PMCID
string | Sentences
string | ner
list |
|---|---|---|
PMC11590005
|
Attending uni-versity and envisioning a professional career, which other family members may not have been able to do, may have influenced an argumentation stance with camouflaged prejudice among men, compared to women in the study sample.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Attending",
"uni-versity",
"and",
"envisioning",
"a",
"professional",
"career",
",",
"which",
"other",
"family",
"members",
"may",
"not",
"have",
"been",
"able",
"to",
"do",
",",
"may",
"have",
"influenced",
"an",
"argumentation",
"stance",
"with",
"camouflaged",
"prejudice",
"among",
"men",
",",
"compared",
"to",
"women",
"in",
"the",
"study",
"sample",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
S. P. Desikan, G. Montalban-Bravo, M. Ohanian, N. Daver, T. Kadia, S. Venugopal, K. Chien, H. Kantarjian, G. Garcia-Manero Leukemia, MD Anderson, houston, United States of America Background: Patients with higher risk (HR) MDS status post HMA failure have poor survival, 4-6 months. [
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"S.",
"P.",
"Desikan",
",",
"G.",
"Montalban-Bravo",
",",
"M.",
"Ohanian",
",",
"N.",
"Daver",
",",
"T.",
"Kadia",
",",
"S.",
"Venugopal",
",",
"K.",
"Chien",
",",
"H.",
"Kantarjian",
",",
"G.",
"Garcia-Manero",
"Leukemia",
",",
"MD",
"Anderson",
",",
"houston",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
"Background",
":",
"Patients",
"with",
"higher",
"risk",
"(",
"HR",
")",
"MDS",
"status",
"post",
"HMA",
"failure",
"have",
"poor",
"survival",
",",
"4",
"-",
"6",
"months",
".",
"["
]
}
] |
PMC8164677
|
Figure 5Intracellular platinum-DNA binding levels in A2780 and A2780 calculated in response to sequential (0/0, 0/4 and 4/0 h) drug administration; data are expressed as means ± SEM (n = 3); and analyzed by ANOVA (two-way) followed by multiple comparison test (post hoc Bonferroni) using the software Graph Pad Prism-6. **
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Figure",
"5Intracellular",
"platinum-DNA",
"binding",
"levels",
"in",
"A2780",
"and",
"A2780",
"calculated",
"in",
"response",
"to",
"sequential",
"(",
"0/0",
",",
"0/4",
"and",
"4/0",
"h",
")",
"drug",
"administration",
";",
"data",
"are",
"expressed",
"as",
"means",
"±",
"SEM",
"(",
"n",
"=",
"3",
")",
";",
"and",
"analyzed",
"by",
"ANOVA",
"(",
"two-way",
")",
"followed",
"by",
"multiple",
"comparison",
"test",
"(",
"post",
"hoc",
"Bonferroni",
")",
"using",
"the",
"software",
"Graph",
"Pad",
"Prism-6",
".",
"*",
"*"
]
}
] |
PMC11773391
|
After incubation, the cells were collected and total RNA was isolated utilising TRIzol reagent (Invitrogen, USA).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"incubation",
",",
"the",
"cells",
"were",
"collected",
"and",
"total",
"RNA",
"was",
"isolated",
"utilising",
"TRIzol",
"reagent",
"(",
"Invitrogen",
",",
"USA",
")",
"."
]
}
] |
PMC11741577
|
F: forward, R: reverse RNA was extracted and retrotranscribed as described above.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"F",
":",
"forward",
",",
"R",
":",
"reverse",
"RNA",
"was",
"extracted",
"and",
"retrotranscribed",
"as",
"described",
"above",
"."
]
}
] |
PMC11770199
|
The data showed that Dox-induced mMSCs-tet-p14 treatment was able to inhibit tumor growth (Fig. 6D and E).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"data",
"showed",
"that",
"Dox-induced",
"mMSCs-tet-p14",
"treatment",
"was",
"able",
"to",
"inhibit",
"tumor",
"growth",
"(",
"Fig.",
"6D",
"and",
"E",
")",
"."
]
}
] |
PMC9111184
|
Spectra were smoothed by eight points Savitsky-Golay function.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Spectra",
"were",
"smoothed",
"by",
"eight",
"points",
"Savitsky-Golay",
"function",
"."
]
}
] |
PMC5600151
|
While obtaining a system with higher specificity, they ultimately generate safer nanoparticles since these alterations shield the cationic groups associated with toxicity.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"While",
"obtaining",
"a",
"system",
"with",
"higher",
"specificity",
",",
"they",
"ultimately",
"generate",
"safer",
"nanoparticles",
"since",
"these",
"alterations",
"shield",
"the",
"cationic",
"groups",
"associated",
"with",
"toxicity",
"."
]
}
] |
PMC9817179
|
In short, our simulation suggests that having unequal fixation rates in and out of puncta is necessary to cause a fixation artifact of LLPS systems and the artifact is dependent on the punctate percentage of POI in living cells.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"short",
",",
"our",
"simulation",
"suggests",
"that",
"having",
"unequal",
"fixation",
"rates",
"in",
"and",
"out",
"of",
"puncta",
"is",
"necessary",
"to",
"cause",
"a",
"fixation",
"artifact",
"of",
"LLPS",
"systems",
"and",
"the",
"artifact",
"is",
"dependent",
"on",
"the",
"punctate",
"percentage",
"of",
"POI",
"in",
"living",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11718031
|
In addition, changes in the by-product metabolites are also known to affect the pH of the internal Golgi body, which can largely influence the mAb product quality.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"changes",
"in",
"the",
"by-product",
"metabolites",
"are",
"also",
"known",
"to",
"affect",
"the",
"pH",
"of",
"the",
"internal",
"Golgi",
"body",
",",
"which",
"can",
"largely",
"influence",
"the",
"mAb",
"product",
"quality",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Infused drugs included isotonic fluids (5% glucose, 0.9% saline, Ringer’s solution) in 100%, tramadole in 81.25%, parenteral potassium in 78.1%, furosemide in 78.1%, dexamethasone in 18.75%, meropenem in 12.5%, methylprednisolone in 6.25%, diazepam in 6.25%, haloperidol in 6.25%, gentamicin in 6.25%, morphine in 6.25% and ketoprofen in 3.1% of patients with HC.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Infused",
"drugs",
"included",
"isotonic",
"fluids",
"(",
"5",
"%",
"glucose",
",",
"0.9",
"%",
"saline",
",",
"Ringer",
"’s",
"solution",
")",
"in",
"100",
"%",
",",
"tramadole",
"in",
"81.25",
"%",
",",
"parenteral",
"potassium",
"in",
"78.1",
"%",
",",
"furosemide",
"in",
"78.1",
"%",
",",
"dexamethasone",
"in",
"18.75",
"%",
",",
"meropenem",
"in",
"12.5",
"%",
",",
"methylprednisolone",
"in",
"6.25",
"%",
",",
"diazepam",
"in",
"6.25",
"%",
",",
"haloperidol",
"in",
"6.25",
"%",
",",
"gentamicin",
"in",
"6.25",
"%",
",",
"morphine",
"in",
"6.25",
"%",
"and",
"ketoprofen",
"in",
"3.1",
"%",
"of",
"patients",
"with",
"HC",
"."
]
}
] |
PMC9966931
|
To the prior solution, 100 mmol of acyl chloride were slowly added.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"the",
"prior",
"solution",
",",
"100",
"mmol",
"of",
"acyl",
"chloride",
"were",
"slowly",
"added",
"."
]
}
] |
PMC11650848
|
Significant differences in methylation could be seen between the three genotypes for rs2747429, measured via ANOVA (p < 0.001).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Significant",
"differences",
"in",
"methylation",
"could",
"be",
"seen",
"between",
"the",
"three",
"genotypes",
"for",
"rs2747429",
",",
"measured",
"via",
"ANOVA",
"(",
"p",
"<",
"0.001",
")",
"."
]
}
] |
PMC11190062
|
The packages used with version number include the following: packageVersion (“org.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"packages",
"used",
"with",
"version",
"number",
"include",
"the",
"following",
":",
"packageVersion",
"(",
"“",
"org",
"."
]
}
] |
PMC11472569
|
The endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) machinery, which is crucial for membrane shaping and scission, is a major regulator of exosome biogenesis and a key determinant of their functional properties.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"endosomal",
"sorting",
"complex",
"required",
"for",
"transport",
"(",
"ESCRT",
")",
"machinery",
",",
"which",
"is",
"crucial",
"for",
"membrane",
"shaping",
"and",
"scission",
",",
"is",
"a",
"major",
"regulator",
"of",
"exosome",
"biogenesis",
"and",
"a",
"key",
"determinant",
"of",
"their",
"functional",
"properties",
"."
]
}
] |
PMC9844987
|
Pooled libraries (Supplementary file 1) were sequenced with spiked-in PhiX on an Illumina HiSeq 2500 machine single-end for 50 cycles using v4 sequencing chemistry (Illumina Inc) and a custom sequencing primer (Takahashi et al., 2012).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Pooled",
"libraries",
"(",
"Supplementary",
"file",
"1",
")",
"were",
"sequenced",
"with",
"spiked-in",
"PhiX",
"on",
"an",
"Illumina",
"HiSeq",
"2500",
"machine",
"single-end",
"for",
"50",
"cycles",
"using",
"v4",
"sequencing",
"chemistry",
"(",
"Illumina",
"Inc",
")",
"and",
"a",
"custom",
"sequencing",
"primer",
"(",
"Takahashi",
"et",
"al.",
",",
"2012",
")",
"."
]
}
] |
PMC8873393
|
Exponentially growing human fibroblast-derived MRC5_VA cells were plated in 6-well tissue culture plates (1 × 10 cells seeded per well).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Exponentially",
"growing",
"human",
"fibroblast-derived",
"MRC5_VA",
"cells",
"were",
"plated",
"in",
"6-well",
"tissue",
"culture",
"plates",
"(",
"1",
"×",
"10",
"cells",
"seeded",
"per",
"well",
")",
"."
]
}
] |
PMC10968586
|
In adenocarcinomic human alveolar epithelial cells A549 (a model for non-small cell lung cancer), 50 μM and 150 μM OLE-induced apoptosis after 24 h incubation was mediated by the decrement in Bcl-2 and Bcl-XL anti-apoptotic proteins flanked by the increase in (I) mitochondrial-located pro-apoptotic protein Bax, (II) cytochrome c release from the mitochondria, (III) activation of apoptosome component apoptotic protease activating factor-1 (Apaf-1), (IV) activation of caspase-3, and (V) mitochondrial methylglyoxal detoxicating enzyme Glo2 (mGlo2), which physically interacted with Bax .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"adenocarcinomic",
"human",
"alveolar",
"epithelial",
"cells",
"A549",
"(",
"a",
"model",
"for",
"non-small",
"cell",
"lung",
"cancer",
")",
",",
"50",
"μM",
"and",
"150",
"μM",
"OLE-induced",
"apoptosis",
"after",
"24",
"h",
"incubation",
"was",
"mediated",
"by",
"the",
"decrement",
"in",
"Bcl-2",
"and",
"Bcl-XL",
"anti-apoptotic",
"proteins",
"flanked",
"by",
"the",
"increase",
"in",
"(",
"I",
")",
"mitochondrial-located",
"pro-apoptotic",
"protein",
"Bax",
",",
"(",
"II",
")",
"cytochrome",
"c",
"release",
"from",
"the",
"mitochondria",
",",
"(",
"III",
")",
"activation",
"of",
"apoptosome",
"component",
"apoptotic",
"protease",
"activating",
"factor-1",
"(",
"Apaf-1",
")",
",",
"(",
"IV",
")",
"activation",
"of",
"caspase-3",
",",
"and",
"(",
"V",
")",
"mitochondrial",
"methylglyoxal",
"detoxicating",
"enzyme",
"Glo2",
"(",
"mGlo2",
")",
",",
"which",
"physically",
"interacted",
"with",
"Bax",
"."
]
}
] |
PMC11742290
|
LGR5 has been shown to play a role in promoting cancer cell proliferation, tumorigenesis, clonogenicity, adhesion, migration, invasion, metastasis and angiogenesis, and inhibiting apoptosis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"LGR5",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"play",
"a",
"role",
"in",
"promoting",
"cancer",
"cell",
"proliferation",
",",
"tumorigenesis",
",",
"clonogenicity",
",",
"adhesion",
",",
"migration",
",",
"invasion",
",",
"metastasis",
"and",
"angiogenesis",
",",
"and",
"inhibiting",
"apoptosis",
"."
]
}
] |
PMC9065483
|
Together, we demonstrate that EGFR signaling plays an integral role in vanadium viral sensitization and that pharmacological EGFR blockade can counteract vanadium/oncolytic virus combination therapy.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Together",
",",
"we",
"demonstrate",
"that",
"EGFR",
"signaling",
"plays",
"an",
"integral",
"role",
"in",
"vanadium",
"viral",
"sensitization",
"and",
"that",
"pharmacological",
"EGFR",
"blockade",
"can",
"counteract",
"vanadium/oncolytic",
"virus",
"combination",
"therapy",
"."
]
}
] |
PMC11225860
|
The increased G2 peak is the result of 4n tetraploid cells accompanying the normal 4n G2 cells in the G2 peak.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"increased",
"G2",
"peak",
"is",
"the",
"result",
"of",
"4n",
"tetraploid",
"cells",
"accompanying",
"the",
"normal",
"4n",
"G2",
"cells",
"in",
"the",
"G2",
"peak",
"."
]
}
] |
PMC10940855
|
BM cells were analyzed by flow cytometry to identify multiple myeloma cells and mouse leukocytes using the following antibodies: APC anti-human CD138 (BioLegend, 352308), APC anti-mouse CD138 (BioLegend, 142506), V450 Rat Anti-mouse CD45 (BD Biosciences, 56050), and PE anti-human CD34 (BD Biosciences, 550761).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"BM",
"cells",
"were",
"analyzed",
"by",
"flow",
"cytometry",
"to",
"identify",
"multiple",
"myeloma",
"cells",
"and",
"mouse",
"leukocytes",
"using",
"the",
"following",
"antibodies",
":",
"APC",
"anti-human",
"CD138",
"(",
"BioLegend",
",",
"352308",
")",
",",
"APC",
"anti-mouse",
"CD138",
"(",
"BioLegend",
",",
"142506",
")",
",",
"V450",
"Rat",
"Anti-mouse",
"CD45",
"(",
"BD",
"Biosciences",
",",
"56050",
")",
",",
"and",
"PE",
"anti-human",
"CD34",
"(",
"BD",
"Biosciences",
",",
"550761",
")",
"."
]
}
] |
PMC11785489
|
Amino acid interaction strength (AAIS) has been postulated to estimate a TCR’s average affinity to peptide-MHC (pMHC), but this has not been directly tested.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Amino",
"acid",
"interaction",
"strength",
"(",
"AAIS",
")",
"has",
"been",
"postulated",
"to",
"estimate",
"a",
"TCR",
"’s",
"average",
"affinity",
"to",
"peptide-MHC",
"(",
"pMHC",
")",
",",
"but",
"this",
"has",
"not",
"been",
"directly",
"tested",
"."
]
}
] |
PMC9559528
|
Additional testing, such as histopathology and tests specific to infectious etiology, should be employed in patients with persistent and complex symptoms despite treatment.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Additional",
"testing",
",",
"such",
"as",
"histopathology",
"and",
"tests",
"specific",
"to",
"infectious",
"etiology",
",",
"should",
"be",
"employed",
"in",
"patients",
"with",
"persistent",
"and",
"complex",
"symptoms",
"despite",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC11678130
|
CM is a malignant tumor that develops in melanocytes, the cells responsible for the synthesis of the pigment called melanin , and is associated with several risk factors, such as the number of melanocytic nevi, family history, genetic susceptibility, and exposure to ultraviolet radiation (UVR) .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CM",
"is",
"a",
"malignant",
"tumor",
"that",
"develops",
"in",
"melanocytes",
",",
"the",
"cells",
"responsible",
"for",
"the",
"synthesis",
"of",
"the",
"pigment",
"called",
"melanin",
",",
"and",
"is",
"associated",
"with",
"several",
"risk",
"factors",
",",
"such",
"as",
"the",
"number",
"of",
"melanocytic",
"nevi",
",",
"family",
"history",
",",
"genetic",
"susceptibility",
",",
"and",
"exposure",
"to",
"ultraviolet",
"radiation",
"(",
"UVR",
")",
"."
]
}
] |
PMC11543853
|
We propose that cellular membrane-remodeling machinery disrupts endosomes and thus enables the diffusion of enterovirus particles and genomes into the cytoplasm.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"propose",
"that",
"cellular",
"membrane-remodeling",
"machinery",
"disrupts",
"endosomes",
"and",
"thus",
"enables",
"the",
"diffusion",
"of",
"enterovirus",
"particles",
"and",
"genomes",
"into",
"the",
"cytoplasm",
"."
]
}
] |
PMC8303372
|
This latter ability of GA is due to multiple mechanisms, such as cell cycle arrest , induction of autophagy and apoptosis and so on.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"latter",
"ability",
"of",
"GA",
"is",
"due",
"to",
"multiple",
"mechanisms",
",",
"such",
"as",
"cell",
"cycle",
"arrest",
",",
"induction",
"of",
"autophagy",
"and",
"apoptosis",
"and",
"so",
"on",
"."
]
}
] |
PMC9268620
|
A scanning electron microscopy analysis (Figure 8) showed that the control (untreated) cells with irregular shapes and sizes appeared healthy.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"scanning",
"electron",
"microscopy",
"analysis",
"(",
"Figure",
"8)",
"showed",
"that",
"the",
"control",
"(",
"untreated",
")",
"cells",
"with",
"irregular",
"shapes",
"and",
"sizes",
"appeared",
"healthy",
"."
]
}
] |
PMC11279598
|
Forty micrograms of total cell protein were then resolved by 4–15% SDS-PAGE and transferred to a PVDF membrane.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Forty",
"micrograms",
"of",
"total",
"cell",
"protein",
"were",
"then",
"resolved",
"by",
"4–15",
"%",
"SDS-PAGE",
"and",
"transferred",
"to",
"a",
"PVDF",
"membrane",
"."
]
}
] |
PMC4277423
|
To test whether CCR5 genome-disrupted cells were resistant to R5-tropic HIV-1 infection, sorted CCR5/CR2 and CCR5/GF1 CEMss cells were infected with either X4-tropic HIV-1 Bru-3 or R5-tropic HIV-1 Bru-Yu2 at the MOI of 0.2 at 37°C, 5% CO2 for 2 hours.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"test",
"whether",
"CCR5",
"genome-disrupted",
"cells",
"were",
"resistant",
"to",
"R5-tropic",
"HIV-1",
"infection",
",",
"sorted",
"CCR5/CR2",
"and",
"CCR5/GF1",
"CEMss",
"cells",
"were",
"infected",
"with",
"either",
"X4-tropic",
"HIV-1",
"Bru-3",
"or",
"R5-tropic",
"HIV-1",
"Bru-Yu2",
"at",
"the",
"MOI",
"of",
"0.2",
"at",
"37",
"°",
"C",
",",
"5",
"%",
"CO2",
"for",
"2",
"hours",
"."
]
}
] |
PMC11656048
|
Transmission electron microscopy revealed that MG63 and 143B cells treated with shikonin (1.5 uM) after 24 h exhibited mitochondrial shrinkage, higher density of the mitochondrial membrane, and reduction or disappearance of mitochondrial cristae (red arrows), which are typical morphological features of ferroptosis, compared to control group (Figures 3A, B).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Transmission",
"electron",
"microscopy",
"revealed",
"that",
"MG63",
"and",
"143B",
"cells",
"treated",
"with",
"shikonin",
"(",
"1.5",
"uM",
")",
"after",
"24",
"h",
"exhibited",
"mitochondrial",
"shrinkage",
",",
"higher",
"density",
"of",
"the",
"mitochondrial",
"membrane",
",",
"and",
"reduction",
"or",
"disappearance",
"of",
"mitochondrial",
"cristae",
"(",
"red",
"arrows",
")",
",",
"which",
"are",
"typical",
"morphological",
"features",
"of",
"ferroptosis",
",",
"compared",
"to",
"control",
"group",
"(",
"Figures",
"3A",
",",
"B",
")",
"."
]
}
] |
PMC11742290
|
Further studies need to also investigate how post-transcription regulation and TME influence LGR5 mRNA and protein stability.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Further",
"studies",
"need",
"to",
"also",
"investigate",
"how",
"post-transcription",
"regulation",
"and",
"TME",
"influence",
"LGR5",
"mRNA",
"and",
"protein",
"stability",
"."
]
}
] |
PMC11633763
|
Ubiquitin‐specific protease 22 (USP22), a member of the DUB family, plays various roles in the physiological functions of tumour cells, including DNA damage repair, cell proliferation, apoptosis and tumour stem cell maintenance and metabolism .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Ubiquitin‐specific",
"protease",
"22",
"(",
"USP22",
")",
",",
"a",
"member",
"of",
"the",
"DUB",
"family",
",",
"plays",
"various",
"roles",
"in",
"the",
"physiological",
"functions",
"of",
"tumour",
"cells",
",",
"including",
"DNA",
"damage",
"repair",
",",
"cell",
"proliferation",
",",
"apoptosis",
"and",
"tumour",
"stem",
"cell",
"maintenance",
"and",
"metabolism",
"."
]
}
] |
PMC11755467
|
However, this data is contentious partly because different experimental setups were employed such as timing, cell types, and virus strains.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"this",
"data",
"is",
"contentious",
"partly",
"because",
"different",
"experimental",
"setups",
"were",
"employed",
"such",
"as",
"timing",
",",
"cell",
"types",
",",
"and",
"virus",
"strains",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
AZA 75 mg/m was administered IV or SC on days 1-7 of each 28-day cycle.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"AZA",
"75",
"mg/m",
"was",
"administered",
"IV",
"or",
"SC",
"on",
"days",
"1",
"-",
"7",
"of",
"each",
"28-day",
"cycle",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The primary endpoint was the number of pts enrolled/treated and the number of enrolling sites.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"primary",
"endpoint",
"was",
"the",
"number",
"of",
"pts",
"enrolled/treated",
"and",
"the",
"number",
"of",
"enrolling",
"sites",
"."
]
}
] |
PMC11047729
|
Studies on cell lines RS4-11 (MLL-AF4+ B-ALL), Nalm-6 (non-MLL-r B-ALL), and MOLM-13 (MLL-AF9+ AML) show the melatonin-induced suppression of mixed lineage leukemia (MLL).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Studies",
"on",
"cell",
"lines",
"RS4",
"-",
"11",
"(",
"MLL-AF4",
"+",
"B-ALL",
")",
",",
"Nalm-6",
"(",
"non-MLL-r",
"B-ALL",
")",
",",
"and",
"MOLM-13",
"(",
"MLL-AF9",
"+",
"AML",
")",
"show",
"the",
"melatonin-induced",
"suppression",
"of",
"mixed",
"lineage",
"leukemia",
"(",
"MLL",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
of Medicine, Hematology and Oncology, University of Münster, Münster; Deutsche Gesellschaft für Hämatologie und medizinische Onkologie, Berlin; Dept.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"of",
"Medicine",
",",
"Hematology",
"and",
"Oncology",
",",
"University",
"of",
"Münster",
",",
"Münster",
";",
"Deutsche",
"Gesellschaft",
"für",
"Hämatologie",
"und",
"medizinische",
"Onkologie",
",",
"Berlin",
";",
"Dept",
"."
]
}
] |
PMC11730311
|
Statistical significance was determined at a p value of < 0.05 in all statistical tests.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Statistical",
"significance",
"was",
"determined",
"at",
"a",
"p",
"value",
"of",
"<",
"0.05",
"in",
"all",
"statistical",
"tests",
"."
]
}
] |
PMC11583010
|
To evaluate its PK and safety profile, IV doses of ETx-22 (10 and 20 mg/kg) were administered to cynomolgus monkeys up to three times every 2 weeks under GLP conditions.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"evaluate",
"its",
"PK",
"and",
"safety",
"profile",
",",
"IV",
"doses",
"of",
"ETx-22",
"(",
"10",
"and",
"20",
"mg/kg",
")",
"were",
"administered",
"to",
"cynomolgus",
"monkeys",
"up",
"to",
"three",
"times",
"every",
"2",
"weeks",
"under",
"GLP",
"conditions",
"."
]
}
] |
PMC9105697
|
These seem to depend more on the mere presence of tumor cells, and less on tumor size, grading and stage.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"seem",
"to",
"depend",
"more",
"on",
"the",
"mere",
"presence",
"of",
"tumor",
"cells",
",",
"and",
"less",
"on",
"tumor",
"size",
",",
"grading",
"and",
"stage",
"."
]
}
] |
PMC10852540
|
Epidermal growth factor receptor (EGFR) is a 170 kDa glycoprotein that contains various signal transduction systems that affect cellular growth, differentiation, and proliferation.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Epidermal",
"growth",
"factor",
"receptor",
"(",
"EGFR",
")",
"is",
"a",
"170",
"kDa",
"glycoprotein",
"that",
"contains",
"various",
"signal",
"transduction",
"systems",
"that",
"affect",
"cellular",
"growth",
",",
"differentiation",
",",
"and",
"proliferation",
"."
]
}
] |
PMC11519077
|
Furthermore, it has been shown that loss of function mutations in NOD2 is linked to ileal CD, according to genome mapping of CD patients .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"it",
"has",
"been",
"shown",
"that",
"loss",
"of",
"function",
"mutations",
"in",
"NOD2",
"is",
"linked",
"to",
"ileal",
"CD",
",",
"according",
"to",
"genome",
"mapping",
"of",
"CD",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC7612475
|
H2595 (RRID:CVCL_A545), H2591 (RRID:CVCL_A543), REN (RRID:CVCL_M202), and H28 (RRID:CVCL_1555) were cultured in RPMI1640 media supplemented with 10% FCS plus nonessential amino acids for the REN cell line.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"H2595",
"(",
"RRID",
":",
"CVCL_A545",
")",
",",
"H2591",
"(",
"RRID",
":",
"CVCL_A543",
")",
",",
"REN",
"(",
"RRID",
":",
"CVCL_M202",
")",
",",
"and",
"H28",
"(",
"RRID",
":",
"CVCL_1555",
")",
"were",
"cultured",
"in",
"RPMI1640",
"media",
"supplemented",
"with",
"10",
"%",
"FCS",
"plus",
"nonessential",
"amino",
"acids",
"for",
"the",
"REN",
"cell",
"line",
"."
]
}
] |
PMC11754291
|
While the experimental setup was designed to minimize fibroblast influence, the absence of direct controls to assess fibroblast-specific contributions remains a limitation of this study.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"While",
"the",
"experimental",
"setup",
"was",
"designed",
"to",
"minimize",
"fibroblast",
"influence",
",",
"the",
"absence",
"of",
"direct",
"controls",
"to",
"assess",
"fibroblast-specific",
"contributions",
"remains",
"a",
"limitation",
"of",
"this",
"study",
"."
]
}
] |
PMC6379402
|
In the main document, and as detailed in Methods section Enrichment-based measures, we use biological annotations to assess if our iCells can be used to identify functionally coherent sets of genes.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"the",
"main",
"document",
",",
"and",
"as",
"detailed",
"in",
"Methods",
"section",
"Enrichment-based",
"measures",
",",
"we",
"use",
"biological",
"annotations",
"to",
"assess",
"if",
"our",
"iCells",
"can",
"be",
"used",
"to",
"identify",
"functionally",
"coherent",
"sets",
"of",
"genes",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
This population is difficult to treat and has poor prognosis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"population",
"is",
"difficult",
"to",
"treat",
"and",
"has",
"poor",
"prognosis",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The primary endpoints are DLTs of lemzo.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"primary",
"endpoints",
"are",
"DLTs",
"of",
"lemzo",
"."
]
}
] |
PMC11401350
|
B Transduction of murine splenic T cells after TCR-stimulation was performed with mCD8-LVs (10 ng p24 content) or VSV-G-LVs (2 ng p24 content) carrying the EF1a-GFP or the PGK-GFP expression cassettes Transduction was analyzed by FACS on day 3 post-transduction by gating on CD4 + T cell and CD8 + T cells and summarized in (C).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"B",
"Transduction",
"of",
"murine",
"splenic",
"T",
"cells",
"after",
"TCR-stimulation",
"was",
"performed",
"with",
"mCD8-LVs",
"(",
"10",
"ng",
"p24",
"content",
")",
"or",
"VSV-G-LVs",
"(",
"2",
"ng",
"p24",
"content",
")",
"carrying",
"the",
"EF1a-GFP",
"or",
"the",
"PGK-GFP",
"expression",
"cassettes",
"Transduction",
"was",
"analyzed",
"by",
"FACS",
"on",
"day",
"3",
"post-transduction",
"by",
"gating",
"on",
"CD4",
"+",
"T",
"cell",
"and",
"CD8",
"+",
"T",
"cells",
"and",
"summarized",
"in",
"(",
"C",
")",
"."
]
}
] |
PMC11721277
|
In the in vitro studies, an unpaired two-tailed t-test was used to determine statistically significant differences between the two groups.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"the",
"in",
"vitro",
"studies",
",",
"an",
"unpaired",
"two-tailed",
"t-test",
"was",
"used",
"to",
"determine",
"statistically",
"significant",
"differences",
"between",
"the",
"two",
"groups",
"."
]
}
] |
PMC10170482
|
Thus, to have a more realistic 3D biomimetic microenvironment, we utilized collagen scaffolds in this study.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Thus",
",",
"to",
"have",
"a",
"more",
"realistic",
"3D",
"biomimetic",
"microenvironment",
",",
"we",
"utilized",
"collagen",
"scaffolds",
"in",
"this",
"study",
"."
]
}
] |
PMC9856122
|
In a study, methanolic extract from Indonesian plants was investigated against HSV-1.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"a",
"study",
",",
"methanolic",
"extract",
"from",
"Indonesian",
"plants",
"was",
"investigated",
"against",
"HSV-1",
"."
]
}
] |
PMC11528603
|
B: Dose-response curves of inhibitory activity of SA-EA extract on HL60, and NIH 3T3 cell lines.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"B",
":",
"Dose-response",
"curves",
"of",
"inhibitory",
"activity",
"of",
"SA-EA",
"extract",
"on",
"HL60",
",",
"and",
"NIH",
"3T3",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The exposure, expressed as AUC, was calculated for each patient using a three-compartmental model (adapted from Langenhorst et al.) in n=19 consecutive patients receiving a conditioning regime with fludarabine being diagnosed with acute myeloid leukemia.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"exposure",
",",
"expressed",
"as",
"AUC",
",",
"was",
"calculated",
"for",
"each",
"patient",
"using",
"a",
"three-compartmental",
"model",
"(",
"adapted",
"from",
"Langenhorst",
"et",
"al.",
")",
"in",
"n=19",
"consecutive",
"patients",
"receiving",
"a",
"conditioning",
"regime",
"with",
"fludarabine",
"being",
"diagnosed",
"with",
"acute",
"myeloid",
"leukemia",
"."
]
}
] |
PMC10996034
|
no. H20203702; Sichuan Huiyu Pharmaceutical Co., Ltd.).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"no.",
"H20203702",
";",
"Sichuan",
"Huiyu",
"Pharmaceutical",
"Co.",
",",
"Ltd.",
")",
"."
]
}
] |
PMC10523483
|
For example, NRF2 recruits histone acetyltransferases to cooperatively activate transcription (17); upregulation of trimethylated histone H3K9 (H3K9me3) suppresses NRF2 transcription and consequently increases cellular oxidative stress (18).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"example",
",",
"NRF2",
"recruits",
"histone",
"acetyltransferases",
"to",
"cooperatively",
"activate",
"transcription",
"(",
"17",
")",
";",
"upregulation",
"of",
"trimethylated",
"histone",
"H3K9",
"(",
"H3K9me3",
")",
"suppresses",
"NRF2",
"transcription",
"and",
"consequently",
"increases",
"cellular",
"oxidative",
"stress",
"(",
"18",
")",
"."
]
}
] |
PMC11476837
|
FITC annexin V (5 µL) and propidium iodide (5 µL) were added to cells in suspension, gently vortexed, and incubated at room temperature in the dark for 15 min.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"FITC",
"annexin",
"V",
"(",
"5",
"µL",
")",
"and",
"propidium",
"iodide",
"(",
"5",
"µL",
")",
"were",
"added",
"to",
"cells",
"in",
"suspension",
",",
"gently",
"vortexed",
",",
"and",
"incubated",
"at",
"room",
"temperature",
"in",
"the",
"dark",
"for",
"15",
"min",
"."
]
}
] |
PMC11033779
|
We will culture primary human mammary epithelial cells and further separate luminal and myoepithelial cells using flow cytometry to then decipher Hedgehog signaling.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"will",
"culture",
"primary",
"human",
"mammary",
"epithelial",
"cells",
"and",
"further",
"separate",
"luminal",
"and",
"myoepithelial",
"cells",
"using",
"flow",
"cytometry",
"to",
"then",
"decipher",
"Hedgehog",
"signaling",
"."
]
}
] |
PMC11143482
|
Their finding showed that among all types of cell line used, HOS-143B was found to be highly metastatic.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Their",
"finding",
"showed",
"that",
"among",
"all",
"types",
"of",
"cell",
"line",
"used",
",",
"HOS-143B",
"was",
"found",
"to",
"be",
"highly",
"metastatic",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Preliminary analysis in 20 patients showed reduced neutralisation of omicron compared with the Wuhan spike, with neutralising antibody ID50 of 93 vs 218 (p=0.06, Fig. 1a).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Preliminary",
"analysis",
"in",
"20",
"patients",
"showed",
"reduced",
"neutralisation",
"of",
"omicron",
"compared",
"with",
"the",
"Wuhan",
"spike",
",",
"with",
"neutralising",
"antibody",
"ID50",
"of",
"93",
"vs",
"218",
"(",
"p=0.06",
",",
"Fig.",
"1a",
")",
"."
]
}
] |
PMC11640555
|
CK2 directly orchestrates varied cellular signaling pathways: it potentiates and modulates phosphatidyl inositol 3-kinase/protein B (PI3K/Akt), induces the degradation of IκB-α by reducing its inhibitory action, and controls the JAK/STAT3 pathway .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CK2",
"directly",
"orchestrates",
"varied",
"cellular",
"signaling",
"pathways",
":",
"it",
"potentiates",
"and",
"modulates",
"phosphatidyl",
"inositol",
"3-kinase/protein",
"B",
"(",
"PI3K/Akt",
")",
",",
"induces",
"the",
"degradation",
"of",
"IκB-α",
"by",
"reducing",
"its",
"inhibitory",
"action",
",",
"and",
"controls",
"the",
"JAK/STAT3",
"pathway",
"."
]
}
] |
PMC9776316
|
Data from The Cancer Genome Atlas Ovarian Cancer (TCGA-OV) were analyzed by the GEPIA according to the instructions on the website .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Data",
"from",
"The",
"Cancer",
"Genome",
"Atlas",
"Ovarian",
"Cancer",
"(",
"TCGA-OV",
")",
"were",
"analyzed",
"by",
"the",
"GEPIA",
"according",
"to",
"the",
"instructions",
"on",
"the",
"website",
"."
]
}
] |
PMC11763533
|
We humanized the luciferases of Amydetes vivianii (Amy-Luc) and Cratomorphus distinctus (Crt-Luc) fireflies, inserted them into the pCDNA3 vector, and compared their bioluminescence and pH-sensing properties with those of Macrolampis firefly luciferase (Mac-Luc) inside fibroblasts.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"humanized",
"the",
"luciferases",
"of",
"Amydetes",
"vivianii",
"(",
"Amy-Luc",
")",
"and",
"Cratomorphus",
"distinctus",
"(",
"Crt-Luc",
")",
"fireflies",
",",
"inserted",
"them",
"into",
"the",
"pCDNA3",
"vector",
",",
"and",
"compared",
"their",
"bioluminescence",
"and",
"pH-sensing",
"properties",
"with",
"those",
"of",
"Macrolampis",
"firefly",
"luciferase",
"(",
"Mac-Luc",
")",
"inside",
"fibroblasts",
"."
]
}
] |
PMC11352666
|
Data from the cell density assays were evaluated using one- or two-way ANOVA with Bonferroni’s or Tukey’s post-tests, respectively, to determine statistical differences (p < 0.05).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Data",
"from",
"the",
"cell",
"density",
"assays",
"were",
"evaluated",
"using",
"one-",
"or",
"two-way",
"ANOVA",
"with",
"Bonferroni",
"’s",
"or",
"Tukey",
"’s",
"post-tests",
",",
"respectively",
",",
"to",
"determine",
"statistical",
"differences",
"(",
"p",
"<",
"0.05",
")",
"."
]
}
] |
PMC8839885
|
Our previous data demonstrated that re-activation of ERK1/2 phosphorylation in direct co-culture of OC cells with MSC resulted in restoring platinum drug sensitivity to OC cells .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"previous",
"data",
"demonstrated",
"that",
"re-activation",
"of",
"ERK1/2",
"phosphorylation",
"in",
"direct",
"co-culture",
"of",
"OC",
"cells",
"with",
"MSC",
"resulted",
"in",
"restoring",
"platinum",
"drug",
"sensitivity",
"to",
"OC",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Methods: We conducted a phase 1b, investigator-initiated study of ibr + obin in R/R CLL (NCT02537613).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Methods",
":",
"We",
"conducted",
"a",
"phase",
"1b",
",",
"investigator-initiated",
"study",
"of",
"ibr",
"+",
"obin",
"in",
"R/R",
"CLL",
"(",
"NCT02537613",
")",
"."
]
}
] |
PMC11407042
|
Timing: 4–5 h Timing: 4–5 h In this section, we describe steps for culturing and collecting P. aeruginosa cells.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Timing",
":",
"4–5",
"h",
"Timing",
":",
"4–5",
"h",
"In",
"this",
"section",
",",
"we",
"describe",
"steps",
"for",
"culturing",
"and",
"collecting",
"P.",
"aeruginosa",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC10507284
|
Consistently, the expression level of TROAP is ameliorated in the STS cell line SW982 compared with human skin fibroblast (HSF), while no significant change is observed in SW872 (Figure 6D).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Consistently",
",",
"the",
"expression",
"level",
"of",
"TROAP",
"is",
"ameliorated",
"in",
"the",
"STS",
"cell",
"line",
"SW982",
"compared",
"with",
"human",
"skin",
"fibroblast",
"(",
"HSF",
")",
",",
"while",
"no",
"significant",
"change",
"is",
"observed",
"in",
"SW872",
"(",
"Figure",
"6D",
")",
"."
]
}
] |
PMC11806818
|
Moreover, the fixation method of recognition elements must address the requirements of both detection strategies.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moreover",
",",
"the",
"fixation",
"method",
"of",
"recognition",
"elements",
"must",
"address",
"the",
"requirements",
"of",
"both",
"detection",
"strategies",
"."
]
}
] |
PMC7823217
|
Chemical crosslinking methods can be based on enzymes (e.g., mushroom tyrosinase for gelatin) , tannic acid (for collagen crosslinking), and divalent cations such as calcium ions (for alginate) .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Chemical",
"crosslinking",
"methods",
"can",
"be",
"based",
"on",
"enzymes",
"(",
"e.g.",
",",
"mushroom",
"tyrosinase",
"for",
"gelatin",
")",
",",
"tannic",
"acid",
"(",
"for",
"collagen",
"crosslinking",
")",
",",
"and",
"divalent",
"cations",
"such",
"as",
"calcium",
"ions",
"(",
"for",
"alginate",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Results: A total of 51 patients were included, with a median age of 62 years (range 35 – 69).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
":",
"A",
"total",
"of",
"51",
"patients",
"were",
"included",
",",
"with",
"a",
"median",
"age",
"of",
"62",
"years",
"(",
"range",
"35",
"–",
"69",
")",
"."
]
}
] |
PMC6182045
|
With this perspective in mind, the TZ97008-rgp120 is one a few gp120s that is designed to incorporate glycoforms required for bNAb binding and expressly produced for human clinical trials.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"With",
"this",
"perspective",
"in",
"mind",
",",
"the",
"TZ97008-rgp120",
"is",
"one",
"a",
"few",
"gp120s",
"that",
"is",
"designed",
"to",
"incorporate",
"glycoforms",
"required",
"for",
"bNAb",
"binding",
"and",
"expressly",
"produced",
"for",
"human",
"clinical",
"trials",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
M. Velasco Estevez, A. Fernandez, A. Otero-Sobrino, P. Aguilar-Garrido, M. A. Navarro-Aguadero, R. Sanchez, A. Gimenez Sanchez, V. Garrido Garcia, L. Carneros Blanco, J. Martinez-Lopez, M. Gallardo H12O-CNIO Haematological Malignancies Group, Clinical Research Unit, Centro Nacional de Investigaciones Oncologicas (CNIO); Grupo de Hematología Traslacional, Hospital 12 de Octubre de Madrid, Madrid, Spain Background: Mechanotransduction is the process through which cells sense the mechanical input in and out the cell, and translate it into biochemical signals adapt and respond.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"M.",
"Velasco",
"Estevez",
",",
"A.",
"Fernandez",
",",
"A.",
"Otero-Sobrino",
",",
"P.",
"Aguilar-Garrido",
",",
"M.",
"A.",
"Navarro-Aguadero",
",",
"R.",
"Sanchez",
",",
"A.",
"Gimenez",
"Sanchez",
",",
"V.",
"Garrido",
"Garcia",
",",
"L.",
"Carneros",
"Blanco",
",",
"J.",
"Martinez-Lopez",
",",
"M.",
"Gallardo",
"H12O-CNIO",
"Haematological",
"Malignancies",
"Group",
",",
"Clinical",
"Research",
"Unit",
",",
"Centro",
"Nacional",
"de",
"Investigaciones",
"Oncologicas",
"(",
"CNIO",
")",
";",
"Grupo",
"de",
"Hematología",
"Traslacional",
",",
"Hospital",
"12",
"de",
"Octubre",
"de",
"Madrid",
",",
"Madrid",
",",
"Spain",
"Background",
":",
"Mechanotransduction",
"is",
"the",
"process",
"through",
"which",
"cells",
"sense",
"the",
"mechanical",
"input",
"in",
"and",
"out",
"the",
"cell",
",",
"and",
"translate",
"it",
"into",
"biochemical",
"signals",
"adapt",
"and",
"respond",
"."
]
}
] |
PMC11139449
|
Eliminating the CASP8AP2 gene in the CHO cell line using the CRISPR-Cas9 system increased cell survival and elevated protein expression.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Eliminating",
"the",
"CASP8AP2",
"gene",
"in",
"the",
"CHO",
"cell",
"line",
"using",
"the",
"CRISPR-Cas9",
"system",
"increased",
"cell",
"survival",
"and",
"elevated",
"protein",
"expression",
"."
]
}
] |
PMC11720107
|
For SOD1 mRNA expression in the BJ cell line, exposure to 0.250 mg/mL of the tested extracts showed that only the Harnaś and Morado cultivars significantly increased SOD1 mRNA expression, by 14.6% and 22.6%, respectively, compared with the control (Figure 6D).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"SOD1",
"mRNA",
"expression",
"in",
"the",
"BJ",
"cell",
"line",
",",
"exposure",
"to",
"0.250",
"mg/mL",
"of",
"the",
"tested",
"extracts",
"showed",
"that",
"only",
"the",
"Harnaś",
"and",
"Morado",
"cultivars",
"significantly",
"increased",
"SOD1",
"mRNA",
"expression",
",",
"by",
"14.6",
"%",
"and",
"22.6",
"%",
",",
"respectively",
",",
"compared",
"with",
"the",
"control",
"(",
"Figure",
"6D",
")",
"."
]
}
] |
PMC5916734
|
Panel C – The taxonomic tree for a mammalian VKORC1 protein visualized using the Tree Viewer software (NCBI, USA).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Panel",
"C",
"–",
"The",
"taxonomic",
"tree",
"for",
"a",
"mammalian",
"VKORC1",
"protein",
"visualized",
"using",
"the",
"Tree",
"Viewer",
"software",
"(",
"NCBI",
",",
"USA",
")",
"."
]
}
] |
PMC10582049
|
Their work showed that ADH1B CAFs were enriched in early stage LUADs of the papillary subtype, whereas FAP CAFs dominated in late stage tumors of the solid histological subtype.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Their",
"work",
"showed",
"that",
"ADH1B",
"CAFs",
"were",
"enriched",
"in",
"early",
"stage",
"LUADs",
"of",
"the",
"papillary",
"subtype",
",",
"whereas",
"FAP",
"CAFs",
"dominated",
"in",
"late",
"stage",
"tumors",
"of",
"the",
"solid",
"histological",
"subtype",
"."
]
}
] |
PMC11519583
|
c Cos7 cells were transfected with the indicated plasmids.
|
[
{
"tags": [
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"c",
"Cos7",
"cells",
"were",
"transfected",
"with",
"the",
"indicated",
"plasmids",
"."
]
}
] |
PMC11496491
|
The histogram of the top 10 most significantly enriched signal pathway graphs and the results of the bubble analysis group are shown in Fig. 9.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"histogram",
"of",
"the",
"top",
"10",
"most",
"significantly",
"enriched",
"signal",
"pathway",
"graphs",
"and",
"the",
"results",
"of",
"the",
"bubble",
"analysis",
"group",
"are",
"shown",
"in",
"Fig.",
"9",
"."
]
}
] |
PMC10729469
|
Comparison of Treg function of the engineered Treg cells or systemic Tregs from different mice treatments was performed as described earlier .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Comparison",
"of",
"Treg",
"function",
"of",
"the",
"engineered",
"Treg",
"cells",
"or",
"systemic",
"Tregs",
"from",
"different",
"mice",
"treatments",
"was",
"performed",
"as",
"described",
"earlier",
"."
]
}
] |
PMC10936243
|
There were no incomplete responses used, as the survey software JISC does not allow for the collection of incomplete data.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"There",
"were",
"no",
"incomplete",
"responses",
"used",
",",
"as",
"the",
"survey",
"software",
"JISC",
"does",
"not",
"allow",
"for",
"the",
"collection",
"of",
"incomplete",
"data",
"."
]
}
] |
PMC11190538
|
The blood sample was collected from a healthy volunteer who was not taking any non-steroidal drugs two weeks before the experiment.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"blood",
"sample",
"was",
"collected",
"from",
"a",
"healthy",
"volunteer",
"who",
"was",
"not",
"taking",
"any",
"non-steroidal",
"drugs",
"two",
"weeks",
"before",
"the",
"experiment",
"."
]
}
] |
PMC10317042
|
To determine the effects of BRD4 on EWSR1::ATF1 expression and CCS cell proliferation, we treated CCS cell lines with JQ1 finding that JQ1 reduced the number of viable cells in four cell lines in a dose-dependent manner (Fig. 4C).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"determine",
"the",
"effects",
"of",
"BRD4",
"on",
"EWSR1::ATF1",
"expression",
"and",
"CCS",
"cell",
"proliferation",
",",
"we",
"treated",
"CCS",
"cell",
"lines",
"with",
"JQ1",
"finding",
"that",
"JQ1",
"reduced",
"the",
"number",
"of",
"viable",
"cells",
"in",
"four",
"cell",
"lines",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"(",
"Fig.",
"4C",
")",
"."
]
}
] |
PMC10482220
|
This response is characterized by the induction of the heat-shock proteins, stress-induced transcription factors, and formation of stress granules (SGs; Theodorakis and Morimoto, 1987; Petersen and Lindquist, 1988; Nover et al., 1983, 1989; Morimoto, 1998; Kedersha et al., 1999, 2000).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"response",
"is",
"characterized",
"by",
"the",
"induction",
"of",
"the",
"heat-shock",
"proteins",
",",
"stress-induced",
"transcription",
"factors",
",",
"and",
"formation",
"of",
"stress",
"granules",
"(",
"SGs",
";",
"Theodorakis",
"and",
"Morimoto",
",",
"1987",
";",
"Petersen",
"and",
"Lindquist",
",",
"1988",
";",
"Nover",
"et",
"al.",
",",
"1983",
",",
"1989",
";",
"Morimoto",
",",
"1998",
";",
"Kedersha",
"et",
"al.",
",",
"1999",
",",
"2000",
")",
"."
]
}
] |
PMC11707832
|
Interestingly, M. bovis consistently caused disease, whereas M. tuberculosis infection was effectively controlled.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Interestingly",
",",
"M.",
"bovis",
"consistently",
"caused",
"disease",
",",
"whereas",
"M.",
"tuberculosis",
"infection",
"was",
"effectively",
"controlled",
"."
]
}
] |
PMC11594074
|
Interestingly, compounds 1 and 3 showed only low levels of DNMT1 inhibition at 21.6% and 25.1%, respectively, leading to their exclusion in further investigations.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Interestingly",
",",
"compounds",
"1",
"and",
"3",
"showed",
"only",
"low",
"levels",
"of",
"DNMT1",
"inhibition",
"at",
"21.6",
"%",
"and",
"25.1",
"%",
",",
"respectively",
",",
"leading",
"to",
"their",
"exclusion",
"in",
"further",
"investigations",
"."
]
}
] |
PMC11342785
|
As expected, mCh-Cry2WT showed no clusters upon light stimulation, while FUS-mCh-Cry2WT formed spherical drops distributed throughout the cell (39).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"expected",
",",
"mCh-Cry2WT",
"showed",
"no",
"clusters",
"upon",
"light",
"stimulation",
",",
"while",
"FUS-mCh-Cry2WT",
"formed",
"spherical",
"drops",
"distributed",
"throughout",
"the",
"cell",
"(",
"39",
")",
"."
]
}
] |
PMC11643491
|
Since the uptake was evaluated by flow cytometry as the percentage of cells that underwent uptake, the biological effect is likely due to an increase in the number of cells that took up one or more particles in a specific cell population.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Since",
"the",
"uptake",
"was",
"evaluated",
"by",
"flow",
"cytometry",
"as",
"the",
"percentage",
"of",
"cells",
"that",
"underwent",
"uptake",
",",
"the",
"biological",
"effect",
"is",
"likely",
"due",
"to",
"an",
"increase",
"in",
"the",
"number",
"of",
"cells",
"that",
"took",
"up",
"one",
"or",
"more",
"particles",
"in",
"a",
"specific",
"cell",
"population",
"."
]
}
] |
PMC11695623
|
Compared with stage I of pathological stage, DCUN1D5 was significantly up-regulated in stage III (Fig. 2D).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Compared",
"with",
"stage",
"I",
"of",
"pathological",
"stage",
",",
"DCUN1D5",
"was",
"significantly",
"up-regulated",
"in",
"stage",
"III",
"(",
"Fig.",
"2D",
")",
"."
]
}
] |
PMC11661040
|
Data processing using the ImageJ software.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Data",
"processing",
"using",
"the",
"ImageJ",
"software",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The combination of del17p with TP53 mutation data identified 95 cases with no TP53 aberrations, 8 cases del17p only, 58 cases TP53-mutated only, and 68 cases bearing both del17p deletion and TP53 mutation (Fig.1CD).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"combination",
"of",
"del17p",
"with",
"TP53",
"mutation",
"data",
"identified",
"95",
"cases",
"with",
"no",
"TP53",
"aberrations",
",",
"8",
"cases",
"del17p",
"only",
",",
"58",
"cases",
"TP53-mutated",
"only",
",",
"and",
"68",
"cases",
"bearing",
"both",
"del17p",
"deletion",
"and",
"TP53",
"mutation",
"(",
"Fig.1CD",
")",
"."
]
}
] |
PMC9672323
|
After incubation for 72 h at 37 °C, 5% CO2, and 95% humidity, supernatants were obtained, and LDH activity was measured using an autoanalyzer system.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"incubation",
"for",
"72",
"h",
"at",
"37",
"°",
"C",
",",
"5",
"%",
"CO2",
",",
"and",
"95",
"%",
"humidity",
",",
"supernatants",
"were",
"obtained",
",",
"and",
"LDH",
"activity",
"was",
"measured",
"using",
"an",
"autoanalyzer",
"system",
"."
]
}
] |
PMC11711663
|
HHH GLDM Dependence Variance 13.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"HHH",
"GLDM",
"Dependence",
"Variance",
"13",
"."
]
}
] |
PMC11700340
|
Statistical Analysis The MTT test was conducted with six duplicates, and the results are shown as the mean ± standard deviation (SD) values.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Statistical",
"Analysis",
"The",
"MTT",
"test",
"was",
"conducted",
"with",
"six",
"duplicates",
",",
"and",
"the",
"results",
"are",
"shown",
"as",
"the",
"mean",
"±",
"standard",
"deviation",
"(",
"SD",
")",
"values",
"."
]
}
] |
PMC11694066
|
In this context, we can hope that the use of last-generation potent PARP1-selective inhibitors (e.g., AZD5305) will allow the enhancement of PARPi efficacy while limiting hematologic toxicity.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"context",
",",
"we",
"can",
"hope",
"that",
"the",
"use",
"of",
"last-generation",
"potent",
"PARP1-selective",
"inhibitors",
"(",
"e.g.",
",",
"AZD5305",
")",
"will",
"allow",
"the",
"enhancement",
"of",
"PARPi",
"efficacy",
"while",
"limiting",
"hematologic",
"toxicity",
"."
]
}
] |
PMC11591030
|
AOP predominantly consist of glucosyl residues linked in a main chain, along with arabinosyl, galactosyl, mannose, and galacturonic acid residues in various configurations and linkages.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"AOP",
"predominantly",
"consist",
"of",
"glucosyl",
"residues",
"linked",
"in",
"a",
"main",
"chain",
",",
"along",
"with",
"arabinosyl",
",",
"galactosyl",
",",
"mannose",
",",
"and",
"galacturonic",
"acid",
"residues",
"in",
"various",
"configurations",
"and",
"linkages",
"."
]
}
] |
PMC11591794
|
IC50 could not be determined in 24, 48, and 72-h DOX application to HaCaT cells.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"IC50",
"could",
"not",
"be",
"determined",
"in",
"24",
",",
"48",
",",
"and",
"72-h",
"DOX",
"application",
"to",
"HaCaT",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The most common treatment-emergent adverse events (TEAE) of any grade, regardless of attribution, were neutrophil count decrease (36%), nausea (32%), fatigue (32%), diarrhea (28%), and constipation (24%).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"most",
"common",
"treatment-emergent",
"adverse",
"events",
"(",
"TEAE",
")",
"of",
"any",
"grade",
",",
"regardless",
"of",
"attribution",
",",
"were",
"neutrophil",
"count",
"decrease",
"(",
"36",
"%",
")",
",",
"nausea",
"(",
"32",
"%",
")",
",",
"fatigue",
"(",
"32",
"%",
")",
",",
"diarrhea",
"(",
"28",
"%",
")",
",",
"and",
"constipation",
"(",
"24",
"%",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Two (12%) pts had TEAEs leading to parsaclisib discontinuation.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Two",
"(",
"12",
"%",
")",
"pts",
"had",
"TEAEs",
"leading",
"to",
"parsaclisib",
"discontinuation",
"."
]
}
] |
PMC10940855
|
Flow cytometric analyses were performed to detect human CD138 cells engrafted in the BM, peripheral blood, and vertebral bones; some samples were lost due to poor viability during processing and analysis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Flow",
"cytometric",
"analyses",
"were",
"performed",
"to",
"detect",
"human",
"CD138",
"cells",
"engrafted",
"in",
"the",
"BM",
",",
"peripheral",
"blood",
",",
"and",
"vertebral",
"bones",
";",
"some",
"samples",
"were",
"lost",
"due",
"to",
"poor",
"viability",
"during",
"processing",
"and",
"analysis",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.