Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11774251
Flow cytometry analysis of apoptosis using Annexin-V/PI staining.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Flow", "cytometry", "analysis", "of", "apoptosis", "using", "Annexin-V/PI", "staining", "." ] } ]
PMC11509224
Clavirolide H was evaluated for cytotoxic activities against human leukemia K562, HL-60, HeLa, HCT-116, A549, normal human hepatocytes L-02, and human hepatocellular carcinoma BEL-7402 cell lines, but no activity was observed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Clavirolide", "H", "was", "evaluated", "for", "cytotoxic", "activities", "against", "human", "leukemia", "K562", ",", "HL-60", ",", "HeLa", ",", "HCT-116", ",", "A549", ",", "normal", "human", "hepatocytes", "L-02", ",", "and", "human", "hepatocellular", "carcinoma", "BEL-7402", "cell", "lines", ",", "but", "no", "activity", "was", "observed", "." ] } ]
PMC11680049
During the cultivation process, the tissue turned dark brown with small green elements, and growth processes were completely halted, leading to partial tissue death.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "During", "the", "cultivation", "process", ",", "the", "tissue", "turned", "dark", "brown", "with", "small", "green", "elements", ",", "and", "growth", "processes", "were", "completely", "halted", ",", "leading", "to", "partial", "tissue", "death", "." ] } ]
PMC9429973
Among others, sgRNAs targeting BCL2, BRIP1 or COPS2 dropped out in the in vivo screen specifically during treatment; single knockout experiments confirmed that knockout of either BCL2, BRIP1 or COPS2 re-sensitized PDX ALL cells towards chemotherapy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "others", ",", "sgRNAs", "targeting", "BCL2", ",", "BRIP1", "or", "COPS2", "dropped", "out", "in", "the", "in", "vivo", "screen", "specifically", "during", "treatment", ";", "single", "knockout", "experiments", "confirmed", "that", "knockout", "of", "either", "BCL2", ",", "BRIP1", "or", "COPS2", "re-sensitized", "PDX", "ALL", "cells", "towards", "chemotherapy", "." ] } ]
PMC3931643
The parental and scrambled-shRNA control VAL cells behaved as expected with no significant increase in death with MLN0128.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "parental", "and", "scrambled-shRNA", "control", "VAL", "cells", "behaved", "as", "expected", "with", "no", "significant", "increase", "in", "death", "with", "MLN0128", "." ] } ]
PMC11782508
Lane M: 1 kb Gene Ruler (Fermentas, UK), Lane 1: PCR amplicon of the azurin gene (azu) from isolate 105 with the expected size of 442 bp. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lane", "M", ":", "1", "kb", "Gene", "Ruler", "(", "Fermentas", ",", "UK", ")", ",", "Lane", "1", ":", "PCR", "amplicon", "of", "the", "azurin", "gene", "(", "azu", ")", "from", "isolate", "105", "with", "the", "expected", "size", "of", "442", "bp", ".", "(" ] } ]
PMC10652261
Leukemia, the most common childhood cancer, is a category of hematological malignancies caused by the rapid and uncontrolled proliferation of aberrant white blood cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Leukemia", ",", "the", "most", "common", "childhood", "cancer", ",", "is", "a", "category", "of", "hematological", "malignancies", "caused", "by", "the", "rapid", "and", "uncontrolled", "proliferation", "of", "aberrant", "white", "blood", "cells", "." ] } ]
PMC9318744
Although those receptors increase virus entry, they do not support virus infection in the absence of the ACE2 receptor .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "those", "receptors", "increase", "virus", "entry", ",", "they", "do", "not", "support", "virus", "infection", "in", "the", "absence", "of", "the", "ACE2", "receptor", "." ] } ]
PMC11190238
In another model of ovarian cancer cells, the loss of the epithelial-specific TF GRHL2 causes the switch of the chromatin states at the promoters of known EMT signature genes during EMT.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "another", "model", "of", "ovarian", "cancer", "cells", ",", "the", "loss", "of", "the", "epithelial-specific", "TF", "GRHL2", "causes", "the", "switch", "of", "the", "chromatin", "states", "at", "the", "promoters", "of", "known", "EMT", "signature", "genes", "during", "EMT", "." ] } ]
PMC6799808
Here, we show that ReishiMax GLp, containing G. lucidum polysaccharides and triterpenes (GLPT), inhibited cell proliferation and induced cell death in human lung cancer cells (A549 and A427) and simultaneously suppressed the signaling pathways of mammalian target of rapamycin complexes 1 and 2 (mTORC1 and mTORC2), respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "we", "show", "that", "ReishiMax", "GLp", ",", "containing", "G.", "lucidum", "polysaccharides", "and", "triterpenes", "(", "GLPT", ")", ",", "inhibited", "cell", "proliferation", "and", "induced", "cell", "death", "in", "human", "lung", "cancer", "cells", "(", "A549", "and", "A427", ")", "and", "simultaneously", "suppressed", "the", "signaling", "pathways", "of", "mammalian", "target", "of", "rapamycin", "complexes", "1", "and", "2", "(", "mTORC1", "and", "mTORC2", ")", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11012012
The type of cell, the type of SLAMF receptor, and the predominating ITSM-binding ligand will determine which signaling pathways will be activated or inhibited and what will be the resulting biological effect.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "type", "of", "cell", ",", "the", "type", "of", "SLAMF", "receptor", ",", "and", "the", "predominating", "ITSM-binding", "ligand", "will", "determine", "which", "signaling", "pathways", "will", "be", "activated", "or", "inhibited", "and", "what", "will", "be", "the", "resulting", "biological", "effect", "." ] } ]
PMC11539788
Therefore, we examined the effect of RNF19A on the activity of mTOR signalling via western blotting, and the results revealed decreased phosphorylation levels of AKT, mTOR, and S6K1 in RNF19A-overexpressing BCa cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "we", "examined", "the", "effect", "of", "RNF19A", "on", "the", "activity", "of", "mTOR", "signalling", "via", "western", "blotting", ",", "and", "the", "results", "revealed", "decreased", "phosphorylation", "levels", "of", "AKT", ",", "mTOR", ",", "and", "S6K1", "in", "RNF19A-overexpressing", "BCa", "cells", "." ] } ]
PMC11753949
Another protein tested, GFP-Sec61β, however, was localized in SALs, indicating that not every ER protein is excluded from them (Figure S5).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Another", "protein", "tested", ",", "GFP-Sec61β", ",", "however", ",", "was", "localized", "in", "SALs", ",", "indicating", "that", "not", "every", "ER", "protein", "is", "excluded", "from", "them", "(", "Figure", "S5", ")", "." ] } ]
PMC11655498
In addition to the EBV-encoded proteins described above, the process of EBV reactivation is also regulated by distinct miRNAs (Figure 2C and Table 2).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "the", "EBV-encoded", "proteins", "described", "above", ",", "the", "process", "of", "EBV", "reactivation", "is", "also", "regulated", "by", "distinct", "miRNAs", "(", "Figure", "2C", "and", "Table", "2", ")", "." ] } ]
PMC9952933
Further, 200 µL cell suspension was treated with CAP for 0 s, 5 s, 10 s, 20 s, and 40 s. In addition, 200 µL of medium without cells was treated identically.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Further", ",", "200", "µL", "cell", "suspension", "was", "treated", "with", "CAP", "for", "0", "s", ",", "5", "s", ",", "10", "s", ",", "20", "s", ",", "and", "40", "s.", "In", "addition", ",", "200", "µL", "of", "medium", "without", "cells", "was", "treated", "identically", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: We used a combination of flow cytometry, ELISA and qRT-PCR to determine protein and mRNA expression of both IL21 and IL21R in primary AML samples and analyzed the correlation between IL21 serum levels with patients’ survival and complete remission rate.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "We", "used", "a", "combination", "of", "flow", "cytometry", ",", "ELISA", "and", "qRT-PCR", "to", "determine", "protein", "and", "mRNA", "expression", "of", "both", "IL21", "and", "IL21R", "in", "primary", "AML", "samples", "and", "analyzed", "the", "correlation", "between", "IL21", "serum", "levels", "with", "patients", "’", "survival", "and", "complete", "remission", "rate", "." ] } ]
PMC11489351
A, representative confocal images of MCF10A cells treated for 24 h with EIPA to lower pHi or NH4Cl to raise pHi.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", ",", "representative", "confocal", "images", "of", "MCF10A", "cells", "treated", "for", "24", "h", "with", "EIPA", "to", "lower", "pHi", "or", "NH4Cl", "to", "raise", "pHi", "." ] } ]
PMC11765243
Interestingly, as observed in the thymus, the percentage of Foxp3CD25 Treg among CD4 T cells was significantly lower in p110αKD-T spleens (Figure 5C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "as", "observed", "in", "the", "thymus", ",", "the", "percentage", "of", "Foxp3CD25", "Treg", "among", "CD4", "T", "cells", "was", "significantly", "lower", "in", "p110αKD-T", "spleens", "(", "Figure", "5C", ")", "." ] } ]
PMC10926885
From the TCGA database, we took the NDE1 expression data, processed it using log2(X + 1) and then took the gene expression profile of each tumour included in the data.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "From", "the", "TCGA", "database", ",", "we", "took", "the", "NDE1", "expression", "data", ",", "processed", "it", "using", "log2(X", "+", "1", ")", "and", "then", "took", "the", "gene", "expression", "profile", "of", "each", "tumour", "included", "in", "the", "data", "." ] } ]
PMC6364197
PCL scaffold increased cell survival and drug resistance toward chemotherapy drug Ara-C and daunorubicin (DNR).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PCL", "scaffold", "increased", "cell", "survival", "and", "drug", "resistance", "toward", "chemotherapy", "drug", "Ara-C", "and", "daunorubicin", "(", "DNR", ")", "." ] } ]
PMC11730320
Reduced responsiveness to IL-7 is likely to limit CD8+ memory T cell survival, contributing to the preferential loss of CD8+ T cells seen in the patient.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Reduced", "responsiveness", "to", "IL-7", "is", "likely", "to", "limit", "CD8", "+", "memory", "T", "cell", "survival", ",", "contributing", "to", "the", "preferential", "loss", "of", "CD8", "+", "T", "cells", "seen", "in", "the", "patient", "." ] } ]
PMC6835428
Novel therapeutic approaches include the use of poly (ADP-Ribose) polymerase (PARP) inhibitors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Novel", "therapeutic", "approaches", "include", "the", "use", "of", "poly", "(", "ADP-Ribose", ")", "polymerase", "(", "PARP", ")", "inhibitors", "." ] } ]
PMC11792888
Briefly, scorpion venom was obtained from adult R. junceus scorpions by electrical stimulation, centrifuged at 13,000 rpm for 15 min, and soluble protein supernatant filtered through a 0.2-µm syringe filter.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "scorpion", "venom", "was", "obtained", "from", "adult", "R.", "junceus", "scorpions", "by", "electrical", "stimulation", ",", "centrifuged", "at", "13,000", "rpm", "for", "15", "min", ",", "and", "soluble", "protein", "supernatant", "filtered", "through", "a", "0.2-µm", "syringe", "filter", "." ] } ]
PMC8414691
Cells were stained with DAPI (blue) and anti-α-Tubulin (green).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "stained", "with", "DAPI", "(", "blue", ")", "and", "anti-α-Tubulin", "(", "green", ")", "." ] } ]
PMC6364197
We further explored the possible mechanisms that lead to cell chemoresistance.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "further", "explored", "the", "possible", "mechanisms", "that", "lead", "to", "cell", "chemoresistance", "." ] } ]
PMC11381192
Validation of ENO1 expression in cell lines and clinical samples. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Validation", "of", "ENO1", "expression", "in", "cell", "lines", "and", "clinical", "samples", ".", "(" ] } ]
PMC10969097
HMG-CoA reductase is considered a metabolic oncogene that can promote tumour growth and cooperates with Ras for colony formation .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HMG-CoA", "reductase", "is", "considered", "a", "metabolic", "oncogene", "that", "can", "promote", "tumour", "growth", "and", "cooperates", "with", "Ras", "for", "colony", "formation", "." ] } ]
PMC11746948
g Immunoblot confirmation of APT2 and GPX4 expression in A375 cells with APT2 knockdown, infected with HA-APT2 lentivirus.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "g", "Immunoblot", "confirmation", "of", "APT2", "and", "GPX4", "expression", "in", "A375", "cells", "with", "APT2", "knockdown", ",", "infected", "with", "HA-APT2", "lentivirus", "." ] } ]
PMC11612315
Given the essential role that GLP-1 plays in regulating glucose levels in the body, we primarily utilized intraperitoneal glucose administration and assessed changes in heat sensitivity in mice via hot plate tests.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Given", "the", "essential", "role", "that", "GLP-1", "plays", "in", "regulating", "glucose", "levels", "in", "the", "body", ",", "we", "primarily", "utilized", "intraperitoneal", "glucose", "administration", "and", "assessed", "changes", "in", "heat", "sensitivity", "in", "mice", "via", "hot", "plate", "tests", "." ] } ]
PMC11366496
RNF122 knocked down efficiency in LN‐229 and A‐172 cells, which were validated by WB (Figure S1E).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RNF122", "knocked", "down", "efficiency", "in", "LN‐229", "and", "A‐172", "cells", ",", "which", "were", "validated", "by", "WB", "(", "Figure", "S1E", ")", "." ] } ]
PMC8806312
KEGG pathway analysis of differentially immune-related genes A total of nine DIRGs related to clinical outcomes were extracted (P < 0.05) (Table 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "KEGG", "pathway", "analysis", "of", "differentially", "immune-related", "genes", "A", "total", "of", "nine", "DIRGs", "related", "to", "clinical", "outcomes", "were", "extracted", "(", "P", "<", "0.05", ")", "(", "Table", "1", ")", "." ] } ]
PMC11087766
This is consistent with previous results that two surface-exposed amino acids which are distant in the primary sequence are essential for the localization of GFPmut1 to the PhiKZ nucleus (10).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "is", "consistent", "with", "previous", "results", "that", "two", "surface-exposed", "amino", "acids", "which", "are", "distant", "in", "the", "primary", "sequence", "are", "essential", "for", "the", "localization", "of", "GFPmut1", "to", "the", "PhiKZ", "nucleus", "(", "10", ")", "." ] } ]
PMC11478724
Shi et al. (2016) proposed hsa-MiR-25, hsa-MiR-146, and hsa-MiR-210 as biomarkers for predicting PMX efficacy in lung adenocarcinoma.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Shi", "et", "al.", "(", "2016", ")", "proposed", "hsa-MiR-25", ",", "hsa-MiR-146", ",", "and", "hsa-MiR-210", "as", "biomarkers", "for", "predicting", "PMX", "efficacy", "in", "lung", "adenocarcinoma", "." ] } ]
PMC9429973
F. Stella, V. Marasco, G. Levati, A. Guidetti, A. Chiappella, G. Perrone, M. Pennisi, C. Tecchio, N. Mordini, G. Ferrara, G. Gobbi, L. Saracino, C. Carniti, P. Corradini Dept.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "F.", "Stella", ",", "V.", "Marasco", ",", "G.", "Levati", ",", "A.", "Guidetti", ",", "A.", "Chiappella", ",", "G.", "Perrone", ",", "M.", "Pennisi", ",", "C.", "Tecchio", ",", "N.", "Mordini", ",", "G.", "Ferrara", ",", "G.", "Gobbi", ",", "L.", "Saracino", ",", "C.", "Carniti", ",", "P.", "Corradini", "Dept", "." ] } ]
PMC8956657
Interestingly the mammalian host PDE-domain containing A-kinase anchoring protein 7 gamma (AKAP7γ) (which has been proposed as the common genetic origin of ORF4b, NS2, and VP3) does contain an N-terminal NLS motif and localizes strongly to the nucleus, however, the NLS region is not homologous to that of merbecovirus ORF4b.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", "the", "mammalian", "host", "PDE-domain", "containing", "A-kinase", "anchoring", "protein", "7", "gamma", "(", "AKAP7γ", ")", "(", "which", "has", "been", "proposed", "as", "the", "common", "genetic", "origin", "of", "ORF4b", ",", "NS2", ",", "and", "VP3", ")", "does", "contain", "an", "N-terminal", "NLS", "motif", "and", "localizes", "strongly", "to", "the", "nucleus", ",", "however", ",", "the", "NLS", "region", "is", "not", "homologous", "to", "that", "of", "merbecovirus", "ORF4b", "." ] } ]
PMC5941560
Investigations into microsatellite instability revealed that MSH2 is not expressed in Jurkat due to a stop-gained point mutation in exon 13 .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Investigations", "into", "microsatellite", "instability", "revealed", "that", "MSH2", "is", "not", "expressed", "in", "Jurkat", "due", "to", "a", "stop-gained", "point", "mutation", "in", "exon", "13", "." ] } ]
PMC11095939
not significant; ***p<0.001; ****p<0.0001 by two-way ANOVA. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "not", "significant", ";", "*", "*", "*", "p<0.001", ";", "*", "*", "*", "*", "p<0.0001", "by", "two-way", "ANOVA", ".", "(" ] } ]
PMC11680562
Pectin (extra pure), xanthan gum (food grade), and sodium hydroxide were obtained from the Fine Chem Lab, Chennai.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pectin", "(", "extra", "pure", ")", ",", "xanthan", "gum", "(", "food", "grade", ")", ",", "and", "sodium", "hydroxide", "were", "obtained", "from", "the", "Fine", "Chem", "Lab", ",", "Chennai", "." ] } ]
PMC9429973
Pathology services should try to standardise their language to reduce the amount of ambiguity in their reports.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pathology", "services", "should", "try", "to", "standardise", "their", "language", "to", "reduce", "the", "amount", "of", "ambiguity", "in", "their", "reports", "." ] } ]
PMC10093184
The number of migrating/invading cells were counted in five independent microscopic fields.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "number", "of", "migrating/invading", "cells", "were", "counted", "in", "five", "independent", "microscopic", "fields", "." ] } ]
PMC9429973
According to the plasmatic levels of each lncRNA patients were split into two groups (low- or high-) and this subdivision was used to unveil the potential correlation between the various lncRNAs and the clinical features of MF patients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "According", "to", "the", "plasmatic", "levels", "of", "each", "lncRNA", "patients", "were", "split", "into", "two", "groups", "(", "low-", "or", "high-", ")", "and", "this", "subdivision", "was", "used", "to", "unveil", "the", "potential", "correlation", "between", "the", "various", "lncRNAs", "and", "the", "clinical", "features", "of", "MF", "patients", "." ] } ]
PMC9429973
X. Yin, Z. Li, L. Chunyi, W. yan, J. Wang, Y. Si, S. Cui, R. Xu Shandong University of Traditional Chinese Medicine; Shandong University of Traditional Chinese Medicine Affiliated Hospital, Jinan, China Background: AML is a malignant tumor caused by changes in myeloid hematopoietic stem cells and abnormal changes in the proportion of primitive and immature myeloid cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "X.", "Yin", ",", "Z.", "Li", ",", "L.", "Chunyi", ",", "W.", "yan", ",", "J.", "Wang", ",", "Y.", "Si", ",", "S.", "Cui", ",", "R.", "Xu", "Shandong", "University", "of", "Traditional", "Chinese", "Medicine", ";", "Shandong", "University", "of", "Traditional", "Chinese", "Medicine", "Affiliated", "Hospital", ",", "Jinan", ",", "China", "Background", ":", "AML", "is", "a", "malignant", "tumor", "caused", "by", "changes", "in", "myeloid", "hematopoietic", "stem", "cells", "and", "abnormal", "changes", "in", "the", "proportion", "of", "primitive", "and", "immature", "myeloid", "cells", "." ] } ]
PMC11298021
This manuscript is extracted from Ph.D. research thesis of Fateme Arjmand submitted to Zanjan University of Medical Sciences, Zanjan, Iran.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "manuscript", "is", "extracted", "from", "Ph.D.", "research", "thesis", "of", "Fateme", "Arjmand", "submitted", "to", "Zanjan", "University", "of", "Medical", "Sciences", ",", "Zanjan", ",", "Iran", "." ] } ]
PMC11610461
Presenilin enhancer gamma-secretase subunit (PSENEN), the straight target of metformin, is highly expressed in several cancers.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Presenilin", "enhancer", "gamma-secretase", "subunit", "(", "PSENEN", ")", ",", "the", "straight", "target", "of", "metformin", ",", "is", "highly", "expressed", "in", "several", "cancers", "." ] } ]
PMC10854447
FTIR spectra of target compounds 7a–o confirmed the disappearance of (NH2) and (C = O) peaks of the precursor aryl carboximidamides 6a–o. The presence of (CH) peaks at 3144, 3001, 2965 cm, (C = N and C = C) peaks at 1602, 1579, 1468 cm, and (Ar–CH bending) at 856 cm in the FTIR spectrum of compound 7g as a representative example verified the prior observations.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "FTIR", "spectra", "of", "target", "compounds", "7a", "–", "o", "confirmed", "the", "disappearance", "of", "(", "NH2", ")", "and", "(", "C", "=", "O", ")", "peaks", "of", "the", "precursor", "aryl", "carboximidamides", "6a", "–", "o.", "The", "presence", "of", "(", "CH", ")", "peaks", "at", "3144", ",", "3001", ",", "2965", "cm", ",", "(", "C", "=", "N", "and", "C", "=", "C", ")", "peaks", "at", "1602", ",", "1579", ",", "1468", "cm", ",", "and", "(", "Ar", "–", "CH", "bending", ")", "at", "856", "cm", "in", "the", "FTIR", "spectrum", "of", "compound", "7", "g", "as", "a", "representative", "example", "verified", "the", "prior", "observations", "." ] } ]
PMC11721587
Both the cytoplasmic and nuclear Ci complexes migrated to similar position (~600 Kd) on blue native gels (BN-PAGE) that preserve the native composition of protein complexes (fig. S3C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Both", "the", "cytoplasmic", "and", "nuclear", "Ci", "complexes", "migrated", "to", "similar", "position", "(", "~600", "Kd", ")", "on", "blue", "native", "gels", "(", "BN-PAGE", ")", "that", "preserve", "the", "native", "composition", "of", "protein", "complexes", "(", "fig.", "S3C", ")", "." ] } ]
PMC9739791
In addition, the photoabsorbers that are utilized to reduce Pt(IV) prodrugs in the presence of light could also act as PDT agents, thus combining the advantages of PDT and PACT in one approach .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "the", "photoabsorbers", "that", "are", "utilized", "to", "reduce", "Pt(IV", ")", "prodrugs", "in", "the", "presence", "of", "light", "could", "also", "act", "as", "PDT", "agents", ",", "thus", "combining", "the", "advantages", "of", "PDT", "and", "PACT", "in", "one", "approach", "." ] } ]
PMC10890055
The resulting cell density was higher and, therefore, the concentration of Zn per cell was lower.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "resulting", "cell", "density", "was", "higher", "and", ",", "therefore", ",", "the", "concentration", "of", "Zn", "per", "cell", "was", "lower", "." ] } ]
PMC11462929
The middle panel indicates chromatin immunoprecipitation‐sequencing (ChIP‐seq) analysis for histone modifications (H3K27ac, H3K4me1, and H3K4me3) in NALM6 expressing high levels of the MYC gene.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "middle", "panel", "indicates", "chromatin", "immunoprecipitation‐sequencing", "(", "ChIP‐seq", ")", "analysis", "for", "histone", "modifications", "(", "H3K27ac", ",", "H3K4me1", ",", "and", "H3K4me3", ")", "in", "NALM6", "expressing", "high", "levels", "of", "the", "MYC", "gene", "." ] } ]
PMC11597167
Supporting our results, the expression of TNF-α is increased after gallic acid treatment through necroptosis .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Supporting", "our", "results", ",", "the", "expression", "of", "TNF-α", "is", "increased", "after", "gallic", "acid", "treatment", "through", "necroptosis", "." ] } ]
PMC11723210
Moreover, the phase obtained from both methods is utilized to quantify the changes in dry mass throughout the cell division process (Figure 5c).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "the", "phase", "obtained", "from", "both", "methods", "is", "utilized", "to", "quantify", "the", "changes", "in", "dry", "mass", "throughout", "the", "cell", "division", "process", "(", "Figure", "5c", ")", "." ] } ]
PMC10165258
non-significant; ∗: .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "non-significant", ";", "∗", ":", "." ] } ]
PMC6901583
Tumor volume growth curves from day 1 to 19 of treatment are presented.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Tumor", "volume", "growth", "curves", "from", "day", "1", "to", "19", "of", "treatment", "are", "presented", "." ] } ]
PMC9429973
Then 80 patients with ICUS were followed up to January 2022.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Then", "80", "patients", "with", "ICUS", "were", "followed", "up", "to", "January", "2022", "." ] } ]
PMC10114490
B Representative phase contrast images of iHDF and iHDF-T at PD (just derived; approximately PD24), PD (PD 30–40) and PD (PD 100–110).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", "Representative", "phase", "contrast", "images", "of", "iHDF", "and", "iHDF-T", "at", "PD", "(", "just", "derived", ";", "approximately", "PD24", ")", ",", "PD", "(", "PD", "30–40", ")", "and", "PD", "(", "PD", "100–110", ")", "." ] } ]
PMC11499955
In addition, as the chemistry behind this technology allows the bioorthogonal, mild detachment of tags from antibodies (no apparent cell toxicity of DBCO was found at concentrations up to 400 μM, Fig. S12†), cyclic MS detection is theoretically possible.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "as", "the", "chemistry", "behind", "this", "technology", "allows", "the", "bioorthogonal", ",", "mild", "detachment", "of", "tags", "from", "antibodies", "(", "no", "apparent", "cell", "toxicity", "of", "DBCO", "was", "found", "at", "concentrations", "up", "to", "400", "μM", ",", "Fig.", "S12†", ")", ",", "cyclic", "MS", "detection", "is", "theoretically", "possible", "." ] } ]
PMC11777207
The same experiment was completed three times with two to three mice per treatment group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "same", "experiment", "was", "completed", "three", "times", "with", "two", "to", "three", "mice", "per", "treatment", "group", "." ] } ]
PMC11391695
TERT plays a pivotal role in the initiation of cancer, ensuring genomic stability by preserving telomere length and enabling cells to evade senescence .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TERT", "plays", "a", "pivotal", "role", "in", "the", "initiation", "of", "cancer", ",", "ensuring", "genomic", "stability", "by", "preserving", "telomere", "length", "and", "enabling", "cells", "to", "evade", "senescence", "." ] } ]
PMC11470381
Mix the cells by gentle pipetting and transfer the cells to culture plates containing equilibrated post-nucleofection RPMI medium.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mix", "the", "cells", "by", "gentle", "pipetting", "and", "transfer", "the", "cells", "to", "culture", "plates", "containing", "equilibrated", "post-nucleofection", "RPMI", "medium", "." ] } ]
PMC8389560
It has been shown that under the action of the Ca-ATPase ER blocker, Thapsigargin, cyt c is released .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "has", "been", "shown", "that", "under", "the", "action", "of", "the", "Ca-ATPase", "ER", "blocker", ",", "Thapsigargin", ",", "cyt", "c", "is", "released", "." ] } ]
PMC9429973
In preliminary analyses, the annual pooled rate of MGUS progression was 1.1% (95%CI 0.9-1.3) to HM and 0.9% (95%CI 0.7-1.1) to MM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "preliminary", "analyses", ",", "the", "annual", "pooled", "rate", "of", "MGUS", "progression", "was", "1.1", "%", "(", "95%CI", "0.9", "-", "1.3", ")", "to", "HM", "and", "0.9", "%", "(", "95%CI", "0.7", "-", "1.1", ")", "to", "MM", "." ] } ]
PMC9429973
After recovery 20pts (55%) had active myeloma, reinfection was found in 5pts (13.5%) and they were in active phase of disease.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "recovery", "20pts", "(", "55", "%", ")", "had", "active", "myeloma", ",", "reinfection", "was", "found", "in", "5pts", "(", "13.5", "%", ")", "and", "they", "were", "in", "active", "phase", "of", "disease", "." ] } ]
PMC11453018
C Kaplan-Meier survival curves reveal significant differences in survival outcomes between the two patient groups identified through NMF clustering.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "Kaplan-Meier", "survival", "curves", "reveal", "significant", "differences", "in", "survival", "outcomes", "between", "the", "two", "patient", "groups", "identified", "through", "NMF", "clustering", "." ] } ]
PMC11705547
More than 60% of patients who receive chemotherapy (e.g. neoadjuvant chemotherapy) are resistant to cisplatin .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "More", "than", "60", "%", "of", "patients", "who", "receive", "chemotherapy", "(", "e.g.", "neoadjuvant", "chemotherapy", ")", "are", "resistant", "to", "cisplatin", "." ] } ]
PMC9429973
Clinical trial information: NCT04778397.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Clinical", "trial", "information", ":", "NCT04778397", "." ] } ]
PMC8041314
In order to obtain novel agents that had scaffolds not associated with simultaneous inhibition of ABCB1, ABCC1, and ABCG2 before, substructures of Supplementary Table 4 were emphasized that have not been part of any of the 1049 molecules, which was the case for 146 substructures.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "order", "to", "obtain", "novel", "agents", "that", "had", "scaffolds", "not", "associated", "with", "simultaneous", "inhibition", "of", "ABCB1", ",", "ABCC1", ",", "and", "ABCG2", "before", ",", "substructures", "of", "Supplementary", "Table", "4", "were", "emphasized", "that", "have", "not", "been", "part", "of", "any", "of", "the", "1049", "molecules", ",", "which", "was", "the", "case", "for", "146", "substructures", "." ] } ]
PMC11402217
Through extensive pharmacological experiments conducted at the genetic, cellular, and animal levels, we aim to provide compelling evidence supporting the use of DKK1 small molecule inhibitors as a promising treatment option for metastatic OS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Through", "extensive", "pharmacological", "experiments", "conducted", "at", "the", "genetic", ",", "cellular", ",", "and", "animal", "levels", ",", "we", "aim", "to", "provide", "compelling", "evidence", "supporting", "the", "use", "of", "DKK1", "small", "molecule", "inhibitors", "as", "a", "promising", "treatment", "option", "for", "metastatic", "OS", "." ] } ]
PMC9429973
The women’s age ranged from 27 to 49 years (median 38 years).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "women", "’s", "age", "ranged", "from", "27", "to", "49", "years", "(", "median", "38", "years", ")", "." ] } ]
PMC11590005
It is essential to reflect upon the implications and understand the na-ture of prejudice .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "essential", "to", "reflect", "upon", "the", "implications", "and", "understand", "the", "na-ture", "of", "prejudice", "." ] } ]
PMC7642379
Suspension cell lines 293-F, 293-H and Freestyle 293-F (Gibco) were obtained from Thermo Fisher Scientific and cultivated in 293 SFM II medium (Gibco) supplemented with Glutamax at a final concentration of 4 mM (Gibco).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Suspension", "cell", "lines", "293-F", ",", "293-H", "and", "Freestyle", "293-F", "(", "Gibco", ")", "were", "obtained", "from", "Thermo", "Fisher", "Scientific", "and", "cultivated", "in", "293", "SFM", "II", "medium", "(", "Gibco", ")", "supplemented", "with", "Glutamax", "at", "a", "final", "concentration", "of", "4", "mM", "(", "Gibco", ")", "." ] } ]
PMC11742431
Proteolysis targeting chimeras (PROTACs) are an innovative class of molecules that have been employed to selectively degrade proteins of interest. ,
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Proteolysis", "targeting", "chimeras", "(", "PROTACs", ")", "are", "an", "innovative", "class", "of", "molecules", "that", "have", "been", "employed", "to", "selectively", "degrade", "proteins", "of", "interest", ".", "," ] } ]
PMC7081114
All the experiments were conducted in triplicate.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "the", "experiments", "were", "conducted", "in", "triplicate", "." ] } ]
PMC6799808
The results are presented as the mean ± SD (mean value ± standard deviation).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "are", "presented", "as", "the", "mean", "±", "SD", "(", "mean", "value", "±", "standard", "deviation", ")", "." ] } ]
PMC8481254
P < 0.01, ***P < 0.001, ****P < 0.0001.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P", "<", "0.01", ",", "*", "*", "*", "P", "<", "0.001", ",", "*", "*", "*", "*", "P", "<", "0.0001", "." ] } ]
PMC2196094
Nucleotide or aa sequences for a large panel of mature (NH2-terminally processed) hematopoietic serine proteases and some selected non-hematopoietic serine proteases were compared using the pairwise algorithm in the DNASTAR program (for Macintosh; DNASTAR, Ltd. London, UK).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nucleotide", "or", "aa", "sequences", "for", "a", "large", "panel", "of", "mature", "(", "NH2-terminally", "processed", ")", "hematopoietic", "serine", "proteases", "and", "some", "selected", "non-hematopoietic", "serine", "proteases", "were", "compared", "using", "the", "pairwise", "algorithm", "in", "the", "DNASTAR", "program", "(", "for", "Macintosh", ";", "DNASTAR", ",", "Ltd.", "London", ",", "UK", ")", "." ] } ]
PMC11599565
The neuronal nature of these cells is confirmed by the expression of βIII-tubulin (F).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "neuronal", "nature", "of", "these", "cells", "is", "confirmed", "by", "the", "expression", "of", "βIII-tubulin", "(", "F", ")", "." ] } ]
PMC11638288
Moreover, research has demonstrated that NKp46 on group 1 NKp46 innate lymphoid cells (ILCs) binds to soluble plasma glycoproteins, the complement factor P (CFP; properdin).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "research", "has", "demonstrated", "that", "NKp46", "on", "group", "1", "NKp46", "innate", "lymphoid", "cells", "(", "ILCs", ")", "binds", "to", "soluble", "plasma", "glycoproteins", ",", "the", "complement", "factor", "P", "(", "CFP", ";", "properdin", ")", "." ] } ]
PMC11047729
The levels of p-Akt were decreased in a dose-dependent manner after 24 h .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "levels", "of", "p-Akt", "were", "decreased", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "after", "24", "h", "." ] } ]
PMC2193049
In a survey of antigenic peptides carrying the motif Ala–Leu–Val present at the COOH terminus of peptide MAGE-3271–279, we identified two such peptides.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "a", "survey", "of", "antigenic", "peptides", "carrying", "the", "motif", "Ala", "–", "Leu", "–", "Val", "present", "at", "the", "COOH", "terminus", "of", "peptide", "MAGE-3271–279", ",", "we", "identified", "two", "such", "peptides", "." ] } ]
PMC9429973
The aims of this study were to (1) characterize the concentration versus response relationship of IGM-2323 in vitro and compare with bispecific IgG TCEs, and (2) build a mechanistic binding model based on preclinical in vitro data to aid in prediction of an optimal dose of IGM-2323 in the clinic.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "aims", "of", "this", "study", "were", "to", "(", "1", ")", "characterize", "the", "concentration", "versus", "response", "relationship", "of", "IGM-2323", "in", "vitro", "and", "compare", "with", "bispecific", "IgG", "TCEs", ",", "and", "(", "2", ")", "build", "a", "mechanistic", "binding", "model", "based", "on", "preclinical", "in", "vitro", "data", "to", "aid", "in", "prediction", "of", "an", "optimal", "dose", "of", "IGM-2323", "in", "the", "clinic", "." ] } ]
PMC3122064
Suppression of MDM2 with siRNA extremely sensitised TC cells to cisplatin-induced apoptosis, almost similar to our observations with Nutlin-3.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Suppression", "of", "MDM2", "with", "siRNA", "extremely", "sensitised", "TC", "cells", "to", "cisplatin-induced", "apoptosis", ",", "almost", "similar", "to", "our", "observations", "with", "Nutlin-3", "." ] } ]
PMC11265931
Neuroblastomas constitute almost 7% of all cancers in children and adolescents, and these are the most common solid tumors after central nervous system tumors (Van Heerden et al., 2021).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Neuroblastomas", "constitute", "almost", "7", "%", "of", "all", "cancers", "in", "children", "and", "adolescents", ",", "and", "these", "are", "the", "most", "common", "solid", "tumors", "after", "central", "nervous", "system", "tumors", "(", "Van", "Heerden", "et", "al.", ",", "2021", ")", "." ] } ]
PMC9429973
We also suggest that EPOR-mutant erythrocytoses differentiate from HIF2A- and VHL-mutant erythrocytoses not only in low EPO levels, but also in the regulation of systemic iron homeostasis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "also", "suggest", "that", "EPOR-mutant", "erythrocytoses", "differentiate", "from", "HIF2A-", "and", "VHL-mutant", "erythrocytoses", "not", "only", "in", "low", "EPO", "levels", ",", "but", "also", "in", "the", "regulation", "of", "systemic", "iron", "homeostasis", "." ] } ]
PMC11519077
Patients with IBD may experience gastrointestinal pain, diarrhea, hematochezia, and unintentional weight loss at first .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patients", "with", "IBD", "may", "experience", "gastrointestinal", "pain", ",", "diarrhea", ",", "hematochezia", ",", "and", "unintentional", "weight", "loss", "at", "first", "." ] } ]
PMC11714165
Quantification of the TRAP‐positive stained area after treatment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Quantification", "of", "the", "TRAP‐positive", "stained", "area", "after", "treatment", "." ] } ]
PMC11088135
After transfection for 48 h, the transfection efficiency was detected by qRT-PCR.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "transfection", "for", "48", "h", ",", "the", "transfection", "efficiency", "was", "detected", "by", "qRT-PCR", "." ] } ]
PMC11422497
Additionally, the development of personalized medicine approaches, tailored to the specific molecular characteristics of individual tumors, holds promise for further improving outcomes in this challenging disease landscape.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "the", "development", "of", "personalized", "medicine", "approaches", ",", "tailored", "to", "the", "specific", "molecular", "characteristics", "of", "individual", "tumors", ",", "holds", "promise", "for", "further", "improving", "outcomes", "in", "this", "challenging", "disease", "landscape", "." ] } ]
PMC11758416
n = 3 (D) Annexin V staining in L cells pre-incubated with anti-CD3 after incubation with unstimulated or anti-CD3/anti-CD28 stimulated naive (∗∗p ≤ 0.01), memory (∗∗p ≤ 0.01) or TEMRA CD8+ T cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "n", "=", "3", "(", "D", ")", "Annexin", "V", "staining", "in", "L", "cells", "pre-incubated", "with", "anti-CD3", "after", "incubation", "with", "unstimulated", "or", "anti-CD3/anti-CD28", "stimulated", "naive", "(", "∗∗p", "≤", "0.01", ")", ",", "memory", "(", "∗∗p", "≤", "0.01", ")", "or", "TEMRA", "CD8", "+", "T", "cells", "." ] } ]
PMC11228511
The A- and B-type lamins assemble into separate but interacting net-like fibrillar meshworks (10–12).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "A-", "and", "B-type", "lamins", "assemble", "into", "separate", "but", "interacting", "net-like", "fibrillar", "meshworks", "(", "10–12", ")", "." ] } ]
PMC11482552
The implementation of molecular Human Papilloma Virus (HPV) assays has accelerated programs based on HPV primary screening for the prevention of HPV-related Cervical Cancer (CC).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "implementation", "of", "molecular", "Human", "Papilloma", "Virus", "(", "HPV", ")", "assays", "has", "accelerated", "programs", "based", "on", "HPV", "primary", "screening", "for", "the", "prevention", "of", "HPV-related", "Cervical", "Cancer", "(", "CC", ")", "." ] } ]
PMC9429973
At the diagnosis, 91% of patients had bone lesions, 56% anemia, 41% hypercalcemia, and 26% presented with impaired renal function.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "the", "diagnosis", ",", "91", "%", "of", "patients", "had", "bone", "lesions", ",", "56", "%", "anemia", ",", "41", "%", "hypercalcemia", ",", "and", "26", "%", "presented", "with", "impaired", "renal", "function", "." ] } ]
PMC11478724
Cells were treated with PMX for 24 and 48 h, then washed, trypsinized, and collected in PBS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "treated", "with", "PMX", "for", "24", "and", "48", "h", ",", "then", "washed", ",", "trypsinized", ",", "and", "collected", "in", "PBS", "." ] } ]
PMC10812665
After 1 h, the treatment compound was applied to the cells, with exposure times ranging between 0 and 24 h. All the samples were collected simultaneously at the end of the experiment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "1", "h", ",", "the", "treatment", "compound", "was", "applied", "to", "the", "cells", ",", "with", "exposure", "times", "ranging", "between", "0", "and", "24", "h.", "All", "the", "samples", "were", "collected", "simultaneously", "at", "the", "end", "of", "the", "experiment", "." ] } ]
PMC9622879
In this section, we consider a community including a group of smart homes , as illustrated in Fig. 1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "section", ",", "we", "consider", "a", "community", "including", "a", "group", "of", "smart", "homes", ",", "as", "illustrated", "in", "Fig.", "1", "." ] } ]
PMC6650823
Highlighted by Tiziano Tuccinardi The PROteolysis-TArgeting Chimera (PROTAC) technology has emerged as a promising therapeutic tool that induces protein degradation by exploiting the ubiquitin proteasome system.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Highlighted", "by", "Tiziano", "Tuccinardi", "The", "PROteolysis-TArgeting", "Chimera", "(", "PROTAC", ")", "technology", "has", "emerged", "as", "a", "promising", "therapeutic", "tool", "that", "induces", "protein", "degradation", "by", "exploiting", "the", "ubiquitin", "proteasome", "system", "." ] } ]
PMC11352666
New strategies for treatment are needed, and molecularly targeted approaches are expected to have fewer side effects .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "New", "strategies", "for", "treatment", "are", "needed", ",", "and", "molecularly", "targeted", "approaches", "are", "expected", "to", "have", "fewer", "side", "effects", "." ] } ]
PMC11707577
The photodamage mediated by M13EGFR(TNP) on cancer cells was further investigated by time lapse confocal microscopy (Figure 6A–F).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "photodamage", "mediated", "by", "M13EGFR(TNP", ")", "on", "cancer", "cells", "was", "further", "investigated", "by", "time", "lapse", "confocal", "microscopy", "(", "Figure", "6A", "–", "F", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Among up-regulated there were MEF2C, MN1, and IGFBP7, which have been all associated with an immature phenotype, and MAF and RUNX2 transcription factors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "up-regulated", "there", "were", "MEF2C", ",", "MN1", ",", "and", "IGFBP7", ",", "which", "have", "been", "all", "associated", "with", "an", "immature", "phenotype", ",", "and", "MAF", "and", "RUNX2", "transcription", "factors", "." ] } ]
PMC11549062
However, the related molecular pathways that participated in the interaction of endo‐lysosome and the trafficking of PDGFR are largely unknown.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "related", "molecular", "pathways", "that", "participated", "in", "the", "interaction", "of", "endo‐lysosome", "and", "the", "trafficking", "of", "PDGFR", "are", "largely", "unknown", "." ] } ]
PMC8708099
We hypothesized that osthole prevents histamine-induced changes in the secretion of pro-(IL-1β, IL-6, IL-8, interferon-gamma—IFN-γ, tumor necrosis factor-alpha—TNF-α) and anti-inflammatory (IL-4, IL-10, IL-13) CKs, and in the expression of genes encoding histamine receptor H1 (HRH1), histamine receptor H4 (HRH4), interleukin 1 receptor type 1 (IL1R1), interleukin 4 receptor (IL4R), nuclear factor-kappa B (NFκB), and cyclooxygenase-2 (COX-2) in the Caco-2 cell line.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "hypothesized", "that", "osthole", "prevents", "histamine-induced", "changes", "in", "the", "secretion", "of", "pro-(IL-1β", ",", "IL-6", ",", "IL-8", ",", "interferon-gamma", "—", "IFN-γ", ",", "tumor", "necrosis", "factor-alpha", "—", "TNF-α", ")", "and", "anti-inflammatory", "(", "IL-4", ",", "IL-10", ",", "IL-13", ")", "CKs", ",", "and", "in", "the", "expression", "of", "genes", "encoding", "histamine", "receptor", "H1", "(", "HRH1", ")", ",", "histamine", "receptor", "H4", "(", "HRH4", ")", ",", "interleukin", "1", "receptor", "type", "1", "(", "IL1R1", ")", ",", "interleukin", "4", "receptor", "(", "IL4R", ")", ",", "nuclear", "factor-kappa", "B", "(", "NFκB", ")", ",", "and", "cyclooxygenase-2", "(", "COX-2", ")", "in", "the", "Caco-2", "cell", "line", "." ] } ]