Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11224020
These experiments indicate that both CCR7 expression and cell motility respond to precise cell shape changes, suggesting that these events might be mechanistically coupled.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "experiments", "indicate", "that", "both", "CCR7", "expression", "and", "cell", "motility", "respond", "to", "precise", "cell", "shape", "changes", ",", "suggesting", "that", "these", "events", "might", "be", "mechanistically", "coupled", "." ] } ]
PMC11656657
As detailed in the heat-map, in both in vitro and in vivo models, the 143B tumor showed a higher production of G-CSF (for in vitro model: 555.55 pg/ml ± 0.34 pg/ml; and in vivo model: 3917.96 pg/ml ± 992.19 pg/ml) and CXCL8 (for in vitro model: 2560.42 pg/ml ± 26.15 pg/ml; and in vivo model: 3633.04 pg/ml ± 1951.73 pg/ml), as compared the other sarcoma cell lines, this finding supporting the potential involvement of these cytokines in murine MDSCs expansion (Fig. 5D-E).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "detailed", "in", "the", "heat-map", ",", "in", "both", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "models", ",", "the", "143B", "tumor", "showed", "a", "higher", "production", "of", "G-CSF", "(", "for", "in", "vitro", "model", ":", "555.55", "pg/ml", "±", "0.34", "pg/ml", ";", "and", "in", "vivo", "model", ":", "3917.96", "pg/ml", "±", "992.19", "pg/ml", ")", "and", "CXCL8", "(", "for", "in", "vitro", "model", ":", "2560.42", "pg/ml", "±", "26.15", "pg/ml", ";", "and", "in", "vivo", "model", ":", "3633.04", "pg/ml", "±", "1951.73", "pg/ml", ")", ",", "as", "compared", "the", "other", "sarcoma", "cell", "lines", ",", "this", "finding", "supporting", "the", "potential", "involvement", "of", "these", "cytokines", "in", "murine", "MDSCs", "expansion", "(", "Fig.", "5D-E", ")", "." ] } ]
PMC10165258
Photographs of droplets doing the steps shown in (c).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Photographs", "of", "droplets", "doing", "the", "steps", "shown", "in", "(", "c", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Summary/Conclusion: Our research revealed the most important predictors of mortality in patients with blood diseases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Summary/Conclusion", ":", "Our", "research", "revealed", "the", "most", "important", "predictors", "of", "mortality", "in", "patients", "with", "blood", "diseases", "." ] } ]
PMC9429973
Interim PET (PET2) was performed at 15.5 ±3 days (range, 5-26) after the 2-3 cycle of treatment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interim", "PET", "(", "PET2", ")", "was", "performed", "at", "15.5", "±3", "days", "(", "range", ",", "5", "-", "26", ")", "after", "the", "2", "-", "3", "cycle", "of", "treatment", "." ] } ]
PMC11411131
The specificity of the MeHg sensor, among other electrophiles, was then addressed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "specificity", "of", "the", "MeHg", "sensor", ",", "among", "other", "electrophiles", ",", "was", "then", "addressed", "." ] } ]
PMC7823217
Liver cancer has a poor prognosis owing to delayed diagnosis and thus limited treatment options.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Liver", "cancer", "has", "a", "poor", "prognosis", "owing", "to", "delayed", "diagnosis", "and", "thus", "limited", "treatment", "options", "." ] } ]
PMC10452486
These diversified functions in normal cells and malignant cells merit extensive investigation, which may shed light on organ metastasis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "diversified", "functions", "in", "normal", "cells", "and", "malignant", "cells", "merit", "extensive", "investigation", ",", "which", "may", "shed", "light", "on", "organ", "metastasis", "." ] } ]
PMC8708099
To each well, 50 µL of a serum-free medium and 50 µL of MTT Reagent were added, and the plates were incubated at 37 °C for 3 h. After that time, 150 µL of MTT solvent was added to each well, and plates were incubated on a shaker at 37 °C in the dark.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "each", "well", ",", "50", "µL", "of", "a", "serum-free", "medium", "and", "50", "µL", "of", "MTT", "Reagent", "were", "added", ",", "and", "the", "plates", "were", "incubated", "at", "37", "°", "C", "for", "3", "h.", "After", "that", "time", ",", "150", "µL", "of", "MTT", "solvent", "was", "added", "to", "each", "well", ",", "and", "plates", "were", "incubated", "on", "a", "shaker", "at", "37", "°", "C", "in", "the", "dark", "." ] } ]
PMC11785489
pp65 56-mer: RLKAESTVAPEEDTDEDSDNEIHNPAVFTWPPWQAGILARNLVPMVATVQSGARA* MART-1 56-mer: MPREDAHFIYGYPKKGHGHSYTTAEEAAGIGILTVILGVLLLIGCWYCRRRNGYRA All antibodies were purchased from BioLegend and were used at 1 μL per million cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "pp65", "56-mer", ":", "RLKAESTVAPEEDTDEDSDNEIHNPAVFTWPPWQAGILARNLVPMVATVQSGARA", "*", "MART-1", "56-mer", ":", "MPREDAHFIYGYPKKGHGHSYTTAEEAAGIGILTVILGVLLLIGCWYCRRRNGYRA", "All", "antibodies", "were", "purchased", "from", "BioLegend", "and", "were", "used", "at", "1", "μL", "per", "million", "cells", "." ] } ]
PMC11763111
These findings underscore the potential of the Hu-PBL-SCID model as an effective platform for evaluating universal CAR-T-cell therapy in vivo.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "findings", "underscore", "the", "potential", "of", "the", "Hu-PBL-SCID", "model", "as", "an", "effective", "platform", "for", "evaluating", "universal", "CAR-T-cell", "therapy", "in", "vivo", "." ] } ]
PMC5600151
In vitro assays showed that there was an increase in cytotoxicity in MCF7/ADR cells when DOX PAMAM-HA was used in combination with MVP-siRNA, indicating the chemosensitization from the downregulation of MVP protein and an enhanced effect of DOX when associated in the dendrimer system.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "vitro", "assays", "showed", "that", "there", "was", "an", "increase", "in", "cytotoxicity", "in", "MCF7/ADR", "cells", "when", "DOX", "PAMAM-HA", "was", "used", "in", "combination", "with", "MVP-siRNA", ",", "indicating", "the", "chemosensitization", "from", "the", "downregulation", "of", "MVP", "protein", "and", "an", "enhanced", "effect", "of", "DOX", "when", "associated", "in", "the", "dendrimer", "system", "." ] } ]
PMC9268620
This study reports the effect of damnacanthal and nordamnacanthal (Figure 1) treatment at a cellular level and the ultrastructural changes that happen in T-lymphoblastic leukemia (CEM-SS) cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "study", "reports", "the", "effect", "of", "damnacanthal", "and", "nordamnacanthal", "(", "Figure", "1", ")", "treatment", "at", "a", "cellular", "level", "and", "the", "ultrastructural", "changes", "that", "happen", "in", "T-lymphoblastic", "leukemia", "(", "CEM-SS", ")", "cells", "." ] } ]
PMC8984067
The flow cytometric analysis revealed that the EpCAM expression rate of this cell line was 51.5%, as shown in Figure 10.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "flow", "cytometric", "analysis", "revealed", "that", "the", "EpCAM", "expression", "rate", "of", "this", "cell", "line", "was", "51.5", "%", ",", "as", "shown", "in", "Figure", "10", "." ] } ]
PMC11638288
Additionally, the study found that immature bone marrow-derived dendritic cells (imBM-DCs) and immature DCs from the skin express the NKp46/NCR1 ligand, which is downregulated upon imBM-DC maturation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "the", "study", "found", "that", "immature", "bone", "marrow-derived", "dendritic", "cells", "(", "imBM-DCs", ")", "and", "immature", "DCs", "from", "the", "skin", "express", "the", "NKp46/NCR1", "ligand", ",", "which", "is", "downregulated", "upon", "imBM-DC", "maturation", "." ] } ]
PMC9250505
Concomitantly, CAOV2 cells treated with NPB and Olaparib marginally increased cell populations in the G1-phase along with reduced G2M-phase compared to cells treated with Ola (Supplementary Fig. 4C).
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Concomitantly", ",", "CAOV2", "cells", "treated", "with", "NPB", "and", "Olaparib", "marginally", "increased", "cell", "populations", "in", "the", "G1-phase", "along", "with", "reduced", "G2M-phase", "compared", "to", "cells", "treated", "with", "Ola", "(", "Supplementary", "Fig.", "4C", ")", "." ] } ]
PMC11748335
L H3K27me3 modification near the IGF2BP1 gene in different Roadmap samples.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "L", "H3K27me3", "modification", "near", "the", "IGF2BP1", "gene", "in", "different", "Roadmap", "samples", "." ] } ]
PMC9532503
Manganese is the key ingredient shown to influence antibody fucosylation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Manganese", "is", "the", "key", "ingredient", "shown", "to", "influence", "antibody", "fucosylation", "." ] } ]
PMC11509224
The molecule monamphilectine A (138, Figure 13) is a diterpenoid β-lactam alkaloid generated by Hymeniacidon sp. .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "molecule", "monamphilectine", "A", "(", "138", ",", "Figure", "13", ")", "is", "a", "diterpenoid", "β-lactam", "alkaloid", "generated", "by", "Hymeniacidon", "sp.", "." ] } ]
PMC8481254
Scale bars: 200 μm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bars", ":", "200", "μm", "." ] } ]
PMC11653533
VLC = Vacuum liquid chromatography; SGCC = Silica Gel Column chromatography; SGDCC = Silica Gel Dry Column Chromatography; PC = Paper Chromatography; TLC = Thin Layer Chromatography; HPLC = High-performance Liquid Chromatography; Sp-HPLC = Semi preparative High-performance Liquid Chromatography; HR-ESI-MS = High-resolution electrospray ionisation mass spectrometry; GC–MS = Gas Chromatography Mass Spectrometry; LC–MS = Liquid chromatography–mass spectrometry; GC-EIMS = Gas chromatography-electron ionization mass spectrometry; HR-FAB-MS = High resolution fast atom bombardment mass spectrometry; UV–Vis = Ultraviolet–visible spectroscopy; IR = Infrared spectroscopy; FTIR = Fourier-transform infrared spectroscopy; 1H–1H COSY = Correlation Spectroscopy; NOESY = Nuclear Overhauser enhancement exchange spectroscopy; HMBC = Heteronuclear Multiple Bond Correlation Spectroscopy; ROESY = Rotating Frame Overhauser Enhancement Spectroscopy; HSQC = Heteronuclear single quantum coherence spectroscopy; XRD = X-ray diffraction analysis; DEPT = Distortionless enhancement by polarization transfer; SPME = Solid Phase Microextraction; DAD = Diode Array Detector; PDA = Photodiode Array Absorbance; Various chemicals, especially flavonoids, terpenes, sterols, and organic acids, have been isolated from those species by different methods.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "VLC", "=", "Vacuum", "liquid", "chromatography", ";", "SGCC", "=", "Silica", "Gel", "Column", "chromatography", ";", "SGDCC", "=", "Silica", "Gel", "Dry", "Column", "Chromatography", ";", "PC", "=", "Paper", "Chromatography", ";", "TLC", "=", "Thin", "Layer", "Chromatography", ";", "HPLC", "=", "High-performance", "Liquid", "Chromatography", ";", "Sp-HPLC", "=", "Semi", "preparative", "High-performance", "Liquid", "Chromatography", ";", "HR-ESI-MS", "=", "High-resolution", "electrospray", "ionisation", "mass", "spectrometry", ";", "GC", "–", "MS", "=", "Gas", "Chromatography", "Mass", "Spectrometry", ";", "LC", "–", "MS", "=", "Liquid", "chromatography", "–", "mass", "spectrometry", ";", "GC-EIMS", "=", "Gas", "chromatography-electron", "ionization", "mass", "spectrometry", ";", "HR-FAB-MS", "=", "High", "resolution", "fast", "atom", "bombardment", "mass", "spectrometry", ";", "UV", "–", "Vis", "=", "Ultraviolet", "–", "visible", "spectroscopy", ";", "IR", "=", "Infrared", "spectroscopy", ";", "FTIR", "=", "Fourier-transform", "infrared", "spectroscopy", ";", "1H–1H", "COSY", "=", "Correlation", "Spectroscopy", ";", "NOESY", "=", "Nuclear", "Overhauser", "enhancement", "exchange", "spectroscopy", ";", "HMBC", "=", "Heteronuclear", "Multiple", "Bond", "Correlation", "Spectroscopy", ";", "ROESY", "=", "Rotating", "Frame", "Overhauser", "Enhancement", "Spectroscopy", ";", "HSQC", "=", "Heteronuclear", "single", "quantum", "coherence", "spectroscopy", ";", "XRD", "=", "X-ray", "diffraction", "analysis", ";", "DEPT", "=", "Distortionless", "enhancement", "by", "polarization", "transfer", ";", "SPME", "=", "Solid", "Phase", "Microextraction", ";", "DAD", "=", "Diode", "Array", "Detector", ";", "PDA", "=", "Photodiode", "Array", "Absorbance", ";", "Various", "chemicals", ",", "especially", "flavonoids", ",", "terpenes", ",", "sterols", ",", "and", "organic", "acids", ",", "have", "been", "isolated", "from", "those", "species", "by", "different", "methods", "." ] } ]
PMC11021472
The postulated functional mechanism of the ZDHHC11 transcripts in regulating growth of BL was to ensure high levels of MYB by binding to miR-150.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "postulated", "functional", "mechanism", "of", "the", "ZDHHC11", "transcripts", "in", "regulating", "growth", "of", "BL", "was", "to", "ensure", "high", "levels", "of", "MYB", "by", "binding", "to", "miR-150", "." ] } ]
PMC11665555
The top 10 differentially regulated genes were validated by quantitative PCR (qPCR) (Supplemental Table 4).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "top", "10", "differentially", "regulated", "genes", "were", "validated", "by", "quantitative", "PCR", "(", "qPCR", ")", "(", "Supplemental", "Table", "4", ")", "." ] } ]
PMC11612626
Error bars in each figure represent the relative SEM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Error", "bars", "in", "each", "figure", "represent", "the", "relative", "SEM", "." ] } ]
PMC10747160
Griffithsin protein was serially diluted in at least 80 μL of PBS for the inhibition assay.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Griffithsin", "protein", "was", "serially", "diluted", "in", "at", "least", "80", "μL", "of", "PBS", "for", "the", "inhibition", "assay", "." ] } ]
PMC11658074
AdipoQ in AT-EVs may have anti-inflammatory and protective effects in response to UVB exposure.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "AdipoQ", "in", "AT-EVs", "may", "have", "anti-inflammatory", "and", "protective", "effects", "in", "response", "to", "UVB", "exposure", "." ] } ]
PMC11675244
With the later discoveries that underpinned Wnt, a stimulating link with the cell cycle had been established because, through β-catenin stabilization, it influences the transcription and expression of key regulatory genes like cyclin D1 and c-myc, essential for the G1/S transition in the cell cycle .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "With", "the", "later", "discoveries", "that", "underpinned", "Wnt", ",", "a", "stimulating", "link", "with", "the", "cell", "cycle", "had", "been", "established", "because", ",", "through", "β-catenin", "stabilization", ",", "it", "influences", "the", "transcription", "and", "expression", "of", "key", "regulatory", "genes", "like", "cyclin", "D1", "and", "c-myc", ",", "essential", "for", "the", "G1/S", "transition", "in", "the", "cell", "cycle", "." ] } ]
PMC10969097
They also created a nude mouse xenograft model (BALB/c) inoculating HepG2 and Bel-7404 cells to evaluate the effects in vivo.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "also", "created", "a", "nude", "mouse", "xenograft", "model", "(", "BALB/c", ")", "inoculating", "HepG2", "and", "Bel-7404", "cells", "to", "evaluate", "the", "effects", "in", "vivo", "." ] } ]
PMC6190245
Cell viability was quantified by the MTT assay and the results revealed that F. gummosa exerts cytotoxicity activity in this cell line.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "viability", "was", "quantified", "by", "the", "MTT", "assay", "and", "the", "results", "revealed", "that", "F.", "gummosa", "exerts", "cytotoxicity", "activity", "in", "this", "cell", "line", "." ] } ]
PMC11628309
The graphs display the number of articles published up to the end of 2023.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "graphs", "display", "the", "number", "of", "articles", "published", "up", "to", "the", "end", "of", "2023", "." ] } ]
PMC11746948
Then, the intraperitoneal injection of 2-BP or 2-BP plus Lip-1 was continued for one week.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Then", ",", "the", "intraperitoneal", "injection", "of", "2-BP", "or", "2-BP", "plus", "Lip-1", "was", "continued", "for", "one", "week", "." ] } ]
PMC11476004
These cells have unlimited proliferative potential, are self-sufficient in terms of growth factors, and are not susceptible to either apoptotic or antiproliferative factors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "cells", "have", "unlimited", "proliferative", "potential", ",", "are", "self-sufficient", "in", "terms", "of", "growth", "factors", ",", "and", "are", "not", "susceptible", "to", "either", "apoptotic", "or", "antiproliferative", "factors", "." ] } ]
PMC11733919
Representative dot plots and microphotographs are shown.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Representative", "dot", "plots", "and", "microphotographs", "are", "shown", "." ] } ]
PMC11791478
In vitro coagulation assays confirmed that 25A3 does not interfere with the clotting cascade; even at a concentration of 100 nmol/L, it did not affect the activation of coagulation factor X or thrombin generation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "vitro", "coagulation", "assays", "confirmed", "that", "25A3", "does", "not", "interfere", "with", "the", "clotting", "cascade", ";", "even", "at", "a", "concentration", "of", "100", "nmol/L", ",", "it", "did", "not", "affect", "the", "activation", "of", "coagulation", "factor", "X", "or", "thrombin", "generation", "." ] } ]
PMC10529414
Finally, slide mounting was carried out with 7 µL of ProLong™ Gold Antifade Mountant mounting medium with DAPI (Invitrogen-USA, P36931).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Finally", ",", "slide", "mounting", "was", "carried", "out", "with", "7", "µL", "of", "ProLong", "™", "Gold", "Antifade", "Mountant", "mounting", "medium", "with", "DAPI", "(", "Invitrogen-USA", ",", "P36931", ")", "." ] } ]
PMC11078693
Alternatives: Other commercial kits are also available for antibody conjugation, and commercially available primary antibodies already conjugated to fluorophores can also be used.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Alternatives", ":", "Other", "commercial", "kits", "are", "also", "available", "for", "antibody", "conjugation", ",", "and", "commercially", "available", "primary", "antibodies", "already", "conjugated", "to", "fluorophores", "can", "also", "be", "used", "." ] } ]
PMC11653552
Consistent with these results, elevated levels of miR-590-3p were found in various MM cell lines and transgenic mouse models (Vk*Che-1 and Vk*Myc) compared to control ones.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consistent", "with", "these", "results", ",", "elevated", "levels", "of", "miR-590", "-", "3p", "were", "found", "in", "various", "MM", "cell", "lines", "and", "transgenic", "mouse", "models", "(", "Vk*Che-1", "and", "Vk*Myc", ")", "compared", "to", "control", "ones", "." ] } ]
PMC9046263
Analysis of CpG island methylation frequency (via ANOVA with multiple comparisons correction) in each cell line demonstrated that A172 cells had significantly lower mean number of CpG islands relative to M059J cells (MD = − 0.2, p < 0.0001) and H4 cells (MD = − 0.3, p < 0.0001).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Analysis", "of", "CpG", "island", "methylation", "frequency", "(", "via", "ANOVA", "with", "multiple", "comparisons", "correction", ")", "in", "each", "cell", "line", "demonstrated", "that", "A172", "cells", "had", "significantly", "lower", "mean", "number", "of", "CpG", "islands", "relative", "to", "M059J", "cells", "(", "MD", "=", "−", "0.2", ",", "p", "<", "0.0001", ")", "and", "H4", "cells", "(", "MD", "=", "−", "0.3", ",", "p", "<", "0.0001", ")", "." ] } ]
PMC11721096
To optimize the ligand fishing procedure utilizing CHO@hTYR, several parameters were evaluated, including the number of CHO cells, the incubation time, the incubation buffer, the desorption time, and the desorption solvent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "optimize", "the", "ligand", "fishing", "procedure", "utilizing", "CHO@hTYR", ",", "several", "parameters", "were", "evaluated", ",", "including", "the", "number", "of", "CHO", "cells", ",", "the", "incubation", "time", ",", "the", "incubation", "buffer", ",", "the", "desorption", "time", ",", "and", "the", "desorption", "solvent", "." ] } ]
PMC11740508
Data analysis used FlowJo (BD Biosciences).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "analysis", "used", "FlowJo", "(", "BD", "Biosciences", ")", "." ] } ]
PMC9096373
Tumor metabolism (B,C) in the APA + RT group was significantly lower compared with the control, RT, and DDPs + RT groups (F=15.25, 15.11, and 7.73, respectively, P<0.05).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Tumor", "metabolism", "(", "B", ",", "C", ")", "in", "the", "APA", "+", "RT", "group", "was", "significantly", "lower", "compared", "with", "the", "control", ",", "RT", ",", "and", "DDPs", "+", "RT", "groups", "(", "F=15.25", ",", "15.11", ",", "and", "7.73", ",", "respectively", ",", "P<0.05", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Bariatric surgery was associated with inferior EFS (10-year: 31% vs 69%; P=0.009) and FFS (10-year: 16% vs 54%; P<0.0001) compared with control, with a trend for worse OS (10-year: 65% vs 85%; P=0.09) (Figure 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bariatric", "surgery", "was", "associated", "with", "inferior", "EFS", "(", "10-year", ":", "31", "%", "vs", "69", "%", ";", "P=0.009", ")", "and", "FFS", "(", "10-year", ":", "16", "%", "vs", "54", "%", ";", "P<0.0001", ")", "compared", "with", "control", ",", "with", "a", "trend", "for", "worse", "OS", "(", "10-year", ":", "65", "%", "vs", "85", "%", ";", "P=0.09", ")", "(", "Figure", "1", ")", "." ] } ]
PMC9429973
S. Rontauroli, E. Bianchi, L. Tavernari, M. Dall’Ora, G. Grisendi, M. Mirabile, S. Sartini, E. Genovese, C. Carretta, S. Mallia, S. Parenti, L. Fabbiani, N. Bartalucci, L. Losi, M. Dominici, A. M. Vannucchi, R. Manfredini Centre for Regenerative Medicine, Life Sciences Department, University of Modena and Reggio Emilia, Modena; Rigenerand S.R.L., Medolla (MO); Division of Oncology, Laboratory of Cellular Therapy, Department of Medical and Surgical Sciences of Children & Adults; Department of Medical and Surgical Sciences of Children & Adults, Pathology Unit, University of Modena and Reggio Emilia, Modena; Department of Experimental and Clinical Medicine, and Center Research and Innovation of Myeloproliferative Neoplasms (CRIMM), University of Florence, Careggi University Hospital, Florence; Department of Life Sciences, Pathology Unit, University of Modena and Reggio Emilia, Modena, Italy Background: Primary myelofibrosis (PMF) is a stem cell disorder belonging to Philadelphia-negative myeloproliferative neoplasms (MPNs).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "S.", "Rontauroli", ",", "E.", "Bianchi", ",", "L.", "Tavernari", ",", "M.", "Dall’Ora", ",", "G.", "Grisendi", ",", "M.", "Mirabile", ",", "S.", "Sartini", ",", "E.", "Genovese", ",", "C.", "Carretta", ",", "S.", "Mallia", ",", "S.", "Parenti", ",", "L.", "Fabbiani", ",", "N.", "Bartalucci", ",", "L.", "Losi", ",", "M.", "Dominici", ",", "A.", "M.", "Vannucchi", ",", "R.", "Manfredini", "Centre", "for", "Regenerative", "Medicine", ",", "Life", "Sciences", "Department", ",", "University", "of", "Modena", "and", "Reggio", "Emilia", ",", "Modena", ";", "Rigenerand", "S.R.L.", ",", "Medolla", "(", "MO", ")", ";", "Division", "of", "Oncology", ",", "Laboratory", "of", "Cellular", "Therapy", ",", "Department", "of", "Medical", "and", "Surgical", "Sciences", "of", "Children", "&", "Adults", ";", "Department", "of", "Medical", "and", "Surgical", "Sciences", "of", "Children", "&", "Adults", ",", "Pathology", "Unit", ",", "University", "of", "Modena", "and", "Reggio", "Emilia", ",", "Modena", ";", "Department", "of", "Experimental", "and", "Clinical", "Medicine", ",", "and", "Center", "Research", "and", "Innovation", "of", "Myeloproliferative", "Neoplasms", "(", "CRIMM", ")", ",", "University", "of", "Florence", ",", "Careggi", "University", "Hospital", ",", "Florence", ";", "Department", "of", "Life", "Sciences", ",", "Pathology", "Unit", ",", "University", "of", "Modena", "and", "Reggio", "Emilia", ",", "Modena", ",", "Italy", "Background", ":", "Primary", "myelofibrosis", "(", "PMF", ")", "is", "a", "stem", "cell", "disorder", "belonging", "to", "Philadelphia-negative", "myeloproliferative", "neoplasms", "(", "MPNs", ")", "." ] } ]
PMC9429973
exCMPs, which can be produced in large quantities in polyvinyl-alcohol (PVA)-based cultures (Wilkinson et al., Nature 2019), had lower CXCR4 expression, different integrin expression patterns, better cytokine responsiveness and mitogenic potential, as well as higher expression of platelet-related genes compared to fresh CMP.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "exCMPs", ",", "which", "can", "be", "produced", "in", "large", "quantities", "in", "polyvinyl-alcohol", "(PVA)-based", "cultures", "(", "Wilkinson", "et", "al.", ",", "Nature", "2019", ")", ",", "had", "lower", "CXCR4", "expression", ",", "different", "integrin", "expression", "patterns", ",", "better", "cytokine", "responsiveness", "and", "mitogenic", "potential", ",", "as", "well", "as", "higher", "expression", "of", "platelet-related", "genes", "compared", "to", "fresh", "CMP", "." ] } ]
PMC11641532
A non-targeting siRNA served as the control.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "non-targeting", "siRNA", "served", "as", "the", "control", "." ] } ]
PMC11489175
UCHL3 is the first structurally characterized DUB 20.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "UCHL3", "is", "the", "first", "structurally", "characterized", "DUB", "20", "." ] } ]
PMC11569208
Relative viability was measured by resazurin metabolic dye over mock transfected, uninfected controls at indicated timepoints (n = 3, mean ± SD; ****P < 0.0001 by two-way ANOVA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Relative", "viability", "was", "measured", "by", "resazurin", "metabolic", "dye", "over", "mock", "transfected", ",", "uninfected", "controls", "at", "indicated", "timepoints", "(", "n", "=", "3", ",", "mean", "±", "SD", ";", "*", "*", "*", "*", "P", "<", "0.0001", "by", "two-way", "ANOVA", ")", "." ] } ]
PMC11670407
Fig. 7OTULIN regulated the protein stability of GPX4 by preventing its proteasomal degradation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "7OTULIN", "regulated", "the", "protein", "stability", "of", "GPX4", "by", "preventing", "its", "proteasomal", "degradation", "." ] } ]
PMC7081114
An overall score > 5 was considered as high expression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "An", "overall", "score", ">", "5", "was", "considered", "as", "high", "expression", "." ] } ]
PMC11543853
This indicates that endosome disruption can be triggered by a cellular mechanism without the direct involvement of virus components.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "indicates", "that", "endosome", "disruption", "can", "be", "triggered", "by", "a", "cellular", "mechanism", "without", "the", "direct", "involvement", "of", "virus", "components", "." ] } ]
PMC11756514
The influence of various wall teichoic acid (WTA) structures on the Langerin and MBL recognition of S. aureus. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "influence", "of", "various", "wall", "teichoic", "acid", "(", "WTA", ")", "structures", "on", "the", "Langerin", "and", "MBL", "recognition", "of", "S.", "aureus", ".", "(" ] } ]
PMC6268318
= aqueous extract; MeOH ext.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "=", "aqueous", "extract", ";", "MeOH", "ext", "." ] } ]
PMC11751675
Among these, xanthatin (47) demonstrated broad-spectrum antiviral activity against a range of viruses, including herpes simplex, vaccinia, and vesicular stomatitis in HEL cell cultures; feline coronavirus and feline herpesvirus in CRFK cell cultures; and vesicular stomatitis virus, coxsackievirus B4, and respiratory syncytial virus in HeLa cell cultures.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "these", ",", "xanthatin", "(", "47", ")", "demonstrated", "broad-spectrum", "antiviral", "activity", "against", "a", "range", "of", "viruses", ",", "including", "herpes", "simplex", ",", "vaccinia", ",", "and", "vesicular", "stomatitis", "in", "HEL", "cell", "cultures", ";", "feline", "coronavirus", "and", "feline", "herpesvirus", "in", "CRFK", "cell", "cultures", ";", "and", "vesicular", "stomatitis", "virus", ",", "coxsackievirus", "B4", ",", "and", "respiratory", "syncytial", "virus", "in", "HeLa", "cell", "cultures", "." ] } ]
PMC11583690
The impact of free MSN and BPMO on the cells was also evaluated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "impact", "of", "free", "MSN", "and", "BPMO", "on", "the", "cells", "was", "also", "evaluated", "." ] } ]
PMC10748106
For this reason, an iso-surface of −10 kcal/mol value of MEP was obtained (Figure S4).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "this", "reason", ",", "an", "iso-surface", "of", "−10", "kcal/mol", "value", "of", "MEP", "was", "obtained", "(", "Figure", "S4", ")", "." ] } ]
PMC11469524
The development of the new BCR network model allowed us to introduce so far not described links in BCR mediated intracellular signaling.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "development", "of", "the", "new", "BCR", "network", "model", "allowed", "us", "to", "introduce", "so", "far", "not", "described", "links", "in", "BCR", "mediated", "intracellular", "signaling", "." ] } ]
PMC6114978
The effectiveness of TSA in the above experiments in promoting histone acetylation was validated in three cell lines, RD, Saos2, and sNF96.2 that demonstrated an increase in expression of MST1 and MST2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "effectiveness", "of", "TSA", "in", "the", "above", "experiments", "in", "promoting", "histone", "acetylation", "was", "validated", "in", "three", "cell", "lines", ",", "RD", ",", "Saos2", ",", "and", "sNF96.2", "that", "demonstrated", "an", "increase", "in", "expression", "of", "MST1", "and", "MST2", "." ] } ]
PMC11792888
No changes were observed in the Bax/Bcl-2 or the cleaved-caspase 3/Total caspase 3 ratios in cells treated with venom.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No", "changes", "were", "observed", "in", "the", "Bax/Bcl-2", "or", "the", "cleaved-caspase", "3/Total", "caspase", "3", "ratios", "in", "cells", "treated", "with", "venom", "." ] } ]
PMC11482552
In cervical cancer screening molecular HPV testing, a “fixed” volume of resuspended cervical or self-sample is used to perform the analysis based on manufacturers indications, irrespective of the abundance of sample collection.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "cervical", "cancer", "screening", "molecular", "HPV", "testing", ",", "a", "“", "fixed", "”", "volume", "of", "resuspended", "cervical", "or", "self-sample", "is", "used", "to", "perform", "the", "analysis", "based", "on", "manufacturers", "indications", ",", "irrespective", "of", "the", "abundance", "of", "sample", "collection", "." ] } ]
PMC11637276
Cells were imaged using a 60× Nikon A1 confocal microscope.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "imaged", "using", "a", "60", "×", "Nikon", "A1", "confocal", "microscope", "." ] } ]
PMC6102174
The whole plant is widely used by local people for the treatment of hepatitis, inflammation and digestive diseases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "whole", "plant", "is", "widely", "used", "by", "local", "people", "for", "the", "treatment", "of", "hepatitis", ",", "inflammation", "and", "digestive", "diseases", "." ] } ]
PMC11391695
The interaction between ACYP2 and TERT was subsequently confirmed using a Co-IP assay (Fig. 4B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "interaction", "between", "ACYP2", "and", "TERT", "was", "subsequently", "confirmed", "using", "a", "Co-IP", "assay", "(", "Fig.", "4B", ")", "." ] } ]
PMC10589262
Western blot analysis showed that strong ER stress rapidly and drastically reduced ATF6, cleaved-ATF6 (cATF6), and MT-KIT levels over time, whereas phospho-IRE1α, phospho-PERK, and CHOP levels drastically increased after 1 h of treatment with TG and continuously increased for 8 h (Fig. 4D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Western", "blot", "analysis", "showed", "that", "strong", "ER", "stress", "rapidly", "and", "drastically", "reduced", "ATF6", ",", "cleaved-ATF6", "(", "cATF6", ")", ",", "and", "MT-KIT", "levels", "over", "time", ",", "whereas", "phospho-IRE1α", ",", "phospho-PERK", ",", "and", "CHOP", "levels", "drastically", "increased", "after", "1", "h", "of", "treatment", "with", "TG", "and", "continuously", "increased", "for", "8", "h", "(", "Fig.", "4D", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Assessing combinatorial treatment in a primary PDX sample using multi-dose matrix analyses of both inhibitors revealed a positive mean Bliss synergy score of +4.8 indicating synergistic activity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Assessing", "combinatorial", "treatment", "in", "a", "primary", "PDX", "sample", "using", "multi-dose", "matrix", "analyses", "of", "both", "inhibitors", "revealed", "a", "positive", "mean", "Bliss", "synergy", "score", "of", "+", "4.8", "indicating", "synergistic", "activity", "." ] } ]
PMC11806106
The on-rate correlated with the respective affinity (Fig. 4G) and to some extent also with the respective efficacy of the agonist (Fig. 2B and Supplementary Fig. 4G).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "on-rate", "correlated", "with", "the", "respective", "affinity", "(", "Fig.", "4", "G", ")", "and", "to", "some", "extent", "also", "with", "the", "respective", "efficacy", "of", "the", "agonist", "(", "Fig.", "2B", "and", "Supplementary", "Fig.", "4", "G", ")", "." ] } ]
PMC11434983
The lipophilicity was determined using the shake flask method.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "lipophilicity", "was", "determined", "using", "the", "shake", "flask", "method", "." ] } ]
PMC11794568
On the one hand, it provides energy and metabolic intermediates to tumor cells to support their rapid growth and proliferation; on the other hand, the regulation of mitochondrial function can also be used as a therapeutic target to reduce the energy supply of tumor cells by inhibiting mitochondrial biogenesis, which in turn inhibits tumor progression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "the", "one", "hand", ",", "it", "provides", "energy", "and", "metabolic", "intermediates", "to", "tumor", "cells", "to", "support", "their", "rapid", "growth", "and", "proliferation", ";", "on", "the", "other", "hand", ",", "the", "regulation", "of", "mitochondrial", "function", "can", "also", "be", "used", "as", "a", "therapeutic", "target", "to", "reduce", "the", "energy", "supply", "of", "tumor", "cells", "by", "inhibiting", "mitochondrial", "biogenesis", ",", "which", "in", "turn", "inhibits", "tumor", "progression", "." ] } ]
PMC8973085
calcd for C23H17FN4OS: C, 66.33; H, 4.11; N, 13.45.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "calcd", "for", "C23H17FN4OS", ":", "C", ",", "66.33", ";", "H", ",", "4.11", ";", "N", ",", "13.45", "." ] } ]
PMC11763764
A two-way analysis of variance (ANOVA) test (Tukey’s multiple comparison test) was used to test hypotheses about effects in multiple groups with two variables. *
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "two-way", "analysis", "of", "variance", "(", "ANOVA", ")", "test", "(", "Tukey", "’s", "multiple", "comparison", "test", ")", "was", "used", "to", "test", "hypotheses", "about", "effects", "in", "multiple", "groups", "with", "two", "variables", ".", "*" ] } ]
PMC9318744
In this work, we show that ACE2pluC3 cells were susceptible to infection by multiple SARS-CoV-2 variants, allowing for studies with a broad range of viral strains.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "work", ",", "we", "show", "that", "ACE2pluC3", "cells", "were", "susceptible", "to", "infection", "by", "multiple", "SARS-CoV-2", "variants", ",", "allowing", "for", "studies", "with", "a", "broad", "range", "of", "viral", "strains", "." ] } ]
PMC8469018
The supernatant was transferred to another tube and centrifuged again at 15,000× g at 4 °C for 10 min, the obtained precipitate was a mitochondrial fraction.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "supernatant", "was", "transferred", "to", "another", "tube", "and", "centrifuged", "again", "at", "15,000", "×", "g", "at", "4", "°", "C", "for", "10", "min", ",", "the", "obtained", "precipitate", "was", "a", "mitochondrial", "fraction", "." ] } ]
PMC11457557
In addition, the current review highlights the most recent data on genetic variations (related to RAS, glucose and lipid metabolism, and some cytoskeleton proteins) that confirm the importance of genetic factors in diabetic nephropathy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "the", "current", "review", "highlights", "the", "most", "recent", "data", "on", "genetic", "variations", "(", "related", "to", "RAS", ",", "glucose", "and", "lipid", "metabolism", ",", "and", "some", "cytoskeleton", "proteins", ")", "that", "confirm", "the", "importance", "of", "genetic", "factors", "in", "diabetic", "nephropathy", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: We aimed to characterize real-world data regarding gilteritinib treatment in FLT3-mutated R/R AML and to compare outcomes with matched FLT3-mutated R/R AML patients treated with chemotherapy-based salvage regimens.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "We", "aimed", "to", "characterize", "real-world", "data", "regarding", "gilteritinib", "treatment", "in", "FLT3-mutated", "R/R", "AML", "and", "to", "compare", "outcomes", "with", "matched", "FLT3-mutated", "R/R", "AML", "patients", "treated", "with", "chemotherapy-based", "salvage", "regimens", "." ] } ]
PMC9429973
Conditioning regimens in CART group were either busulfan/fludarabine (n=12) or TBI/fludarabine (n=6).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Conditioning", "regimens", "in", "CART", "group", "were", "either", "busulfan/fludarabine", "(", "n=12", ")", "or", "TBI/fludarabine", "(", "n=6", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Most of the patients 183 (60.6 %) were low probability, 108 (35.8%) intermediate and the rest 11(3.6%) were high probability.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Most", "of", "the", "patients", "183", "(", "60.6", "%", ")", "were", "low", "probability", ",", "108", "(", "35.8", "%", ")", "intermediate", "and", "the", "rest", "11(3.6", "%", ")", "were", "high", "probability", "." ] } ]
PMC5600151
As well as other positively charged polymers, the high charge and strong interaction with the negatively charged cell membranes can cause cell destabilization, with leakage of cytoplasmic proteins and subsequent lysis .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "well", "as", "other", "positively", "charged", "polymers", ",", "the", "high", "charge", "and", "strong", "interaction", "with", "the", "negatively", "charged", "cell", "membranes", "can", "cause", "cell", "destabilization", ",", "with", "leakage", "of", "cytoplasmic", "proteins", "and", "subsequent", "lysis", "." ] } ]
PMC9429973
Main symptoms are fatigue (80%) and dyspnea (64%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Main", "symptoms", "are", "fatigue", "(", "80", "%", ")", "and", "dyspnea", "(", "64", "%", ")", "." ] } ]
PMC11727000
A total of 146 proteins were enriched at least 3-fold comparing cells expressing the USP44-BioID fusion compared with those expressing the BioID fusion alone, 90 of which were recovered only from USP44-BioID-expressing—and not from BioID-expressing—cells (Table S1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "total", "of", "146", "proteins", "were", "enriched", "at", "least", "3-fold", "comparing", "cells", "expressing", "the", "USP44-BioID", "fusion", "compared", "with", "those", "expressing", "the", "BioID", "fusion", "alone", ",", "90", "of", "which", "were", "recovered", "only", "from", "USP44-BioID-expressing", "—", "and", "not", "from", "BioID-expressing", "—", "cells", "(", "Table", "S1", ")", "." ] } ]
PMC11655536
The expression levels of TFE3 in both compartments were increased with HA treatment compared with control (Fig. 4B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "expression", "levels", "of", "TFE3", "in", "both", "compartments", "were", "increased", "with", "HA", "treatment", "compared", "with", "control", "(", "Fig.", "4B", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Patients with rare or unknown translocations were subjected to long-distance inverse PCR (LDI-PCR), anchored multiplex PCR (ArcherDX, CO, USA) or custom targeted KMT2A enrichment panel (Illumina, CA, USA; Meyer et al., 2019).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patients", "with", "rare", "or", "unknown", "translocations", "were", "subjected", "to", "long-distance", "inverse", "PCR", "(", "LDI-PCR", ")", ",", "anchored", "multiplex", "PCR", "(", "ArcherDX", ",", "CO", ",", "USA", ")", "or", "custom", "targeted", "KMT2A", "enrichment", "panel", "(", "Illumina", ",", "CA", ",", "USA", ";", "Meyer", "et", "al.", ",", "2019", ")", "." ] } ]
PMC4005030
This study proves the utility of PCA in preventing damage by agents causing oxidative stress mediated nephrotoxicity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "study", "proves", "the", "utility", "of", "PCA", "in", "preventing", "damage", "by", "agents", "causing", "oxidative", "stress", "mediated", "nephrotoxicity", "." ] } ]
PMC11679033
IC50 values were determined by a nonlinear fit equation predefined in Prism software 8 (GraphPad Software, San Diego, CA, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IC50", "values", "were", "determined", "by", "a", "nonlinear", "fit", "equation", "predefined", "in", "Prism", "software", "8", "(", "GraphPad", "Software", ",", "San", "Diego", ",", "CA", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11684269
The splenic CD4 T cells undergo enhanced glycolysis and mitochondrial metabolism to meet the energy demand for aberrant autoimmune response.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "splenic", "CD4", "T", "cells", "undergo", "enhanced", "glycolysis", "and", "mitochondrial", "metabolism", "to", "meet", "the", "energy", "demand", "for", "aberrant", "autoimmune", "response", "." ] } ]
PMC9596868
p ≤ 0.05; **p ≤ 0.01; ****p ≤ 0.0001 represent significant changes. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "≤", "0.05", ";", "*", "*", "p", "≤", "0.01", ";", "*", "*", "*", "*", "p", "≤", "0.0001", "represent", "significant", "changes", ".", "(" ] } ]
PMC11679326
Currently, the main pattern recognition receptors (PRRs) in mollusks are the following families of carbohydrate-binding proteins: lectins, fibrinogen-related proteins (FREPs), C1q domain-containing proteins (C1qDCs), Toll-like receptors (TLRs), and scavenger receptors (SRs) .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Currently", ",", "the", "main", "pattern", "recognition", "receptors", "(", "PRRs", ")", "in", "mollusks", "are", "the", "following", "families", "of", "carbohydrate-binding", "proteins", ":", "lectins", ",", "fibrinogen-related", "proteins", "(", "FREPs", ")", ",", "C1q", "domain-containing", "proteins", "(", "C1qDCs", ")", ",", "Toll-like", "receptors", "(", "TLRs", ")", ",", "and", "scavenger", "receptors", "(", "SRs", ")", "." ] } ]
PMC11438317
Jurkat cells (A) or PBL (B) were plated on coverslips covered with antibody for CD3 for the indicated periods of time.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Jurkat", "cells", "(", "A", ")", "or", "PBL", "(", "B", ")", "were", "plated", "on", "coverslips", "covered", "with", "antibody", "for", "CD3", "for", "the", "indicated", "periods", "of", "time", "." ] } ]
PMC11507371
50 to 70 cells, were taken of each specimen.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "50", "to", "70", "cells", ",", "were", "taken", "of", "each", "specimen", "." ] } ]
PMC11697703
See also Figure S3.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "See", "also", "Figure", "S3", "." ] } ]
PMC11626627
However, the mechanism by which ERβ regulates tumor EMT through the circATP2B1/miR-204–3p signaling pathway remains unclear.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "mechanism", "by", "which", "ERβ", "regulates", "tumor", "EMT", "through", "the", "circATP2B1/miR-204–3p", "signaling", "pathway", "remains", "unclear", "." ] } ]
PMC11659734
A shared folder gathering the results was created and web meetings, involving the fellow, supervisors and other members of the two institutes participating to the study, were organised to monitor the progress of the experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "shared", "folder", "gathering", "the", "results", "was", "created", "and", "web", "meetings", ",", "involving", "the", "fellow", ",", "supervisors", "and", "other", "members", "of", "the", "two", "institutes", "participating", "to", "the", "study", ",", "were", "organised", "to", "monitor", "the", "progress", "of", "the", "experiments", "." ] } ]
PMC11641532
Our goal was to identify biomarkers associated with tumor progression and prognosis in ccRCC by leveraging both single-cell and bulk transcriptomic data.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "goal", "was", "to", "identify", "biomarkers", "associated", "with", "tumor", "progression", "and", "prognosis", "in", "ccRCC", "by", "leveraging", "both", "single-cell", "and", "bulk", "transcriptomic", "data", "." ] } ]
PMC9920575
Cells were incubated with the S. chinantlense extract at the IC50 value or cisplatin for 24 h. All adhering and floating cells were harvested, and 2 × 10 cells were resuspended in an ice-cold lysis buffer for 10 min.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "incubated", "with", "the", "S.", "chinantlense", "extract", "at", "the", "IC50", "value", "or", "cisplatin", "for", "24", "h.", "All", "adhering", "and", "floating", "cells", "were", "harvested", ",", "and", "2", "×", "10", "cells", "were", "resuspended", "in", "an", "ice-cold", "lysis", "buffer", "for", "10", "min", "." ] } ]
PMC9429973
Markers of FeO included hepcidin, iron, transferrin saturation (TSAT), ferritin, and liver iron concentration (LIC) by magnetic resonance imaging.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Markers", "of", "FeO", "included", "hepcidin", ",", "iron", ",", "transferrin", "saturation", "(", "TSAT", ")", ",", "ferritin", ",", "and", "liver", "iron", "concentration", "(", "LIC", ")", "by", "magnetic", "resonance", "imaging", "." ] } ]
PMC9429973
Flow cytometry was performed with the anti-NKG2DL mAbs (MIC-A/B-PE, ULBP-1-APC, ULBP-2/5/6-PerCP).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Flow", "cytometry", "was", "performed", "with", "the", "anti-NKG2DL", "mAbs", "(", "MIC-A/B-PE", ",", "ULBP-1-APC", ",", "ULBP-2/5/6-PerCP", ")", "." ] } ]
PMC11201245
The colonization of OC cells in the abdominal cavity does not occur via an endothelial barrier, as is the case with most other solid tumors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "colonization", "of", "OC", "cells", "in", "the", "abdominal", "cavity", "does", "not", "occur", "via", "an", "endothelial", "barrier", ",", "as", "is", "the", "case", "with", "most", "other", "solid", "tumors", "." ] } ]
PMC10547921
The linker needs to balance stability and release efficiency.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "linker", "needs", "to", "balance", "stability", "and", "release", "efficiency", "." ] } ]
PMC9429973
The outpatient consultations are also covered in other parts of Estonia.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "outpatient", "consultations", "are", "also", "covered", "in", "other", "parts", "of", "Estonia", "." ] } ]
PMC10758402
HSV titers were determined by a standard plaque assay on Vero cells according to a previously published protocol (14).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HSV", "titers", "were", "determined", "by", "a", "standard", "plaque", "assay", "on", "Vero", "cells", "according", "to", "a", "previously", "published", "protocol", "(", "14", ")", "." ] } ]
PMC11621493
8Pla2g4d-deficient keratinocytes show complex lipidomic changes. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "8Pla2g4d-deficient", "keratinocytes", "show", "complex", "lipidomic", "changes", ".", "(" ] } ]
PMC11637276
We utilised Reactome to assess the enrichment for biological pathways in the positive and negative regulators identified by the screen, and enriched pathways included negative regulation of MAPK signalling pathway (p-value: 2.68E-05) and MAPK signalling cascades (p-value: 3.23E-04; S2 Table).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "utilised", "Reactome", "to", "assess", "the", "enrichment", "for", "biological", "pathways", "in", "the", "positive", "and", "negative", "regulators", "identified", "by", "the", "screen", ",", "and", "enriched", "pathways", "included", "negative", "regulation", "of", "MAPK", "signalling", "pathway", "(", "p-value", ":", "2.68E-05", ")", "and", "MAPK", "signalling", "cascades", "(", "p-value", ":", "3.23E-04", ";", "S2", "Table", ")", "." ] } ]