PMCID
string | Sentences
string | ner
list |
|---|---|---|
PMC6114978
|
Although TAZ and YAP have been acknowledged as central oncoproteins in multiple cancers including breast, colon, liver, lung, pancreatic, and thyroid cancers , the dominant paradigm is that these two oncoproteins are activated relatively late in tumor progression.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Although",
"TAZ",
"and",
"YAP",
"have",
"been",
"acknowledged",
"as",
"central",
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"multiple",
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",",
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",",
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",",
"and",
"thyroid",
"cancers",
",",
"the",
"dominant",
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"is",
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"two",
"oncoproteins",
"are",
"activated",
"relatively",
"late",
"in",
"tumor",
"progression",
"."
]
}
] |
PMC11770746
|
p < 0.001, ****p < 0.0001 (one-way ANOVA).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"p",
"<",
"0.001",
",",
"*",
"*",
"*",
"*",
"p",
"<",
"0.0001",
"(",
"one-way",
"ANOVA",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The ORR improved in 22% of patients, confirming the efficacy of this chemo-free regimen in combination with rituximab maintenance in relapsed/refractory WM.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"ORR",
"improved",
"in",
"22",
"%",
"of",
"patients",
",",
"confirming",
"the",
"efficacy",
"of",
"this",
"chemo-free",
"regimen",
"in",
"combination",
"with",
"rituximab",
"maintenance",
"in",
"relapsed/refractory",
"WM",
"."
]
}
] |
PMC11521786
|
This effect was not reproduced by preimmune sera, which confirms the specificity of this result ( Figure 1C ).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"effect",
"was",
"not",
"reproduced",
"by",
"preimmune",
"sera",
",",
"which",
"confirms",
"the",
"specificity",
"of",
"this",
"result",
"(",
"Figure",
"1C",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
In vivo treatment of leukemically diseased rats or humans was well tolerated, led to an increase of platelets and granulocytes and stable (low) blast counts in PB – probably mediated by a (leukemia specifically) DC/DCleu activated immune system.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"vivo",
"treatment",
"of",
"leukemically",
"diseased",
"rats",
"or",
"humans",
"was",
"well",
"tolerated",
",",
"led",
"to",
"an",
"increase",
"of",
"platelets",
"and",
"granulocytes",
"and",
"stable",
"(",
"low",
")",
"blast",
"counts",
"in",
"PB",
"–",
"probably",
"mediated",
"by",
"a",
"(",
"leukemia",
"specifically",
")",
"DC/DCleu",
"activated",
"immune",
"system",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Results: The overall prevalence of thrombotic complications in our patients’ group was 25,01%.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
":",
"The",
"overall",
"prevalence",
"of",
"thrombotic",
"complications",
"in",
"our",
"patients",
"’",
"group",
"was",
"25,01",
"%",
"."
]
}
] |
PMC10158546
|
Therefore, we deemed it unlikely that the use of antibiotics prevented prion replication in this study, although we cannot completely rule out the possibility of antibiotics having a negative impact.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"we",
"deemed",
"it",
"unlikely",
"that",
"the",
"use",
"of",
"antibiotics",
"prevented",
"prion",
"replication",
"in",
"this",
"study",
",",
"although",
"we",
"can",
"not",
"completely",
"rule",
"out",
"the",
"possibility",
"of",
"antibiotics",
"having",
"a",
"negative",
"impact",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The coexistence or mutual exclusion between genes and chromosomes may provide a basis for further definitive diagnosis and therapeutic regimen.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"coexistence",
"or",
"mutual",
"exclusion",
"between",
"genes",
"and",
"chromosomes",
"may",
"provide",
"a",
"basis",
"for",
"further",
"definitive",
"diagnosis",
"and",
"therapeutic",
"regimen",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Aims: We aimed to evaluate the role of Ruxolitinib on the NK cell mediated GvL effect.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aims",
":",
"We",
"aimed",
"to",
"evaluate",
"the",
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"of",
"Ruxolitinib",
"on",
"the",
"NK",
"cell",
"mediated",
"GvL",
"effect",
"."
]
}
] |
PMC11532793
|
We note that edgeR-v4 correctly controlled the FDR below the nominal level for all sample sizes and for all FDR levels regardless of the number of resamples conducted or the type of resampling algorithm.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"note",
"that",
"edgeR-v4",
"correctly",
"controlled",
"the",
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"below",
"the",
"nominal",
"level",
"for",
"all",
"sample",
"sizes",
"and",
"for",
"all",
"FDR",
"levels",
"regardless",
"of",
"the",
"number",
"of",
"resamples",
"conducted",
"or",
"the",
"type",
"of",
"resampling",
"algorithm",
"."
]
}
] |
PMC10243817
|
Further investigations will be required to elucidate the mechanisms employed by MEX3B in airway epithelial cells.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Further",
"investigations",
"will",
"be",
"required",
"to",
"elucidate",
"the",
"mechanisms",
"employed",
"by",
"MEX3B",
"in",
"airway",
"epithelial",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC10291556
|
Briefly, 3 × 10 cells were seeded in 100 mm culture dishes and grown overnight.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Briefly",
",",
"3",
"×",
"10",
"cells",
"were",
"seeded",
"in",
"100",
"mm",
"culture",
"dishes",
"and",
"grown",
"overnight",
"."
]
}
] |
PMC11352311
|
The human renal cell carcinoma cell lines 786-O and A498 were purchased from Zhong Qiao Xin Zhou Biotechnology (Shanghai, China).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"human",
"renal",
"cell",
"carcinoma",
"cell",
"lines",
"786-O",
"and",
"A498",
"were",
"purchased",
"from",
"Zhong",
"Qiao",
"Xin",
"Zhou",
"Biotechnology",
"(",
"Shanghai",
",",
"China",
")",
"."
]
}
] |
PMC11711127
|
Many tolDC phenotypes have been described, often exhibiting capacity for one or few tolerance mechanisms.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"tolDC",
"phenotypes",
"have",
"been",
"described",
",",
"often",
"exhibiting",
"capacity",
"for",
"one",
"or",
"few",
"tolerance",
"mechanisms",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Continuous variables were expressed as median and range.
|
[
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"tokens": [
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"variables",
"were",
"expressed",
"as",
"median",
"and",
"range",
"."
]
}
] |
PMC11748363
|
PerkinElmer Informatics, Waltham, MA, USA).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"PerkinElmer",
"Informatics",
",",
"Waltham",
",",
"MA",
",",
"USA",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Neurosurgery, National Hospital for Neurology and Neurosurgery, Queen’s Square; Dept.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Neurosurgery",
",",
"National",
"Hospital",
"for",
"Neurology",
"and",
"Neurosurgery",
",",
"Queen",
"’s",
"Square",
";",
"Dept",
"."
]
}
] |
PMC11536589
|
To corroborate decreased MGST1 expression conferred the susceptibility of cancer to ferroptosis, we also performed IHC with antibody specific for 4-HNE (a lipid peroxidation marker) to examine the ferroptosis level in xenografts.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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",",
"we",
"also",
"performed",
"IHC",
"with",
"antibody",
"specific",
"for",
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"(",
"a",
"lipid",
"peroxidation",
"marker",
")",
"to",
"examine",
"the",
"ferroptosis",
"level",
"in",
"xenografts",
"."
]
}
] |
PMC7759933
|
Z-stacks were processed and analysed using the Leica confocal software and presented as a “maximum intensity projection image” gallery.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Z-stacks",
"were",
"processed",
"and",
"analysed",
"using",
"the",
"Leica",
"confocal",
"software",
"and",
"presented",
"as",
"a",
"“",
"maximum",
"intensity",
"projection",
"image",
"”",
"gallery",
"."
]
}
] |
PMC9847912
|
We initially measured the activity of GSK232 against HIV-1, HIV-2, and SIV isolates in spreading infections of an immortalized, human T cell line (CEMss).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"initially",
"measured",
"the",
"activity",
"of",
"GSK232",
"against",
"HIV-1",
",",
"HIV-2",
",",
"and",
"SIV",
"isolates",
"in",
"spreading",
"infections",
"of",
"an",
"immortalized",
",",
"human",
"T",
"cell",
"line",
"(",
"CEMss",
")",
"."
]
}
] |
PMC10047551
|
These fusion proteins are composed of the inactive dSaCas9 or dSpCas9 protein (D10A and N580A or D10A and H840A, respectively) C-terminally fused with the active catalytic domains of TET1 or DNMT3A or the corresponding inactive catalytic domains denoted as dTET1 (H1672Y and D1674A) or dDNMT3A (E752A) .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"fusion",
"proteins",
"are",
"composed",
"of",
"the",
"inactive",
"dSaCas9",
"or",
"dSpCas9",
"protein",
"(",
"D10A",
"and",
"N580A",
"or",
"D10A",
"and",
"H840A",
",",
"respectively",
")",
"C-terminally",
"fused",
"with",
"the",
"active",
"catalytic",
"domains",
"of",
"TET1",
"or",
"DNMT3A",
"or",
"the",
"corresponding",
"inactive",
"catalytic",
"domains",
"denoted",
"as",
"dTET1",
"(",
"H1672Y",
"and",
"D1674A",
")",
"or",
"dDNMT3A",
"(",
"E752A",
")",
"."
]
}
] |
PMC9841531
|
To get further insights into the ligand–transporter interactions and the structural background of MCT1 inhibition, molecular docking of the reference MCT1 inhibitors 7 and 8, as well as the lead MCT1 inhibitors 24 and 30, was applied using a recently released cryo-EM structure of human MCT1 (PDB ID: 7CKR).Figure 13 shows the human MCT1 cryo-EM structure with compound 7 embedded within the transmembrane regions.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"get",
"further",
"insights",
"into",
"the",
"ligand",
"–",
"transporter",
"interactions",
"and",
"the",
"structural",
"background",
"of",
"MCT1",
"inhibition",
",",
"molecular",
"docking",
"of",
"the",
"reference",
"MCT1",
"inhibitors",
"7",
"and",
"8",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"lead",
"MCT1",
"inhibitors",
"24",
"and",
"30",
",",
"was",
"applied",
"using",
"a",
"recently",
"released",
"cryo-EM",
"structure",
"of",
"human",
"MCT1",
"(",
"PDB",
"ID",
":",
"7CKR).Figure",
"13",
"shows",
"the",
"human",
"MCT1",
"cryo-EM",
"structure",
"with",
"compound",
"7",
"embedded",
"within",
"the",
"transmembrane",
"regions",
"."
]
}
] |
PMC11640555
|
Our data demonstrated that 24 h after treatment with CX-4945 at the concentrations of 10 and 15 μM, the expression levels of HO-1 and MnSOD significantly reduced compared to the control group (Figure 3A and Figure 3B, densitometric analysis Figure 3(A1) and Figure 3(B1), respectively).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"data",
"demonstrated",
"that",
"24",
"h",
"after",
"treatment",
"with",
"CX-4945",
"at",
"the",
"concentrations",
"of",
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"15",
"μM",
",",
"the",
"expression",
"levels",
"of",
"HO-1",
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"MnSOD",
"significantly",
"reduced",
"compared",
"to",
"the",
"control",
"group",
"(",
"Figure",
"3A",
"and",
"Figure",
"3B",
",",
"densitometric",
"analysis",
"Figure",
"3(A1",
")",
"and",
"Figure",
"3(B1",
")",
",",
"respectively",
")",
"."
]
}
] |
PMC8998437
|
We analyzed the mRNA expression levels of the inflammatory chemokine receptors CCR1, CCR2, CCR3, and CCR5 in 13 BL cell lines, four EBV-negative cell lines (DG75, BL41, Akata-, Mutu cl.30), and in nine EBV-carrying cell lines.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"analyzed",
"the",
"mRNA",
"expression",
"levels",
"of",
"the",
"inflammatory",
"chemokine",
"receptors",
"CCR1",
",",
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",",
"CCR3",
",",
"and",
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",",
"four",
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",",
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",",
"Akata-",
",",
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"cl.30",
")",
",",
"and",
"in",
"nine",
"EBV-carrying",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC9119314
|
The organic layer was washed with water twice, dried over anhydrous sodium sulfate, filtered, evaporated under reduced pressure, and dried in vacuo.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"organic",
"layer",
"was",
"washed",
"with",
"water",
"twice",
",",
"dried",
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"anhydrous",
"sodium",
"sulfate",
",",
"filtered",
",",
"evaporated",
"under",
"reduced",
"pressure",
",",
"and",
"dried",
"in",
"vacuo",
"."
]
}
] |
PMC11300639
|
Ns, not significant.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Ns",
",",
"not",
"significant",
"."
]
}
] |
PMC10772747
|
Active compounds in EBE From the literature review, a total of 16 active compounds (Table 1) with potential anticancer activity have been identified.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"the",
"literature",
"review",
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"compounds",
"(",
"Table",
"1",
")",
"with",
"potential",
"anticancer",
"activity",
"have",
"been",
"identified",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Methods: Patients aged ≥18 years with diagnoses of AdvSM per local investigator were treated with once-daily avapritinib <200 mg (n=17), 200 mg (n=126), and ≥300 mg (n=50).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O"
],
"tokens": [
"Methods",
":",
"Patients",
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"investigator",
"were",
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"200",
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"(",
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")",
",",
"200",
"mg",
"(",
"n=126",
")",
",",
"and",
"≥300",
"mg",
"(",
"n=50",
")",
"."
]
}
] |
PMC11767725
|
For instance, S. epidermidis produces AMPs, such as phenol-soluble modulins, which inhibit the colonization of pathogenic bacteria like Staphylococcus aureus.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"instance",
",",
"S.",
"epidermidis",
"produces",
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",",
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"as",
"phenol-soluble",
"modulins",
",",
"which",
"inhibit",
"the",
"colonization",
"of",
"pathogenic",
"bacteria",
"like",
"Staphylococcus",
"aureus",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Histological examination of a wedge biopsy specimen obtained from the lungs confirmed the diagnosis of LCH and consequent molecular studies identified the M1043V PIK3CA mutation.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Histological",
"examination",
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"biopsy",
"specimen",
"obtained",
"from",
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"the",
"diagnosis",
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"LCH",
"and",
"consequent",
"molecular",
"studies",
"identified",
"the",
"M1043V",
"PIK3CA",
"mutation",
"."
]
}
] |
PMC11604768
|
Each connected set of data points represents a single promoter.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"Each",
"connected",
"set",
"of",
"data",
"points",
"represents",
"a",
"single",
"promoter",
"."
]
}
] |
PMC11095939
|
The results showed that pRb was undetectable by 6 hr after PHx.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"results",
"showed",
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"pRb",
"was",
"undetectable",
"by",
"6",
"hr",
"after",
"PHx",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Iron support works improving effective erythopoiesis.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Iron",
"support",
"works",
"improving",
"effective",
"erythopoiesis",
"."
]
}
] |
PMC2011258
|
Continuous exposure of cultured 791T cells indicated that the vindesine was partially inactivated following conjugation since the conjugate was less toxic than the free drug.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Continuous",
"exposure",
"of",
"cultured",
"791",
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"that",
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"vindesine",
"was",
"partially",
"inactivated",
"following",
"conjugation",
"since",
"the",
"conjugate",
"was",
"less",
"toxic",
"than",
"the",
"free",
"drug",
"."
]
}
] |
PMC11531744
|
CellMiner (http://discover.nci.nih.gov/cellminer) was web-based applications for mining publicly available genomic, molecular, and pharmacological datasets of human cancer cell lines (Reinhold et al., 2012; Reinhold et al., 2015).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CellMiner",
"(",
"http://discover.nci.nih.gov/cellminer",
")",
"was",
"web-based",
"applications",
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"datasets",
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"human",
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"(",
"Reinhold",
"et",
"al.",
",",
"2012",
";",
"Reinhold",
"et",
"al.",
",",
"2015",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Second primary malignancies were reported in 44 (20.8%) patients in the Ven-Obi arm and 32 (15.0%) in the Clb-Obi arm.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Second",
"primary",
"malignancies",
"were",
"reported",
"in",
"44",
"(",
"20.8",
"%",
")",
"patients",
"in",
"the",
"Ven-Obi",
"arm",
"and",
"32",
"(",
"15.0",
"%",
")",
"in",
"the",
"Clb-Obi",
"arm",
"."
]
}
] |
PMC11519077
|
RealQ Plus Master Mix Green (AMPLIQONIII) was used for real-time PCR in accordance with the manufacturer's instructions.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"RealQ",
"Plus",
"Master",
"Mix",
"Green",
"(",
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")",
"was",
"used",
"for",
"real-time",
"PCR",
"in",
"accordance",
"with",
"the",
"manufacturer",
"'s",
"instructions",
"."
]
}
] |
PMC11216402
|
Training gkm-SVM on differentially active peaks detects RUNX, AP-1, and TEAD activation in Mes-like peaks and detects KLF, GATA, GRHL, FOXA, and HNF4A activation in Epi-like peaks.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Training",
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"and",
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"peaks",
"and",
"detects",
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",",
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",",
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",",
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",",
"and",
"HNF4A",
"activation",
"in",
"Epi-like",
"peaks",
"."
]
}
] |
PMC8469018
|
Thus, the decreased level of cellular thiols is an early symptom of cell death progression in response to oxidative stress .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Thus",
",",
"the",
"decreased",
"level",
"of",
"cellular",
"thiols",
"is",
"an",
"early",
"symptom",
"of",
"cell",
"death",
"progression",
"in",
"response",
"to",
"oxidative",
"stress",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Summary/Conclusion: aPTT is a rare and severe disease that should be promptly diagnosed, since time until the beginning of treatment is determinant on the disease mortality.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Summary/Conclusion",
":",
"aPTT",
"is",
"a",
"rare",
"and",
"severe",
"disease",
"that",
"should",
"be",
"promptly",
"diagnosed",
",",
"since",
"time",
"until",
"the",
"beginning",
"of",
"treatment",
"is",
"determinant",
"on",
"the",
"disease",
"mortality",
"."
]
}
] |
PMC9065483
|
Supernatant was collected 48 hpi and viral titer was assessed by plaque assay (n = 3, mean ± SEM; ∗∗p < 0.01 by one-way ANOVA). (
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Supernatant",
"was",
"collected",
"48",
"hpi",
"and",
"viral",
"titer",
"was",
"assessed",
"by",
"plaque",
"assay",
"(",
"n",
"=",
"3",
",",
"mean",
"±",
"SEM",
";",
"∗∗p",
"<",
"0.01",
"by",
"one-way",
"ANOVA",
")",
".",
"("
]
}
] |
PMC11681005
|
The intratumor heterogeneity (ITH) of bladder cancer (BLCA) facilitates resistance to treatment and enables evasion of immune surveillance, directly impacting patient outcomes and clinical prognosis.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"intratumor",
"heterogeneity",
"(",
"ITH",
")",
"of",
"bladder",
"cancer",
"(",
"BLCA",
")",
"facilitates",
"resistance",
"to",
"treatment",
"and",
"enables",
"evasion",
"of",
"immune",
"surveillance",
",",
"directly",
"impacting",
"patient",
"outcomes",
"and",
"clinical",
"prognosis",
"."
]
}
] |
PMC10713411
|
A risk model was established via LASSO Cox regression analysis based on 17 PRPCDGs’ mRNA expression in KIRC-training dataset.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"risk",
"model",
"was",
"established",
"via",
"LASSO",
"Cox",
"regression",
"analysis",
"based",
"on",
"17",
"PRPCDGs",
"’",
"mRNA",
"expression",
"in",
"KIRC-training",
"dataset",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Adverse events (AE) were similar to what is expected with the used drugs (nausea Grade 1 (n=1), fatigue Grade 1 (n=1), hypophosphatemia Grade 1 (n=1), hyperglycemia Grade 1 (n=1), leukocytosis Grade 1 (n=1), anemia Grade 1 (n=1)), including immune-related AE (fever Grade 1 (n=1), rash Grade 3 (n=1)).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Adverse",
"events",
"(",
"AE",
")",
"were",
"similar",
"to",
"what",
"is",
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"with",
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"nausea",
"Grade",
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"n=1",
")",
",",
"fatigue",
"Grade",
"1",
"(",
"n=1",
")",
",",
"hypophosphatemia",
"Grade",
"1",
"(",
"n=1",
")",
",",
"hyperglycemia",
"Grade",
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"n=1",
")",
",",
"leukocytosis",
"Grade",
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"(",
"n=1",
")",
",",
"anemia",
"Grade",
"1",
"(",
"n=1",
")",
")",
",",
"including",
"immune-related",
"AE",
"(",
"fever",
"Grade",
"1",
"(",
"n=1",
")",
",",
"rash",
"Grade",
"3",
"(",
"n=1",
")",
")",
"."
]
}
] |
PMC11046454
|
Scale bars represent 5 μm.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Scale",
"bars",
"represent",
"5",
"μm",
"."
]
}
] |
PMC11087055
|
We electroporated unincubated eggs at pre-streak stages IX to XII for cell flow imaging.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"electroporated",
"unincubated",
"eggs",
"at",
"pre-streak",
"stages",
"IX",
"to",
"XII",
"for",
"cell",
"flow",
"imaging",
"."
]
}
] |
PMC10813895
|
Notably, ELF5 expression is inversely proportional to promoter methylation with age.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Notably",
",",
"ELF5",
"expression",
"is",
"inversely",
"proportional",
"to",
"promoter",
"methylation",
"with",
"age",
"."
]
}
] |
PMC11718817
|
The bone-marrow-derived cells were flushed through a 70 µm cell strainer (Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, Germany, catalog no. 130-041-407) and then lysed for 3 min to remove erythrocytes.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"bone-marrow-derived",
"cells",
"were",
"flushed",
"through",
"a",
"70",
"µm",
"cell",
"strainer",
"(",
"Miltenyi",
"Biotec",
",",
"Bergisch",
"Gladbach",
",",
"Germany",
",",
"catalog",
"no.",
"130",
"-",
"041",
"-",
"407",
")",
"and",
"then",
"lysed",
"for",
"3",
"min",
"to",
"remove",
"erythrocytes",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
B. Wienert, K. Wallace, C. Bandoro, A. Churi, J. Partridge, R. Sharma, W. Matern, S. Treusch, D. Dever Graphite Bio, Inc., South San Francisco, CA, United States of America Background: β-thalassemia is a genetic disorder characterized by reduced production of β-globin, a protein that forms functional, oxygen-carrying hemoglobin with α-globin (HbA, α2β2).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"B.",
"Wienert",
",",
"K.",
"Wallace",
",",
"C.",
"Bandoro",
",",
"A.",
"Churi",
",",
"J.",
"Partridge",
",",
"R.",
"Sharma",
",",
"W.",
"Matern",
",",
"S.",
"Treusch",
",",
"D.",
"Dever",
"Graphite",
"Bio",
",",
"Inc.",
",",
"South",
"San",
"Francisco",
",",
"CA",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
"Background",
":",
"β-thalassemia",
"is",
"a",
"genetic",
"disorder",
"characterized",
"by",
"reduced",
"production",
"of",
"β-globin",
",",
"a",
"protein",
"that",
"forms",
"functional",
",",
"oxygen-carrying",
"hemoglobin",
"with",
"α-globin",
"(",
"HbA",
",",
"α2β2",
")",
"."
]
}
] |
PMC11674891
|
We further explored the effects of GRPR knockdown on the metastatic potential of LUAD cells in vivo.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"further",
"explored",
"the",
"effects",
"of",
"GRPR",
"knockdown",
"on",
"the",
"metastatic",
"potential",
"of",
"LUAD",
"cells",
"in",
"vivo",
"."
]
}
] |
PMC6617630
|
In addition to the cell of origin, genetic studies have identified a prognostic role for MYC rearrangements in DLBCL.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
"to",
"the",
"cell",
"of",
"origin",
",",
"genetic",
"studies",
"have",
"identified",
"a",
"prognostic",
"role",
"for",
"MYC",
"rearrangements",
"in",
"DLBCL",
"."
]
}
] |
PMC7582629
|
However, the actual peak location of a functional group in a molecule may differ (shift) from the isolated case because of interactions and bonding with its neighbors .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"the",
"actual",
"peak",
"location",
"of",
"a",
"functional",
"group",
"in",
"a",
"molecule",
"may",
"differ",
"(",
"shift",
")",
"from",
"the",
"isolated",
"case",
"because",
"of",
"interactions",
"and",
"bonding",
"with",
"its",
"neighbors",
"."
]
}
] |
PMC11387401
|
Therefore, follow-up experiments should investigate whether the loss of RNA expression (or the possible induced loss in protein expression) is responsible for the observed phenotype.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"follow-up",
"experiments",
"should",
"investigate",
"whether",
"the",
"loss",
"of",
"RNA",
"expression",
"(",
"or",
"the",
"possible",
"induced",
"loss",
"in",
"protein",
"expression",
")",
"is",
"responsible",
"for",
"the",
"observed",
"phenotype",
"."
]
}
] |
PMC10470467
|
The manuscript presents research on animals that do not require ethical approval for their study.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"manuscript",
"presents",
"research",
"on",
"animals",
"that",
"do",
"not",
"require",
"ethical",
"approval",
"for",
"their",
"study",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
However, DNA integrity is threatened by endogenous and exogenous sources.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"DNA",
"integrity",
"is",
"threatened",
"by",
"endogenous",
"and",
"exogenous",
"sources",
"."
]
}
] |
PMC9635307
|
To investigate the role of CEACAM1 expression in mature B cells, we employed an agonistic anti-CEACAM1 mAb, CC1 , in our study.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"investigate",
"the",
"role",
"of",
"CEACAM1",
"expression",
"in",
"mature",
"B",
"cells",
",",
"we",
"employed",
"an",
"agonistic",
"anti-CEACAM1",
"mAb",
",",
"CC1",
",",
"in",
"our",
"study",
"."
]
}
] |
PMC3765139
|
The RNA yield was quantified by spectrophotometric analysis (NanoDrop® Technologies, Wilmington, USA) using the convention that 1 absorbance unit at 260 nm equals to 40 μg/mL RNA.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"RNA",
"yield",
"was",
"quantified",
"by",
"spectrophotometric",
"analysis",
"(",
"NanoDrop",
"®",
"Technologies",
",",
"Wilmington",
",",
"USA",
")",
"using",
"the",
"convention",
"that",
"1",
"absorbance",
"unit",
"at",
"260",
"nm",
"equals",
"to",
"40",
"μg/mL",
"RNA",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
M. Muraru, A. Skowronska, S. Dyer, A. Beggs, J. Woodley, C. Poxon, J. Mason West Midlands Regional Genetics Laboratory, Birmingham Women’s and Children’s NHS Foundation Trust; Cancer and Genomic Sciences, University of Birmingham, Birmingham, United Kingdom Background: Here we present the Central and South Genomic Laboratory Hub experience of verifying Optical Genome Mapping (OGM).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"M.",
"Muraru",
",",
"A.",
"Skowronska",
",",
"S.",
"Dyer",
",",
"A.",
"Beggs",
",",
"J.",
"Woodley",
",",
"C.",
"Poxon",
",",
"J.",
"Mason",
"West",
"Midlands",
"Regional",
"Genetics",
"Laboratory",
",",
"Birmingham",
"Women",
"’s",
"and",
"Children",
"’s",
"NHS",
"Foundation",
"Trust",
";",
"Cancer",
"and",
"Genomic",
"Sciences",
",",
"University",
"of",
"Birmingham",
",",
"Birmingham",
",",
"United",
"Kingdom",
"Background",
":",
"Here",
"we",
"present",
"the",
"Central",
"and",
"South",
"Genomic",
"Laboratory",
"Hub",
"experience",
"of",
"verifying",
"Optical",
"Genome",
"Mapping",
"(",
"OGM",
")",
"."
]
}
] |
PMC6600592
|
ESIMS: m/z 366.2070 [M + H], 388.1886 [M + Na], calculated for C23H27NO3 (365.47).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ESIMS",
":",
"m/z",
"366.2070",
"[",
"M",
"+",
"H",
"]",
",",
"388.1886",
"[",
"M",
"+",
"Na",
"]",
",",
"calculated",
"for",
"C23H27NO3",
"(",
"365.47",
")",
"."
]
}
] |
PMC11092382
|
Although sophocarpine was shown to have beneficial effects in this study, further animal and human studies are needed to confirm and evaluate the role of sophocarpine in both type 1 and type 2 diabetes.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Although",
"sophocarpine",
"was",
"shown",
"to",
"have",
"beneficial",
"effects",
"in",
"this",
"study",
",",
"further",
"animal",
"and",
"human",
"studies",
"are",
"needed",
"to",
"confirm",
"and",
"evaluate",
"the",
"role",
"of",
"sophocarpine",
"in",
"both",
"type",
"1",
"and",
"type",
"2",
"diabetes",
"."
]
}
] |
PMC9910796
|
Consistent with previous reports , immuno-EM analysis showed that those areas represent discrete patches of highly electron-dense coats underneath the PM or around endosomal-lysosomal compartments (Fig 6D and 6E).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Consistent",
"with",
"previous",
"reports",
",",
"immuno-EM",
"analysis",
"showed",
"that",
"those",
"areas",
"represent",
"discrete",
"patches",
"of",
"highly",
"electron-dense",
"coats",
"underneath",
"the",
"PM",
"or",
"around",
"endosomal-lysosomal",
"compartments",
"(",
"Fig",
"6D",
"and",
"6E",
")",
"."
]
}
] |
PMC9919300
|
In this way, curcumin modulates various signaling molecules with key roles in cellular signal transduction pathways pertinent to growth, differentiation, and malignant transformation and exerts potent anti-inflammatory and anticarcinogenic actions.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"way",
",",
"curcumin",
"modulates",
"various",
"signaling",
"molecules",
"with",
"key",
"roles",
"in",
"cellular",
"signal",
"transduction",
"pathways",
"pertinent",
"to",
"growth",
",",
"differentiation",
",",
"and",
"malignant",
"transformation",
"and",
"exerts",
"potent",
"anti-inflammatory",
"and",
"anticarcinogenic",
"actions",
"."
]
}
] |
PMC7022782
|
The dimensional analysis showed that NPs were dimensionally stable regardless of the storage temperature over time (p > 0.05).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"dimensional",
"analysis",
"showed",
"that",
"NPs",
"were",
"dimensionally",
"stable",
"regardless",
"of",
"the",
"storage",
"temperature",
"over",
"time",
"(",
"p",
">",
"0.05",
")",
"."
]
}
] |
PMC9221284
|
Nonspecific binding sites were blocked for 1 h with 5% non-fat dry milk in TBS containing 0.1% Tween-20.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Nonspecific",
"binding",
"sites",
"were",
"blocked",
"for",
"1",
"h",
"with",
"5",
"%",
"non-fat",
"dry",
"milk",
"in",
"TBS",
"containing",
"0.1",
"%",
"Tween-20",
"."
]
}
] |
PMC11473843
|
Quantification of DHR (ROS marker, green) in A549 cells treated with the combination of XMD8-92 and Seliciclib (10 µM) or VS-4718 (5 µM) in the presence or absence of the SOD mimetic, MnTMPyp (25 µM); n = 3. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Quantification",
"of",
"DHR",
"(",
"ROS",
"marker",
",",
"green",
")",
"in",
"A549",
"cells",
"treated",
"with",
"the",
"combination",
"of",
"XMD8",
"-",
"92",
"and",
"Seliciclib",
"(",
"10",
"µM",
")",
"or",
"VS-4718",
"(",
"5",
"µM",
")",
"in",
"the",
"presence",
"or",
"absence",
"of",
"the",
"SOD",
"mimetic",
",",
"MnTMPyp",
"(",
"25",
"µM",
")",
";",
"n",
"=",
"3",
".",
"("
]
}
] |
PMC10538569
|
Cells were washed twice with FACS buffer.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cells",
"were",
"washed",
"twice",
"with",
"FACS",
"buffer",
"."
]
}
] |
PMC10196713
|
Since depletion of Fdx1 results in dysregulation of iron homeostasis, leading to mitochondrial iron overload (24), it can be envisaged that Fdx1 is critically involved in the regulation of ferroptosis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Since",
"depletion",
"of",
"Fdx1",
"results",
"in",
"dysregulation",
"of",
"iron",
"homeostasis",
",",
"leading",
"to",
"mitochondrial",
"iron",
"overload",
"(",
"24",
")",
",",
"it",
"can",
"be",
"envisaged",
"that",
"Fdx1",
"is",
"critically",
"involved",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"ferroptosis",
"."
]
}
] |
PMC9672323
|
We found a slight increase in SOD3 activity and TAC levels in piroxicam-treated PBMCs, although not significant.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"found",
"a",
"slight",
"increase",
"in",
"SOD3",
"activity",
"and",
"TAC",
"levels",
"in",
"piroxicam-treated",
"PBMCs",
",",
"although",
"not",
"significant",
"."
]
}
] |
PMC10965680
|
The SNP numbers of the other six breeds are also listed in Figure 2B, and detailed information can be found in Supplementary Table S4.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"SNP",
"numbers",
"of",
"the",
"other",
"six",
"breeds",
"are",
"also",
"listed",
"in",
"Figure",
"2B",
",",
"and",
"detailed",
"information",
"can",
"be",
"found",
"in",
"Supplementary",
"Table",
"S4",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Image: Summary/Conclusion: These preliminary data show promising efficacy for BGB-11417 and an improved safety profile, particularly in combination cohorts.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Image",
":",
"Summary/Conclusion",
":",
"These",
"preliminary",
"data",
"show",
"promising",
"efficacy",
"for",
"BGB-11417",
"and",
"an",
"improved",
"safety",
"profile",
",",
"particularly",
"in",
"combination",
"cohorts",
"."
]
}
] |
PMC4395774
|
The expression of GFP in mice reconstituted with the PRF.PRF was higher in CD8 T cells and NK cells, isolated from the spleen and stimulated in culture, confirming preferential expression in effector cells with this promoter (Supplementary Figure S4b).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"expression",
"of",
"GFP",
"in",
"mice",
"reconstituted",
"with",
"the",
"PRF.PRF",
"was",
"higher",
"in",
"CD8",
"T",
"cells",
"and",
"NK",
"cells",
",",
"isolated",
"from",
"the",
"spleen",
"and",
"stimulated",
"in",
"culture",
",",
"confirming",
"preferential",
"expression",
"in",
"effector",
"cells",
"with",
"this",
"promoter",
"(",
"Supplementary",
"Figure",
"S4b",
")",
"."
]
}
] |
PMC3734024
|
Apoptosis was measured at 18 hours by flow cytometry as the percentage of CD4cells that were positive for Annexin V staining. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Apoptosis",
"was",
"measured",
"at",
"18",
"hours",
"by",
"flow",
"cytometry",
"as",
"the",
"percentage",
"of",
"CD4cells",
"that",
"were",
"positive",
"for",
"Annexin",
"V",
"staining",
".",
"("
]
}
] |
PMC9429973
|
Aims: To explore whether the addition of liposomal adriamycin can improve the response.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aims",
":",
"To",
"explore",
"whether",
"the",
"addition",
"of",
"liposomal",
"adriamycin",
"can",
"improve",
"the",
"response",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
While iron excess in FPN MDS mice did not improve erythropoiesis and hematologic parameters in the peripheral blood, iron restriction by Vamifeport significantly ameliorated red blood cell maturation and hemoglobin levels in MDS mice.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"While",
"iron",
"excess",
"in",
"FPN",
"MDS",
"mice",
"did",
"not",
"improve",
"erythropoiesis",
"and",
"hematologic",
"parameters",
"in",
"the",
"peripheral",
"blood",
",",
"iron",
"restriction",
"by",
"Vamifeport",
"significantly",
"ameliorated",
"red",
"blood",
"cell",
"maturation",
"and",
"hemoglobin",
"levels",
"in",
"MDS",
"mice",
"."
]
}
] |
PMC11644761
|
Furthermore, studies on the “cell cycle hypothesis” have underscored the pivotal role of DNA methylation, particularly in cellular dysfunction associated with ND.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"studies",
"on",
"the",
"“",
"cell",
"cycle",
"hypothesis",
"”",
"have",
"underscored",
"the",
"pivotal",
"role",
"of",
"DNA",
"methylation",
",",
"particularly",
"in",
"cellular",
"dysfunction",
"associated",
"with",
"ND",
"."
]
}
] |
PMC6684588
|
Therapeutic interventions based on these follistatin isoforms, or derivatives thereof, have demonstrated efficacy in normal animals and disease models through improvements in muscle mass, strength, regeneration and fibrosis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therapeutic",
"interventions",
"based",
"on",
"these",
"follistatin",
"isoforms",
",",
"or",
"derivatives",
"thereof",
",",
"have",
"demonstrated",
"efficacy",
"in",
"normal",
"animals",
"and",
"disease",
"models",
"through",
"improvements",
"in",
"muscle",
"mass",
",",
"strength",
",",
"regeneration",
"and",
"fibrosis",
"."
]
}
] |
PMC11323699
|
c C57BL/6 J female mice were IP injected with ID8 Trp53 Brca2.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"c",
"C57BL/6",
"J",
"female",
"mice",
"were",
"IP",
"injected",
"with",
"ID8",
"Trp53",
"Brca2",
"."
]
}
] |
PMC11144200
|
Various tissues were collected from these mice, including tumors, blood and spleens, for human CD8 evaluation.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Various",
"tissues",
"were",
"collected",
"from",
"these",
"mice",
",",
"including",
"tumors",
",",
"blood",
"and",
"spleens",
",",
"for",
"human",
"CD8",
"evaluation",
"."
]
}
] |
PMC6771295
|
Protein levels of SIRT1, SIRT3, and SIRT5 were determined by SDS PAGE followed by Western blot.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Protein",
"levels",
"of",
"SIRT1",
",",
"SIRT3",
",",
"and",
"SIRT5",
"were",
"determined",
"by",
"SDS",
"PAGE",
"followed",
"by",
"Western",
"blot",
"."
]
}
] |
PMC9412887
|
Researchers have confirmed the advantages of methods that combine immunotherapy with chemotherapy in the treatment of cancers .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Researchers",
"have",
"confirmed",
"the",
"advantages",
"of",
"methods",
"that",
"combine",
"immunotherapy",
"with",
"chemotherapy",
"in",
"the",
"treatment",
"of",
"cancers",
"."
]
}
] |
PMC11087055
|
This study further suggests evolutional distinctions underlying cell biological mechanisms of the large-scale cell flow and midline morphogenesis, between amniotes and non-amniotes.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"study",
"further",
"suggests",
"evolutional",
"distinctions",
"underlying",
"cell",
"biological",
"mechanisms",
"of",
"the",
"large-scale",
"cell",
"flow",
"and",
"midline",
"morphogenesis",
",",
"between",
"amniotes",
"and",
"non-amniotes",
"."
]
}
] |
PMC9479186
|
The aim of this study was to further elucidate the role of NDUFC1 in HCC and the possible mechanisms.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"aim",
"of",
"this",
"study",
"was",
"to",
"further",
"elucidate",
"the",
"role",
"of",
"NDUFC1",
"in",
"HCC",
"and",
"the",
"possible",
"mechanisms",
"."
]
}
] |
PMC10759659
|
Briefly, HepG2/2.2.15 cells were transfected with negative control siRNA using Lipofectamine™ 3000 (#L3000001; Invitrogen) according to the manufacturer’s instructions.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Briefly",
",",
"HepG2/2.2.15",
"cells",
"were",
"transfected",
"with",
"negative",
"control",
"siRNA",
"using",
"Lipofectamine",
"™",
"3000",
"(",
"#",
"L3000001",
";",
"Invitrogen",
")",
"according",
"to",
"the",
"manufacturer",
"’s",
"instructions",
"."
]
}
] |
PMC8427838
|
Our recent study demonstrated that loss of TMIGD1 in mice alters intestinal apical membrane organization .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"recent",
"study",
"demonstrated",
"that",
"loss",
"of",
"TMIGD1",
"in",
"mice",
"alters",
"intestinal",
"apical",
"membrane",
"organization",
"."
]
}
] |
PMC11703992
|
A The gene expression of IL32, ARHGAP15, RGCC, ARID5B, DDIT4 and TNFRSF25 in different types of cells in GCA.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"The",
"gene",
"expression",
"of",
"IL32",
",",
"ARHGAP15",
",",
"RGCC",
",",
"ARID5B",
",",
"DDIT4",
"and",
"TNFRSF25",
"in",
"different",
"types",
"of",
"cells",
"in",
"GCA",
"."
]
}
] |
PMC11750161
|
The cells were washed with Opti-MEM and the DNA-Lipofectamine complex was added.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cells",
"were",
"washed",
"with",
"Opti-MEM",
"and",
"the",
"DNA-Lipofectamine",
"complex",
"was",
"added",
"."
]
}
] |
PMC11218145
|
However, the essential role of this type of ATPases is to synthesize ATP from ADP and inorganic phosphate at the expense of an electrochemical proton gradient.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"the",
"essential",
"role",
"of",
"this",
"type",
"of",
"ATPases",
"is",
"to",
"synthesize",
"ATP",
"from",
"ADP",
"and",
"inorganic",
"phosphate",
"at",
"the",
"expense",
"of",
"an",
"electrochemical",
"proton",
"gradient",
"."
]
}
] |
PMC11637284
|
For p166, the TAC60 binding site corresponds to the C-terminal 11 amino acids of p166.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"p166",
",",
"the",
"TAC60",
"binding",
"site",
"corresponds",
"to",
"the",
"C-terminal",
"11",
"amino",
"acids",
"of",
"p166",
"."
]
}
] |
PMC7039683
|
This result is consistent with the the prediction that SNP2 lies in a periderm enhancer .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"result",
"is",
"consistent",
"with",
"the",
"the",
"prediction",
"that",
"SNP2",
"lies",
"in",
"a",
"periderm",
"enhancer",
"."
]
}
] |
PMC10890307
|
It was the only cell line in our study that could proliferate in all conditions tested (Figure 3A,B,a,b).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"was",
"the",
"only",
"cell",
"line",
"in",
"our",
"study",
"that",
"could",
"proliferate",
"in",
"all",
"conditions",
"tested",
"(",
"Figure",
"3A",
",",
"B",
",",
"a",
",",
"b",
")",
"."
]
}
] |
PMC8041314
|
In essence, these experience-based decisions as well as availability and price of the compounds led to the selection of 87 candidates, from which 43 were ordered from ENAMINE.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"essence",
",",
"these",
"experience-based",
"decisions",
"as",
"well",
"as",
"availability",
"and",
"price",
"of",
"the",
"compounds",
"led",
"to",
"the",
"selection",
"of",
"87",
"candidates",
",",
"from",
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"43",
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PMC9429973
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We can suppose that the revealed CALR mutation с.1154_1155insGTGTC, p.E386fs*46 plays its role in our patient’s polycythemia phenotype.
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PMC11001582
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Quantitative PCR (qPCR) with reverse transcription showed comparable levels of (GR)400, (PR)400 and eGFP transcripts in the spinal cord (Extended Data Fig. 2a).
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PMC11534035
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The cells were left to react with resazurin in the incubator for 4 h in the A431 cell line, and for 10 h in the CAL39 cell line.
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PMC9780037
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Cyt c mitochondrial efflux has also been reported in neurodegenerative diseases including Parkinson’s disease and Huntington’s disease , in which extensive apoptosis of neuronal cells in implied .
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PMC11546117
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Analyses were conducted with a Shimadzu UHPLC-MS system (Kyoto, Kyoto, Japan) consisting of two pumps (LC-30AD), an autosampler (ISL-30AC), a column over CTO-20AC, and an LCMS-8050 triple quadrupole mass spectrometer equipped with electrospray ionization (ESI).
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PMC11541241
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Furthermore, the second‐generation TOR inhibitors also inhibited the hyphal growth of F. oxysporum (Li et al., 2021).
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PMC9429973
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Fifty percent had cardiovascular risk factors prior to transplantation (smoking, dyslipidemia, obesity and hypertension), without previous structural heart disease, arrhythmias, thrombotic or ischemic pathology.
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PMC8839885
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Semi-quantitative RT-PCR: RT-PCR analysis was performed as previously described .
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Values of p<0.05 were considered statistically significant.
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Subsets and Splits
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