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BioData-CellLine_annotated

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PMC11047729
This substance also promotes the shortening of telomeres .
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PMC11472569
Munoz et al. suggested that microvesicles are the primary carriers of anti-miR-9 from MSCs to glioblastoma multiforme cells, reversing chemoresistance by downregulating ABCB1.
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PMC10212663
The enriched expression of RANKL in advanced KRAS‐mt LUAD was confirmed by specimens from our hospital.
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PMC11323699
Fig. 5, middle panel).
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PMC11012012
In two analyzed CLL cell lines, SLAMF8/CD353 was negative in MEC-1 cells, while its expression in OSU-CLL cells could be regarded as very weakly positive .
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PMC11765879
In addition, several evidence and investigations indicate quercetin’s effectiveness against breast cancer .
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PMC10114490
Genes expressed at low levels in fetal vs. adult liver can be considered as mature markers (HPD, CYP3A4, GYS2, CYP2B6 and CYP2E1); thus, we concluded a hybrid immature/mature phenotype.
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PMC11502066
Although plant polyphenols, flavonoids, are well known for their diverse anticancer effects inhibiting the growth, proliferation, migration, and invasion of malignant cells, involvement of GPCRs in these activities has still remained largely unelucidated.
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PMC5386478
We described that the hypoxic induction of TG2 was HIF-2 dependent.
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PMC11787381
Results are expressed as mean ± SEM [n = 12 except for control (n = 11) and Aβ (n = 11)].
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PMC11740907
The resultant optically clear system was disseminated at a speed of 24,000 rpm within a time frame of 5 min utilizing a rotor-stator (Ultra-Turrax, IKA T18 basic; Staufen, Germany).
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PMC11656048
Molecular docking was used to detect whether shikonin could directly interact with Nrf2 protein, and the results showed that shikonin may directly interact with Nrf2 to degrade it (binding energy of −5.8 kcal/mol) (Figure 4D).
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PMC7961460
ECM composition can modulate tumour cell functions and signalling, eventually favouring the angiogenesis and diffusion of the metastasis.
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PMC10578720
IP analysis of CS and PDHC hyperacetylation in human THP-1 macrophages following exposure to HBV (10 IU/mL). (
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PMC8708099
no. D6429), and supplemented with 10% fetal bovine serum (Gibco, Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA, cat no. 16000044), 1% non-essential amino acids serum (Gibco, Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA, cat.
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PMC11706297
BTT-3, BTT-4, and BTT-7 are recorded in the literature (Spectral Data: Supplementary Information.
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PMC5035325
Co-expression was detected by yellow fluorescence using the Olympus BX51 LTD microscope (Olympus Optical Co., Ltd., Japan).
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PMC10759659
As ARID1A is one of the most frequently mutated genes in HCC and ICBs, it has become one of the main treatment options for HCC.
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PMC11257988
The inhibitor functions by preferentially targeting the inactive state of KRAS to prevent its reactivation through nucleotide exchange.
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PMC11429241
The scaffold-free method refers to culturing and forming cells in a 3D structure without an external matrix or scaffold.
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PMC10852540
MTT test was performed for cell survival (viability) analysis after incubation.
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PMC9874064
FANCD2 protein expression in BEL-7404DPP cells after 48 ​h treatment with different drugs by Western blot.
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PMC9910796
As a positive control, the signal detected for MCP p72 was similar under permissive and restrictive conditions. (
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PMC4659567
A single-crystal X-ray structural analysis of [Ru(η -p-cym)(2Me4Claza)Cl2] (6) revealed a typical piano-stool geometry with an N7-coordination mode of 2-methyl-4-chloro-7-azaindole (2Me4Claza).
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PMC9429973
Subjects continue study treatment until progression and are followed for long-term survival.
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PMC10212663
p‐value < 0.001; **p‐value < 0.005; *p‐value < 0.05.
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PMC10674574
The viability of Caco-2 cells exposed to the tested compound for a period of time equal to or longer than the conditions of the permeability test should be determined.
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PMC9429973
Notably, disease onset occurred earlier (i.e., between age 2 and 5 years) in the previously reported patients compared to our patients.
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PMC8303372
A final concentration of 0.1% v/v of DMSO was utilized in all samples because it did not induce any alterations in cell vitality.
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PMC11632064
RSK isoforms have context-specific expression patterns and exert diverse functions by phosphorylating many protein substrates (reviewed in Houles et al ).
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PMC11476222
Data acquisition was performed using Data Dependent Acquisition (DDA) in negative mode.
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PMC11204465
Due to the unique skeletons of AFs and their risk to human health, numerous teams have been working on their total synthesis over the last 60 years.
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PMC9684669
In the current work, an aberrant increase in CREB1 phosphorylation was observed in MDR cells, and inhibition of CREB1 decreased ABCB1 expression and activity, indicating that CREB1 is a viable target for MDR reversal in cancer therapy.
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PMC11224020
The next day, samples were washed with PBS and incubated with the corresponding secondary antibodies for 1 h, washed three times with PBS and mounted with Fluoromount solution.
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PMC11519788
The primer sequences for plasmid construction were listed in Table S2.
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PMC9429973
Our findings suggest that autophagy inhibitors could synergize with AZA in AML therapy.
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PMC11534377
These cellular processes were further evaluated using additional biochemical assays using A549 as a model cell line for the study.
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PMC10965315
The format for the data presentation was mean and standard deviation.
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PMC7057940
no. A3840201; Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc.) in a sterile 24-well culture plate (18).
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PMC11502327
Another interesting study found the ability of co-delivery of resveratrol and curcumin polymer micelles to reduce cardiotoxicity caused by DOX in vitro.
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Fractions were collected every minute and combined into a total of 18 fractions, then lyophilised.
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Other sources of contamination could be cell remnants.
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Palmitoylation is a reversible post-translational modification involving the attachment of palmitic acid to proteins.
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PMC10976516
injected B16-F10 melanoma cell line forming tumor foci in the lung of syngeneic C57BL6 mice, followed by i.v.
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Responses included a complete response in 4 patients, a very good response in 4 patient and a partial response in six patients, representing overall response of 83.3%.
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PMC10747139
At the same time, the determination of the nucleoprotein (NP) of the influenza virus showed that the relative NP expression of the H1N1+60 group was 32.6% that of the H1N1 group.
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After the washing procedures, the columns were centrifuged once at 12,000× g for another 3 min to dry them.
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PMC11283030
Herein, we explored the association between ACLY gene and tumor immune infiltration, especially immune cells and immunoinhibitors, in ccRCC using TIMER2 and TISIDB databases.
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PMC11578343
We observed broad heterogeneity in the elastic G′ moduli at the single‐cell level in both risk groups (Figure 5B; Figure S6, Supporting Information).
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PMC11767817
HIF-1α, a key transcription factor, allows cancer cells to adapt to the hypoxic tumor microenvironment by promoting angiogenesis, metabolic reprogramming, and stress response pathways.
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PMC11525028
In our study, we predicted the NAT10 protein structure using AlphaFold and selected the ATP binding pocket as the targeting site for virtual screening by molecular docking.
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PMC9919300
The uncontrolled transferability of FFAs to mitochondria results in deficient oxidization, which further escalates the generation of ROS .
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PMC8609870
DEL: Differentially expressed lncRNAs; DEMs: Differentially expressed miRNAs; DEGs: Differentially expressed genesTable 1Top 20 downregulated DELsand DEGsNameLog2FCp valueFDRlncRNAslnc-LUC7L-2− 12.397336252.73E−234.473E−19lnc-SVIL-1− 10.141997810.0094390.8407162lnc-GYPB-2− 10.041605451.05E−146.891E−11lnc-TAL1-3− 9.0987391111.69E−116.145E−08lnc-GPAT4-4− 8.3013841282.41E−097.187E−06lnc-CXorf58-2− 8.0015699160.0406420.9999888lnc-TAL1-2− 7.9935997121.46E−070.0003185lnc-TAL1-1− 7.4735405265.28E−070.0010197lnc-CCDC80-5− 7.3605782891.01E−146.891E−11lnc-GPX2-4− 7.178325992.87E−060.0047lnc-GCDH-3− 7.1460890664.05E−060.0055418lnc-ZNF674-14− 6.7159032085.78E−050.0364908lnc-ANKRD34B-1− 6.5945668220.0001170.065244lnc-SLC4A1-1− 6.5911007283.72E−050.0259794IL21R-AS1− 6.5740070810.0001540.0803045lnc-NT5C2-1− 6.4994323930.0002650.1146595lnc-LRRC71-4− 6.4937853070.0019770.4445064lnc-EEF1A1-1− 6.49332320.0001410.074564lnc-MTA3-2− 6.4576480980.0002170.098679lnc-TBC1D2B-8− 6.4462821050.0001820.0916568GeneHBZ− 12.298770631.1E−172.346E−14HBE1− 12.083900311.16E−086.391E−06CTSE− 10.902115752.04E−173.882E−14PKLR− 10.53962626.11E−156.549E−12HBG1− 10.258897229.69E−106.64E−07AHSP− 10.187623182.16E−152.614E−12GYPB− 9.8394598156.36E−146.411E−11RHAG− 9.681683866.79E−136.123E−10HBG2− 9.4363373556.3E−1291.07E−124TGIF2-RAB5IF− 9.1532511140.0191580.674672CD5L− 8.9681986224.78E−092.826E−06GFI1B− 8.7402146771.55E−099.851E−07KLF1− 8.6317279434.25E−103.164E−07ABHD14A-ACY1− 8.5928608210.0278910.7822296TRIM10− 8.2907267554.07E−092.49E−06SLC4A1− 7.4879111261.84E−731.575E−69DUS4L-BCAP29− 7.4630072411.78E−152.352E−12FAM83A− 7.252002360.0024890.2557698GYPA− 7.0566139556.81E−146.484E−11APOC3− 6.9335549680.009250.4944919Log2FoldChange: Log2FC; DEL: differential expression LncRNAs; DEGs: differential expression genesTable 2Top 15 upregulated DEMsNameLog2FCp valueFDRhsa-let-7d-3p2.33661340.00228680.1875138chr19_193962.3272170.00039660.4314759hsa-miR-6715b-3p2.27660420.00362170.2375866hsa-miR-10b-5p1.72644990.00046810.0658066hsa-miR-210-5p1.7117490.00805210.4170136hsa-miR-181c-5p1.63004420.00792540.4170136hsa-let-7b-5p1.62971790.00151610.1421603hsa-let-7i-5p1.61875410.00087940.0979275hsa-miR-187-3p1.57386130.00158920.1421603hsa-miR-653-5p1.4324270.00976680.4452522hsa-let-7d-5p1.30723490.03256170.9977985hsa-miR-874-3p1.29361170.01350010.5535043hsa-miR-10b-3p1.26246560.03796350.9977985hsa-miR-146a-5p1.17347030.04600920.9977985hsa-miR-36901.13088180.0452130.9977985Log2FoldChange: Log2FC; DEMs: differential expression miRNAs Heatmap analysis of DEL, DEM and DEGs.
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GFP and HSP90 are loading controls.
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The optimal final concentration of sunitinib to use for the in vitro experiment was 2.5 μM. For western blot analysis, sunitinib treatment was performed for 15 days.
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PMC11682224
Monoclonal proliferation assays and CCK-8 were used to detect the proliferation capacity of A431 cells and Colon16 cells; wound healing experiments and Transwell assays were used to examine the migration and invasion capacity of A431 cells and Colon16 cells; angiogenesis experiments were conducted to assess the influence of A431 cells on angiogenesis; a nude mouse tumor xenograft experiment and HE staining were utilized to evaluate the impact of CHD1L on the progression of cutaneous squamous cell carcinoma; western blot analysis was performed to detect the expression of p-PI3K, p-AKT, and PD-L1 in A431 cells, as well as CD9, TSG101, PD-L1 in exosomes, and CD206, Arginase-1, iNOS, IL-1β, p-AKT, p-mTOR, VEGF, COX-2, MMP2, MMP9, p-ERK1/2 in tumor-associated macrophages.
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PMC11803918
Blood from healthy mice was collected and centrifuged at 3000 rpm for 10 min to acquire blood plasma.
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PMC9964654
The cytotoxic activities of BCMs, BCMs-[Au(cdc)2], and [Au(cdc)2] were evaluated with the matched pair of cisplatin-sensitive/-resistant A2780 cell lines (A2780/A2780cisR) and in normal fibroblasts (V79), using the MTT assay, as previously described .
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PMC11724582
Significance: ns, not significant; *p < 0.05; **p < 0.01; ***p < 0.001; ****p < 0.0001 We selected the classical cytokine TGF-β1 (transforming growth factor β1) for the activation of CAFs, which has been confirmed to be associated with the transformation of CAFs in previous studies .
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PMC11694346
δ 8.53 (dd, J = 8.5, 2.0 Hz, 1H), 8.49 (d, J = 2.0 Hz, 1H) 8.38 (d, J = 6.5 Hz, 2H), 8.26 (d, J = 9.0 Hz, 1H), 7.68 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 7.67 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.57 (d, J = 9.0 Hz, 2H), 7.32 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 6.93 (d, J = 9.0 Hz, 2H), 3.54 (t, J = 5.0 Hz, 4H), 3.37 (t, J = 5.0 Hz, 4H).
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PMC9429973
The expected study duration from first patient’s first visit to last patient’s last visit is approximately 3 years.
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PMC11738017
Design of CAR T. Anti-BCMA scFv domain of CAR T was replaced with the anti-BCMA heavy and light chain variable domains of teclistamab to generate CAR T. Figure created with BioRender.com. (
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PMC9688728
Obtained spectrum files were processed by ChromaTOF (v. 5.51, LECO Corporation, Benton Harbor, MI, USA) for deconvolution, peak picking, alignment, and primary database searching.
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PMC11748363
The sample was heated and stirred for 30 min, and then 2 mmol of the corresponding amine dissolved in 5 mL of DCM was added.
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PMC9964635
Molecule 7f also presented very low toxicity at 1.19 ± 0.02 relative to reference Triton-X-100.
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PMC11730305
Today, the use of multi-agent nanoproducts in cancer treatment has attracted the attention of researchers.
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PMC7351993
e Fluorescence images of sorted and unsorted particles in the collection and waste tubes, respectively (n = 2).
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PMC6803987
Ducklings infected with the hepatitis B virus were purchased from Guilin Wenshi Group Co., Ltd. (Guangxi, China).
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PMC8873393
A Schematic illustration of the cellular fractionation procedure.
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PMC5941560
The effects of these variants are less certain, but our comprehensive variant catalog will facilitate further investigations of the Jurkat genome and allow for re-analysis of Jurkat variants as more information about their effects becomes available.
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PMC10812665
Both effects can lead to metabolite accumulations.
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PMC10968586
Breast cancer is the most frequent malignant tumor in women worldwide, with a constantly rising incidence .
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PMC6642070
In addition, DCA has been reported to increase mitochondrial oxidative metabolism leading to an improved cellular energy state in skeletal muscles , and revert simvastatin-induced CK elevation through inhibition of forkhead box protein O (FOXO) mediated proteolysis .
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Notably, a group O patient at a different hospital received a split of the same apheresis unit, with no reaction.
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Among pts yielding <2×10/Kg CD34+ cells, 4 received PLX, while 10 did not.
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PMC11434983
In this category, the development of pharmacophores that combine metal complexes with EGFR TKIs may be promising novel multi-target anticancer drugs, resulting in a combination of different mechanisms of action .
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n = 5–9 per group.
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PMC10743717
Why are the immune-histological micrographs stained with guinea pig or mouse anti-ABAD completely distinct from those stained with rabbit anti-ERAB/ABAD ?
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PMC9164404
Transmission electron microscopy (TEM) and dynamic light scattering (DLS) demonstrated that Abplatin was in spherical structure with a diameter at 174.7 nm at a feed mass ratio of 1/10 (Pt to HSA) (Fig. 1A and B).
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PMC11635519
Samples were read using a 0.1 cm cuvette path length with 10 accumulations per run and 50 nm/min scanning speed.
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PMC11703992
Our workflow is illustrated in Fig. 1.
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PMC11656380
In this study, we developed a 25-mer antitumor peptide, Tat-Ram13, by fusing the RAM domain of the NOTCH1 intracellular fragment with the HIV-1 TAT peptide to directly antagonize NOTCH signaling in T-ALL.
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PMC9429973
Further amino acid analysis revealed that the frequency of serine 57 of the HLA-DQB1 pocket 9 was higher in ALL (RR=2.03, 95% CI: 1.26-3.27; p=0.037).
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PMC2193049
After side chain deprotection and release from the resin, the peptides were purified by reverse-phase preparative HPLC using a Vydac C18 column.
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PMC11267830
Additionally, CRISPR screening data from CCLE CRISPRi revealed the dependence of T-ALL Jurkat cell survival on THOC1 (Fig. 7c, Supplementary Table 12).
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PMC11317131
Amplicon sequencing primers were designed to flank each target sequence.
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PMC9429973
Profiling of transcriptional response to RVU120 in DMNT3A mutant cells has been performed by RNA-seq.
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PMC11087301
Also, SOX2 levels were positively correlated with endothelial markers CD31 and VE-cadherin.
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PMC11802929
Briefly, potential HLA A*02:01 binding epitopes (9-11 mer peptides) were generated from the complete SARS-CoV-2 genome (Wuhan-Hu-1 strain, GenBank ID: MN908947.3) and filtered by NetMHCpan-4.1 prediction.
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PMC10154097
Briefly, cell protein was isolated and quantified by BCA method followed by separation on SDS-PAGE for western blot.
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PMC11350568
As depicted in Figure 4e, the fluorescence signal was weakest in the AptG-1 group, indicating efficient protein degradation.
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PMC9429973
Overall survival (OS) was 89.5%, with 6 deaths (2 due to CLL progression) and estimated OS at 24 months was 90.5% (95% CI 81.0%-99.9%).
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PMC6337547
Salvianic acid C is synthesized by the condensation of two molecules of caffeic acid .
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PMC11597291
An increase in the molecular weight of the (linear) PEG from 2 to 20 kDa decreased the size and tended to increase the ζ-potential of the nCGO-PEG particles (Table 2), indicating a more effective stabilizing and charge screening effect of the high MW PEG polymers.
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PMC10988555
Interestingly, for complexes 3 and 4, with the phenantroline coligands, a slight shielding of the ortho protons (Δδ Hortho = −0.12 ppm) was also found, suggesting the involvement of the P center in the overall extended π back-donation system.
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A significant difference between overall survival probability (Log rank p-value: 0.019) was again found between stable clusters of the energetics hallmark (K = 3).
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PMC11621493
Notably, under basal conditions, we observed no significant lipidomic changes, suggesting that lack of PLA2G4D activity is compensated by other enzymes.
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PMC11754436
C DHRS4-AS1-dependent lncRNA subnetwork. (
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PMC10976516
Therefore, MSCs can effectively transport genetically engineered OVs to solid tumors such as lung cancer, and overall (pre)clinical results suggest that systemic OV therapies using MSC carrier systems have a perspective in lung cancer treatment (Tables 2 and 3).
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PMC9429973
The median follow-up from 2L therapy was 8.2 years.
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