tokens listlengths 2 298 | ner_tags listlengths 2 298 |
|---|---|
[
"In",
"vitro",
"and",
"in",
"vivo",
"approaches",
"to",
"study",
"osteocyte",
"biology",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Osteocytes",
",",
"the",
"most",
"abundant",
"cell",
"population",
"of",
"the",
"bone",
"lineage",
",",
"have",
"been",
"a",
"major",
"focus",
"in",
"the",
"bone",
"research",
"field",
"in",
"recent",
"years",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"population",
"of",
"cells",
"that",
"resides",
"within",
"mineralized",
"matrix",
"is",
"now",
"thought",
"to",
"be",
"the",
"mechanosensory",
"cell",
"in",
"bone",
"and",
"plays",
"major",
"roles",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"bone",
"formation",
"and",
"resorption",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Studies",
"of",
"osteocytes",
"had",
"been",
"impaired",
"by",
"their",
"location",
",",
"resulting",
"in",
"numerous",
"attempts",
"to",
"isolate",
"primary",
"osteocytes",
"and",
"to",
"generate",
"cell",
"lines",
"representative",
"of",
"the",
"osteocytic",
"phenotype",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Progress",
"has",
"been",
"achieved",
"in",
"recent",
"years",
"by",
"utilizing",
"in",
"vivo",
"genetic",
"technology",
"and",
"generation",
"of",
"osteocyte",
"directed",
"transgenic",
"and",
"gene",
"deficiency",
"mouse",
"models",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"will",
"provide",
"an",
"overview",
"of",
"the",
"current",
"in",
"vitro",
"and",
"in",
"vivo",
"models",
"utilized",
"to",
"study",
"osteocyte",
"biology",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"discuss",
"generation",
"of",
"osteocyte",
"-",
"like",
"cell",
"lines",
"and",
"isolation",
"of",
"primary",
"osteocytes",
"and",
"summarize",
"studies",
"that",
"have",
"utilized",
"these",
"cellular",
"models",
"to",
"understand",
"the",
"functional",
"role",
"of",
"osteocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Approaches",
"that",
"attempt",
"to",
"selectively",
"identify",
"and",
"isolate",
"osteocytes",
"using",
"fluorescent",
"protein",
"reporters",
"driven",
"by",
"regulatory",
"elements",
"of",
"genes",
"that",
"are",
"highly",
"expressed",
"in",
"osteocytes",
"will",
"be",
"discussed",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"recent",
"in",
"vivo",
"studies",
"utilizing",
"overexpression",
"or",
"conditional",
"deletion",
"of",
"various",
"genes",
"using",
"dentin",
"matrix",
"protein",
"(",
"Dmp1",
")",
"directed",
"Cre",
"recombinase",
"are",
"outlined",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"conclusion",
",",
"evaluation",
"of",
"the",
"benefits",
"and",
"deficiencies",
"of",
"currently",
"used",
"cell",
"lines",
"/",
"genetic",
"models",
"in",
"understanding",
"osteocyte",
"biology",
"underlines",
"the",
"current",
"progress",
"in",
"this",
"field",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"future",
"efforts",
"will",
"be",
"directed",
"towards",
"developing",
"novel",
"in",
"vitro",
"and",
"in",
"vivo",
"models",
"that",
"would",
"additionally",
"facilitate",
"in",
"understanding",
"the",
"multiple",
"roles",
"of",
"osteocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"article",
"is",
"part",
"of",
"a",
"Special",
"Issue",
"entitled",
"\"",
"The",
"Osteocyte",
"\"",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Effects",
"of",
"conjugated",
"linoleic",
"acid",
"supplementation",
"and",
"exercise",
"on",
"post",
"-",
"heparin",
"lipoprotein",
"lipase",
",",
"butyrylcholinesterase",
",",
"blood",
"lipid",
"profile",
"and",
"glucose",
"metabolism",
"in",
"young",
"men",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"study",
"was",
"designed",
"to",
"investigate",
"the",
"effects",
"of",
"conjugated",
"linoleic",
"acid",
"(",
"CLA",
")",
"supplementation",
"and",
"endurance",
"exercise",
"training",
"-",
"induced",
"changes",
"on",
"post",
"-",
"heparin",
"lipoprotein",
"lipase",
"(",
"PH",
"-",
"LPL",
")",
"and",
"butyrylcholinesterase",
"(",
"BChE",
")",
"activities",
"along",
"with",
"leptin",
",",
"insulin",
"and",
"lipid",
"levels",
"in",
"plasma",
"by",
"a",
"randomized",
"double",
"blind",
"experiment",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Eighteen",
"sedentary",
"male",
"volunteers",
"were",
"randomly",
"divided",
"into",
"CLA",
"and",
"Placebo",
"(",
"PLC",
")",
"supplementation",
"groups",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"groups",
"underwent",
"daily",
"supplementation",
"of",
"either",
"3g",
"CLA",
"or",
"3g",
"placebo",
"for",
"30days",
",",
"respectively",
",",
"and",
"performed",
"exercise",
"on",
"a",
"bicycle",
"ergometer",
"3",
"times",
"per",
"week",
"for",
"30",
"-",
"40min",
"at",
"50",
"%",
"VO2",
"peak",
"workload",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"plasma",
"glucose",
",",
"insulin",
"and",
"leptin",
"levels",
"and",
"BChE",
"activity",
"fasting",
"blood",
"was",
"used",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"PH",
"-",
"LPL",
"measurements",
",",
"blood",
"was",
"collected",
"15min",
"after",
"50IU",
"/",
"kg",
"iv",
"heparin",
"injection",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"all",
"groups",
",",
"there",
"is",
"a",
"statistically",
"significant",
"decrease",
"in",
"BChE",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"03",
",",
"p",
"=",
"0",
".",
"02",
")",
"and",
"leptin",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"002",
")",
",",
"insulin",
"and",
"HOMA",
"-",
"IR",
"levels",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"02",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Exercise",
"with",
"or",
"without",
"CLA",
"supplementation",
"decreased",
"insulin",
"levels",
"and",
"increased",
"insulin",
"sensitivity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PH",
"-",
"LPL",
"activity",
"was",
"increased",
"significantly",
"in",
"both",
"groups",
",",
"displaying",
"increased",
"fatty",
"acid",
"mobilization",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"that",
"though",
"CLA",
"supplementation",
"and",
"exercise",
"can",
"affect",
"these",
"parameters",
",",
"CLA",
"is",
"not",
"more",
"effective",
"than",
"exercise",
"alone",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Hence",
",",
"a",
"prolonged",
"supplementation",
"regime",
"may",
"be",
"more",
"effective",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Taken",
"together",
"in",
"our",
"small",
"study",
"group",
",",
"our",
"findings",
"display",
"that",
"BChE",
"is",
"a",
"potential",
"marker",
"for",
"synthetic",
"function",
"of",
"liver",
",",
"fat",
"metabolism",
",",
"an",
"obesity",
"marker",
",",
"a",
"function",
"long",
"overlooked",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"vivo",
"genotoxicity",
"of",
"methyleugenol",
"in",
"gpt",
"delta",
"transgenic",
"rats",
"following",
"medium",
"-",
"term",
"exposure",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Methyleugenol",
"(",
"MEG",
")",
",",
"which",
"is",
"commonly",
"used",
"as",
"a",
"fragrance",
"and",
"flavoring",
"agent",
",",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"induce",
"hepatocellular",
"tumors",
"in",
"rodents",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"the",
"role",
"of",
"genotoxicity",
"as",
"a",
"possible",
"mechanism",
"of",
"action",
"is",
"not",
"fully",
"understood",
"even",
"though",
"the",
"DNA",
"-",
"reactive",
"metabolite",
"of",
"MEG",
"has",
"been",
"identified",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"a",
"gpt",
"delta",
"transgenic",
"rat",
"model",
"was",
"used",
"to",
"clarify",
"whether",
"genotoxic",
"mechanisms",
"are",
"involved",
"in",
"MEG",
"-",
"induced",
"hepatocarcinogenesis",
"following",
"medium",
"-",
"term",
"exposure",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"F344",
"gpt",
"delta",
"rats",
"were",
"subjected",
"to",
"repeated",
"oral",
"administration",
"of",
"MEG",
"at",
"dosages",
"of",
"0",
",",
"10",
",",
"30",
",",
"or",
"100mg",
"/",
"kg",
"(",
"a",
"carcinogenic",
"dose",
")",
"for",
"13",
"weeks",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"relative",
"weight",
"of",
"the",
"liver",
"of",
"the",
"male",
"and",
"female",
"rats",
"that",
"were",
"administered",
"100mg",
"/",
"kg",
"MEG",
"and",
"the",
"absolute",
"weight",
"of",
"the",
"liver",
"of",
"the",
"male",
"rats",
"that",
"were",
"administered",
"100mg",
"/",
"kg",
"MEG",
"were",
"significantly",
"increased",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"the",
"number",
"and",
"area",
"of",
"glutathione",
"S",
"-",
"transferase",
"placental",
"form",
"(",
"GST",
"-",
"P",
")",
"positive",
"foci",
"and",
"proliferating",
"cell",
"nuclear",
"antigen",
"(",
"PCNA",
")",
"positive",
"cell",
"ratios",
"in",
"the",
"hepatocytes",
"were",
"significantly",
"increased",
"in",
"the",
"male",
"and",
"female",
"rats",
"that",
"were",
"administered",
"100mg",
"/",
"kg",
"MEG",
"compared",
"with",
"the",
"control",
"animals",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"in",
"vivo",
"mutation",
"assays",
",",
"a",
"significant",
"increase",
"in",
"the",
"gpt",
"and",
"Spi",
"(",
"-",
")",
"mutant",
"frequencies",
"was",
"observed",
"in",
"both",
"sexes",
"at",
"the",
"carcinogenic",
"dose",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"the",
"possible",
"participation",
"of",
"genotoxic",
"mechanisms",
"in",
"MEG",
"-",
"induced",
"hepatocarcinogenesis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Temperature",
"controlled",
"water",
"/",
"oil",
"wettability",
"of",
"a",
"surface",
"fabricated",
"by",
"a",
"block",
"copolymer",
":",
"application",
"as",
"a",
"dual",
"water",
"/",
"oil",
"on",
"-",
"off",
"switch",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"temperature",
"controlled",
"dual",
"water",
"/",
"oil",
"on",
"-",
"off",
"switch",
"is",
"achieved",
"by",
"using",
"a",
"PMMA",
"-",
"b",
"-",
"PNIPAAm",
"block",
"-",
"copolymer",
"coated",
"mesh",
",",
"determined",
"by",
"the",
"conformational",
"change",
"of",
"the",
"PNIPAAm",
"chain",
"around",
"the",
"lower",
"critical",
"solution",
"temperature",
"(",
"LCST",
")",
"and",
"also",
"the",
"cooperation",
"between",
"PNIPAAm",
"and",
"PMMA",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O"
] |
[
"Water",
"can",
"permeate",
"through",
"the",
"BCP",
"-",
"coated",
"mesh",
",",
"and",
"oil",
"cannot",
"below",
"the",
"LCST",
",",
"whereas",
"oil",
"can",
"and",
"water",
"cannot",
"above",
"the",
"LCST",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Resolving",
"sub",
"-",
"molecular",
"binding",
"and",
"electrical",
"switching",
"mechanisms",
"of",
"single",
"proteins",
"at",
"electroactive",
"conducting",
"polymers",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Polymer",
"-",
"based",
"electrodes",
"for",
"interfacing",
"biological",
"tissues",
"are",
"becoming",
"increasingly",
"sophisticated",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Their",
"many",
"functions",
"place",
"them",
"at",
"the",
"cross",
"-",
"roads",
"of",
"electromaterials",
",",
"biomaterials",
",",
"and",
"drug",
"-",
"delivery",
"systems",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"conducting",
"polymers",
",",
"the",
"mechanism",
"of",
"conductivity",
"requires",
"doping",
"with",
"anionic",
"molecules",
"such",
"as",
"extracellular",
"matrix",
"molecules",
",",
"a",
"process",
"that",
"distinguishes",
"them",
"as",
"biomaterials",
"and",
"provides",
"a",
"means",
"to",
"control",
"interactions",
"at",
"the",
"cellular",
"-",
"electrode",
"interface",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"due",
"to",
"their",
"complex",
"structure",
",",
"directly",
"observing",
"the",
"selective",
"binding",
"of",
"target",
"molecules",
"or",
"proteins",
"has",
"so",
"far",
"eluded",
"researchers",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"situation",
"is",
"compounded",
"by",
"the",
"polymer",
"'",
"s",
"ability",
"to",
"adopt",
"different",
"electronic",
"states",
"that",
"alter",
"the",
"polymer",
"-",
"dopant",
"interactions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"the",
"ability",
"to",
"resolve",
"sub",
"-",
"molecular",
"binding",
"specificity",
"between",
"sulfate",
"and",
"carboxyl",
"groups",
"of",
"dopants",
"and",
"heparin",
"binding",
"domains",
"of",
"human",
"plasma",
"fibronectin",
"is",
"demonstrated",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"interaction",
"exploits",
"a",
"form",
"of",
"biological",
"'",
"charge",
"complementarity",
"'",
"to",
"enable",
"specificity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"When",
"an",
"electrical",
"signal",
"is",
"applied",
"to",
"the",
"polymer",
",",
"the",
"specific",
"interaction",
"is",
"switched",
"to",
"a",
"non",
"-",
"specific",
",",
"high",
"-",
"affinity",
"binding",
"state",
"that",
"can",
"be",
"reversibly",
"controlled",
"using",
"electrochemical",
"processes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"the",
"specific",
"and",
"non",
"-",
"specific",
"interactions",
"are",
"integral",
"for",
"controlling",
"protein",
"conformation",
"and",
"dynamics",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"details",
",",
"which",
"represent",
"the",
"first",
"direct",
"measurement",
"of",
"biomolecular",
"recognition",
"between",
"a",
"single",
"protein",
"and",
"any",
"type",
"of",
"organic",
"conductor",
",",
"give",
"new",
"molecular",
"insight",
"into",
"controlling",
"cellular",
"interactions",
"on",
"these",
"polymer",
"surfaces",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"iron",
"chelator",
",",
"deferasirox",
",",
"as",
"a",
"novel",
"strategy",
"for",
"cancer",
"treatment",
":",
"oral",
"activity",
"against",
"human",
"lung",
"tumor",
"xenografts",
"and",
"molecular",
"mechanism",
"of",
"action",
"."
] | [
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Deferasirox",
"is",
"an",
"orally",
"effective",
"iron",
"(",
"Fe",
")",
"chelator",
"currently",
"used",
"for",
"the",
"treatment",
"of",
"iron",
"-",
"overload",
"disease",
"and",
"has",
"been",
"implemented",
"as",
"an",
"alternative",
"to",
"the",
"gold",
"standard",
"chelator",
",",
"desferrioxamine",
"(",
"DFO",
")",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"Earlier",
"studies",
"demonstrated",
"that",
"DFO",
"exhibits",
"anticancer",
"activity",
"due",
"to",
"its",
"ability",
"to",
"deplete",
"cancer",
"cells",
"of",
"iron",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"investigation",
",",
"we",
"examined",
"the",
"in",
"vitro",
"and",
"in",
"vivo",
"activity",
"of",
"deferasirox",
"against",
"cells",
"from",
"human",
"solid",
"tumors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"date",
",",
"there",
"have",
"been",
"no",
"studies",
"to",
"investigate",
"the",
"effect",
"of",
"deferasirox",
"on",
"these",
"types",
"of",
"tumors",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Deferasirox",
"demonstrated",
"similar",
"activity",
"at",
"inhibiting",
"proliferation",
"of",
"DMS",
"-",
"53",
"lung",
"carcinoma",
"and",
"SK",
"-",
"N",
"-",
"MC",
"neuroepithelioma",
"cell",
"lines",
"compared",
"with",
"DFO",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"deferasirox",
"was",
"generally",
"similar",
"or",
"slightly",
"more",
"effective",
"than",
"DFO",
"at",
"mobilizing",
"cellular",
"(",
"59",
")",
"Fe",
"and",
"inhibiting",
"iron",
"uptake",
"from",
"human",
"transferrin",
"depending",
"on",
"the",
"cell",
"type",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"deferasirox",
"potently",
"inhibited",
"DMS",
"-",
"53",
"xenograft",
"growth",
"in",
"nude",
"mice",
"when",
"given",
"by",
"oral",
"gavage",
",",
"with",
"no",
"marked",
"alterations",
"in",
"normal",
"tissue",
"histology",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"understand",
"the",
"antitumor",
"activity",
"of",
"deferasirox",
",",
"we",
"investigated",
"its",
"effect",
"on",
"the",
"expression",
"of",
"molecules",
"that",
"play",
"key",
"roles",
"in",
"metastasis",
",",
"cell",
"cycle",
"control",
",",
"and",
"apoptosis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"demonstrated",
"that",
"deferasirox",
"increased",
"expression",
"of",
"the",
"metastasis",
"suppressor",
"protein",
"N",
"-",
"myc",
"downstream",
"-",
"regulated",
"gene",
"1",
"and",
"upregulated",
"the",
"cyclin",
"-",
"dependent",
"kinase",
"inhibitor",
"p21",
"(",
"CIP1",
"/",
"WAF1",
")",
"while",
"decreasing",
"cyclin",
"D1",
"levels",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"this",
"agent",
"increased",
"the",
"expression",
"of",
"apoptosis",
"markers",
",",
"including",
"cleaved",
"caspase",
"-",
"3",
"and",
"cleaved",
"poly",
"(",
"ADP",
"-",
"ribose",
")",
"polymerase",
"1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Collectively",
",",
"we",
"demonstrate",
"that",
"deferasirox",
"is",
"an",
"orally",
"effective",
"antitumor",
"agent",
"against",
"solid",
"tumors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Nature",
"of",
"halogen",
"bonding",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"study",
"based",
"on",
"the",
"topological",
"analysis",
"of",
"the",
"Laplacian",
"of",
"the",
"electron",
"charge",
"density",
"and",
"an",
"energy",
"decomposition",
"analysis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"work",
"we",
"investigate",
"the",
"nature",
"of",
"the",
"Cl",
".",
".",
".",
"N",
"interactions",
"in",
"complexes",
"formed",
"between",
"substituted",
"ammonium",
"[",
"NHn",
"(",
"X3",
"-",
"n",
")",
"(",
"with",
"n",
"=",
"0",
",",
"1",
",",
"2",
",",
"3",
"and",
"X",
"=",
"-",
"CH3",
",",
"-",
"F",
"]",
"as",
"Lewis",
"bases",
"and",
"F",
"-",
"Cl",
"molecule",
"as",
"Lewis",
"acid",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O"
] |
[
"They",
"have",
"been",
"chosen",
"as",
"a",
"study",
"case",
"due",
"to",
"the",
"wide",
"range",
"of",
"variation",
"of",
"their",
"binding",
"energies",
",",
"BEs",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"M",
"o",
"ller",
"-",
"Plesset",
"[",
"MP2",
"/",
"6",
"-",
"311",
"+",
"+",
"G",
"(",
"2d",
",",
"2p",
")",
"]",
"calculations",
"show",
"that",
"the",
"BEs",
"for",
"this",
"set",
"of",
"complexes",
"lie",
"in",
"the",
"range",
"from",
"1",
".",
"27",
"kcal",
"/",
"mol",
"(",
"in",
"F",
"-",
"Cl",
".",
".",
".",
"NF3",
")",
"to",
"27",
".",
"62",
"kcal",
"/",
"mol",
"[",
"in",
"F",
"-",
"Cl",
".",
".",
".",
"N",
"(",
"CH3",
")",
"3",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"intermolecular",
"distribution",
"of",
"the",
"electronic",
"charge",
"density",
"and",
"their",
"L",
"(",
"r",
")",
"=",
"-",
"(1/4)",
"nabla",
"(",
"2",
")",
"rho",
"(",
"r",
")",
"function",
"have",
"been",
"investigated",
"within",
"the",
"framework",
"of",
"the",
"atoms",
"in",
"molecules",
"(",
"AIM",
")",
"theory",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"intermolecular",
"interaction",
"energy",
"decomposition",
"has",
"also",
"been",
"analyzed",
"using",
"the",
"reduced",
"variational",
"space",
"(",
"RVS",
")",
"method",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"topological",
"analysis",
"of",
"the",
"L",
"(",
"r",
")",
"function",
"reveals",
"that",
"the",
"local",
"topological",
"properties",
"measured",
"at",
"the",
"(",
"3",
",",
"+",
"1",
")",
"critical",
"point",
"[",
"in",
"L",
"(",
"r",
")",
"topology",
"]",
"are",
"good",
"descriptors",
"of",
"the",
"strength",
"of",
"the",
"halogen",
"bonding",
"interactions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"results",
"obtained",
"from",
"energy",
"decomposition",
"analysis",
"indicate",
"that",
"electrostatic",
"interactions",
"play",
"a",
"key",
"role",
"in",
"these",
"halogen",
"bonding",
"interactions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"allow",
"us",
"to",
"establish",
"that",
",",
"when",
"the",
"halogen",
"atom",
"is",
"bonded",
"to",
"a",
"group",
"with",
"high",
"electron",
"-",
"withdrawing",
"capacity",
",",
"the",
"electrostatic",
"interaction",
"between",
"the",
"electron",
"cloud",
"of",
"the",
"Lewis",
"base",
"and",
"the",
"halogen",
"atom",
"unprotected",
"nucleus",
"of",
"the",
"Lewis",
"acid",
"produces",
"the",
"formation",
"and",
"determines",
"the",
"geometry",
"of",
"the",
"halogen",
"bonded",
"complexes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"a",
"good",
"linear",
"relationship",
"has",
"been",
"established",
"between",
":",
"the",
"natural",
"logarithm",
"of",
"the",
"BEs",
"and",
"the",
"electrostatic",
"interaction",
"energy",
"between",
"electron",
"charge",
"distribution",
"of",
"N",
"atom",
"and",
"nucleus",
"of",
"Cl",
"atom",
",",
"denoted",
"as",
"V",
"e",
"-",
"n",
"(",
"N",
",",
"Cl",
")",
"within",
"the",
"AIM",
"theory",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Contamination",
",",
"parasitism",
"and",
"condition",
"of",
"Anguilla",
"anguilla",
"in",
"three",
"Italian",
"stocks",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"conjunction",
"with",
"habitat",
"loss",
"and",
"overfishing",
",",
"pollution",
"and",
"parasitism",
"are",
"believed",
"to",
"be",
"relevant",
"causes",
"of",
"collapse",
"of",
"Anguilla",
",",
"as",
"these",
"can",
"affect",
"eel",
"swimming",
"ability",
"and",
"the",
"development",
"of",
"gonads",
"and",
"embryos",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"study",
"investigated",
"Persistent",
"Organic",
"Pollutant",
"(",
"POP",
")",
"concentrations",
",",
"infection",
"levels",
"of",
"Anguillicoloides",
"crassus",
",",
"lipid",
"content",
"and",
"gonad",
"abnormalities",
"in",
"eels",
"sampled",
"in",
"2007",
"-",
"2008",
"in",
"three",
"Italian",
"water",
"bodies",
"(",
"Caprolace",
"Lake",
",",
"Lesina",
"Lagoon",
"and",
"Tevere",
"River",
")",
"that",
"vary",
"in",
"salinity",
",",
"trophic",
"condition",
",",
"contamination",
"level",
"and",
"fishing",
"pressure",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"analysis",
"revealed",
"that",
"low",
"-",
"to",
"-",
"moderate",
"levels",
"of",
"contamination",
"and",
"parasitism",
"were",
"not",
"associated",
"with",
"gonad",
"abnormalities",
"in",
"Caprolace",
"Lake",
"and",
"Lesina",
"Lagoon",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"On",
"the",
"contrary",
",",
"POP",
"concentrations",
"and",
"abundances",
"of",
"swim",
"bladder",
"nematodes",
"were",
"remarkably",
"high",
"in",
"eels",
"from",
"the",
"heavily",
"urbanized",
"Tevere",
"River",
"and",
"were",
"associated",
"with",
"significant",
"gonad",
"and",
"swim",
"bladder",
"alterations",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Contamination",
"and",
"infestation",
"levels",
"were",
"so",
"high",
"to",
"potentially",
"impair",
"spawner",
"successful",
"migration",
"and",
"reproduction",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"POP",
"concentrations",
"in",
"Tevere",
"eels",
"also",
"exceeded",
"levels",
"considered",
"safe",
"for",
"food",
"consumption",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Though",
"marginally",
"contaminated",
",",
"eels",
"from",
"the",
"oligotrophic",
"Caprolace",
"Lake",
"were",
"in",
"critical",
"health",
"condition",
":",
"their",
"lipid",
"reserve",
"was",
"so",
"low",
"as",
"to",
"be",
"considered",
"insufficient",
"to",
"sustain",
"the",
"energetic",
"costs",
"of",
"the",
"transoceanic",
"migration",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Lesina",
"eel",
"stock",
"was",
"the",
"only",
"one",
"displaying",
"relatively",
"good",
"quality",
"but",
"here",
"spawner",
"abundance",
"is",
"likely",
"limited",
"by",
"overfishing",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"suggest",
"that",
"multiple",
"stressors",
"may",
"potentially",
"affect",
"eel",
"reproductive",
"success",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"More",
"definitive",
"studies",
"are",
"needed",
"to",
"assess",
"whether",
"health",
"effects",
"caused",
"by",
"these",
"multiple",
"stressors",
"are",
"additive",
",",
"compensatory",
"or",
"synergistic",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Induction",
"of",
"hepatic",
"multidrug",
"resistance",
"-",
"associated",
"protein",
"3",
"by",
"ethynylestradiol",
"is",
"independent",
"of",
"cholestasis",
"and",
"mediated",
"by",
"estrogen",
"receptor",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"Multidrug",
"resistance",
"-",
"associated",
"protein",
"3",
"(",
"Mrp3",
";",
"Abcc3",
")",
"expression",
"and",
"activity",
"are",
"up",
"-",
"regulated",
"in",
"rat",
"liver",
"after",
"in",
"vivo",
"repeated",
"administration",
"of",
"ethynylestradiol",
"(",
"EE",
")",
",",
"a",
"cholestatic",
"synthetic",
"estrogen",
",",
"whereas",
"multidrug",
"resistance",
"-",
"associated",
"protein",
"2",
"(",
"Mrp2",
")",
"is",
"down",
"-",
"regulated",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"study",
"was",
"undertaken",
"to",
"determine",
"whether",
"Mrp3",
"induction",
"results",
"from",
"a",
"direct",
"effect",
"of",
"EE",
",",
"independent",
"of",
"accumulation",
"of",
"any",
"endogenous",
"common",
"Mrp2",
"/",
"Mrp3",
"substrates",
"resulting",
"from",
"cholestasis",
"and",
"the",
"potential",
"mediation",
"of",
"estrogen",
"receptor",
"(",
"ER",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"in",
"vivo",
"studies",
",",
"male",
"rats",
"were",
"given",
"a",
"single",
",",
"noncholestatic",
"dose",
"of",
"EE",
"(",
"5",
"mg",
"/",
"kg",
"s",
".",
"c",
".",
")",
",",
"and",
"basal",
"bile",
"flow",
"and",
"the",
"biliary",
"excretion",
"rate",
"of",
"bile",
"salts",
"and",
"glutathione",
"were",
"measured",
"5",
"hours",
"later",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"treatment",
"increased",
"Mrp3",
"mRNA",
"by",
"4",
"-",
"fold",
",",
"detected",
"by",
"real",
"-",
"time",
"polymerase",
"chain",
"reaction",
",",
"despite",
"the",
"absence",
"of",
"cholestasis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Primary",
"culture",
"of",
"rat",
"hepatocytes",
"incubated",
"with",
"EE",
"(",
"1",
"-",
"10",
"micro",
"M",
")",
"for",
"5",
"hours",
"exhibited",
"a",
"3",
"-",
"fold",
"increase",
"in",
"Mrp3",
"mRNA",
"(",
"10",
"micro",
"M",
")",
",",
"consistent",
"with",
"in",
"vivo",
"findings",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"increase",
"in",
"Mrp3",
"mRNA",
"by",
"EE",
"was",
"prevented",
"by",
"actinomycin",
"D",
",",
"indicating",
"transcriptional",
"regulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"When",
"hepatocytes",
"were",
"incubated",
"with",
"an",
"ER",
"antagonist",
"[",
"7",
"alpha",
",",
"17",
"beta",
"-",
"[",
"9",
"-",
"[",
"(",
"4",
",",
"4",
",",
"5",
",",
"5",
",",
"5",
"-",
"Pentafluoropentyl",
")",
"sulfinyl",
"]",
"nonyl",
"]",
"estra",
"-",
"1",
",",
"3",
",",
"5",
"(",
"10",
")",
"-",
"triene",
"-",
"3",
",",
"17",
"-",
"diol",
"(",
"ICI182",
"/",
"780",
")",
",",
"1",
"micro",
"M",
"]",
",",
"in",
"addition",
"to",
"EE",
",",
"induction",
"of",
"Mrp3",
"mRNA",
"was",
"abolished",
",",
"implicating",
"ER",
"as",
"a",
"key",
"mediator",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"EE",
"induced",
"an",
"increase",
"in",
"ER",
"-",
"alpha",
"phosphorylation",
"at",
"30",
"minutes",
"and",
"expression",
"of",
"c",
"-",
"Jun",
",",
"a",
"well",
"-",
"known",
"ER",
"target",
"gene",
",",
"at",
"60",
"minutes",
",",
"as",
"detected",
"by",
"Western",
"blotting",
"of",
"nuclear",
"extracts",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"increases",
"were",
"prevented",
"by",
"ICI182",
"/",
"780",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O"
] |
[
"In",
"summary",
",",
"EE",
"increased",
"the",
"expression",
"of",
"hepatic",
"Mrp3",
"transcriptionally",
"and",
"independently",
"of",
"any",
"cholestatic",
"manifestation",
"and",
"required",
"participation",
"of",
"an",
"ER",
",",
"most",
"likely",
"ER",
"-",
"alpha",
",",
"through",
"its",
"phosphorylation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cell",
"loss",
"and",
"autophagy",
"in",
"the",
"extra",
"-",
"adrenal",
"chromaffin",
"organ",
"of",
"Zuckerkandl",
"are",
"regulated",
"by",
"glucocorticoid",
"signalling",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Neuroendocrine",
"chromaffin",
"cells",
"exist",
"in",
"both",
"intra",
"-",
"and",
"extra",
"-",
"adrenal",
"locations",
";",
"the",
"organ",
"of",
"Zuckerkandl",
"(",
"OZ",
")",
"constitutes",
"the",
"largest",
"accumulation",
"of",
"extra",
"-",
"adrenal",
"chromaffin",
"tissue",
"in",
"mammals",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"OZ",
"disappears",
"postnatally",
"by",
"modes",
"that",
"are",
"still",
"enigmatic",
"but",
"can",
"be",
"maintained",
"by",
"treatment",
"with",
"glucocorticoids",
"(",
"GC",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Whether",
"the",
"response",
"to",
"GC",
"reflects",
"a",
"pharmacological",
"or",
"a",
"physiological",
"role",
"of",
"GC",
"has",
"not",
"been",
"clarified",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Using",
"mice",
"with",
"a",
"conditional",
"deletion",
"of",
"the",
"GC",
"-",
"receptor",
"(",
"GR",
")",
"gene",
"restricted",
"to",
"cells",
"expressing",
"the",
"dopamine",
"beta",
"-",
"hydroxylase",
"(",
"DBH",
")",
"gene",
"[",
"GR",
"(",
"fl",
"/",
"fl",
")",
";",
"DBHCre",
"abbreviated",
"(",
"GR",
"(",
"DBHCre",
")",
")",
"]",
",",
"we",
"now",
"present",
"the",
"first",
"evidence",
"for",
"a",
"physiological",
"role",
"of",
"GC",
"signalling",
"in",
"the",
"postnatal",
"maintenance",
"of",
"the",
"OZ",
":",
"postnatal",
"losses",
"of",
"OZ",
"chromaffin",
"cells",
"in",
"GR",
"(",
"DBHCre",
")",
"mice",
"are",
"doubled",
"compared",
"to",
"wild",
"-",
"type",
"littermates",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"find",
"that",
"postnatal",
"cell",
"loss",
"in",
"the",
"OZ",
"starts",
"at",
"birth",
"and",
"is",
"accompanied",
"by",
"autophagy",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Electron",
"microscopy",
"reveals",
"autophagic",
"vacuoles",
"and",
"autophagolysosomes",
"in",
"chromaffin",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Autophagy",
"in",
"OZ",
"extra",
"-",
"adrenal",
"chromaffin",
"cells",
"is",
"confirmed",
"by",
"showing",
"accumulation",
"of",
"p62",
"protein",
",",
"which",
"occurs",
",",
"when",
"autophagy",
"is",
"blocked",
"by",
"deleting",
"the",
"Atg5",
"gene",
"(",
"Atg5",
"(",
"DBHCre",
")",
"mice",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.