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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC5810978
For viral culture trials, the cells were rinsed before the inoculation step and maintained with the serum-free medium for each cell line-specific growth medium.
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PMC9429973
After 04 cures of rituximab, the aPTT wase normalised (patient 30 sec/control 30 sec) which means a total removal of factor VIII inhibitor.
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PMC11777207
We confirmed within the KikGR model that after two consecutive days of topical IMQ application and intraperitoneal PD-L1 43H12 antibody injection that less KikRed DCs migrated to the skin-dLNs by both number and frequency (fig. S9B) and that there was less surface-associated staining of PD-L1 and CD80 on the KikRed DCs in the dLN after 2 days of topical IMQ application compared to the IgG isotype control mice (fig. S9C).
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PMC6650823
From the data, it therefore appears that bigger, ultra-large docking libraries are actually appropriate for the rapid and efficient discovery of new candidate drugs in the various areas of biomedical research.
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PMC11240448
The data confusion matrices were diagonal, showing perfect separation, whereas a cross-validation demonstrated its high robustness, as described below.
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PMC9878278
ZIKV titers were also measured in TLR7 silenced SC but no differences were found when compared to siCtrl cells at 24 hpi (data not shown) and 48 hpi (Figure 2F).
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PMC11790599
Cells were cultured on 35 mm glass-bottom dishes (SPL) and treated with test compounds.
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PMC3931643
An interesting observation from these western blots was that the VAL cell line did not express any 4EBP1 protein ( Fig. 2 , 3 ).
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PMC11684821
CD69 upregulation by Jurkat cells expressing MC.27.759S or MC.7.G5 TCRs in response to 4 different cancer cells was enhanced by the presence of CD8-αα or CD8-αβ (Figure 2E), with similar levels of CD69 seen for CD8-αα or CD8-αβ.
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PMC5034105
In contrast, DENV-2 showed a much narrower range of human tissue tropism, with ⩾2 log increase in the mean viral load (P<0.01) in only 9/18 cell lines (HEK, SF268, RD, ARPE19, Hep-2, Calu-3, HFL, Caco-2 and Huh-7; Figure 1C).
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PMC9512971
Patients were enrolled, randomized, and allocated to each group using an interactive web response system.
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PMC11786704
Cells were stimulated with 850 μg/mL H₂O₂ for 30 min, and a scratch was made using a pipette tip.
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PMC11697703
See also Figure S3.
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PMC11209164
The slides were imaged using the Zeiss Axiocam HRM Inverted fluorescent microscope (Zeiss, Toronto, Canada) and Axiovision 4.0 software.
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PMC9429973
Results: GPR56 activation alters cell cycle progression with significant accumulation of M1 cells in the G0/1 and G2/M phases of the cell cycle compared to WT (p <0.005).
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PMC11190538
The LC for all formulations was between 44.33 and 24.46 %.
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PMC11705067
Nevertheless, the methylation sites of the FDX1 gene included cg05485370 (HR:0.518, 95%CI: 0.311-0.863, P = 0.012), cg13258606 (HR:0.42, 95%CI: 0.245-0.718, P = 0.0015), cg23587050 (HR:0.411, 95%CI: 0.269-0.639, P < 0.001) and cg26061355 (HR:0.584, 95%CI: 0.351-0.974, P = 0.039), suggesting a good prognosis for patients suffering from ccRCC.
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PMC11587606
N: Normal tissue; T: Tumor tissue. (
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PMC11618052
The in vitro tests showed that compounds 8g, 8h, and 8j are strong antiproliferative agents that might work as dual EGFR/BRAF inhibitors.
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PMC7987994
Zn concentration of 120 µM was toxic towards L929 cells in medium MEM with 10% FBS whereas it was not toxic towards L929 cells in medium DMEM with 10% FBS.
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PMC11527437
Four KRAS G12V-reactive TCRs from Bear et al. (11) have the potential for use in TCR-T (Table 1).
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PMC11680049
Using specific histochemical reactions, we observed that starting from the earliest stages of the development of leaf primordia in the bud and subsequently in the leaves and stems at various stages of vegetative growth, there are special zones with increased localization of polyphenols (cuticle, stomata, epidermal, vascular, and transfusion tissues, parenchyma surrounding the vascular bundle, and albuminous cells; Figure 2).
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PMC11544122
Similarly, the phospho-mimetic CT-EE peptide showed greater binding to SNX9 relative to the unphosphorylated CT peptide. (
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PMC11025866
However, the global effects of VPM in human cells have not been studied.
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PMC10852540
Our research showed that RA can inhibit the expression of the apoptosis factor Bcl-2.
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PMC9429973
Bone marrow (BM) mesenchymal stem cells (MSCs) are multipotent stromal cells with multidifferentiation capacities, haematopoiesis support and immunomodulatory effects.
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PMC10024132
The gradient was prepared using Ficoll-Paque PLUS (Sigma) according to the manufacturer's instructions.
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PMC5941560
For example, our finding that Jurkat expresses p53 ψ, a newly recognized p53 isoform with direct links to malignant transformation, suggests that the cell line could be used as a model system for examination of p53 ψ’s non-canonical activities.
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PMC10955424
Peak determination and peak area integration performed with Compound Discoverer 3.3 (Thermo Xcalibur, Version 3.3.0.305).
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PMC8358176
MTT assay assessed the cell survival, and using qRT-PCR, the expression levels of TNF, CD40LG, TNFSF10, TNFSF8, CD40, TNFRSF10A, TNFRSF10B, TNFRSF11B, TNFRSF1A, TNFRSF21, TNFRSF25, and TNFRSF9 were examined.
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PMC11748335
Further, through expression level analyses of genes associated with tumor-gain LOCKs, we observed that most genes in these regions, with the exception of a few outliers, show very low expression in both normal and tumor cell lines, indicating that H3K27me3 long LOCKs compensate for the gene-suppressing effect of H3K9me3 in normal cells within these domains (Fig. S5D).
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PMC11371747
However, the gut has also a high FRα (Nutt et al., 2010), enabling a relatively efficient uptake of folic acid, commonly used to control toxicity in combination treatment with PMX in malignancies (Vogelzang et al., 2003; Nutt et al., 2010) and with MTX in rheumatoid arthritis (van Ede et al., 2001).
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PMC11078693
Otherwise, cap the tube, then shake and rotate it to position the cover glass correctly.
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PMC11394730
Tumor cells rely on glutamine as a metabolic substrate and energy source, which impacts amino acid transport, autophagy, and metabolism (Figure 1).
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PMC11748335
The ESC poised promoters were obtained from our previous study .
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We analyzed the relationship between gene copy number and expression level at single cell resolution.
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All lipids were purchased from Avanti Polar Lipids Inc. (USA/Canada) instead of cholesterol (from Merck).
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PMC9351137
B Histograms showing the fluorescence intensity of immunostaining in RNAi-treated and mock-treated cells.
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Here, in agreement with normal levels of MuSK transcripts, we did not detect any changes in AChR cluster areas, a result which could be attributed to a species difference.
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PMC11310713
The significance of all pharmaceutical hormone-treated OVX groups over the 12 weeks is noted in Figs. S1 and S2.
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The synthetic process generated monodispersed, uniformly sized 1D‐TNP (6.3 ± 0.45 nm width), fully maintaining the morphological characteristics of the template phage (Figure 1B).
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PMC11803149
On day 8, when tumor volume reached about 50 mm, young and aged OT-I TCR-T cells were adoptively transferred into young and aged mice, respectively ( Figure 3A ).
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No association of endogenous or overexpressed USP43 with HIF-2α was observed (Fig. EV3A–C), consistent with the HIF-1α specificity observed in the ccRCC lines.
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PMC11089031
I The quantification of wound healing assay in 786–0 cells.
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Additionally, the BCMs without encapsulated gold complexes (Figure 6) displayed a ca.
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All patients provided informed consent.
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In addition, these transcription condensates promote a three-dimensional morphological alteration in the chromatin architecture, generating transcriptional hot spots.
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We observe elevated levels of truncated products when dCas9 targeted the NTS compared to targeting the TS.
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The data were fitted using the one‐site binding model.
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But in the case of 1-fluoro-2-nitro benzene dehalogenation takes place, so the efficiency of the catalyst toward reduction for halogenated benzene is in the order F < Cl < Br depending upon the electronegativity of the halogen atom present.
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The data are shown as the means ± standard deviations (SD).
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A trend towards a higher rate of metabolic complications was found, with a statistically significant higher OS rate at 60 days.
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The plasmids pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro lentiviral vector (LM-1480, LMAI Bio), pGEX-4T-3-LC3 and pcDNA3-MYC-LC3 (gifts from Dr Wannian Yang Lab), and pAcGFP1 (a gift from Dr Likai Ji at Jiangsu University) were used.
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PMC11467964
Human synovial sarcoma cell line (SW982) was sourced from the American Type Culture Collection.
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Fluorescent signal was captured using an FL9 detector and a 405 nm laser.
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The phase and structure of the samples synthesized were examined using XRD measurements, as shown in Fig. 2 A. The XRD pattern displayed sharp and intense diffraction peaks corresponding to the (220), (311), (400), (422), (511), and (440) planes.
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PMC8984067
After it is oxidized by ROS, the characteristic absorption peak in the 350∼450 nm range would be significantly weakened.
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PMC11490153
Table 4qPCR analysis of Bax and Bcl-2 expression in MDA-MB-231 cells under normoxic and hypoxic conditionsSamplesBaxBcl-2Bax/Bcl-2SusceptibilityAlgNPs in normoxic1.040.981.06-AlgNPs in hypoxic1.10.971.13-C. citratus-AlgNP in normoxic1.330.811.64+C. citratus-AlgNP in hypoxic2.250.54.5+++citral-AlgNP in normoxic1.750.941.86+citral-AlgNP in hypoxic5.260.77.51++++C. citratus EO in normoxic1.880.842.23++C. citratus EO in hypoxic2.230.713.14+++citral in normoxic0.930.960.96-citral in hypoxic2.230.653.43+++A Bax/Bcl-2 ratio < 1.00 indicates cancer-resistant cells, and a Bax/Bcl-2 > 1.00 indicates cancer-sensitive cells.
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PMC11783017
When soaked into 0.5 mM H2O2 for 18 days, the cumulative release percentage of Lipo-IL11 was 90.31 ± 3.02 %, which was much higher than immersing into the PBS solution without H2O2 (31.89 ± 2.45 %), indicating more hydrogels degradation in the medium with addition of H2O2.
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PMC11721096
Semi-preparative HPLC was conducted on the same Shimadzu LC-20AD system but with a COSMOSIL C18 column (10 × 250 mm, 5 μm, Nacalai Tesque Corporation, Kyoto, Japan).
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PMC11747467
Disrupting or blocking STAT3 feedback could enhance drug efficacy in many oncogene-addicted cells.
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PMC9872547
In another study, curcumin concentrations above 40 μM induced apoptosis in HeLa cancer cells (38).
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PMC11697065
Fscn1 and Synpo2 are involved in actin filament bundle formation and assembly and are important for cell migration and focal adhesion.
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PMC10553757
All women had term births and initiated lactation between postpartum days 2-4.
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PMC11805741
The ANOVA test revealed that there is a statistically significant difference among at least one pair of groups (control, DMSO, concentration 600 µg, and concentration 1200 µg) based on their qPCR results in MDA-MB-231 cells.
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PMC11742231
The data is shuffled and split into 80% as a training set, 10% as a validation set, and 10% as a test set.
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PMC8427838
In this study, we identified moesin as a major TMIGD1 binding protein and a key regulator of α-tubulin acetylation.
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PMC11547972
A novel investigation points to the synthesis of silk fibroin protein nanoparticles that may allow controlled and long-term SFN release .
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PMC9684669
p<0.001.
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PMC8973725
CYP2J2 has been shown to have a higher expression in ccRCC and prolong the survival rate of ccRCC patients .
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PMC11765879
Images were taken using a Leica MC170 HD camera (Leica Microsystems) and Leica LAS EZ software.
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PMC9688728
FITC Annexin V Apoptosis Detection Kit I (BD Biosciences, Franklin Lakes, NJ, USA) was used to detect apoptotic and dead cells.
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PMC11787651
Samples were vacuum centrifuged to dryness and stored at −20 °C until further analysis.
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PMC8358006
We found that widespread loss of the grand H3K27me3 domains in of esophageal squamous cell carcinomas (ESCCs) were enriched in genes involved in epithelium and endothelium differentiation, which were significantly associated with overexpression with increase of active modifications of H3K4me3, H3K4me1, and H3K27ac marks, as well as DNA hypermethylation in the gene bodies.
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PMC11281366
Cells were resuspended in PBS-EDTA for flow cytometry analyses.
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PMC11750165
PCR was performed as described by Yeo & Chitnis (2007).
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The one-generation common garden experiment was conducted to alleviate the environmental effects.
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PMC11683240
As illustrated in Fig. 11, α1AT exhibited the largest number of interactions with subunit three (S3), contacting at least 31 amino acid residues from pertussis toxin.
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PMC11593713
Comparisons of oxidative stress markers in virus-infected cells were made using ANOVA followed by Dunnett’s test or, if assumptions were not met, the Kruskal–Wallis ANOVA test.
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PMC5173112
We performed colony formation assays and showed that overexpression of USP21 markedly increase colony numbers (Figure 5B and 5C).
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PMC11144200
A, B The tumor size was measured every 3 days.
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PMC5854676
The rate of decrease in cell viability was maximal for the MgO NR’s as opposed to the other morphological varieties and was modelled with suitable constants provided by the above equations.
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PMC6268318
= carbon tetrachloride extract; MeCl2 ext.
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D Foci formation: CAOV2 cells were incubated in the indicated drug concentrations of NPB (N), Olaparib (O), Rucaparib (R), and Talazoparib (T) or combinations for colony formation stained with 0.2% crystal violet (n = 3).
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PMC6835428
In this way, even if the siRNAs reach healthy cells, they cannot exert major detrimental effects, as the target gene is expressed at low or negligible levels.
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PMC8097906
The stock solutions of plant-derived extracts were further diluted in different concentrations for the biological investigation and anti-tumor activity testing.
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PMC9878278
Accumulating studies implicate these TGF-β members also respond to virus infections including SARS-CoV-2 and HCV (Chusri et al., 2016; Ferreira-Gomes et al., 2021).
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PMC5386478
Numerous studies that investigated the putative role of TG2 in cancers described the dual role of the protein acting either as a facilitator or attenuator of cell proliferation.
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PMC11388384
To reconcile this contradiction, it has been suggested that HH is transported within specialized membrane protrusions called cytonemes, where HH can travel without contacting the aqueous extracellular environment (Fig. 1A) (9, 10).
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PMC11783017
Ⅰ: Control, Ⅱ: Lipo-IL11, Ⅲ: Mn@Lipo-IL11, Ⅳ: Cis/Mn@Lipo-IL11, Ⅴ: Cis/Mn@Lipo-IL11+NH, Ⅵ: Cis/Mn/NH@PGP.
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PMC11796104
Non-specific amplification was monitored with a melting curve, and relative expression levels were calculated using the 2^ method, with triplicate wells for each sample.
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PMC11774112
The morphology of Co-PHRD was observed using transmission electron microscopy.
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PMC10698968
Additionally, several in vivo animal models have been set up with good engraftment percentages .
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PMC3164356
Moreover, we anticipate that characterizing effects of sequence variations on gene products and expression would improve the functional annotation of these cell lines.
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PMC11224020
e, Left, representative images of DCs from LmnA/C and LmnA/C DCs.
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PMC9325715
The procedure, among others, implies heat denaturation of all proteins to obtain precipitate.
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R-CHOP, the standard treatment for DLBCL plays a minimal role preventing leptomeningeal and/or brain parenchyma relapse.
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PMC9592219
The overexpression of TOP2A stimulated the invasion and migration of HCC cells and accelerated the liver cancer progression.
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PMC9429973
Within a median follow-up of 12.4mo, 44 (77%) initiated further therapy whereby 7 (16%) initiated investigational therapies, 9 (20%) CPI, 7 (16%) tafasitamab +/- lenalidomide, 6 (14%) pola-containing, 5 (11%) lenalidomide +/- anti-CD20, 3 (7%) CT/CIT, 3 (7%) anti-CD20 monoclonal antibody, 2 (5%) BTKi, and 2 (5%) allo-SCT as their first post CAR-T therapy.
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PMC9559528
One dose of benzathine penicillin G 2.4 million units intramuscularly (IM) was given to treat the syphilis infection, and acitretin, salicylic acid, calcipotriol/betamethasone, and vitamin E were continued to treat psoriasis.
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