id int64 0 4.72k | body stringlengths 12 227 | answer stringlengths 2 3.35k | relevant_passages listlengths 1 83 | approx_word_count_original int64 10 3.79k | approx_word_count_translated int64 8 2.21k |
|---|---|---|---|---|---|
2,300 | Welke test wordt gebruikt om kleurensynesthesie te diagnosticeren? | Een gestandaardiseerde testbatterij voor de studie van synesthesie. We gebruikten synesthetische versies van de Stroop-test met gekleurde letters en cijfers die werden gepresenteerd in het rechter- of linker visuele veld van vierendertig synestheten. Beoordeling van de hemisferische lateraliteit van grafeem-kleur synesthesie met Stroop-achtige tests. | [
"Om dit tekort te verhelpen hebben we de Synesthesia Battery ontwikkeld. Deze uniforme verzameling tests is gratis online toegankelijk (http://www.synesthete.org). Het bestaat uit een vragenlijst en verschillende online softwareprogramma's, en testresultaten zijn onmiddellijk beschikbaar voor gebruik door synestheten en uitgenodigde onderzoekers.",
"Een gestandaardiseerde testbatterij voor de studie van synesthesie.",
"De toepassing en resultaten van consistentie-, psychofysische en Stroop-tests worden later gepresenteerd.",
"Deze studie heeft als doel de meest betrouwbare manier te vinden om grafeem-kleur synesthesie te diagnosticeren op basis van het maximaliseren van sensitiviteit (d.w.z. het vermogen van een test om echte synestheten te identificeren) en specificiteit (d.w.z. het vermogen van een test om echte niet-synestheten te identificeren).",
"Beoordeling van de hemisferische lateraliteit van grafeem-kleur synesthesie met Stroop-achtige tests",
"We gebruikten synesthetische versies van de Stroop-test met gekleurde letters en cijfers die werden gepresenteerd in het rechter- of linker visuele veld van vierendertig synestheten."
] | 188 | 189 |
2,301 | Hoe beïnvloedt verhoogde GDF15 het lichaamsgewicht? | Bij mensen correleert verhoogde GDF15 met gewichtsverlies, en de toediening van GDF15 aan muizen met obesitas vermindert het lichaamsgewicht, althans gedeeltelijk, door de voedselinname te verlagen. | [
"Bij mensen correleert verhoogde GDF15 met gewichtsverlies, en de toediening van GDF15 aan muizen met obesitas vermindert het lichaamsgewicht, althans gedeeltelijk, door de voedselinname te verlagen. De mechanismen waardoor GDF15 het lichaamsgewicht verlaagt, zijn nog slecht begrepen, omdat de bijbehorende receptor voor GDF15 onbekend is. Hier tonen we aan dat recombinant GDF15 gewichtsverlies induceert bij muizen die een vetrijk dieet krijgen en bij niet-menselijke primaten met spontane obesitas.",
"Gfral wordt tot expressie gebracht in neuronen van het area postrema en de nucleus van de solitary tract bij muizen en mensen, en genetische verwijdering van de receptor maakt het vermogen van GDF15 om de voedselinname en het lichaamsgewicht bij muizen te verlagen ongedaan."
] | 141 | 141 |
2,302 | Wat zijn de beste methoden voor de voorspelling van circulair RNA (circRNA)? | Een circRNA-voorspellingssoftware voor planten. Circulair RNA-profiel in gliomen onthuld door identificatietool UROBORUS. Talrijke algoritmen die de expressie van circRNA-genoomwijd detecteren uit RNA-sequencinggegevens zijn de afgelopen jaren ontwikkeld, maar er is weinig overlap in hun voorspellingen en er is geen duidelijke gouden standaardmethode om de nauwkeurigheid van deze algoritmen te beoordelen. MiARma-Seq: een uitgebreid hulpmiddel voor miRNA-, mRNA- en circRNA-analyse. Hier gebruiken we gangbare RNAseq-datasets om de output van vijf verschillende algoritmen te onderzoeken en te vergelijken; circRNA_finder, find_circ, CIRCexplorer, CIRI en MapSplice, en evalueren de niveaus van echte en fout-positieve circRNAs op basis van RNase R-resistentie. | [
"Talrijke algoritmen die worden gebruikt om genoomwijde circRNA-expressie uit RNA-sequencing (RNA-seq) gegevens te detecteren, zijn de afgelopen jaren ontwikkeld, maar er is weinig overlap in hun voorspellingen en er is geen duidelijke gouden standaardmethode om de nauwkeurigheid van deze algoritmen te beoordelen.",
"We ontwikkelden de software tandem, DCC en CircTest. DCC gebruikt output van de STAR-read mapper om systematisch back-splice junctions te detecteren in next-generation sequencing data.",
"Circulair RNA-profiel in gliomen onthuld door identificatietool UROBORUS.",
"In dit werk hebben we een computationele pijplijn ontwikkeld genaamd UROBORUS om circRNAs te detecteren in totale RNA-seq data.",
"Hier gebruiken we gangbare RNAseq-datasets om de output van vijf verschillende algoritmen te onderzoeken en te vergelijken; circRNA_finder, find_circ, CIRCexplorer, CIRI en MapSplice, en evalueren de niveaus van echte en fout-positieve circRNAs op basis van RNase R-resistentie.",
"miARma-Seq: een uitgebreid hulpmiddel voor miRNA-, mRNA- en circRNA-analyse.",
"PcircRNA_finder: een software voor circRNA-voorspelling in planten.",
"Een circRNA-voorspellingssoftware voor planten (genoemd PcircRNA_finder) werd ontwikkeld die gevoeliger is in het detecteren van circRNAs dan andere veelgebruikte programma's (zoals find_circ en CIRCexplorer).",
"Onlangs werd circulair RNA (circRNA), een klasse van endogene niet-proteïne-coderende RNA's die een circulaire lus bevatten, gevonden die meerdere biologische effecten vertoont.",
"RESULTATEN Een circRNA-voorspellingssoftware voor planten (genoemd PcircRNA_finder) werd ontwikkeld die gevoeliger is in het detecteren van circRNAs dan andere veelgebruikte programma's (zoals find_circ en CIRCexplorer). Gebaseerd op analyse van gesimuleerde en echte rRNA-/RNAase R RNA-Seq data van Arabidopsis thaliana en rijst biedt PcircRNA_finder een meer uitgebreide, gevoelige en precieze voorspellingsmethode voor plantencircRNAs."
] | 370 | 342 |
2,303 | Wat wordt geremd door het medicijn rilotumumab? | Rilotumumab is een volledig humaan monoklonaal antilichaam dat selectief het hepatocytengroeifactor (HGF) target. Het wordt gebruikt voor de behandeling van kanker. | [
"De hepatocytengroeifactorreceptor (MET) werd gericht bij onbehandelde patiënten in een fase III-studie met MoAb rilotumumab, met of zonder chemotherapie, maar de studie werd gestopt vanwege een oversterfte in de rilotumumab-arm.",
"DOELSTELLINGEN: Rilotumumab is een volledig humaan monoklonaal antilichaam dat wordt onderzocht voor de behandeling van MET-positieve maagkanker.",
"Het hepatocytengroeifactor (HGF) bindende antilichaam rilotumumab (AMG102) werd aangepast voor gebruik als een 89Zr-gebaseerde immuno-PET beeldvormingsagent om niet-invasief de lokale niveaus van HGF-eiwit in tumoren te bepalen.",
"Bovendien zijn negatieve studiedata gepubliceerd voor rilotumumab en ficlatuzumab, die beiden de binding van hepatocytengroeifactor aan de mesenchymale-epitheliale transitie (MET) receptor blokkeren.",
"In deze fase 1/2-studie werd rilotumumab (een anti-HGF antilichaam) gecombineerd met erlotinib geëvalueerd bij patiënten met gemetastaseerde, eerder behandelde niet-kleincellige longkanker.",
"ACHTERGROND: Rilotumumab is een volledig humaan monoklonaal antilichaam dat selectief de ligand van de MET-receptor, hepatocytengroeifactor (HGF), target.",
"Rilotumumab is een experimenteel, volledig humaan, monoklonaal antilichaam immunoglobuline G2 tegen hepatocytengroeifactor (HGF) dat de binding van HGF aan zijn receptor MET blokkeert en heeft trends naar verbeterde overleving laten zien in een fase 2 klinische studie bij maagkanker.",
"DOEL Rilotumumab is een experimenteel, volledig humaan monoklonaal antilichaam tegen hepatocytengroeifactor.",
"DOELSTELLING Om de werkzaamheid, veiligheid, biomarkers en farmacokinetiek van rilotumumab, een volledig humaan monoklonaal antilichaam tegen hepatocytengroeifactor (HGF)/scatter factor, gecombineerd met mitoxantron en prednison (MP) te evalueren bij patiënten met castratieresistente prostaatkanker (CRPC).",
"ACHTERGROND Rilotumumab is een volledig humaan monoklonaal antilichaam dat selectief de ligand van de MET-receptor, hepatocytengroeifactor (HGF), target."
] | 284 | 253 |
2,304 | Welke subeenheid van RNA-polymerase II draagt RNA-splitsingsactiviteit? | De eukaryote transcriptiefactor TFIIS versterkt de elongatie en de splitsingsactiviteit van het pas gesynthetiseerde transcript van RNA-polymerase II in een vastgelopen elongatiecomplex. | [
"Daarentegen is Pol II volledig beschermd door associatie met de splitsingsstimulerende factor TFIIS, die een snelle herstel mogelijk maakt van elke diepte door RNA-splitsing.",
"Dit mechanisme wordt ook gebruikt door transcriptiefactor IIS, een factor die aan Pol II kan binden en sterke RNA-splitsing kan induceren.",
"Dit gemuteerde enzym kan reageren op SII voor transcriptie-doorloop en SII-geactiveerde splitsing van pas gesynthetiseerd RNA uitvoeren.",
"In vitro, in afwezigheid van TFIIS, vertoonden het gezuiverde wt-polymerase en de twee gemuteerde polymerases een vergelijkbare specifieke activiteit in polymerisatie, doorloop bij intrinsieke transcriptie-arrestatieplaatsen en splitsing van pas gesynthetiseerd RNA. In tegenstelling tot het wt-polymerase werden beide gemuteerde polymerases niet gestimuleerd door toevoeging van een 3-voudige molaire overmaat van TFIIS in assays van promotor-onafhankelijke transcriptie, doorloop of splitsing.",
"In vitro karakterisering van gemuteerd gist RNA-polymerase II met verminderde binding aan elongatiefactor TFIIS.",
"Het zinklint-dipeptide Asp-Glu van transcriptiefactor TFIIS is cruciaal voor stimulatie van elongatie en RNA-splitsing door RNA-polymerase II.",
"De eukaryote transcriptiefactor TFIIS versterkt de elongatie en de splitsingsactiviteit van het pas gesynthetiseerde transcript van RNA-polymerase II in een vastgelopen elongatiecomplex.",
"Door gerichte mutagenese hebben we aangetoond dat de onveranderlijke residuen Asp-261 en Glu-262 van het nucleïnezuur-bindende TFIIS Zn-lint cruciaal zijn voor stimulatie van zowel elongatie als RNA-splitsingsactiviteiten van RNA-polymerase II.",
"Zeer gezuiverd gist RNA-polymerase II is in staat transcript-hydrolyse uit te voeren in afwezigheid van TFIIS.",
"De eukaryote transcriptiefactor TFIIS versterkt de elongatie en de splitsingsactiviteit van het pas gesynthetiseerde transcript van RNA-polymerase II in een vastgelopen elongatiecomplex.",
"Door gerichte mutagenese hebben we aangetoond dat de onveranderlijke residuen Asp-261 en Glu-262 van het nucleïnezuur-bindende TFIIS Zn-lint cruciaal zijn voor stimulatie van zowel elongatie als RNA-splitsingsactiviteiten van RNA-polymerase II.",
"De transcriptie-elongatiefactor S-II, ook aangeduid als TFIIS, stimuleert de intrinsieke splitsingsactiviteit van het pas gesynthetiseerde transcript van RNA-polymerase II.",
"RNA-polymerase II zelf kan een Zn-lint bevatten, aangezien de 15-kDa subeenheid van de polymerase een sequentie bevat die goed overeenkomt met de TFIIS Zn-lint sequentie, inclusief een vergelijkbaar geplaatste paar zure residuen.",
"Betrokkenheid van de vaccinia RNA-polymerase subeenheid rpo30 bij de transcript-verkortingsreactie wordt gesuggereerd op basis van sequentiegelijkheid van rpo30 met het mammaliene eiwit SII (TFIIS), een extrinsieke transcriptiefactor die vereist is voor splitsing van pas gesynthetiseerd RNA door RNA-polymerase II (Reines, D. (1991) J. Biol.",
"De RNA-splitsingsactiviteit van RNA-polymerase III wordt gemedieerd door een essentiële TFIIS-achtige subeenheid en is belangrijk voor transcriptiebeëindiging.",
"In het resulterende model van Pol I bereikt het C-terminale lint (C-lint) domein van A12.2 de actieve plaats via de polymerasepoort, net als het C-lint van de Pol II splitsingsfactor TFIIS, wat verklaart waarom de intrinsieke RNA-splitsingsactiviteit van Pol I sterk is, in tegenstelling tot de zwakke splitsingsactiviteit van Pol II.",
"De amino- en carboxylregio's van C11 zijn homolog aan domeinen van de Pol II subeenheid Rpb9p, respectievelijk aan de Pol II elongatie- en RNA-splitsingsfactor TFIIS."
] | 508 | 471 |
2,305 | Wat is het transcriptoom van RNA-polymerase III? | RNA-polymerase III (Pol III) transcribeert een beperkte set korte genen in eukaryoten die overvloedige kleine RNA's produceren, voornamelijk tRNA. Het oorspronkelijk gedefinieerde Pol III-transcriptoom van gist lijkt uit te breiden door de toepassing van nieuwe methoden. Nieuw geïdentificeerde Pol III-transcripten omvatten kleine nucleolaire RNA's, microRNA's, korte interspersed nucleaire element-gecodeerde of tRNA-afgeleide RNA's en nieuwe klassen van ncRNA die significante sequentiecomplementariteit kunnen vertonen met eiwit-coderende genen en daardoor mogelijk hun expressie reguleren. | [
"RNA-polymerase III (Pol III) transcribeert een beperkte set korte genen in eukaryoten die overvloedige kleine RNA's produceren, voornamelijk tRNA. Het oorspronkelijk gedefinieerde Pol III-transcriptoom van gist lijkt uit te breiden door de toepassing van nieuwe methoden.",
"De rol van RNA-polymerase (Pol) III in eukaryote transcriptie wordt gewoonlijk beschouwd als beperkt tot een kleine set hooguitgedrukte, housekeeping niet-eiwit-coderende (nc)RNA-genen.",
"Nieuw geïdentificeerde Pol III-transcripten omvatten kleine nucleolaire RNA's, microRNA's, korte interspersed nucleaire element-gecodeerde of tRNA-afgeleide RNA's en nieuwe klassen van ncRNA die significante sequentiecomplementariteit kunnen vertonen met eiwit-coderende genen en daardoor mogelijk hun expressie reguleren.",
"RNA-polymerase III (Pol III) transcribeert kleine niet-vertalende RNA's, zoals tRNA's."
] | 197 | 176 |
2,306 | Hoeveel PML-isoformen bestaan er in het menselijk genoom? | PML, de organisator van nucleaire lichamen (NB's), wordt tot expressie gebracht in verschillende isoformen aangeduid als PMLI tot VII, die verschillen in hun C-terminale regio door alternatieve splicing van een enkel gen. | [
"De PML-isoformen die het meest gevoelig zijn voor virusinfectie komen nauw overeen met die welke recentelijk zijn geïdentificeerd als covalent geconjugeerd aan PIC1.",
"Met behulp van een paneel van verschillende PML-isoformen tonen we specifieke co-localisatie aan tussen de E6-eiwitten en PML-isoformen I-IV, maar niet met PML-isoformen V en VI.",
"PML-isoformen I en II nemen deel aan PML-afhankelijke beperking van HSV-1-replicatie.",
"We rapporteren dat individuele expressie van PML-isoformen I en II gedeeltelijk de toename in ICP0-null mutant HSV-1 plaquevorming die optreedt in PML-gedepleteerde cellen, terugdraait.",
"PML, de organisator van nucleaire lichamen (NB's), wordt tot expressie gebracht in verschillende isoformen aangeduid als PMLI tot VII, die verschillen in hun C-terminale regio door alternatieve splicing van een enkel gen.",
"Met behulp van een bioluminescentie resonantie energieoverdracht (BRET)-assay in levende cellen, vonden we dat As₂O₃ de SUMOylatie en interactie met RNF4 van nucleaire PML-isoformen (I tot VI) versterkte.",
"PML is het structurele onderdeel van PML-nucleaire lichamen en heeft verschillende nucleaire splice-isoformen die een gemeenschappelijke N-terminale regio delen maar verschillen in hun C-terminale uiteinden.",
"Verschillende PML-isoformen worden gegenereerd uit een enkel PML-gen door alternatieve splicing.",
"Zes belangrijke PML-isoformen worden tot expressie gebracht als gevolg van alternatieve splicing, elk coderend voor een unieke C-terminale regio.",
"De biochemische consequenties en oncogene veranderingen van PML-geassocieerde E1B-55K door SUMO-afhankelijke PML-IV en PML-V interactie zijn tot nu toe echter onduidelijk gebleven."
] | 262 | 250 |
2,307 | Gebruiken hoofdkwabben RNA-bewerking minder vaak dan andere soorten? | Uitgebreide messenger RNA-bewerking genereert transcript- en proteïnediversiteit in genen die betrokken zijn bij neurale prikkelbaarheid, zoals eerder beschreven, evenals in genen die deelnemen aan een breed scala van andere cellulaire functies. | [
"Uitgebreide messenger RNA-bewerking genereert transcript- en proteïnediversiteit in genen die betrokken zijn bij neurale prikkelbaarheid, zoals eerder beschreven, evenals in genen die deelnemen aan een breed scala van andere cellulaire functies",
"Door een methode toe te passen die oorspronkelijk was ontworpen om linkage disequilibrium van DNA-mutaties te detecteren, onderzochten we de editomen van tien metazoïsche soorten en detecteerden uitgebreide koppeling van bewerking in Drosophila en hoofdkwabben.",
"We tonen hier aan dat RNA-bewerking bijzonder vaak voorkomt bij gedragsmatig geavanceerde coleoid hoofdkwabben, met tienduizenden evolutionair geconserveerde sites.",
"Zelfs voor de subset van RNA-bewerkingssites die gedeeld worden door diep divergentie hoofdkwab-lijnen, is het primaire effect van nucleaire bewerking een toename - geen afname - van proteïne-divergentie.",
"Coleoid hoofdkwabben (octopus, inktvis en zeekat) zijn actieve, vindingrijke roofdieren met een rijk gedragsrepertoire.",
"We identificeerden honderden hoofdkwab-specifieke genen, waarvan vele verhoogde expressieniveaus vertoonden in gespecialiseerde structuren zoals de huid, de zuignappen en het zenuwstelsel.",
"Onze analyse suggereert dat substantiële uitbreiding van een handvol genfamilies, samen met uitgebreide herstructurering van genoomkoppeling en repetitieve inhoud, een cruciale rol speelde in de evolutie van morfologische innovaties bij hoofdkwabben, inclusief hun grote en complexe zenuwstelsels."
] | 227 | 216 |
2,308 | Wordt er een RNAi-medicijn ontwikkeld voor de behandeling van amyloïdose? | Ja, patisiran is een experimentele RNA-interferentie (RNAi) therapeutische behandeling in ontwikkeling voor de behandeling van erfelijke ATTR (hATTR) amyloïdose. | [
"Patisiran is een experimentele RNA-interferentie (RNAi) therapeutische behandeling in ontwikkeling voor de behandeling van erfelijke ATTR (hATTR) amyloïdose, een progressieve ziekte die gepaard gaat met aanzienlijke invaliditeit, morbiditeit en mortaliteit."
] | 55 | 57 |
2,309 | Aan welke receptor bindt GDF15? | GDF15 bindt specifiek aan GDNF familie receptor α-achtig (GFRAL) | [
"GFRAL is de receptor voor GDF15 en is vereist voor de anti-obesitas effecten van de ligand.",
"Hier tonen we aan dat GDF15 specifiek bindt aan GDNF familie receptor α-achtig (GFRAL) met hoge affiniteit, en dat GFRAL associatie met de coreceptor RET vereist om intracellulaire signalering teweeg te brengen als reactie op GDF15 stimulatie."
] | 62 | 64 |
2,310 | Is er een verband tussen het carcinoïd syndroom en mitralisklepziekte? | Ja, mitralisklepschade werd gerapporteerd bij patiënten met het carcinoïd syndroom. | [
"Andere gelijktijdige operaties omvatten mitralisklep ingreep (11%), aortaklep ingreep (9%), sluiting van een open foramen ovale of atriumseptumdefect (23%), cardiale metastasectomieën of biopsie (4%) en gelijktijdige coronaire bypassoperatie (11%).",
"Hoge circulerende serotonine (carcinoïd syndroom) en serotoninerge geneesmiddelen zijn bekend als veroorzakers van valvulopathie die pathologische kenmerken deelt met DMVD.",
"De chirurgie omvatte tricuspidalisklepvervanging bij alle patiënten, pulmonalisklepvervanging bij 3 en valvectomie bij 7, mitralisklepvervanging bij 6 en reparatie bij 1, aortaklepvervanging bij 4 en reparatie bij 2, CABG bij 2 en sluiting van een open foramen ovale bij 5.",
"Wij rapporteren twee observaties van significante betrokkenheid van het linkerhart bij patiënten met het carcinoïd syndroom, beoordeeld door transthoracale en transoesofageale echocardiografie. Echocardiografische laesies van dit type zijn slechts twee keer gerapporteerd. In de huidige gevallen was er mitralisbetrokkenheid met mitralisinsufficiëntie in het ene geval en een mitro-aortale betrokkenheid met mitralis- en aortainsufficiëntie in het andere.",
"Een observatie van het carcinoïd syndroom bij een 47-jarige vrouw met kwaadaardig carcinoïd van het ileum met metastasen in de lever en rechter eierstok wordt beschreven. Het klinische beeld omvatte diarree, warmteopwellingen, bronchospasmen, hypertensie, hyperserotoninemie, aantasting van de mitralisklep en het linker atrium.",
"Er wordt een geval van carcinoïd syndroom gerapporteerd, voortkomend uit een tumor van de dikke darm met levermetastasen. Klinische kenmerken omvatten hartaandoening met drievoudige klepleasie: tricuspidalisklepinsufficiëntie met stenose, pulmonalisklepstenose en mitralisinsufficiëntie.",
"Hoge circulerende serotonine (carcinoïd syndroom) en serotoninerge geneesmiddelen zijn bekend als veroorzakers van valvulopathie die pathologische kenmerken deelt met DMVD."
] | 272 | 251 |
2,311 | Hoeveel van de menselijke PML-isoformen zijn cytosolisch? | Met een systeem waarin slechts één enkele EYFP-gekoppelde PML-isoform wordt tot expressie gebracht, tonen we aan dat PMLI, PMLII en PMLVI zich ophopen in het cytoplasma na behandeling met arseen, terwijl PMLIII, PMLIV en PMLV dat niet doen. De PML-isoformen die het meest gevoelig zijn voor virusinfectie komen nauw overeen met die welke recentelijk zijn geïdentificeerd als covalent gekoppeld aan PIC1. | [
"Met een systeem waarin slechts één enkele EYFP-gekoppelde PML-isoform wordt tot expressie gebracht, tonen we aan dat PMLI, PMLII en PMLVI zich ophopen in het cytoplasma na behandeling met arseen, terwijl PMLIII, PMLIV en PMLV dat niet doen.",
"De PML-isoformen die het meest gevoelig zijn voor virusinfectie komen nauw overeen met die welke recentelijk zijn geïdentificeerd als covalent gekoppeld aan PIC1."
] | 126 | 126 |
2,312 | Welke pezen zijn aangedaan bij de De Quervain tenosynovitis? | De Quervain tenosynovitis is een veelvoorkomende oorzaak van pijn aan de radiale zijde van de pols. Symptomen ontstaan door een nauwe eerste dorsale compartiment en bijbehorende tendinose van de ingesloten extensor pollicis brevis en/of abductor pollicis longus. | [
"De Quervain tenosynovitis is een veelvoorkomende oorzaak van pijn aan de radiale zijde van de pols. Symptomen ontstaan door een nauwe eerste dorsale compartiment en bijbehorende tendinose van de ingesloten extensor pollicis brevis en/of abductor pollicis longus (APL).",
"De Quervain ziekte van het eerste dorsale compartiment van de pols is een veelvoorkomende polspatologie, pijn ontstaat door weerstand bij het glijden van de abductor pollicis longus en de extensor pollicis brevis pees in het fibro-osseuze kanaal.",
"De Quervain tenosynovitis, die de abductor pollicis longus en extensor pollicis brevis pezen betreft, komt veel vaker voor bij vrouwen dan bij mannen en wordt veroorzaakt door repetitieve bewegingen van de hand zoals grijpen en draaien.",
"De Quervain tenosynovitis, die de abductor pollicis longus en extensor pollicis brevis pezen betreft, komt veel vaker voor bij vrouwen dan bij mannen en wordt veroorzaakt door repetitieve bewegingen van de hand zoals grijpen en draaien."
] | 173 | 188 |
2,313 | Worden RNAi-benaderingen overwogen voor de behandeling van nierbeschadiging? | Ja, RNAi-benaderingen worden overwogen voor de behandeling van nierbeschadiging. | [
"Hierin beschrijven we ammonium-gefunctionaliseerde koolstofnanobuis (fCNT)-gemedieerde transport van siRNA selectief en met hoge efficiëntie naar proximale tubuluscellen van de nier in diermodellen van acute nierbeschadiging (AKI).",
"fCNT verbeterde de levering van siRNA aan tubuluscellen vergeleken met siRNA alleen en onderdrukte effectief de expressie van verschillende doelgenen, waaronder Trp53, Mep1b, Ctr1 en EGFP. Een klinisch relevant muismodel van AKI geïnduceerd door cisplatine werd gebruikt om het therapeutische potentieel van fCNT-gerichte siRNA te evalueren om de pathogenese van nierbeschadiging effectief te stoppen.",
"De nanokoolstof-gemedieerde levering van siRNA biedt een therapeutisch middel voor de preventie van AKI om veilig de aanhoudende barrière van nefrotoxiciteit tijdens medische interventie te overwinnen."
] | 122 | 119 |
2,314 | Wat doet davunetide met microtubuli? | Davunetide of NAP is een microtubuli-stabilisator. | [
"Microtubuli-stabiliserende peptiden en kleine moleculen die axonale transport en hersenfunctie beschermen: focus op davunetide (NAP).",
"We hebben recent de effecten van NAP bij neurodegeneratieve aandoeningen beschreven, en we bespreken nu de gunstige effecten van NAP en andere microtubuli-stabiliserende middelen op stoornissen in het axonale transport."
] | 53 | 53 |
2,315 | Wordt propranolol gebruikt voor de behandeling van infantiele hemangiomen? | Ja, propranolol wordt de voorkeursbehandeling voor gecompliceerde infantiele hemangiomen. | [
"Laagdosis propranolol voor infantiele hemangiomen van het hoofd en de nek: Analyse van 23 opeenvolgende patiënten.",
"ACHTERGROND: Steeds meer infantiele hemangiomen (IH) worden behandeld met propranolol, maar de effectiviteit, dosering en behandelduur zijn nog onderwerp van discussie.",
"CONCLUSIES: Laagdosis propranolol lijkt effectief en veilig voor IH, vooral bij patiënten die eerder met corticosteroïden werden behandeld en geen respons hadden of ernstige bijwerkingen ondervonden.",
"Cardiovasculair profiel van propranolol na meervoudige dosering bij infantiele hemangiomen.",
"Propranolol wordt de voorkeursbehandeling voor gecompliceerde infantiele hemangiomen.",
"Samenvattend veroorzaakt propranolol 2 mg/kg lichaamsgewicht per dag een statistisch, maar niet klinisch relevante daling van de bloeddruk en hartslag bij cardiaal gezonde zuigelingen met infantiele hemangiomen.",
"Belang: Propranololhydrochloride is de primaire medische behandeling geworden voor problematische infantiele hemangiomen; echter, de expressie van propranolol's doelreceptoren tijdens groei, involutie en behandeling van hemangiomen blijft onduidelijk.",
"ACHTERGROND: Infantiele hemangiomen (IH) zijn de meest voorkomende goedaardige vasculaire tumoren bij kinderen. Propranolol is een effectief geneesmiddel voor de behandeling van IH.",
"Echografie als objectief hulpmiddel voor de beoordeling van de behandeling van infantiele hemangiomen met propranolol.",
"CONCLUSIE: Echografische metingen dragen bij aan het aantonen van tumorregressie en de respons van IH op propranolol.",
"Recent werd gemeld dat propranololbehandeling succesvol is voor de behandeling van ernstige infantiele hemangiomen.",
"Wij concluderen dat het initiële gebruik van propranolol als enige behandeling voor infantiele luchtweghemangiomen veelbelovend is.",
"Propranolol is voorgesteld voor de behandeling van infantiele hemangiomen.",
"Propranololtherapie verandert het behandelingsparadigma voor infantiele hemangiomen.",
"Propranolol is recent succesvol gebruikt bij een beperkt aantal kinderen met infantiele hemangiomen.",
"Propranolol is voorgesteld voor de behandeling van infantiele hemangiomen.",
"CONCLUSIES Dit is het eerste verslag van succesvolle therapie van een intracraniële infantiele hemangioom met propranolol.",
"DOEL Het succesvolle gebruik van nadolol als alternatief voor propranololtherapie in drie gevallen van infantiele hemangiomen wordt gerapporteerd.",
"Propranolol is succesvol gebruikt bij een beperkt aantal kinderen met infantiele hemangiomen.",
"CONCLUSIES Hoge dosis propranolol is zeer effectief bij de behandeling van infantiele hemangiomen met geringe bijwerkingen en een korte ziekteduur.",
"Propranolol is een nieuw en veilig medicijn voor de behandeling van infantiele hemangiomen.",
"Propranolol is de enige door de Food and Drug Administration goedgekeurde therapie voor de behandeling van patiënten met deze vasculaire afwijking en moet als eerstelijnsbehandeling worden beschouwd voor genitale infantiele hemangiomen.",
"CONCLUSIE Propranolol kan een veelbelovende therapeutische optie zijn voor infantiele hemangiomen.",
"Propranolol, dat vaak wordt gebruikt voor de behandeling van cutane infantiele hemangiomen, is momenteel geen standaardbehandeling voor intracraniële infantiele hemangiomen.",
"Voorlopige resultaten van propranololbehandeling bij patiënten met infantiele hemangiomen.",
"Propranololtherapie verandert het behandelingsparadigma voor infantiele hemangiomen.",
"Propranolol moet worden beschouwd als een eerstelijnsbehandeling voor infantiele hemangiomen.",
"Propranolol, een niet-selectieve bètablokker, is recent geïntroduceerd als behandeling voor infantiele hemangiomen."
] | 449 | 426 |
2,316 | Kunnen de CEP290-genmutaties worden aangepakt met AAV-gemedieerde gentherapie? | De grote omvang van het CEP290-gen verhindert het gebruik ervan in adeno-geassocieerde virus (AAV)-gemedieerde genaugmentatietherapie. | [
"De grote omvang van het CEP290-gen verhindert het gebruik ervan in adeno-geassocieerde virus (AAV)-gemedieerde genaugmentatietherapie."
] | 43 | 36 |
2,317 | Welke eiwitten regelen het sterolmetabolisme in S. cerevisiae? | Het gistgenoom codeert voor zeven oxysterol-bindende proteïne-homologen, Osh1p-Osh7p, die betrokken zijn bij de regulatie van intracellulair lipide- en vesiculair transport. Het gistgenoom codeert voor zeven oxysterol-bindende proteïne-homologen, Osh1p-Osh7p, die betrokken zijn bij de regulatie van intracellulair lipide- en vesiculair transport. Upc2p, een transcriptiefactor van de zinkclusterfamilie, is een belangrijke regulator van sterolsynthese en azoolmedicijnresistentie in Candida albicans. | [
"We hebben gebruikgemaakt van deze eigenschap om de regulatie van het Delta8-Delta7-sterolisomerase-coderende ERG2-gen te bestuderen in een ergosterol-auxotroof mutant zonder squalene-synthase-activiteit.",
"Ergosterol-tekort leidt tot een 8- tot 16-voudige toename in ERG2-genexpressie.",
"Het gistgenoom codeert voor zeven oxysterol-bindende proteïne-homologen, Osh1p-Osh7p, die betrokken zijn bij de regulatie van intracellulair lipide- en vesiculair transport.",
"Sterolmetabolisme en ERG2-genregulatie in de gist Saccharomyces cerevisiae.",
"Genoomwijde locatie-analyse van Candida albicans Upc2p, een regulator van sterolmetabolisme en azoolmedicijnresistentie.",
"Om de functie van Upc2p in C. albicans beter te begrijpen, gebruikten we genoomwijde locatieprofilering om de transcriptiedoelen van Upc2p in vivo te identificeren.",
"Upc2p, een transcriptiefactor van de zinkclusterfamilie, is een belangrijke regulator van sterolsynthese en azoolmedicijnresistentie in Candida albicans.",
"Samengevat wijzen onze resultaten erop dat Upc2p een sleutelregulator is van het ergosterolmetabolisme. Ze suggereren ook dat Upc2p kan bijdragen aan azoolresistentie door de expressie van genen die coderen voor medicijnafvoerpompen te reguleren, naast genen voor ergosterolsynthese.",
"Northern blot-analyse toonde aan dat verhoogde binding correleert met verhoogde expressie voor de geanalyseerde Upc2p-doelen (ERG11, MDR1, CDR1, YOR1, SUT1, SMF12 en CBP1).",
"Oververtegenwoordigde functionele groepen genen waarvan de promotoren door Upc2p werden gebonden, omvatten 12 genen betrokken bij ergosterolsynthese (NCP1, ERG11, ERG2 en anderen).",
"Cell wall onderhoudsgenen TIR4 en CCW12, sterolmetabolisme-gen UPC2, genen voor transport van kleine moleculen AUS1 en YHK8, en stressrespons-gen CUP1-1 werden tot minstens 2,5 keer hoger tot expressie gebracht dan het expressieniveau gevonden in 9763S."
] | 320 | 282 |
2,318 | Welke enzymen zijn verantwoordelijk voor de creatie van base J in Trypanosoma brucei? | De base wordt gesynthetiseerd via een tweestapsroute. Aanvankelijk wordt een thymidine-residu in DNA gehydroxyleerd door een thymidinehydroxylase (TH). Dit intermediair (HOMedU) wordt vervolgens geglucosyleerd om base J te vormen. Twee eiwitten die betrokken zijn bij de J-synthese, JBP1 (J-bindend eiwit 1) en JBP2, bevatten een vermoedelijk TH-domein dat verwant is aan de familie van Fe(2+)/2-oxoglutaraat-afhankelijke hydroxylasen. JBP2 is een chromatine-herstructureer eiwit dat de novo J-synthese induceert, waardoor JBP1, een J-DNA-bindend eiwit, extra J-synthese stimuleert. Een recente computationele screening identificeerde een mogelijke kandidaat voor de base J-geassocieerde glucosyltransferase (JGT) in trypanosomatide genomen. | [
"De synthese van de gemodificeerde thyminebase, beta-d-glucosyl-hydroxymethyluracil of J, binnen telomerisch DNA van Trypanosoma brucei correleert met de bloedbaanvorm-specifieke epigenetische onderdrukking van telomerische variant oppervlak glycoproteïnegenen die betrokken zijn bij antigenische variatie.",
"We hebben recent een model voorgesteld waarin chromatineherstructurering door een SWI2/SNF2-achtig eiwit (JBP2) de ontwikkeling en de novo sitespecifieke lokalisatie van J-synthese binnen bloedbaanvorm trypanosoom DNA reguleert.",
"JBP1 en JBP2 zijn twee verschillende thymidinehydroxylasen die betrokken zijn bij de J-biosynthese in het genoom van Afrikaanse trypanosomen.",
"De base wordt gesynthetiseerd via een tweestapsroute. Aanvankelijk wordt een thymidine-residu in DNA gehydroxyleerd door een thymidinehydroxylase (TH). Dit intermediair (HOMedU) wordt vervolgens geglucosyleerd om base J te vormen. Twee eiwitten die betrokken zijn bij de J-synthese, JBP1 (J-bindend eiwit 1) en JBP2, bevatten een vermoedelijk TH-domein dat verwant is aan de familie van Fe(2+)/2-oxoglutaraat-afhankelijke hydroxylasen.",
"Hier tonen we aan dat mutatie van sleutelresiduen in het TH-domein van JBP2 zijn vermogen om de novo J-synthese te induceren uitschakelt.",
"We concluderen dat JBP2 en JBP1 de TH-enzymen zijn die betrokken zijn bij de J-biosynthese.",
"Twee thymidinehydroxylasen reguleren verschillend de vorming van geglucosyleerd DNA in regio's grenzend aan polymerase II polycistronische transcriptie-eenheden door het hele genoom van Trypanosoma brucei.",
"We hebben eerder twee thymidinehydroxylasen (TH), JBP1 en JBP2, gekarakteriseerd die de J-biosynthese reguleren.",
"JBP2 is een chromatine-herstructureer eiwit dat de novo J-synthese induceert, waardoor JBP1, een J-DNA-bindend eiwit, extra J-synthese stimuleert.",
"JBP2 en JBP1 zijn in staat om de novo J-synthese te stimuleren.",
"Interne J-afzetting op chromosomen wordt voornamelijk gemedieerd door JBP1, terwijl JBP2 gestimuleerde J-afzetting plaatsvindt in de telomerische regio's.",
"β-d-glucopyranosyloxymethyluracil (base J) synthese wordt geïnitieerd door de JBP1/2-enzymen die thymine hydroxylëren, waarbij 5-hydroxymethyluracil (hmU) wordt gevormd.",
"Een recente computationele screening identificeerde een mogelijke kandidaat voor de base J-geassocieerde glucosyltransferase (JGT) in trypanosomatide genomen.",
"Hier bespreken we de regulatie van hmU- en base J-vorming in het trypanosoomgenoom door JGT en base J-bindend eiwit.",
"De thymidinehydroxylasen (JBP1 en JBP2) die de eerste stap katalyseren zijn gekarakteriseerd, maar de identiteit van de glucosyltransferase die de tweede stap katalyseert is nog ongrijpbaar gebleken.",
"De verwijdering van beide allelen van JGT uit het genoom van Trypanosoma brucei genereert een cellijn die volledig base J mist.",
"De verwijdering van beide allelen van JGT uit het genoom van Trypanosoma brucei genereert een cellijn die volledig base J mist.",
"β-d-glucopyranosyloxymethyluracil (base J) synthese wordt geïnitieerd door de JBP1/2-enzymen die thymine hydroxylëren, waarbij 5-hydroxymethyluracil (hmU) wordt gevormd."
] | 492 | 481 |
2,319 | Welke methode voor het subsamplen van NGS-reads vereist alleen genentellingen? | SamExploreR: het verkennen van reproduceerbaarheid en robuustheid van RNA-seq-resultaten op basis van SAM-bestanden. We introduceren het subseq R-pakket, dat een nieuwe efficiënte aanpak gebruikt om dit subsamplen uit te voeren en informatieve metrieken te berekenen bij elke diepte die nodig is om een breed scala aan functionele en evolutionaire studies te informeren. Onze methoden zijn breed toepasbaar voor het ontdekken van polymorfismen in matige tot grote genomen, zelfs bij sterk gedivergeerde loci, en we hebben door subsampling de Illumina SBS-dekking diepte gerelateerde vragen voor het experimentele ontwerp vastgesteld. SubSeq: het bepalen van de juiste sequencingdiepte door efficiënte read-subsampling. | [
"Onze methoden zijn breed toepasbaar voor het ontdekken van polymorfismen in matige tot grote genomen, zelfs bij sterk gedivergeerde loci, en we hebben door subsampling de Illumina SBS-dekking diepte vastgesteld die nodig is om een breed scala aan functionele en evolutionaire studies te informeren.",
"Interessant is dat na subsampling tot dezelfde dekking voor GSNAP en TopHat, we constateren dat beide mappers vergelijkbare prestaties hebben, wat impliceert dat het voordeel van TopHat voornamelijk een artefact is van de lagere dekking.",
"Door het subsamplen van sequentiereads vonden we dat bij gebruik van viervoudige biologische replicatie, 6 miljoen reads per conditie 96% power bereikte om een tweevoudige verandering (of meer) te detecteren bij een foutpositieve ontdekkingstarief van 5%.",
"We introduceren het subSeq R-pakket, dat een nieuwe efficiënte aanpak gebruikt om dit subsamplen uit te voeren en informatieve metrieken te berekenen bij elke diepte.",
"subSeq: het bepalen van de juiste sequencingdiepte door efficiënte read-subsampling.",
"We introduceren een R-pakket genaamd samExploreR dat het subsamplen (m uit n bootstrap) van short-reads op basis van SAM-bestanden mogelijk maakt, wat het onderzoeken van sequencingdiepte-gerelateerde vragen voor het experimentele ontwerp vergemakkelijkt.",
"We pasten subsampling toe om het effect van de grootte van de trainingsset en het aantal RNA-sequencingreads op de classificatienauwkeurigheid van moleculaire subtype- en routinebiomarker-voorspellingsmodellen (onbegeleid en begeleid) te bepalen.",
"samExploreR: het verkennen van reproduceerbaarheid en robuustheid van RNA-seq-resultaten op basis van SAM-bestanden.",
"Door willekeurig lagere dieptes te bemonsteren uit een sequencingexperiment en te bepalen waar de verzadiging van power en nauwkeurigheid optreedt, kan men bepalen wat de meest bruikbare diepte zou moeten zijn voor toekomstige experimenten, en bovendien bevestigen of een bestaand experiment voldoende diepte had om de conclusies te rechtvaardigen.",
"Een complicatie is dat de power en nauwkeurigheid van dergelijke experimenten sterk afhankelijk zijn van het aantal gesequencede reads, dus het is belangrijk en uitdagend om de optimale read-diepte voor een experiment te bepalen of te verifiëren of men voldoende diepte heeft in een bestaand experiment."
] | 398 | 417 |
2,320 | Welke topoisomerase is essentieel in gist? | Eukaryotische DNA-topoisomerase II is een overvloedig aanwezig nucleair enzym dat essentieel is voor celproliferatie. Gist DNA-topoisomerase II wordt gecodeerd door een enkelvoudig, essentieel gen. | [
"Gist DNA-topoisomerase II wordt gecodeerd door een enkelvoudig, essentieel gen.",
"Het verstoren van één kopie van het gen in een diploïde gist veroorzaakt een recessieve lethale mutatie, wat aangeeft dat het enkele DNA-topoisomerase II-gen van gist een essentiële functie heeft.",
"De type II topoisomerase kan een essentiële rol spelen bij de compactie en/of segregatie van chromosomen tijdens de nucleaire deling, maar ook het defect van het type I enzym aanvullen, waarvan de belangrijkste functie het behoud van chromatine-organisatie gedurende de celcyclus is.",
"Aangezien DNA-topoisomerase II (EC 5.99.1.3) een essentieel enzym is in gist, kan heterologe expressie van het topoisomerase II-gen in gistcellen een systeem bieden voor het analyseren van de structuur en functie van topoisomerase II-genen van andere soorten.",
"Eukaryotische DNA-topoisomerase II is een overvloedig aanwezig nucleair enzym dat essentieel is voor celproliferatie.",
"Topoisomerase II is een alomtegenwoordig enzym dat knopen en verwikkelingen uit het genetisch materiaal verwijdert door het genereren van tijdelijke dubbelstrengs DNA-breuken. Hoewel het enzym zijn essentiële cellulaire functies niet kan uitvoeren zonder het knippen van DNA, is deze knipactiviteit inherent gevaarlijk voor de chromosomale integriteit.",
"Topoisomerase II (Topo II) voert topologische modificaties uit op dubbelstrengs DNA-moleculen die essentieel zijn voor chromosoomcondensatie, resolutie en segregatie.",
"Type II topoisomerasen zijn essentieel voor het oplossen van topologisch verstrengeld dubbelstrengs DNA.",
"DNA-topoisomerasen zijn gespecialiseerde nucleaire enzymen die topologische modificaties uitvoeren op dubbelstrengs DNA (dsDNA) en daarom essentieel zijn voor DNA-metabolisme zoals replicatie, transcriptie, recombinatie, condensatie en segregatie.",
"Eukaryotische topoisomerase II (topo II) is de essentiële decatenase van nieuw gerepliceerde chromosomen en de belangrijkste relaxase van nucleosomaal DNA.",
"De decatenatie-activiteit van DNA-topoisomerase II is essentieel voor levensvatbaarheid wanneer eukaryote cellen door de mitose gaan.",
"Studies met gist DNA-topoisomerase-mutanten geven aan dat noch topoisomerase I noch II essentieel lijkt te zijn voor transcriptie door RNA-polymerase II.",
"Het gen dat topoisomerase II in gist codeert is uniek en essentieel, vereist voor zowel mitotische als meiotische proliferatie.",
"De decatenatie-activiteit van DNA-topoisomerase II is essentieel voor levensvatbaarheid wanneer eukaryote cellen door de mitose gaan.",
"Gist DNA-topoisomerase II wordt gecodeerd door een enkelvoudig, essentieel gen.",
"Het verstoren van één kopie van het gen in een diploïde gist veroorzaakt een recessieve lethale mutatie, wat aangeeft dat het enkele DNA-topoisomerase II-gen van gist een essentiële functie heeft.",
""
] | 391 | 382 |
2,321 | Wat is de genetische basis van het Ohdo-syndroom? | MED12 veroorzaakt X-gebonden Ohdo-syndroom | [
"Mutaties in MED12 veroorzaken X-gebonden Ohdo-syndroom",
"In de twee families werden MED12 missense-mutaties (c.3443G>A [p.Arg1148His] of c.3493T>C [p.Ser1165Pro]) die met het fenotype segregeren, geïdentificeerd. Bij een vervolgonderzoek van een extra cohort van negen simplex mannelijke individuen met Ohdo-syndroom, werd een extra de novo missense-verandering (c.5185C>A [p.His1729Asn]) in MED12 gedetecteerd.",
"Het voorkomen van drie verschillende hemizygote missense-mutaties in drie niet-verwante families die getroffen zijn door het Ohdo-syndroom MKB-type toont aan dat mutaties in MED12 de onderliggende oorzaak zijn van deze X-gebonden vorm van het Ohdo-syndroom.",
"FG-syndroom, Lujan-syndroom en Ohdo-syndroom, het Maat-Kievit-Brunner-type, zijn beschreven als afzonderlijke syndromen met overlappende niet-specifieke kenmerken en verschillende missense-mutaties van het MED12-gen zijn in al deze syndromen gerapporteerd.",
"Parallelle sequencing van alle exonen van het X-chromosoom identificeerde een frameshift-mutatie (c.5898dupC) van MED12.",
"De ernstige mate van verstandelijke beperking bij mannelijke patiënten, evenals variabele cognitieve beperkingen bij heterozygote vrouwen, suggereert dat de duplicatie die in de huidige familie werd waargenomen mogelijk een ernstiger effect heeft op de functie van MED12 dan missense-mutaties. Bij een cognitief beperkte man uit deze familie, die ook een lange gestalte en dysmorfie vertoonde en de MED12-mutatie niet had, werd een 600 kb duplicatie op 17p13.3 inclusief het YWHAE-gen gevonden in een mozaïektoestand.",
"Tot nu toe omvatten deze aandoeningen het Opitz-Kaveggia (FG) syndroom, Lujan-syndroom, Ohdo-syndroom (Maat-Kievit-Brunner-type, of OSMKB), en één grote familie met ernstige X-gebonden verstandelijke beperking door een nieuwe c.5898insC frameshift-mutatie die, in tegenstelling tot de andere drie syndromen, vrouwelijke dragers trof en leidde tot truncatie van het MED12-eiwit.",
"Deze casus ondersteunt de zich ontwikkelende theorie dat de subtypes van Ohdo, en mogelijk andere MED12-aandoeningen, een spectrum van kenmerken weerspiegelen in plaats van afzonderlijke syndromen.",
"MED12 [MIM *300188] (mediator complex subunit 12) mutaties zijn gekoppeld aan talrijke XLID-syndromen, waaronder Lujan, FG en Ohdo, en MED12 is opgenomen in veel XLID-panelen.",
"Ten slotte identificeerde directe sequencing van MED12, het gen dat gemuteerd is bij het Opitz-Kaveggia syndroom, Lujan-Fryns syndroom en X-gebonden Ohdo syndroom, bij de twee broers de missense-mutatie c.3443G>A (p.Arg1148His) geërfd van de moeder.",
"Mutaties in MED12 veroorzaken X-gebonden Ohdo-syndroom.",
"Voorbij het Ohdo-syndroom: een familiale missense-mutatie breidt het MED12-spectrum uit."
] | 365 | 346 |
2,322 | Welke geneesmiddelen werden getest in de KEYNOTE-006 studie? | De KEYNOTE-006 studie vergeleek pembrolizumab versus ipilimumab voor gevorderde melanoom. | [
"Het model gebruikte Kaplan-Meier schattingen van progressievrije overleving en totale overleving uit een recente gerandomiseerde fase 3 studie (KEYNOTE-006) die pembrolizumab en ipilimumab vergeleek.",
"Pembrolizumab versus ipilimumab voor gevorderde melanoom: definitieve resultaten van de totale overleving van een multicentrische, gerandomiseerde, open-label fase 3 studie (KEYNOTE-006).",
"ACHTERGROND: Tussentijdse analyses van de fase 3 KEYNOTE-006 studie toonden superieure totale en progressievrije overleving van pembrolizumab versus ipilimumab bij patiënten met gevorderde melanoom.",
"INTERPRETATIE: Ter bevestiging van de resultaten van de tussentijdse analyses van KEYNOTE-006 bleef pembrolizumab superieure totale overleving bieden ten opzichte van ipilimumab, zonder verschil tussen de doseringsschema's van pembrolizumab.",
"DOELSTELLING: Rapporteren van resultaten van door patiënten gerapporteerde gezondheidsgerelateerde kwaliteit van leven (HRQoL) en symptomen uit de fase III KEYNOTE-006 studie van pembrolizumab versus ipilimumab bij patiënten met ipilimumab-naïeve gevorderde melanoom.",
"Door patiënten gerapporteerde uitkomsten in KEYNOTE-006, een gerandomiseerde studie van pembrolizumab versus ipilimumab bij patiënten met gevorderde melanoom.",
"Pembrolizumab (Keytruda(®)) is een gehumaniseerde monoklonale antilichaam tegen geprogrammeerde dood receptor-1 (PD-1), een belangrijke immunoinhibitorische controle-eiwit betrokken bij het naar beneden reguleren van antitumor immuunresponsen. Dit intraveneuze geneesmiddel is geïndiceerd voor de behandeling van gevorderde (niet-reseceerbare of gemetastaseerde) melanoom, op basis van het klinische voordeel in deze setting in de fase I KEYNOTE 001 studie (uitbreidingscohorten) en de fase II en III studies, KEYNOTE 002 en 006.",
"CONCLUSIES: Het anti-PD-1 antilichaam pembrolizumab verlengde de progressievrije overleving en totale overleving en had minder hoge-graad toxiciteit dan ipilimumab bij patiënten met gevorderde melanoom. (Gefinancierd door Merck Sharp&Dohme; KEYNOTE-006 ClinicalTrials.gov nummer, NCT01866319.).",
"Tussentijdse analyses van de fase 3 KEYNOTE-006 studie toonden superieure totale en progressievrije overleving van pembrolizumab versus ipilimumab bij patiënten met gevorderde melanoom.",
"Rapporteer resultaten van door patiënten gerapporteerde gezondheidsgerelateerde kwaliteit van leven (HRQoL) en symptomen uit de fase III KEYNOTE-006 studie van pembrolizumab versus ipilimumab bij patiënten met ipilimumab-naïeve gevorderde melanoom.",
"Het model gebruikte Kaplan-Meier schattingen van progressievrije overleving en totale overleving uit een recente gerandomiseerde fase 3 studie (KEYNOTE-006) die pembrolizumab en ipilimumab vergeleek.",
"Er werd een kosteneffectiviteitsmodel ontwikkeld om de kosten en gevolgen van behandeling met pembrolizumab te analyseren in vergelijking met behandeling met ipilimumab bij patiënten met gevorderde melanoom die eerder niet met ipilimumab waren behandeld. Het model werd geparametriseerd met gegevens uit een directe fase III gerandomiseerde klinische studie, KEYNOTE-006.",
"ACHTERGROND Tussentijdse analyses van de fase 3 KEYNOTE-006 studie toonden superieure totale en progressievrije overleving van pembrolizumab versus ipilimumab bij patiënten met gevorderde melanoom.",
"DOELSTELLING Rapporteer resultaten van door patiënten gerapporteerde gezondheidsgerelateerde kwaliteit van leven (HRQoL) en symptomen uit de fase III KEYNOTE-006 studie van pembrolizumab versus ipilimumab bij patiënten met ipilimumab-naïeve gevorderde melanoom.",
"INTERPRETATIE Ter bevestiging van de resultaten van de tussentijdse analyses van KEYNOTE-006 bleef pembrolizumab superieure totale overleving bieden ten opzichte van ipilimumab, zonder verschil tussen de doseringsschema's van pembrolizumab.",
"Het model gebruikte Kaplan-Meier schattingen van progressievrije overleving en totale overleving uit een recente gerandomiseerde fase 3 studie (KEYNOTE-006) die pembrolizumab en ipilimumab vergeleek.",
"In de studies met actieve vergelijkingsarmen verbeterden pembrolizumab-regimes significant de progressievrije overleving (PFS), totale overleving (OS) en totale responspercentages (ORR) ten opzichte van ipilimumab bij ipilimumab-naïeve patiënten (KEYNOTE 006), en verbeterden significant PFS en ORR, maar niet OS (hoewel OS-gegevens nog onvolwassen zijn), ten opzichte van chemotherapie bij ipilimumab-refractaire patiënten, die ook BRAF/MEK remmertherapie hadden ontvangen indien BRAF-mutatie positief (KEYNOTE 002)."
] | 517 | 539 |
2,323 | Wat is het doel van de FRAX-schaal? | De FRAX-score (The WHO Fracture Risk Assessment Tool) is een gratis webgebaseerde klinische schaal die de 10-jarige kans op een groot osteoporotisch fractuurrisico beoordeelt en de noodzaak voor leefstijladvies/ geruststelling, duale röntgenabsorptiometrie (DEXA) scanning of preventieve behandeling. | [
"RESULTATEN: De DA werd als acceptabel ervaren door de proefpersonen, maar 17% van de patiënten in de decision aid-groep voerde hun T-scores onjuist in in de FRAX-gebaseerde risicocalculator.",
"Vergelijking van zelfwaargenomen en geschat fractuurrisico door FRAX® bij vrouwen met osteoporose.",
"In deze studie vergeleken we subjectieve fractuurrisico’s van Hongaarse vrouwen met osteoporose met FRAX®-gebaseerde schattingen.",
"DOEL: De belangrijkste doelstellingen waren het onderzoeken van verbanden tussen zelfwaargenomen 10-jarige fractuurrisico’s van vrouwen met osteoporose (OP) en hun risico’s berekend met het FRAX®-algoritme, en het identificeren van determinanten van onderschatting van het risico.",
"De ontwikkeling van absolute fractuurrisico (AFR) algoritmen, zoals FRAX® en de Garvan absolute fractuurrisicocalculator, om het risico op fracturen over een bepaalde periode (meestal 10 jaar) te voorspellen, heeft tot doel niet-BMD risicofactoren in de klinische beoordeling te integreren. FRAX® is aangetoond nuttig te zijn voor het beoordelen van fractuurrisico bij CKD, maar kan het fractuurrisico bij gevorderde CKD onderschatten.",
"HET DOEL: was een evaluatie van de correlatie tussen het 10-jarige risico op overlijden door CVD en het 10-jarige fractuurrisico (FRAX).",
"DOELSTELLING: Het verifiëren van de fractuurrisicobeoordelingstool (FRAX) om de waarschijnlijkheid van osteoporotische fractuur te schatten bij patiënten met reumatoïde artritis (RA) met of zonder botmineraaldichtheid (BMD), en het identificeren van geassocieerde risicofactoren voor osteoporose.",
"Kunnen paramedici FRAX (de WHO Fracture Risk Assessment Tool) gebruiken om huisartsen te helpen het toekomstige fractuurrisico bij patiënten die vallen te verbeteren?",
"Paramedici die patiënten bijstaan die gevallen zijn, kunnen goed geplaatst zijn om het toekomstige fractuurrisico te beoordelen met behulp van de Fracture Risk Assessment Tool (FRAX) en die informatie direct aan huisartsen (GP’s) door te geven.",
"Belangrijke wijzigingen zijn herziening van de criteria voor het starten van farmacologische behandeling, samen met de introductie van de fractuurrisicofactoren die in FRAX® worden gebruikt, opname van nieuw ontwikkelde geneesmiddelen en herziening van de aanbevelingsgraden voor farmacologische behandeling van osteoporose.",
"De Fracture Risk Assessment Tool (FRAX) is ontwikkeld om het fractuurrisico in de algemene bevolking te schatten.",
"FRAX geeft de 10-jarige kans op grote fracturen.",
"De WHO Fracture Risk Assessment Tool (FRAX; http://www.shef.ac.uk/FRAX) schat de 10-jarige kans op een grote osteoporotische fractuur.",
"Een van de belangrijkste wijzigingen is de herziening van de criteria voor het starten van farmacologische behandeling, samen met de introductie van de fractuurrisicofactoren die in FRAX® worden gebruikt.",
"De belangrijkste variabele was de waarschijnlijkheid van fractuur geëvalueerd met de FRAX®-tool voor de Spaanse bevolking.",
"Toepassing van de WHO fractuurrisicobeoordelingstool (FRAX) om de noodzaak voor DEXA-scanning en behandeling te voorspellen bij patiënten met inflammatoire darmziekte die risico lopen op osteoporose.",
"De FRAX-score, ontwikkeld door de WHO, is een gratis webgebaseerde klinische schaal die het 10-jarige fractuurrisico en de noodzaak voor leefstijladvies/ geruststelling, duale röntgenabsorptiometrie (DEXA) scanning of preventieve behandeling beoordeelt.",
"DOEL: De WHO fractuurrisicovoorspellingsinstrument (FRAX®) gebruikt klinische risicofactoren om de kans op fractuur over een periode van 10 jaar te schatten.",
"DOEL Het WHO fractuurrisicovoorspellingsinstrument (FRAX®) gebruikt klinische risicofactoren om de kans op fractuur over een periode van 10 jaar te schatten.",
"De FRAX-score, ontwikkeld door de WHO, is een gratis webgebaseerde klinische schaal die het 10-jarige fractuurrisico en de noodzaak voor leefstijladvies/ geruststelling, duale röntgenabsorptiometrie (DEXA) scanning of preventieve behandeling beoordeelt."
] | 546 | 541 |
2,324 | Zijn mutaties in het nf1-gen geassocieerd met geheugen? | Ja, verschillende functionele domeinen van neurofibromatose type 1 reguleren onmiddellijke versus langetermijngeheugenformatie. | [
"We stelden de hypothese op dat NF1-mutaties de expressie van genen die belangrijk zijn voor geheugenformatie verstoren",
"Ons eerdere werk heeft aangetoond dat defecte cAMP-signaaloverdracht leidt tot het leerfenotype bij Drosophila Nf1-mutanten. In het huidige rapport toonden onze experimenten aan dat naast leren ook het langetermijngeheugen werd uitgeschakeld bij Nf1-mutanten.",
"Verschillende functionele domeinen van neurofibromatose type 1 reguleren onmiddellijke versus langetermijngeheugenformatie."
] | 85 | 77 |
2,325 | Heeft Cas9-genbewerking het potentieel om erfelijke gehoorverlies te corrigeren? | CRISPR/Cas9-gemedieerde genoombewerking kan efficiënt worden uitgevoerd in het binnenoor van zoogdieren in vivo. De genetische correctie van geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSC's), geïnduceerd uit somatische cellen van patiënten met sensorineuraal gehoorverlies (veroorzaakt door erfelijke factoren), is een veelbelovende methode voor de behandeling ervan. De correctie van genmutaties in iPSC's kan de normale functie van cellen herstellen en een rijke bron van cellen voor transplantatie bieden. | [
"CRISPR/Cas9-gemedieerde HDR is met succes gebruikt om het Cdh23 (ahl) allel efficiënt te corrigeren in C57BL/6NTac-muizen en het bijbehorende auditieve fenotype te herstellen.",
"We gebruikten een CRISPR/Cas9-benadering om de MYO15A-mutatie in de iPSC's genetisch te corrigeren en herstelden de morfologie en functie van de afgeleide haarcelachtige cellen.",
"Ons recente werk heeft aangetoond dat CRISPR/Cas9-gemedieerde genoombewerking efficiënt kan worden uitgevoerd in het binnenoor van zoogdieren in vivo.",
"De genetische correctie van geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSC's), geïnduceerd uit somatische cellen van patiënten met sensorineuraal gehoorverlies (veroorzaakt door erfelijke factoren), is een veelbelovende methode voor de behandeling ervan. De correctie van genmutaties in iPSC's kan de normale functie van cellen herstellen en een rijke bron van cellen voor transplantatie bieden.",
"De huidige studie kan verder inzicht bieden in de pathogenese van sensorineuraal gehoorverlies en de ontwikkeling van therapeutische strategieën tegen monogene ziekten vergemakkelijken door de genetische reparatie van patiëntspecifieke iPSC's."
] | 223 | 214 |
2,326 | Hoe kan CTCF splicing mediëren? | Twee verschillende mechanismen brengen DNA-methyleringsinformatie over in de regulatie van alternatieve splicing. Het eerste betreft de modulatie van de elongatiesnelheid van RNA-polymerase II (Pol II) door CCCTC-bindend factor (CTCF) en methyl-CpG-bindend eiwit 2 (MeCP2); het tweede betreft de vorming van een eiwitbrug door heterochromatine-eiwit 1 (HP1) die splicingfactoren rekruteert op getranscribeerde alternatieve exonen. | [
"Twee verschillende mechanismen brengen DNA-methyleringsinformatie over in de regulatie van alternatieve splicing. Het eerste betreft de modulatie van de elongatiesnelheid van RNA-polymerase II (Pol II) door CCCTC-bindend factor (CTCF) en methyl-CpG-bindend eiwit 2 (MeCP2); het tweede betreft de vorming van een eiwitbrug door heterochromatine-eiwit 1 (HP1) die splicingfactoren rekruteert op getranscribeerde alternatieve exonen.",
"Bovendien vonden we mutaties in de splicingfactor SFPQ en in de niet-klassieke regulatoren van mRNA-verwerking CTCF en RAD21.",
"We tonen aan dat CTCF gebonden aan HTLV-1 fungeert als een enhancerblokker, HTLV-1 mRNA-splicing reguleert en langafstandinteracties vormt met aangrenzend gastheerchromatine.",
"Veel CTCF-sites zijn ook betrokken bij andere functies zoals modulatie van RNA-splicing en specifieke regulatie van genexpressie, en de relatie tussen deze activiteiten en lusvorming is een andere onbeantwoorde vraag die onderzoekers nog geruime tijd bezig zal houden.",
"TET-gekatalyseerde oxidatie van intragenische 5-methylcytosine reguleert CTCF-afhankelijke alternatieve splicing.",
"Intragenische 5-methylcytosine en CTCF mediëren tegengestelde effecten op pre-mRNA-splicing: CTCF bevordert de inclusie van zwakke upstream exonen via pauzeren van RNA-polymerase II, terwijl 5-methylcytosine CTCF verdrijft, wat leidt tot exonuitsluiting.",
"Hier onthullen we de methylcytosine-dioxygenasen TET1 en TET2 als actieve regulatoren van CTCF-gemedieerde alternatieve splicing door omzetting van 5-methylcytosine in zijn oxidatie-derivaten.",
"Een chromatinecode voor alternatieve splicing die een veronderstelde associatie tussen CTCF en HP1α-eiwitten omvat.",
"Recente experimenten suggereren een nieuw complex netwerk van splicingregulatie waarbij chromatine, transcriptie en meerdere eiwitfactoren betrokken zijn. In het bijzonder zijn het CCCTC-bindend factor (CTCF), het Argonaute-eiwit AGO1 en leden van de heterochromatine-eiwit 1 (HP1)-familie geïmpliceerd in de regulatie van splicing geassocieerd met chromatine en de elongatie van RNAPII.",
"Onze resultaten tonen aan dat een aanzienlijk aantal alternatieve splicinggebeurtenissen een chromatine-afhankelijke regulatie kan hebben waarbij de associatie van HP1α en CTCF nabij gereguleerde exonen betrokken is. Daarnaast vinden we verder bewijs voor de betrokkenheid van HP1α en AGO1 bij chromatine-gerelateerde splicingregulatie.",
"CTCF functioneert ook in de regulatie van RNA-polymerase II en kan daardoor co-transcriptionele splicinggebeurtenissen beïnvloeden.",
"CTCF wordt ubiquitair tot expressie gebracht en speelt diverse rollen in genregulatie, imprinting, isolatie, intra/interchromosomale interacties, nucleaire compartimentalisatie en alternatieve splicing.",
"Er was echter geen correlatie tussen de KTS+/KTS- splicingvarianten van WT1 en de methylatiestatus van de CpG's van de CTCF-bindingsplaats.",
"CTCF-geïnduceerd pauzeren van RNA-polymerase II koppelt DNA-methylering aan splicing.",
"Hier leveren we het eerste bewijs dat een DNA-bindend eiwit, CCCTC-bindend factor (CTCF), inclusie van zwakke upstream exonen kan bevorderen door lokale pauzes van RNA-polymerase II te mediëren, zowel in een zoogdiermodel voor alternatieve splicing, CD45, als op genoomwijde schaal."
] | 482 | 443 |
2,327 | Is ACI-35 een passief vaccin? | Nee, ACI-35 is een actief vaccin. | [
"Twee actieve vaccins die respectievelijk niet-gefosforyleerde (AAD-vac1) en gefosforyleerde tau (ACI-35) targeten, zijn gestart met fase I-onderzoek."
] | 25 | 26 |
2,328 | Welke hoofd ribotype van Clostridium difficile is verantwoordelijk voor de recente uitbraak? | De uitbraak van de hypervirulente stam behorend tot ribotype 027 heeft de incidentie en ernst van CDI in sommige landen verhoogd. | [
"Van mei 2013 tot mei 2014 vond een uitbraak van C. difficile ribotype 027 plaats in een Nederlands academisch ziekenhuis, waarbij 72 patiënten betrokken waren.",
"Tijdens deze periode deden zich 70 endemische gevallen van CDI voor evenals 78 gevallen van CDI gerelateerd aan een uitbraak van C. difficile ribotype 027",
"De uitbraak van de hypervirulente stam behorend tot ribotype 027 heeft de incidentie en ernst van CDI in sommige landen verhoogd.",
"Een uitbraak van Clostridium difficile PCR ribotype 027 in Spanje: risicofactoren voor recidief en een nieuwe behandelingsstrategie.",
"Het doel van deze studie was te bepalen of het risico op vroege recidief hoger was na infectie met ribotype 027 (uitbraakstam) vergeleken met infectie met endemische stamtypes van C. difficile.",
"De snelle verspreiding van Clostridium difficile NAP1/BI/027 (C. difficile 027) is een van de belangrijkste bedreigingen geworden van zorggerelateerde infecties wereldwijd.",
"Een uitbraak van Clostridium difficile ribotype 027 infectie (CDI) vond plaats in een universitair ziekenhuis, waarbij 19 afdelingen betrokken waren.",
"De meerderheid van de stammen uit Bosnië en Herzegovina en Servië behoorde tot PCR ribotype 027 (65,8%).",
"Ribotype 027 is zeer prevalent in Duitsland, maar de infecties zijn beperkt tot oudere patiënten, terwijl ze afwezig zijn bij kinderen."
] | 219 | 221 |
2,329 | Wat is de functie van de TFIIS transcriptiefactor (Dst1) in gist? | TFIIS, een elongatiefactor gecodeerd door DST1 in Saccharomyces cerevisiae, stimuleert transcriptknip in gestopte RNA-polymerase II. | [
"TFIIS, een elongatiefactor gecodeerd door DST1 in Saccharomyces cerevisiae, stimuleert transcriptknip in gestopte RNA-polymerase II.",
"Co-immunoprecipitatie-experimenten toonden aan dat TFIIS kan binden aan de Cdk8-module en SAGA in celvrije extracten",
"Leden van de SAGA- en Mediator-complexen zijn partners van de transcriptie-elongatiefactor TFIIS.",
"Er wordt voorgesteld dat TFIIS en de Spt8-bevattende vorm van SAGA samenwerken om RNA-polymerase II te redden van niet-productieve elongatiecomplexen, en dat de Cdk8-module tijdelijk transcriptie blokkeert tijdens transcriptknip.",
"TFIIS bevordert het intrinsieke vermogen van RNA-polymerase II om het 3'-uiteinde van het nieuw gesynthetiseerde RNA te knippen.",
"TFIIS en Rpb9 zijn essentieel wanneer de cellen worden blootgesteld aan microtubule-destabiliserende geneesmiddelen;",
"Hoewel TFIIS een uitgesproken effect heeft op transcriptie-elongatie in vitro, heeft de verwijdering van DST1 geen groot effect op de levensvatbaarheid van de cel.",
"We stellen voor dat TFIIS vereist is onder stresscondities en dat TFIIS belangrijk is voor de overgang tussen initiatie en elongatie in vivo.",
"De eukaryote transcriptie-elongatiefactor TFIIS wordt gecodeerd door een niet-essentieel gen, PPR2, in Saccharomyces cerevisiae.",
"Genoomwijde locatie-analyse onthult een rol van TFIIS in RNA-polymerase III transcriptie.",
"TFIIS is een transcriptie-elongatiefactor die de transcriptknipactiviteit van gestopte RNA-polymerase II (Pol II) stimuleert.",
"Recente studies hebben aangetoond dat TFIIS ook een rol speelt bij Pol II transcriptie-initiatie.",
"TFIIS- en Pol III-bezettingen correleerden goed genoomwijd op deze nieuwe klasse van doelwitten.",
"Deze gegevens leveren sterk in vivo en in vitro bewijs ten gunste van een rol van TFIIS als een algemene Pol III transcriptiefactor.",
"Transcriptiefactor IIS (TFIIS) stimuleert RNA-knip door RNA-polymerase II door backtracked enzymen in staat te stellen transcriptie-elongatie te hervatten.",
"TFIIS is vereist voor de gebalanceerde expressie van de genen die ribosomale componenten coderen onder transcriptiestress.",
"We bespreken het effect van transcriptiestress op ribosoombiogenese en stellen voor dat TFIIS bijdraagt aan het voorkomen van een transcriptie-ongelijkheid tussen rDNA- en RP-genen.",
"Hier onderzochten we de rol van de stimulatieactiviteit van het knippen van het pas gesynthetiseerde transcript bij het behoud van transcriptietrouw in gist.",
"TFIIS is een transcriptie-elongatiefactor die de transcriptknipactiviteit van gestopte RNA-polymerase II (Pol II) stimuleert.",
"Een milde maar systematische toename in RNA-polymerase-bezetting en een strikte afhankelijkheid van de transcriptknipfactor TFIIS (Dst1) suggereren ook een langzamere translocatiesnelheid of een hogere waarschijnlijkheid van transcriptiestalling in deze mutatie.",
"Ook had een DST1 en RPB9 dubbele mutant een ernstiger defect in transcriptietrouw vergeleken met de DST1 genverwijderingsmutant, wat suggereert dat Rpb9 transcriptietrouw handhaaft via twee mechanismen, versterking van S-II afhankelijke knipstimulatie en S-II onafhankelijke functie(s).|"
] | 436 | 403 |
2,330 | Is DNA-methylatie gecorreleerd met nucleosoombezetting? | DNA-methylatie kan de positionering van nucleosomen bepalen. Met behulp van een nieuwe bio-informatica-pijplijn tonen we een opvallende anti-correlatie aan tussen nucleosoombezetting en DNA-methylatie bij CTCF-regio's die niet aanwezig is bij promotoren. DNA-methylatie bepaalt de nucleosoombezetting in de 5'-CpG-eilanden van tumorsuppressorgenen. Daarentegen vertonen exonen een hoge mate van methylatie en nucleosoombezetting. Hoewel globale DNA-demethylatie is waargenomen na behandeling, is het onduidelijk in welke mate demethylatie veranderingen in nucleosoombezetting induceert, een belangrijke bepalende factor voor genexpressie. Om potentiële diversiteiten tussen CGI's systematisch te evalueren en uiteindelijk de link tussen diversiteit van CGI's en hun epigenetische variatie te verhelderen, analyseerden we de DNA-methylatiekaarten op nucleotide-resolutie van meerdere cellulaire oorsprongen. Met deze globale benadering observeren we de afhankelijkheid van nucleosoombezetting van de DNA-methylatiestatus. Exonische DNA-methylatie lijkt samen te functioneren met exonische nucleosomen en H3K36me3 voor de juiste splicing van transcripties met verschillende expressieniveaus. Transcriptie, histonmodificaties en DNA-methylatie veranderen deze "grondtoestand" door verschillende effecten te hebben op zowel nucleosoompositionering als -bezetting. | [
"Hier toon ik aan dat CpG-eilanden niet alleen geassocieerd zijn met methylatievrije promotoren, maar ook met nucleosoomvrije promotoren.",
"Nucleosoomvrije regio's werden alleen waargenomen in promotoren die een CpG-eiland bevatten.",
"In tegenstelling tot de methylatie- en nucleosoomvrije toestanden van CpG-eilandpromotoren, waren exonen dicht gemethyleerd bij CpG's en verpakt in nucleosomen.",
"Ik vond ook dat nucleosomen, DNA-methylatie en H3K36me3 de exonen markeerden van transcripties met lage, middelmatige en hoge genexpressieniveaus, respectievelijk.",
"Menselijke promotoren die een CpG-eiland bevatten, neigen ernaar nucleosoomvrij en methylatievrij te blijven.",
"Daarentegen vertonen exonen een hoge mate van methylatie en nucleosoombezetting.",
"Exonische DNA-methylatie lijkt samen te werken met exonische nucleosomen en H3K36me3 voor de juiste splicing van transcripties met verschillende expressieniveaus.",
"Ter ondersteuning van een dergelijke associatie hebben recente rapporten onderscheidende histonmethylatiepatronen, verhoogde nucleosoombezetting en verrijkte DNA-methylatie bij exonen ten opzichte van intronen geïdentificeerd.",
"DNA-methylatie onderdrukt direct genen met niet-CpG-eilandpromotoren en creëert een nucleosoombezet promotor.",
"Met behulp van een nieuwe bio-informatica-pijplijn tonen we een opvallende anti-correlatie aan tussen nucleosoombezetting en DNA-methylatie bij CTCF-regio's die niet aanwezig is bij promotoren.",
"Drie posities bij de splice-sites vertonen een hoge CpG-rijke aanwezigheid en gaan gepaard met verhoogde nucleosoombezetting in een vlakke GC-architectuur.",
"De eerste groep heeft een hogere nucleosoombezetting op exonen dan op intronen, terwijl de tweede groep een zwakke nucleosoommarkering van exonen vertoont, wat suggereert dat een ander type epigenetische marker exonen onderscheidt van intronen wanneer het GC-gehalte vergelijkbaar is.",
"DNA-methylatie kan nucleosoompositionering bepalen.",
"DNA-methylatie bepaalt de nucleosoombezetting in de 5'-CpG-eilanden van tumorsuppressorgenen.",
"De inductie van DNA-hypomethylatiegebeurtenissen door genetische (DNMT1/DNMT3B-deficiënte cellen) of medicamenteuze (een DNA-demethylerend middel) benaderingen gaat gepaard met het verdrijven van nucleosomen uit eerder hypergemethyleerde CpG-eilanden van tumorsuppressorgenen.",
"Met deze globale benadering observeren we de afhankelijkheid van nucleosoombezetting van de DNA-methylatiestatus. Onze resultaten suggereren dus dat er een nauwe associatie bestaat tussen hypergemethyleerde CpG-eilanden en de aanwezigheid van nucleosomen, zodanig dat elk van deze epigenetische mechanismen de rekrutering van de ander kan bepalen.",
"Hoewel globale DNA-demethylatie is waargenomen na behandeling, is het onduidelijk in welke mate demethylatie veranderingen in nucleosoombezetting induceert, een belangrijke bepalende factor voor genexpressie.",
"Onze resultaten geven aan dat slechts een minderheid van de gedemethyleerde promotoren geassocieerd is met nucleosoomhermodellering, en deze zouden mogelijk de epigenetische drijvers kunnen zijn die het verlies van tumorigeniteit veroorzaken.",
"Met onderdrukte genen die vaak geassocieerd zijn met lokale DNA-hypermethylatie en toename van nucleosomen bij hun promotoren.",
"Transcriptie, histonmodificaties en DNA-methylatie veranderen deze \"grondtoestand\" door verschillende effecten te hebben op zowel nucleosoompositionering als -bezetting.",
"Om potentiële diversiteiten tussen CGI's systematisch te evalueren en uiteindelijk de link tussen diversiteit van CGI's en hun epigenetische variatie te verhelderen, analyseerden we de DNA-methylatiekaarten op nucleotide-resolutie (methylomen) van meerdere cellulaire oorsprongen.",
"De meestal ongemethyleerde CpG-eilanden hebben een verminderde nucleosoombezetting en zijn verrijkt in celtype-onafhankelijke bindingsplaatsen voor CTCF.",
"Daarentegen zijn buiten CpG-eilanden de meeste CpG's gemethyleerd, en oscilleert de gemiddelde methylatiedichtheid zodanig dat deze het hoogst is in de linkerregio tussen nucleosomen.",
"Abnormale verwerving van nucleosomen bij enhancer-geassocieerde NDR's gaat gepaard met hypermethylatie en epigenetische silenceringstekens, en omgekeerd, verlies van nucleosomen met demethylatie en epigenetische activatie.",
"Prominente uitzonderingen op de correlaties tussen gemethyleerde CpG-dichtheid en nucleosoombezetting omvatten CpG-eilanden gemarkeerd door H3K27me3 en CpG-arme heterochromatine gemarkeerd door H3K9me3, en deze modificaties, samen met DNA-methylatie, onderscheiden de belangrijkste silenceringmechanismen van het menselijke epigenoom.",
"Door het hele genoom was nucleosoombezetting gecorreleerd met bepaalde histonmethylatie- of acetylatiemodificaties.",
"We tonen verder aan dat de mate van nucleosoomdepletie bij promotoren direct gecorreleerd is met het expressieniveau en meerdere nucleosomen kan accommoderen en leveren genoomwijde bewijzen dat geëxprimeerde niet-CpG-eilandpromotoren nucleosoomarm zijn."
] | 787 | 712 |
2,331 | Welk R/Bioconductor-pakket is ontwikkeld voor de analyse van psychiatrische ziektegenen? | PsyGeNET is een kennisbron over psychiatrische ziekten en hun genen, ontwikkeld door tekstmining en gecureerd door domeinexperts. Psygenet2r is een R-pakket dat verschillende functies bevat om de PsyGeNET-database te benutten en de analyse en interpretatie ervan te vergemakkelijken. Het pakket biedt verschillende soorten queries aan de database, samen met diverse analyse- en visualisatietools, waaronder de studie van de anatomische structuren waarin de genen tot expressie komen en het verkrijgen van inzicht in de moleculaire functie van genen. Psygenet2r is vooral geschikt voor netwerkgeneeskunde-analyse van psychiatrische aandoeningen. | [
"psygenet2r: een R/Bioconductor-pakket voor de analyse van psychiatrische ziektegenen.",
"Psychiatrische aandoeningen hebben een grote impact op morbiditeit en mortaliteit. Genotype-fenotypebronnen voor psychiatrische ziekten zijn essentieel om de vertaling van onderzoeksresultaten naar betere patiëntenzorg mogelijk te maken. PsyGeNET is een kennisbron over psychiatrische ziekten en hun genen, ontwikkeld door tekstmining en gecureerd door domeinexperts.Resultaten: We presenteren psygenet2r, een R-pakket dat verschillende functies bevat om de PsyGeNET-database te benutten en de analyse en interpretatie ervan te vergemakkelijken. Het pakket biedt verschillende soorten queries aan de database, samen met diverse analyse- en visualisatietools, waaronder de studie van de anatomische structuren waarin de genen tot expressie komen en het verkrijgen van inzicht in de moleculaire functie van genen. Psygenet2r is vooral geschikt voor netwerkgeneeskunde-analyse van psychiatrische aandoeningen.",
"Het pakket is geïmplementeerd in R en is beschikbaar onder de MIT-licentie via Bioconductor ( http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/psygenet2r.html ).",
"Psygenet2r is vooral geschikt voor netwerkgeneeskunde-analyse van psychiatrische aandoeningen.",
"Psygenet2r is vooral geschikt voor netwerkgeneeskunde-analyse van psychiatrische aandoeningen."
] | 268 | 248 |
2,332 | Welke Janus-kinase richt decernotinib zich op? | Decernotinib (VX-509) is een krachtige en selectieve remmer van janus-kinase 3 (JAK3). | [
"Het doel van deze studie was om de potentie en selectiviteit te evalueren van de experimentele JAK3-remmer VX-509 (decernotinib) [(R)-2-((2-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)pyrimidin-4-yl)amino)-2-methyl-N-(2,2,2-trifluorethyl)butanamiden] tegen JAK3-kinase-activiteit en remming van JAK3-gemedieerde signalering in vitro en JAK3-afhankelijke fysiologische processen in vivo.",
"Deze resultaten tonen aan dat VX-509 JAK3 krachtig remt in enzymassays (Ki = 2,5 nM + 0,7 nM) en cellulaire assays die afhankelijk zijn van JAK3-activiteit (IC50-bereik, 50-170 nM), met beperkte of geen meetbare potentie tegen andere JAK-isotypen of niet-JAK-kinasen.",
"Deze bevindingen tonen aan dat VX-509 een selectieve en krachtige remmer is van JAK3 in vitro en de pro-inflammatoire respons moduleert in modellen van immuungemedieerde ziekten, zoals collageen-geïnduceerde artritis en vertraagde-type overgevoeligheid.",
"VX-509 (decernotinib) is een krachtige en selectieve janus-kinase 3-remmer die ontsteking vermindert in diermodellen van auto-immuunziekten."
] | 144 | 136 |
2,333 | Wat is de genetische basis van het vertraagde slaap-fase syndroom (DSPS)? | Circadiane genmutaties worden ook geassocieerd met circadiane ritmestoornissen zoals familiaal gevorderd slaap-fase syndroom, vertraagd slaap-fase syndroom en non-24-uurs slaap-waak syndroom. Mogelijke associatie van het humane leukocytenantigeen DR1 met vertraagd slaap-fase syndroom. De studie onderzocht het humane leukocytenantigeen (HLA), types A, B en DR, van 42 patiënten met vertraagd slaap-fase syndroom (DSPS) en vergeleek de frequenties van de antigenen met die van 117 gezonde controles. De vergelijking toonde aan dat de genfrequenties en positiviteiten van HLA-A, -B en -DR, behalve voor DR1, geen significante verschillen vertoonden tussen de patiënten en controles. De frequentie van HLA-DR1 was verhoogd bij de DSPS-patiënten vergeleken met die bij de gezonde controles (P = 0,0069 in positiviteit). Bij humane leukocytenantigeen (HLA) typering was de incidentie van DR1-positiviteit alleen significant hoger bij DSPS-patiënten dan bij gezonde proefpersonen. | [
"Circadiane genmutaties worden ook geassocieerd met circadiane ritmestoornissen zoals familiaal gevorderd slaap-fase syndroom, vertraagd slaap-fase syndroom en non-24-uurs slaap-waak syndroom.",
"Mogelijke associatie van het humane leukocytenantigeen DR1 met vertraagd slaap-fase syndroom.",
"De studie onderzocht het humane leukocytenantigeen (HLA), types A, B en DR, van 42 patiënten met vertraagd slaap-fase syndroom (DSPS) en vergeleek de frequenties van de antigenen met die van 117 gezonde controles.",
"De vergelijking toonde aan dat de genfrequenties en positiviteiten van HLA-A, -B en -DR, behalve voor DR1, geen significante verschillen vertoonden tussen de patiënten en controles.",
"De frequentie van HLA-DR1 was verhoogd bij de DSPS-patiënten vergeleken met die bij de gezonde controles (P = 0,0069 in positiviteit).",
"Bij humane leukocytenantigeen (HLA) typering was de incidentie van DR1-positiviteit alleen significant hoger bij DSPS-patiënten dan bij gezonde proefpersonen.",
"Recente vooruitgang in onderzoek naar de biologische klok heeft genetische analyse van circadiane ritme slaapstoornissen, zoals vertraagd slaap-fase syndroom (DSPS) en non-24-uurs slaap-waak syndroom (N-24), vergemakkelijkt.",
"Associatie van structurele polymorfismen in het humane period3-gen met vertraagd slaap-fase syndroom.",
"Een van de haplotypen was significant geassocieerd met DSPS (Bonferroni gecorrigeerde P = 0,037; odds ratio = 7,79; 95% BI 1,59-38,3) in onze studiepopulatie. Onze resultaten suggereren dat structurele polymorfismen in het hPer3-gen betrokken kunnen zijn bij de pathogenese van DSPS.",
"Een lengtepolymorfisme in het circadiane klokgen Per3 is gekoppeld aan vertraagd slaap-fase syndroom en extreme diurnale voorkeur.",
"Polymorfismen in de CLOCK-, BMAL1-, Per3- en TIMELESS-genen zijn geassocieerd met vatbaarheid voor stemmingsstoornissen, en single nucleotide polymorfismen en haplotypen in verschillende circadiane genen zijn waargenomen bij personen met bepaalde circadiane fenotypes, waaronder slechtere stemming in de avond, slapeloosheid bij manie en vroege, midden- of late slapeloosheid bij depressie.",
"Om de link te onderzoeken tussen extreme diurnale voorkeur, vertraagd slaap-fase syndroom en een lengtepolymorfisme in Per3",
"Het Per3-polymorfisme correleerde significant met extreme diurnale voorkeur, waarbij het langere allel geassocieerd was met ochtendmens zijn en het kortere allel met avondmens zijn. Het kortere allel was sterk geassocieerd met de patiënten met vertraagd slaap-fase syndroom, van wie 75% homozygoot was.",
"We bestudeerden de associatie tussen het AA-NAT-gen en vertraagd slaap-fase syndroom (DSPS). Resultaten geven aan dat er een significant verschil is in allelpositiviteit bij het single nucleotide polymorfisme dat betrokken is bij een aminozuursubstitutie van alanine naar threonine op positie 129 tussen patiënten met DSPS en gezonde controles. De frequentie van het 129 threonine-allel is significant hoger bij de patiënten dan bij de controles (P=0,0029). De gegevens suggereren dat AA-NAT een vatbaarheidsgen voor DSPS zou kunnen zijn.",
"Onze resultaten suggereren dat de breedtegraad een rol speelt in de invloed van het hPer3-genpolymorfisme op vertraagd slaap-fase syndroom en bevestigen eerdere gegevens die de associatie met ochtend-avond voorkeuren tonen.",
"Associatie van het lengtepolymorfisme in het humane Per3-gen met het vertraagde slaap-fase syndroom: heeft de breedtegraad er invloed op?"
] | 631 | 584 |
2,334 | Wat zijn jakinibs? | Jakinibs zijn Janus kinase (JAK) remmers. Ze worden beschouwd als een nieuwe klasse van kinase-remmers bij kanker en auto-immuunziekten. Jakinibs kunnen aanzienlijk verschillen in hun selectiviteit tegen JAKs. | [
"Jakinibs: een nieuwe klasse van kinase-remmers bij kanker en auto-immuunziekten.",
"Jakinibs: een nieuwe klasse van kinase-remmers bij kanker en auto-immuunziekten",
"Deze receptoren zijn afhankelijk van de Janus-familie van kinasen (Jaks) voor signaaltransductie. Onlangs is de eerste Jak-remmer (jakinib) goedgekeurd door de FDA en een tweede is aanbevolen voor goedkeuring.",
"Recente vooruitgang in de behandeling van RA is bereikt met janus kinase (JAK) remmers (Jakinibs), een oraal beschikbaar ziekte-modificerend anti-reumatisch medicijn dat de intracellulaire kinase JAK target en met een vergelijkbare werkzaamheid als biologische middelen.",
"Gezien deze veelbelovende bevindingen worden Jakinibs verwacht de volgende generatie verbindingen te vertegenwoordigen voor de behandeling van RA, en een aantal Jakinibs zijn momenteel in klinische onderzoeken. Jakinibs kunnen aanzienlijk verschillen in hun selectiviteit tegen JAKs; tofacitinib en baricitinib richten zich op meerdere JAKs, terwijl de meest recent ontwikkelde Jakinibs slechts één enkele JAK target."
] | 167 | 164 |
2,335 | Wat is de functie van het gen MDA5? | Melanoom differentiatie-geassocieerd gen 5 (MDA5) is een patroonherkenningsreceptor die viraal dubbelstrengs RNA (dsRNA) in het cytoplasma herkent en snelle aangeboren antivirale reacties initieert. MDA5 vormt een filamentachtig multimeer langs het dsRNA wat leidt tot oligomerisatie, die op zijn beurt het adaptor-eiwit mitochondriaal antiviraal signaleringsproteïne (MAVS) activeert om een signaalplatform te bieden voor de inductie van type I interferon (IFN) en pro-inflammatoire cytokines. De conformationele wisselwerking van MDA5 veroorzaakt antivirale verdediging, maar overmatige activatie van de MDA5-MAVS route kan leiden tot auto-immuunziekten. | [
"Het waarnemen van viraal RNA door de cytosolische receptoren RIG-I en melanoom differentiatie-geassocieerd gen 5 (MDA5) leidt tot een aangeboren antivirale respons.",
"De aangeboren immuunrespons van de gastheer op RNA-virusinfectie omvat voornamelijk pathogeen-herkennende toll-like receptoren (TLR's) TLR3 en TLR7 en retinoïnezuur-induceerbaar gen I-achtige receptor RIG-I en melanoom differentiatie-geassocieerd gen 5 (MDA5).",
"RNA PRR's bestaan uit TLR3, TLR7, TLR8, RIG-I, MDA5, NLRP3, NOD2 en enkele andere minderheden.",
"Melanoom differentiatie-geassocieerd gen 5 (MDA5) is een patroonherkenningsreceptor die viraal dubbelstrengs RNA (dsRNA) in het cytoplasma herkent en snelle aangeboren antivirale reacties initieert. MDA5 vormt een filamentachtig multimeer langs het dsRNA wat leidt tot oligomerisatie, die op zijn beurt het adaptor-eiwit mitochondriaal antiviraal signaleringsproteïne (MAVS) activeert om een signaalplatform te bieden voor de inductie van type I interferon (IFN) en pro-inflammatoire cytokines. De conformationele wisselwerking van MDA5 veroorzaakt antivirale verdediging, maar overmatige activatie van de MDA5-MAVS route kan leiden tot auto-immuunziekten.",
"Retinoïnezuur-induceerbaar gen-I (RIG-I)-achtige receptoren (RLR's), waaronder melanoom differentiatie-geassocieerd gen 5 (MDA5) en RIG-I, zijn cruciaal voor de herkenning door de gastheer van niet-eigen RNA's, vooral viraal RNA."
] | 261 | 257 |
2,336 | Wat is het geconserveerde motief van DEAD box-eiwitten? | Het geconserveerde motief is: Asp(D)-Glu-(E)-Ala(A)-Asp(D) | [
"DEAD box-eiwitten zijn veronderstelde RNA-helicases die betrokken zijn bij cellulaire processen waarbij de secundaire structuur van RNA wordt gewijzigd, zoals de initiatie van translatie en splicing. Deze eiwitten delen acht geconserveerde aminozuurmotieven, waaronder Asp(D)-Glu-(E)-Ala(A)-Asp(D), dat deel uitmaakt van een uitgebreider motief."
] | 57 | 52 |
2,337 | Welke individuen vertonen een voorkeur voor kolonisatie van de Prevotellaceae-bacteriën in hun darmen? | Hoewel het onderscheid tussen enterotypen als discrete clusters of een continuüm nader onderzoek vereist, hebben talrijke studies de wederzijdse uitsluiting aangetoond van de nauw verwante geslachten Prevotellaceae en Bacteroides in de darmmicrobiota van gezonde menselijke proefpersonen, waarbij Prevotella lijkt te fungeren als een onderscheidend taxon voor verblijf in meer agrarische samenlevingen. | [
"een nieuw lid van de familie Prevotellaceae dat werd geïsoleerd uit stoelmonsters van een 45-jarige patiënt.",
"Met behulp van univariate niet-parametrische statistieken waren er geen verschillen in alpha- of beta-diversiteit tussen AH8.1-dragers (categorieën I en II) en niet-dragers (categorieën III en IV), maar vier verschillende taxa (Prevotellaceae, Clostridium XVIII, Coprococcus, Enterorhabdus) hadden nominaal significant lagere abundantie bij AH8.1-dragers dan bij niet-dragers.",
"De toename van Bacteroidetes bleek te wijten te zijn aan een toename van leden van de families Bacteroidaceae of Prevotellaceae.",
"Fecale gemeenschappen groepeerden in eerder beschreven enterotypen die voornamelijk werden onderscheiden door niveaus van Bacteroides en Prevotella.",
"Hoewel het onderscheid tussen enterotypen als discrete clusters of een continuüm nader onderzoek vereist, hebben talrijke studies de wederzijdse uitsluiting aangetoond van de nauw verwante geslachten Prevotellaceae en Bacteroides in de darmmicrobiota van gezonde menselijke proefpersonen, waarbij Prevotella lijkt te fungeren als een onderscheidend taxon voor verblijf in meer agrarische samenlevingen",
"Lachnospiraceae, Ruminococcaceae, Bacteroidaceae, Prevotellaceae en Rickenellaceae waren de overheersende families die werden gedetecteerd in de actieve microbiota",
"Specifiek waren Firmicutes dominant bij personen met een normaal gewicht en bij obese personen, maar significant afgenomen bij personen na een maag-bypass, die een proportionele toename van Gammaproteobacteria hadden. Aantallen van de H(2)-producerende Prevotellaceae waren sterk verrijkt bij de obese personen.",
"Een vergelijkende sequentieanalyse toonde aan dat deze twee soorten leden zijn van de familie 'Prevotellaceae', maar fylogenetisch ver verwijderd (<88% sequentiegelijkheid) van de bekende geslachten die tot deze familie behoren, waaronder Prevotella, Hallela en Xylanibacter."
] | 289 | 297 |
2,338 | Beschrijf GARLIC (GWAS-gebaseerde Voorspellings Toolkit voor het Verbinden van Ziekten en Celtypen) | GARLIC (GWAS-gebaseerde Voorspellings Toolkit voor het Verbinden van Ziekten en Celtypen) is een bioinformatica toolkit voor het etiologisch verbinden van ziekten en celtype-specifieke regulatoire kaarten. GARLIC kan worden gebruikt om potentiële ziekteveroorzakende genetische varianten op te halen die overlappen met regulatoire sequenties van belang. Over het geheel genomen kan GARLIC aan verschillende belangrijke behoeften binnen het vakgebied van medische genetica voldoen, en zo mogelijk bijdragen aan het uiteindelijke doel om de ongrijpbare en complexe genetische basis van veelvoorkomende menselijke aandoeningen te onthullen. | [
"GARLIC: een bioinformatica toolkit voor het etiologisch verbinden van ziekten en celtype-specifieke regulatoire kaarten.",
"Gebaseerd op opkomend bewijs dat suggereert dat ziekte-geassocieerde SNP's vaak worden gevonden binnen celtype-specifieke regulatoire sequenties, presenteren wij hier GARLIC (GWAS-gebaseerde Voorspellings Toolkit voor het Verbinden van Ziekten en Celtypen), een gebruiksvriendelijke, multifunctionele software met een bijbehorende database en online viewer die, met behulp van globale kaarten van cis-regulatoire elementen, menselijke ziekten etiologisch kan verbinden met relevante celtypen. Bovendien kan GARLIC worden gebruikt om potentiële ziekteveroorzakende genetische varianten op te halen die overlappen met regulatoire sequenties van belang. Over het geheel genomen kan GARLIC aan verschillende belangrijke behoeften binnen het vakgebied van medische genetica voldoen, en zo mogelijk bijdragen aan het uiteindelijke doel om de ongrijpbare en complexe genetische basis van veelvoorkomende menselijke aandoeningen te onthullen.",
"Gebaseerd op opkomend bewijs dat suggereert dat ziekte-geassocieerde SNP's vaak worden gevonden binnen celtype-specifieke regulatoire sequenties, presenteren wij hier GARLIC (GWAS-gebaseerde Voorspellings Toolkit voor het Verbinden van Ziekten en Celtypen), een gebruiksvriendelijke, multifunctionele software met een bijbehorende database en online viewer die, met behulp van globale kaarten van cis-regulatoire elementen, menselijke ziekten etiologisch kan verbinden met relevante celtypen.",
"Bovendien kan GARLIC worden gebruikt om potentiële ziekteveroorzakende genetische varianten op te halen die overlappen met regulatoire sequenties van belang."
] | 265 | 297 |
2,339 | Hoe beïnvloedt Dst1 knock-out de transcriptie in gist? | Hoewel TFIIS een uitgesproken effect heeft op transcriptie-elongatie in vitro, heeft de verwijdering van DST1 geen groot effect op de levensvatbaarheid van cellen. We toonden aan dat: dst1- en rpb9-mutanten een synthetisch groeidefectief fenotype vertonen wanneer ze worden gecombineerd met fyv4-, gim5-, htz1-, yal011w-, ybr231c-, soh1-, vps71- en vps72-mutanten, wat verergerd wordt tijdens kieming of bij hoge zoutconcentraties. In vivo waren sommige dst1-mutanten gedeeltelijk defect in tRNA-synthese en vertoonden een verminderde Pol III-bezetting bij de restrictieve temperatuur. | [
"Hoewel TFIIS een uitgesproken effect heeft op transcriptie-elongatie in vitro, heeft de verwijdering van DST1 geen groot effect op de levensvatbaarheid van cellen.",
"Genetische interacties van DST1 in Saccharomyces cerevisiae suggereren een rol van TFIIS in de overgang van initiatie naar elongatie.",
"We toonden aan dat: (1) dst1- en rpb9-mutanten een synthetisch groeidefectief fenotype vertonen wanneer ze worden gecombineerd met fyv4-, gim5-, htz1-, yal011w-, ybr231c-, soh1-, vps71- en vps72-mutanten, wat verergerd wordt tijdens kieming of bij hoge zoutconcentraties; ",
"Toch vinden we sterke genetische interactie van rpb4∆ met mutanten in vele transcriptie-elongatiefactoren zoals Paf1, Spt4, Dst1, Elp3 en Rpb9.",
"In vivo waren sommige dst1-mutanten gedeeltelijk defect in tRNA-synthese en vertoonden een verminderde Pol III-bezetting bij de restrictieve temperatuur.",
"Co-immunoprecipitatie-experimenten toonden aan dat TFIIS kan binden aan de Cdk8-module en SAGA in celvrije extracten. spt8Delta- en dst1Delta-mutanten waren gevoelig voor nucleotide-uitputtende geneesmiddelen en epistatisch ten opzichte van null-mutanten van de RNA-polymerase II-subunit Rpb9, wat suggereert dat hun elongatiedefecten worden gemedieerd door Rpb9. rpb9Delta, spt8Delta en dst1Delta waren lethaal in cellen die de Rpb4-subunit misten.",
"Ess1 werkt tegen elongatiefactoren Dst1 en Spt4/5, en overexpressie van ESS1 maakt cellen gevoeliger voor de elongatie-remmer 6-AU.",
"Ook had een DST1 en RPB9 dubbelmutant een ernstiger defect in transcriptietrouw vergeleken met de DST1 genverwijderingsmutant, wat suggereert dat Rpb9 transcriptietrouw handhaaft via twee mechanismen: versterking van S-II afhankelijke knipstimulerende activiteit en S-II onafhankelijke functie(s).",
"We tonen daarnaast aan dat Dst1, een homologe van de zoogdier transcriptie-elongatiefactor TFIIS, interfereert met NER-afhankelijke reparatie van AP-lesies terwijl het het homologe recombinatiepad onderdrukt.",
"Over het algemeen bemiddelen Def1 en Dst1 zeer verschillende uitkomsten als reactie op AP-geïnduceerde transcriptiestop.",
"Toch vinden we sterke genetische interactie van rpb4∆ met mutanten in vele transcriptie-elongatiefactoren zoals Paf1, Spt4, Dst1, Elp3 en Rpb9.",
"Ook had een DST1 en RPB9 dubbelmutant een ernstiger defect in transcriptietrouw vergeleken met de DST1 genverwijderingsmutant, wat suggereert dat Rpb9 transcriptietrouw handhaaft via twee mechanismen: versterking van S-II afhankelijke knipstimulerende activiteit en S-II onafhankelijke functie(s).",
"Echter, verwijdering van DST1, het gen dat de gist-homoloog van TFIIS codeert, had slechts een klein effect op transcriptietrouw, zoals bepaald met deze test.",
"Verwijderingen van drie gistgenen, SET2, CDC73 en DST1, betrokken bij transcriptie-elongatie en/of chromatine-metabolisme, werden gebruikt in combinatie met genetische array-technologie om ongeveer 4700 gistverwijderingen te screenen en dubbelverwijderingsmutanten te identificeren die synthetische groeidefecten veroorzaken."
] | 479 | 451 |
2,340 | Welk medicijn kan worden teruggedraaid met idarucizumab? | Idarucizumab is een antilichaamfragment dat specifiek de door dabigatran veroorzaakte anticoagulatie terugdraait. | [
"Tot nu toe is slechts één omkeeragent goedgekeurd door de Food and Drug Administration (FDA), namelijk idarucizumab voor een van de DOAC's, namelijk dabigatran.",
"Nieuwe orale anticoagulantia zoals apixaban, rivaroxaban of dabigatran kunnen de voorkeur krijgen boven vitamine K-antagonisten bij patiënten zonder kanker of nierfalen, vooral na de ontwikkeling van omkeeragentia zoals idarucizumab en andexanet alfa.",
"ACHTERGROND EN DOELSTELLINGEN: Idarucizumab is een antilichaamfragment dat specifiek de door dabigatran veroorzaakte anticoagulatie terugdraait.",
"Idarucizumab resulteerde in onmiddellijke, volledige en aanhoudende terugdraaiing van de anticoagulerende activiteit van dabigatran en was veilig en goed verdragen bij middelbare leeftijd, ouderen en nierpatiënten.",
"Effect van leeftijd en nierfunctie op de farmacokinetiek van idarucizumab en de door idarucizumab gemedieerde terugdraaiing van dabigatran-anticoagulantie in een gerandomiseerde, dubbelblinde, crossover fase Ib-studie.",
"We bespreken ook terugdraaiingsstrategieën, zowel specifiek als niet-specifiek, voor elk medicijn, inclusief het voorkeursgebruik van idarucizumab voor de terugdraaiing van dabigatran en twee middelen, andexanet en ciraparantag, die momenteel in ontwikkeling zijn voor de terugdraaiing van rivaroxaban, apixaban en edoxaban.",
"Idarucizumab is een gericht omkeeragent dat is goedgekeurd voor de urgente terugdraaiing van de anticoagulerende effecten van dabigatran.",
"CONCLUSIES: De eerste gegevens suggereren een duidelijke rol voor idarucizumab bij de behandeling van bloedingen geassocieerd met dabigatran.",
"De toediening van 5 g intraveneus idarucizumab draaide snel en volledig de anticoagulerende activiteit van dabigatran terug, beoordeeld met routinematige en specifieke stollingstests (aPTT van 75 naar 26 s, PT van 26 naar 11 s en verdunde trombinetijd van 92 naar 27 s).",
"Idarucizumab, een monoklonaal antilichaamfragment dat met hoge affiniteit aan dabigatran bindt, wordt ontwikkeld als een specifiek tegengif voor dabigatran.",
"Een gerandomiseerde studie bij gezonde vrijwilligers om de veiligheid, verdraagbaarheid en farmacokinetiek van idarucizumab, een specifiek tegengif voor dabigatran, te onderzoeken.",
"Evaluatie van de rol van idarucizumab, een gehumaniseerd monoklonaal antilichaamfragment, als specifiek omkeeragent voor de anticoagulerende activiteit van dabigatran en een overzicht van de farmacologie, farmacokinetische eigenschappen, werkzaamheid en veiligheid van dit middel.",
"Dabigatran etexilaat is een orale trombine-remmer die kan worden teruggedraaid door idarucizumab.",
"Bij een intracerebrale bloeding gerelateerd aan dabigatran kan de anticoagulatie snel worden teruggedraaid met idarucizumab.",
"Idarucizumab is een omkeeragent voor dabigatran etexilaat.",
"Idarucizumab draaide het anticoagulerende effect van dabigatran binnen enkele minuten volledig terug.",
"Dabigatran etexilaat is een orale trombine-remmer die kan worden teruggedraaid door idarucizumab.",
"INLEIDING Idarucizumab is een omkeeragent voor dabigatran etexilaat.",
"Idarucizumab is een gehumaniseerd monoklonaal antilichaamfragment voor het terugdraaien van de anticoagulerende effecten van dabigatran.",
"Idarucizumab is een monoklonaal antilichaamfragment dat specifiek gericht is op dabigatran.",
"Idarucizumab is een monoklonaal antilichaamfragment dat specifiek gericht is op dabigatran.",
"ACHTERGROND EN DOELSTELLINGEN Idarucizumab is een antilichaamfragment dat specifiek de door dabigatran veroorzaakte anticoagulatie terugdraait.",
"Idarucizumab, een monoklonaal antilichaamfragment, bindt direct aan dabigatran etexilaat en neutraliseert de activiteit ervan.",
"Idarucizumab is een antilichaamfragment dat met hoge affiniteit aan dabigatran bindt.",
"CONCLUSIE Terugdraaien van dabigatran etexilaat met idarucizumab was veilig en succesvol zonder interacties met recombinant weefselplasminogeenactivator.",
"RESULTATEN Idarucizumab vertegenwoordigt een nieuwe behandelingsoptie omdat het het enige gehumaniseerde, monoklonale antilichaamfragment is dat specifiek aan dabigatran bindt.",
"In 2015 werd het gehumaniseerde monoklonale antilichaamfragment idarucizumab goedgekeurd voor snelle (minuten) terugdraaiing van de anticoagulerende effecten van dabigatran.",
"Idarucizumab is een specifiek tegengif gericht op het terugdraaien van de directe trombineremmer dabigatran, die recentelijk is goedgekeurd voor gebruik in de VS.",
"Idarucizumab, een antilichaamfragment gericht op dabigatran, is het eerste specifieke tegengif voor een NOAC dat is goedgekeurd, maar de ervaring uit de praktijk is beperkt.",
"Idarucizumab neutraliseerde plasmaconcentraties van dabigatran en draaide de effecten van het medicijn op stollingsvariabelen terug.",
"Idarucizumab is een antilichaamfragment dat specifiek de door dabigatran veroorzaakte anticoagulatie terugdraait.",
"Idarucizumab, een antilichaamfragment, werd ontwikkeld om de anticoagulerende effecten van dabigatran terug te draaien.",
"Idarucizumab draaide ook de effecten van dabigatran terug en was, in tegenstelling tot PCC's, niet geassocieerd met overcorrectie van trombinevorming.",
"Dabigatran etexilaat (DE) verlengde dosisafhankelijk de verdunde trombinetijd en de bloedingstijd van de staartader, welke werden teruggedraaid door idarucizumab.",
"In dit artikel bespreken we het bewijs met betrekking tot de veiligheid, verdraagbaarheid en werkzaamheid van idarucizumab voor het terugdraaien van het effect van dabigatran.",
"Dit was tot de recente goedkeuring door de Food and Drug Administration van idarucizumab, een potentieel omkeeragent voor dabigatran.",
"Idarucizumab draaide de door dabigatran geïnduceerde anticoagulatie onmiddellijk en volledig terug op een dosisafhankelijke wijze; de gemiddelde ratio van dag 4 AUEC2-12 tot dag 3 AUEC2-12 voor dTT was 1,01 met placebo, 0,26 met 1 g idarucizumab (74% reductie), 0,06 met 2 g idarucizumab (94% reductie), 0,02 met 4 g idarucizumab (98% reductie) en 0,01 met 5 g plus 2,5 g idarucizumab (99% reductie).",
"Idarucizumab voor het terugdraaien van door dabigatran geïnduceerde anticoagulatie: een systematische review."
] | 720 | 739 |
2,341 | Wat is de functie van de TMEM132-genen? | De extracellulaire delen van TMEM132-eiwitten bevatten vijf geconserveerde domeinen, waaronder drie tandem immunoglobuline-domeinen en een cohesine-domeinhomoloog, het eerste dergelijke domein dat bij dieren is gevonden. Deze bevindingen voorspellen sterk een functie in cellulaire adhesie voor de TMEM132-familie, die het extracellulaire medium verbindt met het intracellulaire actine-cytoskelet. | [
"TMEM132: een oude architectuur van cohesine- en immunoglobuline-domeinen definieert een nieuwe familie van neurale adhesiemoleculen.",
"Hier tonen we de volledige domeinarchitectuur van menselijke TMEM132-familie-eiwitten, opgelost met behulp van diepgaande sequentie- en structurele analyse. We onthullen dat het vijf eerder ondergewaardeerde celadhesiemoleculen zijn waarvan de domeinarchitectuur een vroege holozoïsche oorsprong heeft, vóór het ontstaan van choanoflagellaten en metazoa. De extracellulaire delen van TMEM132-eiwitten bevatten vijf geconserveerde domeinen, waaronder drie tandem immunoglobuline-domeinen en een cohesine-domeinhomoloog, het eerste dergelijke domein dat bij dieren is gevonden. Deze bevindingen voorspellen sterk een functie in cellulaire adhesie voor de TMEM132-familie, die het extracellulaire medium verbindt met het intracellulaire actine-cytoskelet.",
"De moleculaire functies van TMEM132-genen blijven slecht begrepen en onderzocht, ondanks dat mutaties ervan geassocieerd zijn met niet-syndromisch gehoorverlies, paniekstoornis en kanker.",
"Deze bevindingen voorspellen sterk een functie in cellulaire adhesie voor de TMEM132-familie, die het extracellulaire medium verbindt met het intracellulaire actine-cytoskelet.",
"De extracellulaire delen van TMEM132-eiwitten bevatten vijf geconserveerde domeinen, waaronder drie tandem immunoglobuline-domeinen en een cohesine-domeinhomoloog, het eerste dergelijke domein dat bij dieren is gevonden.",
"Deze bevindingen voorspellen sterk een functie in cellulaire adhesie voor de TMEM132-familie, die het extracellulaire medium verbindt met het intracellulaire actine-cytoskelet."
] | 248 | 238 |
2,342 | Speelt DDX54 een rol in de DNA-schade respons? | Ja. DDX54, een kandidaat genotoxische stress-responsieve RNA-helicase, reguleert transcriptiedynamiek tijdens de DNA-schade respons. | [
"DDX54 reguleert transcriptiedynamiek tijdens de DNA-schade respons.",
"De bijdrage van post-transcriptionele genregulerende netwerken aan de DNA-schade respons (DDR) is niet uitgebreid bestudeerd. Hier identificeerden we systematisch RNA-bindende eiwitten die verschillend interageren met gepolyadenyleerde transcripties na blootstelling van menselijke borstkankercellen aan ioniserende straling (IR). Interessant is dat meer dan 260 eiwitten, waaronder veel nucleolaire eiwitten, een verhoogde binding aan poly(A)+RNA vertoonden in IR-blootgestelde cellen. De functionele analyse van DDX54, een kandidaat genotoxische stress-responsieve RNA-helicase, toonde aan dat dit eiwit een onmiddellijke tot vroege DDR-regulator is die vereist is voor de splicing-efficiëntie van zijn doelwit IR-geïnduceerde pre-mRNA's. Na IR-blootstelling werkt DDX54 door verhoogde interactie met een goed gedefinieerde klasse van pre-mRNA's die introns met zwakke acceptorspleetplaatsen bevatten, evenals door eiwit-eiwitcontacten binnen componenten van U2 snRNP en het spliceosomale B-complex, wat resulteert in lagere intronretentie en hogere verwerkingssnelheden van zijn doeltranscripten. Omdat DDX54 de overleving bevordert na blootstelling aan IR, kunnen de expressie en/of mutatiefrequentie ervan invloed hebben op DDR-gerelateerde pathologieën. Ons werk wijst op het belang van vele niet-gekarakteriseerde RBPs die mogelijk betrokken zijn bij de DDR.",
"De functionele analyse van DDX54, een kandidaat genotoxische stress-responsieve RNA-helicase, toonde aan dat dit eiwit een onmiddellijke tot vroege DDR-regulator is die vereist is voor de splicing-efficiëntie van zijn doelwit IR-geïnduceerde pre-mRNA's."
] | 229 | 224 |
2,343 | Noem de belangrijkste klinische kenmerken van het POEMS-syndroom. | POEMS is een acroniem voor de belangrijkste klinische kenmerken van het syndroom, namelijk Polyneuropathie, Organomegalie, Endocrinopathie, M-eiwit en Huidafwijkingen. Andere kenmerken zijn papiloedeem, extravasculair volume-overload, sclerotische botlaesies, trombocytose en Castleman-ziekte. Het is een multisystemische aandoening met een goede langetermijnprognose. | [
"Het POEMS-syndroom is een zeldzaam paraneoplastisch syndroom secundair aan een plasmaceldyscrasie. Het herkennen van een combinatie van perifere neuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale plasmaproliferatieve aandoening, huidveranderingen, papiloedeem, extravasculair volume-overload, sclerotische botlaesies, trombocytose en Castleman-ziekte is de eerste stap in de behandeling van de ziekte.",
"De behandeling van polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen (POEMS) syndroom moet gericht zijn op de onderliggende plasmacelklonale afwijking met risicogeadapteerde therapie op basis van de omvang van de plasmacelaandoening.",
"Polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale plasmacelaandoening, huidveranderingen (POEMS) syndroom is een zeldzame paraneoplastische aandoening.",
"POEMS is een acroniem voor de belangrijkste klinische kenmerken van het syndroom, namelijk Polyneuropathie, Organomegalie, Endocrinopathie, M-eiwit en Huidafwijkingen.",
"POEMS-syndroom (polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen) is een multisystemische aandoening met een goede langetermijnprognose.",
"De associatie van polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen vormt een karakteristiek multisysteemsyndroom, Crow-Fukase syndroom, of acroniem POEMS-syndroom.",
"Polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen (POEMS) syndroom is een multisystemische aandoening die voortkomt uit een onderliggende plasmaceldyscrasie.",
"Polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen (POEMS) syndroom is een zeldzame aandoening gerelateerd aan een paraneoplastisch syndroom secundair aan een onderliggende plasmacelaandoening.",
"Pulmonale hypertensie is een van de bekende klinische manifestaties van polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen (POEMS) syndroom, voorkomend bij ongeveer 25-30% van de getroffen personen.",
"Polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen (POEMS) syndroom is een zeldzame aandoening.",
"Polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen (POEMS) syndroom, een plasmaceldyscrasie geassocieerd met pulmonale hypertensie, is in het verleden behandeld met anticytokinestrategieën met een slechte uitkomst.",
"Een 48-jarige man met polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen (POEMS) syndroom had bilateraal papiloedeem (ODE), bilaterale cystoïde macula-oedeem (CME), anasarca en verhoogde serumwaarden van vasculair endotheliaal groeifactor (VEGF).",
"Een 39-jarige vrouw presenteerde zich met polyneuropathie, hepatomegalie, splenomegalie, endocrinopathie, monoklonaal eiwit en huidveranderingen, verschillende van de vele klinische kenmerken van het recent beschreven POEMS-syndroom.",
"Het acroniem POEMS is afgeleid van de belangrijkste kenmerken van het syndroom, namelijk 'polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidlaesies'.",
"POEMS-syndroom, ook bekend als Crow-Fukase syndroom, vertegenwoordigt een zeldzaam multisysteemsyndroom gekenmerkt door polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, M-eiwit en huidveranderingen.",
"Polyneuropathie is vaak een eerste manifestatie van polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, M-eiwit en huidveranderingen (POEMS) syndroom en daarom wordt deze aandoening vaak verkeerd gediagnosticeerd als chronische inflammatoire demyeliniserende polyneuropathie (CIDP).",
"POEMS-syndroom is een zeldzame paraneoplastische aandoening, vaak geassocieerd met Castleman-ziekte, die zich manifesteert met progressieve distale polyneuropathie en een monoklonale plasmacelaandoening, vaak vergezeld van endocrinopathie, organomegalie, huidveranderingen, sclerotische botlaesies, ascites, erytrocytose en trombocytose.",
"POEMS-syndroom, een zeldzame multisystemische ziekte, is een variant van osteosclerotisch myeloom en wordt gekenmerkt door polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale eiwitten en huidveranderingen.",
"Wij rapporteren een geval van een 64-jarige man met POEMS (polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen) syndroom die eerder verkeerd was gediagnosticeerd als systemische sclerose.",
"POEMS-syndroom is een zeldzame plasmaceldyscrasie gekenmerkt door polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, M-eiwit en huidveranderingen.",
"Het POEMS (polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidveranderingen) syndroom is een zeldzame variant van plasmaceldyscrasie met multisystemische manifestaties.",
"Een 39-jarige vrouw presenteerde zich met polyneuropathie, hepatomegalie, splenomegalie, endocrinopathie, monoklonaal eiwit en huidveranderingen, verschillende van de vele klinische kenmerken van het recent beschreven POEMS-syndroom. Daarnaast had zij Castleman-ziekte, angiofolliculaire lymfeklierhyperplasie. In dit geval was ascites een belangrijk presenteerbaar kenmerk, waardoor het POEMS-syndroom moet worden toegevoegd aan de lijst van zeldzame oorzaken van ascites. Elektronenmicroscopie van de lever toonde perisinusoïdale fibrose.",
"Het POEMS-syndroom is een zeldzame multisystemische aandoening met polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie in diverse vormen, productie van monoklonaal M-component en huidveranderingen. Wij beschrijven een 46-jarige man die ascites ontwikkelde één jaar na het begin van perifere neuropathie met bijbehorende spieratrofie en toenemende zwakte. Uitgebreide evaluatie toonde aan dat de patiënt geen onderliggende leverziekte, maligniteit, infectie of hart- of nierziekte had. De ascites reageerde aanvankelijk op hoge dosis corticosteroïdtherapie. De patiënt had veel klinische kenmerken van het beschreven POEMS-syndroom, waaronder sclerotische botlaesies, een persistente lambda paraproteïne en refractaire ascites. In dit geval was ascites een belangrijk presenteerbaar kenmerk, waardoor het POEMS-syndroom moet worden toegevoegd aan de lijst van zeldzame oorzaken van refractaire ascites.",
"POEMS-syndroom is een paraneoplastische manifestatie geassocieerd met hematopoëtische aandoeningen zoals multipel myeloom en Castleman-ziekte. POEMS is een acroniem voor de belangrijkste klinische kenmerken van het syndroom, namelijk polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, M-eiwit en huidafwijkingen. Glomeruloïde hemangiomen worden beschouwd als een specifieke klinische marker van het POEMS-syndroom, hoewel ze niet pathognomonisch zijn. Hun aanwezigheid moet echter verdenking op dit syndroom oproepen of clinici waarschuwen voor mogelijke toekomstige ontwikkeling, aangezien deze laesies jaren vóór het begin van het syndroom kunnen verschijnen. Wij rapporteren de gevallen van 2 vrouwen met plasmaceldyscrasieën en plotselinge aanvang van laesies met een vasculaire uitstraling en histologische bevindingen die consistent zijn met glomeruloïde hemangiomen. Het herkennen van deze vasculaire tumor is belangrijk voor de vroege diagnose van het POEMS-syndroom.",
"POEMS-syndroom is een zeldzame verzameling van aandoeningen geassocieerd met plasmaceldyscrasie. Het acroniem POEMS is afgeleid van de belangrijkste kenmerken van het syndroom, namelijk polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonale gammopathie en huidlaesies. Andere klinische kenmerken zijn de aanwezigheid van sclerotische botlaesies, Castleman-ziekte, papiloedeem, pleuravocht, oedeem, ascites, erytrocytose en trombocytose. Myeloom is de meest voorkomende plasmaceldyscrasie geassocieerd met het POEMS-syndroom. Nierbetrokkenheid is zeldzaam en nierbiopsie wordt gekenmerkt door glomerulaire betrokkenheid met membranoproliferatieve glomerulonefritis en endotheliale schade. Wij rapporteren een geval van een 67-jarige man die zich presenteerde met klinische kenmerken die voldeden aan de diagnostische criteria van het POEMS-syndroom en die een snel progressieve nierinsufficiëntie had. Nierbiopsie toonde uitgebreide interstitiële infiltratie door plasmacellen en gelijktijdige aanwezigheid van klassieke polyarteritis nodosa. Hoewel associatie met vasculitis van kleine bloedvaten is gerapporteerd bij patiënten met POEMS-syndroom, is dit voor zover wij weten het eerste rapport van POEMS-syndroom geassocieerd met vasculitis van middelgrote bloedvaten.",
"POEMS-syndroom, ook bekend als Crow-Fukase syndroom, vertegenwoordigt een zeldzaam multisysteemsyndroom gekenmerkt door polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, M-eiwit en huidveranderingen. Hypothyreoïdie is een van de veelvoorkomende endocriene afwijkingen die centrale kenmerken zijn van het POEMS-syndroom. Klinische gegevens met betrekking tot de meting van de schildklierfunctie en de klinische betekenis ervan bij het POEMS-syndroom zijn nog zeldzaam. Hier rapporteren wij 24 gevallen met POEMS-syndroom waarbij schildklierfunctie en klinische manifestaties werden bestudeerd en een geassocieerde analyse werd uitgevoerd tussen hypothyreoïdie en oedeem/vochtophopingen. Van de 24 patiënten met POEMS-syndroom had 17 (70,8%) een erkende hypothyreoïdie, waaronder 11 klinische hypothyreoïdie en 6 subklinische hypothyreoïdie. Veertien patiënten (58,3%) hadden enige vorm van extravasculair volume-overload. Van de 14 patiënten met oedeem/vochtophopingen werden er 12 gediagnosticeerd met hypothyreoïdie. Hypothyreoïdie kan een van de oorzaken zijn van oedeem/vochtophopingen. Na behandeling met schildklierhormoon en chemotherapie verbeterden de symptomen van hypothyreoïdie en oedeem/vochtophopingen aanzienlijk.",
"Wij presenteren een geval van een vrouw met een uniek multisysteemsyndroom, POEMS-syndroom, en bijbehorende endocriene afwijkingen. Het POEMS-acroniem omvat de dominante kenmerken: polyneuropathie, organomegalie, endocrinopathie, monoklonaal eiwit (M-eiwit) en huidveranderingen. De associatie tussen plasmaceldyscrasie en polyneuropathie werd beschreven in 1956 door Crow. De belangrijkste kenmerken werden in 1980 door Bardwick samengevat in het acroniem POEMS. Het polysymptomatische klinische beeld, het progressieve beloop en het ontbreken van gelijktijdige manifestaties van de belangrijkste kenmerken bemoeilijken de diagnose. In dit geval waren de eerste symptomen sensomotorische polyneuropathie, perifere oedeem, osteosclerotische botlaesies, huidveranderingen en organomegalie, die de diagnose met 3 jaar voorafgingen. De eerste endocrinopathie was hypothyreoïdie. De definitieve diagnose werd vertraagd omdat we de aanwezigheid van M-eiwit niet konden detecteren; immuno-elektroforese vond het niet, maar analyse met immunofixatie detecteerde M-eiwit in serum en urine. Binnen 3 jaar na de eerste symptomen ontwikkelde zij hypogonadisme, aanvankelijk hypergonadotroop. Eerst werd monotherapie met corticosteroïden gebruikt, daarna melfalan met prednison vanwege progressie van de ziekte. Thalidomide werd in de therapie gebruikt; dit is een anti-VEGF-middel. Een van de bijwerkingen van thalidomidebehandeling is progressie van polyneuropathie, wat bij deze patiënt werd waargenomen. Na het beëindigen van deze therapie kreeg zij chemotherapie. Dit casusrapport benadrukt de noodzaak van constante observatie van patiënten met POEMS-syndroom omdat er een mogelijkheid is dat zij andere aandoeningen ontwikkelen. Bij het voorkomen van polyneuropathie en plasmaceldyscrasie moet aan deze ziekte worden gedacht."
] | 1,444 | 1,312 |
2,344 | Welk gen gerelateerd aan retinale dystrofie wordt door het AAV2-hRPE65v2 medicijn gericht? | AAV2-hRPE65v2, ook wel voretigene neparvovec genoemd, richt zich op het RPE65-gen, waarvan mutaties leiden tot retinale dystrofie. | [
"Voretigene neparvovec genvervanging verbeterde de functionele visie bij RPE65-gemedieerde erfelijke retinale dystrofie die voorheen medisch onbehandelbaar was.",
"In deze open-label, gerandomiseerde, gecontroleerde fase 3 studie uitgevoerd op twee locaties in de VS, kwamen personen van 3 jaar of ouder in aanmerking met in elk oog een beste gecorrigeerde gezichtsscherpte van 20/60 of slechter, of een gezichtsveld van minder dan 20 graden in een willekeurige meridiaan, of beide, met een bevestigde genetische diagnose van biallelische RPE65-mutaties, voldoende levensvatbaar netvlies, en het vermogen om gestandaardiseerde multi-luminantie mobiliteitstests (MLMT) uit te voeren binnen het geëvalueerde luminantiebereik.",
"Werkzaamheid en veiligheid van voretigene neparvovec (AAV2-hRPE65v2) bij patiënten met RPE65-gemedieerde erfelijke retinale dystrofie: een gerandomiseerde, gecontroleerde, open-label, fase 3 studie."
] | 131 | 139 |
2,345 | Wat is de functie van gist TERRA RNA's? | De uiteinden van lineaire eukaryote chromosomen worden getranscribeerd in verschillende soorten niet-coderende transcripties (het telomerische transcriptome), waaronder TERRA (telomerische herhaling-bevattende RNA) moleculen. TERRA maakt deel uit van de DNA-schade respons die wordt geactiveerd door disfunctionele telomeren. Naast zijn rol als sjabloon voor telomerisch DNA-synthese, is aangetoond dat telomerase RNA functioneert als een flexibel raamwerk voor eiwitsubunits van het RNP holo-enzym. | [
"We tonen verder aan dat TERRA (Telomeric Repeat-containing RNA) verhoogd is in post-mitotische cellen met korte telomeren en correleert met telomeer herschikkingen.",
"Net als bij mens en gist, bevat schizosaccharomyces cerevisiae een populatie van telomerische RNA-moleculen met G-rijke telomerische herhalingen die worden getranscribeerd van de subtelomeer naar de telomeer.",
"De uiteinden van lineaire eukaryote chromosomen worden getranscribeerd in verschillende soorten niet-coderende transcripties (het telomerische transcriptome), waaronder TERRA (telomerische herhaling-bevattende RNA) moleculen.",
"TERRA maakt deel uit van de DNA-schade respons die wordt geactiveerd door disfunctionele telomeren.",
"Telomeric repeat-containing RNA (TERRA) is betrokken bij de controle van heterochromatine en telomerase.",
"Gist TERRA wordt gereguleerd door telomeer-bindende eiwitten op een chromosoomuiteinde-specifieke wijze die afhankelijk is van subtelomerische repetitieve DNA-elementen.",
"Voorbeelden hiervan zijn telomerase RNA en telomeer-gecodeerde transcripties. Naast zijn rol als sjabloon voor telomerisch DNA-synthese, is aangetoond dat telomerase RNA functioneert als een flexibel raamwerk voor eiwitsubunits van het RNP holo-enzym.",
"Hier presenteren we gedetailleerde protocollen voor live-cel imaging van de Saccharomyces cerevisiae telomerase RNA-subunit, genaamd TLC1, en ook van het niet-coderende telomerische herhaling-bevattende RNA TERRA.",
"Live-cel imaging van telomerase RNA en TERRA in gist.",
"We tonen hier aan dat TERRA RNA interacteert met verschillende telomeer-geassocieerde eiwitten, waaronder telomeer herhalingsfactoren 1 (TRF1) en 2 (TRF2), subunits van het origin recognition complex (ORC), heterochromatine-eiwit 1 (HP1), histon H3 trimethyl K9 (H3 K9me3), en leden van het DNA-schade detectiepad.",
"Telomeer herhaling coderend RNA, aangeduid als TERRA, is geïdentificeerd als een potentieel onderdeel van gist- en zoogdier-telomeren. We tonen hier aan dat TERRA RNA interacteert met verschillende telomeer-geassocieerde eiwitten, waaronder telomeer herhalingsfactoren 1 (TRF1) en 2 (TRF2), subunits van het origin recognition complex (ORC), heterochromatine-eiwit 1 (HP1), histon H3 trimethyl K9 (H3 K9me3) en leden van het DNA-schade detectiepad. SiRNA-depletie van TERRA veroorzaakte een toename van telomeer disfunctie geïnduceerde focale afwijkingen in metafase telomeren en een verlies van histon H3 K9me3 en ORC op telomeer herhalings-DNA. Eerdere studies vonden dat het TRF2 amino-terminale GAR-domein ORC naar telomeren rekruteerde. We tonen nu aan dat TERRA RNA direct kan interageren met het TRF2 GAR-domein en ORC1 om een stabiel ternair complex te vormen. We concluderen dat TERRA de interactie tussen TRF2 en ORC faciliteert en een centrale rol speelt in het structureel onderhoud van telomeren en de vorming van heterochromatine.",
"Telomeren spelen cruciale rollen in het behoud van genoomintegriteit en de controle van cellulaire veroudering. De meeste eukaryote telomeren kunnen worden getranscribeerd om een telomerische herhaling-bevattende RNA (TERRA) te genereren die als heterogeen nucleair RNA aanwezig blijft en ontwikkelingsmatig gereguleerd kan worden. De precieze functie en regulatie van TERRA in normale en kankercelontwikkeling blijft echter slecht begrepen. Hier tonen we aan dat TERRA zich ophoopt in sterk prolifererende normale en kankercellen en grote nucleaire focale vormen die verschillen van eerder gekarakteriseerde markers van DNA-schade of replicatiestress. Met behulp van een muismodel voor medulloblastoom aangedreven door chronische Sonic Hedgehog (SHH) signalering werd TERRA RNA gedetecteerd in tumorcellen maar niet in aangrenzende normale cellen, met zowel RNA fluorescentie in situ hybridisatie (FISH) als northern blotting. RNA FISH toonde de vorming van TERRA focale (TERFs) in de nucleaire regio's van snel prolifererende tumorcellen. In het normaal ontwikkelend cerebellum konden TERRA aggregaten ook worden gedetecteerd in sterk prolifererende zones van voorlopercellen van neuronen. SHH kon TERRA-expressie in gezuiverde granule voorlopercellen in vitro verhogen, wat suggereert dat proliferatiesignalen bijdragen aan TERRA-expressie in responsief weefsel. TERRA focale colocaliseerden niet met γH2AX focale, promyelocytaire leukemie (PML) of Cajal-lichamen in muizentumorweefsel. We leveren ook bewijs dat TERRA verhoogd is in diverse menselijke kankers. Deze bevindingen suggereren dat verhoogde TERRA-niveaus een nieuwe vroege vorm van telomeerregulatie weerspiegelen tijdens replicatiestress en kankercel-evolutie, en dat TERRA RNA-aggregaten mogelijk een nieuw nucleair lichaam vormen in sterk prolifererende zoogdiercellen."
] | 697 | 663 |
2,346 | Wat zijn de 4 kardinale tekenen van ontsteking volgens Celsus? | roodheid of rubor, warmte of calor, zwelling of tumor, en pijn of dolor | [
"Tumor, calor, rubor en dolor beschrijven vier kardinale tekenen van ontsteking.",
"Er werd verwezen naar de kardinale tekenen van ontsteking (pijn, warmte, roodheid en zwelling)",
"Ontsteking is de reactie van het lichaam op letsel of infectie. Al 2000 jaar geleden herkende de Romeinse encyclopedist Aulus Cornelius Celsus vier kardinale tekenen van deze reactie - roodheid, warmte, zwelling en pijn;",
"ontsteking geeft aanleiding tot klinische kardinale tekenen: rubor, calor, dolor, tumor",
"De kardinale tekenen van ontsteking dolor, calor, tumor en rubor",
"Het concept van de vier kardinale tekenen van acute ontsteking komt uit de oudheid als rubor et tumor cum calore et dolore, (roodheid en zwelling met warmte en pijn)",
"Ontsteking wordt beschouwd als een niet-specifieke reactie op letsel, gekenmerkt door exsudatie van serum in beschadigd weefsel, en geïdentificeerd door de kardinale tekenen van rubor, calor, dolor en tumor.",
"vier bekende kardinale tekenen van Celsus (rubor, calor, tumor, dolor)",
"vier kardinale tekenen van Celsus (roodheid, warmte, zwelling en pijn). Ontsteking",
"(de beroemde vier kardinale tekenen van Celsus: pijn, roodheid, zwelling, warmte)",
"Al 2000 jaar geleden herkende de Romeinse encyclopedist Aulus Cornelius Celsus vier kardinale tekenen van deze reactie - roodheid, warmte, zwelling en pijn; een vijfde teken is functieverlies.[...",
"Het was Galenus die de functiestoornis (functio laesa) toevoegde als het vijfde kardinale teken van ontsteking aan de vier bekende kardinale tekenen van Celsus (rubor, calor, tumor, dolor).",
"Het concept van de vier kardinale tekenen van acute ontsteking komt uit de oudheid als rubor et tumor cum calore et dolore, (roodheid en zwelling met warmte en pijn) later uitgebreid met functio laesa (functieverlies).",
"De kardinale tekenen van ontsteking dolor, calor, tumor en rubor zijn intrinsiek verbonden met gebeurtenissen zoals vasodilatatie, oedeem en leukocytenverkeer naar de ontstekingsplaats.",
"Tumor, calor, rubor en dolor beschrijven vier kardinale tekenen van ontsteking.",
"De vier kardinale tekenen van ontsteking zijn roodheid, zwelling, warmte en pijn, fenomenen die op cellulair niveau worden verklaard.",
"ontsteking is de reactie van het lichaam op letsel of infectie al 2000 jaar geleden herkende de Romeinse encyclopedist Aulus Cornelius Celsus vier kardinale tekenen van deze reactie roodheid warmte zwelling en pijn een vijfde teken is functieverlies."
] | 371 | 357 |
2,347 | Veroorzaken bacteriën van het geslacht Morexella luchtweginfecties? | Bacteriën van het geslacht Morexella kunnen luchtweginfecties veroorzaken | [
"tegen pathogenen geassocieerd met aandoeningen van de luchtwegen [Staphylococcus aureus (ATCC 25923), Klebsiella pneumoniae (ATCC 13883) en Morexella catarrhalis (ATCC 14468)]",
"De werkzaamheid en veiligheid van orale ofloxacine, 400 mg eenmaal daags, voor de behandeling van patiënten met infecties van de lagere luchtwegen werden bestudeerd. De meest voorkomende soorten die werden teruggevonden in de sputummonsters van deze patiënten waren Haemophilus influenzae, gevolgd door Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae), Staphylococcus aureus (S. aureus), Gram-positieve kokken niet geïdentificeerd, Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), Morexella catarrhalis,",
"de werkzaamheid en veiligheid van orale ofloxacine 400 mg eenmaal daags voor de behandeling van patiënten met infecties van de lagere luchtwegen werden bestudeerd. De meest voorkomende soorten die werden teruggevonden in de sputummonsters van deze patiënten waren Haemophilus influenzae, gevolgd door Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae), Staphylococcus aureus (S. aureus), Gram-positieve kokken niet geïdentificeerd, Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), Morexella catarrhalis, Streptococcus epidermidis en een andere Haemophilus-soort, in deze volgorde. Al deze bacteriën waren gevoelig voor ofloxacine, behalve één stam van methicilline-resistente S. aureus. Een bevredigend klinisch resultaat werd bereikt bij 34 van de 40 patiënten (85%). Er wordt geconcludeerd dat ofloxacine 400 mg eenmaal daags nuttig is voor patiënten met infecties van de luchtwegen."
] | 205 | 206 |
2,348 | Welke twee genen zijn betrokken bij het Juveniele polyposis syndroom? | Juveniel polyposis syndroom (JPS) is een zeldzame autosomaal dominante aandoening die leidt tot gastro-intestinale hamartomateuze poliepen en kanker, waarbij een pathogene SMAD4- of BMPR1A-germlijnmutatie bij ongeveer 40-50% van de patiënten wordt vastgesteld. | [
"JPS wordt het vaakst veroorzaakt door mutaties in de SMAD4- of BMPR1A-genen. Hier rapporteren we een kind met juveniel polyposis syndroom (JPS) met een nieuwe mutatie in het SMAD4-gen.",
"Vervolg genetische screening toonde een nieuwe mutatie in SMAD4, exon 5 (p.Ser144Stop).",
"Een SMAD4-mutatie die wijst op juveniel polyposis syndroom in een familie die eerder was gediagnosticeerd met Menetrier's ziekte.",
"CONCLUSIE: De 1244_1247delACAG-mutatie van SMAD4 is de oorzaak van JPS en waarschijnlijk ook de oorzaak van MD in een grote familie die aanvankelijk met MD werd gediagnosticeerd.",
"Een dominante 1244_1247delACAG-mutatie van SMAD4 werd geïdentificeerd bij elk van de personen met JPS evenals bij elk van de personen met MD.",
"Sinds zijn initiële diagnose van JPS hebben verdere studies een associatie bevestigd tussen JPS en mutaties in BMPR1A op chromosoomband 10q23.2, wat dicht bij PTEN ligt.",
"Prevalentie van thoracale aortopathie bij patiënten met juveniel polyposis syndroom-erfelijke hemorragische teleangiëctasie door SMAD4.",
"Exoomsequencing identificeerde een germlijn heterozygote mutatie in SMAD9 (SMAD9(V90M)).",
"Tot nu toe zijn oorzakelijke mutaties voor JPS geïdentificeerd in twee genen, SMAD4 en BMPR1A.",
"Somatische veranderingen in juveniele poliepen van dragers van BMPR1A- en SMAD4-mutaties.",
"Juveniel polyposis syndroom (JPS) is een zeldzame autosomaal dominante aandoening die leidt tot gastro-intestinale hamartomateuze poliepen en kanker, waarbij een pathogene SMAD4- of BMPR1A-germlijnmutatie (1e hit) bij ongeveer 40-50% van de patiënten wordt vastgesteld.",
"JPS wordt veroorzaakt door mutaties in SMAD4 en BMPR1A.",
"Germlijnmutaties in SMAD4 en BMPR1A verstoren het signaaltransductiepad van transforming growth factor β en worden geassocieerd met juveniel polyposis syndroom.",
"Deze studie evalueerde het differentiële effect van SMAD4- en BMPR1A-genmutaties op het kankerrisico en het oncologische fenotype bij patiënten met juveniel polyposis syndroom.",
"Juveniel polyposis syndroom (JPS) wordt veroorzaakt door heterozygote mutaties in SMAD4 of BMPR1A. Personen met JPS door mutaties in SMAD4 lopen een groter risico om tekenen van erfelijke hemorragische teleangiëctasie (HHT) te vertonen.",
"BMPR1A- en SMAD4-germlijnmutaties zijn gevonden bij patiënten met juveniel polyposis syndroom.",
"Bij ongeveer 50%-60% van de patiënten met de diagnose juveniel polyposis syndroom wordt een germlijnmutatie in het SMAD4- of BMPR1A-gen gevonden.",
"Juveniel polyposis syndroom (JPS) wordt veroorzaakt door heterozygote mutaties in SMAD4 of BMPR1A.",
"ACHTERGROND: Bij patiënten met juveniel polyposis syndroom (JPS) was de frequentie van grote genomische deleties in de SMAD4- en BMPR1A-genen onbekend.",
"Bij patiënten met juveniel polyposis syndroom (JPS) was de frequentie van grote genomische deleties in de SMAD4- en BMPR1A-genen onbekend. Mutatie- en fenotype-analyse werd uitgevoerd bij 80 niet-verwante patiënten, waarvan 65 voldeden aan de klinische criteria voor typisch JPS en 15 vermoedelijk JPS hadden. Door directe sequencing van de twee genen werden puntmutaties geïdentificeerd bij 30 patiënten (46% van typisch JPS). Met MLPA werden grote genomische deleties gevonden bij 14 van alle patiënten met typisch JPS: zes deleties in SMAD4 en drie deleties in BMPR1A. Mutatieanalyse van het PTEN-gen bij de overige 41 mutatie-negatieve gevallen onthulde een puntmutatie bij twee patiënten (5%). SMAD4-mutatie-dragers hadden een significant hogere frequentie van gastrische polyposis (73%) dan patiënten met BMPR1A-mutaties (8%, p < 0,001). Alle zeven gevallen van maagkanker kwamen voor in families met SMAD4-mutaties. SMAD4-mutatie-dragers met maagpoliepen waren significant ouder bij gastroscopie dan degenen zonder (p < 0,001). Bij 22 van de 23 niet-verwante SMAD4-mutatie-dragers werd ook klinisch erfelijke hemorragische teleangiëctasie (HHT) vastgesteld. De gedocumenteerde histologische bevindingen omvatten een brede verspreiding van verschillende poliep-types vergelijkbaar met die beschreven in erfelijke gemengde polyposis syndromen (HMPS). Screening op grote deleties verhoogde de mutatiedetectiesnelheid tot 60% bij de 65 patiënten met typisch JPS. Er werd een sterke genotype-fenotype correlatie gevonden voor gastrische polyposis, maagkanker en HHT, wat implicaties heeft voor counseling en surveillance. Histopathologische resultaten bij hamartomateuze polyposis syndromen moeten kritisch worden geïnterpreteerd.",
"Juveniel polyposis syndroom is een zeldzaam autosomaal dominant syndroom gekenmerkt door meerdere onderscheidende juveniele poliepen in het gastro-intestinale kanaal en een verhoogd risico op colorectale kanker. Het cumulatieve levenslange risico op colorectale kanker is 39% en het relatieve risico is 3,4. Juveniele poliepen hebben een kenmerkende histologie met een overvloed aan oedeemachtige lamina propria met ontstekingscellen en cystisch verwijdde klieren bekleed met kubisch tot kolomvormig epitheel met reactieve veranderingen. Klinisch wordt juveniel polyposis syndroom gedefinieerd door de aanwezigheid van 5 of meer juveniele poliepen in het colorectum, juveniele poliepen door het hele gastro-intestinale kanaal of een willekeurig aantal juveniele poliepen met een positieve familiegeschiedenis van juveniele polyposis. Bij ongeveer 50-60% van de patiënten met de diagnose juveniel polyposis syndroom wordt een germlijnmutatie in het SMAD4- of BMPR1A-gen gevonden. Beide genen spelen een rol in het BMP/TGF-beta signaalpad. Er is gesuggereerd dat kanker bij juveniele polyposis kan ontstaan via het zogenaamde landscaper-mechanisme, waarbij een abnormale stromale omgeving leidt tot neoplastische transformatie van het aangrenzende epitheel en uiteindelijk invasief carcinoom. Herkenning van deze zeldzame aandoening is belangrijk voor patiënten en hun families met betrekking tot behandeling, follow-up en screening van risicopersonen. Elke arts die wordt geconfronteerd met de diagnose van een juveniele poliep moet daarom de mogelijkheid van juveniel polyposis syndroom overwegen. Bovendien biedt juveniel polyposis syndroom een uniek model om de pathogenese van colorectale kanker in het algemeen te bestuderen en geeft het inzicht in de moleculair-genetische basis van kanker. Deze review bespreekt klinische manifestaties, genetica, pathogenese en behandeling van juveniel polyposis syndroom.",
"Juveniel polyposis syndroom is een autosomaal dominant erfelijke aandoening gekenmerkt door meerdere juveniele poliepen in het gastro-intestinale kanaal en een verhoogd risico op gastro-intestinale kankers, met name colonkanker. BMPR1A- en SMAD4-germlijnmutaties zijn gevonden bij patiënten met juveniel polyposis syndroom. Wij identificeerden een BMPR1A-mutatie die een duplicatie van coderend exon 3 betreft (c.230_452_333_441dup1995) via multiple ligation-dependent probe amplification bij een patiënt met juveniel polyposis syndroom. De mutatie veroorzaakt een frameshift die leidt tot een getruncateerd eiwit (p.D112NfsX2). Daarom wordt aangenomen dat de mutatie pathogeen is. We identificeerden ook een duplicatie-breekpunt waarin Alu-sequenties zijn gelokaliseerd. Deze resultaten suggereren dat het duplicatie-evenement het gevolg is van recombinatie tussen Alu-sequenties. Voor zover wij weten is partiële duplicatie in het BMPR1A-gen nog niet eerder gerapporteerd. Dit is het eerste casusrapport dat een duplicatie van coderend exon 3 in het BMPR1A-gen documenteert bij een patiënt met juveniel polyposis syndroom.",
"Juveniel polyposis syndroom is een dominant gastro-intestinaal polyposis syndroom gedefinieerd door 5 gastro-intestinale juveniele poliepen of 1 juveniele poliep met een familiegeschiedenis van juveniele polyposis. Mutaties in BMPR1A of SMAD4 worden gevonden bij 50% van de individuen. Erfelijke hemorragische teleangiëctasie is een dominant syndroom gekenmerkt door epistaxis, viscerale arterioveneuze malformaties en teleangiëctasieën. Erfelijke hemorragische teleangiëctasie wordt gediagnosticeerd wanneer 3 criteria, waaronder klinische manifestaties of een familiegeschiedenis, aanwezig zijn. Een overlap syndroom van juveniele polyposis en erfelijke hemorragische teleangiëctasie is eerder gerapporteerd bij 22% van de patiënten met juveniele polyposis door een SMAD4-mutatie. Ons doel was de prevalentie en klinische manifestaties van erfelijke hemorragische teleangiëctasie volgens de Curaçao-criteria te bepalen bij onze juveniele polyposis SMAD4-patiënten. Dit was een cohortstudie van juveniele polyposis patiënten in onze erfelijke colonkankerregistraties. Manifestaties van erfelijke hemorragische teleangiëctasie werden verkregen uit medische dossiers, patiëntcontact en/of prospectieve screening. De Curaçao-criteria werden gebruikt voor de diagnose van erfelijke hemorragische teleangiëctasie: 3 criteria = diagnose, 2 criteria = verdenking. Prevalentie en klinische manifestaties van erfelijke hemorragische teleangiëctasie bij juveniele polyposis SMAD4-patiënten: 41 families met juveniele polyposis werden geïdentificeerd. Genetische testen waren beschikbaar voor individuen binnen 18 families. SMAD4-mutaties werden gevonden bij 21 familieleden in 9 families. 81% van de SMAD4-patiënten had erfelijke hemorragische teleangiëctasie en 14% werd verdacht van erfelijke hemorragische teleangiëctasie. Epistaxis en astma zijn de meest voorkomende symptomen bij onze overlappatiënten. Symptomatische en subklinische arterioveneuze malformaties werden vrijwel universeel opgemerkt. Er was een enkel tertiair verwijzingscentrum. Bijna alle juveniele polyposis SMAD4-patiënten hebben het overlap syndroom. De klinische implicaties en de noodzaak voor screening op erfelijke hemorragische teleangiëctasie zijn belangrijke factoren voor genetische testing bij juveniele polyposis. Zorgverleners moeten zich bewust zijn van het juveniele polyposis-erfelijke hemorragische teleangiëctasie overlap syndroom en de implicaties voor de behandeling van deze patiënten."
] | 1,381 | 1,298 |
2,349 | Voorspellen chromatinekenmerken genen die geassocieerd zijn met eQTL's? | Ja, genomische nabijheid plus vijf TF- en chromatinekenmerken kunnen >90% van de doelgenen binnen 1 megabase van eQTL's voorspellen | [
"Met behulp van de random forest-classificator vonden we dat genomische nabijheid plus vijf TF- en chromatinekenmerken >90% van de doelgenen binnen 1 megabase van eQTL's kunnen voorspellen",
"Met behulp van de random forest-classificator vonden we dat genomische nabijheid plus vijf TF- en chromatinekenmerken >90% van de doelgenen binnen 1 megabase van eQTL's kunnen voorspellen.",
"Celtype-specifieke genexpressie bij mensen omvat complexe interacties tussen regulatorische factoren en DNA bij enhancers en promoters. Mappingstudies voor expression quantitative trait loci (eQTL's), transcriptiefactoren (TF's) en chromatinemarkers zijn wijdverbreide hulpmiddelen geworden voor het identificeren van genregulerende elementen, maar het voorspellen van doelgenen blijft een grote uitdaging. Hier integreren we genoomwijde gegevens over TF-bindingsplaatsen, chromatinemarkers en functionele annotaties om genen te voorspellen die geassocieerd zijn met menselijke eQTL's. Met behulp van de random forest-classificator vonden we dat genomische nabijheid plus vijf TF- en chromatinekenmerken >90% van de doelgenen binnen 1 megabase van eQTL's kunnen voorspellen. Hoewel nabijheid regelmatig wordt gebruikt om doelgenen in kaart te brengen, is het geen goede indicator voor eQTL-doelgenen die 150 kilobasen verwijderd zijn, maar isolatoren, TF-co-occurrence, open chromatine en functionele overeenkomsten tussen TF's en genen zijn betere indicatoren. Het gebruik van alle zes kenmerken in de classificator behaalde een oppervlakte onder de specificiteits- en sensitiviteitscurve van 0,91, veel beter vergeleken met maximaal 0,75 bij gebruik van een enkel kenmerk. We hopen dat deze studie niet alleen validatie van eQTL-mappingstudies zal bieden, maar ook inzicht zal geven in de moleculaire mechanismen die verklaren hoe genetische variatie genexpressie kan beïnvloeden."
] | 278 | 269 |
2,350 | Noem de 6 genen die geassocieerd zijn met de autosomaal recessieve vorm van Osteogenesis imperfecta | Er zijn minstens 6 genen geassocieerd met osteogenesis imperfecta, Sp7/Osx, FK506-bindend eiwit, Hsp47/SERPINH1, WNT1, CRTAP, P3H1, en PPIB, LEPRE1, PLOD2, TMEM38B | [
"Patiënten die afstammen van niet-consanguine ouders werden meestal geïdentificeerd met heterozygote veranderingen in COL1A1 of COL1A2, hoewel er ook enkele gevallen waren met heterozygote mutaties in IFITM5 en WNT1. Slechts één sporadische patiënt was een compound heterozygoot voor twee recessieve mutaties. Patiënten die afstammen van consanguine ouders vertoonden homozygote veranderingen in verschillende genen, waaronder CRTAP, FKBP10, LEPRE1, PLOD2, PPIB, SERPINF1, TMEM38B, en WNT1.",
"Er is minimale literatuur over het werkingsmechanisme van varianten in SERPINH1 die resulteren in osteogenesis imperfecta",
"De meerderheid van de patiënten (ongeveer 90%) met een klinische diagnose van OI heeft een mutatie in de COL1A1- of COL1A2-genen, wat een autosomaal dominant overervingspatroon vertoont. Zes andere genen, CRTAP, LEPRE1, FKBP10, PP1B, SP7/Osterix (OSX), en SERPINH1, zijn geassocieerd met autosomaal recessieve vormen van OI.",
"Deze resultaten breiden het spectrum van CRTAP/LEPRE1-mutaties uit die resulteren in recessieve OI",
"Autosomal recessieve osteogenesis imperfecta (OI) is verantwoordelijk voor 10% van alle OI-gevallen, en momenteel zijn mutaties in 10 genen (CRTAP, LEPRE1, PPIB, SERPINH1, FKBP10, SERPINF1, SP7, BMP1, TMEM38B, en WNT1) bekend als oorzaak van deze vorm van de ziekte.",
"We hebben recent aangetoond dat FKBP10, eerder gerapporteerd als een nieuw autosomaal recessief OI-gen, ook een nieuw Bruck-syndroom locus (BKS3) definieert.",
"Autosomal recessieve mutaties in een aantal genen zijn ook beschreven, waaronder het BMP1-gen dat het zoogdier Tolloid (mTLD) en zijn kortere isoform botmorfogenetisch eiwit-1 (BMP1) codeert.",
"In dit artikel voerden we een klinische beoordeling uit en zochten we naar mutaties bij patiënten uit 10 niet-verwante families met AR-OI, waarvan één werd gepresenteerd met de aanvullende kenmerken van het Bruck-syndroom (BS). Pathogene veranderingen werden geïdentificeerd in vijf verschillende genen: drie families hadden mutaties in FKBP10, drie in SERPINF1, twee in LEPRE1, één in CRTAP, en één in PPIB.",
"Twee van de genen die eiwitten coderen die betrokken zijn bij dat enzymcomplex, LEPRE1 en het kraakbeen-geassocieerde eiwit, zijn bij mutatie aangetoond autosomaal recessieve osteogenesis imperfecta te veroorzaken",
"De ontdekking van mutaties in de CRTAP- en LEPRE1-genen bij ernstige/dodelijke en recessief overervende osteogenesis imperfecta heeft gedeeltelijke antwoorden gegeven op vragen over 'andere' osteogenesis imperfecta-genen bij patiënten met een osteogenesis imperfecta fenotype maar zonder COL1A1- en COL1A2-mutaties"
] | 367 | 376 |
2,351 | Wat is masitinib een remmer van? | Masitinib is een remmer van de mastcel-glia-as en een Fyn-kinaseremmer. Het is een orale tyrosinekinaseremmer met activiteit tegen c-Kit en platelet-derived growth factor receptors (PDGFR). | [
"Deze studie evalueerde het therapeutisch potentieel van masitinib, een orale tyrosinekinaseremmer met activiteit tegen c-Kit en platelet-derived growth factor receptors (PDGFR), om het ischemische hersengebied en neurologisch tekort te verminderen.",
"Masitinib, een selectieve tyrosinekinaseremmer, werd onderzocht als radiosensitizer in drie primaire feline injectieplaats-sarcoom (ISS) cellijnen.",
"Dubbele werking van masitinib als remmer van de mastcel-glia-as en een Fyn-kinaseremmer worden besproken in de context van AD-pathologie."
] | 110 | 91 |
2,352 | Wat is de naam van het RNAi-onderzoeksgeneesmiddel dat wordt ontwikkeld tegen erfelijke amyloïdose? | Patisiran. | [
"Patisiran is een experimentele RNA-interferentie (RNAi) therapeutische behandeling in ontwikkeling voor de behandeling van erfelijke ATTR (hATTR) amyloïdose, een progressieve ziekte die gepaard gaat met aanzienlijke invaliditeit, morbiditeit en mortaliteit."
] | 41 | 42 |
2,353 | Wat is de functie van het H19 (ICR) locus in het menselijk genoom? | We ontdekten dat gelokaliseerde DNA-demethylering in het H19 imprinting control region (ICR), geïnduceerd door 5-AzaCdR, leidde tot verminderde IGF2-expressie, verhoogde H19-expressie, verhoogde rekrutering van CTCF en cohesine en veranderde histonmodificaties. | [
"We ontdekten dat gelokaliseerde DNA-demethylering in het H19 imprinting control region (ICR), geïnduceerd door 5-AzaCdR, leidde tot verminderde IGF2-expressie, verhoogde H19-expressie, verhoogde rekrutering van CTCF en cohesine en veranderde histonmodificaties.",
"Bovendien nam de chromatine-toegankelijkheid locus-breed toe en werd de chromatine-lus topografie veranderd, zodanig dat een CTCF-plaats stroomafwaarts van de H19-enhancers zijn associatie met de CTCF-plaats stroomopwaarts van de IGF2-promoters wisselde naar associatie met het ICR.",
"De ouder-afhankelijke expressie van IGF2 en H19 wordt gecontroleerd door het imprinting centrum 1 (IC1), bestaande uit een methyleringsgevoelige chromatine-insulator.",
"Concluderend kunnen methyleringsdefecten op het IGF2-H19 locus het gevolg zijn van geërfde mutaties van het imprinting centrum en een hoog recidief risico hebben, of onafhankelijk ontstaan van de sequentiecontext en niet worden doorgegeven aan de nakomelingen.",
"Specifieke epigenetische veranderingen van het IGF2-H19 locus in spermatozoa van onvruchtbare mannen.",
"In de teratozoöspermie-groep vertoonden 11 van de 19 patiënten verlies van methylering op variabele CpG-posities, hetzij in de IGF2 DMR2, hetzij in zowel de IGF2 DMR2 als de 6e CTCF van de H19 DMR.",
"Deze studie toont aan dat epigenetische verstoringen van de 6e CTCF-plaats van de H19 DMR een relevante biomarker kunnen zijn voor kwantitatieve defecten in de spermatogenese bij mensen.",
"Hyper- en hypomethylering in het IGF2-H19 imprinting control region (ICR) resulteren in wederzijdse veranderingen in IGF2-H19 expressie en de twee tegengestelde groeistoornissen, Beckwith-Wiedemann syndroom (BWS) en Silver-Russell syndroom (SRS).",
"De twee alternatieve chromatineconformaties worden verschillend bevoordeeld in BWS en SRS, wat waarschijnlijk het locus predisponeert voor activatie van respectievelijk IGF2 of H19.",
"Epigenetische status van het H19 locus in menselijke oöcyten na in vitro rijping.",
"Om te evalueren of het in vitro rijpen van menselijke oöcyten epigenetisch schadelijk zou zijn, bepaalden we eerst het methyleringsprofiel van de differentieel gemethyleerde regio (DMR) van H19. De methyleringsstatus van de H19 DMR lijkt bijzonder kwetsbaar voor in vitro kweekomstandigheden.",
"We hebben een regio geïdentificeerd met kenmerken van een vader-specifieke methyleringsimprint op het menselijke H19 locus.",
"Structurele analyse onthulde de aanwezigheid van CpG-eilanden en een grote directe herhaling met een 400 bp sequentie die meerdere keren werd herhaald, maar geen significante sequentiehomologie met het overeenkomstige gebied van het muis H19-gen.",
"Deze bevindingen suggereren een rol voor secundaire DNA-structuur in genomische imprinting over soorten heen, en ze presenteren ook een intrigerend aspect van de evolutie van de H19-regulerende regio in mens en muis.",
"Muis/mens sequentie divergentie in een regio met een vader-specifieke methyleringsimprint op het menselijke H19 locus.",
"Bovendien kan de chromatine-lus georganiseerd door de CTCF-gebonden, differentieel gemethyleerde regio bij het Igf2/H19 locus worden gedetecteerd tijdens mitose.",
"Het H19 locus functioneert in vivo als een tumorsuppressor.",
"Het H19 locus behoort tot een cluster van geïmprinte genen die gekoppeld zijn aan het menselijke Beckwith-Wiedemann syndroom. De expressie van H19 en het nauw verwante IGF2-gen is vaak gedereguleerd in sommige menselijke tumoren, zoals Wilms-tumoren.",
"Het H19 locus vertoont dus duidelijk een tumorsuppressor effect bij muizen.",
"Mono-allele expressie op het muis IGF2/H19 locus wordt gecontroleerd door differentiële allelische DNA-methylering van het imprinting control region (ICR).",
"In het muis Igf2/H19 geïmprint locus wordt differentiële methylering van het imprinting control region (H19 ICR) vastgesteld tijdens spermatogenese en gehandhaafd in de nakomelingen gedurende de ontwikkeling.",
"Geïmprintte expressie van het muis Igf2/H19 locus wordt gecontroleerd door ouder-afhankelijke methylering van het imprinting control region (ICR).",
"De geïmprintte expressie van het muis Igf2/H19 locus wordt beheerst door de differentiële methylering van het imprinting control region (ICR), die aanvankelijk wordt vastgesteld in kiemcellen en vervolgens wordt gehandhaafd in somatische cellen, afhankelijk van de ouderlijke oorsprong.",
"Microdeleties in het menselijke H19/IGF2 ICR (IC1) worden verondersteld verantwoordelijk te zijn voor IC1 epimutaties geassocieerd met imprintingstoornissen zoals Beckwith-Wiedemann syndroom (BWS).",
"CTCF-bindingsplaatsen en DNA-methylering bij het ICR zijn eerder geïdentificeerd als sleutel cis-werkende elementen die nodig zijn voor correcte H19/Igf2 imprinting.",
"Genomische imprinting bij het H19/Igf2 locus wordt geregeld door een cis-werkend Imprinting-Control Region (ICR), gelegen 2 kb stroomopwaarts van het H19-gen.",
"Een maternale H19 ICR remt Igf2-genactivatie door de stroomafwaartse enhancer vanwege zijn insulatorfunctie, terwijl het H19-gentranscriptie onderdrukt door promotor-DNA-methylering wanneer het paternale wordt geërfd.",
"Dus recapituleerde het ICR autonoom imprinting binnen het normaal niet-geïmprimeerde transgene beta-globine gen locus, maar de temporele vaststelling van imprinting-methylering verschilt van die bij het endogene Igf2/H19 locus.",
"Net als de meeste geïmprimeerde genen worden H19 en Igf2 gereguleerd door een differentieel gemethyleerd imprinting control region (ICR).",
"Men denkt dat het H19 imprinting control region (ICR) de silencering van het maternale Igf2-allel aanstuurt via een CTCF-afhankelijke chromatine-insulator.",
"Mutatie van CTCF-bindingsplaatsen in het H19 ICR leidt tot verlies van CTCF-binding en de novo methylering van een CTCF-doelplaats binnen Igf2 DMR1, wat aantoont dat CTCF regionale epigenetische markeringen kan coördineren.",
"Dus recapituleerde het ICR autonoom imprinting binnen het normaal niet-geïmprimeerde transgene beta-globine gen locus, maar de temporele vaststelling van imprinting-methylering verschilt van die bij het endogene Igf2/H19 locus.<br>",
"De geïmprimeerde expressie van het muis igf2 h19 locus wordt beheerst door de differentiële methylering van het imprinting control region icr, die aanvankelijk wordt vastgesteld in kiemcellen en vervolgens wordt gehandhaafd in somatische cellen afhankelijk van de ouderlijke oorsprong. Door een 2,9 kbp h19 icr-fragment in een menselijke beta-globine yeast artificial chromosome in transgene muizen in te brengen, toonden we eerder aan dat het icr geïmprimeerde methylering en expressie op een heteroloog locus kan recapitularen, wat suggereert dat het h19 icr in het beta-globine locus voldoende informatie bevat om de methyleringsmarkering te behouden (K. Tanimoto et al., Proc Natl Acad Sci USA 102:10250-10255, 2005). Vreemd genoeg was het transgene h19 icr echter niet gemethyleerd in sperma, wat verschilde van het endogene locus. Hier herbeoordeelden we het vermogen van het h19 icr om de ouderlijke oorsprong te markeren met strengere criteria. In de testis varieerden de methyleringsniveaus van het solitaire 2,9 kbp transgene icr-fragment aanzienlijk tussen zes transgene muizenlijnen. Echter, in somatische cellen vertoonde het paternale icr-fragment consequent hogere methyleringsniveaus in vijf van de zes willekeurig geïntegreerde locaties in het muizengenoom. Deze resultaten toonden duidelijk aan dat het h19 icr ouder-afhankelijke methylering na bevruchting kan verwerven, onafhankelijk van de chromosomale integratieplaats of de vereiste methyleringsverwerving in mannelijke kiemcellen.",
"Mono-allele expressie op het muis igf2 h19 locus wordt gecontroleerd door differentiële allelische DNA-methylering van het imprinting control region (ICR). Omdat een willekeurig geïntegreerd h19 icr-fragment in het genoom van transgene muizen alleel-specifiek werd gemethyleerd in somatische maar niet in kiemcellen, werd gesuggereerd dat een alleel-onderscheidend epigenetisch signaal binnen of buiten het transgene h19 icr-fragment in kiemcellen later werd vertaald in een differentieel DNA-methyleringspatroon. Om te testen of de kip β-globine hs4 (chs4) chromatine-insulator de methyleringsimprinting bij het h19 icr zou kunnen verstoren, plaatsten we het h19 icr-fragment geflankeerd door een set floxed chs4-kernsequenties in een menselijke β-globine locus YAC en genereerden transgene muizen met geïsoleerd icr (insulated icr tgm). Als controles werden de chs4-sequenties aan één zijde (5' hs4 deleted icr) of beide zijden (pseudo wt icr) verwijderd door in vivo cre-loxp recombinatie. De data tonen aan dat hoewel maternale transgene h19 icr niet gemethyleerd was in geïsoleerde icr tgm, het significant werd gemethyleerd bij paternale transmissie, hoewel het niveau lager was dan in de pseudo wt icr controle. Omdat dit verminderde methyleringsniveau ook werd waargenomen in de 5' hs4 deleted icr tgm, speculeren we dat het fenotype te wijten is aan vezf1-afhankelijke demethyleringsactiviteit in plaats van de insulatorfunctie van chs4. Hoewel we de mogelijkheid niet kunnen uitsluiten dat chs4 niet in staat is een alleel-onderscheidend signaal van buiten het transgen te blokkeren, lijkt het epigenetische signaal intrinsiek binnen het h19 icr gemarkeerd te zijn.",
"Een subset van genen bij zoogdieren is onderhevig aan genomische imprinting. Het muis h19-gen bijvoorbeeld is alleen actief wanneer maternale geërfd, en het naburige igf2-gen wordt paternale tot expressie gebracht. Dit geïmprimeerde expressiepatroon wordt gereguleerd door het imprinting control region (ICR) stroomopwaarts van het h19-gen. Een maternale h19 icr remt igf2-genactivatie door de stroomafwaartse enhancer vanwege zijn insulatorfunctie, terwijl het h19-gentranscriptie onderdrukt door promotor-DNA-methylering wanneer het paternale wordt geërfd. Deze ouder-specifieke functies zijn afhankelijk van de alleel-specifieke methylering van het icr-DNA, die wordt vastgesteld tijdens gametogenese. Daarom kan het icr ook functioneren als een herkenningspunt voor epigenetische modificaties. Om te onderzoeken of het icr deze activiteiten autonoom conferreert, introduceerden we een 2,9 kbp icr-bevattend DNA-fragment in een menselijke beta-globine yeast artificial chromosome aan het 3'-uiteinde van de locus control region en stelden transgene muizenlijnen op. De expressie van alle beta-achtige globinegenen was hoger wanneer het transgen paternale werd geërfd. Overeenkomstig was transgeen icr-DNA uit genucleëerde erytrocyten zwaarder gemethyleerd bij paternale transmissie. Chromatine immunoprecipitatie-assays bevestigden dat CCCTC-binding factor (CTCF) voorkeur heeft voor binding aan het maternale transgene icr in vivo. Verrassend genoeg werd het ouder-specifieke methyleringspatroon niet waargenomen in kiemcellen in de testis, wat aantoont dat methylering na bevruchting wordt vastgesteld. Dus recapituleerde het icr autonoom imprinting binnen het normaal niet-geïmprimeerde transgene beta-globine gen locus, maar de temporele vaststelling van imprinting-methylering verschilt van die bij het endogene igf2/h19 locus.",
"Genomische imprinting bij het h19 igf2 locus wordt geregeld door een cis-werkend imprinting control region (ICR), gelegen 2 kb stroomopwaarts van het h19-gen. Dit gebied bezit een insulatorfunctie die wordt geactiveerd op het ongemethyleerde maternale allel door binding van de CTCF-factor. Eerder is gerapporteerd dat paternale transmissie van de h19 silk-deletie, die het 3'-gedeelte van het h19 icr verwijdert, leidt tot verlies van h19 imprinting. Hier tonen we aan dat in de lever deze heractivatie van het paternale h19-gen gepaard gaat met een dramatische afname van igf2 mRNA-niveaus. Deze deletie verandert de hogere-orde chromatinestructuur, het gebruik van igf2-promoters en weefsel-specifieke expressie. Daarom is het 3'-gedeelte van het h19 icr, wanneer gemethyleerd, een bifunctioneel regulatoir element dat niet alleen betrokken is bij h19 imprinting, maar ook bij het vormen van de hogere-orde chromatinestructuur voor correcte weefsel-specifieke expressie van zowel h19 als igf2-genen.",
"Geïmprimeerde expressie van het muis igf2 h19 locus wordt gecontroleerd door ouder-specifieke methylering van het imprinting control region (ICR). We toonden eerder aan dat wanneer het h19 icr-fragment in een heteroloog genomisch context wordt geplaatst, het een intrinsieke activiteit bevat die het in staat stelt differentiële methylering in somatische cellen te verwerven, maar niet in kiemcellen. In de huidige studie onderzochten we de vereisten voor de CTCF-bindingsplaatsen van het icr bij het verwerven van post-bevruchtingsmethylering. Daartoe werden twee gemuteerde icr-fragmenten geïntroduceerd in het menselijke beta-globine locus in een yeast artificial chromosome transgene muismodel (TGM). 4xmut had mutaties in alle vier de icr CTCF-bindingsplaatsen die CTCF-binding voorkwamen, maar behielden de methylering-doel CpG-motieven. 9cg had mutaties in de CpG-motieven binnen de CTCF-bindingsplaatsen, maar elke plaats behield constitutieve CTCF-bindingsactiviteit. In TGM kiemcellen en pre-implantatie blastocysten leidde het ontbreken van CTCF-bindingsplaatsen (4xmut) niet tot hypermethylering van het transgene h19 icr. Echter, na implantatie beïnvloedden de mutaties van CTCF-plaatsen (4xmut en 9cg) het onderhoud van methylering. Deze resultaten toonden aan dat hoewel de CTCF-bindingsplaatsen onmisbaar zijn voor het onderhoud van de ongemethyleerde staat van het maternale icr in post-implantatie embryo's, ze niet vereist zijn voor het vestigen van paternale alleel-specifieke methylering van het transgene h19 icr in pre-implantatie embryo's.",
"Een van de best bestudeerde uitkomsten van epigenetische verandering is de differentiële expressie van geïmprimeerde genen die worden gecontroleerd door differentiële methylering van imprinting control regions (ICR's). Om de impact van genotype op het epigenoom te onderzoeken, voerden we een gedetailleerde studie uit bij 128 paren van monozygote (MZ) en 128 paren van dizygote (DZ) tweelingen, waarbij de DNA-methyleringsstatus van de ICR's van IGF2, H19, KCNQ1, GNAS en het niet-geïmprimeerde gen RUNX1 werd onderzocht. Hoewel we een vergelijkbaar algemeen methyleringspatroon vonden tussen MZ- en DZ-tweelingen, observeerden we ook een hoge mate van variabiliteit in individuele CpG-methyleringsniveaus, met name bij de H19/IGF2 loci. Een mate van methyleringsplasticiteit onafhankelijk van de genoomsequentie werd waargenomen met zowel lokale als regionale CpG-methyleringsveranderingen die discordant waren tussen MZ- en DZ-individuele paren."
] | 2,227 | 1,934 |
2,354 | Wat is de werkingswijze van teriparatide? | Teriparatide is een effectief anabool middel (d.w.z. botgroei bevorderend) dat wordt gebruikt bij de behandeling van sommige vormen van osteoporose. | [
"Teriparatide veroorzaakt een snelle toename van botvormingsmarkers, gevolgd door een toename van botresorptiemarkers, waardoor een \"anabole venster\" ontstaat, een periode waarin PTH maximaal anabool is. Teriparatide keert de structurele schade die bij osteoporose wordt gezien om en herstelt de structuur van trabeculair bot. Het heeft een positief effect op het corticale bot, en eventuele vroege toename van corticale porositeit lijkt te worden gecompenseerd door toename van corticale dikte en diameter.",
"Teriparatide (recombinant humaan 1-34 parathyroïdhormoon) wordt gebruikt voor de behandeling van vrouwen met postmenopauzale osteoporose en mannen met een hoog risico op fracturen.",
"Een nieuwe klasse geneesmiddelen, anabole middelen genaamd, vertegenwoordigd door teriparatide, heeft het potentieel om vernietigd bot te herstellen en terug te brengen naar de oorspronkelijke staat.",
"Teriparatide [PTH (1-34)] is een genetisch gemodificeerd analoog van humaan parathyroïdhormoon dat werkt als een anabool middel door de activiteit van zowel osteoblasten als osteoclasten te verhogen.",
"Teriparatide (recombinant humaan parathyroïdhormoon) is een anabool middel dat is goedgekeurd voor de behandeling van patiënten met een hoog risico op fracturen.",
"Teriparatide bevordert botvorming, terwijl bisfosfonaten botresorptie onderdrukken.",
"CONCLUSIES Deze resultaten bevestigen de tegengestelde werkingsmechanismen van teriparatide en alendronaat op botremodellering en bevestigen het botvormende effect van teriparatide.",
"Teriparatide, een anabool middel voor de behandeling van patiënten met osteoporose",
"Teriparatide, een behandelingsformule van parathyroïdhormoon (PTH), is een krachtig anabool middel voor bot, dat de botmassa, geometrie en microarchitectuur verbetert.",
"Het recombinante amino-terminale fragment van humaan parathyroïdhormoon (Teriparatide) is een botanabool middel dat het fractuurrisico vermindert door de botmassa te verhogen en de botmicroarchitectuur te verbeteren."
] | 272 | 267 |
2,355 | Wat is de Strelka workflow? | Whole-genoom- en exoomsequencing van gekoppelde tumor-normale monsterparen wordt steeds gebruikelijker in kankeronderzoek. De daardoor toegenomen vraag naar somatische variantanalyse van gekoppelde monsters vereist methoden die gespecialiseerd zijn in het modelleren van dit probleem, zodat varianten gevoelig kunnen worden aangeroepen bij elk praktisch niveau van tumoronzuiverheid. Strelka is een methode voor het detecteren van somatische SNV's en kleine indels uit sequencinggegevens van gekoppelde tumor-normale monsters. De methode gebruikt een nieuwe Bayesiaanse benadering die continue allelfrequenties voor zowel tumor- als normale monsters weergeeft, terwijl het verwachte genotypestructuur van het normale monster wordt benut. Dit wordt bereikt door het normale monster te representeren als een mengsel van germinale variatie met ruis, en het tumormonster als een mengsel van het normale monster met somatische variatie. Een natuurlijk gevolg van de modelstructuur is dat de gevoeligheid behouden kan blijven bij hoge tumoronzuiverheid zonder dat zuiverheidsschattingen nodig zijn. Strelka heeft superieure nauwkeurigheid en gevoeligheid bij onzuivere monsters vergeleken met benaderingen gebaseerd op diploïde genotypelikelihoods of algemene allelfrequentietests. | [
"Strelka: nauwkeurige somatische kleine-variantdetectie van gesequencede tumor-normale monsterparen.",
"Whole-genoom- en exoomsequencing van gekoppelde tumor-normale monsterparen wordt steeds gebruikelijker in kankeronderzoek. De daardoor toegenomen vraag naar somatische variantanalyse van gekoppelde monsters vereist methoden die gespecialiseerd zijn in het modelleren van dit probleem, zodat varianten gevoelig kunnen worden aangeroepen bij elk praktisch niveau van tumoronzuiverheid. RESULTATEN: We beschrijven Strelka, een methode voor het detecteren van somatische SNV's en kleine indels uit sequencinggegevens van gekoppelde tumor-normale monsters. De methode gebruikt een nieuwe Bayesiaanse benadering die continue allelfrequenties voor zowel tumor- als normale monsters weergeeft, terwijl het verwachte genotypestructuur van het normale monster wordt benut. Dit wordt bereikt door het normale monster te representeren als een mengsel van germinale variatie met ruis, en het tumormonster als een mengsel van het normale monster met somatische variatie. Een natuurlijk gevolg van de modelstructuur is dat de gevoeligheid behouden kan blijven bij hoge tumoronzuiverheid zonder dat zuiverheidsschattingen nodig zijn. We tonen aan dat de methode superieure nauwkeurigheid en gevoeligheid heeft bij onzuivere monsters vergeleken met benaderingen gebaseerd op diploïde genotypelikelihoods of algemene allelfrequentietests.",
"De daardoor toegenomen vraag naar somatische variantanalyse van gekoppelde monsters vereist methoden die gespecialiseerd zijn in het modelleren van dit probleem, zodat varianten gevoelig kunnen worden aangeroepen bij elk praktisch niveau van tumoronzuiverheid.<br><b>RESULTATEN</b>: We beschrijven Strelka, een methode voor het detecteren van somatische SNV's en kleine indels uit sequencinggegevens van gekoppelde tumor-normale monsters.",
"Voor SNV-detectie rapporteren we EBCall, Mutect, Virmid en Strelka als de meest betrouwbare somatische variantdetectoren voor zowel exoomsequencing als gerichte diepe sequencing.",
"RESULTATEN We beschrijven Strelka, een methode voor het detecteren van somatische SNV's en kleine indels uit sequencinggegevens van gekoppelde tumor-normale monsters.",
"Vier recent gepubliceerde algoritmen voor de detectie van somatische SNV-locaties in gekoppelde kanker-normale sequencingdatasets zijn VarScan, SomaticSniper, JointSNVMix en Strelka.",
"Whole-genoom- en exoomsequencing van gekoppelde tumor-normale monsterparen wordt steeds gebruikelijker in kankeronderzoek. De daardoor toegenomen vraag naar somatische variantanalyse van gekoppelde monsters vereist methoden die gespecialiseerd zijn in het modelleren van dit probleem, zodat varianten gevoelig kunnen worden aangeroepen bij elk praktisch niveau van tumoronzuiverheid. We beschrijven Strelka, een methode voor het detecteren van somatische SNV's en kleine indels uit sequencinggegevens van gekoppelde tumor-normale monsters. De methode gebruikt een nieuwe Bayesiaanse benadering die continue allelfrequenties voor zowel tumor- als normale monsters weergeeft, terwijl het verwachte genotypestructuur van het normale monster wordt benut. Dit wordt bereikt door het normale monster te representeren als een mengsel van germinale variatie met ruis, en het tumormonster als een mengsel van het normale monster met somatische variatie. Een natuurlijk gevolg van de modelstructuur is dat de gevoeligheid behouden kan blijven bij hoge tumoronzuiverheid zonder dat zuiverheidsschattingen nodig zijn. We tonen aan dat de methode superieure nauwkeurigheid en gevoeligheid heeft bij onzuivere monsters vergeleken met benaderingen gebaseerd op diploïde genotypelikelihoods of algemene allelfrequentietests. De Strelka workflow broncode is beschikbaar op ftp strelka ftp illumina com csaunders illumina com.",
"Strelka: nauwkeurige somatische kleine-variantdetectie van gesequencede tumor-normale monsterparen.",
"Vier populaire somatische single nucleotide variant (SNV) detectiemethoden VarScan, SomaticSniper, Strelka en Mutect2 werden zorgvuldig geëvalueerd op echte whole exome sequencing (WES) met een diepte van 50x en ultra diepe gerichte sequencing (UDT-Seq) met een diepte van 370x data. De vier tools gaven weinig consensus over kandidaten; slechts 20% van de aanroepen werden door meerdere detectoren bevestigd voor zowel WES als UDT-Seq. Mutect2 en Strelka behaalden het grootste aandeel van COSMIC vermeldingen en de laagste frequentie van dbSNP aanwezigheid en hoge alternatieve allelen in controle-aanroepen, wat hun superieure gevoeligheid en nauwkeurigheid aantoont. Het combineren van verschillende detectoren verhoogt de betrouwbaarheid van kandidaten, maar beperkt de lijst tot een zeer beperkt bereik van tumorleesdiepte en variant allelfrequentie. SNV-detectie op UDT-Seq data, die een veel hogere leesdiepte hadden, ontdekte extra ware positieve varianten ondanks een nog grotere toename van fout-positieve voorspellingen. Onze bevindingen bieden niet alleen een waardevolle benchmark voor state-of-the-art SNV detectiemethoden, maar werpen ook licht op de toegang tot meer accurate SNV-identificatie in de toekomst.",
"High-throughput next-generation sequencing is een krachtig hulpmiddel om de genotypische landschappen van somatische varianten en therapeutische doelen in diverse kankers, waaronder maagkanker, te identificeren, wat de basis vormt voor gepersonaliseerde geneeskunde in de klinische praktijk. Hoewel de komst van vele computationele algoritmen leidt tot hogere nauwkeurigheid in somatische variantdetectie, bestaat er geen standaardmethode vanwege de beperkingen van elke methode. Hier hebben we een nieuwe pipeline ontwikkeld waarin we twee verschillende somatische variantdetectoren met verschillende algoritmen, Strelka en VarScan 2, combineerden en de prestaties evalueerden met whole exome sequencing data van 19 Japanse maagkankergevallen. Vervolgens karakteriseerden we deze tumoren op basis van geïdentificeerde driver moleculaire veranderingen. Meer single nucleotide varianten (SNV's) en kleine inserties/deleties werden respectievelijk door Strelka en VarScan 2 gedetecteerd. SNV's die door beide tools werden gedetecteerd, toonden een hogere nauwkeurigheid bij het schatten van somatische varianten vergeleken met die gedetecteerd door slechts één van de twee tools, en toonden nauwkeurig het mutatiesignatuur en mutaties van drivergenen die voor maagkanker zijn gerapporteerd. Onze combinatorische pipeline kan een voordeel bieden bij de detectie van somatische mutaties in maagkanker en kan nuttig zijn voor verdere genomische karakterisering van Japanse patiënten met maagkanker om de effectiviteit van behandelingen te verbeteren. J Med Invest 64: 233-240, augustus 2017.",
"Met de komst van relatief betaalbare high-throughput technologieën is DNA-sequencing van kankers nu gemeengoed in kankeronderzoeksprojecten en zal het steeds vaker worden gebruikt in de klinische praktijk om diagnose en behandeling te informeren. Somatische kanker-specifieke single nucleotide varianten (SNV's) zijn de eenvoudigste klasse mutaties, maar hun identificatie in DNA-sequencingdata wordt bemoeilijkt door germinale polymorfismen, tumorheterogeniteit en sequencing- en analysefouten. Vier recent gepubliceerde algoritmen voor de detectie van somatische SNV-locaties in gekoppelde kanker-normale sequencingdatasets zijn VarScan, SomaticSniper, JointSNVMix en Strelka. In deze analyse passen we deze vier SNV-detectiealgoritmen toe op kanker-normale Illumina exoomsequencing van een patiënt met chronische myeloïde leukemie (CML). De kandidaat-SNV-locaties die door elk algoritme worden geretourneerd, worden gefilterd om waarschijnlijk fout-positieven te verwijderen, vervolgens gekarakteriseerd en vergeleken om de sterke en zwakke punten van elk SNV-detectiealgoritme te onderzoeken. Vergelijking van de kandidaat-SNV-sets geretourneerd door VarScan, SomaticSniper, JointSNVMix2 en Strelka toonde aanzienlijke verschillen in aantal en karakter van geretourneerde locaties, de somatische waarschijnlijkheidsscores toegekend aan dezelfde locaties, hun vatbaarheid voor verschillende bronnen van ruis en hun gevoeligheid voor kandidaten met lage allelfrequentie. Data accession nummer SRA081939, code op http code google com p snv caller review david adelson adelaide edu au, aanvullende data beschikbaar op Bioinformatics online.",
"Next-generation sequencing wordt uitgebreid toegepast om somatische mutaties in kanker te catalogiseren in onderzoeksomgevingen en steeds meer in klinische omgevingen voor moleculaire diagnostiek die therapiebeslissingen stuurt. Somatische variantdetectoren voeren gepaarde vergelijkingen uit van sequencingdata van kankergezwel en gekoppeld normaal weefsel om somatische mutaties te detecteren. De komst van vele nieuwe somatische variantdetectoren creëert een behoefte aan vergelijking en validatie van de tools, aangezien er geen de facto standaard bestaat voor detectie van somatische mutaties en slechts beperkte vergelijkingen zijn gerapporteerd. We hebben een uitgebreide evaluatie uitgevoerd met exoomsequencing en gerichte diepe sequencingdata van gekoppelde tumor-normale monsters van vijf borstkankerpatiënten om de prestaties van negen publiek beschikbare somatische variantdetectoren te evalueren: EBCall, Mutect, Seurat, Shimmer, Indelocator, Somatic Sniper, Strelka, VarScan 2 en Virmid voor de detectie van single nucleotide mutaties en kleine deleties en inserties. We rapporteren een grote variatie in het aantal aanroepen van de negen somatische variantdetectoren op dezelfde sequencingdata en sterk variabele overeenstemming. Sequencingdiepte had een duidelijk diverse impact op individuele detectoren; voor sommige detectoren verbeterde een verhoogde sequencingdiepte de gevoeligheid voor SNV-detectie sterk. We rapporteren EBCall, Mutect, Virmid en Strelka als de meest betrouwbare somatische variantdetectoren voor zowel exoomsequencing als gerichte diepe sequencing. Voor indel-detectie is EBCall superieur vanwege hoge gevoeligheid en robuustheid tegen veranderingen in sequencingdiepte.",
"High-throughput sequencing wordt snel gemeengoed in klinische diagnostiek en kankeronderzoek. Veel algoritmen zijn ontwikkeld voor detectie van somatische single nucleotide varianten (SNV's) in gekoppelde tumor-normale DNA-sequencing. Hoewel talrijke studies de prestaties van verschillende algoritmen op exoomdata hebben vergeleken, is er nog geen systematische evaluatie geweest met PCR-verrijkte amplicondata met een reeks variant allelfrequenties. De recent ontwikkelde gouden standaard variantenset voor het referentie-individu NA12878 door het NIST-geleide Genome in a Bottle consortium (NIST GIAB) biedt een goede bron om mengsels met verschillende SNV-fracties te evalueren. Met de NIST GIAB gouden standaard vergeleken we de prestaties van vijf populaire somatische SNV-detectiealgoritmen: GATK UnifiedGenotyper gevolgd door eenvoudige aftrekking, Mutect, Strelka, SomaticSniper en VarScan2 voor gekoppelde tumor-normale amplicon- en exoomsequencingdata. We toonden aan dat de vijf veelgebruikte somatische SNV-detectiemethoden toepasbaar zijn op zowel gerichte amplicon- als exoomsequencingdata. Echter, de gevoeligheden van deze methoden variëren op basis van de allelfrequentie van de mutatie in het tumormonster. Onze analyse kan onderzoekers helpen bij het kiezen van een somatische SNV-detectiemethode die geschikt is voor hun specifieke behoeften.",
"Het identificeren van genomische varianten is een fundamentele eerste stap naar het begrijpen van de rol van erfelijke en verworven variatie in ziekte. De versnellende groei van de hoeveelheid sequencingdata die dergelijke analyses ondersteunt, maakt de data-download bottleneck duidelijker, wat aanzienlijke lasten legt op de onderzoeksgemeenschap om bij te blijven. Als gevolg hiervan heeft de zoektocht naar alternatieve benaderingen voor het traditionele download-en-analyse paradigma op lokale computerbronnen geleid tot een snel groeiende vraag naar cloud computing oplossingen voor genomica-analyse. Hier introduceren we het Genome Variant Investigation Platform (GenomeVIP), een open source raamwerk voor het uitvoeren van genomische variantontdekking en annotatie met behulp van cloud- of lokale high-performance computing infrastructuur. GenomeVIP orkestreert de analyse van whole-genome en exoomsequencingdata met een set robuuste en populaire taak-specifieke tools, waaronder VarScan, GATK, Pindel, BreakDancer, Strelka en Genome STRiP via een webinterface. GenomeVIP is gebruikt voor genomische analyse in grote dataprojecten zoals TCGA PanCanAtlas en in andere projecten zoals ICGC Pilots, CPTAC, ICGC TCGA DREAM Challenges en het 1000 Genomes SV project. Hier demonstreren we de capaciteit van GenomeVIP om hoog-confidente geannoteerde somatische, germinale en de novo varianten van potentiële biologische betekenis te leveren met behulp van publiek beschikbare datasets.",
"Precisiegeneeskunde probeert kankertherapie te individualiseren door tumorspecifieke genetische veranderingen te koppelen aan effectieve gerichte therapieën. Een cruciale eerste stap in dit proces is de betrouwbare identificatie van kankerrelevante varianten, wat aanzienlijk wordt bemoeilijkt door de onzuiverheid en heterogeniteit van klinische tumorstalen. We vergeleken de impact van vermenging met niet-kankerachtige cellen en lage somatische allelfrequenties op de gevoeligheid en precisie van 19 state-of-the-art SNV-detectoren. We bestudeerden zowel whole exome als gerichte genpaneeldata en tot 13 verschillende parameterconfiguraties per tool. We vonden grote verschillen tussen detectoren. Op basis van onze uitgebreide analyses bevelen we gezamenlijke tumor-normale detectie aan met Mutect, EBCall of Strelka voor whole exome somatische variantdetectie en HaplotypeCaller of FreeBayes voor whole exome germinale detectie. Voor gerichte genpaneeldata op een enkel tumormonster presteerde LoFreqStar het beste. We vonden verder dat tumoronzuiverheid en vermenging een negatieve impact hadden op precisie en vooral gevoeligheid in whole exome experimenten; bij vermengingsniveaus van 60 tot 90%, soms gezien in pathologische biopsieën, daalde de gevoeligheid significant, zelfs wanneer varianten oorspronkelijk aanwezig waren in de tumor met 100% allelfrequentie. Gevoeligheid voor lage frequentie SNV's verbeterde met gerichte paneldata, maar whole exome data maakte efficiëntere identificatie van germinale varianten mogelijk. Effectieve somatische variantdetectie vereist hoogwaardige pathologische monsters met minimale vermenging, een bewust gekozen sequencingstrategie en de juiste variantdetectietool met instellingen geoptimaliseerd voor het gekozen datatype.",
"We voerden whole exome sequencing uit van pre-behandelingsbiopten en onderzochten of genoomwijde metrieken van totale mutatielast, klonale heterogeniteit of veranderingen op variant-, gen- en pathway-niveau geassocieerd zijn met behandelrespons en overleving. Tweehonderddrie biopten uit de NeoALTTO-studie werden geanalyseerd. Mutaties werden aangeroepen met Mutect en Strelka met gebruik van gepoold normaal DNA. Associaties tussen DNA-veranderingen en uitkomst werden geëvalueerd met logistieke regressie en Cox proportionele hazard regressie. Er waren geen terugkerende single genmutaties significant geassocieerd met pathologische complete respons (PCR), behalve PIK3CA (odds ratio 0,42, p=0,0185). Mutaties in 33 van 714 pathways waren significant geassocieerd met respons, maar verschillende genen waren in verschillende individuen aangedaan. PIK3CA was aanwezig in 23 van deze pathways, wat een trastuzumab-resistentienetwerk van 459 genen definieert. Patiënten met mutaties in dit netwerk hadden lage PCR-rates op trastuzumab (2,50-4%) vergeleken met patiënten zonder mutaties (9,16-56%, p=0,035-0,001). Mutaties in de regulatie van RHOA-activiteit pathway waren geassocieerd met hogere PCR-rates op lapatinib (OR 14,8, aangepast p=0,001), lapatinib + trastuzumab (OR 3,0, aangepast p=0,09) en alle armen gecombineerd (OR 3,77, aangepast p=0,02). Patiënten (n=124) met mutaties in het trastuzumab-resistentienetwerk maar intacte RHOA-pathway hadden een PCR-rate van 2,1-41% met alleen trastuzumab (p=0,026-0,001), maar toevoeging van lapatinib verhoogde de PCR-rate tot 45,17-38% (p=1,68-0,3). Patiënten (n=46) zonder mutaties in beide genensets hadden een PCR-rate van 6% (1,15) met lapatinib, maar de hoogste"
] | 2,469 | 2,210 |
2,356 | Beschrijf het Manta-algoritme voor detectie van structurele varianten | Manta is een methode om structurele varianten en indels te ontdekken uit next generation sequencing-gegevens. Manta is geoptimaliseerd voor snelle germinale en somatische analyse, waarbij structurele varianten, middelgrote indels en grote inserties worden aangeroepen op standaard computerhardware in minder dan een tiende van de tijd die vergelijkbare methoden nodig hebben om slechts subsets van deze varianttypen te identificeren: bijvoorbeeld NA12878 bij 50× genomische dekking wordt in minder dan 20 minuten geanalyseerd. Manta kan varianten ontdekken en scoren op basis van ondersteunend gepaarde en gesplitste leesbewijzen, met scoringsmodellen die geoptimaliseerd zijn voor germinale analyse van diploïde individuen en somatische analyse van tumor-normale monsterparen. De kwaliteit van de aanroepen is vergelijkbaar met of beter dan vergelijkbare methoden, zoals bepaald door pedigreeconsistentie van germinale aanroepen en vergelijking van somatische aanroepen met COSMIC-databasevarianten. Manta assembleert consequent een hoger aandeel van zijn aanroepen tot basepaarresolutie, wat verbeterde downstream annotatie en analyse van klinische relevantie mogelijk maakt. | [
"We beschrijven Manta, een methode om structurele varianten en indels te ontdekken uit next generation sequencing-gegevens. Manta is geoptimaliseerd voor snelle germinale en somatische analyse, waarbij structurele varianten, middelgrote indels en grote inserties worden aangeroepen op standaard computerhardware in minder dan een tiende van de tijd die vergelijkbare methoden nodig hebben om slechts subsets van deze varianttypen te identificeren: bijvoorbeeld NA12878 bij 50× genomische dekking wordt in minder dan 20 minuten geanalyseerd. Manta kan varianten ontdekken en scoren op basis van ondersteunend gepaarde en gesplitste leesbewijzen, met scoringsmodellen die geoptimaliseerd zijn voor germinale analyse van diploïde individuen en somatische analyse van tumor-normale monsterparen. De kwaliteit van de aanroepen is vergelijkbaar met of beter dan vergelijkbare methoden, zoals bepaald door pedigreeconsistentie van germinale aanroepen en vergelijking van somatische aanroepen met COSMIC-databasevarianten. Manta assembleert consequent een hoger aandeel van zijn aanroepen tot basepaarresolutie, wat verbeterde downstream annotatie en analyse van klinische relevantie mogelijk maakt. We bieden Manta aan als een gemeenschapsresource om praktische en routinematige analyse van structurele varianten in klinische en onderzoekssequencing-scenario's te faciliteren.",
"Manta: snelle detectie van structurele varianten en indels voor germinale en kankersequencing-toepassingen.",
": We beschrijven Manta, een methode om structurele varianten en indels te ontdekken uit next generation sequencing-gegevens.",
"We bieden Manta aan als een gemeenschapsresource om praktische en routinematige analyse van structurele varianten in klinische en onderzoekssequencing-scenario's te faciliteren.",
"Manta kan varianten ontdekken en scoren op basis van ondersteunend gepaarde en gesplitste leesbewijzen, met scoringsmodellen die geoptimaliseerd zijn voor germinale analyse van diploïde individuen en somatische analyse van tumor-normale monsterparen.",
"Manta is geoptimaliseerd voor snelle germinale en somatische analyse, waarbij structurele varianten, middelgrote indels en grote inserties worden aangeroepen op standaard computerhardware in minder dan een tiende van de tijd die vergelijkbare methoden nodig hebben om slechts subsets van deze varianttypen te identificeren: bijvoorbeeld NA12878 bij 50× genomische dekking wordt in minder dan 20 minuten geanalyseerd.",
"Manta assembleert consequent een hoger aandeel van zijn aanroepen tot basepaarresolutie, wat verbeterde downstream annotatie en analyse van klinische relevantie mogelijk maakt.",
"We bieden Manta aan als een gemeenschapsresource om praktische en routinematige analyse van structurele varianten in klinische en onderzoekssequencing-scenario's te faciliteren.<br><b>BESCHIKBAARHEID EN IMPLEMENTATIE</b>: Manta wordt uitgebracht onder de open-source GPLv3-licentie.",
"Manta is geoptimaliseerd voor snelle germinale en somatische analyse, waarbij structurele varianten, middelgrote indels en grote inserties worden aangeroepen op standaard computerhardware in minder dan een tiende van de tijd die vergelijkbare methoden nodig hebben om slechts subsets van deze varianttypen te identificeren: bijvoorbeeld NA12878 bij 50× genomische dekking wordt in minder dan 20 minuten geanalyseerd.",
"<b>ONGETITELD</b>: : We beschrijven Manta, een methode om structurele varianten en indels te ontdekken uit next generation sequencing-gegevens.",
"Manta kan varianten ontdekken en scoren op basis van ondersteunend gepaarde en gesplitste leesbewijzen, met scoringsmodellen die geoptimaliseerd zijn voor germinale analyse van diploïde individuen en somatische analyse van tumor-normale monsterparen.",
"ONGETITELD: : We beschrijven Manta, een methode om structurele varianten en indels te ontdekken uit next generation sequencing-gegevens.",
"Manta kan varianten ontdekken en scoren op basis van ondersteunend gepaarde en gesplitste leesbewijzen, met scoringsmodellen die geoptimaliseerd zijn voor germinale analyse van diploïde individuen en somatische analyse van tumor-normale monsterparen.",
"ONGETITELD : We beschrijven Manta, een methode om structurele varianten en indels te ontdekken uit next generation sequencing-gegevens.",
"Manta is geoptimaliseerd voor snelle germinale en somatische analyse, waarbij structurele varianten, middelgrote indels en grote inserties worden aangeroepen op standaard computerhardware in minder dan een tiende van de tijd die vergelijkbare methoden nodig hebben om slechts subsets van deze varianttypen te identificeren: bijvoorbeeld NA12878 bij 50× genomische dekking wordt in minder dan 20 minuten geanalyseerd.",
"Manta kan varianten ontdekken en scoren op basis van ondersteunend gepaarde en gesplitste leesbewijzen, met scoringsmodellen die geoptimaliseerd zijn voor germinale analyse van diploïde individuen en somatische analyse van tumor-normale monsterparen.",
"We bieden Manta aan als een gemeenschapsresource om praktische en routinematige analyse van structurele varianten in klinische en onderzoekssequencing-scenario's te faciliteren.",
"Manta assembleert consequent een hoger aandeel van zijn aanroepen tot basepaarresolutie, wat verbeterde downstream annotatie en analyse van klinische relevantie mogelijk maakt.",
"we beschrijven manta een methode om structurele varianten en indels te ontdekken uit next generation sequencing-gegevens manta is geoptimaliseerd voor snelle germinale en somatische analyse waarbij structurele varianten middelgrote indels en grote inserties worden aangeroepen op standaard computerhardware in minder dan een tiende van de tijd die vergelijkbare methoden nodig hebben om slechts subsets van deze varianttypen te identificeren bijvoorbeeld na12878 bij 50 genomische dekking wordt geanalyseerd in minder dan 20 minuten manta kan varianten ontdekken en scoren op basis van ondersteunend gepaarde en gesplitste leesbewijzen met scoringsmodellen geoptimaliseerd voor germinale analyse van diploïde individuen en somatische analyse van tumor-normale monsterparen de kwaliteit van de aanroepen is vergelijkbaar met of beter dan vergelijkbare methoden zoals bepaald door pedigreeconsistentie van germinale aanroepen en vergelijking van somatische aanroepen met COSMIC-databasevarianten manta assembleert consequent een hoger aandeel van zijn aanroepen tot basepaarresolutie wat verbeterde downstream annotatie en analyse van klinische relevantie mogelijk maakt we bieden manta aan als een gemeenschapsresource om praktische en routinematige analyse van structurele varianten in klinische en onderzoekssequencing-scenario's te faciliteren manta wordt uitgebracht onder de open source gplv3-licentie broncode documentatie en linux-binaries zijn beschikbaar via https github com illumina manta csaunders illumina com aanvullende gegevens zijn beschikbaar op bioinformatics online.",
"manta snelle detectie van structurele varianten en indels voor germinale en kankersequencing-toepassingen"
] | 1,012 | 1,015 |
2,357 | Is Kummell’s ziekte een avasculaire necrose van het wervellichaam? | Ja, Kummell’s ziekte is een avasculaire necrose van het wervellichaam. | [
"Kummell's ziekte is een avasculaire necrose van het wervellichaam, secundair aan een wervelcompressiefractuur. Deze aandoening wordt gekenmerkt door de geleidelijke ontwikkeling in de tijd van een instorting van het wervellichaam na een triviaal werveltrauma, gepaard gaand met verergerende rugpijn en een progressieve kyfose.",
"Kummell's ziekte is een zeldzame wervelaandoening die wordt gekenmerkt als avasculaire necrose van een wervellichaam die vertraagd optreedt na een lichte verwonding.",
"Kummell's ziekte is een wervelaandoening die wordt gekenmerkt door vertraagde posttraumatische instorting van een wervellichaam met avasculaire necrose.",
"Kummell ziekte, of avasculaire necrose van een wervellichaam, presenteert zich als wervelosteonecrose die typisch een thoracale wervel aantast met compressiedeformatie, intravertebrale vacuüm spleet en uitgesproken kyfose weken tot maanden na een lichte traumatische verwonding.",
"INLEIDING Kummell's ziekte is een avasculaire necrose van het wervellichaam, secundair aan een wervelcompressiefractuur.",
"Kummell ziekte is de eponiem voor avasculaire necrose van het wervellichaam na een wervelcompressiefractuur.",
"Kummell's ziekte vertraagde posttraumatische osteonecrose van het wervellichaam",
"Kummell's ziekte, veroorzaakt door osteonecrose van het wervellichaam, is een oorzaak van wervelinstorting.",
"Kummell's ziekte is een posttraumatische instorting van het wervellichaam",
"Kummell's ziekte is een zeldzame, vertraagde posttraumatische instorting van een wervellichaam die enkele maanden of zelfs jaren na een osteoporotische compressiefractuur kan optreden.",
"Avasculaire necrose van een wervellichaam, een relatief zeldzame aandoening, wordt veroorzaakt door maligniteit, infectie, bestraling, systemische steroïde behandeling, trauma en dergelijke.1 Wervelosteonecrose veroorzaakt door trauma wordt Kummell's ziekte genoemd."
] | 258 | 234 |
2,358 | Wat veroorzaakt "Puffy hand syndrome"? | Puffy hand syndrome is een complicatie van intraveneus drugsgebruik. | [
"Intravenous drug addiction is verantwoordelijk voor veel complicaties, vooral cutane en infectieuze. Er is een syndroom, zelden waargenomen in de reumatologie, dat resulteert in \"puffy hands\": het puffy hand syndrome.",
"Ze presenteerden zich met een oedeem van de handen, bilateraal, pijnloos, zonder putvorming, voorkomend bij een van onze patiënten tijdens heroïne-intoxicatie, en bij de andere 2 jaar na het stoppen met injecties. Bij onze twee patiënten waren aanvullende onderzoeken (biologisch, radiologisch, echografie) onopvallend, wat ons hielp om, in de context, de diagnose van puffy hand syndrome te stellen.",
"Puffy hand syndrome ontwikkelt zich na langdurig intraveneus drugsgebruik.",
"De auteurs rapporteren een originele klinische presentatie van factitieuze stoornissen van de bovenste extremiteit bij een ex-drugsverslaafde patiënt met puffy hand syndrome.",
"Puffy hand syndrome is een niet-erkende complicatie van intraveneus drugsgebruik.",
"Puffy hand syndrome door drugsverslaving: een case-control studie van de pathogenese.",
"DOEL: We bestudeerden de pathogenese van puffy hand syndrome bij intraveneus drugsgebruik.",
"CONCLUSIES: Injectiepraktijken veroorzaken waarschijnlijk puffy hand syndrome, maar misbruik van buprenorfine moet niet als een significante risicofactor worden beschouwd.",
"[Puffy hand syndrome bij drugsverslaving behandeld met laagrekverbanden].",
"ACHTERGROND: Puffy hand syndrome is een complicatie van intraveneus drugsgebruik waarvoor momenteel geen behandeling beschikbaar is.",
"Fysiopathologische mechanismen van puffy hand syndrome zijn onduidelijk en omvatten veneuze en lymfatische insufficiënties, infectieuze complicaties en directe toxiciteit van geïnjecteerde drugs en hun adulteranten.",
"Puffy hand syndrome is een complicatie van intraveneus drugsgebruik waarvoor momenteel geen behandeling beschikbaar is.",
"Puffy hand syndrome is een niet-erkende complicatie van intraveneus drugsgebruik.",
"Het puffy hand teken is een minder vaak voorkomende complicatie bij hard-core injectieverslaafden.",
"Andere IVDA-complicaties in de bovenste extremiteit die bloedvaten en lymfevaten aantasten, omvatten hematoom, arterieel aneurysma en pseudo-aneurysma, trombose, tromboflebitis, \"puffy hand\" syndroom en lymfadenopathie.",
"<b>DOEL</b>: We bestudeerden de pathogenese van puffy hand syndrome bij intraveneus drugsgebruik.",
"In respectievelijk 69,7% van de gevallen en 59,4% van de controles was er sprake van misbruik van hoge dosis sublinguale buprenorfine, hoewel dit niet als een significante risicofactor voor puffy hand syndrome bleek te zijn.<br><b>CONCLUSIES</b>: Injectiepraktijken veroorzaken waarschijnlijk puffy hand syndrome, maar misbruik van buprenorfine moet niet als een significante risicofactor worden beschouwd.",
"puffy hand syndrome is een niet-erkende complicatie van intraveneus drugsgebruik dit pijnloze syndroom verschijnt tijdens of na een lange periode van drugsverslaving het betreft de handen en soms de onderarmen en kan functionele, esthetische en sociale stoornissen veroorzaken wanneer het handvolume groot is fysiopathologische mechanismen van puffy hand syndrome zijn onduidelijk en omvatten veneuze en lymfatische insufficiënties, infectieuze complicaties en directe toxiciteit van geïnjecteerde drugs en hun adulteranten laagrekverband en elastische kledingstukken die gewoonlijk worden gebruikt bij de behandeling van lymfoedeem worden voorgesteld om puffy hand syndrome te behandelen.",
"we bestudeerden de pathogenese van puffy hand syndrome bij intraveneus drugsgebruik we stelden de hypothese dat injecties van hoge dosis sublinguale buprenorfine in plaats van de aanbevolen sublinguale toediening een belangrijke rol kunnen spelen bij lymfatische obstructie en vernietiging we voerden een case-control studie uit in substitutiecentra waarbij intraveneuze drugsverslaafden met en zonder puffy hands werden gerekruteerd respectievelijk werden de proefpersonen gevraagd anoniem een vragenlijst van 40 items in te vullen met sociale en demografische status, geschiedenis van illegaal drugsgebruik, misbruik van buprenorfine en injectiepraktijken we includeerden 33 gevallen en 33 controles met een gemiddelde leeftijd van 34 jaar ze waren voormalige heroïnegebruikers, voornamelijk methadon-substitutie in multivariate analyse waren vrouwelijk geslacht of 8,9 p 0,03, injecties in de handen of 5,9 p 0,03, injecties in de voeten of 6,5 p 0,01 en het ontbreken van een tourniquet of 7,0 p 0,02 significante risicofactoren voor puffy hand syndrome in respectievelijk 69,7% van de gevallen en 59,4% van de controles was er sprake van misbruik van hoge dosis sublinguale buprenorfine hoewel dit niet als een significante risicofactor voor puffy hand syndrome bleek te zijn injectiepraktijken veroorzaken waarschijnlijk puffy hand syndrome maar misbruik van buprenorfine moet niet als een significante risicofactor worden beschouwd echter moeten intraveneuze drugsgebruikers nog steeds worden gewaarschuwd voor lokale en systemische complicaties van intraveneus drugsgebruik.",
"puffy hand bij langdurige intraveneuze drugsgebruikers",
"narcotica-verslaving kan systemische en lokale complicaties veroorzaken intraveneuze injecties van drugs kunnen veneuze trombose en septische of embolische complicaties veroorzaken het puffy hand teken is een minder vaak voorkomende complicatie bij hard-core injectieverslaafden drie langdurige intraveneuze drugsgebruikers, twee mannen en één vrouw, gemiddelde leeftijd 30,6 jaar (26-37), presenteerden puffy hands deze patiënten waren drugsverslaafden geweest gedurende vier tot twaalf jaar (gemiddeld 7,3 jaar) en waren gestopt met heroïne-injecties gedurende 3,5 jaar (gemiddeld 4,6) en namen deel aan een buprenorfine-substitutieprogramma het oedeem verscheen enkele jaren na het stoppen met drugs (1,5-5, gemiddeld 2,3) typisch was de zwelling bilateraal, de handen gezwollen van de proximale segmenten van de vingers tot de pols bij één patiënt was het oedeem gelokaliseerd in zowel de handen als de voeten het oedeem was niet putvormend en werd niet beïnvloed door elevatie duplex-echografie van de extremiteiten was normaal lymfangiografie uitgevoerd bij één patiënt wees op diepe lymfatische vernietiging puffy hand syndrome lijkt het eindresultaat te zijn van lymfatische obstructie herhaalde injecties van drugs in of buiten de aderen vernietigen de lymfevaten buprenorfine kan een belangrijke rol spelen bij het puffy hand teken hoewel het verondersteld wordt oraal te worden toegediend gebruiken veel drugsverslaafden het als een i.v.-oplossing omdat buprenorfine slecht oplosbaar is veroorzaakt het lymfatische obstructie dit type hand waarvoor geen therapie bestaat moet worden onderscheiden van diepe palmaire ruimte-infectie met dorsaal oedeem die incisie en drainage vereist.",
"puffy hand syndrome is een complicatie van intraveneus drugsgebruik waarvoor momenteel geen behandeling beschikbaar is arm- en onderarm-oedeem zijn volumineus en veroorzaken functionele en esthetische stoornissen we rapporteren twee gevallen die succesvol werden behandeld met laagrekverbanden een 40-jarige man en een 34-jarige vrouw, beiden intraveneuze drugsgebruikers met puffy hand syndrome, werden 11 dagen gehospitaliseerd de behandeling omvatte dagelijkse multilayer verbandlegging lymfoedeemvolumes berekend met behulp van de formule voor een afgeknotte kegel daalden met 16% aan de linkerzijde en 12% aan de rechterzijde voor de eerste patiënt en 31% en 17% voor de tweede handomtrek daalde met 4,3 cm aan de linkerzijde en 3,2 cm aan de rechterzijde in geval 1 en respectievelijk 2,5 cm en 1,9 cm voor geval 2 de patiënten werden tijdens hun ziekenhuisopname geleerd zichzelf te verbinden elastische handschoenen werden aan het einde van de behandeling aangemeten reductie van het lymfoedeemvolume bleef stabiel na 18 maanden bij één patiënt terwijl voor de tweede patiënt verdere behandeling en hospitalisatie nodig waren vanwege slechte therapietrouw de pathogenese van dit oedeem is waarschijnlijk multifactorieel veneuze en lymfatische insufficiëntie en de directe toxiciteit van geïnjecteerde drugs lymfoedeembehandeling bestaat momenteel uit laagrekverbanden en het dragen van elastische kledingstukken wat effectief is in het verminderen van het volume van puffy hand syndrome.",
"de incidentie van vasculaire complicaties door drugsgebruik neemt momenteel toe door nieuwe soorten drugs en door de verschillende manieren van inname van dergelijke stoffen de vasculaire complicaties gerelateerd aan drugsgebruik kunnen veneuze, arteriële en lymfatische gebieden aantasten en in het bijzonder ischemie na intra-arteriële injecties, arteriële en veneuze pseudo-aneurysma's, vasculitis, aneurysma's, aortadissecties, abcessen gecompliceerd door erosies van vaten, arterioveneuze fistels, compartimentsyndroom, oppervlakkige en diepe veneuze trombose, septische tromboflebitis, puffy hand syndrome de wetenschappelijke kennis op dit gebied is onvolledig vanwege de nieuwe pathologische gevallen en het gebrek aan informatie over de effectiviteit van verschillende behandelingen de auteurs rapporteren vier patiënten met vasculaire pathologieën door drugsgebruik in één geval heeft een heroïneverslaafde meerdere fasciotomieën ondergaan voor compartimentsyndroom dat ontstond omdat de patiënt een onnatuurlijke houding meerdere uren aanhield tijdens een overdosiscoma in een tweede geval werd een segmentale rechter subclavia diepe veneuze trombose behandeld met farmacologische therapie met bevredigend functioneel herstel van de arm een derde patiënt onderging met succes intra-arteriële farmacologische vasodilatatie voor gegeneraliseerde vasospasmen van de onderste ledematen veroorzaakt door drugsgebruik in het laatste geval veroorzaakte het vrijwillig innemen van een grote dosis cocaïne de dood van de patiënt na meerdere ischemische en hemorragische cerebrale episodes na de beschrijving van deze gevallen wordt een overzicht van de recente literatuur en enkele observaties over dit onderwerp gepresenteerd een betere kennis van vasculaire complicaties door drugsgebruik zou de therapeutische benadering van deze patiënten moeten verbeteren.",
"Intravenous drug addiction is verantwoordelijk voor veel complicaties, vooral cutane en infectieuze. Er is een syndroom, zelden waargenomen in de reumatologie, dat resulteert in puffy hands: het puffy hand syndrome. We rapporteren twee gevallen van deze aandoening uit onze reumatologische consultatie. Onze twee patiënten hadden intraveneuze drugsverslaving. Ze presenteerden zich met een oedeem van de handen, bilateraal, pijnloos, zonder putvorming, voorkomend bij een van onze patiënten tijdens heroïne-intoxicatie en bij de andere 2 jaar na het stoppen met injecties. Bij onze twee patiënten waren aanvullende onderzoeken (biologisch, radiologisch, echografie) onopvallend, wat ons hielp om, in de context, de diagnose van puffy hand syndrome te stellen. De pathofysiologie, nog onduidelijk, is deels gebaseerd op een lymfatische toxiciteit van drugs en hun hulpstoffen. Er is geen etiologische behandeling, maar elastische compressie ’s nachts heeft het oedeem van de handen bij een van onze patiënten verbeterd.",
"Puffy hand syndrome ontwikkelt zich na langdurige intraveneuze drugsverslaving. Het wordt gekenmerkt door een niet-putvormend oedeem dat de dorsale zijde van vingers en handen aantast met een gezwollen aspect. Frequentie en ernst van de complicaties van dit syndroom worden zelden gerapporteerd. Lokale infectieuze complicaties zoals cellulitis kunnen ernstig zijn en kunnen de diagnose mogelijk maken. Hier rapporteren we het geval van een 41-jarige man die naar de spoedeisende hulp kwam met buikpijn, koorts en blaarvormige laesies aan benen en armen met oedeem. Bacteriologisch onderzoek van een gesloten blaarvormige laesie toonde een methicilline-gevoelige Staphylococcus aureus aan. De CT-scan van de buik sloot diepe infecties en peritoneale effusie uit. De patiënt werd succesvol behandeld met intraveneuze oxacilline en clindamycine. Hij had een voorgeschiedenis van intraveneuze heroïneverslaving. We stelden de diagnose puffy hand syndrome, onthuld door een ernstige stafylokokkeninfectie met toxische betrokkenheid die een cellulitis van vier ledematen nabootste. Behalve de chronische lymfoedeembehandeling is er geen specifieke medicatie beschikbaar voor puffy hand syndrome. Prophylactische maatregelen tegen huidinfecties zijn essentieel."
] | 1,710 | 1,629 |
2,359 | Beschrijf het werkingsmechanisme van Ozanimod. | Ozanimod is een nieuw, selectief, oraal modulator van de sphingosine-1-fosfaat (1 en 5) receptor in klinische ontwikkeling voor de behandeling van chronische immuungemedieerde, inflammatoire aandoeningen, zoals multiple sclerose en inflammatoire darmziekte. Toch is het exacte werkingsmechanisme onbekend. | [
"De sphingosine-1-fosfaat receptor-1 (S1P1) agonist ozanimod verbetert colitis ulcerosa, maar het werkingsmechanisme is onbekend.",
"Ten slotte toonde de S1P1 receptor agonist ozanimod veelbelovende resultaten in vroege onderzoeken bij colitis ulcerosa.",
"Tot voor kort waren drie S1P-modulatoren met verschillende selectiviteit voor S1P-receptoren in klinische ontwikkeling voor IBD: ozanimod (RPC1063), etrasimod (APD334) en amiselimod (MT-1303).",
"Ozanimod is een orale selectieve modulator van S1P1R en S1P5R receptoren in klinische ontwikkeling voor de behandeling van chronische immuungemedieerde, inflammatoire aandoeningen.",
"Ozanimod is een nieuw, selectief, oraal modulator van de sphingosine-1-fosfaat (1 en 5) receptor in ontwikkeling voor multiple sclerose en inflammatoire darmziekte.",
"Opkomende strategieën om in te grijpen in cellulaire adhesieprocessen die betrokken zijn bij de rekrutering van lymfocyten worden besproken, inclusief zowel integrineblokkade (natalizumab, vedolizumab, etrolizumab) als sphingosine-1-fosfaat receptorremming (fingolimod, ozanimod).",
"RECENTE VINDINGEN: We bespreken de belangrijkste bevindingen van een gepubliceerde fase II-studie die zich richtte op de β7 integrine (etrolizumab), twee fase II-studies die zich richtten op de α4β7 integrine ligand: mucosale adresseringscel adhesiemolecuul 1 (MAdCAM-1, PF-00547659), een fase II-studie gericht op de chemokine IP-10 (CXCL10) bij de ziekte van Crohn, en een fase II-studie die zich richtte op de sphingosine-1-fosfaat receptor-1: ozanimod bij patiënten met colitis ulcerosa.",
"Als zodanig zijn middelen die selectiever subtype 1 van de S1PR targeten van belang en bevinden zich in verschillende ontwikkelingsstadia. Deze omvatten ponesimod (ACT128800), siponimod (BAF312), ozanimod (RPC1063), ceralifimod (ONO-4641), GSK2018682 en MT-1303.",
"Effecten van maaltijden met hoog en laag vetgehalte op de farmacokinetiek van Ozanimod, een nieuw modulator van de sphingosine-1-fosfaat receptor.",
"Ozanimod (RPC1063) is een orale selectieve modulator van de sphingosine-1-fosfaat 1 en 5 receptoren in ontwikkeling voor de behandeling van relapsing multiple sclerose en inflammatoire darmziekte.",
"Ozanimod is een nieuw, selectief, oraal modulator van de sphingosine-1-fosfaat (1 en 5) receptor in ontwikkeling voor multiple sclerose en inflammatoire darmziekte.",
"Cardiale veiligheid van Ozanimod, een nieuw modulator van de sphingosine-1-fosfaat receptor:",
"Ozanimod (RPC1063) is een orale selectieve modulator van de sphingosine-1-fosfaat 1 en 5 receptoren in ontwikkeling voor de behandeling van relapsing multiple sclerose en inflammatoire darmziekte.",
"<b>ACHTERGROND</b>: Ozanimod (RPC1063) is een orale agonist van de sphingosine-1-fosfaat receptor subtypes 1 en 5 die perifere lymfocytensekwestratie induceert, wat mogelijk het aantal geactiveerde lymfocyten dat circuleert naar het gastro-intestinale kanaal vermindert.<br><b>METHODEN</b>: We voerden een dubbelblinde, placebogecontroleerde fase 2-studie uit met ozanimod bij 197 volwassenen met matige tot ernstige colitis ulcerosa.",
"Verschillende nieuwe medicijnen worden onderzocht in late fase studies voor de behandeling van patiënten met relapsing of progressieve multiple sclerose (MS). Deze middelen vertegenwoordigen verschillende werkingsmechanismen en bieden niet alleen lagere relapsepercentages maar ook verbetering van handicaps. De meerderheid van de onderzoeksstudies betreft selectieve sphingosine-1-fosfaat receptor 1 immunomodulatoren zoals laquinimod, ozanimod, ponesimod en siponimod, in een poging voort te bouwen op het succes van fingolimod. Ocrelizumab is een CD20-positieve B-cel gerichte monoklonale antilichaam met een veelbelovend nieuw werkingsmechanisme. Ofatumumab is ook een CD20-remmer. Daclizumab, een interleukine 2-remmer, heeft bewijs van goede werkzaamheid maar wordt geassocieerd met ongunstige bijwerkingen. Masitinib is een mastcelremmer die ook werkzaamheid heeft getoond bij de ziekte van Alzheimer en amyotrofische laterale sclerose. Fase 3-studies voor sommige van deze middelen zullen binnen 12 maanden worden afgerond en hun fabrikanten zullen naar verwachting kort daarna een aanvraag indienen bij de Amerikaanse Food and Drug Administration. Dit overzichtsartikel vat gegevens samen van recent goedgekeurde en late fase onderzoeksmedicijnen voor de behandeling van patiënten met MS.",
"Sphingosine-1-fosfaat (S1P) receptor modulatoren bezitten een uniek werkingsmechanisme als ziekte-modificerende therapie voor multiple sclerose (MS). Subtype 1 S1P-receptoren worden tot expressie gebracht op het oppervlak van lymfocyten en zijn belangrijk bij het reguleren van het verlaten van lymfeklieren. De S1P receptor modulatoren antagoniseren indirect de functie van de receptor en sekwestreren lymfocyten in de lymfeklieren. Fingolimod was het eerste S1P-middel dat in 2010 in de VS werd goedgekeurd voor relapsing MS, nadat twee fase III-studies (FREEDOMS en TRANSFORMS) krachtige werkzaamheid en goede veiligheid en verdraagbaarheid hadden aangetoond. Post-marketing ervaring evenals een derde fase III-studie (FREEDOMS II) toonden ook gunstige resultaten. Meer selectieve S1P receptor middelen zoals ponesimod (ACT128800), siponimod (BAF312), ozanimod (RPC1063), ceralifimod (ONO-4641), GSK2018682 en MT-1303 bevinden zich nog in relatief vroege ontwikkelingsstadia, maar fase I en II-studies toonden veelbelovende werkzaamheid en veiligheid. Deze bevindingen moeten echter nog worden bevestigd in fase III klinische studies.",
"Resultaten van de eerste humane studie met ozanimod, een nieuw selectief modulator van de sphingosine-1-fosfaat receptor.",
"Cardiale veiligheid van ozanimod, een nieuw modulator van de sphingosine-1-fosfaat receptor: resultaten van een grondige QT/QTc-studie.",
"Effecten van maaltijden met hoog en laag vetgehalte op de farmacokinetiek van ozanimod, een nieuw modulator van de sphingosine-1-fosfaat receptor.",
"Ozanimod (RPC1063) is een krachtige agonist van de sphingosine-1-fosfaat receptor 1 (S1P1) en receptor 5 (S1P5) met auto-immuunziekte modificerende activiteit.",
"Sphingosine-1-fosfaat receptor (S1PR) modulatoren bezitten een uniek werkingsmechanisme bij de behandeling van multiple sclerose (MS). Subtype 1 van de S1PR wordt tot expressie gebracht op het oppervlak van lymfocyten en is belangrijk bij het reguleren van het verlaten van lymfeklieren. De S1PR modulatoren antagoniseren indirect de functie van de receptor, wat leidt tot sekwestratie van lymfocyten in de lymfeklieren. Fingolimod was de eerste S1PR modulator die regulatoire goedkeuring kreeg voor relapsing-remitting MS, nadat twee fase III-studies krachtige werkzaamheid, veiligheid en verdraagbaarheid hadden aangetoond. Fingolimod kan ongewenste effecten veroorzaken als gevolg van interactie met andere S1PR subtypes die tot expressie worden gebracht in diverse weefsels, waaronder hartmyocyten. Daarom zijn middelen die selectiever subtype 1 van de S1PR targeten van belang en bevinden zich in verschillende ontwikkelingsstadia. Deze omvatten ponesimod (ACT128800), siponimod (BAF312), ozanimod (RPC1063), ceralifimod (ONO-4641), GSK2018682 en MT-1303. Gegevens uit fase II-studies en vroege resultaten uit fase III-studies zijn veelbelovend en worden in dit overzicht gepresenteerd. Van bijzonder belang zijn de resultaten van de EXPAND-studie met siponimod, die een potentiële rol voor S1PR modulatoren bij secundair progressieve MS suggereren.",
"De sphingosine-1-fosfaat receptor 1 (S1P) agonist ozanimod verbetert colitis ulcerosa, maar het werkingsmechanisme is onbekend. Hier onderzoeken we de cel-subsets die S1P in de darm tot expressie brengen met behulp van S1P-EGFP muizen, de regulatie van S1P-expressie in lymfocyten na toediening van dextraansulfaat natrium (DSS), na colitis geïnduceerd door overdracht van CD4+CD45RB-cellen en door het kruisen van een muis met TNF-gedreven ileitis met S1P-EGFP muizen. Vervolgens bepaalden we de expressie van enzymen die de intestinale S1P-niveaus reguleren en het effect van FTY720 op het gedrag van lymfocyten en S1P-expressie. We vonden dat niet alleen T- en B-cellen S1P tot expressie brengen, maar ook dendritische cellen (DC) en endotheelcellen. Bovendien verhoogden chronische, maar niet acute, inflammatoire signalen de S1P-expressie, terwijl de enzymen die de weefsel-S1P-niveaus bij muizen en mensen met inflammatoire darmziekte (IBD) reguleren uniform gedysreguleerd waren, met een voorkeur voor synthese boven afbraak. Ten slotte observeerden we dat FTY720 de T-cel snelheid verminderde en S1P-afbraak induceerde en retentie van naïeve, maar niet van effector T-cellen. Onze gegevens tonen aan dat chronische ontsteking de S1P-expressie en weefsel-S1P-niveaus moduleert en suggereren dat de anti-inflammatoire eigenschappen van S1PR agonisten mogelijk niet uitsluitend te wijten zijn aan hun lymfopenische effecten, maar ook aan potentiële effecten op DC-migratie en vasculaire barrièrefunctie.",
"Ozanimod (RPC1063) is een orale selectieve modulator van de sphingosine-1-fosfaat 1 en 5 receptoren in ontwikkeling voor de behandeling van relapsing multiple sclerose en inflammatoire darmziekte. De effecten van maaltijden met hoog en laag vetgehalte op de farmacokinetiek (PK) van een enkele orale dosis ozanimod werden geëvalueerd in 24 gezonde vrijwilligers in een gerandomiseerde open-label crossover-studie. Elke deelnemer kreeg een dosis van 1 mg ozanimod hydrochloride onder drie maaltijdcondities: nuchter, hoog vet en laag vet, elk gescheiden door 7 dagen. De gemiddelde plasmaconcentratie-tijdprofielen voor ozanimod en zijn actieve metabolieten RP101988 (belangrijk) en RP101075 (minder belangrijk) waren vergelijkbaar onder alle drie de condities. Bovendien waren alle PK-parameters voor ozanimod, RP101988 en RP101075 vergelijkbaar onder de drie maaltijdcondities. De 90% betrouwbaarheidsintervallen (CI's) voor de verhoudingen van de geometrische least squares mean (gevoed/nuchter) lagen binnen de equivalentielimieten van 0,80 tot 1,25 voor de oppervlakte onder de concentratie-tijdcurve van tijd 0 tot oneindig (AUC) en maximale plasmaconcentratie (Cmax) voor ozanimod, RP101988 en RP101075, behalve voor het effect van een vetrijke maaltijd op RP101075 Cmax (90% CI 0,76-0,88). Gezien dit gebrek aan een voedsel-effect op de blootstelling aan ozanimod en zijn actieve metabolieten, kan ozanimod zonder rekening te houden met maaltijden worden ingenomen.",
"Ozanimod is een nieuw, selectief, oraal modulator van de sphingosine-1-fosfaat 1 en 5 receptor in ontwikkeling voor multiple sclerose en inflammatoire darmziekte. Deze gerandomiseerde, dubbelblinde, placebogecontroleerde, positief gecontroleerde, parallelle groep, grondige QT-studie karakteriseerde de effecten van ozanimod op cardiale repolarisatie bij gezonde proefpersonen. Geschikte proefpersonen werden gerandomiseerd naar een van twee groepen: ozanimod, opgehoogd van 0,25 tot 2 mg over 14 dagen, of placebo gedurende 14 dagen. Een enkele dosis moxifloxacine 400 mg of placebo werd toegediend op dag 2 en 17. De primaire eindpunt was de tijdsgematchte, placebogecorrigeerde, baseline-gecorrigeerde gemiddelde QTcf (ΔΔQTcf). In totaal voltooiden 113, 124 en 91,1 proefpersonen de studie. De bovengrenzen van de tweezijdige 90% betrouwbaarheidsintervallen voor ΔΔQTcf voor zowel ozanimod 1 als 2 mg lagen onder de 10 milliseconden regulatoire drempel. Er werd geen QTcf >480 milliseconden of postdose verandering in QTcf van >60 milliseconden waargenomen. Er was geen bewijs van een positieve relatie tussen concentraties van ozanimod en zijn actieve metabolieten en ΔΔQTcf. Hoewel ozanimod de waargenomen diurnale toename in hartslag dempte, waren de dalingen onder de predose hartslagen niet groter dan bij placebo. De resultaten tonen aan dat ozanimod het QTc-interval niet verlengt of klinisch significante bradycardie veroorzaakt, wat het gunstige cardiale veiligheidsprofiel van ozanimod ondersteunt."
] | 1,635 | 1,571 |
2,360 | Beschrijf swirl sign bij intracerebrale bloeding. | Swirl sign wordt beschreven als gebieden met lage attenuatie, radiolucentie of onregelmatige dichtheid. Het werd eerder beschreven bij epidurale hematomen. Bij intracerebrale bloedingen wordt swirl sign geassocieerd met een groter hematoomvolume, ongunstige uitkomsten en een groter sterfterisico. | [
"Univariate analyse toonde aan dat de aanwezigheid van extravasatie op CT, een groot initieel hematoomgrootte (>30 mL), de aanwezigheid van \"swirl sign\" op NCCT, de Glasgow Coma Scale en ICH-scores, en de internationale genormaliseerde ratio geassocieerd waren met een verhoogde mortaliteit.",
"ACHTERGROND: Swirl sign is eerder beschreven bij epidurale hematomen als gebieden met lage attenuatie, radiolucentie of onregelmatige dichtheid.",
"61% van de patiënten met swirl sign was overleden na één maand vergeleken met 21% van degenen zonder swirl sign (p<0,001). Slechts 19% van de patiënten met swirl sign vertoonde een gunstige uitkomst na drie maanden vergeleken met 53% van degenen zonder swirl sign (p<0,001). Patiënten met swirl sign hadden grotere ICH's met een gemiddeld ICH-volume van 52 ± 50 ml (mediaan 42 ml) vergeleken met 15 ± 25 ml (mediaan 6) bij patiënten waarvan de CT geen swirl sign toonde (p<0,001). Swirl sign was een onafhankelijke voorspeller van overlijden na één maand (p = 0,03; aangepaste odds ratio 2,6, 95% CI 1,1 - 6) en functionele uitkomst na drie maanden (p = 0,045; aangepaste odds ratio 2,6, 95% CI 1,02 - 6,5). CONCLUSIES: Aangezien swirl sign een onheilspellend teken bleek te zijn, raden wij aan dit teken te identificeren bij gevallen van ICH's.",
"De volgende NCCT-markers werden geïdentificeerd: intrahematoma hypodensiteiten, black hole sign, swirl sign, blend sign, heterogene hematoomdichtheid en onregelmatige vorm.",
"Het risico op evolutie naar hersendood (BD) werd geclassificeerd als laag (corneale reflexen aanwezig en geen swirl sign), hoog (≥1 corneale reflexen afwezig en swirl sign), en intermediair.",
"Patiënten met swirl sign hadden grotere ICH's met een gemiddeld ICH-volume van 52 ± 50 ml (mediaan 42 ml) vergeleken met 15 ± 25 ml (mediaan 6) bij patiënten waarvan de CT geen swirl sign toonde (p < 0,001).",
"<b>ACHTERGROND</b>: Swirl sign is eerder beschreven bij epidurale hematomen als gebieden met lage attenuatie, radiolucentie of onregelmatige dichtheid.",
"Swirl sign was een onafhankelijke voorspeller van overlijden na één maand (p = 0,03; aangepaste odds ratio 2,6, 95% CI 1,1 - 6) en functionele uitkomst na drie maanden (p = 0,045; aangepaste odds ratio 2,6, 95% CI 1,02 - 6,5).<br><b>CONCLUSIES</b>: Aangezien swirl sign een onheilspellend teken bleek te zijn, raden wij aan dit teken te identificeren bij gevallen van ICH's.<br>",
"ACHTERGROND: Swirl sign is eerder beschreven bij epidurale hematomen als gebieden met lage attenuatie, radiolucentie of onregelmatige dichtheid.",
"CONCLUSIES Detectie van hematocriet-effect door CT-scanning van intracraniële hematomen moet voorzichtig geïnterpreteerd worden bij gebruik van orale anticoagulantia, terwijl detectie van swirl sign moet wijzen op actieve bloeding.",
"CONCLUSIES Aangezien swirl sign een onheilspellend teken bleek te zijn, raden wij aan dit teken te identificeren bij gevallen van ICH's.",
"Samenvattend werd de aanwezigheid van swirl sign op de hoofd-CT-scan van patiënten met AEDH significant geassocieerd met een slechte uitkomst.",
"Patiënten met swirl sign hadden grotere ICH's met een gemiddeld ICH-volume van 52 ± 50 ml (mediaan 42 ml) vergeleken met 15 ± 25 ml (mediaan 6) bij patiënten waarvan de CT geen swirl sign toonde (p < 0,001).",
"Swirl sign is eerder beschreven bij epidurale hematomen als gebieden met lage attenuatie, radiolucentie of onregelmatige dichtheid. De doelstellingen van deze studie waren het beschrijven van swirl sign bij ICH, het bestuderen van de prevalentie, het onderzoeken van de betrouwbaarheid van de subjectieve evaluatie op computertomografie (CT) en het verkennen van de prognostische waarde. CT's van 203 patiënten met ICH werden retrospectief geëvalueerd op de aanwezigheid van swirl sign. De associatie tussen swirl sign en verschillende klinische en radiologische variabelen werd bestudeerd. Inter- en intra-observer overeenstemming met betrekking tot het voorkomen van swirl sign was substantieel (κ 0,80) en bijna perfect (κ 0,87) respectievelijk. Swirl sign werd gevonden bij 30% van de studiepopulatie. 61% van de patiënten met swirl sign was overleden na één maand vergeleken met 21% van degenen zonder swirl sign (p 0,001). Slechts 19% van de patiënten met swirl sign vertoonde een gunstige uitkomst na drie maanden vergeleken met 53% van degenen zonder swirl sign (p 0,001). Patiënten met swirl sign hadden grotere ICH's met een gemiddeld ICH-volume van 52 ± 50 ml (mediaan 42 ml) vergeleken met 15 ± 25 ml (mediaan 6) bij patiënten waarvan de CT geen swirl sign toonde (p 0,001). Swirl sign was een onafhankelijke voorspeller van overlijden na één maand (p 0,03; aangepaste odds ratio 2,6, 95% CI 1,1 - 6) en functionele uitkomst na drie maanden (p 0,045; aangepaste odds ratio 2,6, 95% CI 1,02 - 6,5). Aangezien swirl sign een onheilspellend teken bleek te zijn, raden wij aan dit teken te identificeren bij gevallen van ICH's.",
"Het doel van de studie was het identificeren van voorspellers van hersendood (BD) bij opname op de intensivecareafdeling (IC) van comateuze patiënten met spontane intracerebrale bloeding (ICH). Patiënten met spontane ICH die tussen 2002 en 2010 op onze IC werden opgenomen en mechanisch werden beademd, werden retrospectief geanalyseerd. Van de 72 patiënten ontwikkelden 49 hersendood, 39 overleden na het stopzetten van levensondersteuning en 12 werden levend ontslagen. De meest onderscheidende kenmerken om hersendood te voorspellen werden opgenomen in twee modellen. Model 1 bevatte 3 afgeschaftte hersenstamreflexen (aangepaste odds ratio's 8,4; 2,4; 29,1) en het swirl sign op de basale CT-scan (aangepaste odds ratio 5,0; 1,6; 15,9). Model 2 betrof het afwezig zijn van corneale reflexen (unilateraal, bilateraal; aangepaste odds ratio's 4,2; 0,9; 20,1; 8,8; 2,4; 32,3) en het swirl sign op de basale CT-scan (aangepaste odds ratio 6,2; 1,9; 20,0). Twee scores die hersendood voorspellen werden gecreëerd met een sensitiviteit van 0,89 en 0,88 en specificiteit van 0,68 en 0,65. Het risico op evolutie naar hersendood werd geclassificeerd als laag (corneale reflexen aanwezig en geen swirl sign), hoog (≥1 corneale reflexen afwezig en swirl sign) en intermediair. Eenvoudige tekenen bij opname op de IC kunnen hersendood voorspellen bij comateuze patiënten met ICH en zouden het potentieel voor orgaandonatie kunnen vergroten."
] | 999 | 988 |
2,361 | Wat is Morgellons-ziekte? | Het is een huidaandoening waarbij individuen huidlaesies hebben die een soort vezels bevatten. Patiënten klagen vaak over beestjes die onder hun huid kruipen. De ziekte is van onbekende oorsprong en kan psychosomatisch zijn, maar recent bewijs wijst erop dat het door een teken kan worden overgedragen. | [
"\"Morgellons-ziekte\" is een controversieel onderwerp geweest in de geschiedenis van de psychodermatologie. De meest geaccepteerde wetenschappelijke mening is dat het een primaire psychiatrische stoornis is, met name een waanstoornis, hoewel ook andere oorzaken zijn genoemd. Sommige auteurs hebben gesuggereerd dat het kan overeenkomen met een veelvoorkomende dermatosis met secundaire psychopathologie.",
"Morgellons-ziekte is een zeldzame ziekte met onbekende etiologie",
"In de afgelopen jaren is er een toename gemeld van huidaandoeningen met kleine vezels of andere deeltjes. De aandoening wordt aangeduid als Morgellons-ziekte. Patiënten presenteren zich met prikkelende, branderige of kruipende sensaties op de huid, met waargenomen extrusie van levenloze materialen naast vermoeidheid en andere systemische symptomen. Lijders ervaren vaak aanzienlijke morbiditeit en een vermindering van de levenskwaliteit.",
"inclusief waanachtige besmetting, Morgellons-syndroom, ",
"Morgellons-ziekte (MD) is een dermopathie die wordt gekenmerkt door meerkleurige filamenten die onder de huid liggen, erin zijn ingebed of uit de huid steken. Hoewel MD aanvankelijk werd beschouwd als een waanstoornis, hebben recente studies aangetoond dat de dermopathie geassocieerd is met een door teken overgedragen infectie, dat de filamenten bestaan uit keratine en collageen, en dat ze het resultaat zijn van proliferatie van keratinocyten en fibroblasten in epitheliaal weefsel.",
"Morgellons-ziekte (MD) is een complexe huidaandoening die wordt gekenmerkt door ulcererende laesies met uitstekende of ingebedde filamenten. Veel clinici verwijzen naar deze aandoening als waanachtige parasitaire besmetting of waanachtige infestatie en beschouwen de filamenten als geïntroduceerde textielvezels. Daarentegen wijzen recente studies erop dat MD een echte somatische ziekte is die geassocieerd wordt met een door teken overgedragen infectie, dat de filamenten bestaan uit keratine en collageen en dat ze het resultaat zijn van proliferatie en activatie van keratinocyten en fibroblasten in de huid.",
"Morgellons is een medisch betwiste diagnose met voornamelijk dermatologische symptomen. Patiënten ervaren vezels die uit de huid komen, samen met een reeks andere somatische, psychiatrische en neurologische klachten.",
"Morgellons-ziekte is een aandoening met pijnlijke huidlaesies, vezelachtige uitgroeisels die uit de huid steken, en onderhuidse prikkelende en branderige sensaties, samen met symptomen van angst, depressie, vermoeidheid en geheugen- en aandachtsstoornissen.",
"Morgellons-ziekte is een opkomende huidaandoening die wordt gekenmerkt door de vorming van dermale filamenten geassocieerd met multisystemische symptomen en door teken overgedragen ziekte.",
"Morgellons-ziekte wordt gekenmerkt door klachten van ongemakkelijke huidsensaties en vezels die uit niet-genezende huidlaesies komen.",
"Morgellons-ziekte is een controversiële en slecht gedefinieerde symptoomcluster van huidlaesies en somatische symptomen, met name 'vezels' in de huid.",
"Morgellons-ziekte is een psycho-dermatologische aandoening waarbij patiënten melden dat er vezels of filamenten uit hun huid \"groeien\".",
"Morgellons-ziekte is een zeldzame syndromale aandoening die typisch middelbare leeftijd blanke vrouwen treft, gekenmerkt door kruipende sensaties op en onder de huid, geassocieerd met jeukende uitslag, prikkelende zweren, vezelachtige filamenten die uit de zweren komen, ernstige vermoeidheid, concentratieproblemen en geheugenverlies.",
"Morgellons-ziekte is een controversiële ziekte waarbij patiënten klagen over prikkelende, branderige en bijtende sensaties onder de huid. Ongebruikelijke onderhuidse vezels zijn het unieke objectieve bevinding.",
"Morgellons-ziekte is een mysterieuze huidaandoening die meer dan 300 jaar geleden voor het eerst werd beschreven. De ziekte wordt gekenmerkt door vezelachtige strengen die uit de huid steken in combinatie met verschillende dermatologische en neuropsychiatrische symptomen.|"
] | 548 | 541 |
2,362 | Wat is Cellbase? | CellBase, een uitgebreide verzameling RESTful webservices voor het ophalen van relevante biologische informatie uit heterogene bronnen. | [
"CellBase, een uitgebreide verzameling RESTful webservices voor het ophalen van relevante biologische informatie uit heterogene bronnen.",
"CellBase biedt een oplossing voor de groeiende noodzaak aan integratie door de toegang tot biologische data te vergemakkelijken. CellBase implementeert een set RESTful webservices die een gecentraliseerde database bevragen met de meest relevante biologische databronnen. De database wordt gehost op onze servers en wordt regelmatig bijgewerkt. Documentatie over CellBase is te vinden op http://docs.bioinfo.cipf.es/projects/cellbase.",
"CellBase, een uitgebreide verzameling RESTful webservices voor het ophalen van relevante biologische informatie uit heterogene bronnen",
"CellBase implementeert een set RESTful webservices die een gecentraliseerde database bevragen met de meest relevante biologische databronnen.",
"In de afgelopen jaren hebben de vooruitgangen in high-throughput technologieën geleid tot een ongekende groei in het aantal en de omvang van repositories en databases die relevante biologische data opslaan. Tegenwoordig is er meer biologische informatie dan ooit tevoren, maar helaas is de huidige status van veel van deze repositories verre van optimaal. Enkele van de meest voorkomende problemen zijn dat de informatie verspreid is over veel kleine databases; vaak zijn er verschillende standaarden tussen repositories en sommige databases worden niet langer ondersteund of bevatten te specifieke en niet-verbonden informatie. Bovendien wordt de omvang van data steeds meer een obstakel bij het benaderen of opslaan van biologische data. Al deze kwesties maken het zeer moeilijk om informatie uit verschillende bronnen te extraheren en te integreren, experimenten te analyseren of deze informatie op een programmatische manier te benaderen en te bevragen. CellBase biedt een oplossing voor de groeiende noodzaak aan integratie door de toegang tot biologische data te vergemakkelijken. CellBase implementeert een set RESTful webservices die een gecentraliseerde database bevragen met de meest relevante biologische databronnen. De database wordt gehost op onze servers en wordt regelmatig bijgewerkt. Documentatie over CellBase is te vinden op http://docs.bioinfo.cipf.es/projects/cellbase.",
"cellbase een uitgebreide verzameling restful webservices voor het ophalen van relevante biologische informatie uit heterogene bronnen",
"HGVA berekent populatiefrequenties voor deze projecten en verrijkt hun data met variantannotatie geleverd door CellBase, een rijke en snelle annotatieoplossing."
] | 344 | 344 |
2,363 | Wat is de relatie tussen de buis van Eustachius en de palatumspier van de uvula? | De musculatuur van het gehemelte is bekend als verantwoordelijk voor het actieve openen van de buis van Eustachius. | [
"De musculatuur van het gehemelte is bekend als verantwoordelijk voor het actieve openen van de buis van Eustachius (auditieve buis). Omdat laser-geassisteerde uvulopalatoplastiek (LAUP) mogelijk gedeeltelijke doorsnijding van deze spieren inhoudt, is het effect van deze procedure op de middenoor drukken (MEP's) en middenoor volumes (MEV's) relevant."
] | 72 | 78 |
2,364 | Zijn geconserveerde niet-exonische elementen (CNEE's) belangrijk in fylogenomica onderzoek? | Ja. Geconserveerde niet-exonische elementen (CNEE's) lijken veelbelovend als fylogenomische markers, met een fylogenetische resolutie die net zo hoog is als die van UCE's en introns, maar met minder gaten, minder ambiguïteit in uitlijningen en met patronen van nucleotidevervanging die beter overeenkomen met de aannames van veelgebruikte methoden voor fylogenetische analyse. | [
"Over het algemeen lijken CNEE's veelbelovend als fylogenomische markers, met een fylogenetische resolutie die net zo hoog is als die van UCE's en introns, maar met minder gaten, minder ambiguïteit in uitlijningen en met patronen van nucleotidevervanging die beter overeenkomen met de aannames van veelgebruikte methoden voor fylogenetische analyse.",
"Geconserveerde niet-exonische elementen: een nieuwe klasse van markers voor fylogenomica.",
"Doelgerichte verrijking voor gewervelde dieren wordt momenteel gedomineerd door twee benaderingen - anchored hybrid enrichment (AHE) en ultraconserved elements (UCE) - en beide benaderingen zijn nuttig gebleken voor het beantwoorden van vragen in fylogenomica, fylogeografie en populatiegenomica.",
"geconserveerde niet-exonische elementen een nieuwe klasse van markers voor fylogenomica"
] | 149 | 160 |
2,365 | Wat is de definitie van Algemene Regulerende Factoren (GRF's)? | GRF's, die binden aan locaties verspreid over het genoom binnen promotoren, spelen niet alleen een sleutelrol in het reguleren van genexpressie, maar verdelen ook het genoom in functioneel onafhankelijke domeinen. | [
"Algemene regulerende factoren (GRF's) als genoomverdelers",
"GRF's, die binden aan locaties verspreid over het genoom binnen promotoren, spelen niet alleen een sleutelrol in het reguleren van genexpressie, maar verdelen ook het genoom in functioneel onafhankelijke domeinen.",
"Abf1 en Rap1 zijn algemene regulerende factoren (GRF's) die bijdragen aan de transcriptieactivatie van een groot aantal genen, evenals aan replicatie, silencen en telomeerstructuur in gist.",
"Uitgebreide rol van de algemene regulerende factoren, Abf1 en Rap1, in het bepalen van de genoomwijde chromatinestructuur in budding gist.",
"Hier gebruiken we hoogresolutie tiling-arrays om de bijdragen van twee algemene regulerende factoren, Abf1 en Rap1, aan nucleosoombezetting in Saccharomyces cerevisiae te onderzoeken.",
"Van deze factoren is aangetoond dat ze elk aan enkele honderden promotoren binden, maar wij vinden hier dat duizenden loci gelokaliseerde gebieden van veranderde nucleosoombezetting vertonen binnen 1 uur na verlies van Abf1- of Rap1-binding, en dat veranderde chromatinestructuur kan optreden via bindingsplaatsen met een breed scala aan affiniteiten.",
"We vonden dat nucleosomen en specifieke DNA-bindende eiwitten, waaronder de algemene regulerende factoren (GRF's) Reb1p, Rap1p en Abf1p, en Pol III transcriptiefactoren de efficiëntie van NNS-terminatie verhogen door fysiek de voortgang van Pol II te blokkeren.",
"In het modelorganisme Saccharomyces cerevisiae liggen deze regio's naast bindingsplaatsen voor algemene regulerende transcriptiefactoren, en het Reb1-eiwit is vaak gebonden aan promotor-DNA nabij dergelijke regio's.",
"We speculeren dat een belangrijke functie van algemene regulerende factoren zoals Reb1p is om juiste transcriptiestartplaatsen bij promotoren vast te stellen en te behouden, en dat wanneer de binding van dergelijke factoren wordt belemmerd, de resulterende effecten op mRNA-vertaling een ondergewaardeerd aspect van genregulatiestudies kunnen zijn.",
"Abf1 en andere algemene regulerende factoren regelen de genexpressie van ribosoombiogenese in budding gist.",
"Meervoudige rollen van de algemene regulerende factor Abf1 in gist ribosoombiogenese.",
"Deze observatie verandert het paradigma van algemene regulerende factoren als relatief statische DNA-bindende eiwitten die constitutief gebonden zijn aan zeer actieve promotoren, en wijst op Abf1, dat aan honderden niet-RPG promotoren binnen het gistgenoom bindt, als een mogelijke sleutelregelaar in voedings- en stressafhankelijke transcriptiemodulatie.",
"Insulators zijn sequenties die aangrenzende chromosoomdomeinen ontkoppelen. Hier hebben we aangetoond dat Saccharomyces cerevisiae Rap1p en Abf1p-eiwitten beschikken over een krachtige isolerende capaciteit. Isolerende domeinen in Rap1p vallen samen met eerder beschreven transcriptieactivatiedomeinen, terwijl vier aangrenzende subdomeinen die het gehele C-terminus van Abf1p (440-731) beslaan, autonome isolerende capaciteit vertonen. Dat zowel Rap1p als Abf1p silencingsdomeinen een isolerend domein bevatten of er grotendeels mee overlappen, suggereert dat isolatie een nog ongedefinieerde capaciteit voor chromosoomorganisatie overbrengt die ook bijdraagt aan een functie in silencen. Samen met Reb1p en Tbf1p, eerder betrokken bij de activiteit van Saccharomyces cerevisiae subtelomerische isolators, komt isolerend potentieel naar voren als een aanvullende gemeenschappelijke eigenschap van Algemene Regulerende Factoren (GRF's). Zo zouden GRF's, die binden aan locaties verspreid over het genoom binnen promotoren, niet alleen een sleutelrol spelen in het reguleren van genexpressie, maar ook het genoom verdelen in functioneel onafhankelijke domeinen.",
"In Saccharomyces cerevisiae is een groep van meer dan 200 co-gereguleerde genen (Ribi-genen) betrokken bij ribosoombiogenese. Dit regulon is recentelijk aangetoond afhankelijk te zijn van een kleine set transcriptieregulatoren (voornamelijk Abf1, maar ook Reb1, Tbf1 en Rap1) die eerder werden aangeduid als algemene regulerende factoren (GRF's) vanwege hun wijdverspreide binding en werking bij veel promotoren en andere gespecialiseerde genomische regio's.",
"Samen met Reb1p en Tbf1p, eerder betrokken bij de activiteit van Saccharomyces cerevisiae subtelomerische isolators, komt isolerend potentieel naar voren als een aanvullende gemeenschappelijke eigenschap van Algemene Regulerende Factoren (GRF's).",
"Algemene regulerende factoren (GRF's) als genoomverdelers.",
"Dit regulon is recentelijk aangetoond afhankelijk te zijn van een kleine set transcriptieregulatoren (voornamelijk Abf1, maar ook Reb1, Tbf1 en Rap1) die eerder werden aangeduid als algemene regulerende factoren (GRF's) vanwege hun wijdverspreide binding en werking bij veel promotoren en andere gespecialiseerde genomische regio's.",
"Abf1 en Rap1 zijn algemene regulerende factoren (GRF's) die bijdragen aan transcriptieactivatie van een groot aantal genen, evenals aan replicatie, silencen en telomeerstructuur in gist.",
"Zo zouden GRF's, die binden aan locaties verspreid over het genoom binnen promotoren, niet alleen een sleutelrol spelen in het reguleren van genexpressie, maar ook het genoom verdelen in functioneel onafhankelijke domeinen.",
"Zo zouden GRF's, die binden aan locaties verspreid over het genoom binnen promotoren, niet alleen een sleutelrol spelen in het reguleren van genexpressie, maar ook het genoom verdelen in functioneel onafhankelijke domeinen.<br>",
"Genregulatiefuncties (GRF) bieden een unieke eigenschap van een cis-regulerend module (CRM), die de concentraties van transcriptiefactoren (input) relateert aan de promotoractiviteiten (output).",
"Er zijn verschillende algemene conclusies getrokken: 1) langafstandinteracties, multilayer assemblage en DNA-lusvorming kunnen leiden tot complexe GRF's die niet beschreven kunnen worden door lineaire functies van bindingsplaatsbezettingen; 2) in het algemeen kunnen GRF's niet beschreven worden door Booleaanse logica, terwijl een drie-staten niet-Booleaanse logica volstaat voor de bestudeerde voorbeelden; 3) bestudeerde CRM's van intacte fagen leken een vergelijkbare GRF-topologie te hebben (het aantal plateaus en pieken dat overeenkomt met verschillende expressieregimes); we veronderstellen dat functioneel equivalente CRM's topologisch equivalente GRF's kunnen hebben voor een grotere klasse genetische systemen; en 4) binnen een gegeven GRF-klasse is een set mechanistisch-mathematische transformaties geïdentificeerd, die het mogelijk maakt de GRF te vormen voordat een systeemniveau-analyse wordt uitgevoerd.<br>",
"We vonden dat nucleosomen en specifieke DNA-bindende eiwitten, waaronder de algemene regulerende factoren (GRF's) Reb1p, Rap1p en Abf1p, en Pol III transcriptiefactoren de efficiëntie van NNS-terminatie verhogen door fysiek de voortgang van Pol II te blokkeren.",
"Hier richten we ons op de rollen van genregulerende factoren (GRF's), in het bijzonder transcriptiefactoren (TF's) en lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) tijdens de menselijke evolutie.",
"Onze benadering onthult dat de specifieke sequenties waaraan GRF's binden aanzienlijk zijn gedivergeerd tijdens de evolutie, wat overeenkomt met een aantal belangrijke evolutionaire overgangen in het repertoire van GRF's.",
"In Saccharomyces cerevisiae is een groep van meer dan 200 co-gereguleerde genen (Ribi-genen) betrokken bij ribosoombiogenese. Dit regulon is recentelijk aangetoond afhankelijk te zijn van een kleine set transcriptieregulatoren (voornamelijk Abf1, maar ook Reb1, Tbf1 en Rap1) die eerder werden aangeduid als algemene regulerende factoren (GRF's) vanwege hun wijdverspreide binding en werking bij veel promotoren en andere gespecialiseerde genomische regio's. Intrigerend is dat Abf1-binding aan Ribi-genen verschillend wordt gemoduleerd als reactie op verschillende voedingssignaleringsroutes. Zo'n dynamische promotorassociatie heeft het potentieel om zowel activatie als repressie van Ribi-genen te coördineren in synergie met naburige regulerende sites en via de functionele interactie van histonacetyltransferasen en deacetylasen.",
"Het ontcijferen van de moleculaire basis van hoe moderne menselijke fenotypes zijn geëvolueerd is een van de meest fascinerende uitdagingen in de biologie. Hier richten we ons op de rollen van genregulerende factoren (GRF's), in het bijzonder transcriptiefactoren (TF's) en lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) tijdens de menselijke evolutie. We presenteren voorbeelden van TF's en lncRNA's die veranderd zijn of tekenen van positieve selectie vertonen bij mensen vergeleken met chimpansees, bij moderne mensen vergeleken met archaïsche mensen, of binnen moderne menselijke populaties. Op basis van de huidige kennis over de functies van deze GRF-genen speculeren we dat ze betrokken zijn geweest bij soortvorming en bij het vormgeven van fenotypes zoals hersenfuncties, skeletmorfologie en metabole processen.",
"De verpakking van eukaryote genomen in nucleosomen speelt een cruciale rol in chromatineorganisatie en genregulatie. Studies in Saccharomyces cerevisiae tonen aan dat nucleosoombezetting gedeeltelijk gecodeerd wordt door intrinsieke antinucleosomale DNA-sequenties zoals poly-A sequenties, evenals door bindingsplaatsen voor trans-werkende factoren die nucleosomen kunnen verdrijven, zoals Reb1 en het RSC3 30-complex. Hier gebruiken we genoomwijde nucleosoombezettingskaarten in 13 Ascomycota-schimmels om grootschalige evolutionaire herprogrammering van zowel intrinsieke als trans-determinanten van chromatinestructuur te ontdekken. We vinden dat poly-G's fungeren als intrinsieke antinucleosomale sequenties vergelijkbaar met de bekende functie van poly-A's, maar dat de abundanties van poly-G's sterk zijn gedivergeerd tussen soorten, waardoor hun antinucleosomale effect wordt verduisterd in soorten met weinig poly-G's zoals S. cerevisiae. We ontwikkelen ook een computationele methode die nucleosoombezettingskaarten gebruikt om trans-werkende algemene regulerende factor (GRF) bindingsplaatsen te ontdekken. Onze benadering onthult dat de specifieke sequenties waaraan GRF's binden aanzienlijk zijn gedivergeerd tijdens de evolutie, wat overeenkomt met een aantal belangrijke evolutionaire overgangen in het repertoire van GRF's. We valideren experimenteel een voorgestelde evolutionaire overgang van Cbf1 als een belangrijke GRF in pre-whole genome duplicatie (WGD) gisten naar Reb1 in post-WGD gisten. We tonen verder aan dat het paringstype-switch activerende eiwit Sap1 een GRF is in S. pombe, wat de algemene toepasbaarheid van onze benadering aantoont. Onze resultaten onthullen dat de onderliggende mechanismen die in vivo chromatineorganisatie bepalen zijn gedivergeerd en dat vergelijkende genomica kan helpen nieuwe determinanten van chromatineorganisatie te ontdekken.",
"RNA-polymerase II (Pol II) transcriptie-terminatie door het Nrd1p Nab3p Sen1p (NNS) pad is cruciaal voor de productie van stabiele niet-coderende RNA's en de controle van wijdverspreide transcriptie in Saccharomyces cerevisiae. Om determinanten van NNS-terminatie te ontdekken, hebben we de 3'-einden van NNS-terminerende transcripties genoomwijd in kaart gebracht. We vonden dat nucleosomen en specifieke DNA-bindende eiwitten, waaronder de algemene regulerende factoren (GRF's) Reb1p, Rap1p en Abf1p, en Pol III transcriptiefactoren, de efficiëntie van NNS-terminatie verhogen door fysiek de voortgang van Pol II te blokkeren. Dezelfde DNA-gebonden factoren die NNS-terminatie bevorderen, zijn eerder aangetoond de 3'-einden van Okazaki-fragmenten die door Pol δ tijdens DNA-replicatie worden gesynthetiseerd te definiëren. Verminderde binding van deze factoren resulteert in defecte NNS-terminatie en Pol II doorlezing. Bovendien maakt het inactiveren van NNS Pol II-elongatie door deze obstakels mogelijk, wat aantoont dat effectieve Pol II-terminatie afhankelijk is van een synergie tussen het NNS-machinerie en obstakels in chromatine. In overeenstemming met deze bevinding zijn loci die Pol II-doorlezing vertonen bij GRF-bindingsplaatsen uitgeput van upstream NNS-signalen. Over het geheel genomen benadrukken deze resultaten hoe RNA-terminatiesignalen het gedrag van Pol II bij chromatineobstakels beïnvloeden en stellen ze vast dat gemeenschappelijke genomische elementen grenzen definiëren voor zowel DNA- als RNA-synthesemachinerie.",
"Ribosoombiogenese in Saccharomyces cerevisiae omvat een regulon van 200 genen, Ribi-genen, die gecoördineerd worden gereguleerd als reactie op nutriëntbeschikbaarheid en cellulaire groeisnelheid. Twee cis-werkende elementen, PAC en RRPE, zijn bekend als mediatoren van Ribi-genrepressie bij voedingsafname. Hier tonen we aan dat de meeste Ribi-genpromotoren ook bindingsplaatsen bevatten voor een of meer algemene regulerende factoren (GRF's), het vaakst Abf1 en Reb1, en dat deze factoren in vivo verrijkt zijn bij Ribi-promotoren. Abf1-, Reb1- en Tbf1-promotorassociatie was vereist voor volledige Ribi-genexpressie in rijk medium en voor de modulatie ervan als reactie op glucosesterving, gekenmerkt door een snelle daling gevolgd door een langzame herstel. Zo'n respons ging niet gepaard met veranderingen in Abf1-bezetting, maar werd gevolgd door een snelle toename en daarna een langzame afname van Rpd3L histondeacetylase-bezetting. Opmerkelijk was dat verstoring van de Abf1-plaats ook de rekrutering van het Rpd3L-complex in reactie op sterfte uitschakelde. Uitgebreide mutatieanalyse van de DBP7-promotor onthulde een complexe wisselwerking van Tbf1-plaatsen, PAC en RRPE in de transcriptieregulatie van dit Ribi-gen. Onze observaties wijzen op GRF's als nieuwe veelzijdige spelers in Ribi-genregulatie, zowel tijdens exponentiële groei als onder repressieve omstandigheden.",
"Abf1 en Rap1 zijn algemene regulerende factoren (GRF's) die bijdragen aan transcriptieactivatie van een groot aantal genen, evenals aan replicatie, silencen en telomeerstructuur in gist. Ondanks hun wijdverspreide rollen in transcriptie is de reikwijdte van hun functionele doelwitten genoomwijd nog niet eerder bepaald. Hier gebruiken we microarrays om de bijdrage van deze essentiële GRF's aan transcriptie genoomwijd te onderzoeken door gebruik te maken van temperatuurgevoelige (ts) mutanten die dissociëren van hun bindingsplaatsen bij 37 graden Celsius. We combineren deze data vervolgens met gepubliceerde ChIP-chip studies en motiefanalyse om waarschijnlijke directe doelwitten voor Abf1 en Rap1 te identificeren. We identificeren ook een aanzienlijk aantal genen die waarschijnlijk Rap1 of Abf1 binden maar niet worden beïnvloed door verlies van GRF-binding. Interessant is dat de resultaten sterk suggereren dat Rap1 kan bijdragen aan genactivatie vanaf een grotere afstand stroomopwaarts dan Abf1. Ook consistent met eerder werk zijn meer genen die Abf1 binden onaangetast door verlies van binding dan genen die Rap1 binden. Ten slotte tonen we voor verschillende van deze genen aan dat het C-terminus van Abf1, dat het vermoedelijke activatiedomein bevat, niet nodig is om dit bijzondere geheugeneffect te bewerkstelligen dat voortdurende transcriptie mogelijk maakt na verlies van Abf1-binding."
] | 2,074 | 1,962 |
2,366 | Welk virus kan worden gediagnosticeerd met de monospot-test? | Het Epstein-Barr-virus (EBV) kan worden gedetecteerd met de monospot-test. EBV is een zeer veelvoorkomend virus, dat wordt overgedragen via speeksel, en dat vaak asymptomatische infecties veroorzaakt bij kinderen, maar vaak leidt tot infectieuze mononucleosis bij adolescenten. | [
"Het Epstein-Barr-virus (EBV) is een zeer veelvoorkomend virus, dat wordt overgedragen via speeksel, en dat vaak asymptomatische infecties veroorzaakt bij kinderen, maar vaak leidt tot infectieuze mononucleosis bij adolescenten. Heterofiele antilichaamtests, waaronder de Monospot-test, zijn rode bloedcel- of latexagglutinatie-assays, die antiredcelantilichamen detecteren die worden geproduceerd als onderdeel van een polyclonale antilichaamrespons die optreedt tijdens EBV-infectie.",
"Laboratoriumonderzoek toonde aan dat de monospot-test positief was, EBV-serologietests; Anti-EA-D IgG: 3+, Anti-VCA gp125 IgG: 3+, Anti-VCA p19 IgM: 2+, Anti EBNA-1 IgM: negatief, Anti EBNA-1 IgM: negatief, Anti EBNA-1 IgG: negatief.",
"Een 75-jarige vrouw presenteerde zich met een veranderde mentale status, een septisch beeld en griepachtige symptomen. Aanvankelijk onderzoek toonde atypische lymfocytose, trombocytopenie, verhoogde leverenzymen en een positieve monospot-test. Verder onderzoek toonde aan dat de Epstein-Barr-virus virale kapselantilichamen IgM/IgG en Epstein-Barr-virus DNA via polymerasekettingreactie negatief waren; echter waren haar cytomegalovirus (CMV) IgM en IgG positief, wat suggereert dat haar mononucleosis-achtig syndroom werd veroorzaakt door een acute CMV-infectie.",
"De monospot-test was positief. Hij onderging vervolgens zowel een CT longangiogram als een CT-angiogram van de aorta om longembolie en aortadissectie uit te sluiten. De CT toonde splenomegalie met een groot subdiafragmatisch hematoom als gevolg van miltruptuur. Dit had waarschijnlijk pijn veroorzaakt door irritatie van het diafragma. Hij werd met spoed geopereerd voor een splenectomie. De eenduidige diagnose was infectieuze mononucleosis gecompliceerd door spontane miltruptuur als gevolg van een Epstein-Barr-virusinfectie.",
"ACHTERGROND: Infectie met het Epstein-Barr-virus (EBV) komt bijna universeel voor bij mensen en vindt meestal plaats op twee leeftijden: infantiel, wat meestal asymptomatisch is en geassocieerd wordt met slechtere sociaaleconomische omstandigheden, en adolescent, wat in ongeveer 25% van de gevallen infectieuze mononucleosis (IM) veroorzaakt. De factoren die bepalen of de infectie IM veroorzaakt, blijven onzeker. Wij wilden de seizoensgebondenheid en temporele trends in IM evalueren. METHODEN: Gegevens van alle Monospot-tests, gebruikt als marker voor IM, werden verzameld uit de Grampian-populatie over 16 jaar. RESULTATEN: Positieve Monospot-testresultaten piekten op 17-jarige leeftijd bij vrouwen en 19-jarige leeftijd bij mannen.",
"De geëvalueerde diagnostische methoden waren realtime PCR (RT-PCR), IgM/IgG-antilichamen gemeten met verschillende assays [meting van Epstein-Barr-virus viraal load (EBV-VL) in perifere bloed, neutrofiel/lymfocyt/monocyt tellingen, C-reactief proteïne waarden en monospot-test].",
"Serologische tests voor EBV-infectie waren consistent met acute infectie (EBV-virus kapselantigeen reageerde met IgM- en IgG-antilichamen). De Monospot-test was ook positief.",
"Onderzoeken toonden lymfocytose en geactiveerde atypische lymfocyten in het perifere uitstrijkje, en een positieve monospot-test. De jongen herstelde vervolgens binnen een week met volledige verdwijning van zijn uitslag. Infectieuze mononucleosis gerelateerd aan het Epstein-Barr-virus werd als de meest waarschijnlijke diagnose voor onze patiënt beschouwd.",
"Serums negatief voor de markers van beide virussen: Hepatitis A (HAV) en Hepatitis B (HBV) werden vervolgens getest op IGM heterofiele antilichamen tegen het Epstein-Barr-virus (EBV) met de Monospot-slide-test om acute infectieuze mononucleosis te diagnosticeren en getest op anti-CMV (IgM) met ELISA-techniek voor de diagnose van acute cytomegalovirus (CMV)-infectie.",
"Een serologische test voor vroeg antigeen (EA) is specifieker voor het diagnosticeren van actieve EBV-ziekte dan de monospot- of heterofiele test.",
"Zijn sepsis-screening was negatief, maar hij had een positieve Monospot-test en immunoglobuline G voor het Epstein-Barr-virus.",
"Heterofiele antilichaamtests, waaronder de Monospot-test, zijn rode bloedcel- of latexagglutinatie-assays, die antiredcelantilichamen detecteren die worden geproduceerd als onderdeel van een polyclonale antilichaamrespons die optreedt tijdens EBV-infectie."
] | 587 | 557 |
2,367 | Waarom wordt de Fyn-kinase beschouwd als een veelbelovend therapeutisch doelwit voor de ziekte van Alzheimer? | Fyn is een aantrekkelijk doelwit voor AD-therapieën, niet alleen vanwege de activatie door Aβ via het cellulaire prioneiwit, maar ook vanwege de bekende interactie met tau, die op unieke wijze de twee belangrijkste pathologieën bij AD verbindt. | [
"Fyn is een aantrekkelijk doelwit voor AD-therapieën, niet alleen vanwege de activatie door Aβ via het cellulaire prioneiwit, maar ook vanwege de bekende interactie met tau, die op unieke wijze de twee belangrijkste pathologieën bij AD verbindt."
] | 85 | 87 |
2,368 | Wat is de link tussen TADs en GRBs? | Topologisch associërende domeinen (TADs) zijn oude kenmerken die samenvallen met Metazoaire clusters van extreme niet-coderende conservatie (ook wel GRBs genoemd). | [
"Topologisch associërende domeinen zijn oude kenmerken die samenvallen met Metazoaire clusters van extreme niet-coderende conservatie",
"Clusters van CNE's komen sterk overeen met topologische organisatie, wat de grenzen voorspelt van honderden topologisch associërende domeinen (TADs) bij mens en Drosophila. De set TADs die geassocieerd zijn met hoge niveaus van niet-coderende conservatie vertoont duidelijke eigenschappen vergeleken met TADs zonder extreme niet-coderende conservatie.",
"Metazoaire genomen bevatten veel clusters van geconserveerde niet-coderende elementen. Hier leveren de auteurs bewijs dat deze clusters samenvallen met onderscheidende topologisch associërende domeinen bij mensen en Drosophila, wat een geconserveerde regulatorische genomische architectuur onthult.",
"Hier tonen we aan dat clusters van CNE's sterk samenvallen met topologische organisatie, wat de grenzen voorspelt van honderden topologisch associërende domeinen (TADs) bij mens en Drosophila.",
"Clusters van CNE's definiëren de reikwijdte van regulatorische inputs voor vele belangrijke ontwikkelingsregulatoren en zijn eerder beschreven als genomische regulatorische blokken (GRBs).",
"Ontwikkelingsgenen in metazoaire genomen worden omgeven door dichte clusters van geconserveerde niet-coderende elementen (CNE's). CNE's vertonen onverklaarbare extreme niveaus van sequentieconservatie, waarbij velen fungeren als ontwikkelingslangeafstand enhancer-elementen. Clusters van CNE's definiëren de reikwijdte van regulatorische inputs voor vele belangrijke ontwikkelingsregulatoren en zijn eerder beschreven als genomische regulatorische blokken (GRBs). Hun functie en distributie rond belangrijke regulatorische genen roept de vraag op hoe ze zich verhouden tot de 3D-conformatie van deze loci. Hier tonen we aan dat clusters van CNE's sterk samenvallen met topologische organisatie, wat de grenzen voorspelt van honderden topologisch associërende domeinen (TADs) bij mens en Drosophila. De set TADs die geassocieerd zijn met hoge niveaus van niet-coderende conservatie vertoont duidelijke eigenschappen vergeleken met TADs zonder extreme niet-coderende conservatie. De nauwe overeenkomst tussen extreme niet-coderende conservatie en TADs suggereert dat deze TADs oud zijn, wat een regulatorische architectuur onthult die al honderden miljoenen jaren geconserveerd is. Metazoaire genomen bevatten veel clusters van geconserveerde niet-coderende elementen. Hier leveren de auteurs bewijs dat deze clusters samenvallen met onderscheidende topologisch associërende domeinen bij mensen en Drosophila, wat een geconserveerde regulatorische genomische architectuur onthult."
] | 346 | 345 |
2,369 | Wat is Target Explorer? | Target Explorer is een geautomatiseerd hulpmiddel voor de identificatie van nieuwe doelgenen voor een gespecificeerde set transcriptiefactoren. Het is specifiek ontworpen voor het goed geannoteerde Drosophila melanogaster-genoom, maar de meeste opties kunnen ook worden gebruikt voor sequenties van andere genomen. Target Explorer is beschikbaar op http://trantor.bioc.columbia.edu/Target_Explorer/ | [
"Target Explorer: Een geautomatiseerd hulpmiddel voor de identificatie van nieuwe doelgenen voor een gespecificeerde set transcriptiefactoren.",
"Target Explorer automatiseert het gehele proces van het creëren van een aangepaste bibliotheek van bindingsplaatsen voor bekende transcriptiefactoren tot aan de voorspelling en annotatie van vermoedelijke doelgenen die mogelijk door deze factoren worden gereguleerd. Het is specifiek ontworpen voor het goed geannoteerde Drosophila melanogaster-genoom, maar de meeste opties kunnen ook worden gebruikt voor sequenties van andere genomen. Target Explorer is beschikbaar op http://trantor.bioc.columbia.edu/Target_Explorer/",
"Target Explorer automatiseert het gehele proces van het creëren van een aangepaste bibliotheek van bindingsplaatsen voor bekende transcriptiefactoren tot aan de voorspelling en annotatie van vermoedelijke doelgenen die mogelijk door deze factoren worden gereguleerd.",
"Met het toenemende aantal beschikbare eukaryote genomen worden geautomatiseerde tools voor hoge doorvoer voor de identificatie van regulatorische DNA-sequenties steeds haalbaarder. Verschillende computationele benaderingen voor de voorspelling van regulatorische elementen zijn recent ontwikkeld. Hier combineren we de voorspelling van clusters van bindingsplaatsen voor transcriptiefactoren met contextinformatie afkomstig uit genoomannotaties. Target Explorer automatiseert het gehele proces van het creëren van een aangepaste bibliotheek van bindingsplaatsen voor bekende transcriptiefactoren tot aan de voorspelling en annotatie van vermoedelijke doelgenen die mogelijk door deze factoren worden gereguleerd. Het is specifiek ontworpen voor het goed geannoteerde Drosophila melanogaster-genoom, maar de meeste opties kunnen ook worden gebruikt voor sequenties van andere genomen. Target Explorer is beschikbaar op http://trantor.bioc.columbia.edu/Target_Explorer/.",
"Target Explorer, een geautomatiseerd hulpmiddel voor de identificatie van nieuwe doelgenen voor een gespecificeerde set transcriptiefactoren"
] | 312 | 285 |
2,370 | Kan het gistproteïne Abf1 fungeren als isolator? | Saccharomyces cerevisiae Rap1p- en Abf1p-eiwitten beschikken over een krachtige isolerende capaciteit | [
"Saccharomyces cerevisiae Rap1p- en Abf1p-eiwitten beschikken over een krachtige isolerende capaciteit",
"Isolerende domeinen in Rap1p vallen samen met eerder beschreven transcriptieactivatiedomeinen, terwijl vier aangrenzende subdomeinen die het gehele C-terminus van Abf1p (440-731) beslaan, autonoom isolerende capaciteit vertonen",
"Dat zowel Rap1p- als Abf1p-silenteringsdomeinen een isolerend domein bevatten of er grotendeels mee overlappen, suggereert dat isolatie een nog ongedefinieerde capaciteit voor chromosoomorganisatie overbrengt die ook bijdraagt aan een functie in silentering."
] | 94 | 83 |
2,371 | Wat bevat de humane IVIG-behandeling voor de ziekte van Alzheimer? | Humaan intraveneus immunoglobuline (IVIG) is een mengsel van polyklonale IgG-antilichamen die zijn geïsoleerd en verzameld uit duizenden gezonde menselijke donoren. | [
"Humaan intraveneus immunoglobuline (IVIG) is een mengsel van polyklonale IgG-antilichamen die zijn geïsoleerd en verzameld uit duizenden gezonde menselijke donoren."
] | 48 | 48 |
2,372 | Is er een algoritme met lineaire tijd en lineaire ruimte voor de berekening van vermeden woorden in biologische sequenties? | Ja. Er is een algoritme met lineaire tijd en lineaire ruimte voor de berekening van vermeden woorden van lengte k in een gegeven sequentie x. | [
"De systematische zoektocht naar vermeden woorden is bijzonder nuttig voor de analyse van biologische sequenties. We presenteren een algoritme met lineaire tijd en lineaire ruimte voor de berekening van vermeden woorden van lengte k in een gegeven sequentie x. We stellen een aanpassing van dit algoritme voor zodat het alle vermeden woorden van x berekent, ongeacht hun lengte, binnen dezelfde tijdcomplexiteit. We presenteren ook combinatorische resultaten met betrekking tot vermeden woorden en afwezige woorden.",
"We presenteren een algoritme met lineaire tijd en lineaire ruimte voor de berekening van vermeden woorden van lengte <br>",
"<b>ACHTERGROND</b>: De afwijking van de waargenomen frequentie van een woord <br><b>RESULTATEN</b>: In dit artikel stellen we een algoritme voor met [Formule: zie tekst]-tijd en [Formule: zie tekst]-ruimte om alle [Formule: zie tekst]-vermeden woorden van lengte <br><b>CONCLUSIES</b>: De systematische zoektocht naar vermeden woorden is bijzonder nuttig voor de analyse van biologische sequenties.",
"We presenteren een algoritme met lineaire tijd en lineaire ruimte voor de berekening van vermeden woorden van lengte",
"We presenteren een algoritme met lineaire tijd en lineaire ruimte voor de berekening van vermeden woorden van lengte k in een gegeven sequentie x.",
"Daarom kan het naïef berekenen van al deze woorden een zeer tijdrovende procedure zijn, vooral voor grote k. RESULTATEN In dit artikel stellen we een algoritme voor met [Formule: zie tekst]-tijd en [Formule: zie tekst]-ruimte om alle [Formule: zie tekst]-vermeden woorden van lengte k te berekenen in een gegeven sequentie van lengte n over een alfabet met vaste grootte.",
"We presenteren ook een tijd-optimaal algoritme met [Formule: zie tekst]-tijd om alle [Formule: zie tekst]-vermeden woorden (van elke lengte) te berekenen in een sequentie van lengte n over een geheelallig alfabet van grootte [Formule: zie tekst].",
"De afwijking van de waargenomen frequentie van een woord ten opzichte van de verwachte frequentie in een gegeven sequentie wordt gebruikt om te bepalen of het woord vermeden is. Dit concept is bijzonder nuttig in DNA-taalanalyse. De waarde van de afwijking, aangeduid met formule zie tekst, karakteriseert effectief de mate van een woord door zijn randcontrast in de context waarin het voorkomt. Een woord van lengte formule zie tekst is een formule zie tekst vermeden woord in als formule zie tekst voor een gegeven drempel formule zie tekst. Merk op dat zo’n woord volledig afwezig kan zijn. Daarom kan het naïef berekenen van al deze woorden een zeer tijdrovende procedure zijn, vooral voor grote k. In dit artikel stellen we een algoritme voor met formule zie tekst tijd en formule zie tekst ruimte om alle formule zie tekst vermeden woorden van lengte k te berekenen in een gegeven sequentie van lengte n over een alfabet met vaste grootte. We presenteren ook een tijd-optimaal algoritme met formule zie tekst tijd om alle formule zie tekst vermeden woorden van elke lengte te berekenen in een sequentie van lengte n over een geheelallig alfabet van grootte formule zie tekst. Daarnaast bieden we een strakke asymptotische bovengrens voor het aantal formule zie tekst vermeden woorden over een geheelallig alfabet en de verwachte lengte van het langste woord. We maken een implementatie van ons algoritme beschikbaar. Experimentele resultaten met zowel echte als synthetische data tonen de efficiëntie en toepasbaarheid van onze implementatie in de analyse van biologische sequenties. De systematische zoektocht naar vermeden woorden is bijzonder nuttig voor de analyse van biologische sequenties. We presenteren een algoritme met lineaire tijd en lineaire ruimte voor de berekening van vermeden woorden van lengte k in een gegeven sequentie. We stellen een aanpassing van dit algoritme voor zodat het alle vermeden woorden van x berekent, ongeacht hun lengte, binnen dezelfde tijdcomplexiteit. We presenteren ook combinatorische resultaten met betrekking tot vermeden woorden en afwezige woorden."
] | 605 | 642 |
2,373 | Wat is het mechanisme van het auxine-induceerbare degron-systeem? | Het fuseren van induceerbare afbraaksignalen, zogenaamde degrons, aan cellulaire eiwitten is een elegante methode om eiwitniveaus in vivo te reguleren. Het auxine-induceerbare degron (AID) systeem maakt snelle en omkeerbare proteolyse van eiwitten van belang mogelijk en stelt in staat om conditionele mutanten van gist te genereren. Strategieën die gebruikmaken van ubiquitine-gemedieerde eiwitafbraak om het product van een gen van belang te elimineren, zoals het hitte-induceerbare degron (td) en auxine-induceerbare degron (AID), zijn krachtige methoden voor het construeren van conditionele mutanten. Auxine-induceerbare degron (AID) technologie maakt snelle uitputting van eiwitten in dierlijke cellen en schimmels mogelijk, maar de toepassing ervan op menselijke cellen is beperkt door de moeilijkheden bij het taggen van endogene eiwitten. Het auxine-induceerbare degron heeft groot potentieel voor dynamische eiwituitputting in gist. Hier karakteriseren we grondig en kwantitatief het auxine-induceerbare degron in individuele gistcellen. | [
"Het fuseren van induceerbare afbraaksignalen, zogenaamde degrons, aan cellulaire eiwitten is een elegante methode om eiwitniveaus in vivo te reguleren.",
"Het auxine-induceerbare degron (AID) systeem maakt snelle en omkeerbare proteolyse van eiwitten van belang mogelijk en stelt in staat om conditionele mutanten van gist te genereren.",
"Strategieën die gebruikmaken van ubiquitine-gemedieerde eiwitafbraak om het product van een gen van belang te elimineren, zoals het hitte-induceerbare degron (td) en auxine-induceerbare degron (AID), zijn krachtige methoden voor het construeren van conditionele mutanten.",
"Auxine-induceerbare degron (AID) technologie maakt snelle uitputting van eiwitten in dierlijke cellen en schimmels mogelijk, maar de toepassing ervan op menselijke cellen is beperkt door de moeilijkheden bij het taggen van endogene eiwitten.",
"Het auxine-induceerbare degron heeft groot potentieel voor dynamische eiwituitputting in gist. Hier karakteriseren we grondig en kwantitatief het auxine-induceerbare degron in individuele gistcellen. We tonen aan dat een auxineconcentratie van 0,25 mM noodzakelijk is voor snelle en uniforme eiwituitputting tussen individuele cellen, en dat in moedercellen eiwitten sneller worden uitgeput dan in hun dochters.",
"We introduceren een eenvoudige en efficiënte methode om conditionele knockout-celijnen te genereren op basis van het combineren van auxine-induceerbare degron (AID) technologie met CRISPR/Cas9 genbewerking.",
"Planten hebben een uniek systeem ontwikkeld waarbij het plantenhormoon auxine direct snelle afbraak induceert van de AUX/IAA familie van transcriptierepressoren door een specifieke vorm van het SCF E3 ubiquitine ligase. Andere eukaryoten missen de auxine-respons maar delen het SCF-afbraakpad, waardoor we het auxine-induceerbare degron (AID) systeem kunnen overbrengen naar niet-plantcellen en een klein molecuul kunnen gebruiken om eiwitstabiliteit conditioneel te reguleren.",
"We hebben een auxine-induceerbaar degron (AID) systeem geconstrueerd, dat auxine-afhankelijke poly-ubiquitinering van Aux/IAA eiwitten door SCFTIR1 in planten benut, in schizosaccharomyces pombe.",
"RESULTATEN We hebben een auxine-induceerbaar degron (AID) systeem geconstrueerd, dat auxine-afhankelijke poly-ubiquitinering van Aux/IAA eiwitten door SCFTIR1 in planten benut, in schizosaccharomyces pombe.",
"Hiervoor werd een afbraaksysteem ontwikkeld in gist dat gebruikmaakt van TIR1, een plantaardig F-box eiwit, dat eiwitten met een auxine-induceerbaar degron kan rekruteren naar een E3 ubiquitine ligase complex, maar alleen in aanwezigheid van het fytohormoon auxine.",
"Planten hebben een uniek systeem ontwikkeld waarbij het plantenhormoon auxine direct snelle afbraak induceert van de AUX/IAA familie van transcriptierepressoren door een specifieke vorm van het SCF E3 ubiquitine ligase.",
"Induceerbare inactivatie van een eiwit is een krachtige benadering voor de analyse van zijn functie binnen cellen. Schizosaccharomyces pombe is een nuttig model voor het bestuderen van fundamentele mechanismen zoals chromosoomonderhoud en celcyclus. Eerder gepubliceerde strategieën voor eiwituitputting zijn echter alleen succesvol voor sommige eiwitten onder specifieke omstandigheden en bereiken nog niet efficiënte uitputting om acute fenotypen zoals onmiddellijke celcyclusarrest te veroorzaken. Het doel van dit werk was het construeren van een nuttig en krachtig eiwituitputtingssysteem in S. pombe. We hebben een auxine-induceerbaar degron (AID) systeem geconstrueerd dat auxine-afhankelijke poly-ubiquitinering van Aux/IAA eiwitten door SCFTIR1 in planten benut in schizosaccharomyces pombe. Hoewel expressie van het plantaardige F-box eiwit TIR1 de Mcm4-AID, een component van het Mcm-complex essentieel voor DNA-replicatie, getagd met het Aux/IAA peptide, verminderde, resulteerde uitputting niet in een duidelijk groeidefect. We verbeterden met succes de afbraakefficiëntie van Mcm4-AID door fusie van TIR1 met Schizosaccharomyces pombe Skp1, een geconserveerd F-box interactiecomponent van SCF (verbeterd AID-systeem, iAID), en de cellen vertoonden ernstige groeidefecten. Het iAID-systeem induceerde degradatie van Mcm4-AID in het chromatinegebonden Mcm-complex evenals in de oplosbare fracties. Het iAID-systeem in combinatie met transcriptierepressie (off-AID systeem) bereikte efficiëntere uitputting van andere eiwitten, waaronder Pol1 en Cdc45, wat leidde tot arrest in de vroege S-fase. Verbetering van het AID-systeem stelde ons in staat conditionele null-mutanten van S. pombe te construeren. Wij stellen voor dat het off-AID systeem een krachtige methode is voor in vivo eiwituitputting in schizosaccharomyces pombe.",
"Planten hebben een uniek systeem ontwikkeld waarbij het plantenhormoon auxine direct snelle afbraak induceert van de AUX/IAA familie van transcriptierepressoren door een specifieke vorm van het SCF E3 ubiquitine ligase. Andere eukaryoten missen de auxine-respons maar delen het SCF-afbraakpad, waardoor we het auxine-induceerbare degron (AID) systeem kunnen overbrengen naar niet-plantcellen en een klein molecuul kunnen gebruiken om eiwitstabiliteit conditioneel te reguleren. Het AID-systeem maakte snelle en omkeerbare afbraak van doelwit-eiwitten mogelijk als reactie op auxine en stelde ons in staat efficiënte conditionele mutanten van essentiële eiwitten in gist te genereren, evenals cellijnen afgeleid van kip, muis, hamster, aap en menselijke cellen, waardoor het een krachtig hulpmiddel is om eiwitexpressie te reguleren en eiwitfunctie te bestuderen.",
"De analyse van de gevolgen na experimentele eliminatie van genfunctie is geweest en zal blijven een uiterst succesvolle strategie in biologisch onderzoek. Mutationale eliminatie van genfunctie is veelvuldig gebruikt in de fruitvlieg Drosophila melanogaster. RNA-interferentie wordt ook uitgebreid gebruikt in de vlieg. Uitzonderlijk precieze temporele en ruimtelijke controle over eliminatie van genfunctie kan worden bereikt in combinatie met geavanceerde transgene benaderingen en klonale analyses. Echter, methoden die op gen- en transcriptniveau werken kunnen eiwitproducten die al aanwezig zijn op het moment dat mutantcellen worden gegenereerd of RNA-interferentie wordt gestart, niet elimineren. Gerichte induceerbare eiwitafbraak is daarom van groot belang voor gecontroleerde snelle eliminatie van genfunctie. Hiervoor werd een afbraaksysteem ontwikkeld in gist dat gebruikmaakt van TIR1, een plantaardig F-box eiwit, dat eiwitten met een auxine-induceerbaar degron kan rekruteren naar een E3 ubiquitine ligase complex, maar alleen in aanwezigheid van het fytohormoon auxine. Hier tonen we aan dat het auxine-induceerbare afbraaksysteem ook efficiënt functioneert in Drosophila melanogaster. Noch auxine, noch TIR1-expressie hebben duidelijke toxische effecten in dit organisme en in combinatie leiden ze tot snelle afbraak van een doelwit-eiwit gefuseerd aan het auxine-induceerbare degron.",
"Isolatie van een strakke conditionele mutant van een gen van belang is een effectieve manier om de functies van essentiële genen te bestuderen. Strategieën die gebruikmaken van ubiquitine-gemedieerde eiwitafbraak om het product van een gen van belang te elimineren, zoals het hitte-induceerbare degron (td) en auxine-induceerbare degron (AID), zijn krachtige methoden voor het construeren van conditionele mutanten. Deze methoden werken echter niet bij sommige genen. Hier beschrijven we een verbeterd AID-systeem (iAID) voor het isoleren van strakke conditionele mutanten in de gist Saccharomyces cerevisiae. In deze methode wordt transcriptierepressie door de tet-off promotor gecombineerd met proteolytische eliminatie van het doelwit-eiwit door het AID-systeem. Ter illustratie beschrijven we de constructie van strakke mutanten van de replicatiefactoren Dpb11 en Mcm10 (Dpb11-iAID en Mcm10-iAID). Omdat Dpb11 en Mcm10 nodig zijn voor de initiatie van DNA-replicatie, kunnen hun strakke mutanten de S-fase niet binnengaan. Dit is het geval voor Dpb11-iAID en Mcm10-iAID cellen na toevoeging van tetracycline en auxine. Zowel de tet-off promotor als het AID-systeem zijn aangetoond te werken in model-eukaryoten anders dan gist. Daarom is het iAID-systeem niet alleen nuttig in gist, maar kan het ook worden toegepast in andere modelsystemen om strakke conditionele mutanten te isoleren.|"
] | 1,309 | 1,223 |
2,374 | Welke bacterie veroorzaakt erythrasma? | Corynebacterium minutissimum is de bacterie die leidt tot cutane erupties van erythrasma en is de meest voorkomende oorzaak van interdigitale voetinfecties. | [
"Erythrasma veroorzaakt door Corynebacterium minutissimum kan verward worden met oppervlakkige mycosen.",
"Exogene coproporfyrine III productie door Corynebacterium aurimucosum en Microbacterium oxydans in erythrasma-laesies.",
"Erythrasma is een oppervlakkige huidaandoening veroorzaakt door Gram-positieve Corynebacterium-soorten.",
"DOEL: Het bestuderen van een reeks demografische kenmerken van patiënten met pitted keratolysis, en het presenteren van een overzicht van Corynebacterium-geassocieerde infecties, inclusief pitted keratolysis, erythrasma en trichobacteriose.",
"Corynebacterium minutissimum is de bacterie die leidt tot cutane erupties van erythrasma en is de meest voorkomende oorzaak van interdigitale voetinfecties.",
"Bacteriële huidinfecties veroorzaakt door corynebacteriën omvatten erythrasma, trichomycosis axillaris en pitted keratolysis.",
"Corynebacterium minutissimum is de bacterie die leidt tot cutane erupties van erythrasma en is de meest voorkomende oorzaak van interdigitale voetinfecties.",
"Corynebacteriën veroorzaken erythrasma, trichomycosis of pitted keratolysis.",
"ACHTERGROND Erythrasma is een oppervlakkige huidinfectie veroorzaakt door Corynebacterium minutissimum.",
"Huidinfecties zijn veelvoorkomend en kunnen worden veroorzaakt door bacteriën, schimmels of virussen. Beschadigingen van de huidintegriteit, vooral die welke pathogenen in de dermis inbrengen, veroorzaken of verergeren vaak huidinfecties. Bacteriële huidinfecties veroorzaakt door corynebacteriën omvatten erythrasma, trichomycosis axillaris en pitted keratolysis. Stafylokokken kunnen impetigo, ecthyma en folliculitis veroorzaken. Streptokokken huidinfecties omvatten impetigo en erysipelas. Humaan papillomavirus huidinfecties presenteren zich als verschillende soorten wratten, afhankelijk van het geïnfecteerde oppervlak, de relatieve vochtigheid en drukpatronen. De vele dermatomycosen, huidinfecties veroorzaakt door schimmels of gisten, omvatten tinea capitis, tinea barbae, tinea cruris, tinea manus, tinea pedis en tinea unguium (onychomycose). Candidale infecties komen voor in vochtige gebieden zoals vulva, mond, penis, huidplooien en luiergebied. Wonden veroorzaakt door houtsplinters of doornen kunnen leiden tot sporotrichose. Dierbeten kunnen resulteren in complexe, ernstige infecties die tetanus- en mogelijk rabiësprofylaxe vereisen naast passende antibioticatherapie.",
"Erythrasma is een oppervlakkige huidaandoening veroorzaakt door grampositieve corynebacterium-soorten. Koraalrode fluorescentie onder Wood's lamp, sterk suggestief voor erythrasma, kan worden toegeschreven aan de aanwezigheid van porfyrines. Gefractioneerde porfyrine-analyse in erythrasma-laesies is nog niet gerapporteerd. Wij probeerden erythrasma-laesies te onderzoeken door de verantwoordelijke bacteriën te isoleren en hun exogene porfyrineproductie te bepalen via HPLC-analyse. We observeerden een 78-jarige vrouw met erythrasma die een scherp begrensde, licht schilferende plek had op haar linker voet tussen de vierde en vijfde teen. Twee soorten kolonies op 5% schapenbloedagar werden uit deze laesie verkregen. Analyse van de 16S rRNA-sequentie toonde aan dat de kolonies Corynebacterium aurimucosum en Microbacterium oxydans waren. HPLC-analyse toonde aan dat coproporfyrine III (copro III) niveaus duidelijk verhoogd waren, hoewel de hoeveelheden protoporfyrine verminderd waren. Deze resultaten geven aan dat de fluorescerende stof copro III was. Deze studie ondersteunt de opvatting dat overmatige copro III-synthese door C. aurimucosum en M. oxydans leidt tot ophoping van porfyrine in het cutane weefsel, wat een koraalrode fluorescentie uitzendt bij blootstelling aan Wood's lamp.",
"Interdigitale voetinfecties worden meestal aanvankelijk veroorzaakt door dermatofyten, gisten en minder vaak door bacteriën. Erythrasma veroorzaakt door Corynebacterium minutissimum kan verward worden met oppervlakkige mycosen. Het doel van de studie was het bepalen van de prevalentie van de etiologische agentia van oppervlakkige mycosen en de frequentie van Corynebacterium minutissimum bij interdigitale voetinfecties. Alle monsters verkregen van de 121 patiënten met interdigitale voetinfecties werden direct onderzocht met behulp van 20% kaliumhydroxide-montages en Gram-kleuring onder de microscoop en gekweekt op Sabouraud's dextrose-agarplaten. Bij identificatie van oppervlakkige mycosen werd een percentage van 14% gevonden met de kweekmethode en 14% met directe microscopische examinatie. Door een combinatie van directe microscopische examinatie en kweek werd een ratio van 33,8% bereikt in de kweek van deze monsters. De meest geïsoleerde factor was Trichophyton rubrum (33,7%) bij 24% van de patiënten. 19,8% Corynebacterium minutissimum werd gedetecteerd door Gram-kleuring bij 6% van deze patiënten. Trichophyton rubrum werd gevonden, Trichophyton mentagrophytes werd gevonden bij 2% en Trichosporon spp. bij 1%. Bij het onderzoek van interdigitale voetlaesies in het laboratorium moet de coëxistentie van erythrasma met dermatofyten en gist worden overwogen.",
"Exogene coproporfyrine III productie door Corynebacterium aurimucosum en Microbacterium oxydans in erythrasma-laesies.",
"Corynebacterium minutissimum is de bacterie die leidt tot cutane erupties van erythrasma en is de meest voorkomende oorzaak van interdigitale voetinfecties. Het wordt vooral gevonden in afgesloten intertrigineuze gebieden zoals de oksels, inframammaire gebieden, tussenruimtes van de tenen, intergluteale en crurale plooien en komt vaker voor bij personen met diabetes mellitus dan bij andere klinische patiënten. Dit organisme kan worden geïsoleerd van een cutane locatie samen met een gelijktijdige dermatofyten- of Candida albicans-infectie. De differentiële diagnose van erythrasma omvat psoriasis, dermatophytose, candidiasis en intertrigo. Methoden voor differentiatie omvatten Wood's lamp-onderzoek en bacteriële en mycologische kweek. Erythromycine 250 mg vier keer per dag gedurende 14 dagen is de behandeling van keuze en andere antibacteriële middelen omvatten tetracycline en chloramfenicol. Het gebruik van chloramfenicol is echter beperkt door beenmergsuppressie, wat kan leiden tot neutropenie, agranulocytose en aplastische anemie. Verdere studies zijn nodig, maar claritromycine kan een aanvullend geneesmiddel zijn voor toekomstig gebruik bij therapeutisch falen of intertrigineuze betrokkenheid. Topische oplossingen zoals clindamycine, Whitfield-zalf, natriumfusidaatzalf en antibacteriële zepen kunnen nodig zijn voor zowel behandeling als profylaxe. Er bestaan beperkte studies over de werkzaamheid van deze medicaties, maar systemische erytromycine toont genezingspercentages tot wel 100% in vergelijking met tetracyclines. Systemische erytromycine heeft een grotere werkzaamheid bij patiënten met betrokkenheid van oksels en lies en vergelijkbare werkzaamheid voor interdigitale infecties. Whitfield-zalf heeft gelijke werkzaamheid als systemische erytromycine in oksels en lies, maar toont grotere werkzaamheid in de interdigitale gebieden en is vergelijkbaar met 2% natriumfusidaatzalf voor de behandeling van alle gebieden. Bijwerkingen van geneesmiddelen en mogelijke geneesmiddelinteracties moeten worden overwogen. Er zijn geen gegevens over kosteneffectiviteit beschikbaar, maar er zijn beperkte gegevens over kosten gerelateerde behandelproblemen. Er wordt een richtlijn voorgesteld voor detectie, evaluatie, behandeling en profylaxe van deze cutane eruptie.",
"Erythrasma is een oppervlakkige huidinfectie veroorzaakt door Corynebacterium minutissimum. Interdigitale erythrasma is de meest voorkomende vorm en wordt gemakkelijk verward met tinea pedis. Het doel van deze studie was het bepalen van de prevalentie van interdigitale erythrasma bij patiënten met klinisch vermoeden van tinea pedis. Deze studie werd uitgevoerd tussen 1 januari 2011 en 31 januari 2012. Het omvatte 182 patiënten die zich presenteerden met klachten over interdigitale laesies. Alle patiënten werden onderzocht met een Wood's lamp en uitstrijkjes werden gekleurd met de Gram-methode. Direct onderzoek met 20% kaliumhydroxide werd uitgevoerd. Van de 182 patiënten met interdigitale laesies werd bij 73 (40,1%) erythrasma vastgesteld. De gemiddelde leeftijd van de patiënten met erythrasma was 45,52 ± 10,83 jaar (bereik 22-70 jaar). De meeste patiënten met erythrasma waren vrouwen (56,2%). De meest voorkomende klinische bevinding was desquamatie. Alleen met Wood's lamp-onderzoek of Gram-kleuring werden respectievelijk 31 (42,5%) of 14 (19,2%) positieve patiënten gevonden. Het gelijktijdig gebruik van Wood's lamp-onderzoek en Gram-kleuring resulteerde in 28 positieve patiënten (38,4%). Interdigitale erythrasma is een veelvoorkomende aandoening en kan moeilijk te onderscheiden zijn van tinea pedis. Een eenvoudige en snelle diagnose kan worden gesteld met Wood's lamp-onderzoek, maar Gram-kleuring is ook een nuttige methode, vooral bij patiënten met negatieve Wood's lamp-onderzoek bevindingen.",
"Erythrasma is een zeldzame vulvaire infectie die het beste wordt gediagnosticeerd door de fluorescentie onder de Wood-lamp. Dit rapport toont aan dat ondanks een negatieve Wood-lamp-onderzoek de diagnose histologisch kan worden gesteld. Een 42-jarige vrouw werd verwezen naar onze kliniek met een aanhoudende candidainfectie. Evaluatie omvatte een Wood-lamp-onderzoek, natte preparaten en kaliumhydroxide-test van de aangedane huid, die allemaal negatief waren. Een biopsie van het gebied toonde staven en filamentachtige organismen in de keratotische laag, consistent met een Corynebacterium minutissimum-infectie. De patiënt werd gediagnosticeerd met erythrasma en reageerde op orale erytromycine. Aanhoudende vulvaire aandoeningen kunnen worden veroorzaakt door erythrasma ondanks een negatieve Wood-lamp-onderzoek; de diagnose kan worden gesteld door biopsie van de laesie.",
"Erythrasma is een huidinfectie veroorzaakt door Corynebacterium minutissimum. Interdigitale erythrasma is de meest voorkomende vorm. Het doel van deze studie was het vaststellen van de frequentie en risicofactoren van interdigitale erythrasma bij patiënten met klinisch vermoeden van tinea pedis. Deze studie werd uitgevoerd tussen juni en december 2010 en omvatte 122 patiënten met interdigitale voetlaesies. Alle patiënten werden onderzocht met een Wood's lamp. De uitstrijkjes werden gekleurd met de Gram-methode. Direct onderzoek werd uitgevoerd met 20% kaliumhydroxide. Sabouraud dextrose agar en brain heart infusion agar werden gebruikt voor kweek. Bovendien werden demografische kenmerken van patiënten, gelijktijdige ziekten en klinische bevindingen geregistreerd. Gevallen die positief waren bij Wood's lamp-onderzoek en/of Gram-kleuring en kweek werden beschouwd als erythrasma. Het percentage erythrasma werd vastgesteld op 46,7%. De gemiddelde leeftijd was 43,6 jaar en de ziekte kwam vaker voor bij mannen. De meest voorkomende klinische bevinding was desquamatie. Mycologisch onderzoek was positief bij 40 (35%) van de patiënten. Er werd geen groei waargenomen in bacteriologische kweek. Alleen met Wood's lamp-onderzoek of Gram-kleuring werden respectievelijk 11 (9%) en 19 (15,6%) positieve patiënten gevonden, terwijl het gelijktijdig gebruik van Wood's lamp-onderzoek en Gram-kleuring resulteerde in 27 (22,1%) positieve patiënten. Interdigitale erythrasma is een veelvoorkomende aandoening en kan klinisch lijken op tinea pedis. Een Wood's lamp is een goed diagnostisch hulpmiddel, maar Gram-kleuring kan vooral nuttig zijn bij patiënten met een negatieve Wood's lamp-uitslag.",
"Erythrasma is een oppervlakkige infectie veroorzaakt door Corynebacterium minutissimum en treft de grote huidplooien en de interdigitale gebieden van de voeten. Het wordt gekenmerkt door erythemateuze, bruine, schilferige plekken en maceratie en vertoont koraalrode fluorescentie onder Wood-licht. Het doel van deze studie was het bepalen van de frequentie van erythrasma bij patiënten met interdigitale laesies. Een open prospectieve longitudinale observationele studie werd uitgevoerd in een ziekenhuis in Mexico-Stad tussen maart en december 2006. Alle patiënten met interdigitale laesies werden onderzocht met een Wood-lamp en direct onderzoek werd uitgevoerd met 20% kaliumhydroxide. Kweken werden gedaan op Sabouraud dextrose agar en brain heart infusion agar en uitstrijkjes werden geanalyseerd. Algemene kenmerken en gelijktijdige ziekten werden geregistreerd. We onderzochten 73 patiënten, van wie 24 (32,8%) werden gediagnosticeerd met erythrasma op basis van koraalrode fluorescentie onder Wood-licht en identificatie van corynebacteriën door Gram-kleuring. De ziekte kwam vaker voor bij vrouwen (83,33%) en de gemiddelde leeftijd van de patiënten was 43,5 jaar. De belangrijkste klinische bevindingen waren schilfering en maceratie en de vierde interdigitale ruimte was het meest getroffen. Corynebacterium kon in geen van de gevallen worden geïsoleerd. Mycologie was positief in 15 gevallen (62,5%) en de volgende micro-organismen werden geïsoleerd: Candida (16,6%), dermatofyten (12,5%) en Trichosporon (4,1%). Interdigitale erythrasma is een veelvoorkomende aandoening en kan gemakkelijk worden verward met interdigitale tinea. Het blijft bestaan als het niet adequaat wordt behandeld. Snelle diagnose wordt gemakkelijk verkregen door onderzoek met een Wood-lamp, terwijl kweek moeilijk en onnodig is voor diagnose. De coëxistentie van erythrasma met dermatofyten en Candida moet worden overwogen wanneer de interdigitale ruimten zijn aangedaan.",
"Erythrasma is een oppervlakkige cutane infectie veroorzaakt door Corynebacterium minutissimum en wordt gekenmerkt door fluorescentie onder Wood's licht (UV) vanwege de aanwezigheid van porfyrines. Deze moleculen zijn fotosensitizerend en wij stellen voor de werkzaamheid te beoordelen van rood licht dat porfyrines activeert voor een fotodynamische reactie bij de behandeling van deze pathologie. Beoordeling van de effecten van fotodynamische actie van rood licht voor de behandeling van erythrasma zonder exogene fotosensitizerende moleculen. Dertien patiënten met erythrasma werden behandeld met één belichting van 80 J/cm² door rood licht met een breedbandpiek bij 635 nm zonder exogene fotosensitizerende moleculen. Verdwijning of vermindering van de omvang van laesies werd 2 weken later waargenomen. Indien laesies nog aanwezig waren, werd een tweede bestraling uitgevoerd met dezelfde methode. Voorlopige resultaten worden gepresenteerd. Als resultaat van roodlichtbestraling zagen we een volledig herstel bij drie patiënten en in de meeste andere gevallen een vermindering van de omvang van laesies (gemiddeld 29%) na één sessie. De behandeling werd goed verdragen. Wij rapporteren de eerste gevallen van fotodynamische behandeling van erythrasma. Er zijn andere rapporten van klinische toepassingen van antimicrobiële werking van fotodynamische therapie in de dermatologie (acne vulgaris, leishmaniasis, wratten, enz.), maar er zijn weinig toepassingen zonder toevoeging van exogene fotosensitizerende middelen. De originaliteit en het belang van onze studie is het gebruik van de spontane aanwezigheid van porfyrines in de laesies. Deze techniek lijkt een interessante, goedkope en gemakkelijke alternatieve behandeling voor deze gelokaliseerde infectie, maar een optimale methode moet nog worden bepaald om de werkzaamheid te verbeteren.",
"Bacteriële huidinfecties zijn belangrijk om te herkennen omdat we de middelen hebben om bijna alle te bestrijden. Primaire huidinfecties worden voornamelijk veroorzaakt door stafylokokken of streptokokken. Stafylokokkeninfecties presenteren zich als furunkels en carbunkels, oppervlakkige folliculitis, impetigo of zelden het gestolde huid syndroom. Streptokokkeninfecties presenteren zich als impetigo, ecthyma, erysipelas of cellulitis. Corynebacteriën veroorzaken erythrasma, trichomycosis of pitted keratolysis. Gramnegatieve primaire huidinfecties, hoewel zeldzaam, kunnen voorkomen. Bacteriële kweek is over het algemeen noodzakelijk voor diagnose. Secundaire bacteriële infecties van reeds bestaande wonden, brandwonden, dermatitis of retentiecysten zijn veelvoorkomende gebeurtenissen.",
"Infectieuze embolische retinopathie als gevolg van bacteriële endocarditis wordt beschreven bij een 31-jarige vrouw met mitralisklepprolaps. Het infectieuze organisme Corynebacterium minutissimum is nog niet eerder gevonden als veroorzaker van oculaire of multisysteemziekten. Het is een veelvoorkomende mucocutane bewoner die erythras"
] | 2,336 | 2,102 |
2,375 | Mutaties in welk gen veroorzaken Schimke immuno-osseuze dysplasie? | SMARCAL1, ook bekend als HARP, is een ATP-afhankelijke annealerende helicase die replicatievorken stabiliseert tijdens DNA-schade. Mutaties in dit gen zijn de oorzaak van Schimke immuno-osseuze dysplasie, een autosomaal recessieve aandoening gekenmerkt door T-cel immunodeficiëntie en groeistoornissen. | [
"SMARCAL1 (SWI/SNF-gerelateerd, matrix-geassocieerd, actine-afhankelijke regulator van chromatine, subfamilie A-achtig 1), ook bekend als HARP, is een ATP-afhankelijke annealerende helicase die replicatievorken stabiliseert tijdens DNA-schade. Mutaties in dit gen veroorzaken Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD), een autosomaal recessieve aandoening gekenmerkt door T-cel immunodeficiëntie en groeistoornissen.",
"Het huidige rapport beschrijft voor het eerst een kind met Schimke immuno-osseuze dysplasie met een SMARCAL1 missense mutatie (R561H) en manifestaties van intussusceptie secundair aan Epstein-Barr virus-negatieve non-Hodgkin lymfoom, die overleed aan sepsis na chemotherapie.",
"Mutaties in het SWI/SNF2-gerelateerde, matrix-geassocieerde, actine-afhankelijke regulator van chromatine, subfamilie A-achtig 1 (SMARCAL1) gen zijn verantwoordelijk voor de ziekte.",
"Sequentieanalyse toonde aan dat de patiënt compound heterozygoot was voor twee SMARCAL1 mutaties: een nieuwe missense verandering (p.Arg247Pro) en een bekende nonsense mutatie (p.",
"Mutaties in SMARCAL1, dat codeert voor een DNA-annealerende helicase met functies in het herstarten van DNA-replicatievorken, DNA-reparatie en modulatie van genexpressie, veroorzaken Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD), een autosomaal recessieve ziekte gekenmerkt door skeletdysplasie, nierziekte, T-cel immunodeficiëntie en arteriosclerose.",
"Biallelische mutaties van de DNA-annealerende helicase SMARCAL1 (SWI/SNF-gerelateerd, matrix-geassocieerd, actine-afhankelijke regulator van chromatine, subfamilie A-achtig 1) veroorzaken Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD, MIM 242900), een onvolledig penetrante autosomaal recessieve aandoening.",
"Een nieuwe SMARCAL1 mutatie geassocieerd met een mild fenotype van Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD).",
"SIOD wordt veroorzaakt door mutaties in het gen SMARCAL1.",
"Schimke immuno-osseuze dysplasie (OMIM 242900) is een zeldzame autosomaal recessieve multisysteemziekte veroorzaakt door mutaties in SMARCAL1 (SWI/SNF-gerelateerd, matrix-geassocieerd, actine-afhankelijke regulator van chromatine, subfamilie A-achtig 1), een gen dat codeert voor een vermoedelijk chromatine-remodeleringsproteïne.",
"Schimke immuno-osseuze dysplasie is een autosomaal recessieve multisysteemstoornis veroorzaakt door defecten in het SWI/SNF-gerelateerde, matrix-geassocieerde, actine-afhankelijke regulator van chromatine, subfamilie A-achtig 1 gen (SMARCAL1).",
"Autosomal recessieve Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD), gekenmerkt door spondylo-epifysaire dysplasie, focale segmentale glomerulosclerose (FSGS), T-cel immunodeficiëntie en gelaatsdysmorfie, wordt veroorzaakt door defecten in het SMARCAL1 gen.",
"DOELSTELLING Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD) is een autosomaal recessieve erfelijke ziekte veroorzaakt door SMARCAL1 (MIM:20606622) mutaties, terwijl bij ongeveer de helft van de patiënten geen mutatie in SMARCAL1 kon worden gevonden.",
"SIOD wordt veroorzaakt door mutaties in het gen SMARCAL1.",
"Mutant chromatine-remodeleringsproteïne SMARCAL1 veroorzaakt Schimke immuno-osseuze dysplasie.",
"Een nieuwe SMARCAL1 mutatie geassocieerd met een mild fenotype van Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD).",
"Schimke immuno-osseuze dysplasie is een zeldzame autosomaal recessieve multisysteemstoornis met de belangrijkste klinische kenmerken van disproportionele groeiachterstand, defecte cellulaire immuniteit en progressieve nierziekte. Het wordt veroorzaakt door mutaties in SMARCAL1, een gen dat codeert voor een vermoedelijk chromatine-remodeleringsproteïne van onbekende functie. Omdat een gedetailleerde beschrijving van de klinische kenmerken een essentiële eerste stap is in het ontrafelen van de functie van SMARCAL1, presenteren wij de eerste gedetailleerde antropometrische gegevens van Schimke immuno-osseuze dysplasie patiënten door middel van uitgebreide antropometrische onderzoeken van 28 parameters bij 8 patiënten (3 vrouwen) met de typische bevindingen van Schimke immuno-osseuze dysplasie, gemiddelde leeftijd 14,8 jaar (bereik 4,9-30,5 jaar) en 304 patiënten (117 vrouwen) met congenitale en erfelijke chronische nierziekte, gemiddelde leeftijd 10,7 ± 4,8 jaar (bereik 3-21,8 jaar). We tonen aan dat Schimke immuno-osseuze dysplasie patiënten significant verschillen van die met andere vormen van chronische nierziekte. Z-scores werden berekend met referentielimieten afgeleid van 5155 gezonde kinderen (2591 vrouwen) van 3 tot 18 jaar. De belangrijkste bevinding was dat in de laatstgenoemde groep de mediane beenlengte significant meer gereduceerd was dan de zithoogte, terwijl bij Schimke immuno-osseuze dysplasie patiënten de reductie van zithoogte significant uitgesprokener was dan die van beenlengte. Daarom kan de verhouding zithoogte/beenlengte een eenvoudig hulpmiddel zijn voor de clinicus om Schimke immuno-osseuze dysplasie te onderscheiden van andere chronische nierziekte patiënten. Schimke immuno-osseuze dysplasie is zeer waarschijnlijk als deze verhouding 0,83 is; echter moeten andere vormen van chronische nierziekte worden overwogen bij een verhouding van 1,01.",
"Schimke immuno-osseuze dysplasie is een autosomaal recessieve multisysteemstoornis veroorzaakt door defecten in het SWI/SNF-gerelateerde, matrix-geassocieerde, actine-afhankelijke regulator van chromatine, subfamilie A-achtig 1 gen (SMARCAL1). Het SMARCAL1-product is een helicase die een rol speelt in selectieve cellulaire proliferatie. De aandoening wordt gekenmerkt door spondylo-epifysaire dysplasie met korte gestalte, nefropathie, T-cel deficiëntie, neurologische en cutane tekenen. Patiënten kunnen hypergepigmenteerde huidlaesies hebben die lijken op café-au-lait vlekken. Symptomen en ziekte-ernst bij Schimke immuno-osseuze dysplasie variëren per patiënt; genetische, epigenetische en omgevingsfactoren spelen een rol in de ernst van de ziekte. Hier rapporteren wij over een patiënt met korte gestalte, steroïd-resistente nefrotisch syndroom en recidiverende infecties. Cutane bevindingen en ontwikkelingsachterstand hielpen ons de diagnose Schimke immuno-osseuze dysplasie te stellen. Een homozygote missense mutatie in het SMARCAL1 gen bevestigde de klinische diagnose.",
"Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD, OMIM 242900) is een autosomaal recessieve pleiotrope aandoening gekenmerkt door spondylo-epifysaire dysplasie, nierfunctiestoornis en T-cel immunodeficiëntie. SIOD wordt veroorzaakt door mutaties in het SMARCAL1 gen. Wij rapporteren de klinische en genetische diagnose van een 5-jarig meisje met SIOD, verwezen naar ons centrum vanwege nefrotische proteïnurie, incidenteel ontdekt tijdens de follow-up van congenitale hypothyreoïdie. Mutatieanalyse van het SMARCAL1 gen werd uitgevoerd via polymerasekettingreactie (PCR) en bidirectionele sequencing. Sequentieanalyse toonde aan dat de patiënt compound heterozygoot was voor twee SMARCAL1 mutaties: een nieuwe missense verandering p.Arg247Pro en een bekende nonsense mutatie p.Glu848. Dit rapport beschrijft het klinische en genetische beeld van een mild fenotype van Schimke immuno-osseuze dysplasie geassocieerd met nefrotische proteïnurie, die afnam na gecombineerde therapie met ACE-remmers en sartans. Onze ervaring benadrukt het belang van gedetailleerde klinische evaluatie, passende genetische counseling en moleculaire testen om tijdige behandeling en een nauwkeuriger prognose te bieden.",
"Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD) is een autosomaal recessieve erfelijke ziekte veroorzaakt door SMARCAL1 (MIM 20606622) mutaties, terwijl bij ongeveer de helft van de patiënten geen mutatie in SMARCAL1 kon worden gevonden. Deze ziekte betreft meerdere systemen en wordt gekenmerkt door korte en asymmetrische gestalte met spondylo-epifysaire dysplasie, progressieve nierinsufficiëntie, lymfopenie met recidiverende infecties en hypergepigmenteerde maculae. Deze studie had tot doel het SMARCAL1 gen te analyseren bij 2 niet-verwante vermoedelijke SIOD-kinderen om een definitieve diagnose te stellen en meer SMARCAL1 mutatietypen bij Chinese SIOD te vinden. Twee vermoedelijke Chinese Han-mannelijke SIOD-kinderen die ons ziekenhuis bezochten tussen 2008 en 2014, respectievelijk 3 jaar en 6 maanden en 7 jaar en 8 maanden oud, waren beiden klein en hadden spondylo-epifysaire dysplasie, progressieve nierinsufficiëntie, lymfopenie met recidiverende infecties. Na geïnformeerde toestemming werden van hen en hun ouders DNA uit bloed geïsoleerd. PCR's voor alle 16 exonen van SMARCAL1 werden uitgevoerd en PCR-producten werden gezuiverd via 2% gel-elektroforese en direct gesequenced. Pathogeniciteit van missense variaties werd bevestigd door SIFT en sequencing van SMARCAL1 bij vijftig normale controles. Vier genvariaties werden gevonden bij de twee kinderen: twee gerapporteerde missense mutaties c.1129G>C p.Glu377Gln en c.1933C>T p.Arg645Cys, en twee splicing mutaties c.1334-1G>A en c.2142-1G>A. 2) c.1129G>C p.Glu377Gln werd eerder gerapporteerd als ziekteveroorzakende mutatie, maar bleek een single nucleotide polymorfisme (SNP) te zijn, gevonden bij 15 van 50 normale controles. 3) Twee nieuwe splicing mutaties werden in deze studie gevonden: c.1334-1G>A en c.2142-1G>A. 1) We detecteerden 3 ziekteveroorzakende mutaties bij 2 SIOD-kinderen via SMARCAL1 genanalyse, terwijl 2 splicing mutaties nieuw waren. 2) c.1129G>C p.Glu377Gln was een SNP, maar geen ziekteveroorzakende mutatie, althans niet in de Chinese populatie.",
"Mutaties in SMARCAL1, dat codeert voor een DNA-annealerende helicase met functies in het herstarten van DNA-replicatievorken, DNA-reparatie en modulatie van genexpressie, veroorzaken Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD), een autosomaal recessieve ziekte gekenmerkt door skeletdysplasie, nierziekte, T-cel immunodeficiëntie en arteriosclerose. De klinische kenmerken van SIOD ontstaan door pathologische veranderingen in genexpressie, maar het onderliggende mechanisme voor deze genexpressieveranderingen blijft onduidelijk. Wij stelden de hypothese dat veranderingen in het epigenoom genexpressie in SIOD wijzigen. Om dit te testen voerden wij een genetische screening uit voor interactie tussen Marcal1, het Drosophila melanogaster ortholoog van SMARCAL1, en de genen van de Trithorax groep (trxG) en Polycomb groep (pcG), die epigenetische regulatoren coderen. SMARCAL1 en Marcal1 interageerden genetisch met leden van trxG en pcG. Een homozygote null-mutatie van Marcal1 onderdrukte de vleugel-naar-haltere transformatie, ectopische ultrabithorax (Ubx) expressie en ectopische Ubx minigen expressie veroorzaakt door pcG-deficiëntie. De onderdrukking van ectopische Ubx expressie correleerde met verminderde chromatine toegankelijkheid van de Ubx-promotor. Voor zover wij weten is dit het eerste in vivo bewijs dat een deficiëntie van een SMARCAL1 ortholoog de chromatinestructuur van een gen verandert.",
"Autosomal recessieve Schimke immuno-osseuze dysplasie (SIOD), gekenmerkt door spondylo-epifysaire dysplasie, focale segmentale glomerulosclerose (FSGS), T-cel immunodeficiëntie en gelaatsdysmorfie, wordt veroorzaakt door defecten in het SMARCAL1 gen. Het genproduct is betrokken bij de transcriptieregulatie van andere genen. Een 12-jarig jongetje van consanguine Turkse afkomst ontwikkelde disproportionele korte gestalte door spondylo-epifysaire dysplasie op 6-jarige leeftijd en nefrotisch syndroom op 10-jarige leeftijd. Nierbiopsie toonde FSGS; de nierfunctie was normaal. T-lymfocyten waren verminderd zonder infectieuze complicaties en hij had geen cerebrale ischemie. Analyse van het SMARCAL1 gen van de patiënt toonde een nieuwe homozygote c.1798T overgang die leidde tot een R561C substitutie. De ouders en twee gezonde zussen waren heterozygoot; een jongere broer die ook homozygoot was voor de mutatie was klinisch asymptomatisch en had geen proteïnurie op 18 maanden, maar zijn CD4-cellen waren nog steeds verminderd. Voor SMARCAL1 mutaties is een duidelijke genotype-fenotype correlatie gerapporteerd: ernstige SIOD met in utero of vroege kinderleeftijd aanvang leidt binnen enkele jaren tot eindstadium nierziekte en wordt veroorzaakt door nonsense, frameshift of splice mutaties; veel patiënten overlijden in de kindertijd aan infecties en cerebrovasculaire insulten. Milde SIOD manifesteert zich later en verloopt langzamer zonder infectieuze of cerebrovasculaire complicaties, met als onderliggend defect missense mutaties. De nieuwe R561C missense mutatie in onze patiënt met milde SIOD is aanvullend bewijs voor de genotype-fenotype correlatie bij SMARCAL1 mutaties.",
"Schimke immuno-osseuze dysplasie is een zeldzame autosomaal recessieve multisysteemstoornis gekenmerkt door steroïd-resistent nefrotisch syndroom, immunodeficiëntie en spondylo-epifysaire dysplasie. Mutaties in het SWI/SNF-gerelateerde, matrix-geassocieerde, actine-afhankelijke regulator van chromatine, subfamilie A-achtig 1 (SMARCAL1) gen zijn verantwoordelijk voor de ziekte. Het huidige rapport beschrijft voor het eerst een kind met Schimke immuno-osseuze dysplasie met een SMARCAL1 missense mutatie R561H en manifestaties van intussusceptie secundair aan Epstein-Barr virus-negatieve non-Hodgkin lymfoom, die overleed aan sepsis na chemotherapie. Het rapport benadrukt de noodzaak van meer beperkte immunosuppressieve protocollen bij Schimke immuno-osseuze dysplasie patiënten met lymfoproliferatieve aandoeningen.",
"De rol van SMARCAL1 in replicatievorkstabiliteit en telomeeronderhoud.",
"Omdat een gedetailleerde beschrijving van de klinische kenmerken een essentiële eerste stap is in het ontrafelen van de functie van SMARCAL1, presenteren wij de eerste gedetailleerde antropometrische gegevens van Schimke immuno-osseuze dysplasie patiënten.",
"SMARCAL1 genanalyse van 2 Chinese Schimke immuno-osseuze dysplasie kinderen.",
"Chromatine veranderingen bij SMARCAL1-deficiëntie: een hypothese voor de genexpressieveranderingen bij Schimke immuno-osseuze dysplasie."
] | 1,874 | 1,705 |
2,376 | Wat is de meest voorkomende histologische diagnose van "vlinderglioma"? | Vlinderglioma is glioblastoom multiforme dat het corpus callosum binnendringt. | [
"Corpus callosum glioblastoom multiforme (GBM): vlinderglioma.",
"De diagnose van vlinderglioma (glioblastoom multiforme) werd gesteld op basis van beeldvormingskenmerken en verder bevestigd door biopsiegegevens.",
"Met behulp van Cox proportionele hazard regressie waren de onafhankelijke prognostische factoren een Karnofsky Performance Status score ≤70, betrokkenheid van het splenium en vlinderglioblastoom.",
"Caniene vlinderglioblastomen: een neuroradiologische review.",
"Alle tumoren toonden klassieke histopathologische kenmerken van glioblastoom multiforme (GBM), waaronder gliale cel pseudopalisadering, slingerende necrose, microvasculaire proliferatie en invasie van het corpus callosum door neoplastische astrocyten.",
"Metastatisch adenoïd cystisch carcinoom dat vlinderglioblastoom nabootst: een zeldzame presentatie in het splenium van het corpus callosum.",
"ACHTERGROND: Intracraniële verspreiding van een adenoïd cystisch carcinoom (ACC) van de parotis is zeldzaam, en metastatische ACC naar het splenium van het corpus callosum die vlinderglioblastoom (GBM) nabootst, is eerder niet gerapporteerd.",
"Diverse moleculaire patronen in een bihemisferisch glioblastoom (vlinderglioma) bij een 16-jarige jongen.",
"Glioblastoom multiforme (GBM), de meest voorkomende kwaadaardige hersentumor bij volwassenen, is relatief zeldzaam bij kinderen. Bij een GBM die een 16-jarige jongen trof, verspreidde de tumor zich over het corpus callosum (vlinderglioma).",
"De oorspronkelijke \"duidelijke\" diagnose van glioblastoom multiforme, gebaseerd op CT-scans, werd onverwacht weerlegd door onderzoek van stereotactisch verkregen hersenbiopsieën, die neuronale ceroid lipofuscinosis (Kufs' ziekte) aantoonden.",
"De diagnose van vlinderglioma (glioblastoom multiforme) werd gesteld op basis van beeldvormingskenmerken en verder bevestigd door biopsiegegevens.",
"Naast een groot vlinderglioblastoom dat uit het frontale deel van het corpus callosum voortkomt, toonde neuropathologisch onderzoek een mycotische encefalitis met de vorming van talrijke schimmelbevattende ontstekingshaarden in alle delen van de hersenen en in het glioma.",
"Corpus callosum glioblastoom multiforme (GBM): vlinderglioma.",
"Wanneer een tumor met adenoïde histologische kenmerken en een \"vlinder\" fenotype groeit in het corpus callosum bij een patiënt met bekende parotis ACC, moeten zowel metastase als adenoïde variant GBM worden overwogen.",
"Bij een GBM die een 16-jarige jongen trof, verspreidde de tumor zich over het corpus callosum (vlinderglioma).",
"ACHTERGROND: Intracraniële verspreiding van een adenoïd cystisch carcinoom (ACC) van de parotis is zeldzaam, en metastatische ACC naar het splenium van het corpus callosum die vlinderglioblastoom (GBM) nabootst, is eerder niet gerapporteerd.",
"De pathologieën betreffen het bilaterale corpus callosum dat het vlinderpatroon op axiale beelden vormt. Deze tumoren zijn zelden onderzocht op zowel klinische manifestaties als uitkomst. Het doel van deze studie was de klinische kenmerken en uitkomsten van de vlindertumor te beschrijven en de voorspellende factoren geassocieerd met overlevingsuitkomst te identificeren. Een retrospectieve studie van 50 vlindertumoren werd uitgevoerd tussen 2003 en 2016. De klinische kenmerken, beeldvorming en uitkomst werden beoordeeld voor beschrijvende analyse met de Kaplan-Meier methode. De mediane totale overleving van de vlindertumor werd bepaald. Verder werd met Cox proportionele hazard regressie de geschatte hazard ratio voor overlijden bepaald. Diffuus groot B-cel lymfoom was veelvoorkomend bij vlindervormige laesies. Het sterftecijfer was 78% en de mediane totale overlevingstijd was 16,03 maanden (95% betrouwbaarheidsinterval 14,0-19,8). Met Cox proportionele hazard regressie waren de onafhankelijke prognostische factoren Karnofsky Performance Status score ≤70, betrokkenheid van het splenium en vlinderglioblastoom. De vlindertumor is een ziekte met slechte prognose vergeleken met elke histologische subgroep. Verdere moleculaire onderzoeken zijn wenselijk om genetische variaties geassocieerd met deze tumoren te verkennen.",
"Een 45-jarige man met een vlinderglioma onderging stereotactische biopsie voor histologische bevestiging van de klinische diagnose. Microscopisch waren de resultaten controversieel omdat sommige biopsiepreparaten duidelijke ontstekingsveranderingen toonden, terwijl andere typische kenmerken van een kwaadaardig glioma vertoonden. De patiënt overleed vier dagen na de stereotactische procedure door therapieresistente intracraniële drukverhoging. Naast een groot vlinderglioblastoom dat uit het frontale deel van het corpus callosum voortkwam, toonde neuropathologisch onderzoek een mycotische encefalitis met de vorming van talrijke schimmelbevattende ontstekingshaarden in alle delen van de hersenen en in het glioma. Algemene autopsie toonde pulmonale aspergillose als bron van de ontstekingsverspreiding. Een eerdere steroïdmedicatie gedurende enkele weken voor de behandeling van verhoogde intracraniële druk kan worden beschouwd als een belangrijke factor in het ontstaan van de pulmonale aspergillose die het vlinderglioma compliceerde.",
"Clinics in Diagnostic Imaging 175 corpus callosum glioblastoom multiforme GBM vlinderglioma",
"Een 54-jarige man presenteerde zich met gedragsverandering, nachtelijk bedplassen, abnormale ledemaatbewegingen en hoofdpijn van een week duur. De diagnose vlinderglioma glioblastoom multiforme werd gesteld op basis van beeldvormingskenmerken en verder bevestigd door biopsiegegevens. Aangezien het corpus callosum gewoonlijk resistent is tegen infiltratie door tumoren, wijst een massa die het corpus callosum omvat en doorkruist op een agressieve neoplasma. Andere neoplastische en niet-neoplastische aandoeningen die het corpus callosum kunnen aantasten en een vlinderglioma kunnen nabootsen, evenals bijbehorende beeldvormingskenmerken, worden besproken.",
"Intracraniële verspreiding van een adenoïd cystisch carcinoom (ACC) van de parotis is zeldzaam en metastatische ACC naar het splenium van het corpus callosum die vlinderglioblastoom (GBM) nabootst, is eerder niet gerapporteerd. Wij rapporteren een zeldzaam geval van metastase naar het splenium van het corpus callosum van ACC van de parotis. De tumor bezette het splenium en imiteerde de presentatie van een vlinderglioma. De patiënt had vijf jaar voor deze intracraniële laesie een parotidectomie ondergaan. Op magnetische resonantiebeeldvorming was de laesie gescheiden van de pijnappelklier en duwde de interne cerebrale aders naar beneden. Ventriculaire obstructie en verhoogde cellulariteit werden ook gesuggereerd en meerdere met vocht gevulde cystische ruimtes werden waargenomen. De tumor werd gedeeltelijk verwijderd omdat de uiterste laterale grens niet zichtbaar was. Histologische analyse met anti-c-kit antilichaam toonde sterke expressie van het epitheliale component. Immunohistochemie met anti-p63 antilichaam toonde nestjes van positieve tumorcellen die het myo-epitheliale component benadrukten. De tumor kleurde ook positief voor anti-Myb antilichaam. De behandeling van deze laesie bestaat uit chirurgische debulking gevolgd door bestralingstherapie. De algehele prognose blijft echter somber vanwege beperkte chemotherapie-opties en een neiging tot recidief, zowel lokaal als op afstand. Wanneer een tumor met adenoïde histologische kenmerken en een vlinderfenotype groeit in het corpus callosum bij een patiënt met bekende parotis ACC, moeten zowel metastase als adenoïde variant GBM worden overwogen. Zorgvuldige klinische en radiologische correlatie is vereist om deze zeldzame laesie te diagnosticeren en te behandelen.",
"De auteurs rapporteren een geval van neuronale ceroid lipofuscinosis (Kufs' ziekte) bevestigd door stereotactisch verkregen hersenbiopsieën en aanvankelijk gediagnosticeerd als vlinderglioma. De presentatie bij de 64-jarige patiënt bestond uit mentale veranderingen met progressieve dementie, gevolgd door spieraantasting en myoclonieën met distale dominantie. De milde initiële coördinatiestoornissen namen toe en de patiënt ontwikkelde een sterk atactisch looppatroon. Computertomografie (CT) en magnetische resonantiebeeldvorming toonden gegeneraliseerde cerebrale atrofie en een bifrontale ruimte innemende laesie die het corpus callosum betrof. De oorspronkelijke duidelijke diagnose van glioblastoom multiforme op basis van CT-scans werd onverwacht weerlegd door onderzoek van stereotactisch verkregen hersenbiopsieën, die neuronale ceroid lipofuscinosis (Kufs' ziekte) aantoonden. Voor zover de auteurs weten, is dit het eerste rapport van een geval met zowel diffuse hersenatrofie als gelokaliseerde accumulatie van neuronale lipofuscine die een massa-laesie nabootst op radiologische studies.",
"Diverse moleculaire patronen in een bihemisferisch glioblastoom (vlinderglioma) bij een 16-jarige jongen.",
"Caniene vlinderglioblastomen: een neuroradiologische review.",
"Glioblastoom multiforme (GBM), de meest voorkomende kwaadaardige hersentumor bij volwassenen, is relatief zeldzaam bij kinderen. Bij een GBM die een 16-jarige jongen trof, verspreidde de tumor zich over het corpus callosum (vlinderglioma). Dit type bilaterale hemisferische groei werd eerder gedacht te ontstaan door verspreiding langs de witte stofbanen. Twee monsters verkregen van tegenovergestelde zijden van dezelfde tumor werden uitgebreid geanalyseerd op verlies van heterozygotie (LOH) en microsatellietinstabiliteit (MSI). Amplificatie van EGFR en MDM2 werd bestudeerd met multiplex polymerasekettingreactie. Exons 5, 6, 7 en 8 van TP53 werden gescreend op mutaties door sequencing. In geen van de monsters werden moleculaire veranderingen gevonden in de EGFR-, MDM2- of TP53-genen. Het monster uit de rechterhersenhelft vertoonde een hoog niveau van MSI en LOH in chromosoomarmen 5q, 9p en 13q. Het monster uit de linkerhersenhelft vertoonde LOH in chromosoomarmen 3p, 5q, 9p, 9q, 10p, 10q en 13q. Hier stellen we vier plausibele hypothetische scenario's voor die ten grondslag liggen aan de tumorvorming van dit GBM.",
"Bij mensen kunnen hooggradige gliomen infiltreren over het corpus callosum, resulterend in bihemisferische laesies die symmetrische vleugelachtige verschijningen kunnen hebben. Deze specifieke tumormanifestatie wordt een vlinderglioma (BG) genoemd. Hoewel caniene en menselijke gliomen veel neuroradiologische en pathologische kenmerken delen, is de BG-morfologie eerder niet gerapporteerd bij honden. Hier beschrijven we de kenmerken van magnetische resonantiebeeldvorming (MRI) van BG bij drie honden en bespreken we de potentiële differentiële diagnoses op basis van neuroimaging bevindingen. Alle honden presenteerden zich met gegeneraliseerde aanvallen en interictale neurologische afwijkingen die wijzen op multifocale of diffuse voorhersenziekte. MRI-onderzoeken toonden asymmetrische (2/3) of symmetrische (1/3) bihemisferische intra-axiale massa-laesies die voornamelijk de frontopariëtale lobben aantastten, geassocieerd met uitgebreide perilesionale oedeem en betrokkenheid van het corpus callosum. De massa's vertoonden heterogene T1-, T2- en FLAIR-signaalintensiteiten, variabele contrastversterking (2/3) en massa-effect. Alle tumoren toonden klassieke histopathologische kenmerken van glioblastoom multiforme (GBM), waaronder gliale cel pseudopalisadering, slingerende necrose, microvasculaire proliferatie en invasie van het corpus callosum door neoplastische astrocyten. Hoewel zeldzaam, moet GBM worden overwogen als differentiële diagnose bij honden met MRI-bewijs van asymmetrische of symmetrische bilaterale intra-axiale cerebrale massa-laesies met signaalkarakteristieken die compatibel zijn met glioma."
] | 1,576 | 1,450 |
2,377 | Welke chromosomen zijn betrokken bij het Emanuel-syndroom? | Het Emanuel-syndroom wordt geassocieerd met een supernumerair chromosoom t(11;22)(q23;q11), dat bestaat uit extra genetisch materiaal van chromosomen 11 en 22. | [
"Single-nucleotide polymorfisme-array analyse van de proband toonde een gedeeltelijke duplicatie van chromosomen 22 en 11 aan op respectievelijk 22q11.1-q11.21 en 11q23.3-q25, wat de diagnose van ES bevestigde.",
"NGS- en FISH-analyse bevestigden dat het supernumeraire markerschromosoom dat door de foetus werd gedragen der(22) t(11;22) (q23;q11) was.",
"Het Emanuel-syndroom wordt geassocieerd met een supernumerair chromosoom, dat bestaat uit extra genetisch materiaal van chromosoom 11 en 22.",
"Meerdere aangeboren afwijkingen en craniofaciale dysmorfie kenmerken het zogenaamde Emanuel- of supernumeraire der(22)t(11;22)-syndroom (OMIM609029).",
"Complexe kleine supernumeraire markerschromosomen (sSMC's) bestaan uit chromosomaal materiaal afkomstig van meer dan één chromosoom, bijvoorbeeld het derivaat der(22)t(11;22)(q23;q11.2) bij het Emanuel-syndroom.",
"Een geval met Emanuel-syndroom: extra derivaat 22-chromosoom geërfd van de moeder.",
"Getroffen kinderen worden meestal in de pasgeboren periode geïdentificeerd als nakomelingen van dragers van een gebalanceerde (11;22)-translocatie.",
"We rapporteren een 3-jarige jongen met het t(11;22)(q23;q11)-chromosoom, overgedragen in een ongebalanceerde vorm van zijn moeder.",
"Gebalanceerde dragers van t(11;22) vertonen meestal geen klinische symptomen en worden vaak geïdentificeerd na de geboorte van nakomelingen met een ongebalanceerde vorm van deze translocatie, bekend als het Emanuel-syndroom.",
"Derivaat 11;22 (Emanuel) syndroom: een casusrapport en een overzicht.",
"Complexe sSMC's bestaan uit chromosomaal materiaal afkomstig van meer dan één chromosoom; de bekendste vertegenwoordiger van deze groep is het derivaatchromosoom 22 {der(22)t(11;22)} of Emanuel-syndroom.",
"Het syndroom wordt veroorzaakt door chromosomale onbalans door een supernumerair derivaatchromosoom 22.",
"We hebben iPSCs gegenereerd van monosomie X [Turner-syndroom (TS)], trisomie 8 (Warkany-syndroom 2), trisomie 13 (Patau-syndroom) en partiële trisomie 11;22 (Emanuel-syndroom), met behulp van huidfibroblasten van getroffen individuen of amniocyten van prenatale diagnostische tests.",
"Het Emanuel-syndroom is een erfelijke chromosomale afwijking die het gevolg is van 3:1 meiotische segregatie van een ouderlijke gebalanceerde translocatiedrager t(11;22)(q23;q11), meestal van maternale oorsprong.",
"Hier beschrijven we een vrouwelijke patiënt met supernumerair der(22)-syndroom (Emanuel-syndroom) als gevolg van een gebalanceerde translocatiedrager vader t(11;22) (q23;q11).",
"De t(11;22)(q23;q11.2) is de belangrijkste terugkerende kiembaantranslocatie bij mensen. Ongebalanceerde translocaties kunnen worden overgedragen aan nakomelingen en kunnen het Emanuel-syndroom veroorzaken.",
"Complexe kleine supernumeraire markerschromosomen (sSMC's) vormen een van de kleinste subsets binnen de patiënten met een sSMC. Complexe sSMC's bestaan uit chromosomaal materiaal afkomstig van meer dan één chromosoom, bijvoorbeeld het derivaat der(22)t(11;22)(q23;q11.2) bij het Emanuel-syndroom.",
"Het Emanuel-syndroom wordt geassocieerd met een supernumerair chromosoom, dat bestaat uit extra genetisch materiaal van chromosoom 11 en 22.",
"Het waargenomen aantal gevallen van Emanuel-syndroom was 36 en dat van t(11;22) gebalanceerde translocatiedragers 40.",
"Het Emanuel-syndroom is een erfelijke chromosomale afwijking die het gevolg is van 3:1 meiotische segregatie van een ouderlijke gebalanceerde translocatiedrager t(11;22)(q23;q11), meestal van maternale oorsprong.",
"Het Emanuel-syndroom ontstaat door +der(22)t(11q23;22q11).",
"Hier beschrijven we een vrouwelijke patiënt met supernumerair der(22)-syndroom (Emanuel-syndroom) als gevolg van een gebalanceerde translocatiedrager vader t(11;22) (q23;q11).",
"Complexe sSMC's bestaan uit chromosomaal materiaal afkomstig van meer dan één chromosoom; de bekendste vertegenwoordiger van deze groep is het derivaatchromosoom 22 {der(22)t(11;22)} of Emanuel-syndroom.",
"Complexe sSMC's bestaan uit chromosomaal materiaal afkomstig van meer dan één chromosoom, bijvoorbeeld het derivaat der(22)t(11;22)(q23;q11.2) bij het Emanuel-syndroom.",
"Gebalanceerde dragers van t(11;22) vertonen meestal geen klinische symptomen en worden vaak geïdentificeerd na de geboorte van nakomelingen met een ongebalanceerde vorm van deze translocatie, bekend als het Emanuel-syndroom.",
"Supernumerair chromosoom der 22 t 11 22 Emanuel-syndroom geassocieerd met nieuwe kenmerken",
"Een geval met Emanuel-syndroom: extra derivaat 22-chromosoom geërfd van de moeder",
"Het Emanuel-syndroom is een zeldzame chromosomale aandoening die wordt gekenmerkt door ernstige verstandelijke beperking en meerdere afwijkingen. Het syndroom wordt veroorzaakt door chromosomale onbalans door een supernumerair derivaatchromosoom 22. Er is weinig bekend over de kenmerken van prenatale biochemische screening of echografische markers bij dit syndroom. Wij wilden een prenataal screeningspatroon identificeren dat kenmerkend is voor het Emanuel-syndroom. We rapporteren de prenatale kenmerken van vijf foetussen met Emanuel-syndroom, waarvan er vier prenataal werden gediagnosticeerd. We vonden geen consistent patroon van prenatale biochemische markers of andere prenatale kenmerken. Niettemin kunnen verhoogde NT, lage PAPP-A en echografische kenmerken zoals intra-uteriene groeibeperking, posterior fossa afwijkingen, hart- en darmafwijkingen nuttig zijn om de verdenking op dit zeldzame genetische syndroom te verhogen. Een overzicht van de biochemische screeningsresultaten, echografische bevindingen en demografische kenmerken van deze Emanuel-syndroom casusserie evenals van de relevante literatuur suggereert geen karakteristiek prenataal patroon.",
"Het Emanuel-syndroom wordt geassocieerd met een supernumerair chromosoom dat bestaat uit extra genetisch materiaal van chromosoom 11 en 22. De frequentie van dit syndroom is gerapporteerd als 1 op 110.000. Het is een zeldzame afwijking geassocieerd met meerdere systemische malformaties zoals micrognathie en aangeboren hartafwijkingen. Daarnaast kunnen patiënten met Emanuel-syndroom epileptische aandoeningen hebben. Wij hebben de anesthesiologische behandeling ervaren van een patiënt met Emanuel-syndroom die een palatoplastiek onderging. Deze patiënt had een tracheotomie ondergaan vanwege micrognathie. Daarnaast had hij een atriumseptumdefect, milde pulmonale arteriestenose en een gespleten gehemelte. De palatoplastiek werd zonder complicaties tijdens de anesthesie uitgevoerd, waarbij speciale aandacht werd besteed aan de hartfunctie, epilepsiebeheer en luchtwegmanagement.",
"Complexe kleine supernumeraire markerschromosomen (sSMC's) vormen een van de kleinste subgroepen van sSMC's. Over het algemeen bestaan complexe sSMC's uit chromosomaal materiaal afkomstig van meer dan één chromosoom. De bekendste vertegenwoordiger van deze groep is het derivaatchromosoom 22 der(22) t(11;22) of Emanuel-syndroom. In 2008 speculeerden we dat complexe sSMC's deel kunnen uitmaken van een onderschatte entiteit. Hier worden de tot nu toe gerapporteerde 412 complexe sSMC's samengevat. Ze vormen 8,4% van alle tot nu toe gedetailleerd gekarakteriseerde sSMC-gevallen. Het merendeel van de complexe sSMC's wordt veroorzaakt door patiënten met Emanuel-syndroom (82%). Daarnaast zijn er een der(22) t(8;22)(q24.1;q11.1) en een der(13) t(13;18)(q11;p11.21) of der(21) t(18;21)(p11.21;q11.1) der(13) of 21 t(13;21)(18)-syndroom. Deze laatste twee vertegenwoordigen respectievelijk 2,6% en 2,2% van de complexe sSMC-gevallen. Het merendeel van de complexe sSMC's heeft een centric minute-vorm en is afgeleid van een acrocentrisch chromosoom. Niettemin kunnen complexe sSMC's materiaal van elke chromosomale oorsprong bevatten. De meeste complexe sSMC's worden geërfd van een gebalanceerde translocatie bij een van de ouders en zijn niet-mosaïcistisch. Interessant is dat er hotspots zijn voor de betrokken chromosomale breukpunten. Complexe sSMC's moeten in de diagnostiek worden overwogen, vooral bij niet-mosaïcistische centric minute-vormige sSMC's. Tot nu toe zijn drie complexe sSMC-geassocieerde syndromen geïdentificeerd waarbij terugkerende breukpunten in de complexe sSMC's zijn gekarakteriseerd. Het is te verwachten dat meer syndromen worden geïdentificeerd in deze subgroep van sSMC's. Over het geheel genomen benadrukken complexe sSMC's nogmaals het belang van gedetailleerde cytogenetische analyses, vooral bij patiënten met idiopathische verstandelijke beperking.",
"Het Emanuel-syndroom wordt gekenmerkt door meerdere aangeboren afwijkingen en ontwikkelingsachterstand. Het wordt veroorzaakt door de aanwezigheid van een supernumerair derivaatchromosoom dat materiaal bevat van chromosomen 11 en 22. De oorsprong van deze onbalans is 3:1 malsegregatie van een ouderlijke gebalanceerde translocatie tussen chromosomen 11 en 22, wat de meest voorkomende terugkerende reciproque translocatie bij mensen is. Er is weinig gepubliceerd over de klinische kenmerken van dit syndroom sinds de jaren 80 en informatie over de natuurlijke geschiedenis is beperkt. We hebben een vragenlijst ontworpen om informatie te verzamelen van families die via een internationale online steungroep Chromosome 22 Central zijn gerekruteerd. Verzamelde gegevens omvatten informatie over aangeboren afwijkingen, medische en chirurgische geschiedenis, ontwikkelings- en gedragsproblemen en huidige vaardigheden. We ontvingen informatie over 63 individuen met Emanuel-syndroom, variërend van pasgeborenen tot volwassenen. Zoals eerder erkend, waren aangeboren afwijkingen veelvoorkomend, waarbij de meest frequente oorpitsen (76%), micrognathie (60%), hartafwijkingen (57%) en gespleten gehemelte (54%) waren. Onze gegevens suggereren dat visuele en gehoorstoornissen, epileptische aanvallen, falen om te gedijen en terugkerende infecties, met name otitis media, vaak voorkomen bij dit syndroom. Psychomotorische ontwikkeling is uniform vertraagd, maar de meerderheid van de individuen (meer dan 70%) leert uiteindelijk lopen met ondersteuning. Taalontwikkeling en zelfzorgvaardigheden zijn ook sterk beperkt. Deze studie biedt nieuwe informatie over het klinische spectrum en de natuurlijke geschiedenis van het Emanuel-syndroom voor families en artsen die voor deze individuen zorgen.",
"Het Emanuel-syndroom is een erfelijke chromosomale afwijking die het gevolg is van 3:1 meiotische segregatie van een ouderlijke gebalanceerde translocatiedrager t(11;22)(q23;q11), meestal van maternale oorsprong. Het wordt gekenmerkt door verstandelijke beperking, microcefalie, preauriculaire tag of sinus, oorafwijkingen, gespleten of hoog gewelfd gehemelte, micrognathie, aangeboren hartafwijkingen, nierafwijkingen, structurele hersenafwijkingen en genitale afwijkingen bij mannen. Hier beschrijven we een vrouwelijke patiënt met supernumerair der(22)-syndroom (Emanuel-syndroom) als gevolg van een gebalanceerde translocatiedrager vader t(11;22)(q23;q11). Zij was mentaal en fysiek gehandicapt en vertoonde de meeste craniofaciale dysmorfieën van dit syndroom. Onze patiënt had een gespleten gehemelte, onderontwikkeld corpus callosum en achterhersenen met normale interne organen. Daarnaast waren arachnodactylie, hyperextensibiliteit van handgewrichten, abnormale diepe handpalmen en vingerplooien, extra vingerplooien en bilaterale talipes aanwezig, wat nog niet eerder met dit syndroom was beschreven. Cytogenetische analyse en FISH toonden aan dat de patiënt beide translocatiechromosomen plus een extra kopie van der(22) had met karyotypering 47,XX,t(11;22)(q23;q11),der(22)t(11;22)(q23;q11). We stelden dat deze zeldzame chromosomale samenstelling kan ontstaan door 2:2 segregatie in de eerste meiotische deling van de gebalanceerde translocatievader, gevolgd door nondisjunctie in meiose II in de gebalanceerde spermatocyt.",
"Het Emanuel-syndroom ontstaat door der(22)t(11q23;22q11). Gespleten gehemelte, oorafwijkingen, hartafwijkingen, genitale afwijkingen, hypotonie en verstandelijke beperking zijn de belangrijkste kenmerken van het syndroom. We rapporteren een negenjarige jongen met het t(11;22)(q23;q11)-chromosoom, overgedragen in een ongebalanceerde vorm van zijn moeder en ontstaan in de meiose van de grootmoeder van moederszijde. Naast verstandelijke beperking, hypotonie, craniofaciale afwijkingen en cryptorchidie heeft hij nieuwe bevindingen zoals gewrichtshyperextensibiliteit, afwezigheid van de linker leverlob, linkerzijdige malpositie van de galblaas en pancreas hypoplasie. Dit is het eerste rapport dat deze kenmerken associeert met het Emanuel-syndroom."
] | 1,648 | 1,514 |
2,378 | Is een CpG-eiland methylator fenotype betrokken bij ependymomen? | Hoewel ze geen terugkerende enkelvoudige nucleotidevarianten en focale kopieaantalafwijkingen vertonen, tonen ependymomen met een slechte prognose in de achterhersenen een CpG-eiland methylator fenotype. | [
"Hoewel ze geen terugkerende enkelvoudige nucleotidevarianten en focale kopieaantalafwijkingen vertonen, tonen ependymomen met een slechte prognose in de achterhersenen een CpG-eiland methylator fenotype.",
"Hoewel er geen terugkerend gemuteerde genen werden gevonden in deze groepen ependymomen, vertoonde PFA een CpG-eiland methylator fenotype, was PFB geassocieerd met uitgebreide chromosomale afwijkingen, en werd het C11orf95-RELA fusiegen vaak waargenomen in supratentoriale ependymomen.",
"Supratentoriale en spinale pediatrische ependymomen vertonen een hypergemethyleerd fenotype dat het verlies van tumorrepressor genen omvat die betrokken zijn bij de controle van celgroei en celdood.",
"Supratentoriale en spinale tumoren vertoonden significant meer hypergemethyleerde genen dan tumoren in de achterste schedelgroeve, vergelijkbaar met het 'CpG-eiland methylator fenotype' (CIMP) dat is geïdentificeerd in gliomen en coloncarcinomen.",
"De gegevens suggereren dat epigenetische stillegging van tumorrepressor genen een belangrijk mechanisme is in de pathogenese van supratentoriale en spinale, maar niet van achterste schedelgroeve ependymomen. Hypermethylatie correleerde met een afname in expressie van een aantal tumorrepressor genen en pathways die een belangrijke rol kunnen spelen in de tumorpathogenese.",
"Hoewel ze geen terugkerende enkelvoudige nucleotidevarianten en focale kopieaantalafwijkingen vertonen, tonen ependymomen met een slechte prognose in de achterhersenen een CpG-eiland methylator fenotype.",
"CpG-eiland methylator fenotype-positieve ependymomen in de achterhersenen reageren op klinische geneesmiddelen die DNA of H3K27-methylatie targeten, zowel in vitro als in vivo.",
"Whole-genome en whole-exome sequencing van 47 ependymomen in de achterhersenen onthult een extreem lage mutatiefrequentie en geen significante terugkerende somatische enkelvoudige nucleotidevarianten.",
"Hoewel er geen terugkerend gemuteerde genen werden gevonden in deze groepen ependymomen, vertoonde PFA een CpG-eiland methylator fenotype, was PFB geassocieerd met uitgebreide chromosomale afwijkingen, en werd het C11orf95-RELA fusiegen vaak waargenomen in supratentoriale ependymomen.",
"Ependymomen zijn veelvoorkomende hersentumoren bij kinderen die overal in het zenuwstelsel voorkomen, maar het meest in de pediatrische achterhersenen. De huidige standaardtherapie bestaat uit chirurgie en bestraling, maar niet uit cytotoxische chemotherapie omdat dit de overleving niet verder verhoogt. Whole-genome en whole-exome sequencing van 47 ependymomen in de achterhersenen onthult een extreem lage mutatiefrequentie en geen significante terugkerende somatische enkelvoudige nucleotidevarianten. Hoewel ze geen terugkerende enkelvoudige nucleotidevarianten en focale kopieaantalafwijkingen vertonen, tonen ependymomen met een slechte prognose in de achterhersenen een CpG-eiland methylator fenotype. Transcriptionele stillegging gedreven door CpG-methylatie concentreert zich exclusief op doelwitten van het polycomb repressive complex 2, dat de expressie van differentiatiegenen onderdrukt via trimethylatie van H3K27. CpG-eiland methylator fenotype-positieve ependymomen in de achterhersenen reageren op klinische geneesmiddelen die DNA of H3K27-methylatie targeten, zowel in vitro als in vivo. We concluderen dat epigenetische modulatoren de eerste rationele therapeutische kandidaten zijn voor deze dodelijke maligniteit, die epigenetisch ontregeld maar genetisch eenvoudig is.",
"Supratentoriale en spinale pediatrische ependymomen vertonen een hypergemethyleerd fenotype dat het verlies van tumorrepressor genen omvat die betrokken zijn bij de controle van celgroei en celdood.",
"Epigenomische veranderingen definiëren dodelijke CIMP-positieve ependymomen van de vroege kinderjaren.",
"Moleculaire genetica van ependymomen en pediatrische diffuse gliomen: een korte review.",
"Epigenetische veranderingen, waaronder methylatie, zijn aangetoond als een belangrijk mechanisme van genstillegging bij kanker. Ependymoom is goed gekarakteriseerd op DNA-kopieaantal en mRNA-expressieniveau, maar er is weinig bekend over DNA-methylatieveranderingen. Om een meer globaal beeld te krijgen van het methylatieprofiel van ependymoom, voerden we een array-gebaseerde analyse uit. Onze data toonden aan dat tumoren zich scheidden volgens hun locatie in het centrale zenuwstelsel, wat geassocieerd was met een verschil in het globale methylatieniveau. Supratentoriale en spinale tumoren vertoonden significant meer hypergemethyleerde genen dan tumoren in de achterste schedelgroeve, vergelijkbaar met het CpG-eiland methylator fenotype (CIMP) geïdentificeerd in gliomen en coloncarcinomen. Dit hypergemethyleerde profiel was geassocieerd met een verhoogde expressie van genen die coderen voor eiwitten betrokken bij DNA-methylatie, wat wijst op een onderliggend mechanisme. Een geïntegreerde analyse van methylatie- en mRNA-expressie-arraydata stelde ons in staat methylatie-geïnduceerde expressieveranderingen te identificeren, met name genen betrokken bij de controle van celgroei en celdood en het immuunsysteem, waaronder leden van het JNK-pathway en PPARγ. Concluderend hebben we een globaal beeld gegenereerd van het methylatieprofiel van ependymoom. De data suggereren dat epigenetische stillegging van tumorrepressor genen een belangrijk mechanisme is in de pathogenese van supratentoriale en spinale, maar niet van achterste schedelgroeve ependymomen. Hypermethylatie correleerde met een afname in expressie van een aantal tumorrepressor genen en pathways die een belangrijke rol kunnen spelen in de tumorpathogenese.",
"Hier bespreken we de recente literatuur over moleculaire ontdekkingen in ependymomen en pediatrische diffuse gliomen. Ependymomen kunnen nu worden gecategoriseerd in drie locatie-gerelateerde subgroepen volgens hun biologische profiel: achterste schedelgroeve ependymomen groep A (PFA) en B (PFB) en supratentoriale ependymomen. Hoewel er geen terugkerend gemuteerde genen werden gevonden in deze groepen ependymomen, vertoonde PFA een CpG-eiland methylator fenotype, was PFB geassocieerd met uitgebreide chromosomale afwijkingen, en werd het C11orf95-RELA fusiegen vaak waargenomen in supratentoriale ependymomen. Ondertussen is het nu duidelijk geworden dat pediatrische diffuse gliomen een andere genetische status hebben dan hun volwassen tegenhangers, hoewel ze een ononderscheidbare histologie delen. Bij pediatrische laaggradige diffuse gliomen werd een intragenische duplicatie gevonden van het deel van FGFR1 dat de tyrosinekinasedomein (TKD) codeert, en werden rearrangementen van MYB en MYBL1 herhaaldelijk en exclusief gevonden. Wat betreft niet-hersenstam hogegradige tumoren, naast H3F3A, TP53 en ATRX mutaties die vaak werden waargenomen bij oudere kinderen, werden terugkerende fusies gemeld die NTRK1, NTRK2 en NTRK3 betrokken bij baby's jonger dan 3 jaar. Bovendien werden bij diffuse intrinsieke pontiene gliomen (DIPG) terugkerende somatische mutaties van ACVR1 gevonden in associatie met HIST1H3B mutaties.|"
] | 920 | 884 |
2,379 | Wordt de lusdomeinen behouden bij verlies van cohesine? | Nee. Afbraak van cohesine leidt tot het verdwijnen van lusdomeinen. Noch compartimentsdomeinen, noch histonmerken worden beïnvloed. Verlies van lusdomeinen leidt niet tot wijdverspreide ectopische genactivatie, maar beïnvloedt wel een significante minderheid van actieve genen. | [
"Verlies van cohesine elimineert alle lusdomeinen.",
"Het menselijk genoom vouwt zich om duizenden intervallen te creëren, \"contactdomeinen\" genoemd, die een verhoogde contactfrequentie binnen zichzelf vertonen. \"Lusdomeinen\" ontstaan door het vastbinden tussen twee loci - bijna altijd gebonden door CTCF en cohesine - die op hetzelfde chromosoom liggen. \"Compartimentsdomeinen\" ontstaan wanneer genomische intervallen met vergelijkbare histonmerken samen segregëren. Hier onderzoeken we de effecten van het afbreken van cohesine. Alle lusdomeinen worden geëlimineerd, maar noch compartimentsdomeinen noch histonmerken worden beïnvloed. Verlies van lusdomeinen leidt niet tot wijdverspreide ectopische genactivatie, maar beïnvloedt wel een significante minderheid van actieve genen.",
"verlies van cohesine elimineert alle lusdomeinen"
] | 146 | 140 |
2,380 | Welk workflow in Bioconductor is ontwikkeld voor toegang tot menselijke RNA-seq monsters? | De recount2-bron bestaat uit meer dan 70.000 uniform verwerkte menselijke RNA-seq monsters die TCGA en SRA omvatten, inclusief GTEx. | [
"recount workflow: Toegang tot meer dan 70.000 menselijke RNA-seq monsters met Bioconductor.",
"De recount2-bron bestaat uit meer dan 70.000 uniform verwerkte menselijke RNA-seq monsters die TCGA en SRA omvatten, inclusief GTEx.",
"recount workflow toegang tot meer dan 70.000 menselijke RNA-seq monsters met Bioconductor",
"De recount2-bron bestaat uit meer dan 70.000 uniform verwerkte menselijke RNA-seq monsters die TCGA en SRA omvatten, inclusief GTEx. De verwerkte data kan worden benaderd via de recount2-website en het Bioconductor-pakket. Deze workflow legt in detail uit hoe het pakket te gebruiken is en hoe het te integreren met andere Bioconductor-pakketten voor verschillende analyses die uitgevoerd kunnen worden met de recount2-bron. In het bijzonder beschrijven we hoe de coverage count matrices in recount2 zijn berekend, evenals verschillende manieren om publieke metadata te verkrijgen die downstream analyses kunnen vergemakkelijken. Stapsgewijze instructies tonen hoe een gen-niveau differentiële expressieanalyse uit te voeren, base-level genoom coverage data te visualiseren en analyses op meerdere feature-niveaus uit te voeren. Deze workflow biedt dus aanvullende informatie om de data in recount2 te begrijpen en een compendium van R-code om de data te gebruiken."
] | 210 | 205 |
2,381 | Wat doet VBP15 met skeletspieren? | VBP15 beschermt en bevordert efficiënte reparatie van skeletspiercellen. Krachtige remming van NF-κB wordt gemedieerd via eiwitinteracties van de glucocorticoïdereceptor, maar VBP15 vertoont aanzienlijk verminderde transcriptieactiviteit van de hormonale receptor. Bij DMD-modelmuizen verbetert het de spierkracht, live-imaging en pathologie door zowel preventieve als post-onset interventieregimes. | [
"We constateren dat VBP15 skeletspiercellen beschermt en efficiënte reparatie bevordert na laserbeschadiging, in tegenstelling tot prednisolon. Krachtige remming van NF-κB wordt gemedieerd via eiwitinteracties van de glucocorticoïdereceptor, maar VBP15 vertoont aanzienlijk verminderde transcriptieactiviteit van de hormonale receptor. De vertaling van deze medicijnmechanismen naar DMD-modelmuizen verbetert spierkracht, live-imaging en pathologie door zowel preventieve als post-onset interventieregimes. Deze gegevens tonen een succesvolle verbetering van dystrofie aan, onafhankelijk van hormonale, groeigerelateerde of immunosuppressieve effecten, wat aangeeft dat VBP15 klinisch onderzoek voor DMD verdient en ook andere chronische inflammatoire ziekten ten goede zou komen."
] | 148 | 137 |
2,382 | Wat is filgotinib? | Filgotinib is een orale selectieve Janus kinase-remmer. Het is getest bij patiënten met reumatoïde artritis en de ziekte van Crohn, en is aangetoond veilig en effectief te zijn. | [
"Filgotinib (GLPG0634/GS-6034), een orale selectieve JAK1-remmer, is effectief als monotherapie bij patiënten met actieve reumatoïde artritis: resultaten van een gerandomiseerde, dosis-vindende studie (DARWIN 2).",
"Om de werkzaamheid en veiligheid van verschillende doses filgotinib, een orale Janus kinase 1-remmer, als monotherapie te evalueren bij patiënten met actieve reumatoïde artritis (RA) en een eerdere onvoldoende respons op methotrexaat (MTX).",
"Gedurende 24 weken was filgotinib als monotherapie effectief in de behandeling van de tekenen en symptomen van actieve RA, met een snelle aanvang van werking.",
"Filgotinib (GLPG0634, GS-6034) is een eenmaal daags oraal toegediende, selectieve Janus kinase 1 (JAK1)-remmer. De FITZROY-studie onderzocht de werkzaamheid en veiligheid van filgotinib voor de behandeling van matige tot ernstige ziekte van Crohn.",
"In de intention-to-treat populatie bereikten 60 (47%) van de 128 patiënten die met filgotinib 200 mg werden behandeld klinische remissie na 10 weken versus tien (23%) van de 44 patiënten die placebo kregen (verschil 24 procentpunten [95% BI 9-39], p=0,0077). In een gecombineerde analyse van alle perioden van filgotinib- en placebo-expositie over 20 weken werden ernstige behandelingsgerelateerde bijwerkingen gerapporteerd bij 14 (9%) van de 152 patiënten behandeld met filgotinib en drie (4%) van de 67 patiënten behandeld met placebo.",
"Filgotinib induceerde klinische remissie bij significant meer patiënten met actieve ziekte van Crohn vergeleken met placebo, en had een acceptabel veiligheidsprofiel."
] | 232 | 239 |
2,383 | Wat is Q-nexus? | Q-nexus is een uitgebreide en efficiënte analysepipeline ontworpen voor ChIP-nexus. | [
"Q-nexus: een uitgebreide en efficiënte analysepipeline ontworpen voor ChIP-nexus."
] | 22 | 20 |
2,384 | Wat is het werkingsmechanisme van Tisagenlecleucel? | Tisagenlecleucel is een CD19-gerichte chimerische antigeenreceptor T-cel (CART19) product dat de T-cellen van een patiënt herprogrammeert met een transgen dat codeert voor een chimerische antigeenreceptor om CD19-expressieve cellen te identificeren en te elimineren. Het is goedgekeurd voor kinderen en jongvolwassenen met terugkerende of refractaire B-cel acute lymfoblastaire leukemie. | [
"Een deskundigenpanel heeft goedkeuring aanbevolen voor Novartis' experimentele chimerische antigeen T-celtherapie, tisagenlecleucel, voor kinderen en jongvolwassenen met terugkerende of refractaire B-cel acute lymfoblastaire leukemie.",
"Tisagenlecleucel (CTL019) is een experimentele immunotherapie waarbij de T-cellen van een patiënt worden herprogrammeerd met een transgen dat codeert voor een chimerische antigeenreceptor om CD19-expressieve cellen te identificeren en te elimineren.",
"De eerste chimerische antigeenreceptor T-celtherapie, tisagenlecleucel, kreeg FDA-goedkeuring voor de behandeling van patiënten tot 25 jaar met B-cel precursor acute lymfoblastaire leukemie die niet reageerden op standaardtherapie of minstens twee keer waren teruggevallen.",
"Chimerische antigeenreceptor (CAR)-gemodificeerde T-cellen worden uitgebreid bestudeerd voor kankerimmunotherapie. CD19-specifieke CAR-T-cellen, tisagenlecleucel, zijn recent goedgekeurd voor klinische toepassing.",
"Het meest indrukwekkend is dat CD19-gerichte chimerische antigeenreceptor T-cellen (CART19) indrukwekkende responsen hebben veroorzaakt bij patiënten met B-cel leukemie en lymfoom. CTL019, of KYMRIAH™ (tisagenlecleucel), een CD19 CAR T-celproduct ontwikkeld door Novartis en de Universiteit van Pennsylvania, werd recent goedgekeurd voor klinisch gebruik door de Food and Drug Administration, wat een mijlpaal vertegenwoordigt in de toepassing van adoptieve T-celtherapieën.",
"Inderdaad, op 30 augustus 2017 werd de door de Universiteit van Pennsylvania ontworpen CD19-gerichte CART (CART-19) celtherapie (CTL019, tisagenlecleucel-t, Kymriah - Novartis) de eerste CART-therapie die werd goedgekeurd door de Food and Drug Administration (FDA) voor acute lymfoblastaire leukemie.",
"Tisagenlecleucel (CTL019) is een experimentele immunotherapie waarbij de T-cellen van een patiënt worden herprogrammeerd met een transgen dat codeert voor een chimerische antigeenreceptor om CD19-expressieve cellen te identificeren en te elimineren.",
"CD19-specifieke CAR-T-cellen, tisagenlecleucel, zijn recent goedgekeurd voor klinische toepassing.",
"CTL019, of KYMRIAH™ (tisagenlecleucel), een CD19 CAR T-celproduct ontwikkeld door Novartis en de Universiteit van Pennsylvania, werd recent goedgekeurd voor klinisch gebruik door de Food and Drug Administration, wat een mijlpaal vertegenwoordigt in de toepassing van adoptieve T-celtherapieën.",
"Een deskundigenpanel heeft goedkeuring aanbevolen voor Novartis' experimentele chimerische antigeen T-celtherapie, tisagenlecleucel, voor kinderen en jongvolwassenen met terugkerende of refractaire B-cel acute lymfoblastaire leukemie.",
"Een deskundigenpanel heeft goedkeuring aanbevolen voor Novartis' experimentele chimerische antigeen T-celtherapie tisagenlecleucel voor kinderen en jongvolwassenen met terugkerende of refractaire B-cel acute lymfoblastaire leukemie. De therapie zou de eerste in zijn soort zijn die wordt goedgekeurd voor kanker en heeft het potentieel om de standaardzorg voor gevorderde bloedkankers te transformeren.",
"Nieuwe immunotherapeutische middelen die gericht zijn op de tumor-micro-omgeving revolutioneren de kankertherapie. Chimerische antigeenreceptor (CAR) gemodificeerde T-cellen worden uitgebreid bestudeerd voor kankerimmunotherapie. CD19-specifieke CAR-T-cellen, tisagenlecleucel, zijn recent goedgekeurd voor klinische toepassing. Lopende klinische onderzoeken testen CAR-ontwerpen gericht op nieuwe doelen betrokken bij hematologische en solide maligniteiten. Naast onderzoeken met enkelvoudige doelwit CAR-T-cellen worden gelijktijdige en opeenvolgende CAR-T-cellen bestudeerd voor klinische toepassingen. Multi-target CAR-gemodificeerde T-cellen komen ook in klinische onderzoeken. T-celreceptor-gemodificeerde, CAR-T- en universele CAR-T-cellen vertegenwoordigen nieuwe grenzen in de ontwikkeling van CAR-T-cellen. In deze studie analyseerden we de kenmerken van CAR-constructen en geregistreerde klinische onderzoeken van CAR-T-cellen in China en gaven we een snel overzicht van het landschap van CAR-T-studies in China.",
"In deze review bespreken we de meest recente ontwikkelingen in genbewerkingstechnologie en hun toepassing op adoptieve T-cel immunotherapie. Gemodificeerde T-celtherapieën gericht op kankerantigenen hebben significante werkzaamheid aangetoond in specifieke patiëntengroepen. Het meest indrukwekkend zijn CD19-gerichte chimerische antigeenreceptor T-cellen (CART19) die indrukwekkende responsen hebben veroorzaakt bij patiënten met B-cel leukemie en lymfoom. CTL019 of Kymriah (tisagenlecleucel), een CD19 CAR T-celproduct ontwikkeld door Novartis en de Universiteit van Pennsylvania, werd recent goedgekeurd voor klinisch gebruik door de Food and Drug Administration, wat een mijlpaal vertegenwoordigt in de toepassing van adoptieve T-celtherapieën. Nu CART19 routinematig klinisch wordt toegepast, is het verbeteren van de werkzaamheid van dit veelbelovende platform de volgende stap voor bredere toepassing. Nieuwe genbewerkingstechnologieën zoals CRISPR-Cas9 maken het gemakkelijk om specifieke genen binnen het genoom te bewerken, wat een krachtig platform genereert om de activiteit van gemodificeerde T-cellen verder te optimaliseren.",
"Autologe patiënt-specifieke chimerische antigeenreceptor T-cel (CAR-T) therapie is uitgegroeid tot een krachtige en potentieel curatieve therapie voor kanker, vooral voor CD19-positieve hematologische maligniteiten. Inderdaad, op 30 augustus 2017 werd de door de Universiteit van Pennsylvania ontworpen CD19-gerichte CART (CART19) celtherapie CTL019 (tisagenlecleucel-t, Kymriah, Novartis) de eerste CAR-T-therapie die werd goedgekeurd door de Food and Drug Administration (FDA) voor acute lymfoblastaire leukemie. De ontwikkeling van CAR-T-technologie en de bredere toepassing ervan wordt echter deels beperkt door het patiënt-specifieke karakter van zo'n platform en door de tijd die nodig is voor productie. De efficiënte generatie van universele allogene CAR-T-cellen zou deze beperkingen overwinnen en een grote vooruitgang in het veld betekenen. Er moeten echter verschillende obstakels worden overwonnen bij de generatie van universele CAR-T-cellen, namelijk het risico op afstoting van CAR-T en het risico op graft-versus-hostziekte veroorzaakt door de allogene CAR-T. In deze review bespreken we de verschillende strategieën die worden gebruikt om universele CAR-T te genereren en geven we ons perspectief op de succesvolle ontwikkeling van een echt kant-en-klaar CAR-T-product."
] | 889 | 816 |
2,385 | Wat is LHON, ook bekend als het Lebers syndroom? | Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) is een veelvoorkomende erfelijke mitochondriale aandoening die wordt gekenmerkt door degeneratie van de oogzenuwen, wat leidt tot verlies van het gezichtsvermogen. | [
"Mitochondriale ziekten zijn een klinisch heterogene groep aandoeningen. Ze kunnen worden veroorzaakt door mutaties in het nucleaire DNA of mitochondriaal DNA (mtDNA). Sommige treffen een enkel orgaan, maar veel betreffen meerdere orgaansystemen en presenteren zich vaak met prominente neurologische en myopathische kenmerken. Het oog wordt vaak aangetast, samen met spieren en hersenen, maar multisysteemziekte is gebruikelijk. Oftalmologische manifestaties omvatten staar, retinopathie, optische atrofie, corticaal gezichtsverlies, ptosis en oftalmoplegie. Kearns-Sayre-syndroom (KSS), mitochondriale encefalopathie, lactaatacidose beroerte (MELAS), myoclonische epilepsie en ragged red fiber myopathie (MERRF) en Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) zijn bekende klinische entiteiten die secundair zijn aan mtDNA-afwijkingen, welke oftalmologische manifestaties hebben.",
"Genetische counseling bij Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON).",
"Om het belang van mitochondriaal DNA (mtDNA) analyse aan te tonen bij de diagnose van Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) en de moeilijkheden in de genetische counseling van de ziekte te illustreren.",
"Om recente vooruitgang in potentiële behandelingen voor Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) te bespreken, een typisch visueel verwoestende erfelijke optische neuropathie veroorzaakt door mutaties in het mitochondriale genoom.",
"Kearns-Sayre-syndroom (KSS), mitochondriale encefalopathie, lactaatacidose beroerte (MELAS), myoclonische epilepsie en ragged red fiber myopathie (MERRF) en Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) zijn bekende klinische entiteiten die secundair zijn aan mtDNA-afwijkingen, welke oftalmologische manifestaties hebben.",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) is een maternale mitochondriale aandoening met bilateraal verlies van centraal zicht, voornamelijk veroorzaakt door mutaties in mitochondriaal DNA (mtDNA) in subeenheden van complex I in de ademhalingsketen (primaire LHON-mutaties), terwijl andere mtDNA-mutaties ook oorzakelijk kunnen zijn.",
"De fenotypische kenmerken van het syndroom lijken op die gevonden in andere mitochondriale (mt)DNA-gemedieerde aandoeningen zoals Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) of maternale diabetes en doofheid (MIDD).",
"ACHTERGROND Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) is een maternale erfelijke optische neuropathie veroorzaakt door mutaties in mitochondriaal DNA (mtDNA).",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) is een mitochondriale genetische ziekte die wordt gekenmerkt door bilateraal acuut of subacuut progressief centraal gezichtsverlies.",
"Leigh-syndroom (LS) is een fatale neurodegeneratieve aandoening bij zuigelingen, en Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) veroorzaakt blindheid bij jongvolwassenen.",
"ACHTERGROND Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) die samen voorkomt met een multiple sclerose-achtige ziekte (LHON-MS) wordt voorgesteld als een aparte ziekte-entiteit genaamd Harding's ziekte.",
"Om de prevalentie en het spectrum van mitochondriale ND4-mutaties te onderzoeken bij personen met Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Drie mitochondriale mutaties zijn verantwoordelijk voor 95% van Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) in",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) en mitochondriale encefalopathie, myopathie",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) is een maternale overgedragen ziekte.",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) is een mitochondriale aandoening die wordt gekenmerkt door bilaterale pijnloze optische atrofie en blindheid.",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON) is een erfelijke vorm van bilaterale optische atrofie die leidt tot verlies van het centrale gezichtsvermogen.",
"3 Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON),",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"LHON (Leber's erfelijke optische neuropathie)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)",
"Leber's erfelijke optische neuropathie (LHON)"
] | 531 | 517 |
2,386 | Wat is ReliableGenome? | De toenemende adoptie van klinische whole-genome resequencing (WGS) vraagt om zeer nauwkeurige en reproduceerbare variant calling (VC) methoden. De waargenomen discordantie tussen state-of-the-art VC-pijplijnen geeft echter aan dat de huidige praktijk nog steeds lijdt onder niet te verwaarlozen aantallen vals-positieve en vals-negatieve SNV- en INDEL-aanroepen, die verrijkt bleken te zijn onder discordante aanroepen maar ook in genomische regio’s met lage sequentiecomplexiteit. ReliableGenome is een methode om genomen te verdelen in regio’s met hoge en lage concordantie met betrekking tot een set van onderzochte VC-pijplijnen. Het combineert aanroepensets die zijn afgeleid van meerdere pijplijnen uit willekeurige aantallen datasets en interpoleert de verwachte concordantie voor genomische regio’s zonder data. | [
"ReliableGenome: annotatie van genomische regio’s met hoge/lage variant calling concordantie.",
"De toenemende adoptie van klinische whole-genome resequencing (WGS) vraagt om zeer nauwkeurige en reproduceerbare variant calling (VC) methoden. De waargenomen discordantie tussen state-of-the-art VC-pijplijnen geeft echter aan dat de huidige praktijk nog steeds lijdt onder niet te verwaarlozen aantallen vals-positieve en vals-negatieve SNV- en INDEL-aanroepen, die verrijkt bleken te zijn onder discordante aanroepen maar ook in genomische regio’s met lage sequentiecomplexiteit.RESULTATEN: Hier beschrijven we onze methode ReliableGenome (RG) voor het verdelen van genomen in regio’s met hoge en lage concordantie met betrekking tot een set van onderzochte VC-pijplijnen. Onze methode combineert aanroepensets die zijn afgeleid van meerdere pijplijnen uit willekeurige aantallen datasets en interpoleert de verwachte concordantie voor genomische regio’s zonder data. Door RG toe te passen op 219 diepe menselijke WGS-datasets, tonen we aan dat VC-concordantie voornamelijk afhangt van de genomische context in plaats van de daadwerkelijke sequencingdata, wat zich uit in een hoge herhaling van regio’s die wel of niet betrouwbaar kunnen worden getypeerd door een enkele methode. Dit maakt de toepassing van vooraf berekende regio’s mogelijk op andere data die zijn gemaakt met vergelijkbare sequencingtechnologie en software.",
"Hier beschrijven we onze methode ReliableGenome (RG) voor het verdelen van genomen in regio’s met hoge en lage concordantie met betrekking tot een set van onderzochte VC-pijplijnen.",
"De waargenomen discordantie tussen state-of-the-art VC-pijplijnen geeft echter aan dat de huidige praktijk nog steeds lijdt onder niet te verwaarlozen aantallen vals-positieve en vals-negatieve SNV- en INDEL-aanroepen, die verrijkt bleken te zijn onder discordante aanroepen maar ook in genomische regio’s met lage sequentiecomplexiteit.<br><b>RESULTATEN</b>: Hier beschrijven we onze methode ReliableGenome (RG) voor het verdelen van genomen in regio’s met hoge en lage concordantie met betrekking tot een set van onderzochte VC-pijplijnen.",
"Hier beschrijven we onze methode ReliableGenome (RG) voor het verdelen van genomen in regio’s met hoge en lage concordantie met betrekking tot een set van onderzochte VC-pijplijnen.",
"RESULTATEN Hier beschrijven we onze methode ReliableGenome (RG) voor het verdelen van genomen in regio’s met hoge en lage concordantie met betrekking tot een set van onderzochte VC-pijplijnen.",
"reliablegenome annotatie van genomische regio’s met hoge lage variant calling concordantie",
"de toenemende adoptie van klinische whole genome resequencing wgs vraagt om zeer nauwkeurige en reproduceerbare variant calling vc methoden de waargenomen discordantie tussen state of the art vc pijplijnen geeft echter aan dat de huidige praktijk nog steeds lijdt onder niet te verwaarlozen aantallen vals-positieve en vals-negatieve snv en indel aanroepen die verrijkt bleken te zijn onder discordante aanroepen maar ook in genomische regio’s met lage sequentiecomplexiteit hier beschrijven we onze methode reliablegenome rg voor het verdelen van genomen in hoge en lage concordantie regio’s met betrekking tot een set van onderzochte vc pijplijnen onze methode combineert aanroepensets afgeleid van meerdere pijplijnen uit willekeurige aantallen datasets en interpoleert verwachte concordantie voor genomische regio’s zonder data door rg toe te passen op 219 diepe menselijke wgs datasets tonen we aan dat vc concordantie voornamelijk afhangt van genomische context in plaats van de daadwerkelijke sequencingdata wat zich uit in hoge herhaling van regio’s die wel of niet betrouwbaar kunnen worden getypeerd door een enkele methode dit maakt de toepassing van vooraf berekende regio’s mogelijk op andere data gemaakt met vergelijkbare sequencingtechnologie en software rg presteert beter dan vergelijkbare pogingen in het voorspellen van vc concordantie en vals-positieve aanroepen in lage concordantie regio’s wat het nut onderstreept voor variant filtering annotatie en prioritering rg maakt het mogelijk om resource-intensieve algoritmen zoals consensus calling methoden te richten op het kleinere discordante deel van het genoom (20-30%) wat kan resulteren in een verhoogde algehele nauwkeurigheid tegen redelijke kosten onze methode en analyse van discordante aanroepen kunnen verder nuttig zijn voor ontwikkeling benchmarking en optimalisatie van vc algoritmen en voor de relatieve vergelijking van aanroepensets tussen verschillende studies pijplijnen rg is geïmplementeerd in java broncode en binaries zijn vrij beschikbaar voor niet-commercieel gebruik op https github com popitsch wtchg rg contact niko wtchg ox ac uk aanvullende informatie aanvullende data zijn beschikbaar op bioinformatics online."
] | 739 | 763 |
2,387 | Noem polyubiquitine-bindende eiwitten die betrokken zijn bij NF-kappaB-signaaltransductie. | NEMO
A20
ABIN-1
ABIN-2
optineurine
p62 | [
"De ontdekking dat NEMO een polyubiquitine-bindend eiwit is en dat het IKK-complex wordt gemoduleerd door andere proteïnekinasen die zelf worden gereguleerd door polyubiquitineketens, heeft een dieper moleculair begrip verschaft van de niet-afbrekende rollen van ubiquitylering",
"Essentiële rollen van K63-gekoppelde polyubiquitine-bindende eiwitten TAB2 en TAB3 in B-celactivatie via MAPK's.",
"Nieuwe polyubiquitine-bindende eiwitten AWP1, CALCOCO2, N4BP1, RIO3, TEX27, TTC3, UBFD1 en ZNF313 werden geïdentificeerd met deze benadering, terwijl bekende NF-kappaB-regulatoren zoals NEMO, A20, ABIN-1, ABIN-2, optineurine en p62 ook werden geïdentificeerd"
] | 90 | 84 |
2,388 | Wat zijn de bijwerkingen van prednison bij DMD-patiënten? | Bijwerkingen van prednison bij DMD-patiënten zijn onder andere een verminderde groeisnelheid en toename van het lichaamsgewicht. | [
"Bijwerkingen omvatten een afname van de groeisnelheid bij de met prednison behandelde patiënten en overmatige gewichtstoename bij één controlepatiënt en drie behandelde patiënten."
] | 47 | 45 |
2,389 | Wat is de specificiteit van de deubiquitinase USP25? | Ubiquitin Specifieke Protease 25 (USP25), een lid van de deubiquitinase familie, is betrokken bij verschillende ziekte-gerelateerde signaalroutes, waaronder myogenese, immuniteit en eiwitafbraak. Het katalyseert specifiek de hydrolyse van de K48-gekoppelde en K63-gekoppelde polyubiquitineketens. | [
"Hier tonen we aan dat het tandem UIM-gebied bindt aan Lys48",
"Bovendien toonde gedetailleerde analyse aan dat USP25 lysine 48- en lysine 63-gekoppelde polyubiquitineketens in vitro en in vivo spleet, en dat zijn deubiquitinerende enzymactiviteit (DUB) afhankelijk was van een cysteïne-residu (Cys178) en een histidine-residu (His607)",
"Ubiquitin Specifieke Protease 25 (USP25), een lid van de deubiquitinase familie, is betrokken bij verschillende ziekte-gerelateerde signaalroutes, waaronder myogenese, immuniteit en eiwitafbraak. Het katalyseert specifiek de hydrolyse van de K48-gekoppelde en K63-gekoppelde polyubiquitineketens."
] | 124 | 116 |
2,390 | Is functieverlies een van de kardinale tekenen van ontsteking? | Functio Laesa, ook bekend als functieverlies, wordt beschouwd als het 5e kardinale teken van ontsteking. | [
"Het concept van de vier kardinale tekenen van acute ontsteking komt uit de oudheid als rubor et tumor cum calore et dolore (roodheid en zwelling met warmte en pijn), later uitgebreid met functio laesa (functieverlies).",
"Al 2000 jaar geleden herkende de Romeinse encyclopedist Aulus Cornelius Celsus vier kardinale tekenen van deze reactie - roodheid, warmte, zwelling en pijn; een vijfde teken is functieverlies.[...",
"Het was Galenus die de functiestoornis (functio laesa) toevoegde als het vijfde kardinale teken van ontsteking aan de vier bekende kardinale tekenen van Celsus (rubor, calor, tumor, dolor).",
"Tumor, calor, rubor en dolor beschrijven vier kardinale tekenen van ontsteking. Het vijfde - functio laesa, of functieverlies - werd gepromoot door Rudolf Virchow, die in de 19e eeuw ook een ingewikkeld verband tussen ontsteking en kanker opmerkte."
] | 157 | 148 |
2,391 | Volgt de associatie van PARP1 en CTCF een circadiaans ritme? | Synchronisatie van het circadiaanse ritme door serumshock induceert oscillaties in PARP1-CTCF-interacties, wat gepaard gaat met oscillerende rekrutering van circadiane loci naar de lamina, gevolgd door de verwerving van repressieve H3K9me2-markeringen en transcriptie-attenuatie. Bovendien werkt het uitputten van H3K9me2/3, remming van PARP-activiteit door olaparib, of neerwaartse regulatie van PARP1- of CTCF-expressie zowel de rekrutering naar de envelop als de circadiane transcriptie tegen. PARP1- en CTCF-gereguleerde contacten tussen circadiane loci en de repressieve chromatine-omgeving bij de lamina bemiddelen daarom circadiane transcriptieplasticiteit. | [
"Hier hebben we een interchromosomaal netwerk ontdekt dat actieve loci, verrijkt met circadiane genen, verbindt met gereprimeerde lamina-geassocieerde domeinen (LADs).",
"Synchronisatie van het circadiaanse ritme door serumshock induceert oscillaties in PARP1-CTCF-interacties, wat gepaard gaat met oscillerende rekrutering van circadiane loci naar de lamina, gevolgd door de verwerving van repressieve H3K9me2-markeringen en transcriptie-attenuatie.",
"PARP1- en CTCF-gereguleerde contacten tussen circadiane loci en de repressieve chromatine-omgeving bij de lamina bemiddelen daarom circadiane transcriptieplasticiteit.",
"Synchronisatie van het circadiaanse ritme door serumshock induceert oscillaties in PARP1-CTCF-interacties, wat gepaard gaat met oscillerende rekrutering van circadiane loci naar de lamina, gevolgd door de verwerving van repressieve H3K9me2-markeringen en transcriptie-attenuatie. Bovendien werkt het uitputten van H3K9me2/3, remming van PARP-activiteit door olaparib, of neerwaartse regulatie van PARP1- of CTCF-expressie zowel de rekrutering naar de envelop als de circadiane transcriptie tegen. PARP1- en CTCF-gereguleerde contacten tussen circadiane loci en de repressieve chromatine-omgeving bij de lamina bemiddelen daarom circadiane transcriptieplasticiteit.",
"Transcriptioneel actieve en inactieve chromatine-domeinen neigen ertoe zich te scheiden in aparte subnucleaire compartimenten om stabiele expressiepatronen te behouden, maar hier hebben we een interchromosomaal netwerk ontdekt dat actieve loci, verrijkt met circadiane genen, verbindt met gereprimeerde lamina-geassocieerde domeinen (LADs). Het interactoom wordt gereguleerd door PARP1 en zijn cofactor CTCF; zij mediëren niet alleen chromatinevezelinteracties, maar bevorderen ook de rekrutering van circadiane genen naar de lamina. Synchronisatie van het circadiaanse ritme door serumshock induceert oscillaties in PARP1-CTCF-interacties, wat gepaard gaat met oscillerende rekrutering van circadiane loci naar de lamina, gevolgd door de verwerving van repressieve H3K9me2-markeringen en transcriptie-attenuatie. Bovendien werkt het uitputten van H3K9me2/3, remming van PARP-activiteit door olaparib, of neerwaartse regulatie van PARP1- of CTCF-expressie zowel de rekrutering naar de envelop als de circadiane transcriptie tegen. PARP1- en CTCF-gereguleerde contacten tussen circadiane loci en de repressieve chromatine-omgeving bij de lamina bemiddelen daarom circadiane transcriptieplasticiteit.",
"Synchronisatie van het circadiaanse ritme door serumshock induceert oscillaties in PARP1-CTCF-interacties, wat gepaard gaat met oscillerende rekrutering van circadiane loci naar de lamina, gevolgd door de verwerving van repressieve H3K9me2-markeringen en transcriptie-attenuatie."
] | 432 | 408 |
2,392 | Wat induceert de expressie van Arabidopsis ROF1? | De hoeveelheid ROF1 nam meerdere keren toe onder stressomstandigheden zoals verwonding, hitte-stress of blootstelling aan verhoogde NaCl-niveaus. | [
"Endogene ROF1 bleek zich op te hopen als reactie op hoge zoutbehandeling in jonge bladeren van Arabidopsis thaliana evenals in zaailingen die gekiemd waren op medium met hoge zoutconcentraties (0,15 en 0,2 M NaCl) op zowel mRNA- als eiwitniveau.",
"Arabidopsis ROF1 (AtFKBP62) is een peptidyl prolyl cis/trans isomerase en een lid van de FKBP (FK506 bindend eiwit) familie. ROF1-expressie wordt geïnduceerd door hitte-stress en is ontwikkelingsgebonden gereguleerd.",
"Blootstelling van planten aan lage niveaus van MDA met behulp van een recent ontwikkeld protocol verhoogde krachtig de expressie van veel genen op een cDNA-microarray met een voorkeur voor diegenen die betrokken zijn bij abiotische/omgevingsstress (bijv. ROF1 en XERO2).",
"Arabidopsis immunophilines ROF1 (AtFKBP62) en ROF2 (AtFKBP65) vertonen weefselspecificiteit, worden geïnduceerd door hitte-stress en binden HSP90.",
"De hoeveelheid ROF1 mRNA nam meerdere keren toe onder stressomstandigheden zoals verwonding of blootstelling aan verhoogde NaCl-niveaus."
] | 158 | 157 |
2,393 | Wat is de voorkeursoriëntatie van CTCF-bindingsplaatsen voor chromatine-lussen? | Chromatine-lussen vormen bij voorkeur tussen CTCF-bindingsplaatsen die in een convergente richting zijn georiënteerd. CTCF-plaatsen bij lusankers komen voornamelijk (>90%) voor in een convergente oriëntatie, waarbij de asymmetrische motieven "naar elkaar toe" gericht zijn. | [
"Recente rapporten hebben gesuggereerd dat CTCF-binding dynamischer is tijdens de ontwikkeling dan eerder werd aangenomen.",
"Daarentegen zijn CTCF-bindingsplaatsen in NPC's grotendeels al aanwezig in pluripotente stamcellen. Slechts een klein aantal CTCF-plaatsen ontstaat de novo in NPC's.",
"Bovendien verstoort siRNA knockdown van Yy1 specifiek de interacties tussen belangrijke NPC-enhancers en hun doelgenen. Door YY1 gemedieerde interacties tussen NPC-regulatoire elementen zijn vaak genest binnen constitutieve lussen die worden verankerd door CTCF.",
"Zoals recentelijk gerapporteerd, suggereren onze gegevens ook dat chromatine-lussen bij voorkeur vormen tussen CTCF-bindingsplaatsen die in een convergente richting zijn georiënteerd.",
"In alle gevallen gingen CTCF- en cohesine-rekrutering verloren en werden chromatine-lussen met distale, convergente CTCF-plaatsen verstoord of gedestabiliseerd.",
"Herinvoeging van CTCF-herkenningssequenties met tegengestelde oriëntatie herstelde de rekrutering van CTCF en cohesine, maar stelde chromatine-lussen niet opnieuw in staat te vormen.",
"Recente studies hebben een correlatie vastgesteld tussen de oriëntatie van CTCF-bindingsplaatsen (CBS's) en chromatine-lussen.",
"CRISPR-inversie van CTCF-plaatsen verandert de genoomtopologie en de functie van enhancer/promoter.",
"CTCF-plaatsen bij lusankers komen voornamelijk (>90%) voor in een convergente oriëntatie, waarbij de asymmetrische motieven \"naar elkaar toe\" gericht zijn.",
"Zoals recentelijk gerapporteerd, suggereren onze gegevens ook dat chromatine-lussen bij voorkeur vormen tussen CTCF-bindingsplaatsen die in een convergente richting zijn georiënteerd.",
"CCCTC-bindingsfactor CTCF is een architecturaal eiwit betrokken bij de driedimensionale (3D) organisatie van chromatine. In deze studie onderzochten we de 3D-genoomcontactprofielen van een groot aantal CTCF-bindingsplaatsen met hoge resolutie 4C-seq. Zoals recentelijk gerapporteerd, suggereren onze gegevens ook dat chromatine-lussen bij voorkeur vormen tussen CTCF-bindingsplaatsen die in een convergente richting zijn georiënteerd. Om dit direct te testen, gebruikten we CRISPR-Cas9-genoomediting om kern-CTCF-bindingsplaatsen in drie loci te verwijderen, inclusief de CTCF-plaats in de SOX2 super-enhancer. In alle gevallen gingen CTCF- en cohesine-rekrutering verloren en werden chromatine-lussen met distale convergente CTCF-plaatsen verstoord of gedestabiliseerd. Herinvoeging van CTCF-herkenningssequenties met tegengestelde oriëntatie herstelde de rekrutering van CTCF en cohesine, maar stelde chromatine-lussen niet opnieuw in staat te vormen. We concluderen dat de polariteit van CTCF-binding een functionele rol speelt in de vorming van hogere-orde chromatinestructuur.",
"We gebruikten recentelijk in situ Hi-C om kilobase-resolutie 3D-kaarten van zoogdiergenomen te creëren. Hier combineren we deze kaarten met nieuwe Hi-C-microscopie en genoomediting-experimenten om de fysieke structuur van chromatinedraden, domeinen en lussen te bestuderen. We vinden dat de waargenomen contactdomeinen niet overeenkomen met de evenwichtstoestand van een gewoon gecondenseerd polymeer. Door Hi-C-gegevens te combineren met nieuwe wiskundige theorema's tonen we aan dat contactdomeinen ook niet overeenkomen met een fractale globule. In plaats daarvan gebruiken we fysieke simulaties om twee modellen van genoomvouwing te bestuderen: in het ene leidt intermonomeer-attractie tijdens polymeercondensatie tot de vorming van een anisotrope spanningsglobule; in het andere werken CCCTC-bindingsfactor CTCF en cohesine samen om ongeknoopte lussen uit te extruderen tijdens de interfase. Beide modellen zijn consistent met de waargenomen contactdomeinen en met de observatie dat contactdomeinen de neiging hebben binnen lussen te vormen. Het extrusiemodel verklaart echter een veel breder scala aan observaties, zoals waarom lussen de neiging hebben niet te overlappen en waarom de CTCF-bindingsmotieven bij paren van lusankers in de convergente oriëntatie liggen. Ten slotte voeren we 13 genoomediting-experimenten uit om het effect van het wijzigen van CTCF-bindingsplaatsen op chromatinevouwing te onderzoeken. De convergentieregel voorspelt correct de beïnvloede lussen in elk geval. Bovendien voorspelt het extrusiemodel nauwkeurig in silico de 3D-kaarten die voortkomen uit elk experiment, uitsluitend op basis van de locatie van CTCF-bindingsplaatsen in het wildtype. Zo tonen we aan dat het mogelijk is om lussen en domeinen te verstoren, te herstellen en te verplaatsen met gerichte mutaties zo klein als een enkele basepaar."
] | 636 | 605 |
2,394 | Verhoogt erythromycine het risico op hypertrofische pylorusstenose? | Ja, blootstelling aan erythromycine na de geboorte wordt geassocieerd met een verhoogd risico op hypertrofische pylorusstenose. De associatie is sterker wanneer de blootstelling plaatsvindt in de eerste 2 levensweken. | [
"Blootstelling aan erythromycine na de geboorte en het risico op infantiele hypertrofische pylorusstenose: een systematische review en meta-analyse.",
"DOEL: Macrolide-antibiotica, met name erythromycine, zijn in verband gebracht met de ontwikkeling van infantiele hypertrofische pylorusstenose (IHPS).",
"Over het algemeen was blootstelling aan erythromycine significant geassocieerd met de ontwikkeling van IHPS [OR 2,45 (1,12-5,35), p = 0,02].",
"Gegevens over blootstelling aan erythromycine in de eerste 14 dagen van het leven werden uit 4 van de 9 studies gehaald en toonden een sterke associatie tussen blootstelling aan erythromycine en de daaropvolgende ontwikkeling van IHPS [OR 12,89 (7,67-2167), p < 0,00001]. CONCLUSIE: Deze studie toont een significante associatie aan tussen blootstelling aan erythromycine na de geboorte en de ontwikkeling van IHPS, die sterker lijkt te zijn wanneer de blootstelling plaatsvindt in de eerste 2 levensweken.",
"ACHTERGROND EN DOELSTELLING: Het gebruik van orale erythromycine bij zuigelingen wordt geassocieerd met infantiele hypertrofische pylorusstenose (IHPS).",
"CONCLUSIES: Inname van orale azithromycine en erythromycine verhoogt het risico voor jonge zuigelingen om IHPS te ontwikkelen.",
"Een associatie tussen erythromycine en IHPS werd ook bevestigd. Blootstelling aan erythromycine in de eerste 14 dagen van het leven had een aOR van 13,3 (95% CI, 6,80-25,9), en tussen 15 en 42 dagen van het leven een aOR van 4,10 (95% CI, 1,69-9,91).",
"Vroege blootstelling aan orale erythromycine bij jonge zuigelingen, vooral in de eerste 2 levensweken, is eerder in verband gebracht met de ontwikkeling van hypertrofische pylorusstenose. Wij rapporteren een geval van een zuigeling die een verkorte kuur van 4 dagen orale erythromycine kreeg voor vermoedelijke Chlamydia-conjunctivitis op dag 5 van het leven en minder dan 2 weken later een pyloromyotomie onderging vanwege pylorusstenose.",
"Gebruik van erythromycine en andere macrolide-antibiotica door moeder en zuigeling als risicofactoren voor infantiele hypertrofische pylorusstenose.",
"Een casusrapport suggereerde dat blootstelling aan erythromycine via moedermelk infantiele hypertrofische pylorusstenose kan veroorzaken.",
"Macrolide-antibiotica, met name erythromycine, zijn in verband gebracht met de ontwikkeling van infantiele hypertrofische pylorusstenose (IHPS).",
"Zuigelingen die systemisch erythromycine kregen voorgeschreven, hadden een verhoogd risico op IHPS, met het hoogste risico in de eerste 2 levensweken (relatief risico = 10,51 voor erythromycine in de eerste 2 weken, 95% CI 4,48, 24,66).",
"Er was een associatie tussen maternale voorschriften voor niet-erythromycine macroliden en infantiele hypertrofische pylorusstenose (aangepaste odds ratio 2,77, 95% betrouwbaarheidsinterval 1,22, 6,30, P = 0,01). <br><b>CONCLUSIE</b>: De veronderstelde associatie tussen erythromycine en infantiele pylorusstenose werd niet waargenomen.",
"Macrolide-antibiotica, met name erythromycine, zijn in verband gebracht met de ontwikkeling van infantiele hypertrofische pylorusstenose (IHPS)."
] | 404 | 427 |
2,395 | Uit hoeveel aminozuren bestaat davunetide? | Davunetide of NAP is een peptide van acht aminozuren. | [
"We hebben de effecten van NAP (davunetide), een peptide van acht aminozuren dat de hyperfosforylering van tau vermindert, beoordeeld bij muizen die wild-type menselijke α-synucleïne overexpressen (Thy1-aSyn muizen), een model dat aspecten van de ziekte van Parkinson nabootst."
] | 47 | 50 |
2,396 | Kan een circRNA worden vertaald in eiwit? | Circ-ZNF609 is geassocieerd met zware polysomen en wordt vertaald in een eiwit op een splicing-afhankelijke en cap-onafhankelijke manier, wat een voorbeeld geeft van een eiwit-coderend circRNA in eukaryoten. Circulaire RNA's (circRNA's) vormen een grote klasse van niet-coderende RNA's (ncRNA's) die recentelijk naar voren zijn gekomen als regulatoren van genexpressie. Echter, of circRNA's functionele eiwitten coderen blijft onduidelijk, hoewel de vertaling van verschillende circRNA's recentelijk is gerapporteerd. | [
"Echter, of circRNA's functionele eiwitten coderen blijft onduidelijk, hoewel de vertaling van verschillende circRNA's recentelijk is gerapporteerd.",
"Circulaire RNA's (circRNA's) zijn lange, niet-coderende RNA's die ontstaan door de niet-canonieke splicing van lineaire pre-mRNA's.",
"Circulaire RNA's (circRNA's) zijn een grote soort niet-coderende RNA's die gekenmerkt worden door hun circulaire vorm, voortkomend uit covalent gesloten continue lussen.",
"Ze staan bekend als microRNA (miRNA) sponsoren, regulatoren van alternatieve splicing, transcriptiefactoren en coderen voor eiwitten.",
"Covalent gesloten lusstructuren verhogen de stabiliteit van dit nieuwe type niet-coderend RNA.",
"Circulaire RNA's (circRNA's) zijn een nieuwe klasse van niet-coderend RNA die een covalent gesloten continue conformatie aanneemt.",
"Circulaire RNA's (circRNA's) vormen een grote klasse van niet-coderende RNA's (ncRNA's) die recentelijk naar voren zijn gekomen als regulatoren van genexpressie.",
"Circulaire RNA's (circRNA's) zijn zeer overvloedige en evolutionair geconserveerde niet-coderende RNA's die worden geproduceerd door circularisatie van specifieke exonen.",
"Circ-ZNF609 is een circulair RNA dat vertaald kan worden en functioneert in myogenese.",
"Circ-ZNF609 is geassocieerd met zware polysomen en wordt vertaald in een eiwit op een splicing-afhankelijke en cap-onafhankelijke manier, wat een voorbeeld geeft van een eiwit-coderend circRNA in eukaryoten.",
"Al met al levert onze studie sterk bewijs voor de vertaling van circRNA's, wat het bestaan onthult van een onontdekte laag van genactiviteit.",
"Bovendien waren de meeste circRNA's niet geassocieerd met vertalende ribosomen, daarom werden circRNA's als niet-coderend beschouwd. Echter, de nieuwste onderzoeksresultaten toonden aan dat sommige circRNA's in vivo eiwitten kunnen genereren, wat het landschap van het transcriptoom en proteoom uitbreidt. Om inzicht te krijgen in het nieuwe gebied van circRNA-vertaling introduceren we een geïntegreerd hulpmiddel dat in staat is circRNA's met eiwit-coderend potentieel te detecteren uit high-throughput sequencing data."
] | 327 | 332 |
2,397 | Wat is het fenomeen van genkussen? | Clustering van genen met vergelijkbare expressiepatronen vormt een fenomeen dat soms "genkussen" wordt genoemd. | [
"Deze positionering kan ook resulteren in de clustering van genen met vergelijkbare expressiepatronen, een fenomeen dat soms \"genkussen\" wordt genoemd.",
"We speculeren dat onze bevindingen inzicht kunnen bieden in andere typen genkussen, waarvan sommige ook cis-werkende DNA-sequenties en trans-werkende eiwitten vereisen.",
"Het opleggen op afstand van nieuwe chromatinestructuren met regulerende impact kan zowel in cis als in trans plaatsvinden, en wordt onderzocht als intrachromosomale verspreiding van teleregulatie en interchromosomaal \"genkussen\".",
"Voorbeelden van twee verschillende allelen die elkaar aanraken werden gevonden in 20-47% van de kernen, afhankelijk van het weefsel. De frequentie van dergelijke \"kussen\"-gebeurtenissen was niet significant verschillend in cellen die een hoog aandeel van de Hox-clusters tot expressie brachten vergeleken met cellen die geen of slechts enkele Hox-genen tot expressie brachten.",
"We vonden dat de HoxB- en HoxC-clusters, die zich bevinden in genrijke regio's, vaker betrokken waren bij genkussen in embryonale kernen.",
"Deze positionering kan ook resulteren in de clustering van genen met vergelijkbare expressiepatronen, een fenomeen dat soms \"genkussen\" wordt genoemd.",
"We speculeren dat onze bevindingen inzicht kunnen bieden in andere typen genkussen, waarvan sommige ook cis-werkende DNA-sequenties en trans-werkende eiwitten vereisen.<br>",
"Genomen zijn ruimtelijk georganiseerd op vele niveaus en de positionering van genen binnen de kern draagt bij aan hun juiste expressie. Deze positionering kan ook resulteren in de clustering van genen met vergelijkbare expressiepatronen, een fenomeen dat soms genkussen wordt genoemd. We hebben gevonden dat gistgenen worden gericht naar de nucleaire periferie via interactie van het nucleaire poriecomplex met kleine cis-werkende DNA-zipcodes in hun promotoren. Onze recente studie toonde aan dat genen met dezelfde zipcodes samenklonteren aan de nucleaire periferie. De zipcodes waren noodzakelijk en voldoende om interchromosomale clustering te induceren. Ten slotte identificeerden we een transcriptiefactor Put3 die bindt aan de GRS I-zipcode. Put3 bindt aan GRS I en is vereist voor zowel GRS I-afhankelijke positionering aan de nucleaire periferie als interchromosomale clustering van GRS I-gerichte genen. We speculeren dat onze bevindingen inzicht kunnen bieden in andere typen genkussen, waarvan sommige ook cis-werkende DNA-sequenties en trans-werkende eiwitten vereisen."
] | 374 | 344 |
2,398 | Wit eiwit is de meest voorkomende oorzaak van erfelijke nieramyloïdose? | De meest voorkomende oorzaak van erfelijke nieramyloïdose is overexpressie van een gemuteerde vorm van het Fibrinogeen A Alfa-eiwit | [
"Fibrinogeen A alfa-keten amyloïdose is een autosomaal dominante ziekte geassocieerd met mutaties in het fibrinogeen A alfa-keten (FGA) gen, en het is de meest voorkomende oorzaak van erfelijke nieramyloïdose in het Verenigd Koninkrijk",
"Erfelijke nieramyloïdose is een autosomaal dominante aandoening met aanzienlijke overlap met andere typen amyloïdose",
"We vermoedden amyloïdose met fibrinogeen A alfa-keten afzettingen, wat de meest frequente oorzaak is van erfelijke amyloïdose in Europa, met een voorkeur voor glomerulaire aantasting.",
"Drie familieleden die overleden aan nieramyloïdose bleken een enkele nucleotidevervanging te delen in het fibrinogeen alfa-keten gen.",
"Een Franse familie met autosomaal dominante erfelijke nieramyloïdose bleek een nieuwe mutatie te hebben in het fibrinogeen A alfa-keten gen.",
"Twee families met erfelijke nieramyloïdose bleken een nieuwe mutatie te hebben in het fibrinogeen A alfa-keten gen.",
"De voornaamste oorzaak van erfelijke nieramyloïdose is een mutatie van de fibrinogeen A alfa-keten (AFib), waarbij de E526V mutatie het meest voorkomt.",
"De ontdekking van deze nieuwe mutatie bevestigt de associatie tussen het fibrinogeen A alfa-keten variant en erfelijke nieramyloïdose en stelt een nieuw biochemisch subtype van amyloïdose vast.",
"Erfelijke nieramyloïdose geassocieerd met een gemuteerde fibrinogeen alfa-keten.",
"Mutaties in de fibrinogeen Aα-keten genen zijn de meest voorkomende oorzaak van erfelijke nieramyloïdose.",
"Gemuteerde fibrinogeen A-alfa-keten geassocieerd met erfelijke nieramyloïdose en perifere neuropathie.",
"Mutaties in het fibrinogeen A alfa-keten gen zijn de meest voorkomende oorzaak van erfelijke nieramyloïdose in het Verenigd Koninkrijk.",
"Inleiding Fibrinogeen A alfa-keten amyloïdose is een autosomaal dominante ziekte geassocieerd met mutaties in het fibrinogeen A alfa-keten (FGA) gen, en het is de meest voorkomende oorzaak van erfelijke nieramyloïdose in het VK.",
"Mutaties in de fibrinogeen Aα-keten genen zijn de meest voorkomende oorzaak van erfelijke nieramyloïdose.",
"Erfelijke amyloïdose met overwegend nierziekte kan worden veroorzaakt door mutaties in het gen dat codeert voor de fibrinogeen Aα-keten (AFib)."
] | 332 | 305 |
2,399 | Wat zijn de bijwerkingen van deflazacort bij DMD-patiënten? | De bijwerkingen die werden waargenomen bij DMD-patiënten na behandeling met deflazacort omvatten groeiachterstand en gewichtstoename, een voller gezicht, bloeddruk, botgezondheid, staar, gastro-intestinale symptomen, gedrag, hypertrichose en de noodzaak van medicamenteuze interventies. | [
"Bijwerkingen waren groeiachterstand en gewichtstoename, een voller gezicht, bloeddruk, botgezondheid, staar, gastro-intestinale symptomen, gedrag, hypertrichose en de noodzaak van medicamenteuze interventies."
] | 64 | 58 |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.