Datasets:
OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
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PMC11774112
The data in D are expressed as the means ± SDs (n= 6). (
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PMC11656048
Our data demonstrated that shikonin suppressed Nrf2 expression via inducing proteasomal degradation, and the proteasome inhibitor MG132 abrogated the suppressive effect of shikonin on Nrf2 expression.
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PMC10891340
HSV-1 neurophilic infection induces antiviral immune responses in microglia and also causes gut microbiota dysbiosis, but metabolites from gut microbes activate mitophagy in cells, which would inhibits progression of herpes simplex virus encephalitis (Li et al., 2023).
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PMC10988555
Despite the much progress achieved in oncology over the last decades, medical science has not succeeded in providing an efficient solution to cure cancer.
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PMC11248911
To clarify the cytotoxic effect of the newly synthesized compound, the cell cycle progression was examined against MCF-7 cells.
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PMC11300639
In this study, we found that CDK4/6 inhibitors are involved in regulating the protein stability of TSC1 in ccRCC.
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PMC11687663
In this case, the default settings for AutoDock Vina 1.5.7 were utilized, where the grid box axis and dimensions were automatically selected.
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PMC11594074
To further underline cell cycle results, an immunofluorescence analysis using MDA-MB-468 cells and Ki-67 was conducted.
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PMC9398137
Such pattern of MCL1 binding specificity was, however, also observed in S63845-resistant Burkitt lymphoma cell line Raji (Fig. 3B), indicating that there might be other mechanisms mediating resistance to S63845 in cell lines that are primed for death on MCL1 (38, 39).
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PMC11612315
When 1 μM exendin 20–29 was applied, no significant effect was found, in contrast to the 92% inhibition elicited by 1 μM BCTC (Supplementary Fig. 7a–c).
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PMC11781181
MiRNAs are found in secreted exosomes and play important roles in diverse progress of cell death 14-18.
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PMC11699465
Combining the Cut&Tag seq and RNA seq data, we estimated the regulatory potential by considering the bound peaks within 100 kb upstream and downstream of the transcription start site (TSS).
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PMC10890307
Interestingly, the MCF-7 µ value with lactate present was similar to the µ value with glucose under normoxia (Table 1 and Table 3).
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PMC9143157
Development of new drugs is thus necessary to find potentially more effective treatments for advanced uterine sarcoma, and our current study strongly suggested that P-THP may become a candidate for uterine sarcoma.
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PMC10887351
In another study, it has been sustained that β3-ARs are expressed by all the type of cancers and mostly in melanoma .
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PMC11474209
In 1996, 50 dialysis patients died in Caruaru, Brazil, after drinking water contaminated with MCs.
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PMC11387401
To date, several lncRNAs, including the non-coding repressor of NFAT (NRON) (Li et al, 2016) and LINC01426 (Huan et al, 2018), have been reported to play a role in HIV-1 infectivity and/or latency maintenance by directly interacting with HIV-1 proteins.
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PMC3765139
Two explanations of this phenomenon have been suggested so far: (1) the process of tumor initiation is a developmental process in which the CD133- subset gains tumorigenic capacity in the host, most likely through the influence of the adjacent environment or niche . (
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PMC11756907
This result suggests a possible mechanism of sustained release of 2-ME from the rGO-2ME due to the greater lipophilicity of the graphene carrier and/or more efficient penetration of the hydrophobic complex through lipid membranes (greater bioavailability).
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PMC11699178
In the cellular component (CC) category, terms such as cell junction, apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex, and extracellular matrix were significantly enriched.
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PMC11518702
For example, HGAL’s C-terminal PDZ-RhoGEF-binding motif (“PBM”) is proving to be important for GC DLBCL B-cell migration and dissemination (5, 55).
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PMC11747467
The results showed the same trends ( Supplementary Figures S3B–E ).
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PMC11371747
Exposure time to the drugs was 4 h, with [5-H]-deoxycytidine present for the last 2 h. Representative curves out of three separate experiments are shown.
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PMC11802929
Middle: SCT protein expression efficiency for the Pep-Groups.
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PMC11200978
Additionally, we investigated the effect of combining cryoablation with gemcitabine, a standard chemotherapy drug as a potential adjunctive treatment path for NSCLC.
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PMC8409415
Although IMGN853 is the most advanced ADC for OvCA that is presented under clinical development for OvCA, IMGN853 showed a modest improvement in progression‐free survival (hazard ratio 0.98, P = .897) and overall survival rates (hazard ratio 0.81, P = .248).
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PMC10759659
d, e Representative flow cytometric analysis showing galectin-9-positive cells in Hep3B and HepG2/2.215 cells.
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PMC11423992
Collectively, TFAB002s exhibited conditional agonism on T cell function dependent on target cell presence (Fig 3C).
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PMC9429973
V. de Jonge, C. Duetz, W. Bruins, E. van Werkhoven, M. Nijland, K. de Heer, M. van der Poel, Y. Sandberg, C. Klerk, D. de Jong, J. Zijlstra, M. J. Kersten, T. Mutis, M. Chamuleau Department of Hematology, Amsterdam UMC, Amsterdam; HOVON Data Center, Department of Hematology, Erasmus MC Cancer Institute, Rotterdam; Hematology, University Medical Center Groningen, Groningen; Department of Internal Medicine, Flevoziekenhuis, Almere; Department of Internal Medicine, Maastricht University Medical Center, Maastricht; Department of Internal Medicine, Maasstad Hospital, Rotterdam; Department of Internal Medicine, Dijklanderziekenhuis, Hoorn; Department of Pathology, Amsterdam UMC, Amsterdam, Netherlands Background: Patients with high grade B cell lymphoma (HGBL) who harbor a MYC rearrangement with BCL2 and/or BCL6 rearrangements (HGBL-DH/TH) have a poor prognosis upon treatment with R-CHOP [Rosenwald, JCO 2019].
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Table 4 displays the computational time of the optimization problem of the community with the proposed CEMS in four cases: 10 homes, 50 homes, 100 homes, and 500 homes.
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Selective targeting of the T cell antigen receptor beta-chain expressed by the (clonal) malignancy spares normal T cells expressing the other chain.
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For cell fractionation analysis, nuclear and cytoplasmic fractions were collected using the Nuclear Extract Kit (#40010; Active Motif, Carlsbad, CA, USA) following manufacturer instructions.
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Cells were lyzed in a modified radioimmune precipitation buffer, as described .
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After 12 h, the proliferation decreased to the level of the control.
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Overall, these findings can contribute to the value of designing forthcoming studies on the antiproliferation of cumin constituents derived from p-cymene, mainly cuminaldehyde and sodium cuminate, as promising compounds to fight against cancer.
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Subsequently, the eIF2 effector provokes the depletion of global protein synthesis and the translation of selected mRNAs, including the ATF4 transcription factor.
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Methanol extract exhibited higher antioxidant activity compared to ethanol extract in both DPPH and FRAP assays.
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with ACE-083 or vehicle.
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a Effects of intraperitoneal (i.p.)
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Dasatinib treatment impaired cells migration, and both sequential and co-administration with PEM significantly increased apoptosis.
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HDACi, histone deacetylase inhibitor; PTM, post-translational modification.
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Therefore, many studies aim to find novel anticancer agents to be used against lung cancer.
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These findings imply that ATRA’s anti-leukemic action may be mediated by its capacity to drive the differentiation of promyelocytic leukemia cells through the down-regulation of the hTERT gene.
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In the future, targeting CGREF1 could potentially offer a novel therapeutic strategy for treating osteosarcoma.
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However, this increases the number of dead cells, which tend to acquire large amounts of probe and therefore give false positives.
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As in vitro, 6-gingerol effectively suppresses tumor growth in nude mice .
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The JAK/STAT signaling cascade functions in a range of intracellular processes.
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The primary antibody information is detailed in Supplementary Table 1.
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Subsequently, we washed the cells once with PBS (0.1 M, pH 7.4) and trypsinized them using 0.25% trypsin–EDTA (Gibco™).
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CT103A led to a deepening and durable response with robust expansion and prolonged persistence.
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ccRCC cells were cultured on coverslips and treated with FITC-labeled CBDP1.
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Variant results were further filtered for minimum variant quality Phred score 70 and maximum strand bias Phred score 60 (strand bias filter applied only if ≥85% of the variant supporting reads were on a single strand) by command lofreq filter—no-defaults—snvqual-thresh 70—sb-incl-indels -B 60.
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N = 3 biological replicates of WT.
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PMC11803918
Encouragingly, the hybrid exosomes showed stable size distribution under physiological conditions for at least 96 h, suggesting their excellent stability during blood circulation (Figure 2J).
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These data suggest that the imGPS is a robust tool to predict the response to pembrolizumab treatment for RMHNC.
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During the study period, 47 escalations were observed.
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After 72 h, each well was treated with 10 μL of a 5 mg/mL MTT saline solution, and following 5 h of incubation, 100 μL of a sodium dodecyl sulfate (SDS) solution in HCl 0.01 M were added.
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PMC11760643
Notably, P2X7 expression on invariant (i) NK T cells (687.5 ± 75.9), identified as Vα24‐Jα18 T cell receptor, was significantly greater than total NK T cells (331.5 ± 36.9) (p = 0.006; Figure 3I).
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PMC11530949
However, the ability of NPs, due to their nano size, to easily penetrate the cell walls of cancer cells, leads to higher toxicity (71, 72).
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PMC11612794
Mis12C binds to CENP-C and CENP-T independently in each pathway, acting as a hub for KMN network assembly by recruiting Ndc80C and Knl1C.
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PicA is a protein identified to be involved in selective protein trafficking into the phage nucleus, and we show that it is essential for viral reproduction.
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PMC8996378
Overall, diterpenoids with good activity against MDR and low toxicity from natural sources could be developed into lead compounds of new drugs.
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PMC6379402
In the main paper, we quantify how much the wiring patterns of a gene (node) change between healthy and cancer conditions by the dissimilarity between the nonredundant 2- to 4-node GDVs of the node in the healthy and cancer networks.
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PMC11519077
Additionally, it was found that BM-MSC (15.85 ± 1.603; p < 0.001) and BM-CM (11.34 ± 0.865; p < 0.001) groups had significantly increased MCP-1 gene expression than the control group.
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PMC11683130
SerpinB5 is an autoantigen of an autoimmune response and is the target of an enhanced T-cell response in psoriasis.
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PMC3734024
After 5 days in culture, supernatants and B cells were collected for further study.
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PMC11122631
Twenty-three carbon signals, including three methyls [δC 14.0 (C-20), 21.2 (C-2), and 51.6 (1-OMe)], eight methylenes [δC 33.4 (C-2), 24.5 (C-3), 27.0 (C-4), 39.3 (C-13), 27.4 (C-16), 29.1 (C-17), 31.5 (C-18), and 22.5 (C-19)], eight methines [δC 133.3 (C-5), 129.6 (C-6), 68.3 (C-7), 57.2 (C-8), 133.7 (C-10), 165.4 (C-11), 121.8 (C-14), and 135.7 (C-15)], two ester carbonyls [δC 174.0 (C-1) and 170.3 (C-1′)], one carbonyl [δC 204.8 (C-9)], and one non-protonated carbon [δC 79.5 (C-12)] were recognized in the C and DEPT spectra.
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The cells were grown in Dulbecco's modified Eagle medium (DMEM), including 10% fetal bovine serum and 100 units/ml penicillin/streptomycin.
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PMC11367146
Previous studies on the carrageenan-induced hind paw edema model have revealed that vanillin, syringaldehyde, and gigantol possess anti-inflammatory properties .
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Conventionally, tumors are grown subcutaneously, orthotopically, or as xenografts in immunodeficient recipients and are examined for desired effects.
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PMC11064533
Multidimensional scaling plot of distances between the samples of RNA sequencing, and leading log-fold change is the root mean square average of the largest log2-fold changes between each pair of samples.
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Moreover, the genome sequence can be used to reconstruct models of CHO-K1 metabolism, which allow the assessment of how genetic manipulations affect other pathways and can predict nonintuitive genetic changes to improve product yield or quality. (
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PMC8875242
On the other hand, velpatasvir had no effect on digoxin transport in Caco-2 cells, but inhibited ABCB1 in hPCIS.
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Sequential treatment leads to longer-lasting reduction of RUNX1/ETO transcript and associated target genes (LAPTM5, CCND2, C/EBPA and ANGPT1) and loss of RUNX1/ETO protein.
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It is known that Chk1 can be phosphorylated on S345 by ATR, and autophosphorylated on S296, in response to DNA damage .
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The levels of STAT3, LMP1, EBNA2, and p100/52 expression are shown for each condition as indicated.
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Moreover, the interaction between OAS1 and vtRNA 2-1 is poorly understood in the context of innate immunity.
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PMC11750712
The LibraT1 study included on-treatment biopsy samples of sites of disease after AUTO4 administration when feasible.
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These results show that VE-465 by itself can induce apoptosis, and can synergize with paclitaxel at Aurora-A specific concentrations (< 5 nM) to enhance cell killing.
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The light microscopic images of BEL-7404 and Hela cells.
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The 50% maximum inhibitory concentration (IC50), representing the concentration at which cell growth decreased by half compared to control cell growth, was determined using GraphPad Prism 5.0 software (GraphPad, Inc., San Diego, CA, USA).
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Cells in the logarithmic growth phase were seeded in 24-well plates (5 × 10 per well) and cultured in a CO2 incubator (5% CO2, 37°C).
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Fluorescence spectra of ThT bound to the β-sheet structure of SF.
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Real-time PCR data were analyzed using the ΔΔCT method and quantification was performed with the help of a computer program.
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The characterization of the complex was confirmed using a comparative RP-HPLC analysis using the analogous rhenium complex fac-[Re(CO)3(imQz)(PPh3)] (2) as a reference (HPLC: tR = 13.3 min).
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For the di-MGO adduct of cyanidin-3-glucoside (M at m/z = 593), the same fragmentation pattern is observed in the MS spectrum.
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The ‘interrupted’ poly-A tails are detected in the 3′-UTRs of the two dsRNAs, which have also been reported in other members of Partitiviridae.
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F, inducible synMAP circuits (TPPP-DDX4 design) can nucleate microtubule aster formation following nocodazole treatment as shown in (E). (
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Sulfur and magnesium oxide (MgO) are very well-known pharmaceutical compounds.
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The development of tumors is not a single process involving complex multi-mechanistic pathways.
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The inhibitory effects of the compounds on P-gp, MRP1 and BCRP were evaluated by flow cytometric determination of accumulation of rhodamine 123 in, respectively, P-gp-overexpressing MES-SA/DX5 cells, calcein AM in MRP1-overexpressing Flp-In HEK293 cells and mitoxantrone in BCRP-overexpressing HEK293 cells.
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All the cells were maintained at 37 °C in a humidified atmosphere supplied with 5% CO2 in an Eppendorf CO2 incubator (CellXpert C170i-CO2 incubator, Eppendorf).
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PMC11720107
A decrease in cell viability, measured using the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-5-(3-carboxymethoxyphenyl)-2-(4-sulfophenyl)-2H-tetrazolium (MTS) assay, was also observed in the A498 and A549 cell lines after treatment with small extracellular vesicles derived from garlic at concentrations ranging from 5 to 50 µg/mL .
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PMC8864075
This inspired us to reconstruct a compound combination with baicalein, wogonin, and oroxylin-A. In this study, we reconstructed TFAE with baicalein (65.8%), wogonin (21.2%), and oroxylin-A (13.0%) and named it as reTFAE (Figure 1A), and found that the reTFAE could significantly inhibit EMT of A549 cells.
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PMC9429973
Results: Three phase III RCT with total of 1362 patients were included for our analysis (Figure).
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PMC11785489
Many nonproductive TCRs are short in length due to a stop codon; accordingly, we lifted our minimum CDR3 amino acid requirement.
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PMC10587429
Growth curves of primary tumors in control or MAG treated huNSG-SGM3 mice. (
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PMC10719213
Effect of cladribine on mitochondrial membrane potential in CCRF-CEM cells.
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PMC9872547
Nanocurcumin, as a safe and herbal drug, may have the potential to be used as a supplement along with common cervical cancer treatment strategies such as chemotherapy drugs.
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PMC10965315
In addition, according to the company report, the purity reported to be ≥95.0% (HPLC) (http://www.golexir.com/harmaline/).
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