OTAR3088/BioData-CellLine_annotated · Datasets at Hugging Face

PMCID string	Sentences string	ner list
PMC9479186	On day 5, in the BEL-7404 cells, OD490 of Lv-shNDUFC1 group was only 3.51 ± 0.12, whereas that of Lv-shCtrl group was 5.31 ± 0.10; in the SK-HEP-1 cells, OD490 of Lv-shNDUFC1 group was only 3.51 ± 0.12, whereas that of Lv-shCtrl group was 5.31 ± 0.10.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "day", "5", ",", "in", "the", "BEL-7404", "cells", ",", "OD490", "of", "Lv-shNDUFC1", "group", "was", "only", "3.51", "±", "0.12", ",", "whereas", "that", "of", "Lv-shCtrl", "group", "was", "5.31", "±", "0.10", ";", "in", "the", "SK-HEP-1", "cells", ",", "OD490", "of", "Lv-shNDUFC1", "group", "was", "only", "3.51", "±", "0.12", ",", "whereas", "that", "of", "Lv-shCtrl", "group", "was", "5.31", "±", "0.10", "." ] } ]
PMC9429973	Also, there was no significant difference in proportion of patients achieving complete (53% vs 66%) or partial response (24% vs 19%) between patients exposed and non-exposed to statins.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Also", ",", "there", "was", "no", "significant", "difference", "in", "proportion", "of", "patients", "achieving", "complete", "(", "53", "%", "vs", "66", "%", ")", "or", "partial", "response", "(", "24", "%", "vs", "19", "%", ")", "between", "patients", "exposed", "and", "non-exposed", "to", "statins", "." ] } ]
PMC11453018	We proceeded to assess the potential synergistic effects of these senolytics when combined with iP300w, testing each senolytic across a concentration range from 0 to 50 μM. Dasatinib displayed an IC50 between 1–10 μM, while Fisetin and Navitoclax fell within the 20–50 μM range (Supplementary Fig. 7B, C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "proceeded", "to", "assess", "the", "potential", "synergistic", "effects", "of", "these", "senolytics", "when", "combined", "with", "iP300w", ",", "testing", "each", "senolytic", "across", "a", "concentration", "range", "from", "0", "to", "50", "μM.", "Dasatinib", "displayed", "an", "IC50", "between", "1–10", "μM", ",", "while", "Fisetin", "and", "Navitoclax", "fell", "within", "the", "20–50", "μM", "range", "(", "Supplementary", "Fig.", "7B", ",", "C", ")", "." ] } ]
PMC9429973	A. Sissoko, A. Fricot, L. Dumas, C. Roussel, S. Manceau, C. Capito, S. Allali, N. Yekkache, M. Dussiot, Y. NGUYEN, A. Lefort, B. Aussilhou, M. Tichit, D. Hardy, B. Maître, A. Michel, M. De Montalembert, M. Cavazzana, L. Joseph, P. Buffet UMR-S 1134 BIGR, APHP, GREx; UMR-S 1134 BIGR “biologie intégrée du globule rouge”, Université de Paris, UMR-S 1134 BIGR “biologie intégrée du globule rouge”; UMR-S 1134 BIGR “biologie intégrée du globule rouge”, Inserm/Université de Paris, UMR-S 1134 BIGR “biologie intégrée du globule rouge”; APHP, Paris, Assistance Publique Hôpitaux de Paris; GR-Ex, Paris, France.,	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "Sissoko", ",", "A.", "Fricot", ",", "L.", "Dumas", ",", "C.", "Roussel", ",", "S.", "Manceau", ",", "C.", "Capito", ",", "S.", "Allali", ",", "N.", "Yekkache", ",", "M.", "Dussiot", ",", "Y.", "NGUYEN", ",", "A.", "Lefort", ",", "B.", "Aussilhou", ",", "M.", "Tichit", ",", "D.", "Hardy", ",", "B.", "Maître", ",", "A.", "Michel", ",", "M.", "De", "Montalembert", ",", "M.", "Cavazzana", ",", "L.", "Joseph", ",", "P.", "Buffet", "UMR-S", "1134", "BIGR", ",", "APHP", ",", "GREx", ";", "UMR-S", "1134", "BIGR", "“", "biologie", "intégrée", "du", "globule", "rouge", "”", ",", "Université", "de", "Paris", ",", "UMR-S", "1134", "BIGR", "“", "biologie", "intégrée", "du", "globule", "rouge", "”", ";", "UMR-S", "1134", "BIGR", "“", "biologie", "intégrée", "du", "globule", "rouge", "”", ",", "Inserm/Université", "de", "Paris", ",", "UMR-S", "1134", "BIGR", "“", "biologie", "intégrée", "du", "globule", "rouge", "”", ";", "APHP", ",", "Paris", ",", "Assistance", "Publique", "Hôpitaux", "de", "Paris", ";", "GR-Ex", ",", "Paris", ",", "France", ".", "," ] } ]
PMC11741906	These findings suggested that high expression of these four miRNAs correlated with poor overall survival of ovarian cancer patients.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "findings", "suggested", "that", "high", "expression", "of", "these", "four", "miRNAs", "correlated", "with", "poor", "overall", "survival", "of", "ovarian", "cancer", "patients", "." ] } ]
PMC8170755	Based on our findings and the effects of VPA on Nm23-H1, epigenetic alternations of this gene in A459 cancer cells may also be a mechanism involved in the metastatic behavior of lung cancer cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Based", "on", "our", "findings", "and", "the", "effects", "of", "VPA", "on", "Nm23-H1", ",", "epigenetic", "alternations", "of", "this", "gene", "in", "A459", "cancer", "cells", "may", "also", "be", "a", "mechanism", "involved", "in", "the", "metastatic", "behavior", "of", "lung", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC11783017	By regulating the levels of MYC and ICD, the proportion of M1 macrophages and mature dendritic cells were enhanced and thereby strengthening anti-tumor immunity to inhibit MYC-amplified osteosarcoma growth and metastasis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "regulating", "the", "levels", "of", "MYC", "and", "ICD", ",", "the", "proportion", "of", "M1", "macrophages", "and", "mature", "dendritic", "cells", "were", "enhanced", "and", "thereby", "strengthening", "anti-tumor", "immunity", "to", "inhibit", "MYC-amplified", "osteosarcoma", "growth", "and", "metastasis", "." ] } ]
PMC11024707	The relationship between the mi-RNA levels and the scales was examined using correlation analyses.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "relationship", "between", "the", "mi-RNA", "levels", "and", "the", "scales", "was", "examined", "using", "correlation", "analyses", "." ] } ]
PMC11119602	Although there has been significant progress in the treatment of HCC over the past decades, drug resistance to chemotherapy remains a major obstacle in its successful management.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "there", "has", "been", "significant", "progress", "in", "the", "treatment", "of", "HCC", "over", "the", "past", "decades", ",", "drug", "resistance", "to", "chemotherapy", "remains", "a", "major", "obstacle", "in", "its", "successful", "management", "." ] } ]
PMC10006224	Experiments were performed three times with similar results.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Experiments", "were", "performed", "three", "times", "with", "similar", "results", "." ] } ]
PMC9429973	We also analyzed the expression of pro and anti-inflammatory markers and NO production by flow cytometry.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "also", "analyzed", "the", "expression", "of", "pro", "and", "anti-inflammatory", "markers", "and", "NO", "production", "by", "flow", "cytometry", "." ] } ]
PMC11706491	Pellets were resuspended in Tris buffer (0.1 M Tris—HCl (pH 8.0), 1 mM EDTA, 1% SDS), loading buffer was added and samples were boiled for 5 min at 100°C.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pellets", "were", "resuspended", "in", "Tris", "buffer", "(", "0.1", "M", "Tris", "—", "HCl", "(", "pH", "8.0", ")", ",", "1", "mM", "EDTA", ",", "1", "%", "SDS", ")", ",", "loading", "buffer", "was", "added", "and", "samples", "were", "boiled", "for", "5", "min", "at", "100", "°", "C", "." ] } ]
PMC11536589	The intracellular GSH level was assessed in parental PDAC cells and MRTX1133-resistant PDAC cells. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "intracellular", "GSH", "level", "was", "assessed", "in", "parental", "PDAC", "cells", "and", "MRTX1133-resistant", "PDAC", "cells", ".", "(" ] } ]
PMC10551595	1% l‐glutamine (Gibco) was added to culture medium for the NALM6 cell line and patient primary cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "1", "%", "l‐glutamine", "(", "Gibco", ")", "was", "added", "to", "culture", "medium", "for", "the", "NALM6", "cell", "line", "and", "patient", "primary", "cells", "." ] } ]
PMC4270159	Treatment of a control cell line with the growth factor ligand alone.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Treatment", "of", "a", "control", "cell", "line", "with", "the", "growth", "factor", "ligand", "alone", "." ] } ]
PMC9429973	Despite higher CR/CRi, ASXL1 mutated patients had shortened mOS due to higher relapse.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Despite", "higher", "CR/CRi", ",", "ASXL1", "mutated", "patients", "had", "shortened", "mOS", "due", "to", "higher", "relapse", "." ] } ]
PMC11773391	Among DNA repair systems, MGMT‐mediated repair is unique relative to many complex DNA repair mechanisms.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "DNA", "repair", "systems", ",", "MGMT‐mediated", "repair", "is", "unique", "relative", "to", "many", "complex", "DNA", "repair", "mechanisms", "." ] } ]
PMC9592219	Therefore, we assessed the clinical benefits of dabrafenib and refametinib.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "we", "assessed", "the", "clinical", "benefits", "of", "dabrafenib", "and", "refametinib", "." ] } ]
PMC8336407	In the group treated with the extract concentration of 1.5 mg/mL and 200 μM t-BHP, the cell viability decreased to 72.52 ± 1.1% (p < 0.001).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "group", "treated", "with", "the", "extract", "concentration", "of", "1.5", "mg/mL", "and", "200", "μM", "t-BHP", ",", "the", "cell", "viability", "decreased", "to", "72.52", "±", "1.1", "%", "(", "p", "<", "0.001", ")", "." ] } ]
PMC10758402	After 9 days, when the tumor volumes reached about 100mm, DMF (200mg/kg) or vehicle alone was injected intratumorally.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "9", "days", ",", "when", "the", "tumor", "volumes", "reached", "about", "100", "mm", ",", "DMF", "(", "200mg/kg", ")", "or", "vehicle", "alone", "was", "injected", "intratumorally", "." ] } ]
PMC9429973	Secondary endpoints were changes of TNF-α & sIL2R serum pre-& post-chemotherapy.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Secondary", "endpoints", "were", "changes", "of", "TNF-α", "&", "sIL2R", "serum", "pre-", "&", "post-chemotherapy", "." ] } ]
PMC8345486	When the plasma membrane is depolarized, its permeability increases and the dye penetrates through the membrane, leading to enhanced green fluorescence.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "the", "plasma", "membrane", "is", "depolarized", ",", "its", "permeability", "increases", "and", "the", "dye", "penetrates", "through", "the", "membrane", ",", "leading", "to", "enhanced", "green", "fluorescence", "." ] } ]
PMC11264242	Our results support a role for FYN in attenuation of anti-cancer activity upon inhibition of SS18-SSX function and demonstrate the feasibility of targeting FYN to improve the effectiveness of HDACi treatment against synovial sarcoma.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "results", "support", "a", "role", "for", "FYN", "in", "attenuation", "of", "anti-cancer", "activity", "upon", "inhibition", "of", "SS18-SSX", "function", "and", "demonstrate", "the", "feasibility", "of", "targeting", "FYN", "to", "improve", "the", "effectiveness", "of", "HDACi", "treatment", "against", "synovial", "sarcoma", "." ] } ]
PMC11746948	The target sequences of the genes in this study are listed in Supplementary Table 2.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "target", "sequences", "of", "the", "genes", "in", "this", "study", "are", "listed", "in", "Supplementary", "Table", "2", "." ] } ]
PMC10198699	First, the fact that there are certain restrictions on what owners may lawfully do with their property does not mean that there is no ownership.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "First", ",", "the", "fact", "that", "there", "are", "certain", "restrictions", "on", "what", "owners", "may", "lawfully", "do", "with", "their", "property", "does", "not", "mean", "that", "there", "is", "no", "ownership", "." ] } ]
PMC10810426	For example, the HIV-2 capsid is more labile than the HIV-1 capsid and is more susceptible to nucleic acid sensors .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "example", ",", "the", "HIV-2", "capsid", "is", "more", "labile", "than", "the", "HIV-1", "capsid", "and", "is", "more", "susceptible", "to", "nucleic", "acid", "sensors", "." ] } ]
PMC9429973	Nevertheless, the prevalence of homozygous (Homo) and heterozygous (Hetero) G17V mutations and the difference in their oncogenicity due to its zygosity remain unclear.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nevertheless", ",", "the", "prevalence", "of", "homozygous", "(", "Homo", ")", "and", "heterozygous", "(", "Hetero", ")", "G17V", "mutations", "and", "the", "difference", "in", "their", "oncogenicity", "due", "to", "its", "zygosity", "remain", "unclear", "." ] } ]
PMC10538569	Of note, blocking egress of migratory T cells from lymph nodes into efferent lymph vessels and interrupting T cell recirculation by the use of a S1PR1 (sphingosine 1-phosphate receptor 1) antagonist FTY720 at early onset of HIV-1 infection resulted in limited HIV-1 dissemination and reduction of plasma viremia (16), indicating that cell-cell transmission of HIV-1 may be important in establishment of systemic HIV-1 infection.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "note", ",", "blocking", "egress", "of", "migratory", "T", "cells", "from", "lymph", "nodes", "into", "efferent", "lymph", "vessels", "and", "interrupting", "T", "cell", "recirculation", "by", "the", "use", "of", "a", "S1PR1", "(", "sphingosine", "1-phosphate", "receptor", "1", ")", "antagonist", "FTY720", "at", "early", "onset", "of", "HIV-1", "infection", "resulted", "in", "limited", "HIV-1", "dissemination", "and", "reduction", "of", "plasma", "viremia", "(", "16", ")", ",", "indicating", "that", "cell-cell", "transmission", "of", "HIV-1", "may", "be", "important", "in", "establishment", "of", "systemic", "HIV-1", "infection", "." ] } ]
PMC9105697	As each breakpoint has a unique sequence, this allows tracking of each tumor individually with high specificity.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "each", "breakpoint", "has", "a", "unique", "sequence", ",", "this", "allows", "tracking", "of", "each", "tumor", "individually", "with", "high", "specificity", "." ] } ]
PMC8633974	a-b) Insertion-deletion profiles among the generated gRNAs obtained through a co-transfection screen were assessed by the Synthego ICE v2.0 algorithm.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "a-b", ")", "Insertion-deletion", "profiles", "among", "the", "generated", "gRNAs", "obtained", "through", "a", "co-transfection", "screen", "were", "assessed", "by", "the", "Synthego", "ICE", "v2.0", "algorithm", "." ] } ]
PMC9429973	Paired sample t-test was used to compare continuous semen analysis parameters before and after TKI therapy.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Paired", "sample", "t-test", "was", "used", "to", "compare", "continuous", "semen", "analysis", "parameters", "before", "and", "after", "TKI", "therapy", "." ] } ]
PMC9429973	SCF/IL-6 dependent HPC cells are kept on agarose-coated plates to prevent adherence-induced myeloid differentiation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SCF/IL-6", "dependent", "HPC", "cells", "are", "kept", "on", "agarose-coated", "plates", "to", "prevent", "adherence-induced", "myeloid", "differentiation", "." ] } ]
PMC11543885	Lysis buffer (10 mL)ReagentStock concentrationFinal concentrationAmountRIPA lysis bufferN/AN/A700 μLTrolox500 mM5 mM100 μLSodium ascorbate1 M10 mM100 μLSodium azide1 M10 mM100 μLPhosSTOP phosphatase inhibitorN/AN/A1 tabletcOmplete, Mini, EDTA-free ProteaseN/AN/A1 tabletTotalN/AN/A10 mL CRITICAL: Should be freshly prepared before use.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lysis", "buffer", "(", "10", "mL)ReagentStock", "concentrationFinal", "concentrationAmountRIPA", "lysis", "bufferN/AN/A700", "μLTrolox500", "mM5", "mM100", "μLSodium", "ascorbate1", "M10", "mM100", "μLSodium", "azide1", "M10", "mM100", "μLPhosSTOP", "phosphatase", "inhibitorN/AN/A1", "tabletcOmplete", ",", "Mini", ",", "EDTA-free", "ProteaseN/AN/A1", "tabletTotalN/AN/A10", "mL", "CRITICAL", ":", "Should", "be", "freshly", "prepared", "before", "use", "." ] } ]
PMC11543885	Plot ROC Curve: Plot TPR against FPR to generate a ROC curve.e.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Plot", "ROC", "Curve", ":", "Plot", "TPR", "against", "FPR", "to", "generate", "a", "ROC", "curve.e", "." ] } ]
PMC11257988	However, the oncogenic mutation of KRAS protein interferes with GTP hydrolysis, causing the protein to remain in an active GTP state and continuously transmit signals to the downstream pathway to recruit and activate the proteins required for growth factor and other receptors (such as RAF and PI3K) signal transduction .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "oncogenic", "mutation", "of", "KRAS", "protein", "interferes", "with", "GTP", "hydrolysis", ",", "causing", "the", "protein", "to", "remain", "in", "an", "active", "GTP", "state", "and", "continuously", "transmit", "signals", "to", "the", "downstream", "pathway", "to", "recruit", "and", "activate", "the", "proteins", "required", "for", "growth", "factor", "and", "other", "receptors", "(", "such", "as", "RAF", "and", "PI3", "K", ")", "signal", "transduction", "." ] } ]
PMC11683240	Cells were incubated at 4 °C during the experiment to allow binding but prevent internalization.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "incubated", "at", "4", "°", "C", "during", "the", "experiment", "to", "allow", "binding", "but", "prevent", "internalization", "." ] } ]
PMC11635519	Immediately after adding the reagent, samples were read using a luminometer with a 480 nm filter.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Immediately", "after", "adding", "the", "reagent", ",", "samples", "were", "read", "using", "a", "luminometer", "with", "a", "480", "nm", "filter", "." ] } ]
PMC11530949	The physicochemical properties of the NPs were evaluated using various techniques such as Field emission scanning electron microscopy (FESEM), Transmission Electron Microscope (TEM), X-ray diffraction (XRD), and Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "physicochemical", "properties", "of", "the", "NPs", "were", "evaluated", "using", "various", "techniques", "such", "as", "Field", "emission", "scanning", "electron", "microscopy", "(", "FESEM", ")", ",", "Transmission", "Electron", "Microscope", "(", "TEM", ")", ",", "X-ray", "diffraction", "(", "XRD", ")", ",", "and", "Fourier-transform", "infrared", "spectroscopy", "(", "FTIR", ")", "." ] } ]
PMC11477621	On one hand, it may be attributed to off-target effects, as hydroxamic acid is known for its non-specific metal binding capability .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "one", "hand", ",", "it", "may", "be", "attributed", "to", "off-target", "effects", ",", "as", "hydroxamic", "acid", "is", "known", "for", "its", "non-specific", "metal", "binding", "capability", "." ] } ]
PMC11781181	Considering these data, we concluded that ferroptosis inhibitors may be potential therapeutic agents for SJS/TEN treatment in the future.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Considering", "these", "data", ",", "we", "concluded", "that", "ferroptosis", "inhibitors", "may", "be", "potential", "therapeutic", "agents", "for", "SJS/TEN", "treatment", "in", "the", "future", "." ] } ]
PMC10538569	Consequently, CEMss-CCR5-CR2N cells are rendered completely resistant to CCR5-tropic HIV-1 Yu-2 infection (41).	[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consequently", ",", "CEMss-CCR5-CR2N", "cells", "are", "rendered", "completely", "resistant", "to", "CCR5-tropic", "HIV-1", "Yu-2", "infection", "(", "41", ")", "." ] } ]
PMC10852540	The other type is those that trigger apoptosis such as BAX, Bcl-Xs, Bik/Nbk and Bid29.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "other", "type", "is", "those", "that", "trigger", "apoptosis", "such", "as", "BAX", ",", "Bcl-Xs", ",", "Bik/Nbk", "and", "Bid29", "." ] } ]
PMC10253973	As metal ions and metals are needed to maintain biological processes, they are often used in the medical diagnostics and treatment .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "metal", "ions", "and", "metals", "are", "needed", "to", "maintain", "biological", "processes", ",", "they", "are", "often", "used", "in", "the", "medical", "diagnostics", "and", "treatment", "." ] } ]
PMC4277423	However, further side-by-side study is needed to compare CCR5 gene disruption by these three gene editing approaches.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "further", "side-by-side", "study", "is", "needed", "to", "compare", "CCR5", "gene", "disruption", "by", "these", "three", "gene", "editing", "approaches", "." ] } ]
PMC11247842	Annotation of variants by Variants Effect Predictor (VEP) is another common option used.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Annotation", "of", "variants", "by", "Variants", "Effect", "Predictor", "(", "VEP", ")", "is", "another", "common", "option", "used", "." ] } ]
PMC11322866	Similar to the treatment in (C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Similar", "to", "the", "treatment", "in", "(", "C", ")", "." ] } ]
PMC11588008	The activation of ERK1/2–Nrf2 can up-regulate the expression of HO-1 and reduce the level of cellular OS .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "activation", "of", "ERK1/2–Nrf2", "can", "up-regulate", "the", "expression", "of", "HO-1", "and", "reduce", "the", "level", "of", "cellular", "OS", "." ] } ]
PMC5673060	This may be the result of previously reported restricted pTyr motifs recognised by anti-phosphotyrosine antibodies used in the immunoprecipitation .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "may", "be", "the", "result", "of", "previously", "reported", "restricted", "pTyr", "motifs", "recognised", "by", "anti-phosphotyrosine", "antibodies", "used", "in", "the", "immunoprecipitation", "." ] } ]
PMC5386478	Furthermore, we show that in cells derived from biphasic MPM, the levels of expressed TG2 and transamidating activity significantly increase in response to chronic hypoxia.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "we", "show", "that", "in", "cells", "derived", "from", "biphasic", "MPM", ",", "the", "levels", "of", "expressed", "TG2", "and", "transamidating", "activity", "significantly", "increase", "in", "response", "to", "chronic", "hypoxia", "." ] } ]
PMC8777939	Cell cycle distributions were analyzed by flow cytometry (BD Bioscience Accuri C6).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "cycle", "distributions", "were", "analyzed", "by", "flow", "cytometry", "(", "BD", "Bioscience", "Accuri", "C6", ")", "." ] } ]
PMC11738017	The figures represent 3 different anti-BCMA TCEs, namely teclistamab, elranatamab, and alnuctamab, and their respective reported BCMA KD off rates.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "figures", "represent", "3", "different", "anti-BCMA", "TCEs", ",", "namely", "teclistamab", ",", "elranatamab", ",", "and", "alnuctamab", ",", "and", "their", "respective", "reported", "BCMA", "KD", "off", "rates", "." ] } ]
PMC11740399	Following incubation with the respective treatments for 2 h, the cells were washed with cold PBS to remove excess particles.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Following", "incubation", "with", "the", "respective", "treatments", "for", "2", "h", ",", "the", "cells", "were", "washed", "with", "cold", "PBS", "to", "remove", "excess", "particles", "." ] } ]
PMC6771295	The datasets generated for this study are available on request to the corresponding author.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "datasets", "generated", "for", "this", "study", "are", "available", "on", "request", "to", "the", "corresponding", "author", "." ] } ]
PMC11786156	The following clinical data of the patients were collected from the medical records of Fukushima Medical University: age, sex, original organs of the tissue specimens, number of extra-nodal lesions, presence of bone marrow or peripheral blood involvement, clinical stage, presence of B symptoms, international prognostic index (IPI), cause of death, and survival period.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "following", "clinical", "data", "of", "the", "patients", "were", "collected", "from", "the", "medical", "records", "of", "Fukushima", "Medical", "University", ":", "age", ",", "sex", ",", "original", "organs", "of", "the", "tissue", "specimens", ",", "number", "of", "extra-nodal", "lesions", ",", "presence", "of", "bone", "marrow", "or", "peripheral", "blood", "involvement", ",", "clinical", "stage", ",", "presence", "of", "B", "symptoms", ",", "international", "prognostic", "index", "(", "IPI", ")", ",", "cause", "of", "death", ",", "and", "survival", "period", "." ] } ]
PMC11122631	Within all Clavularia species, four species, namely C. viridis, C. inflata, C. kentingsnsis, and C. koellikeri, were found in Taiwan.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Within", "all", "Clavularia", "species", ",", "four", "species", ",", "namely", "C.", "viridis", ",", "C.", "inflata", ",", "C.", "kentingsnsis", ",", "and", "C.", "koellikeri", ",", "were", "found", "in", "Taiwan", "." ] } ]
PMC11413393	Cell lines RCC22, RCC162, RCC222, RCC243, RCC323, RCC364 and RCC407 were generated as previously described in Lobo et al.. The continued use of these patient-derived lines is approved under UHN Research Ethics Board approval, protocol #15-9559.	[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "lines", "RCC22", ",", "RCC162", ",", "RCC222", ",", "RCC243", ",", "RCC323", ",", "RCC364", "and", "RCC407", "were", "generated", "as", "previously", "described", "in", "Lobo", "et", "al", "..", "The", "continued", "use", "of", "these", "patient-derived", "lines", "is", "approved", "under", "UHN", "Research", "Ethics", "Board", "approval", ",", "protocol", "#", "15", "-", "9559", "." ] } ]
PMC9031474	Felix et al. observed reduced expression of survivin—an antiapoptotic protein critical in apoptosis resistance of cancer cells—in Colo-320 cells after the addition of the drimane lactone 75 (Figure 18) .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Felix", "et", "al.", "observed", "reduced", "expression", "of", "survivin", "—", "an", "antiapoptotic", "protein", "critical", "in", "apoptosis", "resistance", "of", "cancer", "cells", "—", "in", "Colo-320", "cells", "after", "the", "addition", "of", "the", "drimane", "lactone", "75", "(", "Figure", "18", ")", "." ] } ]
PMC9919300	To investigate the molecular pathways involved in human fatty liver we used a microarray approach aimed at evaluating the expression of genes related to insulin and adipokine signaling, metabolic pathways, inflammatory response, and apoptosis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "investigate", "the", "molecular", "pathways", "involved", "in", "human", "fatty", "liver", "we", "used", "a", "microarray", "approach", "aimed", "at", "evaluating", "the", "expression", "of", "genes", "related", "to", "insulin", "and", "adipokine", "signaling", ",", "metabolic", "pathways", ",", "inflammatory", "response", ",", "and", "apoptosis", "." ] } ]
PMC8759873	The proliferation and apoptosis of cells were measured to clarify the inhibitory effect of the VHL gene in renal cell carcinoma.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "proliferation", "and", "apoptosis", "of", "cells", "were", "measured", "to", "clarify", "the", "inhibitory", "effect", "of", "the", "VHL", "gene", "in", "renal", "cell", "carcinoma", "." ] } ]
PMC11711127	Ageing is a natural biological process that occurs due to the accumulation of a wide variety of molecular and cellular damage over time and results in the decline of physiological functions.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ageing", "is", "a", "natural", "biological", "process", "that", "occurs", "due", "to", "the", "accumulation", "of", "a", "wide", "variety", "of", "molecular", "and", "cellular", "damage", "over", "time", "and", "results", "in", "the", "decline", "of", "physiological", "functions", "." ] } ]
PMC11705862	SH-SY5Y cells were seeded on and harvested from a petri dish by trypsinization (5 × 10 cells).	[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SH-SY5Y", "cells", "were", "seeded", "on", "and", "harvested", "from", "a", "petri", "dish", "by", "trypsinization", "(", "5", "×", "10", "cells", ")", "." ] } ]
PMC9429973	P. Strati, E. Hawkes, N. Ghosh, J. Tuscano, Q. Chu, M. A. Anderson, A. Patel, M. R. Burgess, K. Hege, S. Chhagan, S. Boyanapalli, T. Day, F. Shen, A. Mehta The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, United States of America; Austin Health–Austin Hospital, Heidelberg, Australia; Levine Cancer Institute, Charlotte; University of California, Davis, Sacramento, United States of America; Cross Cancer Institute, Edmonton, Canada; Peter MacCallum Cancer Centre, Melbourne, Australia; Bristol Myers Squibb, Princeton; University of Alabama at Birmingham, Birmingham, United States of America Background: CD47 is a cell-surface ligand overexpressed in various malignancies that binds to SIRPα on effector macrophages to promote tumor cell evasion of phagocytosis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P.", "Strati", ",", "E.", "Hawkes", ",", "N.", "Ghosh", ",", "J.", "Tuscano", ",", "Q.", "Chu", ",", "M.", "A.", "Anderson", ",", "A.", "Patel", ",", "M.", "R.", "Burgess", ",", "K.", "Hege", ",", "S.", "Chhagan", ",", "S.", "Boyanapalli", ",", "T.", "Day", ",", "F.", "Shen", ",", "A.", "Mehta", "The", "University", "of", "Texas", "MD", "Anderson", "Cancer", "Center", ",", "Houston", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Austin", "Health", "–", "Austin", "Hospital", ",", "Heidelberg", ",", "Australia", ";", "Levine", "Cancer", "Institute", ",", "Charlotte", ";", "University", "of", "California", ",", "Davis", ",", "Sacramento", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Cross", "Cancer", "Institute", ",", "Edmonton", ",", "Canada", ";", "Peter", "MacCallum", "Cancer", "Centre", ",", "Melbourne", ",", "Australia", ";", "Bristol", "Myers", "Squibb", ",", "Princeton", ";", "University", "of", "Alabama", "at", "Birmingham", ",", "Birmingham", ",", "United", "States", "of", "America", "Background", ":", "CD47", "is", "a", "cell-surface", "ligand", "overexpressed", "in", "various", "malignancies", "that", "binds", "to", "SIRPα", "on", "effector", "macrophages", "to", "promote", "tumor", "cell", "evasion", "of", "phagocytosis", "." ] } ]
PMC5363531	Western blot analyses reported in Figure 4C show the expression data obtained after treatment with both drugs at IC50 doses (upper panel).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Western", "blot", "analyses", "reported", "in", "Figure", "4C", "show", "the", "expression", "data", "obtained", "after", "treatment", "with", "both", "drugs", "at", "IC50", "doses", "(", "upper", "panel", ")", "." ] } ]
PMC11451829	The protocols were approved by the Committee of Ethics for the Use of Experimental Animals for the School of Medicine of Tecnologico de Monterrey (2023-002-R2).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "protocols", "were", "approved", "by", "the", "Committee", "of", "Ethics", "for", "the", "Use", "of", "Experimental", "Animals", "for", "the", "School", "of", "Medicine", "of", "Tecnologico", "de", "Monterrey", "(", "2023", "-", "002-R2", ")", "." ] } ]
PMC6600253	Hinds and Pietruska have collated the relevant content in a previous literature review .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hinds", "and", "Pietruska", "have", "collated", "the", "relevant", "content", "in", "a", "previous", "literature", "review", "." ] } ]
PMC11055323	p < 0.0001.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.0001", "." ] } ]
PMC11673128	All cell lines were cultured in Roswell Park Memorial Institute (RPMI) 1640 (Euroclone, Milan, Italy) with 10% fetal bovine serum (FBS; Euroclone, Milan, Italy), 1 mM L-glutamine and 100 U/mL penicillin/streptomycin (Euroclone, Milan, Italy), in a humidified, 5% CO2 incubator at 37 °C.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "cell", "lines", "were", "cultured", "in", "Roswell", "Park", "Memorial", "Institute", "(", "RPMI", ")", "1640", "(", "Euroclone", ",", "Milan", ",", "Italy", ")", "with", "10", "%", "fetal", "bovine", "serum", "(", "FBS", ";", "Euroclone", ",", "Milan", ",", "Italy", ")", ",", "1", "mM", "L-glutamine", "and", "100", "U/mL", "penicillin/streptomycin", "(", "Euroclone", ",", "Milan", ",", "Italy", ")", ",", "in", "a", "humidified", ",", "5", "%", "CO2", "incubator", "at", "37", "°", "C", "." ] } ]
PMC11707577	T1 excited state can be populated via intersystem crossing from S1 to T1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "T1", "excited", "state", "can", "be", "populated", "via", "intersystem", "crossing", "from", "S1", "to", "T1", "." ] } ]
PMC9848491	IC50 of ABT.263 in high and low risk groups. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IC50", "of", "ABT.263", "in", "high", "and", "low", "risk", "groups", ".", "(" ] } ]
PMC11612315	After washing five times with lysis buffer, the complexes were mixed with lysis buffer containing 290 mM imidazole, and the bound proteins were eluted by boiling in 5× sodium dodecyl sulfate (SDS) loading buffer for 5 min.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "washing", "five", "times", "with", "lysis", "buffer", ",", "the", "complexes", "were", "mixed", "with", "lysis", "buffer", "containing", "290", "mM", "imidazole", ",", "and", "the", "bound", "proteins", "were", "eluted", "by", "boiling", "in", "5", "×", "sodium", "dodecyl", "sulfate", "(", "SDS", ")", "loading", "buffer", "for", "5", "min", "." ] } ]
PMC6450504	Lane 1 shows FBS diluted to 2.5% (v/v), lanes 2 and 3 are 0% PEIPOS and 0.5% PEIPOS and lane 4 is a PEGylated liposomal formulation (3 mol% PEG2000-PE). (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lane", "1", "shows", "FBS", "diluted", "to", "2.5", "%", "(", "v/v", ")", ",", "lanes", "2", "and", "3", "are", "0", "%", "PEIPOS", "and", "0.5", "%", "PEIPOS", "and", "lane", "4", "is", "a", "PEGylated", "liposomal", "formulation", "(", "3", "mol%", "PEG2000-PE", ")", ".", "(" ] } ]
PMC8343815	As cervical cancer cells are radioresistant, radiotherapy success for patients with cervical cancer depends on better dose enhancement, which can be achieved by radiosensitizers; therefore, type and shape of gold nanomaterials are among factors, which may help achieve this goal.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "cervical", "cancer", "cells", "are", "radioresistant", ",", "radiotherapy", "success", "for", "patients", "with", "cervical", "cancer", "depends", "on", "better", "dose", "enhancement", ",", "which", "can", "be", "achieved", "by", "radiosensitizers", ";", "therefore", ",", "type", "and", "shape", "of", "gold", "nanomaterials", "are", "among", "factors", ",", "which", "may", "help", "achieve", "this", "goal", "." ] } ]
PMC9429973	50% presented the episode in the setting of thrombotic microangiopathy, or suspicion of it.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "50", "%", "presented", "the", "episode", "in", "the", "setting", "of", "thrombotic", "microangiopathy", ",", "or", "suspicion", "of", "it", "." ] } ]
PMC11194678	It is worth noting that STAU1 levels in HepG2, SW1990, as well as Caco-2 cells were dramatically higher than those in other cells; correspondingly, the puncta sizes of endogenous STAU1 in the three cancer cells were also significantly larger (Fig. 1, A–C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "worth", "noting", "that", "STAU1", "levels", "in", "HepG2", ",", "SW1990", ",", "as", "well", "as", "Caco-2", "cells", "were", "dramatically", "higher", "than", "those", "in", "other", "cells", ";", "correspondingly", ",", "the", "puncta", "sizes", "of", "endogenous", "STAU1", "in", "the", "three", "cancer", "cells", "were", "also", "significantly", "larger", "(", "Fig.", "1", ",", "A", "–", "C", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Of these, 94 (79.6%) were treated at the preliminary RP2D, including 51 (54.3%) participants with CLL/SLL.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "these", ",", "94", "(", "79.6", "%", ")", "were", "treated", "at", "the", "preliminary", "RP2D", ",", "including", "51", "(", "54.3", "%", ")", "participants", "with", "CLL/SLL", "." ] } ]
PMC11585254	Using bioluminescence resonance energy transfer, we show that β-arrestin1 and β-arrestin2 are dose-dependently recruited to CXCR5 by its cognate ligand C-X-C motif chemokine ligand 13 (CXCL13).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Using", "bioluminescence", "resonance", "energy", "transfer", ",", "we", "show", "that", "β-arrestin1", "and", "β-arrestin2", "are", "dose-dependently", "recruited", "to", "CXCR5", "by", "its", "cognate", "ligand", "C-X-C", "motif", "chemokine", "ligand", "13", "(", "CXCL13", ")", "." ] } ]
PMC10890307	Our results indicate that in the presence of glucose and hypoxia, the µ of lung cancer cells MCF-7 and MRC-5 slightly increased with acidosis in comparison to neutral conditions (except A549), while the specific rate of glucose consumption and lactate production diminished with acidosis in contrast with neutral conditions.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "results", "indicate", "that", "in", "the", "presence", "of", "glucose", "and", "hypoxia", ",", "the", "µ", "of", "lung", "cancer", "cells", "MCF-7", "and", "MRC-5", "slightly", "increased", "with", "acidosis", "in", "comparison", "to", "neutral", "conditions", "(", "except", "A549", ")", ",", "while", "the", "specific", "rate", "of", "glucose", "consumption", "and", "lactate", "production", "diminished", "with", "acidosis", "in", "contrast", "with", "neutral", "conditions", "." ] } ]
PMC11266100	It can be seen (Figure 3) that the buffers are not toxic by themselves, however, when combined with electric field the overall toxicity of the treatment starts to rise and is also are highly dependent on buffer composition.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "can", "be", "seen", "(", "Figure", "3", ")", "that", "the", "buffers", "are", "not", "toxic", "by", "themselves", ",", "however", ",", "when", "combined", "with", "electric", "field", "the", "overall", "toxicity", "of", "the", "treatment", "starts", "to", "rise", "and", "is", "also", "are", "highly", "dependent", "on", "buffer", "composition", "." ] } ]
PMC9429973	New atrial fibrillation and grade ≥3 any-cause toxicity occurred in 3/59 pts (5.8%) and 8/57 (14.0%) respectively.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "New", "atrial", "fibrillation", "and", "grade", "≥3", "any-cause", "toxicity", "occurred", "in", "3/59", "pts", "(", "5.8", "%", ")", "and", "8/57", "(", "14.0", "%", ")", "respectively", "." ] } ]
PMC9622879	To accomplish this setting, we determine the following constraints for variable s(t):26[12pt] $$& _^E_^(t) _^E_^(t) - M (1-s(t)) $$∑i=1NEi,Combuy(t)≥∑i=1NEi,Comsell(t)-M·(1-s(t))27[12pt] $$& _^E_^(t) _^E_^(t) + M s(t), $$∑i=1NEi,Combuy(t)≤∑i=1NEi,Comsell(t)+M·s(t),where M is a very large value that and never exceed; e.g., .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "accomplish", "this", "setting", ",", "we", "determine", "the", "following", "constraints", "for", "variable", "s(t):26[12pt", "]", "$", "$", "&", "_", "^E_^(t", ")", "_", "^E_^(t", ")", "-", "M", "(", "1-s(t", ")", ")", "$", "$", "∑i=1NEi", ",", "Combuy(t)≥∑i=1NEi", ",", "Comsell(t)-M·(1-s(t))27[12pt", "]", "$", "$", "&", "_", "^E_^(t", ")", "_", "^E_^(t", ")", "+", "M", "s(t", ")", ",", "$", "$", "∑i=1NEi", ",", "Combuy(t)≤∑i=1NEi", ",", "Comsell(t)+M·s(t),where", "M", "is", "a", "very", "large", "value", "that", "and", "never", "exceed", ";", "e.g.", ",", "." ] } ]
PMC9429973	The median follow-up was 130 months (range, 13-324) and median treatment duration was 38 months (range, 1–105).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "median", "follow-up", "was", "130", "months", "(", "range", ",", "13", "-", "324", ")", "and", "median", "treatment", "duration", "was", "38", "months", "(", "range", ",", "1–105", ")", "." ] } ]
PMC7887261	300 ng of total RNA from each sample was used to synthesize cDNA by the Superscript III first-strand synthesis system (Invitrogen, #18080051).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "300", "ng", "of", "total", "RNA", "from", "each", "sample", "was", "used", "to", "synthesize", "cDNA", "by", "the", "Superscript", "III", "first-strand", "synthesis", "system", "(", "Invitrogen", ",", "#", "18080051", ")", "." ] } ]
PMC9219615	Differential nuclear staining (DNS) is a live cell imaging assay that uses two nuclear fluorescent dyes to distinguish between live and dead populations based on cell permeability .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Differential", "nuclear", "staining", "(", "DNS", ")", "is", "a", "live", "cell", "imaging", "assay", "that", "uses", "two", "nuclear", "fluorescent", "dyes", "to", "distinguish", "between", "live", "and", "dead", "populations", "based", "on", "cell", "permeability", "." ] } ]
PMC11185260	Sera from tumor bearing mice receiving the indicated treatment were collected on day 35 (top panel) and day 56 (lower panel) and analyzed for levels of liver enzymes (AST and ALT) and BUN, indicators of hepatic and renal toxicity, respectively. *	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Sera", "from", "tumor", "bearing", "mice", "receiving", "the", "indicated", "treatment", "were", "collected", "on", "day", "35", "(", "top", "panel", ")", "and", "day", "56", "(", "lower", "panel", ")", "and", "analyzed", "for", "levels", "of", "liver", "enzymes", "(", "AST", "and", "ALT", ")", "and", "BUN", ",", "indicators", "of", "hepatic", "and", "renal", "toxicity", ",", "respectively", ".", "*" ] } ]
PMC10854447	Calc. (%)	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Calc", ".", "(", "%", ")" ] } ]
PMC11798926	Interestingly, a smaller deletion of residues 161–72 still retains binding to μ2 when normalized for its lower total expression, suggesting that amino acids 173-FLMM-176 could be a noncanonical endocytic signal with a phenylalanine residue instead of a tyrosine.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "a", "smaller", "deletion", "of", "residues", "161–72", "still", "retains", "binding", "to", "μ2", "when", "normalized", "for", "its", "lower", "total", "expression", ",", "suggesting", "that", "amino", "acids", "173-FLMM-176", "could", "be", "a", "noncanonical", "endocytic", "signal", "with", "a", "phenylalanine", "residue", "instead", "of", "a", "tyrosine", "." ] } ]
PMC11612315	These findings suggest that exendin 9–39 directly interacts with TRPV1, independent of GLP-1R, to inhibit its activation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "findings", "suggest", "that", "exendin", "9–39", "directly", "interacts", "with", "TRPV1", ",", "independent", "of", "GLP-1R", ",", "to", "inhibit", "its", "activation", "." ] } ]
PMC11502327	Another interesting study showed that a polymer-loaded system of curcumin respectively increased drug uptake twice for cisplatin-resistant A2780CP cells and six times for metastatic MDA-MB-231 cells, of which the anti-tumor mechanism is related to the enhancement of tumor cell apoptosis induced by Nano-CUR6.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Another", "interesting", "study", "showed", "that", "a", "polymer-loaded", "system", "of", "curcumin", "respectively", "increased", "drug", "uptake", "twice", "for", "cisplatin-resistant", "A2780CP", "cells", "and", "six", "times", "for", "metastatic", "MDA-MB-231", "cells", ",", "of", "which", "the", "anti-tumor", "mechanism", "is", "related", "to", "the", "enhancement", "of", "tumor", "cell", "apoptosis", "induced", "by", "Nano-CUR6", "." ] } ]
PMC11317131	We observed efficiencies up to 21.0% with the highest activity variant (Bxb1-L8-5) increasing 2.5-fold over wildtype Bxb1 integrase (Figure 4C and Supplementary Figure S3b).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "observed", "efficiencies", "up", "to", "21.0", "%", "with", "the", "highest", "activity", "variant", "(", "Bxb1-L8", "-", "5", ")", "increasing", "2.5-fold", "over", "wildtype", "Bxb1", "integrase", "(", "Figure", "4C", "and", "Supplementary", "Figure", "S3b", ")", "." ] } ]
PMC10178190	Lane et al. (2011) reported that elevated IL-6 levels in ascites of ovarian cancer patients correlated to lower progression-free survival rates.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lane", "et", "al.", "(", "2011", ")", "reported", "that", "elevated", "IL-6", "levels", "in", "ascites", "of", "ovarian", "cancer", "patients", "correlated", "to", "lower", "progression-free", "survival", "rates", "." ] } ]
PMC11768281	Dendritic cells (DCs) present Plasmodium antigens to T cell receptors (TCR) on naïve T cells, initiating T cell activation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Dendritic", "cells", "(", "DCs", ")", "present", "Plasmodium", "antigens", "to", "T", "cell", "receptors", "(", "TCR", ")", "on", "naïve", "T", "cells", ",", "initiating", "T", "cell", "activation", "." ] } ]
PMC11266100	Asterisk (*) corresponds to statistically significant differences (p < 0.05).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Asterisk", "(", "*", ")", "corresponds", "to", "statistically", "significant", "differences", "(", "p", "<", "0.05", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Five out of 6 pts had high-risk cytogenetic profiles, including 2 pts with del(17p).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Five", "out", "of", "6", "pts", "had", "high-risk", "cytogenetic", "profiles", ",", "including", "2", "pts", "with", "del(17p", ")", "." ] } ]
PMC11467964	Furthermore, the areas under curves of the ROC curve were 0.852, 0.816, and 0.759 at 1‐, 3‐, and 5‐ year (Figure 5F), indicating that the novel signature was successfully constructed, and it has a practical value in predicting STS patients' survival.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "the", "areas", "under", "curves", "of", "the", "ROC", "curve", "were", "0.852", ",", "0.816", ",", "and", "0.759", "at", "1‐", ",", "3‐", ",", "and", "5‐", "year", "(", "Figure", "5F", ")", ",", "indicating", "that", "the", "novel", "signature", "was", "successfully", "constructed", ",", "and", "it", "has", "a", "practical", "value", "in", "predicting", "STS", "patients", "'", "survival", "." ] } ]
PMC11655536	F The effect of NHE1 inhibitor HA on cell viability in RPMI-8226, U266, MM.1S and ARH-77 cell lines.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "F", "The", "effect", "of", "NHE1", "inhibitor", "HA", "on", "cell", "viability", "in", "RPMI-8226", ",", "U266", ",", "MM.1S", "and", "ARH-77", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC11224020	Granulocytes are eliminated during differentiation because they are nonadherent, whereas macrophages are much more adherent than the other two cell types and stick to the bottom of the plate.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Granulocytes", "are", "eliminated", "during", "differentiation", "because", "they", "are", "nonadherent", ",", "whereas", "macrophages", "are", "much", "more", "adherent", "than", "the", "other", "two", "cell", "types", "and", "stick", "to", "the", "bottom", "of", "the", "plate", "." ] } ]
PMC10253553	The induction of NDRG1 mRNA could also be a response to apoptosis in cells treated with 250 and 1000 nM Torin 2 (Figure 6).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "induction", "of", "NDRG1", "mRNA", "could", "also", "be", "a", "response", "to", "apoptosis", "in", "cells", "treated", "with", "250", "and", "1000", "nM", "Torin", "2", "(", "Figure", "6", ")", "." ] } ]
PMC11015054	IHC (Immunohistochemical Staining Kit, Cell Biological, China) and H&E (H&E Staining Kit, Solarbio, China) were performed on paraffin‐embedded tumor tissues.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IHC", "(", "Immunohistochemical", "Staining", "Kit", ",", "Cell", "Biological", ",", "China", ")", "and", "H&E", "(", "H&E", "Staining", "Kit", ",", "Solarbio", ",", "China", ")", "were", "performed", "on", "paraffin‐embedded", "tumor", "tissues", "." ] } ]
PMC6102174	Interferons (INF-α and PegIFN-α) take effects by enhancing the immune system of patients, but their application is limited by the low curing rate and serious side effects.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interferons", "(", "INF-α", "and", "PegIFN-α", ")", "take", "effects", "by", "enhancing", "the", "immune", "system", "of", "patients", ",", "but", "their", "application", "is", "limited", "by", "the", "low", "curing", "rate", "and", "serious", "side", "effects", "." ] } ]
PMC11587606	Since protein kinase C-ζ (PKCζ) is a critical component of the apicobasal polarity complex of mammary epithelial cells , and is highly expressed in breast cancer cells in the TCGA database (P < 0.01) (Fig. 2A), we investigated RHBDF1 and PKCζ protein levels in human breast cancer tissues and cancer-adjacent normal tissues (para-cancerous tissues).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Since", "protein", "kinase", "C-ζ", "(", "PKCζ", ")", "is", "a", "critical", "component", "of", "the", "apicobasal", "polarity", "complex", "of", "mammary", "epithelial", "cells", ",", "and", "is", "highly", "expressed", "in", "breast", "cancer", "cells", "in", "the", "TCGA", "database", "(", "P", "<", "0.01", ")", "(", "Fig.", "2A", ")", ",", "we", "investigated", "RHBDF1", "and", "PKCζ", "protein", "levels", "in", "human", "breast", "cancer", "tissues", "and", "cancer-adjacent", "normal", "tissues", "(", "para-cancerous", "tissues", ")", "." ] } ]

PMC9479186

On day 5, in the BEL-7404 cells, OD490 of Lv-shNDUFC1 group was only 3.51 ± 0.12, whereas that of Lv-shCtrl group was 5.31 ± 0.10; in the SK-HEP-1 cells, OD490 of Lv-shNDUFC1 group was only 3.51 ± 0.12, whereas that of Lv-shCtrl group was 5.31 ± 0.10.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "day", "5", ",", "in", "the", "BEL-7404", "cells", ",", "OD490", "of", "Lv-shNDUFC1", "group", "was", "only", "3.51", "±", "0.12", ",", "whereas", "that", "of", "Lv-shCtrl", "group", "was", "5.31", "±", "0.10", ";", "in", "the", "SK-HEP-1", "cells", ",", "OD490", "of", "Lv-shNDUFC1", "group", "was", "only", "3.51", "±", "0.12", ",", "whereas", "that", "of", "Lv-shCtrl", "group", "was", "5.31", "±", "0.10", "." ] } ]

PMC9429973

Also, there was no significant difference in proportion of patients achieving complete (53% vs 66%) or partial response (24% vs 19%) between patients exposed and non-exposed to statins.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Also", ",", "there", "was", "no", "significant", "difference", "in", "proportion", "of", "patients", "achieving", "complete", "(", "53", "%", "vs", "66", "%", ")", "or", "partial", "response", "(", "24", "%", "vs", "19", "%", ")", "between", "patients", "exposed", "and", "non-exposed", "to", "statins", "." ] } ]

PMC11453018

We proceeded to assess the potential synergistic effects of these senolytics when combined with iP300w, testing each senolytic across a concentration range from 0 to 50 μM. Dasatinib displayed an IC50 between 1–10 μM, while Fisetin and Navitoclax fell within the 20–50 μM range (Supplementary Fig. 7B, C).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "proceeded", "to", "assess", "the", "potential", "synergistic", "effects", "of", "these", "senolytics", "when", "combined", "with", "iP300w", ",", "testing", "each", "senolytic", "across", "a", "concentration", "range", "from", "0", "to", "50", "μM.", "Dasatinib", "displayed", "an", "IC50", "between", "1–10", "μM", ",", "while", "Fisetin", "and", "Navitoclax", "fell", "within", "the", "20–50", "μM", "range", "(", "Supplementary", "Fig.", "7B", ",", "C", ")", "." ] } ]

PMC9429973

A. Sissoko, A. Fricot, L. Dumas, C. Roussel, S. Manceau, C. Capito, S. Allali, N. Yekkache, M. Dussiot, Y. NGUYEN, A. Lefort, B. Aussilhou, M. Tichit, D. Hardy, B. Maître, A. Michel, M. De Montalembert, M. Cavazzana, L. Joseph, P. Buffet UMR-S 1134 BIGR, APHP, GREx; UMR-S 1134 BIGR “biologie intégrée du globule rouge”, Université de Paris, UMR-S 1134 BIGR “biologie intégrée du globule rouge”; UMR-S 1134 BIGR “biologie intégrée du globule rouge”, Inserm/Université de Paris, UMR-S 1134 BIGR “biologie intégrée du globule rouge”; APHP, Paris, Assistance Publique Hôpitaux de Paris; GR-Ex, Paris, France.,

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "Sissoko", ",", "A.", "Fricot", ",", "L.", "Dumas", ",", "C.", "Roussel", ",", "S.", "Manceau", ",", "C.", "Capito", ",", "S.", "Allali", ",", "N.", "Yekkache", ",", "M.", "Dussiot", ",", "Y.", "NGUYEN", ",", "A.", "Lefort", ",", "B.", "Aussilhou", ",", "M.", "Tichit", ",", "D.", "Hardy", ",", "B.", "Maître", ",", "A.", "Michel", ",", "M.", "De", "Montalembert", ",", "M.", "Cavazzana", ",", "L.", "Joseph", ",", "P.", "Buffet", "UMR-S", "1134", "BIGR", ",", "APHP", ",", "GREx", ";", "UMR-S", "1134", "BIGR", "“", "biologie", "intégrée", "du", "globule", "rouge", "”", ",", "Université", "de", "Paris", ",", "UMR-S", "1134", "BIGR", "“", "biologie", "intégrée", "du", "globule", "rouge", "”", ";", "UMR-S", "1134", "BIGR", "“", "biologie", "intégrée", "du", "globule", "rouge", "”", ",", "Inserm/Université", "de", "Paris", ",", "UMR-S", "1134", "BIGR", "“", "biologie", "intégrée", "du", "globule", "rouge", "”", ";", "APHP", ",", "Paris", ",", "Assistance", "Publique", "Hôpitaux", "de", "Paris", ";", "GR-Ex", ",", "Paris", ",", "France", ".", "," ] } ]

PMC11741906

These findings suggested that high expression of these four miRNAs correlated with poor overall survival of ovarian cancer patients.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "findings", "suggested", "that", "high", "expression", "of", "these", "four", "miRNAs", "correlated", "with", "poor", "overall", "survival", "of", "ovarian", "cancer", "patients", "." ] } ]

PMC8170755

Based on our findings and the effects of VPA on Nm23-H1, epigenetic alternations of this gene in A459 cancer cells may also be a mechanism involved in the metastatic behavior of lung cancer cells.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Based", "on", "our", "findings", "and", "the", "effects", "of", "VPA", "on", "Nm23-H1", ",", "epigenetic", "alternations", "of", "this", "gene", "in", "A459", "cancer", "cells", "may", "also", "be", "a", "mechanism", "involved", "in", "the", "metastatic", "behavior", "of", "lung", "cancer", "cells", "." ] } ]

PMC11783017

By regulating the levels of MYC and ICD, the proportion of M1 macrophages and mature dendritic cells were enhanced and thereby strengthening anti-tumor immunity to inhibit MYC-amplified osteosarcoma growth and metastasis.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "regulating", "the", "levels", "of", "MYC", "and", "ICD", ",", "the", "proportion", "of", "M1", "macrophages", "and", "mature", "dendritic", "cells", "were", "enhanced", "and", "thereby", "strengthening", "anti-tumor", "immunity", "to", "inhibit", "MYC-amplified", "osteosarcoma", "growth", "and", "metastasis", "." ] } ]

PMC11024707

The relationship between the mi-RNA levels and the scales was examined using correlation analyses.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "relationship", "between", "the", "mi-RNA", "levels", "and", "the", "scales", "was", "examined", "using", "correlation", "analyses", "." ] } ]

PMC11119602

Although there has been significant progress in the treatment of HCC over the past decades, drug resistance to chemotherapy remains a major obstacle in its successful management.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "there", "has", "been", "significant", "progress", "in", "the", "treatment", "of", "HCC", "over", "the", "past", "decades", ",", "drug", "resistance", "to", "chemotherapy", "remains", "a", "major", "obstacle", "in", "its", "successful", "management", "." ] } ]

PMC10006224

Experiments were performed three times with similar results.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Experiments", "were", "performed", "three", "times", "with", "similar", "results", "." ] } ]

PMC9429973

We also analyzed the expression of pro and anti-inflammatory markers and NO production by flow cytometry.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "also", "analyzed", "the", "expression", "of", "pro", "and", "anti-inflammatory", "markers", "and", "NO", "production", "by", "flow", "cytometry", "." ] } ]

PMC11706491

Pellets were resuspended in Tris buffer (0.1 M Tris—HCl (pH 8.0), 1 mM EDTA, 1% SDS), loading buffer was added and samples were boiled for 5 min at 100°C.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pellets", "were", "resuspended", "in", "Tris", "buffer", "(", "0.1", "M", "Tris", "—", "HCl", "(", "pH", "8.0", ")", ",", "1", "mM", "EDTA", ",", "1", "%", "SDS", ")", ",", "loading", "buffer", "was", "added", "and", "samples", "were", "boiled", "for", "5", "min", "at", "100", "°", "C", "." ] } ]

PMC11536589

The intracellular GSH level was assessed in parental PDAC cells and MRTX1133-resistant PDAC cells. (

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "intracellular", "GSH", "level", "was", "assessed", "in", "parental", "PDAC", "cells", "and", "MRTX1133-resistant", "PDAC", "cells", ".", "(" ] } ]

PMC10551595

1% l‐glutamine (Gibco) was added to culture medium for the NALM6 cell line and patient primary cells.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "1", "%", "l‐glutamine", "(", "Gibco", ")", "was", "added", "to", "culture", "medium", "for", "the", "NALM6", "cell", "line", "and", "patient", "primary", "cells", "." ] } ]

PMC4270159

Treatment of a control cell line with the growth factor ligand alone.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Treatment", "of", "a", "control", "cell", "line", "with", "the", "growth", "factor", "ligand", "alone", "." ] } ]

PMC9429973

Despite higher CR/CRi, ASXL1 mutated patients had shortened mOS due to higher relapse.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Despite", "higher", "CR/CRi", ",", "ASXL1", "mutated", "patients", "had", "shortened", "mOS", "due", "to", "higher", "relapse", "." ] } ]

PMC11773391

Among DNA repair systems, MGMT‐mediated repair is unique relative to many complex DNA repair mechanisms.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "DNA", "repair", "systems", ",", "MGMT‐mediated", "repair", "is", "unique", "relative", "to", "many", "complex", "DNA", "repair", "mechanisms", "." ] } ]

PMC9592219

Therefore, we assessed the clinical benefits of dabrafenib and refametinib.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "we", "assessed", "the", "clinical", "benefits", "of", "dabrafenib", "and", "refametinib", "." ] } ]

PMC8336407

In the group treated with the extract concentration of 1.5 mg/mL and 200 μM t-BHP, the cell viability decreased to 72.52 ± 1.1% (p < 0.001).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "group", "treated", "with", "the", "extract", "concentration", "of", "1.5", "mg/mL", "and", "200", "μM", "t-BHP", ",", "the", "cell", "viability", "decreased", "to", "72.52", "±", "1.1", "%", "(", "p", "<", "0.001", ")", "." ] } ]

PMC10758402

After 9 days, when the tumor volumes reached about 100mm, DMF (200mg/kg) or vehicle alone was injected intratumorally.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "9", "days", ",", "when", "the", "tumor", "volumes", "reached", "about", "100", "mm", ",", "DMF", "(", "200mg/kg", ")", "or", "vehicle", "alone", "was", "injected", "intratumorally", "." ] } ]

PMC9429973

Secondary endpoints were changes of TNF-α & sIL2R serum pre-& post-chemotherapy.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Secondary", "endpoints", "were", "changes", "of", "TNF-α", "&", "sIL2R", "serum", "pre-", "&", "post-chemotherapy", "." ] } ]

PMC8345486

When the plasma membrane is depolarized, its permeability increases and the dye penetrates through the membrane, leading to enhanced green fluorescence.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "the", "plasma", "membrane", "is", "depolarized", ",", "its", "permeability", "increases", "and", "the", "dye", "penetrates", "through", "the", "membrane", ",", "leading", "to", "enhanced", "green", "fluorescence", "." ] } ]

PMC11264242

Our results support a role for FYN in attenuation of anti-cancer activity upon inhibition of SS18-SSX function and demonstrate the feasibility of targeting FYN to improve the effectiveness of HDACi treatment against synovial sarcoma.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "results", "support", "a", "role", "for", "FYN", "in", "attenuation", "of", "anti-cancer", "activity", "upon", "inhibition", "of", "SS18-SSX", "function", "and", "demonstrate", "the", "feasibility", "of", "targeting", "FYN", "to", "improve", "the", "effectiveness", "of", "HDACi", "treatment", "against", "synovial", "sarcoma", "." ] } ]

PMC11746948

The target sequences of the genes in this study are listed in Supplementary Table 2.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "target", "sequences", "of", "the", "genes", "in", "this", "study", "are", "listed", "in", "Supplementary", "Table", "2", "." ] } ]

PMC10198699

First, the fact that there are certain restrictions on what owners may lawfully do with their property does not mean that there is no ownership.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "First", ",", "the", "fact", "that", "there", "are", "certain", "restrictions", "on", "what", "owners", "may", "lawfully", "do", "with", "their", "property", "does", "not", "mean", "that", "there", "is", "no", "ownership", "." ] } ]

PMC10810426

For example, the HIV-2 capsid is more labile than the HIV-1 capsid and is more susceptible to nucleic acid sensors .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "example", ",", "the", "HIV-2", "capsid", "is", "more", "labile", "than", "the", "HIV-1", "capsid", "and", "is", "more", "susceptible", "to", "nucleic", "acid", "sensors", "." ] } ]

PMC9429973

Nevertheless, the prevalence of homozygous (Homo) and heterozygous (Hetero) G17V mutations and the difference in their oncogenicity due to its zygosity remain unclear.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nevertheless", ",", "the", "prevalence", "of", "homozygous", "(", "Homo", ")", "and", "heterozygous", "(", "Hetero", ")", "G17V", "mutations", "and", "the", "difference", "in", "their", "oncogenicity", "due", "to", "its", "zygosity", "remain", "unclear", "." ] } ]

PMC10538569

Of note, blocking egress of migratory T cells from lymph nodes into efferent lymph vessels and interrupting T cell recirculation by the use of a S1PR1 (sphingosine 1-phosphate receptor 1) antagonist FTY720 at early onset of HIV-1 infection resulted in limited HIV-1 dissemination and reduction of plasma viremia (16), indicating that cell-cell transmission of HIV-1 may be important in establishment of systemic HIV-1 infection.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "note", ",", "blocking", "egress", "of", "migratory", "T", "cells", "from", "lymph", "nodes", "into", "efferent", "lymph", "vessels", "and", "interrupting", "T", "cell", "recirculation", "by", "the", "use", "of", "a", "S1PR1", "(", "sphingosine", "1-phosphate", "receptor", "1", ")", "antagonist", "FTY720", "at", "early", "onset", "of", "HIV-1", "infection", "resulted", "in", "limited", "HIV-1", "dissemination", "and", "reduction", "of", "plasma", "viremia", "(", "16", ")", ",", "indicating", "that", "cell-cell", "transmission", "of", "HIV-1", "may", "be", "important", "in", "establishment", "of", "systemic", "HIV-1", "infection", "." ] } ]

PMC9105697

As each breakpoint has a unique sequence, this allows tracking of each tumor individually with high specificity.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "each", "breakpoint", "has", "a", "unique", "sequence", ",", "this", "allows", "tracking", "of", "each", "tumor", "individually", "with", "high", "specificity", "." ] } ]

PMC8633974

a-b) Insertion-deletion profiles among the generated gRNAs obtained through a co-transfection screen were assessed by the Synthego ICE v2.0 algorithm.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "a-b", ")", "Insertion-deletion", "profiles", "among", "the", "generated", "gRNAs", "obtained", "through", "a", "co-transfection", "screen", "were", "assessed", "by", "the", "Synthego", "ICE", "v2.0", "algorithm", "." ] } ]

PMC9429973

Paired sample t-test was used to compare continuous semen analysis parameters before and after TKI therapy.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Paired", "sample", "t-test", "was", "used", "to", "compare", "continuous", "semen", "analysis", "parameters", "before", "and", "after", "TKI", "therapy", "." ] } ]

PMC9429973

SCF/IL-6 dependent HPC cells are kept on agarose-coated plates to prevent adherence-induced myeloid differentiation.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SCF/IL-6", "dependent", "HPC", "cells", "are", "kept", "on", "agarose-coated", "plates", "to", "prevent", "adherence-induced", "myeloid", "differentiation", "." ] } ]

PMC11543885

Lysis buffer (10 mL)ReagentStock concentrationFinal concentrationAmountRIPA lysis bufferN/AN/A700 μLTrolox500 mM5 mM100 μLSodium ascorbate1 M10 mM100 μLSodium azide1 M10 mM100 μLPhosSTOP phosphatase inhibitorN/AN/A1 tabletcOmplete, Mini, EDTA-free ProteaseN/AN/A1 tabletTotalN/AN/A10 mL CRITICAL: Should be freshly prepared before use.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lysis", "buffer", "(", "10", "mL)ReagentStock", "concentrationFinal", "concentrationAmountRIPA", "lysis", "bufferN/AN/A700", "μLTrolox500", "mM5", "mM100", "μLSodium", "ascorbate1", "M10", "mM100", "μLSodium", "azide1", "M10", "mM100", "μLPhosSTOP", "phosphatase", "inhibitorN/AN/A1", "tabletcOmplete", ",", "Mini", ",", "EDTA-free", "ProteaseN/AN/A1", "tabletTotalN/AN/A10", "mL", "CRITICAL", ":", "Should", "be", "freshly", "prepared", "before", "use", "." ] } ]

PMC11543885

Plot ROC Curve: Plot TPR against FPR to generate a ROC curve.e.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Plot", "ROC", "Curve", ":", "Plot", "TPR", "against", "FPR", "to", "generate", "a", "ROC", "curve.e", "." ] } ]

PMC11257988

However, the oncogenic mutation of KRAS protein interferes with GTP hydrolysis, causing the protein to remain in an active GTP state and continuously transmit signals to the downstream pathway to recruit and activate the proteins required for growth factor and other receptors (such as RAF and PI3K) signal transduction .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "oncogenic", "mutation", "of", "KRAS", "protein", "interferes", "with", "GTP", "hydrolysis", ",", "causing", "the", "protein", "to", "remain", "in", "an", "active", "GTP", "state", "and", "continuously", "transmit", "signals", "to", "the", "downstream", "pathway", "to", "recruit", "and", "activate", "the", "proteins", "required", "for", "growth", "factor", "and", "other", "receptors", "(", "such", "as", "RAF", "and", "PI3", "K", ")", "signal", "transduction", "." ] } ]

PMC11683240

Cells were incubated at 4 °C during the experiment to allow binding but prevent internalization.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "incubated", "at", "4", "°", "C", "during", "the", "experiment", "to", "allow", "binding", "but", "prevent", "internalization", "." ] } ]

PMC11635519

Immediately after adding the reagent, samples were read using a luminometer with a 480 nm filter.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Immediately", "after", "adding", "the", "reagent", ",", "samples", "were", "read", "using", "a", "luminometer", "with", "a", "480", "nm", "filter", "." ] } ]

PMC11530949

The physicochemical properties of the NPs were evaluated using various techniques such as Field emission scanning electron microscopy (FESEM), Transmission Electron Microscope (TEM), X-ray diffraction (XRD), and Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "physicochemical", "properties", "of", "the", "NPs", "were", "evaluated", "using", "various", "techniques", "such", "as", "Field", "emission", "scanning", "electron", "microscopy", "(", "FESEM", ")", ",", "Transmission", "Electron", "Microscope", "(", "TEM", ")", ",", "X-ray", "diffraction", "(", "XRD", ")", ",", "and", "Fourier-transform", "infrared", "spectroscopy", "(", "FTIR", ")", "." ] } ]

PMC11477621

On one hand, it may be attributed to off-target effects, as hydroxamic acid is known for its non-specific metal binding capability .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "one", "hand", ",", "it", "may", "be", "attributed", "to", "off-target", "effects", ",", "as", "hydroxamic", "acid", "is", "known", "for", "its", "non-specific", "metal", "binding", "capability", "." ] } ]

PMC11781181

Considering these data, we concluded that ferroptosis inhibitors may be potential therapeutic agents for SJS/TEN treatment in the future.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Considering", "these", "data", ",", "we", "concluded", "that", "ferroptosis", "inhibitors", "may", "be", "potential", "therapeutic", "agents", "for", "SJS/TEN", "treatment", "in", "the", "future", "." ] } ]

PMC10538569

Consequently, CEMss-CCR5-CR2N cells are rendered completely resistant to CCR5-tropic HIV-1 Yu-2 infection (41).

[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consequently", ",", "CEMss-CCR5-CR2N", "cells", "are", "rendered", "completely", "resistant", "to", "CCR5-tropic", "HIV-1", "Yu-2", "infection", "(", "41", ")", "." ] } ]

PMC10852540

The other type is those that trigger apoptosis such as BAX, Bcl-Xs, Bik/Nbk and Bid29.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "other", "type", "is", "those", "that", "trigger", "apoptosis", "such", "as", "BAX", ",", "Bcl-Xs", ",", "Bik/Nbk", "and", "Bid29", "." ] } ]

PMC10253973

As metal ions and metals are needed to maintain biological processes, they are often used in the medical diagnostics and treatment .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "metal", "ions", "and", "metals", "are", "needed", "to", "maintain", "biological", "processes", ",", "they", "are", "often", "used", "in", "the", "medical", "diagnostics", "and", "treatment", "." ] } ]

PMC4277423

However, further side-by-side study is needed to compare CCR5 gene disruption by these three gene editing approaches.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "further", "side-by-side", "study", "is", "needed", "to", "compare", "CCR5", "gene", "disruption", "by", "these", "three", "gene", "editing", "approaches", "." ] } ]

PMC11247842

Annotation of variants by Variants Effect Predictor (VEP) is another common option used.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Annotation", "of", "variants", "by", "Variants", "Effect", "Predictor", "(", "VEP", ")", "is", "another", "common", "option", "used", "." ] } ]

PMC11322866

Similar to the treatment in (C).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Similar", "to", "the", "treatment", "in", "(", "C", ")", "." ] } ]

PMC11588008

The activation of ERK1/2–Nrf2 can up-regulate the expression of HO-1 and reduce the level of cellular OS .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "activation", "of", "ERK1/2–Nrf2", "can", "up-regulate", "the", "expression", "of", "HO-1", "and", "reduce", "the", "level", "of", "cellular", "OS", "." ] } ]

PMC5673060

This may be the result of previously reported restricted pTyr motifs recognised by anti-phosphotyrosine antibodies used in the immunoprecipitation .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "may", "be", "the", "result", "of", "previously", "reported", "restricted", "pTyr", "motifs", "recognised", "by", "anti-phosphotyrosine", "antibodies", "used", "in", "the", "immunoprecipitation", "." ] } ]

PMC5386478

Furthermore, we show that in cells derived from biphasic MPM, the levels of expressed TG2 and transamidating activity significantly increase in response to chronic hypoxia.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "we", "show", "that", "in", "cells", "derived", "from", "biphasic", "MPM", ",", "the", "levels", "of", "expressed", "TG2", "and", "transamidating", "activity", "significantly", "increase", "in", "response", "to", "chronic", "hypoxia", "." ] } ]

PMC8777939

Cell cycle distributions were analyzed by flow cytometry (BD Bioscience Accuri C6).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "cycle", "distributions", "were", "analyzed", "by", "flow", "cytometry", "(", "BD", "Bioscience", "Accuri", "C6", ")", "." ] } ]

PMC11738017

The figures represent 3 different anti-BCMA TCEs, namely teclistamab, elranatamab, and alnuctamab, and their respective reported BCMA KD off rates.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "figures", "represent", "3", "different", "anti-BCMA", "TCEs", ",", "namely", "teclistamab", ",", "elranatamab", ",", "and", "alnuctamab", ",", "and", "their", "respective", "reported", "BCMA", "KD", "off", "rates", "." ] } ]

PMC11740399

Following incubation with the respective treatments for 2 h, the cells were washed with cold PBS to remove excess particles.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Following", "incubation", "with", "the", "respective", "treatments", "for", "2", "h", ",", "the", "cells", "were", "washed", "with", "cold", "PBS", "to", "remove", "excess", "particles", "." ] } ]

PMC6771295

The datasets generated for this study are available on request to the corresponding author.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "datasets", "generated", "for", "this", "study", "are", "available", "on", "request", "to", "the", "corresponding", "author", "." ] } ]

PMC11786156

The following clinical data of the patients were collected from the medical records of Fukushima Medical University: age, sex, original organs of the tissue specimens, number of extra-nodal lesions, presence of bone marrow or peripheral blood involvement, clinical stage, presence of B symptoms, international prognostic index (IPI), cause of death, and survival period.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "following", "clinical", "data", "of", "the", "patients", "were", "collected", "from", "the", "medical", "records", "of", "Fukushima", "Medical", "University", ":", "age", ",", "sex", ",", "original", "organs", "of", "the", "tissue", "specimens", ",", "number", "of", "extra-nodal", "lesions", ",", "presence", "of", "bone", "marrow", "or", "peripheral", "blood", "involvement", ",", "clinical", "stage", ",", "presence", "of", "B", "symptoms", ",", "international", "prognostic", "index", "(", "IPI", ")", ",", "cause", "of", "death", ",", "and", "survival", "period", "." ] } ]

PMC11122631

Within all Clavularia species, four species, namely C. viridis, C. inflata, C. kentingsnsis, and C. koellikeri, were found in Taiwan.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Within", "all", "Clavularia", "species", ",", "four", "species", ",", "namely", "C.", "viridis", ",", "C.", "inflata", ",", "C.", "kentingsnsis", ",", "and", "C.", "koellikeri", ",", "were", "found", "in", "Taiwan", "." ] } ]

PMC11413393

Cell lines RCC22, RCC162, RCC222, RCC243, RCC323, RCC364 and RCC407 were generated as previously described in Lobo et al.. The continued use of these patient-derived lines is approved under UHN Research Ethics Board approval, protocol #15-9559.

[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "lines", "RCC22", ",", "RCC162", ",", "RCC222", ",", "RCC243", ",", "RCC323", ",", "RCC364", "and", "RCC407", "were", "generated", "as", "previously", "described", "in", "Lobo", "et", "al", "..", "The", "continued", "use", "of", "these", "patient-derived", "lines", "is", "approved", "under", "UHN", "Research", "Ethics", "Board", "approval", ",", "protocol", "#", "15", "-", "9559", "." ] } ]

PMC9031474

Felix et al. observed reduced expression of survivin—an antiapoptotic protein critical in apoptosis resistance of cancer cells—in Colo-320 cells after the addition of the drimane lactone 75 (Figure 18) .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Felix", "et", "al.", "observed", "reduced", "expression", "of", "survivin", "—", "an", "antiapoptotic", "protein", "critical", "in", "apoptosis", "resistance", "of", "cancer", "cells", "—", "in", "Colo-320", "cells", "after", "the", "addition", "of", "the", "drimane", "lactone", "75", "(", "Figure", "18", ")", "." ] } ]

PMC9919300

To investigate the molecular pathways involved in human fatty liver we used a microarray approach aimed at evaluating the expression of genes related to insulin and adipokine signaling, metabolic pathways, inflammatory response, and apoptosis.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "investigate", "the", "molecular", "pathways", "involved", "in", "human", "fatty", "liver", "we", "used", "a", "microarray", "approach", "aimed", "at", "evaluating", "the", "expression", "of", "genes", "related", "to", "insulin", "and", "adipokine", "signaling", ",", "metabolic", "pathways", ",", "inflammatory", "response", ",", "and", "apoptosis", "." ] } ]

PMC8759873

The proliferation and apoptosis of cells were measured to clarify the inhibitory effect of the VHL gene in renal cell carcinoma.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "proliferation", "and", "apoptosis", "of", "cells", "were", "measured", "to", "clarify", "the", "inhibitory", "effect", "of", "the", "VHL", "gene", "in", "renal", "cell", "carcinoma", "." ] } ]

PMC11711127

Ageing is a natural biological process that occurs due to the accumulation of a wide variety of molecular and cellular damage over time and results in the decline of physiological functions.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ageing", "is", "a", "natural", "biological", "process", "that", "occurs", "due", "to", "the", "accumulation", "of", "a", "wide", "variety", "of", "molecular", "and", "cellular", "damage", "over", "time", "and", "results", "in", "the", "decline", "of", "physiological", "functions", "." ] } ]

PMC11705862

SH-SY5Y cells were seeded on and harvested from a petri dish by trypsinization (5 × 10 cells).

[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SH-SY5Y", "cells", "were", "seeded", "on", "and", "harvested", "from", "a", "petri", "dish", "by", "trypsinization", "(", "5", "×", "10", "cells", ")", "." ] } ]

PMC9429973

P. Strati, E. Hawkes, N. Ghosh, J. Tuscano, Q. Chu, M. A. Anderson, A. Patel, M. R. Burgess, K. Hege, S. Chhagan, S. Boyanapalli, T. Day, F. Shen, A. Mehta The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, United States of America; Austin Health–Austin Hospital, Heidelberg, Australia; Levine Cancer Institute, Charlotte; University of California, Davis, Sacramento, United States of America; Cross Cancer Institute, Edmonton, Canada; Peter MacCallum Cancer Centre, Melbourne, Australia; Bristol Myers Squibb, Princeton; University of Alabama at Birmingham, Birmingham, United States of America Background: CD47 is a cell-surface ligand overexpressed in various malignancies that binds to SIRPα on effector macrophages to promote tumor cell evasion of phagocytosis.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P.", "Strati", ",", "E.", "Hawkes", ",", "N.", "Ghosh", ",", "J.", "Tuscano", ",", "Q.", "Chu", ",", "M.", "A.", "Anderson", ",", "A.", "Patel", ",", "M.", "R.", "Burgess", ",", "K.", "Hege", ",", "S.", "Chhagan", ",", "S.", "Boyanapalli", ",", "T.", "Day", ",", "F.", "Shen", ",", "A.", "Mehta", "The", "University", "of", "Texas", "MD", "Anderson", "Cancer", "Center", ",", "Houston", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Austin", "Health", "–", "Austin", "Hospital", ",", "Heidelberg", ",", "Australia", ";", "Levine", "Cancer", "Institute", ",", "Charlotte", ";", "University", "of", "California", ",", "Davis", ",", "Sacramento", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Cross", "Cancer", "Institute", ",", "Edmonton", ",", "Canada", ";", "Peter", "MacCallum", "Cancer", "Centre", ",", "Melbourne", ",", "Australia", ";", "Bristol", "Myers", "Squibb", ",", "Princeton", ";", "University", "of", "Alabama", "at", "Birmingham", ",", "Birmingham", ",", "United", "States", "of", "America", "Background", ":", "CD47", "is", "a", "cell-surface", "ligand", "overexpressed", "in", "various", "malignancies", "that", "binds", "to", "SIRPα", "on", "effector", "macrophages", "to", "promote", "tumor", "cell", "evasion", "of", "phagocytosis", "." ] } ]

PMC5363531

Western blot analyses reported in Figure 4C show the expression data obtained after treatment with both drugs at IC50 doses (upper panel).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Western", "blot", "analyses", "reported", "in", "Figure", "4C", "show", "the", "expression", "data", "obtained", "after", "treatment", "with", "both", "drugs", "at", "IC50", "doses", "(", "upper", "panel", ")", "." ] } ]

PMC11451829

The protocols were approved by the Committee of Ethics for the Use of Experimental Animals for the School of Medicine of Tecnologico de Monterrey (2023-002-R2).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "protocols", "were", "approved", "by", "the", "Committee", "of", "Ethics", "for", "the", "Use", "of", "Experimental", "Animals", "for", "the", "School", "of", "Medicine", "of", "Tecnologico", "de", "Monterrey", "(", "2023", "-", "002-R2", ")", "." ] } ]

PMC6600253

Hinds and Pietruska have collated the relevant content in a previous literature review .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hinds", "and", "Pietruska", "have", "collated", "the", "relevant", "content", "in", "a", "previous", "literature", "review", "." ] } ]

PMC11055323

p < 0.0001.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.0001", "." ] } ]

PMC11673128

All cell lines were cultured in Roswell Park Memorial Institute (RPMI) 1640 (Euroclone, Milan, Italy) with 10% fetal bovine serum (FBS; Euroclone, Milan, Italy), 1 mM L-glutamine and 100 U/mL penicillin/streptomycin (Euroclone, Milan, Italy), in a humidified, 5% CO2 incubator at 37 °C.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "cell", "lines", "were", "cultured", "in", "Roswell", "Park", "Memorial", "Institute", "(", "RPMI", ")", "1640", "(", "Euroclone", ",", "Milan", ",", "Italy", ")", "with", "10", "%", "fetal", "bovine", "serum", "(", "FBS", ";", "Euroclone", ",", "Milan", ",", "Italy", ")", ",", "1", "mM", "L-glutamine", "and", "100", "U/mL", "penicillin/streptomycin", "(", "Euroclone", ",", "Milan", ",", "Italy", ")", ",", "in", "a", "humidified", ",", "5", "%", "CO2", "incubator", "at", "37", "°", "C", "." ] } ]

PMC11707577

T1 excited state can be populated via intersystem crossing from S1 to T1.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "T1", "excited", "state", "can", "be", "populated", "via", "intersystem", "crossing", "from", "S1", "to", "T1", "." ] } ]

PMC9848491

IC50 of ABT.263 in high and low risk groups. (

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IC50", "of", "ABT.263", "in", "high", "and", "low", "risk", "groups", ".", "(" ] } ]

PMC11612315

After washing five times with lysis buffer, the complexes were mixed with lysis buffer containing 290 mM imidazole, and the bound proteins were eluted by boiling in 5× sodium dodecyl sulfate (SDS) loading buffer for 5 min.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "washing", "five", "times", "with", "lysis", "buffer", ",", "the", "complexes", "were", "mixed", "with", "lysis", "buffer", "containing", "290", "mM", "imidazole", ",", "and", "the", "bound", "proteins", "were", "eluted", "by", "boiling", "in", "5", "×", "sodium", "dodecyl", "sulfate", "(", "SDS", ")", "loading", "buffer", "for", "5", "min", "." ] } ]

PMC6450504

Lane 1 shows FBS diluted to 2.5% (v/v), lanes 2 and 3 are 0% PEIPOS and 0.5% PEIPOS and lane 4 is a PEGylated liposomal formulation (3 mol% PEG2000-PE). (

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lane", "1", "shows", "FBS", "diluted", "to", "2.5", "%", "(", "v/v", ")", ",", "lanes", "2", "and", "3", "are", "0", "%", "PEIPOS", "and", "0.5", "%", "PEIPOS", "and", "lane", "4", "is", "a", "PEGylated", "liposomal", "formulation", "(", "3", "mol%", "PEG2000-PE", ")", ".", "(" ] } ]

PMC8343815

As cervical cancer cells are radioresistant, radiotherapy success for patients with cervical cancer depends on better dose enhancement, which can be achieved by radiosensitizers; therefore, type and shape of gold nanomaterials are among factors, which may help achieve this goal.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "cervical", "cancer", "cells", "are", "radioresistant", ",", "radiotherapy", "success", "for", "patients", "with", "cervical", "cancer", "depends", "on", "better", "dose", "enhancement", ",", "which", "can", "be", "achieved", "by", "radiosensitizers", ";", "therefore", ",", "type", "and", "shape", "of", "gold", "nanomaterials", "are", "among", "factors", ",", "which", "may", "help", "achieve", "this", "goal", "." ] } ]

PMC9429973

50% presented the episode in the setting of thrombotic microangiopathy, or suspicion of it.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "50", "%", "presented", "the", "episode", "in", "the", "setting", "of", "thrombotic", "microangiopathy", ",", "or", "suspicion", "of", "it", "." ] } ]

PMC11194678

It is worth noting that STAU1 levels in HepG2, SW1990, as well as Caco-2 cells were dramatically higher than those in other cells; correspondingly, the puncta sizes of endogenous STAU1 in the three cancer cells were also significantly larger (Fig. 1, A–C).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "worth", "noting", "that", "STAU1", "levels", "in", "HepG2", ",", "SW1990", ",", "as", "well", "as", "Caco-2", "cells", "were", "dramatically", "higher", "than", "those", "in", "other", "cells", ";", "correspondingly", ",", "the", "puncta", "sizes", "of", "endogenous", "STAU1", "in", "the", "three", "cancer", "cells", "were", "also", "significantly", "larger", "(", "Fig.", "1", ",", "A", "–", "C", ")", "." ] } ]

PMC9429973

Of these, 94 (79.6%) were treated at the preliminary RP2D, including 51 (54.3%) participants with CLL/SLL.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "these", ",", "94", "(", "79.6", "%", ")", "were", "treated", "at", "the", "preliminary", "RP2D", ",", "including", "51", "(", "54.3", "%", ")", "participants", "with", "CLL/SLL", "." ] } ]

PMC11585254

Using bioluminescence resonance energy transfer, we show that β-arrestin1 and β-arrestin2 are dose-dependently recruited to CXCR5 by its cognate ligand C-X-C motif chemokine ligand 13 (CXCL13).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Using", "bioluminescence", "resonance", "energy", "transfer", ",", "we", "show", "that", "β-arrestin1", "and", "β-arrestin2", "are", "dose-dependently", "recruited", "to", "CXCR5", "by", "its", "cognate", "ligand", "C-X-C", "motif", "chemokine", "ligand", "13", "(", "CXCL13", ")", "." ] } ]

PMC10890307

Our results indicate that in the presence of glucose and hypoxia, the µ of lung cancer cells MCF-7 and MRC-5 slightly increased with acidosis in comparison to neutral conditions (except A549), while the specific rate of glucose consumption and lactate production diminished with acidosis in contrast with neutral conditions.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "results", "indicate", "that", "in", "the", "presence", "of", "glucose", "and", "hypoxia", ",", "the", "µ", "of", "lung", "cancer", "cells", "MCF-7", "and", "MRC-5", "slightly", "increased", "with", "acidosis", "in", "comparison", "to", "neutral", "conditions", "(", "except", "A549", ")", ",", "while", "the", "specific", "rate", "of", "glucose", "consumption", "and", "lactate", "production", "diminished", "with", "acidosis", "in", "contrast", "with", "neutral", "conditions", "." ] } ]

PMC11266100

It can be seen (Figure 3) that the buffers are not toxic by themselves, however, when combined with electric field the overall toxicity of the treatment starts to rise and is also are highly dependent on buffer composition.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "can", "be", "seen", "(", "Figure", "3", ")", "that", "the", "buffers", "are", "not", "toxic", "by", "themselves", ",", "however", ",", "when", "combined", "with", "electric", "field", "the", "overall", "toxicity", "of", "the", "treatment", "starts", "to", "rise", "and", "is", "also", "are", "highly", "dependent", "on", "buffer", "composition", "." ] } ]

PMC9429973

New atrial fibrillation and grade ≥3 any-cause toxicity occurred in 3/59 pts (5.8%) and 8/57 (14.0%) respectively.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "New", "atrial", "fibrillation", "and", "grade", "≥3", "any-cause", "toxicity", "occurred", "in", "3/59", "pts", "(", "5.8", "%", ")", "and", "8/57", "(", "14.0", "%", ")", "respectively", "." ] } ]

PMC9622879

To accomplish this setting, we determine the following constraints for variable s(t):26[12pt] $$& _^E_^(t) _^E_^(t) - M (1-s(t)) $$∑i=1NEi,Combuy(t)≥∑i=1NEi,Comsell(t)-M·(1-s(t))27[12pt] $$& _^E_^(t) _^E_^(t) + M s(t), $$∑i=1NEi,Combuy(t)≤∑i=1NEi,Comsell(t)+M·s(t),where M is a very large value that and never exceed; e.g., .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "accomplish", "this", "setting", ",", "we", "determine", "the", "following", "constraints", "for", "variable", "s(t):26[12pt", "]", "$", "$", "&", "_", "^E_^(t", ")", "_", "^E_^(t", ")", "-", "M", "(", "1-s(t", ")", ")", "$", "$", "∑i=1NEi", ",", "Combuy(t)≥∑i=1NEi", ",", "Comsell(t)-M·(1-s(t))27[12pt", "]", "$", "$", "&", "_", "^E_^(t", ")", "_", "^E_^(t", ")", "+", "M", "s(t", ")", ",", "$", "$", "∑i=1NEi", ",", "Combuy(t)≤∑i=1NEi", ",", "Comsell(t)+M·s(t),where", "M", "is", "a", "very", "large", "value", "that", "and", "never", "exceed", ";", "e.g.", ",", "." ] } ]

PMC9429973

The median follow-up was 130 months (range, 13-324) and median treatment duration was 38 months (range, 1–105).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "median", "follow-up", "was", "130", "months", "(", "range", ",", "13", "-", "324", ")", "and", "median", "treatment", "duration", "was", "38", "months", "(", "range", ",", "1–105", ")", "." ] } ]

PMC7887261

300 ng of total RNA from each sample was used to synthesize cDNA by the Superscript III first-strand synthesis system (Invitrogen, #18080051).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "300", "ng", "of", "total", "RNA", "from", "each", "sample", "was", "used", "to", "synthesize", "cDNA", "by", "the", "Superscript", "III", "first-strand", "synthesis", "system", "(", "Invitrogen", ",", "#", "18080051", ")", "." ] } ]

PMC9219615

Differential nuclear staining (DNS) is a live cell imaging assay that uses two nuclear fluorescent dyes to distinguish between live and dead populations based on cell permeability .

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Differential", "nuclear", "staining", "(", "DNS", ")", "is", "a", "live", "cell", "imaging", "assay", "that", "uses", "two", "nuclear", "fluorescent", "dyes", "to", "distinguish", "between", "live", "and", "dead", "populations", "based", "on", "cell", "permeability", "." ] } ]

PMC11185260

Sera from tumor bearing mice receiving the indicated treatment were collected on day 35 (top panel) and day 56 (lower panel) and analyzed for levels of liver enzymes (AST and ALT) and BUN, indicators of hepatic and renal toxicity, respectively. *

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Sera", "from", "tumor", "bearing", "mice", "receiving", "the", "indicated", "treatment", "were", "collected", "on", "day", "35", "(", "top", "panel", ")", "and", "day", "56", "(", "lower", "panel", ")", "and", "analyzed", "for", "levels", "of", "liver", "enzymes", "(", "AST", "and", "ALT", ")", "and", "BUN", ",", "indicators", "of", "hepatic", "and", "renal", "toxicity", ",", "respectively", ".", "*" ] } ]

PMC10854447

Calc. (%)

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Calc", ".", "(", "%", ")" ] } ]

PMC11798926

Interestingly, a smaller deletion of residues 161–72 still retains binding to μ2 when normalized for its lower total expression, suggesting that amino acids 173-FLMM-176 could be a noncanonical endocytic signal with a phenylalanine residue instead of a tyrosine.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "a", "smaller", "deletion", "of", "residues", "161–72", "still", "retains", "binding", "to", "μ2", "when", "normalized", "for", "its", "lower", "total", "expression", ",", "suggesting", "that", "amino", "acids", "173-FLMM-176", "could", "be", "a", "noncanonical", "endocytic", "signal", "with", "a", "phenylalanine", "residue", "instead", "of", "a", "tyrosine", "." ] } ]

PMC11612315

These findings suggest that exendin 9–39 directly interacts with TRPV1, independent of GLP-1R, to inhibit its activation.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "findings", "suggest", "that", "exendin", "9–39", "directly", "interacts", "with", "TRPV1", ",", "independent", "of", "GLP-1R", ",", "to", "inhibit", "its", "activation", "." ] } ]

PMC11502327

Another interesting study showed that a polymer-loaded system of curcumin respectively increased drug uptake twice for cisplatin-resistant A2780CP cells and six times for metastatic MDA-MB-231 cells, of which the anti-tumor mechanism is related to the enhancement of tumor cell apoptosis induced by Nano-CUR6.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Another", "interesting", "study", "showed", "that", "a", "polymer-loaded", "system", "of", "curcumin", "respectively", "increased", "drug", "uptake", "twice", "for", "cisplatin-resistant", "A2780CP", "cells", "and", "six", "times", "for", "metastatic", "MDA-MB-231", "cells", ",", "of", "which", "the", "anti-tumor", "mechanism", "is", "related", "to", "the", "enhancement", "of", "tumor", "cell", "apoptosis", "induced", "by", "Nano-CUR6", "." ] } ]

PMC11317131

We observed efficiencies up to 21.0% with the highest activity variant (Bxb1-L8-5) increasing 2.5-fold over wildtype Bxb1 integrase (Figure 4C and Supplementary Figure S3b).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "observed", "efficiencies", "up", "to", "21.0", "%", "with", "the", "highest", "activity", "variant", "(", "Bxb1-L8", "-", "5", ")", "increasing", "2.5-fold", "over", "wildtype", "Bxb1", "integrase", "(", "Figure", "4C", "and", "Supplementary", "Figure", "S3b", ")", "." ] } ]

PMC10178190

Lane et al. (2011) reported that elevated IL-6 levels in ascites of ovarian cancer patients correlated to lower progression-free survival rates.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lane", "et", "al.", "(", "2011", ")", "reported", "that", "elevated", "IL-6", "levels", "in", "ascites", "of", "ovarian", "cancer", "patients", "correlated", "to", "lower", "progression-free", "survival", "rates", "." ] } ]

PMC11768281

Dendritic cells (DCs) present Plasmodium antigens to T cell receptors (TCR) on naïve T cells, initiating T cell activation.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Dendritic", "cells", "(", "DCs", ")", "present", "Plasmodium", "antigens", "to", "T", "cell", "receptors", "(", "TCR", ")", "on", "naïve", "T", "cells", ",", "initiating", "T", "cell", "activation", "." ] } ]

PMC11266100

Asterisk (*) corresponds to statistically significant differences (p < 0.05).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Asterisk", "(", "*", ")", "corresponds", "to", "statistically", "significant", "differences", "(", "p", "<", "0.05", ")", "." ] } ]

PMC9429973

Five out of 6 pts had high-risk cytogenetic profiles, including 2 pts with del(17p).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Five", "out", "of", "6", "pts", "had", "high-risk", "cytogenetic", "profiles", ",", "including", "2", "pts", "with", "del(17p", ")", "." ] } ]

PMC11467964

Furthermore, the areas under curves of the ROC curve were 0.852, 0.816, and 0.759 at 1‐, 3‐, and 5‐ year (Figure 5F), indicating that the novel signature was successfully constructed, and it has a practical value in predicting STS patients' survival.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "the", "areas", "under", "curves", "of", "the", "ROC", "curve", "were", "0.852", ",", "0.816", ",", "and", "0.759", "at", "1‐", ",", "3‐", ",", "and", "5‐", "year", "(", "Figure", "5F", ")", ",", "indicating", "that", "the", "novel", "signature", "was", "successfully", "constructed", ",", "and", "it", "has", "a", "practical", "value", "in", "predicting", "STS", "patients", "'", "survival", "." ] } ]

PMC11655536

F The effect of NHE1 inhibitor HA on cell viability in RPMI-8226, U266, MM.1S and ARH-77 cell lines.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "F", "The", "effect", "of", "NHE1", "inhibitor", "HA", "on", "cell", "viability", "in", "RPMI-8226", ",", "U266", ",", "MM.1S", "and", "ARH-77", "cell", "lines", "." ] } ]

PMC11224020

Granulocytes are eliminated during differentiation because they are nonadherent, whereas macrophages are much more adherent than the other two cell types and stick to the bottom of the plate.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Granulocytes", "are", "eliminated", "during", "differentiation", "because", "they", "are", "nonadherent", ",", "whereas", "macrophages", "are", "much", "more", "adherent", "than", "the", "other", "two", "cell", "types", "and", "stick", "to", "the", "bottom", "of", "the", "plate", "." ] } ]

PMC10253553

The induction of NDRG1 mRNA could also be a response to apoptosis in cells treated with 250 and 1000 nM Torin 2 (Figure 6).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "induction", "of", "NDRG1", "mRNA", "could", "also", "be", "a", "response", "to", "apoptosis", "in", "cells", "treated", "with", "250", "and", "1000", "nM", "Torin", "2", "(", "Figure", "6", ")", "." ] } ]

PMC11015054

IHC (Immunohistochemical Staining Kit, Cell Biological, China) and H&E (H&E Staining Kit, Solarbio, China) were performed on paraffin‐embedded tumor tissues.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IHC", "(", "Immunohistochemical", "Staining", "Kit", ",", "Cell", "Biological", ",", "China", ")", "and", "H&E", "(", "H&E", "Staining", "Kit", ",", "Solarbio", ",", "China", ")", "were", "performed", "on", "paraffin‐embedded", "tumor", "tissues", "." ] } ]

PMC6102174

Interferons (INF-α and PegIFN-α) take effects by enhancing the immune system of patients, but their application is limited by the low curing rate and serious side effects.

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interferons", "(", "INF-α", "and", "PegIFN-α", ")", "take", "effects", "by", "enhancing", "the", "immune", "system", "of", "patients", ",", "but", "their", "application", "is", "limited", "by", "the", "low", "curing", "rate", "and", "serious", "side", "effects", "." ] } ]

PMC11587606

Since protein kinase C-ζ (PKCζ) is a critical component of the apicobasal polarity complex of mammary epithelial cells , and is highly expressed in breast cancer cells in the TCGA database (P < 0.01) (Fig. 2A), we investigated RHBDF1 and PKCζ protein levels in human breast cancer tissues and cancer-adjacent normal tissues (para-cancerous tissues).

[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Since", "protein", "kinase", "C-ζ", "(", "PKCζ", ")", "is", "a", "critical", "component", "of", "the", "apicobasal", "polarity", "complex", "of", "mammary", "epithelial", "cells", ",", "and", "is", "highly", "expressed", "in", "breast", "cancer", "cells", "in", "the", "TCGA", "database", "(", "P", "<", "0.01", ")", "(", "Fig.", "2A", ")", ",", "we", "investigated", "RHBDF1", "and", "PKCζ", "protein", "levels", "in", "human", "breast", "cancer", "tissues", "and", "cancer-adjacent", "normal", "tissues", "(", "para-cancerous", "tissues", ")", "." ] } ]