Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11707832
Eliminating N-glycan expression on tumour cells has shown promise in enhancing the efficacy of immunotherapy .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Eliminating", "N-glycan", "expression", "on", "tumour", "cells", "has", "shown", "promise", "in", "enhancing", "the", "efficacy", "of", "immunotherapy", "." ] } ]
PMC11541241
Key downstream components: ATG, autophagy‐related; RPS6, ribosomal protein S6; S6K1, ribosomal protein S6 kinase; SFP1, major facilitator superfamily protein; SIT4, PP2A‐like protein phosphatase; TAP42, two a‐associated protein of 42 kDa; YPK2, the yeast homologue of SGK1 (serum‐ and glucocorticoid‐activated kinase).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Key", "downstream", "components", ":", "ATG", ",", "autophagy‐related", ";", "RPS6", ",", "ribosomal", "protein", "S6", ";", "S6K1", ",", "ribosomal", "protein", "S6", "kinase", ";", "SFP1", ",", "major", "facilitator", "superfamily", "protein", ";", "SIT4", ",", "PP2A‐like", "protein", "phosphatase", ";", "TAP42", ",", "two", "a‐associated", "protein", "of", "42", "kDa", ";", "YPK2", ",", "the", "yeast", "homologue", "of", "SGK1", "(", "serum‐", "and", "glucocorticoid‐activated", "kinase", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: We obtained a distinctive signature of 24 miRNAs capable of distinguishing pediatric AML patients with excellent or poor outcome.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "We", "obtained", "a", "distinctive", "signature", "of", "24", "miRNAs", "capable", "of", "distinguishing", "pediatric", "AML", "patients", "with", "excellent", "or", "poor", "outcome", "." ] } ]
PMC11612626
Compound A increased the presentation of individual MHC-I–bound peptides by >100-fold and unmasked tumor-specific neoantigens on myeloma cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Compound", "A", "increased", "the", "presentation", "of", "individual", "MHC-I", "–", "bound", "peptides", "by", ">", "100-fold", "and", "unmasked", "tumor-specific", "neoantigens", "on", "myeloma", "cells", "." ] } ]
PMC11746948
d, e Immunoblots of GPX4 in A375 cells pre-treated with 2-BP for 24 h, followed by cycloheximide (CHX) treatment for indicated times (d).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "d", ",", "e", "Immunoblots", "of", "GPX4", "in", "A375", "cells", "pre-treated", "with", "2-BP", "for", "24", "h", ",", "followed", "by", "cycloheximide", "(", "CHX", ")", "treatment", "for", "indicated", "times", "(", "d", ")", "." ] } ]
PMC9429973
The Kaplan-Meier method was used to assess RFS and OS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Kaplan-Meier", "method", "was", "used", "to", "assess", "RFS", "and", "OS", "." ] } ]
PMC11687663
A. helferiana extract exhibited an IC50 value of 236.93 μg/mL, indicating that a relatively large concentration is required to inhibit 50% of the HepG2 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "helferiana", "extract", "exhibited", "an", "IC50", "value", "of", "236.93", "μg/mL", ",", "indicating", "that", "a", "relatively", "large", "concentration", "is", "required", "to", "inhibit", "50", "%", "of", "the", "HepG2", "cells", "." ] } ]
PMC11319300
The resolution of PCHi-C data was not good enough to determine if the interactions were mediated via MYEOV promoter element or MYEOV-3′-putative enhancer, therefore we could only determine if the MYEOV region interacts with either gene.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "resolution", "of", "PCHi-C", "data", "was", "not", "good", "enough", "to", "determine", "if", "the", "interactions", "were", "mediated", "via", "MYEOV", "promoter", "element", "or", "MYEOV-3′-putative", "enhancer", ",", "therefore", "we", "could", "only", "determine", "if", "the", "MYEOV", "region", "interacts", "with", "either", "gene", "." ] } ]
PMC11569208
Significantly downregulated (> 1 log2-fold change) gene expressions were processed by Gorilla to identify relevant gene ontology (GO) terms.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Significantly", "downregulated", "(", ">", "1", "log2-fold", "change", ")", "gene", "expressions", "were", "processed", "by", "Gorilla", "to", "identify", "relevant", "gene", "ontology", "(", "GO", ")", "terms", "." ] } ]
PMC5716223
Skeletal muscle regeneration depends upon optimal activation, proliferation and differentiation of myogenic precursors, the satellite cells, whose behavior is controlled by components, such as cytokines and growth factors, contained in the satellite cell microenvironment .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Skeletal", "muscle", "regeneration", "depends", "upon", "optimal", "activation", ",", "proliferation", "and", "differentiation", "of", "myogenic", "precursors", ",", "the", "satellite", "cells", ",", "whose", "behavior", "is", "controlled", "by", "components", ",", "such", "as", "cytokines", "and", "growth", "factors", ",", "contained", "in", "the", "satellite", "cell", "microenvironment", "." ] } ]
PMC11173119
All obtained cell lines have a large nuclear–cytoplasmic ratio, grow in densely packed iPSC-like single-layer colonies (Figure 1A), and express the early stem cell marker endogenous alkaline phosphatase (Figure 1B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "obtained", "cell", "lines", "have", "a", "large", "nuclear", "–", "cytoplasmic", "ratio", ",", "grow", "in", "densely", "packed", "iPSC-like", "single-layer", "colonies", "(", "Figure", "1A", ")", ",", "and", "express", "the", "early", "stem", "cell", "marker", "endogenous", "alkaline", "phosphatase", "(", "Figure", "1B", ")", "." ] } ]
PMC6617630
c, d ChIP assay was performed in the I-BET-treated DHL (LY1) and THL (Val) cells using BRD4 antibody, and RT-PCR was performed using MYC promoter primers.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "c", ",", "d", "ChIP", "assay", "was", "performed", "in", "the", "I-BET-treated", "DHL", "(", "LY1", ")", "and", "THL", "(", "Val", ")", "cells", "using", "BRD4", "antibody", ",", "and", "RT-PCR", "was", "performed", "using", "MYC", "promoter", "primers", "." ] } ]
PMC9429973
Resilience is positively correlated with quality of life (Spearman’s rho = 0.494, p< 0,001) and negatively with anxiety (-0,609, p<0,01) and depression (-0,537, p<0,001).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Resilience", "is", "positively", "correlated", "with", "quality", "of", "life", "(", "Spearman", "’s", "rho", "=", "0.494", ",", "p", "<", "0,001", ")", "and", "negatively", "with", "anxiety", "(", "-0,609", ",", "p<0,01", ")", "and", "depression", "(", "-0,537", ",", "p<0,001", ")", "." ] } ]
PMC5673955
The massive death of Jurkat cells was determined at the days 15–25 of cultivation (Fig. 4A and C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "massive", "death", "of", "Jurkat", "cells", "was", "determined", "at", "the", "days", "15–25", "of", "cultivation", "(", "Fig.", "4A", "and", "C", ")", "." ] } ]
PMC11804588
Knowing where TF–DNA interactions take place throughout the genome is important because aberrations in TF binding have been linked to developmental disorders, cancers, and complex diseases such as diabetes and neurodegeneration.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Knowing", "where", "TF", "–", "DNA", "interactions", "take", "place", "throughout", "the", "genome", "is", "important", "because", "aberrations", "in", "TF", "binding", "have", "been", "linked", "to", "developmental", "disorders", ",", "cancers", ",", "and", "complex", "diseases", "such", "as", "diabetes", "and", "neurodegeneration", "." ] } ]
PMC9503685
The additional hydrophobic carbons in CSA-131 help anchor the ceragenin on the bacterial membrane and result in lower MICs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "additional", "hydrophobic", "carbons", "in", "CSA-131", "help", "anchor", "the", "ceragenin", "on", "the", "bacterial", "membrane", "and", "result", "in", "lower", "MICs", "." ] } ]
PMC11489175
In humans, the CP class is the best characterized one and includes over 80 proteins.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "humans", ",", "the", "CP", "class", "is", "the", "best", "characterized", "one", "and", "includes", "over", "80", "proteins", "." ] } ]
PMC10994876
The bead stays inside the reaction tube with minimal remaining label that is not bound.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "bead", "stays", "inside", "the", "reaction", "tube", "with", "minimal", "remaining", "label", "that", "is", "not", "bound", "." ] } ]
PMC9964654
The antimicrobial properties of the BCMs and BCMs-[Au(cdc)2] were assessed based on the determination of the MIC values with respect to the Gram-positive bacteria S. aureus Newman and the yeast C. glabrata CBS138, using the microdilution method (Table 7).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "antimicrobial", "properties", "of", "the", "BCMs", "and", "BCMs-[Au(cdc)2", "]", "were", "assessed", "based", "on", "the", "determination", "of", "the", "MIC", "values", "with", "respect", "to", "the", "Gram-positive", "bacteria", "S.", "aureus", "Newman", "and", "the", "yeast", "C.", "glabrata", "CBS138", ",", "using", "the", "microdilution", "method", "(", "Table", "7", ")", "." ] } ]
PMC10975211
Several temporins with antimicrobial activities against Gram-positive bacteria (e.g., S. aureus, B. megaterium, and Streptococcus pyogenes), Gram-negative bacteria (e.g., E. coli, P. aeruginosa, Aeromonas hydrophyla), and fungi (C. candida) exhibited specific anticancer properties against cell lines like MCF-7 (human breast cancer), HeLa, and NCI-H460.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O" ], "tokens": [ "Several", "temporins", "with", "antimicrobial", "activities", "against", "Gram-positive", "bacteria", "(", "e.g.", ",", "S.", "aureus", ",", "B.", "megaterium", ",", "and", "Streptococcus", "pyogenes", ")", ",", "Gram-negative", "bacteria", "(", "e.g.", ",", "E.", "coli", ",", "P.", "aeruginosa", ",", "Aeromonas", "hydrophyla", ")", ",", "and", "fungi", "(", "C.", "candida", ")", "exhibited", "specific", "anticancer", "properties", "against", "cell", "lines", "like", "MCF-7", "(", "human", "breast", "cancer", ")", ",", "HeLa", ",", "and", "NCI-H460", "." ] } ]
PMC11046454
The universality of this Apt-CAR design for target cancer cell-directed T cell activation was further confirmed in different combination of aptamers and cancer cells, including anti-CD71 aptamer (AptCD71) against CD71 CEM cells (Figure S19), and AptEpCAM against 231 cells (Figure S20) but not EpCAM HeLa cells (Figure S21).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "universality", "of", "this", "Apt-CAR", "design", "for", "target", "cancer", "cell-directed", "T", "cell", "activation", "was", "further", "confirmed", "in", "different", "combination", "of", "aptamers", "and", "cancer", "cells", ",", "including", "anti-CD71", "aptamer", "(", "AptCD71", ")", "against", "CD71", "CEM", "cells", "(", "Figure", "S19", ")", ",", "and", "AptEpCAM", "against", "231", "cells", "(", "Figure", "S20", ")", "but", "not", "EpCAM", "HeLa", "cells", "(", "Figure", "S21", ")", "." ] } ]
PMC7171147
GAPDH was used as a loading control.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GAPDH", "was", "used", "as", "a", "loading", "control", "." ] } ]
PMC9599726
We could not detect any significant modifications in the mRNA expression of all ferroptosis-related tested genes after 24 h of CA3 treatment (Figure 7A, lower panels).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "could", "not", "detect", "any", "significant", "modifications", "in", "the", "mRNA", "expression", "of", "all", "ferroptosis-related", "tested", "genes", "after", "24", "h", "of", "CA3", "treatment", "(", "Figure", "7A", ",", "lower", "panels", ")", "." ] } ]
PMC11683130
SerpinB7 deficiency significantly increased the expression of chemokines (TNF-α, IL-1b, IL-23, CXCL2 and IFN-γ), neutrophil markers Ly6G, and antimicrobial peptide S100A8, thereby exacerbating skin inflammation (85).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SerpinB7", "deficiency", "significantly", "increased", "the", "expression", "of", "chemokines", "(", "TNF-α", ",", "IL-1b", ",", "IL-23", ",", "CXCL2", "and", "IFN-γ", ")", ",", "neutrophil", "markers", "Ly6", "G", ",", "and", "antimicrobial", "peptide", "S100A8", ",", "thereby", "exacerbating", "skin", "inflammation", "(", "85", ")", "." ] } ]
PMC11746948
Scale bar, 500 μm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bar", ",", "500", "μm", "." ] } ]
PMC11802929
The SARS-CoV-2 SCT-dextramer-positive CD8 T cells were filtered to only include those with an assigned patient ID, antigen specificity, and paired TCRα/β sequences.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "SARS-CoV-2", "SCT-dextramer-positive", "CD8", "T", "cells", "were", "filtered", "to", "only", "include", "those", "with", "an", "assigned", "patient", "ID", ",", "antigen", "specificity", ",", "and", "paired", "TCRα/β", "sequences", "." ] } ]
PMC11531744
Thereafter, depended on the model risk score, patients were divided into high and low risk subgroups.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thereafter", ",", "depended", "on", "the", "model", "risk", "score", ",", "patients", "were", "divided", "into", "high", "and", "low", "risk", "subgroups", "." ] } ]
PMC11774112
PBS buffer solution containing dithiothreitol (DTT; 10 μL) was added to above solution to give a final concentration of 10 mm DTT, and were incubated for 1 h. The samples were then electrophoresed at 100 V for 20 min on a 1.0% (w/v) agarose gel with GelRed stain in Tris-acetate-EDTA (TAE) buffer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PBS", "buffer", "solution", "containing", "dithiothreitol", "(", "DTT", ";", "10", "μL", ")", "was", "added", "to", "above", "solution", "to", "give", "a", "final", "concentration", "of", "10", "mm", "DTT", ",", "and", "were", "incubated", "for", "1", "h.", "The", "samples", "were", "then", "electrophoresed", "at", "100", "V", "for", "20", "min", "on", "a", "1.0", "%", "(", "w/v", ")", "agarose", "gel", "with", "GelRed", "stain", "in", "Tris-acetate-EDTA", "(", "TAE", ")", "buffer", "." ] } ]
PMC10565698
CircUSP10 promotes LC cell tumorigenic properties by regulating miR-211-5p-mediated TCF12 expression and is relevant to the EMT pathway.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CircUSP10", "promotes", "LC", "cell", "tumorigenic", "properties", "by", "regulating", "miR-211", "-", "5p-mediated", "TCF12", "expression", "and", "is", "relevant", "to", "the", "EMT", "pathway", "." ] } ]
PMC11473843
Scale bars: 100 μm. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bars", ":", "100", "μm", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
Pts must have received prior RUX for ≥3 mo, or for ≥28 d with development of red blood cell transfusion requirement (≥2 units/mo for 2 mo) or grade ≥3 thrombocytopenia, anemia, hematoma, or hemorrhage.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pts", "must", "have", "received", "prior", "RUX", "for", "≥3", "mo", ",", "or", "for", "≥28", "d", "with", "development", "of", "red", "blood", "cell", "transfusion", "requirement", "(", "≥2", "units/mo", "for", "2", "mo", ")", "or", "grade", "≥3", "thrombocytopenia", ",", "anemia", ",", "hematoma", ",", "or", "hemorrhage", "." ] } ]
PMC7090062
On one hand, though playing an important role, beclin-1 is not the only target of miR-30a regulation and ATG5/ATG12 may also contribute to the biological effects of miR-30a in GIST according to target prediction.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "one", "hand", ",", "though", "playing", "an", "important", "role", ",", "beclin-1", "is", "not", "the", "only", "target", "of", "miR-30a", "regulation", "and", "ATG5/ATG12", "may", "also", "contribute", "to", "the", "biological", "effects", "of", "miR-30a", "in", "GIST", "according", "to", "target", "prediction", "." ] } ]
PMC11551844
The chromatographic conditions are as follows: column: (InertSustain column, C-18; 250 × 10 mm), mobile phase (ultra-pure water and acetonitrile); column temperature: room temperature; flow rate: 2.0 mL min; injection volume: 100 μL; wavelengths: 222 and 197 nm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "chromatographic", "conditions", "are", "as", "follows", ":", "column", ":", "(", "InertSustain", "column", ",", "C-18", ";", "250", "×", "10", "mm", ")", ",", "mobile", "phase", "(", "ultra-pure", "water", "and", "acetonitrile", ")", ";", "column", "temperature", ":", "room", "temperature", ";", "flow", "rate", ":", "2.0", "mL", "min", ";", "injection", "volume", ":", "100", "μL", ";", "wavelengths", ":", "222", "and", "197", "nm", "." ] } ]
PMC11585254
However, the adaptors remain largely unknown, although direct interactions with clathrin adaptors such as AP2 have been reported to mediate β-arrestin-independent internalizations of some GPCRs (Patwardhan et al., 2021).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "adaptors", "remain", "largely", "unknown", ",", "although", "direct", "interactions", "with", "clathrin", "adaptors", "such", "as", "AP2", "have", "been", "reported", "to", "mediate", "β-arrestin-independent", "internalizations", "of", "some", "GPCRs", "(", "Patwardhan", "et", "al.", ",", "2021", ")", "." ] } ]
PMC11082662
Based on these compelling results, we could conclude that the SMPDL3B gene promotes the proliferation of ovarian cancer cells within ovarian cancer cell lines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Based", "on", "these", "compelling", "results", ",", "we", "could", "conclude", "that", "the", "SMPDL3B", "gene", "promotes", "the", "proliferation", "of", "ovarian", "cancer", "cells", "within", "ovarian", "cancer", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC9429973
At d+100 32 pts (39%) were in MLFS, CRi or CR, and had a significant better for EFS (p<.01, Figure 1D) and OS (p<.05).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "d+100", "32", "pts", "(", "39", "%", ")", "were", "in", "MLFS", ",", "CRi", "or", "CR", ",", "and", "had", "a", "significant", "better", "for", "EFS", "(", "p<.01", ",", "Figure", "1D", ")", "and", "OS", "(", "p<.05", ")", "." ] } ]
PMC9429973
J.-J. Kiladjian, A. Tefferi, F. Passamonti, A. Vannucchi, M. Talpaz, F. Cervantes, C. N. Harrison, R. A. Mesa, J. Mascarenhas, N. Schaap, S. Verstovsek, T. Devos, S. Rose, J. Zhang, O. Sy, A. Pardanani Hôpital Saint-Louis; Université de Paris, INSERM, Paris, France; Mayo Clinic of Rochester, Rochester, United States of America; University of Insubria, Varese; CRIMM, University of Florence, AOU Careggi, Florence, Italy; University of Michigan Comprehensive Cancer Center, Ann Arbor, United States of America; Hospital Clinic Provincial de Barcelona, Barcelona, Spain; Guy’s and St Thomas’ Hospital, London, United Kingdom; Mays Cancer Center at UT Health San Antonio MD Anderson Cancer Center, San Antonio; Tisch Cancer Institute, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, United States of America; Radboud University Medical Centre, Nijmegen, Netherlands; The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, United States of America; University Hospitals Leuven and Laboratory of Molecular Immunology (Rega Institute), KU Leuven, Leuven, Belgium; Bristol Myers Squibb, Princeton, United States of America Background: In myelofibrosis (MF), splenomegaly is a marker of disease progression, and larger spleen size (SS) is correlated with poorer survival and debilitating symptoms.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "J.-J.", "Kiladjian", ",", "A.", "Tefferi", ",", "F.", "Passamonti", ",", "A.", "Vannucchi", ",", "M.", "Talpaz", ",", "F.", "Cervantes", ",", "C.", "N.", "Harrison", ",", "R.", "A.", "Mesa", ",", "J.", "Mascarenhas", ",", "N.", "Schaap", ",", "S.", "Verstovsek", ",", "T.", "Devos", ",", "S.", "Rose", ",", "J.", "Zhang", ",", "O.", "Sy", ",", "A.", "Pardanani", "Hôpital", "Saint-Louis", ";", "Université", "de", "Paris", ",", "INSERM", ",", "Paris", ",", "France", ";", "Mayo", "Clinic", "of", "Rochester", ",", "Rochester", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "University", "of", "Insubria", ",", "Varese", ";", "CRIMM", ",", "University", "of", "Florence", ",", "AOU", "Careggi", ",", "Florence", ",", "Italy", ";", "University", "of", "Michigan", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "Ann", "Arbor", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Hospital", "Clinic", "Provincial", "de", "Barcelona", ",", "Barcelona", ",", "Spain", ";", "Guy", "’s", "and", "St", "Thomas", "’", "Hospital", ",", "London", ",", "United", "Kingdom", ";", "Mays", "Cancer", "Center", "at", "UT", "Health", "San", "Antonio", "MD", "Anderson", "Cancer", "Center", ",", "San", "Antonio", ";", "Tisch", "Cancer", "Institute", ",", "Icahn", "School", "of", "Medicine", "at", "Mount", "Sinai", ",", "New", "York", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Radboud", "University", "Medical", "Centre", ",", "Nijmegen", ",", "Netherlands", ";", "The", "University", "of", "Texas", "MD", "Anderson", "Cancer", "Center", ",", "Houston", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "University", "Hospitals", "Leuven", "and", "Laboratory", "of", "Molecular", "Immunology", "(", "Rega", "Institute", ")", ",", "KU", "Leuven", ",", "Leuven", ",", "Belgium", ";", "Bristol", "Myers", "Squibb", ",", "Princeton", ",", "United", "States", "of", "America", "Background", ":", "In", "myelofibrosis", "(", "MF", ")", ",", "splenomegaly", "is", "a", "marker", "of", "disease", "progression", ",", "and", "larger", "spleen", "size", "(", "SS", ")", "is", "correlated", "with", "poorer", "survival", "and", "debilitating", "symptoms", "." ] } ]
PMC10033453
When average tumor volume was over 150 mm (day 0), mice received intratumoral injection with either PBS, VMG at a dose of 2e5 TCID50, or VMG 2e6 TCID50.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "average", "tumor", "volume", "was", "over", "150", "mm", "(", "day", "0", ")", ",", "mice", "received", "intratumoral", "injection", "with", "either", "PBS", ",", "VMG", "at", "a", "dose", "of", "2e5", "TCID50", ",", "or", "VMG", "2e6", "TCID50", "." ] } ]
PMC11129910
Several oncogenes and tumor suppressor genes such as RAS, BRCA-1, BRCA-2, and BCL-2 contribute to tumorigenesis of the mammary gland .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Several", "oncogenes", "and", "tumor", "suppressor", "genes", "such", "as", "RAS", ",", "BRCA-1", ",", "BRCA-2", ",", "and", "BCL-2", "contribute", "to", "tumorigenesis", "of", "the", "mammary", "gland", "." ] } ]
PMC10502403
Here, we found that αβ-TCR-transduced γδ-T cells could utilize more mitochondrial energy metabolism.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "we", "found", "that", "αβ-TCR-transduced", "γδ-T", "cells", "could", "utilize", "more", "mitochondrial", "energy", "metabolism", "." ] } ]
PMC11628309
This impairment is attributed to a decrease of dopamine in striatum, which is directly associated with the death of dopaminergic neurons, particularly those found in the substantia nigra pars compacta (Ye et al., 2022).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "impairment", "is", "attributed", "to", "a", "decrease", "of", "dopamine", "in", "striatum", ",", "which", "is", "directly", "associated", "with", "the", "death", "of", "dopaminergic", "neurons", ",", "particularly", "those", "found", "in", "the", "substantia", "nigra", "pars", "compacta", "(", "Ye", "et", "al.", ",", "2022", ")", "." ] } ]
PMC11738017
Ongoing combination trials with other anti-MM therapies (anti-CD38, immunomodulatory drugs/CELMoDs) or anti-BCMA/GPRC5D TCE combinations and sBCMA dose-adapted anti-BCMA TCE studies will provide further insight into the clinical relevance of such approaches.44, 45, 46, 47, 48 Conflict-of-interest disclosure: S.S. and D.V. are employees of Janssen and may have stock/other ownership interests in Janssen.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ongoing", "combination", "trials", "with", "other", "anti-MM", "therapies", "(", "anti-CD38", ",", "immunomodulatory", "drugs/CELMoDs", ")", "or", "anti-BCMA/GPRC5D", "TCE", "combinations", "and", "sBCMA", "dose-adapted", "anti-BCMA", "TCE", "studies", "will", "provide", "further", "insight", "into", "the", "clinical", "relevance", "of", "such", "approaches.44", ",", "45", ",", "46", ",", "47", ",", "48", "Conflict-of-interest", "disclosure", ":", "S.S.", "and", "D.V.", "are", "employees", "of", "Janssen", "and", "may", "have", "stock/other", "ownership", "interests", "in", "Janssen", "." ] } ]
PMC11791478
Both XB002 and 25A3 were conjugated with the fluorescent dye Alexa Fluor 647 (AF647) to enable real-time monitoring of their binding and uptake.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Both", "XB002", "and", "25A3", "were", "conjugated", "with", "the", "fluorescent", "dye", "Alexa", "Fluor", "647", "(", "AF647", ")", "to", "enable", "real-time", "monitoring", "of", "their", "binding", "and", "uptake", "." ] } ]
PMC9429973
Results: Summary/Conclusion: Here were described three different cases of thrombosis that presented within 6 week of receiving first dose of Covishield vaccine.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "Summary/Conclusion", ":", "Here", "were", "described", "three", "different", "cases", "of", "thrombosis", "that", "presented", "within", "6", "week", "of", "receiving", "first", "dose", "of", "Covishield", "vaccine", "." ] } ]
PMC8343815
Both AuNRs and AuNPs showed low toxicity on HeLa cells, while AuNRs were more toxic than AuNPs at the examined concentrations.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Both", "AuNRs", "and", "AuNPs", "showed", "low", "toxicity", "on", "HeLa", "cells", ",", "while", "AuNRs", "were", "more", "toxic", "than", "AuNPs", "at", "the", "examined", "concentrations", "." ] } ]
PMC11228511
In wild-type SMCs, lamin B1 is located at the nuclear rim, whereas in nonfarnesyl-progerin–expressing SMCs some of the lamin B1 was in the nucleoplasm, likely trapped there by interactions with nucleoplasmic nonfarnesyl-progerin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "wild-type", "SMCs", ",", "lamin", "B1", "is", "located", "at", "the", "nuclear", "rim", ",", "whereas", "in", "nonfarnesyl-progerin", "–", "expressing", "SMCs", "some", "of", "the", "lamin", "B1", "was", "in", "the", "nucleoplasm", ",", "likely", "trapped", "there", "by", "interactions", "with", "nucleoplasmic", "nonfarnesyl-progerin", "." ] } ]
PMC11739484
Moreover, ROC curve analysis serves as a powerful tool to assess the diagnostic performance of biomarkers, offering insights into their sensitivity and specificity in discriminating between disease and non-disease states.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "ROC", "curve", "analysis", "serves", "as", "a", "powerful", "tool", "to", "assess", "the", "diagnostic", "performance", "of", "biomarkers", ",", "offering", "insights", "into", "their", "sensitivity", "and", "specificity", "in", "discriminating", "between", "disease", "and", "non-disease", "states", "." ] } ]
PMC8427838
These residues on TMIGD1 are thus likely to be involved in the recognition of moesin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "residues", "on", "TMIGD1", "are", "thus", "likely", "to", "be", "involved", "in", "the", "recognition", "of", "moesin", "." ] } ]
PMC11753435
The magenta region refers to hotspot amino acids 35 to 51, and the yellow region refers to hotspot amino acids 102 to 124. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "magenta", "region", "refers", "to", "hotspot", "amino", "acids", "35", "to", "51", ",", "and", "the", "yellow", "region", "refers", "to", "hotspot", "amino", "acids", "102", "to", "124", ".", "(" ] } ]
PMC11448304
5Properties of the identified Khib peptides.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "5Properties", "of", "the", "identified", "Khib", "peptides", "." ] } ]
PMC11593084
All mice were euthanized by cervical dislocation 22~30 days after cell inoculation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "mice", "were", "euthanized", "by", "cervical", "dislocation", "22~30", "days", "after", "cell", "inoculation", "." ] } ]
PMC11703896
Figure 2 represents the changes in morphology of cancer cell lines and normal cell line upon treatment with different rapamycin concentrations.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "2", "represents", "the", "changes", "in", "morphology", "of", "cancer", "cell", "lines", "and", "normal", "cell", "line", "upon", "treatment", "with", "different", "rapamycin", "concentrations", "." ] } ]
PMC9429973
or treatment toxicity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "or", "treatment", "toxicity", "." ] } ]
PMC9065483
These cells used DMEM (HyClone cat.10-013) supplemented with 1% (v/v) penicillin-streptomycin (Gibco), 30 mM HEPES buffer, and 10% (v/v) serum composed of 3 parts HyClone newborn calf serum (Thermo Fisher, cat.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "cells", "used", "DMEM", "(", "HyClone", "cat.10", "-", "013", ")", "supplemented", "with", "1", "%", "(", "v/v", ")", "penicillin-streptomycin", "(", "Gibco", ")", ",", "30", "mM", "HEPES", "buffer", ",", "and", "10", "%", "(", "v/v", ")", "serum", "composed", "of", "3", "parts", "HyClone", "newborn", "calf", "serum", "(", "Thermo", "Fisher", ",", "cat", "." ] } ]
PMC9920575
Cisplatin is the most preferred agent for concurrent chemoradiotherapy, other agents have been tried for CCRT, but none have been found to be as effective or superior to cisplatin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cisplatin", "is", "the", "most", "preferred", "agent", "for", "concurrent", "chemoradiotherapy", ",", "other", "agents", "have", "been", "tried", "for", "CCRT", ",", "but", "none", "have", "been", "found", "to", "be", "as", "effective", "or", "superior", "to", "cisplatin", "." ] } ]
PMC9352806
Groups were divided into Control, BMS at 50 μg/mL, 100 μg/mL and 200 μg/mL, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Groups", "were", "divided", "into", "Control", ",", "BMS", "at", "50", "μg/mL", ",", "100", "μg/mL", "and", "200", "μg/mL", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11394730
Wang et al. conducted a study wherein they found that emodin had anticancer effects on various kidney cancer cells, including 786-0, ACHN, CAKI, and OS-RC-2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O" ], "tokens": [ "Wang", "et", "al.", "conducted", "a", "study", "wherein", "they", "found", "that", "emodin", "had", "anticancer", "effects", "on", "various", "kidney", "cancer", "cells", ",", "including", "786", "-", "0", ",", "ACHN", ",", "CAKI", ",", "and", "OS-RC-2", "." ] } ]
PMC6312945
HBV DNA can also be integrated into the genome of hepatocytes by reverse transcription reactions, causing mutations in the gene and inducing liver cancer (14).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HBV", "DNA", "can", "also", "be", "integrated", "into", "the", "genome", "of", "hepatocytes", "by", "reverse", "transcription", "reactions", ",", "causing", "mutations", "in", "the", "gene", "and", "inducing", "liver", "cancer", "(", "14", ")", "." ] } ]
PMC10291556
Moreover, the upregulation of fatty acyl-CoA synthetase FACL4 by Pt(II) complex 1 was recently described.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "the", "upregulation", "of", "fatty", "acyl-CoA", "synthetase", "FACL4", "by", "Pt(II", ")", "complex", "1", "was", "recently", "described", "." ] } ]
PMC11365427
Schematic of our mechanism research. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Schematic", "of", "our", "mechanism", "research", ".", "(" ] } ]
PMC11365983
Stimulation with SAG further increased signal intensity ~ 2 fold (PKW = 6.2 × 10; Fig. 4B,C) and such enhanced axonemal tip accumulation of Gli2 is consistent with Foxc1 impacting a core cilia-mediated signaling pathway.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Stimulation", "with", "SAG", "further", "increased", "signal", "intensity", "~", "2", "fold", "(", "PKW", "=", "6.2", "×", "10", ";", "Fig.", "4B", ",", "C", ")", "and", "such", "enhanced", "axonemal", "tip", "accumulation", "of", "Gli2", "is", "consistent", "with", "Foxc1", "impacting", "a", "core", "cilia-mediated", "signaling", "pathway", "." ] } ]
PMC9118379
From the perspective of MS-based qualitative proteomics, the procedure of variant event identification is highly similar to the protein identification procedure, which is conducted at three hierarchical levels—the PSM, peptide, and protein levels—to filter out false-positive identification.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "From", "the", "perspective", "of", "MS-based", "qualitative", "proteomics", ",", "the", "procedure", "of", "variant", "event", "identification", "is", "highly", "similar", "to", "the", "protein", "identification", "procedure", ",", "which", "is", "conducted", "at", "three", "hierarchical", "levels", "—", "the", "PSM", ",", "peptide", ",", "and", "protein", "levels", "—", "to", "filter", "out", "false-positive", "identification", "." ] } ]
PMC11387401
The considerable overlap suggests a high accuracy of the identified interactions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "considerable", "overlap", "suggests", "a", "high", "accuracy", "of", "the", "identified", "interactions", "." ] } ]
PMC9429973
Most common grade 3 or higher adverse events included neutropenia (44%), thrombocytopenia (38%), febrile neutropenia (25%), anemia (25%), and sepsis (19%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Most", "common", "grade", "3", "or", "higher", "adverse", "events", "included", "neutropenia", "(", "44", "%", ")", ",", "thrombocytopenia", "(", "38", "%", ")", ",", "febrile", "neutropenia", "(", "25", "%", ")", ",", "anemia", "(", "25", "%", ")", ",", "and", "sepsis", "(", "19", "%", ")", "." ] } ]
PMC10344560
Progression of the effluent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Progression", "of", "the", "effluent", "." ] } ]
PMC11698348
As p63 is a key regulator of epidermal lineage commitment, epidermal differentiation and cell adhesion , the use of Elf5 to modulate p63 expression may provide some benefits to patients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "p63", "is", "a", "key", "regulator", "of", "epidermal", "lineage", "commitment", ",", "epidermal", "differentiation", "and", "cell", "adhesion", ",", "the", "use", "of", "Elf5", "to", "modulate", "p63", "expression", "may", "provide", "some", "benefits", "to", "patients", "." ] } ]
PMC11525293
Moreover, evaluation of ACE2 mRNA by qRT-PCR in parallel samples showed increased ACE2 mRNA levels in the samples transfected with the ΔNp63α plasmid, thus indicating that ACE2 might be a ΔNp63α transcriptional target (Fig. 2C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "evaluation", "of", "ACE2", "mRNA", "by", "qRT-PCR", "in", "parallel", "samples", "showed", "increased", "ACE2", "mRNA", "levels", "in", "the", "samples", "transfected", "with", "the", "ΔNp63α", "plasmid", ",", "thus", "indicating", "that", "ACE2", "might", "be", "a", "ΔNp63α", "transcriptional", "target", "(", "Fig.", "2C", ")", "." ] } ]
PMC8427838
However, the presence of moesin in filopodia protrusions in the context of TMIGD1 was less prominent (Fig. 4C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "presence", "of", "moesin", "in", "filopodia", "protrusions", "in", "the", "context", "of", "TMIGD1", "was", "less", "prominent", "(", "Fig.", "4C", ")", "." ] } ]
PMC11683240
Subsequently, the experiment was performed as described in (B and C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Subsequently", ",", "the", "experiment", "was", "performed", "as", "described", "in", "(", "B", "and", "C", ")", "." ] } ]
PMC7039683
Transverse section of an 11 hpf (4-somite stage) Tg(krt4:gfp) embryo, showing GFP is confined to the superficial layer of cells, and workflow of ATAC-seq in periderm and non-periderm cells. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transverse", "section", "of", "an", "11", "hpf", "(", "4-somite", "stage", ")", "Tg(krt4:gfp", ")", "embryo", ",", "showing", "GFP", "is", "confined", "to", "the", "superficial", "layer", "of", "cells", ",", "and", "workflow", "of", "ATAC-seq", "in", "periderm", "and", "non-periderm", "cells", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
Our data indicated that repair of dysfunctional BM EPCs may be a promising therapeutic approach for MDS patients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "data", "indicated", "that", "repair", "of", "dysfunctional", "BM", "EPCs", "may", "be", "a", "promising", "therapeutic", "approach", "for", "MDS", "patients", "." ] } ]
PMC9429973
The species diversity of the microbiome was assessed using the Shannon index.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "species", "diversity", "of", "the", "microbiome", "was", "assessed", "using", "the", "Shannon", "index", "." ] } ]
PMC11792766
The bacterial strains were inoculated from frozen stocks the day before the experiment and cultured overnight in Nutrient Broth Oxoid No. 2 in a sterile Schott flask at 37°C.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "bacterial", "strains", "were", "inoculated", "from", "frozen", "stocks", "the", "day", "before", "the", "experiment", "and", "cultured", "overnight", "in", "Nutrient", "Broth", "Oxoid", "No.", "2", "in", "a", "sterile", "Schott", "flask", "at", "37", "°", "C", "." ] } ]
PMC9429973
Interestingly, a competitive bone marrow transplantation assay confirmed this effect in terms of in vivo engraftment capacity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "a", "competitive", "bone", "marrow", "transplantation", "assay", "confirmed", "this", "effect", "in", "terms", "of", "in", "vivo", "engraftment", "capacity", "." ] } ]
PMC9429973
OS and PFS at 6 mo were 79% (95% CI 71-86%) and 66% (95% CI 56-75%), respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "OS", "and", "PFS", "at", "6", "mo", "were", "79", "%", "(", "95", "%", "CI", "71", "-", "86", "%", ")", "and", "66", "%", "(", "95", "%", "CI", "56", "-", "75", "%", ")", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC8009078
Fig. 5TMPRSS2 backbone RMSD bound with proposed moleculesTable 3Average, maximum and minimum values of MD simulation parametersParametersA1A2A3A4A5RMSD (Å)TMPRSS2 (Ca, C and N)Average3.7022.5503.4213.7303.832Maximum5.2863.8114.4465.4375.887Minimum0.0000.0000.0000.0000.000LigandAverage1.6340.3780.3110.2890.313Maximum2.7341.3751.2381.3100.688Minimum0.0000.0000.0000.0000.000RMSF (Å)Average1.8981.5951.8091.7192.001Maximum13.2939.3799.4868.34412.260Minimum0.5410.4880.5350.5970.737RoG (Å)Average24.28023.96524.62423.79124.677Maximum24.94224.56825.22924.31525.308Minimum23.77923.52523.91523.37324.005Table 4Binding free energy of proposed TMPRSS2 inhibitorsMoleculeEnergy (Kcal/mol)Standard error of ∆GbindElecvdW∆GbindA1− 37.317− 43.564− 36.5464.726A2− 19.191− 51.521− 42.2523.370A3− 18.494− 45.633− 36.5342.617A4− 25.883− 35.702− 30.4623.079A5− 25.566− 50.009− 42.9163.845Electrostaticven der Waal’s TMPRSS2 backbone RMSD bound with proposed molecules Average, maximum and minimum values of MD simulation parameters Binding free energy of proposed TMPRSS2 inhibitors Electrostatic ven der Waal’s The RMSF parameter is extremely essential to explore the role of individual amino acid in the stability of any protein–ligand complex.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "5TMPRSS2", "backbone", "RMSD", "bound", "with", "proposed", "moleculesTable", "3Average", ",", "maximum", "and", "minimum", "values", "of", "MD", "simulation", "parametersParametersA1A2A3A4A5RMSD", "(Å)TMPRSS2", "(", "Ca", ",", "C", "and", "N)Average3.7022.5503.4213.7303.832Maximum5.2863.8114.4465.4375.887Minimum0.0000.0000.0000.0000.000LigandAverage1.6340.3780.3110.2890.313Maximum2.7341.3751.2381.3100.688Minimum0.0000.0000.0000.0000.000RMSF", "(Å)Average1.8981.5951.8091.7192.001Maximum13.2939.3799.4868.34412.260Minimum0.5410.4880.5350.5970.737RoG", "(Å)Average24.28023.96524.62423.79124.677Maximum24.94224.56825.22924.31525.308Minimum23.77923.52523.91523.37324.005Table", "4Binding", "free", "energy", "of", "proposed", "TMPRSS2", "inhibitorsMoleculeEnergy", "(Kcal/mol)Standard", "error", "of", "∆GbindElecvdW∆GbindA1−", "37.317−", "43.564−", "36.5464.726A2−", "19.191−", "51.521−", "42.2523.370A3−", "18.494−", "45.633−", "36.5342.617A4−", "25.883−", "35.702−", "30.4623.079A5−", "25.566−", "50.009−", "42.9163.845Electrostaticven", "der", "Waal", "’s", "TMPRSS2", "backbone", "RMSD", "bound", "with", "proposed", "molecules", "Average", ",", "maximum", "and", "minimum", "values", "of", "MD", "simulation", "parameters", "Binding", "free", "energy", "of", "proposed", "TMPRSS2", "inhibitors", "Electrostatic", "ven", "der", "Waal", "’s", "The", "RMSF", "parameter", "is", "extremely", "essential", "to", "explore", "the", "role", "of", "individual", "amino", "acid", "in", "the", "stability", "of", "any", "protein", "–", "ligand", "complex", "." ] } ]
PMC10380508
We used the files that contain “fragments per kilobase per million” (FPKM) values.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "used", "the", "files", "that", "contain", "“", "fragments", "per", "kilobase", "per", "million", "”", "(", "FPKM", ")", "values", "." ] } ]
PMC11754291
The decrease in the AlamarBlue signal suggests that cellular metabolism in keratinocytes is diminishing under these conditions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "decrease", "in", "the", "AlamarBlue", "signal", "suggests", "that", "cellular", "metabolism", "in", "keratinocytes", "is", "diminishing", "under", "these", "conditions", "." ] } ]
PMC10878518
In the malignant and intermediate group including osteosarcomas, synovial sarcomas, and giant cell tumors, CAR expression was observed in the cytoplasm and membrane of tumor cells, whereas hTERT expression was observed in the nuclear and cytoplasm of tumor cells (Fig 3A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "malignant", "and", "intermediate", "group", "including", "osteosarcomas", ",", "synovial", "sarcomas", ",", "and", "giant", "cell", "tumors", ",", "CAR", "expression", "was", "observed", "in", "the", "cytoplasm", "and", "membrane", "of", "tumor", "cells", ",", "whereas", "hTERT", "expression", "was", "observed", "in", "the", "nuclear", "and", "cytoplasm", "of", "tumor", "cells", "(", "Fig", "3A", ")", "." ] } ]
PMC11666785
An additional image is reconstructed from all the single molecules collected in 2-4 consecutive frames.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "An", "additional", "image", "is", "reconstructed", "from", "all", "the", "single", "molecules", "collected", "in", "2", "-", "4", "consecutive", "frames", "." ] } ]
PMC11750712
The unbound (TRBC2) fraction was harvested from the first incubation on the magnetic rack.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "unbound", "(", "TRBC2", ")", "fraction", "was", "harvested", "from", "the", "first", "incubation", "on", "the", "magnetic", "rack", "." ] } ]
PMC11657744
The cells were fixed with 70% ice-cold ethanol, washed twice with PBS, and incubated in 50 µg/ml propidium iodide (BD Pharmingen) and 50 µg/ml RNase A. The data were acquired using a BD Accuri C6 Plus flow cytometer, and the results were analyzed using the FCS Express software.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cells", "were", "fixed", "with", "70", "%", "ice-cold", "ethanol", ",", "washed", "twice", "with", "PBS", ",", "and", "incubated", "in", "50", "µg/ml", "propidium", "iodide", "(", "BD", "Pharmingen", ")", "and", "50", "µg/ml", "RNase", "A.", "The", "data", "were", "acquired", "using", "a", "BD", "Accuri", "C6", "Plus", "flow", "cytometer", ",", "and", "the", "results", "were", "analyzed", "using", "the", "FCS", "Express", "software", "." ] } ]
PMC6034753
Protein complexes were pulled out using mouse anti-Meq and anti-FLAG.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Protein", "complexes", "were", "pulled", "out", "using", "mouse", "anti-Meq", "and", "anti-FLAG", "." ] } ]
PMC11389534
Moreover, the enzymatic activities of UFSP2, UBA5 and UFC1 are required in the negative regulation of macrophage activation mediated by IFN‐γ and LPS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "the", "enzymatic", "activities", "of", "UFSP2", ",", "UBA5", "and", "UFC1", "are", "required", "in", "the", "negative", "regulation", "of", "macrophage", "activation", "mediated", "by", "IFN‐γ", "and", "LPS", "." ] } ]
PMC9250505
Mice were treated daily with vehicle (V), 20 mg/kg NPB (N), 50 mg/kg Olaparib (O) or combined NPB-Olaparib by i.p.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mice", "were", "treated", "daily", "with", "vehicle", "(", "V", ")", ",", "20", "mg/kg", "NPB", "(", "N", ")", ",", "50", "mg/kg", "Olaparib", "(", "O", ")", "or", "combined", "NPB-Olaparib", "by", "i.p", "." ] } ]
PMC11591038
For example, HIF-1α can affect APP processing by regulating the activities of α-, β-, and γ-secretase, thereby increasing the generation of Aβ or decreasing the secretion of sAPPα.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "example", ",", "HIF-1α", "can", "affect", "APP", "processing", "by", "regulating", "the", "activities", "of", "α-", ",", "β-", ",", "and", "γ-secretase", ",", "thereby", "increasing", "the", "generation", "of", "Aβ", "or", "decreasing", "the", "secretion", "of", "sAPPα", "." ] } ]
PMC7757104
By contrast, OPNc knockdown in ACRP cells resulted in the upregulation of OPNa and OPNb mRNA expression levels compared with those in the ASO-SCR group, although this result did not achieve statistical significance (Fig. S1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "contrast", ",", "OPNc", "knockdown", "in", "ACRP", "cells", "resulted", "in", "the", "upregulation", "of", "OPNa", "and", "OPNb", "mRNA", "expression", "levels", "compared", "with", "those", "in", "the", "ASO-SCR", "group", ",", "although", "this", "result", "did", "not", "achieve", "statistical", "significance", "(", "Fig.", "S1", ")", "." ] } ]
PMC11697065
However, the individual functions of these proteins might be revealing.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "individual", "functions", "of", "these", "proteins", "might", "be", "revealing", "." ] } ]
PMC11786767
After removing nocodazole, cells were treated with 2 μM RO-3306 for 15 or 30 min and then harvested for immunostaining.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "removing", "nocodazole", ",", "cells", "were", "treated", "with", "2", "μM", "RO-3306", "for", "15", "or", "30", "min", "and", "then", "harvested", "for", "immunostaining", "." ] } ]
PMC11742670
It also promotes collaboration among medicinal chemists, chemo informaticians, and data scientists, facilitating their joint efforts.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "also", "promotes", "collaboration", "among", "medicinal", "chemists", ",", "chemo", "informaticians", ",", "and", "data", "scientists", ",", "facilitating", "their", "joint", "efforts", "." ] } ]
PMC11001582
The protein group output files were further processed using Perseus software suite (v.1.6.15.0) for downstream statistical analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "protein", "group", "output", "files", "were", "further", "processed", "using", "Perseus", "software", "suite", "(", "v.1.6.15.0", ")", "for", "downstream", "statistical", "analysis", "." ] } ]
PMC10705095
Conversely, HBQ1 knockdown enhanced ROS levels and inhibited cell proliferation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Conversely", ",", "HBQ1", "knockdown", "enhanced", "ROS", "levels", "and", "inhibited", "cell", "proliferation", "." ] } ]
PMC9429973
Nonetheless, if these data are confirmed, IBD patients screened and positive for CH should undergo hematologic follow-up to assess the risk of developing HM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nonetheless", ",", "if", "these", "data", "are", "confirmed", ",", "IBD", "patients", "screened", "and", "positive", "for", "CH", "should", "undergo", "hematologic", "follow-up", "to", "assess", "the", "risk", "of", "developing", "HM", "." ] } ]
PMC8956657
Data reduction and integration was performed using iMosflm and XDS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "reduction", "and", "integration", "was", "performed", "using", "iMosflm", "and", "XDS", "." ] } ]
PMC9429973
At the 2-year (y) follow-up, 46% of pts remained in TFR; in a multivariate analysis, longer duration of prior dasatinib, first-line (1L) dasatinib, and older age were significantly associated with TFR maintenance (Shah et al. Leuk Lymphoma 2019).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "the", "2-year", "(", "y", ")", "follow-up", ",", "46", "%", "of", "pts", "remained", "in", "TFR", ";", "in", "a", "multivariate", "analysis", ",", "longer", "duration", "of", "prior", "dasatinib", ",", "first-line", "(", "1L", ")", "dasatinib", ",", "and", "older", "age", "were", "significantly", "associated", "with", "TFR", "maintenance", "(", "Shah", "et", "al.", "Leuk", "Lymphoma", "2019", ")", "." ] } ]
PMC11474209
High expression of OATPs in the liver, most consumed MC accumulates in hepatocytes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "High", "expression", "of", "OATPs", "in", "the", "liver", ",", "most", "consumed", "MC", "accumulates", "in", "hepatocytes", "." ] } ]
PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: Frail pts with RRMM who received PVd had longer PFS and higher ORR than pts who received Vd, consistent with the overall OPTIMISMM results.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "Frail", "pts", "with", "RRMM", "who", "received", "PVd", "had", "longer", "PFS", "and", "higher", "ORR", "than", "pts", "who", "received", "Vd", ",", "consistent", "with", "the", "overall", "OPTIMISMM", "results", "." ] } ]
PMC11682224
Tumor cells, in order to adapt to the hypoxic environment, increase glycolysis rates and develop a network of blood vessels.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Tumor", "cells", ",", "in", "order", "to", "adapt", "to", "the", "hypoxic", "environment", ",", "increase", "glycolysis", "rates", "and", "develop", "a", "network", "of", "blood", "vessels", "." ] } ]
PMC11394386
The inhibitors used for the Wnt/β-catenin pathway included ICRT14 (Toronto Research Chemical Canada I163900) and C59 (Bio-vision 2063-5, San Francisco, CA, USA), while the PI3K/AKT pathway was inhibited using Buparlisip (BKM120; NVP-BKM120, HY-70063, Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA) solubilized in dimethyl sulfoxide (DMSO; Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "inhibitors", "used", "for", "the", "Wnt/β-catenin", "pathway", "included", "ICRT14", "(", "Toronto", "Research", "Chemical", "Canada", "I163900", ")", "and", "C59", "(", "Bio-vision", "2063", "-", "5", ",", "San", "Francisco", ",", "CA", ",", "USA", ")", ",", "while", "the", "PI3K/AKT", "pathway", "was", "inhibited", "using", "Buparlisip", "(", "BKM120", ";", "NVP-BKM120", ",", "HY-70063", ",", "Sigma-Aldrich", ",", "St.", "Louis", ",", "MO", ",", "USA", ")", "solubilized", "in", "dimethyl", "sulfoxide", "(", "DMSO", ";", "Sigma-Aldrich", ",", "St.", "Louis", ",", "MO", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Our study is limited by its retrospective design.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "study", "is", "limited", "by", "its", "retrospective", "design", "." ] } ]