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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC5415764
At predetermined periods (0.5, 1, 2, 4, 8, 12, 24, 48, 72, 96 h), 1 mL of dialysis medium was sampled for PTX and TET measurement by HPLC using the aforementioned protocols.
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PMC11509224
Many of these molecules exhibit strong biological activity, highlighting the potential and significance of Spongia sponges as a valuable resource for marine drug development.
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PMC4270159
ERK.
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PMC9429973
Survival data are not yet mature.
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PMC11085211
The gradient was composed of an isocratic phase of 10 min (90% A and 10% B), a gradient from 90% A to 80% A in 1.1 min, an isocratic phase of 20 min (80% A and 20% B), a gradient from 80% A to 70% A in 1.1 min, an isocratic phase of 10 min (70% A and 30% B), a gradient from 70% A to 50% A in 1.1 min, an isocratic phase of 10 min (50% A and 50% B) a gradient from 50% A to 30% A in 1.1 min, an isocratic phase of 5 min (30% A and 70% B), a gradient from 30% A to 0% A in 1.1 min, an isocratic phase of 5 min (0% A and 100% B).
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PMC11754436
Overexpression expression of DHRS4-AS1 in MG63, *Represent comparison with the BC group. (
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PMC11575040
However, the real relationship between miR-1270 and these target genes in melanoma remains unclear.
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PMC11019355
With these new findings in hand, it begs the question: why did previous studies miss the significant trans effects observed here?
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PMC11429241
Two human ovarian cancer cell lines were tested for their ability to form reproducible 3D cell cultures using 3D-printed scaffolds.
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PMC11093197
Conversely, in certain contexts, p27 is known to interact with active CDK4 and cyclin D1, subsequently becoming insensitive to palbociclib.
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PMC9910796
Therefore, we next explored the expression, proteolytic processing and subcellular localization of these precursors in vEP84Ri-infected cells under restrictive conditions.
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PMC11269933
Briefly, the eggs of 30 mature females were mixed and divided into 30 beakers for each species, each fertilized with sperm from one of the 30 males, to maximize parental contribution.
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PMC5173112
Moreover, we observed an increase of invasion ability in RCC cell lines transfected with USP21-FLAG-HA compared with empty vector (Figure 5D).
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PMC11040965
Total RNA and miRNA were extracted from U266 and RPMI 8226 cells or immunomagnetically purified plasma cells using the mirVana miRNA Isolation Kit (Thermo Fisher Scientific, #AM1560) according to the manufacturer’s instructions.
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PMC11656657
Data are represented as mean ± standard deviation (SD) from n = 3.
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PMC11806106
Moreover, we were able to directly apply our approach on the other family members, as we developed comparable FRET-based sensors for the kappa opioid receptor as well as for the nociceptin/orphanin FQ receptor.
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PMC11711127
For example, nuclear export of the transcription factor NFAT has been reported to be slower than its transcription partner AP-1 (46).
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PMC3888431
These transcripts were clustered into 17,598 clusters using wcd .
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PMC10728535
Based on increasing findings, meta‐analysis enhances the statistical power of expression profiling and allows for an investigation of cross‐study heterogeneity; this can result in more reliable and robust gene signatures.
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PMC6901583
Scale bar: 25 μm.
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PMC10243817
The resulting single cell suspension was filtered and cell pellets were suspended in erythrocyte lysis buffer and incubated for 5 minutes.
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PMC10882807
Moreover, expression of EIF4A3 was also detected by Western Blot and IHC (Fig. 5E-F).
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PMC11670407
Nude mice with xenografts of shRNA-NC and shRNA-OTULIN 143B cells were treated with PBS or cisplatin.
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PMC11277157
Figure 3 summarizes DEG findings for the three experimental pairs.
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PMC10114490
Cells were seeded in a T25 flask and left untouched for 3 days.
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PMC10899471
Additionally, miR-939-3p was upregulated in sarcoma tissues and cells, correlating with a poor prognosis of sarcoma patients.
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PMC8753818
Fig. 5Caspase 3 activity assay; this chart represents the caspase 3 activity in lysate of CHO-KO and CHO-K1 cells undergoing the apoptosis mediated by NaBu (11 mM).
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PMC6114978
Phosphorylation of these serines leads to binding of 14-3-3 proteins, ultimately resulting in translocation of TAZ/YAP from the nucleus into the cytoplasm, where they undergo ubiquitin-mediated degradation .
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PMC10919056
The clinical nomogram was subsequently validated.
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PMC11321678
The top annotation indicates receptor types.
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PMC10813895
However, the regulatory process is interrupted when ELF5 is acetylated, leading to the inhibition of CCND1 expression.
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PMC11678130
The first assessment conducted in the present study consisted of an evaluation of the effects of QUE and 5-FU (5, 10, 25, or 50 µM), as well as the combinatorial treatment of QUE (10 µM) + 5-FU (5, 10, 25, or 50 µM), on the viability of A375 cells after a 24 h treatment.
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PMC10040136
All experiments were repeated at least thrice.
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PMC9429973
Aims: The purpose of the present study was to analyze the mutational status of the TNFRSF13B gene, since the majority of mutations are presented in these exons.
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PMC11345828
In a reaction vessel, the N-H indole core (e.g., 36, 46) (1.0 equiv) was dissolved in DMF (0.2 M) followed by addition of Cs2CO3 (2.0 equiv).
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PMC11348300
administration of ALA.
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PMC11323699
Survival curves were compared using the Gehan–Breslow–Wilcoxon test as previously described .
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PMC8524093
Garg et al. (2020) implemented virus like particles (VLPs) produced in 293T cells as a model for CHIKV vaccines, highlighting a new role of this cell in CHIKV research.
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PMC11525028
acRIP was conducted following a previously published protocol.
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PMC11707577
Nematocyte distribution was evaluated by toluidine‐blue staining.
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Survival statistical analysis performed with Kaplan Meyer method.
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PMC11680562
Likewise, other research groups have synthesized CuO NPs using environmentally friendly methods and assessed their effectiveness against various cancer cell lines to determine their potential as anticancer agents .
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PMC6267596
b & c) Western blotting confirmed up-regulated target proteins and their quantification after normalization. (
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PMC11711871
We next analyzed the sEH-converted plasma metabolites of the linoleic, docosahexaenoic, and arachidonic acid pathways in 5- and 10-week-old GR wild-type and mutant rats under NSD conditions and found no differences.
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PMC10965680
A neighbor-joining (NJ) tree of all the samples was constructed using MEGA v7.0 software based on the genetic distance matrix provided by PLINK v1.9 (Vipan Kumar Sohpal et al., 2010; Purcell, S et al., 2007).
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PMC11742670
It consists of numerous layers of neurons.
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Note that the APIP and PDHX genes share the same promoter anchor for the HiChIP analysis.
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PMC9111184
PC loadings and score scatter plots of the corresponding PC1 and PC2.
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PMC11750165
Then, 500 μL of the lysate was immunoprecipitated with the indicated antibodies and proteinA-coated beads.
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PMC11743975
The COS-7 cells were cultured in high-glucose Dulbecco′s modification Eagle′s medium (DMEM, Corning) with 10% fetal bovine serum (FBS, Gibco) and 1% penicillin G/streptomycin (Beyotime) at 37℃ in a humidified 5% CO2 incubator.
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PMC11486946
First, we optimized the conditions of the image acquisition (Supplementary Fig. 2), and the suitability of this approach as a screening method was assessed using the indices calculated from MSD500ms, with the positive control being cells treated with gefitinib and EGF and the negative control being cells treated only with EGF (Fig. 2a).
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PMC7136814
MYOD1 is one of the four myogenic regulatory genes that drive differentiation of muscle cell precursors to mature muscle cells, and it has been shown to be sufficient to convert nonmuscle cells into myoblast-like cells .
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PMC9000591
The TPC and antioxidant activities (DPPH and ABTS assays) are presented in Table 1.
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PMC11319300
MYEOV has also been proposed as a biomarker for prognosis in hepatocellular carcinoma (Deng et al., 2019).
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PMC11637276
To determine the trafficking pathway followed by ECM components, we measured Matrigel colocalisation with an early endosomal marker, EEA1, and a late endosomal/lysosomal marker, LAMP2, in MDA-MB-231 triple-negative breast cancer cells.
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Perhaps BSA in serum binds other molecules in complexes, which are larger than 100KD, and/or its tertiary structure prevents its exclusion from the 100KD-cutoff column.
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The three experimental groups were SK1 (N = 20), SK1 + SK2 (N = 20), and SK2 (N = 20) injection.
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Finally, 15 µL of 2 × SDS loading buffer (Beyotime) was added and boiled for 5 min.
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PMC11594641
The proteins were separated by SDS-PAGE electrophoresis run for 1.5 h at 180 V, followed by a wet transfer to PVDF membrane for 90 min at 270 mA. The membranes were briefly washed in Tris-buffered saline with 0.05% Tween-20 (TBST) (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA) and blocked using 5% BSA in Tris-buffered saline with 0.05% Tween-20 (TBST) (for 1 h at room temperature).
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PMC11757230
Fig. 2 Differential effects of canine adipose-derived mesenchymal stromal cells (cADSCs) on leukemia/lymphoma (LL) cell survival.
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PMC11774747
As mentioned before, other targets than CD19 were also investigated in early phase clinical trial.
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PMC5673060
For TiO2-enriched samples, peptides were resolved on a 75 μm I.D. 50 cm C18 Easy-Spray packed emitter column (2 μm particle size; PepMap RSLC, Thermo Fisher Scientific) over 240 min using a multi-step gradient of buffers A:B (t = 0 min 5% B, t = 5.5 min 4% B, t = 45 min 10% B, t = 175 min 25% B, t = 245 min 50% B, t = 250 min, 95% B, t = 255 min, 95% B, t = 260 min 4% B, t = 280 4% B) (buffer A: 2% acetonitrile/0.1% formic acid; buffer B: 80% acetonitrile/0.1% formic acid) at 250 nl/min.
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Consensus clustering was used to distinguish subgroups based on the expression levels of each prognostic-related HSPs in ccRCC patients.
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PMC11225860
Drug treated U2932 and VAL, cells were fixed for 24-hours at 4°C in a 70% methanol solution.
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After the addition of EDTA and heat inactivation, reverse transcription was performed using the LunaScript RT Supermix Kit (E3010, New England Biolabs) according to manufacturer’s instructions.
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PMC11612626
Membranes were imaged using a Li-COR system interfaced with the Odyssey-CLx and Imaging Studio 4.0 software.
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After transfection, the treated cells were collected and fixed in ice-cold 70% ethanol overnight.
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Five to seven animals were used per genotype and diet condition.
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PMC11743316
Complex II (SDH) mutations lead to the formation of ROS and succinate buildup, which in turn inhibit HIF prolyl hydroxylase and activate the HIF pathway .
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PMC11518702
To avoid possible complications in interpreting HGAL effects in mice harboring endogenous murine Hgal/M17, Hgal/M17 knockout mice could be used in which B- and T-cell formation and function are only nominally affected (41).
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PMC6461034
Centrifuge for 5 min at 16,000 × g and room temperature to pellet all particulate matter.
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PMC11546117
The bidirectional apparent permeabilities of the probe substrates for membrane transporters were very low, and showed limited polarity, suggesting limited membrane transporter functionality in the hMEC in vitro model under the conditions tested (Figure 5, Table 1).
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PMC11765243
The differentiation of Tfh in vitro was lower in p110αKD-T mice (Figure 7), and p110α inhibition showed that unlike other cytokines, IL-21 production by cultured CD4 T cells was dependent on p110α .
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PMC9275501
In combination antitumor therapy, the optimal proportion of drugs has a great influence on the antitumor effect.
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PMC11306331
We constructed fluorescent, iLID-tagged variants of all three FET family protein members and observed visible condensates after transient transfection, although we found that these condensates were less spherical and, for FUS and TAF15, showed lower enrichment in the condensed phase compared to their IDR-only counterparts (Fig. S5A).
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PMC11185260
The size of the subcutaneous tumor was measured semi-weekly and the tumor volume (L×W×H) was in mm calculated.
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PMC4443654
Together these give a comprehensive overview of model performance, both in terms of regression accuracy of the continuous eigenvector, and in how that same model could be used to label discrete chromatin compartments.
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PMC8494202
Although the results of this current study confirmed that CKAP2L is a novel oncogenic gene that significantly reduces the survival time of patients, the molecular mechanism underlying the biological function of CKAP2L remains unknown.
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PMC9429973
A proportion of these patients have alternative diagnoses on biopsy, with a subsequent delay in referral to the most appropriate specialty.
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PMC11739504
Western blot data showed that the acetylation level of α-tubulin decreased in garcinol-treated NIH/3T3 cells.
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PMC9031474
Natural sources provide structural diverse and bioactive drimane and coloratane sesquiterpenoids.
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Based on these results, we used a maximal concentration of 40 nM GSK232 in drug-treated CEMss cultures.
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PMC11277157
The interferon-γ induces apoptotic mechanisms, nitric oxide production, and antigen-presenting pathways (i.e., MHC class I and II with numerous HLA genes).
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PMC11711345
Both very low (Calu-3) or absence (other cell lines) toxicity at 100 µM and the high IC50 value (Calu-3) indeed demonstrated very low toxicity of the compounds against the HCCLs assayed.
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PMC11786704
There was almost no apoptosis in the negative control group (untreated group) while there was a large number of apoptotic cells in the positive control group (H2O2 treated group).
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PMC10551595
P53R175H, (B) P53R248Q 2D interaction plot: , Hydrophobic interaction; , Hydrogen bond.
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When a portable electrospinning device was used to prepare an electrospinning dressing, the aluminum foil changed from a bright silver color (reflective) before spinning to a white color (non-reflective) after spinning (Figure 1a and b).
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Panel (B) illustrates GEPIA2 based-based mRNA expression of MMP7, MMP11, and MMP14 genes in skin cutaneous melanoma (SKCM) samples of different cancer stages and control samples.
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PMC9596868
We further assessed the effect of quercetin, MST-312 and their combination on colony forming ability of PA-1, A2780 and HCT116 cells.
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PMC11551844
This study aims at demonstrating the importance of the presence of phytoreductants in extracts for the formation of AuNPs, the improved cellular uptake and the synergistic actions of molecules for anti-cancer action.
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PMC9577200
In addition, the technology underlying the antibacterial effect of the GO nanosheets is not well understood.
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Cells were seeded in T25 flasks at 4 × 10 cells per flask and were incubated for 48 h or until they reached confluency.
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Counts of ROH individuals of the 7 breeds.
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Proteins from a biological sample are digested with trypsin, and phosphopeptides are enriched for analysis by (orbitrap‐based) LC‐MS/MS.
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PMC11786767
Our results indicate that nuclear lipids exert a novel role in isolating or individualizing condensed sister chromatid pairs during mitosis of cultured mammalian cells.
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PMC9429973
As OS and PFS increased, the number of CD184+ cells decreased.
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PMC6468656
In addition, Aurora A’s interactive network had also been explored based on clinical data that MMP2 and VEGF were also increased in high ghrelin group (Figure 1D), indicating the potential value of studying ghrelin-Aurora A axis in RCC.
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PMC11634794
Stable expression of LAMP1 was established in 786O and A498 human renal carcinoma cell lines by transfecting them with LAMP1 lentivirus at a confluency of 20%-30% using Lipofectamine 2000 reagent (Thermo Fisher Scientific).
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PMC11755467
Analysis Steps in R:Load Data: The script loads and combines data from the specified paths for both drug conditions and the control;Mean Reactivity Calculation: It calculates the mean reactivity for specific indices (19–28 and 43–50) from the loaded datasets;Normalization: The mean reactivity values for both drug conditions are normalized against the mean reactivity of the control condition;Statistical Testing: A Mann–Whitney U test is performed to assess whether there are statistically significant differences between the normalized reactivities of the drug conditions and the control.
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PMC9429973
Mean white blood cell count was found to be significantly lower in patients with diagnostic bone marrow cultures (2.4 ×10/µL versus 8.7 ×10/µL; P=.038).
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