Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11429241
In addition, more sophisticated hydrogels with bioactive molecules will improve the personalized usage of scaffolds for various research purposes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "more", "sophisticated", "hydrogels", "with", "bioactive", "molecules", "will", "improve", "the", "personalized", "usage", "of", "scaffolds", "for", "various", "research", "purposes", "." ] } ]
PMC11697703
ANOVA-Tukey, p values are presented as follows; ∗p < 0.05, ∗∗p < 0.01.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ANOVA-Tukey", ",", "p", "values", "are", "presented", "as", "follows", ";", "∗p", "<", "0.05", ",", "∗∗p", "<", "0.01", "." ] } ]
PMC9429973
The relapse rate was 29% of all patients in remission; 4% for LR group, 39% for AR1 group, 18% for AR2 group and 39% for VHR group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "relapse", "rate", "was", "29", "%", "of", "all", "patients", "in", "remission", ";", "4", "%", "for", "LR", "group", ",", "39", "%", "for", "AR1", "group", ",", "18", "%", "for", "AR2", "group", "and", "39", "%", "for", "VHR", "group", "." ] } ]
PMC9429973
L-MT group received lenalidomide as 25mg every other day or 10mg daily, on days 1–21 in a 28-day cycle.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "L-MT", "group", "received", "lenalidomide", "as", "25", "mg", "every", "other", "day", "or", "10", "mg", "daily", ",", "on", "days", "1–21", "in", "a", "28-day", "cycle", "." ] } ]
PMC10988555
NMR spectra were recorded in acetone-d6 at probe temperature using a Bruker Avance 400 spectrometer on 400.13 MHz (H NMR), 100.62 MHz (APT-C NMR) or 161.97 (P NMR).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "NMR", "spectra", "were", "recorded", "in", "acetone-d6", "at", "probe", "temperature", "using", "a", "Bruker", "Avance", "400", "spectrometer", "on", "400.13", "MHz", "(", "H", "NMR", ")", ",", "100.62", "MHz", "(", "APT-C", "NMR", ")", "or", "161.97", "(", "P", "NMR", ")", "." ] } ]
PMC3019555
The 1A9/2MRC cells acquired a different β-tubulin mutation (Vβ236I) that impairs 2ME2 binding and renders these cells >80-fold resistant to 2ME2 (Escuin et al., 2009).
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "1A9/2MRC", "cells", "acquired", "a", "different", "β-tubulin", "mutation", "(", "Vβ236I", ")", "that", "impairs", "2ME2", "binding", "and", "renders", "these", "cells", ">", "80-fold", "resistant", "to", "2ME2", "(", "Escuin", "et", "al.", ",", "2009", ")", "." ] } ]
PMC11787355
U87 TMG cell line was generated by transfection with pMXs-IRES-PuroR plasmid encoding TMG as illustrated in Supplementary Fig. 4a.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "U87", "TMG", "cell", "line", "was", "generated", "by", "transfection", "with", "pMXs-IRES-PuroR", "plasmid", "encoding", "TMG", "as", "illustrated", "in", "Supplementary", "Fig.", "4a", "." ] } ]
PMC11243198
In C3HT101/2 cells, one of the compounds, BAS 07019774 (a p-phenylenediamine), significantly reduced Gli1 mRNA at both 48 and 96 h. In contrast, Z27610715 was ineffective at 48 h but potent at 96 h, while GANT61 appeared to be more effective in inhibiting Gli1 mRNA expression at 48 h rather than at 96 h (Figure 4), suggesting differing stabilities or solubilities amongst these compounds.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "C3HT101/2", "cells", ",", "one", "of", "the", "compounds", ",", "BAS", "07019774", "(", "a", "p-phenylenediamine", ")", ",", "significantly", "reduced", "Gli1", "mRNA", "at", "both", "48", "and", "96", "h.", "In", "contrast", ",", "Z27610715", "was", "ineffective", "at", "48", "h", "but", "potent", "at", "96", "h", ",", "while", "GANT61", "appeared", "to", "be", "more", "effective", "in", "inhibiting", "Gli1", "mRNA", "expression", "at", "48", "h", "rather", "than", "at", "96", "h", "(", "Figure", "4", ")", ",", "suggesting", "differing", "stabilities", "or", "solubilities", "amongst", "these", "compounds", "." ] } ]
PMC9429973
Pts received up to 6 cycles of AN+AD (consisting of BV 1.2 mg/kg, nivolumab 240 mg, doxorubicin 25 mg/m, and dacarbazine 375 mg/m).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pts", "received", "up", "to", "6", "cycles", "of", "AN+AD", "(", "consisting", "of", "BV", "1.2", "mg/kg", ",", "nivolumab", "240", "mg", ",", "doxorubicin", "25", "mg/m", ",", "and", "dacarbazine", "375", "mg/m", ")", "." ] } ]
PMC11794847
LT Living Image 4.3 was used to the relative fluorescence intensity which indicated the tumor burden.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "LT", "Living", "Image", "4.3", "was", "used", "to", "the", "relative", "fluorescence", "intensity", "which", "indicated", "the", "tumor", "burden", "." ] } ]
PMC11265931
After 18 h, cells were fixed, and Click-iT Plus TUNEL assay for in situ apoptosis detection protocol was used in order to detect apoptotic cells with the dye DAPI for the nucleus.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "18", "h", ",", "cells", "were", "fixed", ",", "and", "Click-iT", "Plus", "TUNEL", "assay", "for", "in", "situ", "apoptosis", "detection", "protocol", "was", "used", "in", "order", "to", "detect", "apoptotic", "cells", "with", "the", "dye", "DAPI", "for", "the", "nucleus", "." ] } ]
PMC9429973
Intraclonal diversification was assessed through graph networks of all distinct nucleotide variants of each clonotype.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Intraclonal", "diversification", "was", "assessed", "through", "graph", "networks", "of", "all", "distinct", "nucleotide", "variants", "of", "each", "clonotype", "." ] } ]
PMC7153288
Streptomyces sp. SS1-1 was isolated from the stem of Catharanthus roseus using the protocol of Qin et al. with small modifications.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Streptomyces", "sp.", "SS1", "-", "1", "was", "isolated", "from", "the", "stem", "of", "Catharanthus", "roseus", "using", "the", "protocol", "of", "Qin", "et", "al.", "with", "small", "modifications", "." ] } ]
PMC11739696
Moreover, quantitative Real-Time PCR (qRT-PCR) was employed to quantify apoptotic gene expression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "quantitative", "Real-Time", "PCR", "(", "qRT-PCR", ")", "was", "employed", "to", "quantify", "apoptotic", "gene", "expression", "." ] } ]
PMC7369657
The absorbance was recorded at 450 nm using a multifunction microplate reader (SYNGENE, Cambridge, UK).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "absorbance", "was", "recorded", "at", "450", "nm", "using", "a", "multifunction", "microplate", "reader", "(", "SYNGENE", ",", "Cambridge", ",", "UK", ")", "." ] } ]
PMC10809689
A Freeze dryer (National Appliance Company, Germany) was used to lyophilize control, PMA, and Gal-9 groups cell culture supernatants of each cell line.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "Freeze", "dryer", "(", "National", "Appliance", "Company", ",", "Germany", ")", "was", "used", "to", "lyophilize", "control", ",", "PMA", ",", "and", "Gal-9", "groups", "cell", "culture", "supernatants", "of", "each", "cell", "line", "." ] } ]
PMC11365427
The workflows are shown in Fig. 1A.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "workflows", "are", "shown", "in", "Fig.", "1A", "." ] } ]
PMC11697703
ANOVA-Tukey was used to determine significant differences for Sholl analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ANOVA-Tukey", "was", "used", "to", "determine", "significant", "differences", "for", "Sholl", "analysis", "." ] } ]
PMC9429973
A. Hernández-Sánchez, Á. Villaverde-Ramiro, J. Martínez Elicegui, T. González, A. Benner, E. Sträng, G. Castellani, C. A. Heckman, J. Versluis, M. Abáigar, M. Sobas, R. Azibeiro, L. Tur, P. J. Valk, K. H. Metzeler, R. Ayala, D. Dall’Olio, J. Tettero, J. Martínez-López, H. Dombret, M. Pratcorona, F. Damm, K. I. Mills, J. Mayer, C. Thiede, M. T. Voso, G. F. Sanz, F. Calado, K. Döhner, V. I. Gaidzik, M. Heuser, T. Haferlach, A. T. Turki, D. Reinhardt, R. Villoria Medina, M. van Speybroeck, R. Schulze-Rath, M. Barbus, J. E. Butler, J. M. Hernández Rivas, B. J. Huntly, G. J. Ossenkoppele, H. Döhner, L. Bullinger Hospital Universitario de Salamanca; Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL); Centro de Investigación del Cáncer (CIC), Salamanca, Spain; German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg; Charité Universitätsmedizin Berlin, Berlin, Germany; University of Bologna, Bologna, Italy; University of Helsinki; Institute for Molecular Medicine Finland, Helsinki, Finland; Erasmus University Medical Center Cancer Institute, Rotterdam, Netherlands; Wroclaw Medical University, Wroclaw, Poland; GMV Innovating Solutions, Valencia, Spain; University of Munich, Munich, Germany; Hospital Universitario; de Octubre, Madrid, Spain; Amsterdam University Medical Center, Amsterdam, Netherlands; EA3518 Leukemia Translational Laboratory, Paris, France; Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, Barcelona, Spain; Queens University Belfast, Belfast, United Kingdom; University Hospital Brnoand Masaryk University, Brno, Czechia; University of Technics Dresden Medical Dept.,
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "Hernández-Sánchez", ",", "Á.", "Villaverde-Ramiro", ",", "J.", "Martínez", "Elicegui", ",", "T.", "González", ",", "A.", "Benner", ",", "E.", "Sträng", ",", "G.", "Castellani", ",", "C.", "A.", "Heckman", ",", "J.", "Versluis", ",", "M.", "Abáigar", ",", "M.", "Sobas", ",", "R.", "Azibeiro", ",", "L.", "Tur", ",", "P.", "J.", "Valk", ",", "K.", "H.", "Metzeler", ",", "R.", "Ayala", ",", "D.", "Dall’Olio", ",", "J.", "Tettero", ",", "J.", "Martínez-López", ",", "H.", "Dombret", ",", "M.", "Pratcorona", ",", "F.", "Damm", ",", "K.", "I.", "Mills", ",", "J.", "Mayer", ",", "C.", "Thiede", ",", "M.", "T.", "Voso", ",", "G.", "F.", "Sanz", ",", "F.", "Calado", ",", "K.", "Döhner", ",", "V.", "I.", "Gaidzik", ",", "M.", "Heuser", ",", "T.", "Haferlach", ",", "A.", "T.", "Turki", ",", "D.", "Reinhardt", ",", "R.", "Villoria", "Medina", ",", "M.", "van", "Speybroeck", ",", "R.", "Schulze-Rath", ",", "M.", "Barbus", ",", "J.", "E.", "Butler", ",", "J.", "M.", "Hernández", "Rivas", ",", "B.", "J.", "Huntly", ",", "G.", "J.", "Ossenkoppele", ",", "H.", "Döhner", ",", "L.", "Bullinger", "Hospital", "Universitario", "de", "Salamanca", ";", "Instituto", "de", "Investigación", "Biomédica", "de", "Salamanca", "(", "IBSAL", ")", ";", "Centro", "de", "Investigación", "del", "Cáncer", "(", "CIC", ")", ",", "Salamanca", ",", "Spain", ";", "German", "Cancer", "Research", "Center", "(", "DKFZ", ")", ",", "Heidelberg", ";", "Charité", "Universitätsmedizin", "Berlin", ",", "Berlin", ",", "Germany", ";", "University", "of", "Bologna", ",", "Bologna", ",", "Italy", ";", "University", "of", "Helsinki", ";", "Institute", "for", "Molecular", "Medicine", "Finland", ",", "Helsinki", ",", "Finland", ";", "Erasmus", "University", "Medical", "Center", "Cancer", "Institute", ",", "Rotterdam", ",", "Netherlands", ";", "Wroclaw", "Medical", "University", ",", "Wroclaw", ",", "Poland", ";", "GMV", "Innovating", "Solutions", ",", "Valencia", ",", "Spain", ";", "University", "of", "Munich", ",", "Munich", ",", "Germany", ";", "Hospital", "Universitario", ";", "de", "Octubre", ",", "Madrid", ",", "Spain", ";", "Amsterdam", "University", "Medical", "Center", ",", "Amsterdam", ",", "Netherlands", ";", "EA3518", "Leukemia", "Translational", "Laboratory", ",", "Paris", ",", "France", ";", "Hospital", "de", "la", "Santa", "Creu", "i", "Sant", "Pau", ",", "Barcelona", ",", "Spain", ";", "Queens", "University", "Belfast", ",", "Belfast", ",", "United", "Kingdom", ";", "University", "Hospital", "Brnoand", "Masaryk", "University", ",", "Brno", ",", "Czechia", ";", "University", "of", "Technics", "Dresden", "Medical", "Dept", ".", "," ] } ]
PMC9429973
At the time of hospitalization the most of the patients admitted had first- or second-degree pulmonary lesions (28 and 35%, respectively), while 31% of patients performed more severe lesions and the other 6% had no pulmonary damage detected, but they had a positive PCR.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "the", "time", "of", "hospitalization", "the", "most", "of", "the", "patients", "admitted", "had", "first-", "or", "second-degree", "pulmonary", "lesions", "(", "28", "and", "35", "%", ",", "respectively", ")", ",", "while", "31", "%", "of", "patients", "performed", "more", "severe", "lesions", "and", "the", "other", "6", "%", "had", "no", "pulmonary", "damage", "detected", ",", "but", "they", "had", "a", "positive", "PCR", "." ] } ]
PMC11474209
Table 3).Table 3depicts the different advanced biosensors for detecting MC-LR in a water sample and the detection limit.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Table", "3).Table", "3depicts", "the", "different", "advanced", "biosensors", "for", "detecting", "MC-LR", "in", "a", "water", "sample", "and", "the", "detection", "limit", "." ] } ]
PMC7338939
The following data were presented as mean ± SD and analyzed by one-way ANOVA and T-test and post-hoc Bonferroni to assess differences among means using Prism version 6 software and SPSS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "following", "data", "were", "presented", "as", "mean", "±", "SD", "and", "analyzed", "by", "one-way", "ANOVA", "and", "T-test", "and", "post-hoc", "Bonferroni", "to", "assess", "differences", "among", "means", "using", "Prism", "version", "6", "software", "and", "SPSS", "." ] } ]
PMC11335267
We found that fasting resulted in lower diffusion coefficients in the arcuate nucleus of wild type mice, but the arcuate nucleus of Alx3-deficient animals was unresponsive (Fig. 7D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "fasting", "resulted", "in", "lower", "diffusion", "coefficients", "in", "the", "arcuate", "nucleus", "of", "wild", "type", "mice", ",", "but", "the", "arcuate", "nucleus", "of", "Alx3-deficient", "animals", "was", "unresponsive", "(", "Fig.", "7D", ")", "." ] } ]
PMC9368503
Medium was replenished twice weekly.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Medium", "was", "replenished", "twice", "weekly", "." ] } ]
PMC10452486
Not only should HLA typing be known of patients for developing personalized immunotherapy, but a consideration of the immunogenicity and antigenicity of homo- and heterodimers is also potentially critical.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Not", "only", "should", "HLA", "typing", "be", "known", "of", "patients", "for", "developing", "personalized", "immunotherapy", ",", "but", "a", "consideration", "of", "the", "immunogenicity", "and", "antigenicity", "of", "homo-", "and", "heterodimers", "is", "also", "potentially", "critical", "." ] } ]
PMC9429973
Only 1 patient was able to proceed to alloHSCT.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Only", "1", "patient", "was", "able", "to", "proceed", "to", "alloHSCT", "." ] } ]
PMC8526701
BRD9 also identifies butyryl lysine; however, its exact role in epigenetic modification still needs to be explored further .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "BRD9", "also", "identifies", "butyryl", "lysine", ";", "however", ",", "its", "exact", "role", "in", "epigenetic", "modification", "still", "needs", "to", "be", "explored", "further", "." ] } ]
PMC11697703
For control experiments, a similar plasmid was used to drive expression of GFP and a scrambled control microRNA (scrambled control).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "control", "experiments", ",", "a", "similar", "plasmid", "was", "used", "to", "drive", "expression", "of", "GFP", "and", "a", "scrambled", "control", "microRNA", "(", "scrambled", "control", ")", "." ] } ]
PMC11204465
Another important enzyme, HypC, oxidises an intermediate to produce anthraquinone orthoformate (NA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Another", "important", "enzyme", ",", "HypC", ",", "oxidises", "an", "intermediate", "to", "produce", "anthraquinone", "orthoformate", "(", "NA", ")", "." ] } ]
PMC11626627
Validation of the effects of ERβ and TWIST1 was performed using Western blotting (G) and qRT-PCR (H) in 786-O cells transfected with pWPI, oe-ERβ, sh-TWIST1#1, and oe-ERβ+sh-TWIST1#1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Validation", "of", "the", "effects", "of", "ERβ", "and", "TWIST1", "was", "performed", "using", "Western", "blotting", "(", "G", ")", "and", "qRT-PCR", "(", "H", ")", "in", "786-O", "cells", "transfected", "with", "pWPI", ",", "oe-ERβ", ",", "sh-TWIST1#1", ",", "and", "oe-ERβ+sh-TWIST1#1", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: Baseline parameters collected included patient and disease demographics including bone marrow findings, as well as treatment protocols, and complications arising from treatment or relapse.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "Baseline", "parameters", "collected", "included", "patient", "and", "disease", "demographics", "including", "bone", "marrow", "findings", ",", "as", "well", "as", "treatment", "protocols", ",", "and", "complications", "arising", "from", "treatment", "or", "relapse", "." ] } ]
PMC6222635
The molecular weight of the PPFs was determined by high performance gel permeation chromatography (HPGPC) using a series of dextran standard references.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "molecular", "weight", "of", "the", "PPFs", "was", "determined", "by", "high", "performance", "gel", "permeation", "chromatography", "(", "HPGPC", ")", "using", "a", "series", "of", "dextran", "standard", "references", "." ] } ]
PMC11513011
All procedures in animal experiments were performed in accordance with the ethical standards for animal testing facilities and were conducted in compliance with ARRIVE guidelines and related guidelines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "procedures", "in", "animal", "experiments", "were", "performed", "in", "accordance", "with", "the", "ethical", "standards", "for", "animal", "testing", "facilities", "and", "were", "conducted", "in", "compliance", "with", "ARRIVE", "guidelines", "and", "related", "guidelines", "." ] } ]
PMC9429973
To check if the poor survival is not only due to these higher levels of association, we have decided to focus on patients harboring del(1p32) without the main high-risk (HR) CA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "check", "if", "the", "poor", "survival", "is", "not", "only", "due", "to", "these", "higher", "levels", "of", "association", ",", "we", "have", "decided", "to", "focus", "on", "patients", "harboring", "del(1p32", ")", "without", "the", "main", "high-risk", "(", "HR", ")", "CA", "." ] } ]
PMC11632064
DESeq2 version 1.30.1 (Love et al, 2014) was used to normalize gene read counts.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DESeq2", "version", "1.30.1", "(", "Love", "et", "al", ",", "2014", ")", "was", "used", "to", "normalize", "gene", "read", "counts", "." ] } ]
PMC7823217
Recent investigation suggested that the gene alterations during bioprinting are evident demonstrated by changes in the expression of LUCAT1, IL6, CCL26, and NRN1L genes and phosphorylation of critical oncogenic drug resistance pathways in breast cancer cells in thermal bioprinted constructs .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Recent", "investigation", "suggested", "that", "the", "gene", "alterations", "during", "bioprinting", "are", "evident", "demonstrated", "by", "changes", "in", "the", "expression", "of", "LUCAT1", ",", "IL6", ",", "CCL26", ",", "and", "NRN1L", "genes", "and", "phosphorylation", "of", "critical", "oncogenic", "drug", "resistance", "pathways", "in", "breast", "cancer", "cells", "in", "thermal", "bioprinted", "constructs", "." ] } ]
PMC11095939
In quiescent cells, Mecp2 is maintained at relative high levels and serves as both a transcriptional activator and repressor.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "quiescent", "cells", ",", "Mecp2", "is", "maintained", "at", "relative", "high", "levels", "and", "serves", "as", "both", "a", "transcriptional", "activator", "and", "repressor", "." ] } ]
PMC11803149
On day 20, Tim3 expression inf CD8GFP OT-I TCR-T cells (gating strategy is shown in Supplementary Figure S3B ) in tumors was analyzed using flow cytometry.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "day", "20", ",", "Tim3", "expression", "inf", "CD8GFP", "OT-I", "TCR-T", "cells", "(", "gating", "strategy", "is", "shown", "in", "Supplementary", "Figure", "S3B", ")", "in", "tumors", "was", "analyzed", "using", "flow", "cytometry", "." ] } ]
PMC11610461
Immunohistochemical experimental results were analyzed using SPSS 20.0 software.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Immunohistochemical", "experimental", "results", "were", "analyzed", "using", "SPSS", "20.0", "software", "." ] } ]
PMC10965315
The impact of harmaline on the invasion of A2780 ovarian cancer cells was evaluated by treating the cells with 37.5 and 75 μM of harmaline for 24 h in media containing serum. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "impact", "of", "harmaline", "on", "the", "invasion", "of", "A2780", "ovarian", "cancer", "cells", "was", "evaluated", "by", "treating", "the", "cells", "with", "37.5", "and", "75", "μM", "of", "harmaline", "for", "24", "h", "in", "media", "containing", "serum", ".", "(" ] } ]
PMC9509578
Genetic and environmental factors are the main causes of tumor heterogeneity and progression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Genetic", "and", "environmental", "factors", "are", "the", "main", "causes", "of", "tumor", "heterogeneity", "and", "progression", "." ] } ]
PMC9429973
GBT021601 is a next-generation HbS polymerization inhibitor with improved pharmacokinetic (PK) properties that stabilizes Hb in the oxygenated state, thus inhibiting polymerization.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GBT021601", "is", "a", "next-generation", "HbS", "polymerization", "inhibitor", "with", "improved", "pharmacokinetic", "(", "PK", ")", "properties", "that", "stabilizes", "Hb", "in", "the", "oxygenated", "state", ",", "thus", "inhibiting", "polymerization", "." ] } ]
PMC11049548
The intracellular levels of taurine and, to a lesser extent, glutathione are also greatly increased in A2780cis with respect to A2780, HGSOC_T, and HGSOC_A cells, which instead are very similar to each other (Figure 3C and Figure 5).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "intracellular", "levels", "of", "taurine", "and", ",", "to", "a", "lesser", "extent", ",", "glutathione", "are", "also", "greatly", "increased", "in", "A2780cis", "with", "respect", "to", "A2780", ",", "HGSOC_T", ",", "and", "HGSOC_A", "cells", ",", "which", "instead", "are", "very", "similar", "to", "each", "other", "(", "Figure", "3C", "and", "Figure", "5", ")", "." ] } ]
PMC11085211
The flow rate was 20 mL/min, and the run length was 70 min.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "flow", "rate", "was", "20", "mL/min", ",", "and", "the", "run", "length", "was", "70", "min", "." ] } ]
PMC10850553
In IA lesions, C5a can be produced via cleavage by Plasmin in the coagulation-fibrinolysis pathway.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "IA", "lesions", ",", "C5a", "can", "be", "produced", "via", "cleavage", "by", "Plasmin", "in", "the", "coagulation-fibrinolysis", "pathway", "." ] } ]
PMC11767725
Hyperglycemia and altered lipid metabolism in metabolic disorders exacerbate S. aureus colonization by providing an environment rich in nutrients and substrates, including glucose and free fatty acids.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hyperglycemia", "and", "altered", "lipid", "metabolism", "in", "metabolic", "disorders", "exacerbate", "S.", "aureus", "colonization", "by", "providing", "an", "environment", "rich", "in", "nutrients", "and", "substrates", ",", "including", "glucose", "and", "free", "fatty", "acids", "." ] } ]
PMC3164356
In addition to HSV, other viruses, such as pseudorabies virus, are blocked from infecting CHO cells at the level of viral penetration.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "HSV", ",", "other", "viruses", ",", "such", "as", "pseudorabies", "virus", ",", "are", "blocked", "from", "infecting", "CHO", "cells", "at", "the", "level", "of", "viral", "penetration", "." ] } ]
PMC9429973
The prognostic significance of persistent NGS or LC-MS patients cannot be determined at this time and requires longer follow-up.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "prognostic", "significance", "of", "persistent", "NGS", "or", "LC-MS", "patients", "can", "not", "be", "determined", "at", "this", "time", "and", "requires", "longer", "follow-up", "." ] } ]
PMC7724160
Researchers interested in developing consistently productive CHO cell lines will benefit from these data.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Researchers", "interested", "in", "developing", "consistently", "productive", "CHO", "cell", "lines", "will", "benefit", "from", "these", "data", "." ] } ]
PMC11531744
GO analysis was performed to detect biological processes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GO", "analysis", "was", "performed", "to", "detect", "biological", "processes", "." ] } ]
PMC9429973
Cryopreservation duration >3 months did not alter the predictive value of cryotubes (PPV=71%, NPV=68%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cryopreservation", "duration", ">", "3", "months", "did", "not", "alter", "the", "predictive", "value", "of", "cryotubes", "(", "PPV=71", "%", ",", "NPV=68", "%", ")", "." ] } ]
PMC11683240
In addition, due to its natural function as acute phase protein in humans, signaling mechanisms of systemic or local upregulation of α1AT expression are well described in the context of inflammation, while downregulation of α1AT expression is poorly understood (53).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "due", "to", "its", "natural", "function", "as", "acute", "phase", "protein", "in", "humans", ",", "signaling", "mechanisms", "of", "systemic", "or", "local", "upregulation", "of", "α1AT", "expression", "are", "well", "described", "in", "the", "context", "of", "inflammation", ",", "while", "downregulation", "of", "α1AT", "expression", "is", "poorly", "understood", "(", "53", ")", "." ] } ]
PMC11098378
However, when E1 was removed from these in vitro reactions, these higher molecular weight species were not detected, as expected (Fig 5A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "when", "E1", "was", "removed", "from", "these", "in", "vitro", "reactions", ",", "these", "higher", "molecular", "weight", "species", "were", "not", "detected", ",", "as", "expected", "(", "Fig", "5A", ")", "." ] } ]
PMC11513011
The titers of Cleaved-Caspase-3 and E-cadherin was each 1:400 dilution and amount of 150µL diluted 1st antibody was submitted.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "titers", "of", "Cleaved-Caspase-3", "and", "E-cadherin", "was", "each", "1:400", "dilution", "and", "amount", "of", "150µL", "diluted", "1st", "antibody", "was", "submitted", "." ] } ]
PMC9080589
The Wnt/β-catenin signaling pathway plays a critical role in regulating proliferation, survival, metastasis and apoptosis of cancer cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Wnt/β-catenin", "signaling", "pathway", "plays", "a", "critical", "role", "in", "regulating", "proliferation", ",", "survival", ",", "metastasis", "and", "apoptosis", "of", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC4369959
This antihepatocarcinogenic effect of zerumbone was found to be associated with suppression of PCNA and inhibition of a number of apoptotic liver cells by increased Bax and decreased Bcl-2 protein expression .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "antihepatocarcinogenic", "effect", "of", "zerumbone", "was", "found", "to", "be", "associated", "with", "suppression", "of", "PCNA", "and", "inhibition", "of", "a", "number", "of", "apoptotic", "liver", "cells", "by", "increased", "Bax", "and", "decreased", "Bcl-2", "protein", "expression", "." ] } ]
PMC10956161
In order to explore the impact of PRDX6 gene expression on survival time of patients with lung adenocarcinoma, Kaplan–Meier survival curve analyses were undertaken.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "order", "to", "explore", "the", "impact", "of", "PRDX6", "gene", "expression", "on", "survival", "time", "of", "patients", "with", "lung", "adenocarcinoma", ",", "Kaplan", "–", "Meier", "survival", "curve", "analyses", "were", "undertaken", "." ] } ]
PMC7917457
PeptiCRAd is a cancer vaccine platform combining OAd with polylysine-modified tumor antigens.13, 14, 15 PeptiCRAd-1 is a cancer vaccine that consists of VALO-D102 coated with human leukocyte antigen (HLA)-I epitopes from two known tumor antigens: the cancer-testis antigen NY-ESO-1 and human melanoma antigen MAGE-A3.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PeptiCRAd", "is", "a", "cancer", "vaccine", "platform", "combining", "OAd", "with", "polylysine-modified", "tumor", "antigens.13", ",", "14", ",", "15", "PeptiCRAd-1", "is", "a", "cancer", "vaccine", "that", "consists", "of", "VALO-D102", "coated", "with", "human", "leukocyte", "antigen", "(HLA)-I", "epitopes", "from", "two", "known", "tumor", "antigens", ":", "the", "cancer-testis", "antigen", "NY-ESO-1", "and", "human", "melanoma", "antigen", "MAGE-A3", "." ] } ]
PMC10958426
Wilcoxon Rank-Sum Test (paired samples) was used to test whether the coefficient of variations between two cell types/subtypes were significantly different.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Wilcoxon", "Rank-Sum", "Test", "(", "paired", "samples", ")", "was", "used", "to", "test", "whether", "the", "coefficient", "of", "variations", "between", "two", "cell", "types/subtypes", "were", "significantly", "different", "." ] } ]
PMC11381192
Correlations of five cell stress‐related indexes were visualised using ‘circlize’ R package.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Correlations", "of", "five", "cell", "stress‐related", "indexes", "were", "visualised", "using", "‘", "circlize", "’", "R", "package", "." ] } ]
PMC11785489
Thus, we hypothesized that TCR-mem sequence features promote T cell activation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "we", "hypothesized", "that", "TCR-mem", "sequence", "features", "promote", "T", "cell", "activation", "." ] } ]
PMC10968586
Treatment with 555 μM OLE strongly increased the expression of miRNAs inhibiting tumor growth: miR-181b, miR-137, and Let-7d.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Treatment", "with", "555", "μM", "OLE", "strongly", "increased", "the", "expression", "of", "miRNAs", "inhibiting", "tumor", "growth", ":", "miR-181b", ",", "miR-137", ",", "and", "Let-7d", "." ] } ]
PMC6461034
Dilute the reduced and alkylated lysate fourfold to reduce the urea concentration to 2 M while maintaining a 20 mM HEPES pH 8.0 concentration in the diluted lysate.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Dilute", "the", "reduced", "and", "alkylated", "lysate", "fourfold", "to", "reduce", "the", "urea", "concentration", "to", "2", "M", "while", "maintaining", "a", "20", "mM", "HEPES", "pH", "8.0", "concentration", "in", "the", "diluted", "lysate", "." ] } ]
PMC9429973
Several researchers have explored this issue and the conclusions are inconsistent in different studies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Several", "researchers", "have", "explored", "this", "issue", "and", "the", "conclusions", "are", "inconsistent", "in", "different", "studies", "." ] } ]
PMC6803987
After TLC detection, the same components were combined to obtain Fr.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "TLC", "detection", ",", "the", "same", "components", "were", "combined", "to", "obtain", "Fr", "." ] } ]
PMC9429973
While we observed no changes of cellular cluster organisation 2 days after TPO injection, we found some differentially expressed genes in TPO-stimulated cycling iMLL-AF9 HSPC, including potential stemness regulators.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "we", "observed", "no", "changes", "of", "cellular", "cluster", "organisation", "2", "days", "after", "TPO", "injection", ",", "we", "found", "some", "differentially", "expressed", "genes", "in", "TPO-stimulated", "cycling", "iMLL-AF9", "HSPC", ",", "including", "potential", "stemness", "regulators", "." ] } ]
PMC8873393
Furthermore, the distribution of non-coding RNAs is not affected by UV-induced DNA damage (Fig. 5B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "the", "distribution", "of", "non-coding", "RNAs", "is", "not", "affected", "by", "UV-induced", "DNA", "damage", "(", "Fig.", "5B", ")", "." ] } ]
PMC11711871
Although wild-type rats exhibited an increased response to DEA/NO under HSD compared to NSD conditions, no change was observed in GR rats.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "wild-type", "rats", "exhibited", "an", "increased", "response", "to", "DEA/NO", "under", "HSD", "compared", "to", "NSD", "conditions", ",", "no", "change", "was", "observed", "in", "GR", "rats", "." ] } ]
PMC11297139
By employing PONDR and PLAAC amino acid sequence-based analysis, we observed that ARID1A possesses two ordered domains including the ARID domain and the Pfam homology domain and two DDs including PrLD1, and PrLD2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "employing", "PONDR", "and", "PLAAC", "amino", "acid", "sequence-based", "analysis", ",", "we", "observed", "that", "ARID1A", "possesses", "two", "ordered", "domains", "including", "the", "ARID", "domain", "and", "the", "Pfam", "homology", "domain", "and", "two", "DDs", "including", "PrLD1", ",", "and", "PrLD2", "." ] } ]
PMC11727638
Hypoxia and HIF-1α upregulated under hypoxic conditions promote tumor cell survival and chemotherapy resistance in many malignancies .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hypoxia", "and", "HIF-1α", "upregulated", "under", "hypoxic", "conditions", "promote", "tumor", "cell", "survival", "and", "chemotherapy", "resistance", "in", "many", "malignancies", "." ] } ]
PMC9429973
In agranulocytosis, 93 cases were detected: E.coli without ESBL (n=32), E.coli ESBL (n=19).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "agranulocytosis", ",", "93", "cases", "were", "detected", ":", "E.coli", "without", "ESBL", "(", "n=32", ")", ",", "E.coli", "ESBL", "(", "n=19", ")", "." ] } ]
PMC10978090
Anticoagulation with argatroban was initiated with a target anti-IIa activity between 0.8 and 1.2 µg/mL. HIT was later confirmed by HIPA ( Table 1 ).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Anticoagulation", "with", "argatroban", "was", "initiated", "with", "a", "target", "anti-IIa", "activity", "between", "0.8", "and", "1.2", "µg/mL.", "HIT", "was", "later", "confirmed", "by", "HIPA", "(", "Table", "1", ")", "." ] } ]
PMC9429973
P. Bröckelmann, I. Bühnen, J. Zijlstra, A. Fossa, J. Meissner, S. Mathas, J. Rosenbrock, C. Kobe, M. Fuchs, A. Plütschow, S. Marnitz, P. Borchmann, A. Engert, C. Baues Department I of Internal Medicine, Center for Integrated Oncology Aachen Bonn Cologne Duesseldorf (CIO ABCD), University Hospital of Cologne; Max Planck Institute for the Biology of Ageing; German Hodgkin Study Group (GHSG), University of Cologne; Mildred Scheel School of Oncology Aachen Bonn Cologne Düsseldorf (MSSO ABCD), Cologne, Germany; Amsterdam UMC, Department of Hematology, Cancer Center Amsterdam, Vrije Universiteit Amsterdam, Amsterdam, Netherlands; Department of Oncology, Oslo University Hospital, Oslo, Norway; Faculty of Medicine and University Hospital Heidelberg, Department V of Internal Medicine, University of Heidelberg, Heidelberg; Department of Hematology, Oncology and Tumor Immunology, Charité – Universitätsmedizin Berlin, and Experimental and Clinical Research Center (ECRC), Berlin; University Hospital Cologne, Department of Radiation Oncology and Cyberknife Center; Department of Nuclear Medicine; Department I of Internal Medicine, Center for Integrated Oncology Aachen Bonn Cologne Duesseldorf (CIO ABCD), University of Cologne, Faculty of Medicine, Cologne, Germany Background: Failure of anti-PD1 checkpoint blockade in relapsed or refractory Hodgkin lymphoma (r/r HL) constitutes an unmet medical need.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P.", "Bröckelmann", ",", "I.", "Bühnen", ",", "J.", "Zijlstra", ",", "A.", "Fossa", ",", "J.", "Meissner", ",", "S.", "Mathas", ",", "J.", "Rosenbrock", ",", "C.", "Kobe", ",", "M.", "Fuchs", ",", "A.", "Plütschow", ",", "S.", "Marnitz", ",", "P.", "Borchmann", ",", "A.", "Engert", ",", "C.", "Baues", "Department", "I", "of", "Internal", "Medicine", ",", "Center", "for", "Integrated", "Oncology", "Aachen", "Bonn", "Cologne", "Duesseldorf", "(", "CIO", "ABCD", ")", ",", "University", "Hospital", "of", "Cologne", ";", "Max", "Planck", "Institute", "for", "the", "Biology", "of", "Ageing", ";", "German", "Hodgkin", "Study", "Group", "(", "GHSG", ")", ",", "University", "of", "Cologne", ";", "Mildred", "Scheel", "School", "of", "Oncology", "Aachen", "Bonn", "Cologne", "Düsseldorf", "(", "MSSO", "ABCD", ")", ",", "Cologne", ",", "Germany", ";", "Amsterdam", "UMC", ",", "Department", "of", "Hematology", ",", "Cancer", "Center", "Amsterdam", ",", "Vrije", "Universiteit", "Amsterdam", ",", "Amsterdam", ",", "Netherlands", ";", "Department", "of", "Oncology", ",", "Oslo", "University", "Hospital", ",", "Oslo", ",", "Norway", ";", "Faculty", "of", "Medicine", "and", "University", "Hospital", "Heidelberg", ",", "Department", "V", "of", "Internal", "Medicine", ",", "University", "of", "Heidelberg", ",", "Heidelberg", ";", "Department", "of", "Hematology", ",", "Oncology", "and", "Tumor", "Immunology", ",", "Charité", "–", "Universitätsmedizin", "Berlin", ",", "and", "Experimental", "and", "Clinical", "Research", "Center", "(", "ECRC", ")", ",", "Berlin", ";", "University", "Hospital", "Cologne", ",", "Department", "of", "Radiation", "Oncology", "and", "Cyberknife", "Center", ";", "Department", "of", "Nuclear", "Medicine", ";", "Department", "I", "of", "Internal", "Medicine", ",", "Center", "for", "Integrated", "Oncology", "Aachen", "Bonn", "Cologne", "Duesseldorf", "(", "CIO", "ABCD", ")", ",", "University", "of", "Cologne", ",", "Faculty", "of", "Medicine", ",", "Cologne", ",", "Germany", "Background", ":", "Failure", "of", "anti-PD1", "checkpoint", "blockade", "in", "relapsed", "or", "refractory", "Hodgkin", "lymphoma", "(", "r/r", "HL", ")", "constitutes", "an", "unmet", "medical", "need", "." ] } ]
PMC11047729
In the study performed on the NALM-6 cells, 10 μM of constunolide was used, which caused the suppression of telomerase activity to 94%, 89%, 21%, and 2% after 1, 2, 4, and 6 h, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "study", "performed", "on", "the", "NALM-6", "cells", ",", "10", "μM", "of", "constunolide", "was", "used", ",", "which", "caused", "the", "suppression", "of", "telomerase", "activity", "to", "94", "%", ",", "89", "%", ",", "21", "%", ",", "and", "2", "%", "after", "1", ",", "2", ",", "4", ",", "and", "6", "h", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11612626
Protein samples for SDS-PAGE were prepared by adding NuPAGE lithium dodecyl sulfate sample buffer (Invitrogen, #NP0007) and NuPAGE sample reducing agent (#NP0009).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Protein", "samples", "for", "SDS-PAGE", "were", "prepared", "by", "adding", "NuPAGE", "lithium", "dodecyl", "sulfate", "sample", "buffer", "(", "Invitrogen", ",", "#", "NP0007", ")", "and", "NuPAGE", "sample", "reducing", "agent", "(", "#", "NP0009", ")", "." ] } ]
PMC11126803
Interaction prediction software (http://rtools.cbrc.jp/cgi-bin/RNARNA/index.pl) was used to predict the binding site between LncRNA-SERB and ESR2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interaction", "prediction", "software", "(", "http://rtools.cbrc.jp/cgi-bin/RNARNA/index.pl", ")", "was", "used", "to", "predict", "the", "binding", "site", "between", "LncRNA-SERB", "and", "ESR2", "." ] } ]
PMC10047551
Data were considered significant when the p-value/adjusted p-value < 0.05.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "were", "considered", "significant", "when", "the", "p-value/adjusted", "p-value", "<", "0.05", "." ] } ]
PMC8992508
P-gp/ABCB1/MDR1, a 170 kDa glycoprotein, was the first ABC efflux transporter found to be responsible for the sensitivity of cells to chemotherapeutic agents.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P-gp/ABCB1/MDR1", ",", "a", "170", "kDa", "glycoprotein", ",", "was", "the", "first", "ABC", "efflux", "transporter", "found", "to", "be", "responsible", "for", "the", "sensitivity", "of", "cells", "to", "chemotherapeutic", "agents", "." ] } ]
PMC11411131
Because of the difficulty of monitoring the induction of the truncated form of a construct as a MeHg sensor, we adopted a different strategy using a trans-repression factor.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Because", "of", "the", "difficulty", "of", "monitoring", "the", "induction", "of", "the", "truncated", "form", "of", "a", "construct", "as", "a", "MeHg", "sensor", ",", "we", "adopted", "a", "different", "strategy", "using", "a", "trans-repression", "factor", "." ] } ]
PMC7887261
Number of rare deleterious variants within the genes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Number", "of", "rare", "deleterious", "variants", "within", "the", "genes", "." ] } ]
PMC11637820
To analyze the discharge, the applied voltage and discharge current were respectively measured using a voltage probe (P6015A, Tektronix, 75 MHz bandwidth, USA) and a current probe (Tektronix P6021A Oscilloscope Probe 2 mA/mV).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "analyze", "the", "discharge", ",", "the", "applied", "voltage", "and", "discharge", "current", "were", "respectively", "measured", "using", "a", "voltage", "probe", "(", "P6015A", ",", "Tektronix", ",", "75", "MHz", "bandwidth", ",", "USA", ")", "and", "a", "current", "probe", "(", "Tektronix", "P6021A", "Oscilloscope", "Probe", "2", "mA/mV", ")", "." ] } ]
PMC11597167
DMSO was used as solvent control, and cell viability was recorded as 100%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DMSO", "was", "used", "as", "solvent", "control", ",", "and", "cell", "viability", "was", "recorded", "as", "100", "%", "." ] } ]
PMC11674834
Another bioactivation pathway occurs through oxidation to form quinone imines that can produce protein adducts by itself or oxidative DNA damage through reactive oxygens species (ROS) .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Another", "bioactivation", "pathway", "occurs", "through", "oxidation", "to", "form", "quinone", "imines", "that", "can", "produce", "protein", "adducts", "by", "itself", "or", "oxidative", "DNA", "damage", "through", "reactive", "oxygens", "species", "(", "ROS", ")", "." ] } ]
PMC2614415
Consistent with the higher level of expression of Aurora-A, and especially Aurora-B, the 1A9 cells (Figure 2A), were more sensitive than PTX10 cells to VE-465 inhibition treatment at doses of 50, 75, or 100 nM (compare Figures 3A and 3B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consistent", "with", "the", "higher", "level", "of", "expression", "of", "Aurora-A", ",", "and", "especially", "Aurora-B", ",", "the", "1A9", "cells", "(", "Figure", "2A", ")", ",", "were", "more", "sensitive", "than", "PTX10", "cells", "to", "VE-465", "inhibition", "treatment", "at", "doses", "of", "50", ",", "75", ",", "or", "100", "nM", "(", "compare", "Figures", "3A", "and", "3B", ")", "." ] } ]
PMC11657695
p < 0,05 and **: p < 0,01 (Mann–Whitney test) KEGG pathway analysis having revealed a Hippo signature (Fig. 5B), a signalling pathway known to be involved in the control of proliferation in many cancer cells such as bone sarcoma cells , the effects of KCNA2 expression silencing on the activation of this cascade were investigated next.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0,05", "and", "*", "*", ":", "p", "<", "0,01", "(", "Mann", "–", "Whitney", "test", ")", "KEGG", "pathway", "analysis", "having", "revealed", "a", "Hippo", "signature", "(", "Fig.", "5B", ")", ",", "a", "signalling", "pathway", "known", "to", "be", "involved", "in", "the", "control", "of", "proliferation", "in", "many", "cancer", "cells", "such", "as", "bone", "sarcoma", "cells", ",", "the", "effects", "of", "KCNA2", "expression", "silencing", "on", "the", "activation", "of", "this", "cascade", "were", "investigated", "next", "." ] } ]
PMC10705095
At low to moderate levels, they act as signal transducers that activate cell proliferation, migration, invasion, and angiogenesis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "low", "to", "moderate", "levels", ",", "they", "act", "as", "signal", "transducers", "that", "activate", "cell", "proliferation", ",", "migration", ",", "invasion", ",", "and", "angiogenesis", "." ] } ]
PMC11247842
We collected datasets from publicly available annotations for protein coding sequence and regulatory elements (Fig. 1) to postulate biological connections of association results from meta-analyses with CM and SCS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "collected", "datasets", "from", "publicly", "available", "annotations", "for", "protein", "coding", "sequence", "and", "regulatory", "elements", "(", "Fig.", "1", ")", "to", "postulate", "biological", "connections", "of", "association", "results", "from", "meta-analyses", "with", "CM", "and", "SCS", "." ] } ]
PMC10589262
Each group consisted of 5 mice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Each", "group", "consisted", "of", "5", "mice", "." ] } ]
PMC9844987
Our observations indicate that multiple configurations of accessible chromatin may exist for low variable promoters across single cells, which may cause stochastic TSS selection with no or only low impact on expression level.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "observations", "indicate", "that", "multiple", "configurations", "of", "accessible", "chromatin", "may", "exist", "for", "low", "variable", "promoters", "across", "single", "cells", ",", "which", "may", "cause", "stochastic", "TSS", "selection", "with", "no", "or", "only", "low", "impact", "on", "expression", "level", "." ] } ]
PMC11746942
D qRT‒PCR analysis of key psoriasis-associated inflammatory mediators (Il1b, S100a9, Il1a, and Il23) in the skin of WT, S1PR3-KO, IMQ-treated WT and S1PR3-KO mice (n = 4).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", "qRT‒PCR", "analysis", "of", "key", "psoriasis-associated", "inflammatory", "mediators", "(", "Il1b", ",", "S100a9", ",", "Il1a", ",", "and", "Il23", ")", "in", "the", "skin", "of", "WT", ",", "S1PR3-KO", ",", "IMQ-treated", "WT", "and", "S1PR3-KO", "mice", "(", "n", "=", "4", ")", "." ] } ]
PMC11707577
HSA‐TM bioconjugates were also tested as a non‐targeted control carrier.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HSA‐TM", "bioconjugates", "were", "also", "tested", "as", "a", "non‐targeted", "control", "carrier", "." ] } ]
PMC11047729
Epigallocatechin-3-gallate (EGCG) is the main polyphenol present in green tea.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Epigallocatechin-3-gallate", "(", "EGCG", ")", "is", "the", "main", "polyphenol", "present", "in", "green", "tea", "." ] } ]
PMC11200978
Treatment for NSCLC is dependent on the stage and includes surgery, radiation therapy, chemotherapy, targeted drug therapy, and immunotherapy, often in combination .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Treatment", "for", "NSCLC", "is", "dependent", "on", "the", "stage", "and", "includes", "surgery", ",", "radiation", "therapy", ",", "chemotherapy", ",", "targeted", "drug", "therapy", ",", "and", "immunotherapy", ",", "often", "in", "combination", "." ] } ]
PMC10135767
The typical time course of Kindlin-3 knockdown cells showed a significant weakening of calcium signaling (Figure 6D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "typical", "time", "course", "of", "Kindlin-3", "knockdown", "cells", "showed", "a", "significant", "weakening", "of", "calcium", "signaling", "(", "Figure", "6D", ")", "." ] } ]
PMC11540664
Tumor vascular abnormalities lead to hypoxia and acidosis in the tumor microenvironment, which causes immunosuppression through a variety of mechanisms, and anti-angiogenic can normalize the blood vessels around the tumor and improve the microenvironment, thereby promoting the effect of immunotherapy (4, 5).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Tumor", "vascular", "abnormalities", "lead", "to", "hypoxia", "and", "acidosis", "in", "the", "tumor", "microenvironment", ",", "which", "causes", "immunosuppression", "through", "a", "variety", "of", "mechanisms", ",", "and", "anti-angiogenic", "can", "normalize", "the", "blood", "vessels", "around", "the", "tumor", "and", "improve", "the", "microenvironment", ",", "thereby", "promoting", "the", "effect", "of", "immunotherapy", "(", "4", ",", "5", ")", "." ] } ]
PMC11798926
10.3.1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O" ], "tokens": [ "10.3.1", ")", "." ] } ]
PMC11772585
Cells were rinsed slowly with running water and different areas were selected for cell counting.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "rinsed", "slowly", "with", "running", "water", "and", "different", "areas", "were", "selected", "for", "cell", "counting", "." ] } ]
PMC11448304
c Clonogenic assay and bar chart of H1299 after si-EGFR, si-EGFR + WT-EGFR, siEGFR + K716R-EGFR under irradiation Validation of correlation between EGFR lysine 716 site Khib modification and NSCLC cells radioresistance.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "c", "Clonogenic", "assay", "and", "bar", "chart", "of", "H1299", "after", "si-EGFR", ",", "si-EGFR", "+", "WT-EGFR", ",", "siEGFR", "+", "K716R-EGFR", "under", "irradiation", "Validation", "of", "correlation", "between", "EGFR", "lysine", "716", "site", "Khib", "modification", "and", "NSCLC", "cells", "radioresistance", "." ] } ]
PMC11519077
Additionally, it was shown that the AD-MSC (5.12 ± 0.706; p < 0.001) and AD-CM (6.74 ± 0.637; p < 0.001) groups had significantly increased MCP-1 gene expression than the control.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "it", "was", "shown", "that", "the", "AD-MSC", "(", "5.12", "±", "0.706", ";", "p", "<", "0.001", ")", "and", "AD-CM", "(", "6.74", "±", "0.637", ";", "p", "<", "0.001", ")", "groups", "had", "significantly", "increased", "MCP-1", "gene", "expression", "than", "the", "control", "." ] } ]
PMC9429973
Axi-cel ([OR] = 13.1, 95% CI 3.98-43.3; p <0.001), ECOG ≥2 ([OR] = 0.04, 95% CI 1.007-4.38; p= 0.04) and higher s-EASIX score ([OR] = 1.35, 95% CI 1.08-1.67; p= 0.0067) increased the risk of developing grade 3+ ICANS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Axi-cel", "(", "[", "OR", "]", "=", "13.1", ",", "95", "%", "CI", "3.98", "-", "43.3", ";", "p", "<", "0.001", ")", ",", "ECOG", "≥2", "(", "[", "OR", "]", "=", "0.04", ",", "95", "%", "CI", "1.007", "-", "4.38", ";", "p=", "0.04", ")", "and", "higher", "s-EASIX", "score", "(", "[", "OR", "]", "=", "1.35", ",", "95", "%", "CI", "1.08", "-", "1.67", ";", "p=", "0.0067", ")", "increased", "the", "risk", "of", "developing", "grade", "3", "+", "ICANS", "." ] } ]