on the release of HIV-1 virions, an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was used to quantify the HIV-1 P24 antigen in the cell culture supernatants.
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PMC9429973
Aims: To explore the impact of m7G regulators on MM prognosis and further conducted a comprehensive investigation on the differences in m7G-related genes among different m7G modification patterns.
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PMC11257988
The loss of GRP78 induces UPR and apoptotic markers, which are associated with the loss of cell viability in lung cancer cell lines carrying the same KRAS mutation .
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PMC10831439
Therefore, MHC mismatched T cells and mo-DCs were cocultured for 7 days in presence of CD19-CAR-iNKT cells or untransduced iNKT cells.
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PMC5673955
Data are presented as mean ± SEM.
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PMC9429973
Methods: We developed an automated method using a common fluorescent cytoplasmic marker, and imaging flow cytometry to quantify pocked RBC in 128 adult patients with Sickle Cell Disease (SCD).
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PMC11395280
CCR7 can be directly inhibited using a well-defined murine CCL19 antagonist, CCL198-83 .
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PMC11502327
When assembled with drugs, hydrophobic drugs can be dissolved in its hydrophobic core.
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PMC9386809
The pyrazole ring coordination mode was verified by preparing N-labelled Zr–Calix complex 2-N and comparing its N NMR with a ligand.
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PMC10968586
It remains to be assessed if such a modulatory activity is able to contribute to the immunosuppressant environment surrounding cancer cells.
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PMC9352806
Worms were treated from L1 to L4 stage for 48 h followed by ORO staining (A) and TG assay (B).
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The patient was resuscitated with Inj.
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PMC11750712
Data were analyzed using FCS Express (De Novo Software).
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PMC11576293
The overlay of compounds 22 and 29 with sorafenib showed the excellent overlay of the S-Benzyloxy moiety with the ureido-group of sorafenib at the same region of the VEGRF-2 active site, which is responsible for its interaction with the Glu 885 amino acid residue, as shown in Figure 8.
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PMC10852540
RA has very strong antioxidant activity.
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PMC11301242
Additionally, cancer-related ecDNA genes, encompassing both protein-coding and noncoding genes, were screened and subsequently subjected to functional analysis .
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PMC11718817
However, the highest percentage of CTLs within the spheroid was found for Il18r CTLs in the presence of nigericin-treated macrophages after 18 h (Figure 1E, right, dark orange bar).
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PMC8010066
However, our results conformed a unique relationship between co-culture and antibiotic susceptibility (P-value Based on the present study, lasI/R and its dependent virulence factors up-regulated in all combinations except for SA-1/PA-4 in biofilm and planktonic co-culture states.
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PMC6771295
p < 0.001 is indicated with (***), p < 0.01 with (**), and p < 0.05 with (*).
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PMC9895440
Antibodies and CRISPR crRNAs are available at the indicated sources in Supplementary Tables 2, 3.
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PMC11755467
A strong reduction of HIV-1 viral titers (p24 levels) of at least three-fold to up to 78-fold (n = 8, p-value = 0.0023, two-tailed Mann Whitney U-test) starting from day 7 p.i.
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PMC11488203
The common micro RNA (miR) pattern obtained from isolated exosomes of four different MSC (MSC241111 P4; MSC280416 P6; MSC180314 P2; MSC270815 P4) as MSC control exosomes was compared to a common pattern of appropriate miRs obtained from taxol-loaded exosomes of these four MSC.
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PMC11406030
Briefly, cells were seeded into 96-well plates in a fixed volume of 100 μL at a density of 8,000 cells/well.
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PMC8956657
Fluorescence polarization measurements were undertaken to determine the affinity of interaction of MERS ORF4b and mutants across the IMPα family members SF1 (A), SF2 (B), SF3 (C).
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PMC10607604
The primers used for PCR amplification were ZEB-1 forward 5′ GTT CTG CCA ACA GTT GGT TT 3′, reverse 5′ GCT CAA GAC TGT AGT TGA TG 3′; ZEB-2 forward 5′ TCT GAA GAT GAA GAA GGC TG 3′, reverse 5′ AGT GAA TGA GCC TCA GGT AA 3′; SLUG forward 5′ CAG TGG CTC AGA AAG CCC C 3′, reverse 5′ TCA GCT TCA ATG GCA TGG G 3′; SNAIL forward 5′ GCT GCA GGA CTC TAA TCC AGA 3′, reverse 5′ GAC AGA GTC CCA GAT GAG CAT 3′; HPRT forward 5′ CTG ACC TGC TGG ATT ACA 3′, reverse 5′ GCG ACC TTG ACC ATC TTT 3′. The relative quantification of each gene expression was performed using the comparative cycle threshold (CT) method, with control cells as the calibrator sample (expression set at 1), and HPRT values as endogenous RNA normalization control .
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Cells cultured in T25 culture flasks that exhibited favorable growth conditions were digested, centrifuged, and suspended, and DNA was extracted using a blood/cell/tissue genomic DNA extraction kit from Tiangen Biotech (Beijing, China) Co., Ltd., according to the manufacturer’s instructions.
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Five out of fifteen patients carried a CHEK2 variant impairing its function.
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PMC11306331
We developed an NIH3T3 cell line containing a doxycycline-inducible FUS-CHOP construct fused to FusionRed fluorescent protein and the iLID light-activatable domain (Fig. 5A), which we termed FUS-CHOP/OptoMBP cells.
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PMC9111184
One of the techniques that has demonstrated its potential application in biomedical research, disease diagnosis, cellular biochemical studies, and therapeutic response monitoring is FTIR spectroscopy (Ukkonen et al., 2019).
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PMC8009078
Hence, proposed molecules might be crucial chemical components for the TMPRSS2 inhibition.
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PMC9429973
In contrast, rheological characteristics and endothelial stress in PV seem to result in a greater involvement of the intrinsic pathway.
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PMC10759659
Our bioinformatic analysis revealed an active IFN-γ signalling pathway in the ARID1A-deficient group.
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PMC8526701
This further confirmed that silencing BRD9 prominently reduced the tumorigenic proliferation of cells (Fig. 2C).
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PMC11574029
The correlation between NOTCH3 and SPP1 expression was analyzed using Spearman’s correlation test.
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PMC9429973
Independent factors related to survival are high value of D dimer, anemia (hemoglobin <100g/l) and moderate/critical COVID score in LPD group, while maximal value of CRP, anemia, leucocytosis and age (>60 years) in GP group.
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PMC11705547
Furthermore, the current challenges of cisplatin therapy and possibilities of combination therapies have also been discussed.
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PMC11244823
On the molecular level, gG1 and gD1 are independent antigens, thus, giving the individual ample opportunity to mount an antibody response primarily against this or that .
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PMC6160470
Up to half of all human cancers have P-gp levels high enough to display MDR phenotype.
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PMC11742864
Autophagy has double-edged effects that can either promote or inhibit cell mortality.
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PMC10178190
In contrast, exposure to Dasatinib was potent in overriding the protective effect of CM derived from TA HS-5 in OV-90 cells.
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PMC11760643
Cells were incubated with 10 µL of human FcR Blocking Reagent (Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, Germany) for 10 min on ice and then with fluorochrome‐conjugated mAbs (Table S1) for 15 min in the dark on ice.
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PMC10965315
Gelatine zymography was used to evaluate the gelatinolytic activities and secretion of two matrix metalloproteinase (MMP‐2 and ‐9) members.
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PMC11596967
Following incubation, cells were treated with the Ddes-P3 peptide for 24 h. Post-treatment, 10 μL of CCK-8 solution was added to each well, and the cells were incubated for 2 h. Absorbance was recorded at 450 nm using an Epoch 2 microplate reader (BioTek).
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PMC11055510
The FISH assay showed that circIL1RAP was mainly located in the cytoplasm of SKOV3 and A2780 cells (Fig. 1F).
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PMC11755519
Invasive urothelial carcinomas originate from one of two mechanisms: severe dysplasia or carcinoma in situ.
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PMC9429973
Of note, BM-specific Tfr2 deletion boosted erythropoiesis and activated EPO-EPOR pathway without affecting EPO levels both in CKD and turpentine mice.
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PMC11621565
The images are representative of two independent experiments, each performed in duplicate wells (n = 4).
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PMC11701801
Next, we examined the effects of simultaneously suppressing CREBBP/EP300 at the gene level on cell proliferation.
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PMC11733919
The transference into water was performed following a previously reported method with slight modifications.
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Electronic microscopy of the spleen from the child with normal pocked RBC counts showed persistent RBC filtration through inter-endothelial slits.
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PMC10212663
In conclusion, our study revealed that RANKL further promoted the malignant phenotypes of KRAS‐mt LUAD and acted as a good prognostic biomarker for patients with advanced KRAS‐mt LUAD.
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PMC11320834
Before the analysis, the DNA quality and concentration were determined photometrically (OD260/OD280, 1.8 to 2.0).
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PMC10237474
Therefore, stable pools generated via the PB system drastically improve turnaround time.
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PMC11300639
a–d 786-O and A498 cells were transfected with indicated plasmids for 24 h. Then, these cells were treated with or without Everolimus and subjected to western blotting, transwell, CCK-8, and tube formation assay.
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PMC11758416
Adjust aliquots of T cells to a concentration of 100,000 T cells (or desired number of T cells per assay well) per 150 μL. Adjust aliquots of L cells to a concentration of 10,000 L cells (or desired number of L cells per assay well) per 100 μL. Transfer 150 μL of T cells in solution to the appropriate wells.
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PMC11786767
Supplemental Fig. S2 contains uncropped blots of Figure 5B.
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PMC8170755
In another report, however, Nm23-H1 did not modify MMP-9 expression (29).
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PMC9429973
Eligible patients are adults with a diagnosis of CLL/SLL and requirement for therapy per iwCLL 2018 criteria who have received prior therapy that may or may not include a covalent BTKi.
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PMC11723947
Since we show here that HP1γ and SUV39H1 negatively regulate a set of genes critically involved in T cell anergy and exhaustion, including those encoding TOX, PD-1 and LAG-3, interfering with these molecules could be of interest to control allogeneic responses in transplant patients, but also to inhibit pathogenic immune responses in patients suffering from autoimmune pathologies.
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PMC11306019
These findings suggest that the antagonistic capacity is not solely determined by the total VDM concentration, but the origin of the VDMs play a crucial role.
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PMC11792888
R. junceus venom is a promising natural therapeutic strategy emerging as an anticancer treatment.
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PMC11438317
Anti-CD3 Ig (mouse monoclonal IgG1, UCHT1) and anti-CD28 Ig (mouse monoclonal IgG1, CD28.2) from BD Pharmingen (Franklin Lakes, CA, USA); anti-LYP Ig (goat polyclonal, AF3428) from R&D Systems (Minneapolis, MN, USA).
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PMC11562028
At the dosing concentration of 90 μg mL, the viability of the LO2 cells was ∼85.9% ± 3.5%.
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PMC11317131
n = 3.
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PMC11085211
Notably, cell viability was impaired in both models, even at a higher IC50 compared to GIST-882 and GIST-T1 (Figure 5a,b).
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PMC11495567
Furthermore, it has also been observed that metastasis is greatly increased in patients with RPS6KA1-negative lung tumors .
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PMC9964635
In the current study, methyl isothiocyanate and 2-(4-isobutylphenyl) propane hydrazide (0.02 mol) were dissolved in 10% KOH soln.
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PMC11697703
We found that miR-365 oligonucleotides also decreased MapK8 luciferase reporter gene expression with wild-type but not mismatched miR-365 target sequences, although this result did not reach statistical significance (Figure 2C).
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PMC9429973
Post-transplant cyclophosphamide (PTCy) is increasingly used for matched-sibling PBSC transplants despite the absence of randomized data.
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PMC11536589
Control mice (No treated) were administered vehicle at the same time points.
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PMC10669128
In this regard, a valuable research tool is represented by induced pluripotent stem cells.
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PMC11791264
C, stably expressed control vector (pCDH) or pCDH-SETD7 SKOV3 cells were generated.
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PMC10547921
In summary, there are some differences between novel ADC payloads and traditional payloads: 1) The traditional ADC payloads mostly choose small molecules with strong pharmacological effects but also have relatively large toxic side effects, such as PBD, while the novel payloads tend to choose small molecules with moderate pharmacological effects and toxic side effects, such as Dxd.
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PMC8481254
Tumor and adjacent healthy liver tissues (Fig. 2A and Supplementary Fig. 3C) were obtained from our previous study .
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PMC11297139
As in case of ARID1A, BAF subunits also showed increased protein level specifically in Ewing’s sarcoma (Supplementary Fig. 3a).
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PMC9429973
With declining C1-INH levels, C3 deposition increased again.
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PMC11682172
Knockdown of CORO1A in the breast cancer cells reduced their ability to cross the artificial BBB to 60%.
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PMC9429973
Overall 42 and 35 pts were actually transplanted from a haploidentical and unrelated donor, respectively whatever the randomization arm.
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PMC11204465
Sterigmatocystins and aflatoxins are a group of mycotoxins mainly isolated from fungi of the genera Aspergillus.
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PMC9429973
I. Vaide, V. Aabrams, E. Laane Internal Medicin, Pärnu Hospital, Pärnu; Internal Medicin, Sa Kuressaare Haigla, Kuressaare; Hemato-Oncology Department, Tartu University.
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PMC9429973
C. Soussain, C. Grommes, R. Ward, C. Peterson, M. Cravets, A. Mathias, J. Sosa, B. Kirby, Z. Ding, I. Yusuf, M. Rose, M. Steinberg, H. Tun Institut Curie, Saint-Cloud, France; Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, NY; Gossamer Bio, Inc., San Diego, CA; Mayo Clinic, Jacksonville, FL, United States of America Background: Bruton’s tyrosine kinase (BTK) plays an important role in B cell receptor and Toll-like receptor signaling pathways, which are constitutively active in primary CNS lymphoma, and represents an excellent therapeutic target.
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PMC10840195
The medium in the chambers was removed, and 600 µL 4% paraformaldehyde was added to the lower chamber to fix the cells for 30 min.
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PMC6803987
After the ninth drug treatment, the maximum inhibitory effect of esculetin on the secretion of HBsAg and HBeAg in the cell supernatant was 94.74% and 93.88%, respectively.
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PMC11543853
a, b Cells treated with wiskostatin, an inhibitor of N-WASP-mediated actin polymerization that is required for post-endocytic membrane remodeling.
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PMC11705901
Little is known however about the functional significance of these polymorphisms.
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PMC6600253
Telomeres are repetitive nucleotide-sequence motifs that protect the ends of chromosomes from degeneration or fusion with neighboring chromosomes.
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PMC4659567
H NMR (CDCl3, ppm): δ 11.25 (s, N1–H, 1H), 8.84 (s, C6–H, 1H), 8.12 (s, C4–H, 1H), 7.32 (s, C2–H, 1H), 5.60 (d, J = 5.9, C13–H, C15–H, 2H), 5.32 (d, J = 5.9, C12–H, C16–H, 2H), 2.93 (sep, J = 5.9, C17–H, 1H), 1.89 (s, C20–H, 3H), 1.31 (d, J = 7.3, C18–H, C19–H, 6H).
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PMC11583690
A comparison of both release profiles at pH 7.4 and 5.5 revealed that MSN@DTX's release was not significantly improved when compared with free DTX.
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PMC11670954
Notably, the expression of ZO-1 and Occludin was significantly downregulated in the LPS-induced group compared with the control group.
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PMC9587298
We applied an in vitro free-cell model to identify the presence of adducts by direct infusion ESI-MS and ultra-high performance liquid chromatography-mass spectrometry (MS).
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PMC10818573
The virus solution was processed using an OMEGA Viral DNA kit (Omega Bio-tek, Norcross, GA, USA) to obtain EBV DNA, and the DNA quantity and quality were measured using a NanoDrop 2000 (Thermo Fisher Scientific Inc., Waltham, MA, USA).
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PMC9429973
The INK4a-ARF-INK4b locus encodes for p16 and p15 and for the tumor suppressor protein p14 (p19 in the mouse) and is one of the most frequently mutated or epigenetically silenced site in human malignancies.
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PMC11143482
Oncology research, is extremely dependent on a valid and accurate model framework.
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PMC11588085
Furthermore, the oxidative phosphorylation pathway (OXPHOS), which is highly used by CSC (2), was enriched in OVCAR3-KRAB cells with XIST KD as well as in TCGA ovarian cancer patient samples (Fig. 3 C and D).
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PMC9429973
Summary/Conclusion: EPICOVIDEHA Kids is a ready-to-use survey, whose focal point is to gather epidemiological data from pediatric hematological populations and COVID-19.
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