Split (1)

train · 1.76k rows

Ribozyme stringlengths 2 37	Organism stringclasses 56 values	Variable_reactant stringlengths 2 100 ⌀	Kobs stringlengths 1 19 ⌀	Unit_Kobs stringclasses 11 values	km stringclasses 287 values	Unit_Km stringclasses 11 values	kcat stringclasses 262 values	Unit_Kcat stringclasses 9 values	km_kcat stringlengths 1 16 ⌀	Unit_Kcat/Km stringclasses 30 values	Kcleav stringclasses 52 values	Unit_Kcleav stringclasses 3 values	Commentary[Temp] stringclasses 29 values	Commentary[pH] stringclasses 34 values	Commentary[Mutant] stringlengths 2 89 ⌀	Commentary[Others] stringlengths 3 94 ⌀	pubmed_id stringclasses 164 values	Source stringclasses 4 values
G6-15	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.9 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-15	5 mM MgCl6	10525416	Table
G25 population	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.1 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25 population	5 mM MgCl7	10525416	Table
G25-6	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.5 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-6	5 mM MgCl8	10525416	Table
G25-7	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.9 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-7	5 mM MgCl9	10525416	Table
G25-8	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.4 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-8	5 mM MgCl10	10525416	Table
G25-9	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.1 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-9	5 mM MgCl11	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.9 × 10^6	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	WT	5 mM MgCl12	10525416	Table
G6-population	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.4 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-population	5 mM MgCl13	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.2 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-3	5 mM MgCl14	10525416	Table
G6-4	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.2 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-4	5 mM MgCl15	10525416	Table
G6-11	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6.3 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-11	5 mM MgCl16	10525416	Table
G6-12	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.8 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-12	5 mM MgCl17	10525416	Table
G6-13	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.1 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-13	5 mM MgCl18	10525416	Table
G6-15	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.6 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-15	5 mM MgCl19	10525416	Table
G25 population	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.8 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25 population	5 mM MgCl20	10525416	Table
G25-6	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.4 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-6	5 mM MgCl21	10525416	Table
G25-7	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.5 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-7	5 mM MgCl22	10525416	Table
G25-8	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.1 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-8	5 mM MgCl23	10525416	Table
G25-9	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.7 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-9	5 mM MgCl24	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	prTNA^Tyr	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6.0 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	WT	5 mM MgCl25	10525416	Table
G6-4	Escherichia coli	prTNA^Tyr	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.2 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-4	5 mM MgCl26	10525416	Table
G25 population	Escherichia coli	prTNA^Tyr	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.5 × 10^3	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25 population	5 mM MgCl27	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	prTNA^Tyr	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.9 × 10^3	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-10	5 mM MgCl28	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	208	nM	9.5 × 10^-3	min^-1	4.6 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-10	20 mM MgCl2	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	62	nM	1.2 × 10^-2	min^-1	1.9 × 10^6	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	WT	NA	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	105	nM	4.4 × 10^-3	min^-1	4.2 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-3	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	RNA oligonucleotide	NA	NA	229	nM	4.3 × 10^-2	min^-1	1.9 × 10^6	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-10	NA	10525416	Table
M1 RNA	Escherichia coli	ptRNA	NA	NA	5478	nM	3.4 × 10^-1	min^-1	6.0 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	WT	NA	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	ptRNA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.2 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-3	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	ptRNA	NA	NA	2652	nM	5.0 × 10^-4	min^-1	1.9 × 10^3	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-10	NA	10525416	Table
M1 RNA	Escherichia coli	p4.5S RNA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.4 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	WT	NA	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	p4.5S RNA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5.6 × 10^3	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-3	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	p4.5S RNA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.7 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-10	NA	10525416	Table
M1 RNA	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.5 × 10^3	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	WT	100 mM MgCl2, trans	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.8 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-3	100 mM MgCl2, trans	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.6 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-10	100 mM MgCl2, trans	10525416	Table
M1 RNA	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6.5 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	WT	100 mM MgCl2, cis	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7.2 × 10^6	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G6-3	100 mM MgCl2, cis	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.5 × 10^6	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-10	100 mM MgCl2, cis	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.8 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	G25-10	20 mM MgCl2, trans	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.2 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	59U	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.6 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	173G	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.8 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	228U	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.4 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	299C	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	35	nM	3.5 × 10^-6	min^-1	9.8 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	396A	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.6 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	59U 299C	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9.6 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	59U 396A	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.8 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	173G 228U	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.0 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	228U 396A	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9.5 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	299C 296A	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.4 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	59U 228U 299C	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.5 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	59U 173G 299C	NA	10525416	Table
M1GS	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9.7 × 10^2	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	59U 299C 396A	NA	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.2 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	59G	NA	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.5 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	299U	NA	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	300	nM	1.5 × 10^-4	min^-1	5.0 × 10^3	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	396G	NA	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.4 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	59G 299U	NA	10525416	Table
G6-3	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.1 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	370U 374A	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.5 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	59G	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.4 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	173A	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	290	nM	3.7 × 10^-3	min^-1	1.2 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	228C	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.8 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	299U	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	507	nM	2.2 × 10^-3	min^-1	4.3 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	396G	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.1 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	173A 228C	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	520	nM	2× 10^-3	min^-1	3.8 × 10^4	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	228C 396G	NA	10525416	Table
G25-10	Escherichia coli	DNA oligonucleotide	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.3 × 10^5	min^-1 M^-1	NA	NA	37°C	NA	370U 374A	NA	10525416	Table
Class I ligase	NA	S^OH	NA	NA	NA	NA	3.75	min^-1	NA	NA	NA	NA	22°C	6	207t	60 mM MgCl2, 200 mM KCl, 600 µM EDTA	10715133	Text
Class I ligase	NA	S^OH	NA	NA	NA	NA	375	min^-1	NA	NA	NA	NA	22°C	8	207t	60 mM MgCl2, 200 mM KCl, 600 µM EDTA	10715133	Text
Class I ligase	NA	S^OH·PPP S	NA	NA	0.22	µM	3	min^-1	NA	NA	NA	NA	22°C	6	207t	60 mM MgCl2, 200 mM KCl, 600 µM EDTA	10715133	Table
Class I ligase	NA	S^OH·PPP S	NA	NA	0.23	µM	16	min^-1	NA	NA	NA	NA	22°C	8	207t	60 mM MgCl2, 200 mM KCl, 600 µM EDTA	10715133	Table
Class I ligase	NA	S^OH·PPP S	NA	NA	1.5	µM	35	min^-1	NA	NA	NA	NA	22°C	9	207t	60 mM MgCl2, 200 mM KCl, 600 µM EDTA	10715133	Table
Class I ligase	NA	S^OH·PPP S	NA	NA	4.2	µM	3	min^-1	NA	NA	NA	NA	22°C	6	210t	60 mM MgCl2, 200 mM KCl, 600 µM EDTA	10715133	Table
Class I ligase	NA	S^OH·PPP S	NA	NA	7.8	µM	140	min^-1	NA	NA	NA	NA	22°C	8	210t	60 mM MgCl2, 200 mM KCl, 600 µM EDTA	10715133	Table
Class I ligase	NA	S^OH·PPP S	NA	NA	25	µM	360	min^-1	NA	NA	NA	NA	22°C	9	210t	60 mM MgCl2, 200 mM KCl, 600 µM EDTA	10715133	Table
P4-P6	Tetrahymena thermophila	NA	31	s^-1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35°C	8.3	WT	1× TB buffer + 10.6 mM Mg^2+	11015228	Text
P4-P6	Tetrahymena thermophila	NA	15.4	s^-1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35°C	8.3	WT	1× TB buffer + 200 mM NaCl + 10.6 mM Mg^2+	11015228	Text
P4-P6	Tetrahymena thermophila	NA	4.7	s^-1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25°C	8.3	WT	1× TB buffer + 200 mM NaCl + 10.6 mM Mg^2+	11015228	Text
P4-P6	Tetrahymena thermophila	NA	0.99	s^-1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15°C	8.3	WT	1× TB buffer + 200 mM NaCl + 10.6 mM Mg^2+	11015228	Text
P4-P6	Tetrahymena thermophila	NA	0.155	s^-1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4°C	8.3	WT	1× TB buffer + 200 mM NaCl + 10.6 mM Mg^2+	11015228	Text
GTP ribozyme	NA	GTP	NA	NA	4.1	mM	2.4	min^-1	590	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Text
CTP ribozyme	NA	CTP	NA	NA	7.4	mM	2.5	min^-1	340	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	G8	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Text
GTP ribozyme	NA	CTP	NA	NA	20	mM	3 × 10^-2	min^-1	1.5	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Text
CTP ribozyme	NA	GTP	NA	NA	8	mM	4 × 10^-3	min^-1	0.5	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	G8	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Text
GTP ribozyme	NA	pppGGA	NA	NA	0.6	mM	190	min^-1	3 × 10^5	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Text
GTP ribozyme	NA	pyrophosphate	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3 × 10^-2	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl, 100 µM pppGGA	11112542	Text
GTP ribozyme	NA	aaaCCAGUCGG*dA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.5 × 10^-6	min^-1	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Text
GTP ribozyme	NA	pppGGA	NA	NA	0.6	mM	1,9	min^-1	3 × 10^3	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	6	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Text
GTP ribozyme	NA	pppG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Table
GTP ribozyme	NA	pppGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21000	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Table
GTP ribozyme	NA	pppGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800000	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Table
GTP ribozyme	NA	pppGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25000	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Table
GTP ribozyme	NA	pppGGCU	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1800	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Table
GTP ribozyme	NA	pppGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310	M^-1 min^-1	NA	NA	22°C	8	WT	60 mM MgCl2, 200 mM KCl	11112542	Table
DNAzyme	Homo sapiens	12-LOX RNA substrate	NA	NA	3	nM	1	min^-1	33	pM^-1·min^-1	NA	NA	37°C	7.5	WT	10 mM Mg^2+	11409904	Table
DNAzyme	Homo sapiens	12-LOX RNA substrate	NA	NA	10	nM	0.26	min^-1	26	pM^-1·min^-1	NA	NA	37°C	7.5	S-modified	10 mM Mg^2+	11409904	Table
L-21 ScaI	Tetrahymena thermophila	dS_UA	NA	NA	68	nM	null	null	1543	M-1 min-1	NA	NA	30°C	7	WT	2 mM G,50 mM NaMES (pH 7.0), 10 mM MgCl2	11551186	Table
L-21 ScaI	Tetrahymena thermophila	dS_TT	NA	NA	43	nM	null	null	223	M-1 min-1	NA	NA	30°C	7	WT	2 mM G,50 mM NaMES (pH 7.0), 10 mM MgCl2	11551186	Table
L-21 ScaI	Tetrahymena thermophila	dS_T_mp_T	NA	NA	61	nM	null	null	280000	M-1 min-1	NA	NA	30°C	7	WT	2 mM G,50 mM NaMES (pH 7.0), 10 mM MgCl2	11551186	Table
L-21 ScaI	Tetrahymena thermophila	cS_TT	NA	NA	990	nM	null	null	0.015	× 10^7 M^-1 min^-1	NA	NA	50°C	5.5	WT	5 mM pG，50 mM NaMES (pH 7.0), 10 mM MgCl2	11551186	Table
L-21 ScaI	Tetrahymena thermophila	cS_T_mp_T	NA	NA	110	nM	null	null	6.2	× 10^7 M^-1 min^-1	NA	NA	50°C	5.5	WT	5 mM pG，50 mM NaMES (pH 7.0), 10 mM MgCl2	11551186	Table

Subsets and Splits

No community queries yet

The top public SQL queries from the community will appear here once available.