id
int64
0
4.72k
body
stringlengths
12
227
answer
stringlengths
2
3.35k
relevant_passages
listlengths
1
83
approx_word_count_original
int64
10
3.79k
approx_word_count_translated
int64
8
2.21k
2,800
Wordt de bacterie P. gingivalis in de hersenen gevonden?
Ja
[ "studies met behulp van een diermodel van parodontitis en menselijke post-mortem hersenweefsels van personen met AD suggereren sterk dat een gram-negatieve parodontale pathogeen, Porphyromonas gingivalis (Pg) en/of het product gingipain, wordt getransloceerd naar de hersenen.", "De polymicrobiële dysbiotische subgingivale biofilm-microben die geassocieerd zijn met parodontale ziekte lijken bij te dragen aan het ontwikkelen van pathologieën op afstand gelegen lichaamsplaatsen, inclusief de hersenen." ]
62
69
2,801
Is ibudilast effectief voor multiple sclerose?
Ja, ibudilast bleek effectief te zijn voor progressieve multiple sclerose. In een fase 2-studie met patiënten met progressieve multiple sclerose werd ibudilast geassocieerd met een tragere progressie van hersenatrofie dan placebo, maar ging het gepaard met hogere percentages gastro-intestinale bijwerkingen, hoofdpijn en depressie.
[ "Ibudilast vertraagde hersenatrofie bij PPMS- en SPMS-patiënten in een multicenter fase 2b-studie.", "Ibudilast remt verschillende cyclische nucleotide-fosfodiësterasen, macrophage migration inhibitory factor en toll-like receptor 4 en kan de bloed-hersenbarrière passeren, met potentiële gunstige effecten bij progressieve multiple sclerose.", "CONCLUSIES: In een fase 2-studie met patiënten met progressieve multiple sclerose werd ibudilast geassocieerd met een tragere progressie van hersenatrofie dan placebo, maar ging het gepaard met hogere percentages gastro-intestinale bijwerkingen, hoofdpijn en depressie.", "Specifiek wordt het huidige bewijs met betrekking tot de behandeling van progressieve MS met ocrelizumab, simvastatine, ibudilast, alfa-liponzuur, hoge dosis biotine, siponimod en celgebaseerde therapieën besproken.", "Op basis van onze kennis van pathofysiologie worden drie therapeutische strategieën voorgesteld: anti-inflammatoir (ocrelizumab, siponimod…); remyelinerend (opicinumab); en neuroprotectief (hoge dosis biotine, ibudilast, simvastatine…).", "Het huidige artikel geeft een overzicht van de farmacologie van IBD met een focus op preklinische en klinische gegevens die de potentiële neuroprotectieve voordelen ondersteunen voor neurologische aandoeningen, waaronder multiple sclerose, neuropathische pijn, medicatie-overgebruikshoofdpijn, beroerte, opioïde-, alcohol- en methamfetamineverslaving.", "Ontwerp, rationale en basiskenmerken van de gerandomiseerde dubbelblinde fase II klinische studie van ibudilast bij progressieve multiple sclerose.", "METHODEN: SPRINT-MS is een gerandomiseerde, placebogecontroleerde fase II-studie van ibudilast bij patiënten met PMS.", "CONCLUSIE: SPRINT-MS is ontworpen om de veiligheid en werkzaamheid van ibudilast als behandeling voor PMS te evalueren, terwijl tegelijkertijd vijf verschillende beeldvormingsbiomarkers worden gevalideerd als uitkomstmaten voor gebruik in toekomstige fase II proof-of-concept PMS-studies.", "Ibudilast voor de behandeling van multiple sclerose.", "BESPROKEN GEBIEDEN: Dit artikel bespreekt verschillende studies die ibudilast als potentiële therapie voor MS onderzoeken. Het vat eerdere en huidige klinische onderzoeken van ibudilast bij MS samen, evenals de farmacologie ervan. EXPERTMENING: Hoewel ibudilast niet is aangetoond de focale inflammatoire activiteit bij relapsing MS te verminderen, bleek het effect te hebben op het behoud van hersenvolume en de progressie van invaliditeit. Ibudilast kan een rol spelen bij de behandeling van progressieve MS-fenotypes.", "Bijwerkingen van ibudilast omvatten gastro-intestinale symptomen, hoofdpijn en depressie.<br><b>CONCLUSIES</b>: In een fase 2-studie met patiënten met progressieve multiple sclerose werd ibudilast geassocieerd met een tragere progressie van hersenatrofie dan placebo, maar ging het gepaard met hogere percentages gastro-intestinale bijwerkingen, hoofdpijn en depressie.", "Het vat eerdere en huidige klinische onderzoeken van ibudilast bij MS samen, evenals de farmacologie ervan.<br><b>EXPERTMENING</b>: Hoewel ibudilast niet is aangetoond de focale inflammatoire activiteit bij relapsing MS te verminderen, bleek het effect te hebben op het behoud van hersenvolume en de progressie van invaliditeit." ]
446
428
2,802
Activeert gepotidacine bacteriële topoisomerase?
Nee, gepotidacine is een remmer van bacteriële topoisomerase.
[ "GSK2140944 is een nieuw bacterieel topoisomerase-remmend middel in ontwikkeling voor de behandeling van bacteriële infecties." ]
25
25
2,803
Wat is de 3D-genoombrowser?
De 3D-genoombrowser, http://3dgenome.org, stelt gebruikers in staat om gemakkelijk zowel hun eigen als meer dan 300 openbaar beschikbare chromatine-interactiegegevens van verschillende typen te verkennen. De browser biedt meerdere methoden om distale cis-regulerende elementen te koppelen aan hun potentiële doelfgenen. Gebruikers kunnen naadloos duizenden andere omics-gegevens integreren om een uitgebreid overzicht te krijgen van zowel het regulerende landschap als de 3D-genoomstructuur.
[ "De 3D-genoombrowser: een webgebaseerde browser voor het visualiseren van 3D-genoomorganisatie en langafstand chromatine-interacties.", "Hier introduceren we de 3D-genoombrowser, http://3dgenome.org, die gebruikers in staat stelt om gemakkelijk zowel hun eigen als meer dan 300 openbaar beschikbare chromatine-interactiegegevens van verschillende typen te verkennen. We ontwerpen een nieuw binair dataformaat voor Hi-C-gegevens dat de bestandsgrootte met minstens een factor tien vermindert en gebruikers in staat stelt om chromatine-interacties over miljoenen basenparen binnen enkele seconden te visualiseren. Onze browser biedt meerdere methoden om distale cis-regulerende elementen te koppelen aan hun potentiële doelfgenen. Gebruikers kunnen naadloos duizenden andere omics-gegevens integreren om een uitgebreid overzicht te krijgen van zowel het regulerende landschap als de 3D-genoomstructuur.", "We introduceren gelijktijdig een databasesysteem om 3D-genomische gegevens op te slaan en te doorzoeken (3DBG), en een 3D-genoombrowser om 3D-genoomstructuren te visualiseren en te verkennen (3DGB).", "Hier introduceren we de 3D-genoombrowser, http://3dgenome.org, die gebruikers in staat stelt om gemakkelijk zowel hun eigen als meer dan 300 openbaar beschikbare chromatine-interactiegegevens van verschillende typen te verkennen." ]
232
222
2,804
Zijn darmproteobacteriën geassocieerd met inflammatoire aandoeningen?
Het begin van inflammatoire darmziekte wordt geassocieerd met enterale proteobacteriële infectie, maar de mechanistische basis voor deze associatie is onduidelijk.
[ "In de IBD-groep waren Firmicutes, Proteobacteria, Verrucomicrobia en Fusobacteria significant verhoogd,", "De bacteriële microbiota bij patiënten met de ziekte van Crohn werd gekenmerkt door een beperking in biodiversiteit, met een toename van Proteobacteria en Fusobacteria.", "Het begin van inflammatoire darmziekte wordt geassocieerd met enterale proteobacteriële infectie, maar de mechanistische basis voor deze associatie is onduidelijk.", "Vergelijkbaar met de bevindingen bij inflammatoire ziektebeelden hadden SSc-patiënten verlaagde niveaus van commensale bacteriën, zoals Faecalibacterium en Clostridium, en verhoogde niveaus van pathobiont bacteriën, zoals Fusobacterium en γ-Proteobacteria, vergeleken met gezonde controles.", "De colische en cecale microbiota van gezonde muizen die α-MG kregen maar geen DSS, verschoof naar een verhoogde abundantie van Proteobacteria en een verminderde abundantie van Firmicutes en Bacteroidetes, een profiel vergelijkbaar met dat gevonden bij menselijke UC.", "Een significante toename in abundantie van ongebruikelijke aeroben en facultatieve anaeroben, inclusief leden van het phylum Proteobacteria (p=0,031), werd ook waargenomen." ]
168
165
2,805
Welke hersenprocedure kan worden uitgevoerd met het NeuroBlate-systeem?
Het NeuroBlate-systeem wordt gebruikt voor laser interstitiële thermotherapie.
[ "Op 3-jarige leeftijd onderging hij stereotactische laserablatie met als doel het loskoppelen van de laesie. De procedure werd uitgevoerd met de NeuroBlate SideFire-sonde.", "De auteurs voeren een systematische analyse uit van twee commercieel verkrijgbare MRgLITT-systemen die in de neurochirurgie worden gebruikt: de Visualase® thermotherapie en NeuroBlate® systemen.", "We beschrijven de geschiedenis en rationale van laserneurochirurgie evenals de twee beschikbare SLT-systemen (Visualase® en NeuroBlate®; CE-markeringen in afwachting).", "INLEIDING: We beschrijven de haalbaarheid van het gebruik van minimaal invasieve robotgestuurde laser interstitiële thermotherapie (LITT) voor het bereiken van een anterieure tweederde en een volledige corpus callosotomie. METHODEN: Tien sonde-trajecten werden uitgezet op normale magnetische resonantiebeelden (MRI) met behulp van de Brainlab Stereotactic Planning Software (Brainlab, München, Duitsland). Het NeuroBlate® systeem (Monteris Medical, MN, VS) werd gebruikt om de thermische verbranding aan te passen aan het corpus callosum langs het traject van de sonde.", "Hier beschrijven we kort de geschiedenis en rationale van laserneurochirurgie evenals de technische kernkenmerken van de twee momenteel beschikbare systemen voor magnetische resonantie-geleide LiTT (Visualase®, NeuroBlate®; CE-markeringen in afwachting voor beide).", "We rapporteren onze multicenterresultaten van laser interstitiële thermotherapie (LITT) bij DTA-HGG's. We hebben retrospectief 34 opeenvolgende DTA-HGG-patiënten (24 glioblastomen, 10 anaplastische) die LITT ondergingen in de Cleveland Clinic, Washington University en Wake Forest University (mei 2011-december 2012) beoordeeld met gebruik van het NeuroBlate(®) systeem.", "Laser interstitiële thermotherapie bij de behandeling van hersentumoren – het NeuroBlate-systeem.", "DOEL: Laser interstitiële thermotherapie is gebruikt als ablatieve behandeling voor gliomen; de ontwikkeling ervan was echter beperkt door technische problemen. Het NeuroBlate-systeem bevat verschillende technologische verbeteringen om deze nadelen te overwinnen. De auteurs rapporteren een fase I, thermische dosis-escalatietrial waarin de veiligheid en effectiviteit van NeuroBlate bij recidiverend glioblastoom multiforme (rGBM) wordt beoordeeld.", "Drie hadden graad 3 bijwerkingen bij de hoogste dosis.<br><b>CONCLUSIES</b>: NeuroBlate vertegenwoordigt nieuwe technologie voor het leveren van laser interstitiële thermotherapie, waarmee gecontroleerde thermische ablatie van diepe hemisferische rGBM mogelijk is." ]
327
316
2,806
Beschrijf Genomiser
Genomiser is een analyseframework dat niet alleen in staat is om de relevantie van variatie in het niet-coderende genoom te scoren, maar ook om regulatorische varianten te koppelen aan specifieke Mendeliaanse ziekten. Genomiser scoort varianten via bestaande methoden zoals CADD of een op maat gemaakte machine learning-methode en combineert deze met alleelfrequentie, regulatorische sequenties, chromosomale topologische domeinen en fenotypische relevantie om varianten te ontdekken die geassocieerd zijn met specifieke Mendeliaanse aandoeningen. Genomiser kan causale regulatorische varianten identificeren als de topkandidaat in 77% van gesimuleerde volledige genomen, wat effectieve detectie en ontdekking van regulatorische varianten bij Mendeliaanse ziekten mogelijk maakt.
[ "De interpretatie van niet-coderende varianten blijft een grote uitdaging bij de toepassing van whole-genome sequencing bij Mendeliaanse ziekten, vooral voor enkelvoudige-nucleotide en andere kleine niet-coderende varianten. Hier presenteren we Genomiser, een analyseframework dat niet alleen in staat is om de relevantie van variatie in het niet-coderende genoom te scoren, maar ook om regulatorische varianten te koppelen aan specifieke Mendeliaanse ziekten. Genomiser scoort varianten via bestaande methoden zoals CADD of een op maat gemaakte machine learning-methode en combineert deze met alleelfrequentie, regulatorische sequenties, chromosomale topologische domeinen en fenotypische relevantie om varianten te ontdekken die geassocieerd zijn met specifieke Mendeliaanse aandoeningen. Over het geheel genomen kan Genomiser causale regulatorische varianten identificeren als de topkandidaat in 77% van gesimuleerde volledige genomen, wat effectieve detectie en ontdekking van regulatorische varianten bij Mendeliaanse ziekten mogelijk maakt.", "Hier presenteren we Genomiser, een analyseframework dat niet alleen in staat is om de relevantie van variatie in het niet-coderende genoom te scoren, maar ook om regulatorische varianten te koppelen aan specifieke Mendeliaanse ziekten.", "Genomiser scoort varianten via bestaande methoden zoals CADD of een op maat gemaakte machine learning-methode en combineert deze met alleelfrequentie, regulatorische sequenties, chromosomale topologische domeinen en fenotypische relevantie om varianten te ontdekken die geassocieerd zijn met specifieke Mendeliaanse aandoeningen." ]
289
301
2,807
Welk ultraconserved element wordt geassocieerd met zelfvernieuwing van embryonale stamcellen (ESC)?
Ultraconserved elementen (UCE's) vertonen de bijzondere eigenschap om een uitgebreide perfecte sequentie-identiteit te behouden tussen menselijke, muis- en ratgenoom. De meeste van hen worden getranscribeerd en vormen een nieuwe familie van lange niet-coderende RNA's (lncRNA's), de getranscribeerde UCE's (T-UCE's). Ondanks hun betrokkenheid bij menselijke kanker is de fysiologische rol van T-UCE's nog onbekend. Een lncRNA dat de uc.170+ bevat, genaamd T-UCstem1, werd geïdentificeerd met in vitro en in vivo bewijs dat het essentiële rollen speelt in embryonale stamcellen (ESC's) door cytoplasmatische miRNA-niveaus te moduleren en transcriptiedynamiek te behouden.
[ "Een Ultraconserved Element Bevatten lncRNA Behoudt Transcriptiedynamiek en Handhaaft Zelfvernieuwing van ESC.", "Ultraconserved elementen (UCE's) vertonen de bijzondere eigenschap om een uitgebreide perfecte sequentie-identiteit te behouden tussen menselijke, muis- en ratgenoom. De meeste van hen worden getranscribeerd en vormen een nieuwe familie van lange niet-coderende RNA's (lncRNA's), de getranscribeerde UCE's (T-UCE's). Ondanks hun betrokkenheid bij menselijke kanker is de fysiologische rol van T-UCE's nog onbekend. Hier identificeren we een lncRNA dat de uc.170+ bevat, genaamd T-UCstem1, en leveren in vitro en in vivo bewijs dat het essentiële rollen speelt in embryonale stamcellen (ESC's) door cytoplasmatische miRNA-niveaus te moduleren en transcriptiedynamiek te behouden.", "Hier identificeren we een lncRNA dat de uc.170+ bevat, genaamd T-UCstem1, en leveren in vitro en in vivo bewijs dat het essentiële rollen speelt in embryonale stamcellen (ESC's) door cytoplasmatische miRNA-niveaus te moduleren en transcriptiedynamiek te behouden." ]
228
234
2,808
Wat is TPMCalculator?
De kwantificering van RNA-sequencing (RNA-seq) abundanties met behulp van een normalisatiemethode die transcripts per miljoen (TPM) berekent, is een belangrijke stap om meerdere monsters uit verschillende experimenten te vergelijken. TPMCalculator is een software in één stap om RNA-seq uitlijningen in BAM-formaat te verwerken en rapporteert TPM-waarden, ruwe leesaantallen en feature-lengtes voor genen, transcripties, exonen en intronen. Het programma beschrijft de genomische kenmerken via een model dat is gegenereerd uit het gene transfer format (GTF)-bestand dat tijdens de uitlijningen is gebruikt, en rapporteert de TPM-waarden en de ruwe leesaantallen voor elk kenmerk.
[ "TPMCalculator: software in één stap om de mRNA-abundantie van genomische kenmerken te kwantificeren.", " De kwantificering van RNA-sequencing (RNA-seq) abundanties met behulp van een normalisatiemethode die transcripts per miljoen (TPM) berekent, is een belangrijke stap om meerdere monsters uit verschillende experimenten te vergelijken. TPMCalculator is een software in één stap om RNA-seq uitlijningen in BAM-formaat te verwerken en rapporteert TPM-waarden, ruwe leesaantallen en feature-lengtes voor genen, transcripties, exonen en intronen. Het programma beschrijft de genomische kenmerken via een model dat is gegenereerd uit het gene transfer format (GTF)-bestand dat tijdens de uitlijningen is gebruikt, en rapporteert de TPM-waarden en de ruwe leesaantallen voor elk kenmerk." ]
189
196
2,809
Beschrijf de klinische presentatie van het Escobar-syndroom.
De Escobar-variant van het multiple pterygium syndroom (MPS) is een zeldzame, autosomaal recessieve aandoening die wordt gekenmerkt door pterygia, arthrogryposis (gewrichtscontracturen), gezichtsdysporfie samen met andere afwijkingen.
[ "ACHTERGROND: Het Escobar-syndroom, een niet-letal variant van multiple pterygium syndromen (MPS), is een zeldzame autosomaal recessieve aandoening die wordt gekenmerkt door pterygia en meerdere gewrichtscontracturen samen met andere afwijkingen.", "Het wordt over het algemeen gekenmerkt door meerdere pterygia die worden gevonden in de cervicale, antecubitale en popliteale regio's. In dit verslag presenteren we de behandelmanagement van een 14-jarig geval met laat stadium Escobar-syndroom die werd opgenomen vanwege meerdere pterygia en bilaterale kniecontracturen.", "Het Escobar-syndroom is een niet-letal subtype van multiple pterygium syndromen, gekenmerkt door webvorming over de gewrichten, congenitale gewrichtscontracturen, gezichtsdysporfie en een verscheidenheid aan andere congenitale afwijkingen.", "De Escobar-variant van het multiple pterygium syndroom (MPS) is een zeldzame, autosomaal recessieve aandoening die kan leiden tot vele ernstige of zelfs lethale foetale afwijkingen. MPS wordt gekenmerkt door pterygia, arthrogryposis (gewrichtscontracturen) en intra-uteriene groeibeperking (IUGR). In het hieronder beschreven geval was een verhoogde foetale nekplooidikte de eerste afwijking die al in het eerste trimester van de zwangerschap werd vastgesteld. Andere symptomen van de ziekte werden gevonden tijdens het tweede trimester van de zwangerschap met behulp van echografisch onderzoek.", "Niet-letal multiple pterygium syndroom: Escobar-syndroom.", "Escobar-syndroom (ES) of multiple pterygia syndroom (MIM#265000) is een zeldzame aandoening die wordt gekenmerkt door gezichtsdysporfie, meerdere webben (pterygia), congenitale contracturen (arthrogryposis) en andere interne afwijkingen.", "Het Escobar-syndroom wordt gekenmerkt door meerdere pterygia of huidwebben en meerdere congenitale afwijkingen.", "Niet-letal Escobar is een zeldzame aandoening die een variant is van multiple pterygium syndromen. Het is een vorm van arthrogryposis multiplex congenita die wordt gekenmerkt door overmatige webvorming (pterygia), congenitale contracturen (arthrogryposis) en scoliose." ]
282
279
2,810
Wat is small-activating RNA?
small activating RNAs zijn dubbelstrengs RNA's (dsRNA's) die genpromotors targeten en genactivatie veroorzaken.
[ "RNA-activatie (RNAa) is een mechanisme van genactivatie dat wordt veroorzaakt door promotor-gerichte kleine dubbelstrengs RNA's (dsRNA's), ook bekend als small activating RNAs (saRNA's)." ]
43
38
2,811
Wat is het werkingsmechanisme van Ivosidenib?
Ivosidenib is een remmer van het IDH1-mutante enzym die een sterke verlaging van 2-HG vertoont in tumormodellen. Het is effectief bij IDH1-mutante teruggekeerde/refractaire acute myeloïde leukemie.
[ "Ten slotte zijn gerichte middelen die meerdere kinasen remmen (rigosertib), BCL2 (venetoclax) of mutant IDH1 (ivosidenib), IDH2 (enasidenib), FLT3 (sorafenib, midostaurine) of spliceosoomcomponenten (H3B-8800) remmen, andere nieuwe opties.", "Ontdekking van AG-120 (Ivosidenib): een eersteklas remmer van mutant IDH1 voor de behandeling van IDH1-mutante kankers.", "Hier rapporteren we de ontdekking van AG-120 (ivosidenib), een remmer van het IDH1-mutante enzym die een sterke verlaging van 2-HG vertoont in tumormodellen en het vermogen heeft om differentiatie van primaire AML-monsters van patiënten ex vivo te bewerkstelligen.", "Een fase I-studie suggereert dat ivosidenib remissie kan induceren bij patiënten met teruggekeerde of refractaire acute myeloïde leukemie gekenmerkt door IDH1-mutaties.", "Ivosidenib (AG-120) is een orale, gerichte, kleine-molecuulremmer van mutant IDH1. <b>METHODEN</b>: We voerden een fase 1 dosisverhogings- en dosisuitbreidingsstudie uit van ivosidenib-monotherapie bij IDH1-gemuteerde AML.", "CONCLUSIES: Bij patiënten met gevorderde IDH1-gemuteerde teruggekeerde of refractaire AML werd ivosidenib in een dosis van 500 mg dagelijks geassocieerd met een lage frequentie van graad 3 of hogere behandelingsgerelateerde bijwerkingen en met transfusieonafhankelijkheid, duurzame remissies en moleculaire remissies bij sommige patiënten met volledige remissie.", "Biochemische studies voorspelden dat resistentie tegen allosterische IDH-remmers ook kan optreden via IDH-dimeer-interface mutaties in cis, wat werd bevestigd bij een patiënt met verworven resistentie tegen de IDH1-remmer ivosidenib (AG-120).", "De FDA keurde ivosidenib goed voor patiënten met IDH1-mutante teruggekeerde/refractaire acute myeloïde leukemie.", "Ivosidenib (AG-120) is een orale, gerichte, kleine-molecuulremmer van mutant IDH1.<br><b>METHODEN</b>: We voerden een fase 1 dosisverhogings- en dosisuitbreidingsstudie uit van ivosidenib-monotherapie bij IDH1-gemuteerde AML." ]
274
262
2,812
Wat is de basis van het ATAC-Seq-protocol?
Deze methode onderzoekt DNA-toegankelijkheid met een hyperactieve Tn5-transposase, die sequencing-adapters invoegt in toegankelijke regio's van chromatine. Sequencing-lezingen kunnen vervolgens worden gebruikt om regio's met verhoogde toegankelijkheid af te leiden, evenals om regio's van transcriptiefactorbinding en nucleosomepositie in kaart te brengen. De methode is een snelle en gevoelige alternatieve methode voor DNase-seq om chromatine-toegankelijkheid genoomwijd te meten, of voor MNase-seq om nucleosomeposities in toegankelijke regio's van het genoom te bepalen.
[ "Deze methode onderzoekt DNA-toegankelijkheid met een hyperactieve Tn5-transposase, die sequencing-adapters invoegt in toegankelijke regio's van chromatine. Sequencing-lezingen kunnen vervolgens worden gebruikt om regio's met verhoogde toegankelijkheid af te leiden, evenals om regio's van transcriptiefactorbinding en nucleosomepositie in kaart te brengen.", "De methode is een snelle en gevoelige alternatieve methode voor DNase-seq om chromatine-toegankelijkheid genoomwijd te meten, of voor MNase-seq om nucleosomeposities in toegankelijke regio's van het genoom te bepalen.", "Dit uitgebreide protocol begint met het oogsten van cellen, beschrijft vervolgens de moleculaire procedure van chromatine-tagmentatie, de voorbereiding van monsters voor next-generation sequencing, en bevat ook methoden en overwegingen voor de computationele analyses die worden gebruikt om de resultaten te interpreteren.", "Assay for Transposase-Accessible Chromatin met high-throughput sequencing (ATAC-seq) is een methode die wordt gebruikt voor de identificatie van open (toegankelijke) regio's van chromatine.", "ATAC-seq, gebaseerd op de voorkeur voor integratie van een transposon in open chromatine.", "Assay for Transposase Accessible Chromatin (ATAC-seq) technologie kan chromatine-toegankelijkheid onderzoeken vanaf kleine aantallen cellen en maakt het mogelijk om enhancers in pathologieën te bestuderen.", "Assay for transposase-accessible chromatin met high-throughput sequencing (ATAC-Seq) is een krachtige techniek voor het identificeren van nucleosoomvrije regio's van het genoom.", "Onlangs is een nieuwe techniek gekoppeld aan high-throughput sequencing, genaamd Assay for Transposase Accessible Chromatin (ATAC-seq), ontstaan als een efficiënte methode om open chromatine genoomwijd in kaart te brengen. De toepassing van deze techniek op verschillende celtypen maakte het mogelijk weefselspecifieke regulatorische elementen te onthullen en cis-regulatoire netwerken te karakteriseren.", "Deze techniek maakt gebruik van een hyperactieve Tn5-transposase om DNA te knippen en tegelijkertijd sequencing-adapters in open chromatine-regio's van de input-nuclei in te voegen.", "Assay for Transposase-Accessible Chromatin met high-throughput sequencing (ATAC-seq) is een methode die wordt gebruikt voor de identificatie van open (toegankelijke) regio's van chromatine.", "ATAC-seq is een robuuste en gevoelige alternatieve methode voor DNase I-hypersensitiviteitsanalyse gekoppeld aan next-generation sequencing (DNase-seq) en formaldehyde-assisted isolation of regulatory elements (FAIRE-seq) voor genoomwijde analyse van chromatine-toegankelijkheid, en voor sequencing van micrococcale nuclease-gevoelige sites (MNase-seq) om nucleosoompositionering te bepalen.", "Wij presenteren Omni-ATAC, een verbeterd ATAC-seq-protocol voor chromatine-toegankelijkheidsprofilering dat werkt voor meerdere toepassingen met een substantiële verbetering van de signaal-ruisverhouding en informatie-inhoud.", "ATAC-seq is een high-throughput sequencing-techniek die open chromatine identificeert." ]
412
421
2,813
Wat is vcfanno?
Vcfanno extraheert en vat flexibel attributen samen uit meerdere annotatiebestanden en integreert de annotaties binnen de INFO-kolom van het oorspronkelijke VCF-bestand. Er worden aanzienlijke prestatieverbeteringen gerapporteerd door ongeveer 85.000 varianten per seconde te annoteren met 50 attributen uit 17 veelgebruikte genoomannotatiebronnen. Vcfanno is beschikbaar op https://github.com/brentp/vcfanno onder de MIT-licentie.
[ "Vcfanno: snelle, flexibele annotatie van genetische varianten.", "De integratie van genoomannotaties is cruciaal voor het identificeren van genetische varianten die relevant zijn voor studies naar ziekten of andere eigenschappen. Echter, uitgebreide variantannotatie met diverse bestandsformaten is moeilijk met bestaande methoden. Hier beschrijven we vcfanno, dat flexibel attributen extraheert en samenvat uit meerdere annotatiebestanden en de annotaties integreert binnen de INFO-kolom van het oorspronkelijke VCF-bestand. Door gebruik te maken van een parallelle \"chromosoom sweep\"-algoritme tonen we aanzienlijke prestatieverbeteringen door ongeveer 85.000 varianten per seconde te annoteren met 50 attributen uit 17 veelgebruikte genoomannotatiebronnen. Vcfanno is beschikbaar op https://github.com/brentp/vcfanno onder de MIT-licentie." ]
160
149
2,814
Wat is de associatie van ziekte-geassocieerde STR's (daSTRs) met domeingrenzen?
Bijna alle ziekte-geassocieerde STR's (daSTRs) bevinden zich op grenzen die 3D chromatinedomeinen afbakenen. Bijvoorbeeld, patiënten met het Fragiele X-syndroom vertonen ernstige verstoring van grenzen op een wijze die correleert met lokaal verlies van CTCF-bezetting en de mate van FMR1-silencing.
[ "Ziekte-geassocieerde korte tandemherhalingen co-localiseren met chromatinedomeingrenzen.", "Hier ontdekken we dat bijna alle ziekte-geassocieerde STR's (daSTRs) zich bevinden op grenzen die 3D chromatinedomeinen afbakenen. We identificeren een subset van grenzen met een aanzienlijk hogere dichtheid aan CpG-eilanden vergeleken met de rest van het genoom. daSTRs localiseren specifiek naar ultra-hoge dichtheid CpG-eilandgrenzen, wat suggereert dat ze hotspots kunnen zijn voor epigenetische misregulatie of topologische verstoring gerelateerd aan STR-expansie. Patiënten met het Fragiele X-syndroom vertonen ernstige grensverstoring op een wijze die correleert met lokaal verlies van CTCF-bezetting en de mate van FMR1-silencing. Onze gegevens onthullen hogere-orde chromatinestructuur als een nieuwe dimensie in het begrijpen van herhalingsexpansiestoornissen.", "Hier ontdekken we dat bijna alle ziekte-geassocieerde STR's (daSTRs) zich bevinden op grenzen die 3D chromatinedomeinen afbakenen.", "daSTRs localiseren specifiek naar ultra-hoge dichtheid CpG-eilandgrenzen, wat suggereert dat ze hotspots kunnen zijn voor epigenetische misregulatie of topologische verstoring gerelateerd aan STR-expansie." ]
194
187
2,815
Wat is de link tussen ultraconserveerde elementen en de driedimensionale organisatie van het zoogdiergenoom?
Ultraconserveerde elementen (UCE's) bevinden zich in specifieke gebieden van de driedimensionale organisatie van het zoogdiergenoom. UCE's zijn verrijkt binnen contactdomeinen en bovendien is de subset van UCE's binnen domeinen die gedeeld worden door diverse celtypen gekoppeld aan niergerelateerde en neuronale processen. In grenzen zijn UCE's over het algemeen uitgeput, waarbij diegenen die wel grenzen overlappen oververtegenwoordigd zijn in exonic UCE's. Wat betreft lusankers zijn UCE's noch oververtegenwoordigd noch ondervertegenwoordigd, maar degenen die aanwezig zijn in lusankers zijn verrijkt voor splice-sites. Aangezien de relaties tussen UCE's en menselijke Hi-C kenmerken behouden blijven in muizen, dragen UCE's bij aan soortoverschrijdende conservatie van genoomorganisatie en daarmee aan genoomstabiliteit.
[ "Ultraconserveerde elementen bezetten specifieke gebieden van de driedimensionale organisatie van het zoogdiergenoom.", "We vinden dat UCE's verrijkt zijn binnen contactdomeinen en bovendien dat de subset van UCE's binnen domeinen die gedeeld worden door diverse celtypen gekoppeld is aan niergerelateerde en neuronale processen. In grenzen zijn UCE's over het algemeen uitgeput, waarbij diegenen die grenzen overlappen oververtegenwoordigd zijn in exonic UCE's. Wat betreft lusankers zijn UCE's noch oververtegenwoordigd noch ondervertegenwoordigd, maar degenen die aanwezig zijn in lusankers zijn verrijkt voor splice-sites. Ten slotte, aangezien de relaties tussen UCE's en menselijke Hi-C kenmerken behouden blijven in muizen, suggereren onze bevindingen dat UCE's bijdragen aan soortoverschrijdende conservatie van genoomorganisatie en daarmee aan genoomstabiliteit." ]
216
226
2,816
Wat zijn de "Ohnologen"?
Duplicaties van het hele genoom (WGD) zijn nu stevig vastgesteld in alle grote eukaryote rijken. In het bijzonder stammen alle gewervelden af van twee rondes van WGD's, die plaatsvonden bij hun kaakloze voorouder ongeveer 500 miljoen jaar geleden. Paralogen die behouden zijn gebleven na WGD, ook wel 'ohnologen' genoemd naar Susumu Ohno, blijken typisch geassocieerd te zijn met ontwikkeling, signalering en genregulatie.
[ "Paralogen die behouden zijn gebleven na WGD, ook wel 'ohnologen' genoemd naar Susumu Ohno, blijken typisch geassocieerd te zijn met ontwikkeling, signalering en genregulatie.", "Ohnologen - paraloge genparen gegenereerd door duplicatie van het hele genoom - zijn verrijkt voor doseringsgevoelige genen, dat wil zeggen genen die een fenotype vertonen door veranderingen in het aantal kopieën.", "Ohnologen zijn paralogen die voortkomen uit dergelijke genoomduplicatie-evenementen, en sommige zebravisgenen die als \"nieuw\" worden beschouwd, kunnen beter worden geïnterpreteerd als \"ohnologen die verdwenen zijn\", gevallen waarin ohnologen verschillend behouden blijven in verschillende evolutionaire lijnen.", "Variaties in het aantal kopieën zijn niet willekeurig verdeeld in gewervelde genomen, en het is recentelijk gerapporteerd dat ohnologen, die gedupliceerde genen zijn afgeleid van duplicatie van het hele genoom, resistent zijn tegen variaties in het aantal kopieën." ]
174
189
2,817
Wat is TissueEnrich?
TissueEnrich is een hulpmiddel dat weefsel-specifieke genverrijking berekent in een ingevoerde genenset. TissueEnrich kan weefselidentiteiten toewijzen aan enkelcelclusters en gedifferentieerde embryonale stamcellen.
[ "TissueEnrich: Weefsel-specifieke genverrijkingsanalyse.", "Hoewel er hulpmiddelen zijn ontwikkeld om biologische processen te identificeren die verrijkt zijn in genensets, is er nog steeds behoefte aan hulpmiddelen die verrijking van weefsel-specifieke genen identificeren. Daarom hebben we TissueEnrich ontwikkeld, een hulpmiddel dat weefsel-specifieke genverrijking berekent in een ingevoerde genenset. We hebben aangetoond dat TissueEnrich weefselidentiteiten kan toewijzen aan enkelcelclusters en gedifferentieerde embryonale stamcellen. Beschikbaarheid: De TissueEnrich webapplicatie is gratis beschikbaar op http://tissueenrich.gdcb.iastate.edu/. Het R-pakket is beschikbaar via Bioconductor op https://bioconductor.org/packages/TissueEnrich. Zowel de webapplicatie als het R-pakket zijn voor niet-commercieel academisch gebruik onder de MIT-licentie. Aanvullende informatie: Aanvullende gegevens zijn beschikbaar op Bioinformatics online.", "Daarom hebben we TissueEnrich ontwikkeld, een hulpmiddel dat weefsel-specifieke genverrijking berekent in een ingevoerde genenset.", "We hebben aangetoond dat TissueEnrich weefselidentiteiten kan toewijzen aan enkelcelclusters en gedifferentieerde embryonale stamcellen.<br><b>Beschikbaarheid</b>: De TissueEnrich webapplicatie is gratis beschikbaar op http://tissueenrich.gdcb.iastate.edu/." ]
176
157
2,818
Beschrijf OligoSTORM
OligoSTORM en OligoDNA-PAINT combineren de Oligopaint-technologie voor fluorescent in situ hybridisatie (FISH) met respectievelijk Stochastic Optical Reconstruction Microscopy (STORM) en DNA-gebaseerde Point Accumulation for Imaging in Nanoscale Topography (DNA-PAINT) om in situ single-molecule superresolutie beeldvorming van nucleïnezuren mogelijk te maken. Beide strategieën bieden een resolutie van ≤20 nm en zijn geschikt voor het in beeld brengen van nanoschaal kenmerken van de genomen van een breed scala aan soorten, waaronder mens, muis en fruitvlieg (Drosophila).
[ "In Situ Superresolutie Beeldvorming van Genomisch DNA met OligoSTORM en OligoDNA-PAINT.", "OligoSTORM en OligoDNA-PAINT combineren de Oligopaint-technologie voor fluorescent in situ hybridisatie (FISH) met respectievelijk Stochastic Optical Reconstruction Microscopy (STORM) en DNA-gebaseerde Point Accumulation for Imaging in Nanoscale Topography (DNA-PAINT) om in situ single-molecule superresolutie beeldvorming van nucleïnezuren mogelijk te maken. Beide strategieën bieden een resolutie van ≤20 nm en zijn geschikt voor het in beeld brengen van nanoschaal kenmerken van de genomen van een breed scala aan soorten, waaronder mens, muis en fruitvlieg (Drosophila).", "OligoSTORM en OligoDNA-PAINT combineren de Oligopaint-technologie voor fluorescent in situ hybridisatie (FISH) met respectievelijk Stochastic Optical Reconstruction Microscopy (STORM) en DNA-gebaseerde Point Accumulation for Imaging in Nanoscale Topography (DNA-PAINT) om in situ single-molecule superresolutie beeldvorming van nucleïnezuren mogelijk te maken." ]
186
197
2,819
Welke metabole routes zijn geassocieerd met systemische lupus erythematosus?
Genetische polymorfismen van de xenobiotische metabole route die betrokken is bij het oestrogeenmetabolisme kunnen bijdragen aan de pathofysiologie van systemische lupus erythematosus (SLE). Volgens de analyse van de metabole route kan SLE significante veranderingen veroorzaken in de metabole routes van onverzadigde vetzuren en aminozuren. Resultaten suggereren dat het verlagen van FLI1 bij lupus de pathogeniciteit van T-cellen vermindert door het verlagen van TCR-specifieke activatie en IL-4 productie, deels via de modulatie van glycosfingolipide-metabolisme.
[ "De meting van urine-neopterine, een product van een metabole route die wordt gecontroleerd door interferon-gamma, is nuttig gebleken in veel klinische aandoeningen.", "Het doel van deze studie was het onderzoeken van de associatie tussen genetische variaties in genen van de oestrogeenmetabole route, waaronder oestrogeenreceptor alfa (ESR1), oestrogeenreceptor beta (ESR2) en aromatase (CYP19A1), en het risico op SLE.", "Volgens de analyse van de metabole route kan SLE significante veranderingen veroorzaken in de metabole routes van onverzadigde vetzuren en aminozuren.", "Gezamenlijk suggereren onze resultaten dat het verlagen van FLI1 bij lupus de pathogeniciteit van T-cellen vermindert door het verlagen van TCR-specifieke activatie en IL-4 productie, deels via de modulatie van glycosfingolipide-metabolisme.", "Genetische polymorfismen van de xenobiotische metabole route die betrokken is bij het oestrogeenmetabolisme kunnen bijdragen aan de pathofysiologie van systemische lupus erythematosus (SLE).", "De huidige studie werd uitgevoerd om het effect van genetische variaties in de een-koolstofmetabolisme op de epigenetische regulatie van de major histocompatibility complex II transactivator (MHC2TA), de gereduceerde folaatdrager 1 (RFC1/SLC19A1) en het humane leukocytenantigeen (HLA)-DR bij systemische lupus erythematosus (SLE) te verduidelijken.", "Verondersteld functionele polymorfismen van een-koolstof- en xenobiotische metabole routes beïnvloeden de vatbaarheid voor een breed spectrum aan ziekten. De huidige studie was gericht op het onderzoeken van gen-gen interacties tussen deze twee metabole routes bij vier ziekten, namelijk borstkanker, systemische lupus erythematosus (SLE), coronaire hartziekte (CAD) en de ziekte van Parkinson (PD).", "In dit opzicht is ontsteking niet alleen geassocieerd met systemische lupus-patiënten, maar is ook aanwezig bij patiënten met het metabool syndroom en insulineresistentie." ]
308
323
2,820
Wat zijn de 3 belangrijkste bacteriën die in moedermelk worden gevonden?
Moedermelk is rijk aan diverse bacteriën, met name de geslachten Staphylococcus, Streptococcus en Pseudomonas.
[ "In plaats daarvan biedt het baby's een rijke bron van diverse bacteriën, met name microben behorend tot de geslachten Staphylococcus, Streptococcus en Pseudomonas." ]
41
46
2,821
Welk algoritme is ontwikkeld voor trio-gebaseerde benchmarking van variantaanroepen?
Geck is een hulpmiddel voor trio-gebaseerde vergelijkende benchmarking van variantaanroepen. Het is een statistisch mengmodel voor het vergelijken van twee variantaanroeppijplijnen op basis van genotypegegevens die ze produceren na uitvoering op individuele leden van een trio.
[ "geck: trio-gebaseerde vergelijkende benchmarking van variantaanroepen.", "Klassieke methoden voor het vergelijken van de nauwkeurigheid van variantaanroeppijplijnen zijn gebaseerd op waarheidsets van varianten waarvan de genotypen eerder met hoge zekerheid zijn bepaald. Een alternatieve manier om benchmarking uit te voeren is gebaseerd op Mendeliaanse beperkingen tussen verwante individuen. Statistische analyse van Mendeliaanse overtredingen kan waarheidset-onafhankelijke benchmarkinginformatie verschaffen en benchmarking van minder bestudeerde varianten en diverse populaties mogelijk maken.Resultaten: We introduceren een statistisch mengmodel voor het vergelijken van twee variantaanroeppijplijnen op basis van genotypegegevens die ze produceren na uitvoering op individuele leden van een trio. We bepalen de nauwkeurigheid van ons model door de precisie en recall van GATK Unified Genotyper en Haplotype Caller te vergelijken op de hoog-confidente SNP's van het NIST Ashkenazim-trio en de twee onafhankelijke Platinum Genome-trio's. We tonen aan dat onze methode in staat is om differentiële precisie en recall tussen de twee pijplijnen te schatten met een onzekerheid van 10^-3." ]
191
195
2,822
Welke molecule wordt door Caplacizumab gericht?
Caplacizumab is een anti-von Willebrand factor (VWF) antilichaam dat de interactie tussen VWF en bloedplaatjes blokkeert. Het wordt gebruikt voor de behandeling van verworven trombotische trombocytopenische purpura (aTTP).
[ "Caplacizumab, een nanobody die de interactie tussen VWF en bloedplaatjes blokkeert, heeft veelbelovende resultaten laten zien in het verkorten van de hersteltijd van acute gebeurtenissen, wat hopelijk zal leiden tot langdurig klinisch voordeel voor patiënten.", "Ablynx, een Sanofi-bedrijf, heeft de anti-von Willebrand factor Nanobody® caplacizumab (Cablivi™) ontwikkeld voor de behandeling van verworven trombotische trombocytopenische purpura (aTTP).", "Veelbelovende middelen die worden geëvalueerd zijn onder andere N-acetylcysteïne, bortezomib, recombinant ADAMTS13 en caplacizumab, een remmer van de glycoproteïne-Ib/IX-von Willebrand factor-as.", "De meest veelbelovende kandidaten voor toekomstige behandeling van TTP zijn: rituximab voor het beëindigen van het auto-immuunproces, caplacizumab voor het voorkomen van de interactie tussen bloedplaatjes en VWF, en recombinant ADAMTS13 voor vervanging van het geremde of ontbrekende enzym.", "Veelbelovende middelen die worden geëvalueerd zijn onder andere caplacizumab (een remmer van de glycoproteïne-Ib/IX-Von-Willebrand factor-as), N-acetylcysteïne, recombinant ADAMTS13 en anti-plasmocyten verbindingen.", "In de fase II TITAN-studie werd aangetoond dat behandeling met caplacizumab, een anti-von Willebrand factor Nanobody®, de tijd tot bevestigde normalisatie van het aantal bloedplaatjes en exacerbaties tijdens de behandeling verkortte.", "Er wordt nu verwacht dat het eerste op VHH gebaseerde antilichaammiddel, Caplacizumab, een bivalent anti-vWF antilichaam voor de behandeling van zeldzame bloedstollingsstoornissen, in 2018 of kort daarna goedgekeurd en op de markt gebracht zal worden.", "Dagelijkse plasma-uitwisseling en immunosuppressieve therapieën induceren remissie, maar mortaliteit en morbiditeit door microtrombose blijven hoog.<br><b>METHODEN</b>: Caplacizumab, een gehumaniseerde anti-von Willebrand factor single-variable-domain immunoglobuline (Nanobody), remt de interactie tussen ultragrote von Willebrand factor multimeren en bloedplaatjes." ]
249
263
2,823
In welke weefsels wordt het lincRNA Xist tot expressie gebracht?
De relatieve expressie van X-gebonden genen werd onderzocht in lever-, nier- en hersenweefsel door middel van real-time PCR bij volwassen XX(Y)* en XY* mannetjes en XX vrouwtjes. X-chromosoom inactieve specifieke transcript (Xist) werd alleen tot expressie gebracht in vrouwelijk vetweefsel. X-chromosoom inactieve specifieke transcript (Xist) werd alleen tot expressie gebracht in vrouwelijk vetweefsel. Het werd ook tot expressie gebracht in de twaalfvingerige darm en testis.
[ "Xist (alleen bij vrouwen) en Eif2s3y (alleen bij mannen). De frequentie van SDE-probesets varieerde sterk tussen weefsels en was het hoogst in de twaalfvingerige darm (6,2%), terwijl het minder dan 0,05% was in meer dan de helft van de onderzochte weefsels.", "Embryo's die positief waren voor Xist-expressie werden geclassificeerd als vrouwelijk, en embryo's die Xist-negatief waren en positief voor het paardachtige geslachtsbepalende gebied van het Y-chromosoom werden geclassificeerd als mannelijk. Van de 28 geteste embryo's toonden 15 (54%) een positieve Xist-expressie en werden dus als vrouwelijk geclassificeerd.", "Pre-implantatie embryo's op verschillende tijdstippen na ovulatie (Dag 8: n = 9; Dag 10: n = 12; Dag 12: n = 15) werden geanalyseerd op Xist RNA-expressie met behulp van kwantitatieve en kwalitatieve reverse transcriptie-polymerasekettingreactie (RT-PCR).", "De relatieve expressie van X-gebonden genen werd onderzocht in lever-, nier- en hersenweefsel door middel van real-time PCR bij volwassen XX(Y)* en XY* mannetjes en XX vrouwtjes.", "X-chromosoom inactieve specifieke transcript (Xist) werd alleen tot expressie gebracht in vrouwelijk vetweefsel.", "Reverse transcriptie-polymerasekettingreactie (RT-PCR) toonde de aanwezigheid van Xist-transcripten in alle onderzochte volwassen vrouwelijke somatische weefsels. Daarentegen werd bij de onderzochte mannelijke weefsels Xist-expressie alleen gedetecteerd in de testis.", "We rapporteren nu de aanwezigheid van Xist/XIST-transcripten in pasgeboren en volwassen muizen testikels, en in menselijk testiculair weefsel met normale spermatogenese, maar niet in de testikels van patiënten die geen kiemcellen hebben." ]
272
290
2,824
Wat is het hoofdbestanddeel van het Lewy-lichaampje?
Lewy-lichaampjes bestaan uit geaggregeerde intracellulaire vesikels en eiwitten en α-synucleïne wordt gemeld als een belangrijk eiwitbestanddeel.
[ "neurale inclusies bestaande uit α-synucleïne (Lewy-lichaampjes) worden beschouwd als de typische pathologische correlatie van PD", " het tijdperk van alpha-synucleïne, het eiwit aanwezig in Lewy-lichaampjes. ", "Lewy-lichaampjes bestaan uit geaggregeerde intracellulaire vesikels en eiwitten en α-synucleïne wordt gemeld als een belangrijk eiwitbestanddeel. ", "De bestanddelen van het Lewy-lichaampje, α-synucleïne en small ubiquitin-related modifier-1 (SUMO-1)" ]
79
72
2,825
Wat maakt deel uit van het senescentie-geassocieerde secretieprofiel, of SASP?
De diverse reeksen eiwitten die door senescente cellen worden uitgescheiden, zijn beschreven als beïnvloeders van veroudering en hebben zowel pro-tumorigene als anti-tumorigene effecten op de omliggende micro-omgeving. Verdere karakterisering van deze eiwitten, bekend als het senescentie-geassocieerde secretieprofiel (SASP), en hun regulatoren is nodig om dergelijke activiteiten te begrijpen en verder te manipuleren. Het senescentie-geassocieerde secretieprofiel (SASP) wordt gekenmerkt door IL1B, CXCL8, CCL2, TNF, CCL27 en andere pro-inflammatoire factoren, waaronder een nieuw SASP-component CLEC11A.
[ "SASP bemiddelt chemoresistentie en tumor-initierende activiteit van mesothelioomcellen", "Talrijke activiteiten van senescente cellen zijn afhankelijk van het vermogen van deze cellen om talloze bioactieve moleculen uit te scheiden, een gedrag dat het senescentie-geassocieerde secretieprofiel (SASP) wordt genoemd", "Het SASP ondersteunt cel-autonome functies zoals de senescentie-geassocieerde groeistilstand en bemiddelt paracriene interacties tussen senescente cellen en hun omliggende micro-omgeving.", "Culturen verrijkt met niet-diploïde cellen verworven een senescentie-geassocieerd secretieprofiel (SASP) gekenmerkt door IL1B, CXCL8, CCL2, TNF, CCL27 en andere pro-inflammatoire factoren, waaronder een nieuw SASP-component CLEC11A.", "Senescente cellen scheiden cytokines en andere factoren van het senescentie-geassocieerde secretieprofiel (SASP) uit die bijdragen aan tumorrepressie door arrestatie af te dwingen en immuuncellen te rekruteren die deze beschadigde of oncogen-expressieve cellen uit organismen verwijderen.", "Het doel van deze studie was te evalueren of en hoe adalimumab, een monoklonaal antilichaam gericht tegen tumor necrose factor-α (TNF-α), een belangrijk SASP-component, het SASP kan voorkomen", "Endotheelcelsenescentie wordt gekenmerkt door het verwerven van het senescentie-geassocieerde secretieprofiel (SASP), dat inflammaging en kankerprogressie kan bevorderen.", "We hebben aangetoond dat de mitochondriën essentieel zijn voor de ontwikkeling van senescentie en vele van de geassocieerde fenotypes, inclusief het vaak schadelijke senescentie-geassocieerde secretieprofiel (SASP)", "De diverse reeksen eiwitten die door senescente cellen worden uitgescheiden, zijn beschreven als beïnvloeders van veroudering en hebben zowel pro-tumorigene als anti-tumorigene effecten op de omliggende micro-omgeving. Verdere karakterisering van deze eiwitten, bekend als het senescentie-geassocieerde secretieprofiel (SASP), en hun regulatoren is nodig om dergelijke activiteiten te begrijpen en verder te manipuleren." ]
317
314
2,826
Hoeveel pseudogenen zijn er aanwezig in het C. elegans-genoom?
Bewijs suggereert dat een vijfde van de geannoteerde Caenorhabditis elegans-genen pseudogenen kunnen zijn. Ten minste 4% van de geannoteerde C. elegans-genen kan als pseudogen worden herkend door simpelweg de sequentiegegevens nader te bekijken. Dus van de 18.000 transcripties worden er ongeveer 3.500 verwacht pseudogenen te zijn.
[ "Bewijs dat suggereert dat een vijfde van de geannoteerde Caenorhabditis elegans-genen pseudogenen kunnen zijn", "De overige verklaring is dat de meeste van de geannoteerde genen in de recent gedupliceerde categorie pseudogenen zijn, een proportie die overeenkomt met 20% van alle geannoteerde C. elegans-genen", "Ten minste 4% van de geannoteerde C. elegans-genen kan als pseudogen worden herkend door simpelweg de sequentiegegevens nader te bekijken", "meer dan 18.000 transcripties in elk monster", "De overige verklaring is dat de meeste van de geannoteerde genen in de recent gedupliceerde categorie pseudogenen zijn, een proportie die overeenkomt met 20% van alle geannoteerde C. elegans-genen.", "Ten minste 4% van de geannoteerde C. elegans-genen kan als pseudogen worden herkend door simpelweg de sequentiegegevens nader te bekijken." ]
175
167
2,827
Wat is een Aquaporine-kanaal?
Aquaporines zijn membraankanalen die tot expressie komen in bijna elk organisme en betrokken zijn bij de bidirectionele overdracht van water en kleine opgeloste stoffen over celmembranen. Aquaporines hebben belangrijke biologische functies en zijn in verband gebracht met verschillende pathofysiologische aandoeningen, wat wijst op een groot translationeel potentieel in aquaporine-gebaseerde diagnostiek en therapieën.
[ "Aquaporines zijn membraankanalen die tot expressie komen in bijna elk organisme en betrokken zijn bij de bidirectionele overdracht van water en kleine opgeloste stoffen over celmembranen. Aquaporines hebben belangrijke biologische functies en zijn in verband gebracht met verschillende pathofysiologische aandoeningen, wat wijst op een groot translationeel potentieel in aquaporine-gebaseerde diagnostiek en therapieën." ]
96
106
2,828
Wat is cluster of differentiation?
Cluster of Differentiation (CD) zijn cellulaire antigenen die worden gebruikt om celpopulaties te identificeren, zoals T-lymfocytpopulaties en macrofagen.
[ "De karakterisering van de MSC's werd bepaald door hun cluster of differentiation (CD) markerprofiel.", "De monsters werden immunohistochemisch gekleurd voor cluster of differentiation (CD)4, CD8, CD16, CD25, CD56 en CD68 met behulp van immunofluorescentie om verschillende T-lymfocytpopulaties en macrofagen te identificeren.", "definitie van erkende cellulaire antigenen (aangeduid met CD: Cluster of Differentiation)." ]
74
71
2,829
Noem twee medicijnen die zijn opgenomen in de Juluca-pil.
De Juluca®-pil bevat dolutegravir en rilpivirine. Het is het eerste twee-medicijn single-tablet regimen (STR) dat is goedgekeurd voor de behandeling van HIV-1-infectie bij volwassenen.
[ "Dolutegravir/rilpivirine (Juluca®) is het eerste twee-medicijn single-tablet regimen (STR) dat is goedgekeurd voor de behandeling van HIV-1-infectie bij volwassenen." ]
51
50
2,830
Welk hulpmiddel is ontwikkeld voor het taggen van biomedische concepten via interactieve learning?
ezTag is een webgebaseerd annotatiehulpmiddel dat het annoteren van een breed scala aan biologische concepten ondersteunt, met of zonder vooraf bestaande trainingsgegevens. Het stelt curatoren in staat om annotaties uit te voeren en trainingsgegevens te leveren met mensen in de lus. ezTag ondersteunt zowel abstracts in PubMed als volledige artikelen in PubMed Central. Het biedt ook lexicon-gebaseerde concepttagging evenals de meest geavanceerde vooraf getrainde taggers zoals TaggerOne, GNormPlus en tmVar. ezTag is gratis beschikbaar op http://eztag.bioqrator.org.
[ "ezTag: het taggen van biomedische concepten via interactieve learning.", "Om het annoteren van een breed scala aan biologische concepten te ondersteunen, met of zonder vooraf bestaande trainingsgegevens, hebben we ezTag ontwikkeld, een webgebaseerd annotatiehulpmiddel dat curatoren in staat stelt annotaties uit te voeren en trainingsgegevens te leveren met mensen in de lus. ezTag ondersteunt zowel abstracts in PubMed als volledige artikelen in PubMed Central. Het biedt ook lexicon-gebaseerde concepttagging evenals de meest geavanceerde vooraf getrainde taggers zoals TaggerOne, GNormPlus en tmVar. ezTag is gratis beschikbaar op http://eztag.bioqrator.org.", "Om het annoteren van een breed scala aan biologische concepten te ondersteunen, met of zonder vooraf bestaande trainingsgegevens, hebben we ezTag ontwikkeld, een webgebaseerd annotatiehulpmiddel dat curatoren in staat stelt annotaties uit te voeren en trainingsgegevens te leveren met mensen in de lus." ]
199
215
2,831
Welke cellen produceren Interleukine 17A?
Interleukine (IL)-17A wordt uitgescheiden door T helper type 17 (TH17) cellen.
[ "Verschillende studies hebben een verhoogde expressie/afgifte van Th17-gerelateerde cytokine, IL-17A, bij ASD aangetoond.", "interleukine (IL)-17A, uitgescheiden door T helper type 17 (TH17) cellen,", "IL-17A, duidelijk geproduceerd door TH17 cellen", "IL-22 en IL-17A stammen af van zowel onafhankelijke als overlappende lijnen, gedefinieerd als T helper (Th)22 en IL-22+ Th17 cellen." ]
62
60
2,832
Wordt durvalumab gebruikt voor de behandeling van longkanker?
Ja, Durvalumab is een anti-PDL-1 antilichaam dat wordt gebruikt voor de behandeling van niet-kleincellige longkanker.
[ "In de fase III PACIFIC-studie werd consolidatie met durvalumab, een anti-PDL-1 antilichaam, geassocieerd met een overlevingsvoordeel bij patiënten met LA-NSCLC die reageerden op gelijktijdige chemoradiotherapie.", "METHODE: Er werd een elektronische literatuurzoektocht uitgevoerd in openbare databases (MEDLINE, Excerpta Medica dataBASE [EMBASE] en Cochrane) en congresverslagen naar onderzoeken met PD-1 remmers (nivolumab en pembrolizumab) en PD-L1 remmers (atezolizumab, durvalumab en avelumab) bij patiënten met NSCLC.", "Durvalumab bij patiënten met niet-kleincellige longkanker: huidige ontwikkelingen.", "Durvalumab als monotherapie toonde klinische werkzaamheid en een beheersbaar veiligheidsprofiel bij gevorderde niet-kleincellige longkanker, met name in de ≥25% PD-L1+ populatie.", "Zes geneesmiddelen, waaronder één CTLA-4 remmer (ipilimumab), twee PD-1 remmers (nivolumab en pembrolizumab) en drie PD-L1 remmers (atezolizumab, avelumab en durvalumab), zijn goedgekeurd voor de behandeling van verschillende soorten kanker, waaronder zowel solide tumoren zoals melanoom, longkanker, hoofd- en halskanker, blaaskanker en Merkelcelkanker als hematologische tumoren zoals klassiek Hodgkin-lymfoom.", "DOEL VAN DE REVIEW: Het therapeutisch arsenaal voor gevorderde niet-kleincellige longkanker is de afgelopen jaren aanzienlijk geëvolueerd. Immuncheckpointremmers die gericht zijn op geprogrammeerde celdood-1 zoals pembrolizumab en nivolumab of geprogrammeerde celdood ligand 1 zoals atezolizumab, durvalumab en avelumab hebben gunstige werkzaamheidsresultaten laten zien in deze patiëntengroep in de eerstelijns- en tweedelijnsbehandeling.", "Bovendien suggereren preklinische en vroege klinische gegevens dat chemotherapie en bestraling synergistisch kunnen werken met anti-PD-1/PD-L1 therapie om antitumorimmuniteit te bevorderen, wat heeft geleid tot de start van klinische onderzoeken met deze geneesmiddelen bij patiënten met stadium III NSCLC. Een voorlopige rapportage van een gerandomiseerde fase III-studie, de PACIFIC-studie, toonde een indrukwekkende toename van de mediane progressievrije overleving met consolidatieve durvalumab, een PD-L1 remmer, vergeleken met observatie na cCRT.", "ICI, zoals de PD-1 remmers nivolumab en pembrolizumab en de PD-L1 remmer atezolizumab, zijn al op de markt voor de behandeling van voorbehandelde patiënten met gevorderde NSCLC.", "De PACIFIC-studie die durvalumab beoordeelt na standaard chemoradiotherapie voor lokaal gevorderde NSCLC heeft zijn primaire eindpunt al bereikt en het potentieel van durvalumab zal worden versterkt als fase III gerandomiseerde studies van eerstelijns- (MYSTIC-studie) en tweedelijns- of latere lijnen (ARCTIC-studie) therapie superieur blijken te zijn aan de huidige standaard van zorg.<br>" ]
376
352
2,833
Interageert LRP1 met de Urokinase receptor?
Ja
[ "Interacties met een complex gevormd door uPA en zijn remmer PAI-1 veroorzaken een afname van de receptor aan het celoppervlak en recycling van de receptor via het clathrine-gemedieerde pad, een proces dat afhankelijk is van de associatie met LRP-1.", "Hier onderzochten we of er een directe interactie is tussen uPAR, een glycosyl-fosfatidylinositol-verankerd eiwit, en LRP, een transmembraanreceptor,", "Directe binding van domein 3 (D3) van uPAR aan LRP is vereist voor de klaring van uPA-PAI-1-bezet uPAR" ]
71
78
2,834
Is obesitas gerelateerd aan cognitieve achteruitgang?
Obesitas is een veelvoorkomende medische aandoening die steeds meer wordt erkend als een risicofactor voor achteruitgang in cognitieve prestaties, onafhankelijk van andere comorbide medische aandoeningen. Overgewicht en obesitas worden geassocieerd met een verhoogd risico op subnormale intellectuele prestaties bij jonge volwassen mannen. Personen met een laag geboortegewicht en adolescenten met overgewicht/obesitas lopen een bijzonder risico op subnormale prestaties.
[ "De eerste resultaten suggereren dat obese kinderen hogere cognitieve scores hebben en dat dit resultaat wordt gedreven door degenen die vrouwelijk, niet-inheems en woonachtig zijn in een stedelijk gebied.", "Aan de andere kant van de gewichtsverdeling hebben inheemse kinderen die ernstig mager of mager zijn significant lagere cognitieve scores, een relatie die blijft bestaan na correctie voor mogelijke vertekening en die lijkt te versterken tussen de leeftijden van vijf en acht jaar.", "Obesitas wordt geassocieerd met verminderde cognitieve functie, verminderde grijze stofvolume en aangetaste integriteit van de witte stof in cognitieve gerelateerde hersengebieden bij patiënten met MDD.", "De gegevens suggereren dat overgewicht of obesitas in de midlife mogelijk schadelijker is voor de daaropvolgende leeftijdsgerelateerde cognitieve achteruitgang dan overgewicht of obesitas in latere levensfasen.", "Slechte cognitieve prestaties waren aanwezig bij 37% van de steekproef. Algemene obesitas (BMI ≥ 25) en slechte cognitie waren sterk geassocieerd in aanwezigheid van abdominale obesitas. Slechte cognitie was negatief geassocieerd met overgewicht (BMI 23-25) met een normale tailleomvang.", "BMI zou kunnen worden gebruikt als een kandidaat-risicomarker om mensen met een hoger risico op cognitieve tekorten te identificeren, en als een interventiedoel voor aanpassingen van cognitieve uitkomsten.", "Obesitas is een veelvoorkomende medische aandoening die steeds meer wordt erkend als een risicofactor voor achteruitgang in cognitieve prestaties, onafhankelijk van andere comorbide medische aandoeningen.", "Overgewicht en obesitas worden geassocieerd met een verhoogd risico op subnormale intellectuele prestaties bij jonge volwassen mannen. Personen met een laag geboortegewicht en adolescenten met overgewicht/obesitas lopen een bijzonder risico op subnormale prestaties.", "Cognitieve functiestoornissen zijn geassocieerd met obesitas bij zowel mensen als knaagdieren.", "Obesitas in de kleuterjaren werd in deze studie geassocieerd met slechtere uitkomsten voor sommige cognitieve metingen. Sterkere relaties tussen obesitas en cognitie of onderwijsniveau kunnen later in de kindertijd naar voren komen.", "Er is parallel bewijs dat mensen met overgewicht of obesitas doorgaans slechter presteren op verschillende cognitieve taken.", "Hoewel het onderzoek op dit gebied groeit, is onze kennis over obesitas-gerelateerde cognitieve disfunctie en hersenveranderingen nog niet gesynthetiseerd.", "De huidige review integreert de recente literatuur over patronen van obesitas-gerelateerde cognitieve disfunctie en hersenveranderingen en geeft ook mogelijke mechanismen voor deze neuropathologische veranderingen aan.", "De review mondt uit in een voorlopig model van obesitas-gerelateerde cognitieve disfunctie en suggesties voor toekomstig onderzoek, inclusief de mogelijke omkeerbaarheid van deze veranderingen door gewichtsverlies.<br>", "Bewijs voor de verhoogde prevalentie van diabetes en obesitas wordt besproken in relatie tot cognitieve achteruitgang.", "Deze artikelen geven aan dat de leeftijd van aanvang van Type 1 diabetes relevant kan zijn voor toekomstige cognitieve functie en dat de ziekteduur van Type 2 diabetes en socioculturele factoren gerelateerd zijn aan cognitieve achteruitgang tijdens het verouderingsproces.", "Dit themanummer sluit af met een conceptueel kader voor het koppelen van obesitas en diabetes aan versnelde cognitieve achteruitgang gerelateerd aan het verouderingsproces.", "De nadelige effecten van diabetes en obesitas op cognitieve functies worden steeds beter erkend.", "Bovendien tonen deze studies aan dat stressvolle omgevingsomstandigheden neurocognitieve disfunctie geassocieerd met obesitas en diabetes nadelig kunnen beïnvloeden." ]
538
532
2,835
Beschrijf het werkingsmechanisme van ibalizumab.
Ibalizumab is een gehumaniseerde monoklonale antilichaam die werkt als een post-attachment remmer door te binden aan het tweede domein van CD4 op T-lymfocyten en het voorkomen van de verbinding van HIV met CCR5 of CXCR4. Het is recentelijk goedgekeurd door de Food and Drug Administration als een nieuw intraveneus antiretroviraal middel voor zwaar behandelde HIV-volwassenen met multiresistente infecties.
[ "TaiMed Biologics ontwikkelt ibalizumab (Trogarzo™, ibalizumab-uiyk) - een gehumaniseerde IgG4 monoklonale antilichaam - als behandeling voor HIV-1 infectie. Ibalizumab blokkeert de HIV-toegang tot CD4-cellen terwijl het de normale immunologische functie behoudt en is de eerste CD4-gerichte post-attachment HIV-1 remmer en de eerste gehumaniseerde monoklonale antilichaam voor de behandeling van HIV/AIDS.", "Onderzoek naar HIV-toegangsremmers omvat de nieuwe CD4-attachment remmer fostemsavir, die zich richt op het HIV-envelope glycoproteïne 120, en de recent goedgekeurde ibalizumab, die bindt aan de CD4-receptor.", "Hier bespreken we een dergelijk middel, ibalizumab, een parenteraal CD4 post-attachment remmer die effectiviteit heeft aangetoond als onderdeel van combinatie-antiretrovirale therapie bij de behandeling van HIV-1.", "Trogarzo (ibalizumab-uiyk) is een CD4-gerichte post-attachment HIV-1 remmer, geïndiceerd voor gebruik samen met andere antiretrovirale remmers bij volwassenen met multiresistente HIV-1 infectie die niet reageren op hun antiretrovirale regime.", "ACHTERGROND: Ibalizumab, een gehumaniseerde IgG4 monoklonale antilichaam, blokkeert de toegang van het humaan immunodeficiëntievirus type 1 (HIV-1) door niet-competitieve binding aan CD4.", "RESULTATEN: Ibalizumab is een nieuwe gehumaniseerde monoklonale antilichaam. Het werkt als post-attachment remmer door te binden aan het tweede domein van CD4 op T-lymfocyten en het voorkomen van de verbinding van HIV met CCR5 of CXCR4 en is recentelijk goedgekeurd door de Food and Drug Administration in de Verenigde Staten als een nieuw intraveneus antiretroviraal middel voor zwaar behandelde HIV-volwassenen met multiresistente infecties.", "Bovendien vonden we dat een breed neutraliserend antilichaam, ibalizumab, dat zich richt op CD4 in afwezigheid van gp120, hetzelfde bindingsoppervlak bezet als het tweede interface dat hier op gp120 is geïdentificeerd.", "Hier bespreken we een dergelijk middel, ibalizumab, een parenteraal CD4 post-attachment remmer die effectiviteit heeft aangetoond als onderdeel van combinatie-antiretrovirale therapie bij de behandeling van HIV-1.<br><b>RECENTE VINDINGEN</b>: In een fase III klinische studie bij HIV-geïnfecteerde deelnemers met multiklassige antiretrovirale medicijnresistentie leidde de intraveneuze toediening van ibalizumab tot een daling van plasma HIV-1 RNA met meer dan 0,5 log bij 83% van de deelnemers na 1 week." ]
359
368
2,836
Beschrijf informatie verkregen door immunofenotypering.
Massacytometrie maakt uitgebreide immunofenotypering en functionele beoordelingen op enkele cellen mogelijk, waarbij de complexiteit van het immuunsysteem en de moleculair heterogene gevolgen van primaire immunodeficiëntie defecten worden vastgelegd. Circulerende B-, T- en dendritische cellen werden gedefinieerd met behulp van flowcytometrische analyse zoals aanbevolen door het Human Immunology Project Consortium. Klinische toepassingen van flowcytometrie die momenteel in het laboratorium worden gebruikt, omvatten bepaling van celoppervlakteantigenen of immunofenotypering van hematologische cellen, DNA-analyse van hematopoëtische maligniteiten en solide tumoren, en meting van CD4 (T helper/inducer cel) absolute tellingen en T helper/T suppressor (CD4/CD8) verhoudingen bij de evaluatie van immuundeficiëntie.
[ "zowel CD4+ absolute tellingen (cellen/μL) en percentages; en CD8+ absolute tellingen (cellen/μL) en percentages.", "Circulerende B-, T- en dendritische cellen werden gedefinieerd met behulp van flowcytometrische analyse zoals aanbevolen door het Human Immunology Project Consortium.", "Massacytometrie maakt uitgebreide immunofenotypering en functionele beoordelingen op enkele cellen mogelijk, waarbij de complexiteit van het immuunsysteem en de moleculair heterogene gevolgen van primaire immunodeficiëntie defecten worden vastgelegd.", "Klinische toepassingen van flowcytometrie die momenteel in het laboratorium worden gebruikt, omvatten bepaling van celoppervlakteantigenen of immunofenotypering van hematologische cellen, DNA-analyse van hematopoëtische maligniteiten en solide tumoren, en meting van CD4 (T helper/inducer cel) absolute tellingen en T helper/T suppressor (CD4/CD8) verhoudingen bij de evaluatie van immuundeficiëntie.", "De diagnostiek van lymfoproliferatieve aandoeningen (LPD's) omvat het gecombineerde gebruik van flowcytometrie (FC) en immunohistochemie (IHC). Dit resulteert vaak in dubbele immunofenotypische testen." ]
227
228
2,837
Wat is het werkingsmechanisme van Emicizumab?
Emicizumab (Hemlibra®) is een bispecifieke gehumaniseerde monoklonale antilichaam die de functie van ontbrekend geactiveerd FVIII herstelt door geactiveerd FIX en FX te verbinden om effectieve hemostase te faciliteren bij patiënten met hemofilie A.
[ "Emicizumab-kxwh (Hemlibra®) is een bispecifieke gehumaniseerde monoklonale antilichaam die de functie van ontbrekend geactiveerd FVIII herstelt door geactiveerd FIX en FX te verbinden om effectieve hemostase te faciliteren bij patiënten met hemofilie A.", "ACHTERGROND: Emicizumab (ACE910) is een bispecifiek antilichaam dat de cofactorfunctie van geactiveerde stollingsfactor VIII nabootst.", "SAMENVATTING: Achtergrond Emicizumab is een anti-geactiveerd factor IX/FX bispecifiek antilichaam dat de cofactorfunctie van geactiveerd FVIII nabootst.", "Opkomende bypass-middelen, waaronder zymogeenachtige factor IXa- en Xa-moleculen, zijn in ontwikkeling en een bispecifiek antilichaam, emicizumab, toonde werkzaamheid aan in een fase 3-studie bij mensen met hemofilie A en inhibitoren.", "SAMENVATTING: Achtergrond Emicizumab is een anti-factor (F)IXa/X bispecifiek monoklonaal antilichaam (mAb), dat de cofactoractiviteit van factor (F)VIIIa nabootst.", "Er kunnen veiligheidszorgen bestaan bij het combineren van emicizumab met bypass-middelen. Gecombineerde bypass-middelen en bispecifiek antilichaam verhoogden de trombineproductie tot 17 keer." ]
168
167
2,838
Wat is de genetische oorzaak van het Roberts-syndroom?
Het Roberts-syndroom (RBS) is een menselijke ontwikkelingsstoornis veroorzaakt door mutaties in de cohesine-acetyltransferase ESCO2.
[ "Mutaties in Esco2 veroorzaken het Roberts-syndroom, een ontwikkelingsziekte die wordt gekenmerkt door ernstige prenatale retardatie evenals afwijkingen aan ledematen en gezicht.", "Genetische koppelingsstudies tonen aan dat mutaties in cohesie-pathways verantwoordelijk zijn voor multispectrale ontwikkelingsafwijkingen die cohesinopathieën worden genoemd. Deze omvatten het Roberts-syndroom (RBS),", "Het Roberts-syndroom en SC-focomeliasyndroom zijn zeldzame autosomaal recessieve genetische aandoeningen die de uitersten van het spectrum van ernst van dezelfde aandoening vertegenwoordigen, veroorzaakt door mutaties in het ESCO2-gen.", "Het Roberts-syndroom (RBS) is een menselijke ontwikkelingsstoornis veroorzaakt door mutaties in de cohesine-acetyltransferase ESCO2.", "RBS ontstaat door autosomaal recessieve mutaties in de cohesine-hulpfactor ESCO2, het gen dat codeert voor een N-acetyltransferase die het SMC3-subunit van het cohesinecomplex target." ]
137
125
2,839
Wat is DiseaseEnhancer?
DiseaseEnhancer is een handmatig samengestelde bron van een catalogus van menselijk ziekte-geassocieerde enhancers. Vanaf juli 2017 bevat DiseaseEnhancer 847 ziekte-geassocieerde enhancers in 143 menselijke ziekten. Kenmerken van de database omvatten basisinformatie over enhancers (d.w.z. genomische locatie en doelgenen); ziektetypen; geassocieerde varianten op de enhancer en hun gemedieerde fenotypen (d.w.z. winst/verlies van enhancer en de veranderingen in transcriptiefactorbindingen).
[ "DiseaseEnhancer: een bron van een catalogus van menselijk ziekte-geassocieerde enhancers.", "Om beter gebruik te faciliteren van gepubliceerde gegevens en het verkennen van enhancer-deregulatie in verschillende menselijke ziekten, hebben we DiseaseEnhancer (http://biocc.hrbmu.edu.cn/DiseaseEnhancer/) gecreëerd, een handmatig samengestelde database voor ziekte-geassocieerde enhancers. Vanaf juli 2017 bevat DiseaseEnhancer 847 ziekte-geassocieerde enhancers in 143 menselijke ziekten. Kenmerken van de database omvatten basisinformatie over enhancers (d.w.z. genomische locatie en doelgenen); ziektetypen; geassocieerde varianten op de enhancer en hun gemedieerde fenotypen (d.w.z. winst/verlies van enhancer en de veranderingen in transcriptiefactorbindingen).", "DiseaseEnhancer biedt een veelbelovende weg voor onderzoekers om het begrip van enhancer-deregulatie in ziektepathogenese te vergemakkelijken en nieuwe biomarkers te identificeren voor ziekte-diagnose en therapie.", "Om beter gebruik te faciliteren van gepubliceerde gegevens en het verkennen van enhancer-deregulatie in verschillende menselijke ziekten, hebben we DiseaseEnhancer (http://biocc.hrbmu.edu.cn/DiseaseEnhancer/) gecreëerd, een handmatig samengestelde database voor ziekte-geassocieerde enhancers.", "Vanaf juli 2017 bevat DiseaseEnhancer 847 ziekte-geassocieerde enhancers in 143 menselijke ziekten." ]
202
203
2,840
Is Tisagenlecleucel effectief voor B-cellymfoom?
Ja, de CD19-gerichte CAR T-celtherapie tisagenlecleucel produceert duurzame responsen bij patiënten met terugkerend en refractair diffuus grootcellig B-cellymfoom.
[ "De fase II JULIET-studie suggereert dat de CD19-gerichte CAR T-celtherapie tisagenlecleucel duurzame responsen produceert bij patiënten met terugkerend en refractair diffuus grootcellig B-cellymfoom.", "Tisagenlecleucel bij kinderen en jongvolwassenen met B-cel lymfoblastisch leukemie.", "ACHTERGROND: In een single-center fase 1-2a studie produceerde de anti-CD19 chimere antigeenreceptor (CAR) T-celtherapie tisagenlecleucel hoge percentages volledige remissie en werd geassocieerd met ernstige maar voornamelijk omkeerbare toxische effecten bij kinderen en jongvolwassenen met terugkerende of refractaire B-cel acute lymfoblastische leukemie (ALL).", "CONCLUSIES: In deze wereldwijde studie van CAR T-celtherapie zorgde een enkele infusie van tisagenlecleucel voor duurzame remissie met langdurige persistentie bij pediatrische en jongvolwassen patiënten met terugkerende of refractaire B-cel ALL, met voorbijgaande hoge graad toxische effecten.", "Chimere antigeenreceptor T-cellen tonen werkzaamheid bij B-cel maligniteiten, wat leidde tot goedkeuring door de Amerikaanse Food and Drug Administration van axicabtagene ciloleucel (oktober 2017) en tisagenlecleucel (mei 2018) voor grootcellig B-cellymfoom na 2 eerdere therapielijnen.", "Dit artikel bespreekt gegevens over het huidige beheer van diffuus grootcellig B-cellymfoom, met focus op axicabtagene ciloleucel, tisagenlecleucel en lisocabtagene maraleucel.", "Dit artikel bespreekt gegevens over het huidige beheer van diffuus grootcellig B-cellymfoom, met focus op axicabtagene ciloleucel, tisagenlecleucel en lisocabtagene maraleucel.<br>", "De chimere antigeenreceptor (CAR) T-celtherapie tisagenlecleucel richt zich op en elimineert CD19-expressieve B-cellen en toonde werkzaamheid tegen B-cellymfomen in een single-center fase 2a studie.<br><b>METHODE</b>: We voerden een internationale, fase 2, cruciale studie uit van centraal vervaardigde tisagenlecleucel bij volwassen patiënten met terugkerend of refractair diffuus grootcellig B-cellymfoom die niet in aanmerking kwamen voor of ziekteprogressie hadden na autologe hematopoëtische stamceltransplantatie.", "Er werden geen verschillen gevonden tussen responsgroepen in tumorexpressie van CD19 of immuuncontrole-gerelateerde eiwitten.<br><b>CONCLUSIES</b>: In deze internationale studie van CAR T-celtherapie bij terugkerend of refractair diffuus grootcellig B-cellymfoom bij volwassenen werden hoge percentages duurzame responsen bereikt met het gebruik van tisagenlecleucel.", "Dit was een mijlpaal in tumorimmunologie vanwege het significante antitumoreffect van tisagenlecleucel voor de behandeling van patiënten met terugkerende/refractaire B-ALL.", "Op 30 augustus 2017 keurde de Amerikaanse Food and Drug Administration (FDA) Novartis' tisagenlecleucel (CTL-019, Kymriah) goed, een synthetisch bio-immuunproduct van anti-CD19 chimere antigeenreceptor (CAR) T-cellen, voor de behandeling van terugkerende/refractaire B-cel acute lymfoblastische leukemie (B-ALL).", "In het afgelopen jaar werden twee anti-CD19 CAR T-celtherapieproducten, axicabtagene ciloleucel en tisagenlecleucel, goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van terugkerend of refractair grootcellig B-cellymfoom na ten minste twee lijnen systemische therapie, gebaseerd op multicenter single-arm fase twee klinische onderzoeken.", "Op 30 augustus 2017 keurde de Amerikaanse Food and Drug Administration tisagenlecleucel goed voor de behandeling van patiënten tot 25 jaar met B-cel precursor acute lymfoblastische leukemie (ALL) die refractair is of in tweede of latere terugval verkeert.", "Tisagenlecleucel voor de behandeling van B-cel acute lymfoblastische leukemie.", "Achtergrond: Tisagenlecleucel is een anti-CD19 chimere antigeenreceptor (CAR19) T-celtherapie die is goedgekeurd voor de behandeling van kinderen en jongvolwassenen met terugkerende/refractaire (r/r) B-cel acute lymfoblastische leukemie (B-ALL)." ]
502
471
2,841
Wat is de functie van GFRAL?
GFRAL (weesreceptor van de gliale-afgeleide neurotrofische factor (GDNF) receptor α familie) is een receptor met een hoge affiniteit voor GDF15. GFRAL-expressie is beperkt tot neuronen in de achterhersenen en komt niet voor in perifere weefsels, wat suggereert dat de door GDF15-GFRAL gemedieerde regulatie van voedselinname via een centraal mechanisme verloopt.
[ "GFRAL is de receptor voor GDF15 en de ligand bevordert gewichtsverlies bij muizen en niet-menselijke primaten.", "We ontdekten verder dat de expressie van GFRAL beperkt was tot neuronen in de achterhersenen en niet aanwezig was in perifere weefsels, wat suggereert dat de door GDF15-GFRAL gemedieerde regulatie van voedselinname via een centraal mechanisme verloopt.", "Hier rapporteren we dat GDNF-familie receptor α-achtig (GFRAL), een weeslid van de GFR-α familie, een receptor met hoge affiniteit is voor GDF15.", "Hier identificeren we gliale cel-afgeleide neurotrofische factor (GDNF) receptor alpha-achtig (GFRAL) als een hersenstam-beperkte receptor voor groeifactor en differentiatie factor 15 (GDF15).", "Vier laboratoria hebben recentelijk GFRAL geïdentificeerd, een weesreceptor van de gliale-afgeleide neurotrofische factor (GDNF) receptor α familie, als de receptor voor MIC-1/GDF15, die signaleert via de coreceptor Ret." ]
163
175
2,842
Wat is de rol van ZCCHC17?
ZCCHC17 is een hoofdregelaar van synaptische genexpressie bij de ziekte van Alzheimer. Hoofdregelaaranalyse identificeert ZCCHC17 als normaal ondersteunend aan de expressie van een netwerk van synaptische genen, en voorspelt dat disfunctie van ZCCHC17 bij AD leidt tot een lagere expressie van deze genen. ZCCHC17 wordt normaal gesproken tot expressie gebracht in neuronen en is vroeg in het verloop van AD-pathologie verminderd. Het verlies ervan in ratneuronen leidt tot een lagere expressie van de meerderheid van de voorspelde synaptische doelwitten.
[ "ZCCHC17 is een hoofdregelaar van synaptische genexpressie bij de ziekte van Alzheimer.", "In een poging om de moleculaire drijfveren van synaptische en neurofysiologische disfunctie bij de ziekte van Alzheimer (AD) beter te begrijpen, analyseerden we neuronale genexpressiegegevens van menselijk AD-hersenweefsel om hoofdregelaars van synaptische genexpressie te identificeren.Resultaten: Hoofdregelaaranalyse identificeert ZCCHC17 als normaal ondersteunend aan de expressie van een netwerk van synaptische genen, en voorspelt dat disfunctie van ZCCHC17 bij AD leidt tot een lagere expressie van deze genen. We tonen aan dat ZCCHC17 normaal gesproken tot expressie wordt gebracht in neuronen en vroeg in het verloop van AD-pathologie verminderd is. We laten zien dat verlies van ZCCHC17 in ratneuronen leidt tot een lagere expressie van de meerderheid van de voorspelde synaptische doelwitten en dat ZCCHC17 de expressie van een vergelijkbaar genennetwerk bij mensen en ratten aanstuurt. Deze bevindingen ondersteunen een geconserveerde functie van ZCCHC17 tussen soorten en identificeren het verlies van ZCCHC17 als een belangrijke vroege drijfveer van lagere synaptische genexpressie bij AD.", "We tonen aan dat ZCCHC17 normaal gesproken tot expressie wordt gebracht in neuronen en vroeg in het verloop van AD-pathologie verminderd is.", "Resultaten\nHoofdregelaaranalyse identificeert ZCCHC17 als normaal ondersteunend aan de expressie van een netwerk van synaptische genen, en voorspelt dat disfunctie van ZCCHC17 bij AD leidt tot een lagere expressie van deze genen.", "We laten zien dat verlies van ZCCHC17 in ratneuronen leidt tot een lagere expressie van de meerderheid van de voorspelde synaptische doelwitten en dat ZCCHC17 de expressie van een vergelijkbaar genennetwerk bij mensen en ratten aanstuurt.", "Deze bevindingen ondersteunen een geconserveerde functie van ZCCHC17 tussen soorten en identificeren het verlies van ZCCHC17 als een belangrijke vroege drijfveer van lagere synaptische genexpressie bij AD.", "We suggereren dat NEUROD6, ZCCHC17, PPEF1 en MANBAL mogelijk betrokken zijn bij LOAD, met voorspelde verbanden met calciumsignaaltransductie en eiwitmannosylatie.", "Resultaten Hoofdregelaaranalyse identificeert ZCCHC17 als normaal ondersteunend aan de expressie van een netwerk van synaptische genen, en voorspelt dat disfunctie van ZCCHC17 bij AD leidt tot een lagere expressie van deze genen.", "We laten zien dat verlies van ZCCHC17 in ratneuronen leidt tot een lagere expressie van de meerderheid van de voorspelde synaptische doelwitten en dat ZCCHC17 de expressie van een vergelijkbaar genennetwerk bij mensen en ratten aanstuurt.", "Deze bevindingen ondersteunen een geconserveerde functie van ZCCHC17 tussen soorten en identificeren het verlies van ZCCHC17 als een belangrijke vroege drijfveer van lagere synaptische genexpressie bij AD.<br><b>Beschikbaarheid en implementatie</b>: Matlab- en R-scripts die in dit artikel zijn gebruikt, zijn beschikbaar op https://github.com/afteich/AD_ZCC.<br><b>Contact</b>: aft25@cumc.columbia.edu.<br><b>Aanvullende informatie</b>: Aanvullende gegevens zijn beschikbaar op Bioinformatics online.<br>", "We tonen aan dat ZCCHC17 normaal gesproken tot expressie wordt gebracht in neuronen en vroeg in het verloop van AD-pathologie verminderd is." ]
494
513
2,843
Is ADP-ribosylatie een PTM?
Ja, Poly-ADP-ribosylatie (PARylatie) is een post-translationele modificatie (PTM) van eiwitten die een cruciale rol speelt in veel biologische processen die verband houden met celstressreacties.
[ "ADP-ribosylatie is een PTM waarbij ADP-ribosyltransferasen nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) gebruiken om doelwit-eiwitten te modificeren met ADP-ribose", "Poly-ADP-ribosylatie (PARylatie) is een post-translationele modificatie (PTM) van eiwitten die een cruciale rol speelt in veel biologische processen die verband houden met celstressreacties.", "ADP-ribosylatie is een post-translationele modificatie (PTM) die betrokken is bij verschillende belangrijke cellulaire processen, variërend van regulatie van DNA-reparatie en chromatinestructuur tot celmetabolisme en stressreacties." ]
91
89
2,844
Heeft epidurale anesthesie voor pijnbestrijding tijdens de bevalling invloed op de Apgar-score van de baby?
Epidurale analgesie voor pijnbestrijding tijdens de bevalling leek geen directe invloed te hebben op de neonatale toestand zoals bepaald door Apgar-scores of op opnames op de neonatale intensive care.
[ "We hebben retrospectief 93 opeenvolgende patiënten met een eenlingzwangerschap geanalyseerd die een keizersnede ondergingen met gecombineerde spinale-epidurale anesthesie. De patiënten werden verdeeld in twee groepen, afhankelijk van het gebruik van 6% HES 130/0.4: groep A (461 ± 167 ml zoutoplossing-gebaseerde HES toegediend; 43 patiënten) en groep B (geen HES toegediend; 50 patiënten). De belangrijkste uitkomstmaat was het chloridegehalte in de navelstreng bij de bevalling. Het volume dat werd toegediend vanaf opname in de operatiekamer tot de bevalling was niet significant verschillend tussen de groepen. Het chloridegehalte in de navelstreng bij de bevalling was statistisch significant hoger in groep A dan in groep B, maar klinisch vergelijkbaar (108 ± 2 versus 107 ± 2 mmol/l, P = 0,02). Er werden geen verschillen waargenomen in de Apgar-score of andere laboratoriumgegevens van de navelstreng bij de bevalling (Na+, K+, pH, base excess)", "CONCLUSIE Subarachnoïdale of epidurale sufentanil, in de doses gebruikt in deze studie, in combinatie met lokale anesthetica, had hetzelfde effect op de duur van de bevalling na analgesie en op de Apgar-score van pasgeborenen.", "CONCLUSIE Subarachnoïdale of epidurale sufentanil, in de doses gebruikt in deze studie, in combinatie met lokale anesthetica, had hetzelfde effect op de duur van de bevalling na analgesie en op de Apgar-score van pasgeborenen." ]
228
247
2,845
Wat is latexparel fagocytose?
De scavengerfunctie van macrofagen werd beoordeeld met een in vitro latexparel fagocytose assay. Wij ontwikkelden een op scanning cytometrie gebaseerde high-throughput assay voor macrofaag fagocytose die gebonden en geïnternaliseerde niet-opsoniseerde latexparels kwantificeert.
[ "De scavengerfunctie van macrofagen werd beoordeeld met een in vitro latexparel fagocytose assay.", "Wij ontwikkelden een op scanning cytometrie gebaseerde high-throughput assay voor macrofaag fagocytose die gebonden en geïnternaliseerde niet-opsoniseerde latexparels kwantificeert.", "Voor de fagocytose assay werden fluoresceïne-geconjugeerde polystyreenparels geïncubeerd met macrofaagmonolagen in witte luminostrips. Na incubatie werden de cellen gewassen, geliseerd en werd fagocytose gekwantificeerd door het bepalen van de fluorescentie-intensiteit met een fluorescentieplaatlezer. Het aantal gefagocyteerde parels werd bepaald aan de hand van een standaardcurve van parelaantal versus fluorescentie-uitvoer." ]
116
113
2,846
Is fosfolipide hydroperoxide glutathion peroxidase een selenoproteïne?
Ja, de fosfolipide hydroperoxide glutathion peroxidase (PHGPx/GPx4) is het belangrijkste selenoproteïne.
[ "Glutathion peroxidase (Gpx1) is het belangrijkste selenoproteïne in de meeste weefsels bij dieren.", "Het seleno-enzym Gpx4 is essentieel voor vroege embryogenese en celviabiliteit vanwege zijn unieke functie om fosfolipide-oxidatie te voorkomen.", "het belangrijkste selenoproteïne dat wordt tot expressie gebracht door kiemcellen in de testis, de fosfolipide hydroperoxide glutathion peroxidase (PHGPx/GPx4)" ]
62
64
2,847
Beschrijf CGmapTools
CGmapTools verbetert de precisie van heterozygote SNV-aanroepen en ondersteunt alleel-specifieke methyleringsdetectie en visualisatie in bisulfiet-sequencinggegevens.
[ "CGmapTools verbetert de precisie van heterozygote SNV-aanroepen en ondersteunt alleel-specifieke methyleringsdetectie en visualisatie in bisulfiet-sequencinggegevens.", "DNA-methylering is belangrijk voor genstillegging en imprinting in zowel planten als dieren. Recente vooruitgangen in bisulfietsequencing maken detectie van single nucleotide variaties (SNV's) mogelijk met hoge gevoeligheid, maar het nauwkeurig identificeren van heterozygote SNV's uit gedeeltelijk C-naar-T geconverteerde sequenties blijft een uitdaging.Resultaten: We hebben twee methoden ontworpen, BayesWC en BinomWC, die de precisie van heterozygote SNV-aanroepen aanzienlijk verbeterden van ongeveer 80% naar 99%, terwijl vergelijkbare terugroepwaarden behouden bleven. Met deze SNV-aanroepen boden we functies voor alleel-specifieke DNA-methyleringsanalyse (ASM) en het visualiseren van de methyleringsstatus op reads. Toepassing van ASM-analyse op een eerdere dataset toonde aan dat gemiddeld 1,5% van de onderzochte regio's allel-methylering vertoonde, welke significant verrijkt waren in transposonelementen en waarschijnlijk gedeeld werden door hetzelfde celtype. Een dynamische fragmentstrategie werd gebruikt voor DMR-analyse in data met lage dekking en kon differentieel gemethyleerde regio's (DMR's) vinden die gerelateerd zijn aan sleutelgenen betrokken bij tumorgenese met behulp van een openbare kankerdataset. Ten slotte hebben we 40 toepassingen geïntegreerd in het softwarepakket CGmapTools om DNA-methylooms te analyseren. Dit pakket gebruikt CGmap als formaatinterface, ontwerpt binaire formaten om de bestandsgrootte te verkleinen en snelle gegevensopvraging te ondersteunen, en kan worden toegepast voor context-, gen-, bin-, regio- en monstergewijze analyses en visualisaties.Beschikbaarheid en implementatie: De CGmapTools-software is vrij beschikbaar op https://cgmaptools.github.io/.", "Ten slotte hebben we 40 toepassingen geïntegreerd in het softwarepakket CGmapTools om DNA-methylooms te analyseren.", "Ten slotte hebben we 40 toepassingen geïntegreerd in het softwarepakket CGmapTools om DNA-methylooms te analyseren. ", "Ten slotte hebben we 40 toepassingen geïntegreerd in het softwarepakket CGmapTools om DNA-methylooms te analyseren.", "Dit pakket gebruikt CGmap als formaatinterface, ontwerpt binaire formaten om de bestandsgrootte te verkleinen en snelle gegevensopvraging te ondersteunen, en kan worden toegepast voor context-, gen-, bin-, regio- en monstergewijze analyses en visualisaties.<br><b>Beschikbaarheid en implementatie</b>: De CGmapTools-software is vrij beschikbaar op https://cgmaptools.github.io/.<br><b>Contact</b>: guoweilong@cau.edu.cn.<br><b>Aanvullende informatie</b>: Aanvullende gegevens zijn beschikbaar op Bioinformatics online.<br>" ]
343
329
2,848
Is inositol effectief voor trichotillomanie?
Nee, inositol is niet effectief voor trichotillomanie
[ "Patiënten die inositol kregen toegewezen, vertoonden geen significant grotere verminderingen op primaire of secundaire uitkomstmaten vergeleken met placebo (alle P>0,05).", "Dit is de eerste studie die de werkzaamheid van inositol bij de behandeling van trichotillomanie beoordeelt, maar er werden geen verschillen in symptoomvermindering gevonden tussen inositol en placebo.", "Aan het einde van de studie was 42,1% van de patiënten 'veel of zeer veel verbeterd' met inositol vergeleken met 35,3% met placebo.", "Conclusies • De review geeft aan dat yoga, aerobe oefening, acupunctuur, biofeedback, hypnose, en inositol en N-acetylcysteïne allemaal veelbelovend zijn bij de behandeling van excoriatiestoornis en andere lichaamsgerichte repetitieve gedragingen, zoals trichotillomanie.", "Toekomstige studies zouden moeten onderzoeken of inositol gunstig kan zijn bij het beheersen van het trekkingsgedrag in een subgroep van personen met trichotillomanie." ]
125
132
2,849
Hoe wordt de Regulatory Trait Concordance (RTC) berekend?
Regulatory Trait Concordance (RTC) die rekening houdt met de lokale LD-structuur en eQTLs en GWAS-resultaten integreert om de subset van associatiesignalen te onthullen die het gevolg zijn van cis eQTLs.
[ "Regulatory Trait Concordance (RTC) die rekening houdt met de lokale LD-structuur en eQTLs en GWAS-resultaten integreert om de subset van associatiesignalen te onthullen die het gevolg zijn van cis eQTLs.", "Na streng testen op een gedeelde causale variant met behulp van zowel het Joint Likelihood Mapping- als het Regulatory Trait Concordance-framework, vonden we dat gen-niveau kwantificatie het aantal causale cis-eQTLs significant onderschatte.", "We hebben de Regulatory Trait Concordance (RTC) score aangepast om de waarschijnlijkheid te meten dat eQTLs actief zijn in meerdere weefsels en om de waarschijnlijkheid te berekenen dat een GWAS-geassocieerde variant en een eQTL hetzelfde functionele effect taggen.", "In de huidige studie stellen we een empirische methodologie voor, die we Regulatory Trait Concordance (RTC) noemen, die rekening houdt met de lokale LD-structuur en eQTLs en GWAS-resultaten integreert om de subset van associatiesignalen te onthullen die het gevolg zijn van cis eQTLs.", "We hebben de Regulatory Trait Concordance (RTC) score aangepast om de waarschijnlijkheid te meten dat eQTLs actief zijn in meerdere weefsels en om de waarschijnlijkheid te berekenen dat een GWAS-geassocieerde variant en een eQTL hetzelfde functionele effect taggen." ]
215
213
2,850
Waar wordt filipinekleuring voor gebruikt?
Intracellulair en totaal cholesterol (TC) werden gemeten met behulp van filipinekleuring.
[ "sequestratie van cholesterol naar het perinucleaire gebied, zoals blijkt uit de filipinekleuring.", "De huidige diagnose voor NP-C is gebaseerd op de observatie van het opgehoopte cholesterol in fibroblasten van getroffen personen, met behulp van een invasieve en tijdrovende test, genaamd filipinekleuring.", "Het cholesterolgehalte in het membraan werd gemeten door filipinekleuring", "intracellulair en totaal cholesterol (TC) werden gemeten met behulp van filipinekleuring", "filipinekleuring van cholesterol." ]
77
74
2,851
Bevordert TIAM1 de tumorprogressie bij colorectale kanker (CRC)?
Nee. Bij colorectale kanker (CRC) onderdrukt TIAM1 de tumorprogressie door de activiteit van YAP/TAZ te reguleren.
[ "Hier identificeren we TIAM1 als een cruciale antagonist van CRC-progressie door het remmen van TAZ en YAP, effectors van WNT-signaaltransductie. We tonen aan dat TIAM1 tussen het cytoplasma en de kern shuttleert en TAZ/YAP tegengaat via verschillende mechanismen in de twee compartimenten. In het cytoplasma lokaliseert TIAM1 zich bij het destructiecomplex en bevordert het de afbraak van TAZ door de interactie met βTrCP te versterken. Kern-TIAM1 onderdrukt de interactie van TAZ/YAP met TEADs, waardoor de expressie van TAZ/YAP-doelgenen die betrokken zijn bij epitheliale-mesenchymale transitie, celmigratie en invasie wordt geremd, en onderdrukt daardoor de migratie en invasie van CRC-cellen. Belangrijk is dat een hoge hoeveelheid kern-TIAM1 in klinische monsters geassocieerd wordt met een verhoogde overleving van CRC-patiënten. Gezamenlijk suggereren onze bevindingen dat TIAM1 bij CRC de tumorprogressie onderdrukt door de activiteit van YAP/TAZ te reguleren.", "Gezamenlijk suggereren onze bevindingen dat TIAM1 bij CRC de tumorprogressie onderdrukt door de activiteit van YAP/TAZ te reguleren.", "Kern-TIAM1 onderdrukt de interactie van TAZ/YAP met TEADs, remt de expressie van TAZ/YAP-doelgenen die betrokken zijn bij epitheliale-mesenchymale transitie, celmigratie en invasie, en onderdrukt daardoor de migratie en invasie van CRC-cellen.", "Met behulp van een orthotoop xenograftmodel in naakte muizen bevestigden we dat het stilleggen van Tiam1 de tumorgroei kon verminderen door subcutane injectie en de long- en levermetastasen van colorectale kankercellen kon onderdrukken.", "Gezamenlijk suggereren onze bevindingen dat TIAM1 bij CRC de tumorprogressie onderdrukt door de activiteit van YAP/TAZ te reguleren.<br>" ]
221
252
2,852
Welke database is ontwikkeld die experimenteel bevestigde gecarbonyleerde eiwitten bevat?
Eiwitcarbonylatie, een chemisch diverse oxidatieve post-translationele modificatie, wordt algemeen beschouwd als de biomarker voor oxidatieve stress en eiwitschade. CarbonylDB is ontwikkeld als een handmatig samengestelde databron van experimenteel bevestigde gecarbonyleerde eiwitten/plaatsen. De CarbonylDB bevat momenteel 1495 gecarbonyleerde eiwitten en 3781 plaatsen van 21 soorten, met mens, rat en gist als de top drie soorten.
[ "CarbonylDB: een samengestelde databron van eiwitcarbonylatieplaatsen.", "Eiwitcarbonylatie, een chemisch diverse oxidatieve post-translationele modificatie, wordt algemeen beschouwd als de biomarker voor oxidatieve stress en eiwitschade. Ondanks hun belang en uitgebreide studies bestaat er geen database/bron over gecarbonyleerde eiwitten/plaatsen. Aangezien dergelijke informatie zeer nuttig is voor onderzoek in biologie/geneeskunde, hebben we handmatig een databron (CarbonylDB) samengesteld van experimenteel bevestigde gecarbonyleerde eiwitten/plaatsen.Resultaten: De CarbonylDB bevat momenteel 1495 gecarbonyleerde eiwitten en 3781 plaatsen van 21 soorten, met mens, rat en gist als de top drie soorten. We hebben verdere analyses uitgevoerd van deze gecarbonyleerde eiwitten/plaatsen en hun voorkomen en bezettingspatronen gepresenteerd. Carbonylatieplaatsgegevens over serumalbumine bieden met name een uitstekend modelsysteem om de dynamiek van oxidatieve eiwitmodificaties/-schade te begrijpen.", "Aangezien dergelijke informatie zeer nuttig is voor onderzoek in biologie/geneeskunde, hebben we handmatig een databron (CarbonylDB) samengesteld van experimenteel bevestigde gecarbonyleerde eiwitten/plaatsen.", "Resultaten De CarbonylDB bevat momenteel 1495 gecarbonyleerde eiwitten en 3781 plaatsen van 21 soorten, met mens, rat en gist als de top drie soorten.", "Resultaten De CarbonylDB bevat momenteel 1495 gecarbonyleerde eiwitten en 3781 plaatsen van 21 soorten, met mens, rat en gist als de top drie soorten.", "Aangezien dergelijke informatie zeer nuttig is voor onderzoek in biologie/geneeskunde, hebben we handmatig een databron (CarbonylDB) samengesteld van experimenteel bevestigde gecarbonyleerde eiwitten/plaatsen.", "Aangezien dergelijke informatie zeer nuttig is voor onderzoek in biologie/geneeskunde, hebben we handmatig een databron (CarbonylDB) samengesteld van experimenteel bevestigde gecarbonyleerde eiwitten/plaatsen.<br><b>Resultaten</b>: De CarbonylDB bevat momenteel 1495 gecarbonyleerde eiwitten en 3781 plaatsen van 21 soorten, met mens, rat en gist als de top drie soorten.", "Carbonylatieplaatsgegevens over serumalbumine bieden met name een uitstekend modelsysteem om de dynamiek van oxidatieve eiwitmodificaties/-schade te begrijpen.<br><b>Beschikbaarheid en implementatie</b>: De CarbonylDB is beschikbaar als een webbron en voor download op http://digbio.missouri.edu/CarbonylDB/.<br><b>Aanvullende informatie</b>: Aanvullende gegevens zijn beschikbaar op Bioinformatics online.<br>" ]
355
345
2,853
Wat is de functie van het Nup153-eiwit?
Nup153 is een groot (153 kD) O-gebonden glycoproteïne dat een onderdeel is van de mandstructuur aan de nucleoplasmatische zijde van kernporiecomplexen. Nup153 is een nucleoporin die nucleaire import medieert. Naast het belangrijk zijn voor de porie-architectuur, is Nup153 een belangrijke deelnemer aan zowel import als export. Tijdens de overgang naar mitose leidt Nup153 eiwitten die betrokken zijn bij membraanherstructurering naar de nucleaire envelop.
[ "Nup153 bij het hervormen van functionele nucleaire enveloppen", "Gezamenlijk toonden deze resultaten aan dat emerin, LBR en verschillende NPC-componenten (RanBP2, Nup153, p62), maar niet Tpr, zich zeer vroeg in de telofase rondom chromosomen herconstitueerden vóór het herstel van nucleaire importactiviteit.", "Op basis van eiwitdomeinovereenkomst, de menselijke nucleoporin Nup153", "menselijke Nup153 medieert nucleaire import", "Naast het belangrijk zijn voor de porie-architectuur, is Nup153 een belangrijke deelnemer aan zowel import als export", "Tijdens de overgang naar mitose leidt Nup153 eiwitten die betrokken zijn bij membraanherstructurering naar de nucleaire envelop.", "Over het geheel genomen onderstreept de veelzijdige aard van Nup153 een opkomende visie van de nucleaire porie als het knooppunt van vele belangrijke cellulaire processen.", "Nucleoporin NUP153 bewaakt de integriteit van het genoom door de nucleaire import van 53BP1 te bevorderen.", "een kernporiecomponent NUP153 als een nieuw factor die specifiek vereist is voor de nucleaire import van 53BP1.", "De nucleaire mand bestaat uit de 3 nucleoporines Nup153, Nup50 en Tpr, maar hun specifieke rol voor de structurele organisatie van deze NPC-substructuur is echter niet goed vastgesteld", "Het nucleaire porie-eiwit Nup153 associeert met chromatine en reguleert de expressie van hartgenen in dystrofische mdx-harten.", "De nucleoporin Nup153 is betrokken bij de DNA-schade respons, toegeschreven aan een rol in het bevorderen van nucleaire import van 53BP1.", "Nup153 is een groot (153 kD) O-gebonden glycoproteïne dat een onderdeel is van de mandstructuur aan de nucleoplasmatische zijde van kernporiecomplexen.", "Naast het belangrijk zijn voor de porie-architectuur, is Nup153 een belangrijke deelnemer aan zowel import als export.", "Ten slotte tonen we aan dat het C-terminale deel van NUP153 vereist is voor effectieve nucleaire import van 53BP1, en dat 53BP1 via de interactie tussen NUP153 en importine-β in de kern wordt geïmporteerd.", "Onze gegevens definiëren de structuur-functie relaties binnen deze opkomende 53BP1-NUP153/importine-β route en impliceren dit mechanisme in het behoud van genoomintegriteit.", "Hier bieden we de volledige resultaten van deze screening als een informatiebron, en valideren en karakteriseren we functioneel een van de geïdentificeerde 'hits': een kernporiecomponent NUP153 als een nieuw factor die specifiek vereist is voor de nucleaire import van 53BP1." ]
394
394
2,854
Is pacritinib effectief voor de behandeling van myelofibrose?
Ja. Pacritinib (PAC), een multi-kinaseremmer met specificiteit voor JAK2, FLT3 en IRAK1 maar die JAK1 spaart, heeft klinische activiteit aangetoond bij myelofibrose met minimale myelosuppressie.
[ "Pacritinib en het gebruik ervan bij de behandeling van patiënten met myelofibrose die trombocytopenie hebben.", "Pacritinib, een dubbele remmer van JAK2 en FLT3 die ook IRAK1 remt, heeft aangetoond dat het gunstig kan beïnvloeden bij MF-geassocieerde splenomegalie en symptoomlast, terwijl het beperkte myelosuppressie veroorzaakt met beheersbare gastro-intestinale toxiciteit.", "Andere JAK-remmers, zoals fedratinib en pacritinib, bleken nuttig te zijn bij MF.", "Conclusies en relevantie: Bij patiënten met myelofibrose en trombocytopenie, inclusief degenen met eerdere anti-JAK-therapie, was pacritinib twee keer per dag effectiever dan BAT, inclusief ruxolitinib, voor het verminderen van splenomegalie en symptomen.", "Ontwikkelingen van JAK-remmers, zoals ruxolitinib, pacritinib, momelotinib en fedratinib, maakten effectieve behandeling van MF-patiënten mogelijk.", "Pacritinib (PAC), een multi-kinaseremmer met specificiteit voor JAK2, FLT3 en IRAK1 maar die JAK1 spaart, heeft klinische activiteit aangetoond bij MF met minimale myelosuppressie.", "Pacritinib zou een behandelingsoptie kunnen zijn voor patiënten met myelofibrose, inclusief degenen met baseline cytopenieën waarvoor de opties bijzonder beperkt zijn.", "Conclusies en relevantie\nBij patiënten met myelofibrose en trombocytopenie, inclusief degenen met eerdere anti-JAK-therapie, was pacritinib twee keer per dag effectiever dan BAT, inclusief ruxolitinib, voor het verminderen van splenomegalie en symptomen.", "Deskundig commentaar: Pacritinib heeft veelbelovende resultaten getoond bij patiënten met myelofibrose en trombocytopenie.", "Pacritinib, een dubbele remmer van JAK2 en FLT3, verbetert ziektegerelateerde symptomen en tekenen met beheersbare gastro-intestinale toxiciteit bij patiënten met myelofibrose met splenomegalie en hoogrisicokenmerken, zonder duidelijke myelosuppressie te veroorzaken, en kan daarom een belangrijke behandelingsoptie bieden voor een breed scala aan patiënten met myelofibrose.", "Pacritinib is een actief middel bij patiënten met MF en biedt een potentiële behandelingsoptie voor patiënten met bestaande anemie en trombocytopenie.", "Pacritinib (PAC), een multi-kinaseremmer met specificiteit voor JAK2, FLT3 en IRAK1 maar die JAK1 spaart, heeft klinische activiteit aangetoond bij MF met minimale myelosuppressie.", "Dit artikel onderzoekt de rol van JAK2- en FLT3-signaaltransductie bij myelofibrose en geeft een overzicht van de klinische ontwikkeling van pacritinib als nieuwe therapie voor myelofibrose.", "Pacritinib lijkt een effectief middel te zijn voor de controle van MF-gerelateerde symptomen en splenomegalie met mogelijk minder hematologische bijwerkingen vergeleken met ruxolitinib en lijkt een bijzonder veelbelovend middel voor anemische en trombocytopenische patiënten.", "Deskundig commentaar: Pacritinib heeft veelbelovende resultaten getoond bij patiënten met myelofibrose en trombocytopenie." ]
380
376
2,855
Hoe kan PEGylering recombinant geneesmiddelen verbeteren?
PEGylering verbetert voornamelijk de farmacokinetiek en helpt bij het voorkomen van bijwerkingen door de moleculaire massa van eiwitten en peptiden te vergroten en ze te beschermen tegen proteolytische enzymen.
[ "Door de moleculaire massa van eiwitten en peptiden te vergroten en ze te beschermen tegen proteolytische enzymen, verbetert PEGylering voornamelijk de farmacokinetiek en helpt het bij het voorkomen van bijwerkingen." ]
56
63
2,856
Kan blootstelling aan zware metalen zoals lood (Pb) of cadmium (Cd) veranderingen in DNA-methyleringspatronen veroorzaken in Isoetes sinensis?
Veranderingen in DNA-methylering van de bedreigde plant Isoetes sinensis zijn aangetoond te worden beïnvloed door zowel Pb als Cd
[ "DNA-methylering in bedreigde planten na blootstelling aan zware metalen, de Isoetes sinensis, een bedreigde plant, werd blootgesteld aan drie verschillende concentraties van twee zware metalen lood (Pb) en cadmium (Cd)", "De resultaten toonden aan dat het DNA-gemethyleerde profiel van I. sinensis werd beïnvloed door Pb- en Cd-stress.", "Het aandeel DNA-methylering (inclusief hypermethylering) door zowel Pb- als Cd-stress is bijna gelijk (39,04% en 39,71%), maar het aandeel DNA-demethylering door Cd is hoger dan dat door Pb (46,86% versus 33,92%).", "Er was geen significant verschil in de hoeveelheid DNA-methylering tussen de controle (CK), de Pb-stressgroep en de Cd-stressgroep (CK 46,96%, Pb 48,23% en Cd 48,1%).", "Echter, het volledige methyleringsniveau van de Pb-stressgroep (28,34%) en de Cd-stressgroep (20,25%) was lager dan de controle (33,91%), terwijl het hemi-methyleringsniveau van de Pb-stressgroep (19,89%) en de Cd-stressgroep (27,85%) hoger was dan de controle (13,04%).", "Consistent werd een dramatische verandering in DNA-methyleringspatronen gedetecteerd in H. verticillata blootgesteld aan overtollig koper.", "Hydrilla verticillata gebruikt twee verschillende manieren om DNA-methylering te beïnvloeden onder overtollige koperstress. Door de ophoping van zware metalen wordt Hydrilla verticillata (L.f.) Royle, een geworteld ondergedoken meerjarig waterplantje, ontwikkeld als een potentieel hulpmiddel om het door zware metalen vervuilde aquatische ecosysteem te reinigen.", "Het aandeel DNA-methylering (inclusief hypermethylering) door zowel Pb- als Cd-stress is bijna gelijk (39,04% en 39,71%), maar het aandeel DNA-demethylering door Cd is hoger dan dat door Pb (46,86% versus 33,92%).<br>" ]
278
256
2,857
Beschrijf GeneCodeq
De exponentiële daling van de kosten van genoomsequencing heeft geleid tot een snelle groei van genomische data. Het merendeel van de entropie van short read-gegevens ligt niet in de sequentie van de leesbasen zelf, maar in hun Quality Scores - de betrouwbaarheidsmeting dat elke base correct is gesequenced. Verliesvrije compressiemethoden naderen nu hun theoretische limieten en daarom is er behoefte aan verliesgevende methoden die de complexiteit van deze data verder verminderen zonder de downstream analyses te beïnvloeden. GeneCodeq is een Bayesiaanse methode geïnspireerd door coderingstheorie voor het aanpassen van quality scores om de comprimeerbaarheid van quality scores te verbeteren zonder de nauwkeurigheid van genotypering nadelig te beïnvloeden. Het model maakt gebruik van een corpus van k-mers om de entropie van de quality scores te verminderen en daarmee de comprimeerbaarheid van deze data (in FASTQ- of SAM/BAM/CRAM-bestanden), wat resulteert in compressieverhoudingen die die van andere methoden aanzienlijk overtreffen. GeneCodeq kan worden gecombineerd met bestaande verliesgevende compressieschema's om de entropie verder te verminderen en stelt de gebruiker in staat een referentiepanel van verwachte sequentievariaties op te geven om de modelnauwkeurigheid te verbeteren.
[ "GeneCodeq: compressie van quality scores en verbeterde genotypering met behulp van een Bayesiaans kader.", "De exponentiële daling van de kosten van genoomsequencing heeft geleid tot een snelle groei van genomische data. Het merendeel van de entropie van short read-gegevens ligt niet in de sequentie van de leesbasen zelf, maar in hun Quality Scores - de betrouwbaarheidsmeting dat elke base correct is gesequenced. Verliesvrije compressiemethoden naderen nu hun theoretische limieten en daarom is er behoefte aan verliesgevende methoden die de complexiteit van deze data verder verminderen zonder de downstream analyses te beïnvloeden.RESULTATEN: Wij stellen hier GeneCodeq voor, een Bayesiaanse methode geïnspireerd door coderingstheorie voor het aanpassen van quality scores om de comprimeerbaarheid van quality scores te verbeteren zonder de nauwkeurigheid van genotypering nadelig te beïnvloeden. Ons model maakt gebruik van een corpus van k-mers om de entropie van de quality scores te verminderen en daarmee de comprimeerbaarheid van deze data (in FASTQ- of SAM/BAM/CRAM-bestanden), wat resulteert in compressieverhoudingen die die van andere methoden aanzienlijk overtreffen. Onze aanpak kan ook worden gecombineerd met bestaande verliesgevende compressieschema's om de entropie verder te verminderen en stelt de gebruiker in staat een referentiepanel van verwachte sequentievariaties op te geven om de modelnauwkeurigheid te verbeteren. Naast uitgebreide empirische evaluatie, leiden we ook nieuwe theoretische inzichten af die de empirische prestaties en valkuilen van corpus-gebaseerde compressieschema's voor quality scores in het algemeen verklaren. Ten slotte tonen we aan dat als positief neveneffect van compressie het model kan leiden tot verbeterde genotyperingsnauwkeurigheid.BESCHIKBAARHEID EN IMPLEMENTATIE: GeneCodeq is beschikbaar op: github.com/genecodeq/eval", "RESULTATEN\nWij stellen hier GeneCodeq voor, een Bayesiaanse methode geïnspireerd door coderingstheorie voor het aanpassen van quality scores om de comprimeerbaarheid van quality scores te verbeteren zonder de nauwkeurigheid van genotypering nadelig te beïnvloeden.", "RESULTATEN Wij stellen hier GeneCodeq voor, een Bayesiaanse methode geïnspireerd door coderingstheorie voor het aanpassen van quality scores om de comprimeerbaarheid van quality scores te verbeteren zonder de nauwkeurigheid van genotypering nadelig te beïnvloeden.", "Verliesvrije compressiemethoden naderen nu hun theoretische limieten en daarom is er behoefte aan verliesgevende methoden die de complexiteit van deze data verder verminderen zonder de downstream analyses te beïnvloeden.<br><b>RESULTATEN</b>: Wij stellen hier GeneCodeq voor, een Bayesiaanse methode geïnspireerd door coderingstheorie voor het aanpassen van quality scores om de comprimeerbaarheid van quality scores te verbeteren zonder de nauwkeurigheid van genotypering nadelig te beïnvloeden.", "Ten slotte tonen we aan dat als positief neveneffect van compressie het model kan leiden tot verbeterde genotyperingsnauwkeurigheid.<br><b>BESCHIKBAARHEID EN IMPLEMENTATIE</b>: GeneCodeq is beschikbaar op: github.com/genecodeq/eval CONTACT: dan@petagene.comAanvullende informatie: Aanvullende gegevens zijn beschikbaar op Bioinformatics online.<br>" ]
558
590
2,858
Is Glyceraldehyde 3-fosfaat dehydrogenase (GAPDH) gerapporteerd als een plasminogeenreceptor in pathogene bacteriën?
Glyceraldehyde 3-fosfaat dehydrogenase (GAPDH) is gerapporteerd als een plasminogeenreceptor in veel pathogene bacteriën.
[ "binding van plasminogeen (Plg) aan bacteriële oppervlakken, aangezien is aangetoond dat deze interactie bijdraagt aan bacteriële adhesie aan gastheercellen, invasie van gastweefsels en ontduiking van het immuunsysteem. Verschillende bacteriële eiwitten staan bekend als receptoren voor Plg, waaronder glyceraldehyde-3-fosfaat dehydrogenase (GAPDH),", "Bovendien werden verschillende isoformen van glyceraldehyde 3-fosfaat dehydrogenase (GAPDH) en galectine (GAL) geïdentificeerd in beide antigenische extracten als plasminogeen-bindende eiwitten.", "Gezuiverde GAPDH bleek menselijk plasminogeen en fibrinogeen te binden in Far-Western blot en ELISA-gebaseerde assays.", "GAPDH vertoont een hoge affiniteit voor plasmin en een aanzienlijk lagere affiniteit voor plasminogeen.", "Bovendien werden verschillende isoformen van glyceraldehyde 3-fosfaat dehydrogenase (GAPDH) en galectine (GAL) geïdentificeerd in beide antigenische extracten als plasminogeen-bindende eiwitten." ]
146
128
2,859
Welke de novo truncerende mutaties in WASF1 veroorzaken een verstandelijke beperking?
De novo truncerende mutaties in WAS-eiwitfamilielid 1 (WASF1) werden geïdentificeerd bij vijf niet-verwante individuen met een matige tot ernstige verstandelijke beperking met autistische kenmerken en epileptische aanvallen. WASF1, ook bekend als WAVE1, maakt deel uit van het WAVE-complex en fungeert als een mediator tussen Rac-GTPase en actine om actinepolymerisatie te induceren. De drie mutaties die via Matchmaker Exchange werden verbonden waren c.1516C>T (p.Arg506Ter), die voorkomt bij drie niet-verwante individuen, c.1558C>T (p.Gln520Ter), en c.1482delinsGCCAGG (p.Ile494MetfsTer23). Alle drie de varianten worden voorspeld om het C-terminale actine-bindende WCA-domein gedeeltelijk of volledig te verstoren. Functionele studies met fibroblastcellen van twee getroffen individuen met de c.1516C>T-mutatie toonden een getruncateerd WASF1 en een defect in actineherstructurering aan.
[ "Hier identificeerden we, met behulp van exoomsequencing en volledige-genoomsequencing, drie de novo truncerende mutaties in WAS-eiwitfamilielid 1 (WASF1) bij vijf niet-verwante individuen met een matige tot ernstige verstandelijke beperking met autistische kenmerken en epileptische aanvallen. WASF1, ook bekend als WAVE1, maakt deel uit van het WAVE-complex en fungeert als een mediator tussen Rac-GTPase en actine om actinepolymerisatie te induceren. De drie mutaties die via Matchmaker Exchange werden verbonden waren c.1516C>T (p.Arg506Ter), die voorkomt bij drie niet-verwante individuen, c.1558C>T (p.Gln520Ter), en c.1482delinsGCCAGG (p.Ile494MetfsTer23). Alle drie de varianten worden voorspeld om het C-terminale actine-bindende WCA-domein gedeeltelijk of volledig te verstoren. Functionele studies met fibroblastcellen van twee getroffen individuen met de c.1516C>T-mutatie toonden een getruncateerd WASF1 en een defect in actineherstructurering aan. Deze studie levert bewijs dat de novo heterozygote mutaties in WASF1 een zeldzame vorm van verstandelijke beperking veroorzaken." ]
255
257
2,860
Kan CPX-351 worden gebruikt voor de behandeling van tuberculose?
Nee, CPX-351 is een nieuwe liposomale formulering van cytarabine en daunorubicine die recentelijk door de FDA is goedgekeurd voor de behandeling van acute myeloïde leukemie (AML).
[ "CPX-351 is een nieuwe liposomale formulering van cytarabine en daunorubicine die recentelijk door de FDA is goedgekeurd voor de behandeling van acute myeloïde leukemie (AML)." ]
54
58
2,861
Welke eiwitten vormen het nucleaire porie-mandje in menselijke cellen?
Nup133 is vereist voor de juiste assemblage en dynamiek van het nucleaire porie-mandje in embryonale stamcellen. Bovendien vereist de associatie van TREX-2 met het NPC de mandje-nucleoporines NUP153 en TPR, maar is onafhankelijk van transcriptie. De nucleoporin Nup153 is vereist voor de vorming van het nucleaire porie-mandje, verankering van het nucleaire poriecomplex en import van een subset van nucleaire eiwitten.
[ "Nup133 is vereist voor de juiste assemblage en dynamiek van het nucleaire porie-mandje in embryonale stamcellen.", "Hier tonen we aan dat de NPC-mandje-eiwitten Nup1 en Nup60 direct membraanvervorming induceren door amphipatische helixinvoeging in de lipide dubbellaag.", "Bovendien vereist de associatie van TREX-2 met het NPC de mandje-nucleoporines NUP153 en TPR, maar is onafhankelijk van transcriptie.", "In esc1Delta-cellen verspreiden Ulp1 en nucleaire mandjecomponenten Nup60 en Mlp1 zich niet langer breed rond de nucleaire periferie, maar colocaliseren ze in een klein aantal dichtgekleurde perinucleaire focussen.", "De nucleoporin Nup153 is vereist voor de vorming van het nucleaire porie-mandje, verankering van het nucleaire poriecomplex en import van een subset van nucleaire eiwitten.", "NPC's die zijn samengesteld zonder Nup153 misten verschillende componenten van het nucleaire mandje, waren ongelijk verdeeld in de nucleaire envelop (NE) en waren, in tegenstelling tot wildtype NPC's, mobiel binnen de NE.", "De incorporatie van het nucleaire porie-mandje-eiwit Nup153 in nucleaire poriestructuren is afhankelijk van lamina-assemblage: bewijs uit celvrije extracten van Xenopus-eieren.", "Met licht- en EM-immunolokalisatie bepaalden we dat het zoogdierlijke Tpr geconcentreerd is binnen het nucleaire mandje van het poriecomplex in een distributie vergelijkbaar met Nup153 en Nup98.", "Immunofluorescentie en immuno-elektronenmicroscopie lokaliseren het vertebraten Nup93 aan het nucleaire mandje en bij of nabij de nucleaire ingang van het gated kanaal van de porie.", "Opvallend is dat Nup133 en Nup107 van het Nup107/160 subcomplex en Nup153 en Nup50 van het nucleaire porie-mandje bijna een volledige complement van nucleoporines naar de LacO-array rekruteerden.", "Nup153 is een groot (153 kD) O-gebonden glycoproteïne dat een onderdeel is van de mandjestructuur aan de nucleoplasmatische zijde van nucleaire poriecomplexen.", "Nup153 is een moleculair bestanddeel van het nucleaire porie-mandje van het nucleaire poriecomplex (NPC) dat een cruciale rol speelt in de nucleaire export van RNA's en eiwitten.", "De nucleoporines Nup60p, Nup2p en Nup1p vormen een deel van de nucleaire mandjestructuur van het Saccharomyces cerevisiae nucleaire poriecomplex (NPC).", "Door postembedding immuno-elektronenmicroscopie hebben we de posities van verschillende menselijke NPC-eiwitten in kaart gebracht ten opzichte van de NPC-kern en het geassocieerde mandje, waaronder Nup93, Nup96, Nup98, Nup107, Nup153, Nup205 en het coiled coil-gedomineerde 267-kDa eiwit Tpr.", "In esc1Delta-cellen verspreiden Ulp1 en nucleaire mandjecomponenten Nup60 en Mlp1 zich niet langer breed rond de nucleaire periferie, maar colocaliseren ze in een klein aantal dichtgekleurde perinucleaire focussen.", "De targetinformatie voor Nup153 bevindt zich in het NH2-terminale domein aangezien dit deel van het molecuul een normaal cytoplasmatisch eiwit, pyruvaatkinase, naar de nucleaire zijde van het nucleaire poriecomplex kan dirigeren.", "We tonen aan dat de assemblage en integriteit van het nucleaire mandje niet wordt beïnvloed door Nup153-depletie, terwijl de integriteit wordt verstoord in cellen die hoge concentraties van het zinkvingerdomein van Nup153 tot expressie brengen.", "Wanneer het volledige menselijke Nup153 in BHK-cellen wordt tot expressie gebracht, hoopt het zich op de juiste wijze op aan de nucleoplasmatische zijde van de nucleaire envelop.", "Een van deze eiwitten, de nucleoporin Nup153, is gelokaliseerd in het nucleaire mandje van het poriecomplex en is aangetoond een centraal onderdeel te zijn van het nucleaire transportmachinerie.", "Hier wordt een SLAP geïdentificeerd als het nucleaire poriecomplex-eiwit Nup153, een lid van de F/GXFG-motief-bevattende nucleoporines.", "Nup133 is vereist voor de juiste assemblage en dynamiek van het nucleaire porie-mandje in embryonale stamcellen. Nup133 behoort tot het Y-complex, een sleutelelement van het skelet van het nucleaire poriecomplex (NPC).", "De nucleoporin Nup153 is vereist voor de vorming van het nucleaire porie-mandje, verankering van het nucleaire poriecomplex en import van een subset van nucleaire eiwitten. Het nucleaire poriecomplex (NPC) is een grote eiwitrijke structuur waardoor bidirectioneel transport van macromoleculen over de nucleaire envelop (NE) plaatsvindt.", "Om hun bijdragen aan NPC- en mandjestructuur verder te beoordelen, werden de genen die coderen voor Nup93, Nup96, Nup107 en Nup205 posttranscriptioneel gesilenced door RNA-interferentie (RNAi) in HeLa-cellen, ter aanvulling op recente RNAi-experimenten met Nup153 en Tpr.", "Immunogoudlabeling voor Nup98 resulteert ook in preferentiële labeling van NPC-kernregio's, terwijl is aangetoond dat Nup153 via zijn aminoterminale domein bindt aan de nucleaire coaxiale ring die de NPC-kernstructuren en Tpr verbindt.", "Ulp1, waarvan het behoud aan nucleaire poriën afhankelijk is van het Nup84-complex, beïnvloedt THO-afhankelijke genexpressie, terwijl de aan het nucleaire mandje geassocieerde Mlp1/Pml39-eiwitten de pre-mRNA-export in een later stadium voorkomen en bijdragen aan mRNA-kwaliteitscontrole." ]
737
732
2,862
Bindt lucatumumab aan CD140?
Nee, lucatumumab is een volledig gehumaniseerde anti-CD40 antilichaam die de interactie van CD40L met CD40 blokkeert en ook antilichaam-afhankelijke cellulaire cytotoxiciteit (ADCC) medieert.
[ "Lucatumumab is een volledig gehumaniseerde anti-CD40 antilichaam die de interactie van CD40L met CD40 blokkeert en ook antilichaam-afhankelijke cellulaire cytotoxiciteit (ADCC) medieert.", "Fase I-studie van het anti-CD40 gehumaniseerde monoklonale antilichaam lucatumumab (HCD122) bij teruggekeerde chronische lymfatische leukemie.", "Verzadiging van de CD40-receptor op CLL-cellen was uniform bij alle doses na behandeling, maar bleef ook aanwezig op de laagste concentratie tijdstippen in de cohorten van 3,0 mg/kg of hoger." ]
88
90
2,863
Wat is het werkingsmechanisme van arimoclomol?
Arimoclomol is een co-inducer van hitte-shock-eiwitten die de vouwing van pas gesynthetiseerde eiwitten bevordert. Het versterkt het vermogen van gedifferentieerde neuronen om hitte-shock te overleven.
[ "Een lage dosis gelijktijdige toediening van celastrol en arimoclomol, die Hsps induceert, verbeterde het vermogen van gedifferentieerde neuronen om hitte-shock te overleven.", "DOELSTELLING: Het onderzoeken van de veiligheid en verdraagbaarheid evenals de voorlopige werkzaamheid van arimoclomol, een co-inducer van hitte-shock-eiwitten die de vouwing van pas gesynthetiseerde eiwitten bevordert, bij patiënten met snel progressieve SOD1 amyotrofische laterale sclerose (ALS).", "De versterker van hitte-shock-eiwitten arimoclomol verbetert het hervouwen, de rijping en de lysosomale activiteit van glucocerebrosidase.", "Het experimentele geneesmiddel arimoclomol, dat zich in fase II/III klinische onderzoeken bevindt, is een goed gekarakteriseerde HSP-versterker en is uitgebreid klinisch getest.", "Regioselectieve en enantiospecifieke synthese van de HSP co-inducer arimoclomol uit chirale glycidyle derivaten.", "Orale toediening van arimoclomol, een kleine molecuul co-inducer van HSP's die momenteel in klinische onderzoeken is voor Niemann-Pick ziekte type C (NPC), herhaalde de effecten van recombinant menselijk HSP70, wat suggereert dat therapieën gebaseerd op hitte-shock-eiwitten klinische evaluatie verdienen voor de behandeling van lysosomale stapelingsziekten (LSD's).", "Met behulp van rat myoblastculturen vonden we dat het opwaarderen van de hitte-shock-respons met arimoclomol belangrijke pathologische markers van sIBM in vitro verminderde.", "Het werkingsmechanisme van arimoclomol omvat de versterking van de hitte-shock-respons, en behandeling met arimoclomol verhoogde de expressie van Hsp70.", "We hebben eerder aangetoond dat behandeling met een co-inducer van de hitte-shock-respons genaamd arimoclomol effectief is in het SOD(G93A) muismodel van ALS, waarbij de ziekteprogressie wordt vertraagd en de levensduur van SOD(G93A) muizen wordt verlengd (Kieran et al.", "Arimoclomol is een hydroxylamine-derivaat, een groep verbindingen die unieke eigenschappen hebben als co-inducers van hitte-shock-eiwitexpressie, maar alleen onder omstandigheden van cellulaire stress.", "Arimoclomol is een experimenteel geneesmiddel voor amyotrofische laterale sclerose (ALS) dat de genexpressie van hitte-shock-eiwitten versterkt tijdens celstress.", "Arimoclomol is een co-activator die de binding van geactiveerde HSF1 aan hitte-shock-elementen (HSE's) in de promotorregio's van induceerbare Hsp-genen verlengt.", "Het experimentele geneesmiddel arimoclomol, dat zich in fase II/III klinische onderzoeken bevindt, is een goed gekarakteriseerde HSP-versterker en is uitgebreid klinisch getest.", "Arimoclomol, een versterker van hitte-shock-eiwitexpressie die betrokken is bij de cellulaire stressrespons, is de afgelopen jaren naar voren gekomen als een potentiële therapeutische kandidaat bij amyotrofische laterale sclerose (ALS).", "DOELSTELLING Het onderzoeken van de veiligheid en verdraagbaarheid evenals de voorlopige werkzaamheid van arimoclomol, een co-inducer van hitte-shock-eiwitten die de vouwing van pas gesynthetiseerde eiwitten bevordert, bij patiënten met snel progressieve SOD1 amyotrofische laterale sclerose (ALS).", "We hebben eerder aangetoond dat behandeling met arimoclomol, een co-inducer van de hitte-shock-stressrespons, de ziekteprogressie vertraagt in het muismodel met gemuteerd superoxide dismutase 1 van amyotrofische laterale sclerose, een fatale motorneuronziekte.", "Het werkingsmechanisme van arimoclomol omvat de versterking van de hitte-shock-respons, en behandeling met arimoclomol verhoogde de expressie van Hsp70.", "De doelstellingen van de huidige studie waren het beoordelen van de veiligheid, verdraagbaarheid en farmacokinetiek van arimoclomol bij ALS.", "In deze review vatten we het bewijs samen voor de neuroprotectieve effecten van verhoogde hitte-shock-eiwitexpressie door Arimoclomol en andere inducers van de hitte-shock-respons." ]
497
485
2,864
Wat zijn de effecten van STEF-depletie?
De mechanismen die de actinekap reguleren zijn momenteel slecht begrepen. STEF/TIAM2, een Rac1-selectieve guanine nucleotide-uitwisselingsfactor, lokaliseert zich aan de nucleaire envelop, waar het co-localiseert met de belangrijke perinucleaire eiwitten Nesprin-2G en Non-spier myosine IIB (NMMIIB), en reguleert daar de perinucleaire Rac1-activiteit. STEF-depletie vermindert apicale perinucleaire actinekabels (een fenotype dat wordt hersteld door actieve Rac1 naar de nucleaire envelop te richten), verlaagt de nucleaire stijfheid en vermindert de expressie van TAZ-gereguleerde genen, wat wijst op een verandering in mechanosensorische paden als gevolg van verstoring van de actinekap.
[ "De mechanismen die de actinekap reguleren zijn momenteel slecht begrepen. Hier tonen we aan dat STEF/TIAM2, een Rac1-selectieve guanine nucleotide-uitwisselingsfactor, zich lokaliseert aan de nucleaire envelop, waar het co-localiseert met de belangrijke perinucleaire eiwitten Nesprin-2G en Non-spier myosine IIB (NMMIIB), en de perinucleaire Rac1-activiteit reguleert. We laten zien dat STEF-depletie apicale perinucleaire actinekabels vermindert (een fenotype dat wordt hersteld door actieve Rac1 naar de nucleaire envelop te richten), de nucleaire hoogte verhoogt en de nucleaire heroriëntatie belemmert. STEF-downregulatie vermindert ook perinucleair pMLC en verlaagt de door myosine gegenereerde spanning aan de nucleaire envelop, wat suggereert dat STEF-gemedieerde Rac1-activiteit de NMMIIB-activiteit reguleert om de stabilisatie van de perinucleaire actinekap te bevorderen. Ten slotte verlaagt STEF-depletie de nucleaire stijfheid en vermindert het de expressie van TAZ-gereguleerde genen, wat wijst op een verandering in mechanosensorische paden als gevolg van verstoring van de actinekap.", "We laten zien dat STEF-depletie apicale perinucleaire actinekabels vermindert (een fenotype dat wordt hersteld door actieve Rac1 naar de nucleaire envelop te richten), de nucleaire hoogte verhoogt en de nucleaire heroriëntatie belemmert.", "Ten slotte verlaagt STEF-depletie de nucleaire stijfheid en vermindert het de expressie van TAZ-gereguleerde genen, wat wijst op een verandering in mechanosensorische paden als gevolg van verstoring van de actinekap.", "STEF-depletie verminderde drastisch dbcAMP-geïnduceerde neurietgroei.", "STEF-depletie en Rac1-N17-expressie verminderden cAMP-geïnduceerde TC10-inactivatie.", "Ten slotte verlaagt STEF-depletie de nucleaire stijfheid en vermindert het de expressie van TAZ-gereguleerde genen, wat wijst op een verandering in mechanosensorische paden als gevolg van verstoring van de actinekap.<br>" ]
311
328
2,865
Geef alstublieft de symptomen van mazelen weer.
De belangrijkste symptomen van de ziekte zijn hoge koorts die optreedt na een incubatieperiode van 9-10 dagen en de rode uitslag die enkele dagen na het begin van de koorts verschijnt. Naast specifieke gegeneraliseerde symptomen kan mazelen ook oculaire symptomen hebben. De meest voorkomende bijkomende symptomen zijn conjunctivitis, coryza en hoest.
[ "koorts en gegeneraliseerde maculopapulaire uitslag, plus ≥1 van de volgende symptomen: coryza, conjunctivitis of hoest.", "Mazelen is een zeer besmettelijke virale infectie die gepaard gaat met klinische symptomen zoals koorts, hoest, conjunctivitis, coryza, uitslag en verhoogde serum immunoglobuline M (IgM) antilichamen.", "Deze patiënt had typische klinische symptomen van mazeleninfectie: koorts, uitslag, hoest en coryza." ]
104
108
2,866
Verbetert simvastatine de uitkomsten van aneurysmatische subarachnoïdale bloeding?
Nee. Simvastatine toonde geen voordelen bij het verminderen van de incidentie van vasospasme, DCI of sterfte door alle oorzaken na aneurysmatische subarachnoïdale bloeding. Patiënten met aneurysmatische subarachnoïdale bloeding dienen niet routinematig behandeld te worden met simvastatine tijdens de acute fase.
[ "Gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken hebben aangetoond dat simvastatine en intraveneus magnesium DCI niet voorkomen en de functionele uitkomsten na aneurysmatische subarachnoïdale bloeding (aSAH) niet verbeteren.", "Conclusies Simvastatine toonde geen voordelen bij het verminderen van de incidentie van vasospasme, DCI of sterfte door alle oorzaken na aneurysmatische SAH. Wij concluderen dat patiënten met SAH niet routinematig behandeld moeten worden met simvastatine tijdens de acute fase.", "We vonden geen statistisch significante effecten op vasospasme gedetecteerd door transcraniële cerebrale Doppler (relatief risico [RR], 0,91; 95% betrouwbaarheidsinterval [BI], 0,55-1,49), vertraagde cerebrale ischemie (DCI) (RR, 0,85; 95% BI, 0,63-1,14), of sterfte door alle oorzaken (RR, 1,02; 95% BI, 0,67-1,54).", "ACHTERGROND: Simvastatine zou gunstig kunnen zijn voor patiënten met aneurysmatische subarachnoïdale bloeding. Echter, de resultaten blijven controversieel.", "CONCLUSIES: Vergeleken met de controle-interventie bleek simvastatine geen invloed te hebben op vertraagd ischemisch tekort, vertraagde cerebrale infarcten, mRS≤2, vasospasme, IC-opname, ziekenhuisopname en mortaliteit bij patiënten met acute aneurysmatische subarachnoïdale bloeding.", "Huidig bewijs ondersteunt het profylactisch gebruik van clazosentan, magnesium of simvastatine niet.", "Recentelijk werd acute behandeling met simvastatine niet als gunstig aangetoond voor neurologische uitkomst volgens de gemodificeerde Rankin-schaal.", "CONCLUSIES: De huidige studie ondersteunt niet dat acute behandeling met simvastatine de cognitieve uitkomst na aneurysmatische subarachnoïdale bloeding verbetert.", "CONCLUSIE: Deze studie toonde aan dat behandeling met 80 mg simvastatine effectief was in het voorkomen van cerebraal vasospasme na aneurysmatische SAH, maar de klinische uitkomst bij Koreaanse patiënten niet verbeterde.", "Hoge dosis simvastatine is effectief in het voorkomen van cerebraal vasospasme na aneurysmatische subarachnoïdale bloeding: een prospectieve cohortstudie bij Koreaanse patiënten.", "CONCLUSIES De huidige studie ondersteunt niet dat acute behandeling met simvastatine de cognitieve uitkomst na aneurysmatische subarachnoïdale bloeding verbetert.", "CONCLUSIES Hoge dosis simvastatine behandeling dient niet routinematig voorgeschreven te worden bij aneurysmatische subarachnoïdale bloeding.", "Gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken hebben aangetoond dat simvastatine en intraveneus magnesium DCI niet voorkomen en de functionele uitkomsten na aneurysmatische subarachnoïdale bloeding (aSAH) niet verbeteren.", "CONCLUSIES Vergeleken met de controle-interventie bleek simvastatine geen invloed te hebben op vertraagd ischemisch tekort, vertraagde cerebrale infarcten, mRS≤2, vasospasme, IC-opname, ziekenhuisopname en mortaliteit bij patiënten met acute aneurysmatische subarachnoïdale bloeding.", "CONCLUSIES De huidige studie ondersteunt niet dat acute behandeling met simvastatine de cognitieve uitkomst na aneurysmatische subarachnoïdale bloeding verbetert.", "CONCLUSIES Hoge dosis simvastatine behandeling dient niet routinematig voorgeschreven te worden bij aneurysmatische subarachnoïdale bloeding.", "CONCLUSIES Vergeleken met de controle-interventie bleek simvastatine geen invloed te hebben op vertraagd ischemisch tekort, vertraagde cerebrale infarcten, mRS≤2, vasospasme, IC-opname, ziekenhuisopname en mortaliteit bij patiënten met acute aneurysmatische subarachnoïdale bloeding.", "Er waren ook geen verschillen in DID, vertraagde cerebrale infarcten, gunstige mRS-uitkomst en MMSE-scores, en cognitieve stoornissen beoordeeld met MMSE tussen beide groepen.<br><b>CONCLUSIES</b>: De huidige studie ondersteunt niet dat acute behandeling met simvastatine de cognitieve uitkomst na aneurysmatische subarachnoïdale bloeding verbetert.<br>" ]
461
475
2,867
Welke databases kunnen gegevens uitwisselen via de API van Matchmaker Exchange?
Matchmaker Exchange (MME) is opgericht om een gefedereerd netwerk te creëren dat databases met genomische en fenotypische gegevens verbindt via een gemeenschappelijke application programming interface (API). Tot op heden kunnen zeven databases gegevens uitwisselen via de API: GeneMatcher, PhenomeCentral, DECIPHER, MyGene2, matchbox, Australian Genomics Health Alliance Patient Archive en Monarch Initiative; laatstgenoemde is inbegrepen voor het matchen van modelorganismen.
[ "Om dergelijke communicatie te vergemakkelijken en de zoektocht naar patiënten of modelorganismen met vergelijkbare fenotypen en varianten in specifieke kandidaatgenen te verbeteren, hebben we de Matchmaker Exchange (MME) ontwikkeld. MME is opgericht om een gefedereerd netwerk te creëren dat databases met genomische en fenotypische gegevens verbindt via een gemeenschappelijke application programming interface (API). Tot op heden kunnen zeven databases gegevens uitwisselen via de API (GeneMatcher, PhenomeCentral, DECIPHER, MyGene2, matchbox, Australian Genomics Health Alliance Patient Archive en Monarch Initiative; laatstgenoemde is inbegrepen voor het matchen van modelorganismen).", "Tot op heden kunnen zeven databases gegevens uitwisselen via de API (GeneMatcher, PhenomeCentral, DECIPHER, MyGene2, matchbox, Australian Genomics Health Alliance Patient Archive en Monarch Initiative; laatstgenoemde is inbegrepen voor het matchen van modelorganismen).", "Tot op heden kunnen zeven databases gegevens uitwisselen via de API (GeneMatcher, PhenomeCentral, DECIPHER, MyGene2, matchbox, Australian Genomics Health Alliance Patient Archive en Monarch Initiative; laatstgenoemde is inbegrepen voor het matchen van modelorganismen)." ]
205
218
2,868
Is pazopanib een effectieve behandeling voor glioblastoom?
Nee. Pazopanib verbetert de overleving van glioblastoompatiënten niet.
[ "RESULTATEN: De zes-maanden progressievrije overlevingspercentages (PFS) in fase II (n = 41) waren respectievelijk 0% en 15% in de PTEN/EGFRvIII-positieve en PTEN/EGFRvIII-negatieve cohorten, wat leidde tot vroege beëindiging.", "Pazopanib als monotherapie verlengde de PFS in deze patiëntengroep niet, maar toonde in situ biologische activiteit aan, zoals aangetoond door radiografische responsen." ]
63
62
2,869
Wat is het doel van de Ottawa Enkelregel?
De Ottawa Enkelregels zijn een klinisch beslissingsinstrument dat wordt gebruikt om onnodige röntgenfoto's bij enkel- en voetletsels te minimaliseren. Het toont de gebieden van gevoeligheid die moeten worden geëvalueerd bij patiënten met enkeltrauma om de noodzaak van beeldvorming te bepalen.
[ "DOELSTELLING: De Ottawa Enkelregels (OAR) zijn een klinisch beslissingsinstrument dat wordt gebruikt om onnodige röntgenfoto's bij enkel- en voetletsels te minimaliseren. De OAR zijn een betrouwbaar hulpmiddel om fracturen uit te sluiten bij kinderen ouder dan 5 jaar wanneer toegepast door artsen.", "ACHTERGROND: De Ottawa Enkelregels, Ottawa Knie Regel en Canadian C-Spine Rule - samen bekend als The Ottawa Rules - zijn een set internationaal gevalideerde klinische beslissingsregels ontwikkeld om onnodige diagnostische beeldvorming op de spoedeisende hulp te verminderen.", "De Ottawa Enkelregel toont de gebieden van gevoeligheid die moeten worden geëvalueerd bij patiënten met enkeltrauma om de noodzaak van beeldvorming te bepalen.", "DOELSTELLING: Het is belangrijk om de LRAR verder te onderzoeken en te vergelijken met de reeds gevalideerde Ottawa Enkelregels (OAR) om mogelijk de zorgkosten te beperken en onnodige stralingsblootstelling te verminderen zonder afbreuk te doen aan de diagnostische nauwkeurigheid.", "ACHTERGROND: Enkelbeslissingsregels zijn ontwikkeld om de patiëntenzorg te versnellen en het aantal röntgenfoto's van enkel en voet te verminderen. Tot nu toe zijn er slechts drie systematische reviews uitgevoerd over de nauwkeurigheid van de Ottawa Enkel- en Voetregels (OAFR) bij volwassenen en kinderen.", "ONGETITELD: De originele en gewijzigde Ottawa Enkelregels (OARs) zijn ontwikkeld als klinische beslissingsregels voor gebruik op de spoedeisende hulp.", "DOEL: De Ottawa enkelregels hebben geleid tot een vermindering van het aantal röntgenfoto's op de Spoedeisende Hulp (SEH).", "Ottawa enkelregels en subjectieve perceptie van de chirurg om de noodzaak van röntgenfoto's te evalueren na een verstuiking van voet en enkel.", "CONCLUSIE: De Ottawa enkelregels toonden een hoge betrouwbaarheid bij het beslissen wanneer röntgenfoto's moeten worden gemaakt bij verstuikingen van voet en/of enkel.", "DOEL\nDe Ottawa enkelregel (OAR) is een klinische beslissingsregel die wordt gebruikt op spoedeisende hulpafdelingen om te identificeren welke patiënten met een acuut enkel-/middenvoetletsel röntgenonderzoek nodig hebben.", "ACHTERGROND\nDe Ottawa Enkelregels, Ottawa Knie Regel en Canadian C-Spine Rule - samen bekend als The Ottawa Rules - zijn een set internationaal gevalideerde klinische beslissingsregels ontwikkeld om onnodige diagnostische beeldvorming op de spoedeisende hulp te verminderen.", "CONCLUSIE De Ottawa enkelregels toonden een hoge betrouwbaarheid bij het beslissen wanneer röntgenfoto's moeten worden gemaakt bij verstuikingen van voet en/of enkel.", "DOEL De Ottawa enkelregel (OAR) is een klinische beslissingsregel die wordt gebruikt op spoedeisende hulpafdelingen om te identificeren welke patiënten met een acuut enkel-/middenvoetletsel röntgenonderzoek nodig hebben.", "Berekenende beslissingen: Ottawa Enkelregel De Ottawa Enkelregel toont de gebieden van gevoeligheid die moeten worden geëvalueerd bij patiënten met enkeltrauma om de noodzaak van beeldvorming te bepalen.", "Nauwkeurigheid van de Ottawa Enkelregels toegepast door niet-arts zorgverleners op een pediatrische spoedeisende hulp.<AbstractText Label=\"OBJECTIVE\" NlmCategory=\"OBJECTIVE\">De Ottawa Enkelregels (OAR) zijn een klinisch beslissingsinstrument dat wordt gebruikt om onnodige röntgenfoto's bij enkel- en voetletsels te minimaliseren." ]
447
470
2,870
Waarvoor wordt CIBERSORT gebruikt?
CIBERSORT is een veelzijdige computationele methode voor het karakteriseren van de celcompositie van complexe weefsels op basis van hun genexpressieprofielen.
[ "We beschreven onlangs CIBERSORT, een veelzijdige computationele methode voor het kwantificeren van celfracties uit bulkweefsel genexpressieprofielen (GEP's).", "We introduceren CIBERSORT, een methode voor het karakteriseren van de celcompositie van complexe weefsels op basis van hun genexpressieprofielen.", "Door CIBERSORT toe te passen, een computationele benadering om leukocytenrepresentatie in bulk tumortranscriptomen af te leiden, identificeerden we complexe associaties tussen 22 verschillende leukocyten subsets en kanker overleving.", "We pasten een gevestigde computationele benadering (CIBERSORT) toe op bulk genexpressieprofielen van bijna 11.000 tumoren om de proporties van 22 subsets van immuuncellen af te leiden. We onderzochten associaties tussen elk celtype en overleving en respons op chemotherapie, waarbij cellulaire proporties als kwartielen werden gemodelleerd.", "Ten slotte karakteriseerden we de algehele overvloed van tumor-infiltrerende immuuncellen in borstkankers uit TCGA en METABRIC met behulp van ESTIMATE en de relatieve frequentie van 22 immuuncel subsets in borstkankers uit METABRIC met behulp van CIBERSORT.", "In dit hoofdstuk geven we een inleiding op de CIBERSORT-methode en illustreren we het gebruik ervan voor het karakteriseren van TIL's in tumormonsters die geprofileerd zijn met microarray of RNA-Seq.", "We beschreven onlangs CIBERSORT, een veelzijdige computationele methode voor het kwantificeren van celfracties uit bulkweefsel genexpressieprofielen (GEP's).", "Door support vector regressie te combineren met voorafgaande kennis van expressieprofielen van gezuiverde leukocyten subsets, kan CIBERSORT nauwkeurig de immuunsamenstelling van een tumorbiopt schatten.", "De belangrijkste beperkingen van deze studie zijn het gebruik van diverse platforms voor het meten van genexpressie, waaronder enkele die nog niet eerder met CIBERSORT zijn gebruikt, en de gecombineerde analyse van verschillende vormen van follow-up over studies heen.", "In deze studie, gebaseerd op een deconvolutie-algoritme (bekend als CIBERSORT) en klinisch geannoteerde expressieprofielen, analyseerden we voor het eerst uitgebreid de tumor-infiltrerende immuuncellen aanwezig in CRC.", "In deze studie, gebaseerd op een metagene-benadering (bekend als CIBERSORT) en een online database, The Cancer Immunome Atlas (https://tcia.at/), analyseerden we uitgebreid de tumor-infiltrerende immuuncellen aanwezig in longadenocarcinoom (LUAD) en longplaveiselcelcarcinoom (LUSC).", "Met dit kader vergelijken we een veelgebruikte state-of-the-art referentie-gebaseerde algoritme (genaamd constrained projection) met twee niet-geconstrueerde benaderingen, waaronder CIBERSORT en een methode gebaseerd op robuuste partiële correlaties.", "CYT werd gedefinieerd door GZMA- en PRF1-expressie, en CIBERSORT werd gebruikt om de intratumorale immuuncelsamenstelling te evalueren.", "CIBERSORT werd gebruikt om het aandeel van 22 immuunceltypen te schatten om hun relatie met pathologische complete respons (pCR), ziektevrije overleving (DFS) en totale overleving (OS) te bestuderen.", "Door CIBERSORT toe te passen, een computationele benadering om leukocytenrepresentatie in bulk tumortranscriptomen af te leiden, identificeerden we complexe associaties tussen 22 verschillende leukocyten subsets en kanker overleving.", "De recent ontwikkelde CIBERSORT-methode maakt immuuncelprofilering mogelijk door deconvolutie van genexpressie-microarraygegevens.", "Onze gegevens tonen aan dat deconvolutie van genexpressiegegevens met CIBERSORT waardevolle informatie biedt over de immuuncelsamenstelling van HCC-patiënten.", "CIBERSORT werd gebruikt om 22 immuunceltypen te onderscheiden uit de tumortranscriptomen.", "We gebruikten CIBERSORT om immuuncelcomponenten te deconvolueren op basis van PBMC's of genomics datasets van volledig bloed bij IPF.", "Nieuwe algoritmen die deconvolutie van bulk tumortranscriptomen mogelijk maken om de relatieve proporties van infiltrerende leukocyten te vinden, zoals CIBERSORT, zouden geschikt moeten zijn voor dit doel, maar in de praktijk falen ze erin γδ T-lymfocyten nauwkeurig te herkennen.", "CIBERSORT zou grootschalige analyse van RNA-mengsels voor cellulaire biomarkers en therapeutische doelen mogelijk moeten maken (http://cibersort.stanford.edu/).", "We introduceren CIBERSORT, een methode voor het karakteriseren van de celcompositie van complexe weefsels op basis van hun genexpressieprofielen.", "Daarnaast werd CIBERSORT in silico deconvolutie gebruikt om fracties van immuuncel subpopulaties binnen de genexpressiedatasets te bepalen.", "We analyseerden IL-34 mRNA-expressie in borstkankercellijnen en borstkankerpatiënten en pasten gevestigde computationele benaderingen toe (CIBERSORT, ESTIMATE, TIMER, TCIA) om genexpressiegegevens van The Cancer Genome Atlas (TCGA) te analyseren.", "Wanneer toegepast op het tellen van hematopoëtische subsets in RNA-mengsels van verse, ingevroren en gefixeerde weefsels, inclusief solide tumoren, presteerde CIBERSORT beter dan andere methoden met betrekking tot ruis, onbekende mengselinhoud en nauw verwante celtypen.", "In dit hoofdstuk geven we een inleiding op de CIBERSORT-methode en illustreren we het gebruik ervan voor het karakteriseren van TIL's in tumormonsters die geprofileerd zijn met microarray of RNA-Seq.<br>", "Door CIBERSORT toe te passen, bepaalden we de relatieve proporties van immuuncellen in 41 gezonde menselijke levermonsters, 305 HCC-monsters en 82 HCC aangrenzende weefsels." ]
686
676
2,871
Zijn de novo-mutaties in regulatorische elementen verantwoordelijk voor neuro-ontwikkelingsstoornissen?
Ja. De novo-mutaties in sterk evolutionair geconserveerde, foetaal hersenactieve elementen zijn significant en specifiek verrijkt bij neuro-ontwikkelingsstoornissen. Er wordt geschat dat, over het hele genoom, 1-3% van de patiënten zonder een diagnostische coderende variant pathogene de novo-mutaties draagt in foetaal hersenactieve regulatorische elementen en dat slechts 0,15% van alle mogelijke mutaties binnen sterk geconserveerde foetaal hersenactieve elementen neuro-ontwikkelingsstoornissen veroorzaakt met een dominant mechanisme.
[ "De rol van de novo-mutaties in regulatorische elementen die genen beïnvloeden die geassocieerd zijn met ontwikkelingsstoornissen, of andere genen, is in wezen onontgonnen gebleven. We identificeerden de novo-mutaties in drie klassen van veronderstelde regulatorische elementen bij bijna 8.000 patiënten met ontwikkelingsstoornissen. Hier tonen we aan dat de novo-mutaties in sterk evolutionair geconserveerde, foetaal hersenactieve elementen significant en specifiek verrijkt zijn bij neuro-ontwikkelingsstoornissen. We identificeerden een significante tweevoudige verrijking van herhaaldelijk gemuteerde elementen. We schatten dat, over het hele genoom, 1-3% van de patiënten zonder een diagnostische coderende variant pathogene de novo-mutaties draagt in foetaal hersenactieve regulatorische elementen en dat slechts 0,15% van alle mogelijke mutaties binnen sterk geconserveerde foetaal hersenactieve elementen neuro-ontwikkelingsstoornissen veroorzaakt met een dominant mechanisme.", "We schatten dat, over het hele genoom, 1-3% van de patiënten zonder een diagnostische coderende variant pathogene de novo-mutaties draagt in foetaal hersenactieve regulatorische elementen en dat slechts 0,15% van alle mogelijke mutaties binnen sterk geconserveerde foetaal hersenactieve elementen neuro-ontwikkelingsstoornissen veroorzaakt met een dominant mechanisme.", "Hier tonen we aan dat de novo-mutaties in sterk evolutionair geconserveerde, foetaal hersenactieve elementen significant en specifiek verrijkt zijn bij neuro-ontwikkelingsstoornissen.", "We schatten dat, over het hele genoom, 1-3% van de patiënten zonder een diagnostische coderende variant pathogene de novo-mutaties draagt in foetaal hersenactieve regulatorische elementen en dat slechts 0,15% van alle mogelijke mutaties binnen sterk geconserveerde foetaal hersenactieve elementen neuro-ontwikkelingsstoornissen veroorzaakt met een dominant mechanisme.", "Hier tonen we aan dat de novo-mutaties in sterk evolutionair geconserveerde, foetaal hersenactieve elementen significant en specifiek verrijkt zijn bij neuro-ontwikkelingsstoornissen.", "De novo-mutaties in regulatorische elementen bij neuro-ontwikkelingsstoornissen. We schatten eerder dat 42% van de patiënten met ernstige ontwikkelingsstoornissen pathogene de novo-mutaties draagt in coderende sequenties." ]
343
339
2,872
Welke molecule wordt door Olaratumab gericht?
Olaratumab is een recombinant humaan monoklonaal antilichaam dat bindt aan de platelet-derived growth factor receptor-α (PDGFRα). Het wordt gebruikt voor de behandeling van zachte weefsel sarcoom.
[ "Populatie farmacokinetische modellering van Olaratumab, een anti-PDGFRα humaan monoklonaal antilichaam, bij patiënten met gevorderde en/of gemetastaseerde kanker.", "ACHTERGROND EN DOELSTELLINGEN: Olaratumab is een recombinant humaan monoklonaal antilichaam dat bindt aan platelet-derived growth factor receptor-α (PDGFRα).", "Conclusies: Over het geheel genomen geven deze gegevens aan dat olaratumab, alleen en in combinatie met de standaardzorg, de groei van sommige preklinische PDGFRα-expressieve pediatrische bot- en zachte weefsel tumormodellen blokkeert.", "Recente gerandomiseerde fase II-studiegegevens hebben aangetoond dat de toevoeging van olaratumab, een nieuw monoklonaal antilichaam tegen platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGFRα), aan doxorubicine een ongekende verbetering van de algehele overleving geeft aan patiënten met anthracycline-naïeve gevorderde zachte weefsel sarcoom.", "Hoewel preklinische gegevens aantonen dat olaratumab specifiek PDGFRα-gemedieerde oncogene signalering remt met bijbehorende antitumoreffecten, suggereert het ontbreken van correlatie tussen farmacodynamische markers van PDGFRα-remming en klinisch voordeel van olaratumab andere mechanismen dan alleen modulatie van downstream PDGFRα moleculaire routes.", "Lartruvo® (olaratumab) is een volledig humaan immunoglobuline G subklasse 1 (IgG1) monoklonaal antilichaam dat platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGFRα) remt.", "Olaratumab (Lartruvo™) is een volledig humaan IgG1 monoklonaal antilichaam gericht tegen de humane platelet-derived growth factor (PDGF) receptor α (PDGFRα).", "Olaratumab werkt door selectief te binden aan PDGFRα, waardoor PDGF-ligandbinding wordt geblokkeerd en PDGFRα-activatie en downstream signalering worden geremd.", "Olaratumab is een humaan antiplatelet-derived growth factor receptor α monoklonaal antilichaam dat antitumorale activiteit heeft in humane sarcoom xenograftmodellen.", "DOEL Olaratumab is een recombinant humaan IgG1 monoklonaal antilichaam tegen PGDFRα.", "Recentelijk toonde remming van platelet-derived growth factor receptor (PDGFR)-α door het monoklonale antilichaam olaratumab veelbelovende klinische activiteit.", "Olaratumab (IMC-3G3) is een volledig humaan anti-PDGFRα monoklonaal antilichaam.", "Olaratumab is een gehumaniseerd IgG1 monoklonaal antilichaam dat de platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGFRα) blokkeert.", "Lartruvo® (olaratumab) is een volledig humaan immunoglobuline G subklasse 1 (IgG1) monoklonaal antilichaam dat platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGFRα) remt.", "Olaratumab (IMC-3G3) is een volledig humaan IgG1 monoklonaal antilichaam dat selectief bindt aan het externe domein van humane platelet-derived growth factor receptor-α met hoge affiniteit en ligandbinding blokkeert.", "Olaratumab is een volledig humaan IgG1-type anti-PDGFR-α monoklonaal antilichaam met een hoge affiniteit en een lage 50% remmingsconcentratie (IC50).", "Olaratumab (IMC-3G3) is een volledig humaan monoklonaal antilichaam dat selectief bindt aan humane PDGFRα en ligandbinding blokkeert.", "Olaratumab is een volledig humaan IgG1 monoklonaal antilichaam dat bindt aan platelet-derived growth factor receptor α (PDGFR-α) en zo de binding van zijn liganden en receptoractivatie voorkomt.", "ACHTERGROND EN DOELSTELLINGEN Olaratumab is een recombinant humaan monoklonaal antilichaam dat bindt aan platelet-derived growth factor receptor-α (PDGFRα).", "Olaratumab, een monoklonaal antilichaam gericht tegen humane platelet-derived growth factor receptor α, plus doxorubicine verbeterde significant de algehele overleving bij patiënten met gevorderd zachte weefsel sarcoom (STS) in een eerdere fase 1b/2 gerandomiseerde studie.", "Olaratumab (LY3012207/IMC-3G3) is een humaan mAb dat exclusief bindt aan PDGFRα en recent versnelde FDA-goedkeuring en voorwaardelijke EMA-goedkeuring ontving voor de behandeling van gevorderde volwassen sarcoompatiënten in combinatie met doxorubicine.", "Het belangrijkste is de combinatie van het standaard cytotoxische middel doxorubicine plus de platelet-derived growth factor receptor (PDGFR) remmer olaratumab, hoewel definitieve resultaten van een fase III-studie worden verwacht.", "DATA SYNTHESIS Olaratumab is een humaan antiplatelet-derived growth factor receptor α monoklonaal antilichaam.", "Lartruvo (olaratumab) is een monoklonaal antilichaam tegen het extracellulaire domein van PDGFRA.", "Met behulp van fosfo-specifieke antilichamen tonen we aan dat olaratumab PDGFRα-activatie als reactie op PDGF-BB vermindert, en de fosforylering van extracellular signal-regulated kinase 1 en 2, Elk-1, p38, Akt, focal adhesion kinase, mechanistic target of rapamycin, C10 regulator of kinase II, en C10 regulator of kinase-like vermindert, wat suggereert dat PDGFRα bijdraagt aan mitogenese en actine reorganisatie via diverse downstream effectors.", "Olaratumab (IMC-3G3) is een volledig humaan anti-PDGFRα monoklonaal antilichaam.", "<AbstractText Label=\"DATA SYNTHESIS\" NlmCategory=\"RESULTS\">Olaratumab is een humaan antiplatelet-derived growth factor receptor α monoklonaal antilichaam.", "Olaratumab: Eerste wereldwijde goedkeuring. Olaratumab (Lartruvo™) is een volledig humaan IgG1 monoklonaal antilichaam gericht tegen de humane platelet-derived growth factor (PDGF) receptor α (PDGFRα).", "Olaratumab is een humaan antiplatelet-derived growth factor receptor α monoklonaal antilichaam dat antitumorale activiteit heeft in humane sarcoom xenograftmodellen.", "Olaratumab werkt door selectief te binden aan PDGFRα, waardoor PDGF-ligandbinding wordt geblokkeerd en PDGFRα-activatie en downstream signalering worden geremd.", "Fase I-studie van olaratumab bij Japanse patiënten met gevorderde solide tumoren. Olaratumab (IMC-3G3) is een volledig humaan IgG1 monoklonaal antilichaam dat selectief bindt aan het externe domein van humane platelet-derived growth factor receptor-α met hoge affiniteit en ligandbinding blokkeert.", "Populatie farmacokinetische modellering van Olaratumab, een anti-PDGFRα humaan monoklonaal antilichaam, bij patiënten met gevorderde en/of gemetastaseerde kanker.<AbstractText Label=\"ACHTERGROND EN DOELSTELLINGEN\">Olaratumab is een recombinant humaan monoklonaal antilichaam dat bindt aan platelet-derived growth factor receptor-α (PDGFRα).", "Een fase Ib/gerandomiseerde fase II-studie van doxorubicine met of zonder het monoklonale antilichaam tegen PDGFR-α, olaratumab, toonde een significant verschil in mediane algehele overleving in het voordeel van de olaratumab-arm." ]
772
772
2,873
Wat is PANDAS-ziekte?
PANDAS staat voor (pediatric autoimmune neuropsychiatric disorders associated with streptococcal infection) en wordt verondersteld het resultaat te zijn van een verstoorde immuunrespons na een infectie die neuropsychiatrische symptomen veroorzaakt.
[ "Langdurige uitkomsten van kinderen met pediatric autoimmune neuropsychiatric disorder associated with streptococcal infections (PANDAS)", "Antibiotica zijn uitgebreid gebruikt door clinici om patiënten met PANDAS of PANS (pediatric autoimmune neuropsychiatric disorders associated with streptococcal infections) te behandelen.", "De pediatric autoimmune neuropsychiatric disorders associated with streptococcal infection (PANDAS)", "DOELSTELLINGEN Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric Disorders Associated with Streptococcal Infections (PANDAS) is een nieuw gedefinieerde ziekte in de neuropsychiatrie en ontstaat door een auto-immuunmechanisme na een infectie met Group A Beta Hemolytic Streptococcus (GABHS).", "De pediatric autoimmune neuropsychiatric disorders associated with streptococcal infections (PANDAS) worden in de basis gekenmerkt door obsessief-compulsieve symptomen en/of tics die worden uitgelokt door infecties met groep-A beta-hemolytische Streptococcus.", "PANDAS-syndroom (Paediatric Autoimmune Neuropsychiatric Disorders Associated with Streptococcus) is een zeldzame ziekte die in 1998 werd beschreven.", "PANDAS (pediatric autoimmune neuropsychiatric disorders associated with streptococcal infection) is een goed gedefinieerd syndroom waarbij tics (motorisch en/of vocaal) en/of obsessief-compulsieve stoornis consistent verergeren in temporele correlatie met een infectie door groep A beta-hemolytische streptokokken.", "Recentelijk is er interesse voor een subtype van obsessief-compulsieve stoornis (OCD) en ticstoornissen die gezamenlijk bekendstaan als Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric Disorders Associated with Streptococcus (PANDAS), waarvan wordt aangenomen dat het secundair is aan auto-immuniteit van het centraal zenuwstelsel (CZS) die optreedt in relatie tot een infectie met groep A streptokokken.", "DOELSTELLINGEN Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric Disorders Associated with Streptococcal Infections (PANDAS) is een nieuw gedefinieerde ziekte in de neuropsychiatrie en ontstaat door een auto-immuunmechanisme na een infectie met Group A Beta Hemolytic Streptococcus (GABHS).", "Diagnose en behandeling van de PANDAS (pediatric autoimmune neuropsychiatric disorders associated with streptococcal infections) variant van het Gilles de la Tourette-syndroom (GTS) en obsessief-compulsieve stoornis (OCD) met aanvang in de kindertijd zijn nog steeds controversiële kwesties.", "ACHTERGROND Pediatric autoimmune neuropsychiatric disorders associated with streptococcal infections (PANDAS) zijn immuungemedieerde ziekten die worden gekenmerkt door obsessief-compulsieve symptomen en/of tics die worden uitgelokt door infecties met groep A Streptococcus.", "'Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric Disorders Associated with Streptococcal Infections' (PANDAS) identificeerde een unieke subgroep patiënten met plotselinge aanvang van obsessief-compulsieve stoornis (OCD)-symptomen die klinisch gerelateerd zijn aan Streptococcus-infectie en vergezeld gaan van neuropsychologische en motorische symptomen.'" ]
337
363
2,874
Worden fagosomale eiwitten geubiquitineerd?
Ja, fagosomale eiwitten worden geubiquitineerd, en ubiquitinering bleek noodzakelijk te zijn voor de vorming van zure multivesiculaire structuren.
[ "Fagosomale eiwitten worden geubiquitineerd, en ubiquitinering bleek noodzakelijk te zijn voor de vorming van zure multivesiculaire structuren.", "De membranen van de bacteriële fagosoom zijn verrijkt met geubiquitineerde eiwitten op een wijze die het Dot/Icm type IV secretiesysteem vereist, wat wijst op de betrokkenheid van effectors bij de manipulatie van het ubiquitineringsmechanisme van de gastheer." ]
69
73
2,875
Een groepsimmuniteit van welk percentage van de bevolking is vereist om sporadische uitbraken te voorkomen?
Een groepsimmuniteit van 95% van de bevolking is vereist om sporadische uitbraken te voorkomen.
[ "Een groepsimmuniteit van meer dan 95% is vereist om sporadische virale uitbraken in een bevolking te voorkomen.", "Echter, een groepsimmuniteit van meer dan 95% is vereist om sporadische virale uitbraken in een bevolking te voorkomen.", "Echter, een groepsimmuniteit van meer dan 95% is vereist om sporadische virale uitbraken in een bevolking te voorkomen." ]
72
78
2,876
Verbetert tremelimumab de overleving van mesothelioompatiënten?
Nee. Tremelimumab verlengde de totale overleving niet significant vergeleken met placebo bij patiënten met eerder behandeld kwaadaardig mesothelioom.
[ "ACHTERGROND: Tremelimumab, een monoklonaal antilichaam tegen CTLA4, toonde aanvankelijk goede activiteit wanneer het alleen werd gebruikt bij patiënten met mesothelioom, maar verbeterde de totale overleving van patiënten die faalden op eerstelijns- of tweedelijnschemotherapie niet vergeleken met placebo in de DETERMINE-studie.", "INTERPRETATIE: De combinatie van tremelimumab en durvalumab leek actief te zijn, met een goed veiligheidsprofiel bij patiënten met mesothelioom, wat verdere verkenning rechtvaardigt.", "Biologische en klinische overwegingen sluiten het gebruik van tremelimumab als monotherapie voor MM uit en, meer algemeen, is het gebruik van immuuncheckpointremmers voor MM nog grotendeels twijfelachtig en niet ondersteund door bewijs.", "Op de datum van gegevensafsluiting (24 januari 2016) waren 307 (80%) van de 382 patiënten overleden in de tremelimumab-groep en 154 (81%) van de 189 patiënten in de placebogroep. De mediane totale overleving in de intention-to-treat populatie verschilde niet tussen de behandelingsgroepen: 7,7 maanden (95% BI 6,8-8,9) in de tremelimumab-groep en 7,3 maanden (5,9-8,7) in de placebogroep (hazard ratio 0,92 [95% BI 0,76-1,12], p=0,41).", "INTERPRETATIE: Tremelimumab verlengde de totale overleving niet significant vergeleken met placebo bij patiënten met eerder behandeld kwaadaardig mesothelioom.", "ACHTERGROND Tremelimumab, een monoklonaal antilichaam tegen CTLA4, toonde aanvankelijk goede activiteit wanneer het alleen werd gebruikt bij patiënten met mesothelioom, maar verbeterde de totale overleving van patiënten die faalden op eerstelijns- of tweedelijnschemotherapie niet vergeleken met placebo in de DETERMINE-studie.", "INTERPRETATIE Tremelimumab verlengde de totale overleving niet significant vergeleken met placebo bij patiënten met eerder behandeld kwaadaardig mesothelioom.", "De mediane totale overleving in de intention-to-treat populatie verschilde niet tussen de behandelingsgroepen: 7,7 maanden (95% BI 6,8-8,9) in de tremelimumab-groep en 7,3 maanden (5,9-8,7) in de placebogroep (hazard ratio 0,92 [95% BI 0,76-1,12], p=0,41).", "ACHTERGROND Tremelimumab, een monoklonaal antilichaam tegen CTLA4, toonde aanvankelijk goede activiteit wanneer het alleen werd gebruikt bij patiënten met mesothelioom, maar verbeterde de totale overleving van patiënten die faalden op eerstelijns- of tweedelijnschemotherapie niet vergeleken met placebo in de DETERMINE-studie.", "INTERPRETATIE Tremelimumab verlengde de totale overleving niet significant vergeleken met placebo bij patiënten met eerder behandeld kwaadaardig mesothelioom.", "De mediane totale overleving in de intention-to-treat populatie verschilde niet tussen de behandelingsgroepen: 7,7 maanden (95% BI 6,8-8,9) in de tremelimumab-groep en 7,3 maanden (5,9-8,7) in de placebogroep (hazard ratio 0,92 [95% BI 0,76-1,12], p=0,41).", "<b>ACHTERGROND</b>: Tremelimumab, een monoklonaal antilichaam tegen CTLA4, toonde aanvankelijk goede activiteit wanneer het alleen werd gebruikt bij patiënten met mesothelioom, maar verbeterde de totale overleving van patiënten die faalden op eerstelijns- of tweedelijnschemotherapie niet vergeleken met placebo in de DETERMINE-studie." ]
428
414
2,877
Kan enasidenib worden gebruikt voor de behandeling van acute myeloïde leukemie?
Ja, enasidenib is goedgekeurd voor de behandeling van volwassenen met teruggekeerde en refractaire acute myeloïde leukemie met een IDH2-mutatie.
[ "In augustus 2017 heeft de Amerikaanse Food and Drug Administration (FDA) enasidenib (Idhifa, Celgene/Agios) goedgekeurd voor volwassenen met teruggekeerde en refractaire acute myeloïde leukemie (AML) met een IDH2-mutatie." ]
59
56
2,878
Welke membraaneiwitten vormen de TAM-familie van receptor tyrosine kinases (RTK's)?
Tyro3, Axl en Mer zijn integrale membraaneiwitten die de TAM-familie van receptor tyrosine kinases (RTK's) vormen.
[ "TAM-familie RTK's AXL en Mer (MerTK).", "Deregulatie van de TAM (TYRO3, AXL en MERTK", "TAM-familieleden AXL of TYRO3", "receptoren van de Tyro3/Axl/Mer (TAM) familie van receptor tyrosine kinases (RTK's)", "Tyro-3, Axl en Mer vormen de TAM-familie van receptor tyrosine kinases (RTK's) die worden gekenmerkt door een geconserveerde sequentie binnen het kinase-domein en extracellulaire domeinen die lijken op adhesiemoleculen.", "De TYRO3, AXL (ook bekend als UFO) en MERTK (TAM) familie van receptor tyrosine kinases (RTK's) worden abnormaal tot expressie gebracht in meerdere hematologische en epitheliale maligniteiten.", "Gas6 werd in 1993 gekloond en gekarakteriseerd en bleek vergelijkbaar met het plasma-antistollingseiwit S. Kort daarna werd het herkend als een groeifactor-achtig molecuul, omdat het interageerde met receptor tyrosine kinases (RTK's) van de TAM-familie; Tyro3, Axl en MerTK.", "De TAM-subfamilie van receptor tyrosine kinases (RTK's) bevat drie humane eiwitten van therapeutisch belang, Axl, Mer en Tyro3.", "Steeds meer bewijs toont aan dat de TAM (TYRO3, AXL en MERTK) familie van RTK's (receptor tyrosine kinases), die tot expressie komt in macrofagen, ontstekingsreacties vermindert via een negatieve terugkoppelingslus.", "Onder de TAM-familie van RTK's induceert AXL (AXL receptor tyrosine kinase) alleen autophagie in macrofagen na interactie met zijn ligand, GAS6 (growth arrest specific 6).", "Een reeks recente studies bevestigt nu het idee dat fosfatidylserine (PtdSer), een veelvoorkomend fosfolipidebestanddeel van membraan-bilayers, op vergelijkbare wijze wordt hergebruikt als signaal tussen cellen en dat de liganden en receptoren van de Tyro3/Axl/Mer (TAM) familie van receptor tyrosine kinases (RTK's) prominente transducers van dit signaal zijn.", "De TAM-familie: fosfatidylserine-sensende receptor tyrosine kinases die ontsporen bij kanker. De TYRO3, AXL (ook bekend als UFO) en MERTK (TAM) familie van receptor tyrosine kinases (RTK's) worden abnormaal tot expressie gebracht in meerdere hematologische en epitheliale maligniteiten.", "De TAM-familie van RTK's, bestaande uit Tyro3, Axl en MerTK, wordt prominent tot expressie gebracht tijdens de ontwikkeling en functie van het centrale zenuwstelsel (CZS).", "De TAM-familie van RTK's, bestaande uit Tyro3, Axl en MerTK, wordt prominent tot expressie gebracht tijdens de ontwikkeling en functie van het centrale zenuwstelsel (CZS)." ]
355
341
2,879
Wat zijn de effecten van de verwijdering van alle drie de Pcdh-clusters (triclusterverwijdering) bij muizen?
Multicluster Pcdh-diversiteit is vereist voor de assemblage van het olfactorische neurale circuit bij muizen. De vertebraten geclusterde protocadherine (Pcdh) celoppervlakte-eiwitten worden gecodeerd door drie nauw gekoppelde genclusters (Pcdhα, Pcdhβ en Pcdhγ). Hoewel de verwijdering van individuele Pcdh-clusters subtiele fenotypische gevolgen had, leidde het verlies van alle drie de clusters (triclusterverwijdering) tot een ernstig axonaal vertakkingsdefect en verlies van zelfvermijding.
[ "Multicluster Pcdh-diversiteit is vereist voor de assemblage van het olfactorische neurale circuit bij muizen.", "De vertebraten geclusterde protocadherine (Pcdh) celoppervlakte-eiwitten worden gecodeerd door drie nauw gekoppelde genclusters (Pcdhα, Pcdhβ en Pcdhγ). Hier tonen we aan dat alle drie de genclusters functioneel samenwerken om individuele olfactorische sensorische neuronen (OSN's) van muizen te voorzien van de celoppervlaktediversiteit die nodig is voor hun assemblage in verschillende glomeruli in de olfactorische bol. Hoewel de verwijdering van individuele Pcdh-clusters subtiele fenotypische gevolgen had, leidde het verlies van alle drie de clusters (triclusterverwijdering) tot een ernstig axonaal vertakkingsdefect en verlies van zelfvermijding.", "Hoewel de verwijdering van individuele Pcdh-clusters subtiele fenotypische gevolgen had, leidde het verlies van alle drie de clusters (triclusterverwijdering) tot een ernstig axonaal vertakkingsdefect en verlies van zelfvermijding.", "Hier tonen we aan dat alle drie de genclusters functioneel samenwerken om individuele olfactorische sensorische neuronen (OSN's) van muizen te voorzien van de celoppervlaktediversiteit die nodig is voor hun assemblage in verschillende glomeruli in de olfactorische bol.", "Hoewel de verwijdering van individuele <i>Pcdh</i>-clusters subtiele fenotypische gevolgen had, leidde het verlies van alle drie de clusters (triclusterverwijdering) tot een ernstig axonaal vertakkingsdefect en verlies van zelfvermijding.", "Hier tonen we aan dat alle drie de genclusters functioneel samenwerken om individuele olfactorische sensorische neuronen (OSN's) van muizen te voorzien van de celoppervlaktediversiteit die nodig is voor hun assemblage in verschillende glomeruli in de olfactorische bol." ]
291
293
2,880
Wat is CPX351?
CPX-351, een nieuw liposomaal formulering die cytarabine en daunorubicine in een molaire verhouding van 5:1 inkapselt, heeft veelbelovende werkzaamheid getoond, wat heeft geleid tot recente goedkeuring door de Amerikaanse FDA voor eerstelijnsbehandeling van patiënten met therapiegerelateerde AML en AML met myelodysplasie-gerelateerde veranderingen op basis van een grote multicenter fase III klinische studie.
[ "CPX-351, een nieuw liposomaal formulering die cytarabine en daunorubicine in een molaire verhouding van 5:1 inkapselt, heeft veelbelovende werkzaamheid getoond, wat heeft geleid tot recente goedkeuring door de Amerikaanse FDA voor eerstelijnsbehandeling van patiënten met therapiegerelateerde AML en AML met myelodysplasie-gerelateerde veranderingen op basis van een grote multicenter fase III klinische studie." ]
93
105
2,881
Is collageen het meest voorkomende menselijke eiwit?
Ja, collageen is de meest voorkomende eiwitfamilie bij zoogdieren.
[ "Als het meest voorkomende eiwit in het lichaam is collageen essentieel voor het behoud van de normale structuur en sterkte van bindweefsel, zoals botten, huid, kraakbeen en bloedvaten.", "Collageen is de meest voorkomende eiwitfamilie bij zoogdieren.", "Collageen is een fibrillair eiwit dat de conjunctieve en bindweefsels in het menselijk lichaam vormt, met name de huid, gewrichten en botten. Deze molecule is een van de meest voorkomende in veel levende organismen vanwege zijn verbindende rol in biologische structuren." ]
94
89
2,882
Welke micro-RNA's zijn nuttig bij de diagnose en prognose van hartfalen?
In het bijzonder lijken miR-214, miR-423-5p veelbelovend voor de diagnose, prognose en behandeling van HF-patiënten.
[ "In deze review bespreken we de rol van miR-214 bij verschillende hartziekten, waaronder ischemische hartaandoeningen, cardiale hypertrofie, pulmonale arteriële hypertensie (PAH), angiogenese na vaatletsel en hartfalen.", "Evenzo zijn serumspiegels van circulerende miRNA's zoals miR-423-5p geëvalueerd als potentiële biomarkers bij de diagnose en prognose van hartfalen.", "Serumspiegels van circulerende miRNA's zoals miR-423-5p worden geëvalueerd als potentiële biomarkers bij de diagnose en prognose van hartfalen.", "Evenzo zijn serumspiegels van circulerende miRNA's zoals miR-423-5p geëvalueerd als potentiële biomarkers bij de diagnose en prognose van hartfalen." ]
121
103
2,883
Wat is ivosidenib?
AG-120 (ivosidenib) is een remmer van het IDH1-mutante enzym die een sterke verlaging van 2-HG vertoont in tumormodellen en het vermogen heeft om differentiatie van primaire AML-monsters van patiënten ex vivo te bewerkstelligen. Voorlopige gegevens uit fase 1 klinische onderzoeken waarbij patiënten met kankers met een IDH1-mutatie werden opgenomen, geven aan dat AG-120 een aanvaardbaar veiligheidsprofiel en klinische activiteit heeft.
[ "Hier rapporteren we de ontdekking van AG-120 (ivosidenib), een remmer van het IDH1-mutante enzym die een sterke verlaging van 2-HG vertoont in tumormodellen en het vermogen heeft om differentiatie van primaire AML-monsters van patiënten ex vivo te bewerkstelligen. Voorlopige gegevens uit fase 1 klinische onderzoeken waarbij patiënten met kankers met een IDH1-mutatie werden opgenomen, geven aan dat AG-120 een aanvaardbaar veiligheidsprofiel en klinische activiteit heeft." ]
120
126
2,884
Lijst van eiwitten die interageren met Star-PAP
Fosforylering reguleert de interactie tussen Star-PAP en PIPKIα en stuurt de specificiteit naar mRNA-doelen.
[ "Star-PAP is direct geassocieerd met de subeenheden 160 en 73 van het cleavage en polyadenyleringsspecificiteitsfactor (CPSF) en ook met het gerichte pre-mRNA.", "We tonen aan dat Larp7 interacteert met een poly(A) polymerase Star-PAP om de stabiliteit van Lin28 mRNA te behouden.", "Star-PAP en PIPKIalpha functioneren samen in een complex", "Fosforylering reguleert de interactie tussen Star-PAP en PIPKIα en stuurt de specificiteit naar mRNA-doelen.", "We tonen aan dat Larp7 interacteert met een poly(A) polymerase Star-PAP om de stabiliteit van Lin28 mRNA te behouden.", "Star-PAP is direct geassocieerd met de subeenheden 160 en 73 van het cleavage en polyadenyleringsspecificiteitsfactor (CPSF) en ook met het gerichte pre-mRNA." ]
99
118
2,885
Beschrijf de symptomen van het Visual snow-syndroom.
Visual snow (VS) is een constante visuele stoornis die wordt beschreven als flikkerende stippen die het gehele gezichtsveld bezetten. Onlangs werd het gekarakteriseerd als het bepalende kenmerk van een VS-syndroom (VSS), dat palinopsie, fotofobie, fotopsieën, entoptische fenomenen, nyctalopie en tinnitus omvat.
[ "DOEL VAN DE REVIEW: We geven een overzicht van de neurologische aandoening die bekend staat als het visual snow-syndroom. Patiënten die door deze chronische aandoening worden getroffen, hebben last van een pan-veld visuele stoornis die wordt beschreven als kleine flikkerende stippen, die lijken op de statische ruis van een niet-afgestemde televisie.", "ACHTERGROND: Visual snow is een aanhoudende visuele stoornis die wordt gekenmerkt door snel flikkerende stippen door het gehele gezichtsveld.", "RECENTE VINDINGEN: Visual snow is een aandoening waarbij patiënten constante, ontelbare flikkerende stippen door het gehele gezichtsveld zien, vergelijkbaar met \"tv-ruis\".", "ACHTERGROND: Visual snow (VS) is een constante visuele stoornis die wordt beschreven als flikkerende stippen die het gehele gezichtsveld bezetten. Onlangs werd het gekarakteriseerd als het bepalende kenmerk van een VS-syndroom (VSS), dat palinopsie, fotofobie, fotopsieën, entoptische fenomenen, nyctalopie en tinnitus omvat.", "Patiënten met het visual snow-syndroom (VS) lijden aan een invaliderende continue visuele stoornis met onbekend mechanisme.", "Achtergrond Het symptoom \"visual snow\" beschrijft de continue waarneming van kleine flikkerende stippen binnen het gehele gezichtsveld van beide ogen.", "Visual snow is een symptoom dat wordt beschreven als de continue waarneming van kleine flikkerende stippen in het gehele gezichtsveld, vergelijkbaar met de statische ruis van een analoge televisie.", "We bespreken ook de theorieën over de pathofysiologische mechanismen van visual snow, evenals de huidige benadering van behandeling.<br><b>RECENTE VINDINGEN</b>: Visual snow is een aandoening waarbij patiënten constante, ontelbare flikkerende stippen door het gehele gezichtsveld zien, vergelijkbaar met \"tv-ruis\".", "<b>SAMENVATTING</b>: Visual snow is een symptoom dat wordt beschreven als de continue waarneming van kleine flikkerende stippen in het gehele gezichtsveld, vergelijkbaar met de statische ruis van een analoge televisie." ]
295
304
2,886
Wat is de rol van het Leucosporidium ijs-bindend eiwit
Arctische gist Leucosporidium sp. produceert een geglycosyleerd ijs-bindend eiwit (LeIBP) met een molecuulmassa van ongeveer 25 kDa, dat het vriespunt onder het smeltpunt kan verlagen zodra het aan ijs bindt. IJs-bindende eiwitten (IBP's) remmen de ijsgroei door directe interactie met ijskristallen, waardoor het overleven van polaire organismen in extreem koude omgevingen mogelijk wordt.
[ "IJs-bindende eiwitten (IBP's) remmen de ijsgroei door directe interactie met ijskristallen, waardoor het overleven van polaire organismen in extreem koude omgevingen mogelijk wordt.", "IJs-bindende eiwitten (IBP's) kunnen binden aan de ijskristal en de groei ervan remmen. Omdat deze eigenschap van IBP's de overleving van cellen tijdens vries-dooicycli kan verhogen, hebben IBP's de aandacht getrokken van industrieën vanwege hun potentieel gebruik in biotechnologische toepassingen", "Arctische gist Leucosporidium sp. produceert een geglycosyleerd ijs-bindend eiwit (LeIBP) met een molecuulmassa van ongeveer 25 kDa, dat het vriespunt onder het smeltpunt kan verlagen zodra het aan ijs bindt.", "IJs-bindende eiwitten (IBP's) trekken aanzienlijke belangstelling vanwege hun eigenschap om ijsgroei en herkristallisatie te remmen." ]
174
165
2,887
Is het enzym ERAP2 geassocieerd met de ziekte birdshot chorioretinopathie?
Ja, BSCR wordt ook geassocieerd met endoplasmatisch reticulum aminopeptidase 2 (ERAP2), een enzym dat betrokken is bij de verwerking van HLA klasse I liganden.
[ "Allelspecifieke veranderingen in het peptidoom liggen ten grondslag aan de gezamenlijke associatie van HLA-A*29:02 en endoplasmatisch reticulum aminopeptidase 2 (ERAP2) met birdshot chorioretinopathie.", "BSCR wordt ook geassocieerd met endoplasmatisch reticulum aminopeptidase 2 (ERAP2), een enzym betrokken bij de verwerking van HLA klasse I liganden, wat het A*29:02 peptidoom bij deze ziekte impliceert.", "Een genoomwijde associatiestudie identificeert een functioneel ERAP2 haplotype geassocieerd met birdshot chorioretinopathie." ]
86
94
2,888
Vanaf september 2018 wordt welke machine learning-algoritme gebruikt voor het detecteren van hartritmestoornissen uit een korte single-lead ECG opgenomen door een draagbaar apparaat?
Support Vector Machines (SVM) kunnen worden gebruikt voor het detecteren van hartritmestoornissen uit een ECG opgenomen door een draagbaar apparaat.
[ "SVM-benadering voor het detecteren van hartritmestoornissen in korte single-lead ECG opgenomen door een draagbaar apparaat", "Multi-stage SVM-benadering voor het detecteren van hartritmestoornissen in korte single-lead ECG opgenomen door een draagbaar apparaat.<AbstractText Label=\"OBJECTIVE\" NlmCategory=\"OBJECTIVE\">Het gebruik van draagbare ECG-apparaten voor het screenen op hartritmestoornissen is beperkt vanwege slechte signaalkwaliteit, een klein aantal leads en korte opnames, wat leidt tot onjuiste herkenning van pathologische gebeurtenissen." ]
105
102
2,889
Verlengt Panitumumab de overleving van patiënten met galwegkanker?
Nee. Panitumumab in combinatie met chemotherapie verbetert de overleving van patiënten met galwegkanker niet.
[ "Panitumumab in combinatie met gemcitabine en oxaliplatin verlengt de overleving niet bij patiënten met gevorderde galwegkanker met wild-type KRAS: een gerandomiseerde fase 2-studie (Vecti-BIL studie).", "CONCLUSIES: Panitumumab in combinatie met chemotherapie verbetert de ORR, PFS en OS niet bij patiënten met gevorderde galwegkanker met KRAS wild-type.", "Er werden geen verschillen in overleving waargenomen: de mediane totale overleving was 9,9 maanden in arm A en 10,2 maanden in arm B (P = .42). In een subgroepanalyse werden geen verschillen in PFS waargenomen afhankelijk van de locatie van de primaire tumor; patiënten met intrahepatische cholangiocarcinoom behandeld met panitumumab kunnen een overlevingsvoordeel hebben gehad vergeleken met de controlegroep (15,1 versus 11,8 maanden, P = .13).", "CONCLUSIES Panitumumab in combinatie met chemotherapie verbetert de ORR, PFS en OS niet bij patiënten met gevorderde galwegkanker met KRAS wild-type.", "CONCLUSIES Panitumumab in combinatie met chemotherapie verbetert de ORR, PFS en OS niet bij patiënten met gevorderde galwegkanker met KRAS wild-type.", "Ondanks vele klinische onderzoeken met moleculair gerichte middelen zoals erlotinib, cetuximab, panitumumab, bevacizumab, sorafenib, cediranib, trametinib en vandetanib, is geen enkel middel effectief gebleken voor gevorderde galwegkanker.", "Het toevoegen van panitumumab aan standaardprotocollen verlengt de overleving niet, maar veroorzaakt wel extra bijwerkingen." ]
214
210
2,890
Welke microRNA is de mediator van het obesitasfenotype van patiënten met 1p21.3 microdeleties?
MIR137 is de mediator van het obesitasfenotype van patiënten met 1p21.3 microdeleties.
[ "MIR137 is de mediator van het obesitasfenotype van patiënten met 1p21.3 microdeleties.", "CONCLUSIES\nDeze studie suggereert dat MIR137 de mediator is van het obesitasfenotype van patiënten met 1p21.3 microdeleties.", "CASUSBESCHRIJVING\nWe beschrijven een 10-jarige jongen met syndromale obesitas die een nieuwe 1p21.3-deletie draagt die overlapt met het kritieke gebied met alleen het MIR137-gen.", "CONCLUSIES\nDeze studie toonde aan dat dosiseffecten van MIR137 geassocieerd zijn met 1p21.3 microdeleties en daarom kunnen bijdragen aan het ID-fenotype bij patiënten met deleties die dit miRNA bevatten.", "CONCLUSIES Deze studie suggereert dat MIR137 de mediator is van het obesitasfenotype van patiënten met 1p21.3 microdeleties.", "CASUSBESCHRIJVING We beschrijven een 10-jarige jongen met syndromale obesitas die een nieuwe 1p21.3-deletie draagt die overlapt met het kritieke gebied met alleen het MIR137-gen.", "CONCLUSIES Deze studie toonde aan dat dosiseffecten van MIR137 geassocieerd zijn met 1p21.3 microdeleties en daarom kunnen bijdragen aan het ID-fenotype bij patiënten met deleties die dit miRNA bevatten.", "Daarom onderzocht deze studie de mogelijke betrokkenheid van MIR137 bij het 1p21.3-deletiefenotype.", "<AbstractText Label=\"CONCLUSIONS\" NlmCategory=\"CONCLUSIONS\">Deze studie toonde aan dat dosiseffecten van MIR137 geassocieerd zijn met 1p21.3 microdeleties en daarom kunnen bijdragen aan het ID-fenotype bij patiënten met deleties die dit miRNA bevatten.", "<AbstractText Label=\"CASE PRESENTATION\" NlmCategory=\"METHODS\">We beschrijven een 10-jarige jongen met syndromale obesitas die een nieuwe 1p21.3-deletie draagt die overlapt met het kritieke gebied met alleen het <i>MIR137</i>-gen.", "<AbstractText Label=\"CONCLUSIONS\" NlmCategory=\"CONCLUSIONS\">Deze studie suggereert dat <i>MIR137</i> de mediator is van het obesitasfenotype van patiënten met 1p21.3 microdeleties.", "<i>MIR137</i> is het sleutelfgen dat het syndromale obesitasfenotype van patiënten met 1p21.3 microdeleties medieert.<AbstractText Label=\"BACKGROUND\" NlmCategory=\"BACKGROUND\">Deleties in de lange arm van chromosoom 1 zijn beschreven bij patiënten met een fenotype dat voornamelijk bestaat uit obesitas, verstandelijke beperking en autismespectrumstoornis.", "Daarom onderzocht deze studie de mogelijke betrokkenheid van MIR137 bij het 1p21.3-deletiefenotype.", "De studie toonde ook een significante verrijking van miR-137 aan bij de synapsen van corticale en hippocampale neuronen, wat wijst op een rol van miR-137 bij het reguleren van de lokale synaptische eiwitsynthesemachinerie.<br><b>CONCLUSIES</b>: Deze studie toonde aan dat dosiseffecten van MIR137 geassocieerd zijn met 1p21.3 microdeleties en daarom kunnen bijdragen aan het ID-fenotype bij patiënten met deleties die dit miRNA bevatten.", "MIR137 is het sleutelfgen dat het syndromale obesitasfenotype van patiënten met 1p21.3 microdeleties medieert.", "Deze studie suggereert dat MIR137 de mediator is van het obesitasfenotype van patiënten met 1p21.3 microdeleties.", "We beschrijven een 10-jarige jongen met syndromale obesitas die een nieuwe 1p21.3-deletie draagt die overlapt met het kritieke gebied met alleen het MIR137-gen.", "Deze studie toonde aan dat dosiseffecten van MIR137 geassocieerd zijn met 1p21.3 microdeleties en daarom kunnen bijdragen aan het ID-fenotype bij patiënten met deleties die dit miRNA bevatten.", "Chromosoom 1p21.3 microdeleties die DPYD en MIR137 omvatten, worden geassocieerd met verstandelijke beperking.", "Daarom onderzocht deze studie de mogelijke betrokkenheid van MIR137 bij het 1p21.3-deletiefenotype." ]
467
457
2,891
Wat is het doel van het METABRIC-project?
De METABRIC [Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium] cohort heeft als doel de integratie van genomische en transcriptomische profielen van 2000 borstkankertumoren.
[ "de METABRIC borstkankerdata geregistreerd voor meer dan 2000 patiënten", "Het voorspellen van uitkomsten van hormoon- en chemotherapie in de Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium (METABRIC) studie door biochemisch geïnspireerde machine learning.", "Genomische aberraties en op genexpressie gebaseerde subtypen in de grote METABRIC patiëntenpopulatie zijn gebruikt om te stratificeren en overleving te voorspellen.", "Iteratief verfijnen van intrinsieke subtypen van borstkanker in de METABRIC dataset.", "Richtend op de ontwikkeling van robuuste strategieën, hebben we een iteratieve benadering ontworpen om intrinsieke subtypen consistent te onderscheiden en klassevoorspelling in de METABRIC dataset te verbeteren.", "Associaties tussen genomische stratificatie van borstkanker en centraal beoordeelde tumorpatoogie in de METABRIC cohort.", "De integratie van genomische en transcriptomische profielen van 2000 borstkankertumoren uit de METABRIC [Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium] cohort onthulde tien subtypen, aangeduid als integratieve clusters (IntClust/s), gekarakteriseerd door verschillende genomische drijfveren.", "RESULTATEN\nWe tonen aan hoe deze integratie automatisch kan worden bereikt, na de declaratie van geschikte metadata-elementen voor elke klinische dataset; we demonstreren de bruikbaarheid van deze aanpak door toepassing op experimentele resultaten en klinische data van vijf ziekenhuizen in het VK en Canada, uitgevoerd als onderdeel van het METABRIC-project (Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium).", "We passen de aanpak toe en evalueren deze door de vijf verschillende klinische datasets van METABRIC te integreren.", "We hadden een vergelijkbare aanpak aangenomen, genaamd 'BADGER', in het METABRIC-project.", "METABRIC is een grote borstkankerstudie die mogelijk de eerste was waarin eQTL-gebaseerde detectie van mismatches tijdens de studie werd gebruikt, in plaats van achteraf, ter ondersteuning van kwaliteitsborging.", "We voerden een cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTL) analyse uit met normale of tumor borstkanker transcriptoomdata van het Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium (METABRIC), The Cancer Genome Atlas (TCGA), en het Genotype-Tissue Expression (GTEx) project.", "We identificeerden in totaal 101 genen voor 51 leidende varianten na het combineren van de resultaten van een meta-analyse van METABRIC en TCGA, en de resultaten van GTEx bij een Benjamini-Hochberg (BH)-gecorrigeerde p < 0,05.", "In UBC-TAM waren NF1 frame-shift nonsense (FS/NS) mutaties ook een slechte uitkomstfactor die werd gevalideerd in METABRIC.", "Copy number aberratie leidend tot SPAG5 winst of amplificatie en hoge SPAG5 transcript- en SPAG5 proteïneconcentraties waren geassocieerd met kortere totale borstkanker-specifieke overleving (METABRIC cohort [copy number aberratie]: hazard ratio [HR] 1,50, 95% CI 1,18-1,92, p=0,00010; METABRIC cohort [transcript]: 1,68, 1,40-2,01, p<0,0001; en Nottingham-HES-borstkanker cohort [proteïne]: 1,68, 1,32-2,12, p<0,0001).", "In multivariabele analyse waren hoge SPAG5 transcript- en SPAG5 proteïne-expressie geassocieerd met verminderde borstkanker-specifieke overleving na 10 jaar vergeleken met lagere concentraties (Uppsala: HR 1,62, 95% CI 1,03-2,53, p=0,036; METABRIC: 1,27, 1,02-1,58, p=0,034; onbehandelde lymfeklier-negatieve cohort: 2,34, 1,24-4,42, p=0,0090; en Nottingham-HES: 1,73, 1,23-2,46, p=0,0020).", "De nieuwe subtypen tonen nauwkeurige verdelingen van huidige klinische markers ER, PR en HER2, en overlevingscurves in de METABRIC en ROCK datasets.", "De KMPlotter online tool, METABRIC en GSE25066 datasets werden gebruikt om genhandtekeningen te associëren met klinische uitkomst.", "Richtend op de ontwikkeling van robuuste strategieën, hebben we een iteratieve benadering ontworpen om intrinsieke subtypen consistent te onderscheiden en klassevoorspelling in de METABRIC dataset te verbeteren.", "METHODEN\nDe EarlyR prognostische score werd ontwikkeld met behulp van integratieve analyse van microarray datasets en formaline-gefixeerde, paraffine-ingebedde kwantitatieve real-time PCR assay en gevalideerd in Affymetrix datasets en METABRIC cohort met behulp van Cox proportionele hazardmodellen en Kaplan-Meier overlevingsanalyse.", "Classificatie van de gepersonaliseerde landschappen afgeleid van 997 tumormonsters binnen de Metabric ontdekkingsdataset onthult een nieuwe cluster met slechte prognose, reproduceerbaar in de 995-monster validatiedataset.", "Om de bijdrage van cellulaire stofwisseling aan kankerheterogeniteit te onderzoeken, analyseren we de Metabric dataset, een baanbrekende genomische en transcriptomische studie van 2000 individuele borstkankertumoren, in de context van het menselijke genoom-schaal metabolische netwerk.", "We beoordeelden de prognostische rol van RBsig in de METABRIC en in een uitgebreide borstkanker meta-dataset.", "We verkregen informatie over TP53 mutatie en PAM50 subtypen in 699 tumoren uit de Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium (METABRIC) cohort.", "METHODEN We pasten een kunstmatig neurale netwerk-gebaseerde integratieve data mining benadering toe op data van drie cohorten van borstkankerpatiënten (de Nottingham ontdekkingscohort (n=171), Uppsala cohort (n=249), en Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium [METABRIC] cohort; n=1980).", "Met data van zowel The Cancer Genome Atlas (TCGA) als Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium (METABRIC) toonden we aan dat rs62331150 geassocieerd was met het expressieniveau van TET2 in normaal en tumorweefsel van de borst.", "Grote onderzoeksconsortia zoals het Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium (METABRIC), The Cancer Genome Atlas en International Cancer Genomics Consortium onderzoeken systematisch grote sets tumormonsters via geïntegreerde analyse van genoomwijde DNA copy number en promotor methylering, transcriptoomwijde RNA expressie, proteïne-expressie en exoomwijde sequencing.", "Een recente METABRIC studie onderzocht de effecten van cis-werkende en trans-werkende factoren van genexpressieregulatie in borstkanker.", "Onafhankelijke validatie van prognostische interacties werd bereikt met data uit de METABRIC studie.", "De ontdekking van nieuwe biomarkers verbetert de voorspelling van intrinsieke subtypen van borstkanker en brengt de labels in de METABRIC dataset in overeenstemming.<AbstractText Label=\"ACHTERGROND\" NlmCategory=\"BACKGROUND\">De voorspelling van intrinsieke subtypen van borstkanker is geïntroduceerd als een waardevolle strategie om diagnose, prognose en therapierespons van patiënten te bepalen.", "Het voorspellen van uitkomsten van hormoon- en chemotherapie in de Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium (METABRIC) studie door biochemisch geïnspireerde machine learning. Genomische aberraties en op genexpressie gebaseerde subtypen in de grote METABRIC patiëntenpopulatie zijn gebruikt om te stratificeren en overleving te voorspellen.", "METABRIC is een grote borstkankerstudie die mogelijk de eerste was waarin eQTL-gebaseerde detectie van mismatches tijdens de studie werd gebruikt, in plaats van achteraf, ter ondersteuning van kwaliteitsborging.", "Dit kan de integratie van klinische datasets uit verschillende bronnen omvatten: deze datasets kunnen verschillende datadefinities gebruiken en sommige kunnen incompleet zijn.<br><b>METHODEN</b>: In dit werk gebruiken we semantische webtechnieken ontwikkeld binnen het CancerGrid-project, in het bijzonder het gebruik van metadata-elementen en op logica gebaseerde inferentie om heterogene klinische informatie te annoteren, integreren en bevragen.<br><b>RESULTATEN</b>: We tonen aan hoe deze integratie automatisch kan worden bereikt, na de declaratie van geschikte metadata-elementen voor elke klinische dataset; we demonstreren de bruikbaarheid van deze aanpak door toepassing op experimentele resultaten en klinische data van vijf ziekenhuizen in het VK en Canada, uitgevoerd als onderdeel van het METABRIC-project (Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium).<br><b>CONCLUSIE</b>: We beschrijven een metadata-benadering voor het beheren van overeenkomsten en verschillen in klinische datasets op een gestandaardiseerde manier die gebruikmaakt van Common Data Elements (CDEs).", "We passen de aanpak toe en evalueren deze door de vijf verschillende klinische datasets van METABRIC te integreren.<br>", "De huidige studie gebruikte genormaliseerde genexpressiehandtekeningen van paclitaxel medicijnrespons om uitkomst te voorspellen voor verschillende overlevingstijden bij METABRIC-patiënten die hormoontherapie (HT) en in sommige gevallen chemotherapie (CT) kregen.", "We creëren gepersonaliseerde metabole landschappen voor elke tumor door sets van actieve reacties te verkennen die voldoen aan beperkingen afgeleid van menselijke biochemie en maximale overeenstemming met de Metabric transcriptoomdata maximaliseren.|" ]
1,125
1,108
2,892
Noem 3 ziekten waarvoor lucatumomab wordt getest.
Lucatumomab wordt getest als behandeling voor kwaadaardige aandoeningen zoals chronische lymfatische leukemie (CLL), multipel myeloom (MM) en non-Hodgkin-lymfoom (NHL).
[ "Hier zijn Dacetuzumab en Lucatumomab in de meest gevorderde fase en worden ze getest als behandeling voor kwaadaardige aandoeningen zoals chronische lymfatische leukemie (CLL), multipel myeloom (MM) en non-Hodgkin-lymfoom (NHL)." ]
59
54
2,893
Welke transcriptiefactor-bindingsplaats is aanwezig in Alu-herhalingen?
Een nieuw, overvloedig NF-κB-bindingsplaats bevindt zich in gespecialiseerde Alu-repetitieve elementen met het potentieel voor langeafstandstranscriptieregulatie, wat suggereert dat NF-κB naast zijn bekende rol ook een primaatspecifieke functie en een rol in de menselijke evolutie heeft.
[ "Opmerkelijk is dat we een nieuw, overvloedig NF-κB-bindingsplaats hebben geïdentificeerd in gespecialiseerde Alu-repetitieve elementen met het potentieel voor langeafstandstranscriptieregulatie, wat suggereert dat NF-κB naast zijn bekende rol ook een primaatspecifieke functie en een rol in de menselijke evolutie heeft.", "Een de novo motiefverrijkingsanalyse onthult secundaire TFBS's (AP1, SP1) op karakteristieke afstanden van NF-κB/RelA TFBS's." ]
103
92
2,894
Wat is ferroptose?
Ferroptose is een nieuw gedefinieerde, ijzerafhankelijke, niet-apoptotische vorm van celdood met een necrotische morfologie. Ferroptose is een nieuwe vorm van gereguleerde celdood, die volledig verschilt van andere vormen van celdood op basis van morfologische, biochemische en genetische criteria. Ferroptose is een vorm van oxidatieve celdood en is een chemotherapeutisch doelwit geworden voor kankerbehandeling.
[ "Ferroptose is een nieuwe vorm van gereguleerde celdood, die volledig verschilt van andere vormen van celdood op basis van morfologische, biochemische en genetische criteria.", "Ferroptose is een ijzerafhankelijke vorm van gereguleerde niet-apoptotische celdood.", "Ferroptose is een nieuw gedefinieerde, ijzerafhankelijke, niet-apoptotische vorm van celdood met een necrotische morfologie.", "Ferroptose is recentelijk gerapporteerd als een mechanisme van ijzerafhankelijke niet-apoptotische celdood.", "Ferroptose is een vorm van oxidatieve celdood en is een chemotherapeutisch doelwit geworden voor kankerbehandeling." ]
133
123
2,895
Welke ziekte wordt behandeld met laparoscopische Heller-myotomie (LHM)?
Om de uitkomst te vergelijken van perorale endoscopische myotomie (POEM) en laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor de behandeling van slokdarmachalasia
[ "Om de uitkomst te vergelijken van perorale endoscopische myotomie (POEM) en laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor de behandeling van slokdarmachalasia", "Perorale endoscopische myotomie leidt tot hogere percentages abnormale slokdarmzuurblootstelling dan laparoscopische Heller-myotomie bij achalasia", "Perorale endoscopische myotomie (POEM) is een opkomende endoscopische behandeling voor achalasia en de langetermijneffectiviteit van POEM moet nog worden geëvalueerd.", "Deze studie vergeleek de uitkomsten van POEM met die van de standaard laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor achalasia.", "Het doel van deze studie was om robotgeassisteerde laparoscopische Heller-myotomie (RAHM) te vergelijken met laparoscopische Heller-myotomie (LHM) op het gebied van effectiviteit en veiligheid.", "DOELSTELLINGEN\nLaparoscopische Heller-myotomie (LHM) is de voorkeurschirurgische methode voor de behandeling van achalasia.", "ACHTERGROND EN DOEL\nDeze retrospectieve cohortstudie vergeleek klinische uitkomsten en kwaliteit van leven na perorale endoscopische myotomie (POEM) met laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor de behandeling van achalasia.", "INLEIDING\nAchalasia is een zeldzame aandoening bij kinderen die meestal worden behandeld met laparoscopische Heller-myotomie (LHM).", "DOELSTELLINGEN Laparoscopische Heller-myotomie (LHM) is de voorkeurschirurgische methode voor de behandeling van achalasia.", "ACHTERGROND EN DOEL Deze retrospectieve cohortstudie vergeleek klinische uitkomsten en kwaliteit van leven na perorale endoscopische myotomie (POEM) met laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor de behandeling van achalasia.", "DOEL Om de uitkomst te vergelijken van perorale endoscopische myotomie (POEM) en laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor de behandeling van slokdarmachalasia.", "ACHTERGROND Perorale endoscopische myotomie (POEM) is recentelijk naar voren gekomen als een haalbare optie ten opzichte van de klassieke benadering van laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor de behandeling van slokdarmachalasia.", "Hoewel laparoscopische Heller-myotomie (LHM) de huidige gouden standaard is voor de behandeling van type III achalasia, is perorale endoscopische myotomie (POEM) vermoedelijk superieur omdat het een langere myotomie mogelijk maakt.", "Laparoscopische Heller-myotomie versus perorale endoscopische myotomie (POEM) voor achalasia: een systematische review en meta-analyse.<AbstractText Label=\"DOEL\">Om de uitkomst te vergelijken van perorale endoscopische myotomie (POEM) en laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor de behandeling van slokdarmachalasia.", "Verminderde postoperatieve pijnscores en narcoticagebruik pleiten voor perorale endoscopische myotomie boven laparoscopische Heller-myotomie.<AbstractText Label=\"INLEIDING\">Perorale endoscopische myotomie (POEM) is een minder invasieve therapie voor achalasia met een kortere ziekenhuisopname maar met vergelijkbare korte- en langetermijnuitkomsten als laparoscopische Heller-myotomie (LHM).", "Laparoscopische Heller-myotomie (LHM) is de voorkeursbehandeling bij jonge patiënten.", "Systematische review en meta-analyse van perioperatieve uitkomsten van perorale endoscopische myotomie (POEM) en laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor achalasia.<AbstractText Label=\"DOELSTELLINGEN\" NlmCategory=\"OBJECTIVE\">Laparoscopische Heller-myotomie (LHM) is de voorkeurschirurgische methode voor de behandeling van achalasia.", "Vergelijking van vroege uitkomsten en kwaliteit van leven na laparoscopische Heller-cardiomyotomie met perorale endoscopische myotomie voor de behandeling van achalasia.<AbstractText Label=\"ACHTERGROND EN DOEL\" NlmCategory=\"OBJECTIVE\">Deze retrospectieve cohortstudie vergeleek klinische uitkomsten en kwaliteit van leven na perorale endoscopische myotomie (POEM) met laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor de behandeling van achalasia.", "Laparoscopische Heller-myotomie versus perorale endoscopische myotomie: door patiënten gerapporteerde uitkomsten in één instelling.<AbstractText Label=\"ACHTERGROND\" NlmCategory=\"BACKGROUND\">Hoewel laparoscopische Heller-myotomie (LHM) de standaardbehandeling voor achalasia is geweest, heeft perorale endoscopische myotomie (POEM) aan populariteit gewonnen als een haalbaar alternatief.", "Uitkomst van perorale endoscopische myotomie (POEM) voor de behandeling van achalasia vergeleken met laparoscopische Heller-myotomie (LHM).<AbstractText Label=\"DOEL\" NlmCategory=\"OBJECTIVE\">Perorale endoscopische myotomie (POEM) is een opkomende endoscopische behandeling voor achalasia en de langetermijneffectiviteit van POEM moet nog worden geëvalueerd.", "Deze studie vergeleek de uitkomsten van POEM met die van de standaard laparoscopische Heller-myotomie (LHM) voor achalasia." ]
568
519
2,896
Noem 4 bijwerkingen van enasidenib
Enasidenib wordt geassocieerd met bepaalde bijwerkingen zoals verhoogde bilirubinespiegels, diarree, differentiatie syndroom, verlaagde kalium- en calciumspiegels, enz.
[ "Enasidenib wordt geassocieerd met bepaalde bijwerkingen zoals verhoogde bilirubinespiegels, diarree, differentiatie syndroom, verlaagde kalium- en calciumspiegels, enz." ]
50
37
2,897
Is lucatumumab een polyklonaal antilichaam?
Nee, lucatumumab is een monoklonaal antilichaam tegen CD40.
[ "Een fase 1-studie van lucatumumab, een volledig humaan anti-CD40 antagonist monoklonaal antilichaam dat intraveneus wordt toegediend aan patiënten met teruggekeerde of refractaire multipel myeloom.", "In deze open-label, multicentrische fase 1-studie werd een volledig humaan anti-CD40 antagonist monoklonaal antilichaam, lucatumumab, geëvalueerd bij patiënten met teruggekeerd/refractair multipel myeloom (MM)." ]
58
57
2,898
Wat wordt geëvalueerd met de SAD PERSONS-schaal?
De SAD PERSONS-schaal is ontwikkeld om het suïciderisico te evalueren.
[ "METHODE: We vergeleken de voorspellende nauwkeurigheid van de Manchester Self-Harm Rule (MSHR), ReACT Self-Harm Rule (ReACT), SAD PERSONS-schaal (SPS) en Modified SAD PERSONS-schaal (MSPS) in een ongeslecteerde steekproef van patiënten die het ziekenhuis bezochten na zelfbeschadiging.", "Clinici vulden een standaard instrument voor suïciderisicobeoordeling in (gemodificeerde SAD PERSONS-schaal), een 10-punt Likert-schaal beoordeling van hun inschatting van het suïciderisico van de patiënt (Clinician Prediction Scale), en een maat voor hun emotionele reacties op de patiënt (Therapist Response Questionnaire-Suicide Form).", "Doelstellingen: Het evalueren van de prestaties van risicoschalen (Manchester Self-Harm Rule, ReACT Self-Harm Rule, SAD PERSONS-schaal, Modified SAD PERSONS-schaal, Barratt Impulsiveness Scale); en schattingen van risico door patiënt en klinicus bij het identificeren van patiënten die binnen 6 maanden opnieuw zelfbeschadiging plegen.", "Suïcide voorspellen met de SAD PERSONS-schaal.", "De SAD PERSONS-suïciderisicobeoordelingsschaal wordt veel gebruikt in klinische omgevingen ondanks beperkte ondersteunende bewijzen. Dit artikel heeft als doel de capaciteit van de SAD PERSONS-schaal (SPS) te bepalen om toekomstige suïcide op de spoedeisende hulp te voorspellen.", "CONCLUSIES: Hoewel veel gebruikt in educatieve en klinische omgevingen, ondersteunen deze bevindingen het gebruik van de SPS en Modified SPS niet om suïcide te voorspellen bij volwassenen die door psychiatrische diensten op de spoedeisende hulp worden gezien.", "Voor de uitkomst suïcidepoging had de SAD PERSONS-schaal een sensitiviteit van 15% (95% BI 8-24) en specificiteit van 97% (96-98), en de Manchester Self-Harm Rule (MSHR) een sensitiviteit van 97% (97-97) en een specificiteit van 20% (20-21). ReACT, een modificatie van MSHR, had een vergelijkbare lage specificiteit, net als de Sodersjukhuset Self Harm Rule.", "DOELSTELLING De SAD PERSONS-schaal is een veelgebruikt instrument voor risicobeoordeling van suïcidaal gedrag ondanks een gebrek aan ondersteunende gegevens.", "SAD PERSONS voorspelde suïcidepogingen niet beter dan toeval (oppervlakte onder de curve =0,572; 95% betrouwbaarheidsinterval [BI], 0,51-0,64; P-waarde niet significant).", "CONCLUSIE In hun huidige vorm voorspellen SAD PERSONS en MSPS toekomstige suïcidepogingen niet nauwkeurig.", "CONCLUSIES De Chinese SAD PERSONS-schaal is een kort instrument met acceptabele psychometrische eigenschappen voor de voorspelling van zelfbeschadiging.", "De SAD PERSONS-suïciderisicobeoordelingsschaal wordt veel gebruikt in klinische omgevingen ondanks beperkte ondersteunende bewijzen.", "DOELSTELLING De SAD PERSONS-schaal is een veelgebruikt instrument voor risicobeoordeling van suïcidaal gedrag ondanks een gebrek aan ondersteunende gegevens.", "CONCLUSIES De Chinese SAD PERSONS-schaal is een kort instrument met acceptabele psychometrische eigenschappen voor de voorspelling van zelfbeschadiging.", "De SAD PERSONS-schaal (SPS) wordt veel gebruikt voor suïciderisicobeoordeling in klinische en educatieve omgevingen.", "Beck's Medical Lethality Scale (BMLS) werd afgenomen om de mate van medische verwonding te beoordelen, en de SAD PERSONS-mnemonschaal werd gebruikt om suïciderisico te evalueren.", "De SAD PERSONS-schaal voor suïciderisicobeoordeling: een systematische review. De SAD PERSONS-schaal (SPS) wordt veel gebruikt voor suïciderisicobeoordeling in klinische en educatieve omgevingen.", "De SAD PERSONS-suïciderisicobeoordelingsschaal wordt veel gebruikt in klinische omgevingen ondanks beperkte ondersteunende bewijzen.", "<AbstractText Label=\"CONCLUSIONS\" NlmCategory=\"CONCLUSIONS\">De Chinese SAD PERSONS-schaal is een kort instrument met acceptabele psychometrische eigenschappen voor de voorspelling van zelfbeschadiging.", "Suïcidepogingen voorspellen met de SAD PERSONS-schaal: een longitudinale analyse.<AbstractText Label=\"OBJECTIVE\" NlmCategory=\"OBJECTIVE\">De SAD PERSONS-schaal is een veelgebruikt instrument voor risicobeoordeling van suïcidaal gedrag ondanks een gebrek aan ondersteunende gegevens.", "Suïcide voorspellen met de SAD PERSONS-schaal.<AbstractText Label=\"BACKGROUND\">Suïcide is een groot volksgezondheidsprobleem, en een prioriteit is het nauwkeurig identificeren van hoogrisicopersonen.", "Deelnemers vulden een reeks screeningsinstrumenten voor depressie/suïcide in: de Columbia Suicide Severity Scale, SAD PERSONS-schaal, Patient Health Questionnaire 9 en Beck Scale for Suicidal Ideation.", "<b>DOELSTELLING</b>: De SAD PERSONS-schaal is een veelgebruikt instrument voor risicobeoordeling van suïcidaal gedrag ondanks een gebrek aan ondersteunende gegevens.", "Zowel SAD PERSONS als MSPS toonden een slechte voorspellende waarde voor toekomstige suïcidepogingen.", "SAD PERSONS voorspelde suïcidepogingen niet beter dan toeval (oppervlakte onder de curve =0,572; 95% betrouwbaarheidsinterval [BI], 0,51-0,64; P-waarde niet significant)." ]
623
582
2,899
Beschrijf kort een deep learning-systeem dat nauwkeuriger is dan menselijke experts bij het detecteren van melanoom.
In augustus 2018 werd een studie gepubliceerd waarin de diagnostische prestaties van een Convolutional Neural Network (CNN) werden vergeleken met een grote internationale groep van 58 dermatologen, waaronder 30 experts. De meeste dermatologen werden overtroffen door het CNN, dat zowel een hogere sensitiviteit als specificiteit had.
[ "Computerondersteunde diagnosesystemen aangedreven door convolutionele neurale netwerken (CNN's) kunnen de diagnostische nauwkeurigheid verbeteren en levens redden. CNN's zijn met succes gebruikt bij zowel segmentatie als classificatie van huidlaesies.", "Machine learning-gebaseerde diagnose van melanoom met macrobeelden", "We testten het gebruik van een deep learning-algoritme om klinische beelden van 12 huidaandoeningen te classificeren: basaalcelcarcinoom, plaveiselcelcarcinoom, intra-epitheliale carcinoom, actinische keratose, seborroïsche keratose, kwaadaardig melanoom, melanocytair naevus, lentigo, pyogeen granuloom, hemangioom, dermatofibroom en wrat.", "Analyse van huidlaesies gericht op melanoomdetectie met behulp van een deep learning-netwerk.", "Deep learning-computervisiessystemen classificeerden melanoom-dermoscopiebeelden met een nauwkeurigheid die sommige, maar niet alle dermatologen overtrof.", "Diagnostische prestaties van een deep learning convolutioneel neuraal netwerk voor dermoscopische melanoomherkenning in vergelijking met 58 dermatologen.", "Deep learning convolutionele neurale netwerken (CNN) kunnen de detectie van melanoom vergemakkelijken.", "Om aan deze uitdagingen te voldoen, stellen wij een nieuwe methode voor melanoomherkenning voor door gebruik te maken van zeer diepe convolutionele neurale netwerken (CNN's)." ]
207
203