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dict |
|---|---|
300
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{
"en": "The integration of these different data sources allows a better classification of lymphomas which are today divided into several dozen distinct entities in the last WHO classification.",
"fr": "L'intégration de ces différentes sources de données a permis une meilleure classification des lymphomes aujourd'hui scindés en plusieurs dizaines d'entités distinctes."
}
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301
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{
"en": "Both case studies are limited by the fact that we would want some specific events, for example changes in management scenarios or species invasions, to occur only in a controlled manner.",
"fr": "Ces deux études de cas sont limitées par le fait que l'on voudrait que certains événements, par exemple des changements de scénarios de gestion ou des invasions d'espèces, ne se produisent que d'une manière contrôlée."
}
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302
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{
"en": "However, despite this carbon reallocation, we showed that a shift from hexose accumulating metabolism to starch and amino acids accumulating metabolism, was inefficient to compensate the decrease in the total osmolarity, leading to the reduction of fruit size.",
"fr": "Cependant, nous avons montré que cette réallocation du carbone (passage d'un métabolisme accumulant des hexoses à un métabolisme accumulant de l'amidon et des acides aminés) était inefficace pour compenser la diminution de l'osmolarité, conduisant à la réduction de la taille des fruits."
}
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303
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{
"en": "ICEs (Integrative Conjugative Elements) and IMEs (Integrative Mobilizable Elements) are bacterial mobile elements that play a key role in horizontal transfers.",
"fr": "Les ICE (Éléments intégratifs conjugatifs) et les IME (Éléments intégratifs mobilisables) sont des éléments mobiles bactériens qui jouent un rôle clé dans les transferts horizontaux."
}
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304
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{
"en": "Finally, we have designed three PCR primer systems targeting a conserved gene that encodes an alanine-tRNA ligase, for an effective and specific identification of Acanthamoeba.",
"fr": "Finalement, nous avons mis au point différents systèmes d'amorces permettant une identification des espèces d'Acanthamoeba."
}
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305
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{
"en": "My thesis concerns the study of holoprosencephaly (HPE) - an extremely severe cerebral pathology associated with a very low diagnostic yield due to its genetic complexity.",
"fr": "Mes travaux de thèse concernent l'étude d'holoprosencéphalie (HPE) - une pathologie cérébrale extrêmement sévère, associée à un rendement diagnostique très faible due à sa complexité génétique."
}
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306
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{
"en": "Three different methods were developed and applied to the protein domain families of the ProDom-CG database.",
"fr": "Trois méthodes différentes ont été développées et appliquées aux familles de domaines protéiques issues de la base de données ProDom-CG."
}
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307
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{
"en": "Among the potential factors inducing dysbiosis, bacteriophages, called phages, are relevant candidates by their predatory function. The aim of the thesis was to determine whether prophages of bacterial strains from the human gut microbiota have a negative impact on the stability of their host in the gut environment.",
"fr": "Parmi les facteurs qui pourraient induire la dysbiose, les bactériophages (dit phages), sont des candidats pertinents par leur fonction prédatrice.L'objectif de la thèse a été de déterminer si les prophages de souches bactériennes du microbiote intestinal humain ont un impact négatif sur la stabilité de leur hôte dans l'intestin."
}
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308
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{
"en": "Septic shock is the combination of a severe sepsis and a hemodynamic dysfunction characterized by an acute fall in blood pressure that cannot be corrected by a procedure of vascular filling.",
"fr": "Le choc septique est l'association d'un état septique grave et d'une défaillance hémodynamique caractérisée par une chute aiguë de la pression artérielle ne pouvant pas être corrigée par une procédure standard de remplissage vasculaire."
}
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309
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{
"en": "Integrative analysis of epigenomic and transcriptomic data in normal T-cell precursors and primary T-ALLs lead to the identification of an alternative promoter of ATP2C1 as frequently up-regulated in T-ALL patients.",
"fr": "L'analyse intégrative des données épigénomiques et transcriptomiques des précurseurs normaux des lymphocytes T et des LAL-T primaires a conduit à l'identification d'un promoteur alternatif de l'ATP2C1 comme étant fréquemment régulé à la hausse chez les patients LAL-T."
}
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310
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{
"en": "Extracted CBPV RNAs were used for in vitro translation experiments.",
"fr": "Les ARN extraits du CBPV ont été utilisés dans des expériences de traduction in vitro."
}
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311
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{
"en": "In this particular context, the structural annotations of the genes and of the LRR motifs in the protein sequences obtained by generic tools contain many errors.",
"fr": "Dans ce contexte particulier, les annotations structurales des gènes et celles des motifs LRR dans les séquences protéiques obtenues par les outils génériques contiennent beaucoup d'erreurs."
}
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312
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{
"en": "Within the epigenetic markers, DNA methylation holds a crucial position: indeed, its reprogramming is indispensable to the fundamental processes that are germinal cell differentiation, spermatogenesis and the embryonic development.",
"fr": "Parmi les marques épigénétiques, la méthylation de l'ADN tient une place essentielle : son remaniement est en effet indispensable aux processus fondamentaux que sont la différenciation des cellules germinales, la spermatogénèse et le développement embryonnaire précoce."
}
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313
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{
"en": "Method. Urinary DNA was extracted from 81 patients with superficial bladder cancer and has been hybridized on the BCA-oligo array.",
"fr": "Méthode L'ADN de 81 échantillons urinaires de patients atteints d'un cancer de vessie superficiel a été extrait et hybridé sur la puce BCA-oligo."
}
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314
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{
"en": "The present thesis project demonstrates that a population of CD4+ T lymphocytes called regulatory T cells (Tregs), which express the transcription factor Forkhead box P3 (Foxp3), is responsible for TGF-beta activation in tumors.",
"fr": "Ces travaux de thèse démontrent qu'une population de lymphocytes T (LT) CD4+ dite T régulateurs (Tregs), qui exprime le facteur de transcription Forkhead box P3 (Foxp3), est responsable de l'activation du TGF-bêta au sein de la tumeur."
}
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315
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{
"en": "This program uses the same dynamic programming algorithm at all levels and a sequential representation of 3D structures.",
"fr": "Ce programme utilise le même algorithme de programmation dynamique à tous les niveaux et une représentation séquentielle des structures 3D."
}
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316
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{
"en": "This second part of the study, performed on a collection of strains also gathered by the SSA, has lead to the identification of a new, previously unknown, lineage of the MTBC.",
"fr": "Cette seconde partie de l'étude, menée sur une collection à nouveau constituée par le SSA, a conduit à l'identification d'une nouvelle lignée au sein du MTBC, jusqu'alors inconnue."
}
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317
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{
"en": "The higher expression of miR-92a and the down regulation of FOXP1 mRNA and proteinwere also found in human samples of PMBL, while miR-92a expression was low and FOXP1was high in DLBCL.",
"fr": "L'expression plus élevée de miR-92a et la sous-expression de FOXP1 au niveau ARN et protéique a également été retrouvé dans les prélèvements humains de PMBL, alors que le niveau d'expression de miR-92a était bas et FOXP1 était haut dans les DLBCL."
}
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318
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{
"en": "One of the current challenges is to reconstruct pathobiomes from metabarcoding data, in order to identify potential biocontrol agents and to monitor in real time their responses to environmental changes.",
"fr": "L'un des défis actuels consiste à reconstruire les pathobiomes à partir de données de metabarcoding, pour identifier des agents potentiels de biocontrôle et pour surveiller en temps réel leurs réponses aux changements environnementaux."
}
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319
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{
"en": "The proteomics analysis of the bioinformatics data identifies PGC-1[alpha], ERR[alpha] and PPAR[alpha] as major determinants of changes in protein expression of mitochondrial oxidative metabolism.",
"fr": "L'étude protéomique du myocarde et l'analyse des données par bioinformatique identifient PGC-1[alpha], PPAR[alpha] et ERR[alpha] comme principaux déterminants des variations d'expression des protéines du métabolisme oxydatif mitochondrial."
}
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320
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{
"en": "It is modelled as a maximum clique problem in alignment graphs, for which we design a dedicated solver with very good performances.",
"fr": "Elle est modélisée comme une recherche de clique maximum dans des graphes d'alignements, pour laquelle nous présentons un solveur dédié montrant de très bonnes performances."
}
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321
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{
"en": "The basic ideas of LanderWaterman theory led to a number of additional results for particular variations in mapping techniques.",
"fr": "Les idées de base de la théorie de Lander-Waterman ont conduit à l'obtention d'un certain nombre de résultats supplémentaires concernant des variations particulières des techniques de cartographie."
}
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322
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{
"en": "Molecules directly encoded by the genome, such as nucleic acids, proteins and peptides derived from proteins by proteolytic cleavage, are not as a rule included in ChEBI.",
"fr": "Les molécules directement codées par le génome, telles que les acides nucléiques, les protéines et les peptides dérivés de protéines par clivage protéolytique, n'y sont généralement pas répertoriées."
}
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323
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{
"en": "The second condition I studied is the abdominal aortic aneurysm (AAA), a common disorder with a strong hereditary component and rare situations of fully penetrant, dominant inheritance.",
"fr": "La seconde pathologie étudiée, l'anévrysme de l'aorte abdominale (AAA), est une maladie commune à forte composante héréditaire, avec de rares formes dominantes à pénétrance élevée."
}
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324
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{
"en": "In this thesis, we propose a method set for mining the molecular biology literature and extracting relevant facts about human gene expression regulation We first present a generic methodology to extract potential named entities from texts.",
"fr": "Dans cette thèse, nous proposons un ensemble de méthodes pour fouiller la littérature de biologie moléculaire et extraire les faits pertinents en relation avec l'expression de gènes humains. Nous présentons tout d'abord une procédure générique destinée à l extraction d'entités nommées candidates à partir des textes."
}
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325
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{
"en": "My PhD work consisted of developing a set of bioinformatics methods to perform DNA mapping using magnetics tweezer signal consisting of hybridization positions along the studied molecule.",
"fr": "Mon travail de thèse consiste à développer un ensemble de méthodes bio-informatique visant à réaliser cette étape de cartographie. Le signal expérimental consiste en lecture des positions d'hybridation d'un, ou de plusieurs petits oligonucléotides sur la molécule étudiée."
}
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326
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{
"en": "Darwin exposed to the world that living species continuously evolve. Yet the molecular mechanisms of evolution remain under intense research.",
"fr": "Darwin a révélé au monde que les espèces vivantes ne cessent jamais d'évoluer, mais les mécanismes moléculaires de cette évolution restent le sujet de recherches intenses."
}
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327
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{
"en": "In order to complete analysis of the post-translational modifications, we studied the modifications of O-GlcNAc for each one of these proteins.",
"fr": "Afin de compléter l'analyse des modifications post-traductionnelles, nous avons étudié les modifications de O-GlcNAc pour chacune de ces protéines."
}
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328
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{
"en": "High viral richness is also observed in savannah areas.",
"fr": "Une richesse virale importante est également observée dans les zones de savane."
}
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329
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{
"en": "The first part of my thesis project has consisted in characterizing inherited genetic factors modifying cancer risk in women participating in the prospective cohort CoF-AT (“cohorte de femmes apparentées à un enfant atteint d'A-T).",
"fr": "Dans le premier volet de ma thèse, j'ai recherché des facteurs génétiques constitutionnels pouvant modifier le risque de cancer chez les femmes de la cohorte CoF-AT (cohorte de femmes apparentées à un enfant atteint d'A-T)."
}
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330
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{
"en": "The results demonstrate the polyphyletic nature of the Derby serovar with 3 genetically distant lineages. Four different MLST profiles were identified within the strains analysed (ST39, ST40, ST71 and ST682).",
"fr": "Les résultats démontrent la nature polyphylétique du sérovar Derby avec 3 lignées génétiquement distantes caractérisées par 4 profils MLST (ST39, ST40, ST71 and ST682)."
}
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331
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{
"en": "Thus, we introduce the MAXIMUM COLORFUL ARBORESCENCE problem (MCA) in order to de novo determine the molecular formula of unknown metabolites.",
"fr": "Ainsi, on introduit le problème MAXIMUM COLORFUL ARBORESCENCE (MCA) dans le but de déterminer de novo la formule moléculaire de métabolites inconnus."
}
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332
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{
"en": "In addition, we built a bioinformatic tool to screen the whole fungal kingdom for sesquiterpene synthases (STS), which are involved in the synthesis of secondary metabolite used by the fungi to compete with other microorganisms in their natural habitat.",
"fr": "De plus, nous avons développé un outil bioinformatique pour l'identification, dans l'ensemble du règne fongique, des enzymes impliquées dans la cyclisation des sesquiterpènes, métabolites secondaires impliqués dans la communication chimique entre micro-organismes dans leur habitat naturel."
}
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333
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{
"en": "Over the course of treatment, genetic heterogeneity and effective population size in the NS5B regions increases sharply after treatment initiation compared to baseline.",
"fr": "Au cours du traitement, l'hétérogénéité génétique et la taille efficace de la population dans la région NS5B augmente fortement après le début du traitement."
}
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334
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{
"en": "Nowadays, we know that RNA interference is a major regulatory process involved in developmental biology and tumor progression.",
"fr": "Nous savons aujourd'hui que le rôle de l'interférence par l'ARN est fondamental, dans le développement embryonnaire comme dans la progression tumorale."
}
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335
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{
"en": "This metabolic endotoxemia associated with a chronic immuno-inflammatory reaction contributes to the development and/or aggravation of metabolic disorders.",
"fr": "Cette endotoxémie métabolique associée à une réaction immuno-inflammatoire chronique peut contribuer au développement et/ou à l'aggravation de troubles métaboliques."
}
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336
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{
"en": "Hypergraphs are a generalization of graphs in which edges are not just couples of nodes but arbitrary n-tuples.",
"fr": "Les hypergraphes sont une généralisation des graphes dans lesquels les arêtes ne sont pas seulement des couples de nœuds mais des n-uplets arbitraires."
}
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337
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{
"en": "Recently, in silico research of pathways common to the different genes described to be involved in both PN and deafness, has found the direct link between PMP22 and MPZ.",
"fr": "Dernièrement, la recherche in silico de voies communes aux différents gènes décrits comme impliqués dans NP+surdité a permis de confirmer le lien direct entre PMP22 et MPZ."
}
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338
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{
"en": "We further developed Hi-C aggregation plots to enable the analysis of asymmetric LRIs such as enhancer-promoter or insulator-promoter contacts, by orientating the sub-matrices before aggregation.",
"fr": "Nous avons développé une méthode basée sur la visualisation par agrégation permettant l'analyse de LRIs asymétriques telles que présentes dans les contacts enhancer-promoteur et insulateur-promoteur, en orientant les sous matrices avant l'agrégation."
}
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339
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{
"en": "One of the important problems encountered in this study was the selection of alternative transcripts and this led me to develop a software called BATfinder (Best Aligned Transcript finder ).",
"fr": "Un problème important rencontré dans cette étude a consisté en la sélection de transcrits alternatifs et ceci m'a conduit à développer un logiciel dédié nommé BATfinder (\\Best Aligned Transcript finder)."
}
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340
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{
"en": "In this thesis, we propose two approaches for selecting representative subgraphs among frequent ones in order to remove redundancy.",
"fr": "Dans cette thèse, nous proposons deux approches de sélection des sous-graphes représentatifs parmi les fréquents a n d'éliminer la redondance."
}
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341
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{
"en": "Moreover, this analysis and the identification of expressed variants allowed us to identify frequent mutations of tumor suppressor genes such as ATRX (16% of cases) and more generally members of the SWI/SNF complex (47% of cases).",
"fr": "De plus, cette analyse ainsi que l'identification de variants exprimés nous ont permis d'identifier de fréquentes mutations de gènes suppresseurs de tumeurs tels qu'ATRX (16% des tumeurs) et plus généralement des membres du complexe SWI/SNF (47% des tumeurs)."
}
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342
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{
"en": "To our knowledge, this is the first test on the context of survival analysis.",
"fr": "À notre connaissance, il s'agit du premier test sur le contexte de l'analyse de survie."
}
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343
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{
"en": "Hidden Markov Models (HMMs) - from Pfam database for example - are popular tools for protein domain annotation.",
"fr": "Les modèles de Markov cachés (MMC) - par exemple ceux de la librairie Pfam - sont des outils très populaires pour l'annotation des domaines protéiques."
}
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344
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{
"en": "Among them is Selenoprotein N or SelenoN; mutations in the SELENON gene can lead to a group of congenital dystrophies now designated as SELENON-related myopathies.",
"fr": "Parmi elles, la sélénoprotéine N ou SelenoN ; des mutations dans le gène SELENON donnent lieu à un groupe de dystrophies musculaires congénitales appelées myopathies liées à SELENON."
}
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345
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{
"en": "Last but not least, my thesis was dedicated to the generation of a macrophage cell model, based on THP-1 cellsand gene editing by CRISPR-Cas9.",
"fr": "Une partie de ma thèse a été consacrée à la mise en place d'un modèle cellulaire macrophagique basé sur une édition génique de cellules THP-1 par CRISPR-Cas9."
}
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346
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{
"en": "In 2016, this species invaded Africa and devastated crop fields.",
"fr": "En 2016, cette espèce a envahi l'Afrique et dévasté les champs de culture."
}
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347
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{
"en": "We therefore created AMYPdb (AMYloid Protein database), the first database dedicated to amyloid proteins.",
"fr": "Dans ce but, nous avons créé AMYPdb (AMYloid Protein database), la première base de données de données dédiée à ces protéines."
}
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348
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{
"en": "We review some of the strategies that can be applied for personalization to combined radiotherapy and immunotherapy treatments.",
"fr": "Nous passons en revue certaines des stratégies applicables pour la personnalisation aux traitements associant radiothérapie et immunothérapie."
}
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349
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{
"en": "Finally, we search for the X circular code motifs in the complete DNA sequences of chromosomes of the eukaryotic genomes.",
"fr": "Enfin, nous avons généralisé la recherche de motifs de code circulaire X dans l'ADN aux chromosomes d'eucaryotes complets."
}
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350
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{
"en": "Nodes still represent genes and connections between them regulatory influences on gene expression.",
"fr": "Les nœuds représentent toujours les gènes et les connexions entre eux influencent la régulation de l'expression des gènes."
}
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351
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{
"en": "We characterized fusion transcripts in these tumors by high-throughput sequencing (RNA-seq).",
"fr": "Nous avons caractérisé les transcrits de fusion exprimés dans ces tumeurs par séquençage haut-débit (RNA-seq)."
}
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352
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{
"en": "This analysis is more complex and can be hazardous in the context of a candidate gene approach.",
"fr": "Cette approche s'est révélée plus complexe à mettre en place, et son efficacité peut être discutée dans le cas d'une étude d'association centrée sur un gène candidat."
}
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353
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{
"en": "We then applied FORCE and PLINK on psoriasis case-control data from the WTCCC.",
"fr": "Nous avons ensuite utilisé FORCE et PLINK pour analyser un jeu de données du WTCCC, concernant psoriasis."
}
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354
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{
"en": "Live cell imaging is an excellent tool to study in detail the consequences of chemical perturbation on a given biological process.",
"fr": "L'imagerie sur cellules vivantes est un excellent outil pour étudier en détail les conséquences d'une perturbation chimique sur un processus biologique."
}
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355
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{
"en": "We use in this thesis notions of combinatorics, mathematics, graph theory and algorithmics.",
"fr": "Nous utilisons, dans ce manuscrit, des notions d'optimisation combinatoire, de mathématiques, de théorie des graphes et d'algorithmique."
}
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356
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{
"en": "The model I propose is that the two secreted effectors, LphD and RomA, work together to hijack the host's epigenetic machinery in order to facilitate the subversion of the host immune response and promotes the intracellular replication of L. pneumophila.",
"fr": "Le modèle que je propose est que les deux effecteurs sécrétés, LphD et RomA, travaillent ensemble pour détourner la machinerie épigénétique de l'hôte afin de faciliter la subversion de la réponse immunitaire et favoriser la réplication intracellulaire de L. pneumophila."
}
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357
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{
"en": "In this thesis we present four applications in bioinformatics with Markov models.",
"fr": "Dans cette thèse nous présentons quatre applications en bioinformatique avec des modèles de Markov."
}
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358
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{
"en": "It has recently been shown that macrophages are essential for replication of Burkholderia cenocepacia and for triggering acute pro-inflammatory and fatal infection in zebrafish larvae.",
"fr": "Nous avons récemment démontré que les macrophages sont essentiels pour la réplication de Burkholderia cenocepacia, et pour le développement d'une infection pro-inflammatoire aigue et fatale dans des embryons de poisson zèbre."
}
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359
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{
"en": "In this study, I used populations of a common tree species of the Guiana Shield - Eperua falcata (Fabaceae) - to study how neutral and adaptive processes shape the distribution of genetic diversity across forest landscapes characterized by local micro-habitat patchiness.",
"fr": "Dans cette étude, j'ai étudié le processus de différentiation génétique d'une espèce d'arbre (Eperua falcata, Fabaceae) dans les paysages forestiers de Guyane française grâce à la combinaison d'une approche phénotypique (génétique quantitative) et d'une approche moléculaire (génétique des populations)."
}
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360
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{
"en": "The discovery of the first cytochrome P450 from Citrus involved in the production of these compounds, opens up new prospects for the elucidation of their biosynthetic pathway in citrus Molecular evolution, based on the study of sequencing data, established itself as a fundamental approach in the study of the history of living organisms (noticeably through the inference of phylogenetic trees).",
"fr": "La découverte du premier cytochrome P450 de Citrus intervenant dans la production de ces composés, ouvre de nouvelles perspectives quant à l'élucidation de leur voie de biosynthèse chez les agrumes. L'évolution moléculaire, basée sur l'étude des données de séquençage, s'est imposée comme une approche majeure pour l'étude de l'Histoire des organismes vivants (notamment à travers les arbres phylogénétiques)."
}
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361
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{
"en": "Significant advances in early diagnosis, prognostic markers, therapeutic response and toxic effect indicators, together with the identification of new potential drug targets, have improved the survival of patients with breast cancer.",
"fr": "Les progrès significatifs enregistrés ou attendus dans le diagnostic précoce, la prédiction du pronostic, de la réponse thérapeutique ou de la toxicité, ainsi que l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques devraient permettre l'amélioration de la survie des cancers du sein."
}
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362
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{
"en": "According to the nature of the data and the type of technologies, speedup from 3 to 20 has been measured compared with the reference software, BLAST, with the same level of quality.",
"fr": "En fonction de la nature des données et des technologies employées des accélérations de 3 à 20 ont été mesurées par rapport à la référence du domaine, le logiciel BLAST, pour un niveau de qualité équivalent."
}
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363
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{
"en": "In order to dissect the genes that enable the diversification of committed muscle cells to attain their final identity, we generated transcriptomics data for mRNA under translation in two muscle subsets expressing the iTFs Lms and Slou and the Duf+ global muscle RNA by TRAP as well as global embryonic mRNA over three time windows of development.",
"fr": "Afin d'identifier les gènes de la diversification musculaire, nous avons généré les données de transcriptomique par TRAP dans deux sous-ensembles musculaires exprimant les iTFs Lms et Slou. Nous avons également extrait l'ARN musculaire global Duf+ ainsi que les ARNm embryonnaire global sur trois fenêtres temporelles de développement."
}
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364
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{
"en": "Our working hypothesis was that these melanomas occur as a result of a de novo genetic accident.",
"fr": "Notre hypothèse de travail était que ces mélanomes surviennent suite à un accident génétique de novo."
}
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365
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{
"en": "This strategy can be applied for other immune cells, other diseases, and even in a physiological setting, so as to functionally map immune cells.",
"fr": "Cette stratégie peut donc être appliquée pour d'autres types de cellules que les cellules T, d'autres pathologies que le cancer, et même dans un contexte physiologique, afin de cartographier les fonctions des cellules immunitaires."
}
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366
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{
"en": "The aim of my PhD work was first to automatize the PRODISTIN method, developped in the lab in order to extract biological information from interaction networks, and to expand it to weighted networks.",
"fr": "Mon travail de thèse a consisté dans une première étape à automatiser la méthode PRODISTIN, développée au laboratoire dans le but d'extraire de l'information biologique des réseaux d'interactions, et à la faire évoluer vers la prise en compte de la pondération des arêtes du réseau."
}
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367
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{
"en": "It has been shown in vitro that when a double-stranded break of the DNA is non-homologously repaired, the strand used for repairing is close in space to the breakpoint.",
"fr": "Il a été montré in vitro que lors d'une cassure double-brin suivie d'une réparation non-homologue, le brin utilisé pour la réparation se situe spatialement proche de la cassure."
}
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368
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{
"en": "To extend the study of this intriguing trans effect, we developed a bioinformatic tool called DeMinEr that unveiled that MARsEμ regions were also involved in AID-induced collateral damages to \"off-targets\". Using FISH 3D, we show that MARsEμ regions harboured the potential not only to locally recruit SHM but also to cause dynamic changes of nuclear structures. The surprising cis and trans effect of MARsEμ deletion, impacting simultaneously nuclear positioning and SHM, revealed an additional level of regulation for targeting mutations to Ig and \"off-targets\" genes.",
"fr": "A l'aide d'une outil bioinformatique (DeMinEr) que nous avons développé dans le but d'identifier des mutations rares, nous montrons également que les régions MARsEμ sont impliquées dans les dommages collatéraux infligés aux \"off targets\" des cellules B. Grâce à la technique de FISH 3D, nous proposons que les régions MARsEμ participent à la régulation de la SHM en influençant la position des cibles de AID dans le noyau des cellules B. Notre étude met en évidence un niveau de régulation spatiale du processus de SHM médié par les régions MARsEμ du locus IgH."
}
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369
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{
"en": "(2) The DHODases superfamily (after DHOases) show a similar phylogeny as DHOases, including enzymes from other pathways, DHPDases in particular (after DHPases).",
"fr": "(2) L'étude de la superfamille des DHODases (qui suivent les DHOases) montre une phylogénie semblable aux DHOases, avec également des enzymes d'autres voies, dont les DHPDases (qui suivent les DHPases)."
}
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370
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{
"en": "For that, a conduction velocity vector field is estimated and analyzed.",
"fr": "Pour cela, un champ vectoriel de vitesse est estimé et analysé."
}
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371
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{
"en": "Additional methods include the Min Cut Supertree approach, Most Similar Supertree Analysis MSSA, Distance Fit DFIT and Quartet Fit QFIT, implemented in the software CLANN.",
"fr": "Les méthodes supplémentaires incluent la Min Cut Supertree approach, la Most Similar Supertree Analysis MSSA, la Distance Fit DFIT et la Quartet Fit QFIT, implémentées dans le logiciel CLANN."
}
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372
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{
"en": "Sixty percent of PPIs annotated in HPRD are supported by a single experiment whereas 26 of them are found to have two of the three experimental methods annotated.",
"fr": "Soixante pour cent des IPP annotés dans l'HPRD sont supportés par une seule expérimentation, alors que 26 entre eux ont deux des trois méthodes expérimentales annotées."
}
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373
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{
"en": "The objectives of the thesis project will be : (1) by integrating genomic data from high throughput sequencing generated by the team on primary samples of LAM IDHm patients (gene expression, methylation, hydroxymethylation), to identify the molecular mechanisms and biological pathways associated with the response to the allosteric inhibitors AG-221 and AG-120; interest will be given to demethylation dynamics as a contribution to the restoration of TET2 protein activity (2) identify the somatic variants acquired during resistance to the inhibitor ivosidenib, in matched samples of AML IDH1m patients (diagnosis/relapse) (3) to initiate a meta-analysis integrating these data with those of other tumour pathologies with IDH anomalies available in the literature. This study is located at the interface of molecular biology, bioinformatics and the clinic.",
"fr": "Le projet de thèse aura pour objectifs (1) par l'intégration de données génomiques issues du séquençage à haut débit générées par l'équipe sur des échantillons primaires de patients LAM IDHm (expression génique, methylation, hydroxymethylation), d'identifier les mécanismes moléculaires et les voies biologiques associés à la réponse aux inhibiteurs allostériques AG-221 et AG-120 ; un intérêt sera porté à la dynamique de déméthylation signant une contribution d'une restauration de l'activité de la protéine TET2 (2) identifier les variants somatiques acquis lors de la résistance à l'inhibiteur ivosidenib, dans des échantillons appariés de patients LAM IDH1m (diagnostic/rechute) (3) d'engager une meta-analyse intégrant ces données à celles d'autres pathologies tumorales présentant des anomalies IDH disponibles dans la littérature ou localement (collections CIT), afin d'établir des Cette étude se situe à l'interface de la biologie moléculaire, la bioinformatique et la clinique."
}
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374
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{
"en": "Multiple substrates are targets for proteostatic degradation.",
"fr": "Les substrats multiples sont des cibles pour la dégradation protéostatique."
}
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375
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{
"en": "Given the key role of TFs in phenotype establishment, this PhD aim at identify the TFs involved in that of the mutant phenotype of T. lutea.A TFs identification and classification pipeline was elaborated and applied to T. lutea's genome.",
"fr": "Compte tenu du rôle clé des FTs dans l'établissement du phénotype, cette thèse vise à identifier les FTs impliqués dans la mise en place de ce phénotype mutant. Un pipeline bio-informatique d'identification et classification des FTs présents dans le génome de T. lutea a été élaboré."
}
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376
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{
"en": "Because of the limited number of patients with certain diseases and the lack of knowledge about them, diagnosis for patients is often delayed.",
"fr": "En raison du nombre limité de patients atteints de certaines maladies et du manque de connaissances à leur sujet, le diagnostic pour les patients est souvent retardé."
}
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377
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{
"en": "Interesting results were obtained highlighting the influence of active site volume and opening on methods performances.",
"fr": "D'intéressants résultats ont été obtenus mettant en évidence l'influence du volume et de l'ouverture des sites actifs sur les performances des méthodes."
}
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378
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{
"en": "We found that constitutive expression of shvR in B. cenocepacia H111 increased virulence in zebrafish larvae to almost K56-2 levels in an afc dependent manner, which strengthens the finding that AFC is a key factor in acute virulence of B. cenocepacia K56-2, and strengthens our hypothesis that differences in regulatory signals between strains may be a major reason for differences in pathogenicity.",
"fr": "Nous avons montré que l'expression constitutive de shvR dans H111 augmente la virulence de la souche dans les embryons de poisson zèbre, à un niveau similaire à K56-2, dépendamment de la présence de afc. Ceci renforce notre hypothèse que AFC est un facteur clé pour la virulence aigue, et que la différence de pathogénicité observée entre différentes souches pourrait être due à des différences de régulation."
}
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379
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{
"en": "The second objective is to make accessible and exploitable the data generated during this thesis for the largest number of people.",
"fr": "Le deuxième objectif est de rendre accessibles et exploitables les données générées au cours de cette thèse pour le plus grand nombre."
}
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380
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{
"en": "This change in physicochemical property of the pocket is probably a major determinant in the acquisition of the transport property of di-protonated CQ from the digestive vacuole to the cytoplasm of the parasite.",
"fr": "Ce changement de propriété physico-chimique de la poche du transporteur est probablement un déterminant majeur de l'acquisition de la propriété de transport de la CQ di-protonée de la vacuole digestive vers le cytoplasme du parasite."
}
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381
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{
"en": "In this thesis, we propose a refined modeling framework ABAN (Asynchronous Binary Automata Network) and develop reachability analysis techniques based on ABAN: PermReach (Reachability via Permutation search) and ASPReach (Reachability via Answer Set Programming).",
"fr": "Ici, nous proposons un cadre de modélisation raffiné ABAN (Asynchronous Binary Automata Network) et développons des outils pour analyser l'atteignabilité : PermReach (Reachability via Permutation search) et ASPReach (Reachability via Answer Set Programming)."
}
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382
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{
"en": "Recent developments in whole genome sequencing and in machine learning algorithms provide huge opportunities that are largely unexploited in antibiotic resistance.",
"fr": "Les développements récents dans le séquençage génomique et en apprentissage automatique bien que impressionnants ne sont pas exploités dans la résistance aux antibiotiques."
}
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383
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{
"en": "We develop a versatile formalism to calculate the asymptotic distribution of the FDP an the associated regularity conditions, for a wide range of multiple testing procedures, and compare their asymptotic power.",
"fr": "On introduit un formalisme flexible qui permet de calculer la loi asymptotique du FDP et les conditions de régularité associées pour une vaste famille de procédures de tests multiples, et de comparer la puissance de ces procédures."
}
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384
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{
"en": "It has been favoured by the use of the universal Luer connector for medical devices with a risk of confusion with the intravenous route.",
"fr": "Elles sont favorisées par la connexion universelle Luer® utilisée pour la connectique des dispositifs médicaux avec un risque de confusion avec la voie intraveineuse."
}
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385
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{
"en": "Among them, two showed an antiplasmodial activity (pancixanthone B and pratensein), three a selective antiinflammatory activity (6-methoxy-7-hydroxyflavanol, 3-(2',3'-dihydroxy-4'-methoxyphenyl)-5,7-dihydroxyisoflavanone and khrinone C) and eight a cytotoxic activity (three inophyllums, three triterpenes, pyranojacareubin and afromorsin).",
"fr": "Parmi ces composés, deux ont montré une activité antiplasmodiale (la pancixanthone B et la pratenséine), trois une activité antiinflammatoire et sélective (le 6-méthoxy-7-hydroxyflavanol, la 3-(2',3'-dihydroxy-4'-méthoxyphényl)-5,7-dihydroxy-isoflavanone et la khrinone C) et huit une activité cytotoxique (trois inophyllums, trois triterpènes, la pyranojacareubine et l'afromorsine)."
}
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386
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{
"en": "In the third part, we analysed the sequence-dependent structural properties of the bacterium genome.",
"fr": "La troisième partie porte sur les propriétés structurelles séquence-dépendantes du chromosome de Buchnera."
}
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387
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{
"en": "Our work has led to the development of novel bioinformatics tools that should contribute to a better understanding of mitochondrial pathophysiology.",
"fr": "À travers ces deux approches, nous avons pu développer de nouveaux outils bio-informatiques qui devraient contribuer à une meilleure compréhension de la physiopathologie mitochondriale."
}
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388
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{
"en": "In this work, TP53INP1 expression was analyzed in pancreatic tumors in order to study this potential suppressive role.",
"fr": "Dans ce travail, l'expression de TP53INP1 a été analysée dans des tumeurs pancréatiques pour étudier ce rôle potentiel."
}
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389
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{
"en": "Among others, this manuscript introduces a self calibration algorithm for Inertial Measurement Units (IMUs) alignment.",
"fr": "En outre, ce manuscrit introduit un algorithme d'auto-calibration pour l'alignement des unités de mesure inertielle (IMU)."
}
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390
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{
"en": "Canonical role of XPC is to recognize UV DNA damage and allowed DNA reparation by Nucleotide Excision Repair mechanism (NER).",
"fr": "Le rôle canonique de XPC est la reconnaissance des dommages à l'ADN induits par les UVs et permet la réparation de l'ADN par le mécanisme de réparation par excision de nucléotide (NER)."
}
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391
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{
"en": "This is being tested with a cosmological simulation workflow application called RAMSES.",
"fr": "Les tests ont été effectuées sur une simulation de cosmologie appelée RAMSES."
}
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392
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{
"en": "A theoretical approach, based on computer simulations, was initiated to evaluate medium-term influence of a geographically restrained fishing pressure on global patterns of genetic variability in dendritic river networks.",
"fr": "Une approche théorique, basée sur les outils de simulation, a été amorcée pour évaluer l'influence à moyen-terme d'une pression de pêche géographiquement localisée sur les patrons généraux de variabilité génétique au sein des réseaux hydrographiques dendritiques."
}
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393
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{
"en": "Analyses show an over-expression of X-linked genes in females in cell types where an atypical inactivation status is observed.",
"fr": "Des analyses montrent une sur-expression de gènes liés au chromosome X chez la femelle dans les types cellulaires où un statut atypique de l'inactivation est observé."
}
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394
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{
"en": "Combining innovative software that leverages the power of statistical smoothing algorithms and a strong biological rationale, this study thus contributed to the identification of megabase-scale patterns of hypomethylation distinguishing early pregnancy from late pregnancy placenta cells as they distinguish normal from cancers cells.",
"fr": "En combinant, des logiciels innovants reposant sur la puissance d'algorithmes de lissage statistique et sur un solide rationnel biologique, cette étude a ainsi contribué à l'identification de motifs d'hypométhylation à l'échelle du mégabase distinguant les cellules placentaires du début de la grossesse de celles de la fin de la grossesse tout comme ils distinguent les cellules cancéreuses des cellules normales."
}
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395
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{
"en": "In the model plant Arabidopsis thaliana, 51 genas encoding LEA proteins have been previously identified.",
"fr": "Chez la plante modèle Arabidopsis thaliana, 51 gènes codant des protéines LEA ont été identifiés précédemment."
}
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396
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{
"en": "Genome is subdivided in euchromatin and heterochromatin domains.",
"fr": "Le génome est subdivisé en euchromatine et hétérochromatine."
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397
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{
"en": "Our third contribution is managerial.",
"fr": "Notre troisième contribution est managériale."
}
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398
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{
"en": "Although GCs are extensively used to treat inflammatory diseases and antiandrogens for prostate cancer, long-term treatments induce major side effects such as muscle atrophy.",
"fr": "Même si les GCs sont fréquemment utilisés pour traiter les maladies inflammatoires et les antiandrogènes pour le cancer de la prostate, les traitements à long terme induisent des effets secondaires majeurs, notamment l'atrophie musculaire."
}
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399
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{
"en": "They also enable to generate data converters to use between services in workflows.",
"fr": "Elles permettent également de générer des convertisseurs de données à utiliser entre services dans les workflows."
}
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