PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11218145
The histograms report (Y-axis) the ratio (R) of the measurements obtained with Image Lab Software for (A) ERK 1/2 (Phospho-ERK/total ERK), (B) p38 (P-p38/total p38), and (C) BAX (BAX/β-Tubulin) relative to the controls (DMSO, the vehicle, shown as a dotted line) in MeT-5A, Mero-14, Mero-25, Ren, NCI-H28, and MSTO-211H cell lines (X-axis).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "histograms", "report", "(", "Y-axis", ")", "the", "ratio", "(", "R", ")", "of", "the", "measurements", "obtained", "with", "Image", "Lab", "Software", "for", "(", "A", ")", "ERK", "1/2", "(", "Phospho-ERK/total", "ERK", ")", ",", "(", "B", ")", "p38", "(", "P-p38/total", "p38", ")", ",", "and", "(", "C", ")", "BAX", "(", "BAX/β-Tubulin", ")", "relative", "to", "the", "controls", "(", "DMSO", ",", "the", "vehicle", ",", "shown", "as", "a", "dotted", "line", ")", "in", "MeT-5A", ",", "Mero-14", ",", "Mero-25", ",", "Ren", ",", "NCI-H28", ",", "and", "MSTO-211H", "cell", "lines", "(", "X-axis", ")", "." ] } ]
PMC10033453
Furthermore, pilot safety evaluations of VMG in immunocompetent, non-tumor-bearing mice showed an absence of toxicity with intranasal doses as high as 1e10 50% tissue culture infectious dose (TCID50)/kg.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "pilot", "safety", "evaluations", "of", "VMG", "in", "immunocompetent", ",", "non-tumor-bearing", "mice", "showed", "an", "absence", "of", "toxicity", "with", "intranasal", "doses", "as", "high", "as", "1e10", "50", "%", "tissue", "culture", "infectious", "dose", "(TCID50)/kg", "." ] } ]
PMC11659921
The prognostic value of these genes was illustrated through forest plots (Figure 1A,B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "prognostic", "value", "of", "these", "genes", "was", "illustrated", "through", "forest", "plots", "(", "Figure", "1A", ",", "B", ")", "." ] } ]
PMC11470999
In this study, we found that PF alleviates the inhibition of the PP2A catalytic subunit (PP2Ac) by CIP2A.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "study", ",", "we", "found", "that", "PF", "alleviates", "the", "inhibition", "of", "the", "PP2A", "catalytic", "subunit", "(", "PP2Ac", ")", "by", "CIP2A", "." ] } ]
PMC6034753
Although a number of interacting partners of Meq or apoptin have been identified, [9, 33, 37–40], it is still unclear whether Meq and apoptin proteins do directly interact.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "a", "number", "of", "interacting", "partners", "of", "Meq", "or", "apoptin", "have", "been", "identified", ",", "[", "9", ",", "33", ",", "37–40", "]", ",", "it", "is", "still", "unclear", "whether", "Meq", "and", "apoptin", "proteins", "do", "directly", "interact", "." ] } ]
PMC11673902
They achieved high throughput (>100 cells/s) and high purity (~91.8%) cell sorting to separate live cells from a mixture of fixed and live MCF-7 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "achieved", "high", "throughput", "(", ">", "100", "cells/s", ")", "and", "high", "purity", "(", "~91.8", "%", ")", "cell", "sorting", "to", "separate", "live", "cells", "from", "a", "mixture", "of", "fixed", "and", "live", "MCF-7", "cells", "." ] } ]
PMC11574271
Additionally, it was observed that has-miR-659-3p suppressed tumor growth, a phenomenon that was counteracted by the overexpression of RON.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "it", "was", "observed", "that", "has-miR-659", "-", "3p", "suppressed", "tumor", "growth", ",", "a", "phenomenon", "that", "was", "counteracted", "by", "the", "overexpression", "of", "RON", "." ] } ]
PMC11045125
Advantages of the model system we describe here (in which normal human cord blood B cells are infected with an ΔEBNA2 EBV mutant, and Myc over-expression is subsequently induced) in comparison to transgenic Myc and EBV gene over-expression models in mice include the use of human versus mouse B cells, the expression of Myc and EBV proteins at levels similar to those found in human BLs, and the study of viral genes/RNA in the context of the intact EBV genome (other than EBNA2 inactivation).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Advantages", "of", "the", "model", "system", "we", "describe", "here", "(", "in", "which", "normal", "human", "cord", "blood", "B", "cells", "are", "infected", "with", "an", "ΔEBNA2", "EBV", "mutant", ",", "and", "Myc", "over-expression", "is", "subsequently", "induced", ")", "in", "comparison", "to", "transgenic", "Myc", "and", "EBV", "gene", "over-expression", "models", "in", "mice", "include", "the", "use", "of", "human", "versus", "mouse", "B", "cells", ",", "the", "expression", "of", "Myc", "and", "EBV", "proteins", "at", "levels", "similar", "to", "those", "found", "in", "human", "BLs", ",", "and", "the", "study", "of", "viral", "genes/RNA", "in", "the", "context", "of", "the", "intact", "EBV", "genome", "(", "other", "than", "EBNA2", "inactivation", ")", "." ] } ]
PMC10344560
In systemic infection of Rhodotorula, the mortality rate of fungemia was as high as 14.4%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "systemic", "infection", "of", "Rhodotorula", ",", "the", "mortality", "rate", "of", "fungemia", "was", "as", "high", "as", "14.4", "%", "." ] } ]
PMC5363531
Serial photographs of the same scraped section were captured every 6 hours for 30 hours.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Serial", "photographs", "of", "the", "same", "scraped", "section", "were", "captured", "every", "6", "hours", "for", "30", "hours", "." ] } ]
PMC11714165
Osteosarcoma patients are usually associated with symptoms of bone loss and pathological fracture, which are closely related to disrupted bone homeostasis in the tumor environment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Osteosarcoma", "patients", "are", "usually", "associated", "with", "symptoms", "of", "bone", "loss", "and", "pathological", "fracture", ",", "which", "are", "closely", "related", "to", "disrupted", "bone", "homeostasis", "in", "the", "tumor", "environment", "." ] } ]
PMC9429973
Bleeding events and cardiac events were not observed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bleeding", "events", "and", "cardiac", "events", "were", "not", "observed", "." ] } ]
PMC9429973
Biochemical and functional evaluation of plasma FXI was done by western blotting and two coagulation assays (FXI:C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Biochemical", "and", "functional", "evaluation", "of", "plasma", "FXI", "was", "done", "by", "western", "blotting", "and", "two", "coagulation", "assays", "(", "FXI", ":", "C", ")", "." ] } ]
PMC7348793
To expand this cell line’s utility and to enable studies on mitochondrial DNA (mtDNA) transcription and replication, we determined the complete nucleotide sequence of its mitochondrial genome by Sanger sequencing.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "expand", "this", "cell", "line", "’s", "utility", "and", "to", "enable", "studies", "on", "mitochondrial", "DNA", "(", "mtDNA", ")", "transcription", "and", "replication", ",", "we", "determined", "the", "complete", "nucleotide", "sequence", "of", "its", "mitochondrial", "genome", "by", "Sanger", "sequencing", "." ] } ]
PMC11394386
In ovarian and breast cancer, for example, HOTAIR overexpression has been linked to resistance to cisplatin and doxorubicin through activation of the Wnt/β-catenin and PI3K/AKT pathways, by favoring overexpression of β-catenin and maintaining sustained signaling of PI3K/AKT/mTOR pathway effectors, respectively .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "ovarian", "and", "breast", "cancer", ",", "for", "example", ",", "HOTAIR", "overexpression", "has", "been", "linked", "to", "resistance", "to", "cisplatin", "and", "doxorubicin", "through", "activation", "of", "the", "Wnt/β-catenin", "and", "PI3K/AKT", "pathways", ",", "by", "favoring", "overexpression", "of", "β-catenin", "and", "maintaining", "sustained", "signaling", "of", "PI3K/AKT/mTOR", "pathway", "effectors", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11756937
The components were mixed together on the day of the freeze and were filter-sterilized.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "components", "were", "mixed", "together", "on", "the", "day", "of", "the", "freeze", "and", "were", "filter-sterilized", "." ] } ]
PMC11779605
The normalized data were then exported for bioinformatic analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "normalized", "data", "were", "then", "exported", "for", "bioinformatic", "analysis", "." ] } ]
PMC11095939
Data are presented as means ± SEM; n = 6.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "presented", "as", "means", "±", "SEM", ";", "n", "=", "6", "." ] } ]
PMC5574817
RT-qPCR was carried out using Bio-Rad CFX real time PCR system and iScript One-Step RT-PCR kit with SYBR Green (Bio-Rad Laboratories, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RT-qPCR", "was", "carried", "out", "using", "Bio-Rad", "CFX", "real", "time", "PCR", "system", "and", "iScript", "One-Step", "RT-PCR", "kit", "with", "SYBR", "Green", "(", "Bio-Rad", "Laboratories", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC9429973
If true the safety and rationality of prolonged MA treatment and, in particular, MT in NHL patients during the ongoing COVID-19 pandemic should be revised.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "If", "true", "the", "safety", "and", "rationality", "of", "prolonged", "MA", "treatment", "and", ",", "in", "particular", ",", "MT", "in", "NHL", "patients", "during", "the", "ongoing", "COVID-19", "pandemic", "should", "be", "revised", "." ] } ]
PMC10125312
AuNR-PEG cytotoxicity was analyzed at six different molar concentrations (0, 1, 2, 4, 6, and 8 nM) after 24 h of incubation by adding thiazolyl blue tetrazolium bromide (MTT, M2128, CAS 298-93-1, Sigma-Aldrich) to a final concentration of 0.5 mg/mL. Plates were incubated at 37 °C for 30 min.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "AuNR-PEG", "cytotoxicity", "was", "analyzed", "at", "six", "different", "molar", "concentrations", "(", "0", ",", "1", ",", "2", ",", "4", ",", "6", ",", "and", "8", "nM", ")", "after", "24", "h", "of", "incubation", "by", "adding", "thiazolyl", "blue", "tetrazolium", "bromide", "(", "MTT", ",", "M2128", ",", "CAS", "298", "-", "93", "-", "1", ",", "Sigma-Aldrich", ")", "to", "a", "final", "concentration", "of", "0.5", "mg/mL.", "Plates", "were", "incubated", "at", "37", "°", "C", "for", "30", "min", "." ] } ]
PMC11612315
Fig. 5Inhibition of CAP-induced calcium influx via direct interaction with TRPV1 via GLP-1 analogs and exendin 9–39 in HEK293T cells transfected with rat TRPV1 and CHO K1 cells expressing human TRPV1.a Sequence alignment, molecular weight, and function of GLP-1 analogs and exendin 9–39.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "5Inhibition", "of", "CAP-induced", "calcium", "influx", "via", "direct", "interaction", "with", "TRPV1", "via", "GLP-1", "analogs", "and", "exendin", "9–39", "in", "HEK293", "T", "cells", "transfected", "with", "rat", "TRPV1", "and", "CHO", "K1", "cells", "expressing", "human", "TRPV1.a", "Sequence", "alignment", ",", "molecular", "weight", ",", "and", "function", "of", "GLP-1", "analogs", "and", "exendin", "9–39", "." ] } ]
PMC9429973
CD47 blockade by magrolimab induces macrophage-mediated phagocytosis of tumor cells and is synergistic with azacitidine (AZA) in the upregulation of “eat me” signals.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CD47", "blockade", "by", "magrolimab", "induces", "macrophage-mediated", "phagocytosis", "of", "tumor", "cells", "and", "is", "synergistic", "with", "azacitidine", "(", "AZA", ")", "in", "the", "upregulation", "of", "“", "eat", "me", "”", "signals", "." ] } ]
PMC6312945
However, we do not know whether miR-101 and miR-345 have the same effect on human, thus we need to obtain further data in the clinic to verify our results.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "we", "do", "not", "know", "whether", "miR-101", "and", "miR-345", "have", "the", "same", "effect", "on", "human", ",", "thus", "we", "need", "to", "obtain", "further", "data", "in", "the", "clinic", "to", "verify", "our", "results", "." ] } ]
PMC8992508
These compounds were investigated for their inhibitory activity on the BCRP overexpressing MDCK II BCRP cell line by using the pheophorbide A and Hoechst 33342 assays.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "compounds", "were", "investigated", "for", "their", "inhibitory", "activity", "on", "the", "BCRP", "overexpressing", "MDCK", "II", "BCRP", "cell", "line", "by", "using", "the", "pheophorbide", "A", "and", "Hoechst", "33342", "assays", "." ] } ]
PMC9429973
Moreover, a response was detected in 25% (26/103 evaluated patients) of previously seronegative patients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "a", "response", "was", "detected", "in", "25", "%", "(", "26/103", "evaluated", "patients", ")", "of", "previously", "seronegative", "patients", "." ] } ]
PMC9080589
The transfected TPC-1 and BCPAP cells were washed twice with cold phosphate-buffered saline (PBS) and then re-suspended in 500 μl 1× binding buffer, followed by 20 μg ml Annexin V-FITC (KeyGENE Biotech) staining and 20 μg ml propidium iodide (PI; Sigma) incubation for 20 min at the room temperature in dark.
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "transfected", "TPC-1", "and", "BCPAP", "cells", "were", "washed", "twice", "with", "cold", "phosphate-buffered", "saline", "(", "PBS", ")", "and", "then", "re-suspended", "in", "500", "μl", "1", "×", "binding", "buffer", ",", "followed", "by", "20", "μg", "ml", "Annexin", "V-FITC", "(", "KeyGENE", "Biotech", ")", "staining", "and", "20", "μg", "ml", "propidium", "iodide", "(", "PI", ";", "Sigma", ")", "incubation", "for", "20", "min", "at", "the", "room", "temperature", "in", "dark", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: The purpose of this study was the investigation of the incidence of rs1045485 single nucleotide polymorphism (SNP), located in exon 10 of the Casp8 gene, rs13006529 SNP, located in exon 10 of the Casp10 gene and rs2234767 SNP, located in the promoter of FAS gene, in children and adolescents with ALL, compared to healthy individuals.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "The", "purpose", "of", "this", "study", "was", "the", "investigation", "of", "the", "incidence", "of", "rs1045485", "single", "nucleotide", "polymorphism", "(", "SNP", ")", ",", "located", "in", "exon", "10", "of", "the", "Casp8", "gene", ",", "rs13006529", "SNP", ",", "located", "in", "exon", "10", "of", "the", "Casp10", "gene", "and", "rs2234767", "SNP", ",", "located", "in", "the", "promoter", "of", "FAS", "gene", ",", "in", "children", "and", "adolescents", "with", "ALL", ",", "compared", "to", "healthy", "individuals", "." ] } ]
PMC9429973
PFS favored the IXA-POM-DEX arm (one-sided log rank test value = 4.6345, p=0.03134 [< p-value boundary of 0.058]), yielding a hazard ratio of 0.528 (upper 90% bound = 0.777).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PFS", "favored", "the", "IXA-POM-DEX", "arm", "(", "one-sided", "log", "rank", "test", "value", "=", "4.6345", ",", "p=0.03134", "[", "<", "p-value", "boundary", "of", "0.058", "]", ")", ",", "yielding", "a", "hazard", "ratio", "of", "0.528", "(", "upper", "90", "%", "bound", "=", "0.777", ")", "." ] } ]
PMC9429973
The cut-off for data collection was March 31, 2021.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cut-off", "for", "data", "collection", "was", "March", "31", ",", "2021", "." ] } ]
PMC11711063
Changes in proliferation and (D) in motility of HME‐hTert pre‐treated with vehicle or Bex + Carv for 48 h, before adding control or ZG16B‐enriched supernatants for 24 h. Gene ontology analysis highlighted the functions of ECM organization and cell motility affected positively by ZG16B, but negatively by Bex + Carv (Figure 3B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Changes", "in", "proliferation", "and", "(", "D", ")", "in", "motility", "of", "HME‐hTert", "pre‐treated", "with", "vehicle", "or", "Bex", "+", "Carv", "for", "48", "h", ",", "before", "adding", "control", "or", "ZG16B‐enriched", "supernatants", "for", "24", "h.", "Gene", "ontology", "analysis", "highlighted", "the", "functions", "of", "ECM", "organization", "and", "cell", "motility", "affected", "positively", "by", "ZG16B", ",", "but", "negatively", "by", "Bex", "+", "Carv", "(", "Figure", "3B", ")", "." ] } ]
PMC11411004
Consequently, there is a block in the cell cycle at G1/0 phase, thus affecting cell growth (Avello et al. 2022).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consequently", ",", "there", "is", "a", "block", "in", "the", "cell", "cycle", "at", "G1/0", "phase", ",", "thus", "affecting", "cell", "growth", "(", "Avello", "et", "al.", "2022", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: These cases expand the knowledge base of BPDCN treatment in pediatric pts.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "These", "cases", "expand", "the", "knowledge", "base", "of", "BPDCN", "treatment", "in", "pediatric", "pts", "." ] } ]
PMC11267036
Fig. 3D showed that fludarabine undid the functions of DHM in E-cadherin up-regulation and N-cadherin down-regulation, with p-STAT1/STAT1 and RIG-I levels falling (p < 0.01).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "3D", "showed", "that", "fludarabine", "undid", "the", "functions", "of", "DHM", "in", "E-cadherin", "up-regulation", "and", "N-cadherin", "down-regulation", ",", "with", "p-STAT1/STAT1", "and", "RIG-I", "levels", "falling", "(", "p", "<", "0.01", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: Ibr (420mg po daily) effects on anti-apoptotic proteins were evaluated by flow cytometry with samples from 4 previously untreated pts with CLL treated for 1 cycle (28 days).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "Ibr", "(", "420", "mg", "po", "daily", ")", "effects", "on", "anti-apoptotic", "proteins", "were", "evaluated", "by", "flow", "cytometry", "with", "samples", "from", "4", "previously", "untreated", "pts", "with", "CLL", "treated", "for", "1", "cycle", "(", "28", "days", ")", "." ] } ]
PMC7229095
Amino acids are detected (and reported in publications) as molar mass, so the amino acid concentration is calculated with molecular weightCDM4CHO (GE Healthcare, Björkgatan, Uppsala, Sweden), HyCell CHO (GE Healthcare, Björkgatan, Uppsala, Sweden), ActiPro (GE Healthcare, Björkgatan, Uppsala, Sweden), CD FortiCHO (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, US), Cellvento CHO-210 (Merck KGaA, Darmstadt, Germany), ExCell Advanced CHO (SAFC Bioscience, St, Louis, Mo, USA), PowerCHO 2 (Lonza, Verviers, Belgium)CDM1 is an earlier commercial CHO media.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Amino", "acids", "are", "detected", "(", "and", "reported", "in", "publications", ")", "as", "molar", "mass", ",", "so", "the", "amino", "acid", "concentration", "is", "calculated", "with", "molecular", "weightCDM4CHO", "(", "GE", "Healthcare", ",", "Björkgatan", ",", "Uppsala", ",", "Sweden", ")", ",", "HyCell", "CHO", "(", "GE", "Healthcare", ",", "Björkgatan", ",", "Uppsala", ",", "Sweden", ")", ",", "ActiPro", "(", "GE", "Healthcare", ",", "Björkgatan", ",", "Uppsala", ",", "Sweden", ")", ",", "CD", "FortiCHO", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ",", "Waltham", ",", "MA", ",", "US", ")", ",", "Cellvento", "CHO-210", "(", "Merck", "KGaA", ",", "Darmstadt", ",", "Germany", ")", ",", "ExCell", "Advanced", "CHO", "(", "SAFC", "Bioscience", ",", "St", ",", "Louis", ",", "Mo", ",", "USA", ")", ",", "PowerCHO", "2", "(", "Lonza", ",", "Verviers", ",", "Belgium)CDM1", "is", "an", "earlier", "commercial", "CHO", "media", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: To define the transcriptional signature of DH-TP53 and to find out if it was present in other patients who did not have biallelic inactivation of TP53.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "To", "define", "the", "transcriptional", "signature", "of", "DH-TP53", "and", "to", "find", "out", "if", "it", "was", "present", "in", "other", "patients", "who", "did", "not", "have", "biallelic", "inactivation", "of", "TP53", "." ] } ]
PMC11144200
To further validate the effect of LPS-RGD-Nb36-DOX combined with activated CD8 T cell therapy on primary tumors, we constructed a PDX (patient-derived tumor xenograft) mouse models of primary liver cancer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "validate", "the", "effect", "of", "LPS-RGD-Nb36-DOX", "combined", "with", "activated", "CD8", "T", "cell", "therapy", "on", "primary", "tumors", ",", "we", "constructed", "a", "PDX", "(", "patient-derived", "tumor", "xenograft", ")", "mouse", "models", "of", "primary", "liver", "cancer", "." ] } ]
PMC7369657
The 143B cells were seeded and cultured in six-well plates.
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "143B", "cells", "were", "seeded", "and", "cultured", "in", "six-well", "plates", "." ] } ]
PMC11098378
Completion of these models was performed by multiple cycles of manual rebuilding in the program Coot .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Completion", "of", "these", "models", "was", "performed", "by", "multiple", "cycles", "of", "manual", "rebuilding", "in", "the", "program", "Coot", "." ] } ]
PMC10850553
Each bar indicates the actual tag count in each specimen. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Each", "bar", "indicates", "the", "actual", "tag", "count", "in", "each", "specimen", ".", "(" ] } ]
PMC11357960
Data were expressed as mean ± 95%CI. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "were", "expressed", "as", "mean", "±", "95%CI", ".", "(" ] } ]
PMC10589262
Since there are only a few reported Golgi-related proteins [13–15], all possible candidates with commercially available antibodies were selected.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Since", "there", "are", "only", "a", "few", "reported", "Golgi-related", "proteins", "[", "13–15", "]", ",", "all", "possible", "candidates", "with", "commercially", "available", "antibodies", "were", "selected", "." ] } ]
PMC9429973
Emerging evidence has shown important roles of the bone marrow(BM) microenvironment in regulating haematopoiesis and immune balance.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Emerging", "evidence", "has", "shown", "important", "roles", "of", "the", "bone", "marrow(BM", ")", "microenvironment", "in", "regulating", "haematopoiesis", "and", "immune", "balance", "." ] } ]
PMC11335267
For the preparation of muscle lysates, the gastrocnemius muscles were readily dissected and immediately frozen in liquid nitrogen.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "the", "preparation", "of", "muscle", "lysates", ",", "the", "gastrocnemius", "muscles", "were", "readily", "dissected", "and", "immediately", "frozen", "in", "liquid", "nitrogen", "." ] } ]
PMC11629143
Mechanistically, acetylation‐mediated transcriptional activation involved heightened phosphorylation and activity of RNA polymerase II, enabling it to escape promoter‐proximal pausing at the transgene.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mechanistically", ",", "acetylation‐mediated", "transcriptional", "activation", "involved", "heightened", "phosphorylation", "and", "activity", "of", "RNA", "polymerase", "II", ",", "enabling", "it", "to", "escape", "promoter‐proximal", "pausing", "at", "the", "transgene", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: The National Cancer Institute conducted a retrospective analysis of the course of the disease on COVID-19 from March 2020 to October 2021.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "The", "National", "Cancer", "Institute", "conducted", "a", "retrospective", "analysis", "of", "the", "course", "of", "the", "disease", "on", "COVID-19", "from", "March", "2020", "to", "October", "2021", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: We employed smMIP-technology, which follows a hybridization-capture protocol for NGS library preparation to selectively enrich and amplify hundreds of genomic target loci covering 82 regions in 24 CH and AML-related genes in a single reaction.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "We", "employed", "smMIP-technology", ",", "which", "follows", "a", "hybridization-capture", "protocol", "for", "NGS", "library", "preparation", "to", "selectively", "enrich", "and", "amplify", "hundreds", "of", "genomic", "target", "loci", "covering", "82", "regions", "in", "24", "CH", "and", "AML-related", "genes", "in", "a", "single", "reaction", "." ] } ]
PMC9429973
Any-grade immune-mediated AEs occurred in 22 (28.6%) pts, most frequently hypothyroidism (10.4%), hyperglycemia (5.2%), and rash (5.2%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Any-grade", "immune-mediated", "AEs", "occurred", "in", "22", "(", "28.6", "%", ")", "pts", ",", "most", "frequently", "hypothyroidism", "(", "10.4", "%", ")", ",", "hyperglycemia", "(", "5.2", "%", ")", ",", "and", "rash", "(", "5.2", "%", ")", "." ] } ]
PMC11791203
For instance, Myint et al., focused on the anticancer activity of a methanol extract from Smallanthus sonchifolius against human hepatocellular carcinoma cells (IC50 = 58.2 ± 1.9 µg/mL) while Kamsani et al. demonstrated the cytotoxic effect of a methanol extract from Melastoma malabathricum L. leaves against the HT29 colon cancer cell line (IC50 approximately 100 µg/mL).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "instance", ",", "Myint", "et", "al.", ",", "focused", "on", "the", "anticancer", "activity", "of", "a", "methanol", "extract", "from", "Smallanthus", "sonchifolius", "against", "human", "hepatocellular", "carcinoma", "cells", "(", "IC50", "=", "58.2", "±", "1.9", "µg/mL", ")", "while", "Kamsani", "et", "al.", "demonstrated", "the", "cytotoxic", "effect", "of", "a", "methanol", "extract", "from", "Melastoma", "malabathricum", "L.", "leaves", "against", "the", "HT29", "colon", "cancer", "cell", "line", "(", "IC50", "approximately", "100", "µg/mL", ")", "." ] } ]
PMC11748618
Direction corresponds to the effect of the minor allele.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Direction", "corresponds", "to", "the", "effect", "of", "the", "minor", "allele", "." ] } ]
PMC11539788
The results of the transwell invasion assay revealed that RNF19A knockdown led to an enhanced cell invasion capacity (Fig. 3H-I).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "of", "the", "transwell", "invasion", "assay", "revealed", "that", "RNF19A", "knockdown", "led", "to", "an", "enhanced", "cell", "invasion", "capacity", "(", "Fig.", "3H-I", ")", "." ] } ]
PMC6450504
The spheroids were imaged at 10 µm Z-stack intervals starting from the apex of the spheroids using a 555 nm laser and 10x objective.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "spheroids", "were", "imaged", "at", "10", "µm", "Z-stack", "intervals", "starting", "from", "the", "apex", "of", "the", "spheroids", "using", "a", "555", "nm", "laser", "and", "10x", "objective", "." ] } ]
PMC11758416
However, the assay serves the purpose of testing ex vivo CD8 T cell cytotoxicity of a given subset subset/condition if antigen were to be encountered in vivo.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "assay", "serves", "the", "purpose", "of", "testing", "ex", "vivo", "CD8", "T", "cell", "cytotoxicity", "of", "a", "given", "subset", "subset/condition", "if", "antigen", "were", "to", "be", "encountered", "in", "vivo", "." ] } ]
PMC10840195
Relative Twist (B), β-catenin (C), GSK3β (D), TCF4 (E), Snail (F), and E-cadherin (G) expression to β-actin presented separately.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Relative", "Twist", "(", "B", ")", ",", "β-catenin", "(", "C", ")", ",", "GSK3β", "(", "D", ")", ",", "TCF4", "(", "E", ")", ",", "Snail", "(", "F", ")", ",", "and", "E-cadherin", "(", "G", ")", "expression", "to", "β-actin", "presented", "separately", "." ] } ]
PMC11462929
Informed consent: N/A. Registry and the Registration No. of the study/trial: N/A. Animal studies: N/A.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Informed", "consent", ":", "N/A.", "Registry", "and", "the", "Registration", "No.", "of", "the", "study/trial", ":", "N/A.", "Animal", "studies", ":", "N/A." ] } ]
PMC11507371
Unless stated otherwise, the presented data are expressed as the mean ± standard deviation or box–whisker plots, calculated from a minimum of three independent experimental replicates (n ≥ 3).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Unless", "stated", "otherwise", ",", "the", "presented", "data", "are", "expressed", "as", "the", "mean", "±", "standard", "deviation", "or", "box", "–", "whisker", "plots", ",", "calculated", "from", "a", "minimum", "of", "three", "independent", "experimental", "replicates", "(", "n", "≥", "3", ")", "." ] } ]
PMC10243817
After treatment for 6 or 24 hours, the cells were harvested to detect the mRNA and protein levels of MEX3B.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "treatment", "for", "6", "or", "24", "hours", ",", "the", "cells", "were", "harvested", "to", "detect", "the", "mRNA", "and", "protein", "levels", "of", "MEX3B", "." ] } ]
PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: Our study showed no significate influence of Mel mg/kg dose on clinical outcomes of allo-HCT in patients with AML and MDS receiving Flu/Mel RIC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "Our", "study", "showed", "no", "significate", "influence", "of", "Mel", "mg/kg", "dose", "on", "clinical", "outcomes", "of", "allo-HCT", "in", "patients", "with", "AML", "and", "MDS", "receiving", "Flu/Mel", "RIC", "." ] } ]
PMC10747160
Alternatively, SARS-CoV-2 (2019-nCoV) spike-neutralizing antibody, Rabbit Mab (SinoBiological Inc. Cat # 40592-R001, Beijing, China), was thawed on ice and diluted 47-fold in PBS to obtain a stock concentration of approximately 399 nM. Antibody was then serially diluted in at least 80 μL of PBS for the inhibition assay.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Alternatively", ",", "SARS-CoV-2", "(", "2019-nCoV", ")", "spike-neutralizing", "antibody", ",", "Rabbit", "Mab", "(", "SinoBiological", "Inc.", "Cat", "#", "40592-R001", ",", "Beijing", ",", "China", ")", ",", "was", "thawed", "on", "ice", "and", "diluted", "47-fold", "in", "PBS", "to", "obtain", "a", "stock", "concentration", "of", "approximately", "399", "nM.", "Antibody", "was", "then", "serially", "diluted", "in", "at", "least", "80", "μL", "of", "PBS", "for", "the", "inhibition", "assay", "." ] } ]
PMC11615828
n = 6 cells in (b) and 5 cells in (d), from 3 independent experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "n", "=", "6", "cells", "in", "(", "b", ")", "and", "5", "cells", "in", "(", "d", ")", ",", "from", "3", "independent", "experiments", "." ] } ]
PMC11461874
Data are shown as box-whisker plot (b) and means ± SEM (c).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "shown", "as", "box-whisker", "plot", "(", "b", ")", "and", "means", "±", "SEM", "(", "c", ")", "." ] } ]
PMC9111184
Fig. 2Second derivative of Amide I of Control and m-CA, ChA, RA, EZ treated cells in the spectral range 1700–1600 ​cm).Fig.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "2Second", "derivative", "of", "Amide", "I", "of", "Control", "and", "m-CA", ",", "ChA", ",", "RA", ",", "EZ", "treated", "cells", "in", "the", "spectral", "range", "1700–1600", "​cm).Fig", "." ] } ]
PMC11437637
A high BMI of EC patients was reported to be inversely correlated with CD8+T lymphocyte infiltration .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "high", "BMI", "of", "EC", "patients", "was", "reported", "to", "be", "inversely", "correlated", "with", "CD8+T", "lymphocyte", "infiltration", "." ] } ]
PMC11726183
Epidermal growth factor receptor (EGFR) is a membrane protein often targeted by anticancer drugs due to its function in cell proliferation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Epidermal", "growth", "factor", "receptor", "(", "EGFR", ")", "is", "a", "membrane", "protein", "often", "targeted", "by", "anticancer", "drugs", "due", "to", "its", "function", "in", "cell", "proliferation", "." ] } ]
PMC10502403
In the absence of TCR stimulation, the median basal OCR/basal ECAR ratio of NGMCs was similar to or higher than that of NE1-GMCs (NGMCs: 0.95 vs. NE1-GMCs: 0.65) (Figures 5B and S7B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "absence", "of", "TCR", "stimulation", ",", "the", "median", "basal", "OCR/basal", "ECAR", "ratio", "of", "NGMCs", "was", "similar", "to", "or", "higher", "than", "that", "of", "NE1-GMCs", "(", "NGMCs", ":", "0.95", "vs.", "NE1-GMCs", ":", "0.65", ")", "(", "Figures", "5B", "and", "S7B", ")", "." ] } ]
PMC11306019
As a result, it circulates in the blood mainly in conjugated forms, which might lose their vicinal diol moieties, diminishing the antagonistic activity (Almeida et al., 2018).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "a", "result", ",", "it", "circulates", "in", "the", "blood", "mainly", "in", "conjugated", "forms", ",", "which", "might", "lose", "their", "vicinal", "diol", "moieties", ",", "diminishing", "the", "antagonistic", "activity", "(", "Almeida", "et", "al.", ",", "2018", ")", "." ] } ]
PMC11726848
In turn, the different values of the number of DNA breaks after irradiation in the same doses may be associated with the ongoing repair processes during LDR irradiation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "turn", ",", "the", "different", "values", "of", "the", "number", "of", "DNA", "breaks", "after", "irradiation", "in", "the", "same", "doses", "may", "be", "associated", "with", "the", "ongoing", "repair", "processes", "during", "LDR", "irradiation", "." ] } ]
PMC7504302
BAP1 governs crucial cellular processes by regulating the expression of several target genes that control cell cycle progression, cellular proliferation and differentiation, Ca-signaling mediated apoptosis, ferroptosis, and energy metabolism .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "BAP1", "governs", "crucial", "cellular", "processes", "by", "regulating", "the", "expression", "of", "several", "target", "genes", "that", "control", "cell", "cycle", "progression", ",", "cellular", "proliferation", "and", "differentiation", ",", "Ca-signaling", "mediated", "apoptosis", ",", "ferroptosis", ",", "and", "energy", "metabolism", "." ] } ]
PMC11754094
After lengtiviral integration, the bulk cells were selected using Blasticidin (10 μg ml) for 2 days.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "lengtiviral", "integration", ",", "the", "bulk", "cells", "were", "selected", "using", "Blasticidin", "(", "10", "μg", "ml", ")", "for", "2", "days", "." ] } ]
PMC9429973
We also observed that ponatinib treated patients showed a reduced probability of reaching MR2, MMR and DMR responses compared to ponatinib naive patients at both 3 months and last follow up time points.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "also", "observed", "that", "ponatinib", "treated", "patients", "showed", "a", "reduced", "probability", "of", "reaching", "MR2", ",", "MMR", "and", "DMR", "responses", "compared", "to", "ponatinib", "naive", "patients", "at", "both", "3", "months", "and", "last", "follow", "up", "time", "points", "." ] } ]
PMC11258145
The diketo group exhibits keto-enol tautomerism, which can exist in different types of conformers depending on the environment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "diketo", "group", "exhibits", "keto-enol", "tautomerism", ",", "which", "can", "exist", "in", "different", "types", "of", "conformers", "depending", "on", "the", "environment", "." ] } ]
PMC11332076
We recently developed a system that forces membrane localization of the intracellular domain of tropomyosin receptor kinase B (iTrkB) by farnesylation (F-iTrkB).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "recently", "developed", "a", "system", "that", "forces", "membrane", "localization", "of", "the", "intracellular", "domain", "of", "tropomyosin", "receptor", "kinase", "B", "(", "iTrkB", ")", "by", "farnesylation", "(", "F-iTrkB", ")", "." ] } ]
PMC11317131
n = 3. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "n", "=", "3", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
After 12 wk of treatment, pts responding on parsaclisib could continue into an extension period.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "12", "wk", "of", "treatment", ",", "pts", "responding", "on", "parsaclisib", "could", "continue", "into", "an", "extension", "period", "." ] } ]
PMC11637276
Membranes were washed twice TBST (50 mM Tris HCl, 150 mM NaCl, and 0.5% (w/v) Tween 20) and incubated 1 h and 30 min with the primary antibody anti-human CD49b, anti-p38 MAPK, anti-phospho-p38 MAPK, and mouse anti-human GAPDH in TBST.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Membranes", "were", "washed", "twice", "TBST", "(", "50", "mM", "Tris", "HCl", ",", "150", "mM", "NaCl", ",", "and", "0.5", "%", "(", "w/v", ")", "Tween", "20", ")", "and", "incubated", "1", "h", "and", "30", "min", "with", "the", "primary", "antibody", "anti-human", "CD49b", ",", "anti-p38", "MAPK", ",", "anti-phospho-p38", "MAPK", ",", "and", "mouse", "anti-human", "GAPDH", "in", "TBST", "." ] } ]
PMC11697189
qPCR was performed with BlazeTaq™ SYBR Green qPCR Mix (Genecopoeia, Guangzhou, China) on a BIO-RAD PCR System.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "qPCR", "was", "performed", "with", "BlazeTaq", "™", "SYBR", "Green", "qPCR", "Mix", "(", "Genecopoeia", ",", "Guangzhou", ",", "China", ")", "on", "a", "BIO-RAD", "PCR", "System", "." ] } ]
PMC11665555
Notably, several targets upregulated in 5637GR were found to be restored to near parental levels when OXCT1 was knocked out (GR-OXCT1KO lines), supporting a regulatory relationship between OXCT1 expression and OVOL1 activity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Notably", ",", "several", "targets", "upregulated", "in", "5637GR", "were", "found", "to", "be", "restored", "to", "near", "parental", "levels", "when", "OXCT1", "was", "knocked", "out", "(", "GR-OXCT1KO", "lines", ")", ",", "supporting", "a", "regulatory", "relationship", "between", "OXCT1", "expression", "and", "OVOL1", "activity", "." ] } ]
PMC11676169
We hypothesized that NOTCH1 directly represses HR and indirectly modulates the rate of c-NHEJ through BCAT1 upregulation in order to promote cell survival in the presence of a genotoxic insult.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "hypothesized", "that", "NOTCH1", "directly", "represses", "HR", "and", "indirectly", "modulates", "the", "rate", "of", "c-NHEJ", "through", "BCAT1", "upregulation", "in", "order", "to", "promote", "cell", "survival", "in", "the", "presence", "of", "a", "genotoxic", "insult", "." ] } ]
PMC11764090
Future research should focus on mining more target genes and exploring the interaction between transcription factors, WRKY, and other proteins to understand the regulatory mechanism.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Future", "research", "should", "focus", "on", "mining", "more", "target", "genes", "and", "exploring", "the", "interaction", "between", "transcription", "factors", ",", "WRKY", ",", "and", "other", "proteins", "to", "understand", "the", "regulatory", "mechanism", "." ] } ]
PMC10808409
All other chemicals were of analytical grade and were used as received.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "other", "chemicals", "were", "of", "analytical", "grade", "and", "were", "used", "as", "received", "." ] } ]
PMC9429973
Secondary outcomes included: duration of treatment (DOT), overall survival (OS), overall response rate (ORR), & safety (discontinuations due to adverse events [AEs] were reported separately for each study).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Secondary", "outcomes", "included", ":", "duration", "of", "treatment", "(", "DOT", ")", ",", "overall", "survival", "(", "OS", ")", ",", "overall", "response", "rate", "(", "ORR", ")", ",", "&", "safety", "(", "discontinuations", "due", "to", "adverse", "events", "[", "AEs", "]", "were", "reported", "separately", "for", "each", "study", ")", "." ] } ]
PMC11757131
The 3-HIB was dissolved into a stock solution using PBS, which was then diluted according to the specific concentrations used in the experiment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "3-HIB", "was", "dissolved", "into", "a", "stock", "solution", "using", "PBS", ",", "which", "was", "then", "diluted", "according", "to", "the", "specific", "concentrations", "used", "in", "the", "experiment", "." ] } ]
PMC11754784
These experiments were repeated three times.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "experiments", "were", "repeated", "three", "times", "." ] } ]
PMC11604830
Twenty‐four hours post‐lipopolysaccharides(LPS) administration, PFCE‐NE (50 mmol protons/kg) was intravenously injected.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Twenty‐four", "hours", "post‐lipopolysaccharides(LPS", ")", "administration", ",", "PFCE‐NE", "(", "50", "mmol", "protons/kg", ")", "was", "intravenously", "injected", "." ] } ]
PMC6468656
We further dissected the expressional correlation between Aurora A and ghrelin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "further", "dissected", "the", "expressional", "correlation", "between", "Aurora", "A", "and", "ghrelin", "." ] } ]
PMC11806818
Apt/Au@PdMo signal amplification probe is prepared in advance, and HFAuNSs composite material and EpCAM aptamer are modified on the surface of glassy carbon electrode (GCE).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Apt/Au@PdMo", "signal", "amplification", "probe", "is", "prepared", "in", "advance", ",", "and", "HFAuNSs", "composite", "material", "and", "EpCAM", "aptamer", "are", "modified", "on", "the", "surface", "of", "glassy", "carbon", "electrode", "(", "GCE", ")", "." ] } ]
PMC11549612
This study introduces several novel insights into the field of KIRC research.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "study", "introduces", "several", "novel", "insights", "into", "the", "field", "of", "KIRC", "research", "." ] } ]
PMC9917080
It has been shown that in the T98G glioblastoma cell line, sorafenib at concentrations of 0–5 μM, does not induce significant cell death .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "has", "been", "shown", "that", "in", "the", "T98", "G", "glioblastoma", "cell", "line", ",", "sorafenib", "at", "concentrations", "of", "0–5", "μM", ",", "does", "not", "induce", "significant", "cell", "death", "." ] } ]
PMC11530949
There are a considerable number of hydroxyl (OH) groups in the structure, as shown by the strong peak in the 3431 cm-1 spot.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "are", "a", "considerable", "number", "of", "hydroxyl", "(", "OH", ")", "groups", "in", "the", "structure", ",", "as", "shown", "by", "the", "strong", "peak", "in", "the", "3431", "cm-1", "spot", "." ] } ]
PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: realMIND will provide further understanding and characterization of the R/R DLBCL patient journey with respect to treatment patterns, clinical and patient-reported outcomes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "realMIND", "will", "provide", "further", "understanding", "and", "characterization", "of", "the", "R/R", "DLBCL", "patient", "journey", "with", "respect", "to", "treatment", "patterns", ",", "clinical", "and", "patient-reported", "outcomes", "." ] } ]
PMC10993311
However, when these values were analyzed repeatedly, an effect of time on FG was found [F(2;146) = 37.12; p<0.001], with T1>T2 (p=0.035), T1>T3 (p<0.001).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "when", "these", "values", "were", "analyzed", "repeatedly", ",", "an", "effect", "of", "time", "on", "FG", "was", "found", "[", "F(2;146", ")", "=", "37.12", ";", "p<0.001", "]", ",", "with", "T1>T2", "(", "p=0.035", ")", ",", "T1>T3", "(", "p<0.001", ")", "." ] } ]
PMC10606998
To assess the differences between the groups (with or without SPIONs), the Mann–Whitney test was used.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "assess", "the", "differences", "between", "the", "groups", "(", "with", "or", "without", "SPIONs", ")", ",", "the", "Mann", "–", "Whitney", "test", "was", "used", "." ] } ]
PMC8750422
These results suggest that GPR87 plays an oncogenic role in lung cancer progression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "suggest", "that", "GPR87", "plays", "an", "oncogenic", "role", "in", "lung", "cancer", "progression", "." ] } ]
PMC10820104
Fr.
[ { "tags": [ "O", "O" ], "tokens": [ "Fr", "." ] } ]
PMC7338939
Based on Equation (1), injection of DAPT increases the tumor size if R(u(t)) is bigger than CK(u(t)), and it decreases the tumor size if CK(u(t)) is bigger than R(u(t)).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Based", "on", "Equation", "(", "1", ")", ",", "injection", "of", "DAPT", "increases", "the", "tumor", "size", "if", "R(u(t", ")", ")", "is", "bigger", "than", "CK(u(t", ")", ")", ",", "and", "it", "decreases", "the", "tumor", "size", "if", "CK(u(t", ")", ")", "is", "bigger", "than", "R(u(t", ")", ")", "." ] } ]
PMC11714165
The bone‐targeted peptide D‐NBD‐F was synthesized by a similar procedure.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "bone‐targeted", "peptide", "D‐NBD‐F", "was", "synthesized", "by", "a", "similar", "procedure", "." ] } ]
PMC11708541
The antioxidant and antibacterial activities of the complexes were investigated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "antioxidant", "and", "antibacterial", "activities", "of", "the", "complexes", "were", "investigated", "." ] } ]
PMC2193049
This latter construct, termed pGFP/Ub, served as vector for all constructs described below.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "latter", "construct", ",", "termed", "pGFP/Ub", ",", "served", "as", "vector", "for", "all", "constructs", "described", "below", "." ] } ]
PMC4816271
The mean fluorescence intensity of each variant fused to the non-functional iCasp9 is slightly greater than the corresponding non-optimized receptor linked to a functional iCasp9, suggesting highly expressing cells may be lost due to inappropriate, non-specific activation of the iCasp9 (Fig 4B and 4C). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "mean", "fluorescence", "intensity", "of", "each", "variant", "fused", "to", "the", "non-functional", "iCasp9", "is", "slightly", "greater", "than", "the", "corresponding", "non-optimized", "receptor", "linked", "to", "a", "functional", "iCasp9", ",", "suggesting", "highly", "expressing", "cells", "may", "be", "lost", "due", "to", "inappropriate", ",", "non-specific", "activation", "of", "the", "iCasp9", "(", "Fig", "4B", "and", "4C", ")", ".", "(" ] } ]