id
int64 0
4.72k
| body
stringlengths 12
227
| answer
stringlengths 2
3.35k
| relevant_passages
listlengths 1
83
| approx_word_count_original
int64 10
3.79k
| approx_word_count_translated
int64 8
2.21k
|
|---|---|---|---|---|---|
900
|
Zijn er receptoren voor schildklierhormonen op het plasmamembraan?
|
Receptoren voor schildklierhormonen zijn aanwezig op het plasmamembraan van cellen; in het bijzonder binden schildklierhormonen aan integrine, een heterodimerisch onderdeel van het plasmamembraan
|
[
"Integrines zijn heterodimerische structurele componenten van het plasmamembraan waarvan de liganden een groot aantal extracellulaire matrix (ECM) eiwitten omvatten.",
"Recentelijk is aangetoond dat integrine αvβ3 een reeks eerder niet gewaardeerde kleine molecuulreceptorplaatsen heeft voor schildklierhormoon en hormoonanalogen, voor dihydrotestosteron, en voor resveratrol, een polyfenol die bepaalde oestrogeenachtige eigenschappen bezit.",
"De activatie van de integrinereceptor door T4 kan een rol spelen in plasmamembraanprocessen die betrokken zijn bij het mannelijke voortplantingssysteem.",
"Snelle signalering via deze bindingsplaats op het plasmamembraan lijkt verantwoordelijk te zijn voor veel niet-genomische effecten van schildklierhormonen, onafhankelijk van de klassieke nucleaire receptoren."
] | 129
| 119
|
901
|
Welke aandoening wordt beoordeeld volgens de Palmini-classificatie?
|
Het Palmini-classificatiesysteem wordt gebruikt voor de classificatie van focale corticale dysplasie.
|
[
"Deze studie biedt ook een gelegenheid om de voorspellende waarde van de ILAE- en Palmini et al.-classificatieschema's te vergelijken met betrekking tot type I focale corticale dysplasieën.",
"Van de 91 patiënten waren er 50 met ILAE focale corticale dysplasie type Ib, 41 met ILAE focale corticale dysplasie type Ic, 63 met Palmini et al focale corticale dysplasie type IA, en 28 met Palmini et al focale corticale dysplasie type IB.",
"Een ruwe analyse toonde geen significant verschil tussen patiënten met subtypen van ILAE focale corticale dysplasie type I of Palmini et al focale corticale dysplasie type I wat betreft postoperatief resultaat volgens de Engel- en ILAE-scoresystemen op aanvalsequentie. Onze bevindingen toonden geen significant verschil in chirurgisch resultaat met betrekking tot aanvalsequentie voor de histologische subtypen van ILAE focale corticale dysplasie type I (Ib vs Ic) of Palmini et al focale corticale dysplasie type I (IA vs IB).",
"MCD werden geclassificeerd volgens de bestaande classificatieschema's (Barkovich et al., 2012. Brain. 135, 1348-1369; Palmini et al., 2004. Neurology. 62, S2-S8) en de ILAE-classificatie voor FCD die recentelijk werd voorgesteld door Blümcke in 2011.",
"BESPREKING: Deze korte review geeft een overzicht van de kwesties die de verschillende historische benaderingen van FCD-classificatie verklaren en beschrijvingen van grove pathologische bevindingen geassocieerd met FCD, en een overzicht van twee recentelijk ontwikkelde en veelgebruikte schema's, de Palmini et al. (Neurology 62: S2-8, 2004) en de International League Against Epilepsy (ILAE) classificaties Blumcke et al. Epilepsia 52: 158-174, 2011.",
"In tegenstelling tot de eerdere FCD-classificatie van Palmini, die alleen histologische kenmerken in overweging nam, baseert de nieuwe ILAE-classificatie zich ook op bevindingen van magnetische resonantie beeldvorming (MRI) en veronderstelde pathogenese.",
"De frequenties van hoge-frequentie-oscillaties bij patiënten met pathologisch bevestigde focale corticale dysplasie van Palmini type 1a en b werden vergeleken met die van type 2a en b.",
"Tuberous sclerosis complex (TSC) en ernstige corticale dysplasie (CD), of CD type II volgens Palmini-classificatie, vertonen histopathologische overeenkomsten, met name de aanwezigheid van cytomegalische neuronen en balloncellen.",
"Deze studie biedt ook een gelegenheid om de voorspellende waarde van de ILAE- en Palmini et al.-classificatieschema's te vergelijken met betrekking tot type I focale corticale dysplasieën.",
"Tien van de 12 patiënten (83%) bij wie adequaat weefsel werd verwijderd naast de meningioangiomatose toonden bewijs van focale corticale dysplasie, waarvan 6 (60%) geclassificeerd als Palmini type IA, en 4 patiënten (40%) geclassificeerd als Palmini type IIA.",
"Van de 91 patiënten waren er 50 met ILAE focale corticale dysplasie type Ib, 41 met ILAE focale corticale dysplasie type Ic, 63 met Palmini et al focale corticale dysplasie type IA, en 28 met Palmini et al focale corticale dysplasie type IB.",
"Onze bevindingen toonden geen significant verschil in chirurgisch resultaat met betrekking tot aanvalsequentie voor de histologische subtypen van ILAE focale corticale dysplasie type I (Ib vs Ic) of Palmini et al focale corticale dysplasie type I (IA vs IB).",
"Een ruwe analyse toonde geen significant verschil tussen patiënten met subtypen van ILAE focale corticale dysplasie type I of Palmini et al focale corticale dysplasie type I wat betreft postoperatief resultaat volgens de Engel- en ILAE-scoresystemen op aanvalsequentie.",
"Sinds begin 2000 is de definitie van FCD geleidelijk breder geïnterpreteerd dan het geval beschreven door Taylor et al., zoals weergegeven in Palmini's classificatie (2004) of de nieuwste classificatie (2011) voorgesteld door de Neuropathologie Task Force van de International League Against Epilepsy (ILAE).",
"De classificatie van Palmini, voorgesteld in 2004, wordt nu veel gebruikt om FCD te categoriseren.",
"Volgens het classificatiesysteem van Palmini werden deze laesies gecategoriseerd als focale corticale dysplasie (FCD) type II.",
"In tegenstelling tot de eerdere FCD-classificatie van Palmini, die alleen histologische kenmerken in overweging nam, baseert de nieuwe ILAE-classificatie zich ook op bevindingen van magnetische resonantie beeldvorming (MRI) en veronderstelde pathogenese.",
"Volgens het classificatiesysteem van Palmini werden deze laesies gecategoriseerd als focale corticale dysplasie (FCD) type II.",
"Volgens het classificatiesysteem van Palmini werden de volgende pathologische subgroepen geïdentificeerd: FCD type IA (3/38), FCD type IB (20/38), FCD type IIA (5/38) en FCD type IIB (5/38).",
"Bovendien toonden ernstige pathologische kenmerken (Palmini-classificatie, FCD type II) (p = 0,025) een significante correlatie met een beter chirurgisch resultaat.",
"Tuberous sclerosis complex (TSC) en ernstige corticale dysplasie (CD), of CD type II volgens Palmini-classificatie, vertonen histopathologische overeenkomsten, met name de aanwezigheid van cytomegalische neuronen en balloncellen.",
"In detail, volgens Palmini's classificatie werden milde misvormingen van de corticale ontwikkeling (mMCD's) vastgesteld bij drie patiënten, focale corticale dysplasie (FCD) type Ia bij drie patiënten, en FCD type Ib bij vijf patiënten.",
"Deze resultaten toonden aanzienlijke verbetering vergeleken met een eerdere studie die de Palmini FCD-classificatie van 2004 evalueerde.",
"In tegenstelling tot de eerdere FCD-classificatie van Palmini, die alleen histologische kenmerken in overweging nam, baseert de nieuwe ILAE-classificatie zich ook op bevindingen van magnetische resonantie beeldvorming (MRI) en veronderstelde pathogenese.",
"De frequenties van hoge-frequentie-oscillaties bij patiënten met pathologisch bevestigde focale corticale dysplasie van Palmini type 1a en b werden vergeleken met die van type 2a en b.",
"Tien van de 12 patiënten (83%) bij wie adequaat weefsel werd verwijderd naast de meningioangiomatose toonden bewijs van focale corticale dysplasie, waarvan 6 (60%) geclassificeerd als Palmini type IA, en 4 patiënten (40%) geclassificeerd als Palmini type IIA.",
"Talrijke classificaties van de complexe structurele afwijkingen van focale corticale dysplasie zijn voorgesteld - van Taylor et al. in 1971 tot de laatste wijziging van de Palmini-classificatie door Blumcke in 2011.",
"Tuberous sclerosis complex (TSC) en ernstige corticale dysplasie (CD), of CD type II volgens Palmini-classificatie, vertonen histopathologische overeenkomsten, met name de aanwezigheid van cytomegalische neuronen en balloncellen.",
"van 1971 tot de laatste wijziging van de Palmini-classificatie door Blumcke in 2011. Over het algemeen worden drie typen corticale dysplasie herkend. Type I focale corticale dysplasie met milde symptomatische expressie en late aanvang, wordt vaker gezien bij volwassenen, met veranderingen aanwezig in de temporale kwab. Klinische symptomen zijn ernstiger bij type II van corticale dysplasie, meestal gezien bij kinderen.",
"In tegenstelling tot de eerdere FCD-classificatie van Palmini, die alleen histologische kenmerken in overweging nam, baseert de nieuwe ILAE-classificatie zich ook op bevindingen van magnetische resonantie beeldvorming (MRI) en veronderstelde pathogenese.",
"Sinds begin 2000 is de definitie van FCD geleidelijk breder geïnterpreteerd dan het geval beschreven door Taylor et al., zoals weergegeven in Palmini's classificatie (2004) of de nieuwste classificatie (2011) voorgesteld door de Neuropathologie Task Force van de International League Against Epilepsy (ILAE). De ILAE-classificatie beschrijft 3 typen ziekte: Type I, Type II en Type III.",
"van 1971 tot de laatste wijziging van de Palmini-classificatie door Blumcke in 2011. Over het algemeen worden drie typen corticale dysplasie herkend."
] | 1,107
| 1,065
|
902
|
wat is de rol van erytropoëtine bij hartregeneratie na een myocardinfarct?
|
In preklinische studies verbeterde erytropoëtine de hartfunctie en perfusie door angiomyogenese en bescherming van cardiomyocyten bij myocardinfarct, wat aangeeft dat erytropoëtine mogelijk een rol speelt bij de stimulatie van celregeneratie onder normale fysiologische omstandigheden en bij patiënten met myocardiale schade. Overexpressie van Epo bleek de cellulaire regeneratieve eigenschappen van MSC's te versterken via zowel autocriene als paracriene routes. Resultaten van recente klinische onderzoeken ondersteunden echter geen gunstige effecten van cytokinetherapie met erytropoëtine bij patiënten met myocardinfarct.
|
[
"EPO bij patiënten met STEMI behandeld met PCI wordt geassocieerd met een toename van de diameterstenose die niet geassocieerd is met circulerende voorlopercellen.",
"De cytokines granulocyten-kolonie stimulerende factor, erytropoëtine en stamcel factor kunnen een rol spelen bij het stimuleren van celregeneratie onder normale fysiologische omstandigheden en bij patiënten met myocardiale schade.",
"In preklinische studies verbeterden G-CSF en erytropoëtine de hartfunctie en perfusie door angiomyogenese en bescherming van cardiomyocyten bij myocardinfarct. Resultaten van recente klinische onderzoeken ondersteunden echter geen gunstige effecten van cytokinetherapie met G-CSF of erytropoëtine alleen bij patiënten met myocardinfarct.",
"Overexpressie van Epo versterkt de cellulaire regeneratieve eigenschappen van MSC's via zowel autocriene als paracriene routes.",
"Transplantatie van MSC gecombineerd met cytokine EPO is superieur aan elk van de monotherapiebenaderingen voor angiomyogenese en herstel van de hartfunctie."
] | 222
| 209
|
903
|
Interageert Rad9 met Aft1 in S. cerevisiae?
|
Ja. Rad9 werkt samen met Aft1 op DNA-schade-gevoelige chromatine om genoomtoezicht te vergemakkelijken, waardoor een snelle en effectieve reactie op mogelijke DNA-schadegebeurtenissen wordt gegarandeerd.
|
[
"Rad9 interageert met Aft1 om genoomtoezicht te vergemakkelijken op kwetsbare genomische locaties onder niet-DNA-schade-veroorzakende omstandigheden in S. cerevisiae.",
"Hier tonen we aan dat het Rad9 checkpoint-eiwit, bekend om het doorgeven van het schadessignaal van upstream naar downstream essentiële kinasen, interageert met de Aft1 transcriptiefactor in de gist. Aft1 reguleert de ijzerhomeostase en is ook betrokken bij genoomintegriteit met aanvullende ijzer-onafhankelijke functies. Met behulp van genoomwijde expressie- en chromatine-immunoprecipitatiebenaderingen vonden we dat Rad9 werd gerekruteerd naar 16% van de gistgenen, vaak gerelateerd aan cellulaire groei en metabolisme, terwijl het de transcriptie van ongeveer 2% van het coderende genoom beïnvloedde in afwezigheid van exogeen geïnduceerde DNA-schade. Belangrijk is dat Rad9 niet-willekeurig en op een Aft1-afhankelijke wijze wordt gerekruteerd naar kwetsbare genomische regio's (transcriptioneel actief, GC-rijk, centromeren, meiotische recombinatie-hotspots en retrotransposons). Verdere analyses toonden aanzienlijke genoomwijde parallellen aan tussen Rad9-bindingspatronen op het genoom en belangrijke activerende histonmerken, zoals H3K36me, H3K79me en H3K4me. Onze bevindingen suggereren dus dat Rad9 samen met Aft1 functioneert op DNA-schade-gevoelige chromatine om genoomtoezicht te vergemakkelijken, waardoor een snelle en effectieve reactie op mogelijke DNA-schadegebeurtenissen wordt gegarandeerd.",
"Hier tonen we aan dat het Rad9 checkpoint-eiwit, bekend om het doorgeven van het schadessignaal van upstream naar downstream essentiële kinasen, interageert met de Aft1 transcriptiefactor in de gist.",
"Rad9 interageert met Aft1 om genoomtoezicht te vergemakkelijken op kwetsbare genomische locaties onder niet-DNA-schade-veroorzakende omstandigheden in S. cerevisiae.",
"Hier tonen we aan dat het Rad9 checkpoint-eiwit, bekend om het doorgeven van het schadessignaal van upstream naar downstream essentiële kinasen, interageert met de Aft1 transcriptiefactor in de gist. Aft1 reguleert de ijzerhomeostase en is ook betrokken bij genoomintegriteit met aanvullende ijzer-onafhankelijke functies. Met behulp van genoomwijde expressie- en chromatine-immunoprecipitatiebenaderingen vonden we dat Rad9 werd gerekruteerd naar 16% van de gistgenen, vaak gerelateerd aan cellulaire groei en metabolisme, terwijl het de transcriptie van ongeveer 2% van het coderende genoom beïnvloedde in afwezigheid van exogeen geïnduceerde DNA-schade.",
"Belangrijk is dat Rad9 niet-willekeurig en op een Aft1-afhankelijke wijze wordt gerekruteerd naar kwetsbare genomische regio's (transcriptioneel actief, GC-rijk, centromeren, meiotische recombinatie-hotspots en retrotransposons). Verdere analyses toonden aanzienlijke genoomwijde parallellen aan tussen Rad9-bindingspatronen op het genoom en belangrijke activerende histonmerken, zoals H3K36me, H3K79me en H3K4me. Onze bevindingen suggereren dus dat Rad9 samen met Aft1 functioneert op DNA-schade-gevoelige chromatine om genoomtoezicht te vergemakkelijken, waardoor een snelle en effectieve reactie op mogelijke DNA-schadegebeurtenissen wordt gegarandeerd."
] | 420
| 407
|
904
|
Zijn er desmins aanwezig in planten?
|
Nee. Desmins zijn type III intermediaire filament (IF) eiwitten die tot nu toe alleen zijn geïdentificeerd in metazoa (mens, Danio rerio, rund). Desmins worden ook geassocieerd met ernstige vormen van skeletspier-, hartspier- en myofibrillaire myopathieën.
|
[
"Erfelijke mutaties in het gen dat codeert voor het intermediaire filament eiwit desmin zijn aangetoond als oorzaak van ernstige skelet- en hartspiermyopathieën.",
"Mutaties in het intermediaire filament (IF) eiwit desmin veroorzaken ernstige vormen van myofibrillaire myopathie, gekenmerkt door gedeeltelijke aggregatie van het extrasarcomerische desmin cytoskelet en structurele desorganisatie van myofibrillen.",
"De familie van 70 intermediaire filamentgenen (inclusief die coderen voor keratines, desmins en lamines) is nu bekend als geassocieerd met een breed scala aan diverse ziekten, minstens 72 verschillende menselijke pathologieën, waaronder huidblaarvorming, spierdystrofie, cardiomyopathie, voortijdige verouderingssyndromen, neurodegeneratieve aandoeningen en cataract.",
"Mutaties in desmin zijn geassocieerd met een subset van menselijke myopathieën.",
"Karakterisering van een zebravis (Danio rerio) desmin cDNA: een vroege moleculaire marker van myogenese.",
"Acute effecten van desminmutaties op cytoskeletale en cellulaire integriteit in hartspiercellen.",
"Desmin is een spier-specifiek eiwit en een constitutieve subeenheid van de intermediaire filamenten (IF) in skelet-, hart- en gladde spieren. Het is een vroege marker van skeletspiermyogenese. We hebben een clone van desmin cDNA gekarakteriseerd uit een embryonale zebravis (Danio rerio) cDNA-bibliotheek.",
"Immunohistochemisch onderzoek toonde een positieve reactie voor gladde spieractine en desmins in de spoelvormige cellen die in de lymfeklieren waren vermeerderd; er werd geen cytokeratine-positiviteit gedetecteerd.",
"We hebben monoklonale antilichamen (Mab) opgewekt tegen het Mr 55.000 desmin polypeptide, elektroforetisch gezuiverd uit cytoskeletale preparaten van geïsoleerde rundshart Purkinjevezels.",
"Mesotheliale en ovariumcarcinoomcellen konden niet worden onderscheiden door (intermediaire) filament-typering, met gebruik van monoklonale antilichamen (MAbs) tegen keratines, vimentines en desmins.",
"Er wordt een snelle en handige procedure beschreven voor de zuivering van polymerisatie-competente gladde spier desmin. Desmin uit kippenmaag en varkensmaag werd vergeleken met vingerafdruktechnieken."
] | 312
| 291
|
905
|
Zijn virussen betrokken bij de etiologie van menselijke subacute thyreoïditis?
|
Subacute thyreoïditis (SAT) is een ontstekingsaandoening van de schildklier die waarschijnlijk wordt veroorzaakt door virussen. De belangrijkste virusgroepen die betrokken zijn bij SAT omvatten Epstein-Barr en Retroviridae.
|
[
"De etiologie van subacute (de Quervain's) thyreoïditis (SAT) is onzeker, hoewel het waarschijnlijk een niet-specifieke ontstekingsreactie van de schildklier op verschillende virussen vertegenwoordigt.",
"Subacute thyreoïditis is een ontstekingsaandoening van de schildklier die waarschijnlijk wordt veroorzaakt door virussen.",
"Wij geloven dat de etiologische factor het Epstein-Barr-virus was omdat heterofiele en Epstein-Barr-virus-specifieke antilichamen positief waren.",
"Al met al geven deze resultaten aan dat het mechanisme van remming van Spumavirinae-infectie door interferon verschilt van dat beschreven voor de andere Retroviridae, en met name voor typen B, C en D virussen. Onze gegevens zijn van therapeutisch belang aangezien Spumavirinae in verband zijn gebracht met pathologische processen zoals de Quervain-thyreoïditis."
] | 140
| 137
|
906
|
Lijst van kerncircadiane klokgenen.
|
De kerncircadiane klokgenen zijn CLOCK, BMAL1, Per en Cry.
|
[
"PER1, CRY1, CRY2, CLOCK, BMAL1 en CKlε",
"Expressieniveaus van vijf klokgenen (Rev-Erbα, Per1, Per2, Bmal1 en Cry1)",
"veranderde expressiepatronen van de circadiane klokgenen, Bmal1 en Per2.",
"Deze review zal zich richten op de kerncircadiane klokgenen CLOCK, BMAL1, Per en Cry.",
"CLOCK, RORA en NPAS2",
"Rev-erbα en Bmal1",
"De kerncircadiane klokgenen BMAL1, PER1/2 en CRY1/2.",
"CLOCK/BMAL1, de kerncomponenten van de circadiane klok"
] | 78
| 65
|
907
|
Welke perifere neuropathie is geassocieerd met NDRG1-mutaties?
|
Charcot-Marie-Tooth (CMT) 4D ziekte is een ernstige autosomaal recessieve demyeliniserende neuropathie met uitgebreide axonale schade die leidt tot vroege invaliditeit, veroorzaakt door mutaties in het N-myc downstream regulated gene 1 (NDRG1).
|
[
"CMT4D ziekte is een ernstige autosomaal recessieve demyeliniserende neuropathie met uitgebreide axonale schade die leidt tot vroege invaliditeit, veroorzaakt door mutaties in het N-myc downstream regulated gene 1 (NDRG1).",
"In een eerdere studie hebben we aangetoond dat het N-myc downstream-regulated gene 1 (NDRG1), geclassificeerd in databases als een tumorsuppressor en een eiwit dat reageert op zware metalen, gemuteerd is bij erfelijke motorische en sensorische neuropathie Lom (HMSNL), een ernstige autosomaal recessieve vorm van Charcot-Marie-Tooth (CMT) ziekte.",
"Bij de primaire perifere demyeliniserende neuropathieën (CMT1) zijn ten minste 9 genen geassocieerd met de aandoeningen; veranderde dosering van perifere myeline-eiwit 22 (PMP22) of puntmutatie van PMP22, het gap junction-eiwit 1 (GJB1), het myeline-eiwit zero gen (MPZ), het vroege groeirespons gen 2 (EGR2), het myotubularine-gerelateerde eiwit 2 gen (MTMR2), het N-myc downstream-regulated gene 1 (NDRG1), het L-periaxin gen (PRX), het SRY-gerelateerde HMG-BOX gen 10 (SOX10) en het ganglioside-geïnduceerde differentiatie-geassocieerde eiwit 1 gen (GDAP1).",
"Het NDRG1-gen bevindt zich binnen dit interval en NDRG1-mutaties zijn aangetoond als oorzaak van erfelijke motorische en sensorische neuropathie-Lom bij mensen (CMT4D).",
"Genetische studies hebben de volgende genmutaties onthuld als oorzaken van erfelijke neuropathieën; PMP22, MPZ, EGR2, SOX10, SIMPLE/LITAF, ARHGEF10 voor CMT1 (autosomaal dominante demyeliniserende vorm); GDAP1, MTMR2, SBF2/MTMR13, KIAA1985, NDRG1, PRX voor CMT4 (autosomaal recessieve demyeliniserende vorm), MFN2, KIF1B, RAB7, GARS, NEFL, HSPB1, HSPB8 voor CMT2 (autosomaal dominante axonale vorm); LMNA, GAN1, KCC3, TDP1, APTX, SETX voor AR-CMT2 (autosomaal recessieve axonale vorm); GIB1 voor CMTX (X-gebonden CMT); DNM2 voor CMT-DI (autosomaal dominante CMT met intermediaire zenuwsnelheden); en DHH voor minifasciculaire neuropathie.",
"In een eerdere studie hebben we aangetoond dat het N-myc downstream-regulated gene 1 (NDRG1), geclassificeerd in databases als een tumorsuppressor en een eiwit dat reageert op zware metalen, gemuteerd is bij erfelijke motorische en sensorische neuropathie Lom (HMSNL), een ernstige autosomaal recessieve vorm van Charcot-Marie-Tooth (CMT) ziekte.",
"Recentelijk werd het menselijke NDRG1 geïdentificeerd als een gen dat verantwoordelijk is voor erfelijke motorische en sensorische neuropathie-Lom (geclassificeerd als Charcot-Marie-Tooth ziekte type 4D), welke gekenmerkt wordt door vroeg optredende perifere neuropathie, leidend tot ernstige invaliditeit op volwassen leeftijd.",
"CMT4D ziekte is een ernstige autosomaal recessieve demyeliniserende neuropathie met uitgebreide axonale schade die leidt tot vroege invaliditeit, veroorzaakt door mutaties in het N-myc downstream regulated gene 1 (NDRG1).",
"Het succes van moleculair genetische analyse in alle families bevestigt dat autosomaal recessieve vormen van CMT veroorzaakt door mutaties in de NDRG1- en HK1-genen veelvoorkomende oorzaken zijn van erfelijke neuropathieën onder Slowaakse Roma.",
"Recentelijk werd het menselijke NDRG1 geïdentificeerd als een gen dat verantwoordelijk is voor erfelijke motorische en sensorische neuropathie-Lom (geclassificeerd als Charcot-Marie-Tooth ziekte type 4D), welke gekenmerkt wordt door vroeg optredende perifere neuropathie, leidend tot ernstige invaliditeit op volwassen leeftijd.",
"Bij de primaire perifere demyeliniserende neuropathieën (CMT1) zijn ten minste 15 genen geassocieerd met de aandoeningen; veranderde dosering of puntmutatie van PMP22, GJB1, MPZ, EGR2, MTMR2, NDRG1, PRX, SOX10, GDAP1 en MTMR13/SBF2. Bij de primaire perifere axonale neuropathieën (CMT2) zijn ten minste 10 genen geassocieerd met deze aandoeningen; NEFL, KIF1B, MFN2, GAN1, LMNA, RAB7, GARS, TDP1, APTX en SETX.",
"Bij de primaire perifere demyeliniserende neuropathieën (CMT1) zijn ten minste 9 genen geassocieerd met de aandoeningen; veranderde dosering van perifere myeline-eiwit 22 (PMP22) of puntmutatie van PMP22, het gap junction-eiwit 1 (GJB1), het myeline-eiwit zero gen (MPZ), het vroege groeirespons gen 2 (EGR2), het myotubularine-gerelateerde eiwit 2 gen (MTMR2), het N-myc downstream-regulated gene 1 (NDRG1), het L-periaxin gen (PRX), het SRY-gerelateerde HMG-BOX gen 10 (SOX10) en het ganglioside-geïnduceerde differentiatie-geassocieerde eiwit 1 gen (GDAP1). Bij de primaire perifere axonale neuropathieën (CMT2) zijn ten minste 8 genen geassocieerd met deze aandoeningen; het neurofilament lichtketen gen (NEFL), het kinesine 1B gen (KIF1B), het gigaxonine gen (GAN1), Lamin A/C (LMNA) en tyrosyl-DNA fosfodiesterase 1 (TDP1).",
"NDRG1 is een intracellulair eiwit dat wordt geïnduceerd onder een aantal stress- en pathologische omstandigheden, en men denkt dat het geassocieerd is met celgroei en differentiatie. Recentelijk werd het menselijke NDRG1 geïdentificeerd als een gen dat verantwoordelijk is voor erfelijke motorische en sensorische neuropathie-Lom (geclassificeerd als Charcot-Marie-Tooth ziekte type 4D), welke gekenmerkt wordt door vroeg optredende perifere neuropathie, leidend tot ernstige invaliditeit op volwassen leeftijd.",
"Recente genetische studies hebben hun fenotypische en genetische diversiteiten onthuld. Bij de primaire perifere demyeliniserende neuropathieën (CMT1) zijn ten minste 9 genen geassocieerd met de aandoeningen; veranderde dosering van perifere myeline-eiwit 22 (PMP22) of puntmutatie van PMP22, het gap junction-eiwit 1 (GJB1), het myeline-eiwit zero gen (MPZ), het vroege groeirespons gen 2 (EGR2), het myotubularine-gerelateerde eiwit 2 gen (MTMR2), het N-myc downstream-regulated gene 1 (NDRG1), het L-periaxin gen (PRX), het SRY-gerelateerde HMG-BOX gen 10 (SOX10) en het ganglioside-geïnduceerde differentiatie-geassocieerde eiwit 1 gen (GDAP1).",
"Recente genetische studies hebben hun fenotypische en genetische diversiteiten onthuld. Bij de primaire perifere demyeliniserende neuropathieën (CMT1) zijn ten minste 15 genen geassocieerd met de aandoeningen; veranderde dosering of puntmutatie van PMP22, GJB1, MPZ, EGR2, MTMR2, NDRG1, PRX, SOX10, GDAP1 en MTMR13/SBF2.",
"Western blot-analyse toonde een afwezigheid van NDRG1-eiwit in een perifere zenuwbiopsie van een getroffen Greyhound. We hebben dus een kandidaat-veroorzakende mutatie voor polyneuropathie bij Greyhounds geïdentificeerd en het eerste genetisch gekarakteriseerde hond CMT-model vastgesteld, wat een kans biedt om meer inzicht te krijgen in de pathobiologie en therapie van menselijke NDRG1-geassocieerde CMT-ziekte.",
"Bij de primaire perifere demyeliniserende neuropathieën (CMT1) zijn ten minste 15 genen geassocieerd met de aandoeningen; veranderde dosering of puntmutatie van PMP22, GJB1, MPZ, EGR2, MTMR2, NDRG1, PRX, SOX10, GDAP1 en MTMR13/SBF2.",
"Het NDRG1-gen bevindt zich binnen dit interval en NDRG1-mutaties zijn aangetoond als oorzaak van erfelijke motorische en sensorische neuropathie-Lom bij mensen (CMT4D).",
"Bij de primaire perifere demyeliniserende neuropathieën (CMT1) zijn ten minste 9 genen geassocieerd met de aandoeningen; veranderde dosering van perifere myeline-eiwit 22 (PMP22) of puntmutatie van PMP22, het gap junction-eiwit 1 (GJB1), het myeline-eiwit zero gen (MPZ), het vroege groeirespons gen 2 (EGR2), het myotubularine-gerelateerde eiwit 2 gen (MTMR2), het N-myc downstream-regulated gene 1 (NDRG1), het L-periaxin gen (PRX), het SRY-gerelateerde HMG-BOX gen 10 (SOX10) en het ganglioside-geïnduceerde differentiatie-geassocieerde eiwit 1 gen (GDAP1).",
"Recentelijk werd het menselijke NDRG1 geïdentificeerd als een gen dat verantwoordelijk is voor erfelijke motorische en sensorische neuropathie-Lom (geclassificeerd als Charcot-Marie-Tooth ziekte type 4D), welke gekenmerkt wordt door vroeg optredende perifere neuropathie, leidend tot ernstige invaliditeit op volwassen leeftijd."
] | 1,010
| 1,033
|
908
|
Is miR-126 betrokken bij hartfalen?
|
Ja, miR-126 wordt geassocieerd met hartfalen.
|
[
"De miRNA's miR-126 en miR-508-5p worden geassocieerd met de uitkomst van ICM- en NICM-patiënten met CHF. Deze twee miRNA's zouden nuttig kunnen zijn bij de diagnose van CHF-patiënten en kunnen mogelijk nieuwe doelen bieden voor preventie en behandeling van CHF.",
"De plasmaconcentratie van miR-126 was negatief gecorreleerd met leeftijd en NYHA-klasse, en zou een nuttige biomarker voor hartfalen kunnen zijn.",
"Bij 10 patiënten met hartfalen waren de plasmaconcentraties van miR-126 verhoogd bij verbetering van de NYHA-klasse van IV naar III."
] | 93
| 87
|
909
|
Vermindert resveratrol cardiale remodeling?
|
Resveratrol vermindert het remodelleren van de linker ventrikel.
Resveratrol is een gunstig farmacologisch middel dat autofagie versterkt om omgekeerd remodelleren in het postinfarcthart te bewerkstelligen.
Toediening van resveratrol verbeterde de cardiale omgeving door de ontstekingsstatus te verminderen en verminderde ongunstige ventriculaire remodeling van het diabetische hart, wat leidde tot een duidelijke verbetering van de ventriculaire functie.
Resveratrol kan een aanvullende therapeutische optie vormen bij de preventie van gedilateerde cardiomyopathie.
|
[
"Concluderend verminderde resveratrol cardiale oxidatieve schade en remodeling van de linker ventrikel en verhoogde het de verminderde expressie van SIRT1 in harten van oude ratten met emfyseem en zou daardoor een therapeutische modaliteit kunnen zijn voor cardiale schade gecompliceerd door chronische obstructieve longziekte (COPD).",
"Concluderend is resveratrol een gunstig farmacologisch middel dat autofagie versterkt om omgekeerd remodelleren in het postinfarcthart te bewerkstelligen.",
"Toediening van resveratrol verminderde het verlies van atriale CSPC's, slaagde erin de functionele vermogens van CSPC's en volwassen hartcellen te behouden, verbeterde de cardiale omgeving door de ontstekingsstatus te verminderen en verminderde ongunstige ventriculaire remodeling van het diabetische hart, wat leidde tot een duidelijke verbetering van de ventriculaire functie. Deze bevindingen geven aan dat RSV een aanvullende therapeutische optie kan vormen bij de preventie van DCM."
] | 177
| 194
|
910
|
Wat is de receptor voor substraten van chaperonne-gemedieerde autofagie?
|
Chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA) is een lysosomale route voor selectieve verwijdering van beschadigde cytosolische eiwitten. LAMP2A (Lysosoom-geassocieerd membraaneiwit 2 isoform A) functioneert als receptor voor cytosolische eiwitten en ook als essentieel onderdeel van het CMA-translocatiecomplex [28]. Cytosolische substraat-eiwitten binden aan monomeren van LAMP-2A, die vervolgens multimeriseren om het complex te vormen dat nodig is voor de transmembrane import van het substraat.
|
[
"Deze eiwitten worden door chaperonnes herkend en naar lysosomen gebracht, waar ze worden getransloceerd in het lysosomale lumen en afgebroken via het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit type 2A (LAMP-2A)",
"Macroautofagie wordt gevolgd door chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA), waarbij Hsc70 (Heat shock cognate 70) selectief eiwitten met blootgestelde KFERQ-motieven bindt en ze via de LAMP-2A (Lysosoom-geassocieerd membraaneiwit type 2A) receptor in lysosomen duwt.",
"De activiteit van CMA is aangetoond evenredig te zijn met de niveaus van de CMA-receptor Lamp-2a.",
"Lysosomen uit leverweefsel van lipiden-uitgedaagde muizen vertoonden een duidelijke afname in de niveaus van de CMA-receptor, het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit type 2A,",
"We rapporteren dat Bcl-2-gerelateerde vroege staafcel-apoptose geassocieerd was met de opregulatie van autofagie-markers, waaronder de chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA) substraatreceptor LAMP-2",
"We onderzochten de genexpressieniveaus van lysosoom-geassocieerd membraaneiwit 2 (LAMP-2), een CMA-receptor",
"Het lysosomale membraaneiwit type 2A (LAMP-2A) fungeert als receptor voor de substraten van chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA)",
"Chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA) is een selectief type autofagie waarbij specifieke cytosolische eiwitten naar lysosomen worden gestuurd voor afbraak. Substraat-eiwitten binden aan het lysosomale membraan via het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit type 2A (LAMP-2A), een van de drie splicevarianten van het lamp2-gen, en deze binding is beperkend voor hun afbraak via CMA.",
"Substraat-eiwitten binden alleen aan monomere LAMP-2A, terwijl efficiënte translocatie van substraten de vorming van een specifiek hoogmoleculair LAMP-2A-complex vereist",
"We hebben recentelijk gerapporteerd dat UCH-L1 fysiek interacteert met LAMP-2A, de lysosomale receptor voor chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA",
"In deze studie vonden we dat UCH-L1 fysiek interacteert met LAMP-2A, de lysosomale receptor voor CMA,",
"We hebben eerder een leeftijdsgerelateerde afname beschreven in chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA), een selectieve vorm van autofagie waarbij bepaalde cytosolische eiwitten naar lysosomen worden gebracht na binding aan het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit type 2A (LAMP-2A), een receptor voor deze route.",
"Chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA) is een selectief pad voor de afbraak van cytosolische eiwitten in lysosomen. CMA neemt af met de leeftijd door een afname in de niveaus van het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit (LAMP) type 2A, een lysosomale receptor voor deze route.",
"Oxidatie-geïnduceerde activatie van CMA correleert met hogere niveaus van verschillende componenten van het lysosomale translocatiecomplex, maar in het bijzonder van de lumenale chaperonne, vereist voor substraatopname, en van het lysosomale membraaneiwit (lamp) type 2a, eerder geïdentificeerd als receptor voor deze route.",
"We tonen nu aan dat deze protease-activiteit de afbraak van het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit type 2a (lamp2a) veroorzaakt, een receptor voor chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA).",
"We hebben deze receptor eerder geïdentificeerd als het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit type 2a (lamp2a)",
"Lamp2a fungeert als receptor in het lysosomale membraan voor substraat-eiwitten van chaperonne-gemedieerde autofagie.",
"Deze kenmerken kunnen belangrijk zijn voor lamp2a om als receptor voor chaperonne-gemedieerde autofagie te functioneren.",
"Een progressieve leeftijdsgerelateerde afname in de niveaus van het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit type 2a dat fungeert als receptor voor chaperonne-gemedieerde autofagie",
"Hsc70 en Hsp40 zijn leden van een moleculair chaperonnecomplex dat vereist is voor eiwittransport naar het lysosoom tijdens chaperonne-gemedieerde autofagie (CMA).",
"Eenmaal daar binden substraat-eiwitten aan het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit type 2 isoform A (LAMP2A), wat de assemblage van dit receptor-eiwit in een hoger moleculair gewicht eiwitcomplex induceert dat door de substraat-eiwitten wordt gebruikt om het lysosomale lumen te bereiken.",
"Proteïne-substraten binden aan een receptor in het lysosomale membraan, het lysosoom-geassocieerde membraaneiwit (lamp) type 2a."
] | 601
| 567
|
911
|
Wat zijn de kenmerken van congestief hartfalen?
|
Congestief hartfalen (HF) is een klinisch syndroom, met kenmerken van vermoeidheid en dyspneu, dat nog steeds zeer prevalent en morbide is. Veelvoorkomende pathofysiologische kenmerken van HF omvatten veranderingen in de structuur en functie van de linker ventrikel en neurohormonale activatie. Verstoorde myocardiale calciumhuishouding is ook een van de pathofysiologische kenmerken van congestief hartfalen. Een van de kenmerken van chronisch congestief hartfalen is een toename van de sympathische toon naar de perifere circulatie en het hart. Er is voorgesteld dat de activatie van neurohormonale routes en de vorming van zuurstofvrije radicalen uiteindelijk leiden tot de activatie van een familie van transcriptiefactoren die betrokken zijn bij cardiale en vasculaire remodeling, welke kenmerken zijn van congestief hartfalen. Myocardiale falen leidt uiteindelijk tot overdreven neurohumorale compensatiemechanismen en verstoringen van de perifere circulatie, die de kenmerken zijn van congestief hartfalen. Twee aanvullende kenmerken van dit syndroom zijn natrium- en waterretentie. Ophoping van geoxideerde matrix tussen het endotheel en de hartspier, en endocardiale endotheliale disfunctie, zijn ook kenmerken van congestief hartfalen.
|
[
"Verstoorde myocardiale calcium (Ca(+)) huishouding is een van de pathofysiologische kenmerken van cardiovasculaire ziekten zoals congestief hartfalen",
"Congestief hartfalen (HF) is een klinisch syndroom, met kenmerken van vermoeidheid en dyspneu, dat nog steeds zeer prevalent en morbide is.",
"Veelvoorkomende pathofysiologische kenmerken van HF omvatten veranderingen in de structuur en functie van de linker ventrikel en neurohormonale activatie.",
"de compensatoire neurohormonale systemen en ventriculaire remodeling die de kenmerken zijn van CHF",
"De belangrijkste processen die geactiveerd worden bij hartfalen zijn de neurohormonale systemen, waaronder het renine-angiotensinesysteem, het sympathische zenuwstelsel en het endothelinesysteem.",
"de vorming van reactieve zuurstofvrije radicalen is verhoogd bij congestief hartfalen.",
"Er is voorgesteld dat de activatie van neurohormonale routes en de vorming van zuurstofvrije radicalen uiteindelijk leiden tot de activatie van een familie van transcriptiefactoren die betrokken zijn bij cardiale en vasculaire remodeling, welke kenmerken zijn van congestief hartfalen.",
"Myocardiale falen leidt uiteindelijk tot overdreven neurohumorale compensatiemechanismen en verstoringen van de perifere circulatie, die de kenmerken zijn van congestief hartfalen.",
"De twee kenmerken van dit syndroom, natrium- en waterretentie, vormen vaak een therapeutische uitdaging.",
"Ophoping van geoxideerde matrix tussen het endotheel en de hartspier, en endocardiale endotheliale disfunctie, zijn de kenmerken van congestief hartfalen.",
"Een van de kenmerken van chronisch congestief hartfalen is een toename van de sympathische toon naar de perifere circulatie en het hart. Er is een correlatie aangetoond tussen plasma norepinefrine en de ernst van de hartfalenstatus.",
"Verstoorde myocardiale calcium (Ca(+)) huishouding is een van de pathofysiologische kenmerken van cardiovasculaire ziekten zoals congestief hartfalen, cardiale hypertrofie en bepaalde typen tachyaritmieën.",
"Myocardiale falen leidt uiteindelijk tot overdreven neurohumorale compensatiemechanismen en verstoringen van de perifere circulatie, die de kenmerken zijn van congestief hartfalen",
"Een van de kenmerken van chronisch congestief hartfalen is een toename van de sympathische toon naar de perifere circulatie en het hart",
"Myocardiale pompdeficiëntie wordt beschouwd als het hemodynamische kenmerk van congestief hartfalen"
] | 501
| 465
|
912
|
Wat is de overervingswijze van het korte QT-syndroom?
|
Het korte QT-syndroom heeft een autosomaal dominante overervingswijze.
|
[
"Aangeboren korte QT-syndroom is een nieuwe familiaire primaire elektrische aandoening van het hart, die wordt gekenmerkt door een abnormaal korte QT-interval en paroxysmale atriale en ventriculaire tachyaritmieën, inclusief plotselinge hartdood. Er is een autosomaal dominante overervingswijze voorgesteld.",
"Vanaf 1993 kwam het korte QT-syndroom (SQTS) onder onze aandacht als een nieuwe erfelijke \"elektrische aandoening\" die geassocieerd is met een verhoogd risico op plotselinge hartdood en atriumfibrilleren. Mutaties in Ikr-, Iks- en Ikl-kanalen veroorzaken disfunctionele Iks-, Ikr- en Ikl-kanalen met een toename van de netto uitgaande K-stroom, wat leidt tot verkorting van de repolarisatie. Dit leidt op zijn beurt tot een korter QT-interval op het ECG en kortere atriale en ventriculaire refractaire periodes met een verhoogde vatbaarheid voor VF en AF. Er lijkt sprake te zijn van een autosomaal dominante overervingswijze."
] | 150
| 142
|
913
|
Noem klinische onderzoeken die microsurgische clipping direct hebben vergeleken met endovasculaire coiling voor de behandeling van gescheurde hersenaneurysma's?
|
De Barrow Ruptured Aneurysm Trial (BRAT) en de International Subarachnoid Aneurysmal Trial (ISAT) hebben microsurgische clipping direct vergeleken met endovasculaire coiling voor de behandeling van gescheurde hersenaneurysma's. De FIAT-studie, een klinische zorgstudie die tot doel heeft angiografische en klinische uitkomsten te vergelijken na behandeling met een Flow-Diverter of met de beste conventionele behandelingsoptie (inclusief clipping), is gaande.
|
[
"De auteurs rapporteren de 3-jaar resultaten van de Barrow Ruptured Aneurysm Trial (BRAT). Het doel van deze lopende gerandomiseerde studie is het vergelijken van de veiligheid en effectiviteit van microsurgische clip-occlusie en endovasculaire coil-embolizatie voor de behandeling van acuut gescheurde cerebrale aneurysma's en het vergelijken van functionele uitkomsten op basis van klinische en angiografische gegevens.",
"Wij rapporteren het ontwerp van de FIAT-studie, een klinische zorgstudie die tot doel heeft angiografische en klinische uitkomsten te vergelijken na behandeling met een Flow-Diverter of met de beste conventionele behandelingsoptie. De FIAT-studie zal zowel een gerandomiseerd als een registratiedeel omvatten. Patiënten zullen worden voorgesteld voor randomisatie naar ofwel FD-stenting of de beste conventionele behandelingsoptie (observatie, coiling, stenting of clipping) zoals bepaald door de behandelend arts.",
"Het effect van clipping en coiling bij acute ernstige subarachnoïdale bloeding na de resultaten van de International Subarachnoid Aneurysmal Trial (ISAT).",
"Een kritische beoordeling van de ISAT van microsurgische clipping versus coiling wordt gebruikt voor vergelijking met onze resultaten.",
"International Subarachnoid Aneurysm Trial (ISAT) van neurochirurgische clipping versus endovasculaire coiling bij 2143 patiënten met gescheurde intracraniële aneurysma's: een gerandomiseerde vergelijking van effecten op overleving, afhankelijkheid, epileptische aanvallen, herbloeding, subgroepen en aneurysma-occlusie.",
"International Subarachnoid Aneurysm Trial (ISAT) van neurochirurgische clipping versus endovasculaire coiling bij 2143 patiënten met gescheurde intracraniële aneurysma's: een gerandomiseerde studie."
] | 278
| 281
|
914
|
Wat is de reden voor de narcolepsiegevallen die zich ontwikkelden na vaccinatie tegen H1N1-influenza?
|
Het voorgestelde mechanisme voor narcolepsie na vaccinatie is er een waarbij een omgevingsfactor een door antilichamen gemedieerde auto-immuunrespons veroorzaakt of versterkt bij patiënten met een vooraf bestaande genetische aanleg.
|
[
"Het voorgestelde mechanisme voor narcolepsie na vaccinatie is er een waarbij een omgevingsfactor een door antilichamen gemedieerde auto-immuunrespons veroorzaakt of versterkt bij patiënten met een vooraf bestaande genetische aanleg.",
"Het verlies van hypothalamische hypocretine/orexine (hcrt) producerende neuronen veroorzaakt narcolepsie met kataplexie. Een auto-immuunbasis voor de ziekte wordt al lang vermoed en recente resultaten hebben deze hypothese aanzienlijk versterkt.",
"wijzend op processen zoals moleculaire mimiek of bijstanderactivatie als cruciaal voor de ontwikkeling van de ziekte.",
"Hoewel er geen formeel verband kan worden vastgesteld, suggereren de ongebruikelijke kenmerken van de gerapporteerde gevallen en de opvallende temporele relatie dat narcolepsie het resultaat kan zijn van een auto-immuunreactie die wordt veroorzaakt door H1N1-vaccinatie bij vatbare individuen.",
"Pandemrix-vaccinatie is een uitlokkende factor voor narcolepsie, vooral in combinatie met HLA-DQB1*0602.",
"Recent geïdentificeerde autoantilichamen tegen Tribbles homoloog 2 bij sommige patiënten, evenals gevallen geassocieerd met H1N1-vaccinatie, ondersteunen een auto-immuunmechanisme.",
"In China is het begin van narcolepsie sterk gecorreleerd met seizoens- en jaarlijkse patronen van bovenste luchtweginfecties, inclusief H1N1-influenza. In 2010 was het piekseizoensbegin van narcolepsie met 6 maanden vertraagd ten opzichte van winter-H1N1-infecties, en de correlatie was onafhankelijk van H1N1-vaccinatie bij de meerderheid van de steekproef.",
"H1N1-vaccinatie was sterk geassocieerd met een verhoogd risico op narcolepsie-kataplexie bij zowel kinderen als volwassenen in Frankrijk"
] | 249
| 240
|
915
|
Welke biotracers worden gebruikt voor de detectie van de ziekte van Alzheimer met behulp van PET?
|
Pittsburgh compound B (PIB) was de eerste radiotracer die in staat was om afzettingen van beta-amyloïde — een pathologisch kenmerk van de ziekte van Alzheimer — bij levende personen tijdens een PET-scan zichtbaar te maken. De Alzheimer Associatie hielp bij de financiering van de vroege ontwikkeling van PIB. De Associatie kende in 2006 ook een subsidie van $2,1 miljoen toe aan de Alzheimer Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) om deze langlopende, landelijke studie uit te breiden met PIB-PET beeldvorming.
18F flutemetamol (flute), een andere radiotracer die beta-amyloïde tijdens een PET-scan zichtbaar maakt, is structureel identiek aan PIB behalve dat er één fluoratoom in plaats van een koolstofatoom zit. Die kleine chemische verandering zorgt ervoor dat flutemetamol aanzienlijk langer stabiel blijft dan PIB, wat de bruikbaarheid buiten onderzoeksomgevingen kan vergroten. In fase II-studieresultaten gerapporteerd in de Annals of Neurology presteerde flutemetamol vergelijkbaar met PIB. Verdere tests zijn gaande.
Florbetapir F 18 (18F-AV-45) is ook een radiotracer die beta-amyloïde in de hersenen tijdens een PET-scan zichtbaar maakt. Op de Alzheimer’s Association International Conference on Alzheimer’s Disease (AAICAD) in 2010 rapporteerde de ontwikkelaar van florbetapir voor het eerst data, later gepubliceerd in JAMA, die een bijna perfecte correlatie toonden tussen de niveaus van amyloïde in de hersenen gedetecteerd door florbetapir PET-scans bij proefpersonen en de niveaus gevonden bij autopsies van dezelfde personen enkele maanden later. De ontwikkelaar heeft de Food and Drug Administration (FDA) om goedkeuring gevraagd om florbetapir op de markt te brengen onder de merknaam Amyvid. De FDA heeft aangegeven de goedkeuring uit te stellen totdat de ontwikkelaar een professioneel trainingsprogramma heeft opgezet om nauwkeurigheid en consistentie in het lezen en interpreteren van Amyvid-scans te waarborgen.
Florbetaben (BAY 94-9172) is een andere radiotracer ontworpen om beta-amyloïde tijdens een PET-scan te detecteren. Resultaten van fase II-studies en andere florbetaben-gegevens werden gerapporteerd op de Alzheimer’s Association International Conference on Alzheimer’s Disease (AAICAD) in 2010. Fase II-gegevens werden later ook gepubliceerd in Lancet Neurology. Verdere studies zijn nu gaande.
|
[
"(18)F-flutemetamol PET en structurele MRI leverden aanvullende informatie bij de diagnostische classificatie van aMCI-patiënten, wat wijst op een amyloïde-onafhankelijke neurodegeneratieve component onder aMCI-patiënten in deze steekproef.",
"Deze gepoolde analyse van vier studies bepaalde het niveau van associatie tussen opname van de fibrillaire amyloïde β positron emissie tomografie (PET) beeldvormingsagent [(18)F]flutemetamol (Pittsburgh Compound B-analoog met een 5,5 keer langere halfwaardetijd om gebruik in de klinische setting mogelijk te maken) ",
"is betrokken bij de ontwikkeling van late-onset Alzheimer’s disease (AD). We wilden de associaties bepalen tussen beta-amyloïde (Aβ) plaque-afzetting in vivo met behulp van Pittsburgh compound B (PiB) en verschillende indices van cholesterolhomeostase (d.w.z. totaal cholesterol, high-density lipoproteïne cholesterol, low-density lipoproteïne cholesterol, triglyceriden, apolipoproteïne E (ApoE), clusterine, oxysterol metabolieten van cholesterol, en eerder gerapporteerde genen geassocieerd met late-onset AD) bij 175 niet-demente oudere proefpersonen. Hoge Aβ dep",
"biomarkers van de ziekte van Alzheimer omvatten amyloïde-afzetting [gebeeld met [(11)C]Pittsburgh compound B (PiB) PET], veranderde glucosemetabolisme (gebeeld met [(18)F]fluorodeoxyglucose PET), en structurele atrofie (gebeeld met MRI). Recent publiceerden we de eerste subset van beeldvormingsbevindingen voor specifieke regio’s in een cohort van personen met autosomaal dominante ziekte van Alzheimer. We breiden nu uit",
"Criteria voor preklinische ziekte van Alzheimer (AD) stellen dat β-amyloïde (Aβ) plaques neurodegeneratie binnen AD-aangedane regio’s initiëren. Echter, sommige cognitief normale oudere personen vertonen neurale schade vergelijkbaar met patiënten met AD, zonder gelijktijdige Aβ-belasting. Dergelijke bevindingen dagen de voorgestelde volgorde uit en suggereren dat Aβ-onafhankelijke voorlopers ten grondslag liggen aan AD-typische neurodegeneratieve patronen. DOELSTELLING T",
"ol is een positron emissie tomografie (PET) tracer voor in vivo amyloïde beeldvorming. Het vermogen om amyloïde scans binair te classificeren als ‘normaal’ versus ‘Alzheimer-achtig’ is van groot klinisch belang. We evalueerden of een gesuperviseerd machine learning-techniek, support vector machines (SVM), de toewijzingen gemaakt door visuele lezers die blind waren voor de klinische diagnose kan repliceren, welke beeldcomponenten de hoogste diagnostische waarde hebben volgens SVM en hoe (18)F-flutemetamol-gebaseerde classificatie met SVM zich verhoudt tot structurele MRI-gebaseerde classificatie met SVM binnen dezelfde proefpersonen. Met behulp van SVM met een lineaire kernel analyseerden we (18)F-flutemetamol scans en volumetrische MRI-scans van 72 gevallen uit de (18)F-flutemetamol fase 2 studie (27 klinisch waarschijnlijke ziekte van Alzheimer (AD), 20 amnestische milde cognitieve stoornis (MCI), 25 controles). In een leave-one-out benadering trainden we de (18)F-flutemetamol-gebaseerde classifier met behulp van de visuele lezingen en testten of de classifier in staat was de toewijzing op basis van visuele lezingen te reproduceren en welke voxels de hoogste feature-gewichten hadden. De (18)F-flutemetamol-gebaseerde classifier kon de toewijzingen verkregen door visuele lezingen met 100% nauwkeurigheid repliceren. De voxels met de hoogste feature-gewichten bevonden zich in het striatum, precuneus, cingulate en middelste frontale gyrus. Ten tweede, om de overeenstemming tussen de grijze stof volume- en de (18)F-flutemetamol-gebaseerde classificatie te bepalen, trainden we de classifier met de klinische diagnose als gouden standaard. De algehele sensitiviteit van de (18)F-flutemetamol- en de grijze stof volume-gebaseerde classifiers was identiek (85,2%), zij het met discordante classificatie in drie gevallen. De specificiteit van de (18)F-flutemetamol-gebaseerde classifier was 92% vergeleken met 68% voor MRI. Bij de MCI ",
"ziekte (AD) wordt histologisch gedefinieerd door de aanwezigheid van extracellulaire β-amyloïde (Aβ) plaques en intraneuronale neurofibrillaire tangles in de cerebrale cortex. De diagnose dementie, evenals de voorspelling wie dementie zal ontwikkelen, is ondersteund door magnetische resonantie beeldvorming en positron emissie tomografie (PET) met gebruik van [(18)F]fluorodeoxyglucose (FDG). Deze technieken zijn echter niet specifiek voor AD. Op basis van de chemie van histologische kleurstoffen zijn verschillende Aβ-specifieke positron-emitterende radiotracers ontwikkeld om de neuropathologie van AD in beeld te brengen. Onder deze is [(11)C]PiB de meest bestudeerde Aβ-bindende PET-radiofarmacon ter wereld. De histologische en biochemische specificiteit van PiB-binding in verschillende regio’s van het AD-brein werd aangetoond door een directe correlatie te tonen tussen Aβ-bevattende amyloïde plaques en in vivo [(11)C]PiB-retentie gemeten met PET-beeldvorming. Omdat (11)C niet ideaal is voor commercialisatie, zijn verschillende (18)F-gelabelde tracers ontwikkeld. Op dit moment ondergaan [(18)F]3'-F-PiB (Flutemetamol), (18)F-AV-45 (Florbetapir) en (18)F-AV-1 (Florbetaben) uitgebreide fase II en III klinische onderzoeken. Dit artikel geeft een korte review van de amyloïde biologie en chemie van Aβ-specifieke (11)C en (18)F-PET radiofarmaca. Klinische onderzoeken hebben duidelijk aangetoond dat PET-radiofarmaca die in staat zijn om Aβ-gehalte in vivo in de hersenen van AD-patiënten en patiënten met milde cognitieve stoornis te beoordelen, belangrijk zullen zijn als diagnostische middelen om amyloïde hersenpathologie in vivo te detecteren. Daarnaast",
"is het bekend dat veel klinische en genetische factoren geassocieerd zijn met beta-amyloïde afzetting, maar weinig studies hebben de interacties van dergelijke factoren over verschillende stadia van Alzheimer-pathogenese onderzocht. METHODEN: We gebruikten 18F-florbetapir F18 PET-beeldvorming om de dichtheid van neuritische beta-amyloïde plaques te kwantificeren in vier corticale regio’s bij 602 oudere (55-94 jaar) proefpersonen uit de nationale ADNI biomarker studie. De groep bestond uit 194 normale ouderen, 212 vroege milde cognitieve stoornis [EMCI], 132 late milde cognitieve stoornis [LMCI], en 64 milde Alzheimer (AD). BEVINDINGEN: In een model met meerdere voorspellende factoren was het effect van apolipoproteïne E ε4 en diagnose significant in alle vier corticale regio’s. De hoogste signalen werden gezien in de cingulate, gevolgd door frontale en pariëtale gebieden, met de laagste signalen in de temporale kwab (p<0,0001). Het effect van apolipoproteïne E ε4 (Cohen’s D 0,96) op beta-amyloïde plaque-dichtheid was ongeveer twee keer zo groot als het effect van een AD-diagnose (Cohen’s D 0,51) en drie keer zo groot als het effect van een LMCI-diagnose (Cohen’s D 0,34) (p<0,0001). Verrassend genoeg hadden ApoE ε4+ normale controles een grotere gemiddelde plaque-dichtheid in alle corticale regio’s dan ε4- EMCI en ε4- LMCI (p<0,0001, p=0,0009) en vertoonden zij hogere, zij het niet-significante, gemiddelde waarden dan ε4- AD-patiënten (p<0,27). ApoE ε4+ EMCI en LMCI proefpersonen hadden significant grotere gemiddelde plaque-dichtheid in alle corticale regio’s dan ε4- AD-patiënten (p<0,027, p<0,0001). INTERPRETATIE: De neuritische amyloïde plaque-lading varieert sterk per ApoE4-genotype over progressieve klinische stadia van AD. Deze bevindingen ondersteunen de noodzaak voor betere pathologie-gebaseerde en ondersteunde diagnose in de routinematige praktijk. Onze data ook",
"positron emissie tomografie (PET) radiotracers, fluorodeoxyglucose F 18 ((18)F-FDG) is de meest gebruikte verbinding bij de diagnose van neurodegeneratieve dementieën. Deze verbinding toont echter een lagere specificiteit en sensitiviteit voor vroege detectie van de ziekte van Alzheimer dan hoog-affiene liganden voor β-amyloïde (Aβ). Onder de nieuwe breed beschikbare fluorine 18 ((18)F)-gelabelde Aβ-liganden toonde florbetapir F 18 ((18)F-AV-45; Amyvid™) duidelijke kwalitatieve en kwantitatieve correlaties tussen in vivo PET-beeldvorming en postmortale histopathologische analyse van Aβ. Florbetapir F 18 valt op door zijn hoge Aβ-affiniteit en farmacokinetische eigenschappen die een PET-scan van 10 minuten binnen 90 minuten na toediening (dosis = 370 MBq) mogelijk maken. Belangrijk is dat er geen veiligheidsproblemen voor florbetapir F 18 werden gevonden in preklinische studies. In 2012 keurde de Amerikaanse Food and Drug Administration (FDA) Amyvid goed als radiotracer die helpt bij het uitsluiten van de aanwezigheid van Aβ in de hersenen. Het was de",
"(Abeta) plaquevorming is een kenmerk van de ziekte van Alzheimer (AD) en gaat de aanvang van dementie vooraf. Abeta-beeldvorming zou een vroegere diagnose mogelijk moeten maken, maar de klinische toepassing wordt belemmerd door de korte vervaltijd van huidige Abeta-specifieke liganden. (18)F-BAY94-9172 is een Abeta-ligand dat, vanwege de halfwaardetijd van (18)F, geschikt is voor klinisch gebruik. We onderzochten daarom de effectiviteit van dit ligand bij het identificeren van patiënten met AD. METHODEN: 15"
] | 1,488
| 1,519
|
916
|
Wat was het doel van het FANTOM3-project?
|
Het FANTOM3-annotatiesysteem, bestaande uit geautomatiseerde computationele voorspelling, handmatige curatie en uiteindelijke deskundige curatie, faciliteerde de uitgebreide karakterisering van het muistranscriptoom en kon worden toegepast op de transcriptomen van andere soorten
|
[
" Het FANTOM3-annotatiesysteem, bestaande uit geautomatiseerde computationele voorspelling, handmatige curatie en uiteindelijke deskundige curatie, faciliteerde de uitgebreide karakterisering van het muistranscriptoom en kon worden toegepast op de transcriptomen van andere soorten",
" Functionele Annotatie Van Muis 3 (FANTOM3), een internationaal samenwerkingsonderzoeksproject gericht op het uitbreiden van het transcriptoom en daaropvolgende analyses",
" Deze databases werden geleverd voor Functionele Annotatie Van Muis 3 (FANTOM3), een internationaal samenwerkingsonderzoeksproject gericht op het uitbreiden van het transcriptoom en daaropvolgende analyses.",
" Sequencing-projecten, zoals Fantom3 voor muis en H-InvDB voor mens, hebben overvloedige gegevens gegenereerd over getranscribeerde componenten van zoogdiercellen, waarvan het merendeel niet-eiwitcoderend lijkt te zijn.",
" Deze databases werden geleverd voor Functionele Annotatie Van Muis 3 (FANTOM3), een internationaal samenwerkingsonderzoeksproject gericht op het uitbreiden van het transcriptoom en daaropvolgende analyses. ",
" Sequencing-projecten, zoals Fantom3 voor muis en H-InvDB voor mens, hebben overvloedige gegevens gegenereerd over getranscribeerde componenten van zoogdiercellen, waarvan het merendeel niet-eiwitcoderend lijkt te zijn. ",
" Deze databases werden geleverd voor Functionele Annotatie Van Muis 3 (FANTOM3), een internationaal samenwerkingsonderzoeksproject gericht op het uitbreiden van het transcriptoom en daaropvolgende analyses. Nu is de toegang gratis voor alle gebruikers via het World Wide Web op http://fantom3.gsc.riken.jp/.",
" Sequencing-projecten, zoals Fantom3 voor muis en H-InvDB voor mens, hebben overvloedige gegevens gegenereerd over getranscribeerde componenten van zoogdiercellen, waarvan het merendeel niet-eiwitcoderend lijkt te zijn.",
" Hun associaties en TU-attributen zijn beschikbaar om promoters van interesse te vinden. Deze databases werden geleverd voor Functionele Annotatie Van Muis 3 (FANTOM3), een internationaal samenwerkingsonderzoeksproject gericht op het uitbreiden van het transcriptoom en daaropvolgende analyses.",
" Deze databases werden geleverd voor Functionele Annotatie Van Muis 3 (FANTOM3), een internationaal samenwerkingsonderzoeksproject gericht op het uitbreiden van het transcriptoom en daaropvolgende analyses. Nu is de toegang gratis voor alle gebruikers via het World Wide Web op http://fantom3."
] | 336
| 325
|
917
|
In welke isochores zijn Alu-elementen verrijkt?
|
Alu-elementen zijn verrijkt in isochores met een hoog GC% vanwege verminderde Alu-verliezen door recombinatie in deze gebieden. De frequentie van Alu-sequenties neemt toe met stijgende GC, maar bereikt een maximum in H2-isochores.
|
[
"de overgrote meerderheid van Alu-sequenties bleek de hoogste dichtheid te hebben in GC-rijke isochores",
"Alu-sequenties zijn onstabiel in GC-arme isochores maar stabiel in de samenstellingsovereenkomende GC-rijke isochores,",
"Alu-retrotransposons vertonen geen homogene verdeling over het menselijk genoom maar hebben een hogere dichtheid in GC-rijke (H) dan in AT-rijke (L) isochores",
"Dit resultaat, samen met het bekende hogere selectieve nadeel van recombinatieproducten in H-isochores, wijst op Alu-Alu recombinatie als de belangrijkste factor die de dichtheidsverschuiving van Alus naar de GC-rijke delen van het genoom veroorzaakt",
"terwijl GC-rijke Alus voornamelijk aanwezig zijn in GC-rijke isochores",
"de huidige resultaten over de stabiliteit/uitsluiting van Alu en LINE voorspellen significante verliezen van Alu-DNA uit de GC-arme isochores tijdens evolutie, een fenomeen dat blijkbaar te wijten is aan negatieve selectie tegen sequenties die afwijken van de isochore-samenstelling",
"De frequentie van Alu-sequenties neemt ook toe met stijgende GC, maar bereikt een maximum in H2-isochores, in overeenstemming met eerdere experimentele gegevens",
"De CpG-niveaus van zowel Alus als CpG-eilanden nemen toe met hun GC-niveaus",
"gekenmerkt als een GC-rijke isochore verrijkt met CpG-eilanden, genen en Alu-achtige herhalingen",
"Microsatellieten en SINES (Alu, B1, B2) worden in ongeveer gelijke frequenties gevonden in intronen van alle isochoreklassen",
"De resultaten geven aan dat de korte herhalingen van de B1-familie van muis en van de Alu I-familie van de mens het meest frequent zijn in de zware componenten, terwijl de lange herhalingen van de BamHI-familie van muis en van de Kpn I-familie van de mens voornamelijk aanwezig zijn in de twee lichte componenten."
] | 289
| 273
|
918
|
Wordt de renale uitscheiding van oxalaat verhoogd na bariatrische chirurgie?
|
Bariatrische chirurgie wordt geassocieerd met een significant risico op nefrolithiasis. Enterische hyperoxalurie, nefrolithiasis en oxalaatnefropathie moeten worden overwogen naast de andere risico's van bariatrische chirurgie. Hyperoxalurie bij patiënten behandeld met bariatrische chirurgie bleek het gevolg te zijn van hyperabsorptie van oxalaat.
|
[
"Ondanks het feit dat gewichtsverlies door bariatrische chirurgie gepaard gaat met een significante afname van morbiditeit en mortaliteit en verbetering van de nierfunctie, is recentelijk aangetoond dat bariatrische chirurgie geassocieerd is met een significant risico op nefrolithiasis. De belangrijkste risicofactor voor nefrolithiasis is een verhoogde uitscheiding van urine-oxalaat.",
"Enterische hyperoxalurie, nefrolithiasis en oxalaatnefropathie moeten worden overwogen naast de andere risico's van RYGBP.",
"De urine-uitscheiding van oxalaat was hoog: 1.112 µmol/24 uur (normale range: 55-400 µmol/24 uur), en de citraatuitscheiding was laag: 1,48 mmol/24 uur (normale range: 2-5 mmol/24 uur).",
"Hyperoxalurie bij patiënten met JIB bleek het gevolg te zijn van hyperabsorptie van oxalaat, en deze patiënten vertoonden veranderde oxalaatkinetiek met aanhoudende urine-uitscheiding van oraal toegediend 14C-oxalaat gedurende meer dan 48 uur.",
"Malabsorptie van calcium en lage nuchtere urine-calciumuitscheiding bij de JIB-patiënten waren geassocieerd met een hoge tubulaire reabsorptie van calcium, laatstgenoemde vermoedelijk toe te schrijven aan een compenserende toename van circulerend parathyroïdhormoon (PTH). Bij de meeste patiënten met terugkerende nierstenen was de urine-calciumconcentratie verhoogd, met een inverse relatie tot serum-PTH, wat wijst op intestinale hyperabsorptie van calcium. A"
] | 232
| 223
|
919
|
Wat zijn de mutatiehotspots van het menselijke KRAS-oncogen?
|
Het KRAS-oncogen heeft vier belangrijke mutatiehotspots gelegen op codons 12, 13, 61 en 146.
|
[
"In deze studie analyseerden we 15 sMTC op mutaties in de hotspots codon 12, 13 en 61 van het H- en K-ras-oncogen.",
"mutatie in codon 12, 13 en 61 van het H-ras en K-ras-oncogen",
"de mutatiehotspots van het K-ras proto-oncogen in menselijke functionele bijniercorticale tumoren bevinden zich in codons 15, 16, 18 en 31",
"mutaties C742T, G746T, G747T in het TP53-gen en G35T in het KRAS-gen zijn herhaaldelijk gevonden in delen van menselijke tumoren",
"exonen 1 en 2 van KRAS",
"KRAS (codon 12/13 hotspot)",
"drie hotspots in KRAS (codons 12/13, 61 en 146)",
"analyse van KRAS (codon 12/13)",
"mutaties die voorkomen in mutatiehotspots (codons 12 en 13) van het KRAS-eiwit",
"en N-, K- en H-RAS (codons 12, 13 en 61)"
] | 141
| 131
|
920
|
Welke intraflagellaire transport (IFT) motorproteïne is in verband gebracht met menselijke skeletciliopathieën?
|
Cytoplasmatisch dyneïne-2 (dyneïne-2) voert intraflagellair transport uit en wordt geassocieerd met menselijke skeletciliopathieën
|
[
"Cytoplasmatisch dyneïne-2 (dyneïne-2) voert intraflagellair transport uit en wordt geassocieerd met menselijke skeletciliopathieën",
"Cytoplasmatisch dyneïne-2 is de motor voor retrograde intraflagellair transport (IFT), en mutaties in dyneïne-2 zijn bekend om skeletciliopathieën te veroorzaken",
"Intraflagellair transport (IFT) is afhankelijk van twee evolutionair geconserveerde modules, subcomplexen A (IFT-A) en B (IFT-B), om de assemblage en het onderhoud van cilia aan te drijven. Alle zes IFT-A componenten en hun motorproteïne, DYNC2H1, zijn in verband gebracht met menselijke skeletciliopathieën, waaronder asfyxierende thoracale dystrofie (ATD; ook bekend als Jeune syndroom), Sensenbrenner syndroom en Mainzer-Saldino syndroom (MZSDS)",
"Bidirectioneel (anterograad en retrograad) motor-gebaseerd intraflagellair transport (IFT) regelt het transport en de aflevering van ladingen die essentieel zijn voor de groei en het onderhoud van primaire cilia en voor hedgehog signaalfuncties. Het IFT dyneïne-2 motorcomplex dat het retrograde eiwittransport in cilia reguleert bevat een zware keten dyneïne ATPase/motor subeenheid, DYNC2H1, samen met andere minder goed functioneel gedefinieerde subeenheden. Een tekort aan IFT-eiwitten, inclusief DYNC2H1, ligt ten grondslag aan een spectrum van skeletciliopathieën",
"Alle zes IFT-A componenten en hun motorproteïne, DYNC2H1, zijn in verband gebracht met menselijke skeletciliopathieën, waaronder asfyxierende thoracale dystrofie (ATD; ook bekend als Jeune syndroom), Sensenbrenner syndroom en Mainzer-Saldino syndroom (MZSDS).",
"Cytoplasmatisch dyneïne-2 is de motor voor retrograde intraflagellair transport (IFT), en mutaties in dyneïne-2 zijn bekend om skeletciliopathieën te veroorzaken.",
"Een tekort aan IFT-eiwitten, inclusief DYNC2H1, ligt ten grondslag aan een spectrum van skeletciliopathieën.",
"Alle zes IFT-A componenten en hun motorproteïne, DYNC2H1, zijn in verband gebracht met menselijke skeletciliopathieën, waaronder asfyxierende thoracale dystrofie (ATD; ook bekend als Jeune syndroom), Sensenbrenner syndroom en Mainzer-Saldino syndroom (MZSDS)",
"Alle zes IFT-A componenten en hun motorproteïne, DYNC2H1, zijn in verband gebracht met menselijke skeletciliopathieën, waaronder asfyxierende thoracale dystrofie (ATD; ook bekend als Jeune syndroom), Sensenbrenner syndroom en Mainzer-Saldino syndroom (MZSDS). ",
"Cytoplasmatisch dyneïne-2 (dyneïne-2) voert intraflagellair transport uit en wordt geassocieerd met menselijke skeletciliopathieën. ",
"Cytoplasmatisch dyneïne-2 is de motor voor retrograde intraflagellair transport (IFT), en mutaties in dyneïne-2 zijn bekend om skeletciliopathieën te veroorzaken. ",
"Een tekort aan IFT-eiwitten, inclusief DYNC2H1, ligt ten grondslag aan een spectrum van skeletciliopathieën. ",
" Intraflagellair transport (IFT) is afhankelijk van twee evolutionair geconserveerde modules, subcomplexen A (IFT-A) en B (IFT-B), om de assemblage en het onderhoud van cilia aan te drijven. Alle zes IFT-A componenten en hun motorproteïne, DYNC2H1, zijn in verband gebracht met menselijke skeletciliopathieën, waaronder asfyxierende thoracale dystrofie (ATD; ook bekend als Jeune syndroom), Sensenbrenner syndroom en Mainzer-Saldino syndroom (MZSDS).",
"Alle zes IFT-A componenten en hun motorproteïne, DYNC2H1, zijn in verband gebracht met menselijke skeletciliopathieën, waaronder asfyxierende thoracale dystrofie (ATD; ook bekend als Jeune syndroom), Sensenbrenner syndroom en Mainzer-Saldino syndroom (MZSDS). Daarentegen zijn de 14 subeenheden in de IFT-B module, met uitzondering van IFT80, onbekend in hun rol bij menselijke ziekten.",
" Cytoplasmatisch dyneïne-2 is de motor voor retrograde intraflagellair transport (IFT), en mutaties in dyneïne-2 zijn bekend om skeletciliopathieën te veroorzaken. Hier definiëren we voor het eerst de samenstelling van het menselijke cytoplasmatische dyneïne-2 complex.",
"Het IFT dyneïne-2 motorcomplex dat het retrograde eiwittransport in cilia reguleert bevat een zware keten dyneïne ATPase/motor subeenheid, DYNC2H1, samen met andere minder goed functioneel gedefinieerde subeenheden. Een tekort aan IFT-eiwitten, inclusief DYNC2H1, ligt ten grondslag aan een spectrum van skeletciliopathieën.",
"Alle zes IFT-A componenten en hun motorproteïne, DYNC2H1, zijn in verband gebracht met menselijke skeletciliopathieën, waaronder asfyxierende thoracale dystrofie (ATD; ook bekend als Jeune syndroom), Sensenbrenner syndroom en Mainzer-Saldino syndroom (MZSDS).",
"Cytoplasmatisch dyneïne-2 is de motor voor retrograde intraflagellair transport (IFT), en mutaties in dyneïne-2 zijn bekend om skeletciliopathieën te veroorzaken.",
"Een tekort aan IFT-eiwitten, inclusief DYNC2H1, ligt ten grondslag aan een spectrum van skeletciliopathieën."
] | 580
| 598
|
921
|
Wat is het werkingsmechanisme van ocrelizumab voor de behandeling van multiple sclerose?
|
Ocrelizumab is een cytolytisch monoklonaal antilichaam dat bindt aan het CD20-antigeen aanwezig op B-cellen. Het is goedgekeurd voor de behandeling van multiple sclerose.
|
[
"Recente therapeutische vooruitgangen omvatten aanpassingen om de verdraagzaamheid van bestaande producten te verbeteren (bijv. interferon beta en glatirameer acetaat), de ontwikkeling van nieuwe anti-neuro-inflammatoire medicijnen (bijv. fingolimod, teriflunomide en dimethylfumaraat, daclizumab, alemtuzumab, ocrelizumab) en onderzoek naar behandelingen bij progressieve MS (bijv. natalizumab, mastinib, natalizumab, siponimod).",
"Deze review geeft inzicht in klinische studies met de mAbs natalizumab, alemtuzumab, daclizumab, rituximab, ocrelizumab en ofatumumab.",
"Alemtuzumab, ocrelizumab en daclizumab vertegenwoordigen monoklonale antilichamen in gevorderde stadia van klinische ontwikkeling voor gebruik bij RRMS-patiënten. Pogingen om de veiligheid en werkzaamheid van alemtuzumab en B-cel depletende anti-CD20 antilichamen, d.w.z. rituximab, ocrelizumab of ofatumumab, bij CIDP-patiënten te bestuderen, zijn momenteel aan de gang.",
"Meer recentelijk zijn monoklonale antilichamen ontworpen om via specifieke mechanismen te werken, zoals het blokkeren van alfa-4 integrine-interacties (natalizumab) of het lyseren van cellen die specifieke markers dragen, bijvoorbeeld CD52 (alemtuzumab) of CD20 (ocrelizumab en ofatumumab).",
"Bij multiple sclerose (MS) vermindert B-cel depletende therapie met monoklonale anti-CD20 antilichamen, waaronder rituximab (RTX) en ocrelizumab, effectief de ziekteactiviteit.",
"Tegenwoordig is er brede ervaring met natalizumab en andere MOAB (alemtuzumab, daclizumab, rituximab, ocrelizumab, ofatumumab en anti-lingo-1) die in afwachting zijn van commercialisatie of zich in fase II of III van ontwikkeling bevinden met veelbelovende resultaten.",
"Om het risico op infusiereacties te verminderen en de langdurige verdraagzaamheid te verbeteren, zijn de menselijk-afgeleide componenten van het antilichaam verhoogd om gehumaniseerde of menselijke monoklonale antilichamen te vormen zoals ocrelizumab en ofatumumab.",
"Ocrelizumab zal waarschijnlijk ook worden goedgekeurd als tweedelijns therapie bij zeer actieve MS.",
"Dit komt door: (i) het verlopen van patenten, (ii) de introductie van natalizumab, dat de interactie tussen leukocyten en de bloed-CZS-barrière target, (iii) de lancering van drie orale immunomodulerende geneesmiddelen (fingolimod, dimethylfumaraat en teriflunomide), met een ander (laquinimod) in de regelgevende beoordeling en (iv) een aantal immunomodulerende monoklonale antilichamen (alemtuzumab, daclizumab en ocrelizumab) die op het punt staan op de markt te komen.",
"In deze review bespreken we verder het bewijs voor de bijdrage van B-cellen en Ig aan de pathogenese van menselijke MS en NMO, pro-inflammatoire en regulerende B-cel effectorfuncties, verminderde B-cel immuuntolerantie, de B-cel bevorderende micro-omgeving in het CZS, en B-cel gerichte therapeutische interventies voor MS en NMO, inclusief CD20-depletie (rituximab, ocrelizumab en ofatumumab), anti-IL6-R (tocilizumab), complement-blokkering (eculizumab), remmers van AQP4-Ig binding (aquaporumab, kleine moleculaire verbindingen), en BAFF/BAFF-R gerichte middelen.",
"De belangrijkste werkzaamheids- en veiligheidsresultaten van deze geneesmiddelen worden in dit artikel besproken. Ze kunnen worden ingedeeld in 2 groepen: oraal (fingolimod, laquinimod, teriflunomide, BG-12 [dimethylfumaraat], orale cladribine, dalfampridine) en monoklonale antilichamen (rituximab, ocrelizumab, ofatumumab, daclizumab, alemtuzumab).",
"Daclizumab en ocrelizumab zijn monoklonale antilichamen die werkzaamheid en acceptabele veiligheidsprofielen hebben getoond in fase 2-studies; beide worden onderzocht in lopende fase 3-studies.",
"Als zodanig worden hier humorale gerichte immunotherapieën die voor MS worden ontwikkeld besproken: rituximab, ocrelizumab en ofatumumab tonen veelbelovende resultaten als B-cel depletie middelen.",
"De sectie over anti-CD20 antilichamen bespreekt fase II-resultaten over ocrelizumab en ofatumumab, en bespreekt de huidige perspectieven van deze antilichamen voor MS-therapie.",
"Rituximab zal waarschijnlijk niet verder worden ontwikkeld omdat de licentie verloopt, maar ocrelizumab, een ander monoklonaal antilichaam dat direct B-cellen target, bevindt zich momenteel in fase 2 van ontwikkeling en ziet er veelbelovend uit.",
"Daarnaast hebben orale laquinimod, verschillende monoklonale antilichamen (bijv. alemtuzumab, daclizumab en ocrelizumab) en andere middelen voorlopige gunstige resultaten getoond bij relapsing MS in fase 3 klinische studies.",
"Ze kunnen worden gecategoriseerd op basis van hun werkingsmechanisme in verbindingen die (i) leukocytenmigratie naar het CZS targeten (natalizumab); (ii) cytolytische antilichamen (rituximab, ocrelizumab, ofatumumab, alemtuzumab); of (iii) antilichamen en recombinante eiwitten die cytokines en chemokines en hun receptoren targeten (daclizumab, ustekinumab, atacicept, tabalumab [Ly-2127399], secukinumab [AIN457]).",
"Het tweede concept is het depletie van T-cellen en/of B-cellen uit de perifere circulatie met behulp van zeer specifieke monoklonale antilichamen zoals alemtuzumab (anti-CD52) of rituximab/ocrelizumab (anti-CD20).",
"Meer recentelijk zijn monoklonale antilichamen ontworpen om via specifieke mechanismen te werken, zoals het blokkeren van alfa-4 integrine-interacties (natalizumab) of het lyseren van cellen die specifieke markers dragen, bijvoorbeeld CD52 (alemtuzumab) of CD20 (ocrelizumab en ofatumumab).",
"Biogen Idec Inc, Genentech Inc, Roche Holding AG en Chugai Pharmaceutical Co Ltd ontwikkelen ocrelizumab, een gehumaniseerd mAb tegen CD20, voor de potentiële behandeling van inflammatoire aandoeningen en B-cel maligniteiten.",
"Ocrelizumab, een gehumaniseerd monoklonaal antilichaam tegen CD20 voor inflammatoire aandoeningen en B-cel maligniteiten.",
"We wilden de werkzaamheid en veiligheid beoordelen van twee doseringsregimes van het gehumaniseerde anti-CD20 monoklonale antilichaam ocrelizumab bij patiënten met relapsing-remitting multiple sclerose.",
"We wilden de werkzaamheid en veiligheid beoordelen van twee doseringsregimes van het gehumaniseerde anti-CD20 monoklonale antilichaam ocrelizumab bij patiënten met relapsing-remitting multiple sclerose."
] | 760
| 753
|
922
|
Wat is de link tussen Nonidet-40 (NP-40) en biotinylatie?
|
0,5% van het niet-ionische detergent Nonidet-40 (NP-40) tijdens cellyse en isolatie van kernen is voldoende om besmetting door endogene biotinylated carboxylases praktisch te elimineren tijdens de zuivering van biotine-gelabelde nucleaire eiwitten.
|
[
"NP-40 vermindert besmetting door endogene biotinylated carboxylases tijdens de zuivering van biotine-gelabelde nucleaire eiwitten.",
"We tonen aan dat het gebruik van 0,5% van het niet-ionische detergent Nonidet-40 (NP-40) tijdens cellyse en isolatie van kernen voldoende is om besmetting van nucleaire extracten door carboxylases praktisch te elimineren en de achtergrondsignalen in downstream massaspectrometrische analyses sterk te verminderen.",
"Hier beschrijven we een eenvoudige procedure om besmetting van nucleaire extracten door van nature biotinylated cytoplasmatische carboxylases, die een belangrijke bron van niet-specifieke achtergrond vormen bij het gebruik van BirA-gemedieerde biotinylatie tagging voor de zuivering en karakterisering van nucleaire eiwitcomplexen via massaspectrometrie, sterk te verminderen. We tonen aan dat het gebruik van 0,5% van het niet-ionische detergent Nonidet-40 (NP-40) tijdens cellyse en isolatie van kernen voldoende is om besmetting van nucleaire extracten door carboxylases praktisch te elimineren en de achtergrondsignalen in downstream massaspectrometrische analyses sterk te verminderen.",
"Hier beschrijven we een eenvoudige procedure om besmetting van nucleaire extracten door van nature biotinylated cytoplasmatische carboxylases, die een belangrijke bron van niet-specifieke achtergrond vormen bij het gebruik van BirA-gemedieerde biotinylatie tagging voor de zuivering en karakterisering van nucleaire eiwitcomplexen via massaspectrometrie, sterk te verminderen. We tonen aan dat het gebruik van 0,5% van het niet-ionische detergent Nonidet-40 (NP-40) tijdens cellyse en isolatie van kernen voldoende is om besmetting van nucleaire extracten door carboxylases praktisch te elimineren en de achtergrondsignalen in downstream massaspectrometrische analyses sterk te verminderen."
] | 258
| 265
|
923
|
Welke transcript is verantwoordelijk voor X-chromosoominactivatie?
|
De lange niet-coderende RNA Xist (X inactief specifiek transcript)
|
[
"Xist, een gen verantwoordelijk voor X-chromosoominactivatie (XCI)",
"X inactivatie-specifiek transcript (XIST) is een lang ncRNA dat X-chromosoominactivatie medieert",
"het X inactief specifieke transcript (Xist) gen, dat nu bekend staat als de hoofdschakelaar locus die X-inactivatie reguleert",
"Xist, een lang niet-coderend RNA, speelt een belangrijke rol bij het activeren van X-chromosoominactivatie bij eutheriërs",
"X inactief-specifiek transcript (XIST) gen bij mensen",
"Xist (X-inactief specifiek transcript) is een belangrijke effector van het X-inactivatieproces",
"inspanningen zijn gericht op het X inactief-specifiek transcript (Xist) locus, ontdekt als de hoofdregelaar van X-inactivatie",
"X-inactivatie specifiek transcript (Xist) RNA",
"transcriptionele stillegging van een van de vrouwelijke X-chromosomen is een fijn geregeld proces dat accumulatie in cis vereist van het lange niet-coderende RNA X-inactief-specifiek transcript (Xist)",
"het X-inactief-specifiek transcript (Xist) gen, waarvan het genproduct bestaat uit RNA dat een van de X-chromosomen bedekt en daardoor inactiveert",
"het X-inactivatiecentrum (Xic). Xic bevat veel van de regelgevende elementen voor de onderlinge interactie van X-inactief specifiek transcript (Xist)",
"chromosoominactivatie (XCI) bij vrouwelijke zoogdieren is afhankelijk van het niet-coderende RNA X inactivatie specifiek transcript (Xist)",
"Een van de opvallende kenmerken die het Xic-landschap kenmerken is de overvloed aan loci die niet-coderende RNA's (ncRNA's) transcriberen, waaronder Xist, de hoofdregelaar van het inactivatieproces",
"Het proces wordt gemedieerd door het niet-coderende RNA X inactief specifiek transcript (Xist) dat in cis bindt en zich verspreidt langs het inactieve X-chromosoom, waardoor chromosoom-brede stillegging wordt veroorzaakt",
"het X-chromosoom van vaderlijke oorsprong (Xp) wordt tijdens de vroege embryogenese stilgelegd vanwege geïmprinte expressie van het regelgevende RNA, Xist (X-inactief specifiek transcript)",
"X-inactief-specifiek transcript (Xist) gen",
"expressie van het niet-coderende X-inactief specifiek transcript (Xist) RNA en afhankelijk van specifieke cellulaire contexten, waarin essentiële stilleggingsfactoren worden uitgedrukt",
"Xist (X-inactief specifiek transcript) en Tsix genpaar, dat cruciaal is bij X-inactivatie.",
"Bij eutherische zoogdieren wordt X-inactivatie gereguleerd door het X-inactief specifiek transcript (Xist), een cis-werkend niet-coderend RNA dat stillegging van het chromosoom veroorzaakt waarvan het wordt getranscribeerd",
"inactivatie bij vrouwelijke zoogdieren omvat transcriptionele stillegging van een heel chromosoom als reactie op een cis-werkend niet-coderend RNA, het X inactief-specifiek transcript (Xist)",
"chromosoominactivatie (XCI) is afhankelijk van een niet-coderend sense-antisense transcriptpaar, Xist",
"De sleutelregelgevende molecule die stillegging veroorzaakt is het Xist-transcript",
"chromosoominactivatie begint wanneer een nieuw chromosomaal RNA (cRNA) van het geïmprinte muis Xist of menselijke XIST locus een X-chromosoom in cis bedekt of \"verft\" en een cascade van chromosoomherstructureringsgebeurtenissen initieert",
"X-inactief-specifiek transcript (Xist) locus is een cis-werkende schakelaar die X-chromosoominactivatie bij zoogdieren reguleert",
"Bij X-chromosoominactivatie (XCI) bevorderen ongunstige XCI-verhoudingen de penetrantie van X-gebonden ziekten bij vrouwen. Tijdens XCI wordt één X willekeurig stilgelegd door Xist",
"geïmprinte muis Xist (X-inactief specifiek transcript) gen is betrokken bij de initiatie van X-chromosoominactivatie",
"initiatie van X-chromosoominactivatie is kritisch afhankelijk van de expressie van het X-inactief specifiek transcript (Xist)",
"X-chromosoominactivatie vereist de aanwezigheid, in cis, van het X-inactivatiecentrum (XIC). Het Xist-gen, dat binnen het XIC-gebied ligt bij zowel mens als muis",
"inactief-specifiek transcript (Xist)",
"X inactief-specifiek transcript (Xist) wordt verondersteld essentieel te zijn voor de initiatie van X-chromosoominactivatie en doseringscompensatie tijdens de ontwikkeling van vrouwelijke embryo's",
"deleties van het X-inactivatiecentrum (XIC/Xic) en/of het X inactief specifiek transcript (XIST/Xist) gen resulteren in falen van cis X-inactivatie",
"Xist (X inactief specifiek transcript) gen speelt een essentiële rol bij X-chromosoominactivatie.",
"expressie van het Xist (X inactief specifiek transcript) gen correleert met X-inactivatie",
"XIST (X inactief specifiek transcript) gen",
"een van de twee X-chromosomen in somatische cellen van het vrouwelijk individu wordt geïnactiveerd via een proces dat vermoedelijk afhankelijk is van een unieke initiatorregio, het X-chromosoominactivatiecentrum (Xic). De recent gekarakteriseerde Xist-sequentie (X-inactief-specifiek transcript) wordt beschouwd als een mogelijke kandidaat voor Xic",
"menselijk XIST-gen, een kandidaat voor een rol in X-chromosoominactivatie,"
] | 638
| 573
|
924
|
Waar worden virale vectoren voor gebruikt in optogenetica?
|
Virale vectoren worden gebruikt om optogenetische constructen tot expressie te brengen in geselecteerde cellen.
|
[
"Om ChR in neuronen tot expressie te brengen, omvatten de gebruikelijke expressiesystemen virale vectoren, in utero electroporatie en transgene dieren, elk met hun voordelen en beperkingen wat betreft kosten, expressiepatroon en de benodigde inspanning.",
"In deze review worden de verschillende strategieën voor selectieve genetische targeting van een gedefinieerde neuronale populatie besproken, evenals de voor- en nadelen van het gebruik van transgene dieren en recombinante virale vectoren voor de expressie van transgenen in een specifieke set neuronen.",
"We tonen aan hoe het vermogen om astrocyten te targeten met celspecifieke virale vectoren om optogenetische constructen tot expressie te brengen heeft geholpen om enkele eerder onopgemerkte rollen van deze onopvallende cellen te ontrafelen.",
"Optogenetica, het gebruik van licht om neurale circuits te stimuleren of te remmen via virale transductie van proteïnekanalen, is naar voren gekomen als een mogelijke methode voor de behandeling van epilepsie.",
"We tonen aan hoe het vermogen om astrocyten te targeten met celspecifieke virale vectoren om optogenetische constructen tot expressie te brengen heeft geholpen om enkele eerder onopgemerkte rollen van deze onopvallende cellen te ontrafelen.",
"We concluderen dat een virale vectorbenadering met een sterke promotor vereist is voor succesvolle optogenetische stimulatie van distale axonen om neurotransmitterafgifte op te wekken in pre-autonome PVN-neuronen.",
"RESULTATEN: Extracellulaire single-unit opnames werden gemaakt van infralimbische (IL) piramidale cellen, IL-interneuronen en prelimbische (PL) piramidale cellen 2-3 weken na intra-IL injectie van een virale vector die channelrhodopsine 2 (ChR2) codeert onder controle van de CaMKII-promotor (rAAV5/CaMKIIa-ChR2(H134R)-EYFP) of een controlevector die de ChR2-sequentie miste (rAAV5/CaMKIIa-EYFP).",
"We concluderen dat een virale vectorbenadering met een sterke promotor vereist is voor succesvolle optogenetische stimulatie van distale axonen om neurotransmitterafgifte op te wekken in pre-autonome PVN-neuronen.",
"We brachten selectief ChR2(H134R) tot expressie in rostrale VLM catecholaminerge neuronen door Cre-afhankelijke adeno-geassocieerde virale vectoren in de hersenen van volwassen dopamine-β-hydroxylase (DβH)(Cre/0) muizen te injecteren.",
"We ontwikkelden driver- en dubbele reporter-muizenlijnen en virale vectoren met behulp van de Cre/Flp en Cre/Dre dubbele recombinasesystemen en vestigden een nieuwe, her-targetbare genomische locus, TIGRE, die de generatie mogelijk maakte van een grote set Cre/tTA-afhankelijke reporterlijnen die fluorescerende eiwitten, genetisch gecodeerde calcium-, voltage- of glutamaatindicatoren en optogenetische effectors tot expressie brengen, allemaal op aanzienlijk hogere niveaus dan voorheen.",
"We genereerden rabies glycoproteïne-gepseudotypeerde lentivirale vectoren die een positieve feedbacklus gebruiken bestaande uit een Tet-promotor die zowel zijn eigen tetracycline-afhankelijke transcriptieactivator (tTA) (\"TLoop\") als channelrhodopsine-2-YFP (ChR2YFP) aandrijft.",
"Optogenetische controle van cardiomyocyten via virale levering.",
"Hier gebruikten we een optogenetische benadering, waarbij vrouwelijke ratten bilaterale dorsale mPFC micro-injecties kregen van virale constructen die lichtgevoelig eNpHR3.0-eYFP of controle eYFP-eiwit coderen en intracraniële vezeloptische implantaten.",
"We transduceerden rat LC-neuronen door directe injectie van een lentivirale vector die channelrhodopsine2 tot expressie brengt onder controle van de PRS-promotor.",
"Hier beschrijven we de constructie van een blauwlicht-geïnduceerd K(+) kanaal 1 (BLINK1) dat is ontworpen door de plant LOV2-Jα fotosensorische module te fuseren met het kleine virale K(+) kanaal Kcv.",
"Tegelijkertijd leidde opmerkelijk succes in de ontwikkeling van zeer efficiënte virale vectoren voor oculaire gentherapie tot nieuwe strategieën voor het gebruik van deze nieuwe optogenetische hulpmiddelen voor het herstel van het gezichtsvermogen. Deze recente bevindingen tonen aan dat nieuwe optogenetische hulpmiddelen en virale vectoren voor oculaire genafgifte nu beschikbaar zijn, wat vele mogelijkheden biedt om potentiële optogenetische strategieën voor gezichtsherstel te ontwikkelen."
] | 530
| 539
|
925
|
Welke domeinen die zelfassociatie mogelijk maken, bestaan er in TDP-43 en FUS-eiwitten?
|
PRION-EIWITTEN
|
[
"Door gebruik te maken van tijdelijke expressie van een reeks deletie- en chimere FUS-varianten in verschillende gekweekte cellen, toonden we aan dat FUS dat zich ophoopt in het cytoplasma een nieuw type RNA-granules nucleëert, FUS-granules (FG's), die structureel vergelijkbaar maar niet identiek zijn aan fysiologische RNA-transportgranules. De vorming van FG's vereist het N-terminale prion-achtige domein van FUS en het vermogen om specifieke RNA's te binden. Clustering van FG's, gekoppeld aan verdere rekrutering van RNA en eiwitten, produceert grotere structuren, FUS-aggregaten (FA's), die lijken op maar duidelijk verschillend zijn van stressgranules.",
"Ongeveer 1% van de menselijke eiwitten bevat een prion-achtig domein (PrLD) met een vergelijkbare lage complexiteit in sequentie en aminozuursamenstelling als domeinen die prionogenese van gist-eiwitten zoals Sup35 aandrijven. PrLD's zijn oververtegenwoordigd in menselijke RNA-bindende eiwitten en bemiddelen faseovergangen die ten grondslag liggen aan de assemblage van RNP-granules. Deze modaliteit maakt PrLD's vatbaar voor misvouwing in conformaties die zich ophopen in pathologische inclusies die kenmerkend zijn voor verschillende fatale neurodegeneratieve ziekten. Bijvoorbeeld, TDP-43 en FUS vormen cytoplasmatische inclusies bij amyotrofische laterale sclerose (ALS) en mutaties in TDP-43 en FUS kunnen ALS veroorzaken.",
"FUS en TDP-43, die respectievelijk de 1e en 10e plaats innemen onder RRM-bevattende prionkandidaten, vormen cytoplasmatische inclusies in de degenererende motorneuronen van ALS-patiënten en mutaties in TDP-43 en FUS veroorzaken familiaire ALS.",
"Amyotrofische laterale sclerose (ALS) is een verwoestende en universeel fatale neurodegeneratieve ziekte. Mutaties in twee verwante RNA-bindende eiwitten, TDP-43 en FUS, die prion-achtige domeinen bevatten, veroorzaken sommige vormen van ALS.",
"Twee RNA-bindende eiwitten, FUS en TDP-43, die cytoplasmatische aggregaten vormen bij amyotrofische laterale sclerose, bevatten een 'priondomein' vergelijkbaar met die gevonden in verschillende gistprioneiwitten.",
"Mutaties in verwante RNA-bindende eiwitten TDP-43, FUS/TLS en TAF15 zijn in verband gebracht met ALS. Deze drie eiwitten delen verschillende kenmerken, waaronder de aanwezigheid van een bioinformatica-voorspeld priondomein, aggregatiegevoeligheid in vitro en in vivo en toxische effecten wanneer ze in meerdere modelsystemen worden tot expressie gebracht.",
"Bovendien bevatten twee RNA-bindende eiwitten, FUS en TDP-43, die cytoplasmatische aggregaten vormen bij amyotrofische laterale sclerose, een 'priondomein' vergelijkbaar met die gevonden in verschillende gistprioneiwitten.",
"TDP-43 en FUS en verschillende verwante RNA-bindende eiwitten bevatten aggregatiebevorderende prion-achtige domeinen die hen in staat stellen snel zelf te associëren.",
"Moleculaire kloning van subunit 4 van het complex onthulde dat het een proteasoom-COP9 complex-eIF3 domeineiwit is, gecodeerd door een gen dat gelokaliseerd is op chromosoom 5, nabij de chromosomale locatie van de cop8- en fus4-mutaties.",
"Deleties in het C-terminale domein van TDP-43 die interacties met hnRNP A2/B1 verhinderen, maken de TDP-43-afhankelijke redding van CGG-repeat toxiciteit ongedaan.",
"De redding lijkt specifiek voor TDP-43 te zijn, aangezien co-expressie van een ander ALS-geassocieerd RNA-bindend eiwit, FUS, de toxische effecten van CGG-repeats verergert.",
"Recentelijk werd door Next-Generation Exome sequencing een mutatie gevonden die resulteert in een substitutie (p.Q290X) in het nucleaire exportdomein van het FUS-eiwit, genomineerd als oorzaak van autosomaal dominante essentiële tremor (ET) in een grote familie.",
"TDP-43 is een ander RNA-bindend eiwit dat betrokken is bij ALS.",
"We leveren ook meerdere onafhankelijke lijnen van in vitro en in vivo bewijs dat EWSR1 vergelijkbare eigenschappen heeft als TDP-43, FUS en TAF15, inclusief aggregatiegevoelig gedrag in vitro en het vermogen neurodegeneratie te veroorzaken in Drosophila.",
"Voor TDP-43 zijn zowel het RRM1 als het C-terminale glycine-rijke domein vereist voor SG-localisatie.",
"Bovendien vertonen TDP-43 en FUS verschillende domeinvereisten bij aggregaatvorming en cytotoxiciteit.",
"Binding werd gemedieerd door een ongestructureerd C-terminaal domein van TDP-43 en vond plaats binnen de context van een 300-400 kDa complex dat ook C-terminale splitsingsproducten van TDP-43 bevatte die gekoppeld zijn aan neuropathologie.",
"Recentelijk werd vastgesteld dat dominante mutaties in twee verwante RNA-bindende eiwitten, TDP-43 (43-kDa TAR DNA-bindend domeineiwit) en FUS/TLS (fused in sarcoma/translated in liposarcoma), een subset van ALS veroorzaken."
] | 592
| 601
|
926
|
Is er een rol voor transcriptiefabrieken in de organisatie van het genoom?
|
De nucleus van zoogdieren is een zeer complexe structuur die een breed scala aan functies uitvoert, zoals DNA-replicatie, celdeling, RNA-verwerking en nucleaire export/import. Veel van deze activiteiten vinden plaats in discrete subcompartimenten die overlappen met specifieke regio's van het genoom. In de afgelopen decennia is er steeds meer bewijs verzameld dat RNA-transcriptie ook plaatsvindt op gespecialiseerde locaties, zogenaamde transcriptiefabrieken, die mogelijk invloed hebben op hoe het genoom georganiseerd is. Het clusteren van transcriptie-activiteit op deze manier kan bepaalde efficiëntievoordelen bieden. Echter, het clusteren van genen in transcriptiefabrieken kan gevolgen hebben voor de stabiliteit van het genoom en de vatbaarheid voor terugkerende chromosomale translocaties die tot kanker leiden vergroten.
|
[
"De nucleus van zoogdieren is een zeer complexe structuur die een breed scala aan functies uitvoert, zoals DNA-replicatie, celdeling, RNA-verwerking en nucleaire export/import. Veel van deze activiteiten vinden plaats in discrete subcompartimenten die overlappen met specifieke regio's van het genoom. In de afgelopen decennia is er steeds meer bewijs verzameld dat RNA-transcriptie ook plaatsvindt op gespecialiseerde locaties, zogenaamde transcriptiefabrieken, die mogelijk invloed hebben op hoe het genoom georganiseerd is. Het clusteren van transcriptie-activiteit op deze manier kan bepaalde efficiëntievoordelen bieden. Echter, het clusteren van genen in transcriptiefabrieken kan gevolgen hebben voor de stabiliteit van het genoom en de vatbaarheid voor terugkerende chromosomale translocaties die tot kanker leiden vergroten.",
"In de eukaryote nucleus worden genen getranscribeerd in transcriptiefabrieken.",
"Op basis van deze analyse stellen we voor dat transcriptiefabrieken ontstaan door de aggregatie van RNA-polymerase II-bevattende pre-initiatiefcomplexen die naast elkaar zijn geassembleerd in de nucleaire ruimte. Zo'n aggregatie kan worden getriggerd door de fosforylering van de C-terminale domein van RNA-polymerase II-moleculen en hun interactie met verschillende transcriptiefactoren. Individuele transcriptiefabrieken zouden dus weefsel-specifieke, co-gereguleerde evenals housekeeping-genen incorporeren, uitsluitend gebaseerd op hun initiële nabijheid tot elkaar in de nucleaire ruimte.",
"Actieve polymerasen clusteren in replicatie- en transcriptie-\"fabrieken\" in zowel pro- als eukaryoten. We concluderen dat de tweede wet van de thermodynamica werkt via niet-specifieke entropische krachten tussen betrokken polymerasen om de zelforganisatie van genomen in lussen te stimuleren die enkele duizenden (en soms miljoenen) basenparen bevatten.",
"Sinds de komst van FISH (fluorescentie in situ hybridisatie) zijn er grote vorderingen gemaakt in ons begrip van hoe het genoom georganiseerd is in interfase-nuclei. Inderdaad, deze organisatie blijkt niet willekeurig te zijn en individuele chromosomen bezetten discrete regio's die bekendstaan als territoria.",
"In prolifererende cellen is er duidelijk een correlatie tussen radiale positionering en gen-dichtheid. Chromosomen met weinig genen bevinden zich doorgaans aan de rand van de nucleus, terwijl die met meer genen meer intern gepositioneerd zijn.",
"Recent beschreven actieve chromatinehubs en transcriptiefabrieken omvatten ook interacties over lange afstand.",
"Het transcriptiefabriekmodel heeft implicaties voor de regulatie van transcriptie-initiatief en elongatie, voor de organisatie van genen in het genoom, voor de co-regulatie van genen en voor genoominstabiliteit."
] | 481
| 460
|
927
|
Wat zijn de Chompret-criteria voor het Li-Fraumeni-syndroom?
|
1) Volgens de Chompret-criteria voor LFS loopt elke patiënt met een bijniercortexcarcinoom (ACC), ongeacht leeftijd en familiegeschiedenis, een hoog risico op een TP53-germline-mutatie.
2) Alle families met een p53-mutatie moeten ten minste één familielid hebben met een sarcoom, borst-, hersen- of bijniercortexcarcinoom (ACC).
|
[
"Volgens de Chompret-criteria voor LFS loopt elke patiënt met een bijniercortexcarcinoom (ACC), ongeacht leeftijd en familiegeschiedenis, een hoog risico op een TP53-germline-mutatie.",
"Alle families met een p53-mutatie hadden ten minste één familielid met een sarcoom, borst-, hersen- of bijniercortexcarcinoom (ACC)."
] | 106
| 86
|
928
|
Wanneer wordt ceritinib gebruikt in plaats van crizotinib?
|
Ceritinib is goedgekeurd voor de behandeling van ALK-positieve gemetastaseerde NSCLC-patiënten die resistent zijn tegen crizotinib en crizotinib-naïef zijn.
|
[
"Ceritinib is een ALK-remmer van de tweede generatie die werkzaamheid heeft aangetoond bij patiënten die resistent zijn tegen crizotinib, en wordt daarmee een veelbelovende behandelingsoptie in deze populatie.",
"Ceritinib is goedgekeurd voor de behandeling van ALK-positieve gemetastaseerde NSCLC bij patiënten die intolerant zijn voor of progressie vertonen ondanks therapie met crizotinib.",
"Ceritinib is werkzaam bij crizotinib-resistente en crizotinib-naïeve patiënten en lijkt een haalbaar alternatief voor ALK-positieve NSCLC.",
"In deze review presenteren we de huidige kennis over verworven resistentie tegen crizotinib, bekend als een ALK-remmer van de eerste generatie, en mogelijke oplossingen om de kosteneffectiviteit te verbeteren. Tevens bespreken we het verschil tussen ceritinib en crizotinib; preklinische gegevens en resultaten van de elegante vroege klinische studie van ceritinib die leidde tot versnelde goedkeuring, farmacokinetiek, veiligheidsprofiel en verdraagbaarheid, de geactualiseerde resultaten (bijv. werkzaamheid bij hersenmetastasen), het robuuste ontwerp van lopende fase II/III-studies, en toekomstige richtingen van ceritinib als krachtig alternatief voor crizotinib bij ALK-gerangschikte niet-kleincellige longkanker.",
"Al met al tonen onze resultaten aan dat ceritinib crizotinib-resistentie kan overwinnen, in overeenstemming met klinische gegevens die een duidelijke werkzaamheid van ceritinib bij patiënten met crizotinib-resistente ziekte laten zien.",
"Preklinische gegevens toonden indrukwekkende antitumoractiviteit tegen crizotinib-resistente klonen, en op basis van beschikbare gegevens kan ceritinib een geschikte optie zijn bij crizotinib-resistente NSCLC.",
"De ALK-remmer ceritinib overwint crizotinib-resistentie bij niet-kleincellige longkanker.",
"Ceritinib (LDK378): een krachtig alternatief voor crizotinib bij ALK-gerangschikte niet-kleincellige longkanker.",
"We observeerden echter dat ceritinib twee crizotinib-resistente ALK-mutaties, G1202R en F1174C, niet overwon, en een van deze mutaties werd geïdentificeerd in 5 van de 11 biopsieën van patiënten met verworven resistentie tegen ceritinib. Al met al tonen onze resultaten aan dat ceritinib crizotinib-resistentie kan overwinnen, wat overeenkomt met klinische gegevens die een duidelijke werkzaamheid van ceritinib bij patiënten met crizotinib-resistente ziekte laten zien. BETEKENIS: De ALK-remmer van de tweede generatie ceritinib kan verschillende crizotinib-resistente mutaties overwinnen en is krachtig tegen verschillende in vitro en in vivo laboratoriummodellen van verworven resistentie tegen crizotinib. Deze bevindingen vormen de moleculaire basis voor de duidelijke klinische activiteit van ceritinib bij patiënten met ALK-positieve NSCLC met crizotinib-resistente ziekte.",
"We observeerden echter dat ceritinib twee crizotinib-resistente ALK-mutaties, G1202R en F1174C, niet overwon, en een van deze mutaties werd geïdentificeerd in 5 van de 11 biopsieën van patiënten met verworven resistentie tegen ceritinib. Al met al tonen onze resultaten aan dat ceritinib crizotinib-resistentie kan overwinnen, wat overeenkomt met klinische gegevens die een duidelijke werkzaamheid van ceritinib bij patiënten met crizotinib-resistente ziekte laten zien.",
"Al met al tonen onze resultaten aan dat ceritinib crizotinib-resistentie kan overwinnen, wat overeenkomt met klinische gegevens die een duidelijke werkzaamheid van ceritinib bij patiënten met crizotinib-resistente ziekte laten zien. De ALK-remmer van de tweede generatie ceritinib kan verschillende crizotinib-resistente mutaties overwinnen en is krachtig tegen verschillende in vitro en in vivo laboratoriummodellen van verworven resistentie tegen crizotinib.",
"De versnelde goedkeuring van krachtige ALK-remmers, zoals crizotinib en meer recent ceritinib (LDK378), gebaseerd op goed ontworpen fase I/II-studies, is een mijlpaal in klinisch kankeronderzoek en draagt bij aan een nieuw tijdperk van oncogene gerichte therapie, gekenmerkt door elegant klinisch studieontwerp. In deze review presenteren we de huidige kennis over verworven resistentie tegen crizotinib, bekend als een ALK-remmer van de eerste generatie, en mogelijke oplossingen om de kosteneffectiviteit te verbeteren. Tevens bespreken we het verschil tussen ceritinib en crizotinib; preklinische gegevens en resultaten van de elegante vroege klinische studie van ceritinib die leidde tot versnelde goedkeuring, farmacokinetiek, veiligheidsprofiel en verdraagbaarheid, de geactualiseerde resultaten (bijv. werkzaamheid bij hersenmetastasen), het robuuste ontwerp van lopende fase II/III-studies, en toekomstige richtingen van ceritinib als krachtig alternatief voor crizotinib bij ALK-gerangschikte niet-kleincellige longkanker.",
"De ALK-remmer van de tweede generatie ceritinib kan verschillende crizotinib-resistente mutaties overwinnen en is krachtig tegen verschillende in vitro en in vivo laboratoriummodellen van verworven resistentie tegen crizotinib. Deze bevindingen vormen de moleculaire basis voor de duidelijke klinische activiteit van ceritinib bij patiënten met ALK-positieve NSCLC met crizotinib-resistente ziekte.",
"In deze review presenteren we de huidige kennis over verworven resistentie tegen crizotinib, bekend als een ALK-remmer van de eerste generatie, en mogelijke oplossingen om de kosteneffectiviteit te verbeteren. Tevens bespreken we het verschil tussen ceritinib en crizotinib; preklinische gegevens en resultaten van de elegante vroege klinische studie van ceritinib die leidde tot versnelde goedkeuring, farmacokinetiek, veiligheidsprofiel en verdraagbaarheid, de geactualiseerde resultaten (bijv. werkzaamheid bij hersenmetastasen), het robuuste ontwerp van lopende fase II/III-studies, en toekomstige richtingen van ceritinib als krachtig alternatief voor crizotinib bij ALK-gerangschikte niet-kleincellige longkanker. Copyright © 2015 Elsevier Inc."
] | 745
| 740
|
929
|
Wat voor soort enzym is peroxiredoxine 2 (PRDX2)?
|
Peroxiredoxine 2 (PRDX2) is een antioxidant enzym dat cysteïneresiduen gebruikt om peroxiden af te breken.
Peroxiredoxine-2 (PRDX2), een enzym dat waterstofperoxide en lipideperoxiden reduceert
Peroxiredoxine 2 (Prx2) is een thiol-afhankelijke peroxidase.
|
[
"Peroxiredoxine-2 (PRDX-2) is een antioxidant en chaperonne-achtig eiwit dat cruciaal is voor de cel functie.",
"We vonden dat het antioxidant enzym peroxiredoxine-2 (Prx2) omgekeerd correleerde met de metastatische capaciteit van menselijke melanoomacellen.",
"Het doel van deze studie was om de gonadotropine regulatie van het antioxidant enzym sulfiredoxine (Srx) en peroxiredoxine 2 (PRDX2) expressies en modificatie tijdens het ovulatieproces bij ratten te onderzoeken.",
"De mRNA-profiler array toonde meer dan 2-voudige differentiële expressie van 32 genen gerelateerd aan oxidatieve stress in niet-gestimuleerde moDCs, inclusief peroxiredoxine-2 (PRDX2), een enzym dat waterstofperoxide en lipideperoxiden reduceert.",
"Peroxiredoxine-2 (Prx-2) is een overvloedig voorkomend zoogdierenzym dat beschermt tegen oxidatieve stress.",
"Peroxiredoxine 2 (PRDX2) staat bekend als een antioxidant enzym waarvan de hoofdfunctie de reductie van H(2)O(2) in cellen is.",
"Deze gegevens geven aan dat Srx1-activiteit muizen beschermt tegen de dodelijkheid van endotoxische shock, waarbij dit enzym wordt toegevoegd aan andere gastheerfactoren, zoals NRF2 en peroxiredoxine 2, die door het reguleren van cellulair reactief zuurstofniveau fungeren als belangrijke modificeerders in de pathogenese van sepsis.",
"Een van de geïdentificeerde eiwitten was peroxiredoxine 2 (Prx2), een antioxidant enzym.",
"Peroxiredoxine-2 (Prdx2), een krachtige peroxide-reducent, is het derde meest overvloedige eiwit in de erytrocyt en wordt verondersteld een grote rol te spelen in de oxidatieve verdediging van de cel.",
"Belangrijk is dat we ook aantonen dat het antioxidant enzym Prx2 (peroxiredoxine 2) een kritisch cytoplasmatisch doelwit is van cdk5.",
"Menselijke erytrocyt peroxiredoxine 2 (Prx2) is een typische 2-cys cytosolische peroxiredoxine met thiol-afhankelijke waterstofperoxide vangstactiviteit.",
"Peroxiredoxine 2 (Prx2) is een antioxidant enzym dat cysteïneresiduen gebruikt om peroxiden af te breken.",
"Peroxiredoxine 2 (PRDX2), een antioxidant enzym, was het meest opgereguleerd terwijl tribbles homolog 3 (TRB3), een pro-apoptotisch eiwit, het meest omlaag gereguleerd was, wat wijst op een gunstig effect van lithium op neuronale cellen.",
"Na 5 Gy bestraling nam de relatieve hoeveelheid peroxiredoxine 2, een antioxidant enzym, en latexine, een remmer van carboxypeptidase, toe.",
"Peroxiredoxine 2 (Prx2), een thiol-afhankelijke peroxidase, is het derde meest overvloedige eiwit in de erytrocyt, en het ontbreken ervan in knock-out muizen leidt tot hemolytische anemie.",
"Suppressie subtractieve hybridisatie uitgevoerd op Downsyndroom (DS) versus controle foetale hersenen toonde differentiële expressie van peroxiredoxine 2 (PRDX2), gelokaliseerd op 13q12. Peroxiredoxines zijn antioxidant enzymen betrokken bij de bescherming van eiwitten en lipiden tegen oxidatieve schade en in cellulaire signaalroutes die apoptose reguleren. T"
] | 402
| 403
|
930
|
Is de lengte van de poly(A)-staart betrokken bij menselijke ziekten?
|
Ja. Ernstig verkorte poly(A)-staarten van mitochondriale mRNA's bleken betrokken te zijn bij een autosomaal recessieve spastische ataxie met optische atrofie.
|
[
"In menselijke mitochondriën is polyadenylering van mRNA, uitgevoerd door de in de kern gecodeerde mitochondriale poly(A) RNA-polymerase, essentieel voor het behoud van mitochondriale genexpressie. Ons moleculair onderzoek van een autosomaal recessieve spastische ataxie met optische atrofie, aanwezig bij de Old Order Amish, identificeerde een mutatie in MTPAP die geassocieerd is met het ziektefenotype. Bij poly(A)-staartlengte-assays bleken mitochondriale mRNA's van getroffen individuen ernstig verkorte poly(A)-staarten te hebben."
] | 98
| 94
|
931
|
Waarom grafische verwerkingseenheden (GPU's) geschikter zijn voor biologische taken dan centrale verwerkingseenheden (CPU's)?
|
Traditionele centrale verwerkingseenheden (CPU's) bereiken hun limiet in verwerkingskracht en zijn niet primair ontworpen voor multithreaded toepassingen. Grafische verwerkingseenheden (GPU's) daarentegen zijn betaalbare, schaalbare computerkrachtpatsers die, dankzij de steeds toenemende vraag naar hogere kwaliteit graphics, hun limiet nog niet hebben bereikt. Typisch hebben high-end CPU's 8-16 cores, terwijl GPU's meer dan 2.500 cores kunnen hebben. GPU's zijn ook, van ontwerp uit, sterk parallel, multicore en multithreaded, en kunnen duizenden threads aan die dezelfde berekening uitvoeren op verschillende subsets van een grote dataset. Deze capaciteit maakt ze perfect geschikt voor biologische analysetaken. Onlangs is dit potentieel door veel bio-informatica onderzoekers gerealiseerd en is een grote verscheidenheid aan tools en algoritmen naar GPU's overgezet, of vanaf de basis ontworpen om het gebruik van beschikbare cores te maximaliseren.
|
[
"De globale snelheidsverhogingen van 22,11, 38,80 en 44,80 werden gevonden door de parallelle berekening van één GPU, twee GPU's met een exacte rotatie-operator, en twee GPU-versies met een benaderende rotatie-operator te vergelijken met seriële berekening op de CPU.",
"Evalueer het gebruik van general-purpose graphics processing units (GPGPU's) om de prestaties van MODFLOW te verbeteren; een ongestructureerde preconditioned conjugate gradient (UPCG) solver is ontwikkeld.",
"De UPCG solver gebruikt een compressed sparse row opslagmethode en omvat Jacobi, zero fill-in incomplete, en modified-incomplete lower-upper (LU) factorisatie, en gegeneraliseerde least-squares polynomiale preconditioners. De UPCG solver bevat ook opties voor sequentiële en parallelle oplossing op de centrale verwerkingseenheid (CPU) met OpenMP.",
"Tests geven aan dat GPGPU-snelheidsverhogingen van de orde 2 tot 8, ten opzichte van de standaard MODFLOW preconditioned conjugate gradient (PCG) solver, kunnen worden bereikt wanneer (1) geheugenoverdrachten tussen CPU en GPGPU geoptimaliseerd zijn, (2) het percentage tijd besteed aan geheugenoverdrachten tussen CPU en GPGPU klein is ten opzichte van de rekentijd, (3) high-performance GPGPU-kaarten worden gebruikt, en (4) CPU-GPGPU combinaties worden ingezet om sequentiële operaties uit te voeren die moeilijk te paralleliseren zijn.",
"Een list-mode ToF OSEM bibliotheek is ontwikkeld op het GPU-CUDA platform. Onze studies tonen aan dat de GPU-hertaling aanzienlijk sneller is dan een single-threaded referentie CPU-methode, vooral voor ToF-verwerking, terwijl vrijwel identieke beelden worden geproduceerd.",
"Wanneer toegepast op lijnprojectieoperaties voor niet-ToF list-mode PET, is deze nieuwe GPU-CUDA methode >200 keer sneller dan een single-threaded referentie CPU-implementatie.",
"De GPU-gebaseerde parallelle implementatie van het Gillespie stochastische simulatie-algoritme (SSA), de logarithmische directe methode (LDM) en de next reaction methode (NRM) is ongeveer 85 keer sneller dan de sequentiële implementatie van de NRM op een centrale verwerkingseenheid (CPU).",
"Het verkennen van fundamentele biologische processen die de geforceerde ontknoping van multimerische eiwitten, de schuifbeweging in proteïnevezels en de mechanische vervorming van biomoleculaire assemblages onder fysiologische krachten omvat, is uitdagend zelfs voor gedistribueerde computersystemen.",
"We hebben de computationele prestaties van een end-to-end toepassing van het programma beoordeeld, waarbij alle stappen van het algoritme op een GPU draaien, door de simulatie tijd en geheugengebruik te profileren voor een aantal testsystemen.",
"Onze resultaten tonen aan dat GPGPU's aanzienlijke snelheidsverhoging kunnen bieden ten opzichte van conventionele processors.",
"Verken de kracht en haalbaarheid van het gebruik van programmeerbare grafische verwerkingseenheden (GPU's) voor real-time rendering en het weergeven van grote 3D medische datasets voor stereoscopische display werkstations.",
"De prestaties van rendering en weergave werden gemeten en vergeleken tussen GPU-gebaseerde en centrale verwerkingseenheid (CPU)-gebaseerde programmering. De resultaten geven aan dat GPU-gebaseerde programmering in staat was om grote 3D datasets in real-time interactieve snelheden te renderen met stereografische displays."
] | 576
| 551
|
932
|
Welke schildklierhormoonanalogen worden gebruikt in humane studies?
|
TRIAC en TETRAC zijn twee verschillende schildklierhormoonanalogen die worden gebruikt in humane studies
|
[
"Hier evalueren we het therapeutische potentieel van het TH-analoog 3,5,3',5'-tetraiodothyroazijnzuur (tetrac) als vervanging voor T(4) in de hersenontwikkeling.",
"Deze behandeling was voldoende om TH-afhankelijke neuronale differentiatie in het cerebellum, de cerebrale cortex en het striatum te bevorderen, maar was niet effectief in het onderdrukken van hypothalamische TRH-expressie.",
"In de huidige studie onderzochten we het effect van een natuurlijk schildklierhormoonanaloog - 3,3?,5-trijodothyroazijnzuur (TRIAC) op het reguleren van proliferatie en differentiatie en het mogelijke moleculaire mechanisme in normale menselijke epidermale keratinocyten en C57BL/6-muizen.",
"TRIAC was effectief en veilig in het verbeteren van de effecten van hyperthyreoïdie en ADHD-symptomen bij een kind met bekende genetische RTH."
] | 124
| 118
|
933
|
Hebben patiënten met het Marfan-syndroom een verhoogd risico op hartritmestoornissen?
|
Patiënten met het Marfan-syndroom hebben een verhoogd risico op hartritmestoornissen
|
[
"Het Marfan-syndroom (MFS) is een variabel, autosomaal dominant bindweefselziekte. Bij MFS kunnen ernstige ventriculaire aritmieën en plotselinge hartdood (SCD) optreden.",
"Patiënten met Marfan hebben een verhoogd risico op hartritmestoornissen.",
"Ventriculaire aritmieën werden aangetroffen bij 21% en waren geassocieerd met een vergrote linker ventrikel, mitralisklep prolaps en afwijkingen in de repolarisatie.",
"Cardiale complicaties zijn zeldzaam bij jonge patiënten met het Marfan-syndroom die medische therapie en nauwlettende klinische follow-up ondergaan. Plotselinge dood komt nog steeds voor en lijkt vaker voor te komen bij patiënten met een verwijd linker ventrikel. Linker ventrikel dilatatie kan predisponeren tot veranderingen in de repolarisatie en fatale ventriculaire aritmieën."
] | 113
| 116
|
934
|
Wat zijn de behandelingen van keuze voor GIST (gastro-intestinale stromale tumor)?
|
De chirurgische resectie is een behandeling van keuze voor gastro-intestinale stromale tumoren. Er is aangetoond dat adequate chirurgische resectie correleert met hoge 5-jaars overlevingspercentages voor patiënten met maag-GIST. Wanneer ze gelokaliseerd zijn, is de behandeling van keuze chirurgische excisie, maar gevorderde tumoren reageren beperkt op chemotherapie of radiotherapie. Imatinib (STI571 of Glivec) is een selectieve remmer van tyrosinekinase-eiwitten die met succes is gebruikt bij de behandeling van gevorderde GIST.
|
[
"Traditioneel is de behandeling van keuze voor primaire ziekte chirurgische resectie",
"geen enkele chirurg of instelling krijgt uitgebreide ervaring met deze patiënten, waardoor passende besluitvorming moeilijk is, vooral sinds de introductie van de tyrosinekinase-remmer imatinib, die een belangrijk aanvullend beheersinstrument is geworden",
"Chirurgie gericht op een R0-resectie blijft de hoeksteen van de behandeling.",
"De behandeling van keuze voor GIST is chirurgische resectie",
"Extra-luminale colische gastro-intestinale stromale tumoren zijn zeer zeldzaam en kunnen zich presenteren als een buikmassa. Resectie is de behandeling van keuze.",
"Chirurgie blijft de enige curatieve behandeling voor gastro-intestinale stromale tumoren (GIST).",
"Wanneer ze gelokaliseerd zijn, is de behandeling van keuze chirurgische excisie, maar gevorderde tumoren reageren beperkt op chemotherapie of radiotherapie. Imatinib (STI571 of Glivec) is een selectieve remmer van tyrosinekinase-eiwitten die met succes is gebruikt bij de behandeling van gevorderde GIST.",
"Daarom kan Imatinib een therapeutisch alternatief zijn bij patiënten met gemetastaseerde GIST.",
"De chirurgische resectie is een behandeling van keuze voor gastro-intestinale stromale tumoren. Er is aangetoond dat adequate chirurgische resectie correleert met hoge 5-jaars overlevingspercentages voor patiënten met maag-GIST.",
"Ongeveer 80% van de patiënten met gemetastaseerde GIST profiteert van imatinib, hoewel verworven resistentie tegen het middel kan ontstaan. Voor patiënten met primaire GIST blijft chirurgie de behandeling van keuze, en of de uitkomst verbetert door adjuvante imatinib wordt momenteel uitgebreid onderzocht.",
"De combinatie van imatinib-therapie en chirurgie kan ook effectief zijn bij een subset van patiënten met gemetastaseerde of niet-reseceerbare primaire GIST."
] | 327
| 306
|
935
|
Lijst Kartagener-syndroom triade.
|
De triade van situs inversus, bronchiectasie en sinusitis staat bekend als het Kartagener-syndroom.
|
[
"De triade van situs inversus, bronchiectasie en sinusitis staat bekend als het Kartagener-syndroom.",
"ACHTERGROND: KARTAGENER-SYNDROOM (KS) IS EEN ZELDZAME AANGEBOREN AANDOENING GEKENMERKT DOOR EEN KLINISCHE TRIAD VAN SYMPTOMEN: situs inversus, chronische rhinosinusitis en bronchiectasie.",
"Het Kartagener-syndroom is een zeer zeldzame aangeboren afwijking bestaande uit een klassieke triade van sinusitis, situs inversus en bronchiectasie.",
"We presenteren een geval van een patiënt met klinisch zekere ALS, die eerder leed aan het Kartagener-syndroom, dat wordt gekenmerkt door de triade bestaande uit chronische sinusitis, bronchiectasie en situs inversus.",
"Het Kartagener-syndroom (KS), een autosomaal recessief overervende aandoening, wordt gekenmerkt door de triade van situs inversus, bronchiectasie en sinusitis.",
"In 1933 rapporteerde Manes Kartagener, een longarts uit Zürich, vier patiënten met de triade van sinusitis, bronchiectasie en situs inversus.",
"Er wordt een geval beschreven van een negen jaar en acht maanden oud kind met het Kartagener-syndroom (triade): chronische maxillaire sinusitis, bronchiectasie en \"situs inversus totalis\".",
"Het Kartagener-syndroom is een erfelijke aandoening die wordt gekenmerkt door een triade van symptomen—bronchiectasie, situs inversus en sinusitis—en wordt geclassificeerd als een immotiel ciliair syndroom.",
"Het Kartagener-syndroom wordt gekenmerkt door de klinische triade van bronchitis, sinusitis en situs inversus.",
"Het Kartagener-syndroom is een bekende klassieke triade van presentaties bestaande uit bronchiectasie, sinusitis en situs inversus.",
"Het Kartagener-syndroom is een zeldzame aandoening die wordt gekenmerkt door de triade van situs inversus, inclusief dextrocardie, bronchiectasie en paranasale sinusitis.",
"Het Kartagener-syndroom is een erfelijke aandoening die wordt gekenmerkt door een triade van symptomen: bronchiectasie, situs inversus en sinusitis als gevolg van defecte ciliaire beweeglijkheid.",
"Oor-, neus- en keelsymptomen en -tekens werden bestudeerd bij 15 patiënten met het Kartagener-syndroom: een triade bestaande uit chronische rhinosinusitis, chronische bronchitis met bronchiectasie en situs inversus.",
"Het Kartagener-syndroom (een klinische variant van primaire ciliaire dyskinesie) is een autosomaal recessieve aandoening die wordt gekenmerkt door de triade van chronische sinusitis, bronchiectasie en situs inversus met dextrocardie.",
"Het Kartagener-syndroom is een zeldzame autosomaal recessieve aandoening bestaande uit de triade van sinusitis, bronchiectasie en situs inversus met dextrocardie.",
"Het Kartagener-syndroom (KS), een autosomaal recessief overervende aandoening, wordt gekenmerkt door de triade van situs inversus, bronchiectasie en sinusitis.",
"Het Kartagener-syndroom is een erfelijke aandoening die wordt gekenmerkt door een triade van symptomen—bronchiectasie, situs inversus en sinusitis—en wordt geclassificeerd als een immotiel ciliair syndroom.",
"Het Kartagener-syndroom is een zeer zeldzame aangeboren afwijking bestaande uit een klassieke triade van sinusitis, situs inversus en bronchiectasie.",
"Een uitgebreide klinisch-morfologische studie van 24 kinderen met het Zivert-Kartagener-syndroom bevestigde de volledige triade (bronchiectasie, onderontwikkeling van de sinussen en transpositie van de ingewanden) bij allen.",
"De triade situs viscerum inversus, bronchiectasie en sinusitis staat bekend als het Kartagener-syndroom.",
"We presenteren een geval van een patiënt met klinisch zekere ALS, die eerder leed aan het Kartagener-syndroom, dat wordt gekenmerkt door de triade bestaande uit chronische sinusitis, bronchiectasie en situs inversus. Recente linkage- en mutatieanalyses identificeerden verschillende genen die verantwoordelijk zijn voor het Kartagener-syndroom."
] | 462
| 466
|
936
|
Welke ziekte wordt geassocieerd met de ectopische expressie van het eiwit gecodeerd door het gen DUX4?
|
Facioscapulohumerale dystrofie (FSHD) is een progressieve spierdystrofie veroorzaakt door verminderde epigenetische repressie van de D4Z4 macrosatelliet herhalingen en ectopische expressie van DUX4, een retrogen dat een kiemlijn transcriptiefactor codeert die in elke herhaling aanwezig is.
|
[
"De expressie van DUX4 is bevestigd in zowel FSHD-cellen als biopsieën door verschillende laboratoria.",
"Deze resultaten geven aan dat moleculaire markers van de ziekte al tijdens het foetale leven tot expressie komen, wat een nieuw onderzoeksgebied opent voor mechanismen die leiden tot FSHD.",
"Facioscapulohumerale dystrofie (FSHD) is een progressieve spierdystrofie veroorzaakt door verminderde epigenetische repressie van de D4Z4 macrosatelliet herhalingen en ectopische expressie van DUX4, een retrogen dat een kiemlijn transcriptiefactor codeert die in elke herhaling aanwezig is.",
"DUX4, de primaire kandidaat voor de pathogenese van FSHD, is meer dan tien keer verhoogd in FSHD-myoblasten en myotuben met korte telomeren, en de expressie ervan is omgekeerd evenredig met de telomeerlengte. FSHD kan de eerste bekende menselijke ziekte zijn waarbij telomeerpositie-effect (TPE) bijdraagt aan het leeftijdsgerelateerde fenotype.",
"De opregulatie van het DUX4-retrogen uit de laatste D4Z4 herhaalde eenheid wordt verondersteld ten grondslag te liggen aan de pathofysiologie van FSHD. Echter, niemand weet wat het spieraandoening veroorzaakt en wanneer de afwijking ontstaat.",
"Recente studies hebben een plausibel ziekte mechanisme voor FSHD geleverd waarin FSHD het gevolg is van ongepaste expressie van de kiemlijn transcriptiefactor DUX4.",
"Recente studies hebben voorgesteld dat de pathologie van FSHD wordt veroorzaakt door de misexpressie van het DUX4 (double homeobox 4) gen, resulterend in de productie van een pathogeen eiwit, DUX4-FL, dat is gedetecteerd in FSHD, maar niet in niet-aangedane controle myogene cellen en spierweefsel.",
"DUX4, een homeobox-bevattend gen aanwezig in een tandemreeks, wordt in verband gebracht met facioscapulohumerale spierdystrofie (FSHD), een autosomaal dominante ziekte.",
"Facioscapulohumerale ziekte (FSHD) is een dominant overervende progressieve myopathie geassocieerd met aberrante productie van de transcriptiefactor Double Homeobox Protein 4 (DUX4).",
"Een DUX4-transcript afkomstig van de laatste herhalingseenheid in een ingekorte reeks wordt geassocieerd met pathogenese, maar het is onduidelijk hoe.",
"Het pathogene effect van DUX4 in FSHD kan tijdelijk optreden bij of vóór het stadium van myoblastvorming om een cascade van gen dysregulatie te initiëren. Dit staat in contrast met de huidige nadruk op toxische effecten van experimenteel opgehoogde DUX4-expressie in de myoblast- of myotubestadia.",
"Double homeobox 4 (DUX4) is een kandidaat-ziektegen voor facioscapulohumerale dystrofie (FSHD), een van de meest voorkomende spierdystrofieën gekenmerkt door progressieve skeletspierdegeneratie.",
"Bij FSHD resulteert de combinatie van inefficiënte chromatinesilencing van de D4Z4-herhaling en polymorfismen op de FSHD-permissieve allelen die de DUX4-mRNA's stabiliseren die uit de herhaling voortkomen, in ongepaste DUX4-eiwitexpressie in spiercellen.",
"Bij facioscapulohumerale spierdystrofie wijzen recente bevindingen op een gestabiliseerd DUX4-transcript binnen de ingekorte D4Z4-herhalingen, wat de deur opent voor een RNA-interferentie behandelstrategie.",
"Abnormale expressie van DUX4 uit de laatste eenheid van de D4Z4-reeks wordt voorgesteld als de oorzaak van FSHD.",
"Paired-like homeodomain transcriptiefactor 1 (PITX1) werd voorgesteld als onderdeel van de ziekte mechanismen van facioscapulohumerale spierdystrofie (FSHD).",
"Facioscapulohumerale spierdystrofie type 1 (FSHD1) wordt veroorzaakt door contractie van de D4Z4-herhalingsreeks op chromosoom 4 tot een grootte van 1-10 eenheden. Het resterende aantal D4Z4-eenheden correleert omgekeerd met de klinische ernst, maar er bestaat aanzienlijke klinische variabiliteit. Elke eenheid bevat een kopie van het DUX4-retrogen.",
"Facioscapulohumerale spierdystrofie is genetisch gekoppeld aan een verminderd aantal (≤ 8) D4Z4-herhalingen op 4q35 gecombineerd met het 4A(159/161/168) DUX4 polyadenyleringssignaal haplotype.",
"Facioscapulohumerale spierdystrofie (FSHD) is een van de meest voorkomende volwassen spierdystrofieën.",
"We richten ons voornamelijk op de expressie van DUX4-isoformen omdat de expressie van DUX4 is bevestigd in zowel FSHD-cellen als biopsieën door verschillende laboratoria.",
"Facio-scapulo-humerale dystrofie (FSHD) ontstaat door deleties in de subtelomerische macrosatelliet D4Z4-reeks op de 4q35-regio. Opregulatie van het DUX4-retrogen uit de laatste D4Z4-herhaalde eenheid wordt verondersteld ten grondslag te liggen aan de pathofysiologie van FSHD.",
"Facioscapulohumerale spierdystrofie (FSHD) is een veelvoorkomende vorm van spierdystrofie gekenmerkt door asymmetrische progressieve zwakte en atrofie van de gezichtsspieren, schouder- en bovenarmspieren, vaak vergezeld van gehoorverlies en retinale vasculopathie. FSHD is een autosomaal dominante ziekte gekoppeld aan chromosoom 4q35, maar het veroorzakende gen blijft controversieel. DUX4 is een leidende kandidaat als veroorzaker van FSHD. Echter, DUX4-expressie is extreem laag in FSHD-spier, en er is geen DUX4-diermodel dat de pathologie bij menselijke FSHD weerspiegelt. Hier tonen we aan dat de misexpressie van zeer lage niveaus van menselijk DUX4 in zebravisontwikkeling de fenotypen nabootst die worden gezien bij menselijke FSHD-patiënten.",
"Onze resultaten suggereren dat de misexpressie van DUX4-fl, zelfs op extreem laag niveau, het fenotype kan nabootsen dat wordt waargenomen bij FSHD-patiënten in een gewerveld model. Deze resultaten ondersteunen sterk de huidige hypothese voor een rol van DUX4 in de pathogenese van FSHD.",
"DUX4, een homeobox-bevattend gen aanwezig in een tandemreeks, wordt in verband gebracht met facioscapulohumerale spierdystrofie (FSHD), een autosomaal dominante ziekte.",
"Facioscapulohumerale ziekte (FSHD) is een dominant overervende progressieve myopathie geassocieerd met aberrante productie van de transcriptiefactor Double Homeobox Protein 4 (DUX4). De expressie van DUX4 is afhankelijk van een open chromatinestructuur van de D4Z4 macrosatellietreeks en een specifiek haplotype op chromosoom 4.",
"Zelfs wanneer aan deze vereisten wordt voldaan, zijn DUX4-transcripten en eiwit alleen detecteerbaar in een subset van cellen, wat aangeeft dat aanvullende beperkingen de productie van DUX4 reguleren.",
"Autosomaal dominante facioscapulohumerale spierdystrofie (FSHD) heeft een ongewoon pathogenetisch mechanisme. FSHD wordt veroorzaakt door deletie van een subset van D4Z4 macrosatelliet herhalingseenheden in de subtelomeer van chromosoom 4q. Recente studies leveren overtuigend bewijs dat een retrogetransponeerd gen in de D4Z4-herhaling, DUX4, wordt tot expressie gebracht in de menselijke kiemlijn en vervolgens epigenetisch wordt gesilenced in somatische weefsels.",
"Facioscapulohumerale spierdystrofie (FSHD) is een dominante ziekte gekoppeld aan contracties van de D4Z4-herhalingsreeks in 4q35. We hebben eerder een double homeobox-gen (DUX4) geïdentificeerd binnen elke D4Z4-eenheid dat een transcriptiefactor codeert die tot expressie komt in FSHD maar niet in controle-myoblasten. DUX4 en zijn doelgenen dragen bij aan de globale dysregulatie van genexpressie die wordt waargenomen in FSHD.",
"Facioscapulohumerale spierdystrofie (FSHD) is een autosomaal dominante aandoening gekoppeld aan contracties van de D4Z4-herhalingsreeks in de subtelomerische regio van chromosoom 4q.",
"Daarnaast toonden we aan dat het double homeobox 4-gen (DUX4), dat binnen de D4Z4-herhalingseenheid ligt, was opgereguleerd in myoblasten van patiënten op zowel mRNA- als eiwitniveau.",
"Onze resultaten suggereren dat de opregulatie van zowel DUX4 als PITX1 in FSHD-spieren mogelijk een cruciale rol speelt in de moleculaire mechanismen van de ziekte.",
"Facioscapulohumerale dystrofie (FSHD) wordt gekenmerkt door chromatineontspanning van de D4Z4 macrosatellietreeks op chromosoom 4 en expressie van het D4Z4-gecodeerde DUX4-gen in skeletspier.",
"Facioscapulohumerale dystrofie (FSHD) is een progressieve spierdystrofie veroorzaakt door verminderde epigenetische repressie van de D4Z4 macrosatelliet herhalingen en ectopische expressie van DUX4, een retrogen dat een kiemlijn transcriptiefactor codeert die in elke herhaling aanwezig is."
] | 1,109
| 1,068
|
937
|
Welke G-eiwit is essentieel voor de vorming en functie van lamellipodia?
|
De rekrutering van het kleine G-eiwit Rac1 naar het plasmamembraan is essentieel voor het induceren van de lokale vorming van gespecialiseerde cellulaire processen die lamellipodia worden genoemd.
|
[
"We hebben specifiek vastgesteld dat het Spa-homologiedomein (aa 250-420) van GIT1 vereist is voor de lokalisatie van het GIT1-cortactinecomplex aan de voorste rand. De mechanismen omvatten extracellulaire signaal-gereguleerde kinasen 1 en 2-gemedieerde Cortactine-S405 fosforylering en activatie van Rac1/Cdc42.",
"We toonden de bruikbaarheid van dit systeem aan met LAD-constructen die het kleine G-eiwit Rac1 naar het plasmamembraan kunnen rekruteren en de lokale vorming van lamellipodia kunnen induceren als reactie op gerichte belichting.",
"We ontdekten dat fibroblasten van EDG-1 null embryo's niet migreerden naar PDGF of SPP, en remming van de beweeglijkheid correleerde met defecte activatie van het kleine guanosinetrifosfatase Rac, dat vereist is voor de vorming van lamellipodia en directionele locomotie.",
"Verwijdering van edg-1 of remming van sphingosine kinase onderdrukte chemotaxis naar PDGF en ook de activatie van het kleine guanosinetrifosfatase Rac, dat essentieel is voor de uitstulping van lamellipodia en voorwaartse beweging.",
"Bewijs uit deze modellen geeft aan dat migratie een zeer complex proces is, dat waarschijnlijk de strak gecontroleerde ruimtelijke en temporele interactie van meerdere factoren omvat:",
"(v) moleculen die de cytoskeletfunctie reguleren (bijv. Rac), wat de vorming van gespecialiseerde cellulaire processen genaamd lamellipodia mogelijk maakt."
] | 212
| 218
|
938
|
Wat zijn de belangrijkste functies van de APOBEC3-familie van eiwitten?
|
De APOBEC3-familie van cytidine deaminases speelt een cruciale rol in de gastheer-gemedieerde verdediging tegen exogene virussen, met name het humaan immunodeficiëntievirus type 1 (HIV-1), en endogene transposabele elementen, zoals LINE-1 en Alu-retrotransposons.
|
[
"De APOBEC3-cytidine deaminases spelen een cruciale rol in de gastheer-gemedieerde verdediging tegen exogene virussen, met name het humaan immunodeficiëntievirus type 1 (HIV-1) en endogene transposabele elementen",
"de identificatie van APOBEC3G (A3G) als een krachtige restrictiefactor van HIV-1",
"extra A3-familieleden zijn geïdentificeerd als antivirale eiwitten, mechanistische details van het restrictieve vermogen van deze eiwitten zijn opgehelderd",
"Menselijke APOBEC3 (A3) eiwitten zijn cellulaire cytidine deaminases die de replicatie van retrovirussen krachtig beperken door virale cDNA te hypermuteren en/of reverse transcriptie te remmen",
"A3F en A3G zijn de krachtigste remmers van HIV-1",
"APOBEC3A is een specifieke remmer van de vroege fasen van HIV-1-infectie in myeloïde cellen",
"we tonen aan dat de pool van APOBEC3A in doelcellen de vroege fasen van HIV-1-infectie remt",
"Onze resultaten geven aan dat APOBEC3A een eerder niet-erkende antivirale factor is die primatenlentivirussen specifiek in myeloïde cellen aanvalt en die werkt tijdens de vroege fasen van infectie direct in doelcellen",
"Foamy virus Bet-eiwitten functioneren als nieuwe remmers van de APOBEC3-familie van aangeboren antiretrovirale verdedigingsfactoren.",
"Deze remming correleerde met het inpakken van remmende APOBEC3-eiwitten in PFV-virions, door een specifieke PFV Gag/APOBEC3-interactie, en resulteerde in de G naar A-hypermutatie van PFV reverse-transcripten",
"[Antivirale verdediging door APOBEC3-familie-eiwitten].",
"Alle APOBEC3-familie-eiwitten remmen LINE-1-retrotranspositie verschillend.",
"Deze bevindingen roepen de mogelijkheid op dat de verschillende APOBEC3-familieleden functioneren om specifieke lentivirussen te neutraliseren."
] | 265
| 243
|
939
|
Welke histonmodificaties worden geassocieerd met constitutief heterochromatine?
|
Sterke methylatie op H3 lysine 9 kwam bij voorkeur voor in heterochromatische chromocentra van Arabidopsis-nuclei. Over het algemeen is heterochromatine gekoppeld aan trimethylatie van H3 op lysine 9 en parsimonie-analyse toont aan dat histon H3K9-methylatie, naast histondeacetylatie, het evolutionair meest stabiele heterochromatische merkteken is. Klassieke histonmodificaties die geassocieerd zijn met heterochromatine omvatten ook H3K27me1 en H3K27me2. De functie van H3K36me3 is niet beperkt tot actief getranscribeerde regio's en kan bijdragen aan de samenstelling van heterochromatine. Andere histonmethylatie-merken die gewoonlijk in constitutief heterochromatine worden gevonden zijn H4K20me3, H3K9me3 en H3K79me3. H3S10P is een goede marker van pericentromerisch heterochromatine.
|
[
"Opmerkelijk is dat in somatische cellen van zoogdieren H3S10P begint in het pericentromerisch heterochromatine tijdens de late G2-fase, en dat fosforylering zich verspreidt over de chromosoomarmen in de profase, waarbij het behouden blijft tot het begin van de anafase wanneer het wordt gede-fosforyleerd.",
"Op basis van deze bevindingen geloven we dat H3S10P een goede marker is van pericentromerisch heterochromatine, vooral in de late 1- en 2-celligestadia, omdat het beide ouderlijke genomen labelt en dat het kan worden gebruikt om epigenetische regulatie en heterochromatine-mechanismen in vroege pre-implantatie-embryo's verder te onderzoeken.",
"3S10-fosforylering markeert constitutief heterochromatine tijdens de interfase in vroege muisembryo's tot het 4-celligestadium.",
"H3-trimethylatie op lysine 36 wordt geassocieerd met constitutief en facultatief heterochromatine.",
"We tonen hier aan dat het maternale Snurf-Snrpn 3-Mb gebied, dat wordt stilgelegd door een krachtig transcriptie-repressief mechanisme, uniform verrijkt is in histonmethylatie-merken die gewoonlijk in constitutief heterochromatine worden gevonden, zoals H4K20me3, H3K9me3 en H3K79me3.",
"We tonen aan dat de depositie van H3K36me3 binnen dit grote heterochromatine-domein niet correleert met transcriptie-activiteiten, wat suggereert dat er een alternatieve route bestaat voor de depositie van deze histonmodificatie.",
"Daarnaast tonen we aan dat H3K36me3 duidelijk verrijkt is op het niveau van pericentromerisch heterochromatine in muis embryonale stamcellen en fibroblasten.",
"Dit resultaat geeft aan dat H3K36me3 geassocieerd is met zowel facultatief als constitutief heterochromatine.",
"Onze gegevens suggereren dat de functie van H3K36me3 niet beperkt is tot actief getranscribeerde regio's en kan bijdragen aan de samenstelling van heterochromatine, in combinatie met andere histonmodificaties.",
"Accumulation van histon H3.3 en euchromatische histonmodificaties in pericentromerisch heterochromatine als reactie op een afname van DNA-methylatieniveaus.",
"In deze studie tonen we aan dat remming van DNA-methylatie in muisfibroblastcellen histonmodificatie en de subnucleaire lokalisatie van histon H3.3 beïnvloedt op een celcyclus-afhankelijke wijze.",
"Bovendien vonden we dat histon H3.3 werd gedeponeerd op het pericentromerisch heterochromatine vóór de accumulatie van de euchromatische histonmodificaties.",
"Klassieke histonmodificaties geassocieerd met heterochromatine, waaronder H3K9me2, H3K27me1 en H3K27me2, waren verspreid over zowel A- als B-chromosomen.",
"Echter, H3K27me2 vertoonde een verlaagd niveau op het B-chromosoom vergeleken met de A-chromosomen en was niet geassocieerd met sommige klassen van constitutief heterochromatine.",
"Recentelijk geanalyseerde H3K9-methyltransferases (HMTases) zoals SUV39H1, Clr4p, DIM-5, Su(var)3-9 of SUVH2 zijn verantwoordelijk voor de totstandbrenging van histon H3 lysine 9 methylatie (H3K9me), die nauw verbonden is met heterochromatinisatie.",
"Heterochromatische histon H3K9 methyltransferases hebben hun sporen achtergelaten.",
"Samenstelling en parsimonie-analyse tonen aan dat histon H3K9 methylatie, naast histondeacetylatie, het evolutionair meest stabiele heterochromatische merkteken is, dat wordt vastgesteld door ten minste twee subfamilies van gespecialiseerde heterochromatische HMTases in bijna alle bestudeerde eukaryoten.",
"Getrimethyliseerd H3(K9) markeert pericentromerisch constitutief heterochromatine en het mannelijke Y-chromosoom, terwijl H2A.Z dramatisch verminderd is op deze chromosomale locaties.",
"Van acht geteste antilichamen was dat voor histon H4 geacetyleerd op lysine 4, 8, 12 of 16 het beste om constitutief heterochromatine te onderscheiden van niet-uitgedrukt euchromatine, maar de verschillen in de mate van immunoprecipitatie van deze twee typen chromatine waren slechts bescheiden, hoewel zeer reproduceerbaar.",
"Daarnaast werd immunocytochemische analyse uitgevoerd met een antilichaam tegen heterochromatine-eiwit 1alpha (HP1alpha), waarvan de voorkeurbinding aan heterochromatine is gekoppeld aan trimethylatie van H3 op lysine 9.",
"Onze gecombineerde ChIP- en immunocytochemische resultaten suggereren dat factoren anders dan hypoacetylatie van de N-terminale staarten van H4 en hypermethylatie van H3 op lysine 9 een belangrijke rol kunnen spelen bij het bepalen of een chromatinesequentie in zoogdiercellen constitutief heterochromatisch is.",
"Om de vermeende heterochromatinisatie te testen, kwantificeerden we chromatin immunoprecipitatie met een antilichaam voor geacetyleerd histon H4 dat onderscheid maakt tussen constitutief heterochromatine en niet-uitgedrukt euchromatine.",
"Hoge methylatie van H3 lysine 9 is niet noodzakelijk voor constitutief heterochromatine.",
"Sterke methylatie op H3 lysine 4 was beperkt tot euchromatine, terwijl sterke methylatie op H3 lysine 9 bij voorkeur voorkwam in heterochromatische chromocentra van Arabidopsis-nuclei."
] | 706
| 688
|
940
|
Wat is de belangrijkste toepassing van SWATH-MS in proteomica?
|
Met de methode genaamd SWATH-MS kan men monstersets onderzoeken op de aanwezigheid en hoeveelheid van in wezen elk eiwit van belang.
|
[
"het is een waardevolle bron voor de selectie van kandidaat-proteotypische peptiden voor gerichte proteomische experimenten via Selected Reaction Monitoring (SRM) of SWATH-MS",
"SWATH-MS is een data-onafhankelijke acquisitiemethode die, in één meting, een volledige registratie genereert van de fragmentionenspectra van alle analyten in een biologisch monster waarvoor de precursorionen binnen een vooraf bepaalde m/z versus retentietijd venster vallen.",
"Nieuwe strategieën, zoals SWATH™ MS, stellen ons in staat systematisch monstersets te karakteriseren en te kwantificeren van 'elk eiwit van belang' in complexe biologische monsters,",
"Hier presenteren we een nieuwe strategie die systematisch monstersets bevraagt op de aanwezigheid en hoeveelheid van in wezen elk eiwit van belang."
] | 139
| 129
|
941
|
Spelen selenoproteïnen en selenium een rol bij de preventie van prostaatkanker?
|
Nee, hoewel eerste epidemiologische studies bij mensen en op dier- en celgebaseerde modellen aangaven dat selenoproteïnen mogelijk beschermen tegen prostaatkanker, is meer onderzoek nodig om het begrip van seleniummetabolisme en de vereisten voor optimale gezondheid te verbeteren.
|
[
"De muizen die deficient waren in selenoproteïnen vertoonden een versnelde ontwikkeling van laesies die geassocieerd zijn met de progressie van prostaatkanker, wat selenoproteïnen impliceert in het risico en de ontwikkeling van kanker en de mogelijkheid opent dat selenium kanker voorkomt door het moduleren van de niveaus van deze selenoproteïnen.",
"Opmerkelijk en in tegenstelling tot eerdere studies waren RWPE-1 cellen significant gevoeliger voor seleniet dan een van de prostaatkankercellijnen. Deze resultaten tonen aan dat selenoproteïnen en seleniummetabolisme op meerdere niveaus gereguleerd worden in prostaatcellen.",
"In een populatie met lage seleniumspiegels lopen mannen met SOD2-Ala16+ die homozygoot zijn voor SEPP1-Ala234 een verhoogd risico op prostaatkanker/agressieve prostaatkanker, vooral als ze ooit rokers zijn geweest, omdat ze waarschijnlijk meer mitochondriaal H(2)O(2) produceren dat ze niet kunnen verwijderen, wat de proliferatie en migratie van prostaattumorcellen bevordert.",
"Onze resultaten ondersteunen een rol van selenium en polymorfismen in seleno-enzymen in de etiologie van prostaatkanker, wat bevestiging verdient in toekomstige studies.",
"Deze studie levert bewijs dat genetische variatie in SEP15 mogelijk invloed heeft op de mortaliteit door prostaatkanker. Daarnaast werd de associatie van selenium met prostaatkankermortaliteit beïnvloed door een variant, wat suggereert dat sommige mannen met prostaatkanker meer baat kunnen hebben bij selenium dan anderen, afhankelijk van hun genotype.",
"We concluderen dat een verlaagde SEPP-concentratie in serum mogelijk een aanvullende waardevolle marker is voor de diagnostiek van prostaatkanker.",
"De recent afgeronde Selenium and Vitamin E Cancer Prevention Trial (SELECT) was een van de grootste kankerpreventiestudies bij mensen ooit uitgevoerd. Het doel was de rol van selenium en vitamine E in de preventie van prostaatkanker te beoordelen, maar SELECT vond geen afname van prostaatkanker.",
"We bestudeerden Se-niveaus in vol bloed, plasma en prostaat van 32 PC- en 40 patiënten met goedaardige prostaatvergroting (BPH) en in de controlegroep bestaande uit 39 gezonde proefpersonen. Het seleno-enzym glutathionperoxidase (GSH-Px) werd ook gemeten in de rode bloedcellen, plasma en prostaatweefsel van de patiënten. De Se-concentratie in vol bloed en plasma was in beide patiëntengroepen lager vergeleken met de controles, terwijl deze in de prostaatklier significant hoger was bij PC-patiënten dan bij BPH-patiënten en controles. De activiteit van rode bloedcel GSH-Px was gelijk bij PC-patiënten en controles, maar significant lager bij BPH-patiënten.",
"Van bijzonder belang was de positieve correlatie tussen de GPx-activiteit in het weefsel en de Gleason-score, waarbij deze relatie statistisch significant was onder Afro-Amerikanen (r = 0,67, P = 0,02)."
] | 409
| 422
|
942
|
Waar kan Nothobranchius furzeri als modelsysteem voor worden gebruikt?
|
N. furzeri is een interessant modelsysteem om de effecten van experimentele manipulaties op levensduur en leeftijdsgerelateerde pathologieën te onderzoeken.
N. furzeri zou een modelsysteem kunnen zijn voor het bestuderen van de genetische controle van levensgeschiedeniskenmerken in natuurlijke populaties.
N. furzeri kan een zeer nuttig model zijn voor vergelijkende genomica van veroudering.
Het kan worden gebruikt om de effecten van experimentele manipulatie op veroudering en farmacologisch onderzoek te testen.
|
[
"De kortlevende jaarlijkse vis Nothobranchius furzeri vertoont een extreem korte levensduur in gevangenschap en versnelde expressie van leeftijdsmarkers, waardoor het een interessant modelsysteem is om de effecten van experimentele manipulaties op levensduur en leeftijdsgerelateerde pathologieën te onderzoeken.",
"Vanwege grote verschillen in verouderingsfenotypen in verschillende lijnen, zou N. furzeri een modelsysteem kunnen zijn voor het bestuderen van de genetische controle van levensgeschiedeniskenmerken in natuurlijke populaties.",
"Het staat zeer dicht bij de Japanse Medaka, en dicht bij de kogelvissen en stekelbaars en zou een zeer nuttig model kunnen zijn voor vergelijkende genomica van veroudering.",
"In de afgelopen drie jaar is N. furzeri van een biologische curiositeit uitgegroeid tot een veelbelovend modelsysteem voor medicijnvalidatie.",
"Dit resultaat identificeert resveratrol als de eerste molecule die consequent veroudering vertraagt in organismen zo divers als gist, worm, vlieg en vis, maar het onthult ook het potentieel van deze kortlevende vis als een diermodel voor farmacologisch onderzoek. Bovendien, omdat het verwant is aan stekelbaars (Gasterosteus aculeatus), de \"kogelvissen\" Takifugu en Tetraodon, en nog nauwer verwant aan medaka (Oryzias latipes), kan het sterk profiteren van de recente ontwikkeling van genomische bronnen voor deze vismodellen en in de toekomst een compleet modelsysteem worden voor de verouderingsonderzoeksgemeenschap.",
"Deze vissen kunnen uitstekende modellen worden voor verouderingsstudies. Ze kunnen worden gebruikt om de effecten van experimentele manipulatie op veroudering te testen in een tempo vergelijkbaar met dat van Drosophila en om de effecten van natuurlijke selectie op de evolutie van verouderingsgerelateerde genen te onderzoeken."
] | 311
| 308
|
943
|
Wat is de functie van TALENs?
|
Deze chimere enzymen kunnen worden gebruikt om een dubbele strengbreuk in te brengen op een specifieke genomische locatie, die vervolgens het substraat kan worden voor foutgevoelige non-homologe end-joining (NHEJ), waardoor mutaties ontstaan op de plaats van knippen. Kunstmatige transcriptie-activator-achtige effector nucleasen (TALENs) bieden een krachtige nieuwe benadering voor gerichte genoombewerking van zebravissen en functionele genomische toepassingen. Transcriptie-activator-achtige effector nucleasen (TALENs) bestaan uit een nuclease-domein dat is gefuseerd met een DNA-bindend domein dat is ontworpen om aan elke genomische sequentie te binden. Transcriptie-activator-achtige effector nucleasen (TALENs) zijn programmeerbare nucleasen die FokI endonuclease combineren met het modulaire DNA-bindende domein van TALEs.
|
[
"Transcriptie-activator-achtige effector nucleasen (TALENs) zijn programmeerbare nucleasen die FokI endonuclease combineren met het modulaire DNA-bindende domein van TALEs"
] | 124
| 122
|
944
|
Is eiwitcitrullinatie betrokken bij reumatoïde artritis?
|
Ja, eiwitcitrullinatie is betrokken bij reumatoïde artritis.
|
[
": Citrullinatie is de afgelopen jaren een hot topic geworden vanwege de betrokkenheid bij ziekten zoals reumatoïde artritis (RA), multiple sclerose en fibrose.",
"Huidige literatuur suggereert dat verhoogde niveaus van gecitrullineerde eiwitten worden gevonden in verschillende, zo niet alle, inflammatoire ziekten.",
"Antistoffen gericht tegen gecitrullineerde eiwitten en peptiden (ACPAs) zijn de meest specifieke serologische markers die beschikbaar zijn voor het diagnosticeren van RA.",
"Citrullinatie van eiwitten is goed beschreven bij reumatoïde artritis (RA), en hypercitrullinatie van eiwitten kan gerelateerd zijn aan ontsteking in het algemeen.",
"Sommige ACPA's zijn opmerkelijk effectief als diagnostiek bij auto-immuunziekten, met name reumatoïde artritis (RA). Verschillende ACPA's kunnen worden waargenomen voordat andere klinische RA-manifestaties duidelijk zijn.",
"Reumatoïde artritis (RA) is een chronische auto-immuunziekte die wordt gekenmerkt door de aanwezigheid van reumafactor (RF) en anti-gecitrullineerde eiwit/peptide autoantistoffen (ACPAs).",
"Anti-gecitrullineerde peptiden als auto-antigenen bij reumatoïde artritis - relevantie voor behandeling.",
"De implicaties van citrullinatie die de integrinebinding beïnvloedt bij ziekte openen een nieuw studiegebied en kunnen gevolgen hebben voor de pathogenese van inflammatoire ziekten zoals reumatoïde artritis en parodontitis.",
"In dit artikel zullen we de drie belangrijkste klassen van post-translationele modificaties (PTM's) die al geassocieerd zijn met RA bespreken: citrullinatie, carbamylatie en oxidatie.",
"Gecitrullineerd collageen II (CII) is een bekend auto-antigeen bij reumatoïde artritis (RA).",
"Onder de RA-geassocieerde autoantistoffen zijn vooral anti-gecitrullineerde eiwitantistoffen (ACPAs) intensief bestudeerd in het afgelopen decennium.",
"Eiwitcitrullinatie is een post-translationele modificatie die steeds meer aandacht krijgt, vooral vanwege de betrokkenheid bij reumatoïde artritis (RA).",
"Identificatie van gecitrullineerd cellulair fibronectine in synoviaal vocht van patiënten met reumatoïde artritis.",
"Cellulair fibronectine (cFn) is betrokken bij de pathogenese van reumatoïde artritis (RA), en we hebben eerder de aanwezigheid van gecitrullineerd cFn in reumatische synoviale weefsels aangetoond.",
"Bij reumatoïde artritis zijn PAD4 en eiwitcitrullinatie verhoogd in ontstoken gewrichten, en anti-gecitrullineerde eiwitantistoffen (ACPAs) worden gevormd tegen gecitrullineerde antigenen.|"
] | 312
| 296
|
945
|
Toon resultaten van gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken voor certolizumab pegol.
|
Verbetering van klinische resultaten (ACR50, 28-gewrichten ziekteactiviteitsscore (DAS-28) remissie en HAQ-scores) met certolizumab pegol. Bijwerkingen kwamen vaker voor bij certolizumab; er was een statistisch significante toename in het aantal ernstige bijwerkingen, infecties en hypertensie. Gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken (RCT's) van CZP hebben snelle verbeteringen aangetoond in productiviteit op het werk en thuis.
|
[
"RESULTATEN: 4049 RA-patiënten die CZP kregen, werden opgenomen in de veiligheidsanalyse; totale blootstelling 9277 PY, gemiddelde blootstelling 2,1 jaar (bereik 0,04-7,6). SIE, meestal longontsteking (IR 0,73/100 PY), waren de meest voorkomende ernstige bijwerkingen, die vaker voorkwamen bij CZP vergeleken met placebo-behandelde patiënten in RCT (IR 5,61/100 PY vs 1,35/100 PY, odds ratio (OR) 4,35, 95% CI 0,65 tot 29,30). SIE-ratio's waren lager in de CZP-behandelde populatie inclusief OLE (ER 4,33/100 PY). 44 patiënten ontwikkelden tuberculose (IR 0,47/100 PY), 39 uit hoogendemische gebieden. 58 sterfgevallen deden zich voor bij CZP-blootgestelde patiënten (IR 0,63/100 PY) en 70 ontwikkelden maligniteiten exclusief niet-melanoom huidkanker (IR 0,76/100 PY), waaronder vijf lymfomen (IR 0,05/100 PY).",
"Naast het tonen van klinische werkzaamheid is er bewijs dat CZP unieke kenmerken heeft, waaronder verminderde overdracht via de placenta en een verminderde frequentie van injectieplaatsreacties. Bovendien hebben gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken (RCT's) van CZP snelle verbeteringen aangetoond in productiviteit op het werk en thuis bij patiënten, wat bijdraagt aan het verminderen van de aanzienlijke sociaaleconomische last van RA.",
"Om de effectiviteit en veiligheid van certolizumab pegol (CDP870) te beoordelen bij patiënten met RA die niet goed hebben gereageerd op conventionele ziekte-modificerende anti-reumatische geneesmiddelen (DMARDs)",
"Met een over het algemeen hoog bewijsniveau toonde deze review een verbetering van klinische resultaten (ACR50, 28-gewrichten ziekteactiviteitsscore (DAS-28) remissie en HAQ-scores) met certolizumab pegol. Bijwerkingen kwamen vaker voor bij certolizumab; er was een statistisch significante toename in het aantal ernstige bijwerkingen, infecties en hypertensie.",
"Het klinische bewijs was afkomstig van twee multicentrische, geblindeerde gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken (RCT's) die CZP + MTX vergeleken met placebo + MTX (de RAPID 1 en RAPID 2 onderzoeken). RAPID 1 duurde 52 weken met 982 patiënten en RAPID 2 24 weken met 619 patiënten. Bewijs voor klinische effectiviteit van CZP in monotherapie kwam uit het 24 weken durende FAST4WARD-onderzoek met 220 patiënten dat CZP (400 mg elke 4 weken) vergeleek met placebo. De drie belangrijkste RCT's toonden statistisch significante superioriteit van CZP + MTX versus placebo + MTX en van CZP versus placebo met betrekking tot diverse uitkomsten, waaronder ACR 20, ACR 50 en ACR 70 maten en kwaliteitslevensmaten na 3 en 6 maanden. Op basis van resultaten uit indirecte vergelijkingsmeta-analyses suggereerde de fabrikant dat CZP minstens zo effectief kan zijn als andere 'biologische' DMARD (bDMARD) vergelijkingen en, bij enkele ACR-maten na 3 en 6 maanden, effectiever. CZP is een effectieve therapie voor volwassen RA-patiënten bij wie de ziekte onvoldoende heeft gereageerd op cDMARDs inclusief MTX of die intolerant zijn voor MTX. De kosteneffectiviteit van CZP ten opzichte van andere bDMARDs is onduidelijk omdat de uitgevoerde economische modellering mogelijk relevante effectiviteitsgegevens en potentiële verschillen tussen proefpopulaties heeft genegeerd, en daardoor effectiviteitsresultaten kan hebben opgenomen die bevooroordeeld zijn in het voordeel van CZP."
] | 530
| 505
|
946
|
Wat is het massatag dat de ubiquitinering van een lysineresidu onthult?
|
Lys-ɛ-Gly-Gly (K-ɛ-GG) is het restant dat ontstaat door trypsinedigestie van eiwitten met ubiquitine-gemodificeerde lysine-zijketens.
|
[
"Antilichamen die het Lys-ɛ-Gly-Gly (K-ɛ-GG) restant herkennen, geproduceerd door trypsinedigestie van eiwitten met ubiquitine-gemodificeerde lysine-zijketens, hebben de mogelijkheid om endogene ubiquitineringsplaatsen te verrijken en te detecteren met massaspectrometrie (MS) aanzienlijk verbeterd.",
"Recente publicaties hebben ook het gebruik benadrukt van immunoaffiniteitsverrijking op peptideniveau van K-GG-gemodificeerde peptiden uit hele cellysaten voor globale karakterisering van ubiquitineringsplaatsen.",
"In dit werk werden niveaus van lysine-ubiquitinering gekwantificeerd met behulp van een structureel homologe label dat chemisch vergelijkbaar is met het diglycine (GlyGly) tag, dat achterblijft op de ubiquitineringsplaats na trypsinolyse.",
"Tandem massaspectrometrie (LC-MS/MS) analyse van geïmmunoprecipiteerde eiwitten resulteerde in de identificatie van vijf peptiden die ubiquitine (diglycine) modificaties bevatten op eIF2Bε."
] | 137
| 125
|
947
|
Welk gen is betrokken bij CADASIL?
|
Cerebrale autosomaal dominante arteriopathie met subcorticale infarcten en leuko-encefalopathie (CADASIL), de meest voorkomende vorm van familiaire vasculaire dementie, wordt veroorzaakt door mutaties in het NOTCH3-gen.
|
[
"leuko-encefalopathie (CADASIL), de meest voorkomende vorm van familiaire vasculaire dementie, wordt veroorzaakt door mutaties in het NOTCH3-gen",
"Cerebrale autosomaal dominante arteriopathie met subcorticale infarcten en leuko-encefalopathie (CADASIL) is een erfelijke ziekte veroorzaakt door mutaties in het Notch3-gen dat het Notch3-eiwit codeert. Notch3 is betrokken bij de regulatie van apoptose en moduleert Fas-Ligand (Fas-L)-geïnduceerde apoptose.",
": Cerebrale autosomaal dominante arteriopathie met subcorticale infarcten en leuko-encefalopathie (CADASIL) is een kleinevataandoening van de hersenen veroorzaakt door mutaties in het NOTCH3-gen",
"Mutaties in het Notch3-gen worden geassocieerd met cerebrale autosomaal dominante arteriopathie met subcorticale infarcten en leuko-encefalopathie (CADASIL), een aandoening die wordt gekenmerkt door beroerte en dementie bij jonge volwassenen",
"(CADASIL) wordt veroorzaakt door mutaties in het NOTCH3-gen en wordt klinisch gekenmerkt door terugkerende beroertes, cognitieve achteruitgang, psychiatrische stoornissen en migraine",
"Om de rol van apoptose in de pathogenese van hersenletsels bij cerebrale autosomaal dominante arteriopathie met subcorticale infarcten en leuko-encefalopathie (CADASIL) te evalueren, een erfelijke microangiopathie die leidt tot cognitieve achteruitgang en dementie, veroorzaakt door mutaties in het NOTCH3-gen.",
"NOTCH3 (Notch homolog 3), het gen dat betrokken is bij CADASIL, codeert voor een transmembraanreceptor die voornamelijk tot expressie komt in systemische arteriële gladde spiercellen",
"(CADASIL) is een vasculaire dementieziekte veroorzaakt door mutaties in het NOTCH3-gen, waarvan de meeste missense-mutaties zijn die leiden tot een oneven aantal cysteïneresiduen in epidermale groeifactor-achtige herhalingen in het extracellulaire domein van de Notch3-receptor (N3ECD)."
] | 253
| 248
|
948
|
Wat is de rol van de schildklierhormoonreceptor alfa1 in insulineafgifte?
|
Gebonden TR(alpha) speelt een cruciale rol in de replicatie van bètacellen en in de uitbreiding van de bètacelmassa. De TRalpha P398H-mutatie, die niet aan T3 kan binden, wordt geassocieerd met insulineresistentie. Verlies van Thra beschermt muizen tegen door een vetrijke voeding geïnduceerde hepatische en perifere insulineresistentie.
|
[
"Verlies van Thra beschermt muizen tegen door een vetrijke voeding geïnduceerde hepatische steatose en hepatische en perifere insulineresistentie.",
"Gebonden TR(alpha) speelt een cruciale rol in de replicatie van bètacellen en in de uitbreiding van de bètacelmassa tijdens de postnatale ontwikkeling. Daarom kan gebonden TR(alpha) een doelwit zijn voor therapeutische strategieën die de uitbreiding en regeneratie van bètacellen kunnen induceren.",
"De TRalpha P398H-mutatie wordt geassocieerd met viscerale adipositas en insulineresistentie"
] | 117
| 121
|
949
|
Hebben R-lussen de neiging zich te vormen op plaatsen van DNA-replicatie?
|
R-lussen co-localiseren met de ORC binnen hetzelfde CpG-eilandgebied in een aanzienlijk deel van deze efficiënte replicatieoorsprongen. Fysiologische R-lusvorming bij CpG-eilandomzetters kan bijdragen aan de specificatie van DNA-replicatieoorsprongen in deze gebieden, de meest efficiënte replicatie-initiatielocaties in zoogdiercellen. Een mechanisme kan zijn dat stroomafwaarts van een replicatieblokkade RNA bij R-lussen wordt verlengd door DNA-polymerase I, waardoor het DNA-duplex wordt geopend en de replitosoom wordt aangetrokken. Dit zou replicatie mogelijk maken terwijl de oorspronkelijke blokkade wordt gerepareerd of omzeild. Zo is de georganiseerde structuur van de R-lus cruciaal voor de functie van primer-RNA in vivo met belangrijke implicaties voor het RNA-verwerkings- en DNA-replicatiemechanisme.
|
[
"Escherichia coli rnhA-mutanten zonder RNase HI vertonen constitutieve stabiele DNA-replicatie, cSDR, waarvan wordt gedacht dat deze wordt geïnitieerd vanuit R-lussen die gestabiliseerd zijn bij afwezigheid van RNase HI.",
"Wij stellen voor dat de georganiseerde structuur van de R-lus cruciaal is voor de functie van primer-RNA in vivo met belangrijke implicaties voor het RNA-verwerkings- en DNA-replicatiemechanisme.",
"Het voorlopige primer-RNA bestaat als een persistent RNA-DNA-hybride, bekend als een R-lus, gevormd tijdens transcriptie door het replicatieoorspronggebied (Xu, B., en Clayton, D. A. (1996) EMBO J. 15, 3135-3143).",
"We vonden dat overproductie van RecG-eiwit het aantal kopieën van ColE1-type plasmiden drastisch verminderde, die R-lusvorming tussen het sjabloon-DNA en een primer-RNA-transcript (RNA II) vereisen voor de initiatie van replicatie.",
"Deze resultaten suggereren dat overgeproduceerde RecG de initiatie van replicatie remt door voortijdig de R-lussen op te lossen die gevormd zijn in het replicatieoorspronggebied van deze plasmiden met zijn unieke helicase-activiteit. De mogelijkheid dat RecG de initiatie van een unieke modus van DNA-replicatie, oriC-onafhankelijke constitutieve stabiele DNA-replicatie, reguleert door zijn activiteit in het oplossen van R-lussen wordt besproken.",
"Wij stellen voor dat stroomafwaarts van een replicatieblokkade RNA bij R-lussen wordt verlengd door DNA-polymerase I, waardoor het DNA-duplex wordt geopend en de replitosoom wordt aangetrokken. Dit zou replicatie mogelijk maken terwijl de oorspronkelijke blokkade wordt gerepareerd of omzeild.",
"Bovendien verlichtte verhoogde expressie van RNaseH significant de genomische instabiliteit in deficiënte fibroblasten, wat suggereert dat cotranscriptionele R-lusvorming bijdraagt aan het ontstaan van replicatie-afhankelijke dubbelstrengsbreuken (DSB's) in deze cellen.",
"Transcriptie is een belangrijke bron van replicatieve stress en bijgevolg vereist het behoud van genoomintegriteit de bescherming van chromosomen tegen de schadelijke effecten die voortkomen uit de interactie tussen nieuw gevormde RNA's en sjabloon-DNA, leidend tot de vorming van stabiele DNA-RNA-hybriden (R-lussen).",
"Opvallend vonden we dat het afzwakken van replicatie sterk de R-lus-gemedieerde DNA-herschikkingen onderdrukt in zowel E. coli als HeLa-cellen.",
"Belangrijker nog, we tonen vervolgens aan dat R-lusvorming leidt tot het stagneren van de DNA-replicatievork, en dat dit feitelijk ten grondslag ligt aan de effecten van R-lussen op de genomische stabiliteit.",
"R-lus-gemedieerde genomische instabiliteit wordt veroorzaakt door belemmering van de voortgang van de replicatievork.",
"Wanneer een van deze processen niet goed wordt gecoördineerd, ontstaan afwijkende uitkomsten zoals vorkomkering en R-lusvorming, die ongeplande recombinogene gebeurtenissen en genoomherschikkingen veroorzaken.",
"Veel studies tonen aan dat cellen R-lusvorming efficiënt kunnen beheersen en ook de reeds gevormde R-lussen in de cel kunnen verwerken, waardoor de schadelijke effecten van R-lussen op DNA-replicatie, genmutatie en homologe recombinatie gereguleerd kunnen worden.",
"Hier stellen we voor dat fysiologische R-lusvorming bij CpG-eilandpromoters kan bijdragen aan de specificatie van DNA-replicatieoorsprongen in deze gebieden, de meest efficiënte replicatie-initiatielocaties in zoogdiercellen.",
"In overeenstemming hiermee vonden we dat R-lussen co-localiseren met de ORC binnen hetzelfde CpG-eilandgebied in een aanzienlijk deel van deze efficiënte replicatieoorsprongen, precies op de positie met de hoogste dichtheid aan G4-motieven.",
"De verbinding tussen transcriptie en replicatie in menselijke cellen suggereert dat dysregulatie van R-lussen bij CpG-eilandpromoter-oorsprongen kan bijdragen aan het fenotype van DNA-replicatieafwijkingen en verlies van genoomintegriteit dat wordt waargenomen in kankercellen.",
"We tonen aan dat RNA:DNA-hybriden (R-lussen) zich vormen op plaatsen van transcriptie/replicatie-botsingen en dat RNase H1 functioneert om de instabiliteit van fragiele sites (CFS) te onderdrukken.",
"R-lussen en initiatie van DNA-replicatie in menselijke cellen: een ontbrekende schakel?",
"Stabiele RNA-DNA-hybriden (R-lussen) initiëren de replicatie in Escherichia coli-cellen.",
"Wij stellen voor dat stroomafwaarts van een replicatieblokkade RNA bij R-lussen wordt verlengd door DNA-polymerase I, waardoor het DNA-duplex wordt geopend en de replitosoom wordt aangetrokken.",
"Direct na infectie komen RNA-DNA-hybriden (R-lussen) voor op (ten minste sommige) replicatieoorsprongen, waarbij het geanneleerde RNA dient als primer voor de synthese van de leidende streng in één richting.",
"Hier stellen we voor dat fysiologische R-lusvorming bij CpG-eilandpromoters kan bijdragen aan de specificatie van DNA-replicatieoorsprongen in deze gebieden, de meest efficiënte replicatie-initiatielocaties in zoogdiercellen.",
"ColE1-plasmide-replicatieoorsprongen en oriK-sites starten de assemblage van het primosoom via een RNA-DNA-hybridestructuur die bekend staat als een R-lus.",
"Dit scenario bouwt voort op de verbinding tussen transcriptie en replicatie in menselijke cellen en suggereert dat dysregulatie van R-lussen bij CpG-eilandpromoter-oorsprongen kan bijdragen aan het fenotype van DNA-replicatieafwijkingen en verlies van genoomintegriteit dat wordt waargenomen in kankercellen.",
"De meerdere knipplaatsen op het R-lus-substraat komen overeen met de primeringsplaatsen die in vivo worden waargenomen, wat suggereert dat RNase MRP alleen vrijwel alle primers voor de leidende streng kan genereren.",
"Mechanismen van primer-RNA-synthese en D-lus/R-lus-afhankelijke DNA-replicatie in Escherichia coli.",
"Alternatieve oriC-onafhankelijke modi van replicatie-initiatie zijn mogelijk, waarvan een constitutieve stabiele DNA-replicatie (cSDR) is vanuit transcriptie-geassocieerde RNA-DNA-hybriden of R-lussen.",
"Onze resultaten suggereren dat Top1 deze functie uitvoert door de vorming van DNA-RNA-hybriden tijdens transcriptie te onderdrukken, deze zogenaamde R-lussen die de voortgang van replicatievorken verstoren.",
"Kritieke rol van R-lussen bij de verwerking van replicatieblokkades.",
"De mogelijkheid dat RecG de initiatie van een unieke modus van DNA-replicatie, oriC-onafhankelijke constitutieve stabiele DNA-replicatie, reguleert door zijn activiteit in het oplossen van R-lussen wordt besproken.",
"Competitie tussen het RNA-transcript en de niet-sjabloon-DNA-streng tijdens R-lusvorming in vitro: een nick kan dienen als een sterke R-lus-initiatieplaats.",
"Belangrijker nog, we tonen vervolgens aan dat R-lusvorming leidt tot het stagneren van de DNA-replicatievork, en dat dit feitelijk ten grondslag ligt aan de effecten van R-lussen op de genomische stabiliteit.",
"In overeenstemming met deze hypothese bevinden de 3'-uiteinden van de mitochondriale R-lus gevormd door in vitro transcriptie zich dicht bij de initiatieplaatsen van de mitochondriale DNA-replicatie.",
"Een hybride G-quadruplex-structuur gevormd tussen RNA en DNA verklaart de buitengewone stabiliteit van de mitochondriale R-lus.",
"Eerdere studies hebben aangetoond dat de nieuw gesynthetiseerde primers een stabiele en persistente RNA-DNA-hybride vormen, een R-lus, nabij de leidende streng replicatieoorsprong.",
"Escherichia coli rnhA-mutanten zonder RNase HI vertonen constitutieve stabiele DNA-replicatie, cSDR, waarvan wordt gedacht dat deze wordt geïnitieerd vanuit R-lussen die gestabiliseerd zijn bij afwezigheid van RNase HI."
] | 1,088
| 1,012
|
950
|
Welke twee catechol-O-methyltransferase (COMT) remmers kunnen worden gebruikt voor de behandeling van de ziekte van Parkinson?
|
Tolcapone (centraal en perifeer) en entacapone (perifeer) zijn catechol-O-methyltransferase remmers die worden gebruikt voor de behandeling van de ziekte van Parkinson.
|
[
"Entacapone is een zeer krachtige, reversibele, perifeer werkende catechol-O-methyltransferase (COMT) remmer die wordt gebruikt als aanvulling op L-dopa bij de behandeling van patiënten met de ziekte van Parkinson (PD).",
"Stalevo is een combinatiepil bestaande uit levodopa, carbidopa en de COMT-remmer entacapone. Het is verkrijgbaar in vaste doseringscombinaties van levodopa/carbidopa/entacapone, 50/12,5/200, 75/18,75/200, 100/25/200, 125/31,25/200, 150/37,5/200 en 200/50/200 mg. Stalevo is momenteel goedgekeurd voor gebruik bij Parkinsonpatiënten met end-of-dose wearing off.",
"Goed nieuws was de introductie van ropinirole, een nieuwe niet-ergot agonist, in december 2006 en entacapone, de eerste catechol-O-methyltransferase (COMT) remmer in Japan in april 2007. Geconfronteerd met deze nieuwe situaties is de Japanse Neurologische Vereniging begonnen met het herzien van \"de Richtlijn 2002 voor de behandeling van de ziekte van Parkinson\".",
"Stalevo (Orion) combineert levodopa, de dopa-decarboxylase remmer carbidopa en de catechol-O-methyltransferase remmer entacapone in één tablet.",
"We onderzochten of toediening van de catechol-O-methyltransferase (COMT) remmer entacapone, in doses van 200 mg en 400 mg, de farmacokinetiek van apomorfine verandert bij Parkinsonpatiënten die ernstige motorische fluctuaties ervaren.",
"De catechol-O-methyltransferase remmer entacapone wordt gegeven in combinatie met levodopa/dopa decarboxylase remmer voor Parkinsonpatiënten die end-of-dose wearing-off ervaren.",
"Entacapone (Comtess/Comtan) is Orion Pharma's originele gepatenteerde catechol-O-methyltransferase (COMT) remmer. Entacapone kan de afbraak van levodopa vertragen en verbetert de beschikbaarheid en effectiviteit van elke levodopadosis, vandaar het gebruik als aanvulling op levodopa/carbidopa bij patiënten met de ziekte van Parkinson.",
"Slaapaanvallen bij de ziekte van Parkinson veroorzaakt door Entacapone, een COMT-remmer.",
"We presenteren een patiënt die slaapaanvallen kreeg na het starten met entacapone naast levodopa. Entacapone, een catechol-O-methyltransferase remmer, verandert de farmacokinetiek van levodopa, wat leidt tot een toename van de levodopaconcentratie in plasma en hersenen.",
"Twee COMT-remmers, tolcapone en entacapone, zijn recent beschikbaar gekomen als aanvullende middelen bij levodopa.",
"Twee remmers van catechol-O-methyltransferase (COMT), tolcapone en entacapone, zijn recent geïntroduceerd als aanvullingen op levodopa bij de behandeling van patiënten met de ziekte van Parkinson.",
"Tolcapone, een perifere en centrale COMT-remmer, lijkt vrij effectief te zijn en zorgt voor een vermindering van 47% in 'off'-tijd.",
"Entacapone, een puur perifere COMT-remmer met een lagere potentie dan tolcapone, is ook effectief gebleken en is niet geassocieerd met leverbeschadiging, waardoor testen niet nodig is.",
"Hier rapporteren we dat behandeling van het cerebrale weefsel met tolcapone, een centrale en perifere COMT-remmer, de membraanresponsen van dopamine-neuronen in de middenhersenen op dopamine en levodopa niet verandert.",
"Daarom zou de therapeutische werking van tolcapone bij de ziekte van Parkinson afhankelijk kunnen zijn van de vermindering van COMT-activiteit in het extracerebrale weefsel.",
"Voorbehandeling met entacapone (OR-611), een perifere catechol O-methyltransferase (COMT) remmer, vermindert de plasma 3OMFD fractie sterk en biedt een ideale situatie om de bijdrage van de plasma 3OMFD fractie te evalueren in verschillende kinetische modellen van FDOPA-opname.",
"De nieuwe en reversibele remmers zijn de catechol-O-methyltransferase (COMT) remmers, Ro 40-7592 (3,4-dihydroxy-4'-methyl-5-nitrobenzofenon), en de monoamine oxidase type-B (MAO-B) remmer, Ro 19-6327 (N-(2-aminoethyl)-5-chloor-2-pyridinecarboxamide HCl)."
] | 502
| 489
|
951
|
Wat zijn de structuren die gevormd worden wanneer keratinemoleculen samenkomen?
|
Keratin vormt de intermediaire filamenten van het cytoskelet en biedt steigerstructuren binnen cellen.
|
[
"Keratin vormt de intermediaire filamenten van het cytoskelet en biedt steigerstructuren binnen cellen.",
"keratine intermediaire filamenten",
"keratine intermediaire filamenten",
"keratine intermediair filament eiwit.",
"Keratin is een eiwit uit de familie van intermediaire filamenten",
"Keratin is het eiwit van de intermediaire filamenten (IF)",
"plaveiselvormige keratinocyten bevatten gepolymeriseerde bundels van keratine intermediaire filamenten",
"keratine filamenten",
"In deze studie hebben we de verdeling onderzocht van vier groepen IF's [cytokeratines (CK's), vimentine, desmine en lamines]",
"keratine filamentennetwerk",
"Een intact keratine 5/keratine 14 intermediair filament cytoskelet is essentieel voor de integriteit van basale keratinocyten en voor de ontwikkeling en het onderhoud van epidermale structuren.",
"keratine intermediair filament cytoskelet.",
"keratine filamenten,",
"keratine filamentair netwerk.|"
] | 122
| 116
|
952
|
Wat is de prognostische impact van hypothyreoïdie bij patiënten met een acuut myocardinfarct?
|
Schildklierdisfunctie, met name het lage T3-syndroom, is een sterke voorspeller van een slechte prognose op korte en lange termijn bij patiënten met een acuut myocardinfarct.
|
[
"In-hospitaal cardiogene shock (15% versus 3% in de controlegroep; p<0,01) en overlijden (7% versus 1% in de controlegroep; p<0,01) werden vaker waargenomen in de groep met schildklierdisfunctie.",
"Schildklierdisfunctie, met name het zieke euthyreoïde syndroom, bleek gerelateerd te zijn aan in-hospitaal en langdurige mortaliteit bij patiënten met STEMI die een primaire percutane interventie ondergingen.",
"Een laag fT3-niveau, een veelvoorkomend fenomeen bij patiënten met een acuut myocardinfarct, is een sterke voorspeller van een slechte prognose op korte en lange termijn bij patiënten met een acuut myocardinfarct.",
"Troponine T en creatinekinase-B met een M-type subeenheid niveaus waren significant hoger bij de niet-overlevenden vergeleken met de overlevenden. Overlevenden in de AMI-groep hadden hogere TT3, TT4 en lagere FT4-niveaus, terwijl de niet-overlevenden in de AMI-groep hogere thyrotrofine en lagere TT3, FT3 en FT4-niveaus hadden dan de controles.",
"Reverse T3-niveaus >0,41 nmol/L waren geassocieerd met een verhoogd risico op 1-jaars mortaliteit (hazard ratio = 3,0; 95% betrouwbaarheidsinterval: 1,4 tot 6,3; P = 0,005), onafhankelijk van leeftijd, eerder myocardinfarct, eerdere angina, hartfalen, serumcreatinineniveau en piek serum creatinekinase-MB fractieniveaus."
] | 214
| 203
|
953
|
Wat zijn de belangrijkste kenmerken van CREST en andere ALS-gerelateerde eiwitten?
|
CREST en bepaalde andere ALS-gerelateerde eiwitten delen verschillende kenmerken die betrokken zijn bij de pathogenese van ALS, namelijk het vermogen om te aggregeren, gerekruteerd te worden naar stressgranules en de integriteit van paraspeckles te veranderen.
|
[
"Net als verschillende eiwitten die betrokken zijn bij ALS, bevat CREST een prion-achtig domein en werd gerapporteerd dat het een component van paraspeckles is.",
"Net als verschillende andere met ALS geassocieerde eiwitten wordt CREST gerekruteerd naar geïnduceerde stressgranules.",
"CREST en bepaalde andere ALS-gerelateerde eiwitten delen verschillende kenmerken die betrokken zijn bij de pathogenese van ALS, namelijk het vermogen om te aggregeren, gerekruteerd te worden naar stressgranules en de integriteit van paraspeckles te veranderen.",
"Net als verschillende eiwitten die betrokken zijn bij ALS, bevat CREST een prion-achtig domein en werd gerapporteerd dat het een component van paraspeckles is.",
"Net als verschillende andere met ALS geassocieerde eiwitten wordt CREST gerekruteerd naar geïnduceerde stressgranules.",
"Onze gegevens geven aan dat CREST en bepaalde andere ALS-gerelateerde eiwitten verschillende kenmerken delen die betrokken zijn bij de pathogenese van ALS, namelijk het vermogen om te aggregeren, gerekruteerd te worden naar stressgranules en de integriteit van paraspeckles te veranderen.",
"Net als verschillende eiwitten die betrokken zijn bij ALS, bevat CREST een prion-achtig domein en werd gerapporteerd dat het een component van paraspeckles is.",
"Onze gegevens geven aan dat CREST en bepaalde andere ALS-gerelateerde eiwitten verschillende kenmerken delen die betrokken zijn bij de pathogenese van ALS, namelijk het vermogen om te aggregeren, gerekruteerd te worden naar stressgranules en de integriteit van paraspeckles te veranderen. Een verandering in CREST-niveaus in neuronen, die onder pathologische omstandigheden zou kunnen optreden, zou een diepgaand negatief effect hebben op de neuronale homeostase.",
"Calcium-responsieve transactivator (CREST) eiwit deelt een reeks structurele en functionele eigenschappen met andere eiwitten die geassocieerd zijn met amyotrofische laterale sclerose.",
"Het gen dat codeert voor calcium-responsieve transactivator (CREST) is recentelijk in verband gebracht met ALS.",
"Een de novo mutatie in het SS18L1-gen (ook bekend als CREST of KIAA0693), dat codeert voor de calcium-responsieve transactivator en/of subeenheid van het neuronale chromatine-remodelingscomplex, is recentelijk geïdentificeerd door exoomsequencing van 47 sporadische ALS-trio's.",
"Hier rapporteren we dat profiline 1 en het gerelateerde eiwit profiline 2 nieuwe stressgranule-geassocieerde eiwitten zijn in muis primaire corticale neuronen en in menselijke cellijnen, en dat ALS-gerelateerde mutaties in profiline 1 de dynamiek van stressgranules veranderen, wat verder bewijs levert voor de potentiële rol van stressgranules in de pathogenese van ALS.",
"Aggregatie van ALS-gerelateerde FUS-mutant sequestreert RNA-bindende eiwitten en belemmert de vorming van RNA-granules.",
"In de huidige studie onderzochten we de effecten van ALS-gerelateerde FUS-mutanten op ALS-geassocieerde RNA-bindende eiwitten en RNA-granules.",
"Aggregatie van ALS-gerelateerde FUS-mutant sequestreert RNA-bindende eiwitten en belemmert de vorming van RNA-granules."
] | 386
| 433
|
954
|
Mutaties in welke genen zijn geassocieerd met catecholaminerge polymorfe ventriculaire tachycardie (CPVT)?
|
Mutaties in vijf genen – ryanodine receptor 2 (RYR2), calsequestrin 2 (CASQ2), triadin (TRDN), calmoduline 1 (CALM1) en kaliumkanaal, inwardly rectifying subfamily J, lid 2 (KCNJ2) – zijn gevonden in verband met CPVT
|
[
"Mutatie in vier genen – RYR2, CASQ2, TRDN en CALM1 – staat bekend als oorzaak van CPVT of gerelateerde fenotypen van adrenergisch geïnduceerde levensbedreigende hartritmestoornissen. De aanwezigheid van andere nog niet geïdentificeerde loci wordt verondersteld",
"sommige dragers van KCNJ2-mutaties missen de ATS-triad en delen soms het fenotype van catecholaminerge polymorfe ventriculaire tachycardie (CPVT)",
"Bij 50 Japanse probanden uit niet-verwante families die voldeden aan de klinische criteria voor CPVT, werd genetisch onderzoek uitgevoerd in alle exonen van 3 CPVT-gerelateerde genen: het cardiale ryanodine receptor 2 (RYR2), calsequestrin 2 (CASQ2) en inward rectifier kaliumkanaal 2 (KCNJ2)",
"puntmutaties in RYR2, het gen dat codeert voor de cardiale isoform van de RyR (RyR2), zijn geassocieerd met catecholaminerge polymorfe ventriculaire tachycardie (CPVT), een aritmogeen syndroom gekenmerkt door de ontwikkeling van adrenergisch gemedieerde ventriculaire tachycardie bij individuen met een ogenschijnlijk normaal hart.",
"Recessieve CPVT-varianten zijn het gevolg van mutaties in het CASQ2-gen.",
"Recente studies hebben aangetoond dat CPVT wordt veroorzaakt door mutaties in het cardiale ryanodine receptor type 2 (RyR2) of calsequestrin 2 (CASQ2) genen.",
"We identificeerden drie mutaties in triadin die co-segregeerden met de ziekte volgens een recessief overervingspatroon in twee families",
"Catecholaminerge polymorfe ventriculaire tachycardie (CPVT) is een familiaire aritmogeen aandoening geassocieerd met mutaties in het cardiale ryanodine receptor (RyR2) en cardiale calsequestrin (CASQ2) genen.",
"ACHTERGROND: Catecholaminerge polymorfe ventriculaire tachycardie (CPVT) is een erfelijk aritmie syndroom geassocieerd met mutaties in het cardiale ryanodine receptor gen (Ryr2) bij de meerderheid van de patiënten.",
"ACHTERGROND: Catecholaminerge polymorfe ventriculaire tachycardie (CPVT) is een familiair aritmie syndroom veroorzaakt door mutaties in genen die coderen voor de calcium-regulatie-eiwitten cardiale ryanodine receptor (RyR2) of calsequestrin-2 (CASQ2).",
"Catecholaminerge polymorfe ventriculaire tachycardie (CPVT) is een erfelijke aritmogeen ziekte die tot nu toe gerelateerd is aan mutaties in het cardiale ryanodine receptor (RYR2) of het cardiale calsequestrin (CASQ2) genen.",
"Catecholaminerge polymorfe ventriculaire tachycardie (CPVT) is een erfelijk aritmie syndroom geassocieerd met mutaties in het cardiale ryanodine receptor gen (Ryr2) bij de meerderheid van de patiënten"
] | 353
| 354
|
955
|
Wat is de relatie tussen nucleosomen en exonen?
|
Nucleosomen bevinden zich bij voorkeur binnen exonen in vergelijking met nabijgelegen intronische sequenties. De voorkeur voor positionering binnen de exonen is onafhankelijk van de genexpressieniveaus, sterker in exonen met zwakke spliceplaatsen en behouden door de evolutie van metazoën.
|
[
"Nucleosomen bevinden zich bij voorkeur aan de uiteinden van exonen, waardoor splice-verbindingen worden beschermd, met de N9-posities van guanines van de GT- en AG-verbindingen gericht naar de histonen.",
"Er is vastgesteld dat nucleosomen bij voorkeur gepositioneerd zijn binnen constitutieve exonen en/of constitutieve delen van alternatieve exonen, wat niet geassocieerd was met genexpressie of celtoestanden, maar gebaseerd was op sequentie en positief gerelateerd was aan de sequentieconservatie van spliceplaatsen.",
"Hier bespreken we het bewijs ter ondersteuning van deze ideeën, vanaf het eerste voorstel dat chromatine alternatieve splicing beïnvloedt, uitgevoerd 20 jaar geleden, tot de nieuwste bevindingen inclusief genoomwijde bewijzen dat nucleosomen bij voorkeur gepositioneerd zijn in exonen.",
"Hier tonen we, door analyse van datasets van menselijke sperma- en T-cellen en medaka (Japanse killivis, Oryzias latipes) blastulae, aan dat interne exonen van genen worden gekenmerkt door scherp verhoogde gemiddelde nucleosoombezetting in vergelijking met omringende intronische sequenties.",
"Met gebruik van openbare data tonen we hier aan dat er een sterker nucleosoompositioneringssignaal is in interne menselijke exonen en dat deze positionering onafhankelijk is van expressie. We observeerden een vergelijkbaar sterk nucleosoompositioneringssignaal in interne exonen van Caenorhabditis elegans.",
"We hebben een stabiele nucleosoombezetting gevonden binnen menselijke en Caenorhabditis elegans exonen die sterker is in exonen met zwakke spliceplaatsen.",
"Dit bevestigt eerder gerapporteerde bevindingen over de voorkeurspostionering van splice-verbindingen binnen de nucleosomen."
] | 253
| 254
|
956
|
Lijst met programma's geschikt voor farmacofore modellering
|
Een farmacophore is een abstracte beschrijving van moleculaire kenmerken die noodzakelijk zijn voor moleculaire herkenning van een ligand door een biologisch macromolecuul. De IUPAC definieert een farmacophore als "een geheel van sterische en elektronische kenmerken die noodzakelijk zijn om optimale supramoleculaire interacties met een specifiek biologisch doelwit te waarborgen en om de biologische respons te activeren (of te blokkeren)". Een farmacophore model verklaart hoe structureel diverse liganden kunnen binden aan een gemeenschappelijke receptorplaats. Verder kunnen farmacophore modellen worden gebruikt om via denovo ontwerp of virtuele screening nieuwe liganden te identificeren die aan dezelfde receptor binden. Tegenwoordig zijn er veel programma's geschikt voor farmacophore modellering zoals LigandScout, Discovery Studio, Catalyst, PharmaGist, Genetic Algorithm Similarity en Molecular Operating Environment.
|
[
"Farmacophore modellen gebaseerd op thermolysin bindingsmodi en activiteitsprofielen werden gegenereerd met het LigandScout programma",
"In deze studie werden farmacophore hypothesen gebaseerd op bekende remmers gegenereerd met behulp van het common feature farmacophore generatieprotocol beschikbaar in het Discovery Studio programma",
"Een farmacophore-gebaseerde screening werd vervolgens uitgevoerd met het programma Catalyst",
"Het PharmaGist gebruikte algoritme om de beste farmacophores te identificeren door meerdere flexibele uitlijningen te berekenen tussen de invoerliganden. De meerdere uitlijningen worden gegenereerd door uitlijningen paargewijs te combineren tussen een van de gliptine invoerliganden, die als pivot fungeert, en de andere gliptine als ligand. De resulterende meerdere uitlijningen onthullen ruimtelijke ordeningen van consensuskenmerken gedeeld door verschillende subsets van invoerliganden. Het beste farmacophore model is afgeleid met behulp van zowel paargewijze als meerdere uitlijningsmethoden, die gewogen zijn in het farmacophore generatieproces",
"Farmacophore modellen van c-Met kinase remmers zijn ontwikkeld op basis van 22 diverse verbindingen met behulp van het HypoGen algoritme geïmplementeerd in het Discovery Studio programma pakket.",
"Chemische kenmerk gebaseerde farmacophore modellen van MMP-1, MMP-8 en MMP-13 remmers zijn ontwikkeld met behulp van de HypoGen module binnen het Catalyst programma pakket",
"Genetic Algorithm Similarity Program (GASP) werd gebruikt om een 3D farmacophore model af te leiden dat werd gebruikt voor effectieve uitlijning van de dataset.",
"Actieve site complementerende structuur-gebaseerde farmacophore modellen werden ontwikkeld met Discovery Studio 2.5 programma en gevalideerd met een dataset van bekende HDAC8 remmers.",
"Een farmacophore model is gegenereerd uit de trainingsset met behulp van het MOE (Molecular Operating Environment) programma.",
"Een trainingsset van 20 verbindingen met bekende experimentele activiteit werd gebruikt om farmacophore hypothesen te genereren met de 3D QSAR Pharmacophore Generation module beschikbaar in Discovery Studio.",
"Een farmacophore model werd voor het eerst ontwikkeld op een trainingsdataset van 22 CCR3 antagonisten, met behulp van het CATALYST HypoRefine programma.",
"De CatalystHipHop benadering werd gebruikt om een farmacophore model te genereren voor cyclooxygenase-2 (COX-2) remmers gebaseerd op een trainingsset van 15 actieve remmers (1–15).",
"Moleculair modelleringsonderzoek, inclusief fitting aan een 3D-farmacophore model van de ontworpen moleculen (10a-g), met HCV NS3 protease hypothese met behulp van het catalyst programma, werd uitgevoerd.",
"Een farmacophore model (Hypo1) met een goede voorspellende capaciteit voor CysLT(1) antagonisten werd ontwikkeld met het Catalyst/HypoGen programma.",
"Drie farmacophore modellen van opioïde agonisten werden gegenereerd door het Catalyst/HypoGen programma",
"De superpositie van de liganden werd uitgevoerd met de tool Pharmacophore Elucidation (MOE-pakket)",
"Bekende PDE-5 remmers werden gebruikt om een driedimensionaal kwantitatief structuur-activiteit relatie (3D QSAR) model te construeren met het HypoGen programma.",
"Farmacophore modellen werden gegenereerd voor AT1 en ET(A) receptoren gebaseerd op hoog selectieve AT1 en ET(A) antagonisten met het programma Catalyst/HipHop",
"In deze studie zijn chemische kenmerk gebaseerde farmacophore modellen van remmers van 5-LOX ontwikkeld met behulp van de HipHop en HypoGen modules binnen het Catalyst programma pakket",
"Een dataset bestaande uit 24 remmers werd geselecteerd op basis van de informatie-inhoud van de structuren en activiteitsgegevens zoals vereist door het Catalyst/HypoGen programma."
] | 586
| 581
|
957
|
Is seleniumtekort betrokken bij auto-immuun schildklieraandoeningen?
|
Seleniumtekort vormt waarschijnlijk een risicofactor voor een versterkte verstoring van de interactie tussen het immuunsysteem en de schildklier, terwijl seleniumsuppletie de zelfversterkende aard van deze ontspoorde interactie lijkt te dempen.
|
[
"In gebieden met ernstig seleniumtekort is een hogere incidentie van thyroiditis gerapporteerd door een verminderde activiteit van het seleniumafhankelijke glutathionperoxidase-enzym in schildkliercellen.",
"In gebieden met ernstig seleniumtekort is een hogere incidentie van thyroiditis gerapporteerd door een verminderde activiteit van het seleniumafhankelijke glutathionperoxidase-enzym in schildkliercellen.",
"Van de 30 patiënten in de seleniumbehandelde groep waren 6 patiënten duidelijk hypothyroid, 15 subklinisch hypothyroid, 6 euthyroid en 3 subklinisch hyperthyroid. De gemiddelde TPOAb-concentratie daalde significant met 49,5% (P < 0,013) in de seleniumbehandelde groep versus 10,1% (P < 0,95) in de placebogroep.",
"Seleniumtoediening heeft een significante invloed op de ontstekingsactiviteit bij schildklier-specifieke auto-immuunziekten.",
"Serumselenium is laag bij pas gediagnosticeerde ziekte van Graves.",
"S-Se was lager bij patiënten met GD dan bij controles (gemiddelde (SD), GD: 89,9 μg/l (18,4); controles: 98,8 μg/l (19,7), P < 0,01).",
"Patiënten met pas gediagnosticeerde GD en AIH hadden significant lagere s-Se vergeleken met willekeurige controles. Onze observatie ondersteunt de veronderstelde link tussen onvoldoende seleniumvoorziening en manifeste auto-immuun schildklieraandoeningen, vooral GD.",
"Seleniumtekort vormt waarschijnlijk een risicofactor voor een versterkte verstoring van de interactie tussen het immuunsysteem en de schildklier, terwijl seleniumsuppletie de zelfversterkende aard van deze ontspoorde interactie lijkt te dempen.",
"De recente erkenning dat het essentiële spoorelement selenium als selenocysteïne wordt ingebouwd in alle drie de deiodinases heeft de duidelijke relatie tussen selenium en schildklierfunctie definitief bevestigd. Tevens is vastgesteld dat de schildklier meer selenium bevat dan enig ander weefsel en dat seleniumtekort de manifestatie van endemisch myxoedeematisch cretinisme en auto-immuun schildklieraandoeningen verergert.",
"Het handhaven van \"selenostase\" via optimale inname helpt niet alleen de algemene gezondheid te behouden, maar draagt ook substantieel bij aan de preventie van schildklieraandoeningen.",
"Laag geboortegewicht, jodiumoverschot en -tekort, seleniumtekort, pariteit, gebruik van anticonceptiepillen, reproductieve levensduur, foetaal microchimerisme, stress, seizoensvariatie, allergie, roken, stralingsschade aan de schildklier, virale en bacteriële infecties spelen allemaal een rol bij de ontwikkeling van auto-immuun schildklieraandoeningen.",
"Tevens is vastgesteld dat de schildklier meer selenium bevat dan enig ander weefsel en dat seleniumtekort de manifestatie van endemisch myxoedeematisch cretinisme en auto-immuun schildklieraandoeningen verergert.",
"Seleniumtekort kan een belangrijke rol spelen bij het ontstaan en de progressie van auto-immuun schildklieraandoeningen.",
"[Seleniumtekort bij coeliakie: risico op auto-immuun schildklieraandoeningen].",
"Laag geboortegewicht, jodiumoverschot en -tekort, seleniumtekort, pariteit, gebruik van anticonceptiepillen, reproductieve levensduur, foetaal microchimerisme, stress, seizoensvariatie, allergie, roken, stralingsschade aan de schildklier, virale en bacteriële infecties spelen allemaal een rol bij de ontwikkeling van auto-immuun schildklieraandoeningen.",
"Sommige klinische studies hebben aangetoond dat seleniumtekort-patiënten met auto-immuun schildklieraandoeningen baat hebben bij seleniumsuppletie, hoewel de gegevens tegenstrijdig zijn en veel parameters nog moeten worden vastgesteld.",
"Onze observatie ondersteunt de veronderstelde link tussen onvoldoende seleniumvoorziening en manifeste auto-immuun schildklieraandoeningen, vooral GD.",
"Seleniumtekort bij coeliakie: risico op auto-immuun schildklieraandoeningen.",
"Selenoproteïnen bevatten het essentiële spoorelement selenium waarvan tekort leidt tot ernstige aandoeningen waaronder kanker, falen van het mannelijke voortplantingssysteem of auto-immuun schildklieraandoeningen.",
"Tevens is vastgesteld dat de schildklier meer selenium bevat dan enig ander weefsel en dat seleniumtekort de manifestatie van endemisch myxoedeematisch cretinisme en auto-immuun schildklieraandoeningen verergert.",
"EVIDENTIE-SAMENVATTING: Bewijs ter ondersteuning van seleniumsuppletie bij auto-immuun schildklieraandoeningen wordt geëvalueerd, waarbij de hier gepresenteerde resultaten de potentiële effectiviteit van selenium aantonen in het verlagen van de antithyroperoxidase-titer en het verbeteren van de echostructuur bij echografisch onderzoek.",
"Sommige onderzoekers suggereren dat selenium een nuttige aanvullende behandeling kan zijn voor auto-immuun schildklieraandoeningen, zoals Hashimoto en de ziekte van Graves.",
"Daarom kan zelfs een mild seleniumtekort bijdragen aan het ontstaan en het in stand houden van auto-immuun schildklieraandoeningen.",
"Sommige klinische studies hebben aangetoond dat seleniumtekort-patiënten met auto-immuun schildklieraandoeningen baat hebben bij seleniumsuppletie, hoewel de gegevens tegenstrijdig zijn en veel parameters nog moeten worden vastgesteld.",
"Sommige klinische studies hebben aangetoond dat seleniumtekort-patiënten met auto-immuun schildklieraandoeningen baat hebben bij seleniumsuppletie, hoewel de gegevens tegenstrijdig zijn en veel parameters nog moeten worden vastgesteld.",
"Hoge prevalentie van hyperplastische en auto-immuunziekten van de schildklier in de Oekraïense bevolking wordt bepaald door endemisch tekort aan jodium en selenium.",
"Tevens is vastgesteld dat de schildklier meer selenium bevat dan enig ander weefsel en dat seleniumtekort de manifestatie van endemisch myxoedeematisch cretinisme en auto-immuun schildklieraandoeningen verergert.",
"Daarom kan zelfs een mild seleniumtekort bijdragen aan het ontstaan en het in stand houden van auto-immuun schildklieraandoeningen.",
"Sommige onderzoekers suggereren dat selenium een nuttige aanvullende behandeling kan zijn voor auto-immuun schildklieraandoeningen, zoals Hashimoto en de ziekte van Graves.|"
] | 765
| 706
|
958
|
Noem aandoeningen die worden veroorzaakt door mutaties in het mitochondriale MTND6-gen.
|
Mutaties in het mitochondriale MTND6-gen zijn de oorzaak van het Leigh-syndroom en Leber's erfelijke optische neuropathie en/of dystonie.
|
[
"Er is aangetoond dat m14487T>C ook de ongebruikelijke combinatie van optische atrofie, ptosis en encefalomyopathie kan veroorzaken, leidend tot onbehandelbare aanvallen.",
"MTND6-genen werden geïdentificeerd als 'hotspots' van mutaties, waarbij het Leigh-syndroom het merendeel van de geassocieerde fenotypen uitmaakt.",
"De 14487T>C-mutatie in MTND6 was aanwezig bij twee probanden met respectievelijk Leigh-achtige en Leigh-syndroom.",
"Deze resultaten bevestigen de associatie van de MTND6*LDYT14459A-mutatie met Leber's erfelijke optische neuropathie en/of dystonie.",
"Een nieuwe puntmutatie in de ND6-subunit van complex I op positie 14.459 van het mitochondriale DNA (MTND6*LDYT14459A) werd geïdentificeerd als een kandidaatmutatie voor de zeer weefsel-specifieke ziekte Leber's erfelijke optische neuropathie plus dystonie.",
"Representatief voor deze mutaties is een heteroplasmische mutatie in MTND6 op np 14459 waarvan de klinische presentaties variëren van blindheid op volwassen leeftijd tot pediatrische dystonie en degeneratie van de basale ganglia."
] | 164
| 154
|
959
|
Wat zijn de meest voorkomende methoden voor ctDNA (circulerend tumor-DNA) detectie?
|
Onlangs is nanoplasmonica naar voren gekomen als een platform voor éénstaps duale detectie met hoge gevoeligheid en specificiteit. De praktijk van "liquid biopsy" als diagnostisch, prognostisch en theranostisch hulpmiddel bij patiënten met niet-kleincellige longkanker (NSCLC) is een aantrekkelijke benadering, althans in theorie, omdat het niet-invasief is en gemakkelijk herhaald kan worden. Cancer personalized profiling by deep sequencing (CAPP-Seq), een economische en ultrasensitieve methode voor het kwantificeren van ctDNA. Er werd een nieuwe DNA-sensor ontwikkeld die gebruikmaakt van een nikkel(II) fenanthroline complex ([Ni(phen)(2)PHPIP]·2ClO(4)) als elektrochemische probe. De sensor is zeer gevoelig en selectief voor detectie van kalfs thymus DNA (ctDNA) in een waterig medium.
|
[
"Bestaande methoden voor ctDNA-detectie zijn beperkt tot genetische mutaties.",
"Onlangs is nanoplasmonica naar voren gekomen als een platform voor éénstaps duale detectie met hoge gevoeligheid en specificiteit.",
"Deze resultaten tonen aan dat de sensor gelijktijdig de hot-spot mutatie en epigenetische veranderingen op het ctDNA kan detecteren. Veelbelovend is dat andere specifieke tumor-mutanten en epigenetische veranderingen bij lage concentraties met dit platform kunnen worden gedetecteerd.",
"De praktijk van \"liquid biopsy\" als diagnostisch, prognostisch en theranostisch hulpmiddel bij patiënten met niet-kleincellige longkanker (NSCLC) is een aantrekkelijke benadering, althans in theorie, omdat het niet-invasief is en gemakkelijk herhaald kan worden.",
"Hier introduceren we cancer personalized profiling by deep sequencing (CAPP-Seq), een economische en ultrasensitieve methode voor het kwantificeren van ctDNA.",
"Ten slotte evalueerden we tumor screening en genotypering zonder biopsie met CAPP-Seq. We voorzien dat CAPP-Seq routinematig klinisch toegepast kan worden om diverse maligniteiten te detecteren en te monitoren, waardoor gepersonaliseerde kankertherapie wordt vergemakkelijkt.",
"Synthese van een nieuw Ni-fenantroline complex en de toepassing ervan als elektrochemische probe voor detectie van nucleïnezuur",
"Er werd een nieuwe DNA-sensor ontwikkeld die gebruikmaakt van een nikkel(II) fenanthroline complex ([Ni(phen)(2)PHPIP]·2ClO(4)) als elektrochemische probe. De sensor is zeer gevoelig en selectief voor detectie van kalfs thymus DNA (ctDNA) in een waterig medium."
] | 294
| 308
|
960
|
Welk gen wordt geassocieerd met het Muenke-syndroom?
|
Het Muenke-syndroom is gerelateerd aan een mutatie in het Fibroblast Growth Factor Receptor (FGFR3) gen.
|
[
"Samenvatting Muenke is een fibroblast groeifactor receptor 3 (FGFR-3) geassocieerd syndroom, dat voor het eerst werd beschreven eind jaren 90.",
"Het syndroom wordt moleculair gedefinieerd door een unieke puntmutatie c.749C>G in exon 7 van het FGFR3-gen, wat resulteert in een aminozuursubstitutie p.Pro250Arg van het eiwitproduct.",
"Muenke-syndroom is een autosomaal dominant craniosynostose syndroom dat voortkomt uit een bepalende puntmutatie in het Fibroblast Growth Factor Receptor3 (FGFR3) gen.",
"Muenke-syndroom wordt veroorzaakt door een enkele bepalende puntmutatie in het fibroblast groeifactor receptor 3 (FGFR3) gen.",
"Muenke-syndroom wordt gekenmerkt door diverse craniofaciale misvormingen en wordt veroorzaakt door een autosomaal-dominante activerende mutatie in fibroblast groeifactor receptor 3 (FGFR3(P250R)).",
"De Pro250Arg-mutatie in het FGFR3-gen wordt gevonden bij patiënten met Muenke-syndroom en is een van de meest frequent voorkomende mutaties in craniosynostose syndromen.",
"Het Muenke-syndroom (MS) wordt gekenmerkt door unicoronale of bicoronale craniosynostose, midfaciale hypoplasie, oculaire hypertelorisme en een verscheidenheid aan kleine afwijkingen geassocieerd met een mutatie in het fibroblast groeifactor receptor 3 (FGFR3) gen.",
"Hier rapporteren we een familiaal geval van MS bij een vrouwelijke patiënt met een Pro250Arg-mutatie in exon 7 (IgII-IGIII linker domein) van het FGFR3-gen.",
"Fibroblasten van 10 individuen met elk Apert-syndroom (FGFR2 substitutie S252W), Muenke-syndroom (FGFR3 substitutie P250R), Saethre-Chotzen syndroom (verschillende mutaties in TWIST1) en niet-syndromische sagittale synostose (geen mutatie gedetecteerd) werden gekweekt.",
"We rapporteren over een stel eeneiige tweelingen met een de novo C749G-mutatie in het FGFR3-gen codon 250 na een zwangerschap gecompliceerd door prenatale blootstelling aan Nortriptyline.",
"Mutaties in het gen dat Fibroblast Growth Factor Receptor 3 (FGFR3) codeert, worden geassocieerd met Achondroplasie (MIM 100800), Hypochondroplasie (MIM 146000), Muenke-syndroom (MIM 602849), Thanatophore Dysplasie (MIM 187600, MIM 187601) en Lacrimo-Auriculo-Dento-Digitaal Syndroom (MIM 149730).",
"De identificatie van de P250R-mutatie maakte de bevestiging van het Muenke-syndroom mogelijk in 9 van de 52 verwezen gevallen.",
"Muenke-syndroom, gedefinieerd door heterozygotie voor een Pro250Arg-substitutie in fibroblast groeifactor receptor 3 (FGFR3), is de meest voorkomende genetische oorzaak van craniosynostose bij mensen. We hebben gen targeting gebruikt om het Muenke-syndroom mu",
"Muenke-syndroom is een autosomaal dominant aandoening gekenmerkt door coronal suture craniosynostose, gehoorverlies, ontwikkelingsachterstand, carpale en tarsale fusies, en de aanwezigheid van de Pro250Arg-mutatie in het FGFR3-gen.",
"Om de klinische kenmerken van dit syndroom beter te definiëren, zijn we een studie gestart naar de natuurlijke geschiedenis van het Muenke-syndroom. Tot nu toe hebben we een gestandaardiseerde evaluatie uitgevoerd van negen patiënten met een bevestigde Pro250Arg-mutatie in FGFR3.",
"De patiënten werden ingedeeld in de \"Muenke\"-groep (n=11) of de \"niet-Muenke\" controlegroep (n=12) op basis van een test voor de P250R-mutatie in het FGFR3-gen.",
"De P250R-mutatie in het FGFR3-gen, ook bekend als Muenke-syndroom, wordt geassocieerd met coronal craniosynostose, sensorineuraal doofheid, craniofaciale en digitale afwijkingen.",
"Echter, Muenke et al. [(1997); Am J Hum Genet 91: 555-564] beschreven een nieuwe subgroep die de Pro250Arg-mutatie draagt in het fibroblast groeifactor receptor (FGFR) 3 gen op chromosoom 4p16.",
"Muenke-syndroom, ook bekend als FGFR3-geassocieerde coronal synostose, wordt moleculair gedefinieerd door de aanwezigheid van een heterozygote nucleotide transversie, c.749C>G, coderend voor de aminozuursubstitutie Pro250Arg, in het fibroblast groeifactor receptor type 3 gen (FGFR3).",
"Ondanks een variabel fenotype is het Muenke-syndroom gerelateerd aan een unieke mutatie in het FGFR3-gen, Pro 250 naar Arg, die kenmerkend is voor deze ziekte.",
"Hypochondroplasie (HCH) en Muenke-syndroom (MS) worden veroorzaakt door mutaties in het FGFR3-gen."
] | 610
| 533
|
961
|
Is het veilig om Abatacept te gebruiken tijdens de zwangerschap?
|
Het is niet veilig om het geneesmiddel abatacept te gebruiken tijdens de zwangerschap, aangezien er nog zeer beperkte ervaring/kennis is. Daarnaast wordt aanbevolen het geneesmiddel vóór de zwangerschap te stoppen.
|
[
"Deze patiënten werden blootgesteld aan rituximab (anti-CD20 monoklonaal antilichaam) of abatacept (fusie-eiwit CTLA4Ig) tijdens het eerste trimester van hun zwangerschappen. Er werden geen significante bijwerkingen of complicaties waargenomen tijdens de zwangerschappen, en alle drie de patiënten brachten gezonde pasgeborenen ter wereld.",
"Ondanks deze gunstige uitkomsten moet het gebruik van deze twee biologische middelen voldoen aan internationale aanbevelingen. Hun gebruik is momenteel niet toegestaan tijdens de zwangerschap, behalve in gevallen waarin het potentiële voordeel voor de moeder het potentiële risico voor de foetus rechtvaardigt.",
"ZWANGERSCHAP: Azathioprine, chloroquine, cyclosporine A, prednisolon, sulfasalazine, tacrolimus en cyclofosfamide (alleen na het tweede trimester) mogen tijdens de zwangerschap worden toegediend. Biologica moeten worden vermeden tenzij er een behandelingsbehoefte is bij ongecontroleerde ziekteactiviteit.",
"Daarom wordt aanbevolen om abatacept, rituximab en tocilizumab vóór de zwangerschap te stoppen; tumor necrose factor-remmers en anakinra kunnen echter worden voortgezet tot de conceptie.",
"Casusrapporten over abatacept, tocilizumab of anakinra tijdens de zwangerschap zijn niet doorslaggevend.",
"De zeer beperkte ervaring met abatacept, tocilizumab of anakinra tijdens de zwangerschap laat geen uitspraak toe over hun compatibiliteit met de zwangerschap. Momenteel kan het gebruik van biologische middelen gedurende de zwangerschap niet worden aanbevolen.",
"Geneesmiddelen die vóór de zwangerschap moeten worden gestopt, zijn onder andere methotrexaat en leflunomide, plus de biologica: anti-TNF-middelen, rituximab en abatacept.",
"Terwijl methotrexaat, leflunomide, abatacept en rituximab vóór een geplande zwangerschap moeten worden gestopt, kunnen tumor necrose factor-remmers en bisfosfonaten worden voortgezet tot de conceptie.",
"De ervaring met zwangerschap bij abatacept en rituximab is nog te beperkt om hun veiligheid voor de zich ontwikkelende foetus te bewijzen. Ze moeten vóór een geplande zwangerschap worden gestopt.",
"Prophylactisch stoppen van geneesmiddelen vóór de zwangerschap is verplicht voor abatacept, rituximab, LEF en MMF."
] | 321
| 307
|
962
|
Wat is DeepCAGE?
|
De cap-analyse van genexpressie (CAGE) technologie is ontwikkeld om transcriptie-startplaatsen (TSS's) en expressieniveaus te detecteren door gebruik te maken van 5' cDNA-tags en PCR. Er is gerapporteerd dat de hoeveelheid templates evenredig is aan de amplificatie-efficiëntie van PCR. CAGE is gebruikt als een belangrijke techniek voor het analyseren van promotoractiviteit en het vinden van nieuwe transcripties, inclusief alternatieve gespleten producten en niet-coderende transcripties. DeepCAGE kan worden gebruikt voor high-throughput next-generation sequencing technologie. DeepCAGE kan veel diepere transcriptomdatasets produceren en kan meer details van het regelnetwerk onthullen.
|
[
"De cap-analyse van genexpressie (CAGE) technologie is ontwikkeld om transcriptie-startplaatsen (TSS's) en expressieniveaus te detecteren door gebruik te maken van 5' cDNA-tags en PCR. Er is gerapporteerd dat de hoeveelheid templates evenredig is aan de amplificatie-efficiëntie van PCR. CAGE is gebruikt als een belangrijke techniek voor het analyseren van promotoractiviteit en het vinden van nieuwe transcripties, inclusief alternatieve gespleten producten en niet-coderende transcripties. Hier introduceren we krachtigere tools zoals deepCAGE, die gebruikt kunnen worden voor high-throughput next-generation sequencing technologie. DeepCAGE kan veel diepere transcriptomdatasets produceren en kan meer details van het regelnetwerk onthullen.",
"Hier presenteren we een nieuwe methode voor high-throughput sequencing van 5' cDNA-tags - DeepCAGE: het samenvoegen van de Cap Analysis of Gene Expression methode met ultra-high-throughput sequentietechnologie.",
"DeepCAGE kan ook promotoren detecteren die slechts in een kleine subset van cellen binnen het complexe weefsel worden gebruikt.",
"DeepCAGE kan veel diepere transcriptomdatasets produceren en kan meer details van het regelnetwerk onthullen.",
"DeepCAGE kan ook promotoren detecteren die slechts in een kleine subset van cellen binnen het complexe weefsel worden gebruikt.",
"Hier introduceren we krachtigere tools zoals deepCAGE, die gebruikt kunnen worden voor high-throughput next-generation sequencing technologie.",
"Mammalencellen hebben minstens 5-10 ordes groter aantal TSS dan eerder werd aangenomen, en diepere sequencing is noodzakelijk om alle actieve promotoren in een bepaald weefsel te detecteren. Hier presenteren we een nieuwe methode voor high-throughput sequencing van 5' cDNA-tags - DeepCAGE: het samenvoegen van de Cap Analysis of Gene Expression methode met ultra-high-throughput sequentietechnologie.",
"Hier introduceren we krachtigere tools zoals deepCAGE, die gebruikt kunnen worden voor high-throughput next-generation sequencing technologie.",
"Met deze data presenteren we bewijs dat wijst op een sleutelrol voor de Arnt2 transcriptiefactor in genregulatie van de hippocampus. DeepCAGE kan ook promotoren detecteren die slechts in een kleine subset van cellen binnen het complexe weefsel worden gebruikt.",
"Hier introduceren we krachtigere tools zoals deepCAGE, die gebruikt kunnen worden voor high-throughput next-generation sequencing technologie. DeepCAGE kan veel diepere transcriptomdatasets produceren en kan meer details van het regelnetwerk onthullen."
] | 420
| 405
|
963
|
Is STAT3 betrokken bij EIF2AK2-afhankelijke onderdrukking van autofagie?
|
STAT3 kan fungeren als een competitieve remmer van EIF2AK2. Inderdaad, farmacologische of genetische remming van STAT3 stimuleert EIF2AK2-afhankelijke EIF2S1-fosforylering en autofagie. Omgekeerd remt de overexpressie van wildtype STAT3 evenals van STAT3-mutanten die niet gefosforyleerd kunnen worden door JAK2 of die uitgesloten zijn van de kern, autofagie. Echter, STAT3-mutanten die niet met EIF2AK2 kunnen interageren, zijn niet in staat autofagie te onderdrukken.
|
[
"STAT3 kan fungeren als een competitieve remmer van EIF2AK2. Inderdaad, farmacologische of genetische remming van STAT3 stimuleert EIF2AK2-afhankelijke EIF2S1-fosforylering en autofagie. Omgekeerd remt de overexpressie van wildtype STAT3 evenals van STAT3-mutanten die niet gefosforyleerd kunnen worden door JAK2 of die uitgesloten zijn van de kern, autofagie. Echter, STAT3-mutanten die niet met EIF2AK2 kunnen interageren, zijn niet in staat autofagie te onderdrukken.",
"Zowel STAT3-richtende middelen (d.w.z. Stattic, JSI-124 en WP1066) als EIF2AK2-activatoren (zoals de dubbelstrengs RNA-mimeticum polyinosinisch:polycytidylzuur) kunnen de remmende interactie tussen STAT3 en EIF2AK2 in cellen verstoren.",
"Een verdere screening gericht op het identificeren van EIF2AK2-afhankelijke inductoren van autofagie toonde aan dat verschillende vetzuren, waaronder palmitinezuur, autofagie induceren via een pad dat de verstoring van het STAT3-EIF2AK2-complex omvat.",
"Deze resultaten onthullen een onverwachte kruisbestuiving tussen cellulaire stofwisseling (vetzuren), pro-inflammatoire signalering (STAT3), aangeboren immuniteit (EIF2AK2) en translationele controle (EIF2S1) die autofagie reguleert.",
"Cytoplasmatisch STAT3 onderdrukt autofagie door de activiteit van PKR te remmen.",
"Het SH2-domein van STAT3 bleek te interageren met het katalytische domein van de eIF2α-kinase 2 EIF2AK2, beter bekend als proteïnekinase R (PKR). Farmacologische en genetische remming van STAT3 stimuleerde de activerende fosforylering van PKR en de daaropvolgende hyperfosforylering van eIF2α. Bovendien remde PKR-depletie autofagie die werd geïnitieerd door chemische STAT3-remmers of vrije vetzuren zoals palmitinezuur.",
"Chemische stoffen die STAT3 richten en palmitinezuur veroorzaakten de verstoring van remmende STAT3-PKR-interacties, gevolgd door PKR-afhankelijke eIF2α-fosforylering, wat de inductie van autofagie bevordert.",
"Inderdaad, farmacologische of genetische remming van STAT3 stimuleert EIF2AK2-afhankelijke EIF2S1-fosforylering en autofagie.",
"Een verdere screening gericht op het identificeren van EIF2AK2-afhankelijke inductoren van autofagie toonde aan dat verschillende vetzuren, waaronder palmitinezuur, autofagie induceren via een pad dat de verstoring van het STAT3-EIF2AK2-complex omvat, evenals de fosforylering van mitogeen-geactiveerde proteïnekinase 8/c-Jun N-terminale kinase 1 (MAPK8/JNK1) en EIF2S1.",
"Een verdere screening gericht op het identificeren van EIF2AK2-afhankelijke inductoren van autofagie toonde aan dat verschillende vetzuren, waaronder palmitinezuur, autofagie induceren via een pad dat de verstoring van het STAT3-EIF2AK2-complex omvat, evenals de fosforylering van mitogeen-geactiveerde proteïnekinase 8/c-Jun N-terminale kinase 1 (MAPK8/JNK1) en EIF2S1.",
"Inderdaad, farmacologische of genetische remming van STAT3 stimuleert EIF2AK2-afhankelijke EIF2S1-fosforylering en autofagie.",
"Echter, STAT3-mutanten die niet met EIF2AK2 kunnen interageren, zijn niet in staat autofagie te onderdrukken.",
"Directe interactie tussen STAT3 en EIF2AK2 reguleert vetzuur-geïnduceerde autofagie.",
"Een verdere screening gericht op het identificeren van EIF2AK2-afhankelijke inductoren van autofagie toonde aan dat verschillende vetzuren, waaronder palmitinezuur, autofagie induceren via een pad dat de verstoring van het STAT3-EIF2AK2-complex omvat, evenals de fosforylering van mitogeen-geactiveerde proteïnekinase 8/c-Jun N-terminale kinase 1 (MAPK8/JNK1) en EIF2S1.",
"Inderdaad, farmacologische of genetische remming van STAT3 stimuleert EIF2AK2-afhankelijke EIF2S1-fosforylering en autofagie.",
"Directe interactie tussen STAT3 en EIF2AK2 reguleert vetzuur-geïnduceerde autofagie.",
"Deze resultaten onthullen een onverwacht mechanisme van autofagiecontrole waarbij STAT3 en PKR als interactiepartners betrokken zijn.",
"Zowel STAT3-richtende middelen (d.w.z. Stattic, JSI-124 en WP1066) als EIF2AK2-activatoren (zoals de dubbelstrengs RNA-mimeticum polyinosinisch:polycytidylzuur) kunnen de remmende interactie tussen STAT3 en EIF2AK2 in cellen verstoren, maar alleen de laatstgenoemde doet dit in celvrije systemen in vitro. Een verdere screening gericht op het identificeren van EIF2AK2-afhankelijke inductoren van autofagie toonde aan dat verschillende vetzuren, waaronder palmitinezuur, autofagie induceren via een pad dat de verstoring van het STAT3-EIF2AK2-complex omvat, evenals de fosforylering van mitogeen-geactiveerde proteïnekinase 8/c-Jun N-terminale kinase 1 (MAPK8/JNK1) en EIF2S1.",
"Een verdere screening gericht op het identificeren van EIF2AK2-afhankelijke inductoren van autofagie toonde aan dat verschillende vetzuren, waaronder palmitinezuur, autofagie induceren via een pad dat de verstoring van het STAT3-EIF2AK2-complex omvat, evenals de fosforylering van mitogeen-geactiveerde proteïnekinase 8/c-Jun N-terminale kinase 1 (MAPK8/JNK1) en EIF2S1. Deze resultaten onthullen een onverwachte kruisbestuiving tussen cellulaire stofwisseling (vetzuren), pro-inflammatoire signalering (STAT3), aangeboren immuniteit (EIF2AK2) en translationele controle (EIF2S1) die autofagie reguleert.",
"Dus kan STAT3 fungeren als een competitieve remmer van EIF2AK2. Inderdaad, farmacologische of genetische remming van STAT3 stimuleert EIF2AK2-afhankelijke EIF2S1-fosforylering en autofagie.",
"Inderdaad, farmacologische of genetische remming van STAT3 stimuleert EIF2AK2-afhankelijke EIF2S1-fosforylering en autofagie. Omgekeerd remt de overexpressie van wildtype STAT3 evenals van STAT3-mutanten die niet gefosforyleerd kunnen worden door JAK2 of die uitgesloten zijn van de kern, autofagie.",
", Stattic, JSI-124 en WP1066) en EIF2AK2-activatoren (zoals de dubbelstrengs RNA-mimeticum polyinosinisch:polycytidylzuur) kunnen de remmende interactie tussen STAT3 en EIF2AK2 in cellen verstoren, maar alleen de laatstgenoemde doet dit in celvrije systemen in vitro. Een verdere screening gericht op het identificeren van EIF2AK2-afhankelijke inductoren van autofagie toonde aan dat verschillende vetzuren, waaronder palmitinezuur, autofagie induceren via een pad dat de verstoring van het STAT3-EIF2AK2-complex omvat, evenals de fosforylering van mitogeen-geactiveerde proteïnekinase 8/c-Jun N-terminale kinase 1 (MAPK8/JNK1) en EIF2S1."
] | 812
| 778
|
964
|
RTS S AS01-vaccin is ontwikkeld om welke ziekte te voorkomen?
|
RTS,S/AS01-vaccin is ontwikkeld ter preventie van malaria.
|
[
"Deze gerandomiseerde, dubbelblinde studie (NCT01323972) beoordeelde de consistentie van drie RTS,S/AS01-malaria-vaccinbatches, geformuleerd uit commerciële gezuiverde antigen bulkpartijen, wat betreft de geïnduceerde anti-CS-responsen.",
"Tot nu toe heeft slechts één kandidaat-malaria-vaccin, RTS,S/AS01, een bescheiden bescherming getoond in een fase 3-onderzoek bij Afrikaanse zuigelingen.",
"Effectiviteit en veiligheid van het RTS,S/AS01-malaria-vaccin met of zonder een boosterdosis bij zuigelingen en kinderen in Afrika: definitieve resultaten van een fase 3, individueel gerandomiseerd, gecontroleerd onderzoek.",
"ACHTERGROND: De effectiviteit en veiligheid van het RTS,S/AS01-kandidaat-malaria-vaccin gedurende 18 maanden follow-up zijn eerder gepubliceerd.",
"INTERPRETATIE: RTS,S/AS01 voorkwam een aanzienlijk aantal gevallen van klinische malaria over een periode van 3-4 jaar bij jonge zuigelingen en kinderen, toegediend met of zonder een boosterdosis.",
"De WHO verwacht dat het RTS,S/AS01-vaccin zal worden aanbevolen voor de leeftijdsgroep van 6-14 weken voor gelijktijdige toediening met andere vaccins als onderdeel van routinematige immunisatieprogramma's in malaria-endemische landen.",
"Recente fase 3-onderzoeken met het malaria-vaccinkandidaat RTS,S/AS01 (RTS,S) bij kinderen hebben een bescheiden effectiviteit aangetoond tegen klinische en ernstige malaria.",
"Het RTS,S/AS01(E)-malaria-vaccinkandidaat is recentelijk gestart met fase III-testen.",
"De effectiviteit van RTS,S/AS01 als vaccin tegen malaria wordt getest in een fase 3 klinische studie.",
"Beoordeling van ernstige malaria in een multicenter, fase III, RTS,S/AS01-malaria-kandidaatvaccinonderzoek: casusdefinitie, standaardisatie van gegevensverzameling en patiëntenzorg.",
"Indien de fase III-resultaten de waarnemingen uit fase II bevestigen, zou het RTS,S/AS01(E)-vaccin, bij brede implementatie en verstandige integratie met andere malariapreventiemaatregelen, een grote volksgezondheidsimpact hebben in Sub-Sahara Afrika.",
"Het RTS,S/AS01(E)-malaria-vaccinkandidaat is recent gestart met fase 3-testen.",
"Het RTS,S/AS01(E)-kandidaat-malaria-vaccin wordt ontwikkeld voor immunisatie van zuigelingen in Afrika via het uitgebreide immunisatieprogramma (EPI).",
"Het RTS,S/AS01(E)-kandidaat-malaria-vaccin wordt ontwikkeld voor immunisatie van Afrikaanse zuigelingen via het Uitgebreide Programma voor Immunisatie (EPI).",
"Van de vele benaderingen die zijn nagestreefd, vertegenwoordigt het RTS,S/AS01-vaccinkandidaat de meest ontwikkelde en klinisch gevalideerde malaria-vaccinformulering.",
"AS01 is geselecteerd voor de klinische ontwikkeling van verschillende kandidaatvaccins, waaronder het RTS,S-malaria-vaccin en het subunit glycoproteïne E varicella zoster-vaccin (beide momenteel in fase III).",
"Veiligheid en effectiviteit van het RTS,S/AS01E-kandidaat-malaria-vaccin gegeven met vaccins van het uitgebreide immunisatieprogramma: 19 maanden follow-up van een gerandomiseerde, open-label, fase 2-studie.",
"Een gerandomiseerde studie die de veiligheid en immunogeniciteit beoordeelt van AS01- en AS02-geadjuvanteerde RTS,S-malaria-vaccinkandidaten bij kinderen in Gabon.",
"Effect van ingenomen menselijke antilichamen geïnduceerd door RTS,S/AS01-malaria-vaccinatie bij kinderen op de vorming van Plasmodium falciparum-oöcysten en sporogonie in muggen.",
"De incidentie van gegeneraliseerde convulsieve aanvallen binnen 7 dagen na een RTS,S/AS01-booster was 2,2 per 1000 doses bij jonge zuigelingen en 2,5 per 1000 doses bij kinderen. INTERPRETATIE: RTS,S/AS01 voorkwam een aanzienlijk aantal gevallen van klinische malaria over een periode van 3-4 jaar bij jonge zuigelingen en kinderen, toegediend met of zonder een boosterdosis.",
"Ontwikkeling van gestandaardiseerde laboratoriummethoden en kwaliteitsprocessen voor een fase III-studie van het RTS,S/AS01-kandidaat-malaria-vaccin.",
"Statistische methodologie voor de evaluatie van vacceneffectiviteit in een fase III multicenteronderzoek van het RTS,S/AS01-malaria-vaccin bij Afrikaanse kinderen.",
"Meningitis werd gerapporteerd als een ernstig bijwerkinggeval bij respectievelijk 16/5.949 en 1/2.974 kinderen en bij 9/4.358 en 3/2.179 zuigelingen in de RTS,S/AS01- en controlegroepen. CONCLUSIES: RTS,S/AS01 voorkwam veel gevallen van klinische en ernstige malaria gedurende de 18 maanden na de derde vaccinatie, met de grootste impact in gebieden met de hoogste malaria-incidentie.",
"Dit artikel geeft een samenvatting van de discussies, conclusies en aanbevelingen van die bijeenkomst. De sessies omvatten: een overzicht van de effectiviteit van artemisinine-gebaseerde combinatietherapie in Guyana en Suriname; de uitkomsten van een consultatie over niet-malaria koortsziekten; de uitkomsten van de tweede bijeenkomst van de Evidence Review Group over malaria-burden schatting; een update over de herziening van de WHO-richtlijnen voor de behandeling van malaria; een update over de voortgang van de samenstelling van de Technical Expert Group voor vectorcontrole; updates over het RTS,S/AS01-vaccin en de malaria-vaccintechnologie roadmap; financiering en middelenallocatie voor malariabestrijding; malariabewaking en de noodzaak van een Technical Expert Group voor surveillance, monitoring en evaluatie; criteria en classificatie met betrekking tot malaria-eliminatie; de volgende bijeenkomst van de Evidence Review Group over Intermitterende Preventieve Behandeling tijdens de zwangerschap; een update over het binnenkort te lanceren Elimination Scenario Planning Tool; en een update over het proces voor de Global Technical Strategy for Malaria Control and Elimination (2016-2025). Beleidsverklaringen, standpunten en richtlijnen die voortkomen uit de conclusies en aanbevelingen van de MPAC-bijeenkomst zullen formeel worden uitgegeven en verspreid aan de lidstaten van de Wereldgezondheidsorganisatie door het Wereldgezondheidsorganisatie Global Malaria Programme.",
"Het RTS,S/AS01-vaccinkandidaat vertegenwoordigt de meest ontwikkelde en klinisch gevalideerde malaria-vaccinformulering."
] | 791
| 695
|
965
|
Wat zijn de Topologische Domeinen (TAD's)?
|
Topologische domeinen of TAD's zijn megabase-grote lokale chromatine-interactiedomeinen die een alomtegenwoordige structurele eigenschap zijn van de genoomorganisatie. Deze domeinen correleren met regio's van het genoom die de verspreiding van heterochromatine beperken. De domeinen zijn stabiel in verschillende celtypen en sterk geconserveerd tussen soorten, wat aangeeft dat topologische domeinen een inherente eigenschap zijn van zoogdiergenomen. De grenzen van topologische domeinen zijn verrijkt met het insulator-bindende eiwit CTCF, housekeeping-genen, transfer-RNA's en korte verspreide elementen (SINE) retrotransposons, wat erop wijst dat deze factoren een rol kunnen spelen bij het vaststellen van de topologische domeinstructuur van het genoom.
|
[
"We identificeren grote, megabase-grote lokale chromatine-interactiedomeinen, die we 'topologische domeinen' noemen, als een alomtegenwoordige structurele eigenschap van de genoomorganisatie. Deze domeinen correleren met regio's van het genoom die de verspreiding van heterochromatine beperken. De domeinen zijn stabiel in verschillende celtypen en sterk geconserveerd tussen soorten, wat aangeeft dat topologische domeinen een inherente eigenschap zijn van zoogdiergenomen. Ten slotte vinden we dat de grenzen van topologische domeinen verrijkt zijn met het insulator-bindende eiwit CTCF, housekeeping-genen, transfer-RNA's en korte verspreide elementen (SINE) retrotransposons, wat erop wijst dat deze factoren een rol kunnen spelen bij het vaststellen van de topologische domeinstructuur van het genoom.",
"Het menselijk genoom is opgedeeld in topologisch associërende domeinen (TAD's), maar de rol van deze geconserveerde organisatie tijdens tijdelijke veranderingen in genexpressie is niet bekend",
"Recente Hi-C mapping heeft substructuur binnen chromatinecompartimenten onthuld, genaamd topologisch associërende domeinen (TAD's), die grotendeels geconserveerd zijn in hun posities tussen celtypen en vergelijkbaar zijn in grootte met replicatiedomeinen."
] | 263
| 251
|
966
|
Wat is de vibratietheorie van de reukzin?
|
De vibratietheorie van de reukzin gaat ervan uit dat elektronenoverdracht plaatsvindt over geurstoffen bij de actieve plaatsen van geurstofreceptoren (OR's), wat dient als een gevoelige maat voor de vibratiefrequenties van geurstoffen, wat uiteindelijk leidt tot olfactorische waarneming. De theorie stelt dat geurstofreceptoren reageren op de trillingen van de moleculen en niet op hun vorm. Het verschilt van eerdere vibratietheorieën (Dyson, Wright) doordat het een gedetailleerd en plausibel mechanisme biedt voor biologische omzetting van moleculaire trillingen: inelastisch elektronentunneling. De auteurs die deze theorie hebben voorgesteld, suggereren dat reukzin, net als kleurenzicht en gehoor, een spectraalszin is.
|
[
"De vibratietheorie van de reukzin gaat ervan uit dat elektronenoverdracht plaatsvindt over geurstoffen bij de actieve plaatsen van geurstofreceptoren (OR's), wat dient als een gevoelige maat voor de vibratiefrequenties van geurstoffen, wat uiteindelijk leidt tot olfactorische waarneming.",
"Er wordt voorgesteld dat geurstofreceptoren reageren op de trillingen van de moleculen en niet op hun vorm. Het verschilt van eerdere vibratietheorieën (Dyson, Wright) doordat het een gedetailleerd en plausibel mechanisme biedt voor biologische omzetting van moleculaire trillingen: inelastisch elektronentunneling. Elementen van de tunneling-spectroscoop zijn geïdentificeerd in vermoedelijke geurstofreceptoren en hun geassocieerde G-eiwit.",
"Het hier gepresenteerde bewijs suggereert in plaats daarvan dat reukzin, net als kleurenzicht en gehoor, een spectraalszin is.",
"De vibratietheorie van de reukzin gaat ervan uit dat elektronenoverdracht plaatsvindt over geurstoffen bij de actieve plaatsen van geurstofreceptoren (OR's), wat dient als een gevoelige maat voor de vibratiefrequenties van geurstoffen, wat uiteindelijk leidt tot olfactorische waarneming. Een eerdere studie meldde dat menselijke proefpersonen waterstof/deuterium isotopomeren (isomeren met isotopische atomen) van de muskverbinding cyclopentadecanon konden onderscheiden als bewijs ter ondersteuning van de theorie.",
"De vibratietheorie van de reukzin gaat ervan uit dat elektronenoverdracht plaatsvindt over geurstoffen bij de actieve plaatsen van geurstofreceptoren (OR's),",
"De vibratietheorie van de reukzin gaat ervan uit dat elektronenoverdracht plaatsvindt over geurstoffen bij de actieve plaatsen van geurstofreceptoren (OR's), wat dient als een gevoelige maat voor de vibratiefrequenties van geurstoffen, wat uiteindelijk leidt tot olfactorische waarneming."
] | 317
| 323
|
967
|
Zijn CTCF en BORIS betrokken bij genoomregulatie en kanker?
|
Ja. CTCF wordt overal tot expressie gebracht en speelt diverse rollen in genregulatie, imprinting, isolatie, intra-/interchromosomale interacties, nucleaire compartimentalisatie en alternatieve splicing. CTCF heeft één paralog, het testes-specifieke CTCF-achtige gen (CTCFL)/BORIS. CTCF en BORIS kunnen gedereguleerd zijn bij kanker. Het tumorsuppressorgen CTCF kan gemuteerd of verwijderd zijn bij kanker, of de DNA-binding van CTCF kan veranderd zijn door epigenetische veranderingen. BORIS wordt vaak abnormaal tot expressie gebracht bij kanker, wat sommigen ertoe heeft gebracht een pro-tumorigene rol voor BORIS voor te stellen. Echter, BORIS kan celproliferatie remmen en is bij kanker gemuteerd op een vergelijkbare wijze als CTCF, wat suggereert dat BORIS-activatie bij kanker kan voortkomen uit globale genetische of epigenetische veranderingen die typisch zijn voor maligne transformatie.
|
[
"CTCF wordt overal tot expressie gebracht en speelt diverse rollen in genregulatie, imprinting, isolatie, intra-/interchromosomale interacties, nucleaire compartimentalisatie en alternatieve splicing. CTCF heeft één paralog, het testes-specifieke CTCF-achtige gen (CTCFL)/BORIS. CTCF en BORIS kunnen gedereguleerd zijn bij kanker. Het tumorsuppressorgen CTCF kan gemuteerd of verwijderd zijn bij kanker, of de DNA-binding van CTCF kan veranderd zijn door epigenetische veranderingen. BORIS wordt vaak abnormaal tot expressie gebracht bij kanker, wat sommigen ertoe heeft gebracht een pro-tumorigene rol voor BORIS voor te stellen. Echter, BORIS kan celproliferatie remmen en is bij kanker gemuteerd op een vergelijkbare wijze als CTCF, wat suggereert dat BORIS-activatie bij kanker kan voortkomen uit globale genetische of epigenetische veranderingen die typisch zijn voor maligne transformatie",
"Het onderzoek naar de moleculaire mechanismen die door CTCF worden ingezet om tumorgeassocieerde genen te moduleren benadrukt de celtype-afhankelijkheid van zijn tumorsuppressorrol. Inderdaad hangt het vermogen van CTCF om aan hun promotoren te binden strikt af van celtypekenmerken zoals DNA-methylatie, BORIS-binding en post-translationele modificaties zoals PARYlatie",
"Bovendien resulteerde reductie van CTCF in normaal BORIS-negatieve menselijke fibroblasten in derepressie van BORIS-promotoren. Deze resultaten bieden een mechanistische basis om kankergerelateerde associaties tussen haplo-insufficiëntie van CTCF en derepressie van BORIS, en tussen het ontbreken van functioneel p53 en aberrante activatie van BORIS te begrijpen",
"CTCF en BORIS in genoomregulatie en kanker.",
"De nieuwe BORIS + CTCF-genfamilie is uniek betrokken bij de epigenetica van normale biologie en kanker.",
"Gezamenlijk wijzen deze gegevens erop dat wederzijdse binding van CTCF en BORIS aan de NY-ESO-1-promotor epigenetische regulatie van dit CT-gen in longkankercellen medieert, en suggereren dat inductie van BORIS een nieuwe strategie kan zijn om de immunogeniciteit van longcarcinomen te vergroten.",
"BORIS is de enige bekende paralog van CTCF, een gen dat nauw betrokken is bij genomische imprinting, chromatine-isolatie en nucleaire regulatie.",
"Echter, BORIS kan celproliferatie remmen en is bij kanker gemuteerd op een vergelijkbare wijze als CTCF, wat suggereert dat BORIS-activatie bij kanker kan voortkomen uit globale genetische of epigenetische veranderingen die typisch zijn voor maligne transformatie.",
"Wij suggereren dat BORIS waarschijnlijk epigenetische machinerie aan een nieuwe klasse van CTCF/BORIS 11ZF-doelsequenties bindt die inductie van kanker-testisgenen mediëren.",
"In tegenstelling tot CTCF is BORIS-expressie alleen gerapporteerd in de testis en bepaalde maligniteiten, wat heeft geleid tot de classificatie ervan als een \"kanker-testis\" antigeen."
] | 473
| 490
|
968
|
Wat is de toepassing van het ASSET-algoritme in C. elegans?
|
ASSET (Algorithm for the Segmentation and the Standardization of C. elegans Time-lapse recordings) is een robuust algoritme voor de geautomatiseerde segmentatie en standaardisatie van vroege Caenorhabditis elegans-embryo's. Het verzamelt kwantitatieve informatie met subcellulaire precisie in het vroege Caenorhabditis elegans-embryo, dat een aantrekkelijk model is om evolutionair geconserveerde cellulaire mechanismen te onderzoeken. ASSET detecteert automatisch de eierschaal en de celcortex uit DIC-tijdreeksopnamen van levende embryo's in de één-celligestadium en kan ook subcellulaire structuren volgen met behulp van fluorescente tijdreeks-microscopie. Belangrijk is dat ASSET de gegevens standaardiseert in een absoluut coördinatensysteem om robuuste kwantitatieve vergelijkingen tussen embryo's mogelijk te maken.
|
[
"ASSET: een robuust algoritme voor de geautomatiseerde segmentatie en standaardisatie van vroege Caenorhabditis elegans-embryo's.",
"Het vroege Caenorhabditis elegans-embryo is een aantrekkelijk model om evolutionair geconserveerde cellulaire mechanismen te onderzoeken. Er is echter een tekort aan geautomatiseerde methoden om kwantitatieve informatie met subcellulaire precisie in dit systeem te verzamelen. We ontwikkelden ASSET (Algorithm for the Segmentation and the Standardization of C. elegans Time-lapse recordings) om aan deze behoefte te voldoen. ASSET detecteert automatisch de eierschaal en de celcortex uit DIC-tijdreeksopnamen van levende embryo's in het één-celligestadium en kan ook subcellulaire structuren volgen met fluorescente tijdreeks-microscopie. Belangrijk is dat ASSET de gegevens standaardiseert in een absoluut coördinatensysteem om robuuste kwantitatieve vergelijkingen tussen embryo's mogelijk te maken. We illustreren hoe ASSET efficiënt kwantitatieve gegevens kan verzamelen over de beweging van centrosomen en nauwkeurig corticale invaginaties kan volgen, waarbij tot nu toe onopgemerkte verschillen tussen wildtype en saps-1(RNAi) embryo's aan het licht komen. Samengevat vestigen we ASSET als een nieuw hulpmiddel voor de efficiënte kwantificatie en standaardisatie van beelden van vroege C. elegans-embryo's.",
"Samengevat vestigen we ASSET als een nieuw hulpmiddel voor de efficiënte kwantificatie en standaardisatie van beelden van vroege C. elegans-embryo's.",
"We ontwikkelden ASSET (Algorithm for the Segmentation and the Standardization of C. elegans Time-lapse recordings) om aan deze behoefte te voldoen. ASSET detecteert automatisch de eierschaal en de celcortex uit DIC-tijdreeksopnamen van levende embryo's in het één-celligestadium en kan ook subcellulaire structuren volgen met fluorescente tijdreeks-microscopie. Belangrijk is dat ASSET de gegevens standaardiseert in een absoluut coördinatensysteem om robuuste kwantitatieve vergelijkingen tussen embryo's mogelijk te maken.",
"Samengevat vestigen we ASSET als een nieuw hulpmiddel voor de efficiënte kwantificatie en standaardisatie van beelden van vroege C. elegans-embryo's."
] | 369
| 377
|
969
|
Zijn Sidekick-eiwitten leden van de immunoglobuline-superfamilie?
|
Ja, Sidekick zijn celadhesiemoleculen van de immunoglobuline-superfamilie.
|
[
"Hier tonen we aan dat vier nauw verwante adhesiemoleculen van de immunoglobuline-superfamilie (IgSF) -- Dscam (Downsyndroom celadhesiemolecuul), DscamL (referenties 6-9), Sidekick-1 en Sidekick-2",
"Sidekick-1, een celadhesiemolecuul van de immunoglobuline-superfamilie, is verhoogd tot expressie in glomerulaire podocyten bij de collapsende glomerulopathie van HIV-geassocieerde nefropathie (HIVAN)."
] | 60
| 54
|
970
|
Wat zijn de pyknons?
|
Met behulp van een ongecontroleerde patroonontdekkingsmethode werden de menselijke intergene en intronische regio's verwerkt en werden alle patronen met variabele lengte met identiek geconserveerde kopieën en multipliciteiten boven wat door toeval wordt verwacht, gecatalogiseerd. Onder de miljoenen ontdekte patronen werd een subset van 127.998 patronen gevonden, pyknons genoemd, die extra niet-overlappende exemplaren hebben in de niet-vertaalde en eiwitcoderende regio's van 30.675 transcripties van 20.059 menselijke genen. De pyknons rangschikken zich combinatorisch in de niet-vertaalde en coderende regio's van talrijke menselijke genen waar ze mozaïeken vormen. Pyknons kunnen een biologisch belangrijke schakel vertegenwoordigen tussen coderend en niet-coderend DNA.
|
[
"Met behulp van een ongecontroleerde patroonontdekkingsmethode hebben we de menselijke intergene en intronische regio's verwerkt en alle patronen met variabele lengte met identiek geconserveerde kopieën en multipliciteiten boven wat door toeval wordt verwacht, gecatalogiseerd. Onder de miljoenen ontdekte patronen vonden we een subset van 127.998 patronen, pyknons genoemd, die extra niet-overlappende exemplaren hebben in de niet-vertaalde en eiwitcoderende regio's van 30.675 transcripties van 20.059 menselijke genen.",
"In een recent artikel in PNAS beschrijven Rigoutsos et al. (2006) een niet-willekeurig patroon van herhaalde elementen, pyknons genoemd, die vaker voorkomen in de 3'-niet-vertaalde regio's van genen dan in andere regio's van het menselijk genoom.",
"De ontdekking van pyknons, de meest frequente DNA-sequentiemotieven met variabele lengte in het menselijk genoom, suggereert uitgebreide sequentie-gebaseerde connectiviteit tussen niet-coderende en eiwitcoderende componenten van het menselijk genoom.",
"Korte blokken uit de niet-coderende delen van het menselijk genoom komen voor binnen bijna alle bekende genen en zijn gerelateerd aan biologische processen.",
"Pyknons zijn niet-willekeurige sequentiepatronen die significant herhaald worden door het niet-coderende genomische DNA en die ook minstens één keer voorkomen in coderende genen. Ze zijn interessant omdat ze een onverwachte verbinding tussen coderend en niet-coderend DNA voorspellen. Pyknons zijn alleen ontdekt in het menselijk genoom, dus het is onbekend of pyknons bredere biologische relevantie hebben of simpelweg een fenomeen van het menselijk genoom zijn.",
"Deze gegevens onthullen dat pyknons een biologisch belangrijke schakel vertegenwoordigen tussen coderend en niet-coderend DNA.",
"Pyknons zijn niet-willekeurige sequentiepatronen die significant herhaald worden door het niet-coderende genomische DNA en die ook minstens één keer voorkomen in coderende genen.",
"Pyknons zijn niet-willekeurige sequentiepatronen die significant herhaald worden door het niet-coderende genomische DNA en die ook minstens één keer voorkomen in coderende genen.",
"De pyknons rangschikken zich combinatorisch in de niet-vertaalde en coderende regio's van talrijke menselijke genen waar ze mozaïeken vormen."
] | 373
| 388
|
971
|
Welke deiodinases zijn het best bekend als aanwezig in de hersenen?
|
Alle 3 deiodinases (Type 1, Type 2 en Type 3 deiodinase) zijn aanwezig in de "hersenen", maar Type 1 deiodinase wordt alleen gevonden in de neurohypofyse, die eigenlijk niet als echt "hersenenweefsel" kan worden beschouwd.
|
[
"In de hersenen lijkt de aanwezigheid van type III iodothyronine deiodinase (D3) belangrijk te zijn voor het handhaven van de homeostase van T(3)-niveaus.",
"We konden een proteïnefragment detecteren dat overeenkomt met de verwachte moleculaire massa (30 kDa) voor type III deiodinase door middel van Western blot-analyse. RT-PCR evenals Northern blot-analyse bevestigden de aanwezigheid van D3 mRNA in het cerebellum.",
"De aanwezigheid van 5D (type-III) samen met ons eerdere rapport over 5'-deiodinase (type-I bij euthyreoïdie en type-II bij hypothyreoïdie) toont aan dat de iso-enzymen van de deiodinases in de neurohypofyse vrij vergelijkbaar zijn met die in de hersenen."
] | 139
| 139
|
972
|
Wat zijn de computationele methoden voor de voorspelling van beta-barrel transmembraaneiwitten?
|
Computational tools zijn ontwikkeld voor het onderscheiden van beta-barrel transmembraaneiwitten, topologievoorspelling en voorspelling van hun structurele kenmerken. Initiële methoden voor de voorspelling van de transmembraan beta-strengen waren gebaseerd op hydrofobiciteitsanalyse, met gebruik van schuivende vensters langs de sequentie om de afwisselende patronen van hydrofobe-hydrofiele residuen van de transmembraanstrengen vast te leggen, of met gebruik van gegeneraliseerde secundaire structuurvoorspellingsmethoden. Andere benaderingen omvatten de constructie van speciale empirische regels met behulp van aminozuurpropensiteiten en voorkennis van de structurele aard van de eiwitten, en de ontwikkeling van op neurale netwerken gebaseerde voorspellers om de locatie van alfa-koolstofatomen ten opzichte van het membraan te voorspellen. In de afgelopen jaren zijn andere, meer verfijnde methoden verschenen, waaronder: neurale netwerken, verborgen Markovmodellen, support vector machines, k-Nearest Neighbors, radiale basisfuncties, Bayesiaanse netwerken, genetische algoritmen, Mahalanobis discriminantfuncties, cellulaire automaten, N-to-1 extreme learning machines. Methoden gebaseerd op verborgen Markovmodellen behoren tot de meest succesvolle in topologievoorspelling, omdat ze de unieke architectuur van beta-barrel transmembraaneiwitten kunnen vastleggen. Consensusmethoden, evenals pipelines van verschillende gerelateerde tools (bijv. voorspelling van subcellulaire lokalisatie, voorspelling van alfa-helicale transmembraaneiwitten, voorspelling van signaalpeptiden/lipoproteïnen) zijn ook gebruikt voor het onderscheiden van beta-barrel transmembraaneiwitten. Recentelijk zijn een aantal methoden ontwikkeld voor het voorspellen van meer gedetailleerde structurele kenmerken (bijv. oppervlakte toegankelijkheid, residucontacten, zelfs gedetailleerde atomische 3D-modellen) die zijn toegespitst op beta-barrel transmembraaneiwitten, gebaseerd op kennisgebaseerde potentiaal functies, grafentheoretische modellen, fysische modellen en multi-tape S-attribute grammatica’s. Methoden/tools die in bovengenoemde klassen vallen zijn (alfabetisch gerangschikt): BBF (beta-barrel finder), BETAWARE, BOCTOPUS, BOMP, BTMX (Beta barrel TransMembrane eXposure), HHomp, HMM-B2TMR, OMBBpred, PROFtmb, PRED-TMBB, TMB-Hunt, TBBPred, TMBETAPRED-RBF, TMBHMM, TransFold, TMBpro, TMBKNN, Wimley
|
[
"BETAWARE: een machine-learning tool om transmembrane beta-barrel eiwitten in prokaryoten te detecteren en voorspellen",
"Recentelijk ontwikkelden we twee top-presterende methoden gebaseerd op machine-learning benaderingen om zowel de detectie van TMBB’s in eiwitsets als de voorspelling van hun topologie aan te pakken. Hier presenteren we ons BETAWARE programma dat beide benaderingen bevat en als standalone programma op een Linux-gebaseerde computer kan draaien om gemakkelijk grootschalige eiwitannotatie of filtering thuis uit te voeren.",
"We introduceren een grafentheoretisch model voor het voorspellen van de supersecundaire structuur van transmembraan β-barrel eiwitten – een bijzondere klasse eiwitten die diverse belangrijke functies vervult maar waarvan de structuur moeilijk experimenteel te bepalen is. Dit ab initio model lost het eiwitvouwingprobleem op gebaseerd op pseudo-energiminimalisatie met behulp van een eenvoudige probabilistische filter. Het maakt ook het bepalen mogelijk van structuren waarvan het vat een gegeven permutatie volgt in de rangschikking van β-strengen, en maakt snelle discriminatie van transmembraan β-vaten van andere eiwittypen mogelijk.",
"BOCTOPUS: verbeterde topologievoorspelling van transmembraan β-barrel eiwitten",
"Verbetering van de detectie van transmembraan β-barrel ketens met N-to-1 extreme learning machines",
"We introduceren een nieuwe machine learning benadering voor TMBB detectie gebaseerd op N-to-1 Extreme Learning Machines",
"TMBHMM: een frequentieprofiel-gebaseerd HMM voor het voorspellen van de topologie van transmembraan beta-barrel eiwitten en de blootstellingsstatus van transmembraan residuen",
"Hier presenteren we TMBHMM, een computationele methode gebaseerd op een verborgen Markovmodel voor het voorspellen van de structurele topologie van vermoedelijke TMB’s vanuit sequentie. Naast het voorspellen van transmembraanstrengen voorspelt TMBHMM ook de blootstellingsstatus (d.w.z. blootgesteld aan het membraan of verborgen in de eiwitstructuur) van de residuen in het transmembraangebied, wat een nieuw kenmerk is van de TMBHMM methode. Verder kan TMBHMM ook de membraanresiduen voorspellen die geen deel uitmaken van beta-barrel vormende strengen.",
"Voorspelling van de blootstellingsstatus van transmembraan beta-barrel residuen vanuit eiwitsequentie",
"We presenteren BTMX (Beta barrel TransMembrane eXposure), een computationele methode om de blootstellingsstatus (d.w.z. blootgesteld aan de bilayer of verborgen in de eiwitstructuur) van transmembraanresiduen in transmembraan beta-barrel eiwitten (TMB’s) te voorspellen.",
"Gecombineerde voorspelling van transmembraan topologie en signaalpeptide van beta-barrel eiwitten: gebruikmakend van een verborgen Markovmodel en genetische algoritmen",
"Hier presenteren we een HMM die een transmembraan vat submodel en een SP submodel combineert voor zowel topologie- als SP-voorspellingen. Een nieuw genetisch algoritme (GA) wordt hier gepresenteerd om het model te trainen, terwijl tegelijkertijd het Posterior-Viterbi algoritme wordt gebruikt voor decodering.",
"In dit werk stellen we een methode voor gebaseerd op radiale basisnetwerken voor het voorspellen van het aantal beta-strengen in OMP’s en het identificeren van hun membraanspannende segmenten.",
"We hebben een webserver ontwikkeld, TMBETAPRED-RBF, voor het voorspellen van transmembraan beta-strengen vanuit aminozuursequentie en deze is beschikbaar op http://rbf.bioinfo.tw/~sachen/tmrbf.html",
"We hebben een nieuwe benadering ontwikkeld voor het ontleden van transmembraan beta-barrel eiwitten (TMB’s) in genomische sequenties. De kenmerken omvatten (i) de identificatie van TMB’s met behulp van de voorkeur van residuparen in globulaire, transmembraan helicale (TMH) en TMB’s, (ii) eliminatie van globulaire/TMH eiwitten die meer dan 70% sequentie-identiteit vertonen over 80% van de residuen met bekende structuren, (iii) eliminatie van globulaire/TMH eiwitten die meer dan 60% sequentie-identiteit vertonen met bekende sequenties in SWISS-PROT, en (iv) uitsluiting van TMH eiwitten met behulp van SOSUI, een voorspellingssysteem voor TMH eiwitten.",
"TMBpro: voorspelling van secundaire structuur, beta-contacten en tertiaire structuur van transmembraan beta-barrel eiwitten",
"We ontwikkelen een suite (TMBpro) van gespecialiseerde voorspellers voor het voorspellen van secundaire structuur (TMBpro-SS), beta-contacten (TMBpro-CON) en tertiaire structuur (TMBpro-3D) van transmembraan beta-barrel eiwitten.",
"Dit artikel presenteert een k-nearest neighbor (K-NN) methode voor het onderscheiden van TMB en niet-TMB eiwitten.",
"In dit artikel worden, gebaseerd op het concept van pseudo aminozuursamenstelling (PseAA) die volgorde-informatie van een eiwitsequentie kan incorporeren om de kracht van discrete modellen aanzienlijk te verbeteren (Chou, K. C., Proteins: Structure, Function, and Genetics, 2001, 43: 246-255), cellulaire automaten en Lempel-Ziv complexiteit geïntroduceerd om de TM-regio’s van integrale membraaneiwitten, inclusief zowel alfa-helicale als beta-barrel membraaneiwitten, te voorspellen, gevalideerd met jackknife test",
"We presenteren BOCTOPUS; een verbeterde methode voor de topologievoorspelling van TMB’s door gebruik te maken van een combinatie van support vector machines (SVM’s) en verborgen Markovmodellen (HMM’s). De SVM’s en HMM’s houden respectievelijk rekening met lokale en globale residuvoorkeuren.",
"PRED-TMBB: een webserver voor het voorspellen van de topologie van beta-barrel buitenmembraaneiwitten",
"Hier presenteren we een webserver (PRED-TMBB, http://bioinformatics.biol.uoa.gr/PRED-TMBB) die in staat is de transmembraanstrengen en de topologie van beta-barrel buitenmembraaneiwitten van Gram-negatieve bacteriën te voorspellen. De methode is gebaseerd op een verborgen Markovmodel, getraind volgens het Conditional Maximum Likelihood criterium.",
"Voorspelling van transmembraanregio’s van beta-barrel eiwitten met ANN- en SVM-gebaseerde methoden",
"Dit artikel beschrijft een methode ontwikkeld voor het voorspellen van transmembraan beta-barrel regio’s in membraaneiwitten met behulp van machine learning technieken: artificiële neurale netwerken (ANN) en support vector machines (SVM). Het ANN dat in deze studie wordt gebruikt is een feed-forward neuraal netwerk met een standaard back-propagatie trainingsalgoritme.",
"We hebben ook een SVM-gebaseerde methode ontwikkeld met als input een primaire sequentie en bereikten een nauwkeurigheid van 77,4%. Het SVM-model werd aangepast door 36 fysisch-chemische parameters toe te voegen aan de aminozuursequentie-informatie. Ten slotte werden ANN- en SVM-gebaseerde methoden gecombineerd om het volledige potentieel van beide technieken te benutten.",
"We hebben een webserver ontwikkeld, TBBPred, voor het voorspellen van transmembraan beta-barrel regio’s in eiwitten",
"Voorspelling van transmembraan beta-barrels in proteomen",
"Hier introduceren we het ontwerp, de statistieken en resultaten van een nieuw profiel-gebaseerd verborgen Markovmodel voor de voorspelling en discriminatie van TMB’s.",
"Alle proteoomvoorspellingen en de PROFtmb voorspellingsmethode zijn beschikbaar",
"Het beta-barrel finder (BBF) programma, waarmee buitenmembraan beta-barrel eiwitten gecodeerd in prokaryotische genomen kunnen worden geïdentificeerd",
"Hier rapporteren we computationele analyses van zes buitenmembraaneiwitten met bekende 3D-structuren met betrekking tot (1) secundaire structuur, (2) hydrofobiciteit, en (3) amfipathiciteit. Met behulp van deze kenmerken, evenals de aanwezigheid van een N-terminale targetsequentie, werd een programma ontwikkeld waarmee integrale membraan beta-barrel eiwitten gecodeerd in elk volledig gesequenced prokaryotisch genoom kunnen worden voorspeld. Dit programma, beta-barrel finder (BBF) genoemd, werd gebruikt om de eiwitten gecodeerd in het Escherichia coli genoom te analyseren.",
"Een sequentie-profiel-gebaseerd HMM voor het voorspellen en onderscheiden van beta-barrel membraaneiwitten",
"We ontwikkelen een HMM-model dat de topologie van beta-barrel membraaneiwitten kan voorspellen met als input evolutionaire informatie. Het model is cyclisch met 6 typen toestanden: twee voor de beta-streng transmembraankern, één voor de beta-streng kap aan beide zijden van het membraan, één voor de binnenste lus, één voor de buitenste lus en één voor de globulaire domeintoestand in het midden van elke lus. De ontwikkeling van een specifieke input voor HMM gebaseerd op multiple sequence alignment is nieuw.",
"Voorspelling van de transmembraanregio’s van beta-barrel membraaneiwitten met een neuraal netwerk-gebaseerde voorspeller",
"Een methode gebaseerd op neurale netwerken is getraind en getest op een niet-redundante set beta-barrel membraaneiwitten bekend op atomaire resolutie met een jackknife procedure. De methode voorspelt de topografie van transmembraan beta-strengen met residu-nauwkeurigheid tot 78% wanneer evolutionaire informatie als input wordt gebruikt.",
"Een webserver gebaseerd op de voorgestelde methode is beschikbaar op http://yanbioinformatics.cs.usu.edu:8080/TMBKNNsubmit.",
"Voorspelling van driedimensionale structuren van transmembraandomijnen van β-barrel membraaneiwitten",
"We hebben een computationele methode ontwikkeld voor het voorspellen van structuren van de transmembraandomijnen van β-barrel membraaneiwitten. Gebaseerd op fysische principes kan onze methode structuren voorspellen van de transmembraandomijn van β-barrel membraaneiwitten met nieuwe topologieën, inclusief die van eukaryotische mitochondriën. Onze methode is gebaseerd op een model van fysische interacties, een discrete conformationele toestandsruimte, een empirische potentiaal functie, evenals een model om interstreng lusentropie te verklaren.",
"Classificatie van blootstellingsstatus van transmembraan beta-barrel residuen",
"Er bestaan verschillende computationele methoden voor de identificatie van transmembraan beta-barrel eiwitten (TMB’s) vanuit sequentie. Sommige van deze methoden geven ook de transmembraan (TM) grenzen van de vermoedelijke TMB’s. Het doel van deze studie is (1) de propensiteiten van TM residuen om blootgesteld te zijn aan de lipide bilayer af te leiden en (2) de blootstellingsstatus (d.w.z. blootgesteld aan de bilayer of verborgen in de eiwitstructuur) van TMB residuen te voorspellen.",
"De aangepaste Mahalanobis Discriminant voor het voorspellen van buitenmembraaneiwitten met gebruik van Chou’s pseudo aminozuursamenstelling.",
"In deze studie wordt een methode gepresenteerd die diversiteitsvermeerdering combineert met aangepaste Mahalanobis Discriminant, genaamd IDQD, om 208 OMP’s, 206 transmembraan helicale eiwitten (TMHP’s) en 673 globulaire eiwitten (GP’s) te voorspellen met gebruik van Chou’s pseudo aminozuursamenstellingen als parameters.",
"Voorspelling van transmembraan beta-barrels en interstreng residu-interacties vanuit sequentie",
"Een nieuwe methode die paargewijze interstreng residu statistische potentiaal gebruikt afgeleid van globulaire (niet-buitenmembraan) eiwitten wordt geïntroduceerd om de supersecundaire structuur van transmembraan beta-barrel eiwitten te voorspellen. Het algoritme transFold gebruikt een gegeneraliseerd verborgen Markovmodel (d.w.z. multitape S-attribute grammatica) om potentiële beta-barrel supersecundaire structuren te beschrijven en berekent vervolgens met dynamische programmering de minimum vrije energie beta-barrel structuur.",
"Voorspelling van de oplosbaarheidsoppervlakte van transmembraan residuen vanuit eiwitsequentie",
"In deze studie stellen we een nieuwe methode voor om de oplosbare oppervlaktegebieden van transmembraan residuen te voorspellen. Voor zowel transmembraan alfa-helix als beta-barrel residuen liggen de correlatiecoëfficiënten tussen voorspelde en waargenomen toegankelijke oppervlaktegebieden rond 0,65.",
"BOMP: een programma om integrale beta-barrel buitenmembraaneiwitten gecodeerd in genomen van Gram-negatieve bacteriën te voorspellen",
"Dit werk beschrijft de ontwikkeling van een programma dat voorspelt of een polypeptide sequentie van een Gram-negatieve bacterie een integraal beta-barrel buitenmembraaneiwit is. Het programma, beta-barrel Outer Membrane protein Predictor (BOMP) genoemd, is gebaseerd op twee afzonderlijke componenten om integrale beta-barrel eiwitten te herkennen. De eerste component is een C-terminale patroon typisch voor veel integrale beta-barrel eiwitten. De tweede component berekent een integraal beta-barrel score van de sequentie gebaseerd op de mate waarin de sequentie stukken aminozuren bevat die typisch zijn voor transmembraan beta-strengen.",
"Een HMM-gebaseerde methode om de transmembraanregio’s van beta-barrel membraaneiwitten te voorspellen",
"Een nieuwe methode is ontwikkeld om de transmembraanregio’s van beta-barrel membraaneiwitten te modelleren en voorspellen. Deze is gebaseerd op een verborgen Markovmodel (HMM) met een architectuur die voldoet aan de constructieprincipes van deze eiwitten.",
"Ten eerste voorspelde een algoritme dat de gemiddelde hydrofobiciteit van één zijde van vermoedelijke beta-strengen berekent de posities van 16 transmembraansegmenten, een structuur die gemeenschappelijk is voor bekende porines. Ten tweede werden buitenlussen typisch voor porines toegewezen met een artificieel neuraal netwerk getraind om de topologie van bacteriële buitenmembraaneiwitten met een dominantie van beta-strengen te voorspellen.",
"Voorspelling van de membraanspannende beta-strengen van het belangrijkste buitenmembraaneiwit van Chlamydia",
"Topologievoorspelling van Brucella abortus Omp2b en Omp2a porines na kritische beoordeling van transmembraan beta-streng voorspellingen door verschillende secundaire structuur voorspellingsmethoden",
"Vier porines met bekende structuur werden"
] | 2,470
| 1,905
|
973
|
Beschrijf wat het gebruik is van de Theatre softwaretool voor genomische analyse.
|
Theatre is een webgebaseerd computersysteem ontworpen voor de vergelijkende analyse van genomische sequenties, vooral met betrekking tot motieven die waarschijnlijk betrokken zijn bij de regulatie van genexpressie. Theatre is een interface naar veelgebruikte sequentie-analysetools en biologische sequentiedatabases om de posities van coderende regio's, repetitieve sequenties en transcriptiefactor-bindingsplaatsen in families van DNA-sequenties te bepalen of te voorspellen. De informatie wordt weergegeven op een manier die gemakkelijk te begrijpen is en patronen kan onthullen die anders mogelijk niet zouden zijn opgemerkt. Naast webgebaseerde output kan Theatre publicatiekwaliteit kleurenafdrukken produceren die voorspelde kenmerken in uitgelijnde genomische sequenties tonen.
|
[
"Theatre is een webgebaseerd computersysteem ontworpen voor de vergelijkende analyse van genomische sequenties, vooral met betrekking tot motieven die waarschijnlijk betrokken zijn bij de regulatie van genexpressie. Theatre is een interface naar veelgebruikte sequentie-analysetools en biologische sequentiedatabases om de posities van coderende regio's, repetitieve sequenties en transcriptiefactor-bindingsplaatsen in families van DNA-sequenties te bepalen of te voorspellen. De informatie wordt weergegeven op een manier die gemakkelijk te begrijpen is en patronen kan onthullen die anders mogelijk niet zouden zijn opgemerkt. Naast webgebaseerde output kan Theatre publicatiekwaliteit kleurenafdrukken produceren die voorspelde kenmerken in uitgelijnde genomische sequenties tonen.",
"Theatre: Een softwaretool voor gedetailleerde vergelijkende analyse en visualisatie van genomische sequenties.",
"Theatre is een webgebaseerd computersysteem ontworpen voor de vergelijkende analyse van genomische sequenties, vooral met betrekking tot motieven die waarschijnlijk betrokken zijn bij de regulatie van genexpressie. Theatre is een interface naar veelgebruikte sequentie-analysetools en biologische sequentiedatabases om de posities van coderende regio's, repetitieve sequenties en transcriptiefactor-bindingsplaatsen in families van DNA-sequenties te bepalen of te voorspellen."
] | 299
| 266
|
974
|
Hoe worden CRM (cis-regulatoire modules) gedefinieerd?
|
Eukaryote genen worden vaak gereguleerd door meerdere transcriptiefactoren waarvan de bindingsplaatsen dicht bij elkaar liggen en cis-regulatoire modules vormen.
|
[
"Eukaryote genen worden vaak gereguleerd door meerdere transcriptiefactoren waarvan de bindingsplaatsen dicht bij elkaar liggen en cis-regulatoire modules vormen.",
"Bij veel soorten, vooral hogere eukaryoten, komen transcriptiefactorbindingsplaatsen vaak voor als homotypische of heterotypische clusters, ook wel cis-regulatoire modules genoemd.",
"Deze geconserveerde sequentie is daarom voorgesteld als een langafstand, cis-werkende regulator van ledemspecifieke Shh-expressie.",
"De geconserveerde upstream sequentie kan genexpressie activeren vanuit basale promotoren in het hersenblaasje, hoewel het aanvullende cis-regulatoire sequenties vereist om de CNS-specifieke genexpressie volledig te activeren.",
"De genomische instructies die gebruikt worden om ontwikkeling te reguleren zijn gecodeerd binnen een set functionele DNA-elementen die cis-regulatoire modules worden genoemd.",
"Verschillende hulpmiddelen maken het mogelijk om significante co-occurrenties van dicht bij elkaar gelegen bindingsplaatsen (cis-regulatoire modules, CRMs) te detecteren.",
"Echter, studies over de cis-regulatoire sequenties die de synergistische effecten van deze transcriptiefactoren mediëren worden bemoeilijkt door de beperkte kennis van notochordgenen en cis-regulatoire modules (CRMs) die direct door beide worden getarget.",
"De identificatie van transcriptiefactorbindingsplaatsen (TFBS's) en cis-regulatoire modules (CRMs) is een cruciale stap in het bestuderen van genexpressie, maar de computationele methode die probeert CRMs te onderscheiden van NCNR's blijft een uitdagend probleem vanwege de beperkte kennis van specifieke betrokken interacties.",
"Bij eukaryoten wordt transcriptieregulatie meestal gemedieerd door interacties van meerdere transcriptiefactoren (TF's) met hun respectievelijke specifieke cis-regulatoire elementen (CRE's) in de zogenaamde cis-regulatoire modules (CRMs) in DNA.",
"De transcriptieregulatie van een metazoair gen hangt af van de coöperatieve werking van meerdere transcriptiefactoren die binden aan cis-regulatoire modules (CRMs) gelegen in de buurt van het gen.",
"Dynamische in vivo binding van transcriptiefactoren aan cis-regulatoire modules van cer en gsc in de stapsgewijze vorming van de Spemann-Mangold organizer.",
"We identificeerden ook potentiële cis-regulatoire modules (CRMs) gedefinieerd als clusters van geconserveerde TFBS's in het gehele muizengenoom."
] | 312
| 298
|
975
|
Wat is het belangrijkste regulerende molecuul van de SERCA2A-functie in de hartspier?
|
De activiteit van SERCA2a wordt gereguleerd door fosforylering van een ander SR-eiwit, fosfolamban (PLN). Fosfolamban (PLB) remt de activiteit van SERCA2a, de Ca(2+)-ATPase in het cardiale sarcoplasmatisch reticulum, door de schijnbare affiniteit van het enzym voor Ca(2+) te verlagen.
|
[
"Het Ca-transport in het SR wordt gemedieerd door de SR Ca-ATPase (SERCA2a) en zijn regulerende fosfoproteïne, fosfolamban (PLN). Gedefosforyleerd PLN is een remmer van SERCA2a en fosforylering door proteïnekinase A (PKA) of calcium-calmoduline-afhankelijke proteïnekinasen (CAMKII) heft deze remmende effecten op.",
"De activiteit van SERCA2a kan op meerdere niveaus van een signaalcascade, bestaande uit fosfolamban, worden gereguleerd.",
"Fosfolamban (PLN), de reversibele remmer van de sarco(endo)plasmatisch reticulum Ca(2+)-ATPase (SERCA2a), is een belangrijke regulator van de Ca(2+)-cyclus in myocyten met een significante rol bij hartfalen.",
"De sarco(endo)plasmatisch reticulum (SR) Ca(2+)-transport ATPase (SERCA2a) en zijn remmer fosfolamban (PLN) regelen de opname van Ca(2+) door SR-membranen tijdens ontspanning.",
"fosfolamban (PLN), een spier-specifieke SR Ca(2+)-ATPase (SERCA2a) remmer",
"Fosfolamban (PLB) is een belangrijk doelwit van de bèta-adrenerge cascade in het hart en functioneert als een endogene remmer van de Ca-ATPase transportactiviteit.",
"Fosfolamban (PLB) remt de activiteit van SERCA2a, de Ca(2+)-ATPase in het cardiale sarcoplasmatisch reticulum, door de schijnbare affiniteit van het enzym voor Ca(2+) te verlagen.",
"Er wordt gesuggereerd dat fosfolamban een sleutelregulator is van de Ca-cyclus en contractiliteit van het cardiale sarcoplasmatisch reticulum (SR) en een potentieel therapeutisch doelwit bij het herstellen van de verminderde Ca-cyclus in falende harten.",
"fosfolambanregulatie van SERCA2a",
"De activiteit van SERCA2a wordt gereguleerd door fosforylering van een ander SR-eiwit: fosfolamban (PLN). Gedefosforyleerd PLN remt SERCA2a. Fosforylering van PLN door ofwel cAMP- of cGMP-afhankelijke proteïnekinase op Ser16 of door het Ca2+-calmoduline-afhankelijke proteïnekinase (CaMKII) op Thr17 heft deze remming op, wat leidt tot een verhoogde SR Ca2+-opname en SR Ca2+-belasting.",
"Het verwijderen van een spier-specifieke sarcoplasmatisch reticulum Ca2+ ATPase (SERCA2a) remmer, fosfolamban, herstelde het spectrum van fenotypen die lijken op menselijk hartfalen.",
"De sarco(endo)plasmatisch reticulum Ca(2+)-transport adenosinetrifosfatase (SERCA2a) en zijn regulator fosfolamban (PLN) spelen een centrale rol in het moduleren van de Ca(2+)-homeostase en daarmee de hartfunctie."
] | 322
| 332
|
976
|
Welk gen is verantwoordelijk voor de ontwikkeling van het Mowat-Wilson syndroom?
|
Het Mowat-Wilson syndroom is een genetische aandoening veroorzaakt door heterozygote mutaties of deleties van het zinc finger E-box-binding homeobox 2 (ZEB2) gen.
|
[
"De oorzaak van MWS is een de novo mutatie in het ZEB2-gen.",
"zfhz1b is het veroorzakende gen voor het Mowat-Wilson syndroom, waarbij patiënten ontwikkelingsachterstand en Hirschsprung-ziekte vertonen, evenals andere afwijkingen.",
"Intrahepatische galwegafwijkingen bij een patiënt met het Mowat-Wilson syndroom onthullen een rol voor het zinc finger homeobox-gen zfhx1b in de ontwikkeling van de galwegen bij gewervelden.",
"We gebruikten het zebravismodel om te bepalen of zfhx1b een rol speelt in de ontwikkeling van de galwegen bij gewervelden.",
"Uitgebreide ZEB2-genanalyse voor het Mowat-Wilson syndroom in een Noord-Amerikaanse cohort: een voorgestelde benadering voor moleculaire diagnostiek.",
"Een geval van Mowat-Wilson syndroom veroorzaakt door een truncerende mutatie binnen exon 8 van het ZEB2-gen.",
"Alle typische gevallen zijn het gevolg van haplo-insufficiëntie van het ZEB2-gen (ook bekend als ZFHX1B of SIP-1), met inmiddels meer dan 100 verschillende beschreven mutaties.",
"Ongeveer 80% van de patiënten heeft een nonsense- of frameshiftmutatie die detecteerbaar is door sequencing, de rest heeft grote deleties die een dosisgevoelige test vereisen.",
"Zes patiënten hadden deleties in het ZEB2-gen, waaronder twee nieuwe gedeeltelijke gen deleties.",
"Dit rapport, de eerste dergelijke analyse bij Noord-Amerikaanse patiënten, voegt toe aan de groeiende lijst van zowel nieuwe pathogene mutaties geassocieerd met MWS, als andere varianten in het ZEB2-gen. Daarnaast stellen we een economische teststrategie voor.",
"Nonsense-mutaties van het ZFHX1B-gen bij twee Japanse meisjes met het Mowat-Wilson syndroom.",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) is een complex van meerdere aangeboren afwijkingen en verstandelijke beperking veroorzaakt door mutaties in het Zinc Finger Homeobox 1 B-gen (ZFHX1B).",
"Volgens de genanalyse met witte bloedcellen hadden zij nonsense-mutaties in ZFHX1B, respectievelijk R695X en Q433X.",
"Concluderend is moleculair genetische analyse van ZFHX1B belangrijk voor een definitieve diagnose van MWS, dat een breed fenotypisch spectrum van aangeboren afwijkingen heeft.",
"Een missense-mutatie in het ZFHX1B-gen geassocieerd met een atypisch Mowat-Wilson syndroom fenotype.",
"Mutaties die leiden tot haplo-insufficiëntie van het ZFHX1B-gen zijn beschreven als de onderliggende oorzaak van deze aandoening. We rapporteren de klinische bevindingen bij een 2,5-jarige jongen met enkele aspecten buiten het MWS-spectrum, naast ongebruikelijke afwijkingen en een nieuwe missense-mutatie in het ZFHX1B-gen.",
"Genito-urinaire afwijkingen bij Mowat-Wilson syndroom met deletie/mutatie in het zinc finger homeobox 1B-gen (ZFHX1B).",
"Het wordt veroorzaakt door mutaties in het zinc finger homeobox 1B-gen, ZFHX1B (SIP1).",
"Pleiotropische en diverse expressie van ZFHX1B-gentranscripten tijdens muis- en menselijke ontwikkeling ondersteunt de verschillende klinische manifestaties van het \"Mowat-Wilson\" syndroom.",
"ZFHX1B codeert voor Smad-interacterend eiwit 1, een transcriptionele corepressor betrokken bij het transforming growth factor beta (TGFbeta) signaalpad.",
"Mutaties in ZFHX1B veroorzaken een complex ontwikkelingsfenotype gekenmerkt door ernstige verstandelijke beperking (MR) en meerdere aangeboren afwijkingen.",
"Frameshift-mutatie van het zinc finger homeobox 1 B-gen bij syndromische agenese van het corpus callosum (Mowat-Wilson syndroom).",
"Mutatieanalyse van het zinc finger homeobox 1 B (ZFHX1B) gen onthulde een de novo 7 bp deletie (TGGCCCC) op nucleotide 1773 (1773 delTGGCCCC) resulterend in een frameshift en leidend tot een stopcodon bij aminozuurresidu 604 (604 X) in exon 8 C.",
"\"Mowat-Wilson\" syndroom met en zonder Hirschsprung-ziekte is een distinctief, herkenbaar syndroom van meerdere aangeboren afwijkingen en verstandelijke beperking veroorzaakt door mutaties in het zinc finger homeobox 1B-gen.",
"Recent werden mutaties in het gen ZFHX1B (SIP1) aangetoond bij patiënten met \"syndromische Hirschsprung-ziekte\" met verstandelijke beperking (MR) en meerdere aangeboren afwijkingen (MCA), maar het was onduidelijk of Hirschsprung-ziekte een verplicht symptoom is van deze mutaties en of het specifieke gelaatstype beschreven door Mowat et al. [1998: J Med Genet 35: 617-623] specifiek is voor ZFHX1B-mutaties.",
"Intrahepatische galwegafwijkingen bij een patiënt met het Mowat-Wilson syndroom onthullen een rol voor het zinc finger homeobox-gen zfhx1b in de ontwikkeling van de galwegen bij gewervelden.",
"Haplo-insufficiëntie van een gen genaamd ZFHX1B (ook bekend als SIP1) op chromosoom 2 is verantwoordelijk voor deze aandoening, en klinische genetische testen voor MWS zijn recent beschikbaar gekomen.",
"Het Mowat-Wilson syndroom is een recent afgebakende autosomaal dominante ontwikkelingsafwijking, waarbij heterozygote mutaties in het ZFHX1B-gen verstandelijke beperking, vertraagde motorische ontwikkeling, epilepsie en een breed spectrum van klinisch heterogene kenmerken veroorzaken, die wijzen op neurocristopathieën op cephale, cardiale en vagale niveaus.",
"zfhz1b is het veroorzakende gen voor het Mowat-Wilson syndroom, waarbij patiënten ontwikkelingsachterstand en Hirschsprung-ziekte vertonen, evenals andere afwijkingen.",
"ZFHX1B-mutaties bij patiënten met het Mowat-Wilson syndroom.",
"Een vergelijkbare kwestie van differentiële diagnose werd opgeworpen door een grote 4,3 Mb 2q22.3q23.1 deletie die ZEB2 omvat, het gen verantwoordelijk voor het Mowat-Wilson syndroom, waarvan de symptomen kunnen overlappen met RSTS.",
"Het Mowat-Wilson syndroom is een genetische aandoening veroorzaakt door heterozygote mutaties of deleties van het zinc finger E-box-binding homeobox 2 (ZEB2) gen.",
"Op moleculair niveau wordt MWS gekenmerkt door vele verschillende beschreven mutaties in het zinc finger E-box eiwit 2 (ZEB2) gen, die uiteindelijk leiden tot verlies van genfunctie.",
"Individuen met het Mowat-Wilson syndroom (MWS; OMIM#235730) hebben karakteristieke gelaatskenmerken, diverse aangeboren afwijkingen zoals Hirschsprung-ziekte, en verstandelijke beperkingen veroorzaakt door mutatie of deletie van het ZEB2-gen.",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) is een genetische aandoening veroorzaakt door heterozygote mutaties of deleties van het ZEB2-gen, zelden prenataal gediagnosticeerd en met weinig gerapporteerde foetale beschrijvingen.",
"MWS wordt veroorzaakt door de novo heterozygote mutaties in het ZEB2-gen."
] | 854
| 819
|
977
|
Hoe wordt de actieve neurotoxine van Clostridium botulinum gedetecteerd?
|
Actieve neurotoxine van Clostridium botulinum kan worden gedetecteerd door:
muizendodelijkheidstest
massaspectrometrie
bioassay
gedifferentieerde celmodellen
peptide-splitsingsassay
FDC (functionele dubbele coating) microtiterplaat immuno-biochemische assay
endopeptidase-activiteit gemonitord via UV-Vis spectroscopie
|
[
"De detectie van neurotoxine is gebaseerd op de muizendodelijkheidstest.",
"wat door bioassay kon worden aangetoond dat het biologisch actieve type B-toxine in cultuur produceert.",
"Menselijke geïnduceerde pluripotente stamcellen (hiPSC) bieden grote mogelijkheden voor het leveren van verschillende gedifferentieerde celmodellen voor in vitro toxigeniteitstesten.",
"Een directe vergelijking van BoNT-detectie met behulp van primaire rat ruggenmergcellen en hiPSC-afgeleide neuronen toonde gelijke of verhoogde gevoeligheid aan.",
"BoNT/A-intoxicatiestudies tonen aan dat de hiPSC-afgeleide neuronen biologisch actieve BoNT/A reproduceerbaar en kwantitatief detecteren met hoge gevoeligheid (EC(50) ∼0,3 U).",
"Deze gegevens suggereren dat neuronen afgeleid van hiPSC een ideaal en zeer gevoelig platform bieden voor BoNT-potentiebepaling, detectie van neutraliserende antilichamen en voor mechanistische studies.",
"Detectie van botulinum neurotoxine-A activiteit in voedsel door peptide-splitsingsassay.",
"Deze studie rapporteert het succesvolle gebruik van een enzymatische assay met een intern gedempte fluorogene peptide als een snelle, eenvoudige en goedkope alternatieve methode voor de muizenbioassay.",
"BoNT endopeptidase assays",
"De in vivo muizenbioassay is jarenlang de 'gouden standaard' assay geweest die voor dit doel wordt gebruikt.",
"Cel-gebaseerde assays zijn momenteel de enige in vitro alternatieven die volledig functionele BoNT's in één enkele assay detecteren en worden al jaren voor onderzoeksdoeleinden gebruikt.",
"De muizenbioassay (MBA) wordt traditioneel gebruikt om de aanwezigheid van toxine in serum of voedsel te bevestigen.",
"Een nieuwe FDC (functionele dubbele coating) microtiterplaat immuno-biochemische assay,",
"Dit rapport toont een nieuwe assay die gebruikmaakt van de endopeptidase-activiteit van het toxine om Botulinum neurotoxine in een farmaceutisch monster te detecteren. Het splitsen van SNAP-25 wordt gemonitord via UV-Vis spectroscopie met een detectielimiet van 373 fg/mL en is verder ontwikkeld tot een high-throughput methode met een microplaatlezer die tot 600 fg/mL actief toxine detecteert."
] | 310
| 285
|
978
|
Welke factor werkt samen met Treslin/TICRR gedurende de hele celcyclus van menselijke cellen?
|
MDM twee bindingsproteïne (MTBP) is een factor die gedurende de hele celcyclus met Treslin/TICRR samenwerkt. Het uitputten van MTBP door middel van kleine interfererende RNA's remt DNA-replicatie door de assemblage van de CMG (Cdc45-MCM-GINS) holohelikase tijdens het starten van de oorsprong te verhinderen. Hoewel MTBP betrokken is bij de functie van de p53-tumorsuppressor, is het vereist voor DNA-replicatie ongeacht de p53-status van een cel. Er wordt voorgesteld dat MTBP samen met Treslin/TICRR werkt om signalen van de celcyclus en DNA-schade-responsroutes te integreren om de initiatie van DNA-replicatie in menselijke cellen te controleren.
|
[
"We identificeerden MDM twee bindingsproteïne (MTBP) als een factor die gedurende de hele celcyclus met Treslin/TICRR samenwerkt. We tonen aan dat het uitputten van MTBP door middel van kleine interfererende RNA's DNA-replicatie remt door de assemblage van de CMG (Cdc45-MCM-GINS) holohelikase tijdens het starten van de oorsprong te verhinderen. Hoewel MTBP betrokken is bij de functie van de p53-tumorsuppressor, vonden we dat MTBP vereist is voor DNA-replicatie ongeacht de p53-status van een cel. We stellen voor dat MTBP samen met Treslin/TICRR werkt om signalen van de celcyclus en DNA-schade-responsroutes te integreren om de initiatie van DNA-replicatie in menselijke cellen te controleren.",
"We identificeerden MDM twee bindingsproteïne (MTBP) als een factor die gedurende de hele celcyclus met Treslin/TICRR samenwerkt",
"Treslin/TICRR (TopBP1-interacterend, replicatie stimulerend eiwit/TopBP1-interacterend, checkpoint- en replicatieregulator), het menselijke ortholoog van het gist Sld3-eiwit, is een essentieel DNA-replicatiefactor dat wordt gereguleerd door cycline-afhankelijke kinasen en de DNA-schade-checkpoint. We identificeerden MDM twee bindingsproteïne (MTBP) als een factor die gedurende de hele celcyclus met Treslin/TICRR samenwerkt."
] | 267
| 264
|
979
|
Wat is oprozomib?
|
Oprozomib is een proteasoomremmer van de tweede generatie, die zeer selectief is en oraal wordt toegediend, met veelbelovende activiteit tegen multipel myeloom. Oprozomib remde direct de vorming van osteoclasten (OC) en botresorptie in vitro, terwijl het de osteogene differentiatie en matrixmineralisatie bevorderde. Oprozomib verhoogde het trabeculaire botvolume, verminderde botresorptie en versterkte botvorming bij muizen zonder tumoren. Hierdoor lijkt oprozomib effectief de botmicro-omgeving te kunnen verschuiven van een katabole naar een anabole toestand en, vergelijkbaar met bortezomib, kan het skeletcomplicaties van multipel myeloom verminderen. Oprozomib vermindert effectief de levensvatbaarheid van multipel myeloomcellen. Oprozomib remt krachtig de celoverleving en induceert apoptose in HNSCC-celijnen via de opregulatie van pro-apoptotische Bik. De opregulatie van Mcl-1 door deze middelen dempte hun effectiviteit. Oprozomib induceerde ook autofagie, deels gemedieerd door activatie van de UPR-route met opregulatie van de transcriptiefactor ATF4. De inductie van autofagie had een pro-overlevingsrol. Orale toediening van ONX 0912 remde de groei van HNSCC-xenografttumoren op een dosisafhankelijke wijze. Oprozomib remde de expressie van NF-κB.
|
[
"Carfilzomib en ONX 0912 remmen de celoverleving en tumorgroei van hoofd- en halskanker en hun activiteit wordt versterkt door onderdrukking van Mcl-1 of autofagie.",
"ONX 0912 (oprozomib) is een oraal bio-beschikbaar derivaat.",
"Carfilzomib en ONX 0912 induceerden krachtig apoptose in HNSCC-celijnen via opregulatie van pro-apoptotische Bik. De opregulatie van Mcl-1 door deze middelen dempte hun effectiviteit. Carfilzomib en ONX 0912 induceerden ook autofagie, deels gemedieerd door activatie van de UPR-route met opregulatie van de transcriptiefactor ATF4. De inductie van autofagie had een pro-overlevingsrol. Orale toediening van ONX 0912 remde de groei van HNSCC-xenografttumoren op een dosisafhankelijke wijze.",
"Deze resultaten tonen aan dat carfilzomib en ONX 0912 krachtig actief zijn tegen HNSCC-cellen, en dat de activiteit van deze middelen kan worden versterkt door onderdrukking van Mcl-1 of remming van autofagie. Orale ONX 0912 vertoont in vivo activiteit tegen HNSCC-tumoren en kan een nuttig therapeutisch middel zijn voor deze maligniteit.",
"De proteasoomremmers van de volgende generatie carfilzomib en oprozomib activeren pro-overlevingsautofagie via inductie van de unfolded protein response (UPR) en ATF4.",
"We rapporteerden recent de impact en mechanismen van carfilzomib en oprozomib, proteasoomremmers van de tweede generatie met hogere specificiteit en verminderde toxiciteit, tegen hoofd- en halsplaveiselcelcarcinoom (HNSCC). Carfilzomib en oprozomib remmen krachtig de overleving van HNSCC-cellen en de groei van HNSCC-tumoren. Beide verbindingen bevorderen de opregulatie van pro-apoptotische BIK en anti-apoptotische MCL1, die respectievelijk de dodingseffecten van deze proteasoomremmers mediëren en dempen. Beide verbindingen induceren ook een volledige autofagische flux die deels afhankelijk is van activatie van de UPR en opregulatie van ATF4. De door carfilzomib en oprozomib geïnduceerde autofagie bevordert de overleving van HNSCC-cellen. Onze studie geeft aan dat het therapeutisch voordeel van deze veelbelovende proteasoomremmers kan worden verbeterd door remming van MCL1-expressie of autofagie.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare analoog oprozomib verminderden effectief de levensvatbaarheid van MM-cellen na continue of tijdelijke behandeling die de in vivo farmacokinetiek nabootst.",
"Bij klinisch relevante concentraties remden carfilzomib en oprozomib direct de vorming van osteoclasten en botresorptie in vitro, terwijl ze de osteogene differentiatie en matrixmineralisatie bevorderden. Dienovereenkomstig verhoogden carfilzomib en oprozomib het trabeculaire botvolume, verminderden botresorptie en versterkten botvorming bij muizen zonder tumoren. Ten slotte verminderden de epoxyketon-gebaseerde proteasoomremmers de tumorbelasting van muriene 5TGM1 en humane RPMI-8226 in muismodellen van gedissemineerd multipel myeloom en voorkwamen botverlies. Deze gegevens tonen aan dat carfilzomib en oprozomib, naast hun anti-myelom eigenschappen, effectief de botmicro-omgeving verschuiven van een katabole naar een anabole toestand en, vergelijkbaar met bortezomib, skeletcomplicaties van multipel myeloom kunnen verminderen.",
"Ten slotte vonden we dat incubatie van dendritische cellen (DC) met het middel de expressie van IκB versterkte en dat oprozomib de expressie van NF-κB remde. We concludeerden dat oprozomib, op basis van zijn activiteit en orale biologische beschikbaarheid, verder onderzoek verdient in een diermodel voor preventie van graft-versus-host ziekte (GvHD).",
"Carfilzomib en oprozomib werken synergetisch met histon deacetylase-remmers in modellen van hoofd- en halsplaveiselcelcarcinoom met verworven resistentie tegen proteasoomremmers.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare structurele analoog oprozomib zijn proteasoomremmers van de tweede generatie, die zeer selectief zijn.",
"Daarnaast hebben nieuwe geneesmiddelklassen veelbelovende activiteit getoond bij recidiverend/refractair multipel myeloom (RR MM), waaronder de oraal toegediende proteasoomremmers ixazomib en oprozomib; monoklonale antilichamen zoals het anti-CS1 monoklonale antilichaam elotuzumab en het anti-CD38 monoklonale antilichaam daratumumab; en histon deacetylase-remmers zoals panobinostat en rocilinostat.",
"De door carfilzomib en oprozomib geïnduceerde autofagie bevordert de overleving van HNSCC-cellen.",
"Verder wordt de nieuwe oraal toegediende proteasoomremmer van de tweede generatie oprozomib onderzocht.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare structurele analoog oprozomib zijn proteasoomremmers van de tweede generatie, die zeer selectief zijn.",
"Dienovereenkomstig verhoogden carfilzomib en oprozomib het trabeculaire botvolume, verminderden botresorptie en versterkten botvorming bij muizen zonder tumoren.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare analoog oprozomib verminderden effectief de levensvatbaarheid van MM-cellen na continue of tijdelijke behandeling die de in vivo farmacokinetiek nabootst.",
"Ten slotte vonden we dat incubatie van dendritische cellen met het middel de expressie van IκB versterkte en dat oprozomib de expressie van NF-κB remde.",
"Carfilzomib en oprozomib remmen krachtig de overleving van HNSCC-cellen en de groei van HNSCC-tumoren.",
"De proteasoomremmers van de volgende generatie carfilzomib en oprozomib activeren pro-overlevingsautofagie via inductie van de unfolded protein response en ATF4.",
"De epoxyketon-gebaseerde proteasoomremmers carfilzomib en oraal bio-beschikbare oprozomib hebben naast anti-myelom effecten ook anti-resorptieve en bot-anabole activiteit.",
"Verder wordt de nieuwe oraal toegediende proteasoomremmer van de tweede generatie oprozomib onderzocht.",
"Daarnaast hebben nieuwe geneesmiddelklassen veelbelovende activiteit getoond bij recidiverend/refractair multipel myeloom, waaronder de oraal toegediende proteasoomremmers ixazomib en oprozomib; monoklonale antilichamen zoals het anti-CS1 monoklonale antilichaam elotuzumab en het anti-CD38 monoklonale antilichaam daratumumab; en histon deacetylase-remmers zoals panobinostat en rocilinostat.",
"De epoxyketon-gebaseerde proteasoomremmers carfilzomib en oraal bio-beschikbare oprozomib hebben naast anti-myelom effecten ook anti-resorptieve en bot-anabole activiteit.",
"We rapporteerden recent de impact en mechanismen van carfilzomib en oprozomib, proteasoomremmers van de tweede generatie met hogere specificiteit en verminderde toxiciteit, tegen hoofd- en halsplaveiselcelcarcinoom (HNSCC). Carfilzomib en oprozomib remmen krachtig de overleving van HNSCC-cellen en de groei van HNSCC-tumoren.",
"Dienovereenkomstig verhoogden carfilzomib en oprozomib het trabeculaire botvolume, verminderden botresorptie en versterkten botvorming bij muizen zonder tumoren.",
"Bij klinisch relevante concentraties remden carfilzomib en oprozomib direct de vorming van osteoclasten en botresorptie in vitro, terwijl ze de osteogene differentiatie en matrixmineralisatie bevorderden.",
"Carfilzomib en oprozomib remmen krachtig de overleving van HNSCC-cellen en de groei van HNSCC-tumoren.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare structurele analoog oprozomib zijn proteasoomremmers van de tweede generatie, die zeer selectief zijn.",
"De door carfilzomib en oprozomib geïnduceerde autofagie bevordert de overleving van HNSCC-cellen.",
"Carfilzomib en zijn oraal bio-beschikbare structurele analoog oprozomib zijn proteasoomremmers van de tweede generatie, die zeer selectief zijn. De mechanismen van verworven resistentie tegen carfilzomib en oprozomib zijn echter nog niet volledig begrepen, en effectieve strategieën om deze resistentie te overwinnen zijn nodig.",
"Ten slotte vonden we dat incubatie van dendritische cellen met het middel de expressie van IκB versterkte en dat oprozomib de expressie van NF-κB remde. We concludeerden dat oprozomib, op basis van zijn activiteit en orale biologische beschikbaarheid, verder onderzoek verdient in een diermodel voor preventie van graft-versus-host ziekte.",
"Bij klinisch relevante concentraties remden carfilzomib en oprozomib direct de vorming van osteoclasten en botresorptie in vitro, terwijl ze de osteogene differentiatie en matrixmineralisatie bevorderden. Dienovereenkomstig verhoogden carfilzomib en oprozomib het trabeculaire botvolume, verminderden botresorptie en versterkten botvorming bij muizen zonder tumoren.",
"We rapporteerden recent de impact en mechanismen van carfilzomib en oprozomib, proteasoomremmers van de tweede generatie met hogere specificiteit en verminderde toxiciteit, tegen hoofd- en halsplaveiselcelcarcinoom (HNSCC). Carfilzomib en oprozomib remmen krachtig de overleving van HNSCC-cellen en de groei van HNSCC-tumoren.",
"Proteasoomremmers van de volgende generatie omvatten carfilzomib en oprozomib, die irreversibele epoxyketon proteasoomremmers zijn; en ixazomib en delanzomib, die reversibele boronzuur proteasoomremmers zijn. Twee proteasoomremmers, bortezomib en carfilzomib, zijn door de FDA goedgekeurde geneesmiddelen en ixazomib en oprozomib bevinden zich in de laatste fase van klinische onderzoeken.",
""
] | 1,199
| 1,244
|
980
|
Is er een relatie tussen junctine en ryanodine-receptoren?
|
Ja, junctine bindt aan ryanodine-receptoren binnen het junctionele sarcoplasmatisch reticulum van calciumrelease-eenheden, en werkt normaal gesproken als een activator van RyR-kanalen bij lage luminale [Ca(2+)], en als een remmer bij hoge luminale [Ca(2+)].
|
[
"Junctine, een 26 kDa intra-sarcoplasmatisch reticulum (SR) eiwit, vormt een quaternaire complex met triadin, calsequestrin en de ryanodine-receptor (RyR) aan het junctionele SR-membraan.",
"Het verwijderen van junctine lijkt van invloed te zijn op hoe RyR's de SR Ca(2+)-lading 'waarnemen', wat resulteert in een verminderde diastolische SR Ca(2+)-lek ondanks een verhoogde [Ca(2+)](SR).",
"Enkelkanaalopnames van RyR's uit WT en JCN-KO cardiaal SR geven aan dat de afwezigheid van junctine een dubbel effect heeft op de normaal lineaire respons van RyR's op luminale [Ca(2+)]: bij lage luminale [Ca(2+)] (<1 mmol l(-1)) zijn RyR-kanalen zonder junctine minder responsief voor luminale [Ca(2+)]; omgekeerd maakt hoge luminale [Ca(2+)] ze hypersensitief voor deze vorm van kanaalmodulatie. Zo veroorzaakt junctine complexe effecten op Ca(2+)-vonken, transiënten en lek, maar de luminale [Ca(2+)]-afhankelijke dubbele respons van RyR's zonder junctine toont aan dat junctine normaal gesproken fungeert als activator van RyR-kanalen bij lage luminale [Ca(2+)], en als remmer bij hoge luminale [Ca(2+)].",
"Normale Ca(2+)-signaaloverdracht in skeletspier is afhankelijk van de membraan-geassocieerde eiwitten triadin en junctine en hun vermogen om functionele interacties te bemiddelen tussen het Ca(2+)-bindende eiwit calsequestrin en de type 1 ryanodine-receptor in het lumen van het sarcoplasmatisch reticulum.",
"We tonen hier aan dat gezuiverde skelet-ryanodine-receptoren op vergelijkbare wijze worden geactiveerd door gezuiverde triadin of gezuiverde junctine die aan hun luminale zijde worden toegevoegd, hoewel het ontbreken van competitie aangeeft dat de eiwitten op onafhankelijke sites werken. Verrassend genoeg verschilden triadin en junctine aanzienlijk in hun vermogen om informatie over te dragen tussen skeletcalsequestrin en ryanodine-receptoren. Gezuiverde calsequestrin remde junctine/triadin-geassocieerde of junctine-geassocieerde ryanodine-receptoren en de calsequestrin opnieuw geassocieerde kanaalcomplexen werden verder geremd toen luminaal Ca(2+) daalde van 1 mM naar",
"Door GCaMP6f te fuseren aan de N-terminus van triadin 1 of junctine, werd GCaMP6f-T/J gericht naar dyadische verbindingen, waar het colocaliseerde met t-tubuli en RyR's na adenovirus-gemedieerde genoverdracht.",
"Het junctionele oppervlak van het jSR, gericht naar de transversale tubuli, wordt bezet door een moleculair complex bestaande uit de transmembrane Ca2+-releasekanalen (ryanodine-receptoren); het luminale eiwit calsequestrin (CSQ); de 2 membraaneiwitten, junctine (Jct) en triadin (Tr), die de CSQ-ryanodine-receptorinteracties mediëren; en verschillende andere componenten.",
"Calsequestrin, de belangrijkste calciumbuffer in het sarcoplasmatisch reticulum, levert een calciumvoorraad voor vrijgave via de ryanodine-receptor en fungeert als een luminale calciumsensor voor het kanaal via zijn interacties met triadin en junctine. We onderzochten de invloed van fosforylering van calsequestrin op zijn vermogen om calcium op te slaan, te polymeriseren en ryanodine-receptoren te reguleren door binding aan triadin en junctine.",
"Junctine is een 26 kDa membraaneiwit dat bindt aan calsequestrin, triadin en ryanodine-receptoren (RyR's) binnen het junctionele sarcoplasmatisch reticulum van calciumrelease-eenheden."
] | 473
| 454
|
981
|
Welke medicatie moet worden toegediend bij de behandeling van patiënten met vermoedelijke acute opioïd-overdosis?
|
Naloxon is een opioïde-antagonist die moet worden toegediend aan alle patiënten met vermoedelijke acute opioïd-overdosis. Gewoonlijk wordt intraveneus naltrexonhydrochloride toegediend, maar andere formuleringen, waaronder enterale methylnaltrexon, vernevelde naloxon en subcutane naloxon, worden onderzocht en kunnen onder bepaalde omstandigheden worden gebruikt.
|
[
"Opioïd-overdosis heeft een hoge mortaliteit, maar is vaak omkeerbaar met passende overdosisbehandeling en naloxon (opioïde-antagonist).",
"Het trainen van clinici in het omgaan met een opioïd-overdosis en het toedienen van naloxon was effectief.",
"Voor patiënten die dextromethorfan hebben ingenomen en sedatie of coma vertonen, kan naloxon, in de gebruikelijke doses voor de behandeling van opioïd-overdosis, worden overwogen voor prehospitale toediening, vooral als de patiënt ademhalingsdepressie heeft.",
"Naloxonhydrochloride, een injecteerbare opioïde-antagonist die de ademhalingsdepressie, sedatie en hypotensie geassocieerd met opioïden omkeert, wordt al lange tijd gebruikt voor de behandeling van opioïd-overdosis.",
"Experts hebben voorgesteld dat naloxon, als onderdeel van een uitgebreide overdosispreventiestrategie, aan heroïnegebruikers moet worden verstrekt voor toediening door peers na een overdosis.",
"Patiënten die naloxon kregen voor bekende of vermoedelijke opioïd-overdosis werden formeel geëvalueerd één uur later op meerdere potentiële voorspellende variabelen.",
"Patiënten met vermoedelijke opioïd-overdosis kunnen veilig worden ontslagen één uur na toediening van naloxon.",
"Om te bepalen of naloxon dat i.v. wordt toegediend aan patiënten buiten het ziekenhuis met vermoedelijke opioïd-overdosis een snellere therapeutische werking heeft dan naloxon dat subcutaan (s.q.) wordt gegeven.",
"De proefpersonen kregen ofwel naloxon 0,4 mg i.v. (n = 74) of naloxon 0,8 mg s.q. (n = 122), bij ademhalingsdepressie van <10 ademhalingen/min.",
"Er was geen klinisch verschil in het tijdsinterval tot een ademhalingsfrequentie van ≥10 ademhalingen/min tussen naloxon 0,8 mg s.q. en naloxon 0,4 mg i.v. voor de behandeling buiten het ziekenhuis van patiënten met vermoedelijke opioïd-overdosis.",
"Om dit probleem te illustreren rapporteren we de casus van een patiënt die onjuist werd behandeld met naloxon en de resultaten van een retrospectieve beoordeling van de medische dossiers van 15 opeenvolgende kankerpatiënten die naloxon kregen op de spoedeisende hulp gedurende een periode van 5 maanden.",
"De behandeling van opioïd-overdosis, of deze nu illegaal of iatrogeen is, vereist het snelle en vaardige gebruik van opioïde-antagonisten.",
"Het aandeel clinici dat bereid was naloxon te gebruiken bij een opioïd-overdosis steeg van 77% naar 99% na training. Belemmeringen voor het implementeren van training waren de tijd en het vertrouwen van de clinici, de middelen van de dienst, de bereidheid van cliënten en de naloxonformulering.",
"Opioïd-overdosis is zelden de primaire oorzaak van een veranderde mentale status bij kankerpatiënten die opioïde therapie krijgen. Het onjuist toedienen van naloxon om een abnormale mentale status te keren kan ernstige ontwenningsverschijnselen en pijn veroorzaken."
] | 429
| 419
|
982
|
In welke nucleaire compartimenten bevindt heterochromatine zich?
|
Dit compartiment lokaliseert zich in drie hoofdregio's: het perifere heterochromatine, perinucleolair heterochromatine en pericentromerisch heterochromatine. Stillegging lijkt geassocieerd te zijn met trimethylatie van histon H3 lysine 9 (H3K9me3), DNA-methylatie en de lokalisatie van het stilgelegde gen naar een specifiek nucleair compartiment dat verrijkt is met deze modificaties
|
[
"Dit compartiment lokaliseert zich in drie hoofdregio's: het perifere heterochromatine, perinucleolair heterochromatine en pericentromerisch heterochromatine",
"Door cellen te scheiden op basis van transgene expressie tonen we hier aan dat stillegging lijkt geassocieerd te zijn met trimethylatie van histon H3 lysine 9 (H3K9me3), DNA-methylatie en de lokalisatie van het stilgelegde gen naar een specifiek nucleair compartiment dat verrijkt is met deze modificaties",
"De celkern is verdeeld in chromosoomterritoria en het extrachromosomale domein. Dit laatste omvat verschillende structurele en functionele compartimenten die betrokken zijn bij RNA-verwerking en -transport.",
"We beschrijven ook een nieuw apocentrisch nucleair compartiment met een unieke set histonmodificaties dat voorkomt als een zone van chromatine rondom pericentromerisch heterochromatine in gedifferentieerde lymfocyten.",
"Er is weinig bekend over de mechanismen van gen targeting binnen de kern en het effect daarvan op genexpressie, maar de meeste studies concluderen dat genen die zich nabij de nucleaire periferie bevinden, worden stilgelegd door heterochromatine",
"Na behandeling met TSA en NaBt werden de HP1-eiwitten meer intern in de kern gepositioneerd, waarbij ze nauw geassocieerd waren met interchromatine compartimenten, terwijl pericentromerisch heterochromatine dichter bij de nucleaire periferie werd verplaatst",
"Rekening houdend met de verschillende heterochromatische en euchromatische compartimenten van het genoom, suggereren onze gegevens dat de relatieve overvloed van Ty3/gypsy LTR's langs elke chromosoomarm voornamelijk wordt bepaald door de verschillende verhoudingen van heterochromatine, met name pericentromerisch heterochromatine, ten opzichte van de totale arm lengte"
] | 263
| 273
|
983
|
Zijn er mutaties in het ZEB2-gen gevonden bij een menselijk syndroom?
|
Ja, het Mowat-Wilson syndroom
|
[
"Het Mowat-Wilson syndroom is een genetische aandoening veroorzaakt door heterozygote mutaties of deleties van het zinc finger E-box-binding homeobox 2 (ZEB2) gen",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS; OMIM#235730) heeft karakteristieke gelaatskenmerken, een verscheidenheid aan aangeboren afwijkingen zoals Hirschsprung ziekte, en verstandelijke beperkingen veroorzaakt door mutatie of deletie van het ZEB2-gen.",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) is een genetische aandoening veroorzaakt door heterozygote mutaties of deleties van het ZEB2-gen",
"MWS wordt veroorzaakt door de novo heterozygote mutaties in het ZEB2-gen",
"De oorzaak van MWS is een de novo mutatie in het ZEB2-gen",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) is een genetische aandoening veroorzaakt door heterozygote mutaties of deleties van het ZEB2-gen",
"MWS heeft een heterozygote verlies-van-functie mutatie in het zinc finger E-box eiwit 2 (ZEB2) gen, ook wel SIP1 (Smad-interacting protein 1) en ZFHX1B genoemd,",
"bij het menselijke Mowat-Wilson syndroom suggereren we dat deletie van ZEB2 verantwoordelijk is voor de meeste effecten van de mutatie",
"Mutaties op de hZeb2 locus veroorzaken het Mowat-Wilson syndroom (MWS)",
"Mowat-Wilson syndroom en een mutatie in ZEB2",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) wordt veroorzaakt door een heterozygote mutatie of deletie van het ZEB2-gen",
"Het syndroom wordt veroorzaakt door mutaties of deleties van het ZEB2-gen",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) is een autosomaal dominant syndroom met verstandelijke beperking",
"Verlies van één kopie van het ZEB2-gen op 2q22.3 consistent met het Mowat-Wilson syndroom",
"Mowat-Wilson syndroom, bevestigd door moleculaire analyse als een heterozygote deletie van het ZEB2-gen.",
"Deletie die ZEB2 omvat, het gen verantwoordelijk voor het Mowat-Wilson syndroom",
"Zes patiënten hadden deleties in het ZEB2-gen",
"Analyse van het ZEB2-gen voor het Mowat-Wilson syndroom",
"Een Mowat-Wilson syndroom (MWS) achtige verschijning werd opgemerkt. De ziekte wordt veroorzaakt door mutatie of deletie van het ZEB2-gen",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS; OMIM #235730) is een genetische aandoening veroorzaakt door heterozygote mutaties of deleties van het ZEB2-gen",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) is een autosomaal dominant ontwikkelingsstoornis met verstandelijke beperking en variabele meerdere aangeboren afwijkingen door mutaties in het ZEB2 (ZFHX1B)",
"MWS wordt veroorzaakt door heterozygote mutaties of deleties in het Zinc finger E-box-binding homeobox 2 gen, ZEB2, voorheen ZFHX1B (SIP1)",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) is een complex van meerdere aangeboren afwijkingen en verstandelijke beperking veroorzaakt door mutaties in het Zinc Finger Homeobox 1 B gen (ZFHX1B)",
"Het ZFHX1B-gen, waarvan bekend is dat het betrokken is bij het Mowat-Wilson syndroom",
"De novo heterozygote mutaties of deleties van het ZFHX1B-gen gelegen op 2q22",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) is een recent beschreven verstandelijke beperking (MR)-meerdere aangeboren afwijkingen syndroom",
"FHX1B-mutaties bij patiënten met het Mowat-Wilson syndroom",
"Mutaties die leiden tot haplo-insufficiëntie van het ZFHX1B-gen",
"Mutatie in het ZFHX1B-gen geassocieerd met een atypisch Mowat-Wilson syndroom fenotype",
"ZFHX1B-mutatie geassocieerd met een mild Mowat-Wilson syndroom",
"Patiënten met mutaties of deleties in het zinc finger homeobox 1B (ZFHX1B) ontwikkelen meerdere aangeboren afwijkingen inclusief Hirschsprung ziekte, bekend als het Mowat-Wilson syndroom (MWS)",
"Heterozygote mutaties of deleties die het ZFHX1B-gen (voorheen SIP1) [OMIM 605802] betreffen, zijn recentelijk gevonden als oorzaak van MWS",
"ZFHX1B deleties, splice site of truncerende mutaties werden gedetecteerd in alle 28 patiënten geclassificeerd als typisch MWS",
"Mowat-Wilson syndroom met deletie/mutatie in het zinc finger homeobox 1B gen (ZFHX1B)",
"Mutaties in het zinc finger homeobox 1B gen, ZFHX1B (SIP1)",
"ZFHX1B gen transcripties tijdens muis- en menselijke ontwikkeling ondersteunen de verschillende klinische manifestaties van het \"Mowat-Wilson\" syndroom",
"ZFHX1B-mutaties veroorzaken een complex ontwikkelingsfenotype gekenmerkt door ernstige verstandelijke beperking (MR) en meerdere aangeboren afwijkingen",
"Mutatie van het zinc finger homeobox 1 B gen in syndromale corpus callosum agenesie (Mowat-Wilson syndroom)",
"Het syndroom is het resultaat van heterozygote deleties of truncerende mutaties van het ZFHX1B (SIP1) gen",
"Mensen met Zfhx1b-mutaties (Mowat-Wilson syndroom)",
"Het syndroom ontstaat als gevolg van heterozygote mutaties of deleties in het zinc finger E-box-binding homeobox 2 gen, ZEB2, voorheen ZFHX1B (SIP1)",
"Het Mowat-Wilson syndroom (MWS) is een recent beschreven verstandelijke beperking;",
"Het Mowat-Wilson syndroom is een aangeboren syndroom veroorzaakt door een defect in de transcriptie-repressor ZFHX1B (SIP1)",
"Patiënten met het Mowat-Wilson syndroom en alle broers en zussen hadden dezelfde E87X nonsense mutatie in ZFHX1B"
] | 623
| 624
|
984
|
Welke enzymen zijn betrokken bij globale genoom nucleotide excisieherstel (GG-NER) in bacteriën?
|
Nucleotide excisieherstel (NER) wordt universeel gebruikt om vele soorten DNA-schade te herkennen en te verwijderen. Bij eubacteriën bestaat het NER-systeem doorgaans uit UvrA, UvrB, UvrC, de UvrD helicase, DNA-polymerase I en ligase. Schadeherkenning tijdens bacterieel NER is afhankelijk van UvrA, dat aan de schade bindt en UvrB op het DNA laadt. Vervolgens vormen UvrA, UvrB en UvrC het excinuclease-eiwit UvrABC endonuclease, een multi-enzymatisch complex dat het herstel van beschadigd DNA in een opeenvolgende volgorde uitvoert. In sommige gevallen kan Cho het effectieve nuclease voor NER zijn, in plaats van UvrC. UvrC nuclease en het korte oligonucleotide dat de DNA-laesie bevat, worden verwijderd uit het post-incisiecomplex door UvrD, een superfamilie 1A helicase. Bij gram-positieve organismen kan PcrA helicase ook UvrC en het uitgesneden oligonucleotide verdrijven uit een post-incisie NER-complex.
|
[
"We evalueerden de in vivo rol van NER bij het herstel van DNA-adducten die worden gegenereerd door psoralenen (mono- of bifunctioneel) en UV-A licht (PUVA) in E. coli. Culturen van wildtype E. coli K12 en mutanten voor uvrA, uvrB, uvrC of uvrAC genen werden behandeld met PUVA en de overleving van cellen werd bepaald.",
"Nucleotide excisieherstel (NER) wordt universeel gebruikt om vele soorten DNA-schade te herkennen en te verwijderen. Bij eubacteriën bestaat het NER-systeem doorgaans uit UvrA, UvrB, UvrC, de UvrD helicase, DNA-polymerase I en ligase.",
"Tijdens nucleotide excisieherstel (NER) in bacteriën worden het UvrC nuclease en het korte oligonucleotide dat de DNA-laesie bevat, verwijderd uit het post-incisiecomplex door UvrD, een superfamilie 1A helicase.",
"UvrD interageert met UvrB, een component van het post-incisiecomplex.",
"PcrA helicase van Bacillus stearothermophilus kan ook UvrC en het uitgesneden oligonucleotide verdrijven uit een post-incisie NER-complex, wat de gedachte ondersteunt dat PcrA een UvrD-achtige functie vervult tijdens NER in gram-positieve organismen.",
"Cho lijkt in plaats van UvrC een effectief nuclease te zijn voor het NER van DNA-proteïne crosslinks (DPCs).",
"Nucleotide excisieherstel bestaat uit het excinuclease-eiwit UvrABC endonuclease, een multi-enzymatisch complex dat het herstel van beschadigd DNA in een opeenvolgende volgorde uitvoert.",
"Escherichia coli K12 mutantstammen die deficient zijn in nucleotide excisieherstel (NER) werden blootgesteld aan toenemende concentraties cisplatine, en de resultaten toonden aan dat uvrA en uvrB mutanten gevoelig zijn voor dit middel, terwijl uvrC en cho mutanten gelijk bleven aan de wildtype stam.",
"We gebruikten een genetische benadering om de rollen van componenten van het nucleotide excisieherstel (NER) pad in H. pylori mutatie en recombinatie te onderzoeken. RESULTATEN: Inactivatie van een van de vier uvr-genen verhoogde sterk de gevoeligheid van H. pylori voor DNA-schade door ultraviolet licht. Inactivatie van uvrA en uvrB verminderde significant de mutatiefrequenties, terwijl alleen de uvrA-deficiënte mutant een significante afname van de recombinatiefrequentie vertoonde na natuurlijke transformatie. Een uvrC-mutant toonde geen significante veranderingen in mutatie- of recombinatiesnelheden; echter, inactivatie van uvrC bevorderde de incorporatie van significant langere fragmenten donor-DNA (2,2-voudige toename) in het ontvangerchromosoom. Een deletie van uvrD induceerde een hyperrecombinatie fenotype.",
"Transcriptie-gekoppeld DNA-herstel (TCR) is een subpad van nucleotide excisieherstel (NER) die wordt geactiveerd wanneer RNA-polymerase wordt geblokkeerd door DNA-schade. Laesies die door TCR worden gericht, worden sneller hersteld dan laesies die worden hersteld door het transcriptie-onafhankelijke \"globale\" NER-pad, maar het mechanisme achter deze snelheidsverhoging is niet begrepen. Schadeherkenning tijdens bacterieel NER is afhankelijk van UvrA, dat aan de schade bindt en UvrB op het DNA laadt. Bacteriële TCR vereist daarnaast het Mfd-eiwit, een DNA-translocase die de vastgelopen transcriptiecomplexen verwijdert."
] | 571
| 549
|
985
|
Is JTV519 (K201) een potentieel medicijn voor de preventie van hartritmestoornissen?
|
Ja, JTV519 heeft antiaritmische eigenschappen.
|
[
"We vergeleken het onderdrukkende effect van K201 (JTV519), een multikanaalblokker en stabilisator van de cardiale ryanodine receptor-calciumreleasekanaal (RyR2), met dat van diltiazem, een Ca(2+)-kanaalblokker, in 2 studies van isoproterenol-geïnduceerde (n = 30) en ischemie-reperfusie-geïnduceerde ventriculaire aritmieën (VA's) (n = 38) bij ratten.",
"Na toediening van isoproterenol onder Ca(2+)-belasting traden vaak fatale VA's op in de controlegroep (9 van 10 dieren, 90%) en diltiazemgroep (8 van 10, 80%), terwijl K201 de incidentie van aritmieën en mortaliteit significant onderdrukte (2 van 10, 20%). In de reperfusie-studie werden de incidentie en de tijd tot het optreden van reperfusie-geïnduceerde VA en mortaliteit significant onderdrukt in de K201-groep (2 van 15 dieren, 13%) en diltiazemgroep (1 van 9 dieren, 11%) vergeleken met de controlegroep (8 van 14 dieren, 57%).",
"K201 onderdrukte zowel de isoproterenol-geïnduceerde als de reperfusie-geïnduceerde VA's sterk, terwijl diltiazem de isoproterenol-geïnduceerde VA niet onderdrukte.",
"JTV519 (K201) is een nieuw ontwikkeld 1,4-benzothiazepine-medicijn met antiaritmische en cardioprotectieve eigenschappen. Het lijkt zeer effectief te zijn, niet alleen in het voorkomen, maar ook in het omkeren van karakteristieke myocardiale veranderingen en het voorkomen van dodelijke aritmieën.",
"Het nieuwe antiaritmische medicijn K201 (4-[3-{1-(4-benzyl)piperidinyl}propionyl]-7-methoxy-2,3,4,5-tetrahydro-1,4-benzothiazepine monohydrochloride) is momenteel in ontwikkeling voor de behandeling van atriumfibrilleren. K201 reguleert niet alleen de intracellulaire calciumafgifte via de ryanodine-receptoren, maar bezit ook een ventriculaire werking die mogelijk kan leiden tot torsade de pointes-aritmieën.",
"De RyR wordt momenteel gebruikt als therapeutisch doelwit bij maligne hyperthermie, waarbij dantroleen effectief is, en om ventriculaire aritmieën te verlichten met het gebruik van JTV519 en flecainide.",
"Tot slot voorkomen KN-3 en JTV519, twee verbindingen die RyR2 in de gesloten toestand stabiliseren, de inductie van getriggerde activiteit en onderdrukken ze de opwekbaarheid van aanhoudend atriumfibrilleren.",
"JTV-519 verminderde sterk de frequentie van ouabaïne-geïnduceerde aritmogene gebeurtenissen.",
"Stabilisatie van RyR2 door JTV-519 vermindert effectief deze getriggerde aritmieën.",
"Deze bevindingen kunnen het antiaritmische potentieel van K201 onthullen.",
"De voorkeur voor ryanodine receptor-stabilisator (K201) bezit antiaritmische effecten via calciumregulatie.",
"Het medicijn K201 (JTV-519) verhoogt de inotropie en onderdrukt aritmieën in falende harten, maar de effecten van K201 op normale harten zijn onbekend.",
"K201 faalt in het voorkomen van DAD's in RyR2(R4496C+/-) myocyten en ventriculaire aritmieën in RyR2(R4496C+/-) muizen.",
"In vivo toediening van K201 faalde in het voorkomen van inductie van polymorfe ventriculaire tachycardie (VT) in RyR2(R4496C+/-) muizen.",
"De 1,4-benzothiazepine JTV519, die de bindingsaffiniteit van calstabin-2 voor RyR2 verhoogt, remde het diastolische SR Ca2+-lek, monophasische actiepotentiaal-alternans en getriggerde aritmieën.",
"Bij aritmieën voorkwam de calstabin2-stabilisator JTV519 geen aritmieën in calstabin2-/- muizen, maar verminderde de aritmieën in calstabin2+/- muizen, wat het antiaritmische potentieel van het stabiliseren van calstabin2 illustreert.",
"In drie modellen van aritmieën voorkwam de calstabin2-stabilisator JTV519 geen aritmieën in calstabin2(-/-) muizen, maar verminderde de aritmieën in calstabin2(+/-) muizen, wat het antiaritmische potentieel van het stabiliseren van calstabin2 illustreert.",
"Een derivaat van 1,4-benzothiazepine (JTV519) verhoogde de affiniteit van calstabin2 voor RyR2, wat de gesloten toestand van RyR2 stabiliseerde en het Ca2+-lek voorkwam dat aritmieën triggert.",
"JTV-519 had significante beschermende effecten op atriumfibrilleren in het hondelijk model van steriele pericarditis, voornamelijk door het verlengen van de effectieve refractaire periode, wat suggereert dat het potentieel heeft als nieuw antiaritmisch middel voor atriumfibrilleren.",
"JTV-519 verminderde het gemiddelde aantal episodes van aanhoudend atriumfibrilleren significant (van 4,2 +/- 2,9 naar 0 +/- 0, P < 0,01).",
"We concluderen dat JTV-519 antiaritmische effecten kan uitoefenen tegen AF door het remmen van repolariserende K(+)-stromen. Het medicijn kan nuttig zijn voor de behandeling van AF bij patiënten met ischemische hartziekte."
] | 569
| 559
|
986
|
Wat is het mechanisme van microRNA-deregulatie in carcinogenese?
|
MicroRNAs (miRNA's) zijn endogene niet-eiwit-coderende enkelstrengs RNA's (19–25 nucleotiden lang) die worden gevormd door de splitsing van grotere niet-coderende RNA's door het ribonuclease III-enzym Dicer. Ze worden onderdeel van het RNA-geïnduceerde stilleggingscomplex en reguleren genexpressie negatief door te binden aan de homoloog 3'-UTR-regio van doelwit eiwit-coderende mRNA's als een imperfecte match, wat leidt tot translatie-repressie of afbraak. Ongeveer een derde van de eiwit-coderende genen is vatbaar voor miRNA-regulatie. Toenemend bewijs wijst erop dat gedereguleerde miRNA-expressie geassocieerd is met het ontstaan en de progressie van verschillende menselijke kankers. Daarom kunnen kanker-geassocieerde miRNA's (CA-miRNA's) doelwitgenen reguleren door te functioneren als "oncogenen" of "tumor suppressor miRNA's (TS-miRNA's)". In lijn hiermee zijn talrijke kankers (bijv. borst-, long-, slokdarm-, prostaat-, alvleesklier-, maag- en dikkedarmkanker) geclassificeerd op basis van hun unieke miRNA-expressieprofiel.
|
[
"MicroRNAs zijn een klasse van kleine niet-coderende RNA's die genexpressie negatief reguleren door interactie met de 3'UTR van eiwit-coderende mRNA. MicroRNAs zijn betrokken bij vrijwel alle belangrijke biologische en cellulaire processen, en recente bevindingen koppelen microRNA-deregulatie verder aan menselijke carcinogenese.",
"MiR-657 bevordert tumorvorming in hepatocellulair carcinoom door transducin-like enhancer protein 1 te targeten via NF-κB routes.",
"MicroRNAs (miRNA's), kleine niet-coderende RNA's, zijn betrokken bij diverse biologische functies en carcinogenese.",
"Bovendien toonden we aan dat miR-106b de expressie van APC verlaagt door direct te binden aan de 3'-ongetransleerde regio van APC messenger RNA.",
"Verder bieden miRNA's een mechanisme waarmee genen met diverse functies in meerdere routes gelijktijdig post-transcriptioneel kunnen worden gereguleerd. Er is echter weinig bekend over de kanker-gerelateerde routes waarmee kanker-geassocieerde miRNA's (CA-miRNA's) deze processen reguleren, die zowel positieve als negatieve functies in carcinogenese kunnen vertegenwoordigen.",
"MicroRNAs, bekend als kleine niet-coderende miRNA's van 19 tot 24 nt lang, zijn belangrijke genregulatoren en worden erkend als sleutelspelers in carcinogenese. Het mechanisme berust op het feit dat miRNA's kunnen binden aan hun doel-mRNA en vervolgens leiden tot afbraak van het doel-mRNA of repressie van de translatie. Bioinformatica-analyse geeft aan dat elk miRNA honderden gen-doelen kan reguleren en functioneel kan dienen als \"oncogenen\" of \"tumor suppressorgenen\", en daardoor meerdere cellulaire processen relevant voor carcinogenese en kankerprogressie kan reguleren.",
"microRNAs (miRs) zijn endogene kleine niet-coderende RNA's die abnormaal tot expressie komen in diverse carcinomen.",
"Hoewel gedereguleerde miRNA-expressieniveaus in veel tumoren zijn gedetecteerd, is het onbekend of functionele miRNA-impairment ook betrokken is bij carcinogenese.",
"In de afgelopen jaren zijn microRNAs (miRNA's) naar voren gekomen als nieuwe moleculaire spelers betrokken bij carcinogenese. Deregulatie van miRNA-expressie is aangetoond in verschillende menselijke kankers, maar het moleculaire mechanisme achter de verandering in miRNA-expressie is onbekend.",
"Dit zijn microRNAs (miRNA's), een klasse van niet-coderende RNA's van 20-23 nucleotiden lang, die genexpressie van downstream doelgenen (inclusief transcriptiefactoren, oncogenen en tumorrepressorgenen) op post-transcriptioneel niveau kunnen op- of neerreguleren. Sommige leden van deze nieuwe klasse genen lijken het potentieel te hebben om gelijktijdig als oncogenen of tumorrepressorgenen te fungeren, afhankelijk van de moleculaire micro-omgeving van de cel.",
"MicroRNAs kunnen ook worden beïnvloed door chromosomale afwijkingen en zo bijdragen aan carcinogenese.",
"Regulatie van hepatocarcinogenese door microRNAs.",
"MicroRNAs zijn betrokken bij vrijwel alle belangrijke biologische en cellulaire processen, en recente bevindingen koppelen microRNA-deregulatie verder aan menselijke carcinogenese.",
"miR-106b verlaagt de expressie van adenomatous polyposis coli en bevordert celproliferatie in menselijk hepatocellulair carcinoom.",
"Er is echter weinig bekend over de kanker-gerelateerde routes waarmee kanker-geassocieerde miRNA's (CA-miRNA's) deze processen reguleren, die zowel positieve als negatieve functies in carcinogenese kunnen vertegenwoordigen.",
"In combinatie met eerdere kankeronderzoeken onthulde de analyse van de relevantie tussen functies van CA-miRNA's en kanker-gerelateerde routes die verschillende interne carcinogenese stimuli onderzoeken ook het potentieel van de top vijf routes om kernprocessen van carcinogenese te reguleren.",
"MicroRNAs, bekend als kleine niet-coderende miRNA's van 19 tot 24 nt lang, zijn belangrijke genregulatoren en worden erkend als sleutelspelers in carcinogenese.",
"Het androgenenpad stimuleert de transcriptie van microRNA-216a om het tumorrepressorgen in longkanker-1 te onderdrukken in vroege hepatocarcinogenese.",
"Deregulatie van microRNAs (miRNA's) is gebruikelijk in gevorderd menselijk hepatocellulair carcinoom (HCC); echter zijn de miRNA's die betrokken zijn bij vroege carcinogenese nog niet onderzocht.",
"MicroRNA-375 target AEG-1 in hepatocellulair carcinoom en onderdrukt de groei van leverkankercellen in vitro en in vivo.",
"MicroRNAs (miRNA's) worden verondersteld fundamentele rollen te spelen in tumorvorming en hebben groot potentieel voor diagnose en behandeling van kanker. De rollen van miRNA's in hepatocellulaire carcinogenese zijn echter nog niet volledig opgehelderd.",
"Steeds meer bewijs wijst erop dat deregulerende microRNAs (miRNA's) bijdragen aan tumorvorming.",
"ONGETEKEND: Deregulatie van microRNAs (miRNA's) is gebruikelijk in gevorderd menselijk hepatocellulair carcinoom (HCC); echter zijn de miRNA's die betrokken zijn bij vroege carcinogenese nog niet onderzocht.",
"Deregulatie van miRNA-expressie is aangetoond in verschillende menselijke kankers, maar het moleculaire mechanisme achter de verandering in miRNA-expressie is onbekend."
] | 763
| 742
|
987
|
Welk type GTPases is vereist voor aminozuurafhankelijke activatie van mTORC1?
|
Heterodimere Rag GTPases zijn vereist voor aminozuurgemedieerde activatie van mTORC1 bij het lysosoom
|
[
"Heterodimere Rag GTPases zijn vereist voor aminozuurgemedieerde activatie van mTORC1 bij het lysosoom",
"Aminozuren stimuleren, op een Rag-, Ragulator- en vacuolaire adenosinetrifosfatase-afhankelijke wijze, de translocatie van mTORC1 naar het lysosomale oppervlak, waar het interacteert met zijn activator Rheb",
"mTORC1 bevordert groei als reactie op de beschikbaarheid van voedingsstoffen, zoals aminozuren, die mTORC1 naar het lysosomale oppervlak drijven, de plaats van activatie. Hoe aminozuurniveaus aan mTORC1 worden doorgegeven, komt pas recentelijk aan het licht door de ontdekking van een lysosoom-gebaseerd signaalmechanisme bestaande uit Rags (Ras-gerelateerde GTPases) en Ragulator v-ATPase, GATOR (GAP-activiteit richting Rags) en folliculine (FLCN) complexen",
"Het mechanistische doelwit van rapamycine complex 1 (mTORC1) kinase is een belangrijke regulator van celgroei die reageert op talrijke omgevingssignalen. Een belangrijke input zijn aminozuren, die via de heterodimere Rag GTPases (RagA of RagB gebonden aan RagC of RagD) werken om de translocatie van mTORC1 naar het lysosomale oppervlak, de plaats van activatie, te bevorderen",
"De heterodimere Rag GTPases lokaliseren mTORC1 naar lysosomen door hun aminozuurafhankelijke interactie met het lysosomale Ragulator-complex.",
"Deze nieuwe bevindingen definiëren het lysosoom als een werkingsplaats voor FLCN en geven een cruciale rol aan FLCN in de aminozuurafhankelijke activatie van mTOR via zijn directe interactie met de RagA/B GTPases.",
"We tonen aan dat LRS direct bindt aan Rag GTPase, de mediator van aminozuursignalering naar mTORC1, op een aminozuurafhankelijke wijze en functioneert als een GTPase-activerend eiwit (GAP) voor Rag GTPase om mTORC1 te activeren.",
"Activatie van het mammalische doelwit van rapamycine complex 1 (mTORC1) door aminozuren wordt deels gemedieerd door de Rag GTPases, die binden aan de raptor-subunit van mTORC1 op een door aminozuren gestimuleerde wijze en de interactie van mTORC1 met Rheb-GTP, de directe activator, bevorderen",
"De Rag GTPases interageren met mTORC1 en signaleren aminozuurvolledigheid door de translocatie van mTORC1 naar het lysosomale oppervlak, de plaats van activatie, te bevorderen",
"Aminozuren stimuleren de activatie van mTORC1 bij het lysosoom op een wijze die vermoedelijk afhankelijk is van de Rag kleine guanosinetrifosfatasen (GTPases), het Ragulator-complex en de vacuolaire H(+)-adenosinetrifosfatase (v-ATPase)",
"Heterodimere Rag GTPases zijn vereist voor aminozuurgemedieerde activatie van mTORC1 bij het lysosoom.",
"Aminozuren stimuleren, op een Rag-, Ragulator- en vacuolaire adenosinetrifosfatase-afhankelijke wijze, de translocatie van mTORC1 naar het lysosomale oppervlak, waar het interacteert met zijn activator Rheb.",
"Deze nieuwe bevindingen definiëren het lysosoom als een werkingsplaats voor FLCN en geven een cruciale rol aan FLCN in de aminozuurafhankelijke activatie van mTOR via zijn directe interactie met de RagA/B GTPases.",
"Interessant is dat p62 colocaliseert met Rags in het lysosomale compartiment en vereist is voor de interactie van mTOR met Rag GTPases in vivo en voor de translocatie van het mTORC1-complex naar het lysosoom, een cruciale stap voor mTOR-activatie.",
"Onze resultaten geven aan dat FLCN specifiek vereist is voor de aminozuurgestimuleerde rekrutering van mTORC1 naar lysosomen door Rag GTPases.",
"Mutatie van LRS aminozuurresiduen die belangrijk zijn voor leucinebinding maakt de mTORC1-route ongevoelig voor intracellulaire aminozuurniveaus. We tonen aan dat LRS direct bindt aan Rag GTPase, de mediator van aminozuursignalering naar mTORC1, op een aminozuurafhankelijke wijze en functioneert als een GTPase-activerend eiwit (GAP) voor Rag GTPase om mTORC1 te activeren."
] | 544
| 514
|
988
|
In welke genomische regio's zijn Alu-elementen verrijkt?
|
Er zijn regio's zoals de vier homeobox-genclusters, die vrijwel vrij zijn van deze herhalingen, wat contrasteert met herhalingsrijke regio's in andere transcriptioneel actieve delen van het genoom. Alu-elementen zijn meer geclusterd in genen die betrokken zijn bij metabolisme, transport en signaalprocessen. Daarentegen zijn ze aanzienlijk minder aanwezig in genen die coderen voor componenten van informatiepaden en structurele eiwitten. Deze voorkeur in de distributie van Alu is onafhankelijk van het effect van de Alu-dichtheid in de omliggende genomische regio en wordt ook niet beïnvloed door het GC-gehalte van het gen en de upstream- en downstream-regio's.
|
[
"Er zijn regio's zoals de vier homeobox-genclusters, die vrijwel vrij zijn van deze herhalingen, wat contrasteert met herhalingsrijke regio's in andere transcriptioneel actieve delen van het genoom.",
"Deze elementen zijn meer geclusterd in genen die betrokken zijn bij metabolisme, transport en signaalprocessen. Daarentegen zijn ze aanzienlijk minder aanwezig in genen die coderen voor componenten van informatiepaden en structurele eiwitten.",
"Deze voorkeur in de distributie van Alu is onafhankelijk van het effect van de Alu-dichtheid in de omliggende genomische regio en wordt ook niet beïnvloed door het GC-gehalte van het gen en de upstream- en downstream-regio's.",
"De relatieve verhoudingen van Alu-subfamilies (Alu J, Alu S en Alu Y) verschillen niet significant in genen met een hoge Alu-dichtheid die behoren tot de functionele categorieën transport, metabolisme en signalering.",
"Wij suggereren dat Alu-elementen betrokken kunnen zijn bij regulerende mechanismen en daarom differentieel geselecteerd worden in primatengenomen.",
"Sequentieanalyse toonde aan dat deze \"jonge\" Alu-inserties genconversie-evenementen vertegenwoordigden van reeds bestaande oude Alu-elementen of onafhankelijke parallelle inserties van oudere Alu-elementen in dezelfde genomische regio.",
"Deze studie suggereert dat de meerderheid van Alu-inserties in primatengenomen het resultaat zijn van unieke evolutionaire gebeurtenissen.",
"Onze screening van de Alu-insertieloci resulteerde ook in het terugvinden van verschillende \"jonge\" Alu-elementen die zich op orthologe posities in niet-menselijke primatengenomen bevonden."
] | 326
| 300
|
989
|
Wat is het synoniem van de lubag-ziekte?
|
Lubag-ziekte staat ook bekend als X-gebonden dystonie-parkinsonisme (XDP). Deze ziekte wordt gekenmerkt door dystonie en parkinsonisme, en treft Filipijnse mannen, en zelden vrouwen, voornamelijk afkomstig van het eiland Panay.
|
[
"BELANG: Ondanks recessieve overerving is X-gebonden dystonie-parkinsonisme (Lubag-ziekte) ook beschreven bij vrouwen die een laat optredend geïsoleerd parkinsonistisch syndroom vertonen.",
"Anesthesie voor diepe hersenstimulatie bij een patiënt met X-gebonden dystonie-parkinsonisme/Lubag-ziekte.",
"Lubag-ziekte is een genetisch X-gebonden dystonie-parkinsonisme syndroom dat Filipijnse mannen treft.",
"X-gebonden dystonie parkinsonisme syndroom (XDP, lubag): ziekte-specifieke sequentieverandering DSC3 in TAF1/DYT3 beïnvloedt genen in vesiculair transport en dopamine metabolisme.",
"X-chromosomaal dystonie parkinsonisme syndroom (XDP, 'lubag') wordt geassocieerd met sequentieveranderingen binnen het TAF1/DYT3 multiple transcript systeem.",
"De unieke fenomenologie van geslachtsgebonden dystonie parkinsonisme (XDP, DYT3, \"Lubag\").",
"Geslachtsgebonden dystonie parkinsonisme (XDP, DYT3, \"Lubag\") is een progressieve, invaliderende bewegingsstoornis met aanvang op volwassen leeftijd, voor het eerst beschreven bij Filipijnse mannen van de Panay-eilanden in 1975.",
"We behandelen dopa-responsieve dystonie, de ziekte van Wilson, Parkin-, PINK1- en DJ-1-geassocieerd parkinsonisme (PARK2, 6 en 7), X-gebonden dystonie-parkinsonisme/Lubag (DYT3), snel optredend dystonie-parkinsonisme (DYT12) en DYT16 dystonie, de syndromen van neurodegeneratie met hersenijzeraccumulatie (NBIA) inclusief pantotheenzuurkinase (PANK2)- en PLA2G6 (PARK14)-geassocieerde neurodegeneratie, neuroferritinopathie, Kufor-Rakeb ziekte (PARK9) en het recent beschreven SENDA-syndroom; FBXO7-geassocieerde neurodegeneratie (PARK15), autosomaal recessieve spastische paraplegie met een dun corpus callosum (SPG11), en dystonie parkinsonisme door mutaties in het SLC6A3-gen dat de dopamine-transporter codeert.",
"Neuropsychologisch profiel van een Filipijnse heer met X-gebonden dystonie-parkinsonisme: een casusrapport van Lubag-ziekte.",
"X-gebonden dystonie-parkinsonisme (XDP of \"Lubag\") is een progressieve neurodegeneratieve aandoening uniek voor het eiland Panay in de Filipijnen.",
"Eerste geval van X-gebonden dystonie-parkinsonisme (\"Lubag\") dat een respons op bilaterale pallidale stimulatie toont.",
"\"Lubag\" of X-gebonden dystonie-parkinsonisme (XDP) is een genetisch syndroom dat Filipijnse mannen treft.",
"Eerste casusrapport van X-gebonden dystonie parkinsonisme (XDP) of 'lubag' in Australië.",
"DOEL: Het presenteren van het eerste genetisch ondersteunde geval van X-gebonden dystonie parkinsonisme (XDP) of 'lubag' gerapporteerd in een Australisch ziekenhuis.",
"Fenotypische en moleculaire analyses van X-gebonden dystonie-parkinsonisme (\"lubag\") bij vrouwen.",
"ACHTERGROND: X-gebonden dystonie-parkinsonisme (XDP) of \"lubag\" is een X-gebonden recessieve aandoening die Filipijnse mannen, en zelden vrouwen, treft.",
"Reuktesten zijn afwijkend bij 'lubag' of X-gebonden dystonie-parkinsonisme: een pilotstudie.",
"We voerden een cultureel gecorrigeerde University of Pennsylvania Smell Identification Test (ccUPSIT) uit bestaande uit 25 geuritems bij 20 patiënten met 'Lubag' of X-gebonden dystonie-parkinsonisme en 20 controlegroepen, gematcht op geslacht, leeftijd, opleidingsachtergrond, rookgeschiedenis en geografische herkomst.",
"Drie getroffen broers en zussen bleken een identiek haplotype te delen op het locus van X-gebonden dystonie-parkinsonisme (XDP; Lubag; OMIM*314250).",
"Deze neuropathologische bevindingen verschilden van die bij de ziekte van Parkinson of juveniel parkinsonisme, maar lijken op die van X-gebonden dystonie parkinsonisme (Lubag).",
"Fenomenologie van \"Lubag\" of X-gebonden dystonie-parkinsonisme.",
"X-gebonden dystonie-parkinsonisme (XDP), of Lubag-syndroom, staat bekend om het veroorzaken van progressieve dystonie, met of zonder parkinsonisme, bij volwassen Filipijnse mannen met maternale wortels van het Filipijnse eiland Panay.",
"Adductor laryngeale ademhalingsdystonie bij een patiënt met lubag (X-gebonden dystonie-Parkinsonisme syndroom).",
"We rapporteren een patiënt met Lubag (X-gebonden dystonie-parkinsonisme) die zich presenteerde met ernstige respiratoire stridor door adductor laryngeale ademhalingsdystonie.",
"Fenotypische expressie van X-gebonden dystonie-parkinsonisme (lubag) bij twee vrouwen.",
"Lubag (X-gebonden dystonie-parkinsonisme) wordt beschouwd als een geslachtsgebonden recessief kenmerk en is in kaart gebracht naar het pericentromerische gebied van het X-chromosoom.",
"Regionale en globale metabole snelheden voor glucose (rCMRGlc en GMR) werden geschat met behulp van [18F]fluorodeoxyglucose en positronemissietomografie bij 3 patiënten met Filipijns X-gebonden dystonie-parkinsonisme (lubag).",
"Neuropathologie van lubag (x-gebonden dystonie parkinsonisme).",
"Lubag is een X-gebonden recessief dystonie parkinsonisme dat Filipijnse mannen treft, voornamelijk afkomstig van het eiland Panay.",
"Genetische mapping van \"Lubag\" (X-gebonden dystonie-parkinsonisme) in een Filipijnse familie naar het pericentromerische gebied van het X-chromosoom.",
"\"Lubag\" is een X-gebonden aandoening die dystonie en parkinsonisme veroorzaakt en die alleen is beschreven in families uit de Filipijnen, voornamelijk van het eiland Panay.",
"X-gebonden dystonie-parkinsonisme (XDP of \"Lubag\") is een progressieve neurodegeneratieve aandoening uniek voor het eiland Panay in de Filipijnen.",
"Lubag-ziekte is een genetisch X-gebonden dystonie-parkinsonisme syndroom dat Filipijnse mannen treft.",
"Deze neuropathologische bevindingen verschilden van die bij de ziekte van Parkinson of juveniel parkinsonisme, maar lijken op die van X-gebonden dystonie parkinsonisme (Lubag)."
] | 658
| 637
|
990
|
Dracorhodin perchlorate werd getest voor de behandeling van welke kankers?
|
Dracorhodin perchlorate induceert apoptose in prostaatkanker, maagtumor, melanoom en premyelocytaire leukemie.
|
[
"Dracorhodin perchlorate induceerde apoptose van menselijke borstkanker MCF-7 via mitochondriale routes.",
"Er werd gerapporteerd dat DP apoptose kon induceren in menselijke prostaatkanker, menselijke maagtumorcellen en menselijk melanoom, maar het cytotoxische effect van DP op menselijke borstkanker werd niet onderzocht.",
"CONCLUSIE: Daarom was DP een kandidaat voor anti-borstkanker, DP induceerde apoptose van MCF-7 via de mitochondriale route.",
"Recentelijk is aangetoond dat Dracorhodin perchlorate apoptotische celdood induceert in kankercellen. De moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan deze effecten zijn echter onbekend in menselijke maagtumorcellen.",
"Dracorhodin perchlorate onderdrukt proliferatie en induceert apoptose in de menselijke prostaatkankercellijn PC-3.",
"De groeiremming en pro-apoptotische effecten van dracorhodin perchlorate op de menselijke prostaatkankercellijn PC-3 werden onderzocht.",
"Dracorhodin perchlorate, een anthocyanine rood pigment, induceert celdood van menselijke premyelocytaire leukemie HL-60 via de apoptotische route.",
"Dracorhodin perchlorate, een anthocyanine rood pigment, induceert celdood van menselijke melanoom A375-S2 via de apoptotische route.",
"Dracorhodin perchlorate remde de proliferatie van verschillende tumorcellijnen.",
"De groeiremming en pro-apoptotische effecten van dracorhodin perchlorate op de menselijke prostaatkankercellijn PC-3 werden onderzocht.",
"Er werd gerapporteerd dat DP apoptose kon induceren in menselijke prostaatkanker, menselijke maagtumorcellen en menselijk melanoom, maar het cytotoxische effect van DP op menselijke borstkanker werd niet onderzocht.",
"Dracorhodin perchlorate (DP) was een synthetisch analoog van het antimicrobiële anthocyanine rode pigment dracorhodin. Er werd gerapporteerd dat DP apoptose kon induceren in menselijke prostaatkanker, menselijke maagtumorcellen en menselijk melanoom, maar het cytotoxische effect van DP op menselijke borstkanker werd niet onderzocht.",
"De groeiremming en pro-apoptotische effecten van dracorhodin perchlorate op de menselijke prostaatkankercellijn PC-3 werden onderzocht. Na toediening van 10-80 μmol/L dracorhodin perchlorate gedurende 12-48 uur werd de levensvatbaarheid van PC-3 cellen gemeten met MTT-kleurimetrie.",
"Er werd gerapporteerd dat DP apoptose kon induceren in menselijke prostaatkanker, menselijke maagtumorcellen en menselijk melanoom, maar het cytotoxische effect van DP op menselijke borstkanker werd niet onderzocht. Deze studie zou onderzoeken of DP een kandidaatchemische stof was voor anti-menselijke borstkanker.",
"Dracorhodin perchlorate (DP) was een synthetisch analoog van het antimicrobiële anthocyanine rode pigment dracorhodin. Er werd gerapporteerd dat DP apoptose kon induceren in menselijke prostaatkanker, menselijke maagtumorcellen en menselijk melanoom, maar het cytotoxische effect van DP op menselijke borstkanker werd niet onderzocht.",
"De groeiremming en pro-apoptotische effecten van dracorhodin perchlorate op de menselijke prostaatkankercellijn PC-3 werden onderzocht. Na toediening van 10-80 μmol/L dracorhodin perchlorate gedurende 12-48 uur werd de levensvatbaarheid van PC-3 cellen gemeten met MTT-kleurimetrie."
] | 437
| 391
|
991
|
Wat is de rol van veneuze angioplastiek bij multiple sclerose?
|
Chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie (CCSVI) kan een belangrijke factor zijn in de pathogenese van multiple sclerose (MS). De voorgestelde behandeling voor CCSVI is percutane transmurale angioplastiek, ook wel bekend als de 'liberatieprocedure', waarvan wordt beweerd dat deze de bloedstroom in de hersenen verbetert en daarmee sommige symptomen van MS verlicht. Er zijn meldingen die suggereren dat veneuze angioplastiek bij MS-patiënten een haalbare en veilige procedure is en geassocieerd wordt met verbeterde ernst van de ziekteverschijnselen, kwaliteit van leven, correctie van bloeddrukafwijkingen en verbetering van de CSF-dynamiek. Open veneuze reconstructie van de vena jugularis interna is ook geprobeerd met goede resultaten.
Echter, sommige auteurs hebben geen gunstige waarde van veneuze angioplastiek bij MS-patiënten kunnen aantonen en systematische reviews suggereren dat er momenteel geen hoogwaardig bewijs is om de effectiviteit of veiligheid van percutane transmurale angioplastiek voor de behandeling van CCSVI bij mensen met MS te ondersteunen of te weerleggen.
|
[
"Ballonangioplastiek corrigeert bloeddrukafwijkingen bij multiple sclerose-patiënten die een dilatatie van de vena jugularis interna ondergaan.",
"DOEL: Het onderzoeken van de prevalentie van extracraniële afwijkingen in de azygos en vena jugularis interna (IJ) met conventionele venografie en intravasculaire echografie (IVUS) bij patiënten met multiple sclerose (MS) die worden geëvalueerd op chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie, een aandoening van vasculaire hemodynamische disfunctie.",
"Haalbaarheid en veiligheid van endovasculaire behandeling voor chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie bij patiënten met multiple sclerose.",
"CONCLUSIES: Endovasculaire behandeling voor CCSVI lijkt haalbaar en veilig.",
"Dit rapport presenteert het geval van een 45-jarige man met bekende MS en vermoedelijke CCSVI die eerder een angioplastiek en stenting van de vena jugularis interna had ondergaan. De patiënt rapporteerde een dramatische verbetering van de symptomen na de interventie.",
"Open veneuze reconstructie van de vena jugularis interna werd uitgevoerd met een spiraalgraft van de vena saphena. De symptomen van de patiënt verbeterden enkele weken totdat de veneuze reconstructie occludeerde. Dit is het eerste gerapporteerde geval van open veneuze reconstructie voor vermoedelijke CCSVI.",
"Percutane transmurale angioplastiek voor de behandeling van chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie bij mensen met multiple sclerose: een samenvatting van een Cochrane systematische review.",
"ACHTERGROND: Recentelijk is de hypothese geopperd dat chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie (CCSVI) een belangrijke factor kan zijn in de pathogenese van multiple sclerose (MS). De voorgestelde behandeling voor CCSVI is percutane transmurale angioplastiek, ook wel bekend als de 'liberatieprocedure', waarvan wordt beweerd dat deze de bloedstroom in de hersenen verbetert en daarmee sommige symptomen van MS verlicht.",
"CONCLUSIES: Er is momenteel geen hoogwaardig bewijs om de effectiviteit of veiligheid van percutane transmurale angioplastiek voor de behandeling van CCSVI bij mensen met MS te ondersteunen of te weerleggen.",
"CONCLUSIE: De resultaten van de huidige studie suggereren dat endovasculaire evaluatie en behandeling van chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie veilig is, met een lage morbiditeit en geen procedure-gerelateerde mortaliteit.",
"Er zijn klinische onderzoeken gaande of gepland om chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie (CCSVI) te behandelen via angioplastiek.",
"Percutane transmurale angioplastiek voor chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie bij multiple sclerose: dichotomie tussen subjectieve en objectieve uitkomstmaten.",
"Sommige multiple sclerose (MS) patiënten rapporteerden verbetering na percutane transmurale angioplastiek (PTA) voor chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie (CCSVI), ondanks het ontbreken van overeenstemming met objectieve uitkomstmaten.",
"Spontaan uitgevoerde benadering van CCSVI verbetert geen klinische en MRI-parameters, ondanks frequente subjectieve perceptie van verbetering van de kwaliteit van leven.",
"Percutane angioplastiek van de vena jugularis interna en azygos bij patiënten met chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie en multiple sclerose: vroege en middellange termijn resultaten.",
"Doel: De veiligheid beoordelen van endovasculaire behandeling van chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie (CCSVI) bij patiënten met multiple sclerose (MS).",
"Conclusie: Endovasculaire behandeling van de vena jugularis interna en azygos bij patiënten met CCSVI en MS is een veilige procedure zonder post-procedurele complicaties, gevolgd door significante verbetering van de hemodynamische parameters van de vena jugularis interna en afname van de EDSS-score. Of CCSVI percutane behandeling klinische verbetering bij MS-patiënten kan beïnvloeden, moet nog blijken na afronding van grote multicentrische klinische onderzoeken, maar het lijkt erop dat deze procedure niet te verwaarlozen is.",
"CONCLUSIES: PTA bij patiënten met MS en CCSVI verhoogde de CSF-stroom en verlaagde de CSF-snelheid, wat wijst op verbeterde veneuze parenchymdrainage.",
"ACHTERGROND: Er is gesteld dat multiple sclerose (MS) voortkomt uit vernauwingen in de aderen die het bloed uit de hersenen afvoeren, medisch bekend als chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie, of CCSVI. Er is voorgesteld dat ballonangioplastiek de symptomen van MS zou moeten verlichten.",
"De heropleving van dit concept heeft grote belangstelling gewekt in de media en patiëntenverenigingen, vooral gedreven door de hoop dat endovasculaire behandeling van 'CCSVI' MS zou kunnen verlichten.",
"De hier verkregen gegevens ondersteunen over het algemeen niet het 'CCSVI'-concept. Bovendien zijn er geen methodologisch adequate studies om de gunstige effecten van endovasculaire behandeling bij MS te bewijzen of te weerleggen.",
"REDEN: Naar schatting hebben enkele honderden Canadese patiënten met multiple sclerose (MS) naar het buitenland gereisd om gebruik te maken van 'liberatie-therapie' (venoplastiek) na het initiële rapport van Zamboni et al. in 2009.",
"CONCLUSIE: Geen objectieve verbetering werd gevonden na één jaar bij dertig MS-onderwerpen die venoplastiek hadden ondergaan, hoewel velen een mate van subjectief voordeel rapporteerden.",
"Zamboni et al. rapporteerden significante verbetering in neurologische uitkomsten bij MS-patiënten die percutane transmurale angioplastiek (PTA) ondergingen.",
"CONCLUSIE: De studie toonde aan dat PTA bij patiënten met relapsing-remitting MS niet geassocieerd was met neurologische verbetering. Er was echter een toename van ziekteactiviteit, ongeacht de naleving van DMT's.",
"Ernstige complicatie van percutane angioplastiek met stentimplantatie bij zogenaamde \"chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie\" bij een multiple sclerose-patiënt.",
"Wij verzoeken dringend om beperking van de PTA-procedure bij zogenaamde CCSVI, waarvan het concept niet bewezen relevant is voor MS.",
"Percutane transmurale angioplastiek voor de behandeling van chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie (CCSVI) bij multiple sclerose-patiënten.",
"De voorgestelde behandeling voor CCSVI is percutane transmurale angioplastiek, ook wel bekend als de 'liberatieprocedure', waarvan wordt beweerd dat deze de bloedstroom in de hersenen verbetert en daarmee sommige symptomen van MS verlicht.",
"CONCLUSIES VAN DE AUTEURS: Er is momenteel geen hoogwaardig bewijs om de effectiviteit of veiligheid van percutane transmurale angioplastiek voor de behandeling van CCSVI bij mensen met MS te ondersteunen of te weerleggen.",
"Significante verbetering van klinische invaliditeit bij relapsing-remitting patiënten werd bereikt (P < 0,001).",
"Gegevens uit enkele kleine casusseries suggereren mogelijke verbetering van het klinische beloop en de kwaliteit van leven door percutane ballonangioplastiek (PTA) van de stenotische aderen uit te voeren.",
"CONCLUSIE: In het gepresenteerde geval resulteerde PTA van de confluens van de vena jugularis interna in hemodynamische verbetering ondanks de aanwezigheid van externe compressie van de vena jugularis interna.",
"CONCLUSIES: Endovasculaire behandeling van CCSVI bij patiënten met MS lijkt een veilige procedure te zijn die leidt tot significante klinische verbetering.",
"Endovasculaire behandeling van gelijktijdige CCSVI lijkt veilig en herhaalbaar en kan de jaarlijkse recidiefpercentages en cumulatieve invaliditeit bij patiënten met relapsing-remitting MS verminderen.",
"Daarom moet elke potentieel schadelijke interventionele behandeling zoals transmurale angioplastiek en/of stenting sterk worden afgeraden.",
"Het werk van Dr. Zamboni et al., die rapporteerden dat behandeling van de veneuze stenoses die CCSVI veroorzaken met angioplastiek leidde tot significante verbetering van de symptomen en kwaliteit van leven van patiënten met MS (2), heeft geleid tot verdere interesse in deze theorie en potentiële behandeling.",
"Ongeacht deze voortdurende onzekerheid over de veiligheid en effectiviteit van deze therapie reizen MS-patiënten uit Canada en andere jurisdicties naar het buitenland om centrale veneuze angioplastiek te ondergaan en helaas ontvangen sommigen ook veneuze stents.",
"Tot slot is tot op heden geen bewezen (d.w.z. gebaseerd op strikte wetenschappelijke methodologie en op de regels van evidence-based medicine) therapeutisch effect van de \"liberatie\"-procedure (ontstopping van de extracraniële veneuze obstructie met angioplastiek) aangetoond.",
"De angiografische en hemodynamische verbetering ging gepaard met verbetering van de symptomatologie, vooral van cognitieve en constitutionele symptomen die mogelijk gerelateerd zijn aan cerebroveneuze stroming.",
"Concluderend, in deze serie werd endovasculaire interventie om veneuze stenose geassocieerd met multiple sclerose te corrigeren geassocieerd met verbetering van symptomen die mogelijk verband houden met verstoorde veneuze hemodynamica.",
"Sommige onderzoekers zijn overgegaan tot niet-geblindeerde niet-gerandomiseerde angioplastiek- en stentprocedures bij patiënten met CCSVI, met anekdotische rapporten van symptoomverbetering. Vanwege tegenstrijdige gegevens over de aanwezigheid van CCSVI en het ontbreken van gecontroleerde onderzoeken van CCSVI-interventie is de huidige standaard van klinische zorg noch om MS-patiënten te evalueren op CCSVI-afwijkingen, noch om in te grijpen met procedures om dergelijke afwijkingen te wijzigen.",
"Endovasculaire behandeling (percutane transmurale angioplastiek (PTA) met of zonder stenting) van CCSVI werd gerapporteerd als haalbaar met een laag complicatiepercentage.",
"PTA lijkt een effectieve behandeling voor patiënten met CCVI en multiple sclerose, maar gerandomiseerde studies zijn nodig om de effectiviteit van deze nieuwe behandeling voor MS vast te stellen.",
"CONCLUSIES: Endovasculaire behandeling van CCSVI is een veilige procedure; er is een risico van 1,6% op ernstige complicaties.",
"CONCLUSIES: De endovasculaire behandeling bij patiënten met MS en gelijktijdige CCSVI had geen invloed op de neurologische toestand van de patiënt; echter werd op middellange termijn een verbetering in sommige kwaliteit-van-levenparameters waargenomen.",
"Hoewel er momenteel geen methodologisch rigoureus bewijs is om deze hypothese te ondersteunen, hebben een aanzienlijk aantal MS-patiënten endovasculaire CCSVI-procedures ondergaan. Dergelijke procedures omvatten angioplastiek of stentplaatsing in de jugularis- en azygosaderen. De veiligheid en effectiviteit van deze procedures is onbekend, maar niet zonder risico.",
"CONCLUSIES: Terwijl het debat over CCSVI en de relatie met MS voortduurt, worden de complicaties en risico's geassocieerd met veneuze stenting en angioplastiek in jugularis- en azygosaderen steeds duidelijker.",
"CONCLUSIES: Deze studie bevestigt verder de veiligheid van PTA-behandeling bij patiënten met CCSVI geassocieerd met MS.",
"Deze review heeft tot doel de voorgestelde associatie tussen CCSVI en MS te beschrijven, de huidige gegevens samen te vatten en de rol van endovasculaire therapie en de noodzaak van rigoureuze gerandomiseerde klinische onderzoeken te bespreken om deze associatie en behandeling te evalueren.",
"CONCLUSIE: Endovasculaire therapie lijkt een veilige en betrouwbare methode voor de behandeling van CCSVI.",
"In het bijzonder wordt momenteel gedebatteerd over de mogelijke verschuiving in behandelconcepten die kunnen leiden tot een interventionele behandelaanpak, inclusief ballonangioplastiek en veneuze stentplaatsing.",
"Concluderend zouden de huidige overtuigende gegevens die de CCSVI-theorie bij MS weerleggen, moeten leiden tot terughoudendheid ten aanzien van de interventionele behandeling van mogelijke veneuze afwijkingen bij MS-patiënten.",
"Hoewel ballonangioplastiek en stenting veilige procedures lijken te zijn, zijn er momenteel geen gegevens over de behandeling van een grote groep patiënten met deze vasculaire pathologie.",
"CONCLUSIES: De procedures leken veilig en goed verdragen door de patiënten, ongeacht de daadwerkelijke impact van de endovasculaire behandelingen voor veneuze pathologie op het klinische beloop van multiple sclerose, wat langdurige follow-up rechtvaardigt.",
"Twee pilotstudies toonden de veiligheid en haalbaarheid aan van de endovasculaire behandeling van CCSVI door middel van ballonangioplastiek (PTA) in dagbehandeling. Dit resulteert in een significante verlaging van de postoperatieve veneuze druk.",
"Echter lijkt PTA een positieve invloed te hebben op klinische en kwaliteit-van-levenparameters van de geassocieerde MS en rechtvaardigt verdere gerandomiseerde gecontroleerde onderzoeken.",
"Bovendien hebben zij bij sommigen een schijnbare klinische verbetering of stabilisatie bereikt door endovasculaire ballondilatatie van obstructiepunten in de grote aderen, althans tijdelijk.",
"Er is een mogelijke verschuiving in het behandelingsparadigma van MS voorgesteld en uitgevoerd in kleine patiëntseries, waarbij endovasculaire ballonangioplastiek of veneuze stentplaatsing wordt toegepast. In sommige gevallen heeft dit geleid tot ernstige verwondingen.",
"Momenteel dienen invasieve en potentieel gevaarlijke endovasculaire procedures als therapie voor patiënten met MS te worden afgeraden totdat dergelijke studies zijn voltooid, geanalyseerd en wetenschappelijk zijn besproken.",
"Zij ondergingen percutane ballonangioplastiek van de geassocieerde chronische cerebrospinale veneuze insufficiëntie (CCSVI), vanwege membranieuze obstructie van de proximale azygosader, met ernstige stenose van de linker vena jugularis interna. Behandeling van de geassocieerde CCSVI leidde tot parallelle verbetering in zowel klinische als neurofysiologische parameters, waardoor hoge dosis steroïdtherapie kon worden vermeden.",
"CONCLUSIES: PTA van veneuze vernauwingen bij patiënten met CCSVI is veilig, en vooral bij patiënten met RR werd het klinische beloop positief beïnvloed en verbeterden klinische en kwaliteit-van-levenparameters van de geassocieerde MS vergeleken met de preoperatieve beoordeling.",
"In het bijzonder wordt momenteel gedebatteerd over de mogelijke verschuiving in behandelconcepten die kunnen leiden tot een interventionele behandelaanpak, inclusief ballonangioplastiek en veneuze stentplaatsing."
] | 1,965
| 1,907
|
992
|
Zijn de Fanconi-anemie-genen onderdeel van dezelfde signaalroute?
|
De FA-genen coderen voor eiwitten die in complexen samenwerken om de reparatie van beschadigd DNA te coördineren
|
[
"Mutaties in ten minste 14 verschillende genen zijn aangetoond de oorzaak te zijn van FA",
"De FA-genen coderen voor eiwitten die in complexen samenwerken om de reparatie van beschadigd DNA te coördineren",
"De huidige review beschrijft de structuur en functie van de Fanconi-anemie-genen en beschrijft de rol van de gecodeerde Fanconi-anemie-eiwitten in een cellulaire route die de chromosoomstabiliteit reguleert.",
"Fanconi-anemie (FA) is een zeldzame menselijke genetische ziekte veroorzaakt door mutaties in een van de 13 bekende genen die eiwitten coderen die functioneren in één gemeenschappelijke signaalroute, de FA-route, of in onbekende genen.",
"Fanconi-anemie (FA) is een zeldzame erfelijke recessieve ziekte veroorzaakt door mutaties in een van vijftien genen die bekend staan als codering voor componenten van de FA-route.",
"Fanconi-anemie (FA)-eiwitten functioneren in een DNA-schade-responspad dat deel lijkt uit te maken van het netwerk inclusief de genproducten van borstkankergevoeligheid, BRCA1 en BRCA2.",
"Fanconi-anemie (FA)-eiwitten functioneren in een DNA-schade-responspad dat deel lijkt uit te maken van het netwerk inclusief de genproducten van borstkankergevoeligheid, BRCA1 en BRCA2",
"Fanconi-anemie (FA) is een zeldzame menselijke genetische ziekte veroorzaakt door mutaties in een van de 13 bekende genen die eiwitten coderen die functioneren in één gemeenschappelijke signaalroute, de FA-route, of in onbekende genen",
"De Fanconi-anemie (FA) genfamilie omvat ten minste 12 genen die samenwerken in een gemeenschappelijke route betrokken bij DNA-reparatie",
"Deze bevindingen tonen aan dat het nieuw geïdentificeerde FANCE-eiwit een integraal onderdeel is van de FA-route, en ondersteunen het concept van een functionele verbinding tussen alle bekende eiwitten gecodeerd door de genen die gemuteerd zijn bij deze aandoening"
] | 289
| 266
|
993
|
Zijn er klinische onderzoeken met stamcellen voor de behandeling van hartziekten?
|
Ja, er bestaan klinische onderzoeken voor behandeling van het hart met stamcellen.
|
[
"Therapie met mesenchymale stamcellen is een van de veelbelovende middelen om de uitkomsten na een myocardinfarct te verbeteren. Stamcellen afkomstig uit vetweefsel (ASCs) zijn een ideale bron van mesenchymale stamcellen vanwege hun overvloed en gemakkelijke bereiding.",
"Bovendien leveren verschillende lopende klinische onderzoeken met ASCs veelbelovende resultaten op voor hartziekten.",
"Onder de onderzochte celtypen worden volwassen mesenchymale stamcellen veel bestudeerd, en vroege klinische studies tonen veelbelovende resultaten voor herstel en regeneratie van hartweefsel.",
"Opeenstapelende gegevens uit preklinische en vroege klinische onderzoeken documenteren hun veiligheid wanneer ze worden toegediend in autologe of allogene vorm bij diverse cardiovasculaire aandoeningen, en definiëren ook belangrijke parameters van klinische werkzaamheid die verder onderzoek in grotere klinische onderzoeken rechtvaardigen.",
"Verschillende lopende klinische onderzoeken met ASCs leveren veelbelovende resultaten op voor hartziekten.",
"Klinische toepassing van volwassen stamcellen voor therapie bij hartziekten.",
"Stamceltherapieën hebben het potentieel om de behandeling van ischemisch hartletsel en hartfalen fundamenteel te transformeren door te bereiken wat enkele jaren geleden ondenkbaar was - de Heilige Graal van myocardiale regeneratie. Recente therapeutische benaderingen omvatten mononucleaire cellen uit beenmerg (BM) en hun subsets zoals mesenchymale stam-/stromale cellen (MSCs), endotheliale voorlopercellen evenals MSCs afkomstig uit vetweefsel, stamcellen uit hartweefsel en celcombinaties. Klinische onderzoeken met deze cellen hebben aangetoond dat celtherapie haalbaar en veilig is.",
"Opeenstapelende gegevens uit preklinische en vroege klinische onderzoeken documenteren hun veiligheid wanneer ze worden toegediend in autologe of allogene vorm bij diverse cardiovasculaire aandoeningen, en definiëren ook belangrijke parameters van klinische werkzaamheid die verder onderzoek in grotere klinische onderzoeken rechtvaardigen.",
"Gebruik van stam- en voorlopercellen als therapeutisch middel voor chronisch beschadigde organen. Onder de onderzochte celtypen worden volwassen mesenchymale stamcellen veel bestudeerd, en vroege klinische studies tonen veelbelovende resultaten voor herstel en regeneratie van hartweefsel.",
"In de afgelopen 2 decennia zijn er talrijke stamcelstudies gericht op hartziekten geweest, variërend van proof-of-concept tot fase 2 onderzoeken.",
"Kleine ongecontroleerde klinische onderzoeken hebben aangetoond dat hartstamcellen een behandelingsoptie zijn voor cardiomyopathie.",
"Het aantal stamcelpopulaties neemt snel toe, en we zijn nog steeds op zoek naar optimale celtypen voor klinische onderzoeken, aangezien beenmergstamcellen geen significante verbetering van de hartfunctie lieten zien na transplantatie.",
"Verschillende klinische onderzoeken met volwassen stamcellen hebben verbeteringen in hartfunctie aangetoond, maar het werkingsmechanisme is onduidelijk en wijdverspreide weefselregeneratie is niet evident.",
"Terwijl we wachten op resultaten van grotere en langdurigere klinische onderzoeken, blijft de wetenschap van stamceltherapie bij hartziekten zich ontwikkelen.",
"Stamceltherapie voor de behandeling van hartziekten heeft therapeutisch potentieel getoond.",
"Het moet worden opgemerkt dat stamceltherapie niet beperkt is tot de behandeling van ischemische hartziekte.",
"In de afgelopen 2 decennia zijn er talrijke stamcelstudies gericht op hartziekten geweest, variërend van proof-of-concept tot fase 2 onderzoeken.",
"Deze reeks artikelen richt zich op de erfenis van deze studies en het vooruitzicht voor toekomstige behandeling van hartziekten met stamceltherapieën.",
"Celtransplantatie om beschadigd myocardium te herstellen of te regenereren is een nieuw grensgebied in de behandeling van cardiovasculaire ziekten.",
"Huidige therapieën vertragen alleen de progressie van hartziekte of vervangen het zieke hart door een harttransplantatie. Stamcellen vertegenwoordigen een recent ontdekte nieuwe benadering voor de behandeling van hartfalen die mogelijk de vervanging van ziek hartweefsel faciliteert en vervolgens leidt tot verbeterde hartfunctie en hartregeneratie.",
"In de afgelopen 2 decennia zijn er talrijke stamcelstudies gericht op hartziekten geweest, variërend van proof-of-concept tot fase 2 onderzoeken. Deze reeks artikelen richt zich op de erfenis van deze studies en het vooruitzicht voor toekomstige behandeling van hartziekten met stamceltherapieën.",
"Stamceltherapie voor de behandeling van hartziekten heeft therapeutisch potentieel getoond.",
"In de afgelopen 2 decennia zijn er talrijke stamcelstudies gericht op hartziekten geweest, variërend van proof-of-concept tot fase 2 onderzoeken. Deze reeks artikelen richt zich op de erfenis van deze studies en het vooruitzicht voor toekomstige behandeling van hartziekten met stamceltherapieën.",
"Het moet worden opgemerkt dat stamceltherapie niet beperkt is tot de behandeling van ischemische hartziekte. Niet-ischemische cardiomyopathie, perifere vaatziekten en veroudering kunnen mogelijk worden behandeld met stamcellen.",
"Recente klinische onderzoeken hebben gunstige initiële eindpunten bereikt met verbeteringen in hartfunctie en klinische symptomen na celtherapie.",
"We beschouwen hoe de biologie van hartstamcellen ons naar klinische onderzoeken heeft geleid, en we suggereren dat het bereiken van echte hartregeneratie bij patiënten uiteindelijk de oplossing van kritieke controverses in experimentele hartregeneratie vereist.",
"Celgebaseerde therapieën en weefseltechniek bieden nieuwe veelbelovende platforms om toekomstige therapeutische opties te ontwikkelen. Initiële klinische onderzoeken konden veelbelovende resultaten genereren. Verschillende soorten stamcellen zijn gebruikt voor klinische toepassing.",
"Inzichten verkregen uit klinische onderzoeken met volwassen stamcellen, samen met fundamentele wetenschappelijke vooruitgang in hartstamcel- en regeneratieve biologie, beginnen potentiële nieuwe doelen en strategieën voor regeneratieve therapieën op te leveren.",
"Vroege dierproeven hebben aangetoond dat het mogelijk is de hartfunctie te verbeteren door overdracht van HSCs in het myocard, en vroege humane studies hebben de haalbaarheid en veiligheid van deze benadering aangetoond."
] | 879
| 770
|
994
|
Is DNA-methylatie een epigenetische modificatie van chromatine gerelateerd aan genexpressie?
|
Epigenetische veranderingen zoals DNA-methylatie veranderen genexpressie op het niveau van transcriptie door genen te upreguleren, downreguleren of volledig te laten zwijgen.
|
[
"DNA-methylatie is een chemische modificatie van DNA die betrokken is bij de regulatie van genexpressie door de toegang tot de DNA-sequentie te controleren.",
"Epigenetische markeringen zoals DNA-methylatie spelen belangrijke biologische rollen in de regulatie van genexpressie en cellulaire differentiatie tijdens de ontwikkeling.",
"DNA-methylatiepatronen worden gekenmerkt door sterk geconserveerde ontwikkelingsprogramma's, maar maken divergente genexpressie mogelijk als gevolg van stochastische epigenetische drift of verschillende omgevingen.",
"DNA-methylatie speelt een cruciale rol in de regulatie van genexpressie.",
"Epigenetische veranderingen zoals DNA-methylatie en histonmethylatie en -acetylatie veranderen genexpressie op het niveau van transcriptie door genen te upreguleren, downreguleren of volledig te laten zwijgen.",
"Dysregulatie van epigenetische gebeurtenissen kan pathologisch zijn, leidend tot cardiovasculaire aandoeningen, neurologische stoornissen, metabole aandoeningen en de ontwikkeling van kanker.",
"DNA-methylatie is een alomtegenwoordige epigenetische DNA-modificatie die sterk de chromatine-regulatie en genexpressie beïnvloedt.",
"Epigenetische controle, die DNA-methylatie en histonmodificaties omvat, leidt tot chromatine-remodellering en gereguleerde genexpressie.",
"Epigenetische modificaties op de DNA-sequentie (DNA-methylatie) of op chromatine-geassocieerde eiwitten (d.w.z. histonen) vormen het \"cellulaire epigenoom\"; samen spelen deze modificaties een belangrijke rol in de regulatie van genexpressie.",
"Epigenetica is een proces betrokken bij genregulatie, gemedieerd via DNA-methylatie, histonmodificatie, chromatine-remodellering en functionele niet-coderende RNA's, die de toegankelijkheid van het onderliggende DNA voor transcriptiefactoren die expressie activeren of onderdrukken beïnvloeden.",
"Er is aanzienlijke vooruitgang geboekt in het fundamentele begrip van hoe verschillende epigenetische veranderingen zoals DNA-methylatie, histonmodificatie, miRNA-expressie en hogere-orde chromatinestructuur genexpressie beïnvloeden."
] | 276
| 245
|
995
|
Is Growth factor independence 1b (GFI1B) belangrijk voor hematopoëse?
|
Ja. Gfi-1B is een transcriptionele repressor die essentieel is voor de regulatie van erytropoëse en megakaryopoëse. Gfi-1b(-/-) embryonale stamcellen dragen niet bij aan rode bloedcellen van volwassen chimera’s. Gfi-1b(-/-) embryo’s vertonen vertraagde rijping van primitieve erytrocyten en sterven vervolgens door het falen om definitieve, kernloze erytrocyten te produceren.
|
[
"Growth Factor Independence (Gfi) transcriptiefactoren spelen essentiële rollen in de hematopoëse, waarbij ze differentieel transcriptieprogramma’s activeren en onderdrukken die nodig zijn voor de ontwikkeling van hematopoëtische stam-/voorlopercellen (HSPC) en lijnspecificatie.",
"gfi1aa en gfi1b hebben verschillende rollen in het reguleren van primitieve en definitieve hematopoëtische voorlopercellen,",
"gfi1b is vereist voor definitieve hematopoëse",
"LSD1-kd werd geassocieerd met de opregulatie van sleutelgenen in de hematopoëse, waaronder Gfi1b",
"GFI1 en GFI1B controleren het verlies van endotheliale identiteit van hemogene endotheel tijdens hematopoëtische toewijding",
"Samengevat tonen onze bevindingen een kritieke en specifieke rol van de GFI1 transcriptiefactoren aan in de eerste stappen van het proces dat leidt tot de generatie van hematopoëtische voorlopercellen uit hemogene endotheel",
"Een kort Gfi-1B isoform reguleert erytroïde differentiatie",
"Gfi-1B is een transcriptionele repressor die essentieel is voor de regulatie van erytropoëse en megakaryopoëse",
"Onder de weinige naar beneden gereguleerde genen was Gfi1b, een bekende repressor van erytroïde differentiatie",
"Deze omkeerbare modulatie van de endotheliale-hematopoëtische staat wordt bereikt door het gericht naar beneden reguleren van sleutel hematopoëtische transcriptiefactoren, waaronder Runx1, Gata1, Gfi1B, Ikaros en PU.1",
"Gfi1 en Gfi1b: sleutelregulatoren van hematopoëse",
"we bespreken hoe Gfi1 en zijn paralog Gfi1b de ontwikkeling van bloedcellen controleren, hoe veranderingen in Gfi1 en Gfi1b bijdragen aan hematologische ziekten en rapporteren over de moleculaire functie van deze eiwitten.",
"Gfi-1B reguleert menselijke erytroïde en megakaryocytaire differentiatie door TGF-beta signalering te reguleren in het bipotente erytro-megakaryocytaire voorlopercelstadium",
"Growth factor independence-1B (Gfi-1B) is een transcriptionele repressor die essentieel is voor erytropoëse en megakaryopoëse",
"Gerichte genonderbreking van GFI1B in muizen leidt tot embryonale lethaal door falen in de productie van definitieve erytrocyten, wat het bestuderen van Gfi-1B functie in volwassen hematopoëse belemmert",
"We tonen hier aan dat Gfi-1B bij mensen de ontwikkeling van erytrocyten en megakaryocyten reguleert door de proliferatie en differentiatie van bipotente erytro-megakaryocytaire voorlopercellen te reguleren",
"Tot nu toe hebben we twee gemeenschappelijke integratieplaatsen geïdentificeerd die genen coderen voor transcriptiefactoren die een kritieke rol spelen in hematopoëse (Evi1 en Gfi1b loci)",
"Transcriptiefactoren spelen essentiële rollen in zowel normale als kwaadaardige hematopoëse. Dit geldt voor de growth factor independent 1b (GFI1B) transcriptiefactor, die vereist is voor erytroïde en megakaryocytaire differentiatie en overexpressie vertoont in leukemiepatiënten en cellijnen",
"We lokaliseerden verschillende geconserveerde niet-coderende elementen met meerdere erytroïde-specifieke transcriptiefactor bindingsplaatsen op de GFI1B locus. In GFI1B-expressieve cellen nemen een subset van deze geconserveerde niet-coderende elementen en de promotor een nauwe ruimtelijke conformatie aan, lokaliseren zich bij open chromatinesites, bevatten chromatine modificaties geassocieerd met genactivatie en binden meerdere transcriptiefactoren en co-repressoren",
"Onze bevindingen geven aan dat GFI1B regulerende elementen zich gedragen als activatoren en repressoren",
"Om de moleculaire effecten van growth factor independence 1B (Gfi-1B), een transcriptiefactor essentieel voor de ontwikkeling van hematopoëtische cellen en differentiatie van erytroïde en megakaryocytaire lijnen, te onderzoeken",
"Onze data geven aan dat Gfi-1B signalering belangrijk is voor toewijding en rijping van hematopoëtische celpopulaties",
"Gfi-1 en Gfi-1b zijn homologue transcriptie repressoren betrokken bij diverse ontwikkelingscontexten, waaronder hematopoëse en oncogenese",
"Gfi1b:green fluorescent protein knock-in muizen tonen een dynamisch expressiepatroon van Gfi1b tijdens hematopoëse dat grotendeels complementair is aan Gfi1",
"We vonden zeer dynamische expressiepatronen van Gfi1b in erytroïde cellen, megakaryocyten en hun voorlopercellen (MEPS) waar Gfi1 niet wordt gedetecteerd. Omgekeerd werd Gfi1b niet gevonden in granulocyten, geactiveerde macrofagen of hun granulomonocytaire voorlopers (GMPs) of in volwassen naïeve of geactiveerde lymfocyten waar Gfi1 wel wordt uitgedrukt, wat wijst op een complementaire regulatie van beide loci tijdens hematopoëse",
"Gfi1 en Gfi1b werken equivalent in hematopoëse",
"onze bevindingen tonen aan dat een intact SNAG-domein essentieel is voor alle functies van Gfi1 en dat Gfi1b functioneel Gfi1 kan vervangen in hematopoëse",
"Gfi-1 oncoproteïnen in hematopoëse",
"Recente gen-targeting experimenten en mutatiescreening bij mensen hebben een essentiële rol voor Gfi-1 en Gfi-1B in hematopoëse onthuld",
"Gfi-1B verstoring is embryonaal lethaal door een blokkade van erytropoëse. Gfi-1B is vereist voor zowel erytroïde als megakaryocytaire ontwikkeling",
"Erytroïde expansie gemedieerd door het Gfi-1B zinkvingereiwit: rol in normale hematopoëse",
"we identificeerden dat de expressie van Gfi-1B (growth factor independence-1B) sterk beperkt is tot hematopoëtische stamcellen, erytroblasten en megakaryocyten",
"Deze bevindingen vestigen Gfi-1B als een nieuwe erytroïde regulator en onthullen de specifieke betrokkenheid bij de regulatie van erytroïde celgroei door modulatie van erytroïde-specifieke genexpressie",
"Het zinkvinger proto-oncogen Gfi-1b is essentieel voor de ontwikkeling van de erytroïde en megakaryocytaire lijnen",
"we stellen vast dat Gfi-1b vereist is voor de ontwikkeling van twee verwante bloedlijnen, erytroïde en megakaryocytaire, in muizen",
"Gfi-1b(-/-) embryonale stamcellen dragen niet bij aan rode bloedcellen van volwassen chimera’s. Gfi-1b(-/-) embryo’s vertonen vertraagde rijping van primitieve erytrocyten en sterven vervolgens door het falen om definitieve, kernloze erytrocyten te produceren",
"Gfi-1b is een essentiële transcriptionele regulator van erytroïde en megakaryocytaire ontwikkeling",
"Growth factor independence 1b (GFI1B) is een DNA-bindende transcriptie repressor met vitale functies in hematopoëse.",
"Omgekeerd leidt verlies van gfi1b tot het stilleggen van runx-1, c-myb, ikaros en cd41, wat aangeeft dat gfi1b vereist is voor definitieve hematopoëse.",
"Gfi1b:green fluorescent protein knock-in muizen tonen een dynamisch expressiepatroon van Gfi1b tijdens hematopoëse dat grotendeels complementair is aan Gfi1.",
"Gfi1 en Gfi1b: sleutelregulatoren van hematopoëse.",
"We tonen aan dat gfi1aa en gfi1b worden uitgedrukt in de primitieve en definitieve locaties van hematopoëse in zebravis.",
"Gerichte genonderbreking van GFI1B in muizen leidt tot embryonale lethaal door falen in de productie van definitieve erytrocyten, wat het bestuderen van Gfi-1B functie in volwassen hematopoëse belemmert.",
"Growth factor independence 1b (gfi1b) is belangrijk voor de rijping van erytroïde cellen en de regulatie van embryonale globine-expressie.",
"Growth factor-independence 1b (Gfi1b) is een zinkvinger transcriptiefactor essentieel voor erytroïde en megakaryocytaire ontwikkeling.",
"Gfi1b (growth factor independence 1b) is een zinkvinger transcriptiefactor essentieel voor de ontwikkeling van de erytroïde en megakaryocytaire lijnen.",
"In feite tonen we aan dat VPA-behandeling in staat is de expressie van growth factor-independent protein 1B (GFI1B) en van mixed-lineage leukemia getransloceerd naar chromosoom 3 eiwit (MLLT3) te induceren, die cruciale regulatoren zijn van erytrocyt- en megakaryocyt differentiatie, en dat de opregulatie van deze genen wordt gemedieerd door histon hyperacetylatie op hun promotorplaatsen.",
"Growth factor independence-1B (Gfi-1B) is een transcriptionele repressor die essentieel is voor erytropoëse en megakaryopoëse.",
"Gfi-1B (growth factor independence-1B) gen is een erytroïde-specifieke transcriptiefactor, waarvan de expressie een essentiële rol speelt in erytropoëse.",
"Bewijs dat growth factor independence 1b dormantie en perifere bloedmobilisatie van hematopoëtische stamcellen reguleert.",
"We rapporteren hier dat volwassen muizen die conditioneel deficient zijn voor de transcriptiefactor Growth factor independence 1b (Gfi1b) een significante expansie van functionele HSC’s in het beenmerg en bloed vertonen.",
"Growth factor-independence 1b (Gfi1b) is een zinkvinger transcriptiefactor essentieel voor erytroïde en megakaryocytaire ontwikkeling",
"Teleost growth factor independence (gfi) genen reguleren differentieel opeenvolgende golven van hematopoëse.",
"Gfi-1B (growth factor independence-1B) gen is een erytroïde-specifieke transcriptiefactor, waarvan de expressie een essentiële rol speelt in erytropoëse",
"Onze data geven aan dat Gfi-1B signalering belangrijk is voor toewijding en rijping van hematopoëtische celpopulaties.",
"We rapporteren hier dat volwassen muizen die conditioneel deficient zijn voor de transcriptiefactor Growth factor independence 1b (Gfi1b) een significante expansie van functionele HSC’s in het beenmerg en bloed vertonen."
] | 1,148
| 1,145
|
996
|
Is Revlimid goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration?
|
Ja, Revlimid is goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van multipel myeloom.
|
[
"In het afgelopen decennium zijn immunomodulerende geneesmiddelen goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van multipel myeloom (MM) - en een aantal opkomende middelen die de cellulaire routes of eiwitten die betrokken zijn bij de pathofysiologie van MM targeten, zijn momenteel in ontwikkeling. Lenalidomide (Revlimid) en pomalidomide induceren apoptose en sensibiliseren MM-cellen, terwijl ze superieure werkzaamheid en betere verdraagbaarheid tonen dan thalidomide (Thalomid).",
"In het afgelopen decennium hebben we vier nieuwe middelen gezien die zijn goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van multipel myeloom: de proteasoomremmer (PI) bortezomib (Velcade), de immunomodulerende middelen lenalidomide (Revlimid) en thalidomide (Thalomid), en liposomale doxorubicine.",
"In het afgelopen decennium hebben we vier nieuwe middelen gezien die zijn goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van multipel myeloom: de proteasoomremmer (PI) bortezomib (Velcade), de immunomodulerende middelen lenalidomide (Revlimid) en thalidomide (Thalomid), en liposomale doxorubicine.",
"Thalidomide, lenalidomide (Revlimid) en bortezomib (Velcade) zijn gericht niet alleen op MM-cellen maar ook op het beenmergmilieu en zijn snel van laboratorium naar klinische toepassing en goedkeuring door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van MM gegaan.",
"Lenalidomide (CC-5013, Revlimid; Celgene Corporation, Summit, NJ), een thalidomide-analoog, kreeg op 29 juni 2006 goedkeuring van de Amerikaanse Food and Drug Administration (FDA) voor gebruik in combinatie met dexamethason bij patiënten met multipel myeloom (MM) die ten minste één eerdere therapie hebben ontvangen.",
"Lenalidomide, een IMiD-middel (een nieuw type immunomodulerend geneesmiddel), is recent goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van transfusie-afhankelijke anemie bij patiënten met myelodysplastische syndromen (MDS) en interstitiële deleties van chromosoom 5q [del(5q)].",
"Lenalidomide, een immunomodulerend geneesmiddel van de tweede generatie (IMiD), is goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van transfusie-afhankelijke anemie bij MDS-patiënten met een laag risico en een deletie 5q chromosomale afwijking.",
"In het afgelopen decennium hebben we vier nieuwe middelen gezien die zijn goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van multipel myeloom: de proteasoomremmer (PI) bortezomib (Velcade), de immunomodulerende middelen lenalidomide (Revlimid) en thalidomide (Thalomid), en liposomale doxorubicine.",
"lenalidomide (CC5103 of revlimid) zijn recent goedgekeurd voor de behandeling van multipel myeloom.",
"In het afgelopen decennium zijn immunomodulerende geneesmiddelen goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor de behandeling van multipel myeloom (MM) - en een aantal opkomende middelen die de cellulaire routes of eiwitten die betrokken zijn bij de pathofysiologie van MM targeten, zijn momenteel in ontwikkeling. Lenalidomide (Revlimid) en pomalidomide induceren apoptose en sensibiliseren MM-cellen, terwijl ze superieure werkzaamheid en betere verdraagbaarheid tonen dan thalidomide (Thalomid)."
] | 435
| 445
|
997
|
Wat is de uitvoeringstijd (complexiteit) van het Smith-Waterman-algoritme voor de uitlijning van twee sequenties
|
De complexiteit van het Smith-Waterman dynamische programmeeralgoritme is kwadratisch, dat wil zeggen dat het draait in tijd die evenredig is aan het product van de lengtes van de uitgelijnde sequenties.
|
[
"Het probleem van het vinden van een optimale structurele uitlijning voor een paar over elkaar gelegde eiwitten is vaak geschikt voor het Smith-Waterman dynamische programmeeralgoritme, dat draait in tijd die evenredig is aan het product van de lengtes van de uitgelijnde sequenties.",
"Hoewel dit resultaat geen asymptotische verbetering is ten opzichte van het oorspronkelijke Smith-Waterman-algoritme, wordt de complexiteit gekarakteriseerd in termen van enkele spaarzame kenmerken van de matrix en levert het de snelste software-implementatie tot nu toe voor dergelijke zoekopdrachten.",
"Als we N, M en C gebruiken om respectievelijk de grootte van een aminozuursequentie, de grootte van een structuurtemplate en de maximale snijgrootte van langafstandinteracties voor te stellen, vindt het algoritme een optimale structuur-sequentie-uitlijning in O(21C NM) tijd, een polynomiale functie van N en M wanneer C = O(log(N + M)). Bij het uitvoeren van structuur-sequentie-uitlijningsproblemen zonder langafstandintersecties, d.w.z. C = 0, bereikt het algoritme dezelfde asymptotische computationele complexiteit als het Smith-Waterman sequentie-sequentie-uitlijningsalgoritme.",
"Het algoritme is gebaseerd op fractioneel programmeren en de uitvoeringstijd is O(n2log n). In de praktijk is genormaliseerde lokale uitlijning slechts 3-5 keer langzamer dan het standaard Smith-Waterman-algoritme."
] | 227
| 220
|
998
|
Noem mutaties die betrokken zijn bij het Gray Platelet Syndroom.
|
GFI1B- en NBEAL2-mutaties zijn betrokken bij het Gray Platelet Syndroom.
|
[
"Een dominant-negatieve GFI1B-mutatie bij het gray platelet syndroom",
"We ontdekten een nonsense-mutatie in het gen dat codeert voor de transcriptiefactor GFI1B (growth factor independent 1B) die autosomaal dominant gray platelet syndroom veroorzaakt.",
"De genetische afwijking die verantwoordelijk is voor het gray platelet syndroom werd recentelijk geïdentificeerd in biallelic mutaties in het NBEAL2-gen.",
"Mutaties in NBEAL2 liggen ten grondslag aan het gray platelet syndroom (GPS), een zeldzame erfelijke bloedingsstoornis die wordt gekenmerkt door een gebrek aan α-granules in bloedplaatjes en progressieve beenmergfibrose.",
"NBEAL2 is gemuteerd bij het gray platelet syndroom en is vereist voor de biogenese van plaatjes α-granules.",
"Mutaties in NBEAL2, dat codeert voor een BEACH-eiwit, veroorzaken het gray platelet syndroom.",
"Mutaties in NBEAL2 liggen ten grondslag aan het gray platelet syndroom (GPS), een zeldzame erfelijke bloedingsstoornis die wordt gekenmerkt door een gebrek aan α-granules in bloedplaatjes en progressieve beenmergfibrose.",
"De genetische afwijking die verantwoordelijk is voor het gray platelet syndroom werd recentelijk geïdentificeerd in biallelic mutaties in het NBEAL2-gen.",
"Onze studies tonen aan dat GFI1B, naast dat het oorzakelijk gerelateerd is aan het gray platelet syndroom, essentieel is voor de ontwikkeling van megakaryocyten en bloedplaatjes.",
"Een dominant-negatieve GFI1B-mutatie bij het gray platelet syndroom.",
"We ontdekten een nonsense-mutatie in het gen dat codeert voor de transcriptiefactor GFI1B (growth factor independent 1B) die autosomaal dominant gray platelet syndroom veroorzaakt.",
"GPS is in verband gebracht met verlies-van-functie mutaties in NEABL2 (neurobeachin-like 2), en we beschrijven hier een muismodel voor GPS, de Nbeal2(-/-) muis.",
"Hier tonen we aan dat mutaties in NBEAL2 (neurobeachin-like 2), dat codeert voor een BEACH/ARM/WD40 domeineiwit, GPS veroorzaken en dat megakaryocyten en bloedplaatjes van personen met GPS een unieke combinatie van NBEAL2-transcripten tot expressie brengen.",
"Het gray platelet syndroom is een zeldzame erfelijke bloedingsstoornis die wordt gekenmerkt door macrothrombocytopenie en een tekort aan alfa (α)-granules in bloedplaatjes. De genetische afwijking die verantwoordelijk is voor het gray platelet syndroom werd recentelijk geïdentificeerd in biallelic mutaties in het NBEAL2-gen.",
"Het gray platelet syndroom is een zeldzame erfelijke bloedingsstoornis die wordt gekenmerkt door macrothrombocytopenie en een tekort aan alfa (α)-granules in bloedplaatjes. De genetische afwijking die verantwoordelijk is voor het gray platelet syndroom werd recentelijk geïdentificeerd in biallelic mutaties in het NBEAL2-gen.",
"Het gray platelet syndroom is een erfelijke, meestal autosomaal recessieve bloedingsstoornis veroorzaakt door een tekort aan alfa-granules in bloedplaatjes. We ontdekten een nonsense-mutatie in het gen dat codeert voor de transcriptiefactor GFI1B (growth factor independent 1B) die autosomaal dominant gray platelet syndroom veroorzaakt.",
"Mutaties in NBEAL2 liggen ten grondslag aan het gray platelet syndroom (GPS),",
"Het gray platelet syndroom is een erfelijke, meestal autosomaal recessieve bloedingsstoornis veroorzaakt door een tekort aan alfa-granules in bloedplaatjes. We ontdekten een nonsense-mutatie in het gen dat codeert voor de transcriptiefactor GFI1B (growth factor independent 1B) die autosomaal dominant gray platelet syndroom veroorzaakt."
] | 443
| 459
|
999
|
Is enkel gids-RNA gebruikt op menselijke cellen?
|
Ja, sgRNA is gebruikt in menselijke cellijnen.
|
[
"We gebruikten een bibliotheek met 73.000 sgRNA's om knockout-verzamelingen te genereren en voerden screenings uit in twee menselijke cellijnen.",
"Hier ontwerpen we dit systeem om RNA-geleid genoomregulatie in menselijke cellen mogelijk te maken door transcriptieactivatiedomeinen direct te koppelen aan een nuclease-nul Cas9-eiwit of aan een aptameer-gemodificeerd enkel gids-RNA (sgRNA).",
"Het type II CRISPR/Cas-systeem van Streptococcus pyogenes en de vereenvoudigde afgeleide, het Cas9/enkel gids-RNA (sgRNA) systeem, zijn naar voren gekomen als krachtige nieuwe hulpmiddelen voor gerichte gen knockout in bacteriën, gist, fruitvlieg, zebravis en menselijke cellen.",
"Hier ontwerpen we dit systeem om RNA-geleid genoomregulatie in menselijke cellen mogelijk te maken door transcriptieactivatiedomeinen direct te koppelen aan een nuclease-nul Cas9-eiwit of aan een aptameer-gemodificeerd enkel gids-RNA (sgRNA).",
"Met synthetische enkele RNA-gidsen kan Cas9 worden geherprogrammeerd om specifieke dubbelstrengs DNA-breuken te creëren in de genomen van verschillende organismen, variërend van menselijke cellen tot bacteriën, en vormt zo een krachtig hulpmiddel voor genetische manipulatie.",
"Hier ontwerpen we dit systeem om RNA-geleid genoomregulatie in menselijke cellen mogelijk te maken door transcriptieactivatiedomeinen direct te koppelen aan een nuclease-nul Cas9-eiwit of aan een aptameer-gemodificeerd enkel gids-RNA (sgRNA)."
] | 206
| 187
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.