OTAR3088/BioData-CellLine_annotated · Datasets at Hugging Face

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PMC4839679	ccRCC biospecimen with no PBRM1 mutation with respect to biospecimen with PBRM1 mutations).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ccRCC", "biospecimen", "with", "no", "PBRM1", "mutation", "with", "respect", "to", "biospecimen", "with", "PBRM1", "mutations", ")", "." ] } ]
PMC10858941	p < 0.001, n = 3 for each condition.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.001", ",", "n", "=", "3", "for", "each", "condition", "." ] } ]
PMC11747949	However, tumors have heterogeneous oxygen tensions.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "tumors", "have", "heterogeneous", "oxygen", "tensions", "." ] } ]
PMC11352746	All 45 publications utilized IncuCyte’s phase-contrast microscopy to capture the images of neurites.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "45", "publications", "utilized", "IncuCyte", "’s", "phase-contrast", "microscopy", "to", "capture", "the", "images", "of", "neurites", "." ] } ]
PMC9429973	Z. Konova, E. Khamaganova, I. Uribin, M. Drokov, I. Galtseva, U. Maslikova, M. Dovidenko, N. Popova, F. Omarova, A. Dmitrova, O. Starikova, E. Mikhaltsova, O. Koroleva, D. Dubnyak, E. Kolgaeva, V. Vasilyeva, L. Kuzmina, E. Parovichnikova Department of Intensive High-Dose Chemotherapy and Bone Marrow Transplantation; Tissue typing laboratory; Sector for the Study of Immune Effects and Complications after BMT; Laboratory of immunophenotyping of blood cells and bone marrow; Department of immunochemotherapy with a day hospital for patients after BMT; Head of National Research Center for Hematology, National Research Center for Hematology, Moscow, Russia Background: Natural killer cells (NK) are a component of innate immunity and are capable of cytotoxic lysis and cytokine secretion without prior antigen presentation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Z.", "Konova", ",", "E.", "Khamaganova", ",", "I.", "Uribin", ",", "M.", "Drokov", ",", "I.", "Galtseva", ",", "U.", "Maslikova", ",", "M.", "Dovidenko", ",", "N.", "Popova", ",", "F.", "Omarova", ",", "A.", "Dmitrova", ",", "O.", "Starikova", ",", "E.", "Mikhaltsova", ",", "O.", "Koroleva", ",", "D.", "Dubnyak", ",", "E.", "Kolgaeva", ",", "V.", "Vasilyeva", ",", "L.", "Kuzmina", ",", "E.", "Parovichnikova", "Department", "of", "Intensive", "High-Dose", "Chemotherapy", "and", "Bone", "Marrow", "Transplantation", ";", "Tissue", "typing", "laboratory", ";", "Sector", "for", "the", "Study", "of", "Immune", "Effects", "and", "Complications", "after", "BMT", ";", "Laboratory", "of", "immunophenotyping", "of", "blood", "cells", "and", "bone", "marrow", ";", "Department", "of", "immunochemotherapy", "with", "a", "day", "hospital", "for", "patients", "after", "BMT", ";", "Head", "of", "National", "Research", "Center", "for", "Hematology", ",", "National", "Research", "Center", "for", "Hematology", ",", "Moscow", ",", "Russia", "Background", ":", "Natural", "killer", "cells", "(", "NK", ")", "are", "a", "component", "of", "innate", "immunity", "and", "are", "capable", "of", "cytotoxic", "lysis", "and", "cytokine", "secretion", "without", "prior", "antigen", "presentation", "." ] } ]
PMC10652261	Their cytotoxic features on human leukemia cell lines (HL-60, K562, and THP-1) were determined by means of the WST-1 assay.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Their", "cytotoxic", "features", "on", "human", "leukemia", "cell", "lines", "(", "HL-60", ",", "K562", ",", "and", "THP-1", ")", "were", "determined", "by", "means", "of", "the", "WST-1", "assay", "." ] } ]
PMC11335267	Additionally, altered expression of proopiomelanocortin and melanocortin-3 receptor mRNA in the hypothalamus suggests impaired regulation of feeding behavior.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "altered", "expression", "of", "proopiomelanocortin", "and", "melanocortin-3", "receptor", "mRNA", "in", "the", "hypothalamus", "suggests", "impaired", "regulation", "of", "feeding", "behavior", "." ] } ]
PMC11297139	In general, intrinsically disordered regions (IDR) drive LLPS through multivalent interactions between multiple amino acid residues.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "general", ",", "intrinsically", "disordered", "regions", "(", "IDR", ")", "drive", "LLPS", "through", "multivalent", "interactions", "between", "multiple", "amino", "acid", "residues", "." ] } ]
PMC11453346	First, we generated a triple negative breast cancer cell line MDA-MB 231 stably expressing a H6PD-biotin ligase fusion protein.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "First", ",", "we", "generated", "a", "triple", "negative", "breast", "cancer", "cell", "line", "MDA-MB", "231", "stably", "expressing", "a", "H6PD-biotin", "ligase", "fusion", "protein", "." ] } ]
PMC10747139	The Ru center improved the reaction rate through coordination affinity and changed the binding process.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Ru", "center", "improved", "the", "reaction", "rate", "through", "coordination", "affinity", "and", "changed", "the", "binding", "process", "." ] } ]
PMC9776316	So, the JNK-cJUN complex that mediated the transcription of XRCC4 was also possibly promoted by DGKA in the ovarian cancer cells treated with cisplatin.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "So", ",", "the", "JNK-cJUN", "complex", "that", "mediated", "the", "transcription", "of", "XRCC4", "was", "also", "possibly", "promoted", "by", "DGKA", "in", "the", "ovarian", "cancer", "cells", "treated", "with", "cisplatin", "." ] } ]
PMC9429973	Summary/Conclusion: We herein report that MM cell lines enriched in SLe interact with platelets in vitro, and that this interaction partially protects MM cells from NK-mediated cytotoxicity.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Summary/Conclusion", ":", "We", "herein", "report", "that", "MM", "cell", "lines", "enriched", "in", "SLe", "interact", "with", "platelets", "in", "vitro", ",", "and", "that", "this", "interaction", "partially", "protects", "MM", "cells", "from", "NK-mediated", "cytotoxicity", "." ] } ]
PMC10547921	The most in-depth studies of amatoxins are the α-amanitin (88) containing 6-hydroxytryptophan (Htp), trans-4-hydroxyproline (Hyp), and (3R,4R)-4,5-dihydroxyloleucine (Dhil), which is the most effective and specific RNA polymerase II inhibitor known to date, with the potential to break through drug resistance or destroy silent phase tumor cells, effectively preventing tumor metastasis and recurrence (Fig. 14A).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "most", "in-depth", "studies", "of", "amatoxins", "are", "the", "α-amanitin", "(", "88", ")", "containing", "6-hydroxytryptophan", "(", "Htp", ")", ",", "trans-4-hydroxyproline", "(", "Hyp", ")", ",", "and", "(3R,4R)-4,5-dihydroxyloleucine", "(", "Dhil", ")", ",", "which", "is", "the", "most", "effective", "and", "specific", "RNA", "polymerase", "II", "inhibitor", "known", "to", "date", ",", "with", "the", "potential", "to", "break", "through", "drug", "resistance", "or", "destroy", "silent", "phase", "tumor", "cells", ",", "effectively", "preventing", "tumor", "metastasis", "and", "recurrence", "(", "Fig.", "14A", ")", "." ] } ]
PMC11321678	UMAP of clusters labeled by subgroups.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "UMAP", "of", "clusters", "labeled", "by", "subgroups", "." ] } ]
PMC10243817	In conclusion, the present study, for what we believe to be the first time, demonstrated that MEX3B decreases epithelial TGFBR3 mRNA expression by binding to its 3′ UTR and reducing its stability.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "conclusion", ",", "the", "present", "study", ",", "for", "what", "we", "believe", "to", "be", "the", "first", "time", ",", "demonstrated", "that", "MEX3B", "decreases", "epithelial", "TGFBR3", "mRNA", "expression", "by", "binding", "to", "its", "3′", "UTR", "and", "reducing", "its", "stability", "." ] } ]
PMC11572213	Student’s t-test with Welch’s correction was used for the statistical analysis of the comparisons of data.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Student", "’s", "t-test", "with", "Welch", "’s", "correction", "was", "used", "for", "the", "statistical", "analysis", "of", "the", "comparisons", "of", "data", "." ] } ]
PMC9429973	Particularly, the inhibition of miR-214-3p is associated with elevated apoptosis in leukemic B-cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Particularly", ",", "the", "inhibition", "of", "miR-214", "-", "3p", "is", "associated", "with", "elevated", "apoptosis", "in", "leukemic", "B-cells", "." ] } ]
PMC11013014	152–150 °C.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "152–150", "°", "C", "." ] } ]
PMC9000591	In this study, a bioguided fractionation of ethyl acetate extract (SE) from C. speciosa root was carried out to target antioxidant and cytotoxic activities.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "study", ",", "a", "bioguided", "fractionation", "of", "ethyl", "acetate", "extract", "(", "SE", ")", "from", "C.", "speciosa", "root", "was", "carried", "out", "to", "target", "antioxidant", "and", "cytotoxic", "activities", "." ] } ]
PMC11216402	Kim et al. (2022) discovered several cell populations, including immune cells, fibroblasts, and various gastric cell types.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Kim", "et", "al.", "(", "2022", ")", "discovered", "several", "cell", "populations", ",", "including", "immune", "cells", ",", "fibroblasts", ",", "and", "various", "gastric", "cell", "types", "." ] } ]
PMC10745221	The left panel is a Coomassie-stained SDS-PAGE gel, and the right panel is an anti-SDMA immunoblot with an exposure time of 10 seconds.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "left", "panel", "is", "a", "Coomassie-stained", "SDS-PAGE", "gel", ",", "and", "the", "right", "panel", "is", "an", "anti-SDMA", "immunoblot", "with", "an", "exposure", "time", "of", "10", "seconds", "." ] } ]
PMC9429973	Patient demographics and CLL-specific characteristics were extracted from the Mayo Clinic CLL Database and the electronic health record (EHR).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patient", "demographics", "and", "CLL-specific", "characteristics", "were", "extracted", "from", "the", "Mayo", "Clinic", "CLL", "Database", "and", "the", "electronic", "health", "record", "(", "EHR", ")", "." ] } ]
PMC11747949	Cells were selected according to FSC‐A and SSC‐A plots.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "selected", "according", "to", "FSC‐A", "and", "SSC‐A", "plots", "." ] } ]
PMC11496491	GO enrichment analysis results show the top 20 terms that are most significant in terms of biological processes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GO", "enrichment", "analysis", "results", "show", "the", "top", "20", "terms", "that", "are", "most", "significant", "in", "terms", "of", "biological", "processes", "." ] } ]
PMC9429973	Image: Summary/Conclusion: We detected few HF deaths thanks to a MR-guided patient-specific adjustment of the chelation therapy.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "We", "detected", "few", "HF", "deaths", "thanks", "to", "a", "MR-guided", "patient-specific", "adjustment", "of", "the", "chelation", "therapy", "." ] } ]
PMC11684297	On the other hand, BSA (703 a.u.)	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "the", "other", "hand", ",", "BSA", "(", "703", "a.u", ".", ")" ] } ]
PMC11632064	: * p-adj < 0.05. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ ":", "*", "p-adj", "<", "0.05", ".", "(" ] } ]
PMC10858941	D, E Quantification of LC3-II levels (p < 0.05; p < 0.01; **p < 0.005; n = 6–8 for NNC, n = 4–5 for Baf).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", ",", "E", "Quantification", "of", "LC3-II", "levels", "(", "", "p", "<", "0.05", ";", "", "", "p", "<", "0.01", ";", "", "", "", "p", "<", "0.005", ";", "n", "=", "6–8", "for", "NNC", ",", "n", "=", "4–5", "for", "Baf", ")", "." ] } ]
PMC8740518	Of these, indole-3-acetamide and diglycerol were up-regulated in the MM xenograft model, with the other four down-regulated. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "these", ",", "indole-3-acetamide", "and", "diglycerol", "were", "up-regulated", "in", "the", "MM", "xenograft", "model", ",", "with", "the", "other", "four", "down-regulated", ".", "(" ] } ]
PMC10237474	Most importantly, the PB transposon system drastically shortens the stable expression host generation timeline for CHO and HEK293-derived cells since lengthy clonal selection is not needed.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Most", "importantly", ",", "the", "PB", "transposon", "system", "drastically", "shortens", "the", "stable", "expression", "host", "generation", "timeline", "for", "CHO", "and", "HEK293-derived", "cells", "since", "lengthy", "clonal", "selection", "is", "not", "needed", "." ] } ]
PMC11476837	A similar trend was observed in lung cancer cell line A549, where an ROS inductor, hydrogen peroxide, decreased protein expression of KEAP1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "similar", "trend", "was", "observed", "in", "lung", "cancer", "cell", "line", "A549", ",", "where", "an", "ROS", "inductor", ",", "hydrogen", "peroxide", ",", "decreased", "protein", "expression", "of", "KEAP1", "." ] } ]
PMC11766350	Plasmids were acquired from Addgene (Watertown, MA, USA): pAdDeltaF6 (plasmid # 112867), pAAV2/5 (plasmid # 104964), and pAAV-gfp (plasmid # 32395).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Plasmids", "were", "acquired", "from", "Addgene", "(", "Watertown", ",", "MA", ",", "USA", "):", "pAdDeltaF6", "(", "plasmid", "#", "112867", ")", ",", "pAAV2/5", "(", "plasmid", "#", "104964", ")", ",", "and", "pAAV-gfp", "(", "plasmid", "#", "32395", ")", "." ] } ]
PMC7519871	The r values indicate goodness of fit for the pooled data (where r = 1 is a perfect fit) and r of median effect plot for the cell culture system should be greater than 0.95.26–28 Investigation of synergism from combination of cisplatin with WDL and BA was the main focus of the study.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "r", "values", "indicate", "goodness", "of", "fit", "for", "the", "pooled", "data", "(", "where", "r", "=", "1", "is", "a", "perfect", "fit", ")", "and", "r", "of", "median", "effect", "plot", "for", "the", "cell", "culture", "system", "should", "be", "greater", "than", "0.95.26–28", "Investigation", "of", "synergism", "from", "combination", "of", "cisplatin", "with", "WDL", "and", "BA", "was", "the", "main", "focus", "of", "the", "study", "." ] } ]
PMC4270159	a. To assess any effects, the secondary kinase inhibitor may be independent of the ligand and primary kinase inhibitor.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "a.", "To", "assess", "any", "effects", ",", "the", "secondary", "kinase", "inhibitor", "may", "be", "independent", "of", "the", "ligand", "and", "primary", "kinase", "inhibitor", "." ] } ]
PMC10813895	Studies employing single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) on human breast tissues have elucidated that ELF5 is expressed in ER− luminal cells—specifically, the so-called luminal alveolar secretory precursor (LASP) cells —but is absent in ER+ luminal hormone-sensing (LHS) cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Studies", "employing", "single-cell", "RNA", "sequencing", "(", "scRNA-seq", ")", "on", "human", "breast", "tissues", "have", "elucidated", "that", "ELF5", "is", "expressed", "in", "ER−", "luminal", "cells", "—", "specifically", ",", "the", "so-called", "luminal", "alveolar", "secretory", "precursor", "(", "LASP", ")", "cells", "—but", "is", "absent", "in", "ER+", "luminal", "hormone-sensing", "(", "LHS", ")", "cells", "." ] } ]
PMC11026382	While this study focuses on all possible DHFR single mutations in the context of a few TYMS variants, it would be reasonably straightforward to design analogous experiments that more densely sample TYMS variation, or quantify amino acid resolution epistasis to other folate metabolic enzymes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "this", "study", "focuses", "on", "all", "possible", "DHFR", "single", "mutations", "in", "the", "context", "of", "a", "few", "TYMS", "variants", ",", "it", "would", "be", "reasonably", "straightforward", "to", "design", "analogous", "experiments", "that", "more", "densely", "sample", "TYMS", "variation", ",", "or", "quantify", "amino", "acid", "resolution", "epistasis", "to", "other", "folate", "metabolic", "enzymes", "." ] } ]
PMC11190062	Cells were washed before analysis on the LSR II instrument (BD Biosciences, San Jose, CA, USA) with FACS Diva software (BD Biosciences).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "washed", "before", "analysis", "on", "the", "LSR", "II", "instrument", "(", "BD", "Biosciences", ",", "San", "Jose", ",", "CA", ",", "USA", ")", "with", "FACS", "Diva", "software", "(", "BD", "Biosciences", ")", "." ] } ]
PMC11463018	HR-MS (ESI) calcd.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HR-MS", "(", "ESI", ")", "calcd", "." ] } ]
PMC11519567	The C-terminal acidic region (AR) DPEEDDE → AAAAAAA was highlighted.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "C-terminal", "acidic", "region", "(", "AR", ")", "DPEEDDE", "→", "AAAAAAA", "was", "highlighted", "." ] } ]
PMC9429973	Aims: To evaluate sBCMA as a biomarker of early response in pts enrolled in the single step-up dosing cohorts of the cevostamab Phase I study.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "To", "evaluate", "sBCMA", "as", "a", "biomarker", "of", "early", "response", "in", "pts", "enrolled", "in", "the", "single", "step-up", "dosing", "cohorts", "of", "the", "cevostamab", "Phase", "I", "study", "." ] } ]
PMC11615101	The average intensity was measured using Image J software after converting to an 8-bit image format, and the average intensity was used to generate the graph using GraphPad Prism software.37 RAFLS cells were grown and treated as mentioned above.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "average", "intensity", "was", "measured", "using", "Image", "J", "software", "after", "converting", "to", "an", "8-bit", "image", "format", ",", "and", "the", "average", "intensity", "was", "used", "to", "generate", "the", "graph", "using", "GraphPad", "Prism", "software.37", "RAFLS", "cells", "were", "grown", "and", "treated", "as", "mentioned", "above", "." ] } ]
PMC9429973	The JAK 1/2 inhibitor, ruxolitinib (RUX), has shown reductions in spleen volume and improvement in MF-related symptoms when used in the frontline.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "JAK", "1/2", "inhibitor", ",", "ruxolitinib", "(", "RUX", ")", ",", "has", "shown", "reductions", "in", "spleen", "volume", "and", "improvement", "in", "MF-related", "symptoms", "when", "used", "in", "the", "frontline", "." ] } ]
PMC10582049	Dendrograms are generated in accordance with hierarchical clustering.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Dendrograms", "are", "generated", "in", "accordance", "with", "hierarchical", "clustering", "." ] } ]
PMC11703896	Rapamycin production was assessed using the well-diffusion method against Candida albicans (Ganesh and C 2023).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Rapamycin", "production", "was", "assessed", "using", "the", "well-diffusion", "method", "against", "Candida", "albicans", "(", "Ganesh", "and", "C", "2023", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Aims: The objective of this study was to evaluate the ability of IMR-261 to activate Bmp6-mediated synthesis of hepcidin (encoded by the Hamp gene), regulate iron stores and modulate transferrin saturation (TSAT) in a mouse model of iron overload.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "The", "objective", "of", "this", "study", "was", "to", "evaluate", "the", "ability", "of", "IMR-261", "to", "activate", "Bmp6-mediated", "synthesis", "of", "hepcidin", "(", "encoded", "by", "the", "Hamp", "gene", ")", ",", "regulate", "iron", "stores", "and", "modulate", "transferrin", "saturation", "(", "TSAT", ")", "in", "a", "mouse", "model", "of", "iron", "overload", "." ] } ]
PMC11026382	In contrast, the mutations with negative epistasis exhibited a range of growth rate effects in the WT context.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "contrast", ",", "the", "mutations", "with", "negative", "epistasis", "exhibited", "a", "range", "of", "growth", "rate", "effects", "in", "the", "WT", "context", "." ] } ]
PMC9429973	Fatigue was improved significantly in patients testing tele health care (n=3), mind/body interventions (n=2) and several exercise interventions.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fatigue", "was", "improved", "significantly", "in", "patients", "testing", "tele", "health", "care", "(", "n=3", ")", ",", "mind/body", "interventions", "(", "n=2", ")", "and", "several", "exercise", "interventions", "." ] } ]
PMC9429973	Median (range) parsaclisib exposure was 10.6 (0.4–32.8) months.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Median", "(", "range", ")", "parsaclisib", "exposure", "was", "10.6", "(", "0.4–32.8", ")", "months", "." ] } ]
PMC9429973	Image: Summary/Conclusion: Our preclinical data demonstrate that tinostamustine increases the anti-myeloma effect of daratumumab presumably due to enhanced expression of CD38 and MICA.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "Our", "preclinical", "data", "demonstrate", "that", "tinostamustine", "increases", "the", "anti-myeloma", "effect", "of", "daratumumab", "presumably", "due", "to", "enhanced", "expression", "of", "CD38", "and", "MICA", "." ] } ]
PMC9429973	Moreover, chronic GVHD (cGVHD) was higher the closer the patient was to the transplant center with a hazard’s ratio (HR) = 2.183 (P=0.044).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "chronic", "GVHD", "(", "cGVHD", ")", "was", "higher", "the", "closer", "the", "patient", "was", "to", "the", "transplant", "center", "with", "a", "hazard", "’s", "ratio", "(", "HR", ")", "=", "2.183", "(", "P=0.044", ")", "." ] } ]
PMC9429973	All patients with NTD BT had previously had ≥1 transfusion at any point in time that the physician was aware of, with an average (SD) of 2.9 (0.9) transfusions per patient (range, 2.6 in Canada to 3.1 in Germany).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "patients", "with", "NTD", "BT", "had", "previously", "had", "≥1", "transfusion", "at", "any", "point", "in", "time", "that", "the", "physician", "was", "aware", "of", ",", "with", "an", "average", "(", "SD", ")", "of", "2.9", "(", "0.9", ")", "transfusions", "per", "patient", "(", "range", ",", "2.6", "in", "Canada", "to", "3.1", "in", "Germany", ")", "." ] } ]
PMC8875242	Unfortunately, the studies in which this inhibitory activity was observed are not publicly accessible, making it impossible to know what concentrations were tested or which experimental models were used.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Unfortunately", ",", "the", "studies", "in", "which", "this", "inhibitory", "activity", "was", "observed", "are", "not", "publicly", "accessible", ",", "making", "it", "impossible", "to", "know", "what", "concentrations", "were", "tested", "or", "which", "experimental", "models", "were", "used", "." ] } ]
PMC11718109	Our results show a striking morphological difference in the SV pool populations of iPSC-derived DA neurons.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "results", "show", "a", "striking", "morphological", "difference", "in", "the", "SV", "pool", "populations", "of", "iPSC-derived", "DA", "neurons", "." ] } ]
PMC4360730	As new experiments are submitted to the ENCODE DCC, some will not have corresponding terms in their respective ontologies.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "new", "experiments", "are", "submitted", "to", "the", "ENCODE", "DCC", ",", "some", "will", "not", "have", "corresponding", "terms", "in", "their", "respective", "ontologies", "." ] } ]
PMC11468365	As observed, there is an imbalance in the dimensional data between drugs and cancer cell line features.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "observed", ",", "there", "is", "an", "imbalance", "in", "the", "dimensional", "data", "between", "drugs", "and", "cancer", "cell", "line", "features", "." ] } ]
PMC11686380	Scale bar, 50 μm. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bar", ",", "50", "μm", ".", "(" ] } ]
PMC11694625	Since 3a–3d are dihydrazone derivatives, nitrosamine impurities were evaluated and detected.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Since", "3a–3d", "are", "dihydrazone", "derivatives", ",", "nitrosamine", "impurities", "were", "evaluated", "and", "detected", "." ] } ]
PMC5363531	The purified fragment was cloned in pGEMt-easy (Promega) to create pGEMt-TS-Promoter (pGEMt-TS-Prom) plasmid.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "purified", "fragment", "was", "cloned", "in", "pGEMt-easy", "(", "Promega", ")", "to", "create", "pGEMt-TS-Promoter", "(", "pGEMt-TS-Prom", ")", "plasmid", "." ] } ]
PMC10729469	In disease states, Teffs react to misfolded Aβ deposits, clonally expand, then affect neuroinflammation and AD neuropathology [22–25].	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "disease", "states", ",", "Teffs", "react", "to", "misfolded", "Aβ", "deposits", ",", "clonally", "expand", ",", "then", "affect", "neuroinflammation", "and", "AD", "neuropathology", "[", "22–25", "]", "." ] } ]
PMC11437637	Add 20 µl of BD Multitest 6-color TBNK reagent (BD Catalog No. 337166) into the bottom of the flow tube.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Add", "20", "µl", "of", "BD", "Multitest", "6-color", "TBNK", "reagent", "(", "BD", "Catalog", "No.", "337166", ")", "into", "the", "bottom", "of", "the", "flow", "tube", "." ] } ]
PMC11530949	The cytotoxicity assay on healthy cells indicated varying degrees of biocompatibility among the tested treatments.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cytotoxicity", "assay", "on", "healthy", "cells", "indicated", "varying", "degrees", "of", "biocompatibility", "among", "the", "tested", "treatments", "." ] } ]
PMC8806312	Relationship between the level of CD4 naïve T cells and metastasis. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Relationship", "between", "the", "level", "of", "CD4", "naïve", "T", "cells", "and", "metastasis", ".", "(" ] } ]
PMC9429973	Comparison between pre- and post-vaccinated Hb levels of each vaccination was computed using paired t-test.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Comparison", "between", "pre-", "and", "post-vaccinated", "Hb", "levels", "of", "each", "vaccination", "was", "computed", "using", "paired", "t-test", "." ] } ]
PMC6742971	Low avidity clones are considered the ones having an EC50 above 2.50E-10 (M).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Low", "avidity", "clones", "are", "considered", "the", "ones", "having", "an", "EC50", "above", "2.50E-10", "(", "M", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Median (95% CI) OS was 2.8 (1.7–4.2) mo.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Median", "(", "95", "%", "CI", ")", "OS", "was", "2.8", "(", "1.7–4.2", ")", "mo", "." ] } ]
PMC10965315	The bands represent the digested areas of gelatin by MMP‐9 and MMP‐2 after 24 h harmaline treatment (37.5 and 75 μM).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "bands", "represent", "the", "digested", "areas", "of", "gelatin", "by", "MMP‐9", "and", "MMP‐2", "after", "24", "h", "harmaline", "treatment", "(", "37.5", "and", "75", "μM", ")", "." ] } ]
PMC9429973	In this subgroup, median SPINK2 score was higher in patients requiring ≥2 inductions to achieve CR vs. patients requiring 1 course (7 vs 2,P=0.009).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "subgroup", ",", "median", "SPINK2", "score", "was", "higher", "in", "patients", "requiring", "≥2", "inductions", "to", "achieve", "CR", "vs.", "patients", "requiring", "1", "course", "(", "7", "vs", "2,P=0.009", ")", "." ] } ]
PMC5916734	The amino acid sequence of the VKORC1 ORF from CHO DG44 cells was deposited into the GenBank database (accession number, AFG26681.1) on April 3, 2012.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "amino", "acid", "sequence", "of", "the", "VKORC1", "ORF", "from", "CHO", "DG44", "cells", "was", "deposited", "into", "the", "GenBank", "database", "(", "accession", "number", ",", "AFG26681.1", ")", "on", "April", "3", ",", "2012", "." ] } ]
PMC10998613	MDA-MB-231 (WT and DKO) and COS-7 cells either endogenous or transiently transfected with CXCR4-AcGFP1, CXCR4-mCherry, β2AR-AcGFP1, or β2AR-mCherry were seeded at 5 × 10 cells/well in six-well plates until they reached confluency.	[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MDA-MB-231", "(", "WT", "and", "DKO", ")", "and", "COS-7", "cells", "either", "endogenous", "or", "transiently", "transfected", "with", "CXCR4-AcGFP1", ",", "CXCR4-mCherry", ",", "β2AR-AcGFP1", ",", "or", "β2AR-mCherry", "were", "seeded", "at", "5", "×", "10", "cells/well", "in", "six-well", "plates", "until", "they", "reached", "confluency", "." ] } ]
PMC10652261	HRMS (m/z): [M + H] calcd for C24H25ClN4S: 437.1561.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HRMS", "(", "m/z", "):", "[", "M", "+", "H", "]", "calcd", "for", "C24H25ClN4S", ":", "437.1561", "." ] } ]
PMC11588008	Before the inhibition test, we need to test the safe dose of PD98059 (MCE, America) on ovarian cancer cells to avoid its lethal effect on ovarian cancer cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Before", "the", "inhibition", "test", ",", "we", "need", "to", "test", "the", "safe", "dose", "of", "PD98059", "(", "MCE", ",", "America", ")", "on", "ovarian", "cancer", "cells", "to", "avoid", "its", "lethal", "effect", "on", "ovarian", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC9370419	The HepG2 cells were cultured on 6-well plates and were a co-transfection of 1.9 µg pSBtetHX vector and 100 ng SB100X transposase vector per well using Lipofectamine 3000.	[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "HepG2", "cells", "were", "cultured", "on", "6-well", "plates", "and", "were", "a", "co-transfection", "of", "1.9", "µg", "pSBtetHX", "vector", "and", "100", "ng", "SB100X", "transposase", "vector", "per", "well", "using", "Lipofectamine", "3000", "." ] } ]
PMC11337594	Ns: not significant, p > 0.05, p < 0.05, p < 0.01, p < 0.001, **p < 0.0001 The aforementioned experiments demonstrated that substantial apoptosis was observed in TER-treated A375 cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Ns", ":", "not", "significant", ",", "p", ">", "0.05", ",", "", "p", "<", "0.05", ",", "", "", "p", "<", "0.01", ",", "", "", "", "p", "<", "0.001", ",", "", "", "", "", "p", "<", "0.0001", "The", "aforementioned", "experiments", "demonstrated", "that", "substantial", "apoptosis", "was", "observed", "in", "TER-treated", "A375", "cells", "." ] } ]
PMC11574029	However, the regulatory mechanisms of NOTCH in BLCA remain unclear.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "regulatory", "mechanisms", "of", "NOTCH", "in", "BLCA", "remain", "unclear", "." ] } ]
PMC10170482	Specifically, normal human bronchial epithelial cells transferred from stiff to soft 2D substrates showed decreased glycolysis rates.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Specifically", ",", "normal", "human", "bronchial", "epithelial", "cells", "transferred", "from", "stiff", "to", "soft", "2D", "substrates", "showed", "decreased", "glycolysis", "rates", "." ] } ]
PMC3164356	These classes are critical for constructing the core parts of the glycan chains or dictating glycan localization.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "classes", "are", "critical", "for", "constructing", "the", "core", "parts", "of", "the", "glycan", "chains", "or", "dictating", "glycan", "localization", "." ] } ]
PMC9611901	During electrophoresis, DNA loops migrated from the comet head towards the anode.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "During", "electrophoresis", ",", "DNA", "loops", "migrated", "from", "the", "comet", "head", "towards", "the", "anode", "." ] } ]
PMC7369657	For biosafety of CQDs, after 4 and 12 weeks of treatment, all mice survived, and there was no significant body weight loss in any group (Figure 4(c)).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "biosafety", "of", "CQDs", ",", "after", "4", "and", "12", "weeks", "of", "treatment", ",", "all", "mice", "survived", ",", "and", "there", "was", "no", "significant", "body", "weight", "loss", "in", "any", "group", "(", "Figure", "4(c", ")", ")", "." ] } ]
PMC9429973	CTPS1 represents a novel target with the potential to effect rapid and specific disease control in aGvHD.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CTPS1", "represents", "a", "novel", "target", "with", "the", "potential", "to", "effect", "rapid", "and", "specific", "disease", "control", "in", "aGvHD", "." ] } ]
PMC4112127	Further, to map the exact methylation pattern of the CpG sites in the targeted island, three cell lines, KMC-1, Mz-ChA-1, and the H-69 control cell line were selected for bisulfite genomic sequencing (BGS).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Further", ",", "to", "map", "the", "exact", "methylation", "pattern", "of", "the", "CpG", "sites", "in", "the", "targeted", "island", ",", "three", "cell", "lines", ",", "KMC-1", ",", "Mz-ChA-1", ",", "and", "the", "H-69", "control", "cell", "line", "were", "selected", "for", "bisulfite", "genomic", "sequencing", "(", "BGS", ")", "." ] } ]
PMC11798926	We quantified surface expression of WT SynDIG4 and the two endocytic mutants and found a significant increase in AVPA surface expression relative to WT, as we hypothesized, but we also observed decreased surface expression of the AMPA mutant relative to WT (F = 27.82, p < 0.0001) (Figure 2C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "quantified", "surface", "expression", "of", "WT", "SynDIG4", "and", "the", "two", "endocytic", "mutants", "and", "found", "a", "significant", "increase", "in", "AVPA", "surface", "expression", "relative", "to", "WT", ",", "as", "we", "hypothesized", ",", "but", "we", "also", "observed", "decreased", "surface", "expression", "of", "the", "AMPA", "mutant", "relative", "to", "WT", "(", "F", "=", "27.82", ",", "p", "<", "0.0001", ")", "(", "Figure", "2C", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Aims: To investigate the implementation method of targeted nursing intervention program and its application value in the care of chemotherapy patients with leukemia.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "To", "investigate", "the", "implementation", "method", "of", "targeted", "nursing", "intervention", "program", "and", "its", "application", "value", "in", "the", "care", "of", "chemotherapy", "patients", "with", "leukemia", "." ] } ]
PMC9429973	In Sweden with pdVWF/FVIII 2,4:1, LTP was also dominant (-8,841,901 kr; 6.52 QALY) compared with ODT.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "Sweden", "with", "pdVWF/FVIII", "2,4:1", ",", "LTP", "was", "also", "dominant", "(", "-8,841,901", "kr", ";", "6.52", "QALY", ")", "compared", "with", "ODT", "." ] } ]
PMC11564322	p < 0.001 vs. the respective peptide alone After the 24-h exposure of the HL-60 cell line to the VGVAPG and VVGPAG peptides, PPARγ mRNA decreased by 25.28 and 63.72%, respectively, compared to the control.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.001", "vs.", "the", "respective", "peptide", "alone", "After", "the", "24-h", "exposure", "of", "the", "HL-60", "cell", "line", "to", "the", "VGVAPG", "and", "VVGPAG", "peptides", ",", "PPARγ", "mRNA", "decreased", "by", "25.28", "and", "63.72", "%", ",", "respectively", ",", "compared", "to", "the", "control", "." ] } ]
PMC10213199	After 97 days, blood was taken from abdominal aorta to determine SOD (Superoxide Dismutase) activity per gram of hemoglobin.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "97", "days", ",", "blood", "was", "taken", "from", "abdominal", "aorta", "to", "determine", "SOD", "(", "Superoxide", "Dismutase", ")", "activity", "per", "gram", "of", "hemoglobin", "." ] } ]
PMC8382973	The results of the rabbit model showed good safety profiles for the 2% 2P23 gel and 0.4% 2P23 gel.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "of", "the", "rabbit", "model", "showed", "good", "safety", "profiles", "for", "the", "2", "%", "2P23", "gel", "and", "0.4", "%", "2P23", "gel", "." ] } ]
PMC10988555	Once inside cells, complexes can accumulate in the mitochondria and are able to trigger ROS production which was also proved to occur by an in vitro exposure of our complexes to pDNA.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Once", "inside", "cells", ",", "complexes", "can", "accumulate", "in", "the", "mitochondria", "and", "are", "able", "to", "trigger", "ROS", "production", "which", "was", "also", "proved", "to", "occur", "by", "an", "in", "vitro", "exposure", "of", "our", "complexes", "to", "pDNA", "." ] } ]
PMC11699042	For instance, while a median of 99.6% (range 99.3%–99.8%) of the in-exon SNPs were shared after 12 months of continuous culture by each cell line, we could observe relatively less stable cell lines such as A-673, and MHH-ES-1, and remarkably stable cell lines such as TC-71 (Fig. 2b), whereas SK-ES-1 and A-673 displayed less stability at epigenetic level (Fig. 2c).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "instance", ",", "while", "a", "median", "of", "99.6", "%", "(", "range", "99.3%–99.8", "%", ")", "of", "the", "in-exon", "SNPs", "were", "shared", "after", "12", "months", "of", "continuous", "culture", "by", "each", "cell", "line", ",", "we", "could", "observe", "relatively", "less", "stable", "cell", "lines", "such", "as", "A-673", ",", "and", "MHH-ES-1", ",", "and", "remarkably", "stable", "cell", "lines", "such", "as", "TC-71", "(", "Fig.", "2b", ")", ",", "whereas", "SK-ES-1", "and", "A-673", "displayed", "less", "stability", "at", "epigenetic", "level", "(", "Fig.", "2c", ")", "." ] } ]
PMC10547921	The antibody PROTAC conjugate can effectively degrade the BRD4 protein in HER2 high-expression cells SK-BR-3 and has no degradation effect on the BRD4 protein in HER2 low-expression cells MCF-7.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O" ], "tokens": [ "The", "antibody", "PROTAC", "conjugate", "can", "effectively", "degrade", "the", "BRD4", "protein", "in", "HER2", "high-expression", "cells", "SK-BR-3", "and", "has", "no", "degradation", "effect", "on", "the", "BRD4", "protein", "in", "HER2", "low-expression", "cells", "MCF-7", "." ] } ]
PMC11687167	During lipid metabolism, LDL enters T cells, and LDLR interacts with the TCR complex to regulate TCR recycling and signaling, leading to CD8 + T-cell proliferation and activation, which results in increased CTL numbers .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "During", "lipid", "metabolism", ",", "LDL", "enters", "T", "cells", ",", "and", "LDLR", "interacts", "with", "the", "TCR", "complex", "to", "regulate", "TCR", "recycling", "and", "signaling", ",", "leading", "to", "CD8", "+", "T-cell", "proliferation", "and", "activation", ",", "which", "results", "in", "increased", "CTL", "numbers", "." ] } ]
PMC9428827	Mice were inoculated with tumor cells and received 300 IU of mutein or 30,000 IU wtIL-2, twice a day, for 2 weeks separated by a resting week.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mice", "were", "inoculated", "with", "tumor", "cells", "and", "received", "300", "IU", "of", "mutein", "or", "30,000", "IU", "wtIL-2", ",", "twice", "a", "day", ",", "for", "2", "weeks", "separated", "by", "a", "resting", "week", "." ] } ]
PMC9429973	Pathogenic germline mutations were significantly more frequent in Asian than in Caucasian cases (odds ratio (OR)=1.64), consistent with a significantly higher frequency of pathogenic germline DDX41 variants in the former cases.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pathogenic", "germline", "mutations", "were", "significantly", "more", "frequent", "in", "Asian", "than", "in", "Caucasian", "cases", "(", "odds", "ratio", "(OR)=1.64", ")", ",", "consistent", "with", "a", "significantly", "higher", "frequency", "of", "pathogenic", "germline", "DDX41", "variants", "in", "the", "former", "cases", "." ] } ]
PMC3734024	Activated B cells expressing FasL and TGF-β have also been reported to delay the onset of diabetes in non-obese diabetic (NOD) mice, and the frequency of FasL B cells is reduced in mice with severe autoimmune arthritis relative to those with mild or no arthritis , .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Activated", "B", "cells", "expressing", "FasL", "and", "TGF-β", "have", "also", "been", "reported", "to", "delay", "the", "onset", "of", "diabetes", "in", "non-obese", "diabetic", "(", "NOD", ")", "mice", ",", "and", "the", "frequency", "of", "FasL", "B", "cells", "is", "reduced", "in", "mice", "with", "severe", "autoimmune", "arthritis", "relative", "to", "those", "with", "mild", "or", "no", "arthritis", ",", "." ] } ]
PMC11409031	To forecast chemical sensitivity among high and low-risk groups, the Cancer Drug Sensitivity Genomics (GDSC) database, along with the pRRophetic R software package, was employed.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "forecast", "chemical", "sensitivity", "among", "high", "and", "low-risk", "groups", ",", "the", "Cancer", "Drug", "Sensitivity", "Genomics", "(", "GDSC", ")", "database", ",", "along", "with", "the", "pRRophetic", "R", "software", "package", ",", "was", "employed", "." ] } ]
PMC11791264	Error bars represent the mean ± SD (n = 3).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Error", "bars", "represent", "the", "mean", "±", "SD", "(", "n", "=", "3", ")", "." ] } ]
PMC8996378	Compounds 74–76 were isolated from the gorgonian Briareum excavatum (Briareidae) (Table 7).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Compounds", "74–76", "were", "isolated", "from", "the", "gorgonian", "Briareum", "excavatum", "(", "Briareidae", ")", "(", "Table", "7", ")", "." ] } ]
PMC6379402	In the main paper, we consider that an enrichment or a depletion in cancer driver genes is statistically significant if the corresponding p value is lower than or equal to 5%.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "main", "paper", ",", "we", "consider", "that", "an", "enrichment", "or", "a", "depletion", "in", "cancer", "driver", "genes", "is", "statistically", "significant", "if", "the", "corresponding", "p", "value", "is", "lower", "than", "or", "equal", "to", "5", "%", "." ] } ]
PMC11679326	Expression of truncated O-GalNAc glycans was low for all glioma cell lines, but for U-87 MG and T98G, Tn expression was moderate.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Expression", "of", "truncated", "O-GalNAc", "glycans", "was", "low", "for", "all", "glioma", "cell", "lines", ",", "but", "for", "U-87", "MG", "and", "T98", "G", ",", "Tn", "expression", "was", "moderate", "." ] } ]
PMC11283030	e. Kaplan–Meier plotter revealed RFS of 361 ccRCC patients with follow-up, according to ACLY mRNA expression.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "e.", "Kaplan", "–", "Meier", "plotter", "revealed", "RFS", "of", "361", "ccRCC", "patients", "with", "follow-up", ",", "according", "to", "ACLY", "mRNA", "expression", "." ] } ]
PMC11590005	Racial groups are social constructs representing the attributes historically assigned to them by society.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Racial", "groups", "are", "social", "constructs", "representing", "the", "attributes", "historically", "assigned", "to", "them", "by", "society", "." ] } ]

PMC4839679

ccRCC biospecimen with no PBRM1 mutation with respect to biospecimen with PBRM1 mutations).

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PMC10858941

p < 0.001, n = 3 for each condition.

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PMC11747949

However, tumors have heterogeneous oxygen tensions.

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PMC11352746

All 45 publications utilized IncuCyte’s phase-contrast microscopy to capture the images of neurites.

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PMC9429973

Z. Konova, E. Khamaganova, I. Uribin, M. Drokov, I. Galtseva, U. Maslikova, M. Dovidenko, N. Popova, F. Omarova, A. Dmitrova, O. Starikova, E. Mikhaltsova, O. Koroleva, D. Dubnyak, E. Kolgaeva, V. Vasilyeva, L. Kuzmina, E. Parovichnikova Department of Intensive High-Dose Chemotherapy and Bone Marrow Transplantation; Tissue typing laboratory; Sector for the Study of Immune Effects and Complications after BMT; Laboratory of immunophenotyping of blood cells and bone marrow; Department of immunochemotherapy with a day hospital for patients after BMT; Head of National Research Center for Hematology, National Research Center for Hematology, Moscow, Russia Background: Natural killer cells (NK) are a component of innate immunity and are capable of cytotoxic lysis and cytokine secretion without prior antigen presentation.

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Their cytotoxic features on human leukemia cell lines (HL-60, K562, and THP-1) were determined by means of the WST-1 assay.

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PMC11335267

Additionally, altered expression of proopiomelanocortin and melanocortin-3 receptor mRNA in the hypothalamus suggests impaired regulation of feeding behavior.

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In general, intrinsically disordered regions (IDR) drive LLPS through multivalent interactions between multiple amino acid residues.

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First, we generated a triple negative breast cancer cell line MDA-MB 231 stably expressing a H6PD-biotin ligase fusion protein.

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PMC10747139

The Ru center improved the reaction rate through coordination affinity and changed the binding process.

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So, the JNK-cJUN complex that mediated the transcription of XRCC4 was also possibly promoted by DGKA in the ovarian cancer cells treated with cisplatin.

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PMC9429973

Summary/Conclusion: We herein report that MM cell lines enriched in SLe interact with platelets in vitro, and that this interaction partially protects MM cells from NK-mediated cytotoxicity.

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PMC10547921

The most in-depth studies of amatoxins are the α-amanitin (88) containing 6-hydroxytryptophan (Htp), trans-4-hydroxyproline (Hyp), and (3R,4R)-4,5-dihydroxyloleucine (Dhil), which is the most effective and specific RNA polymerase II inhibitor known to date, with the potential to break through drug resistance or destroy silent phase tumor cells, effectively preventing tumor metastasis and recurrence (Fig. 14A).

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UMAP of clusters labeled by subgroups.

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In conclusion, the present study, for what we believe to be the first time, demonstrated that MEX3B decreases epithelial TGFBR3 mRNA expression by binding to its 3′ UTR and reducing its stability.

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Student’s t-test with Welch’s correction was used for the statistical analysis of the comparisons of data.

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Particularly, the inhibition of miR-214-3p is associated with elevated apoptosis in leukemic B-cells.

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152–150 °C.

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PMC9000591

In this study, a bioguided fractionation of ethyl acetate extract (SE) from C. speciosa root was carried out to target antioxidant and cytotoxic activities.

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PMC11216402

Kim et al. (2022) discovered several cell populations, including immune cells, fibroblasts, and various gastric cell types.

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PMC10745221

The left panel is a Coomassie-stained SDS-PAGE gel, and the right panel is an anti-SDMA immunoblot with an exposure time of 10 seconds.

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Patient demographics and CLL-specific characteristics were extracted from the Mayo Clinic CLL Database and the electronic health record (EHR).

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Cells were selected according to FSC‐A and SSC‐A plots.

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GO enrichment analysis results show the top 20 terms that are most significant in terms of biological processes.

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Image: Summary/Conclusion: We detected few HF deaths thanks to a MR-guided patient-specific adjustment of the chelation therapy.

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On the other hand, BSA (703 a.u.)

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D, E Quantification of LC3-II levels (*p < 0.05; **p < 0.01; ***p < 0.005; n = 6–8 for NNC, n = 4–5 for Baf).

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Of these, indole-3-acetamide and diglycerol were up-regulated in the MM xenograft model, with the other four down-regulated. (

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Most importantly, the PB transposon system drastically shortens the stable expression host generation timeline for CHO and HEK293-derived cells since lengthy clonal selection is not needed.

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A similar trend was observed in lung cancer cell line A549, where an ROS inductor, hydrogen peroxide, decreased protein expression of KEAP1.

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Plasmids were acquired from Addgene (Watertown, MA, USA): pAdDeltaF6 (plasmid # 112867), pAAV2/5 (plasmid # 104964), and pAAV-gfp (plasmid # 32395).

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The r values indicate goodness of fit for the pooled data (where r = 1 is a perfect fit) and r of median effect plot for the cell culture system should be greater than 0.95.26–28 Investigation of synergism from combination of cisplatin with WDL and BA was the main focus of the study.

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a. To assess any effects, the secondary kinase inhibitor may be independent of the ligand and primary kinase inhibitor.

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Studies employing single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) on human breast tissues have elucidated that ELF5 is expressed in ER− luminal cells—specifically, the so-called luminal alveolar secretory precursor (LASP) cells —but is absent in ER+ luminal hormone-sensing (LHS) cells.

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PMC11026382

While this study focuses on all possible DHFR single mutations in the context of a few TYMS variants, it would be reasonably straightforward to design analogous experiments that more densely sample TYMS variation, or quantify amino acid resolution epistasis to other folate metabolic enzymes.

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PMC11190062

Cells were washed before analysis on the LSR II instrument (BD Biosciences, San Jose, CA, USA) with FACS Diva software (BD Biosciences).

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PMC11463018

HR-MS (ESI) calcd.

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The C-terminal acidic region (AR) DPEEDDE → AAAAAAA was highlighted.

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Aims: To evaluate sBCMA as a biomarker of early response in pts enrolled in the single step-up dosing cohorts of the cevostamab Phase I study.

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The average intensity was measured using Image J software after converting to an 8-bit image format, and the average intensity was used to generate the graph using GraphPad Prism software.37 RAFLS cells were grown and treated as mentioned above.

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PMC9429973

The JAK 1/2 inhibitor, ruxolitinib (RUX), has shown reductions in spleen volume and improvement in MF-related symptoms when used in the frontline.

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Dendrograms are generated in accordance with hierarchical clustering.

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Rapamycin production was assessed using the well-diffusion method against Candida albicans (Ganesh and C 2023).

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PMC9429973

Aims: The objective of this study was to evaluate the ability of IMR-261 to activate Bmp6-mediated synthesis of hepcidin (encoded by the Hamp gene), regulate iron stores and modulate transferrin saturation (TSAT) in a mouse model of iron overload.

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In contrast, the mutations with negative epistasis exhibited a range of growth rate effects in the WT context.

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PMC9429973

Fatigue was improved significantly in patients testing tele health care (n=3), mind/body interventions (n=2) and several exercise interventions.

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PMC9429973

Median (range) parsaclisib exposure was 10.6 (0.4–32.8) months.

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Image: Summary/Conclusion: Our preclinical data demonstrate that tinostamustine increases the anti-myeloma effect of daratumumab presumably due to enhanced expression of CD38 and MICA.

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PMC9429973

Moreover, chronic GVHD (cGVHD) was higher the closer the patient was to the transplant center with a hazard’s ratio (HR) = 2.183 (P=0.044).

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PMC9429973

All patients with NTD BT had previously had ≥1 transfusion at any point in time that the physician was aware of, with an average (SD) of 2.9 (0.9) transfusions per patient (range, 2.6 in Canada to 3.1 in Germany).

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PMC8875242

Unfortunately, the studies in which this inhibitory activity was observed are not publicly accessible, making it impossible to know what concentrations were tested or which experimental models were used.

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PMC11718109

Our results show a striking morphological difference in the SV pool populations of iPSC-derived DA neurons.

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PMC4360730

As new experiments are submitted to the ENCODE DCC, some will not have corresponding terms in their respective ontologies.

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PMC11468365

As observed, there is an imbalance in the dimensional data between drugs and cancer cell line features.

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Scale bar, 50 μm. (

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Since 3a–3d are dihydrazone derivatives, nitrosamine impurities were evaluated and detected.

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The purified fragment was cloned in pGEMt-easy (Promega) to create pGEMt-TS-Promoter (pGEMt-TS-Prom) plasmid.

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PMC10729469

In disease states, Teffs react to misfolded Aβ deposits, clonally expand, then affect neuroinflammation and AD neuropathology [22–25].

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PMC11437637

Add 20 µl of BD Multitest 6-color TBNK reagent (BD Catalog No. 337166) into the bottom of the flow tube.

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The cytotoxicity assay on healthy cells indicated varying degrees of biocompatibility among the tested treatments.

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Relationship between the level of CD4 naïve T cells and metastasis. (

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Comparison between pre- and post-vaccinated Hb levels of each vaccination was computed using paired t-test.

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PMC6742971

Low avidity clones are considered the ones having an EC50 above 2.50E-10 (M).

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Median (95% CI) OS was 2.8 (1.7–4.2) mo.

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PMC10965315

The bands represent the digested areas of gelatin by MMP‐9 and MMP‐2 after 24 h harmaline treatment (37.5 and 75 μM).

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In this subgroup, median SPINK2 score was higher in patients requiring ≥2 inductions to achieve CR vs. patients requiring 1 course (7 vs 2,P=0.009).

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The amino acid sequence of the VKORC1 ORF from CHO DG44 cells was deposited into the GenBank database (accession number, AFG26681.1) on April 3, 2012.

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PMC10998613

MDA-MB-231 (WT and DKO) and COS-7 cells either endogenous or transiently transfected with CXCR4-AcGFP1, CXCR4-mCherry, β2AR-AcGFP1, or β2AR-mCherry were seeded at 5 × 10 cells/well in six-well plates until they reached confluency.

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PMC10652261

HRMS (m/z): [M + H] calcd for C24H25ClN4S: 437.1561.

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Before the inhibition test, we need to test the safe dose of PD98059 (MCE, America) on ovarian cancer cells to avoid its lethal effect on ovarian cancer cells.

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PMC9370419

The HepG2 cells were cultured on 6-well plates and were a co-transfection of 1.9 µg pSBtetHX vector and 100 ng SB100X transposase vector per well using Lipofectamine 3000.

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Ns: not significant, p > 0.05, *p < 0.05, **p < 0.01, ***p < 0.001, ****p < 0.0001 The aforementioned experiments demonstrated that substantial apoptosis was observed in TER-treated A375 cells.

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PMC11574029

However, the regulatory mechanisms of NOTCH in BLCA remain unclear.

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PMC10170482

Specifically, normal human bronchial epithelial cells transferred from stiff to soft 2D substrates showed decreased glycolysis rates.

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PMC3164356

These classes are critical for constructing the core parts of the glycan chains or dictating glycan localization.

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PMC9611901

During electrophoresis, DNA loops migrated from the comet head towards the anode.

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PMC7369657

For biosafety of CQDs, after 4 and 12 weeks of treatment, all mice survived, and there was no significant body weight loss in any group (Figure 4(c)).

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PMC9429973

CTPS1 represents a novel target with the potential to effect rapid and specific disease control in aGvHD.

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PMC4112127

Further, to map the exact methylation pattern of the CpG sites in the targeted island, three cell lines, KMC-1, Mz-ChA-1, and the H-69 control cell line were selected for bisulfite genomic sequencing (BGS).

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PMC11798926

We quantified surface expression of WT SynDIG4 and the two endocytic mutants and found a significant increase in AVPA surface expression relative to WT, as we hypothesized, but we also observed decreased surface expression of the AMPA mutant relative to WT (F = 27.82, p < 0.0001) (Figure 2C).

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PMC9429973

Aims: To investigate the implementation method of targeted nursing intervention program and its application value in the care of chemotherapy patients with leukemia.

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PMC9429973

In Sweden with pdVWF/FVIII 2,4:1, LTP was also dominant (-8,841,901 kr; 6.52 QALY) compared with ODT.

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PMC11564322

p < 0.001 vs. the respective peptide alone After the 24-h exposure of the HL-60 cell line to the VGVAPG and VVGPAG peptides, PPARγ mRNA decreased by 25.28 and 63.72%, respectively, compared to the control.

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PMC10213199

After 97 days, blood was taken from abdominal aorta to determine SOD (Superoxide Dismutase) activity per gram of hemoglobin.

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PMC8382973

The results of the rabbit model showed good safety profiles for the 2% 2P23 gel and 0.4% 2P23 gel.

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PMC10988555

Once inside cells, complexes can accumulate in the mitochondria and are able to trigger ROS production which was also proved to occur by an in vitro exposure of our complexes to pDNA.

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PMC11699042

For instance, while a median of 99.6% (range 99.3%–99.8%) of the in-exon SNPs were shared after 12 months of continuous culture by each cell line, we could observe relatively less stable cell lines such as A-673, and MHH-ES-1, and remarkably stable cell lines such as TC-71 (Fig. 2b), whereas SK-ES-1 and A-673 displayed less stability at epigenetic level (Fig. 2c).

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PMC10547921

The antibody PROTAC conjugate can effectively degrade the BRD4 protein in HER2 high-expression cells SK-BR-3 and has no degradation effect on the BRD4 protein in HER2 low-expression cells MCF-7.

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PMC11687167

During lipid metabolism, LDL enters T cells, and LDLR interacts with the TCR complex to regulate TCR recycling and signaling, leading to CD8 + T-cell proliferation and activation, which results in increased CTL numbers .

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PMC9428827

Mice were inoculated with tumor cells and received 300 IU of mutein or 30,000 IU wtIL-2, twice a day, for 2 weeks separated by a resting week.

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PMC9429973

Pathogenic germline mutations were significantly more frequent in Asian than in Caucasian cases (odds ratio (OR)=1.64), consistent with a significantly higher frequency of pathogenic germline DDX41 variants in the former cases.

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PMC3734024

Activated B cells expressing FasL and TGF-β have also been reported to delay the onset of diabetes in non-obese diabetic (NOD) mice, and the frequency of FasL B cells is reduced in mice with severe autoimmune arthritis relative to those with mild or no arthritis , .

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PMC11409031

To forecast chemical sensitivity among high and low-risk groups, the Cancer Drug Sensitivity Genomics (GDSC) database, along with the pRRophetic R software package, was employed.

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PMC11791264

Error bars represent the mean ± SD (n = 3).

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PMC8996378

Compounds 74–76 were isolated from the gorgonian Briareum excavatum (Briareidae) (Table 7).

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PMC6379402

In the main paper, we consider that an enrichment or a depletion in cancer driver genes is statistically significant if the corresponding p value is lower than or equal to 5%.

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PMC11679326

Expression of truncated O-GalNAc glycans was low for all glioma cell lines, but for U-87 MG and T98G, Tn expression was moderate.

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PMC11283030

e. Kaplan–Meier plotter revealed RFS of 361 ccRCC patients with follow-up, according to ACLY mRNA expression.

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PMC11590005

Racial groups are social constructs representing the attributes historically assigned to them by society.

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