PMCID
string | Sentences
string | ner
list |
|---|---|---|
PMC10237474
|
By contrast, Expi293F GnTI developed by Thermo Fisher Scientific was shown to produce 30-fold more IgG than HEK293S GnTI via transient expression .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"contrast",
",",
"Expi293F",
"GnTI",
"developed",
"by",
"Thermo",
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"Scientific",
"was",
"shown",
"to",
"produce",
"30-fold",
"more",
"IgG",
"than",
"HEK293S",
"GnTI",
"via",
"transient",
"expression",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The increase of cEPCs during the 1 post-treatment year probably reflects an effort to repair vascular damage caused by the treatment.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"increase",
"of",
"cEPCs",
"during",
"the",
"1",
"post-treatment",
"year",
"probably",
"reflects",
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"effort",
"to",
"repair",
"vascular",
"damage",
"caused",
"by",
"the",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC5600151
|
Taratula et al. showed that PPI dendrimers of higher generations like G4 and G5 effectively initiated the complexation of siRNA, resulting in enhanced downregulation of target mRNA in A549 cells .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Taratula",
"et",
"al.",
"showed",
"that",
"PPI",
"dendrimers",
"of",
"higher",
"generations",
"like",
"G4",
"and",
"G5",
"effectively",
"initiated",
"the",
"complexation",
"of",
"siRNA",
",",
"resulting",
"in",
"enhanced",
"downregulation",
"of",
"target",
"mRNA",
"in",
"A549",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Such studies have shown that most patients maintain MMR and many even achieve it when reduced doses are administered from diagnosis.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Such",
"studies",
"have",
"shown",
"that",
"most",
"patients",
"maintain",
"MMR",
"and",
"many",
"even",
"achieve",
"it",
"when",
"reduced",
"doses",
"are",
"administered",
"from",
"diagnosis",
"."
]
}
] |
PMC11763111
|
Clinical case reports have highlighted the therapeutic potential of CD38-targeted CAR-T cells in ALL and AML .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Clinical",
"case",
"reports",
"have",
"highlighted",
"the",
"therapeutic",
"potential",
"of",
"CD38-targeted",
"CAR-T",
"cells",
"in",
"ALL",
"and",
"AML",
"."
]
}
] |
PMC6461034
|
SK‐Mel‐28 melanoma cells with mutant BRAF.
|
[
{
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"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"SK‐Mel‐28",
"melanoma",
"cells",
"with",
"mutant",
"BRAF",
"."
]
}
] |
PMC9960565
|
The lower the RF value, the better the compound overcomes cancer cells’ resistance to the drug .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"lower",
"the",
"RF",
"value",
",",
"the",
"better",
"the",
"compound",
"overcomes",
"cancer",
"cells",
"’",
"resistance",
"to",
"the",
"drug",
"."
]
}
] |
PMC10778532
|
Currently, our knowledge on the relationship between VHL mutations and the outcome of immunotherapy trials is not well established .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Currently",
",",
"our",
"knowledge",
"on",
"the",
"relationship",
"between",
"VHL",
"mutations",
"and",
"the",
"outcome",
"of",
"immunotherapy",
"trials",
"is",
"not",
"well",
"established",
"."
]
}
] |
PMC10878518
|
Non-tumorigenic HOS cells showed higher CAR and hTERT expressions than tumorigenic MNNG/HOS and metastatic 143B cells (Fig 1), suggesting the dynamic changes in CAR and hTERT expressions during tumor progression.
|
[
{
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"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Non-tumorigenic",
"HOS",
"cells",
"showed",
"higher",
"CAR",
"and",
"hTERT",
"expressions",
"than",
"tumorigenic",
"MNNG/HOS",
"and",
"metastatic",
"143B",
"cells",
"(",
"Fig",
"1",
")",
",",
"suggesting",
"the",
"dynamic",
"changes",
"in",
"CAR",
"and",
"hTERT",
"expressions",
"during",
"tumor",
"progression",
"."
]
}
] |
PMC9583612
|
Through this multibasin field study, we describe how a measurement framework that accounts for spatial and temporal variations in methane emissions can help improve inventory estimates.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Through",
"this",
"multibasin",
"field",
"study",
",",
"we",
"describe",
"how",
"a",
"measurement",
"framework",
"that",
"accounts",
"for",
"spatial",
"and",
"temporal",
"variations",
"in",
"methane",
"emissions",
"can",
"help",
"improve",
"inventory",
"estimates",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Event was defined as death, refractoriness to treatment or progressive disease.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"was",
"defined",
"as",
"death",
",",
"refractoriness",
"to",
"treatment",
"or",
"progressive",
"disease",
"."
]
}
] |
PMC11806818
|
Therefore, HER2 expression is a key tumor feature for diagnosis and treatment of breast cancer .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"HER2",
"expression",
"is",
"a",
"key",
"tumor",
"feature",
"for",
"diagnosis",
"and",
"treatment",
"of",
"breast",
"cancer",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Functionality was evaluated using in vitro cytotoxicity assays against AML cell lines (TF-1, THP-1, and HL-60).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Functionality",
"was",
"evaluated",
"using",
"in",
"vitro",
"cytotoxicity",
"assays",
"against",
"AML",
"cell",
"lines",
"(",
"TF-1",
",",
"THP-1",
",",
"and",
"HL-60",
")",
"."
]
}
] |
PMC11286266
|
Our findings indicate that CRT, beyond its known role as a chaperone, also serves as an ER repressor of ATF6α to selectively regulate one arm of the UPR.The endoplasmic reticulum (ER), and its associated chaperones, constitutes the major cellular compartment for the synthesis, folding, and quality control of secretory proteins (Sun and Brodsky, 2019).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"findings",
"indicate",
"that",
"CRT",
",",
"beyond",
"its",
"known",
"role",
"as",
"a",
"chaperone",
",",
"also",
"serves",
"as",
"an",
"ER",
"repressor",
"of",
"ATF6α",
"to",
"selectively",
"regulate",
"one",
"arm",
"of",
"the",
"UPR.The",
"endoplasmic",
"reticulum",
"(",
"ER",
")",
",",
"and",
"its",
"associated",
"chaperones",
",",
"constitutes",
"the",
"major",
"cellular",
"compartment",
"for",
"the",
"synthesis",
",",
"folding",
",",
"and",
"quality",
"control",
"of",
"secretory",
"proteins",
"(",
"Sun",
"and",
"Brodsky",
",",
"2019",
")",
"."
]
}
] |
PMC11720808
|
The structure of SCU. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"structure",
"of",
"SCU",
".",
"("
]
}
] |
PMC11748335
|
Raw RNA-seq reads were aligned to the human genome using HISAT2 .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Raw",
"RNA-seq",
"reads",
"were",
"aligned",
"to",
"the",
"human",
"genome",
"using",
"HISAT2",
"."
]
}
] |
PMC11585587
|
Then, we further mapped the gene networks related to the top 5 BP, CC, and MF.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Then",
",",
"we",
"further",
"mapped",
"the",
"gene",
"networks",
"related",
"to",
"the",
"top",
"5",
"BP",
",",
"CC",
",",
"and",
"MF",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Another risk factor for OM in leukemic children is the associated neutropenia.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Another",
"risk",
"factor",
"for",
"OM",
"in",
"leukemic",
"children",
"is",
"the",
"associated",
"neutropenia",
"."
]
}
] |
PMC8270637
|
CD8+ T cells in the circulatory system infiltrate the tumor tissue and are activated by tumor antigens to become effector CD8+ T cells with the function of killing tumor cells.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CD8",
"+",
"T",
"cells",
"in",
"the",
"circulatory",
"system",
"infiltrate",
"the",
"tumor",
"tissue",
"and",
"are",
"activated",
"by",
"tumor",
"antigens",
"to",
"become",
"effector",
"CD8",
"+",
"T",
"cells",
"with",
"the",
"function",
"of",
"killing",
"tumor",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11755519
|
In addition, 11 studies were disqualified for having a different source of EVs than bladder cancer cells and no in vitro cell studies (Figure 2).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"11",
"studies",
"were",
"disqualified",
"for",
"having",
"a",
"different",
"source",
"of",
"EVs",
"than",
"bladder",
"cancer",
"cells",
"and",
"no",
"in",
"vitro",
"cell",
"studies",
"(",
"Figure",
"2",
")",
"."
]
}
] |
PMC11727062
|
These ingredients, characterized by a sweet and salty flavor, are traditionally used for their purported anti-tumor effects and their potential to counteract tumor resistance.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"ingredients",
",",
"characterized",
"by",
"a",
"sweet",
"and",
"salty",
"flavor",
",",
"are",
"traditionally",
"used",
"for",
"their",
"purported",
"anti-tumor",
"effects",
"and",
"their",
"potential",
"to",
"counteract",
"tumor",
"resistance",
"."
]
}
] |
PMC11453690
|
Conditioned media (CM) was created from each sample.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Conditioned",
"media",
"(",
"CM",
")",
"was",
"created",
"from",
"each",
"sample",
"."
]
}
] |
PMC11467964
|
Mutation frequencies of TP53 and RB1 in low‐risk group were markedly higher, while those of ATRX, TTN, and MUC16 were markedly higher ones in high‐risk group.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Mutation",
"frequencies",
"of",
"TP53",
"and",
"RB1",
"in",
"low‐risk",
"group",
"were",
"markedly",
"higher",
",",
"while",
"those",
"of",
"ATRX",
",",
"TTN",
",",
"and",
"MUC16",
"were",
"markedly",
"higher",
"ones",
"in",
"high‐risk",
"group",
"."
]
}
] |
PMC7602170
|
The epithelioid cell type is mainly composed of cords or small nests of epithelioid cells with abundant eosinophilic cytoplasm, without distinctive cell borders (Figure 1B).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"epithelioid",
"cell",
"type",
"is",
"mainly",
"composed",
"of",
"cords",
"or",
"small",
"nests",
"of",
"epithelioid",
"cells",
"with",
"abundant",
"eosinophilic",
"cytoplasm",
",",
"without",
"distinctive",
"cell",
"borders",
"(",
"Figure",
"1B",
")",
"."
]
}
] |
PMC4270159
|
M14 cells2% VariancepHER3pAKTpERKF(3, 8)4297.46015283.29946645.7378ηp²0.9993798630.999495520.999598901Effect size f40.1440844.5111149.92144Power99.99%99.99%99.99%Total sample size across all groups88815% variancepHER3pAKTpERKF(3, 8)76.3992906793.92532267118.1464498ηp²0.9662728850.9723924660.977927341Effect size f5.3525455.9348126.656194Power99.99%99.99%99.99%Total sample size across all groups88828% variancepHER3pAKTpERKF(3, 8)21.9258168426.9556091833.90682551ηp²0.8915657840.9099776570.927087448Effect size f2.8674353.1793643.565818Power98.24%99.42%99.88%Total sample size88840% variancepHER3pAKTpERKF(3, 8)10.7436502513.208248516.6143445ηp²0.8011481250.83202010.861694667Effect size f2.0072042.2255552.496073Power82.32%89.11%94.57%Total sample size across all groups888KHM-S3 cells2% VariancepEGFRpAKTpERKpMETF(3, 8)7271.8941594.15613697.78226041.5258ηp²0.9996334260.9983300170.9992793670.999558805Effect size f52.2203224.4501237.23847.59802Power99.99%99.99%99.99%99.99%Total sample size across all groups888815% variancepEGFRpAKTpERKpMETF(3, 8)129.278115628.3405528965.73835022107.4049031ηp²0.9797895250.9139985230.9610165050.975773338Effect size f6.9627073.2600164.9650666.346404Power99.99%99.57%99.99%99.99%Total sample size across all groups888828% variancepEGFRpAKTpERKpMETF(3, 8)37.10158.1334494918.8662357130.82411122ηp²0.9329446920.7530890750.8761585120.920376091Effect size f3.7300221.7464372.6598573.399859Power99.94%98.31%96.62%99.75%Total sample size across all groups8128840% variancepEGFRpAKTpERKpMETF(3, 8)18.1797353.985390259.244455515.1038145ηp²0.8720802420.599121490.7761196110.84993841Effect size f2.6110151.2225061.86192.379901Power96.09%94.83%99.19%92.58%Total sample size across all groups816128 In order to produce quantitative replication data, we will run the experiment three times.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"M14",
"cells2",
"%",
"VariancepHER3pAKTpERKF(3",
",",
"8)4297.46015283.29946645.7378ηp²0.9993798630.999495520.999598901Effect",
"size",
"f40.1440844.5111149.92144Power99.99%99.99%99.99%Total",
"sample",
"size",
"across",
"all",
"groups88815",
"%",
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",",
"8)76.3992906793.92532267118.1464498ηp²0.9662728850.9723924660.977927341Effect",
"size",
"f5.3525455.9348126.656194Power99.99%99.99%99.99%Total",
"sample",
"size",
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"all",
"groups88828",
"%",
"variancepHER3pAKTpERKF(3",
",",
"8)21.9258168426.9556091833.90682551ηp²0.8915657840.9099776570.927087448Effect",
"size",
"f2.8674353.1793643.565818Power98.24%99.42%99.88%Total",
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"size88840",
"%",
"variancepHER3pAKTpERKF(3",
",",
"8)10.7436502513.208248516.6143445ηp²0.8011481250.83202010.861694667Effect",
"size",
"f2.0072042.2255552.496073Power82.32%89.11%94.57%Total",
"sample",
"size",
"across",
"all",
"groups888KHM-S3",
"cells2",
"%",
"VariancepEGFRpAKTpERKpMETF(3",
",",
"8)7271.8941594.15613697.78226041.5258ηp²0.9996334260.9983300170.9992793670.999558805Effect",
"size",
"f52.2203224.4501237.23847.59802Power99.99%99.99%99.99%99.99%Total",
"sample",
"size",
"across",
"all",
"groups888815",
"%",
"variancepEGFRpAKTpERKpMETF(3",
",",
"8)129.278115628.3405528965.73835022107.4049031ηp²0.9797895250.9139985230.9610165050.975773338Effect",
"size",
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"sample",
"size",
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"all",
"groups888828",
"%",
"variancepEGFRpAKTpERKpMETF(3",
",",
"8)37.10158.1334494918.8662357130.82411122ηp²0.9329446920.7530890750.8761585120.920376091Effect",
"size",
"f3.7300221.7464372.6598573.399859Power99.94%98.31%96.62%99.75%Total",
"sample",
"size",
"across",
"all",
"groups8128840",
"%",
"variancepEGFRpAKTpERKpMETF(3",
",",
"8)18.1797353.985390259.244455515.1038145ηp²0.8720802420.599121490.7761196110.84993841Effect",
"size",
"f2.6110151.2225061.86192.379901Power96.09%94.83%99.19%92.58%Total",
"sample",
"size",
"across",
"all",
"groups816128",
"In",
"order",
"to",
"produce",
"quantitative",
"replication",
"data",
",",
"we",
"will",
"run",
"the",
"experiment",
"three",
"times",
"."
]
}
] |
PMC11783017
|
Subsequently, the in vitro therapeutic effect of different materials against 143B cells was investigated using CCK-8 assay and Calcein-AM/PI staining experiment.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Subsequently",
",",
"the",
"in",
"vitro",
"therapeutic",
"effect",
"of",
"different",
"materials",
"against",
"143B",
"cells",
"was",
"investigated",
"using",
"CCK-8",
"assay",
"and",
"Calcein-AM/PI",
"staining",
"experiment",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
A total of 3 participants (12.5%) experienced 1 or more TEAE: 2 in the 30 mg/kg nipocalimab cohort and 1 in the 60 mg/kg nipocalimab cohort (Table).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"total",
"of",
"3",
"participants",
"(",
"12.5",
"%",
")",
"experienced",
"1",
"or",
"more",
"TEAE",
":",
"2",
"in",
"the",
"30",
"mg/kg",
"nipocalimab",
"cohort",
"and",
"1",
"in",
"the",
"60",
"mg/kg",
"nipocalimab",
"cohort",
"(",
"Table",
")",
"."
]
}
] |
PMC11764090
|
Under cold stress, plants undergo various physiological and biochemical changes such as alterations in cell membrane permeability, osmotic regulators, peroxides, enzymes, and hormones.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Under",
"cold",
"stress",
",",
"plants",
"undergo",
"various",
"physiological",
"and",
"biochemical",
"changes",
"such",
"as",
"alterations",
"in",
"cell",
"membrane",
"permeability",
",",
"osmotic",
"regulators",
",",
"peroxides",
",",
"enzymes",
",",
"and",
"hormones",
"."
]
}
] |
PMC11792766
|
This exposure also led to a statistically significant increase in cytotoxicity of 15.9% for HepG2 and 9.3% for Caco‐2 cell lines.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"exposure",
"also",
"led",
"to",
"a",
"statistically",
"significant",
"increase",
"in",
"cytotoxicity",
"of",
"15.9",
"%",
"for",
"HepG2",
"and",
"9.3",
"%",
"for",
"Caco‐2",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC10808409
|
Meanwhile TP53INP1 is considered one of the regulators of autophagy in which TP53INP1 protein was a target of miR‑221 in CRC cells, which might elucidate the inhibitory effect of autophagy by miR‑221.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Meanwhile",
"TP53INP1",
"is",
"considered",
"one",
"of",
"the",
"regulators",
"of",
"autophagy",
"in",
"which",
"TP53INP1",
"protein",
"was",
"a",
"target",
"of",
"miR‑221",
"in",
"CRC",
"cells",
",",
"which",
"might",
"elucidate",
"the",
"inhibitory",
"effect",
"of",
"autophagy",
"by",
"miR‑221",
"."
]
}
] |
PMC11322866
|
Either GSK126 treatment or RRM2 overexpression resulted in an increase in p21 and a decrease in p-RB level, and simultaneous addition of GSK126 and RRM2 overexpression resulted in a further increase in p21 and a further decrease in p-RB level ( Figure 2A).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Either",
"GSK126",
"treatment",
"or",
"RRM2",
"overexpression",
"resulted",
"in",
"an",
"increase",
"in",
"p21",
"and",
"a",
"decrease",
"in",
"p-RB",
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",",
"and",
"simultaneous",
"addition",
"of",
"GSK126",
"and",
"RRM2",
"overexpression",
"resulted",
"in",
"a",
"further",
"increase",
"in",
"p21",
"and",
"a",
"further",
"decrease",
"in",
"p-RB",
"level",
"(",
"Figure",
"2A",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
This hypothesis is further sustained by the same response to the treatment with Bz.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"hypothesis",
"is",
"further",
"sustained",
"by",
"the",
"same",
"response",
"to",
"the",
"treatment",
"with",
"Bz",
"."
]
}
] |
PMC11402217
|
The apoptotic mechanism was further confirmed by increased caspase-3 activation, a key apoptosis regulator, in 143B and MG63 cells with ascending XD23 doses.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"apoptotic",
"mechanism",
"was",
"further",
"confirmed",
"by",
"increased",
"caspase-3",
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",",
"a",
"key",
"apoptosis",
"regulator",
",",
"in",
"143B",
"and",
"MG63",
"cells",
"with",
"ascending",
"XD23",
"doses",
"."
]
}
] |
PMC11185260
|
Collectively, our data suggest that restoring SMARCB1 function via the scL-SMARCB1 nanocomplex may lead to therapeutic benefits in ATRT patients when combined with traditional chemoradiation therapies.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Collectively",
",",
"our",
"data",
"suggest",
"that",
"restoring",
"SMARCB1",
"function",
"via",
"the",
"scL-SMARCB1",
"nanocomplex",
"may",
"lead",
"to",
"therapeutic",
"benefits",
"in",
"ATRT",
"patients",
"when",
"combined",
"with",
"traditional",
"chemoradiation",
"therapies",
"."
]
}
] |
PMC11473750
|
A 3D model of RNF121 protein, built using AlphaFold2, was examined to predict the effect of the M158R mutation.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"3D",
"model",
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"RNF121",
"protein",
",",
"built",
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"AlphaFold2",
",",
"was",
"examined",
"to",
"predict",
"the",
"effect",
"of",
"the",
"M158R",
"mutation",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Image: Summary/Conclusion: Eltrombopag is safe and effective in pediatric patients with primary ITP ,It can effectively reduce the bleeding risk of children with persistent / chronic ITP and improve the quality of life of children with ITP,and the level of Treg cells in children may be a predictor of eltrombopag response rate.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Image",
":",
"Summary/Conclusion",
":",
"Eltrombopag",
"is",
"safe",
"and",
"effective",
"in",
"pediatric",
"patients",
"with",
"primary",
"ITP",
",",
"It",
"can",
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"bleeding",
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"of",
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"persistent",
"/",
"chronic",
"ITP",
"and",
"improve",
"the",
"quality",
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"children",
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"ITP,and",
"the",
"level",
"of",
"Treg",
"cells",
"in",
"children",
"may",
"be",
"a",
"predictor",
"of",
"eltrombopag",
"response",
"rate",
"."
]
}
] |
PMC10761571
|
Fig. 6 SEM (a, d), and TEM (b, c) images of Fe3O4@Glu-Gingerol NPs.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Fig.",
"6",
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"(",
"a",
",",
"d",
")",
",",
"and",
"TEM",
"(",
"b",
",",
"c",
")",
"images",
"of",
"Fe3O4@Glu-Gingerol",
"NPs",
"."
]
}
] |
PMC11194678
|
Through separating the condensed phase from the aqueous phase by centrifugation, we found the liquid phase fraction of STAU1 proteins increased in a concentration-dependent manner (Fig. S1 C).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"manner",
"(",
"Fig.",
"S1",
"C",
")",
"."
]
}
] |
PMC11350568
|
Comparing the stability of the probes in 20% FBS for different times. (
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Comparing",
"the",
"stability",
"of",
"the",
"probes",
"in",
"20",
"%",
"FBS",
"for",
"different",
"times",
".",
"("
]
}
] |
PMC9429973
|
S. Edtmayer, A. Witalisz-Siepracka, B. Zdársky, T. Eder, V. Poli, F. Grebien, D. Stoiber Department of Pharmacology, Physiology and Microbiology, Karl Landsteiner University of Health Sciences, Krems an der Donau; Institute of Medical Biochemistry, University of Veterinary Medicine Vienna, Vienna, Austria; Department of Molecular Biotechnology and Health Sciences, University of Torino, Turin, Italy Background: Signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) is a mediator of cytokine signaling existing in two alternatively spliced isoforms known as the full-length isoform STAT3α (770aa) and the C-terminally truncated isoform STAT3β (722aa).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"S.",
"Edtmayer",
",",
"A.",
"Witalisz-Siepracka",
",",
"B.",
"Zdársky",
",",
"T.",
"Eder",
",",
"V.",
"Poli",
",",
"F.",
"Grebien",
",",
"D.",
"Stoiber",
"Department",
"of",
"Pharmacology",
",",
"Physiology",
"and",
"Microbiology",
",",
"Karl",
"Landsteiner",
"University",
"of",
"Health",
"Sciences",
",",
"Krems",
"an",
"der",
"Donau",
";",
"Institute",
"of",
"Medical",
"Biochemistry",
",",
"University",
"of",
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"Medicine",
"Vienna",
",",
"Vienna",
",",
"Austria",
";",
"Department",
"of",
"Molecular",
"Biotechnology",
"and",
"Health",
"Sciences",
",",
"University",
"of",
"Torino",
",",
"Turin",
",",
"Italy",
"Background",
":",
"Signal",
"transducer",
"and",
"activator",
"of",
"transcription",
"3",
"(",
"STAT3",
")",
"is",
"a",
"mediator",
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"cytokine",
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"STAT3α",
"(",
"770aa",
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"and",
"the",
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"(",
"722aa",
")",
"."
]
}
] |
PMC11471157
|
Amino acid analysis revealed that the content per 100 g of DFP was: 4224 mg of Ala, 4452 mg of Arg, 5878 mg of Asp/Asn, 748 mg of Cys, 9159 mg of Glu/Gln, 5361 mg of Gly, 1583 mg of His, 2699 mg of Ile, 5059 mg of Leu, 5147 mg of Lys, 1310 mg of Met, 2973 mg of Phe, 3254 mg of Pro, 2989 mg of Ser, 2904 mg of Thr, 1255 mg of Tyr, and 2993 mg of Val (Table 2).Table 1Component analysis results of DFP.Table 1ItemValueNoteEnergy317 kcal/100 gEnergy conversion factors were calculated as 4 kcal/g for protein, 9 kcal/g for lipids, and 4 kcal/g for carbohydrates.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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",",
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",",
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",",
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",",
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",",
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",",
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",",
"2973",
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",",
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",",
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",",
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",",
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"Tyr",
",",
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"2993",
"mg",
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"Val",
"(",
"Table",
"2).Table",
"1Component",
"analysis",
"results",
"of",
"DFP.Table",
"1ItemValueNoteEnergy317",
"kcal/100",
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",",
"and",
"4",
"kcal/g",
"for",
"carbohydrates",
"."
]
}
] |
PMC11476004
|
According to McGranahan et al. , genome instability is a feature of most tumours in humans and of intratumour heterogeneity, unfortunately associated with a poor prognosis and drug resistance.
|
[
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"et",
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",",
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"humans",
"and",
"of",
"intratumour",
"heterogeneity",
",",
"unfortunately",
"associated",
"with",
"a",
"poor",
"prognosis",
"and",
"drug",
"resistance",
"."
]
}
] |
PMC9164404
|
A Intracellular uptake of Abplatin@Cy5.5 by BEL-7404 cells via confocal laser scanning microscope (CLSM), scale bar = 40 µm.
|
[
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
],
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"Intracellular",
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"Abplatin@Cy5.5",
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")",
",",
"scale",
"bar",
"=",
"40",
"µm",
"."
]
}
] |
PMC10571053
|
The ability of P-gp and ABCG2 to affect brain penetration of targeted therapies has most dramatically been demonstrated in mouse models in which the ABCB1 homologs Abcb1a and Abcb1b are knocked out, the ABCG2 homolog Abcg2 is knocked out, or all of the homologous transporters have been deleted.
|
[
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"ability",
"of",
"P-gp",
"and",
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"to",
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"brain",
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"therapies",
"has",
"most",
"dramatically",
"been",
"demonstrated",
"in",
"mouse",
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"the",
"ABCB1",
"homologs",
"Abcb1a",
"and",
"Abcb1b",
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"knocked",
"out",
",",
"the",
"ABCG2",
"homolog",
"Abcg2",
"is",
"knocked",
"out",
",",
"or",
"all",
"of",
"the",
"homologous",
"transporters",
"have",
"been",
"deleted",
"."
]
}
] |
PMC9250505
|
Olaparib treatment of OC cells has been reported to increase the expression of the DNA damage signaling marker, γH2AX, along with RAD51, an indicator of HR repair in OC cells.
|
[
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Olaparib",
"treatment",
"of",
"OC",
"cells",
"has",
"been",
"reported",
"to",
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"the",
"expression",
"of",
"the",
"DNA",
"damage",
"signaling",
"marker",
",",
"γH2AX",
",",
"along",
"with",
"RAD51",
",",
"an",
"indicator",
"of",
"HR",
"repair",
"in",
"OC",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11711127
|
Immunological tolerance is a fundamental arm of any functioning immune system.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O"
],
"tokens": [
"Immunological",
"tolerance",
"is",
"a",
"fundamental",
"arm",
"of",
"any",
"functioning",
"immune",
"system",
"."
]
}
] |
PMC11407042
|
Note: It is recommended to perform positive and negative controls.
|
[
{
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
],
"tokens": [
"Note",
":",
"It",
"is",
"recommended",
"to",
"perform",
"positive",
"and",
"negative",
"controls",
"."
]
}
] |
PMC10482220
|
Suppression of SG assembly by BC-containing mutants did not reflect overexpression of these mutants in transfected cells because SGs were absent from cells expressing low levels of these mutants (Fig. 3 A, 1–3).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"SG",
"assembly",
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"BC-containing",
"mutants",
"did",
"not",
"reflect",
"overexpression",
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"these",
"mutants",
"in",
"transfected",
"cells",
"because",
"SGs",
"were",
"absent",
"from",
"cells",
"expressing",
"low",
"levels",
"of",
"these",
"mutants",
"(",
"Fig.",
"3",
"A",
",",
"1–3",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Methods: Dose escalation for the IMGN632+AZA+VEN triplet is complete.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Methods",
":",
"Dose",
"escalation",
"for",
"the",
"IMGN632+AZA+VEN",
"triplet",
"is",
"complete",
"."
]
}
] |
PMC9516401
|
Cepa did not have any considerable influence on IDE activity (Figure 3).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cepa",
"did",
"not",
"have",
"any",
"considerable",
"influence",
"on",
"IDE",
"activity",
"(",
"Figure",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC10810426
|
For the BMDCs cultures, bone marrow from APOBEC3 knockout mice was harvested from the hind limbs of mice, cultured in RPMI supplemented with 10% FBS, 2 mM L-glutamine, 100 U/ml penicillin, 100 μg/ml streptomycin, and 50 μM β-mercaptoethanol and differentiated with 20 ng/ml murine granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (GM-CSF) (Peprotech, 315–03).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"the",
"BMDCs",
"cultures",
",",
"bone",
"marrow",
"from",
"APOBEC3",
"knockout",
"mice",
"was",
"harvested",
"from",
"the",
"hind",
"limbs",
"of",
"mice",
",",
"cultured",
"in",
"RPMI",
"supplemented",
"with",
"10",
"%",
"FBS",
",",
"2",
"mM",
"L-glutamine",
",",
"100",
"U/ml",
"penicillin",
",",
"100",
"μg/ml",
"streptomycin",
",",
"and",
"50",
"μM",
"β-mercaptoethanol",
"and",
"differentiated",
"with",
"20",
"ng/ml",
"murine",
"granulocyte-macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"(",
"GM-CSF",
")",
"(",
"Peprotech",
",",
"315–03",
")",
"."
]
}
] |
PMC11736898
|
Keloids are more common in populations with dark skin pigmentation, such as African Americans and others of African descent, with a 15-fold or greater increase in keloid incidence in Black versus White populations, and often greater severity of keloids in individuals of African ancestry [15–18].
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Keloids",
"are",
"more",
"common",
"in",
"populations",
"with",
"dark",
"skin",
"pigmentation",
",",
"such",
"as",
"African",
"Americans",
"and",
"others",
"of",
"African",
"descent",
",",
"with",
"a",
"15-fold",
"or",
"greater",
"increase",
"in",
"keloid",
"incidence",
"in",
"Black",
"versus",
"White",
"populations",
",",
"and",
"often",
"greater",
"severity",
"of",
"keloids",
"in",
"individuals",
"of",
"African",
"ancestry",
"[",
"15–18",
"]",
"."
]
}
] |
PMC11332076
|
These results suggest that F-iIR or F-iIGF1R does not form a stable dimer, and their transphosphorylation may be induced by transient interactions.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"F-iIR",
"or",
"F-iIGF1R",
"does",
"not",
"form",
"a",
"stable",
"dimer",
",",
"and",
"their",
"transphosphorylation",
"may",
"be",
"induced",
"by",
"transient",
"interactions",
"."
]
}
] |
PMC9341513
|
A, left) Box plot showing the distribution of the radius of gyration of the CCND1 gene body (a measure of its 3D size) in simulations for each of the three cell types (440 configurations for each case). (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
",",
"left",
")",
"Box",
"plot",
"showing",
"the",
"distribution",
"of",
"the",
"radius",
"of",
"gyration",
"of",
"the",
"CCND1",
"gene",
"body",
"(",
"a",
"measure",
"of",
"its",
"3D",
"size",
")",
"in",
"simulations",
"for",
"each",
"of",
"the",
"three",
"cell",
"types",
"(",
"440",
"configurations",
"for",
"each",
"case",
")",
".",
"("
]
}
] |
PMC9065483
|
Absolute luminescence was log-transformed and graphed (n = 8–10, mean ± SEM; ∗p < 0.05 by one-way ANOVA). (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Absolute",
"luminescence",
"was",
"log-transformed",
"and",
"graphed",
"(",
"n",
"=",
"8–10",
",",
"mean",
"±",
"SEM",
";",
"∗p",
"<",
"0.05",
"by",
"one-way",
"ANOVA",
")",
".",
"("
]
}
] |
PMC10975211
|
In obtaining buforin IIIa, the cell-penetrating motif was changed while keeping the rest of the structure identical to buforin IIb.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"obtaining",
"buforin",
"IIIa",
",",
"the",
"cell-penetrating",
"motif",
"was",
"changed",
"while",
"keeping",
"the",
"rest",
"of",
"the",
"structure",
"identical",
"to",
"buforin",
"IIb",
"."
]
}
] |
PMC11674146
|
However, there are limitations to our study.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"there",
"are",
"limitations",
"to",
"our",
"study",
"."
]
}
] |
PMC8777939
|
The solution was washed several times with distilled water to remove excess dye.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"solution",
"was",
"washed",
"several",
"times",
"with",
"distilled",
"water",
"to",
"remove",
"excess",
"dye",
"."
]
}
] |
PMC11790971
|
The balanced accuracies increased to 0.952 ± 0.005 and 0.968 ± 0.004 for passage 1 and passage 2, respectively (p value = 6.681 × 10), and the impurity scores of passage 1 and passage 2 dropped to 0.041 ± 0.003 and 0.022 ± 0.002, respectively (p value = 2.412 × 10).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"balanced",
"accuracies",
"increased",
"to",
"0.952",
"±",
"0.005",
"and",
"0.968",
"±",
"0.004",
"for",
"passage",
"1",
"and",
"passage",
"2",
",",
"respectively",
"(",
"p",
"value",
"=",
"6.681",
"×",
"10",
")",
",",
"and",
"the",
"impurity",
"scores",
"of",
"passage",
"1",
"and",
"passage",
"2",
"dropped",
"to",
"0.041",
"±",
"0.003",
"and",
"0.022",
"±",
"0.002",
",",
"respectively",
"(",
"p",
"value",
"=",
"2.412",
"×",
"10",
")",
"."
]
}
] |
PMC10142392
|
The characteristics of liposomes are controlled by various factors, such as the lipid composition, number of lipid bilayers, size, surface charge, non-polar chain length, degree of unsaturation, and preparation method.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"characteristics",
"of",
"liposomes",
"are",
"controlled",
"by",
"various",
"factors",
",",
"such",
"as",
"the",
"lipid",
"composition",
",",
"number",
"of",
"lipid",
"bilayers",
",",
"size",
",",
"surface",
"charge",
",",
"non-polar",
"chain",
"length",
",",
"degree",
"of",
"unsaturation",
",",
"and",
"preparation",
"method",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
PDCs were implanted intravenously into NSG-SGM3 mice and after disease onset animals were treated orally with RVU120.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"PDCs",
"were",
"implanted",
"intravenously",
"into",
"NSG-SGM3",
"mice",
"and",
"after",
"disease",
"onset",
"animals",
"were",
"treated",
"orally",
"with",
"RVU120",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Mean age was 41.1 years, and 90% of patients were women.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Mean",
"age",
"was",
"41.1",
"years",
",",
"and",
"90",
"%",
"of",
"patients",
"were",
"women",
"."
]
}
] |
PMC11469524
|
Representative Western blot. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Representative",
"Western",
"blot",
".",
"("
]
}
] |
PMC11707832
|
MAN2B1 expression across various immune cell types.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MAN2B1",
"expression",
"across",
"various",
"immune",
"cell",
"types",
"."
]
}
] |
PMC11267830
|
a The radar chart illustrates the extent of protein expression differences.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"a",
"The",
"radar",
"chart",
"illustrates",
"the",
"extent",
"of",
"protein",
"expression",
"differences",
"."
]
}
] |
PMC11656657
|
The cell lines 143B (wild-type control, orange line), 143B CXCL8 (143B CXCL8 knockout, red line), and 143B G-CSF (143B G-CSF knockout, blue line), where analyzed for GD2 expression (percentage and GD2 MFI) by flow-cytometry and normalized on the Isotype Control.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cell",
"lines",
"143B",
"(",
"wild-type",
"control",
",",
"orange",
"line",
")",
",",
"143B",
"CXCL8",
"(",
"143B",
"CXCL8",
"knockout",
",",
"red",
"line",
")",
",",
"and",
"143B",
"G-CSF",
"(",
"143B",
"G-CSF",
"knockout",
",",
"blue",
"line",
")",
",",
"where",
"analyzed",
"for",
"GD2",
"expression",
"(",
"percentage",
"and",
"GD2",
"MFI",
")",
"by",
"flow-cytometry",
"and",
"normalized",
"on",
"the",
"Isotype",
"Control",
"."
]
}
] |
PMC11680049
|
To analyze the fungicidal activity of complex extracts from the biomass obtained from the shoots of Sequoia during the winter growing season and from callus tissue in the third cultivation cycle, we utilized the mycelium of the fungus Fusarium oxisporum L. This fungus was cultivated on nutrient media containing various concentrations of the studied extracts and grown for 21 days.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"analyze",
"the",
"fungicidal",
"activity",
"of",
"complex",
"extracts",
"from",
"the",
"biomass",
"obtained",
"from",
"the",
"shoots",
"of",
"Sequoia",
"during",
"the",
"winter",
"growing",
"season",
"and",
"from",
"callus",
"tissue",
"in",
"the",
"third",
"cultivation",
"cycle",
",",
"we",
"utilized",
"the",
"mycelium",
"of",
"the",
"fungus",
"Fusarium",
"oxisporum",
"L.",
"This",
"fungus",
"was",
"cultivated",
"on",
"nutrient",
"media",
"containing",
"various",
"concentrations",
"of",
"the",
"studied",
"extracts",
"and",
"grown",
"for",
"21",
"days",
"."
]
}
] |
PMC9780037
|
Cytoplasmic cyt c can evade the cell.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cytoplasmic",
"cyt",
"c",
"can",
"evade",
"the",
"cell",
"."
]
}
] |
PMC11612508
|
The schematic of magnetic microspheres and drug release under a magnetic field.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"schematic",
"of",
"magnetic",
"microspheres",
"and",
"drug",
"release",
"under",
"a",
"magnetic",
"field",
"."
]
}
] |
PMC8806312
|
Immune infiltration is a feature of most cancers, and many cancers have a complex chemokine network that modulates tumor cell growth, survival and migration, as well as the extent and phenotype of this infiltration .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Immune",
"infiltration",
"is",
"a",
"feature",
"of",
"most",
"cancers",
",",
"and",
"many",
"cancers",
"have",
"a",
"complex",
"chemokine",
"network",
"that",
"modulates",
"tumor",
"cell",
"growth",
",",
"survival",
"and",
"migration",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"extent",
"and",
"phenotype",
"of",
"this",
"infiltration",
"."
]
}
] |
PMC10170482
|
Subsequently, cDNA was generated using the Maxima H Minus First Strand cDNA Synthesis Kit (Thermo Fisher Scientific, USA).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Subsequently",
",",
"cDNA",
"was",
"generated",
"using",
"the",
"Maxima",
"H",
"Minus",
"First",
"Strand",
"cDNA",
"Synthesis",
"Kit",
"(",
"Thermo",
"Fisher",
"Scientific",
",",
"USA",
")",
"."
]
}
] |
PMC11127909
|
Hence, targeting mitochondria to treat cancer and overcome chemoresistance has attracted increasing attention for various cancers.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Hence",
",",
"targeting",
"mitochondria",
"to",
"treat",
"cancer",
"and",
"overcome",
"chemoresistance",
"has",
"attracted",
"increasing",
"attention",
"for",
"various",
"cancers",
"."
]
}
] |
PMC9275501
|
In vitro drug release studies verified the redox triggering and synchronous rapid release of CPT and GEM by the co-assembled nano micelles.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"vitro",
"drug",
"release",
"studies",
"verified",
"the",
"redox",
"triggering",
"and",
"synchronous",
"rapid",
"release",
"of",
"CPT",
"and",
"GEM",
"by",
"the",
"co-assembled",
"nano",
"micelles",
"."
]
}
] |
PMC11194678
|
Right: Quantitative analysis of the WB assay is normalized by β-actin.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Right",
":",
"Quantitative",
"analysis",
"of",
"the",
"WB",
"assay",
"is",
"normalized",
"by",
"β-actin",
"."
]
}
] |
PMC11762280
|
The statistic of epidermal thickness and average optical densities of TUNEL, MPO, MMP9, F4/80 positive staining were analyzed (n = 3).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"statistic",
"of",
"epidermal",
"thickness",
"and",
"average",
"optical",
"densities",
"of",
"TUNEL",
",",
"MPO",
",",
"MMP9",
",",
"F4/80",
"positive",
"staining",
"were",
"analyzed",
"(",
"n",
"=",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC11400680
|
For the test set, it is further divided into three levels of difficulties based on the cellular appearance, quality of the image, and contrast (4,22).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"the",
"test",
"set",
",",
"it",
"is",
"further",
"divided",
"into",
"three",
"levels",
"of",
"difficulties",
"based",
"on",
"the",
"cellular",
"appearance",
",",
"quality",
"of",
"the",
"image",
",",
"and",
"contrast",
"(",
"4,22",
")",
"."
]
}
] |
PMC11806818
|
Despite their superior performance, the development of dual-mode sensors necessitates careful design of biorecognition molecules that accommodate both detection modalities.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Despite",
"their",
"superior",
"performance",
",",
"the",
"development",
"of",
"dual-mode",
"sensors",
"necessitates",
"careful",
"design",
"of",
"biorecognition",
"molecules",
"that",
"accommodate",
"both",
"detection",
"modalities",
"."
]
}
] |
PMC11012313
|
Cells were then fixed and permeabilized using eBioscience™ IC Fixation Buffer and Permeabilization Buffer as recommended by the vendor (Thermo Fisher Scientific).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cells",
"were",
"then",
"fixed",
"and",
"permeabilized",
"using",
"eBioscience",
"™",
"IC",
"Fixation",
"Buffer",
"and",
"Permeabilization",
"Buffer",
"as",
"recommended",
"by",
"the",
"vendor",
"(",
"Thermo",
"Fisher",
"Scientific",
")",
"."
]
}
] |
PMC11512230
|
For instance, it was shown that SP from Tobacco mosaic virus (TMV, genus Tobamovirus, family Virgaviridae) induce antitumor immunity, leading to a slowdown in melanoma growth .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"instance",
",",
"it",
"was",
"shown",
"that",
"SP",
"from",
"Tobacco",
"mosaic",
"virus",
"(",
"TMV",
",",
"genus",
"Tobamovirus",
",",
"family",
"Virgaviridae",
")",
"induce",
"antitumor",
"immunity",
",",
"leading",
"to",
"a",
"slowdown",
"in",
"melanoma",
"growth",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Compensation donors and occasional donors are evenly distributed between the sexes p=0.41 p=0.17 (NS) respectively.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Compensation",
"donors",
"and",
"occasional",
"donors",
"are",
"evenly",
"distributed",
"between",
"the",
"sexes",
"p=0.41",
"p=0.17",
"(",
"NS",
")",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC6222635
|
Polysaccharides are the main component and account for 20% to 40% of the total compounds .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Polysaccharides",
"are",
"the",
"main",
"component",
"and",
"account",
"for",
"20",
"%",
"to",
"40",
"%",
"of",
"the",
"total",
"compounds",
"."
]
}
] |
PMC11412752
|
Western blotting analysis showed that protein levels were undetectable in the STING knockout cell line compared to the WT cell line, further confirming the efficiency of the gene knockout (Figure 1(e)).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Western",
"blotting",
"analysis",
"showed",
"that",
"protein",
"levels",
"were",
"undetectable",
"in",
"the",
"STING",
"knockout",
"cell",
"line",
"compared",
"to",
"the",
"WT",
"cell",
"line",
",",
"further",
"confirming",
"the",
"efficiency",
"of",
"the",
"gene",
"knockout",
"(",
"Figure",
"1(e",
")",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The mean age was 62 among the ino and blin cohorts and 66 for the other agents group; a larger proportion of the ino cohort qualified for Medicare with non-age-related factors (disability) than those initiating blin or other agents.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"mean",
"age",
"was",
"62",
"among",
"the",
"ino",
"and",
"blin",
"cohorts",
"and",
"66",
"for",
"the",
"other",
"agents",
"group",
";",
"a",
"larger",
"proportion",
"of",
"the",
"ino",
"cohort",
"qualified",
"for",
"Medicare",
"with",
"non-age-related",
"factors",
"(",
"disability",
")",
"than",
"those",
"initiating",
"blin",
"or",
"other",
"agents",
"."
]
}
] |
PMC7039683
|
All the classifiers picked the same SNP as having the strongest effect, but the significance was highest with the classifier trained on zebrafish periderm.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"the",
"classifiers",
"picked",
"the",
"same",
"SNP",
"as",
"having",
"the",
"strongest",
"effect",
",",
"but",
"the",
"significance",
"was",
"highest",
"with",
"the",
"classifier",
"trained",
"on",
"zebrafish",
"periderm",
"."
]
}
] |
PMC9250505
|
The care and use of laboratory animals were approved by the Laboratory Animal Ethics Committee (Certificate number: YW) at Peking University Shenzhen as previously described, and ethical approval was obtained from Tsinghua Shenzhen International Graduate School (Number:9, Year 2020).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"care",
"and",
"use",
"of",
"laboratory",
"animals",
"were",
"approved",
"by",
"the",
"Laboratory",
"Animal",
"Ethics",
"Committee",
"(",
"Certificate",
"number",
":",
"YW",
")",
"at",
"Peking",
"University",
"Shenzhen",
"as",
"previously",
"described",
",",
"and",
"ethical",
"approval",
"was",
"obtained",
"from",
"Tsinghua",
"Shenzhen",
"International",
"Graduate",
"School",
"(",
"Number:9",
",",
"Year",
"2020",
")",
"."
]
}
] |
PMC8609870
|
GRIA1 (Glutamate Ionotropic Receptor AMPA Type Subunit 1) is located on the chromosome 5q33.2 and the encoded protein is the main excitatory neurotransmitter receptor in the mammalian brain.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"GRIA1",
"(",
"Glutamate",
"Ionotropic",
"Receptor",
"AMPA",
"Type",
"Subunit",
"1",
")",
"is",
"located",
"on",
"the",
"chromosome",
"5q33.2",
"and",
"the",
"encoded",
"protein",
"is",
"the",
"main",
"excitatory",
"neurotransmitter",
"receptor",
"in",
"the",
"mammalian",
"brain",
"."
]
}
] |
PMC10758402
|
As a starting point, human renal 786-0 carcinoma cells, which are typically resistant to oncolytic virus infection, underwent a pre-treatment phase of 4 hours with DMF as per previous studies (24).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"a",
"starting",
"point",
",",
"human",
"renal",
"786",
"-",
"0",
"carcinoma",
"cells",
",",
"which",
"are",
"typically",
"resistant",
"to",
"oncolytic",
"virus",
"infection",
",",
"underwent",
"a",
"pre-treatment",
"phase",
"of",
"4",
"hours",
"with",
"DMF",
"as",
"per",
"previous",
"studies",
"(",
"24",
")",
"."
]
}
] |
PMC11525293
|
The following quantities of Abs were used to immunoprecipitate the DNA–protein complexes: 2 μg of anti-p63α (D2K8X) XP® Rabbit mAb (Cell Signaling Technology #131,095), 2 μg of anti-acetylated H4-histone Ab (BioRad #AHP148), and 1 μg of an unrelated, negative control Ab.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"following",
"quantities",
"of",
"Abs",
"were",
"used",
"to",
"immunoprecipitate",
"the",
"DNA",
"–",
"protein",
"complexes",
":",
"2",
"μg",
"of",
"anti-p63α",
"(",
"D2K8X",
")",
"XP",
"®",
"Rabbit",
"mAb",
"(",
"Cell",
"Signaling",
"Technology",
"#",
"131,095",
")",
",",
"2",
"μg",
"of",
"anti-acetylated",
"H4-histone",
"Ab",
"(",
"BioRad",
"#",
"AHP148",
")",
",",
"and",
"1",
"μg",
"of",
"an",
"unrelated",
",",
"negative",
"control",
"Ab",
"."
]
}
] |
PMC11300639
|
Currently, a phase I clinical trial (NCT03905889) is underway to investigate combination therapy with abemaciclib and sunitinib for the treatment of metastatic RCC (US National Library of Medicine.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Currently",
",",
"a",
"phase",
"I",
"clinical",
"trial",
"(",
"NCT03905889",
")",
"is",
"underway",
"to",
"investigate",
"combination",
"therapy",
"with",
"abemaciclib",
"and",
"sunitinib",
"for",
"the",
"treatment",
"of",
"metastatic",
"RCC",
"(",
"US",
"National",
"Library",
"of",
"Medicine",
"."
]
}
] |
PMC8956657
|
Finally, we examined the crystal structure of a MERS-CoV ORF4b Arg to Ala (R37A) mutant bound to IMPα2 and found that the major site was also disrupted and formed a Lys P2 register similar to the R24A and R33A mutants (Fig. 3E).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Finally",
",",
"we",
"examined",
"the",
"crystal",
"structure",
"of",
"a",
"MERS-CoV",
"ORF4b",
"Arg",
"to",
"Ala",
"(",
"R37A",
")",
"mutant",
"bound",
"to",
"IMPα2",
"and",
"found",
"that",
"the",
"major",
"site",
"was",
"also",
"disrupted",
"and",
"formed",
"a",
"Lys",
"P2",
"register",
"similar",
"to",
"the",
"R24A",
"and",
"R33A",
"mutants",
"(",
"Fig.",
"3E",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
For OS, NMA results showed a trend favoring zanubrutinib over acalabrutinib (0.75, [0.35, 1.59]), ibrutinib (0.62, [0.31, 1.22]), and BR (0.52, [0.21, 1.24]).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"OS",
",",
"NMA",
"results",
"showed",
"a",
"trend",
"favoring",
"zanubrutinib",
"over",
"acalabrutinib",
"(",
"0.75",
",",
"[",
"0.35",
",",
"1.59",
"]",
")",
",",
"ibrutinib",
"(",
"0.62",
",",
"[",
"0.31",
",",
"1.22",
"]",
")",
",",
"and",
"BR",
"(",
"0.52",
",",
"[",
"0.21",
",",
"1.24",
"]",
")",
"."
]
}
] |
PMC11742290
|
LGR5-KD in ovarian cancer (HO8910) cells significantly inhibited cell proliferation .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"LGR5-KD",
"in",
"ovarian",
"cancer",
"(",
"HO8910",
")",
"cells",
"significantly",
"inhibited",
"cell",
"proliferation",
"."
]
}
] |
PMC11422150
|
So we introduced a three-dimensional treadmill gait analysis system to evaluate the gait function.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"So",
"we",
"introduced",
"a",
"three-dimensional",
"treadmill",
"gait",
"analysis",
"system",
"to",
"evaluate",
"the",
"gait",
"function",
"."
]
}
] |
PMC10362265
|
MSAs were generated by MMseq2 , using the databases of UniRef100 and PDB70 05Sep15 which is a clustered version of PDB .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MSAs",
"were",
"generated",
"by",
"MMseq2",
",",
"using",
"the",
"databases",
"of",
"UniRef100",
"and",
"PDB70",
"05Sep15",
"which",
"is",
"a",
"clustered",
"version",
"of",
"PDB",
"."
]
}
] |
PMC3019555
|
Similar results were obtained in a parallel experiment in which single HeLa–GFP-Ago2 cells were followed over time though live cell imaging (Fig. S4 A).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Similar",
"results",
"were",
"obtained",
"in",
"a",
"parallel",
"experiment",
"in",
"which",
"single",
"HeLa",
"–",
"GFP-Ago2",
"cells",
"were",
"followed",
"over",
"time",
"though",
"live",
"cell",
"imaging",
"(",
"Fig.",
"S4",
"A",
")",
"."
]
}
] |
PMC5311252
|
microRNA (miRNA) dysregulation is a common feature of cancer cells, but the complex roles of miRNAs in cancer are not fully elucidated.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"microRNA",
"(",
"miRNA",
")",
"dysregulation",
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PMC8751435
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Fluorescence images in A549 cells treated with CME 100 μg/ml or AD‐Cd 270pM for 24 h. Cells were stained with Hoechst 33258 (blue) to highlight the nuclei. (
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PMC9583612
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Characterizing operator-specific distributions of the frequency and duration of intermittent emission events is critical to developing an accurate annualized emissions estimate.
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PMC11377827
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CA9: control vs. USP43 sgRNA, **P = 0.0031, one-way ANOVA. (
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PMC11095939
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Meanwhile, we mapped the binding landscape of Mecp2 in Mecp2 livers before and after PHx using ChIP-seq by filtering out peaks identified in Mecp2-cKO livers (Figure 6—figure supplement 1C).
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Subsets and Splits
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