PMCID
string | Sentences
string | ner
list |
|---|---|---|
PMC10955424
|
The immunoblot experiments were performed twice with comparable results.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"immunoblot",
"experiments",
"were",
"performed",
"twice",
"with",
"comparable",
"results",
"."
]
}
] |
PMC11209164
|
The Vero cells were initially cultured in 12-well plates at a specific density of 3 × 10 cells per well.
|
[
{
"tags": [
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"Vero",
"cells",
"were",
"initially",
"cultured",
"in",
"12-well",
"plates",
"at",
"a",
"specific",
"density",
"of",
"3",
"×",
"10",
"cells",
"per",
"well",
"."
]
}
] |
PMC11228511
|
In contrast, only 3% of blebs with strong lamin B1 staining had a morphologically abnormal progerin meshwork (n = 102 cells) (Fig. 5D).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"contrast",
",",
"only",
"3",
"%",
"of",
"blebs",
"with",
"strong",
"lamin",
"B1",
"staining",
"had",
"a",
"morphologically",
"abnormal",
"progerin",
"meshwork",
"(",
"n",
"=",
"102",
"cells",
")",
"(",
"Fig.",
"5D",
")",
"."
]
}
] |
PMC11489351
|
For F and H, significance was determined using a ratio paired t test.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"F",
"and",
"H",
",",
"significance",
"was",
"determined",
"using",
"a",
"ratio",
"paired",
"t",
"test",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The most frequent alloantibody was anti-K with 32%, and anti-E with 11.3% of all identified antibodies.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"most",
"frequent",
"alloantibody",
"was",
"anti-K",
"with",
"32",
"%",
",",
"and",
"anti-E",
"with",
"11.3",
"%",
"of",
"all",
"identified",
"antibodies",
"."
]
}
] |
PMC10196713
|
Intriguingly, it was shown that the siRNA-mediated depletion of Fdx1 in cisplatin-resistant cells resulted in enhanced ferroptosis by increasing the mitochondrial membrane potential and lipid peroxidation induced by cisplatin.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Intriguingly",
",",
"it",
"was",
"shown",
"that",
"the",
"siRNA-mediated",
"depletion",
"of",
"Fdx1",
"in",
"cisplatin-resistant",
"cells",
"resulted",
"in",
"enhanced",
"ferroptosis",
"by",
"increasing",
"the",
"mitochondrial",
"membrane",
"potential",
"and",
"lipid",
"peroxidation",
"induced",
"by",
"cisplatin",
"."
]
}
] |
PMC11306019
|
Hence, limiting polyphenol intake during BTZ treatment for MM is advisable.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Hence",
",",
"limiting",
"polyphenol",
"intake",
"during",
"BTZ",
"treatment",
"for",
"MM",
"is",
"advisable",
"."
]
}
] |
PMC5417661
|
For determination of disruption of the established cords, VEGF (20 ng/mL) was applied alone on day 0 to form cord networks and 4 days later the compounds were administrated in the continued presence of VEGF (20 ng/mL).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"determination",
"of",
"disruption",
"of",
"the",
"established",
"cords",
",",
"VEGF",
"(",
"20",
"ng/mL",
")",
"was",
"applied",
"alone",
"on",
"day",
"0",
"to",
"form",
"cord",
"networks",
"and",
"4",
"days",
"later",
"the",
"compounds",
"were",
"administrated",
"in",
"the",
"continued",
"presence",
"of",
"VEGF",
"(",
"20",
"ng/mL",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
According to data previously shown in UC patients, this fact may be considered to demonstrate that the mechanisms at the basis of the inflammatory environment potentially select for the growth of CH specific mutations.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"According",
"to",
"data",
"previously",
"shown",
"in",
"UC",
"patients",
",",
"this",
"fact",
"may",
"be",
"considered",
"to",
"demonstrate",
"that",
"the",
"mechanisms",
"at",
"the",
"basis",
"of",
"the",
"inflammatory",
"environment",
"potentially",
"select",
"for",
"the",
"growth",
"of",
"CH",
"specific",
"mutations",
"."
]
}
] |
PMC11502443
|
Tirzepatide consistently exhibited lower efficacy relative to GIP(1-42) for all five signaling pathways (8 to 21-fold) (Figure 2G).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Tirzepatide",
"consistently",
"exhibited",
"lower",
"efficacy",
"relative",
"to",
"GIP(1",
"-",
"42",
")",
"for",
"all",
"five",
"signaling",
"pathways",
"(",
"8",
"to",
"21-fold",
")",
"(",
"Figure",
"2",
"G",
")",
"."
]
}
] |
PMC10530622
|
However, available clinical data regarding its effectiveness is lacking .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"available",
"clinical",
"data",
"regarding",
"its",
"effectiveness",
"is",
"lacking",
"."
]
}
] |
PMC9398137
|
We have previously shown that in U2932, another S63845-resistant DLBCL cell line, the MCL1 protein is also occupied by NOXA (19).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"have",
"previously",
"shown",
"that",
"in",
"U2932",
",",
"another",
"S63845-resistant",
"DLBCL",
"cell",
"line",
",",
"the",
"MCL1",
"protein",
"is",
"also",
"occupied",
"by",
"NOXA",
"(",
"19",
")",
"."
]
}
] |
PMC11768927
|
Furthermore, VSV has a broad tissue tropism, making it suitable for targeting a variety of cancer types .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"VSV",
"has",
"a",
"broad",
"tissue",
"tropism",
",",
"making",
"it",
"suitable",
"for",
"targeting",
"a",
"variety",
"of",
"cancer",
"types",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Aims: Here, we report early clinical results from a phase I open-label, non-randomized, prospective investigator initiate trial (IIT) of GC502 in r/r B-ALL patients to evaluate safety and preliminary efficacy Methods: GC502 is manufactured using leukopaks from HLA-unmatched healthy donors.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aims",
":",
"Here",
",",
"we",
"report",
"early",
"clinical",
"results",
"from",
"a",
"phase",
"I",
"open-label",
",",
"non-randomized",
",",
"prospective",
"investigator",
"initiate",
"trial",
"(",
"IIT",
")",
"of",
"GC502",
"in",
"r/r",
"B-ALL",
"patients",
"to",
"evaluate",
"safety",
"and",
"preliminary",
"efficacy",
"Methods",
":",
"GC502",
"is",
"manufactured",
"using",
"leukopaks",
"from",
"HLA-unmatched",
"healthy",
"donors",
"."
]
}
] |
PMC11742670
|
While AI is being used to enhance human intuition and expertise in the creation of new bioactive compounds, FRS prioritizes the best compounds from the selected databases.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"While",
"AI",
"is",
"being",
"used",
"to",
"enhance",
"human",
"intuition",
"and",
"expertise",
"in",
"the",
"creation",
"of",
"new",
"bioactive",
"compounds",
",",
"FRS",
"prioritizes",
"the",
"best",
"compounds",
"from",
"the",
"selected",
"databases",
"."
]
}
] |
PMC11190538
|
Previous research demonstrated that the change in the blue color of PC is caused by the denaturation of the protein structure, which is triggered by either acid or alkaline conditions.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Previous",
"research",
"demonstrated",
"that",
"the",
"change",
"in",
"the",
"blue",
"color",
"of",
"PC",
"is",
"caused",
"by",
"the",
"denaturation",
"of",
"the",
"protein",
"structure",
",",
"which",
"is",
"triggered",
"by",
"either",
"acid",
"or",
"alkaline",
"conditions",
"."
]
}
] |
PMC11321678
|
The CNV profiles of progenitor‐like tumor cells and SHH tumor cells indicated that they belonged to different subclones in patient A4 (Figure S3D, Supporting Information).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"CNV",
"profiles",
"of",
"progenitor‐like",
"tumor",
"cells",
"and",
"SHH",
"tumor",
"cells",
"indicated",
"that",
"they",
"belonged",
"to",
"different",
"subclones",
"in",
"patient",
"A4",
"(",
"Figure",
"S3D",
",",
"Supporting",
"Information",
")",
"."
]
}
] |
PMC11473843
|
The preparation for the drug delivery to the mice was done the day of the treatment by adding first the PEG 300, followed by Tween 80 and saline.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"preparation",
"for",
"the",
"drug",
"delivery",
"to",
"the",
"mice",
"was",
"done",
"the",
"day",
"of",
"the",
"treatment",
"by",
"adding",
"first",
"the",
"PEG",
"300",
",",
"followed",
"by",
"Tween",
"80",
"and",
"saline",
"."
]
}
] |
PMC9813422
|
The host RNA polymerase II then uses cccDNA as a template to make all viral RNAs.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"host",
"RNA",
"polymerase",
"II",
"then",
"uses",
"cccDNA",
"as",
"a",
"template",
"to",
"make",
"all",
"viral",
"RNAs",
"."
]
}
] |
PMC9479186
|
The silencing of NDUFC1 may, at least in part, allow HCC to exit the cell cycle and enter senescence status.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"silencing",
"of",
"NDUFC1",
"may",
",",
"at",
"least",
"in",
"part",
",",
"allow",
"HCC",
"to",
"exit",
"the",
"cell",
"cycle",
"and",
"enter",
"senescence",
"status",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Results: In human AML, serum IL21 was identified as an independent positive prognostic biomarker for overall survival (OS).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
":",
"In",
"human",
"AML",
",",
"serum",
"IL21",
"was",
"identified",
"as",
"an",
"independent",
"positive",
"prognostic",
"biomarker",
"for",
"overall",
"survival",
"(",
"OS",
")",
"."
]
}
] |
PMC11126803
|
After being evenly divided into two groups, 500 PM biotin-labeled anti-sense oligonucleotide targeting ERβ/ESR2 (5′-TCT GTC TCC GCA CAA GGC GGT ACC C-3′) was added to the experimental group, and the same amount of 1× Tris-EDTA (TE) buffer was used as a control group and rotated at 4 °C overnight.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"being",
"evenly",
"divided",
"into",
"two",
"groups",
",",
"500",
"PM",
"biotin-labeled",
"anti-sense",
"oligonucleotide",
"targeting",
"ERβ/ESR2",
"(",
"5′-TCT",
"GTC",
"TCC",
"GCA",
"CAA",
"GGC",
"GGT",
"ACC",
"C-3′",
")",
"was",
"added",
"to",
"the",
"experimental",
"group",
",",
"and",
"the",
"same",
"amount",
"of",
"1",
"×",
"Tris-EDTA",
"(",
"TE",
")",
"buffer",
"was",
"used",
"as",
"a",
"control",
"group",
"and",
"rotated",
"at",
"4",
"°",
"C",
"overnight",
"."
]
}
] |
PMC11543885
|
Refer to Table 1 for the appropriate volumes.2.Add tetracycline (tet) to achieve a final concentration of 1 μg/mL to induce the expression of flag-NLRP3-APEX2.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Refer",
"to",
"Table",
"1",
"for",
"the",
"appropriate",
"volumes.2.Add",
"tetracycline",
"(",
"tet",
")",
"to",
"achieve",
"a",
"final",
"concentration",
"of",
"1",
"μg/mL",
"to",
"induce",
"the",
"expression",
"of",
"flag-NLRP3-APEX2",
"."
]
}
] |
PMC11522251
|
2HOXB8 expression was up-regulated in cetuximab-resistant cells A, B In three kinds of cells, cetuximab dramatically reduced SW48 cells’ capacity to migrate and invade, and had no significant effect on HCT116 and CACO2 cells. ***
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"2HOXB8",
"expression",
"was",
"up-regulated",
"in",
"cetuximab-resistant",
"cells",
"A",
",",
"B",
"In",
"three",
"kinds",
"of",
"cells",
",",
"cetuximab",
"dramatically",
"reduced",
"SW48",
"cells",
"’",
"capacity",
"to",
"migrate",
"and",
"invade",
",",
"and",
"had",
"no",
"significant",
"effect",
"on",
"HCT116",
"and",
"CACO2",
"cells",
".",
"*",
"*",
"*"
]
}
] |
PMC11656657
|
Chimeric antigen receptor (CAR) T-cell immunotherapy stands out as one of the most promising approach for tumor treatment.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Chimeric",
"antigen",
"receptor",
"(",
"CAR",
")",
"T-cell",
"immunotherapy",
"stands",
"out",
"as",
"one",
"of",
"the",
"most",
"promising",
"approach",
"for",
"tumor",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC11572213
|
As TET2 mRNA expression was found to increase in glutamine-deficient medium (50 µM glutamine), we downregulated its expression.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"TET2",
"mRNA",
"expression",
"was",
"found",
"to",
"increase",
"in",
"glutamine-deficient",
"medium",
"(",
"50",
"µM",
"glutamine",
")",
",",
"we",
"downregulated",
"its",
"expression",
"."
]
}
] |
PMC11770199
|
In our previous study, we found that enhancing the syncytial characteristic of oncolytic herpes viruses to induce stronger cell–cell fusion significantly improved the intratumoral viral spread and antitumor efficacy of oncolytic viruses .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"our",
"previous",
"study",
",",
"we",
"found",
"that",
"enhancing",
"the",
"syncytial",
"characteristic",
"of",
"oncolytic",
"herpes",
"viruses",
"to",
"induce",
"stronger",
"cell",
"–",
"cell",
"fusion",
"significantly",
"improved",
"the",
"intratumoral",
"viral",
"spread",
"and",
"antitumor",
"efficacy",
"of",
"oncolytic",
"viruses",
"."
]
}
] |
PMC10898159
|
With the combination of BGJ398 and sunitinib, SDH-GIST patients may get better outcomes .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"With",
"the",
"combination",
"of",
"BGJ398",
"and",
"sunitinib",
",",
"SDH-GIST",
"patients",
"may",
"get",
"better",
"outcomes",
"."
]
}
] |
PMC10998613
|
The combined administration of CXCL12 and epinephrine also enhances multimerization between CXCR4 and β2AR (Fig. 5B).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"combined",
"administration",
"of",
"CXCL12",
"and",
"epinephrine",
"also",
"enhances",
"multimerization",
"between",
"CXCR4",
"and",
"β2AR",
"(",
"Fig.",
"5B",
")",
"."
]
}
] |
PMC11802855
|
Concurrently, it was discovered that CXCL7 could activate the JAK/STAT3 pathway via CXCR2 and upregulate the expression levels of MMP13 and C-myc, facilitating MM cell proliferation and activation of the osteoclast signaling pathway.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Concurrently",
",",
"it",
"was",
"discovered",
"that",
"CXCL7",
"could",
"activate",
"the",
"JAK/STAT3",
"pathway",
"via",
"CXCR2",
"and",
"upregulate",
"the",
"expression",
"levels",
"of",
"MMP13",
"and",
"C-myc",
",",
"facilitating",
"MM",
"cell",
"proliferation",
"and",
"activation",
"of",
"the",
"osteoclast",
"signaling",
"pathway",
"."
]
}
] |
PMC10899471
|
The participants provided their written informed consent to participate in this study.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"participants",
"provided",
"their",
"written",
"informed",
"consent",
"to",
"participate",
"in",
"this",
"study",
"."
]
}
] |
PMC11768281
|
These cells are essential in combating malaria but face challenges due to the parasite’s complex life cycle and immune evasion strategies.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"cells",
"are",
"essential",
"in",
"combating",
"malaria",
"but",
"face",
"challenges",
"due",
"to",
"the",
"parasite",
"’s",
"complex",
"life",
"cycle",
"and",
"immune",
"evasion",
"strategies",
"."
]
}
] |
PMC11258145
|
The level of membrane lipid peroxidation in the examined cells after treatment with curcumin was determined by measuring the MDA (Fig. 6).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"level",
"of",
"membrane",
"lipid",
"peroxidation",
"in",
"the",
"examined",
"cells",
"after",
"treatment",
"with",
"curcumin",
"was",
"determined",
"by",
"measuring",
"the",
"MDA",
"(",
"Fig.",
"6",
")",
"."
]
}
] |
PMC11745823
|
The obtained luciferase data were normalised (the target luciferase activity value was divided by the internal reference activity value), and the relative expression levels of luciferase under different experimental conditions were analysed to evaluate the activity changes of the target regulatory sequence.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"obtained",
"luciferase",
"data",
"were",
"normalised",
"(",
"the",
"target",
"luciferase",
"activity",
"value",
"was",
"divided",
"by",
"the",
"internal",
"reference",
"activity",
"value",
")",
",",
"and",
"the",
"relative",
"expression",
"levels",
"of",
"luciferase",
"under",
"different",
"experimental",
"conditions",
"were",
"analysed",
"to",
"evaluate",
"the",
"activity",
"changes",
"of",
"the",
"target",
"regulatory",
"sequence",
"."
]
}
] |
PMC11621493
|
The release of glycerol and FFAs was quantified using commercial kits.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"release",
"of",
"glycerol",
"and",
"FFAs",
"was",
"quantified",
"using",
"commercial",
"kits",
"."
]
}
] |
PMC11297139
|
The protein solution was loaded onto a confocal dish and imaged using a Zeiss LSM700 microscope.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"protein",
"solution",
"was",
"loaded",
"onto",
"a",
"confocal",
"dish",
"and",
"imaged",
"using",
"a",
"Zeiss",
"LSM700",
"microscope",
"."
]
}
] |
PMC10577955
|
The growth medium from the 96 well micro titer was drained once the cells had formed a merged sheet, then replaced with different concentrations of compounds (ALUP, BA, LUP & Doxorubicin) (µg /ml) for 48 h, where the compounds were priorly dissolved in RPMI before adding to culture medium, the plate was incubated at 37 °C.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"growth",
"medium",
"from",
"the",
"96",
"well",
"micro",
"titer",
"was",
"drained",
"once",
"the",
"cells",
"had",
"formed",
"a",
"merged",
"sheet",
",",
"then",
"replaced",
"with",
"different",
"concentrations",
"of",
"compounds",
"(",
"ALUP",
",",
"BA",
",",
"LUP",
"&",
"Doxorubicin",
")",
"(",
"µg",
"/ml",
")",
"for",
"48",
"h",
",",
"where",
"the",
"compounds",
"were",
"priorly",
"dissolved",
"in",
"RPMI",
"before",
"adding",
"to",
"culture",
"medium",
",",
"the",
"plate",
"was",
"incubated",
"at",
"37",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
An additional 10 myeloid gene mutations were detected by NGS technique: 5 were already known (ASXL1 G1397S; JAK2 L393V; KITD816Y; LNK E208Q; TET2 Y867H) while the other 5 have not been previously described (ETV6A215P; KIT Y553C; NFE2 1291T; SH2B3 G382D; SH2B3 L438V).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"An",
"additional",
"10",
"myeloid",
"gene",
"mutations",
"were",
"detected",
"by",
"NGS",
"technique",
":",
"5",
"were",
"already",
"known",
"(",
"ASXL1",
"G1397S",
";",
"JAK2",
"L393V",
";",
"KITD816Y",
";",
"LNK",
"E208Q",
";",
"TET2",
"Y867H",
")",
"while",
"the",
"other",
"5",
"have",
"not",
"been",
"previously",
"described",
"(",
"ETV6A215P",
";",
"KIT",
"Y553C",
";",
"NFE2",
"1291",
"T",
";",
"SH2B3",
"G382D",
";",
"SH2B3",
"L438V",
")",
"."
]
}
] |
PMC11422497
|
The transfection efficiency of each group was confirmed through RT-qPCR. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"transfection",
"efficiency",
"of",
"each",
"group",
"was",
"confirmed",
"through",
"RT-qPCR",
".",
"("
]
}
] |
PMC9275501
|
RES could activate TRPM2 channels in DBTRG glioblastoma cells to enhance PTX apoptosis and oxidation by increasing intracellular steady-state ROS levels and mitochondrial dysfunction (Ozturk et al., 2019).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"RES",
"could",
"activate",
"TRPM2",
"channels",
"in",
"DBTRG",
"glioblastoma",
"cells",
"to",
"enhance",
"PTX",
"apoptosis",
"and",
"oxidation",
"by",
"increasing",
"intracellular",
"steady-state",
"ROS",
"levels",
"and",
"mitochondrial",
"dysfunction",
"(",
"Ozturk",
"et",
"al.",
",",
"2019",
")",
"."
]
}
] |
PMC11453018
|
H GSEA enrichment analyses reveal significant enrichment (p=2.18e-4) of cell cycle checkpoints in iP300w-treated ES cell lines (EWS) compared to other cancer cell lines (Other).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"H",
"GSEA",
"enrichment",
"analyses",
"reveal",
"significant",
"enrichment",
"(",
"p=2.18e-4",
")",
"of",
"cell",
"cycle",
"checkpoints",
"in",
"iP300w-treated",
"ES",
"cell",
"lines",
"(",
"EWS",
")",
"compared",
"to",
"other",
"cancer",
"cell",
"lines",
"(",
"Other",
")",
"."
]
}
] |
PMC11377827
|
We, therefore, focused on which 14-3-3 isoform was involved.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
",",
"therefore",
",",
"focused",
"on",
"which",
"14",
"-",
"3",
"-",
"3",
"isoform",
"was",
"involved",
"."
]
}
] |
PMC10854447
|
Cancer can be treated by regulating or stopping the uncontrolled multiplication of cancer cells.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cancer",
"can",
"be",
"treated",
"by",
"regulating",
"or",
"stopping",
"the",
"uncontrolled",
"multiplication",
"of",
"cancer",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC8524093
|
E1-E2 dimers will be deposited in the cell membrane forming the ‘virus budding microdomain’, a membrane domain where the budding process will occur (16).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"E1-E2",
"dimers",
"will",
"be",
"deposited",
"in",
"the",
"cell",
"membrane",
"forming",
"the",
"‘",
"virus",
"budding",
"microdomain",
"’",
",",
"a",
"membrane",
"domain",
"where",
"the",
"budding",
"process",
"will",
"occur",
"(",
"16",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
All patients had received two doses of anti-SARS-CoV-2 vaccines, and 77% of them a further, booster dose.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"patients",
"had",
"received",
"two",
"doses",
"of",
"anti-SARS-CoV-2",
"vaccines",
",",
"and",
"77",
"%",
"of",
"them",
"a",
"further",
",",
"booster",
"dose",
"."
]
}
] |
PMC11064533
|
E. coli is the leading cause of death from bacterial infections, attributable to and associated with antimicrobial resistance, totaling over 800,000 per year (3).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"E.",
"coli",
"is",
"the",
"leading",
"cause",
"of",
"death",
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"antimicrobial",
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"800,000",
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"year",
"(",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Ocular toxicity improved after treatment interruption (drug intervals 4-6 weeks) and no patients required complete treatment cessation.
|
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"and",
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"."
]
}
] |
PMC11745600
|
Furthermore, human glucagon was also detected in the plasma of these mice at 2 wk posttransplantation (Figure 5G and H).
|
[
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"O",
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"O"
],
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"human",
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"plasma",
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"these",
"mice",
"at",
"2",
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"posttransplantation",
"(",
"Figure",
"5",
"G",
"and",
"H",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
A structure (e.g., Delphi process method or focus groups) and a series of meetings are recommended to best address the following: a) critically discuss existing PROMs, b) decide on an aim (e.g., clinical or research oriented PROM) and group, c) decide on methodology (replicate or diverge from existing methodologies), d) review theoretical models to guide the PROM content, e) develop the initial domains, structure, items, f) develop a statistical analysis plan, g) decide on the instructions of the PROM (e.g., rationale of administration); (iv) to complete readability tests, aiming at a final score of 6 grade and reword accordingly; (v) to format the PROM structure and the overall layout (e.g., spacing, font size) according to the condition (e.g., visual impairments, cognitive abilities) and preferences of the patient group; (vi) to invite a separate patient group to review comprehensibility, ease, and timing of completion, rate the content in terms of relevance and offer any further suggestions around the items (including addition or removal); (vii) to repeat the steps above as appropriate depending on the extent of changes made; (viii) to pilot test the PROM with a third group of patients and run initial analyses; (ix) conduct the full study for further testing (e.g., validity, reliability) of the PROM and its content (e.g., factor analysis, Cronbach’s alpha and kappa).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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":",
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")",
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"clinical",
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")",
"decide",
"on",
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"(",
"replicate",
"or",
"diverge",
"from",
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")",
",",
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")",
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")",
"develop",
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")",
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"v",
")",
"to",
"format",
"the",
"PROM",
"structure",
"and",
"the",
"overall",
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"(",
"e.g.",
",",
"spacing",
",",
"font",
"size",
")",
"according",
"to",
"the",
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"e.g.",
",",
"visual",
"impairments",
",",
"cognitive",
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")",
"and",
"preferences",
"of",
"the",
"patient",
"group",
";",
"(",
"vi",
")",
"to",
"invite",
"a",
"separate",
"patient",
"group",
"to",
"review",
"comprehensibility",
",",
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",",
"and",
"timing",
"of",
"completion",
",",
"rate",
"the",
"content",
"in",
"terms",
"of",
"relevance",
"and",
"offer",
"any",
"further",
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"the",
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"to",
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"on",
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"of",
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"viii",
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"to",
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")",
"of",
"the",
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"and",
"its",
"content",
"(",
"e.g.",
",",
"factor",
"analysis",
",",
"Cronbach",
"’s",
"alpha",
"and",
"kappa",
")",
"."
]
}
] |
PMC10577955
|
Our study showed that treatment of A549 cells with ALUP, BA, and LUP at the IC50 for 48 h induced cell cycle arrest at the G2/M phase.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"study",
"showed",
"that",
"treatment",
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"A549",
"cells",
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"ALUP",
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",",
"and",
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"at",
"the",
"IC50",
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"h",
"induced",
"cell",
"cycle",
"arrest",
"at",
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"G2/M",
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"."
]
}
] |
PMC11748618
|
We identify three genetic variants: rs72999655-A-G, rs7525622-G-A, and rs73004025-C-T, which explain significantly more variance of HIV spVL than rs59784663-A-G. The putatively causal variant rs7525622-G-A is a CHD1L eQTL in fibroblasts (NES = 0.24, p < 4.4 × 10) and skeletal muscle (NES = 0.43, p < 1.4 × 10) from the GTEx database, however the variant was not a statistically significant eQTL in the MESA or AGFR cohorts.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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],
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"explain",
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"=",
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",",
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"<",
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"×",
"10",
")",
"from",
"the",
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"however",
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"variant",
"was",
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"or",
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"cohorts",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Most patients (82%) presented with severe infections and this was also the most common cause of death.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Most",
"patients",
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"%",
")",
"presented",
"with",
"severe",
"infections",
"and",
"this",
"was",
"also",
"the",
"most",
"common",
"cause",
"of",
"death",
"."
]
}
] |
PMC11564322
|
Similarly, a decrease in the mTOR protein expression in the MEG-01 cells was a result of cell differentiation and maturation .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Similarly",
",",
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"in",
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"mTOR",
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"expression",
"in",
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"MEG-01",
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"was",
"a",
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"of",
"cell",
"differentiation",
"and",
"maturation",
"."
]
}
] |
PMC8540692
|
Finally, the impact of the analyzed compounds was also evaluated in regard to the UHRF1 expression (Figure 8).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Finally",
",",
"the",
"impact",
"of",
"the",
"analyzed",
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"was",
"also",
"evaluated",
"in",
"regard",
"to",
"the",
"UHRF1",
"expression",
"(",
"Figure",
"8)",
"."
]
}
] |
PMC8140214
|
In our experiment, the activity of CAT significantly increased after 48 hr exposure to 30 mM D-glucose and quercetin significantly reduced this increase compared to the corresponding value.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"our",
"experiment",
",",
"the",
"activity",
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"CAT",
"significantly",
"increased",
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"48",
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"exposure",
"to",
"30",
"mM",
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"and",
"quercetin",
"significantly",
"reduced",
"this",
"increase",
"compared",
"to",
"the",
"corresponding",
"value",
"."
]
}
] |
PMC11509224
|
Some reviews focus on specific types of sponges, such as molecules from the order Dictyoceratida , the families Hymedesmiidae and Latrunculiidae , and the genera Amphimedon , Aaptos , Callyspongia , Haliclona , Petrosia , Phorbas , Reniera , Stelletta , and Suberea .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Some",
"reviews",
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"on",
"specific",
"types",
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"as",
"molecules",
"from",
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"Dictyoceratida",
",",
"the",
"families",
"Hymedesmiidae",
"and",
"Latrunculiidae",
",",
"and",
"the",
"genera",
"Amphimedon",
",",
"Aaptos",
",",
"Callyspongia",
",",
"Haliclona",
",",
"Petrosia",
",",
"Phorbas",
",",
"Reniera",
",",
"Stelletta",
",",
"and",
"Suberea",
"."
]
}
] |
PMC10975211
|
The amino acid sequence side chains from buforin IIb are compatible and non-reactive with Pt, resulting in a Pt-buforin IIb conjugate more cytotoxic and selective to the ovarian cancer cell line (A2780cisR) than the parental AMP buforin IIb.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"amino",
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"sequence",
"side",
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"from",
"buforin",
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"and",
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"Pt",
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"selective",
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"ovarian",
"cancer",
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"A2780cisR",
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"parental",
"AMP",
"buforin",
"IIb",
"."
]
}
] |
PMC6600592
|
92.9-93.6 °C.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"92.9",
"-",
"93.6",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC11575040
|
A, B Evaluation of the migration and invasion ability of A2058 cells after LINC00094 knockdown, followed by the quantification of their relative motility.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
",",
"B",
"Evaluation",
"of",
"the",
"migration",
"and",
"invasion",
"ability",
"of",
"A2058",
"cells",
"after",
"LINC00094",
"knockdown",
",",
"followed",
"by",
"the",
"quantification",
"of",
"their",
"relative",
"motility",
"."
]
}
] |
PMC11680562
|
The gels were labelled as PXFCu1, PXFCu2, PXFCu3, PXFCu4, PXFCu5, and PXFCu6.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"gels",
"were",
"labelled",
"as",
"PXFCu1",
",",
"PXFCu2",
",",
"PXFCu3",
",",
"PXFCu4",
",",
"PXFCu5",
",",
"and",
"PXFCu6",
"."
]
}
] |
PMC11409031
|
BMS -536924. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"BMS",
"-536924",
".",
"("
]
}
] |
PMC11359735
|
about 30 proteins are anchored to the plasma membrane with GPIs, with most of these identified in the asexual blood stages of the parasite (3).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"about",
"30",
"proteins",
"are",
"anchored",
"to",
"the",
"plasma",
"membrane",
"with",
"GPIs",
",",
"with",
"most",
"of",
"these",
"identified",
"in",
"the",
"asexual",
"blood",
"stages",
"of",
"the",
"parasite",
"(",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC11637276
|
Finally, for both methodologies used, 10 μl of the sample was loaded into a 384-well plate.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Finally",
",",
"for",
"both",
"methodologies",
"used",
",",
"10",
"μl",
"of",
"the",
"sample",
"was",
"loaded",
"into",
"a",
"384-well",
"plate",
"."
]
}
] |
PMC11486946
|
Left, representative images of EGFR-mEGFP observed with AiSIS.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Left",
",",
"representative",
"images",
"of",
"EGFR-mEGFP",
"observed",
"with",
"AiSIS",
"."
]
}
] |
PMC11171319
|
A bidirectional relationship between tumor cells and HCMV could be at play which will curtail viral replication and favor tumor escape with a limited deleterious accumulation of the inflammatory cells at the viral infection site .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"bidirectional",
"relationship",
"between",
"tumor",
"cells",
"and",
"HCMV",
"could",
"be",
"at",
"play",
"which",
"will",
"curtail",
"viral",
"replication",
"and",
"favor",
"tumor",
"escape",
"with",
"a",
"limited",
"deleterious",
"accumulation",
"of",
"the",
"inflammatory",
"cells",
"at",
"the",
"viral",
"infection",
"site",
"."
]
}
] |
PMC11746942
|
Here, we demonstrated that FTY720 treatment ameliorated the manifestations of psoriasis (erythema, scaling, and infiltration) and reduced the synthesis of inflammatory cytokines (Il22, Il23, and Tnf), showing anti-inflammatory effects and anti-proliferative effects.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Here",
",",
"we",
"demonstrated",
"that",
"FTY720",
"treatment",
"ameliorated",
"the",
"manifestations",
"of",
"psoriasis",
"(",
"erythema",
",",
"scaling",
",",
"and",
"infiltration",
")",
"and",
"reduced",
"the",
"synthesis",
"of",
"inflammatory",
"cytokines",
"(",
"Il22",
",",
"Il23",
",",
"and",
"Tnf",
")",
",",
"showing",
"anti-inflammatory",
"effects",
"and",
"anti-proliferative",
"effects",
"."
]
}
] |
PMC11756514
|
It has been shown that S. aureus WTA is a ligand for both langerin and MBL (22, 23).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"has",
"been",
"shown",
"that",
"S.",
"aureus",
"WTA",
"is",
"a",
"ligand",
"for",
"both",
"langerin",
"and",
"MBL",
"(",
"22",
",",
"23",
")",
"."
]
}
] |
PMC8978939
|
Molecular electrostatic potential (MEP) is mapped on the Connolly surface as calculated for WT and P138R or L163R pVHL variants.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Molecular",
"electrostatic",
"potential",
"(",
"MEP",
")",
"is",
"mapped",
"on",
"the",
"Connolly",
"surface",
"as",
"calculated",
"for",
"WT",
"and",
"P138R",
"or",
"L163R",
"pVHL",
"variants",
"."
]
}
] |
PMC11271800
|
The anti-inflammatory factor IL-10 promotes the transition from M1 to M2 TAMs through positive feedback, but also inhibits the synthesis and expression of proinflammatory cytokines, including IL-1β, IL-6, TNF, and IFN-γ.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"anti-inflammatory",
"factor",
"IL-10",
"promotes",
"the",
"transition",
"from",
"M1",
"to",
"M2",
"TAMs",
"through",
"positive",
"feedback",
",",
"but",
"also",
"inhibits",
"the",
"synthesis",
"and",
"expression",
"of",
"proinflammatory",
"cytokines",
",",
"including",
"IL-1β",
",",
"IL-6",
",",
"TNF",
",",
"and",
"IFN-γ",
"."
]
}
] |
PMC11591794
|
He et al. attributed the source of this problem to manufacturers and different formulas used in laboratories.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"He",
"et",
"al.",
"attributed",
"the",
"source",
"of",
"this",
"problem",
"to",
"manufacturers",
"and",
"different",
"formulas",
"used",
"in",
"laboratories",
"."
]
}
] |
PMC11656380
|
Generally, aggressive adherent cells exhibit high macropinocytic activity.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Generally",
",",
"aggressive",
"adherent",
"cells",
"exhibit",
"high",
"macropinocytic",
"activity",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Crizanlizumab has been provided through Novartis Managed Access Program (MAP), classified in Brazil as Expanded Access Program (EAP), as an alternative therapy for SCD patients with an immediately life-threatening condition or serious disease.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Crizanlizumab",
"has",
"been",
"provided",
"through",
"Novartis",
"Managed",
"Access",
"Program",
"(",
"MAP",
")",
",",
"classified",
"in",
"Brazil",
"as",
"Expanded",
"Access",
"Program",
"(",
"EAP",
")",
",",
"as",
"an",
"alternative",
"therapy",
"for",
"SCD",
"patients",
"with",
"an",
"immediately",
"life-threatening",
"condition",
"or",
"serious",
"disease",
"."
]
}
] |
PMC11200978
|
Further, the data suggest that the combination of gemcitabine pretreatment and freezing resulted in a shift of the minimum lethal temperature for LC from −25 °C to −15 °C.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Further",
",",
"the",
"data",
"suggest",
"that",
"the",
"combination",
"of",
"gemcitabine",
"pretreatment",
"and",
"freezing",
"resulted",
"in",
"a",
"shift",
"of",
"the",
"minimum",
"lethal",
"temperature",
"for",
"LC",
"from",
"−25",
"°",
"C",
"to",
"−15",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC11694346
|
The reaction mixture was subsequently allowed to return to room temperature and stirred for an additional 16 hours.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"reaction",
"mixture",
"was",
"subsequently",
"allowed",
"to",
"return",
"to",
"room",
"temperature",
"and",
"stirred",
"for",
"an",
"additional",
"16",
"hours",
"."
]
}
] |
PMC8009078
|
The hydrogens associated with covalent bonds were constraint using the SHAKE algorithm.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"hydrogens",
"associated",
"with",
"covalent",
"bonds",
"were",
"constraint",
"using",
"the",
"SHAKE",
"algorithm",
"."
]
}
] |
PMC8592717
|
Excessive oxidative stress correlated with lipid overload, indicating that fatty acid played a role in ROS generation .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Excessive",
"oxidative",
"stress",
"correlated",
"with",
"lipid",
"overload",
",",
"indicating",
"that",
"fatty",
"acid",
"played",
"a",
"role",
"in",
"ROS",
"generation",
"."
]
}
] |
PMC11733919
|
The levels of NF-κB were decreased after 2 and 6 h of treatment with the nanoplatform, suggesting that at these time points, senescent skin cancer cells cannot be protected against nanoplatform-mediated apoptosis by NF-κB transcriptional activity (Figure 4d).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"levels",
"of",
"NF-κB",
"were",
"decreased",
"after",
"2",
"and",
"6",
"h",
"of",
"treatment",
"with",
"the",
"nanoplatform",
",",
"suggesting",
"that",
"at",
"these",
"time",
"points",
",",
"senescent",
"skin",
"cancer",
"cells",
"can",
"not",
"be",
"protected",
"against",
"nanoplatform-mediated",
"apoptosis",
"by",
"NF-κB",
"transcriptional",
"activity",
"(",
"Figure",
"4d",
")",
"."
]
}
] |
PMC11684821
|
We compared how Donor 216T and 192D CD8 T cells transduced with the MC.7.G5 TCR ± TCR replacement and the MC.7.G5 T cell clone recognized the MR1*01/*02 breast cancer cell line MCF-7 using TNF as a readout.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"compared",
"how",
"Donor",
"216",
"T",
"and",
"192D",
"CD8",
"T",
"cells",
"transduced",
"with",
"the",
"MC.7.G5",
"TCR",
"±",
"TCR",
"replacement",
"and",
"the",
"MC.7.G5",
"T",
"cell",
"clone",
"recognized",
"the",
"MR1",
"*",
"01/*02",
"breast",
"cancer",
"cell",
"line",
"MCF-7",
"using",
"TNF",
"as",
"a",
"readout",
"."
]
}
] |
PMC11507371
|
However, the exact mode of action seems to be dose-dependent and cell-type specific and needs further thorough investigations .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"the",
"exact",
"mode",
"of",
"action",
"seems",
"to",
"be",
"dose-dependent",
"and",
"cell-type",
"specific",
"and",
"needs",
"further",
"thorough",
"investigations",
"."
]
}
] |
PMC11721295
|
This may provide insight into the efficacy of combining immune checkpoint inhibitor (ICI) therapies with KRAS inhibitors.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"may",
"provide",
"insight",
"into",
"the",
"efficacy",
"of",
"combining",
"immune",
"checkpoint",
"inhibitor",
"(",
"ICI",
")",
"therapies",
"with",
"KRAS",
"inhibitors",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Although some pts in VC2 received upfront 2GTKIs, the CCPS should further be tested especially in cases receiving 2GTKIs in the first-line setting.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Although",
"some",
"pts",
"in",
"VC2",
"received",
"upfront",
"2GTKIs",
",",
"the",
"CCPS",
"should",
"further",
"be",
"tested",
"especially",
"in",
"cases",
"receiving",
"2GTKIs",
"in",
"the",
"first-line",
"setting",
"."
]
}
] |
PMC11612315
|
Like GLP-1, both CAP-induced TRPV1 inward currents and Ca responses were decreased by 85% and 90.6%, respectively (Fig. 3b, c).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Like",
"GLP-1",
",",
"both",
"CAP-induced",
"TRPV1",
"inward",
"currents",
"and",
"Ca",
"responses",
"were",
"decreased",
"by",
"85",
"%",
"and",
"90.6",
"%",
",",
"respectively",
"(",
"Fig.",
"3b",
",",
"c",
")",
"."
]
}
] |
PMC6487404
|
The optimal mobile phase for REG was a mixture of acetonitrile and phosphate buffer 0.02 M (60:40 V/V) delivered at a flow rate of 1 mL/min.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O"
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"."
]
}
] |
PMC2193049
|
Purification and biochemical characterization of peptides naturally associated with defined MHC class I alleles led to the discovery that these peptides are of relatively homogenous length (8–10 amino acids) and carry conserved amino acid residues at certain positions.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"and",
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"amino",
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"certain",
"positions",
"."
]
}
] |
PMC9454852
|
The activity of caspase-8 was assessed with the Caspase-8 Detection Kit (FITC-IETD-FMK) according to the manufacturer’s instruction.
|
[
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"."
]
}
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PMC8427838
|
The captured proteins were released and resolved on SDS-PAGE followed by Western blotting using an anti-GFP antibody.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"."
]
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] |
PMC11683240
|
On the other hand, mutations in cluster two always led to the destabilization of the complex.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"of",
"the",
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"."
]
}
] |
PMC10847511
|
Among 14 PARP inhibitor assays, none showed a significant difference between the two groups.
|
[
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"O",
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"O",
"O",
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"."
]
}
] |
PMC6487404
|
Some research groups have suggested that a log p value of at least 2.92, an 18-atom-long/longer molecular axis, a molecular weight of less than 800, and the presence of at least one basic nitrogen atom are common characteristics of the P-gp-substrates (30).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"of",
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"P-gp-substrates",
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"30",
")",
"."
]
}
] |
PMC9910796
|
As illustrated in Fig 3A and quantified in Fig 3B, defective vEP84Ri particles produced under non-permissive conditions contained greatly reduced levels of pE84R as well as the core shell components pp220/p150 and pp62/p35.
|
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"pp220/p150",
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"pp62/p35",
"."
]
}
] |
PMC8662250
|
In the present study, we demonstrated such a theory showing that the SARS‐CoV‐2 SP was able to cause direct damage in Caco‐2 epithelial cells in vitro.
|
[
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"B-CellLine",
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"Caco‐2",
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"."
]
}
] |
PMC11506827
|
Treatment with GEF or TRAIL alone marginally increased apoptosis.
|
[
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"TRAIL",
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"."
]
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] |
PMC10253553
|
Sample spots were then probed with antibodies by a tyramide-based signal amplification approach and visualized by a DAB colorimetric reaction to produce stained slides.
|
[
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]
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] |
PMC11733919
|
The senolysis-promoting concentration (100 nM) of 17-AAG and 17-DMAG decreased the metabolic activity of A431 cells to 73 and 65% of control levels, respectively, whereas the metabolic activity of BJ and WI-38 fibroblasts was not affected (Figure 3a).
|
[
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"B-CellLine",
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"Figure",
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"."
]
}
] |
PMC11412721
|
Survival curves of patients from dataset #GSE181063, for the 30% patients with the highest ACKR4 mRNA levels and the 30% patients with the lowest ACKR4 mRNA levels, classified according to sex (n = cohort sizes), and diagnosed with either a diffuse large B-cell (top) or a Burkitt (bottom) lymphoma. (
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"%",
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"the",
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"=",
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"bottom",
")",
"lymphoma",
".",
"("
]
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] |
PMC10996034
|
Finally, the cell crawls were washed three times with PBS, and blocked with an anti-fluorescence quencher.
|
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] |
PMC10631132
|
Similar observations were made between multiple experiments.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"Similar",
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"between",
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"experiments",
"."
]
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] |
PMC9164404
|
In order to assess the potential toxicity of Abplatin, histology analysis was performed on major organs including heart, spleen, liver, kidney, and lung.
|
[
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"O",
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"O",
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"liver",
",",
"kidney",
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"and",
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"."
]
}
] |
PMC6901583
|
7BRD4-upregulated CCL2 activates TAMs.a Representative images of GIST tissues with high or low levels of CD68-positive cells in the intratumoral tissues with different BRD4 expression levels.
|
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"O",
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"different",
"BRD4",
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]
}
] |
PMC11795610
|
Involucrin mRNA.
|
[
{
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"O"
],
"tokens": [
"Involucrin",
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"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.