id int64 0 4.72k | body stringlengths 12 227 | answer stringlengths 2 3.35k | relevant_passages listlengths 1 83 | approx_word_count_original int64 10 3.79k | approx_word_count_translated int64 8 2.21k |
|---|---|---|---|---|---|
2,200 | Lijst van kenmerken van het Kaufman Oculocerebrofaciale Syndroom. | Klinische kenmerken van het Kaufman Oculocerebrofaciale Syndroom omvatten hypotonie, ontwikkelingsachterstand, verstandelijke beperking, lage cholesterolwaarden, microcefalie, lang smal gezicht, oculaire afwijkingen en lange dunne handen en voeten. | [
"Een paar zussen werd vastgesteld met meerdere aangeboren afwijkingen, waaronder uitgesproken craniofaciale dysmorfismen met blefarofimose, en ernstige psychomotore achterstand.",
"Genetische syndromen die zowel hersen- als oogafwijkingen omvatten zijn talrijk en omvatten syndromen zoals Warburg micro syndroom, Kaufman oculocerebrofaciaal syndroom, Cerebro-oculo-facio-skeletaal syndroom, Kahrizi syndroom en anderen.",
"Biallelische mutaties van UBE3B zijn recentelijk aangetoond de oorzaak te zijn van het Kaufman oculocerebrofaciale syndroom (ook gerapporteerd als blefarofimose-ptose-verstandelijke beperking syndroom), een autosomaal recessieve aandoening gekenmerkt door hypotonie, ontwikkelingsachterstand, verstandelijke beperking, aangeboren afwijkingen, karakteristieke gezichts-dysmorfische kenmerken en lage cholesterolwaarden.",
"ACHTERGROND: Het Kaufman oculocerebrofaciale syndroom (KOS) is een ontwikkelingsstoornis gekenmerkt door verminderde groei, microcefalie, oculaire afwijkingen (microcornea, strabismus, myopie en bleke papil), onderscheidende gelaatskenmerken (smalle oogopeningen, telecanthus, dunne en lateraal brede wenkbrauwen, preauriculaire tags en micrognathie), verstandelijke beperking en gegeneraliseerde hypotonie.",
"Het Kaufman oculocerebrofaciale syndroom (KOS) is een zeldzame autosomaal recessieve aandoening gekenmerkt door ernstige verstandelijke beperking, microcefalie, lang smal gezicht, oculaire afwijkingen en lange dunne handen en voeten.",
"Beiden vertoonden psychomotore retardatie, microcefalie, blefarofimose en vertraagde groei als belangrijkste kenmerken; de baby had ook preauriculaire tags en een grote clitoris.",
"Het Kaufman oculocerebrofaciale syndroom (KOS) is een ontwikkelingsstoornis gekenmerkt door verminderde groei, microcefalie, oculaire afwijkingen (microcornea, strabismus, myopie en bleke papil), onderscheidende gelaatskenmerken (smalle oogopeningen, telecanthus, dunne en lateraal brede wenkbrauwen, preauriculaire tags en micrognathie), verstandelijke beperking en gegeneraliseerde hypotonie.",
"Biallelische mutaties van UBE3B zijn recentelijk aangetoond de oorzaak te zijn van het Kaufman oculocerebrofaciale syndroom (ook gerapporteerd als blefarofimose-ptose-verstandelijke beperking syndroom), een autosomaal recessieve aandoening gekenmerkt door hypotonie, ontwikkelingsachterstand, verstandelijke beperking, aangeboren afwijkingen, karakteristieke gezichts-dysmorfische kenmerken en lage cholesterolwaarden.",
"Het Kaufman oculocerebrofaciale syndroom (KOS) is een ontwikkelingsstoornis gekenmerkt door verminderde groei, microcefalie, oculaire afwijkingen (microcornea, strabismus, myopie en bleke papil), onderscheidende gelaatskenmerken (smalle oogopeningen, telecanthus, dunne en lateraal brede wenkbrauwen, preauriculaire tags en micrognathie), verstandelijke beperking en gegeneraliseerde hypotonie.",
"Het Kaufman oculocerebrofaciale syndroom (KOS) is een zeldzame autosomaal recessieve aandoening gekenmerkt door ernstige verstandelijke beperking, microcefalie, lang smal gezicht, oculaire afwijkingen en lange dunne handen en voeten.",
"Het Kaufman oculocerebrofaciale syndroom (KOS) is een zeldzame autosomaal recessieve aandoening gekenmerkt door ernstige verstandelijke beperking, microcefalie, lang smal gezicht, oculaire afwijkingen en lange dunne handen en voeten."
] | 388 | 374 |
2,201 | Wat is de rol van DNA-reparatiecofactoren ATMIN en NBS1? | De DNA-dubbelstrengsbreuk signaleringskinase ATM en zijn cofactor NBS1 zijn vereist tijdens de ontwikkeling van T-cellen en voor het behoud van genomische stabiliteit. De rol van een tweede ATM-cofactor, ATMIN (ook bekend als ASCIZ), in T-cellen is veel minder duidelijk, en of ATMIN en NBS1 synergistisch functioneren in T-cellen is onbekend. | [
"DNA-reparatiecofactoren ATMIN en NBS1 zijn vereist om T-celactivatie te onderdrukken.",
"Hier onderzoeken we de rollen van ATMIN en NBS1, afzonderlijk of in combinatie, met behulp van muismodellen. We tonen aan dat verlies van NBS1 leidde tot een ontwikkelingsblokkade in de dubbel-positieve fase van de T-celontwikkeling, evenals verminderde TCRα-recombinatie, wat onverwacht noch verergerd noch verlicht werd door gelijktijdig verlies van ATMIN. Daarentegen versterkte het verlies van zowel ATMIN als NBS1 DNA-schade die spontane perifere T-cel hyperactivatie, proliferatie en overmatige productie van pro-inflammatoire cytokines en chemokines veroorzaakte, wat leidde tot een sterk ontstekingsbevorderende omgeving. Intrigerend genoeg waren de ziekteveroorzakende T-cellen grotendeels bekwaam voor zowel ATMIN als NBS1. In vivo resulteerde dit in ernstige darmontsteking, colitis en voortijdige dood. Onze bevindingen onthullen een nieuw model voor een fenotype van inflammatoire darmziekte dat optreedt bij gecombineerd verlies van de DNA-reparatiecofactoren ATMIN en NBS1.",
"Onze bevindingen onthullen een nieuw model voor een fenotype van inflammatoire darmziekte dat optreedt bij gecombineerd verlies van de DNA-reparatiecofactoren ATMIN en NBS1.",
"Daarentegen versterkte het verlies van zowel ATMIN als NBS1 DNA-schade die spontane perifere T-cel hyperactivatie, proliferatie en overmatige productie van pro-inflammatoire cytokines en chemokines veroorzaakte, wat leidde tot een sterk ontstekingsbevorderende omgeving.",
"DNA-reparatiecofactoren ATMIN en NBS1 zijn vereist om T-celactivatie te onderdrukken",
"Onze bevindingen onthullen een nieuw model voor een fenotype van inflammatoire darmziekte dat optreedt bij gecombineerd verlies van de DNA-reparatiecofactoren ATMIN en NBS1",
"Onze bevindingen onthullen een nieuw model voor een fenotype van inflammatoire darmziekte dat optreedt bij gecombineerd verlies van de DNA-reparatiecofactoren ATMIN en NBS1.",
"Daarentegen versterkte het verlies van zowel ATMIN als NBS1 DNA-schade die spontane perifere T-cel hyperactivatie, proliferatie en overmatige productie van pro-inflammatoire cytokines en chemokines veroorzaakte, wat leidde tot een sterk ontstekingsbevorderende omgeving.",
"We tonen aan dat verlies van NBS1 leidde tot een ontwikkelingsblokkade in de dubbel-positieve fase van de T-celontwikkeling, evenals verminderde TCRα-recombinatie, wat onverwacht noch verergerd noch verlicht werd door gelijktijdig verlies van ATMIN.",
"DNA-reparatiecofactoren ATMIN en NBS1 zijn vereist om T-celactivatie te onderdrukken."
] | 415 | 373 |
2,202 | Het BMR-vaccin beschermt tegen welke 3 virussen? | Het BMR-vaccin biedt immuniteit tegen mazelen, bof en rodehond. | [
"mazelen, bof en rodehond (BMR) vaccin ",
"Mazelen-, bof-, rodehond (BMR) vaccin is een levend vaccinpreparaat dat verzwakte stammen van alle 3 de virussen bevat."
] | 40 | 38 |
2,203 | Noem de belangrijkste kenmerken van het Triple A-syndroom. | Het Triple A-syndroom, ook bekend als het Allgrove-syndroom, is een zeldzame ziekte die voornamelijk bij kinderen voorkomt. De belangrijkste symptomen zijn achalasie, alacrima en bijnierinsufficiëntie. | [
"ONGETITELD: Het Triple A-syndroom (alacrima, achalasie, bijnierfalen, progressieve neurodegeneratieve aandoening) wordt veroorzaakt door mutaties in het AAAS-gen dat het eiwit alacrima achalasie bijnierinsufficiëntie neurologische aandoening (ALADIN) codeert.",
"Het Triple A-syndroom, ook bekend als het Allgrove-syndroom, is een zeldzame ziekte die voornamelijk bij kinderen voorkomt. De belangrijkste symptomen zijn achalasie, alacrima en resistentie tegen adrenocorticotroop hormoon (ACTH).",
"ACHTERGROND: Slokdarmachalasie is goed bekend maar relatief zeldzaam bij kinderen, en verschijnt soms als het \"triple A\"-syndroom (met bijnierinsufficiëntie en alacrima).",
"Patiënten vertonen meestal de triade van achalasie, alacrima en ACTH-resistente bijnierinsufficiëntie, hoewel de presentatie wisselend is.",
"Het Allgrove (Triple A) syndroom is een zeldzame autosomaal recessieve aandoening die wordt gekenmerkt door de belangrijkste kenmerken van bijnierinsufficiëntie door resistentie tegen adrenocorticotroop hormoon (ACTH), achalasie en alacrima.",
"Het Triple A-syndroom, ook bekend als het Allgrove-syndroom, is een zeldzame autosomaal recessieve aandoening die wordt gekenmerkt door drie belangrijke symptomen: bijnierinsufficiëntie door ACTH-resistentie, achalasie en alacrima.",
"Het Allgrove (Triple A) syndroom is een zeldzame autosomaal recessieve aandoening die wordt gekenmerkt door de belangrijkste kenmerken van bijnierinsufficiëntie door resistentie tegen adrenocorticotroop hormoon (ACTH), achalasie en alacrima."
] | 206 | 203 |
2,204 | Beschrijf de toepasbaarheid van Basset in de context van deep learning | Basset is een open source pakket dat CNN's toepast om de functionele activiteit van DNA-sequenties te leren uit genomische data. Basset is getraind op een verzameling toegankelijke genomische locaties die in 164 celtypen zijn in kaart gebracht met DNase-seq, en toonde een grotere voorspellende nauwkeurigheid dan eerdere methoden. Basset-voorspellingen voor de verandering in toegankelijkheid tussen variant-allelen waren veel groter voor Genome-wide association study (GWAS) SNP's die waarschijnlijk causaal zijn in vergelijking met nabijgelegen SNP's in linkage disequilibrium met hen. Met Basset kan een onderzoeker een enkele sequencing assay uitvoeren in hun celtype van interesse en tegelijkertijd de chromatine-toegankelijkheidscode van die cel leren en elke mutatie in het genoom annoteren met de invloed op de huidige toegankelijkheid en het latente potentieel voor toegankelijkheid. Zo biedt Basset een krachtige computationele benadering om het niet-coderende genoom te annoteren en te interpreteren. | [
"Basset: het leren van de regulerende code van het toegankelijke genoom met diepe convolutionele neurale netwerken.",
"We introduceren het open source pakket Basset om CNN's toe te passen om de functionele activiteit van DNA-sequenties te leren uit genomische data. We trainden Basset op een verzameling toegankelijke genomische locaties die in 164 celtypen zijn in kaart gebracht met DNase-seq, en tonen een grotere voorspellende nauwkeurigheid dan eerdere methoden. Basset-voorspellingen voor de verandering in toegankelijkheid tussen variant-allelen waren veel groter voor Genome-wide association study (GWAS) SNP's die waarschijnlijk causaal zijn in vergelijking met nabijgelegen SNP's in linkage disequilibrium met hen. Met Basset kan een onderzoeker een enkele sequencing assay uitvoeren in hun celtype van interesse en tegelijkertijd de chromatine-toegankelijkheidscode van die cel leren en elke mutatie in het genoom annoteren met de invloed op de huidige toegankelijkheid en het latente potentieel voor toegankelijkheid. Zo biedt Basset een krachtige computationele benadering om het niet-coderende genoom te annoteren en te interpreteren.",
"Basset: het leren van de regulerende code van het toegankelijke genoom met diepe convolutionele neurale netwerken."
] | 306 | 318 |
2,205 | Codeert het Abelson-gerelateerde gen (ARG) voor een serinekinase? | Nee, het ARG-gen codeert voor een niet-receptor tyrosinekinase. | [
"Een isoform van Arg/Abl2 tyrosinekinase is nucleair en de andere zeven cytosolische isoformen moduleren op verschillende wijze de celmorfologie, motiliteit en het cytoskelet.",
"Het niet-receptor tyrosinekinase Abelson-gerelateerd gen (Arg/Abl2) reguleert celmigratie en morfogenese door het moduleren van het cytoskelet.",
"Het menselijke Arg (Abl2) niet-receptor tyrosinekinase speelt een rol bij cytoskeletale herschikkingen via zijn C-terminale F-actine- en microtubule-bindende sequenties.",
"Het tyrosinekinase abl-gerelateerde gen ARG is gefuseerd met ETV6 in een AML-M4Eo patiënt met een t(1;12)(q25;p13): moleculaire kloning van beide reciproque transcripties.",
"Het ARG-gen codeert voor een niet-receptor tyrosinekinase dat gekenmerkt wordt door een hoge homologe met c-Abl in de TK-, SH2- en SH3-domeinen. Dit is het eerste rapport over betrokkenheid van ARG bij een menselijke maligniteit.",
"Ultraviolet-A en -B wijzigen verschillend het tyrosinekinaseprofiel van menselijke keratinocyten en induceren de expressie van Arg+.",
"Arg (Abelson-gerelateerd gen, Abl2) was het PTK met de hoogste prevalentie (30% van alle PTK's) en UVA leidde tot een verdere inductie van Arg-expressie, die negenvoudige mRNA-baseline expressie bereikte 17 uur na bestraling.",
"Om het expressieprofiel van proteïne tyrosinekinasen (PTK's) in normale menselijke epidermale keratinocyten (NHEK) te onderzoeken als reactie op UVA en UVB, gebruikten we een omgekeerde transcriptase polymerasekettingreactie (PCR)-benadering met degeneratieve primers afgeleid van het geconserveerde katalytische domein van PTK's.",
"Door middel van 3' snelle amplificatie van cDNA-einden-polymerasekettingreactie (3'RACE-PCR) werd een nieuw fusietranscript geïdentificeerd tussen ETV6 en het Abelson-gerelateerde gen (ARG) op 1q25, resulterend in een chimere proteïne bestaande uit het HLH-oligomerisatiedomein van ETV6 en de SH2-, SH3- en proteïne tyrosinekinase (PTK)-domeinen van ARG.",
"Het niet-receptor tyrosinekinase Abelson-gerelateerd gen (Arg/Abl2) reguleert celmigratie en morfogenese door het moduleren van het cytoskelet.",
"Arg (Abelson-gerelateerd gen, Abl2) was het PTK met de hoogste prevalentie (30% van alle PTK's) en UVA leidde tot een verdere inductie van Arg-expressie, die negenvoudige mRNA-baseline expressie bereikte 17 uur na bestraling.",
"We bestudeerden de relatie tussen directe karyotypen, bepaald bij diagnose en remissie, en Abelson-gerelateerde tyrosinekinase-activiteit en de cytogenetische kenmerken van erytroïde en myeloïde kolonies afgeleid van remissiemerg van zes kinderen met acute lymfatische leukemie (ALL).",
"ABL2/ARG (ABL-gerelateerd gen) behoort tot de ABL (Abelson tyrosine-proteïne kinase) familie van tyrosinekinasen.",
"Het niet-receptor tyrosinekinase Abelson-gerelateerd gen (Arg/Abl2) reguleert celmigratie en morfogenese door het moduleren van het cytoskelet.",
"Het ARG-gen codeert voor een niet-receptor tyrosinekinase dat gekenmerkt wordt door een hoge homologe met c-Abl in de TK-, SH2- en SH3-domeinen.",
"ABL2/ARG (ABL-gerelateerd gen) behoort tot de ABL (Abelson tyrosine-proteïne kinase) familie van tyrosinekinasen.",
"We rapporteren dat de Abelson (Abl) en Abl-gerelateerde genen (Arg) niet-receptor tyrosinekinasen vereist zijn voor het behoud van corticale dendrieten in de muizenhersenen.",
"De producten van het menselijke ARG-gen en het menselijke ABL-gen kenmerken de Abelson-familie van niet-receptor tyrosine proteïnekinasen.",
"De producten van het menselijke Arg-gen en de menselijke, muis-, Drosophila- en nematode Abl-genen kenmerken de Abelson-familie van niet-receptor tyrosine proteïnekinasen.",
"Door middel van 3' snelle amplificatie van cDNA-einden-polymerasekettingreactie (3'RACE-PCR) werd een nieuw fusietranscript geïdentificeerd tussen ETV6 en het Abelson-gerelateerde gen (ARG) op 1q25, resulterend in een chimere proteïne bestaande uit het HLH-oligomerisatiedomein van ETV6 en de SH2-, SH3- en proteïne tyrosinekinase (PTK)-domeinen van ARG.",
"Het tyrosinekinase abl-gerelateerde gen ARG is gefuseerd met ETV6 in een AML-M4Eo patiënt met een t(1;12)(q25;p13): moleculaire kloning van beide reciproque transcripties."
] | 563 | 516 |
2,206 | Welk organisme veroorzaakt tularemie? | Francisella tularensis, de veroorzaker van tularemie, is een Gram-negatieve coccobacil die voornamelijk pathogeen is voor dieren en af en toe voor mensen. F. tularensis is de veroorzaker van zoönotische tularemie. | [
"Francisella tularensis, de veroorzaker van tularemie, is een Gram-negatieve coccobacil die voornamelijk pathogeen is voor dieren en af en toe voor mensen.",
"F. tularensis is de veroorzaker van zoönotische tularemie",
"Tularemie is een zoönose veroorzaakt door Francisella tularensis die op verschillende manieren op de mens kan worden overgedragen en verschillende klinische manifestaties kan veroorzaken",
"Tularemie is een bacteriële zoönose die wordt veroorzaakt door Francisella tularensis en behoort tot de infectieuze oorzaken van koorts van onbekende oorsprong (FUO) bij kinderen",
"De bacterie Francisella tularensis veroorzaakt de door vectoren overgedragen zoönose tularemie en kan een breed scala aan gastheren infecteren, waaronder ongewervelden, zoogdieren en vogels",
"Francisella tularensis, de Gram-negatieve bacterie die tularemie veroorzaakt, wordt beschouwd als een potentiële bioterrorismebedreiging vanwege de lage infectieuze dosis en de hoge morbiditeit en mortaliteit door luchtwegaandoeningen",
"Francisella tularensis veroorzaakt ziekte (tularemie) bij een groot aantal zoogdieren, waaronder de mens",
"De tularemie-veroorzakende bacterie Francisella tularensis is een facultatief intracellulair organisme met een complexe intracellulaire levenscyclus die zijn overleving en proliferatie in verschillende typen zoogdiercellen, waaronder professionele fagocyten, verzekert.",
"Francisella tularensis is een zeer virulente bacterie die tularemie veroorzaakt, een ziekte die vaak fataal is als deze niet wordt behandeld.",
"Tularemie, veroorzaakt door de gram-negatieve bacterie Francisella tularensis, is een ernstige, soms dodelijke ziekte.",
"Tularemie, veroorzaakt door de bacterie Francisella tularensis, waarbij F."
] | 234 | 237 |
2,207 | Is Prochlorococcus het meest voorkomende fotosynthetische organisme? | Ja, de mariene cyanobacterie Prochlorococcus is het kleinste en meest voorkomende fotosynthetische organisme op aarde. | [
"De mariene cyanobacterie Prochlorococcus is het kleinste en meest voorkomende fotosynthetische organisme op aarde.",
"De mariene cyanobacterie Prochlorococcus is het numeriek dominante fotosynthetische organisme in de oligotrofe oceanen, en een model systeem in de mariene microbiële ecologie.",
"De mariene cyanobacterie Prochlorococcus is het meest voorkomende fotosynthetische organisme in oligotrofe gebieden van de oceanen.",
"De oceanische picoplankton Prochlorococcus - waarschijnlijk het meest voorkomende fotosynthetische organisme op onze planeet - kan groeien op grote diepten waar de lichtintensiteit zeer laag is."
] | 95 | 96 |
2,208 | Noem 3 kenmerken van het IRVAN-syndroom. | Idiopathische retinale vasculitis, aneurysma's en neuroretinitis worden aangeduid als het IRVAN-syndroom. | [
"Fluoresceïne-fotodiagnose van idiopathische retinale vasculitis, aneurysma's en neuroretinitis (IRVAN)-syndroom: een casusrapport en langetermijnuitkomst van fotocoagulatie-therapie.",
"Idiopathische retinale vasculitis, aneurysma's en neuroretinitis (IRVAN)-syndroom is een aandoening die wordt gekenmerkt door meerdere retina macroaneurysma's, neuroretinitis en perifere capillaire non-perfusie, wat leidt tot onomkeerbaar verlies van het gezichtsvermogen.",
"[Vroege behandeling van idiopathische vasculitis, aneurysma's en neuroretinitis (IRVAN). Een casusrapport].",
"CASUSRAPPORT: Een 55-jarige vrouw presenteerde zich met retinale vasculitis, meerdere aneurysma's, maculaire exsudatie en wijdverspreide retinale non-perfusie en werd gediagnosticeerd met IRVAN.",
"Een 7-jarig meisje met IRVAN (idiopathische retinale vasculitis, aneurysma's en neuroretinitis) syndroom werd 9 jaar gevolgd.",
"Gezichtsverlies geassocieerd met het idiopathische retinale vasculitis, aneurysma's en neuroretinitis (IRVAN) syndroom ontstaat meestal door maculair oedeem of complicaties gerelateerd aan neovascularisatie.",
"DOEL: Het rapporteren van een geval van idiopathische retinale vasculitis, aneurysma's en neuroretinitis (IRVAN) syndroom geassocieerd met positieve perinucleaire antineutrofiele cytoplasmatische antilichamen (P-ANCA).",
"DOEL: Wij rapporteren onze ervaring met de behandeling van 2 patiënten met idiopathische retinale vasculitis, aneurysma en neuroretinitis (IRVAN) syndroom met het antitumornecrosefactormiddel infliximab, die een zeer gunstige respons op de behandeling vertoonden.",
"Fluoresceïne-angiografie toonde sacculaire aneurysma's van de retinale arteriolaire vaatstructuur, en het IRVAN-syndroom werd gediagnosticeerd.",
"De auteurs beschrijven de klinische kenmerken van tien patiënten met een nieuw syndroom dat wordt gekenmerkt door de aanwezigheid van retinale vasculitis, meerdere macroaneurysma's, neuroretinitis en perifere capillaire non-perfusie. De auteurs evalueerden tien patiënten die klinische kenmerken vertoonden die compatibel zijn met het syndroom van idiopathische retinale vasculitis, aneurysma's en neuroretinitis (IRVAN).",
"De auteurs evalueerden tien patiënten die klinische kenmerken vertoonden die compatibel zijn met het syndroom van idiopathische retinale vasculitis, aneurysma's en neuroretinitis (IRVAN)."
] | 268 | 266 |
2,209 | Welke Proproteïne Convertase Subtilisine Kexine 9 (PCSK9) remmers zijn door de FDA goedgekeurd? | De PCSK9-remmers die door de FDA zijn goedgekeurd zijn:
1) Alirocumab en
2) Evolocumab. | [
"Remming van het PCSK9-eiwit door monoklonale antilichamen resulteert in een dramatische verlaging van 40%-60% van het serum low-density lipoproteïne cholesterol (LDL-C).",
"Alirocumab en evolocumab zijn door de FDA goedgekeurd voor de behandeling van patiënten met heterozygote familiaire hypercholesterolemie en patiënten met klinische atherosclerotische cardiovasculaire ziekte die hun LDL-C-doel niet bereiken met maximaal verdragen statinetherapie en dieetmodificatie. Daarnaast is evolocumab door de FDA goedgekeurd voor homozygote familiaire hypercholesterolemie.",
"De verlaging van LDL-cholesterol (LDLC) is revolutionair veranderd door PCSK9-remmers, Alirocumab (Praluent) en Evolocumab (Repatha), goedgekeurd als aanvullende therapie bij maximaal verdragen cholesterolverlagende behandeling bij heterozygote (HeFH) of homozygote (HoFH) familiaire hypercholesterolemie en/of klinische atherosclerotische cardiovasculaire ziekte (CVD) waarbij de LDLC-verlaging onvoldoende is.",
"Een nieuwe klasse lipidenverlagende geneesmiddelen, remmers van PCSK9, heeft de afgelopen jaren indrukwekkende klinische gegevens opgeleverd, en alirocumab (Praluent) is de eerste die door de Amerikaanse FDA is goedgekeurd.",
"De tweede door de FDA goedgekeurde PCSK9-remmer evolocumab (Repatha) lijkt vergelijkbaar in werkzaamheid en veiligheid met alirocumab (Praluent), maar er zijn geen vergelijkende studies beschikbaar.",
"Twee proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) remmers, evolocumab en alirocumab, zijn recentelijk goedgekeurd door zowel de Food and Drug Administration (FDA) als het Europees Geneesmiddelenbureau (EMA) voor de behandeling van hypercholesterolemie.",
"Nieuwere middelen voor LDL-cholesterolverlaging omvatten de cholesterolestertransferproteïne-remmers, de microsomale triglyceride transferproteïne-remmer lomitapide, het apolipoproteïne B antisense oligonucleotide mipomersen en verschillende moleculen die proproteïne convertase subtilisine/kexine 9 (PCSK9) remmen of beïnvloeden. Van de verschillende PCSK9-remmers zijn er menselijke gegevens beschikbaar voor monoklonale antilichamen tegen PCSK9, waarvan de twee meest gevorderde alirocumab (SAR236553/REGN727) en AMG 145 zijn.",
"De 2- of 4-wekelijks subcutane therapie met de recent goedgekeurde antilichamen alirocumab en evolocumab voor remming van proproteïne convertase subtilisine-kexine type 9 (PCSK9) verlaagt het low-density lipoproteïne cholesterol (LDL-C) naast statines en ezetimibe met 50-60%.",
"In 2015 keurde de Amerikaanse Food and Drug Administration de eerste twee proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) remmers goed, alirocumab (Praluent®; Sanofi/Regeneron) en evolocumab (Repatha®; Amgen), voor gebruik bij patiënten met heterozygote en homozygote familiaire hypercholesterolemie en voor patiënten die statines niet verdragen of een hoog risico op cardiovasculaire ziekte (CVD) hebben maar hun LDL-cholesterol (LDL-C) niet tot optimale niveaus kunnen verlagen met statines en ezetimibe.",
"Zeer recente klinische onderzoeken hebben overweldigend de effectiviteit en veiligheid van PCSK9-remmers voor het verlagen van LDL-C bewezen. Zowel alirocumab als evolocumab zijn nu goedgekeurd door de Amerikaanse FDA en er zijn enkele eerste gunstige uitkomstgegevens.",
"De Food and Drug Administration keurde de eerste twee proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) remmers goed, alirocumab (Praluent®; Sanofi/Regeneron) en evolocumab (Repatha®; Amgen), voor gebruik bij patiënten met heterozygote en homozygote familiaire hypercholesterolemie en voor patiënten die statines niet verdragen of een hoog risico op cardiovasculaire ziekte (CVD) hebben maar hun LDL-cholesterol (LDL-C) niet tot optimale niveaus kunnen verlagen met statines en ezetimibe."
] | 494 | 466 |
2,210 | Is dupilumab een antilichaam dat zich richt op de IL-1 receptor? | Nee, Dupilumab is een volledig humaan monoklonaal antilichaam gericht tegen de IL-4 receptor α-subunit dat de signalering van IL-4 en IL-13 blokkeert, beide sleutelcytokines in Th2-gemedieerde routes. | [
"Atopische dermatitis (AD) wordt gekenmerkt door type 2 helper T (Th2) cel-gedreven ontsteking. Dupilumab is een volledig humaan monoklonaal antilichaam gericht tegen de IL-4 receptor α-subunit dat de signalering van IL-4 en IL-13 blokkeert, beide sleutelcytokines in Th2-gemedieerde routes.",
"Dupilumab, een gehumaniseerd monoklonaal antilichaam tegen de interleukine-4R, is het eerste antilichaam (d.w.z. 'biologisch middel') met gepubliceerde werkzaamheid aangetoond in gecontroleerde prospectieve studies bij atopische dermatitis.",
"Dupilumab, een humaan monoklonaal antilichaam tegen interleukine-4 receptor alfa, remt de signalering van interleukine-4 en interleukine-13, type 2 cytokines die mogelijk belangrijke drijfveren zijn van atopische of allergische aandoeningen zoals atopische dermatitis.",
"Het beste bewijs voor de klinische werkzaamheid van nieuwe immunologische benaderingen met biologische middelen bij patiënten met AD is beschikbaar voor het anti-IL-4 receptor α-keten antilichaam dupilumab, maar er lopen momenteel verschillende studies met andere specifieke antagonisten van immuunsysteemspelers.",
"Dupilumab, een volledig humaan anti-interleukine-4 receptor α monoklonaal antilichaam, remt de signalering van interleukine-4 en interleukine-13, sleutelregulatoren van type-2-gemedieerde ontsteking.",
"Dupilumab werd ook geïntroduceerd als mogelijke behandeling voor patiënten met ernstige pemphigus. Het kan IL-4 direct remmen door zich te richten op de IL-4 α-keten receptor.",
"We evalueerden de werkzaamheid en veiligheid van dupilumab (SAR231893/REGN668), een volledig humaan monoklonaal antilichaam tegen de alfa-subunit van de interleukine-4 receptor"
] | 236 | 233 |
2,211 | Lijst van werkzame stoffen in de Stribild polypil. | Werkzame stoffen van Stribild zijn elvitegravir, cobicistat, emtricitabine en tenofovir. Het wordt gebruikt voor de behandeling van HIV-infectie. | [
"DOEL: Het doel van deze studie is het beoordelen van de veiligheid en verdraagbaarheid van Stribild (elvitegravir [EVG]/cobicistat [COBI]/tenofovir disoproxilfumaraat [TDF]/emtricitabine [FTC]) na marktintroductie.",
"INLEIDING: Gecombineerd elvitegravir, cobicistat, emtricitabine en tenofovir (EVG/COBI/FTC/TDF of Stribild™) is de nieuwste antiretrovirale tablet goedgekeurd in de EU.",
"ACHTERGROND: Gecombineerd elvitegravir, cobicistat, emtricitabine en tenofovir disoproxilfumaraat (EVG/COBI/FTC/TDF; Stribild(®)) is een richtlijn-aanbevolen regime voor HIV-behandelingsnaïeve patiënten en een switch-optie voor virologisch onderdrukte patiënten.",
"ACHTERGROND: Gecombineerd elvitegravir, cobicistat, emtricitabine en tenofovir disoproxilfumaraat (EVG/COBI/FTC/TDF; Stribild(®)) is een aanbevolen integraseremmer-gebaseerd regime in behandelrichtlijnen van het Amerikaanse Department of Health and Human Services en de British HIV Association.",
"Elvitegravir/cobicistat/emtricitabine/tenofovir disoproxilfumaraat enkel-tablet regime (Stribild®): een overzicht van het gebruik bij de behandeling van HIV-1 infectie bij volwassenen.",
"Een nieuwe enkel-tablet, vaste-dosis formulering bestaande uit elvitegravir, een HIV-1 integrase strand transfer remmer (INSTI); cobicistat, een farmacokinetische versterker; emtricitabine, een nucleoside reverse transcriptase remmer; en tenofovir disoproxilfumaraat (tenofovir DF), een nucleotide reverse transcriptase remmer (elvitegravir/cobicistat/emtricitabine/tenofovir DF 150 mg/150 mg/200 mg/300 mg; Stribild®) is beschikbaar in sommige landen voor de eenmaal daagse behandeling van HIV-1 infectie bij antiretrovirale therapie-naïeve volwassenen.",
"Het doel is het beoordelen van klinische studies, farmacologische kenmerken, veiligheid en werkzaamheid van de elvitegravir/cobicistat/emtricitabine/tenofovir enkel-tablet formulering (Stribild). Literatuuronderzoek werd uitgevoerd in MEDLINE (1948-september 2012) en PubMed (1966-september 2012) met de zoektermen GS-9137, elvitegravir, GS 9350, cobicistat, quad pill, Stribild en integraseremmers.",
"Het evalueren van de farmacokinetiek van dolutegravir en elvitegravir/cobicistat bij HIV-negatieve vrijwilligers tot 10 dagen na het stoppen van de medicatie. Gezonde vrijwilligers kregen 50 mg dolutegravir eenmaal daags gedurende 10 dagen, gevolgd door een wash-out periode van 9 dagen, waarna zij elvitegravir/cobicistat als onderdeel van Stribild(®) (245 mg tenofovir, 200 mg emtricitabine, 150 mg elvitegravir en 150 mg cobicistat) gedurende 10 dagen kregen."
] | 304 | 300 |
2,212 | Lijst van klinische kenmerken van het IMAGe-syndroom. | Klinische kenmerken van het IMAGe-syndroom omvatten intra-uteriene groeibeperking, metafysaire dysplasie, congenitale hypoplasie van de bijnier en genitale afwijkingen. Het wordt veroorzaakt door gain-of-function mutaties in het maternale expressiegen CDKN1C op chromosoom 11p15.5. | [
"Onlangs beschreef onze groep gain-of-function mutaties in de PCNA-bindingsplaats van CDKN1C die resulteren in een groeiachterstandsyndroom genaamd IMAGe-syndroom (Intra-uteriene groeibeperking, Metafysaire dysplasie, Adrenale hypoplasie en Genitale anomalieën), met levensbedreigende gevolgen.",
"Het IMAGe-syndroom is een uiterst zeldzame aandoening die voor het eerst werd beschreven in 1999. Componenten van het syndroom zijn intra-uteriene groeivertraging (IUGR), metafysaire dysplasie, congenitale adrenale hypoplasie en genitale anomalieën.",
"DOELSTELLING: Arboleda et al. hebben recent aangetoond dat het IMAGe-syndroom (intra-uteriene groeibeperking, metafysaire dysplasie, congenitale adrenale hypoplasie en genitale afwijkingen) wordt veroorzaakt door gain-of-function mutaties in het maternale expressiegen CDKN1C op chromosoom 11p15.5.",
"Intrigerend is dat gain-of-function variaties in CDKN1C recentelijk werden gevonden bij patiënten met het IMAGe-syndroom (intra-uteriene groeibeperking, metafysaire dysplasie, congenitale adrenale hypoplasie en genitale anomalieën)."
] | 159 | 153 |
2,213 | Welke genmutaties voorspellen de respons op anti-TNF-therapie bij patiënten met reumatoïde artritis? | Mutaties in de TLR5- en TLR1-genen dragen bij aan een differentiële respons op anti-TNF-behandeling bij RA. Variatie in FCGR2A en functioneel gerelateerde genen zoals DHX32 en RGS12 wordt ook geassocieerd met de respons op anti-TNF-therapie bij reumatoïde artritis. | [
"Genetische variaties in loci van patroonherkenningsreceptoren zijn geassocieerd met anti-TNF-respons bij patiënten met reumatoïde artritis",
"Zes van de twintig succesvol getypeerde polymorfismen waren nominaal geassocieerd met EULAR-behandelingsrespons. Drie hiervan vertoonden een zwakke tot matige linkage disequilibrium met polymorfismen die eerder werden gerapporteerd als geassocieerd met anti-TNF-behandelingsrespons. Dragers van het TLR5(rs5744174) variantallel (odds ratio (OR) = 1,7 (1,1-2,5), p = 0,010, q = 0,46) en homozygote dragers van het TLR1(rs4833095) variantallel (OR = 2,8 (1,1-7,4), p = 0,037, q = 0,46) hadden een hogere kans op een positieve behandelrespons. Dragers van het NLRP3(rs10754558) variantallel (OR = 0,6 (0,4-1,0), p = 0,045, q = 0,46) hadden een grotere kans op een negatieve behandelrespons. De associatie in TLR5(rs5744174) bleef significant na correctie voor meerdere vergelijkingen bij patiënten die negatief waren voor RF (OR = 6,2 (2,4-16,3), p = 0,0002, q = 0,024).",
"Variatie in FCGR2A en functioneel gerelateerde genen is geassocieerd met de respons op anti-TNF-therapie bij reumatoïde artritis",
"We streefden ernaar deze genetische associatie te valideren in een patiëntencohort uit de Spaanse populatie, en ook om nieuwe genen te identificeren die functioneel gerelateerd zijn aan FCGR2A en eveneens geassocieerd zijn met anti-TNF-respons.",
"In totaal werden 348 RA-patiënten die behandeld werden met een anti-TNF-therapie geïncludeerd en getypeerd voor het FCGR2A-polymorfisme rs1081274.",
"Met behulp van genexpressieprofielen van macrofagen verkregen uit synoviaal vocht van RA-patiënten zochten we naar genen die sterk gecorreleerd zijn met FCGR2A-expressie.",
"We vonden een significante associatie tussen FCGR2A en de respons op adalimumab (P=0,022). Bij analyse van de subset anti-CCP-positieve RA-patiënten (78%) vonden we ook een significante associatie tussen FCGR2A en de respons op infliximab (P=0,035). DHX32 en RGS12 waren de meest consistent gecorreleerde genen met FCGR2A-expressie in RA-synoviale vloeistofmacrofagen (P<0,001).",
"We vonden een significante associatie tussen de genetische variatie in DHX32 (rs12356233, gecorrigeerde P=0,019) en een nominaal significante associatie tussen RGS12 en de respons op adalimumab (rs4690093, ongecorrigeerde P=0,040).",
"In de anti-CCP-positieve groep patiënten vonden we ook een nominaal significante associatie tussen RGS12 en de respons op infliximab (rs2857859, ongecorrigeerde P=0,042)."
] | 368 | 371 |
2,214 | Welke methode wordt gebruikt voor de voorspelling van nieuwe microRNA-genen in kanker-geassocieerde genomische regio's? | SSCprofiler is een computationeel hulpmiddel dat een probabilistische methode gebruikt gebaseerd op Profile Hidden Markov Models om nieuwe miRNA-voorlopers te voorspellen. Door de gelijktijdige integratie van biologische kenmerken zoals sequentie, structuur en conservatie, bereikt SSCprofiler een prestatie-accuratesse van 88,95% sensitiviteit en 84,16% specificiteit op een grote set menselijke miRNA-genen. De getrainde classifier wordt gebruikt om nieuwe miRNA-genkandidaten te identificeren die zich bevinden binnen kanker-geassocieerde genomische regio's en rangschikt de resulterende voorspellingen met behulp van expressie-informatie van een volledige genoom tiling array. SSCprofiler is vrij beschikbaar als een webservice op http://www.imbb.forth.gr/SSCprofiler.html. | [
"In dit werk presenteren we een nieuw computationeel hulpmiddel (SSCprofiler) dat een probabilistische methode gebruikt gebaseerd op Profile Hidden Markov Models om nieuwe miRNA-voorlopers te voorspellen. Door de gelijktijdige integratie van biologische kenmerken zoals sequentie, structuur en conservatie, bereikt SSCprofiler een prestatie-accuratesse van 88,95% sensitiviteit en 84,16% specificiteit op een grote set menselijke miRNA-genen. De getrainde classifier wordt gebruikt om nieuwe miRNA-genkandidaten te identificeren die zich bevinden binnen kanker-geassocieerde genomische regio's en rangschikt de resulterende voorspellingen met behulp van expressie-informatie van een volledige genoom tiling array. Ten slotte worden vier van de hoogst scorende voorspellingen experimenteel geverifieerd met behulp van northern blot-analyse. Ons werk combineert zowel analytische als experimentele technieken om aan te tonen dat SSCprofiler een zeer nauwkeurig hulpmiddel is dat kan worden gebruikt om nieuwe miRNA-genkandidaten in het menselijk genoom te identificeren. SSCprofiler is vrij beschikbaar als een webservice op http://www.imbb.forth.gr/SSCprofiler.html.",
"In dit werk presenteren we een nieuw computationeel hulpmiddel (SSCprofiler) dat een probabilistische methode gebruikt gebaseerd op Profile Hidden Markov Models om nieuwe miRNA-voorlopers te voorspellen.",
"Ons werk combineert zowel analytische als experimentele technieken om aan te tonen dat SSCprofiler een zeer nauwkeurig hulpmiddel is dat kan worden gebruikt om nieuwe miRNA-genkandidaten in het menselijk genoom te identificeren."
] | 301 | 301 |
2,215 | Interageert de histon-chaperonne ASF1 met histonen H1/H2? | Nee, de histon-chaperonne ASF1 interageert met histonen H3/H4. | [
"De C-terminus van de histon-chaperonne Asf1 vormt cross-links met histon H3 in gist en bevordert de interactie met histonen H3 en H4.",
"De centrale histon H3/H4 chaperonne Asf1 bestaat uit een sterk geconserveerde globulaire kern en een afwijkende C-terminale staart.",
"De histon H3-H4 chaperonne Asf1 is betrokken bij chromatine-assemblage (of desassemblage), histonuitwisseling, regulatie van transcriptie en chromatinesilencing in verschillende organismen.",
"Een ASF1-EGFP fusie-eiwit lokaliseert zich in de kern. Door tandem-affiniteitszuivering/massaspectrometrie en gist two-hybrid analyse identificeerden we histonen H3 en H4 als ASF1 interactiepartners.",
"Deze remming vereist Asf1-binding aan H3-H4 en Rtt109 KAT-activiteit, maar niet staartacetylatie van H3-H4 of K56-acetylatie van H3.",
"Asf1 is een geconserveerde histon H3/H4 chaperonne die nucleosomen kan assembleren en desassembleren en histonacetylatie kan bevorderen.",
"Hier karakteriseren we verdere interacties tussen de gist Saccharomyces cerevisiae Asf1 en Set2 met behulp van assays voor intragenische transcriptie, post-translationele modificatie van H3/H4, cross-linking in coderende regio’s van Asf1 en Set2, en co-voorkomen van Asf1 en Set2 in eiwitcomplexen.",
"In overeenstemming met deze mogelijkheid tonen we aan dat Asf1 de bezetting van Set2 op de coderende regio van een sterk getranscribeerd gen stimuleert via een mechanisme dat afhankelijk is van Asf1-binding aan H3/H4.",
"Drosophila histonen H3 en H4 kunnen ook worden geproduceerd als een oplosbaar (H3H4)(2) heterotetramere complex indien ze samen worden tot expressie gebracht met de histon-chaperonne Asf1.",
"Structuur en functie van de histon-chaperonne CIA/ASF1 in complex met histonen H3 en H4.",
"Nieuw gesynthetiseerde histonen H3-H4 binden eerst aan de histon-chaperonne Asf1 en worden daarna overgedragen aan andere chaperonnes voor nucleosoomassemblage.",
"De C-terminus van de histon-chaperonne Asf1 vormt cross-links met histon H3 in gist en bevordert de interactie met histonen H3 en H4.",
"Histon-chaperonne Asf1 is vereist voor acetylatie van lysine 56 op histon H3, een modificatie geassocieerd met de S-fase in mitose en meiose.",
"Antisilencing functie 1 (ASF1) is een belangrijke histon H3-H4 chaperonne die histonen H3 en H4 op DNA deponeert.",
"Rtt109, een recent ontdekte histon-acetyltransferase (HAT) uit Saccharomyces cerevisiae, werkt samen met de histon-chaperonne Asf1 om lysine K56 op histon H3 (H3K56) te acetylëren, een modificatie geassocieerd met nieuw gesynthetiseerde histonen.",
"In dit nummer van Cell presenteren English et al. de eerste kristalstructuur van een histon-chaperonne (Asf1) gebonden aan histonen (het H3/H4 heterodimeer).",
"Door tandem-affiniteitszuivering/massaspectrometrie en gist two-hybrid analyse identificeerden we histonen H3 en H4 als ASF1 interactiepartners.",
"Anti-silencing functie 1 (Asf1) is een sterk geconserveerde chaperonne van histonen H3/H4 die chromatine assembleert of desassembleert tijdens transcriptie, replicatie en reparatie.",
"Analyse van een reeks Asf1-mutaties die het vermogen van Asf1 om te binden aan histonen H3/H4 moduleren, toont aan dat de histonbindende activiteit van Asf1 vereist is voor de acetylatie van Lys-9 en Lys-56 op nieuw gesynthetiseerd H3.",
"Dus concurreert Rad53 met histonen H3-H4 en co-chaperonnes HirA/CAF-I voor binding aan Asf1.",
"Structuur en functie van de histon-chaperonne CIA/ASF1 in complex met histonen H3 en H4.",
"Momenteel is de best gekarakteriseerde chaperonne-histon interactie die tussen de ubiquitair aanwezige chaperonne Asf1 en een dimeer van H3 en H4."
] | 499 | 481 |
2,216 | Is hepatisch mesenchymaal hamartoom meestal een kwaadaardige tumor? | Mesenchymaal hamartoom van de lever (MHL) is een zeldzame goedaardige levertumor die meestal kinderen onder de 2 jaar treft. | [
"Mesenchymaal hamartoom van de lever (MHL) is een goedaardige en zeldzame leverafwijking,",
"Mesenchymaal hamartoom van de lever (MHL) is een zeldzame goedaardige levertumor die meestal kinderen onder de 2 jaar treft",
"Deze review over de pathologie van levertumoren in de kindertijd, gebaseerd op een persoonlijke serie van 245 tumoren, richt zich op incidentie, behandeling, en beschrijving van veelvoorkomende tumoren zoals hepatoblastoom, fibrolamellair carcinoom en ongedifferentieerd sarcoom voor kwaadaardige tumoren, focale nodulaire hyperplasie, hepatocellulair adenoom en mesenchymaal hamartoom voor goedaardige tumoren.",
"Mesenchymaal hamartoom van de lever is een zeldzame goedaardige levertumor bij kinderen, meestal afkomstig uit de rechter leverkwab en vertegenwoordigt ongeveer 5 tot 6% van alle primaire levertumoren",
"Hepatisch mesenchymaal hamartoom (HMH) is de op één na meest voorkomende goedaardige levertumor bij kinderen",
"Hepatisch mesenchymaal hamartoom is een zeldzame goedaardige tumor bij kinderen, en infantiel hepatisch hemangioendothelioom is ook een zeldzame leverneoplasma",
"Deze review over de pathologie van levertumoren in de kindertijd, gebaseerd op een persoonlijke serie van 245 tumoren, richt zich op incidentie, behandeling, en beschrijving van veelvoorkomende tumoren zoals hepatoblastoom, fibrolamellair carcinoom en ongedifferentieerd sarcoom voor kwaadaardige tumoren, focale nodulaire hyperplasie, hepatocellulair adenoom en mesenchymaal hamartoom voor goedaardige tumoren",
"Mesenchymaal hamartoom is een zeldzame en goedaardige tumor. Het vertegenwoordigt 5 tot 8% van de levertumoren bij kinderen en wordt zelden beschreven bij volwassenen",
"We rapporteren een geval van hepatisch mesenchymaal hamartoom, een zeldzame goedaardige tumor, bij een 10 maanden oude baby.",
"Hepatisch mesenchymaal hamartoom is een zeldzame goedaardige tumor bij kinderen.",
"Mesenchymaal hamartoom is een goedaardige afwijking die het beste behandeld wordt door chirurgische resectie, wat meestal tot genezing leidt.",
"Hepatisch mesenchymaal hamartoom zijn zeldzame goedaardige tumoren.",
"Hepatisch mesenchymaal hamartoom is een zeldzame goedaardige tumor bij kinderen, en infantiel hepatisch hemangioendothelioom is ook een zeldzame leverneoplasma.",
"Mesenchymaal hamartoom is een zeldzame goedaardige levertumor die ontstaat uit het mesenchym van de portale triade.",
"Mesenchymaal hamartoom van de lever (MHL) is een zeldzame goedaardige tumor die voornamelijk voorkomt bij kinderen jonger dan 2 jaar",
"Er wordt een geval gepresenteerd van een prenataal herkend hepatisch mesenchymaal hamartoom en de literatuur wordt besproken. Deze tumoren zijn goedaardig en presenteren zich meestal in de vroege kindertijd met symptomen die gerelateerd zijn aan het massa-effect op aangrenzende organen."
] | 370 | 374 |
2,217 | Lijst klinische kenmerken van het EEM-syndroom. | Het EEM-syndroom wordt gekenmerkt door ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie. | [
"Hypotrichose met juveniele maculaire dystrofie (HJMD) en ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie (EEM) worden beide veroorzaakt door mutaties in het CDH3-gen.",
"Verlies-van-functie mutaties in CDH3, dat P-cadherine codeert, leiden tot twee allelische autosomaal recessieve aandoeningen: hypotrichose met juveniele maculaire dystrofie (HJMD) en ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie (EEM) syndromen.",
"Recentelijk is aangetoond dat mutaties in het P-cadherine-gen (CDH3) twee erfelijke ziekten bij mensen veroorzaken: hypotrichose met juveniele maculaire dystrofie (HJMD) en ectodermale dysplasie, ectrodactylie, maculaire dystrofie (EEM-syndroom).",
"Het EEM-syndroom is een zeldzame aandoening die wordt gekenmerkt door ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie.",
"ACHTERGROND: Het EEM-syndroom is de zeldzame combinatie van ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie.",
"Verschillende CDH3-mutaties veroorzaken ectodermale dysplasie, ectrodactylie, maculaire dystrofie (EEM-syndroom).",
"Ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie (EEM-syndroom) bij broers en zussen.",
"Associatie van ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie: het EEM-syndroom.",
"Associatie van ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie: EEM-syndroom (casusrapport).",
"Het EEM-syndroom is de zeldzame combinatie van ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie.",
"Wij rapporteren een broer en zus met ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie (het EEM-syndroom).",
"Ectodermale dysplasie, ectrodactylie en maculaire dystrofie (EEM-syndroom) bij broers en zussen.",
"Verschillende CDH3-mutaties veroorzaken ectodermale dysplasie, ectrodactylie, maculaire dystrofie (EEM-syndroom)."
] | 211 | 200 |
2,218 | Hoeveel keer is CLAST sneller dan BLAST? | was in staat om sequentieovereenkomsten ~80,8 keer sneller te identificeren dan blast en 9,6 keer sneller dan blat. | [
"CLAST was in staat om sequentieovereenkomsten ~80,8 keer sneller te identificeren dan BLAST en 9,6 keer sneller dan BLAT",
"Ten eerste was CLAST in staat om sequentieovereenkomsten ~80,8 keer sneller te identificeren dan BLAST en 9,6 keer sneller dan BLAT.",
"Ten eerste was CLAST in staat om sequentieovereenkomsten ~80,8 keer sneller te identificeren dan BLAST en 9,6 keer sneller dan BLAT",
"Ten eerste was CLAST in staat om sequentieovereenkomsten ~80,8 keer sneller te identificeren dan BLAST en 9,6 keer sneller dan BLAT.",
"Ten eerste was CLAST in staat om sequentieovereenkomsten ~80,8 keer sneller te identificeren dan BLAST en 9,6 keer sneller dan BLAT."
] | 115 | 122 |
2,219 | Wat zijn de meest voorkomende methoden voor de detectie van circulair RNA uit RNASeq? | De belangrijkste algoritmen zijn circRNA_finder, find_circ, CIRCexplorer, CIRI en MapSplice. | [
"Hier gebruiken we veelvoorkomende RNAseq-datasets om de output van vijf verschillende algoritmen te onderzoeken en te vergelijken; circRNA_finder, find_circ, CIRCexplorer, CIRI en MapSplice, en evalueren we de niveaus van echte en fout-positieve circRNA's op basis van RNase R-resistentie."
] | 58 | 60 |
2,220 | Uit welk celtype wordt leptine uitgescheiden? | Leptine wordt voornamelijk geproduceerd en uitgescheiden door adipocyten, maar recent is ook aangetoond dat andere weefsels en maagklieren het in een dubbele (endocriene en exocriene) modus produceren. | [
"Hoewel leptine voornamelijk wordt geproduceerd door wit vetweefsel, hebben verschillende laboratoria lage niveaus van leptineproductie aangetoond door een groeiend aantal weefsels, waaronder de voorkwab van de hypofyse.",
"Lipolyse (gestimuleerd door bèta-adrenerge middelen) en leptineafscheiding door adipocyten worden geremd door neuronen in cocultuur, effecten die blijkbaar worden gemedieerd door neuropeptide Y (NPY)",
"Leptine wordt voornamelijk geproduceerd en uitgescheiden door adipocyten, maar recent is ook aangetoond dat andere weefsels en maagklieren het in een dubbele (endocriene en exocriene) modus produceren.",
"Leptine werd ook gedetecteerd in sommige microglobules in volledige speeksel verkregen van vier gezonde vrijwilligers. Co-localisatie van leptine, leptinereceptor en glucocorticoïdreceptor in hetzelfde celtype suggereerde een functionele relatie tussen glucocorticoïde hormoon en leptineafscheiding ook op het niveau van de speekselklieren.",
"Leptine, een circulerend hormoon dat voornamelijk door vetweefsel wordt uitgescheiden, bezit beschermende effecten op veel celtypen.",
"Leptine, het door adipocyten uitgescheiden hormoon dat gewicht reguleert, staat bekend om het koppelen van vetmetabolisme aan ontsteking in verschillende celtypen",
"Leptine, een 16-kDa eiwit dat voornamelijk door adipocyten wordt uitgescheiden, speelt een beschermende rol in veel celtypen",
"Beïnvloeden de adipocytokines leptine en adiponectine de expressie van anti-Mülleriaans hormoon (AMH) en de receptor (AMHR-II) in granulosa cellen? Leptine onderdrukt AMH mRNA-niveaus in menselijke geluteïniseerde granulosa cellen via het JAK2/STAT3-pad, terwijl adiponectine dit effect niet heeft. AMH is een van de meest betrouwbare markers van ovariumreserve",
"Leptine, het door adipocyten uitgescheiden hormoon, oefent zijn hoofdfunctie uit als regulator van voedselinname en energieverbruik via centrale effecten op hypothalamisch niveau.",
"Adipokines zijn een groep vet-uitscheidende hormonen en cytokines, waaronder leptine en adiponectine, met belangrijke functies bij mensen.",
"Leptine, een door vetweefsel uitgescheiden hormoon, koppelt metabolisme en immuniteit.",
"Sinds de ontdekking van leptine uitgescheiden door adipocyten, zijn gespecialiseerde weefsels en cellen gevonden die verschillende peptiden (of cytokines) afscheiden die gekarakteriseerd zijn om het metabole proces negatief en positief te reguleren.",
"Adipokines (leptine, adiponectine en hepatocyten groeifactor (HGF)) uitgescheiden door vetweefsel worden erkend voor hun bijdrage aan de mechanismen waarmee obesitas en gerelateerde metabole stoornissen het risico op borstkanker beïnvloeden.",
"Deze resultaten tonen aan dat er een duidelijk vrouwelijk- en mannelijk-type leptinepulsatiepatroon is en elk kan worden versterkt door gonadale steroïden, hetzij via mechanismen die leptinepulsatiepatronen direct op het niveau van adipocyten beïnvloeden en/of op hypothalamische doelgebieden.",
"Leptine is een circulerend hormoon dat wordt uitgescheiden door vetweefsel en enkele andere weefsels.",
"Cycline D1 wordt uitsluitend tot expressie gebracht in luminale keratine 8-immunoreactieve tumorcellen en is afhankelijk van het door vetweefsel uitgescheiden hormoon leptine.",
"In maagcellen volgt leptine een snel gereguleerd secretiepad, terwijl adipocyten leptine op een constitutief trage wijze afscheiden."
] | 458 | 434 |
2,221 | Welk hulpmiddel wordt gebruikt voor de identificatie van terugkerende varianten in niet-coderende regio's? | LARVA is een integratief kader voor grootschalige analyse van terugkerende varianten in niet-coderende annotaties. Het integreert varianten met een uitgebreide set niet-coderende functionele elementen, waarbij de mutatieaantallen van de elementen worden gemodelleerd met een β-binomiale verdeling om overdispersie te verwerken. Bovendien gebruikt LARVA regionale genomische kenmerken zoals replicatietiming om lokale mutatiesnelheden en mutationale hotspots beter te schatten. Verder benadrukt LARVA verschillende nieuwe sterk gemuteerde regulatorische sites die mogelijk niet-coderende drijvers kunnen zijn. | [
"LARVA: een integratief kader voor grootschalige analyse van terugkerende varianten in niet-coderende annotaties.",
"In kankeronderzoek zijn achtergrondmodellen voor mutatiesnelheden uitgebreid gekalibreerd in coderende regio's, wat heeft geleid tot de identificatie van veel drijvergenen die vaker gemuteerd zijn dan verwacht. Niet-coderende regio's worden ook geassocieerd met ziekte; echter zijn achtergrondmodellen hiervoor niet zo gedetailleerd onderzocht. Dit komt deels door beperkte functionele annotatie van niet-coderende gebieden. Ook zorgen grote mutatieheterogeniteit en mogelijke correlaties tussen aangrenzende sites voor aanzienlijke overdispersie in het aantal mutaties, wat problematische schattingen van de achtergrondmutatiesnelheid veroorzaakt. Hier pakken we deze problemen aan met een nieuw computationeel kader genaamd LARVA. Het integreert varianten met een uitgebreide set niet-coderende functionele elementen, waarbij de mutatieaantallen van de elementen worden gemodelleerd met een β-binomiale verdeling om overdispersie te verwerken. Bovendien gebruikt LARVA regionale genomische kenmerken zoals replicatietiming om lokale mutatiesnelheden en mutationale hotspots beter te schatten. We tonen de effectiviteit van LARVA aan op 760 volledige genoomtumorsequenties, waarbij wordt aangetoond dat het bekende niet-coderende drijvers identificeert, zoals mutaties in de TERT-promotor. Verder benadrukt LARVA verschillende nieuwe sterk gemuteerde regulatorische sites die mogelijk niet-coderende drijvers kunnen zijn. We stellen LARVA beschikbaar als softwaretool en publiceren onze sterk gemuteerde annotaties als een online bron (larva.gersteinlab.org).",
"LARVA: een integratief kader voor grootschalige analyse van terugkerende varianten in niet-coderende annotaties",
"LARVA: een integratief kader voor grootschalige analyse van terugkerende varianten in niet-coderende annotaties."
] | 314 | 307 |
2,222 | Welke lichaamsdelen zijn ook bekend als falangen? | De anatomische structuur van elke vinger bestaat uit vier falangen (distale, middelste, proximale en metacarpale falanx). Tenen worden ook wel falangen genoemd | [
"Metacarpale en falangeale breuken van de lange vingers a",
"De anatomische structuur van elke vinger bestaat uit vier falangen (distale, middelste, proximale en metacarpale falanx).",
"Verschillende kenmerken van de tenen, bulten in de teenlijn, falangemarkeringen, platvoetsituatie, putjes, scheuren, likdoorns, enz., werden bestudeerd.",
"802), waarin fysieke verwondingen worden vermeld, variërend van verlies van enkele falangen, onderscheiden tussen duim, wijsvinger, pink en de andere vingers, tot de dood, wordt vergeleken met moderne graden van invaliditeit.",
"Ze hadden een opvallende ongepaarde dijbeen naast gepaarde tibiotarsi, tarsometatarsi en soortspecifieke falangen van de tenen.",
"De botstructuur is verdund bij de distale metafysen van de metacarpen en de proximale metafysen van de basale falangen van de vingers."
] | 140 | 133 |
2,223 | Worden seleniumsupplementen aanbevolen voor de preventie van prostaatkanker? | Nee. De SELECT-studie toonde geen significante risicoreductie voor prostaatkankers die toegeschreven kunnen worden aan selenium- en vitamine E-suppletie. | [
"Onze meta-analyse van prospectieve studies toonde een significante inverse associatie tussen seleniumstatus en het risico op hart- en vaatziekten binnen een smal seleniumgebied, en een nul-effect van seleniumsuppletie op hart- en vaatziekten werd waargenomen in gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken (RCT's). Deze bevindingen benadrukken het belang van het overwegen van seleniumstatus, dosis en veiligheid bij gezondheidsbeoordeling en toekomstig onderzoeksontwerp.",
"Seleniumsuppletie van 140 μg/dag of meer na de diagnose van niet-gemetastaseerde prostaatkanker kan het risico op sterfte door prostaatkanker verhogen. Voorzichtigheid is geboden bij het gebruik van dergelijke supplementen bij mannen met prostaatkanker.",
"De SELECT-studie toonde geen significante risicoreductie voor prostaatkankers die toegeschreven kunnen worden aan selenium- en vitamine E-suppletie.",
"Vitamines en supplementen, waaronder selenium of vitamine E, zijn in klinische onderzoeken niet bewezen om prostaatkanker te voorkomen en in het geval van vitamine E is vastgesteld dat het het risico op het ontstaan van prostaatkanker verhoogt. Lopende en toekomstige onderzoeken kunnen de rol van voeding en immunotherapie bij de preventie van prostaatkanker verder verduidelijken."
] | 185 | 183 |
2,224 | Welke ziekte wordt behandeld met lucinactant? | Lucinactant wordt gebruikt voor de preventie van respiratoir distress syndroom bij premature zuigelingen. | [
"Lucinactant voor de preventie van respiratoir distress syndroom bij premature zuigelingen.",
"Lucinactant is een synthetisch surfactans dat sinapultide bevat, een bio-engineerd peptide dat het surfactant-geassocieerde eiwit B nabootst. Een meta-analyse van klinische onderzoeken toont aan dat lucinactant even effectief is als dierlijke surfactantia bij het voorkomen van RDS bij premature pasgeborenen, en in vitro studies suggereren dat het beter bestand is tegen oxidatieve en door eiwitten geïnduceerde inactivatie. De synthetische oorsprong brengt een lager risico op infectie en ontsteking met zich mee, evenals andere potentiële voordelen, waardoor lucinactant een voordelig alternatief kan zijn voor de dierlijke tegenhangers, die momenteel de standaardbehandeling voor RDS vormen.",
"We hebben geëvalueerd of intratracheaal toegediende lucinactant, een synthetisch surfactans dat peptiden bevat, veilig en goed verdragen werd bij zuigelingen met acute hypoxemische respiratoire insufficiëntie, en hebben de effecten op klinische uitkomsten beoordeeld.",
"Een verbetering van de oxygenatie en een significant verminderde behoefte aan herbehandeling suggereren dat lucinactant de longfunctie kan verbeteren bij zuigelingen met acute hypoxemische respiratoire insufficiëntie.",
"CONCLUSIE: Deze gegevens suggereren dat vroege interventie met lucinactant mogelijk effectiever de pulmonale pathofysiologische gevolgen van RDS kan verminderen dan de dierlijke surfactantia poractant alfa of beractant.",
"Lucinactant voor de behandeling van respiratoir distress syndroom bij pasgeborenen.",
"De uitgevoerde klinische onderzoeken, hoewel onderbemand, kunnen erop wijzen dat lucinactant superieur is aan synthetische fosfolipide surfactans-preparaten en minstens even effectief als dierlijke surfactantia in het verminderen van morbiditeit en mortaliteit door RDS."
] | 228 | 244 |
2,225 | Welke eiwitten regelen de afbraak van cryptische onstabiele transcripties (CUTs) in gist? | De beëindiging van cryptische onstabiele transcripties wordt gestuurd door de RNA-bindende eiwitten Nrd1 en Nab3 in gist. Deze cryptische onstabiele transcripties (CUTs) worden snel afgebroken door het nucleaire exosoom. Belangrijke substraten voor exosomale afbraak zijn abnormale functionele RNA's en cryptische onstabiele transcripties (CUTs). De RNA-bindende eiwitten Nrd1 en Nab3 in gist sturen de beëindiging van sn/snoRNA's en zijn recentelijk ook betrokken gebleken bij voortijdige transcriptiebeëindiging van het NRD1-gen. Deze resultaten suggereren dat transcriptiebeëindiging van CUTs, gestuurd door Nrd1 en Nab3, een vereiste is voor snelle afbraak door het nucleaire exosoom. | [
"De beëindiging van cryptische onstabiele transcripties wordt gestuurd door de RNA-bindende eiwitten Nrd1 en Nab3 in gist.",
"Deze cryptische onstabiele transcripties (CUTs) worden snel afgebroken door het nucleaire exosoom. De RNA-bindende eiwitten Nrd1 en Nab3 in gist sturen de beëindiging van sn/snoRNA's en zijn recentelijk ook betrokken gebleken bij voortijdige transcriptiebeëindiging van het NRD1-gen.",
"Deze resultaten suggereren dat transcriptiebeëindiging van CUTs, gestuurd door Nrd1 en Nab3, een vereiste is voor snelle afbraak door het nucleaire exosoom.",
"Belangrijke substraten voor exosomale afbraak zijn abnormale functionele RNA's en cryptische onstabiele transcripties (CUTs).",
"Het ontbreken van TRAMP-activiteit stabiliseert ongeveer 1600 CUTs in meiotische cellen, die 40% van de bindingscapaciteit van het nucleaire cap-binding complex (CBC) innemen. CBC-mutanten vertonen defecten in de vorming van meiotische dubbelstrengsbreuken (DSB's), en we zien vergelijkbare defecten in TRAMP-mutanten, wat suggereert dat een belangrijke functie van het nucleaire exosoom is om verzadiging van het CBC-complex door CUTs te voorkomen.",
"We vinden dat TRAMP-mutanten hoge niveaus van CUTs produceren tijdens meiose die ondetecteerbaar zijn in wildtype cellen, wat aantoont dat het nucleaire exosoom functioneel blijft voor CUT-afbraak, en we rapporteren verder dat het meiotische exosoomcomplex Rrp6 bevat.",
"Het exosoomcomponent Rrp6 is vereist voor RNA-polymerase II-beëindiging bij specifieke doelen van het Nrd1-Nab3-pad.",
"Bekende doelen van het nucleaire exosoom zijn korte (<1000 bp) RNAPII-transcripten zoals kleine niet-coderende RNA's (snRNA's), cryptische onstabiele transcripties (CUTs) en sommige stabiele niet-geannoteerde transcripties (SUTs) die worden beëindigd door een Nrd1-, Nab3- en Sen1 (NNS)-afhankelijk mechanisme.",
"Recente studies suggereren dat Nrd1 noodzakelijk is voor transcriptomesurveillance, het reguleren van promotorrichting en het onderdrukken van antisense-transcriptie onafhankelijk van, of voorafgaand aan, Rrp6-activiteit.",
"Cryptische onstabiele transcripties (CUTs) zijn recentelijk beschreven als een hoofdklasse van RNA-polymerase II-transcripten in Saccharomyces cerevisiae. Deze transcripties worden direct na synthese afgebroken door de werking van de Nrd1-exosoom-TRAMP-complexen.",
"In Saccharomyces cerevisiae zijn niet-coderende RNA's, inclusief cryptische onstabiele transcripties (CUTs), onderhevig aan afbraak door het exosoom. Het Trf4/5-Air1/2-Mtr4 polyadenyleringscomplex (TRAMP) in S. cerevisiae is een nucleair exosoomcofactor die het exosoom rekruteert om RNA's af te breken.",
"Het MTREC-complex bindt specifiek aan CUTs, meiotische mRNA's en ongespleten pre-mRNA-transcripten en richt deze RNA's op voor afbraak door het nucleaire exosoom, terwijl het TRAMP-complex slechts een kleine rol speelt in dit proces.",
"De eukaryote exosoom-exoribonuclease Rrp6 vormt een complex met Rrp47 dat functioneert in nucleaire RNA-kwaliteitscontrolemechanismen, de afbraak van cryptische onstabiele transcripties (CUTs) en in de 3'-eindrijping van stabiele RNA's.",
"Nrd1 en Nab3 colocaliseren naar gebieden van het genoom die antisense CUTs tot expressie brengen, en deze transcripties vereisen gist nucleaire exosoom- en TRAMP-componenten voor afbraak.",
"Genoomwijde studies hebben overvloedige kleine, niet-coderende RNA's geïdentificeerd, inclusief kleine nucleaire RNA's, kleine nucleolaire RNA's (snoRNA's), cryptische onstabiele transcripties (CUTs) en upstream regulatorische RNA's (uRNA's), die worden getranscribeerd door RNA-polymerase II (pol II) en beëindigd door een Nrd1-afhankelijk pad.",
"Nrd1 en Nab3 colocaliseren naar gebieden van het genoom die antisense CUTs tot expressie brengen, en deze transcripties vereisen gist nucleaire exosoom- en TRAMP-componenten voor afbraak.",
"Hier tonen we, door het overlappen van stabiele (SUTs, stabiele niet-geannoteerde transcripties) en onstabiele (CUTs, cryptische onstabiele transcripties) transcripties met coderende genen, aan dat de voorspelde Nrd1- en Nab3-bindingsplaatssequenties in verschillende frequenties voorkomen.",
"Voorbeelden zijn de consensus-bindingsplaatssequenties van de RNA-bindende eiwitten Nrd1 en Nab3 die niet-coderende transcripties op het oog hebben voor afbraak.",
"De beëindiging van cryptische onstabiele transcripties wordt gestuurd door de RNA-bindende eiwitten Nrd1 en Nab3 in gist.",
"Sommige worden aangeduid als Cryptic Unstable Transcripts (CUTs) omdat ze worden beëindigd door het Nrd1-Nab3-Sen1-pad en vervolgens snel worden afgebroken door het nucleaire exosoom."
] | 676 | 655 |
2,226 | Is er enige betrokkenheid van L1-retrotranspositie bij het Rett-syndroom? | Ja. Recente studies geven aan dat lange interspersed nucleaire element-1 (L1) worden gemobiliseerd in het genoom van menselijke neurale voorlopercellen en versterkt zijn bij het Rett-syndroom en ataxia telangiectasia. | [
"Met behulp van neuronale voorlopercellen afgeleid van menselijke geïnduceerde pluripotente stamcellen en menselijk weefsel, hebben we aangetoond dat patiënten met het Rett-syndroom (RTT), die MeCP2-mutaties dragen, een verhoogde gevoeligheid voor L1-retrotranspositie hebben. Onze gegevens tonen aan dat L1-retrotranspositie weefsel-specifiek kan worden gecontroleerd en dat ziekte-gerelateerde genetische mutaties de frequentie van neuronale L1-retrotranspositie kunnen beïnvloeden. Onze bevindingen voegen een nieuw niveau van complexiteit toe aan de moleculaire gebeurtenissen die kunnen leiden tot neurologische aandoeningen.",
"Bovendien reguleren sommige neurologische ziekten, zoals het Rett-syndroom en ataxia telangiectasia, L1-retrotranspositie verkeerd, wat kan bijdragen aan sommige pathologische aspecten.",
"Recente studies geven aan dat lange interspersed nucleaire element-1 (L1) worden gemobiliseerd in het genoom van menselijke neurale voorlopercellen en versterkt zijn bij het Rett-syndroom en ataxia telangiectasia.",
"Daarnaast geven recente gegevens aan dat geconstrueerde menselijke L1's somatische retrotranspositie kunnen ondergaan in menselijke neurale voorlopercellen en dat een toename van mens-specifieke L1-DNA-inhoud kan worden gedetecteerd in de hersenen van normale controles, evenals bij patiënten met het Rett-syndroom.",
"Bovendien reguleren sommige neurologische ziekten, zoals het Rett-syndroom en ataxia telangiectasia, L1-retrotranspositie verkeerd, wat kan bijdragen aan sommige pathologische aspecten.",
"Met behulp van neuronale voorlopercellen afgeleid van menselijke geïnduceerde pluripotente stamcellen en menselijk weefsel, hebben we aangetoond dat patiënten met het Rett-syndroom (RTT), die MeCP2-mutaties dragen, een verhoogde gevoeligheid voor L1-retrotranspositie hebben.",
"Daarnaast geven recente gegevens aan dat geconstrueerde menselijke L1's somatische retrotranspositie kunnen ondergaan in menselijke neurale voorlopercellen en dat een toename van mens-specifieke L1-DNA-inhoud kan worden gedetecteerd in de hersenen van normale controles, evenals bij patiënten met het Rett-syndroom.",
"Met behulp van neuronale voorlopercellen afgeleid van menselijke geïnduceerde pluripotente stamcellen en menselijk weefsel, hebben we aangetoond dat patiënten met het Rett-syndroom (RTT), die MeCP2-mutaties dragen, een verhoogde gevoeligheid voor L1-retrotranspositie hebben",
"Bovendien reguleren sommige neurologische ziekten, zoals het Rett-syndroom en ataxia telangiectasia, L1-retrotranspositie verkeerd, wat kan bijdragen aan sommige pathologische aspecten",
"Met behulp van neuronale voorlopercellen afgeleid van menselijke geïnduceerde pluripotente stamcellen en menselijk weefsel, hebben we aangetoond dat patiënten met het Rett-syndroom (RTT), die MeCP2-mutaties dragen, een verhoogde gevoeligheid voor L1-retrotranspositie hebben.",
"Bovendien reguleren sommige neurologische ziekten, zoals het Rett-syndroom en ataxia telangiectasia, L1-retrotranspositie verkeerd, wat kan bijdragen aan sommige pathologische aspecten.",
"Recente studies geven aan dat lange interspersed nucleaire element-1 (L1) worden gemobiliseerd in het genoom van menselijke neurale voorlopercellen en versterkt zijn bij het Rett-syndroom en ataxia telangiectasia."
] | 420 | 408 |
2,227 | Is het syndroom van Down geassocieerd met een verminderd risico op leukemie? | Nee, meerdere studies hebben vastgesteld dat de incidentie van leukemie bij patiënten met het syndroom van Down 10- tot 20 keer hoger is dan bij de algemene bevolking. | [
"De associatie tussen het syndroom van Down en leukemie is al meer dan 50 jaar gedocumenteerd. Meerdere studies hebben vastgesteld dat de incidentie van leukemie bij patiënten met het syndroom van Down 10- tot 20 keer hoger is dan bij de algemene bevolking.",
"Wij presenteren een geval van congenitale acute myeloïde leukemie die zich manifesteerde vanaf de allereerste dag van de geboorte. De diagnose acute myeloïde leukemie werd vermoed door de aanwezigheid van blasten in de perifere bloeduitstrijk en werd bevestigd in het beenmerg door flowcytometrie. Karyotypering toonde Trisomie 21 aan.",
"Juveniele myelomonocytaire leukemie (JMML) en een enkel geval van acute myeloïde leukemie (AML) bij het syndroom van Down.",
"Dit werd dus bevestigd als een geval van transiënte leukemie bij het syndroom van Down."
] | 144 | 159 |
2,228 | Welke enzym wordt geremd door ixazomib? | Ixazomib is een proteasoomremmer. Het wordt gebruikt voor de behandeling van multipel myeloom. | [
"In het afgelopen decennium is de behandeling van MM aanzienlijk verbeterd door de introductie van nieuwe therapeutica zoals immunomodulerende middelen (thalidomide, lenalidomide en pomalidomide), proteasoomremmers (bortezomib, carfilzomib en ixazomib), monoklonale antilichamen (daratumumab en elotuzumab), histon deacetylase (HDAC)-remmers (panobinostat).",
"Vanwege het grotendeels ongeneeslijke karakter van multipel myeloom is de ontwikkeling van nieuwere middelen gaande en omvat nieuwe orale PI's (ixazomib), immunotherapieën (bijv. CD38- of SLAMF7-gerichte antilichamen) en kleine moleculen.",
"Ixazomib (MLN9708-MLN2238), de tweede generatie proteasoomremmer, met selectiviteit en potentie vergelijkbaar met die van bortezomib, wordt momenteel onderzocht in fase I-studies.",
"In de afgelopen weken heeft de FDA drie nieuwe therapieën voor multipel myeloom goedgekeurd: ixazomib, de eerste orale proteasoomremmer; en daratumumab en elotuzumab, twee monoklonale antilichamen die respectievelijk CD38 en SLAMF7 targeten.",
"Ixazomib, de eerste orale proteasoomremmer die geëvalueerd wordt bij multipel myeloom, oefent aanzienlijke anti-myelom activiteit uit als monotherapie en vooral in combinatie met immunomodulerende geneesmiddelen en kan een aantrekkelijke optie zijn voor onderhoudstherapie.",
"Sinds de introductie van bortezomib in 2003 zijn verschillende proteasoomremmers van de volgende generatie ook klinisch gebruikt, waaronder carfilzomib, oprozomib, ixazomib en delanzomib.",
"DOEL: Het doel van de huidige studie was het karakteriseren van de farmacokinetiek van de orale proteasoomremmer ixazomib bij patiënten met solide tumoren en matige of ernstige leverinsufficiëntie, om doseringsaanbevelingen te geven.",
"Farmacokinetiek van ixazomib, een orale proteasoomremmer, bij patiënten met solide tumoren en matige of ernstige leverinsufficiëntie.",
"Ixazomib is de eerste orale proteasoomremmer die fase III-onderzoeken heeft bereikt.",
"MLN2238 (ixazomib), een orale proteasoomremmer, heeft verbeterde farmacotherapeutische parameters vergeleken met bortezomib.",
"Deze populatiefarmacokinetische analyse van de experimentele orale proteasoomremmer ixazomib beoordeelde de haalbaarheid van overschakeling van op lichaamsoppervlak (BSA) gebaseerde dosering naar vaste dosering, en de impact van baseline-covariaten op de farmacokinetiek van ixazomib."
] | 301 | 288 |
2,229 | Bindt PCSK9 (Proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9) aan de HDL-receptor (HDL-R)? | Nee, Proproteïne Convertase Subtilisine Kexine 9 (PCSK9) bindt aan de LDL-receptor (LDL-R) en veroorzaakt de afbraak ervan in het lysosoom, met als gevolg dat LDL-C zich ophoopt in het bloed. | [
"Onlangs werd onthuld dat het uitgescheiden Proproteïne Convertase Subtilisine Kexine 9 (PCSK9) bindt aan de LDL-receptor (LDL-R) en daardoor afbraak veroorzaakt in het lysosoom, wat leidt tot ophoping van LDL-C in het bloed.",
"Het belangrijkste doel van deze studie is het identificeren van peptide(s) uit het katalytische domein van hPCSK9 die de binding van hPCSK9 aan LDL-R kunnen blokkeren en daardoor de afbraak van LDL-R kunnen verminderen, wat leidt tot de verwijdering van LDL-C uit het plasma.",
"In vitro toediening van SRT3025 aan gekweekte AML12 hepatocyten verminderde de secretie van Pcsk9 en de binding ervan aan Ldlr, waardoor de Pcsk9-gemedieerde Ldlr-afbraak werd geremd en de expressie van Ldlr en LDL-opname toenamen.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9), dat betrokken is bij het metabolisme van low-density lipoproteïne cholesterol (LDL-C) door interactie met de LDL-receptor, wordt beschouwd als een krachtig therapeutisch doelwit voor de behandeling van hypercholesterolemie.",
"Samengevat suggereren deze resultaten dat IgG1-PA4 kan dienen als een potentiële kandidaat voor de behandeling van hypercholesterolemie door de PCSK9-gemedieerde afbraak van LDLR op het celoppervlak te remmen.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) bindt aan de low-density lipoproteïne receptor en begeleidt deze naar vernietiging in het lysosoom, waardoor de recirculatie van de LDL-receptor naar het hepatocytenoppervlak wordt voorkomen.",
"Echter, statines zijn minder efficiënt omdat ze ook PCSK9 verhogen, wat LDLR voor afbraak target.",
"Remming van het enzym PCSK9 (proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9), dat betrokken is bij de afname van de LDL-receptor, is een nieuwe farmacologische benadering.",
"Proproteïne convertase subtilisine kexine type 9 (PCSK9) reguleert LDL-c via post-translationele afbraak van de LDLR.",
"Mechanistisch werd aangetoond dat hepatische S1P KD de lever- en plasmaconcentraties van het eiwit proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9), dat LDLR-eiwit afbreekt, verlaagt.",
"Hier rapporteren we de ontwikkeling van sdAbs die gericht zijn tegen menselijke PCSK9 (proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9) als alternatief voor anti-PCSK9 mAbs.",
"Het PCSK9-eiwit (proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9) speelt een belangrijke rol in het LDL-cholesterol (LDL-C) metabolisme vanwege zijn rol in de afbraak van de LDL-receptor.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) bindt aan LDL-receptoren, wat leidt tot hun afbraak.",
"Low density lipoproteïne bindt aan proproteïne convertase subtilisine/kexine type-9 (PCSK9) in menselijk plasma en remt PCSK9-gemedieerde afbraak van de low density lipoproteïne receptor.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type-9 (PCSK9) is een uitgescheiden eiwit dat bindt aan het epidermale groeifactor-achtige A-domein van de low density lipoproteïne receptor (LDLR) en LDLR-afbraak in de lever medieert.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) bindt LDL-receptoren en richt deze op voor afbraak.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9), dat bindt aan de low-density lipoproteïne receptor en deze voor afbraak target, is naar voren gekomen als een belangrijke regulator van serumcholesterolniveaus en het risico op cardiovasculaire aandoeningen.",
"Uitgescheiden proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) bindt aan de low-density lipoproteïne receptor (LDLR) aan het celoppervlak en verstoort de normale recycling van de LDLR.",
"Proproteïne convertase, subtilisine/kexine type 9 (PCSK9), een belangrijke regulator van plasma LDL-cholesterol (LDL-c) en cardiovasculair risico, wordt geproduceerd in de lever en uitgescheiden in het plasma waar het bindt aan hepatische LDL-receptoren (LDLR), wat leidt tot hun afbraak.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) bevordert de afbraak van de hepatische low-density lipoproteïne receptor (LDL-R) en is daarom een belangrijk therapeutisch doelwit voor het verlagen van LDL-cholesterol.",
"In de huidige studie hebben we het gerelateerde gen van een klinisch gediagnosticeerde autosomale genetische hypercholesterolemie-familie gescreend op mogelijke mutaties en een eukaryotische expressieve vector van de mutatie van het proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) gen geconstrueerd met genrecombinatietechniek om de bijdrage van de variatie aan het metabolisme en de functieverandering van de low density lipoproteïne receptor (LDL-R) te onderzoeken. Mutatiedetectie werd uitgevoerd voor LDL-R, apolipoproteïne B(100) (apoB(100)) en PCSK9-gen met nucleotide sequencing in een Chinese FH-familie.",
"Proproteïne convertase subtilisine-kexine type 9 (PCSK9) biedt een sleutelstap in LDL-metabolisme door stimulatie van LDL-receptorafbraak.",
"De proproteïne convertase subtilisine-kexine type 9 (PCSK9) route speelt een sleutelrol in lipoproteïnemetabolisme door bevordering van LDL-receptorafbraak.",
"Proproteïne convertase subtilisine-kexine type 9 (PCSK9) speelt een sleutelrol in de verwerking van de LDL-receptor.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) bevordert de afbraak van de LDL-receptor (LDLr) in hepatocyten, en de expressie ervan in muizenlever is aangetoond te dalen na fenofibraatbehandeling. We ontwikkelden een sandwich ELISA met behulp van recombinant menselijk PCSK9-eiwit en 2 affiniteit-gezuiverde polyklonale antilichamen gericht tegen menselijk PCSK9.",
"Proproteïne convertase subtilisine kexine type 9 (PCSK9) versterkt de afbraak van de LDLR en moduleert lever CD81-niveaus.",
"Low-density lipoproteïne (LDL) metabolisme wordt gereguleerd door proproteïne convertase subtilisine-kexine type 9 (PCSK9), dat de expressie van LDL-receptoren verlaagt, wat resulteert in hogere LDL-cholesterol (LDL-C).",
"Proproteïne convertase subtilisine kexine type 9 (PCSK9) krijgt steeds meer aandacht als een belangrijke regulator van serum LDL-cholesterol (LDLC).",
"Het proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) gen reguleert cholesterolhomeostase door de afbraak van de low-density lipoproteïne receptor (LDLR) te versnellen, wat resulteert in verminderde katabolisme van low-density lipoproteïne (LDL) en leidt tot hypercholesterolemie.",
"Low density lipoproteïne bindt aan proproteïne convertase subtilisine/kexine type-9 (PCSK9) in menselijk plasma en remt PCSK9-gemedieerde afbraak van de low density lipoproteïne receptor.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type-9 (PCSK9) is een uitgescheiden eiwit dat bindt aan het epidermale groeifactor-achtige A-domein van de low density lipoproteïne receptor (LDLR) en LDLR-afbraak in de lever medieert.",
"Proproteïne convertase subtilisine/kexine type 9 (PCSK9) is een regulator van LDL-cholesterol receptorhomeostase en komt naar voren als een therapeutisch doelwit in de preventie van cardiovasculaire (CV) ziekten.",
"De huidige studie werd uitgevoerd om de rol van plasmaconcentraties van proproteïne convertase subtilisine kexine type 9 (PCSK9), een regulator van LDL-receptorexpressie, te onderzoeken bij het ontstaan van diabetische dyslipidemie."
] | 895 | 918 |
2,230 | Hy's wet meet faalfunctie voor welk orgaan? | Hy's wet correleert enzymverhogingen met leverbeschadiging en daaropvolgende falen. | [
"De Hy's wet van door geneesmiddelen veroorzaakte hepatocytaire geelzucht die een sterftecijfer of noodzaak voor transplantatie van 10% of hoger veroorzaakt, is gevalideerd in verschillende grote nationale registers, waaronder het lopende, prospectieve U.S. Drug-Induced Liver Injury Network.",
"Enzymverhogingen alleen zijn mogelijk niet schadelijk, maar als ze worden veroorzaakt door een geneesmiddel en gevolgd worden door geelzucht (genoemd 'Hy's wet'), is er een grote kans op ernstige DILI.",
"Er werden geen extra allelen buiten die geassocieerd met leverbeschadigingspatronen gevonden die de potentiële ernst beïnvloeden zoals gemeten door de criteria van Hy's wet.",
"We vergeleken de prestaties ervan met die van Hy's wet, die de ernst van DILI voorspelt op basis van niveaus van alanine-aminotransferase of aspartaat-aminotransferase en totaal bilirubine, en valideerden het model in een aparte steekproef. We voerden een retrospectieve cohortstudie uit van 15.353 Kaiser Permanente Northern California-leden gediagnosticeerd met DILI van 2004 tot 2010, leveraminotransferaseniveaus boven de bovengrens van normaal, en geen vooraf bestaande leverziekte.",
"Risico op acuut leverfalen bij patiënten met door geneesmiddelen veroorzaakte leverbeschadiging: evaluatie van Hy's wet en een nieuw prognostisch model.",
"Hy's wet, die stelt dat hepatocytaire door geneesmiddelen veroorzaakte leverbeschadiging (DILI) met geelzucht een ernstige reactie aangeeft, wordt veel gebruikt om het risico op acuut leverfalen (ALF) te bepalen.",
"Hy's wet is een methode die wordt gebruikt om door geneesmiddelen veroorzaakte leverbeschadiging (DILI) te identificeren.",
"Potentieel ernstige leverbeschadiging wordt in klinische onderzoeken geïdentificeerd door ALT>3× bovengrens van normaal (ULN) en totaal bilirubine>2× ULN, en genoemd 'Hy's wet' door de Amerikaanse FDA.",
"Ernstige leverbeschadiging wordt geïdentificeerd door de leverchemiedrempel van alanine-aminotransferase (ALT)>3× bovengrens van normaal (ULN) en bilirubine>2× ULN, genoemd Hy's wet door de Food and Drug Administration."
] | 279 | 279 |
2,231 | Is apremilast effectief voor psoriatische artritis? | Ja, apremilast, een orale fosfodiësterase 4-remmer, is effectief voor psoriatische artritis. | [
"Apremilast, een orale fosfodiësterase 4-remmer, bij patiënten met psoriatische artritis en huidbetrokkenheid: een fase III, gerandomiseerde, gecontroleerde studie (PALACE 3).",
"DOELSTELLING: Het evalueren van apremilastbehandeling bij patiënten met actieve psoriatische artritis, inclusief huidbetrokkenheid, ondanks eerdere therapie met conventionele ziekte-modificerende antireumatische geneesmiddelen en/of biologische middelen.",
"CONCLUSIES: Apremilast toonde klinisch betekenisvolle verbeteringen in psoriatische artritis en psoriasis na 16 weken; aanhoudende verbeteringen werden gezien bij voortgezette behandeling tot 52 weken.",
"Apremilast: Een nieuw geneesmiddel voor de behandeling van psoriasis en psoriatische artritis.",
"DOELSTELLING: Het beoordelen van de farmacologie, werkzaamheid en veiligheid van apremilast en het bepalen van de rol ervan ten opzichte van andere middelen bij de behandeling van psoriasis en psoriatische artritis.",
"CONCLUSIES: Apremilast heeft een nieuw werkingsmechanisme en is veilig en effectief voor het beheer van psoriasis en psoriatische artritis.",
"In het bijzonder is apremilast recent goedgekeurd voor de behandeling van psoriasis en psoriatische artritis.",
"Apremilast, een orale fosfodiësterase 4-remmer, heeft een acceptabel veiligheidsprofiel en is effectief voor de behandeling van plaque psoriasis en psoriatische artritis.",
"Als onderdeel van het National Institute for Health and Clinical Excellence (NICE) single technology appraisal (STA) proces, werd de fabrikant van apremilast uitgenodigd om bewijs in te dienen voor de klinische en kosteneffectiviteit voor de behandeling van actieve psoriatische artritis (PsA) bij wie ziekte-modificerende antireumatische geneesmiddelen (DMARDs) onvoldoende effectief waren, niet werden verdragen of gecontra-indiceerd waren.",
"Psoriatic Arthritis Long-term Assessment of Clinical Efficacy 1 (PALACE 1) vergeleek apremilast met placebo bij patiënten met actieve psoriatische artritis ondanks eerdere traditionele ziekte-modificerende antireumatische geneesmiddelen (DMARD) en/of biologische therapie.",
"Bij patiënten met psoriatische artritis zijn er geen klinische onderzoeken die apremilast vergelijken met TNF-alfa-antagonisten, en geen interpreteerbare onderzoeken van apremilast na falen van een TNF-alfa-antagonist.",
"Psoriatic Arthritis Long-term Assessment of Clinical Efficacy 1 (PALACE 1) vergeleek apremilast met placebo bij patiënten met actieve psoriatische artritis ondanks eerdere traditionele ziekte-modificerende antireumatische geneesmiddelen (DMARD) en/of biologische therapie. In de 24 weken durende, placebogecontroleerde fase van PALACE 1 werden patiënten (N=504) gerandomiseerd (1:1:1) naar placebo, apremilast 20 mg twee keer per dag (BID) of apremilast 30 mg BID.",
"Er werd geen onevenwicht waargenomen in grote ongewenste hartgebeurtenissen, ernstige of opportunistische infecties, maligniteiten of laboratoriumafwijkingen. Apremilast was effectief in de behandeling van psoriatische artritis, met verbetering van tekenen en symptomen en fysieke functie.",
"Apremilast is een nieuwe orale PDE4-enzymremmer die in staat is de productie van IL-12, IL-23, TNF-a, INF- door leukocyten te blokkeren met daaropvolgende onderdrukking van Th1- en Th17-gemedieerde immuunresponsen, en bewezen klinische werkzaamheid voor psoriasis evenals reumatoïde en psoriatische artritis. Cutaneous Lupus Erythematosus Disease Area and Severity Index (CLASI) toonde een significante (P<0,05) afname na 85 dagen behandeling met apremilast 20 mg twee keer per dag bij 8 patiënten met actieve discoïde lupus.",
"Het doel van deze studie is een overzicht te geven van de nieuwe behandelingen die door de Amerikaanse Food and Drug Administration (FDA) zijn goedgekeurd voor gebruik bij psoriatische artritis (PsA). De FDA heeft drie nieuwe geneesmiddelen voor PsA goedgekeurd: Certolizumab-pegol: een PEGyleerde Fc-vrije tumor necrose factor remmer (TNFi); ustekinumab: een anti-interleukine (IL)-12 en IL-23 monoklonaal antilichaam; en apremilast, een orale fosfodiësterase 4-remmer.",
"In alle onderzoeken had het geneesmiddel een acceptabel veiligheidsprofiel, met de meest voorkomende bijwerkingen diarree, misselijkheid en hoofdpijn. Apremilast heeft een nieuw werkingsmechanisme en is veilig en effectief voor het beheer van psoriasis en psoriatische artritis.",
"Apremilast is een goed verdragen en effectief fosfodiësterase type 4-remmer die geïndiceerd is voor de behandeling van matige tot ernstige plaque psoriasis en psoriatische artritis.",
"Psoriatic Arthritis Long-term Assessment of Clinical Efficacy 1 (PALACE 1) vergeleek apremilast met placebo bij patiënten met actieve psoriatische artritis ondanks eerdere traditionele ziekte-modificerende antireumatische geneesmiddelen (DMARD) en/of biologische therapie. In de 24 weken durende, placebogecontroleerde fase van PALACE 1 werden patiënten (N=504) gerandomiseerd (1:1:1) naar placebo, apremilast 20 mg twee keer per dag (BID) of apremilast 30 mg BID.",
"Nieuwere geneesmiddelen in het behandelarsenaal die werkzaamheid hebben getoond voor zowel psoriasis als psoriatische artritis zijn onder andere de anti-IL-17 agent secukinumab en een fosfodiësterase-4-remmer, apremilast.",
"Om de farmacologie, werkzaamheid en veiligheid van apremilast te beoordelen en de rol ervan ten opzichte van andere middelen bij de behandeling van psoriasis en psoriatische artritis te bepalen. Een PubMed-zoekopdracht (1946 tot december 2015) met de termen apremilast en CC-10004 werd uitgevoerd om relevante artikelen te identificeren. In vitro of in vivo evaluaties van apremilast gepubliceerd in het Engels kwamen in aanmerking voor opname.",
"Bij patiënten met psoriatische artritis zijn er geen klinische onderzoeken die apremilast vergelijken met TNF-alfa-antagonisten, en geen interpreteerbare onderzoeken van apremilast na falen van een TNF-alfa-antagonist.",
"Er werd geen onevenwicht waargenomen in grote ongewenste hartgebeurtenissen, ernstige of opportunistische infecties, maligniteiten of laboratoriumafwijkingen. Apremilast was effectief in de behandeling van psoriatische artritis, met verbetering van tekenen en symptomen en fysieke functie.",
"Apremilast is een nieuwe orale PDE4-enzymremmer die in staat is de productie van IL-12, IL-23, TNF-a, INF- door leukocyten te blokkeren met daaropvolgende onderdrukking van Th1- en Th17-gemedieerde immuunresponsen, en bewezen klinische werkzaamheid voor psoriasis evenals reumatoïde en psoriatische artritis. Cutaneous Lupus Erythematosus Disease Area and Severity Index (CLASI) toonde een significante (P<0,05) afname na 85 dagen behandeling met apremilast 20 mg twee keer per dag bij 8 patiënten met actieve discoïde lupus.",
"Apremilast was effectief in de behandeling van psoriatische artritis, met verbetering van tekenen en symptomen en fysieke functie.",
"Apremilast heeft een nieuw werkingsmechanisme en is veilig en effectief voor het beheer van psoriasis en psoriatische artritis.",
"Apremilast, een orale fosfodiësterase 4-remmer, toonde effectiviteit (ten opzichte van placebo) voor de behandeling van actieve psoriatische artritis in het psoriatische artritis langetermijnevaluatie van klinische werkzaamheid (PALACE) fase III klinische programma.",
"Psoriatic Arthritis Long-term Assessment of Clinical Efficacy 1 (PALACE 1) vergeleek apremilast met placebo bij patiënten met actieve psoriatische artritis ondanks eerdere traditionele ziekte-modificerende antireumatische geneesmiddelen (DMARD) en/of biologische therapie.",
"Apremilast: Een overzicht bij psoriasis en psoriatische artritis.",
"Geneesmiddelveiligheidsevaluatie van apremilast voor de behandeling van psoriatische artritis.",
"Apremilast voor de behandeling van psoriatische artritis.",
"Werkingsmechanisme van apremilast en toepassing bij psoriasis en psoriatische artritis.",
"Apremilast: Een fosfodiësterase 4-remmer voor de behandeling van psoriatische artritis."
] | 967 | 978 |
2,232 | Is er een rol voor TBR1 bij autisme? | Ja. Exoomsequencingstudies hebben meerdere genen geïdentificeerd die de novo verlies-van-functie (LoF) varianten bevatten bij personen met autismespectrumstoornissen (ASS), waaronder T-Brain-1 (TBR1), een hoofdregelaar van de corticale ontwikkeling. T-brain-1 (TBR1) is een hersenspecifieke T-box transcriptiefactor. In 1995 werd Tbr1 voor het eerst geïdentificeerd via subtractieve hybridisatie die embryonale en volwassen telencephalon van muizen vergeleek. Eerdere studies met Tbr1 (-∕-) muizen hebben kritieke rollen van TBR1 aangetoond in de ontwikkeling van de cerebrale cortex, amygdala en reukbol. Neuronale migratie en axonale projectie zijn twee belangrijke ontwikkelingskenmerken die door TBR1 worden gecontroleerd. | [
"TBR1 reguleert autismerisicogenen in de zich ontwikkelende neocortex",
"Exoomsequencingstudies hebben meerdere genen geïdentificeerd die de novo verlies-van-functie (LoF) varianten bevatten bij personen met autismespectrumstoornissen (ASS), waaronder TBR1, een hoofdregelaar van de corticale ontwikkeling. We voerden ChIP-seq uit voor TBR1 tijdens muizencorticale neurogenese en tonen aan dat TBR1-gebonden regio’s verrijkt zijn nabij ASS-genen. ASS-genen waren ook verrijkt onder genen die differentieel tot expressie komen in Tbr1 knockout-muizen, wat samen met de ChIP-seq gegevens wijst op directe transcriptieregulatie. Van de negen onderzochte ASS-genen waren er zeven verkeerd tot expressie gebracht in de cortex van Tbr1 knockout-muizen, waaronder zes met verhoogde expressie in de diepe corticale lagen. ASS-genen met aangrenzende corticale TBR1 ChIP-seq pieken vertoonden ook ongewoon lage niveaus van LoF-mutaties in een referentiepopulatie van mensen en onder IJslanders. We maakten vervolgens gebruik van TBR1-binding om een aantrekkelijke subset kandidaat-ASS-genen te identificeren. Onze bevindingen benadrukken een door TBR1 gereguleerd netwerk van ASS-genen in de zich ontwikkelende neocortex die relatief intolerant zijn voor LoF-mutaties, wat aangeeft dat deze genen mogelijk cruciale rollen spelen in de normale corticale ontwikkeling.",
"T-Brain-1 – Een potentiële hoofdregelaar bij autismespectrumstoornissen.",
"T-Brain-1 (TBR1), een oorzakelijk gen bij autismespectrumstoornissen (ASS), codeert voor een hersenspecifieke T-box transcriptiefactor. Het is daarom mogelijk dat TBR1 de expressie van andere autismerisicofactoren reguleert. De downstream-genen van TBR1 zijn geïdentificeerd met microarray- en promotoranalyses. In deze studie hebben we individuele genen downstream van TBR1 geannoteerd en onderzocht of er associaties zijn met ASS via uitgebreide literatuuronderzoeken. Van de 124 TBR1-doelgenen werden er 23 gerapporteerd als geassocieerd met ASS.",
"Onder deze 24 genen werden vier transcriptiefactoren gevonden: Auts2, Nfia, Nr4a2 en Sox5, wat suggereert dat TBR1 een transcriptiecascade controleert die relevant is voor de pathogenese van autisme. Verder coderen vijf van de 24 genen (Cd44, Cdh8, Cntn6, Gpc6 en Ntng1) voor membraaneiwitten die celadhesie en axonale uitgroei reguleren. Deze genen dragen waarschijnlijk bij aan de rol van TBR1 in de regulatie van neuronale migratie en axonale extensie. Daarnaast wijzen afnames in Grin2b-expressie en toename in Gad1-expressie erop dat neuronale activiteit afwijkend kan zijn in Tbr1-deficiënte muizen. Deze analyses bieden richting voor toekomstige experimenten om het pathogenetische mechanisme van autisme te onthullen.",
"De activiteit-gereguleerde genexpressie van transcriptiefactoren is vereist voor neurale plasticiteit en functie als reactie op neuronale stimulatie. T-brain-1 (TBR1), een cruciale neuron-specifieke transcriptiefactor voor de ontwikkeling van de voorhersenen, wordt erkend als een hoogvertrouwd risicogen voor autismespectrumstoornissen.",
"Disruptieve mutaties in het TBR1-gen zijn herhaaldelijk geïdentificeerd bij patiënten met autismespectrumstoornissen (ASS).",
"Next-generation sequencing heeft recentelijk aangetoond dat terugkerende disruptieve mutaties in enkele genen mogelijk 1% van de sporadische autismegevallen verklaren. Het koppelen van deze nieuwe genetische data aan empirische assays van eiwitfunctie kan cruciale moleculaire netwerken verhelderen. Hier tonen we de kracht van deze aanpak aan door de eerste functionele analyses uit te voeren van TBR1-varianten geïdentificeerd bij sporadisch autisme.",
"T-brain-1 (TBR1) is een hersenspecifieke T-box transcriptiefactor. In 1995 werd Tbr1 voor het eerst geïdentificeerd via subtractieve hybridisatie die embryonale en volwassen telencephalon van muizen vergeleek. Eerdere studies met Tbr1 (-∕-) muizen hebben kritieke rollen van TBR1 aangetoond in de ontwikkeling van de cerebrale cortex, amygdala en reukbol. Neuronale migratie en axonale projectie zijn twee belangrijke ontwikkelingskenmerken die door TBR1 worden gecontroleerd. Recentelijk zijn terugkerende de novo disruptieve mutaties in het TBR1-gen gevonden bij patiënten met autismespectrumstoornissen (ASS). Menselijke genetische studies hebben TBR1 geïdentificeerd als een hoogvertrouwde risicofactor voor ASS.",
"TBR1 reguleert autismerisicogenen in de zich ontwikkelende neocortex.",
"De novo TBR1-mutaties bij sporadisch autisme verstoren eiwitfuncties.",
"Bij mensen zijn PAX6, EOMES en TBR1 in verband gebracht met verstandelijke beperking en autisme.",
"Het is daarom mogelijk dat TBR1 de expressie van andere autismerisicofactoren reguleert.",
"Neuronale excitatie verhoogt Tbr1, een hoogvertrouwd risicogen voor autisme, dat de expressie van Grin2b in de volwassen hersenen medieert.",
"T-Brain-1 (TBR1), een oorzakelijk gen bij autismespectrumstoornissen (ASS), codeert voor een hersenspecifieke T-box transcriptiefactor.",
"Recentelijk zijn terugkerende de novo disruptieve mutaties in het TBR1-gen gevonden bij patiënten met autismespectrumstoornissen (ASS).",
"Hier tonen we de kracht van deze aanpak aan door de eerste functionele analyses uit te voeren van TBR1-varianten geïdentificeerd bij sporadisch autisme.",
"Onder deze 24 genen werden vier transcriptiefactoren gevonden: Auts2, Nfia, Nr4a2 en Sox5, wat suggereert dat TBR1 een transcriptiecascade controleert die relevant is voor de pathogenese van autisme.",
"Disruptieve mutaties in het TBR1-gen zijn herhaaldelijk geïdentificeerd bij patiënten met autismespectrumstoornissen (ASS).",
"T-Brain-1 (TBR1), een oorzakelijk gen bij autismespectrumstoornissen (ASS), codeert voor een hersenspecifieke T-box transcriptiefactor.",
"Onder deze 24 genen werden vier transcriptiefactoren gevonden: Auts2, Nfia, Nr4a2 en Sox5, wat suggereert dat TBR1 een transcriptiecascade controleert die relevant is voor de pathogenese van autisme.",
"Disruptieve mutaties in het TBR1-gen zijn herhaaldelijk geïdentificeerd bij patiënten met autismespectrumstoornissen (ASS).",
"Onder deze 24 genen werden vier transcriptiefactoren gevonden: Auts2, Nfia, Nr4a2 en Sox5, wat suggereert dat TBR1 een transcriptiecascade controleert die relevant is voor de pathogenese van autisme.",
"Het is daarom mogelijk dat TBR1 de expressie van andere autismerisicofactoren reguleert.",
"TBR1 reguleert autismerisicogenen in de zich ontwikkelende neocortex.",
"De novo TBR1-mutaties bij sporadisch autisme verstoren eiwitfuncties.",
"Onze bevindingen benadrukken een door TBR1 gereguleerd netwerk van ASS-genen in de zich ontwikkelende neocortex die relatief intolerant zijn voor LoF-mutaties, wat aangeeft dat deze genen mogelijk cruciale rollen spelen in de normale corticale ontwikkeling."
] | 952 | 923 |
2,233 | Wat is de rol van het MCM2-7 complex? | Het MCM2-7 complex is een ringvormige heterohexameer helicase, die de DNA-dubbelhelix ontwindt voor de andere replicatiemachinerie. Tijdens de vorming van het pre-replicatiecomplex (pre-RC) laden het origin recognition complex (ORC), Cdc6 en Cdt1 samen een dubbel-hexameer MCM2-7 complex op het DNA. Het laden van MCM2-7 is een vereiste voor de licentiëring van eukaryote DNA-replicatie. Tijdens de S-fase functioneert MCM2-7 als onderdeel van de replicatieve helicase, maar binnen het pre-RC is MCM2-7 inactief. | [
"De rol van het MCM2-7 helicasecomplex tijdens de zaadontwikkeling van Arabidopsis.",
"Het MINICHROMOSOME MAINTENANCE 2-7 (MCM2-7) complex, een ringvormige heterohexameer, ontwindt de DNA-dubbelhelix voor de andere replicatiemachinerie.",
"MCM7 is een van de subunits van het MCM2-7 complex die een cruciale rol speelt bij de initiatie van DNA-replicatie en celproliferatie van eukaryote cellen. Na de vorming van het pre-replicatiecomplex (pre-RC) met andere componenten, wordt het MCM2-7 complex geactiveerd door DDK/cycline-afhankelijke kinase om DNA-replicatie te starten.",
"Hexameercomplexen van de zes gerelateerde Mcm2-7 eiwitten vormen de kern van de replicatieve helicase.",
"MCM-BP reguleert het ontladen van de MCM2-7 helicase in de late S-fase.",
"Oorsprongen van DNA-replicatie worden gelicentieerd door het rekruteren van MCM2-7 om het pre-replicatiecomplex (pre-RC) samen te stellen.",
"Mec1 is een van de meerdere kinasen die de Mcm2-7 helicase voorbereiden voor fosforylering door Cdc7.",
"Activatie van de eukaryote replicatieve DNA-helicase, het Mcm2-7 complex, vereist fosforylering door Cdc7/Dbf4 (Dbf4-afhankelijke kinase of DDK), wat op zijn beurt afhankelijk is van voorafgaande fosforylering van Mcm2-7 door een onbekende kinase (of kinasen).",
"Het heterohexameercomplex van minichromosoom onderhoudseiwitten (MCM2-7 complex) speelt een essentiële rol bij origin-licentiëring.",
"Een dubbel-hexameer MCM2-7 complex wordt geladen op origin-DNA tijdens de licentiëring van eukaryote DNA-replicatie.",
"Tijdens de vorming van het pre-replicatiecomplex (pre-RC) laden het origin recognition complex (ORC), Cdc6 en Cdt1 samen het 6-subunit mini chromosoom onderhoud (MCM2-7) complex op DNA. Het laden van MCM2-7 is een vereiste voor DNA-licentiëring die DNA-replicatie beperkt tot één keer per celcyclus. Tijdens de S-fase functioneert MCM2-7 als onderdeel van de replicatieve helicase, maar binnen het pre-RC is MCM2-7 inactief.",
"De quaternaire structuur van MCM2-7 verandert tijdens pre-RC vorming: MCM2-7 is voor het laden een enkel hexameer in oplossing, maar wordt tijdens pre-RC vorming omgevormd tot een dubbel-hexameer. Met behulp van elektronenmicroscopie (EM) observeerden we dat geladen MCM2-7 het DNA omsluit. Het geladen MCM2-7 complex kan op DNA schuiven, en het schuiven is niet directioneel. Onze resultaten bieden belangrijke inzichten in de mechanismen van pre-RC vorming en hebben belangrijke implicaties voor het begrijpen van de rol van MCM2-7 bij de totstandbrenging van bidirectionele replicatievorken.",
"Cdt1 is vereist voor het laden van de replicatieve DNA-helicase MCM2/7, een proces dat bekend staat als DNA-replicatie licentiëring.",
"Zowel de Mcm4/6/7 als de Mcm2~7 complexen stimuleren RNA-primer synthese door DNA-primase in vitro.",
"MCM7 is een van de subunits van het MCM2-7 complex die een cruciale rol speelt bij de initiatie van DNA-replicatie en celproliferatie van eukaryote cellen.",
"Deze biochemische gegevens suggereren dat fosforylering van MCM4 op deze plaatsen door CDK een directe rol speelt bij het losmaken van MCM2-7 van chromatine en/of het voorkomen van herladen van het complex op chromatine.",
"Het heterohexameercomplex van minichromosoom onderhoudseiwitten (MCM2-7 complex) speelt een essentiële rol bij origin-licentiëring.",
"In dit rapport hebben we bimoleculaire fluorescentie complementatie-assays gebruikt in HeLa-cellen om de interacties tussen Cdc45, Mcm2-7 en het GINS-complex (gezamenlijk het CMG-complex genoemd) te onderzoeken, die een sleutelrol lijken te spelen bij de vorming en progressie van replicatievorken.",
"Het origin recognition complex (ORC) van Saccharomyces cerevisiae bindt origin-DNA en werkt samen met Cdc6 en Cdt1 om de replicatieve helicase MCM2-7 op DNA te laden.",
"Het CMG (Cdc45·Mcm2-7·GINS) complex, dat bestaat uit Cdc45, Mcm2-7 en het GINS (Go-Ichi-Ni-San) complex bestaande uit Sld5 en Psf1 tot Psf3, wordt gerekruteerd door Cdc6 en Cdt1 op origins gebonden door het heterohexameer origin recognition complex (ORC) en functioneert als replicatieve helicase.",
"MCM7 is een van de subunits van het MCM2-7 complex die een cruciale rol speelt bij de initiatie van DNA-replicatie en celproliferatie van eukaryote cellen.",
"Het MCM2-7 complex, dat mogelijk fungeert als replicatieve helicase tijdens DNA-synthese, speelt een centrale rol in de stabiliteit van het genoom tijdens de S-fase.",
"Het heterohexameercomplex van minichromosoom onderhoudseiwitten (MCM2-7 complex) speelt een essentiële rol bij origin-licentiëring.",
"In dit werk tonen we aan dat subunits van het MCM2-7 complex gecoördineerd tot expressie komen tijdens de ontwikkeling van Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) en overvloedig aanwezig zijn in prolifererende en endocyclische weefsels, wat wijst op een rol in DNA-replicatie.",
"Cdc6 en Cdt1 spelen een essentiële rol bij de initiatie van DNA-replicatie door het laden van het Mcm2-7 complex, dat nodig is voor het ontwinden van de DNA-helix, op chromosomale origins.",
"Geïnspireerd door de rol van het stijve gebied in promoters, speculeren we dat de stijve replicatieorigins de binding van eiwitten kunnen vergemakkelijken, waaronder het origin recognition complex (ORC), Cdc6, Cdt1 en het MCM2-7 complex.",
"Over het geheel genomen identificeren onze gegevens een nieuw Mcm-eiwit, dat geen deel uitmaakt van het Mcm2-7 complex en dat alleen structureel gebonden is tijdens de S-fase, wat wijst op een specifieke rol in DNA-replicatie.",
"Met behulp van Mcm4/6/7 als hulpmiddel onthullen we een rol voor nucleotidebinding door Saccharomyces cerevisiae Mcm2 in het moduleren van DNA-binding door Mcm-complexen.",
"Het ORC/Cdc6/MCM2-7 complex faciliteert MCM2-7 dimerisatie tijdens de vorming van het pre-replicatiecomplex.",
"Hier worden structurele bewijzen gerapporteerd voor intermediairen bestaande uit een ORC-Cdc6-Mcm2-7 complex en een ORC-Cdc6-Mcm2-7-Mcm2-7 complex, die samen nieuwe inzichten bieden in DNA-licentiëring.",
"Onze resultaten bieden belangrijke inzichten in de mechanismen van pre-RC vorming en hebben belangrijke implicaties voor het begrijpen van de rol van MCM2-7 bij de totstandbrenging van bidirectionele replicatievorken.",
"De Mcm-eiwitten zijn een familie van zes homoloog eiwitten (Mcm2-7) die een belangrijke rol spelen in DNA-replicatie."
] | 894 | 902 |
2,234 | In welke gebieden van DNA-sequencing worden Bloom-filters toegepast? | Een nieuw algoritme, snelle en nauwkeurige classificatie van sequenties (FACSs), wordt geïntroduceerd dat sequenties nauwkeurig en snel kan classificeren als behorend tot of niet behorend tot een referentie-sequentie. Classificatie van DNA-sequenties met behulp van Bloom-filters Lighter is een snel, geheugen-efficiënt hulpmiddel voor het corrigeren van sequencingfouten. | [
"Een nieuw algoritme, snelle en nauwkeurige classificatie van sequenties (FACSs), wordt geïntroduceerd dat sequenties nauwkeurig en snel kan classificeren als behorend tot of niet behorend tot een referentie-sequentie.",
"Classificatie van DNA-sequenties met behulp van Bloom-filters",
"Lighter is een snel, geheugen-efficiënt hulpmiddel voor het corrigeren van sequencingfouten. Lighter vermijdt het tellen van k-mers. In plaats daarvan gebruikt het een paar Bloom-filters, één die een steekproef van de invoer k-mers bevat en de andere die k-mers bevat die waarschijnlijk correct zijn.",
"Snelle verliesvrije compressie via cascaderende Bloom-filters",
"In tegenstelling tot referentie-gebaseerde methoden die eerst reads op het genoom uitlijnen, hashen we alle reads in Bloom-filters om te coderen, en decoderen door dezelfde Bloom-filters te bevragen met behulp van subsequenties van referentie-genoom van leeslengte. Verdere compressie wordt bereikt door gebruik te maken van een cascade van dergelijke filters.",
"Gebruik van cascaderende Bloom-filters om het geheugengebruik voor de Bruijn-grafen te verbeteren",
"In dit werk tonen we aan hoe het geheugen dat nodig is voor de datastructuur van Chikhi en Rizk (WABI'12), die Bruijn-grafen representeert met Bloom-filters, kan worden verminderd.",
"We introduceren een nieuwe op hash gebaseerde methode voor het construeren van de stringgrafiek. We gebruiken incrementeel hashen, en specifiek een modificatie van de Karp-Rabin vingerafdruk, en Bloom-filters.",
"Verder merken we op dat Bloom-filters geschikt zouden zijn om spaced seeds impliciet op te slaan en tolerant te zijn voor sequencingfouten.",
"Het gebruikt een paar cache-oblivious Bloom-filters, één die een uniforme steekproef bevat van [Formule: zie tekst]-gespreide gesequencede [Formule: zie tekst]-mers en de andere die [Formule: zie tekst]-mers bevat die als waarschijnlijk correct zijn geclassificeerd, met behulp van een eenvoudige statistische test.",
"Verbetering van Bloom-filterprestaties op sequentiegegevens met behulp van k-mer Bloom-filters",
"BFs verminderen de geheugenvraag die nodig is om miljoenen k-mers op te slaan terwijl ze snelle set-bevattingsvragen mogelijk maken, tegen de kost van een lage vals-positieve ratio (FPR).",
"We beschouwen verschillende varianten van dergelijke k-mer Bloom-filters (kBFs), leiden theoretische bovengrenzen af voor hun FPR, en bespreken hun toepassingsbereik en beperkingen.",
"Snelle verliesvrije compressie via cascaderende Bloom-filters.",
"Snelle verliesvrije compressie via cascaderende Bloom-filters."
] | 373 | 376 |
2,235 | Welke 2 medicijnen zijn opgenomen in de Qsymia-pil? | De Qsymia-pil bevat fentermine en topiramaat. Het wordt gebruikt voor de behandeling van obesitas. | [
"DOEL: Het kwantificeren van de incrementele kosteneffectiviteit van Qsymia (fentermine en topiramaat met verlengde afgifte) voor verbeteringen in de gezondheidsgerelateerde kwaliteit van leven.",
"De interventie bestond uit dieet- en leefstijladvies plus de aanbevolen dosis Qsymia (fentermine 7,5 mg plus topiramaat 46,0 mg) versus controle, die dieet- en leefstijladvies plus placebo omvatte.",
"Deze omvatten combinaties (in lage dosis) van bestaande geneesmiddelen, bijvoorbeeld bupropion + naltrexon (Contrave), fentermine + topiramaat (Qsymia), hogere doses van bestaande geneesmiddelen die voor andere indicaties zijn goedgekeurd (liraglutide, 3 mg), en nieuwe entiteiten (lorcaserin).",
"RECENTE BEVINDINGEN: Twee nieuwe anti-obesitasmiddelen - naltrexon/bupropion (Contrave) en liraglutide (Saxenda) - werden in 2014 goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration en voegen zich bij vier andere goedgekeurde obesitasmedicijnen, waaronder fentermine/topiramaat XR (Qsymia) en lorcaserin (Belviq), waarmee het grootste aantal beschikbare medicijnen voor de behandeling van obesitas wordt gevormd.",
"Als aanvulling op de momenteel beschikbare farmacotherapieën voor obesitas heeft de Food and Drug Administration recentelijk 2 nieuwe combinatiemedicijnen goedgekeurd, bekend als lorcaserin (Belviq) en fentermine-topiramaat (Qsymia).",
"Na een lange periode van mislukking in de ontwikkeling zijn twee nieuwe medicijnen (fentermine/topiramaat ER - Qsymia™ en lorcaserin - Belviq®) goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor langdurig gewichtsbeheer bij personen met obesitas (BMI ≥ 30 kg/m(2)) of bij mensen met overgewicht (BMI ≥ 27 kg/m(2)) met comorbiditeiten.",
"De interventie bestond uit dieet- en leefstijladvies plus de aanbevolen dosis Qsymia (fentermine 7,5 mg plus topiramaat 46,0 mg) versus controle, die dieet- en leefstijladvies plus placebo omvatte.",
"Huidige anti-obesitasmedicijnen en farmacologische strategieën zullen worden besproken. Twee nieuwe anti-obesitasmiddelen - naltrexon/bupropion (Contrave) en liraglutide (Saxenda) - werden in 2014 goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration en voegen zich bij vier andere goedgekeurde obesitasmedicijnen, waaronder fentermine/topiramaat XR (Qsymia) en lorcaserin (Belviq), waarmee het grootste aantal beschikbare medicijnen voor de behandeling van obesitas wordt gevormd.",
"Bijna een decennium nadat de Food and Drug Administration het eerste medicijn voor gewichtsverlies goedkeurde, keurde zij recentelijk twee nieuwe anti-obesitasmiddelen goed: Belviq (lorcaserin) en Qsymia (topiramaat en fentermine), waarmee het begin van een nieuw tijdperk in de farmacotherapie van obesitas wordt ingeluid.",
"Obesitas is een volksgezondheidscrisis die ongeveer meer dan 33% van de Amerikanen treft en het gezondheidszorgsysteem jaarlijks meer dan $190 miljard kost. Om de 2 nieuwe medicijnen te bespreken die recentelijk zijn goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration (FDA) voor de behandeling van obesitas, lorcaserin HCl (Belviq) en fentermine/topiramaat (Qsymia), en hun potentiële impact op de behandeling van obese patiënten. Leefstijlmodificatie is de eerste en belangrijkste behandeling voor obesitas.",
"Als aanvulling op de momenteel beschikbare farmacotherapieën voor obesitas heeft de Food and Drug Administration recentelijk 2 nieuwe combinatiemedicijnen goedgekeurd, bekend als lorcaserin (Belviq) en fentermine-topiramaat (Qsymia).",
"Twee nieuwe anti-obesitasmiddelen - naltrexon/bupropion (Contrave) en liraglutide (Saxenda) - werden in 2014 goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration en voegen zich bij vier andere goedgekeurde obesitasmedicijnen, waaronder fentermine/topiramaat XR (Qsymia) en lorcaserin (Belviq), waarmee het grootste aantal beschikbare medicijnen voor de behandeling van obesitas wordt gevormd.",
"Om de 2 nieuwe medicijnen te bespreken die recentelijk zijn goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration (FDA) voor de behandeling van obesitas, lorcaserin HCl (Belviq) en fentermine/topiramaat (Qsymia), en hun potentiële impact op de behandeling van obese patiënten."
] | 529 | 539 |
2,236 | Is sonidegib effectief voor basaalcelcarcinoom? | Ja. Sonidegib, een orale smoothened-antagonist, is geïndiceerd voor de behandeling van volwassenen met lokaal gevorderd basaalcelcarcinoom (laBCC) die geen kandidaten zijn voor chirurgie of radiotherapie, of volwassenen met recidiverend laBCC na chirurgie of radiotherapie. | [
"Deze literatuurreview heeft tot doel eerdere en huidige behandelingsopties voor orale therapie bij lokaal gevorderde en gemetastaseerde NMSC te beschrijven die anders niet geschikt zijn voor standaardbehandeling. Orale Smoothened (Smo) remmers Vismodegib, Sonidegib en Taladegib hebben in verschillende onderzoeken effectiviteit getoond.",
"Sonidegib is een nieuwe smoothened-remmer die momenteel wordt onderzocht voor de behandeling van laBCC en een vergelijkbaar veiligheidsprofiel vertoont als vismodegib.",
"De recente ontwikkeling van nieuwe hedgehog-pathway remmers voor hoog-risico BCC (inclusief orale vismodegib en sonidegib) kan een paradigmaverschuiving betekenen richting medische behandeling van NMSC.",
"Sonidegib (Odomzo®), een orale smoothened (SMO) antagonist, is geïndiceerd voor de behandeling van volwassenen met lokaal gevorderd basaalcelcarcinoom (laBCC) die geen kandidaten zijn voor chirurgie of radiotherapie, of volwassenen met recidiverend laBCC na chirurgie of radiotherapie.",
"Het acceptabele baten-risico profiel van sonidegib, samen met het beperkte aantal behandelingsopties en de ernst van de aandoening, maakt sonidegib een opkomende optie voor de behandeling van volwassenen met laBCC die is teruggekeerd na chirurgie of radiotherapie, of voor degenen die geen kandidaten zijn voor chirurgie of radiotherapie.",
"Sonidegibfosfaat: nieuwe goedkeuring voor basaalcelcarcinoom.",
"Sonidegib, een nieuwe smoothened-remmer voor de behandeling van gevorderd basaalcelcarcinoom.",
"Ernstige bijwerkingen traden op bij 11 (14%) van 79 patiënten in de 200 mg groep en 45 (30%) van 150 patiënten in de 800 mg groep. Het baten-risico profiel van 200 mg sonidegib kan een nieuwe behandelingsoptie bieden voor patiënten met gevorderd basaalcelcarcinoom, een moeilijk te behandelen populatie. Novartis Pharmaceuticals Corporation.<CopyrightInformation>Copyright © 2015 Elsevier Ltd. Alle rechten voorbehouden.</",
"Tot op heden hebben Hh-remmers, specifiek die gericht op Smoothened [zoals vismodegib, BMS-833923, saridegib (IPI-926), sonidegib/erismodegib (LDE225), PF-04449913, LY2940680, LEQ 506 en TAK-441], goede werkzaamheid als monotherapie aangetoond bij patiënten met basaalcelcarcinoom en medulloblastoom, maar beperkte activiteit bij andere tumortypes.",
"De hedgehog-pathway remmer sonidegib toonde betekenisvolle tumorkrimping bij meer dan 90% van de patiënten met lokaal gevorderd basaalcelcarcinoom (BCC) of gemetastaseerd BCC in de BCC Outcomes with LDE225 Treatment studie. Dit rapport biedt langetermijn follow-up gegevens verzameld tot 12 maanden na randomisatie van de laatste patiënt. In deze multicenter, gerandomiseerde, dubbelblinde fase II studie werden patiënten 1:2 gerandomiseerd naar sonidegib 200 of 800 mg. De primaire eindpunt was de objectieve responsratio beoordeeld door centrale beoordeling. Objectieve responsratio's in de 200- en 800-mg groepen waren respectievelijk 57,6% en 43,8% bij lokaal gevorderd B",
"Ernstige bijwerkingen traden op bij 11 (14%) van 79 patiënten in de 200 mg groep en 45 (30%) van 150 patiënten in de 800 mg groep. Het baten-risico profiel van 200 mg sonidegib kan een nieuwe behandelingsoptie bieden voor patiënten met gevorderd basaalcelcarcinoom, een moeilijk te behandelen populatie. Novartis Pharmaceuticals Corporation.<CopyrightInformation>Copyright © 2015 Elsevier Ltd. Alle rechten voorbehouden.</C",
"Orale sonidegib is goedgekeurd in Zwitserland voor de behandeling van volwassen patiënten met gevorderd basaalcelcarcinoom (BCC) en in de VS en EU voor de behandeling van volwassen patiënten met lokaal gevorderd BCC dat is teruggekeerd na chirurgie of radiotherapie, of voor degenen die geen kandidaten zijn voor chirurgie of radiotherapie.",
"Sonidegibfosfaat: nieuwe goedkeuring voor basaalcelcarcinoom."
] | 558 | 513 |
2,237 | Welk R-pakket kan worden gebruikt voor de identificatie van pediatrische hersentumoren? | MethPed | [
"MethPed: een R-pakket voor de identificatie van subtypen van pediatrische hersentumoren",
"We hebben daarom de MethPed-classificator ontwikkeld, een multiclass random forest-algoritme, gebaseerd op DNA-methyleringsprofielen van vele subgroepen van pediatrische hersentumoren",
"Het MethPed R-pakket classificeert pediatrische hersentumoren efficiënt met behulp van de ontwikkelde MethPed-classificator. MethPed is beschikbaar via Bioconductor: http://bioconductor.org/packages/MethPed/",
"DNA-methyleringsprofilering van pediatrische hersentumoren biedt een nieuwe manier om deze tumoren te diagnosticeren en in subgroepen te verdelen, wat de huidige klinische diagnostiek op basis van histopathologie verbetert. We hebben daarom de MethPed-classificator ontwikkeld, een multiclass random forest-algoritme, gebaseerd op DNA-methyleringsprofielen van vele subgroepen van pediatrische hersentumoren",
"We hebben een R-pakket ontwikkeld dat de MethPed-classificator implementeert, waardoor het gemakkelijk beschikbaar en toegankelijk is. Het pakket kan worden gebruikt om de waarschijnlijkheid te schatten dat een onbekende sample behoort tot elk van de negen diagnoses/subgroepen van pediatrische hersentumoren",
"Het MethPed R-pakket classificeert pediatrische hersentumoren efficiënt met behulp van de ontwikkelde MethPed-classificator",
"MethPed: een R-pakket voor de identificatie van subtypen van pediatrische hersentumoren.",
"MethPed: een R-pakket voor de identificatie van subtypen van pediatrische hersentumoren.",
"Het MethPed R-pakket classificeert pediatrische hersentumoren efficiënt met behulp van de ontwikkelde MethPed-classificator.",
"We hebben een R-pakket ontwikkeld dat de MethPed-classificator implementeert, waardoor het gemakkelijk beschikbaar en toegankelijk is."
] | 218 | 201 |
2,238 | Beschrijf het nut van CAMUR in The Cancer Genome Atlas (TCGA) | CAMUR is een nieuwe methode die meerdere en equivalente classificatiemodellen extraheert. CAMUR berekent iteratief een regelgebaseerd classificatiemodel, berekent de machtsverzameling van de genen die in de regels aanwezig zijn, elimineert iteratief die combinaties uit de dataset en voert de classificatieprocedure opnieuw uit totdat een stopcriterium is bereikt. CAMUR bevat een speciaal kennisrepository (database) en een querytool. Drie verschillende typen RNA-seq datasets (borst-, hoofd- en hals- en maagkanker) werden geanalyseerd uit The Cancer Genome Atlas (TCGA) en CAMUR en zijn modellen werden ook gevalideerd op niet-TCGA data. Experimentele resultaten tonen de effectiviteit van CAMUR aan door het verkrijgen van meerdere betrouwbare equivalente classificatiemodellen, waaruit de meest frequente genen, hun relaties en de relatie met een bepaald type kanker worden afgeleid. | [
"CAMUR: Kennisextractie uit RNA-seq kankergegevens via equivalente classificatieregels",
"CAMUR, een nieuwe methode die meerdere en equivalente classificatiemodellen extraheert. CAMUR berekent iteratief een regelgebaseerd classificatiemodel, berekent de machtsverzameling van de genen die in de regels aanwezig zijn, elimineert iteratief die combinaties uit de dataset en voert de classificatieprocedure opnieuw uit totdat een stopcriterium is bereikt. CAMUR bevat een speciaal kennisrepository (database) en een querytool. We analyseren drie verschillende typen RNA-seq datasets (borst-, hoofd- en hals- en maagkanker) uit The Cancer Genome Atlas (TCGA) en valideren CAMUR en zijn modellen ook op niet-TCGA data. Onze experimentele resultaten tonen de effectiviteit van CAMUR aan: we verkrijgen meerdere betrouwbare equivalente classificatiemodellen, waaruit de meest frequente genen, hun relaties en de relatie met een bepaald type kanker worden afgeleid",
"CAMUR bevat een speciaal kennisrepository (database) en een querytool. We analyseren drie verschillende typen RNA-seq datasets (borst-, hoofd- en hals- en maagkanker) uit The Cancer Genome Atlas (TCGA) en valideren CAMUR en zijn modellen ook op niet-TCGA data.",
"CAMUR: Kennisextractie uit RNA-seq kankergegevens via equivalente classificatieregels.",
"Wij stellen CAMUR voor, een nieuwe methode die meerdere en equivalente classificatiemodellen extraheert."
] | 332 | 307 |
2,239 | Welke markers worden gescreend met de drievoudige test voor de detectie van syndromen bij de foetus? | De markers die worden gescreend met de drievoudige test voor de detectie van syndromen bij de foetus zijn:
1) alfa-fetoproteïne (AFP),
2) bèta-choriongonadotrofine (bèta-CG) en
3) ongeconjugeerd oestriol (uE3). | [
"Onze studie had als doel het berekenen en valideren van de medianen van de drievoudige markers die worden gebruikt bij screening van Egyptische vrouwen, evenals het aanbevelen van programmatische conventies om de screening in dit land te uniformeren.",
"Choriongonadotrofine (CG), α-fetoproteïne (AFP) en ongeconjugeerd oestriol (uE3) werden gemeten met de Siemens Immulite-analyzer.",
"Drievoudige test screening voor het syndroom van Down: een op Egypte afgestemde studie.",
"Het doel van dit artikel was het evalueren van de betrouwbaarheid van maternale serum drievoudige marker screening van alfa-fetoproteïne, humane choriongonadotrofine en ongeconjugeerd oestriol voor de prenatale diagnose van chromosomale afwijkingen bij de foetus bij Turkse zwangere vrouwen.",
"De drievoudige test in het tweede trimester is een effectief screeningsinstrument voor het opsporen van het syndroom van Down bij Turkse vrouwen.",
"Het doel van deze prospectieve studie was het vergelijken van drievoudige test screening (alfa-fetoproteïne, bèta-choriongonadotrofine en ongeconjugeerd oestriol) met vruchtwaterpunctie bij de detectie van foetussen met het syndroom van Down bij vrouwen van 35 jaar of ouder.",
"Het doel van deze prospectieve studie was het vergelijken van drievoudige test screening (alfa-fetoproteïne, bèta-choriongonadotrofine en ongeconjugeerd oestriol) met vruchtwaterpunctie bij de detectie van foetussen met het syndroom van Down bij vrouwen van 35 jaar of ouder.",
"Geen van de andere vijf markers voegde meer dan 2% detectie toe bij hetzelfde vals-positieve percentage. De prestaties van screening met behulp van maternale leeftijd en serumvrije bèta-hCG en PAPP-A bij 10 weken zwangerschap waren beter dan de dubbele test (alfa-fetoproteïne en hCG met maternale leeftijd) en vergelijkbaar met de drievoudige test (alfa-fetoproteïne, ongeconjugeerd oestriol en hCG met maternale leeftijd) bij 15-22 weken.",
"Aan artsen die prenatale zorg verlenen aanbevelingen doen over (1) of prenatale screening en diagnose van het syndroom van Down (DS) raadzaam is en (2) alternatieve screening- en diagnosemanouvres. \"Drievoudige marker\" screening van maternale serumspiegels van alfa-fetoproteïne, humane choriongonadotrofine en ongeconjugeerd oestriol; foetale echoscopische onderzoek; vruchtwaterpunctie; en chorionvlokkenbiopsie (CVS). Nauwkeurigheid van detectie van DS bij foetussen, en risico's voor de moeder, inclusief psychische stress, en voor de foetus door de screening- en diagnostische interventies. Een MEDLINE-zoekopdracht naar relevante a",
"Een beslissingsanalytisch model werd ontworpen voor vrouwen met een verhoogd risico op een DS-foetus vanwege ofwel gevorderde maternale leeftijd (AMA) of een positieve uitgebreide maternale serum alfa-fetoproteïne (MSAFP) screeningstest, ook bekend als een drievoudige screening (+drievoudig) test.",
"Deze tests hebben een beperkte detectiegraad voor het syndroom van Down: ongeveer 40% voor hCG of vrije bèta-subunit alleen, ongeveer 60% voor de drievoudige screeningstest, en ongeveer 70% voor de viervoudige markertest, allemaal bij 5%, of een relatief hoog vals-positief percentage.",
"Serum humane choriongonadotrofine (hCG) en hCG vrije bèta-subunit tests worden gebruikt in combinatie met ongeconjugeerd oestriol en alfa-fetoproteïne in de drievoudige screeningstest, en met toevoeging van inhibine-A in de viervoudige markertest voor het detecteren van het syndroom van Down in het tweede trimester van de zwangerschap.",
"Initiële en herziene screen-positieve percentages en detectiepercentages werden beoordeeld voor vrouwen die drievoudige marker testen ondergingen (maternale serum alfa-fetoproteïne, humane choriongonadotrofine en ongeconjugeerd oestriol)."
] | 504 | 517 |
2,240 | Wat is de rol van het TAD-eiwitdomein? | Het TAD-domein is een transcriptie-activatiedomein dat voorkomt in transcriptiefactoren. | [
"Zo activeert nucleair ERK5 transcriptiefactoren door directe fosforylering of door te fungeren als co-activator dankzij een uniek transcriptie-activatie TAD-domein dat zich bevindt aan de C-terminale staart.",
"Hoewel ze geen kinase-activiteit bezitten, activeren deze vormen transcriptie door interactie met transcriptiefactoren via het TAD-domein.",
"Myc heeft een N-terminale transcriptie-activatiedomein (TAD) dat interacteert met verschillende co-activatoren en een C-terminale basische-helix-lus-helix-leucine-ritssluiting (bHLHZip) domein dat vereist is voor E-box-specifieke DNA-binding en heterodimerisatie met zijn verplichte bHLHZip-eiwitpartner Max.",
"p300 werkte synergistisch met MRTF-A om de transcriptie van MYH9, MYL9 en CYR61 te activeren. Zoals geïdentificeerd door co-IP, interageerde p300 met het C-terminale TAD-domein van MRTF-A.",
"Om de rol van cytoplasmatische sequestratie van p53 in de remming door het E1B 55-kDa eiwit verder te onderzoeken, hebben we systematisch domeinen onderzocht in zowel het Ad12 55-kDa eiwit als p53 die hun colocalisatie in het cytoplasmatische lichaam ondersteunen en tonen aan dat het N-terminale transactivatiedomein (TAD) van p53 essentieel is voor het vasthouden van p53 in het cytoplasmatische lichaam.",
"Fysieke interactie tussen het transactivatiedomein (TAD) van het mixed-lineage leukemia-eiwit (MLL) en het KIX-domein van het cyclic-AMP response element binding protein (CREB) binding protein (CBP) is noodzakelijk voor MLL-gemedieerde transcriptie-activatie.",
"De IE62 bezit verschillende domeinen die essentieel zijn voor trans-activatie, waaronder een zuur trans-activatiedomein (TAD), een serinerijke streng (SRT), en bindingsdomeinen voor USF, TFIIB en TATA-box bindend eiwit (TBP).",
"Om de rol van cytoplasmatische sequestratie van p53 in de remming door het E1B 55-kDa eiwit verder te onderzoeken, hebben we systematisch domeinen onderzocht in zowel het Ad12 55-kDa eiwit als p53 die hun colocalisatie in het cytoplasmatische lichaam ondersteunen en tonen aan dat het N-terminale transactivatiedomein (TAD) van p53 essentieel is voor het vasthouden van p53 in het cytoplasmatische lichaam.",
"We hebben twee transcriptie-activatiedomeinen (TADs) in Da gekarakteriseerd, genaamd activatiedomein 1 (AD1) en lus-helix (LH), en hebben hun rollen geëvalueerd in het bevorderen van perifere neurogenese.",
"Met name de intrinsieke histon-acetyltransferase (HAT) activiteit en transactivatiedomeinen (TAD) spelen essentiële rollen voor hun co-activatorfunctie."
] | 340 | 327 |
2,241 | Wat is de functie van lncRNA? | Lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) zijn betrokken bij verschillende biologische processen, waaronder de epigenetische controle van genexpressie, post-transcriptionele regulatie van mRNA, en cellulaire proliferatie en differentiatie | [
"lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) zijn voornamelijk bestudeerd met behulp van gekweekte cellijnen, en deze benadering heeft de betrokkenheid van lncRNA's bij diverse biologische processen aan het licht gebracht, waaronder de epigenetische controle van genexpressie, post-transcriptionele regulatie van mRNA, en cellulaire proliferatie en differentiatie",
"Veel duizenden niet-coderende RNA's worden getranscribeerd en erkend als functionele RNA's met diverse groottes, structuren en biologische functies.",
"Bescherming tegen infectie en het behoud van homeostase zijn de kenmerken van het aangeboren immuunsysteem. De complexe signaalroutes die plaatsvinden na microbiële infectie zijn jarenlang intensief bestudeerd en lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) vertegenwoordigen nieuwe regulerende componenten van deze paden.",
"In het afgelopen decennium zijn lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) naar voren gekomen als een fundamentele moleculaire klasse waarvan de leden cruciale rollen spelen in de regulatie van het genoom.",
"Door hun talrijke functies spelen lncRNA's een cruciale rol in groei, ontwikkeling, veroudering, celdood en andere belangrijke fysiologische en pathologische processen.",
"lncRNA's functioneren meestal via interacties met eiwitten, wat het belang benadrukt van het identificeren van de bindingsproteïnen van lncRNA's om de moleculaire mechanismen achter de functies van lncRNA's te begrijpen.",
"Lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) zijn betrokken bij meerdere processen die cruciaal zijn voor normale cellulaire functies en disfunctie van lncRNA MIAT kan bijdragen aan de pathofysiologie van schizofrenie.",
"lncRNA's functioneren als adaptoren die specifieke chromatineloci koppelen aan chromatine-remodellerende complexen en transcriptiefactoren.",
"De resultaten geven aan dat lncRNA-CIR bijdraagt aan de afbraak van de extracellulaire matrix (ECM) en een sleutelrol speelt in de pathogenese van artrose (OA). We stellen voor dat lncRNA-CIR kan worden gebruikt als een potentieel doelwit in de therapie van OA.",
"Hier rapporteren we dat lncRNA#32 geassocieerd is met type I IFN-signaaltransductie.",
"Onze resultaten onthullen een rol voor lncRNA#32 in antivirale gastheerresponsen.",
"Lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) zijn naar voren gekomen als kritische epigenetische regulatoren van genexpressie.",
"RNA's en krachtige genregulatoren, die een belangrijke en gevarieerde rol spelen in cellulaire functies.",
"Er is gerapporteerd dat lncRNA's deelnemen aan een breed scala aan biologische processen, en dysregulatie van lncRNA leidt tot diverse menselijke ziekten, waaronder kanker.",
"Echter, met de ontdekking van lncRNA XIST en HOTAIR worden de opkomende rollen van lncRNA's in ontwikkeling en tumorvorming onthuld. In de afgelopen decennia heeft steeds meer bewijs aangetoond dat lncRNA's betrokken zijn bij een breed scala aan biologische functies, zoals X-chromosoominactivatie, het herprogrammeren van pluripotentie van stamcellen, regulatie van de immuunrespons en carcinogenese."
] | 405 | 405 |
2,242 | Wat is de functie van het exosoom? | Exosomen zijn 40-100 nm grote vesikels die door de meeste celtypen worden vrijgegeven na fusie van multivesiculaire endosomen met het plasmamembraan. Exosomen bevatten eiwitten en RNA-soorten en kunnen communicatie en immuunresponsen mediëren. | [
"Exosoom-gesekreteerde microRNA's spelen een belangrijke rol bij metastatische verspreiding",
"Exosoom-gemedieerde communicatie",
"Cellen zijn in staat verschillende typen vesikels te produceren en vrij te geven, zoals microvesikels en exosomen, in de extracellulaire micro-omgeving. Volgens de wetenschappelijke gemeenschap kunnen zowel microvesikels als exosomen verschillende macromoleculen van en naar andere cellen opnemen en overdragen, en op deze manier kunnen ze de functie van de ontvangende cel beïnvloeden",
"Exosomen zijn 40-100 nm grote vesikels die door de meeste celtypen worden vrijgegeven na fusie van multivesiculaire endosomen met het plasmamembraan. Exosomen, die overal in lichaamsvloeistoffen voorkomen, inclusief urine, bevatten eiwitten en RNA-soorten die specifiek zijn voor het weefsel van herkomst.",
"Exosomen, kleine membraanvesikels die in de extracellulaire omgeving worden uitgescheiden, komen naar voren als een andere belangrijke intercellulaire boodschapper in immuunresponsen.",
"Het exosoom is een complex van 3' --> 5' exoribonucleasen dat een sleutelrol speelt bij de verwerking en afbraak van een breed scala aan RNA-substraten",
"Het RNA-exosoom is verantwoordelijk voor een breed scala aan RNA-verwerkings- en afbraakreacties",
"Het vermogen van exosomen om bioactieve moleculen (bijv. lipiden, eiwitten en nucleïnezuren) te dragen en selectief af te leveren, geeft hen de capaciteit om de activiteit van receptorcellen te moduleren, zelfs als deze cellen zich in verre weefsels of organen bevinden.",
"Onze gegevens tonen aan dat NKG2D een waarschijnlijke fysiologische doelwit is voor exosoom-gemedieerde immuunontduiking bij kanker.",
"Exosomen, een belangrijk onderdeel van paracriene secretie door cellen, kunnen beschermende effecten uitoefenen in verschillende ziekte modellen",
"Exosoomsecretie draagt bij aan de uitroeiing van verouderde eiwitten, maar verschillende bevindingen, vooral in het immuunsysteem, geven aan dat exosomen een potentieel middel van intercellulaire communicatie vormen",
"Exosomen, nano-grote extracellulaire vesikels, worden verondersteld een belangrijke rol te spelen in intercellulaire communicatie. Deze studie toont aan dat exosomen die door menselijke macrofagen worden vrijgegeven, de migratie van endotheelcellen negatief reguleren door controle van integrine-trafficking.",
"We vonden dat de meerderheid van de extracellulaire vesikels in het kamerwater binnen het exosoom-groottebereik viel, wat suggereert dat miRNA's die in exosomen zijn gehuisvest, kunnen functioneren in communicatie tussen de aan- en afvoerende weefsels van het kamerwater.",
"Tumorceld-afgeleide exosomen (TEX) onderdrukken functies van immuuncellen."
] | 361 | 369 |
2,243 | Welke factoren drijven de afbraak van het replisoom tijdens de beëindiging van DNA-replicatie en mitose? | CUL-2LRR-1 en UBXN-3. | [
"Met behulp van vroege embryo's van Caenorhabditis elegans en eierextracten van Xenopus laevis tonen we aan dat de E3-ligase CUL-2LRR-1 zich associeert met het replisoom en de ubiquitylering en afbraak van CMG aandrijft, samen met de CDC-48 cofactoren UFD-1 en NPL-4. Verwijdering van CMG van chromatine in kikkereierextracten vereist CUL2-neddylatie, en onze gegevens identificeren de rekrutering van CUL2LRR1 aan chromatine als een belangrijke gereguleerde stap tijdens de beëindiging van DNA-replicatie. Interessant is echter dat CMG op chromatine blijft tot de profase in wormen die CUL-2LRR-1 missen, maar vervolgens wordt verwijderd door een mitotisch pad dat de CDC-48 cofactor UBXN-3 vereist, ortholoog aan de menselijke tumorrepressor FAF1.",
"CUL-2 en UBXN-3 drijven de afbraak van het replisoom aan tijdens de beëindiging van DNA-replicatie en mitose."
] | 119 | 138 |
2,244 | Heeft RNA-polymerase II RNA-splitsingsactiviteit? | Naast RNA-synthese ondersteunen multisubeenheid RNA-polymerasen (msRNAP's) enzymatische reacties zoals intrinsieke transcript-splitsing. De eukaryote transcriptiefactor TFIIS versterkt de elongatie en de splitsingsactiviteit van het pas gesynthetiseerde transcript door RNA-polymerase II in een vastgelopen elongatiecomplex. | [
"Naast RNA-synthese ondersteunen multisubeenheid RNA-polymerasen (msRNAP's) enzymatische reacties zoals intrinsieke transcript-splitsing.",
"De actieve centra van msRNAP's van verschillende soorten lijken een verschillende efficiëntie van intrinsieke transcript-splitsing te vertonen en zijn waarschijnlijk geëvolueerd om fijnregeling van het transcriptieproces mogelijk te maken.",
"Hier tonen we aan dat een enkele aminozuursubstitutie in de triggerlus (TL) van Saccharomyces RNAP II, Rpb1 H1085Y, een toename van intrinsieke splitsingsactiviteit veroorzaakt waarbij het vervangen tyrosine lijkt deel te nemen aan zuur-base chemie bij alkalische pH voor zowel intrinsieke splitsing als nucleotidyltransferase.",
"De eukaryote transcriptiefactor TFIIS versterkt de elongatie en de splitsingsactiviteit van het pas gesynthetiseerde transcript door RNA-polymerase II in een vastgelopen elongatiecomplex.",
"Het zinklint-dipeptide Asp-Glu van transcriptiefactor TFIIS is cruciaal voor stimulatie van elongatie en RNA-splitsing door RNA-polymerase II.",
"Door gerichte mutagenese hebben we aangetoond dat de onveranderlijke residuen Asp-261 en Glu-262 van het nucleïnezuur-bindende TFIIS Zn-lint cruciaal zijn voor stimulatie van zowel elongatie- als RNA-splitsingsactiviteiten van RNA-polymerase II.",
"Complexen van gist RNA-polymerase II en RNA zijn substraten voor TFIIS-geïnduceerde RNA-splitsing.",
"RNA in dergelijke RNA-RNA-polymerasecomplexen ondergaat reacties die eerder als uniek werden beschouwd voor pas gesynthetiseerd RNA in tertiaire complexen met DNA, inclusief TFIIS-afhankelijke splitsing en elongatie door 3'-terminaal toevoegen van NMP uit NTP.",
"Splitsing van pas gesynthetiseerd RNA door vastgelopen RNA-polymerase II vereist geen upstream translocatie van het elongatiecomplex op DNA.",
"Hier tonen we aan dat in aanwezigheid van SII en nucleotiden transcript-splitsing wordt gedetecteerd tijdens SII-afhankelijke elongatie maar niet tijdens SII-onafhankelijke transcriptie.",
"Onder typische transcriptieomstandigheden is SII noodzakelijk maar onvoldoende om RNA-splitsing te activeren. RNA-splitsing zou kunnen dienen om RNA-polymerase II weg te bewegen van het transcriptie-obstakel en/of RNA-polymerase II meerdere pogingen tot RNA-elongatie te laten doen.",
"SII is een RNA-polymerase II-bindend eiwit dat transcriptie-elongatie stimuleert en ook de splitsing van pas gesynthetiseerd transcript door RNA-polymerase II in elongatiecomplexen in vitro activeert.",
"Het RNA-polymerase II elongatiecomplex. Factor-afhankelijke transcriptie-elongatie omvat splitsing van pas gesynthetiseerd RNA.",
"Splitsing was niet beperkt tot een elongatiecomplex dat op deze specifieke plaats was gestopt, wat aantoont dat hydrolyse van pas gesynthetiseerd RNA een algemene eigenschap is van RNA-polymerase II elongatiecomplexen.",
"Elongatiefactor SII (ook bekend als TFIIS) is een RNA-polymerase II-bindend eiwit dat het mogelijk maakt om arrestatieplaatsen op het sjabloon te passeren door een splitsingsreactie van pas gesynthetiseerd RNA te activeren.",
"Tijdens gen-transcriptie kan het actieve centrum van RNA-polymerase (Pol) RNA-splitsing katalyseren.",
"Tijdens gen-transcriptie kan het actieve centrum van RNA-polymerase (Pol) RNA-splitsing katalyseren.",
"De eukaryote transcriptiefactor TFIIS versterkt de elongatie en de splitsingsactiviteit van het pas gesynthetiseerde transcript door RNA-polymerase II in een vastgelopen elongatiecomplex.",
"Rpb9, een kleine subeenheid van RNA-polymerase II, versterkt de stimulatie van splitsingsactiviteit door S-II.",
"Deze resultaten suggereren dat zowel S-II als Rpb9 de transcriptietrouw handhaven door de intrinsieke splitsingsactiviteit van RNA-polymerase II te stimuleren.",
"Het is ook mogelijk dat de transcript-splitsingsactiviteit van RNA-polymerase II een correctiefunctie van het enzym vertegenwoordigt.",
"Splitsing van pas gesynthetiseerd RNA door vastgelopen RNA-polymerase II vereist geen upstream translocatie van het elongatiecomplex op DNA.",
"Intrinsieke transcript-splitsing in gist RNA-polymerase II elongatiecomplexen."
] | 541 | 503 |
2,245 | Is er een sequentievoorkeur in MNase-verteringspatronen? | De knipvoorkeur van MNase in combinatie met grootte-selectie genereert een sequentie-afhankelijke bias in de resulterende fragmenten. | [
"Bovendien knipt MPE-Fe(II), in tegenstelling tot MNase, nucleair DNA met weinig sequentievoorkeur.",
"Deze bevindingen geven gezamenlijk aan dat MPE-seq een unieke en eenvoudige methode biedt voor de genoomwijde analyse van chromatinestructuur met minimale DNA-sequentiebias.",
"Micrococcale nuclease veroorzaakt geen substantiële bias in nucleosoommapping.",
"MNase is tot nu toe zeer veel gebruikt om nucleosomen in kaart te brengen, hoewel er zorgen zijn geuit over de mogelijkheid dat het bias introduceert.",
"Deze resultaten geven aan dat biases in nucleosoompositioneringsgegevens verzameld met MNase, onder onze condities, niet significant zijn.",
"Signaalvariatie in deze simulaties onthult een belangrijke DNA-samplingbias die voortkomt uit een buurt-effect van MNase-verteringstechnieken.",
"Gestandaardiseerde verzameling van MNase-seq experimenten maakt onbevooroordeelde datasetvergelijkingen mogelijk.",
"Hier tonen we aan dat de knipvoorkeur van MNase in combinatie met grootte-selectie een sequentie-afhankelijke bias genereert in de resulterende fragmenten.",
"We stellen voor dat gecombineerde MNase/exoIII-vertering kan worden toegepast op in situ chromatine voor onbevooroordeelde genoomwijde mapping van nucleosoomposities die niet worden beïnvloed door DNA-sequenties bij de kern/linker-overgangen.",
"Signaalvariatie in deze simulaties onthult een belangrijke DNA-samplingbias die voortkomt uit een buurt-effect van MNase-verteringstechnieken.",
"Signaalvariatie in deze simulaties onthult een belangrijke DNA-samplingbias die voortkomt uit een buurt-effect van MNase-verteringstechnieken.",
"Deze resultaten geven aan dat biases in nucleosoompositioneringsgegevens verzameld met MNase, onder onze condities, niet significant zijn.",
"Micrococcale nuclease veroorzaakt geen substantiële bias in nucleosoommapping.",
"We vinden dat maïs MNase-hypersensitieve (MNase HS) regio's zich bevinden rond actieve genen en binnen recombinatie-hotspots, waarbij bevooroordeelde genconversie zich concentreert aan hun flanken."
] | 269 | 244 |
2,246 | Is NEMO een zinkvingereiwit? | De functie van NEMO wordt gemedieerd door twee distale ubiquitine-bindingsdomeinen die zich bevinden in het regulerende C-terminale domein van het eiwit: het coiled-coil 2-leucine zipper (CC2-LZ) domein en het zinkvinger (ZF) domein. | [
"Om de thermodynamica en dynamiek van de zinkvinger van NEMO (NF-κB essentiële modulator) beter te begrijpen",
"een wijziging in het zinkvingerdomein van NEMO (K392R)",
"CYLD en de NEMO zinkvinger reguleren tumor necrose factor signalering en vroege embryogenese.",
"onze simulaties van de zinkvinger NEMO",
"Een belangrijk regulerend domein van NF-[Formule: zie tekst]B essentiële modulator (NEMO) is een ubiquitine-bindende zinkvinger, met een tetraëdrische CYS3HIS1 zink-coördinerende bindingsplaats.",
"De functie van NEMO wordt gemedieerd door twee distale ubiquitine-bindingsdomeinen die zich bevinden in het regulerende C-terminale domein van het eiwit: het coiled-coil 2-leucine zipper (CC2-LZ) domein en het zinkvinger (ZF) domein.",
"We tonen hier aan dat het C-terminus van NEMO, bestaande uit het ubiquitine-bindingsgebied en een zinkvinger,"
] | 150 | 140 |
2,247 | Beïnvloedt TFIIS de positionering van nucleosomen? | Transcriptiesplitsingsfactor TFIIS heractiveert de teruggelopen complexen en bevordert pol II transcriptie door het nucleosoom. Dezelfde nucleosomen die in de tegenovergestelde richting worden getranscribeerd, vormen een zwakkere, meer diffuse barrière die grotendeels wordt opgeheven door hogere zoutconcentraties, TFIIS of FACT | [
"Transcriptiesplitsingsfactor TFIIS heractiveert de teruggelopen complexen en bevordert pol II transcriptie door het nucleosoom.",
"Dezelfde nucleosomen die in de tegenovergestelde richting worden getranscribeerd, vormen een zwakkere, meer diffuse barrière die grotendeels wordt opgeheven door hogere zoutconcentraties, TFIIS of FACT",
"Het systeem bevat natuurlijke of recombinante histonen, chromatine-assemblagefactoren, de histon-acetyltransferase p300, alle componenten van de algemene transcriptiemachinerie, algemene co-activatoren en de elongatiefactor SII (TFIIS).",
"Efficiënte en snelle doorgang van nucleosomen door RNA-polymerase II hangt af van een combinatie van transcriptie-elongatiefactoren.",
"We tonen nu aan dat hoewel TFIIF of TFIIS afzonderlijk een bescheiden stimulans geven voor nucleosoomdoorgang, beide factoren samen de transcriptie door nucleosomen op een synergetische wijze verhogen.",
"Belangrijk is dat we vonden dat nucleosomen met een Sin-mutant histon in dezelfde mate en bijna met dezelfde snelheid worden doorkruist als equivalente pure DNA-sjablonen, mits zowel TFIIS als TFIIF aanwezig zijn.",
"Na gedeeltelijke ontwinding van nucleosomaal DNA van het histon-octameer door Pol II en teruglopen van het enzym, wikkelt het nucleosomale DNA zich weer om het octameer, waardoor Pol II in de gestopte toestand wordt vergrendeld. Histon-chaperonnes en transcriptiefactoren TFIIS, TFIIF en FACT vergemakkelijken transcriptie door chromatine via verschillende moleculaire mechanismen.",
"Transcriptiesplitsingsfactor TFIIS heractiveert de teruggelopen complexen en bevordert pol II transcriptie door het nucleosoom.",
"De sterk geconserveerde eukaryote transcriptie-elongatiefactor TFIIS stelt RNA-polymerase II (RNAPII) in staat om pauze- of terminatieplaatsen, nucleosomen en sequentiespecifieke DNA-bindende eiwitten te passeren.",
"We bestudeerden ook het effect van TFIIF en TFIIS op de transcriptie van nucleosomen die een Sin-mutant histon bevatten.",
"Dezelfde nucleosomen die in de tegenovergestelde richting worden getranscribeerd, vormen een zwakkere, meer diffuse barrière die grotendeels wordt opgeheven door hogere zoutconcentraties, TFIIS of FACT."
] | 310 | 303 |
2,248 | Welke twee cotransporters worden geremd door sotagliflozine? | Sotagliflozine werkt door het remmen van natrium-glucose cotransporter 1 (SGLT1) en natrium-glucose cotransporter 2 (SGLT2). Het wordt gebruikt voor de behandeling van diabetes. | [
"De huidige studie gebruikte moleculaire docking met Autodock4.2 volgens ons \"Click-By-Click\"-protocol, Ligplot1.4.3 en \"verandering in toegankelijke oppervlakte (ΔASA)-berekeningen\" om de binding van twee experimentele antidiabetica, Ertugliflozine en Sotagliflozine, aan een vastgesteld doelwit (SGLT2) en een onderzoeksdoelwit (menselijke hersen AChE) te onderzoeken.",
"SGLT2-remmers zoals canagliflozine en sotagliflozine (een dubbele remmer van SGLT1/SGLT2) hebben ook een milde tot matige intestinale en renale SGLT1-remmende werking vanwege hun relatief zwakke selectiviteit voor SGLT2 ten opzichte van SGLT1.",
"Waterstofgebonden structuren en interactie-energieën in twee vormen van de SGLT-2 remmer sotagliflozine.",
"We evalueerden de veiligheid en werkzaamheid van sotagliflozine, een orale remmer van natrium-glucose cotransporters 1 en 2, in combinatie met insulinebehandeling bij patiënten met type 1 diabetes.",
"Fase 2-studies met de SGLT2-remmer empagliflozine en de dubbele SGLT1 en SGLT2-remmer sotagliflozine, die werkt in de darm en de nier, hebben verminderingen in A1C, gewicht en glucoseschommelingen aangetoond zonder een verhoogde incidentie van hypoglykemie.",
"Sotagliflozine kan aan deze behoefte voldoen, omdat deze verbinding de bloedglucose verlaagt via insuline-onafhankelijke mechanismen door remming van nier-SGLT2 en intestinale SGLT1.",
"BESCHREVEN GEBIEDEN: Hier richten de auteurs zich specifiek op sotagliflozine (LX4211), de eerste dubbele SGLT1/SGLT2-remmer in zijn soort.",
"Ondanks een zwakkere werking op UGE dan selectieve SGLT2-remmers, is sotagliflozine even effectief als SGLT2-remmers in het verlagen van HbA1C, met een vergelijkbaar veiligheidsprofiel in kortetermijnstudies.",
"Daarom is sotagliflozine (LX4211) ontwikkeld als een dubbele remmer van SGLT1 en SGLT2.",
"Sotagliflozine, een dubbele SGLT1 en SGLT2-remmer, als aanvullende therapie bij insuline bij type 1 diabetes.",
"DOELSTELLING: De veiligheid en werkzaamheid beoordelen van dubbele remming van natrium-glucose cotransporter (SGLT) 1 en SGLT2 met sotagliflozine als aanvullende therapie bij insuline bij type 1 diabetes. ONDERZOEKSDESIGN EN METHODEN: We behandelden 33 patiënten met sotagliflozine, een orale dubbele SGLT1 en SGLT2-remmer, of placebo in een gerandomiseerde, dubbelblinde studie waarbij veiligheid, insulinedosis, glykemische controle en andere metabole parameters over 29 dagen behandeling werden beoordeeld.",
"CONCLUSIES: Als aanvulling op insuline verbeterde dubbele remming van SGLT1 en SGLT2 met sotagliflozine de glykemische controle en het CGM-profiel met verlaging van de bolusinsulinedosis, gewichtsverlies en geen toename van hypoglykemie bij type 1 diabetes.",
"We evalueerden de veiligheid en werkzaamheid van sotagliflozine, een orale remmer van natrium-glucose cotransporters 1 en 2, in combinatie met insulinebehandeling bij patiënten met type 1 diabetes.",
"Ondanks een zwakkere werking op UGE dan selectieve SGLT2-remmers, is sotagliflozine even effectief als SGLT2-remmers in het verlagen van HbA1C, met een vergelijkbaar veiligheidsprofiel in kortetermijnstudies.",
"DOELSTELLING: De veiligheid en werkzaamheid beoordelen van dubbele remming van natrium-glucose cotransporter (SGLT) 1 en SGLT2 met sotagliflozine als aanvullende therapie bij insuline bij type 1 diabetes.",
"Daarom is sotagliflozine (LX4211) ontwikkeld als een dubbele remmer van SGLT1 en SGLT2.",
"CONCLUSIES: Als aanvulling op insuline verbeterde dubbele remming van SGLT1 en SGLT2 met sotagliflozine de glykemische controle en het CGM-profiel met verlaging van de bolusinsulinedosis, gewichtsverlies en geen toename van hypoglykemie bij type 1 diabetes.",
"BESCHREVEN GEBIEDEN: Hier richten de auteurs zich specifiek op sotagliflozine (LX4211), de eerste dubbele SGLT1/SGLT2-remmer in zijn soort.",
"De veiligheid en werkzaamheid beoordelen van dubbele remming van natrium-glucose cotransporter (SGLT) 1 en SGLT2 met sotagliflozine als aanvullende therapie bij insuline bij type 1 diabetes."
] | 533 | 522 |
2,249 | Wat is de toedieningsweg van IVIG bij patiënten met de ziekte van Alzheimer? | IVIG wordt intraveneus toegediend. | [
"Intravenieuze immunoglobuline (IVIG) behandeling oefent antioxidante en neurobeschermende effecten uit in preklinische modellen van de ziekte van Alzheimer.",
"Intravenieuze immunoglobuline (IVIG) heeft tot nu toe beperkte hoop getoond in klinische studies bij mensen met de ziekte van Alzheimer (AD), maar overweldigend positief preklinisch werk bij dieren en menselijke hersenculturen ondersteunt het idee dat de therapie mogelijk effectief blijft."
] | 64 | 72 |
2,250 | Wat is metaSPAdes? | MetaSPAdes is een nieuwe veelzijdige metagenomische assembler. | [
"metaSPAdes: een nieuwe veelzijdige metagenomische assembler.",
"Hoewel metagenomica is uitgegroeid tot een technologie bij uitstek voor het analyseren van bacteriële populaties, blijft de assemblage van metagenomische data een uitdaging, wat biologische ontdekkingen belemmert. Bovendien hebben recente studies aangetoond dat complexe bacteriële populaties kunnen bestaan uit tientallen verwante stammen, wat de uitdaging van metagenomische assemblage verder vergroot. metaSPAdes pakt verschillende uitdagingen van metagenomische assemblage aan door gebruik te maken van computationele ideeën die nuttig bleken bij assemblages van enkele cellen en sterk polymorfe diploïde genomen.",
"metaSPAdes pakt verschillende uitdagingen van metagenomische assemblage aan door gebruik te maken van computationele ideeën die nuttig bleken bij assemblages van enkele cellen en sterk polymorfe diploïde genomen.",
"Faucet gebruikte orders van grootte minder tijd en schijfruimte dan de gespecialiseerde metagenoom-assemblers MetaSPAdes en Megahit, terwijl het ook hun geheugengebruik verbeterde; dit kwam grotendeels overeen met de prestaties van andere assemblers die resource-efficiëntie optimaliseren, namelijk Minia en LightAssembler.",
"metaspades een nieuwe veelzijdige metagenomische assembler.",
"metaspades pakt verschillende uitdagingen van metagenomische assemblage aan door gebruik te maken van computationele ideeën die nuttig bleken bij assemblages van enkele cellen en sterk polymorfe diploïde genomen. We vergelijken metaspades met andere state-of-the-art metagenoom-assemblers en tonen aan dat het resulteert in assemblages van hoge kwaliteit over diverse datasets.",
"Specifiek voor metagenomen ontworpen tools, met name metaSPAdes, MEGAHIT en IDBA-UD, waren het meest effectief bij het assembleren van viromen.",
"Faucet gebruikte orders van grootte minder tijd en schijfruimte dan de gespecialiseerde metagenoom-assemblers MetaSPAdes en Megahit, terwijl het ook hun geheugengebruik verbeterde; dit kwam grotendeels overeen met de prestaties van andere assemblers die resource-efficiëntie optimaliseren, namelijk Minia en LightAssembler."
] | 257 | 266 |
2,251 | Wat wordt gemeten met de NOMe-Seq-methodologie? | We hebben een methode ontwikkeld (NOMe-seq) die een GpC-methyltransferase (M.CviPI) en next generation sequencing gebruikt om een hoogresolutie voetafdruk van nucleosoompositionering over het hele genoom te genereren met minder dan 1 miljoen cellen, terwijl de endogene DNA-methylatie-informatie van dezelfde DNA-streng behouden blijft. DNaseI-seq en NOMe-seq. | [
"Met behulp van Nucleosome Occupancy Methylome-Sequencing, NOMe-Seq, een single-molecule, hoogresolutie nucleosoompositioneringsassay, tonen we aan dat actieve, maar niet inactieve, niet-CpG-eilandpromoters een nucleosoom-arme regio (NDR) direct stroomopwaarts van de transcriptiestartplaats (TSS) vertonen.",
"Met behulp van Nucleosome Occupancy Methylome-Sequencing, NOMe-Seq, een single-molecule, hoogresolutie nucleosoompositioneringsassay, tonen we aan dat actieve, maar niet inactieve, niet-CpG-eilandpromoters een nucleosoom-arme regio (NDR) direct stroomopwaarts van de transcriptiestartplaats (TSS) vertonen.",
"Volgens onze genoomwijde expressie- en DNA-methylatieprofielen blijkt dat de volledige heractivatie van gesilenceerde genen de invoeging van het histonvariant H2A.Z vereist, wat de verwerving van volledig nucleosoom-arme regio's vergemakkelijkt zoals aangetoond door de NOMe-seq (Nucleosome Occupancy Methylome-sequencing) assay.",
"We hebben een methode ontwikkeld (NOMe-seq) die een GpC-methyltransferase (M.CviPI) en next generation sequencing gebruikt om een hoogresolutie voetafdruk van nucleosoompositionering over het hele genoom te genereren met minder dan 1 miljoen cellen, terwijl de endogene DNA-methylatie-informatie van dezelfde DNA-streng behouden blijft.",
"Genoomwijde kaartlegging van nucleosoompositionering en DNA-methylatie binnen individuele DNA-moleculen.",
"Belangrijk is dat NOMe-seq DNA-methylatie- en nucleosoompositioneringsinformatie van hetzelfde DNA-molecuul verkrijgt, wat de eerste genoomwijde correlatie tussen DNA-methylatie en nucleosoompositionering op single-molecule, en dus single-cell niveau geeft, die gebruikt kan worden om ziekteprogressie en respons op therapie te monitoren.",
"Hier evalueren we de omvang van globale epigenetische veranderingen bij enhancers en insulator-elementen in prostaat- en borstkankercellen met behulp van gelijktijdige genoomwijde kaartlegging van DNA-methylatie en nucleosoombezetting (NOMe-seq).",
"Nucleosome Occupancy and Methylome sequencing (NOMe-seq) werd gebruikt om de alleelspecifieke positionering van nucleosomen rond heterozygote splice-site mutaties te bepalen in lymfoblastoïde cellijnen (LCL's) afgeleid van zes Lynch-syndroom patiënten.",
"Om dit aan te pakken gebruikten we Nucleosome Occupancy and Methylation sequencing (NOMe-seq) om de genoomwijde DNA-methylatie- en nucleosoombezettingsprofielen te vergelijken tussen normale en kankercellijnmodellen van borst en prostaat.",
"Hier beschrijven we de bio-informatica-pijplijn en methoden die we hebben ontwikkeld voor de verwerking en analyse van de NOMe-seq data gepubliceerd door (Taberlay et al., 2014 [1]) en gedeponeerd in de Gene Expression Omnibus met accession GSE57498.",
"De NOMe-seq toegankelijkheidsassay onthulde onverwacht symmetrische en transcriptie-onafhankelijke nucleosomale fasering over actieve, paraatstaande en inactieve genomische elementen.",
"TEPIC kan worden toegepast op verschillende open-chromatine data, bijvoorbeeld DNaseI-seq en NOMe-seq.",
"Ten slotte voorspellen deze scores correct bekende transcriptieregulatoren, geïllustreerd door de toepassing op nieuwe DNaseI-seq en NOMe-seq data voor primaire humane hepatocyten en CD4+ T-cellen, respectievelijk.",
"Recentelijk zijn Methyltransferase Accessibility Protocol for individual templates-Bisulfite Genome Sequencing (MAPit-BGS) en nucleosoombezetting en methyloomsequencing (NOMe-seq) ontwikkeld voor het gelijktijdig profileren van chromatintoegankelijkheid en DNA-methylatie op single-molecule niveau.",
"Hier heb ik Nucleosome Occupancy and Methylome-sequencing (NOMe-seq) aangepast om chromatintoegankelijkheid en endogene DNA-methylatie in enkele cellen te meten (scNOMe-seq).",
"Recentelijk zijn Methyltransferase Accessibility Protocol for individual templates-Bisulfite Genome Sequencing (MAPit-BGS) en nucleosoombezetting en methyloomsequencing (NOMe-seq) ontwikkeld voor het gelijktijdig profileren van chromatintoegankelijkheid en DNA-methylatie op single-molecule niveau.",
"We ontwikkelen een statistische methode, epiG, om verschillende epi-allelische haplotypen, geannoteerd met CpG-methylatiestatus en DNA-polymorfismen, af te leiden en te onderscheiden uit whole-genome bisulfiet sequencing data, en nucleosoombezetting uit NOMe-seq data.",
"In deze studie boeken we vooruitgang in het begrijpen van deze tegenstrijdige fenomenen door een bio-informatica benadering te implementeren die MNase-seq en NOMe-seq data combineert en door DNA-methylatie en nucleosoombezetting uitgebreid te profileren door het menselijk genoom heen.",
"Nucleosome Occupancy and Methylome sequencing (NOMe-seq) werd gebruikt om de alleelspecifieke positionering van nucleosomen rond heterozygote splice-site mutaties te bepalen in lymfoblastoïde cellijnen (LCL's) afgeleid van zes Lynch-syndroom patiënten.",
"Hier evalueren we de omvang van globale epigenetische veranderingen bij enhancers en insulator-elementen in prostaat- en borstkankercellen met behulp van gelijktijdige genoomwijde kaartlegging van DNA-methylatie en nucleosoombezetting (NOMe-seq)."
] | 649 | 600 |
2,252 | Wat is de functie van de dormantie-overlevingsregelaar (DosR) in Mycobacterium tuberculosis? | Tijdens deze fase zijn minstens 48 genen, gezamenlijk het Dormancy survival regulator (DosR) regulon genoemd, belangrijk voor het langdurig overleven van bacillen in een niet-ademende toestand. | [
"De ontdekking dat de tuberkelbacterie een medicijntolerante, sluimerende vorm kan ontwikkelen en de identificatie van het onderliggende genetische programma tien jaar geleden, effenden de weg voor een dieper begrip van het leven van de parasiet binnen menselijke laesies en voor nieuwe benaderingen in de ontdekking van antimycobacteriële geneesmiddelen. Hier vatten we samen wat we hebben geleerd sinds de ontdekking van de hoofdregelaar van dormantie, DosR, en de belangrijkste kennishiaten die nog bestaan.",
"M. tb-uitgebreide CD4+CD25+ (85% Foxp3(+)) cellen en D4GDI induceerden intracellulair M. tb om de dormantie-overlevingsregelaar DosR en DosR-afhankelijke genen tot expressie te brengen, wat suggereert dat D4GDI een niet-replicerende toestand in de pathogeen induceert.",
"Tijdens deze fase zijn minstens 48 genen, gezamenlijk het Dormancy survival regulator (DosR) regulon genoemd, belangrijk voor het langdurig overleven van bacillen in een niet-ademende toestand, een conditie die bacillen tegenkomen binnen granulomateuze laesies.",
"De niet-replicerende of dormantie-achtige toestand van deze pathogeen, die ongevoelig is voor anti-tuberculosemiddelen, wordt algemeen erkend als de oorzaak van dit scenario. Het dormantie-overlevingsregulon (DosR regulon), bestaande uit 48 co-gereguleerde genen, wordt als essentieel beschouwd voor de persistentie van Mtb.",
"Het DosR regulon stelt de pathogeen in staat te overleven tijdens langdurige hypoxie.",
"Bij een daling van het zuurstofgehalte kunnen bacteriën van het Mycobacterium tuberculosis-complex een genetisch programma induceren dat wordt gekenmerkt door gestopte duplicatie, wat Non-replicating persistence (NRP) wordt genoemd.",
"Het dormantie-overlevingsregulon (Dos regulon), gereguleerd door de responsregelaar DosR, lijkt essentieel voor hypoxisch overleven in M. tuberculosis, maar het is niet bekend hoe het regulon het overleven bevordert.",
"Het dormantie-overlevingsregulon (DosR regulon) is hoofdzakelijk verantwoordelijk voor het coderen van dormantie-gerelateerde functies van M. tuberculosis.",
"Onze resultaten tonen inductie van dosR (Rv3133c) en 20 andere leden van het DosR regulon die vermoedelijk de overgang naar dormantie mediëren, en dat rel(Mtb) vereist is voor het overleven van Mycobacterium tuberculosis tijdens extracellulaire persistentie binnen gastheergranulomen.",
"Unieke rollen van DosT en DosS in de inductie van het DosR regulon en dormantie van Mycobacterium tuberculosis.",
"In Mycobacterium tuberculosis activeren de sensor-kinasen DosT en DosS de transcriptieregulator DosR, wat resulteert in de inductie van het DosR regulon, dat belangrijk is voor anaerobe overleving en mogelijk latente infectie.",
"Het DosR regulon van Mycobacterium tuberculosis helpt bij metabolische homeostase en maakt snelle herstel mogelijk van niet-ademende dormantie.",
"De DosR dormantieregelaar van Mycobacterium tuberculosis stimuleert de Na(+)/K(+) en Ca(2+) ATPase-activiteiten in plasmamembraanblaasjes van mycobacteriën.",
"DosR/DevR van M. tuberculosis is een tweedelig dormantie-overlevingsresponsregelaar die de expressie van 48 genen induceert.",
"Het dormantie-overlevingsregulon (DosR regulon), bestaande uit 48 co-gereguleerde genen, wordt als essentieel beschouwd voor de persistentie van Mtb.",
"DosR (Dormancy Survival Regulator, Rv3133c) regulon-genen worden tot expressie gebracht onder de condities van latentie/dormantie.",
"Op basis van deze twee functies, dormantie-overleving en regulatie, hebben we het Rv3133c-gen dosR genoemd, voor dormantie-overlevingsregelaar.",
"Een bindingsmotief vergelijkbaar met de bindingsplaats van de dormantie-overlevingsregelaar (DosR) van M. tuberculosis is geïdentificeerd in de upstream-sequenties van de meeste genen in deze loci.",
"Onze resultaten leveren overtuigend bewijs dat DosR een sleutelregelaar is in de zuurstoftekort-geïnduceerde mycobacteriële dormantie-respons.",
"M. tb-uitgebreide CD4+CD25+ (85% Foxp3(+)) cellen en D4GDI induceerden intracellulair M. tb om de dormantie-overlevingsregelaar DosR en DosR-afhankelijke genen tot expressie te brengen, wat suggereert dat D4GDI een niet-replicerende toestand in de pathogeen induceert.",
"Dormantie-overlevingsregelaar (DosR) regulon-gecodeerde eiwitten kunnen een rol spelen in het onderhoud van LTBI.",
"De eiwitten gecodeerd door het dormantie-overlevingsregulon (DosR regulon) zijn voornamelijk verantwoordelijk voor het overleven van de bacillen in een latente vorm.",
"Hoe Mycobacterium tuberculosis in slaap valt: de dormantie-overlevingsregelaar DosR een decennium later.",
"Een bindingsmotief vergelijkbaar met de bindingsplaats van de dormantie-overlevingsregelaar (DosR) van M.",
"Het dormantie-overlevingsregulon (Dos regulon), gereguleerd door de responsregelaar DosR, lijkt essentieel voor hypoxisch overleven in M.",
"De DosR dormantieregelaar van Mycobacterium tuberculosis stimuleert de Na(+)/K(+) en Ca(2+) ATPase-activiteiten in plasmamembraanblaasjes van mycobacteriën.",
"Unieke rollen van DosT en DosS in de inductie van het DosR regulon en dormantie van Mycobacterium tuberculosis."
] | 663 | 642 |
2,253 | Wat zijn de effecten van ALDH2-deficiëntie? | Bij alcoholgebruikers is ALDH2-deficiëntie een bekende risicofactor voor kankers van het bovenste aerodigestieve kanaal, d.w.z. hoofd- en halskanker en slokdarmkanker. Diabetische patiënten met ALDH2-mutaties zijn vatbaarder voor ernstiger diastolische disfunctie.
Deze gegevens tonen aan dat ALDH2-deficiëntie de door EtOH geïnduceerde verstoring van de intestinale epitheliale tight junctions, barrièrefunctiestoornissen en leverbeschadiging versterkt. | [
"Het genetisch-epidemiologisch en biochemisch bewijs bij ALDH2-deficiënte mensen levert sterk bewijs voor de causale relatie tussen acetaldehyde-expositie door alcoholconsumptie en kanker van het bovenste spijsverteringskanaal.",
"Diabetische patiënten met ALDH2-mutaties zijn vatbaarder voor ernstiger diastolische disfunctie.",
"Bij alcoholgebruikers is ALDH2-deficiëntie een bekende risicofactor voor kankers van het bovenste aerodigestieve kanaal, d.w.z. hoofd- en halskanker en slokdarmkanker.",
"meer in ALDH2(+/-) muizen vergeleken met wildtype muizen.CONCLUSIES: Deze gegevens tonen aan dat ALDH2-deficiëntie de door EtOH geïnduceerde verstoring van de intestinale epitheliale tight junctions, barrièrefunctiestoornissen en leverbeschadiging versterkt."
] | 141 | 135 |
2,254 | Wat is de rol van de positieve transcriptie-effector (pet) in het hepatitis B-virus? | Dit element, dat we pet (positieve transcriptie-effector) hebben genoemd, oefent zijn effect uit in cis op een positie- en oriëntatieafhankelijke manier, wat suggereert dat het mogelijk functioneert als onderdeel van het ontluikende pregenoomtranscript. In aanwezigheid van dit gebied activeert verwijdering van pet de transcriptie van downstream-promoters, wat suggereert dat pregenoom-transcriptiecomplexen er niet in slagen de downstream-promoters te bereiken. In vitro transcriptie-experimenten ondersteunen het model dat pet vereist is voor transcriptie-elongatie op het DHBV-sjabloon. We speculeren dat pet nodig is om transcriptiebeëindiging te onderdrukken tijdens de eerste doorgang van pregenoom-transcriptiecomplexen door een virale beëindigingsregio op het circulaire virale DNA. | [
"Dit element, dat we pet (positieve transcriptie-effector) hebben genoemd, oefent zijn effect uit in cis op een positie- en oriëntatieafhankelijke manier, wat suggereert dat het mogelijk functioneert als onderdeel van het ontluikende pregenoomtranscript.",
"In aanwezigheid van dit gebied activeert verwijdering van pet de transcriptie van downstream-promoters, wat suggereert dat pregenoom-transcriptiecomplexen er niet in slagen de downstream-promoters te bereiken. In vitro transcriptie-experimenten ondersteunen het model dat pet vereist is voor transcriptie-elongatie op het DHBV-sjabloon. We speculeren dat pet nodig is om transcriptiebeëindiging te onderdrukken tijdens de eerste doorgang van pregenoom-transcriptiecomplexen door een virale beëindigingsregio op het circulaire virale DNA.",
"We rapporteren de aanwezigheid van twee elementen, pet en net, die vereist zijn voor correcte transcriptie van het eendenhepatitis B-virus (DHBV).",
"Dit element, dat we pet (positieve transcriptie-effector) hebben genoemd, oefent zijn effect uit in cis op een positie- en oriëntatieafhankelijke manier, wat suggereert dat het mogelijk functioneert als onderdeel van het ontluikende pregenoomtranscript.",
"We observeerden dat pet vereist was voor pregenoomtranscriptie van circulaire virale monomeren, en bij afwezigheid van pet-afhankelijke transcriptie werd de expressie van de virale envelopgenen verhoogd.",
"De vereiste voor pet hangt af van de aanwezigheid in de transcriptie-eenheid van een regio van het DHBV-genoom gelegen stroomopwaarts van de enveloppromoters, die specifiek de transcriptie onderdrukt van sjablonen die pet missen.",
"In vitro transcriptie-experimenten ondersteunen het model dat pet vereist is voor transcriptie-elongatie op het DHBV-sjabloon."
] | 356 | 329 |
2,255 | Wat is de rol van Kmt5a in de lever? | H4K20 monomethylatie behoudt de integriteit van het genoom door het reguleren van een juiste mitotische condensatie, DNA-schade respons en replicatie-licentiëring. In niet-delende hepatocyten is H4K20Me1 specifiek verrijkt in actieve genlichamen en dynamisch gereguleerd door de antagonistische werking van Kmt5a methylase en Kdm7b demethylase. In lever-specifieke Kmt5a-deficiënte muizen correleerden verminderde niveaus van H4K20Me1 met verminderde RNA Pol II vrijgave uit promoter-proximale regio's. Genen die glucose- en vetzuurmetabolisme reguleren waren het meest gevoelig voor verstoring van RNA Pol II vrijgave. De downregulatie van glycolytische genen resulteerde in een energietekort dat gedeeltelijk werd gecompenseerd door activatie van AMP-geactiveerde proteïnekinase (AMPK) en verhoogde mitochondriale activiteit. Deze metabole herprogrammering genereerde een sterk gesensibiliseerde toestand die, onder verschillende metabole stresscondities, snel verergerde tot een senescent fenotype door ROS-overproductie-gemedieerde oxidatieve DNA-schade. | [
"Kmt5a reguleert hepatische metabole routes door het faciliteren van RNA Pol II vrijgave uit promoter-proximale regio's.",
"H4K20 monomethylatie behoudt de integriteit van het genoom door het reguleren van een juiste mitotische condensatie, DNA-schade respons en replicatie-licentiëring. Hier tonen we aan dat in niet-delende hepatocyten H4K20Me1 specifiek verrijkt is in actieve genlichamen en dynamisch gereguleerd wordt door de antagonistische werking van Kmt5a methylase en Kdm7b demethylase. In lever-specifieke Kmt5a-deficiënte muizen correleerden verminderde niveaus van H4K20Me1 met verminderde RNA Pol II vrijgave uit promoter-proximale regio's. Genen die glucose- en vetzuurmetabolisme reguleren waren het meest gevoelig voor verstoring van RNA Pol II vrijgave. De downregulatie van glycolytische genen resulteerde in een energietekort dat gedeeltelijk werd gecompenseerd door activatie van AMP-geactiveerde proteïnekinase (AMPK) en verhoogde mitochondriale activiteit. Deze metabole herprogrammering genereerde een sterk gesensibiliseerde toestand die, onder verschillende metabole stresscondities, snel verergerde tot een senescent fenotype door ROS-overproductie-gemedieerde oxidatieve DNA-schade. De resultaten illustreren hoe defecten in het algemene proces van RNA Pol II overgang naar een productieve elongatiefase specifieke metabole veranderingen en genoominstabiliteit kunnen veroorzaken.",
"In lever-specifieke Kmt5a-deficiënte muizen correleerden verminderde niveaus van H4K20Me met verminderde RNA Pol II vrijgave uit promoter-proximale regio's.",
"In lever-specifieke Kmt5a-deficiënte muizen correleerden verminderde niveaus van H4K20Me1 met verminderde RNA Pol II vrijgave uit promoter-proximale regio's."
] | 333 | 335 |
2,256 | Is tretinoïne effectief voor fotoveroudering? | Ja, tretinoïne wordt vaak topisch gebruikt bij de behandeling van fotoveroudering. | [
"Achtergrond. Er is aangetoond dat tretinoïne de fotoverouderde huid verbetert. Deze studie was ontworpen om de werkzaamheid en verdraagbaarheid van een 5% retinoïnezuurpeeling gecombineerd met microdermabrasie voor gezichts-fotoveroudering te evalueren.",
"Conclusie. Deze studie toonde aan dat een 5% retinoïnezuurpeelingcrème gecombineerd met microdermabrasie veilig en effectief was bij de behandeling van fotoveroudering in de Iraanse populatie.",
"CONCLUSIES: Behandeling met een dubbel geconjugeerde retinoïde crème toonde vroege verminderingen van fotobeschadiging en verbeteringen in hydratatie. AHA-Ret veroorzaakte minder erytheem dan retinol en was beter verdraagbaar dan retinol en tretinoïne.",
"Deze vergelijkende producten omvatten voorgeschreven tretinoïne, artssterkte idebenon, kinetine, polyhydroxy-, melk- en glycolzuren bij het omkeren van tekenen van fotoveroudering.",
"CONCLUSIE: Zowel topische tretinoïne (0,25%) als retinol (0,25%) kunnen veilig en effectief worden gebruikt wanneer ze direct na SA-peeling in de kliniek worden aangebracht om tekenen van fotoveroudering te verbeteren.",
"CONCLUSIE: Het behandelresultaat van Retinol 0,2%/LR2412 2% crème verschilt niet van dat van tretinoïne 0,025% crème. Klinische resultaten waren statistisch niet verschillend.",
"INLEIDING: Topische tretinoïne wordt beschouwd als de gouden standaard voor de behandeling van fotoverouderde huid, maar het gaat gepaard met bijwerkingen en is alleen op recept verkrijgbaar.",
"Tretinoïne wordt vaak topisch gebruikt voor de behandeling van acne en fotoveroudering.",
"ACHTERGROND: Topische tretinoïne is een effectieve behandeling voor zowel acne als fotoveroudering.",
"De werkzaamheid van tretinoïne is goed vastgesteld bij de behandeling van acne en fotoverouderde huid, maar als typische bijwerking van tretinoïnebehandeling ontwikkelt de meeste patiënten een milde irritatieve dermatitis.",
"Topische tretinoïne is vastgesteld als een effectieve behandeling voor fotoveroudering.",
"ACHTERGROND Topische tretinoïne is een effectieve behandeling voor zowel acne als fotoveroudering.",
"Tretinoïne is de enige farmacologische stof waarvan is aangetoond dat het sommige tekenen van fotoveroudering gedeeltelijk kan omkeren.",
"Hoewel het ooit als een onomkeerbaar proces werd beschouwd, is nu vastgesteld dat fotoveroudering kan worden behandeld met topische tretinoïne.",
"Bovendien hebben studies die de pathofysiologie van fotoveroudering hebben uitgelegd, aanzienlijk bewijs geleverd dat topische tretinoïne (all-trans retinoïnezuur), het enige tot nu toe goedgekeurde middel voor de behandeling van fotoveroudering, ook werkt om het te voorkomen.",
"ACHTERGROND EN ONTWERP De werkzaamheid van topische tretinoïne (all-trans-retinoïnezuur) bij de behandeling van fotoveroudering is goed vastgesteld.",
"BELANGRIJKE CONCLUSIES Tretinoïne kan worden gebruikt voor de behandeling van fotoveroudering of gecombineerde behandeling via verschillende mechanismen.",
"Tretinoïne is nog steeds de best geteste retinoïde om fotoverouderde huid te herstellen.",
"De scheiding tussen klinische verbetering en irritatie suggereert dat mechanismen anders dan irritatie domineren bij de door tretinoïne geïnduceerde reparatie van fotoveroudering bij mensen.",
"* Een crème met 0,05% tretinoïne (Retinova((R)) is goedgekeurd voor de behandeling van door zon veroorzaakte huidbeschadiging (\"fotoveroudering\").",
"Gerandomiseerde, gecontroleerde onderzoeken hebben aangetoond dat topische tretinoïne effectief is bij de behandeling van fotoverouderde huid.",
"Er is aangetoond dat tretinoïne de fotoverouderde huid verbetert.",
"Topische tretinoïne is een effectieve behandeling voor zowel acne als fotoveroudering.",
"Gerandomiseerde, gecontroleerde onderzoeken hebben aangetoond dat topische tretinoïne effectief is bij de behandeling van fotoverouderde huid.",
"Tretinoïne verzachtende crème 0,05% lijkt veilig en effectief te zijn bij de behandeling van fotobeschadigde huid.",
"Topische tretinoïne verbetert fotoverouderde huid. Een dubbelblinde, placebogecontroleerde studie."
] | 469 | 489 |
2,257 | Wat is het verschil tussen ganglion-moedercellen (GMC) en intermediaire neurale voorlopercellen (INP) in Drosophila? | GMC deelt slechts één keer om twee postmitotische cellen (neuronen of gliacellen) voort te brengen, terwijl de INP ook zelfvernieuwend kan zijn, zij het voor minder rondes dan een NSC, en GMC's kan genereren | [
"Neuroblasten (NB's) geven via intermediaire voorlopers, genaamd GMC's of INP's, aanleiding tot gedifferentieerde neuronen en gliacellen.",
"De expressie van E(spl)mγ en m8, maar niet van dpn, is afhankelijk van Notch-signaaloverdracht van de dochtercel GMC/INP naar de NB.",
"Een nieuwe rol van Klumpfuss bij het vaststellen van de celbestemming tijdens de asymmetrische celdeling van GMC.",
"Studies in de embryonale NB4-2-lijn van Drosophila suggereren dat de transcriptiefactor Klumpfuss (Klu) functioneert binnen embryonale neuroblastlijnen om te differentiëren tussen de identiteiten van twee aangrenzende ganglion-moedercellen (GMC's)",
"Verrassend genoeg is in deze lijn klu noodzakelijk om te differentiëren tussen de bestemmingen van de twee neuronen die geboren worden uit een unieke GMC",
"Bovendien tonen onze resultaten aan dat Klu werkt in de GMC en/of in de pas geboren neuron, maar niet in de neuroblast.",
"Neurale voorlopercellen van de larvale hersenen van Drosophila, neuroblasten genoemd, kunnen worden verdeeld in verschillende populaties op basis van patronen van proliferatie en differentiatie.",
"Zowel bij gewervelden als insecten ontstaan neuronen doorgaans uit neurale stamcellen of terminal delende intermediaire voorlopers.",
"Elke NB heeft een unieke identiteit en ondergaat herhaalde celdelingen om meerdere kleinere secundaire voorlopercellen, ganglion-moedercellen (GMC's), te produceren; elke GMC deelt eenmaal om twee neuronen en/of gliacellen te produceren, waarmee een specifieke lijn van neuronen/gliacellen wordt gegenereerd.",
"Type I neuroblasten produceren ganglion-moedercellen (GMC's) die eenmaal delen om gedifferentieerde nakomelingen te produceren, terwijl type II neuroblasten zelfvernieuwende intermediaire neurale voorlopers (INP's) produceren en zo lijnen genereren met veel meer nakomelingen.",
"In het centrale zenuwstelsel van Drosophila ondergaan neuroblasten zelfvernieuwende asymmetrische delingen, terwijl hun nakomelingen, ganglion-moedercellen (GMC's), asymmetrisch delen om terminale postmitotische neuronen te genereren.",
"NB's delen asymmetrisch om zichzelf te regenereren en produceren een secundaire voorlopercel genaamd ganglion-moedercel (GMC), die deelt om neuronen en gliacellen te produceren.",
"Elk van de ongeveer 25 NB's per hemisegment ondergaat herhaalde asymmetrische delingen om gemiddeld 5-10 kleinere ganglion-moedercellen (GMC's) te produceren; elke GMC deelt op zijn beurt om twee neuronen te produceren.",
"We tonen aan dat het verlies van Btd leidt tot eliminatie van rijpe INP's door voortijdige differentiatie van INP's in terminal delende ganglion-moedercellen.",
"In het embryonale centrale zenuwstelsel van Drosophila melanogaster delen secundaire voorlopercellen - ganglion-moedercellen (GMC's) - en produceren postmitotische neuronen die verschillende celbestemmingen aannemen.",
"De bipotente ganglion-moedercellen, of GMC's, in het centrale zenuwstelsel van Drosophila delen asymmetrisch om twee verschillende postmitotische neuronen te genereren."
] | 417 | 414 |
2,258 | Wat is de FIRE (Functionele Inferentie van Regulatoren van Expressie) tool? | FIRE (Functionele Inferentie van Regulatoren van Expressie) is een tool om zowel niet-coderende als coderende SNV's te scoren op basis van hun potentieel om de expressieniveaus van nabijgelegen genen te reguleren. | [
"Methoden om te voorspellen of individuele SNV's waarschijnlijk genexpressie reguleren, zouden de interpretatie van varianten van onbekende betekenis die zijn geïdentificeerd in whole-genome sequencing studies vergemakkelijken.Resultaten: We ontwikkelden FIRE (Functionele Inferentie van Regulatoren van Expressie), een tool om zowel niet-coderende als coderende SNV's te scoren op basis van hun potentieel om de expressieniveaus van nabijgelegen genen te reguleren. FIRE bestaat uit 23 random forests die getraind zijn om SNV's in cis-expressie kwantitatieve eigenschapslocaties (cis-eQTL's) te herkennen met behulp van een set van 92 genomische annotaties als voorspellende kenmerken. FIRE-scores onderscheiden cis-eQTL SNV's van niet-eQTL SNV's in de trainingsset met een cross-gevalideerde oppervlakte onder de receiver operating characteristic curve (AUC) van 0,807, en onderscheiden cis-eQTL SNV's die gedeeld worden over zes populaties van verschillende afkomst van niet-eQTL SNV's met een AUC van 0,939. FIRE-scores zijn ook voorspellend voor cis-eQTL SNV's in verschillende weefseltypen.",
"We ontwikkelden FIRE (Functionele Inferentie van Regulatoren van Expressie), een tool om zowel niet-coderende als coderende SNV's te scoren op basis van hun potentieel om de expressieniveaus van nabijgelegen genen te reguleren.",
"Resultaten We ontwikkelden FIRE (Functionele Inferentie van Regulatoren van Expressie), een tool om zowel niet-coderende als coderende SNV's te scoren op basis van hun potentieel om de expressieniveaus van nabijgelegen genen te reguleren."
] | 244 | 245 |
2,259 | Remt TUC.338 colorectale kanker? | Nee. TUC.338 is significant verhoogd in colorectale kankers (CRC) weefsel en CRC cellijnen, en de verhoogde TUC.338 is geassocieerd met lymfekliermetastase. TUC.338 fungeert als een nieuw oncogen door het TIMP-1 gen te targeten, waardoor de migratie en invasie van colorectale kankercellen wordt bevorderd. | [
"TUC.338 bevordert invasie en metastase bij colorectale kanker.",
"Tot nu toe blijft de rol van TUC.338 in colorectale kankers ongedefinieerd. Deze studie toonde aan dat TUC.338 significant verhoogd is in colorectale kankers (CRC) weefsel en CRC cellijnen, en de verhoogde TUC.338 is geassocieerd met lymfekliermetastase.",
"Deze bevindingen suggereren dus dat TUC.338 fungeert als een nieuw oncogen door het TIMP-1 gen te targeten, waardoor de migratie en invasie van colorectale kankercellen wordt bevorderd.",
"Deze bevindingen suggereren dus dat TUC.338 fungeert als een nieuw oncogen door het TIMP-1 gen te targeten, waardoor de migratie en invasie van colorectale kankercellen wordt bevorderd.",
"Deze studie toonde aan dat TUC.338 significant verhoogd is in colorectale kankers (CRC) weefsel en CRC cellijnen, en de verhoogde TUC.338 is geassocieerd met lymfekliermetastase.",
"TUC.338 bevordert invasie en metastase bij colorectale kanker."
] | 171 | 172 |
2,260 | Beschrijf het werkingsmechanisme van Napabucasin. | Napabucasin (BBI608) is een oraal toegediende kleine molecule die de stamcelactiviteit in kankercellen blokkeert door het signalerende transductie- en activator van transcriptie 3 (STAT3) pad te richten. | [
"Napabucasin (BBI608) is een oraal toegediende kleine molecule die de stamcelactiviteit in kankercellen blokkeert door het signalerende transductie- en activator van transcriptie 3 pad te richten.",
"De STAT3 transcriptiefactorremmer, BBI608 (Napabucasin), remde de groei sterk in bijna alle PDO-culturen, wat suggereert dat stamcelprogrammering betrokken is bij de vorming en/of groei van organoïden.",
"Diallyltrisulfide en napabucasin remmen de signalering via de signalerende transductie- en activator van transcriptie 3 (Stat3), wat mogelijk de immuunfunctie verbetert door effecten op T-helperlymfocyten en bevordering van apoptose.",
"Een kleine molecule, napabucasin (BBI608), is recentelijk geïdentificeerd die de stamcelrijke kankercellen onderdrukt in verschillende soorten kanker.",
"Napabucasin (BBI608) is een oraal toegediende kleine molecule die de stamcelactiviteit in kankercellen blokkeert door het signalerende transductie- en activator van transcriptie 3 pad te richten."
] | 163 | 150 |
2,261 | Heeft ruxolitinib FDA-goedkeuring ontvangen? | Ja, ruxolitinib is FDA-goedgekeurd. In 2011 werd de orale JAK2-kinaseremmer ruxolitinib het eerste door de Food and Drug Administration (FDA) goedgekeurde medicijn voor de behandeling van myelofibrose. | [
"Testen op JAK2-mutaties is nu opgenomen in de criteria van de Wereldgezondheidsorganisatie (WHO) voor de diagnose van MPN, en in 2011 werd de orale JAK2-kinaseremmer ruxolitinib het eerste door de Food and Drug Administration (FDA) goedgekeurde medicijn voor de behandeling van myelofibrose."
] | 72 | 71 |
2,262 | Vuren replicatieoorsprongen dicht bij gistcentromeren vroeg of laat af? | Epigenetisch overgeërfd centromeer- en neocentromeer-DNA repliceert het vroegst in de S-fase; we ontdekten dat elk centromeer geassocieerd is met een replicatieoorsprong die als eerste afvuurt op het betreffende chromosoom. | [
"Epigenetisch overgeërfd centromeer- en neocentromeer-DNA repliceert het vroegst in de S-fase",
"we ontdekten dat elk centromeer geassocieerd is met een replicatieoorsprong die als eerste afvuurt op het betreffende chromosoom.",
"een neocentromeer werd het eerste dat replikeerde en werd geassocieerd met componenten van het origin recognition complex (ORC).",
"Ten slotte onthulde analyse van centromeer-geassocieerd DNA een replicatie-afhankelijk sequentiepatroon dat kenmerkend is voor constitutief actieve replicatieoorsprongen.",
"We stellen voor dat Rad53 door het bevorderen van de integriteit van de replicatievork onder deze omstandigheden de duplicatie van het centromeer verzekert.",
"Tweedimensionale gelanalyse bevestigde dat mat1 bij voorkeur wordt gerepliceerd door een centromeer-verafgelegen oorsprong(en).",
"Mutaties in twee van deze LCS (lineaire chromosoomstabiliteit) genen hadden weinig of geen effect op het verliespercentage van een circulaire YAC die hetzelfde centromeer en replicatieoorsprong had als aanwezig op de lineaire YA",
"Geen positionele vereisten voor autonoom replicerende sequentie-elementen op kunstmatige gistchromosomen.",
"We vinden dat terminale blokken van telomeerherhalingen voldoende zijn om als telomeren herkend te worden. Bovendien waren kunstmatige chromosomen die telomeer-geassocieerde Y'-sequenties en telomerische ARS'en bevatten niet stabieler tijdens zowel mitose als meiose dan kunstmatige chromosomen zonder terminale ARS'en, wat aangeeft dat gist-specifieke blokken van telomeersequenties de enige cis-werkende vereiste zijn voor een functioneel telomeer tijdens zowel mitotische groei als meiose.",
"Zorgen centromeren voor hun vroege replicatie door vroege activatie van nabijgelegen oorsprongen te bevorderen, of zijn ze in de loop van de evolutie gemigreerd naar gebieden die vroeg repliceren?",
"Omdat de activatietijd van individuele oorsprongen geen intrinsieke eigenschap is van S. cerevisiae-oorsprongen, maar wordt beïnvloed door omliggende sequenties, wilden we de hypothese testen dat centromeren de replicatietijd beïnvloeden door een centromeer naar een laat replicerend domein te verplaatsen.",
"Zorgen centromeren voor hun vroege replicatie door vroege activatie van nabijgelegen oorsprongen te bevorderen, of zijn ze in de loop van de evolutie gemigreerd naar gebieden die vroeg repliceren? In Candida albicans bevat een neocentromeer een vroeg afvurende oorsprong, wat de eerste hypothese ondersteunt maar niet beantwoordt of de nieuwe oorsprong intrinsiek vroeg afvuurt of dat het centromeer de replicatietijd beïnvloedt.",
"cerevisiae-replicatie is geconserveerd: centromeren repliceren vroeg, terwijl telomeren laat repliceren, we vonden dat replicatieoorsprongen zowel in L."
] | 379 | 374 |
2,263 | Is duiken veilig tijdens de zwangerschap? | Nee, duiken met perslucht moet gedurende de hele zwangerschap worden vermeden omdat de foetus een verhoogd risico loopt op decompressieziekte tijdens deze activiteit. | [
"Duiken met perslucht is gecontra-indiceerd.",
"Over het algemeen maakten de vrouwen niet genoeg duiken per zwangerschap, daarom kon er geen significante correlatie tussen duiken en foetale afwijkingen worden vastgesteld. Deze gegevens geven aan dat vrouwen steeds meer de aanbevelingen van de duikindustrie opvolgen en afzien van duiken tijdens de zwangerschap.",
"Duiken met perslucht moet ook gedurende de hele zwangerschap worden vermeden omdat de foetus een verhoogd risico loopt op decompressieziekte tijdens deze activiteit.",
"Duiken met perslucht moet ook gedurende de hele zwangerschap worden vermeden omdat de foetus een verhoogd risico loopt op decompressieziekte tijdens deze activiteit.",
"Duiken met perslucht moet ook gedurende de hele zwangerschap worden vermeden omdat de foetus een verhoogd risico loopt op decompressieziekte tijdens deze activiteit.",
"De verschillende internationale federaties en de Undersea and Hyperbaric Medical Society raden duiken met perslucht af voor zwangere vrouwen of vrouwen die een zwangerschap plannen, maar er zijn geen gerandomiseerde onderzoeken of studies die een solide wetenschappelijke basis bieden.",
"Zwangere vrouwen wordt aanbevolen niet te duiken, omdat het risico op geboorteafwijkingen groter lijkt te zijn bij degenen die dat wel doen, en er is een ernstig risico op foetale decompressieziekte.",
"De verschillende internationale federaties en de Undersea and Hyperbaric Medical Society raden duiken met perslucht af voor zwangere vrouwen of vrouwen die een zwangerschap plannen, maar er zijn geen gerandomiseerde onderzoeken of studies die een solide wetenschappelijke basis bieden.",
"Duiken met perslucht moet ook gedurende de hele zwangerschap worden vermeden omdat de foetus een verhoogd risico loopt op decompressieziekte tijdens deze activiteit.",
"Snorkelen kan nog steeds worden beoefend tijdens de zwangerschap, maar duiken met perslucht moet worden stopgezet tot na de bevallingsperiode.",
"Snorkelen kan nog steeds worden beoefend tijdens de zwangerschap, maar duiken met perslucht moet worden stopgezet tot na de bevallingsperiode.|"
] | 286 | 308 |
2,264 | Heeft deflazacort meer bijwerkingen dan prednison? | Deflazacort veroorzaakt minder bijwerkingen dan prednison bij DMD-patiënten. | [
"Hoewel deflazacort en prednison de klinische uitkomsten verbeteren bij patiënten met Duchenne spierdystrofie (DMD), veroorzaakt deflazacort minder bijwerkingen."
] | 34 | 30 |
2,265 | Verhoogt echinacea het risico op anafylaxie? | Ja, er is bewijs dat het gebruik van echinacea geassocieerd is met anafylaxie. | [
"Chicorinezuur (dicaffeoyl-tartraatzuur) is een natuurlijk fenolisch verbinding die voorkomt in verschillende planten, zoals cichorei (Cichorium intybus) en Echinacea (Echinacea purpurea), en bezit antioxidante, ontstekingsremmende, antivirale en pijnstillende eigenschappen. Hoewel deze biologische effecten van chicorinezuur zijn onderzocht, zijn er geen meldingen van de antiallergische gerelateerde ontstekingsremmende effecten in humane mestcellen (HMC)-1 of anafylactische activiteit in een muismodel.",
"ACHTERGROND: Vijftig procent van de Australiërs gebruikt complementaire en alternatieve geneesmiddelen (anders dan vitamines) binnen een periode van 12 maanden, waarvan producten met echinacea steeds populairder worden. Recente rapporten hebben het risico op allergische reacties op complementaire geneesmiddelen bij atopische patiënten benadrukt.",
"Twee patiënten kregen anafylaxie en een derde had een acute astma-aanval 10 minuten na hun allereerste dosis echinacea.",
"Een analyse van 51 Australische meldingen van bijwerkingen waarbij echinacea betrokken was, werd ook uitgevoerd. Er waren 26 gevallen die mogelijk immunoglobuline E-gemedieerde overgevoeligheid suggereerden (4 anafylaxie, 12 acute astma, 10 urticaria/angio-oedeem).",
"Echinacea-geassocieerde anafylaxie.",
"Een vrouw met atopie ervoer anafylaxie na het innemen van, naast andere voedingssupplementen, een commercieel extract van echinacea.",
"Risico op anafylaxie bij complementaire en alternatieve geneeskunde.",
"Verschillende veroorzakers, waaronder Andrographis paniculata, Echinacea-soorten, bijenproducten, Ginkgo biloba en Ginseng, worden hier besproken. SAMENVATTING: Het kennen van de factoren die het risico op anafylaxie verhogen, maakt het mogelijk reacties te herkennen, te rapporteren en verder te onderzoeken."
] | 220 | 224 |
2,266 | Worden neurexines gelokaliseerd bij presynapsen? | Ja, neurexines zijn gelokaliseerd bij presynapsen. | [
"Neurexines en neuroligines zijn twee verschillende families van enkelvoudige transmembraaneiwitten die respectievelijk bij pre- en postsynapsen gelokaliseerd zijn.",
"presynaptische neurexines",
"de best-gekarakteriseerde transsynaptische interacties worden gevormd door presynaptische neurexines, die binden aan diverse postsynaptische liganden.",
"presynaptische neurexine"
] | 42 | 43 |
2,267 | Is er een rol voor 5hmC in de ontwikkeling en differentiatie van T-cellen? | Ja. 5hmC is verrijkt in het genlichaam van sterk tot expressie gebrachte genen in alle verschillende stadia van T-celontwikkeling in de thymus en de aanwezigheid ervan correleert positief met genexpressie. Verder benadrukkend de verbinding met genexpressie, is 5hmC verrijkt in actieve thymus-specifieke enhancers en genen die sleuteltranscriptieregulatoren coderen vertonen hoge intragenische 5hmC-niveaus in voorlopercellen in die ontwikkelingsstadia waarin zij een positief effect uitoefenen. | [
"We hebben 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) in kaart gebracht in verschillende stadia van T-celontwikkeling in de thymus en T-celdifferentiatie in de periferie. We tonen aan dat 5hmC verrijkt is in het genlichaam van sterk tot expressie gebrachte genen in alle ontwikkelingsstadia en dat de aanwezigheid ervan positief correleert met genexpressie. Verder benadrukkend de verbinding met genexpressie, vinden we dat 5hmC verrijkt is in actieve thymus-specifieke enhancers en dat genen die sleuteltranscriptieregulatoren coderen hoge intragenische 5hmC-niveaus vertonen in voorlopercellen in die ontwikkelingsstadia waarin zij een positief effect uitoefenen. Onze gegevens vormen een waardevolle bron die gedetailleerde analyse van de rol van 5hmC in T-celontwikkeling en differentiatie zal vergemakkelijken.",
"We tonen aan dat 5hmC verrijkt is in het genlichaam van sterk tot expressie gebrachte genen in alle ontwikkelingsstadia en dat de aanwezigheid ervan positief correleert met genexpressie.",
"Verder benadrukkend de verbinding met genexpressie, vinden we dat 5hmC verrijkt is in actieve thymus-specifieke enhancers en dat genen die sleuteltranscriptieregulatoren coderen hoge intragenische 5hmC-niveaus vertonen in voorlopercellen in die ontwikkelingsstadia waarin zij een positief effect uitoefenen.",
"We tonen aan dat 5hmC verrijkt is in het genlichaam van sterk tot expressie gebrachte genen in alle ontwikkelingsstadia en dat de aanwezigheid ervan positief correleert met genexpressie.",
"Hier rapporteren we vroege en wijdverspreide 5mC/5hmC-herschikking tijdens menselijke CD4(+) T-celdifferentiatie ex vivo bij genen en cel-specifieke enhancers met bekende T-celfunctie.",
"Onze resultaten ondersteunen 5hmC-gemedieerde DNA-demethylering als een sleutelelement van de CD4(+) T-celbiologie bij mensen, met belangrijke implicaties voor genregulatie en lijncommitment.",
"5hmC speelt belangrijke rollen in de regulatie van genexpressie en differentiatie en is betrokken bij T-celmaligniteiten en auto-immuniteit."
] | 346 | 326 |
2,268 | Wat zijn de eigenschappen van zoogdierlijke GA-sequenties? | In dit artikel identificeren we voor het eerst expliciet de GA-sequenties als een klasse van fractale genomische sequenties die gemakkelijk te herkennen en te extraheren zijn, en die dicht verspreid zijn over de chromosomen van een groot aantal genomen van verschillende soorten en rijken, inclusief het menselijk genoom. De meeste GA-sequenties [1] deelden ketens van tetra-GA-motieven en bevatten upstream poly(A)-segmenten. Hoewel ze er geen integraal onderdeel van zijn, werden Alu-elementen direct stroomopwaarts gevonden van alle menselijke en chimpanse GA-sequenties met een upstream poly(A)-segment. Het artikel stelt de hypothese dat genoomnavigatie deze eigenschappen van GA-sequenties op de volgende manier gebruikt. Het artikel beschrijft DNA-sequenties van zoogdierlijke genomen die langer zijn dan 50 basen, maar uitsluitend bestaan uit G's en A's ('pure GA-sequenties'). Met uitzondering van een klein aantal poly-A-, poly-G-, poly-GA- en poly-GAAA-sequenties (gezamenlijk <0,5%), waren alle pure GA-sequenties van de geteste zoogdieren unieke individuen, bevatten ze meerdere herhaalde korte GA-bevattende motieven en deelden ze een gemeenschappelijk hexa-nucleotide spectrum. | [
" In dit artikel identificeren we voor het eerst expliciet de GA-sequenties als een klasse van fractale genomische sequenties die gemakkelijk te herkennen en te extraheren zijn, en die dicht verspreid zijn over de chromosomen van een groot aantal genomen van verschillende soorten en rijken, inclusief het menselijk genoom.",
" De meeste GA-sequenties [1] deelden ketens van tetra-GA-motieven en bevatten upstream poly(A)-segmenten. Hoewel ze er geen integraal onderdeel van zijn, werden Alu-elementen direct stroomopwaarts gevonden van alle menselijke en chimpanse GA-sequenties met een upstream poly(A)-segment.",
" Het artikel stelt de hypothese dat genoomnavigatie deze eigenschappen van GA-sequenties op de volgende manier gebruikt.",
" Het artikel beschrijft DNA-sequenties van zoogdierlijke genomen die langer zijn dan 50 basen, maar uitsluitend bestaan uit G's en A's ('pure GA-sequenties'). Hoewel hun frequentie van voorkomen 10^(-16) of kleiner zou moeten zijn, bevatten de chromosomen van mens, chimpansee, hond, kat, rat en muis er vele tienduizenden die overal langs de chromosomen voorkomen met een soortafhankelijke dichtheid, en bereiken ze lengtes tot 1300 [b]. Met uitzondering van een klein aantal poly-A-, poly-G-, poly-GA- en poly-GAAA-sequenties (gezamenlijk <0,5%), waren alle pure GA-sequenties van de geteste zoogdieren unieke individuen, bevatten ze meerdere herhaalde korte GA-bevattende motieven en deelden ze een gemeenschappelijk hexa-nucleotide spectrum. Hooguit 2% van de menselijke GA-sequenties werden getranscribeerd in mRNA's; alle anderen codeerden niet voor eiwitten.",
" Hier rapporteren we dat alpha d(GA) x d(GA)-sequenties een antiparallel gestrengde duplex DNA vormen bij neutrale pH.",
" Afwisselende polypurine d(GA)n-sequenties vertonen een aanzienlijke polymorfie.",
" Daarom delen guanine en thymine belangrijke eigenschappen met betrekking tot complementariteit aan adenine, terwijl de TA- en GA-sequenties op ten minste twee onderling compatibele manieren kunnen stapelen binnen de hier geanalyseerde DNA-duplexen.",
" De implicaties van deze resultaten voor het begrip van de moleculaire principes achter de conformationele flexibiliteit van afwisselende d(GA.TC)n-sequenties worden besproken.",
" De functies van pure GA-sequenties zijn niet bekend.",
" Hoewel ze er geen integraal onderdeel van zijn, werden Alu-elementen direct stroomopwaarts gevonden van alle menselijke en chimpanse GA-sequenties met een upstream poly(A)-segment.",
" Afhankelijk van de omstandigheden kunnen d(GA)n DNA-sequenties antiparallel- en parallelgestrengde homoduplexen, multistrengige complexen en geordende enkelstrengige conformaties vormen.",
" Door een nieuwe methode te introduceren om grote stukken genomisch DNA te visualiseren (zie Appendix S1), rapporteert het artikel dat de meeste GA-sequenties [1] ketens van tetra-GA-motieven deelden en upstream poly(A)-segmenten bevatten.",
" Deze observatie toont aan dat homoduplexen van afwisselende GA- en TA-sequenties kunnen coëxisteren in één DNA-molecuul.",
" Duplexen van de dodeca-satelliet purine-rijke streng, met tandem 5'-GA:GA-3' mismatches, zijn net zo stabiel als equivalente volledig Watson-Crick duplexen met tandem 5'-TA:TA-3' Watson-Crick paren in plaats van de niet-Watson-Crick G.A-paren.",
" Met uitzondering van een klein aantal poly-A-, poly-G-, poly-GA- en poly-GAAA-sequenties (gezamenlijk <0,5%), waren alle pure GA-sequenties van de geteste zoogdieren unieke individuen, bevatten ze meerdere herhaalde korte GA-bevattende motieven en deelden ze een gemeenschappelijk hexa-nucleotide spectrum.",
" Om veilige en effectieve topische huidverlichtende middelen te ontdekken, hebben we alkylesters van het natuurlijke product gentisinezuur (GA) geëvalueerd, dat verwant is aan onze leidende verbinding methyl gentisate (MG), en vier vermeende tyrosinase-remmers, gebruikmakend van zoogdierlijke melanocyten celkweken en celvrije extracten.",
" Fysisch-chemische karakterisering van de nieuwe structuren en modelbouw zijn consistent met, in het geval van d(TC)n-d(GA)n, een tetra-strengig complex dat gevormd wordt door de toevoeging van d(GA)n aan de resterende ruimte in de grote groeve van het drievoudige strengcomplex d(TC)n-d(GA)n-d(CT)n. Een mogelijke rol voor tetra-strengige complexen in chromosoomcondensatie wordt gesuggereerd door het natuurlijke voorkomen van herhalende sequenties pyrimidine-purine DNA's en de eigenschappen van gecondenseerde chromosomen.<br>",
" Eigenschappen en distributie van pure GA-sequenties van zoogdierlijke genomen.",
" Het artikel beschrijft DNA-sequenties van zoogdierlijke genomen die langer zijn dan 50 basen, maar uitsluitend bestaan uit G's en A's ('pure GA-sequenties').",
" Het artikel stelt de hypothese dat genoomnavigatie deze eigenschappen van GA-sequenties op de volgende manier gebruikt.",
" Overzicht van een genoomnavigatiesysteem gebaseerd op de eigenschappen van GA-sequenties en hun flanken.",
" De potentiële bijdrage van de structurele eigenschappen van d(GA x TC)(n)-sequenties aan dit effect wordt besproken.",
" Daarom delen guanine en thymine belangrijke eigenschappen met betrekking tot complementariteit aan adenine, terwijl de TA- en GA-sequenties op ten minste twee onderling compatibele manieren kunnen stapelen binnen de hier geanalyseerde DNA-duplexen."
] | 817 | 836 |
2,269 | Wat is de hoofdfocus van het CVE R/Bioconductor-pakket? | Het CVE-pakket maakt interactieve variantprioritering mogelijk om de analyse van kankersequencingstudies te versnellen. | [
"CVE: een R-pakket voor interactieve variantprioritering in precisie-oncologie.",
"Met gebruik van Oncotator en de Drug Gene Interaction Database biedt CVE de mogelijkheid om varianten binnen één of meerdere tumorexomen te verkennen om drijvende factoren, resistentiemechanismen te identificeren en de geneesbaarheid te beoordelen.",
"Het CVE-pakket maakt interactieve variantprioritering mogelijk om de analyse van kankersequencingstudies te versnellen."
] | 75 | 72 |
2,270 | Zijn er ultraconserveerde genomische regio's in de gist Saccharomyces cerevisiae? | Ja. Naast enkele fundamentele biologische functies spelen ultraconserveerde genomische regio's een belangrijke rol bij de aanpassing van S. cerevisiae aan de zure omgeving. | [
"Hier presenteren we een systematische studie van ultraconserveerde genomische regio's in de gist Saccharomyces cerevisiae op basis van de openbaar beschikbare genoomsequenties, om hun relatie met de aanpasbaarheid of fitnessvoordelen van de gist te onthullen.Resultaten: Onze resultaten geven aan dat, naast enkele fundamentele biologische functies, de UCS's een belangrijke rol spelen bij de aanpassing van S. cerevisiae aan de zure omgeving, wat wordt ondersteund door eerdere waarnemingen. Daarnaast vinden we ook dat de sterk onveranderde genen (HUG's) verrijkt zijn in enkele andere routes, zoals het voedingsgevoelige signaalpad. Om het onderzoek naar unieke UCS's te vergemakkelijken, werd de UCSC Genome Browser gebruikt om de chromosomale positie en gerelateerde annotaties van UCS's in het S. cerevisiae-genoom te visualiseren.",
"Hier presenteren we een systematische studie van ultraconserveerde genomische regio's in de gist Saccharomyces cerevisiae op basis van de openbaar beschikbare genoomsequenties, om hun relatie met de aanpasbaarheid of fitnessvoordelen van de gist te onthullen."
] | 189 | 181 |
2,271 | Wordt davunetide overwogen voor de behandeling van progressieve supranucleaire verlamming? | Ja, de werkzaamheid en verdraagbaarheid van Davunetide worden getest in een placebogecontroleerde studie bij PSP-patiënten. | [
"Kritische beoordeling van de rol van davunetide bij de behandeling van progressieve supranucleaire verlamming.",
"De werkzaamheid en verdraagbaarheid van Davunetide worden getest in een placebogecontroleerde studie bij PSP-patiënten, waardoor het de meest gevorderde geneesmiddelkandidaat is voor deze indicatie. Deze review onderzoekt de ziektekenmerken van PSP, de rationale voor de behandeling van PSP met davunetide en beoordeelt enkele van de uitdagingen van klinische onderzoeken in deze patiëntengroep."
] | 89 | 88 |
2,272 | Wat is de oorsprong van XUT-transcripten in gist? | XUTs zijn een klasse van Xrn1-gevoelige antisense regulerende niet-coderende RNA's in gist | [
"XUTs zijn een klasse van Xrn1-gevoelige antisense regulerende niet-coderende RNA's in gist",
"Hier identificeren we, met behulp van streng-specifieke RNA-sequencing (RNA-seq), een nieuwe klasse van 1.658 Xrn1-gevoelige onstabiele transcripten (XUTs), waarvan 66% antisense is ten opzichte van open leesramen.",
"De meerderheid van de XUTs hoopt zich sterk op in lithium-bevattende media, wat aangeeft dat ze mogelijk een rol spelen in adaptieve reacties op veranderingen in groeicondities.",
"Bovendien leidt het uitschakelen van H3K4me3 tot het stilleggen van andere genen met antisense XUTs, wat een model ondersteunt waarin H3K4me3 de repressieve activiteit van antisense ncRNA tegengaat.",
"Nonsense-Mediated Decay (NMD) destabiliseert de Xrn1-gevoelige aslncRNAs (XUT), maar wat hun gevoeligheid bepaalt is nog onduidelijk. We rapporteren dat 3' enkelstrengse (3'-ss) extensie de afbraak van XUTs door NMD medieert, geholpen door de helicases Mtr4 en Dbp2.",
"Ribosoomprofilering toonde aan dat XUTs worden vertaald, waardoor ze vatbaar worden voor NMD-activiteit.",
"Interessant is dat mutanten van de Mtr4- en Dbp2-helicases XUTs ophoopten, wat suggereert dat het ontwinden van dsRNA een cruciale stap is voor afbraak.",
"Opvallend werd antisense transcriptie gedetecteerd voor de meeste eiwit-coderende genen, wat correleert met lage sense transcriptie, vooral wanneer deze overlapt met het mRNA-startpunt. RNA-profilering toonde aan dat de resulterende aslncRNAs voornamelijk overeenkomen met cryptische Xrn1/Exo2-gevoelige transcripten (XUTs)",
"Tot slot toonden we aan dat asXUTs worden gecontroleerd door de histonchaperonne Spt6 en reageren op inductie van meiose, in beide gevallen anti-correlatie vertonend met niveaus van de bijbehorende sense mRNAs, wat de fysiologische relevantie van antisense-gemedieerde genattenuatie ondersteunt. Ons werk benadrukt dat antisense transcriptie veel uitgebreider is dan verwacht en mogelijk een aanvullende niet-promoterbepaler is van de complexiteit van genregulatie.",
"Antisense lange niet-coderende (aslnc)RNAs vormen een aanzienlijk deel van eukaryote transcriptomen die, in gist, worden gecontroleerd door de Xrn1 exonuclease. Nonsense-Mediated Decay (NMD) destabiliseert de Xrn1-gevoelige aslncRNAs (XUT), maar wat hun gevoeligheid bepaalt is nog onduidelijk. We rapporteren dat 3' enkelstrengse (3'-ss) extensie de afbraak van XUTs door NMD medieert, geholpen door de helicases Mtr4 en Dbp2. Onderzoek aan individuele genen, genoomwijde RNA-analyses en mapping van dubbelstrengs (ds)RNA toonden aan dat 3'-ss extensies de NMD-doelwit XUTs onderscheiden van stabiele lncRNAs. Ribosoomprofilering toonde aan dat XUTs worden vertaald, waardoor ze vatbaar worden voor NMD-activiteit. Interessant is dat mutanten van de Mtr4- en Dbp2-helicases XUTs ophoopten, wat suggereert dat het ontwinden van dsRNA een cruciale stap is voor afbraak. Inderdaad beschermt expressie van anticomplementaire transcripten cryptische intergene lncRNAs tegen NMD. Onze resultaten geven aan dat aslncRNAs dsRNA vormen die alleen worden vertaald en gericht op NMD als ze worden losgemaakt door Mtr4 en Dbp2. We stellen voor dat NMD de genoomexpressie bufferet door alomtegenwoordige regulerende transcripten te verwijderen.",
"Opmerkelijk is dat RNAPII chromatine-immunoprecipitatie gevolgd door DNA-sequencing (ChIP-seq) analyse van Xrn1-deficiënte stammen een significante afname van RNAPII-bezetting liet zien over 273 genen met antisense XUTs.",
"XUTs zijn een klasse van Xrn1-gevoelige antisense regulerende niet-coderende RNA's in gist.",
"Nonsense-Mediated Decay (NMD) destabiliseert de Xrn1-gevoelige aslncRNAs (XUT), maar wat hun gevoeligheid bepaalt is nog onduidelijk."
] | 451 | 492 |
2,273 | Uit hoeveel genen bestaat het DosR-regulon, gecontroleerd door de dormantie-overlevingsregelaar (DosR) in Mycobacterium tuberculosis? | Het dormantie-overlevingsregelaar (DosR) regulon van Mycobacterium bestaat uit 48 co-gereguleerde genen. | [
"Tijdens deze fase zijn ten minste 48 genen, gezamenlijk genoemd Dormantie-overlevingsregelaar (DosR) regulon, belangrijk voor het langdurig overleven van bacillen in een niet-ademende toestand, een conditie die bacillen tegenkomen binnen granulomateuze laesies.",
"Het dormantie-overlevingsregelaar (DosR) regulon, bestaande uit 48 co-gereguleerde genen, wordt als essentieel beschouwd voor de persistentie van Mtb.",
"DosR/DevR van M. tuberculosis is een tweedelig dormantie-overlevingsresponsregelaar die de expressie van 48 genen induceert.",
"Het functionele belang van tandemrangschikking werd vastgesteld door het analyseren van promotorvarianten met Dev-boxen met gewijzigde afstand. Geconserveerde sequentielogo's werden gegenereerd uit 47 bindingssequenties, waaronder 24 nieuw ontdekte Dev-boxen.",
"De tweedelige sensor/regelaar dosRS is een belangrijke mediator in de transcriptierespons van M. tuberculosis op hypoxie en controleert een regulon van ongeveer 50 genen die onder deze conditie worden geïnduceerd.",
"In silico analyse van het DosR-regulon in BCG en M. tuberculosis toonde ten minste 97% aminozuursequentiehomologie, met 41 van de 48 genen identiek.",
"DosR/DevR van M. tuberculosis is een tweedelig dormantie-overlevingsresponsregelaar die de expressie van 48 genen induceert.",
"Tuberculose is een tweedelig dormantie-overlevingsresponsregelaar die de expressie van 48 genen induceert."
] | 224 | 190 |
2,274 | Wordt autofagie op een circadiaanse wijze gereguleerd? | Ja, metabole routes, galzuursynthese en autofagische en immuun/inflammatoire processen worden aangedreven door de biologische klok. | [
"Het TOR-signaleringspad en autofagie zijn betrokken bij de regulatie van circadiane ritmes in gedrag en plasticiteit van L2-interneuronen in de hersenen van Drosophila melanogaster.",
"Onze resultaten geven aan dat het TOR-signaleringspad en autofagie betrokken zijn bij de regulatie van circadiane ritmes in het gedrag en de plasticiteit van neuronen in de hersenen van volwassen vliegen.",
"de routes van autofagie, mTOR, SIRT1 en Wnt die het circadiane ritme bij zoogdieren regelen",
"Metabole routes, galzuursynthese en autofagische en immuun/inflammatoire processen worden aangedreven door de biologische klok.",
"Onze bevindingen suggereren dat het klokgen Bmal1 een positieve regulator is van autofagie via het mTOR-signaleringspad en cardiomyocyten beschermt tegen hoge-glucose toxiciteit.",
"Autofagie is een sterk geconserveerd intracellulair afbraaksysteem en werd recentelijk aangetoond circadiane ritmes te vertonen bij muizen."
] | 147 | 138 |
2,275 | Is Drk essentieel voor anesthesie-resistente geheugen (ARM) in Drosophila? | Ja. Drk, het Drosophila-ortholoog van het adaptor-eiwit Grb2, is essentieel voor ARM binnen volwassen mushroom body-neuronen in Drosophila. | [
"Anesthesie-resistente geheugen (ARM) werd decennia geleden beschreven, maar de mechanismen die ten grondslag liggen aan deze eiwitsynthese-onafhankelijke vorm van geconsolideerd geheugen in Drosophila blijven slecht begrepen. Of de verschillende signaalmoleculen, receptoren en synaptische eiwitten die momenteel bij ARM betrokken zijn, in één of meerdere paden opereren en hoe ze functioneren in het proces, blijft onduidelijk. We presenteren bewijs dat Drk, het Drosophila-ortholoog van het adaptor-eiwit Grb2, essentieel is voor ARM binnen volwassen mushroom body-neuronen.",
"We presenteren bewijs dat Drk, het Drosophila-ortholoog van het adaptor-eiwit Grb2, essentieel is voor ARM binnen volwassen mushroom body-neuronen."
] | 119 | 117 |
2,276 | Wat is oclacitinib? | Oclacitinib (APOQUEL(®)) is een Januskinaseremmer met activiteit tegen cytokinen die betrokken zijn bij allergieën. Het is een krachtige remmer van JAK1. Het controleert effectief de klinische tekenen die geassocieerd zijn met allergische huidaandoeningen bij honden. | [
"Het doel van deze studie was om te bepalen of de nieuwe JAK-remmer oclacitinib de activiteit van cytokinen die betrokken zijn bij allergische huidaandoeningen bij honden kon verminderen.",
"Oclacitinib remde JAK-familieleden met 50% bij concentraties (IC50's) variërend van 10 tot 99 nm en remde een panel van 38 niet-JAK-kinasen niet (IC50's >1000 nM). Oclacitinib was het krachtigst in het remmen van JAK1 (IC50 = 10 nM). Oclacitinib remde ook de functie van JAK1-afhankelijke cytokinen die betrokken zijn bij allergie en ontsteking (IL-2, IL-4, IL-6 en IL-13) evenals jeuk (IL-31) bij IC50's variërend van 36 tot 249 nM. Oclacitinib had minimale effecten op cytokinen die het JAK1-enzym in cellen niet activeerden (erytropoëtine, granulocyt/macrofagen-coloniestimulerende factor, IL-12, IL-23; IC50's >1000 nM). Deze resultaten tonen aan dat oclacitinib een gerichte therapie is die selectief JAK1-afhankelijke cytokinen remt die betrokken zijn bij allergie, ontsteking en jeuk, en suggereren dat dit de mechanismen zijn waarmee oclacitinib effectief klinische tekenen geassocieerd met allergische huidaandoeningen bij honden onder controle houdt.",
"Oclacitinib (APOQUEL(®)) is een nieuwe Januskinaseremmer met activiteit tegen cytokinen die betrokken zijn bij allergie."
] | 211 | 211 |
2,277 | Zijn TAD-grenzen in Drosophila uitgeput in hoog-expressieve genen? | Drosophila inter-TADs bevatten actief chromatine en constitutief getranscribeerde (huishoudelijke) genen. | [
"Bovendien vinden we dat deze TAD-grenzen aanwezig zijn ongeacht de expressie en looping van genen die zich ertussen bevinden.",
"In het bijzonder toonde Hi-C aan dat chromosomen van dieren georganiseerd zijn in topologisch associërende domeinen (TADs), evolutionair geconserveerde compacte chromatinedomeinen die genexpressie beïnvloeden.",
"Drosophila inter-TADs bevatten actief chromatine en constitutief getranscribeerde (huishoudelijke) genen.",
"De insulator-achtige, TAD-grens-achtige en TAD-interieur-achtige regio's zijn elk verrijkt met verschillende epigenetische merkers en correleren elk met verschillende niveaus van genexpressie.",
"We concluderen dat epigenetische modificaties, gen-dichtheid en transcriptie-activiteit samen de lokale verpakking van het A. thaliana nucleair genoom vormgeven.",
"Verstoringen van topologische chromatinedomeinen veroorzaken pathogene herbedrading van gen-enhancer interacties.",
"Onze resultaten tonen het functionele belang van TADs aan voor het orkestreren van genexpressie via genoomarchitectuur en geven criteria aan voor het voorspellen van de pathogene aard van menselijke structurele varianten, met name in niet-coderende regio's van het menselijk genoom.",
"De driedimensionale organisatie van een genoom speelt een cruciale rol bij het reguleren van genexpressie, maar er is weinig bekend over de machinerie en mechanismen die de hogere-orde chromosoomstructuur bepalen.",
"Ectopisch tot expressie gebrachte roX1 en roX2 RNA's richten zich op HAS op het X-chromosoom in trans en veroorzaken via ruimtelijke nabijheid verspreiding van het MSL-complex in cis, wat leidt tot verhoogde expressie van naburige autosomale genen.",
"Gezamenlijk suggereren onze resultaten dat TADs gecondenseerde chromatinedomeinen zijn die uitgeput zijn in actieve chromatinemerkers, gescheiden door regio's van actief chromatine.",
"Echter, Drosophila inter-TADs bevatten actief chromatine en constitutief getranscribeerde (huishoudelijke) genen."
] | 246 | 248 |
2,278 | Noem de twee belangrijkste hematologische kenmerken van het Evans-syndroom | Het Evans-syndroom is een zeldzame auto-immuunziekte, die wordt gekenmerkt door immuun trombocytopenie en auto-immuun hemolytische anemie. | [
"Evans-syndroom (ES) werd gedefinieerd door de combinatie van immuun trombocytopenie (trombocytenaantal <100.000/mm3) en AIHA.",
"Trombocytopenie werd alleen gevonden in deze cluster (36% van de gevallen, gemanifesteerd als immuun trombocytopenie (ITP) of Evans-syndroom).",
"ACHTERGROND: Auto-immuun cytopenieën worden gekenmerkt door immuun-gemedieerde vernietiging van hematopoëtische cellijnen met immuun trombocytopenie (ITP) die de bloedplaatjes aantast en Evans-syndroom (ES) dat bloedplaatjes en rode bloedcellen aantast.",
"Primair Evans-syndroom (ES) wordt gedefinieerd door het gelijktijdig of opeenvolgend optreden van immuun trombocytopenie en auto-immuun hemolytische anemie zonder onderliggende oorzaak.",
"Evans-syndroom (ES) is een zeldzame auto-immuunziekte, die wordt gekenmerkt door immuun trombocytopenie en auto-immuun hemolytische anemie.",
"ACHTERGROND: Evans-syndroom (ES) is een zeldzame immuunstoornis bij kinderen, gemanifesteerd door gelijktijdige of opeenvolgende auto-immuun cytopenieën (AC's) van onbekende oorzaak en met een chronisch beloop met perioden van verergering en remissie.",
"Evans-syndroom (ES) is een zeldzame auto-immuunziekte waarvan de exacte pathofysiologie onbekend is. Het wordt gekenmerkt door de gelijktijdige of opeenvolgende ontwikkeling van auto-immuun hemolytische anemie (AIHA) en immuun trombocytopenie (ITP).",
"Evans-syndroom is een ongebruikelijke ziekte van auto-immuun etiologie, gekenmerkt door trombocytopenie en hemolytische anemie.",
"Evans-syndroom is een zeldzame aandoening die wordt gekenmerkt door gelijktijdige of opeenvolgende ontwikkeling van immuun trombocytopenie (ITP) en auto-immuun hemolytische anemie (AIHA) met een positieve directe antiglobulinetest (DAT) zonder bekende onderliggende oorzaak.",
"Evans-syndroom is een zeldzame aandoening die wordt gedefinieerd door de combinatie (gelijktijdig of opeenvolgend) van immuun trombocytopenische purpura en auto-immuun hemolytische anemie met een positieve directe antiglobulinetest zonder bekende onderliggende oorzaak.",
"Evans-syndroom is een zeer zeldzame hematologische auto-immuunziekte, gekenmerkt door een directe Coombs-positieve hemolytische anemie en immuun trombocytopenische purpura zonder bekende onderliggende oorzaak.",
"Evans-syndroom wordt meestal gecompliceerd door hemolytische of trombocytopenische symptomen.",
"De selectiecriteria waren Evans-syndroom in de zwangerschap; auto-immuun hemolytische anemie; immuun trombocytopenie.",
"Evans-syndroom is een ongebruikelijke ziekte van auto-immuun etiologie, gekenmerkt door trombocytopenie en hemolytische anemie.",
"Evans-syndroom verwijst naar een hematologische auto-immuunstoornis met auto-immuun hemolytische anemie vergezeld van immuun trombocytopenie.",
"Evans-syndroom is een zeer zeldzame hematologische auto-immuunziekte, gekenmerkt door een directe Coombs-positieve hemolytische anemie en immuun trombocytopenische purpura zonder bekende onderliggende oorzaak."
] | 376 | 336 |
2,279 | Is er een verhoogde recombinatiesnelheid in menselijke regelgevende domeinen? | Nee. Er is bewijs voor een significant verminderde recombinatiesnelheid vergeleken met overeenkomende controlegebieden in menselijke regelgevende domeinen. | [
"Bewijs van verminderde recombinatiesnelheid in menselijke regelgevende domeinen.",
"We bestuderen de relatie tussen recombinatiesnelheid en genregulerende domeinen, gedefinieerd door een gen en zijn gekoppelde controle-elementen. We definiëren deze koppelingen met behulp van expression quantitative trait loci (eQTL's), methylatie quantitative trait loci (meQTL's), chromatineconformatie uit publiek beschikbare datasets (Hi-C en ChIA-PET), en gecorreleerde activiteitskoppelingen die we afleiden over celtypen heen. Elk type koppeling toont een \"recombinatiesnelheidsvallei\" van significant verminderde recombinatiesnelheid vergeleken met overeenkomende controlegebieden. Deze recombinatiesnelheidsvallei is het meest uitgesproken voor genregulerende domeinen van genen die betrokken zijn bij vroege embryonale ontwikkeling, housekeeping-genen en constitutieve regelgevende elementen, waarvan bekend is dat ze een verhoogde evolutionaire beperking vertonen over soorten heen. Recombinatiesnelheidsvalleien vertonen verhoogde DNA-methylatie, verminderde initiatie van dubbelstrengsbreuken en verhoogde reparatie-efficiëntie, specifiek in de lijn die leidt naar de kiemlijn. Bovendien zijn we, door alleen het overlappen van functionele koppelingen en DNA-methylatie in kiemcellen te gebruiken, in staat om de recombinatiesnelheid met hoge nauwkeurigheid te voorspellen. CONCLUSIES: Onze resultaten suggereren het bestaan van een recombinatiesnelheidsvallei bij regelgevende domeinen en bieden een potentieel moleculair mechanisme om de wisselwerking tussen genetische en epigenetische variaties te interpreteren."
] | 211 | 206 |
2,280 | Is enzastaurine een effectieve behandeling van glioblastoom? | Nee. Enzastaurine verbetert de prognose van patiënten met glioblastoom niet. | [
"RESULTATEN: veertien gerandomiseerde klinische onderzoeken werden geïdentificeerd (7 met bevacizumab, 2 cilengitide, 1 enzastaurine, 1 dasatinib, 1 vandetanib, 1 temsirolimus, 1 cediranib) met in totaal 4330 patiënten. Antiangiogene geneesmiddelen toonden geen verbetering in de algehele overleving met een gecombineerde HR van 1,00; er werd een tendens tot een slechtere uitkomst, in termen van algehele overleving, waargenomen in de groep patiënten die alleen een antiangiogeen middel kregen vergeleken met alleen een cytotoxisch middel (HR=1,24, p=0,056).",
"Enzastaurine (LY317615) in combinatie met bevacizumab voor terugkerende maligne gliomen wordt goed verdragen, met respons en progressievrije overleving vergelijkbaar met bevacizumab monotherapie.",
"Tot nu toe verlengde remming van angiogenese door verbindingen zoals bevacizumab, cediranib, enzastaurine of cilengitide, evenals alternatieve doseringsschema’s van temozolomide, de overleving niet, noch bij primaire diagnose noch bij terugkerende ziekte.",
"Ondanks veelbelovende resultaten in fase II klinische onderzoeken en patiëntvoordeel in termen van klinische verbetering en langere progressievrije overleving, is een voordeel in algehele overleving niet aangetoond in vier gerandomiseerde fase III onderzoeken met bevacizumab of cilengitide bij pas gediagnosticeerd glioblastoom of cediranib of enzastaurine bij terugkerend glioblastoom.",
"CONCLUSIES: PFS-6 miste de primair geplande uitkomst van 55%.",
"OS (mediaan, 74 weken) en PFS (mediaan, 36 weken) resultaten van de huidige studie waren vergelijkbaar met die van een eerdere fase II studie met erlotinib en waren significant beter dan die van 2 andere eerdere studies met thalidomide of cis-retinoïnezuur, allen in combinatie met temozolomide plus RT.",
"Recente antiangiogene middelen, waaronder enzastaurine, cediranib, bevacizumab en anderen die voornamelijk de VEGF-route targeten, zijn geëvalueerd bij deze sterk angiogene ziekte. Hiervan is alleen bevacizumab geassocieerd met duidelijke antitumoractiviteit, hoewel het ontbreken van controlegroepen de impact van de resultaten tot nu toe beperkt.",
"Enzastaurine heeft anti-glioma activiteit bij patiënten met terugkerend hooggradig glioom, maar lijkt niet voldoende activiteit als monotherapie te hebben om nuttig te zijn.",
"Verschillende signaaltransductieremmers zijn onderzocht in preklinische en klinische onderzoeken bij maligne gliomen, waaronder antiangiogene middelen (bevacizumab, enzastaurine), en remmers van epidermale groeifactorreceptor tyrosinekinase (gefitinib en erlotinib), mammalian target of rapamycin (temsirolimus, everolimus) en integrine (cilengitide). Hoewel voorlopige klinische resultaten van gerichte middelen niet hebben geleid tot significant betere overleving, onderzoeken recentere fase II studies de combinatie van multitarget geneesmiddelen met cytotoxische chemotherapie en radiotherapie om de resistentie van tumoren tegen gerichte monotherapieën te overwinnen.",
"Verschillende geneesmiddelen zijn getest, waaronder epidermale groeifactorreceptor (EGFR) tyrosinekinaseremmers (gefitinib en erlotinib), mammalian target of rapamycin (mTOR) remmers (temsirolimus en everolimus), en remmers van vasculaire endotheliale groeifactorreceptor (VEGFR), proteïnekinase C-beta en andere angiogenese routes (vatalanib, bevacizumab en enzastaurine). Hoewel voorlopige werkzaamheidsresultaten van de meeste onderzoeken bij terugkerende ziekte tegenvielen, zijn aanzienlijke vorderingen geboekt door bijbehorend translationeel onderzoek.",
"Tot nu toe verlengde remming van angiogenese door verbindingen zoals bevacizumab, cediranib, enzastaurine of cilengitide, evenals alternatieve doseringsschema’s van temozolomide, de overleving niet, noch bij primaire diagnose noch bij terugkerende ziekte."
] | 499 | 465 |
2,281 | Welke gistnucleosomen worden bij voorkeur gemarkeerd door H2A.Z? | Gistnucleosomen die het histonvariant H2A.Z (Htz1p in gist) bevatten, bestaan voornamelijk uit H4 K12ac en H3 K4me3. | [
"De H2A- en H2A.Z-nucleosomen hebben verschillende sequentievoorkeuren. De verschoven pieken vallen samen met DNA-regio's die interageren met de histonlussen.",
"De afzetting van het histonvariant H2A.Z in genlichamen reguleert transcriptie door de toegankelijkheid van chromatine in planten te wijzigen.",
"We toonden aan dat H2A.Z bij voorkeur geassocieerd is met H3K4me3 bij promotoren, terwijl het werd gevonden met H3K27me3 bij enhancers, en dat de afzetting van H2A.Z negatief correleerde met genexpressie.",
"Daarnaast toonden we aan dat H2A.Z genexpressie onderdrukt door lage gen-toegankelijkheid te vestigen bij het +1 nucleosoom en hoge gen-toegankelijkheid te behouden bij het -1 nucleosoom. Verder lieten we zien dat hoge maten van genresponsiviteit correleren met de H2A.Z-geassocieerde gesloten +1 nucleosoomstructuur.",
"In het bijzonder is aangetoond dat de vervanging van het canonieke H2A-histon door de varianten macroH2A en H2A.Z de DNA-toegankelijkheid en nucleosoomstabiliteit beïnvloedt;",
"Met behulp van genoomwijde nucleosoomkaarten en histonvariantbezetting in de muizenlever tonen we aan dat de meerderheid van de genen geassocieerd was met een enkel prominent H2A.Z-bevattend nucleosoom in hun promotorregio.",
"De nabijheid van het H2A.Z-bevattende nucleosoom tot de transcriptiestartplaats beïnvloedt de genexpressieniveaus in de lever en hersenen van zoogdieren.",
"De genen zonder detecteerbaar H2A.Z vertoonden het laagste expressieniveau, terwijl H2A.Z dichter bij de TSS van genen met hogere expressieniveaus werd gepositioneerd.",
"De nabijheid van het histonvariant H2A.Z, maar niet H3.3, tot de TSS over zeven opeenvolgende nucleosomen correleerde met expressie.",
"Onze resultaten suggereren dat genexpressieniveaus in vivo worden bepaald door de toegankelijkheid van de TSS en de nabijheid van H2A.Z.",
"We vinden ook dat menselijke H2A.Z-nucleosomen slechts ongeveer 120 bp DNA beschermen tegen MNase-afbraak en specifieke sequentievoorkeuren vertonen, wat wijst op een nieuw mechanisme van nucleosoomorganisatie voor het H2A.Z-variant.",
"Het variant histon H2A.Z is globaal gelokaliseerd bij de promotoren van inactieve gistgenen en reguleert de positionering van nucleosomen.",
"We hebben 4.862 kleine regio's geïdentificeerd — typisch één of twee nucleosomen breed — versierd met H2A.Z. Deze \"Z-loci\" worden voornamelijk gevonden binnen specifieke nucleosomen in de promotor van inactieve genen verspreid over het hele genoom.",
"Genoomwijde profilering van Anp32e toonde een opmerkelijke co-bezetting tussen Anp32e en H2A.Z. Cellen die Anp32e overexpressen vertoonden een sterk globaal verlies van H2A.Z bij de +1 nucleosomen, terwijl cellen met een tekort aan Anp32e een matige globale toename van H2A.Z bij de +1 nucleosomen vertoonden.",
"Dit suggereert dat Anp32e kan helpen bij het oplossen van de niet-nucleosomale H2A.Z-aggregaten en ook de verwijdering van H2A.Z bij de +1 nucleosomen kan faciliteren, wat RNA-polymerase II kan helpen de eerste nucleosomale barrière te passeren.",
"Hoewel verschillende epigenetische markeringen correleren met verschillende chromatine-staten, is het grotendeels onbekend hoe ze binnen enkele nucleosomen worden geïntegreerd om combinatorische signalen te genereren. We rapporteren de succesvolle implementatie van enkelmolecuultechnieken bestaande uit fluorescentiecorrelatiespectroscopie (FCS), puls-interval excitatie-gebaseerde Förster resonantie energieoverdracht (PIE-FRET) en fluorescentielevensduurbeeldvorming-gebaseerde FRET (FLIM-FRET) om de samenstelling van enkele nucleosomen die het histonvariant H2A.Z (Htz1p in gist) bevatten in vitro en in vivo te verduidelijken. We tonen aan dat gistnucleosomen die Htz1p bevatten voornamelijk bestaan uit H4 K12ac en H3 K4me3, maar niet H3 K36me3, en dat deze patronen behouden blijven in zoogdiercellen."
] | 513 | 511 |
2,282 | Is dasatinib effectief voor de behandeling van glioblastoom? | Nee, dasatinib is niet effectief voor de behandeling van glioblastoom en gaat gepaard met aanzienlijke toxiciteit. | [
"RESULTATEN: veertien gerandomiseerde klinische onderzoeken werden geïdentificeerd (7 met bevacizumab, 2 cilengitide, 1 enzastaurine, 1 dasatinib, 1 vandetanib, 1 temsirolimus, 1 cediranib) met in totaal 4330 patiënten. Antiangiogene geneesmiddelen toonden geen verbetering in de algehele overleving met een gecombineerde HR van 1,00; er werd een tendens naar een slechtere uitkomst, in termen van algehele overleving, waargenomen in de groep patiënten die alleen een antiangiogeen middel kregen vergeleken met alleen een cytotoxisch middel (HR=1,24, p=0,056).",
"CONCLUSIES: Intraparticipanten dosisverhoging was haalbaar, maar dasatinib was niet effectief bij recidiverend GBM.",
"De mediane progressievrije overleving (PFS) was 1,35 maanden (95% betrouwbaarheidsinterval: 1,2-1,4) en de 6-maanden PFS was 7,7%. In deze fase I-studie bij patiënten met recidiverend glioblastoom toonde de combinatie van CCNU en dasatinib significante hematologische toxiciteiten en leidde tot suboptimale blootstelling aan beide middelen.",
"Dasatinib in combinatie met bevacizumab lijkt geen werkzaamheid te hebben bij patiënten met recidiverend, zwaar voorbehandeld GBM."
] | 159 | 167 |
2,283 | Welk algoritme is beschikbaar voor het berekenen van minimale afwezige woorden met behulp van extern geheugen? | emMAW | [
"emMAW: het berekenen van minimale afwezige woorden in extern geheugen.",
"We presenteren emMAW, het eerste algoritme voor extern geheugen om minimale afwezige woorden te berekenen. Een gratis open-source implementatie van ons algoritme is beschikbaar gesteld. Dit maakt het mogelijk om minimale afwezige woorden te berekenen op veel grotere datasets dan voorheen mogelijk was. Onze implementatie vereist minder dan 3 uur op een standaard werkstation om het volledige menselijke genoom te verwerken wanneer slechts 1 GB RAM beschikbaar is.",
"We presenteren emMAW, het eerste algoritme voor extern geheugen om minimale afwezige woorden te berekenen.",
"We presenteren emMAW, het eerste algoritme voor extern geheugen om minimale afwezige woorden te berekenen.",
"Resultaten We presenteren emMAW, het eerste algoritme voor extern geheugen om minimale afwezige woorden te berekenen."
] | 118 | 135 |
2,284 | Is IVIG getest in klinische onderzoeken voor de behandeling van de ziekte van Alzheimer? | Ja, IVIG is getest in klinische onderzoeken voor de behandeling van de ziekte van Alzheimer. | [
"Klinische onderzoeken met intraveneuze immunoglobuline voor de ziekte van Alzheimer.",
"Preklinische en klinische studies hebben aangetoond dat IVIG anti-amyloïde en immuunmodulerende eigenschappen heeft die relevant zijn voor de behandeling van neurodegeneratieve aandoeningen. In vroege fase AD-klinische onderzoeken bleek dat IVIG cognitieve achteruitgang verminderde en het glucosemetabolisme in de hersenen verhoogde. Helaas voldeed IVIG niet aan de primaire uitkomstdoelen in de Noord-Amerikaanse fase 3 klinische studie bij milde tot matige AD.",
"Hoewel de resultaten van klinische onderzoeken tot nu toe geen ondersteuning bieden voor het gebruik van IVIG voor de behandeling van AD bij de geteste doseringen, zijn aanvullende studies naar de werkingsmechanismen van IVIG gerechtvaardigd en kunnen deze de ontwikkeling van effectievere therapieën voor AD in de toekomst begeleiden."
] | 134 | 144 |
2,285 | Welk type urine-incontinentie wordt gediagnosticeerd met de Q-tip test? | Stress urine-incontinentie wordt gediagnosticeerd met de Q-tip test. De test evalueert de mobiliteit van de urethra. | [
"ONDERZOEKSOPZET: 141 vrouwen die instemden met een midurethrale slingoperatie vanwege stress urine-incontinentie met een hypermobiele urethra werden opgenomen in deze niet-gerandomiseerde prospectieve observationele studie. Preoperatief werd de mobiliteit van de urethra gemeten met de Q-tip test.",
"Valsalva lekpuntdruk-geassocieerde Q-tip hoek en eenvoudige symptomen van stress urine-incontinentie bij vrouwen.",
"DOEL: Om de associatie tussen klinisch gedefinieerde eenvoudige symptomen van stress urine-incontinentie (SUI) en urodynamische SUI te verduidelijken, onderzochten we de relatie tussen Valsalva lekpuntdruk (VLPP) gemeten met de Q-tip test en Stamey graad bij eenvoudige vrouwelijke SUI. METHODEN: Tweehonderd vrouwelijke SUI-patiënten met graad I of II en SUI-symptomen werden onderzocht door medische geschiedenis te bekijken; lichamelijk onderzoek; urethramobiliteit beoordeeld met de Q-tip test; stresstest; en cystometrie, inclusief VLPP-meting.",
"CONCLUSIES: Bij eenvoudige vrouwelijke SUI is VLPP geassocieerd met de Q-tip hoek en Stamey graad, wat kan helpen sommige urodynamische items te verminderen.",
"Elke vrouw onderging na 12 en 24 maanden een postoperatieve evaluatie door middel van urodynamica, Q-tip test, CST, transperineale echografie en het invullen van de \"King's Health Questionnaire\" (KHQ).",
"METHODEN: In totaal werden 25 vrouwen met klinische stress urine-incontinentie (SUI) opgenomen. Na urodynamische beoordeling, bepaling van het prolapsstadium van de bekkenorganen, urinekweek, Q-tip test en stresstest, onderging elke deelnemer kleurendopplerechografie om de clitorale bloedstroom te registreren en EMG van de urethrale sfincter met een naaldelektrode die via het slijmvlies in het spierweefsel werd ingebracht vóór de operatie.",
"Preoperatief ondergingen patiënten POP-Q classificatie, Q-tip test, challenge stresstest en urodynamica, en vulden zij de I-QoL, PISQ-12 en PGI-S vragenlijsten in.",
"MATERIALEN EN METHODEN: Honderd patiënten met klinische en/of urodynamische stress urine-incontinentie (SUI) werden gerandomiseerd in groepen met biologisch materiaal TOT (PELVILACE® TO) of synthetisch materiaal TOT (ALIGN® TO Urethral Support System). Preoperatief en 1 jaar postoperatief werden urogynecologische symptoombeoordeling, 1-uurs incontinentietest, 4-daags blaasschema, stresstest, Q-tip test en urodynamica uitgevoerd.",
"Rol van de Q-tip test bij de evaluatie van stress urine-incontinentie.",
"Vijftien vrouwen met een klinische en urodynamische diagnose van stress urine-incontinentie hadden een negatieve Q-tip test (een verandering van de Q-tip hoek bij persen van groter dan of gelijk aan 30 graden).",
"Eenvoudige klinische tests ter ondersteuning van de urethrovesicale junctie, zoals de Q-tip test, zijn niet-specifiek bij patiënten met stress urine-incontinentie.",
"DOEL Om de associatie tussen klinisch gedefinieerde eenvoudige stress urine-incontinentie (SUI) symptomen en urodynamische SUI te verduidelijken, onderzochten we de relatie tussen Valsalva lekpuntdruk (VLPP) gemeten met de Q-tip test en Stamey graad bij eenvoudige vrouwelijke SUI.",
"Rol van de Q-tip test bij de evaluatie van stress urine-incontinentie."
] | 437 | 419 |
2,286 | Heeft een tonsillectomie invloed op de stem van de patiënt? | Sommige patiënten klagen over een droge keel, het gevoel van een vreemd voorwerp of stemverandering na een tonsillectomie. Groep B had een beter bewustzijn van tandbeschadiging. Er waren geen verschillen in secundaire uitkomsten tussen de behandelgroepen. De incidentiecijfers van stemverandering, velofaryngeale insufficiëntie, bloedingen, obstipatie, uitdroging en pijn werden gemeten. | [
"Groep B had een beter bewustzijn van tandbeschadiging (78% versus 30% van de patiënten, P ≤ .001), stemverandering (61 versus 19%, P = .005) en brandwonden aan lippen en mond (44% versus 8%, P = .005). Ten slotte beoordeelde 35% meer patiënten uit groep B hun begrip van tonsillectomie als goed of zeer goed (P = .017).",
"Sommige patiënten klagen over een droge keel, het gevoel van een vreemd voorwerp of stemverandering na een tonsillectomie.",
"Het percentage patiënten met tijdelijke stemverandering was 62,7%, en 15,4% had een vervolgafspraak in de kliniek.",
"Er is geen dosis-respons op dexamethason (0,0625-1,0 mg/kg) bij pediatrische tonsillectomie- of adenotonsillectomiepatiënten voor het voorkomen van braken, het verminderen van pijn, het verkorten van de tijd tot de eerste vloeistofinname, of de incidentie van stemverandering.",
"Er waren geen verschillen in secundaire uitkomsten (pijnstillersbehoefte, tijd tot eerste vloeistofinname en stemverandering) tussen de behandelgroepen.",
"Stemverandering, gerapporteerd door ongeveer 70% van alle patiënten, was de meest voorkomende klacht, maar verdween in alle gevallen.",
"De incidentiecijfers van stemverandering, velofaryngeale insufficiëntie, bloedingen, obstipatie, uitdroging en pijn werden gemeten.",
"Tonsillectomie beïnvloedt de stemprestatie op korte termijn negatief bij volwassenen; echter, het beïnvloedt de stemprestatie op lange termijn na de operatie niet.",
"De chirurgische techniek, of het nu een koud mes of een thermisch lasapparaat is, lijkt geen invloed te hebben op stem en spraak bij tonsillectomiepatiënten.",
"DOEL: Het evalueren van veranderingen in akoestische kenmerken van de stem na tonsillectomie.",
"Chirurgische indicaties voor tonsillectomie bij jonge stempatiënten worden besproken.",
"DOEL: Ons doel was om de perceptie van de patiënt en akoestische kenmerken van de stem voor en na bovenste luchtwegchirurgie te beoordelen.",
"In dit rapport onderzochten we de verandering in farynxgrootte en akoestische kenmerken van de stem na tonsillectomie.",
"CONCLUSIE Tonsillectomie beïnvloedt de stemprestatie op korte termijn negatief bij volwassenen; echter, het beïnvloedt de stemprestatie op lange termijn na de operatie niet.",
"Sommige patiënten klagen over een droge keel, het gevoel van een vreemd voorwerp of stemverandering na tonsillectomie.",
"Tonsillectomie beïnvloedt de stemprestatie op korte termijn negatief bij volwassenen; echter, het beïnvloedt de stemprestatie op lange termijn na de operatie niet.",
"De chirurgische techniek, of het nu een koud mes of een thermisch lasapparaat is, lijkt geen invloed te hebben op stem en spraak bij tonsillectomiepatiënten.",
"Er is geen dosis-respons op dexamethason (0,0625-1,0 mg/kg) bij pediatrische tonsillectomie- of adenotonsillectomiepatiënten voor het voorkomen van braken, het verminderen van pijn, het verkorten van de tijd tot de eerste vloeistofinname, of de incidentie van stemverandering."
] | 435 | 447 |
2,287 | Noem de vier belangrijkste interferonopathieën | Aicardi-Goutières syndroom
chilblain lupus
ubiquitine-specifieke peptidase 18 (USP18)-deficiëntie
Singleton-Merten syndroom | [
"Zoals gedefinieerd, vertegenwoordigen de type I interferonopathieën discrete voorbeelden van een verstoring van de homeostatische controle van dit systeem veroorzaakt door Mendeliaanse mutaties.",
"Familiaire chilblain lupus behoort tot de groep van type I interferonopathieën en wordt gekenmerkt door typische huidmanifestaties en acrale ischemie.",
"interferonopathieën zoals het Aicardi-Goutières syndroom.",
"Ongepaste opregulatie van type I IFN-signaaltransductie en interferon-gestimuleerde genexpressie zijn in verband gebracht met verschillende CNS-ziekten die \"interferonopathieën\" worden genoemd, waaronder het Aicardi-Goutières syndroom en ubiquitine-specifieke peptidase 18 (USP18)-deficiëntie.",
"interferonopathieën (Singleton-Merten syndroom)",
"Aicardi-Goutières syndroom (AGS) is een inflammatoire aandoening die behoort tot de recent gekarakteriseerde groep van type I interferonopathieën.",
"Ongepaste opregulatie van type I IFN-signaaltransductie en interferon-gestimuleerde genexpressie zijn in verband gebracht met verschillende CNS-ziekten die \"interferonopathieën\" worden genoemd, waaronder het Aicardi-Goutières syndroom en ubiquitine-specifieke peptidase 18 (USP18)-deficiëntie.",
"Vervolgens belangrijke spelers die autoinflammatie aansturen, zoals type-1 interferonopathieën (inclusief de recent beschreven haplo-insufficiëntie in A20 en otulipenia), TNF-geassocieerde periodieke syndromen, defecten in ubiquitinering, en SAID met overlappende kenmerken van auto-immuniteit of immunodeficiëntie.",
"Familiaire chilblain lupus behoort tot de groep van type I interferonopathieën en wordt gekenmerkt door typische huidmanifestaties en acrale ischemie."
] | 189 | 182 |
2,288 | Noem de partners van de knopvormende gist Cdc48 die belangrijk zijn voor de demontage van ubiquitylering van CMG-helicase aan het einde van de chromosoomreplicatie | Het ubiquitine-bindende Ufd1-Npl4-complex rekruteert Cdc48 naar ubiquitylering van CMG-helicase aan het einde van de chromosoomreplicatie. | [
"Ufd1-Npl4 rekruteert Cdc48 voor demontage van ubiquitylering van CMG-helicase aan het einde van de chromosoomreplicatie.",
"We tonen aan dat het ubiquitine-bindende Ufd1-Npl4-complex Cdc48 rekruteert naar ubiquitylering van CMG.",
"Mutatie van K29 verhindert in vitro de rekrutering van Ufd1-Npl4-Cdc48 naar de CMG-helicase, wat een model ondersteunt waarbij Ufd1-Npl4 Cdc48 rekruteert naar ubiquitylering van CMG aan het einde van de chromosoomreplicatie, waardoor de demontagereactie wordt aangedreven.",
"Mutatie van K29 verhindert in vitro de rekrutering van Ufd1-Npl4-Cdc48 naar de CMG-helicase, wat een model ondersteunt waarbij Ufd1-Npl4 Cdc48 rekruteert naar ubiquitylering van CMG aan het einde van de chromosoomreplicatie, waardoor de demontagereactie wordt aangedreven."
] | 126 | 134 |
2,289 | Hoe zijn topologisch associërende domeinen (TAD) geassocieerd met replicatietiming? | Topologisch associërende domeinen en hun langafstandcontacten worden gevormd tijdens het vroege G1, gelijktijdig met de totstandbrenging van het replicatietimingsprogramma. Topologisch associërende domeinen zijn stabiele eenheden van replicatietimingsregulatie. | [
"Topologisch associërende domeinen en hun langafstandcontacten worden gevormd tijdens het vroege G1, gelijktijdig met de totstandbrenging van het replicatietimingsprogramma.",
"Determinanten van het replicatietimingsprogramma worden opnieuw vastgesteld tijdens de vroege G1-fase van elke celcyclus en gaan verloren in de G2-fase, maar het is niet bekend wanneer de TAD-structuur en inter-TAD-contacten opnieuw worden gevormd na hun eliminatie tijdens de mitose.",
"We constateren dat zowel de vorming van TAD's als hun compartimentalisatie plaatsvinden tijdens het vroege G1, binnen hetzelfde tijdsbestek als de totstandbrenging van het replicatietimingsprogramma.",
"Al met al onthult deze studie een sterke verbinding tussen chromatinereorganisatie tijdens G1, de totstandbrenging van replicatietiming en de ontwikkelingscontrole daarvan.",
"Topologisch associërende domeinen zijn stabiele eenheden van replicatietimingsregulatie.",
"Vroege en late replicatie correleren respectievelijk met open en gesloten driedimensionale chromatinecompartimenten die zijn geïdentificeerd door hoogresolutie chromosoomconformatie-captatie (Hi-C), en in mindere mate correleert late replicatie met lamina-geassocieerde domeinen (LAD's).",
"We tonen aan dat replicatiedomeingrenzen gezamenlijk bijna een-op-een overeenkomen met TAD-grenzen, terwijl binnen een celtype aangrenzende TAD's die op vergelijkbare tijden repliceren replicatiedomeingrenzen verdoezelen, wat grotendeels de eerder gerapporteerde ontbrekende uitlijning verklaart.",
"Hi-C segregeert ook inter-TAD-contacten in gedefinieerde 3D-ruimtelijke compartimenten die precies overeenkomen met genoomwijde replicatietimingsprofielen.",
"Met een door ons voorgestelde nieuwe domeingebaseerde uitlijning definieerden we verschillende typen hiërarchische TAD-veranderingen die eerder niet systematisch bestudeerd waren, en gebruikten deze vervolgens om aan te tonen dat TAD's en sub-TAD's statistisch verschilden in correlatie met chromosomaal compartiment, replicatietiming en gentranscriptie.",
"Om de moleculaire basis van TAD-vorming te onderzoeken, voerden we Hi-C-experimenten uit op cellen waarin de Forkhead-transcriptiefactoren Fkh1 en Fkh2 waren uitgeput, die eerder geassocieerd waren met replicatietiming.",
"We tonen aan dat replicatiedomeingrenzen gezamenlijk bijna een-op-een overeenkomen met TAD-grenzen, terwijl binnen een celtype aangrenzende TAD's die op vergelijkbare tijden repliceren replicatiedomeingrenzen verdoezelen, wat grotendeels de eerder gerapporteerde ontbrekende uitlijning verklaart.",
"Bovendien partitioneert celtypespecifieke replicatietiming van TAD's het genoom in twee grootschalige subnucleaire compartimenten, waarbij replicatietimingovergangen niet te onderscheiden zijn van laat-replicerende regio's in chromatinesamenstelling en lamina-associatie, wat de verminderde correlatie van replicatietiming met LAD's en heterochromatine verklaart.",
"Het genoom van metazoïsche cellen is georganiseerd in topologisch associërende domeinen (TAD's) die vergelijkbare histonmodificaties, transcriptieniveaus en DNA-replicatietiming vertonen.",
"Genoomwijde chromatin conformatie-captatie (Hi-C) heeft sub-megabase topologisch associërende domeinen (TAD's) onthuld, die de structurele tegenhangers zijn van replicatiedomeinen.",
"Topologisch associërende domeinen zijn stabiele eenheden van replicatietimingsregulatie.",
"Topologisch associërende domeinen en hun langafstandcontacten worden gevormd tijdens het vroege G1, gelijktijdig met de totstandbrenging van het replicatietimingsprogramma."
] | 452 | 410 |
2,290 | Hoe worden cryptische onstabiele transcripties (CUTs) gedefinieerd? | Deze bron bevat deleties van kleine nucleaire RNA's (snRNA's), transfer RNA's (tRNA's), kleine nucleolaire RNA's (snoRNA's) en andere geannoteerde ncRNA's, evenals de recentelijk geïdentificeerde stabiele ongeannoteerde transcripties (SUTs) en cryptische onstabiele transcripties (CUTs) waarvan de functies grotendeels onbekend zijn. Er is uitgebreide transcriptie door het eukaryote genoom heen, wat resulteert in zowel antisense transcripties van coderende regio's als cryptische onstabiele transcripties (CUTs) uit intergene regio's. Deze cryptische onstabiele transcripties (CUTs) worden snel afgebroken door het nucleaire exosoom. Deze resultaten suggereren dat transcriptiebeëindiging van CUTs, gestuurd door Nrd1 en Nab3, een vereiste is voor snelle afbraak door het nucleaire exosoom. Het is waarschijnlijk dat velen hiervan cryptische onstabiele transcripties (CUTs) zijn, die snel worden afgebroken en waarvan de functie(s) binnen de cel nog onduidelijk zijn, terwijl anderen mogelijk nieuwe functionele transcripties zijn. Deze recentelijk geïdentificeerde transcripties bestaan ofwel stabiel in cellen (stabiele ongeannoteerde transcripties, SUTs) of worden snel afgebroken door het RNA-surveillancepad (cryptische onstabiele transcripties, CUTs) | [
"Deze bron bevat deleties van kleine nucleaire RNA's (snRNA's), transfer RNA's (tRNA's), kleine nucleolaire RNA's (snoRNA's) en andere geannoteerde ncRNA's, evenals de recentelijk geïdentificeerde stabiele ongeannoteerde transcripties (SUTs) en cryptische onstabiele transcripties (CUTs) waarvan de functies grotendeels onbekend zijn",
"Er is uitgebreide transcriptie door het eukaryote genoom heen, wat resulteert in zowel antisense transcripties van coderende regio's als cryptische onstabiele transcripties (CUTs) uit intergene regio's",
"Deze cryptische onstabiele transcripties (CUTs) worden snel afgebroken door het nucleaire exosoom.",
"In dit artikel tonen we aan dat Nrd1 en Nab3 vereist zijn voor transcriptiebeëindiging van CUTs",
"Deze resultaten suggereren dat transcriptiebeëindiging van CUTs, gestuurd door Nrd1 en Nab3, een vereiste is voor snelle afbraak door het nucleaire exosoom.",
"Het is waarschijnlijk dat velen hiervan cryptische onstabiele transcripties (CUTs) zijn, die snel worden afgebroken en waarvan de functie(s) binnen de cel nog onduidelijk zijn, terwijl anderen mogelijk nieuwe functionele transcripties zijn.",
"Deze recentelijk geïdentificeerde transcripties bestaan ofwel stabiel in cellen (stabiele ongeannoteerde transcripties, SUTs) of worden snel afgebroken door het RNA-surveillancepad (cryptische onstabiele transcripties, CUTs)",
"Een kenmerk van alomtegenwoordige transcriptie is de uitgebreide overlap van SUTs en CUTs met eerder geannoteerde kenmerken, wat vragen oproept over hoe deze transcripties worden gegenereerd en of ze een functie uitoefenen",
"Studies van enkele genen hebben aangetoond dat transcriptie van SUTs en CUTs functioneel kan zijn, via mechanismen die de gegenereerde RNA's of hun generatie zelf betreffen",
"We tonen aan dat zowel SUTs als CUTs verschillende distributiepatronen vertonen op specifieke locaties",
"Cryptische onstabiele transcripties (CUTs) werden recentelijk beschreven als een hoofdklasse van RNA-polymerase II transcripties in Saccharomyces cerevisiae",
"Hoewel de afbraakmechanismen van CUTs in detail zijn geanalyseerd, zijn de genoomwijde distributie op nucleotide-resolutie en de prevalentie van CUTs onbekend.",
"Hier rapporteren we de eerste genoomkaart met hoge resolutie van CUTs in gist, die een klasse van potentieel functionele CUTs en de intrinsieke bidirectionele aard van eukaryote promotoren onthult",
"De resulterende gedetailleerde genoomkaart van CUTs toonde aan dat ze afkomstig zijn van zeer wijdverspreide en goed gedefinieerde transcriptie-eenheden en niet het resultaat zijn van onspecifieke transcriptiegeluiden.",
"De transcriptie van CUTs vindt voornamelijk plaats binnen nucleosoomvrije regio's, waarvan de meeste overeenkomen met promotorregio's van echte genen.",
"Sommige van de CUTs beginnen stroomopwaarts van boodschapper-RNA's en overlappen hun 5'-uiteinde.",
"De meeste van de geïdentificeerde CUTs kwamen overeen met transcripties die divergent zijn van de promotorregio's van genen, wat aangeeft dat ze bijproducten zijn van divergente transcriptie die bij veel en mogelijk de meeste promotoren voorkomt.",
"De meeste van deze ncRNA's (ncRNAs) worden beëindigd via het Nrd1-afhankelijke pad en snel afgebroken door het nucleaire exosoom en worden cryptische onstabiele transcripties (CUTs) genoemd. CUTs worden vaak beschouwd als bijproducten van transcriptiegeluid, maar in een toenemend aantal gevallen spelen ze een centrale rol in de controle van genexpressie",
"Regulerende mechanismen waarbij de expressie van een CUT betrokken is, zijn divers en omvatten attenuatie, transcriptie-interferentie en alternatieve keuze van transcriptiestartplaatsen",
"Het is goed vastgesteld dat eukaryote genomen alomtegenwoordige transcriptie vertonen die cryptische onstabiele transcripties (CUTs) produceren.",
"We tonen aan dat verlies van abp1 resulteert in de accumulatie van CUTs, die worden gericht voor afbraak via het exosoompad.",
"Hier tonen we, door de overlap van stabiele (SUTs, stabiele ongeannoteerde transcripties) en onstabiele (CUTs, cryptische onstabiele transcripties) transcripties met eiwit-coderende genen te onderzoeken, aan dat de voorspelde Nrd1- en Nab3-bindingsplaatssequenties in verschillende frequenties voorkomen.",
"Cryptische onstabiele transcripties (CUTs) zijn een grotendeels onontdekte klasse van door het nucleaire exosoom afgebroken, niet-coderende RNA's in gist. Er is veel discussie over of CUT-transcriptie een functionele rol in de cel heeft of dat CUTs ruis in het gisttranscriptoom vertegenwoordigen.",
"Door configuraties van gen-CUT-paren te identificeren, waarbij CUT-expressie afkomstig is van de 5' of 3' nucleosoomvrije regio van het gen, observeerden we verschillende genexpressietrends die specifiek zijn voor deze configuraties en die het meest voorkwamen bij aanwezigheid van geconserveerde CUT-expressie.",
"Verder bieden we de eerste beoordeling van geconserveerde CUT-expressie in gist en tonen we globaal mogelijke modi van CUT-gebaseerde regulatie van genexpressie aan.",
"De meeste van deze ncRNA's (ncRNAs) worden beëindigd via het Nrd1-afhankelijke pad en snel afgebroken door het nucleaire exosoom en worden cryptische onstabiele transcripties (CUTs) genoemd.",
"Sommigen worden Cryptische Onstabiele Transcripties (CUTs) genoemd omdat ze worden beëindigd door het Nrd1-Nab3-Sen1-pad en vervolgens snel worden afgebroken door het nucleaire exosoom.",
"Cryptische onstabiele transcripties (CUTs) zijn korte, 300-600-nucleotide (nt) RNA-polymerase II transcripties die snel worden afgebroken door het nucleaire RNA-exosoom in gist.",
"ACHTERGROND Cryptische onstabiele transcripties (CUTs) zijn een grotendeels onontdekte klasse van door het nucleaire exosoom afgebroken, niet-coderende RNA's in gist.",
"Cryptische onstabiele transcripties (CUTs) zijn een grotendeels onontdekte klasse van door het nucleaire exosoom afgebroken, niet-coderende RNA's in gist.",
"Bekende doelwitten van het nucleaire exosoom zijn korte (<1000 bp) RNAPII-transcripties zoals kleine niet-coderende RNA's (snRNA's), cryptische onstabiele transcripties (CUTs) en sommige stabiele ongeannoteerde transcripties (SUTs) die worden beëindigd door een Nrd1-, Nab3- en Sen1 (NNS)-afhankelijk mechanisme."
] | 944 | 927 |
2,291 | Hoeveel Groucho-gerelateerde genen (GRG) zijn er in het muizengenoom aanwezig? | Het beslaat ongeveer 7 kb op chromosoom 10 en bestaat uit zeven exonen. De groucho-gerelateerde genen (Grg) van de muis omvatten ten minste vier familieleden. | [
"Hier beschrijven we de genomische organisatie van het muis Grg-gen. Het beslaat ongeveer 7 kb op chromosoom 10 en bestaat uit zeven exonen.",
"Het Grg-gen codeert voor een eiwit van 197 aminozuren dat homolog is aan het amino-terminale domein van het product van het groucho-gen van het Drosophila Enhancer of split-complex.",
"Het muis Grg-gen codeert voor een nucleair eiwit van 197 aminozuren dat homolog is aan het amino-terminale domein van het product van het groucho (gro) gen van het Drosophila Enhancer of split-complex.",
"De groucho-gerelateerde genen (Grg) van de muis omvatten ten minste vier familieleden.",
"De muriene grg (Groucho-gerelateerd gen) producten worden verondersteld te interageren met transcriptiefactoren en transcriptie te onderdrukken, waardoor celproliferatie en differentiatie worden gereguleerd.",
"We hebben cDNA's geïsoleerd die meerdere leden van muriene groucho-homologen vertegenwoordigen, aangeduid als Grg voor groucho-gerelateerde genen."
] | 167 | 162 |
2,292 | Wat is het werkingsmechanisme van galunisertib? | Galunisertib is een remmer van de type I kinase van de receptor voor transformeerende groeifactor-β (TGF-βRI). Het werd getest voor de behandeling van solide tumoren, waaronder glioblastoom en neuroblastoom, en leverfibrose. | [
"Blokkade van TGFβR1 met Galunisertib (LY2157299) versterkt de anti-neuroblastoomactiviteit van het anti-GD2 antilichaam Dinutuximab (ch14.18) met natuurlijke killercellen.",
"Galunisertib, een remmer van TGFβR1, werd onderzocht op zijn vermogen om de werkzaamheid van dinutuximab in combinatie met ex vivo geactiveerde menselijke NK (aNK) cellen tegen neuroblastoom te verbeteren.",
"Bijgevolg is blokkade van TGFβ-signaaltransductie met galunisertib in combinatie met het anti-GD2 mAb dinutuximab plus adoptief overgedragen NK-cellen een veelbelovend middel voor de behandeling van neuroblastoom.",
"De kleine molecuul kinase-remmer galunisertib, gericht op de TGF-β receptor I (TGF-βRI), remt de progressie van HCC in preklinische modellen en toont veelbelovende effecten in lopende klinische onderzoeken.",
"Galunisertib, een remmer van Transforming growth factor-βRI (TGF-βRI) kinase, blokkeert TGF-β-gemedieerde tumorgroei in glioblastoom.",
"Galunisertib, een remmer van de TGF-β receptor type I kinase, is een potentiële kandidaat voor de behandeling van leverfibrose.",
"Een xenograftmodel leverde aanvullende bevestiging voor de combinatie van TGF-β remmer (Galunisertib) en autophagieremmer (CQ) om tumorgroei beter \"uit te schakelen\".",
"Verder kan het richten op TGF-β/Smad3-signaaltransductie met galunisertib, een remmer van de TGF-β type I receptor kinase, de secretie van miR-21 door gliomacellen verminderen.",
"Dispositie en metabolisme van [C]-galunisertib, een TGF-βRI kinase/ALK5 remmer, na orale toediening bij gezonde proefpersonen en mechanistische voorspelling van het effect van itraconazol op de farmacokinetiek van galunisertib.",
"De combinatie van galunisertib, een remmer van de transformeerende groeifactor (TGF)-β receptor (R)1 kinase, en lomustine vertoonde antitumoractiviteit in muismodellen van glioblastoom.",
"1. De disposities en het metabolisme van galunisertib (LY2157299 monohydraat, een TGF-βRI kinase/ALK5 remmer) werden gekarakteriseerd na een enkele orale dosis van 150 mg [C]-galunisertib (100 µCi) aan zes gezonde menselijke proefpersonen.",
"Effecten van remming van TGF-beta signalering met galunisertib (LY2157299) in modellen van hepatocellulair carcinoom en in ex vivo hele tumorweefselmonsters van patiënten.",
"Klinische ontwikkeling van galunisertib (LY2157299 monohydraat), een kleine molecuul remmer van het transformeerende groeifactor-beta signaalpad.",
"Galunisertib (LY2157299), een selectieve ATP-mimetische remmer van TGF-β receptor I (TGF-βRI), is de enige bekende remmer van het TGF-β pad.",
"Galunisertib (LY2157299) is een selectieve ATP-mimetische remmer van de activatie van TGF-β receptor (TβR)-I die momenteel klinisch wordt onderzocht bij patiënten met hepatocellulair carcinoom (HCC).",
"Galunisertib (LY2157299 monohydraat) is een orale kleine molecuul remmer van de TGF-β receptor I kinase die specifiek de fosforylering van SMAD2 downreguleert, waardoor de activatie van het canonieke pad wordt opgeheven.",
"Galunisertib, een remmer van Transforming growth factor-βRI (TGF-βRI) kinase, blokkeert TGF-β-gemedieerde tumorgroei in glioblastoom.",
"De kleine molecuul kinase-remmer galunisertib, gericht op de TGF-β receptor I (TGF-βRI), remt de progressie van HCC in preklinische modellen en toont veelbelovende effecten in lopende klinische onderzoeken.",
"Galunisertib, een remmer van de TGF-β receptor type I kinase, is een potentiële kandidaat voor de behandeling van leverfibrose.",
"ACHTERGROND De combinatie van galunisertib, een remmer van de transformerende groeifactor (TGF)-β receptor (R)1 kinase, en lomustine vertoonde antitumoractiviteit in muismodellen van glioblastoom."
] | 467 | 474 |
2,293 | Wat is een coligo? | Coligos zijn gecirculariseerde oligodeoxynucleotiden | [
"Gecirculariseerde oligonucleotiden, of coligos,",
"gecirculariseerde oligodeoxynucleotiden (coligos)"
] | 12 | 12 |
2,294 | Wat is de relatie tussen fyn kinase en tau? | De Fyn kinase interageert met tau. De geactiveerde Fyn kinase hyperfosforyleert het tau-eiwit. | [
"Fyn is een aantrekkelijk doelwit voor AD-therapieën, niet alleen vanwege de activatie door Aβ via het cellulair prioneiwit, maar ook vanwege de bekende interactie met tau, die op unieke wijze de twee belangrijkste pathologieën bij AD verbindt.",
"Dit PrPC-Aβo-complex activeert Fyn kinase, die op zijn beurt tau (P-Tau) hyperfosforyleert, wat resulteert in synaptische disfunctie, neuronverlies en cognitieve tekorten."
] | 79 | 77 |
2,295 | Wat zijn de belangrijkste manifestaties van het Ohdo-syndroom? | Ernstige verstandelijke beperking, afwezige of onvoldoende taal, skeletmanifestaties waaronder bilaterale patellaluxaties. | [
"Deze bevinding, samen met de fenotypische analogieën die gedeeld worden met dragers van de c.5898dupC-mutatie, suggereert het bestaan van een vierde MED12-gerelateerde aandoening, gekenmerkt door ernstige verstandelijke beperking, afwezige of onvoldoende taal en mildere klinische manifestaties bij heterozygoten.",
"Skeletmanifestaties bij het Ohdo-syndroom: een geval met bilaterale patellaluxaties.",
"We rapporteren een nieuw geval van het Ohdo-syndroom met bilaterale patellaluxaties waarbij chirurgische interventie is geïndiceerd. Een overzicht van de skeletmanifestaties die in de literatuur over het Ohdo-syndroom zijn gerapporteerd, toont aan dat gewrichtslaxiteit en skeletafwijkingen belangrijke aspecten van het fenotype zijn.",
"We bevestigen het bestaan van deze aandoening die, hoewel vergelijkbaar met het Ohdo-syndroom, lijkt te zijn een onafhankelijke klinische entiteit.",
"We rapporteren een nieuw geval van het Ohdo-syndroom met bilaterale patellaluxaties waarbij chirurgische interventie is geïndiceerd.",
"Skeletmanifestaties bij het Ohdo-syndroom: een geval met bilaterale patellaluxaties.",
"Deze bevinding, samen met de fenotypische analogieën die gedeeld worden met dragers van de c.5898dupC-mutatie, suggereert het bestaan van een vierde MED12-gerelateerde aandoening, gekenmerkt door ernstige verstandelijke beperking, afwezige of onvoldoende taal en mildere klinische manifestaties bij heterozygoten."
] | 190 | 183 |
2,296 | Welk algoritme wordt gebruikt door de UCSC Genome Browser? | De UCSC Genome Browser organiseert gegevens en annotaties (tracks genoemd) rond de referentie-sequenties of conceptassemblages van vele eukaryote genomen en presenteert deze via een krachtige webgebaseerde grafische interface. De database is geoptimaliseerd om snelle interactieve prestaties te ondersteunen met de webgebaseerde UCSC Genome Browser, een tool gebouwd bovenop de database voor snelle visualisatie en het opvragen van gegevens op vele niveaus. De annotaties voor een gegeven genoom worden in de browser weergegeven als een reeks tracks uitgelijnd met de genomische sequentie. Sequentiegegevens en annotaties kunnen ook worden bekeken in een tekstgebaseerd tabelvormig formaat of worden gedownload als tab-gescheiden platte bestanden. | [
"De UCSC Genome Browser organiseert gegevens en annotaties (tracks genoemd) rond de referentie-sequenties of conceptassemblages van vele eukaryote genomen en presenteert deze via een krachtige webgebaseerde grafische interface.",
"De database is geoptimaliseerd om snelle interactieve prestaties te ondersteunen met de webgebaseerde UCSC Genome Browser, een tool gebouwd bovenop de database voor snelle visualisatie en het opvragen van gegevens op vele niveaus. De annotaties voor een gegeven genoom worden in de browser weergegeven als een reeks tracks uitgelijnd met de genomische sequentie. Sequentiegegevens en annotaties kunnen ook worden bekeken in een tekstgebaseerd tabelvormig formaat of worden gedownload als tab-gescheiden platte bestanden.",
"De University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Browser (genome.ucsc.edu) is een populair webgebaseerd hulpmiddel om snel een opgevraagd gedeelte van een genoom op elke schaal weer te geven, vergezeld van een reeks uitgelijnde annotatie \"tracks\".",
"De databasetabellen die ten grondslag liggen aan de Genome Browser-tracks kunnen worden bekeken, gedownload en gemanipuleerd met een andere webgebaseerde applicatie, de UCSC Table Browser.",
"De University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Browser is een populair webgebaseerd hulpmiddel om snel een opgevraagd gedeelte van een genoom op elke schaal weer te geven, vergezeld van een reeks uitgelijnde annotatie \"tracks\".",
"De functie Saved Session stelt gebruikers in staat om aangepaste weergaven op te slaan en te delen, wat de bruikbaarheid van het systeem voor het organiseren van meerdere denkstromen vergroot. Binary Alignment/Map (BAM), Variant Call Format en de Personal Genome Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) dataformaten zijn nuttig voor het visualiseren van een groot sequencing-experiment (whole-genome of whole-exome), waarbij de verschillen tussen de dataset en de referentie-assemblage grafisch kunnen worden weergegeven. Ondersteuning voor high-throughput sequencing strekt zich uit tot compacte, geïndexeerde dataformaten, zoals BAM, bigBed en bigWig, waardoor snelle visualisatie van grote datasets van RNA-seq en ChIP-seq experimenten via lokale hosting mogelijk is.",
"De databasetabellen die ten grondslag liggen aan de Genome Browser-tracks kunnen worden bekeken, gedownload en gemanipuleerd met een andere webgebaseerde applicatie, de UCSC Table Browser.",
"De databasetabellen die ten grondslag liggen aan de Genome Browser-tracks kunnen worden bekeken, gedownload en gemanipuleerd met een andere webgebaseerde applicatie, de UCSC Table Browser.",
"De databasetabellen die ten grondslag liggen aan de Genome Browser-tracks kunnen worden bekeken, gedownload en gemanipuleerd met een andere webgebaseerde applicatie, de UCSC Table Browser.",
"De vergelijkende genomica-annotaties in de browser omvatten paargewijze uitlijningen, die helpen bij het identificeren van orthologe regio's tussen soorten, en conservatietracks die maten van evolutionaire conservatie tonen tussen sets van meervoudig uitgelijnde soorten, waarbij regio's van het genoom worden benadrukt die mogelijk functioneel belangrijk zijn.",
"De Genome Bioinformatics-groep heeft verschillende tools en methodologieën ontwikkeld in haar studie van vergelijkende genomica, waarvan vele zijn opgenomen in de UCSC Genome Browser (http://genome.ucsc.edu), een gebruiksvriendelijke online tool voor het bladeren door genomische gegevens en uitgelijnde annotatie \"tracks\" in één venster.",
"Dit protocol beschrijft hoe de UCSC Genome Browser te gebruiken om geselecteerde tracks te visualiseren op gespecificeerde genomische regio's, de gegevens en annotaties te downloaden voor verdere analyse, en meervoudige sequentie-uitlijningen en hun conservatiescores op te halen.",
"Deze eenheid beschrijft hoe de Genome Browser en Table Browser te gebruiken voor genoomanalyse, het downloaden van de onderliggende databasetabellen, en het creëren en weergeven van aangepaste annotatietracks.",
"De University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Browser (genome.ucsc.edu) is een populair webgebaseerd hulpmiddel om snel een opgevraagd gedeelte van een genoom op elke schaal weer te geven, vergezeld van een reeks uitgelijnde annotatie \"tracks\".",
"De University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Bioinformatics-groep heeft verschillende tools en methodologieën ontwikkeld in haar studie van vergelijkende genomica, waarvan vele zijn opgenomen in de UCSC Genome Browser (http://genome.ucsc.edu), een gebruiksvriendelijke online tool voor het bladeren door genomische gegevens en uitgelijnde annotatie \"tracks\" in één venster.",
"Een gerelateerd hulpmiddel, de UCSC Table Browser, biedt een eenvoudige interface voor het opvragen, analyseren en downloaden van de gegevens die ten grondslag liggen aan de Genome Browser-annotatietracks.",
"Sommige van de recent ontwikkelde of verbeterde tracks visualiseren gegevens uit gepubliceerde high-throughput RNA-sequencing studies, de NCBI Conserved Domain Database, sequenties uit pre-genoom sequencing studies, voorspelde gen-grenzen van drie verschillende eiwit-genvoorspellingsalgoritmen, tRNAscan-SE genvoorspellingen met RNA secundaire structuren en CRISPR locus voorspellingen."
] | 759 | 769 |
2,297 | Welke aminozuurpositie in het menselijke CREB-eiwit is gefosforyleerd? | pCREB is gefosforyleerd op zijn Serine 133. | [
" pCREB(Ser133) als modelsysteem",
"CREB en zijn geactiveerde vorm pCREB-Ser(133) (pCREB)"
] | 28 | 23 |
2,298 | Welk gen is de paralog van gist UPC2? | de gerelateerde transcriptiefactoren Ecm22 en Upc2 spelen een cruciale rol in de filamentatie van Saccharomyces cerevisiae. | [
"Hier onderzoeken we de rol van de gerelateerde transcriptiefactoren Ecm22 en Upc2 in de filamentatie van Saccharomyces cerevisiae.",
"De zinkcluster-eiwitten Upc2 en Ecm22 bevorderen filamentatie in Saccharomyces cerevisiae via sterol-biosynthese-afhankelijke en -onafhankelijke routes.",
"Upc2, een zinkcluster transcriptiefactor, is een regulator van ergosterol-biosynthese in gist.",
"De zinkcluster-eiwitten Ecm22, Upc2, Sut1 en Sut2 zijn aanvankelijk geïdentificeerd als regulatoren van sterolimport in de knopvormende gist Saccharomyces cerevisiae.",
"Giststudies hebben een 7-bp consensus sterol-respons element (SRE) gedefinieerd dat gemeenschappelijk is voor genen betrokken bij sterol-biosynthese en twee transcriptiefactoren, Upc2 en Ecm22, die de transcriptie van sterol-biosynthetische genen aansturen.",
"Ecm22 en Upc2 regelen positief de expressie van FHN1, NPR1, PRR2 en sterol-biosynthese genen.",
"RNA-seq analyse toont aan dat de hypoxische regulatie van sterolsynthesegenen in Y. lipolytica voornamelijk wordt gemedieerd door Upc2.",
"Echter, in gisten zoals Saccharomyces cerevisiae en Candida albicans wordt sterolsynthese gereguleerd door Upc2, een niet-verwante transcriptiefactor met een Gal4-type zinkvinger.",
"Recombinante endogene promotorstudies tonen aan dat de UPC2 anaerobe AR1b-elementen in trans werken om de expressie van ergosterolgenen te reguleren.",
"Een dergelijke factor zou het zoogdier-equivalent kunnen zijn van het genproduct van UPC2.",
"Gelijktijdige deletie van ECM22 en UPC2 evenals mutatie van de drie Ste12-bindingsplaatsen in de PRM1-promotor schaft de basale en feromoon-geïnduceerde PRM1-expressie volledig af, wat aangeeft dat Ste12 en Ecm22/Upc2 de transcriptie van PRM1 via verschillende routes controleren.",
"Ecm22 en Upc2 reguleren positief de basale expressie van PRM1 en PRM4.",
"Onze resultaten geven aan dat Upc2 de UPC2 AR1b-elementen moet bezetten om inductie van ERG-genexpressie te laten plaatsvinden.",
"Een gistmutant (upc2-1) met een defect in de aerobe uitsluiting van sterolen vertoonde verhoogde gevoeligheid voor LiCl en NaCl.",
"De AR1b-elementen zijn absoluut noodzakelijk voor auto-inductie van UPC2-genexpressie en eiwit en vereisen Upc2 en Ecm22 voor hun functie.",
"Secretie van apoE werd alleen bereikt door gebruik van een mutant (upc2) giststam met het fenotype van verhoogde opname en intracellulaire esterificatie van exogeen cholesterol.",
"Gaschromatografische analyse van de niet-saponificeerbare fracties van de verschillende stammen toonde aan dat het belangrijkste sterol voor alle YLR228c- en UPC2-combinaties ergosterol was, het consensus giststerol.",
"In de pathogene gist Candida albicans is aangetoond dat de zinkcluster transcriptiefactor Upc2p de expressie van ERG11 en andere genen betrokken bij ergosterol-biosynthese reguleert bij blootstelling aan azool-antischimmelmiddelen.",
"Door de genexpressieprofielen van het fluconazol-resistente isolaat te vergelijken met stammen die wildtype en gemuteerde UPC2-allelen dragen, identificeerden we doelgenen die door Upc2p worden gecontroleerd."
] | 426 | 393 |
2,299 | Waar is het enzym PM20D1 gelokaliseerd? | PM20D1 is verrijkt in UCP1+ adipocyten | [
"we identificeren een uitgescheiden enzym, peptidase M20 domein bevattend 1 (PM20D1), dat verrijkt is in UCP1(+) versus UCP1(-) adipocyten",
"Een uitgescheiden enzym, PM20D1, verrijkt in UCP1+ adipocyten, vertoont katalytische en hydrolytische activiteit om reversibel N-acyl aminozuren te vormen."
] | 48 | 47 |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.