Ribozyme stringlengths 2 37 | Organism stringclasses 56
values | Variable_reactant stringlengths 2 100 ⌀ | Kobs stringlengths 1 19 ⌀ | Unit_Kobs stringclasses 11
values | km stringclasses 287
values | Unit_Km stringclasses 11
values | kcat stringclasses 262
values | Unit_Kcat stringclasses 9
values | km_kcat stringlengths 1 16 ⌀ | Unit_Kcat/Km stringclasses 30
values | Kcleav stringclasses 52
values | Unit_Kcleav stringclasses 3
values | Commentary[Temp] stringclasses 29
values | Commentary[pH] stringclasses 34
values | Commentary[Mutant] stringlengths 2 89 ⌀ | Commentary[Others] stringlengths 3 94 ⌀ | pubmed_id stringclasses 164
values | Source stringclasses 4
values |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
B6-7/7 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0.0002 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | NA | 38-mer | 11911367 | Table |
B23-7/7 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0.0002 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | NA | 40-mer | 11911367 | Table |
GCcgaaagGCGaGuCaaGGuCu | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0.07 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | 8.1 GCcgaaagGCGaGuCaaGGuCu | 40-mer | 11911367 | Table |
GCcgaaagGCGaGucaaGGuCu | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0.03 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | 8.2 GCcgaaagGCGaGucaaGGuCu | 40-mer | 11911367 | Table |
GCcgaaagGCGaGucaaGGuCu | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0.024 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | 8.3 GCcgaaagGCGaGucaaGGuCu | 40-mer | 11911367 | Table |
RNase P | Escherichia coli | mature tRNA | NA | NA | 63 | nM | 0.037 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.8 | WT | 60 mM MgCl2, 100 mM NH4Cl, 5% polyethylene glycol 6000, 50 mM Tris-HCl | 12400701 | Text |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.078 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | WT | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.013 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | C18dC | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.0033 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | C19dC | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.0057 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | U20dU | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.033 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | C21dC | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.028 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | U23dU | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.029 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G25dG | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.0093 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G28G* | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.0087 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G29G* | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.021 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G38dG | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.011 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G38G* | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.026 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G39dG | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.021 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G39I | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.011 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G40dG | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.01 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | C41dC | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.01 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | A42dA | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.0053 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | A42A* | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.019 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | A43dA | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.0043 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G74dG | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.0028 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | C75dC | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.012 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G76dG | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.011 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | A77dA | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.017 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | A77A* | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.0034 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | A78dA | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.015 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | A78A* | 10 mM Mg2+ | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 11 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 25°C | 7.4 | CdS4 | 0.1 mM EDTA | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.16 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G74dG | 40 mM Tris/HCl | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.43 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | C75dC | 40 mM Tris/HCl | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.54 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | G76dG | 40 mM Tris/HCl | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.95 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | A77dA | 40 mM Tris/HCl | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | null | 0.27 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.4 | A78dA | 40 mM Tris/HCl | 12444967 | Table |
HDV | Hepatitis delta virus | Imidazole | 0.0021 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.1 | C75(N4Et)dC | 200 mM Imidazole | 12444967 | Text |
DiGIR1 | Didymium iridis | NA | 0.053 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 45°C | NA | WT | 1 M K^+, 25 mM Mg^2+ | 12458083 | Text |
DiGIR1 | Didymium iridis | NA | 0.006 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 45°C | NA | U232C | 1 M K^+, 25 mM Mg^2+ | 12458083 | Text |
DiGIR1 | Didymium iridis | NA | 0.016 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 45°C | NA | G109A | 1 M K^+, 25 mM Mg^2+ | 12458083 | Text |
DiGIR1 | Didymium iridis | NA | ~0.000 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 45°C | NA | ΔCAU | 1 M K^+, 25 mM Mg^2+ | 12458083 | Figure |
DiGIR1 | Didymium iridis | NA | 0.013 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 45°C | NA | U203C/U207C | 1 M K^+, 25 mM Mg^2+ | 12458083 | Figure |
DiGIR1 | Didymium iridis | NA | 0.009 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 45°C | NA | G109A/U203C/U207C | 1 M K^+, 25 mM Mg^2+ | 12458083 | Figure |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 1.5 × 10^-1 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bc | 5 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 9.7 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bc | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 2.0 × 10^-3 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc | 5 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 5.4 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 5.1 × 10^-3 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bc(A184U) | 5 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 8.7 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bc(A184U) | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 1.2 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5/J5 | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 2.8 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bc/L9 | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 4.2 × 10^-4 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc/L9 | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 1.2 × 10^-3 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5/J5/L9 | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | GTP | NA | NA | 39 | μM | 2.0 × 10^-1 | /min | 5.1 × 10^3 | /M/min | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bc | 5 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | GTP | NA | NA | 93 | μM | 5.5 × 10^-3 | /min | 5.9 × 10^1 | /M/min | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc | 5 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | GTP | NA | NA | 780 | μM | 3.3 × 10^-1 | /min | 4.2 × 10^2 | /M/min | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc-BT | 5 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | GTP | NA | NA | 0.75 | μM | 1.0 × 10^-1 | /min | 1.3 × 10^5 | /M/min | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bc | 25 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | GTP | NA | NA | 3.3 | μM | 7.4 × 10^-2 | /min | 2.2 × 10^4 | /M/min | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc | 25 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | GTP | NA | NA | 2.2 | μM | 1.9 × 10^-1 | /min | 8.6 × 10^4 | /M/min | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc-BT | 25 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 7.1 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bc-BT | 5 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 6.3 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc-BT | 5 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 2.7 × 10^-1 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bc-BT | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 3.2 × 10^-1 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc-BT | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 4.7 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5bcBT/L9 | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 4.4 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bcBT/L9 | 15 mM Mg^2+ | 12485161 | Table |
Group I intron | Tetrahymena thermophila | NA | 8.5 × 10^-2 | /min | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | ΔP5a2bc | 25 mM Mg^2+ | 12485161 | Text |
9F21 | NA | branched RNA | 0.1 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | NA | 20 mM Mn^2+ | 12783536 | Text |
9F13 | NA | branched RNA | 2.2 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37°C | 7.5 | NA | 20 mM Mn^2+ | 12783536 | Text |
DNA splint | NA | Mg2+-dependent self-splicing group Il introns | 1 × 10^-4 | h^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 80 mM Mg^2+ | 12783536 | Text |
DNA splint | NA | Mg2+-dependent spliceosome in vitro | 1 | h^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 80 mM Mg^2+ | 12783536 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.5 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5 | WT | 200 µM Pb^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 2 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5 | Mg5 | 200 µM Pb^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 1 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5 | 17E | 200 µM Pb^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 5.75 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | 100 µM Pb^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 1.35 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | 10 mM Zn^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 0.24 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | 10 mM Mn^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 0.25 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | 10 mM Co^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 0.008 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | 10 mM Ni^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 0.017 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | 10 mM Mg^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 0.015 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | 10 mM Ca^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 0.0005 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | 10 mM Sr^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 0.0003 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | 10 mM Ba^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | NA | NA | 13.5 | µM | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | Pb^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | NA | NA | 0.9970 | mM | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6 | 17E | Zn^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | NA | NA | 10.5 | mM | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 7 | 17E | Mg^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.99 | min^-1 | 0.52 | µM | 0.5 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | 28°C | 5 | 17E | 200 µM Pb^2+, 100 mM NaNO3 | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.99 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 6 | 17E | 5 mM Zn^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.47 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 5 | 8-17 | 200 µM Pb^2+, 100 mM NaNO3 | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.12 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 6 | 8-17 | 5 mM Zn^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 2.1 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 5 | Mg5 | 200 µM Pb^2+, 100 mM NaNO3 | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.74 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 6 | Mg5 | 5 mM Zn^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.1 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 5 | (E) C^2.2 → T | 200 µM Pb^2+, 100 mM NaNO3 | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.091 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 6 | (E) C^2.2 → T | 5 mM Zn^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.4 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 5 | (E) A^16.1 → G | 200 µM Pb^2+, 100 mM NaNO3 | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.3 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 6 | (E) A^16.1 → G | 5 mM Zn^2+ | 12795611 | Text |
8-17 | NA | NA | 0.47 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 5 | (E) -A^15.0; T^12 → A | 200 µM Pb^2+, 100 mM NaNO3 | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 0.12 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 6 | (E) -A^15.0; T^12 → A | 5 mM Zn^2+ | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 2.06 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 5 | (E) T^12 → A; C^3 → G; C^4 → T; G^5 → C; C^9 → G; G^10 → A; G^11 → C | 200 µM Pb^2+, 100 mM NaNO3 | 12795611 | Table |
8-17 | NA | NA | 0.74 | min^-1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 28°C | 6 | (E) T^12 → A; C^3 → G; C^4 → T; G^5 → C; C^9 → G; G^10 → A; G^11 → C | 5 mM Zn^2+ | 12795611 | Table |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.